【手続補正書】
【提出日】平成29年10月4日(2017.10.4)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のためのシステムであって、
イオンの連続ビームを提供するイオン源と、
ロッドの選択領域と、ロッドの伝送領域と、前記選択領域と前記伝送領域とを分離する障壁電極レンズとを含む質量分離器であって、前記質量分離器は、前記連続イオンビームを前記イオン源から受け取る、質量分離器と、
前記イオン源および前記質量分離器と通信するプロセッサと
を備え、
前記プロセッサは、
前記選択領域内において、前記イオンのビームからの２つ以上の異なる前駆体イオンを共振させるための２つ以上の異なる交流（ＡＣ）電圧周波数を前記選択領域のロッドに印加することによって、前記２つ以上の異なる前駆体イオンを選択することと、
前記共振する２つ以上の異なる前駆体イオンのみが越えて伝送される電場電位障壁を作成するために、前記選択領域のロッドおよび前記伝送領域のロッドに関して、直流（ＤＣ）電圧を前記障壁電極レンズに印加することによって、前記２つ以上の異なる前駆体イオンを前記選択領域から前記伝送領域に伝送することと
を行う、システム。
【請求項２】
前記障壁電極レンズは、メッシュ電極またはレンズを備えている、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のためのシステムの前記請求項の任意の組み合わせのシステム。
【請求項３】
前記伝送領域は、前記選択領域より長さが短い、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のためのシステムの前記請求項の任意の組み合わせのシステム。
【請求項４】
前記質量分離器は、前記選択領域の前に位置付けられている両側イオンビーム電極レンズおよびロッドのイオンビーム伝送領域をさらに含む、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のためのシステムの前記請求項の任意の組み合わせのシステム。
【請求項５】
前記プロセッサは、前記イオンビーム伝送領域のロッドおよび前記選択領域のロッドに関して、ＤＣ電圧を前記両側イオンビーム電極レンズの片側に印加し、それによって、前記選択領域内で共振させられていない前記イオンのビームからの前駆体イオンは、前記両側イオンビーム電極レンズの前記片側に返送され、前記イオンのビームから除去される、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のためのシステムの前記請求項の任意の組み合わせのシステム。
【請求項６】
前記質量分離器は、前記伝送領域の後に位置付けられている出口電極レンズをさらに含む、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のためのシステムの前記請求項の任意の組み合わせのシステム。
【請求項７】
前記プロセッサは、前記障壁電極レンズおよび前記出口電極レンズに関して、ＤＣバイアス電圧を前記伝送領域のロッドに印加することによって、前記２つ以上の異なる前駆体イオンを前記伝送領域内で集束させ、その結果、前記２つ以上の異なる前駆体イオンの平行移動進行時間は、前記伝送領域のロッドに印加されるＡＣ電圧に起因する、前記２つ以上の異なる前駆体イオンの半径方向運動の調波振動周期の半分の倍数である、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のためのシステムの前記請求項の任意の組み合わせのシステム。
【請求項８】
電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法であって、
プロセッサを使用して、選択領域内において、イオンの連続ビームからの２つ以上の異なる前駆体イオンを共振させるための２つ以上の異なる交流（ＡＣ）電圧周波数を質量分離器の前記選択領域のロッドに印加することによって、前記２つ以上の異なる前駆体イオンを選択することであって、前記質量分離器は、前記ロッドの選択領域と、ロッドの伝送領域と、前記選択領域と前記伝送領域とを分離する障壁電極レンズとを含み、前記質量分離器は、前記連続イオンビームをイオン源から受け取る、ことと、
