【手続補正書】
【提出日】平成29年11月6日(2017.11.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ジスルフィド結合を有する１つ又は複数の成分（ｉ）を含むポリヌクレオチド構築物であって、前記１つ又は複数の成分の各々が、前記ポリヌクレオチド構築物のヌクレオチド間架橋基又は末端基に結合しており、且つ前記１つ又は複数の成分（ｉ）の各々が、前記ジスルフィド基に対して近位の１つ又は複数の嵩高い基を含有し；
前記１つ又は複数の成分（ｉ）が、前記ジスルフィド結合を前記末端基に連結するアルキレン基を含むとき、前記末端基と前記ジスルフィド基との間の原子の数は、２、３、４、若しくは５であり；
前記１つ又は複数の成分（ｉ）は、前記ジスルフィド結合を前記ヌクレオチド間架橋基に連結するアルケニレンを含まない、ポリヌクレオチド構築物。
【請求項２】
ジスルフィド結合を有する１つ又は複数の成分（ｉ）を含むポリヌクレオチド構築物であって、前記１つ又は複数の成分（ｉ）の各々が、前記ポリヌクレオチド構築物のヌクレオチド間架橋基又は末端基に結合しており、且つ前記１つ又は複数の成分（ｉ）の各々が、前記ジスルフィド結合と前記ヌクレオチド間架橋基又は前記末端基のリン原子との間の鎖内に少なくとも４個の原子を含有し；
前記鎖が、リン酸塩、アミド、エステル、若しくはアルケニレンを含有せず；
前記鎖が、アルキレン基を含むとき、前記末端基と前記ジスルフィド基との間の原子の数は、４又は５である、ポリヌクレオチド構築物。
【請求項３】
前記１つ又は複数の成分（ｉ）が各々、独立に、（Ｒ4）r−Ｌ−Ａ1−Ｓ−Ｓ−Ａ2−Ａ3−Ａ4−の構造を有する基を含み、
式中、Ａ1は、１つ又は複数の任意選択で置換されたＮ、Ｏ、−Ｓ、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ2〜6アルケニレン；任意選択で置換されたＣ2〜6アルキニレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換された（Ｃ3〜8シクロアルキル）−Ｃ1〜4−アルキレン；任意選択で置換された（Ｃ3〜8シクロアルケニル）−Ｃ1〜4−アルキレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；任意選択で置換された（Ｃ6〜14アリール）−Ｃ1〜4−アルキレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換された（Ｃ1〜9ヘテロアリール）−Ｃ1〜4−アルキレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレン；並びにＮ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換された（Ｃ1〜9ヘテロシクリル）−Ｃ1〜4−アルキレン（但し、Ａ1が、任意選択で置換されたＮ、Ｏ、及びＳの１つ又は複数を含むとき、前記任意選択で置換されたＮ、Ｏ、及びＳのいずれも、前記ジスルフィドに直接結合されない）を含む結合若しくはリンカーであり；且つＡ2は、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレン；並びにＮ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレンからなる群から選択され；或いはＡ1及びＡ2は、−Ｓ−Ｓ−と一緒に結合して、任意選択で置換された５〜１６員環を形成し；
Ａ3は、結合、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン、Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレン；Ｏ；任意選択で置換されたＮ；及びＳからなる群から選択され；
Ａ4は、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；並びにＮ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレンからなる群から選択され；
Ｌは、非存在であるか、又は１つ若しくは複数の共役部分を含む結合部分であり；且つ  Ｒ4は、水素、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキル、親水性官能基、又は小分子、ポリペプチド、炭水化物、中性有機ポリマー、陽荷電ポリマー、治療薬、ターゲティング部分、エンドソームエスケープ部分、及びこれらの組み合わせからなる群から選択される補助部分を含む基であり；
Ａ4は、前記ヌクレオチド間架橋基又は前記末端基に対して近位であり；
Ａ1又はＡ2は、−Ｓ−Ｓ−に対して近位の１つ又は複数の嵩高い基を含有する、請求項１又は２に記載のポリヌクレオチド構築物。
【請求項４】
