(57)【要約】  煩雑な分離工程を要さずβ−グルコシダーゼを生産・回収できるＳ．ポンベ変異体の形質転換体、およびシゾサッカロミセス属酵母の形質転換に有用なベクターの提供。  本発明のＳ．ポンベ変異体の形質転換体は、Ｇｓｆ活性が増大しており、かつピルビン酸転移酵素Ｐｖｇ１の酵素活性が低下または失活しているシゾサッカロミセス・ポンベ（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｐｏｍｂｅ）変異体の形質転換体であって、糸状菌由来のβ−グルコシダーゼをコードする構造遺伝子配列並びに該構造遺伝子を発現させるためのプロモーター配列およびターミネーター配列を、染色体中に有するか、または、染色体外遺伝子として有することを特徴とする。さらに、本発明は、ｈｓｐ９遺伝子が有するプロモーターまたはｉｈｃ１遺伝子が有するプロモーターを有することを特徴とする、シゾサッカロミセス属酵母の形質転換に有用なクローニングベクター、発現ベクター、形質転換体等に関する。
2014030644.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｇｓｆ活性が増大しており、かつピルビン酸転移酵素Ｐｖｇ１の酵素活性が低下または失活しているシゾサッカロミセス・ポンベ（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｐｏｍｂｅ）変異体の形質転換体であって、糸状菌由来のβ−グルコシダーゼをコードする構造遺伝子配列並びに該構造遺伝子を発現させるためのプロモーター配列およびターミネーター配列を、染色体中に有するか、または、染色体外遺伝子として有することを特徴とするシゾサッカロミセス・ポンベ変異体の形質転換体。
【請求項２】
前記β−グルコシダーゼがＢＧＬ１である請求項１に記載のシゾサッカロミセス・ポンベ変異体の形質転換体。
【請求項３】
前記糸状菌が、アスペルギルス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）属の微生物である請求項１または２に記載のシゾサッカロミセス・ポンベ変異体の形質転換体。
【請求項４】
前記β−グルコシダーゼが、配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるか、または該アミノ酸配列において１個以上のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列からなり、β−Ｄ−グルコピラノシド結合の加水分解反応を触媒する活性を有するβ−グルコシダーゼである請求項１〜３のいずれか一項に記載のシゾサッカロミセス・ポンベ変異体の形質転換体。
【請求項５】
請求項１〜４のいずれか一項に記載の形質転換体を培養し、得られた菌体または培養液上清から、β−グルコシダーゼを取得することを特徴とするβ−グルコシダーゼの製造方法。
【請求項６】
シゾサッカロミセス（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）属酵母のｈｓｐ９遺伝子が有するプロモーターまたはｉｈｃ１遺伝子が有するプロモーター、該プロモーターの下流に位置しかつ該プロモーターによって支配される外来構造遺伝子を導入するためのクローニングサイト、および、シゾサッカロミセス属酵母内で機能し得るターミネーターを有することを特徴とするクローニングベクター。
【請求項７】
前記ｈｓｐ９遺伝子が有するプロモーターが、ｈｓｐ９遺伝子のＯＲＦ（オープンリーディングフレーム）の５’末端の上流１〜４００ｂｐを含む領域である請求項６に記載のクローニングベクター。
【請求項８】
前記プロモーターが、配列番号６で表される塩基配列、または該塩基配列中の１以上の塩基を置換、欠失、もしくは付加された塩基配列からなり、かつプロモーター活性を有する請求項７に記載のクローニングベクター。
【請求項９】
前記ｉｈｃ１遺伝子が有するプロモーターが、ｉｈｃ１遺伝子のＯＲＦ（オープンリーディングフレーム）の５’末端の上流１〜５０１ｂｐを含む領域である請求項６に記載のクローニングベクター。
【請求項１０】
前記プロモーターが、配列番号９で表される塩基配列、または該塩基配列中の１以上の塩基を置換、欠失、もしくは付加された塩基配列からなり、かつプロモーター活性を有する請求項９に記載のクローニングベクター。
【請求項１１】
請求項６〜１０のいずれか一項に記載のクローニングベクター中のクローニングサイトに、外来構造遺伝子を導入することを特徴とする発現ベクターの製造方法。
【請求項１２】
請求項６〜１０のいずれか一項に記載のクローニングベクター中のクローニングサイトに、外来構造遺伝子が導入されていることを特徴とする発現ベクター。
【請求項１３】
請求項１２に記載の発現ベクターを、シゾサッカロミセス属酵母に導入することを特徴とする、シゾサッカロミセス属酵母の形質転換体の製造方法。
【請求項１４】
請求項１２に記載の発現ベクターを含むことを特徴とする、シゾサッカロミセス属酵母の形質転換体。
【請求項１５】
請求項１４に記載の形質転換体を培養し、得られた菌体または培養液上清から、前記外来構造遺伝子がコードする蛋白質を取得することを特徴とする蛋白質の製造方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、非性的凝集性を有し、β−グルコシダーゼを生産できるシゾサッカロミセス・ポンベ（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｐｏｍｂｅ）変異体の形質転換体、およびシゾサッカロミセス属酵母の形質転換に有用なベクターに関する。
【背景技術】
【０００２】
木材、稲ワラ、もみ殻、雑草等のセルロース系バイオマスから、発酵原料としての糖、ひいてはバイオエタノールなどのバイオマス燃料を生産するためには、植物細胞壁の主要な構成成分であるセルロースを分解する必要がある。セルロースの分解には、濃硫酸糖化法、希硫酸糖化法等の酸糖化法、酵素を利用した酵素糖化法等の方法があり、近年のバイオテクノロジーの隆盛を背景に、酵素糖化法の研究開発が盛んに行われている。
セルロースの酵素糖化には、セルラーゼと総称される一群の酵素が利用される。まず、セルロース鎖をランダムに切断する活性を有するエンドグルカナーゼ（ＥＧ）が、セルロースの非結晶領域を分解し、グルコース末端を露出させる。露出したグルコース末端は、セロビオハイドラーゼ（ＣＢＨ）により分解され、セロビオースが遊離する。そして、遊離したセロビオースをβ−グルコシダーゼ（ＢＧＬ）が分解することで、グルコースが遊離する。【０００３】
結晶セルロースを分解して糖化するための種々のセルラーゼおよびヘミセルラーゼを生産できること、並びに、それらの酵素を細胞外に大量に分泌することができることから、セルロースの酵素糖化には、アスペルギルス属、トリコデルマ属等の糸状菌が広く利用されている。【０００４】
また、これら糸状菌のセルラーゼを異種株で発現させることも試みられており、非特許文献１には、糸状菌のひとつであるアスペルギルス・アクリータス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ａｃｕｌｅａｔｕｓ）のβ−グルコシダーゼＩ（ＢＧＬＩ）をコードする遺伝子によって出芽酵母サッカロミセス・セレビジエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）を形質転換し、得られた形質転換体にこれらの酵素を発現させたことが開示されている。【０００５】
しかし、酵素糖化法の場合、酵素によるセルロースの加水分解反応が進行し、グルコースが反応系内に蓄積すると、蓄積したグルコースがβ−グルコシダーゼを阻害し、セロビオースが蓄積し、さらに、蓄積したセロビオースがエンドグルカナーゼとセロビオハイドラーゼを阻害する結果、セルロースの完全分解が出来なくなるという問題がある。そのため、β−グルコシダーゼの高機能化が望まれていた。
一方、アスペルギルス属およびトリコデルマ属よりも、シゾサッカロミセス属酵母の方が、その遺伝子解析が進んでおり、種々の有用な変異体および遺伝子導入用ベクターが確立しており、蛋白質の工業的大量生産に適しているといった利点がある。しかし、シゾサッカロミセス属酵母は、固有のβ−グルコシダーゼ遺伝子を有しておらず、セロビオースを資化することができない。本発明者らは、β−グルコシダーゼをコードする遺伝子によってシゾサッカロミセス属酵母を形質転換し、得られた形質転換体にこれらの酵素を発現させた（特許文献１）。
なお、非特許文献１には、出芽酵母に生産させたβ−グルコシダーゼのグルコース阻害については全く触れられていない。【０００６】
一方、該形質転換体によって分泌されたβ−グルコシダーゼを回収するためには、培地上清と菌体とを分離する工程を要する。分離工程としては、遠心分離、連続遠心分離、膜分離等の工程が挙げられるが、いずれも煩雑な工程であり、多大な労力と時間を要する。
さらに、β−グルコシダーゼの生産規模の拡大に従い、該分離工程の煩雑性の増大が容易に予想される。【０００７】
これに対して、非性的凝集性（非性的に凝集する性質）を有する酵母は、培養終了後の培養液から凝集した酵母菌体と培養液とを容易に分離できるため、β−グルコシダーゼの生産においては、非性的凝集性を有する酵母を宿主とすることが好ましい。【０００８】
非性的凝集性を有する酵母としては、出芽酵母サッカロミセス・セレビシエにおいてＦＬＯ変異体が知られている。また、分裂酵母シゾサッカロミセス・ポンベ（以下、Ｓ．ポンベともいう）でも、非性的凝集性を有する変異体も報告されている（たとえば、特許文献２参照）。【０００９】
さらに一方で、Ｓ．ポンベをはじめとするシゾサッカロミセス属酵母は、出芽酵母サッカロミセス・セレビシエとは進化系統的に全く異なる酵母である。すでに、染色体構造、ゲノム複製機構、ＲＮＡスプライシング機構、転写機構、翻訳後修飾等の諸機構が他の酵母と大きく異なり、その一部は動物細胞と類似していることが知られている。このため真核生物のモデルとして広く用いられている（非特許文献２参照）。
Ｓ．ポンベはその様々な特徴から、より高等動物細胞に近い単細胞真核生物であると位置づけられ、外来遺伝子、特に高等動物由来遺伝子の発現用宿主として非常に有用な酵母であると考えられる。特にヒトを含む動物細胞由来の遺伝子の発現に適していることが知られている（特許文献３〜９参照）。【００１０】
Ｓ．ポンベを宿主として外来構造遺伝子由来の蛋白質を発現させるためには、通常、その蛋白質をコードする外来構造遺伝子の転写を促進するプロモーターが必要である。該プロモーターとしては、Ｓ．ポンベが本来有している遺伝子中のプロモーターや、他の生物やウィルスが有するプロモーターがある。
Ｓ．ポンベを宿主とした蛋白質発現において利用されているプロモーターとしては、Ｓ．ポンベが本来有している遺伝子中のプロモーターとして、アルコールデヒドロゲナーゼ（ａｄｈ１）遺伝子プロモーター、チアミンの代謝に関与するｎｍｔ１遺伝子プロモーター、グルコースの代謝に関与するフルクトース−１、６−ビスホスファターゼ（ｆｂｐ１）遺伝子プロモーター、カタボライト抑制に関与するインベルターゼ（ｉｎｖ１）遺伝子のプロモーター（特許文献７または１０参照）、熱ショック蛋白質遺伝子プロモーター（特許文献１１参照）などが挙げられる。またｈＣＭＶ、ＳＶ４０、ＣａＭＶ（構成的発現）などのウィルスのプロモーターも知られている（特許文献４、６、または１２参照）。
【先行技術文献】
【特許文献】
【００１１】
【特許文献１】国際公開第２０１２／０６０３８９号
【特許文献２】特開２０００−１０６８６７号公報
【特許文献３】特許第２７７６０８５号公報
【特許文献４】特開平０７−１６３３７３号公報
【特許文献５】国際公開第９６／２３８９０号
【特許文献６】特開平１０−２３４３７５号公報
【特許文献７】特開平１１−１９２０９４号公報
【特許文献８】特開２０００−１３６１９９号公報
【特許文献９】特開２０００−２６２２８４号公報
【特許文献１０】国際公開第９９／２３２２３号
【特許文献１１】国際公開第２００７／２６６１７号
【特許文献１２】特開平５−１５３８０号公報
【非特許文献】
【００１２】
【非特許文献１】Ｇ．Ｔａｎａｋａ，ｅｔ  ａｌ．  Ｂｉｏｓｃｉ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，６２（８），１６１５−１６１８，１９９８．
【非特許文献２】Ｇｉｇａ−Ｈａｍａ  ａｎｄ  Ｋｕｍａｇａｉ，  ｅｄｓ．，  Ｆｏｒｅｉｇｎ  ｇｅｎｅ  ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  ｉｎ  ｆｉｓｓｉｏｎ  ｙｅａｓｔ  Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｐｏｍｂｅ，  Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ，  （１９９７）．
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１３】
酵母の培養中に、培養液のｐＨが酸性にシフトしてしまうことがある。特に、分泌性の酸性蛋白質を大量に合成させた場合には、培養終了時の培養液のｐＨが２〜５の酸性となる場合が多い。また、酵母の培養では、目的蛋白質の生産性を考慮した場合、培養時の最適なｐＨは５より低くなることがある。
このため、たとえばｐＨ５より上の比較的ｐＨの高い培養液中では凝集性を有するが、ｐＨ２〜５の酸性条件下では凝集しない場合には、酵母を凝集させるために、培養終了後にｐＨを中性付近に調整する中和処理を行わなくてはならない。【００１４】
特許文献１に記載の酵母は、非性的凝集性を有するＳ．ポンベ変異体であり、前記発現系の宿主として好適と考えられる。しかし、該Ｓ．ポンベ変異体は、ＹＰＤ培地（通常、ｐＨ５．６〜６．０）中で非性的に凝集することが確認されているものの、酸性条件下でも充分な凝集性を有しているか否か、不明である。【００１５】
そこで本発明では、煩雑な分離工程を要さずβ−グルコシダーゼを生産・回収できるＳ．ポンベ変異体の形質転換体、および該形質転換体を用いたβ−グルコシダーゼの製造方法を提供する。【００１６】
また、本発明は、新規なプロモーターにかかわる、シゾサッカロミセス属酵母を宿主として遺伝子工学的に外来遺伝子由来の蛋白質を効率よく発現させられる発現ベクター、該発現ベクターを作製するためのクローニングベクター、該発現ベクターの製造方法、該発現ベクターを含む形質転換体、該形質転換体の製造方法、および該形質転換体を用いた蛋白質の製造方法をも提供する。
【課題を解決するための手段】
【００１７】
本発明のＳ．ポンベ変異体の形質転換体は、Ｇｓｆ活性が増大しており、かつピルビン酸転移酵素Ｐｖｇ１の酵素活性が低下または失活しているシゾサッカロミセス・ポンベ（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｐｏｍｂｅ）変異体の形質転換体であって、糸状菌由来のβ−グルコシダーゼをコードする構造遺伝子配列並びに該構造遺伝子を発現させるためのプロモーター配列およびターミネーター配列を、染色体中に有するか、または、染色体外遺伝子として有することを特徴とする。