前記プロセッサを使用して、前記共振する２つ以上の異なる前駆体イオンのみが越えて伝送される電場電位障壁を作成するために、前記選択領域のロッドおよび前記伝送領域のロッドに関して、直流（ＤＣ）電圧を前記障壁電極レンズに印加することによって、前記２つ以上の異なる前駆体イオンを前記選択領域から前記伝送領域に伝送することと
を含む、方法。
【請求項９】
前記障壁電極レンズは、メッシュ電極またはレンズを備えている、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法の前記請求項の任意の組み合わせの方法。
【請求項１０】
前記伝送領域は、前記選択領域より長さが短い、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法の前記請求項の任意の組み合わせの方法。
【請求項１１】
前記質量分離器は、前記選択領域の前に位置付けられている両側イオンビーム電極レンズおよびロッドのイオンビーム伝送領域をさらに含む、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法の前記請求項の任意の組み合わせの方法。
【請求項１２】
前記プロセッサを使用して、前記イオンビーム伝送領域のロッドおよび前記選択領域のロッドに関して、ＤＣ電圧を前記両側イオンビーム電極レンズの片側に印加することをさらに含み、それによって、前記選択領域内で共振させられていない前記イオンのビームからの前駆体イオンは、前記両側イオンビーム電極レンズの前記片側に返送され、前記イオンのビームから除去される、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法の前記請求項の任意の組み合わせの方法。
【請求項１３】
前記質量分離器は、前記伝送領域の後に位置付けられている出口電極レンズをさらに含む、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法の前記請求項の任意の組み合わせの方法。
【請求項１４】
前記プロセッサを使用して、前記障壁電極レンズおよび前記出口電極レンズに関して、ＤＣバイアス電圧を前記伝送領域のロッドに印加することによって、前記２つ以上の異なる前駆体イオンを前記伝送領域内で集束させることをさらに含み、その結果、前記２つ以上の異なる前駆体イオンの平行移動進行時間は、前記伝送領域のロッドに印加されるＡＣ電圧に起因する、前記２つ以上の異なる前駆体イオンの半径方向運動の調波振動周期の半分の倍数である、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法の前記請求項の任意の組み合わせの方法。
【請求項１５】
非一過性の有形コンピュータ読み取り可能な記憶媒体を備えているコンピュータプログラム製品であって、そのコンテンツは、プロセッサ上で実行される命令を伴うプログラムを含み、前記命令は、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法を実施し、前記方法は、
システムを提供することであって、前記システムは、１つ以上の個別のソフトウェアモジュールを備え、前記個別のソフトウェアモジュールは、制御モジュールを備えている、ことと、
前記制御モジュールを使用して、前記選択領域内において、イオンの連続ビームからの２つ以上の異なる前駆体イオンを共振させるための２つ以上の異なる交流（ＡＣ）電圧周波数を質量分離器の選択領域のロッドに印加することによって、２つ以上の異なる前駆体イオンを選択することであって、前記質量分離器は、前記ロッドの選択領域と、ロッドの伝送領域と、前記選択領域と前記伝送領域とを分離する障壁電極レンズとを含み、前記質量分離器は、前記連続イオンビームをイオン源から受け取る、ことと、
前記制御モジュールを使用して、前記共振する２つ以上の異なる前駆体イオンのみが越えて伝送される電場電位障壁を作成するために、前記選択領域のロッドおよび前記伝送領域のロッドに関して、直流（ＤＣ）電圧を前記障壁電極レンズに印加することによって、前記２つ以上の異なる前駆体イオンを前記選択領域から前記伝送領域に伝送することと
を含む、コンピュータプログラム製品。
【請求項１６】
生成イオンの前駆体イオンを多重化前駆体イオン選択を実施するタンデム質量分析計によって生成される組み合わせられた生成イオンスペクトルから識別するためのシステムであって、
