(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヒトＩＬ−１３と結合し、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２および配列番号５４から選択される重鎖ならびに配列番号２４、１０８、１１０、１１２および１１４から選択される軽鎖を含む、抗体またはその抗原結合ドメイン。
【請求項２】
配列番号５４の重鎖および配列番号１０８の軽鎖を含む、請求項１に記載の抗体またはその抗原結合ドメイン。
【請求項３】
ＩＬ−１３と結合でき、ＩＬ−４およびＩＬ−５のうち少なくとも１つとも結合できる、請求項１または２に記載の抗体またはその抗原結合ドメイン。
【請求項４】
配列番号７８、７９、８０、８１および９４から選択される少なくとも１つのｄＡｂを含む、請求項３に記載の抗体またはその抗原結合ドメイン。
【請求項５】
配列番号６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、および１１７〜１３８から選択される重鎖ならびに配列番号２４、１０８、１１０、１１２および１１４から選択される軽鎖を含む、請求項４に記載の抗体またはその抗原結合ドメイン。
【請求項６】
配列番号９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６から選択される重鎖ならびに配列番号２４、１０８および１１０から選択される軽鎖を含む、請求項５に記載の抗体またはその抗原結合ドメイン。
【請求項７】
第１および第２ベクターを含む形質転換またはトランスフェクトされた組換え宿主細胞であって、前記第１ベクターは請求項１〜６のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合ドメインの重鎖をコードするポリヌクレオチドを含み、前記第２ベクターは請求項１〜６のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合ドメインの軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含む、細胞。
【請求項８】
請求項１〜６のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合ドメインおよび医薬上許容可能な担体を含む医薬組成物。
【請求項９】
アレルギー性喘息、重症喘息、困難性喘息、ブリットル喘息、夜間性喘息、月経前喘息、ステロイド抵抗性喘息、ステロイド依存性喘息、アスピリン誘発性喘息、成人発症型喘息、小児喘息、アトピー性皮膚炎、アレルギー性鼻炎、クローン病、ＣＯＰＤ、線維性疾患もしくは障害（特発性肺線維症を含む）、進行性全身性硬化症、肝線維症、肝肉芽腫、住血吸虫症、リーシュマニア症、細胞周期調節疾患（ホジキン病を含む）、Ｂ細胞慢性リンパ球性白血病の治療または予防における使用のための、請求項８に記載の医薬組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、インターロイキン１３（ＩＬ−１３）と結合し、その活性を中和する抗原結合タンパク質（特に抗体）、かかる抗原結合タンパク質をコードするポリヌクレオチド、前記抗原結合タンパク質を含む医薬品ならびに炎症（喘息など）関連疾患の治療および／もしくは予防におけるかかる抗原結合タンパク質の使用に関する。本発明の他の態様、目的および利益は、以下の本明細書から明らかとなるであろう。
【背景技術】
【０００２】
インターロイキン−１３（ＩＬ−１３）
ＩＬ−１３は、炎症サイトカイン産生を阻害するＴ細胞由来サイトカインとして元々記載されている１２ｋＤａ分泌サイトカインである。構造的試験により、ＩＬ−１３は２つのジスルフィド結合により保持されている４つのヘリックスバンドルの配置を有することが示される。ＩＬ−１３は４つの潜在的グリコシル化部位を有するが、ラット肺由来の天然ＩＬ−１３は、非グリコシル化分子として産生されることが分析により示されている。ＮＳＯおよびＣＯＳ−７細胞におけるヒトＩＬ−１３発現により、この観察所見が確認されている（Ｅｉｓｅｎｍｅｓｓｅｒ  ｅｔ  ａｌ，  Ｊ．  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．  ２００１  ３１０（１）：２３１−２４１；  Ｍｏｙ  ｅｔ  ａｌ，  Ｊ．  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ  ２００１  ３１０（１）：２１９−２３０；  Ｃａｎｎｏｎ−Ｃａｒｌｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ，  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  ａｎｄ  Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  １９９８  １２（２）：２３９−２４８）。
【０００３】
ＩＬ−１３は、喘息、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、アトピー性皮膚炎およびアレルギー性鼻炎を含むアレルギー疾患、食道好酸球増加症、腫瘍学適応症、例えばＢ細胞慢性リンパ性白血病（Ｂ−ＣＬＬ）およびホジキン病、炎症腸疾患、例えば潰瘍性大腸炎、クローン病および不確定性大腸炎、乾癬および乾癬性関節炎、急性移植片対宿主病、糖尿病性腎症、線維状態（肺線維症、例えば特発性肺線維症（ＩＰＦ）など）に関係している。
【発明の概要】
【０００４】
本発明は、ＩＬ−１３（例えばＩＬ−１３抗体）、およびかかるＩＬ−１３抗体とＩＬ−４アンタゴニストおよび／またはＩＬ−５アンタゴニストの組み合わせと結合する抗原結合タンパク質を提供する。本発明のＩＬ−１３抗体は、ＣＤＲＨ３が変異しているマウスｍＡｂ  ６Ａ１に関連または由来する。６Ａ１マウス重鎖可変領域アミノ酸配列は、配列番号５８として提供される。６Ａ１マウス軽鎖可変領域アミノ酸配列は、配列番号５９として提供される。
【０００５】
本発明の重鎖可変領域（ＶＨ）は、（Ｋａｂａｔ（Ｋａｂａｔ  ｅｔ  ａｌ；  Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ  ＮＩＨ，  １９８７）により定義される）以下のＣＤＲを含む：
本発明の重鎖可変領域のＣＤＲは、以下のＣＤＲを含み得る：
0005919188.tif 000002
【０００６】
本発明の軽鎖可変領域は、（Ｋａｂａｔにより定義される）以下のＣＤＲを含む：
0005919188.tif 000003
【０００７】
抗体のＣＤＲ配列は、上表に説明するようにＫａｂａｔ番号付け系（Ｋａｂａｔ  ｅｔ  ａｌ；  Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ  ＮＩＨ，  １９８７）により決定することもでき、あるいはＣｈｏｔｈｉａ番号付け系（Ａｌ−Ｌａｚｉｋａｎｉ  ｅｔ  ａｌ．，  （１９９７）  ＪＭＢ  ２７３，９２７−９４８）、接触点の定義方法（ＭａｃＣａｌｌｕｍ  Ｒ．Ｍ．，  ａｎｄ  Ｍａｒｔｉｎ  Ａ．Ｃ．Ｒ．  ａｎｄ  Ｔｈｏｒｎｔｏｎ  Ｊ．Ｍ，  （１９９６），  Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，  ２６２  （５），  ７３２−７４５）または当業者にとって既知である抗体中残基の番号付けおよびＣＤＲ決定のため他の任意の確立された方法を用いて決定することもできる。本明細書に記載の本発明のＣＤＲは、これらのいずれかの方法によって、またはＣｈｏｔｈｉａ番号付けとＫａｂａｔ番号付けの組み合わせを用いて定義し得る。例えばＣＤＲＨ１は、ＦＹＩＫＤＴＹＭＨ（配列番号６０）またはＧＦＹＩＫＤＴＹＭＨ（配列番号６１）を含むものとして定義し得る。
【０００８】
本発明は、１つまたは複数のエピトープ結合ドメインと結合している本発明のＩＬ−１３抗体を含む抗原結合タンパク質、例えばＩＬ−４と結合できるエピトープ結合ドメインと結合している本発明のＩＬ−１３抗体を含む抗原結合タンパク質、またはＩＬ−５と結合できるエピトープ結合ドメインと結合している本発明のＩＬ−１３抗体を含む抗原結合タンパク質、またはＩＬ−４と結合できる第１のエピトープ結合ドメインおよびＩＬ−５と結合できる第２のエピトープ結合ドメインと結合している本発明のＩＬ−１３抗体を含む抗原結合タンパク質も提供する。
【０００９】
本発明は、残基８９（ｋａｂａｔ番号付け）の、「Ｑ」（グルタミン）、「Ｇ」（グリシン）、「Ｓ」（セリン）、「Ｍ」（メチオニン）、「Ａ」（アラニン）、「Ｔ」（トレオニン）および「Ｅ」（グルタミン酸）から選択される残基への変異による、免疫グロブリン単一可変ドメイン（例えばヒトｄＡｂ、例えばヒトＶＫドメイン抗体）の凝集傾向の低減方法も提供する。一実施形態では、この方法は、残基８９（ｋａｂａｔ番号付け）を「Ｑ」（グルタミン）、「Ｇ」（グリシン）、「Ｓ」（セリン）、「Ｍ」（メチオニン）および「Ｅ」（グルタミン酸）から選択される残基に変異させることを含む。さらなる実施形態では、この方法は、残基８９（ｋａｂａｔ番号付け）を「Ｑ」（グルタミン）に変異させることを含む。
【００１０】
一実施形態では、この方法は配列番号８０の抗ＩＬ−４ドメイン抗体に適用して、変異ｄＡｂ配列（例えば配列番号９４）をもたらすことができる。
【００１１】
かかる変異ｄＡｂは、単独またはより大きな配列の一部（例えばｍＡｂｄＡｂ配列の一部）であってよく、例えば、配列番号１１７〜１３４から選択される配列を含むｄＡｂをもたらし得る。
【００１２】
本発明は、凝集プロファイルが改善されているヒトＶＫ  ｄＡｂ、例えばＶＫ  ｄＡｂの残基８９（ｋａｂａｔ番号付け）が「Ｑ」（グルタミン）であるＩＧＫＶ１−１７、ＩＧＫＶ１Ｄ−１７、ＩＧＫＶ１／ＯＲ２−１０８、ＩＧＫＶ１−６、ＩＧＫＶ５−２、ＩＧＫＶ１Ｄ−４２、ＩＧＫＶ２−２４、ＩＧＫＶ２−２８、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ２−４０、ＩＧＫＶ２Ｄ−２９、ＩＧＫＶ２Ｄ−３０、ＩＧＫＶ２Ｄ−２４およびＩＧＫＶ６−２１から選択される生殖系列フレームワークに由来するヒトＶＫ  ｄＡｂも提供する。１つのかかる実施形態では、ＶＫ  ｄＡｂは、ＶＫ  ｄＡｂの残基８９（ｋａｂａｔ番号付け）が「Ｑ」（グルタミン）である生殖系列フレームワークＩＧＫＶ１−１７、ＩＧＫＶ１Ｄ−１７、ＩＧＫＶ１／ＯＲ２−１０８、ＩＧＫＶ１−６、ＩＧＫＶ５−２、ＩＧＫＶ１Ｄ−４２、ＩＧＫＶ２−２４、ＩＧＫＶ２−２８、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ２−４０、ＩＧＫＶ２Ｄ−２９、ＩＧＫＶ２Ｄ−３０、ＩＧＫＶ２Ｄ−２４およびＩＧＫＶ６−２１から選択される生殖系列フレームワーク領域を含む。
【００１３】
一実施形態では、本発明は、８９位（ｋａｂａｔ番号付け）に変異を含み、８９位が「Ｑ」（グルタミン）、「Ｇ」（グリシン）、「Ｓ」（セリン）、「Ｍ」（メチオニン）、「Ａ」（アラニン）、「Ｔ」（トレオニン）および「Ｅ」（グルタミン酸）から選択されるものに変異している配列番号８０の配列を含むヒトｄＡｂを提供する。例えば本発明は、８９位（ｋａｂａｔ番号付け）が、「Ｑ」（グルタミン）、「Ｇ」（グリシン）、「Ｓ」（セリン）、「Ｍ」（メチオニン）および「Ｅ」（グルタミン酸）から選択される残基に変異している配列番号８０の配列を含むヒトｄＡｂを提供する。
【００１４】
一実施形態では、本発明は、配列番号９４の配列を含むヒトｄＡｂを提供する。
【００１５】
本発明は、本明細書に記載の任意の抗原結合タンパク質重鎖をコードするポリヌクレオチド配列、および本明細書に記載の任意の抗原結合タンパク質軽鎖をコードするポリヌクレオチドも提供する。かかるポリヌクレオチドは等価物のポリペプチド配列に相当するコード配列を表すが、かかるポリヌクレオチド配列は開始コドン、適切なシグナル配列および停止コドンと共に発現ベクター中にクローン化し得ることが理解されるであろう。
【００１６】
本発明は、本明細書に記載の任意の抗原結合タンパク質の重鎖および軽鎖をコードする１つまたは複数のポリヌクレオチドを含む組換え形質転換またはトランスフェクトされた宿主細胞も提供する。
【００１７】
本発明はさらに、本明細書に記載の任意の抗原結合タンパク質の産生方法を提供し、この方法は、第１および第２ベクターを含む宿主細胞の培養工程を含み、前記第１ベクターは本明細書に記載の任意の抗原結合タンパク質重鎖をコードするポリヌクレオチドを含み、前記第２ベクターは、適切な培地（例えば無血清培地）中、本明細書に記載の任意の抗原結合タンパク質軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含む。
【００１８】
本発明はさらに、本明細書に記載の抗原結合タンパク質および医薬上許容可能な担体を含む医薬組成物を提供する。
【００１９】
さらなる態様では、本発明は、本発明の抗原結合タンパク質の投与によりアトピー性疾患／障害および慢性炎症疾患／障害と関連した疾患または障害の治療または予防の方法を提供する。特定の興味は、喘息、例えばアレルギー性喘息、特に重症喘息（すなわちコルチコステロイドの全身投与を含む現在の治療が奏効しない喘息；Ｂｕｓｓｅ  ＷＷ  ｅｔ  ａｌ，  Ｊ  Ａｌｌｅｒｇｙ  Ｃｌｉｎ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ  ２０００，  １０６：  １０３３−１０４２を参照されたい）、「困難性」喘息（ｄｉｆｆｉｃｕｌｔ  ａｓｔｈｍａ）（最大推奨用量の吸入ステロイド処方にもかかわらず制御不成功を特徴とする喘息性形質として定義、Ｂａｒｎｅｓ  ＰＪ  （１９９８），  Ｅｕｒ  Ｒｅｓｐｉｒ  Ｊ  １２：１２０８−１２１８を参照されたい）、「ブリットル」喘息（Ｂｒｉｔｔｌｅ  ａｓｔｈｍａ）（高用量の吸入ステロイドにもかかわらず大きく変動する最大呼気流量（ＰＥＦ）を維持する重度の不安定喘息患者のサブグループを定義、Ａｙｒｅｓ  ＪＧ  ｅｔ  ａｌ  （１９９８）  Ｔｈｏｒａｘ  ５８：３１５−３２１を参照されたい）、夜間性喘息、月経前喘息、ステロイド抵抗性喘息（Ｗｏｏｄｃｏｃｋ  ＡＪ  （１９９３）  Ｅｕｒ  Ｒｅｓｐｉｒ  Ｊ  ６：７４３−７４７を参照されたい）、ステロイド依存性喘息（高用量の経口ステロイドでのみ制御できる喘息として定義）、アスピリン誘発性喘息、成人発症型喘息、小児喘息の治療における本発明の抗原結合タンパク質の使用である。本発明の抗体は、急性喘息エピソード（喘息発作重積状態）を予防する、頻度を減らす、または作用を緩和するために使用してよい。本発明の抗体は、喘息の治療に使用される他の薬の必要な投薬を（投薬の投与量または投与頻度のいずれかに関して）減らすためにも使用してよい。例えば、本発明の抗体は、喘息のステロイド治療（コルチコステロイド治療など）に必要な投薬を減らす（「ステロイド使用を控える」）ために使用してよい。本発明の抗体で治療し得る他の疾患または障害としては、アトピー性皮膚炎、アレルギー性鼻炎、クローン病、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、好酸球性食道炎、線維性疾患もしくは障害（特発性肺線維症など）、進行性全身性硬化症（強皮症）、肝線維症、肝肉芽腫、住血吸虫症、リーシュマニア症、および細胞周期調節疾患、例えばホジキン病、Ｂ細胞慢性リンパ球性白血病が挙げられる。
【００２０】
別の態様では、本発明は、アトピー性疾患／障害および慢性炎症疾患／障害の治療または予防のための薬の調製における本発明の抗原結合タンパク質の使用を提供する。特定の興味は、喘息、例えばアレルギー性喘息、特に重症喘息（すなわちコルチコステロイドの全身投与を含む現在の治療が奏効しない喘息；Ｂｕｓｓｅ  ＷＷ  ｅｔ  ａｌ，  Ｊ  Ａｌｌｅｒｇｙ  Ｃｌｉｎ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ  ２０００，  １０６：  １０３３−１０４２を参照されたい）、「困難性」喘息（最大推奨用量の吸入ステロイド処方にもかかわらず制御不成功を特徴とする喘息性形質として定義、Ｂａｒｎｅｓ  ＰＪ  （１９９８），  Ｅｕｒ  Ｒｅｓｐｉｒ  Ｊ  １２：１２０８−１２１８を参照されたい）、「ブリットル」喘息（高用量の吸入ステロイドにもかかわらず大きく変動する最大呼気流量（ＰＥＦ）を維持する重度の不安定喘息患者のサブグループを定義、Ａｙｒｅｓ  ＪＧ  ｅｔ  ａｌ  （１９９８）  Ｔｈｏｒａｘ  ５８：３１５−３２１を参照されたい）、夜間性喘息、月経前喘息、ステロイド抵抗性喘息（Ｗｏｏｄｃｏｃｋ  ＡＪ  （１９９３）  Ｅｕｒ  Ｒｅｓｐｉｒ  Ｊ  ６：７４３−７４７を参照されたい）、ステロイド依存性喘息（高用量の経口ステロイドでのみ制御できる喘息として定義）、アスピリン誘発性喘息、成人発症型喘息、小児喘息の治療における本発明の抗原結合タンパク質の使用である。本発明の抗体は、急性喘息エピソード（喘息発作重積状態）を予防する、頻度を減らす、または作用を緩和するために使用してよい。本発明の抗体は、喘息の治療に使用される他の薬の必要な投薬を（投薬の投与量または投与頻度のいずれかに関して）減らすためにも使用してよい。例えば、本発明の抗体は、喘息のステロイド治療（コルチコステロイド治療など）に必要な投薬を減らす（「ステロイド使用を控える」）ために使用してよい。本発明の抗体で治療し得る他の疾患または障害としては、アトピー性皮膚炎、アレルギー性鼻炎、クローン病、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、好酸球性食道炎、線維性疾患もしくは障害（特発性肺線維症など）、進行性全身性硬化症（強皮症）、肝線維症、肝肉芽腫、住血吸虫症、リーシュマニア症、および細胞周期調節疾患、例えばホジキン病、Ｂ細胞慢性リンパ球性白血病が挙げられる。
【００２１】
本発明の他の態様および利益を本明細書およびその実施形態に詳細に記載する。
【００２２】
定義
本発明のその抗原結合タンパク質に関して本明細書を通して使用される「ヒトＩＬ−１３と結合する」という用語は、抗原結合タンパク質が他のヒトタンパク質（ＩＬ−４など）と結合しないかわずかしか結合せずに、ヒトＩＬ−１３（以下、ｈＩＬ−１３と呼ぶ）と結合することを意味する。特に、本発明の抗原結合タンパク質は、Ｂｉａｃｏｒｅアッセイ（例えば実施例３に記載のＢｉａｃｏｒｅアッセイ）にてヒトＩＬ−１３と結合することを見ることができる点から、ヒトＩＬ−１３と結合する。しかしながら、この用語は、本発明のある抗原結合タンパク質は他種由来のＩＬ−１３（例えばカニクイザルＩＬ−１３）と交差反応もし得るという事実を除外しない。
【００２３】
本明細書で使用する「抗原結合タンパク質」という用語は、ヒトＩＬ−１３と結合でき、中和できる抗体、抗体断片および他のタンパク質構築物を指す。
【００２４】
Ｆｖ、Ｆｃ、Ｆｄ、Ｆａｂ、またはＦ（ａｂ）２という用語は、標準的な意味で使用される（例えば、Ｈａｒｌｏｗ  ｅｔ  ａｌ．，  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，  Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，  （１９８８）を参照されたい）。
【００２５】
「キメラ抗体」とは、アクセプター抗体に由来する軽鎖および重鎖定常領域に関連したドナー抗体由来の天然可変領域（軽鎖および重鎖）を含む加工された抗体の一種を指す。
【００２６】
「ヒト化抗体」とは、非ヒトドナー免疫グロブリンに由来するＣＤＲを有し、分子の残りの免疫グロブリン派生部分は１つ（以上）のヒト免疫グロブリンに由来する加工された抗体の一種を指す。加えて、フレームワーク支持残基は、結合親和性を保持するために改変し得る（例えば、Ｑｕｅｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ，  ８６：１００２９−１００３２  （１９８９），  Ｈｏｄｇｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，  ９：４２１  （１９９１）を参照されたい）。適切なヒトアクセプター抗体は、ドナー抗体のヌクレオチド配列およびアミノ酸配列への相同により、従来のデータベース、例えば、ＫＡＢＡＴ（登録商標）データベース、Ｌｏｓ  Ａｌａｍｏｓデータベース、およびＳｗｉｓｓタンパク質データベースから選択し得る。ドナー抗体のフレームワーク領域との（アミノ酸に基づく）相同を特徴とするヒト抗体は、ドナーＣＤＲを挿入するための重鎖定常領域および／または重鎖可変フレームワーク領域の提供に適し得る。軽鎖の定常または可変フレームワーク領域を供与できる適切なアクセプター抗体を類似の形態にて選択し得る。アクセプター抗体の重鎖と軽鎖は同じアクセプター抗体に由来している必要がないことに留意されたい。先行技術にて、かかるヒト化抗体の産生方法がいくつか記載されている−例えば欧州特許第Ａ−０２３９４００号および欧州特許第Ａ−０５４９５１号を参照されたい。
【００２７】
「ドナー抗体」という用語は、領域をコードする改変された免疫グロブリンならびにその結果発現したドナー抗体の抗原特異性および中和活性特徴を有する改変抗体を提供するようにその可変領域、ＣＤＲ、または他の、その機能的断片もしくは第１免疫グロブリンパートナーアナログのアミノ酸配列に寄与する（モノクローナル、および／または組換え）抗体を指す。
【００２８】
「アクセプター抗体」という用語は、第１免疫グロブリンパートナーに対するその重鎖および／もしくは軽鎖フレームワーク領域ならびに／またはその重鎖および／もしくは軽鎖定常領域をコードするアミノ酸配列のすべて（または任意の一部だが、いくつかの実施形態では、すべて）に寄与する、ドナー抗体と異種の（モノクローナルおよび／または組換え）抗体を指す。ある実施形態では、ヒト抗体はアクセプター抗体である。
