【手続補正書】
【提出日】平成29年3月9日(2017.3.9)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
マーカーをコードする異種性核酸配列を備える組換えリステリアファージを含む組成物であって、該組換えリステリアファージが、組換えＬＰ４０及びその派生株、組換えＬＰ４８及びその派生株、組換えＬＰ９９及びその派生株、組換えＬＰ１０１及びその派生株、組換えＬＰ１２４及びその派生株、組換えＬＰ１２５及びその派生株、並びに組換えＬＰ１４３及びその派生株から選択される、組成物。
【請求項２】
マーカーをコードする異種性核酸配列を備える少なくとも２種類の組換えリステリアファージを含み、該組換えリステリアファージが、組換えＡ５１１及びその派生株、組換えＰ１００及びその派生株、組換えＬＰ４０及びその派生株、組換えＬＰ４８及びその派生株、組換えＬＰ９９及びその派生株、組換えＬＰ１０１及びその派生株、組換えＬＰ１２４及びその派生株、組換えＬＰ１２５及びその派生株、並びに組換えＬＰ１４３及びその派生株から選択される、組成物。
【請求項３】
マーカーがルシフェラーゼである、請求項１又は２に記載の組換えリステリアファージ。
【請求項４】
マーカーをコードする異種性核酸配列が、配列番号２又は配列番号４に対して少なくとも７０％同一である、請求項１又は２に記載の組成物。
【請求項５】
マーカーをコードする異種性核酸配列が配列番号２に対して少なくとも７０％同一であるルシフェラーゼを含む場合、ファージが、ＬＰ４８：：ｆｆｌｕｃ、ＬＰ９９：：ｆｆｌｕｃ、ＬＰ１０１：：ｆｆｌｕｃ、ＬＰ１２４：：ｆｆｌｕｃ、ＬＰ１２５：：ｆｆｌｕｃ、ＬＰ１４３：：ｆｆｌｕｃ、Ａ５１１：：ｆｆｌｕｃ、及びＰ１００：：ｆｆｌｕｃから選択される、請求項４に記載の組成物。
【請求項６】
マーカーをコードする異種性核酸配列が配列番号４に対して少なくとも７０％同一であるルシフェラーゼを含む場合、ファージが、ＬＰ４０：：ｎｌｕｃ、ＬＰ１２４：：ｎｌｕｃ、ＬＰ１２５：：ｎｌｕｃ、Ａ５１１：：ｎｌｕｃ、及びＰ１００：：ｎｌｕｃから選択される、請求項４に記載の組成物。
【請求項７】
ａ）炭水化物及び関連の化合物から選択される少なくとも１種類の化合物、ｂ）窒素含有化合物から選択される少なくとも１種類の化合物、ｃ）核酸及び関連の化合物から選択される少なくとも１種類の化合物、ｄ）脂質から選択される少なくとも１種類の化合物、ｅ）少なくとも１種類の無機化合物、及びｆ）少なくとも１種類の有機化合物、のうちの少なくとも１つから選択される少なくとも１種類の非ファージ性成分をさらに含む、請求項１〜６のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項８】
ａ）炭水化物及び関連の化合物から選択される少なくとも１種類の化合物、ｂ）窒素含有化合物から選択される少なくとも１種類の化合物、ｃ）核酸及び関連の化合物から選択される少なくとも１種類の化合物、ｄ）脂質から選択される少なくとも１種類の化合物、ｅ）少なくとも１種類の無機化合物、及びｆ）少なくとも１種類の有機化合物、のうちの少なくとも１つから選択される少なくとも１種類の非ファージ性成分を含む溶液をさらに含む、請求項１〜７のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項９】
請求項１〜８のいずれか１項に記載のマーカーをコードする異種性核酸配列を備える組換えリステリアファージを含む組成物に試料を曝露すること；及び
曝露された試料中の該マーカーの存在についてアッセイすること
を含む、標的細菌を検出する方法。
【請求項１０】
第１セットの標的細菌に感染することができ、且つ、第１マーカーをコードする異種性核酸配列を備える請求項１〜８のいずれか１項に記載の組換えリステリアファージを含む組成物に試料を曝露すること；
第２セットの標的細菌に感染することができ、且つ、第２マーカーをコードする異種性核酸配列を備える請求項１〜８のいずれか１項に記載の組換えリステリアファージを含む組成物に試料を曝露すること；及び
該曝露された試料の中の第１マーカーと第２マーカーの存在についてアッセイすること
を含む、標的細菌を検出する方法。
【請求項１１】
異なる細菌種の複数の液体培養試料を請求項１〜８のいずれか１項に記載の組換えリステリアファージを含む組成物に曝露すること、及び
ファージが該複数の異なる細菌種に感染するか判定すること
を含む、ファージの標的細菌を特定する方法。
【請求項１２】
リステリアファージの標的細菌が、リステリア・イノキュア（Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｉｎｎｏｃｕａ）、リステリア・モノサイトゲネス（Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ）、リステリア・ゼーリゲリ（Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｓｅｅｌｉｇｅｒｉ）、リステリア・イワノビ（Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｉｖａｎｏｖｉｉ）、リステリア・グレイ（Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｇｒａｙｉ）、リステリア・マルティイ（Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍａｒｔｈｉｉ）、リステリア・ロコウルティ（Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｒｏｃｏｕｒｔｉ）及びリステリア・ウェルシメリ（Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｗｅｌｓｈｉｍｅｒｉ）から選択される少なくとも１種のリステリアを含む、請求項９〜１１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１３】
