(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
修飾型一本鎖オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、前記修飾型オリゴヌクレオチドが配列番号２６からなる核酸塩基配列を有する２０個の連結ヌクレオシドからなり、
前記修飾型オリゴヌクレオチドが、
１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
５個の連結ヌクレオシドからなる５’ウイングセグメント；および
５個の連結ヌクレオシドからなる３’ウイングセグメント；
を含み、
前記ギャップセグメントが前記５’ウイングセグメントと前記３’ウイングセグメントの間に位置し、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドが２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖を含み、前記修飾型オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であり、前記修飾型オリゴヌクレオチドの各シトシン残基が５−メチルシトシンである、前記の化合物。
【請求項２】
前記化合物が複合体化されている、請求項１に記載の化合物。
【請求項３】
前記化合物が、前記修飾型オリゴヌクレオチドの塩を含む、請求項１または２に記載の化合物。
【請求項４】
前記塩が、ナトリウム塩またはカリウム塩である、請求項３に記載の化合物。
【請求項５】
請求項１〜４のいずれか一項に記載の化合物および少なくとも１の薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む、組成物。
【請求項６】
ａ）動物におけるＰＴＰ１Ｂに関する疾患または状態を予防するか、治療するか、改善するか、その疾患または状態の進行を遅らせるか、またはその疾患または状態の開始を遅延させる際に使用するための、または
ｂ）動物における血中グルコースレベルの増加を予防するかまたはその増加の開始を遅らせる際に使用するための、
請求項１〜４のいずれか１項に記載の化合物を含む医薬組成物。
【請求項７】
ａ）前記動物がヒトである、
ｂ）前記動物が糖尿病動物である、および／または
ｃ）血中グルコースレベルが血漿グルコースレベルまたは血清グルコースレベルである、
請求項６に記載の医薬組成物。
【請求項８】
前記疾患または状態が
ａ）糖尿病、場合により２型糖尿病；または
ｂ）肥満；
である、請求項６に記載の医薬組成物。
【請求項９】
前記化合物または組成物を第２の薬剤とともに共投与し、そして、場合により、前記化合物または組成物と前記第２の薬剤が同時投与される、請求項６〜８のいずれかに記載の医薬組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
配列表
本願は電子形式の配列表と共に出願される。その配列表は、２０１２年４月１２日に作製されたＢＩＯＬ０１４９ＷＯＳＥＱ．ｔｘｔという表題の、サイズが１１１Ｋｂであるファイルとして提供される。配列表の電子形式の情報は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０００２】
分野
動物においてＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡとタンパク質の発現を低減させる方法、化合物および組成物が本明細書において提供される。そのような方法、化合物および組成物は、例えば、代謝性疾患、特に、糖尿病に関連する障害の治療、予防、遅延化または改善に有用である。
【背景技術】
【０００３】
タンパク質チロシンホスファターゼ１Ｂ（ＰＴＰ１Ｂ）は、ＰＴＰファミリーに属する（Barfordら, Science 1994. 263: 1397-1404）細胞質内酵素である（Neel and Tonks, Curr. Opin. Cell Biol. 1997. 9: 193-204）。ＰＴＰ１Ｂは、肝臓、筋肉および脂肪などの主要なインスリン代謝調整因子である組織を含め遍在的に発現し（Goldstein, Receptor 1993. 3: 1-15）、そこでＰＴＰ１Ｂは主なＰＴＰ酵素である。
【０００４】
ＰＴＰ１Ｂは、インスリンシグナル伝達の負の調節因子と考えられている。ＰＴＰ１Ｂはインスリン受容体と相互作用して脱リン酸化するので、インスリンシグナル伝達を弱化させ、停止させる可能性もある。（Goldsteinら, J. Biol. Chem. 2000. 275: 4383-4389）。インスリンシグナル伝達におけるＰＴＰ１Ｂの生理学的役割は、ノックアウトマウスモデルで証明されている。ＰＴＰ１Ｂ遺伝子が欠失したマウスでは、インスリン抵抗性および肥満が予防された（Elcheblyら, Science 1999. 283: 1544-1548）。ＰＴＰ１Ｂ欠損マウスは、低肥満であり、基礎代謝率並びに総エネルギー消費量が増加し、食餌誘発性肥満が予防された。インスリン刺激性グルコース取込みは骨格筋では増加したが、脂肪組織は影響を受けず、ＰＴＰ１Ｂ欠損マウスにおけるインスリン感受性の増加が組織特有である証拠が提供された（Klamanら, Mol. Cell. Biol. 2000. 20: 5479-5489）。これらのマウスは表現型的には正常であり、食餌誘発性肥満、インスリン抵抗性に対する耐性もあり、高脂肪食でトリグリセリドレベルが有意に低かった。従って、ＩＩ型糖尿病、メタボリックシンドローム、糖尿病性異脂肪血症または関連の代謝性疾患の患者におけるＰＴＰ１Ｂの阻害は有益であろう。
【０００５】
ＰＴＰ１Ｂのアンチセンス阻害は、アンチセンス阻害剤が化合物のタンパク質への競合的結合に依存せず、ＰＴＰ１Ｂの発現を低減させることによって活性を直接阻害するという点で、従来の小分子阻害剤に対して独特な利点を提供する。アンチセンス技術は、ある遺伝子産物の発現を低減させるための有効な手段として現れつつあり、したがって、それはＰＴＰ１Ｂの調節について多数の治療上、診断上および研究上の応用で独自の有用性が判明し得る。
【０００６】
代謝性障害の治療にとって許容できる選択肢は現在のところ無い。それ故、そのような疾患および障害の治療用の化合物および方法を提供することが、本願の１つの目的である。
【０００７】
本願で引用される、特許、特許出願、記事、書籍および学術論文を含むが、これらに限定されないあらゆる文書、または文書の一部が、本明細書で考察される文書の一部ならびにそれらの全体についての参照により明確に本明細書に組み込まれる。
【発明の概要】
【０００８】
ＰＴＰ１Ｂ発現の調節のための、ならびに代謝性障害、特に、糖尿病関連障害および／またはその症状の治療、予防、遅延化または改善のための方法、化合物および組成物が本明細書で提供される。
【図面の簡単な説明】
【０００９】
本発明の多数の目的および利点は、添付の図面を参照することにより、当業者にはよりよく理解されよう。
【図１】ＰＴＰ１ＢアンチセンスオリゴヌクレオチドＩＳＩＳ４０４１７３およびＩＳＩＳ１４２０８２のウェスタンブロットを示し、８ｍｇｋ／週でＰＴＰ１Ｂタンパク質の発現が低減し、かかる化合物の効力が示されている。表４７参照。
【図２】カニクイザルの主要な忍容性の研究の集計表である（実施例１７参照）。
【図３】用量反応前臨床試験におけるヒトＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの減少のグラフ表示である。ＩＳＩＳ４０４１７３での処置を以前の臨床候補のＩＳＩＳ１１３７１５での処置と比較した。ここに示すように、ＩＳＩＳ４０４１７３を用いた投与は、ＩＳＩＳ１１３７１５を用いた投与と比べて効力が高く、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルの有意な低下をもたらした。特に、０．３μＭ用量で、ＩＳＩＳ４０４１７３ではＩＳＩＳ１１３７１５と比べてＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルが５倍減少した。
【発明を実施するための形態】
【００１０】
特許請求の範囲で請求されるように、前述の概要および下記の詳細な説明の両方が例示および説明のみを目的とし、本発明を限定するものではないことが理解されるものとする。本明細書において、単数形の使用は、別途特に明言されない限り、複数形を包含する。本明細書で使用される場合、「または（or）」の使用は、別途明言されない限り、「および／または（and/or）」を意味する。さらに、「含んでいる（including）」という用語ならびに「含む（includes）」および「含んだ（included）」などの他の語形の使用は非限定的である。また、「要素（element）」または「成分（component）」などの用語は、別途特に明言されない限り、１つの単位を含む複数の要素および成分ならびに１つより多い副単位を含む複数の要素および成分の両方を包含する。
【００１１】
本明細書で使用されている項目は文書の構成のみを目的としており、記載内容を限定するものと解釈されてはならない。本願で引用される、特許、特許出願、記事、書籍および学術論文を含むが、これらに限定されないあらゆる文書、または文書の一部が、本明細書で考察される文書の一部ならびにそれらの全体についての参照により明示的に本明細書に組み込まれる。
【００１２】
定義
特定の定義が提供されない限り、本明細書に記載される、分析化学、合成有機化学および医化学および薬化学に関連して使用される命名法、およびそれらの方法および技術は周知であり、当技術分野において一般に使用される。化学合成および化学分析に標準的な技法を使用することができる。許される場合、本願で引用される、あらゆる特許、特許出願、特許出願公開、および他の論文発表、ＧＥＮＢＡＮＫ受託番号、および国立生物工学情報センター（ＮＣＢＩ）などのデータベースから得ることができる関連の配列情報、および本開示を通して参照される他のデータを含むが、これらに限定されないあらゆる文書、または文書の一部が、本明細書で考察される文書の一部ならびにそれらの全体について、参照により本明細書に組み込まれる。
【００１３】
特定の定義が提供されない限り、本明細書に記載される、分析化学、合成有機化学および医化学および薬化学に関連して使用される命名法、およびそれらの方法および技術は周知であり、当技術分野において一般に使用される。化学合成および化学分析に標準的な技法を使用することができる。許される場合、あらゆる特許、特許出願、特許出願公開、および他の発表論文、ＧＥＮＢＡＮＫ受託番号、および国立生物工学情報センター（ＮＣＢＩ）などのデータベースから得ることができる関連の配列情報、および本開示を通して参照される他のデータが、本明細書で考察される文書の一部ならびにそれらの全体について、参照により本明細書に組み込まれる。
【００１４】
別途指示されない限り、以下の用語は次の意味を有する。
【００１５】
「２’−Ｏ−メトキシエチル」（２’−ＭＯＥおよび２’−Ｏ（ＣＨ２）２−ＯＣＨ３も）はフロシル環の２’位のＯ−メトキシ−エチル修飾を指す。２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖は修飾型糖である。
【００１６】
「２’−Ｏ−メトキシエチルヌクレオチド」は２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖部分を含むヌクレオチドを意味する。
【００１７】
「３’標的部位」は、特定のアンチセンス化合物の最も３’側のヌクレオチドに相補的な標的核酸のヌクレオチドを指す。
【００１８】
「５’標的部位」は、特定のアンチセンス化合物の最も５’側のヌクレオチドに相補的な標的核酸のヌクレオチドを指す。
【００１９】
「５−メチルシトシン」は、５’位に結合したメチル基で修飾されたシトシンを意味する。５−メチルシトシンは修飾型核酸塩基である。
【００２０】
「約」はある値の±１０％以内を意味する。例えば、「マーカーが約５０％増加し得る」と記述される場合、それは、そのマーカーが４５％〜５５％だけ増加し得ることを暗に意味する。
【００２１】
「活性薬剤」は、個体に投与されると治療上の利益をもたらす医薬組成物中の単数の物質または複数の物質を意味する。例えば、ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが活性薬剤である。
【００２２】
「活性標的領域」または「標的領域」は１つ以上の活性アンチセンス化合物が標的とする領域を意味する。「活性アンチセンス化合物」は、標的核酸レベルまたはタンパク質レベルを低減させるアンチセンス化合物を意味する。
【００２３】
「脂肪形成」は前脂肪細胞からの脂肪細胞の発生を意味する。「脂質生成」は脂肪の産生または形成、脂肪変性または脂肪浸潤のどちらかを意味する。
【００２４】
「肥満症」または「肥満」は、肥満である状態、すなわち、除脂肪体重に比して非常に大量の体脂肪または脂肪組織がある状態を指す。体脂肪の量には身体での脂肪の分布および貯蔵脂肪組織のサイズと質量の両方に対する問題が含まれる。体脂肪分布は、皮下脂肪の測定値、腹囲対臀囲比、または超音波、コンピュータ断層法もしくは核磁気共鳴画像法などの技術によって推定することができる。疾病予防管理センターによれば、３０以上のボディマス指数（ＢＭＩ）を有する個体は肥満であるとみなされている。「肥満」という用語は、本明細書で使用される場合、身体での脂肪組織の過剰な蓄積の結果として身体上の必要を越えた体脂肪の増加が存在する状態を包含する。「肥満」という用語には、次の状態が含まれるが、これらに限定されない：成人発症型肥満；食餌性肥満；内在性または炎症性肥満；内分泌性肥満；家族性肥満；高インスリン性肥満；過形成性肥厚性肥満；性機能低下性肥満；甲状腺機能低下性肥満；終身性肥満；病的肥満および外因性肥満。
【００２５】
「同時に投与される」は、２つの薬剤の両方の薬理学的効果が同時に患者で現れるあらゆる方法でのそれらの薬剤の共投与を指す。同時投与は、両方の薬剤が単一の医薬組成物、同一の剤形または同一の投与経路で投与されることを必要としない。両方の薬剤の効果が同時に発現することを必要としない。ある期間効果が重なっているだけでよく、同一の期間に効果が存在する必要は無い。
【００２６】
「投与」は動物に薬剤を提供することを意味し、そして、医療従事者による投与および自己投与を含むがこれらに限定されない。
【００２７】
「薬剤」は、動物に投与されると治療上の利益を提供し得る活性物質を意味する。「第１薬剤」は、本明細書で提供される治療用化合物を意味する。例えば、第１薬剤はＰＴＰ１Ｂを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドであり得る。「第２薬剤」は本発明の第２治療用化合物（例えば、ＰＴＰ１Ｂを標的とする第２アンチセンスオリゴヌクレオチド）および／または非ＰＴＰ１Ｂ治療用化合物を意味する。
【００２８】
「改善」は、関連の疾患、障害または健康状態の少なくとも１つの指標、徴候または症状の減少を指す。指標の重症度は当業者に知られている主観的測定方法または客観的測定方法により決定され得る。
【００２９】
「動物」はヒトまたは非ヒト動物を指し、非ヒト動物はマウス、ラット、ウサギ、イヌ、ネコ、ブタおよび非ヒト霊長類を含むが、これらに限定されず、非ヒト霊長類はサルおよびチンパンジーを含むが、これらに限定されない。
【００３０】
「アンチセンス活性」は、アンチセンス化合物のその標的核酸へのハイブリダイゼーションに帰すことができるあらゆる検出可能または測定可能な活性を意味する。ある特定の実施形態では、アンチセンス活性は、標的核酸またはそのような標的核酸によりコードされるタンパク質の量または発現の低下である。
【００３１】
「アンチセンス化合物」は、水素結合を介して標的核酸にハイブリダイゼーションすることができるオリゴマー化合物を意味する。
【００３２】
「アンチセンス阻害」は、標的核酸に相補的であるアンチセンス化合物の存在下で、そのアンチセンス化合物が存在しないときの標的核酸レベルまたは標的タンパク質レベルと比較した、標的核酸レベルまたは標的タンパク質レベルの低下を意味する。
【００３３】
「アンチセンスオリゴヌクレオチド」は、標的核酸の対応する領域または区域へのハイブリダイゼーションを可能とする核酸塩基配列を有する一本鎖オリゴヌクレオチドを意味する。
【００３４】
「二環式糖」は、２個の非ジェミナル環原子の架橋により修飾されたフロシル環を意味する。二環式糖は修飾型糖である。
【００３５】
「二環式核酸」または「ＢＮＡ」は、ヌクレオシドまたはヌクレオチドのフラノース部分がフラノース環上の２個の炭素原子を連結する架橋を含み、それにより二環式系を形成しているヌクレオシドまたはヌクレオチドを指す。
【００３６】
「キャップ構造」または「末端キャップ部分」は、アンチセンス化合物のどちらかの末端に組み込まれている化学修飾を意味する。
【００３７】
「化学的に異なる領域」は、あるアンチセンス化合物の別の領域と何らかの点で化学的に異なる同一のアンチセンス化合物のある領域を指す。例えば、２’−Ｏ−メトキシエチルヌクレオチドを有する領域は２’−Ｏ−メトキシエチル修飾が無いヌクレオチドを有する領域と化学的に異なる。
【００３８】
「キメラアンチセンス化合物」は、少なくとも２つの化学的に異なる領域を有するアンチセンス化合物を意味する。
【００３９】
「共投与」は２つ以上の薬剤の個体への投与を意味する。その２つ以上の薬剤は単一の医薬組成物の形状であり得るし、別々の医薬組成物の形状でもあり得る。２つ以上の薬剤のそれぞれが同一の、または異なる投与経路を介して投与され得る。共投与は並行投与または順次投与を包含する。
【００４０】
「コレステロール」はあらゆる動物組織の細胞膜に見出されるステロール分子である。コレステロールは、超低密度リポタンパク質（ＶＬＤＬ）、中間密度リポタンパク質（ＩＤＬ）、低密度リポタンパク質（ＬＤＬ）および高密度リポタンパク質（ＨＤＬ）を含むリポタンパク質によって動物の血漿中に輸送されなければならない。「血漿コレステロール」は血漿または血清中に存在する全てのリポタンパク質（ＶＤＬ、ＩＤＬ、ＬＤＬ、ＨＤＬ）エステル化および／または非エステル化コレステロール全体を指す。
【００４１】
「コレステロール吸収阻害剤」は食事から得られる外因性コレステロールの吸収を阻害する薬剤を意味する。
【００４２】
「相補性」は第１核酸と第２核酸の核酸塩基間で対合する能力を意味する。
【００４３】
「連続核酸塩基」は互いに直ぐ隣接する核酸塩基を意味する。
【００４４】
「デオキシリボヌクレオチド」は、ヌクレオチドの糖部分の２’位に水素を有するヌクレオチドを意味する。デオキシリボヌクレオチドは様々な置換基のうちのいずれかにより修飾され得る。
【００４５】
「真性糖尿病」または「糖尿病」は、不十分なレベルのインスリンまたはインスリン感受性の低下に起因する代謝乱調および異常高血糖（高血糖症）を特徴とする症候群である。特徴的な症状は、高血糖レベルが原因の大量の尿の産生（多尿症）、排尿の増加を補償しようとする多渇と水分摂取の増加（多飲症）、眼の光学系への高血糖の影響が原因の霞視、原因不明の体重減少および気力、活力の欠如である。
【００４６】
「糖尿病性脂質異常症」または「脂質異常症併発２型糖尿病」は、２型糖尿病、ＨＤＬ−Ｃ低下、トリグリセリド増加および高密度小ＬＤＬ粒子の増加を特徴とする健康状態を意味する。
【００４７】
「希釈剤」は、薬理学的活性は無いが、薬学的に必要な、または望ましい組成物中の成分を意味する。例えば、注射組成物中の希釈剤は液体、例えば、生理食塩水であり得る。
【００４８】
「脂質異常症」は、脂質および／またはリポタンパク質の過剰産生または欠乏を含む、脂質代謝および／またはリポタンパク質代謝の障害を指す。脂質異常症は、コレステロールおよびトリグリセリドなどの脂質ならびに低密度リポタンパク質（ＬＤＬ）コレステロールなどのリポタンパク質の増加が徴候となり得る。
【００４９】
「投薬単位」は、医薬が提供される形状、例えば、丸剤、錠剤、または当技術分野において公知の他の投薬単位を意味する。ある特定の実施形態では、投薬単位は凍結乾燥アンチセンスオリゴヌクレオチドを含有するバイアルである。ある特定の実施形態では、投薬単位は加水して再構成したアンチセンスオリゴヌクレオチドを含有するバイアルである。
【００５０】
「用量」は、単回投与で、または特定の期間に提供される医薬品の特定の量を意味する。ある特定の実施形態では、１、２またはそれ以上のボーラス、錠剤または注射で用量が投与され得る。例えば、皮下投与が望ましいある特定の実施形態では、所望の用量が単回注射では容易に処理されない体積を必要とし、それ故、所望の用量を達成するために２回以上の注射が用いられ得る。ある特定の実施形態では、医薬が長時間にわたる点滴によって、または持続的に投与される。用量は１時間、１日、１週間または１か月当たりの医薬の量と述べることができる。
【００５１】
「有効量」または「治療上有効量」は、活性医薬の、その薬剤を必要とする個体において所望の生理的結果を生じさせるのに十分な量を意味する。有効量は、治療される個体の健康状態および生理状態、治療される個体の分類群、組成物の剤形、個体の医学的状態の評価、および他の妥当な要因に応じて個体間でまちまちであり得る。
【００５２】
「完全に相補的な」または「１００％相補的な」は、第１核酸の核酸塩基配列の各核酸塩基が第２核酸の第２核酸塩基配列中に相補的な核酸塩基を有することを意味する。ある特定の実施形態では、第１核酸はアンチセンス化合物であり、標的核酸が第２核酸である。
【００５３】
「ギャップマー」は、１つ以上のヌクレオシドを有する外部領域の間にＲＮａｓｅ  Ｈ切断を助ける複数のヌクレオシドを有する内部領域が位置し、内部領域を含むヌクレオシドが外部領域を含む単数のヌクレオシドまたは複数のヌクレオシドと化学的に異なるキメラアンチセンス化合物を意味する。その内部領域を「ギャップセグメント」と呼称することができ、その外部領域を「ウイングセグメント」と呼称することができる。
【００５４】
「ギャップが拡張した」は、１個から６個までのヌクレオシドを有する５’および３’ウイングセグメントの間に、およびそれらに直ぐ隣接して位置する１２個以上の連続する２’−デオキシリボヌクレオシドのギャップセグメントを有するキメラアンチセンス化合物を意味する。
【００５５】
「グルコース」はエネルギー源および炎症性中間物として細胞によって使用される単糖である。「血漿グルコース」は血漿中に存在するグルコースを指す。
【００５６】
「ＨＭＧ−ＣｏＡレダクターゼ阻害剤」は、酵素ＨＭＧ−ＣｏＡレダクターゼ阻害を通じて作用するアトルバスタチン、ロスバスタチン、フルバスタチン、ロバスタチン、プラバスタチンおよびシンバスタチンなどの薬剤を指す。
【００５７】
「ハイブリダイゼーション」は相補的な核酸分子のアニーリングを意味する。ある特定の実施形態では、相補的な核酸分子にはアンチセンス化合物と標的核酸が含まれる。
【００５８】
「高脂質血症」または「高脂肪血症」は、血清中脂質または循環（血漿中）脂質の増加を特徴とする健康状態である。この健康状態は異常に高濃度の脂肪を示す。循環血液中の脂質画分はコレステロール、低密度リポタンパク質、超低密度リポタンパク質およびトリグリセリドである。
【００５９】
「高トリグリセリド血症」はトリグリセリドレベルの上昇を特徴とする健康状態を意味する。
【００６０】
代謝性を有する動物を「特定すること」または「選択すること」は、代謝性疾患もしくは代謝性障害と診断されている対象を特定もしくは選択すること、または、メタボリックシンドローム、高血糖症、高トリグリセリド血症、高血圧、インスリン抵抗性の増加、インスリン感受性の低下、正常値を超える体重、および／もしくは正常値を超える体脂肪、もしくはこれらのあらゆる組合せを含むが、これらに限定されない代謝性疾患の任意の症状を有する対象を特定もしくは選択することを意味する。そのような特定は、血清または循環（血漿）血糖の測定、血清または循環（血漿）トリグリセリドの測定、血圧の測定、体脂肪の測定、体重測定などのような標準的な臨床試験または臨床評価を含むが、これらに限定されない任意の方法により達成することができる。
【００６１】
「直ぐ隣接する」は、直ぐ隣接する要素の間に介在性要素が存在しないことを意味する。
【００６２】
「個体」または「対象」または「動物」は処置または治療に選択されたヒトまたは非ヒト動物を意味する。
【００６３】
「発現または活性の阻害」は、ＲＮＡまたはタンパク質の発現または活性の低下または妨害を指し、発現または活性の完全な排除を必ずしも表さない。
【００６４】
「インスリン抵抗性」は、正常量のインスリンが脂肪細胞、筋肉細胞および肝細胞から正常なインスリン応答を引き出すのに不十分である健康状態と定義される。脂肪細胞におけるインスリン抵抗性は貯蔵トリグリセリドの加水分解を引き起こし、それが血漿中の遊離脂肪酸を増加させる。筋肉でのインスリン抵抗性はグルコース取込を低下させ、一方、肝臓でのインスリン抵抗性はグルコース貯蔵を低下させ、両方の効果が血糖を増加させるように働く。インスリン抵抗性が原因のインスリンとグルコースの高血漿中レベルが、多くの場合、メタボリックシンドロームと２型糖尿病を引き起こす。
【００６５】
「インスリン感受性」は、個体がどれくらい効果的にグルコースを処理するかということの尺度である。高インスリン感受性を有する個体は効果的にグルコースを処理し、一方、低インスリン感受性を有する個体は効果的にグルコースを処理することがない。
【００６６】
「ヌクレオシド間結合」はヌクレオシド間の化学結合を指す。
【００６７】
「静脈内投与」は静脈への投与を意味する。
【００６８】
「連結ヌクレオシド」は共に結合している隣接ヌクレオシドを意味する。
【００６９】
「脂質低下治療」または「脂質低下薬剤」は、対象において１つ以上の脂質を低下させるために対象に提供される治療計画を意味する。ある特定の実施形態では、ＡｐｏＢ、総コレステロール、ＬＤＬ−Ｃ、ＶＬＤＬ−Ｃ、ＩＤＬ−Ｃ、非ＨＤＬ−Ｃ、トリグリセリド、高密度小ＬＤＬ粒子およびＬｐ（ａ）のうちの１つ以上を対象で低下させるために、脂質低下治療が提供される。脂質低下治療の例にはスタチン類、フィブラート類およびＭＴＰ阻害剤が挙げられる。
【００７０】
「主要リスクファクター」は、特定の疾患または健康状態の高いリスクに寄与する要因を指す。ある特定の実施形態では、冠状動脈性心疾患の主要リスクファクターには、喫煙、高血圧、低ＨＤＬ−Ｃ、冠状動脈性心疾患の家族歴、年齢、および本明細書で開示される他の要因が挙げられるが、これらに限定されない。
【００７１】
「代謝性疾患」または「代謝性障害」は、代謝機能の異常または障害を特徴とする健康状態を指す。「代謝性」および「代謝」は当技術分野において周知の用語であり、そして、生物内で起こる生化学的処理の全範囲を一般に包含する。代謝性疾患または代謝性障害は肥満、糖尿病、高血糖症、前糖尿病、非アルコール性脂肪肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、メタボリックシンドローム、インスリン抵抗性、糖尿病性脂質異常症または高トリグリセリド血症、またはそれらの組合せを包含するが、これらに限定されない。
【００７２】
「メタボリックシンドローム」は、代謝起源の脂質性および非脂質性心血管系リスクファクターの集積を特徴とする健康状態を意味する。ある特定の実施形態では、メタボリックシンドロームは、次の要因のうちのいずれか３つの存在により特定される：男性では１０２ｃｍ、または女性では８８ｃｍを超える腹囲；少なくとも１５０ｍｇ／ｄＬの血清中トリグリセリド；男性では４０ｍｇ／ｄＬ未満、または女性では５０ｍｇ／ｄＬ未満のＨＤＬ−Ｃ；少なくとも１３０／８５ｍｍＨｇの血圧；および少なくとも１１０ｍｇ／ｄＬの空腹時グルコース。これらの決定要素は臨床診療で容易に測定され得る（JAMA, 2001, 285: 2486-2497）。
【００７３】
「ミスマッチ」または「非相補的核酸塩基」は、第１核酸の核酸塩基が第２核酸または標的核酸の対応する核酸塩基と対合することができない場合を指す。
【００７４】
「混合型脂質異常症」はコレステロールの増加とトリグリセリドの増加を特徴とする健康状態を意味する。
【００７５】
「修飾型ヌクレオシド間結合」は天然のヌクレオシド間結合（すなわち、ホスホジエステルヌクレオシド間結合）からの置換またはあらゆる変化を指す。
【００７６】
「修飾型核酸塩基」はアデニン、シトシン、グアニン、チミジンまたはウラシル以外のあらゆる核酸塩基を指す。「非修飾型核酸塩基」はプリン塩基であるアデニン（Ａ）およびグアニン（Ｇ）ならびにピリミジン塩基であるチミン（Ｔ）、シトシン（Ｃ）およびウラシル（Ｕ）を意味する。
【００７７】
「修飾型ヌクレオシド」は独立して修飾型糖部分または修飾型核酸塩基を有するヌクレオシドを意味する。
【００７８】
「修飾型ヌクレオチド」は独立して修飾型糖部分、修飾型ヌクレオシド間結合または修飾型核酸塩基を有するヌクレオチドを意味する。「修飾型ヌクレオシド」は独立して修飾型糖部分または修飾型核酸塩基を有するヌクレオシドを意味する。
【００７９】
「修飾型オリゴヌクレオチド」は少なくとも１つの修飾型ヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチドを意味する。
【００８０】
「修飾型糖」は天然糖からの置換または変化を指す。
【００８１】
「モチーフ」はアンチセンス化合物内の化学的に異なる領域のパターンを意味する。
【００８２】
「ＭＴＰ阻害剤」は酵素であるミクロソームトリグリセリド移送タンパク質を阻害する薬剤を意味する。
【００８３】
「天然ヌクレオシド間結合」は３’から５’ホスホジエステル結合を意味する。
【００８４】
「天然糖部分」はＤＮＡ（２’−Ｈ）またはＲＮＡ（２’−ＯＨ）に見出される糖を意味する。
【００８５】
「非アルコール性脂肪肝疾患」または「ＮＡＦＬＤ」は、過剰なアルコール使用（例えば、２０ｇ／日を超えるアルコール消費）が原因ではない肝臓の脂肪性炎症を特徴とする健康状態を意味する。ある特定の実施形態では、ＮＡＦＬＤはインスリン抵抗性およびメタボリックシンドロームに関連する。ＮＡＦＬＤは肝細胞での単なるトリグリセリド蓄積（脂肪肝）から炎症併発性脂肪肝（脂肪性肝炎）、線維症および硬変までの範囲の疾患を包含する。
【００８６】
「非アルコール性脂肪性肝炎」（ＮＡＳＨ）はトリグリセリドの蓄積を超えたＮＡＦＬＤの進行から生じる。壊死、炎症および線維症を誘導することができる「第２撃」がＮＡＳＨの発生に必要とされる。その第２撃の候補は、酸化ストレスの増加を引き起こす要因、および炎症誘発性サイトカインの発現を促進する要因という大分類に分けることができる。
【００８７】
「核酸」は単量体のヌクレオチドから構成される分子を指す。核酸にはリボ核酸（ＲＮＡ）、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）、一本鎖核酸、二本鎖核酸、低分子干渉リボ核酸（ｓｉＲＮＡ）、およびマイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）が含まれる。核酸はまた一つの分子にこれらの要素の組み合わせを含むこともできる。
【００８８】
「核酸塩基」は別の核酸の塩基と対合することができる複素環部分を意味する。
【００８９】
「核酸塩基配列」はあらゆる糖、結合または核酸塩基修飾から独立した連続する核酸塩基の順序を意味する。
【００９０】
「ヌクレオシド」は糖に結合した核酸塩基を意味する。
【００９１】
「ヌクレオシド模倣物」は、例えば、モルホリノ糖模倣物、シクロヘキセニル糖模倣物、シクロヘキシル糖模倣物、テトラヒドロピラニル糖模倣物、ビシクロまたはトリシクロ糖模倣物、例えば、非フラノース糖単位を有するヌクレオシド模倣物など、糖、または糖と塩基を置換するために使用され、必ずしもオリゴマー化合物の１つ以上の位置の結合を置換するために使用されるわけではない構造を包含する。
【００９２】
「ヌクレオチド」は、ヌクレオシドの糖部分に共有結合したリン酸基を有するヌクレオシドを意味する。
【００９３】
「ヌクレオチド模倣物」は、例えば、ペプチド核酸またはモルホリノ類（−Ｎ（Ｈ）−Ｃ（＝Ｏ）−Ｏ−または他の非ホスホジエステル結合によって連結したモルホリノ類）など、オリゴマー化合物の１つ以上の位置のヌクレオシドと結合を置換するために使用される構造を包含する。
【００９４】
「オリゴマー化合物」または「オリゴマー」は、２つ以上の副構造を含み、核酸分子のある領域にハイブリダイズすることができる重合体構造を指す。ある特定の実施形態では、オリゴマー化合物はオリゴヌクレオシドである。ある特定の実施形態では、オリゴマー化合物はオリゴヌクレオチドである。ある特定の実施形態では、オリゴマー化合物はアンチセンス化合物である。ある特定の実施形態では、オリゴマー化合物はアンチセンスオリゴヌクレオチドである。ある特定の実施形態では、オリゴマー化合物はキメラオリゴヌクレオチドである。
【００９５】
「オリゴヌクレオチド」は、ヌクレオシドのそれぞれが互いに独立して修飾型または非修飾型であり得る、連結したヌクレオシドからなる重合体を意味する。
【００９６】
「非経口投与」は注射または点滴による投与を意味する。非経口投与には皮下投与、静脈内投与、筋肉内投与、動脈内投与、腹腔内投与または頭蓋内投与、例えば、髄腔内投与もしくは脳室内投与が含まれる。投与は連続投与、または長期投与、または短期投与、または断続的投与であり得る。
【００９７】
「ペプチド」は、アミド結合により少なくとも２つのアミノ酸を結合して形成された分子を意味する。ペプチドはポリペプチドおよびタンパク質を指す。
【００９８】
「医薬」は、個体に投与されると治療上の利益を提供する物質を意味する。例えば、ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドは医薬である。
【００９９】
「医薬組成物」は個体への投与に適切な物質の混合物を意味する。例えば、医薬組成物は１つ以上の活性薬剤および無菌水溶液を含み得る。
【０１００】
「薬学的に許容可能な担体」は、オリゴヌクレオチドの構造に干渉しない媒体または希釈剤を意味する。そのような担体のある特定のものによって、医薬組成物は、例えば、対象による経口摂取用の錠剤、丸剤、糖衣剤、カプセル剤、液剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー剤、懸濁剤およびトローチ剤として製剤され得る。例えば、薬学的に許容可能な担体は無菌水溶液であり得る。
【０１０１】
「薬学的に許容可能な誘導体」は本明細書に記載される化合物の薬学的に許容可能な塩、複合体、プロドラッグまたは異性体を包含する。
【０１０２】
「薬学的に許容可能な塩」はアンチセンス化合物の生理学的および薬学的に許容可能な塩、すなわち、親オリゴヌクレオチドの所望の生物活性を保持し、望ましくない毒性をそれに加えない塩を意味する。
【０１０３】
「ホスホロチオエート結合」は、非架橋酸素原子のうちの１つをイオウ原子で置換することによりホスホジエステル結合が修飾されているヌクレオシド間の結合を意味する。ホスホロチオエート結合は修飾型ヌクレオシド間結合である。
【０１０４】
「部分」は、核酸の限定した数の連続する（すなわち、連結した）核酸塩基を意味する。ある特定の実施形態では、部分は、標的核酸の限定した数の連続する核酸塩基である。ある特定の実施形態では、部分は、アンチセンス化合物の限定した数の連続する核酸塩基である。
【０１０５】
「予防する」は、数分から無限までの期間、疾患、障害または病気の発症または発生を遅らせること、または未然に防ぐことを指す。「予防する」は疾患、障害または病気の発生のリスクを低減することも意味する。
【０１０６】
「プロドラッグ」は、不活性型で調製され、内在性の酵素または他の化学物質または条件によって体内または細胞内でその活性型に変換される治療薬を意味する。
【０１０７】
「タンパク質チロシンホスファターゼ１Ｂ」または「ＰＴＰ１Ｂ」（ＰＴＰＮ１；タンパク質チロシンホスファターゼ非受容体１型；ＰＴＰ−１Ｂ；ＲＫＰＴＰとしても知られる）はＰＴＰ１Ｂの任意の核酸またはタンパク質を意味する。
【０１０８】
「ＰＴＰ１Ｂ発現」はＰＴＰ１Ｂをコードする遺伝子から転写されるｍＲＮＡのレベル、またはそのｍＲＮＡから翻訳されたタンパク質のレベルを意味する。ＰＴＰ１Ｂ発現は、ノーザンブロットまたはウェスタンブロットなどの当技術分野で公知の方法によって決定することができる。
【０１０９】
「ＰＴＰ１Ｂ核酸」はＰＴＰ１Ｂをコードするあらゆる核酸を意味する。例えば、ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸はＰＴＰ１ＢをコードするＤＮＡ配列、ＰＴＰ１ＢをコードするＤＮＡ（イントロンおよびエクソンを含むゲノムＤＮＡを包含する）から転写されるＲＮＡ配列、およびＰＴＰ１ＢをコードするｍＲＮＡ配列を包含する。「ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡ」はＰＴＰ１Ｂタンパク質をコードするｍＲＮＡを意味する。
