【手続補正書】
【提出日】平成29年6月15日(2017.6.15)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ベクター配列がリポータトランスジーンを含む組換えＡＡＶベクターにおいて、前記リポータトランスジーンが、（ａ）一本鎖又は自己相補的ゲノムを含み、（ｂ）１つ又は複数の発現調節エレメントに作動可能に連結され、かつ（ｃ）１つ又は複数のフランキングエレメントによってフランキングされている、組換えＡＡＶベクター。
【請求項２】
ベクターがリポータトランスジーンを含む組換えＡＡＶベクターにおいて、前記リポータトランスジーンが、（ａ）一本鎖又は自己相補的ゲノムを含み、（ｂ）１つ又は複数の発現調節エレメントに作動可能に連結され、かつ（ｃ）１つ又は複数のフランキングエレメントによってフランキングされており、ここで、前記組換えＡＡＶベクターは、感染性組換えＡＡＶ粒子を含む、組換えＡＡＶベクター。
【請求項３】
ＡＡＶに結合する抗体を、分析又は検出若しくは測定するための方法において、以下：
（ａ）組換えベクターを包膜する感染性組換えＡＡＶ粒子を用意するステップであって、（ｉ）前記ベクターが、リポータトランスジーンを含み、（ｉｉ）前記リポータトランスジーンが、一本鎖若しくは自己相補的ゲノムを含むと共に、（ｉｉｉ）前記リポータトランスジーンが、１つ又は複数の発現調節エレメントに作動可能に連結され、かつ１つ又は複数のフランキングエレメントによってフランキングされている、ステップ；
（ｂ）ＡＡＶに結合する抗体を分析又は検出するために、被験者からの生体サンプルを用意するステップ；
（ｃ）前記感染性組換えＡＡＶ粒子に感染し得る細胞を用意するステップ；
（ｄ）（ａ）の感染性組換えＡＡＶ粒子を（ｂ）の生体サンプルと接触させるか、又はインキュベートし、これによって得られる混合物（Ｍ）を生成するステップ；
（ｅ）得られた混合物（Ｍ）と（ｃ）の細胞を、（ａ）の前記感染性組換えＡＡＶ粒子が、前記細胞中の前記リポータトランスジーンに感染して、これを発現させることを可能にする条件下で、接触させるステップ；
（ｆ）前記リポータトランスジーンの発現を測定するステップ；並びに
（ｇ）（ｆ）の前記リポータトランスジーン発現を対照のリポータトランスジーンと比較するステップであって、前記対照が、（ｉ）ＡＡＶに結合する抗体が欠失した陰性（−）対照であるか、又は（ｉｉ）ＡＡＶに結合する既定量の抗体を有する陰性（−）対照であるかのいずれかであり、これによって、ＡＡＶに結合する抗体の存在を分析、又は検出若しくは測定するステップ
を含む方法。
【請求項４】
前記細胞が、哺乳動物細胞を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
前記細胞が、ＡＡＶ複製及び／又はゲノム組込みのためのヘルパー機能をコードする核酸配列をもたらす、請求項３に記載の方法。
【請求項６】
前記細胞が、ＡＡＶ血清型ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、Ｒｈ７４、若しくはＲｈ１０、又はこれらＡＡＶ血清型のいずれかのハイブリッド若しくはキメラのＶＰ１、ＶＰ２若しくはＶＰ３配列と９０％以上同一のＶＰ１、ＶＰ２若しくはＶＰ３配列を含むＡＡＶ粒子に感染し得る、請求項３に記載の方法。
【請求項７】
前記細胞が、ＡＡＶ血清型ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、Ｒｈ７４、若しくはＲｈ１０、又は前記ＡＡＶ血清型のいずれかのハイブリッド若しくはキメラに感染し得る、請求項３に記載の方法。
【請求項８】
前記細胞が、哺乳動物細胞を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項９】
前記細胞が、ＨＥＫ−２９３、ＣＨＯ、ＢＨＫ、ＭＤＣＫ、１０Ｔ１／２、ＷＥＨＩ細胞、ＣＯＳ、ＢＳＣ  １、ＢＳＣ  ４０、ＢＭＴ  １０、ＶＥＲＯ、ＷＩ３８、ＭＲＣ５、Ａ５４９、ＨＴ１０８０、２９３、Ｂ−５０、３Ｔ３、ＮＩＨ３Ｔ３、ＨｅｐＧ２、Ｓａｏｓ−２、Ｈｕｈ７、ＨＥＲ、ＨＥＫ、ＨＥＬ、又はＨｅＬａ細胞を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項１０】
