【手続補正書】
【提出日】平成22年11月17日(2010.11.17)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ウイルス遺伝子に由来する核酸によりコードされている７〜２０アミノ酸残基の配列を有するポリペプチドであって、ウイルスタンパク質または断片の相同的な配列が置き換えられると前記ポリペプチドが発現される宿主に対する、前記ウイルスタンパク質またはその断片の免疫抑制特性をモデュレーションすることができ（免疫抑制モデュレートリー配列）、
以下の最小共通アミノ酸配列：
【表１】
2008506357.tif 000001
（式中、
Ｘ1およびＸ2は、前記の免疫抑制特性に影響を及ぼすように選択され、例えば、
・Ｘ1はＥ、ＫもしくはＱであり、Ｘ2は、ウイルスタンパク質の構造が保存されることを確実にするアミノ酸であるか、または
・Ｘ1はＥ、ＫもしくはＱであり、Ｘ2はＡであるか、または
・Ｘ1はＷであり、Ｘ2はＩもしくはＶであるか、または
・Ｘ1はＲ、ＨもしくはＫであり、Ｘ2は、ウイルスタンパク質の構造が保存されることを確実にするアミノ酸であるか、または
・Ｘ1はＲ、ＨまたはＫであり、Ｘ2はＦ、Ｗ、ＹもしくはＨであるか、または
・Ｘ1はＦ、Ｗ、ＹもしくはＨであり、Ｘ２はＲ、ＨもしくはＫであり、
Ｙ9〜Ｙ12は、可変アミノ酸残基を示す）
を含む、ポリペプチド。
【請求項２】
Ｘ1がＥ、ＫまたはＱであり、Ｘ2がＡである、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項３】
Ｘ1がＫであり、Ｘ2がＦである、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項４】
Ｘ1がＲであり、Ｘ2がＦである、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項５】
ウイルスｅｎｖ遺伝子に由来する核酸によりコードされている、請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項６】
レトロウイルスｅｎｖ遺伝子に由来する核酸によりコードされている、請求項１〜５のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項７】
前記レトロウイルスが、ＭｏＭＬＶ、フレンドレトロウイルス、ＦｅＬＶ、ＨＴＬＶ−１、ＨＴＬＶ−２、ＳＴＬＶ−１およびＭＰＭＶからなる群より選択される、請求項６に記載のポリペプチド。
【請求項８】
以下の配列：
【表２】
2008506357.tif 000002
配列を含む、請求項１、２または５〜７のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項９】
以下の配列：
【表３】
2008506357.tif 000003
を含む、請求項１または４〜７のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１０】
【表４】
2008506357.tif 000004
（式中、これらの免疫抑制モデュレートリー配列は、それらを含むタンパク質に、免疫抑制特性を与える）
からなる群より選択される以上の配列を含む、請求項１、２または５〜７のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１１】
【表５】
2008506357.tif 000005
（式中、これらの免疫抑制モデュレートリー配列は、それらを含むタンパク質に、低い免疫抑制特性を与える）
あるいは
【表６】
2008506357.tif 000006
（式中、これらの免疫抑制モデュレートリー配列は、それらを含むタンパク質に、実質的に全く免疫抑制特性を与えない）
からなる群より選択される以上の配列を含む、請求項１または３〜７のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１２】
以下の共通配列：
【表７】
