【手続補正書】
【提出日】平成23年8月19日(2011.8.19)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１７１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１７１】
【表２】
2010536384.tif 000001
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】変更
【補正の内容】
【配列表】
2010536384000001.app
【手続補正３】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヒトＰＣＳＫ９の表面に結合する抗原結合タンパク質であって、前記表面は、ＥＧＦａが結合し、抗体２１Ｂ１２（軽鎖可変領域は配列番号２３、重鎖可変領域は配列番号４９）が結合し、または抗体３１Ｈ４（軽鎖可変領域は配列番号１２、重鎖可変領域は配列番号６７）が結合する表面と重複することを特徴とし、および
ＰＣＳＫ９がＬＤＬＲに結合する能力を低減できる中和能力を有する、前記抗原結合タンパク質。
【請求項２】
ＥＧＦａが結合し、抗体２１Ｂ１２が結合し、または抗体３１Ｈ４が結合するＰＣＳＫ９の表面に結合する、請求項１に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項３】
ヒトＰＣＳＫ９に結合する抗原結合タンパク質であって、アミノ酸の下記の集合： 
（ｉ）アミノ酸Ｄ３７４、Ｖ３８０、またはＳ３８１（配列番号３を参照したナンバリング）；
（ｉｉ）アミノ酸Ｄ３６７またはＱ３８２（配列番号３を参照したナンバリング）；
（ｉｉｉ）アミノ酸Ｉ３６９、Ｓ３７２、Ｃ３７８、またはＦ３７９（配列番号３を参照したナンバリング）
（ｉｖ）アミノ酸Ｓ３７３（配列番号３を参照したナンバリング）；
（ｖ）アミノ酸Ｓ１５３、Ｒ１９４、Ｄ２３８、Ｄ３７４、Ｔ３７７、またはＦ３７９（配列番号３を参照したナンバリング）；
（ｖｉ）アミノ酸Ｒ２３７、Ｋ２４３、Ｓ３７３、またはＳ３７６（配列番号３を参照したナンバリング）；
（ｖｉｉ）アミノ酸Ｉ１５４、Ａ２３９、Ｉ３６９、Ｓ３７２、Ｃ３７５、またはＣ３７８（配列番号３を参照したナンバリング）；
（ｖｉｉｉ）アミノ酸Ｈ１９３またはＥ１９５（配列番号３を参照したナンバリング）；
（ｉｘ）アミノ酸Ｓ１５３、Ｉ１５４、Ｐ１５５、Ｒ１９４、Ｄ２３８、Ａ２３９、Ｉ３６９、Ｓ３７２、Ｄ３７４、Ｃ３７５、Ｔ３７７、Ｃ３７８、Ｆ３７９、Ｖ３８０、およびＳ３８１（配列番号３を参照したナンバリング）；または
（ｘ）アミノ酸Ｗ１５６、Ｌ１５８、Ｅ１５９、Ｈ１９３、Ｅ１９５、Ｒ２３７、Ｇ２４０、Ｋ２４３、Ｄ３６７、Ｉ３６８、Ａ３７１、Ｓ３７３、Ｓ３７６、およびＱ３８２（配列番号３を参照したナンバリング）
の少なくとも１種と相互作用および／または遮断する、前記抗原結合タンパク質。
【請求項４】
ＰＣＳＫ９に結合する場合、前記抗原結合タンパク質は、以下のアミノ酸：Ｋ６９、Ｄ７０、Ｐ７１、Ｗ７２、Ｓ１４８、Ｖ１４９、Ｆ１５０、Ａ１５１、Ｑ１５２、Ｓ１５３、Ｉ１５４、Ｐ１５５、Ｗ１５６、Ｎ１５７、Ｌ１５８、Ｅ１５９、Ｄ１８６、Ｔ１８７、Ｓ１８８、Ｉ１８９、Ｑ１９０、Ｓ１９１、Ｄ１９２、Ｈ１９３、Ｒ１９４、Ｅ１９５、Ｉ１９６、Ｅ１９７、Ｇ１９８、Ｒ１９９、Ｖ２００、Ｍ２０１、Ｖ２０２、Ｅ２１１、Ｄ２１２、Ｇ２１３、Ｔ２１４、Ｒ２１５、Ｆ２１６、Ｈ２１７、Ｒ２１８、Ｑ２１９、Ａ２２０、Ｓ２２１、Ｋ２２２、Ｃ２２３、Ｄ２２４、Ｓ２２５、Ｈ２２６、Ｇ２２７、Ｔ２２８、Ｈ２２９、Ｓ２３５、Ｇ２３６、Ｒ２３７、Ｄ２３８、Ａ２３９、Ｇ２４０、Ｋ２４３、Ｇ２４４、Ｍ２４７、Ｌ２５３、Ｎ２５４、Ｃ２５５、Ｑ２５６、Ｇ２５７、Ｋ２５８、Ｇ２５９、Ｐ２８８、Ａ２９０、Ｇ２９１、Ｇ３１６、Ｎ３１７、Ｆ３１８、Ｒ３１９、Ｙ３２５、Ｖ３４６、Ｔ３４７、Ｌ３４８、Ｇ３４９、Ｔ３５０、Ｌ３５１、Ｇ３５２、Ｔ３５３、Ｇ３６５、Ｅ３６６、Ｄ３６７、Ｉ３６８、Ｉ３６９、Ｇ３７０、Ａ３７１、Ｓ３７２、Ｓ３７３、Ｄ３７４、Ｃ３７５、Ｓ３７６、Ｔ３７７、Ｃ３７８、Ｆ３７９、Ｖ３８０、Ｓ３８１、Ｑ３８２、Ｓ３８３、Ｇ３８４、Ｔ３８５、Ｓ３８６、およびＱ３８７（配列番号３を参照したナンバリング）のうちの少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、またはそれ以上から、８オングストローム以下の位置にある、請求項３に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項５】
以下：
（ａ）配列番号：９、１０、１２、１３、１６、１７、２０、２１、２２、２３、２４、２６、３０、３１、３３、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４６１、４６５、４７３、４７７および４８５からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；および
（ｂ）配列番号：７１、７２、６７、８７、５２、５１、５４、５５、５６、４９、５７、５０、６４、６２、６５、７９、８０、７６、７７、７８、８３、４５９、４６３、４７１、４７５および４８３からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも８０％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン
を含み、ヒトＰＣＳＫ９に特異的に結合する、抗原結合タンパク質。
【請求項６】
以下：
（ａ）配列番号：９、１０、１２、１３、１６、１７、２０、２１、２２、２３、２４、２６、３０、３１、３３、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４６１、４６５、４７３、４７７および４８５からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；および