前記細胞が、ＡＡＶ  Ｅ４遺伝子を発現する、請求項３に記載の方法。
【請求項１１】
前記細胞が、２Ｖ６．１１細胞を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項１２】
前記リポータトランスジーンが、酵素、比色、蛍光、発光、化学発光、又は電気化学シグナルを賦与するタンパク質をコードする、請求項３に記載の方法。
【請求項１３】
前記リポータトランスジーンが、ルシフェラーゼ遺伝子を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項１４】
前記ルシフェラーゼ遺伝子が、ウミシイタケ（ｒｅｎｉｌｌａ）ルシフェラーゼ遺伝子又はホタル（ｆｉｒｅｆｌｙ）ルシフェラーゼ遺伝子を含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記リポータトランスジーンが、βガラクトシダーゼ遺伝子、βグルコロニダーゼ遺伝子、又はクロラムフェニコールトランスフェラーゼ遺伝子を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項１６】
前記リポータトランスジーンが、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）、赤色蛍光タンパク質（ＲＦＰ）又はアルカリホスファターゼをコードする、請求項３に記載の方法。
【請求項１７】
前記組換えベクターが、ＡＡＶベクターを含む、請求項３に記載の方法。
【請求項１８】
前記ＡＡＶベクターが、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、Ｒｈ７４、若しくはＲｈ１０ベクター、又はこれらＡＡＶベクターのいずれかのハイブリッド若しくはキメラを含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記発現調節エレメントが、哺乳動物細胞において作動可能なプロモータ及び／又はエンハンサー核酸配列を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項２０】
前記発現調節エレメントが、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）最初期プロモータ／エンハンサー、ラウス肉腫ウイルス（ＲＳＶ）プロモータ／エンハンサー、ＳＶ４０プロモータ、ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）プロモータ、ニワトリβアクチン（ＣＢＡ）プロモータ、ホスホグリセロールキナーゼ（ＰＧＫ）プロモータ、又は伸長因子−１α（ＥＦ１−α）プロモータを含む、請求項３に記載の方法。
【請求項２１】
前記リポータトランスジーンが、一本鎖ゲノムである、請求項３に記載の方法。
【請求項２２】
前記リポータトランスジーンが、自己相補的ゲノムである、請求項３に記載の方法。
【請求項２３】
前記フランキングエレメントが、１つ又は複数のＡＡＶ逆方向末端反復配列（ＩＴＲ）を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項２４】
前記リポータトランスジーンが、１つ又は複数の５’及び／又は３’ＡＡＶ  ＩＴＲの間に位置する、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記自己相補的リポータトランスジーンゲノムが、二本鎖逆方向反復配列構造を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項２６】
前記フランキングエレメントが、ＡＡＶ  Ｒｅｐタンパク質によりプロセシングされていない突然変異又は変異型ＡＡＶ  ＩＴＲを含む、請求項３に記載の方法。
【請求項２７】
前記フランキングエレメントが、感染性組換えＡＡＶ粒子において、自己相補的リポータトランスジーンゲノムの二本鎖逆方向配列構造への形成を可能にするか、又はそれを促進する突然変異若しくは変異型ＡＡＶ  ＩＴＲを含む、請求項３に記載の方法。
【請求項２８】
