【手続補正書】
【提出日】平成29年10月6日(2017.10.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
治療的作用物質にコンジュゲートされた治療有効量の抗体またはその抗体断片を含む、薬学的組成物であって、該抗体または抗体断片が、アミノ酸配列NYTFASTEGQYLLDTSTWSECTEPKHIVEWNVS (SEQ ID NO: 1)を含む4回膜貫通型L6ファミリーメンバー1（TM4SF1）においてポリペプチド配列に結合する、前記薬学的組成物。
【請求項２】
前記ポリペプチド配列が、グリコシル化部位を含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項３】
前記グリコシル化部位が、N結合型である、請求項2記載の薬学的組成物。
【請求項４】
前記グリコシル化部位が、TM4SF1の残基N129または残基N159である、請求項2記載の薬学的組成物。
【請求項５】
前記抗体または抗体断片が、グリコシル化依存性様式でポリペプチドに結合する、請求項2記載の薬学的組成物。
【請求項６】
前記抗体または抗体断片が、10 nM以下のKd値でTM4SF1に結合する、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項７】
前記抗体または抗体断片が、2 nM以下のKd値でTM4SF1に結合する、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項８】
前記抗体または抗体断片が、500 pM以下のKd値でTM4SF1に結合する、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項９】
前記抗体または抗体断片が、前記ポリペプチドとの結合後に、TM4SF1発現細胞中へインターナライズされる、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項１０】
前記抗体が、モノクローナル抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、または合成抗体である、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項１１】
前記抗体が、Fab、Fab'、F(ab')2、scFv、SMIP、ドメイン抗体、ダイアボディ、ミニボディ、scFv-Fc、アフィボディ、またはナノボディである、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項１２】
前記治療的作用物質が、細胞傷害性物質、化学療法薬、タンパク質、ペプチド、抗体、成長阻害物質、および抗ホルモン薬からなる群より選択される、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項１３】
前記細胞傷害性物質が、リボソーム不活性化タンパク質、ヒストンデアセチラーゼ(HDAC)インヒビター、チューブリンインヒビター、アルキル化薬、抗生物質、抗腫瘍薬、増殖抑制薬、代謝拮抗物質、トポイソメラーゼIまたはIIインヒビター、ホルモンアゴニストまたはアンタゴニスト、免疫調節物質、DNA副溝バインダー、および放射性物質からなる群より選択される、請求項12記載の薬学的組成物。
【請求項１４】
前記抗体または抗体断片が、GFTFSSFAMS (SEQ ID NO: 2)、TISSGSIYIYYTDGVKG (SEQ ID NO: 3)、RGIYYGYDGYAMDY (SEQ ID NO: 4)、RSSQSLVHSNGNTYLH (SEQ ID NO: 5)、KVSNRFS (SEQ ID NO: 6)、およびSQSTHVYT (SEQ ID NO: 7)からなる群より選択されるアミノ酸配列から1つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列を含む結合ドメインを含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項１５】
前記抗体または抗体断片が、GFTFSSFAMS (SEQ ID NO: 2)、TISSGSIYIYYTDGVKG (SEQ ID NO: 3)、RGIYYGYDGYAMDY (SEQ ID NO: 4)、RSSQSLVHSNGNTYLH (SEQ ID NO: 5)、KVSNRFS (SEQ ID NO: 6)、およびSQSTHVYT (SEQ ID NO: 7)からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む結合ドメインを含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項１６】
前記抗体または抗体断片が、GFTFSSFAMS (SEQ ID NO: 2)、TISSGSIYIYYTDGVKG (SEQ ID NO: 3)、RGIYYGYDGYAMDY (SEQ ID NO: 4)、RSSQSLVHSNGNTYLH (SEQ ID NO: 5)、KVSNRFS (SEQ ID NO: 6)、およびSQSTHVYT (SEQ ID NO: 7)からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む結合ドメインを含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項１７】
前記抗体または抗体断片が、GFTFSSFAMS (SEQ ID NO: 2)、TISSGSIYIYYTDGVKG (SEQ ID NO: 3)、RGIYYGYDGYAMDY (SEQ ID NO: 4)、RSSQSLVHSNGNTYLH (SEQ ID NO: 5)、KVSNRFS (SEQ ID NO: 6)、およびSQSTHVYT (SEQ ID NO: 7)からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む結合ドメインを含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項１８】