前記１つ又は複数の成分（ｉ）の少なくとも１つが、ポリペプチド、炭水化物、中性有機ポリマー、陽荷電ポリマー、治療薬、ターゲティング部分、又はエンドソームエスケープ部分のうちの１つ又は複数をさらに含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５】
式Ｉ：
【化１】
2016537027.tif 000001
の構造、又はその塩を有するポリヌクレオチド構築物であって、
式中、ｎは、０〜１５０の数であり；
各Ｂ1は、独立に、核酸塩基であり；
各Ｘは、独立に、Ｏ、Ｓ、及び任意選択で置換されたＮからなる群から選択され；
各Ｙは、独立に、水素、ヒドロキシル、ハロ、任意選択で置換されたＣ1〜6アルコキシ、及び保護ヒドロキシル基からなる群から選択され；
各Ｙ1は、独立に、Ｈ又は任意選択で置換されたＣ1〜6アルキルであり；
各Ｚは、独立に、Ｏ又はＳであり；
Ｒ1は、Ｈ、ヒドロキシル、任意選択で置換されたＣ1〜6アルコキシ、保護ヒドロキシル基、一リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、四リン酸塩、五リン酸塩、５’キャップ、ホスホチオール、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキル、アミノ含有基、ビオチン含有基、ジゴキシゲニン含有基、コレステロール含有基、色素含有基、クエンチャー含有基、ポリペプチド、炭水化物、中性有機ポリマー、陽荷電ポリマー、治療薬、ターゲティング部分、エンドソームエスケープ部分、及びこれらの任意の組み合わせからなる群から選択されるか、又はＲ1は、
【化２】
2016537027.tif 000002
若しくはその塩であり；
Ｒ2は、Ｈ、ヒドロキシル、任意選択で置換されたＣ1〜6アルコキシ、保護ヒドロキシル基、一リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、四リン酸塩、五リン酸塩、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキル、アミノ含有基、ビオチン含有基、ジゴキシゲニン含有基、コレステロール含有基、クエンチャー含有基、ホスホチオール、ポリペプチド、炭水化物、中性有機ポリマー、陽荷電ポリマー、治療薬、ターゲティング部分、エンドソームエスケープ部分、及びこれらの任意の組み合わせからなる群から選択されるか、又はＲ2は、
【化３】
2016537027.tif 000003
若しくはその塩であり；
各Ｒ3は、独立に、非存在であるか、水素、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキル、又は式ＩＩ：
【化４】
2016537027.tif 000004
の構造を有する基であり、
式中、各Ａ1は、独立に、任意選択で置換されたＮ；Ｏ；Ｓ；任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ2〜6アルケニレン；任意選択で置換されたＣ2〜6アルキニレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換された（Ｃ3〜8シクロアルキル）−Ｃ1〜4−アルキレン；任意選択で置換された（Ｃ3〜8シクロアルケニル）−Ｃ1〜4−アルキレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；任意選択で置換された（Ｃ6〜14アリール）−Ｃ1〜4−アルキレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換された（Ｃ1〜9ヘテロアリール）−Ｃ1〜4−アルキレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレン；並びにＮ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換された（Ｃ1〜9ヘテロシクリル）−Ｃ1〜4−アルキレン（但し、Ａ1が、任意選択で置換されたＮ、Ｏ、及びＳの１つ又は複数を含むとき、前記任意選択で置換されたＮ、Ｏ、若しくはＳは、ジスルフィドに直接結合されない）のうちの１つ又は複数を含む結合若しくはリンカーであり；且つ各Ａ2は、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレン；並びにＮ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレンからなる群から選択され；或いはＡ1及びＡ2は、−Ｓ−Ｓ−と一緒に結合して、任意選択で置換された５〜１６員環を形成し；
各Ａ3は、結合、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン、Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレン；Ｏ；任意選択で置換されたＮ；及びＳからなる群から独立に選択され；
