(57)【要約】  本発明は、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスに対する新規の抗ウイルス剤を提供する。本発明の抗ウイルス剤は、コブラ毒由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２のアイソフォームＣＭ-ＩＩまたは特定のアミノ酸配列からなるポリペプチドを含む。【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の（ａ）〜（ｇ）からなる群より選択されるいずれかのポリペプチドまたは遺伝子を含むことを特徴とする、抗ウイルス剤であって、
前記抗ウイルス剤の処置対象となるウイルスが、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有することを特徴とする、抗ウイルス剤：
（ａ）配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｂ）配列番号１で示されるアミノ酸配列において、１もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチド、
（ｃ）配列番号１で示されるアミノ酸配列と８０％以上の相同性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチド、
（ｄ）配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする遺伝子、
（ｅ）配列番号１で示されるアミノ酸配列において、１もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子、
（ｆ）配列番号１で示されるアミノ酸配列と８０％以上の相同性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子、および
（ｇ）前記（ｄ）〜（ｆ）のいずれかの遺伝子と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子。
【請求項２】
コブラ毒由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２のアイソフォームＣＭ−ＩＩポリペプチド、および／または当該ポリペプチドをコードする遺伝子を含む、抗ウイルス剤であって、
前記抗ウイルス剤の処置対象となるウイルスが、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有することを特徴とする、抗ウイルス剤。
【請求項３】
前記抗ウイルス剤の処置対象となるウイルスが、フラビウイルス科またはヘパドナウイルス科に属することを特徴とする、請求項１または２に記載の抗ウイルス剤。
【請求項４】
前記抗ウイルス剤の処置対象となるウイルスが、デングウイルス、日本脳炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルスおよびＢ型肝炎ウイルスからなる群より選択される少なくとも一つであることを特徴とする、請求項１〜３のいずれか１項に記載の抗ウイルス剤。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、抗ウイルス剤に関する。
【背景技術】
【０００２】
ウイルスは、その外周構造の相違から、宿主細胞の様々な膜を構成する脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスと、エンベロープを有さないウイルスとの２種類に大別される。また、宿主細胞の膜は、（１）小胞体（ＥＲ）膜、並びにそれに関連する、核膜、脂肪滴膜、ＥＲ−ゴルジ体中間区画（ＥＲＧＩＣ）膜およびシスゴルジ体膜と、（２）細胞膜（ＰＭ）、並びにそれに由来する、エンドソーム膜、多小胞体（ＭＶＢ）膜およびトランスゴルジ体膜、の２種類に大別される。従って、エンベロープを有するウイルスは、エンベロープを獲得する部位に応じて、宿主細胞の小胞体（ＥＲ）膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスと、宿主細胞の細胞膜（ＰＭ）由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスとに分類することができる。【０００３】
このうち、宿主細胞の小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスには、フラビウイルス科、コロナウイルス科等に属するウイルスが含まれる。特に、フラビウイルス科のウイルスは、デングウイルス、日本脳炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、黄熱ウイルス、ウエストナイルウイルス等に代表されるように、これらウイルスの感染により発症する疾患が一般に重症化する傾向が多く見られる。また、コロナウイルス科のウイルスも、重症急性呼吸器症候群（ＳＡＲＳ）および中東呼吸器症候群（ＭＥＲＳ）のような重症の感染症を引き起こす（重症急性呼吸器症候群および中東呼吸器症候群を引き起こすウイルスは、それぞれＳＡＲＳコロナウイルスおよびＭＥＲＳコロナウイルスと呼ばれる）。近年では、Ｂ型肝炎ウイルスに代表されるヘパドナウイルス科のウイルスも、宿主細胞の小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有することが報告されている（Liou W, et al., J. Biomed. Sci., 15, 311-316, 2008およびWei Y, et al., Pathol. Biol., 58, 267-272, 2010を参照）。【０００４】
ところで、最近になって、種々の毒ヘビ由来のホスホリパーゼＡ２が、抗ウイルス活性を有することが明らかとなってきた。例えば、非特許文献１には、ムフェジコブラの一種であるＮａｊａ  ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ  ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２のアイソフォーム（ＣＭ−ＩＩＩ）が、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）（細胞膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有する）に対して抗ウイルス活性を有することが記載されている。このアイソフォーム（ＣＭ−ＩＩＩ）は宿主細胞の細胞膜を直接障害し、強い細胞障害活性および溶血活性を示すことが知られている。【０００５】
また、非特許文献２には、ガラガラヘビの一種であるＣｒｏｔａｌｕｓ  ｄｕｒｉｓｓｕｓ  ｔｅｒｒｉｆｉｃｕｓ由来のホスホリパーゼＡ２が、デングウイルスおよび黄熱病ウイルス（小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有する）に対して抗ウイルス活性を有することが記載されている。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００６】
【非特許文献１】Fenard D, et al., J.Clin.Invest., 104, 611-618, 1999
【非特許文献２】Muller V D M, et al., Toxicon., 59, 507-515, 2012
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
しかしながら、非特許文献１および２に記載のタンパク質は、処置対象の細胞等への細胞毒性が高いこと、抗ウイルス活性の選択毒性が低いこと、抗ウイルス効果が期待される対象ウイルスの範囲が明確でないこと等の種々の問題点があった。そのため、抗ウイルス剤にはさらなる改善の余地があった。【０００８】
本発明は、前記の問題点に鑑みてなされたものであり、本発明の目的は、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスの感染により発症する疾患を処置し得る、新規の抗ウイルス剤を提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
本発明者らは、前記の課題を解決するべく鋭意検討を重ねた結果、特定のポリペプチドが、抗ウイルス活性、とりわけ小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスに対する特異的な抗ウイルス活性を有し、かつ、処置対象の細胞への毒性が低いことを見出し、本発明を完成させるに至った。すなわち、本発明の一態様は、以下の発明を包含するものである。【００１０】
〔１〕以下の（ａ）〜（ｇ）からなる群より選択されるいずれかのポリペプチドまたは遺伝子を含むことを特徴とする、抗ウイルス剤であって、
前記抗ウイルス剤の処置対象となるウイルスが、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有することを特徴とする、抗ウイルス剤：
