【手続補正書】
【提出日】平成22年12月16日(2010.12.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５３】
表１−ＰＩＫ４ＣＢを標的とする二本鎖ｓｉＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）
【表１】
2010532163.tif 000001
【表２】
2010532163.tif 000002
【表３】
2010532163.tif 000003
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５４】
表２−ＰＩＫ４ＣＡを標的とする二本鎖ｓｉＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）
【表４】
2010532163.tif 000004
【表５】
2010532163.tif 000005
【表６】
2010532163.tif 000006
【手続補正３】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
細胞におけるホスファチジルイノシトール４−キナーゼ（ＰＩ４Ｋ）の発現を阻害するための二本鎖リボ核酸（ｄｓＲＮＡ）であって、ここで、互いに相補的である少なくとも２個の配列を含み、ここで、センス鎖は第１の配列を含み、そしてアンチセンス鎖は、実質的にＰＩ４ＫをコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的である相補性領域を含む第２の配列を含み、ここで、該相補性領域は３０ヌクレオチド長未満であり、そして、該ＰＩ４Ｋ遺伝子を発現する細胞と接触すると、該ＰＩ４Ｋ遺伝子の発現を阻害する、ｄｓＲＮＡ。
【請求項２】
該第２の配列が実質的にヒトホスファチジルイノシトール４−キナーゼ、触媒的ベータポリペプチド（ＰＩＫ４ＣＢ）をコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的である配列を含む、請求項１に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項３】
該第１の配列および該第２の配列が表１からなる群から選択される、請求項２に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項４】
該ｄｓＲＮＡが少なくとも１個の修飾ヌクレオチドを含む、請求項２に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項５】
該ｄｓＲＮＡが少なくとも１個の修飾ヌクレオチドを含む、請求項３に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項６】
該修飾ヌクレオチドが２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチド、５’−ホスホロチオエート基を含むヌクレオチドおよびコレステリル誘導体またはドデカン酸ビスデシルアミド基と結合している末端ヌクレオチドの群から選択される、請求項４または５に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項７】
該修飾ヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロ修飾ヌクレオチド、２’−デオキシ−修飾ヌクレオチド、ロックされたヌクレオチド、非塩基性(abasic)ヌクレオチド、２’−アミノ−修飾ヌクレオチド、２’−アルキル−修飾ヌクレオチド、モルホリノヌクレオチド、ホスホロアミダートおよび非天然塩基を含むヌクレオチドの群から選択される、請求項４または５に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項８】
該第１の配列が表１からなる群から選択され、そして該第２の配列が表１からなる群から選択される、請求項４または５に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項９】
該アンチセンス鎖が実質的にヒトホスファチジルイノシトール４−キナーゼ、触媒的アルファポリペプチド（ＰＩＫ４ＣＡ）をコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的である配列を含む、請求項１に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項１０】
該第１の配列および該第２の配列が表２からなる群から選択される、請求項９に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項１１】
該ｄｓＲＮＡが少なくとも１個の修飾ヌクレオチドを含む、請求項９に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項１２】
