【手続補正書】
【提出日】平成22年11月24日(2010.11.24)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
マイクロアレイを用いたメラノーマを有する対象に特異的な転写モジュールを作成する方法であって、
１又は複数のメラノーマ遺伝子を１又は複数のモジュールに分離するステップ、
各モジュールにおける１又は複数のメラノーマ発現ベクトルの発現量を含むデータセットを確定するステップ、及び
メラノーマ発現ベクトルの各々を個別の識別子で表示するステップ
を含む方法。
【請求項２】
以下から選択される６種以上のメラノーマ遺伝子がマイクロアレイ上に配置される、請求項１に記載の方法：
ＲＮＡ結合領域（ＲＮＰ１、ＲＲＭ）含有１；網膜芽細胞腫結合タンパク質６；ＧｒｐＥ様１（ミトコンドリア（大腸菌））；ｐｅｌｌｉｎｏホモログ１（ショウジョウバエ）；リングフィンガータンパク質１０；仮想タンパク質ＬＯＣ９０６３７；ポリコームホモログ１（ショウジョウバエ）のエンハンサー；全長インサートｃＤＮＡクローンＺＢ８１Ｂ１２；ＰＴＫ９プロテインチロシンキナーゼ９；細胞分裂周期関連４；ピリオドホモログ１（ショウジョウバエ）；ジンクフィンガータンパク質２３７；ＴＣＤＤ誘導性ポリ（ＡＤＰ−リボース）ポリメラーゼ；サイクリンＬ１；ＴＳＰＹ様２；グルタミン酸受容体（イオンチャンネル共役型、Ｎ−メチルＤ−アスパラギン酸様１Ａ型）；ＫＩＡＡ０８６３タンパク質；ｖ−ｍａｆ筋腱膜性線維肉腫癌遺伝子のホモログＦ（鳥類）；ＰＲＯ０１４９タンパク質；タンパク質チロシンホスファターゼＩＶＡ型、メンバー１；セリン／トレオニンキナーゼ受容体関連タンパク質；多プリン要素結合タンパク質Ｂ；ホスホジエステラーゼ４Ｂ、ｃＡＭＰ特異的（ホスホジエステラーゼＥ４ｄｕｎｃｅホモログ、ショウジョウバエ）；エストロゲン受容体結合タンパク質；ストレス７０タンパク質シャペロン、ミクロソーム関連、６０ｋＤａ；ＢＴＧファミリーのメンバー３；トランスフェリン受容体（ｐ９０、ＣＤ７１）；仮想タンパク質ＦＬＪ２０４３６；ホスホジエステラーゼ４Ｄ、ｃＡＭＰ特異的（ホスホジエステラーゼＥ３ｄｕｎｃｅホモログ、ショウジョウバエ）；ＫＩＡＡ００６３遺伝子産物；ｔ−ＳＮＡＲＥとの相互作用による小胞輸送ホモログ１Ａ（酵母）；ＬＯＣ４４０３０９；ＳＮＦ１様キナーゼ；二重特異性ホスファターゼ８；ＲＮＡ結合領域（ＲＮＰ１、ＲＲＭ）含有２；ダイニン軽鎖２；膜結合性ＤＮＡ結合タンパク質；セリン／トレオニンキナーゼ１７ｂ（アポトーシス誘発性）；腫瘍壊死因子α誘導タンパク質３；不均一核内リボ核タンパク質Ｃ（Ｃ１／Ｃ２）；ホスホジエステラーゼ４Ｄ、ｃＡＭＰ特異的（ホスホジエステラーゼＥ３ｄｕｎｃｅホモログ、ショウジョウバエ）；ｋｅｌｃｈ様１５（ショウジョウバエ）；ＫＩＡＡ０８６３タンパク質；活性化転写因子４（ｔａｘ応答性エンハンサー要素Ｂ６７）；ビリン２（エズリン）；核内小リボ核タンパク質のポリペプチドＡ’；ジンクフィンガータンパク質１９８；ｃＡＭＰ応答性要素モジュレーター；スプライシング因子３ａ、サブユニット１、１２０ｋＤａ；ＣＤ８３抗原（活性化Ｂリンパ球、免疫グロブリンスーパーファミリー）；ＤｎａＪ（Ｈｓｐ４０）ホモログ、サブファミリーＢ、メンバー６；染色体２０のオープンリーディングフレーム１１１；エタノールアミンキナーゼ１；染色体４のオープンリーディングフレーム１５；リングフィンガータンパク質１３９；リボヌクレアーゼＨ１；ｊｕｎ  