前記突然変異、改変若しくは変異型ＡＡＶ  ＩＴＲが、欠失Ｄ配列、及び／又は突然変異、改変若しくは変異型末端分離（ｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎ）部位（ＴＲＳ）配列を有する、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
前記突然変異、改変若しくは変異型末端分離（ｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎ）部位（ＴＲＳ）配列が、ＣＧＧＴＴＧを含む、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
前記突然変異又は変異型ＡＡＶ  ＩＴＲが、前記リポータトランスジーンの自己相補的配列同士の間に位置する、請求項２７又は２８に記載の方法。
【請求項３１】
前記突然変異又は変異型ＡＡＶ  ＩＴＲが、ＡＡＶ２ゲノム配列のヌクレオチド１２２〜１４４に対応するヌクレオチドが欠失したＡＡＶ２  ＩＴＲを含む、請求項２７又は２８に記載の方法。
【請求項３２】
前記組換えベクターが、ＡＡＶの第１の逆方向末端反復配列（ＩＴＲ）；哺乳動物細胞において作動可能なプロモータ；リポータトランスジーン；ポリアデニル化シグナル；及び任意選択でＡＡＶの第２のＩＴＲを含む請求項３に記載の方法。
【請求項３３】
前記組換えベクターが、哺乳動物細胞において、作動可能なプロモータの下流にリポータトランスジーンの挿入を可能にする制限部位を、また、該制限部位の下流に転写後調節エレメントを含み、ここで、前記プロモータ、前記制限部位及び前記転写後調節エレメントは、５’ＡＡＶ  ＩＴＲの下流に、また任意選択の３’ＡＡＶ  ＩＴＲの上流に位置する、請求項３に記載の方法。
【請求項３４】
前記感染性組換えＡＡＶ粒子が、霊長類に感染するＡＡＶ血清型を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項３５】
前記感染性組換えＡＡＶ粒子が、ヒト又はアカゲザル（ｒｈｅｓｕｓ  ｍａｃａｑｕｅ）に感染するＡＡＶ血清型を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項３６】
前記感染性組換えＡＡＶ粒子が、ＡＡＶ血清型ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、Ｒｈ７４、若しくはＲｈ１０、又はこれらＡＡＶ血清型のいずれかのハイブリッド若しくはキメラのＶＰ１、ＶＰ２又はＶＰ３配列と９０％以上同一であるＶＰ１、ＶＰ２又はＶＰ３配列を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項３７】
前記感染性組換えＡＡＶ粒子が、ＡＡＶ血清型ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、Ｒｈ７４、若しくはＲｈ１０、又は前記ＡＡＶ血清型のいずれかのハイブリッド若しくはキメラを含む、請求項３に記載の方法。
【請求項３８】
前記生体サンプルが、霊長類サンプルを含む、請求項３に記載の方法。
【請求項３９】
前記生体サンプルが、血清を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項４０】
前記生体サンプルが、血漿を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項４１】
前記生体サンプルが、ヒト血清又はヒト血漿を含む、請求項３に記載の方法。
【請求項４２】
前記被験者が、哺乳動物である、請求項３に記載の方法。
【請求項４３】
前記被験者が、ヒトである、請求項３に記載の方法。
【請求項４４】
前記被験者が、タンパク質の不十分な発現又は活性に起因する障害に罹患している、請求項３に記載の方法。
【請求項４５】
前記被験者が、異常、欠陥若しくは望ましくないタンパク質の発現又は活性に起因する疾患に罹患している、請求項３に記載の方法。
【請求項４６】
前記被験者が、遺伝性疾患に罹患している、請求項３に記載の方法。
【請求項４７】
前記被験者が、遺伝子置換又は補充療法の候補である、請求項３に記載の方法。
【請求項４８】
前記被験者が、遺伝子ノックダウン又はノックアウト療法の候補である、請求項３に記載の方法。