該ｄｓＲＮＡが少なくとも１個の修飾ヌクレオチドを含む、請求項１０に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項１３】
該修飾ヌクレオチドが２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチド、５’−ホスホロチオエート基を含むヌクレオチドおよびコレステリル誘導体またはドデカン酸ビスデシルアミド基と結合している末端ヌクレオチドの群から選択される、請求項１１または１２に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項１４】
該修飾ヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロ修飾ヌクレオチド、２’−デオキシ−修飾ヌクレオチド、ロックされたヌクレオチド、非塩基性ヌクレオチド、２’−アミノ−修飾ヌクレオチド、２’−アルキル−修飾ヌクレオチド、モルホリノヌクレオチド、ホスホロアミダートおよび非天然塩基を含むヌクレオチドの群から選択される、請求項１１または１２に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項１５】
該第１の配列が表２からなる群から選択され、そして該第２の配列が表２からなる群から選択される、請求項１１または１２に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項１６】
請求項１または９に記載のｄｓＲＮＡを含む細胞。
【請求項１７】
ｄｓＲＮＡおよび薬学的に許容される担体を含む生物におけるホスファチジルイノシトール４−キナーゼ、触媒的ベータポリペプチド（ＰＩＫ４ＣＢ）遺伝子の発現を阻害するための医薬組成物であって、ここで、該ｄｓＲＮＡは互いに相補的である少なくとも２個の配列を含み、ここで、センス鎖は第１の配列を含み、そしてアンチセンス鎖は、実質的にＰＩ４ＫＣＢをコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的である相補性領域を含む第２の配列を含み、ここで、該相補性領域は３０ヌクレオチド長未満であり、そして、該ＰＩ４ＫＣＢ遺伝子を発現する細胞と接触すると、該ＰＩＫ４ＣＢの発現を少なくとも１０％阻害する医薬組成物。
【請求項１８】
該ｄｓＲＮＡの該第１の配列が表１からなる群から選択され、そして該ｄｓＲＮＡの該第２の配列が表１からなる群から選択される、請求項１７に記載の医薬組成物。
【請求項１９】
該ｄｓＲＮＡが少なくとも１個の修飾ヌクレオチドを含む、請求項１８に記載の医薬組成物。
【請求項２０】
ｄｓＲＮＡおよび薬学的に許容される担体を含む生物におけるホスファチジルイノシトール４−キナーゼ、触媒的アルファポリペプチド（ＰＩＫ４ＣＡ）遺伝子の発現を阻害するための医薬組成物であって、ここで、該ｄｓＲＮＡは互いに相補的である少なくとも２個の配列を含み、ここで、センス鎖は第１の配列を含み、そしてアンチセンス鎖は、実質的にＰＩＫ４ＣＡをコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的である相補性領域を含む第２の配列を含み、ここで、該相補性領域は３０ヌクレオチド長未満であり、そして、該ＰＩＫ４ＣＡ遺伝子を発現する細胞と接触すると、該ＰＩＫ４ＣＡの発現を少なくとも１０％阻害する医薬組成物。
【請求項２１】
該ｄｓＲＮＡの該第１の配列が表２からなる群から選択され、そして該ｄｓＲＮＡの該第２の配列が表２からなる群から選択される、請求項２０に記載の医薬組成物。
【請求項２２】
該ｄｓＲＮＡが少なくとも１個の修飾ヌクレオチドを含む、請求項２２に記載の医薬組成物。
【請求項２３】
細胞におけるホスファチジルイノシトール４−キナーゼ、触媒的ベータポリペプチド（ＰＩＫ４ＣＢ）遺伝子の発現を阻害するための方法であって：
（ａ）細胞に二本鎖リボ核酸（ｄｓＲＮＡ）を導入し、ここで、互いに相補的である少なくとも２個の配列を含み、ここで、センス鎖は第１の配列を含み、そしてアンチセンス鎖は、実質的にＰＩＫ４ＣＢをコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的である相補性領域を含む第２の配列を含み、ここで、該相補性領域は３０ヌクレオチド長未満であり、そして、該ＰＩＫ４ＣＢ遺伝子を発現する細胞と接触すると、該ＰＩＫ４ＣＢの発現を少なくとも４０％阻害する；そして、
（ｂ）工程（ａ）で製造される細胞をＰＩＫ４ＣＢ遺伝子のｍＲＮＡ転写の分解を達するために十分な時間維持し、それにより細胞におけるＰＩＫ４ＣＢ遺伝子の発現を抑制する、
ことを含む方法。
【請求項２４】
細胞におけるホスファチジルイノシトール４−キナーゼ、触媒的ベータポリペプチド（ＰＩＫ４ＣＡ）遺伝子の発現を阻害するための方法であって：
