【手続補正書】
【提出日】平成27年5月26日(2015.5.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
バイオチップを装着するための装着部と、
前記バイオチップの第１領域を第１の温度に設定する第１温度設定部と、
前記バイオチップの前記第１領域とは異なる第２領域を前記第１の温度とは異なる第２の温度に設定する第２温度設定部と、
前記第１領域と前記第２領域との、重力の作用する方向に対しての位置関係を変化させる駆動機構と、
前記駆動機構を制御する制御部と、
を含み、
前記制御部は、
前記第１領域が前記第２領域よりも重力の作用する方向に対して下方となる第１の配置で第１の時間停止させるように前記駆動機構を制御する処理と、
前記第２領域が前記第１領域よりも重力の作用する方向に対して下方となる第２の配置で第２の時間停止させるように前記駆動機構を制御する処理と、を行う、熱サイクル装置。
【請求項２】
請求項１に記載の熱サイクル装置において、
前記制御部は、
前記第１の配置から前記第２の配置へと切り換える場合と、前記第２の配置から前記第１の配置へと切り換える場合とで、逆方向に回転させるように前記駆動機構を制御する、熱サイクル装置。
【請求項３】
請求項１または２に記載の熱サイクル装置において、
前記制御部は、
前記第１の配置で前記第１の時間停止させるように前記駆動機構を制御する処理と、前記第１の配置から前記第２の配置へと切り換える処理と、前記第２の配置で前記第２の時間停止させるように前記駆動機構を制御する処理と、前記第２の配置から前記第１の配置へと切り換える処理と、を含むサイクルを行った回数を計測する処理と、
前記計測回数が所定回数に達したとき、停止する処理を行う、熱サイクル装置。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１７】
１．実施形態
１−１．実施形態における熱サイクル装置の構成
図１は、実施形態に係る熱サイクル装置１の斜視図である。（Ａ）は熱サイクル装置１の蓋５０を閉じた状態、（Ｂ）は熱サイクル装置１の蓋５０を開けた状態であり、装着部１１にバイオチップ１００が装着された状態を表す。図２は、実施形態に係る熱サイクル装置１における本体１０の分解斜視図である。図４（Ａ）および図４（Ｂ）は、実施形態に係る熱サイクル装置１における本体１０の、図１（Ａ）のＡ−Ａ線における断面を模式的に示す断面図である。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７２】
（変形例４）
実施形態においては、バイオチップ１００の位置を定める構造は底板１７であったが、位置を定める構造は所望の位置にバイオチップ１００を保持できるものであればよい。位置を定める構造は、熱サイクル装置２に設けられた構造であっても、バイオチップ１００に設けられた構造であっても、両方の組み合わせであってもよい。例えば、螺子、差込式の棒、バイオチップ１００に突出部を設けた構造、装着部１１とバイオチップ１００とが勘合する構造を採用できる。螺子や棒を用いる場合には、螺子の長さやねじ込む長さ、棒を差込む位置を変更することで、熱サイクルの反応条件やバイオチップ１００の大きさ等に合わせて保持する位置を調節できるようにしてもよい。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７７】
（変形例８）
実施形態に例示したように、装着部１１が第１加熱部１２の一部として形成されている場合には、バイオチップ１００を装着部１１に密着させる機構を設けてもよい。密着させる機構は、バイオチップ１００の少なくとも一部を装着部１１に密着させることができればよい。例えば、本体１０や蓋５０に設けたバネによってバイオチップ１００を装着部１１の一方の壁面に押し付けてもよい。これにより、第１加熱部１２の熱をバイオチップ１００にさらに安定して伝えることができるので、バイオチップ１００の温度をさらに安定させることができる。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１００
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１００】
（変形例２７）
スペーサー１４及び固定板１９は、透明であってもよい。これにより、透明なバイオチップ１００を熱サイクル処理に使用した場合に、装置の外部から反応液１４０が移動する様子を観察できる。したがって、熱サイクル処理が適切に行われているか否かを、目視により確認できる。したがって、ここでの「透明」の程度は、これらの部材を熱サイクル装置２に採用して熱サイクル処理を行った場合に、反応液１４０の移動が視認できる程度であればよい。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１０１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１０１】
（変形例２８）
熱サイクル装置２の内部を観察するためには、スペーサー１４を透明にして固定板１９を無くしても、固定板１９を透明にしてスペーサー１４を無くしても、スペーサー１４と固定板１９の両方を無くしてもよい。観察者と観察対象のバイオチップ１００の間に存在する部材が少ないほど、物体による光の屈折の影響が少なくなるので、内部の観察が容易になる。また、部材が少なければ、製造コストを削減できる。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１０２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１０２】
（変形例２９）
熱サイクル装置２の内部を観察するためには、図６及び図８に例示するように、本体１０ａに観察窓２３を設けてもよい。観察窓２３は、例えば、スペーサー１４又は固定板１９に形成された穴やスリットであってもよい。図８の例では、観察窓２３は固定板１９と一体に形成された透明なスペーサー１４に設けられた凹部である。観察窓２３を設けることで、観察者と観察対象のバイオチップ１００の間に存在する部材の厚みを少なくできるので、内部の観察が容易になる。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１０５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１０５】
（変形例３２）
実施形態においては、第１の温度、第２の温度、第１の時間、第２の時間、及び熱サイクルのサイクル数、駆動機構２０の動作を制御部３０によって制御する例を示したが、これらの項目のうち少なくとも１つを使用者が制御することも可能である。使用者が第１の温度又は第２の温度を制御する場合は、例えば温度センサーによって測定された温度を表示部２４で表示し、使用者が設定部２５を操作して温度を調節してもよい。使用者が熱サイクルのサイクル数を制御する場合、所定回数に達した場合に使用者が熱サイクル装置２
を停止させる。サイクル数の計数は、使用者が行っても、熱サイクル装置２が計数を行ってサイクル数を表示部２４に表示してもよい。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１２２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１２２】
本実施例で使用したプローブはTaqManプローブである。このプローブは核酸が増幅されると検出される蛍光輝度が増加する性質を有する。図１２（Ａ）に示す通り、熱サイクル処理を行う前と比較して、熱サイクル処理を行った後では反応液１４０ａの蛍光輝度は増加した。算出された輝度変化率は核酸が十分に増幅されたことを示す値であり、本実施例の熱サイクル装置２によって核酸が増幅されたことが確認できた。
【手続補正１０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１３６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１３６】
２回の蛍光測定（ステップＳ２０１及びステップＳ２０６）の結果を、図１２（Ｂ）に示した。実施例１と同様にして輝度変化率を算出した。本実施例で使用したプローブはSYBR Green Iである。このプローブも、核酸増幅に伴い検出される蛍光輝度が増加する。図１２（Ｂ）に示す通り、熱サイクル処理を行う前と比較して、熱サイクル処理を行った後では反応液１４０ａの蛍光輝度は増加した。算出された輝度変化率は核酸が十分に増幅されたことを示す値であり、本実施例の熱サイクル装置２によって核酸が増幅されたことが確認できた。