【０１１０】
「副作用」は、ある処置に帰することができる、所望の効果以外の生理的反応を意味する。ある特定の実施形態では、副作用には注射部位反応、肝機能検査異常、腎機能異常、肝毒性、腎毒性、中枢神経系異常、筋障害および倦怠感が含まれる。例えば、血清中のアミノトランスフェラーゼレベルの上昇は肝毒性または肝機能異常を示し得る。例えば、ビリルビンの増加は肝毒性または肝機能異常を示し得る。
【０１１１】
「一本鎖オリゴヌクレオチド」は、相補鎖にハイブリダイズされていないオリゴヌクレオチドを意味する。
【０１１２】
「特異的にハイブリダイズ可能な」は、インビボ測定および治療の場合に、所望の効果を誘導するのに十分な程度のアンチセンスオリゴヌクレオチドと標的核酸の間の相補性を有しているが、特異的な結合が望ましい条件、すなわち、生理的条件では、非標的核酸に対して最小の効果を示す、または全く効果を示さないアンチセンス化合物を指す。
【０１１３】
「スタチン」はＨＭＧ−ＣｏＡ還元酵素の活性を阻害する薬剤を意味する。
【０１１４】
「皮下投与」は皮膚のすぐ下への投与を意味する。
【０１１５】
「標的とする」または「標的とした」は、標的核酸に特異的にハイブリダイズし、そして、所望の効果を誘導するアンチセンス化合物の設計および選択の過程を意味する。
【０１１６】
「標的核酸」、「標的ＲＮＡ」および「標的ＲＮＡ転写物」は全てアンチセンス化合物によって標的とされ得る核酸を指す。
【０１１７】
「標的セグメント」は、アンチセンス化合物が標的とする標的核酸のヌクレオチド配列を意味する。「５’標的部位」は標的セグメントの最も５’側のヌクレオチドを指す。「３’標的部位」は標的セグメントの最も３’側のヌクレオチドを指す。
【０１１８】
「治療上有効量」は、個体に治療上の利益を提供する薬剤の量を意味する。
【０１１９】
「治療のための生活習慣の変更（therapeutic lifestyle change）」は、脂肪／脂肪組織質量および／またはコレステロールの低減を目的とした食事および生活習慣の変更を意味する。そのような変更は心臓疾患を発症するリスクを低下させることができ、そして、１日の総カロリー、総脂肪、飽和脂肪、多価不飽和脂肪、一価不飽和脂肪、炭水化物、タンパク質、コレステロール、不溶性繊維の食事による摂取に対する勧告ならびに身体活動に対する勧告を包含する。
【０１２０】
「トリグリセリド」または「ＴＧ」は、３つの脂肪酸分子と組み合わさったグリセロールからなる脂質または中性脂肪を意味する。
【０１２１】
「２型糖尿病」（「２型真性糖尿病」または「真性糖尿病、２型」としても知られており、以前は「真性糖尿病２型」、「非インスリン依存性糖尿病（ＮＩＤＤＭ）」、「肥満関連糖尿病」または「成人発症性糖尿病」と呼ばれていた）は、インスリン抵抗性、相対的インスリン欠乏および高血糖症を主な特徴とする代謝性障害である。
【０１２２】
「治療する」は、疾患、障害または健康状態の変化または改善をもたらすために動物に医薬組成物を投与することを指す。
【０１２３】
「非修飾型ヌクレオチド」は天然の核酸塩基、糖部分およびヌクレオシド間結合から構成されるヌクレオチドを意味する。ある特定の実施形態では、非修飾型ヌクレオチドはＲＮＡヌクレオチド（すなわち、β−Ｄ−リボヌクレオシド）またはＤＮＡヌクレオチド（すなわち、β−Ｄ−デオキシリボヌクレオシド）である。
【０１２４】
ある特定の実施形態
特定の実施形態は、ＰＴＰ１Ｂ発現を阻害するための方法、化合物および組成物を提供する。
【０１２５】
ある特定の実施形態は、ＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするアンチセンス化合物を提供する。ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸は、ＧＥＮＢＡＮＫ受託番号ＮＭ＿００２８２７．２（配列番号１として本明細書に組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫ受託番号ＮＴ＿０１１３６２．９から切り出したヌクレオチド１４１７８０００から１４２５６０００（配列番号２として本明細書に組み込まれる）；およびアカゲザルＰＴＰ１Ｂ足場のエクソン１〜９、イントロン９およびエクソン１０の配列の連鎖（配列番号３として本明細書に組み込まれる）に示されるもののうちの任意の配列である。
【０１２６】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する１０〜３０個のヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１２７】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１０〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９または３０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１２８】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１０〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号４〜３２または１００〜１１１のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有することができる。
【０１２９】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１０〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号２６または４４のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有することができる。
【０１３０】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１０〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３７３、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有することができる。
【０１３１】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１０〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有することができる。
【０１３２】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する１５〜３０個のヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１３３】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１５〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９または３０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１３４】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１５〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号４〜３２または１００〜１１１のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有することができる。
【０１３５】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１５〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号２６または４４のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有することができる。
【０１３６】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１５〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３７３、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有することができる。
【０１３７】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１５〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有することができる。
【０１３８】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する１８〜２１個のヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１３９】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１８〜２１個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０または２１個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１４０】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１８〜２１個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号４〜３２または３９〜４９のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１４１】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１８〜２１個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号２６または４４のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１４２】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１８〜２１個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３７３、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１４３】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、１８〜２１個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１４４】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する２０〜３５個のヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１４５】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４または３５個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１４６】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号４〜３２または５０の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１４７】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号２６の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１４８】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３７３、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１４９】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１５０】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する２０〜３０個のヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１５１】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９または３０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１５２】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号４〜３２または５０の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１５３】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号２６の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１５４】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、ＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１５５】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜３０個の連結したヌクレオシドからなり、ＩＳＩＳ番号４０４１７３の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１５６】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する２０〜２５個のヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１５７】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２５個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４または２５個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１５８】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２５個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号４〜３２の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１５９】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２５個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号２６の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１６０】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２５個の連結したヌクレオシドからなり、ＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１６１】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２５個の連結したヌクレオシドからなり、ＩＳＩＳ番号４０４１７３の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１６２】
ある特定の実施形態では、本発明の化合物または組成物は、配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する２０〜２４個のヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１６３】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２４個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１６４】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２４個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号４〜３２の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１６５】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２４個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号２６の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１６６】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２４個の連結したヌクレオシドからなり、ＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３７３、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１６７】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２４個の連結したヌクレオシドからなり、ＩＳＩＳ番号４０４１７３の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１６８】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する２０〜２３個のヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１６９】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２３個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２または２３個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１７０】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２３個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号４〜３２の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１７１】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２３個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号２６の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１７２】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２３個の連結したヌクレオシドからなり、ＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３７３、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１７３】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２３個の連結したヌクレオシドからなり、ＩＳＩＳ番号４０４１７３の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１７４】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する２０〜２２個のヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１７５】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２２個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１または２２個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１７６】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２２個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号４〜３２の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１７７】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２２個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号２６の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１７８】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２２個の連結したヌクレオシドからなり、ＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３７３、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１７９】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２２個の連結したヌクレオシドからなり、ＩＳＩＳ番号４０４１７３の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１８０】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する２０〜２１個のヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１８１】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２１個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０または２１個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１８２】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２１個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号４〜３２の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１８３】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２１個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号２６の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１８４】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２１個の連結したヌクレオシドからなり、ＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３７３、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２のいずれかの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１８５】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０〜２１個の連結したヌクレオシドからなり、ＩＳＩＳ番号４０４１７３の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１８６】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０個のヌクレオシドからなり、配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１８７】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０１８８】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号４〜３２の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１８９】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、２０個の連結したヌクレオシドからなり、配列番号２６の少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
【０１９０】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、ＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３７３、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２のいずれかからなる。
【０１９１】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、ＩＳＩＳ番号４０４１７３からなる。
【０１９２】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号２６からなる。
【０１９３】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は前記修飾型オリゴヌクレオチドの塩を含む。
【０１９４】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は薬学的に許容可能な担体または希釈剤をさらに含む。
【０１９５】
ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、前記修飾型オリゴヌクレオチドの全体に対して測定すると、配列番号１〜３のいずれか１つに対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％相補的である。
【０１９６】
ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、前記修飾型オリゴヌクレオチドの全体に対して測定すると、配列番号４〜３２または３９〜５０のいずれか１つに対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の同一性を有する。
【０１９７】
ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、前記修飾型オリゴヌクレオチドの全体に対して測定すると、配列番号２６から４４のいずれか１つに対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の同一性を有する。
【０１９８】
ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、前記修飾型オリゴヌクレオチドの全体に対して測定すると、ＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３７３、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２のいずれか１つに対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の同一性を有する。
【０１９９】
ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、前記修飾型オリゴヌクレオチドの全体に対して測定すると、ＩＳＩＳ番号４０４１７３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の同一性を有する。
【０２００】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物は一本鎖修飾型オリゴヌクレオチドからなる。
【０２０１】
ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドは８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４または３５個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドは２０個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドは１８個の連結したヌクレオシドからなる。
【０２０２】
ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシド間結合は修飾型ヌクレオシド間結合である。ある特定の実施形態では、各ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
【０２０３】
ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシドは修飾型核酸塩基を含む。ある特定の実施形態では、前記修飾型核酸塩基は５−メチルシトシンである。
【０２０４】
ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドは、ａ）連結したデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；ｂ）連結したヌクレオシドからなる５’ウイングセグメント；およびｃ）連結したヌクレオシドからなる３’ウイングセグメントを含む。ギャップセグメントは前記５’ウイングセグメントと前記３’ウイングセグメントの間に位置し、そして、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドが修飾型糖を含む。
【０２０５】
ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドは２０個の連結したヌクレオシドからなり、前記ギャップセグメントは１０個の連結したデオキシヌクレオシドからなり、前記５’ウイングセグメントは５個の連結したヌクレオシドからなり、前記３’ウイングセグメントは５個の連結したヌクレオシドからなり、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドが２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖を含み、各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であり、そして、各シトシンが５−メチルシトシンである。
【０２０６】
ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドは２０個の連結したヌクレオシドからなり、前記ギャップセグメントは８個の連結したデオキシヌクレオシドからなり、前記５’ウイングセグメントは６個の連結したヌクレオシドからなり、前記３’ウイングセグメントは６個の連結したヌクレオシドからなり、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドが２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖を含み、各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であり、そして、各シトシンが５−メチルシトシンである。
【０２０７】
ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドは２０個の連結したヌクレオシドからなり、前記ギャップセグメントは１３個の連結したデオキシヌクレオシドからなり、前記５’ウイングセグメントは２個の連結したヌクレオシドからなり、前記３’ウイングセグメントは５個の連結したヌクレオシドからなり、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドは２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖を含み、各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であり、そして、各シトシンが５-メチルシトシンである。
【０２０８】
ある特定の実施形態では、前記修飾型オリゴヌクレオチドは１８個の連結したヌクレオシドからなり、前記ギャップセグメントは８個の連結したデオキシヌクレオシドからなり、前記５’ウイングセグメントは５個の連結したヌクレオシドからなり、前記３’ウイングセグメントは５個の連結したヌクレオシドからなり、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドは２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖を含み、各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であり、そして、各シトシンが５−メチルシトシンである。
【０２０９】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する２０個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含み、前記修飾型オリゴヌクレオチドは、ａ）１０個の連結したデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；ｂ）５個の連結したヌクレオシドからなる５’ウイングセグメント；およびｃ）５個の連結したヌクレオシドからなる３’ウイングセグメントを含む。前記ギャップセグメントは前記５’ウイングセグメントと前記３’ウイングセグメントの間に位置し、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドが２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖を含み、各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であり、そして、各シトシン残基が５−メチルシトシンである。
【０２１０】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号１〜３のいずれかの等しい長さの部分に相補的である少なくとも８個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、１８個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含み、前記修飾型オリゴヌクレオチドは、ａ）８個の連結したデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；ｂ）６個の連結したヌクレオシドからなる５’ウイングセグメント；およびｃ）６個の連結したヌクレオシドからなる３’ウイングセグメントを含む。前記ギャップセグメントは前記５’ウイングセグメントと前記３’ウイングセグメントの間に位置し、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドが２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖を含み、各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であり、そして、各シトシン残基が５−メチルシトシンである。