また、本発明のＳ．ポンベ変異体の形質転換体において、前記β−グルコシダーゼがＢＧＬ１であることが好ましい。
また、本発明のＳ．ポンベ変異体の形質転換体において、前記糸状菌が、アスペルギルス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）属の微生物であることが好ましい。
また、本発明のＳ．ポンベ変異体の形質転換体において、前記β−グルコシダーゼが、配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるか、または該アミノ酸配列に１個以上のアミノ酸の欠失、置換もしくは付加が入ったアミノ酸配列からなり、β−Ｄ−グルコピラノシド結合の加水分解反応を触媒する活性を有するβ−グルコシダーゼであることが好ましい。
さらに、本発明β−グルコシダーゼの製造方法は、上記形質転換体を培養し、得られた菌体または培養液上清から、β−グルコシダーゼを取得することを特徴とする。
以下、上記β−グルコシダーゼをコードする構造遺伝子配列を有する形質転換体に係る本発明を、第一の態様に係る本発明という。【００１８】
本発明のクローニングベクターは、シゾサッカロミセス属酵母のｈｓｐ９遺伝子が有するプロモーターまたはｉｈｃ１遺伝子が有するプロモーター、該プロモーターの下流に位置しかつ該プロモーターによって支配される外来構造遺伝子を導入するためのクローニングサイト、および、シゾサッカロミセス属酵母内で機能し得るターミネーターを有することを特徴とする。
ｈｓｐ９遺伝子が有するプロモーター（以下、ｈｓｐ９プロモーターともいう）は、ｈｓｐ９遺伝子のＯＲＦの５’末端の上流１〜４００ｂｐを含む領域であることが好ましく、配列番号６で表される塩基配列、または該塩基配列中の１以上の塩基を置換、欠失、もしくは付加された塩基配列からなり、かつプロモーター活性を有するものであることがより好ましい。
ｉｈｃ１遺伝子が有するプロモーター（以下、ｉｈｃ１プロモーターともいう）は、ｉｈｃ１遺伝子のＯＲＦ（オープンリーディングフレーム）の５’末端の上流１〜５０１ｂｐを含む領域であることが好ましく、配列番号９で表される塩基配列、または該塩基配列中の１以上の塩基を置換、欠失、もしくは付加された塩基配列からなり、かつプロモーター活性を有するものであることがより好ましい。【００１９】
本発明の発現ベクターの製造方法は前記クローニングベクター中のクローニングサイトに外来構造遺伝子を導入することを特徴とし、本発明の発現ベクターは前記クローニングベクター中のクローニングサイトに外来構造遺伝子が導入されている発現ベクターである。
本発明の形質転換体の製造方法は上記発現ベクターをシゾサッカロミセス属酵母に導入することを特徴とし、本発明の形質転換体は上記発現ベクターを含む形質転換体である。
本発明の蛋白質の製造方法は、上記形質転換体を培養し、得られた菌体または培養液上清から、前記外来構造遺伝子がコードする蛋白質を取得することを特徴とする。
以下、上記ｈｓｐ９プロモーターまたはｉｈｃ１プロモーターを有する、クローニングベクター、発現ベクターおよび形質転換体に係る本発明、ならびに、上記発現ベクターの製造方法、形質転換体の製造方法および蛋白質の製造方法に係る本発明を、第二の態様に係る本発明という。
【発明の効果】
【００２０】
本発明のＳ．ポンベ変異体の形質転換体によれば、煩雑な分離工程を要さずβ−グルコシダーゼを生産・回収できる。
【図面の簡単な説明】
【００２１】
【図１】図１は、発現ベクターｐＳＬ６ＡａＢＧＬ１の構成図である。
【図２】図２は、発現ベクターｐＳＬ６Ｐ３ＡａＢＧＬ１の構成図である。
【図３】図３は、発現ベクターｐＳＬ１４Ｐ３ＡａＢＧＬ１の構成図である。
【図４】図４は、発現ベクターｐＵＣ１９−ｕｒａ４の構成図である。
【図５】図５は、試験例８における通常株および凝集株の菌体増殖を表すグラフである。
【図６】図６（ａ）は、試験例８における通常株および凝集株の培養液中のグルコース濃度を表すグラフである。図６（ｂ）は、試験例８における通常株および凝集株の培養液中のエタノール濃度を表すグラフである。
【図７】図７は、試験例９における通常株および凝集株のＡａＢＧＬ１のｐＮＰＧ分解活性を表すグラフである。
【図８】図８は、試験例１０における通常株および凝集株の菌体増殖を表すグラフである。
【図９】図９（ａ）は、試験例１０における通常株および凝集株の培養液中のグルコース濃度を表すグラフである。図９（ｂ）は、試験例１０における通常株および凝集株の培養液中のエタノール濃度を表すグラフである。
【図１０】図１０は、試験例１１における通常株および凝集株の沈降状態を表す写真である。
【図１１】図１１は、試験例１１における通常株および凝集株の検鏡観察結果を表す写真である。
【図１２】図１２は、試験例１２における３０℃および３４℃での菌体増殖を表すグラフである。
【図１３Ａ】図１３Ａは、試験例１２における３０℃および３４℃での培養液中のグルコース濃度を表すグラフである。
【図１３Ｂ】図１３Ｂは、試験例１２における３０℃および３４℃での培養液中のエタノール濃度を表すグラフである。
【図１４】図１４は、試験例１２における３０℃および３４℃でのＡａＢＧＬ１のｐＮＰＧ分解活性を表すグラフである。
【図１５】図１５は、試験例１３におけるＳＤＳ−ＰＡＧＥの結果を表す写真である。
【図１６】図１６は、発現ベクターｐＳＬ１４−ＥＧＦＰの構成図である。
【図１７】図１７は、発現ベクターｐＳＬ６−ＥＧＦＰの構成図である。
【図１８】図１８は、試験例１４における、各培養液の蛍光強度（ＳＬ６Ｅ株の培養液の蛍光強度を１とした場合の相対値）の測定結果を示した図である。
【図１９】図１９は、マルチクローニングベクターｐＳＬ６の構成図である。
【図２０】図２０は、マルチクローニングベクターｐＳＬ１２の構成図である。
【図２１】図２１は、マルチクローニングベクターｐＳＬ１７の構成図である。
【図２２】図２２は、発現ベクターｐＳＬ１２−ＥＧＦＰの構成図である。
【図２３】図２３は、試験例１５における、各培養液の［蛍光強度／ＯＤ６００］の経時的変化の測定結果を示した図である。
【図２４】図２４は、マルチクローニングベクターｐＳＬ９の構成図である。
【図２５】図２５は、マルチクローニングベクターｐＳＬ１４の構成図である。
【図２６】図２６は、マルチクローニングベクターｐＳＬ１４ｌａｃＺの構成図である。
【発明を実施するための形態】
【００２２】
本明細書において「外来構造遺伝子」とは、発現ベクターが有する、蛋白質をコードする遺伝子であり、発現ベクターを導入する宿主が本来有する構造遺伝子であってもよく、宿主とは異種の生物の構造遺伝子であってもよい。
本明細書において「外来構造遺伝子由来の蛋白質」とは形質転換体が産生する外来構造遺伝子由来の蛋白質であり、以下、「外来蛋白質」ともいう。なお、外来構造遺伝子が宿主とは異種の生物の構造遺伝子の場合には異種蛋白質ともいう。
【００２３】
まず、第一の態様に係る本発明を説明する。
［Ｓ．ポンベ変異体］
本発明において、Ｓ．ポンベ変異体の形質転換体の宿主となるＳ．ポンベ変異体は、Ｓ．ポンベの遺伝子の少なくとも一部が改変された結果、Ｇｓｆ活性が増大しており、かつピルビン酸転移酵素Ｐｖｇ１の酵素活性が低下または失活している変異体である。Ｓ．ポンベにおいて、Ｇｓｆ活性が増大し、かつＰｖｇ１の酵素活性が低下または失活すると、酸性条件下においても非性的に凝集する形質が獲得される。以下、酸性条件下において非性的に凝集する性質を、耐酸性非性的凝集性ともいう。
すなわち、本発明におけるＳ．ポンベ変異体は、耐酸性非性的凝集性を獲得した変異体である。
【００２４】
本発明において、「非性的凝集性」とは、Ｓ．ポンベが本来有する性的に凝集する性質（性的凝集性）とは異なる凝集性を有する性質をいう。しかし、本来有する性的凝集性が失われていることを意味するものではない。また、「構成的凝集性」とは非性的凝集性と同一の性質をいうが、特に増殖過程において増殖と同時に（非性的に）凝集する性質を指していう。
【００２５】
本発明において、「Ｇｓｆ活性」とは、Ｓ．ポンベが通常培養されるｐＨ（たとえば、ｐＨ５〜６）において示される非性的凝集性を意味する。また、Ｇｓｆ活性に関連する遺伝子を凝集素遺伝子という。
ｇｓｆ２遺伝子は、Ｓ．ポンベにおいては凝集素遺伝子である。Ｓ．ポンベのｇｓｆ２遺伝子の系統名はＳＰＣＣ１７４２．０１である。
Ｐｖｇ１は、ピルビン酸転移酵素である。Ｓ．ポンベのＰｖｇ１をコードするｐｖｇ１遺伝子の系統名はＳＰＡＣ８Ｆ１１．１０ｃである。
【００２６】
なお、Ｓ．ポンベの染色体の全塩基配列は、サンガー研究所のデータベース「ＧｅｎｅＤＢ」に「Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｐｏｍｂｅ Ｇｅｎｅ ＤＢ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｅｎｅｄｂ．ｏｒｇ／ｇｅｎｅｄｂ／ｐｏｍｂｅ／）」として、収録され、公開されている。本明細書記載のＳ．ポンベの遺伝子の配列データは上記データベースから遺伝子名または系統名で検索して、入手できる。
【００２７】
Ｓ．ポンベは本来フェロモンで誘導される性的凝集性を有する。たとえば、増殖過程において栄養不足をきたすと性的凝集を生じやすい。しかし、タンク培養等による人工的大量培養においては通常充分な量の栄養を有する培養液中で培養が行われることより性的凝集を起こすことは少ない。一方、本発明におけるＳ．ポンベ変異体は非性的凝集性を有すため、充分な量の栄養を有する培養液中で培養が行われても、増殖とともに凝集（構成的凝集）を起こす。
【００２８】
Ｓ．ポンベ変異体のＧｓｆ活性は、たとえば、ｇｓｆ２遺伝子の発現量を増大させることにより、増大させられる。また、Ｓ．ポンベのＰｖｇ１の酵素活性は、Ｐｖｇ１をコードするｐｖｇ１遺伝子を欠失する、または該遺伝子にＰｖｇ１の酵素活性が低下もしくは失活する変異を導入することにより、低下または失活させられる。
このため、本発明におけるＳ．ポンベ変異体は、遺伝子工学的方法により、野生株等の耐酸性非性的凝集性を有さないＳ．ポンベを宿主とし、遺伝子工学的方法により、外来のｇｓｆ２遺伝子を組み込み、かつＰｖｇ１をコードする遺伝子を欠失する、または該遺伝子にＰｖｇ１の酵素活性が低下もしくは失活する変異を導入することで製造できる。
【００２９】
ｇｓｆ２遺伝子の発現量は、遺伝子工学的方法で外来のｇｓｆ２遺伝子を組み込むことにより、増大させられる。宿主にｇｓｆ２遺伝子を新たに導入することが重要であり、導入されるｇｓｆ２遺伝子は、宿主の内在性のｇｓｆ２遺伝子と同種であってもよく、異種生物由来のｇｓｆ２遺伝子であってもよい。
【００３０】
遺伝子工学的方法で宿主にｇｓｆ２遺伝子を導入する方法としては公知の方法を使用できる。Ｓ．ポンベを宿主としてこれに外来の構造遺伝子を導入する方法としては、たとえば、特開平５−１５３８０号公報、国際公開第９５／０９９１４号パンフレット、特開平１０−２３４３７５号公報、特開２０００−２６２２８４号公報、特開２００５−１９８６１２号公報、国際公開第２０１０／０８７３４４号公報等に記載の方法を使用できる。
【００３１】
ｇｓｆ２遺伝子は、Ｓ．ポンベの染色体に導入されることが好ましい。染色体にｇｓｆ２遺伝子を導入することにより、継代の維持安定性に優れた形質転換体が得られる。また、ｇｓｆ２遺伝子を染色体に複数導入することもできる。ｇｓｆ２遺伝子を複数導入することにより、ｇｓｆ２遺伝子の発現効率を高めることができる。Ｓ．ポンベ変異体において、染色体に組み込まれたｇｓｆ２遺伝子の数は１〜２０が好ましく、１〜８がより好ましい。
【００３２】
染色体にｇｓｆ２遺伝子を導入する方法としては公知の方法を使用できる。たとえば、前記特開２０００−２６２２８４号公報に記載の方法で染色体にｇｓｆ２遺伝子を複数導入できる。また、この方法で染色体にｇｓｆ２遺伝子を１個導入することもできる。また、後述のように、染色体の複数の箇所に１個または複数のｇｓｆ２遺伝子を導入することもできる。
ｇｓｆ２遺伝子をＳ．ポンベの染色体に導入する方法としては、ｇｓｆ２遺伝子を有する発現カセットと組換え部位とを有するベクター（以下、ｇｓｆ２ベクターという）を用い、相同組換え法により導入する方法が好ましい。
【００３３】
ｇｓｆ２ベクターは、ｇｓｆ２遺伝子を有する発現カセットと組換え部位を有する。
発現カセットとは、Ｇｓｆ２を発現するために必要なＤＮＡの組み合わせであり、ｇｓｆ２遺伝子とＳ．ポンベ内で機能するプロモーターとＳ．ポンベ内で機能するターミネーターを含む。さらに、５’−非翻訳領域、３’−非翻訳領域のいずれか１つ以上が含まれていてもよい。さらに、栄養要求性相補マーカーが含まれていてもよい。好ましい発現カセットは、ｇｓｆ２遺伝子、プロモーター、ターミネーター、５’−非翻訳領域、３’−非翻訳領域、栄養要求性相補マーカーを含む発現カセットである。発現カセットには複数のｇｓｆ２遺伝子が存在していてもよい。発現カセット中のｇｓｆ２遺伝子の数は１〜８が好ましく、１〜５がより好ましい。
【００３４】
Ｓ．ポンベ内で機能するプロモーターとターミネーターは、酸性条件下においても形質転換により得られる変異体内で機能してＧｓｆ２の発現を維持できるものであればよい。Ｓ．ポンベ内で機能するプロモーターとしては、Ｓ．ポンベが本来有するプロモーター（転写開始活性が高いものが好ましい）またはＳ．ポンベが本来有しないプロモーター（ウイルス由来のプロモーター等）を使用できる。プロモーターはベクター内に２種以上存在していてもよい。
Ｓ．ポンベが本来有するプロモーターとしては、たとえば、アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子プロモーター、チアミンの代謝に関与するｎｍｔ１遺伝子プロモーター、グルコースの代謝に関与するフルクトース−１、６−ビスホスファターゼ遺伝子プロモーター、カタボライト抑制に関与するインベルターゼ遺伝子のプロモーター（国際公開第９９／２３２２３号パンフレット参照）、熱ショック蛋白質遺伝子プロモーター（国際公開第２００７／２６６１７号パンフレット参照）等が挙げられる。Ｓ．ポンベが本来有しないプロモーターとしては、たとえば、特開平５−１５３８０号公報、特開平７−１６３３７３号公報、特開平１０−２３４３７５号公報に記載されている動物細胞ウイルス由来のプロモーター等が挙げられる。該プロモーターのうち、発現効率が良好なｎｍｔ１遺伝子プロモーターおよびその改変プロモーター（たとえば、ｎｍｔ１＋、ｎｍｔ４１）、ｈＣＭＶプロモーター、ＳＶ４０プロモーターが好ましい。
なお、後述の第二の態様に係る本発明におけるｈｓｐ９プロモーターまたはｉｈｃ１プロモーターを使用することも好ましい。
【００３５】
Ｓ．ポンベ内で機能するターミネーターとしては、Ｓ．ポンベが本来有するターミネーターまたはＳ．ポンベが本来有しないターミネーターを使用できる。ターミネーターはベクター内に２種以上存在していてもよい。
ターミネーターとしては、たとえば、特開平５−１５３８０号公報、特開平７−１６３３７３号公報、特開平１０−２３４３７５号公報に記載されているヒト由来のターミネーターが挙げられ、ヒトリポコルチンＩのターミネーターが好ましい。
【００３６】