【００２９】
「ＣＤＲ」は、免疫グロブリン重鎖および軽鎖の超可変領域である抗体の相補性決定領域アミノ酸配列として定義する。例えば、Ｋａｂａｔ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，  ４ｔｈ  Ｅｄ．，  Ｕ．Ｓ．  Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ  ａｎｄ  Ｈｕｍａｎ  Ｓｅｒｖｉｃｅｓ，  Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ  （１９８７）を参照されたい。免疫グロブリンの可変部分には３つの重鎖および３つの軽鎖ＣＤＲ（またはＣＤＲ領域）がある。したがって、本明細書で使用する「ＣＤＲ」とは、全３つの重鎖ＣＤＲまたは全３つの軽鎖ＣＤＲ（または適切な場合、全重鎖ＣＤＲと全軽鎖ＣＤＲの両方）を指す。抗体の構造およびタンパク質の折り畳み部分は、他の残基が抗原結合領域の一部とみなされ、当業者によりそのように理解されることを意味し得る。例えばＣｈｏｔｈｉａ  ｅｔ  ａｌ．，  （１９８９）  Ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｓ  ｏｆ  ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ  ｈｙｐｅｒｖａｒｉａｂｌｅ  ｒｅｇｉｏｎｓ；  Ｎａｔｕｒｅ  ３４２，  ｐ８７７−８８３を参照されたい。
【００３０】
本明細書で使用する「ドメイン」という用語は、残りのタンパク質とは独立した三次構造を有する折り畳まれたタンパク質構造を指す。一般に、ドメインは、タンパク質の別々の機能特性を担い、多くの場合、残るタンパク質および／またはドメインの機能を失わずに他のタンパク質に添加、除去または移動し得る。「単一抗体可変ドメイン」とは、抗体可変ドメインに特徴的な配列を含む折り畳まれたポリペプチドドメインである。したがって、完全な抗体可変ドメインおよび修飾可変ドメイン（例えば、１つまたは複数のループが抗体可変ドメインに特徴的でない配列に置換されている）、またはＮもしくはＣ末端伸長部分が切断されているか含まれる抗体可変ドメイン、ならびに完全長ドメインの少なくとも結合活性および特異性を保持する可変ドメインの折り畳まれた断片を含む。
【００３１】
「免疫グロブリン単一可変ドメイン」という語句は、異なるＶ領域またはＶドメインとは独立して抗原またはエピトープと特異的結合する抗体可変ドメイン（ＶＨ、ＶＨＨ、ＶＬ）を指す。免疫グロブリン単一可変ドメインは、単一免疫グロブリン可変ドメインによる抗原結合のための他の領域またはドメインが不要である他の異なる可変領域または可変ドメインと1つの型式（例えば、ホモまたはヘテロ多量体）で存在できる（すなわち免疫グロブリン単一可変ドメインは、追加の可変ドメインとは独立して抗原と結合する）。「ドメイン抗体」または「ｄＡｂ」とは、本明細書で使用する、抗原と結合できる「免疫グロブリン単一可変ドメイン」という用語と同義である。免疫グロブリン単一可変ドメインは、ヒト抗体可変ドメインであり得るが、齧歯類（例えば、ＷＯ００／２９００４号に開示のもの）、テンジクザメおよびラクダＶＨＨ  ｄＡｂ（ナノボディ）などの他種に由来する単一抗体可変ドメインも含む。ラクダＶＨＨは、天然で軽鎖を欠いている重鎖抗体を産生するラクダ、ラマ、アルパカ、ヒトコブラクダ、およびグアナコを含む種に由来する免疫グロブリン単一可変ドメインポリペプチドである。かかるＶＨＨドメインは、当技術分野で利用可能な標準的な技術に従いヒト化し得、かかるドメインは、依然として本発明による「ドメイン抗体」とみなされる。本明細書で使用する「ＶＨ」は、ラクダＶＨＨドメインを含む。ＮＡＲＶは、テンジクザメを含む軟骨魚において同定された別の種類の免疫グロブリン単一可変ドメインである。これらのドメインは、新規の抗原受容体可変領域（一般にＶ（ＮＡＲ）またはＮＡＲＶと略される）としても知られている。詳細については、Ｍｏｌ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  ４４，  ６５６−６６５  （２００６）および米国特許第２００５００４３５１９Ａ１号を参照されたい。
【００３２】
「エピトープ結合ドメイン」という用語は、異なるＶ領域またはＶドメインとは独立して抗原またはエピトープと特異的結合するドメインを指し、これはドメイン抗体（ｄＡｂ）、例えばヒト、ラクダまたはサメ免疫グロブリン単一可変ドメインであってもよく、天然リガンド以外のリガンドへの結合を達成するためにタンパク質工学にかけられた非免疫グロブリン足場、例えばＣＴＬＡ−４（Ｅｖｉｂｏｄｙ）；リポカリン；プロテインＡ派生分子（プロテインＡのＺドメイン（Ａｆｆｉｂｏｄｙ、ＳｐＡ）、Ａドメイン（Ａｖｉｍｅｒ／Ｍａｘｉｂｏｄｙ）など）；熱ショックタンパク質（ＧｒｏＥｌおよびＧｒｏＥＳなど）；トランスフェリン（ｔｒａｎｓ−ｂｏｄｙ）；アンキリン反復タンパク質（ＤＡＲＰｉｎ）；ペプチドアプタマー；Ｃ型レクチンドメイン（Ｔｅｔｒａｎｅｃｔｉｎ）；ヒトγクリスタリンおよびヒトユビキチン（ａｆｆｉｌｉｎ）；ＰＤＺドメイン；ヒトプロテアーゼ阻害剤のサソリ毒クニッツ型ドメイン；ならびにフィブロネクチン（ａｄｎｅｃｔｉｎ）からなる群から選択される非免疫グロブリン足場の誘導体であるドメインであってもよい。
【００３３】
ＣＴＬＡ−４（細胞傷害性Ｔリンパ球結合抗原４）は主にＣＤ４＋Ｔ細胞上で発現するＣＤ２８ファミリー受容体である。その細胞外ドメインは、可変ドメイン様Ｉｇ折り畳み部分を有する。抗体のＣＤＲに対応するループは、異なる結合特性を与えるために異種配列と置換することができる。異なる結合特異性を有するように加工されたＣＴＬＡ−４分子は、Ｅｖｉｂｏｄｙとしても知られている。詳細については、Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ２４８  （１−２），  ３１−４５  （２００１）を参照されたい。
【００３４】
リポカリンは、小さな疎水性分子（ステロイド、ビリン、レチノイドおよび脂質など）を輸送する細胞外タンパク質ファミリーである。それらは、異なる標的抗原と結合するように加工することができる、円錐構造の開端にループをいくつか有する硬βシート状二次構造を有する。Ａｎｔｉｃａｌｉｎは、サイズが１６０〜１８０個のアミノ酸であり、リポカリンに由来する。詳細については、Ｂｉｏｃｈｉｍ  Ｂｉｏｐｈｙｓ  Ａｃｔａ  １４８２：  ３３７−３５０  （２０００）、米国特許第７２５０２９７Ｂ１号および米国特許第２００７０２２４６３３号を参照されたい。
【００３５】
Ａｆｆｉｂｏｄｙ（アフィボディ）は、抗原と結合するように加工することができる黄色ブドウ球菌のプロテインＡに由来する足場である。ドメインは、約５８個のアミノ酸の３つのヘリックスバンドルからなる。ライブラリは、表面残基の無作為化により生成されている。詳細については、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｎｇ．  Ｄｅｓ．  Ｓｅｌ．  １７，  ４５５−４６２  （２００４）および欧州特許第１６４１８１８Ａ１号を参照されたい。
【００３６】
Ａｖｉｍｅｒ（アビマー）は、Ａドメイン足場ファミリーに由来する多ドメインタンパク質である。約３５個のアミノ酸の天然ドメインは、定義されたジスルフィド結合構造をとる。多様性は、Ａドメインファミリーによって示される天然変異をシャッフルすることによって生成される。詳細については、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ２３（１２），  １５５６  −  １５６１  （２００５）  ａｎｄ  Ｅｘｐｅｒｔ  Ｏｐｉｎｉｏｎ  ｏｎ  Ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｉｏｎａｌ  Ｄｒｕｇｓ  １６（６），  ９０９−９１７  （Ｊｕｎｅ  ２００７）を参照されたい。
【００３７】
トランスフェリンは、単量体血清輸送糖タンパク質である。トランスフェリンは、許容状態の表面ループへのペプチド配列の挿入によって、異なる標的抗原と結合するように加工することができる。加工されたトランスフェリン足場の例としては、Ｔｒａｎｓ−ｂｏｄｙが挙げられる。詳細については、Ｊ．  Ｂｉｏｌ．  Ｃｈｅｍ  ２７４，  ２４０６６−２４０７３  （１９９９）を参照されたい。
【００３８】
設計されたアンキリン反復タンパク質（ＤＡＲＰｉｎ）は、内在性膜タンパク質の細胞骨格への結合を媒介するタンパク質ファミリーであるアンキリンに由来する。単一アンキリン反復は、２つのα−ヘリックスおよびβ−ターンからなる３３残基のモチーフである。それらは、各反復の第１α−ヘリックスおよびβ−ターンにおける残基を無作為化することによって、異なる標的抗原と結合するように加工することができる。それらの結合界面は、モジュール数を増大することによって増大できる（親和性成熟の方法）。詳細については、Ｊ．  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．  ３３２，  ４８９−５０３  （２００３），  ＰＮＡＳ  １００（４），  １７００−１７０５  （２００３）およびＪ．  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．  ３６９，  １０１５−１０２８  （２００７）ならびに米国特許第２００４０１３２０２８Ａ１号を参照されたい。
【００３９】
フィブロネクチンは、抗原と結合するように加工することができる足場である。Ａｄｎｅｃｔｉｎは、ヒトフィブロネクチンＩＩＩ型（ＦＮ３）１５反復単位の１０番目ドメイン天然アミノ酸配列の主鎖からなる。β−サンドイッチの片端における３つのループは、Ａｄｎｅｃｔｉｎが興味の治療標的を特異的に認識することを可能にするように加工することができる。詳細については、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｎｇ．  Ｄｅｓ．  Ｓｅｌ．  １８，  ４３５−４４４  （２００５）、米国特許第２００８０１３９７９１号、ＷＯ２００５０５６７６４号および米国特許第６８１８４１８Ｂ１号を参照されたい。
【００４０】
ペプチドアプタマーは、普遍的な足場タンパク質、典型的には、活性部位に挿入された制限された可変ペプチドループを含むチオレドキシン（ＴｒｘＡ）からなるコンビナトリアル認識分子である。詳細については、Ｅｘｐｅｒｔ  Ｏｐｉｎ．  Ｂｉｏｌ．  Ｔｈｅｒ．５，  ７８３−７９７  （２００５）を参照されたい。
【００４１】
微小体（Ｍｉｃｒｏｂｏｄｙ）は、３〜４個のシステイン架橋を含む２５〜５０個のアミノ酸の長さの天然マイクロタンパク質に由来し、マイクロタンパク質の例としては、ＫａｌａｔａＢ１およびコノトキシンおよびノッチンが挙げられる。マイクロタンパク質は、マイクロタンパク質の全体的な折り畳み部分に影響を与えずに最大２５個のアミノ酸を含むように加工することができるループを有する。加工されたノッチンドメインの詳細については、ＷＯ２００８０９８７９６号を参照されたい。
【００４２】
他のエピトープ結合ドメインとしては、異なる標的抗原結合特性を加工するために足場として使用されてきたタンパク質が挙げられ、ヒトγクリスタリンおよびヒトユビキチン（ａｆｆｉｌｉｎ）、ヒトプロテアーゼ阻害剤のクニッツ型ドメイン、Ｒａｓ結合プロテインＡＦ−６のＰＤＺドメイン、サソリ毒（カリブドトキシン）、Ｃ型レクチンドメイン（ｔｅｔｒａｎｅｃｔｉｎ）が挙げられ、Ｃｈａｐｔｅｒ  ７  −  Ｎｏｎ−Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｓｃａｆｆｏｌｄｓ  ｆｒｏｍ  Ｈａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  （２００７，  ｅｄｉｔｅｄ  ｂｙ  Ｓｔｅｆａｎ  Ｄｕｂｅｌ）およびＰｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  １５：１４−２７  （２００６）に概説されている。本発明のエピトープ結合ドメインは、これらの任意の代替タンパク質ドメインに由来し得る。
【００４３】
本明細書で使用する「抗原結合部位」という用語は、抗原と特異的結合できるタンパク質上の部位を指し、これは単一ドメイン、例えばエピトープ結合ドメインであってもよく、または標準的な抗体上に見つけることができるような対になったＶＨ／ＶＬドメインであってもよい。本発明のいくつかの態様では、単鎖Ｆｖ（ＳｃＦｖ）ドメインは、抗原結合部位を提供できる。
【００４４】
本明細書で使用する「ｍＡｂｄＡｂ」および「ｄＡｂｍＡｂ」という用語は、本発明の抗原結合タンパク質を指す。２つの用語は同義的に使用でき、本明細書で使用する場合に同じ意味を有することが意図される。
【００４５】
本明細書で使用する「抗原結合タンパク質」という用語は、抗体、抗体断片、例えばドメイン抗体（ｄＡｂ）、ＳｃＦｖ、ＦＡｂ、ＦＡｂ２、およびＩＬ−１３と結合できる他のタンパク質構築物を指す。抗原結合分子は、Ｉｇ可変ドメイン（例えば抗体、ドメイン抗体、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ、ＳｃＦｖ、二重特異性抗体、ｍＡｂｄＡｂ、Ａｆｆｉｂｏｄｙ、ヘテロ抱合体抗体もしくは二重特異性抗体）を少なくとも１つ含み得る。一実施形態では、抗原結合分子は抗体である。別の実施形態では、抗原結合分子はｄＡｂ、すなわち異なるＶ領域またはＶドメインとは独立して抗原またはエピトープと特異的結合するＶＨ、ＶＨＨまたはＶＬなどの免疫グロブリン単一可変ドメインである。抗原結合分子は、２つの標的と結合可能であり得る、すなわち二重標的タンパク質であり得る。抗原結合分子は、抗体および抗原結合断片（例えば、１つもしくは複数のドメイン抗体ならびに／またはモノクローナル抗体と結合した１つもしくは複数のＳｃＦｖなど）の組み合わせであり得る。抗原結合分子は、ＩＬ−１３への結合を達成するためにタンパク質工学にかけられた非Ｉｇドメイン、例えばＣＴＬＡ−４（Ｅｖｉｂｏｄｙ）；リポカリン；プロテインＡ派生分子（プロテインＡのＺドメイン（Ａｆｆｉｂｏｄｙ、ＳｐＡ）、Ａドメイン（Ａｖｉｍｅｒ／Ｍａｘｉｂｏｄｙ）など）；熱ショックタンパク質（ＧｒｏＥｌおよびＧｒｏＥＳなど）；トランスフェリン（ｔｒａｎｓ−ｂｏｄｙ）；アンキリン反復タンパク質（ＤＡＲＰｉｎ）；ペプチドアプタマー；Ｃ型レクチンドメイン（Ｔｅｔｒａｎｅｃｔｉｎ）；ヒトγクリスタリンおよびヒトユビキチン（ａｆｆｉｌｉｎ）；ＰＤＺドメイン；ヒトプロテアーゼ阻害剤のサソリ毒クニッツ型ドメイン；ならびにフィブロネクチン（ａｄｎｅｃｔｉｎ）からなる群から選択される足場の誘導体であるドメインも含み得る。本明細書で使用する「抗原結合タンパク質」はヒトＩＬ−１３を拮抗および／または中和できる。加えて、抗原結合タンパク質はＩＬ−１３と結合することによってＩＬ−１３活性をブロックし得、天然リガンドによる受容体への結合および／または受容体の活性化を防止し得る。
【００４６】
本明細書で使用する「ＩＬ−１３アンタゴニスト」は、ＩＬ−１３の活性を少なくとも１つ低減およびまたは除去できる任意の化合物を含む。例として、ＩＬ−１３アンタゴニストはＩＬ−１３と結合し、この結合はＩＬ−１３活性を直接低減または除去する場合もあり、リガンドの受容体結合を少なくとも１つブロックすることによって間接的に低減または除去する場合もある。
【００４７】
本明細書で使用する「ＩＬ−４アンタゴニスト」は、ＩＬ−４の活性を少なくとも１つ低減およびまたは除去できる任意の化合物を含む。例として、ＩＬ−４アンタゴニストはＩＬ−４と結合し、この結合はＩＬ−４活性を直接低減または除去する場合もあり、リガンドの受容体結合を少なくとも１つブロックすることによって間接的に低減または除去する場合もある。
【００４８】
本明細書で使用する「ＩＬ−５アンタゴニスト」は、ＩＬ−５の活性を少なくとも１つ低減およびまたは除去できる任意の化合物を含む。例として、ＩＬ−５アンタゴニストはＩＬ−５と結合し、この結合はＩＬ−５活性を直接低減または除去する場合もあり、リガンドの受容体結合を少なくとも１つブロックすることによって間接的に低減または除去する場合もある。
【図面の簡単な説明】
【００４９】
【図１】ＴＦ−１細胞増殖アッセイにおいてＹ１００Ｂ変異体を含むｍＡｂｄＡｂのヒトＩＬ−１３を中和能力を示すグラフ
【図２】ＴＦ−１細胞増殖アッセイにおいてＹ１００Ｂ変異体を含むｍＡｂｄＡｂのヒトＩＬ−１３を中和能力を示すグラフ
【図３】ＢＰＣ２２２２のＳＥＣトレース
【図４】ＢＰＣ２２２３のＳＥＣトレース
【図５】ＢＰＣ２２３０のＳＥＣトレース
【図６】ＢＰＣ２２３１のＳＥＣトレース
【図７】ＢＰＣ１０８５のＳＥＣトレース
【図８】ＢＰＣ１０８６のＳＥＣトレース
【図９】ＢＰＣ１０８７のＳＥＣトレース
【図１０】ＥＬＩＳＡにより決定した、精製されたｍＡｂｄＡｂ（ＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７）のヒトＩＬ−４への結合を示すグラフ。ＩＬ−４対照ｍＡｂは「パスコリズマブ」と表示する。
【図１１】ＴＦ−１細胞バイオアッセイにおいて、ヒトＩＬ−４に対し精製されたｍＡｂｄＡｂ（ＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７）によるヒトＩＬ−４中和を示すグラフ。ＩＬ−４対照ｍＡｂは「パスコリズマブ」と表示する。
【図１２】ＴＦ−１細胞バイオアッセイにおいて、ヒトＩＬ−１３に対し精製されたｍＡｂｄＡｂ（ＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７）によるヒトＩＬ−１３中和を示すグラフ。ＩＬ−４対照ｍＡｂは「パスコリズマブ」と表示する。
【図１３】ＢＰＣ３２１４のＳＥＣプロファイル。
【図１４】ＢＰＣ３２１５のＳＥＣプロファイル。
【図１５】ＥＬＩＳＡにより決定した、精製されたｍＡｂｄＡｂ  ＢＰＣ３２１４、ＢＰＣ３２１５、ＢＰＣ１０８５および対照ｍＡｂ  Ａ１Ｙ１００ＢＶＡＬ１および抗ＩＬ−４  ｍＡｂのヒトＩＬ−１３への結合を示すグラフ。ＩＬ−４対照ｍＡｂは「パスコリズマブ」と表示する。
【図１６】ＥＬＩＳＡにより決定した、精製されたｍＡｂｄＡｂ  ＢＰＣ３２１４、ＢＰＣ３２１５、ＢＰＣ１０８５および対照ｍＡｂ  Ａ１Ｙ１００ＢＶＡＬ１および抗ＩＬ−４  ｍＡｂのヒトＩＬ−４への結合を示すグラフ。ＩＬ−４対照ｍＡｂは「パスコリズマブ」と表示する。
【図１７】ＥＬＩＳＡにより決定した、一過性発現したｍＡｂｄＡｂの組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−４への結合を示すグラフ。ＩＬ−４対照ｍＡｂは「パスコリズマブ」と表示する。
【発明を実施するための形態】
【００５０】
一実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８および配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４および配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７および配列番号１８からなる一覧から選択されるＣＤＲＨ３ならびに適切なＣＤＲＨ１およびＣＤＲＨ２を含む重鎖可変領域を含み、適切なＣＤＲＬ１、ＣＤＲＬ２およびＣＤＲＬ３を含む軽鎖可変領域と対をなして、ヒトＩＬ−１３と結合する抗原結合Ｆｖ単位を形成する。一実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、ヒトＩＬ−１３活性を中和する。
【００５１】
この実施形態の一態様では、配列番号１もしくは配列番号６０、もしくは配列番号６１に説明されるＣＤＲＨ１ならびに配列番号２に説明されるＣＤＲＨ２も重鎖可変領域に存在する。この実施形態のさらなる態様では、配列番号１９に説明されるＣＤＲＨＬ１、配列番号２０に説明されるＣＤＲＬ２および配列番号２１に説明されるＣＤＲＬ３も軽鎖可変領域に存在する。
【００５２】
別の態様では、抗原結合タンパク質は、Ｂｉａｃｏｒｅにより１０ｎＭ以下、より特に２ｎＭ以下、例えば約０．８ｎＭ〜２ｎＭ、１ｎＭ以下、または１００ｐＭ以下、例えば約２０ｐＭ〜約１００ｐＭまたは約２０ｐＭ〜約８０ｐＭ、または約２０ｐＭ〜約６０ｐＭと測定された高親和性でヒトＩＬ−１３と結合する。１つのかかる実施形態では、これは例えば実施例３に説明するように、バイオセンサーチップ上に捕捉された抗原結合タンパク質を用いてＢｉａｃｏｒｅにより測定される。
【００５３】
本発明の重鎖可変領域はヒトＩＬ−１３と結合させる軽鎖可変領域と共に、従来の免疫グロブリン形態で（例えば、ヒトＩｇＧ、ＩｇＡ、ＩｇＭなど）またはヒトＩＬ−１３との結合を可能にする他の任意の「抗体様」型式（例えば、単一鎖Ｆｖ、二重特異性抗体、Ｔａｎｄａｂ（商標）など）において構成し得る（代替「抗体」型式の概要については、Ｈｏｌｌｉｇｅｒ  ａｎｄ  Ｈｕｄｓｏｎ，  Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，  ２００５，  Ｖｏｌ  ２３，  Ｎｏ．  ９，  １１２６−１１３６を参照されたい）。
【００５４】
本発明の抗原結合タンパク質は、配列番号５８および配列番号５９に記載の可変領域を有するマウス抗体、または非マウスのその等価物（ラット、ヒト、キメラまたはそのヒト化変異体など）に由来し、例えば配列番号２２および配列番号２４に記載の重鎖および軽鎖を有するヒト化抗体に由来する。
