【手続補正書】
【提出日】平成22年8月23日(2010.8.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１２】
さらに別の好ましい実施形態において、本発明は、病原性感染を予防又は治療する方法を提供する。そのような方法は、細菌、原虫、ウイルス、藻類、及び真菌等の微生物病原体を含む多岐にわたる病原体による感染を治療するために、本発明のキナーゼ阻害剤を含む組成物を、治療有効量でそれを必要とする患者に投与することを含む。特に、本発明は、大腸菌（腸管病原性大腸菌（ＥＰＥＣ）、腸管出血性大腸菌（ＥＨＥＣ）、尿路病原性大腸菌（ＵＰＥＣ）、及び腸管組織侵入性大腸菌（ＥＩＥＣ））、マイコバクテリウム・ツベルクローシス（ｍＴＢ）、シュードモナス・エルギノーサ、クラミジア・トラコマーティス、ポックスウイルス（ワクシニアウイルス及び痘瘡ウイルスを含む）、ポリオーマウイルス（ＪＣウイルス及びＢＫウイルスを含む）、ヒト免疫不全ウイルス（例えばＨＩＶ−１）、ヘルペスウイルス（単純疱疹ウイルス、エプスタインバーウイルス、及びガンマヘルペスウイルスを含む）、インフルエンザウイルス、シゲラ・フレックスネリ、コクサッキーウイルス、ヘリコバクター・ピロリ、西ナイルウイルス、リステリア・モノサイトゲネス、サルモネラ・チフィムリウム、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、及び文献に記載されている他の病原体を含む病原体と関連する疾患を治療するために、これらの組成物の使用を提供する。一つの好ましい実施形態において、本発明は、急性の病原性感染を治療するために、短期間で、好ましくは３週間未満でこれらの組成物の使用を提供し、毒性を回避する。病原性感染の治療のため治療有効量が送達される限り、組成物は任意の投与手段により投与できる。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
病原性感染を予防又は治療するための方法であって、多岐にわたる病原体により引き起こされる感染を予防又は治療するために、表Ａに示した１つ以上のキナーゼ阻害剤を含む治療有効量の組成物を、治療有効量の組成物を必要とする患者に投与することを含む方法。
（項目２）
前記キナーゼ阻害剤がチロシンキナーゼ阻害剤である、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記チロシンキナーゼ阻害剤がＡｂｌファミリーチロシンキナーゼ阻害剤又はＳｒｃファミリーチロシンキナーゼ阻害剤である、項目２に記載の方法。
（項目４）
前記病原性感染が細菌性病原体により引き起こされる、項目１に記載の方法。
（項目５）
前記細菌性病原体が、大腸菌（腸管病原性大腸菌（ＥＰＥＣ）、腸管出血性大腸菌（ＥＨＥＣ）、尿路病原性大腸菌（ＵＰＥＣ）、及び腸管組織侵入性大腸菌（ＥＩＥＣ））、マイコバクテリウム・ツベルクローシス（ｍＴＢ）、シュードモナス・エルギノーサ、クラミジア・トラコマーティス、ポックスウイルス（ワクシニアウイルス及び痘瘡ウイルスを含む）、ポリオーマウイルス（ＪＣウイルス及びＢＫウイルスを含む）、ヒト免疫不全ウィルス（例えばＨＩＶ−１）、ヘルペスウイルス（単純疱疹ウイルス、エプスタインバーウイルス、及びガンマヘルペスウイルスを含む）、インフルエンザウイルス、シゲラ・フレックスネリ、コクサッキーウイルス、ヘリコバクター・ピロリ、西ナイルウイルス、リステリア・モノサイトゲネス、サルモネラ・チフィムリウム、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、及び他の病原体からなる群から選択される、項目４に記載の方法。