前記抗体または抗体断片が、GFTFSSFAMS (SEQ ID NO: 2)、TISSGSIYIYYTDGVKG (SEQ ID NO: 3)、およびRGIYYGYDGYAMDY (SEQ ID NO: 4)から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのアミノ酸配列を含む結合ドメインを含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項１９】
前記抗体または抗体断片が、RSSQSLVHSNGNTYLH (SEQ ID NO: 5)、KVSNRFS (SEQ ID NO: 6)、およびSQSTHVYT (SEQ ID NO: 7)から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのアミノ酸配列を含む結合ドメインを含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項２０】
前記抗体または抗体断片が、以下の6つのアミノ酸配列：GFTFSSFAMS (SEQ ID NO: 2)、TISSGSIYIYYTDGVKG (SEQ ID NO: 3)、RGIYYGYDGYAMDY (SEQ ID NO: 4)、RSSQSLVHSNGNTYLH (SEQ ID NO: 5)、KVSNRFS (SEQ ID NO: 6)、およびSQSTHVYT (SEQ ID NO: 7)を含む結合ドメインを含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項２１】
前記抗体の重鎖が、EVILVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSSFAMSWVRQTPEKRLEWVATISSGSIYIYYTDGVKGRFTISRDNAKNTVHLQMSSLRSEDTAMYYCARRGIYYGYDGYAMDYWGQGTSVTVSS (SEQ ID NO: 8)に対して少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項２２】
前記抗体の軽鎖が、AVVMTQTPLSLPVSLGDQASISCRSSQSLVHSNGNTYLHWYMQKPGQSPKVLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEADDLGIYFCSQSTHIP-LAFGAGTKLELK (SEQ ID NO: 9)に対して少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項２３】
前記抗体の重鎖が、EVILVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSSFAMSWVRQTPEKRLEWVATISSGSIYIYYTDGVKGRFTISRDNAKNTVHLQMSSLRSEDTAMYYCARRGIYYGYDGYAMDYWGQGTSVTVSS (SEQ ID NO: 8)に対して少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ
前記抗体の軽鎖が、AVVMTQTPLSLPVSLGDQASISCRSSQSLVHSNGNTYLHWYMQKPGQSPKVLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEADDLGIYFCSQSTHIP-LAFGAGTKLELK (SEQ ID NO: 9)に対して少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項２４】
前記抗体の重鎖が、EVILVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSSFAMSWVRQTPEKRLEWVATISSGSIYIYYTDGVKGRFTISRDNAKNTVHLQMSSLRSEDTAMYYCARRGIYYGYDGYAMDYWGQGTSVTVSS (SEQ ID NO: 8)に対して少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項２５】
前記抗体の軽鎖が、AVVMTQTPLSLPVSLGDQASISCRSSQSLVHSNGNTYLHWYMQKPGQSPKVLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEADDLGIYFCSQSTHIP-LAFGAGTKLELK (SEQ ID NO: 9)に対して少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項２６】
前記抗体の重鎖が、EVILVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSSFAMSWVRQTPEKRLEWVATISSGSIYIYYTDGVKGRFTISRDNAKNTVHLQMSSLRSEDTAMYYCARRGIYYGYDGYAMDYWGQGTSVTVSS (SEQ ID NO: 8)に対して少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ
前記抗体の軽鎖が、AVVMTQTPLSLPVSLGDQASISCRSSQSLVHSNGNTYLHWYMQKPGQSPKVLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEADDLGIYFCSQSTHIP-LAFGAGTKLELK (SEQ ID NO: 9)に対して少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項２７】
前記抗体がハイブリドーママウス細胞株8G4-5-13-13F(PTA-120523)によって産生される、請求項1記載の薬学的組成物。
