【手続補正書】
【提出日】平成29年6月12日(2017.6.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
構造的に類似している薬物候補をスクリーニングする方法であって、
（ａ）６つまたはそれを超える構造的に類似している薬物候補を含むライブラリーを用意するステップと、
（ｂ）表面選択的非線形光学技術を使用して、非線形活性標識標的タンパク質の第１の立体配置状態を測定し、それによってベースラインを作成するステップと、
（ｃ）前記薬物候補の各々を前記非線形活性標識標的タンパク質と接触させるステップと、
（ｄ）前記薬物候補の各々について、前記非線形活性標識標的タンパク質の第２の立体配置状態をリアルタイムで測定するステップと、
（ｅ）各々について測定された前記第２の立体配置状態を使用して少なくとも第１および第２の薬物候補のシグネチャーを判定するステップと、
（ｆ）前記第１の薬物候補の前記シグネチャーを前記第２の薬物候補の前記シグネチャーと比較するステップと、
（ｇ）（ｆ）でのシグネチャーの比較に基づいて、前記構造的に類似している薬物候補のライブラリーから、そのシグネチャーが所望の薬理特性と相関している１つまたは複数の薬物候補を選択するステップと
を含む方法。
【請求項２】
前記６つまたはそれを超える薬物候補が、
（ｉ）他の薬物候補の各々の１５０ｇ／ｍｏｌ以内の分子量、
（ｉｉ）他の薬物候補の各々の分子量の３０％以内の分子量、
（ｉｉｉ）他の薬物候補の各々の原子の１５個以内の化学式、
（ｉｖ）薬物候補の各々の間の１５未満の全原子数の差、
（ｖ）５未満の炭素原子数の差、
（ｖｉ）５未満の水素原子数の差、
（ｖｉｉ）５未満の窒素原子数の差、
（ｖｉｉｉ）５未満の酸素原子数の差、
（ｉｘ）５未満の硫黄原子数の差、
（ｘ）他の薬物候補の各々の１０％以内のｌｏｇ  Ｄで測定される極性、
（ｘｉ）他の薬物候補の各々の１０％以内のｌｏｇ  Ｐ（分配係数）で測定される極性、
（ｘｉｉ）他の薬物候補の各々の１０％以内のＰＳＡ（極性表面積）で測定される極性、
（ｘｉｉｉ）同一の足場コア、
（ｘｉｖ）グラフ理論で測定される化学的類似性、
（ｘｖ）０．８５を超えるＴａｎｉｍｏｔｏ（またはＪａｃｃａｒｄ）係数Ｔ、
（ｘｖｉ）３未満の芳香族基数の差、
（ｘｖｉｉ）３未満の複素環基数の差、
（ｘｖｉｉｉ）３未満の単環基数の差、
（ｘｉｘ）３未満の縮合環系数の差、および
（ｘｘ）３未満の二重結合数の差
からなる群から選択される１つまたは複数の構造類似性パラメータを使用して判定するときに構造的に類似している、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記１つまたは複数の薬物候補の選択を促進するため、コンピュータ実行可能プログラムを使用して、前記シグネチャーを分析するステップをさらに含む、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
前記薬物候補の各々が、前記非線形活性標識標的タンパク質の立体配置状態において異なる変化を生成する、請求項１または２に記載の方法。
【請求項５】
（ｃ）での接触の際に、前記薬物候補の各々が異なるシグネチャーを生じる、請求項１または２に記載の方法。
【請求項６】
前記薬物候補の少なくとも２つが、類似の薬理特性または機能的効果を有する、請求項１または２に記載の方法。
【請求項７】
ｉ）前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの大きさの変化、
ｉｉ）前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの方向の変化、および
ｉｉｉ）前記非線形活性標識標的タンパク質と薬物候補との接触の際の前記シグネチャーの単位時間あたりのシグナルの速度の変化
からなる群から選択されるパラメータを測定するステップをさらに含む、請求項１または２に記載の方法。
【請求項８】
ｉ）第１の薬物候補と非線形活性標識標的タンパク質との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの大きさの前記変化が、第２の薬物候補と非線形活性標識標的タンパク質との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの大きさの前記変化の５０％以内であること、