【００５５】
本発明の一態様では、ヒトＩＬ−１３と結合し、ＣＤＲＨ３  ＳＩＹＤＤＹＨＹＤＤＹＹＡＭＤＹ（配列番号３）の変異体を含み、ＣＤＲＨ３が１つもしくは複数の以下の位置（Ｋａｂａｔ番号付けを使用）で以下に説明する代替アミノ酸に置換されている抗原結合タンパク質（例えば抗体）を提供する：
ａ）１位のＳ９５は、トリプトファン（Ｗ）と置換されている
ｂ）２位のＩ９６は、バリン（Ｖ）と置換されている
ｃ）３位のＹ９７は、フェニルアラニン（Ｆ）と置換されている
ｄ）４位のＤ９８は、グルタミン（Ｅ）と置換されている
ｅ）７位のＨ１００Ａは、アラニン（Ａ）、グルタミン酸（Ｅ）、グルタミン（Ｑ）、アルギニン（Ｒ）、セリン（Ｓ）、トレオニン（Ｔ）もしくはバリン（Ｖ）と置換されている、ならびに
ｆ）８位のＹ１００Ｂは、アラニン（Ａ）、イソロイシン、（Ｉ）、トリプトファン（Ｗ）もしくはバリン（Ｖ）と置換されている。
【００５６】
本発明の別の態様では、ヒトＩＬ−１３と結合し、配列番号３に説明されるＣＤＲＨ３を含む抗原結合タンパク質（例えば抗体）を提供し、このＣＤＲＨ３は、Ｓ９５Ｗ、Ｉ９６Ｖ、Ｙ９７Ｆ、Ｄ９８Ｅ、Ｈ１００Ａ＿Ａ、Ｈ１００Ａ＿Ｅ、Ｈ１００Ａ＿Ｑ、Ｈ１００Ａ＿Ｒ、Ｈ１００Ａ＿Ｓ、Ｈ１００Ａ＿Ｔ、Ｈ１００Ａ＿Ｖ、Ｙ１００Ｂ＿Ａ、Ｙ１００Ｂ＿Ｉ、Ｙ１００Ｂ＿Ｗ、およびＹ１００Ｂ＿Ｖの置換を１つまたは複数含む。
【００５７】
一態様では、本発明の抗原結合タンパク質（例えば本発明の抗体）は、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８および配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４および配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７および配列番号１８に説明されるものから選択されるＣＤＲＨ３配列を含む。かかる抗原結合タンパク質はさらに以下のＣＤＲ配列
ＣＤＲＨ１：配列番号１、６０および６１から選択される、
ＣＤＲＨ２：配列番号２、
ＣＤＲＬ１：配列番号１９、
ＣＤＲＬ２：配列番号２０、ならびに
ＣＤＲＬ３：配列番号２１
を含み得る。
【００５８】
一実施形態では、抗原結合タンパク質は、以下のＣＤＲ：
ＣＤＲＨ１：配列番号１、
ＣＤＲＨ２：配列番号２、
ＣＤＲＨ３：配列番号１８、
ＣＤＲＬ１：配列番号１９、
ＣＤＲＬ２：配列番号２０、および
ＣＤＲＬ３：配列番号２１
を含む。
【００５９】
別の実施形態では、抗原結合タンパク質は、以下のＣＤＲ：
ＣＤＲＨ１：配列番号１、
ＣＤＲＨ２：配列番号２、
ＣＤＲＨ３：配列番号１７、
ＣＤＲＬ１：配列番号１９、
ＣＤＲＬ２：配列番号２０、および
ＣＤＲＬ３：配列番号２１
を含む。
【００６０】
別の実施形態では、抗原結合タンパク質は、以下のＣＤＲ：
ＣＤＲＨ１：配列番号１、
ＣＤＲＨ２：配列番号２、
ＣＤＲＨ３：配列番号１６、
ＣＤＲＬ１：配列番号１９、
ＣＤＲＬ２：配列番号２０、および
ＣＤＲＬ３：配列番号２１
を含む。
【００６１】
別の実施形態では、抗原結合タンパク質は、以下のＣＤＲ：
ＣＤＲＨ１：配列番号１、
ＣＤＲＨ２：配列番号２、
ＣＤＲＨ３：配列番号１５、
ＣＤＲＬ１：配列番号１９、
ＣＤＲＬ２：配列番号２０、および
ＣＤＲＬ３：配列番号２１
を含む。
【００６２】
本明細書を通して、抗体配列中のアミノ酸残基は、Ｋａｂａｔスキームに従い番号付けされる。同様に、「ＣＤＲ」、「ＣＤＲＬ１」、「ＣＤＲＬ２」、「ＣＤＲＬ３」、「ＣＤＲＨ１」、「ＣＤＲＨ２」、「ＣＤＲＨ３」（例えば配列番号６０および６１に説明されるＣＤＲＨ３）という用語は、別に示されない限り、Ｋａｂａｔ  ｅｔ  ａｌ；  “Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ”  ＮＩＨ，  １９８７に説明されるようにＫａｂａｔ番号付け系に従う。
【００６３】
本発明の別の態様では、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号８８、配列番号８９、配列番号９０および配列番号９１から選択される配列を有する重鎖；ならびに配列番号２４の軽鎖を含む抗原結合タンパク質（ヒト化抗体またはその抗原結合断片など）を提供する。
【００６４】
本発明は、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号８８、配列番号８９、配列番号９０から選択される重鎖を含む抗原結合タンパク質（ヒト化抗体またはその抗原結合断片など）を提供する。
【００６５】
本発明は、配列番号１０８、配列番号１１０、配列番号１１２および配列番号１１４から選択される軽鎖を含む抗原結合タンパク質（ヒト化抗体またはその抗原結合断片など）も提供する。
【００６６】
本発明はさらに、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号８８、配列番号８９、配列番号９０および配列番号９１から選択される配列を有する重鎖；ならびに配列番号１０８、配列番号１１０、配列番号１１２および配列番号１１４の軽鎖を含む抗原結合タンパク質（ヒト化抗体またはその抗原結合断片など）を提供する。
【００６７】
一実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号８８、配列番号８９、配列番号９０および配列番号９１から選択される重鎖、ならびに配列番号２４、配列番号１０８、配列番号１１０、配列番号１１２および配列番号１１４から選択される軽鎖を含む抗体を含む。
【００６８】
一実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２および配列番号５４から選択される重鎖；ならびに配列番号２４、配列番号１０８、配列番号１１０、配列番号１１２および配列番号１１４から選択される軽鎖を含み、例えば抗原結合タンパク質は配列番号４８の重鎖および配列番号２４の軽鎖、または配列番号５０の重鎖および配列番号２４の軽鎖、または配列番号５２の重鎖および配列番号２４の軽鎖、または配列番号５４の重鎖および配列番号２４の軽鎖、または配列番号８８の重鎖および配列番号２４の軽鎖または配列番号８９の重鎖および配列番号２４の軽鎖、または配列番号９０の重鎖および配列番号２４の軽鎖、または配列番号９１の重鎖および配列番号２４の軽鎖、または配列番号４８の重鎖および配列番号１０８の軽鎖、または配列番号５０の重鎖および配列番号１０８の軽鎖、または配列番号５２の重鎖および配列番号１０８の軽鎖、または配列番号５４の重鎖および配列番号１０８の軽鎖、または配列番号８８の重鎖および配列番号１０８の軽鎖または配列番号８９の重鎖および配列番号１０８の軽鎖、または配列番号９０の重鎖および配列番号１０８の軽鎖、または配列番号９１の重鎖および配列番号１０８の軽鎖、または配列番号４８の重鎖および配列番号１１０の軽鎖、または配列番号５０の重鎖および配列番号１１０の軽鎖、または配列番号５２の重鎖および配列番号１１０の軽鎖、または配列番号５４の重鎖および配列番号１１０の軽鎖、または配列番号８８の重鎖および配列番号１１０の軽鎖または配列番号８９の重鎖および配列番号１１０の軽鎖、または配列番号９０の重鎖および配列番号１１０の軽鎖、または配列番号９１の重鎖および配列番号１１０の軽鎖を含む。
【００６９】
１つのかかる実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２および配列番号５４から選択される重鎖；ならびに配列番号１０８および配列番号１１０から選択される軽鎖（例えば配列番号４８の重鎖および配列番号１０８の軽鎖を含む抗原結合タンパク質、または配列番号４８の重鎖および配列番号１１０の軽鎖を含む抗原結合タンパク質、または配列番号５０の重鎖および配列番号１０８の軽鎖を含む抗原結合タンパク質、または配列番号５０の重鎖および配列番号１１０の軽鎖を含む抗原結合タンパク質、または配列番号５２の重鎖および配列番号１０８の軽鎖を含む抗原結合タンパク質、または配列番号５２の重鎖および配列番号１１０の軽鎖を含む抗原結合タンパク質、または配列番号５４の重鎖および配列番号１０８の軽鎖を含む抗原結合タンパク質、または配列番号５４の重鎖および配列番号１１０の軽鎖を含む抗原結合タンパク質）を含む。
【００７０】
本発明のＩＬ−１３抗体はＩＬ−４および／もしくはＩＬ−５アンタゴニスト、例えばＩＬ−４抗体もしくはエピトープ結合ドメイン、ならびに／またはＩＬ−５抗体もしくはエピトープ結合ドメインとの組み合わせであり得る。これらは、同時に投与する、すなわち同時投与するか、または互いに２４時間以内（例えば互いに２０時間以内、または１５時間以内または１２時間以内、または１０時間以内、または８時間以内、または６時間以内、または４時間以内、または２時間以内、または１時間以内、または３０分以内）に投与する分離する分子の混合物として投与し得る。
【００７１】
さらなる実施形態では、アンタゴニストは、２つ以上の抗原と結合できる１分子として存在し、例えば本発明は、ＩＬ−１３と結合でき、ＩＬ−４へも結合できるまたはＩＬ−５へも結合できる、またはＩＬ−４とＩＬ−５へも結合できる本発明のＩＬ−１３抗体を含む抗原結合タンパク質を提供する。
【００７２】
一実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、本発明の少なくともＣＤＲＨ３、ならびに任意選択的に１つもしくは複数のＣＤＲＨ１、ＣＤＲＨ２、ＣＤＲＬ１、ＣＤＲＬ２、およびＣＤＲＬ３を含み、ＩＬ−１３と結合でき、１つもしくは複数のＩＬ−４もしくはＩＬ−５へも結合できる多特異的な抗体であり得る。１つのかかる実施形態では、ＣＤＲＨ３、すなわち本明細書において定義される抗原結合タンパク質を含み、ＩＬ−４、またはＩＬ−５と結合できる抗原結合部位をさらに含む多特異的な抗体を提供する。
【００７３】
本発明の抗原結合タンパク質の１例は、ＩＬ−４もしくはＩＬ−５に特異性の１つもしくは複数のエピトープ結合ドメインと結合している、本明細書において定義されるＣＤＲＨ１、ＣＤＲＨ２、ＣＤＲＨ３、ＣＤＲＬ１、ＣＤＲＬ２、およびＣＤＲＬ３を含むＩＬ−１３に特異的な抗体、例えばＩＬ−１３とＩＬ−４もしくはＩＬ−１３とＩＬ−５と結合できる二重特異性抗原結合タンパク質、またはＩＬ−１３、ＩＬ−４およびＩＬ−５と結合できる三重特異性抗原結合タンパク質である。
【００７４】
本明細書に記載の任意の抗原結合タンパク質は、例えば、実施例８に記載したものなどの適切なアッセイを用いて化学量論分析により決定されるように２つ以上の抗原に同時と結合可能であり得ることが理解されるであろう。
【００７５】
本発明は、１つまたは複数のエピトープ結合ドメインと結合している本発明のＩＬ−１３抗体を含む抗原結合タンパク質、例えばＩＬ−４と結合できるエピトープ結合ドメインと結合している本発明のＩＬ−１３抗体を含む抗原結合タンパク質、またはＩＬ−５と結合できるエピトープ結合ドメインと結合している本発明のＩＬ−１３抗体を含む抗原結合タンパク質、またはＩＬ−４と結合できる第１のエピトープ結合ドメインおよびＩＬ−５と結合できる第２のエピトープ結合ドメインと結合している本発明のＩＬ−１３抗体を含む抗原結合タンパク質も提供する。
【００７６】
エピトープ結合ドメインは、ＩＬ−１３抗体重鎖のＣ末端もしくはＮ末端またはＩＬ−１３抗体軽鎖のＣ末端もしくはＮ末端と結合し得る。
【００７７】
本発明の抗体はリンカーを用いることによりエピトープ結合ドメインと結合し得る。適切なリンカーの例としては、１個のアミノ酸〜１５０個のアミノ酸の長さ、または１個のアミノ酸〜１４０個のアミノ酸、例えば、１個のアミノ酸〜１３０個のアミノ酸、または１〜１２０個のアミノ酸、または１〜８０個のアミノ酸、または１〜５０個のアミノ酸、または１〜２０個のアミノ酸、または１〜１０個のアミノ酸、または５〜１８個のアミノ酸であり得るアミノ酸配列が挙げられる。かかる配列はそれら自体の三次構造を有し得る、例えば、本発明のリンカーは単一可変ドメインを含み得る。リンカーのサイズは一実施形態では、単一可変ドメインと等価物である。適切なリンカーのサイズは、１〜２０オングストローム、例えば１５オングストローム未満、または１０オングストローム未満、または５オングストローム未満であり得る。
【００７８】
本発明の一実施形態では、少なくとも１つのエピトープ結合ドメインは、１〜１５０個のアミノ酸、例えば１〜２０個のアミノ酸、例えば１〜１０個のアミノ酸を含むリンカーでＩＬ−１３抗体と直接結合している。
【００７９】
かかるリンカーは、配列番号８２〜８７、９２〜９３に説明されるものの任意の１つまたはかかるリンカーの複数から選択され得る。
【００８０】
本発明の抗原結合タンパク質において使用するリンカーは、単独または他のリンカーに加えて、１つまたは複数のＧＳ残基セット、例えば「ＧＳＴＶＡＡＰＳ」（配列番号９２）または「ＴＶＡＡＰＳＧＳ」（配列番号８７）または「ＧＳＴＶＡＡＰＳＧＳ」（配列番号９３）を含み得る。一実施形態では、リンカーは、配列番号８３を含む。
【００８１】
一実施形態では、エピトープ結合ドメインはリンカー「（ＰＡＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ」によりＩＬ−１３抗体と結合している。別の実施形態では、エピトープ結合ドメインはリンカー「（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ」によりＩＬ−１３抗体と結合している。別の実施形態では、エピトープ結合ドメインはリンカー「（ＴＶＡＡＰＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ」によりＩＬ−１３抗体と結合している。別の実施形態では、エピトープ結合ドメインはリンカー「（ＧＳ）ｍ（ＴＶＡＡＰＳＧＳ）ｎ」によりＩＬ−１３抗体と結合している。別の実施形態では、エピトープ結合ドメインはリンカー「（ＰＡＶＰＰＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ」によりＩＬ−１３抗体と結合している。別の実施形態では、エピトープ結合ドメインはリンカー「（ＴＶＳＤＶＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ」によりＩＬ−１３抗体と結合している。別の実施形態では、エピトープ結合ドメインはリンカー「（ＴＧＬＤＳＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ」によりＩＬ−１３抗体と結合している。かかる実施形態のすべてにおいて、ｎ＝１〜１０、およびｍ＝０〜４である。
【００８２】
かかるリンカーの例としては、（ＰＡＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝１およびｍ＝１）、（ＰＡＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝２およびｍ＝１）、（ＰＡＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝３およびｍ＝１）、（ＰＡＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝４およびｍ＝１）、（ＰＡＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝２およびｍ＝０）、（ＰＡＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝３およびｍ＝０）、（ＰＡＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ式中ｎ＝４およびｍ＝０が挙げられる。
【００８３】
かかるリンカーの例としては、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝１およびｍ＝１）、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝２およびｍ＝１）、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝３およびｍ＝１）、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝４およびｍ＝１）、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝２およびｍ＝０）、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝３およびｍ＝０）、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ式中ｎ＝４およびｍ＝０が挙げられる。
【００８４】
かかるリンカーの例としては、（ＴＶＡＡＰＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ式中ｎ＝１およびｍ＝１（配列番号８７）、（ＴＶＡＡＰＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ式中ｎ＝２およびｍ＝１（配列番号１４５）、（ＴＶＡＡＰＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ式中ｎ＝３およびｍ＝１（配列番号１４６）、（ＴＶＡＡＰＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝４およびｍ＝１）、（ＴＶＡＡＰＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝２およびｍ＝０）、（ＴＶＡＡＰＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝３およびｍ＝０）、（ＴＶＡＡＰＳ）ｎ（ＧＳ）ｍ式中ｎ＝４およびｍ＝０が挙げられる。
【００８５】
かかるリンカーの例としては、（ＧＳ）ｍ（ＴＶＡＡＰＳＧＳ）ｎ式中ｎ＝１およびｍ＝１（配列番号１３９）、（ＧＳ）ｍ（ＴＶＡＡＰＳＧＳ）ｎ式中ｎ＝２およびｍ＝１（配列番号１４０）、（ＧＳ）ｍ（ＴＶＡＡＰＳＧＳ）ｎ式中ｎ＝３およびｍ＝１（配列番号１４１）、または（ＧＳ）ｍ（ＴＶＡＡＰＳＧＳ）ｎ式中ｎ＝４およびｍ＝１（配列番号１４２）、（ＧＳ）ｍ（ＴＶＡＡＰＳＧＳ）ｎ式中ｎ＝５およびｍ＝１（配列番号１４３）、（ＧＳ）ｍ（ＴＶＡＡＰＳＧＳ）ｎ式中ｎ＝６およびｍ＝１（配列番号１４４）、（ＧＳ）ｍ（ＴＶＡＡＰＳＧＳ）ｎ式中ｎ＝１およびｍ＝０（配列番号８７）、（ＧＳ）ｍ（ＴＶＡＡＰＳＧＳ）ｎ（式中ｎ＝２およびｍ＝１０）、（ＧＳ）ｍ（ＴＶＡＡＰＳＧＳ）ｎ（式中ｎ＝３およびｍ＝０）、または（ＧＳ）ｍ（ＴＶＡＡＰＳＧＳ）ｎ式中ｎ＝０が挙げられる。
【００８６】
かかるリンカーの例としては、（ＰＡＶＰＰＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝１およびｍ＝１）、（ＰＡＶＰＰＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ式中ｎ＝２およびｍ＝１（配列番号６５）、（ＰＡＶＰＰＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝３およびｍ＝１）、（ＰＡＶＰＰＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝４およびｍ＝１）、（ＰＡＶＰＰＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝２およびｍ＝０）、（ＰＡＶＰＰＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝３およびｍ＝０）、（ＰＡＶＰＰＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ式中ｎ＝４およびｍ＝０が挙げられる。
【００８７】
かかるリンカーの例としては、（ＴＶＳＤＶＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ式中ｎ＝１およびｍ＝１（配列番号６７）、（ＴＶＳＤＶＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝２およびｍ＝１）、（ＴＶＳＤＶＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝３およびｍ＝１）、（ＴＶＳＤＶＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝４およびｍ＝１）、（ＴＶＳＤＶＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝２およびｍ＝０）、（ＴＶＳＤＶＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝３およびｍ＝０）、（ＴＶＳＤＶＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ式中ｎ＝４およびｍ＝０が挙げられる。
【００８８】
かかるリンカーの例としては、（ＴＧＬＤＳＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝１およびｍ＝１）、（ＴＧＬＤＳＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝２およびｍ＝１）、（ＴＧＬＤＳＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝３およびｍ＝１）、（ＴＧＬＤＳＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝４およびｍ＝１）、（ＴＧＬＤＳＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝２およびｍ＝０）、（ＴＧＬＤＳＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ（式中ｎ＝３およびｍ＝０）、（ＴＧＬＤＳＰ）ｎ（ＧＳ）ｍ式中ｎ＝４およびｍ＝０が挙げられる。