各Ａ4は、独立に、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；並びにＮ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレンからなる群から選択され；
各Ｌは、独立に、非存在であるか、又は１つ若しくは複数の共役部分を含む共役基であり；
各Ｒ4は、独立に、水素、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキル、親水性官能基、又は小分子、ポリペプチド、炭水化物、中性有機ポリマー、陽荷電ポリマー、治療薬、ターゲティング部分、エンドソームエスケープ部分、及びこれらの組み合わせからなる群から選択される補助部分を含む基であり；
各ｒは、独立に、１〜１０の整数であり；
Ｒ1、Ｒ2、及びＲ3の少なくとも１つにおいて、Ａ2、Ａ3、及びＡ4が結合して、−Ｓ−Ｓ−とＸとを連結する最も短い鎖内に少なくとも３つの原子を有する基を形成し；
少なくとも１つのＲ3は、式（ＩＩ）の前記構造を有するか、又はＲ1及びＲ2の少なくとも１つは、
【化５】
2016537027.tif 000005
又はその塩であり；
Ｒ1又はＲ2が、
【化６】
2016537027.tif 000006
若しくはその塩（ここで、Ａ2、Ａ3、及びＡ4は結合して、アルキレン基を形成する）であるとき、前記アルキレン基は、Ｃ4〜5アルキレンであり；或いは
Ｒ1又はＲ2が、
【化７】
2016537027.tif 000007
若しくはその塩であるとき、前記基−Ａ2−Ａ3−Ａ4−Ｘ−は、アミド、エステル、又はアルケニレンを含有しない、ポリヌクレオチド構築物。
【請求項６】
前記ジスルフィドの最大で９０％が、１つ又は複数の補助部分に連結している、請求項５に記載のポリヌクレオチド構築物。
【請求項７】
前記ポリヌクレオチド構築物中のヌクレオチドの最大で７５％が、前記ジスルフィドに連結している、請求項５〜６のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物。
【請求項８】
前記ポリヌクレオチド構築物が、５〜５０個のヌクレオチドを含む、請求項５〜７のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物。
【請求項９】
Ｌが、１〜５００個のモノマーを含み、前記モノマーの各々が、独立に、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ2〜6アルケニレン；任意選択で置換されたＣ2〜6アルキニレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレン；カルボニル；チオカルボニル；イミノ；任意選択で置換されたＮ；Ｏ；又はＳ（Ｏ）m（ここで、ｍは、０、１、若しくは２である）である、請求項５〜８のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物。
【請求項１０】
Ａ3が、結合、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；Ｏ；任意選択で置換されたＮ；及びＳからなる群から選択される、請求項５〜９のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物。
【請求項１１】
Ａ1が、結合であるか、又は任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換された（Ｃ3〜8シクロアルキル）−Ｃ1〜4−アルキレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；任意選択で置換された（Ｃ6〜14アリール）−Ｃ1〜4−アルキレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換された（Ｃ1〜9ヘテロアリール）−Ｃ1〜4−アルキレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換された（Ｃ1〜9ヘテロシクリル）−Ｃ1〜4−アルキレン；任意選択で置換されたＮ；及びＯからなる群から独立に選択される１つ又は複数の基を含む、請求項５〜１０のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物。
【請求項１２】
Ａ2が、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン、任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；又はＮ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレンである、請求項５〜１１のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物。
【請求項１３】