（ｂ）配列番号：７１、７２、６７、８７、５２、５１、５４、５５、５６、４９、５７、５０、６４、６２、６５、７９、８０、７６、７７、７８、８３、４５９、４６３、４７１、４７５および４８３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン
を含み、ＰＣＳＫ９に特異的に結合する、請求項５に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項７】
以下のいずれかを含む抗原結合タンパク質であって、
（ａ）配列番号：１２、１７、２３、３５、４６１または４６５に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列からなる群から選択される軽鎖可変ドメイン、および配列番号：４９、５１、６７、７９、４５９または４６３に少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列からなる群から選択される重鎖可変ドメイン；または
（ｂ）軽鎖可変ドメインと重鎖可変ドメインとの組合せであって、前記軽鎖可変ドメインおよび重鎖可変ドメインが、配列番号１２と少なくとも９０％同一である配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号６７と少なくとも９０％同一である配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；配列番号１７と少なくとも９０％同一である配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号５１と少なくとも９０％同一である配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；配列番号２３と少なくとも９０％同一である配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号４９と少なくとも９０％同一である配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；配列番号３５と少なくとも９０％同一である配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号７９と少なくとも９０％同一である配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；配列番号４６１と少なくとも９０％同一である配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号４５９と少なくとも９０％同一である配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；および配列番号４６５と少なくとも９０％同一である配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号４６３と少なくとも９０％同一である配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せからなる群から選択される、
ＰＣＳＫ９に特異的に結合する、請求項５に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項８】
前記軽鎖可変ドメインおよび重鎖可変ドメインが、配列番号１２に示される配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号６７に示される配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；配列番号１７に示される配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号５１に示される配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；配列番号２３に示される配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号４９に示される配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；配列番号３５に示される配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号７９に示される配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；配列番号４６１に示される配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号４５９に示される配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；および配列番号４６５に示される配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号４６３に示される配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せからなる群から選択され、
ＰＣＳＫ９に特異的に結合する、請求項７に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項９】
さらに、下記：
（ａ）配列番号１５６の軽鎖定常配列；
（ｂ）配列番号１５７の軽鎖定常配列；
（ｃ）配列番号１５４重鎖定常配列；
（ｄ）配列番号１５５の重鎖定常配列；
（ｅ）配列番号１５６の軽鎖定常配列および配列番号１５４の重鎖定常配列；
（ｆ）配列番号１５７の軽鎖定常配列および配列番号１５４の重鎖定常配列；
（ｇ）配列番号１５６の軽鎖定常配列および配列番号１５５の重鎖定常配列；または
（ｈ）配列番号１５７の軽鎖定常配列および配列番号１５５の重鎖定常配列
を含む、請求項８に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項１０】
下記の特性：
（ａ）Ｄ３７４Ｙ点突然変異を有するＰＣＳＫ９バリアントに結合する；