ベクターの組換え部位は、Ｓ．ポンベの染色体における相同組換えの標的部位に対して相同組換えを行わせることのできる塩基配列を有する部位である。また、標的部位は、Ｓ．ポンベの染色体内で発現カセットを組み込む標的となる部位である。標的部位は、ベクターの組換え部位を該標的部位に対して相同組換えを行わせる塩基配列とすることにより自由に設定できる。
前記組換え部位の塩基配列と標的部位の塩基配列との相同性は７０％以上とすることが必要である。また、組換え部位の塩基配列と標的部位の塩基配列との相同性は、相同組換えが起きやすくなる点から、９０％以上とすることが好ましく、９５％以上であることがより好ましい。このような組換え部位を有するベクターを用いることにより、発現カセットが相同組換えにより標的部位に組み込まれる。
組換え部位の長さ（塩基数）は、２０〜２０００ｂｐであることが好ましい。組換え部位の長さが２０ｂｐ以上であれば、相同組換えが起きやすくなる。また、組換え部位の長さが２０００ｂｐ以下であれば、ベクターが長くなりすぎて相同組換えが起き難くなることを防ぎやすい。組換え部位の長さは１００ｂｐ以上であることがより好ましく、２００ｂｐ以上であることがさらに好ましい。また、組換え部位の長さは８００ｂｐ以下であることがより好ましく、４００ｂｐ以下であることがさらに好ましい。
【００３７】
ベクターは、前記発現カセットと組換え部位以外に他のＤＮＡ領域を有していてもよい。たとえば、大腸菌内での複製のために必要な「ｏｒｉ」と呼ばれる複製開始領域、抗生物質耐性遺伝子（ネオマイシン耐性遺伝子等）等が挙げられる。これらは大腸菌を使用してベクターを構築する場合に通常必要とされる遺伝子である。ただし、上記複製開始領域は後述のようにベクターを宿主の染色体に組み込む際には除去されることが好ましい。
ベクターは、環状ＤＮＡ構造または線状ＤＮＡ構造を有するベクターであり、Ｓ．ポンベの細胞に導入する際には線状ＤＮＡ構造で導入することが好ましい。すなわち、通常用いられるプラスミドＤＮＡ等の環状ＤＮＡ構造を有するベクターである場合には、制限酵素でベクターを線状に切り開いた後にＳ．ポンベの細胞に導入することが好ましい。
この場合、環状ＤＮＡ構造を有するベクターを切り開く位置は、組換え部位内とする。これにより、切り開かれたベクターの両端にそれぞれ組換え部位が部分的に存在することとなり、相同組換えによりベクター全体が染色体の標的部位に組み込まれる。
ベクターは、両端それぞれに組換え部位の一部が存在するような線状ＤＮＡ構造とすることができれば、環状ＤＮＡ構造を有するベクターを切り開く方法以外の方法で構築してもよい。
【００３８】
ベクターとしては、たとえば、ｐＢＲ３２２、ｐＢＲ３２５、ｐＵＣ１１８、ｐＵＣ１１９、ｐＵＣ１８、ｐＵＣ１９等の大腸菌由来のプラスミドを好適に用いることができる。
この場合、相同組換えに用いる際のプラスミドベクターは、大腸菌内での複製のために必要な「ｏｒｉ」と呼ばれる複製開始領域が除去されていることが好ましい。これにより、上述したベクターを染色体に組み込む際に、その組み込み効率を向上させることができる。
複製開始領域が除去されたベクターの構築方法は特に限定されないが、特開２０００−２６２２８４号公報に記載されている方法を用いることが好ましい。すなわち、組換え部位内の切断箇所に複製開始領域が挿入された前駆体ベクターを構築しておき、前述のように線状ＤＮＡ構造とすると同時に複製開始領域が切り出されるようにする方法が好ましい。これにより、簡便に複製開始領域が除去されたベクターを得ることができる。
また、特開平５−１５３８０号公報、特開平７−１６３３７３号公報、国際公開第９６／２３８９０号パンフレット、特開平１０−２３４３７５号公報等に記載された発現ベクターおよびその構築方法を適用して、発現カセットおよび組換え部位を有する前駆体ベクターを構築し、さらに通常の遺伝子工学的手法で該前駆体ベクターから複製開始領域を除去して相同組換えに用いるベクターを得る方法であってもよい。
【００３９】
ベクターを組み込む標的部位は、Ｓ．ポンベの染色体中の１箇所のみに存在していてもよく、２箇所以上に存在していてもよい。標的部位が２箇所以上存在している場合、Ｓ．ポンベの染色体に組み込まれるベクターを２箇所以上にできる。また、発現カセット中のｇｓｆ２遺伝子を複数とした場合には、標的部位の１箇所に複数のｇｓｆ２遺伝子を組み込むことができる。さらに、２種以上の標的部位に、それぞれの標的部位に対応する組換え部位を有する２種以上のベクターを用いて、発現カセットを組み込むこともできる。
【００４０】
１箇所の標的部位に発現カセットを組み込む場合、たとえば特開２０００−２６２２８４号公報に記載の標的部位を使用できる。異なる組込み部位を有する２種以上のベクターを用いて、異なる標的部位にそれぞれベクターを組み込むことができる。しかし、染色体の２箇所以上にベクターを組み込む場合、この方法は煩雑である。
【００４１】
染色体中に複数箇所存在する互いに実質的に同一の塩基配列部分を標的部位として、この複数箇所の標的部位にそれぞれベクターを組み込むことができれば、１種類のベクターを使用して染色体の２箇所以上にベクターを組み込むことができる。互いに実質的に同一の塩基配列とは、塩基配列の相同性が９０％以上であることを意味する。標的部位同士の相同性は９５％以上であることが好ましい。また、互いに実質的に同一である塩基配列の長さは、前記ベクターの組換え部位を包含する長さであり、１０００ｂｐ以上であることが好ましい。１箇所の標的部位に複数のｇｓｆ２遺伝子が組み込まれている場合に比較して、ｇｓｆ２遺伝子の組み込み数が同一であっても、複数存在する標的部位にｇｓｆ２遺伝子が分散して組み込まれている場合には、形質転換体が増殖する際にｇｓｆ２遺伝子が染色体から１度に脱落することが少なくなり、形質転換体の継代における維持安定性が向上する。
【００４２】
染色体中に複数箇所存在する標的部位としては、トランスポゾン遺伝子Ｔｆ２が好ましい。Ｔｆ２は、Ｓ．ポンベの３本（一倍体）の染色体それぞれに合計１３箇所存在するトランスポゾン遺伝子であり、長さ（塩基数）は約４９００ｂｐであり、それらの遺伝子間における塩基配列相同性は９９．７％であることが知られている（下記文献参照）。
Ｎａｔｈａｎ  Ｊ． Ｂｏｗｅｎ  ｅｔ  ａｌ, “Ｒｅｔｒｏｔｒａｎｓｐｏｓｏｎｓ  ａｎｄ  Ｔｈｅｉｒ  Ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ  ｏｆ  ｐｏｌ  ＩＩ  Ｐｒｏｍｏｔｅｒｓ：  Ａ  Ｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅ  Ｓｕｒｖｅｙ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｔｒａｎｓｐｏｓａｂｌｅ  Ｅｌｅｍｅｎｔｓ  Ｆｒｏｍ  ｔｈｅ Ｃｏｍｐｌｅｔｅ  Ｇｅｎｏｍｅ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ｏｆ  Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｐｏｍｂｅ”,Ｇｅｎｏｍｅ  Ｒｅｓ．  ２００３  １３：  １９８４−１９９７
染色体に１３箇所存在するＴｆ２の１箇所のみにベクターを組み込むことができる。この場合、２個以上のｇｓｆ２遺伝子を有するベクターを組み込むことにより、２個以上のｇｓｆ２遺伝子を有する形質転換体を得ることができる。また、Ｔｆ２の２箇所以上にベクターを組み込むことにより、２個以上のｇｓｆ２遺伝子を有する形質転換体を得ることができる。この場合、２個以上のｇｓｆ２遺伝子を有するベクターを組み込むことにより、さらに多くのｇｓｆ２遺伝子を有する形質転換体を得ることができる。Ｔｆ２の１３箇所すべてにベクターが組み込まれると、形質転換体の生存や増殖に対する負荷が大きくなりすぎるおそれがある。１３箇所のＴｆ２の８箇所以下にベクターが組み込まれることが好ましく、５箇所以下にベクターが組み込まれることがより好ましい。
【００４３】
遺伝子工学的方法により本発明におけるＳ．ポンベ変異体を製造する場合に宿主として使用するＳ．ポンベには、形質転換体を選択するためのマーカーを有するものを用いることが好ましい。たとえば、ある遺伝子が欠落していることにより特定の栄養成分が生育に必須である宿主を使用することが好ましい。ベクターにこの欠落している遺伝子（栄養要求性相補マーカー）を組み込んでおくことにより、形質転換体は宿主の栄養要求性が消失する。
この宿主と形質転換体の栄養要求性の相違により、両者を区別して形質転換体を得ることができる。
たとえば、オロチジンリン酸デカルボキシラーゼ遺伝子（ｕｒａ４遺伝子）が欠失または失活してウラシル要求性となっているＳ．ポンベを宿主とし、ｕｒａ４遺伝子（栄養要求性相補マーカー）を有するベクターにより形質転換した後、ウラシル要求性が消失したものを選択することにより、ベクターが組み込まれた形質転換体を得ることができる。宿主において欠落により栄養要求性となる遺伝子は、形質転換体の選択に用いられるものであればｕｒａ４遺伝子には限定されず、イソプロピルリンゴ酸デヒドロゲナーゼ遺伝子（ｌｅｕ１遺伝子）等であってもよい。
【００４４】
通常、相同組換えを行った後、得られた形質転換体を選択する。選択する方法としては、たとえば、以下に示す方法が挙げられる。前記栄養要求性マーカーにより形質転換体を選択できる培地によりスクリーニングし、得られたコロニーから複数を選択する。次に、それらを別々に液体培養した後、それぞれの菌体当たりのｇｓｆ２遺伝子の発現量を調べ、該発現量がより多い変異体を選択する。また、それら選択した変異体に対してパルスフィールドゲル電気泳動法によるゲノム解析を行うことにより、染色体に組み込まれたベクターの数および発現カセットの数を調べることができる。
染色体に組み込まれるベクターの数は組み込み条件等を調整することによりある程度は調整できるが、ベクターの大きさ（塩基数）および構造により、組み込み効率および組み込み数も変化すると考えられる。
【００４５】
遺伝子工学的方法でｐｖｇ１遺伝子を欠損させる、またはｐｖｇ１遺伝子にＰｖｇ１の酵素活性が低下もしくは失活する変異を導入することにより、宿主であるＳ．ポンベのＰｖｇ１の酵素活性を低下もしくは失活できる。確実にＰｖｇ１の酵素活性を失活できるため、ｐｖｇ１遺伝子自身を染色体から欠損させることが好ましい。
【００４６】
ｐｖｇ１遺伝子の欠失または失活は、公知の方法で行うことができる。たとえば、Ｌａｔｏｕｒ法（Ｎｕｃｒｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ誌、２００６年、３４巻、ｅ１１頁、国際公開第２００７／０６３９１９号パンフレット等に記載）を用いることによりｐｖｇ１遺伝子を欠失させることができる。
また、ｐｖｇ１遺伝子の塩基配列の一部に欠失、挿入、置換、付加を起こすことにより、該ｐｖｇ１遺伝子を失活させることもできる。該遺伝子の欠失、挿入、置換、付加による変異は、それらのいずれか１つのみを起こしてもよく、２つ以上を起こしてもよい。
【００４７】
ｐｖｇ１遺伝子の一部に前記変異を導入する方法は、公知の方法を用いることができる。たとえば、変異剤を用いた突然変異分離法（酵母分子遺伝学実験法、１９９６年、学会出版センター）、ＰＣＲを利用したランダム変異法（ピーシーアール・メソッズ・アプリケーション（ＰＣＲ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ａｐｐｌ．）、１９９２年、第２巻、ｐ．２８−３３．）等が挙げられる。
【００４８】
本発明におけるＳ．ポンベ変異体は、たとえば非性的凝集性を有しない通常のＳ．ポンベから人工的突然変異手段によっても取得できる。すなわち、非性的凝集性を有しないＳ．ポンベを突然変異処理し、処理されたＳ．ポンベから、野生株よりもＧｓｆ活性が増大しており、かつＰｖｇ１の酵素活性が低下または失活している菌を選択し、さらに選択された菌からＧｓｆ活性増大やＰｖｇ１の酵素活性の低下等が優性変異であるものを選択することにより作製できる。
【００４９】
Ｓ．ポンベに対する突然変異処理は、ＥＭＳ（メタンスルホン酸エチル）等の突然変異誘発物質を用いてもよく、紫外線等の短波長の光を照射してもよい。また、突然変異処理後のＳ．ポンベからの耐酸性非性的凝集性を有する菌の選抜は、カルシウムイオン等の陽イオンの存在下で行ってもよい。
【００５０】
Ｓ．ポンベ変異体のＧｓｆ活性は、沈降速度を指標として評価することができる。このため、突然変異処理されたＳ．ポンベを固体培地上で培養し、形成されたコロニーを適当な溶媒中に投入した場合に、野生株のコロニーよりも有意に早く沈降した（沈降速度が速い）場合には、該コロニーを形成する菌は、野生株よりもＧｓｆ活性が増大していると評価できる。野生株のコロニーと突然変異処理された菌のコロニーをほぼ同時に溶媒へ投入し、沈降の速さを比較してもよく、特定の条件における野生株の沈降速度を予め測定し、得られた結果から決定された閾値と、突然変異処理された菌のコロニーの沈降速度とを比較してもよい。コロニーの沈降試験に用いる溶媒は、酵母が生存可能な溶液であれば特に限定されるものではないが、カルシウムイオン、リチウムイオン、マンガンイオン、銅イオン、および亜鉛イオンからなる群より選択される１種以上の陽イオンを含むバッファーであることが好ましい。たとえば、乾燥菌体の濃度が３．６ｇ／Ｌの場合に、カルシウムイオン含有乳酸緩衝液（８０ｍＭ  乳酸、１００ｍＭ  塩化カルシウム、ｐＨ６．０）中における沈降速度が１．０ｍ／ｈ以上である菌を、Ｇｓｆ活性が増大した変異体として選抜できる。
【００５１】
たとえば、以下の操作により耐酸性非性的凝集株を得る事が出来る。まず、Ｓ．ポンベに対してＥＭＳを用いて突然変異を誘発した後、それらを単離し培養する。その後、上清を除去して回収された菌体を、乳酸−水酸化ナトリウム緩衝液（８０ｍＭ  乳酸、１００ｍＭ  塩化カルシウム、ｐＨ２．０）に乾燥菌体の濃度が３．６ｇ／Ｌとなるよう懸濁させ、沈降速度を測り、沈降速度が２．０ｍ／ｈを超える菌株を、耐酸性非性的凝集株として選択する。
【００５２】
Ｇｓｆ活性が増大した変異体は、ｇｓｆ２遺伝子の発現量を指標として選抜することもできる。ｇｓｆ２遺伝子の発現量は、ＲＴ−ＰＣＲ、標識済みプローブを用いたノザンブロッティング等の遺伝子発現解析に通常用いられる測定方法により測定され得る。
【００５３】
Ｐｖｇ１の酵素活性が低下または失活すると、細胞表層のピルビン酸の存在量が有意に低下する傾向がある。このため、Ｓ．ポンベのＰｖｇ１の酵素活性は、細胞表層ピルビン酸の存在量を指標として評価できる。すなわち、突然変異処理されたＳ．ポンベから、細胞表層ピルビン酸が欠失している菌を、Ｐｖｇ１の酵素活性が低下または失活している変異体として選抜できる。
【００５４】
細胞表層ピルビン酸の欠失変異体は、Ａｎｄｒｅｉｓｈｃｈｅｖａらの方法（ＴｈｅＪｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ２００４  Ａｕｇ２０；２７９（３４）：３５６４４−５５）を参考にして作製できる。まず、ポンベに対してＥＭＳを用いて突然変異を誘発した後、それらを適切な液体培地で４８時間培養する。その後、培養物から陽電荷を帯びたＱ−セファロースを用いて吸着する菌体を取り除き、上清に残った菌体を回収する。該Ｑ−セファロースによる選別を何度か繰返した後、得られた培養液上清をプレートに塗布し、単離培養する事で、細胞表層ピルビン酸の欠失変異体が得られる。