（ａ）配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｂ）配列番号１で示されるアミノ酸配列において、１もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチド、
（ｃ）配列番号１で示されるアミノ酸配列と８０％以上の相同性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチド、
（ｄ）配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする遺伝子、
（ｅ）配列番号１で示されるアミノ酸配列において、１もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子、
（ｆ）配列番号１で示されるアミノ酸配列と８０％以上の相同性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子、および
（ｇ）前記（ｄ）〜（ｆ）のいずれかの遺伝子と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子。【００１１】
〔２〕コブラ毒由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２のアイソフォームＣＭ−ＩＩポリペプチド、および／または当該ポリペプチドをコードする遺伝子を含む、抗ウイルス剤であって、
前記抗ウイルス剤の処置対象となるウイルスが、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有することを特徴とする、抗ウイルス剤。【００１２】
〔３〕前記抗ウイルス剤の処置対象となるウイルスが、フラビウイルス科またはヘパドナウイルス科に属することを特徴とする、〔１〕または〔２〕に記載の抗ウイルス剤。【００１３】
〔４〕前記抗ウイルス剤の処置対象となるウイルスが、デングウイルス、日本脳炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルスおよびＢ型肝炎ウイルスからなる群より選択される少なくとも一つであることを特徴とする、〔１〕〜〔３〕のいずれかに記載の抗ウイルス剤。
【発明の効果】
【００１４】
本発明の一態様における抗ウイルス剤は、特定のウイルスに対して強力な抗ウイルス活性を示すと共に、処置対象の細胞への低い毒性を示す。
【発明を実施するための形態】
【００１５】
本発明の一実施形態において、特定のポリペプチドまたは遺伝子を含むことを特徴とする、新規の抗ウイルス剤を提供する。本発明の一実施形態は、特定のポリペプチドが、抗ウイルス活性、とりわけ、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスに対する抗ウイルス活性を有することを初めて見出したことに基づくものである。それ故、当該ポリペプチドまたは当該ポリペプチドをコードする遺伝子を含む本発明の抗ウイルス剤は、ウイルス感染による疾患、とりわけ、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスの感染による疾患を効果的に処置することができる。以下、本発明の実施形態について、〔１．ポリペプチド〕、〔２．遺伝子〕および〔３．抗ウイルス剤〕の順に詳述する。
【００１６】
なお、本明細書に記載された文献の全てが、本明細書において参考として援用される。また、本明細書において特記しない限り、数値範囲を表す「Ａ〜Ｂ」は、「Ａ以上（Ａを含みかつＡより大きい）Ｂ以下（Ｂを含みかつＢより小さい）」を意味する。
【００１７】
〔１．ポリペプチド〕
本明細書において「ポリペプチド」なる用語は、「タンパク質」または「ペプチド」と交換可能に使用される。本明細書において使用される場合、アミノ酸の表記は、適宜ＩＵＰＡＣおよびＩＵＢの定める１文字表記または３文字表記を使用する。
【００１８】
本発明の一実施形態において「ポリペプチド」は、アミノ酸がペプチド結合により結合した縮合重合体を意味し、抗ウイルス活性を有している限り別段限定されない。本発明の一実施形態におけるポリペプチドは、コブラ毒由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２（以下、「ｓＰＬＡ２」と称することもある。）のアイソフォームＣＭ−ＩＩである。コブラとしては、コブラ科に属し、かつ毒を有しているヘビであれば特に限定されず、例えば、台湾コブラ（Ｎａｊａ  ａｔｒａ）、タイコブラ（Ｎａｊａ  ｋａｏｕｔｈｉａ）、ムフェジコブラ（Ｎａｊａ  ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ）、タイドクハキコブラ（Ｎａｊａ  ｓｉａｍｅｎｓｉｓ）等のフードコブラ属（Ｎａｊａ）；Ｂｕｎｇａｒｕｓ  ｂｕｎｇａｒｏｉｄｅｓ、Ｂｕｎｇａｒｕｓ  ｆａｓｃｉａｔｕｓ等のアマガサヘビ属（Ｂｕｎｇａｒｕｓ）に属するヘビが挙げられる。本発明の一実施形態におけるポリペプチドは、ムフェジコブラの一種であるＮａｊａ  ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ  ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ（以下、「Ｎ．ｍ．ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ」とも称する。）のコブラ毒由来のｓＰＬＡ２のアイソフォームＣＭ−ＩＩである。
【００１９】
本発明の一実施形態におけるポリペプチドは、後述の実施例に示すように、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスに対して、極めて高い抗ウイルス活性を有している。一方、治療薬として使用する場合の副作用の指標となる細胞障害活性および溶血活性に関しては、極めて高用量で投与した場合に限り、それぞれの活性を有する。このように、本発明の一実施形態におけるポリペプチドが、十分に抗ウイルス活性を有する投与量では、細胞障害活性および溶血活性を示さないという効果を奏することは、驚くべき知見である。このような効果により、処置対象に与える負の影響を最小限にとどめつつ、効果的にウイルス感染症を処置できるという新規な治療薬を提供することが可能となる。
【００２０】
また、本発明の一実施形態において使用されるポリペプチドとしては、以下の（ａ）〜（ｃ）からなる群より選択されるいずれかのポリペプチドが用いられる：
（ａ）配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｂ）配列番号１で示されるアミノ酸配列において、１もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチド、および
（ｃ）配列番号１で示されるアミノ酸配列と８０％以上の相同性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチド。
【００２１】
上記（ａ）のポリペプチドについて具体的に説明する。配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドは、ムフェジコブラの一種であるＮ．ｍ．ｍｏｓｓａｍｂｉｃａのコブラ毒に由来するポリペプチドである。また、配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドは、上記コブラ毒に由来する分泌型ホスホリパーゼＡ２のアイソフォーム（ＣＭ−Ｉ、ＣＭ−ＩＩおよびＣＭ−ＩＩＩ）のうちの一つ（ＣＭ−ＩＩ）であり、全長１１８アミノ酸残基から構成されるポリペプチドである。
【００２２】
上記（ｂ）のポリペプチドは、配列番号１で示されるアミノ酸配列を有するタンパク質の、機能的に同等の変異体、誘導体、バリアント、アレル、ホモログ、オルソログ、部分ペプチド、または他のタンパク質・ペプチドとの融合タンパク質等であって、抗ウイルス活性を有するタンパク質をコードする限り、その具体的な配列については限定されない。上記ポリペプチドを含む抗ウイルス剤の処置対象となるウイルスは、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有する。すなわち、上記抗ウイルス活性は、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスに対する抗ウイルス活性である。
【００２３】
ここで欠失、置換または付加されてもよいアミノ酸の数は、前記抗ウイルス活性を失わせない限り、限定されないが、部位特異的突然変異誘発法、遺伝子断片欠失変異体作製法等の公知の導入法によって欠失、置換または付加できる程度の数である。また、明細書中において「変異」とは、部位特異的突然変異誘発法、遺伝子断片欠失変異体作製法等によって人為的に導入された変異を主に意味するが、天然に存在する同様の変異であってもよい。
【００２４】
