【誤訳訂正書】
【提出日】平成23年10月17日(2011.10.17)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】特許請求の範囲
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
親バシルス種（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）ＴＳ‐２３アルファ‐アミラーゼの変異体であって、前記変異体が配列番号４に対して９０％の同一性を有し、前記変異体が、配列番号１に存在する下記ａ）ｂ）、又はｃ）の少なくとも二つを含み、及び任意に下記ｄ）からｋ）いずれかの一以上を含むことを特徴とする変異体。
ａ）Ｃ末端の欠失、
ｂ）Ｒ１８０及び／又はＳ１８１の欠失、
ｃ）Ｍ２０１Ｌ、
ｄ）Ｑ８７からＥ、Ｒへ、
ｅ）Ｎ２２５からＥ、Ｒへ、
ｆ）Ｎ２７２からＥ又はＲへ、
ｇ）Ｎ２８２からＥ又はＲへ、
ｈ）Ｔ１８２の欠失、
ｉ）Ｇ１８３の欠失、
ｊ）Ｑ９８Ｒ，Ｍ２０１Ｌ，Ｓ２４３Ｑ、Ｒ３０９Ａ、Ｑ３２０Ｒ、Ｑ３５９Ｅ、及びＫ４４４Ｅ、又は
ｋ）Ｓ２４３Ｑ、Ａ、Ｅ、Ｄ
【請求項２】
変異体が、配列番号４に対して少なくとも約９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号４の１８０‐１８１位にてΔＲＳ欠失及び配列番号４のＭ２０１Ｌ、及び少なくとも次のひとつ、即ち
ａ）Ｑ８７からＥ、Ｒへ、
ｂ）Ｎ２２５からＥ、Ｒへ、
ｃ）Ｎ２７２からＥ又はＲへ、
ｄ）Ｎ２８２からＥ又はＲへ、
ｅ）Ｔ１８２の欠失、
ｆ）Ｇ１８３の欠失、
ｇ）Ｑ９８Ｒ，Ｍ２０１Ｌ，Ｓ２４３Ｑ、Ｒ３０９Ａ、Ｑ３２０Ｒ、Ｑ３５９Ｅ、及びＫ４４４Ｅ、又は
ｈ）Ｓ２４３Ｑ、Ａ、Ｅ、Ｄ
を含むことを特徴とする、請求項１に記載の変異体。
【請求項３】
前記変異体が配列番号４に対して少なくとも約９５％の配列同一性を有することを特徴とする、請求項１に記載の変異体。
【請求項４】
前記変異体が配列番号４に対して少なくとも約９８％の配列同一性を有することを特徴とする、請求項３に記載の変異体。
【請求項５】
前記変異体が次の特徴、即ち
ａ）酵素活性についてカルシウムイオンの必要性が６０ｐｐｍ未満であり、
ｂ）親バシルス種（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）ＴＳ‐２３アルファ‐アミラーゼに比較して改善される酸化安定性があり、及び／又は
ｃ）親バシルス種（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）ＴＳ‐２３アルファ‐アミラーゼに比較して改善される熱安定性があるという
特徴を有する、請求項１に記載の変異体。
【請求項６】
前記Ｃ末端の欠失が１アミノ酸から１００アミノ酸であることを特徴とする、請求項１に記載の変異体。
【請求項７】
親バシルス種（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）ＴＳ‐２３アルファ‐アミラーゼの変異体をコードする単離される核酸であって、前記変異体が少なくとも下記ａ）ｂ）、又はｃ）を含み及び任意に下記ｄ）からｋ）いずれかの一以上を含み、ａ）からｋ）は
ａ）Ｃ末端の欠失、
ｂ）Ｒ１８０及び／又はＳ１８１の欠失、
ｃ）Ｍ２０１Ｌ、
ｄ）Ｑ８７からＥ、Ｒへ、
ｅ）Ｎ２２５からＥ、Ｒへ、
ｆ）Ｎ２７２からＥ又はＲへ、
ｇ）Ｎ２８２からＥ又はＲへ、
ｈ）Ｔ１８２の欠失、
ｉ）Ｇ１８３の欠失、
ｊ）Ｑ９８Ｒ，Ｍ２０１Ｌ，Ｓ２４３Ｑ、Ｒ３０９Ａ、Ｑ３２０Ｒ、Ｑ３５９Ｅ、及びＫ４４４Ｅ、
ｋ）Ｓ２４３Ｑ、Ａ、Ｅ、Ｄ
であり、配列番号１に相当し、配列番号１に対して少なくとも約９０％配列同一性を有し、前記変異体がアルファ‐アミラーゼ活性を有することを特徴とする核酸。
【請求項８】
請求項１から６のいずれかの請求項に記載の変異体をコードする核酸配列を含むことを特徴とする単離される核酸。
【請求項９】
前記核酸が前記変異体をコードする核酸配列からなることを特徴とする、請求項８に記載の単離される核酸。
