【手続補正書】
【提出日】平成29年7月7日(2017.7.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）被験者の生物学的試料中の、フィーカリバクテリウム・プラウスニッツィに特異的なＣＤ４＋ＣＤ８αα低いＦｏｘｐ３陰性表現型を有する制御性Ｔリンパ球の数及び／又は濃度及び／又は比率を決定する工程；
；及び
（ｂ）工程（ａ）の結果（群）から、被験者が炎症性腸疾患に患っているかどうかを推定する工程
を含む、被験者が炎症性腸疾患を患っているかどうかをインビトロで決定する方法。
【請求項２】
工程（ａ）及び（ｂ）の間に；
（ａ１）工程（ａ）の結果を、ｉ）健康な被験者の同質の生物学的試料中に典型的に見られるこれらの制御性Ｔリンパ球の数及び／若しくは濃度及び／若しくは比率に対応する対照標準値と、並びに／又は、ｉｉ）炎症性腸疾患を患う患者の同質の生物学的試料中に典型的に見られるこれらの制御性Ｔリンパ球の数及び／若しくは濃度及び／若しくは比率に対応する対照標準値とを比較する工程を含み、
工程（ｂ）が、工程（ａ）及び／又は工程（ａ１）の結果から、被験者が炎症性腸疾患を患っているかどうかを推定することを含む、
請求項１記載のインビトロの方法。
【請求項３】
患者の生物学的試料中の、Ｆ．プラウスニッツィに特異的なＣＤ４＋ＣＤ８αα低いＦｏｘｐ３陰性表現型を有する制御性Ｔリンパ球の数及び／又は濃度及び／又は比率を決定する工程を含む、炎症性腸疾患を患っている患者における炎症性腸疾患の転帰をインビトロで予後予測する方法。
【請求項４】
以下の工程：
（ａ）患者の生物学的試料中の、Ｆ．プラウスニッツィに特異的なＣＤ４＋ＣＤ８αα低いＦｏｘｐ３陰性表現型を有する制御性Ｔリンパ球の数及び／又は濃度及び／又は比率を決定する工程；及び
（ｂ）工程ａ）の結果から該患者の予後を推定する工程
を含む、請求項３記載の炎症性腸疾患の転帰をインビトロで予後予測する方法。
【請求項５】
被験者が炎症性腸疾患を発症するリスクがあるかどうかをインビトロで予測する方法であって、
ａ）被験者の生物学的試料中の、Ｆ．プラウスニッツィに特異的なＣＤ４＋ＣＤ８αα低いＦｏｘｐ３陰性表現型を有する制御性Ｔリンパ球の数及び／又は濃度及び／又は比率を決定する工程；
ｂ）同質の試料についての参照値に比べて工程（ａ）の低い数値は該被験者が炎症性腸疾患を発症するリスクがあることを示すものとして、工程（ａ）の結果から該被験者が炎症性腸疾患を患うリスクがあるかどうかを予測する工程
を含む、方法。
【請求項６】
処置の最中の被験者の生物学的試料中の、Ｆ．プラウスニッツィに特異的なＣＤ４＋ＣＤ８αα低いＦｏｘｐ３陰性表現型を有する制御性Ｔリンパ球の数及び／又は濃度及び／又は比率をモニタリングする工程を含む、炎症性腸疾患の予防的又は治療的処置の効力をインビトロでモニタリングする方法。
【請求項７】
炎症性腸疾患がクローン病である、請求項１〜６のいずれか一項記載の方法。
【請求項８】
生物学的試料が、大腸粘膜試料、消化管の生検試料、大腸生検試料、小腸生検試料、血液試料、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）及び末梢血リンパ球（ＰＢＬ）を含む血液分画からなる群より選択される、請求項１〜７のいずれか一項記載の方法。
【請求項９】
炎症性腸疾患の処置用の医薬品としての使用のためのＦ．プラウスニッツィに特異的なＣＤ４＋ＣＤ８αα低いＦｏｘｐ３陰性表現型を有する制御性Ｔリンパ球。
【請求項１０】
Ｆ．プラウスニッツィに特異的なＣＤ４＋ＣＤ８αα低いＦｏｘｐ３陰性表現型を有する制御性Ｔリンパ球が、処置しようとする被験者から得られた自己リンパ球である、請求項９記載の使用のための制御性Ｔリンパ球。