（項目６）
前記病原性感染がウイルス性病原体により引き起こされる、項目１に記載の方法。
（項目７）
前記ウイルス性病原体が、アデノウイルス科、アレナウイルス科、アストロウイルス科、バクテリオファージ、バキュロウイルス科、ブンヤウイルス科、カリシウイルス科、コロナウイルス科、デルタウイルス、フィロウイルス科、フラビウイルス科、ジェミニウイルス科、ヘパドナウイルス科、ヘルペスウイルス科、ノダウイルス科、オルソミクソウイルス科、パポバウイルス科、パラミクソウイルス科、パルボウイルス科、フィコドナウイルス科、ピコルナウイルス科、ポックスウイルス科、レオウイルス科、レトロウイルス科、ラブドウイルス科、トバモウイルス科、及びトガウイルス科、ワクシニアウイルス及び痘瘡ウイルスを含むポックスウイルス、ＪＣウイルスおよびＢＫウイルスを含むポリオーマウイルス、単純性疱疹ウイルス、エプスタインバーウイルス及びガンマヘルペスウイルスを含むヘルペスウイルス、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、並びにヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１）からなる群から選択される、項目６に記載の方法。
（項目８）
前記病原性感染がポックスウイルスにより引き起こされる、項目６に記載の方法。
（項目９）
前記病原性感染がワクシニアウイルスにより引き起こされる、項目８に記載の方法。
（項目１０）
病原性感染が、単純疱疹ウイルス、エプスタインバーウイルス、及びガンマヘルペスウイルスを含むヘルペスウイルスにより引き起こされる、項目６に記載の方法。
（項目１１）
前記キナーゼ阻害剤がＳｔｉＡＦ３−ｉＡＲ又はＬＧ２−７１である、項目１に記載の方法。
（項目１２）
前記キナーゼ阻害剤が、ＷＢＺ−６、ＣＧＰ５１１４８ＷＢＺ−４、Ｅｐｈ２＿ｗｂｚ、Ａｐｃｋ１０３、Ａｐｃｋ２１、ＡＰｃｋ２５、ＡＰｃＫ３６、ＡＰＣＫ５０、ＡＰＣＫ５１、ＡＰＣＫ５３、ＬＧ２−５５、ＬＧ２−７７、又はＬＧ２−８１である、項目１に記載の方法。
（項目１３）
前記病原性感染が急性感染である、項目１に記載の方法。
（項目１４）
前記急性感染が短期間治療される、項目１３に記載の方法。
（項目１５）
前記短期間が３週間未満である、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記キナーゼ阻害剤が総括表Ｂに示されている、項目１に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００９４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００９４】
プラークアッセイに基づいてポックスウイルス及び特にワクシニアウイルス（ＶＶ）に対する活性を有する化合物が同定された。例えば、図１は、化合物Ｅｐｈ＿２ｗｂｚ＿１０５、Ｅｐｈ＿２ｗｂｚ＿２０３、Ｅｐｈ＿２ｗｂｚ＿２０６及びＬＧ２−７１がコメットを有する小さなプラークを生成する一方で（図１Ｂ）、化合物ＤＭ−Ｉ−１８７及びＤＭ−Ｉ−１９６はコメットを有しないより小さな（点状）プラークを生成する（図１Ｃ）ことを示す。化合物Ｅｐｈ＿２ｗｂｚ＿１１０、Ａｐｃｋ１０８、Ａｐｃｋ１１１、Ａｐｃｋ２６、及びＡｐｃｋ２７は、点状プラークを生成するが（図２Ａ）、化合物Ａｐｃｋ１０５、ＬＧ２−９１及びＬＧ２−９６はプラークを生成しない（図２Ｂ）。