【請求項２８】
請求項1〜27のいずれか一項記載の抗体またはその抗体断片をコードする、ポリヌクレオチド。
【請求項２９】
請求項28記載のポリヌクレオチドを含む、ベクター。
【請求項３０】
請求項29記載のベクターを含む、宿主細胞。
【請求項３１】
病的血管新生を治療するための、請求項1〜27のいずれか一項記載の薬学的組成物の使用。
【請求項３２】
病的血管新生を治療するための医薬の製造のための、請求項1〜27のいずれか一項記載の薬学的組成物の使用。
【請求項３３】
前記病的血管新生が癌に関連する、請求項31または32記載の使用。
【請求項３４】
前記癌が、乳癌、卵巣癌、腎臓癌（renal cancer）、結腸直腸癌、肝臓癌、胃癌、皮膚癌、食道癌、腎臓癌（kidney cancer）、脳腫瘍、甲状腺癌、前立腺癌、膵臓癌、肺癌、精巣癌、小腸癌、唾液腺癌、および副腎癌からなる群より選択される、請求項33記載の使用。
【請求項３５】
前記病的血管新生が、肥満、黄斑変性、糖尿病性網膜症、乾癬、関節リウマチ、細胞性免疫、アテローム性動脈硬化症、または酒さである、請求項31または32記載の使用。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２１】
本発明の全ての局面の好ましい態様において、対象は、哺乳動物、好ましくはヒトである。
[本発明1001]
アミノ酸配列
2016535584.tif 000001
を含むエピトープにおいてポリペプチドと特異的に結合する結合性ドメインを含む、化合物。
[本発明1002]
前記ポリペプチドが4回膜貫通型L6ファミリーメンバー1（TM4SF1）である、本発明1001の化合物。
[本発明1003]
前記TM4SF1がヒトTM4SF1である、本発明1002の化合物。
[本発明1004]
前記ヒトTM4SF1がグリコシル化ヒトTM4SF1である、本発明1003の化合物。
[本発明1005]
前記グリコシル化ヒトTM4SF1が、残基N129または残基N159でグリコシル化されている、本発明1004の化合物。
[本発明1006]
前記グリコシル化ヒトTM4SF1が、残基N129および残基N159でグリコシル化されている、本発明1005の化合物。
[本発明1007]
10 nM以下のKd値で前記グリコシル化ヒトTM4SF1に特異的に結合することができる、本発明1006の化合物。
[本発明1008]
前記Kd値が2 nM以下である、本発明1007の化合物。
[本発明1009]
前記Kd値が500 pM以下である、本発明1008の化合物。
[本発明1010]
前記結合性ドメインが、
2016535584.tif 000002
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、本発明1001〜1009のいずれかの化合物。
[本発明1011]
前記結合性ドメインが、
2016535584.tif 000003
より選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのアミノ酸配列を含む、本発明1010の化合物。
[本発明1012]
前記結合性ドメインが、
2016535584.tif 000004
より選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのアミノ酸配列を含む、本発明1010の化合物。
[本発明1013]
前記結合性ドメインが、
2016535584.tif 000005
の6つのアミノ酸配列を含む、本発明1010の化合物。
[本発明1014]
抗体である、本発明1001〜1013のいずれかの化合物。
[本発明1015]
前記抗体がハイブリドーママウス細胞株8G4-5-13-13F(PTA-120523)によって産生される、本発明1014の化合物。
[本発明1016]
前記抗体の重鎖が、
2016535584.tif 000006
に対して少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、本発明1014または1015の化合物。
[本発明1017]
前記抗体の軽鎖が、
2016535584.tif 000007
に対して少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、本発明1014または1015の化合物。
[本発明1018]
前記抗体の重鎖が、
2016535584.tif 000008
に対して少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ
前記抗体の軽鎖が、
2016535584.tif 000009
に対して少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、本発明1014または1015の化合物。
[本発明1019]
前記抗体が、モノクローナル抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、または合成抗体である、本発明1014〜1018のいずれかの化合物。
[本発明1020]
前記抗体が抗体断片である、本発明1014〜1019のいずれかの化合物。
[本発明1021]
作用物質をさらに含む、本発明1001〜1020のいずれかの化合物。
[本発明1022]
前記作用物質が治療的作用物質または診断的作用物質である、本発明1021の化合物。
[本発明1023]
前記治療的作用物質が生物活性部分である、本発明1022の化合物。
[本発明1024]
前記診断的作用物質が標識である、本発明1022の化合物。
[本発明1025]
前記生物活性部分が、細胞傷害性物質、化学療法薬、タンパク質、ペプチド、抗体、成長阻害物質、および抗ホルモン薬からなる群より選択される、本発明1023の化合物。
[本発明1026]
細胞傷害性物質が、リボソーム不活性化タンパク質、ヒストンデアセチラーゼ(HDAC)インヒビター、チューブリンインヒビター、アルキル化薬、抗生物質、抗腫瘍薬、増殖抑制薬、代謝拮抗物質、トポイソメラーゼIまたはIIインヒビター、ホルモンアゴニストまたはアンタゴニスト、免疫調節物質、DNA副溝バインダー、および放射性物質からなる群より選択される、本発明1025の化合物。
