【手続補正書】
【提出日】平成29年9月7日(2017.9.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験者の胃がんステージを検出または診断する方法、あるいは、被験者が胃がんのステージにある尤度を決定する方法であって、
前記被験者から得られる非細胞性生体液サンプル中に、表８、表１５、表１６、および表１７からなる群より選択される表の少なくとも一つに掲載されるマイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）と少なくとも９０％の配列同一性を有する少なくとも一つのｍｉＲＮＡの発現レベルを測定する工程を含み、
コントロールと比べる場合の前記サンプル中のｍｉＲＮＡ発現の差次的発現により、前記被験者が胃がんステージ１、ステージ２、ステージ３、またはステージ４のいずれか一つにあると診断し、
差次的発現が、表８、表１５、表１６、および表１７からなる群より選択される表の少なくとも一つにおける「アップレギュレートされた」として掲載される少なくとも一つのｍｉＲＮＡのｍｉＲＮＡ発現のアップレギュレーションおよび「ダウンレギュレートされた」として掲載される少なくとも一つのｍｉＲＮＡのｍｉＲＮＡ発現のダウンレギュレーションである、方法。
【請求項２】
前記コントロールが胃がんの無い被験者である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記コントロールと比較する「アップレギュレートされた」ｍｉＲＮＡのアップレギュレーションによって、前記被験者がステージ１の胃がんを有すると診断し、ならびに、前記「アップレギュレートされた」ｍｉＲＮＡが、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４２−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２９ｃ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２９ｂ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２７ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１０１−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５９０−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２１−３ｐ、およびｈｓａ−ｍｉＲ−１０６ｂ−３ｐからなる群より選択される、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
前記コントロールと比較する「ダウンレギュレートされた」ｍｉＲＮＡのダウンレギュレーションによって、前記被験者がステージ１の胃がんを有すると診断し、ならびに、前記「ダウンレギュレートされた」ｍｉＲＮＡが、ｈｓａ−ｍｉＲ−１０３ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２６ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４６ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１５ｂ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３６２−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−６７１−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−４５４−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３２８、ｈｓａ−ｍｉＲ−２２１−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２３ｃ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１３６−５ｐ、およびｈｓａ−ｍｉＲ−４８５−３ｐからなる群より選択される、請求項１または２に記載の方法。
【請求項５】
前記コントロールと比較する「アップレギュレートされた」ｍｉＲＮＡのアップレギュレーションによって、前記被験者がステージ２の胃がんを有すると診断し、ならびに、前記「アップレギュレートされた」ｍｉＲＮＡが、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４２−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２９ｃ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１９ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−９３−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４０−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４８ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１８３−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２９ｂ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−４２４−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２７ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−６２９−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１２８０、ｈｓａ−ｍｉＲ−１８ｂ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１９５−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１８ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５５０ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１９７−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３６３−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−４５０ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２０ｂ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１５ｂ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５０１−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−４３０６、ｈｓａ−ｍｉＲ−１８１ａ−２−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１６−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１２８、ｈｓａ−ｍｉＲ−５００ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５０１−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−６２９−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２５−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２９ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２３ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５９８、ｈｓａ−ｍｉＲ−１８６−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−９３−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２３ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３３９−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１５ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４０−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２９ｃ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３２０ｂ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１５ｂ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２２１−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２９ｂ−２−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５３２−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３７４ｂ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５８９−５ｐ、およびｈｓａ−ｍｉＲ−１０６ｂ−３ｐからなる群より選択される、請求項１または２に記載の方法。
【請求項６】
前記コントロールと比較する「ダウンレギュレートされた」ｍｉＲＮＡのダウンレギュレーションによって、前記被験者がステージ２の胃がんを有すると診断し、ならびに、前記「ダウンレギュレートされた」ｍｉＲＮＡが、ｈｓａ−ｍｉＲ−１０７、ｈｓａ−ｍｉＲ−１２６−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−９９ｂ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３３９−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３２０ａ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３３７−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１９３ｂ−３ｐ、およびｈｓａ−ｍｉＲ−８８５−５ｐからなる群より選択される、請求項１または２に記載の方法。
【請求項７】