【００８９】
別の実施形態では、エピトープ結合ドメインとＩＬ−１３抗体の間にリンカーはない。別の実施形態では、エピトープ結合ドメインはリンカー「ＴＶＡＡＰＳ」（配列番号８３）によりＩＬ−１３抗体と結合している。別の実施形態では、エピトープ結合ドメインはリンカー「ＴＶＡＡＰＳＧＳ」（配列番号８７）によりＩＬ−１３抗体と結合している。別の実施形態では、エピトープ結合ドメインはリンカー「ＧＳ」によりＩＬ−１３抗体と結合している。別の実施形態では、エピトープ結合ドメインはリンカー「ＡＳＴＫＧＰＴ」（配列番号８４）によりＩＬ−１３抗体と結合している。
【００９０】
本発明において使用するエピトープ結合ドメインは、異なるＶ領域またはＶドメインとは独立して抗原またはエピトープと特異的結合するドメインであり、これはドメイン抗体であってもよいし、天然リガンド以外のリガンドへの結合を達成するためにタンパク質工学にかけられた非免疫グロブリンドメイン、例えばＣＴＬＡ−４（Ｅｖｉｂｏｄｙ）；リポカリン；プロテインＡ派生分子（プロテインＡのＺドメイン（Ａｆｆｉｂｏｄｙ、ＳｐＡ）、Ａドメイン（Ａｖｉｍｅｒ／Ｍａｘｉｂｏｄｙ）など）；熱ショックタンパク質（ＧｒｏＥｌおよびＧｒｏＥＳなど）；トランスフェリン（ｔｒａｎｓ−ｂｏｄｙ）；アンキリン反復タンパク質（ＤＡＲＰｉｎ）；ペプチドアプタマー；Ｃ型レクチンドメイン（Ｔｅｔｒａｎｅｃｔｉｎ）；ヒトγクリスタリンおよびヒトユビキチン（ａｆｆｉｌｉｎ）；ＰＤＺドメイン；ヒトプロテアーゼ阻害剤のサソリ毒クニッツ型ドメイン；ならびにフィブロネクチン（ａｄｎｅｃｔｉｎ）からなる群から選択される非免疫グロブリン足場の誘導体であるドメインであってもよい。一実施形態では、これはドメイン抗体または他の適切なドメイン（ＣＴＬＡ−４、リポカリン、ＳｐＡ、Ａｆｆｉｂｏｄｙ、ａｖｉｍｅｒ、ＧｒｏＥｌ、トランスフェリン、ＧｒｏＥＳおよびフィブロネクチンからなる群から選択されるドメインなど）であり得る。一実施形態では、これは免疫グロブリン単一可変ドメイン、Ａｆｆｉｂｏｄｙ、アンキリン反復タンパク質（ＤＡＲＰｉｎ）およびａｄｎｅｃｔｉｎから選択し得る。別の実施形態では、これはＡｆｆｉｂｏｄｙ、アンキリン反復タンパク質（ＤＡＲＰｉｎ）およびａｄｎｅｃｔｉｎから選択し得る。別の実施形態では、これはドメイン抗体、例えばヒト、ラクダ（ナノボディ）、またはサメ（ＮＡＲＶ）ドメイン抗体から選択されるドメイン抗体であり得る。
【００９１】
かかる抗原結合タンパク質の例としては、重鎖のＣ末端もしくはＮ末端またはＣ末端と結合するＩＬ−４アンタゴニストであるエピトープ結合ドメインを有する本発明のＩＬ−１３抗体が挙げられる。例としては、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号９８、配列番号１００、配列番号１０２、配列番号１０４、配列番号１０６または配列番号１１７〜１３８に説明される重鎖配列、ならびに配列番号２４、配列番号１０８、配列番号１１０、配列番号１１２もしくは配列番号１１４に説明される軽鎖配列を含む抗原結合タンパク質が挙げられ、重鎖および軽鎖の片方または両方はさらにＩＬ−４と拮抗できる１つまたは複数のエピトープ結合ドメイン、例えばＩＬ−４と結合できる単一可変ドメインを含む。かかるエピトープ結合ドメインは、配列番号７８〜８１および９４に説明されるものから選択できる。
【００９２】
一実施形態では、本発明の抗原結合構築物は、配列番号６２の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列、または配列番号６４の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列、または配列番号６６の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列、または配列番号６８の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列、または配列番号７０の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列、または配列番号７２の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列、または配列番号７４の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列、または配列番号７６の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列を含む。
【００９３】
一実施形態では、本発明の抗原結合構築物は、配列番号９４の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列、または配列番号９６の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列、または配列番号９８の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列、または配列番号１００の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列、または配列番号１０２の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列、または配列番号１０４の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列、または配列番号１０６の重鎖配列および配列番号２４の軽鎖配列を含む。
【００９４】
一実施形態では、本発明の抗原結合構築物は、配列番号６２の重鎖配列および配列番号１０８の軽鎖配列、または配列番号６４の重鎖配列および配列番号１０８の軽鎖配列、または配列番号６６の重鎖配列および配列番号１０８の軽鎖配列、または配列番号６８の重鎖配列および配列番号１０８の軽鎖配列、または配列番号７０の重鎖配列および配列番号１０８の軽鎖配列、または配列番号７２の重鎖配列および配列番号１０８の軽鎖配列、または配列番号７４の重鎖配列および配列番号１０８の軽鎖配列、または配列番号７６の重鎖配列および配列番号１０８の軽鎖配列、または配列番号６２の重鎖配列および配列番号１１０の軽鎖配列、または配列番号６４の重鎖配列および配列番号１１０の軽鎖配列、または配列番号６６の重鎖配列および配列番号１１０の軽鎖配列、または配列番号６８の重鎖配列および配列番号１１０の軽鎖配列、または配列番号７０の重鎖配列および配列番号１１０の軽鎖配列、または配列番号７２の重鎖配列および配列番号１１０の軽鎖配列、または配列番号７４の重鎖配列および配列番号１１０の軽鎖配列、または配列番号７６の重鎖配列および配列番号１１０の軽鎖配列を含む。
【００９５】
一実施形態では、本発明の抗原結合構築物は、配列番号９６の重鎖配列および配列番号１０８の軽鎖配列、または配列番号９８の重鎖配列および配列番号１０８の軽鎖配列、または配列番号１００の重鎖配列および配列番号１０８の軽鎖配列、または配列番号１０２の重鎖配列および配列番号１０８の軽鎖配列、または配列番号１０４の重鎖配列および配列番号１０８の軽鎖配列、または配列番号１０６の重鎖配列および配列番号１０８の軽鎖配列、または配列番号９６の重鎖配列および配列番号１１０の軽鎖配列、または配列番号９８の重鎖配列および配列番号１１０の軽鎖配列、または配列番号１００の重鎖配列および配列番号１１０の軽鎖配列、または配列番号１０２の重鎖配列および配列番号１１０の軽鎖配列、または配列番号１０４の重鎖配列および配列番号１１０の軽鎖配列、または配列番号１０６の重鎖配列および配列番号１１０の軽鎖配列を含む。
【００９６】
一実施形態では、ＩＬ−１３抗体の重鎖は、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２および配列番号５４に説明されるものから選択される。別の実施形態では、重鎖は配列番号８８〜９１、配列番号９６〜１０６、および配列番号１１７〜１３８に説明されるものから選択される。１つのかかる実施形態では、重鎖は配列番号９６、配列番号９８、配列番号１００、配列番号１０２、配列番号１０４および配列番号１０６から選択される。
【００９７】
一実施形態では、抗原結合タンパク質は、ＩＬ−５アンタゴニストであるエピトープ結合ドメインと結合した抗ＩＬ−１３抗体を含み、この抗ＩＬ−１３抗体は配列番号３〜１８、例えば配列番号１５〜１８に説明されるものおよび配列番号２４の軽鎖配列から選択されるＣＤＲＨ３を含む。
【００９８】
例としては、配列番号２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２もしくは５４に説明される重鎖配列ならびに配列番号２４に説明される軽鎖配列を含み、重鎖および軽鎖の片方または両方がさらにＩＬ−５と拮抗できる１つまたは複数のエピトープ結合ドメイン、例えばＩＬ−５と結合できる免疫グロブリン単一可変ドメインを含む抗原結合タンパク質が挙げられる。
【００９９】
さらなる実施形態では、抗原結合タンパク質は、配列番号２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２もしくは５４に説明される重鎖配列ならびに配列番号２４に説明される軽鎖配列を含み、この重鎖および軽鎖の片方または両方はさらにＩＬ−４と拮抗できる１つまたは複数のエピトープ結合ドメイン（例えばＩＬ−４と結合できる免疫グロブリン単一可変ドメイン）、およびＩＬ−５と拮抗できる１つまたは複数のエピトープ結合ドメイン（例えばＩＬ−５と結合できる免疫グロブリン単一可変ドメイン）を含む。
【０１００】
一実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、ヒト血清アルブミンと結合できるエピトープ結合ドメインを少なくとも１つ含む。
【０１０１】
一実施形態では、少なくとも３つの抗原結合部位がある、例えば４、または５または６または８または１０個の抗原結合部位があり、抗原結合タンパク質は少なくとも３または４または５または６または８または１０個の抗原と結合できる、例えば抗原結合タンパク質は、３または４または５または６または８または１０個の抗原と同時に結合できる。
【０１０２】
一実施形態では、第１のエピトープ結合ドメインはタンパク質足場と結合しており、第２のエピトープ結合ドメインは第１のエピトープ結合ドメインと結合している。例えばタンパク質足場がＩｇＧ足場である場合、第１のエピトープ結合ドメインはＩｇＧ足場の重鎖のＣ末端と結合していてもよく、そのエピトープ結合ドメインはそのＣ末端で第２のエピトープ結合ドメインと結合でき、または例えば第１のエピトープ結合ドメインはＩｇＧ足場の軽鎖のＣ末端と結合していてもよく、第１のエピトープ結合ドメインはさらにそのＣ末端で第２のエピトープ結合ドメインと結合していてもよいし、または例えば第１のエピトープ結合ドメインはＩｇＧ足場の軽鎖のＮ末端と結合していてもよく、第１のエピトープ結合ドメインはさらにそのＮ末端で第２のエピトープ結合ドメインと結合していてもよいし、または例えば第１のエピトープ結合ドメインは、ＩｇＧ足場の重鎖のＮ末端と結合していてもよく、第１のエピトープ結合ドメインはさらにそのＮ末端で第２のエピトープ結合ドメインと結合していてもよい。
【０１０３】
エピトープ結合ドメインがドメイン抗体である場合、一部のドメイン抗体は足場内の特定の位置に適合し得る。
【０１０４】
本発明において使用する免疫グロブリン単一可変ドメインは、ＩＬ−１３  ｍＡｂの重鎖および／または軽鎖のＣ末端と結合できる。加えて一部の免疫グロブリン単一可変ドメインは、従来の抗体の重鎖および軽鎖の両Ｃ末端と結合できる。
【０１０５】
免疫グロブリン単一可変ドメインのＮ末端が抗体定常ドメイン（ＣＨ３またはＣＬのいずれか）に融合している構築物において、ペプチドリンカーは免疫グロブリン単一可変ドメインが抗原と結合するのを補助し得る。実際、ｄＡｂのＮ末端は、抗原結合活性に関与するＣＤＲに近接して位置する。したがって短いペプチドリンカーは、エピトープ結合ドメインと抗体の定常ドメイン間のスペーサーとして働き、これはｄＡｂ  ＣＤＲがより容易に抗原に達することを可能にし得るため、高親和性で結合し得る。
【０１０６】
免疫グロブリン単一可変ドメインがＩｇＧと結合する環境は、それらがどの抗体鎖へ融合しているかによって異なる：
抗体軽鎖のＣ末端で融合している場合、各免疫グロブリン単一可変ドメインは、抗体ヒンジおよびＦｃ部分に近接して位置することが予期される。かかる免疫グロブリン単一可変ドメインは互いに遠く離れて位置している可能性が高い。従来の抗体では、Ｆａｂ断片間の角度および各Ｆａｂ断片とＦｃ部分間の角度は非常に著しく変わり得る。ｍＡｂｄＡｂと、Ｆａｂ断片間の角度は著しく異なることはないであろうが、各Ｆａｂ断片とＦｃ部分間の角度にはいくらか制限が観察され得る。
【０１０７】
抗体重鎖のＣ末端で融合している場合、各免疫グロブリン単一可変ドメインは、Ｆｃ部分のＣＨ３ドメインに近接して位置することが予期される。これはＦｃ受容体（例えばＦｃγＲＩ、ＩＩ、ＩＩＩ、ＦｃＲｎ）に対するＦｃ結合特性に影響を与えることは予期されない。なぜなら、これらの受容体はＣＨ２ドメイン（ＦｃγＲＩ、ＩＩおよびＩＩＩクラスの受容体について）またはＣＨ２ドメインとＣＨ３ドメイン間のヒンジ（例えばＦｃＲｎ受容体）と結合するためである。かかる抗原結合タンパク質はさらに、両免疫グロブリン単一可変ドメインが空間的に互いに近いことを特徴とし、適切なリンカーの供給によって柔軟性が得られる場合、これらの免疫グロブリン単一可変ドメインはホモ二量体種さえも形成し得るため、Ｆｃ部分の「ジッパー型」四次構造を増やして構築物の安定性を高め得ることが予期される。
【０１０８】
かかる構造に関する考察は、抗体にエピトープ結合ドメイン、例えば免疫グロブリン単一可変ドメインを結合させるために最も適した位置の選択に役立つことができる。
【０１０９】
抗原のサイズ、その局在性（血中または細胞表面上）、その四次構造（単量体または多量体）は変わり得る。従来の抗体は、ヒンジ領域の存在のためにアダプター構築物として機能するように当然設計され、Ｆａｂ断片の先端の２つの抗原結合部位の配向は広範囲に変わり得るため、抗原の分子特性およびその環境に適応し得る。一方、ヒンジ領域のない抗体と結合した免疫グロブリン単一可変ドメインは、直接的にも間接的にも構造的な柔軟性に欠け得る。
【０１１０】
溶液状態および免疫グロブリン単一可変ドメインへの結合形態の理解も役立つ。インビトロのヒトｄＡｂは大部分が溶液中に単量体、ホモ二量体または多量体形態で存在し得るという証拠が増えている（Ｒｅｉｔｅｒ  ｅｔ  ａｌ．  （１９９９）  Ｊ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ  ２９０  ｐ６８５−６９８；  Ｅｗｅｒｔ  ｅｔ  ａｌ  （２００３）  Ｊ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ  ３２５，  ｐ５３１−５５３，  Ｊｅｓｐｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ  （２００４）  Ｊ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ    ３３７  ｐ８９３−９０３；  Ｊｅｓｐｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ  （２００４）  Ｎａｔ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ  ２２  ｐ１１６１−１１６５；  Ｍａｒｔｉｎ  ｅｔ  ａｌ  （１９９７）  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｎｇ．  １０  ｐ６０７−６１４；  Ｓｅｐｕｌｖａｄａ  ｅｔ  ａｌ  （２００３）  Ｊ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ  ３３３  ｐ３５５−３６５）。これは、免疫グロブリン軽鎖の二量体であるベンス−ジョーンズタンパク質（Ｅｐｐ  ｅｔ  ａｌ  （１９７５）  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  １４  ｐ４９４３−４９５２；  Ｈｕａｎ  ｅｔ  ａｌ  （１９９４）  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ３３  ｐ１４８４８−１４８５７；  Ｈｕａｎｇ  ｅｔ  ａｌ  （１９９７）  Ｍｏｌ  ｉｍｍｕｎｏｌ  ３４  ｐ１２９１−１３０１）およびアミロイド線維（Ｊａｍｅｓ  ｅｔ  ａｌ．  （２００７）  Ｊ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ．  ３６７：６０３−８）などのＩｇドメインでインビボにおいて観察される多量体化事象を十分に暗示する。
【０１１１】
例えば、溶液中で二量体化する傾向があるｄＡｂは、軽鎖Ｃ末端よりもＦｃ部分のＣ末端と結合させることが本発明の抗原結合タンパク質との関連で所望され得る。なぜなら、ＦｃのＣ末端への結合はそれらのｄＡｂの二量体化を可能にさせるためである。
【０１１２】
本発明の抗原結合タンパク質は、単一抗原に特異的な抗原結合部位を含んでいてもよいし、２つ以上の抗原もしくは単一抗原上の２つ以上のエピトープに特異的な抗原結合部位を有してもよく、またはそれぞれの抗原結合部位が同じもしくは異なる抗原上の異なるエピトープに特異的である抗原結合部位があってもよい。
【０１１３】
本発明の抗原結合タンパク質は、天然抗体または機能的断片またはその等価物の構造内に構成し得る本発明の重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み得る。したがって本発明の抗原結合タンパク質は、適切な軽鎖と対をなす場合、完全長抗体、（Ｆａｂ」）２断片、Ｆａｂ断片、またはその等価物（ｓｃＦＶ、二量体、三量体、または四量体、Ｔａｎｄａｂなど）内に形成された本発明のＶＨ領域を含み得る。抗体は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、もしくはＩｇＧ４；またはＩｇＭ；ＩｇＡ、ＩｇＥもしくはＩｇＤまたはその修飾変異型であり得る。それに応じて抗体重鎖の定常ドメインを選択し得る。軽鎖定常ドメインは、κ定常ドメインであってもλ定常ドメインであってもよい。さらに、抗原結合タンパク質は、すべてのクラスの修飾、例えばＩｇＧ二量体、Ｆｃ受容体と結合しなくなったまたはＣ１ｑ結合を媒介しなくなったＦｃ変異体を含み得る。抗原結合タンパク質は、抗原結合領域および非免疫グロブリン領域を含むＷＯ８６／０１５３３号に記載されている種類のキメラ抗体でもあり得る。
【０１１４】
定常領域は、必要な任意の機能性に応じて選択される。ＩｇＧ１は、補体結合を介して溶解能を示し得るおよび／またはＡＤＣＣ（抗体依存性細胞傷害）を媒介し得る。非細胞傷害性ブロック抗体が必要である場合、ＩｇＧ４を使用できる。しかしながら、ＩｇＧ４抗体は産生において不安定性を示し得るため、代替的に、一般にさらに安定したＩｇＧ１に修飾する。推奨される修飾は、欧州特許第０３０７４３４号に記載されている（例えば２３５位および２３７位の変異）。したがって本発明は、本発明による抗原結合タンパク質（例えば抗体）の溶解または非溶解形態を提供する。
【０１１５】
ある形態では、本発明の抗体は本明細書に記載の任意の重鎖可変領域を有する完全長（例えばＨ２Ｌ２四量体）溶解または非溶解ＩｇＧ１抗体である。さらなる態様では、本発明は、本明細書に記載の軽鎖および重鎖可変領域をコードするポリヌクレオチドを提供する。
【０１１６】
本発明の一実施形態では、抗原結合部位はＢｉａｃｏｒｅ（商標）の測定に基づき少なくとも約１ｍＭのＫｄで抗原と結合する、例えば少なくとも約１０ｎＭ、少なくとも約１ｎＭ、少なくとも約５００ｐＭ、少なくとも約２００ｐＭ、少なくとも約１００ｐＭ、または少なくとも約５０ｐＭのＫｄで各抗原と結合する。
【０１１７】
本発明の一実施形態では、抗原結合部位はＢｉａｃｏｒｅ（商標）の測定に基づき少なくとも約１ｍＭのＫｄで抗原と結合する、例えば少なくとも約１０ｎＭ、少なくとも約１ｎＭ、少なくとも約５００ｐＭ、少なくとも約２００ｐＭ、少なくとも約１００ｐＭ、または少なくとも約５０ｐＭのＫｄで各抗原と結合する。
【０１１８】
一実施形態では、本発明は、Ｂｉａｃｏｒｅの測定に基づき、ヒトＩＬ−１３に対して抗ＩＬ＝１３抗体よりも少なくとも２倍高い親和性、または少なくとも４倍高い親和性、または少なくとも６倍高い親和性、または少なくとも８倍高い親和性、または少なくとも１０倍高い親和性を有する、配列番号２２に説明される重鎖配列および配列番号２４に説明される軽鎖配列を含む抗原結合タンパク質を提供する。
【０１１９】