置換されるアミノ酸残基は、アミノ酸側鎖の性質が保存されている別のアミノ酸に置換されていることが好ましい。例えば、アミノ酸側鎖の性質としては、疎水性アミノ酸（Ａ、Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｆ、Ｐ、Ｗ、Ｙ、Ｖ）、親水性アミノ酸（Ｒ、Ｄ、Ｎ、Ｃ、Ｅ、Ｑ、Ｇ、Ｈ、Ｋ、Ｓ、Ｔ）、脂肪族側鎖を有するアミノ酸（Ｇ、Ａ、Ｖ、Ｌ、Ｉ、Ｐ）、水酸基含有側鎖を有するアミノ酸（Ｓ、Ｔ、Ｙ）、硫黄原子含有側鎖を有するアミノ酸（Ｃ、Ｍ）、カルボン酸およびアミド含有側鎖を有するアミノ酸（Ｄ、Ｎ、Ｅ、Ｑ）、塩基含有側鎖を有するアミノ酸（Ｒ、Ｋ、Ｈ）、芳香族含有側鎖を有するアミノ酸（Ｈ、Ｆ、Ｙ、Ｗ）が挙げられる（括弧内はいずれもアミノ酸の一文字表記を表す）。あるアミノ酸配列に対する１または複数個のアミノ酸残基の欠失、付加および／または他のアミノ酸による置換により修飾されたアミノ酸配列を有するポリペプチドがその生物学的活性を維持することはすでに知られている。さらに、変異後のアミノ酸残基は、共通した性質をできるだけ多く有するアミノ酸残基に変異していることがより好ましい。
【００２５】
本明細書において「機能的に同等」とは、対象となるポリペプチドが、目的とするポリペプチドと同等（同一および／または類似）の生物学的機能や生化学的機能を有することを意図する。生物学的な性質には発現する部位の特異性、発現量等も含まれ得る。変異を導入したポリペプチドが所望の機能を有するかどうかは、その変異ポリペプチドが抗ウイルス活性を有するかどうか調べることにより判断できる。
【００２６】
本明細書において「抗ウイルス活性」は、ウイルスの感染性、増殖能または免疫回避能を低下させる活性を意味する。
【００２７】
ウイルスの感染性は、ウイルスが宿主細胞に吸着または侵入する性質を意味する。このときの抗ウイルス活性は、例えば、ポリペプチドがウイルス粒子の表面タンパク質と接触することにより、宿主細胞に対するウイルスの吸着または侵入を抑制する活性を示す。すなわち、当該抗ウイルス活性は、ウイルスの中和活性と言い換えることができる。
【００２８】
ウイルスの増殖能は、宿主細胞におけるウイルス粒子の構成タンパク質の合成能、ウイルス遺伝子の複製能またはウイルス粒子の形成能を意味する。このときの抗ウイルス活性は、例えば、宿主細胞において、あるウイルスタンパク質の合成を阻害したり、合成されたウイルスタンパク質の機能を阻害したり、ウイルス遺伝子の複製を阻害することにより、成熟したウイルス粒子の形成を抑制する活性を意味する。当該ウイルスタンパク質としては、ウイルスタンパク質の合成を促進するか、もしくは合成に必須なウイルスタンパク質、またはウイルス粒子の形成を促進するか、もしくは形成に必須なウイルスタンパク質、またはウイルス遺伝子の複製を促進するか、もしくは複製に必須なウイルスタンパク質等が挙げられる。
【００２９】
ウイルスの免疫回避能は、宿主の免疫機構によってウイルスが排除されることを回避する能力を意味する。このときの抗ウイルス活性は、例えば、ウイルス粒子の表面タンパク質に結合して、ウイルス粒子を抗原として認識可能な形態に変化させる活性、または宿主の免疫機構の一部を妨害するウイルスタンパク質を失活させる活性である。
【００３０】
ポリペプチドが、抗ウイルス活性を有するポリペプチドであるか否かを判定するためには、ポリペプチドと、ウイルス（および／または宿主細胞）とを接触させた際に、上記で例示したような抗ウイルス活性が生じるか否かを試験すればよい。すなわち、ポリペプチドと、ウイルス（および／または宿主細胞）とを接触させた際に、例えば、ウイルスの感染性の低下、増殖能の低下、免疫回避能の低下等が生じれば、当該ポリペプチドを、抗ウイルス活性を有するポリペプチドであると判定することができる。
【００３１】
抗ウイルス活性の具体的な判定方法は特に限定されず、適宜、周知の方法を用いることができる。抗ウイルス活性の具体的な判定方法としては、ポリペプチド、ウイルスおよび宿主細胞の関係を考慮して、例えば、以下の（１）〜（４）の方法が挙げられる。
【００３２】
（１）ポリペプチドと宿主細胞とを接触させて、一定時間処理した後に、当該ポリペプチドを除去する。続いて、ウイルスを前記宿主細胞へ感染させて、感染から１時間後に余剰の当該ウイルスを除去する。その後に、当該ポリペプチドを含まない培養液で当該宿主細胞を一定時間培養し、ウイルス感染価を測定する。この方法により、ポリペプチドが、ウイルス感染を抑制する因子（インターフェロン等）の発現を宿主細胞に誘導するか否か（すなわち、ポリペプチドが、宿主細胞へのウイルス感染を阻害するか否か）を判定することができる。
【００３３】
（２）ポリペプチドとウイルスとを接触させて、一定時間反応させる。その後に、当該ウイルスを宿主細胞へ感染させ、感染から１時間後に余剰の当該ウイルスを除去する。その後に、当該ポリペプチドを含まない培養液で当該宿主細胞を一定時間培養し、ウイルス感染価を測定する。この方法により、ポリペプチドが、感染性ウイルス粒子の感染能を直接阻害するか否か（すなわち、ポリペプチドが、宿主細胞へのウイルス感染を阻害するか否か）を判定することができる。
【００３４】
また、ポリペプチドが、感染性ウイルス粒子の感染能を直接阻害するか否かを判定し得る（２）の変法として、以下の（２’）および／または（２’’）の方法が用いられる。
【００３５】
（２’）ポリペプチドとウイルスとの混合液を宿主細胞に感染させ、感染から１時間後に余剰の当該ウイルスを含む混合液を除去する。その後に、当該ポリペプチドを含まない培養液で当該宿主細胞を培養し、一定時間経過後に、当該宿主細胞を固定して、抗ウイルス抗体を用いた蛍光抗体法により感染細胞を計測し、当該ポリペプチド・ウイルス混合液中のウイルス感染価を測定する。
【００３６】
（２’’）ポリペプチドとウイルスとの混合液を宿主細胞に感染させ、感染から１時間後に余剰の当該ウイルスを含む混合液を除去する。その後に、１％メチルセルロース添加培養液で培養し、一定時間経過後に、１個の感染性ウイルス粒子に由来する死滅したウイルス感染細胞の集団が形成する細胞シートの穴（以下、「プラク」と称する）の数を計測して、当該ポリペプチド・ウイルス混合液中のウイルス感染価を測定する。（以下、この方法を「プラク形成法」と称する。）
（３）ウイルスを宿主細胞に感染させて、感染から１時間後に当該ウイルスを除去し、ポリペプチドを含む培養液で当該宿主細胞を一定時間培養した後、ウイルス感染価を測定する。この方法により、ポリペプチドが、宿主細胞内に侵入したウイルスの遺伝子複製、ウイルスタンパク質の合成、ウイルス粒子の形成および／または放出等を阻害し得るか否かを判定することができる。
【００３７】
（４）ポリペプチドとウイルスとを接触させて、一定時間反応させた後に、当該ウイルスを宿主細胞へ感染させ、当該ポリペプチドを含む培養液で当該宿主細胞を一定時間培養し、ウイルス感染価を測定する。この方法により、上記（２）および（３）の効果を同時に測定することができる。
【００３８】
上記（ｃ）のポリペプチドは、上記（ｂ）のポリペプチドと同様に、配列番号１で示されるアミノ酸配列を有するタンパク質の、機能的に同等の変異体、誘導体、バリアント、アレル、ホモログ、オルソログ、部分ペプチド、または他のタンパク質・ペプチドとの融合タンパク質等を意図しており、抗ウイルス活性を有するタンパク質をコードする限り、その具体的な配列については限定されない。上記ポリペプチドを含む抗ウイルス剤の処置対象となるウイルスは、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有する。すなわち、上記抗ウイルス活性は、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスに対する抗ウイルス活性である。
【００３９】
アミノ酸配列の相同性とは、アミノ酸配列全体（または機能発現に必要な領域）で、少なくとも８０％以上、より好ましくは９０％以上、さらに好ましくは９５％以上（例えば、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上）の配列の同一性を有することを意味する。アミノ酸配列の相同性は、ＢＬＡＳＴＮ（核酸レベル）やＢＬＡＳＴＸ（アミノ酸レベル）のプログラム（Altschul et al. J. Mol. Biol., 215, 403-410, 1990）を利用して決定することができる。当該プログラムは、KarlinおよびAltschulによるアルゴリズムＢＬＡＳＴ（Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87, 2264-2268, 1990, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 5873-5877, 1993）に基づいている。ＢＬＡＳＴＮによって塩基配列を解析する場合には、パラメーターは例えばｓｃｏｒｅ＝１００、ｗｏｒｄｌｅｎｇｔｈ＝１２とする。また、ＢＬＡＳＴＸによってアミノ酸配列を解析する場合には、パラメーターは例えばｓｃｏｒｅ＝５０、ｗｏｒｄｌｅｎｇｔｈ＝３とする。また、Ｇａｐｐｅｄ  ＢＬＡＳＴプログラムを用いて、アミノ酸配列を解析する場合は、Altschulら（Nucleic Acids Res. 25, 3389-3402, 1997）に記載されているように行うことができる。ＢＬＡＳＴとＧａｐｐｅｄ  ＢＬＡＳＴプログラムを用いる場合には、各プログラムのデフォルトパラメーターを用いる。これらの解析方法の具体的な手法は公知である。比較対象の塩基配列またはアミノ酸配列を最適な状態にアラインメントするために、付加または欠失（例えば、ギャップ等）を許容してもよい。
