【手続補正書】
【提出日】平成23年2月21日(2011.2.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヒト個体における循環器疾患に対する罹病性を決定するための方法であって、該個体から得られた核酸サンプル中の、又は該個体に由来する遺伝子型データセット中の少なくとも一つの多型マーカーの少なくとも一つのアレルの存在又は不存在を決定することを含み、該少なくとも一つの多型マーカーが、多型マーカーｒｓ１０１１６２７７、ｒｓ１３３３０４０、Ｄ９Ｓ１８７０、ｒｓ２３８３２０７、及びＤ９Ｓ１８１４並びにそれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択され、そして該少なくとも一つのアレルの存在が、循環器疾患に対する罹病性を示す、前記方法。
【請求項２】
ヒト個体における循環器疾患に対する罹病性を評価することに使用するためのマーカーの同定の方法であって：
ａ．ＬＤブロックＣ０９（配列番号９４）内の少なくとも一つのマーカーと連鎖不平衡にある少なくとも一つの多型マーカーを同定すること；
ｂ．循環器疾患と診断されたか又は循環器疾患に対する罹病性を有すると診断された個体のサンプルの遺伝子型状態を決定すること；及び
ｃ．対照個体のサンプルの遺伝子型状態を決定すること；
を含み、
対照サンプル中の少なくとも一つのアレルの頻度と比較し、循環器疾患と診断されたか又は循環器疾患に対する罹病性を有すると診断された個体における少なくとも一つの多型中の少なくとも一つのアレルの頻度の有意な相違が、循環器疾患に対する罹病性を評価するために有用である少なくとも一つの多型を示し、
対照サンプル中の少なくとも一つのアレルの頻度と比較し、循環器疾患と診断されたか又は循環器疾患に対する罹病性を有すると診断された個体における少なくとも一つの多型中の少なくとも一つのアレルの頻度の増加が、該少なくとも一つの多型が循環器疾患に対する増加した罹病性を評価するために有用であることを示し、そして、
対照サンプル中の少なくとも一つのアレルの頻度と比較し、循環器疾患と診断されたか又は循環器疾患に対する罹病性を有すると診断された個体における少なくとも一つの多型中の少なくとも一つのアレルの頻度の減少が、該少なくとも一つの多型が循環器疾患に対する減少した罹病性を評価するために有用であることを示す、
前記方法。
【請求項３】
循環器疾患に関連する症状を予防するため及び／又は改善するための療法剤に対する応答の可能性について個体を評価する方法であって、該個体から得られた核酸サンプル中の、少なくとも一つの多型マーカーの少なくとも一つのアレルの存在又は不存在を決定することを含み、該少なくとも一つの多型マーカーは、多型マーカーｒｓ１０１１６２７７、ｒｓ１３３３０４０、Ｄ９Ｓ１８７０、ｒｓ２３８３２０７、及びＤ９Ｓ１８１４並びにそれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群より選択され、該少なくとも一つのマーカーの少なくとも一つのアレルの存在が療法剤への陽性応答の可能性を示す、前記方法。
【請求項４】
循環器疾患と診断された個体の予後を予測する方法であって、該個体から得られた核酸サンプル中の、少なくとも一つの多型マーカーの少なくとも一つのアレルの存在又は不存在を決定することを含み、該少なくとも一つの多型マーカーは、多型マーカーｒｓ１０１１６２７７、ｒｓ１３３３０４０、Ｄ９Ｓ１８７０、ｒｓ２３８３２０７、及びＤ９Ｓ１８１４並びにそれらと連鎖不平衡にあるマーカーからなる群より選択され、該少なくとも一つのマーカーの少なくとも一つのアレルの存在が、該個体の循環器疾患のより悪い予後を示す、前記方法。
【請求項５】