本明細書を通して使用される、本発明の抗原結合タンパク質に関する「中和」という用語およびその文法的変形は、本発明の抗原結合タンパク質の存在下においてＩＬ−１３の生体活性が、かかる抗原結合タンパク質の不在下のＩＬ−１３の活性よりも完全にまたは部分的に低下することを意味する。中和は、これらに限定されないが、１つまたは複数のリガンド結合をブロックし、リガンドによる受容体活性化を防止し、ＩＬ−１３受容体をダウンレギュレートし、またはエフェクター機能に影響を与えたために起こり得る。中和レベルはいくつかの方法において、例えば以下の実施例に説明されるアッセイ、例えばＴＦ１アッセイ（例えば実施例４に記載のように実行し得る）を用いて測定できる。このアッセイにおけるＩＬ−１３、ＩＬ−４またはこれら両サイトカインの中和は、中和する抗原結合タンパク質の存在下、ＴＦ１細胞増殖の阻害を評価することによって測定する。
【０１２０】
例えば、中和する抗原結合タンパク質の存在下でＩＬ−１３とその受容体間の低減した結合を評価することによる他の中和の評価方法は当該分野において知られており、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅアッセイなどが挙げられる。
【０１２１】
本発明の代替態様では、本明細書において例示した抗体、例えば実施例４に説明するように実行できるＴＦ１細胞増殖アッセイにおけるＡ１Ｙ１００ＢＡｌａＬ１、Ａ１Ｙ１００ＢＩｌｅＬ１、Ａ１  Ｙ１００ＢＴｒｐＬ１またはＡ１Ｙ１００ＢＶａｌＬ１の中性活性を保持する抗原結合タンパク質と少なくとも実質的に等しい中性活性を有する抗原結合タンパク質を提供する。
【０１２２】
抗原結合タンパク質（例えば本発明の抗体）は、本発明の抗原結合タンパク質コード配列を含む発現ベクターを用いた宿主細胞のトランスフェクションにより産生し得る。発現ベクターまたは組換えプラスミドは、宿主細胞における複製および発現ならびに／または宿主細胞からの分泌を制御できる従来の調節制御配列との操作可能に結合して抗原結合タンパク質に対するこれらのコード配列を配置することにより産生される。調節配列としては、プロモーター配列、例えば、ＣＭＶプロモーター、および他の既知の抗体に由来し得るシグナル配列が挙げられる。同様に、相補的な抗原結合タンパク質軽鎖または重鎖をコードするＤＮＡ配列を有する第２の発現ベクターを産生できる。ある実施形態では、この第２の発現ベクターは、各ポリペプチド鎖が機能的に発現することを可能な限り確実にするためにコード配列および選択マーカーが考慮される点を除き第１の発現ベクターと同一である。あるいは、抗原結合タンパク質の重鎖および軽鎖コード配列は単一ベクター上に存在し得る。選択された宿主細胞を第１ベクターと第２ベクターの両方を従来技術により共トランスフェクトして（または単一ベクターにより単にトランスフェクトして）、組換えまたは合成の軽鎖および重鎖の両方を含むトランスフェクトされた本発明の宿主細胞を作製する。次いでトランスフェクトされた細胞を従来技術により培養し、本発明の加工された抗原結合タンパク質を産生する。組換え重鎖および／または軽鎖の両結合を含む抗原結合タンパク質は、適切なアッセイ（ＥＬＩＳＡまたはＲＩＡなど）により培養からスクリーニングされる。他の抗原結合タンパク質を構築するために類似の従来技術を適用し得る。
【０１２３】
本発明の組成物の方法および構築において使用されるクローニング工程およびサブクローニング工程に適したベクターは、当業者によって選択され得る。例えば、クローニングベクターの従来のｐＵＣシリーズを使用してよい。１つのベクターであるｐＵＣ１９は、Ａｍｅｒｓｈａｍ（Ｂｕｃｋｉｎｇｈａｍｓｈｉｒｅ，  Ｕｎｉｔｅｄ  Ｋｉｎｇｄｏｍ）またはＰｈａｒｍａｃｉａ  （Ｕｐｐｓａｌａ，  Ｓｗｅｄｅｎ）などの供給源から市販されている。さらに、容易に複製でき、豊富なクローニング部位および選択可能な遺伝子（例えば、抗生剤耐性）を有し、容易に操作される任意のベクターをクローニングに使用してよい。したがって、クローニングベクターの選択は、本発明における限定要素ではない。
【０１２４】
発現ベクターは、異種ＤＮＡ配列の発現を増幅するのに適した遺伝子、例えば、哺乳動物ジヒドロ葉酸還元酵素遺伝子（ＤＨＦＲ）も特徴とし得る。他のベクター配列としては、ウシ成長ホルモン（ＢＧＨ）由来などのポリＡシグナル配列およびベータグロビンプロモーター配列（ｂｅｔａｇｌｏｐｒｏ）が挙げられる。本明細書において有用な発現ベクターは、当業者にとって周知の技術により合成され得る。
【０１２５】
かかるベクターの成分、例えばレプリコン、選択遺伝子、エンハンサー、プロモーター、シグナル配列などは、市販または天然の供給源から得てもよいし、選択された宿主において組換えＤＮＡ生成物の発現および／または分泌の対象における使用のための既知の手段によって合成してもよい。当該分野において知られている、哺乳動物、細菌、昆虫、酵母、および真菌の発現に適した他の多くの種類の発現ベクターもこの目的のために選択してよい。
【０１２６】
本発明は、本発明の抗原結合タンパク質のコード配列を含む組換えプラスミドを用いてトランスフェクトされた細胞系も包含する。これらのクローニングベクターのクローニングおよび他の操作に有用な宿主細胞も従来のものである。しかしながら、様々な大腸菌株由来の細胞を、クローニングベクターの複製および本発明の抗原結合タンパク質の構築における他の工程に使用してよい。
【０１２７】
本発明の抗原結合タンパク質の発現に適した宿主細胞または細胞系としては、ＮＳ０、Ｓｐ２／０、ＣＨＯ（例えばＤＧ４４）、ＣＯＳ、ＨＥＫ、線維芽細胞（例えば、３Ｔ３）、および骨髄腫細胞などの哺乳動物細胞が挙げられ、例えばＣＨＯまたは骨髄腫細胞において発現し得る。分子がヒトグリコシル化パターンで修飾されることを可能にするようにヒト細胞を使用してよい。あるいは、他の真核細胞系を適用し得る。形質転換、培養、増幅、スクリーニングならびに生成物の産生および精製に適した哺乳動物宿主細胞の選択および方法は当該分野において知られている。例えば、上に引用したＳａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．を参照されたい。
【０１２８】
細菌細胞は、本発明の組換えＦａｂ、または他の実施形態の発現に適した宿主細胞として有用であることが分かるかもしれない（例えば、Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ，  Ａ．，  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  Ｒｅｖ．，  １３０：１５１−１８８  （１９９２）を参照されたい）。しかしながら、細菌細胞内で発現するタンパク質は折り畳まれていないか不適切に折り畳まれた形態または非グリコシル化形態となる傾向があるために、細菌細胞内で産生した組換えＦａｂはいずれも抗原結合能力の保持についてスクリーニングする必要があるであろう。細菌細胞によって発現している分子が適切に折り畳まれた形態で産生した場合、その細菌細胞は所望される宿主であり得、または代替的な実施形態では、分子は細菌宿主内で発現し、続いて再び折り畳まれ得る。例えば、発現のために使用される様々な大腸菌株が生物工学分野において宿主細胞として周知である。様々な枯草菌、ストレプトミセス属、他の桿菌株などもこの方法に使用してよい。
【０１２９】
所望の場合、当業者に知られている酵母細胞の株、ならびに昆虫細胞（例えばショウジョウバエおよび鱗翅類）およびウイルス発現系も宿主細胞として利用可能である。例えばＭｉｌｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，  ８：２７７−２９８，  Ｐｌｅｎｕｍ  Ｐｒｅｓｓ  （１９８６）およびそこで引用されている参考文献を参照されたい。
【０１３０】
ベクターを構築し得る一般的な方法、本発明の宿主細胞を産生するために必要とされるトランスフェクション方法、およびかかる宿主細胞から本発明の抗原結合タンパク質を産生するために必要な培養方法はすべて従来技術であってよい。典型的には、本発明の培養方法は、無血清培養方法、通常、懸濁液中での無血清細胞培養である。同様に、産生後は、本発明の抗原結合タンパク質は、硫酸アンモニウム沈殿法、親和性カラム、カラムクロマトグラフィー、ゲル電気泳動などを含む当該技術分野の標準的な手段に従い細胞培養の内容物から精製し得る。かかる技術は、当該技術分野の技術範囲内であり、本発明を限定しない。例えば、改変抗体の調製については、ＷＯ９９／５８６７９号およびＷＯ９６／１６９９０号に記載されている。
【０１３１】
抗原結合タンパク質のさらに別の発現方法は、米国特許第４，８７３，３１６号に記載されるように、遺伝子導入動物における発現の利用である。これは、哺乳動物に遺伝子導入で組み込まれた場合、雌の母乳において所望の組換えタンパク質の産生を可能にする動物のカゼインプロモーターを用いる発現系に関する。
【０１３２】
本発明のさらなる態様では、本発明の抗体の産生方法を提供し、この方法は、本発明の抗体の軽鎖および／もしくは重鎖をコードするベクターを用いて形質転換またはトランスフェクトされた宿主細胞を培養する工程、およびその結果産生した抗体を回収する工程を含む。
【０１３３】
本発明に従い、ヒトＩＬ−１３と結合してその活性を中和する本発明の抗ＩＬ−１３抗体の産生方法を提供し、この方法は以下；
（ａ）抗体重鎖をコードする第１ベクターを提供する工程；
（ｂ）抗体軽鎖をコードする第２ベクターを提供する工程；
（ｃ）前記第１および第２ベクターを用いて哺乳動物宿主細胞（例えばＣＨＯ）を形質転換する工程；
（ｄ）前記培地内へ前記宿主細胞から抗体の分泌を促す条件下で工程（ｃ）の宿主細胞を培養する工程；
（ｅ）工程（ｄ）の分泌した抗体を回収する工程
を含む。
【０１３４】
所望の方法によって発現後は、適切なアッセイを用いて抗体のインビトロ活性を検討する。現在、抗体のＩＬ−１３に対する定性および定量的結合を評価するために従来のＥＬＩＳＡアッセイ形態が使用されている。さらに、通常のクリアランス機序にもかかわらず体内における抗体の持続性を評価するために実施するヒト臨床研究の前に、中和効力を検証するために他のインビトロアッセイを使用してよい。
【０１３５】
治療の用量および期間は、ヒト循環における本発明の分子の相対的な持続時間に関し、治療する状態および患者の一般的な健康状態に応じて、当業者によって調整されることができる。最大の治療効果に達するために、長期（例えば４〜６ヶ月）にわたる反復投薬（例えば週１回または隔週）が必要な場合があることが想定される。
【０１３６】
本発明の治療薬の投与方法は、その作用物質を宿主へ送達する上で適した任意の経路であってよい。本発明の抗原結合タンパク質および医薬組成物は、非経口投与、すなわち、皮下（ｓ．ｃ．）、髄腔内、腹腔内、筋肉内（ｉ．ｍ．）、静脈内（ｉ．ｖ．）、または鼻腔内投与に特に有用である。
【０１３７】
本発明の治療薬は、医薬上許容可能な担体中に有効成分として有効量の本発明の抗原結合タンパク質を含む医薬組成物として調製し得る。一実施形態では、本発明の予防薬は、抗原結合タンパク質を注射形態で含む水性懸濁液または溶液である。一実施形態では、懸濁液または溶液は生理的ｐＨに緩衝されており、一実施形態では、非経口投与用の組成物は、本発明の抗原結合タンパク質の溶液または医薬上許容可能な担体に溶解したその混合物を含む。一実施形態では、担体は水性担体である。様々な水性担体、例えば、０．９％食塩水、０．３％グリシンなどを適用し得る。これらの溶液は、滅菌で作製し得、一般に粒子物質を含まない。これらの溶液は、従来の周知の滅菌技術（例えば、濾過）により滅菌し得る。組成物には、生理的状態に近づけるために必要に応じて医薬上許容可能な補助物質（ｐＨ調節剤および緩衝剤など）を含み得る。かかる医薬製剤中の本発明の抗原結合タンパク質の濃度は広範囲、すなわち、約０．５重量％未満、通常、約１重量％以上から約１５または２０重量％程度に変わり得、選択された特定の投与方法に従い、主に体液の容量および粘性などに基づき選択されるであろう。
【０１３８】
したがって、筋肉内注射用の本発明の医薬組成物は、滅菌緩衝水約１ｍＬ、ならびに本発明の抗原結合タンパク質、例えば抗体を約１ｎｇ〜約１００ｍｇ、例えば約５０ｎｇ〜約３０ｍｇもしくは約５ｍｇ〜約２５ｍｇ含むように調製できる。同様に、静脈内注射用の本発明の医薬組成物は、滅菌リンガー溶液を最大約２５０ｍｌ、ならびに本発明の抗原結合タンパク質を約１〜約３０もしくは５ｍｇ〜約２５ｍｇ／ｍｌリンガー溶液含むように作製し得る。非経口投与可能な組成物を調製するための実際の方法は当業者に周知または明白であり、例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅ，  １５ｔｈ  ｅｄ．，  Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏｍｐａｎｙ，  Ｅａｓｔｏｎ，  Ｐｅｎｎｓｙｌｖａｎｉａに詳述されている。静脈内に投与可能な本発明の抗原結合タンパク質製剤の調製については、Ｌａｓｍａｒ  Ｕ  ａｎｄ  Ｐａｒｋｉｎｓ  Ｄ  “Ｔｈｅ  ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｂｉｏｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  ｐｒｏｄｕｃｔｓ”，  Ｐｈａｒｍａ．  Ｓｃｉ．Ｔｅｃｈ．ｔｏｄａｙ，  ｐａｇｅ  １２９−１３７，  Ｖｏｌ．３  （３ｒｄ  Ａｐｒｉｌ  ２０００）；  Ｗａｎｇ，  Ｗ  “Ｉｎｓｔａｂｉｌｉｔｙ，  ｓｔａｂｉｌｉｓａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｌｉｑｕｉｄ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ”，  Ｉｎｔ．  Ｊ．  Ｐｈａｒｍ  １８５  （１９９９）  １２９−１８８；  Ｓｔａｂｉｌｉｔｙ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ  Ｐａｒｔ  Ａ  ａｎｄ  Ｂ  ｅｄ  Ａｈｅｒｎ  Ｔ．Ｊ．，  Ｍａｎｎｉｎｇ  Ｍ．Ｃ．，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，  ＮＹ：  Ｐｌｅｎｕｍ  Ｐｒｅｓｓ  （１９９２）；  Ａｋｅｒｓ，Ｍ．Ｊ．  “Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔ−Ｄｒｕｇ  ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ  ｉｎ  Ｐａｒｅｎｔｅｒａｌ  Ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎｓ”，  Ｊ．Ｐｈａｒｍ  Ｓｃｉ  ９１  （２００２）  ２２８３−２３００；  Ｉｍａｍｕｒａ，  Ｋ  ｅｔ  ａｌ  “Ｅｆｆｅｃｔｓ  ｏｆ  ｔｙｐｅｓ  ｏｆ  ｓｕｇａｒ  ｏｎ  ｓｔａｂｉｌｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｄｒｉｅｄ  ｓｔａｔｅ”，  Ｊ  Ｐｈａｒｍ  Ｓｃｉ  ９２  （２００３）  ２６６−２７４；  Ｉｚｕｔｓｕ，  Ｋｋｏｊｉｍａ，  Ｓ．  “Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔ  ｃｒｙｓｔａｌｉｎｉｔｙ  ａｎｄ  ｉｔｓ  ｐｒｏｔｅｉｎ−ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ−ｓｔａｂｉｌｉｚｉｎｇ  ｅｆｆｅｃｔ  ｄｕｒｉｎｇ  ｆｒｅｅｚｅ−ｄｒｙｉｎｇ”，  Ｊ  Ｐｈａｒｍ．  Ｐｈａｒｍａｃｏｌ，  ５４  （２００２）  １０３３−１０３９；  Ｊｏｈｎｓｏｎ，  Ｒ，  “Ｍａｎｎｉｔｏｌ−ｓｕｃｒｏｓｅ  ｍｉｘｔｕｒｅｓ−ｖｅｒｓａｔｉｌｅ  ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎｓ  ｆｏｒ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｌｙｏｐｈｉｌｉｚａｔｉｏｎ”，  Ｊ．  Ｐｈａｒｍ．  Ｓｃｉ，  ９１  （２００２）  ９１４−９２２；およびＨａ，Ｅ  Ｗａｎｇ  Ｗ，  Ｗａｎｇ  Ｙ．ｊ．  “Ｐｅｒｏｘｉｄｅ  ｆｏｒｍａｔｉｏｎ  ｉｎ  ｐｏｌｙｓｏｒｂａｔｅ  ８０  ａｎｄ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｓｔａｂｉｌｉｔｙ”，  Ｊ．  Ｐｈａｒｍ  Ｓｃｉ，  ９１，  ２２５２−２２６４，（２００２）を参照されたく、その全体の内容は参照によって本明細書に組み込まれ、読��は、この全内容を特に参照する。
【０１３９】
一実施形態では、本発明の治療薬は、医薬調製物中にある場合、単位用量形態で存在する。適切な治療有効量は当業者によって容易に決定されるであろう。患者に適した用量は体重に応じて算出し得、例えば適切な用量は、約０．１〜約２０ｍｇ／ｋｇ、例えば約１〜約２０ｍｇ／ｋｇ、例えば約１０〜約２０ｍｇ／ｋｇまたは例えば約１〜約１５ｍｇ／ｋｇ、例えば約１０〜約１５ｍｇ／ｋｇの範囲であり得る。本発明の抗原結合タンパク質の、ヒトにおける喘息またはＩＰＦなどの状態を効果的に治療するために適した用量は、約０．１〜約１０００ｍｇ、例えば約０．１〜約５００ｍｇ、例えば約５００ｍｇ、例えば約０．１〜約１００ｍｇ、または約０．１〜約８０ｍｇ、または約０．１〜約６０ｍｇ、または約０．１〜約４０ｍｇ、または例えば約１〜約１００ｍｇ、または約１〜約５０ｍｇの範囲内であり得、これは非経口（例えば皮下、静脈内または筋肉内）投与し得る。かかる用量は、必要な場合、医師によって適切に選択された適切な時間間隔で反復し得る。
【０１４０】
本明細書に記載の抗原結合タンパク質は、保存用に凍結乾燥し、使用前に適切な担体中で再構成することができる。この技術は従来の免疫グロブリンで有効であることが示されており、当技術分野において知られている凍結乾燥および再構成技術を使用できる。
【０１４１】
別の態様では、本発明は、アトピー性疾患／障害および慢性炎症疾患／障害、例えば、喘息、例えばアレルギー性喘息、特に重症喘息（すなわちコルチコステロイドの全身投与を含む現在の治療が奏効しない喘息；Ｂｕｓｓｅ  ＷＷ  ｅｔ  ａｌ，  Ｊ  Ａｌｌｅｒｇｙ  Ｃｌｉｎ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ  ２０００，  １０６：  １０３３−１０４２を参照されたい）、「困難性」喘息（最大推奨用量の吸入ステロイド処方にもかかわらず制御不成功を特徴とする喘息性形質として定義、Ｂａｒｎｅｓ  ＰＪ  （１９９８），  Ｅｕｒ  Ｒｅｓｐｉｒ  Ｊ  １２：１２０８−１２１８を参照されたい）、「ブリットル」喘息（高用量の吸入ステロイドにもかかわらず大きく変動する最大呼気流量（ＰＥＦ）を維持する重度の不安定喘息患者のサブグループを定義、Ａｙｒｅｓ  ＪＧ  ｅｔ  ａｌ  （１９９８）  Ｔｈｏｒａｘ  ５８：３１５−３２１を参照されたい）、夜間性喘息、月経前喘息、ステロイド抵抗性喘息（Ｗｏｏｄｃｏｃｋ  ＡＪ  （１９９３）  Ｅｕｒ  Ｒｅｓｐｉｒ  Ｊ  ６：７４３−７４７を参照されたい）、ステロイド依存性喘息（高用量の経口ステロイドでのみ制御できる喘息として定義）、アスピリン誘発性喘息、成人発症型喘息、小児喘息の治療または予防のための本発明の抗原結合タンパク質もしくはその機能的断片ならびに医薬上許容可能な担体を含む医薬組成物を提供する。本発明の抗体は、急性喘息エピソード（喘息発作重積状態）を予防する、頻度を減らす、または作用を緩和するために使用してよい。本発明の抗体は、喘息の治療に使用される他の薬の必要な投薬を（投薬の投与量または投与頻度のいずれかに関して）減らすためにも使用してよい。例えば、本発明の抗体は、喘息のステロイド治療（コルチコステロイド治療など）に必要な投薬を減らす（「ステロイド使用を控える」）ために使用してよい。本発明の抗体で治療し得る他の疾患または障害としては、アトピー性皮膚炎、アレルギー性鼻炎、クローン病、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、好酸球性食道炎、線維性疾患もしくは障害（特発性肺線維症など）、進行性全身性硬化症（強皮症）、肝線維症、肝肉芽腫、住血吸虫症、リーシュマニア症、および細胞周期調節疾患、例えばホジキン病、Ｂ細胞慢性リンパ球性白血病が挙げられる。一実施形態では、障害は重症喘息である。さらなる実施形態では、障害は線維性障害（ＩＰＦなど）である。
【０１４２】
よりさらなる態様では、本発明は、本発明の抗原結合タンパク質および医薬上許容可能な担体を含む医薬組成物を、アトピー性疾患／障害および慢性炎症疾患／障害、例えば、喘息、例えばアレルギー性喘息、特に重症喘息（すなわちコルチコステロイドの全身投与を含む現在の治療が奏効しない喘息；Ｂｕｓｓｅ  ＷＷ  ｅｔ  ａｌ，  Ｊ  Ａｌｌｅｒｇｙ  Ｃｌｉｎ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ  ２０００，  １０６：  １０３３−１０４２を参照されたい）、「困難性」喘息（最大推奨用量の吸入ステロイド処方にもかかわらず制御不成功を特徴とする喘息性形質として定義、Ｂａｒｎｅｓ  ＰＪ  （１９９８），  Ｅｕｒ  Ｒｅｓｐｉｒ  Ｊ  １２：１２０８−１２１８を参照されたい）、「ブリットル」喘息（高用量の吸入ステロイドにもかかわらず大きく変動する最大呼気流量（ＰＥＦ）を維持する重度の不安定喘息患者のサブグループを定義、Ａｙｒｅｓ  ＪＧ  ｅｔ  ａｌ  （１９９８）  Ｔｈｏｒａｘ  ５８：３１５−３２１を参照されたい）、夜間性喘息、月経前喘息、ステロイド抵抗性喘息（Ｗｏｏｄｃｏｃｋ  ＡＪ  （１９９３）  Ｅｕｒ  Ｒｅｓｐｉｒ  Ｊ  ６：７４３−７４７を参照されたい）、ステロイド依存性喘息（高用量の経口ステロイドでのみ制御できる喘息として定義）、アスピリン誘発性喘息、成人発症型喘息、小児喘息の治療のために提供する。本発明の抗体は、急性喘息エピソード（喘息発作重積状態）を予防する、頻度を減らす、または作用を緩和するために使用してよい。本発明の抗体は、喘息の治療に使用される他の薬の必要な投薬を（投薬の投与量または投与頻度のいずれかに関して）減らすためにも使用してよい。例えば、本発明の抗体は、喘息のステロイド治療（コルチコステロイド治療など）に必要な投薬を減らす（「ステロイド使用を控える」）ために使用してよい。本発明の抗体で治療し得る他の疾患または障害としては、アトピー性皮膚炎、アレルギー性鼻炎、クローン病、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、好酸球性食道炎、線維性疾患もしくは障害（特発性肺線維症など）、進行性全身性硬化症（強皮症）、肝線維症、肝肉芽腫、住血吸虫症、リーシュマニア症、および細胞周期調節疾患、例えばホジキン病、Ｂ細胞慢性リンパ球性白血病が挙げられる。一実施形態では、障害は重症喘息である。さらなる実施形態では、障害は線維性障害（ＩＰＦなど）である。
