【手続補正書】
【提出日】平成23年10月19日(2011.10.19)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ET-743化学療法に対する癌患者の応答を予測するための方法であって、
a)ET-743化学療法の前に患者の生体試料中のXPG mRNAの発現レベルまたはXPGタンパク質の発現レベルを決定する段階と、
b)前記生体試料中のXPG mRNAの発現量を、生体試料のコレクションで測定されるXPG mRNAの発現の中央値と比較する段階、またはXPGタンパク質の発現レベルの決定結果を、負の発現(0)、低発現(1+)、中程度の発現(2+)、もしくは高発現(3+)として記録する段階と
を含み、
XPG mRNAの発現レベルの中央値に等しいかもしくはそれよりも高いXPG mRNAの発現レベル、またはXPGタンパク質の中程度のもしくは高発現レベルが、患者がET-743を使用した治療に対して肯定的な応答を示すことになることを示す方法。
【請求項２】
a)ET-743化学療法の前に前記患者の生体試料中のBRCA1 mRNAの発現レベルを決定する段階と、
b)前記生体試料中のBRCA1 mRNAの発現量を、生体試料のコレクションで測定されるBRCA1 mRNAの発現の中央値と比較する段階と
をさらに含み、
(i)XPG mRNAの発現レベルの中央値に等しいかもしくはそれよりも高いXPG mRNAの発現レベル、またはXPGタンパク質の中程度のもしくは高発現レベル、および(ii)BRCA1 mRNAの発現レベルの中央値よりも低いBRCA1 mRNAの発現レベルが、患者がET-743を使用した治療に対して肯定的な応答を示すことになることを示す、請求項1に記載の方法。
【請求項３】
ET-743化学療法の前に前記患者の生体試料中のXPG遺伝子の遺伝子座rs17655でのAsp1104His SNPの遺伝子型を決定する段階をさらに含み、
(i)XPG mRNAの発現レベルの中央値に等しいかもしくはそれよりも高いXPG mRNAの発現レベル、またはXPGタンパク質の中程度のもしくは高発現レベル、および(ii)SNP遺伝子座rs17655の対立遺伝子のうちの少なくとも1つにおけるCヌクレオチドの存在が、患者がET-743を使用した治療に対して肯定的な応答を示すことになることを示す、請求項1に記載の方法。
【請求項４】
ET-743化学療法の前に前記患者の生体試料中のXPG遺伝子の遺伝子座rs17655でのAsp1104His SNPの遺伝子型を決定する段階をさらに含み、
(i)XPG mRNAの発現レベルの中央値に等しいかもしくはそれよりも高いXPG mRNAの発現レベル、またはXPGタンパク質の中程度のもしくは高発現レベル、(ii)BRCA1 mRNAの発現レベルの中央値よりも低いBRCA1 mRNAの発現レベル、および(iii)SNP遺伝子座rs17655での対立遺伝子のうちの少なくとも1つにおけるCヌクレオチドの存在が、患者がET-743を使用した治療に対して肯定的な応答を示すことになることを示す、請求項2に記載の方法。
【請求項５】
ET-743化学療法に対する癌患者の応答を予測する方法であって、ET-743化学療法の前に前記患者の生体試料中のXPG遺伝子の遺伝子座rs17655でのAsp1104His SNPの遺伝子型を決定する段階を含み、
SNP遺伝子座rs17655での対立遺伝子のうちの少なくとも1つにおけるCヌクレオチドの存在が、患者がET-743を使用した治療に対して肯定的な応答を示すことになることを示す方法。
【請求項６】
a)ET-743化学療法の前に前記患者の生体試料中のBRCA1 mRNAの発現レベルを決定する段階と、
b)前記生体試料中のBRCA1 mRNAの発現量を、生体試料のコレクションで測定されるBRCA1 mRNAの発現の中央値と比較する段階と
をさらに含み、
(i)XPG遺伝子のSNP遺伝子座rs17655での対立遺伝子のうちの少なくとも1つにおけるCヌクレオチドの存在、および(ii)BRCA1 mRNAの発現レベルの中央値よりも低いBRCA1 mRNAの発現レベルが、患者がET-743を使用した治療後に肯定的な応答を示すことになることを示す、請求項5に記載の方法。
【請求項７】
癌に罹ったヒト患者のための個別の化学療法を設計するためのインビトロ方法であって、
a)前記患者由来の生体試料中のXPG mRNAの発現レベルまたはXPGタンパク質の発現レベルを決定する段階と、
b)a)で得られるXPG mRNAの発現レベルを、生体試料のコレクションで測定されるXPG mRNAの発現レベルの中央値と比較する段階、またはXPGタンパク質の発現レベルの決定結果を、負の発現(0)、低発現(1+)、中程度の発現(2+)、もしくは高発現(3+)として記録する段階と、