【０２１１】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号４〜３２の少なくとも１９個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、２０個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含み、前記修飾型オリゴヌクレオチドは、ａ）１０個の連結したデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；ｂ）５個の連結したヌクレオシドからなる５’ウイングセグメント；およびｃ）５個の連結したヌクレオシドからなる３’ウイングセグメントを含む。前記ギャップセグメントは前記５’ウイングセグメントと前記３’ウイングセグメントの間に位置し、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドが２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖を含み、各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であり、そして、各シトシン残基が５−メチルシトシンである。
【０２１２】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号２６の少なくとも１９個の連続する核酸塩基配列を有する、２０個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含み、前記修飾型オリゴヌクレオチドは、ａ）１０個の連結したデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；ｂ）５個の連結したヌクレオシドからなる５’ウイングセグメント；およびｃ）５個の連結したヌクレオシドからなる３’ウイングセグメントを含む。前記ギャップセグメントは前記５’ウイングセグメントと前記３’ウイングセグメントの間に位置し、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドが２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖を含み、各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であり、そして、各シトシン残基が５−メチルシトシンである。
【０２１３】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号２６の核酸塩基配列を有する２０個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含み、前記修飾型オリゴヌクレオチドは、ａ）１０個の連結したデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；ｂ）５個の連結したヌクレオシドからなる５’ウイングセグメント；およびｃ）５個の連結したヌクレオシドからなる３’ウイングセグメントを含む。前記ギャップセグメントは前記５’ウイングセグメントと前記３’ウイングセグメントの間に位置し、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドが２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖を含み、各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であり、そして、各シトシン残基が５−メチルシトシンである。
【０２１４】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号２６または４４の少なくとも１９個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する２０個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含み、前記修飾型オリゴヌクレオチドは、ａ）１０個の連結したデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；ｂ）５個の連結したヌクレオシドからなる５’ウイングセグメント；およびｃ）５個の連結したヌクレオシドからなる３’ウイングセグメントを含む。前記ギャップセグメントは前記５’ウイングセグメントと前記３’ウイングセグメントの間に位置し、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドが２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖を含み、各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であり、そして、各シトシン残基が５−メチルシトシンである。ある特定の実施形態では、前記化合物または組成物はＩＳＩＳ番号 ４０４１７３、４１０００２、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２のいずれかの化合物を含む。
【０２１５】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号４〜３２の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、２０個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含み、前記修飾型オリゴヌクレオチドは、ａ）１０個の連結したデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；ｂ）５個の連結したヌクレオシドからなる５’ウイングセグメント；およびｃ）５個の連結したヌクレオシドからなる３’ウイングセグメントを含む。前記ギャップセグメントは前記５’ウイングセグメントと前記３’ウイングセグメントの間に位置し、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドが２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖を含み、各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であり、そして、各シトシン残基が５−メチルシトシンである。
【０２１６】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号２６の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、２０個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含み、前記修飾型オリゴヌクレオチドは、ａ）１０個の連結したデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；ｂ）５個の連結したヌクレオシドからなる５’ウイングセグメント；およびｃ）５個の連結したヌクレオシドからなる３’ウイングセグメントを含む。前記ギャップセグメントは前記５’ウイングセグメントと前記３’ウイングセグメントの間に位置し、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドが２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖を含み、各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であり、そして、各シトシン残基が５−メチルシトシンである。
【０２１７】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、配列番号２６の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する２０個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含み、前記修飾型オリゴヌクレオチドは、ａ）１０個の連結したデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；ｂ）５個の連結したヌクレオシドからなる５’ウイングセグメント；およびｃ）５個の連結したヌクレオシドからなる３’ウイングセグメントを含む。前記ギャップセグメントは前記５’ウイングセグメントと前記３’ウイングセグメントの間に位置し、各ウイングセグメントの各ヌクレオシドが２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型糖を含み、各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエート結合であり、そして、各シトシン残基が５−メチルシトシンである。ある特定の実施形態では、前記化合物または組成物はＩＳＩＳ番号４０４１７３の化合物を含む。
【０２１８】
特定の実施形態は、ＰＴＰ１Ｂ発現を阻害するための方法、化合物および組成物を提供する。
【０２１９】
特定の実施形態は、本明細書に記載されるような化合物を動物に投与することを含む、前記動物においてＰＴＰ１Ｂ発現を低下させる方法を提供する。ある特定の実施形態では、前記化合物は、ＰＴＰ１Ｂを標的とする、１０〜３０個の連結したヌクレオシドの長さの修飾型オリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、前記化合物は、ＰＴＰ１Ｂを標的とする、２０〜３５個の連結したヌクレオシドの長さの修飾型オリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、前記化合物は、ＰＴＰ１Ｂを標的とする、２０〜２５個の連結したヌクレオシドの長さの修飾型オリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、前記化合物は、ＰＴＰ１Ｂを標的とする、２０〜２４個の連結したヌクレオシドの長さの修飾型オリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、前記化合物は、ＰＴＰ１Ｂを標的とする、２０〜２３個の連結したヌクレオシドの長さの修飾型オリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、前記化合物は、ＰＴＰ１Ｂを標的とする、２０〜２２個の連結したヌクレオシドの長さの修飾型オリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、前記化合物は、ＰＴＰ１Ｂを標的とする、２０〜２１個の連結したヌクレオシドの長さの修飾型オリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、前記化合物は、ＰＴＰ１Ｂを標的とする、２０個の連結したヌクレオシドの長さの修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０２２０】
特定の実施形態は、本明細書に記載されるような化合物を動物に投与することを含む、前記動物において代謝性疾患を予防、改善または治療する方法を提供する。ある特定の実施形態では、前記化合物は、ＰＴＰ１Ｂを標的とする、１０〜３０個の連結したヌクレオシドの長さの修飾型オリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、前記化合物は、ＰＴＰ１Ｂを標的とする、２０個の連結したヌクレオシドの長さの修飾型オリゴヌクレオチドを含む。代謝性疾患または障害の例には肥満、糖尿病、高血糖症、前糖尿病、非アルコール性脂肪肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、メタボリックシンドローム、インスリン抵抗性、糖尿病性脂質異常症または高トリグリセリド血症、またはそれらの組合せが挙げられるが、これらに限定されない。
【０２２１】
特定の実施形態は、本明細書に記載されるような化合物を動物に投与することを含む、前記動物においてグルコースレベルを低下させる方法を提供する。ある特定の実施形態では、前記化合物は、ＰＴＰ１Ｂを標的とする、１０〜３０個の連結したヌクレオシドの長さの修飾型オリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、前記化合物は、ＰＴＰ１Ｂを標的とする、２０個の連結したヌクレオシドの長さの修飾型オリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、動物でのグルコースレベルの低下が代謝性疾患を予防、改善または治療する。ある特定の実施形態では、動物でのグルコースレベルの低下が糖尿病を予防、改善または治療する。ある特定の実施形態では、動物でのグルコースレベルの低下が肥満を予防、改善または治療する。ある特定の実施形態では、動物でのグルコースレベルの低下がメタボリックシンドロームを予防、改善または治療する。ある特定の実施形態では、動物でのグルコースレベルの低下がインスリン抵抗性を予防、改善または治療する。ある特定の実施形態では、動物でのグルコースレベルの低下が高血糖症を予防、改善または治療する。ある特定の実施形態では、動物でのグルコースレベルの低下がＮＡＦＬＤを予防、改善または治療する。ある特定の実施形態では、動物でのグルコースレベルの低下が糖尿病性脂質異常症を予防、改善または治療する。ある特定の実施形態では、グルコースレベルが少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％または１００％低下する。
【０２２２】
ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂは、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号：ＧＥＮＢＡＮＫ受託番号ＮＭ＿００２８２７．２（配列番号１として本明細書に組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫ受託番号ＮＴ＿０１１３６２．９から切り出したヌクレオチド１４１７８０００から１４２５６０００まで（配列番号２として本明細書に組み込まれる）；およびアカゲザルＰＴＰ１Ｂ足場のエクソン１〜９、イントロン９およびエクソン１０の配列の連鎖（配列番号３として本明細書に組み込まれる）のいずれかに示されるような配列を有する。ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂは、配列番号１〜２に示されるようなヒト配列を有する。ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂは、配列番号３に示されるようなアカゲザル配列を有する。
【０２２３】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、それらの塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。ある特定の実施形態では、前記組成物は、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号４〜３２、５０に列挙される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドまたはその塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。ある特定の実施形態では、前記組成物は、２０〜２５個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号４〜３２、５０に列挙される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドまたはその塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。ある特定の実施形態では、前記組成物は、２０個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号４〜３２、５０に列挙される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドまたはその塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。
【０２２４】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、それらの塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。ある特定の実施形態では、前記組成物は、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号２６に列挙される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドまたはその塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。ある特定の実施形態では、前記組成物は、２０〜２５個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号２６に列挙される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドまたはその塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。ある特定の実施形態では、前記組成物は、２０個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号２６に列挙される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドまたはその塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。
【０２２５】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、それらの塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。ある特定の実施形態では、前記組成物は、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２に列挙される核酸塩基配列の中から選択される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドまたはその塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。ある特定の実施形態では、前記組成物は、２０〜２５個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２に列挙される核酸塩基配列の中から選択される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドまたはその塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。ある特定の実施形態では、前記組成物は、２０個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２に列挙される核酸塩基配列の中から選択される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドまたはその塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。
【０２２６】
ある特定の実施形態では、本明細書において提供される化合物または組成物は、それらの塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。ある特定の実施形態では、前記組成物は、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３に列挙される核酸塩基配列の中から選択される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドまたはその塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。ある特定の実施形態では、前記組成物は、２０〜２５個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３に列挙される核酸塩基配列の中から選択される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドまたはその塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。ある特定の実施形態では、前記組成物は、２０個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３に列挙される核酸塩基配列の中から選択される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドまたはその塩、および薬学的に許容可能な担体または希釈剤を含む。
【０２２７】
特定の実施形態は、ＰＴＰ１Ｂが関連する疾患または健康状態を有する動物を治療する方法であって、ａ）前記のＰＴＰ１Ｂが関連する疾患または健康状態を有する前記動物を特定すること、およびｂ）１０〜３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドであって、前記修飾型オリゴヌクレオチドの全体にわたって測定すると、配列番号１〜３のいずれかに対して少なくとも９０％相補的である核酸塩基配列を有する前記修飾型オリゴヌクレオチドを含む化合物の治療上有効量を前記動物に投与することを含む前記方法を提供する。ある特定の実施形態では、動物に投与された前記の治療上有効量の化合物が前記の動物におけるＰＴＰ１Ｂが関連する疾患もしくは健康状態またはその症状を治療または軽減する。ある特定の実施形態では、前記のＰＴＰ１Ｂが関連する疾患または健康状態は糖尿病である。
【０２２８】
特定の実施形態は、ＰＴＰ１Ｂが関連する疾患または健康状態を有する動物を治療する方法であって、ａ）前記のＰＴＰ１Ｂが関連する疾患または健康状態を有する前記動物を特定すること、およびｂ）２０個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドであって、前記修飾型オリゴヌクレオチドの全体にわたって測定すると、配列番号１〜３のいずれかに対して少なくとも１００％相補的である核酸塩基配列を有する前記修飾型オリゴヌクレオチドを含む化合物の治療上有効量を前記動物に投与することを含む前記方法を提供する。ある特定の実施形態では、動物に投与された前記の治療上有効量の化合物が前記の動物におけるＰＴＰ１Ｂが関連する疾患もしくは健康状態またはその症状を治療または軽減する。ある特定の実施形態では、前記のＰＴＰ１Ｂが関連する疾患または健康状態は糖尿病である。
【０２２９】
特定の実施形態は、代謝性疾患を治療、予防または改善する方法を提供する。ある特定の実施形態では、前記代謝性疾患は肥満、糖尿病、高血糖症、前糖尿病、非アルコール性脂肪肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、メタボリックシンドローム、インスリン抵抗性、糖尿病性脂質異常症または高トリグリセリド血症、またはそれらの組合せである。
【０２３０】
特定の実施形態は、過剰増殖性疾患を治療、予防または改善する方法を提供する。
【０２３１】
特定の実施形態は、動物に対して本明細書に記載されるような化合物を動物に投与することを含む方法を提供する。ある特定の実施形態では、前記方法は、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号４〜３２または５０に列挙される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドを動物に投与することを含む。特定の実施形態は、動物に対して本明細書に記載されるような化合物を動物に投与することを含む方法を提供する。ある特定の実施形態では、前記方法は、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなり、かつ配列番号２６に列挙される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドを動物に投与することを含む。
【０２３２】
特定の実施形態は、動物に対して本明細書に記載されるような化合物を動物に投与することを含む方法を提供する。ある特定の実施形態では、前記方法は、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３、４１０００２、４３８３８３、４３８４４５、４３８４５４、４３８４６３または４３８４７２に列挙される核酸塩基配列の中から選択される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドを動物に投与することを含む。
【０２３３】
特定の実施形態は、動物に対して本明細書に記載されるような化合物を動物に投与することを含む方法を提供する。ある特定の実施形態では、前記方法は、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなり、かつＩＳＩＳ番号４０４１７３に列挙される核酸塩基配列の中から選択される核酸塩基配列の少なくとも２０個の連続する核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する修飾型オリゴヌクレオチドを動物に投与することを含む。
【０２３４】
ある特定の実施形態では、前記動物はヒトである。
【０２３５】
ある特定の実施形態では、前記の投与が本明細書に記載されるような代謝性疾患を予防、治療、改善し、またはその進行を遅らせる。
【０２３６】
ある特定の実施形態では、前記の投与が本明細書に記載されるような糖尿病を予防、治療、改善し、またはその進行を遅らせる。
【０２３７】
ある特定の実施形態では、前記化合物は第２の薬剤と共投与される。
【０２３８】
ある特定の実施形態では、前記化合物と前記第２薬剤は同時投与される。
【０２３９】
ある特定の実施形態では、投与は非経口投与である。
【０２４０】
特定の実施形態は、動物においてＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡまたはタンパク質の発現を減少させる方法であって、前記動物においてＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡまたはタンパク質の発現を減少させるために本明細書に記載されるような化合物または組成物を前記動物に投与することを含む前記方法をさらに提供する。ある特定の実施形態では、前記動物はヒトである。ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡまたはタンパク質の発現の低下が代謝性疾患を予防、治療、改善し、またはその進行を遅らせる。ある特定の実施形態では、前記の代謝性の疾患または健康状態は糖尿病である。
【０２４１】
特定の実施形態は、代謝性疾患を有するヒトを治療する方法であって、その疾患を有するヒトを特定し、そして、治療上有効量の本明細書に記載されるような化合物または組成物をそのヒトに投与することを含む前記方法を提供する。ある特定の実施形態では、前記の治療が、メタボリックシンドローム、高血糖症、高トリグリセリド血症、高血圧、グルコースレベルの上昇、インスリン抵抗性の増加、インスリン感受性の低下、正常値を超える体重、および／または正常値を超える体脂肪、またはそれらの任意の組合せからなる群より選択される症状を軽減する。
【０２４２】
特定の実施形態は、糖尿病を有するヒトを治療する方法であって、その疾患を有するヒトを特定し、そして、治療上有効量の本明細書に記載されるような化合物または組成物をそのヒトに投与することを含む前記方法を提供する。ある特定の実施形態では、前記の治療が、メタボリックシンドローム、高血糖症、高トリグリセリド血症、高血圧、グルコースレベルの上昇、インスリン抵抗性の増加、インスリン感受性の低下、正常値を超える体重、および／または正常値を超える体脂肪、またはそれらの任意の組合せからなる群より選択される症状を軽減する。
【０２４３】
治療上有効量の本明細書に記載されるような化合物または組成物をヒトに投与し、それにより代謝性疾患を軽減または予防することを含む、代謝性疾患を軽減または予防する方法がさらに提供される。
【０２４４】
治療上有効量の本明細書に記載されるような化合物または組成物をヒトに投与し、それにより糖尿病を軽減または予防することを含む、糖尿病を軽減または予防する方法がさらに提供される。
【０２４５】
代謝性疾患の症状を改善する方法であって、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む化合物を必要とする人に投与することを含み、前記修飾型オリゴヌクレオチドは配列番号１、２または３に特異的にハイブリダイズし、それによりそのヒトの代謝性疾患の症状が改善する方法がさらに提供される。
【０２４６】
糖尿病の症状を改善する方法であって、１０〜３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む化合物を必要とする人に投与することを含み、前記修飾型オリゴヌクレオチドは配列番号１、２または３に特異的にハイブリダイズし、それによりそのヒトの糖尿病の症状が改善する方法がさらに提供される。
【０２４７】
糖尿病の症状を改善する方法であって、２０個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む化合物を必要とする人に投与することを含み、前記修飾型オリゴヌクレオチドは配列番号１、２または３に特異的にハイブリダイズし、それによりそのヒトの糖尿病の症状が改善する方法がさらに提供される。
【０２４８】
代謝性疾患に関係する症状の進行を減速させる方法であって、１０〜３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む化合物を必要とするヒトに投与し、前記修飾型オリゴヌクレオチドは配列番号１、２または３に特異的にハイブリダイズし、それによりそのヒトの代謝性疾患の症状の進行が減速する方法がさらに提供される。
【０２４９】
糖尿病に関係する症状の進行を減速させる方法であって、２０〜３５個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチド含む化合物を必要とするヒトに投与し、前記修飾型オリゴヌクレオチドは配列番号１、２または３に特異的にハイブリダイズし、それによりそのヒトの糖尿病の症状の進行が減速する方法がさらに提供される。
【０２５０】
糖尿病に関係する症状の進行を減速させる方法であって、２０個の連結したヌクレオシドからなる修飾型オリゴヌクレオチド含む化合物を必要とするヒトに投与し、前記修飾型オリゴヌクレオチドは配列番号１、２または３に特異的にハイブリダイズし、それによりそのヒトの糖尿病の症状の進行が減速する方法がさらに提供される。
【０２５１】
代謝性疾患の治療、予防または改善用の医薬の調製のための方法および化合物もまた提供される。
【０２５２】
糖尿病の治療、予防または改善用の医薬の調製のための方法および化合物もまた提供される。
【０２５３】
ある特定の実施形態は、代謝性疾患の治療、改善または予防用の医薬の製造における本明細書に記載されるような化合物の使用法を提供する。
【０２５４】
ある特定の実施形態は、糖尿病の治療、改善または予防用の医薬の製造における本明細書に記載されるような化合物の使用法を提供する。
【０２５５】
ある特定の実施形態は、追加の薬剤との併用療法または本明細書に記載されるような治療法による、本明細書に記載されるような代謝性疾患の治療、予防または改善に使用される、本明細書に記載されるような化合物を提供する。薬剤または治療法を共投与または同時投与することができる。
【０２５６】
ある特定の実施形態は、追加の薬剤との併用療法または本明細書に記載されるような治療法による、本明細書に記載されるような糖尿病の治療、予防または改善に使用される、本明細書に記載されるような化合物を提供する。薬剤または治療法を共投与または同時投与することができる。
【０２５７】
ある特定の実施形態は、追加の薬剤との併用療法または本明細書に記載されるような治療法による、本明細書に記載されるような代謝性疾患の治療、予防または改善用の医薬の製造における本明細書に記載されるような化合物の使用法を提供する。薬剤または治療法を共投与または同時投与することができる。
【０２５８】
ある特定の実施形態は、追加の薬剤との併用療法または本明細書に記載されるような治療法による、本明細書に記載されるような糖尿病の治療、予防または改善用の医薬の製造における本明細書に記載されるような化合物の使用法を提供する。薬剤または治療法を共投与または同時投与することができる。
【０２５９】
ある特定の実施形態は、本明細書に記載されるような追加の薬剤または治療法が後に投与される患者での本明細書に記載されるような代謝性疾患の治療、予防または改善用の医薬の製造における本明細書に記載されるような化合物の使用法を提供する。
【０２６０】
ある特定の実施形態は、本明細書に記載されるような追加の薬剤または治療法が後に投与される患者での本明細書に記載されるような糖尿病の治療、予防または改善用の医薬の製造における本明細書に記載されるような化合物の使用法を提供する。
【０２６１】
ある特定の実施形態は、本明細書に記載されるような代謝性疾患の治療、予防または改善用のキットであって、
（ｉ）本明細書に記載されるような化合物；および、代わりに
（ｉｉ）本明細書に記載されるような追加の薬剤または治療法
を含む前記キットを提供する。
【０２６２】
ある特定の実施形態は、本明細書に記載されるような糖尿病の治療、予防または改善用のキットであって、
（ｉ）本明細書に記載されるような化合物；および、代わりに
（ｉｉ）本明細書に記載されるような追加の薬剤または治療法
を含む前記キットを提供する。
【０２６３】
本明細書に記載されるようなキットは、本明細書に記載されるような併用療法により本明細書に記載されるような代謝性疾患を治療、予防または改善するためにそのキットを使用するための使用説明書をさらに含み得る。ある特定の実施形態では、前記代謝性疾患は糖尿病である。
【０２６４】
アンチセンス化合物
オリゴマー化合物にはオリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオシド、オリゴヌクレオチド類似体、オリゴヌクレオチド模倣物、アンチセンス化合物、アンチセンスオリゴヌクレオチドおよびｓｉＲＮＡが含まれるが、これらに限定されない。オリゴマー化合物は標的核酸に対して「アンチセンス」であり得るが、それは、水素結合を介した標的核酸へのハイブリダイゼーションを行うことができることを意味する。
【０２６５】
ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、５’から３’方向で記述されると、それが標的とする標的核酸の標的セグメントの逆相補的配列を含む核酸塩基配列を有する。特定のそのような実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、５’から３’方向で記述されると、それが標的とする標的核酸の標的セグメントの逆相補的配列を含む核酸塩基配列を有する。
【０２６６】
ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするアンチセンス化合物は長さが１０〜３０ヌクレオチドである。すなわち、アンチセンス化合物は１０個から３０個までの連結した核酸塩基である。ほかの実施形態では、前記アンチセンス化合物は、８〜８０個、１０〜５０個、１５〜３０個、１８〜２１個、２０〜８０個、２０〜３５個、２０〜３０個、２０〜２９個、２０〜２８個、２０〜２７個、２０〜２６個、２０〜２５個、２０〜２４個、２０〜２３個、２０〜２２個、２０〜２１個または２０個の連結した核酸塩基からなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む。特定のそのような実施形態では、アンチセンス化合物は８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９または８０個の長さの、または上記の値のいずれか２つにより限定される範囲の連結した核酸塩基からなる修飾型オリゴヌクレオチドを含む。
【０２６７】
ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物は短縮化または切断化修飾型オリゴヌクレオチドを含む。短縮化または切断化修飾型オリゴヌクレオチドは５’末端（５’切断）、または代わりに３’末端（３’切断）から１個のヌクレオシドを欠失させることができる。短縮化または切断化修飾型オリゴヌクレオチドは２つのヌクレオシドを５’末端から欠失させることができ、または代わりに３’から２個のサブユニットを欠失させることができる。あるいは、例えば、５’末端から１個のヌクレオシドを欠失させ、３’末端から１個のヌクレオシドを欠失させたアンチセンス化合物において、欠失したヌクレオシドは前記修飾型オリゴヌクレオチド全体に散在し得る。
【０２６８】
延長型オリゴヌクレオチドに１個の追加のヌクレオシドが存在するとき、その追加のヌクレオシドは前記オリゴヌクレオチドの５’末端または３’末端に位置することができる。２個以上の追加のヌクレオシドが存在するとき、例えば、オリゴヌクレオチドの５’末端（５’付加）、または代わりに３’末端（３’付加）に２個のヌクレオシドが付加されているオリゴヌクレオチドでは、その付加されたヌクレオシドは互いに隣接することができる。あるいは、例えば１個のヌクレオシドが５’末端に付加され、１個のサブユニットが３’末端に付加されているオリゴヌクレオチドでは、付加されたヌクレオシドはアンチセンス化合物全体に散在させることができる。
【０２６９】
活性を損なうことなく、アンチセンスオリゴヌクレオチドなどのアンチセンス化合物の長さを増加もしくは減少することができ、および／またはミスマッチ塩基を導入することができる。例えば、Woolfら（Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:7305-7309, 1992）では、卵母細胞注入モデルで標的ＲＮＡの切断を誘導する能力について１３〜２５核酸塩基長の一連のアンチセンスオリゴヌクレオチドが試験された。アンチセンスオリゴヌクレオチドの末端付近に８または１１か所のミスマッチ塩基を有する２５核酸塩基長のアンチセンスオリゴヌクレオチドが、ミスマッチを含まないアンチセンスオリゴヌクレオチドよりも程度が低いものの標的ｍＲＮＡの特異的な切断を指令することができた。同様に、１または３か所のミスマッチを有するものを含む、１３核酸塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチドを使用して標的特異的切断が達成された。
【０２７０】
Gautschiら（J. Natl. Cancer Inst. 93:463-471, March 2001）は、ｂｃｌ−２  ｍＲＮＡに対して１００％の相補性を有し、および、ｂｃｌ−ｘＬ  ｍＲＮＡに対して３か所のミスマッチを有するオリゴヌクレオチドがｂｃｌ−２とｂｃｌ−ｘＬの両方の発現をインビトロとインビボで低下させる能力を示した。さらに、このオリゴヌクレオチドは強力な抗腫瘍活性をインビボで示した。
【０２７１】
MaherおよびDolnick（Nuc. Acid. Res. 16:3341-3358,1988）は、ウサギ網赤血球アッセイでヒトＤＨＦＲの翻訳を停止させる能力について一連の１４核酸塩基のタンデムアンチセンスオリゴヌクレオチド、ならびに、それぞれ２つまたは３つのそのタンデムアンチセンスオリゴヌクレオチドの配列から構成される２８核酸塩基および４２核酸塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチドを試験した。２８核酸塩基または４２核酸塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチドよりも控えめなレベルではあったが、前記の３つの１４核酸塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれだけでも翻訳を阻害することができた。
【０２７２】
アンチセンス化合物モチーフ
ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするアンチセンス化合物は、強化された阻害活性、標的核酸への増大した結合親和性、または生体内核酸分解酵素による分解に対する抵抗性などの特性を前記アンチセンス化合物に付与するための、パターンまたはモチーフとして配列されている化学的に修飾されたサブユニットを有する。
【０２７３】
キメラアンチセンス化合物は通常、核酸分解酵素による分解に対する増大した抵抗性、増加した細胞内取り込み、標的核酸への増大した結合親和性および／または増加した阻害活性を付与するように修飾された少なくとも１つの領域を含有する。キメラアンチセンス化合物の第２領域は、ＲＮＡ：ＤＮＡ二本鎖のＲＮＡ鎖を切断する細胞性エンドヌクレアーゼＲＮａｓｅ  Ｈの基質として働いても働かなくてもよい。
【０２７４】
ギャップマーモチーフを有するアンチセンス化合物はキメラアンチセンス化合物とみなされる。ギャップマーでは、ＲＮａｓｅＨ切断を助ける複数のヌクレオチドを有する内部領域は、その内部領域のヌクレオシドと化学的に異なる複数のヌクレオチドを有する外部領域の間に位置する。ギャップマーモチーフを有するアンチセンスオリゴヌクレオチドの場合、ギャップセグメントは一般にエンドヌクレアーゼ切断の基質として働くが、ウイングセグメントは修飾型ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態では、ギャップマーの領域は、それぞれの別個の領域を含む糖部分の種類が様々である。ギャップマーの領域に差異を生じさせるために使用される糖部分の種類には、いくつかの実施形態では、β−Ｄ−リボヌクレオシド、β−Ｄ−デオキシリボヌクレオシド、２’修飾型ヌクレオシド（そのような２’−修飾型ヌクレオシドは、中でも２’−ＭＯＥおよび２’−Ｏ−ＣＨ３を含み得る）、および二環式糖修飾型ヌクレオシド（そのような二環式糖修飾型ヌクレオシドには拘束エチルを有するヌクレオシドが含まれ得る）が含まれ得る。ある特定の実施形態では、ウイングは、例えば、２’−ＭＯＥおよび拘束エチルを含む、いくつかの修飾型糖部分を含み得る。ある特定の実施形態では、ウイングはいくつかの修飾型および非修飾型糖部分を含み得る。ある特定の実施形態では、ウイングは２’−ＭＯＥヌクレオシド、拘束エチルヌクレオシドおよび２’−デオキシヌクレオシドの様々な組合せを含み得る。
【０２７５】
それぞれの別個の領域は均一な糖部分、異型体または交替性の糖部分を含み得る。ウイング−ギャップ−ウイングモチーフはしばしば「Ｘ−Ｙ−Ｚ」と記述され、「Ｘ」は５’−ウイングの長さを表し、「Ｙ」はギャップの長さを表し、「Ｚ」は３’−ウイングの長さを表す。「Ｘ」と「Ｚ」は均一な糖部分、異型体または交替性の糖部分を含み得る。ある特定の実施形態では、「Ｘ」と「Ｙ」は１個以上の２’−デオキシヌクレオシドを含み得る。「Ｙ」は２’−デオキシヌクレオシドを含み得る。本明細書で使用される場合、「Ｘ−Ｙ−Ｚ」と記述されるギャップマーは、ギャップが５’−ウイングと３’−ウイングのそれぞれに直ぐに隣接して位置するような配置を有する。したがって、５’−ウイングとギャップの間、またはギャップと３’−ウイングの間に介在性ヌクレオチドが存在しない。本明細書に記載されるアンチセンス化合物のいずれもギャップマーモチーフを有し得る。ある特定の実施形態では、「Ｘ」と「Ｚ」が同一であり、他の実施形態ではそれらは異なる。ある特定の実施形態では、「Ｙ」は８ヌクレオシドと１５ヌクレオシドの間である。Ｘ、ＹまたはＺは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０またはそれ以上のヌクレオシドのいずれかであり得る。 
【０２７６】
ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするアンチセンス化合物は５−１０−５ギャップマーモチーフを有する。
【０２７７】
ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするアンチセンス化合物は６−８−６ギャップマーモチーフを有する。
【０２７８】
ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするアンチセンス化合物は５−８−５ギャップマーモチーフを有する。
【０２７９】
ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするアンチセンス化合物はギャップ拡張モチーフを有する。
【０２８０】
ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするアンチセンス化合物は２−１３−５のギャップ拡張モチーフを有する。
【０２８１】
標的核酸、標的領域およびヌクレオチド配列
ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸は、ＧＥＮＢＡＮＫ受託番号ＮＭ＿００２８２７．２（配列番号１として本明細書に組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫ受託番号ＮＴ＿０１１３６２．９から切り出した１４１７８０００から１４２５６０００まで（配列番号２として本明細書に組み込まれる）；およびアカゲザルＰＴＰ１Ｂ足場のエクソン１〜９、イントロン９およびエクソン１０の配列の連鎖（配列番号３として本明細書に組み込まれる）に示されるような配列のいずれかである。
【０２８２】
本明細書に含まれる実施例の各配列番号で示される配列は糖部分、ヌクレオシド間結合または核酸塩基に対する任意の修飾と無関係であることが理解される。したがって、配列番号によって限定されるアンチセンス化合物は、糖部分、ヌクレオシド間結合または核酸塩基に対して１つ以上の修飾を独立して含み得る。Ｉｓｉｓ番号（Ｉｓｉｓ番号）で記述されるアンチセンス化合物は核酸塩基配列とモチーフの組合せを示す。
【０２８３】
ある特定の実施形態では、標的領域は標的核酸の構造的に限定された領域である。例えば、標的領域は３’ＵＴＲ、５’ＵＴＲ、エクソン、イントロン、エクソン／イントロンジャンクション、コード領域、翻訳開始領域、翻訳終止領域または他の限定的な核酸領域を包含し得る。ＮＣＢＩなどの配列データベースから受託番号によってＰＴＰ１Ｂの構造的に限定された領域を入手することができ、そして、そのような情報が参照により本明細書に組み込まれる。ある特定の実施形態では、標的領域は標的領域内の１つの標的セグメントの５’標的部位から同じ標的領域内の別の標的セグメントの３’標的部位までの配列を包含することができる。
【０２８４】
標的化には、所望の効果が生じるように、アンチセンス化合物がハイブリダイズする少なくとも１つの標的セグメントの決定が含まれる。ある特定の実施形態では、所望の効果はｍＲＮＡ標的核酸レベルの低下である。ある特定の実施形態では、所望の効果は標的核酸によってコードされるタンパク質のレベルの低下または標的核酸が関係する表現型の変化である。
【０２８５】
標的領域は１つ以上の標的セグメントを含み得る。標的領域内の複数の標的セグメントが重なり合ってよい。あるいは、それらは重なり合っていなくてよい。ある特定の実施形態では、標的領域内の標的セグメントは約３００を超えないヌクレオチドによって分断されている。ある特定の実施形態では、標的領域内の標的セグメントは標的核酸上の２５０、２００、１５０、１００、９０、８０、７０、６０、５０、４０、３０、２０、もしくは１０ヌクレオチドの、約２５０、２００、１５０、１００、９０、８０、７０、６０、５０、４０、３０、２０、もしくは１０ヌクレオチドの、２５０、２００、１５０、１００、９０、８０、７０、６０、５０、４０、３０、２０、もしくは１０ヌクレオチドを超えない、約２５０、２００、１５０、１００、９０、８０、７０、６０、５０、４０、３０、２０、もしくは１０ヌクレオチドを超えない多数のヌクレオチドによって分断されている、または前述の値のうちのいずれか２つによって限定される範囲にあるヌクレオチドによって分断されている。ある特定の実施形態では、標的領域内の標的セグメントは、標的核酸上の５以下または約５以下のヌクレオチドによって分断されている。ある特定の実施形態では、標的セグメントは連続している。本明細書に列挙される５’標的部位または３’標的部位のいずれかである出発核酸を有する範囲によって限定される標的範囲が企図されている。
【０２８６】
５’ＵＴＲ、コード領域、３’ＵＴＲ、イントロン、エクソンまたはエクソン／イントロンジャンクション内に適切な標的セグメントを見つけることができる。開始コドンまたは終止コドンを含む標的セグメントも適切な標的セグメントである。適切な標的セグメントは、開始コドンまたは終止コドンなどの特定の構造的に限定された領域を特異的に排除することができる。
【０２８７】
適切な標的セグメントの決定には、標的核酸の配列のゲノム全体の他の配列に対する比較が含まれ得る。例えば、様々な核酸の間でにている領域を特定するためにＢＬＡＳＴアルゴリズムを使用することができる。この比較によって、選択された標的核酸以外の配列（すなわち、非標的配列または標的外配列）に非特異的にハイブリダイズし得るアンチセンス化合物配列の選択を防ぐことができる。
【０２８８】
活性標的領域内におけるアンチセンス化合物の（例えば、標的核酸レベルのパーセント減少で定義されるような）活性は様々であり得る。ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルの低下はＰＴＰ１Ｂ発現の阻害を示す。ＰＴＰ１Ｂタンパク質レベルの低下も標的ｍＲＮＡの発現の阻害を示す。さらに、表現型の変化がＰＴＰ１Ｂ発現の阻害を示す。ある特定の実施形態では、グルコースレベルの低下、脂質レベルの低下および体重の減少がＰＴＰ１Ｂ発現の阻害を示し得る。ある特定の実施形態では、代謝性疾患関連の症状の改善がＰＴＰ１Ｂ発現の阻害を示し得る。ある特定の実施形態では、糖尿病関連の症状の改善がＰＴＰ１Ｂ発現の阻害を示し得る。ある特定の実施形態では、インスリン抵抗性の低下がＰＴＰ１Ｂ発現の阻害を示す。ある特定の実施形態では、糖尿病バイオマーカーの減少がＰＴＰ１Ｂ発現の阻害を示し得る。
【０２８９】
ハイブリダイゼーション
いくつかの実施形態では、ハイブリダイゼーションが本発明で開示されるアンチセンス化合物とＰＴＰ１Ｂ核酸の間で起こる。ハイブリダイゼーションの最も一般的な機序には核酸分子の相補的な核酸塩基の間の水素結合（例えば、ワトソン−クリック型水素結合、フーグスティーン型水素結合または逆フーグスティーン型水素結合）が関わる。
【０２９０】
ハイブリダイゼーションは様々な条件下で起こり得る。ストリンジェントな条件は配列依存的であり、ハイブリダイズされる核酸分子の性質と組成によって決定される。
【０２９１】
配列が標的核酸に特異的にハイブリダイズすることが可能であるかどうか判定する方法は当技術分野で周知である。ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるアンチセンス化合物はＰＴＰ１Ｂ核酸に特異的にハイブリダイズすることが可能である。
【０２９２】
相補性
アンチセンス化合物の十分な数の核酸塩基が標的核酸の対応する核酸塩基と水素結合することができるとき、前記のアンチセンス化合物と標的核酸は互いに相補的であり、所望の効果（例えば、ＰＴＰ１Ｂ核酸などの標的核酸のアンチセンス阻害）が生じる。
【０２９３】
アンチセンス化合物はＰＴＰ１Ｂ核酸の１つ以上のセグメントに、介在性セグメントまたは隣接セグメントがハイブリダイゼーション事象に関わらないように、ハイブリダイズすることができる（例えば、ループ構造、ミスマッチ構造またはヘアピン構造）。
【０２９４】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるアンチセンス化合物、またはそれらの特定の部分はＰＴＰ１Ｂ核酸、その標的領域、標的セグメントまたは特定の部分に対して７０％、８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％もしくは１００％相補的である、または少なくとも７０％、８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％もしくは１００％相補的である。日常的方法を用いてアンチセンス化合物の標的核酸とのパーセント相補性を決定することができる。
【０２９５】
例えば、アンチセンス化合物の２０核酸塩基のうち１８核酸塩基が標的領域に相補的であり、それ故、特異的にハイブリダイズするだろうアンチセンス化合物なら９０パーセントの相補性を表すだろう。この例では、残りの非相補的核酸塩基はクラスターを形成していても相補的な核酸塩基がそれらの間に点在していてもよく、互いに対して、または相補的な核酸塩基に対して連続していなくてよい。したがって、標的核酸と完全に相補的な２つの領域が隣接する４個の非相補的核酸塩基を有する１８核酸塩基長のアンチセンス化合物なら標的核酸と全体で７７．８％の相補性を有し、従って、本明細書の範囲内に収まるだろう。当技術分野において公知のＢＬＡＳＴ（基本的局所アラインメント検索ツール（basic local alignment search tools））プログラムとＰｏｗｅｒＢＬＡＳＴプログラムを使用して標的核酸の領域を有するアンチセンス化合物のパーセント相補性を日常的に決定することができる（Altschulら, J. Mol. Biol., 1990, 215, 403 410; Zhang and Madden, Genome Res., 1997, 7, 649 656）。例えば、初期設定を用いる、Ｓｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎアルゴリズム（Adv. Appl. Math., 1981, 2, 482 489）を使用するＧａｐプログラム（Wisconsin Sequence Analysis Package, Version 8 for Unix, Genetics Computer Group, University Research Park, Madison Wis.）によりパーセント相同性、配列同一性または相補性を決定することができる。
【０２９６】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるアンチセンス化合物またはそれらの特定の部分は、標的核酸またはその特定の部分に対して完全に相補的（すなわち、１００％相補的）である。例えば、アンチセンス化合物はＰＴＰ１Ｂ核酸、または標的領域、またはその標的セグメントもしくは標的配列に対して完全に相補的であり得る。本明細書で使用される場合、「完全に相補的な」は、アンチセンス化合物の各核酸塩基が標的核酸の対応する核酸塩基と正確に塩基対合することができることを意味する。例えば、２０核酸塩基のアンチセンス化合物は、そのアンチセンス化合物に対して完全に相補的である対応する２０核酸塩基部分が標的核酸に存在する限り、４００核酸塩基長の標的配列に対して完全に相補的である。第１核酸および／または第２核酸の特定の部分への言及において「完全に相補的な」を使用することもできる。例えば、３０核酸塩基のアンチセンス化合物の２０核酸塩基部分は４００核酸塩基長の標的配列に対し「完全に相補的」であり得る。前記標的配列が対応する２０核酸塩基部分を有し、その各核酸塩基が前記のアンチセンス化合物の２０核酸塩基部分に相補的である場合、前記の３０核酸塩基のオリゴヌクレオチドの前記２０核酸塩基部分は前記標的配列に対して完全に相補的である。同時に、前記アンチセンス化合物の残りの１０核酸塩基も前記標的配列に相補的であるかどうかによって、前記３０核酸塩基のアンチセンス化合物の全体は前記標的配列に対して完全に相補的である場合もあれば、完全には相補的ではない場合もある。
【０２９７】
非相補的核酸塩基の位置は、アンチセンス化合物の５’末端または３’末端であり得る。あるいは、非相補的核酸塩基（単数または複数）はアンチセンス化合物の内部にあり得る。２つ以上の非相補的核酸塩基が存在するとき、それらは連続（すなわち連結）していても、連続していなくてもよい。１つの実施形態では、ギャップマーアンチセンスオリゴヌクレオチドのウイングセグメントに非相補的核酸塩基が位置する。
【０２９８】
ある特定の実施形態では、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０核酸塩基長の、または最大で１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０核酸塩基長のアンチセンス化合物は、ＰＴＰ１Ｂ核酸などの標的核酸またはその特定の部分に対して４個を超えない、３個を超えない、２個をこえない、または１個を超えない非相補的核酸塩基を含む。
【０２９９】
ある特定の実施形態では、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９もしくは３０核酸塩基長の、または最大で１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９もしくは３０核酸塩基長のアンチセンス化合物は、ＰＴＰ１Ｂ核酸などの標的核酸またはその特定の部分に対して６個を超えない、５個を超えない、４個を超えない、３個を超えない、２個を超えないまたは１を超えない非相補的核酸塩基を含む。
【０３００】
本明細書で提供されるアンチセンス化合物は、標的核酸のある部分に相補的であるものも包含する。本明細書で使用される場合、「部分」は、標的核酸の領域またはセグメント内にある限定された数の連続する（すなわち、連結した）核酸塩基を指す。「部分」はアンチセンス化合物の限定された数の連続する核酸塩基も指すことができる。ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも８核酸塩基の部分に相補的である。ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも１２核酸塩基の部分に相補的である。ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも１３核酸塩基の部分に相補的である。ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも１４核酸塩基の部分に相補的である。ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも１５核酸塩基の部分に相補的である。ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも１６核酸塩基の部分に相補的である。ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも１７核酸塩基の部分に相補的である。ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも１８核酸塩基の部分に相補的である。ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも１９核酸塩基の部分に相補的である。ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも２０核酸塩基の部分に相補的である。標的セグメントの少なくとも９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０またはそれより多い核酸塩基部分またはこれらの値のうちのいずれか２つによって限定される範囲の核酸塩基部分に相補的であるアンチセンス化合物も企図されている。
【０３０１】
同一性
本明細書で提供されるアンチセンス化合物は、特定のヌクレオチド配列、配列番号、または特定のＩｓｉｓ番号で表される化合物、またはそれらの部分に対する限定されたパーセント同一性を有することもできる。本明細書で使用される場合、アンチセンス化合物は、それが同一の核酸塩基対合能力を有する場合、本明細書で開示される配列に対して同一である。例えば、開示されるＤＮＡ配列中にチミジンの代わりにウラシルを含有するＲＮＡは、ウラシルとチミジンの両方がアデニンと対合するので、そのＤＮＡ配列に対して同一であるとみなされるだろう。本明細書に記載されるアンチセンス化合物の短縮型および延長型ならびに本明細書で提供されるアンチセンス化合物に対して同一ではない塩基を有する化合物もまた企図されている。同一ではない塩基は互いに隣接していてもアンチセンス化合物全体に散在していてもよい。アンチセンス化合物のパーセント同一性は、それが比較される配列に対する同一の塩基対合を有する塩基の数にしたがって計算される。
【０３０２】
ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物またはそれらの部分は、本明細書で開示されるアンチセンス化合物または配列番号、またはそれらの部分のうちの１つ以上と少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％同一である。
【０３０３】
修飾
ヌクレオシドは塩基と糖の組合せである。ヌクレオシドの核酸塩基（塩基としても知られる）部分は通常は複素環塩基部分である。ヌクレオチドは、ヌクレオシドの糖部分に共有結合したリン酸基をさらに含むヌクレオシドである。ペントフラノシル糖を含むヌクレオシドでは、リン酸基は糖の２’、３’または５’ヒドロキシル部分に結合し得る。オリゴヌクレオチドは互いに隣接するヌクレオシドの、直鎖重合オリゴヌクレオチドを形成するための共有結合により形成される。オリゴヌクレオチド構造内で、リン酸基はオリゴヌクレオチドのヌクレオシド間結合を形成すると一般に称される。
【０３０４】
アンチセンス化合物に対する修飾は、ヌクレオシド間結合、糖部分または核酸塩基への置換または変更を包含する。修飾型アンチセンス化合物は、多くの場合、例えば、強化された細胞内取込、核酸標的との強化された親和性、核酸分解酵素存在下での増加した安定性、または増加した阻害活性などの望ましい特性のため、天然型よりも好まれる。
【０３０５】
短縮化または切断化アンチセンスオリゴヌクレオチドとその標的核酸との結合親和性を増加させるために化学的に修飾されたヌクレオシドを使用することもできる。その結果、そのような化学的に修飾されたヌクレオシドを有するより短いアンチセンス化合物を使用して、多くの場合、同等の結果を得ることができる。
【０３０６】
修飾型ヌクレオシド間結合
ＲＮＡおよびＤＮＡの天然ヌクレオシド間結合は、３’から５’ホスホジエステル結合である。１つ以上の修飾型、すなわち非天然のヌクレオシド間結合を有するアンチセンス化合物は、例えば強化された細胞内取込、核酸標的との強化された親和性および核酸分解酵素存在下での増加した安定性などの望ましい特性のため、天然のヌクレオシド間結合を有するアンチセンス化合物よりも多く選択される。
【０３０７】
修飾型ヌクレオシド間結合を有するオリゴヌクレオチドは、リン原子を保持するヌクレオシド間結合ならびにリン原子を持たないヌクレオシド間結合を包含する。代表的なリン含有ヌクレオシド間結合にはホスホジエステル、ホスホトリエステル、メチルホスホナート、ホスホラミデートおよびホスホロチオエートが含まれるが、これらに限定されない。リン含有結合およびリン非含有結合の調製方法は周知である。
【０３０８】
ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするアンチセンス化合物は１つ以上の修飾型ヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態では、修飾型ヌクレオシド間結合はホスホロチオエート結合である。ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物の各ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
【０３０９】
修飾型糖部分
本明細書で提供されるアンチセンス化合物は、糖基が修飾されている１つ以上のヌクレオシドを任意で含有することができる。そのような糖修飾型ヌクレオシドは強化された核酸分解酵素安定性、増加した結合親和性または他の有益な生物学的特性をアンチセンス化合物に付与することができる。
ある特定の実施形態では、ヌクレオシドは化学的に修飾されたリボフラノース環部分を含む。化学的に修飾されたリボフラノース環の例には置換基の付加（５’ 置換基および２’置換基を含む）；二環式核酸（ＢＮＡ）を形成するための非ジェミナル環原子の架橋；リボシル環酸素原子のＳ、Ｎ（Ｒ）、またはＣ（Ｒ１）（Ｒ）２（Ｒ＝Ｈ、Ｃ１〜Ｃ１２アルキルまたは保護基）による置換；およびそれらの組合せが挙げられるが、これらに限定されない。化学的に修飾された糖の例としては、２’−Ｆ−５’−メチル置換ヌクレオシド（他の開示された５’，２’−ビス置換ヌクレオシドについては２００８年８月２１日に公開されたＰＣＴ国際特許出願公開第２００８／１０１１５７号を参照のこと）、２’位にさらなる置換を有するリボシル環酸素原子のＳによる置換（２００５年６月１６日に公開された米国特許出願公開第２００５／０１３０９２３号を参照のこと）、または代わりに、ＢＮＡの５’置換（２００７年１１月２２日に公開されたＰＣＴ国際特許出願公開第２００７／１３４１８１号（例えば、５’−メチル基または５’−ビニル基でＬＮＡが置換されている）を参照のこと）が挙げられる。
【０３１０】
修飾型糖部分を有するヌクレオシドの例には、５’−ビニル置換基、５’−メチル置換基（ＲまたはＳ）、４’−Ｓ置換基、２’−Ｆ置換基、２’−ＯＣＨ３置換基および２’−Ｏ（ＣＨ２）２ＯＣＨ３置換基を含むヌクレオシドが挙げられるが、これらに限定されない。２’位の置換基もアリル、アミノ、アジド、チオ、Ｏ−アリル、Ｏ−Ｃ１〜Ｃ１０アルキル、ＯＣＦ３、Ｏ（ＣＨ２）２ＳＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２−Ｏ−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）、およびＯ−ＣＨ２−Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）から選択され得るが、式中、ＲｍおよびＲｎはそれぞれ独立してＨまたは置換型もしくは非置換型のＣ１〜Ｃ１０アルキルである。
【０３１１】
本明細書で使用される場合、「二環式ヌクレオシド」は、二環式糖部分を含む修飾型ヌクレオシドを指す。二環式ヌクレオシドの例としては、４’と２’リボシル環原子間の架橋を含むヌクレオシドが挙げられるが、これに限定されない。ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるアンチセンス化合物は、架橋が４’から２’二環式ヌクレオシドを含む１個以上の二環式ヌクレオシドを含む。そのような４’から２’二環式ヌクレオシドの例としては式：４’−（ＣＨ２）−Ｏ−２’（ＬＮＡ）；４’−（ＣＨ２）−Ｓ−２’；４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’（ＥＮＡ）；４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’および４’−ＣＨ（ＣＨ２ＯＣＨ３）−Ｏ−２’のうちの１つ、およびその類似体（２００８年７月１５日に発行された米国特許第７，３９９，８４５号を参照のこと）；４’−Ｃ（ＣＨ３）（ＣＨ３）−Ｏ−２’およびその類似体（２００９年１月８日に公開されたＰＣＴ国際特許出願公開第２００９／００６４７８号を参照のこと）；４’−ＣＨ２−Ｎ（ＯＣＨ３）−２’およびその類似体（２００８年１２月１１日に公開されたＰＣＴ国際特許出願公開第２００８／１５０７２９号を参照のこと）；４’−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（ＣＨ３）−２’（２００４年９月２日に公開された米国特許出願公開第２００４／０１７１５７０号を参照のこと）；４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−２’（ここでＲはＨ、Ｃ１〜Ｃ１２アルキルまたは保護基である）（２００８年９月２３日に発行された米国特許第７，４２７，６７２号を参照のこと）；４’−ＣＨ２−Ｃ（Ｈ）（ＣＨ３）−２’（ Chattopadhyayaら, J.  Org.  Chem.,2009, 74, 118-134を参照のこと）；および４’−ＣＨ２−Ｃ（＝ＣＨ２）−２’およびその類似体（２００８年１２月８日に公開されたＰＣＴ国際特許出願公開第２００８／１５４４０１号を参照のこと）が挙げられるが、これらに限定されない。例えば、Singhら, Chem.  Commun., 1998, 4, 455-456; Koshkinら, Tetrahedron, 1998, 54, 3607-3630; Wahlestedtら, Proc.  Natl.  Acad.  Sci.  U.  S.  A., 2000, 97, 5633-5638; Kumarら, Bioorg.  Med.  Chem.  Lett., 1998, 8, 2219-2222; Singhら, J.  Org.  Chem., 1998, 63, 10035-10039; Srivastavaら, J.  Am.  Chem.  Soc., 129(26) 8362-8379 (Jul.  4, 2007); Elayadiら, Curr.  Opinion Invens.  Drugs, 2001, 2, 558-561; Braaschら, Chem.  Biol., 2001, 8, 1-7; Orumら, Curr.  Opinion Mol.  Ther., 2001, 3, 239-243; 米国特許第６，６７０，４６１号、同第７，０５３，２０７号、同第６，２６８，４９０号、同第６，７７０，７４８号、同第６，７９４，４９９号、同第７，０３４，１３３号、同第６，５２５，１９１号、同第７，３９９，８４５号；ＰＣＴ国際特許出願公開第２００４／１０６３５６号、同第９４／１４２２６号、同第２００５／０２１５７０号および同第２００７／１３４１８１号；米国特許公開第２００４／０１７１５７０号、同第２００７／０２８７８３１号および同第２００８／００３９６１８号；および米国特許出願第１２／１２９，１５４号、同第６０／９８９，５７４号、同第６１／０２６，９９５号、同第６１／０２６，９９８号、同第６１／０５６，５６４号、同第６１／０８６，２３１号、同第６１／０９７，７８７および同第６１／０９９，８４４号；およびＰＣＴ国際特許出願第ＰＣＴ／ＵＳ２００８／０６４５９１号、同第ＰＣＴ／ＵＳ２００８／０６６１５４号、および同第ＰＣＴ／ＵＳ２００８／０６８９２２号も参照のこと。前述の二環式ヌクレオシドはそれぞれ、例えばα−Ｌ−リボフラノースおよびβ−Ｄ−リボフラノースを含む１つ以上の立体化学的糖構造を有して調製され得る（国際公開第９９／１４２２６号として１９９９年３月２５日に公開されたＰＣＴ国際特許出願第ＰＣＴ／ＤＫ９８／００３９３号を参照のこと）。
【０３１２】
ある特定の実施形態では、ＢＮＡヌクレオシドの二環式糖部分は、限定ではないが、ペントフラノシル糖部分の４’位と２’位間に少なくとも１つの架橋を有し、そのような架橋が−［Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ−、−Ｃ（Ｒａ）＝Ｃ（Ｒｂ）−、−Ｃ（Ｒａ）＝Ｎ−、−Ｃ（＝ＮＲａ）−、−Ｃ（＝Ｏ）−、−Ｃ（＝Ｓ）−、−Ｏ−、−Ｓｉ（Ｒａ）２−、−Ｓ（＝Ｏ）ｘ−および−Ｎ（Ｒａ）−
（式中、
ｘは０、１または２であり；
ｎは１、２、３または４であり；