循環器疾患について治療を受けている個体における、治療の進行のモニタリング法であって、該個体から得られた核酸サンプル中の、少なくとも一つの多型マーカーの少なくとも一つのアレルの存在又は不存在を決定することを含み、該少なくとも一つの多型マーカーは、多型マーカーｒｓ１０１１６２７７、ｒｓ１３３３０４０、Ｄ９Ｓ１８７０、ｒｓ２３８３２０７、及びＤ９Ｓ１８１４並びにそれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択され、該少なくとも一つのアレルの存在が、該個体の治療結果を示す、前記方法。
【請求項６】
ヒト個体において循環器疾患を診断するため及び／又は循環器疾患に対する罹病性を評価するための診断薬の製造におけるオリゴヌクレオチドプローブの使用であって、該プローブは、配列番号９４に示されたヌクレオチド配列の核酸のセグメントにハイブリダイズし、該断片は１５〜５００のヌクレオチドの長さである、前記使用。
【請求項７】
ヒト個体における循環器疾患についての遺伝的指標を決定するための装置であって；
コンピューター可読メモリー；及び
コンピューター可読メモリー上に保存されたルーチン；
を含み；
該ルーチンは、多型マーカーｒｓ１０１１６２７７、ｒｓ１３３３０４０、Ｄ９Ｓ１８７０、ｒｓ２３８３２０７、及びＤ９Ｓ１８１４並びにそれらと連鎖不平衡にあるマーカーより選択される少なくとも一つの多型マーカーに関して少なくとも一つのヒト個体についてのマーカー及び／又はハプロタイプ情報を分析するためにプロセッサーで実行されるのに適合しており、そしてマーカー及び／又はハプロタイプ情報に基づいたアウトプットを発生し、該アウトプットはヒト個体についての循環器疾患の遺伝的指標としての該少なくとも一つのマーカー又はハプロタイプのリスク尺度を含む；
前記装置。
【請求項８】
個体からのサンプル中の少なくとも一つのバイオマーカーを評価することをさらに含み、該バイオマーカーが、好ましくは心臓マーカー又は炎症マーカーであり、そしてより好ましくは、クレアチンキナーゼ、トロポニン、グリコーゲンホスホリラーゼ、Ｃ反応性タンパク質（ＣＲＰ）、血清アミロイドＡ、フィブリノゲン、インターロイキン−６、組織壊死因子アルファ、可溶性血管細胞接着分子（ｓＶＣＡＭ）、可溶性脈管間の接着分子（ｓＩＣＡＭ）、Ｅ−セレクチン、マトリックスメタロプロテアーゼ１型、マトリックスメタロプロテアーゼ２型、マトリックスメタロプロテアーゼ３型、マトリックスメタロプロテアーゼ９型、血清ｓＣＤ４０Ｌ、ロイコトリエン、ロイコトリエン代謝物、インターロイキン−６、組織壊死因子アルファ、ミエロペルオキシダーゼ（ＭＰＯ）及びＮ−チロシンから選択されるバイオマーカーである、請求項１〜５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項９】
ヒト個体の循環器疾患に対する罹病性を評価するためのキットであって、該キットが、個体のゲノム中の少なくとも一つの多型マーカーの少なくとも一つのアレルを選択的に検出するための試薬を含み、該多型マーカーは、マーカーｒｓ１０１１６２７７、ｒｓ１３３３０４０、Ｄ９Ｓ１８７０、ｒｓ２３８３２０７、及びＤ９Ｓ１８１４並びにそれらと連鎖不平衡にあるマーカーから選択され、そして該少なくとも一つのアレルの存在が循環器疾患に対する罹病性を示す、前記キット。
【請求項１０】
試薬が、該少なくとも一つの多型マーカーを含む該個体のゲノムの断片へハイブリダイズする、少なくとも一つの近接するオリゴヌクレオチド、緩衝液及び検出可能な標識を含む、請求項９に記載のキット。
【請求項１１】
該オリゴヌクレオチドが、約１８〜約５０ヌクレオチドの長さである、請求項１０に記載のキット。
【請求項１２】
該少なくとも一つのアレル又はハプロタイプの存在により与えられる罹病性が、増加した罹病性である、請求項１〜５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１３】
