【手続補正書】
【提出日】平成29年3月6日(2017.3.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＭＯＭＰタンパク質の表面露出断片の３つ以上の免疫反復単位を含むポリペプチドにおいて、前記免疫反復単位が、
ａ）クラミジア種（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｓｐ．）の任意の血清型由来の前記ＭＯＭＰタンパク質の１つ又は複数の表面露出断片を含むアミノ酸配列を含む１つの免疫反復単位；及び
ｂ）ａ）に定義したのと同じ配列であるアミノ酸配列を含む２つ以上の別の免疫反復単位、又は任意のクラミジア種（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｓｐ．）血清型由来の前記ＭＯＭＰタンパク質のＶＤ４領域を含む２つ以上の別の免疫反復単位
から構成されることを特徴とするポリペプチド。
【請求項２】
請求項１に記載のポリペプチドにおいて、前記免疫反復単位が、相同性又は異種であることを特徴とするポリペプチド。
【請求項３】
請求項１又は２に記載のポリペプチドにおいて、前記外膜タンパク質が、肺炎クラミジア（Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）又はクラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の血清型Ｄ、Ｅ、Ｆ、Ｇ、Ｉａ若しくはＪ由来のＭＯＭＰであることを特徴とするポリペプチド。
【請求項４】
請求項１乃至３の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、ＭＯＭＰの可変ドメイン１、２、３、４の１つ又は複数を含むことを特徴とするポリペプチド。
【請求項５】
請求項１乃至４の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、前記アミノ酸配列が、任意選択で直線化されることを特徴とするポリペプチド。
【請求項６】
請求項１乃至５の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、ＭＯＭＰの前記可変ドメイン４（ＶＤ４）を含む前記アミノ酸配列が、互いに隣接して配置されるか、又はリンカーで隔てられることを特徴とするポリペプチド。
【請求項７】
請求項６に記載のポリペプチドにおいて、式Ｉ：
ｘｘ１−ＶＤ４−ｘｘ２（式Ｉ）
（式中、
ＶＤ４は、配列番号１５〜２０又はこれらと少なくとも８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列から独立に選択され、
ｘｘ１は、
ｉ）アミノ酸配列
ＥＷＱＡＳＬＡＬＳＹＲＬＮＭＦＴＰＹＩＧＶＫＷＳＲＡＳＦＤＡＤＴＩＲＩＡＱＰＫ（配列番号２１）、又は
ｉｉ）ｉ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜３８個のアミノ酸残基を含み、ｉ）の前記アミノ酸配列においてＣ末端のＫで開始するサブ配列
から構成され、
ｘｘ２は、
ｉｉｉ）アミノ酸配列
ＤＴＭＱＩＶＳＬＱＬＮＫＭＫＳＲＫＳＣＧＩＡＶＧＴＴＩＶＤＡ（配列番号２２）、又は
ｖｉ）ｉｉｉ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜２９個のアミノ酸残基を含み、ｉｉｉ）の前記アミノ酸配列においてＮ末端のＤで開始するサブ配列
から構成される）
で定義されるアミノ酸配列を含むことを特徴とするポリペプチド。
【請求項８】
請求項６又は７に記載のポリペプチドにおいて、前記配列が、配列番号２３〜２８、４９〜５９から選択されることを特徴とするポリペプチド。
【請求項９】
請求項１乃至８の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、ＭＯＭＰの前記可変ドメイン１（ＶＤ１）を含む断片をさらに含み、ＭＯＭＰのＶＤ１を含む前記アミノ酸配列が、互いに隣接して配置されるか、又はリンカーで隔てられることを特徴とするポリペプチド。
【請求項１０】
請求項９に記載のポリペプチドにおいて、式ＩＩ：
ｙｙ１−ＶＤ１−ｙｙ２（式ＩＩ）
（式中、
ＶＤ１は、配列番号１〜６又はこれらと少なくとも８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列から独立に選択され、
ｙｙ１は、
ｖ）アミノ酸配列
ＤＡＩＳＭＲＶＧＹＹＧＤＦＶＦＤＲＶＬＫＴＤＶＮＫＥＦＱＭＧ  配列番号７）、又は
ｖｉ）ｖ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜３０個のアミノ酸残基を含み、ｖ）の前記アミノ酸配列においてＣ末端のＧで開始するサブ配列
から構成され、
ｙｙ２は、
ｖｉｉ）アミノ酸配列ＮＰＡＹＧＲＨＭＱＤＡＥＭＦＴＮＡＡ（配列番号８）、又は
ｖｉｉｉ）ｖｉｉ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜１８個のアミノ酸残基を含み、ｖｉｉ）の前記アミノ酸配列においてＮ末端のＮで開始するサブ配列
から構成される）
で定義されるアミノ酸配列を含むことを特徴とするポリペプチド。
【請求項１１】
請求項９又は１０に記載のポリペプチドにおいて、前記配列が、配列番号９〜１４、４５〜４８から選択されることを特徴とするポリペプチド。
【請求項１２】
請求項１乃至１１の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、ＭＯＭＰの前記可変ドメイン２（ＶＤ２）を含む断片をさらに含み、前記アミノ酸配列が、互いに隣接して配置されるか、又はリンカーで隔てられることを特徴とするポリペプチド。
【請求項１３】
請求項１２に記載のポリペプチドにおいて、式ＩＩＩ：
ｚｚ１−ＶＤ２−ｚｚ２（式ＩＩＩ）
（式中、
ＶＤ２は、配列番号２９〜３４又はこれらと少なくとも８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列から独立に選択され、
ｚｚ１は、