ＲａとＲｂはそれぞれ独立してＨ、保護基、ヒドロキシル、Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、置換型Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、置換型Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、置換型Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、Ｃ５〜Ｃ２０アリール、置換型Ｃ５〜Ｃ２０アリール、複素環ラジカル、置換型複素環ラジカル、ヘテロアリール、置換型ヘテロアリール、Ｃ５〜Ｃ７脂環式ラジカル、置換型Ｃ５〜Ｃ７脂環式ラジカル、ハロゲン、ＯＪ１、ＮＪ１Ｊ２、ＳＪ１、Ｎ３、ＣＯＯＪ１、アシル（Ｃ（＝Ｏ）−Ｈ）、置換型アシル、ＣＮ、スルホニル（Ｓ（＝Ｏ）２−Ｊ１）、またはスルフオキシル（Ｓ（＝Ｏ）−Ｊ１）であり；
Ｊ１とＪ２がそれぞれ独立してＨ、Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、置換型Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、置換型Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、置換型Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、Ｃ５〜Ｃ２０アリール、置換型Ｃ５〜Ｃ２０アリール、アシル（Ｃ（＝Ｏ）−Ｈ）、置換型アシル、複素環ラジカル、置換型複素環ラジカル、Ｃ１〜Ｃ１２アミノアルキル、置換型Ｃ１〜Ｃ１２アミノアルキル、または保護基である）
より独立して選択される１個または２個から４個の連結した基を独立して含む、化合物を含む。
【０３１３】
ある特定の実施形態では、二環式糖部分の架橋は−［Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ−、−［Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ−Ｏ−、−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−または−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｏ−Ｎ（Ｒ）−である。ある特定の実施形態では、架橋は４’−ＣＨ２−２’、４’−（ＣＨ２）２−２’、４’−（ＣＨ２）３−２’、４’−ＣＨ２−Ｏ−２’、４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’、４’−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（Ｒ）−２’および４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−２’−であり、式中、各Ｒは独立してＨ、保護基またはＣ１〜Ｃ１２アルキルである。
【０３１４】
ある特定の実施形態では、異性体配置によって二環式ヌクレオシドをさらに定義する。例えば、４’−２’メチレン−オキシ架橋を含むヌクレオシドは、α−Ｌ配置またはβ−Ｄ配置であり得る。これまでに、α−Ｌ−メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＢＮＡがアンチセンスオリゴヌクレオチドに組み込まれ、アンチセンス活性を示している（Friedenら, Nucleic Acids Research, 2003, 21, 6365-6372）。
【０３１５】
ある特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドには、限定ではないが、以下に図示されるような（Ａ）α−Ｌ−メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＢＮＡ、（Ｂ）β−Ｄ−メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＢＮＡ、（Ｃ）エチレンオキシ（４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’）ＢＮＡ、（Ｄ）アミノオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（Ｒ）−２’）ＢＮＡ、（Ｅ）オキシアミノ（４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−２’）ＢＮＡ、（Ｆ）メチル（メチレンオキシ）（４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’）ＢＮＡ、（Ｇ）メチレン−チオ（４’−ＣＨ２−Ｓ−２’）ＢＮＡ、（Ｈ）メチレン−アミノ（４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）２’）ＢＮＡ、（Ｉ）メチル炭素環式（４’−ＣＨ２−ＣＨ（ＣＨ３）−２’）ＢＮＡおよび（Ｊ）プロピレン炭素環式（４’−（ＣＨ２）３−２’）ＢＮＡ
【０３１６】
【化１】
0005951752.tif 000002
が含まれ、式中、Ｂｘは塩基部分であり、Ｒは独立してＨ、保護基またはＣ１〜Ｃ１２アルキルである。
【０３１７】
ある特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドは式Ｉ：
【０３１８】
【化２】
0005951752.tif 000003
を有し、式中、
Ｂｘは複素環塩基部分であり；
−Ｑａ−Ｑｂ−Ｑｃ−は−ＣＨ２−Ｎ（Ｒｃ）−ＣＨ２−、−Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒｃ）−ＣＨ２−、−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（Ｒｃ）−、−ＣＨ２−Ｎ（Ｒｃ）−Ｏ−または−Ｎ（Ｒｃ）−Ｏ−ＣＨ２であり； 
ＲｃはＣ１〜Ｃ１２アルキルまたはアミノ保護基であり；
ＴａとＴｂはそれぞれ独立してＨ、ヒドロキシル保護基、複合体基、反応性リン基、リン部分、または支持媒体への共有結合である。
【０３１９】
ある特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドは式ＩＩ：
【０３２０】
【化３】
0005951752.tif 000004
を有し、式中、
Ｂｘは複素環塩基部分であり；
ＴａとＴｂはそれぞれ独立してＨ、ヒドロキシル保護基、複合体基、反応性リン基、リン部分または支持媒体への共有結合であり；
ＺａはＣ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、置換型Ｃ１〜Ｃ６アルキル、置換型Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、置換型Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、アシル、置換型アシル、置換型アミド、チオールまたは置換型チオである。
【０３２１】
１つの実施形態では、置換された基はそれぞれハロゲン、オキソ、ヒドロキシル、ＯＪｃ、ＮＪｃＪｄ、ＳＪｃ、Ｎ３、ＯＣ（＝Ｘ）ＪｃおよびＮＪｅＣ（＝Ｘ）ＮＪｃＪｄより独立して選択される置換基で独立して単一置換または多重置換されており、式中、Ｊｃ、ＪｄおよびＪｅはそれぞれ独立してＨ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、または置換型Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり、ＸはＯまたはＮＪｃである。
【０３２２】
ある特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドは式ＩＩＩ：
【０３２３】
【化４】
0005951752.tif 000005
を有し、式中、
Ｂｘは複素環塩基部分であり；
ＴａとＴｂはそれぞれ独立してＨ、ヒドロキシル保護基、複合体基、反応性リン基、リン部分、または支持媒体への共有結合であり；
ＺｂはＣ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、置換型Ｃ１〜Ｃ６アルキル、置換型Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、置換型Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、または置換型アシル（Ｃ（＝Ｏ）−）である。
【０３２４】
ある特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドは式ＩＶ：
【０３２５】
【化５】
0005951752.tif 000006
を有し、式中、
Ｂｘは複素環塩基部分であり；
ＴａとＴｂはそれぞれ独立してＨ、ヒドロキシル保護基、複合体基、反応性リン基、リン部分、または支持媒体への共有結合であり；
ＲｄはＣ１〜Ｃ６アルキル、置換型Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、置換型Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニルまたは置換型Ｃ２〜Ｃ６アルキニルであり；
ｑａ、ｑｂ、ｑｃおよびｑｄはそれぞれ独立してＨ、ハロゲン、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、置換型Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、置換型Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、または置換型Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシル、置換型Ｃ１〜Ｃ６アルコキシル、アシル、置換型アシル、Ｃ１〜Ｃ６アミノアルキル、または置換型Ｃ１〜Ｃ６アミノアルキルである。
【０３２６】
ある特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドは式Ｖ：
【０３２７】
【化６】
0005951752.tif 000007
を有し、式中、
Ｂｘは複素環塩基部分であり；
ＴａとＴｂはそれぞれ独立してＨ、ヒドロキシル保護基、複合体基、反応性リン基、リン部分または支持媒体への共有結合であり；
ｑａ、ｑｂ、ｑｅおよびｑｆはそれぞれ独立して水素、ハロゲン、Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、置換型Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、置換型Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、置換型Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、Ｃ１〜Ｃ１２アルコキシ、置換型Ｃ１〜Ｃ１２アルコキシ、ＯＪｊ、ＳＪｊ、ＳＯＪｊ、ＳＯ２Ｊｊ、ＮＪｊＪｋ、Ｎ３、ＣＮ、Ｃ（＝Ｏ）ＯＪｊ、Ｃ（＝Ｏ）ＮＪｊＪｋ、Ｃ（＝Ｏ）Ｊｊ、Ｏ−Ｃ（＝Ｏ）ＮＪｊＪｋ、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝ＮＨ）ＮＪｊＪｋ、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝Ｏ）ＮＪｊＪｋまたはＮ（Ｈ）Ｃ（＝Ｓ）ＮＪｊＪｋであり；または
ｑｅとｑｆは一緒になって＝Ｃ（ｑｇ）（ｑｈ）であり；
ｑｇとｑｈはそれぞれ独立してＨ、ハロゲン、Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、または置換型Ｃ１〜Ｃ１２アルキルである。
【０３２８】
メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＢＮＡ単量体アデニン、シトシン、グアニン、５−メチル−シトシン、チミンおよびウラシルの合成ならびに調製と共にそれらのオリゴマー化および核酸認識特性について記述されている（例えばKoshkinら, Tetrahedron, 1998, 54, 3607-3630を参照のこと）。ＢＮＡとその調製も国際公開第９８／３９３５２および同第９９／１４２２６号に記載されている。
【０３２９】
メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＢＮＡの類似体、メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＢＮＡおよび２’−チオ−ＢＮＡも調製されている（例えばKumarら, Bioorg.  Med.  Chem.  Lett., 1998, 8, 2219-2222を参照のこと）。核酸ポリメラーゼの基質としてのオリゴデオキシリボヌクレオチド二重鎖を含むロックドヌクレオシド類似体の調製も記述されている（例えばWengelら, 国際公開第９９／１４２２６号を参照のこと）。さらに、新規の立体構造的に限定された高親和性オリゴヌクレオチド類似体である２’−アミノ−ＢＮＡの合成が当技術分野において記述されている（例えばSinghら, J.  Org.  Chem., 1998, 63, 10035-10039を参照のこと）。さらに、２’−アミノ−ＢＮＡおよび２’−メチルアミノ−ＢＮＡが調製されており、それらの二重鎖と相補的なＲＮＡ鎖およびＤＮＡ鎖との熱安定性がこれまでに報告されている。
【０３３０】
ある特定の実施形態では、二環式ヌクレオシドは式ＶＩ：
【０３３１】
【化７】
0005951752.tif 000008
を有し、式中、
Ｂｘは複素環式塩基部分であり；
ＴａとＴｂはそれぞれ独立してＨ、ヒドロキシル保護基、複合体基、反応性リン基、リン部分、または支持媒体への共有結合であり；
ｑｉ、ｑｊ、ｑｋおよびｑｌはそれぞれ独立してＨ、ハロゲン、Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、置換型Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、置換型Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、置換型Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、Ｃ１〜Ｃ１２アルコキシル、置換型Ｃ１〜Ｃ１２アルコキシル、ＯＪｊ、ＳＪｊ、ＳＯＪｊ、ＳＯ２Ｊｊ、ＮＪｊＪｋ、Ｎ３、ＣＮ、Ｃ（＝Ｏ）ＯＪｊ、Ｃ（＝Ｏ）ＮＪｊＪｋ、Ｃ（＝Ｏ）Ｊｊ、Ｏ−Ｃ（＝Ｏ）ＮＪｊＪｋ、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝ＮＨ）ＮＪｊＪｋ、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝Ｏ）ＮＪｊＪｋ、またはＮ（Ｈ）Ｃ（＝Ｓ）ＮＪｊＪｋであり；
ｑｉとｑｊ、またはｑｌとｑｋは一緒になって＝Ｃ（ｑｇ）（ｑｈ）であり、式中、ｑｇとｑｈはそれぞれ独立してＨ、ハロゲン、Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、または置換型Ｃ１〜Ｃ１２アルキルである。
【０３３２】
４’−（ＣＨ２）３−２’架橋を有する１つの炭素環二環式ヌクレオシドおよびアルケニル類似体である架橋４’−ＣＨ＝ＣＨ−ＣＨ２−２’が記述されている（例えばFreierら, Nucleic Acids Research, 1997, 25(22), 4429-4443およびAlbaekら, J.  Org.  Chem., 2006, 71, 7731-7740を参照のこと）。炭素環二環式ヌクレオシドの合成と調製と共にそれらのオリゴマー化および生化学的研究も記述されている（例えばSrivastavaら, J.  Am.  Chem.  Soc.  2007, 129(26), 8362-8379を参照のこと）。
【０３３３】
本明細書で使用される場合、「４’−２’二環式ヌクレオシド」または「４’から２’二環式ヌクレオシド」は、２’炭素原子と４’炭素原子を連結する架橋を含むフラノース環を含む二環式ヌクレオシドを指す。
【０３３４】
本明細書で使用される場合、「単環式ヌクレオシド」は、二環式糖部分ではない修飾型糖部分を含むヌクレオシドを指す。ある特定の実施形態では、ヌクレオシドの糖部分または糖部分類似体は任意の位置で修飾または置換されていてよい。
【０３３５】
本明細書で使用される場合、「２’−修飾型糖」は２’位を修飾されたフラノシル糖を意味する。ある特定の実施形態では、そのような修飾は、ハライド、置換型および非置換型アルコキシ、置換型および非置換型チオアルキル、置換型および非置換型アミノアルキル、置換型および非置換型アルキル、置換型および非置換型アリル、ならびに置換型および非置換型アルキニルを含むが、これらに限定されない置換基から選択される置換基を包含する。ある特定の実施形態では、２’修飾は、限定ではないがＯ［（ＣＨ２）ｎＯ］ｍＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）ｎＮＨ２、Ｏ（ＣＨ２）ｎＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）ｎＯＮＨ２、ＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）Ｎ（Ｈ）ＣＨ３およびＯ（ＣＨ２）ｎＯＮ［（ＣＨ２）ｎＣＨ３］２（ここでｎとｍは１から１０である）を含む置換基から選択される。他の２’−置換基もＣ１〜Ｃ１２アルキル；置換型アルキル；アルケニル；アルキニル；アルカリール；アラルキル；Ｏ−アルカリールまたはＯ−アラルキル；ＳＨ；ＳＣＨ３；ＯＣＮ；Ｃｌ；Ｂｒ；ＣＮ；ＣＦ３；ＯＣＦ３；ＳＯＣＨ３；ＳＯ２ＣＨ３；ＯＮＯ２；ＮＯ２；Ｎ３；ＮＨ２；複素環アルキル；複素環アルカリール；アミノアルキルアミノ；ポリ-アルキルアミノ；置換型シリル；ＲＮＡ切断基；レポーター基；インターカレーター；アンチセンス化合物の薬物動態特性を改善する基；およびアンチセンス化合物の薬力学特性を改善する基、および類似の特性を有する他の置換基から選択され得る。ある特定の実施形態では、修飾型ヌクレオシドは２’−ＭＯＥ側鎖を含む（例えばBakerら, J.  Biol.  Chem., 1997, 272, 11944-12000を参照のこと）。そのような２’−ＭＯＥ置換が、非修飾型ヌクレオシドならびに２’−Ｏ−メチル、Ｏ−プロピルおよびＯ−アミノプロピルなどの他の修飾型ヌクレオシドと比較して結合親和性を向上させたと記載されている。２’−ＭＯＥ置換基を有するオリゴヌクレオチドも、インビボでの使用に有望な特徴を有する遺伝子発現のアンチセンス阻害剤であることが示されている（例えばMartin, P., Helv.  Chim.  Acta, 1995, 78, 486-504; Altmannら, Chimia, 1996, 50, 168-176; Altmannら, Biochem.  Soc.  Trans., 1996, 24, 630-637; およびAltmannら, Nucleosides Nucleotides, 1997, 16, 917-926を参照のこと）。
【０３３６】
本明細書で使用される場合、「修飾型テトラヒドロピランヌクレオシド」または「修飾型ＴＨＰヌクレオシド」は通常のヌクレオシドのペントフラノシル残基が６員のテトラヒドロピラン「糖」で置換されたヌクレオシドを意味する（糖代用物）。修飾型ＴＨＰヌクレオシドには、限定ではないが、当技術分野ではヘキシトール核酸（ＨＮＡ）、アニトール核酸（ＡＮＡ）、マニトール核酸（ＭＮＡ）（Leumann, CJ.  Bioorg.  & Med.  Chem.  (2002) 10:841-854を参照のこと）、フルオロＨＮＡ（Ｆ−ＨＮＡ）と称されるもの、または式Ｘ：
【０３３７】
【化８】
0005951752.tif 000009
を含む化合物を含み、
式中、式Ｘの前記少なくとも１つのテトラヒドロピランヌクレオシド類似体のそれぞれについて独立して、
Ｂｘは複素環塩基部分であり；
Ｔ３とＴ４はそれぞれ独立してテトラヒドロピランヌクレオシド類似体をアンチセンス化合物に結合するヌクレオシド間結合基であり、またはＴ３とＴ４のうち一方がテトラヒドロピランヌクレオシド類似体をアンチセンス化合物に結合するヌクレオシド間結合基であり、Ｔ３とＴ４のうち他方がＨ、ヒドロキシル保護基、連結した複合体基、または５’末端基もしくは３’末端基であり；
ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６およびｑ７はそれぞれ独立してＨ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、置換型Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、置換型Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、または置換型Ｃ２〜Ｃ６アルキニルであり；
Ｒ１とＲ２の一方が水素であり、他方がハロゲン、置換型または非置換型アルコキシ、ＮＪ１Ｊ２、ＳＪ１、Ｎ３、ＯＣ（＝Ｘ）Ｊ１、ＯＣ（＝Ｘ）ＮＪ１Ｊ２、ＮＪ３Ｃ（＝Ｘ）ＮＪ１Ｊ２、およびＣＮから選択され、式中、ＸはＯ、ＳまたはＮＪ１であり、Ｊ１、Ｊ２およびＪ３はそれぞれ独立してＨまたはＣ１〜Ｃ６アルキルである。
【０３３８】
ある特定の実施形態では、ｑｍ、ｑｎ、ｑｐ、ｑｒ、ｑｓ、ｑｔ、およびｑｕがそれぞれＨである式Ｘの修飾型ＴＨＰヌクレオシドが提供される。ある特定の実施形態では、ｑｍ、ｑｎ、ｑｐ、ｑｒ、ｑｓ、ｑｔ、およびｑｕのうちの少なくとも１つがＨ以外である。ある特定の実施形態では、ｑｍ、ｑｎ、ｑｐ、ｑｒ、ｑｓ、ｑｔおよびｑｕのうちの少なくとも１つがメチルである。ある特定の実施形態では、Ｒ１とＲ２の一方がＦである式ＸのＴＨＰヌクレオシドが提供される。ある特定の実施形態では、Ｒ１はフルオロでＲ２はＨであり、Ｒ１はメトキシでＲ２はＨであり、Ｒ１はメトキシエトキシでＲ２はＨである。
【０３３９】
本明細書で使用される場合、「２’−修飾型」または「２’−置換型」は、２’位にＨまたはＯＨ以外の置換基を含む糖を含むヌクレオシドを指す。２’−修飾型ヌクレオシドには、限定ではないが、糖環の２つの炭素原子を連結する架橋が糖環の２’炭素と別の炭素を連結する二環式ヌクレオシド、およびアリル、アミノ、アジド、チオ、Ｏ−アリル、Ｏ−Ｃ１〜Ｃ１０アルキル、−ＯＣＦ３、Ｏ−（ＣＨ２）２−Ｏ−ＣＨ３、２’−Ｏ（ＣＨ２）２ＳＣＨ３、Ｏ−（ＣＨ２）２−Ｏ−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）またはＯ−ＣＨ２−Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）（ここで各ＲｍとＲｎは独立してＨまたは置換型もしくは非置換型Ｃ１〜Ｃ１０アルキルである）などの非架橋２’置換基を有するヌクレオシドが含まれる。２’−修飾型ヌクレオシドは、例えば糖の他の位置および／または核酸塩基に他の修飾をさらに含むことができる。
【０３４０】
本明細書で使用される場合、「２’−Ｆ」は２’位にフルオロ基を含む糖を指す。
【０３４１】
本明細書で使用される場合、「２’−ＯＭｅ」または「２’−ＯＣＨ３」または「２’−Ｏ−メチル」はそれぞれ糖環の２’位に−ＯＣＨ３基を含む糖を指す。
【０３４２】
本明細書で使用される場合、「オリゴヌクレオチド」は複数の連結したヌクレオシドを含む化合物を指す。ある特定の実施形態では、複数のヌクレオシドのうちの１個以上が修飾されている。ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは１個以上のリボヌクレオシド（ＲＮＡ）および／またはデオキシリボヌクレオシド（ＤＮＡ）を含む。
【０３４３】
アンチセンス化合物への組み込み用にヌクレオシドを修飾するために使用され得る他の多くの二環式および三環式の糖代用環系も当技術分野において公知である（例えば総説：Leumann, J.  C, Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2002, 10, 841-854を参照のこと）。そのような環系は様々な追加の置換を受けて活性を増強させることができる。
【０３４４】
修飾型糖の調製方法は当業者に周知である。
【０３４５】
修飾型糖部分を有するヌクレオチドでは、適切な核酸標的とのハイブリダイゼーションのために核酸塩基部分（天然型、修飾型、またはそれらの組合せ）が維持される。
【０３４６】
ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、修飾型糖部分を有する１個以上のヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、その修飾型糖部分は２’−ＭＯＥである。ある特定の実施形態では、その２’−ＭＯＥ修飾型ヌクレオチドはギャップマーモチーフ内に配置される。ある特定の実施形態では、その修飾型糖部分はｃＥｔである。ある特定の実施形態では、そのｃＥｔ修飾型ヌクレオチドはギャップマーモチーフのウイング中に配置される。
【０３４７】
修飾型核酸塩基
核酸塩基（または塩基）修飾または置換は天然または合成の非修飾型核酸塩基と構造的に区別可能であるが、機能的には互換性がある。天然型核酸塩基と修飾型核酸塩基の両方が水素結合に関与することができる。そのような核酸塩基修飾は、アンチセンス化合物に核酸分解酵素安定性、結合親和性または他の有益な生物学的特性を付与することができる。修飾型核酸塩基には、例えば、５−メチルシトシン（５−ｍｅ−Ｃ）などの合成核酸塩基および天然核酸塩基が含まれる。５−メチルシトシン置換を含む特定の核酸塩基置換は、アンチセンス化合物の標的核酸への結合親和性を増加させるのに特に有用である。例えば、５−メチルシトシン置換は、核酸二重鎖の安定性を０．６〜１．２℃増加させることが示されている（Sanghvi, Y.S., Crooke, S.T. and Lebleu, B., eds., Antisense Research and Applications, CRC Press, Boca Raton, 1993, pp. 276-278）。
【０３４８】
さらなる非修飾型核酸塩基には、５−ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの６−メチル誘導体および他のアルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの２−プロピル誘導体および他のアルキル誘導体、２−チオウラシル、２−チオチミンおよび２−チオシトシン、５−ハロウラシルおよび５−ハロシトシン、５−プロピニル（−ＣoＣ−ＣＨ３）ウラシルおよび５−プロピニルシトシンならびにピリミジン塩基の他のアルキニル誘導体、６−アゾウラシル、６−アゾシトシンおよび６−アゾチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、８−ハロ、８−アミノ、８−チオール、８−チオアルキル、８−ヒドロキシルおよび他の８−置換型アデニンおよびグアニン、５−ハロ特に５−ブロモ、５−トリフルオロメチルおよび他の５−置換型ウラシルおよびシトシン、７−メチルグアニンおよび７−メチルアデニン、２−Ｆ−アデニン、２−アミノ−アデニン、８−アザグアニンおよび８−アザアデニン、７−デアザグアニンおよび７−デアザアデニンおよび３−デアザグアニンおよび３−デアザアデニンが含まれる。
【０３４９】
複素環塩基部分は、例えば７−デアザ−アデニン、７−デアザグアノシン、２−アミノピリジンおよび２−ピリドンなど、そのプリン塩基またはピリミジン塩基が他の複素環で置換されたものも含みうる。アンチセンス化合物の結合親和性の増強に特に有用な核酸塩基は５−置換型ピリミジン、６−アザピリミジンならびに２アミノプロピルアデニン、５−プロピニルウラシルおよび５−プロピニルシトシンを含むＮ−２、Ｎ−６およびＯ−６置換型プリンを包含する。
【０３５０】
ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするアンチセンス化合物は１個以上の修飾型核酸塩基を含む。ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするギャップ拡張型アンチセンスオリゴヌクレオチドは１個以上の修飾型核酸塩基を含む。ある特定の実施形態では、前記修飾型核酸塩基は５−メチルシトシンである。ある特定の実施形態では、各シトシンは５−メチルシトシンである。
【０３５１】
組成物および医薬組成物の製剤方法
医薬組成物または製剤の調製のためにアンチセンスオリゴヌクレオチドを薬学的に許容される活性または不活性物質と混合することができる。組成物および医薬組成物の製剤方法は、限定ではないが投与経路、疾患の程度または投与される用量を含む多数の基準に依存する。
【０３５２】
ＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするアンチセンス化合物は、アンチセンス化合物を適切な薬学的に許容可能な希釈剤または担体と組み合わせることにより医薬組成物に利用され得る。薬学的に許容可能な希釈剤にはリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）が含まれる。ＰＢＳは非経口的に送達される組成物での使用に適した希釈剤である。従って、１つの実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするアンチセンス化合物と薬学的に許容可能な希釈剤を含む医薬組成物が本明細書に記載される方法に使用される。ある特定の実施形態では、薬学的に許容可能な希釈剤はＰＢＳである。ある特定の実施形態では、前記アンチセンス化合物はアンチセンスオリゴヌクレオチドである。
【０３５３】
アンチセンス化合物を含む医薬組成物は任意の薬学的に許容可能な塩、エステル、またはそのようなエステルの塩、またはヒトを含む動物に投与されると、生物学的に活性がある代謝物もしくはその残基を（直接的または間接的に）提供することができる他の任意のオリゴヌクレオチドを包含する。したがって、例えば、本開示はまたアンチセンス化合物の薬学的に許容可能な塩、プロドラッグ、そのようなプロドラッグの薬学的に許容可能な塩、および他の生物学的等価物を対象とする。適切な薬学的に許容可能な塩にはナトリウム塩およびカリウム塩が含まれるが、これらに限定されない。
【０３５４】
当技術分野において周知の方法によって本明細書に記載される化合物の薬学的に許容可能な塩を調製することができる。薬学的に許容可能な塩の概説については、Stahl and Wermuth, Handbook of Pharmaceutical Salts: Properties, Selection and Use（Wiley-VCH, Weinheim, Germany, 2002）を参照のこと。アンチセンスオリゴヌクレオチドのナトリウム塩はヒトへの治療用投与に有用であり、十分に許容される。したがって、１つの実施形態では、本明細書に記載される化合物はナトリウム塩の形態である。
【０３５５】
プロドラッグは、身体内の内在性核酸分解酵素によって切断されて活性型アンチセンス化合物を形成する、前記アンチセンス化合物の一端または両端での追加のヌクレオシドの組み込みを包含し得る。
【０３５６】
複合体化アンチセンス化合物
アンチセンス化合物は、結果生じるアンチセンスオリゴヌクレオチドの活性、細胞内分布または細胞取込を増強する１つ以上の部分または複合体に共有結合することができる。典型的な複合体基にはコレステロール部分および脂質部分が含まれる。その他の複合体基には炭水化物、リン脂質、ビオチン、フェナジン、葉酸、フェナントリジン、アントラキノン、アクリジン、フルオレセイン、ローダミン、クマリンおよび色素が含まれる。
【０３５７】
アンチセンス化合物は、例えば、核酸分解酵素への安定性などの特性を強化するために一般にアンチセンス化合物の一端または両端に結合する１つ以上の安定化基を有するように修飾されることもできる。安定化基に含まれるものはキャップ構造である。これらの末端修飾は、末端核酸を有するアンチセンス化合物をエクソヌクレアーゼによる分解から保護し、細胞内送達および／または局在化を助けることができる。キャップは５’末端（５’キャップ）または３’末端（３’キャップ）に存在し得るか、または両端に存在し得る。キャップ構造は当技術分野において周知であり、例えば逆方向デオキシ脱塩基キャップを包含する。核酸分解酵素安定性を付与するためにアンチセンス化合物の一端または両端をキャップするために使用され得るさらなる３’安定化基および５’安定化基には、２００３年１月１６日に公開された国際公開第０３／００４６０２号に開示されるものが含まれる。
【０３５８】
細胞培養およびアンチセンス化合物処理
ＰＴＰ１Ｂ核酸のレベル、活性または発現に及ぼすアンチセンス化合物の効果は、様々な細胞型でインビトロで試験され得る。そのような分析に使用される細胞型は、供給業者（例えばアメリカ培養細胞系統保存機関、バージニア州マナサス；Zen-Bio社、ノースカロライナ州リサーチトライアングルパーク；クロネティックス社、メリーランド州ウォーカーズビル）から入手可能であり、供給業者の使用説明書に従って市販の試薬（例えばインビトロジェンライフテクノロジーズ社、カリフォルニア州カールスバッド）を使用して細胞を培養する。例となる細胞型としては、限定ではないがＨｅｐＧ２細胞、Ｈｅｐ３Ｂ細胞、初代培養肝細胞、Ａ５４９細胞、ＧＭ０４２８１線維芽細胞およびＬＬＣ−ＭＫ２細胞が挙げられる。
【０３５９】
アンチセンスオリゴヌクレオチドのインビトロ試験
アンチセンスオリゴヌクレオチドを使用する細胞の処理方法が本明細書に記載されるが、それは、他のアンチセンス化合物を用いる処理のために適切に改変され得る。
【０３６０】
一般に、培養中に細胞がおよそ６０〜８０％の集密に至ったときにアンチセンスオリゴヌクレオチドでその細胞が処理される。
【０３６１】
アンチセンスオリゴヌクレオチドを培養細胞に導入するのに一般的に使用される１つの試薬に、カチオン性脂質形質移入試薬リポフェクチン（登録商標）（インビトロジェン社、カリフォルニア州カールスバッド）がある。アンチセンスオリゴヌクレオチドをＯＰＴＩ−ＭＥＭ（登録商標）１（インビトロジェン社、カリフォルニア州カールスバッド）中リポフェクチン（登録商標）と混合し、アンチセンスオリゴヌクレオチドの所望の最終濃度および典型的には１００ｎＭのアンチセンスオリゴヌクレオチド当たり２から１２ｕｇ／ｍＬの範囲のリポフェクチン（登録商標）濃度を得る。
【０３６２】
アンチセンスオリゴヌクレオチドを培養細胞に導入するのに使用される別の試薬に、リポフェクタミン２０００（登録商標）（インビトロジェン社、カリフォルニア州カールスバッド）がある。アンチセンスオリゴヌクレオチドをＯＰＴＩ−ＭＥＭ（登録商標）１減血清培地（インビトロジェン社、カリフォルニア州カールスバッド）中リポフェクタミン２０００（登録商標）と混合し、アンチセンスオリゴヌクレオチドの所望濃度および典型的には１００ｎＭのアンチセンスオリゴヌクレオチド当たり２から１２ｕｇ／ｍＬの範囲のリポフェクタミン（登録商標）濃度を得る。
【０３６３】
アンチセンスオリゴヌクレオチドを培養細胞に導入するのに使用される別の試薬に、サイトフェクチン（登録商標）（インビトロジェン社、カリフォルニア州カールスバッド）がある。アンチセンスオリゴヌクレオチドをＯＰＴＩ−ＭＥＭ（登録商標）１減血清培地（インビトロジェン社、カリフォルニア州カールスバッド）中サイトフェクチン（登録商標）と混合し、アンチセンスオリゴヌクレオチドの所望濃度および典型的には１００ｎＭのアンチセンスオリゴヌクレオチド当たり２から１２ｕｇ／ｍＬの範囲のサイトフェクチン（登録商標）濃度を得る。
【０３６４】
培養細胞にアンチセンスオリゴヌクレオチドを導入するために使用される別の技術には電気穿孔法が含まれる。
【０３６５】
日常的方法によりアンチセンスオリゴヌクレオチドで細胞を処理する。通常、細胞はアンチセンスオリゴヌクレオチド処理後１６〜２４時間で回収され、その時点で標的核酸のＲＮＡまたはタンパク質のレベルを当技術分野において公知の方法および本明細書に記載される方法により測定する。一般に、複数繰り返して処理を実施するときは、繰り返した処理の平均としてデータが提示される。
【０３６６】