Ｄ癌原遺伝子；Ｓ期キナーゼ関連タンパク質１Ａ（ｐ１９Ａ）；メチルＣｐＧ結合タンパク質２（レット症候群）；不均一核内リボ核タンパク質Ｈ３（２Ｈ９）；仮想タンパク質ＤＫＦＺｐ５８６Ｉ１４２０；ヌクレオソームアセンブリータンパク質１様５；Ｒａｓ−ＧＴＰアーゼ活性化タンパク質ＳＨ３ドメイン結合性タンパク質２；ジンクフィンガータンパク質３３１；カリン��；シュバッハマンボディアンダイアモンド症候群；ステロールＣ５デサチュラーゼ（ＥＲＧ３δ−５−デサチュラーゼホモログ、真菌）様；ホスファチジルイノシトールグリカン、クラスＡ（発作性夜間血色素尿症）；イソペンテニル二リン酸δイソメラーゼ；染色体２０のオープンリーディングフレーム６７；ｖ−ｍａｆ筋腱膜性線維肉腫癌遺伝子のホモログＫ（鳥類）；ウィスコットアルドリッチ症候群タンパク質相互作用性タンパク質；ｋｅｌｃｈ様７（ショウジョウバエ）；腫瘍壊死因子α誘導タンパク質３；仮想ＬＯＣ３８８７９６；アルマジロリピート含有８；膜結合性ＤＮＡ結合タンパク質；ジンクフィンガータンパク質３３１；ｃＡＭＰ応答性要素モジュレーター；推定翻訳開始因子；ＤｎａＪ（Ｈｓｐ４０）ホモログ、サブファミリーＢ、メンバー６；核内受容体サブファミリー４、グループＡ、メンバー２；円柱腫（ターバン頭布腫症候群）；核内受容体サブファミリー４、グループＡ、メンバー２；６−ピルボイルテトラヒドロプテリンシンターゼ；Ｓ期キナーゼアクチベーター；活性化ＲＮＡポリメラーゼIIの転写補因子４（活性化ＲＮＡポリメラーゼIIの転写コアクチベーターｐ１５に関連（正の補因子４）（ＰＣ４）（ｐ１４））；仮想ＬＯＣ３８８７９６；接合媒介／調節タンパク質；仮想遺伝子ＣＧ０１８；推定翻訳開始因子；二重特異性ホスファターゼ５；スプリット１のトランスデューシン様エンハンサー（ショウジョウバエのＥ（ｓｐ１）ホモログ）；ミトコンドリア運搬体タンパク質；タンパク質チロシンホスファターゼＩＶＡ型、メンバー１；ジンクフィンガータンパク質３３１；ＣＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：３０３３２３１６の部分ｃｄｓ；インターロイキンエンハンサー結合因子３、９０ｋＤａ；ホモサピエンス、クローンＩＭＡＧＥ：４７５３７１４、ｍＲＮＡ；ＳＯＮ  ＤＮＡ結合タンパク質；ＡＰ１γサブユニット結合タンパク質１；ジンクフィンガータンパク質３９４；真核性翻訳開始因子５；活性化転写因子７相互作用性タンパク質２；仮想タンパク質ＬＯＣ２８５８３１；アクチン関連タンパク質２／３複合体のサブユニット５様；仮想タンパク質ＬＯＣ１４４４３８；推定翻訳開始因子；Ｈ３ヒストン、ファミリー３Ｂ（Ｈ３．３Ｂ）；ｋｅｌｃｈリピート及びＢＴＢ（ＰＯＺ）ドメイン含有２；ＣＤＮＡ  ＦＬＪ４０７２５  ｆｉｓのクローンＴＫＩＤＮ１０００００１（ミトコンドリア内膜２３のトランスロカーゼに酷似）；円柱腫（ターバン頭布腫症候群）；ホスホジエステラーゼ４Ｄ、ｃＡＭＰ特異的（ホスホジエステラーゼＥ３ｄｕｎｃｅホモログ、ショウジョウバエ）；熱ショック７０ｋＤａタンパク質１４；ＨＳＰＣ１２８タンパク質；ＲＮＡ（グアニン−７−）メチルトランスフェラーゼ；イズロン酸２−スルファターゼ（ハンター症候群）；仮想タンパク質ＭＧＣ２９８１４；カゼインキナーゼ１（ε）；プロテインホスファターゼ１の調節（阻害）サブユニット１６Ｂ；イソペンテニル二リン酸δイソメラーゼ；ＲＡＤ２３ホモログＢ（Ｓ．