【手続補正書】
【提出日】平成29年3月16日(2017.3.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
融合タンパク質を発現している組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを植物生育環境へと導入すること、または、融合タンパク質を発現している組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを植物、植物種子、または植物もしくは植物種子の周辺域へと適用することを含む、植物の生育を刺激する方法であって、
ここで、前記融合タンパク質は、植物生育刺激タンパク質またはペプチドを少なくとも１つ、および、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーのエキソスポリウムへと融合タンパク質を向かわせる標的化配列、エキソスポリウムタンパク質またはエキソスポリウムタンパク質断片を含有するものである、方法。
【請求項２】
組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーで処理された植物種子であって、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーは融合タンパク質を発現し、前記融合タンパク質は少なくとも一つの対象のタンパク質またはペプチド、および組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーのエキソスポリウムへと融合タンパク質を向かわせる標的化配列、エキソスポリウムタンパク質またはエキソスポリウムタンパク質断片を含有するものである、植物種子。
【請求項３】
前記植物種子が組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーおよび農学的に受容可能な担体を含む種子コーティング製剤でコートされたものである、請求項２に記載の植物種子。
【請求項４】
融合タンパク質を発現する組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーであって、前記融合タンパク質は、
組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーのエキソスポリウムへと融合タンパク質を向かわせる標的化配列、エキソスポリウムタンパク質またはエキソスポリウムタンパク質断片；および
少なくとも１つの植物生育刺激タンパク質またはペプチド、ここで、前記植物生育刺激タンパク質またはペプチドは、任意にエンドグルカナーゼ、ホスホリパーゼ、キトサナーゼ、プロテアーゼ、グリコシド加水分解酵素、ホスファターゼ、ニトロゲナーゼ、ヌクレアーゼ、アミダーゼ、硝酸還元酵素、亜硝酸還元酵素、アンモニアオキシダーゼ、グルコシダーゼ、フィターゼ、ぺクチナーゼ、グルカナーゼ、スルファターゼ、ウレアーゼ、またはキシラナーゼを含む、
を含むものである、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項５】
融合タンパク質を発現する組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーであって、前記融合タンパク質は少なくとも一つの対象のタンパク質またはペプチド、および組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーのエキソスポリウムへと融合タンパク質を向かわせる標的化配列、エキソスポリウムタンパク質またはエキソスポリウムタンパク質断片を含有し、
組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーには、植物生育促進細菌株が含まれ、
前記植物生育促進細菌株は、任意に殺虫性毒素（任意にはＣｒｙ毒素）を産生する、殺真菌性化合物（任意にはβ−グルカナーゼ、キトサナーゼ、リチカーゼまたはそれらの組み合わせ）を産生する、殺線虫性化合物（任意にはＣｒｙ毒素）を産生する、殺菌性化合物を産生する、１以上の抗生物質に対して抵抗性である、１以上の遊離複製プラスミドを含有する、植物の根に結合する、植物の根にコロニー形成する、バイオフィルムを形成する、栄養素を可溶化する、有機酸を分泌する、またはそれらの組み合わせである、
組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項６】
植物生育刺激タンパク質もしくはペプチドを少なくとも１つ、植物におけるストレス耐性を増強させるタンパク質もしくはペプチドを少なくとも１つ、または、植物結合タンパク質もしくはペプチドを少なくとも１つ、および組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーのエキソスポリウムへと融合タンパク質を向かわせる標的化配列、エキソスポリウムタンパク質またはエキソスポリウムタンパク質断片を含有する融合タンパク質であって、
ここで、前記植物生育刺激タンパク質またはペプチドは、ペプチドホルモン、非ホルモン性ペプチド、または植物生育刺激化合物の産生または活性化に関与する酵素を含有する、前記融合タンパク質。
【請求項７】
病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドを少なくとも１つ、および組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーのエキソスポリウムへと融合タンパク質を向かわせる標的化配列、エキソスポリウムタンパク質またはエキソスポリウムタンパク質断片を含む融合タンパク質であって、
ここで、前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドは、ハーピン、αエラスチン、βエラスチン、システミン、フェニルアラニンアンモニアリアーゼ、エリシチン、ディフェンシン、クリプトゲイン、フラジェリンタンパク質、フラジェリンペプチド、バクテリオシン、リゾチーム、リゾチームペプチド、シデロフォア、非リボソーム活性ペプチド、コンアルブミン、アルブミン、ラクトフェリン、ラクトフェリンペプチド、またはＴａｓＡを含有し；ここで、前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドは、殺虫活性、殺蠕虫活性を有するか、または、昆虫もしくは蠕虫の捕食を抑制するか、またはそれらの組み合わせであり；または、ここで、前記病原体から植物を防御するタンパク質は、酵素を含有する、前記融合タンパク質。
【請求項８】
融合タンパク質が：
（ａ）配列番号１のアミノ酸２０〜３５と少なくとも約４３％の同一性を有するアミノ酸配列を含有する標的化配列であって、ここで、アミノ酸２５〜３５との同一性は少なくとも約５４％である、前記標的化配列；
（ｂ）配列番号１のアミノ酸１〜３５を含有する標的化配列；
（ｃ）配列番号１のアミノ酸２０〜３５を含有する標的化配列；
（ｄ）配列番号１を含有する標的化配列；
（ｅ）配列番号２と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｆ）配列番号３のアミノ酸１〜２７を含有する標的化配列；
（ｇ）配列番号３のアミノ酸１２〜２７を含有する標的化配列；
（ｈ）配列番号３を含有する標的化配列；
（ｉ）配列番号４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｊ）配列番号５のアミノ酸１〜３８を含有する標的化配列；
（ｋ）配列番号５のアミノ酸２３〜３８を含有する標的化配列；
（ｌ）配列番号５を含有する標的化配列；
（ｍ）配列番号６と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｎ）配列番号７のアミノ酸１〜２８を含有する標的化配列；
（ｏ）配列番号７のアミノ酸１３〜２８を含有する標的化配列；
（ｐ）配列番号７を含有する標的化配列；
（ｑ）配列番号８と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｒ）配列番号９のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ｓ）配列番号９のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ｔ）配列番号９を含有する標的化配列；
（ｕ）配列番号１０と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｖ）配列番号１１のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｗ）配列番号１１のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｘ）配列番号１１を含有する標的化配列；
（ｙ）配列番号１２と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｚ）配列番号１３のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ａａ）配列番号１３のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ａｂ）配列番号１３を含有する標的化配列；
（ａｃ）配列番号１４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｄ）配列番号１５のアミノ酸１〜４３を含有する標的化配列；
（ａｅ）配列番号１５のアミノ酸２８〜４３を含有する標的化配列；
（ａｆ）配列番号１５を含有する標的化配列；
（ａｇ）配列番号１６と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｈ）配列番号１７のアミノ酸１〜２７を含有する標的化配列；
（ａｉ）配列番号１７のアミノ酸１２〜２７を含有する標的化配列；
（ａｊ）配列番号１７を含有する標的化配列；
（ａｋ）配列番号１８と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｌ）配列番号１９のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ａｍ）配列番号１９のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ａｎ）配列番号１９を含有する標的化配列；
（ａｏ）配列番号２０と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｐ）配列番号２１のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ａｑ）配列番号２１のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ａｒ）配列番号２１を含有する標的化配列；
（ａｓ）配列番号２２と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｔ）配列番号２３のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ａｕ）配列番号２３のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ａｖ）配列番号２３を含有する標的化配列；
（ａｗ）配列番号２４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｘ）配列番号２５のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ａｙ）配列番号２５のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ａｚ）配列番号２５を含有する標的化配列；
