【手続補正書】
【提出日】平成27年3月12日(2015.3.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
下記（ａ）及び（ｂ）のオリゴヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチド対、並びに
下記（ｃ）及び（ｄ）のオリゴヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチド対、
からなる群より選ばれる少なくとも１種のオリゴヌクレオチド対を用いてサーモアスカス（Thermoascus）属真菌の検出を行う、サーモアスカス属真菌の検出方法。
（ａ）配列番号１に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は配列番号１に記載の塩基配列において１個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できるオリゴヌクレオチド
（ｂ）配列番号２に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は配列番号２に記載の塩基配列において１個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できるオリゴヌクレオチド
（ｃ）配列番号３に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は配列番号３に記載の塩基配列において１個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できるオリゴヌクレオチド
（ｄ）配列番号４に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は配列番号４に記載の塩基配列において１個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できるオリゴヌクレオチド
【請求項２】
検出を行うために、前記少なくとも１種のオリゴヌクレオチド対を用いてサーモアスカス属真菌のＲＮＡポリメラーゼIIラージサブユニット遺伝子又はβ−チューブリン遺伝子の塩基配列で表される核酸の一部を増幅し、増幅産物の有無を確認し、サーモアスカス属真菌の検出を行う、請求項１記載の検出方法。
【請求項３】
前記（ａ）及び（ｂ）のオリゴヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチド対を核酸プライマーとして用いてポリメラーゼ連鎖反応法を行い、サーモアスカス属真菌のＲＮＡポリメラーゼIIラージサブユニット遺伝子の塩基配列で表される核酸の一部を増幅し、増幅産物の有無を確認し、サーモアスカス属真菌検出を行う、請求項２記載の検出方法。
【請求項４】
前記サーモアスカス属真菌のＲＮＡポリメラーゼIIラージサブユニット遺伝子の塩基配列が下記（ｅ）〜（ｊ）の塩基配列のいずれかである、請求項１〜３のいずれか１項記載の検出方法。
（ｅ）配列番号５に記載のＲＮＡポリメラーゼIIラージサブユニット遺伝子の塩基配列又はその相補配列
（ｆ）配列番号５に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できる塩基配列、又はその相補配列
（ｇ）配列番号６に記載のＲＮＡポリメラーゼIIラージサブユニット遺伝子の塩基配列又はその相補配列
（ｈ）配列番号６に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できる塩基配列、又はその相補配列
（ｉ）配列番号７に記載のＲＮＡポリメラーゼIIラージサブユニット遺伝子の塩基配列又はその相補配列
（ｊ）配列番号７に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できる塩基配列、又はその相補配列
【請求項５】
前記（ｃ）及び（ｄ）のオリゴヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチド対を核酸プライマーとして用いてポリメラーゼ連鎖反応法を行い、サーモアスカス属真菌のβ−チューブリン遺伝子の塩基配列で表される核酸の一部を増幅し、増幅産物の有無を確認し、サーモアスカス属真菌検出を行う、請求項２記載の検出方法。
【請求項６】
前記サーモアスカス属真菌のβ−チューブリン遺伝子の塩基配列が下記（ｋ）〜（ｎ）の塩基配列のいずれかである、請求項１、２及び５のいずれか１項記載の検出方法。
（ｋ）配列番号８に記載のβ−チューブリン遺伝子の塩基配列又はその相補配列
（ｌ）配列番号８に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できる塩基配列、又はその相補配列
（ｍ）配列番号９に記載のβ−チューブリン遺伝子の塩基配列又はその相補配列
（ｎ）配列番号９に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できる塩基配列、又はその相補配列
【請求項７】
下記（ａ）〜（ｄ）のオリゴヌクレオチドからなる群より選ばれるオリゴヌクレオチド、又は下記（ａ）及び（ｂ）のオリゴヌクレオチド若しくは下記（ｃ）及び（ｄ）のオリゴヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチド対。
（ａ）配列番号１に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は配列番号１に記載の塩基配列において１個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス（Thermoascus）属真菌の検出に使用できるオリゴヌクレオチド
（ｂ）配列番号２に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は配列番号２に記載の塩基配列において１個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できるオリゴヌクレオチド
（ｃ）配列番号３に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は配列番号３に記載の塩基配列において１個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できるオリゴヌクレオチド
（ｄ）配列番号４に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド、又は配列番号４に記載の塩基配列において１個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できるオリゴヌクレオチド
【請求項８】
前記オリゴヌクレオチドが核酸プローブ又は核酸プライマーである、請求項７記載のオリゴヌクレオチド又はオリゴヌクレオチド対。
【請求項９】
前記（ａ）及び（ｂ）のオリゴヌクレオチドがそれぞれ、下記（ｅ）〜（ｊ）の塩基配列のいずれかで表される核酸にハイブリダイズすることができ、サーモアスカス属真菌を検出するための核酸プローブ又は核酸プライマーとして機能し得る、請求項８記載のオリゴヌクレオチド又はオリゴヌクレオチド対。
（ｅ）配列番号５に記載のＲＮＡポリメラーゼIIラージサブユニット遺伝子の塩基配列又はその相補配列
（ｆ）配列番号５に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できる塩基配列、又はその相補配列
（ｇ）配列番号６に記載のＲＮＡポリメラーゼIIラージサブユニット遺伝子の塩基配列又はその相補配列
（ｈ）配列番号６に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できる塩基配列、又はその相補配列
（ｉ）配列番号７に記載のＲＮＡポリメラーゼIIラージサブユニット遺伝子の塩基配列又はその相補配列
（ｊ）配列番号７に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できる塩基配列、又はその相補配列
【請求項１０】
前記（ａ）及び（ｂ）のオリゴヌクレオチドが、ポリメラーゼ連鎖反応法によって前記（ｅ）〜（ｊ）の塩基配列のいずれかで表される核酸の一部を増幅でき、サーモアスカス属真菌を検出するための核酸プライマーとして機能し得るものである、請求項９記載のオリゴヌクレオチド又はオリゴヌクレオチド対。
【請求項１１】
前記（ｃ）及び（ｄ）のオリゴヌクレオチドがそれぞれ、下記（ｋ）〜（ｎ）の塩基配列のいずれかで表される核酸にハイブリダイズすることができ、サーモアスカス属真菌を検出するための核酸プローブ又は核酸プライマーとして機能し得る、請求項８記載のオリゴヌクレオチド又はオリゴヌクレオチド対。
（ｋ）配列番号８に記載のβ−チューブリン遺伝子の塩基配列又はその相補配列
（ｌ）配列番号８に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できる塩基配列、又はその相補配列
（ｍ）配列番号９に記載のβ−チューブリン遺伝子の塩基配列又はその相補配列
（ｎ）配列番号９に記載の塩基配列において１若しくは数個の塩基が欠失、置換、挿入若しくは付加されておりかつサーモアスカス属真菌の検出に使用できる塩基配列、又はその相補配列
【請求項１２】
前記（ｃ）及び（ｄ）のオリゴヌクレオチドが、ポリメラーゼ連鎖反応法によって前記（ｋ）〜（ｎ）の塩基配列のいずれかで表される核酸の一部を増幅でき、サーモアスカス属真菌を検出するための核酸プライマーとして機能し得るものである、請求項１１記載のオリゴヌクレオチド又はオリゴヌクレオチド対。
【請求項１３】
請求項７〜１２のいずれか１項記載のオリゴヌクレオチド又はオリゴヌクレオチド対を含むサーモアスカス（Thermoascus）属真菌検出キット。