（ａ）細胞に二本鎖リボ核酸（ｄｓＲＮＡ）を導入し、ここで、互いに相補的である少なくとも２個の配列を含み、ここで、センス鎖は第１の配列を含み、そしてアンチセンス鎖は、実質的にＰＩＫ４ＣＡをコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的である相補性領域を含む第２の配列を含み、ここで、該相補性領域は３０ヌクレオチド長未満であり、そして、該ＰＩＫ４ＣＡ遺伝子を発現する細胞と接触すると、該ＰＩＫ４ＣＡの発現を少なくとも４０％阻害する；そして、
（ｂ）工程（ａ）で製造される細胞をＰＩＫ４ＣＡ遺伝子のｍＲＮＡ転写の分解を達するために十分な時間維持し、それにより細胞におけるＰＩＫ４ＣＡ遺伝子の発現を抑制する、
ことを含む方法。
【請求項２５】
治療または予防有効量のｄｓＲＮＡを処置、予防または管理を必要とする患者に投与することを含むプラス鎖ＲＮＡウイルス感染が介在する病理過程を処置するための方法であって、ここで、該ｄｓＲＮＡは互いに相補的である少なくとも２個の配列を含み、ここで、センス鎖は第１の配列を含み、そしてアンチセンス鎖は、実質的にホスファチジルイノシトール４−キナーゼ、触媒的ベータポリペプチド（ＰＩＫ４ＣＢ）をコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的である相補性領域を含む第２の配列を含み、ここで、該相補性領域は３０ヌクレオチド長未満であり、そして、ＰＩＫ４ＣＢ遺伝子を発現する細胞と接触すると、該ＰＩＫ４ＣＢの発現を阻害する方法。
【請求項２６】
該プラス鎖ＲＮＡウイルスがＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト・パピローマウイルス（ＨＰＶ）およびデング熱ウイルスから選択される、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
治療または予防有効量のｄｓＲＮＡを処置、予防または管理を必要とする患者に投与することを含むプラス鎖ＲＮＡウイルス感染が介在する病理過程を処置するための方法であって、ここで、該ｄｓＲＮＡは互いに相補的である少なくとも２個の配列を含み、ここで、センス鎖は第１の配列を含み、そしてアンチセンス鎖は、実質的にホスファチジルイノシトール４−キナーゼ、触媒的アルファポリペプチド（ＰＩＫ４ＣＡ）をコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的である相補性領域を含む第２の配列を含み、ここで、該相補性領域は３０ヌクレオチド長未満であり、そして、ＰＩＫ４ＣＡ遺伝子を発現する細胞と接触すると、該ＰＩＫ４ＣＡの発現を阻害する方法。
【請求項２８】
該プラス鎖ＲＮＡウイルスがＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト・パピローマウイルス（ＨＰＶ）およびデング熱ウイルスから選択される、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
細胞におけるホスファチジルイノシトール４−キナーゼ、触媒的ベータポリペプチド（ＰＩＫ４ＣＢ）遺伝子の発現を阻害するためのベクターであって、該ベクターはｄｓＲＮＡの少なくとも一本鎖をコードする核酸配列と作動可能に結合している調節配列を含み、ここで、該ｄｓＲＮＡの鎖の１個は実質的にＰＩＫ４ＣＢをコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的であり、ここで、該ｄｓＲＮＡは３０塩基対長未満であり、そして、ＰＩＫ４ＣＢ遺伝子を発現する細胞と接触すると、該ＰＩＫ４ＣＢの発現を抑制するベクター。
【請求項３０】
請求項２９に記載のベクターを含む細胞。
【請求項３１】
細胞におけるホスファチジルイノシトール４−キナーゼ、触媒的アルファポリペプチド（ＰＩＫ４ＣＡ）遺伝子の発現を阻害するためのベクターであって、該ベクターはｄｓＲＮＡの少なくとも一本鎖をコードする核酸配列と作動可能に結合している調節配列を含み、ここで、該ｄｓＲＮＡの鎖の１個は実質的にＰＩＫ４ＣＡをコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的であり、ここで、該ｄｓＲＮＡは３０塩基対長未満であり、そして、ＰＩＫ４ＣＡ遺伝子を発現する細胞と接触すると、該ＰＩＫ４ＣＡの発現を抑制するベクター。
【請求項３２】
請求項３１に記載のベクターを含む細胞。
【請求項３３】
細胞におけるホスファチジルイノシトール４−キナーゼ、触媒的ベータポリペプチド（ＰＩＫ４ＣＢ）遺伝子の発現レベルを減少させるための二本鎖リボ核酸（ｄｓＲＮＡ）であって、ここで、互いに相補的である少なくとも２個の配列を含み、ここで、センス鎖は第１の配列を含み、そしてアンチセンス鎖は、実質的にＰＩＫ４ＣＢをコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的である相補性領域を含む第２の配列を含み、そして、ＰＩＫ４ＣＢ遺伝子を発現する細胞と接触すると、該ＰＩＫ４ＣＢの発現レベルを減少させる二本鎖リボ核酸（ｄｓＲＮＡ）。