（ｂａ）配列番号２６と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｂ）配列番号２７のアミノ酸１〜３０を含有する標的化配列；
（ｂｃ）配列番号２７のアミノ酸１５〜３０を含有する標的化配列；
（ｂｄ）配列番号２７を含有する標的化配列；
（ｂｅ）配列番号２８と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｆ）配列番号２９のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｂｇ）配列番号２９のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｂｈ）配列番号２９を含有する標的化配列；
（ｂｉ）配列番号３０と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｊ）配列番号３１のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ｂｋ）配列番号３１のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ｂｌ）配列番号３１を含有する標的化配列；
（ｂｍ）配列番号３２と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｎ）配列番号３３のアミノ酸１〜１５を含有する標的化配列；
（ｂｏ）配列番号３３を含有する標的化配列；
（ｂｐ）配列番号３４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｑ）配列番号３５のアミノ酸１〜１６を含有する標的化配列；
（ｂｒ）配列番号３５を含有する標的化配列；
（ｂｓ）配列番号３６と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｔ）配列番号４３のアミノ酸１〜２９を含有する標的化配列；
（ｂｕ）配列番号４３のアミノ酸１４〜２９を含有する標的化配列；
（ｂｖ）配列番号４３を含有する標的化配列；
（ｂｗ）配列番号４４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｘ）配列番号４５のアミノ酸１〜３５を含有する標的化配列；
（ｂｙ）配列番号４５のアミノ酸２０〜３５を含有する標的化配列；
（ｂｚ）配列番号４５を含有する標的化配列；
（ｃａ）配列番号４６と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｂ）配列番号４７のアミノ酸１〜４３を含有する標的化配列；
（ｃｃ）配列番号４７のアミノ酸２８〜４３を含有する標的化配列；
（ｃｄ）配列番号４７を含有する標的化配列；
（ｃｅ）配列番号４８と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｆ）配列番号４９のアミノ酸１〜３２を含有する標的化配列；
（ｃｇ）配列番号４９のアミノ酸１７〜３２を含有する標的化配列；
（ｃｈ）配列番号４９を含有する標的化配列；
（ｃｉ）配列番号５０と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｊ）配列番号５１のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｋ）配列番号５１のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｌ）配列番号５１を含有する標的化配列；
（ｃｍ）配列番号５２と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｎ）配列番号５３のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｏ）配列番号５３のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｐ）配列番号５３を含有する標的化配列；
（ｃｑ）配列番号５４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｒ）配列番号５５のアミノ酸１〜３０を含有する標的化配列；
（ｃｓ）配列番号５５のアミノ酸１５〜３０を含有する標的化配列；
（ｃｔ）配列番号５５を含有する標的化配列；
（ｃｕ）配列番号５６と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｖ）配列番号５７のアミノ酸１〜１３０を含有する標的化配列；
（ｃｗ）配列番号５７のアミノ酸１１５〜１３０を含有する標的化配列；
（ｃｘ）配列番号５７を含有する標的化配列；
（ｃｙ）配列番号５８と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｚ）配列番号５９と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質断片；
（ｄａ）配列番号６０を含有する標的化配列；
（ｄｂ）配列番号６１を含有する標的化配列；
（ｄｃ）配列番号６２を含有する標的化配列；
（ｄｄ）配列番号６３を含有する標的化配列；
（ｄｅ）配列番号６４を含有する標的化配列；
（ｄｆ）配列番号６５を含有する標的化配列；
（ｄｇ）配列番号６６を含有する標的化配列；
（ｄｈ）配列番号６７を含有する標的化配列；
（ｄｉ）配列番号６８を含有する標的化配列；
（ｄｊ）配列番号６９を含有する標的化配列；
（ｄｋ）配列番号７０を含有する標的化配列；
（ｄｌ）配列番号７１と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｍ）配列番号７２と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｎ）配列番号７３と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｏ）配列番号７４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｐ）配列番号７５と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｑ）配列番号７６と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｒ）配列番号７７と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｓ）配列番号７８と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｔ）配列番号７９と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｕ）配列番号８０と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｖ）配列番号８１と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｗ）配列番号８２と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｘ）配列番号８３と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｙ）配列番号８４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｚ）配列番号１のアミノ酸２２〜３１を含有する標的化配列；
（ｅａ）配列番号１のアミノ酸２２〜３３を含有する標的化配列；
（ｅｂ）配列番号１のアミノ酸２０〜３１を含有する標的化配列；
（ｅｃ）配列番号３のアミノ酸１４〜２３を含有する標的化配列；
（ｅｄ）配列番号３のアミノ酸１４〜２５を含有する標的化配列；または、
（ｅｆ）配列番号３のアミノ酸１２〜２３を含有する標的化配列、
を含有する、請求項１に記載の方法、請求項２または３に記載の植物種子、請求項４または５に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または請求項６または７に記載の融合タンパク質。
【請求項９】
病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドを少なくとも１つ、および：
（ａ）１６アミノ酸からなり、および、配列番号１のアミノ酸２０〜３５と少なくとも約４３％の同一性を有するアミノ酸配列からなる標的化配列であって、ここで、アミノ酸２５〜３５との同一性は少なくとも約５４％である、前記標的化配列；
（ｂ）配列番号１のアミノ酸１〜３５を含有する標的化配列；
（ｃ）配列番号１のアミノ酸２０〜３５を含有する標的化配列；
（ｄ）配列番号１を含有する標的化配列；
（ｅ）配列番号６０を含有する標的化配列；
（ｆ）配列番号３のアミノ酸１〜２７を含有する標的化配列；
（ｇ）配列番号３のアミノ酸１２〜２７を含有する標的化配列；
（ｈ）配列番号３を含有する標的化配列；
（ｉ）配列番号４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｊ）配列番号５のアミノ酸１〜３８を含有する標的化配列；
（ｋ）配列番号５のアミノ酸２３〜３８を含有する標的化配列；
（ｌ）配列番号５を含有する標的化配列；
（ｍ）配列番号６と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｎ）配列番号７のアミノ酸１〜２８を含有する標的化配列；
（ｏ）配列番号７のアミノ酸１３〜２８を含有する標的化配列；
（ｐ）配列番号７を含有する標的化配列；
（ｑ）配列番号８と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｒ）配列番号９のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ｓ）配列番号９のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ｔ）配列番号９を含有する標的化配列；
（ｕ）配列番号１０と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｖ）配列番号１１のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｗ）配列番号１１のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｘ）配列番号１１を含有する標的化配列；
（ｙ）配列番号１２と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｚ）配列番号１３のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ａａ）配列番号１３のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ａｂ）配列番号１３を含有する標的化配列；
（ａｃ）配列番号１４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｄ）配列番号１５のアミノ酸１〜４３を含有する標的化配列；
（ａｅ）配列番号１５のアミノ酸２８〜４３を含有する標的化配列；
（ａｆ）配列番号１５を含有する標的化配列；
（ａｇ）配列番号１６と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｈ）配列番号１７のアミノ酸１〜２７を含有する標的化配列；
