【手続補正書】
【提出日】平成22年11月12日(2010.11.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
下記式（I）の修飾されたポリペプチド：
2010510236.tif 000001
式中、
各R1およびR2は独立して、H、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり；
各R3は独立して、アルキル、アルケニル、アルキニル；[R4-K-R4]nであり；その各々は、0〜6個のR5で置換され；
各R4は独立して、アルキル、アルケニル、またはアルキニルであり；
各R5は独立して、ハロ、アルキル、OR6、N(R6)2、SR6、SOR6、SO2R6、CO2R6、R6、蛍光部分、または放射性同位元素であり；
各Kは、O、S、SO、SO2、CO、CO2、CONR6、または
2010510236.tif 000002
であり；
各R6は独立して、H、アルキル、または治療的物質であり；
nは、1〜4の整数であり；
xは、3、4、または6であり；
yおよびwは独立して、0〜100の整数であり；
zは、1〜10の整数であり；かつ
各Xaaは独立して、アミノ酸であり；
該修飾されたポリペプチドは、MAMLポリペプチドと少なくとも60%同一であるアミノ酸配列を含み、
（a）修飾されたポリペプチドの8個の連続したアミノ酸の配列内で、3、4、または6アミノ酸で隔てられた少なくとも1対のアミノ酸の側鎖が、式Iに示すアミノ酸対のα炭素に接続している連結基R3で置き換えられ；および
（b）アミノ酸対の第一のα炭素が式Iに示すR1で置換されており、かつアミノ酸対の第二のα炭素が式Iに示すR2で置換され；かつ
NまたはCは、PEG、スペルミン、または炭水化物で置換することができ、
さらに、表面プラズモン共鳴法により測定された見かけ上のKdが1μM未満で、Notch複合体と結合する、前記修飾されたポリペプチド。
【請求項２】
各yが独立して、3〜15の間の整数である、請求項1記載の修飾されたポリペプチド。
【請求項３】
R1およびR2が各々独立して、HまたはC1-C6アルキルである、請求項1記載の修飾されたポリペプチド。
【請求項４】
R3が、直鎖アルキル、アルケニル、またはアルキニルである、請求項1記載の修飾されたポリペプチド。
【請求項５】
8個の連続したアミノ酸内に、3または6アミノ酸で隔てられた少なくとも1対のアミノ酸の側鎖が、アミノ酸対のα炭素に接続している式Iに示す連結基R3で置き換えられていること、および
アミノ酸対の第一のα炭素が式Iに示すR1で置換されており、かつアミノ酸対の第二のα炭素が式Iに示すR2で置換されていること
を除いて、
MAMLポリペプチドが、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、またはSEQ ID NO:8である、請求項1記載の修飾されたポリペプチド。
【請求項６】
[Xaa]wが、AVMERL、RLRRRI、LCR、LCRRHH、TCE、RYE、TCEARY CEARYE、LERQHT、HTF、およびHTFALHから選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1記載の修飾されたポリペプチド。
【請求項７】
乳酸とグリコール酸のコポリマーをさらに含む、請求項1記載の修飾されたポリペプチド。
【請求項８】
PEGをさらに含む、請求項1記載の修飾されたポリペプチド。
【請求項９】
標的化部分をさらに含む、請求項1記載の修飾されたポリペプチド。
【請求項１０】
下記式（II）のポリペプチドを提供する工程：
2010510236.tif 000003
、および
式（II）の化合物を触媒で処理して閉環メタセシスを促進し、それによって下記式（III）の化合物を提供する工程：
2010510236.tif 000004
を含む、式（III）の修飾されたポリペプチドを作製する方法であって、
式中、各R1およびR2が独立して、H、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり；
各nが独立して、1〜15の整数であり；
xが、3、4、または6であり；
各yが独立して、0〜100の整数であり；
zが、1〜3の整数であり；かつ
各Xaaが独立してアミノ酸であり；
該ポリペプチドが水溶液中でαヘリックス構造を含み、かつ
該修飾されたポリペプチドは、MAMLポリペプチドと少なくとも60%同一であるアミノ酸配列を含み、
（a）修飾されたポリペプチドの8個の連続したアミノ酸の配列内で、3、4、または6アミノ酸で隔てられた少なくとも1対のアミノ酸の側鎖が、式Iに示すアミノ酸対のα炭素に接続している連結基R3で置き換えられ；および
（b）アミノ酸対の第一のα炭素が式Iに示すR1で置換されており、かつアミノ酸対の第二のα炭素が式Iに示すR2で置換され；かつ
NまたはCは、PEG、スペルミン、または炭水化物で置換することができ、
さらに、表面プラズモン共鳴法により測定された見かけ上のKdが1μM未満で、修飾されたポリペプチドがNotch複合体と結合する、
前記方法。
【請求項１１】
請求項1記載の修飾されたポリペプチドと、任意で、薬学的に許容できる担体または補助剤を含む、薬学的組成物。
【請求項１２】