セレビシエ）；ホスホジエステラーゼ４Ｄ、ｃＡＭＰ特異的（ホスホジエステラーゼＥ３ｄｕｎｃｅホモログ、ショウジョウバエ）；ジンクフィンガータンパク質２９５；仮想タンパク質ＦＬＪ１３１４９；及���ＢＴＧファミリー、メンバー３、並びにそれらの組合せ。
【請求項３】
以下から選択される６種以上のメラノーマ遺伝子がマイクロアレイ上に配置される、請求項１に記載の方法：
ＷＡＲＳ、ＩＦＩ５３、ＩＦＰ５３、ＧＡＭＭＡ−２、ＦＡＭ４６Ｃ、ＦＬＪ２０２０２、Ｈ３Ｆ３Ｂ、Ｈ３．３Ｂ、ＦＯＸＫ２、ＩＬＦ、ＩＬＦ１、ＩＬＦ−１、ＤＵＳＰ５、ＨＶＨ３、ＡＲＦ６、ＤＫＦＺｐ７６２Ｃ１８６、ＢＲＤ２、ＮＡＴ、ＲＮＦ３、ＦＳＲＧ１、ＲＩＮＧ３、ＤＳ６１１３Ｅ、ＫＩＡＡ９００１、ＲＯＲＡ、ＲＯＲ１、ＲＯＲ２、ＲＯＲ３、ＲＺＲＡ、ＮＲ１Ｆ１、ＤＫＦＺｐ７６２Ｃ１８６、ＤＮＡＪＢ１、ＳＵＩ１、ＣＸＣＲ４、ＨＭ８９、ＬＡＰ３、ＮＰＹＲ、ＷＨＩＭ、ＬＥＳＴＥＲ、ＮＰＹ３Ｒ、ＨＳＹ３ＲＲ、ＮＰＹＹ３Ｒ、Ｄ２Ｓ２０１Ｅ、ＧＲＩＮＬ１Ａ、ＣＴＳＢ、ＴＲＩＰ−Ｂｒ２、ＰＤＥ４Ｂ、ＤＰＤＥ４、ＰＤＥＩＶＢ、ＰＭＡＩＰ１、ＡＰＲ、ＮＯＸＡ、ＢＴＧ２、ＰＣ３、ＴＩＳ２１、ＡＳＡＨＬ、ＳＯＮ、ＳＵＩ１、Ａ１２１、ＩＳＯ１、ＨＥＲＰＵＤ１、ＳＵＰ、Ｍｉｆ１、ＫＩＡＡ００２５、ＤＵＳＰ２、ＰＡＣ１、ＰＡＣ−１、ＲＮＦ１３９、ＲＣＡ１、ＴＲＣ８、ＨＲＣＡ１、ＭＧＣ３１９６１、ＴＮＦＡＩＰ３、Ａ２０、ＴＮＦＡＩＰ２、ＡＲＳ２、ＨＮＲＰＬ、ｈｎＲＮＰ−Ｌ、Ｐ／ＯＫｃ１．１４、Ｃ２０ｏｒｆ６７、Ｃ２０ｏｒｆ１１１、ＨＳＰＣ２０７、ｄＪ１１８３Ｉ２１．１、ＺＮＦ３３１、ＲＩＴＡ、ＺＮＦ３６１、ＺＮＦ４６３、Ｃ２０ｏｒｆ６７、ＩＥＲ５、ＳＢＢＩ４８、ＳＵＩ１、ＪＵＮ、ＡＰ１、ＣＤ６９、ＴＯＢ１、Ｈ３Ｆ３Ｂ、Ｈ３．３Ｂ、ＦＯＬＲ１、ＴＮＦＡＩＰ３、ＴＣＦ８、ＢＺＰ、ＺＥＢ、ＺＥＢ１、ＡＲＥＢ６、ＺＦＨＥＰ、ＮＩＬ−２Ａ、ＺＦＨＸ１Ａ、ＮＩＬ−２−Ａ、ＤＵＳＰ１０、ＭＫＰ５、ＭＫＰ−５、ＧＧＴＬＡ４、ＭＧＣ５０５５０、ｄＪ８３１Ｃ２１．２、ＰＭＡＩＰ１、ＺＣ３ＨＡＶ１、ＺＡＰ、ＦＬＢ６４２１、ＺＣ３ＨＤＣ２、ＦＬＪ１３２８８、ＭＧＣ４８８９８、ＤＳＩＰＩ、ＤＩＰ、ＧＩＬＺ、ｈＤＩＰ、ＴＳＣ−２２Ｒ、ＭＣＬ１、ＴＭ、ＥＡＴ、ＭＣＬ１Ｌ、ＭＣＬ１Ｓ、ＭＧＣ１８３９、ＳＨ３ＴＣ１、ＦＬＪ２０３５６、ＣＩＡＳ１、ＦＣＵ、ＭＷＳ、ＦＣＡＳ、ＮＡＬＰ３、Ｃ１ｏｒｆ７、ＰＹＰＡＦ１、ＡＩＩ／ＡＶＰ、ＡＧＴＡＶＰＲＬ、ＳＬＣ１５Ａ３、ＰＨＴ２、ＰＴＲ３、ｈＰＴＲ３、ＰＴＤＳＲ、ＰＳＲ、ＰＴＤＳＲ１、ＫＩＡＡ０５８５、ＢＨＬＨＢ２、ＤＥＣ１、ＳＴＲＡ１３、Ｓｔｒａ１４、ＨＭＧＥ、ＫＩＡＡ００６３、ＮＲ４Ａ２、ＮＯＴ、ＰＮＲ１、ＨＺＦ−３、ＴＩＮＵＲ、ＮＲ４Ａ２、ＮＯＴ、ＰＮＲ１、ＨＺＦ−３、ＮＵＲＲ１、ＴＩＮＵＲ、ＰＴＳ、ＰＴＰＳ、ＨＥＡＢ、ＣＬＰ１、ｈＣｌｐ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＧＦ、ＣＲＤＧＦ、ＭＧＣ１３６４７、ＥＤＧ４、ＬＰＡ２、ＥＤＧ−４、ＬＰＡＲ２、ＣＲＥＭ、ＩＣＥＲ、ＭＧＣ１７８８１、ＭＧＣ４１８９３、ＣＤ８３、ＢＬ１１、ＨＢ１５、ＺＮＦ３９４、ＦＬＪ１２２９８、及びそれらの組合せから選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