−Ｓ−Ｓ−Ａ2−Ａ3−Ａ4−の硫黄原子に結合した炭素原子が、アルキレン炭素原子であるとき、前記アルキレン炭素原子は、最大で１個の水素原子に連結している、請求項５〜１２のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物。
【請求項１４】
−Ｓ−Ｓ−Ａ2−Ａ3−Ａ4−の硫黄原子に結合した炭素原子が、アルケニレン炭素原子であるとき、前記アルケニレン炭素原子は、水素原子に連結していない、請求項５〜１２のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物。
【請求項１５】
（Ｒ4）r−Ｌ−Ａ1−Ｓ−Ｓ−の硫黄原子に結合した炭素原子が、アルキレン炭素原子であるとき、前記炭素原子は、最大で１個の水素原子に連結している、請求項５〜１４のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物。
【請求項１６】
Ａ1及びＡ2が、これらが結合した−Ｓ−Ｓ−と一緒に結合して、任意選択で置換された５〜１６員環を形成する、請求項５〜１０のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物。
【請求項１７】
Ｒ1が、Ｈ、ヒドロキシル、任意選択で置換されたＣ1〜6アルコキシ、保護ヒドロキシル基、一リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキル、アミノ含有基、ビオチン含有基、ポリペプチド、炭水化物、中性有機ポリマー、陽荷電ポリマー、治療薬、ターゲティング部分、エンドソームエスケープ部分、及びこれらの任意の組み合わせからなる群から選択される、請求項５〜１６のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物。
【請求項１８】
Ｒ2が、Ｈ、ヒドロキシル、任意選択で置換されたＣ1〜6アルコキシ、保護ヒドロキシル基、一リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキル、アミノ含有基、ビオチン含有基、ポリペプチド、炭水化物、中性有機ポリマー、陽荷電ポリマー、治療薬、ターゲティング部分、エンドソームエスケープ部分、及びこれらの任意の組み合わせからなる群から選択される、請求項５〜１７のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物。
【請求項１９】
ポリヌクレオチドの１つ又は複数のヌクレオチド間架橋基又は末端ヌクレオチド基に結合した式（Ｖ）：
【化８】
2016537027.tif 000008
の１つ又は複数の基、又はその塩を含み、
式中、
各Ｌは、独立に、結合又は１つ若しくは複数の共役部分を含む共役基であり；
各Ｒ4は、独立に、水素、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキル、親水性官能基、又は小分子、ポリペプチド、炭水化物、中性有機ポリマー、陽荷電ポリマー、治療薬、ターゲティング部分、エンドソームエスケープ部分、及びこれらの組み合わせからなる群から選択される補助部分を含む基であり；
各ｒは、独立に、１〜１０の整数であり；且つ
各Ａ5は、独立に：
【化９】
2016537027.tif 000009
からなる群から選択され、
各Ｒ9は、独立に、ハロ、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキル；任意選択で置換されたＣ2〜6アルケニル；任意選択で置換されたＣ2〜6アルキニル；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキル；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニル；任意選択で置換された（Ｃ3〜8シクロアルキル）−Ｃ1〜4−アルキル；任意選択で置換された（Ｃ3〜8シクロアルケニル）−Ｃ1〜4−アルキル；任意選択で置換されたＣ6〜14アリール；任意選択で置換された（Ｃ6〜14アリール）−Ｃ1〜4−アルキル；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリール；Ｎ、Ｏから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換された（Ｃ1〜9ヘテロアリール）−Ｃ1〜4−アルキル；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリル；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換された（Ｃ1〜9ヘテロシクリル）−Ｃ1〜4−アルキル；アミノ；又は任意選択で置換されたＣ1〜6アルコキシであり；或いは２つの隣接するＲ9基は、前記Ｒ9が各々結合した原子と一緒に結合して、Ｃ6アリール、Ｃ2〜5ヘテロシクリル、又はＣ2〜5ヘテロアリールからなる群から選択される環状基を形成し、前