【手続補正書】
【提出日】平成23年10月13日(2011.10.13)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
プレグナンＸ受容体（ＰＸＲ）タンパク質またはそのフラグメントを調整する化合物またはその塩をスクリーニングする方法であって、該ＰＸＲ受容体を１つまたは複数の候補化合物と接触させる工程、および該ＰＸＲ受容体を調整する化合物またはその塩を選択する工程を含む、方法。
【請求項２】
前記候補化合物がリファマイシンアナログを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記調整が、ＰＸＲタンパク質またはそのフラグメントのリファマイシンアナログへの結合によって誘導されるシグナル伝達の調整を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記ＰＸＲ受容体が、膜に結合し、トランスジェニックマウス中に存在し、アッセイプレート中に存在し、細胞中に存在し、そして／または人工膜中に存在する、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記ＰＸＲタンパク質が、配列アクセッション番号Ｏ７５４６９、Ｑ８ＳＱ０１、Ｑ９Ｒ１Ａ７、Ｏ５４９１５、ＮＰ＿１４８９３４、ＮＰ＿００３８８０もしくはＮＰ＿０７１２８５、またはそのフラグメントもしくは改変体によって示されるアミノ酸配列、あるいは配列アクセッション番号ＮＭ＿０３３０１３、ＮＭ＿００９８０３、ＮＭ＿０２２００２、ＮＭ＿００３８８９、ＣＳ６１８１３７、ＣＳ６１８１３５、ＣＳ６１８１３３、またはそのフラグメントもしくは改変体によって示される核酸を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
ＣＹＰ３Ａ１１、ＧＳＴＡ１、ＭＲＰ２、およびＯＡＴＰ２が全て上方制御された、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
リファキシミンでの前処理をさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
候補化合物での前記ＰＸＲ受容体タンパク質の前処理をさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記候補化合物での前処理が、ＣＹＰ３Ａ基質ミダゾラムの薬物動態に影響を及ぼさない、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記候補化合物での前処理が、１’−ヒドロキシミダゾラムのＣｍａｘを増加させ、Ｔｍａｘを減少させる、請求項８に記載の方法。
【請求項１１】
ＣＹＰ３Ａ１１が、前記候補化合物での処理後、コントロールと比較して約１倍〜約４倍増加する、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
候補化合物での処理後にＧＳＴＡ１  ｍＲＮＡが上方制御される、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
前記上方制御が約６５％〜約２００％の範囲である、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
候補化合物処理後に腸内ＭＲＰ２  ｍＲＮＡが上方制御される、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
ＰＸＲ受容体タンパク質またはその活性フラグメントおよびリファマイシンアナログを含む、ＰＸＲ受容体またはそのフラグメントを調整する化合物またはその塩をスクリーニン
グするためのキット。
【請求項１６】
プレグナンＸ受容体（ＰＸＲ）タンパク質またはそのフラグメントを調整する化合物またはその塩、もしくはＰＸＲタンパク質またはそのフラグメントのリファマイシンアナログへの結合によって誘導されるシグナル伝達を調整する化合物またはその塩を含む、ＰＸＲ関連障害を治療するための医薬。
【請求項１７】
プレグナンＸ受容体（ＰＸＲ）タンパク質またはそのフラグメントを調整する化合物またはその塩を含む、被験体のＰＸＲ関連障害を治療、予防、または緩和するための組成物。
【請求項１８】
前記調整が、ＰＸＲタンパク質またはそのフラグメントのリファマイシンアナログへの結合によって誘導されるシグナル伝達の調整を含む、請求項１７に記載の組成物。
【請求項１９】
