【手続補正書】
【提出日】平成29年9月5日(2017.9.5)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
疑われる病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を試験個体が有する可能性の決定方法であって、下記工程、
(i)  前記試験個体からのサンプル中の2種以上の各タンパク質バイオマーカーのレベルを検出及び数量化する工程であって、前記試験個体が、前記疑われる病気を有すると診断又は差別的に診断されておらず、前記タンパク質バイオマーカーは、表1に示す補体断片C5a(C5a)、アンジオポエチン-1(Ang-1)、アンジオポエチン-2(Ang-2)、10kDaのインターフェロンγ誘導タンパク質(IP-10)、免疫グロブリン様ループと上皮成長因子ドメイン-2を有する可溶性チロシンキナーゼ(sTie-2)、可溶性細胞内接着分子-1(sICAM-1)、血管内皮成長因子A(VEGF)、可溶性血管内皮成長因子受容体1(sFlt-1)、キチナーゼ3様タンパク質1(CHI3L1)、骨髄系細胞-1に発現する可溶性誘発性受容体(sTREM-1)、C反応性タンパク質(CRP)、プロカルシトニン(PCT)、アンジオポエチン様タンパク質3(Ang様3)、補体D因子(D因子)、又はインターロイキン18結合タンパク質(IL18bpa)、エンドグリン(End)、p-セレクチン(p-SEL)、フォン上皮細胞可溶性Tie-2受容体(Tie-2)及びヴィルブランド因子(vWF)である、前記工程、
(ii)  前記タンパク質バイオマーカーの前記数量化レベルを、コントロール集団からの前記タンパク質バイオマーカーのコントロールレベルと比較する工程、
(iii)  工程(ii)の比較において、前記試験個体が重篤及び／又は致命的な反応を有するリスクが高いかどうかに関しての決定を下すべく各バイオマーカーについて差別的レベルを決定する工程、
を含む方法。
【請求項２】
工程(i)の前記検出及び数量化が、前記コントロール集団と比較するために使用できる前記2種以上の各タンパク質バイオマーカーのレベルを示すデータに前記サンプルを変換するための1つ以上のデバイスを利用する、請求項1に記載の方法。
【請求項３】
前記1つ以上のデバイスが、サンプルをデータに変換するために利用される酵素結合免疫アッセイである、請求項2に記載の方法。
【請求項４】
工程(iii)の決定が、同定された高いリスクの結果として前記個体が治療プロトコルの適用を必要とすることを示す、請求項1に記載の方法。
【請求項５】
前記個体が、前記治療プロトコルを受ける、請求項4に記載の方法。
【請求項６】
前記コントロール集団が、(i)重篤及び／又は致命的な病気を有する個体の集団である、(ii)重篤及び／又は致命的な病気を有する個体の集団であって、前記個体が、前記病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を発症していない、(iii)重篤及び／又は致命的な病気を有する個体の集団であって、前記個体が、前記病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を発症している、(iv)正常な個体の集団である、(v)重篤及び／又は致命的な病気を有しない個体の集団である、又は(vi)該コントロール集団のメンバーが、重篤及び／又は致命的な病気を有しない個体の集団である、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記病気が、肺炎、上気道感染症、下気道感染症、インフルエンザ、大腸菌感染症、菌血症、リケッチア感染症、サルモネラ症、連鎖球菌感染症、ブドウ球菌感染症、マラリア、敗血症、デング熱、ウエストナイルウイルス、毒素性ショック症候群、レプトスピラ症、又はウイルス性出血熱である、請求項1に記載の方法。
【請求項８】
疑われる病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を試験個体が有する可能性の決定方法であって、下記工程、
