【誤訳訂正書】
【提出日】平成23年8月22日(2011.8.22)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【書類名】  明細書
【発明の名称】  ゲルスポットピッカー
【特許請求の範囲】
【請求項１】  サンプル分析用の分析装置で使用されるゲルシート（１）であって、ゲルシート（１）上又はゲルシート（１）内に少なくとも２つの基準マーク（５'−５'''）が設けられており、上記基準マーク（５'−５'''）が、分析すべきサンプルから構成されていないことを特徴とする、ゲルシート（１）。
【請求項２】  上記ゲルシート（１）が少なくとも３つの基準マーク（５'−５'''）を有することを特徴とする、請求項１記載のゲルシート。
【請求項３】  上記基準マークの少なくとも一つ（５'''）が、上記基準マークの他の２つ（５'、５''）を結ぶ直線の一方の側に位置することを特徴とする、請求項２記載のゲルシート。
【請求項４】  上記ゲルシート（１）を脱染プロセスで処理された後に上記基準マーク（５'−５'''）が検出可能であることを特徴とする、請求項１乃至請求項３のいずれか１項記載のゲルシート。
【請求項５】  ゲルシート（１）からサンプルスポット（３）を抽出する方法であって、
ａ）サンプルからは構成されない少なくとも２つの基準マーク（５'−５'''）を、ゲルシート（１）の表面上又はゲルシート（１）内部に設けるステップと、
ｂ）走査装置内で上記基準マーク（５'−５'''）間の距離（ｄ１−ｄ３）と、各々のサンプルスポット（３）と上記基準マーク（５'−５'''）との間の距離を測定し、それらの距離をメモリに格納するステップと、
ｃ）上記ゲルシートをスポットピッカー装置に移動するステップと、
ｄ）上記スポットピッカー装置内で上記基準マーク（５'−５'''）間の距離（ｄ１'−ｄ３'）を測定するステップと、
ｅ）ゲルシート（１）がどの程度変形したかを計算するために上記走査装置内での上記基準マーク（５'−５'''）間の距離（ｄ１−ｄ３）と上記スポットピッカー装置内での上記基準マーク（５'−５'''）間の距離（ｄ１'−ｄ３'）とを比較するステップと、
ｆ）ステップｅ）で計算された変形を基に各々のサンプルスポットに対する新しい位置を計算するステップと、
ｇ）ステップｆ）で計算された各々のサンプルスポットに対する新しい位置に、スポットピッカーヘッドを配置しサンプルスポットを抽出するステップと
を含むことを特徴とする方法。
【請求項６】  ステップｇ）を実施する前に上記ゲルシート（１）を脱染するステップを実施することを特徴とする、請求項５記載の方法。
【請求項７】  請求項５又は請求項６記載の方法で用いられる基準マークであって、当該基準マークが、上記ゲルシート内又はゲルシート上に配置することができるラベルであり、上記方法で分析されるサンプルからは構成されず、１種以上の染料を含む少なくとも一つの層を備え、上記染料が、Ｃｙ２染料、Ｃｙ３染料、Ｃｙ５染料、Ｓｙｐｒｏルビー／レッド染料、及びＳｙｐｒｏオレンジ／タンジェリン染料からなる群から選択されることを特徴とする、基準マーク。
【請求項８】  自動接着性のラベルを含むことを特徴とする、請求項７記載の基準マーク。
【請求項９】  ゲルからサンプルスポットを抽出するシステムであって、
ゲルスキャナ（９）、及び画像化手段とスポットピッカー（１５）とを備えるスポットピッカー装置（１１）を含み、
上記スキャナ（９）により走査されるゲルの画像上の請求項７又は請求項８記載の基準マーク（５'−５'''）の位置と、上記画像化手段（１３）により生成される上記ゲルの画像上の同じ基準マークの画像とを相関付けるためのソフトウエアを備える制御装置を含む、システム。
【発明の詳細な説明】
【０００１】
【技術分野】