c)前記XPG mRNA発現レベルがXPG mRNAの発現レベルの中央値に等しいかもしくはそれよりも大きい場合、または前記XPGタンパク質発現レベルが(2+)もしくは(3+)の値を有する場合、ET-743に基づく化学療法治療を選択する段階と
を含むインビトロ方法。
【請求項８】
a)前記患者由来の生体試料中のBRCA1 mRNAの発現レベルを決定する段階と、
b)a)で得られるBRCA1 mRNAの発現レベルを、生体試料のコレクションで測定されるBRCA1 mRNAの発現レベルの中央値と比較する段階と、
c)(i)XPG mRNA発現レベルがXPG mRNAの発現レベルの中央値に等しいかもしくはそれよりも大きく、またはXPGタンパク質発現レベルが(2+)もしくは(3+)の値を有し、(ii)BRCA1 mRNA発現レベルがBRCA1 mRNAの発現レベルの中央値よりも小さい場合、ET-743に基づく化学療法治療を選択する段階と
をさらに含む、請求項7に記載の方法。
【請求項９】
前記患者由来の生体試料中のXPG遺伝子の遺伝子座rs17655でのAsp1104His SNPの遺伝子型を決定する段階と、(i)XPG mRNA発現レベルがXPG mRNAの発現レベルの中央値に等しいかもしくはそれよりも大きく、またはXPGタンパク質発現レベルが(2+)もしくは(3+)の値を有し、(ii)SNP遺伝子座rs17655での少なくとも1つの対立遺伝子にCヌクレオチドが存在する場合、ET-743に基づく化学療法治療を選択する段階とをさらに含む、請求項7に記載の方法。
【請求項１０】
前記患者由来の生体試料中のXPG遺伝子の遺伝子座rs17655でのAsp1104His SNPの遺伝子型を決定する段階と、(i)XPG mRNA発現レベルがXPG mRNAの発現レベルの中央値に等しいかもしくはそれよりも大きく、またはXPGタンパク質発現レベルが(2+)もしくは(3+)の値を有し、(ii)BRCA1 mRNA発現レベルがBRCA1 mRNAの発現レベルの中央値よりも小さく、(iii)SNP遺伝子座rs17655での対立遺伝子のうちの少なくとも1つにCヌクレオチドが存在する場合、ET-743に基づく化学療法治療を選択する段階とをさらに含む、請求項8に記載の方法。
【請求項１１】
癌に罹ったヒト患者のための個別の化学療法を設計するためのインビトロ方法であって、
a)前記患者由来の生体試料中のXPG遺伝子の遺伝子座rs17655でのAsp1104His SNPの遺伝子型を決定する段階と、
b)前記SNP遺伝子座での対立遺伝子のうちの少なくとも1つにCヌクレオチドが存在する場合、ET-743に基づく化学療法治療を選択する段階と
を含むインビトロ方法。
【請求項１２】
a)ET-743化学療法の前に前記患者の生体試料中のBRCA1 mRNAの発現レベルを決定する段階と、
b)前記生体試料中のBRCA1 mRNAの発現量を、生体試料のコレクションで測定されるBRCA1 mRNAの発現の中央値と比較する段階と、
c)(i)前記SNP遺伝子座での対立遺伝子のうちの少なくとも1つにCヌクレオチドが存在し、(ii)BRCA1 mRNA発現レベルがBRCA1 mRNAの発現レベルの中央値よりも小さい場合、ET-743に基づく化学療法治療を選択する段階と
をさらに含む、請求項11に記載の方法。
【請求項１３】
患者が罹った癌が、肉腫、平滑筋肉腫、脂肪肉腫、骨肉腫、卵巣癌、乳癌、メラノーマ、結腸直腸癌、中皮腫、腎癌、子宮内膜癌および肺癌から選択される、請求項1から12のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
生体試料のコレクション中のXPG mRNAの発現の中央レベルに対して、高レベルのXPGタンパク質発現を有する、または高レベルのXPG mRNA発現を有するヒト患者における癌の治療剤であって、ET-743からなる治療剤。
【請求項１５】
XPG遺伝子の対立遺伝子のうちの少なくとも1つにAsp1104His SNP遺伝子型を有するヒト患者における癌の治療剤であって、ET-743からなる治療剤。
【請求項１６】
患者がXPG遺伝子の対立遺伝子のうちの少なくとも1つにAsp1104His SNP遺伝子型を有する、請求項14に記載の治療剤。
【請求項１７】
患者が低発現レベルのBRCA1を有する、請求項14から16のいずれか一項に記載の治療剤。
【請求項１８】
治療される癌が、肉腫、平滑筋肉腫、脂肪肉腫、骨肉腫、卵巣癌、乳癌、メラノーマ、結腸直腸癌、中皮腫、腎癌、子宮内膜癌および肺癌から選択される、請求項14から17のいずれか一項に記載の治療剤。