(i)  前記試験個体からのサンプル中の2種以上の各タンパク質バイオマーカーのレベルを検出及び数量化する工程であって、前記試験個体が、前記疑われる病気を有すると診断又は差別的に診断されておらず、前記タンパク質バイオマーカーは、表1に示す補体断片C5a(C5a)、アンジオポエチン-1(Ang-1)、アンジオポエチン-2(Ang-2)、10kDaのインターフェロンγ誘導タンパク質(IP-10)、免疫グロブリン様ループと上皮成長因子ドメイン-2を有する可溶性チロシンキナーゼ(sTie-2)、可溶性細胞内接着分子-1(sICAM-1)、血管内皮成長因子A(VEGF)、可溶性血管内皮成長因子受容体1(sFlt-1)、キチナーゼ3様タンパク質1(CHI3L1)、骨髄系細胞-1に発現する可溶性誘発性受容体(sTREM-1)、C反応性タンパク質(CRP)、プロカルシトニン(PCT)、アンジオポエチン様タンパク質3(Ang様3)、補体D因子(D因子)、又はインターロイキン18結合タンパク質(IL18bpa)、エンドグリン(End)、p-セレクチン(p-SEL)、フォン上皮細胞可溶性Tie-2受容体(Tie-2)及びヴィルブランド因子(vWF)である、前記工程、
(ii)  1つ以上のコントロール集団において前記タンパク質バイオマーカーを試験することから導かれる分類指標において前記サンプルからの前記各タンパク質バイオマーカーの数量化レベルを利用する工程、
(iii)  前記分類指標の適用の結果として、前記個体の致命的な反応のリスクが高いかどうかに関しての決定を下す工程、
を含む方法。
【請求項９】
工程(i)の前記検出及び数量化が、前記分類指標に使用できる前記2種以上の各タンパク質バイオマーカーのレベルを示すデータに前記サンプルを変換するための1つ以上のデバイスを利用する、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記1つ以上のデバイスが、サンプルをデータに変換するために利用される酵素結合免疫アッセイである、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
工程(iii)の決定が、同定された高いリスクの結果として前記個体が治療プロトコルの適用を必要とすることを示す、請求項８に記載の方法。
【請求項１２】
前記個体が、前記治療プロトコルを受ける、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記分類指標が、(i)少なくとも2つのコントロール集団、すなわち前記疑われる病気を有し、かつ前記疑われる病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を有しない個体の集団並びに前記疑われる病気を有し、かつ前記疑われる病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を有する個体の集団、(ii)少なくとも2つのコントロール集団、すなわち重篤及び／又は致命的であり得る病気を有し、かつ前記病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を有しない個体の集団並びに重篤及び／又は致命的であり得る病気を有し、かつ前記病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を有する個体の集団、又は(iii)少なくとも2つのコントロール集団、すなわち正常とみなされる個体の集団並びに重篤及び／又は致命的であり得る病気を有し、かつ前記病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を有する個体の集団を用いて導かれる、請求項８に記載の方法。
【請求項１４】
前記疑われる病気が、肺炎、上気道感染症、下気道感染症、インフルエンザ、大腸菌感染症、菌血症、リケッチア感染症、サルモネラ症、連鎖球菌感染症、ブドウ球菌感染症、マラリア、敗血症、デング熱、ウエストナイルウイルス、毒素性ショック症候群、レプトスピラ症、又はウイルス性出血熱である、請求項８に記載の方法。
【請求項１５】
病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を試験個体が有する可能性の決定方法であって、下記工程、
(i)  前記試験個体からのサンプル中の2種以上の各タンパク質バイオマーカーのレベルを検出及び数量化する工程であって、前記タンパク質バイオマーカーは、表1に示す補体断片C5a(C5a)、アンジオポエチン-1(Ang-1)、アンジオポエチン-2(Ang-2)、10kDaのインターフェロンγ誘導タンパク質(IP-10)、免疫グロブリン様ループと上皮成長因子ドメイン-2を有する可溶性チロシンキナーゼ(sTie-2)、可溶性細胞内接着分子-1(sICAM-1)、血管内皮成長因子A(VEGF)、可溶性血管内皮成長因子受容体1(sFlt-1)、キチナーゼ3様タンパク質1(CHI3L1)、骨髄系細胞-1に発現する可溶性誘発性受容体(sTREM-1)、C反応性タンパク質(CRP)、プロカルシトニン(PCT)、アンジオポエチン様タンパク質3(Ang様3)、補体D因子(D因子)、又はインターロイキン18結合タンパク質(IL18bpa)、エンドグリン(End)、p-セレクチン(p-SEL)、フォン上皮細胞可溶性Tie-2受容体(Tie-2)及びヴィルブランド因子(vWF)である、前記工程、
