【手続補正書】
【提出日】平成23年3月14日(2011.3.14)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
治療剤にコンジュゲートされたＡＢＣＢ５に選択的に結合する単離された分子を含む、細胞の細胞内区画に治療剤を送達するための組成物。
【請求項２】
ＡＢＣＢ５に選択的に結合する前記単離された分子が単離されたペプチドであり、該単離されたペプチドが必要に応じて抗体またはその抗原結合断片である、請求項１記載の組成物。
【請求項３】
前記治療剤が毒素、ｓｉＲＮＡ、化学治療剤および治療抗体からなる群より選択される、請求項１記載の組成物。
【請求項４】
ＡＢＣＢ５に選択的に結合する単離されたペプチドを含む組成物であって、該単離されたペプチドは、
（ａ）配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８よりなる群から選択されるアミノ酸配列、または保存的置換を含有するその機能的に同等な変異体を含み、ここで、該単離されたペプチドはｍＡｂ  ３Ｃ２−１Ｄ１２ではないか；
（ｂ）配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８よりなる群から選択されるアミノ酸配列、または保存的置換を含有するその機能的に同等な変異体を含み、ここで、該単離されたペプチドはヒト被験体において化学的増感を増強するのに有効な量にて存在するか；または
（ｃ）配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８よりなる群から選択されるアミノ酸配列、または保存的置換を含有するその機能的に同等な変異体を含み、ここで、該単離されたペプチドは治療剤と同時製剤化される、組成物。
【請求項５】
ＡＢＣＢ５に選択的に結合し、かつ配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８よりなる群から選択されるアミノ酸配列、または保存的置換を含有するその機能的に同等な変異体を含む単離されたペプチドを含む、癌を有する被験体に全身投与するために製剤化された、癌を有する被験体を治療するための組成物。
【請求項６】
請求項４の組成物を、癌を治療するのに有効な量にて含む、癌を有する被験体を治療するための組成物。
【請求項７】
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含む単離されたペプチドであって、ここで：（ｉ）ＣＤＲ１−Ｈ１は配列番号３のアミノ酸配列を含み；（ｉｉ）ＣＤＲ２−Ｈ２は配列番号４のアミノ酸配列を含み；および（ｉｉｉ）ＣＤＲ３−Ｈ３配列、ここで、該単離されたペプチドはｍＡｂ  ３Ｃ２−１Ｄ１２ではない、単離されたペプチド。
【請求項８】
ヒトＡＢＣＢ５に結合する、請求項７記載の単離されたペプチド。
【請求項９】
抗体である、請求項８記載の単離されたペプチド。
【請求項１０】
免疫グロブリン軽鎖可変ドメインを含む単離されたペプチドであって、ここで：（ｉ）ＣＤＲ１−Ｌ１は配列番号６のアミノ酸配列を含み；（ｉｉ）ＣＤＲ２−Ｌ２は配列番号７のアミノ酸配列を含み；および（ｉｉｉ）ＣＤＲ３−Ｌ３配列、ここに、該単離されたペプチドはｍＡｂ  ３Ｃ２−１Ｄ１２ではない、単離されたペプチド。
【請求項１１】
前記ＣＤＲ３−Ｌ３が配列番号８のアミノ酸配列を含む、請求項１０記載の単離されたペプチド。
【請求項１２】
（ａ）請求項７記載の単離されたペプチドを含む重鎖抗体可変ドメイン；および（ｂ）請求項１０記載の単離されたペプチドを含む軽鎖抗体可変ドメインを含む少なくとも２つの抗体可変ドメインを含む、単離されたペプチド。
【請求項１３】
前記ペプチドが単一鎖Ｆｖ、Ｆａｂ単離ペプチドまたは完全にヒトの単離されたペプチドである、請求項１２記載の単離されたペプチド。
【請求項１４】
さらに、変異体ＣＤＲ１−Ｈ１、ＣＤＲ２−Ｈ２、ＣＤＲ３−Ｈ３に対応する単離されたペプチド変異体ドメインについてのフレームワーク領域ＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３および／またはＦＲ４を含み、ここで、該フレームワーク領域は単一のポリペプチド鋳型から得られる、請求項１２記載の単離されたペプチド。
