【手続補正書】
【提出日】平成29年2月6日(2017.2.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
哺乳動物被験体への経口投与のために処方される有効量の第一型の細菌および第二型の細菌を含む組成物であって、前記第一および第二型の細菌が、(ｉ)単離され、(ｉｉ)同一でなく、ならびに(ｉｉｉ)クロストリジウム・ディフィシル増殖のために必要とされる濃度より低い閾値濃度の栄養物を有する栄養培地中で独立して増殖可能である、組成物。
【請求項２】
前記栄養物が、グルコース、マンニトール、フルクトース、Ｎ−アセチルグルコサミン(ＮＡＧ)またはＮ−アセチルノイラミン酸(ＮＡＮ)などの炭水化物栄養物を含む、請求項１記載の組成物。
【請求項３】
前記栄養物が、ビオチン、パントテン酸塩またはピリドキシンなどのビタミン栄養物を含む、請求項１記載の組成物。
【請求項４】
前記第一および第二型の細菌が、クロストリジウム・ディフィシル増殖のために必要とされる濃度より低い閾値濃度のグルコース、マンニトール、フルクトース、Ｎ−アセチルグルコサミン(ＮＡＧ)およびＮ−アセチルノイラミン酸(ＮＡＮ)、または、ビオチン、パントテン酸塩およびピリドキシン、を有する栄養培地中で独立して増殖可能である、請求項１記載の組成物。
【請求項５】
前記閾値濃度が、クロストリジウム・ディフィシル増殖のために必要とされる濃度の９０％以下、クロストリジウム・ディフィシル増殖のために必要とされる濃度の５０％以下、またはクロストリジウム・ディフィシル増殖のために必要とされる濃度の１０％、５％または１％である、請求項１から４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項６】
前記第一および第二型の細菌が、グルコース、マンニトール、フルクトース、Ｎ−アセチルグルコサミン(ＮＡＧ)およびＮ−アセチルノイラミン酸(ＮＡＮ)からなる群、またはビオチン、パントテン酸塩およびピリドキシンからなる群から選択される栄養物の濃度を有する栄養培地中でクロストリジウム・ディフィシルより少なくとも１０％または少なくとも５０％速い速度で独立して増殖可能である、請求項１記載の組成物。
【請求項７】
前記第一および第二型の細菌が、ビオチン、パントテン酸塩、ピリドキシン、グルコース、マンニトール、フルクトース、Ｎ−アセチルグルコサミン(ＮＡＧ)およびＮ−アセチルノイラミン酸(ＮＡＮ)の濃度を有する栄養培地中でクロストリジウム・ディフィシルより少なくとも１０％速い速度で独立して増殖可能である、請求項１記載の組成物。
【請求項８】
前記第一型の細菌および第二型の細菌が、１種以上の必須炭水化物栄養物、１種以上の必須アミノ酸栄養物、または１種以上の必須ビタミンまたはミネラル栄養物の限定濃度を有する栄養培地中でクロストリジウム・ディフィシルより少なくとも１０％速い速度で独立して増殖可能である、請求項１記載の組成物。
【請求項９】
前記第一および第二型の細菌が、(ｉ)単離され、(ｉｉ)同一でなく、ならびに(ｉｉｉ)クロストリジウム・ディフィシルより少なくとも１０％または少なくとも５０％速い速度で独立して糖化することができる、請求項１記載の組成物。
【請求項１０】
前記第一型の細菌が、(ｉ)単離され、(ｉｉ)前記第二型の細菌と同一でなく、ならびに(ｉｉｉ)クロストリジウム・ディフィシルより少なくとも１０％速い速度で独立して糖化することができ、前記第二型の細菌が、(ｉ)単離され、(ｉｉ)前記第一型の細菌と同一でなく、ならびに(ｉｉｉ)クロストリジウム・ディフィシルより少なくとも１０％より速い速度で、またはクロストリジウム・ディフィシルより少なくとも１０％低い濃度で、あるいはその組み合わせで、グルコース、マンニトール、フルクトース、Ｎ−アセチルグルコサミン(ＮＡＧ)およびＮ−アセチルノイラミン酸(ＮＡＮ)からなる群から選択される栄養物を独立して解糖することができる、請求項１記載の組成物。
【請求項１１】
前記栄養物が、炭素含有栄養物である、請求項１記載の組成物。
【請求項１２】