2008506357.tif 000007
（式中、
Ｘ1およびＸ2は、請求項１に定義された通りであり、Ｙ1〜Ｙ14は、任意のアミノ酸を示す）
を有する、請求項１〜１１のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１３】
【表８】
2008506357.tif 000008
（式中、これらの免疫抑制モデュレートリー配列は、それらを含むタンパク質に、免疫抑制特性を与える）
からなる群より選択される配列を有する、請求項１２に記載のポリペプチド。
【請求項１４】
【表９】
2008506357.tif 000009
（式中、これらの免疫抑制モデュレートリー配列は、それらを含むタンパク質に、低い免疫抑制特性を与える）
あるいは
【表１０】
2008506357.tif 000010
（式中、これらの免疫抑制モデュレートリー配列は、それらを含むタンパク質に、実質的に全く免疫抑制特性を与えない）
からなる群より選択される配列を有する、請求項１２に記載のポリペプチド。
【請求項１５】
以下の配列：
【表１１】
2008506357.tif 000011
（式中、
Ｘ1はＥ、ＫまたはＱであり、Ｘ2はＡ、Ｖ、Ｌ、ＩまたはＫであり、Ｙ1〜Ｙ12は任意のアミノ酸を示し、
ここで、アミノ酸Ｘ1はＲまたはＨにより置換されている）
を実質的に含む、野生型ＥＮＶタンパク質の変異から得られた変異ＥＮＶタンパク質（ただし、前記変異ＥＮＶタンパク質は、野生型ＥＮＶタンパク質に対する免疫抑制活性が殆どない）、
あるいは、少なくとも７アミノ酸長であるその断片（ただし、前記断片は、変異アミノ酸Ｘ1および場合によりＸ2を有し、免疫抑制活性が殆どない前記変異ＥＮＶタンパク質と類似した免疫抑制活性を有し、場合により、その抗原性構造は、前記変異ＥＮＶタンパク質において採用されている構造と実質的に類似している）、
あるいは、少なくとも１アミノ酸の挿入、欠失もしくは置換により、前記変異ＥＮＶタンパク質から得られた、前記変異ＥＮＶタンパク質と少なくとも８０％の配列同一性、特に少なくとも９０％の配列同一性を提示するタンパク質またはその断片（ただし、前記の得られたタンパク質は、変異アミノ酸Ｘ1およびＸ2を有し、前記変異ＥＮＶタンパク質と類似した免疫抑制活性を有し、場合により、その抗原性構造は、前記変異ＥＮＶタンパク質またはその断片の構造と実質的に類似している）。
【請求項１６】
以下の配列：
【表１２】
2008506357.tif 000012
（式中、
Ｘ1はＲまたはＨにより置換され、Ｘ2はＦ、Ｍ、ＹまたはＷにより置換されている）
を実質的に含む、野生型ＥＮＶタンパク質の変異から得られた、請求項１５に記載の変異ＥＮＶタンパク質。
【請求項１７】
前記変異ＥＮＶタンパク質またはその断片の抗原性に関与する構造が、野生型ＥＮＶタンパク質に対して実質的に保存されている、請求項１５または１６に記載の変異ＥＮＶタンパク質もしくはその断片。
【請求項１８】
前記ＥＮＶタンパク質が、ＨＥＲＶ  ＥＮＶ、特に
ＨＥＲＶ−ＦＲＤ  ＥＮＶ（配列番号８２）（ここで、Ｘ1はＱ４２７であり、Ｘ2はＡ４３３である）、または
ＨＥＲＶ−Ｔ  ＥＮＶ（配列番号８４）（ここで、Ｘ1はＱ５１６であり、Ｘ2はＡ５２２である）、または
ＨＥＲＶ−Ｒ  ＥＮＶ（配列番号８６）（ここで、Ｘ1はＥ５６１であり、Ｘ2はＫ５６７である）、または
ＨＥＲＶ−Ｖ  ＥＮＶ（配列番号８８）（ここで、Ｘ1はＱ３８１であり、Ｘ2はＶ３８７である）、または
ＨＥＲＶ−Ｒ（ｂ）ＥＮＶ（配列番号９０）（ここで、Ｘ1はＥ３９１であり、Ｘ2はＬ３９７である）
から選択される、請求項１５〜１７のいずれか１項に記載の変異ＥＮＶタンパク質またはその断片。
【請求項１９】
前記ＥＮＶタンパク質がＨＥＲＶ−ＦＲＤ  ＥＮＶであり、前記変異ＥＮＶタンパク質の配列が、
配列番号１２０、
配列番号１２２
から選択される、請求項１８に記載の変異ＥＮＶタンパク質またはその断片。
【請求項２０】
前記ＥＮＶタンパク質がＨＥＲＶ−Ｖ  ＥＮＶであり、前記変異ＥＮＶタンパク質の配列が、