ｉｉ）前記第１の薬物候補と非線形活性標識標的タンパク質との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの方向の前記変化が、前記第２の薬物候補と非線形活性標識標的タンパク質との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの方向の前記変化と同じであること、および
ｉｉｉ）前記第１の薬物候補と非線形活性標識標的タンパク質との接触の際の前記シグネチャーの単位時間あたりのシグナルの速度の変化が、前記第２の薬物候補と非線形活性標識標的タンパク質との接触の際の前記シグネチャーの単位時間あたりのシグナルの速度の変化の２倍以内であること
からなる群から選択される１つまたは複数のシグネチャー類似性パラメータを使用して判定したときに、前記第１の薬物候補によって生じる前記シグネチャーおよび前記第２の薬物候補によって生じる前記シグネチャーが類似している、請求項１または２に記載の方法。
【請求項９】
前記非線形活性標識標的タンパク質が、天然変性タンパク質である、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１０】
前記天然変性タンパク質が、アルファシヌクレインである、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記非線形活性標識標的タンパク質が、公知の立体配置モジュレーターを有しない、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１２】
前記表面選択的非線形光学技術を使用して前記第１または第２の立体配置状態を測定するステップが、内部全反射（ＴＩＲ）を使用することを含む、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１３】
前記非線形光学技術が、第２高調波発生（ＳＨＧ）、和周波発生（ＳＦＧ）、または差周波発生（ＤＦＧ）である、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１４】
前記シグネチャーを判定するステップが、ＳＨＧシグナル、ＳＦＧシグナル、またはＤＦＧシグナルのシグナル強度を測定することを含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記構造的に類似している薬物候補が、小分子薬物候補または生物学的薬物候補である、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１６】
前記非線形活性標識標的タンパク質を標識するのに用いられている非線形活性標識が、１−（２−マレイミジルエチル）−４−（５−（４−メトキシフェニル）オキサゾール−２−イル）ピリジニウムメタンスルホネート（ＰｙＭＰＯ−Ｍａｌｅｉｍｉｄｅ）、１−（３−（スクシンイミジルオキシカルボニル）ベンジル）−４−（５−（４−メトキシフェニル）オキサゾール−２−イル）ピリジニウムブロミド（ＰｙＭＰＯ−ＳＥ）、ＰｙＭＰＯ−ＮＨＳ、６−ブロモアセチル−２−ジメチルアミノナフタレン（Ｂａｄａｎ）、６−アクリロイル−２−ジメチルアミノナフタレン（Ａｃｒｙｌｏｄａｎ）、またはケトクマリンである、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１７】
前記非線形活性標識標的タンパク質を標識するのに用いられている非線形活性標識が、非線形活性非天然アミノ酸である、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１８】
前記非線形活性非天然アミノ酸が、Ａｌａｄａｎである、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
薬物候補との接触の際の前記非線形活性標識標的タンパク質の立体配置状態の変化を、公知の立体配置モジュレーターによって生成される立体配置状態の変化と比較するステップをさらに含む、請求項１または２に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２５６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２５６】