【請求項３４】
該接触がＰＩＫ４ＣＢの発現レベルを少なくとも４０％減少させる、請求項３３に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項３５】
該接触をインビトロで３０ｎＭ以下で行う、請求項３３に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項３６】
請求項３３に記載のｄｓＲＮＡおよび薬学的に許容される担体を含む、生物におけるＰＩＫ４ＣＢの発現レベルを減少させるための医薬組成物。
【請求項３７】
治療有効量の請求項３３に記載のｄｓＲＮＡを処置を必要とする患者に投与することを含むプラス鎖ＲＮＡウイルス感染を処置するための方法。
【請求項３８】
該プラス鎖ＲＮＡウイルスがＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト・パピローマウイルス（ＨＰＶ）およびデング熱ウイルスから選択される、請求項３７に記載の方法。
【請求項３９】
細胞におけるホスファチジルイノシトール４−キナーゼ、触媒的アルファポリペプチド（ＰＩＫ４ＣＡ）遺伝子の発現レベルを減少させるための二本鎖リボ核酸（ｄｓＲＮＡ）であって、ここで、互いに相補的である少なくとも２個の配列を含み、ここで、センス鎖は第１の配列を含み、そしてアンチセンス鎖は、実質的にＰＩＫ４ＣＡをコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的である相補性領域を含む第２の配列を含み、そして、ＰＩＫ４ＣＡ遺伝子を発現する細胞と接触すると、該ＰＩＫ４ＣＡの発現レベルを減少させる二本鎖リボ核酸（ｄｓＲＮＡ）。
【請求項４０】
該接触がＰＩＫ４ＣＡの発現レベルを少なくとも４０％減少させる、請求項３９に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項４１】
該接触をインビトロで３０ｎＭ以下で行う、請求項３９に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項４２】
請求項３９に記載のｄｓＲＮＡおよび薬学的に許容される担体を含む、生物におけるＰＩＫ４ＣＡの発現レベルを減少させるための医薬組成物。
【請求項４３】
治療有効量の請求項３９に記載のｄｓＲＮＡを処置を必要とする患者に投与することを含むプラス鎖ＲＮＡウイルス感染を処置するための方法。
【請求項４４】
該プラス鎖ＲＮＡウイルスがＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト・パピローマウイルス（ＨＰＶ）およびデング熱ウイルスから選択される、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
表１に記載されているものから選択されるｄｓＲＮＡ。
【請求項４６】
請求項４５に記載のｄｓＲＮＡを含む医薬組成物。
【請求項４７】
表２に記載されているものから選択されるｄｓＲＮＡ。
【請求項４８】
請求項４７に記載のｄｓＲＮＡを含む医薬組成物。
【請求項４９】
複数のｄｓＲＮＡを含む医薬組成物であって、ここで、少なくとも１個のｄｓＲＮＡは表１に記載されているものから選択され、そして少なくとも１個のｄｓＲＮＡは実質的にプラス鎖ＲＮＡウイルスをコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的である領域を有する核酸配列を含むアンチセンス鎖を有するｄｓＲＮＡから選択される医薬組成物。
【請求項５０】
該プラス鎖ＲＮＡウイルスがＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト・パピローマウイルス（ＨＰＶ）およびデング熱ウイルスから選択される、請求項４９に記載の医薬組成物。
【請求項５１】
それぞれのｄｓＲＮＡが少なくとも１個の修飾ヌクレオチドを含む、請求項４９に記載の医薬組成物。
【請求項５２】
複数のｄｓＲＮＡを含む医薬組成物であって、ここで、少なくとも１個のｄｓＲＮＡは表２に記載されているものから選択され、そして少なくとも１個のｄｓＲＮＡは実質的にプラス鎖ＲＮＡウイルスをコードするｍＲＮＡの少なくとも一部に相補的である領域を有する核酸配列を含むアンチセンス鎖を有するｄｓＲＮＡから選択される医薬組成物。
【請求項５３】
該プラス鎖ＲＮＡウイルスがＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト・パピローマウイルス（ＨＰＶ）およびデング熱ウイルスから選択される、請求項５２に記載の医薬組成物。
【請求項５４】
それぞれのｄｓＲＮＡが少なくとも１個の修飾ヌクレオチドを含む、請求項５２に記載の医薬組成物。
【請求項５５】
ａ）表１および表２に記載されているものから選択される少なくとも１個のｄｓＲＮＡ；およびｂ）ｉ）完全にカプセル化されたリポソーム；ｉｉ）脂質複合体；およびｉｉｉ）ポリマーから選択される送達モダリティー(modality)を含む医薬組成物。