（ａｉ）配列番号１７のアミノ酸１２〜２７を含有する標的化配列；
（ａｊ）配列番号１７を含有する標的化配列；
（ａｋ）配列番号１８と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｌ）配列番号１９のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ａｍ）配列番号１９のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ａｎ）配列番号１９を含有する標的化配列；
（ａｏ）配列番号２０と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｐ）配列番号２１のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ａｑ）配列番号２１のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ａｒ）配列番号２１を含有する標的化配列；
（ａｓ）配列番号２２と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｔ）配列番号２３のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ａｕ）配列番号２３のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ａｖ）配列番号２３を含有する標的化配列；
（ａｗ）配列番号２４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ａｘ）配列番号２５のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ａｙ）配列番号２５のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ａｚ）配列番号２５を含有する標的化配列；
（ｂａ）配列番号２６と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｂ）配列番号２７のアミノ酸１〜３０を含有する標的化配列；
（ｂｃ）配列番号２７のアミノ酸１５〜３０を含有する標的化配列；
（ｂｄ）配列番号２７を含有する標的化配列；
（ｂｅ）配列番号２８と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｆ）配列番号２９のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｂｇ）配列番号２９のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｂｈ）配列番号２９を含有する標的化配列；
（ｂｉ）配列番号３０と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｊ）配列番号３１のアミノ酸１〜２４を含有する標的化配列；
（ｂｋ）配列番号３１のアミノ酸９〜２４を含有する標的化配列；
（ｂｌ）配列番号３１を含有する標的化配列；
（ｂｍ）配列番号３２と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｎ）配列番号３３のアミノ酸１〜１５を含有する標的化配列；
（ｂｏ）配列番号３３を含有する標的化配列；
（ｂｐ）配列番号３４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｑ）配列番号３５のアミノ酸１〜１６を含有する標的化配列；
（ｂｒ）配列番号３５を含有する標的化配列；
（ｂｓ）配列番号３６と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｔ）配列番号４３のアミノ酸１〜２９を含有する標的化配列；
（ｂｕ）配列番号４３のアミノ酸１４〜２９を含有する標的化配列；
（ｂｖ）配列番号４３を含有する標的化配列；
（ｂｗ）配列番号４４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂｘ）配列番号４５のアミノ酸１〜３５を含有する標的化配列；
（ｂｙ）配列番号４５のアミノ酸２０〜３５を含有する標的化配列；
（ｂｚ）配列番号４５を含有する標的化配列；
（ｃａ）配列番号４６と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｂ）配列番号４７のアミノ酸１〜４３を含有する標的化配列；
（ｃｃ）配列番号４７のアミノ酸２８〜４３を含有する標的化配列；
（ｃｄ）配列番号４７を含有する標的化配列；
（ｃｅ）配列番号４８と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｆ）配列番号４９のアミノ酸１〜３２を含有する標的化配列；
（ｃｇ）配列番号４９のアミノ酸１７〜３２を含有する標的化配列；
（ｃｈ）配列番号４９を含有する標的化配列；
（ｃｉ）配列番号５０と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｊ）配列番号５１のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｋ）配列番号５１のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｌ）配列番号５１を含有する標的化配列；
（ｃｍ）配列番号５２と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｎ）配列番号５３のアミノ酸１〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｏ）配列番号５３のアミノ酸１８〜３３を含有する標的化配列；
（ｃｐ）配列番号５３を含有する標的化配列；
（ｃｑ）配列番号５４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｒ）配列番号５５のアミノ酸１〜３０を含有する標的化配列；
（ｃｓ）配列番号５５のアミノ酸１５〜３０を含有する標的化配列；
（ｃｔ）配列番号５５を含有する標的化配列；
（ｃｕ）配列番号５６と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｖ）配列番号５７のアミノ酸１〜１３０を含有する標的化配列；
（ｃｗ）配列番号５７のアミノ酸１１５〜１３０を含有する標的化配列；
（ｃｘ）配列番号５７を含有する標的化配列；
（ｃｙ）配列番号５８と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃｚ）配列番号５９と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質断片；
（ｄａ）配列番号６１を含有する標的化配列；
（ｄｂ）配列番号６２を含有する標的化配列；
（ｄｃ）配列番号６３を含有する標的化配列；
（ｄｄ）配列番号６４を含有する標的化配列；
（ｄｅ）配列番号６５を含有する標的化配列；
（ｄｆ）配列番号６６を含有する標的化配列；
（ｄｇ）配列番号６７を含有する標的化配列；
（ｄｈ）配列番号６８を含有する標的化配列；
（ｄｉ）配列番号６９を含有する標的化配列；
（ｄｊ）配列番号７０を含有する標的化配列；
（ｄｋ）配列番号７１と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｌ）配列番号７２と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｍ）配列番号７３と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｎ）配列番号７４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｏ）配列番号７５と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｐ）配列番号７６と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｑ）配列番号７７と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｒ）配列番号７８と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｓ）配列番号７９と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｔ）配列番号８０と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｕ）配列番号８１と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｖ）配列番号８２と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｗ）配列番号８３と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｘ）配列番号８４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄｙ）配列番号１のアミノ酸２２〜３１を含有する標的化配列；
（ｄｚ）配列番号１のアミノ酸２２〜３３を含有する標的化配列；
（ｅａ）配列番号１のアミノ酸２０〜３１を含有する標的化配列；
（ｅｂ）配列番号３のアミノ酸１４〜２３を含有する標的化配列；
（ｅｃ）配列番号３のアミノ酸１４〜２５を含有する標的化配列；または、
（ｅｄ）配列番号３のアミノ酸１２〜２３を含有する標的化配列、
を含有する融合タンパク質。
【請求項１０】
前記標的化配列が、配列番号１のアミノ酸２０〜３５と少なくとも約６２％の同一性を有するアミノ酸配列を含有し、ここで、アミノ酸２５〜３５との同一性は、少なくとも約７２％である、請求項８に記載の方法、植物種子、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または融合タンパク質。
【請求項１１】
前記標的化配列が、配列番号１のアミノ酸２０〜３５と少なくとも約８１％の同一性を有するアミノ酸配列を含有し、ここで、アミノ酸２５〜３５との同一性は、少なくとも約９０％である、請求項８に記載の方法、植物種子、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または融合タンパク質。
【請求項１２】
前記標的化配列が、
（ａ）１６アミノ酸からなり、および、配列番号１のアミノ酸２０〜３５と少なくとも約４３％の同一性を有するアミノ酸配列であって、ここで、アミノ酸２５〜３５との同一性は、少なくとも約５４％である、前記アミノ酸配列；
（ｂ）配列番号１のアミノ酸１〜３５；
（ｃ）配列番号１のアミノ酸２０〜３５；
（ｄ）配列番号１；または、
（ｅ）配列番号６０、
からなる、請求項８に記載の方法、植物種子、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または融合タンパク質、または請求項９に記載の融合タンパク質。
【請求項１３】
融合タンパク質が、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、５９、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９、８０、８１、８２、８３、または、８４と少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質またはエキソスポリウムタンパク質断片を含有する、請求項８に記載の方法、植物種子、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または融合タンパク質。