配列番号１２４、
配列番号１２６
から選択される、請求項１８に記載の変異ＥＮＶタンパク質またはその断片。
【請求項２１】
前記ＥＮＶタンパク質がＨＥＲＶ−Ｔ  ＥＮＶであり、前記変異ＥＮＶタンパク質の配列が、
配列番号１２８、
配列番号１３０
から選択される、請求項１８に記載の変異ＥＮＶタンパク質またはその断片。
【請求項２２】
前記ＥＮＶタンパク質がＨＥＲＶ−Ｒ  ＥＮＶであり、前記変異ＥＮＶタンパク質の配列が、
配列番号１４６、
配列番号１４８
から選択される、請求項１８に記載の変異ＥＮＶタンパク質またはその断片。
【請求項２３】
前記ＥＮＶタンパク質が、
ＨＴＬＶ−１ＥＮＶ（配列番号９２）（ここで、Ｘ1はＱ３８９であり、Ｘ2はＡ３９５である）、または
ＨＴＬＶ−２ＥＮＶ（配列番号９４）（ここで、Ｘ1はＱ３８５であり、Ｘ2はＡ３９１である）、または
ＦｅＬＶ  ＥＮＶ（配列番号９６）（ここで、Ｘ1はＥ５２７であり、Ｘ2はＡ５３３である）、または
ＰＥＲＶ  ＥＮＶ（配列番号９８）（ここで、Ｘ1はＥ５４５であり、Ｘ2はＡ５５１である）、または
ＳＴＬＶ−１ＥＮＶ（配列番号１００）（ここで、Ｘ1はＱ３８９であり、Ｘ2はＡ３９５である）、または
ＭｏＭＬＶ  ＥＮＶ（配列番号７０）（ここで、Ｘ1はＥ５５１であり、Ｘ2はＡ５５７である）、または
ＭＰＭＶ  ＥＮＶ（配列番号７２）（ここで、Ｘ1はＱ４７１であり、Ｘ2はＡ４７７である）、または
ＦＶ  ＥＮＶ（配列番号１０２）（ここで、Ｘ1はＥ５６１であり、Ｘ2はＡ５６７である）
から選択される、請求項１５〜１７のいずれか１項に記載の変異ＥＮＶタンパク質またはその断片。
【請求項２４】
前記ＥＮＶタンパク質がＦｅＬＶ  ＥＮＶであり、前記変異ＥＮＶタンパク質の配列が、
配列番号１０４、
配列番号１０６
から選択される、請求項２３に記載の変異ＥＮＶタンパク質またはその断片。
【請求項２５】
前記ＥＮＶタンパク質がＨＴＬＶ−１ＥＮＶであり、前記変異ＥＮＶタンパク質の配列が、
配列番号１０８、
配列番号１１０
から選択される、請求項２３に記載の変異ＥＮＶタンパク質またはその断片。
【請求項２６】
前記ＥＮＶタンパク質がＨＴＬＶ−２ＥＮＶであり、前記変異ＥＮＶタンパク質の配列が、
配列番号１１２、
配列番号１１４
から選択される、請求項２３に記載の変異ＥＮＶタンパク質またはその断片。
【請求項２７】
前記ＥＮＶタンパク質がＰＥＲＶ  ＥＮＶであり、前記変異ＥＮＶタンパク質の配列が、
配列番号１５０、
配列番号１５２
から選択される、請求項２３に記載の変異ＥＮＶタンパク質またはその断片。
【請求項２８】
以下の配列：
【表１３】
2008506357.tif 000013
（式中、
Ｘ1はＲであり、Ｘ2はＦであり、Ｙ1〜Ｙ12は任意のアミノ酸を示し、
ここで、アミノ酸Ｘ1はＥまたはＱにより置換されている）
を実質的に含む、野生型ＥＮＶタンパク質の変異から得られた変異ＥＮＶタンパク質（ただし、前記変異ＥＮＶタンパク質は免疫抑制活性を有するが、野生型ＥＮＶタンパク質には免疫抑制活性がない）、
あるいは、少なくとも７アミノ酸長であるその断片（ただし、前記断片は、変異アミノ酸Ｘ1およびＸ2を有し、免疫抑制性である前記変異ＥＮＶタンパク質と類似した免疫抑制活性を有し、場合により、その抗原性構造は、前記変異ＥＮＶタンパク質において採用されている構造と実質的に類似している）、
あるいは、少なくとも１アミノ酸の挿入、欠失もしくは置換により、前記変異ＥＮＶタンパク質から得られた、前記変異ＥＮＶタンパク質と少なくとも８０％の配列同一性、特に少なくとも９０％の配列同一性を提示するタンパク質またはその断片（ただし、前記の得られたタンパク質は、変異アミノ酸Ｘ1およびＸ2を有し、前記変異ＥＮＶタンパク質と類似した免疫抑制活性を有し、場合により、その抗原性構造は、前記変異ＥＮＶタンパク質またはその断片の構造と実質的に類似している）。
【請求項２９】
以下の配列：
【表１４】
2008506357.tif 000014
（式中、
アミノ酸Ｘ1はＥまたはＱにより置換され、アミノ酸Ｘ2はＡにより置換されている）