記環状基は、任意選択で、Ｃ2〜7アルカノイル；Ｃ1〜6アルキル；Ｃ2〜6アルケニル；Ｃ2〜6アルキニル；Ｃ1〜6アルキルスルフィニル；Ｃ6〜10アリール；アミノ；（Ｃ6〜10アリール）−Ｃ1〜4−アルキル；Ｃ3〜8シクロアルキル；（Ｃ3〜8シクロアルキル）−Ｃ1〜4−アルキル；Ｃ3〜8シクロアルケニル；（Ｃ3〜8シクロアルケニル）−Ｃ1〜4−アルキル；ハロ；Ｃ1〜9ヘテロシクリル；Ｃ1〜9ヘテロアリール；（Ｃ1〜9ヘテロシクリル）オキシ；（Ｃ1〜9ヘテロシクリル）アザ；ヒドロキシ；Ｃ1〜6チオアルコキシ；−（ＣＨ2）qＣＯ2ＲA（ここで、ｑは、０〜４の整数であり、且つＲAは、Ｃ1〜6アルキル、Ｃ6〜10アリール、及び（Ｃ6〜10アリール）−Ｃ1〜4−アルキルからなる群から選択される）；−（ＣＨ2）qＣＯＮＲBＲC（ここで、ｑは、０〜４の整数であり、且つここで、ＲB及びＲCは、独立に、水素、Ｃ1〜6アルキル、Ｃ6〜10アリール、及び（Ｃ6〜10アリール）−Ｃ1〜4−アルキルからなる群から選択される）；−（ＣＨ2）qＳＯ2ＲD（ここで、ｑは、０〜４の整数であり、且つここで、ＲDは、Ｃ1〜6アルキル、Ｃ6〜10アリール、及び（Ｃ6〜10アリール）−Ｃ1〜4−アルキルからなる群から選択される）；−（ＣＨ2）qＳＯ2ＮＲEＲF（ここで、ｑは、０〜４の整数であり、且つここで、ＲE及びＲFの各々は、独立に、水素；Ｃ1〜6アルキル；Ｃ6〜10アリール；（Ｃ6〜10アリール）−Ｃ1〜4−アルキルからなる群から選択される）；チオール；Ｃ6〜10アリールオキシ；Ｃ3〜8シクロアルコキシ；（Ｃ6〜10アリール）−Ｃ1〜4−アルコキシ；（Ｃ1〜9ヘテロシクリル）−Ｃ1〜4−アルキル；（Ｃ1〜9ヘテロアリール）−Ｃ1〜4−アルキル；Ｃ3〜12シリル；シアノ；並びに−Ｓ（Ｏ）ＲH（ここで、ＲHは、水素、Ｃ1〜6アルキル、Ｃ6〜10アリール、及び（Ｃ6〜10アリール）−Ｃ1〜4−アルキルからなる群から選択される）からなる群から選択される１、２、若しくは３個の置換基で置換され；
各ｑは、独立に、０、１、２、３、又は４であり；
各ｓは、独立に、０、１、又は２であり；
式（ＩＩＩ）の基が前記ポリヌクレオチドの５’又は３’末端で結合しているとき、Ａ5は、（ｉ）、（ｘｖｉｉｉ）、（ｘｘｖ）、（ｘｘｖｉ）、（ｘｘｖｉｉ）又は（ｘｘｖｉｉｉ）ではない、ポリヌクレオチド構築物。
【請求項２０】
相補的ポリヌクレオチドにハイブリダイズした請求項１〜１９のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物を含む、ハイブリダイズポリヌクレオチド。
【請求項２１】
前記相補的ポリヌクレオチドが、１つ若しくは複数の成分（ｉ）、１つ若しくは複数の式（ＩＩ）の基、又は１つ若しくは複数の式（Ｖ）の基を含む、請求項２０に記載のハイブリダイズポリヌクレオチド。
【請求項２２】
ヌクレオチドの総数の７５％以下が、前記成分（ｉ）、式（ＩＩ）の基、又は式（Ｖ）の基を含む、請求項１９又は２０に記載のハイブリダイズポリヌクレオチド。
【請求項２３】
請求項１〜１９のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物と前記相補的ポリヌクレオチドとが各々、１０〜３２個のヌクレオチドを有する、請求項２０〜２２のいずれか一項に記載のハイブリダイズポリヌクレオチド。
【請求項２４】
請求項１〜１９のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物が、ガイド鎖であり、及び前記相補的ポリヌクレオチドが、パッセンジャー鎖である、請求項２２〜２３のいずれか一項に記載のハイブリダイズポリヌクレオチド。
【請求項２５】
前記パッセンジャー鎖が、細胞内酵素により切断可能ではない部分を有する１つ又は複数のホスホトリエステルを含む、請求項２４に記載のハイブリダイズポリヌクレオチド。
【請求項２６】
式（ＶＩＩ）：
【化１０】
2016537027.tif 000010
の構造、又はその塩を有する化合物であって、
式中、
Ｂ1は、核酸塩基であり；
Ｘは、Ｏ、Ｓ、及びＮＲ4からなる群から選択され；
Ｙは、水素、ヒドロキシル、ハロ、任意選択で置換されたＣ1〜6アルコキシ、及び保護ヒドロキシル基からなる群から選択され；
Ｙ1は、Ｈ又は任意選択で置換されたＣ1〜6アルキルであり；
Ｚは、非存在であるか、Ｏ、又はＳであり；
Ｒ1は、ヒドロキシル、任意選択で置換されたＣ1〜6アルコキシ、保護ヒドロキシル基、一リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、四リン酸塩、及び五リン酸塩、５’キャップ、ホスホチオール、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキル、アミノ含有基、ビオチン含有基、ジゴキシゲニン含有基、コレステロール含有基、色素含有基、クエンチャー含有基、ポリペプチド、炭水化物、中性有機ポリマー、陽荷電ポリマー、治療薬、ターゲティング部分、エンドソームエスケープ部分、及びこれらの任意の組み合わせからなる群から選択され；