【請求項１４】
配列番号４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９、８０、８１、８２、８３、または、８４と少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質、または、配列番号５９と少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の同一性を有するアミノ酸配列からなるエキソスポリウムタンパク質断片を含有する、請求項９に記載の融合タンパク質。
【請求項１５】
対象のタンパク質またはペプチドを少なくとも１つ、および：
（ａ）配列番号７１と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｂ）配列番号７５と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｃ）配列番号８０と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｄ）配列番号８１と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｅ）配列番号８２と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
（ｆ）配列番号８３と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；または、
（ｇ）配列番号８４と少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質；
を含有する融合タンパク質。
【請求項１６】
配列番号７１、７５、８０、８１、８２、８３、または８４と少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％の同一性を有するアミノ酸配列を含有するエキソスポリウムタンパク質を含有する、請求項１５に記載の融合タンパク質。
【請求項１７】
前記対象のタンパク質またはペプチドが、植物生育刺激タンパク質もしくはペプチド、病原体から植物を防御するタンパク質もしくはペプチド、植物におけるストレス耐性を増強させるタンパク質もしくはペプチド、または、植物結合タンパク質もしくはペプチド、を含有し、
任意に、前記植物生育刺激タンパク質またはペプチドが、ペプチドホルモン、非ホルモン性ペプチド、または、植物生育刺激化合物の産生または活性化に関与する酵素、または、細菌、真菌もしくは植物の栄養源を分解または改変する酵素、を含有する、請求項２、３、８および１０〜１３のいずれか１項に記載の植物種子、請求項４、５、８および１０〜１３のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または請求項１５または１６に記載の融合タンパク質。
【請求項１８】
前記融合タンパク質がさらに、前記標的化配列、前記エキソスポリウムタンパク質、または、前記エキソスポリウムタンパク質断片と、前記植物生育刺激タンパク質もしくはペプチド、前記病原体から植物を防御するタンパク質もしくはペプチド、前記植物におけるストレス耐性を増強させるタンパク質もしくはペプチド、または、前記植物結合タンパク質もしくはペプチド、の間にアミノ酸リンカーを含有し、
任意に、前記リンカーが、ポリアラニンリンカー、ポリグリシンリンカー、または、アラニン残基とグリシン残基の両方の混合物；および／またはプロテアーゼ認識部位を含有する、請求項１、８および１０〜１３のいずれか１項に記載の方法、請求項２、３、８および１０〜１３のいずれか１項に記載の植物種子、請求項４、５、８および１０〜１３のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または請求項６〜１７のいずれか１項に記載の融合タンパク質。
【請求項１９】
前記植物生育刺激タンパク質またはペプチドが、ペプチドホルモンを含有し、前記ペプチドホルモンが、フィトスルホカイン（任意にフィトスルホカイン−α）、クラバータ３（ＣＬＶ３）、システミン、ＺｍｌＧＦ、またはＳＣＲ／ＳＰ１１を含有する；
前記植物生育刺激タンパク質またはペプチドが、非ホルモン性ペプチドを含有し、前記非ホルモン性ペプチドが、ＲＫＮ  １６Ｄ１０、Ｈｇ−Ｓｙｖ４６、ｅＮＯＤ４０ペプチド、メリチン、マストパラン、Ｍａｓ７、ＲＨＰＰ、ＰＯＬＡＲＩＳ、または、ｋｕｎｉｔｚトリプシンインヒビター（ＫＴＩ）を含有する；または
前記植物生育刺激タンパク質またはペプチドが、植物生育刺激化合物の産生または活性化に関与する酵素を含有し、前記植物生育刺激化合物が、根圏で細菌または真菌により産生される化合物または植物成長ホルモンを含有する、
請求項１、８、１０〜１３および１８のいずれか１項に記載の方法、請求項１７または１８に記載の植物種子、請求項１７または１８に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または請求項６、８、１０〜１３、１７および１８のいずれか１項に記載の融合タンパク質。
【請求項２０】
前記植物生育刺激タンパク質またはペプチドが、植物生育刺激化合物の産生または活性化に関与する酵素を含有し、および、前記植物生育刺激化合物の産生または活性化に関与する酵素が、アセトイン還元酵素、インドール−３−アセトアミド加水分解酵素、トリプトファンモノオキシゲナーゼ、アセト乳酸合成酵素、αアセト乳酸デカルボキシラーゼ、ピルビン酸デカルボキシラーゼ、ジアセチル還元酵素、ブタンジオール脱水素酵素、アミノトランスフェラーゼ、トリプトファンデカルボキシラーゼ、アミンオキシダーゼ、インドール−３−ピルビン酸デカルボキシラーゼ、インドール−３−アセトアルデヒド脱水素酵素、トリプトファン側鎖オキシダーゼ、ニトリル加水分解酵素、ニトリラーゼ、ペプチダーゼ、プロテアーゼ、アデノシンホスフェートイソペンテニルトランスフェラーゼ、ホスファターゼ、アデノシンキナーゼ、アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ、ＣＹＰ７３５Ａ、５’リボヌクレオチドホスホヒドロラーゼ、アデノシンヌクレオシダーゼ、ゼアチン  シス−トランスイソメラーゼ、ゼアチン  Ｏ−グルコシルトランスフェラーゼ、β−グルコシダーゼ、シス−ヒドロキシラーゼ、ＣＫシス−ヒドロキシラーゼ、ＣＫ  Ｎ−グルコシルトランスフェラーゼ、２，５−リボヌクレオチドホスホヒドロラーゼ、アデノシンヌクレオシダーゼ、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ、ゼアチン還元酵素、ヒドロキシルアミン還元酵素、２−オキソグルタレートジオキシゲナーゼ、ジべレリン２Ｂ／３Ｂ加水分解酵素、ジベレリン３−オキシダーゼ、ジベレリン２０−オキシダーゼ、キトシナーゼ、キチナーゼ、β−１，３−グルカナーゼ、β−１，４−グルカナーゼ、β−１，６−グルカナーゼ、アミノシクロプロパン−１−カルボン酸デアミナーゼ、または、ノッド因子の産生に関与する酵素（任意にｎｏｄＡ、ｎｏｄＢ、またはｎｏｄＩを含有する）、を含有する、請求項１９に記載の方法、植物種子、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または融合タンパク質。
【請求項２１】
前記植物生育刺激化合物の産生または活性化に関与する酵素が、タンパク質、ペプチド、プロタンパク質、またはプレプロタンパク質を開裂して生物活性型ペプチドを生成するプロテアーゼまたはペプチダーゼを含有し：
任意に、前記プロテアーゼまたはペプチダーゼが、サブチリシン、酸プロテアーゼ、アルカリプロテアーゼ、プロテイナーゼ、エンドペプチダーゼ、エキソペプチダーゼ、サーモリシン、パパイン、ペプシン、トリプシン、プロナーゼ、カルボキシラーゼ、セリンプロテアーゼ、グルタミン酸プロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、システインプロテアーゼ、スレオニンプロテアーゼまたはメタロプロテアーゼを含有する；
任意に、前記生物活性型ペプチドが、ＲＫＮ  １６Ｄ１０またはＲＨＰＰを含有する；および／または
任意に、前記プロテアーゼまたはペプチダーゼが、タンパク質に富んだ食品（任意に、大豆食品または酵母抽出物である）中のタンパク質を開裂する、
請求項２０に記載の方法、植物種子、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または融合タンパク質。
【請求項２２】
前記植物生育刺激タンパク質が、酵素を含有する、請求項１、８、１０〜１３および１８のいずれか１項に記載の方法、請求項１７または１８に記載の植物種子、請求項１７または１８に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または請求項１７または１８に記載の融合タンパク質。
【請求項２３】
前記酵素が、細菌、真菌、もしくは植物の栄養源を分解または改変する酵素を含有する、請求項２２に記載の方法、植物種子、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または融合タンパク質。
【請求項２４】
前記細菌、真菌、もしくは植物の栄養源を分解または改変する酵素が、セルラーゼ、リパーゼ、リグニンオキシダーゼ、プロテアーゼ、グリコシド加水分解酵素、ホスファターゼ、ニトロゲナーゼ、ヌクレアーゼ、アミダーゼ、硝酸還元酵素、亜硝酸還元酵素、アミラーゼ、アンモニアオキシダーゼ、リグニナーゼ、グルコシダーゼ、ホスホリパーゼ、フィターゼ、ぺクチナーゼ、グルカナーゼ、スルファターゼ、ウレアーゼ、またはキシラナーゼを含有する、請求項２３に記載の方法、植物種子、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または融合タンパク質。
【請求項２５】
前記細菌、真菌もしくは植物の栄養源を分解または改変する酵素が：
セルラーゼを含有し、前記セルラーゼが、エンドセルラーゼ、エキソセルラーゼ、またはβ−グルコシダーゼを含有する；
リパーゼを含有し、前記リパーゼが、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓリパーゼ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓリパーゼ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓリパーゼ、または、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｌａｕｓｉｉリパーゼを含有する；
リグニンオキシダーゼを含有し、前記リグニンオキシダーゼが、リグニンペルオキシダーゼ、ラッカーゼ、グリオキサルオキシダーゼ、リグニナーゼ、およびマンガンペルオキシダーゼを含有する；
プロテアーゼを含有し、前記プロテアーゼが、サブチリシン、酸プロテアーゼ、アルカリプロテアーゼ、プロテイナーゼ、ペプチダーゼ、エンドペプチダーゼ、エキソペプチダーゼ、サーモリシン、パパイン、ペプシン、トリプシン、プロナーゼ、カルボキシラーゼ、セリンプロテアーゼ、グルタミン酸プロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、システインプロテアーゼ、スレオニンプロテアーゼまたはメタロプロテアーゼを含有する；
