【手続補正書】
【提出日】平成29年11月2日(2017.11.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ポリ（ADP-リボース）ポリメラーゼファミリーメンバー9（PARP9）の阻害剤および／またはポリ（ADP-リボース）ポリメラーゼファミリーメンバー14（PARP14）の活性化剤を含む、(a)マクロファージの活性化を阻害するための、または(b)炎症促進性マクロファージの活性化を阻害するための、または(c)過度もしくは持続性の炎症を阻害するための、または(d)アテローム動脈硬化症および／もしくは血管疾患を治療するもしくは予防するための、薬学的組成物。
【請求項２】
PARP9阻害剤および／またはPARP14活性化剤の脂質封入製剤を含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項３】
PARP9阻害剤が、PARP9の発現を阻害するかまたはPARP9タンパク質の活性を阻害する、請求項1または2記載の薬学的組成物。
【請求項４】
PARP9阻害剤が、PARP9に対する抗体またはその抗原結合性断片、小分子、および核酸からなる群より選択される、請求項1〜3のいずれか一項記載の薬学的組成物。
【請求項５】
核酸が、PARP9特異的RNA干渉剤、またはPARP9特異的RNA干渉剤をコードするベクターである、請求項4記載の薬学的組成物。
【請求項６】
RNA干渉剤が、PARP9核酸配列とハイブリダイズする、請求項5記載の薬学的組成物。
【請求項７】
RNA干渉剤が、GENBANK（商標）アクセッション番号BC039580を有するヒトPARP9遺伝子由来の核酸配列を含む、請求項5または請求項6記載の薬学的組成物。
【請求項８】
RNA干渉剤が、SEQ ID NO:1〜28、33〜36、および41〜44からなる群より選択される1つまたは複数のヌクレオチド配列を含む、請求項5〜7のいずれか一項記載の薬学的組成物。
【請求項９】
PARP14活性化剤が、PARP14の発現および／またはPARP14タンパク質の活性を増加させる、請求項1〜8のいずれか一項記載の薬学的組成物。
【請求項１０】
PARP14活性化剤が、PARP9に対する抗体またはその抗原結合性断片、小分子、および核酸からなる群より選択される、請求項9記載の薬学的組成物。
【請求項１１】
(a)マクロファージの活性化を阻害するための、または(b)炎症促進性マクロファージの活性化を阻害するための、または(c)過度もしくは持続性の炎症を阻害するための、または(d)アテローム動脈硬化症および／もしくは血管疾患を治療するもしくは予防するための、医薬の製造における、ポリ（ADP-リボース）ポリメラーゼファミリーメンバー9（PARP9）の阻害剤および／またはポリ（ADP-リボース）ポリメラーゼファミリーメンバー14（PARP14）の活性化剤の使用。
【請求項１２】
PARP9阻害剤および／またはPARP14活性化剤の脂質封入製剤を含む、請求項11記載の使用。
【請求項１３】
PARP9阻害剤が、PARP9の発現を阻害するかまたはPARP9タンパク質の活性を阻害する、請求項11または12記載の使用。
【請求項１４】
PARP9阻害剤が、PARP9に対する抗体またはその抗原結合性断片、小分子、および核酸からなる群より選択される、請求項11〜13のいずれか一項記載の使用。
【請求項１５】
核酸が、PARP9特異的RNA干渉剤、またはPARP9特異的RNA干渉剤をコードするベクターである、請求項14記載の使用。
【請求項１６】
RNA干渉剤が、PARP9核酸配列とハイブリダイズする、請求項15記載の使用。
【請求項１７】
RNA干渉剤が、GENBANK（商標）アクセッション番号BC039580を有するヒトPARP9遺伝子由来の核酸配列を含む、請求項15または請求項16記載の使用。
【請求項１８】
RNA干渉剤が、SEQ ID NO:1〜28、33〜36、および41〜44からなる群より選択される1つまたは複数のヌクレオチド配列を含む、請求項15〜17のいずれか一項記載の使用。
【請求項１９】
PARP14活性化剤が、PARP14の発現および／またはPARP14タンパク質の活性を増加させる、請求項11〜18のいずれか一項記載の使用。
【請求項２０】
PARP14活性化剤が、PARP9に対する抗体またはその抗原結合性断片、小分子、および核酸からなる群より選択される、請求項19記載の使用。
【請求項２１】
マクロファージの活性化の阻害、または炎症促進性マクロファージの活性化の阻害、または過度もしくは持続性の炎症の阻害、またはアテローム動脈硬化症および／もしくは血管疾患の治療もしくは予防が、炎症促進性M1の極性化を阻害することを含む、請求項1〜10のいずれか一項記載の薬学的組成物または請求項11〜20のいずれか一項記載の使用。