【請求項１１】
Ｆ．プラウスニッツィに特異的なＣＤ４＋ＣＤ８αα低いＦｏｘｐ３陰性表現型を有する制御性Ｔリンパ球が、一次培養細胞又は樹立細胞株である、請求項９又は１０記載の使用のための制御性Ｔリンパ球。
【請求項１２】
炎症性腸疾患の処置においてＦ．プラウスニッツィに特異的なＣＤ４＋ＣＤ８αα低いＦｏｘｐ３陰性表現型を有する制御性Ｔリンパ球を活性化及び／又はその増殖を誘導するための医薬品としての使用のための、
（ｉ）Ｆ．プラウスニッツィ菌株；及び／又は
（ｉｉ）弱毒生菌Ｆ．プラウスニッツィ株；及び／又は
（ｉｉｉ）死菌Ｆ．プラウスニッツィ株；及び／又は
（ｉｖ）（ｉ）、（ｉｉ）及び（ｉｉｉ）の少なくとも１つの菌株の少なくとも１つの断片；及び／又は
（ｖ）（ｉ）、（ｉｉ）、（ｉｉｉ）及び（ｉｖ）の少なくとも１つが負荷された抗原提示細胞（ＡＰＣ）
を含む組成物。
【請求項１３】
抗原提示細胞が、処置しようとする被験者から得られた抗原提示細胞である、請求項１２記載の使用のための組成物。
【請求項１４】
Ｆ．プラウスニッツィに特異的なＣＤ４＋ＣＤ８αα低いＦｏｘｐ３陰性表現型を有する制御性Ｔリンパ球の数及び／又は濃度及び／又は比率を決定するための手段を含む、ＩＢＤを発症するリスクを診断、予後予測及び／若しくは予測するための、並びに／又はＩＢＤの処置の効力をモニタリングするためのキット。
【請求項１５】
−包装材料；
−既知の量の：
（ｉ）Ｆ．プラウスニッツィに特異的なＣＤ４＋ＣＤ８αα低いＦｏｘｐ３陰性表現型を有する単離された制御性Ｔリンパ球集団、又はその医薬組成物；及び／又は
（ｉｉ）単離されたＦ．プラウスニッツィ菌株、又はその医薬組成物；及び／又は
（ｉｉｉ）単離された弱毒生菌Ｆ．プラウスニッツィ株、又はその医薬組成物；及び／又は
（ｉｖ）単離された死菌Ｆ．プラウスニッツィ株、又はその医薬組成物；及び／又は
（ｖ）（ｉｉ）、（ｉｉｉ）及び（ｉｖ）の少なくとも１つの菌株の少なくとも１つの断片、又はその医薬組成物；及び／又は
（ｖｉ）（ｉ）、（ｉｉ）、（ｉｉｉ）及び（ｉｖ）の少なくとも１つが負荷された；混合物（ｉｉ）、（ｉｉｉ）、（ｉｖ）及び（ｖ）の少なくとも１つが負荷された、抗原提示細胞（ＡＰＣ）、又はその医薬組成物
を含む、炎症性腸疾患を処置又は予防するためのキット。
【請求項１６】
ＡＰＣが、単離されたＡＰＣである、請求項１５記載のキット。
【請求項１７】
キットが、前記包装材料と共に含まれるラベル又は添付文書を含み、そこには「薬物」（ｉ）〜（ｖｉ）又はその医薬組成物が、ＩＢＤを患う又はＩＢＤを発症するリスクのある被験者におけるＩＢＤの予防及び／又は処置において有効であることが示されている、請求項１５又は１６記載のキット。
【請求項１８】
ＩＢＤが、クローン病である、請求項１５〜１７のいずれか一項記載のキット。
【請求項１９】
ａ）Ｆ．プラウスニッツィの存在下でＡＰＣ（抗原提示細胞）を培養し、これによりＦ．プラウスニッツィが負荷されたＡＰＣを得る工程、及び
ｂ）未感作ＣＤ４ Ｔ細胞を、
○工程ａ）で得られたＦ．プラウスニッツィの負荷されたＡＰＣの存在下で培養し、これにより、Ｆ．プラウスニッツィに特異的なＣＤ４＋ＣＤ８αα低いＦｏｘｐ３陰性表現型を有する制御性Ｔリンパ球を得る工程
を含む、Ｆ．プラウスニッツィに特異的なＣＤ４＋ＣＤ８αα低いＦｏｘｐ３陰性表現型を有する制御性Ｔリンパ球を得るためのプロセス。
【請求項２０】
工程（ａ）で、Ｆ．プラウスニッツィ及び酪酸塩の存在下でＡＰＣを培養する、請求項１９記載のプロセス。
【請求項２１】
工程（ｂ）で、未感作ＣＤ４  Ｔ細胞をＩＬ−２及び／又は酪酸塩の存在下で培養する、請求項１９又は２０記載のプロセス。