【請求項５６】
それぞれのｄｓＲＮＡが少なくとも１個の修飾ヌクレオチドを含む、請求項５５に記載の医薬組成物。
【請求項５７】
複数のｄｓＲＮＡ配列が表１および表２に記載の配列から選択されることをさらに含む、請求項５５に記載の医薬組成物。
【請求項５８】
治療有効量の請求項１７、２０または５５に記載の医薬組成物を処置を必要とする患者に投与することを含むＨＣＶ感染を処置するための方法。
【請求項５９】
ホスファチジルイノシトール４−キナーゼ（ＰＩ４Ｋ）の活性を選択的に抑制する化合物を処置を必要とする患者に投与することを含むプラス鎖ＲＮＡウイルスによる感染を処置するための方法。
【請求項６０】
化合物が前記のものをコードするｄｓＲＮＡ、ＤＮＡアンチセンスＤＮＡ、リボザイムまたはＤＮＡベクターから選択される、請求項５９に記載の方法。
【請求項６１】
化合物がｄｓＲＮＡである、請求項６０に記載の方法。
【請求項６２】
化合物が請求項２または請求項９に記載のｄｓＲＮＡである、請求項６１に記載の方法。
【請求項６３】
化合物が配列番号１から配列番号４１６から選択される配列を有するｄｓＲＮＡである、請求項６２に記載の方法。
【請求項６４】
細胞におけるホスファチジルイノシトール４−キナーゼ（ＰＩ４Ｋ）の発現を阻害するための二本鎖リボ核酸（ｄｓＲＮＡ）であって、ここで、該ｄｓＲＮＡは第１の鎖および第２の鎖を含み、ここで、第１および／または第２の鎖がＰＩ４ＫＣＡ−２（配列番号２１０および３１４）またはＰＩ４ＫＣＢ−１（配列番号１および１０５）の配列から最高で３個のミスマッチを有する配列を含むｄｓＲＮＡ。
【請求項６５】
該ｄｓＲＮＡが少なくとも１個の修飾ヌクレオチドを含む、請求項６４に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項６６】
該修飾ヌクレオチドが２’−Ｏ−メチル修飾ヌクレオチド、５’−ホスホロチオエート基を含むヌクレオチドおよびコレステリル誘導体またはドデカン酸ビスデシルアミド基と結合している末端ヌクレオチドの群から選択される、請求項６５に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項６７】
該修飾ヌクレオチドが２’−デオキシ−２’−フルオロ修飾ヌクレオチド、２’−デオキシ−修飾ヌクレオチド、ロックされたヌクレオチド、非塩基性ヌクレオチド、２’−アミノ−修飾ヌクレオチド、２’−アルキル−修飾ヌクレオチド、モルホリノヌクレオチド、ホスホロアミダートおよび非天然塩基を含むヌクレオチドの群から選択される、請求項６５に記載のｄｓＲＮＡ。
【請求項６８】
請求項６４に記載のｄｓＲＮＡおよび薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
【請求項６９】
該ｄｓＲＮＡが少なくとも１個の修飾ヌクレオチドを含む、請求項６８に記載の医薬組成物。
【請求項７０】
細胞におけるＰＩＫ４の発現を阻害するための方法であって：
（ａ）細胞に請求項６４に記載のｄｓＲＮＡを導入し、そして、
（ｂ）工程（ａ）で製造される細胞をＰＩＫ４遺伝子のｍＲＮＡ転写の分解を達するために十分な時間維持し、それにより細胞におけるＰＩＫ４遺伝子の発現を抑制する、
ことを含む方法。
【請求項７１】
治療または予防有効量の請求項６４に記載のｄｓＲＮＡを処置、予防または管理を必要とする患者に投与することを含むプラス鎖ＲＮＡウイルス感染が介在する病理過程を処置するための方法。
【請求項７２】
該プラス鎖ＲＮＡウイルスがＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、ヒト・パピローマウイルス（ＨＰＶ）およびデング熱ウイルスから選択される、請求項７１に記載の方法。
【請求項７３】
細胞におけるホスファチジルイノシトール４−キナーゼ、触媒的ベータポリペプチド（ＰＩＫ４ＣＢ）遺伝子の発現を阻害するためのベクターであって、該ベクターは請求項６４に記載のｄｓＲＮＡの少なくとも一本鎖をコードする核酸配列と作動可能に結合している調節配列を含むベクター。
【請求項７４】
請求項７３に記載のベクターを含む細胞。
【手続補正４】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】全図
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図１】
2010532163.tif 000007
【図２】
2010532163.tif 000008
【図３】
2010532163.tif 000009
【図４】
2010532163.tif 000010
【図５】
2010532163.tif 000011
【図６−１】
2010532163.tif 000012
【図６−２】
2010532163.tif 000013
【図７】
2010532163.tif 000014
【図８】
2010532163.tif 000015