【００５５】
Ｐｖｇ１の酵素活性が低下または失活している変異体は、突然変異処理された各菌のＰｖｇ１の酵素活性を測定することによっても選抜できる。Ｓ．ポンベのＰｖｇ１の酵素活性は、標識した基質を用いた測定方法等、他の転移酵素の酵素活性の測定に通常用いられる測定方法により測定できる。
【００５６】
本発明におけるＳ．ポンベ変異体は、遺伝子工学的方法と突然変異処理とを組み合わせて製造してもよい。たとえば、突然変異処理によりｇｓｆ２遺伝子の発現量が増大した変異体に対して、遺伝子工学的方法によりＰｖｇ１の酵素活性を低下または失活させてもよく、突然変異処理によりＰｖｇ１の酵素活性が低下または失活した変異体に対して、遺伝子工学的方法によりｇｓｆ２遺伝子の発現量を増大させてもよい。遺伝子工学的方法によりＰｖｇ１の酵素活性を低下または失活させた変異体に対して突然変異処理を行い、ｇｓｆ２遺伝子の発現量が増大した変異体を選抜してもよい。
【００５７】
本発明におけるＳ．ポンベ変異体は、耐酸性非性的凝集性を維持し得る限り、その他の遺伝子に変異を有していてもよく、さらに、染色体中または染色体外に外来の構造遺伝子が導入されていてもよい。
【００５８】
本発明におけるＳ．ポンベ変異体が備える耐酸性非性的凝集性は、培養液中の酸の種類には影響されない。すなわち、培養液のｐＨを２〜５にたらしめている酸が乳酸、クエン酸、酢酸、コハク酸、フマル酸、リンゴ酸等の有機酸であろうと、塩酸および硫酸等の鉱酸であろうと、該Ｓ．ポンベ変異体は非性的に凝集する。
【００５９】
本発明におけるＳ．ポンベ変異体が備える非性的凝集性の強さは、たとえば、沈降速度を指標にできる。酵母の沈降速度は、たとえば、試験管等の透明な容器に分注した酵母菌体を懸濁処理後に静置して沈降を開始させた後、液表面から固液界面（沈降した酵母菌体と上清との界面）までの距離を沈降開始からの経過時間で除することにより、求められる。
【００６０】
本発明におけるＳ．ポンベ変異体は、カルシウムイオン含有乳酸緩衝液（８０ｍＭ  乳酸、１００ｍＭ  塩化カルシウム、ｐＨ２．０）中で非性的に凝集する性質を有する。本発明におけるＳ．ポンベ変異体の該カルシウムイオン含有乳酸緩衝液中における沈降速度は、乾燥菌体の濃度が３．６ｇ／Ｌの場合に、２．０ｍ／ｈ以上であることが好ましく、４．０ｍ／ｈ以上であることがより好ましく、６．０ｍ／ｈ以上であることがさらに好ましい。
【００６１】
また、本発明におけるＳ．ポンベ変異体は、カルシウムイオン含有乳酸緩衝液（８０ｍＭ  乳酸、１００ｍＭ  塩化カルシウム、ｐＨ４．０）中で非性的に凝集する性質を有する。本発明におけるＳ．ポンベ変異体の該カルシウムイオン含有乳酸緩衝液中における沈降速度は、乾燥菌体の濃度が３．６ｇ／Ｌの場合に、２．０ｍ／ｈ以上であることが好ましく、４．０ｍ／ｈ以上であることがより好ましく、８．０ｍ／ｈ以上であることがさらに好ましい。
ｐＨ４．０における沈降速度が８．０ｍ／ｈ以上であることにより、ｐＨ４よりもさらに低いｐＨにおいても、充分な凝集性が示される。
【００６２】
本発明におけるＳ．ポンベ変異体が備える耐酸性非性的凝集性は、カルシウムイオン、リチウムイオン、マンガンイオン、銅イオン、および亜鉛イオンからなる群より選択される１種以上の陽イオンに依存していてもよい。耐酸性非性的凝集性がカルシウムイオン等に依存する場合には、ＥＤＴＡ等のキレート剤を培養液に添加することにより、該Ｓ．ポンベ変異体の凝集を阻害できる。
【００６３】
本発明におけるＳ．ポンベ変異体が備える耐酸性非性的凝集性は、ガラクトースにより阻害される性質であってもよい。耐酸性非性的凝集性がガラクトースにより阻害される場合には、培養液中に最終濃度が５ｍＭ以上となるようにガラクトースを添加することにより、該Ｓ．ポンベ変異体の凝集を阻害できる。
【００６４】
本発明におけるＳ．ポンベ変異体は、酸性（たとえば、ｐＨ２〜５）条件下で強力な非性的凝集性を示す。このため、該Ｓ．ポンベ変異体は、特に、酸性蛋白質を合成するための発現系の宿主として好適である。また、目的蛋白質の生産性を考慮した結果、培養時の最適なｐＨが５より低くなる場合にも、発現系の宿主として好適である。
【００６５】
本発明におけるＳ．ポンベ変異体を宿主としてβ−グルコシダーゼを大量製造するために、後述する本発明のＳ．ポンベ変異体の形質転換体を作製し、該形質転換体をタンク培養等で培養した場合に、培養終了時に培養液のｐＨが２〜５となった場合でも、遠心分離、濾過等の固液分離処理や中和反応等を行うことなく、菌体を凝集させることができ、それにより菌体と培養液を容易に分離できる。なお、本発明におけるＳ．ポンベ変異体は、酸性条件下のみならず、弱酸性〜アルカリ性（たとえば、ｐＨ５〜１０）条件下でも非性的に凝集可能であってもよい。
【００６６】
［Ｓ．ポンベ変異体の形質転換体］
本発明のＳ．ポンベ変異体の形質転換体は、上述したＳ．ポンベ変異体を宿主として、糸状菌由来のβ−グルコシダーゼをコードする構造遺伝子配列並びに該構造遺伝子を発現させるためのプロモーター配列およびターミネーター配列含む発現カセットを染色体中に有するか、または、染色体外遺伝子として有する。上記発現カセットを染色体中に有するとは、シゾサッカロミセス属酵母の染色体中の１カ所以上に発現カセットが組み込まれていることであり、染色体外遺伝子として有するとは、発現カセットを含むプラスミドを細胞内に有するということである。形質転換体の継代培養が容易であることから、上記発現カセットを染色体中に有することが好ましい。
なお、発現カセットとは、［Ｓ．ポンベ変異体］において述べたものと同様であり、β−グルコシダーゼを発現するために必要なＤＮＡの組み合わせであり、β−グルコシダーゼ構造遺伝子とシゾサッカロミセス属酵母内で機能するプロモーターとターミネーターとを含む。
【００６７】
また、シゾサッカロミセス属酵母の細胞外に分泌されるβ−グルコシダーゼが増大し、β−グルコシダーゼの回収、精製が容易になることから、β−グルコシダーゼ構造遺伝子の５’末端側に、シゾサッカロミセス属酵母内で機能する分泌シグナル配列をコードする塩基配列（分泌シグナルの構造遺伝子）を有することが好ましい。β−グルコシダーゼ構造遺伝子の５’末端側とは、β−グルコシダーゼ構造遺伝子の５’末端側上流であって、β−グルコシダーゼ構造遺伝子の５’末端に隣接する位置である。また、β−グルコシダーゼの活性に影響しないＮ末側の数アミノ酸をコードする塩基配列が除かれ、その位置にシグナル配列をコードする遺伝子を導入されていてもよい。
【００６８】
プロモーターとターミネーターは、宿主であるＳ．ポンベ変異体内で機能して糸状菌由来のβ−グルコシダーゼを発現できるものであればよい。Ｓ．ポンベ変異体内で機能するプロモーターとしては、［Ｓ．ポンベ変異体］において述べたものと同様のものが挙げられる。
【００６９】
（β−グルコシダーゼ）
β-グルコシダーゼ（ＥＣ．３．２．１．２１）とは、β−Ｄ−グルコピラノシド結合の加水分解反応を特異的に触媒する酵素の総称として用いられる。特にセロビオースをグルコースに分解することからセロビアーゼとも呼ばれ、広く細菌、糸状菌、植物および動物に分布する。それぞれの生物種内に、β−グルコシダーゼをコードする遺伝子が複数存在することが多く、たとえば、糸状菌の１種であるアスペルギルス・オリゼー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｏｒｙｚａｅ）では、ｂｇｌ１〜ｂｇｌ７の存在が報告されている（Ｓｏｙ  ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｊａｐａｎ  １２，７８−８３，２００９、特開２００８−０８６３１０号公報）。これらのうち、活性の高さ等から、ＢＧＬ１をコードするｂｇｌ１が好ましい。
【００７０】
本発明のＳ．ポンベ変異体の形質転換体が有するβ−グルコシダーゼの構造遺伝子は、糸状菌由来のものである。
糸状菌とは、菌類のうち、菌糸と呼ばれる管状の細胞から構成される真核細胞微生物である。糸状菌としては、たとえば、アスペルギルス属（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ)、トリコデルマ属（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ)属、フサリウム属（Ｆｕｓａｒｉｕｍ）、ペニシリウム属（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ)およびアクレモニウム属（Ａｃｒｅｍｏｎｉｕｍ）等が挙げられる。本発明におけるβ−グルコシダーゼの構造遺伝子は、β−グルコシダーゼを産生する糸状菌であればいずれの糸状菌由来のものであってもよいが、酵素活性の高さなどから、アスペルギルス属の糸状菌由来のβ−グルコシダーゼが好ましい。アスペルギルス属の糸状菌としては、たとえば、アスペルギルス・ニジュランス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｎｉｄｕｌａｎｓ）、アスペルギルス・オリゼー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｏｒｙｚａｅ）、アスペルギルス・アクリータス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ａｃｕｌｅａｔｕｓ）、アスペルギルス・ニガー（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓｎｉｇｅｒ）、アスペルギルス・パルベルレンタス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｐｕｌｖｅｒｕｌｅｎｔｕｓ）を挙げることができる。結晶セルロース分解力が高く、単糖生成力に優れていることから、アスペルギルス・アクリータス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ａｃｕｌｅａｔｕｓ）由来のβ−グルコシダーゼをコードする遺伝子が好ましく、アスペルギルス・アクリータス（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ａｃｕｌｅａｔｕｓ）由来のＢＧＬ１（以下、ＡａＢＧＬ１ともいう）をコードする遺伝子がより好ましい。
坂本禮一郎博士論文（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ａｃｕｌｅａｔｕｓ  Ｎｏ．Ｆ−５０のセルラーゼ系に関する研究、大阪府立大学、１９８４年）によれば、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ａｃｕｌｅａｔｕｓから精製した野生型のＡａＢＧＬ１の分子量は約１３３ＫＤａ、至適ｐＨは４．０で、安定ｐＨ範囲は３〜７（２５℃、２４時間）である。
【００７１】
ＡａＢＧＬ１のアミノ酸配列は、配列番号１で表されるものである。本発明においてβ−グルコシダーゼをコードする遺伝子配列は、配列番号１で示されるアミノ酸配列からなるβ−グルコシダーゼをコードする遺伝子配列が好ましい。また、配列番号１で表されるアミノ酸配列に１〜数十個、好ましくは１〜数個、さらに好ましくは１〜９個、のアミノ酸の欠失、置換または付加が入ったアミノ酸配列からなり、β-D-グルコピラノシド結合の加水分解反応を触媒する活性を有するβ−グルコシダーゼをコードする遺伝子配列であってもよい。
配列番号１で表されるアミノ酸配列からなるβ−グルコシダーゼは、１〜数十個のアミノ酸の欠失、置換または付加が入ってもβ-D-グルコピラノシド結合の加水分解反応を触媒する活性を有するものである。
【００７２】
なお、上記の糸状菌由来のβ−グルコシダーゼをコードする遺伝子をそのまま用いてもよいが、シゾサッカロミセス属酵母内での発現量を増大させるために、上記遺伝子配列を、シゾサッカロミセス属酵母での高発現遺伝子において使用頻度の高いコドンに改変することが好ましい。
【００７３】
本発明において、β−グルコシダーゼを発現させるためのベクター（以下、ｂｇｌベクターともいう）としては、上述したＧｓｆ２を発現させるためのｇｓｆ２ベクターと同様のものが挙げられる。
さらに、ｂｇｌベクターは、Ｓ．ポンベ変異体内で機能する分泌シグナル遺伝子を有することが好ましい。分泌シグナル遺伝子の位置は、β−グルコシダーゼ構造遺伝子の５’末端側である。Ｓ．ポンベ変異体内で機能する分泌シグナル遺伝子は、発現した外来蛋白質を宿主細胞外に分泌させる機能を有するアミノ酸配列をコードする遺伝子である。分泌シグナル遺伝子が結合した外来構造遺伝子から、Ｎ末端に分泌シグナルが付加した外来蛋白質が発現する。この外来蛋白質は、宿主内の小胞体やゴルジ装置等で分泌シグナルが切断され、その後分泌シグナルが除去された外来蛋白質が細胞外に分泌される。分泌シグナル遺伝子（および分泌シグナル）はＳ．ポンベ変異体内で機能することが必要である。Ｓ．ポンベ変異体内で機能する分泌シグナル遺伝子としては、たとえば、国際公開第１９９６／２３８９０号に記載のものを使用できる。
本発明では、β−グルコシダーゼの構造遺伝子の５’末端側にこの分泌シグナルの構造遺伝子を導入することにより、Ｎ末端に上記分泌シグナルが付加されたβ−グルコシダーゼを発現させ、シゾサッカロミセス属酵母の菌体外にβ−グルコシダーゼを分泌させることができる。シゾサッカロミセス属酵母内で機能する分泌シグナルとしては、国際公開第１９９６／２３８９０号に記載のＰ３シグナルが特に好ましい。
【００７４】
上記ｂｇｌベクターを用いて、宿主であるＳ．ポンベ変異体を形質転換する。該Ｓ．ポンベ変異体へのβ−グルコシダーゼの構造遺伝子の導入は、ｇｓｆ２遺伝子の導入およびと同様にして行える。また、形質転換体の選択方法についても同様である。
【００７５】
本発明のＳ．ポンベ変異体の形質転換体の培養液には、公知の酵母培養培地を用いることができ、シゾサッカロミセス属酵母が資化しうる炭素源、窒素源、無機塩類等を含有し、シゾサッカロミセス属酵母の培養を効率良く行えるものであればよい。培養液としては、天然培地を用いてもよく、合成培地を用いてもよい。
【００７６】
炭素源としては、たとえば、グルコース、フルクトース、スクロース等の糖が挙げられる。
窒素源としては、たとえば、アンモニア、塩化アンモニウム、酢酸アンモニウム等の無機酸または無機酸のアンモニウム塩、ペプトン、カザミノ酸が挙げられる。
無機塩類としては、たとえば、リン酸マグネシウム、硫酸マグネシウム、塩化ナトリウムが挙げられる。
【００７７】
培養には公知の酵母培養方法を用いることができ、たとえば振盪培養、攪拌培養等により行うことができる。
また、培養温度は、２３〜３７℃であることが好ましい。また、培養時間は適宜決定することができる。
また、培養は、回分培養（バッチ培養）または流加培養（フェドバッチ培養）であってもよく、連続培養であってもよい。
【００７８】