本発明の好ましい実施形態が本明細書で示され、記載されているが、そのような実施形態は例としてだけ提供されることは当業者に明らかである。当業者であれば、本発明を逸脱しない範囲で、それにより多くの変形、変更および置換を思いつくと予想される。本明細書に記載される本発明の実施形態への様々な代替物を本発明の実施で用いることができることを理解すべきである。以下の請求項が本発明の範囲を規定し、これらの請求項の範囲内の方法および構造ならびにそれらの均等物はそれに含まれるものとする。
例えば、本発明は以下の項目を提供する。
（項目１）
生化学的実体をスクリーニングする方法であって、
（ａ）６つまたはそれを超える候補生化学的実体を含むライブラリーを用意するステップであり、前記６つまたはそれを超える候補生化学的実体は：
（ｉ）前記候補生化学的実体の各々の１５０ｇ／ｍｏｌ以内の分子量、
（ｉｉ）前記候補生化学的実体の各々の３０％以内の分子量、
（ｉｉｉ）前記候補生化学的実体の各々の原子が１５個以内の化学式、
（ｉｖ）前記候補生化学的実体の各々の間の１５未満の全原子数の差、
（ｖ）５未満の炭素原子数の差、
（ｖｉ）５未満の水素原子数の差、
（ｖｉｉ）５未満の窒素原子数の差、
（ｖｉｉｉ）５未満の酸素原子数の差、
（ｉｘ）５未満の硫黄原子数の差、
（ｘ）前記候補生化学的実体の各々の１０％以内のｌｏｇ  Ｄで測定される極性、
（ｘｉ）前記候補生化学的実体の各々の１０％以内のｌｏｇ  Ｐ（分配係数）で測定される極性、
（ｘｉｉ）前記候補生化学的実体の各々の１０％以内のＰＳＡ（極性表面積）で測定される極性、
（ｘｉｉｉ）同一の足場コア、
（ｘｉｖ）グラフ理論で測定される化学的類似性、
（ｘｖ）０．８５を超えるＴａｎｉｍｏｔｏ（またはＪａｃｃａｒｄ）係数Ｔ、
（ｘｖｉ）３未満の芳香族基数の差、
（ｘｖｉｉ）３未満の複素環基数の差、
（ｘｖｉｉｉ）３未満の単環基数の差、
（ｘｉｘ）３未満の縮合環系数の差、および
（ｘｘ）３未満の二重結合数の差
からなる群から選択される１つまたは複数の構造類似性パラメータを使用して判定するときに構造的に類似している、ステップと、
（ｂ）標的生化学的実体の第１の立体配置状態を測定し、それによってベースラインを作成するステップと、
（ｃ）前記候補生化学的実体の各々を同じ標的生化学的実体と接触させるステップと、
（ｄ）前記標的生化学的実体の第２の立体配置状態を測定するステップと、
（ｅ）前記第２の立体配置状態を使用して前記標的生化学的実体のシグネチャーを判定するステップと、
（ｆ）前記シグネチャーに基づいて前記候補生化学的実体から１つまたは複数の生化学的実体を選択するステップと
を含む方法。
（項目２）
前記第１または第２の立体配置状態を測定するステップが、内部全反射（ＴＩＲ）を使用する、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記第１または第２の立体配置状態を測定するステップが、第２高調波発生（ＳＨＧ）を使用する、項目１に記載の方法。
（項目４）
前記シグネチャーを判定するステップが、前記標的生化学的実体の立体配置状態の動態学的（リアルタイム）変化を測定するステップを含む、項目１に記載の方法。
（項目５）
前記シグネチャーを判定するステップが、前記標的生化学的実体の立体配置状態のエンドポイント変化を測定するステップを含む、項目１に記載の方法。
（項目６）
前記シグネチャーを判定するステップが、前記シグナルのシグナル強度を測定するステップを含む、項目１に記載の方法。
（項目７）
前記シグネチャーを判定するステップが、前記ベースラインを使用する、項目１に記載の方法。
（項目８）
コンピュータ実行可能プログラムを使用して、１つまたは複数の構造類似性パラメータに基づいて前記６つまたはそれを超える候補生化学的実体を分析するステップをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目９）
コンピュータ実行可能プログラムを使用して、前記シグネチャーを分析するステップをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目１０）
前記候補生化学的実体の各々が、前記標的生化学的実体の立体配置状態において異なる変化を生成する、項目１に記載の方法。
（項目１１）
前記標的生化学的実体の立体配置状態の前記変化を、公知の立体配置モジュレーターによって生成される立体配置状態の変化と比較するステップをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目１２）