本発明は、ゲルシート、及びゲルシートからゲルプラグを拾い出す方法に関する。
【０００２】
２次元電気泳動のような、多くの生化学分析方法は、分析対象物質がスポットに群れをなすゲルシートの形態を、結果として生成する。関心対象たる物質のスポットを含むゲルの円筒プラグを切り出して抽出し、更なる分析のためのマイクロタイタープレートや試験管のような他の装置にそのプラグを移すことにより、物質の更なる分析が為され得る。
【０００３】
関心対象たるスポットを抽出する自動化システムでは、ゲルは、可視化するために関心対象の物質に吸収され得る着色染料で処理され得る。ゲルシートは走査され得、走査結果はコンピュータプログラムで分析され、そのプログラムはスポットの座標を計算する。ゲルは、スポットピッカーと呼ばれるスポット抽出装置に移動され得、関心対象のスポットの座標が、スポットピッカーを制御するコンピュータの中にロードされる。コンピュータはスポットピッカーのスポット抽出ヘッドの移動を制御し、抽出される予定の各々のスポットの座標にまで動くようにスポット抽出ヘッドに指示する。スポットを含むゲルのプラグは、次のようにしてゲルシートから引き抜かれる。つまり、スポットピッカーヘッド上の円筒中空ニードルを、ゲルを覆う液体とゲルとを通過して支持ベースプレートに達するまで引き下げ、ベースプレートからニードルの中へプラグを引き上げニードルの先端近辺のバルクヘッドで捉えるために、ニードルの上方端部に吸い出し作用を加えることによる。続いてプラグは、スポットピッカーヘッドによって、マイクロタイタープレートのウエルや試験管の上部の位置に移動され、ニードルの上方部に付加される与圧液体によりニードルから排出される得る。それからスポットから脱染できる。ゲルシートから正確な材料が確実に引き抜かれるように、スポットピッカーは０．１ｍｍ若しくはそれ以上の精度で配置されるべきである。
【０００４】
この方法に対する問題点は、スキャナ及びスポットピッカーの両方に対して、複雑且つ費用のかかる機械工学的に高い精度が要求されるということである。更に、ゲルの形状は、スキャナとスポットピッカーとの間の輸送の間に変動し得る。このことは、スポットは新しい座標に移動し、不正確なゲルのプラグが抽出されることになる、ということを意味する。更に、スポットがゲルから引き上げられた後のスポットの個別の脱染は、時間がかかる。本発明はこれらの問題点を克服することを目的とする。
【０００５】
【発明の概要】
本発明は、請求項１の特徴的な部分の特性を備えるゲルシートにより先行技術の装置の問題を解決する。本発明に係る方法は、請求項６の特徴的な部分に示される特性を有する。ゲル及び方法にて利用される基準マークは、請求項７の特徴的な部分に示される特性を有する。方法を実施するシステムは、請求項１０に示される特性を有する。
【０００６】
本発明により、スキャナのための単純化されたガイドとスポットピッカーが利用される、即ち、ガイドの利用により備品の装着が除去可能になり、よって、器具のコストが減少しゲルの取り扱いがスピードアップする。更に、ゲルの形状が走査の際とスポット抽出の際との間で変動しても、スポットは抜き取り可能である。更に、本発明に係る装置の実施形態では、脱染後でもスポットを抜き取ることが可能である。
【０００７】
【発明の実施の形態】