前記ＰＸＲタンパク質が、配列アクセッション番号Ｏ７５４６９、Ｑ８ＳＱ０１、Ｑ９Ｒ１Ａ７、Ｏ５４９１５、ＮＰ＿１４８９３４、ＮＰ＿００３８８０もしくはＮＰ＿０７１２８５、またはそのフラグメントもしくは改変体によって示されるアミノ酸配列あるいは配列アクセッション番号ＮＭ＿０３３０１３、ＮＭ＿００９８０３、ＮＭ＿０２２００２、ＮＭ＿００３８８９、ＣＳ６１８１３７、ＣＳ６１８１３５、ＣＳ６１８１３３、またはそのフラグメントもしくは改変体によって示される核酸を含む、請求項１７に記載の組成物。
【請求項２０】
治療効果を生成するのに有効な量でＰＸＲタンパク質アゴニストを含む、組成物。
【請求項２１】
内因性プレグナンＸ受容体（ＰＸＲ）遺伝子のホモ接合性破壊を含む、トランスジェニックマウス。
【請求項２２】
前記マウスがヒトＰＸＲ遺伝子を含む、請求項２１に記載のトランスジェニックマウス。
【請求項２３】
請求項２１に記載のトランスジェニックマウスから単離した細胞または組織。
【請求項２４】
ＰＸＲ遺伝子またはＰＸＲ遺伝子発現産物の活性を調整することができる薬剤を同定する方法であって、
推定上の薬剤を請求項２２に記載のトランスジェニックマウスに投与する工程、
該薬剤を野生型コントロールマウスに投与する工程、および
該トランスジェニックマウスの生理学的応答をコントロールマウスの応答と比較する工程であって、該トランスジェニックマウスと該コントロールマウスとの間の生理学的応答の相違は、該薬剤が該遺伝子または遺伝子発現産物の活性を調整することができることの指標である、工程
を含む、方法。
【請求項２５】
腸疾患活性を有する薬物候補をスクリーニングする方法であって、
配列ＮＭ＿０３３０１３、ＮＭ＿００９８０３、ＮＭ＿０２２００２、ＮＭ＿００３８８９、ＣＳ６１８１３７、ＣＳ６１８１３５、ＣＳ６１８１３３からなる群から選択される核酸配列によってコードされるＰＸＲ遺伝子、またはＯ７５４６９、Ｑ８ＳＱ０１、Ｑ９Ｒ１Ａ７、Ｏ５４９１５、ＮＰ＿１４８９３４、ＮＰ＿００３８８０、ＮＰ＿０７１２
８５、そのフラグメントもしくは改変体を発現する細胞を提供する工程、
該細胞を薬物候補と接触させる工程、および
組織サンプル中のＢＤポリヌクレオチドの発現に対する該薬物候補の影響をモニタリングする工程
を含む、方法。
【請求項２６】
ＰＸＲポリペプチドに結合する、単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項２７】
前記抗体またはそのフラグメントが固体支持体に付着し、該抗体がモノクローナル抗体であり、該抗体がポリクローナル抗体であり、そして／または該抗体またはそのフラグメントが検出可能な標識をさらに含む、請求項２６に記載の単離抗体。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６１】
他の実施形態を以下に開示する。
本発明の好ましい実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
プレグナンＸ受容体（ＰＸＲ）タンパク質またはそのフラグメントを調整する化合物またはその塩をスクリーニングする方法であって、該ＰＸＲ受容体を１つまたは複数の候補化合物と接触させる工程、および該ＰＸＲ受容体を調整する化合物またはその塩を選択する工程を含む、方法。
（項目２）
前記候補化合物がリファマイシンアナログを含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記調整が、ＰＸＲタンパク質またはそのフラグメントのリファマイシンアナログへの結合によって誘導されるシグナル伝達の調整を含む、項目１に記載の方法。
（項目４）
前記ＰＸＲ受容体が、膜に結合し、トランスジェニックマウス中に存在し、アッセイプレート中に存在し、細胞中に存在し、そして／または人工膜中に存在する、項目１に記載の方法。
（項目５）
前記ＰＸＲタンパク質が、配列アクセッション番号Ｏ７５４６９、Ｑ８ＳＱ０１、Ｑ９Ｒ１Ａ７、Ｏ５４９１５、ＮＰ＿１４８９３４、ＮＰ＿００３８８０もしくはＮＰ＿０７１２８５、またはそのフラグメントもしくは改変体によって示されるアミノ酸配列、あるいは配列アクセッション番号ＮＭ＿０３３０１３、ＮＭ＿００９８０３、ＮＭ＿０２２００２、ＮＭ＿００３８８９、ＣＳ６１８１３７、ＣＳ６１８１３５、ＣＳ６１８１３３、またはそのフラグメントもしくは改変体によって示される核酸を含む、項目１に記載の方法。
（項目６）
ＣＹＰ３Ａ１１、ＧＳＴＡ１、ＭＲＰ２、およびＯＡＴＰ２が全て上方制御された、項目１に記載の方法。
（項目７）
リファキシミンでの前処理をさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目８）
候補化合物での前記ＰＸＲ受容体タンパク質の前処理をさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目９）
