【手続補正書】
【提出日】平成29年10月18日(2017.10.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
障害の症状を軽減する組成物であって、抗ＴＬＲ４アンタゴニストを含み、前記組成物が対象に前記障害の前記症状を軽減するのに十分な量で投与されることを特徴とし、前記対象が、発現の対照レベルと比較して、上昇したレベルの１種もしくは複数のＴＬＲ４リガンドまたは１種もしくは複数の他のバイオマーカーを有する、組成物。
【請求項２】
前記１種もしくは複数のＴＬＲ４リガンドまたは前記１種もしくは複数のバイオマーカーが、抗シトルリン化タンパク質抗体（ＡＣＰＡ）、シトルリン化タンパク質、ＨＭＧＢ１、Ｓ１００Ａ８／Ａ９、テネイシンＣ、およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
前記シトルリン化タンパク質が、シトルリン化フィブリノーゲン、シトルリン化フィブリン、シトルリン化ビメンチン、シトルリン化ヒストン、シトルリン化エノラーゼ、またはシトルリン化ケモカインである、請求項２に記載の組成物。
【請求項４】
前記シトルリン化ヒストンが、シトルリン化ヒストン２ｂである、請求項３に記載の組成物。
【請求項５】
前記シトルリン化ケモカインが、シトルリン化ＣＸＣＬ１０である、請求項３に記載の組成物。
【請求項６】
前記シトルリン化タンパク質が、免疫複合体中にある、請求項２に記載の組成物。
【請求項７】
免疫複合体中の前記シトルリン化タンパク質が、ＩｇＧタンパク質を含む免疫複合体中のシトルリン化フィブリノーゲン（ｃＦｂ）（ｃＦｂ−ＩＣ）である、請求項６に記載の組成物。
【請求項８】
前記生体試料が、血液であるか、または血液に由来する、請求項１に記載の組成物。
【請求項９】
前記生体試料が、尿であるか、または尿に由来する、請求項１に記載の組成物。
【請求項１０】
前記生体試料が、滑液であるか、または滑液に由来する、請求項１に記載の組成物。
【請求項１１】
前記抗ＴＬＲ４アンタゴニストが、抗ＴＬＲ４抗体またはその免疫学的に活性な断片である、請求項１に記載の組成物。
【請求項１２】
前記抗ＴＬＲ４抗体またはその免疫学的に活性な断片が、ＧＧＹＳＷＨ（配列番号１）の可変重鎖相補性決定領域１（ＶＨ  ＣＤＲ１）アミノ酸配列；ＹＩＨＹＳＧＹＴＤＦＮＰＳＬＫＴ（配列番号２）のアミノ酸配列を含むＶＨ  ＣＤＲ２領域；ＫＤＰＳＤＡＦＰＹ（配列番号３）のアミノ酸配列を含むＶＨ  ＣＤＲ３領域；ＲＡＳＱＳＩＳＤＨＬＨ（配列番号４）のアミノ酸配列を含む可変軽鎖相補性決定領域１（ＶＬ  ＣＤＲ１）領域；ＹＡＳＨＡＩＳ（配列番号５）のアミノ酸配列を含むＶＬ  ＣＤＲ２領域；およびＱＱＧＨＳＦＰＬＴ（配列番号６）のアミノ酸配列を含むＶＬ  ＣＤＲ３領域を含む、請求項１１に記載の組成物。
【請求項１３】
前記抗ＴＬＲ４抗体またはその免疫学的に活性な断片が、重鎖可変アミノ酸配列ＱＶＱＬＱＥＳＧＰＧＬＶＫＰＳＤＴＬＳＬＴＣＡＶＳＧＹＳＩＴＧＧＹＳＷＨＷＩＲＱＰＰＧＫＧＬＥＷＭＧＹＩＨＹＳＧＹＴＤＦＮＰＳＬＫＴＲＩＴＩＳＲＤＴＳＫＮＱＦＳＬＫＬＳＳＶＴＡＶＤＴＡＶＹＹＣＡＲＫＤＰＳＤＡＦＰＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号７）、および軽鎖可変アミノ酸配列ＥＩＶＬＴＱＳＰＤＦＱＳＶＴＰＫＥＫＶＴＩＴＣＲＡＳＱＳＩＳＤＨＬＨＷＹＱＱＫＰＤＱＳＰＫＬＬＩＫＹＡＳＨＡＩＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＮＳＬＥＡＥＤＡＡＴＹＹＣＱＱＧＨＳＦＰＬＴＦＧＧＧＴＫＶＥＩＫ（配列番号８）を含む、請求項１２に記載の組成物。