下記式を有する化合物：
2010510236.tif 000005
R1は、-CH2CH2COOH [E]もしくは-CH2COOH [D]であるか、またはR1およびR8は架橋Rxを形成し；
R2は、-CH2CH(CH3)2 [L]または-CH2CH2CH2N(H)C(NH)NH2 [R]であり；
R3は、-CH2CH2COOH [E]であり；
R4は、-CH2CH2CH2N(H)C(NH)NH2 [R]であり；
R5は、-CH2CH2C(O)NH2 [Q]、-CH2CH2COOH [E]、もしくはCH2CH2CH2N(H)C(NH)NH2 [R]であるか、またはR5およびR9は架橋Ryを形成するか、またはR5およびR12は架橋Rxを形成し；
R6は、-CH2OH [S]、
2010510236.tif 000006
、または-CH2COOH [D]であり；
R7は、-C(OH)CH3 [T]であり；
R8は、ベンジル[F]、-CH2CH(CH3)2 [L]、-CH(CH3)2 [V]であるか、またはR1およびR8は架橋Rxを形成し；
R9は、-CH3 [A]もしくは-CH2CH2C(O)NH2 [Q]、および-CH2OH [S]から選択されるか、またはR5およびR9は架橋Ryを形成し；
R10は、-CH2CH(CH3)2 [L]であり；
R11は、
2010510236.tif 000007
、-CH2CH(CH3)2 [L]、または
2010510236.tif 000008
であり、
R12は、-CH2CH2C(O)NH2 [Q]または-CH2OH [S]であるか、またはR5およびR12は架橋Rxを形成し
ただし、R1およびR8が架橋Rxを形成する場合、R5およびR9は架橋Ryを形成せず、かつR5およびR12は架橋Rxを形成せず；
さらに、ただし、R5およびR9が架橋Ryである場合、R1およびR8は架橋Rxを形成せず、かつR5およびR12は架橋Rxを形成せず；
さらに、ただし、R5およびR12が架橋Rxを形成する場合、R5およびR9は架橋Ryを形成せず、かつR1およびR8は架橋Rxを形成せず；
RxおよびRyは、アルキル、アルケニル、アルキニル；[Rx1-K-Rx1]nであり；その各々は、0〜6個のRx2で置換され；
Rx1は、アルキル、アルケニル、またはアルキニルであり；
Rx2は、ハロ、アルキル、ORx3、N(Rx3)2、SRx3、SORx3、SO2Rx3、CO2Rx3、Rx3、蛍光部分、または放射性同位元素であり；
Kは、O、S、SO、SO2、CO、CO2、CONRx3、または
2010510236.tif 000009
であり；
Rx3は、H、アルキル、または治療的物質であり；かつ
RzおよびRwは独立して、H、ヒドロキシル、アミノ酸、ペプチド結合によって連結された2〜10アミノ酸、tat、およびPEGであり、
表面プラズモン共鳴法により測定された見かけ上のKdが1μM未満で、Notch複合体と結合する、
前記化合物。
【請求項１３】
R1およびR2が各々独立して、HまたはC1-C6アルキルである、請求項12記載のポリペプチド。
【請求項１４】
細胞膜を通って輸送される、請求項12記載のポリペプチド。
【請求項１５】
MAMLポリペプチドと少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項1記載の修飾されたポリペプチド。
【請求項１６】
MAMLポリペプチドが配列Ile-Xaa-Xaa-Cys-Arg-Xaa-His-Hisを含み、Xaaがアミノ酸である、請求項1記載の修飾されたポリペプチド。
【請求項１７】
表面プラズモン共鳴法により測定された見かけ上のKdが、1μM未満で、Notch ICN-CSL複合体と結合する、請求項1記載の修飾されたポリペプチド。
【請求項１８】
MAMLポリペプチドが、
2010510236.tif 000010
である、請求項1記載の修飾されたポリペプチド。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５４】
本発明の1種または複数の態様の詳細は、添付図面および以下の説明に記されている。本発明の他の特徴、目的、および利点は、説明および図面、ならびに「特許請求の範囲」から明らかであると思われる。
[請求項1001]
下記式(I)の修飾されたポリペプチド:
2010510236.tif 000011
式中、
各R1およびR2は独立して、H、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり;
各R3は独立して、アルキル、アルケニル、アルキニル;[R4-K-R4]nであり;その各々は、0〜6個のR5で置換され;
各R4は独立して、アルキル、アルケニル、またはアルキニルであり;
各R5は独立して、ハロ、アルキル、OR6、N(R6)2、SR6、SOR6、SO2R6、CO2R6、R6、蛍光部分、または放射性同位元素であり;
各Kは独立して、O、S、SO、SO2、CO、CO2、CONR6、または
2010510236.tif 000012
であり;
各R6は独立して、H、アルキル、または治療的物質であり;
nは、1〜4の整数であり;
xは、3、4、または6であり;
yおよびwは独立して、0〜100の整数であり;
zは、1〜10の整数であり;かつ
各Xaaは独立して、アミノ酸であり;