を実質的に含む、野生型ＥＮＶタンパク質の変異から得られた、請求項２８に記載の変異ＥＮＶタンパク質。
【請求項３０】
前記変異ＥＮＶタンパク質またはその断片の抗原性に関与する構造が、野生型ＥＮＶタンパク質に対して実質的に保存されている、請求項２８または２９に記載の変異ＥＮＶタンパク質もしくはその断片。
【請求項３１】
前記ＥＮＶタンパク質が、ＨＥＲＶ−Ｗ  ＥＮＶ、例えば配列番号７４により示される配列であり、変異ＨＥＲＶ−Ｗ  ＥＮＶの配列が、
配列番号１１６、
配列番号１１８
から選択される、請求項２８〜３０のいずれか１項に記載の変異ＥＮＶタンパク質またはその断片。
【請求項３２】
請求項１〜１４のいずれか１項に記載のポリペプチドまたは請求項１５〜３１のいずれか１項に記載の変異ＥＮＶタンパク質をコードする核酸。
【請求項３３】
配列番号１０３、
配列番号１０５、
配列番号１０７、
配列番号１０９、
配列番号１１１、
配列番号１１３、
配列番号１１５、
配列番号１１７、
配列番号１１９、
配列番号１２１、
配列番号１２３、
配列番号１２５、
配列番号１２７、
配列番号１２９、
配列番号１４５、
配列番号１４７、
配列番号１４９、および
配列番号１５１
を含むリストから選択される配列により示されることを特徴とする、請求項３２に記載の核酸。
【請求項３４】
請求項３２または３３に記載の核酸並びに前記核酸の発現に必要なエレメントを含むことを特徴とする、真核または原核発現ベクター。
【請求項３５】
前記ベクターが、ウイルスベクター、特に、鶏痘、カナリア痘、もしくはＭＶＡ（改変されたワクシニアウイルスアンカラ）ベクター、アデノウイルスベクター、麻疹ベクター、またはＣＭＶ（サイトメガロウイルス）ベクターから選択されるポックスベクターである、請求項３４に記載の真核または原核発現ベクター。
【請求項３６】
前記ベクターが、請求項３２または３３に記載の変異ＥＮＶタンパク質もしくはその断片をコードする核酸配列、特に、配列番号１０３または配列番号１０５により示される変異ＦｅＬＶ  ＥＮＶ、並びに、場合により、前記の変異ＥＮＶと同じウイルスを起源とするＧＡＧタンパク質をコードする核酸を含む、ウイルスベクター、特にカナリア痘ベクターである、請求項３４または３５に記載の真核または原核発現ベクター。
【請求項３７】
請求項３２もしくは３３に記載の核酸、または、請求項３４〜３６のいずれか１項に記載の真核もしくは原核発現ベクターを含むことを特徴とする、組換え細胞。
【請求項３８】
活性物質として、
請求項１〜１４のいずれか１項に記載の少なくとも１種類のポリペプチド、または
請求項１５〜３１のいずれか１項に記載の少なくとも１種類の変異ＥＮＶタンパク質もしくはその断片、または
請求項３２もしくは３３に記載の少なくとも１種類の核酸、または
請求項３４〜３６のいずれか１項に記載の少なくとも１種類の原核もしくは真核発現ベクター、または
請求項３７に記載の少なくとも１種類の組換え細胞を、
薬学的に許容されうる担体と共に含む、医薬またはワクチン組成物。
【請求項３９】
ウイルス疾患の予防および／または処置を目的とした医薬またはワクチンの製造のための、請求項１５〜２７のいずれか１項に記載の変異ＥＮＶタンパク質もしくはその断片を含むか、またはそれらから構成される少なくとも１種類のタンパク質、または、前記タンパク質をコードする核酸の使用。
【請求項４０】
ウイルス疾患がＨＴＬＶまたはＦｅＬＶ感染である、請求項３９に記載の使用。
【請求項４１】
癌の予防および／または処置を目的とした医薬またはワクチンの製造のための、請求項１８または１９に記載の変異ＥＮＶタンパク質もしくはその断片を含むか、またはそれらから構成される少なくとも１種類のタンパク質、または、前記タンパク質をコードする核酸の使用。
【請求項４２】
自己免疫疾患、アレルギーまたは移植片拒絶から選択される免疫系の阻害を必要とする病態の予防および／または処置を目的とした医薬またはワクチンの製造のための、請求項２８〜３１のいずれか１項に記載の変異ＥＮＶタンパク質もしくはその断片を含むか、またはそれらから構成される少なくとも１種類のタンパク質、または、前記タンパク質をコードする核酸の使用。