【請求項１５】
前記単離されたペプチドがモノクローナル抗体である、請求項７記載の単離されたペプチド。
【請求項１６】
少なくとも１つのヒト領域を有する、抗ＡＢＣＢ５抗体またはその抗原結合断片であって、ここで、該抗ＡＢＣＢ５抗体または抗原結合断片はｍＡｂ  ３Ｃ２−１Ｄ１２のＡＢＣＢ５への結合を競合的に阻害する、抗ＡＢＣＢ５抗体またはその抗原結合断片。
【請求項１７】
前記抗体または抗原結合断片がヒト定常領域およびヒト可変フレームワーク領域を含む、請求項１６記載の抗体。
【請求項１８】
前記抗原結合断片が単一鎖抗体である、請求項１６記載の抗体。
【請求項１９】
機能的抗原結合領域を有するヒト化抗体可変ドメインであって、前記ヒト化抗体可変ドメインは、ヒト抗体可変ドメインに一体化された、ｍＡｂ  ３Ｃ２−１Ｄ１２のＣＤＲ１−Ｈ１、ＣＤＲ２−Ｈ２、ＣＤＲ３−Ｈ３、ＣＤＲ１−Ｌ１、ＣＤＲ２−Ｌ２、およびＣＤＲ３−Ｌ３に対して少なくとも９０％相同性を有する非ヒトＣＤＲ１−Ｈ１、ＣＤＲ２−Ｈ２、ＣＤＲ３−Ｈ３、ＣＤＲ１−Ｌ１、ＣＤＲ２−Ｌ２、およびＣＤＲ３−Ｌ３を含む、ヒト化抗体可変ドメイン。
【請求項２０】
ＡＢＣＢ５に特異的に結合する可変ドメイン、および定常ドメインを含むキメラ抗体であって、ここで、該可変ドメインおよび該定常ドメインは異なる種からのものである、キメラ抗体。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３０】
本発明は、その適用を、以下に記述されまたは図面において示された構成の詳細、および構成要素の配置に制限されない。本発明は、他の実施形態が可能であり、かつ種々の方法で実行し、または行うことができる。また、本明細書中で用いられる用語および専門用語は記述を目的とするものであり、限定的であるとみなされるべきではない。本明細書中において、「包含する」、「含む」、または「有する」、「含有する」、「関連する」、およびその変形の使用は、後にリストされる項目、およびその均等物、ならびに追加の項目を含むことを意図する。
本発明の好ましい実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
細胞を、該細胞の細胞内区画に治療剤を送達するのに有効な量の、治療剤にコンジュゲートされたＡＢＣＢ５に選択的に結合する単離された分子と接触させることを含む、細胞の細胞内区画に治療剤を送達する方法。
（項目２）
ＡＢＣＢ５に選択的に結合する該単離された分子が単離されたペプチドである、項目１記載の方法。
（項目３）
前記単離されたペプチドが抗体またはその抗原結合断片である、項目２記載の方法。
（項目４）
前記治療剤が毒素である、項目１記載の方法。
（項目５）
前記治療剤がｓｉＲＮＡである、項目１記載の方法。
（項目６）
前記治療剤が化学治療剤である、項目１記載の方法。
（項目７）
前記治療剤が治療抗体である、項目１記載の方法。
（項目８）
さらに細胞を、ＣＤ４９ｅ、ＣＤ１３３、およびＣＤ１６６よりなる群から選択される表面マーカーに選択的に結合する単離された分子と接触させることを含む、項目１記載の方法。
（項目９）
さらに細胞を、ＢＭＰＲ−１ａ、ＴＩＲ−１、ＶＥ−カドヘリン（ＣＤ１４４）およびネスチンよりなる群から選択される表面マーカーに選択的に結合する単離された分子と接触させることを含む、項目１記載の方法。
（項目１０）
ＡＢＣＢ５に選択的に結合し、かつ配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８よりなる群から選択されるアミノ酸配列、または保存的置換を含有するその機能的に同等な変異体を含む単離されたペプチドを含み、ここで、該単離されたペプチドはｍＡｂ  ３Ｃ２−１Ｄ１２ではない、組成物。
（項目１１）
ＡＢＣＢ５に選択的に結合し、かつ配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８よりなる群から選択されるアミノ酸配列、または保存的置換を含有するその機能的に同等な変異体を含む単離されたペプチドを含み、ここで、該単離されたペプチドはヒト被験体において化学的増感を増強するのに有効な量にて存在する、組成物。
（項目１２）
