【手続補正書】
【提出日】平成23年10月21日(2011.10.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
前立腺幹細胞抗原（SEQ ID NO:17）、変異体HnRNPG、SEQ ID NO:71のアミノ酸配列を有する変異体HnRNPG、216位、218位、219位および/もしくは222位に1つもしくは複数のアミノ酸置換を伴うSEQ ID NO:113のアミノ酸配列を有する変異体HnRNPG、またはSEQ ID NO:23、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:111、もしくはSEQ ID NO:112のアミノ酸配列を含むポリペプチドに結合する、以下を含む結合タンパク質：
SEQ ID NO:7のアミノ酸配列またはその変異体を含む単離された軽鎖CDR1；および/または
アミノ酸配列SEQ ID NO:8またはその変異体を含む単離された軽鎖CDR2；および/または
アミノ酸配列SEQ ID NO:9またはその変異体を含む単離された軽鎖CDR3；および/または
アミノ酸配列SEQ ID NO:10またはその変異体を含む単離された重鎖CDR1；および/または
アミノ酸配列SEQ ID NO:11またはその変異体を含む単離された重鎖CDR2；および/または
アミノ酸配列SEQ ID NO:12またはその変異体を含む単離された重鎖CDR3。
【請求項２】
以下を含む請求項1記載の結合タンパク質：
SEQ ID NO:7、8および9の軽鎖相補性決定領域またはその変異体を含む軽鎖可変領域、ならびにSEQ ID NO:10、11および12の重鎖相補性決定領域またはその変異体を含む重鎖可変領域。
【請求項３】
単離された軽鎖可変領域が、SEQ ID NO:16のアミノ酸配列またはその変異体を含む、請求項2記載の結合タンパク質。
【請求項４】
単離された重鎖可変領域が、SEQ ID NO:14のアミノ酸配列またはその変異体を含む、請求項2または3記載の結合タンパク質。
【請求項５】
癌細胞上または癌細胞内の抗原に結合することができる結合タンパク質であって、
1つまたは複数の濃度の試験結合タンパク質が、抗原またはエピトープへの結合に関してAb1と競合するその能力について試験される、
（1）請求項1から4のいずれか一項記載の結合タンパク質；および
（2）SEQ ID NO: 17、71、23、41、111もしくは112のアミノ酸配列を含む抗原またはエピトープ
を含む競合結合アッセイ法
によって、同定することができる結合タンパク質。
【請求項６】
結合タンパク質が抗体である、請求項1から5のいずれか一項記載の結合タンパク質。
【請求項７】
抗体が抗体断片である、請求項6記載の結合タンパク質。
【請求項８】
前記抗体断片が、Fab、Fab'、F(ab')2、scFv、dsFv、ds-scFv、二量体、ミニボディ、二重特異性抗体、もしくはその多量体、または二重特異性抗体断片である、請求項7記載の結合タンパク質。
【請求項９】
請求項１から8記載の結合タンパク質をコードする、単離された核酸配列。
【請求項１０】
SEQ ID NO:15の軽鎖可変領域またはその変異体を含む、請求項9記載の核酸配列。
【請求項１１】
SEQ ID NO:13の重鎖可変領域またはその変異体を含む、請求項9または10記載の核酸配列。
【請求項１２】
請求項1から8のいずれか一項記載の結合タンパク質、ならびに薬学的に許容される賦形剤、担体、緩衝剤または安定剤
を含む、組成物。
【請求項１３】
（2）癌治療薬
に付着した、
（1）癌細胞上の抗原に結合する請求項1から8のいずれか一項記載の結合タンパク質
を含む、免疫複合体。
【請求項１４】
前記癌治療薬が細胞毒素である、請求項13記載の免疫複合体。
【請求項１５】
前記細胞毒素がリボソーム不活化ポリペプチドである、請求項14記載の免疫複合体。
【請求項１６】
前記細胞毒素が、ゲロニン、ボウガニン（bouganin）、サポリン、リシン、リシンA鎖、ブリオジン（bryodin）、ジフテリア、レストリクトシン（restrictocin）およびシュードモナス（Pseudomonas）外毒素Aまたはその変異体からなる群より選択される、請求項14記載の免疫複合体。
【請求項１７】
前記細胞毒素が改変ボウガニンもしくはその変異体、またはアミノ酸252〜608からなる切断型のシュードモナス外毒素Aもしくはその変異体である、請求項14記載の免疫複合体。
【請求項１８】
免疫毒素が癌細胞によって内部に取り込まれる、請求項13から17のいずれか一項記載の免疫複合体。
【請求項１９】
SEQ ID NO:49またはSEQ ID NO:51のアミノ酸配列を含む、請求項18記載の免疫複合体。
【請求項２０】
請求項13から19のいずれか一項記載の免疫複合体をコードする、単離された核酸配列。
【請求項２１】
SEQ ID NO:48またはSEQ ID NO:50の核酸配列を含む、請求項20記載の単離された核酸配列。
【請求項２２】