該修飾されたポリペプチドは、
(a)8個の連続したアミノ酸内に、3、4、または6アミノ酸で隔てられた少なくとも1対のアミノ酸の側鎖が、式Iに示すアミノ酸対のα炭素に接続している連結基R3で置き換えられていること;および
(b)アミノ酸対の第一のα炭素が式Iに示すR1で置換されており、かつアミノ酸対の第二のα炭素が式Iに示すR2で置換されていること
を除いて、MAMLポリペプチドの少なくとも8個の連続したアミノ酸を含み;かつ
NまたはCは、PEG、スペルミン、または炭水化物で置換することができる。
[請求項1002]
MAMLポリペプチドがSEQ ID NO:1〜7のいずれかを含む、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1003]
修飾されたポリペプチドが、CSLとICNを含む複合体に結合する、請求項1001記載のポリペプチド。
[請求項1004]
MAMLポリペプチドがヒトMAML-1、MAML-2、およびMAML-3から選択される、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1005]
MOLT4細胞、ALL-SIL T-ALL細胞、KOPTK1 T-ALL細胞、およびTALL1細胞の少なくとも1つの生存度を低下させる、請求項1001記載のポリペプチド。
[請求項1006]
xが3である、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1007]
xが4である、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1008]
xが6である、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1009]
xが2または6であり、R3が単一の二重結合を含むアルケニルであり、かつR1およびR2が両方ともHである、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1010]
各yが独立して、3〜15の間の整数である、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1011]
R1およびR2が各々独立して、HまたはC1-C6アルキルである、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1012]
R1およびR2が各々独立して、C1-C3アルキルである、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1013]
R1およびR2の少なくとも一方がメチルである、請求項1011記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1014]
R1およびR2がメチルである、請求項1012記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1015]
R3がアルキルである、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1016]
xが3である、請求項1014記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1017]
R3がC8アルキルである、請求項1015記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1018]
xが6である、請求項1014記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1019]
R3がC11アルキルである、請求項1017記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1020]
R3がアルケニルである、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1021]
xが3である、請求項1018記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1022]
R3がC8アルケニルである、請求項1020記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1023]
xが6である、請求項1019記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1024]
R3がC11アルケニルである、請求項1019記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1025]
R3が、直鎖アルキル、アルケニル、またはアルキニルである、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1026]
R3が[R4-K-R4]であり、かつR4が直鎖アルキル、アルケニル、またはアルキニルである、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1027]