メラノーマ発現ベクトルが、血小板、血小板糖タンパク質、血小板由来免疫メディエーター、ＭＨＣ／リボソームタンパク質、ＭＨＣクラスＩ分子、β２ミクログロブリン、リボソームタンパク質に関連する遺伝子、ヘモグロブリン遺伝子、又はそれらの組合せを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
メラノーマ発現ベクトルが、インターフェロン誘導性遺伝子、シグナル伝達分子、キナーゼ、ＲＡＳファミリーメンバー、又はそれらの組合せを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
１又は複数のメラノーマ発現ベクトルの発現量が、ｍＲＮＡの発現量、タンパク質の発現量、又はｍＲＮＡの発現量、タンパク質の発現量双方を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
メラノーマ発現ベクトルの発現量が、ｍＲＮＡの発現量を含み、ポリメラーゼ連鎖反応、リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応、ハイブリダイゼーション、プローブハイブリダイゼーション及び遺伝子発現アレイからなる群から選択される方法により定量化される、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
１又は複数のメラノーマ発現ベクトル中の１又は複数の多形を検出するステップを更に含む、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
ポリメラーゼ連鎖反応、ヘテロデュプレックス分析、一本鎖構造多形分析、リガーゼ連鎖反応、比較ゲノムハイブリダイゼーション、サザンブロット、ノーザンブロット、ウェスタンブロット、酵素免疫吸着アッセイ、蛍光共鳴エネルギー移動、及び配列決定からなる群から選択される少なくとも１種の技法を用いて発現量を検出する、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
試料の表現型を決定するためのコンピュータにより実行される方法であって、
複数の試料プローブ強度を得るステップ、
複数の試料プローブ強度に基づいてメラノーマ発現ベクトルの発現量を定量するステップ、及び
複数の試料プローブ強度と基準プローブ強度との間の線形相関係数を計算するステップ、及び
線形相関係数が閾値より大きい場合、試料の表現型として暫定的な表現型を受け入れるステップ
を含むコンピュータにより実行される方法。
【請求項１１】
試料の表現型を決定する方法を実施するためのコンピュータ実行可能な指令を含む、コンピュータ可読性媒体であって、前記方法が、
複数の試料プローブ強度を得るステップ、
複数の試料プローブ強度と基準プローブ強度との間の線形相関係数を計算するステップ、及び