前記公知の立体配置モジュレーターが、公知の薬物である、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
前記公知の立体配置モジュレーターによって誘導される立体配置状態の前記変化に最も類似している立体配置状態の前記変化に基づいて、１つまたは複数の生化学的実体を選択するステップをさらに含む、項目１１に記載の方法。
（項目１４）
前記公知の立体配置モジュレーターによって生成される立体配置状態の前記変化が、薬理特性または機能的効果に相関する、項目１１に記載の方法。
（項目１５）
ステップ（ｃ）での接触の際に、前記候補生化学的実体の各々が異なるシグネチャーを生じる、項目１に記載の方法。
（項目１６）
前記候補生化学的実体の少なくとも２つが、類似の薬理特性または機能的効果を有する、項目１に記載の方法。
（項目１７）
前記候補生化学的実体の少なくとも２つが、類似の薬理特性または機能的効果を有しない、項目１に記載の方法。
（項目１８）
ｉ）前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの大きさの変化、
ｉｉ）前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの方向の変化、および
ｉｉｉ）前記候補生化学的実体の接触の際の前記シグネチャーの単位時間あたりのシグナルの速度の変化
からなる群から選択されるシグネチャーパラメータを測定するステップをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目１９）
ｉ）第１の候補生化学的実体との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの大きさの前記変化が、第２の候補生化学的実体との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの大きさの前記変化の５０％以内であること、
ｉｉ）前記第１の候補生化学的実体との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの方向の前記変化が、前記第２の候補生化学的実体との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの方向の前記変化と同じであること、および
ｉｉｉ）前記第１の候補生化学的実体との接触の際の前記シグネチャーの単位時間あたりのシグナルの速度の変化が、前記第２の候補生化学的実体との接触の際の前記シグネチャーの単位時間あたりのシグナルの速度の変化の２倍以内であること
からなる群から選択される１つまたは複数のシグネチャー類似性パラメータを使用して判定したときに、前記第１の候補生化学的実体によって生じる前記シグネチャーおよび前記第２の候補生化学的実体によって生じる前記シグネチャーが類似している、項目１に記載の方法。
（項目２０）
前記第１の立体配置状態が、前記標的生化学的実体を薬剤とインキュベートした後に測定される、項目１に記載の方法。
（項目２１）
前記薬剤が、前記ライブラリーからの候補生化学的実体である、項目１に記載の方法。
（項目２２）
１つまたは複数の生化学的実体が、前記シグネチャーと公知の薬理特性または公知の機能的効果との相関に基づいて選択される、項目１に記載の方法。
（項目２３）
生化学的実体をスクリーニングする方法であって、
（ａ）６つまたはそれを超える候補生化学的実体を含むライブラリーを用意するステップと、
（ｂ）標的生化学的実体の第１の立体配置状態を測定し、それによってベースラインを作成するステップと、
（ｃ）前記候補生化学的実体の各々を同じ標的生化学的実体と接触させるステップと、
（ｄ）前記標的生化学的実体の第２の立体配置状態を測定するステップと、
（ｅ）前記第２の立体配置状態を使用して少なくとも第１および第２の候補生化学的実体のシグネチャーを判定するステップと、
（ｆ）前記第１の生化学的実体の前記シグネチャーを前記第２の生化学的実体の前記シグネチャーと比較するステップと、
（ｇ）（ｆ）での比較に基づいて、前記候補生化学的実体から１つまたは複数の生化学的実体を選択するステップと
を含む方法。
（項目２４）
前記６つまたはそれを超える候補生化学的実体が、
（ｉ）前記候補生化学的実体の各々の１５０ｇ／ｍｏｌ以内の分子量、
（ｉｉ）前記候補生化学的実体の各々の３０％以内の分子量、