【請求項１４】
前記抗ＴＬＲ４抗体またはその免疫学的に活性な断片が、重鎖アミノ酸配列ＭＧＷＳＷＩＦＬＦＬＬＳＧＴＡＧＶＨＣＱＶＱＬＱＥＳＧＰＧＬＶＫＰＳＤＴＬＳＬＴＣＡＶＳＧＹＳＩＴＧＧＹＳＷＨＷＩＲＱＰＰＧＫＧＬＥＷＭＧＹＩＨＹＳＧＹＴＤＦＮＰＳＬＫＴＲＩＴＩＳＲＤＴＳＫＮＱＦＳＬＫＬＳＳＶＴＡＶＤＴＡＶＹＹＣＡＲＫＤＰＳＤＡＦＰＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡＰＳＳＫＳＴＳＧＧＴＡＡＬＧＣＬＶＫＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴＶＰＳＳＳＬＧＴＱＴＹＩＣＮＶＮＨＫＰＳＮＴＫＶＤＫＲＶＥＰＫＳＣＤＫＴＨＴＣＰＰＣＰＡＰＥＬＬＧＧＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳＨＥＤＰＥＶＫＦＮＷＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡＫＴＫＰＲＥＥＱＹＮＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫＥＹＫＣＫＶＳＳＫＡＦＰＡＰＩＥＫＴＩＳＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱＶＹＴＬＰＰＳＲＥＥＭＴＫＮＱＶＳＬＴＣＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹＳＫＬＴＶＤＫＳＲＷＱＱＧＮＶＦＳＣＳＶＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴＱＫＳＬＳＬＳＰＧＫ（配列番号９）、および軽鎖アミノ酸配列ＭＥＷＳＷＶＦＬＦＦＬＳＶＴＴＧＶＨＳＥＩＶＬＴＱＳＰＤＦＱＳＶＴＰＫＥＫＶＴＩＴＣＲＡＳＱＳＩＳＤＨＬＨＷＹＱＱＫＰＤＱＳＰＫＬＬＩＫＹＡＳＨＡＩＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＮＳＬＥＡＥＤＡＡＴＹＹＣＱＱＧＨＳＦＰＬＴＦＧＧＧＴＫＶＥＩＫＲＴＶＡＡＰＳＶＦＩＦＰＰＳＤＥＱＬＫＳＧＴＡＳＶＶＣＬＬＮＮＦＹＰＲＥＡＫＶＱＷＫＶＤＮＡＬＱＳＧＮＳＱＥＳＶＴＥＱＤＳＫＤＳＴＹＳＬＳＳＴＬＴＬＳＫＡＤＹＥＫＨＫＶＹＡＣＥＶＴＨＱＧＬＳＳＰＶＴＫＳＦＮＲＧＥＣ（配列番号１０）を含む、請求項１３に記載の組成物。
【請求項１５】
前記対象がヒトである、請求項１に記載の組成物。
【請求項１６】
前記障害が、自己免疫障害または炎症性障害である、請求項１に記載の組成物。
【請求項１７】
前記障害が、異常なＴＬＲ４シグナル伝達、上昇したＴＬＲ４リガンド発現または活性、異常な炎症促進性サイトカイン産生、およびこれらの組合せと関連している、請求項１に記載の組成物。
【請求項１８】
前記障害が関節リウマチ（ＲＡ）である、請求項１に記載の組成物。
【請求項１９】
前記障害がアテローム性動脈硬化症である、請求項１に記載の組成物。
【請求項２０】
前記障害が、臓器または組織の移植と関連している請求項１に記載の組成物。
【請求項２１】
前記障害が、急性肺傷害と関連している、請求項１に記載の組成物。
【請求項２２】
前記障害が、虚血／再潅流傷害と関連している、請求項１に記載の組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３８】