【請求項２２】
マクロファージの活性化の阻害、または炎症促進性マクロファージの活性化の阻害、または過度もしくは持続性の炎症の阻害、またはアテローム動脈硬化症および／もしくは血管疾患の治療もしくは予防が、炎症促進性M1遺伝子の抑制を含む、請求項1〜10のいずれか一項記載の薬学的組成物または請求項11〜20のいずれか一項記載の使用。
【請求項２３】
抑制される炎症促進性M1遺伝子が、腫瘍壊死因子アルファ（TNF-α）、インターロイキン1β（IL-1β）および誘導型一酸化窒素合成酵素（iNOS）からなる群より選択される、請求項22記載の薬学的組成物または使用。
【請求項２４】
マクロファージの活性化の阻害、または炎症促進性マクロファージの活性化の阻害、または過度もしくは持続性の炎症の阻害、またはアテローム動脈硬化症および／もしくは血管疾患の治療もしくは予防が、抗炎症性M2のマーカーの発現を増加させることを含む、請求項1〜10のいずれか一項記載の薬学的組成物または請求項11〜20のいずれか一項記載の使用。
【請求項２５】
抗炎症性M2のマーカーが、アルギナーゼ1（Arg1）またはマンノース受容体Cタイプ1（MRC1）である、請求項24記載の薬学的組成物または使用。
【請求項２６】
a.  単球またはマクロファージの集団を提供する段階；および
b.  単球またはマクロファージの集団を、ポリ（ADP-リボース）ポリメラーゼファミリーメンバー9（PARP9）の阻害剤および／またはポリ（ADP-リボース）ポリメラーゼファミリーメンバー14（PARP14）の活性化剤を含む組成物の有効量とエクスビボまたはインビトロで接触させる段階
を含む、マクロファージの活性化を阻害するエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項２７】
マクロファージの活性化の阻害が、炎症促進性M1の極性化を阻害することを含む、請求項26記載のエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項２８】
マクロファージの活性化の阻害が、炎症促進性M1遺伝子の抑制を含む、請求項26または27記載のエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項２９】
抑制される炎症促進性M1遺伝子が、腫瘍壊死因子アルファ（TNF-α）、インターロイキン1β（IL-1β）および誘導型一酸化窒素合成酵素（iNOS）からなる群より選択される、請求項28記載のエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項３０】
マクロファージM1の活性化の阻害が、抗炎症性M2のマーカーの発現を増加させることを含む、請求項26〜29のいずれか一項記載のエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項３１】
抗炎症性M2のマーカーが、アルギナーゼ1（Arg1）またはマンノース受容体Cタイプ1（MRC1）である、請求項30記載のエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項３２】
組成物が、PARP9阻害剤および／またはPARP14活性化剤の脂質封入製剤を含む、請求項26〜31のいずれか一項記載のエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項３３】
PARP9阻害剤が、PARP9の発現を阻害するかまたはPARP9タンパク質の活性を阻害する、請求項26〜32のいずれか一項記載のエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項３４】
PARP9阻害剤が、PARP9に対する抗体またはその抗原結合性断片、小分子、および核酸からなる群より選択される、請求項26〜33のいずれか一項記載のエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項３５】
核酸が、PARP9特異的RNA干渉剤、またはPARP9特異的RNA干渉剤をコードするベクターである、請求項34記載のエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項３６】
RNA干渉剤が、PARP9核酸配列とハイブリダイズする、請求項35記載のエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項３７】
RNA干渉剤が、GENBANK（商標）アクセッション番号BC039580を有するヒトPARP9遺伝子由来の核酸配列を含む、請求項35または36記載のエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項３８】
