【手続補正書】
【提出日】平成23年5月2日(2011.5.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
結合相互作用をスクリーニングする方法であって、当該方法が；
一意的に同定可能な微粒子の複数の組み合わせを調製し、すなわち、ある組み合わせに含まれる当該微粒子が、一意的に同定可能な同じ特性を有しており、また、一つまたはそれ以上の組み合わせが、微粒子の一部を含み、そして、当該微粒子の一部が、生体試料に含まれる標的分子に対する結合パートナーとして機能する少なくとも一つのユニークプローブを提供する、一意的に同定可能な微粒子の複数の組み合わせを調製し、
当該微粒子の複数の組み合わせを、生体試料に含まれる標的分子がプローブに結合できる条件下で、生体試料と接触せしめ、
当該標的分子と当該プローブとの間の結合相互作用を示すシグナルの出現によって、生体試料に含まれる標的分子と当該微粒子上のプローブとの間の結合を検出し、
当該微粒子に関する結合相互作用を示すシグナルを評価し、
当該結合相互作用を示すシグナルが、当該生体試料に含まれる一つまたはそれ以上の標的分子の存在を示す選択した閾値よりも大きい一意的に同定可能な微粒子の組み合わせを決定し、および
当該結合相互作用を示す一意的に同定可能な微粒子の組み合わせの数を決定する、
工程を含む、結合相互作用をスクリーニングする方法。
【請求項２】
前記プローブが、配列特異的オリゴヌクレオチド(ＳＳＯ)プローブ、ＳＳＯプライマー、ペプチド抗原、および、タンパク質抗原からなるグループから選択される請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記生体試料が、試料ＤＮＡであり、また、前記結合相互作用が、当該試料ＤＮＡと前記ＳＳＯプローブとの間のハイブリダイゼーションである請求項２に記載の方法。
【請求項４】
以下の工程、すなわち；
一意的に同定可能な微粒子の一つまたはそれ以上の組み合わせに関する結合相互作用において最大のシグナルを示す微粒子の１００％未満の割合を選択し、および
選択した割合において当該結合相互作用を示すシグナルが、前記生体試料に含まれる一つまたはそれ以上の標的分子の存在を示す選択した閾値よりも大きい一意的に同定可能な微粒子の当該組み合わせを決定する、
工程をさらに含む請求項１乃至３のいずれかに記載の方法。
【請求項５】
微粒子の組み合わせに関して選択した前記割合が、微粒子の組み合わせに対するユニークプローブを提供する微粒子の一部の数の逆数と同等またはそれ未満である請求項４に記載の方法。
【請求項６】
ＤＮＡを利用した組織適合検査方法であって、当該方法が；
一意的に同定可能な微粒子の複数の組み合わせを調製し、すなわち、ある組み合わせに含まれる当該微粒子が、一意的に同定可能な同じ特性を有しており、また、一つまたはそれ以上の組み合わせが、微粒子の一部を含み、そして、当該微粒子の一部が、組織適合検査用抗原対立遺伝子とハイブリダイズするように選択された少なくとも一つのユニーク配列特異的オリゴヌクレオチド(ＳＳＯ)を提供する、一意的に同定可能な微粒子の複数の組み合わせを調製し、
当該微粒子の複数の組み合わせを、ハイブリダイゼーション条件下で、試料ＤＮＡと接触せしめ、
当該試料ＤＮＡとＳＳＯとの間のハイブリダイゼーションを示すシグナルの出現によって、当該微粒子での当該試料ＤＮＡとＳＳＯとの間のハイブリダイゼーションを検出し、
当該微粒子に関する当該試料ＤＮＡとＳＳＯとの間のハイブリダイゼーションを示すシグナルを評価し、