使用されるアンチセンスオリゴヌクレオチドの濃度は細胞株毎に異なる。特定の細胞株に最適なアンチセンスオリゴヌクレオチド濃度を決定する方法は当技術分野において周知である。通常、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、リポフェクタミン２０００（登録商標）、リポフェクチンまたはサイトフェクチンを使用して形質移入されるとき、１ｎＭ〜３００ｎＭの範囲の濃度で使用される。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、電気穿孔法を使用して形質移入されるとき、６２５〜２０，０００ｎＭの範囲にある、より高い濃度で使用される。
【０３６７】
ＲＮＡの単離
全細胞性ＲＮＡまたはポリ（Ａ）＋  ｍＲＮＡに対してＲＮＡ分析を実行することができる。ＲＮＡ単離の方法は当技術分野において周知である。当技術分野において周知の方法を使用して、例えば製造業者が勧めるプロトコルに従ってＴＲＩＺＯＬ（登録商標）試薬（インビトロジェン社、カリフォルニア州カールスバッド）を使用してＲＮＡが調製される。
【０３６８】
標的のレベルまたは発現の阻害の分析
ＰＴＰ１Ｂ核酸のレベルまたは発現の阻害は、当技術分野において公知の様々な方法で測定することができる。例えば、標的核酸レベルは、例えばノーザンブロット分析、競合的ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、または定量的リアルタイムＰＣＲにより定量化され得る。全細胞性ＲＮＡまたはポリ（Ａ）＋  ｍＲＮＡに対してＲＮＡ分析を実施することができる。ＲＮＡ単離の方法は当技術分野において周知である。ノーザンブロット分析も当技術分野においては日常的方法である。定量的リアルタイムＰＣＲは、好都合なことに、カリフォルニア州フォスターシティーのＰＥ−アプライドバイオシステムズ社から入手可能であり、製造業者の使用説明書に従い用いられる市販のＡＢＩ  ＰＲＩＳＭ（登録商標）７６００、７７００または７９００配列検出システムを使用して達成することができる。
【０３６９】
標的ＲＮＡレベルの定量的リアルタイムＰＣＲ分析
標的ＲＮＡレベルの定量は、製造業者の使用説明書に従いＡＢＩ  ＰＲＩＳＭ（登録商標）７６００、７７００または７９００配列検出システム（ＰＥ−アプライドバイオシステムズ社、カリフォルニア州フォスターシティー）を使用して定量的リアルタイムＰＣＲにより達成することができる。定量的リアルタイムＰＣＲの方法は当技術分野において周知である。
【０３７０】
リアルタイムＰＣＲの前に、単離されたＲＮＡを逆転写（ＲＴ）反応に供して相補性ＤＮＡ（ｃＤＮＡ）を生産してから、ｃＤＮＡをリアルタイムＰＣＲ増幅の基質として用いる。ＲＴとリアルタイムＰＣＲ反応は同一の試料ウェル中で連続して実行される。ＲＴとリアルタイムＰＣＲの試薬やインビトロジェン社（カリフォルニア州カールスバッド）から得られる。ＲＴ反応、リアルタイムＰＣＲ反応は当業者に周知の方法により実施される。
【０３７１】
リアルタイムＰＣＲで得られた遺伝子（またはＲＮＡ）標的の量を、シクロスフィリンＡなどの発現が一定である遺伝子の発現レベルを使用するか、リボグリーン（登録商標）（インビトロジェン社、カリフォルニア州カールスバッド）を使用して全ＲＮＡを定量化することにより、正規化する。標的と同時に、多重化して、または別々にリアルタイムＰＣＲを行うことにより、シクロスフィリンＡの発現が定量化される。全ＲＮＡはリボグリーン（登録商標）ＲＮＡ定量試薬（インビトロジェン社、オレゴン州ユージーン）を使用して定量化される。リボグリーン（登録商標）によるＲＮＡ定量の方法はJones, L.J.ら（Analytical Biochemistry, 1998, 265, 368-374）に教示される。リボグリーン（登録商標）の蛍光を測定するためにＣＹＴＯＦＬＵＯＲ（登録商標）４０００機器（ＰＥ−アプライドバイオシステムズ社）が使用される。
【０３７２】
プローブとプライマーはＰＴＰ１Ｂ核酸にハイブリダイズするように設計される。リアルタイムＰＣＲプローブとプライマーを設計する方法は当技術分野において周知であり、ＰＲＩＭＥＲ  ＥＸＰＲＥＳＳ（登録商標）ソフトウェア（アプライドバイオシステムズ社、カリフォルニア州フォスターシティー）などのソフトウェアの使用が含まれ得る。
【０３７３】
タンパク質レベルの分析
ＰＴＰ１Ｂ核酸のアンチセンス阻害は、ＰＴＰ１Ｂタンパク質レベルを測定することにより評価することができる。ＰＴＰ１Ｂのタンパク質レベルは、免疫沈降、ウェスタンブロット分析（イムノブロッティング）、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、定量的タンパク質アッセイ、タンパク質活性アッセイ（例えばカスパーゼ活性アッセイ）、免疫組織化学、免疫細胞化学または蛍光活性化細胞分別（ＦＡＣＳ）などの当技術分野において周知の様々な方法で評価または定量化できる。標的に対する抗体は、抗体のＭＳＲＳカタログ（Aerie Corporation社、ミシガン州バーミンガム）などの様々なソースから同定して得ることができ、または当技術分野において周知の従来のモノクローナルまたはポリクローナル抗体作製方法により調製することができる。ヒトおよびラットのＰＴＰ１Ｂ検出に有用な抗体は市販されている。
【０３７４】
アンチセンス化合物のインビボ試験
アンチセンス化合物、例えばアンチセンスオリゴヌクレオチドを動物で試験して、ＰＴＰ１Ｂの発現を阻害し表現型の変化をもたらす能力を評価する。正常な動物または実験用疾患モデルで試験を実施することができる。動物への投与のため、アンチセンスオリゴヌクレオチドはリン酸緩衝生理食塩水などの薬学的に許容可能な希釈液中で製剤される。投与には非経口投与経路が含まれる。アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処置期間の後にＲＮＡを組織から単離し、ＰＴＰ１Ｂ核酸の発現の変化を測定する。ＰＴＰ１Ｂタンパク質レベルの変化も測定する。
【０３７５】
ある特定の適応症
ある特定の実施形態では、本明細書に記載されるような１つ以上の医薬組成物を投与することを含む、個体を治療する方法が本明細書で提供される。ある特定の実施形態では、その個体は代謝関連疾患を有する。
【０３７６】
下記の実施例で示されるように、本明細書に記載されるようなＰＴＰ１Ｂを標的とする化合物は、メタボリックシンドローム、真性糖尿病、インスリン抵抗性、糖尿病性脂質異常症、高トリグリセリド血症、肥満および体重増加を含む代謝関連疾患の生理的症状の重症度を軽減することが示されている。実験のいくつかでは、化合物により血中グルコースレベルが低下し、例えば、動物の症状は継続したが、未処置の動物と比較すると症状は軽かった。しかし、他の実験では、化合物は糖尿病の症状を軽減するようであり、例えば、長期間処置を受けた動物は、化合物を短期間投与された動物と比較して症状が軽かった。しかし、他の実験では、化合物は体重増加を阻害するようであり、例えば、長期間処置を受けた動物は、化合物を短期間投与された動物と比較して症状が軽かった。しかし、他の実験では、化合物は高グリセリド血症を阻害するようであり、例えば、長期間処置を受けた動物は、化合物を短期間投与された動物と比較して症状が軽かった。従って、以下に例示する化合物の機能回復能は、本明細書に記載の化合物を用いる処置により疾患の症状が逆転し得ることを示す。
【０３７７】
真性糖尿病は多数の身体的および生理的症状を特徴とする。２型糖尿病に関連して当業者に知られる任意の症状が、前述の方法で上述したように改善またはその他調節されうる。ある特定の実施形態では、症状は、グルコースレベルの上昇、大幅な体重増加、頻尿、異常な口渇、過度の空腹、過度の疲労、霞視、頻繁な感染、四肢の刺痛またはしびれ、皮膚の乾燥および痒み、体重減少、傷の治癒が遅い、および歯肉の腫れからなる群より選択される身体的症状である。
【０３７８】
ある特定の実施形態では、症状は、インスリン抵抗性の増加、グルコースレベルの上昇、体脂肪量の増加、代謝速度の低下、グルコースクリアランスの低下、グルコース忍容性の低下、インスリン感受性の低下、肝臓のインスリン感受性の低下、脂肪組織のサイズと重量の増加、体脂肪の増加および体重の増加からなる群より選択される生理的症状である。
【０３７９】
ある特定の実施形態では、身体的症状は大幅な体重増加である。ある特定の実施形態では、症状は頻尿である。ある特定の実施形態では、症状は異常な口渇である。ある特定の実施形態では、症状は過度の空腹である。ある特定の実施形態では、症状は過度の疲労である。ある特定の実施形態では、症状は霞視である。ある特定の実施形態では、症状は頻繁な感染である。ある特定の実施形態では、症状は四肢の刺痛またはしびれである。ある特定の実施形態では、症状は皮膚の乾燥および痒みである。ある特定の実施形態では、症状は体重減少である。ある特定の実施形態では、症状は傷の治癒が遅いことである。ある特定の実施形態では、症状は歯肉の腫れである。ある特定の実施形態では、症状はインスリン抵抗性の増加である。ある特定の実施形態では、症状は増体脂肪量の増加である。ある特定の実施形態では、症状は代謝速度の低下である。ある特定の実施形態では、症状はグルコースクリアランスの低下である。ある特定の実施形態では、症状はグルコース忍容性の低下である。ある特定の実施形態では、症状はインスリン感受性の低下である。ある特定の実施形態では、症状は肝臓のインスリン感受性の低下である。ある特定の実施形態では、症状は脂肪組織のサイズと重量の増加である。ある特定の実施形態では、症状は体脂肪の増加である。ある特定の実施形態では、症状は体重の増加である。
【０３８０】
Liu and Chernoffは、ＰＴＰ１Ｂが上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）に結合しその基質として働くことを示している（Liu and Chernoff, Biochem. J.,1997, 327, 139-145）。さらに、Ａ４３１ヒト類表皮癌細胞では、ＰＴ１Ｂは、ＥＧＦの追加により生じたＨ２Ｏ２の存在により不活性化されることが見出された。これらの研究は、腫瘍形成中はしばしば調節解除されるＰＴＰ１Ｂが、細胞の酸化状態により負に調節され得ることを示す（Leeら, J. Biol. Chem., 1998, 273, 15366-15372）。
【０３８１】
ＰＴＰ１Ｂの過剰発現は悪性卵巣癌で示されており、この相関関係に伴い関連の成長因子受容体の発現が同時に増加した（Wienerら, Am. J. Obstet. Gynecol., 1994, 170, 1177-1183）。
【０３８２】
ＰＴＰ１Ｂは、ｎｅｕ発がん遺伝子に誘導されるＮＩＨ３Ｔ３細胞における形質転換を抑制すること（Brown-Shimerら, Cancer Res., 1992, 52, 478-482）並びにｖ−ｓｒｋ、ｖ−ｓｒｃおよびｖ−ｒａｓに誘導されるラット３Ｙ１線維芽細胞における形質転換を抑制すること（Liuら, Mol. Cell. Biol., 1998, 18, 250-259）およびｂｃｒ−ａｂｌに誘導されるラット−１線維芽細胞における形質転換を抑制すること（LaMontagneら, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1998, 95, 14094-14099）が示されている。ＰＴＰ１Ｂは、ｂｃｒ−ａｂｌ腫瘍タンパク質阻害剤と同様に、慢性骨髄性白血病細胞株であるＫ５６２細胞の分化を促進することも示されている。これらの研究は、ＰＴＰ１Ｂが慢性骨髄性白血病の病原性を制御する役割を果たし得ることを記述している（LaMontagneら, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1998, 95, 14094-14099）。
【０３８３】
従って、本明細書では過剰増殖性疾患に関連する症状を改善することを、それを必要とする対象において行う方法が提供される。ある特定の実施形態では、過剰増殖性疾患は癌である。ある特定の実施形態では、癌関連の症状を改善する方法が本明細書で提供される。ある特定の実施形態では、過剰増殖性疾患関連の症状の発症の速度を低下させる方法が提供される。ある特定の実施形態では、癌関連の症状の発症の速度を低下させる方法が提供される。ある特定の実施形態では、過剰増殖性疾患関連の症状の重症度を軽減する方法が提供される。ある特定の実施形態では、癌関連の症状の重症度を軽減する方法が提供される。そのような実施形態では、方法は、必要とする個体にＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とする化合物を治療上有効な量投与することを含む。
【０３８４】
ある特定の実施形態では、本明細書に記載されるような１つ以上の医薬組成物を投与することを含む、個体を治療する方法が提供される。ある特定の実施形態では、その個体は代謝関連疾患を有する。
【０３８５】
ある特定の実施形態では、ＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするアンチセンス化合物の投与により、ＰＴＰ１Ｂ発現が少なくとも約１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５もしくは９９％またはこれらの値のうち任意の２つで限定される範囲だけ低下する。
【０３８６】
ある特定の実施形態では、トランスチレチンを標的とするアンチセンス化合物を含む医薬組成物が、代謝関連疾患患者または罹患しやすい患者の治療用医薬の調製に使用される。
【０３８７】
ある特定の実施形態では、本明細書に記載される方法には、配列番号２６（ＩＳＩＳ４０４１７３）に列挙される配列の本明細書に記載されるような連続核酸塩基部分を有する修飾型オリゴヌクレオチドを含む化合物を投与することが含まれる。
【０３８８】
投与
ある特定の実施形態では、局所的治療が望ましいか、全身的治療が望ましいかということ、および治療される領域に応じて多数の方法で本明細書に記載されるような化合物と組成物を投与することができる。投与は、局所投与；噴霧器によるものを含む、粉剤の吸入もしくは吹送による肺性投与；気管支内投与；鼻腔内投与；表皮投与および経皮投与；経口投与または非経口投与であり得る。本明細書に記載されるような化合物と組成物は組織または器官に直接投与され得る。
【０３８９】
ある特定の実施形態では、本明細書に記載されるような化合物と組成物が非経口的に投与される。「非経口投与」は注射または点滴による投与を意味する。非経口投与には皮下投与、静脈内投与、筋肉内投与、動脈内投与、腹腔内投与、または頭蓋内投与、例えば、脳内投与、髄腔内投与、脳室内投与、脳室性投与、側脳室内投与、大脳脳室内投与もしくは大脳脳室性投与が含まれる。投与は連続投与、または長期投与、または短期投与、または断続的投与であり得る。
【０３９０】
ある特定の実施形態では、非経口投与は注射による。注射は注射筒またはポンプを用いて行われ得る。ある特定の実施形態では、注射はボーラス注射である。ある特定の実施形態では、注射は組織または器官に直接投与される。
【０３９１】
ある特定の実施形態では、本明細書に記載されるような化合物と組成物は非経口的に投与される。
【０３９２】
ある特定の実施形態では、非経口投与は皮下投与である。
【０３９３】
さらなる実施形態では、投与用の製剤は本明細書に記載される化合物と生理食塩水である。
【０３９４】
ある特定の実施形態では、１か月毎、２か月毎、９０日毎、３か月毎、６か月毎、１年に２回、または１年に１回の注射または点滴によりアンチセンスオリゴヌクレオチドを送達する。
【０３９５】
ある特定の併用療法
ある特定の実施形態では、本発明の１つ以上の医薬組成物は１つ以上の他の医薬と共投与される。ある特定の実施形態では、そのような１つ以上の他の医薬が、本明細書に記載される１つ以上の医薬組成物が治療するものと同じ疾患、傷害、または健康状態を治療するように企図される。ある特定の実施形態では、そのような１つ以上の他の医薬は、本明細書に記載される１つ以上の医薬組成物が治療するものと異なる疾患、傷害、または健康状態を治療するように企図される。ある特定の実施形態では、そのような１つ以上の他の医薬は本明細書に記載されるような１つ以上の医薬組成物の望まれない副作用を治療するように企図される。ある特定の実施形態では、１つ以上の医薬組成物は別の医薬と、前記の他の医薬の望まれない副作用を治療するために共投与される。ある特定の実施形態では、複合的効果をもたらすために１つ以上の医薬組成物が別の医薬と共投与される。ある特定の実施形態では、相乗的効果をもたらすために１つ以上の医薬組成物が別の医薬と共投与される。
【０３９６】
ある特定の実施形態では、第１薬剤と１つ以上の第２薬剤が同時に投与される。ある特定の実施形態では、前記の第１薬剤と１つ以上の第２薬剤が異なる時点で投与される。ある特定の実施形態では、前記の第１薬剤と１つ以上の第２薬剤が単一の医薬製剤中に一緒に調製される。ある特定の実施形態では、前記の第１薬剤と１つ以上の第２薬剤が別々に調製される。
【０３９７】
ある特定の実施形態では、本発明の医薬組成物の投与の前に前記第２化合物が投与される。ある特定の実施形態では、本発明の医薬組成物の投与の後に前記第２化合物が投与される。ある特定の実施形態では、本発明の医薬組成物と同時に前記第２化合物が投与される。ある特定の実施形態では、共投与される第２化合物の用量は、前記第２化合物が単独で投与される場合に投与されるだろう用量と同一である。ある特定の実施形態では、共投与される第２化合物の用量は、前記第２化合物が単独で投与される場合に投与されるだろう用量よりも少ない。ある特定の実施形態では、共投与される第２化合物の用量は、前記第２化合物が単独で投与される場合に投与されるだろう用量よりも多い。
【０３９８】
ある特定の実施形態では、第１化合物と第２化合物の共投与が第１化合物の単独投与の効果よりも大きい効果をもたらすように、第２化合物の共投与が第１化合物の効果を増強する。ある特定の実施形態では、前記の共投与は、前記化合物が単独で投与されたときの効果の相加である効果をもたらす。ある特定の実施形態では、前記の共投与は、前記化合物が単独で投与されたときの効果の相加よりも高い効果をもたらす。ある特定の実施形態では、前記第１化合物はアンチセンス化合物である。ある特定の実施形態では、前記第２化合物はアンチセンス化合物である。
【０３９９】
ある特定の実施形態では、第２薬剤にはグルコース低下薬剤が含まれるが、これに限定されない。グルコース低下薬剤には治療のための生活習慣の変更、ＰＰＡＲアゴニスト、ジペプチジルペプチダーゼ（ＩＶ）阻害剤、ＧＬＰ−１類似体、インスリンもしくはインスリン類似体、インスリン分泌促進物質、ＳＧＬＴ２阻害剤、ヒトアミリン類似体、ビグアニド、α−グルコシダーゼ阻害剤、またはそれらの組合せが含まれ得るが、これらに限定されない。グルコース低下薬剤にはメトホルミン、スルホニル尿素、ロシグリタゾン、メグリチニド、チアゾリジンジオン、α−グルコシダーゼ阻害剤、またはそれらの組合せが含まれ得るが、これらに限定されない。スルホニル尿素はアセトヘキサミド、クロルプロパミド、トルブタミド、トラザミド、グリメピリド、グリピジド、グリブリドまたはグリクラジドであり得る。メグリチニドはナテグリニドまたはレパグリニドであり得る。チアゾリジンジオンはピオグリタゾンまたはロシグリタゾンであり得る。α−グルコシダーゼはアカルボースまたはミグリトールであり得る。
【０４００】
いくつかの実施形態では、グルコース低下治療薬はＧＬＰ−１類似体である。いくつかの実施形態では、ＧＬＰ−１類似体はエキセンジン−４またはリラグルチドである。
【０４０１】
他の実施形態では、グルコース低下治療薬はスルホニル尿素である。いくつかの実施形態では、スルホニル尿素はアセトヘキサミド、クロルプロパミド、トルブタミド、トラザミド、グリメピリド、グリピジド、グリブリドまたはグリクラジドである。
【０４０２】
いくつかの実施形態では、グルコース低下薬はビグアニドである。いくつかの実施形態では、ビグアニドはメトホルミンであり、そして、いくつかの実施形態では、メトホルミン単独で治療した後に観察される乳酸アシドーシスと比較して、乳酸アシドーシスが上昇することなく血中グルコースレベルが低下する。
【０４０３】
いくつかの実施形態では、グルコース低下薬はメグリチニドである。いくつかの実施形態では、メグリチニドはナテグリニドまたはレパグリニドである。
【０４０４】
いくつかの実施形態では、グルコース低下薬はチアゾリジンジオンである。いくつかの実施形態では、チアゾリジンジオンはピオグリタゾン、ロシグリタゾンまたはトログリタゾンである。いくつかの実施形態では、ロシグリタゾン治療単独で観察されるものより大きな体重増加を経ることなく、血中グルコースレベルが低下する。
【０４０５】
いくつかの実施形態では、グルコース低下薬はα−グルコシダーゼ阻害剤である。いくつかの実施形態では、α−グルコシダーゼ阻害剤はアカルボースまたはミグリトールである。
【０４０６】
ある特定の実施形態では、共投与されるグルコース低下薬剤はＩＳＩＳ１１３７１５である。
【０４０７】
ある特定の実施形態では、グルコース低下治療は治療のための生活習慣の変更である。
【０４０８】
ある特定の実施形態では、第２薬剤には脂質低下薬剤が含まれるが、これらに限定されない。脂質低下薬剤にはアトルバスタチン、シンバスタチン、ロスバスタチンおよびエゼチミブが含まれ得るが、これらに限定されない。特定のそのような実施形態では、本発明の医薬組成物の投与前に脂質低下薬剤が投与される。特定のそのような実施形態では、本発明の医薬組成物の投与の後に脂質低下薬剤が投与される。特定のそのような実施形態では、本発明の医薬組成物と同時に脂質低下薬剤が投与される。特定のそのような実施形態では、共投与される脂質低下薬剤の用量は、前記脂質低下薬剤が単独で投与される場合に投与されるだろう用量と同一である。特定のそのような実施形態では、共投与される脂質低下薬剤の用量は、前記脂質低下薬剤が単独で投与される場合に投与されるだろう用量よりも少ない。特定のそのような実施形態では、共投与される脂質低下薬剤の用量は、前記脂質低下薬剤が単独で投与される場合に投与されるだろう用量よりも多い。
【０４０９】
ある特定の実施形態では、共投与される脂質低下薬剤はＨＭＧ−ＣｏＡ還元酵素阻害剤である。特定のそのような実施形態では、ＨＭＧ−ＣｏＡ還元酵素阻害剤はスタチンである。特定のそのような実施形態では、スタチンはアトルバスタチン、シンバスタチン、プラバスタチン、フルバスタチンおよびロスバスタチンから選択される。
【０４１０】
ある特定の実施形態では、共投与される脂質低下薬剤はコレステロール吸収阻害剤である。特定のそのような実施形態では、コレステロール吸収阻害剤はエゼチミブである。
【０４１１】
ある特定の実施形態では、共投与される脂質低下薬剤は、共製剤されたＨＭＧ−ＣｏＡ還元酵素阻害剤とコレステロール吸収阻害剤である。特定のそのような実施形態では、共製剤された脂質低下薬剤はエゼチミブ／シンバスタチンである。
【０４１２】
ある特定の実施形態では、共投与される脂質低下薬剤はミクロソーム・トリグリセリド転移タンパク質阻害剤（ＭＴＰ阻害剤）である。
【０４１３】
ある特定の実施形態では、共投与される脂質低下薬剤は、ＡｐｏＢを標的とするオリゴヌクレオチドである。
【０４１４】
ある特定の実施形態では、第２薬剤には抗肥満薬または薬剤が含まれるが、これらに限定されない。そのような抗肥満薬剤にはオルリスタット、シブトラミンまたはリモナバンが含まれるが、これらに限定されず、そして、それらは体脂肪蓄積または体重低下薬剤として上述のように投与され得る。ある特定の実施形態では、アンチセンス化合物は食欲抑制剤と共投与され得る。そのような食欲抑制剤にはジエチルプロピオン・テニュエート、マジンドール、オルリスタット、フェンジメトラジン、フェンテルミン、およびシブトラミンが含まれるが、これらに限定されず、そして、それらは本明細書に記載されるように投与され得る。ある特定の実施形態では、抗肥満薬剤は、シブトラミンまたは、これに限定されないが、リラグルチドなどのＧＬＰ−１系薬剤などの、しかし、これらに限定されないＣＮＳ系薬剤である。
【０４１５】
製剤
本明細書で提供される化合物はまた、例えば、取込、分布および／または吸収を補助するためのリポソーム、受容体標的化分子または他の製剤のような他の分子、分子構造または化合物の混合物と混合、複合体化、そうでなければ結合され得る。そのような取込、分布および／または吸収補助製剤の調製を教示する代表的な米国特許には米国特許第５，１０８，９２１号；第５，３５４，８４４号；第５，４１６，０１６号；第５，４５９，１２７号；第５，５２１，２９１号；第５，５４３，１５８号；第５，５４７，９３２号；第５，５８３，０２０号；第５，５９１，７２１号；第４，４２６，３３０号；第４，５３４，８９９号；第５，０１３，５５６号；第５，１０８，９２１号；第５，２１３，８０４号；第５，２２７，１７０号；第５，２６４，２２１号；第５，３５６，６３３号；第５，３９５，６１９号；第５，４１６，０１６号；第５，４１７，９７８号；第５，４６２，８５４号；第５，４６９，８５４号；第５，５１２，２９５号；第５，５２７，５２８号；第５，５３４，２５９号；第５，５４３，１５２号；第５，５５６，９４８号；第５，５８０，５７５号；および第５，５９５，７５６号が含まれるが、これらに限定されず、これらの各々が参照により本明細書に組み込まれる。
【０４１６】
本明細書で提供されるアンチセンス化合物は、任意の薬学的に許容可能な塩、エステル、またはそのようなエステルの塩、またはヒトを含む動物に投与されると、生物学的に活性がある代謝物またはその残基を（直接的または間接的に）提供することができる他の任意の化合物を包含する。
【０４１７】
「薬学的に許容可能な塩」という用語は、本明細書で提供される化合物の生理的および薬学的に許容可能な塩：すなわち、親化合物の所望の生物活性を保持し、それに望ましくない毒性を加えない塩を指す。「薬学的に許容可能な塩」という用語には、無機または有機の酸および塩基を包含する薬学的に許容可能な毒性が無い酸または塩基から調製された塩が含まれる。オリゴヌクレオチドについて、薬学的に許容可能な塩の好ましい例とそれらの使用法は米国特許第６，２８７，８６０号にさらに記載され、その全体が参照により組み込まれる。ナトリウム塩はオリゴヌクレオチド薬品の適切な形態であることが示されている。
【０４１８】
「薬学的に許容可能な誘導体」という用語は、本明細書に記載される化合物の薬学的に許容可能な塩、溶媒和化合物、水和物、エステル、プロドラッグ、多形体、異性体、同位体により標識された異型体を包含するが、これらに限定されない。
【０４１９】
本発明は、本明細書で提供されるアンチセンス化合物を包含する、医薬組成物および製剤も包含する。本発明の医薬組成物は、局所的治療が望ましいか、全身的治療が望ましいかということ、および治療される領域に応じて多数の方法で投与され得る。投与は非経口投与であり得る。非経口投与には静脈内、動脈内、皮下、腹腔内もしくは筋肉内の注射もしくは点滴；または頭蓋内投与、例えば、脳内投与、髄腔内投与、脳室内投与、脳室性投与、側脳室内投与、大脳脳室内投与もしくは大脳脳室性投与が含まれる。
【０４２０】
非経口投与が肝臓および血漿中のＰＴＰ１Ｂ発現を標的とするために好ましい。少なくとも１つの２’−Ｏ−メトキシエチル修飾を有するオリゴヌクレオチドは経口投与に特に有用であると考えられている。局所投与用の医薬組成物と製剤には経皮パッチ、軟膏、外用水薬、クリーム剤、ゲル剤、滴剤、坐剤、スプレー剤、液剤および粉剤が含まれ得る。従来の医薬担体、水性、粉体または油系の基剤、増粘剤などが必要または望ましい場合がある。被覆されたコンドーム、グローブなども有用であり得る。
【０４２１】
単位剤形で都合よくも提供され得る本発明の医薬製剤は製薬業界に周知の従来の技術に従って調製され得る。そのような技術は活性成分を医薬担体または添加剤と会合させるステップを包含する。一般に、活性成分を液体担体または細分した固形担体または両方と均一に密に会合させ、その後、必要であれば、産物を成形することにより製剤が調製される。
【０４２２】
本発明の組成物は、錠剤、カプセル剤、ゲルカプセル剤、液体シロップ剤、軟質ゲル剤、坐剤、および直腸投与剤などの、しかし、これらに限定されない多数の可能な剤形のうちのいずれかに製剤され得る。本発明の組成物は水性媒体、非水性媒体、または混合媒体中の懸濁液としても製剤され得る。水性懸濁液は、例えば、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ソルビトールおよび／またはデキストランを含む、前記の懸濁液の粘度を上昇させる物質をさらに含有することができる。前記懸濁液は安定化剤を含有することもできる。
【０４２３】
本発明の医薬組成物には水剤、乳剤、泡剤およびリポソーム含有製剤が含まれるが、これらに限定されない。本発明の医薬組成物および製剤は１つ以上の浸透増強剤、担体、添加剤または他の活性成分もしくは非活性成分を含み得る。
【０４２４】
乳剤は、直径が通常０．１μｍを超える液滴の形状の、１つの液体が別の液体に分散した通常は非均質的な系である。乳剤は、分散相、および水相、油相または分離した相としてのそれ自体の形態の溶液として存在し得る活性薬品に加えて追加成分を含有し得る。本発明の実施形態としてミクロエマルジョンが含まれる。乳剤とそれらの使用法は当技術分野において周知であり、そして、それらは米国特許第６，２８７，８６０号にさらに記載され、その全体が本明細書に組み込まれる。
【０４２５】
本発明の製剤にはリポソーム製剤が含まれる。本発明で使用される場合、「リポソーム」という用語は、球状の二層または複数の二層に配置された脂肪族脂質から構成される小胞を意味する。リポソームは、送達される組成物を含有する水性内部と親油性物質から形成される膜を有する単層または多重層の小胞である。カチオン性リポソームは、負に帯電したＤＮＡ分子と相互作用して安定な複合体を形成すると考えられている、正に帯電したリポソームである。ｐＨ感受性である、または負に帯電したリポソームはＤＮＡと複合体を形成するよりもむしろＤＮＡを封入すると考えられている。カチオン性リポソームと非カチオン性リポソームの両方がＤＮＡを細胞に送達するために使用されている。
【０４２６】
リポソームには「静電気的に安定化された」リポソームも含まれ、その用語は、本明細書で使用される場合、１つ以上の特殊な脂質を含むリポソームであって、リポソームに組み込まれると、そのような特殊な脂質を欠くリポソームに対して循環存続期間を向上することになる脂質を含む前記リポソームを指す。リポソームとそれらの使用法は米国特許第６，２８７，８６０号にさらに記載され、その全体が本明細書に組み込まれる。
【０４２７】
別の実施形態では、本発明の製剤には生理食塩水製剤が含まれる。ある特定の実施形態では、製剤は本明細書に記載される化合物と生理食塩水からなる。ある特定の実施形態では、製剤は本明細書に記載される化合物と生理食塩水から基本的になる。ある特定の実施形態では、前記生理食塩水は薬学的に許容可能な等級の生理食塩水である。ある特定の実施形態では、前記生理食塩水は緩衝生理食塩水である。ある特定の実施形態では、前記生理食塩水はリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）である。
【０４２８】
ある特定の実施形態では、製剤はリポソームを除外する。ある特定の実施形態では、前記製剤は静電気的に安定化されたリポソームを除外する。ある特定の実施形態では、製剤はリン脂質を除外する。ある特定の実施形態では、前記製剤は本明細書に記載される化合物と生理食塩水から基本的になり、そして、リポソームを除外する。
【０４２９】
本発明の医薬製剤と組成物は界面活性剤を含むこともできる。界面活性剤とそれらの使用法は米国特許第６，２８７，８６０号にさらに記載され、その全体が本明細書に組み込まれる。
【０４３０】
１つの実施形態では、本発明は、核酸、特に、オリゴヌクレオチドの効率的な送達に影響する様々な浸透増強剤を使用する。浸透増強剤とそれらの使用法は米国特許第６，２８７，８６０号にさらに記載され、その全体が本明細書に組み込まれる。
【０４３１】
当業者は、製剤がそれらの意図された使用法、すなわち、投与経路に従って日常的にデザインされることを理解する。
【０４３２】
局所投与用の製剤には、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドが脂質、リポソーム、脂肪酸、脂肪酸エステル、ステロイド類、キレート剤および界面活性剤などの局所送達薬剤と混合されている製剤が含まれる。好ましい脂質とリポソームには中性のもの（例えば、ジオレオイルホスファチジルＤＯＰＥエタノールアミン、ジミリストイルホスファチジルコリンＤＭＰＣ、ジステアロイルホスファチジルコリン）、陰性のもの（例えば、ジミリストイルホスファチジルグリセロールＤＭＰＧ）および陽性のもの（例えば、ジオレオイルテトラメチルアミノプロピルＤＯＴＡＰおよびジオレオイルホスファチジルエタノールアミンＤＯＴＭＡ）が含まれる。
【０４３３】
静脈内、動脈内、皮下、腹腔内、筋肉内の注射もしくは点滴、または頭蓋内投与を含む非経口投与用の組成物および製剤は、緩衝剤、希釈剤、ならびに、これらに限定されないが、浸透増強剤、担体化合物および他の薬学的に許容可能な担体または添加剤などの他の適切な添加物を含有することもできる無菌水溶液を包含し得る。
【０４３４】
本明細書で提供される特定の実施形態は、１つ以上のオリゴマー化合物、および非アンチセンス機序により機能する１つ以上の他の化学療法剤を含有する医薬組成物を提供する。そのような化学療法剤の例には、ダウノルビシン、ダウノマイシン、ダクチノマイシン、ドキソルビシン、エピルビシン、イダルビシン、エソルビシン、ブレオマイシン、マホスファミド、イホスファミド、シトシンアラビノシド、ｂｉｓ−クロロエチルニトロソウレア、ブスルファン、マイトマイシンＣ、アクチノマイシンＤ、ミトラマイシン、プレドニゾン、ヒドロキシプロゲステロン、テストステロン、タモキシフェン、ダカルバジン、プロカルバジン、ヘキサメチルメラミン、ペンタメチルメラミン、ミトキサントロン、アムサクリン、クロラムブチル、メチルシクロヘキシルニトロソウレア、ナイトロジェンマスタード、メルファラン、シクロホスファミド、６−メルカプトプリン、６−チオグアニン、シタラビン、５−アザシチジン、ヒドロキシウレア、デオキシコホルマイシン、４−ヒドロキシペルオキシシクロホスホルアミド、５−フルオロウラシル（５−ＦＵ）、５−フルオロデオキシウリジン（５−ＦＵｄＲ）、メトトレキサート（ＭＴＸ）、コルヒチン、タキソール、ビンクリスチン、ビンブラスチン、エトポシド（ＶＰ−１６）、トリメトレキサート、イリノテカン、トポテカン、ゲムシタビン、テニポシド、シスプラチンおよびジエチルスチルベストロール（ＤＥＳ）などの癌化学療法薬が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書で提供される化合物と共に使用されるとき、そのような化学療法剤は個々に（例えば、５−ＦＵとオリゴヌクレオチド）、連続的に（例えば、ある期間に５−ＦＵとオリゴヌクレオチドとそれらに続いてＭＴＸとオリゴヌクレオチド）、または１つ以上の他のそのような化学療法剤と組み合わせて（例えば、５−ＦＵ、ＭＴＸとオリゴヌクレオチド、または５−ＦＵ、放射線治療とオリゴヌクレオチド）使用され得る。非ステロイド性抗炎症薬とコルチコステロイドを含むが、これらに限定されない抗炎症薬、ならびにリビビリン（ribivirin）、ビダラビン、アシクロビルおよびガンシクロビルを含むが、これらに限定されない抗ウイルス薬も本明細書で提供される組成物に組み合わせることができる。アンチセンス化合物と他の非アンチセンス薬の組合せもこの発明の範囲内である。２つ以上の組み合わせた化合物を一緒に、または連続的に使用することができる。
【０４３５】
別の関連の実施形態では、本明細書で提供される組成物は、第１核酸を標的とする１つ以上のアンチセンス化合物、特にオリゴヌクレオチドと第２核酸標的を標的とする１つ以上の追加のアンチセンス化合物を含有することができる。あるいは、本明細書で提供される組成物は、同一の核酸標的の異なる領域を標的とする２つ以上のアンチセンス化合物を含有することができる。アンチセンス化合物の多数の例が当技術分野において公知である。２つ以上の組み合わせた化合物を一緒に、または逐次的に使用することができる。
【０４３６】
投薬