ホスファターゼを含有し、および、前記ホスファターゼがリン酸モノエステル加水分解酵素、ホスホモノエステラーゼ、リン酸ジエステル加水分解酵素、ホスホジエステラーゼ、三リン酸モノエステル加水分解酵素、無水ホスホリル加水分解酵素、ピロホスファターゼ、フィターゼ、トリメタホスファターゼ、またはトリホスファターゼを含有する；または
ニトロゲナーゼを含有し、および、前記ニトロゲナーゼが、Ｎｉｆファミリーのニトロゲナーゼを含有する、
請求項２４に記載の方法、植物種子、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または融合タンパク質。
【請求項２６】
前記セルラーゼが、エンドセルラーゼを含有し、および前記エンドセルラーゼがエンドグルカナーゼ（任意に、バチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ）エンドグルカナーゼ、バチルス・スリンギエンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）エンドグルカナーゼ、バチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）エンドグルカナーゼ、または、バチルス・クラウシィ（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｌａｕｓｉｉ）エンドグルカナーゼを含有する）を含有する；
前記セルラーゼがエキソセルラーゼを含有し、および、前記エキソセルラーゼが、トリコデルマ・リーセイ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ  ｒｅｅｓｅｉ）エキソセルラーゼを含有する；
前記セルラーゼが、β−グルコシダーゼを含有し、および、前記β−グルコシダーゼが、バチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ）β−グルコシダーゼ、バチルス・スリンギエンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）β−グルコシダーゼ、バチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）β−グルコシダーゼ、または、バチルス・クラウシィ（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｌａｕｓｉｉ）β−グルコシダーゼを含有する；
前記ホスファターゼがホスホモノエステラーゼを含有し、および、前記ホスホモノエステラーゼが、ＰｈｏＡ４を含有する；または
前記ホスファターゼがフィターゼを含有し、および、前記フィターゼが、バチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ）ＥＥ１４８フィターゼ、または、バチルス・スリンギエンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）ＢＴ０１３Ａフィターゼを含有する、
請求項２５に記載の方法、植物種子、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または融合タンパク質。
【請求項２７】
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドが、植物免疫システム増強タンパク質またはペプチドを含有し、任意に、前記植物免疫システム増強タンパク質またはペプチドは、ハーピン、α−エラスチン、β−エラスチン、システミン、フェニルアラニンアンモニア−リアーゼ、エリシチン、ディフェンシン、クリプトゲイン、フラジェリンタンパク質またはフラジェリンペプチド（任意にｆｌｇ２２）を含有する；
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドが、抗細菌活性、抗真菌活性、または、抗細菌活性と抗真菌活性の両方を有し、任意に、前記タンパク質またはペプチドが、バクテリオシン、リゾチーム、リゾチームペプチド（任意にＬｙｓＭ）、シデロフォア、非リボソーム活性ペプチド、コンアルブミン、アルブミン、ラクトフェリン、ラクトフェリンペプチド（任意にＬｆｃｉｎＢ）、またはＴａｓＡを含有する；
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドは、殺虫活性、殺蠕虫活性を有するか、昆虫もしくは蠕虫の捕食を抑制するか、またはそれらの組み合わせであり、任意に、殺虫性細菌毒素（任意にＶＩＰ殺虫性毒素）、エンドトキシン、Ｃｒｙ毒素（任意にバチルス・スリンギエンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）由来のＣｒｙ毒素、Ｃｒｙ５Ｂタンパク質またはＣｒｙ２１Ａタンパク質）、プロテアーゼインヒビタータンパク質もしくはペプチド（任意にトリプシンインヒビターまたはクワイプロテアーゼインヒビター）、システインプロテアーゼ、またはキチナーゼを含有する；または
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドは、酵素を含有し、任意に、前記酵素は、プロテアーゼまたはラクトナーゼを含有するかまたは細菌または真菌の細胞成分に特異的であり、ここで、任意に：
前記プロテアーゼまたはラクトナーゼは、細菌性シグナル伝達分子（任意に細菌性ラクトンホモセリンシグナル伝達分子）に特異的である；
前記酵素はラクトナーゼを含有し、前記ラクトナーゼは、１，４−ラクトナーゼ、２−ピロン−４，６−ジカルボキシレートラクトナーゼ、３−オキソアジペートエノールラクトナーゼ、アクチノマイシンラクトナーゼ、デオキシリモネートＡ環−ラクトナーゼ、グルコノラクトナーゼＬ−ラムノノ−１、４−ラクトナーゼ、リモニン−Ｄ環−ラクトナーゼ、ステロイド−ラクトナーゼ、トリアセテート−ラクトナーゼ、または、キシロノ−１，４−ラクトナーゼを含有する；または
前記酵素は、細菌または真菌の細胞成分に特異的であり、前記酵素が、β−１，３−グルカナーゼ、β−１，４−グルカナーゼ、β−１，６−グルカナーゼ、キトシナーゼ、キチナーゼ、キトシナーゼ様酵素、リチカーゼ、ペプチダーゼ、プロテイナーゼ、プロテアーゼ、ムタノリシン、スタホリシン、またはリゾチームを含有する、
請求項７〜１４、１７および１８のいずれか１項に記載の融合タンパク質、請求項１７または１８に記載の植物種子、または請求項１７または１８に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項２８】
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドは、細菌性病原体、真菌性病原体、蠕虫病原体、または昆虫病原体から植物を防御し、任意に：
前記細菌性病原体は、αクラスプロテオバクテリア、βクラスプロテオバクテリア、γクラスプロテオバクテリア、または、それらの組み合わせを含有する；
前記細菌性病原体は、アグロバクテリウム・ツメファシエンス（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｕｍｅｆａｃｉｅｎｓ）、パントエア・ステワルティ（Ｐａｎｔｏｅａ  ｓｔｅｗａｒｔｉｉ）、エルウィニア・カロトボラ（Ｅｒｗｉｎｉａ  ｃａｒｏｔｏｖｏｒａ）、ラルストニア・ソラナセアラム（Ｒａｌｓｔｏｎｉａ  ｓｏｌａｎａｃｅａｒｕｍ）、シュードモナス・シリンガエ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｓｙｒｉｎｇａｅ）、シュードモナス・アエルギノサ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ）、キサントモナス・カンペストリス（Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ  ｃａｍｐｅｓｔｒｉｓ）、またはそれらの組み合わせを含有する；
前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドは、蠕虫または昆虫の病原体による捕食から植物を防御する；または
前記蠕虫または昆虫の病原体は、ヨトウムシ（ａｒｍｙ  ｗｏｒｍ）、タマナヤガ、Ｅｕｒｏｐｅａｎ  ｃｏｒｎ  ｂｏｒｅｒ、ツマジロクサヨトウ、ヨトウムシ（ｃｕｔｗｏｒｍ）、マメコガネ、ｌｅｓｓｅｒ  ｃｏｒｎｓｔａｌｋ  ｂｏｒｅｒ、ｍａｉｚｅ  ｂｉｌｌｂｕｇ、ｓｅｅｄ  ｃｏｒｎ  ｍａｇｇｏｔ、ｗｅｂｗｏｒｍ、ｓｏｕｔｈｅｒｎ  ｃｏｒｎｓｔａｌｋ  ｂｏｒｅｒ、ｓｏｕｔｈｅｒｎ  ｃｏｒｎ  ｒｏｏｔｗｏｒｍ、ｓｏｕｔｈｅｒｎ  ｐｏｔａｔｏ  ｗｉｒｅｗｏｒｍ、ｓｔａｌｋ  ｂｏｒｅｒ、ｓｕｇａｒｃａｎｅ  ｂｅｅｔｌｅ、コガネムシの幼虫、ｃａｂｂａｇｅ  ｌｏｏｐｅｒ、ワタミハナゾウムシ、ｙｅｌｌｏｗ  ｓｔｒｉｐｅｄ  ａｒｍｙｗｏｒｍ、ｃｅｒｅａｌ  ｌｅａｆ  ｂｅｅｔｌｅ、ヒメコガネナガカメムシ、アブラムシ、ビートアワヨトウ、インゲンテントウ、ｓｏｙｂｅａｎ  ｌｏｏｐｅｒ、ｓｏｙｂｅａｎ  ｓｔｅｍ  ｂｏｒｅｒ、またはそれらの組み合わせを含有する、
請求項７〜１４、１７、１８および２７のいずれか１項に記載の融合タンパク質、請求項１７、１８および２７のいずれか１項に記載の植物種子、または請求項１７、１８および２７のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項２９】
前記融合タンパク質は、植物におけるストレス耐性を増強させるタンパク質またはペプチドを少なくとも１つ含有し、前記植物におけるストレス耐性を増強させるタンパク質またはペプチドは、ストレス関連化合物を分解する酵素または環境ストレスから植物を防御するタンパク質またはペプチドを含み：
前記植物におけるストレス耐性を増強させるタンパク質またはペプチドは、ストレス関連化合物を分解する酵素を含み、任意に、前記ストレス関連化合物には、アミノシクロプロパン−１−カルボン酸（ＡＣＣ）、活性酸素種、一酸化窒素、オキシリピン、フェノール類、またはそれらの組み合わせが含まれる；
前記植物におけるストレス耐性を増強させるタンパク質またはペプチドは、ストレス関連化合物を分解する酵素を含み、任意に、前記ストレス関連化合物を分解する酵素には、スーパーオキシドジスムターゼ、オキシダーゼ、カタラーゼ、アミノシクロプロパン−１−カルボン酸デアミナーゼ、ペルオキシダーゼ、抗酸化酵素、または、抗酸化ペプチドが含まれる；
前記植物におけるストレス耐性を増強させるタンパク質またはペプチドは、環境ストレスから植物を防御するタンパク質またはペプチドを含み、任意に、前記環境ストレスには、干ばつ、洪水、高温、凍結、塩、重金属、低ｐＨ、高ｐＨ、またはそれらの組み合わせが含まれる；または
前記植物におけるストレス耐性を増強させるタンパク質またはペプチドは、環境ストレスから植物を防御するタンパク質またはペプチドを含み、任意に、前記環境ストレスから植物を防御するタンパク質またはペプチドには、氷核形成タンパク質、プロリナーゼ、フェニルアラニンアンモニアリアーゼ、イソコリスミ酸シンターゼ、イソコリスミ酸ピルビン酸リアーゼ、またはコリン脱水素酵素が含まれる、
請求項６、８、１０〜１３、１７および１８のいずれか１項に記載の融合タンパク質、請求項１７または１８に記載の植物種子、または請求項１７または１８に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項３０】
前記融合タンパク質は、植物結合タンパク質またはペプチドを少なくとも１つ含有し、前記植物結合タンパク質またはペプチドには、アドヘシン（任意にリカドヘシン（ｒｈｉｃａｄｈｅｓｉｎ））、フラジェリン、オムプチン、レクチン、エクスパンシン、バイオフィルム構造タンパク質（任意にＴａｓＡまたはＹｕａＢ）、線毛タンパク質、カーラスタンパク質、インチミン、インベーシン、アグルチニン、および、非線毛タンパク質が含まれる、