【請求項１０】
請求項７又は８のいずれかの請求項に記載の核酸を含むことを特徴とするベクター。
【請求項１１】
請求項７又は８のいずれかの請求項に記載の核酸を含むことを特徴とする単離される宿主細胞。
【請求項１２】
単離される宿主細胞が請求項１１に記載のベクターを含み、前記宿主細胞が原核細胞又は真核細胞であることを特徴とする宿主細胞。
【請求項１３】
前記単離される宿主細胞が細菌類又は菌類であることを特徴とする、請求項１２に記載の単離される宿主細胞。
【請求項１４】
前記細菌類がバシルス ズブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）、バシルス リチェニフォルミス（Ｂ． ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ）、バシルス レンツス（Ｂ． ｌｅｎｔｕｓ）、 バシルス ブレビス（Ｂ． ｂｒｅｖｉｓ）、バシルス ステアロテルモフィルス（Ｂ． ｓｔｅａｒｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）、バシルス アルカロフィリス（Ｂ． ａｌｋａｌｏｐｈｉｌｕｓ）、バシルス アミロリケファシエンス（Ｂ． ａｍｙｌｏｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓ）、バシルス コアグランス（Ｂ． ｃｏａｇｕｌａｎｓ）、バシルス シルクランス（Ｂ． ｃｉｒｃｕｌａｎｓ）、バシルス ランツス（Ｂ． ｌａｕｔｕｓ）、 バシルス ツリンギエンシス（Ｂ． ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）ストレプトミセス リビダンス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｌｉｖｉｄａｎｓ）及びストレプトミセス ムリナス（Ｓ． ｍｕｒｉｎｕｓ）からなる群から選択されるグラム陽性菌又はグラム陰性菌であり、前記グラム陰性菌は大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）及びシュードモナス種（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｓｐ．）であることを特徴とする、請求項１３に記載の単離される宿主細胞。
【請求項１５】
請求項１から６のいずれかの請求項に記載の変異体を含むことを特徴とする洗剤添加剤。
【請求項１６】
さらに、セルラーゼ、プロテアーゼ、アミノペプチダーゼ、アミラーゼ、カルボヒドラーゼ、カルボキシペプチダーゼ、カタラーゼ、キチナーゼ、クチナーゼ、シクロデキストリン グルカノトランスフェラーゼ、デオキシリボヌクレアーゼ、エステラーゼ、アルファ‐ガラクトシダーゼ、ベータ‐ガラクトシダーゼ、グルコアミラーゼ、アルファ‐グルコシダーゼ、ベータ‐グルコシダーゼ、ハロペルオキシダーゼ、インベルターゼ、ラッカーゼ、リパーゼ、マンノシダーゼ、オキシダーゼ、ペクチン分解酵素、ペプチドグルタミナーゼ、ペルオキシダーゼ、フィターゼ、ポリフェノールオキシダーゼ、デンプン分解酵素、リボヌクレアーゼ、トランスグルタミナーゼ、キシラナーゼ、プルラナーゼ、イソアミラーゼ、カラギナーゼ、及びそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される酵素の一以上含むことを特徴とする請求項１５に記載の洗剤添加剤。
【請求項１７】
非粉塵化（ｄｕｓｔｉｎｇ）粒状、マイクロ粒状、被安定化液、又は被保護酵素の形態である請求項１６記載の洗剤添加剤。
【請求項１８】
請求項１６に記載の洗剤添加剤を含むことを特徴とする洗剤組成物。
【請求項１９】
界面活性剤及び請求項１から６のいずれかの請求項に記載の変異体を含むことを特徴とする洗剤組成物。
【請求項２０】
前記洗剤組成物が洗濯洗剤又は食器洗剤であることを特徴とする、請求項１９に記載の洗剤組成物。
【請求項２１】