本発明は、本明細書に提供される方法のいずれかを実践するためのキットも提供する。例えば、一部の実施形態では、キットは、１種または複数のＴＬＲ４リガンドまたは他のバイオマーカーに特異的な検出試薬、および検出試薬を検出するための手段を含む。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
（項目１）
障害の症状を軽減する方法であって、対象に由来する生体試料中の１種もしくは複数のＴＬＲ４リガンドまたは１種もしくは複数の他のバイオマーカーのレベルを検出する工程と、前記１種もしくは複数のＴＬＲ４リガンドまたは前記１種もしくは複数のバイオマーカーの前記検出レベルを発現の対照レベルと比較する工程と、前記検出レベルが上昇している場合、抗ＴＬＲ４アンタゴニストを、前記対象に前記障害の前記症状を軽減するのに十分な量で投与する工程とを含む、方法。
（項目２）
前記１種もしくは複数のＴＬＲ４リガンドまたは前記１種もしくは複数のバイオマーカーが、抗シトルリン化タンパク質抗体（ＡＣＰＡ）、シトルリン化タンパク質、ＨＭＧＢ１、Ｓ１００Ａ８／Ａ９、テネイシンＣ、およびこれらの組合せからなる群から選択される、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記シトルリン化タンパク質が、シトルリン化フィブリノーゲン、シトルリン化フィブリン、シトルリン化ビメンチン、シトルリン化ヒストン、シトルリン化エノラーゼ、またはシトルリン化ケモカインである、項目２に記載の方法。
（項目４）
前記シトルリン化ヒストンが、シトルリン化ヒストン２ｂである、項目３に記載の方法。
（項目５）
前記シトルリン化ケモカインが、シトルリン化ＣＸＣＬ１０である、項目３に記載の方法。
（項目６）
前記シトルリン化タンパク質が、免疫複合体中にある、項目２に記載の方法。
（項目７）
免疫複合体中の前記シトルリン化タンパク質が、ＩｇＧタンパク質を含む免疫複合体中のシトルリン化フィブリノーゲン（ｃＦｂ）（ｃＦｂ−ＩＣ）である、項目６に記載の方法。
（項目８）
前記生体試料が、血液であるか、または血液に由来する、項目１に記載の方法。
（項目９）
前記生体試料が、尿であるか、または尿に由来する、項目１に記載の方法。
（項目１０）
前記生体試料が、滑液であるか、または滑液に由来する、項目１に記載の方法。
（項目１１）
前記抗ＴＬＲ４アンタゴニストが、抗ＴＬＲ４抗体またはその免疫学的に活性な断片である、項目１に記載の方法。
（項目１２）
前記抗ＴＬＲ４抗体またはその免疫学的に活性な断片が、ＧＧＹＳＷＨ（配列番号１）の可変重鎖相補性決定領域１（ＶＨ  ＣＤＲ１）アミノ酸配列；ＹＩＨＹＳＧＹＴＤＦＮＰＳＬＫＴ（配列番号２）のアミノ酸配列を含むＶＨ  ＣＤＲ２領域；ＫＤＰＳＤＡＦＰＹ（配列番号３）のアミノ酸配列を含むＶＨ  ＣＤＲ３領域；ＲＡＳＱＳＩＳＤＨＬＨ（配列番号４）のアミノ酸配列を含む可変軽鎖相補性決定領域１（ＶＬ  ＣＤＲ１）領域；ＹＡＳＨＡＩＳ（配列番号５）のアミノ酸配列を含むＶＬ  ＣＤＲ２領域；およびＱＱＧＨＳＦＰＬＴ（配列番号６）のアミノ酸配列を含むＶＬ  ＣＤＲ３領域を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
前記抗ＴＬＲ４抗体またはその免疫学的に活性な断片が、重鎖可変アミノ酸配列ＱＶＱＬＱＥＳＧＰＧＬＶＫＰＳＤＴＬＳＬＴＣＡＶＳＧＹＳＩＴＧＧＹＳＷＨＷＩＲＱＰＰＧＫＧＬＥＷＭＧＹＩＨＹＳＧＹＴＤＦＮＰＳＬＫＴＲＩＴＩＳＲＤＴＳＫＮＱＦＳＬＫＬＳＳＶＴＡＶＤＴＡＶＹＹＣＡＲＫＤＰＳＤＡＦＰＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号７）、および軽鎖可変アミノ酸配列ＥＩＶＬＴＱＳＰＤＦＱＳＶＴＰＫＥＫＶＴＩＴＣＲＡＳＱＳＩＳＤＨＬＨＷＹＱＱＫＰＤＱＳＰＫＬＬＩＫＹＡＳＨＡＩＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＮＳＬＥＡＥＤＡＡＴＹＹＣＱＱＧＨＳＦＰＬＴＦＧＧＧＴＫＶＥＩＫ（配列番号８）を含む、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