【０１４３】
本明細書に記載の配列（配列番号２６〜配列番号５５および配列番号６２〜配列番号１４６）は、本明細書に記載の配列と実質的に同一である、例えば、少なくとも９０％同一である、例えば、少なくとも９１％、または少なくとも９２％、または少なくとも９３％、または少なくとも９４％または少なくとも９５％、または少なくとも９６％、または少なくとも９７％または少なくとも９８％、または少なくとも９９％同一である配列を含むことが理解されるであろう。
【０１４４】
核酸において、「実質的な同一性」という用語は、適切にヌクレオチドを挿入してまたは欠失させて至適整列および比較時に、少なくとも約８０％のヌクレオチド、少なくとも約９０％〜約９５％、または少なくとも約９８％〜約９９．５％のヌクレオチドが同一である２つの核酸、またはその設計された配列を示す。あるいは、実質的な同一性は、選択的ハイブリダイゼーション条件下でセグメントが鎖の補体にハイブリダイズする場合に存在する。
【０１４５】
ヌクレオチド配列およびアミノ酸配列において、「同一」という用語は、２つの核酸またはアミノ酸配列を適切に挿入してまたは欠失させて至適整列および比較時の同一度を示す。あるいは、実質的な同一性は、選択的ハイブリダイゼーション条件下でＤＮＡセグメントが鎖の補体にハイブリダイズする場合に存在する。
【０１４６】
２配列間の同一性％は、２配列の至適整列のために導入する必要があるギャップ数、および各ギャップの長さを考慮した、配列の共有する同一の位置数の関数（すなわち、同一性％＝同一の位置数／総位置数×１００）である。配列の比較および２配列間の同一性％の決定は、以下の非制限的な実施例に記載のように数学アルゴリズムを用いて成し遂げることができる。
【０１４７】
２つのヌクレオチド配列間の同一性％は、ＧＣＧソフトウェアパッケージ内のＧＡＰプログラムを用いて、ＮＷＳｇａｐｄｎａ．ＣＭＰ行列、ならびに４０、５０、６０、７０、もしくは８０のギャップウェイト、ならびに１、２、３、４、５、もしくは６のレングスウェイトを用いて決定することができる。２つのヌクレオチド配列またはアミノ酸配列間の同一性％は、ＡＬＩＧＮプログラム（バージョン２．０）に組み込まれているＥ．  Ｍｅｙｅｒｓ  ａｎｄ  Ｗ．  Ｍｉｌｌｅｒ  （Ｃｏｍｐｕｔ．  Ａｐｐｌ．  Ｂｉｏｓｃｉ．，  ４：１１−１７  （１９８８））のアルゴリズムを用いて、ＰＡＭ１２０ウェイト残基表、ギャップレングスペナルティ１２、およびギャップペナルティ４を用いて決定することもできる。加えて、２つのアミノ酸配列間の同一性％は、ＧＣＧソフトウェアパッケージ内のＧＡＰプログラムに組み込まれているＮｅｅｄｌｅｍａｎ  ａｎｄ  Ｗｕｎｓｃｈ  （Ｊ．  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．  ４８：４４４−４５３  （１９７０））アルゴリズムを用いて、Ｂｌｏｓｓｕｍ６２行列もしくはＰＡＭ２５０行列のいずれか、ならびに１６、１４、１２、１０、８、６、もしくは４のギャップウェイト、ならびに１、２、３、４、５、もしくは６のレングスウェイトを用いて決定することができる。
【０１４８】
例として、本発明のポリヌクレオチド配列は、配列番号２５の基準配列と同一、すなわち１００％同一であってもよく、または、基準配列と比較してヌクレオチド改変を特定の整数の数まで含んでもよい。かかる改変は、少なくとも１つのヌクレオチド欠失、置換（転位および塩基転換を含む）、または挿入からなる群から選択され、前記改変は基準ヌクレオチド配列の５’もしくは３’末端位またはそれら末端位の間のどこかで、基準配列中のヌクレオチド間に個々に散在してまたは基準配列中の１つもしくは複数の連続基としてのいずれかで生じ得る。ヌクレオチド改変数は、配列番号２５の総ヌクレオチド数にそれぞれの同一性％の％数値を乗じて（１００で割って）、その積を前記配列番号２３の総ヌクレオチド数から減算するか、または：
ｎｎ≦ｘｎ−（ｘｎ  ×  ｙ）、
式中ｎｎはヌクレオチド改変数であり、ｘｎは配列番号２５の総ヌクレオチド数であり、ｙは、５０％の場合は０．５０、６０％の場合は０．６０、７０％の場合は０．７０、８０％の場合は０．８０、８５％の場合は０．８５、９０％の場合は０．９０、９５％の場合は０．９５、９７％の場合は０．９７または１００％の場合は１．００であり、ｘｎとｙの積が整数ではない場合はいずれも端数を切り捨てて最も近い整数にした後でｘｎから減算することによって決定する。配列番号２５のポリヌクレオチド配列改変はこのコード配列中にナンセンス、ミスセンスまたはフレームシフト変異を生じ得、その結果かかる改変に続いてポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドを改変する。
【０１４９】
同様に、別の例では、本発明のポリペプチド配列は、配列番号２４によりコードされた基準配列と同一、すなわち１００％同一であってもよく、または、基準配列と比較して同一性％が１００％未満であるようにアミノ酸改変を特定の整数の数まで含んでもよい。かかる改変は、少なくとも１つのアミノ酸欠失、置換（保存的および非保存的置換を含む）、または挿入からなる群から選択され、前記改変は基準ポリペプチド配列のアミノもしくはカルボキシ末端位またはそれら末端位の間のどこかで、基準配列中のアミノ酸間に個々に散在してまたは基準配列中の１つもしくは複数の連続基としてのいずれかで生じ得る。所定の同一性％のアミノ酸改変数は、配列番号２４によりコードされるポリペプチド配列の総アミノ酸数にそれぞれの同一性％の％数値を乗じて（１００で割って）、次いでその積を前記配列番号２４によりコードされるポリペプチド配列の総アミノ酸数から減算するか、または：
ｎａ≦ｘａ−（ｘａ  ×  ｙ）、
式中ｎａは、アミノ酸改変数であり、ｘａは配列番号２４によりコードされるポリペプチド配列の総アミノ酸数であり、ｙは、例えば７０％の場合は０．７０、８０％の場合は０．８０、８５％の場合は０．８５、などであり、ｘａとｙの積が整数ではない場合はいずれも端数を切り捨てて最も近い整数にした後でｘａから減算することによって決定する。
【０１５０】
以下の実施例により例証するが、これらは本発明を限定しない。
実施例
【実施例１】
【０１５１】
組換え抗ＩＬ−１３抗体の構築
オリジナルのマウスｍＡｂを組換えヒトＩＬ−１３を有するマウスの免疫化により産生した。反応した動物由来の脾臓を回収して、骨髄腫細胞に融合させてハイブリドーマを生成した。ハイブリドーマ上清物質の結合をスクリーニングした。標準的な技術を用いて興味のハイブリドーマをモノクローン化した。生成したマウス抗体（６Ａ１）は配列番号５８および配列番号５９に示す可変領域を含む。このマウス抗体およびこの抗体Ａ１Ｌ１（配列番号２２および２４）のヒト化バージョンの詳細については、ＷＯ２００６／００３４０７号に記載されており、これは参照によって本明細書に組み込まれる。抗ＩＬ−１３  ｍＡｂ抗体Ａ１Ｌ１を比較抗体として以下の実施例のいくつかに使用した。
【０１５２】
配列番号２２に説明した重鎖を含むヒト化抗体の変異体をいくつか産生した。これらはすべて抗体のＣＤＲＨ３領域が異なる（配列番号３）。
【０１５３】
ＲｌｄおよびＲｌｎ哺乳動物発現ベクター内へクローニングのための制限部位を含む重複オリゴヌクレオチドならびにヒトシグナル配列を形成して本発明の抗体のための塩基性ＤＮＡ発現構築物、配列番号２３（重鎖）および配列番号２５（軽鎖）をｄｅ  ｎｏｖｏで調製した。Ｈｉｎｄ  ＩＩＩおよびＳｐｅ  Ｉ制限部位を導入して、ヒトγ１定常領域を含むＲｌｄ内へのクローニングのためにシグナル配列（配列番号５６）を含むＶＨドメインを枠組みした。Ｈｉｎｄ  ＩＩＩおよびＢｓｉＷＩ制限部位を導入して、ヒトκ定常領域を含むＲｌｎ内へのクローニングのためにシグナル配列（配列番号５６）を含むＶＬドメインを枠組みした。代替構築物は同様にヒト定常領域を含むｐＴＴベクターを用いて産生した。適切な場合、部位指向変異（ＳＤＭ）を用いて異なるヒト化構築物を生成した。
【実施例２】
【０１５４】
ＨＥＫ  ２９３  ６Ｅ細胞における抗体発現
重鎖と軽鎖をそれぞれコードするｐＴＴプラスミドをＨＥＫ  ２９３  ６Ｅ細胞内に一過性共トランスフェクトし、少量発現させて抗体を産生した。抗体を組織培養上清から直接評価した。固定化プロテインＡカラムを用いて他の抗体を精製して、吸光度を２８０ｎｍで読み取ることにより定量化し、指定の場合、精製された抗体物質を以下に説明する実施例に記載のアッセイにおいて評価した。
【０１５５】
我々がコード（すなわちＡ１Ｙ１００ＢＴｒｐＬ１）により抗体を指す場合、我々は記載の第１プラスミドと第２プラスミドの共トランスフェクションおよび発現により生成したｍＡｂを指している。例えば「Ａ１Ｙ１００ＢＴｒｐＬ１」とは、適切な細胞系においてＡ１Ｙ１００ＢＴｒｐ配列を含むプラスミドとＬ１配列を含むプラスミドの共トランスフェクションにより生成したｍＡｂに関する。
【実施例３】
【０１５６】
抗ＩＬ−１３ヒト化ｍＡｂのＢｉａｃｏｒｅ分析
動力学分析
ＣＤＲＨ３変異体の初回スクリーニングをＰｒｏｔｅＯｎ  ＸＰＲ３６（Ｂｉｏｒａｄ）上で実施した。方法は以下のとおりであった。抗ヒトＩｇＧ（Ｂｉａｃｏｒｅ  ＢＲ−１００８〜３９）を第１級アミンカップリングによりＧＬＭチップ上に固定化してから、ＣＤＲＨ３変異体抗体をこの表面上に捕捉して、ＩＬ１３を２５６、６４、１６、４、１ｎＭで通過させ、０ｎＭ注入（すなわち緩衝液単独）を二重照合に使用した。３Ｍ  ＭｇＣｌ２を用いて捕捉表面を再生し、結合ＣＤＲＨ３変異体抗体を除去して、別のサイクルの捕捉およびアナライト注入を準備した。データは、機械に固有のソフトウェアを用いて１：１モデルに適合させた。精製された物質であった親抗体を除きすべての作業を組織培養上清から直接抗体を用いて実施した。
【０１５７】
スクリーニングにより、親分子より良好な動力学プロファイルを有するように思われた抗体をいくつか同定してから、これらの同一試料をＢｉａｃｏｒｅ  Ｔ１００上で分析して類似の方法を用いて結果を確認し、同じ抗ヒトＩｇＧ捕捉抗体を第１級アミンカップリングによりＣＭ５チップ上に固定化して、ＩＬ１３を表面上に２５６、６４、１６、４、１および０．２５ｎＭで通過させ、０ｎＭを二重照合に使用して、３Ｍ  ＭｇＣｌ２で再生し、Ｔ１００に固有の１：１モデルにデータを適合させた。ＰｒｏｔｅＯｎスクリーニングおよびＴ１００実行から選択された構築物の全体の親和性（平衡解離定数ＫＤ）を表１に詳述する。
【表１】
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【０１５８】
データにより、Ｙ１００Ｂ残基のいくつかの変異により全体の親和性が改善されると思われることが強調された。この観点から、先に記載のものと同じ方法でＰｒｏｔｅＯｎを用いて、組織培養上清から再び抗体を直接用いて、初回スクリーニング時に存在しなかったこの残基の変異を試験した。試験した変異のうち、Ａ１Ｙ１００Ｂ  ＶａｌＬ１において、親の０．３９０〜０．４６０ｎＭ値と比較して０．１６６ｎＭ値が得られ、全体の親和性（平衡解離定数ＫＤ）が改善されると思われた。先に記載のものと同じ方法を用いてＢｉａｃｏｒｅ  Ｔ１００上でＹ１００Ｂ  Ｖａｌを試験時、平衡解離定数ＫＤは親の０．３４６ｎＭ値と比較して０．０２５ｎＭで測定された。
【０１５９】
抗体変異体を組織培養上清から直接用いてこれまで実行した作業の点から、精製された抗体をＡ１Ｙ１００ＢＬ１変異体Ａｌａ、ＩｌｅおよびＴｒｐのために産生した。これらは、この段階で精製しなかったＡ１Ｙ１００Ｂ  ＶａｌＬ１変異体を対象として、前と同じ方法を用いてＢｉａｃｏｒｅ  Ｔ１００上で実行した。この実験から得られたデータを表２に示す。
【表２】
0005919188.tif 000005
【０１６０】
実験により、変異体はＩＬ１３に対する結合親和性を親分子と比較して改善しなかったことを確認した。
【０１６１】
精製されたＡ１Ｙ１００ＢＬ１変異体では組織培養上清から得られるよりも良好な結合親和性が得られることから、Ａ１Ｙ１００Ｂ  ＶａｌＬ１を精製し、同様に親和性を改善した他の精製されたＡ１Ｙ１００ＢＬ１変異体と共に、Ｂｉａｃｏｒｅ  Ｔ１００機械で先に記載の方法を用いて実行した。この実験から得られたデータを表３に示す。この実験は表２のデータと十分一致し、Ｙ１００Ｂ変異の親和性の改善が確認された。
【表３】
0005919188.tif 000006
【実施例４】
【０１６２】
ＴＦ−１細胞増殖バイオアッセイにおける大腸菌発現組換えヒトＩＬ−１３の中和
ヒトＩＬ−１３を含むいくつかの異なるサイトカインに対する反応において、ＴＦ−１細胞は増殖する。したがってＩＬ−１３のためのこれらの細胞の増殖反応を用いてＩＬ−１３の生体活性を測定し、続いてアッセイを開発してｍＡｂのＩＬ−１３中和効能（ＩＬ−１３生体活性の阻害）を決定することができる。
【０１６３】
アッセイは滅菌９６ウェル組織培養プレートにおいて滅菌条件下で実施して、すべての試験ウェルは三連で実施した。１４ｎｇ／ｍｌの組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−１３を様々な希釈のｍＡｂ（通常３倍希釈液で滴定した９３．４ｎＭ〜０．０１４ｎＭ）と３７℃で１時間プレインキュベートした。無関係な特異性抗体を陰性対照として同様に滴定した。次いでこれらの試料を、滅菌９６ウェル組織培養プレート中ＴＦ−１細胞５０μｌ（濃度２×１０５細胞／ｍｌ）に添加した。したがって最終１００μｌアッセイ体積には、様々な希釈のｍＡｂ（３倍希釈液で滴定した最終濃度４６．７ｎＭ〜０．００７ｎＭ）、組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−１３（最終濃度７ｎｇ／ｍｌ）およびＴＦ−１細胞（最終濃度１×１０５細胞／ｍｌ）を含有した。アッセイプレートは加湿ＣＯ２インキュベーター内で３７℃で約３日間インキュベートした。次いでＰｒｏｍｅｇａ製「Ｃｅｌｌ  Ｔｉｔｒｅ９６（登録商標）Ｎｏｎ−Ｒａｄｉｏａｃｔｉｖｅ  Ｃｅｌｌ  Ｐｒｏｌｉｆｅｒａｔｉｏｎ  Ａｓｓａｙ」（カタログ番号Ｇ４１００）を製造業者の説明書に記載どおりに用いて、細胞増殖量を決定した。９６ウェルプレート中の試料の吸光度はプレートリーダーで５７０ｎｍで読み取った。
【０１６４】
組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−１３の生体活性を中和するｍＡｂの能力は定義した量のヒトＩＬ−１３（７ｎｇ／ｍｌ）の生体活性を５０％中和するために必要なｍＡｂ濃度（＝ＮＤ５０）として表した。必要なｍＡｂ濃度が低いほど、中和能力は強力である。本明細書に提供するＮＤ５０データ（表４）はマイクロソフトエクセルのＲｏｂｏｓａｇｅを用いて算出した。データの図解は図１に見ることができる。
【表４】
0005919188.tif 000007
【実施例５】
【０１６５】
ＣＤＲＨ３変異型抗ＩＬ−１３  ｍＡｂを含むｍＡｂ−ｄＡｂの構築および発現
標準的な分子生物学技術を用いて、Ａ１抗体のＣＤＲＨ３変異体の可変重鎖領域の各配列をコードする遺伝子を既存の構築物から、ｈＩｇＧ１定常領域のＣ末端にてＴＶＡＡＰＳまたはＡＳＴＫＧＰＳリンカーを介して抗ヒトＩＬ−４ドメイン抗体（ＤＯＭ９−１１２−２１０）に融合したｈＩｇＧ１定常領域を含む発現ベクターに移した。構築した重鎖の詳細を表５に列挙する。
【表５】
0005919188.tif 000008
【０１６６】
ＢＰＣ１６２４、ＢＰＣ１６２５、ＢＰＣ１６２６およびＢＰＣ１６２７をＨＥＫ２９３細胞内で発現した。簡単に述べると、２５０ｍｌのＨＥＫ２９３細胞１．５×１０６細胞／ｍｌを、２９３ｆｅｃｔｉｎ試薬（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ＃５１〜００３１）で先にインキュベートした重鎖および軽鎖発現プラスミドと共トランスフェクトした。これらを３７℃、５％ＣＯ２、および９５％相対湿度で攪拌インキュベーター内に入れた。２４時間後にトリプトン供給培養を添加して、細胞をさらに５日間増殖させた。上清を遠心分離により収穫してフィルター滅菌した。固定化プロテインＡカラムを用いて発現した分子を親和性クロマトグラフィーにより精製して、吸光度を２８０ｎｍで測定することによって濃度を決定した。精製された試料中のタンパク質凝集レベルをサイズ排除クロマトグラフィーにより決定した。精製されたタンパク質の収率および凝集レベルを表５ｂに示す。
【０１６７】
0005919188.tif 000009
【実施例６】
【０１６８】
ＣＤＲＨ３変異型抗ＩＬ−１３  ｍＡｂを含むｍＡｂ−ｄＡｂの中和活性データ
ＴＦ−１細胞増殖バイオアッセイにおいてＣＤＲＨ３変異型抗ＩＬ−１３  ｍＡｂを含むｍＡｂ−ｄＡｂによる大腸菌発現組換えヒトＩＬ−１３の中和を試験した。
【０１６９】
アッセイは滅菌９６ウェル組織培養プレートにおいて滅菌条件下で実施して、すべての試験ウェルは三連で実施した。約２０ｎｇ／ｍｌの組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−１３を様々な希釈のｍＡｂｄＡｂ（通常３倍希釈液で滴定した、５０ｎＭ〜０．０２ｎＭ）（ＨＥＫ細胞内で作製し、実施例５に記載のように精製されたｍＡｂｄＡｂ）の総体積５０μｌと３７℃で１時間プレインキュベートした。無関係な特異性抗体を陰性対照として同様に滴定した（データは示さず）。次いでこれらの試料を、滅菌９６ウェル組織培養プレート中ＴＦ−１細胞５０μｌ（濃度２×１０５細胞／ｍｌ）に添加した。したがって最終１００μｌアッセイ体積には、様々な希釈のｍＡｂｄＡｂ（３倍希釈液で滴定した最終濃度２５ｎＭ〜０．０１ｎＭ）、組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−１３（最終濃度１０ｎｇ／ｍｌ）およびＴＦ−１細胞（最終濃度１×１０５細胞／ｍｌ）を含有した。アッセイプレートは加湿ＣＯ２インキュベーター内で３７℃で約３日間インキュベートした。次いでＰｒｏｍｅｇａ製「Ｃｅｌｌ  Ｔｉｔｒｅ９６（登録商標）Ｎｏｎ−Ｒａｄｉｏａｃｔｉｖｅ  Ｃｅｌｌ  Ｐｒｏｌｉｆｅｒａｔｉｏｎ  Ａｓｓａｙ」（カタログ番号Ｇ４１００）を製造業者の説明書に記載どおりに用いて、細胞増殖量を決定した。９６ウェルプレート中の試料の吸光度はプレートリーダーで５７０ｎｍで読み取った。
【０１７０】
ヒトＩＬ−１３の生体活性を中和するｍＡｂｄＡｂの能力は定義した量のヒトＩＬ−１３（１０ｎｇ／ｍｌ）の生体活性を５０％中和するために必要なｍＡｂ−ｄＡｂ濃度（＝ＮＤ５０）として表した。必要なｍＡｂｄＡｂ濃度が低いほど、中和能力は強力である。本明細書に提供するＮＤ５０データ（表６）はＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍを用いて算出した。これらのデータを図２に図式的に表す。
【表６】
0005919188.tif 000010
【実施例７】
【０１７１】
ＣＨＯＥ１ａ発現系におけるＣＤＲＨ３変異型抗ＩＬ−１３  ｍＡｂを含むｍＡｂ−ｄＡｂの発現
表５に示す分子ＢＰＣ１６２４〜１６３１もＣＨＯＥ１ａ細胞内で発現した。重鎖および軽鎖をコードするＤＮＡベクターを懸濁ＣＨＯ細胞内に共電気穿孔した。攪拌フラスコ内のＭＲ１基底選択的培地で、３７℃、５％ＣＯ２、１３０ｒｐｍで細胞生存能および細胞数が改善されるまで細胞を継代させた。次いでＣＨＯ細胞をＭＲ１基底×２選択的培地内で播種し、３４℃、５％ＣＯ２、１３０ｒｐｍで８〜１２日間インキュベートした。細胞を遠心分離によりペレットして、上清を滅菌濾過した。
【０１７２】
固定化プロテインＡカラムを用いて発現物質を親和性クロマトグラフィーにより精製して、吸光度を２８０ｎｍで測定することによって収率を決定した。凝集レベルをサイズ排除クロマトグラフィーにより決定した。凝集を調製用サイズ排除クロマトグラフィーにより除去し、収率を再評価した。この発現系から得られる収率および凝集レベルを表７に列挙する。
【表７】
0005919188.tif 000011
【実施例８】
【０１７３】
抗原結合タンパク質の化学量論評価（Ｂｉａｃｏｒｅ（商標）を使用）
この実施例は予測である。本発明の抗原結合タンパク質を試験できる追加アッセイを実行するための指針を提供する。
【０１７４】
抗ヒトＩｇＧは、第１級アミンカップリングによりＣＭ５バイオセンサーチップ上に固定化する。抗原結合タンパク質をこの表面上に捕捉後、単一濃度のＩＬ−１３またはＩＬ−４またはＩＬ−５を通過させる。この濃度は結合表面を飽和するのに十分であり、観察される結合シグナルは完全なＲｍａｘに達する。次いで以下の式：
化学量論値＝Ｒｍａｘ  ×  Ｍｗ（リガンド）  ／  Ｍｗ（アナライト）  ×  Ｒ（固定化または捕捉されたリガンド）
を用いて化学量論値を算出する。
【０１７５】