8個の連続したアミノ内に、3または6アミノ酸で隔てられた少なくとも1対のアミノ酸の側鎖が、アミノ酸対のα炭素に接続している式Iに示す連結基R3で置き換えられていること、および
アミノ酸対の第一のα炭素が式Iに示すR1で置換されており、かつアミノ酸対の第二のα炭素が式Iに示すR2で置換されていること
を除いて、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、またはSEQ ID NO:4の少なくとも8個の連続したアミノ酸を含む、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1028]
[Xaa]wが、AVMERL、RLRRRI、LCR、LCRRHH、TCE、RYE、TCEARY CEARYE、LERQHT、HTF、およびHTFALHから選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1029]
R1またはR2の少なくとも一方がアルキルである、請求項1015記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1030]
各R1およびR2が独立して、HまたはC1-C3アルキルである、請求項1011記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1031]
R1およびR2がメチルである、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1032]
xが3または6であり、かつzが1である、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1033]
R3が、C8またはC11のアルキルまたはアルケニルである、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1037]
乳酸とグリコール酸のコポリマーをさらに含む、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1038]
PEGをさらに含む、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1039]
標的化部分をさらに含む、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1040]
ビオチン部分をさらに含む、請求項1001記載の修飾されたポリペプチド。
[請求項1041]
下記式(II)のポリペプチドを提供する工程:
2010510236.tif 000013
、および
式(II)の化合物を触媒で処理して閉環メタセシスを促進し、それによって下記式(III)の化合物を提供する工程:
2010510236.tif 000014
を含む、式(III)のポリペプチドを作製する方法であって、
式中、各R1およびR2が独立して、H、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり;
各nが独立して、1〜15の整数であり;
xが、3、4、または6であり;
各yが独立して、0〜100の整数であり;
zが、1〜3の整数であり;かつ
各Xaaが独立してアミノ酸であり;かつ
該ポリペプチドが水溶液中でαヘリックス構造を含む、方法。
[請求項1042]
ポリペプチドがICNとCSLを含む複合体に結合する、請求項1041記載の方法。
[請求項1043]
触媒がルテニウム触媒である、請求項1041記載の方法。
[請求項1044]
閉環メタセシスに続いて、還元剤または酸化剤を提供する工程をさらに含む、請求項1041記載の方法。
[請求項1045]
還元剤がH2であるか、または酸化剤が四酸化オスミウムである、請求項1044記載の方法。
[請求項1046]
請求項1001記載の化合物を対象へ投与する工程を含む、対象を処置する方法。
[請求項1047]
追加の治療的物質を投与する工程をさらに含む、請求項1046記載の方法。
[請求項1048]
請求項1001記載の化合物を対象へ投与する工程を含む、対象の癌を処置する方法。
[請求項1049]
追加の治療的物質を投与する工程をさらに含む、請求項1048記載の方法。
[請求項1050]
式(I)である、請求項1001記載の化合物のライブラリー。
[請求項1051]
下記式を有する化合物:
2010510236.tif 000015
R1は、-CH2CH2COOH [E]もしくは-CH2COOH [D]であるか、またはR1およびR8は合わせてRxであり;
R2は、-CH2CH(CH3)2 [L]または-CH2CH2CH2N(H)C(NH)NH2 [R]であり;
R3は、-CH2CH2COOH [E]であり;
R4は、-CH2CH2CH2N(H)C(NH)NH2 [R]であり;
R5は、-CH2CH2C(O)NH2 [Q]、-CH2CH2COOH [E]、もしくはCH2CH2CH2N(H)C(NH)NH2 [R]であるか、またはR5およびR9は合わせてRyであるか、またはR5およびR12は合わせてRxであり;
R6は、-CH2OH [S]、
2010510236.tif 000016
、または-CH2COOH [D]であり;
R7は、-C(OH)CH3 [T]であり;