イオンの連続ビームを提供するイオン源と、
多重化前駆体イオン選択を実施する質量フィルタを含むタンデム質量分析計と、
前記イオン源および前記タンデム質量分析計と通信するプロセッサと
を備え、
前記プロセッサは、
Ｎ個の前駆体イオンを選択することと、
前記Ｎ個の前駆体イオンのＮ個のグループを作成することであって、前記Ｎ個のグループの各々は、前記Ｎ個の前駆体イオンのうちのＮ−１個の前駆体イオンを有し、前記Ｎ個の前駆体イオンのうちの異なる前駆体イオンが、前記Ｎ個のグループの各々に含まれない、ことと、
前記タンデム質量分析計に、前記Ｎ個のグループの各々に対して、前記イオンの連続ビームに対して多重化前駆体イオン選択を実施し、前記Ｎ個のグループの各々において選択された前記Ｎ−１個の前駆体イオンの各々を断片化し、前記Ｎ個のグループの各々によって生成される生成イオンの強度を測定してＮ個の生成イオンスペクトルを生成するように命令することと、
前記Ｎ個の生成イオンスペクトルの各々に対してヒートマップをプロットし、Ｎ個のヒートマップを生成することと、
前記Ｎ個の生成イオンスペクトルを組み合わせられた生成イオンスペクトルに組み合わせ、
ピークの質量に対するデータを有していない、前記Ｎ個のヒートマップのうちのヒートマップを見つけ、前記ヒートマップを生成したグループに含まれない、前記Ｎ個の前駆体イオンのうちの前駆体イオンが、前記対応する前駆体イオンであることを決定することによって、前記組み合わせられた生成イオンスペクトル中のピークの対応する前駆体イオンを識別することと
を行う、システム。
【請求項１７】
前記質量フィルタは、四重極を備えている、前駆体イオンを識別するためのシステムの前記請求項の任意の組み合わせのシステム。
【請求項１８】
前記四重極は、共振する選択された前駆体イオンによって、多重化前駆体イオン選択を実施し、前記共振する選択された前駆体イオンのみ、電場電位障壁を越えて伝送する、前駆体イオンを識別するためのシステムの前記請求項の任意の組み合わせのシステム。
【請求項１９】
前記プロセッサは、前記Ｎ個の生成イオンスペクトルを合計し、前記組み合わせられた生成イオンスペクトルを生成することによって、前記Ｎ個の生成イオンスペクトルを組み合わせる、前駆体イオンを識別するためのシステムの前記請求項の任意の組み合わせのシステム。
【請求項２０】
前記Ｎ個のヒートマップのうちのヒートマップは、前記ヒートマップの対応する生成イオンスペクトルが、ある質量または質量範囲において生成イオンを含むこと、または含まないことの指示を提供する、前駆体イオンを識別するためのシステムの前記請求項の任意の組み合わせのシステム。
【請求項２１】
生成イオンの前駆体イオンを多重化前駆体イオン選択を実施するタンデム質量分析計によって生成される組み合わせられた生成イオンスペクトルから識別する方法であって、
プロセッサを使用して、Ｎ個の前駆体イオンを選択することと、
前記プロセッサを使用して、前記Ｎ個の前駆体イオンのＮ個のグループを作成することであって、前記Ｎ個のグループの各々は、前記Ｎ個の前駆体イオンのうちのＮ−１個の前駆体イオンを有し、前記Ｎ個の前駆体イオンのうちの異なる前駆体イオンが、前記Ｎ個のグループの各々に含まれない、ことと、
前記プロセッサを使用して、タンデム質量分析計に、前記Ｎ個のグループの各々に対して、イオン源によって提供されるイオンの連続ビームに対して多重化前駆体イオン選択を実施し、前記Ｎ個のグループの各々において選択される前記Ｎ−１個の前駆体イオンの各々を断片化し、前記Ｎ個のグループの各々によって生成される生成イオンの強度を測定するように命令し、Ｎ個の生成イオンスペクトルを生成することと、
前記プロセッサを使用して、前記Ｎ個の生成イオンスペクトルの各々に対してヒートマップをプロットし、Ｎ個のヒートマップを生成することと、
前記プロセッサを使用して、前記Ｎ個の生成イオンスペクトルを組み合わせられた生成イオンスペクトルに組み合わせることと、
前記プロセッサを使用して、前記ピークの質量に対するデータを有していない前記Ｎ個のヒートマップのうちのヒートマップを見つけ、前記ヒートマップを生成したグループに含まれない前記Ｎ個の前駆体イオンのうちの前駆体イオンが、前記対応する前駆体イオンであることを決定することによって、前記組み合わせられた生成イオンスペクトル中のピークの対応する前駆体イオンを識別することと