Ｒ2は、Ｈ、ヒドロキシル、任意選択で置換されたＣ1〜6アルコキシ、保護ヒドロキシル基、一リン酸塩、二リン酸塩、三リン酸塩、四リン酸塩、五リン酸塩、アミノ、５’キャップ、ホスホチオール、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキル、アミノ含有基、ビオチン含有基、ジゴキシゲニン含有基、コレステロール含有基、色素含有基、クエンチャー含有基、ポリペプチド、炭水化物、中性有機ポリマー、陽荷電ポリマー、治療薬、ターゲティング部分、エンドソームエスケープ部分、及びこれらの組み合わせからなる群から選択され；並びに
Ｒ3は、式（ＶＩＩＩ）：
【化１１】
2016537027.tif 000011
の構造を有する基であり、
式中、Ａ1は、結合、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ2〜6アルケニレン；任意選択で置換されたＣ2〜6アルキニレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換された（Ｃ3〜8シクロアルキル）−Ｃ1〜4−アルキレン；任意選択で置換された（Ｃ3〜8シクロアルケニル）−Ｃ1〜4−アルキレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；任意選択で置換された（Ｃ6〜14アリール）−Ｃ1〜4−アルキレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換された（Ｃ1〜9ヘテロアリール）−Ｃ1〜4−アルキレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレン；並びにＮ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換された（Ｃ1〜9ヘテロシクリル）−Ｃ1〜4−アルキレンからなる群から選択され；且つＡ2は、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレン；並びにＮ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレンからなる群から選択され；或いはＡ1及びＡ2は、−Ｓ−Ｓ−と一緒に結合して、任意選択で置換された５〜１６員環を形成し；
Ａ3は、結合、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン、Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレン；Ｏ；任意選択で置換されたＮ；及びＳからなる群から選択され；
Ａ4は、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；並びにＮ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレンからなる群から選択され；
Ｌは、結合、又は１つ若しくは複数の共役部分を含む共役基であり；
Ｒ4は、非存在であるか、水素、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキル、親水性官能基、又は小分子、ポリペプチド、炭水化物、中性有機ポリマー、陽荷電ポリマー、治療薬、ターゲティング部分、エンドソームエスケープ部分、及びこれらの任意の組み合わせからなる群から選択される補助部分を含む基であり；
ｒは、１〜１０の整数であり；
Ａ2、Ａ3、及びＡ4は結合して、−Ｓ−Ｓ−とＸとを連結する最も短い鎖内に少なくとも３つの原子を有する基を形成する、化合物。
【請求項２７】
Ｌが、１〜５００のモノマーを含み、前記モノマーの各々が、独立に、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ2〜6アルケニレン；任意選択で置換されたＣ2〜6アルキニレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレン；カルボニル；チオカルボニル；イミノ；任意選択で置換されたＮ；Ｏ；又はＳ（Ｏ）m（ここで、ｍは、０、１、若しくは２である）である、請求項２６に記載の化合物。
【請求項２８】
Ａ3が、結合、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；Ｏ；任意選択で置換されたＮ；及びＳからなる群から選択される、請求項２６〜２７のいずれか一項に記載の化合物。
【請求項２９】