（ｂ）ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、多重特異的抗体、組換え抗体、抗原結合抗体断片、一本鎖抗体、ダイアボディ、Ｆａｂ断片、Ｆ（ｆａ’）ｘ断片、ＩｇＧ１抗体、ＩｇＧ２抗体、ＩｇＧ３抗体、およびＩｇＧ４抗体からなる群から選択される；
（ｃ）１ｎＭよりも小さい、または１００ｐＭよりも小さいＫｄで、ＰＣＳＫ９に結合する；
（ｄ）２００ｐＭ未満のＩＣ５０で、Ｄ３７４Ｙ  ＰＣＳＫ９のＬＤＬＲへの結合をブロックできる；または
（ｅ）ＰＣＳＫ９のＬＤＬＲへの結合を、実質的に少なくとも約６０％、または少なくとも約８０％阻害できる
の少なくとも１つを有する、請求項１〜９のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項１１】
ＰＣＳＫ９に結合した場合、
（ａ）参照抗体と同じＫｄでＰＣＳＫ９に結合する；
（ｂ）参照抗体と同じＩＣ５０でＰＣＳＫ９のＬＤＬＲへの結合を阻害する；または
（ｃ）参照抗体のＰＣＳＫ９への結合を交差競合する、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質であって、
ここで、前記参照抗体が、配列番号１２に示される配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号６７に示される配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；配列番号１７に示される配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号５１に示される配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；配列番号２３に示される配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号４９に示される配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；配列番号３５に示される配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号７９に示される配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；配列番号４６１に示される配列を有する軽鎖可変ドメインと配列番号４５９に示される配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ；および配列番号４６５を有する軽鎖可変ドメインと配列番号４６３に示される配列を有する重鎖可変ドメインとの組合せ、からなる群から選択される組合せを含む、前記抗原結合タンパク質。
【請求項１２】
請求項１〜１１のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質をコードする核酸。
【請求項１３】
請求項１２に記載の核酸分子を含む組換え発現ベクター。
【請求項１４】
請求項１３に記載のベクターを含む宿主細胞。
【請求項１５】
請求項１０に記載の抗体を産生可能であるハイブリドーマ。
【請求項１６】
請求項１〜１１のいずれか一項に記載の少なくとも１種の抗原結合タンパク質と、医薬として許容される賦形剤と、を含む医薬組成物。
【請求項１７】
前記医薬組成物が少なくとも１種の他の治療剤の投与の前に、同時に、または後で投与され、場合によって前記他の治療剤がスタチンである、請求項１６に記載の医薬組成物。
【請求項１８】
請求項１６または１７に記載の組成物を含む、コレステロール関連疾患の治療のためのキット。
【請求項１９】
対象における上昇した血清コレステロールレベルに伴う症状を治療または予防するのに使用するための、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項２０】
前記症状が、高コレステロール血漿、心臓血管疾患、メタボリック症候群、糖尿病、卒中、アルツハイマー病および異常脂肪血症からなる群から選択される、請求項１９に記載の抗原結合タンパク質。
【手続補正４】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図２Ｃ
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図２Ｃ】
2010536384.tif 000002
【手続補正５】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図３Ｄ
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図３Ｄ】
2010536384.tif 000003
【手続補正６】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図３ＣＣＣ
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図３ＣＣＣ】
2010536384.tif 000004
【手続補正７】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図３ＤＤＤ
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図３ＤＤＤ】
2010536384.tif 000005
【手続補正８】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図１３Ａ
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図１３Ａ】
2010536384.tif 000006
【手続補正９】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図１３Ｃ
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図１３Ｃ】
2010536384.tif 000007