さらに、セルラーゼ、プロテアーゼ、アミノペプチダーゼ、アミラーゼ、カルボヒドラーゼ、カルボキシペプチダーゼ、カタラーゼ、キチナーゼ、クチナーゼ、シクロデキストリン グルカノトランスフェラーゼ、デオキシリボヌクレアーゼ、エステラーゼ、アルファ‐ガラクトシダーゼ、ベータ‐ガラクトシダーゼ、グルコアミラーゼ、アルファ‐グルコシダーゼ、ベータ‐グルコシダーゼ、ハロペルオキシダーゼ、インベルターゼ、ラッカーゼ、リパーゼ、マンノシダーゼ、オキシダーゼ、ペクチン分解酵素、ペプチドグルタミナーゼ、ペルオキシダーゼ、フィターゼ、ポリフェノールオキシダーゼ、デンプン分解酵素、リボヌクレアーゼ、トランスグルタミナーゼ、キシラナーゼ、プルラナーゼ、イソアミラーゼ、カラギナーゼ、及びそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される酵素の一以上を含むことを特徴とする請求項２０に記載の洗剤組成物。
【請求項２２】
洗濯洗剤組成物が、請求項２１に記載の洗剤組成物を含むことを特徴とし、さらに界面活性剤、洗剤ビルダー、錯化剤、ポリマー、漂白システム、安定剤、泡増進剤、石鹸泡抑制剤、抗腐食剤、泥懸濁剤、抗泥再堆積剤、染料、抗菌剤、ハイドロトープ、蛍光増白剤、繊維コンディショナー、及び香料の一以上を含むことを特徴とする洗濯洗剤組成物。
【請求項２３】
バイオフィルム加水分解組成物が溶液又はゲル中に請求項１から６いずれかの請求項に記載の変異体を含むことを特徴とし、さらに任意にセルラーゼ、ヘミセルラーゼ、キシラナーゼ、リパーゼ、プロテアーゼ、ペクチナーゼ、抗菌剤、又はそれらの任意の組み合わせを含むことを特徴とするバイオフィルム加水分解組成物。
【請求項２４】
バイオフィルムを処理するために十分な時間請求項２３に記載の組成物を投与することを含むことを特徴とするバイオフィルムを加水分解する方法。
【請求項２５】
溶液又はゲル中に請求項１から６のいずれかの請求項に記載の変異体を含むことを特徴とする焼成組成物。
【請求項２６】
請求項２５に記載の焼成組成物を投与することを含むことを特徴とする焼成方法。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１４
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１４】
ある態様は、親バシルス種（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）ＴＳ‐２３アルファ‐アミラーゼの変異体であって、前記変異体が配列番号４に対して９０％の同一性を有し、前記変異体が、配列番号１に存在する下記ａ）ｂ）、又はｃ）の少なくとも二つ含み、及び任意に下記ｄ）からｋ）いずれかの一以上を含むことを特徴とする変異体である。
ａ）Ｃ末端の欠失、
ｂ）Ｒ１８０及び／又はＳ１８１の欠失、
ｃ）Ｍ２０１Ｌ、
ｄ）Ｑ８７からＥ、Ｒへ、
ｅ）Ｎ２２５からＥ、Ｒへ、
ｆ）Ｎ２７２からＥ又はＲへ、
ｇ）Ｎ２８２からＥ又はＲへ、
ｈ）Ｔ１８２の欠失、
ｉ）Ｇ１８３の欠失、
ｊ）Ｑ９８Ｒ，Ｍ２０１Ｌ，Ｓ２４３Ｑ、Ｒ３０９Ａ、Ｑ３２０Ｒ、Ｑ３５９Ｅ、及びＫ４４４Ｅ、又は
ｋ）Ｓ２４３Ｑ、Ａ、Ｅ、Ｄ
【誤訳訂正３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１５】
あるいは、変異体が、配列番号４に対して少なくとも約９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号４の１８０‐１８１位にてΔＲＳ欠失及び配列番号４のＭ２０１Ｌ、及び少なくとも次のひとつ、即ち
ａ）Ｑ８７からＥ、Ｒへ、
ｂ）Ｎ２２５からＥ、Ｒへ、
ｃ）Ｎ２７２からＥ又はＲへ、
ｄ）Ｎ２８２からＥ又はＲへ、
ｅ）Ｔ１８２の欠失、
ｆ）Ｇ１８３の欠失、
ｇ）Ｑ９８Ｒ，Ｍ２０１Ｌ，Ｓ２４３Ｑ、Ｒ３０９Ａ、Ｑ３２０Ｒ、Ｑ３５９Ｅ、及びＫ４４４Ｅ、又は
ｈ）Ｓ２４３Ｑ、Ａ、Ｅ、Ｄ
を含むことを特徴とする変異体である。
【誤訳訂正４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１６】
さらに変異体が配列番号４に対して少なくとも約９５％、９８％又は９９％の配列同一性を有し、本明細書に記載の任意の欠失、置換又は挿入を含む。