を含む、方法。
【請求項２２】
前記質量フィルタは、四重極を備えている、前駆体イオンを識別する方法の前記請求項の任意の組み合わせの方法。
【請求項２３】
前記四重極は、共振する選択された前駆体イオンによって、多重化前駆体イオン選択を実施し、前記共振する選択された前駆体イオンのみ、電場電位障壁を越えて伝送させる、前駆体イオンを識別する方法の前記請求項の任意の組み合わせの方法。
【請求項２４】
前記Ｎ個の生成イオンスペクトルは、前記Ｎ個の生成イオンスペクトルを合計することによって組み合わせられ、前記組み合わせられた生成イオンスペクトルを生成する、前駆体イオンを識別する方法の前記請求項の任意の組み合わせの方法。
【請求項２５】
前記Ｎ個のヒートマップのうちのヒートマップは、前記ヒートマップの対応する生成イオンスペクトルが、ある質量または質量範囲において生成イオンを含むこと、または含まないことの指示を提供する、前駆体イオンを識別する方法の前記請求項の任意の組み合わせの方法。
【請求項２６】
非一過性の有形コンピュータ読み取り可能な記憶媒体を備えているコンピュータプログラム製品であって、そのコンテンツは、プロセッサ上で実行される命令を伴うプログラムを含み、前記命令は、多重化前駆体イオン選択を実施するタンデム質量分析計によって生成される組み合わせられた生成イオンスペクトルから生成イオンの前駆体イオンを識別する方法を実施し、前記方法は、
システムを提供することであって、前記システムは、１つ以上の個別のソフトウェアモジュールを備え、前記個別のソフトウェアモジュールは、制御モジュールおよび識別モジュールを備えている、ことと、
前記制御モジュールを使用して、Ｎ個の前駆体イオンを選択することと、
前記制御モジュールを使用して、前記Ｎ個の前駆体イオンのＮ個のグループを作成することであって、前記Ｎ個のグループの各々は、前記Ｎ個の前駆体イオンのうちのＮ−１個の前駆体イオンを有し、前記Ｎ個の前駆体イオンのうちの異なる前駆体イオンが、前記Ｎ個のグループの各々に含まれない、ことと、
前記制御モジュールを使用して、タンデム質量分析計に、前記Ｎ個のグループの各々に対して、イオン源によって提供されるイオンの連続ビームに対して多重化前駆体イオン選択を実施し、前記Ｎ個のグループの各々において選択される前記Ｎ−１個の前駆体イオンの各々を断片化し、前記Ｎ個のグループの各々によって生成される生成イオンの強度を測定するように命令し、Ｎ個の生成イオンスペクトルを生成することと、
前記識別モジュールを使用して、前記Ｎ個の生成イオンスペクトルの各々に対してヒートマップをプロットし、Ｎ個のヒートマップを生成することと、
前記識別モジュールを使用して、前記Ｎ個の生成イオンスペクトルを組み合わせられた生成イオンスペクトルに組み合わせることと、
前記識別モジュールを使用して、前記ピークの質量に対するデータを有していない前記Ｎ個のヒートマップのうちのヒートマップを見つけ、前記ヒートマップを生成したグループに含まれない前記Ｎ個の前駆体イオンのうちの前駆体イオンが、前記対応する前駆体イオンであることを決定することによって、前記組み合わせられた生成イオンスペクトル中のピークの対応する前駆体イオンを識別することと
を含む、コンピュータプログラム製品。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２２】
本出願者の教示のこれらおよび他の特徴が、本明細書に記載される。
本願明細書は、例えば、以下の項目も提供する。
（項目１）
電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のためのシステムであって、
イオンの連続ビームを提供するイオン源と、
ロッドの選択領域と、ロッドの伝送領域と、前記選択領域と前記伝送領域とを分離する障壁電極レンズとを含む質量分離器であって、前記質量分離器は、前記連続イオンビームを前記イオン源から受け取る、質量分離器と、
前記イオン源および前記質量分離器と通信するプロセッサと
を備え、
前記プロセッサは、
前記選択領域内において、前記イオンのビームからの２つ以上の異なる前駆体イオンを共振させるための２つ以上の異なる交流（ＡＣ）電圧周波数を前記選択領域のロッドに印加することによって、前記２つ以上の異なる前駆体イオンを選択することと、