請求項６、８、１０〜１３、１７および１８のいずれか１項に記載の融合タンパク質、請求項１７または１８に記載の植物種子、または請求項１７または１８に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項３１】
請求項６〜３０のいずれか１項に記載の融合タンパク質を発現する組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項３２】
請求項６〜２９のいずれか１項に記載の、植物生育刺激タンパク質もしくはペプチド、病原体から植物を防御するタンパク質もしくはペプチド、または、植物におけるストレス耐性を増強させるタンパク質もしくはペプチドを含有する融合タンパク質を少なくとも１つ、および、請求項６、８、１０〜１３、１７、１８、および３０のいずれか１項に記載の植物結合タンパク質またはペプチドを含有する融合タンパク質を少なくとも１つ、を共発現する、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項３３】
前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーには、バチルス・アントラキス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｎｔｈｒａｃｉｓ）、バチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）、バチルス・スリンギエンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）、バチルス・シュードマイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｓｅｕｄｏｍｙｃｏｉｄｅｓ）、バチルス・サマニィ（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓａｍａｎｉｉ）、バチルス・ガエモケンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｇａｅｍｏｋｅｎｓｉｓ）、バチルス・ウェイヘンステフェンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｗｅｉｈｅｎｓｔｅｐｈｅｎｓｉｓ）、またはそれらの組み合わせが含まれる、請求項１、８、１０〜１３および１８〜２６のいずれか１項に記載の方法、請求項２、３、８、１０〜１３および１７〜２６のいずれか１項に記載の植物種子、または請求項４、５、８、１０〜１３および１７〜３２のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項３４】
前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーには、植物生育促進細菌株が含まれ、任意に、前記植物生育促進細菌株は：殺虫性毒素（任意にＣｒｙ毒素）を産生する、殺真菌性化合物（任意にβ−１，３−グルカナーゼ、キトシナーゼ、リチカーゼ、またはそれらの組み合わせ）を産生する、殺線虫性化合物（任意にＣｒｙ毒素）を産生する、殺菌性化合物を産生する、１以上の抗生物質に対して抵抗性である、１以上の遊離複製プラスミドを含有する、植物の根に結合する、植物の根にコロニー形成する、バイオフィルムを形成する、栄養素を可溶化する、有機酸を分泌する、またはそれらの組み合わせである、
請求項１、８、１０〜１３および１８〜２６のいずれか１項に記載の方法、請求項２、３、８、１０〜１３、１７〜２６および３３のいずれか１項に記載の植物種子、または請求項４、８、１０〜１３および１７〜３３のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項３５】
組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーには、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＢＴ１５５（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２１）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＥＥ１１８（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９１８）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＥＥ１４１（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９１６）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＢＴ４６−３（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２２）、バチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーであるＥＥ１２８（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９１７）、バチルス・スリンギエンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）  ＢＴ０１３Ａ（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２４）、または、バチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーであるＥＥ３４９（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２８）が含まれる、請求項３３に記載の方法、植物種子、または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項３６】
前記融合タンパク質は、配列番号６０の標的化配列を含有する、請求項３５に記載の方法、植物種子、または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項３７】
前記植物生育刺激タンパク質もしくはペプチドは、非ホルモン性ペプチドを含有し、前記非ホルモン性ペプチドは、ｋｕｎｉｔｚトリプシンインヒビター（ＫＴＩ）を含有し；前記植物生育刺激タンパク質もしくはペプチドは、植物生育刺激化合物の産生または活性化に関与する酵素を含有し、前記植物生育刺激化合物の産生または活性化に関与する酵素は、キトサナーゼを含有し；前記植物結合タンパク質またはペプチドは、ＴａｓＡを含有し；前記病原体から植物を防御するタンパク質またはペプチドは、ＴａｓＡを含有し；または、前記植物生育刺激タンパク質もしくはペプチドは、細菌、真菌もしくは植物の栄養源を分解または改変する酵素を含有し、前記細菌、真菌もしくは植物の栄養源を分解または改変する酵素は、ホスファターゼ（任意にＰｈｏＡ）またはエンドグルカナーゼを含有する、請求項３６に記載の方法、植物種子、または組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項３８】
前記融合タンパク質は、前記融合タンパク質の標的化配列、エキソスポリウムタンパク質、またはエキソスポリウムタンパク質断片に対して天然型である芽胞形成プロモーターおよび／または高発現芽胞形成プロモーターの制御下で発現され、任意に：
前記高発現芽胞形成プロモーターには、シグマ−Ｋ芽胞形成特異的ポリメラーゼプロモーター配列が含まれるか、または前記シグマ−Ｋ芽胞形成特異的ポリメラーゼプロモーター配列（複数含む）は、配列番号８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、１００、１０１、１０２、または１０３の相当するヌクレオチドと１００％の同一性を有する；および／または
前記芽胞形成プロモーターは、配列番号８５〜１０３のいずれか１つの核酸配列と少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の同一性を有する核酸配列を含有する、
請求項１、８、１０〜１３、１８〜２６および３３〜３７のいずれか１項に記載の方法、請求項２、３、８、１０〜１３、１７〜３０および３３〜３７のいずれか１項に記載の植物種子、または請求項４、５、８、１０〜１３および１７〜３７のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー。
【請求項３９】
請求項４、５、８、１０〜１３および１７〜３８のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーおよび農学的に受容可能な担体を含有する製剤であって、任意に：
前記農学的に受容可能な担体には、分散剤、界面活性剤（任意に重油、重油蒸留物、ポリオール脂肪酸エステル、ポリエトキシル化脂肪酸エステル、アリールアルキルポリオキシエチレングリコール、アルキル酢酸アミン、アルキルスルホン酸アリール、多価アルコール、リン酸アルキル、またはそれらの組み合わせ）、添加剤（任意に油、ゴム、樹脂、粘土、ポリオキシエチレングリコール、テルペン、粘着性有機物、脂肪酸エステル、硫酸化アルコール、スルホン酸アルキル、硫酸化石油、アルコール硫酸、ナトリウムアルキルブタンジアメート（ｓｏｄｉｕｍ  ａｌｋｙｌ  ｂｕｔａｎｅ  ｄｉａｍａｔｅ）、ナトリウムチオブタンジオエートのポリエステル、ベンゼンアセトニトリル誘導体、タンパク質性物質または、それらの組み合わせ）、水、増粘剤（任意にポリエチレングリコールの長鎖スルホン酸アルキル、オレイン酸ポリオキシエチレン、またはそれらの組み合わせ）、凝固防止剤、残基分解物、たい肥化剤、粒状塗布物、珪藻土、油、着色剤、安定化剤、防腐剤、ポリマー類、コーティング、およびそれらの組み合わせが含まれる；
前記製剤には、種子コーティング製剤（任意に種子への適用のための水性溶液もしくは油性溶液、または、種子への適用のための粉末製剤もしくは顆粒製剤）、植物もしくは植物生育環境への適用のための液体製剤（任意に濃縮製剤またはすぐに使える（ｒｅａｄｙ−ｔｏ−ｕｓｅ）製剤）、または、植物もしくは植物生育環境への適用のための固形製剤（任意に顆粒剤または粉末剤）が含まれる；
前記製剤にはさらに、肥料、微量栄養素肥料物質、殺虫剤、除草剤、植物生育改善物質、防かび剤、殺虫剤、軟体動物駆除剤、殺藻剤、細菌接種剤、真菌接種剤、またはそれらの組み合わせが含まれる；および／または
前記農学的に受容可能な担体には、バーミキュライト、木炭、製糖工場の炭酸化プレス泥、もみ殻、カルボキシメチルセルロース、泥炭、パーライト、細砂、炭酸カルシウム、粉末、ミョウバン、デンプン、滑石、ポリビニルピロリドン、またはそれらの組み合わせが含まれる、
製剤。
【請求項４０】
前記細菌接種剤が植物生育促進細菌株を含有し、任意に前記植物生育促進細菌株が：
殺虫性毒素（任意にＣｒｙ毒素）を産生する、殺真菌性化合物（任意にβ−１，３−グルカナーゼ、キトシナーゼ、リチカーゼ、またはそれらの組み合わせ）を産生する、殺線虫性化合物（任意にＣｒｙ毒素）を産生する、殺菌性化合物を産生する、１以上の抗生物質に対して抵抗性である、１以上の遊離複製プラスミドを含有する、植物の根に結合する、植物の根にコロニー形成する、バイオフィルムを形成する、栄養素を可溶化する、有機酸を分泌する、またはそれらの組み合わせである、
請求項３９に記載の製剤。
【請求項４１】