さらに、図４は、化合物Ａｐｃｋ３４及びＡｐｃｋ３２により生成された大きなコメットを有する小さなプラーク（図４Ａ）；化合物ＪＧＡＰ−１３及びブチエオラクトン−１で処理されることにより、ＷＴより多くのプラークが生成されたこと（図４Ｂ）；及び化合物Ａｐｃｋ１０１及びＹＹＢ２１で処理されることにより、損傷を受けた単層が生成されたこと（図４Ｃ）等の追加的な表現型を例証する。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００９５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００９５】
Ｓｒｃファミリーキナーゼ及びＡｂｌファミリーキナーゼの阻害剤（例えばＰＤ１６６３２６及びＢＭＳ３５４８２５）での結果に基づいて、発明者らは、感染した単層を、（クラスＩ）未処理の細胞との差がないこと；（クラスＩＩ）Ａｂｌファミリーキナーゼ及びＥＥＶの放出を示す、コメットの痕跡のない小さなプラーク；並びに（クラスＩＩＩ）Ｓｒｃファミリーキナーゼ及びＡｂｌファミリーキナーゼの阻害剤、アクチン尾部の阻止並びにＥＥＶの放出を示す、点状プラーク又はプラークの非存在及びコメットの非存在という３つのカテゴリーに数値化した。クラスＩＩカテゴリーに属する化合物には、Ｅｐｈ２＿ｗｂｚ１０７；ＷＢＺ−４；Ｅｐｈ２−ｗｂｚ２０６；Ｅｐｈ２−ｗｂｚ２１１；ＡＰｃＫ−１０７；ＡＰｃＫ１０９；ＡＰｃＫ１１０；ＹＹＢ４１；ＹＹＢ４４；ＬＧ２−６２；ＬＧ２−７９；ＪＡＫ２Ｆが含まれるが、それらに限定されない。クラスＩＩＩカテゴリーに属する化合物には、Ｅｐｈ２＿ｗｂｚ１０２；Ｅｐｈ２＿ｗｂｚ１０３；Ｅｐｈ２＿ｗｂｚ１０４；Ｅｐｈ２＿ｗｂｚ１０５；Ｅｐｈ２＿ｗｂｚ１０６；Ｅｐｈ２＿ｗｂｚ１１０；Ｅｐｈ２−ｗｂｚ１１２；Ｅｐｈ２−ｗｂｚ１１７；ＳＴＩ−ＯＨ；ＳＴＩ−Ｆ；ＳＴＬＬ３；ＳｔｉＡＦ３＿Ｕｅ；ＳＴＬＦ２；Ｅｐｈ２＿ｗｂｚ２０２；Ｅｐｈ２−ｗｂｚ２０３；Ｅｐｈ２＿ｗｂｚ２１６、ＡＳ６０５０９１；ＡＳ６０４８５０；ＡＳ６０５２４０；ＡＰｃＫ−１０２；ＡＰｃＫ−１０３；ＡＰｃＫ１０４；ＡＰｃＫ−１０５；ＡＰｃＫ−１０６；ＡＰｃＫ１０８；ＡＰｃＫ１１１；ＡＰｃＫ−２６；ＡＰｃＫ２７；ＡＰｃＫ３５；ＡＰｃＫ４０：ＡＰｃＫ４３；ＡＰｃＫ４４；ＡＰｃＫ４８；ｄｍ−Ｉ−１８７；ｄｍ−Ｉ−１９３；ｄｍ−Ｉ−１９６；ｄｍ−Ｉ−２０３；ＰＤ１６６３２６；ＰＤ−Ｂｒ；ＹＹＡ１０４；ＹＹＡ１８８；ＹＹＡ１９４；ＹＹＡ１９５；ＹＹＢ１９；ＹＹＢ３１；ＹＹＢ３２；ＬＧ２−９；ＬＧ２−１１；ＬＧ２−１３；ＬＧ２−８５；ＬＧ２−７１；ＬＧ２−９５；ＬＧ２−９１；ＬＧ２−１０１；ＬＧ２−１０２；ＬＧ２−９８；ＬＧ２−９６が含まれるが、それらに限定されない。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００９６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００９６】
これらで検査された化合物の幾つか、例えばＡｐＣＫ１０３、Ａｐｃｋ−４３、ＬＧ２−５５、及びＬＧ２−７１は、ヘルペスアッセイ及びワクシニアアッセイの両方において効果を示した（下記も参照されたい）。他には（例えば先願に記述されているＰＤ１６６３２６及び関連化合物）、ワクシニアアッセイ及び病原性大腸菌を用いたアッセイの両方で効果を示したものもあった（Ｓｗｉｍｍ  ｅｔ  ａｌ．，２００４，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｃｅｌｌ．２００４．１５：３５２０−３５２９）。幾つかのクラスＩＩ及びＩＩＩ化合物も、上述のように顕微鏡アッセイで検査した。