Ａ1が、結合であるか、又は任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換された（Ｃ3〜8シクロアルキル）−Ｃ1〜4−アルキレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；任意選択で置換された（Ｃ6〜14アリール）−Ｃ1〜4−アルキレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換された（Ｃ1〜9ヘテロアリール）−Ｃ1〜4−アルキレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロシクリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換された（Ｃ1〜9ヘテロシクリル）−Ｃ1〜4−アルキレン；任意選択で置換されたＮ；及びＯからなる群から独立に選択される１つ又は複数の基を含む、請求項２６〜２８のいずれか一項に記載の化合物。
【請求項３０】
Ａ2が、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン、任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；又はＮ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ1〜9ヘテロアリレンである、請求項２６〜２９のいずれか一項に記載の化合物。
【請求項３１】
−Ｓ−Ｓ−Ａ2−Ａ3−Ａ4−の硫黄原子に結合した炭素原子が、アルキレン炭素原子であるとき、前記アルキレン炭素原子は、最大で１個の水素原子に連結している、請求項２６〜３０のいずれか一項に記載の化合物。
【請求項３２】
−Ｓ−Ｓ−Ａ2−Ａ3−Ａ4−の硫黄原子に結合した炭素原子が、アルケニレン炭素原子であるとき、前記アルケニレン炭素原子は、水素原子に連結していない、請求項２６〜３０のいずれか一項に記載の化合物。
【請求項３３】
（Ｒ4）r−Ｌ−Ａ1−Ｓ−Ｓ−の硫黄原子に結合した炭素原子が、アルキレン炭素原子であるとき、前記炭素原子は、最大で１個の水素原子に連結している、請求項２６〜３２のいずれか一項に記載の化合物。
【請求項３４】
Ａ1及びＡ2が、これらが結合した−Ｓ−Ｓ−と一緒に結合して、任意選択で置換された５〜１６員環を形成する、請求項２６〜３３のいずれか一項に記載の化合物。
【請求項３５】
Ａ1が、結合、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ2〜6アルケニレン；任意選択で置換されたＣ2〜6アルキニレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換された（Ｃ3〜8シクロアルキル）−Ｃ1〜4−アルキレン；任意選択で置換された（Ｃ3〜8シクロアルケニル）−Ｃ1〜4−アルキレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；任意選択で置換された（Ｃ6〜14アリール）−Ｃ1〜4−アルキレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ2〜9ヘテロアリレン；Ｎ、Ｏから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換された（Ｃ2〜9ヘテロアリール）−Ｃ1〜4−アルキレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ2〜9ヘテロシクリレン；並びにＮ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換された（Ｃ2〜9ヘテロシクリル）−Ｃ1〜4−アルキレンからなる群から選択され；且つＡ2は、任意選択で置換されたＣ1〜6アルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルキレン；任意選択で置換されたＣ3〜8シクロアルケニレン；任意選択で置換されたＣ6〜14アリレン；Ｎ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ2〜9ヘテロアリレン；並びにＮ、Ｏ、及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を有する、任意選択で置換されたＣ2〜9ヘテロシクリレンからなる群から選択され；或いはＡ1及びＡ2は、−Ｓ−Ｓ−と一緒に結合して、任意選択で置換された５〜１６員環を形成する、請求項２６に記載の化合物。
【請求項３６】
ポリヌクレオチド構築物を細胞に送達する方法であって、前記細胞を請求項１〜１９のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物又は請求項２０〜２５のいずれか一項に記載のハイブリダイズポリヌクレオチドと接触させるステップを含む、方法。
【請求項３７】
細胞におけるポリペプチドの発現を低減する方法であって、前記細胞を請求項１〜１９のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド構築物又は請求項２０〜２５のいずれか一項に記載のハイブリダイズポリヌクレオチドと接触させるステップを含む、方法。