【手続補正書】
【提出日】平成23年6月7日(2011.6.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
脂肪酸または脂肪酸誘導体を産生するように改変された培養微生物であって、
該改変された微生物が以下から選択される１以上のポリペプチドをコードする１以上の核酸配列を含み: 
(a) accA (EC 6.4.1.2)、accB (EC 6.4.1.2)、accC (EC 6.4.1.2)、accD (EC 6.4.1.2)、 fadD (EC 2.3.1.86)、fabA (EC4.2.1.60)、fabB (EC 2.3.1.41)、fabD (EC 2.3.1.39)、fabG (EC 1.1.1.100)、fabH (EC 2.3.1.180)、fabI (EC 1.3.1.9)、およびfabZ (EC 4.2.1.-)、および
(b)ろうシンターゼ (EC 2.3.1.75)またはアルコールアセチルトランスフェラーゼ (2.3.1.84)、
ここで該１以上の核酸配列が過剰発現され、該改変された微生物が脂肪酸または脂肪酸誘導体を産生する、改変された培養微生物。
【請求項２】
該微生物がチオエステラーゼ(3.1.2.-、3.1.1.-)をコードする１以上の外来性核酸配列を発現する、請求項 1の改変された微生物。
【請求項３】
accA (EC 6.4.1.2)、accB (EC 6.4.1.2)、accC (EC 6.4.1.2)およびaccD (EC 6.4.1.2) が過剰発現されている請求項 1または2の改変された微生物。
【請求項４】
fadEが減弱されている請求項1〜 3のいずれかの改変された微生物。
【請求項５】
fadDが過剰発現されている請求項1〜 4のいずれかの改変された微生物。
【請求項６】
該微生物が、発酵ブロス、および少なくとも 10 mg/Lの脂肪酸エステル、10 mg/Lの脂肪アルコール、10 mg/Lの炭化水素または少なくとも 10 mg/Lのろうを含む容器中にて培養されている請求項1〜 5のいずれかの改変された微生物。
【請求項７】
該培養微生物が１以上の二重結合を含む脂肪酸誘導体を産生する請求項1〜 6のいずれかの改変された微生物。
【請求項８】
該培養微生物が8から30の炭素鎖長を含む脂肪酸誘導体を産生する請求項1〜 7のいずれかの改変された微生物。
【請求項９】
脂肪酸誘導体が１以上の分枝点を含む請求項1〜 8のいずれかの微生物。
【請求項１０】
該微生物が、アルスロバクター・エスピー(Arthrobacter sp.)、バシラス・エスピー(Bacillus sp.)、ボツリオコッカス・ブラウニ(Botryococcus braunii)、クロマチウム・エスピー(Chromatium sp.)、クラドスポリウム・レシナ(Cladosporium resina)(ATCC22711)、クロストリジウム・パステウリアヌム・ブイケーエム(Clostridium pasteurianum VKM)、クロストリジウム・テナノモルフム(Clostridium tenanomorphum)、クロストリジウム・アシディウリキ(Clostridium acidiurici)、コリネバクテリウム種(Corynebacterium species)、シアノバクテリア種(cyanobacterial species)( ノストック・ムスコルム(Nostoc muscorum)、アナシスティス (シネココッカス)・ニドゥランス(Anacystis (Synechococcus) nidulans)、フォルミジウム・ルリダム(Phormidium luridum)、クロログロエア・フリツキ(Chlorogloea fritschii)、トリコデスミウム・エリタエウム(Trichodesmium erythaeum)、オシラトリア・ウィリアムシ(Oscillatoria williamsii)、ミクロコレウス・キトノプラセイス(Microcoleus chthonoplaseis)、コッコクロリス・エラベンス(Coccochloris elabens)、アグメネルム・クアドルプリカツム(Agmenellum quadruplicatum)、プレクトネマ・テレブランス(Plectonema terebrans)、エム・ヴァギナツス(M vaginatus)およびシー・スコプロルム(C. scopulorum))、デスルフォビブリオ・デスルフリカンス(Desulfovibrio desulfuricans)(ATCC29577)、キネオコッカス・ラジオトレランス(Kineococcus radiotolerans)(BAA-149)、ミクロコッカス・ルテウス(Micrococcus luteus)(FD533、ATCC 272、381、382、ISU、540、4698、7468、27141)、ミクロコッカス・エスピー(Micrococcus sp.)(ATCC 146、398、401、533)、ミクロコッカス・ロセウス(Micrococcus roseus)(ATCC 412、416、516)、ミクロコッカス・リソデイクチクス(Micrococcus lysodeikticus)、マイコバクテリウム種(Mycobacterium species)、ペニシリウム・エスピー(Penicillium sp.)、アスペルギルス・エスピー(Aspergillus sp.)、トリコデルマ・ビリダ(Trichoderma virida)、プルラリア・プルランス(Pullularia pullulans)、ジェオトガリコッカス・エスピー(Jeotgalicoccus sp.)( エム・カンディカンス(M. candicans))(ATCC 8456)、ロドシュードモナス・スフェロイド(Rhodopseudomonas spheroids)、クロロビウム・エスピー(Chlorobium sp.)、ロドスピリリウム・ルブラム(Rhodospirillium rubrum)(ATCC11170)、ロドミクロビウム・バニエリ(Rhodomicrobium vannielii)、ステノトロフォモナス・マルトフィリア(Stenotrophomonas maltophilia)(ATCC 13637、17444、17445、17666、17668、17673、17674、17679、17677)、サッカロマイコデス・ルドウィギ(Saccharomycodes ludwigii)(ATCC 22711)、サッカロマイセス・エスピー(Saccharomyces sp.)(オビフォルムス(oviformus)、ルドウィギ(ludwiggi)、トロピカリス(tropicalis))、ビブリオ・ファーニッシ(Vibrio furnissii)M1、ビブリオ・マリヌス(Vibrio marinus)MP-1、ビブリオ・ポンチクス(Vibrio ponticus)、セッラティア・マリノルブラ(Serratia marinorubra)、ウスティラゴ・マイディス(Ustilago maydis)、ウスティラゴ・ヌダ(Ustilago nuda)、ウロシスティス・アグロピリ(Urocystis agropyri)、スファセロテカ・レイリアナ(Sphacelotheca reiliana)、またはティレティア・エスピー(Tilletia sp.)(フォエチダ(foetida)、カリエス(caries)、コントロヴェルサ(controversa))である、請求項1〜 9のいずれかの改変された微生物。
【請求項１１】
該微生物が大腸菌(E. coli)である請求項1〜 9のいずれかの改変された微生物。
【請求項１２】
以下の工程を含む、精製脂肪酸誘導体を得る方法:
(a)請求項1〜 11のいずれかの微生物を、脂肪酸誘導体を産生するのに十分な条件下で培養容器中で培養する工程;
(b)脂肪酸誘導体を有機相中に分離させる工程;および、
(c) 有機相から脂肪酸誘導体を得る工程。
【請求項１３】
該微生物をろうエステルを産生するのに十分な条件下で培養する工程、およびろうエステルを分離する工程をさらに含む、請求項 12の方法。
【請求項１４】
該微生物を脂肪酸エステルを産生するのに十分な条件下で培養する工程、および脂肪酸エステルを分離する工程をさらに含む、請求項 12の方法。
【請求項１５】
該微生物が炭素源の存在下で培養される請求項12〜14のいずれかの方法。