当該試料ＤＮＡ/ＳＳＯハイブリダイゼーションを示すシグナルが、当該試料に含まれる一つまたはそれ以上の組織適合検査用抗原対立遺伝子の存在を示す選択した閾値よりも大きい一意的に同定可能な微粒子の組み合わせを決定し、および
当該ＤＮＡ/ＳＳＯハイブリダイゼーションを示す一意的に同定可能な微粒子の組み合わせの数を決定する、
工程を含む、ＤＮＡを利用した組織適合検査方法。
【請求項７】
以下の工程、すなわち；
一意的に同定可能な微粒子の少なくとも一つの組み合わせに関するＤＮＡ/ＳＳＯハイブリダイゼーションにおいて最大のシグナルを示す微粒子の１００％未満の割合を選択し、および
選択した割合において当該ＤＮＡ/ＳＳＯハイブリダイゼーションを示すシグナルが、前記生体試料に含まれる一つまたはそれ以上の組織適合検査用抗原の存在を示す選択した閾値よりも大きい一意的に同定可能な微粒子の当該組み合わせを決定する、
工程をさらに含む請求項６に記載の方法。
【請求項８】
一意的に同定可能な微粒子の少なくとも一つの組み合わせに含まれる少なくとも二つの微粒子の一部が、１：１以外の一定の数値的比率で存在する請求項１乃至７のいずれかに記載の方法。
【請求項９】
ＤＮＡを利用した組織適合検査方法であって、当該方法が；
一意的に同定可能な微粒子の複数の組み合わせを調製し、すなわち、ある組み合わせに含まれる当該微粒子が、一意的に同定可能な同じ特性を有しており、また、一つまたはそれ以上の組み合わせが、微粒子の一部を含み、そして、当該微粒子の一部が、組織適合検査用抗原対立遺伝子とハイブリダイズするように選択された少なくとも一つのユニーク配列特異的オリゴヌクレオチド(ＳＳＯ)を提供する、一意的に同定可能な微粒子の複数の組み合わせを調製し、
当該微粒子の複数の組み合わせを、ハイブリダイゼーション条件下で、試料ＤＮＡと接触せしめ、
当該試料ＤＮＡとＳＳＯとの間のハイブリダイゼーションを示すシグナルの出現によって、当該微粒子での当該試料ＤＮＡとＳＳＯとの間のハイブリダイゼーションを検出し、
当該微粒子に関する当該試料ＤＮＡとＳＳＯとの間のハイブリダイゼーションを示すシグナルを評価し、
一意的に同定可能な微粒子の当該組み合わせに関する試料ＤＮＡ/ＳＳＯハイブリダイゼーションにおいて最大のシグナルを示す微粒子の１００％未満の割合を選択し、
当該試料ＤＮＡ/ＳＳＯハイブリダイゼーションを示すシグナルが、当該試料に含まれる一つまたはそれ以上の組織適合検査用抗原対立遺伝子の存在を示す選択した閾値よりも大きい一意的に同定可能な微粒子の組み合わせを決定し、および
当該ＤＮＡ/ＳＳＯハイブリダイゼーションを示す一意的に同定可能な微粒子の組み合わせの数を決定する、
工程を含む、ＤＮＡを利用した組織適合検査方法。
【請求項１０】
一意的に同定可能な微粒子の少なくとも一つの組み合わせに含まれる少なくとも二つの微粒子の一部が、１：１以外の一定の数値的比率で存在し、かつ、当該比率が、微粒子の組み合わせにおいて選択した割合を決定する請求項７乃至９のいずれかに記載の方法。
【請求項１１】
前記プローブまたは前記組織適合検査用抗原が、ＨＬＡ抗原、ＨＮＡ抗原、血液型判定用抗原、ＴＣＲ抗原、および、ＫＩＬ抗原からなるグループから選択される請求項１乃至１０のいずれかに記載の方法。
【請求項１２】
ＤＮＡを利用した組織適合検査方法、すなわち、試料ＤＮＡがコードする組織適合検査用抗原対立遺伝子を同定するために、ユニーク配列特異的オリゴヌクレオチド(ＳＳＯ)を提供し、かつ一意的に同定可能な微粒子の多様な組み合わせと当該試料ＤＮＡとを接触せしめ、および、同定可能な微粒子の当該組み合わせに対して提供したＳＳＯと、当該試料ＤＮＡに含まれる対立遺伝子とのハイブリダイゼーションの有無を決定する、工程を含むＤＮＡを利用した組織適合検査方法において、以下の工程、すなわち；