ＡＢＣＢ５に選択的に結合し、かつ配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８よりなる群から選択されるアミノ酸配列、または保存的置換を含有するその機能的に同等な変異体を含む単離されたペプチドを含み、ここで、該単離されたペプチドは治療剤と同時製剤化される、組成物。
（項目１３）
前記単離されたペプチドが治療剤にコンジュゲートされている、項目１２記載の組成物。
（項目１４）
前記治療剤がカンプトテシン９−ＮＨ２、ミトキサントロン、カンプトテシン７−Ｃｌ、ピラゾフリン、メノガリル、カンプトテシン２０エステル、カンプトテシン、アムサクリン、エトポシド、アントラピラゾール誘導体、テルニポシド、カンプトテシン１１−ホルミル、カンプトテシン１０−ＯＨ、ダウノルビシン、デオキシドキソルビシン、ドキソルビシン、オキサントラゾール、カンプトテシン１１−ＨＯＭｅ、ゾルビシン、ウラシルマスタード、ピペラジンジオン、ヘプスルファム、メルファラン、ビサントレン、トリエチレンメラミン、スピロムスチン、Ｙｏｓｈｉ−８６４、クロラムブシル、ピペラジンマスタード、ヒドロキシ尿素、ポルフィロマイシン、メクロレタミン、フルオロドパン、マイトマイシン、シタラビン（ａｒａＣ）、ジアンヒドロガラクチトール、ゲムシタビン、チオテパ、Ｎ，Ｎ−ジベンジルダウノマイシン、テロキシロンおよびアフィジコリングリシネートよりなる群から選択される、項目１２記載の組成物。
（項目１５）
ＡＢＣＢ５に選択的に結合し、かつ配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８よりなる群から選択されるアミノ酸配列、または保存的置換を含有するその機能的に同等な変異体を含む単離されたペプチドを収容する容器、および該単離されたペプチドをヒト被験体に投与するための指示書を含む、キット。
（項目１６）
ＡＢＣＢ５に選択的に結合し、かつ配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８よりなる群から選択されるアミノ酸配列、または保存的置換を含有するその機能的に同等な変異体を含む単離されたペプチドを、癌を治療するのに有効な量にて癌を有する被験体に全身投与することを含む、被験体を治療する方法。
（項目１７）
項目１０〜１２の組成物のうちのいずれか１つを、癌を治療するのに有効な量にて癌を有する被験体に投与することを含む、被験体を治療する方法。
（項目１８）
ＡＢＣＢ５に選択的に結合し、かつ配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８よりなる群から選択されるアミノ酸配列、または保存的置換を含有するその機能的に同等な変異体を含む単離されたペプチド、および化学治療剤を、癌を治療するのに有効な量にて癌を有する被験体に投与することを含む、被験体を治療する方法。
（項目１９）
ＡＢＣＢ５に選択的に結合する単離された抗体または抗体断片、および化学治療剤を、癌を治療するのに有効な量にて癌を有する被験体に全身投与することを含む、被験体を治療する方法。
（項目２０）
免疫グロブリン重鎖可変ドメインを含む単離されたペプチドであって、ここで：（ｉ）ＣＤＲ１−Ｈ１は配列番号３のアミノ酸配列を含み；（ｉｉ）ＣＤＲ２−Ｈ２は配列番号４のアミノ酸配列を含み；および（ｉｉｉ）ＣＤＲ３−Ｈ３配列、ここで、該単離されたペプチドはｍＡｂ  ３Ｃ２−１Ｄ１２ではない、単離されたペプチド。
（項目２１）
前記ＣＤＲ３−Ｈ３が配列番号３のアミノ酸配列を含む、項目２０記載の単離されたペプチド。
（項目２２）
ヒトＡＢＣＢ５に結合する、項目２０記載の単離されたペプチド。
（項目２３）
抗体である、項目２２記載の単離されたペプチド。
（項目２４）
さらに、軽鎖可変ドメインを含み、ここで、ＣＤＲ１−Ｌ１が配列番号６のアミノ酸配列を含む、項目２０記載の単離されたペプチド。
（項目２５）
さらに、配列番号７のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２−Ｌ２を含む、項目２４記載の単離されたペプチド。
（項目２６）
さらに、配列番号８のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３−Ｌ３を含む、項目２４記載の単離されたペプチド。
