【手続補正書】
【提出日】平成27年5月21日(2015.5.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
複数の検体間で小型RNAの発現量を比較解析する方法であって、
前記複数の検体のそれぞれについて、複数の小型RNAの発現量の測定と同時に複数のmRNAの発現量の測定を行なう、測定工程；
各検体について、mRNA発現量の測定値から、対数値で表された代表値を取得する、代表値取得工程；
任意に選択された第１の検体を基準検体とし、基準検体のmRNA代表値と残りの第２以降の検体のmRNA代表値との差を、当該第２以降の検体のための補正係数としてそれぞれ取得する、補正係数取得工程；
取得された第２以降の検体のための補正係数をそれぞれ用いて、第２以降の検体において測定された小型RNA発現量を補正する、補正工程；及び
基準検体における小型RNA発現量と、第２以降の検体における補正済みの小型RNA発現量とを対比する、対比工程
を含み、
前記補正係数取得工程において、基準検体のmRNA代表値から第２以降の検体のmRNA代表値を減算した値を補正係数として取得する場合、前記補正工程では、第２以降の検体における小型RNA発現量測定値の対数値に補正係数を加算することにより前記補正を行ない、
前記補正係数取得工程において、第２以降の検体のmRNA代表値から基準検体のmRNA代表値を減算した値を補正係数として取得する場合、前記補正工程では、第２以降の検体における小型RNA発現量測定値の対数値から補正係数を減算することにより前記補正を行なう、前記方法。
【請求項２】
２つの検体間で小型RNAの発現量を比較解析する請求項１記載の方法。
【請求項３】
前記測定工程が、支持体上に固定化された複数の小型RNA捕捉プローブ及び複数のmRNA捕捉プローブと、標識物質で標識された検体由来の核酸試料とを接触させてハイブリダイゼーションを行ない、洗浄後、支持体上の個々のプローブ固定化領域における標識物質からのシグナルを測定することにより、各小型RNA及び各mRNAの発現量をシグナル強度測定値としてそれぞれ測定することを含む、請求項１又は２記載の方法。
【請求項４】
前記プローブが核酸プローブであり、前記標識物質が蛍光色素である請求項３記載の方法。
【請求項５】
前記代表値が、mRNA発現量測定値の対数値で算出された平均値である請求項１ないし４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６】
小型RNAがmiRNAである請求項１ないし５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
複数の検体における小型RNAの発現量を比較解析する小型RNA発現解析装置であって、
複数の検体のそれぞれについて、同時に測定された複数の小型RNAの発現量及び複数のmRNAの発現量の測定値を記憶する記憶手段と、
各検体について、mRNA発現量の測定値から、対数値で表された代表値を取得する、代表値取得手段と、
任意に選択された第１の検体を基準検体とし、基準検体のmRNA代表値と残りの第２以降の検体のmRNA代表値との差を、当該第２以降の検体のための補正係数としてそれぞれ取得する、補正係数取得手段と、
前記補正係数取得手段によって取得された第２以降の検体のための補正係数をそれぞれ用いて、第２以降の検体において測定された小型RNA発現量を補正する、補正手段と、
基準検体の小型RNA発現量と、第２以降の検体における補正済みの小型RNA発現量との対比結果を出力する出力手段と
を含み、
前記補正係数取得手段が、基準検体のmRNA代表値から第２以降の検体のmRNA代表値を減算した値を補正係数として取得する場合、前記補正手段は、第２以降の検体における小型RNA発現量測定値の対数値に補正係数を加算することにより前記補正を行ない、
前記補正係数取得手段が、第２以降の検体のmRNA代表値から基準検体のmRNA代表値を減算した値を補正係数として取得する場合、前記補正手段は、第２以降の検体における小型RNA発現量測定値の対数値から補正係数を減算することにより前記補正を行なう、前記装置。
【請求項８】
２つの検体間で小型RNAの発現量を比較解析する請求項７記載の装置。
【請求項９】
前記代表値が、mRNA発現量測定値の対数値で算出された平均値である請求項７又は８記載の装置。
【請求項１０】
複数の検体間で小型RNA発現量を比較解析するために、コンピューターを、
複数の検体のそれぞれについて、同時に測定された複数の小型RNAの発現量及び複数のmRNAの発現量の測定値を記憶する、記憶手段、
各検体について、mRNA発現量の測定値から、対数値で表された代表値を取得する、代表値取得手段、
複数の検体のうちで「基準検体」として指定する第１の検体を入力する、入力手段、
基準検体のmRNA代表値と残りの第２以降の検体のmRNA代表値との差を、当該第２以降の検体のための補正係数としてそれぞれ取得する、補正係数取得手段、
前記補正係数取得手段によって取得された第２以降の検体のための補正係数をそれぞれ用いて、第２以降の検体において測定された小型RNA発現量を補正する、補正手段、及び
基準検体の小型RNA発現量と、第２以降の検体における補正済みの小型RNA発現量との対比結果を出力する、出力手段
として機能させるためのプログラムであって、
前記補正係数取得手段が、基準検体のmRNA代表値から第２以降の検体のmRNA代表値を減算した値を補正係数として取得する場合、前記補正手段は、第２以降の検体における小型RNA発現量測定値の対数値に補正係数を加算することにより前記補正を行ない、
前記補正係数取得手段が、第２以降の検体のmRNA代表値から基準検体のmRNA代表値を減算した値を補正係数として取得する場合、前記補正手段は、第２以降の検体における小型RNA発現量測定値の対数値から補正係数を減算することにより前記補正を行なう、前記プログラム。
【請求項１１】
複数の検体間で小型RNA発現量を比較解析するために、コンピューターを、
複数の検体のそれぞれについて、同時に測定された複数の小型RNAの発現量及び複数のmRNAの発現量の測定値を記憶する、記憶手段、
各検体について、mRNA発現量の測定値から、対数値で表された代表値を取得する、代表値取得手段、
複数の検体から「基準検体」とする第１の検体を選出する、基準検体選出手段、
基準検体のmRNA代表値と残りの第２以降の検体のmRNA代表値との差を、当該第２以降の検体のための補正係数としてそれぞれ取得する、補正係数取得手段、
前記補正係数取得手段によって取得された第２以降の検体のための補正係数をそれぞれ用いて、第２以降の検体において測定された小型RNA発現量を補正する、補正手段、及び
基準検体の小型RNA発現量と、第２以降の検体における補正済みの小型RNA発現量との対比結果を出力する、出力手段
として機能させるためのプログラムであって、
前記補正係数取得手段が、基準検体のmRNA代表値から第２以降の検体のmRNA代表値を減算した値を補正係数として取得する場合、前記補正手段は、第２以降の検体における小型RNA発現量測定値の対数値に補正係数を加算することにより前記補正を行ない、
前記補正係数取得手段が、第２以降の検体のmRNA代表値から基準検体のmRNA代表値を減算した値を補正係数として取得する場合、前記補正手段は、第２以降の検体における小型RNA発現量測定値の対数値から補正係数を減算することにより前記補正を行なう、
前記プログラム。
【請求項１２】
２つの検体間で小型RNAの発現量を比較解析する請求項１０又は１１記載のプログラム。
【請求項１３】
前記代表値が、mRNA発現量測定値の対数値で算出された平均値である請求項１０ないし１２のいずれか１項に記載のプログラム。
【請求項１４】
請求項１０ないし１３のいずれか１項に記載のプログラムを記録した、コンピュータ読み取り可能な記録媒体。
【請求項１５】
複数の小型RNA捕捉プローブ及び複数のmRNA捕捉プローブが固定化された支持体を含む、小型RNA発現解析用チップ。