本発明のＳ．ポンベ変異体の形質転換体として、分泌シグナル遺伝子を結合させたβ−グルコシダーゼ構造遺伝子を有する形質転換体を用いる場合、β−グルコシダーゼが培養液中に分泌される。そして、β−グルコシダーゼを大量製造するべく、該形質転換体をタンク培養等で培養した場合に、培養終了時に培養液のｐＨが２〜５となった場合でも、該形質転換体は耐酸性非性的凝集性を有するため、遠心分離、濾過等の固液分離処理や中和反応等を行うことなく、菌体を凝集させることができ、それにより菌体と培養液を容易に分離できる。
【００７９】
また、本発明のＳ．ポンベ変異体の形質転換体として、分泌シグナル遺伝子を結合させていないβ−グルコシダーゼ構造遺伝子を有する形質転換体を用いる場合、β−グルコシダーゼの分離手段として、公知の蛋白質分離方法を用いることができる。
たとえば、培養後、沈降した菌体を培養液から分離し、菌体を破壊してβ−グルコシダーゼを含む細胞破砕液を得て、その細胞破砕液から塩析、カラム精製、クロマトグラフィー、免疫沈降等の公知の蛋白質分離方法を用いてβ−グルコシダーゼを取得できる。
【００８０】
次に、第二の態様に係る本発明を説明する。
［クローニングベクター］
本発明の第二の態様に係るクローニングベクターは、外来蛋白質を発現させるためにシゾサッカロミセス属酵母に導入される発現ベクターを作製するためのクローニングベクターであり、外来蛋白質の発現を制御するプロモーターがシゾサッカロミセス属酵母のｈｓｐ９プロモーターまたはｉｈｃ１プロモーターであることを特徴とする。なお、以下、本発明の第二の態様に係るクローニングベクターを本発明のクローニングベクターともいう。
【００８１】
＜ｈｓｐ９プロモーター＞
シゾサッカロミセス属酵母のｈｓｐ９遺伝子は、シゾサッカロミセス属酵母が有する熱ショック蛋白質（ｈｅａｔｓｈｏｃｋ  ｐｒｏｔｅｉｎ、ｈｓｐ）の一種であるＨｓｐ９蛋白質をコードする遺伝子である。Ｓ．ｐｏｍｂｅの遺伝子配列データベース（Ｓ．ｐｏｍｂｅ  ＧｅｎｅＤＢ；ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｅｎｅｄｂ．ｏｒｇ／ｇｅｎｅｄｂ／ｐｏｍｂｅ／）に登録されているｈｓｐ９遺伝子の系統名はＳＰＡＰ８Ａ３．０４ｃである。
熱ショック蛋白質とは、細胞や個体が平常温度より５〜１０℃高い温度変化（熱ショック）を急激に受けたときにその合成が誘導され、シャペロンとして機能することによって蛋白質の熱変性や凝集を阻害する蛋白質の総称である。熱ショック蛋白質の生体内合成は、熱ショックの他、様々な化学物質、たとえば電子伝達系の阻害剤、遷移金属、ＳＨ試薬、エタノールなどによっても誘導される。
したがって、ｈｓｐ９プロモーターを有する発現ベクターを導入した形質転換体においては、Ｈｓｐ９蛋白質の発現と同様に、熱ショックや様々な化学物質による刺激によって外来蛋白質の発現を制御できる。
【００８２】
ｈｓｐ９プロモーターは、シゾサッカロミセス属酵母内で非常に発現効率が高い。このため、該プロモーターを使用することで、シゾサッカロミセス属酵母の形質転換体から外来蛋白質を従来になく大量に生産可能な発現ベクターを作製することができる。
ｈｓｐ９プロモーターは、シゾサッカロミセス属酵母が有するｈｓｐ９遺伝子のプロモーターであればよく、いずれのシゾサッカロミセス属酵母由来であってもよいが、より汎用されているため、Ｓ．ｐｏｍｂｅのｈｓｐ９プロモーターを用いることが好ましい。Ｓ．ｐｏｍｂｅのｈｓｐ９プロモーターは、ｈｓｐ９遺伝子のＯＲＦの５’末端（開始コドンＡＴＧのＡ）の上流１〜４００ｂｐに含まれる領域である（配列番号６参照）。
【００８３】
ｈｓｐ９プロモーターを有する、Ｓ．ポンベ以外のシゾサッカロミセス属酵母としては、シゾサッカロミセス・ジャポニカス（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｊａｐｏｎｉｃｕｓ）、シゾサッカロミセス・オクトスポラス（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｏｃｔｏｓｐｏｒｕｓ）等が挙げられる。また、クローニングベクターに用いられるｈｓｐ９プロモーターは、該クローニングベクターから作製された発現ベクターが導入されるシゾサッカロミセス属酵母と同じ生物種由来であってもよく、異なる生物種由来であってもよい。
【００８４】
ｈｓｐ９プロモーターは、野生型のシゾサッカロミセス属酵母が本来有しているプロモーター（野生型のｈｓｐ９プロモーター）と同一の塩基配列以外にも、当該塩基配列中の１以上の塩基、好ましくは１〜数十個、より好ましくは１〜十数個、さらに好ましくは１〜９個、よりさらに好ましくは１〜数個の塩基が欠失、置換、もしくは付加された塩基配列からなり、かつ野生型のｈｓｐ９プロモーターと同様にプロモーター活性を有する領域であってもよい。
【００８５】
また、本発明に係るクローニングベクターに用いるｈｓｐ９プロモーターは、野生型のｈｓｐ９プロモーターと同一の塩基配列とのホモロジーが８０％以上、好ましくは８５％以上、より好ましくは９０％以上、さらに好ましくは９５％以上である塩基配列からなり、かつ野生型のｈｓｐ９プロモーターと同様にプロモーター活性を有する領域であってもよい。
【００８６】
Ｓ．ポンベのｈｓｐ９プロモーターは、ｈｓｐ９遺伝子のＯＲＦの５’末端（開始コドンＡＴＧのＡ）の上流１〜４００ｂｐに含まれる領域である。該領域の塩基配列を配列番号６に表す。すなわち、本発明に係るクローニングベクターとしては、配列番号６で表される塩基配列からなる領域を備えることが好ましい。また、配列番号６で表される塩基配列中の１以上の塩基、好ましくは１〜数十個、より好ましくは１〜十数個、さらに好ましくは１〜９個、よりさらに好ましくは１〜数個の塩基が欠失、置換、もしくは付加された塩基配列、または配列番号６で表される塩基配列とのホモロジーが８０％以上、好ましくは８５％以上、より好ましくは９０％以上、さらに好ましくは９５％以上である塩基配列からなり、かつ野生型のｈｓｐ９プロモーターと同様にプロモーター活性を有する領域も、本発明に係るクローニングベクターに用いるｈｓｐ９プロモーターとして好適に用いることができる。
【００８７】
＜ｉｈｃ１プロモーター＞
ｉｈｃ１遺伝子は、分子量１５，４００の蛋白質であるＩｈｃ１をコードする遺伝子である。ｉｈｃ１遺伝子は、シゾサッカロミセス属酵母をはじめとする真菌類に広く保存されている。
Ｉｈｃ１蛋白質は、増殖開始時等の菌体密度が低い状態では発現が抑制されており、菌体密度が高い状態では発現が誘導される。このＩｈｃ１蛋白質の発現はｉｈｃ１遺伝子のプロモーターにより制御されている。したがって、ｉｈｃ１プロモーターは、増殖開始時等の菌体密度が低い状態では、発現誘導が抑制されており、菌体密度が高い状態では発現が高誘導できる。このため、該プロモーターを使用することで、シゾサッカロミセス属酵母の形質転換体において、外来蛋白質の発現を、菌体密度依存的に調整可能な発現ベクターを作製することができる。
ｉｈｃ１プロモーターは、シゾサッカロミセス属酵母が有するｉｈｃ１遺伝子のプロモーターであればよく、いずれのシゾサッカロミセス属酵母由来であってもよいが、より汎用されているため、Ｓ．ｐｏｍｂｅのｉｈｃ１プロモーターを用いることが好ましい。
Ｓ．ｐｏｍｂｅのｉｈｃ１遺伝子は公知であり、Ｓ．ｐｏｍｂｅの遺伝子配列データベース（Ｓ．ｐｏｍｂｅ  ＧｅｎｅＤＢ；ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｅｎｅｄｂ．ｏｒｇ／ｇｅｎｅｄｂ／ｐｏｍｂｅ／）に登録されているｉｈｃ１遺伝子の系統名はＳＰＡＣ２２Ｇ７．１１ｃであり、そのｉｈｃ１プロモーターは、ｉｈｃ１遺伝子のＯＲＦの５’末端（開始コドンＡＴＧのＡ）の上流１〜５０１ｂｐに含まれる領域である（配列番号９参照）。
【００８８】
本発明に係るクローニングベクターに用いられるｉｈｃ１プロモーターは、シゾサッカロミセス属酵母が有するｉｈｃ１遺伝子のプロモーターであればよく、いずれのシゾサッカロミセス属酵母由来であってもよい。シゾサッカロミセス属酵母としては、Ｓ．ポンベ、シゾサッカロミセス・ジャポニカス（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｊａｐｏｎｉｃｕｓ）、シゾサッカロミセス・オクトスポラス（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｏｃｔｏｓｐｏｒｕｓ）等が挙げられる。また、クローニングベクターに用いられるｉｈｃ１プロモーターは、該クローニングベクターから作製された発現ベクターが導入されるシゾサッカロミセス属酵母と同じ生物種由来であってもよく、異なる生物種由来であってもよい。本発明においては、より汎用されているため、Ｓ．ポンベのｉｈｃ１プロモーターを用いることが好ましい。
【００８９】
本発明に係るクローニングベクターに用いるｉｈｃ１プロモーターは、野生型のシゾサッカロミセス属酵母が本来有しているプロモーター（野生型のｉｈｃ１プロモーター）と同一の塩基配列以外にも、当該塩基配列中の１以上の塩基、好ましくは１〜数十個、より好ましくは１〜十数個、さらに好ましくは１〜９個、よりさらに好ましくは１〜数個の塩基が欠失、置換、もしくは付加された塩基配列からなり、かつ野生型のｉｈｃ１プロモーターと同様にプロモーター活性を有する領域であってもよい。
【００９０】
また、本発明に係るクローニングベクターに用いるｉｈｃ１プロモーターは、野生型のｉｈｃ１プロモーターと同一の塩基配列とのホモロジーが８０％以上、好ましくは８５％以上、より好ましくは９０％以上、さらに好ましくは９５％以上である塩基配列からなり、かつ野生型のｉｈｃ１プロモーターと同様にプロモーター活性を有する領域であってもよい。
【００９１】
Ｓ．ポンベのｉｈｃ１プロモーターは、ｉｈｃ１遺伝子のＯＲＦの５’末端（開始コドンＡＴＧのＡ）の上流１〜５０１ｂｐに含まれる領域である（配列番号９）。該領域の塩基配列を配列番号９に表す。すなわち、本発明に係るクローニングベクターとしては、配列番号９で表される塩基配列からなる領域を備えることが好ましい。また、配列番号９で表される塩基配列中の１以上の塩基、好ましくは１〜数十個、より好ましくは１〜十数個、さらに好ましくは１〜９個、よりさらに好ましくは１〜数個の塩基が欠失、置換、もしくは付加された塩基配列、または配列番号９で表される塩基配列とのホモロジーが８０％以上、好ましくは８５％以上、より好ましくは９０％以上、さらに好ましくは９５％以上である塩基配列からなり、かつ野生型のｉｈｃ１プロモーターと同様にプロモーター活性を有する領域も、本発明に係るクローニングベクターに用いるｉｈｃ１プロモーターとして好適に用いることができる。
【００９２】
＜クローニングベクター＞
本発明のクローニングベクターは、前記ｈｓｐ９プロモーターおよびｉｈｃ１プロモーターのいずれかに加えて、該プロモーターの下流に位置しかつ該プロモーターによって支配される外来構造遺伝子を導入するためのクローニングサイト、および、シゾサッカロミセス属酵母内で機能しうるターミネーターを有する。
【００９３】
クローニングベクターが備えるクローニングサイトは、クローニングベクターにおいて該クローニングサイトにのみ存在する制限酵素認識部位が存在する場所である。本発明のクローニングベクターが備えるクローニングサイトは、１種類の制限酵素によって認識される制限酵素認識部位を有していてもよく、２種類以上の制限酵素によって認識可能な制限酵素認識部位を有するマルチクローニングサイトであってもよい。該マルチクローニングサイトとしては、公知のクローニングベクターが備えるマルチクローニングサイトをそのまま使用でき、また、公知のマルチクローニングサイトを適宜改変したものを使用できる。その他、本発明のクローニングベクターは、クローニングサイト内の下流端側領域または該クローニングサイトの下流に、終止コドンを備えていてもよい。
【００９４】
シゾサッカロミセス属酵母内で機能するターミネーターとしては、シゾサッカロミセス属酵母が本来有するターミネーターやシゾサッカロミセス属酵母が本来有しないターミネーターを使用することができる。なお、ターミネーターはベクター内に２種以上存在していてもよい。シゾサッカロミセス属酵母が本来有するターミネーターとしては、たとえば、シゾサッカロミセス属酵母のｉｎｖ１遺伝子のターミネーター等が挙げられる。また、シゾサッカロミセス属酵母が本来有しないターミネーターとしては、たとえば、特許文献２、４、または１０に記載されているヒト由来のターミネーター等が挙げられ、ヒトリポコルチンＩのターミネーターが好ましい。
【００９５】
本発明のクローニングベクターには、前記プロモーターの下流でかつクローニングサイトの上流に、５’−非翻訳領域が含まれていることが好ましく、また、クローニングサイトの下流に３’−非翻訳領域が含まれていることが好ましい。また、本発明のクローニングベクターは、クローニングサイトに外来構造遺伝子が導入された発現ベクターと識別するためのマーカーを有することが好ましい。該マーカーとしては、たとえば、アンピシリン耐性遺伝子等、大腸菌内で機能し得る薬剤耐性遺伝子等が挙げられる。
【００９６】
さらに、本発明のクローニングベクターは、形質転換体を選択するためのマーカーを有することが好ましい。該マーカーとしては、たとえば、ｕｒａ４遺伝子などの栄養要求性相補マーカー、イソプロピルリンゴ酸デヒドロゲナーゼ遺伝子（ｌｅｕ１遺伝子）等が挙げられる。
【００９７】
本発明のクローニングベクターは、さらに、そのクローニングサイトに外来構造遺伝子を導入した際に発現カセットを構成する領域以外に、形質転換体の製造に必要なＤＮＡ領域を有していてもよい。たとえば、発現カセットを染色体に導入する場合は組換え部位を有することが好ましい。前記第一の態様に係る本発明においてｇｓｆ２ベクターの発現カセットを染色体に導入する場合に用いられる組み換え部位を、そのまま外来構造遺伝子（ｇｓｆ２遺伝子に限られない）を有する発現カセットを染色体に導入するために使用することができる。ｇｓｆ２遺伝子以外の外来構造遺伝子を有する発現カセットの場合であっても、その発現カセットを染色体に導入する方法もまた第一の態様に係る本発明に関して記載した遺伝子工学的方法をそのまま適用することができる。
【００９８】
本発明のクローニングベクターから作製された発現ベクターの発現カセットが、宿主細胞内で染色体外遺伝子として保持される形質転換体を作製する場合には、本発明のクローニングベクターは、シゾサッカロミセス属酵母内で複製されるための配列、即ち、自律複製配列（Autonomously Replicating Sequence: ARS）を含むことが好ましい。なお、発現カセットを染色体に組み込む場合には、発現ベクターからＡＲＳを削除して宿主に導入することが好ましい。
【００９９】
本発明に係るクローニングベクターは、外来蛋白質を宿主に発現させるための発現ベクターを作製するために用いられる公知のクローニングベクターからそれが備えるプロモーター領域を、ｈｓｐ９プロモーターまたはｉｈｃ１プロモーターに置換することによって作製することができる。たとえば、前記特開平７−１６３３７３号公報、特開平１０−２３４３７５号公報、特開平１１−１９２０９４号公報、特開２０００−１３６１９９号公報等に記載のマルチクローニングベクターのプロモーター部位をｈｓｐ９プロモーターまたはｉｈｃ１プロモーターに置換することによって作製することができる。