ｉｘ）アミノ酸配列ＴＬＧＡＴＳＧＹＬＫＧＮＳＡＳＦＮＬＶＧＬＦＧ（配列番号３５）、又は
ｘ）ｉｘ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜２３個のアミノ酸残基を含み、ｉｘ）の前記アミノ酸配列においてＣ末端のＧで開始するサブ配列
から構成され、
ｚｚ２は、
ｘｉ）アミノ酸配列ＶＶＥＬＹＴＤＴＴＦＡＷＳＶＧＡＲＡＡＬＷＥ（配列番号３６）、又は
ｘｉｉ）ｘｉ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜２２個のアミノ酸残基を含み、ｘｉ）の前記アミノ酸配列においてＮ末端のＶで開始するサブ配列
から構成される）
で定義されるアミノ酸配列を含むことを特徴とするポリペプチド。
【請求項１４】
請求項１乃至１３の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、ＭＯＭＰの前記可変ドメイン３（ＶＤ３）を含む断片をさらに含み、ＭＯＭＰのＶＤ３を含む前記アミノ酸配列が、互いに隣接して配置されるか、又はリンカーで隔てられることを特徴とするポリペプチド。
【請求項１５】
請求項１４に記載のポリペプチドにおいて、式ＩＶ：
ｑｑ１−ＶＤ３−ｑｑ２（式ＩＶ）
（式中、
ＶＤ３は、配列番号３７〜４２又はこれらと少なくとも８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列から独立に選択され、
ｑｑ１は、
ｘｉｉｉ）アミノ酸配列
ＡＴＬＧＡＳＦＱＹＡＱＳＫＰＫＶＥＥＬＮＶＬＣＮＡＡＥＦＴＩＮＫＰＫＧＹＶＧ（配列番号４３）、又は
ｘｉｖ）ｘｉｉｉ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜２２個のアミノ酸残基を含み、ｘｉｉｉ）の前記アミノ酸配列においてＣ末端のＧで開始するサブ配列
から構成され、
ｑｑ２は、
ｘｖ）アミノ酸配列
ＴＧＴＫＤＡＳＩＤＹＨＥＷＱＡＳＬＡＬＳＹＲＬＮＭＦＴＰＹＩＧＶＫＷＳ（配列番号４４）、又は
ｘｖｉ）ｘｖ）の前記アミノ酸配列のサブ配列であって、１〜３５個のアミノ酸残基を含み、ｘｖ）の前記アミノ酸配列においてＮ末端のＴで開始するサブ配列
から構成される）
で定義されるアミノ酸配列を含むことを特徴とするポリペプチド。
【請求項１６】
請求項１乃至１５の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、組み換えにより生成された場合に前記ポリペプチドの輸送を促進する部分（例えば、シグナルペプチド）、前記融合タンパク質の精製を容易にする部分（例えば、ｈｉｓタグ）及び／又は免疫原性を増強する部分（例えば、Ｔ細胞抗原）をさらに含むことを特徴とするポリペプチド。
【請求項１７】
請求項１６に記載のポリペプチドにおいて、免疫原性のエンハンサーが、ＣＴ０４３、ＣＴ００４、ＣＴ４１４、ＣＴ６８１又はその部分などのＣｔ抗原から選択される別のＴ細胞標的であることを特徴とするポリペプチド。
【請求項１８】
請求項１７に記載のポリペプチドにおいて、前記配列が、配列番号６０〜６８から選択されることを特徴とするポリペプチド。
【請求項１９】
請求項１乃至１８の何れか１項に記載のポリペプチドにおいて、前記ポリペプチドが、
ａ）異種免疫反復配列を投与することを含む実験セットアップで試験したとき、１０−３以下の５０％中和力価で、クラミジア・トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）血清亜型Ｄをｉｎ  ｖｉｔｒｏで中和する能力、
ｂ）異種免疫反復配列を投与することを含むマウスモデルで試験したとき、感染から７日後に、マウスの少なくとも５０％において、クラミジア・トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）血清亜型Ｄをｉｎ  ｖｉｖｏで中和する能力、
ｃ）異種免疫反復配列を投与したとき、免疫応答をクラミジア・トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）の複数の血清亜型にｉｎ  ｖｉｔｒｏで拡大する能力
を有することを特徴とするポリペプチド。
【請求項２０】
請求項１乃至１９の何れか１項に記載のポリペプチドをコード化することを特徴とする核酸。
【請求項２１】
請求項１９に記載のポリペプチド又は請求項２０に記載の核酸を含むことを特徴とする医薬組成物。
【請求項２２】
請求項２１に記載の医薬組成物において、化合物が、ワクチンであることを特徴とする医薬組成物。
【請求項２３】
請求項２２に記載の医薬組成物において、薬理的に許容される担体、賦形剤、アジュバント又は免疫モジュレータをさらに含むことを特徴とする医薬組成物。
【請求項２４】
請求項２３に記載の医薬組成物において、前記アジュバントが、ＤＤＡ／ＴＤＢ又はミョウバンであることを特徴とする医薬組成物。
【請求項２５】
請求項２３に記載の医薬組成物において、前記担体が、ウイルス様粒子であることを特徴とする医薬組成物。
【請求項２６】
請求項２１乃至２５に記載の医薬組成物において、クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）又は肺炎クラミジア（Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）による感染症などのクラミジア種（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｓｐ．）感染症に対する予防又は治療に使用するためのものであることを特徴とする医薬組成物。
【請求項２７】
クラミジア・トラコマチス（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）及び肺炎クラミジア（Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）による感染症などのクラミジア種（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｓｐ．）感染症を予防、治療及び／又はその発生数を低減するための請求項２６に記載の医薬組成物の使用。