請求項13から19のいずれか一項記載の免疫複合体を薬学的に許容される賦形剤、担体、緩衝剤または安定剤と共に含む、組成物。
【請求項２３】
癌を治療または予防するため薬剤の製造のための、請求項13から19のいずれか一項記載の免疫複合体の有効量の使用。
【請求項２４】
同時、別々または連続的に癌を治療または予防するための医薬の製造のための1つまたは複数のさらなる癌治療薬の使用をさらに含む、請求項23記載の使用。
【請求項２５】
癌を治療または予防するためのキットであって、
請求項13から19のいずれか一項記載の免疫複合体の有効量、および癌を治療または予防するためのその使用に関する説明書を含む、キット。
【請求項２６】
被験者の癌を検出またはモニターする方法であって、
以下の段階を含む方法：
（1）該被験者から採取した試験試料を、癌細胞上または癌細胞内の抗原に特異的に結合する請求項1から8のいずれか一項記載の結合タンパク質と接触させて、結合タンパク質-抗原複合体を生成する段階；
（2）該試験試料中の結合タンパク質-抗原複合体の量を測定する段階；および
（3）該試験試料中の結合タンパク質-抗原複合体の量を対照と比較する段階。
【請求項２７】
癌を診断するためのキットであって、
癌細胞上または癌細胞内の抗原に結合する請求項1から4及び8のいずれか一項記載の結合タンパク質、およびその使用に関する説明書を含む、キット。
【請求項２８】
（2）直接的もしくは間接的に検出可能なシグナルを生じる標識
に付着した、
（1）癌細胞上または癌細胞内の抗原に結合する請求項1から8のいずれか一項記載の結合タンパク質
を含む、診断薬。
【請求項２９】
標識が、放射性同位体、蛍光化合物、化学発光化合物、酵素、造影剤または金属イオンである、請求項28記載の診断薬。
【請求項３０】
請求項9、10、11、20、および21のいずれか一項記載の核酸分子を含む、組換え発現ベクター。
【請求項３１】
請求項30記載の組換え発現ベクターを含む、宿主細胞。
【請求項３２】
SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:112、216位、218位、219位および/もしくは222位に1つもしくは複数のアミノ酸置換を伴うSEQ ID NO:113、またはSEQ ID NO:71のアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド、あるいはその変異体。
【請求項３３】
請求項32記載の単離されたポリペプチドをコードする、単離された核酸配列。
【請求項３４】
請求項33記載の核酸配列を含む、組換え発現ベクター。
【請求項３５】
癌を有するまたは癌を有することが疑われる被験者において癌を検出またはモニターする方法であって、
単離されたポリペプチドが細胞上または細胞内で検出される場合には癌を示す、試料中の細胞上または細胞内の請求項32記載の単離されたポリペプチドを検出する段階
を含む方法。
【請求項３６】
適した希釈剤または担体との混合物中の、請求項32記載の単離されたポリペプチドまたはその断片、請求項33記載の単離された核酸配列、あるいは請求項34記載の組換え発現ベクターの有効量を含む、薬学的組成物。
【請求項３７】
アジュバントをさらに含む、請求項36記載の薬学的組成物。
【請求項３８】
被験者において癌を治療もしくは予防するためのまたは免疫応答を誘発する薬剤の製造のための、請求項36または37記載の組成物の使用。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３０】
本発明の他の特徴および利点は、以下の詳細な説明から明らかであると考えられる。しかし、本発明の精神および範囲内の様々な変更および改変は、当業者であればこの詳細な説明から明らかであると考えられるため、詳細な説明および具体例は、本発明の好ましい態様を示している一方で、例示のために示すにすぎないことが理解されるべきである。
[請求項1001]
以下からなる群より選択される、単離された相補性決定領域（CDR）：
SEQ ID NO:7のアミノ酸配列またはその変異体を含む単離された軽鎖CDR1；
アミノ酸配列SEQ ID NO:8またはその変異体を含む単離された軽鎖CDR2；
アミノ酸配列SEQ ID NO:9またはその変異体を含む単離された軽鎖CDR3；
アミノ酸配列SEQ ID NO:10またはその変異体を含む単離された重鎖CDR1；
アミノ酸配列SEQ ID NO:11またはその変異体を含む単離された重鎖CDR2；
アミノ酸配列SEQ ID NO:12またはその変異体を含む単離された重鎖CDR3。
[請求項1002]
請求項1001記載の相補性決定領域をコードする、単離された核酸配列。
[請求項1003]
以下からなる群より選択される、単離された可変領域：
SEQ ID NO:7、8および/もしくは9の軽鎖相補性決定領域またはその変異体を含む単離された軽鎖可変領域、ならびにSEQ ID NO:10、11および/もしくは12の重鎖相補性決定領域またはその変異体を含む単離された重鎖可変領域。