(ii)  前記タンパク質バイオマーカーの前記数量化レベルを、コントロール集団からの前記タンパク質バイオマーカーのコントロールレベルと比較する工程、
(iii)  工程(ii)の比較において、前記試験個体が前記病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を有するリスクが高いかどうかに関しての決定を下すべく各バイオマーカーについて差別的レベルを決定する工程、
を含む方法。
【請求項１６】
工程(i)の前記検出及び数量化が、前記コントロール集団と比較するために使用できる前記２種以上の各タンパク質バイオマーカーのレベルを示すデータに前記サンプルを変換するための１つ以上のデバイスを利用する、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
前記１つ以上のデバイスが、サンプルをデータに変換するために利用される酵素結合免疫アッセイである、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
工程(iii)の決定が、同定された高いリスクの結果として前記個体が治療プロトコルの適用を必要とすることを示す、請求項１５に記載の方法。
【請求項１９】
前記個体が、前記治療プロトコルを受ける、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記コントロール集団が、(i)重篤及び／又は致命的な病気を有する個体の集団である、(ii)重篤及び／又は致命的な病気を有する個体の集団であって、前記個体が、前記病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を発症したことがない、(iii)重篤及び／又は致命的な病気を有する個体の集団であって、前記個体が、前記病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を発症している、(iv)正常な個体の集団である、(v)重篤及び／又は致命的な病気を有しない個体の集団である、又は(vi)該コントロール集団のメンバーが重篤及び／又は致命的な病気を有しない個体の集団である、請求項15に記載の方法。
【請求項２１】
前記疑われる病気が、肺炎、上気道感染症、下気道感染症、インフルエンザ、大腸菌感染症、菌血症、リケッチア感染症、サルモネラ症、連鎖球菌感染症、ブドウ球菌感染症、マラリア、敗血症、デング熱、ウエストナイルウイルス、毒素性ショック症候群、レプトスピラ症、又はウイルス性出血熱である、請求項１５に記載の方法。
【請求項２２】
病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を試験個体が有する可能性の決定方法であって、下記工程、
(i)  前記試験個体からのサンプル中の2種以上の各タンパク質バイオマーカーのレベルを検出及び数量化する工程であって、前記タンパク質バイオマーカーは、表1に示す補体断片C5a(C5a)、アンジオポエチン-1(Ang-1)、アンジオポエチン-2(Ang-2)、10kDaのインターフェロンγ誘導タンパク質(IP-10)、免疫グロブリン様ループと上皮成長因子ドメイン-2を有する可溶性チロシンキナーゼ(sTie-2)、可溶性細胞内接着分子-1(sICAM-1)、血管内皮成長因子A(VEGF)、可溶性血管内皮成長因子受容体1(sFlt-1)、キチナーゼ3様タンパク質１(CHI3L1)、骨髄系細胞-1に発現する可溶性誘発性受容体(sTREM-1)、C反応性タンパク質(CRP)、プロカルシトニン(PCT)、アンジオポエチン様タンパク質3(Ang様3)、補体D因子(D因子)、又はインターロイキン18結合タンパク質(IL18bpa)、エンドグリン(End)、p-セレクチン(p-SEL)、フォン上皮細胞可溶性Tie-2受容体(Tie-2)及びヴィルブランド因子(vWF)である、前記工程、
(ii)  １つ以上のコントロール集団において前記タンパク質バイオマーカーを試験することから導かれる分類指標において前記サンプルからの前記各タンパク質バイオマーカーの数量化レベルを利用する工程、