線形相関係数が閾値より大きい場合、試料の表現型として暫定的な表現型を受け入れるステップ
を含む、コンピュータ可読性媒体。
【請求項１２】
マイクロアレイを用いた移植に関連した免疫抑制の対象に特異的な転写モジュールを作成する方法であって、
１又は複数の免疫抑制遺伝子を１又は複数のモジュールに分離するステップ、
各モジュールにおける１又は複数の免疫抑制発現ベクトルの発現量を決定するステップ、及び
免疫抑制発現ベクトルの各々を個別の識別子で表示するステップ
を含む方法。
【請求項１３】
１又は複数の免疫抑制発現ベクトルの発現量が、ｍＲＮＡの発現量、タンパク質の発現量、又はｍＲＮＡの発現量、タンパク質の発現量双方を含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
発現量が、ｍＲＮＡの発現量を含み、ポリメラーゼ連鎖反応、リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応、ハイブリダイゼーション、プローブハイブリダイゼーション及び遺伝子発現アレイからなる群から選択される方法により定量化される、請求項１２に記載の方法。
【請求項１５】
１又は複数の免疫抑制発現ベクトル中の１又は複数の多形を検出するステップを更に含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項１６】
ポリメラーゼ連鎖反応、ヘテロデュプレックス分析、一本鎖構造多形分析、リガーゼ連鎖反応、比較ゲノムハイブリダイゼーション、サザンブロット、ノーザンブロット、ウェスタンブロット、酵素免疫吸着アッセイ、蛍光共鳴エネルギー移動、及び配列決定からなる群から選択される少なくとも１種の技法を用いて発現量を定量する、請求項１２に記載の方法。
【請求項１７】
１又は複数の免疫抑制発現ベクトルが白血球に由来している、請求項１２に記載の方法。
【請求項１８】
試料の免疫抑制性向を決定するためのコンピュータにより実行される方法であって、
複数の試料プローブ強度を得るステップ、
試料プローブ強度に基づいて免疫抑制発現ベクトルの発現量を定量するステップ、及び
試料プローブ強度と基準プローブ強度との間の線形相関係数を計算するステップ、及び
線形相関係数が閾値より大きい場合、試料の表現型として暫定的な表現型を受け入れるステップ
を含むコンピュータにより実行される方法。
【請求項１９】
以下から選択される６種以上の遺伝子からなる群から選択される４種以上の遺伝子を基材上に配置してメラノーマのヒト対象に特異的な転写モジュールを作成するためのマイクロアレイ：
ＲＮＡ結合領域（ＲＮＰ１、ＲＲＭ）含有１；網膜芽細胞腫結合タンパク質６；ＧｒｐＥ様１（ミトコンドリア（大腸菌））；ｐｅｌｌｉｎｏホモログ１（ショウジョウバエ）；リングフィンガータンパク質１０；仮想タンパク質ＬＯＣ９０６３７；ポリコームホモログ１（ショウジョウバエ）のエンハンサー；全長インサートｃＤＮＡクローンＺＢ８１Ｂ１２；ＰＴＫ９プロテインチロシンキナーゼ９；細胞分裂周期関連４；ピリオドホモログ１（ショウジョウバエ）；ジンクフィンガータンパク質２３７；ＴＣＤＤ誘導性ポリ（ＡＤＰ−リボース）ポリメラーゼ；サイクリンＬ１；ＴＳＰＹ様２；グルタミン酸受容体（イオンチャンネル共役型、Ｎ−メチルＤ−アスパラギン酸様１Ａ型）；