その結果、そのアッセイで検査されたクラスＩＩ化合物は、アクチン尾部の数に影響しなかったが、そのアッセイで検査されたクラスＩＩＩ化合物は、アクチン尾部を低減したか又は除去したことが示された（図３を参照）。上述のように、図３は、顕微鏡アッセイ及びプラークワクシニアアッセイによる、野生型についてのアクチンタンパク質尾部及びプラーク形成（ＷＴ、ワクシニアウイルス感染のみ）（最上段列）、並びに化合物ＳＴＩ−Ｆ（中段列）及びＥｐｈ＿２ｗｂｚ＿２０３（最下段列）でのアクチンタンパク質尾部及びプラーク形成、並びにそれらの予想されるキナーゼファミリー標的を例証する。アクチン運動性のキナーゼ依存性の特徴付けに基づくこれらのデータにより、クラスＩＩ化合物はＡｂｌファミリーキナーゼを阻害する可能性が高く、クラスＩＩＩ化合物はＡｂｌファミリーキナーゼ及びＳｒｃファミリーキナーゼの両方を阻害する可能性が高いことが示されたが、他のキナーゼも阻害される可能性があり得る。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００９９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００９９】
７日後、未処理のままだった対照細胞は、著しい細胞変性効果、すなわち単層を介した初感染の拡散、及びそれに続く感染細胞の溶解に起因する効果を示した。化合物で処理した細胞では、３つの表現型が明白だった。（ｉ）化合物で処理した細胞は、対照と同程度に細胞変性効果の痕跡を示した。未感染のままの化合物で処理した細胞が、細胞変性効果の痕跡をほとんど示さなかったため、この表現型は、この表現型を引き起こす化合物がウイルスの侵入、感染細胞からの放出、単層内での拡散、又は細胞溶解に影響を与えなかったことを示す。（ｉｉ）このグループの化合物で処理された後でも細胞の単層は無損傷のままであり、ＧＦＰ蛍光を検査で、蛍光焦点は単層全体にわたっては広がらなかったことが示された。この表現型は、この表現型を引き起こす化合物がウイルスの侵入又は放出を阻止する可能性が高いことを示す。典型的な化合物には、本発明のＣＧＰ−２（Ｇｌｅｅｖｅｃ（登録商標））、ＳｔｉＡＦ３−ｉＡＲ、及びＬＧ２−７１化合物が含まれるが、それらに限定されない。（ｉｉｉ）このグループの化合物で処理された後でも細胞の単層はまた無損傷のままであったが、ＧＦＰ蛍光を検査で、単層全体にわたって蛍光が認められた。この表現型は、この表現型を引き起こす化合物がウイルスの侵入又は放出を阻止しないが、細胞溶解は阻害できることを示す。典型的な化合物には、ＣＧＰ５１１４８ＷＢＺ−４、Ａｐｃｋ１０３、Ａｐｃｋ２１、ＡＰｃｋ２５、ＡＰｃＫ３６、ＡｐｃＫ４２、ＡＰＣＫ５０、ＡＰＣＫ５１、ＡＰＣＫ５３、ＬＧ２−５５、ＬＧ２−７７、及びＬＧ２−８１が含まれるが、それらに限定されない。これらのデータをまとめると、グループ（ｉｉ）及び（ｉｉｉ）の化合物は、ウイルス増殖に影響を与え、新しいウイルスの生成を制限することが示唆され、さらに病原性感染を治療及び予防するのに有用であることが期待される。
【手続補正６】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
多岐にわたる病原体により引き起こされる病原性感染を予防又は治療するための組成物であって、表Ａに示した１つ以上のキナーゼ阻害剤を治療有効量含む組成物。
【請求項２】
前記キナーゼ阻害剤がチロシンキナーゼ阻害剤である、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