(iii)  前記分類指標の適用の結果として、前記個体の致命的な反応のリスクが高いかどうかに関しての決定を下す工程、
を含む方法。
【請求項２３】
工程(i)の前記検出及び数量化が、前記分類指標に使用できる前記２種以上の各タンパク質バイオマーカーのレベルを示すデータに前記サンプルを変換するための1つ以上のデバイスを利用する、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記１つ以上のデバイスが、サンプルをデータに変換するために利用される酵素結合免疫アッセイである、請求項２２に記載の方法。
【請求項２５】
工程(iii)の決定が、同定された高いリスクの結果として前記個体が治療プロトコルの適用を必要とすることを示す、請求項２２に記載の方法。
【請求項２６】
前記個体が、前記治療プロトコルを受ける、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
前記分類指標が、(i)少なくとも2つのコントロール集団、すなわち前記病気を有し、かつ前記病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を有しない個体の集団並びに前記病気を有し、かつ前記病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を有する個体の集団、(ii)少なくとも2つのコントロール集団、すなわち重篤及び／又は致命的であり得る病気を有し、かつ前記病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を有しない個体の集団並びに重篤及び／又は致命的であり得る病気を有し、かつ前記病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を有する個体の集団、又は(iii)少なくとも2つのコントロール集団、すなわち正常とみなされる個体の集団並びに重篤及び／又は致命的であり得る病気を有し、かつ前記病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を有する個体の集団を用いて導かれる、請求項２２に記載の方法。
【請求項２８】
前記病気が、肺炎、上気道感染症、下気道感染症、インフルエンザ、大腸菌感染症、菌血症、リケッチア感染症、サルモネラ症、連鎖球菌感染症、ブドウ球菌感染症、マラリア、敗血症、デング熱、ウエストナイルウイルス、毒素性ショック症候群、レプトスピラ症、又はウイルス性出血熱である、請求項２２に記載の方法。
【請求項２９】
2種以上の抗体のコレクション及び適切な緩衝液を含む組成物であって、前記組成物は、病気を有すると疑われる試験個体から単離したサンプルの少なくとも2種のタンパク質バイオマーカーに選択的に結合可能であり、前記タンパク質バイオマーカーは、表1に示す補体断片C5a(C5a)、アンジオポエチン-1(Ang-1)、アンジオポエチン-2(Ang-2)、10kDaのインターフェロンγ誘導タンパク質(IP-10)、免疫グロブリン様ループと上皮成長因子ドメイン-2を有する可溶性チロシンキナーゼ(sTie-2)、可溶性細胞内接着分子-1(sICAM-1)、血管内皮成長因子A(VEGF)、可溶性血管内皮成長因子受容体1(sFlt-1)、キチナーゼ3様タンパク質1(CHI3L1)、骨髄系細胞-1に発現する可溶性誘発性受容体(sTREM-1)、C反応性タンパク質(CRP)、プロカルシトニン(PCT)、アンジオポエチン様タンパク質3(Ang様3)、補体D因子(D因子)、又はインターロイキン18結合タンパク質(IL18bpa)、エンドグリン(End)、p-セレクチン(p-SEL)、フォン上皮細胞可溶性Tie-2受容体(Tie-2)及びヴィルブランド因子(vWF)であり、かつ前記組成物が、前記サンプル中の前記タンパク質バイオマーカーのレベルを数量化し、前記試験個体が前記病気に対する重篤及び／又は致命的な反応を有するリスクが高いかどうかを決定するために使用される、前記組成物。
【請求項３０】