治療組成物を製剤し、続いてこれを投与（投薬）することは、当業者の技術の範囲内であると考えられる。投薬は、治療される疾患状態の重症度および反応性に依存し、治療期間は数日から数か月、または治癒がもたらされるまで、または疾患状態の消失が達成されるまで続く。患者体内の薬品蓄積の測定から最適な投薬計画を見積もることができる。個々のオリゴヌクレオチドの相対的な力価に応じて最適な投薬量は変化し得るが、インビトロとインビボの動物モデルで有効であることが分かっているＥＣ５０に基づいて一般に推定され得る。一般に、投薬量は体重１ｋｇ当たり０．０１μｇから１００ｇまでであり、一日、一週間、一か月または一年に１回以上、または所望の間隔で与えられ得る。治療が成功した後に疾患状態の再発を防ぐために、体重１ｋｇ当たり０．０１μｇから１００ｇの範囲の維持用量のオリゴヌクレオチドが１日に１回以上投与される維持療法を患者に受けさせることが望ましい場合がある。
【０４３７】
本発明は、その好ましい実施形態に従い具体的に記述されているが、以下の実施例は本発明の例示のためのみに役立ち、それが本発明を限定することは意図されていない。本願で引用される参照文献、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号などの各々の全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０４３８】
ある特定の化合物
約２７６種の様々な長さ、モチーフおよび骨格組成の新規に設計されたアンチセンス化合物を、インビトロでヒトＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡに及ぼす効果について複数の細胞型で試験した。新規の化合物を、インビトロでもっとも効力のあるアンチセンス化合物の一部であると以前に判断されているＩＳＩＳ１０７７７２、ＩＳＩＳ１０７８３１、ＩＳＩＳ１４２０２５、ＩＳＩＳ１４２０２６、ＩＳＩＳ１４２０２７、ＩＳＩＳ１４２０２８、ＩＳＩＳ１４２０８２、ＩＳＩＳ１４６９０８およびＩＳＩＳ１４６９０９（例えば２００３年１１月２７日に公開された米国特許公報第２００３／０２２０２８２号および２００７年１１月１５日に公開されたＰＣＴ国際特許出願公開第２００７／１３１２３７号を参照のこと）を含む約５００種の以前に設計された化合物と比較した。新規および以前に設計されたアンチセンス化合物約２８５種のうち約１１種の化合物がインビトロの効力に基づきさらなる試験のために選択された。選択された化合物を用量依存的阻害についてＨｕＶＥＣ、ＨｅｐＧ２、ＨｕＶＥＣ、ＬＬＣ−ＭＫ２およびカニクイザル初代培養肝細胞で試験した。試験した全細胞株でＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの有意な減少を示した、選択された化合物の一つであるＩＳＩＳ４０９８２６のマイクロウォークに基づき、追加のオリゴヌクレオチドを設計した。オリゴヌクレオチドは、事前のスクリーン（実施例１）のギャップマーと共にＨｕＶＥＣ細胞で試験した（実施例５）。実施例５のスクリーンから複数のアンチセンスオリゴヌクレオチドを選択し、用量依存的阻害をＨｕＶＥＣ細胞（実施例６）およびＨｅｐＧ２細胞（実施例７）で試験した。加えて、選択した化合物の一つであるＩＳＩＳ１４２８０８２に対するショートマーとして２種のオリゴヌクレオチドを設計した。これら２種のショートマー（ＩＳＩＳ４４６４３１、ＩＳＩＳ４４６４３２）ならびに実施例６および７に記載の研究から選択された５種のＩＳＩＳオリゴヌクレオチドをＨｅｐＧ２細胞、ＬＬＣ−ＭＫ２細胞、ＨｕＶＥＣ細胞およびカニクイザル初代培養肝細胞で試験した（実施例８〜１１）。全細胞株でＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの用量依存的減少を示したＩＳＩＳオリゴヌクレオチドのインビボの忍容性を試験した。ＩＳＩＳ４０９８２６に対するショートマーとして設計したもう２種類のオリゴヌクレオチドＩＳＩＳ４４６４３３およびＩＳＩＳ４４６４３４もインビボの忍容性研究に含めた。
【０４３９】
選択した１２種のギャップマーをマウスモデル（実施例１２を参照）およびラットモデル（実施例１３）で試験した。それらの相補的配列により、化合物は、配列番号１の領域３２９１〜３３１０、９８９〜１００８、３２９０〜３３０９、３２８７〜３３０６、３２９１〜３３１０、３２８８〜３３０７、３２９２〜３３０９、３２９３〜３３０８、３２８８〜３３０５および３２８９〜３３０４に相補的である。インビボモデルでは、体重および器官重量、アラニントランスアミナーゼ、アスパラギン酸トランスアミナーゼおよびビリルビンなどの肝臓代謝マーカー、ＢＵＮおよびクレアチニン、血漿グルコースレベル、コレステロールおよびトリグリセリドレベルなどの腎臓代謝マーカーならびに炎症性サイトカインレベルを測定した。試験した１２種の化合物のうち５種の化合物であるＩＳＩＳ１４２０８２、ＩＳＩＳ４０４１７３、ＩＳＩＳ４１０００３、ＩＳＩＳ４４６４３１およびＩＳＩＳ４４６４３２を選択し、それらの粘度を測定した（実施例１４）。５種すべてのオリゴヌクレオチドは、試験用に記述された基準に従い、粘度は最適であると考えられた。
【０４４０】
これらの研究の最終評価（実施例１２〜１４）から、配列番号２７（ＩＳＩＳ１４２０８２）、４６（ＩＳＩＳ４４６４３１）、２６（ＩＳＩＳ４０４１７３）および２３（ＩＳＩＳ４０９８２６）に記載の配列の核酸塩基配列を有する４種の化合物が選択された。それらの相補的配列により、化合物は配列番号１の領域３２９１〜３３１０、３２９２〜３３０９、３２９０〜３３０９、３２８７〜３３０６に相補的である。ある特定の実施形態では、本発明でさらに記載されるように、列挙した領域を標的とする化合物は、本明細書にさらに記載される、配列番号に列挙される配列の何らかの核酸塩基部分を有する修飾型オリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、列挙された領域を標的とする、すなわち列挙された配列番号に記載の配列の核酸塩基部分を有する化合物は、本明細書にさらに記載されるように、長さが様々であり得るし、本明細書にさらに記載されるように、様々なモチーフのうちの１つを有し得る。ある特定の実施形態では、ある領域を標的とする、すなわち列挙された配列番号に記載の配列の核酸塩基部分を有する化合物は、ＩＳＩＳ番号：ＩＳＩＳ１４２０８２、ＩＳＩＳ４４６４３１、ＩＳＩＳ４０４１７３およびＩＳＩＳ４０９８２６により表されるように、特定の長さとモチーフを有する。
【０４４１】
配列番号２７（ＩＳＩＳ１４２０８２）、２３（ＩＳＩＳ４０４１７３）および４６（ＩＳＩＳ４４６４３１）に記載の配列の核酸塩基を有する３種の化合物を、マウスモデルで長期の６か月間忍容性研究でさらに試験した（実施例１５を参照のこと）。配列番号５３（ＩＳＩＳ４０９８２６）、２７（ＩＳＩＳ１４２０８２）、２６（ＩＳＩＳ４０４１７３）および４６（ＩＳＩＳ４４６４３１）に記載の配列の核酸塩基配列を有する全４種の化合物のＣＤ１マウスの肝臓における半減期も評価した（実施例１６）。
【０４４２】
これら４種の化合物を有効性、薬物動態プロファイルおよび忍容性についてカニクイザルで試験した（実施例１７）。これらのサルにおける阻害研究で、これらの化合物のいくつかでの処置により肝臓と脂肪組織でＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの減少がもたらされることが示された。具体的には、ＩＳＩＳ４０９８２６、ＩＳＩＳ１４２０８２、ＩＳＩＳ４４６４３１およびＩＳＩＳ４０４１７３での処置により、それぞれＰＢＳ対照と比較して、４５％、４８％、１８および２２％のＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの減少が肝臓組織でもたらされた。ＩＳＩＳ４０９８２６、ＩＳＩＳ１４２０８２、ＩＳＩＳ４４６４３１およびＩＳＩＳ４０４１７３での処置により、ＰＢＳ対照と比較して、脂肪組織中それぞれ２１％、２８％、１２％および３１％のＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡ減少がもたらされた。ＩＳＩＳ４０４１７３はＩＳＩＳ１４２０８２と比較して、それら２種のオリゴヌクレオチドが配列番号１の標的部位の１つの塩基対シフトにより互いに異なるにもかかわらず、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの同様の減少をもたらしたことが注目された。ウェスタンブロット分析により、肝臓組織のタンパク質分析も行った。ＩＳＩＳ４０９８２６、ＩＳＩＳ１４２０８２、ＩＳＩＳ４４６４３１およびＩＳＩＳ４０４１７３を用いてのＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの減少を、有効性については４０ｍｇｋ／週の最大用量で、効力については８ｍｇｋ／週の低用量で測定した（表４５を参照のこと）。８ｍｇｋ／週の低用量でのタンパク質分析では、ＩＳＩＳ４０４１７３（３３％）がＩＳＩＳ１４２０８２（２０％）よりも大幅なＰＴＰ１Ｂタンパク質の減少をもたらすことが示され、ＩＳＩＳ４０４１７３はＩＳＩＳ１４２０８２よりも効力が大きいことが示された（表４７および図１を参照のこと）。４０ｍｇ／週の高用量でのタンパク質分析で、ＩＳＩＳ４０４１７３（タンパク質６０％減少）は、ＩＳＩＳ１４２０８２（タンパク質６５％減少）と同じくらい有効であることが示された。最後に、ＰＢＳ対照と比較して、ＩＳＩＳ４０９８２６およびＩＳＩＳ１４２０８２での処置によりトリグリセリドレベルは２２％減少し、ＩＳＩＳ４０４１７３での処置の結果トリグリセリドレベルは３７％減少した。
【０４４３】
カニクイザルでの忍容性試験（実施例１７）で、この霊長類でＩＳＩＳ１４２０８２での処置はＩＳＩＳ４０４１７３での処置ほど忍容性が高くないことが示された。肝臓で合成されて炎症マーカーとして働くＣ反応性タンパク質のレベルを９３日目に測定した。４０ｍｇ／週の高用量では、ＩＳＩＳ１４２０８２での処置により、ＣＲＰレベルは対照レベルの１．２ｍｇ／Ｌと比較して１２ｍｇ／Ｌと有意に増加した。ＩＳＩＳ４０４１７３を４０ｍｇ／Ｌで用いる処置では１．６ｍｇ／ＬのＣＲＰレベルの増加がもたらされた。試験した他の化合物のＩＳＩＳ４０９８２６とＩＳＩＳ４４６４３１によりＣＲＰレベルは４．８ｍｇ／Ｌと６．７ｍｇ／Ｌ増加した。従って、ＩＳＩＳ４０４１７３がもたらしたＣＲＰレベルの増加が最小であり、ＩＳＩＳ４０４１７３が極めて忍容性が高く非炎症誘発性であることが示された。器官重量も測定し、ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドの忍容性をサルで評価した。ＩＳＩＳ１４２０８２を４０ｍｇ／Ｌで用いる処置は腎臓で２１ｇ、肝臓で１８ｇの重量増加をもたらしたが、これは対照（腎臓１０ｇ、肝臓１０．５ｇ）の２倍の増加である。ＩＳＩＳ４０９８２６での処置により、肝臓の重量は２倍増加し（１８．５ｇに対し対照は１０．５ｇ）、脾臓の重量は３倍増加した（６．０ｇに対し対照は２．３ｇ）。ＩＳＩＳ４４６４３１での処置により、脾臓の重量は４倍増加した（９．６ｇに対し対照は２．３ｇ）。ＩＳＩＳ４０４１７３での処置は、すべての器官で１倍よりも少ない増加をもたらした（腎臓１４．８ｇ；肝臓１５．５ｇ；脾臓３．７ｇ）。（図２）を参照されたい。従って、前記サルでは、ＩＳＩＳ１４２０８２、ＩＳＩＳ４０９８２６およびＩＳＩＳ４４６４３１での処置は忍容されないがＩＳＩＳ４０４１７３での処置は忍容されると考えられた。
【０４４４】
ＩＳＩＳ１４２０８２での処置は器官重量の増加とＣＲＰレベルの上昇をもたらし、炎症状態を示した。ＩＳＩＳ４０９８２６での処置もＣＲＰレベルの上昇と低補体Ｃ３レベルをもたらし、疾患状態を示した。ＩＳＩＳ４０４１７３およびＩＳＩＳ４４６４３１での処置はカニクイザルの忍容性プロファイルという点で最適であると考えられた。しかし、ＩＳＩＳ４４６４３１はＩＳＩＳ４０４１７３と比較すると効力が低いことが示された。
【０４４５】
肝臓と腎臓におけるオリゴヌクレオチドの薬物動態プロファイル試験の場合、どのＩＳＩＳオリゴヌクレオチドも何ら異常な肝臓対腎臓の濃度比率を示さなかった。ＩＳＩＳ４０４１７３はＩＳＩＳ１４２０８２と比較して直腸での蓄積が優れているという結果が示された。
【０４４６】
従って、インビボ試験、特にカニクイザルでの試験は、ＩＳＩＳ４０４１７３が他の化合物とちょうど同程度の効力を持ちながら、忍容性はそれらよりも極めて高かったことを示している。これらの試験で、ＩＳＩＳ１４２０８２は、ＩＳＩＳ４０７１７３から１個核酸塩基をシフトさせただけであるが、ＩＳＩＳ４０４１７３と同じくらいの有効性はあるものの効力と忍容性は劣ることが、代謝および炎症性マーカーの測定で示された。全体的に、ＩＳＩＳ４０４１７３は他のどの化合物と比較しても効力と忍容性が高かった。
【０４４７】
従って、改善された特性のうちのいずれか１つ以上を有するアンチセンス化合物が本明細書で提供される。ある特定の実施形態では、本明細書にさらに記載されるような、配列番号１のヌクレオチドの領域を標的とする、またはそれと特異的にハイブリダイズ可能である修飾型オリゴヌクレオチドを含む化合物が本明細書で提供される。
【０４４８】
従って、改善された特性のうちのいずれか１つ以上を有するアンチセンス化合物が本明細書で提供される。ある特定の実施形態では、本明細書にさらに記載されるような、配列番号２のヌクレオチドの領域を標的とする、またはそれと特異的にハイブリダイズ可能である修飾型オリゴヌクレオチドを含む化合物が本明細書で提供される。
【０４４９】
ある特定の実施形態では、本明細書に記載されるような化合物は、実施例１１に記載されるように電気穿孔法を用いてカニクイザルの肝細胞細胞株に送達されると、０．４μＭ未満、０．３５μＭ未満、０．３μＭ未満、２．５μＭ未満、２．０μＭ未満、１．５μＭ未満、１．０μＭ未満のインビトロＩＣ５０のうちの少なくとも１つを有するため、有効である。ある特定の実施形態では、本明細書に記載されるような化合物は、生理食塩水で処置した動物に対し４倍、３倍または２倍を超えないＡＬＴまたはＡＳＴ値の増加；または肝臓、脾臓または腎臓の重量の３０％、２０％、１５％、１２％、１０％、５％または２％を超えない増加のうちの少なくとも１つを有することにより示されるように、極めて忍容できるものである。
【実施例】
【０４５０】
非限定的な開示および参照による組み込み
本明細書に記載の特定の化合物、組成物および方法は特定の実施形態に従い具体的に記述されているが、以下の実施例は本明細書に記載の化合物を例示説明するためのみに用いられ、その化合物を限定することは意図しない。本願で引用される参照文献、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号などはそれぞれその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０４５１】
実施例１：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡのアンチセンス阻害
ヒトＰＴＰ１Ｂ核酸を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計し、それらがＰＴＰ１Ｂ  ＲＮＡ転写物に及ぼす効果をインビトロで試験した。以前の特許（ＢＩＯＬ００１ＵＳＰ２）で請求されたＩＳＩＳ１０７７７２、ＩＳＩＳ１０７８３１、ＩＳＩＳ１４２０２５、ＩＳＩＳ１４２０２６、ＩＳＩＳ１４２０２７、ＩＳＩＳ１４２０２８、ＩＳＩＳ１４２０８２、ＩＳＩＳ１４６９０８およびＩＳＩＳ１４６９０９を比較のためにこの測定に含めた。培養ＨｕＶＥＣ細胞をウェル当たり５０００細胞の密度で２ｎＭのアンチセンスオリゴヌクレオチドと共にＬｉｐｏｆｅｃｔＡＭＩＮＥ  ２０００（登録商標）を使用して形質移入した。およそ２４時間後、ＲＮＡを細胞から単離し、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルを定量的リアルタイムＰＣＲにより測定した。ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをリボグリーン（登録商標）で測定される全ＲＮＡ含量に従って補正した。結果は未処理の対照細胞に対するＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害パーセントとして示される。
【０４５２】
表１のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、５−１０−５ＭＯＥギャップマーまたは２−１３−５ＭＯＥギャップマーである。５−１０−５ＭＯＥギャップマーは、１０個の２’−デオキシヌクレオシドを含むギャップセグメントと、５個の２’−ＭＯＥヌクレオシドを含む２つのウイングセグメントを有する。２−１３−５ＭＯＥギャップマーは、１３個の２’−デオキシヌクレオシドを含むギャップセグメント、２個の２’−ＭＯＥヌクレオシドを含む５’ウイングセグメント、および３個の２’−ＭＯＥヌクレオシドを含む３’ウイングセグメントを有する。各ギャップマー全体のヌクレオシド間結合はホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）結合である。各ギャップマー全体の全シトシン残基は５−メチルシトシンである。「標的開始部位」は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする、ヒト遺伝子配列中の最も５’側のヌクレオチドを表す。「標的終止部位」は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする、ヒト遺伝子配列中の最も３’側のヌクレオチドを表す。表１に列挙した全アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ここでは配列番号１として示されるｍＲＮＡ配列（ＧＥＮＢＡＮＫアクセション番号ＮＭ＿００２８２７．２）またはここでは配列番号２として示されるゲノム配列（ＧＥＮＢＡＮＫ受託番号ＮＴ＿０１１３６２．９から切り出したヌクレオチド１４１７８０００から１４２５６０００）の一方、または両方を標的とする。
【０４５３】
表１のヒトオリゴヌクレオチドの一部はまた、アカゲザルの遺伝子配列と完全に交差反応性である。「ｎ／ａ」は、ヒトオリゴヌクレオチドとアカゲザル遺伝子配列の間に３塩基よりも多いミスマッチがあったことを表す。ヒトオリゴヌクレオチドとアカゲザル遺伝子配列の間の相補性が高いほど、ヒトオリゴヌクレオチドはアカゲザル配列と交差反応できる可能性がより高い。表１のヒトオリゴヌクレオチドを配列番号３（アカゲザルＰＴＰ１Ｂ足場のエクソン１〜９、イントロン９およびエクソン１０）と比較した。「アカゲザル標的開始部位」は、ギャップマーが標的とする、アカゲザル遺伝子配列の最も５’側のヌクレオチドを表す。「アカゲザル標的終止部位」は、ギャップマーが標的とする、アカゲザル遺伝子配列の最も３’側のヌクレオチドを表す。
【０４５４】
【表１−１】
0005951752.tif 000010
【表１−２】
0005951752.tif 000011
【０４５５】
実施例２：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの用量依存的アンチセンス阻害
実施例１に記載の研究でＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの有意なアンチセンス阻害を示した複数のアンチセンスオリゴヌクレオチドを、ＨｕＶＥＣ細胞において様々な用量でさらに試験した。細胞をウェル当たり５０００細胞の密度で蒔き、ＬｉｐｏｆｅｃｔＡＭＩＮＥ  ２０００（登録商標）を用いて０．９３７５ｎＭ、１．８７５ｎＭ、３．７５ｎＭ、７．５ｎＭ、１５ｎＭおよび３０ｎＭの濃度の各アンチセンスオリゴヌクレオチドで形質移入した。およそ１６時間後、ＲＮＡを細胞から単離し、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをプライマープローブセットＲＴＳ３０００（ここでは配列番号３３として示されるフォワード配列CTGGTTTAACCTCCTATCCTTGGA；ここでは配列番号３４として示されるリバース配列CAGAGCAGCTCGCTACCTCTCT、ここでは配列番号３５として示されるプローブ配列CAGCTGGCTCTCCACCTTGTTACACATTATGT）を用いて定量的リアルタイムＰＣＲにより測定した。ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをリボグリーン（登録商標）で測定される全ＲＮＡ含量に対し正規化した。結果を未処理の対照細胞に対するＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの阻害パーセントとして表２に示す。
【０４５６】
【表２】
0005951752.tif 000012
【０４５７】
実施例３：ＬＬＣ−ＭＫ２細胞におけるＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの用量依存的アンチセンス阻害
実施例２に記載の試験のアンチセンスオリゴヌクレオチドはまた、アカゲザル遺伝子配列（配列番号３）と交差反応性があり、アカゲザルＬＬＣ−ＭＫ２細胞において様々な用量でさらに試験された。細胞をウェル当たり３０００細胞の密度で蒔き、リポフェクチンを用いて３．１２５ｎＭ、６．２５ｎＭ、１２．５ｎＭ、２５ｎＭ、５０ｎＭおよび１００ｎＭの濃度の各アンチセンスオリゴヌクレオチドで形質移入した。およそ１６時間後、ＲＮＡを細胞から単離し、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをプライマープローブセットＲＴＳ１９８（ここでは配列番号３６として示されるフォワード配列GGAGTTCGAGCAGATCGACAA；ここでは配列番号３７として示されるリバース配列GGCCACTCTACATGGGAAGTC、ここでは配列番号３８として示されるプローブ配列AGCTGGGCGGCCATTTACCAGGAT）を用いて定量的リアルタイムＰＣＲにより測定した。ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをリボグリーン（登録商標）で測定される全ＲＮＡ含量に対し正規化した。結果を未処理の対照細胞に対するＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの阻害パーセントとして表３に示す。アカゲザル配列番号３（アカゲザルＰＴＰ１Ｂ足場（遺伝子足場２４０）のエクソン１〜９、イントロン９およびエクソン１０の連鎖）の各オリゴヌクレオチドの開始および終止部位を表４に示す。
【０４５８】
【表３】
0005951752.tif 000013
【０４５９】
【表４】
0005951752.tif 000014
【０４６０】
実施例４：カニクイザル初代培養肝細胞におけるＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの用量依存的アンチセンス阻害
実施例１、２および３に記載の研究のアンチセンスオリゴヌクレオチドの一部をカニクイザル初代培養肝細胞において様々な用量でさらに試験した。細胞をウェルあたり３５０００細胞の密度で蒔き、リポフェクチンを用いて６．２５ｎＭ、１２．５ｎＭ、２５ｎＭ、５０ｎＭ、１００ｎＭおよび２００ｎＭの濃度の各アンチセンスオリゴヌクレオチドで形質移入した。およそ１６時間後、ＲＮＡを細胞から単離し、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをプライマープローブセットＲＴＳ１９８を用いて定量的リアルタイムＰＣＲにより測定した。ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをリボグリーン（登録商標）で測定される全ＲＮＡ含量に対し正規化した。結果を未処理の対照細胞に対するＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの阻害パーセントとして表５に示す。
【０４６１】
【表５】
0005951752.tif 000015
【０４６２】
実施例５：マイクロウォークにより設計されたオリゴヌクレオチドによるＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡのアンチセンス阻害
試験した全細胞株で有意なＰＴＰ１Ｂ阻害を示したＩＳＩＳ４０９８２６に基づき追加のギャップマーを設計した。これらのギャップマーは、ＩＳＩＳ４０９８２６のわずかに上流および下流にシフトさせたギャップマー（すなわち「マイクロウォーク」）を作成することで設計した。オリゴヌクレオチドはまた、様々なモチーフ、例えば５−１０−５ＭＯＥ、５−８−５ＭＯＥ、２−１３−５ＭＯＥ、６−８−６ＭＯＥモチーフで作成し、またはデオキシとＭＯＥユニットの均質のオリゴヌクレオチドであった。これらのギャップマーをインビトロで試験した。ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドのＩＳＩＳ１４２０８２、ＩＳＩＳ１１３７１５、ＩＳＩＳ３７３１２５、ＩＳＩＳ４０４１６１、ＩＳＩＳ４０４１７２、ＩＳＩＳ４０４１７３、ＩＳＩＳ４０４１７６、ＩＳＩＳ４０９８２５、ＩＳＩＳ４０９８２７、ＩＳＩＳ４０９８２８、ＩＳＩＳ４０９８２９、ＩＳＩＳ４０９８４５、ＩＳＩＳ４０９９９８、ＩＳＩＳ４０９９９９、ＩＳＩＳ４１００００、ＩＳＩＳ４１０００１、ＩＳＩＳ４１０００２、ＩＳＩＳ４１０００３、ＩＳＩＳ４１０００４およびＩＳＩＳ４１００３０（実施例１より）、並びに以前の出願（ＣＯＲＥ００６１ＷＯ１５）のＩＳＩＳ３９９０３８、ＩＳＩＳ４０４１５９およびＩＳＩＳ４０４１７４も比較のために測定に含めた。培養ＨｕＶＥＣ細胞をウェル当たり２０，０００細胞の密度で電気穿孔法を使用して２，０００ｎＭのアンチセンスオリゴヌクレオチドで形質移入した。およそ２４時間の処置期間後、ＲＮＡを細胞から単離し、定量的リアルタイムＰＣＲによりＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルを測定した。ヒトプライマープローブセットＲＴＳ３０００を使用してＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルを測定した。ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをリボグリーン（登録商標）で測定される全ＲＮＡ含量に従い補正した。結果を未処理対照細胞に対するＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの阻害パーセントとして表す。結果を表６および７に示す。
【０４６３】
５−１０−５ＭＯＥギャップマーは長さが２０ヌクレオチドであり、中央のギャップセグメントは１０個の２’−デオキシヌクレオチドで構成され、両側（５’と３’の方向）にそれぞれ５個のヌクレオチドを含むウイングが隣接する。５−８−５ＭＯＥギャップマーは長さが１８ヌクレオチドであり、中央のギャップセグメントは８個の２’−デオキシヌクレオチドで構成され、両側（５’と３’の方向）にそれぞれ５個のヌクレオチドを含むウイングが隣接する。２−１３−５ＭＯＥギャップマーは長さが２０ヌクレオチドであり、中央のギャップセグメントは１３個の２’−デオキシヌクレオチドで構成され、５’と３’の方向にそれぞれ２個と５個のヌクレオチドを含むウイングが隣接する。６−８−６ＭＯＥギャップマーは長さが１８ヌクレオチドであり、中央のギャップセグメントは８個の２’−デオキシヌクレオチドで構成され、両側（５’と３’の方向）にそれぞれ６個のヌクレオチドを含むウイングが隣接する。各モチーフ（５−１０−５、５−８−５、２−１３−５および６−８−６）で、５’ウイングセグメントの各ヌクレオチドと３’ウイングセグメントの各ヌクレオチドは２’−ＭＯＥ修飾を有する。均質なオリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの全長に分布するデオキシとＭＯＥユニットを有する。均質なオリゴヌクレオチド配列中の様々な単位の化学物質の記号は次のとおりである：「ｄ」＝２’−デオキシリボース；「ｅ」＝２’−Ｏ−メトキシエチルリボース。各ギャップマー全体のすべてのヌクレオシド間結合はホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）結合である。各ギャップマー全体のシチジン残基は５−メチルシチジンである。「標的開始部位」は、ギャップマーが標的とする最も５’側のヌクレオチドを表す。「標的終止部位」は、ギャップマーが標的とする最も３’側のヌクレオチドを表す。表６に列挙する各ギャップマーは、配列番号１（ＧＥＮＢＡＮＫ受託番号ＮＭ＿００２８２７．２）を標的とする。表７に列挙するアンチセンスオリゴヌクレオチドはすべて配列番号２（ＧＥＮＢＡＮＫ受託番号ＮＴ＿０１１３６２．９から切り出したヌクレオチド１４１７８０００から１４２５６０００）を標的とする。
【０４６４】
表６および７に示すように、ＩＳＩＳ番号：１１３７１５、１４２０８２、３７３１２５、３９９０３８、４０４１５９、４０４１６１、４０４１７２、４０４１７３、４０４１７６、４０９８２６、４０９８２７、４０９９９９、４１００００、４１０００１、４１０００２、４１０００３、４１０００４、４３８３７１、４３８３７２、４３８３７３、４３８３７４、４３８３７５、４３８３７７、４３８３７９、４３８３８０、４３８３８１、４３８３８２、４３８３８３、４３８３８４、４３８４３９、４３８４４２、４３８４４３、４３８４４４、４３８４４５、４３８４５０、４３８４５１、４３８４５２、４３８４５３、４３８４５４、４３８４５５、４３８４５６、４３８４５８、４３８４５９、４３８４６０、４３８４６１、４３８４６２、４３８４６４、４３８４６５、４３８４６８、４３８４６９、４３８４７２、４３８４７３および４３８４７４を含む複数のギャップマーが少なくとも５０％の阻害を示した。
【０４６５】
ＩＳＩＳ番号：１１３７１５、１４２０８２、３７３１２５、３９９０３８、４０４１６１、４０４１７２、４０４１７３、４０４１７６、４０９８２６、４０９８２７、４０９９９９、４１００００、４１０００１、４１０００２、４１０００３、４３８３７３、４３８３７４、４３８３８０、４３８３８１、４３８３８２、４３８４４２、４３８４４４、４３８４４５、４３８４５０、４３８４５１、４３８４５２、４３８４５３、４３８４５９、４３８４６０、４３８４６１、４３８４６２、４３８４６８、４３８４６９、４３８４７２および４３８４７４を含む複数のギャップマーが少なくとも６０％の阻害を示した。
【０４６６】
ＩＳＩＳ番号：１４２０８２、３７３１２５、３９９０３８、４０４１６１、４０４１７２、４０４１７３、４０４１７６、４０９８２６、４０９８２７、４０９９９９、４１００００、４１０００１、４１０００２、４１０００３、４３８３７３、４３８３７４、４３８４４４、４３８４５１、４３８４５２、４３８４５３、４３８４６０、４３８４６１、４３８４６２、４３８４６８、４３８４６９、４３８４７２および４３８４７４を含む複数のギャップマーが少なくとも７０％の阻害を示した。
【０４６７】
ＩＳＩＳ番号：１４２０８２、４０４１６１、４０４１７３、４０４１７６、４０９８２６、４１００００、４１０００１、４１０００２、４１０００３、４３８４５１、４３８４５２、４３８４６０、４３８４６１および４３８４７４を含む複数のギャップマーが少なくとも８０％の阻害を示した。
【０４６８】
ＩＳＩＳ番号：１４２０８２、４０４１６１、４０４１７３、４０４１７６、４０９８２６、４１０００１、４１０００２および４１０００３を含む複数のギャップマーが少なくとも８５％の阻害を示した。
【０４６９】
ＩＳＩＳ番号：１４２０８２、４０４１６１および４０９８２６を含む複数のギャップマーが少なくとも９０％の阻害を示した。
【０４７０】
【表６−１】
0005951752.tif 000016
【表６−２】
0005951752.tif 000017
【表６−３】
0005951752.tif 000018
【表６−４】
0005951752.tif 000019
【表６−５】
0005951752.tif 000020
【０４７１】
【表７−１】
0005951752.tif 000021
【表７−２】
0005951752.tif 000022
【表７−３】
0005951752.tif 000023
【表７−４】
0005951752.tif 000024
【表７−５】
0005951752.tif 000025
【０４７２】
実施例６：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの用量依存的アンチセンス阻害
実施例５に記載される研究でＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの有意なアンチセンス阻害を示した複数のアンチセンスオリゴヌクレオチドをＨｕＶＥＣ細胞において様々な用量でさらに試験した。ウェル当たり２０００細胞の密度で細胞を蒔き、電気穿孔法により３１．２５ｎＭ、６２．５ｎＭ、１２５ｎＭ、２５０ｎＭ、５００ｎＭ、１０００ｎＭ、２０００ｎＭおよび４０００ｎＭの濃度の各アンチセンスオリゴヌクレオチドで形質移入した。およそ１６時間後、ＲＮＡを細胞から単離し、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをプライマープローブセットＲＴＳ３０００を用いて定量的リアルタイムＰＣＲにより測定した。リボグリーン（登録商標）で測定し、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルを総ＲＮＡ含量に対し正規化した。結果を未処理対照細胞に対するＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの阻害パーセントとして表８に示す。
【０４７３】
【表８】
0005951752.tif 000026
【０４７４】
実施例７：ＨｅｐＧ２細胞におけるヒトＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの用量依存的アンチセンス阻害
実施例６に記載される研究で試験したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、ＨｅｐＧ２細胞において様々な用量でさらに試験した。ウェル当たり２０，０００細胞の密度で細胞を蒔き、電気穿孔法により３１．２５ｎＭ、６２．５ｎＭ、１２５ｎＭ、２５０ｎＭ、５００ｎＭ、１０００ｎＭ、２０００ｎＭおよび４０００ｎＭの濃度の各アンチセンスオリゴヌクレオチドで形質移入した。およそ１６時間後、ＲＮＡを細胞から単離し、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをプライマープローブセットＲＴＳ３０００を用いて定量的リアルタイムＰＣＲにより測定した。リボグリーン（登録商標）で測定し、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルを総ＲＮＡ含量に対し正規化した。結果を未処理対照細胞に対するＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの阻害パーセントとして表９に示す。ｍＲＮＡレベルはまた、アカゲザルプライマープローブセットＲＴＳ１９８を用いて分析を行い、その結果が表１０に示される。アカゲザル配列番号３の各オリゴヌクレオチドの開始および終止部位を表１１に示す。
【０４７５】
【表９】
0005951752.tif 000027
【０４７６】
【表１０】
0005951752.tif 000028
【０４７７】
【表１１】
0005951752.tif 000029
【０４７８】
実施例８：ＨｅｐＧ２細胞におけるヒトＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの用量依存的アンチセンス阻害
ＩＳＩＳ１４２０８２の標的部位に対する短いアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計した。かかるショートマーの標的部位、モチーフおよび配列の詳細を表１２に示す。かかるアンチセンスオリゴヌクレオチドをＨｅｐＧ２細胞において様々な用量で試験した。実施例７に記載の研究のアンチセンスオリゴヌクレオチドの一部を比較のために測定に含めた。ウェル当たり２０，０００細胞の密度で細胞を蒔き、電気穿孔法により７８．１２５ｎＭ、１５６．２５ｎＭ、３１２．５ｎＭ、６２５ｎＭ、１，２５０ｎＭ、２，５００ｎＭ、５，０００ｎＭおよび１０，０００ｎＭの濃度の各アンチセンスオリゴヌクレオチドで形質移入した。およそ１６時間後、ＲＮＡを細胞から単離し、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをプライマープローブセットＲＴＳ３０００を用いて定量的リアルタイムＰＣＲにより測定した。ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをリボグリーン（登録商標）で測定される全ＲＮＡ含量に対し正規化した。結果を未処理対照細胞に対するＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの阻害パーセントとして表１３に示す。