【誤訳訂正５】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１９
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１９】
別の態様において、上記変異体をコードする核酸を含む。親バシルス種（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．）ＴＳ‐２３アルファ‐アミラーゼの変異体をコードするそのような単離される核酸であって、前記変異体が少なくとも下記ａ）ｂ）、又はｃ）を含み及び任意に下記ｄ）からｋ）いずれかの一以上を含み、ａ）からｋ）は
ａ）Ｃ末端の欠失、
ｂ）Ｒ１８０及び／又はＳ１８１の欠失、
ｃ）Ｍ２０１Ｌ、
ｄ）Ｑ８７からＥ、Ｒへ、
ｅ）Ｎ２２５からＥ、Ｒへ、
ｆ）Ｎ２７２からＥ又はＲへ、
ｇ）Ｎ２８２からＥ又はＲへ、
ｈ）Ｔ１８２の欠失、
ｉ）Ｇ１８３の欠失、
ｊ）Ｑ９８Ｒ，Ｍ２０１Ｌ，Ｓ２４３Ｑ、Ｒ３０９Ａ、Ｑ３２０Ｒ、Ｑ３５９Ｅ、及びＫ４４４Ｅ、
ｋ）Ｓ２４３Ｑ、Ａ、Ｅ、Ｄ
であり、配列番号１に相当し、配列番号１に対して少なくとも約９０％配列同一性を有し、前記変異体がアルファ‐アミラーゼ活性を有することを特徴とする核酸を意図する。
【誤訳訂正６】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００２３
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００２３】
別の態様は溶液又はゲル中に前述及び本明細書に記載の任意の変異体を含み、さらに任意にセルラーゼ、ヘミセルラーゼ、キシラナーゼ、リパーゼ、プロテアーゼ、ペクチナーゼ、抗菌剤、又はそれらの任意の組み合わせを含むバイオフィルム加水分解組成物に関する。これらのバイオフィルム加水分解組成物は、バイオフィルムを処理するために十分な時間請求項２４に記載の組成物を投与することを含むバイオフィルムを加水分解する方法に用いることができる。
【誤訳訂正７】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００６３
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００６３】
「相同体」は、対象のアミノ酸配列及び対象のヌクレオチド配列とある度合いの同一性を有する物を意味する。相同配列は対象配列に対して少なくとも約７５％、８０％、８５％、又は９０％同一のアミノ酸配列、又は少なくとも約９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％同一のアミノ酸配列を含むと考えられる。一般的に、相同性は対象アミノ酸配列の同様の活性部位を含む。整列した時別の配列に対して特定のパーセント（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、又は９９％）の配列同一性を有するポリヌクレオチド又はポリペプチドは、塩基又はアミノ酸残基の割合が二つの配列を比較して同じであることを意味する。このアライメント及びパーセント相同性又は同一性は周知の任意の適切なソフトウエアプログラムを用いて決定できる。例えばCURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY (F. M. Ausubel他、(eds) 1987, Supplement 30, section 7.7.18)に記載される。そのようなプログラムはGCG Pileup program, FASTA (Pearson 他 (1988) Proc. Natl, Acad. Sci USA 85:2444-2448)、及びBLAST (BLAST Manual, Altschul 他, Natl Cent. Biotechnol. Inf., Natl Lib. Med. (NCIB NLM NIH), Bethesda, Md.