前記共振する２つ以上の異なる前駆体イオンのみが越えて伝送される電場電位障壁を作成するために、前記選択領域のロッドおよび前記伝送領域のロッドに関して、直流（ＤＣ）電圧を前記障壁電極レンズに印加することによって、前記２つ以上の異なる前駆体イオンを前記選択領域から前記伝送領域に伝送することと
を行う、システム。
（項目２）
前記障壁電極レンズは、メッシュ電極またはレンズを備えている、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のためのシステムの前記項目の任意の組み合わせのシステム。
（項目３）
前記伝送領域は、前記選択領域より長さが短い、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のためのシステムの前記項目の任意の組み合わせのシステム。
（項目４）
前記質量分離器は、前記選択領域の前に位置付けられている両側イオンビーム電極レンズおよびロッドのイオンビーム伝送領域をさらに含む、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のためのシステムの前記項目の任意の組み合わせのシステム。
（項目５）
前記プロセッサは、前記イオンビーム伝送領域のロッドおよび前記選択領域のロッドに関して、ＤＣ電圧を前記両側イオンビーム電極レンズの片側に印加し、それによって、前記選択領域内で共振させられていない前記イオンのビームからの前駆体イオンは、前記両側イオンビーム電極レンズの前記片側に返送され、前記イオンのビームから除去される、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のためのシステムの前記項目の任意の組み合わせのシステム。
（項目６）
前記質量分離器は、前記伝送領域の後に位置付けられている出口電極レンズをさらに含む、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のためのシステムの前記項目の任意の組み合わせのシステム。
（項目７）
前記プロセッサは、前記障壁電極レンズおよび前記出口電極レンズに関して、ＤＣバイアス電圧を前記伝送領域のロッドに印加することによって、前記２つ以上の異なる前駆体イオンを前記伝送領域内で集束させ、その結果、前記２つ以上の異なる前駆体イオンの平行移動進行時間は、前記伝送領域のロッドに印加されるＡＣ電圧に起因する、前記２つ以上の異なる前駆体イオンの半径方向運動の調波振動周期の半分の倍数である、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のためのシステムの前記項目の任意の組み合わせのシステム。
（項目８）
電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法であって、
プロセッサを使用して、選択領域内において、イオンの連続ビームからの２つ以上の異なる前駆体イオンを共振させるための２つ以上の異なる交流（ＡＣ）電圧周波数を質量分離器の前記選択領域のロッドに印加することによって、前記２つ以上の異なる前駆体イオンを選択することであって、前記質量分離器は、前記ロッドの選択領域と、ロッドの伝送領域と、前記選択領域と前記伝送領域とを分離する障壁電極レンズとを含み、前記質量分離器は、前記連続イオンビームをイオン源から受け取る、ことと、
前記プロセッサを使用して、前記共振する２つ以上の異なる前駆体イオンのみが越えて伝送される電場電位障壁を作成するために、前記選択領域のロッドおよび前記伝送領域のロッドに関して、直流（ＤＣ）電圧を前記障壁電極レンズに印加することによって、前記２つ以上の異なる前駆体イオンを前記選択領域から前記伝送領域に伝送することと
を含む、方法。
（項目９）
前記障壁電極レンズは、メッシュ電極またはレンズを備えている、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法の前記項目の任意の組み合わせの方法。
（項目１０）
前記伝送領域は、前記選択領域より長さが短い、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法の前記項目の任意の組み合わせの方法。
（項目１１）
