【誤訳訂正書】
【提出日】平成23年8月22日(2011.8.22)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】特許請求の範囲
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験体における末梢動脈疾患（ＰＡＤ）状態を特徴付けするための方法であって：
ａ．該被験体由来のα１β糖タンパク質を測定する工程；および、
ｂ．該測定値とＰＡＤ状態とを相関させる工程と、
を包含する方法。
【請求項２】
前記工程（ａ）が、運動前に被験体から得たサンプルで行われる、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
アルブミン、フェチュイン、アルブミンの三電荷二量体、トランスサイレチン、およびα１アンチトリプシンの二量体からなる群より選択される第二のバイオマーカーを測定する工程、および、該測定値をＰＡＤ状態と相関させる工程をさらに包含する、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
アルブミン、フェチュイン、アルブミンの三電荷二量体、トランスサイレチン、およびα１アンチトリプシンの二量体の各々を測定する工程をさらに包含する、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記α１β糖タンパク質が、ＳＥＬＤＩプローブの吸着性の表面上に該α１β糖タンパク質を捕獲すること、およびレーザー脱離イオン化質量分析によって該捕獲されたα１β糖タンパク質を検出することによって測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記α１β糖タンパク質が、イムノアッセイによって測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記サンプルが血漿である、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
ＰＡＤ状態が、非ＰＡＤ、ＰＡＤおよび長期跛行性のＰＡＤから選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
ＰＡＤ状態が、非ＰＡＤおよびＰＡＤから選択される、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
ＰＡＤ状態が、非ＰＡＤおよび長期跛行性のＰＡＤから選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
ＰＡＤ状態が、ＰＡＤおよび長期跛行性のＰＡＤから選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
前記吸着剤がカチオン交換吸着剤である、請求項５に記載の方法。
【請求項１３】
請求項１に記載の方法を含む、被験体のＰＡＤ状態を特徴付けするための方法であって、以下の条件：被験体がタバコを吸う、被験体が高脂血症を有する、被験体が高血圧を有する、および被験体の家族が末梢動脈疾患の病歴を有する、
から選択される少なくとも１つの条件が該被験体にあてはまる、方法。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０００５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０００５】
本発明は、ＰＡＤを有する被験体において、詳細にはＰＡＤ対正常な被験体において示差的に存在するポリペプチドベースのバイオマーカーを提供する。さらに本発明は、被験体における疾患を特徴付けするためにポリペプチドベースのバイオマーカーを用いる方法を提供する。
【誤訳訂正３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０００６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０００６】
従って、１局面では、本発明は、被験体におけるＰＡＤ状態を特徴付けするための方法であって：（ａ）この被験体由来の生物学的サンプル中における少なくとも１つのバイオマーカーを測定する工程であって、この少なくとも１つのバイオマーカーが、本明細書に記載の表１Ａ、１Ｂ、２、３、４、５、６および１８のバイオマーカーからなる群より選択される工程と；（ｂ）この測定値とＰＡＤ状態とを相関させる工程とを包含する方法、を提供する。１実施形態では、このサンプルは血漿である。好ましい実施形態では、このバイオマーカーは、表１Ａまたは１Ｂから選択される。さらに好ましい実施形態では、このバイオマーカーは、表１Ａから選択される。別の好ましい実施形態では、このバイオマーカーは、アルブミン、フェチュイン、アルブミンの三電荷二量体、トランスサイレチン、α１Ｂ糖タンパク質およびα１アンチトリプシンの二量体からなる群より選択される。関連の実施形態では、アルブミン、フェチュイン、アルブミンの三電荷二量体、トランスサイレチン、α１Ｂ糖タンパク質およびα１アンチトリプシンの群から選択されるバイオマーカーの各々を測定する。さらに別の関連の実施形態では、このバイオマーカーは、本明細書に記載される表１８に列挙されるバイオマーカーからなる群より選択される。
【誤訳訂正４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１１
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１１】
別の実施形態では、本発明は、被験体におけるＰＡＤ状態を特徴付けするための方法であって、表４、５または６由来のバイオマーカーを測定する工程を包含し、このバイオマーカーが、被験体由来の少なくとも２つのサンプルにおいて測定され、そのサンプル１つが運動の直後または２時間後の被験体から採取される、方法を提供する。
【誤訳訂正５】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００２７
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００２７】
表１〜３は、有意な強度を有するピークが観察され得るバイオマーカーおよび条件を集めており、ここでこの有意差は、３つの患者群（すなわち、正常、長期跛行ＰＡＤ、およびＰＡＤ）の間で、特定の時点でのピーク相違のクラスカル−ワリス分析によって決定される。詳細には、表１Ａには、運動前（ベースライン）時点でＰＡＤ状態を特徴付けするために用いられ得る、ｐ値＜０．０１であるバイオマーカーを集めている。同様に表１Ｂは、運動前（ベースライン）時点でＰＡＤ状態と相関され得る、ｐ値＜０．０５未満であるバイオマーカーを集めている。表２は、トレッドミル運動を完了した直後の患者から採取したサンプルを用いて、ＰＡＤ状態を特徴付けするために用いられ得る、好ましいｐ値＜０．０１であるバイオマーカー、およびｐ値＜０．０５未満であるバイオマーカーを集めている。表３は、トレッドミル運動を完了したほぼ２時間後の患者から採取したサンプルを用いて、ＰＡＤ状態を特徴付けするために用いられ得る、好ましいｐ値＜０．０１を有するバイオマーカー、およびｐ値＜０．０５であるバイオマーカーを集めている。