（項目２７）
免疫グロブリン軽鎖可変ドメインを含み、ここで：（ｉ）ＣＤＲ１−Ｌ１は配列番号６のアミノ酸配列を含み；（ｉｉ）ＣＤＲ２−Ｌ２は配列番号７のアミノ酸配列を含み；および（ｉｉｉ）ＣＤＲ３−Ｌ３配列、ここに、該単離されたペプチドはｍＡｂ  ３Ｃ２−１Ｄ１２ではない、単離されたペプチド。
（項目２８）
前記ＣＤＲ３−Ｌ３が配列番号８のアミノ酸配列を含む、項目２７記載の単離されたペプチド。
（項目２９）
（ａ）項目２０記載の単離されたペプチドを含む重鎖抗体可変ドメイン；および（ｂ）項目２７記載の単離されたペプチドを含む軽鎖抗体可変ドメインを含む少なくとも２つの抗体可変ドメインを含む、単離されたペプチド。
（項目３０）
単一鎖Ｆｖである、項目２９記載の単離されたペプチド。
（項目３１）
Ｆａｂ単離ペプチドである、項目２９記載の単離されたペプチド。
（項目３２）
完全にヒトの単離されたペプチドである、項目２９記載の単離されたペプチド。
（項目３３）
さらに、変異体ＣＤＲ１−Ｈ１、ＣＤＲ２−Ｈ２、ＣＤＲ３−Ｈ３に対応する単離されたペプチド変異体ドメインについてのフレームワーク領域ＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３および／またはＦＲ４を含み、ここで、該フレームワーク領域は単一のポリペプチド鋳型から得られる、項目２９記載の単離されたペプチド。
（項目３４）
前記フレームワーク領域の各々が、ポリペプチド配列番号１のフレームワーク領域アミノ酸配列に対応するアミノ酸配列を含む、項目３３記載の単離されたペプチド。
（項目３５）
さらに、重鎖ポリペプチド可変ドメインのＣ末端領域に連結された二量体化ドメインを含む、項目２９記載の単離されたペプチド。
（項目３６）
前記二量体化ドメインがロイシンジッパードメイン、または少なくとも１つのシステイン残基を含む配列を含む、項目３５記載の単離されたペプチド。
（項目３７）
前記二量体化ドメインがポリペプチドからのヒンジ領域、およびロイシンジッパーを含む、項目３５記載の単離されたペプチド。
（項目３８）
前記二量体化ドメインが単一システインである、項目３５記載の単離されたペプチド。
（項目３９）
前記単離されたペプチドがモノクローナル抗体である、項目２０記載の単離されたペプチド。
（項目４０）
前記単離されたペプチドが二重特異性抗体である、項目２０記載の単離されたペプチド。
（項目４１）
前記単離されたペプチドが合成抗体である、項目２０記載の単離されたペプチド。
（項目４２）
少なくとも１つのヒト領域を有する、抗ＡＢＣＢ５抗体またはその抗原結合断片であって、ここで、該抗ＡＢＣＢ５抗体または抗原結合断片はｍＡｂ  ３Ｃ２−１Ｄ１２のＡＢＣＢ５への結合を競合的に阻害する、抗ＡＢＣＢ５抗体またはその抗原結合断片。
（項目４３）
前記抗原結合断片がＦａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、ｄｓＦｖ、Ｆｄ、ＶＨ  ｄＡｂ、およびＶＬ  ｄＡｂよりなる群から選択される、項目４２記載の抗体。
（項目４４）
前記抗体または抗原結合断片が免疫グロブリンクラスＩｇＡ、ＩｇＧｂ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４またはＩｇＭのものである、項目４２記載の抗体。
（項目４５）
前記抗体または抗原結合断片がヒト定常領域およびヒト可変フレームワーク領域を含む、項目４２記載の抗体。
（項目４６）
前記抗原結合断片が単一鎖抗体である、項目４２記載の抗体。
（項目４７）
前記単一鎖抗体がラクダ科動物抗体である、項目４６記載の抗体。
（項目４８）
機能的抗原結合領域を有するヒト化抗体可変ドメインであって、前記ヒト化抗体可変ドメインは、ヒト抗体可変ドメインに一体化されたｍＡｂ  ３Ｃ２−１Ｄ１２のＣＤＲ１−Ｈ１、ＣＤＲ２−Ｈ２、ＣＤＲ３−Ｈ３、ＣＤＲ１−Ｌ１、ＣＤＲ２−Ｌ２、およびＣＤＲ３−Ｌ３に対して少なくとも９０％相同性を有する非ヒトＣＤＲ１−Ｈ１、ＣＤＲ２−Ｈ２、ＣＤＲ３−Ｈ３、ＣＤＲ１−Ｌ１、ＣＤＲ２−Ｌ２、およびＣＤＲ３−Ｌ３を含む、ヒト化抗体可変ドメイン。
（項目４９）
ＡＢＣＢ５に特異的に結合する可変ドメイン、および定常ドメインを含み、ここで、該可変ドメインおよび該定常ドメインは異なる種からのものである、キメラ抗体。