【００４０】
本明細書において「相同性」とは、性質が類似のアミノ酸残基数の割合（ｈｏｍｏｌｏｇｙ、ｐｏｓｉｔｉｖｅ等）を意図しているが、より好ましくは、同一のアミノ酸残基数の割合、すなわち同一性（ｉｄｅｎｔｉｔｙ）である。なお、アミノ酸の性質については上述したとおりである。
【００４１】
本発明の一実施形態におけるポリペプチドは、アミノ酸がペプチド結合しているものであればよいが、これに限定されるものではなく、糖鎖やイソプレノイド基などのポリペプチド以外の構造を含む複合ペプチドであってもよい。アミノ酸の官能基は修飾されていてもよい。アミノ酸はＬ型であることが好ましいが、これに限定されない。
【００４２】
本発明の一実施形態におけるポリペプチドは、当該分野において公知の任意の手法に従って容易に入手もしくは産生され得る。例えば、本発明の一実施形態におけるポリペプチドは、精製された天然物、化学合成の産物、および原核生物宿主または真核生物宿主（例えば、細菌細胞、酵母細胞、高等植物細胞、昆虫細胞、および哺乳動物細胞を含む）を用いた組み換え技術によって産生された産物であってもよい。組み換え技術において用いられる宿主に依存して、本発明の一実施形態におけるポリペプチドは、グリコシル化され得るか、または非グリコシル化され得る。さらに、本発明の一実施形態におけるポリペプチドはまた、いくつかの場合、宿主媒介プロセスの結果として、開始の改変メチオニン残基を含み得る。
【００４３】
本発明の一実施形態におけるポリペプチドの生産方法は、例えば、当該ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むベクターを用いて行われる。この場合、特に、上記ベクターを組み換え発現系において用いることが好ましい。組み換え発現系を用いる場合、本発明の一実施形態におけるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを組み換え発現ベクターに組み込んだ後、公知の方法により発現可能な宿主に導入し、宿主（形質転換体）内で翻訳されて得られるポリペプチドを精製するという方法などを採用することができる。組み換え発現ベクターは、プラスミドであってもなくてもよく、宿主に目的ポリヌクレオチドを導入することができればよい。
【００４４】
このように宿主に外来ポリヌクレオチドを導入する場合、発現ベクターは、外来ポリヌクレオチドを発現するように宿主内で機能するプロモーターを組み込んであることが好ましい。組み換え技術によって産生されたポリペプチドを精製する方法は、用いた宿主、ポリペプチドの性質によって異なるが、タグの利用等によって比較的容易に目的のポリペプチドを精製することが可能である。
【００４５】
本発明の一実施形態におけるポリペプチドの生産方法は、当該ポリペプチドを含む細胞または組織の抽出液から当該ポリペプチドを精製する工程をさらに包含し得る。ポリペプチドを精製する工程は、周知の方法（例えば、細胞または組織を破壊した後に遠心分離して可溶性画分を回収する方法）で細胞や組織から細胞抽出液を調製した後、この細胞抽出液から周知の方法（例えば、硫安沈殿またはエタノール沈殿、酸抽出、陰イオンまたは陽イオン交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、およびレクチンクロマトグラフィー）によって精製する工程が好ましいが、これらに限定されない。最も好ましくは、高速液体クロマトグラフィー（「ＨＰＬＣ」）が精製のために用いられる。
【００４６】
本発明の一実施形態におけるポリペプチドの生産方法の別の例として、当該ポリペプチドを天然に発現する細胞または組織から当該ポリペプチドを精製することができる。当該ポリペプチドを天然に発現するものの例として、コブラ毒が挙げられる。本方法は、抗体またはオリゴヌクレオチドを用いて本発明の一実施形態におけるポリペプチドを天然に発現する細胞または組織を同定する工程を包含することができる。また、本方法は、当該ポリペプチドを精製する工程をさらに包含し得る。
【００４７】
さらに、本発明の一実施形態におけるポリペプチドの生産方法の別の例として、本発明の一実施形態におけるポリペプチドを化学合成することが挙げられる。当業者は、本明細書に記載されている本発明のポリペプチドのアミノ酸配列に基づいて周知の化学合成技術を適用すれば、本発明のポリペプチドを化学合成できることを、容易に理解する。化学合成技術としては、固相法または液相法を挙げることができる。固相法において、例えば、市販の各種ペプチド合成装置（Ｍｏｄｅｌ  ＭｕｌｔｉＰｅｐ  ＲＳ（Ｉｎｔａｖｉｓ  ＡＧ）等）を利用することができる。
【００４８】
以上のように、本発明の一実施形態におけるポリペプチドを生産する方法によって取得されるポリペプチドは、天然に存在する変異ポリペプチドであっても、人為的に作製された変異ポリペプチドであってもよい。
【００４９】
このように、本発明の一実施形態におけるポリペプチドは、少なくとも、当該ポリペプチドのアミノ酸配列、または当該ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの塩基配列に基づいて公知慣用技術を用いて生産すればよいといえる。
【００５０】
〔２．遺伝子〕
本発明の一実施形態において、上記〔１〕で記載した本発明の一実施形態におけるポリペプチドをコードする遺伝子を提供する。本発明の一実施形態において使用される遺伝子は、コブラ毒由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２のアイソフォームＣＭ−ＩＩポリペプチドをコードする遺伝子であることが好ましい。本発明の一実施形態におけるポリペプチドが抗ウイルス剤等として有用であるのと同様の理由で、本発明の一実施形態における遺伝子もまた、抗ウイルス剤等として有用である。
【００５１】
本明細書において「遺伝子」なる用語は、「ポリヌクレオチド」、「核酸」または「核酸分子」と交換可能に使用され、ヌクレオチドの重合体が意図される。本明細書において「塩基配列」なる用語は、「核酸配列」または「ヌクレオチド配列」と交換可能に使用され、デオキシリボヌクレオチド（Ａ、Ｇ、ＣおよびＴと省略される）の配列として示される。
【００５２】
本発明の一実施形態において使用される遺伝子としては、以下の（ｄ）〜（ｇ）からなる群より選択されるいずれかの遺伝子が用いられる：
（ｄ）配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする遺伝子、
（ｅ）配列番号１で示されるアミノ酸配列において、１もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子、
（ｆ）配列番号１で示されるアミノ酸配列と８０％以上の相同性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子、および
（ｇ）前記（ｄ）〜（ｆ）のいずれかの遺伝子と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子。
【００５３】
上記（ｄ）の遺伝子は、上述した配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする遺伝子である。なお、配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドは、上述したとおりである（以下、項目〔２〕において同様。）。
【００５４】
上記（ｄ）の遺伝子としては、例えば配列番号２で示される塩基配列からなる遺伝子が挙げられる。配列番号２は、Ｎ．ｍ．ｍｏｓｓａｍｂｉｃａの近縁種である、Ｎａｊａ  ｎａｊａ  ａｔｒａ（台湾コブラ）のホスホリパーゼＡ２の塩基配列（ＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ  ｎｏ．Ｘ７３２２５）を基に、Ｎ．ｍ．ｍｏｓｓａｍｂｉｃａに由来する分泌型ホスホリパーゼＡ２のアイソフォームＣＭ−ＩＩのアミノ酸配列を示すように推定された塩基配列である。
【００５５】
上記（ｅ）の遺伝子は、配列番号１で示されるアミノ酸配列を有するタンパク質の、機能的に同等の変異体、誘導体、バリアント、アレル、ホモログ、オルソログ、部分ペプチド、または他のタンパク質・ペプチドとの融合タンパク質等であって、抗ウイルス活性を有するタンパク質をコードする遺伝子である限り、その具体的な配列については限定されない。上記遺伝子を含む抗ウイルス剤の処置対象となるウイルスは、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有する。すなわち、上記抗ウイルス活性は、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスに対する抗ウイルス活性であることが好ましい。
【００５６】
なお、「欠失、置換または付加されてもよいアミノ酸の数」や「その導入方法」、「変異」の定義、「変異するアミノ酸残基」の記載、「機能的に同等」の定義、「抗ウイルス活性」の定義等は、上記〔１〕で記載したものと同様である。