前記コントロールと比較する「アップレギュレートされた」ｍｉＲＮＡのアップレギュレーションによって、前記被験者がステージ３の胃がんを有すると診断し、前記「アップレギュレートされた」ｍｉＲＮＡが、ｈｓａ−ｍｉＲ−１９ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４０−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４８ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−４２４−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−６２９−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−６５０、ｈｓａ−ｍｉＲ−１２８０、ｈｓａ−ｍｉＲ−２７ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１８ｂ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５００ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−６２９−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５５０ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−４３０６、ｈｓａ−ｍｉＲ−１９７−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−６１６−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１２８、ｈｓａ−ｍｉＲ−４５０ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５９８、ｈｓａ−ｍｉＲ−１５ｂ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１２９０、ｈｓａ−ｍｉＲ−９３−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２２−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２３ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３２０ｃ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１３０ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３２０ｂ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３２０ｅ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３７８ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−９−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２９ｂ−２−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５３２−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５９０−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５８９−５ｐ、およびｈｓａ−ｍｉＲ−２９ｃ−５ｐからなる群より選択される、請求項１または２に記載の方法。
【請求項８】
前記コントロールと比較する「ダウンレギュレートされた」ｍｉＲＮＡのダウンレギュレーションによって、前記被験者がステージ３の胃がんを有すると診断し、前記「ダウンレギュレートされた」ｍｉＲＮＡが、ｈｓａ−ｍｉＲ−３０ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１０７、ｈｓａ−ｍｉＲ−１２６−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−９９ｂ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１２６−５ｐ、およびｈｓａ−ｍｉＲ−２７ａ−３ｐからなる群より選択される、請求項１または２に記載の方法。
【請求項９】
前記コントロールと比較する「アップレギュレートされた」ｍｉＲＮＡのアップレギュレーションによって、前記被験者がステージ４の胃がんを有すると診断し、前記「アップレギュレートされた」ｍｉＲＮＡが、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４２−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２９ｃ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１９ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−９３−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４０−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４８ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１８３−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２９ｂ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−４２４−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２７ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３３８−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−４５０ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５７９、ｈｓａ−ｍｉＲ−６１６−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２００ｂ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−６２９−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−４３０６、ｈｓａ−ｍｉＲ−１５ｂ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−６２７、ｈｓａ−ｍｉＲ−２０ｂ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１９７−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１０１−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５９８、ｈｓａ−ｍｉＲ−２３ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４１−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５５０ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１８ｂ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５９０−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１２８０、ｈｓａ−ｍｉＲ−１９１−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−５８９−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４０−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−６２８−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−９３−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１０６ｂ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−４８４、ｈｓａ−ｍｉＲ−２９ａ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２９ｂ−２−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２９ｃ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−４２５−５ｐ、およびｈｓａ−ｍｉＲ−４２５−３ｐからなる群より選択される、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１０】
前記コントロールと比較する「ダウンレギュレートされた」ｍｉＲＮＡのダウンレギュレーションによって、前記被験者がステージ４の胃がんを有すると診断し、前記「ダウンレギュレートされた」ｍｉＲＮＡが、ｈｓａ−ｍｉＲ−３０ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１０７、ｈｓａ−ｍｉＲ−２６ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１２６−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−９９ｂ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３３９−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１８１ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３０ｄ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３０ｂ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４６ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１０ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１３９−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１０ｂ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−２３ｃ、ｈｓａ−ｍｉＲ−４９７−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１５４−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３８２−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１３４、ｈｓａ−ｍｉＲ−４０９−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−４８７ｂ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１３６−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１５０−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１９３ｂ−３ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−９９ａ−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３３７−５ｐ、ｈｓａ−ｍｉＲ−４９５、ｈｓａ−ｍｉＲ−８８５−５ｐ、およびｈｓａ−ｍｉＲ−１２２−５ｐからなる群より選択される、請求項１または２に記載の方法。
【請求項１１】
前記方法が、ｍｉＲ−２２３−３ｐ、ｍｉＲ−２０ａ−５ｐ、ｍｉＲ−１７−５ｐ、ｍｉＲ−１０６ｂ−５ｐ、ｍｉＲ−４２３−５ｐ、およびｍｉＲ−２１−５ｐからなる群より選択される任意の一又は複数のｍｉＲＮＡの発現レベルを比較する工程をさらに含む、請求項５に記載の方法。
【請求項１２】
前記方法が、ｍｉＲ−２１−５ｐｍ、ｍｉＲ−２２３−３ｐ、およびｍｉＲ−４２３−５ｐからなる群より選択される任意の一又は複数のｍｉＲＮＡの発現レベルを比較する工程をさらに含む、請求項７に記載の方法。
【請求項１３】
前記方法が、ｍｉＲ−２１−５ｐｍ、ｍｉＲ−２２３−３ｐｍ、ｍｉＲ−２０ａ−５ｐｍ、ｍｉＲ−１０６ｂ−５ｐ、およびｍｉＲ−１７−５ｐからなる群より選択される任意の一又は複数のｍｉＲＮＡの発現レベルを比較する工程をさらに含む、請求項９に記載の方法。