【請求項４９】
前記被験者が、以下：肺疾患（例えば、嚢胞性線維症）、出血性疾患（例えば、抑制因子を伴う、若しくは伴わないＡ型血友病又はＢ型血友病）、サラセミア、血液疾患（例えば、貧血）、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）、てんかん、リソソーム蓄積症、銅若しくは鉄蓄積障害（例えば、ウィルソン若しくはメンケス病）、リソソーム酸性リパーゼ欠損症、神経若しくは神経変性疾患、癌、１型若しくは２型糖尿病、ゴーシェ病、ハーラー病、アデノシンデアミナーゼ欠損症、代謝異常（例えば、グリコーゲン蓄積症）、網膜変性疾患（例えば、ＲＰＥ６５欠損症、コロイデレミア、及びその他の眼病）、固形臓器（例えば、脳、肝臓、腎臓、心臓）の疾患、又は感染性ウイルス性（例えば、Ｂ型及びＣ型肝炎、ＨＩＶなど）、細菌性若しくは真菌性疾患に罹患している、請求項３に記載の方法。
【請求項５０】
陰性（−）対照と比較した（ｆ）の前記リポータトランスジーン発現に基づいて、前記生体サンプル中のＡＡＶに結合する抗体の量を計算するステップをさらに含む、請求項３に記載の方法。
【請求項５１】
前記生体サンプル中のＡＡＶに結合する抗体の前記量を、前記被験者に関連する報告書に入力又は算入するステップをさらに含む、請求項３に記載の方法。
【請求項５２】
前記生体サンプル中のＡＡＶに結合する抗体の前記量をデータベースに入力し、これによって、データベースエントリー、すなわち前記被験者に関連するデータベースエントリーを作成するステップをさらに含む、請求項３に記載の方法。
【請求項５３】
分析又は検出される前記抗体が、ＡＡＶキャプシドタンパク質に結合する、請求項３に記載の方法。
【請求項５４】
分析又は検出される前記抗体が、ＡＡＶ血清型ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、Ｒｈ７４、若しくはＲｈ１０、又は前記ＡＡＶ血清型のいずれかのハイブリッド若しくはキメラに結合する、請求項３に記載の方法。
【請求項５５】
前記既定量の抗体が、ＡＡＶ血清型ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、Ｒｈ７４、若しくはＲｈ１０、又は前記ＡＡＶ血清型のいずれかのハイブリッド若しくはキメラに結合する、請求項３に記載の方法。
【請求項５６】
前記生体サンプルを、（ａ）の感染性組換えＡＡＶ粒子との接触又はインキュベートの前に希釈する、請求項３に記載の方法。
【請求項５７】
前記生体サンプルの複数の希釈物を分析する、請求項３に記載の方法。
【請求項５８】
複数の異なる希釈率の前記生体サンプルを分析する、請求項３に記載の方法。
【請求項５９】
前記生体サンプルを、（ａ）の感染性組換えＡＡＶ粒子との接触又はインキュベートの前に、１：１〜１：５００に希釈する、請求項３に記載の方法。
【請求項６０】
前記生体サンプルを、（ａ）の感染性組換えＡＡＶ粒子との接触又はインキュベートの前に、１：５００〜１：５０００に希釈する、請求項３に記載の方法。
【請求項６１】
少なくとも２つ、３つ、４つ、５つ若しくは６つの異なる希釈率の生体サンプルを分析する、請求項３に記載の方法。
【請求項６２】
前記細胞を、前記得られた混合物（ｄ）と６〜４８時間接触させる、請求項３に記載の方法。
【請求項６３】
前記細胞を、前記得られた混合物（ｄ）と１２〜３６時間接触させる、請求項３に記載の方法。
【請求項６４】
前記細胞を、前記得られた混合物（ｄ）と２０〜３０時間接触させる、請求項３に記載の方法。
【請求項６５】
前記細胞を、前記得られた混合物（ｄ）と約２４時間接触させる、請求項３に記載の方法。
【請求項６６】
前記リポータトランスジーンの発現を測定する前に、前記細胞を溶解させる、請求項３に記載の方法。
【請求項６７】
前記生体サンプルが、熱失活させてある、請求項３に記載の方法。
【請求項６８】
前記生体サンプルが、約５０〜７０℃で約１５分〜１時間熱失活させてある、請求項３に記載の方法。
【請求項６９】
前記生体サンプルが、約５６℃で約３０分間熱失活させてある、請求項３に記載の方法。
【請求項７０】
前記方法がｉｎ  ｖｉｔｒｏで実施される、請求項３に記載の方法。