本発明に係るクローニングベクターを構築するための具体的操作方法としては、公知の方法を使用することができる。たとえば、文献［J. Sambrook et al.,"Molecular Cloning 2nded.", Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989)］に記載されている操作方法を使用できる。その他、ＰＣＲによる酵素的な増幅法や化学合成法、で構築してもよい。
【０１００】
［発現ベクターおよびその製造方法］
第二の態様に係る本発明の発現ベクターは、本発明のクローニングベクター中のクローニングサイトに、外来構造遺伝子を導入することにより製造することができる。クローニングサイトへの外来構造遺伝子の導入は、クローニングベクターの作製と同様に公知の方法を使用することができる。
【０１０１】
本発明の発現ベクターに導入されている外来構造遺伝子は、蛋白質をコードする構造遺伝子であれば特に限定されるものではなく、宿主とするシゾサッカロミセス属酵母が元々有している遺伝子と同種のものであってもよく、異種生物由来の構造遺伝子であってもよい。シゾサッカロミセス属酵母の内在性蛋白質をコードする構造遺伝子（例えば、前記ｇｓｆ２遺伝子）を含む発現ベクターにより得られたシゾサッカロミセス属酵母の形質転換体から、より大量に該内在性蛋白質を生産することができる。また、異種生物由来の構造遺伝子を含む発現ベクターにより得られたシゾサッカロミセス属酵母の形質転換体から、大量の異種蛋白質を生産することができる。
【０１０２】
本発明の発現ベクターに導入されている外来構造遺伝子がコードする蛋白質は、異種蛋白質が好ましく、多細胞生物である動物や植物が産生する蛋白質がより好ましく、哺乳動物（ヒトを含む）の産生する蛋白質がさらに好ましい。このような蛋白質は大腸菌などの原核細胞微生物宿主を用いて製造した場合には、活性の高い蛋白質が得られない場合が多く、またＣＨＯ細胞などの動物細胞を宿主として用いた場合には、通常産生効率が低い。本発明に係る発現ベクターを用い、シゾサッカロミセス属酵母を宿主とした異種蛋白質発現系を用いる場合はこれらの問題が解決される。
【０１０３】
本発明の発現ベクターに導入されている外来構造遺伝子は、蛋白質をコードするものである限り、野生型の構造遺伝子であってもよく、野生型の構造遺伝子を改変した遺伝子であってもよく、人工的に合成された遺伝子であってもよい。野生型以外の構造遺伝子としては、たとえば、野生型の複数の蛋白質を融合させたキメラ蛋白質をコードする遺伝子、野生型の蛋白質のＮ末端またはＣ末端にその他のペプチド等が結合した蛋白質をコードする遺伝子等が挙げられる。該その他のペプチドとしては、分泌シグナル、特定の細胞内小器官への移行シグナル等のシグナル、Ｈｉｓタグ、ＦＬＡＧタグ等のタグ等が挙げられる。各種シグナルは、シゾサッカロミセス属酵母内で機能するシグナルであることが必要である。分泌シグナルは、Ｎ末端に存在することにより、発現した蛋白質を宿主細胞外に分泌させる機能を有するペプチドである。シゾサッカロミセス属酵母内で機能する分泌シグナルとしては、国際公開第１９９６／２３８９０号に記載のＰ３シグナルが特に好ましい。
【０１０４】
［形質転換体およびその製造方法］
第二の態様の本発明に係る形質転換体は、上記第二の態様の本発明に係る発現ベクターを含むことを特徴とする。第二の態様の本発明に係る形質転換体は、シゾサッカロミセス属酵母に上記発現ベクターを導入することで製造される。
【０１０５】
第二の態様の本発明に係る形質転換体の宿主は、シゾサッカロミセス属酵母である。シゾサッカロミセス属酵母は野生型であってもよく、用途に応じて特定の遺伝子を欠失または失活させた変異型であってもよい。特定の遺伝子を欠失または失活させる方法としては、公知の方法を用いることができる。具体的には、Ｌａｔｏｕｒ法（Ｎｕｃｒｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ、２００６年、第３４巻第ｅ１１号、および国際公開第２００７／０６３９１９号等に記載）を用いることにより遺伝子を欠失させることができる。また、変異剤を用いた突然変異分離法（酵母分子遺伝学実験法、１９９６年、学会出版センター）や、ＰＣＲを利用したランダム変異法（ＰＣＲ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ａｐｐｌ．、１９９２年、第２巻、ｐ．２８−３３）等により遺伝子の一部に変異を導入することにより、該遺伝子を失活させることができる。特定遺伝子を欠失または失活させたシゾサッカロミセス属酵母宿主としては、たとえば、国際公開第２００２／１０１０３８号、国際公開第２００７／０１５４７０号等に記載されている。
【０１０６】
さらに宿主となるシゾサッカロミセス属酵母には、形質転換体を選択するためのマーカーを有するものを用いることが好ましい。たとえば、ある遺伝子が欠落していることにより特定の栄養成分が生育に必須である宿主を使用することが好ましい。目的遺伝子配列を含むベクターにより形質転換をして形質転換体を作製する場合、ベクターにこの欠落している遺伝子（栄養要求性相補マーカー）を組み込んでおくことにより、形質転換体は宿主の栄養要求性が消失する。この宿主と形質転換体の栄養要求性の相違により、両者を区別して形質転換体を得ることができる。栄養要求性相補マーカーとしては、たとえば、ｕｒａ４遺伝子（栄養要求性相補マーカー）、イソプロピルリンゴ酸デヒドロゲナーゼ遺伝子（ｌｅｕ１遺伝子）等が挙げられる。
【０１０７】
宿主として用いるシゾサッカロミセス属酵母としては、前記で挙げられた種のものを利用することができる。上記シゾサッカロミセス属酵母のうち、種々の有用な変異株が利用できることから、Ｓ．ポンベが好ましい。本発明で用いるＳ．ポンベの菌株としては、たとえばＡＴＣＣ３８３９９（ｌｅｕ１−３２ｈ−）またはＡＴＣＣ３８４３６（ｕｒａ４−２９４ｈ−）等が挙げられ、これらは、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション（Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ）から入手できる。
また、β−グルコシダーゼ遺伝子以外の外来構造遺伝子を有する発現ベクターを導入する場合であっても、前記第一の態様の本発明におけるＳ．ポンベ変異体を宿主として使用することもできる。
【０１０８】
発現ベクターを用いて宿主であるシゾサッカロミセス属酵母を形質転換する、形質転換方法は、公知のシゾサッカロミセス属酵母の形質転換方法をいずれも用いることができる。そのような形質転換方法としては、たとえば、酢酸リチウム法［K. Okazaki et al., Nucleic Acids Res., 18, 6485-6489 (1990)］、エレクトロポレーション法、スフェロプラスト法、ガラスビーズ法など従来周知の方法や、特開２００５−１９８６１２号公報記載の方法などを挙げることができる。また、市販の酵母形質転換用キットを用いてもよい。
【０１０９】
形質転換を行った後、通常は得られた形質転換体を選抜する。選抜方法としては、たとえば、以下に示す方法が挙げられる。前記栄養要求性マーカーにより形質転換体を選択できる培地によりスクリーニングし、得られたコロニーから複数を選択する。その他、それら選抜した形質転換体に対してパルスフィールドゲル電気泳動法によるゲノム解析を行うことにより、染色体に組み込まれたベクターの数や発現カセットの数を調べることができる。
【０１１０】
（培養方法）
第二の態様の本発明に係る形質転換体は、天然のシゾサッカロミセス属酵母と同様に培養することができる。該培養方法としては、前記第一の態様の形質転換体の培養方法と同様の方法が挙げられる。具体的には、ＹＰＤ培地等の栄養培地（M.D.Rose et al.,  "Methods In Yeast Genetics",Cold Spring Harbor LabolatoryPress(1990)）またはＭＢ培地等の最少培地（K.Okazaki et al.,Nucleic Acids  Res.,  vol.18, p.6485-6489 (1990)）等を使用できる。
【０１１１】
培養には公知の酵母培養方法を用いることができ、たとえば振盪培養、攪拌培養等により行うことができる。
また、培養温度は、２３〜３７℃であることが好ましい。また、培養時間は適宜決定することができる。
また、培養は、回分培養であってもよく、流加培養または連続培養であってもよい。
【０１１２】
［外来蛋白質の生産方法］
第二の態様の本発明に係る蛋白質の生産方法は、前記第二の態様の本発明に係る形質転換体を培養し、得られた菌体または培養液上清から、前記外来構造遺伝子がコードする蛋白質を取得することを特徴とする。
【０１１３】
培養条件は、生産させる目的の外来蛋白質の種類等を考慮して適宜設定することができる。たとえば、１６〜４２℃、好ましくは２５〜３７℃で、８〜１６８時間、好ましくは４８〜９６時間行う。振盪培養と静置培養のいずれも可能であるが、必要に応じて撹拌や通気を加えてもよい。
【０１１４】
第二の態様の本発明に係る形質転換体がｈｓｐ９プロモーターを有する発現ベクターを導入した形質転換体の場合、その形質転換体を熱ストレスなどの誘導刺激を与えた条件下で培養すると、ｈｓｐ９プロモーターが該ストレスにより活性化してそれに支配された外来構造遺伝子の転写が促進され、該外来蛋白質が発現する。この誘導刺激条件下の培養では、通常の条件下での培養に比較してシゾサッカロミセス属酵母の増殖量は少なくなるのが通例である。このため、培養開始時には通常の条件で培養を行い、有る程度培養液中の菌体濃度が高くなった時点で、熱ストレスなどの誘導刺激を与える。これにより、前段の培養により細胞量が多くなっていることにより、培養システム全体として多量の異種蛋白質が産生される。ここで熱ストレスは、誘導刺激の一つであり、誘導刺激は種々効果を確認することによってその他の手段も利用可能である。誘導刺激の手段としては、好適には、熱、カドミウム、浸透圧上昇剤、過酸化水素、エタノール等の添加によって達成できる。
【０１１５】
熱による場合、熱ストレスを与える温度の上限はシゾサッカロミセス属酵母の生存可能な最高温度となる温度である。したがって、熱ストレス時の培養温度は、熱ストレスを与える前の培養温度に対して好ましくは２〜２０℃、より好ましくは３〜１２℃、最も好ましくは４〜６℃、高い温度であって、かつ、１５〜５５℃、好ましくは２５〜４５℃、より好ましくは３０〜４０℃である。熱ストレスを与える時間は、特に制限されるものではないが、数分以上で効果が確認でき、１〜２９時間、好適には１〜１５時間である。
カドミウム添加による場合は、カドミウムイオンとして添加する。カドミウムの最終濃度は、０．１〜１．５ｍＭまで、より好ましくは０．５〜１．０ｍＭまでである。培養する時間は、好適には５時間まで、より好ましくは３時間までである。
浸透圧上昇剤の場合は、高濃度の電解質やソルビトールなどの浸透圧上昇剤を添加して浸透圧を高める。高濃度の塩化カリウムの場合、カリウムの最終濃度は、０．１〜２．０Ｍまで、より好ましくは０．５〜１．５Ｍまでである。添加する時間は、特に制限されないが好適には１〜１２時間まで、より好ましくは１〜１０時間程度である。
過酸化水素の場合は、その最終濃度は、０．１〜１．５ｍＭまで、より好ましくは０．５〜１．０ｍＭまでである。培養する時間は、特に制限されないが好適には１〜１５時間まで、より好ましくは１〜１２時間程度である。
エタノールの場合は、その最終濃度は、５〜２０Ｖ／Ｖ％まで、より好ましくは５〜１５Ｖ／Ｖ％までである。培養する時間は、特に制限されないが、好適には１〜２０時間まで、より好ましくは１〜１５時間程度である。
上記の条件は、単独でまたは複数組み合わせて処理を行なってもよい。組み合わせ効果は、発現量を比較することで容易に確認可能である。
【０１１６】
第二の態様の本発明に係る形質転換体がｉｈｃ１プロモーターを有する発現ベクターを導入した形質転換体の場合、培養開始時点のように菌体密度が低い状態で培養を行うと、外来蛋白質は発現されることはない、もしくは非常に少量しか発現しない。つまり、該形質転換体は、菌体密度が低い状態では外来蛋白質の発現という負荷のない（もしくは小さい）状態で増殖できるため、負荷がある場合に比較して増殖の効率が高く、細胞量を効率的に増大することができる。一方で、菌体密度が高くなるに従い、発現が誘導されるようになる結果、大量の外来蛋白質を生産することができる。
【０１１７】
培養終了後、超音波破砕や機械的破砕により、菌体から目的の外来蛋白質を含む細胞抽出液を調製し、該細胞抽出液から外来蛋白質を単離・精製法できる。また、外来蛋白質が細胞外に分泌される場合は、培養液上清から外来蛋白質を単離・精製法できる。これらの生産された蛋白質を取得するための単離・精製法としては、公知の、塩析または溶媒沈澱法等の溶解度の差を利用する方法、透析、限外濾過またはゲル電気泳動法等の分子量の差を利用する方法、イオン交換クロマトグラフィー等の荷電の差を利用する方法、アフィニティークロマトグラフィー等の特異的親和性を利用する方法、逆相高速液体クロマトグラフィー等の疎水性の差を利用する方法、等電点電気泳動法等の等電点の差を利用する方法等が挙げられる。
【０１１８】
単離・精製した蛋白質の確認方法としては、公知のウエスタンブロッティング法または活性測定法等が挙げられる。精製された蛋白質は、アミノ酸分析、アミノ末端分析、一次構造解析などによりその構造を明らかにすることができる。
【実施例】
【０１１９】
以下、実施例および比較例を示して本発明を詳細に説明する。ただし、本発明は以下の記載によっては限定されない。【０１２０】
［試験例１］発現ベクターの作製１
既知のＡａＢＧＬ１のペプチド配列から、Ｓ．ポンベの高発現型コドンで置き換えた遺伝子配列を設計した(配列番号２参照。以下、ＡａＢＧＬ１遺伝子と称する)。開始コドン前にＫｐｎＩ，ＢｓｐＨＩ認識配列を付加した。終止コドン後にＸｂａＩ，ＳａｃＩ認識配列を付加した。この配列を含んだプラスミド（ジーンアート社、レーゲンスブルク、ドイツ、にて合成）を制限酵素ＢｓｐＨＩ,ＸｂａＩで消化した。
一方、これとは別にｐＳＬ６ｌａｃＺを制限酵素ＡａｒＩ,ＸｂａＩで消化し、アルカリフォスファターゼ処理した。この処理後、アガロースゲル上で電気泳動し、ベクターｐＳＬ６断片と、上記のＡａＢＧＬ１遺伝子断片をアガロースゲルから切出し、ライゲーションした後、大腸菌ＤＨ５α（タカラバイオ社製）に導入して形質転換した。得られた形質転換体よりベクターを調製し、目的とする発現ベクターｐＳＬ６ＡａＢＧＬ１(図１、配列番号３参照)を取得した。制限酵素地図の作製から目的とするベクターであることを確認した。