前記抗ＴＬＲ４抗体またはその免疫学的に活性な断片が、重鎖アミノ酸配列ＭＧＷＳＷＩＦＬＦＬＬＳＧＴＡＧＶＨＣＱＶＱＬＱＥＳＧＰＧＬＶＫＰＳＤＴＬＳＬＴＣＡＶＳＧＹＳＩＴＧＧＹＳＷＨＷＩＲＱＰＰＧＫＧＬＥＷＭＧＹＩＨＹＳＧＹＴＤＦＮＰＳＬＫＴＲＩＴＩＳＲＤＴＳＫＮＱＦＳＬＫＬＳＳＶＴＡＶＤＴＡＶＹＹＣＡＲＫＤＰＳＤＡＦＰＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡＰＳＳＫＳＴＳＧＧＴＡＡＬＧＣＬＶＫＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴＶＰＳＳＳＬＧＴＱＴＹＩＣＮＶＮＨＫＰＳＮＴＫＶＤＫＲＶＥＰＫＳＣＤＫＴＨＴＣＰＰＣＰＡＰＥＬＬＧＧＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳＨＥＤＰＥＶＫＦＮＷＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡＫＴＫＰＲＥＥＱＹＮＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫＥＹＫＣＫＶＳＳＫＡＦＰＡＰＩＥＫＴＩＳＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱＶＹＴＬＰＰＳＲＥＥＭＴＫＮＱＶＳＬＴＣＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹＳＫＬＴＶＤＫＳＲＷＱＱＧＮＶＦＳＣＳＶＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴＱＫＳＬＳＬＳＰＧＫ（配列番号９）、および軽鎖アミノ酸配列ＭＥＷＳＷＶＦＬＦＦＬＳＶＴＴＧＶＨＳＥＩＶＬＴＱＳＰＤＦＱＳＶＴＰＫＥＫＶＴＩＴＣＲＡＳＱＳＩＳＤＨＬＨＷＹＱＱＫＰＤＱＳＰＫＬＬＩＫＹＡＳＨＡＩＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＮＳＬＥＡＥＤＡＡＴＹＹＣＱＱＧＨＳＦＰＬＴＦＧＧＧＴＫＶＥＩＫＲＴＶＡＡＰＳＶＦＩＦＰＰＳＤＥＱＬＫＳＧＴＡＳＶＶＣＬＬＮＮＦＹＰＲＥＡＫＶＱＷＫＶＤＮＡＬＱＳＧＮＳＱＥＳＶＴＥＱＤＳＫＤＳＴＹＳＬＳＳＴＬＴＬＳＫＡＤＹＥＫＨＫＶＹＡＣＥＶＴＨＱＧＬＳＳＰＶＴＫＳＦＮＲＧＥＣ（配列番号１０）を含む、項目１３に記載の方法。
（項目１５）
前記対象がヒトである、項目１に記載の方法。
（項目１６）
前記障害が、自己免疫障害または炎症性障害である、項目１に記載の方法。
（項目１７）
前記障害が、異常なＴＬＲ４シグナル伝達、上昇したＴＬＲ４リガンド発現または活性、異常な炎症促進性サイトカイン産生、およびこれらの組合せと関連している、項目１に記載の方法。
（項目１８）
前記障害が関節リウマチ（ＲＡ）である、項目１に記載の方法。
（項目１９）
前記障害がアテローム性動脈硬化症である、項目１に記載の方法。
（項目２０）
前記障害が、臓器または組織の移植と関連している項目１に記載の方法。
（項目２１）
前記障害が、急性肺傷害と関連している、項目１に記載の方法。
（項目２２）
前記障害が、虚血／再潅流傷害と関連している、項目１に記載の方法。