【手続補正書】
【提出日】平成27年6月2日(2015.6.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２７】
図１及び図２に示される熱サイクル装置１の本体１０においては、温度勾配形成部２０の第１加熱部２１が第１の装着部１１において天板１４から相対的に遠い側（底板１５から相対的に近い側、回転軸Ｒに相対的に近い側）、温度勾配形成部２０の第２加熱部２２が第１の装着部１１において天板１４から相対的に近い側（底板１５から相対的に遠い側、回転軸Ｒに相対的に遠い側）に配置されている。また、図１及び図２に示される熱サイクル装置１の本体１０においては、温度勾配形成部２０の第３加熱部２３が第２の装着部１２において天板１４から相対的に遠い側（底板１５から相対的に近い側、回転軸Ｒに相対的に遠い側）、温度勾配形成部２０の第４加熱部２４が第２の装着部１２において天板１４から相対的に近い側（底板１５から相対的に遠い側、回転軸Ｒに相対的に近い側）に配置されている。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７１】
より具体的には、まず、制御部４０は、第１加熱部２１に対して制御信号Ｓ１を出力することによって、第１加熱部２１の温度を第１温度に制御し、第３加熱部２３に対して制御信号Ｓ３を出力することによって、第３加熱部２３の温度を第１温度に制御する（ステップＳ１００）。本具体例において、第１温度は逆転写酵素によって逆転写反応が進行する温度である。「逆転写酵素によって逆転写反応が進行する温度」は逆転写酵素の種類に依存する温度であるが、一般的には２０℃以上７０℃以下程度の範囲内であり、特に４０℃以上５０℃以下程度の範囲内において反応が進行しやすいことが一般的である。また、本具体例においては、初期動作時における第１の装着部１１、第２の装着部１２及び温度勾配形成部２０の配置は第１の配置である。したがって、反応液１４０は第１領域１１１に保持される。すなわち、反応液１４０は第１温度に保持される。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７４】
第１時間を経過したと制御部４０が判定した場合（ステップＳ１０２でＹＥＳの場合）には、制御部４０は、第１加熱部２１に対して制御信号Ｓ１を出力することによって、第１加熱部２１の温度を第２温度に制御し、第３加熱部２３に対して制御信号Ｓ３を出力することによって、第３加熱部２３の温度を第２温度に制御し、第２加熱部２２に対して制御信号Ｓ２を出力することによって、第２加熱部２２の温度を第３温度に制御し、第４加熱部２４に対して制御信号Ｓ４を出力することによって、第４加熱部２４の温度を第３温度に制御する（ステップＳ１０４）。本具体例においては、第２温度はＰＣＲにおけるアニーリング及び伸長温度である。「ＰＣＲにおけるアニーリング及び伸長温度」は、核酸を増幅することに用いられる酵素（本具体例ではＤＮＡポリメラーゼ）の種類に依存する温度であるが、一般的には５０℃以上７０℃以下程度の範囲内である。本具体例においては、第３温度はＰＣＲにおける熱変性温度である。「ＰＣＲにおける熱変性温度」は、核酸を増幅するための酵素の種類に依存する温度であるが、一般的には９０℃以上１００℃以下程度の範囲内である。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７５】
ステップＳ１０４の後に、制御部４０は、駆動機構３０に対して制御信号Ｓ５を出力することによって、第１の装着部１１、第２の装着部１２及び温度勾配形成部２０の配置を第１の配置から第２の配置へと切換えるように駆動機構３０を制御する（ステップＳ１０６）。上述のように、ステップＳ１０４までは第１の装着部１１、第２の装着部１２及び温度勾配形成部２０の配置が第１の配置になっているので、ステップＳ１０２を行うことで、第１の装着部１１、第２の装着部１２及び温度勾配形成部２０の配置を第２の配置とする。第１の装着部１１、第２の装着部１２及び温度勾配形成部２０の配置が第２の配置である場合には、反応液１４０は第２領域１１２に保持される。すなわち、反応液１４０は、第３温度に保持される。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７６】
ステップＳ１０６の後に、制御部４０は、第１の装着部１１、第２の装着部１２及び温度勾配形成部２０の配置が第２の配置で第２時間を経過させる第２処理を行う。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７８】
第２時間を経過したと制御部４０が判定した場合（ステップＳ１０８でＹＥＳの場合）
には、制御部４０は、第１の装着部１１、第２の装着部１２及び温度勾配形成部２０の配置が第２の配置で第３時間を経過した場合に、駆動機構３０に対して制御信号Ｓ５を出力することによって、第１の装着部１１、第２の装着部１２及び温度勾配形成部２０の配置を、第２の配置から第１の配置へと切換えるように駆動機構３０を制御する第３処理を行う。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７９】
より具体的には、まず、制御部４０が、ステップＳ１０８が終了してから第３時間を経過したか否かを判定する（ステップＳ１１０）。本具体例において、第３時間は、ＰＣＲにおけるＤＮＡの熱変性に必要となる時間である。第３時間を経過していないと制御部４０が判定した場合（ステップＳ１１０でＮＯの場合）には、制御部４０はステップＳ１１０を繰り返す。第３時間を経過したと制御部４０が判定した場合（ステップＳ１１０でＹＥＳの場合）には、制御部４０は、駆動機構３０に対して制御信号Ｓ５を出力することによって、第１の装着部１１、第２の装着部１２及び温度勾配形成部２０の配置を、第２の配置から第１の配置へと切換えるように駆動機構３０を制御する（ステップＳ１１２）。第１の装着部１１、第２の装着部１２及び温度勾配形成部２０の配置が第１の配置である場合には、反応液１４０は第１領域１１１に保持される。すなわち、ステップＳ１１２の結果、反応液１４０は、第２温度に保持される。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８４】
第３処理の後に、制御部４０は、第１の装着部１１、第２の装着部１２及び温度勾配形成部２０の配置が第１の配置で第４時間を経過した場合に、駆動機構３０に対して制御信号Ｓ５を出力することによって、第１の装着部１１、第２の装着部１２及び温度勾配形成部２０の配置を、第１の配置から第２の配置へと切換えるように駆動機構３０を制御する第４処理と、第３処理とを所定回数繰り返して行なってもよい。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８６】
所定のサイクル数に達していないと制御部４０が判定した場合（ステップＳ１１８でＮＯの場合）には、制御部４０は、駆動機構３０に対して制御信号Ｓ５を出力することによって、第１の装着部１１、第２の装着部１２及び温度勾配形成部２０の配置を第１の配置から第２の配置へと切換えるように駆動機構３０を制御する（ステップＳ１２０）。ステップＳ１２０の後に、ステップＳ１１０からステップＳ１１８までを繰り返す。制御部４０が所定のサイクル数に達したと判定した場合（ステップＳ１１８でＹＥＳの場合）には、処理を終了する。なお、本具体例ではサイクル数に基づいて処理の終了を決定したが、ステップＳ１１８の前に、ステップＳ１１４で測定される所定の波長の光の強度が所定値
に達したか否かを判定するステップを加え、光の強度が所定値に達した場合にはステップＳ１１８を行わずに処理を終了してもよい。