【誤訳訂正６】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００３５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００３５】
【表６】
2008501688.tif 000001
選択されたバイオマーカーについて、各々の被験体について測定されたピーク強度は図１にグラフ表示される。図１に示されるとおり、試験被験体においてＰＡＤ状態を特徴付けするためには、患者の群間のバイオマーカーの相対的な濃度、または記載された運動レジメンの経過中の変化のいずれを臨床家によって用いてもよい。
【誤訳訂正７】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００３８
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００３８】
特定のピークについて観察された強度の変化は、患者でのＰＡＤ状態を特徴付けするために用いられ得る。例えば、画分４では、ＣＭ１０アレイを用いて、約６６ｋＤのアルブミンバイオマーカーは、正常な患者で運動後に増大することが観察される。対照的に、ＬＣ患者では、そして特にＰＡＤ患者では、運動後のこの６６ｋＤのバイオマーカーの強度の増大は、実質的に減少される。同様に、画分４における約４２ｋＤのタンパク質に相当するピークの強度は、トレッドミル運動後の正常患者およびＬＣ患者において減少するが、ＰＡＤ被験体では有意に変化しないことが観察される。他方では、１３．９ｋＤのトランスサイレチンバイオマーカーと関連したピーク強度は、運動の関数として実質的に変化しないが、運動にかかわらず正常な被験体およびＰＡＤ被験体に対してＬＣ被験体では実質的に増大され、このことはこのタンパク質の機能的能力における潜在的な役割を反映している。
【誤訳訂正８】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００４３
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００４３】
（ＩＩＩ．ＰＡＤの状態を特徴付けするためのバイオマーカーの検出）
本発明のバイオマーカーは、任意の適切な方法によって検出され得る。この目的を達成するために使用され得る検出パラダイムとしては、視覚的方法、電気化学的方法（ボルタンメトリおよび電流測定技術）、原子間力顕微鏡および高周波方法、例えば、多極共鳴分光法などが挙げられる。共焦点顕微鏡および非共焦点顕微鏡の両方の顕微鏡に加えて、例示的な光学的方法は、蛍光、発光、化学発光、吸光度、反射率、透過率および複屈折、または屈折率の検出である（例えば、表面プラスモン共鳴、偏光解析法、共振ミラー方法、格子結合器導波管法または干渉法）。
【誤訳訂正９】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００６７
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００６７】
患者においてＰＡＤ状態を特徴付けする目的のために、本明細書において有用であると特定されるバイオマーカーとしては、表に列挙される特定のピークに加えて、対応するタンパク質のアミノ酸改変体および翻訳後改変型などが挙げられる。
【誤訳訂正１０】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００７４
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００７４】
（Ｃ．被験体管理）
ＰＡＤ状態を特徴付けする方法の特定の実施形態では、この方法はこの状況に基づいて被験体処置を管理する工程をさらに包含する。このような管理としては、ＰＡＤ状態を決定するための医師の行動または臨床的な結果などが挙げられる。例えば、医師がＰＡＤの診断をすれば、処置の特定のプログラムが処方され得る。処置の適切なプログラムとしては、限定はしないが、監督された運動プログラム；血圧、糖摂取および／または脂質レベルの管理；任意の必要なカウンセリングおよびニコチン代替を含む喫煙の休止；ならびにアスピリン（ジピリダモールの有無と）、クロピドグレル、シロスタゾール、および／またはペントキシフィリン等の投与を含む薬物治療などが挙げられ得る。あるいは、ＰＡＤの診断の後に、ある患者がＰＡＤの特異的な形態に罹患しているか否か、またはこの患者が冠動脈疾患のような関連の疾患に罹患しているか否かを決定するためのさらなる試験を続けてもよい。また、診断試験がＰＡＤ状態に対して決定的でない結果をもたらすならば、さらなる試験が要求され得る。
【誤訳訂正１１】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００７５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００７５】
（Ｖ．ＰＡＤ状態を特徴付けするための分類アルゴリズムの作成）
いくつかの実施形態では、「既知のサンプル（ｋｎｏｗｎ  ｓａｍｐｌｅ）」のようなサンプルを用いて生成されるスペクトル（例えば、質量スペクトルまたは飛行時間スペクトル）に由来するデータを次に用いて、分類モデルを「訓練、トレーニング（ｔｒａｉｎ）」してもよい。「既知のサンプル」とは、予め分類されているサンプルである。スペクトル由来であって、分類モデルを形成するために用いられるデータは、「トレーニングデータセット（ｔｒａｉｎｉｎｇ  ｄａｔａ  ｓｅｔ）」と呼ばれてもよい。一旦トレーニングされれば、分類モデルは、未知のサンプルを用いて生成されるスペクトルに由来するデータ中のパターンを認識できる。次いでこの分類モデルを用いて、未知のサンプルをクラスに分類できる。これは、例えば、特定の生物学的サンプルが、特定の生物学的状態（例えば、疾患対非疾患）と関連しているか否かを予想するのに有用であり得る。
【誤訳訂正１２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００８５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００８５】
（ＶＩ．末梢動脈疾患についてのバイオマーカーの検出用キット）
別の局面では、本発明は、末梢動脈疾患の状態を特徴付けするためのキットを提供し、このキットは、本発明に従うバイオマーカーを検出するために用いられる。１実施形態では、このキットは、その上に捕獲試薬が結合されている固体支持体、例えば、チップ、マイクロタイタープレートまたはビーズもしくは樹脂を含み、この捕獲試薬は、本発明のバイオマーカーに結合する。従って、例えば、本発明のキットは、ＰｒｏｔｅｉｎＣｈｉｐ（登録商標）アレイのようなＳＥＬＤＩの質量分析プローブを備えてもよい。生体特異的な捕獲試薬の場合、キットは、反応性表面を有する固体支持体、およびこの生体特異的な捕獲試薬を含む容器を備えてもよい。