【００５７】
上記（ｆ）の遺伝子は、上記（ｅ）の遺伝子と同様に、配列番号１で示されるアミノ酸配列を有するタンパク質の、機能的に同等の変異体、誘導体、バリアント、アレル、ホモログ、オルソログ、部分ペプチド、または他のタンパク質・ペプチドとの融合タンパク質等を意図しており、抗ウイルス活性を有するタンパク質をコードする遺伝子である限り、その具体的な配列については限定されない。上記遺伝子を含む抗ウイルス剤の処置対象となるウイルスは、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有する。すなわち、上記抗ウイルス活性は、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスに対する抗ウイルス活性である。
【００５８】
なお、「アミノ酸配列の相同性」や「相同性」の定義等は、上記〔１〕で記載したものと同様である。
【００５９】
上記（ｇ）の遺伝子は、上記（ｄ）〜（ｆ）のいずれかの遺伝子と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズする遺伝子を意図しており、抗ウイルス活性を有するタンパク質をコードする遺伝子である限り、その具体的な配列については限定されない。上記遺伝子を含む抗ウイルス剤の処置対象となるウイルスは、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有する。すなわち、上記抗ウイルス活性は、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスに対する抗ウイルス活性である。
【００６０】
ここで、ストリンジェントな条件とは、いわゆる塩基配列に特異的な２本鎖のポリヌクレオチドが形成され、非特異的な２本鎖のポリヌクレオチドが形成されない条件をいう。換言すれば、相同性が高い核酸同士、例えば完全にマッチしたハイブリッドの融解温度（Ｔｍ値）から１５℃、好ましくは１０℃、さらに好ましくは５℃低い温度までの範囲の温度でハイブリダイズする条件ともいえる。例えば、一例を示すと、０．２５Ｍ  Ｎａ２ＨＰＯ４、ｐＨ７．２、７％ＳＤＳ、１ｍＭ  ＥＤＴＡ、１×デンハルト溶液からなる緩衝液中で温度が６０〜６８℃、好ましくは６５℃、さらに好ましくは６８℃の条件下で１６〜２４時間ハイブリダイズさせ、さらに２０ｍＭ  Ｎａ２ＨＰＯ４、ｐＨ７．２、１％  ＳＤＳ、１ｍＭ  ＥＤＴＡからなる緩衝液中で温度が６０〜６８℃、好ましくは６５℃、さらに好ましくは６８℃の条件下で１５分間の洗浄を２回行う条件を挙げることができる。他の例としては、２５％ホルムアミド、より厳しい条件では５０％ホルムアミド、４×ＳＳＣ（塩化ナトリウム／クエン酸ナトリウム）、５０ｍＭ  Ｈｅｐｅｓ  ｐＨ７．０、１０×デンハルト溶液、２０μｇ／ｍＬ変性サケ精子ＤＮＡを含むハイブリダイゼーション溶液中、４２℃で一晩プレハイブリダイゼーションを行った後、標識したプローブを添加し、４２℃で一晩保温することによりハイブリダイゼーションを行う。その後の洗浄における洗浄液および温度条件は、「１×ＳＳＣ、０．１％  ＳＤＳ、３７℃」程度で、より厳しい条件としては「０．５×ＳＳＣ、０．１％  ＳＤＳ、４２℃」程度で、さらに厳しい条件としては「０．２×ＳＳＣ、０．１％  ＳＤＳ、６５℃」程度で実施することができる。このようにハイブリダイゼーションの洗浄の条件が厳しくなるほど、特異性の高いハイブリダイズとなる。ただし、前記ＳＳＣ、ＳＤＳおよび温度の条件の組み合わせは例示であり、当業者であれば、ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーを決定する前記若しくは他の要素（例えば、プローブ濃度、プローブの長さ、ハイブリダイゼーション反応時間等）を適宜組み合わせることにより、前記と同様のストリンジェンシーを実現することが可能である。このことは、例えば、Sambrookら、Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 3rd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory（2001）等に記載されている。
【００６１】
本発明の一実施形態における遺伝子は、ＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ）の形態、またはＤＮＡの形態（例えば、ｃＤＮＡまたはゲノムＤＮＡ）で存在し得る。ＤＮＡは、二本鎖または一本鎖であり得る。一本鎖ＤＮＡまたはＲＮＡは、コード鎖（センス鎖としても知られる）であり得るか、または非コード鎖（アンチセンス鎖としても知られる）であり得る。
【００６２】
本発明の一実施形態における遺伝子は、非翻訳領域（ＵＴＲ）の配列またはベクター配列（発現ベクター配列を含む）などの配列を含むものであってもよい。
【００６３】
本発明の一実施形態において、ベクターは、周知の遺伝子組み換え技術により、本発明の一実施形態における遺伝子を所定のベクターに挿入することにより作製することができる。上記ベクターとしては、別段限定されるものでなく、組み換え発現ベクターであってもよいし、クローニングベクターであってもよい。ベクターの選択は、目的に応じて、適宜選択可能である。
【００６４】
本発明の一実施形態における遺伝子を抗ウイルス剤として用いる場合、遺伝子が所定の発現ベクターに挿入されていることが好ましい。本発明の一実施形態における遺伝子が所定の発現ベクターに挿入されていることにより、例えば、標的部位への遺伝子の送達をより効率的に行うことができたり、標的部位における細胞内への遺伝子の取り込み効率を上げたり、標的部位において抗ウイルス作用を有するポリペプチドの発現を高めたりすることができる。その結果として、本発明の一実施形態における遺伝子を含む抗ウイルス剤によりウイルス感染症を効果的に処置することが可能となる。
【００６５】
このようなベクターは、薬剤送達系（Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ  Ｓｙｓｔｅｍ（ＤＤＳ））の分野において開発が進んでおり、所望の送達および発現効果を有するベクターを適宜選択することが可能である。そのようなベクターの一例として、ウイルスベクター（例えば、レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター等）、ＤＮＡベクター（例えば、ｐＵＭＶＣ４ａ等）等が挙げられるがこれらに限定されない。
【００６６】
〔３．抗ウイルス剤〕
本発明の一実施形態において、上記〔１〕で記載したポリペプチドを含む抗ウイルス剤を提供する。本発明の別の実施形態において、上記〔２〕で記載した遺伝子を含む抗ウイルス剤を提供する。
【００６７】
本発明の一実施形態における抗ウイルス剤が標的とするウイルスは、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有することを特徴とする。
【００６８】
上記エンベロープは、ウイルスが、感染した宿主細胞内で増殖した後、宿主細胞内から細胞外へと放出されるという一連の過程の中で、宿主細胞の細胞膜、小胞体膜等に由来する脂質二重層に宿主細胞内で発現したウイルス由来のタンパク質が挿入されることによって形成される。そのため、エンベロープの組成は、ウイルスの出芽経路を反映していると考えられている。本発明の一実施形態における抗ウイルス剤が標的とするウイルスは、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有する。つまり、本発明の一実施形態における抗ウイルス剤が標的とするウイルスは、宿主細胞の小胞体を経由して出芽すると考えられる。
【００６９】
小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスとしては、フラビウイルス科、コロナウイルス科、ヘパドナウイルス科に属するウイルス等が挙げられる。フラビウイルス科に属するウイルスとしては、例えば、デングウイルス、日本脳炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、黄熱ウイルス、ウエストナイルウイルス、ジカウイルス等が挙げられるがこれらに限定されない。コロナウイルス科に属するウイルスとしては、例えば、ＳＡＲＳコロナウイルス、ＭＥＲＳコロナウイルス等が挙げられるがこれらに限定されない。ヘパドナウイルス科に属するウイルスとしては、例えば、Ｂ型肝炎ウイルス、地リスＢ型肝炎ウイルス、ガチョウＢ型肝炎ウイルス等が挙げられるがこれらに限定されない。
【００７０】
本発明の一実施形態における上記〔１〕で記載したポリペプチドは、後述の実施例に示すように、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスに対して、高い抗ウイルス活性を有している。一方、細胞障害活性および溶血活性に関しては、極めて高用量で投与した場合に限り、それぞれの活性を有する。すなわち、十分に抗ウイルス活性を有する投与量では、細胞障害活性および溶血活性を示さないため、処置対象に与える影響を最小限にとどめつつ、効果的にウイルス感染症を処置することが可能である。