前記植物生育促進細菌株が、バチルス・アリャブハッタイ（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｒｙａｂｈａｔｔａｉ）  ＣＡＰ５３（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０８１９）、バチルス・アリャブハッタイ（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｒｙａｂｈａｔｔａｉ）  ＣＡＰ５６（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０８１７）、バチルス・フレクサス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｆｌｅｘｕｓ）  ＢＴ０５４（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０８１６）、パラコッカス・コンドラティーバエ（Ｐａｒａｃｏｃｃｕｓ  ｋｏｎｄｒａｔｉｅｖａｅ）  ＮＣ３５（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０８２０）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＢＴ１５５（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２１）、エンテロバクター・クロアカエ（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ  ｃｌｏａｃａｅ）  ＣＡＰ１２（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０８２２）、バチルス・ネアルソニイ（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｎｅａｌｓｏｎｉｉ）  ＢＯＢＡ５７（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０８２１）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＥＥ１１８（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９１８）、バチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ）  ＥＥ１４８（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２７）、アルカリゲネス・フェカリス（Ａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ）  ＥＥ１０７（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２０）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＥＥ１４１（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９１６）、バチルス・マイコイデス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｙｃｏｉｄｅｓ）  ＢＴ４６−３（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２２）、バチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーであるＥＥ１２８（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９１７）、バチルス・スリンギエンシス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）  ＢＴ０１３Ａ（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２４）、パエニバチルス・マシリエンシス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）  ＢＴ２３（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２３）、バチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーであるＥＥ３４９（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２８）、バチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ）  ＥＥ２１８（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２６）、バチルス・メガテリウム（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ）  ＥＥ２８１（ＮＲＲＬ  Ｎｏ．Ｂ−５０９２５）、またはそれらの組み合わせを含有する、請求項３９に記載の製剤。
【請求項４２】
請求項４、５、８、１０〜１３および１７〜３８のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または、請求項３９〜４１のいずれか１項に記載の製剤を、植物生育環境へと導入すること；または、
請求項４、５、８、１０〜１３および１７〜３８のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または、請求項３９〜４１のいずれか１項に記載の製剤を、植物、植物種子、または、植物もしくは植物種子の周辺域へと適用すること；
を含む植物の生育を刺激する方法であって、
ここで、前記植物生育刺激タンパク質またはペプチドは、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーのエキソスポリウムに物理的に付加されている、前記方法。
【請求項４３】
前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーの存在下で生育された植物は、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーの非存在下での同一の環境中での植物の生育と比較し、生育の増強を示す、請求項１、８、１０〜１３、１８〜２６、３３〜３８および４２のいずれか１項に記載の植物生育を刺激する方法。
【請求項４４】
前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを含有する植物生育環境中で生育された植物は、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを含有しない前記植物生育環境と同一の環境中での植物の生育と比較し、生育の増強を示す；
前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを適用された植物は、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを適用されずに同一の環境中での植物の生育と比較し、生育の増強を示す；
前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを適用された種子から生育した植物は、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを適用されなかった種子から生育した植物の同一の環境中での植物の生育と比較し、生育の増強を示す；または
前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを適用された地域で生育した植物は、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを適用されなかった地域で生育した植物の同一の環境中での植物の生育と比較し、生育の増強を示す、
請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
請求項５、１７、１８、２７〜２９および３１〜３８のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または、請求項３９〜４１のいずれか１項に記載の製剤を、植物生育環境へと導入すること；または、
請求項５、１７、１８、２７〜２９および３１〜３８のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または、請求項３９〜４１のいずれか１項に記載の製剤を、植物、植物種子、または、植物もしくは植物種子の周辺域へと適用すること；
を含む、病原体から植物を防御する方法、または、植物におけるストレス耐性を増強させる方法であって、
ここで、前記病原体から植物を防御するタンパク質もしくはペプチド、または、前記植物におけるストレス耐性を増強させるタンパク質もしくはペプチドは、組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーのエキソスポリウムに物理的に付加されている、前記方法。
【請求項４６】
前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーの存在下で生育された植物は、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーの非存在下で同一条件で育った植物と比較し、病原体に感染しにくい、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】
前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーの存在下で生育された植物は、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーの非存在下で同一条件で育った植物と比較し、ストレスの影響を受けにくい、請求項４５に記載の方法。
【請求項４８】
請求項５、１７、１８および３０〜３８のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または、請求項３９〜４１のいずれか１項に記載の製剤を、植物生育環境へと導入すること；または、
請求項５、１７、１８および３０〜３８のいずれか１項に記載の組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または、請求項３９〜４１のいずれか１項に記載の製剤を、植物、植物種子、または、植物もしくは植物種子の周辺域へと適用すること；
を含む、植物に組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーの芽胞を固定する方法であって、
ここで、前記植物結合タンパク質またはペプチドは、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーのエキソスポリウムに物理的に付加されている、前記方法。
【請求項４９】
前記植物結合タンパク質またはペプチドは、植物に、任意に植物の根、根の下部構造、植物の空中部分、または植物の空中部分の下部構造に、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを選択的に向かわせ、および維持する、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