ＫＩＡＡ０８６３タンパク質；ｖ−ｍａｆ筋腱膜性線維肉腫癌遺伝子のホモログＦ（鳥類）；ＰＲＯ０１４９タンパク質；タンパク質チロシンホスファターゼＩＶＡ型、メンバー１；セリン／トレオニンキナーゼ受容体関連タンパク質；多プリン要素結合タンパク質Ｂ；ホスホジエステラーゼ４Ｂ、ｃＡＭＰ特異的（ホスホジエステラーゼＥ４ｄｕｎｃｅホモログ、ショウジョウバエ）；エストロゲン受容体結合タンパク質；ストレス７０タンパク質シャペロン、ミクロソーム関連、６０ｋＤａ；ＢＴＧファミリーのメンバー３；トランスフェリン受容体（ｐ９０、ＣＤ７１）；仮想タンパク質ＦＬＪ２０４３６；ホスホジエステラーゼ４Ｄ、ｃＡＭＰ特異的（ホスホジエステラーゼＥ３ｄｕｎｃｅホモログ、ショウジョウバエ）；ＫＩＡＡ００６３遺伝子産物；ｔ−ＳＮＡＲＥとの相互作用による小胞輸送ホモログ１Ａ（酵母）；ＬＯＣ４４０３０９；ＳＮＦ１様キナーゼ；二重特異性ホスファターゼ８；ＲＮＡ結合領域（ＲＮＰ１、ＲＲＭ）含有２；ダイニン軽鎖２；膜結合性ＤＮＡ結合タンパク質；セリン／トレオニンキナーゼ１７ｂ（アポトーシス誘発性）；腫瘍壊死因子α誘導タンパク質３；不均一核内リボ核タンパク質Ｃ（Ｃ１／Ｃ２）；ホスホジエステラーゼ４Ｄ、ｃＡＭＰ特異的（ホスホジエステラーゼＥ３ｄｕｎｃｅホモログ、ショウジョウバエ）；ｋｅｌｃｈ様１５（ショウジョウバエ）；ＫＩＡＡ０８６３タンパク質；活性化転写因子４（ｔａｘ応答性エンハンサー要素Ｂ６７）；ビリン２（エズリン）；核内小リボ核タンパク質のポリペプチドＡ’；ジンクフィンガータンパク質１９８；ｃＡＭＰ応答性要素モジュレーター；スプライシング因子３ａ、サブユニット１、１２０ｋＤａ；ＣＤ８３抗原（活性化Ｂリンパ球、免疫グロブリンスーパーファミリー）；ＤｎａＪ（Ｈｓｐ４０）ホモログ、サブファミリーＢ、メンバー６；染色体２０のオープンリーディングフレーム１１１；エタノールアミンキナーゼ１；染色体４のオープンリーディングフレーム１５；リングフィンガータンパク質１３９；リボヌクレアーゼＨ１；ｊｕｎ  Ｄ癌原遺伝子；Ｓ期キナーゼ関連タンパク質１Ａ（ｐ１９Ａ）；メチルＣｐＧ結合タンパク質２（レット症候群）；不均一核内リボ核タンパク質Ｈ３（２Ｈ９）；仮想タンパク質ＤＫＦＺｐ５８６Ｉ１４２０；ヌクレオソームアセンブリータンパク質１様５；Ｒａｓ−ＧＴＰアーゼ活性化タンパク質ＳＨ３ドメイン結合性タンパク質２；ジンクフィンガータンパク質３３１；カリン��；シュバッハマンボディアンダイアモンド症候群；ステロールＣ５デサチュラーゼ（ＥＲＧ３δ−５−デサチュラーゼホモログ、真菌）様；ホスファチジルイノシトールグリカン、クラスＡ（発作性夜間血色素尿症）；イソペンテニル二リン酸δイソメラーゼ；染色体２０のオープンリーディングフレーム６７；ｖ−ｍａｆ筋腱膜性線維肉腫癌遺伝子のホモログＫ（鳥類）；ウィスコットアルドリッチ症候群タンパク質相互作用性タンパク質；ｋｅｌｃｈ様７（ショウジョウバエ）；腫瘍壊死因子α誘導タンパク質３；仮想ＬＯＣ３８８７９６；アルマジロリピート含有８；膜結合性ＤＮＡ結合タンパク質；ジンクフィンガータンパク質３３１；ｃＡＭＰ応答性要素モジュレーター；推定翻訳開始因子；ＤｎａＪ（Ｈｓｐ４０）ホモログ、サブファミリーＢ、メンバー６；核内受容体サブファミリー４、グループＡ、メンバー２；円柱腫（ターバン頭布腫