ｒｓ１０７５７２６０中のアレルＡ、ｒｓ７０４１６３７中のアレルＡ、ｒｓ２８１１７１２中のアレルＡ、ｒｓ３２１８０１８中のアレルＡ、ｒｓ３２１７９９２中のアレルＡ、ｒｓ２０６９４２６中のアレルＣ、ｒｓ２０６９４２２中のアレルＡ、ｒｓ２１５１２８０中のアレルＴ、ｒｓ１３３３０３４中のアレルＡ、ｒｓ１０１１９７０中のアレルＧ、ｒｓ１３３３０４０中のアレルＴ、ｒｓ１０１１６２７７中のアレルＴ、ｒｓ２３８３２０７中のアレルＧ、ｒｓ１０７５７２７８中のアレルＧ、ｒｓ１３３３０５０中のアレルＴ、ｒｓ１０８１１６５０中のアレルＧ、ｒｓ１０７３８６０７中のアレルＧ、ｒｓ４９７７５７４中のアレルＧ、ｒｓ６４７５６０８中のアレルＧ、ｒｓ１３３３０４５中のアレルＣ、ｒｓ１３３３０４６中のアレルＡ、ｒｓ１３３３０４８中のアレルＣ、Ｄ９Ｓ１８７０中のアレルＸ又はＤ９Ｓ１８１４中のアレル０の存在が、循環器疾患に対する増加した罹病性を示す、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
連鎖不平衡が、連鎖不平衡尺度ｒ２及び／又は｜Ｄ’｜についての特定の数字的カットオフ値により特徴付けられ、好ましくは、０．２より大きなｒ２のカットオフ値により特徴付けられ、より好ましくは、０．５より大きなｒ２のカットオフ値により特徴付けられる、請求項１〜５、８、１２、及び１３の何れか１項に記載の方法。
【請求項１５】
連鎖不平衡が、連鎖不平衡尺度ｒ２及び／又は｜Ｄ’｜についての特定の数字的カットオフ値により特徴付けられ、好ましくは、０．２より大きなｒ２のカットオフ値により特徴付けられ、より好ましくは、０．５より大きなｒ２のカットオフ値により特徴付けられる、請求項９〜１１の何れか１項に記載のキット。
【請求項１６】
連鎖不平衡が、連鎖不平衡尺度ｒ２及び／又は｜Ｄ’｜についての特定の数字的カットオフ値により特徴付けられ、好ましくは、０．２より大きなｒ２のカットオフ値により特徴付けられ、より好ましくは、０．５より大きなｒ２のカットオフ値により特徴付けられる、請求項７に記載の装置。
【請求項１７】
該少なくとも一つの多型マーカーが表１０に示した多型マーカーから選択され、そして好ましくは表３及び表２１に示したマーカーから選択される、請求項１〜５、８、及び１２〜１４の何れか１項に記載の方法。
【請求項１８】
該少なくとも一つの多型マーカーが表１０に示した多型マーカーから選択され、そして好ましくは表３及び表２１に示したマーカーから選択される、請求項７又は１６に記載の装置。
【請求項１９】
該少なくとも一つの多型マーカーが表１５及び表２２に示したマーカーから選択される、請求項１〜５、８、及び１２〜１４の何れか１項に記載の方法。
【請求項２０】
該少なくとも一つの多型マーカーが表１５及び表２２に示したマーカーから選択される、請求項７又は１６に記載の装置。
【請求項２１】
該少なくとも一つの多型マーカーが、ｒｓ１３３３０４９、ｒｓ１０７５７２７８及びｒｓ２３８３２０７から選択される、請求項１〜５、８、及び１２〜１４の何れか１項に記載の方法。
【請求項２２】
該少なくとも一つの多型マーカーが、ｒｓ１３３３０４９、ｒｓ１０７５７２７８及びｒｓ２３８３２０７から選択される、請求項７又は１６に記載の装置。
【請求項２３】
該循環器疾患が動脈疾患である、請求項１〜５、８、１２〜１４、１７、１９及び２１の何れか１項に記載の方法。
【請求項２４】
該循環器疾患が動脈疾患である、請求項６に記載の使用。
【請求項２５】
該循環器疾患が動脈疾患である、請求項９〜１１及び１５の何れか１項に記載のキット。
【請求項２６】
該循環器疾患が動脈疾患である、請求項７、１６及び２２の何れか１項に記載の装置。