また、分泌シグナルであるＰ３シグナルをＮ末端に付加したＡａＢＧＬ１の作製のため、ｐＳＬ６ＡａＢＧＬ１を鋳型としてＩｎ−ｆｕｓｉｏｎプライマーを用いてＰＣＲ法によりＡａＢＧＬ１遺伝子断片を増幅した。一方、ｐＳＬ６Ｐ３ｌａｃＺを制限酵素ＡｆｌＩＩ，ＸｂａＩで消化した。この断片とＰＣＲによって得られた上記ＡａＢＧＬ１遺伝子断片とをＩｎ−ｆｕｓｉｏｎ法により環状化した後、大腸菌ＤＨ５αに導入して形質転換した。得られた形質転換体よりベクターを調製し、目的とする発現ベクターｐＳＬ６Ｐ３ＡａＢＧＬ１(図２、配列番号４参照)を取得した。制限酵素地図の作製および部分塩基配列の確認から目的とするベクターであることを確認した。【０１２１】
［試験例２］発現ベクターの作製２
また、ｈｓｐ９プロモーターを用いたＡａＢＧＬ１発現ベクター作製のため、ｐＳＬ６Ｐ３ＡａＢＧＬ１を鋳型としてＩｎ−ｆｕｓｉｏｎプライマーを用いてＰＣＲ法によりＰ３ＡａＢＧＬ１遺伝子断片を増幅した。一方、ｈｓｐ９プロモーターを持つ下記ｐＳＬ１４ｌａｃＺを制限酵素ＡａｒＩ，Ｘｂａ１で消化した。この断片とＰＣＲによって得られた上記Ｐ３ＡａＢＧＬ１遺伝子断片とをＩｎ−ｆｕｓｉｏｎ法により環状化した後、大腸菌ＤＨ５αに導入して形質転換した。得られた形質転換体よりベクターを調製し、目的とする発現ベクターｐＳＬ１４Ｐ３ＡａＢＧＬ１(図３、配列番号５参照)を取得した。制限酵素地図の作製および部分塩基配列の確認から目的とするベクターであることを確認した。【０１２２】
＜マルチクローニングベクターの作製＞
マルチクローニングベクターｐＳＬ９（図２４、７０３８ｂｐ）のプロモーター領域（図２４中、「ｉｎｖ１  ｐｒｏ．」）を、Ｓ．ｐｏｍｂｅのｈｓｐ９プロモーター(配列番号６)と置換することにより、マルチクローニングベクターｐＳＬ１４（図２５、６２８２ｂｐ）を作製した。
具体的には、まず、Ｓ．ｐｏｍｂｅのｈｓｐ９遺伝子中、ＯＲＦの５’末端（開始コドンＡＴＧのＡ）の上流１〜４００ｂｐの領域（配列番号６）を、Ｓ．ｐｏｍｂｅの野生株（ＡＲＣ０３２株、ＡＴＣＣ３８３６６、９７２ｈ−相当）由来のゲノムＤＮＡを鋳型とし、５’末端にＳａｃＩの制限酵素部位を備えるフォワードプライマーと、５’末端にＰｃｉＩの制限酵素部位を備えるリバースプライマーとを用いたＰＣＲによって増幅し、該領域の５’末端にＳａｃＩ、３’末端にＰｃｉＩの制限酵素部位を備えるフラグメントを得た。
ｐＳＬ９のプロモーター部分を制限酵素ＡａｒＩならびにＳａｃＩで二重消化し、ライゲーション、続く大腸菌ＤＨ５への形質転換後、プラスミドを抽出し、塩基配列の確認を行った。この結果、得られたプラスミドは、３’末端にアデニンが１つ追加されているものの、配列番号６で表される塩基配列を含むプロモーター領域を有することが確認された。該プラスミドをｐＳＬ１４とした。
次いで、ｐＳＬ１４のアンピシリン耐性遺伝子およびｐＢＲ３２２ｏｒｉを含む領域を、カナマイシン耐性遺伝子およびｐＵＣｏｒｉを含む領域へと置換し、クローニングサイトにｌａｃＺ'をコードする構造遺伝子を組み込むことにより、マルチクローニングベクターｐＳＬ１４ｌａｃＺ（図２６、６６７５ｂｐ、配列番号７参照）を作製した。【０１２３】
［試験例３］形質転換体の作製(分裂酵母への形質転換)
宿主としてＳ．ポンベのロイシン要求株（遺伝子型：ｈ−、ｌｅｕ１−３２、東京大学大学院理学系研究科付属遺伝子実験施設・飯野雄一教授より供与）（ＡＴＣＣ３８３９９）をＹＥＳ（０．５％ 酵母エキス，３％グルコース, ０．１ｍｇ／ｍＬ  ＳＰサプリメント)培地で０．６×１０７細胞数／ｍＬになるまで生育させた。集菌、洗浄後１．０×１０８細胞数／ｍＬになるように０．１Ｍ酢酸リチウム（ｐＨ５．０）に懸濁した。その後、懸濁液１００μＬに上記で得られたベクターｐＳＬ１４Ｐ３ＡａＢＧＬ１を制限酵素ＳｗａＩで消化したもの１μｇを加え、さらに５０％（ｗ／ｖ）ポリエチレングリコール（ＰＥＧ４０００）水溶液を２９０μＬ加えてよく撹拌した後、３０℃で６０分間、４２℃で５分間、室温で１０分間の順にインキュベートした。遠心によりＰＥＧ４０００を除去し、洗浄後１５０μＬの滅菌水に懸濁し、最少寒天培地に塗布した。３日後、形質転換体(ＡａＢＧＬ１発現株)が得られた。この形質転換体をＡＳＰ３６６０株（以下、通常株ともいう）とした。【０１２４】
［試験例４］Δｐｖｇ１株（ｐｖｇ１遺伝子欠損株）の作製
Ｓ．ポンベのウラシル要求性株（ＡＲＣ０１０、遺伝子型：ｈ−  ｌｅｕ１−３２  ｕｒａ４−Ｄ１８、東京大学大学院理学系研究科附属遺伝子実験施設・飯野雄一教授より供与）をＬａｔｏｕｒ法（Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．誌、２００６年、３４巻、ｅ１１頁、国際公開第２００７／０６３９１９号パンフレットに記載）に従って形質転換し、ｐｖｇ１遺伝子を削除したΔｐｖｇ１株を作製した。得られた変異体を培養し、パルスフィールドゲル電気泳動法によるゲノム解析を行い、ｐｖｇ１遺伝子が欠損したことを確認した。【０１２５】
削除断片の作製には、Ｓ．ポンベの野生株であるＡＲＣ０３２株（遺伝子型：ｈ−、東京大学大学院理学系研究科附属遺伝子実験施設・飯野雄一教授より供与）よりＤＮｅａｓｙ（キアゲン社製）によって調製した全ゲノムＤＮＡを鋳型とし、ＰＣＲ法により行った。
より具体的には、削除断片をＵＰ領域、ＯＬ領域、およびＤＮ領域に分け、各領域のＤＮＡ断片をそれぞれＫＯＤ−Ｄａｓｈ（東洋紡社製）を用いたＰＣＲ法によって作製したのち、さらにそれらを鋳型として、同様のＰＣＲ法によって全長の削除断片を作製した。【０１２６】
［試験例５］Δｐｖｇ１ｇｓｆ２＋株（ｐｖｇ１遺伝子欠損＋ｇｓｆ２遺伝子発現増大株）の作製
上記のΔｐｖｇ１株をＹＥＳ(０．５％ 酵母エキス，３％ グルコース, ０．１ｍｇ／ｍＬ ＳＰサプリメント)培地で０．６×１０７細胞数／ｍＬになるまで生育させた。集菌、洗浄後１．０×１０８細胞数／ｍＬになるように０．１Ｍ 酢酸リチウム（ｐＨ５．０）に懸濁した。その後、懸濁液１００μＬに下記ｉｈｃ１プロモーターとｇｓｆ２遺伝子を含む遺伝子断片（配列番号８参照）１μｇを加え、さらに５０％（ｗ／ｖ） ポリエチレングリコール（ＰＥＧ４０００）水溶液を２９０μＬ加えてよく撹拌した後、３０℃で６０分間、４２℃で５分間、室温で１０分間の順にインキュベートした。遠心によりＰＥＧ４０００を除去し、洗浄後１５０μＬの滅菌水に懸濁し、ロイシン含有最少寒天培地に塗布した。３日後、形質転換体(ｐｖｇ１遺伝子欠損＋ｇｓｆ２遺伝子発現増大株)が得られた。その後ＦＯＡ処理を行い、再度ウラシル要求性を持たせた。この変異体をＩＧＦ７９９株とした。
前記ｉｈｃ１プロモーターとｇｓｆ２遺伝子を含む遺伝子断片は、以下の様に作製した。まず、ｉｈｃ１プロモーター（配列番号９参照）の５’−末端側にｇｓｆ２プロモーター配列とＵｒａ４配列とを含み、３’−末端側にｇｓｆ２−ＯＲＦを含む配列を鋳型とし、上記遺伝子断片をＰＣＲによって増幅した。【０１２７】
［試験例６］形質転換体の作製(非性的凝集性分裂酵母への形質転換)
宿主として非性的凝集性を有するＳ．ポンベの上記ＩＧＦ７９９株をＹＥＳ(０．５％酵母エキス，３％ グルコース, ０．１ｍｇ／ｍＬ ＳＰサプリメント)培地で０．６×１０７細胞数／ｍＬになるまで生育させた。集菌、洗浄後１．０×１０８細胞数／ｍＬになるように０．１Ｍ 酢酸リチウム（ｐＨ５．０）に懸濁した。その後、懸濁液１００μＬに上記で得られたベクターｐＳＬ１４Ｐ３ＡａＢＧＬ１を制限酵素ＳｗａＩで消化したもの１μｇを加え、さらに５０％（ｗ／ｖ） ポリエチレングリコール（ＰＥＧ４０００）水溶液を２９０μＬ加えてよく撹拌した後、３０℃で６０分間、４２℃で５分間、室温で１０分間の順にインキュベートした。遠心によりＰＥＧ４０００を除去し、洗浄後１５０μＬの滅菌水に懸濁し、ウラシル含有最少寒天培地に塗布した。３日後、形質転換体(ＡａＢＧＬ１発現株)が得られた。この形質転換体をＡＳＰ４１０６株とした。【０１２８】
［試験例７］形質転換体の作製（ウラシル要求性補完）
上記で作製したＡＳＰ４１０６株をＹＥＳ（０．５％酵母エキス，３％グルコース，０．１ｍｇ／ｍＬ ＳＰサプリメント)培地で０．６×１０７細胞数／ｍＬになるまで生育させた。集菌、洗浄後１．０×１０８細胞数／ｍＬになるように０．１Ｍ 酢酸リチウム（ｐＨ５．０）に懸濁した。その後、懸濁液１００μＬにベクターｐＵＣ１９−ｕｒａ４(図４、配列番号１０参照)を制限酵素ＢｓｉｗＩで消化したもの１μｇを加え、さらに５０％  （ｗ／ｖ） ポリエチレングリコール（ＰＥＧ４０００）水溶液を２９０μＬ加えてよく撹拌した後、３０℃で６０分間、４２℃で５分間、室温で１０分間の順にインキュベートした。遠心によりＰＥＧ４０００を除去し、洗浄後１５０μＬの滅菌水に懸濁し、最少寒天培地に塗布した。図４中、ＡおよびＢの配列は、ベクターの組換え部位を表す。３日後、形質転換体が得られた。このＡＳＰ４１０６株のウラシル要求性が補完された形質転換体をＡＳＰ４１５０株（以下、凝集株ともいう）とした。【０１２９】
［試験例８］形質転換体のバッチ培養
上記で得られたＡａＢＧＬ１発現株（通常株および凝集株）をＹＥＳ培地で、試験管にて３２℃２４時間培養した。この培養液２ｍＬを５０ｍＬのＹＰＤ培地(１％酵母エキス，２％ペプトン，２％グルコース)に植継ぎ、５００ｍＬの三角フラスコにて３２℃で４８時間本培養を行った。【０１３０】
形質転換体の菌体増殖を評価するために、培養液のＯＤ６６０ｎｍにおける吸光度を分光光度計（Ｓｐｅｃｔｒｏｐｈｏｔｏｍｅｔｅｒ  Ｕ−１５００）を用いて測定した。培養液原液の濃度が高い場合には, ＲＯ（ＲｅｖｅｒｓｅＯｓｍｏｓｉｓ；逆浸透）水により希釈を行い測定した。凝集株のＯＤ６６０測定の際は、１００〜５００ｍＭのＥＤＴＡで懸濁し、凝集性を解いた後に測定を行った。
菌体増殖の結果を図５に示す。通常株および凝集株において、培養中のＯＤ６６０値の経時変化は、概ね同様の挙動を示し最終ＯＤ６６０値は通常株で２３．４、凝集株で２０．３を示した。【０１３１】
培養液中の残存グルコース濃度、および、その代謝産物であるエタノール濃度をバイオセンサＢＦ５にて測定した。採取した培養液をエッペンドルフチューブに入れ，高速微量遠心機を用い、遠心分離を行い、培養上清を得た。この培養上清３００μＬをＢＦ５サンプルカップに入れ、事前に測定準備の整ったＢＦ５オートサンプラー内に入れた。
以下に示すバイオセンサ運転条件でＢＦ５を運転し分析を行った。【０１３２】
使用機器： バイオセンサＢＦ５（王子計測機器）
流速： １．０ ｍＬ／ｍｉｎ
注入量： ５μＬ
恒温槽温度： ３７℃
計測時間:  ９０ 秒
濃度定量法: グルコースおよびエタノールの酵素分解により発生した過酸化水素を検出し、標準液のピーク高を基準に算出した。【０１３３】
培養液中の残存グルコース濃度の結果を図６（ａ）に示し、該グルコースの代謝産物であるエタノール濃度の結果を図６（ｂ）に示す。通常株および凝集株において、培養中のグルコース濃度およびエタノール濃度の経時変化は、概ね同様の挙動を示した。【０１３４】
通常株および凝集株において、培養中のＯＤ６６０値、グルコース濃度およびエタノール 濃度の経時変化もそれぞれの株で同様に推移した。このことから、同一の培養条件とすることで、通常株および凝集株は概ね同じ速度で糖の代謝および菌体の増殖が進んだと推測される。遺伝子操作によって凝集性を付与したことによる菌体増殖性への影響は小さいと考えられる。【０１３５】
［試験例９］活性測定によるＡａＢＧＬ１の発現確認
上記で得られたＡａＢＧＬ１発現株の培養上清を用いて、酵素希釈サンプルを調製し、下記方法にしたがって活性測定を行った。
（活性測定法）
２０ｍＭ ｐ−ニトロフェニル−β−Ｄ−グルコシド(以下、ｐＮＰＧと略す) １０μＬに、１Ｍ 酢酸ナトリウム緩衝液(ｐＨ４．５)１０μＬと水１３０μＬを加え、酵素希釈サンプル５０μlを添加して、３７℃で１０分間反応させた。２％ 炭酸ナトリウム液１００μＬに反応液１００μＬを加えて反応停止させ、遊離したｐ−ニトロフェノール量を波長４５０ｎｍで比色定量した。
１分間当たり、１μｍｏｌに相当するｐ−ニトロフェノールを生成する酵素量を１Ｕとした。通常株および凝集株における培養上清１ｍＬ当たりのｐＮＰＧ分解活性（以下、ｐＮＰＧ活性ともいう）を図７に示す。【０１３６】
図７に示すように、ｐＮＰＧ 分解活性値は、グルコース枯渇直後である培養１５．５時間後において、凝集株では通常株の１．３８倍の活性値を示し、培養４８時間後において、凝集株で通常株の１．２７倍の活性値を示した。【０１３７】
［試験例１０］形質転換体のフェッドバッチ培養
５ｍＬ ＹＥＳ培地に、通常株または凝集株を植菌し、試験管にて３２℃で２４時間前培養１を行った。さらに、２００ｍＬ ＹＥＳ培地に、前培養１で得られた培養液４ｍＬを加え、１Ｌ坂口フラスコにて３０℃で２４時間前培養２を行った。
次いで、５Ｌジャーファーメンターを用いて、表１に示す成分からなる初発培地１８００ｍＬに、前培養２で得られた培養液２００ｍＬを加え、３０℃で培養を開始した。尚、表１の各成分の濃度は、前培養２植菌後の濃度を示す。培養開始から１４．０時間後に、培養液中の残存グルコース濃度が１．０ｇ／Ｌを下回ったことを確認し流加を開始した。その後、８１時間流加を継続し、表２に示す組成の流加培地１４５０ｍＬを流加し、３０℃で９５時間（培養開始時からの培養時間を示す）培養した。１２．５％アンモニア水の添加制御により、ｐＨを４．５に保った。【０１３８】
【表１】
2014030644.tif 000003
【０１３９】
【表２】
2014030644.tif 000004
【０１４０】
形質転換体の菌体増殖を評価するために、培養液のＯＤ６６０ｎｍにおける吸光度を分光光度計（Ｓｐｅｃｔｒｏｐｈｏｔｏｍｅｔｅｒ  Ｕ−１５００）を用いて測定した。培養液原液の濃度が高い場合には, ＲＯ水により希釈を行い測定した。凝集株のＯＤ６６０ｎｍ測定の際は、１００〜５００ｍＭのＥＤＴＡで懸濁し、凝集性を解いた後に測定を行った。
菌体増殖の結果を図８に示す。通常株および凝集株において、培養中のＯＤ６６０値の経時変化は、概ね同様の挙動を示した。最終ＯＤ６６０値は通常株で３７６、凝集株で３９５であり、天然由来物としてＹｅａｓｔ Ｅｘｔｒａｃｔを合成培地に添加した半合成培地にて高菌体濃度に達した。
培養液中の残存グルコース濃度、および、その代謝産物であるエタノール濃度を試験例８と同様の方法にて測定した。【０１４１】
培養液中の残存グルコース濃度の結果を図９（ａ）に示し、該グルコースの代謝産物であるエタノール濃度の結果を図９（ｂ）に示す。通常株および凝集株において、培養中のグルコース濃度およびエタノール濃度の経時変化は、概ね同様の挙動を示した。流加開始後のグルコース濃度は、１ｇ／Ｌ 以下の低値で推移した。培養中のエタノール濃度は、バッチ培養の段階で発生したエタノールが流加開始後に減少し、最終的に１ｇ／Ｌ以下の低値で推移した。流加開始後、フェドバッチ培養終了まで、エタノール生産フェーズとなるグルコースエフェクトが起こることはなかった。【０１４２】
通常株および凝集株において、培養中のＯＤ６６０値、グルコース濃度およびエタノール濃度の経時変化は、それぞれの株で同様に推移した。このことから、同一の培養条件とすることで、通常株および凝集株は概ね同じ速度で糖の代謝および菌体の増殖が進んだと推測される。遺伝子操作によって凝集性を付与したことによる菌体増殖性への影響は小さいと考えられる。【０１４３】
［試験例１１］沈降速度の測定