【００７１】
実施例では、上記〔１〕で記載したポリペプチドが、感染性ウイルス粒子の感染能を直接阻害する効果が特に高いこと（換言すれば、宿主細胞外での中和活性が高いこと）が見出されている。そのため、本発明の一実施形態におけるポリペプチドは、同様の作用機序を有する中和抗体と同じ治療効果を有すると考えられる。すなわち、本発明の一実施形態におけるポリペプチドは、ウイルス感染症の感染初期の治療薬および重症化の予防薬として、とりわけ有用であり得る。
【００７２】
本発明の一実施形態における抗ウイルス剤の投与対象は、上記〔１〕で記載したポリペプチドまたは上記〔２〕で記載した遺伝子により処置され得る対象であれば別段限定されない。本発明の一実施形態における抗ウイルス剤の投与対象は、例えば、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスの感染症を患う対象であり、例えば、哺乳動物、例えば、ヒトであり得る。
【００７３】
本発明の一実施形態における抗ウイルス剤は、処置対象に対して、直接注入により投与され得る。本発明の一実施形態における抗ウイルス剤はまた、経口投与、粘膜投与、筋肉内投与、静脈内投与、皮下投与、眼内投与または経皮的投与のために処方され得るが、患者体内において専らウイルス血症により感染が拡大するウイルス感染症に対して静脈内投与することがより好ましい。本発明の一実施形態における抗ウイルス剤の投与量は、当該技術分野における通常の方法に基づいて、適宜設定することができる。
【００７４】
本発明の一実施形態において、抗ウイルス剤は、上記〔１〕で記載したポリペプチドおよび上記〔２〕で記載した遺伝子の他に、薬学的に許容可能なキャリア、希釈剤または賦形剤（それらの組み合わせを含む）を含み得る。
【００７５】
本発明の一実施形態において、抗ウイルス剤は、好ましくは、ヒトについての使用のためのものであり、薬学的に許容可能なキャリア、希釈剤または賦形剤の任意の１つ以上を含む。治療的使用のための薬学的に許容可能なキャリアまたは賦形剤は、薬学分野で周知であり、例えば、Remington’s Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co.（A.R.Gennaro編、1985）に記載されている。薬学的に許容可能なキャリア、希釈剤または賦形剤の選択は、意図された投与経路および標準的薬学的慣行に従って、当業者によって容易に選択され得る。また、本発明の一実施形態における抗ウイルス剤は、任意の適切な結合剤、滑沢剤、懸濁剤、被覆剤または可溶化剤をさらに含み得る。
【００７６】
本明細書中の記載に基づけば、当業者は、本発明の一実施形態における抗ウイルス剤の別の形態（例えば、キット）および、本発明の一実施形態における抗ウイルス剤を用いて疾患を処置（予防および／または治療）する方法もまた本発明の範囲内であることを、容易に理解する。
【００７７】
また、他の実施形態において、本発明の一実施形態における抗ウイルス剤は、ウイルスを除去すべき被処理物からウイルスを除去するために用いられ得る。例えば、本発明の一実施形態における抗ウイルス剤は、噴霧剤、塗布剤、浸漬剤等の形態であり得、それぞれ、被処理物に対して噴霧、塗布、被処理物を浸漬するために用いられ得る。本発明の一実施形態において、抗ウイルス剤は、用途に応じて、公知の抗ウイルス剤、界面活性剤、安定剤、ｐＨ調整剤、緩衝剤、等張化剤、キレート剤、保存料、粘張剤、溶媒等をさらに含んでいてもよい。
【００７８】
さらに、本発明の他の実施形態において、抗ウイルス剤は、以下の（ａ）〜（ｇ）からなる群より選択されるいずれかのポリペプチドまたは遺伝子を含み、前記抗ウイルス剤の処置対象となるウイルスが、フラビウイルス科またはヘパドナウイルス科に属することを特徴とする、抗ウイルス剤であってもよい：
（ａ）配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチド、
（ｂ）配列番号１で示されるアミノ酸配列において、１もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチド、
（ｃ）配列番号１で示されるアミノ酸配列と８０％以上の相同性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチド、
（ｄ）配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする遺伝子、
（ｅ）配列番号１で示されるアミノ酸配列において、１もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子、
（ｆ）配列番号１で示されるアミノ酸配列と８０％以上の相同性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子、および
（ｇ）前記（ｄ）〜（ｆ）のいずれかの遺伝子と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつ、抗ウイルス活性を有するポリペプチドをコードする遺伝子。
【００７９】
その他、上記〔１〕〜〔３〕の各項目で記載した内容は、他の項目においても適宜援用できることを付言する。また、本発明は上述した各実施形態に限定されるものではなく、請求項に示した範囲で種々の変更が可能であり、異なる実施形態にそれぞれ開示された技術的手段を適宜組み合わせて得られる実施形態についても本発明の技術的範囲に含まれる。以下、実施例により本発明を更に詳細に説明するが、本発明はかかる実施例のみに限定されるものではない。
【実施例】
【００８０】
〔１．抗ウイルス活性を有する分泌型ホスホリパーゼＡ２の決定〕
４種類のウイルスと、Ｈｕｈ７ｉｔ−１細胞とを用いたｉｎ  ｖｉｔｒｏ感染系で、被験物質に関して、抗ウイルス活性を測定した。上記ウイルスとしては、デングウイルス（Ｔｒｉｎｉｄａｄ  １７５１株）（Hotta H et al., Infect Immun., 41, 462-469, 1983等に記載のウイルス株）、Ｃ型肝炎ウイルス（Ｊ６／ＪＦＨ−１株）（Bungyoku Y et al., J Gen Virol., 90, 1681-1691, 2009等に記載のウイルス株）、シンドビスウイルス（Matsumura T et al., J Gen Virol., 17, 343-347, 1972に記載のウイルス株）、およびＡ型インフルエンザウイルス（Ａ／Ｕｄｏｒｎ／３０７／７２［Ｈ３Ｎ２］）（El-Bitar AM et al., Virol J., 12, 47, 2015に記載のウイルス株）を用いた。また、Ｈｕｈ７ｉｔ−１細胞は、Apriyanto DR et al., Jpn J Infect Dis., 69, 213-220, 2016等に記載の細胞株を用いた。被験物質としては、ムフェジコブラの一種であるＮ．ｍ．ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２アイソフォームＣＭ−ＩＩ（Ｐ７７７８、Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ社製）、Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｖｉｏｌａｃｅｏｒｕｂｅｒ（以下、「Ｓ．ｖｉｏｌａｃｅｏｒｕｂｅｒ」とも称する）由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２（Ｐ８６８５、Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ社製）、ウシ膵臓由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２（Ｐ８９１３、Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ社製）、ブタ膵臓由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２（ＳＡＮＹＯ ＦＩＮＥ社製）を用いた。「培養液」は、１０％牛胎児血清加ダルベッコ改変イーグル培地（日水製薬株式会社製）を用いた。【００８１】
