【手続補正書】
【提出日】平成29年11月17日(2017.11.17)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
複数のピクセルからなるピクセル領域であって、
前記複数のピクセルのそれぞれのピクセルは、
サンプルを収容するように構成された、集積デバイスの表面の上のサンプル・ウェルと、
励起エネルギーに応答して前記サンプル・ウェルの中の前記サンプルから放出されるエミッション・エネルギーに基づいて、放射線パターンを発生させるように構成されている少なくとも１つのコンポーネントと、
前記放射線パターンの少なくとも一部分の空間的な分布を検出するように構成されている少なくとも１つのセンサーとを有している、ピクセル領域と、
前記複数のピクセルの少なくとも一部分に励起エネルギーを送達するように構成されている少なくとも１つの導波路と、
からなる、集積デバイス。
【請求項２】
前記少なくとも１つの導波路が、前記サンプル・ウェルの中の励起領域に励起エネルギーを与え、前記励起領域の中に位置付けされているサンプルが、前記励起領域を照射する励起エネルギーに応答して、エミッション・エネルギーを放出する、請求項１に記載の集積デバイス。
【請求項３】
前記少なくとも１つの導波路が、少なくとも１つの励起供給源から励起エネルギーを受け取る、請求項１に記載の集積デバイス。
【請求項４】
前記少なくとも１つの励起供給源が、前記集積デバイスの外部にある、請求項３に記載の集積デバイス。
【請求項５】
励起供給源カップリング領域をさらに含み、前記励起供給源カップリング領域は、グレーチング・カップラーを有しており、前記グレーチング・カップラーは、前記少なくとも１つの励起供給源から励起エネルギーを受け取るように、及び、前記励起エネルギーを前記少なくとも１つの導波路にカップリングする、請求項４に記載の集積デバイス。
【請求項６】
前記少なくとも１つの励起供給源が、前記ピクセル領域から分離された領域の中の前記集
積デバイスの前記表面の上に設けられいる、請求項３に記載の集積デバイス。
【請求項７】
前記少なくとも１つの導波路が、前記複数のピクセルの前記一部分のそれぞれのピクセルに関して、サンプル・ウェルの付近に励起エネルギーを送達する、請求項１に記載の集積デバイス。
【請求項８】
前記複数のピクセルのそれぞれのピクセルが、少なくとも１つの励起カップリング構造体をさらに含み、前記少なくとも１つの励起カップリング構造体は、前記少なくとも１つの導波路とカップリングするように、及び、励起エネルギーをサンプル・ウェルの付近に方向付けする、請求項１に記載の集積デバイス。
【請求項９】
前記少なくとも１つの励起カップリング構造体がピクセル導波路及び共鳴構造体のうちの少なくとも１つを含む、請求項８に記載の集積デバイス。
【請求項１０】
前記複数のピクセルのそれぞれのピクセルが、少なくとも１つの表面エネルギー・カップリング・エレメントをさらに含み、前記少なくとも１つの表面エネルギー・カップリング・エレメントは、前記サンプル・ウェルの中に位置付けされているサンプルによって放出されるエミッション・エネルギーとカップリングする、請求項１に記載の集積デバイス。
【請求項１１】
前記サンプルが、複数のマーカのうちの１つによって標識され、前記少なくとも１つの表面エネルギー・カップリング・エレメントが、前記複数のマーカのそれぞれからのエミッション・エネルギーのスペクトル範囲に基づいて、放射線パターンを発生させる、請求項１０に記載の集積デバイス。
【請求項１２】
前記少なくとも１つの表面エネルギー・カップリング・エレメントが同心円状のグレーチング構造体及びナノ・アンテナ構造体のうちの少なくとも１つを含んでなる、請求項１０に記載の集積デバイス。
【請求項１３】
前記少なくとも１つの表面エネルギー・カップリング・エレメントが、前記サンプル・ウェルに隣接して設けられており、前記サンプル・ウェルから放出される放射線を、前記放出される放射線の波長に依存する複数の異なる空間的な分布の中へ方向付けする、請求項１０に記載の集積デバイス。
【請求項１４】
前記少なくとも１つのセンサーが、前記複数のマーカのそれぞれに関する前記放射線パターンの少なくとも一部分の空間的な分布を検出する複数のセンサーである、請求項１３に記載の集積デバイス。
【請求項１５】
少なくとも１つのソーティング・エレメントが、前記サンプル・ウェルと前記複数のセンサーとの間に位置付けされており、特定の波長のエミッション・エネルギーを前記複数のセンサーのうちの１つのセンサーに方向付けする、請求項１４に記載の集積デバイス。
【請求項１６】
システムにおいて、
請求項１〜１５のいずれか１項に記載の集積デバイスと、
機器であって、
少なくとも１つの励起エネルギーを放出するように構成されている励起エネルギー供給源、及び、