（ｉｉｉ）前記候補生化学的実体の各々の原子が１５個以内の化学式、
（ｉｖ）前記候補生化学的実体の各々の間の１５未満の全原子数の差、
（ｖ）５未満の炭素原子数の差、
（ｖｉ）５未満の水素原子数の差、
（ｖｉｉ）５未満の窒素原子数の差、
（ｖｉｉｉ）５未満の酸素原子数の差、
（ｉｘ）５未満の硫黄原子数の差、
（ｘ）前記候補生化学的実体の各々の１０％以内のｌｏｇ  Ｄで測定される極性、
（ｘｉ）前記候補生化学的実体の各々の１０％以内のｌｏｇ  Ｐ（分配係数）で測定される極性、
（ｘｉｉ）前記候補生化学的実体の各々の１０％以内のＰＳＡ（極性表面積）で測定される極性、
（ｘｉｉｉ）同一の足場コア、
（ｘｉｖ）グラフ理論で測定される化学的類似性、
（ｘｖ）０．８５を超えるＴａｎｉｍｏｔｏ（またはＪａｃｃａｒｄ）係数Ｔ、
（ｘｖｉ）３未満の芳香族基数の差、
（ｘｖｉｉ）３未満の複素環基数の差、
（ｘｖｉｉｉ）３未満の単環基数の差、
（ｘｉｘ）３未満の縮合環系数の差、および
（ｘｘ）３未満の二重結合数の差
からなる群から選択される１つまたは複数の構造類似性パラメータを使用して判定するときに構造的に類似している、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
コンピュータ実行可能プログラムを使用して、前記シグネチャーを分析するステップをさらに含む、項目２３に記載の方法。
（項目２６）
前記候補生化学的実体の各々が、前記標的生化学的実体の立体配置状態において異なる変化を生成する、項目２３に記載の方法。
（項目２７）
（ｃ）での接触の際に、前記候補生化学的実体の各々が異なるシグネチャーを生じる、項目２３に記載の方法。
（項目２８）
前記候補生化学的実体の少なくとも２つが、類似の薬理特性または機能的効果を有する、項目２３に記載の方法。
（項目２９）
ｉ）前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの大きさの変化、
ｉｉ）前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの方向の変化、および
ｉｉｉ）前記候補生化学的実体の接触の際の前記シグネチャーの単位時間あたりのシグナルの速度の変化
からなる群から選択されるパラメータを測定するステップをさらに含む、項目２３に記載の方法。
（項目３０）
ｉ）第１の候補生化学的実体との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの大きさの前記変化が、第２の候補生化学的実体との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの大きさの前記変化の５０％以内であること、
ｉｉ）前記第１の候補生化学的実体との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの方向の前記変化が、前記第２の候補生化学的実体との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの方向の前記変化と同じであること、および
ｉｉｉ）前記第１の候補生化学的実体との接触の際の前記シグネチャーの単位時間あたりのシグナルの速度の変化が、前記第２の候補生化学的実体との接触の際の前記シグネチャーの単位時間あたりのシグナルの速度の変化の２倍以内であること
からなる群から選択される１つまたは複数のシグネチャー類似性パラメータを使用して判定したときに、前記第１の候補生化学的実体によって生じる前記シグネチャーおよび前記第２の候補生化学的実体によって生じる前記シグネチャーが類似している、項目２３に記載の方法。
（項目３１）
前記標的生化学的実体が、天然変性タンパク質である、項目２３に記載の方法。
（項目３２）
前記天然変性タンパク質が、アルファシヌクレインである、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
前記標的生化学的実体が、公知の立体配置モジュレーターを有しない、項目２３に記載の方法。
（項目３４）
前記生化学的実体の１つまたは複数の前記シグネチャーが、公知の薬理特性または公知の機能的効果と相関する、項目２３に記載の方法。
（項目３５）
生化学的実体を分類する方法であって、
（ａ）生化学的実体のライブラリーを用意するステップであり、前記生化学的実体の各々は異なる分子構造を含む、ステップと、