図１は、本発明に係るゲルシート１の平面図を示す。ゲルシート１は、例えば、２次元電気泳動で利用され、サンプルの電気泳動化成分をスキャナに認識できるように続いて着色されたフレーム２内のゲルのシートでもよく、電気泳動に先立ち染料でラベル付けされたプロテインを含むゲルのシートでもよい。サンプルのこれらの成分は、スポット３として現れており、それらを分析するには、スポットを含むゲルのプラグを除去することが必要である。このことは、図３に示されるようなスキャナ９のベッド７の上のゲルシート１を走査し、スキャナ９により識別されるスポット３位置を制御装置１０の中のコンピュータメモリのような格納手段内に記録することにより、為される。この格納された位置は、スポットピッカー装置の制御装置により、後で利用され得る。本発明では、走査が為される前に、ゲルシート１には、ゲルの表面上に、又はゲルの中に、又はゲルの下の面上に、適宜の方法でプリントされ、又はペイントされ、又は刺され、又は貼付される基準マーク５'−５'''が設定される。それで、それら基準マーク５'−５'''はスキャナにより認識可能に且つ検出可能になる。ゲルシートをどんなに変形しても、これら基準マーク５'−５'''はそれに続く。ゲルが走査されるとき、スキャナ９の制御装置１０と関連するソフトウエアは、スポットの座標を基準マークに関連付け、基準マークの間の距離（ｄ１、ｄ２、ｄ３）も計測される。換言すると、各々のスポットの位置が、基準マーク５'−５'''の位置と相関させられ得る。例えば、画像ソフトウエアは、基準マーク５'を基準マーク５”に結合する画像線は（点線により示される）Ｙ軸の基本線を表し、基準マーク５”を基準マーク５'''に結合する画像線は（破線により示される）Ｘ軸の基本線を表すと、みなし得る。よって、各々のスポット３の位置は各々の基本線に関連付けられメモリに格納され得ることが可能である。所望であれば、ゲル全体を脱染できる。ゲルと、制御装置１０の中に格納されるスポットの位置に係る情報は、カメラ１３が備わるスポットピッカー装置１１（図４参照）へ移動され得る。カメラ１３は、スポットピッカー制御装置１０'の中の画像ソフトウエアと共に利用され、基準マーク５'−５'''を識別してそれらの間の距離（ｄ１'、ｄ２'、ｄ３'）を計測する。それらの間の距離（ｄ１'、ｄ２'、ｄ３'）がスキャナで計測されそのメモリに格納された距離（ｄ１、ｄ２、ｄ３）と同じならば、ゲルシート１は変形しておらず移動可能のスポットピッカーヘッド１５はスポットピッカー制御装置１０'のメモリの中に格納された位置にてスポットを抽出するのに利用され得る、と想定され得る。しかしながら、図２に示すように、ゲルシートが変形してしまうと、距離（ｄ１'、ｄ２'、ｄ３'）のうちの一部又は全部が、格納されている距離（ｄ１、ｄ２、ｄ３）と異なってしまう。このことは、スポット３はメモリ内に格納された位置に最早存在しないことを意味する。スポットピッカー装置は、基準マーク５'−５'''の古い位置と新しい位置との間の相関付けを為し得個々のスポットの新しい位置を計算し得るソフトウエアが備わる。例えば、ゲルがＸ方向及びＹ方向の両方で５％斜めになっているとソフトウエアが計算すると、やはり５％斜めにされた個々のスポット３の新しい位置をソフトウエアが計算する。よってこれらの新しい位置は、スポットを脱染してもはや認識不可能であっても、スポットピッカーヘッドをスポットへガイドするのに利用され得る。更に、スキャナ９からスポットピッカー１１へ移動した後、スポットピッカー１１のＸ軸及びＹ軸に係るフレーム２の方向が、スキャナのＸ軸及びＹ軸に係る方向と異なっていても、スポットピッカーソフトウエアが、カメラ１３からの画像の中の基準マーク５'−５'''を識別しこれらの基準マーク５'−５'''と関連するスポットの位置を計算することが、可能である。ソフトウエアが如何なるアラインメントの誤りも補正するのでスキャナ又はスポットピッカーの軸にフレーム２を整列させる時間も備品も要求されない、ということをこのことは意味する。
【０００８】
３つの基準マークを利用する実施形態により本発明を示したが、ゲルがいかに変形したかをより正確に識別するのにより多くに基準マークを利用することは、もちろん可能である。最も良い結果を得るには、少なくとも一つの基準マークが、２次元の基準フレームを設定するため２つの他の基準マークを結ぶ直線の一方の側に位置しなければならない。
