【手続補正書】
【提出日】平成23年6月24日(2011.6.24)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ａ）配列番号２に対して少なくとも９０％の同一性を有する肺炎連鎖球菌（S. pneumoniae）のポリペプチドをコードする核酸、
ｂ）配列番号２に対して少なくとも９０％の同一性を有する肺炎連鎖球菌（S. pneumoniae）のポリペプチドをコードする核酸に対して完全に相補的な核酸、および
ｃ）前記（ａ）または（ｂ）においてＴがＵで置換されているＲＮＡ
からなる群より選択される単離核酸。
【請求項２】
配列番号２に対して少なくとも９０％の同一性を有する肺炎連鎖球菌（S. pneumoniae）のポリペプチドをコードする単離核酸。
【請求項３】
配列番号２に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を包含する単離ポリペプチド。
【請求項４】
配列番号２に対して少なくとも９０％の同一性を有するポリペプチドに特異的に結合するモノクローナル抗体。
【請求項５】
ａ）配列番号３に対して少なくとも９０％の同一性を有する肺炎連鎖球菌（S. pneumoniae）のポリペプチドをコードする核酸、
ｂ）配列番号３に対して少なくとも９０％の同一性を有する肺炎連鎖球菌（S. pneumoniae）のポリペプチドをコードする核酸に対して完全に相補的な核酸、
ｃ）前記（ａ）または（ｂ）においてＴがＵで置換されているＲＮＡ
からなる群より選択される単離核酸。
【請求項６】
配列番号３に対して少なくとも９０％の同一性を有する肺炎連鎖球菌（S. pneumoniae）のポリペプチドをコードする単離核酸。
【請求項７】
配列番号３に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を包含する単離ポリペプチド。
【請求項８】
配列番号３に対して少なくとも９０％の同一性を有するポリペプチドに特異的に結合するモノクローナル抗体。
【請求項９】
ａ）配列番号４に対して少なくとも９０％の同一性を有する肺炎連鎖球菌（S. pneumoniae）のポリペプチドをコードする核酸、
ｂ）配列番号４に対して少なくとも９０％の同一性を有する肺炎連鎖球菌（S. pneumoniae）のポリペプチドをコードする核酸に対して完全に相補的な核酸、および
ｃ）前記（ａ）または（ｂ）においてＴがＵで置換されているＲＮＡ
からなる群より選択される単離核酸。
【請求項１０】
配列番号４に対して少なくとも９０％の同一性を有する肺炎連鎖球菌（S. pneumoniae）のポリペプチドをコードする単離核酸。
【請求項１１】
配列番号４に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を包含する単離ポリペプチド。
【請求項１２】
配列番号４に対して少なくとも９０％の同一性を有するポリペプチドに特異的に結合するモノクローナル抗体。
【請求項１３】
アミノ酸１とアミノ酸１０１にわたる領域において配列番号４に示されるアミノ酸配列を有するペプチド内に位置する抗原決定基に、特異的に結合するモノクローナル抗体。
【請求項１４】
転写制御要素に機能的に結合した請求項１、２、５、６、９および１０いずれか１項記載の核酸を含む組換え発現ベクター。
【請求項１５】
請求項１４記載の組換え発現ベクターを含む細胞。
【請求項１６】
肺炎連鎖球菌（S. pneumoniae）のポリペプチドが免疫応答を誘発することを特徴とする請求項１、２、５、６、９および１０いずれか１項記載の単離核酸。
【請求項１７】
請求項４、８、１２および１３いずれか１項記載の抗体を含む、宿主における連鎖球菌感染を阻害するための組成物。
【請求項１８】
配列番号２、３および４からなる群より選択される配列あるいは配列番号１５、１６および１７からなる群より選択されるそれらの変異体から成る免疫原性フラグメント。
【請求項１９】
請求項１８記載の免疫原性フラグメントを少なくとも１種類含む組成物。
【請求項２０】
薬学的に許容される担体をさらに含む請求項１９記載の組成物。
【請求項２１】
アジュバントをさらに含むことを特徴とする請求項１９または２０記載の組成物。
【請求項２２】
少なくとも１つの他の免疫原性の連鎖球菌タンパク質またはそれらのフラグメントをさらに含むことを特徴とする請求項１９から２１いずれか１項記載の組成物。
【請求項２３】
前記組成物が、粘膜面への投与に適していることを特徴とする請求項１９から２２いずれか１項記載の組成物。
【請求項２４】
前記組成物がスプレー式点鼻薬であることを特徴とする請求項２３記載の組成物。
【請求項２５】
前記組成物がネブライザー溶液であることを特徴とする請求項２３記載の組成物。
【請求項２６】
前記組成物が噴霧吸入用エアロゾルであることを特徴とする請求項２３記載の組成物。
【請求項２７】
被験体においてＰｈｔＤに特異的な抗体を産生するための組成物である請求項１９から２６いずれか１項記載の組成物。
【請求項２８】
被験体における肺炎球菌の鼻腔内保菌を低減するための組成物である請求項１９から２６いずれか１項記載の組成物。
【請求項２９】
被験体における肺炎球菌の感染の危険性を低減するための組成物である請求項１９から２６いずれか１項記載の組成物。
【請求項３０】
前記肺炎球菌の感染が髄膜炎であることを特徴とする請求項２９記載の組成物。
【請求項３１】
前記肺炎球菌の感染が中耳炎であることを特徴とする請求項２９記載の組成物。
【請求項３２】
前記肺炎球菌の感染が肺炎であることを特徴とする請求項２９記載の組成物。
【請求項３３】
前記肺炎球菌の感染が溶血性の尿毒症であることを特徴とする請求項２９記載の組成物。
【請求項３４】
前記免疫原性フラグメントの投与が、肺炎球菌の鼻腔内保菌を排除しないことを特徴とする請求項２９記載の組成物。
【請求項３５】
ストレプトコッカス（Streptococcus）属の細菌による感染に対して宿主に免疫性を与えるための組成物である請求項１９から２６いずれか１項記載の組成物。
【請求項３６】
ストレプトコッカス（Streptococcus）属の細菌による宿主の感染を治療するための組成物である請求項１９から２６いずれか１項記載の組成物。
【請求項３７】
２つ以上のポリペプチドを含むことを特徴とする請求項１９から３６いずれか１項記載の組成物。
【請求項３８】
ＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される１Ｂ１２、ＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される４Ｄ５、およびＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される９Ｅ１１からなる群より選択されるモノクローナル抗体。
【請求項３９】
ＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するハイブリドーマによって産生される抗体と同一の抗原結合特異性を有するモノクローナル抗体。
【請求項４０】
前記モノクローナル抗体が、配列番号４に示されるアミノ酸配列を有するポリペプチドに特異的に結合することを特徴とする請求項３９記載のモノクローナル抗体。
【請求項４１】
請求項３８から４０いずれか１項記載のモノクローナル抗体の誘導体。
【請求項４２】
固定可能に取り付けられた検出可能なラベルを含む請求項３８から４０いずれか１項記載のモノクローナル抗体またはその誘導体。
【請求項４３】
請求項３８から４２いずれか１項記載のモノクローナル抗体またはその誘導体を含む組成物。
【請求項４４】
前記抗体が、少なくとも約６０％、７５％、９０％、または９５％の純度に精製されたものであることを特徴とする請求項４３記載の組成物。
【請求項４５】
ＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される１Ｂ１２、ＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される４Ｄ５、およびＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される９Ｅ１１からなる群より選択される少なくとも１種類のモノクローナル抗体を含む、宿主におけるストレプトコッカス（Streptococcus）属の細菌による感染を防止または治療するための組成物。
【請求項４６】
２つ以上のモノクローナル抗体を含むことを特徴とする請求項４５記載の組成物。
【請求項４７】
前記モノクローナル抗体が４Ｄ５および９Ｅ１１を含むことを特徴とする請求項４６記載の組成物。
【請求項４８】
生物学的サンプルにおけるタンパク質の量を決定する方法であって、
前記生物学的試験サンプルを、ＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される１Ｂ１２、ＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される４Ｄ５、およびＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される９Ｅ１１、またはそれらの誘導体からなる群より選択されるモノクローナル抗体に曝露し、
前記サンプルに結合する抗体または誘導体の量を測定し、
前記生物学的試験サンプルにおける結合量を、対照の生物学的サンプルに見られる結合量と比較する、工程を含み、
前記対照の生物学的サンプルと比較した前記生物学的試験サンプルにおける結合の増大が、その中の前記タンパク質の存在を示唆することを特徴とする方法。
【請求項４９】
生物学的サンプルにおけるタンパク質の存在の有無を判断する方法であって、
前記サンプルにおいて、ＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される１Ｂ１２、ＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される４Ｄ５、および、ＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される９Ｅ１１、またはそれらの誘導体からなる群より選択されるモノクローナル抗体と反応するタンパク質を検出する工程を含む方法。
【請求項５０】
生物学的サンプルにおけるストレプトコッカス（Streptococcus）属の細菌またはそれらのタンパク質を検出する方法であって、
（ａ）生物学的試験サンプルを、特異性を有する前記サンプルの成分に対する前記抗体を考慮した条件下で、ＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される１Ｂ１２、ＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される４Ｄ５、およびＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される９Ｅ１１、またはそれらの誘導体からなる群より選択される、少なくとも１種類のモノクローナル抗体に曝露し、
（ｂ）前記生物学的試験サンプルの成分に結合する前記抗体の量を決定し、
（ｃ）前記生物学的試験サンプル前記抗体の量を、対照サンプルに結合する量と比較する、工程を含み、
前記対照生物学的サンプルと比較して、前記生物学的試験サンプルの成分への顕著に多い結合量が、前記サンプルにおけるストレプトコッカス（Streptococcus）属の細菌またはそれらのタンパク質の存在を示唆することを特徴とする方法。
【請求項５１】
前記生物学的サンプルが哺乳動物の組織であることを特徴とする請求項４８から５０いずれか１項記載の方法。
【請求項５２】
前記生物学的サンプルが血液であることを特徴とする請求項４８から５１いずれか１項記載の方法。
【請求項５３】
前記生物学的サンプルがヒトの血液であることを特徴とする請求項５２記載の方法。
【請求項５４】
生物学的サンプルにおけるストレプトコッカス（Streptococcus）属の細菌またはそれらのタンパク質を検出するためのキットであって、ＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される１Ｂ１２、ＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される４Ｄ５、およびＡＴＣＣ指定番号ＸＸＸＸを有するマウスのハイブリドーマによって産生される９Ｅ１１、またはそれらの誘導体からなる群より選択される少なくとも１つのモノクローナル抗体と、使用説明書とを含むキット。
【請求項５５】
前記モノクローナル抗体が凍結乾燥の形態であることを特徴とする請求項５４記載のキット。
【請求項５６】
配列番号２４に対して少なくとも９０％の同一性を有するポリペプチドに特異的に結合するモノクローナル抗体。
【請求項５７】
前記モノクローナル抗体が配列番号２６からなるペプチドに特異的に結合することを特徴とする請求項５６記載のモノクローナル抗体。
【請求項５８】
配列番号２６に対して少なくとも９０％の同一性を有するペプチドに特異的に結合するモノクローナル抗体。