Ｈｕｈ７ｉｔ−１細胞を２４ウェルプレートの各ウェルに１，０００μｌずつ播種した。翌日（２４時間後）、１００μｌのウイルスと１００μｌの種々の濃度（０．００２ｎｇ／ｍｌ、０．０２ｎｇ／ｍｌ、０．２ｎｇ／ｍｌ、２ｎｇ／ｍｌ、２０ｎｇ／ｍｌ、２００ｎｇ／ｍｌ、２，０００ｎｇ／ｍｌおよび２０，０００ｎｇ／ｍｌ）の被験物質とを混合し、３７℃で１時間インキュベートした。各ウェルの培養液を除いた後、ウイルスと被験物質との混合物２００μｌを細胞に接種し、さらに１時間インキュベートした。培養液で細胞を洗浄して余剰のウイルスを除き、被験物質を含まない培養液でさらにインキュベートした。２４時間後に蛍光抗体法を実施し、ウイルス感染細胞の数を測定した。被験物質で処理されていないウイルスの溶液をコントロールとして用いた。一次抗体としては、抗デングウイルスのマウスのモノクローナル抗体（Hotta H et al., Proc Soc Exp Biol Med., 175, 320-327, 1984に記載）、Ｃ型肝炎ウイルス感染患者血清（紫外線照射によりウイルス感染性を不活化したもの）（El-Bitar AM et al., Virol J., 12, 47, 2015に記載）、インフルエンザウイルス免疫ウサギ血清（El-Bitar AM et al., Virol J., 12, 47, 2015に記載）を用いた。二次抗体としては、上記一次抗体に対してそれぞれ、ＦＩＴＣ標識抗マウスＩｇＧ、ＦＩＴＣ標識抗ヒトＩｇＧ、ＦＩＴＣ標識抗ウサギＩｇＧを用いた。なお、蛍光抗体法の結果を基に、既報（El-Bitar et al., Virol. J., 12, 47, 2015）の方法に準じて、ウイルス感染価の測定を行った。上記の方法で得られたウイルス感染価を基にして、被験物質がウイルス感染を５０％抑制する濃度（ＩＣ５０；５０％−ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｙ  ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎ）を算出した。蛍光抗体染色用の抗体が入手できなかったシンドビスウイルスについては、１％メチルセルロース添加培養液で７２〜９６時間静置培養してプラクを形成させるプラク形成法により、感染価を測定した（プラク形成法は、Song J et al., J Gen Virol., 80, 879-886, 1999に記載の方法）。【００８２】
また、細胞障害活性および溶血活性の測定は、以下の方法により行った。【００８３】
具体的には、細胞障害活性は、ＷＳＴ−１アッセイ（El-Bitar et al., Virol. J., 12, 47, 2015に記載）により測定した。まず、９６ウェルプレートに播種されたＨｕｈ７ｉｔ−１細胞に、２倍段階希釈した種々の濃度の被験物質を含む培養液を添加し、ウイルス非存在下で、３７℃で２４時間処理した。その後、１０μｌのＷＳＴ−１試薬（Roche社製）を加えて４時間培養した。ＷＳＴ−１試薬は、ミトコンドリアの脱水素酵素によりフォルマザンに変換されるため、フォルマザンの量を分光光度計（４５０ｎｍおよび６３０ｎｍ）で測定することにより、細胞生存率を求めた。コントロールとしては、被験物質での処理を行っていない細胞を用いた。これらの結果を基にして、被験物質が培養細胞の５０％を障害する濃度（ＣＣ５０；５０％−ｃｙｔｏｔｏｘｉｃｉｔｙ  ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎ）を算出した。【００８４】
また、細胞障害活性は、ＬＤＨ細胞障害性測定キット（MK401、タカラバイオ社製）によっても測定した。細胞膜に損傷を受けた細胞は、乳酸脱水素酵素（ＬＤＨ）を漏出する。ＬＤＨアッセイにおいては、培養液中に漏出したＬＤＨの活性を指標にして細胞障害活性を測定する。まず、９６ウェルプレートに播種されたＨｕｈ７ｉｔ−１細胞に、２倍段階希釈した種々の濃度の被験物質を含む培養液を添加し、ウイルス非存在下で、３７℃で２４時間処理した。各ウェルの培養上清１００μｌをＥＬＩＳＡ用９６ウェルプレートに移し、上記キットに添付されている試薬Ｃを１００μｌ加えて、遮光して室温で３０分間反応させた。５０μｌの１Ｎ ＨＣｌを加えて反応を停止させ、分光光度計（４９２ｎｍ）で吸光度を測定して、ＬＤＨ活性を算出し、細胞生存率を求めた。陰性コントロールとしては、被験物質での処理を行っていない細胞の培養上清を、また、陽性コントロールとしては、１％のＴｒｉｔｏｎＸ−１００溶液で処理した細胞の培養上清を用いた。この結果を基にして、被験物質が培養細胞の５０％を障害する濃度（ＣＣ５０；５０％−ｃｙｔｏｔｏｘｉｃｉｔｙ  ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎ）を算出した。【００８５】
溶血活性の測定は、ヒトの赤血球細胞を用いて、既報（Moerman L et al., Eur J Biochem., 269, 4799-4810, 2002 および Diego-Garcia E et al., Cell Mol Life Sci., 65, 187-200, 2008）に準じて行った。具体的には、ヒトの赤血球細胞をバッファー（０．８１％のＮａＣｌ、２０ｍＭのＨＥＰＥＳ、ｐＨ７．４）で３回洗浄後、同じ組成のバッファーで懸濁した。この赤血球細胞懸濁液（１ｍｌあたり１０７〜１０８個の赤血球細胞を含む）を、最終体積が１００μｌとなるように、被験物質を含むバッファーに加え、３７℃で６０分間インキュベートした。続いて遠心した後、遠心上清の５７０ｎｍの吸光度を測定することにより、溶血の有無を決定した。バッファー（または滅菌水）に赤血球細胞を懸濁した溶液、および０．５％のＴｒｉｔｏｎＸ−１００を含むバッファー（または滅菌水）に赤血球細胞を懸濁した溶液を、それぞれ、０％溶血および１００％溶血のコントロールとした。【００８６】
抗ウイルス活性（ＩＣ５０）、細胞障害活性（ＣＣ５０）および溶血活性（ＨＣ５０）についての結果を下記の表１に示す。なお、Ｎ．ｍ．ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２（アイソフォームＣＭ−ＩＩ）についての測定を実施例１とし、真正細菌の一種Ｓ．ｖｉｏｌａｃｅｏｒｕｂｅｒ由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２についての測定を比較例１とし、ウシ膵臓由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２についての測定を比較例２とし、ブタ膵臓由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２についての測定を比較例３とする。【００８７】
【表１】
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表１に示すように、被験物質としてＮ．ｍ．ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２（アイソフォームＣＭ−ＩＩ）を用いた実施例１では、デングウイルスおよびＣ型肝炎ウイルスに対して、それぞれ、０．３１ｎｇ／ｍｌおよび０．０３６ｎｇ／ｍｌという低い濃度で抗ウイルス活性を示した。一方、シンドビスウイルスおよびＡ型インフルエンザウイルスに対しては、１０，０００ｎｇ／ｍｌの高濃度においても、十分な抗ウイルス活性を示さなかった。【００８８】
また、実施例１では、１０μｇ／ｍｌ（１０，０００ｎｇ／ｍｌ）という極めて高い濃度で用いた場合でも、３０〜４０％の細胞を障害するのみであり、細胞障害活性や溶血活性は低いことがわかった。このことから、Ｎ．ｍ．ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２（アイソフォームＣＭ−ＩＩ）は、デングウイルスおよびＣ型肝炎ウイルスに対して強い抗ウイルス活性を有すると共に、処置対象の細胞に対して低い細胞毒性や溶血活性を示すことがわかった。【００８９】
一方、被験物質がＳ．ｖｉｏｌａｃｅｏｒｕｂｅｒ由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２、ウシ膵臓由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２、およびブタ膵臓由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２の場合には、１０，０００ｎｇ／ｍｌの高濃度においても、デングウイルスおよびＣ型肝炎ウイルスに対して、十分な抗ウイルス活性を示さなかった。【００９０】
〔２．作用機序解析〕
Ｎ．ｍ．ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２（アイソフォームＣＭ−ＩＩ）の、デングウイルス、Ｃ型肝炎ウイルスおよびＢ型肝炎ウイルスに対する、抗ウイルス作用の作用機序を調べる目的で、被験物質を作用させる時期を下記（１）〜（３）のように設定し、蛍光抗体法またはプラク形成法により感染細胞を計測した。【００９１】
（１）ウイルス感染の２４時間前からウイルス接種直前まで、種々の濃度（１ｎｇ／ｍｌ、１０ｎｇ／ｍｌ、１００ｎｇ／ｍｌおよび１，０００ｎｇ／ｍｌ）の被験物質で細胞を２時間処理した。培養液で細胞を３回洗浄して被験物質を除いた後、被験物質を含まない状態で細胞に２００μｌのウイルスを接種した。ウイルス接種の１時間後に細胞を培養液で洗浄して余剰のウイルスを除き、被験物質を含まない培養液で細胞を一定時間培養した。２４時間後に、細胞に蛍光抗体染色を行い、感染細胞を計測した。なお、蛍光抗体染色用の抗体が入手できなかったシンドビスウイルスおよび脳心筋炎ウイルスについては、プラク形成法により、感染価を測定した（Song J et al., J Gen Virol., 80, 879-886, 1999に記載の方法）。【００９２】
（２）１００μｌのウイルスと、１００μｌの種々の濃度（２ｎｇ／ｍｌ、２０ｎｇ／ｍｌ、２００ｎｇ／ｍｌ、および２，０００ｎｇ／ｍｌ）の被験物質とを混合して１時間反応させた後に、当該ウイルス・被験物質混合液２００μｌを細胞に接種した。ウイルス接種の１時間後に、培養液で細胞を洗浄してウイルスと被験物質とを除き、被験物質を含まない培養液で細胞を一定時間培養した。上記（１）と同様に、蛍光抗体法またはプラク形成法により感染細胞を計測した。【００９３】