【０００９】
しかしながら、ゲルが長く薄いストリップの形態であるなら、狭い横方向の軸でのゲルの変形は無視できると仮定できるとして、２つの長手方向に分かれた基準マークのみを利用することも可能である。ゲルが実質上固定されるように背部に固着されるならば、２つの基準マークのみが基準フレームを確立するのに必要である。
【００１０】
更に、基準マークは図面に示される形状に限定されず、例えば、矩形、十字、三角、英数文字など、どのような適切な形状であってもよい。
【００１１】
利用されるスキャナ及びカメラのタイプに依存するが、基準マークは採色されても蛍光材料で作成されてもよい。というのは、ゲルを脱染プロセスで処理した後も基準マークはまだ可視状態でなければならないからである。基準マークは、一方の側面にはプリント若しくはペイントが施され、他の一方の側面にはゲルや、ゲルが十分透明である場合には、底の支持部に接着せしめる接着剤を備えるラベルの形態であってもよい。基準マークは、ゲルを走査するのに利用される光の波長と走査方法に依存して、異なる染料や色彩でコートされ得る。可視光が利用されるなら、基準マークは、対照色、例えば白と黒からなる１種以上の顔料を含む。ある波長の励起紫外光（例えば、４８０ｎｍ、５３０ｎｍ、６２０ｎｍなど）が、ゲル内の関心対象たる染められたスポットを別の波長（例えば、５３０ｎｍ、５９０ｎｍ、６８０ｎｍなど）で蛍光させるのに利用されるならば、基準マークは、染料、即ち、同じ波長で蛍光するサンプル（例えば、Ｃｙ２、Ｃｙ３、Ｃｙ５など）を染めるのに利用される同じ染料を含み得る。基準マークは１種以上の染料若しくは顔料を含み得ることも想定され得る。例えば、基準マークは、以下の染料若しくは顔料の１種以上を含む混合体でプリント若しくはペイントされ得る。Ｃｙ２染料、Ｃｙ３染料、Ｃｙ５染料、Ｓｙｐｒｏルビー／レッド染料、Ｓｙｐｒｏオレンジ／タンジェリン染料、マジェンタ顔料（例えば、Ｒａｄｉａｎｔ  ＣｏｌｏｒｓのＳＰＬ  ２１Ｎ／ＪＳＴ  １８）、シャルトルーズ顔料（例えば、Ｒａｄｉａｎｔ  ＣｏｌｏｒｓのＳＰＬ  １７Ｎ／ＪＳＴ  １０）などである。顔料及び染料は、（例えば、Ａｋｚｏ  ＮｏｂｅｌのＵＶＦ００１０６などの）ワニスで溶融され、それからラベル上にペイント又はプリントされ基準マークを形成する。ワニスでは殆ど溶融しない染料もあるが、その場合ジメチルスポキシド（ＤＭＳＯ）のような別の溶媒でそれらを溶融する。それら別の溶媒はワニスと非常によく混合する。一方で、染料や顔料は別の溶媒で溶融して続いて塗布されラベル上に別の層を形成する。異なる染料及び顔料の相対割合は、走査の間には基準マークが、利用される通常の励起光波長の基準マークに関係無く実質的に同じ画素強度を有するように選択されるのが好ましい。このことにより、どんな走査波長に対しても同じラベルを利用するという単純化が実現され、異なる励起波長を利用し更に結果を記録する同じカメラを利用して、同じサンプルを多数回走査することも可能になる。
【００１２】
本発明は、上述の実施形態に限定されず、添付の請求項に定義されるように発明の範囲から乖離することなく多くの変更や修正を為すことが可能である。
【図面の簡単な説明】
【図１】  本発明に係るゲルシートの実施形態についての平面図を模式的に示す。
【図２】  変形後の図１のゲルシートを示す。
【図３】  本発明に係るゲルスキャナの実施形態を示す。
【図４】  本発明に係るゲルピッカーの実施形態を示す。
【符号の説明】
１・・・ゲルシート、３・・・スポット、５'、５''、５'''・・・基準マーク、９・・・ゲルスキャナ、１１・・・スポットピッカー装置、１３・・・カメラ、１５・・・スポットピッカー。