[請求項1004]
単離された軽鎖可変領域が、SEQ ID NO:16のアミノ酸配列またはその変異体を含む、請求項1003記載の可変領域。
[請求項1005]
単離された重鎖可変領域が、SEQ ID NO:14のアミノ酸配列またはその変異体を含む、請求項1003記載の可変領域。
[請求項1006]
請求項1003記載の可変領域をコードする、単離された核酸配列。
[請求項1007]
SEQ ID NO:15の軽鎖可変領域またはその変異体を含む、請求項1006記載の核酸配列。
[請求項1008]
SEQ ID NO:13の重鎖可変領域またはその変異体を含む、請求項1006記載の核酸配列。
[請求項1009]
請求項1003から1005記載の可変領域の1つまたは複数を含む、結合タンパク質。
[請求項1010]
SEQ ID NO:7、8および/もしくは9で規定されるアミノ酸配列を含む軽鎖相補性決定領域、ならびにSEQ ID NO:10、11および/もしくは12で規定されるアミノ酸配列を含む重鎖相補性決定領域またはその変異体を含む、請求項1009記載の結合タンパク質。
[請求項1011]
SEQ ID NO:16の軽鎖可変領域またはその変異体を含む、請求項1009記載の結合タンパク質。
[請求項1012]
SEQ ID NO:14の重鎖可変領域またはその変異体を含む、請求項1009記載の結合タンパク質。
[請求項1013]
SEQ ID NO:16の軽鎖可変領域およびSEQ ID NO:14の重鎖可変領域、またはその変異体を含む、請求項1009記載の結合タンパク質。
[請求項1014]
前立腺幹細胞抗原（SEQ ID NO:17）、変異体HnRNPG、SEQ ID NO:71のアミノ酸配列を有する変異体HnRNPG、216位、218位、219位および/もしくは222位に1つもしくは複数のアミノ酸置換を伴うSEQ ID NO:113のアミノ酸配列を有する変異体HnRNPG、またはSEQ ID NO:23、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:111、もしくはSEQ ID NO:112のアミノ酸配列を含むポリペプチドに結合する、請求項1009から1013のいずれか一項記載の結合タンパク質。
[請求項1015]
SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:111またはSEQ ID NO:112のアミノ酸配列を含むポリペプチドに特異的である、請求項1014記載の結合タンパク質。
[請求項1016]
癌細胞上または癌細胞内の抗原に結合することができる結合タンパク質であって、
1つまたは複数の濃度の試験結合タンパク質が、抗原またはエピトープへの結合に関してAb1と競合するその能力について試験される、
（1）請求項1009から1015のいずれか一項記載の結合タンパク質、好ましくは抗体または抗体断片（Ab1）；および
（2）SEQ ID NO: 17、71、23、41、111もしくは112のアミノ酸配列を含む抗原またはエピトープ
を含む競合結合アッセイ法
によって、同定することができる結合タンパク質。
[請求項1017]
抗体である、請求項1009から1016のいずれか一項記載の結合タンパク質。
[請求項1018]
前記抗体が抗体断片である、請求項1017記載の結合タンパク質。
[請求項1019]
前記抗体断片が、Fab、Fab'、F(ab')2、scFv、dsFv、ds-scFv、二量体、ミニボディ、二重特異性抗体、もしくはその多量体、または二重特異性抗体断片である、請求項1018記載の結合タンパク質。
[請求項1020]
請求項1009から1019のいずれか一項記載の結合タンパク質をコードする、単離された核酸配列。
[請求項1021]
請求項1009から1019のいずれか一項記載の結合タンパク質、ならびに薬学的に許容される賦形剤、担体、緩衝剤または安定剤
を含む、組成物。
[請求項1022]
（2）癌治療薬
に付着した、
（1）癌細胞上の抗原に結合する請求項1009から1019のいずれか一項記載の結合タンパク質
を含む、免疫複合体。
[請求項1023]
前記癌治療薬が細胞毒素である、請求項1022記載の免疫複合体。
[請求項1024]
前記細胞毒素がリボソーム不活化ポリペプチドである、請求項1023記載の免疫複合体。
[請求項1025]
前記細胞毒素が、ゲロニン、ボウガニン（bouganin）、サポリン、リシン、リシンA鎖、ブリオジン（bryodin）、ジフテリア、レストリクトシン（restrictocin）およびシュードモナス（Pseudomonas）外毒素Aまたはその変異体からなる群より選択される、請求項1023記載の免疫複合体。
[請求項1026]
前記細胞毒素が改変ボウガニンまたはその変異体である、請求項1023記載の免疫複合体。
[請求項1027]
前記細胞毒素が、アミノ酸252〜608からなる切断型のシュードモナス外毒素Aまたはその変異体である、請求項1023記載の免疫複合体。
