【手続補正書】
【提出日】平成29年9月5日(2017.9.5)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
無作為化、二重盲検、プラセボ対照クロスオーバープロトコールに従って、微生物を含む組成物とプラセボの摂取後に、被験者の糞便微生物叢の組成の変化を測定するためのインビトロ法であって、
（ｉ）前記プロトコールに従って、本組成物又はプラセボの摂取前及び／又は摂取中及び／又は摂取後に、前記被験者の健康状態及び／又は食習慣についての情報を収集する工程、
（ｉｉ）前記プロトコールに従って、本組成物又はプラセボの摂取前及び／又は摂取中及び／又は摂取後に、前記被験者から得られた糞便試料についてメタゲノム解析を行って微生物叢を解析する工程、及び
（ｉｉｉ）前記プロトコールに従って、本組成物又はプラセボの摂取前及び／又は摂取中及び／又は摂取後に、前記被験者の糞便微生物叢を定性的及び／又は定量的に比較する工程、
を含む、方法。
【請求項２】
前記微生物が、個々の又は組合せの、細菌及び／又は酵母である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記微生物が、ラクトバシルス（Lactobacillus）、ビフィドバクテリウム（Bifidobacterium）、バシラス（Bacillus）、プロピオニバクテリウム（Propionibacterium）、連鎖球菌（Streptococcus）、ラクトコッカス（Lactococcus）、アエロコッカス（Aerococcus）、及びエンテロコッカス（Enterococcus）から選択される属の細菌である、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４】
前記微生物が、ラクトバシルス（Lactobacillus）は、ラクトバシルス・パラカゼイ（Lactobacillus paracasei）、ラクトバシルス・アシドフィルス（Lactobacillus acidophilus）、ラクトバシルス・アミロリティカス（Lactobacillus amylolyticus）、ラクトバシルス・アミロボルス（Lactobacillus amylovorus）、ラクトバシルス・アリメンタリウス（Lactobacillus alimentarius）、ラクトバシルス・アビアリエス（Lactobacillus aviaries）、ラクトバシルス・ブレビス（Lactobacillus brevis）、ラクトバシルス・ブクネリ（Lactobacillus buchneri）、ラクトバシルス・カゼイ（Lactobacillus casei）、ラクトバシルス・セロビオスス（Lactobacillus cellobiosus）、ラクトバシルス・コリニフォルミス（Lactobacillus coryniformis）、ラクトバシルス・クリスパツス（Lactobacillus crispatus）、ラクトバシルス・クルバツス（Lactobacillus curvatus）、ラクトバシルス・デルブルエッキイ（Lactobacillus delbrueckii）、ラクトバシルス・ファルシミニス（Lactobacillus farciminis）、ラクトバシルス・ファーメンタム（Lactobacillus fermentum）、ラクトバシルス・ガリナルム（Lactobacillus gallinarum）、ラクトバシルス・ガッセリ（Lactobacillus gasseri）、ラクトバシルス・ヘルベティカス（Lactobacillus helveticus）、ラクトバシルス・ヒルガルディイ（Lactobacillus hilgardii）、ラクトバシルス・ジョンソニイ（Lactobacillus johnsonii）、ラクトバシルス・ケフィラノファシエンス（Lactobacillus kefiranofaciens）、ラクトバシルス・ケフィリ（Lactobacillus kefiri）、ラクトバシルス・ムコセ（Lactobacillus mucosae）、ラクトバシルス・パニス（Lactobacillus panis）、ラクトバシルス・コリノイデス（Lactobacillus collinoides）、ラクトバシルス・パラプランタルム（Lactobacillus paraplantarum）、ラクトバシルス・ペントスス（Lactobacillus pentosus）、ラクトバシルス・プランタルム（Lactobacillus plantarum）、ラクトバシルス・ポンチス（Lactobacillus pontis）、ラクトバシルス・ロイテリ（Lactobacillus reuteri）、ラクトバシルス・ラムノスス（Lactobacillus rhamnosus）、ラクトバシルス・サケイ（Lactobacillus sakei）、ラクトバシルス・サリバリウス（Lactobacillus salivarius）、及びラクトバシルス・サンフランシセンシス（Lactobacillus sanfranciscensis）の種から選択されるラクトバシルス（Lactobacillus）属の細菌である、請求項１〜３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５】
前記微生物が、ラクトバシルス・パラカゼイ（Lactobacillus paracasei）種の細菌である、請求項１〜４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６】
前記微生物が、１０〜５００億コロニー形成単位（ＣＦＵ）の微生物の量で、組成物中に存在する、請求項１〜５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
前記微生物が、生きているか又は死んでいる微生物として、又は溶解物若しくは抽出物の形態で、組成物中に存在する、請求項１〜６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８】
微生物を含む前記組成物が経口投与用に調製される、請求項１〜７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項９】
前記メタゲノム解析が、以下：
−  糞便試料から核酸を抽出する工程、及び
−  糞便微生物叢中に存在する微生物を分子タイピングする工程、
の少なくとも１つを含む、請求項１〜８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
糞便微生物叢の前記タイピングが、リボゾームの１６Ｓサブユニットをコードする遺伝子の少なくとも一部のヌクレオチド配列を分析することにより行われる、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
糞便微生物叢の前記タイピングが、リボゾームの１６Ｓサブユニットをコードする遺伝子の少なくとも一部のヌクレオチド配列をＰＣＲにより増幅することにより行われる、請求項９又は１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記ＰＣＲが、配列番号１及び２を使用して行われる、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
増幅される前記ヌクレオチド配列が配列決定される、請求項１１又は１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記微生物が、階層的クラスタリングプログラム及び／又は分類学的解析により、及び／又は系統発生樹状図を構築することにより、性状解析される、請求項９〜１３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１５】
前記性状解析の結果が、パラメトリック及び／又はノンパラメトリックな統計的手法を用いて分析される、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
請求項１〜１５のいずれか１項に記載の方法を実施するためのキットであって、
−  キットの識別コード、
−  １０〜５００億コロニー形成単位（ＣＦＵ）の微生物を含む組成物の、少なくとも1つの経口製剤、
−  微生物を含有しないプラセボの少なくとも１つの経口製剤、
を含み、
前記微生物の組成物は、プラセボを対照とする無作為化、二重盲検、クロスオーバープロトコールに従って服用され、微生物を含む前記組成物とプラセボはコードにより識別される、キット。