前記第一型の細菌が、(ｉ)単離され、(ｉｉ)前記第二型の細菌と同一でなく、ならびに(ｉｉｉ)クロストリジウム・ディフィシルより少なくとも１０％速い速度で独立して糖化することができ、前記第二型の細菌が、(ｉ)単離され、(ｉｉ)前記第一型の細菌と同一でなく、ならびに(ｉｉｉ)前記第一型の細菌および前記第二型の細菌が前記被験体の消化管に機能的に住み着き、且つクロストリジウム・ディフィシルによる消化管の個体群を防止するような条件下において、クロストリジウム・ディフィシルより少なくとも１０％より速い速度で、またはクロストリジウム・ディフィシルより少なくとも１０％低い濃度で、あるいはその組合せで、グルコース、マンニトール、フルクトース、Ｎ−アセチルグルコサミン(ＮＡＧ)およびＮ−アセチルノイラミン酸(ＮＡＮ)からなる群から選択される栄養物を独立して解糖することができ、哺乳動物被験体におけるクロストリジウム・ディフィシル感染の処置のための方法に用いられる請求項１記載の組成物であって、該方法が、有効量の組成物を前記被検体に経口投与するステップを含む、組成物。
【請求項１３】
哺乳動物被験体への経口投与のために処方される有効量の第一型の細菌および第二型の細菌を含み、前記第一型および第二型の細菌が、(ｉ)単離され、(ｉｉ)同一でなく、ならびに(ｉｉｉ)前記第一型の細菌および前記第二型の細菌が前記被験体の消化管に機能的に住み着き、且つクロストリジウム・ディフィシルによる消化管の個体群を防止するような条件下において、クロストリジウム・ディフィシル増殖のために必要とされる濃度より低い閾値濃度の炭素含有栄養物を有する栄養培地中で増殖可能であり、哺乳動物被験体におけるクロストリジウム・ディフィシル感染の処置のための方法に用いられる組成物であって、該方法が、有効量の前記組成物を被験体に経口投与するステップを含む、組成物。
【請求項１４】
哺乳動物被験体への経口投与のために処方される有効量の第一型の細菌を含み、前記第一型の細菌が、(ｉ)単離され、ならびに(ｉｉ)前記第一型の細菌が被験体の消化管に機能的に住み着き、且つ前記細菌性病原体または前記細菌病原性片利共生菌による消化管の個体群を防止するような条件下において、前記細菌性病原体または前記細菌病原性片利共生菌のために必要とされる濃度より低い閾値濃度の栄養物を有する栄養培地中で増殖可能であり、哺乳動物被験体における細菌性病原体または細菌病原性片利共生菌の感染の処置のための方法に用いられる組成物であって、該方法が、有効量の前記組成物を被験体に経口投与するステップを含む、組成物。
【請求項１５】
哺乳動物被験体におけるクロストリジウム・ディフィシル感染の処置のための方法に用いられる、または哺乳動物被験体における細菌性病原体または細菌病原性片利共生菌の感染の処置のための方法に用いられる、請求項１〜１４の何れかに記載の組成物であって、方法が、有効量の前記組成物を被験体に経口投与するステップを含む、組成物。
【請求項１６】
ａ）複数の細菌種を選定する工程、
ｂ）各細菌種により用いられる栄養物使用を、クロストリジウム・ディフィシルにより用いられる栄養物の一覧と相互参照する工程、
ｃ）クロストリジウム・ディフィシル栄養物との栄養物使用の重複に関して、細菌種を順位分けする工程、及び
ｄ）少なくとも２種の上位ランクの細菌種を含む細菌組成物を調製して、哺乳動物被験体におけるクロストリジウム・ディフィシル感染の処置のための組成物を選定する工程、を含む、哺乳類動物被験体におけるクロストリジウム・ディフィシル感染の処置のための組成物を選定する方法。
【請求項１７】
前記細菌組成物をクロストリジウム・ディフィシル感染の予防用マウスモデル用いてアッセイすることを更に含む、請求項１６記載の方法。
【請求項１８】
少なくとも２種の細菌種が、上位５０％に等級分けされる種に由来する、請求項１６又は請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
２種の細菌種が、上位３種の細菌種から選択される、請求項１６に記載の方法。
【請求項２０】
前記細菌組成物が、３種の細菌種を含む、請求項１６〜１８の何れか一項に記載の方法。
【請求項２１】
前記３種の細菌種が、上位３種の細菌種から選択される、請求項２０記載の方法。
【請求項２２】
前記細菌組成物が４種の細菌種を含む、請求項１６〜１８の何れか一項に記載の方法。