一意的に同定可能な同じ特性を有している一意的に同定可能な微粒子の複数の組み合わせを調製し、すなわち、当該組み合わせが、微粒子の一部を含み、そして、当該微粒子の一部が、ＨＬＡ対立遺伝子とハイブリダイズするように選択された少なくとも一つのユニーク配列特異的オリゴヌクレオチド(ＳＳＯ)を提供する、一意的に同定可能な微粒子の複数の組み合わせを調製し、
当該微粒子の複数の組み合わせを、ハイブリダイゼーション条件下で、試料ＤＮＡと接触せしめ、
当該試料ＤＮＡとＳＳＯとの間のハイブリダイゼーションを示すシグナルの出現によって、当該微粒子での当該試料ＤＮＡとＳＳＯとの間のハイブリダイゼーションを検出し、
当該微粒子に関する当該試料ＤＮＡとＳＳＯとの間のハイブリダイゼーションを示すシグナルを評価し、
当該試料ＤＮＡ/ＳＳＯハイブリダイゼーションを示すシグナルが、当該試料に含まれる一つまたはそれ以上のＨＬＡ対立遺伝子の存在を示す選択した閾値よりも大きい一意的に同定可能な微粒子の組み合わせを決定し、および
当該ＤＮＡ/ＳＳＯハイブリダイゼーションを示す一意的に同定可能な微粒子の組み合わせの数を決定する、
工程を含む、ＤＮＡを利用した組織適合検査方法。
【請求項１３】
ハイブリダイゼーションの陽性シグナルを伝達する工程をさらに含む請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記同定可能なプローブの組み合わせに対して最大のシグナルを示す微粒子の割合を選択する工程をさらに含む請求項１２または１３に記載の方法。
【請求項１５】
微粒子の組み合わせに関して選択した前記割合が、微粒子の組み合わせに対するユニークＳＳＯを提供する微粒子の一部の数の逆数と同等またはそれ未満である請求項７乃至１４のいずれかに記載の方法。
【請求項１６】
結合相互作用を評価する方法を実施するためのキットであって、一意的に同定可能な同じ特性を有している一意的に同定可能な微粒子の複数の組み合わせ、すなわち、当該組み合わせが、微粒子の一部を含み、そして、当該微粒子の一部が、生体試料に含まれる標的分子に対して結合する少なくとも一つのユニークプローブを提供する一意的に同定可能な微粒子の複数の組み合わせを含むキット。
【請求項１７】
前記標的分子が、ＨＬＡ抗原、ＨＬＡ対立遺伝子、ＨＮＡ抗原、ＨＮＡ対立遺伝子、血液型判定用抗原、ＴＣＲ、および、ＫＩＬからなるグループから選択される請求項１６に記載のキット。
【請求項１８】
前記プローブが、配列特異的オリゴヌクレオチド(ＳＳＯ)プライマー、ペプチド抗原、および、タンパク質抗原からなるグループから選択される請求項１６または１７に記載のキット。
【請求項１９】
ＤＮＡを利用した組織適合検査方法を実施するためのキットであって、一意的に同定可能な同じ特性を有している一意的に同定可能な微粒子の複数の組み合わせ、すなわち、当該組み合わせが、微粒子の一部を含み、そして、当該微粒子の一部が、組織適合検査用抗原対立遺伝子とハイブリダイズするように選択された少なくとも一つのユニーク配列特異的オリゴヌクレオチド(ＳＳＯ)を提供する一意的に同定可能な微粒子の複数の組み合わせを含むキット。
【請求項２０】
前記組織適合検査用抗原が、ＨＬＡ、ＨＮＡ、血液型判定用抗原、ＴＣＲ、および、ＫＩＬからなるグループから選択される請求項１９に記載のキット。