（３）被験物質を含まない状態で、２００μｌのウイルスを細胞に接種し、ウイルス接種の１時間後に、培養液で細胞を洗浄して余剰のウイルスを除き、種々の濃度（１ｎｇ／ｍｌ、１０ｎｇ／ｍｌ、１００ｎｇ／ｍｌおよび１，０００ｎｇ／ｍｌ）の被験物質を含む培養液で細胞を２４時間培養した。上記（１）と同様に、一定時間後に蛍光抗体法またはプラク形成法により感染細胞を計測した。【００９４】
蛍光抗体法においては、一次抗体として、抗デングウイルスのマウスのモノクローナル抗体（Hotta H et al., Proc Soc Exp Biol Med., 175, 320-327, 1984に記載）、Ｃ型肝炎ウイルス感染患者血清（紫外線照射によりウイルス感染性を不活化したもの）（El-Bitar AM et al., Virol J., 12, 47, 2015に記載）、および抗Ｂ型肝炎ウイルスのコアタンパク質のマウスのモノクローナル抗体（B0586, DAKO社）もしくはＨＢｓエンベロープタンパク質の免疫ウサギ血清（ab39716, Abcam社）を用いた。二次抗体としては、上記一次抗体に対してそれぞれ、ＦＩＴＣ標識抗マウスＩｇＧ、ＦＩＴＣ標識抗ヒトＩｇＧを用いた。「培養液」は、１０％牛胎児血清加ダルベッコ改変イーグル培地（日水製薬株式会社製）を用いた。【００９５】
上記（１）〜（３）において、被験物質で処理されていない細胞に各ウイルスを感染させた場合の感染細胞数をコントロールとして用いた。コントロールにおける感染細胞数に対する、被験物質で処理された場合の感染細胞数の割合を、阻害率（％）とした。【００９６】
各条件における阻害率を下記の表２に示す。なお表２中、「−」は未測定であることを意味する。【００９７】
【表２】
2018203427.tif 000003
表２に示すように、上記（１）〜（３）において、特に（２）の方法（被験物質をウイルスに直接作用させる方法）を用いた際に、最も強い抗ウイルス活性が観察された。このことから、Ｎ．ｍ．ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２（アイソフォームＣＭ−ＩＩ）は、感染性ウイルス粒子の感染能を直接阻害する効果が特に高い、換言すれば、宿主細胞外での中和活性が高いことがわかった。【００９８】
上記の結果に基づいて、以下の実験は、（２）の方法を用いて行った。【００９９】
〔３．種々のウイルスに対する分泌型ホスホリパーゼＡ２（アイソフォームＣＭ−ＩＩ）の機能解析〕
Ｎ．ｍ．ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２（アイソフォームＣＭ−ＩＩ）について、以下のウイルスに対する抗ウイルス活性の測定を行った。抗ウイルス活性の測定方法は、上記〔１〕と同様である。
・実施例２：デングウイルス（Ｔｒｉｎｉｄａｄ  １７５１株）（Hotta H et al., Infect Immun., 41, 462-469, 1983等に記載のウイルス株）
・実施例３：日本脳炎ウイルス（Ｎａｋａｙａｍａ株）（Song J et al., J Gen Virol., 80, 879-886, 1999に記載のウイルス株）
・実施例４：Ｃ型肝炎ウイルス（Ｊ６／ＪＦＨ−１株）（Bungyoku Y et al., J Gen Virol., 90, 1681-1691, 2009等に記載のウイルス株）
・実施例５：Ｂ型肝炎ウイルス（Ｂｊ＿ＪＰＮ５６株）（Hayashi M et al., Microbiol Immunol., 60, 17-25, 2016に記載のウイルス株）
・比較例４：シンドビスウイルス（Matsumura T et al., J Gen Virol., 17, 343-347, 1972に記載のウイルス株）
・比較例５：Ａ型インフルエンザウイルス（Ａ／Ｕｄｏｒｎ／３０７／７２［Ｈ３Ｎ２］）（El-Bitar AM et al., Virol J., 12, 47, 2015に記載のウイルス株）
・比較例６：センダイウイルス（Ｆｕｓｈｉｍｉ株）（Hayashi T et al., J Gen Virol., 72, 979-982, 1991に記載のウイルス株）
・比較例７：単純ヘルペスウイルス１型（ＣＨＲ３株）（Hayashi K et al., J Virol., 57, 942-951, 1986に記載のウイルス株）
・比較例８：脳心筋炎ウイルス（ＤＫ−２７株）（Song J et al., J Gen Virol., 80, 879-886, 1999に記載のウイルス株）
・比較例９：コクサッキーウイルス（Ｎａｎｃｙ株）（Mikami S et al., Biochem Biophys Res Commun., 220, 983-989, 1996に記載のウイルス株）。【０１００】
また、ウイルス感染価の測定のための蛍光抗体法において、一次抗体は、抗デングウイルスのマウスのモノクローナル抗体（Hotta H et al., Proc Soc Exp Biol Med., 175, 320-327, 1984に記載）、日本脳炎ウイルス免疫ウサギＩgＧ（GTX131368またはGTX125868、 GeneTex, Inc.）、Ｃ型肝炎ウイルス感染患者血清（紫外線照射によりウイルス感染性を不活化したもの）（El-Bitar AM et al., Virol J., 12, 47, 2015に記載）、抗Ｂ型肝炎ウイルスのコアタンパク質のマウスのモノクローナル抗体（B0586, DAKO社）またはＸタンパク質の免疫ウサギ血清（ab39716, Abcam社）、センダイウイルス免疫ウサギ血清（Hayashi T et al., J Gen Virol., 72, 979-982, 1991）、単純ヘルペスウイルス１型免疫ウサギ血清（Hayashi K et.al, J Virol., 57, 942-951, 1986）、コクサッキーウイルス免疫ウサギ血清（No.300638, Denka Seiken社）である。二次抗体として、上記マウスのモノクローナル抗体に対してＦＩＴＣ標識抗マウスＩｇＧを、上記免疫ウサギＩｇＧに対してＦＩＴＣ標識抗ウサギＩｇＧを、上記感染患者血清に対してＦＩＴＣ標識抗ヒトＩｇＧを用いた。【０１０１】
なお、蛍光抗体染色用の抗体が入手できなかったシンドビスウイルスおよび脳心筋炎ウイルスについては、前述のプラク形成法により感染価を測定した（Song J et al., J Gen Virol., 80, 879-886, 1999に記載の方法）。【０１０２】
結果を下記の表３に示す。【０１０３】
【表３】
2018203427.tif 000004
表３に示すように、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有する、デングウイルス、日本脳炎ウイルスおよびＣ型肝炎ウイルス（いずれもフラビウイルス科に属する）について、Ｎ．ｍ．ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２（アイソフォームＣＭ−ＩＩ）のＩＣ５０は、それぞれ、０．３１ｎｇ／ｍｌ、０．９２ｎｇ／ｍｌおよび０．０３６ｎｇ／ｍｌであった。同様に、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有すると考えられるＢ型肝炎ウイルス（ヘパドナウイルス科に属する）のＩＣ５０は、０．６５ｎｇ／ｍｌであった。このことから、Ｎ．ｍ．ｍｏｓｓａｍｂｉｃａ由来の分泌型ホスホリパーゼＡ２（アイソフォームＣＭ−ＩＩ）は、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスに対して強い抗ウイルス活性を有することがわかった。【０１０４】
一方で、細胞膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有する、シンドビスウイルス、Ａ型インフルエンザウイルス、センダイウイルス、および単純ヘルペスウイルス１型について、１０，０００ｎｇ／ｍｌという高い濃度を投与した場合においても、ウイルス感染阻害は５％以下にしか阻害できなかった。同様に、エンベロープを有さない、脳心筋炎ウイルスおよびコクサッキーウイルスについても、１０，０００ｎｇ／ｍｌという高い濃度を投与した場合においても、ウイルス感染阻害は５％以下にしか阻害できなかった。
【産業上の利用可能性】
【０１０５】
本発明の一態様におけるポリペプチドは、抗ウイルス活性、とりわけ、小胞体膜由来の脂質二重層を含むエンベロープを有するウイルスに対する抗ウイルス活性を有するため、当該ポリペプチドまたは遺伝子を含む本発明の薬剤は、当該ウイルス感染症の治療薬として有用である。また、本発明の一態様は、被処理物からウイルスを除去することが求められるあらゆる技術分野において、とりわけ、医療分野において有用である。
【配列表】
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【国際調査報告】
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