複数のアナライト結合の化学量論値を同時に算出する場合、異なる抗原を飽和抗原濃度および上で算出した化学量論で連続通過させる。この作業は、Ｂｉａｃｏｒｅ  ３０００上、ＨＢＳ−ＥＰランニング緩衝液を用いて２５℃で実行できる。
【実施例９】
【０１７６】
改善されたヒト化変異型ｍＡｂの用量予測
異なるモノクローナル抗体（ｍＡｂ）候補を結合親和性に基づき順位付けるために抗体リガンド結合ＰＫ−ＰＤモデルを開発して、ヒトにおける潜在的治療用量を予測した。
【０１７７】
ヒトにおける予測した潜在的治療用量をこの目的のために、ｍＡｂの月１回静脈内投与１時間後に肺（作用部位）中標的ＩＬ−１３を定常状態で９０％阻害する用量として定義した。各分子の分子量は同じであり、ｍＡｂの標準分子量、すなわち１５０ｋＤａと等しいと推定した。加えて、異なる候補の動物またはヒト薬力学データの不在下、Ａ１Ｌ１抗体のヒト薬力学をすべての候補と推測した。
【０１７８】
同一の抗体リガンド結合ＰＫ−ＰＤモデルならびに標的濃度、標的ターンオーバー、標的組織：血漿比率およびｍＡｂ組織浸透に関する同じ仮定を各ｍＡｂにおいて使用する。したがって、モデルにより提供される順位付けは、もっぱら分子の結合親和性に基づき、変数のみ異なる。かかる状態において、ヒトにおける４つの候補Ａ１Ｙ１００ＢｌｌｅＬ１、Ａ１Ｙ１００ＢＶａｌＬ１、Ａ１Ｙ１００ＢＡｌａＬ１およびＡ１Ｙ１００ＢＴｒｐＬ１の潜在的治療用量は、ヒトにおけるＡ１Ｌ１の予測される潜在的治療用量を超える実質的な改善を提供すると予測される。
【実施例１０】
【０１７９】
変異型ＩＬ−４ｄＡｂを伴う抗ＩＬ１３／ＩＬ４  ｍＡｂｄＡｂ
１０．１構築および発現
凝集予測アルゴリズムを用いて、抗ＩＬ−４ｄＡｂ（ＤＯＭ９−１５５−１５４、配列番号８０）の凝集傾向がある残基を調査した。Ｋａｂａｔ８９位のロイシン残基を凝集促進のための主要残基として同定した。
【０１８０】
このｄＡｂを含むｍＡｂｄＡｂの潜在的凝集を減らすために、このアミノ酸残基を他のアミノ酸と置換していくつかのｍＡｂ−ｄＡｂ変異体を生成した。既存のｍＡｂｄＡｂ構築物の重鎖をコードするＤＮＡ発現ベクターを用いて、部位指向変異により発現構築物を生成した。変異ｄＡｂ配列を含む生成した新規ｍＡｂｄＡｂ重鎖のタンパク質配列は、配列番号１１７〜１３４において提示される。
【０１８１】
８９位に別の変異を挿入された他の重鎖配列は、配列番号９６〜１０６である。これらを実施例１１に詳述する。
【０１８２】
発現した分子の一覧を表８に提供する。
【表８】
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【０１８３】
0005919188.tif 000013
【０１８４】
１０．２  ＨＥＫ  ２９３  ６Ｅ細胞における分子発現
重鎖と軽鎖をそれぞれコードするプラスミドをＨＥＫ  ２９３  ６Ｅ細胞内に一過性共トランスフェクトして少量発現させて、抗体分子を産生した。トランスフェクションから最大２４時間後にトリプトン供給物を各細胞培養に添加して、３日後に細胞を回収した。
【０１８５】
抗体分子を組織培養上清から直接評価して、Ｇｙｒｏｌａｂワークステーションを用いて定量化した。
【０１８６】
細胞上清中の抗体分子の定量化のためのＧｙｒｏｌａｂワークステーション方法
Ｇｙｒｏｌａｂ  Ｂｉｏａｆｆｙワークステーション（Ｇｙｒｏｓ）を用いた定量免疫アッセイにより、少量の一過性ＨＥＫ  ２９３６Ｅトランスフェクション（０．７５〜２．０ｍｌ）から産生した抗体を組織培養上清から定量化した。コンパクトディスク（ＣＤ）マイクロ実験室（Ｇｙｒｏｓ）上にストレプトアビジンコーティングした粒子に固定化したビオチン化抗ＩｇＧＡｆｆｉｂｏｄｙ分子（Ａｂｃａｍ）を用いたＦｃ領域を介して抗体を捕捉された。Ａｆｆｉｂｏｄｙ試薬を簡単にボルテックスして、ＰＢＳ−Ｔｗｅｅｎ  ２０（０．０１％ｖ／ｖ）で最終作業濃度０．１ｍｇ／ｍｌに希釈した。次いで、レーザ誘発蛍光を用いてＡＬＥＸＡ  ６４７標識化Ｆａｂ２抗ヒトＩｇＧκ軽鎖分子により抗体を検出した。ＡＬＥＸＡ  ６４７標識化検出試薬は、簡単にボルテックスすることによって、および１３０００ｒｐｍで４分間遠心分離することによって調製した。標識化Ｆａｂ２検出試薬を非標識化Ｆａｂ２に添加して、これをＲｅｘｃｉｐ  Ｆ検出試薬希釈液（Ｇｙｒｏｓ）を用いて最終濃度７５ｎＭおよび１．５μＭにそれぞれ希釈した。抗体定量化範囲は抗ＣＤ２３モノクローナル抗体標準曲線と比較して０．２４４〜２５０μｇ／ｍｌであった。組織培地（Ｆｒｅｅｓｔｙｌｅ  ２９３発現培地、Ｐｌｕｒｏｎｉｃ  Ｆ６８およびＧｅｎｅｔｉｃｉｎ、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）で抗体を連続希釈して抗ＣＤ２３（１ｍｇ／ｍｌ）標準曲線を作成した。
【０１８７】
場合により、固定化プロテインＡカラムを用いて抗体分子を精製して、吸光度を２８０ｎｍで読み取ることにより定量化し、指定の場合、精製された抗体分子を以下に説明する実施例に記載のアッセイにおいて評価した。
【０１８８】
１０．３  ＩＬ−４結合ＥＬＩＳＡ
以下の方法を用いた直接結合ＥＬＩＳＡにおいて、これらのｍＡｂｄＡｂのＩＬ−４への結合を試験した。
【０１８９】
５μｇ／ｍｌヒトＩＬ−４（ＧＳＫ製）のＮａＨＣＯ３溶液を９６ウェル高結合プレートにコーティングして、４℃で一晩保存した。プレートを０．０５％のＴｗｅｅｎ−２０（ＴＢＳＴ）含有トリス緩衝食塩水で２回洗浄した。１００μＬのブロック溶液（１％ＢＳＡのＴＢＳＴ緩衝液）を各ウェルに添加して、プレートを室温で少なくとも１時間インキュベートした。引き続いてｍＡｂｄＡｂをプレート全体でブロック溶液で希釈した。１時間インキュベーション後、プレートを３回洗浄した。ヤギ抗ヒトκ軽鎖特異的ペルオキシダーゼ抱合抗体（Ｓｉｇｍａ  Ａ７１６４）をブロック溶液で１μｇ／ｍＬに希釈して、５０μＬを各ウェルに添加した。プレートを１時間インキュベートした。さらに３つの洗浄工程後、５０μｌのＯＰＤ（ｏ−フェニレンジアミン二塩酸塩）ＳｉｇｍａＦａｓｔ基質溶液を各ウェルに添加して、３Ｍ硫酸２５μＬ添加により約５分後に反応は停止した。基本終点プロトコルを用いて、ＶｅｒｓａＭａｘ  Ｔｕｎａｂｌｅマイクロプレートリーダー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ）を用いて、吸光度を４９０ｎｍで読み取った。
【０１９０】
精製された物質であった陽性対照（抗ＩＬ−４  ｍＡｂ）および抗ＩＬ１３陰性対照ｍＡｂを除き、ｇｙｒｏｌａｂプラットフォームを用いて定量化されている組織培養上清から直接ｍＡｂｄＡｂを用いて実験を実施した。これらのデータを図１７に示す。
【０１９１】
ＥＬＩＳＡ結果は、これらの一過性発現抗ＩＬ１３  ｍＡｂ−抗ＩＬ４ｄＡｂ結合ＩＬ−４のほとんど（ただし、ＩＬ−４結合活性において一部変形）が観察されたことを示す。精製された陽性対照の抗ＩＬ−４  ｍＡｂもＩＬ−４への結合を示したのに対し、精製された陰性対照ｍＡｂはヒトＩＬ−４と結合しないことが示された。
【０１９２】
１０．４  ｍＡｂｄＡｂ発現における凝集レベルの分析
２９３ｆｅｃｔｉｎ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、１２３４７０１９）を用いて、ＢＰＣ１０９０、ＢＰＣ１０９１、ＢＰＣ１０９２、ＢＰＣ１０９３、ＢＰＣ１０９４およびＢＰＣ１０９５の重鎖および軽鎖をコードするｐＴＴプラスミドをＨＥＫ  ２９３  ６Ｅ細胞内に一過性共トランスフェクトして、実施例１０．２に上述したｍＡｂｄＡｂよりもわずかに多く（２００〜６００ｍｌ）発現させた。同じ方法論を用いてＢＰＣ１１１１およびＢＰＣ１０８５を独立してＨＥＫ２９３  ６Ｅ細胞内で一過性発現させた。上のトランスフェクションに使用したプラスミドは、ＥｎｄｏＦｒｅｅ  Ｐｌａｓｍｉｄ  Ｍａｘｉ  Ｋｉｔ（Ｑｉａｇｅｎ，１２３６２）を用いて生成した。
【０１９３】
２４時間後にトリプトン供給物を各細胞培養に添加して、７２時間後に細胞を回収した。抗体をプロテインＡカラムを用いて精製し、２８０ｎｍでの吸光度の読み取りにより定量化し、サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）により分析した。
【０１９４】
これらのｍＡｂｄＡｂを、独立して発現しているＢＰＣ２２２３、抗ＩＬ１３  ｍＡｂ（８２９）および抗Ｉｌ−１３  ｍＡｂ（５８６）と比較した。
【０１９５】
変異ｄＡｂを含むｍＡｂｄＡｂ（ＢＰＣ１０９０、ＢＰＣ１０９１、ＢＰＣ１０９３、ＢＰＣ１０９４およびＢＰＣ１０９５）と同様に、両抗体（オリジナルのＣＤＲＨ３を有する５８６および変異ＣＤＲＨ３を有する８２９）は低い凝集レベルを示した。オリジナルのｄＡｂを含む、すなわち８９位が変異していなかったＢＰＣ２２２３はＬ８９Ｈ変異を有するＢＰＣ１０９２よりも凝集レベルが高かった。代表的な凝集データを表８ｂに示す。
【表８ｂ】
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【０１９６】
１０．５  ＢＩＡｃｏｒｅ分析
ＢＩＡｃｏｒｅアッセイにおいて、精製されたｍＡｂおよびｍＡｂｄＡｂ構築物について、８９位の変異がｄＡｂのＩＬ−４への結合に対して何らかの影響を与えるかどうかを決定するために試験した。
【０１９７】
プロテインＡを第１級アミンカップリングによりＣＭ５チップ上に固定化した；この表面を、試験する抗体分子の捕捉表面として使用した。組換え大腸菌発現ヒトＩＬ４をアナライトとして２５６、６４、１６、４および１、０．２５および０．０６２５で使用し、０ｎＭ（すなわち緩衝液単独）を結合曲線の二重照合に使用した。抗プロテインＡ表面を５０ｍＭ  ＮａＯＨで再生した。ＨＢＳ−ＥＰをランニング緩衝液として用いてアッセイを２５℃で実行した。データは、Ｂｉａｃｏｒｅ  Ｔ１００分析ソフトウェアに固有の１：１モデルに適合させた。
【表８ｃ】
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【実施例１１】
【０１９８】
ＣＤＲＨ３変異型抗ＩＬ−１３  ｍＡｂおよび変異ｄＡｂを含む抗原結合タンパク質（ＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７）の構築および試験
１１．１構築および発現
代替プラスミド構築物を生成するための塩基構築物として抗ＩＬ−１３  ｍＡｂおよび抗ＩＬ−４ｄＡｂからなる重鎖をコードするプラスミドを使用した。２工程のクローニング戦略を要した。工程１では、ＨｉｎｄＩＩＩおよびＳｐｅＩを用いた制限クローニングにより、Ｈ鎖の抗ＩＬ１３  ｍＡｂ成分のＶＨをコードするＤＮＡ配列を別のヒト化抗ＩＬ１３抗体のＶＨ（配列番号５４）をコードするＤＮＡ配列と置換した。工程２では、ｍＡｂｄＡｂの抗ＩＬ４ｄＡｂ（ＤＯＭ９−１５５−１５４、配列番号８０）成分のＫａｂａｔ８９位でロイシンコードコドンを部位指向変異によりグルタミンに変異した。生成した重鎖ＤＮＡ配列はすべて配列番号９６、９８および１００に提示される。構築および発現した分子の一覧を表９に提供する。
【表９】
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【０１９９】
２９３ｆｅｃｔｉｎ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、１２３４７０１９）を用いて、ＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７  ｍＡｂｄＡｂをコードする重鎖および軽鎖発現プラスミドをＨＥＫ  ２９３６Ｅ細胞内に共トランスフェクトした。２４時間後にトリプトン供給物を各細胞培養に添加して、７２時間後に細胞を回収した。プロテインＡカラムを用いて抗体を精製後、結合アッセイにおいて試験した。
【０２００】
プロテインＡ親和性を用いてＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７  ｍＡｂｄＡｂを精製した。ＡＫＴＡ  Ｘｐｒｅｓｓ系上で１ｍｌプロテインＡカラム（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）を用いて、カラムをＰＢＳ（Ｇｉｂｃｏ／Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）中で平衡させて、Ｐｉｅｒｃｅ  ＩｇＧ溶出液を用いて抗体を溶出した。１Ｍトリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン緩衝液（通常５〜１０％ｖ／ｖ）を用いて溶出した留分を中和した。溶出した抗体留分をプールして、サイズ排除クロマトグラフィーにより凝集分析し、分光光度計を用いてＯＤ２８０ｎｍでの読み取りにより定量化した。
【０２０１】
これらを、表１０に記載する等価物ｍＡｂｄＡｂ（２２２２、２２２３、２２３０および２２３１）と比較した。これらは、以下を含む：
ｉ）ＢＰＣ２２２２、ＢＰＣ２２２３、ＢＰＣ２２３０およびＢＰＣ２２３１において「Ｌ」であり、ＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７において「Ｑ」である８９位を除きＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７に使用されるものと同一である１つのｄＡｂ。
【０２０２】
ｉｉ）同一リンカー
ｉｉｉ）ＢＰＣ２２２２、ＢＰＣ２２２３、ＢＰＣ２２３０およびＢＰＣ２２３１において「Ｙ」であり、ＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７において「Ｖ」である１００Ｂ位を除きＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７に使用されるものと同一である１つのＩＬ−１３  ｍＡｂ配列。
【表１０】
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【０２０３】
プロテインＡ親和性を用いてＢＰＣ２２２２、２２２３、２２３０および２２３１  ｍＡｂｄＡｂを精製した。ＡＫＴＡ  Ｘｐｒｅｓｓ系上で１ｍｌプロテインＡカラム（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）を用いて、カラムをＰＢＳ（Ｇｉｂｃｏ／Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）中で平衡させて、Ｐｉｅｒｃｅ  ＩｇＧ溶出液を用いて抗体を溶出した。１Ｍトリス（ヒドロキシメチル）アミノメタン緩衝液（通常５〜１０％ｖ／ｖ）を用いて溶出した留分を中和した。溶出した抗体留分をプールして、サイズ排除クロマトグラフィーにより凝集分析し、分光光度計を用いてＯＤ２８０ｎｍでの読み取りにより定量化した。
【０２０４】
ＢＰＣ２２２２、２２２３、２２３０および２２３１は３０〜４０％の凝集を示し、凝集した物質は１０分前に溶出した。
【０２０５】
サイズ排除クロマトグラフィーにより評価したところ、構築物ＢＰＣ１０８５、１０８６および１０８７はＢＰＣ２２２２、２２２３、２２３０および２２３１より低い凝集レベルを示した。これらの分子のＳＥＣプロファイルを図３〜９に示す。
【０２０６】
１１．２  ＩＬ−４結合ＥＬＩＳＡ
実施例１０．３に記載の方法に従った直接結合ＥＬＩＳＡにおいて、精製されたＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７  ｍＡｂｄＡｂのＩＬ−４への結合を試験した。
【０２０７】
これらのデータを図１０に示す。ＥＬＩＳＡ結果により、これらの精製されたｍＡｂｄＡｂはＩＬ−４と結合したことを確認した。陽性対照の抗ＩＬ−４  ｍＡｂおよびＢＰＣ２２３１もＩＬ−４への結合を示したのに対し、陰性対照ｍＡｂ（抗ＩＬ−１３  ｍＡｂ）はＩＬ−４と結合しないことが示された。これは、このＥＬＩＳＡにおいて、リンカーの長さをＧＳ（ＴＶＡＡＰＳＧＳ）からＧＳ（ＴＶＡＡＰＳＧＳ）２〜４に伸長時にｄＡｂ効能が向上したことを示した。
【０２０８】
１１．３  ＴＦ−１細胞増殖バイオアッセイにおけるＩＬ−４中和
ＴＦ−１細胞バイオアッセイにおいて、精製されたＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７  ｍＡｂｄＡｂのヒトＩＬ−４中和を試験した。
【０２０９】
ヒトＩＬ−４を含むいくつかの異なるサイトカインに対する反応においてＴＦ−１細胞は増殖する。したがってＩＬ−４のためのこれらの細胞の増殖反応を用いてＩＬ−４の生体活性を測定し、続いてアッセイを開発してｍＡｂｄＡｂのＩＬ−４中和効能（ＩＬ−４生体活性の阻害）を決定することができる。
【０２１０】
アッセイは滅菌９６ウェル組織培養プレートにおいて滅菌条件下で実施して、すべての試験ウェルは二連で実施した。約２．２ｎｇ／ｍｌの組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−４を様々な希釈のｍＡｂｄＡｂ（通常３倍希釈液で滴定した、５６０ｎＭ〜０．００９ｎＭ）の総体積１２０μｌと３７℃で１時間プレインキュベートした。無関係な特異性抗体を陰性対照（抗ＩＬ１３  ｍＡｂ）として同様に滴定した。次いでこれらの試料５０μｌを、滅菌９６ウェル組織培養プレート中ＴＦ−１細胞５０μｌ（濃度２×１０５細胞／ｍｌ）に添加した。したがって最終１００μｌアッセイ体積には、様々な希釈のｍＡｂｄＡｂ（３倍希釈液で滴定した最終濃度２７０ｎＭ〜０．００５ｎＭ）、組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−４（最終濃度１．１ｎｇ／ｍｌ）およびＴＦ−１細胞（最終濃度１×１０５細胞／ｍｌ）を含有した。アッセイプレートは加湿ＣＯ２インキュベーター内で３７℃で約４日間インキュベートした。次いでＰｒｏｍｅｇａ製「Ｃｅｌｌ  Ｔｉｔｒｅ９６（登録商標）Ｎｏｎ−Ｒａｄｉｏａｃｔｉｖｅ  Ｃｅｌｌ  Ｐｒｏｌｉｆｅｒａｔｉｏｎ  Ａｓｓａｙ」（カタログ番号Ｇ４１００）を製造業者の説明書に記載どおりに用いて、細胞増殖量を決定した。９６ウェルプレート中の試料の吸光度はプレートリーダーで５７０ｎｍで読み取った。これらのデータをエクセルシートに入力し、２回の試験ウェル値を平均化して、平均背景値（ｍＡｂ−ｄＡｂなしおよびＩＬ−４試験ウェルなし）を差し引いた。
【０２１１】
組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−４の生体活性を中和するｍＡｂｄＡｂの能力は定義した量のヒトＩＬ−４（１．１ｎｇ／ｍｌ）の生体活性を５０％中和するために必要なｍＡｂ−ｄＡｂ濃度（＝ＮＤ５０）として表した。必要なｍＡｂｄＡｂ濃度が低いほど、中和能力は強力である。本明細書に提供するＮＤ５０データ（表１１）はエクセルのＲｏｂｏｓａｇｅ関数を用いて算出した。これらのデータを図１１に図式的に表す。
【０２１２】
ＴＦ−１細胞バイオアッセイにおいて、抗ＩＬ−４  ｍＡｂおよびＤＯＭ９−１５５−１５４（配列番号８０）をヒトおよびカニクイザルＩＬ−４中和の陽性対照として含んだ。さらに、ＴＦ−１細胞バイオアッセイにおいて、無関係な抗原（ダミーｄＡｂ）に特異的なｄＡｂもヒトまたはカニクイザルＩＬ−４中和の陰性対照として含んだ。
【０２１３】
これらを数回反復し、これらの実験の１つの結果を図１１に示す。ＮＤ５０値をデータセットから算出した。ＮＤ５０値は、ＩＬ−４の生体活性を５０％中和できるｍＡｂｄＡｂまたはｍＡｂまたはｄＡｂ濃度である。平均ＮＤ５０値および試験回数（ｎ）を表１１に示す。
【表１１】
0005919188.tif 000018
【０２１４】
これらのデータにより、精製されたＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７  ｍＡｂｄＡｂは、ヒトおよびカニクイザルＩＬ−４の生体活性を中和したことを確認した。抗ＩＬ−４  ｍＡｂおよびＤＯＭ９−１５５−１５４もヒトおよびカニクイザルＩＬ−４の生体活性を中和し、陰性ｄＡｂ（ダミーｄＡｂ）は同じバイオアッセイにおいて中和を示さなかった。
【０２１５】
全３つのｍＡｂｄＡｂは良好な効能を示し、リンカーの長さが伸びるにつれてｄＡｂ効能の明らかな増大傾向があることが中和アッセイから明らかであった（ただし、より粗いＥＬＩＳＡではこの効能差が見出されなかった）。陰性対照の抗ＩＬ−４  ｍＡｂは同じバイオアッセイにおいて中和を示さなかった。
【０２１６】
１１．４  ＴＦ−１細胞増殖バイオアッセイにおけるヒトＩＬ−１３の中和
ＴＦ−１細胞バイオアッセイにおいて、精製されたＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７  ｍＡｂｄＡｂのヒトＩＬ−１３の中和を下記のとおり試験した。
【０２１７】
ＴＦ−１細胞はいくつかの異なるサイトカイン（ヒトＩＬ−１３を含む）に対する反応において増殖する。したがってＩＬ−１３のためのこれらの細胞の増殖反応を用いてＩＬ−１３の生体活性を測定し、続いてアッセイを開発してｍＡｂｄＡｂのＩＬ−１３中和効能（ＩＬ−１３生体活性の阻害）を決定することができる。
【０２１８】