【０４７９】
【表１２】
0005951752.tif 000030
【０４８０】
【表１３】
0005951752.tif 000031
【０４８１】
実施例９：ＬＬＣ−ＭＫ２細胞におけるＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの用量依存的アンチセンス阻害
実施例８に記載の研究のアンチセンスオリゴヌクレオチドはまた、アカゲザルＰＴＰ１Ｂ遺伝子配列（配列番号３）と交差反応性であり、アカゲザルＬＬＣ−ＭＫ２細胞において様々な用量でさらに試験された。ウェル当たり２５，０００細胞の密度で細胞を蒔き、電気穿孔法を使用して７８．１２５ｎＭ、１５６．２５ｎＭ、３１２．５ｎＭ、６２５ｎＭ、１，２５０ｎＭ、２，５００ｎＭ、５，０００ｎＭおよび１０，０００ｎＭの濃度の各アンチセンスオリゴヌクレオチドで形質移入した。およそ１６時間後、ＲＮＡを細胞から単離し、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをプライマープローブセットＲＴＳ１９８を用いて定量的リアルタイムＰＣＲにより測定した。ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをリボグリーン（登録商標）で測定される全ＲＮＡ含量に対し正規化した。結果を未処理対照細胞に対するＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの阻害パーセントとして表１４に示す。アカゲザル配列番号３の各オリゴヌクレオチドの開始および終止部位を表１５に示す。
【０４８２】
【表１４】
0005951752.tif 000032
【０４８３】
【表１５】
0005951752.tif 000033
【０４８４】
実施例１０：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの用量依存的アンチセンス阻害
実施例８および９に記載の研究で試験されたアンチセンスオリゴヌクレオチドを、ＨｕＶＥＣ細胞において様々な用量でさらに試験した。ウェル当たり２０，０００細胞の密度で細胞を蒔き、電気穿孔法により３１．２５ｎＭ、６２．５ｎＭ、１２５ｎＭ、２５０ｎＭ、５００ｎＭ、１０００ｎＭ、２０００ｎＭおよび４０００ｎＭの濃度の各アンチセンスオリゴヌクレオチドで形質移入した。およそ１６時間後、ＲＮＡを細胞から単離し、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをプライマープローブセットＲＴＳ３０００を用いて定量的リアルタイムＰＣＲにより測定した。ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをリボグリーン（登録商標）で測定される全ＲＮＡ含量に対し正規化した。結果を未処理対照細胞に対するＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの阻害パーセントとして表１６に示す。
【０４８５】
【表１６】
0005951752.tif 000034
【０４８６】
実施例１１：カニクイザル初代培養肝細胞におけるＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの用量依存的アンチセンス阻害
実施例８〜１０に記載の研究のアンチセンスオリゴヌクレオチドを、カニクイザル初代培養肝細胞において様々な用量でさらに試験した。ウェル当たり３５，０００細胞の密度で細胞を蒔き、電気穿孔法を使用して３１．２５ｎＭ、６２．５ｎＭ、１２５ｎＭ、２５０ｎＭ、５００ｎＭ、１０００ｎＭ、２０００ｎＭおよび４０００ｎＭの濃度の各アンチセンスオリゴヌクレオチドで形質移入した。およそ１６時間後、ＲＮＡを細胞から単離し、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをプライマープローブセットＲＴＳ１９８を用いて定量的リアルタイムＰＣＲにより測定した。ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルをリボグリーン（登録商標）で測定される全ＲＮＡ含量に対し正規化した。結果を未処理対照細胞に対するＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの阻害パーセントとして表１７に示す。
【０４８７】
【表１７】
0005951752.tif 000035
【０４８８】
実施例１２：マウスモデルにおけるヒトＰＴＰ１Ｂを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの忍容性
実施例８〜１１に記載の研究で用量依存的阻害を示したＩＳＩＳオリゴヌクレオチドを、ＣＤ１マウスにおける様々な代謝マーカーのレベル変化をモニターし、マウスモデルにおける忍容性を評価した。もう２つのＩＳＩＳオリゴヌクレオチド、ＩＳＩＳ４４６４３３（４−１０−４ＭＯＥ；５’−GTTTATTCCATGGCCATT−３’（配列番号４２）；配列番号１での標的開始部位は３２８８）およびＩＳＩＳ４４６４３４（３−１０−３；５’−TTTATTCCATGGCCAT−３’（配列番号４９）；配列番号１での標的開始部位は３２８９）をＩＳＩＳ４０９８２６に対するショートマー（配列番号１での標的開始部位は３２８７）として設計し、それらもこの研究で評価した。
【０４８９】
処置
ＣＤ１マウス（メイン州バーハーバーのJackson Labsより入手可能）を１２時間明暗周期で飼育し、通常のラボ飼料（ハーランラボラトリーズ社、インディアナ州インディアナポリス）を自由に食べさせた。動物は、実験を開始する前に研究施設内で少なくとも７日間順化させた。ＰＢＳ中アンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、０．２ミクロンのフィルターで濾過して滅菌した。オリゴヌクレオチドは注射用に０．９％ＰＢＳ中に溶解させた。
【０４９０】
各５匹ずつのＣＤ１マウスの群に１００ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ１４２０８２、ＩＳＩＳ３７３１２５、ＩＳＩＳ４０４１７３、ＩＳＩＳ４０９８２６、ＩＳＩＳ４１０００２、ＩＳＩＳ４１０００３、ＩＳＩＳ４３８４５２、ＩＳＩＳ４３８４６０、ＩＳＩＳ４４６４３１、ＩＳＩＳ４４６４３２、ＩＳＩＳ４４６４３３またはＩＳＩＳ４４６４３４を週２回、４週間皮下注射した。５匹のＣＤ１マウスの１群にＰＢＳを週２回、４週間皮下注射した。このＰＢＳ群を対照群とした。尾の切除により血液試料を回収した。最終投与の２日後、体重を量り、マウスを安楽死させ、器官と血漿を採取しさらに分析した。
【０４９１】
体重および器官重量
マウスの体重を毎週測定した。体重を表１８に示す。肝臓、脾臓および腎臓の重量を試験終了時に測定した結果を表１９に示す。結果は、どのＩＳＩＳオリゴヌクレオチドもマウスの総合的な健康になんら有害作用を及ぼさなかったことを示す。
【０４９２】
【表１８】
0005951752.tif 000036
【０４９３】
【表１９】
0005951752.tif 000037
【０４９４】
肝機能
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが肝機能に及ぼす効果を評価するために、臨床化学自動分析装置（日立オリンパスＡＵ４００ｅ、ニューヨーク州メルビル）を用いて血漿トランスアミナーゼレベルを測定した。ＡＬＴ（アラニントランスアミナーゼ）およびＡＳＴ（アスパラギン酸トランスアミナーゼ）の血漿レベルを隔週で測定した。結果は表２０と２１に示され、マウスの肝臓トランスアミナーゼプロファイルが示すようにＩＳＩＳオリゴヌクレオチドのほとんどがマウスで忍容されるとみなされたことを示す。
【０４９５】
【表２０】
0005951752.tif 000038
【０４９６】
【表２１】
0005951752.tif 000039
【０４９７】
血漿グルコースレベル
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドがグルコース代謝に及ぼす効果を評価するために、臨床化学自動分析装置（日立オリンパスＡＵ４００ｅ、ニューヨーク州メルビル）を用いて血漿グルコースレベルを測定した。結果を表２２にｍｇ／ｄＬで表して示す。どのＩＳＩＳオリゴヌクレオチドもマウスのグルコース代謝に何ら有害作用を及ぼさなかった。
【０４９８】
【表２２】
0005951752.tif 000040
【０４９９】
血漿脂質およびトリグリセリドのレベル
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドがコレステロールとトリグリセリドの代謝に及ぼす効果を評価するために、臨床化学自動分析装置（日立オリンパスＡＵ４００ｅ、ニューヨーク州メルビル）を用いてそれらの血漿レベルをそれぞれ測定した。結果を表２３と２４にｍｇ／ｄＬで表して示す。ほとんどのＩＳＩＳオリゴヌクレオチドがマウスの脂質代謝に何ら有害作用を及ぼさなかった。
【０５００】
【表２３】
0005951752.tif 000041
【０５０１】
【表２４】
0005951752.tif 000042
【０５０２】
サイトカインレベル
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが炎症に関与する因子に及ぼす効果を評価するために、処置期間終了後、サイトカインレベルを測定するため血液を採取した。試料を分析のためオーションバイオシステムズ社（マサチューセッツ州ウォバーン）に送った。マウスＩＬ−６、ＪＥ、ＭＩＰ−１αおよびＴＮＦ−αの各レベルをマウス抗体を用いて測定した。結果を表２５に示す。ほとんどのＩＳＩＳオリゴヌクレオチドがマウスのサイトカインレベルになんら有害作用を及ぼさなかった。
【０５０３】
【表２５】
0005951752.tif 000043
【０５０４】
実施例１３：ラットモデルにおけるヒトＰＴＰ１Ｂを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの忍容性
実施例１２に記載の試験のＩＳＩＳオリゴヌクレオチドを、ラットモデルでの忍容性について、スプレーグドーリーラットにおける様々な代謝マーカーレベルの変化をモニタリングすることでさらに評価した。
【０５０５】
処置
スプレーグドーリーラットを１２時間明暗周期で飼育し、通常のラボ飼料（ハーランラボラトリーズ社、インディアナ州インディアナポリス）を自由に食べさせた。動物は、実験を開始する前に研究施設内で少なくとも７日間順化させた。ＰＢＳ中アンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、０．２ミクロンのフィルターで濾過して滅菌した。オリゴヌクレオチドは注射用に０．９％ＰＢＳ中に溶解させた。
【０５０６】
各４匹ずつのラットの群に週２回５０ｍｇ／ｋｇの用量のＩＳＩＳ１４２０８２、ＩＳＩＳ３７３１２５、ＩＳＩＳ４０４１７３、ＩＳＩＳ４０９８２６、ＩＳＩＳ４１０００２、ＩＳＩＳ４１０００３、ＩＳＩＳ４３８４５２、ＩＳＩＳ４３８４６０、ＩＳＩＳ４４６４３１、ＩＳＩＳ４４６４３２、ＩＳＩＳ４４６４３３またはＩＳＩＳ４４６４３４を週２回、４週間皮下注射し、続けて３０ｍｇ／ｋｇの用量を週２回、８週間皮下注射した。４匹のラットの１群にＰＢＳを週２回、１２週間皮下注射した。このＰＢＳ群を対照群とした。尾の切除により血液試料を回収した。最終投与の２日後、体重を量り、ラットを安楽死させ、器官と血漿を採取しさらに分析した。
【０５０７】
体重および器官重量
ラットの体重を毎週測定した。体重を表２６に示す。肝臓、脾臓および腎臓の重量を試験終了時に測定した結果を表２７に示す。「ｎ／ａ」は、ある特定の群のラットをその時点以前に全て安楽死させたため、その群のデータがその時点で入手不能であることを示す。
【０５０８】
【表２６】
0005951752.tif 000044
【０５０９】
【表２７】
0005951752.tif 000045
【０５１０】
肝機能
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが肝機能に及ぼす効果を評価するために、臨床化学自動分析装置（日立オリンパスＡＵ４００ｅ、ニューヨーク州メルビル）を用いて血漿トランスアミナーゼレベルを測定した。ＡＬＴ（アラニントランスアミナーゼ）およびＡＳＴ（アスパラギン酸トランスアミナーゼ）の血漿レベルを隔週で測定した。血漿ビリルビンレベル（ｍｇ／ｄＬ）も同じ臨床化学分析装置を用いて測定した。結果を表２８、２９および３０に示す。「ｎ／ａ」は、ある特定の群のラットをその時点以前に全て安楽死させたため、その群のデータがその時点で入手不能であることを示す。
【０５１１】
【表２８】
0005951752.tif 000046
【０５１２】
【表２９】
0005951752.tif 000047
【０５１３】
【表３０】
0005951752.tif 000048
【０５１４】
腎機能
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが腎機能に及ぼす効果を評価するために、臨床化学自動分析装置（日立オリンパスＡＵ４００ｅ、ニューヨーク州メルビル）を用いて血中尿素窒素（ＢＵＮ）およびクレアチニンの血漿レベルを測定した。結果を表３１および３２にｍｇ／ｄＬで表して示す。総尿タンパク対尿クレアチニン比率も計算し、その結果を表３３に示す。
【０５１５】
【表３１】
0005951752.tif 000049
【０５１６】
【表３２】
0005951752.tif 000050
【０５１７】
【表３３】
0005951752.tif 000051
【０５１８】
血漿グルコースレベル
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドがグルコース代謝に及ぼす効果を評価するために、臨床化学自動分析装置（日立オリンパスＡＵ４００ｅ、ニューヨーク州メルビル）を用いて血漿グルコースレベルを測定した。結果を表３４にｍｇ／ｄＬで表して示す。
【０５１９】
【表３４】
0005951752.tif 000052
【０５２０】
血漿脂質およびトリグリセリドのレベル
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが総コレステロールおよびトリグリセリドのレベルに及ぼす効果を評価するために、臨床化学自動分析装置（日立オリンパスＡＵ４００ｅ、ニューヨーク州メルビル）を用いてそれらの血漿グルコースレベルをそれぞれ測定した。結果を表３５と３６にｍｇ／ｄＬで表して示す。
【０５２１】
【表３５】
0005951752.tif 000053
【０５２２】
【表３６】
0005951752.tif 000054
【０５２３】
サイトカインレベル
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが炎症に関与する因子に及ぼす効果を評価するために、処置期間終了後、サイトカインレベルを測定するため血液を採取した。試料を分析のためオーションバイオシステムズ社（マサチューセッツ州ウォバーン）に送った。ラットＩＬ−６、ＭＣＰ−１、ＭＩＰ−１αおよびＴＮＦ−αの各レベルをそれぞれの抗体を用いて測定した。結果を表３７に示す。
【０５２４】
【表３７】
0005951752.tif 000055
【０５２５】
実施例１４：ヒトＰＴＰ１Ｂを標的とするＩＳＩＳアンチセンスオリゴヌクレオチドの粘度測定
実施例１２および１３に記載の研究から選択されたアンチセンスオリゴヌクレオチドの粘度を、濃度１６５〜１８５ｍｇ／ｍＬで４０ｃＰを超える粘度を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドを排除する目的で測定した。４０ｃＰを上回る粘度を有するオリゴヌクレオチドは、どの対照に投与するにも粘性が高すぎるであろう。
【０５２６】
ガラスバイアル管中にＩＳＩＳオリゴヌクレオチド（３２〜３５ｍｇ）を量りとり、１２０μＬの水を添加し、前記のバイアル管を５０℃で加熱して前記アンチセンスオリゴヌクレオチドを溶液に溶解した。前記の予熱した試料の一部（７５μＬ）をピペットでマイクロ粘度計（ケンブリッジ社）に移した。マイクロ粘度計の温度を２５℃に設定し、前記試料の粘度を測定した。８５℃、２６０ｎＭでのＵＶ測定（Cary社ＵＶ測定器）のために、前記の予熱した試料の別の一部（２０μＬ）をピペットで１０ｍＬの水に加えた。結果は表３８に示され、上述の基準では全てのアンチセンスオリゴヌクレオチド溶液の粘度が最適であることを示している。
【０５２７】
【表３８】
0005951752.tif 000056
【０５２８】
実施例１５：マウスモデルにおけるヒトＰＴＰ１Ｂを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの６か月間忍容性試験
実施例１２〜１４に記載の試験から選択されたＩＳＩＳオリゴヌクレオチドを、マウスモデルにおける長期忍容性について、ＣＤ１マウスの様々な代謝マーカーレベルの変化をモニタリングして評価した。
【０５２９】
処置
雄のＣＤ１マウスを１２時間明暗周期で飼育し、通常のラボ飼料（ハーランラボラトリーズ社、インディアナ州インディアナポリス）を自由に食べさせた。動物は、実験を開始する前に研究施設内で少なくとも７日間順化させた。ＰＢＳ中アンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、０．２ミクロンのフィルターで濾過して滅菌した。オリゴヌクレオチドは注射用に０．９％ＰＢＳ中に溶解させた。
【０５３０】
各１０匹ずつのラットの群に２５ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ１４２０８２、ＩＳＩＳ４０４１７３またはＩＳＩＳ４４６４３１を週２回、２４週間皮下注射した。１０匹のラットの１群にＰＢＳを週２回、２４週間皮下注射した。このＰＢＳ群を対照群とした。１４０日目に下顎からの出血により血液試料を回収した。１６８日目にＣＯ２麻酔下で最終処置の心臓穿刺により血液を回収し、マウスを安楽死させ、器官を採取しさらに分析した。
【０５３１】
血漿グルコースレベル
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドがグルコース代謝に及ぼす効果を評価するために、臨床化学自動分析装置（日立オリンパスＡＵ４００ｅ、ニューヨーク州メルビル）を用いて血漿グルコースレベルを測定した。結果を表３９にｍｇ／ｄＬで表して示す。
【０５３２】
【表３９】
0005951752.tif 000057
【０５３３】
肝機能
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが肝機能に及ぼす効果を評価するために、臨床化学自動分析装置（日立オリンパスＡＵ４００ｅ、ニューヨーク州メルビル）を用いて血漿トランスアミナーゼレベルを測定した。１６８日目のＡＬＴ（アラニントランスアミナーゼ）およびＡＳＴ（アスパラギン酸トランスアミナーゼ）の血漿レベルを測定した。血漿ビリルビンレベル（ｍｇ／ｄＬ）も同じ臨床化学分析装置を用いて測定した。損傷を受けた肝細胞によりその合成量が増加するアルカリホスファターゼも、肝臓疾患のマーカーである（Narayanan, S. Ann. Clin. Lab. Sci. 21: 12-8, 1991）ので同様に測定した。肝臓疾患で典型的に減少するアルブミン（Oettl, K.ら, Biochim. Biophys. Acta. 1782: 469-73, 2008）も同様に測定した。結果を表４０に示す。
【０５３４】
【表４０】
0005951752.tif 000058
【０５３５】
心機能
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが心機能に及ぼす効果を評価するために、臨床化学自動分析装置（日立オリンパスＡＵ４００ｅ、ニューヨーク州メルビル）を用いて１６８日目の血漿クレアチンホスホキナーゼ（ＣＰＫ）レベルを測定した。このマーカーレベルの増加は、心筋の損傷を意味する（Barohn, R.J. In: Goldman L, Ausiello D編. Cecil Medicine. 23版. Philadelphia, Pa: Saunders Elsevier; 2007: 447章）。結果を表４１に示す。
【０５３６】
【表４１】
0005951752.tif 000059
【０５３７】
膵機能
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが膵機能に及ぼす効果を評価するために、臨床化学自動分析装置（日立オリンパスＡＵ４００ｅ、ニューヨーク州メルビル）を用いて１６８日目の血漿アミラーゼレベルを測定した。このマーカーレベルの増加は、急性膵炎を意味する（Sternby, B.ら, Mayo Clin. Proc. 71: 1138-44, 1996）。結果を表４２に示す。
【０５３８】
【表４２】
0005951752.tif 000060
【０５３９】
腎機能
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが腎機能に及ぼす効果を評価するために、臨床化学自動分析装置（日立オリンパスＡＵ４００ｅ、ニューヨーク州メルビル）を用いて血中尿素窒素（ＢＵＮ）およびクレアチニンの血漿レベルを測定した。結果を表４３にｍｇ／ｄＬで表して示す。
【０５４０】
【表４３】
0005951752.tif 000061
【０５４１】
実施例１６：ＣＤ１マウス肝臓におけるアンチセンスオリゴヌクレオチドの半減期測定
ＣＤ１マウスを実施例１４に記載の試験から選択されたＩＳＩＳアンチセンスオリゴヌクレオチドで処置し、オリゴヌクレオチドの半減期並びにオリゴヌクレオチドの分解および肝臓からの排泄までの経過時間を評価した。
【０５４２】
処置
各１０匹ずつのＣＤ１マウスの群に５０ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ１４２０８２、ＩＳＩＳ４４６４３１、ＩＳＩＳ４０４１７３またはＩＳＩＳ４０９８２６を週２回、２週間皮下注射した。最後の投与から３日後および５６日後に各群から５匹のマウスをと殺した。分析のために肝臓を回収した。
【０５４３】
オリゴヌクレオチド濃度の測定
全長型オリゴヌクレオチドの濃度を測定した。使用した方法は、以前公開されたフェノール−クロロホルム（液体−液体）の抽出とそれに続く固相抽出からなる方法（Leedsら, 1996; Gearyら, 1999）の改変である。抽出前に内部標準（ＩＳＩＳ３５５８６８、２７マー２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型ホスホロチオエートオリゴヌクレオチド、GCGTTTGCTCTTCTTCTTGCGTTTTTT、本明細書では配列番号５０として示される）を添加した。およそ１．１４μｇ／ｇの定量下限（ＬＬＯＱ）を有する校正曲線を使用して組織試料濃度を計算した。その後、ＷｉｎＮｏｎｌｉｎソフトウェア（PHARSIGHT社）を使用して半減期を計算した。
【０５４４】
結果を表４４に示す。１１〜３４日以内の半減期をもつアンチセンスオリゴヌクレオチドをその後の試験用に選択した。
【０５４５】
【表４４】
0005951752.tif 000062
【０５４６】
実施例１７：カニクイザルにおけるヒトＰＴＰ１Ｂを標的とするＩＳＩＳアンチセンスオリゴヌクレオチドの効果
カニクイザルを、実施例１５および１６に記載の試験のＩＳＩＳアンチセンスオリゴヌクレオチドで処置した。アンチセンスオリゴヌクレオチドの有効性および忍容性並びに肝臓と腎臓における薬物動態プロファイルを評価した。
【０５４７】
処置
試験に先立ち、前記サルは３０日間の検疫を受け、この間に異常または病気のサルを排除するため血清化学および血液学の標準パネル、糞便試料の寄生虫および寄生虫卵検査、および結核検査が実施された。カニクイザル雄３匹雌２匹を各群にランダムに割り付けた６群に、８ｍｇ／ｋｇまたは４０ｍｇ／ｋｇのいずれかのＩＳＩＳ１４２０８２、ＩＳＩＳ４４６４３１またはＩＳＩＳ４０４１７３を１週目は週３回、その後は週１回１２週間皮下注射した。カニクイザル雄３匹雌２匹の１群に４０ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ４０９８２６を１週目は週３回、その後は週１回１２週間皮下注射した。カニクイザル雄３匹雌２匹の対照１群にＰＢＳを１週目は週３回、その後は週１回１２週間皮下注射した。全群のと殺を最終投与から４８時間後の９３日目に実施した。
【０５４８】
試験期間中、サルの病気または苦痛の兆候について観察した。処置に対し何らかの有害作用を示す動物は除外し、獣医と試験責任者に託した。
【０５４９】
阻害試験
ＲＮＡ分析
ＲＮＡを肝臓と腹部脂肪組織から抽出し、ＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡの別々の領域をそれぞれ標的とするプライマープローブセット１（ここでは配列番号５１として示されるフォワード配列GACCAGCTGCGCTTCTCCTA；ここでは配列番号５２として示されるリバース配列CAGAGGAGTCCCCCATGATG；ここでは配列番号５３として示されるプローブ配列TTGGCTGTGATCGAAGGTGCCAAA）またはプライマープローブセット２（ここでは配列番号５４として示されるフォワード配列GGGCCCTTTGCCTAACACA；ここでは配列番号５５として示されるリバース配列CGACACCCCTGCTTTTCTG；ここでは配列番号５６として示されるプローブ配列CGGTCACTTTTGGGAGATGGTGTGG）を用いてＰＴＰ１ＢのリアルタイムＰＣＲ分析を行った。結果は、リボグリーン（登録商標）で正規化されるＰＢＳ対照に対するＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡ減少パーセントとして示される。表４５に示すように、ＩＳＩＳアンチセンスオリゴヌクレオチドでの処置の結果、ＰＢＳ対照と比較して有意なＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡ減少がもたらされた。ＩＳＩＳ４０４１７３での処置により、ＩＳＩＳ１４２０８２での処置と同様のＰＴＰ１Ｂ  ｍＲＮＡレベルの減少がもたらされた。
【０５５０】
【表４５】
0005951752.tif 000063
【０５５１】
タンパク質の分析
肝臓から組織を抽出し、ウェスタンブロット分析によりＰＴＰ１Ｂタンパク質レベルを測定した。具体的には、ＩＳＩＳ４０４１７３で処置されたサル由来のＰＴＰ１Ｂタンパク質試料を、ＩＳＩＳ１４２０８２で処置された試料と比較した。結果を表４６、４７および４８に対照レベルと比較してのパーセント減少として示して表す。ＰＴＰ１Ｂレベルは、総タンパク質レベルに対し、並びに構造的に発現するタンパク質ＩＲ−βに対し正規化した。ＩＳＩＳ４０４１７３での処置は、８ｍｇ／ｋｇの低用量で、ＩＳＩＳ１４２０８２での処置よりも大幅なＰＴＰ１Ｂ肝臓タンパク質の減少をもたらした（表４７）。
【０５５２】
【表４６】
0005951752.tif 000064
【０５５３】
【表４７】
0005951752.tif 000065
【０５５４】
【表４８】
0005951752.tif 000066
【０５５５】
忍容性の研究
体重と器官重量の測定
ＩＳＩＳアンチセンスオリゴヌクレオチドが動物の総合的な健康に及ぼす効果を評価するために、と殺後、体重と器官重量を測定した。体重を測定し、ＰＢＳ対照動物の体重と比較した。器官重量を測定し、処置群の重量を対応するＰＢＳ対照の重量と比較した。データを表４９に示す。ＩＳＩＳ１４２０８２での処置により、高用量で、肝臓と腎臓の重量は実際増加した。
【０５５６】
【表４９】
0005951752.tif 000067
【０５５７】
肝機能
ＩＳＩＳアンチセンスオリゴヌクレオチドが肝機能に及ぼす効果を評価するために、全研究群の血液試料を処置開始の７日前、並びに処置期間の３０日目、５８日目、９３日目に回収した。血液試料は血清分離のため一切の抗凝固剤なしで試験管に集めた。試験管を９０分室温下に置いた後遠心分離（室温３０００ｒｐｍで１０分間）して血清を得た。
【０５５８】
トランスアミナーゼのレベルは、東芝２００ＦＲ  ＮＥＯ化学分析装置（株式会社東芝、日本国）を使用して測定した。ＡＬＴ（アラニントランスアミナーゼ）とＡＳＴ（アスパラギン酸トランスアミナーゼ）の血漿レベルを測定した結果を表５０および５１にＩＵ／Ｌで表して示す。損傷を受けた肝細胞によりその合成量が増加し、かつ肝臓疾患のマーカーでもあるアルカリホスファターゼを同様に測定たデータを表５２に示す。全処置群のＡＳＴ、ＡＬＴおよびアルカリホスファターゼのレベルは、ＰＢＳ対照群のものと類似していた。
【０５５９】
肝臓で合成され、かつ炎症マーカーとして働くＣ反応性タンパク質（ＣＲＰ）も同様に測定し、そのデータを表５３に示す。ＩＳＩＳ１４２０８２およびＩＳＩＳ４０９８２６の高用量での処置は結果として高ＣＲＰレベルをもたらし、肝臓の炎症が示唆された。
【０５６０】
ビリルビンも肝臓代謝マーカーであり、同様に測定し表５４にｍｇ／ｄＬで表して示す。全処置群のビリルビンレベルはＰＢＳ対照群のものと類似していることが見出された。ガンマ−グルタミルトランスフェラーゼ（ＧＧＴ）は肝臓で産生される酵素であり、初期の肝臓障害または胆汁鬱血性疾患の有用な検査マーカーである（Betro, M.G.ら, Am. J. Clin. Pathol. 60: 672-8, 1973）。ＧＧＴレベルを測定した結果が表５５に示され、ＰＢＳ対照群と処置群の間に差がないことを示している。
【０５６１】
【表５０】
0005951752.tif 000068
【０５６２】
【表５１】
0005951752.tif 000069
【０５６３】
【表５２】
0005951752.tif 000070
【０５６４】
【表５３】
0005951752.tif 000071
【０５６５】
【表５４】
0005951752.tif 000072
【０５６６】
【表５５】
0005951752.tif 000073
【０５６７】
腎機能
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが腎機能に及ぼす効果を評価するために、全研究群から血液試料を回収した。血液試料は血清分離用に一切の抗凝固剤なしで試験管に集めた。試験管を９０分室温下に置いた後遠心分離（室温３０００ｒｐｍで１０分間）して血清を得た。ＢＵＮおよびクレアチニンのレベルを、処置開始の７日前並びに処置期間の３０日目、５８日目、９３日目に、東芝２００ＦＲ  ＮＥＯ化学分析装置（株式会社東芝、日本国）を使用して測定した。結果を表５６および５７にｍｇ／ｄＬで表して示す。ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処置はＢＵＮレベルまたはクレアチニンレベルのいずれにも有害作用を及ぼさなかった。
【０５６８】
【表５６】
0005951752.tif 000074
【０５６９】
【表５７】
0005951752.tif 000075
【０５７０】
コレステロールおよびトリグリセリドのレベル
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが脂質代謝に及ぼす効果を評価するために全研究群から血液試料を回収した。血液試料は血清分離用に一切の抗凝固剤なしで試験管に集めた。試験管を９０分室温下に置いた後遠心分離（室温３０００ｒｐｍで１０分間）して血清を得た。コレステロールおよびトリグリセリドの濃度を、処置開始の７日前並びに処置期間の３０日目、５８日目、９３日目に、東芝２００ＦＲ  ＮＥＯ化学分析装置（株式会社東芝、日本国）を使用して測定した。結果を表５８および５９にｍｇ／ｄＬで表して示す。ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処置はコレステロールレベルまたはトリグリセリドレベルのいずれにも有害作用を及ぼさなかった。
【０５７１】
【表５８】
0005951752.tif 000076
【０５７２】
【表５９】
0005951752.tif 000077
【０５７３】
血液学
カニクイザルにおけるＩＳＩＳオリゴヌクレオチドの炎症性効果を評価するため、利用可能な各研究動物から血液およそ０．５ｍＬの血液試料をＥＤＴＡカリウム塩を含む試験管に回収した。試料を、赤血球（ＲＢＣ）数、白血球（ＷＢＣ）数、血小板数およびヘモグロビン含量について、ＡＤＶＩＡ１２０血液学分析装置（バイヤー社、米国）を使用して分析した。データを表６０〜６３に示す。ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処置により血球数またはヘモグロビンのレベルは対照と比較して有意に変化しなかった。
【０５７４】
【表６０】
0005951752.tif 000078
【０５７５】
【表６１】
0005951752.tif 000079
【０５７６】
【表６２】
0005951752.tif 000080
【０５７７】
【表６３】
0005951752.tif 000081
【０５７８】
炎症因子の分析
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが炎症因子としての補体Ｃ３に及ぼす影響を評価するため、利用可能な全動物から血液を血清分離用に抗凝固剤なしで試験管に回収した。試験管を９０分室温下に置いた後遠心分離（室温３０００ｒｐｍで１０分間）して血清を得た。補体Ｃ３を自動分析装置（東芝２００ＦＲ  ＮＥＯ化学分析装置、株式会社東芝、日本国）を使用して測定した。結果を表６４にｍｇ／ｄＬで表して示す。ＩＳＩＳ４０９８２６での処置の結果、低補体Ｃ３レベルとなり、罹患状態が示された。
【０５７９】
【表６４】
0005951752.tif 000082
【０５８０】
インスリンレベルの分析
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが甲状腺に与える効果を評価するため、一晩絶食させた動物から４２日目、８４日目、９１日目に血液をＥＤＴＡ処理した試験管に回収した。試験管を氷中保管し、遠心分離（４℃３０００ｒｐｍで１０分間）により血液採取の３０分以内に血漿を得た。インスリンレベルを自動分析装置（東芝２００ＦＲ  ＮＥＯ化学分析装置、株式会社東芝、日本国）を使用して測定した。データを表６５にｎｇ／ｍＬで表して示す。
【０５８１】
【表６５】
0005951752.tif 000083
【０５８２】
薬物動態研究
オリゴヌクレオチド濃度の測定
全長型オリゴヌクレオチドの濃度並びにオリゴヌクレオチド全体（分解型も含む）の濃度を測定した。使用した方法は、以前公開されたフェノール−クロロホルム（液体−液体）の抽出とそれに続く固相抽出からなる方法（Leedsら, 1996; Gearyら, 1999）の改変である。抽出前に内部標準（ＩＳＩＳ３５５８６８、２７マー２’−Ｏ−メトキシエチル修飾型ホスホロチオエートオリゴヌクレオチド、GCGTTTGCTCTTCTTCTTGCGTTTTTT、本明細書では配列番号５０として示される）を添加した。およそ１．１４μｇ／ｇの定量下限（ＬＬＯＱ）を有する校正曲線を使用して組織試料濃度を計算した。結果を表６６および６７にμｇ／ｇ組織として表して示す。腎臓対肝臓の濃度比率を計算した。ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処置の結果、比率に一切異常はなかった。この結果は、高用量でＩＳＩＳ４０４１７３がＩＳＩＳ１４２０８２よりも直腸での蓄積が優れていることを示す。
【０５８３】
【表６６】
0005951752.tif 000084
【０５８４】
【表６７】
0005951752.tif 000085
【図１】
0005951752.tif 000086
【図２】
0005951752.tif 000087
【図３】
0005951752.tif 000088
【配列表】
0005951752000001.app