前記組成物は少なくとも3種以上の抗体のコレクションを含み、かつ下記タンパク質バイオマーカー：表1に示す補体断片C5a(C5a)、アンジオポエチン-1(Ang-1)、アンジオポエチン-2(Ang-2)、10kDaのインターフェロンγ誘導タンパク質(IP-10)、免疫グロブリン様ループと上皮成長因子ドメイン-2を有する可溶性チロシンキナーゼ(sTie-2)、可溶性細胞内接着分子-1(sICAM-1)、血管内皮成長因子A(VEGF)、可溶性血管内皮成長因子受容体1(sFlt-1)、キチナーゼ3様タンパク質1(CHI3L1)、骨髄系細胞-1に発現する可溶性誘発性受容体(sTREM-1)、C反応性タンパク質(CRP)、プロカルシトニン(PCT)、アンジオポエチン様タンパク質3(Ang様3)、補体D因子(D因子)、又はインターロイキン18結合タンパク質(IL18bpa)、エンドグリン(End)、p-セレクチン(p-SEL)、フォン上皮細胞可溶性Tie-2受容体(Tie-2)及びヴィルブランド因子(vWF)からの少なくとも3種のタンパク質バイオマーカーに選択的にハイブリダイズすることができる、請求項２９に記載の組成物。
【請求項３１】
前記サンプルが、全血サンプル、血清サンプル又は血漿サンプルである、請求項２８又は２９に記載の組成物。
【請求項３２】
前記組成物が、補体断片C5a(C5a)、血管内皮成長因子A(VEGF)、可溶性血管内皮成長因子受容体1(sFlt-1)、キチナーゼ3様タンパク質1(CHI3L1)、C反応性タンパク質(CRP)、アンジオポエチン様タンパク質3(Ang様3)、補体D因子(D因子)、又はインターロイキン18結合タンパク質(IL18bpa)、エンドグリン(End)、p-セレクチン(p-SEL)、フォン上皮細胞可溶性Tie-2受容体(Tie-2)及びヴィルブランド因子(vWF)である少なくとも1種のタンパク質バイオマーカーに選択的に結合することができる、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３３】
前記サンプルが、全血サンプル、血清サンプル又は血漿サンプルである、請求項３２に記載の組成物。
【請求項３４】
前記疑われる病気が、肺炎、上気道感染症、下気道感染症、インフルエンザ、大腸菌感染症、菌血症、リケッチア感染症、サルモネラ症、連鎖球菌感染症、ブドウ球菌感染症、マラリア、敗血症、デング熱、ウエストナイルウイルス、毒素性ショック症候群、レプトスピラ症、又はウイルス性出血熱である、請求項２９に記載の組成物。
【請求項３５】
治療プロトコルの投与が、病気の1つ以上の症状を呈する試験個体に役立つ可能性があるかどうかを決定する方法であって、下記工程、
(i)  前記試験個体からのサンプル中の2種以上の各タンパク質バイオマーカーのレベルを検出及び数量化する工程であって、前記試験個体の病気は診断又は差別的に診断されたことがなく、前記タンパク質バイオマーカーは、表1に示す補体断片C5a(C5a)、アンジオポエチン-1(Ang-1)、アンジオポエチン-2(Ang-2)、10kDaのインターフェロンγ誘導タンパク質(IP-10)、免疫グロブリン様ループと上皮成長因子ドメイン-2を有する可溶性チロシンキナーゼ(sTie-2)、可溶性細胞内接着分子-1(sICAM-1)、血管内皮成長因子A(VEGF)、可溶性血管内皮成長因子受容体1(sFlt-1)、キチナーゼ3様タンパク質1(CHI3L1)、骨髄系細胞-1に発現する可溶性誘発性受容体(sTREM-1)、C反応性タンパク質(CRP)、プロカルシトニン(PCT)、アンジオポエチン様タンパク質3(Ang様3)、補体D因子(D因子)、又はインターロイキン18結合タンパク質(IL18bpa)、エンドグリン(End)、p-セレクチン(p-SEL)、フォン上皮細胞可溶性Tie-2受容体(Tie-2)及びヴィルブランド因子(vWF)である、前記工程、
(ii)  前記タンパク質バイオマーカーの前記数量化レベルを、コントロール集団からの前記タンパク質バイオマーカーのコントロールレベルと比較する工程、
(iii)  工程(ii)の比較において、前記試験個体が前記治療プロトコルから利益を得る可能性があるかどうかに関しての決定を下すべく各バイオマーカーについて差別的レベルを決定する工程
を含む方法。
【請求項３６】
工程(i)の前記検出及び数量化が、前記コントロール集団と比較するために使用できる前記２種以上の各タンパク質バイオマーカーのレベルを示すデータに前記サンプルを変換するための1つ以上のデバイスを利用する、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
前記1つ以上のデバイスが、サンプルをデータに変換するために利用される酵素結合免疫アッセイである、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
前記試験個体が、前記治療プロトコルを受ける、請求項３５〜３７のいずれか1項に記載の方法。