前記チロシンキナーゼ阻害剤がＡｂｌファミリーチロシンキナーゼ阻害剤又はＳｒｃファミリーチロシンキナーゼ阻害剤である、請求項２に記載の組成物。
【請求項４】
前記病原性感染が細菌性病原体により引き起こされる、請求項１に記載の組成物。
【請求項５】
前記細菌性病原体が、大腸菌（腸管病原性大腸菌（ＥＰＥＣ）、腸管出血性大腸菌（ＥＨＥＣ）、尿路病原性大腸菌（ＵＰＥＣ）、及び腸管組織侵入性大腸菌（ＥＩＥＣ））、マイコバクテリウム・ツベルクローシス（ｍＴＢ）、シュードモナス・エルギノーサ、クラミジア・トラコマーティス、ポックスウイルス（ワクシニアウイルス及び痘瘡ウイルスを含む）、ポリオーマウイルス（ＪＣウイルス及びＢＫウイルスを含む）、ヒト免疫不全ウィルス（例えばＨＩＶ−１）、ヘルペスウイルス（単純疱疹ウイルス、エプスタインバーウイルス、及びガンマヘルペスウイルスを含む）、インフルエンザウイルス、シゲラ・フレックスネリ、コクサッキーウイルス、ヘリコバクター・ピロリ、西ナイルウイルス、リステリア・モノサイトゲネス、サルモネラ・チフィムリウム、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、及び他の病原体からなる群から選択される、請求項４に記載の組成物。
【請求項６】
前記病原性感染がウイルス性病原体により引き起こされる、請求項１に記載の組成物。
【請求項７】
前記ウイルス性病原体が、アデノウイルス科、アレナウイルス科、アストロウイルス科、バクテリオファージ、バキュロウイルス科、ブンヤウイルス科、カリシウイルス科、コロナウイルス科、デルタウイルス、フィロウイルス科、フラビウイルス科、ジェミニウイルス科、ヘパドナウイルス科、ヘルペスウイルス科、ノダウイルス科、オルソミクソウイルス科、パポバウイルス科、パラミクソウイルス科、パルボウイルス科、フィコドナウイルス科、ピコルナウイルス科、ポックスウイルス科、レオウイルス科、レトロウイルス科、ラブドウイルス科、トバモウイルス科、及びトガウイルス科、ワクシニアウイルス及び痘瘡ウイルスを含むポックスウイルス、ＪＣウイルスおよびＢＫウイルスを含むポリオーマウイルス、単純性疱疹ウイルス、エプスタインバーウイルス及びガンマヘルペスウイルスを含むヘルペスウイルス、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、並びにヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１）からなる群から選択される、請求項６に記載の組成物。
【請求項８】
前記病原性感染がポックスウイルスにより引き起こされる、請求項６に記載の組成物。
【請求項９】
前記病原性感染がワクシニアウイルスにより引き起こされる、請求項８に記載の組成物。
【請求項１０】
病原性感染が、単純疱疹ウイルス、エプスタインバーウイルス、及びガンマヘルペスウイルスを含むヘルペスウイルスにより引き起こされる、請求項６に記載の組成物。
【請求項１１】
前記キナーゼ阻害剤がＷＢＺ−６又はＬＧ２−７１である、請求項１に記載の組成物。
【請求項１２】
前記キナーゼ阻害剤が、ＣＧＰ５１１４８、ＷＢＺ−４、Ｅｐｈ２＿ｗｂｚ、Ａｐｃｋ１０３、Ａｐｃｋ２１、ＡＰｃｋ２５、ＡＰｃＫ３６、ＡＰＣＫ５０、ＡＰＣＫ５１、ＡＰＣＫ５３、ＬＧ２−５５、ＬＧ２−７７、又はＬＧ２−８１である、請求項１に記載の組成物。
【請求項１３】
前記病原性感染が急性感染である、請求項１に記載の組成物。
【請求項１４】
前記組成物が、短期間投与されるように用いられることを特徴とする、請求項１３に記載の組成物。
【請求項１５】
前記短期間が３週間未満である、請求項１４に記載の組成物。