前記質量分離器は、前記選択領域の前に位置付けられている両側イオンビーム電極レンズおよびロッドのイオンビーム伝送領域をさらに含む、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法の前記項目の任意の組み合わせの方法。
（項目１２）
前記プロセッサを使用して、前記イオンビーム伝送領域のロッドおよび前記選択領域のロッドに関して、ＤＣ電圧を前記両側イオンビーム電極レンズの片側に印加することをさらに含み、それによって、前記選択領域内で共振させられていない前記イオンのビームからの前駆体イオンは、前記両側イオンビーム電極レンズの前記片側に返送され、前記イオンのビームから除去される、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法の前記項目の任意の組み合わせの方法。
（項目１３）
前記質量分離器は、前記伝送領域の後に位置付けられている出口電極レンズをさらに含む、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法の前記項目の任意の組み合わせの方法。
（項目１４）
前記プロセッサを使用して、前記障壁電極レンズおよび前記出口電極レンズに関して、ＤＣバイアス電圧を前記伝送領域のロッドに印加することによって、前記２つ以上の異なる前駆体イオンを前記伝送領域内で集束させることをさらに含み、その結果、前記２つ以上の異なる前駆体イオンの平行移動進行時間は、前記伝送領域のロッドに印加されるＡＣ電圧に起因する、前記２つ以上の異なる前駆体イオンの半径方向運動の調波振動周期の半分の倍数である、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法の前記項目の任意の組み合わせの方法。
（項目１５）
非一過性の有形コンピュータ読み取り可能な記憶媒体を備えているコンピュータプログラム製品であって、そのコンテンツは、プロセッサ上で実行される命令を伴うプログラムを含み、前記命令は、電場電位障壁を使用した多重化前駆体イオン選択および伝送のための方法を実施し、前記方法は、
システムを提供することであって、前記システムは、１つ以上の個別のソフトウェアモジュールを備え、前記個別のソフトウェアモジュールは、制御モジュールを備えている、ことと、
前記制御モジュールを使用して、前記選択領域内において、イオンの連続ビームからの２つ以上の異なる前駆体イオンを共振させるための２つ以上の異なる交流（ＡＣ）電圧周波数を質量分離器の選択領域のロッドに印加することによって、２つ以上の異なる前駆体イオンを選択することであって、前記質量分離器は、前記ロッドの選択領域と、ロッドの伝送領域と、前記選択領域と前記伝送領域とを分離する障壁電極レンズとを含み、前記質量分離器は、前記連続イオンビームをイオン源から受け取る、ことと、
前記制御モジュールを使用して、前記共振する２つ以上の異なる前駆体イオンのみが越えて伝送される電場電位障壁を作成するために、前記選択領域のロッドおよび前記伝送領域のロッドに関して、直流（ＤＣ）電圧を前記障壁電極レンズに印加することによって、前記２つ以上の異なる前駆体イオンを前記選択領域から前記伝送領域に伝送することと
を含む、コンピュータプログラム製品。
（項目１６）
生成イオンの前駆体イオンを多重化前駆体イオン選択を実施するタンデム質量分析計によって生成される組み合わせられた生成イオンスペクトルから識別するためのシステムであって、
イオンの連続ビームを提供するイオン源と、
多重化前駆体イオン選択を実施する質量フィルタを含むタンデム質量分析計と、
前記イオン源および前記タンデム質量分析計と通信するプロセッサと
を備え、
前記プロセッサは、
Ｎ個の前駆体イオンを選択することと、
前記Ｎ個の前駆体イオンのＮ個のグループを作成することであって、前記Ｎ個のグループの各々は、前記Ｎ個の前駆体イオンのうちのＮ−１個の前駆体イオンを有し、前記Ｎ個の前駆体イオンのうちの異なる前駆体イオンが、前記Ｎ個のグループの各々に含まれない、ことと、
前記タンデム質量分析計に、前記Ｎ個のグループの各々に対して、前記イオンの連続ビームに対して多重化前駆体イオン選択を実施し、前記Ｎ個のグループの各々において選択された前記Ｎ−１個の前駆体イオンの各々を断片化し、前記Ｎ個のグループの各々によって生成される生成イオンの強度を測定してＮ個の生成イオンスペクトルを生成するように命令することと、