植物生育環境へ導入する前に、または、植物、植物種子、または植物もしくは植物種子の周辺域に適用する前に、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを不活性化すること、任意に、不活性化は加熱処置；ガンマ線照射；ｘ線照射；ＵＶ−Ａ照射；ＵＶ−Ｂ照射；グルタルアルデヒド（ｇｌｕｔｅｒａｌｄｅｈｙｄｅ）、ホルムアルデヒド、過酸化水素、酢酸、漂白、またはそれらの組み合わせを用いた処置、または、それらの組み合わせによる、をさらに含む、請求項１、８、１０〜１３、１８〜２６、３３〜３８および４２〜４９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５１】
前記植物生育環境は、土壌、水、水性溶液、砂、砂利、多糖、マルチ、堆肥、ピートモス、わら、丸太、粘土、大豆ミール、酵母抽出物、またはそれらの組み合わせを含有する；および／または
前記植物生育環境は、酵素に対する基質が補充され、任意に、前記基質は、トリプトファン、アデノシン一リン酸、アデノシン二リン酸、アデノシン三リン酸（任意にアデノシン−３−リン酸）、インドール、トリメタホスフェート、フェロドキシン、アセトイン、ジアセチル、ピルビン酸、アセト乳酸、ペクチン、セルロース、メチルセルロース、デンプン、キチン、ペクチン、タンパク質食品、セルロース誘導体、リン酸、アセトイン、キトサン、インドール−３−酢酸の不活性型誘導体、ジベレリン酸の不活性型誘導体、キシラン、アラビノキシラン、脂肪、ワックス、油、フィチン酸、リグニン、フミン酸、コリン、コリン誘導体、プロリン、ポリプロリン、プロリン富化タンパク質、プロリン富化食、フェニルアラニン、またはコリスミ酸、またはそれらの組み合わせを含有する、
請求項１、８、１０〜１３、１８〜２６、３３〜３８および４２〜５０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５２】
植え付けの前に、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバー、または、前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを含有する製剤を用いて種子をコーティングすることを含有する、請求項１、８、１０〜１３、１８〜２６、３３〜３８および４２〜５１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５３】
植物の空中部分に前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーまたは製剤を適用することを含む、請求項１、８、１０〜１３、１８〜２６、３３〜３８および４２〜５２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５４】
前記植物生育環境に前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを導入することには、前記環境に前記組換えバチルス・セレウス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｅｒｅｕｓ）ファミリーのメンバーを含有する液体製剤または固形製剤を適用することを含む、請求項１、８、１０〜１３、１８〜２６、３３〜３８および４２〜５３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５５】
植物生育環境中に少なくとも１つの農薬を導入すること、または、植物もしくは種子に少なくとも１つの農薬を適用することをさらに含有し、前記農薬は、肥料、微量栄養素肥料物質、殺虫剤、除草剤、防かび剤、軟体動物駆除剤、殺藻剤、植物生育改善物質、細菌接種剤、真菌接種剤、またはそれらの組み合わせを含有する；
前記肥料が、液体肥料を含有する；
前記微量栄養素肥料物質がホウ酸、ホウ酸塩、ホウ素フリット、硫酸銅、銅フリット、銅キレート、四ホウ酸ナトリウム十水和物、硫酸鉄、酸化鉄、硫酸鉄アンモニウム、鉄フリット、鉄キレート、硫酸マンガン、酸化マンガン、マンガンキレート、塩化マンガン、マンガンフリット、モリブデン酸ナトリウム、モリブデン酸、硫酸亜鉛、酸化亜鉛、炭酸亜鉛、亜鉛フリット、リン酸亜鉛、亜鉛キレート、もしくはそれらの組み合わせを含有する；
前記殺虫剤が有機リン酸塩、カルバミン酸塩、ピレスロイド、ダニ駆除剤、フタル酸アルキル、ホウ酸、ホウ酸塩、フッ化物、硫黄、ハロ芳香族置換尿素、炭化水素エステル、生物ベースの殺虫剤、もしくはそれらの組み合わせを含有する；
前記除草剤がクロロフェノキシ化合物、ニトロフェノール化合物、ニトロクレゾール化合物、ジピリジル化合物、アセトアミド、脂肪酸、アニリド、ベンズアミド、安息香酸、安息香酸誘導体、アニス酸、アニス酸誘導体、ベンゾニトリル、ベンゾチアジアジノン二酸化物、チオカルバミド酸塩、カルバミン酸塩、カルバニレート、クロロピリジニル、シクロヘキセノン誘導体、ジニトロアミノベンゼン誘導体、フルオロジニトロトルイジン化合物、イソキサゾリジノン、ニコチン酸、イソプロピルアミン、イソプロピルアミン誘導体、オキサジアゾリノン、リン酸塩、フタル酸塩、ピコリン酸化合物、トリアジン、トリアゾール、ウラシル、尿素誘導体、エンドサル、塩素酸ナトリウム、もしくはそれらの組み合わせを含有する；
前記防かび剤が、置換ベンゼン、チオカルバマート、エチレンビスジチオカルバマート、チオフタリドアミド、銅化合物、有機水銀化合物、有機スズ化合物、カドミウム化合物、アニラジン、ベノミル、シクロへキサミド、ドジン、エトリジアゾール、イプロジオン、メトラキシル、チアミメホン、トリホリン、もしくはそれらの組み合わせを含有する；
前記真菌接種剤は、グロメラセア（Ｇｌｏｍｅｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、クラロイドグロメラセア（Ｃｌａｒｏｉｄｏｇｌｏｍｅｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、ギガスポラセア（Ｇｉｇａｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、アカウロスポラセア（Ａｃａｕｌｏｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、サッキュロスポラセア（Ｓａｃｃｕｌｏｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、エンテロホスポラセア（Ｅｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、パシドスポラセア（Ｐａｃｉｄｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、ダイバーシスポラセア（Ｄｉｖｅｒｓｉｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、パラグロメラセア（Ｐａｒａｇｌｏｍｅｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、アカエオスポラセア（Ａｒｃｈａｅｏｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、ゲオシフォナセア（Ｇｅｏｓｉｐｈｏｎａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、アンビスポラセア（Ａｍｂｉｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、スクテロスポラセア（Ｓｃｕｔｅｌｌｏｓｐｏｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、デンティスクルタタセア（Ｄｅｎｔｉｓｃｕｌｔａｔａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、ラコセトラセア（Ｒａｃｏｃｅｔｒａｃｅａｅ）科の真菌接種剤、バシディオマイコタ科（ｐｈｙｌｕｍ  Ｂａｓｉｄｉｏｍｙｃｏｔａ）の真菌接種剤、ｐｈｙｌｕｍ  Ａｓｃｏｍｙｃｏｔａ科の真菌接種剤、ジゴマイコタ科（ｐｈｙｌｕｍ  Ｚｙｇｏｍｙｃｏｔａ）の真菌接種剤、もしくはそれらの組み合わせを含有する；
前記細菌接種剤は、リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉｕｍ）属の細菌接種剤、ブラジリゾビウム（Ｂｒａｄｙｒｈｉｚｏｂｉｕｍ）属の細菌接種剤、メソリゾビウム（Ｍｅｓｏｒｈｉｚｏｂｉｕｍ）属の細菌接種剤、アゾリゾビウム（Ａｚｏｒｈｉｚｏｂｉｕｍ）属の細菌接種剤、アロリゾビウム（Ａｌｌｏｒｈｉｚｏｂｉｕｍ）属の細菌接種剤、シノリゾビウム（Ｓｉｎｏｒｈｉｚｏｂｉｕｍ）属の細菌接種剤、クルイベラ（Ｋｌｕｙｖｅｒａ）属の細菌接種剤、アゾトバクター（Ａｚｏｔｏｂａｃｔｅｒ）属の細菌接種剤、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）属の細菌接種剤、アゾスピリリウム（Ａｚｏｓｐｉｒｉｌｌｉｕｍ）属の細菌接種剤、バチルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）属の細菌接種剤、ストレプトマイセス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ）属の細菌接種剤、パニバチルス（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ）属の細菌接種剤、パラコッカス（Ｐａｒａｃｏｃｃｕｓ）属の細菌接種剤、エンテロバクター（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ）属の細菌接種剤、アルカリゲネス（Ａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓ）属の細菌接種剤、マイコバクテリウム（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属の細菌接種剤、トリコデルマ（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ）属の細菌接種剤、グリオクラジウム（Ｇｌｉｏｃｌａｄｉｕｍ）属の細菌接種剤、グロムス（Ｇｌｏｍｕｓ）属の細菌接種剤、クレブシエラ（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ）属の細菌接種剤、もしくはそれらの組み合わせを含有する；および／または
前記肥料が、硫酸アンモニウム、硝酸アンモニウム、硫酸硝酸アンモニウム、塩化アンモニウム、重硫酸アンモニウム、ポリ硫化アンモニウム、チオ硫化アンモニウム、アンモニア水、無水アンモニア、ポリリン酸アンモニウム、硫酸アルミニウム、硝酸カルシウム、カルシウム硝酸アンモニウム、硫酸カルシウム、か焼マグネサイト、方解石質石灰岩、酸化カルシウム、硝酸カルシウム、ドロマイト質石灰石、消石灰、炭酸カルシウム、リン酸２アンモニウム、リン酸１アンモニウム、硝酸マグネシウム、硫酸マグネシウム、硝酸カリウム、塩化カリウム、硫酸カリウムマグネシウム、硫酸カリウム、硝酸ナトリウム、苦灰質石灰岩、マグネシア、尿素、尿素−ホルムアルデヒド、尿素硝酸アンモニウム、硫黄被覆尿素、ポリマー被覆尿素、イソブチリデンジウレア、Ｋ２ＳＯ４−２ＭｇＳＯ４、カイナイト、シルビナイト、キーゼル石、Ｅｐｓｏｍ塩、元素状硫黄、泥灰土、粉末牡蠣、魚粉、油かす、魚肥料、血粉、リン鉱石、過リン酸肥料、スラグ、骨粉、木灰、肥料、バットグアノ、ピートモス、堆肥、生砂、綿実粉、羽毛粉、蟹粉、魚乳濁液、フミン酸、またはそれらの組み合わせを含有する、
請求項１、８、１０〜１３、１８〜２６、３３〜３８および４２〜５４のいずれか１項に記載の方法。