RNA干渉剤が、SEQ ID NO:1〜28、33〜36、および41〜44からなる群より選択される1つまたは複数のヌクレオチド配列を含む、請求項35〜37のいずれか一項記載のエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項３９】
PARP14活性化剤が、PARP14の発現および／またはPARP14タンパク質の活性を増加させる、請求項26〜38のいずれか一項記載のエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項４０】
PARP14活性化剤が、PARP9に対する抗体またはその抗原結合性断片、小分子、および核酸からなる群より選択される、請求項39記載のエクスビボまたはインビトロ方法。
【請求項４１】
過度または持続性の炎症が、アテローム動脈硬化症、血管疾患、肥満症、2型糖尿病、血管炎、肢虚血、静脈グラフト疾患、動静脈瘻および／またはグラフト、脂肪肝疾患、脳卒中後の脳損傷、脳外傷、急性心筋梗塞後の心臓リモデリング、心臓弁疾患、組織工学による器官、移植器官、がん、ゴーシェ病、自己免疫性または自己炎症性疾患、および炎症性腸疾患からなる群より選択される状態において見出される、請求11〜25のいずれか一項記載の使用。
【請求項４２】
自己免疫性または自己炎症性疾患が、関節リウマチ、エリテマトーデス、およびベーチェット病からなる群より選択される、請求項41記載の使用。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２１２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２１２】
任意の一方法の一態様では、ベクターは、テトラサイクリン誘導性ベクターなどの制御可能なベクターである。例えば、pTet-Onベクター（BD Biosciences Clontech, Palo Alto, CA）を使用してWangら、Proc. Natl. Acad. Sci. 100: 5103-5106に記載されている方法を用いることができる。一態様では、本明細書記載の方法に使用されるRNA干渉剤は、ベクターを使用せずに、静脈内注射、例えば水力学的注射後に、インビボで細胞によって能動的に取り込まれるが、これは、RNA干渉剤の効率的なインビボ送達を例証している。siRNAを送達するための一方法は、標的器官の血液供給血管のカテーテル挿入である。例えば、ベクター、例えばプラスミドまたはウイルスベクター、例えばレンチウイルスベクターによる送達などの、本発明の方法に使用されるRNA干渉剤、例えばsiRNAまたはshRNAの送達のための他の戦略も、採用され得る。そのようなベクターは、例えば、Xiao-Feng Qinら、Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 100: 183-188に記載のように使用することができる。他の送達方法には、RNA干渉剤を塩基性ペプチド、例えばTATペプチドの断片とコンジュゲーションまたは混合することによって塩基性ペプチドを用いる、陽イオン性脂質と混合する、または粒子に製剤化する、本発明のRNA干渉剤、例えばsiRNAまたはshRNAの送達が含まれる。RNA干渉剤、例えばPARP9 mRNAを標的化するsiRNAは、単独で、または他のRNA干渉剤、例えばsiRNA、例えば他の細胞性遺伝子に対するsiRNAと組み合わせて送達され得る。PARP9 siRNAは、また、酸化ストレスに関連する疾患または障害、特に呼吸器疾患を、より著しくは喘息を、治療または予防するために使用される他の医薬品と組み合わせて投与され得る。shRNA分子を含む合成siRNA分子は、当業者に公知のいくつかの技法を用いて得ることができる。例えば、siRNA分子は、適切に保護されたリボヌクレオシドホスホルアミダイトおよび従来型DNA/RNA合成装置を使用するなどして、当技術分野において公知の方法を用いて化学合成または組換え産生することができる（例えば、Elbashir, S.M. et al. (2001) Nature 411:494-498; Elbashir, S.M., W. Lendeckel and T. Tuschl (2001) Genes & Development 15:188-200; Harborth, J. et al . (2001) J. Cell Science 114:4557-4565; Masters, J.R. et al. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci., USA 98:8012-8017;およびTuschl, T. et al . (1999) Genes & Development 13:3191-3197参照)。あるいは、非限定的に、Proligo（Hamburg, Germany）、Dharmacon Research（Lafayette, CO, USA）、Pierce Chemical（Perbio Scienceの一部門、Rockford, IL, USA）、Glen Research（Sterling, VA, USA）、ChemGenes（Ashland, MA, USA）、およびCruachem（Glasgow, UK）を含むいくつかの商業的RNA合成供給業者が利用可能である。このように、siRNA分子は、合成が過度に困難ではなく、RNAiに適切な品質で容易に提供される。加えて、dsRNAは、プラスミドベクター、レトロウイルスおよびレンチウイルスによってコードされるステムループ構造として発現することができる（Paddison, P.J. et al. (2002) Genes Dev. 16:948-958; McManus, M.T. et al. (2002) RNA 8:842-850; Paul, C.P. et al. (2002) Nat. Biotechnol. 20:505-508; Miyagishi, M. et al. (2002) Nat. Biotechnol. 20:497-500; Sui, G. et al. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci., USA 99:5515-5520; Brummelkamp, T. et al. (2002) Cancer Cell 2:243; Lee, N.S., et al. (2002) Nat. Biotechnol. 20:500-505; Yu, J.Y., et al. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci., USA 99:6047-6052; Zeng, Y., et al. (2002) Mol. Cell 9:1327-1333; Rubinson, D.A., et al. (2003) Nat. Genet. 33:401-406; Stewart, S.A., et al. (2003) RNA 9:493-501）。これらのベクターは、一般的に、dsRNAの上流にpolIIIプロモーターを有し、別々におよび／またはヘアピン構造としてセンスおよびアンチセンスRNA鎖を発現することができる。細胞内で、Dicerは、低分子ヘアピン型RNA（shRNA）を有効なsiRNAにプロセシングする。本発明のsiRNA分子の標的化領域は、開始コドンの約25〜50ヌクレオチド、約50〜75ヌクレオチド、または約75〜100ヌクレオチド下流から開始する、所与の標的遺伝子配列、例えばPARP9コード配列より選択することができる。ヌクレオチド配列は、5'または3' UTRおよび開始コドン近くの領域を含み得る。本発明のsiRNA分子を設計する一方法は、23個のヌクレオチド配列モチーフAA(N19)TT（SEQ. ID. NO. 63）（式中、Nは任意のヌクレオチドであることができる）を特定する段階および少なくとも25％、30％、35％、40％、45％、50％、55％、60％、65％、70％または75％のG/C含量を有するヒットを選択する段階を含む。配列の「TT」部分は随意である。あるいは、そのような配列が見つからないならば、モチーフNA(N21)（式中、Nは任意のヌクレオチドであることができる）を用いて検索を延長してもよい。この状況では、センスsiRNAの3'末端が、TTに変換されて、センスおよびアンチセンスの3'オーバーハングの配列組成に対して対称な二重鎖の発生を可能にし得る。次に、アンチセンスsiRNA分子は、ヌクレオチド23個の配列モチーフのヌクレオチド位置1〜21の相補物として合成され得る。対称な3'TTオーバーハングの使用は、低分子干渉リボヌクレオタンパク質粒子（siRNP）が、ほぼ等しい比のセンスおよびアンチセンス標的RNA切断性siRNPを有して形成されることを確実にするために有利であり得る（Elbashir et al., (2001)前記およびElbashir et al., 2001、前記）。非限定的に、NCBI、BLAST、DerwentおよびGenSeqを含む配列データベースの解析、ならびにOLIGOENGINE（登録商標）などの商業的に利用可能なオリゴ合成会社も使用してESTライブラリーに対するsiRNA配列を選択して、遺伝子が1つだけ標的化されることを確実にしてもよい。