前記Ｎ個の生成イオンスペクトルの各々に対してヒートマップをプロットし、Ｎ個のヒートマップを生成することと、
前記Ｎ個の生成イオンスペクトルを組み合わせられた生成イオンスペクトルに組み合わせ、
ピークの質量に対するデータを有していない、前記Ｎ個のヒートマップのうちのヒートマップを見つけ、前記ヒートマップを生成したグループに含まれない、前記Ｎ個の前駆体イオンのうちの前駆体イオンが、前記対応する前駆体イオンであることを決定することによって、前記組み合わせられた生成イオンスペクトル中のピークの対応する前駆体イオンを識別することと
を行う、システム。
（項目１７）
前記質量フィルタは、四重極を備えている、前駆体イオンを識別するためのシステムの前記項目の任意の組み合わせのシステム。
（項目１８）
前記四重極は、共振する選択された前駆体イオンによって、多重化前駆体イオン選択を実施し、前記共振する選択された前駆体イオンのみ、電場電位障壁を越えて伝送する、前駆体イオンを識別するためのシステムの前記項目の任意の組み合わせのシステム。
（項目１９）
前記プロセッサは、前記Ｎ個の生成イオンスペクトルを合計し、前記組み合わせられた生成イオンスペクトルを生成することによって、前記Ｎ個の生成イオンスペクトルを組み合わせる、前駆体イオンを識別するためのシステムの前記項目の任意の組み合わせのシステム。
（項目２０）
前記Ｎ個のヒートマップのうちのヒートマップは、前記ヒートマップの対応する生成イオンスペクトルが、ある質量または質量範囲において生成イオンを含むこと、または含まないことの指示を提供する、前駆体イオンを識別するためのシステムの前記項目の任意の組み合わせのシステム。
（項目２１）
生成イオンの前駆体イオンを多重化前駆体イオン選択を実施するタンデム質量分析計によって生成される組み合わせられた生成イオンスペクトルから識別する方法であって、
プロセッサを使用して、Ｎ個の前駆体イオンを選択することと、
前記プロセッサを使用して、前記Ｎ個の前駆体イオンのＮ個のグループを作成することであって、前記Ｎ個のグループの各々は、前記Ｎ個の前駆体イオンのうちのＮ−１個の前駆体イオンを有し、前記Ｎ個の前駆体イオンのうちの異なる前駆体イオンが、前記Ｎ個のグループの各々に含まれない、ことと、
前記プロセッサを使用して、タンデム質量分析計に、前記Ｎ個のグループの各々に対して、イオン源によって提供されるイオンの連続ビームに対して多重化前駆体イオン選択を実施し、前記Ｎ個のグループの各々において選択される前記Ｎ−１個の前駆体イオンの各々を断片化し、前記Ｎ個のグループの各々によって生成される生成イオンの強度を測定するように命令し、Ｎ個の生成イオンスペクトルを生成することと、
前記プロセッサを使用して、前記Ｎ個の生成イオンスペクトルの各々に対してヒートマップをプロットし、Ｎ個のヒートマップを生成することと、
前記プロセッサを使用して、前記Ｎ個の生成イオンスペクトルを組み合わせられた生成イオンスペクトルに組み合わせることと、
前記プロセッサを使用して、前記ピークの質量に対するデータを有していない前記Ｎ個のヒートマップのうちのヒートマップを見つけ、前記ヒートマップを生成したグループに含まれない前記Ｎ個の前駆体イオンのうちの前駆体イオンが、前記対応する前駆体イオンであることを決定することによって、前記組み合わせられた生成イオンスペクトル中のピークの対応する前駆体イオンを識別することと
を含む、方法。
（項目２２）
前記質量フィルタは、四重極を備えている、前駆体イオンを識別する方法の前記項目の任意の組み合わせの方法。
（項目２３）
前記四重極は、共振する選択された前駆体イオンによって、多重化前駆体イオン選択を実施し、前記共振する選択された前駆体イオンのみ、電場電位障壁を越えて伝送させる、前駆体イオンを識別する方法の前記項目の任意の組み合わせの方法。
（項目２４）
前記Ｎ個の生成イオンスペクトルは、前記Ｎ個の生成イオンスペクトルを合計することによって組み合わせられ、前記組み合わせられた生成イオンスペクトルを生成する、前駆体イオンを識別する方法の前記項目の任意の組み合わせの方法。
（項目２５）
前記Ｎ個のヒートマップのうちのヒートマップは、前記ヒートマップの対応する生成イオンスペクトルが、ある質量または質量範囲において生成イオンを含むこと、または含まないことの指示を提供する、前駆体イオンを識別する方法の前記項目の任意の組み合わせの方法。
（項目２６）
