【手続補正書】
【提出日】平成29年4月25日(2017.4.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＴＮＦＳＦ１５及び／またはＤｃＲ３遺伝子座位における１つまたは複数の変異体の有無を、クローン病及び／または線維症に対する被験体におけるリスクの指標として用いる方法であって：
ＴＮＦＳＦ１５及び／またはＤｃＲ３遺伝子座位における１つまたは複数の変異体の有無を決定するように適応した遺伝子型決定アッセイに、被験体から得られた試料を供すること；
を含み、
前記ＴＮＦＳＦ１５及び／またはＤｃＲ３遺伝子座位における１つまたは複数の変異体の存在に基いてクローン病及び／または線維症に対する被験体におけるリスクが定量化されることを特徴とする、方法。
【請求項２】
請求項１の方法であって、前記変異体は：配列番号．１、配列番号．２、配列番号．３、配列番号．４、配列番号．５、配列番号．６、配列番号．７、配列番号．８、配列番号．９、配列番号．１０、配列番号．１１、配列番号．１２、配列番号．１３、配列番号．１４、配列番号．１５、配列番号．１６、配列番号．１７、配列番号．１８、配列番号．１９、配列番号．２０、配列番号．２１、配列番号．２２、配列番号．２３、配列番号．２４、配列番号．２５及び配列番号．２６からなる群より選択される１つまたは複数の変異体からなる、前記方法。
【請求項３】
請求項１の方法であって、前記変異体は、配列番号．３及び／または配列番号．１３である、前記方法。
【請求項４】
請求項１の方法であって、前記変異体は、配列番号．２２である、前記方法。
【請求項５】
請求項１の方法であって、前記被験体は、非ユダヤ人の白色人種、アシュケナジ、韓国人及び／またはプエルトリコ人である、前記方法。
【請求項６】
請求項１の方法であって、前記被験体は、韓国人であり、及び前記変異体は、配列番号．３、配列番号．１３及び／または配列番号．２２である、前記方法。
【請求項７】
請求項１の方法であって、前記変異体は、リスク変異体である、前記方法。
【請求項８】
請求項１の方法であって、前記変異体は、保護変異体である、前記方法。
【請求項９】
請求項１の方法であって、前記保護変異体は、構造化、ＣＤ、小腸合併症及び／または外科的介入の必要性についての被験体における減少したリスクを定量化する、前記方法。
【請求項１０】
ＴＮＦＳＦ１５及び／またはＤｃＲ３遺伝子座位における１つまたは複数の変異体の有無を、被験体におけるクローン病及び／または線維症に対する感受性の指標として用いる方法であって：
ＴＮＦＳＦ１５及び／またはＤｃＲ３遺伝子座位における１つまたは複数の変異体の有無を決定するように適応した遺伝子型決定アッセイに、被験体から得られた試料を供すること；
を含み、
前記ＴＮＦＳＦ１５及び／またはＤｃＲ３遺伝子座位における１つまたは複数の変異体の存在に基いて被験体におけるクローン病及び／または線維症に対する感受性が診断されることを特徴とする、方法。
【請求項１１】
請求項１０の方法であって、前記変異体は：配列番号．１、配列番号．２、配列番号．３、配列番号．４、配列番号．５、配列番号．６、配列番号．７、配列番号．８、配列番号．９、配列番号．１０、配列番号．１１、配列番号．１２、配列番号．１３、配列番号．１４、配列番号．１５、配列番号．１６、配列番号．１７、配列番号．１８、配列番号．１９、配列番号．２０、配列番号．２１、配列番号．２２、配列番号．２３、配列番号．２４、配列番号．２５及び配列番号．２６からなる群より選択される１つまたは複数の変異体からなる、前記方法。
【請求項１２】
請求項１０の方法であって、前記変異体は、配列番号．３及び／または配列番号．１３である、前記方法。
【請求項１３】
請求項１０の方法であって、前記変異体は、配列番号．２２である、前記方法。
【請求項１４】
請求項１０の方法であって、前記被験体は、非ユダヤ人の白色人種、アシュケナジ、韓国人またはプエルトリコ人である、前記方法。
【請求項１５】
請求項１０の方法であって、前記被験体は、韓国人であり、及び前記変異体は、配列番号．３、配列番号．１３及び／または配列番号．２２である、前記方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５８】
最後に、本明細書において開示した本発明の実施形態が、本発明の原則の例証となることが理解されるべきである。使用され得るその他の改変は、本発明の範囲内であり得る。したがって、例として、限定でないが、本発明の代わりの構成は、本明細書における教示に従って利用することができる。したがって、本発明の実施形態は、正確に示される、及び記述されるものに限定されない。
例えば、本発明は以下の項目を提供する。