【請求項４３】
癌、ウイルス疾患、または自己免疫疾患、アレルギーもしくは移植片拒絶から選択される免疫系の阻害を必要とする病態の予防および／または処置を目的とした医薬の製造のための、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の少なくとも１種類のポリペプチド、または前記ポリペプチドをコードする核酸の使用。
【請求項４４】
癌、ウイルス疾患、または自己免疫疾患、アレルギーもしくは移植片拒絶から選択される免疫系の阻害を必要とする病態の予防および／または処置を目的とした医薬またはワクチンの製造のための、少なくとも１種類のタンパク質または前記タンパク質をコードする核酸の使用であって、前記タンパク質は、
−以下の配列：
【表１５】
2008506357.tif 000015
（式中、
アミノ酸Ｙ1〜Ｙ12は任意のアミノ酸を示し、アミノ酸Ｘ1はＥ、ＫまたはＱを示し、アミノ酸Ｘ2はＡを示す）
を実質的に含む免疫抑制性ＥＮＶタンパク質、
−あるいは、少なくとも７アミノ酸長であるその断片（ただし、前記断片は、アミノ酸Ｘ1および場合によりＸ2を有し、免疫抑制性である前記ＥＮＶタンパク質と類似した免疫抑制活性を有する）、
−あるいは、少なくとも１アミノ酸の挿入、欠失もしくは置換により、前記変異ＥＮＶタンパク質から得られた、前記変異ＥＮＶタンパク質と少なくとも８０％の配列同一性、特に少なくとも９０％の配列同一性を提示するタンパク質またはその断片（ただし、前記の得られたタンパク質は、アミノ酸Ｘ1および場合によりＸ2を有し、前記変異ＥＮＶタンパク質と類似した免疫抑制活性を有する）
を含むか、またはそれらから構成される、前記使用。
【請求項４５】
前記ＥＮＶタンパク質は、
ＨＥＲＶ−Ｔ  ＥＮＶ、例えば配列番号８４により示される配列、または
ＨＥＲＶ−Ｒ  ＥＮＶ、例えば配列番号８６により示される配列、または
ＨＥＲＶ−Ｖ  ＥＮＶ、例えば配列番号８８により示される配列、または
ＨＥＲＶ−Ｒ（ｂ）ＥＮＶ、例えば配列番号９０により示される配列、または
ＨＴＬＶ−１ＥＮＶ、例えば配列番号９２により示される配列、または
ＨＴＬＶ−２ＥＮＶ、例えば配列番号９４により示される配列、または
ＦｅＬＶ  ＥＮＶ、例えば配列番号９６により示される配列、または
ＰＥＲＶ  ＥＮＶ、例えば配列番号９８により示される配列、または
ＳＴＬＶ−１ＥＮＶ、例えば配列番号１００により示される配列、または
ＦＶ  ＥＮＶ、例えば配列番号１０２により示される配列
から選択される、請求項４４に記載の使用。
【請求項４６】
−ポリクローナルもしくはモノクローナル抗体、またはＦａｂもしくはＦ（ａｂ）2’断片であるそれらの断片
−ｓｃＦｖポリペプチド、
−アプタマー、
−結合ペプチド
から選択される、ＥＮＶタンパク質のリガンドの調製のための、請求項１〜１４のいずれか１項に記載のポリペプチドまたは請求項１５〜３１のいずれか１項に記載のタンパク質の使用。
【請求項４７】
対応する野生型ＥＮＶタンパク質には結合しない、請求項１５〜３１のいずれか１項に記載の変異ＥＮＶタンパク質に指向された、抗体もしくはその断片、またはｓｃＦｖポリペプチド。
【請求項４８】
ウイルスまたは腫瘍細胞の免疫抑制活性をモデュレーションしやすい化合物をスクリーニングするための、請求項１〜１４のいずれか１項に記載のポリペプチドまたは請求項１５〜３１のいずれか１項に記載のタンパク質の使用。
【請求項４９】
ウイルスまたは腫瘍細胞の免疫抑制活性をモデュレーションしやすい化合物をスクリーニングするための、請求項４７に記載の抗体もしくはその断片、またはｓｃＦｖポリペプチドの使用。
【請求項５０】
スクリーニングすべき化合物が、ペプチド、特に５〜３０アミノ酸を含むペプチドである、請求項４８または４９に記載の使用。
【請求項５１】
前記ペプチドが、コンビナトリアルペプチドライブラリーを起源とする、請求項５０に記載の使用。