非一過性の有形コンピュータ読み取り可能な記憶媒体を備えているコンピュータプログラム製品であって、そのコンテンツは、プロセッサ上で実行される命令を伴うプログラムを含み、前記命令は、多重化前駆体イオン選択を実施するタンデム質量分析計によって生成される組み合わせられた生成イオンスペクトルから生成イオンの前駆体イオンを識別する方法を実施し、前記方法は、
システムを提供することであって、前記システムは、１つ以上の個別のソフトウェアモジュールを備え、前記個別のソフトウェアモジュールは、制御モジュールおよび識別モジュールを備えている、ことと、
前記制御モジュールを使用して、Ｎ個の前駆体イオンを選択することと、
前記制御モジュールを使用して、前記Ｎ個の前駆体イオンのＮ個のグループを作成することであって、前記Ｎ個のグループの各々は、前記Ｎ個の前駆体イオンのうちのＮ−１個の前駆体イオンを有し、前記Ｎ個の前駆体イオンのうちの異なる前駆体イオンが、前記Ｎ個のグループの各々に含まれない、ことと、
前記制御モジュールを使用して、タンデム質量分析計に、前記Ｎ個のグループの各々に対して、イオン源によって提供されるイオンの連続ビームに対して多重化前駆体イオン選択を実施し、前記Ｎ個のグループの各々において選択される前記Ｎ−１個の前駆体イオンの各々を断片化し、前記Ｎ個のグループの各々によって生成される生成イオンの強度を測定するように命令し、Ｎ個の生成イオンスペクトルを生成することと、
前記識別モジュールを使用して、前記Ｎ個の生成イオンスペクトルの各々に対してヒートマップをプロットし、Ｎ個のヒートマップを生成することと、
前記識別モジュールを使用して、前記Ｎ個の生成イオンスペクトルを組み合わせられた生成イオンスペクトルに組み合わせることと、
前記識別モジュールを使用して、前記ピークの質量に対するデータを有していない前記Ｎ個のヒートマップのうちのヒートマップを見つけ、前記ヒートマップを生成したグループに含まれない前記Ｎ個の前駆体イオンのうちの前駆体イオンが、前記対応する前駆体イオンであることを決定することによって、前記組み合わせられた生成イオンスペクトル中のピークの対応する前駆体イオンを識別することと
を含む、コンピュータプログラム製品。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３８】
イオン源２１０は、イオン２１２の連続ビームを質量分離器２２０に提供する。質量分離器２２０は、ロッド２２５の選択領域２２４と、ロッド２２７の伝送領域２２６とを含む。質量分離器２２０はまた、選択領域２２４および伝送領域２２６を分離する障壁電極レンズ２２８を含む。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６６】
（前駆体識別システム）
図９は、種々の実施形態による、多重化前駆体イオン選択を実施するタンデム質量分析計によって生成される組み合わせられた生成イオンスペクトルから、生成イオンの前駆体イオンを識別するためのシステム９００の概略図である。システム９００は、イオン源９１０と、タンデム質量分析計９２０と、プロセッサ９３０とを含む。イオン源９１０は、イオンの連続ビームをタンデム質量分析計９２０に提供する。タンデム質量分析計９２０は、三連四重極として、図９に示される。タンデム質量分析計９２０は、三連四重極に限定されず、任意のタイプの質量分析計であることができる。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８２】
制御モジュール１１１０への入力は、例えば、標的前駆体イオンのリストである。制御モジュール１１１０は、Ｎ個の前駆体イオンを選択する。制御モジュール１１１０は、Ｎ個の前駆体イオンのＮ個のグループを作成する。Ｎ個のグループの各々は、Ｎ個の前駆体イオンのうちのＮ−１個の前駆体イオンを有し、Ｎ個の前駆体イオンのうちの異なる前駆体イオンが、Ｎ個のグループの各々に含まれない。制御モジュール１１１０は、タンデム質量分析計に、Ｎ個のグループの各々に対して、イオン源によって提供されるイオンの連続ビームに対して多重化前駆体イオン選択を実施し、Ｎ個のグループの各々において選択されるＮ−１個の前駆体イオンの各々を断片化し、Ｎ個のグループの各々によって生成される生成イオンの強度を測定し、Ｎ個の生成イオンスペクトルを生成するように命令する。