（ｂ）前記ライブラリー中の少なくとも１つの生化学的実体を同じ標的生化学的実体と接触させるステップと、
（ｃ）前記標的生化学的実体の立体配置状態を測定するステップと、
（ｄ）前記立体配置状態を使用してシグネチャーを判定するステップと、
（ｅ）前記シグネチャーを使用して構造−活性関係（ＳＡＲ）カタログを作成するステップと
含む方法。
（項目３６）
前記ＳＡＲを作成するステップが、前記シグネチャーを結合特性、機能的特性、効能、力価、選択性またはそれらの組合せと相関させるステップを含む、項目３５に記載の方法。
（項目３７）
前記ＳＡＲを作成するステップが、前記シグネチャーを前記候補生化学的実体の１つまたは複数の構造パラメータと相関させるステップを含み、前記構造パラメータは、分子量、化学式、全原子数、炭素原子数、水素原子数、窒素原子数、酸素原子数、硫黄原子数、ｌｏｇ  Ｄによって測定される極性、ｌｏｇ  Ｐによって測定される極性、ＰＳＡ（極性表面積）によって測定される極性、足場コア、グラフ理論で測定される化学的類似性、Ｔａｎｉｍｏｔｏ（またはＪａｃｃａｒｄ）係数Ｔ、芳香族基数、複素環基数、単環基数、縮合環系数および二重結合数からなる群から選択される、項目３５に記載の方法。
（項目３８）
生化学的実体の前記ライブラリーが、薬物候補を含む、項目３５に記載の方法。
（項目３９）
前記標的生化学的実体が、薬物標的である、項目３５に記載の方法。
（項目４０）
薬理特性または機能的効果と関連する前記生化学的実体の少なくとも１つの中の結合部分を判定するために前記ＳＡＲを分析するステップをさらに含む、項目３５に記載の方法。
（項目４１）
コンピュータ実行可能プログラムを使用して、前記シグネチャーを分析するステップをさらに含む、項目３５に記載の方法。
（項目４２）
前記接触の前に前記標的生化学的実体の前記立体配置状態を測定し、それによってベースラインを作成するステップをさらに含む、項目３５に記載の方法。
（項目４３）
前記シグネチャーが、前記標的生化学的実体の前記立体配置状態の変化を示す、項目３５に記載の方法。
（項目４４）
前記シグネチャーを判定するステップが、前記標的生化学的実体の前記立体配置状態の動態学的（リアルタイム）変化を測定するステップを含む、項目３５に記載の方法。
（項目４５）
前記シグネチャーを判定するステップが、前記標的生化学的実体の前記立体配置状態のエンドポイント変化を測定するステップを含む、項目３５に記載の方法。
（項目４６）
ｉ）前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの大きさの変化、
ｉｉ）前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの方向の変化、および
ｉｉｉ）前記候補生化学的実体の接触の際の前記シグネチャーの単位時間あたりのシグナルの速度の変化
からなる群から選択されるシグネチャーパラメータを測定するステップをさらに含む、項目３５に記載の方法。
（項目４７）
ｉ）第１の候補生化学的実体との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの大きさの前記変化が、第２の候補生化学的実体との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの大きさの前記変化の５０％以内であること、
ｉｉ）前記第１の候補生化学的実体との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの方向の前記変化が、前記第２の候補生化学的実体との接触の際の前記ベースラインと比較した前記シグネチャーの方向の前記変化と同じであること、および
ｉｉｉ）前記第１の候補生化学的実体との接触の際の前記シグネチャーの単位時間あたりのシグナルの速度の変化が、前記第２の候補生化学的実体との接触の際の前記シグネチャーの単位時間あたりのシグナルの速度の変化の２倍以内であること
からなる群から選択される１つまたは複数のシグネチャー類似性パラメータを使用して判定したときに、前記第１の候補生化学的実体によって生じる前記シグネチャーおよび前記第２の候補生化学的実体によって生じる前記シグネチャーが類似している、項目３５に記載の方法。
（項目４８）
前記ＳＡＲカタログまたは前記シグネチャーと、公知の薬理特性または公知の機能的効果との相関に基づいて、１つまたは複数の生化学的実体を選択するステップをさらに含む、項目３５に記載の方法。