症候群）；核内受容体サブファミリー４、グループＡ、メンバー２；６−ピルボイルテトラヒドロプテリンシンターゼ；Ｓ期キナーゼアクチベーター；活性化ＲＮＡポリメラーゼIIの転写補因子４（活性化ＲＮＡポリメラーゼIIの転写コアクチベーターｐ１５に関連（正の補因子４）（ＰＣ４）（ｐ１４））；仮想ＬＯＣ３８８７９６；接合媒介／調節タンパク質；仮想遺伝子ＣＧ０１８；推定翻訳開始因子；二重特異性ホスファターゼ５；スプリット１のトランスデューシン様エンハンサー（ショウジョウバエのＥ（ｓｐ１）ホモログ）；ミトコンドリア運搬体タンパク質；タンパク質チロシンホスファターゼＩＶＡ型、メンバー１；ジンクフィンガータンパク質３３１；ＣＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：３０３３２３１６の部分ｃｄｓ；インターロイキンエンハンサー結合因子３、９０ｋＤａ；ホモサピエンス、クローンＩＭＡＧＥ：４７５３７１４、ｍＲＮＡ；ＳＯＮ  ＤＮＡ結合タンパク質；ＡＰ１γサブユニット結合タンパク質１；ジンクフィンガータンパク質３９４；真核性翻訳開始因子５；活性化転写因子７相互作用性タンパク質２；仮想タンパク質ＬＯＣ２８５８３１；アクチン関連タンパク質２／３複合体のサブユニット５様；仮想タンパク質ＬＯＣ１４４４３８；推定翻訳開始因子；Ｈ３ヒストン、ファミリー３Ｂ（Ｈ３．３Ｂ）；ｋｅｌｃｈリピート及びＢＴＢ（ＰＯＺ）ドメイン含有２；ＣＤＮＡ  ＦＬＪ４０７２５  ｆｉｓのクローンＴＫＩＤＮ１０００００１（ミトコンドリア内膜２３のトランスロカーゼに酷似）；円柱腫（ターバン頭布腫症候群）；ホスホジエステラーゼ４Ｄ、ｃＡＭＰ特異的（ホスホジエステラーゼＥ３ｄｕｎｃｅホモログ、ショウジョウバエ）；熱ショック７０ｋＤａタンパク質１４；ＨＳＰＣ１２８タンパク質；ＲＮＡ（グアニン−７−）メチルトランスフェラーゼ；イズロン酸２−スルファターゼ（ハンター症候群）；仮想タンパク質ＭＧＣ２９８１４；カゼインキナーゼ１（ε）；プロテインホスファターゼ１の調節（阻害）サブユニット１６Ｂ；イソペンテニル二リン酸δイソメラーゼ；ＲＡＤ２３ホモログＢ（Ｓ．セレビシエ）；ホスホジエステラーゼ４Ｄ、ｃＡＭＰ特異的（ホスホジエステラーゼＥ３ｄｕｎｃｅホモログ、ショウジョウバエ）；ジンクフィンガータンパク質２９５；仮想タンパク質ＦＬＪ１３１４９；及���ＢＴＧファミリー、メンバー３、並びにそれらの組合せ。
【請求項２０】
トランスクリプトームベクトルデータを表示する方法であって、
モジュール各々に対して遺伝子発現ベクトル総計値を画像表示するために、１又は複数の遺伝子を１又は複数のモジュールに分離するステップ、及び
各モジュールにおける遺伝子発現ベクトル総計値の過剰発現、過少発現又は等価発現について、遺伝子発現ベクトル総計値を表示するステップ
を含む方法。
【請求項２１】
過剰発現が第１の識別子で特定され、過少発現が第２の識別子で特定される、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
過剰発現が第１の識別子で特定され、過少発現が第２の識別子で特定されており、第１の識別子が第１の色であり、第２の識別子が第２の色であって、第１及び第２の識別子を重ね合わせて混合色を得る、請求項２０に記載の方法。