【請求項３９】
前記コントロール集団が、(i)前記治療プロトコルから利益を得るであろう病気を有する個体の集団である、又は(ii)前記治療プロトコルから利益を得ないであろう病気を有する個体の集団である、請求項３５に記載の方法。
【請求項４０】
前記疑われる病気が、肺炎、上気道感染症、下気道感染症、インフルエンザ、大腸菌感染症、菌血症、リケッチア感染症、サルモネラ症、連鎖球菌感染症、ブドウ球菌感染症、マラリア、敗血症、デング熱、ウエストナイルウイルス、毒素性ショック症候群、レプトスピラ症、又はウイルス性出血熱である、請求項３５に記載の方法。
【請求項４１】
治療プロトコルの投与が、病気の1つ以上の症状を呈したことがある試験個体に役立つ可能性があるかどうかを決定する方法であって、下記工程、
(i)  前記試験個体からのサンプル中の2種以上の各タンパク質バイオマーカーのレベルを検出及び数量化する工程であって、前記試験個体の病気は診断又は差別的に診断されたことがなく、前記タンパク質バイオマーカーは、表1に示す補体断片C5a(C5a)、アンジオポエチン-1(Ang-1)、アンジオポエチン-2(Ang-2)、10kDaのインターフェロンγ誘導タンパク質(IP-10)、免疫グロブリン様ループと上皮成長因子ドメイン-2を有する可溶性チロシンキナーゼ(sTie-2)、可溶性細胞内接着分子-1(sICAM-1)、血管内皮成長因子A(VEGF)、可溶性血管内皮成長因子受容体1(sFlt-1)、キチナーゼ3様タンパク質1(CHI3L1)、骨髄系細胞-1に発現する可溶性誘発性受容体(sTREM-1)、C反応性タンパク質(CRP)、プロカルシトニン(PCT)、アンジオポエチン様タンパク質3(Ang様3)、補体D因子(D因子)、又はインターロイキン18結合タンパク質(IL18bpa)、エンドグリン(End)、p-セレクチン(p-SEL)、フォン上皮細胞可溶性Tie-2受容体(Tie-2)及びヴィルブランド因子(vWF)である、前記工程、
(ii)  1つ以上のコントロール集団において前記タンパク質バイオマーカーを試験することから導かれる分類指標において前記サンプルからの前記各タンパク質バイオマーカーの数量化レベルを利用する工程、
(iii)  前記分類指標の適用の結果として、前記試験個体が前記治療プロトコルから利益を得る可能性があるかどうかに関しての決定を下す工程、
を含む方法。
【請求項４２】
工程(i)の前記検出及び数量化が、前記分類指標に使用できる前記2種以上の各タンパク質バイオマーカーのレベルを示すデータに前記サンプルを変換するための１つ以上のデバイスを利用する、請求項４１に記載の方法。
【請求項４３】
前記１つ以上のデバイスが、サンプルをデータに変換するために利用される酵素結合免疫アッセイである、請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】
前記試験個体が、前記治療プロトコルを受ける、請求項４１〜４３のいずれか1項に記載の方法。
【請求項４５】
前記分類指標が、少なくとも２つのコントロール集団、すなわち前記治療プロトコルを受けることから利益を得るであろう病気を有すると診断又は差別的に診断されたことがある個体の集団並びに前記治療プロトコルを受けることから利益を得ないであろう病気を有すると診断又は差別的に診断されたことがある個体の集団から導かれる、請求項４１に記載の方法。
【請求項４６】
前記治療プロトコルを受けることから利益を得るであろう病気が細菌感染症であり、前記治療プロトコルを受けることから利益を得ないであろう病気がウイルス感染症である、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】
前記細菌感染症が、肺炎桿菌、大腸菌、黄色ブドウ球菌、シゲラ・フレックスネリ、サルモネラ菌、連鎖球菌、インフルエンザ菌、又はアシネトバクターの結果である、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
(i)前記治療プロトコルから利益を得るであろう病気を有する個体の集団のメンバーが、全て同一の細菌感染症を有するわけではない、又は(ii)前記治療プロトコルから利益を得ないであろう病気を有する個体の集団のメンバーが、全て同一のウイルス感染症を有するわけではない、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
前記治療プロトコルが抗生物質の適用である、請求項４１〜４８のいずれか1項に記載の方法。