及びAltschul他, (1997) NAR 25:3389-3402)を含んでよい。他のアライメントプログラムはALIGN Plus (Scientific and Educational Software, PA)であり、デフォルトパラメータを用いる。使用に適した別の配列ソフトウエアプログラムはthe Sequence Software Package Version 6.0(Genetics Computer Group, University of Wisconsin, Madison, WI)で入手できるTFASTA Data Searching Programである。
【誤訳訂正８】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１２０
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１２０】
１．５ 相同性（同一性）
整列後に別の配列に対して特定のパーセント（例えば、８０％、８３％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％）の配列同一性を有するポリヌクレオチド又はポリペプチドは塩基又はアミノ酸残基の割合が二つの配列を比較して同じである。このアライメント及びパーセント相同性又は同一性は周知の任意の適切なソフトウエアプログラムを用いて決定できる。例えばCURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY (F. M. Ausubel他、(eds) 1987, Supplement 30, section 7.7.18)に記載される。好ましいプログラムはthe Vector NTI Advance（商標） 9.0 (Invitrogen Corp. Carlsbad, CA)、GCG Pileup program, FASTA (Pearson 他 (1988) Proc. Natl, Acad. Sci USA 85:2444-2448)、及びBLAST (BLAST Manual, Altschul 他, Natl Cent. Biotechnol. Inf., Natl Lib. Med. (NCIB NLM NIH), Bethesda, Md.及びAltschul他, (1997) Nuc．Acid Res． 25:3389-3402)を含む。他の好ましいアライメントプログラムはALIGN Plus (Scientific and Educational Software, PA)であり、好ましくはデフォルトパラメータを用いる。使用に適した別の配列ソフトウエアプログラムはthe Sequence Software Package Version 6.0(Genetics Computer Group, University of Wisconsin, Madison, WI)で入手できるTFASTA Data Searching Programである。
【誤訳訂正９】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１２１
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１２１】
相同性は第二から第一配列の導出を示す二つの配列間の同一性割合として決定されてよい。相同性はＧＣＧプログラムパッケージ（上述）が提供するＧＡＰのような周知のコンピュータープログラム手段により適切に決定されてよい。つまり、Gap GCG v8は同一性用デフォルトスコアリングマトリックス及び次のデフォルトパラメータを用いてよい。それは、核酸配列比較のためにそれぞれ５．０のＧＡＰクリエーションペナルティー及び０．３のエクステンションペナルティー及びタンパク質配列比較のためにそれぞれ３．０のＧＡＰクリエーションペナルティー及び０．１のエクステンションペナルティーである。アライメントを作り、同一性を計算するためにＧＡＰはNeedleman and Wunsch, J.Mol. Biol. 48:443-453 (1970)の方法を用いる。