試験例１０で得られたフェドバッチ培養終了時のサンプル各１Ｌを１Ｌメスシリンダーにて沈降速度を比較した。各メスシリンダーを充分に懸濁させた後、静置して沈降を開始させた。液表面から固液界面（沈降した酵母菌体と上清との界面）までの距離を沈降開始からの経過時間で除することにより、沈降速度を算出した。結果を図１０に示す。
図１０に示すように、凝集株では通常株と比較して、沈降速度が速いことが確認された。凝集株の沈降速度は、沈降開始２時間後の時点で３０ｍｍ／ｈ、さらに１０時間後（沈降開始１２ 時間後）の時点で６．７ｍｍ／ｈであった。一方、通常株の沈降速度は、沈降開始１２ 時間後の時点で１．５ｍｍ／ｈであった。【０１４４】
また、図１１にフェッドバッチ培養終了時のサンプルの検鏡観察結果（トリパンブルー染色結果）を示す。図１１に示すように、フェドバッチ培養終了時サンプルの検鏡観察結果から、凝集株では数多くの菌体が集合して凝集している様子が確認され、フェドバッチ培養により菌体の凝集性が消失することは無かった。通常株では、菌体の凝集は見られず分散している様子が観察された。【０１４５】
［試験例１２］培養温度最適化検討（フェドバッチ培養）
５ｍＬ ＹＥＳ培地に、通常株（ＡＳＰ３６６０株）を植菌し、Ｌ型試験管にて３０℃で２４時間前培養１を行った。さらに、１２０ｍＬ ＹＥＳ培地に、前培養１で得られた培養液２．４ｍＬを加え、５００ｍＬ坂口フラスコにて３０℃で２４時間前培養２を行った。
次いで、３Ｌジャーファーメンターを用いて、初発培地１０８０ｍＬに、前培養２で得られた培養液１２０ｍＬを加え、培養を開始した。２基の培養槽で温度条件を３０℃および３４℃の２条件振って実施した。初発培地組成は、表１に示す組成からＹｅａｓｔ  ｅｘｔｒａｃｔ、塩化コリン、葉酸、ピリドキシン、チアミン、チミジン、リン酸リボフラビンナトリウムおよびｐ−アミノ安息香酸を除いた培地を用いた。なお、表１の各成分の濃度は、前培養２植菌後の濃度を示す。培養開始から１１．８時間後に流加を開始した。その後、８４．２時間流加を継続し、表２に示す組成の流加培地６８５ｍＬを流加し、３０℃および３４℃で９６時間（培養開始時からの培養時間を示す）培養した。流加培地も同様に、表２に示す組成からＹｅａｓｔ  ｅｘｔｒａｃｔ、塩化コリン、葉酸、ピリドキシン、チアミン、チミジン、リン酸リボフラビンナトリウムおよびｐ−アミノ安息香酸を除いた培地を用いた。１２．５％アンモニア水の添加制御により、ｐＨを４．５に保った。【０１４６】
形質転換体の菌体増殖を評価するために、培養液のＯＤ６６０ｎｍの値を試験例８と同様の方法にて測定した。菌体増殖の結果を図１２に示す。３０℃および３４℃において、培養中のＯＤ６６０値の経時変化は、概ね同様の挙動を示した。最終ＯＤ６６０値は、３０℃で２９５、３４℃で２７１とそれぞれ高菌体濃度に達した。【０１４７】
培養液中の残存グルコース濃度、およびその代謝産物であるエタノール濃度を、試験例８と同様の方法にて測定した。培養液中の残存グルコース濃度の結果を図１３Ａに示し、該グルコースの代謝産物であるエタノール濃度の結果を図１３Ｂに示す。３０℃および３４℃において、培養中のグルコース濃度およびエタノール濃度の経時変化は、概ね同様の挙動を示した。培養２４時間後以降のグルコース濃度は、１ｇ／Ｌ以下の低値で推移した。培養中のエタノール濃度は、バッチ培養で発生したエタノールが流加開始後に減少し、最終的に２ｇ／Ｌ以下の低値で推移した。【０１４８】
培養液中のｐＮＰＧ分解活性を試験例９と同様の方法にて測定した。３０℃および３４℃における培養上清１ｍＬ当たりのｐＮＰＧ分解活性の結果を図１４に示す。ｐＮＰＧ 分解活性値は、培養終了時である培養９６時間後において、３４℃では３０℃での２．２６倍の活性値を示した。【０１４９】
［試験例１３］ＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析によるＡａＢＧＬ１の発現確認
試験例１２で得られたフェドバッチ培養終了時の培養上清サンプル各５μＬをＳＤＳ−ＰＡＧＥサンプルバッファーに溶解させ、４−１２％アクリルアミドゲルを用いてＳＤＳ−ＰＡＧＥを行い、クマシーブリリアントブルーで染色した。得られた結果を図１５に示す。ＳＤＳ−ＰＡＧＥの結果から、培養終了時である培養９６時間後において、３４℃では、３０℃と比較して１２０ｋＤａ以上の分子量にみられるＡａＢＧＬ１のバンドの強度が強く、ＡａＢＧＬ１の分泌発現量が増加していることを示した。ＡａＢＧＬ１に糖鎖が付加されたことにより、スメアなバンドとして確認された。
［試験例１４］ｈｓｐ９プロモーターによる蛋白質生産
＜発現ベクターの作製＞
ＧＦＰ遺伝子を含むｐＥＧＦＰ−Ｎ１（ＣＬＯＮＴＥＣＨ社製）を鋳型としてＩｎ−ｆｕｓｉｏｎプライマーを用いてＰＣＲ法によりＥＧＦＰ遺伝子のＯＲＦ断片を増幅した。一方、ｐＳＬ１４を制限酵素ＡｆｌＩＩおよびＸｂａＩで二重消化した。得られた断片とＰＣＲによって得られた上記ＥＧＦＰ遺伝子のＯＲＦ断片とをＩｎ−ｆｕｓｉｏｎ法により環状化した後、大腸菌ＤＨ５αに導入して形質転換した。得られた形質転換体よりベクターを調製し、目的とする発現ベクターｐＳＬ１４−ＥＧＦＰ(図１６)を取得した。制限酵素地図の作製および部分塩基配列の確認から目的とするベクターであることを確認した。
同様にして、ｐＳＬ６にＥＧＦＰ遺伝子のＯＲＦ断片を組み込んだベクターｐＳＬ６−ＥＧＦＰ（図１７）を作製し、対照とした。【０１５０】
＜形質転換体の作製＞
宿主としてシゾサッカロミセス・ポンベのロイシン要求株（遺伝子型：ｈ−、ｌｅｕ１−３２、東京大学大学院理学系研究科付属遺伝子実験施設・飯野雄一教授より供与）（ＡＴＣＣ３８３９９)をＹＥＳ(０．５％酵母エキス、３％グルコース、０．１ｍｇ／ｍＬ  ＳＰサプリメント)培地で０．６×１０７細胞数／ｍＬになるまで生育させた。集菌、洗浄後１．０×１０８細胞数／ｍＬになるように０．１ｍ 酢酸リチウム（ｐＨ５．０）に懸濁した。その後、懸濁液１００μＬに上記で得られた発現ベクターｐＳＬ１４−ＥＧＦＰを制限酵素ＮｏｔＩで消化したもの１μｇを加え、さらに５０％（ｗ／ｖ）ポリエチレングリコール（ＰＥＧ４０００)水溶液を２９０μＬ加えてよく撹拌した後、３０℃で６０分間、４２℃で５分間、室温で１０分間の順にインキュベートした。遠心によりＰＥＧ４０００を除去し、洗浄後１５０μＬの滅菌水に懸濁し、最少寒天培地に塗布した。
３日後、得られた形質転換体をＡＳＰ３３９５株とした。
同様にして、ｐＳＬ１４−ＥＧＦＰを導入して形質転換体ＳＬ１４Ｅ株を、ｐＳＬ６−ＥＧＦＰを導入して形質転換体ＳＬ６Ｅ株を得た。【０１５１】
＜ＥＧＦＰ発現＞
得られたＡＳＰ３３９５株を試験管内の５ｍＬのＹＥＳ培地に植菌し、３２℃で７０時間培養した。培養終了後の培養液の、４８８ｎｍで励起した場合の蛍光強度を測定した。
対照として、ＳＬ１４Ｅ株およびＳＬ６Ｅ株も同様の条件で培養し、培養終了後の培養液の蛍光強度を測定した。
測定結果を図１８に示す。この結果、ＳＬ６Ｅ株の培養液の蛍光強度を１とした場合、ＳＬ１４Ｅ株の蛍光強度（相対値）は０．５０でしかなかったが、ＡＳＰ３３９５株の蛍光強度（相対値）は１７．１７と非常に高かった。
培養液の蛍光強度は蛍光蛋白質ＥＧＦＰの発現量の指標であり、ｈｓｐ９プロモーターはシゾサッカロミセス属酵母内で非常に発現効率が高く、本発明の発現ベクターによって得られた形質転換体から外来蛋白質を他のプロモーターを用いた場合よりもより大量に生産し得ることが明らかである。【０１５２】
［試験例１５］ｉｈｃ１プロモーターによる蛋白質生産
＜マルチクローニングベクターの作製＞
単座組込型組換えベクターｐＳＬ１７を、以下に示す工程で作製した。すなわち、まず、公知の分裂酵母用組込型のマルチクローニングベクターｐＳＬ６（図１９、５９６０ｂｐ、配列番号１１）のｈＣＭＶプロモーター領域を、Ｓ．ポンベのｉｈｃ１遺伝子のプロモーター（ｉｈｃ１プロモーター）と置換することにより、マルチクローニングベクターｐＳＬ１２（図２０、５８４７ｂｐ）を作製した。
具体的には、まず、Ｓ．ポンベのｉｈｃ１遺伝子中、ＯＲＦの５’末端（開始コドンＡＴＧのＡ）の上流１〜５０１ｂｐの領域（配列番号９）を、Ｓ．ポンベの野生株（ＡＲＣ０３２株、ＡＴＣＣ３８３６６、９７２ｈ−相当）由来のゲノムＤＮＡを鋳型とし、５’末端にＢｌｎＩの制限酵素認識配列を備えるフォワードプライマー（ｉｈｃ１−ｐｒｏｍｏｔｅｒ−Ｆ：表３参照）と、５’末端にＫｐｎＩの制限酵素認識配列を備えるリバースプライマー（ｉｈｃ１−ｐｒｏｍｏｔｅｒ−Ｒ：表３参照）とを用いたＰＣＲによって増幅し、該領域の５’末端にＢｌｎＩ、３’末端にＫｐｎＩの制限酵素認識配列を備える断片（ｉｈｃプロモーター断片）を得た。
ｐＳＬ６を制限酵素ＢｌｎＩおよびＫｐｎＩで二重消化した断片に、ｉｈｃプロモーター断片を制限酵素ＢｌｎＩおよびＫｐｎＩで二重消化した断片をライゲーションにより組み込み、分裂酵母用組込型ベクターｐＳＬ１２（配列番号１４）を得た。【０１５３】
次いで、ｐＳＬ１２のＬＰＩターミネーター領域を、Ｓ．ポンベのｉｈｃ１遺伝子のターミネーター（ｉｈｃ１ターミネーター）と置換することにより、マルチクローニングベクターｐＳＬ１７（図２１、５８３１ｂｐ）を作製した。
具体的には、まず、Ｓ．ポンベのｉｈｃ１遺伝子中、ＯＲＦの３’末端（終止コドンの３文字目）の下流１〜２００ｂｐの領域（配列番号１５）を、Ｓ．ポンベの野生株（ＡＲＣ０３２株、ＡＴＣＣ３８３６６、９７２ｈ−相当）由来のゲノムＤＮＡを鋳型とし、Ｉｎ−ｆｕｓｉｏｎプライマー（ｉｈｃ１−ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒ−Ｆとｉｈｃ１−ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒ−Ｒ：表３参照）を用いたＰＣＲによって増幅し、ｉｈｃターミネーター領域を含む断片（ｉｈｃターミネーター断片）を得た。
ｐＳＬ１２を鋳型とし、Ｉｎ−ｆｕｓｉｏｎプライマー（ｐＳＬ１２−ＦとｐＳＬ１２−Ｒ：表３参照）を用いたＰＣＲによって増幅し、ｐＳＬ１２の全長からＬＰＩターミネーター領域を欠損させた断片を得、当該断片にｉｈｃターミネーター断片をＩｎ−ｆｕｓｉｏｎクローニングキット（製品名：In−Fusion HD Cloning Kit w/Cloning Enhancer、タカラバイオ社製）を用いて組み込み、マルチクローニングベクターｐＳＬ１７（配列番号２０）を作製した。【０１５４】
【表３】
2014030644.tif 000005
【０１５５】
＜発現ベクターの作製＞
ＧＦＰ遺伝子を含むｐＥＧＦＰ−Ｎ１（ＣＬＯＮＴＥＣＨ社製）を鋳型としてＩｎ−ｆｕｓｉｏｎプライマーを用いてＰＣＲ法によりＥＧＦＰ遺伝子のＯＲＦ断片を増幅した。一方、前記ｐＳＬ１２を制限酵素ＡｆｌＩＩおよびＸｂａＩで二重消化した。この断片とＰＣＲによって得られた上記ＥＧＦＰ遺伝子のＯＲＦ断片とをＩｎ−ｆｕｓｉｏｎ法により環状化した後、大腸菌ＤＨ５αに導入して形質転換した。得られた形質転換体よりベクターを調製し、目的とする発現ベクターｐＳＬ１２−ＥＧＦＰ（図２２）を取得した。制限酵素地図の作製および部分塩基配列の確認から目的とするベクターであることを確認した。
同様にして、前記ｐＳＬ６にＥＧＦＰ遺伝子のＯＲＦ断片をくみこんだベクターｐＳＬ６−ＥＧＦＰ（図１７）を作製し、対照とした。【０１５６】
＜形質転換体の作製＞
宿主としてシゾサッカロミセス・ポンベのロイシン要求株（遺伝子型：ｈ−、ｌｅｕ１−３２、東京大学大学院理学系研究科付属遺伝子実験施設・飯野雄一教授より供与）（ＡＴＣＣ３８３９９)をＹＥＳ(０．５％酵母エキス、３％グルコース、０．１ｍｇ／ｍＬ  ＳＰサプリメント)培地で０．６×１０７細胞数／ｍＬになるまで生育させた。集菌、洗浄後１．０×１０８細胞数／ｍＬになるように０．１ｍ 酢酸リチウム（ｐＨ５．０）に懸濁した。その後、懸濁液１００μＬに上記で得られた発現ベクターｐＳＬ１２−ＥＧＦＰを制限酵素ＮｏｔＩで消化したもの１μｇを加え、さらに５０％（ｗ／ｖ）ポリエチレングリコール（ＰＥＧ４０００)水溶液を２９０μＬ加えてよく撹拌した後、３０℃で６０分間、４２℃で５分間、室温で１０分間の順にインキュベートした。遠心によりＰＥＧ４０００を除去し、洗浄後１５０μＬの滅菌水に懸濁し、最少寒天培地に塗布した。
３日後、得られた形質転換体を２７７Ｇ株とした。
同様にして、ｐＳＬ６−ＥＧＦＰを導入して形質転換体ＳＬ６Ｅ株を得た。【０１５７】
＜ＥＧＦＰ発現＞
得られた２７７Ｇ株を試験管内の５ｍＬのＹＥＳ培地に植菌し、３２℃で７２時間培養した。培養開始から培養終了後まで、培養液の４８８ｎｍで励起した場合の蛍光強度および６００ｎｍの吸光度を経時的に測定した。
対照として、ＳＬ６Ｅ株も同様の条件で培養し、培養液の蛍光強度および６００ｎｍの吸光度を経時的に測定した。
図２３に、各株の培養液の［蛍光強度／ＯＤ６００］（蛍光強度を６００ｎｍの吸光度で除した値）の経時的変化を示した。この結果、２７７Ｇ株（図中、「ｉｈｃ１ｐ」）の［蛍光強度／ＯＤ６００］は、培養開始から２４時間経過時点ではｈＣＭＶプロモーターを用いたＳＬ６Ｅ株（図中、「ｈＣＭＶｐ」）よりも低いが、培養開始から４８時間経過後にはＳＬ６Ｅ株よりも高く、一酵母あたりのＥＧＦＰの発現量が高かった。【０１５８】
なお、２０１２年８月２０日に出願された日本特許出願２０１２−１８１８６５号の明細書、特許請求の範囲、図面および要約書の全内容をここに引用し、本発明の明細書の開示として、取り入れるものである。
【図１】
2014030644.tif 000006
【図２】
2014030644.tif 000007
【図３】
2014030644.tif 000008
【図４】
2014030644.tif 000009
【図５】
2014030644.tif 000010
【図６】
2014030644.tif 000011
【図７】
2014030644.tif 000012
【図８】
2014030644.tif 000013
【図９】
2014030644.tif 000014
【図１０】
2014030644.tif 000015
【図１１】
2014030644.tif 000016
【図１２】
2014030644.tif 000017
【図１３Ａ】
2014030644.tif 000018
【図１３Ｂ】
2014030644.tif 000019
【図１４】
2014030644.tif 000020
【図１５】
2014030644.tif 000021
【図１６】
2014030644.tif 000022
【図１７】
2014030644.tif 000023
【図１８】
2014030644.tif 000024
【図１９】
2014030644.tif 000025
【図２０】
2014030644.tif 000026
【図２１】
2014030644.tif 000027
【図２２】
2014030644.tif 000028
【図２３】
2014030644.tif 000029
【図２４】
2014030644.tif 000030
【図２５】
2014030644.tif 000031
【図２６】
2014030644.tif 000032
【配列表】
2014030644000001.app
【国際調査報告】
2014030644.tif 000033
2014030644.tif 000034
2014030644.tif 000035
2014030644.tif 000036