（項目５０）
前記単離されたペプチドがＡＢＣＢ５結合ＣＤＲ３−Ｈ３のアミノ酸配列またはその機能的に同等な変異体を含む、項目１０記載の組成物。
（項目５１）
前記単離されたペプチドがＡＢＣＢ５結合ＣＤＲ２−Ｈ２のアミノ酸配列またはその機能的に同等な変異体を含む、項目１０記載の組成物。
（項目５２）
前記単離されたペプチドがＡＢＣＢ５結合ＣＤＲ１−Ｈ１のアミノ酸配列またはその機能的に同等な変異体を含む、項目１０記載の組成物。
（項目５３）
前記単離されたペプチドがＡＢＣＢ５結合ＣＤＲ３−Ｌ３のアミノ酸配列またはその機能的に同等な変異体を含む、項目１０記載の組成物。
（項目５４）
前記単離されたペプチドがＡＢＣＢ５結合ＣＤＲ２−Ｌ２のアミノ酸配列またはその機能的に同等な変異体を含む、項目１０記載の組成物。
（項目５５）
前記単離されたペプチドがＡＢＣＢ５結合ＣＤＲ１−Ｌ１のアミノ酸配列またはその機能的に同等な変異体を含む、項目１０記載の組成物。
（項目５６）
前記単離されたペプチドが単離された抗体または抗体断片である、項目１０記載の組成物。
（項目５７）
前記単離された抗体または抗体断片が完全な可溶性モノクローナル抗体である、項目５６記載の組成物。
（項目５８）
前記単離された抗体または抗体断片がＦａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、ｄｓＦｖ、Ｆｄ、ＶＨ  ｄＡｂ、およびＶＬ  ｄＡｂよりなる群から選択される単離されたモノクローナル抗体断片である、項目５６記載の組成物。
（項目５９）
前記単離された抗体または抗体断片が化学増感を増強させる、項目５６記載の組成物。
（項目６０）
前記単離されたペプチドが検出可能な標識にコンジュゲートされている、項目１０記載の組成物。
（項目６１）
さらに、医薬上許容される担体を含む、項目１０記載の組成物。
（項目６２）
前記単離されたペプチドがＡＢＣＢ５に選択的に結合する、項目１０記載の組成物。
（項目６３）
前記単離された抗体または抗体断片がヒト化抗体である、項目５６記載の組成物。
（項目６４）
前記単離されたペプチドがｓｃＦｖである、項目１０記載の組成物。
（項目６５）
ＡＢＣＢ５に選択的に結合し、かつ配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８よりなる群から選択されるアミノ酸配列、または保存的置換を含有するその機能的に同等な変異体を含む単離されたペプチドを含む、癌を有する被験体の治療に用いる組成物であって、ここで、該組成物は全身投与のために製剤化される、組成物。
（項目６６）
項目１０〜１２の組成物のいずれか１つを含む、癌を有する被験体の治療用組成物。
（項目６７）
ＡＢＣＢ５に選択的に結合し、かつ配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８よりなる群から選択されるアミノ酸配列、または保存的置換を含有するその機能的に同等な変異体を含む単離されたペプチド、および化学治療剤を含む、癌を有する被験体の治療用組成物。
（項目６８）
ＡＢＣＢ５に選択的に結合する単離された抗体または抗体断片、および化学治療剤を含む、癌を有する被験体の治療用組成物であって、ここで、該組成物は全身投与用に製剤化される、組成物。
（項目６９）
ＡＢＣＢ５に選択的に結合し、かつ配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８よりなる群から選択されるアミノ酸配列、または保存的置換を含有するその機能的に同等な変異体を含む単離されたペプチドを含む組成物の使用であって、ここで、該組成物は癌を有する被験体の治療において全身投与用に製剤化される、使用。
（項目７０）
癌を有する被験体の治療における、項目１０〜１２の組成物のいずれか１つを含む組成物の使用。
（項目７１）
ＡＢＣＢ５に選択的に結合し、かつ配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７および配列番号８よりなる群から選択されるアミノ酸配列、または保存的置換を含有するその機能的に同等な変異体を含む単離されたペプチド、および化学治療剤を含む組成物の、癌を有する被験体の治療における使用。