[請求項1028]
免疫毒素が癌細胞によって内部に取り込まれる、請求項1022から1027のいずれか一項記載の免疫複合体。
[請求項1029]
SEQ ID NO:49のアミノ酸配列を含む、請求項1022記載の免疫複合体。
[請求項1030]
SEQ ID NO:51のアミノ酸配列を含む、請求項1021記載の免疫複合体。
[請求項1031]
請求項1022から1030のいずれか一項記載の免疫複合体をコードする、単離された核酸配列。
[請求項1032]
SEQ ID NO:48の核酸配列を含む、請求項1031記載の単離された核酸配列。
[請求項1033]
SEQ ID NO:50の核酸配列を含む、請求項1031記載の単離された核酸配列。
[請求項1034]
請求項1022から1030のいずれか一項記載の免疫複合体を薬学的に許容される賦形剤、担体、緩衝剤または安定剤と共に含む、組成物。
[請求項1035]
癌を治療または予防するための、請求項1022から1030のいずれか一項記載の免疫複合体の有効量の使用。
[請求項1036]
同時、別々または連続的に癌を治療または予防するための医薬の製造のための1つまたは複数のさらなる癌治療薬の使用をさらに含む、請求項1035記載の使用。
[請求項1037]
癌を治療または予防するためのキットであって、
請求項1022から1030のいずれか一項記載の免疫複合体の有効量、および癌を治療または予防するためのその使用に関する説明書を含む、キット。
[請求項1038]
被験者の癌を検出またはモニターする方法であって、
以下の段階を含む方法：
（1）該被験者から採取した試験試料を、癌細胞上または癌細胞内の抗原に特異的に結合する請求項1009から1019のいずれか一項記載の結合タンパク質と接触させて、結合タンパク質-抗原複合体を生成する段階；
（2）該試験試料中の結合タンパク質-抗原複合体の量を測定する段階；および
（3）該試験試料中の結合タンパク質-抗原複合体の量を対照と比較する段階。
[請求項1039]
癌を診断するためのキットであって、
癌細胞上または癌細胞内の抗原に結合する請求項1009から1019のいずれか一項記載の結合タンパク質、およびその使用に関する説明書を含む、キット。
[請求項1040]
（2）直接的もしくは間接的に検出可能なシグナルを生じる標識
に付着した、
（1）癌細胞上または癌細胞内の抗原に結合する請求項1009から1019のいずれか一項記載の結合タンパク質
を含む、診断薬。
[請求項1041]
標識が、放射性同位体、蛍光化合物、化学発光化合物、酵素、造影剤または金属イオンである、請求項1060記載の診断薬。
[請求項1042]
請求項1040または1041の診断薬およびその使用に関する説明書を含む、キット。
[請求項1043]
請求項1002、1006、1007、1008、1020、1031、1032または1033のいずれか一項記載の核酸分子を含む、組換え発現ベクター。
[請求項1044]
請求項1043記載の組換え発現ベクターを含む、宿主細胞。
[請求項1045]
SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:112、216位、218位、219位および/もしくは222位に1つもしくは複数のアミノ酸置換を伴うSEQ ID NO:113、またはSEQ ID NO:71のアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド、あるいはその変異体。
[請求項1046]
SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:111、SEQ ID NO:112、216位、218位、219位および/もしくは222位に1つもしくは複数のアミノ酸置換を伴うSEQ ID NO:113、またはSEQ ID NO:71のアミノ酸配列からなる単離されたポリペプチド、あるいはその変異体。
[請求項1047]
請求項1045または1046記載の単離されたポリペプチドをコードする、単離された核酸配列。
[請求項1048]
請求項1047記載の核酸配列を含む、組換え発現ベクター。
[請求項1049]
癌を有するまたは癌を有することが疑われる被験者において癌を検出またはモニターする方法であって、
単離されたポリペプチドが細胞上または細胞内で検出される場合には癌を示す、試料中の細胞上または細胞内の請求項1045または1046記載の単離されたポリペプチドを検出する段階
を含む方法。
[請求項1050]
適した希釈剤または担体との混合物中の、請求項1045もしくは1046記載の単離されたポリペプチドまたはその断片、請求項1047記載の単離された核酸配列、あるいは請求項1048記載の組換え発現ベクターの有効量を含む、薬学的組成物。
[請求項1051]
アジュバントをさらに含む、請求項1050記載の薬学的組成物。
[請求項1052]
被験者において癌を治療もしくは予防するためのまたは免疫応答を誘発するための、請求項1050または1051記載の組成物の使用。