（項目１）
クローン病及び／または線維症に対する被験体におけるリスクを定量化するためのアッセイであって：
被験体から試料を得ること；
ＴＮＦＳＦ１５及び／またはＤｃＲ３遺伝子座位における１つまたは複数の変異体の有無を決定するように適応した遺伝子型決定アッセイに前記試料を供すること；及び
前記ＴＮＦＳＦ１５及び／またはＤｃＲ３遺伝子座位における１つまたは複数の変異体の存在に基いてクローン病及び／または線維症に対する被験体におけるリスクを定量化すること、
を含む、前記アッセイ。
（項目２）
項目１の方法であって、前記変異体は：配列番号．１、配列番号．２、配列番号．３、配列番号．４、配列番号．５、配列番号．６、配列番号．７、配列番号．８、配列番号．９、配列番号．１０、配列番号．１１、配列番号．１２、配列番号．１３、配列番号．１４、配列番号．１５、配列番号．１６、配列番号．１７、配列番号．１８、配列番号．１９、配列番号．２０、配列番号．２１、配列番号．２２、配列番号．２３、配列番号．２４、配列番号．２５及び配列番号．２６からなる群より選択される１つまたは複数の変異体からなる、前記方法。
（項目３）
項目１の方法であって、前記変異体は、配列番号．３及び／または配列番号．１３である、前記方法。
（項目４）
項目１の方法であって、前記変異体は、配列番号．２２である、前記方法。
（項目５）
項目１の方法であって、前記被験体は、非ユダヤ人の白色人種、アシュケナジ、韓国人及び／またはプエルトリコ人である、前記方法。
（項目６）
項目１の方法であって、前記被験体は、韓国人であり、及び前記変異体は、配列番号．３、配列番号．１３及び／または配列番号．２２である、前記方法。
（項目７）
項目１の方法であって、前記変異体は、リスク変異体である、前記方法。
（項目８）
項目１の方法であって、前記変異体は、保護変異体である、前記方法。
（項目９）
項目１の方法であって、前記保護変異体は、構造化、ＣＤ、小腸合併症及び／または外科的介入の必要性についての被験体における減少したリスクを定量化する、前記方法。
（項目１０）
被験体におけるクローン病及び／または線維症に対する感受性を診断する方法であって：
被験体から試料を得ること；
ＴＮＦＳＦ１５及び／またはＤｃＲ３遺伝子座位における１つまたは複数の変異体の有無を決定するように適応した遺伝子型決定アッセイに前記試料を供すること；及び
前記ＴＮＦＳＦ１５及び／またはＤｃＲ３遺伝子座位における１つまたは複数の変異体の存在に基いて被験体におけるクローン病及び／または線維症に対する感受性を診断すること、
を含む、前記方法。
（項目１１）
項目１０の方法であって、前記変異体は：配列番号．１、配列番号．２、配列番号．３、配列番号．４、配列番号．５、配列番号．６、配列番号．７、配列番号．８、配列番号．９、配列番号．１０、配列番号．１１、配列番号．１２、配列番号．１３、配列番号．１４、配列番号．１５、配列番号．１６、配列番号．１７、配列番号．１８、配列番号．１９、配列番号．２０、配列番号．２１、配列番号．２２、配列番号．２３、配列番号．２４、配列番号．２５及び配列番号．２６からなる群より選択される１つまたは複数の変異体からなる、前記方法。
（項目１２）
項目１０の方法であって、前記変異体は、配列番号．３及び／または配列番号．１３である、前記方法。
（項目１３）
項目１０の方法であって、前記変異体は、配列番号．２２である、前記方法。
（項目１４）
項目１０の方法であって、前記被験体は、非ユダヤ人の白色人種、アシュケナジ、韓国人またはプエルトリコ人である、前記方法。
（項目１５）
項目１０の方法であって、前記被験体は、韓国人であり、及び前記変異体は、配列番号．３、配列番号．１３及び／または配列番号．２２である、前記方法。
（項目１６）
被験体におけるクローン病及び／または線維症を治療する方法であって：
被験体から試料を得ること；
ＴＮＦＳＦ１５及び／またはＤｃＲ３遺伝子座位における１つまたは複数の変異体の存在を決定するように適応した遺伝子型決定アッセイに前記試料を供すること；及び
前記クローン病及び／または線維症を治療すること、
を含む、前記方法。
（項目１７）
項目１６の方法であって、前記変異体は：配列番号．１、配列番号．２、配列番号．３、配列番号．４、配列番号．５、配列番号．６、配列番号．７、配列番号．８、配列番号．９、配列番号．１０、配列番号．１１、配列番号．１２、配列番号．１３、配列番号．１４、配列番号．１５、配列番号．１６、配列番号．１７、配列番号．１８、配列番号．１９、配列番号．２０、配列番号．２１、配列番号．２２、配列番号．２３、配列番号．２４、配列番号．２５及び配列番号．２６からなる群より選択される１つまたは複数の変異体からなる、前記方法。