[本発明1027]
リボソーム不活性化タンパク質がサポリンである、本発明1026の化合物。
[本発明1028]
前記標識が、蛍光標識、発色標識、または放射標識である、本発明1024の化合物。
[本発明1029]
前記作用物質が、前記化合物に直接的にコンジュゲートされている、本発明1021〜1028のいずれかの化合物。
[本発明1030]
前記作用物質が、リンカーによって前記化合物に間接的にコンジュゲートされている、本発明1021〜1028のいずれかの化合物。
[本発明1031]
本発明1001〜1030のいずれかの化合物を含む、薬学的組成物。
[本発明1032]
薬学的に許容される担体、賦形剤、または希釈剤をさらに含む、本発明1031の薬学的組成物。
[本発明1033]
対象における病的血管新生と関連する障害を治療するために製剤化されている、本発明1031または本発明1032の薬学的組成物。
[本発明1034]
本発明1001〜1030のいずれかの化合物をコードする、ポリヌクレオチド。
[本発明1035]
本発明1034のポリヌクレオチドを含む、ベクター。
[本発明1036]
本発明1035のベクターを含む、宿主細胞。
[本発明1037]
哺乳動物細胞である、本発明1036の宿主細胞。
[本発明1038]
原核細胞である、本発明1036の宿主細胞。
[本発明1039]
培養培地において本発明1036の宿主細胞を培養する工程を含む、本発明1001〜1030のいずれかの化合物を製造する方法。
[本発明1040]
前記宿主細胞または前記培養培地から前記化合物を回収する工程をさらに含む、本発明1039の方法。
[本発明1041]
病的血管新生と関連する障害を有する対象を治療する方法であって、治療有効量の本発明1001〜1023、1025〜1027、1029、および1030のいずれかの化合物またはその薬学的組成物を投与し、それによって該対象を治療する工程を含む、方法。
[本発明1042]
前記化合物が約0.01 mg/kg〜約10 mg/kgの投薬量で前記対象へ投与される、本発明1041の方法。
[本発明1043]
前記化合物が約0.1 mg/kg〜約10 mg/kgの投薬量で前記対象へ投与される、本発明1042の方法。
[本発明1044]
前記化合物が約3 mg/kg〜約10 mg/kgの投薬量で前記対象へ投与される、本発明1043の方法。
[本発明1045]
前記病的血管新生と関連する障害が癌である、本発明1041〜1044のいずれかの方法。
[本発明1046]
前記癌が、乳癌、卵巣癌、腎臓癌（renal cancer）、結腸直腸癌、肝臓癌、胃癌、皮膚癌、食道癌、腎臓癌（kidney cancer）、脳腫瘍、甲状腺癌、前立腺癌、膵臓癌、肺癌、精巣癌、小腸癌、唾液腺癌、および副腎癌からなる群より選択される、本発明1045の方法。
[本発明1047]
前記病的血管新生と関連する障害が、肥満、黄斑変性、糖尿病性網膜症、乾癬、関節リウマチ、細胞性免疫、アテローム性動脈硬化症、または酒さである、本発明1041または本発明1042の方法。
[本発明1048]
前記化合物が、アミノ酸配列
2016535584.tif 000010
を含む前記エピトープとの結合後にTM4SF1発現細胞中へインターナライズされることが可能である、本発明1041〜1047のいずれかの方法。
[本発明1049]
前記化合物が、前記TM4SF1発現細胞の細胞質中へインターナライズされる、本発明1048の方法。
[本発明1050]
前記化合物が、前記TM4SF1発現細胞の核中へインターナライズされる、本発明1048の方法。
[本発明1051]
前記TM4SF1発現細胞が、腫瘍血管内皮細胞または腫瘍細胞である、本発明1048の方法。
[本発明1052]
前記化合物または前記薬学的組成物が、筋肉内に、静脈内に、皮内に、経皮的に、動脈内に、腹腔内に、病巣内に、頭蓋内に、関節内に、前立腺内に、胸膜内に、気管内に、鼻腔内に、硝子体内に、膣内に、直腸内に、局所的に、腫瘍内に、腹膜に、皮下に、結膜下に、小嚢内に、粘膜に、心膜内に、臍帯内に、眼内に、経口的に、局所的に、局在的に、吸入によって、注射によって、注入によって、持続注入によって、標的細胞を直接浸す局在的な灌流によって、カテーテルによって、洗浄によって、クリームの形態で、または脂質組成物の形態で投与される、本発明1041〜1051のいずれかの方法。
[本発明1053]
前記対象が、少なくとも一用量の前記化合物または前記薬学的組成物の投与を受ける、本発明1052の方法。
[本発明1054]
前記対象が、少なくとも二用量の前記化合物または前記組成物の投与を受ける、本発明1053の方法。
[本発明1055]
前記化合物または前記組成物が、1週間に1〜7回、前記対象へ投与される、本発明1053の方法。
[本発明1056]
前記化合物または前記組成物が、4日に1回、前記対象へ投与される、本発明1055の方法。
[本発明1057]
前記対象がヒトである、本発明1041〜1055のいずれかの方法。
[本発明1058]
生物学的サンプル中のアミノ酸配列
2016535584.tif 000011
を含むポリペプチドを検出するための方法であって、
(a)該生物学的サンプルおよび対照サンプルを提供する工程；
(b)該生物学的サンプルおよび該対照サンプルと、本発明1001〜1022、1024、もしくは1028〜1030のいずれかの化合物またはその薬学的組成物とを接触させる工程；ならびに
(c)該生物学的サンプルおよび該対照サンプル中に存在する該化合物と該ポリペプチドとの複合体の量を決定する工程
を含む、方法。
[本発明1059]
前記生物学的サンプルが、病的血管新生と関連する障害を有する疑いのある対象から得られる、本発明1058の方法。
[本発明1060]
(a)本発明1031〜1033のいずれかの薬学的組成物；および
(b)病的血管新生と関連する障害を治療するために該薬学的組成物を対象へ投与するための説明書
を含む、キット。