アッセイは滅菌９６ウェル組織培養プレートにおいて滅菌条件下で実施して、すべての試験ウェルは二連で実施した。約１４ｎｇ／ｍｌの組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−１３を様々な希釈のｍＡｂｄＡｂ（通常３倍希釈液で滴定した５６０ｎＭ〜０．００９ｎＭ）の総体積１２０μｌと３７℃で１時間プレインキュベートした。無関係な特異性の抗体およびｄＡｂを陰性対照として同様に滴定した（それぞれ抗ＩＬ−４  ｍＡｂおよびＤＯＭ９−１５５−１５４）。次いでこれらの試料５０μｌを、滅菌９６ウェル組織培養プレート中ＴＦ−１細胞５０μｌ（濃度２×１０５細胞／ｍｌ）に添加した。したがって最終１００μｌアッセイ体積には様々な希釈のｍＡｂｄＡｂ（３倍希釈液で滴定した最終濃度２７０ｎＭ〜０．００５ｎＭ）、組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−１３（最終濃度７ｎｇ／ｍｌ）およびＴＦ−１細胞（最終濃度１×１０５細胞／ｍｌ）を含有した。アッセイプレートは加湿ＣＯ２インキュベーター内で３７℃で約４日間インキュベートした。次いでＰｒｏｍｅｇａ製「Ｃｅｌｌ  Ｔｉｔｒｅ９６（登録商標）Ｎｏｎ−Ｒａｄｉｏａｃｔｉｖｅ  Ｃｅｌｌ  Ｐｒｏｌｉｆｅｒａｔｉｏｎ  Ａｓｓａｙ」（カタログ番号Ｇ４１００）を製造業者の説明書に記載どおりに用いて、細胞増殖量を決定した。９６ウェルプレート中の試料の吸光度はプレートリーダーで５７０ｎｍで読み取った。これらのデータをエクセルシートに入力し、２回の試験ウェル値を平均化して、平均背景値（ｍＡｂ−ｄＡｂなしおよびＩＬ−１３試験ウェルなし）を差し引いた。
【０２１９】
組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−１３の生体活性を中和するｍＡｂｄＡｂの能力は定義した量のヒトＩＬ−１３（７ｎｇ／ｍｌ）の生体活性を５０％中和するために必要なｍＡｂ−ｄＡｂ濃度（＝ＮＤ５０）として表した。必要なｍＡｂｄＡｂ濃度が低いほど、中和能力は強力である。本明細書に提供するＮＤ５０データ（表１２）はエクセルのＲｏｂｏｓａｇｅ関数を用いて算出した。これらのデータを図１２に図式的に表す。
【０２２０】
ＴＦ−１細胞バイオアッセイにおいて、ヒトＩＬ−１３中和の陽性対照として抗ＩＬ−１３  ｍＡｂ（配列番号２２および２４）を含んだ。さらに、抗ＩＬ−４  ｍＡｂも陰性対照として含んだ。
【０２２１】
図１２は、ＴＦ−１細胞中和アッセイ結果を示す。ＮＤ５０値をデータセットから算出した。ＮＤ５０値は、ＩＬ−１３の生体活性を５０％中和できるｍＡｂｄＡｂまたはｍＡｂまたはｄＡｂ濃度である。
【０２２２】
平均ＮＤ５０値および試験回数を表１２に示す。
【表１２】
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【０２２３】
これらのデータにより、精製されたＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７  ｍＡｂｄＡｂは組換えヒトおよびカニクイザルＩＬ−１３の生体活性を中和したことが確認される。陰性対照の抗ＩＬ−４  ｍＡｂは同じバイオアッセイにおいて中和を示さなかった。
【実施例１２】
【０２２４】
抗ＩＬ−１３  ｍＡｂ軽鎖の再ヒト化
１２．１再ヒト化
一部の抗ＩＬ−１３  ｍＡｂ−抗ＩＬ−４ｄＡｂ分子（ＢＰＣ１０８５）の発現を改善するために、マウス抗体６Ａ１の軽鎖ＣＤＲ（配列番号５９に説明される軽鎖）を新規フレームワーク上に再グラフト化した。ＰＣＲベース戦略およびオリゴヌクレオチド重複を用いてコドン至適化軽鎖可変領域配列（表１３に要約する）をｄｅ  ｎｏｖｏで構築した。ＰＣＲプライマーはシグナル配列（配列番号５６）を組み込み、ＶＬドメインを枠組みするように設計されたＨｉｎｄＩＩＩおよびＢｓｉＷＩ制限部位を含むように設計し、ヒトκＣ領域を含むｐＴＴおよびＲｌｎ哺乳動物発現ベクター内へのクローニングを可能にした。構築されている再ヒト化軽鎖を表１３に要約する。
【表１３】
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【０２２５】
１２．２  ＨＥＫ  ２９３  ６Ｅ細胞における分子発現
再ヒト化軽鎖の発現特性を初めにｍＡｂ型式において検討した。２９３ｆｅｃｔｉｎ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、１２３４７０１９）を用いて、Ａ１Ｙ１００ＢＶＡＬ１（配列番号５４）重鎖をコードするプラスミド、既存の軽鎖（配列番号２４）および再ヒト化軽鎖をＨＥＫ  ２９３  ６Ｅ細胞内に一過性共トランスフェクトした。プラスミドは少量（２×０．７５ｍｌ培養体積）発現して抗体を産生した。２４時間後にトリプトン供給物を細胞培養に添加して、さらに７２時間後に細胞を回収した。構築して発現したｍＡｂのすべてを表１４に要約する。
【表１４】
0005919188.tif 000021
【０２２６】
Ｇｙｒｏｌａｂワークステーションを用いた定量免疫アッセイにより、抗体発現を組織培養上清から直接評価した。再ヒト化軽鎖を含む抗体ＢＰＣ３２０８およびＢＰＣ３２１１（それぞれＰ０およびＰ１で示す）は、Ａ１Ｙ１００ＢＶＡＬ１  ｍＡｂより改善された発現収率を示した。Ｑ０およびＱ１軽鎖（ＢＰＣ３２１９およびＢＰＣ３２２０）は抗ＩＬ−１３  ｍＡｂの発現を改善しなかった。発現データを表１５に提示する。
【表１５】
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【０２２７】
１２．３  ＨＥＫ  ２９３  ６Ｅ細胞内のｍＡｂ−ｄＡｂ発現
ＢＰＣ３２０８およびＢＰＣ３２１１の再ヒト化軽鎖は抗ＩＬ−１３  ｍＡｂの改善された発現を示したため、それらを抗ＩＬ−１３ｍＡｂ−抗ＩＬ−４ｄＡｂとの関連で検討した。２９３ｆｅｃｔｉｎ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、１２３４７０１９）を用いて、再ヒト化軽鎖Ｐ０およびＰ１ならびに５８６（Ｌ１）軽鎖を８２９Ｈ−ＧＳ（ＴＶＡＡＰＳＧＳ）２−２５６重鎖（配列番号９６、詳細は表１６に要約する）とＨＥＫ  ２９３  ６Ｅ細胞内に共トランスフェクトした。プラスミドを５０〜５００ｍｌ発現させて、抗体分子を産生した。２４時間後にトリプトン供給物を細胞培養に添加して、さらに４８時間後に細胞を回収した。固定化プロテインＡカラムを用いて抗体を精製して、吸光度を２８０ｎｍで読み取ることにより定量化し、指定の場合、精製された抗体分子を以下に説明する実施例に記載のアッセイにおいて評価した。図１３および１４に例証するとおりＢＰＣ３２１４およびＢＰＣ３２１５をサイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）により分析した。
【表１６】
0005919188.tif 000023
【０２２８】
ｍＡｂ型式における観察と一致して、再ヒト化軽鎖を含むｍＡｂｄＡｂ（ＢＰＣ３２１４およびＢＰＣ３２１５）は、ＢＰＣ１０８５より改善された発現を示した。代表的な発現データを表１７  ５に要約する。
【表１７】
0005919188.tif 000024
【０２２９】
１２．４  ヒトＩＬ−１３結合ＥＬＩＳＡ
直接結合ＥＬＩＳＡを介して、精製されたＢＰＣ３２１４およびＢＰＣ３２１５のヒトＩＬ−１３への結合についてＢＰＣ１０８５（実施例１０に記載）と比較して試験した。抗ＩＬ−１３  ｍＡｂ  Ａ１Ｙ１００ＢＶＡＬ１および抗ＩＬ−４  ｍＡｂもそれぞれ陽性対照および陰性対照として検討した。組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−１３（バッチ番号ＧＲＩＴＳ３１０６１）５μｇ／ｍｌを９６ウェル高結合プレート５０μｌ／ウェルにコーティングして、＋４℃で一晩インキュベートした。続く工程をすべて室温で行った。プレートを０．０５％のＴｗｅｅｎ−２０含有リン酸緩衝食塩水で３回洗浄した。１００μＬブロック溶液（０．０５％のＴｗｅｅｎ−２０含有１％ＢＳＡのリン酸緩衝食塩水）を各ウェルに添加して、プレートを室温で少なくとも１時間インキュベートした。次いで別の洗浄工程を実施した。引き続いて精製された抗体をプレート全体でブロック溶液で希釈した。１時間インキュベーション後、プレートを洗浄した。ヤギ抗ヒトκ軽鎖特異的ペルオキシダーゼ抱合抗体をブロック溶液で０．７５μｇ／ｍｌに希釈して、５０μｌを各ウェルに添加した。プレートを１時間インキュベートした。さらに２つの洗浄工程後、５０μｌのＯＰＤ（ｏ−フェニレンジアミン二塩酸塩）ＳｉｇｍａＦａｓｔ基質溶液を各ウェルに添加して、３Ｍ硫酸５０μＬを添加することによって反応を停止させた。基本終点プロトコルを用いて、ＶｅｒｓａＭａｘマイクロプレートリーダー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ）を用いて吸光度を４９０ｎｍで読み取った。これらのデータを図１５に示す。直接結合ＥＬＩＳＡにより、ＢＰＣ３２１４およびＢＰＣ３２１５はヒトＩＬ−１３と結合することを確認した。ＢＰＣ３２１４およびＢＰＣ３２１５はＢＰＣ１０８５と類似のＩＬ−１３結合効能を示す。陽性対照の抗ＩＬ−１３  ｍＡｂ  Ａ１Ｙ１００ＢＶＡＬ１も組換えＩＬ−１３への結合を示したのに対し、陰性対照の抗ＩＬ−４  ｍＡｂはヒトＩＬ−１３と結合しないことが示された。
【０２３０】
１２．５  ヒトＩＬ−４結合ＥＬＩＳＡ
直接結合ＥＬＩＳＡにおいて、精製されたＢＰＣ３２１４およびＢＰＣ３２１５の組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−４への結合も試験した。ＥＬＩＳＡを実施例４に記載のように実施し、組換え大腸菌発現ヒトＩＬ−４  ５μｇ／ｍｌを９６ウェル高結合プレート５０μｌ／ウェルにコーティングして、＋４℃で一晩インキュベートした。これらのデータを図１６に示す。直接結合ＥＬＩＳＡにより、ＢＰＣ３２１４およびＢＰＣ３２１５はヒトＩＬ−４と結合することが確認される。ＢＰＣ１０８５も検討した。ＢＰＣ３２１４はＢＰＣ１０８５と類似のＩＬ−４結合効能を示す。陽性対照の抗ＩＬ−４  ｍＡｂも組換えＩＬ−４への結合を示したのに対し、陰性対照の抗ＩＬ−１３  ｍＡｂ  Ａ１Ｙ１００ＢＶＡＬ１はヒトＩＬ−４に対して結合しないことが示された。
【実施例１３】
【０２３１】
ＢＩＡｃｏｒｅ（商標）分析により評価したオリジナルのＩＬ−１３  ｍＡｂ  ＣＤＲＨ３を含むｍＡｂｄＡｂ（ＢＰＣ２２２２、ＢＰＣ２２２３およびＢＰＣ２２３０〜２２３１）のＩＬ−１３およびＩＬ−４結合親和性
方法
プロテインＡを第１級アミンカップリングによりＣ１チップ上に固定化した；この表面を、試験する抗体分子の捕捉表面として使用した。組換え大腸菌発現ヒトＩＬ１３を２５６、６４、１６、４、および１ｎＭで使用し、組換え大腸菌発現ヒトＩＬ４を６４、１６、４、１および０．２５ｎＭで使用し、０ｎＭ（すなわち緩衝液単独）をＩＬ４結合とＩＬ１３結合の両方の結合曲線の二重照合に使用した。プロテインＡ表面を１００ｍＭリン酸で再生した。ＨＢＳ−ＥＰをランニング緩衝液として用いてアッセイを２５℃で実行した。データは、Ｂｉａｃｏｒｅ  Ｔ１００分析ソフトウェアに固有の１：１モデルに適合させた。
【０２３２】
ヒトＩＬ１３への結合結果を表１８に示し、ヒトＩＬ４への結合結果を表１９に示す。
【表１８】
0005919188.tif 000025
【０２３３】
【表１９】
0005919188.tif 000026
【実施例１４】
【０２３４】
ＢＩＡｃｏｒｅ（商標）分析により評価したオリジナルのＩＬ−１３  ｍＡｂ  ＣＤＲＨ３を含むｍＡｂｄＡｂ（ＢＰＣ２２２２、ＢＰＣ２２３１）および変異型抗ＩＬ−１３  ｍＡｂ  ＣＤＲＨ３（ＢＰＣ１０８５〜１０８７）のＩＬ−１３およびＩＬ−４結合親和性
方法
プロテインＡを第１級アミンカップリングによりＣＭ５チップ上に固定化した；この表面を、試験する抗体分子の捕捉表面として使用した。組換え大腸菌発現ヒトＩＬ１３を２５６ｎＭのみで使用し、組換え大腸菌発現ヒトＩＬ４を６４、１６、４および１ｎＭで使用し、０ｎＭ（すなわち緩衝液単独）をＩＬ４結合とＩＬ１３結合の両方の結合曲線の二重照合に使用した。プロテインＡ表面を５０ｍＭ  ＮａＯＨで再生した。ＨＢＳ−ＥＰをランニング緩衝液として用いてアッセイを２５℃で実行した。データは、Ｂｉａｃｏｒｅ  Ｔ１００分析ソフトウェアに固有の１：１モデルに適合させた。
【０２３５】
ヒトＩＬ１３への結合結果を表２０に示し、ヒトＩＬ４への結合結果を表２１に示す。
【表２０】
0005919188.tif 000027
【０２３６】
ＢＰＣ１０８６およびＢＰＣ１０８７の結合速度はＢｉａｃｏｒｅの感度外であるが、我々がこのデータを精密に分析できないという事実から、ＩＬ４との相互作用は速い結合速度での高親和性のものである可能性が高いことが示される。
【表２１】
0005919188.tif 000028
【実施例１５】
【０２３７】
ＢＩＡｃｏｒｅ（商標）分析により評価したいくつかの変異型抗ＩＬ−１３  ｍＡｂ  ＣＤＲＨ３を含むｍＡｂｄＡｂ（ＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０９０−ＢＰＣ１０９５、およびＢＰＣ１１０８−ＢＰＣ１１１９）のＩＬ−４結合親和性
方法（ヒトＩＬ−４結合親和性）
プロテインＡを第１級アミンカップリングによりＣＭ５チップ上に固定化した；この表面を、試験する抗体分子の捕捉表面として使用した。
【０２３８】
組換え大腸菌発現ヒトＩＬ４を６４、１６、４、１および０．２５ｎＭで使用した。すべての結合曲線を０ｎＭ注入（すなわち緩衝液単独）で二重照合した。
【０２３９】
プロテインＡ表面を５０ｍＭ  ＮａＯＨで再生した。ＨＢＳ−ＥＰをランニング緩衝液として用いてアッセイを２５℃で実行した。データは、Ｂｉａｃｏｒｅ  Ｔ１００分析ソフトウェアに固有の１：１モデルに適合させた。
【０２４０】
ヒトＩＬ４への結合結果を表２２に示す。
【表２２】
0005919188.tif 000029
【実施例１６】
【０２４１】
ＢＩＡｃｏｒｅ（商標）分析により評価して、オリジナルの軽鎖（ＢＰＣ１０８５）と比較した再ヒト化軽鎖を含むｍＡｂｄＡｂ（ＢＰＣ３２１４およびＢＰＣ３２１５）のＩＬ−１３結合親和性
方法（ヒトおよびカニクイザルＩＬ−１３結合親和性）
プロテインＡを第１級アミンカップリングによりＣＭ５チップ上に固定化した；この表面を、試験する抗体分子の捕捉表面として使用した。
【０２４２】
組換え大腸菌発現ヒトＩＬ１３およびカニクイザルＩＬ１３を６４、１６、４、１および０．２５ｎＭ使用した。すべての結合曲線を０ｎＭ注入（すなわち緩衝液単独）で二重照合した。
【０２４３】
プロテインＡ表面を５０ｍＭ  ＮａＯＨで再生した。ＨＢＳ−ＥＰをランニング緩衝液として用いてアッセイを２５℃で実行した。データは、Ｂｉａｃｏｒｅ  Ｔ１００分析ソフトウェアに固有の１：１モデルに適合させた。
【０２４４】
ヒトおよびカニクイザルＩＬ１３への結合結果を表２３に示す。
【表２３】
0005919188.tif 000030
【実施例１７】
【０２４５】
変異ｄＡｂを伴うおよび伴わないｍＡｂｄＡｂのストレッサー試験
いくつかのｍＡｂｄＡｂをＰＢＳまたは５０ｍＭ酢酸緩衝液に入れて、３７℃で最大１４日間インキュベートした。次いで、視認可能な沈殿物の存在、溶解性凝集および濃度安定性アドヒアランスについて分析した。
【０２４６】
結果により、変異ｄＡｂを含むｍＡｂｄＡｂ（ＢＰＣ２２２２、２２２３、２２３０、２２３１）は、非変異ｄＡｂ（ＢＰＣ１０８５、１０８６、１０８７）と同様に動作することが示され、両種類のｍＡｂｄＡｂはＰＢＳと酢酸緩衝液の両方において３７℃、２週間のインキュベーション期間に溶液中のタンパク質濃度に変化がなかったことから、安定していると思われた。加えて溶液中の凝集レベルには変化はないかほとんど認められず、沈殿は観察されなかった。
【実施例１８】
【０２４７】
ＰＫ評価
ラットへのＩＶ投与後の分離した試験において、ＢＰＣ１０８５、ＢＰＣ１０８６、およびＢＰＣ１０８７の薬力学を調査した。ＢＰＣ１０８５のＰＫもカニクイザルへのＩＶ投与後に調査した。
【０２４８】
ラットにおける全３分子およびサルにおけるＢＰＣ１０８５のＰＫが標準的ｍＡｂのＰＫと一致することを見出した。
【表２４】
0005919188.tif 000031
【０２４９】
0005919188.tif 000032
【０２５０】
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【０２５１】
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【０２５２】
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【０２５３】
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【０２５４】
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【０２５５】
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【０２５６】
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【０２５７】
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【０２５８】
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【０２５９】
0005919188.tif 000042
【０２６０】
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【０２６１】
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【０２６２】
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【０２６３】
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【０２６４】
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【０２６５】
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【０２６６】
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【０２６７】
0005919188.tif 000050
【０２６８】
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【０２６９】
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【０２７０】
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【０２７１】
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【０２７２】
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【０２７３】
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【０２７４】
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【０２７５】
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【０２７６】
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【０２７７】
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【０２７８】
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【０２７９】
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【０２８０】
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【０２８１】
0005919188.tif 000064
【０２８２】
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【０２８３】
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【０２８４】
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【０２８５】
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【０２８６】
0005919188.tif 000069
【０２８７】
0005919188.tif 000070
【０２８８】
0005919188.tif 000071
【図１】
0005919188.tif 000072
【図２】
0005919188.tif 000073
【図３】
0005919188.tif 000074
【図４】
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【図５】
0005919188.tif 000076
【図６】
0005919188.tif 000077
【図７】
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【図８】
0005919188.tif 000079
【図９】
0005919188.tif 000080
【図１０】
0005919188.tif 000081
【図１１】
0005919188.tif 000082
【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
0005919188.tif 000087
【図１７】
0005919188.tif 000088
【配列表】
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