前記候補化合物での前処理が、ＣＹＰ３Ａ基質ミダゾラムの薬物動態に影響を及ぼさない、項目８に記載の方法。
（項目１０）
前記候補化合物での前処理が、１’−ヒドロキシミダゾラムのＣｍａｘを増加させ、Ｔｍａｘを減少させる、項目８に記載の方法。
（項目１１）
ＣＹＰ３Ａ１１が、前記候補化合物での処理後、コントロールと比較して約１倍〜約４倍増加する、項目１に記載の方法。
（項目１２）
候補化合物での処理後にＧＳＴＡ１  ｍＲＮＡが上方制御される、項目１に記載の方法。
（項目１３）
前記上方制御が約６５％〜約２００％の範囲である、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
候補化合物処理後に腸内ＭＲＰ２  ｍＲＮＡが上方制御される、項目１に記載の方法。
（項目１５）
ＰＸＲ受容体タンパク質またはその活性フラグメントおよびリファマイシンアナログを含む、ＰＸＲ受容体またはそのフラグメントを調整する化合物またはその塩をスクリーニン
グするためのキット。
（項目１６）
プレグナンＸ受容体（ＰＸＲ）タンパク質またはそのフラグメントを調整する化合物またはその塩、もしくはＰＸＲタンパク質またはそのフラグメントのリファマイシンアナログへの結合によって誘導されるシグナル伝達を調整する化合物またはその塩を含む、ＰＸＲ関連障害を治療するための医薬。
（項目１７）
プレグナンＸ受容体（ＰＸＲ）タンパク質またはそのフラグメントを調整する化合物またはその塩を投与する工程を含む、被験体のＰＸＲ関連障害を治療、予防、または緩和する方法。
（項目１８）
前記調整が、ＰＸＲタンパク質またはそのフラグメントのリファマイシンアナログへの結合によって誘導されるシグナル伝達の調整を含む、項目１７に記載の方法。
（項目１９）
前記ＰＸＲ受容体が、膜に結合し、トランスジェニックマウス中に存在し、アッセイプレート中に存在し、細胞中に存在し、そして／または人工膜中に存在する、項目１７に記載の方法。
（項目２０）
前記ＰＸＲタンパク質が、配列アクセッション番号Ｏ７５４６９、Ｑ８ＳＱ０１、Ｑ９Ｒ１Ａ７、Ｏ５４９１５、ＮＰ＿１４８９３４、ＮＰ＿００３８８０もしくはＮＰ＿０７１２８５、またはそのフラグメントもしくは改変体によって示されるアミノ酸配列あるいは配列アクセッション番号ＮＭ＿０３３０１３、ＮＭ＿００９８０３、ＮＭ＿０２２００２、ＮＭ＿００３８８９、ＣＳ６１８１３７、ＣＳ６１８１３５、ＣＳ６１８１３３、またはそのフラグメントもしくは改変体によって示される核酸を含む、項目１７に記載の方法。
（項目２１）
治療効果を生成するのに有効な量でＰＸＲタンパク質アゴニストを含む、組成物。
（項目２２）
内因性プレグナンＸ受容体（ＰＸＲ）遺伝子のホモ接合性破壊を含む、トランスジェニックマウス。
（項目２３）
前記マウスがヒトＰＸＲ遺伝子を含む、項目２２に記載のトランスジェニックマウス。
（項目２４）
項目２２に記載のトランスジェニックマウスから単離した細胞または組織。
（項目２５）
ＰＸＲ遺伝子またはＰＸＲ遺伝子発現産物の活性を調整することができる薬剤を同定する方法であって、
推定上の薬剤を項目２３に記載のトランスジェニックマウスに投与する工程、
該薬剤を野生型コントロールマウスに投与する工程、および
該トランスジェニックマウスの生理学的応答をコントロールマウスの応答と比較する工程であって、該トランスジェニックマウスと該コントロールマウスとの間の生理学的応答の相違は、該薬剤が該遺伝子または遺伝子発現産物の活性を調整することができることの指標である、工程
を含む、方法。
（項目２６）
腸疾患活性を有する薬物候補をスクリーニングする方法であって、
配列ＮＭ＿０３３０１３、ＮＭ＿００９８０３、ＮＭ＿０２２００２、ＮＭ＿００３８８９、ＣＳ６１８１３７、ＣＳ６１８１３５、ＣＳ６１８１３３からなる群から選択される核酸配列によってコードされるＰＸＲ遺伝子、またはＯ７５４６９、Ｑ８ＳＱ０１、Ｑ９Ｒ１Ａ７、Ｏ５４９１５、ＮＰ＿１４８９３４、ＮＰ＿００３８８０、ＮＰ＿０７１２
８５、そのフラグメントもしくは改変体を発現する細胞を提供する工程、
該細胞を薬物候補と接触させる工程、および
組織サンプル中のＢＤポリヌクレオチドの発現に対する該薬物候補の影響をモニタリングする工程
を含む、方法。
（項目２７）
ＰＸＲポリペプチドに結合する単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
（項目２８）
前記抗体またはそのフラグメントが固体支持体に付着し、該抗体がモノクローナル抗体であり、該抗体がポリクローナル抗体であり、そして／または該抗体またはそのフラグメントが検出可能な標識をさらに含む、項目２７に記載の単離抗体。