標的細菌が、セレウス菌（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）、バシラス・メガテリウム（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ）、枯草菌（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ）、エンテロコッカス・デューランス、エンテロコッカス・ファセイウム（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｃｅｉｕｍ）、腸内連鎖球菌（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｈｉｒａｅ）、コクリア・バリアンス（Ｋｏｃｕｒｉａ  ｖａｒｉａｎｓ）、クルチア・ギブソニイ（Ｋｕｒｔｈｉａ  ｇｉｂｓｏｎｉｉ）、クルチア・ゾッフィー（Ｋｕｒｔｈｉａ  ｚｏｐｆｉｉ）、ロドコッカス・エクイ（Ｒｈｏｄｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｑｕｉ）、黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ）、表皮ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ）、スタフィロコッカス・サプロフィティクス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ｓａｐｒｏｐｈｙｔｉｃｕｓ）、ストレプトコッカス・エクイ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｑｕｉ）、ストレプトコッカス・ガロイティクス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｇａｌｌｏｙｔｉｃｕｓ）、ラクトバシラス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ）、ラクトバシラス・ブフネリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｕｃｈｎｅｒｉ）、ラクトバシラス・ラクトゥス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｌａｃｔｕｓ）、ラクトバシラス・ファーメンタム（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｆｅｒｍｅｎｔｕｍ）、ミクロコッカス・ルツエス（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｌｕｔｕｅｓ）、シュードモナス・プロトジェンス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｐｒｏｔｏｇｅｎｓ）、シュードモナス・フロレセンス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｌｏｒｅｓｃｅｎｓ）、アエロモナス属種（Ａｅｒｏｍｏｎａｓ  ｓｐ）、セラチア・リクファシエンス（Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓ）、セラチア・プロテアマキュランス（Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｐｒｏｔｅａｍａｃｕｌａｎｓ）、セラチア・リクファシエンス（Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓ）、バシラス科（Ｂａｃｉｌｌａｃｅａｅ）の細菌、セラチア・プロテアマキュランス（Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｐｒｏｔｅａｍａｃｕｌａｎｓ）、シュードモナス・フロレセンス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｌｏｒｅｓｃｅｎｓ）、シュードモナス・ポアエ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｐｏａｅ）、シュードモナス属種（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｓｐ）、シュードモナス・フラギ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｒａｇｉ）、プロビデンシア・アルカリファシエンス（Ｐｒｏｖｉｄｅｎｃｉａ  ａｌｃａｌｉｆａｃｉｅｎｓ）、セラチア属種（Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｓｐ）、セラチア・グリメシイ（Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｇｒｉｍｅｓｉｉ）、ハフニア属種（Ｈａｆｎｉａ  ｓｐ）、セラチア・プロテアマキュランス（Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｐｒｏｔｅａｍａｃｕｌａｎｓ）、シュードモナス・フロレセンス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｌｏｒｅｓｃｅｎｓ）、クリセオバクテリウム属種（Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐ）、シュードモナス・フラギ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｒａｇｉ）、及び腸内細菌科（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）を含まない、請求項９〜１１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１４】
試料が環境試料である、請求項９〜１１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１５】
第１の種類のファージと第２の種類のファージに対して試料を同時に曝露することを含む、請求項１０に記載の方法。