前記励起エネルギー供給源を前記集積デバイスに整合させるように構成されている少なくとも１つのアライメント・コンポーネントを有する、機器と、
からなる、システム。
【請求項１７】
集積デバイスの製造方法において、
複数のセンサー領域を形成する工程であって、前記複数のセンサー領域のそれぞれのセンサー領域は、複数のセンサーを含んでなる、複数のセンサー領域を工程と、
複数のサンプル・ウェルを形成する工程であって、前記複数のサンプル・ウェルのそれぞれのサンプル・ウェルが、前記複数のセンサー領域のうちの対応する１つに整合する、複数のサンプル・ウェルを形成する工程と、
前記複数のサンプル・ウェルから分離した励起エネルギーとカップリングするように、及び、励起エネルギーを少なくとも１つのサンプル・ウェルに方向付けするように構成されている、少なくとも１つの導波路を形成する工程と、
複数の表面エネルギー・カップリング・エレメントを形成する工程であって、それぞれの表面エネルギー・カップリング・エレメントは、前記複数のセンサー領域のうちの１つの上に放射線パターンを形成するように構成されており、前記放射線パターンは、前記複数のサンプル・ウェルのうちの対応する１つからのエミッション・エネルギーに基づいている、複数の表面エネルギー・カップリング・エレメントを形成する工程と、
からなる、集積デバイスの製造方法。
【請求項１８】
前記複数のサンプル・ウェルから分離された領域の中にグレーチング・カップラーを形成する工程をさらに含んでなり、前記グレーチング・カップラーは、前記集積デバイスの外部にある少なくとも１つの励起供給源から励起エネルギーを受け取り、及び、前記励起エネルギーを前記少なくとも１つの導波路にカップリングする、請求項１７に記載の集積デバイスを形成する方法。
【請求項１９】
前記複数の表面エネルギー・カップリング・エレメントが、複数の同心円状のグレーチング構造体であり、それぞれのサンプル・ウェルが、前記複数の同心円状のグレーチング構造体のうちの１つに対して中心を合わせられている、請求項１７に記載の集積デバイスを形成する方法。
【請求項２０】
複数のソーティング・エレメントを形成する工程をさらに含み、それぞれのソーティング・エレメントが、前記複数のサンプル・ウェルのうちの１つのサンプル・ウェルと前記複数のセンサー領域のうちの１つのセンサー領域との間に位置付けされており、特定の波長のエミッション・エネルギーを前記複数のセンサーのうちの１つのセンサーに方向付けするように構成されている、請求項１７に記載の方法。
【請求項２１】
試料の分析方法において、
複数のピクセルを有する集積デバイスの表面の上に前記試料を堆積させる工程であって、それぞれのピクセルが、複数のマーカのうちの第１のマーカによって標識されたサンプルを受け入れるように構成されているサンプル・ウェル、及び、複数のセンサーを有するセンサー領域を有している、工程と、
前記集積デバイスを機器と整合させる工程であって、前記機器は、第１のピクセルのサンプル・ウェルに励起エネルギーをカップリングするための少なくとも１つの励起エネルギー供給源、及び、前記第１のピクセルの前記センサー領域の前記複数のセンサーから読み出し信号を受け取るための読み出し回路を有している、工程と、
励起エネルギーによって前記第１のマーカを照射する工程と、
前記第１のピクセルの前記センサー領域の前記複数のセンサーからの前記読み出し信号から、前記第１のマーカによるエミッションから発生するエミッション・エネルギーの空間的な分布を検出する工程と、
からなる、試料の分析方法。
【請求項２２】
エミッション・エネルギーの前記空間的な分布に基づいて、前記複数のマーカの間で前記第１のマーカを特定する工程をさらに含んでなり、前記複数のマーカのそれぞれ１つが、
別個の空間的な分布を有している、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記第１のマーカを特定する工程に基づいて、前記第１のマーカによって標識された分子のタイプを決定する工程をさらに含んでなる、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記分子のタイプが、ヌクレオチドであり、前記第１のマーカが、フルオロフォアである、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
第２のサンプルを標識する第２のマーカを励起エネルギーによって照射する工程と、
前記第１のピクセルの前記センサー領域の前記複数のセンサーからの前記読み出し信号から、前記第２のマーカによって発生するエミッション・エネルギーの空間的な分布を検出する工程と、
をさらに含んでなる、請求項２１に記載の方法。