R8は、ベンジル[F]、-CH2CH(CH3)2 [L]、-CH(CH3)2 [V]であるか、またはR1およびR8は合わせてRxであり;
R9は、-CH3 [A]もしくは-CH2CH2C(O)NH2 [Q]、および-CH2OH [S]から選択されるか、またはR5およびR9は合わせてRyであり;
R10は、-CH2CH(CH3)2 [L]であり;
R11は、
2010510236.tif 000017
、-CH2CH(CH3)2 [L]、および
2010510236.tif 000018
であり、
R12は、-CH2CH2C(O)NH2 [Q]および-CH2OH [S]であるか、またはR5およびR12は合わせてRxであり
ただし、R1およびR8が合わせてRxである場合、R5およびR9は合わせてRyではなく、かつR5およびR12は合わせてRxではなく;
さらに、ただし、R5およびR9が合わせてRyである場合、R1およびR8は合わせてRxではなく、かつR5およびR12は合わせてRxではなく;
さらに、ただし、R5およびR12が合わせてRxである場合、R5およびR9は合わせてRyではなく、かつR1およびR8は合わせてRxではなく;
RxおよびRyは、アルキル、アルケニル、アルキニル;[Rx1-K-Rx1]nであり;その各々は、0〜6個のRx2で置換され;
Rx1は、アルキル、アルケニル、またはアルキニルであり;
Rx2は、ハロ、アルキル、ORx3、N(Rx3)2、SRx3、SORx3、SO2Rx3、CO2Rx3、Rx3、蛍光部分、または放射性同位元素であり;
Kは、O、S、SO、SO2、CO、CO2、CONRx3、または
2010510236.tif 000019
であり;
Rx3は、H、アルキル、または治療的物質であり;かつ
RzおよびRwは独立して、H、ヒドロキシル、アミノ酸、ペプチド結合によって連結された2〜10アミノ酸、tat、およびPEGである。
[請求項1052]
各yが独立して、3〜15の間の整数である、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1053]
R1およびR2が各々独立して、HまたはC1-C6アルキルである、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1054]
R1およびR2が各々独立して、C1-C3アルキルである、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1055]
R1およびR2の少なくとも一方がメチルである、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1056]
R1およびR2がメチルである、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1057]
R3がアルキルである、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1058]
xが3である、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1059]
R3がC8アルキルである、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1060]
xが6である、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1061]
R3がC11アルキルである、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1062]
R3がアルケニルである、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1063]
R3がC8アルケニルである、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1064]
R3がC11アルケニルである、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1065]
R3が、直鎖アルキル、アルケニル、またはアルキニルである、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1066]
R3が[R4-K-R4]であり、かつR4が直鎖アルキル、アルケニル、またはアルキニルである、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1066]
xが3であり、かつzが1である、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1067]
細胞膜を通って輸送される、請求項1051記載のポリペプチド。
[請求項1068]
(a)アミノ酸8および12の側鎖が、式Iに示すアミノ酸8および12のα炭素に接続している連結基R3で置き換えられ、かつ
(b)アミノ酸8のα炭素が式Iに示すR1で置換され、かつアミノ酸12のα炭素が式Iに示すR2で置換される、
SEQ ID NO:8、9、および10から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1001記載のポリペプチド。