【手続補正書】
【提出日】平成29年8月23日(2017.8.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（a）生物学的試験試料を複数のオリゴヌクレオチドと接触させる工程であって、複数のオリゴヌクレオチドが少なくとも20個の異なるオリゴヌクレオチド配列を含み、複数のオリゴヌクレオチドの各異なるメンバーがSEQ ID NO: 510599〜510763のいずれか１つに対して少なくとも90％相同である配列を含む、工程；
（b）工程（a）で複数のオリゴヌクレオチドと生物学的試験試料中の標的との間に形成された複合体の存在またはレベルを検出する工程；および
（c）工程（b）で検出された存在またはレベルを、生物学的対照試料からの参照レベルと比較し、それによって疾患または障害を特徴決定する工程
を含む、疾患または障害の特徴決定のための指示を提供する方法。
【請求項２】
工程（b）における検出が、複合体中の複数のオリゴヌクレオチドのメンバーの配列決定、増幅、およびハイブリダイゼーションの少なくとも１つを実施する工程を含む、請求項１記載の方法。
【請求項３】
工程（b）における検出がハイスループット配列決定を含む、請求項１または２記載の方法。
【請求項４】
生物学的試験試料および生物学的対照試料がそれぞれ、組織試料、細胞培養物、または生物学的流体を含み、任意で、生物学的流体が体液を含む、請求項１〜３のいずれか一項記載の方法。
【請求項５】
体液が、末梢血、血清、血漿、腹水、尿、脳脊髄液（CSF）、痰、唾液、骨髄、滑液、眼房水、羊水、耳垢、母乳、気管支肺胞洗浄液、精液、前立腺液、カウパー腺液もしくは尿道球腺液、女性射精液、汗、糞便、涙液、嚢胞液、胸膜液および腹膜液、心膜液、リンパ液、糜粥、乳糜、胆汁、間質液、月経分泌物、膿、皮脂、嘔吐物、膣分泌液、粘膜分泌液、水便、膵液、鼻腔からの洗浄液、気管支肺吸引液、胚盤胞腔液、または臍帯血を含む、請求項４記載の方法。
【請求項６】
体液が、血液、血清、または血漿を含む、請求項４記載の方法。
【請求項７】
生物学的流体が微小胞を含み、任意で、複合体が、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドと少なくとも一つの微小胞との間で形成される、請求項４〜６のいずれか一項記載の方法。
【請求項８】
微小胞が、クロマトグラフィー、ろ過、限外ろ過、遠心分離、超遠心分離、フローサイトメトリー、アフィニティー捕捉（たとえば平面、カラムまたはビーズへの）、ポリマー沈殿の少なくとも一つを使用しかつマイクロ流体工学を使用して単離される、請求項７記載の方法。
【請求項９】
複数のオリゴヌクレオチドの少なくとも１つのメンバーがポリペプチドまたはその断片に結合し、任意で、ポリペプチドまたはその断片が可溶性または膜結合状態であり、任意で、膜が微小胞膜を含む、請求項１〜８のいずれか一項記載の方法。
【請求項１０】
複数のオリゴヌクレオチドの少なくとも１つのメンバーが、微小胞表面抗原に結合する、請求項１〜９のいずれか一項記載の方法。
【請求項１１】
疾患または障害が、乳癌、アルツハイマー病、気管支喘息、膀胱移行上皮癌、巨細胞オステオブラストクラストーマ、脳腫瘍、結腸直腸腺癌、慢性閉塞性肺疾患（COPD）、子宮頸部扁平上皮癌、急性心筋梗塞（AMI）/急性心不全、クローン病、II型糖尿病、食道癌、喉頭扁平上皮癌、急性および慢性骨髄白血病、肺癌、悪性リンパ腫、多発性硬化症、卵巣癌、パーキンソン病、前立腺腺癌、乾癬、関節リウマチ、腎細胞癌、皮膚有棘細胞癌、胃腺癌、甲状腺癌、精巣癌、潰瘍性大腸炎または子宮腺癌を含む、請求項１〜１０のいずれか一項記載の方法。
【請求項１２】
疾患または障害が、癌、前癌状態、炎症性疾患、免疫疾患、自己免疫疾患もしくは障害、心血管疾患もしくは障害、神経疾患もしくは障害、感染症、または疼痛を含む、請求項１〜１０のいずれか一項記載の方法。
【請求項１３】
複数のオリゴヌクレオチドのうちの少なくとも一つのメンバーが、少なくとも一つの機能的修飾を含む、請求項１〜１２のいずれか一項記載の方法。
【請求項１４】
請求項１〜１３のいずれか一項記載の方法を実施するための少なくとも１つの試薬を含むキットであって、少なくとも１つの試薬が複数のオリゴヌクレオチドを含む、キット。
【請求項１５】
少なくとも１つの試薬が、
（a）微小胞を単離するように構成された試薬であって、任意で、微小胞を単離するように構成された少なくとも一つの該試薬が、微小胞抗原への結合物質、カラム、基体、ろ過ユニット、ポリマー、ポリエチレングリコール、PEG4000、PEG8000、粒子またはビーズを含む、該試薬；
（b）オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドを増幅、配列決定、ハイブリダイズまたは検出するためにプライマーまたはプローブとして働くように構成された少なくとも一つのオリゴヌクレオチド；ならびに
（c）生物学的試験試料から1種または複数種の豊富なタンパク質を除去するように構成された試薬であって、任意で、1種または複数種の豊富なタンパク質が、アルブミン、免疫グロブリン、フィブリノーゲンおよびフィブリンのうち少なくとも1種を含む、該試薬
のうちの少なくとも一つをさらに含む、請求項１４記載のキット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００９２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００９２】
本発明はさらに、本明細書の方法を実施するための試薬を含むキットおよびまた本発明のGCライブラリーまたは均衡オリゴヌクレオチドに関連する方法を実施するための試薬の使用を提供する。たとえば、試薬は、GCライブラリーおよび/または均衡オリゴヌクレオチドライブラリーから導出された配列を有する一つまたは複数のオリゴヌクレオチドを含み得る。試薬は、本明細書に開示される他の有用な成分、たとえば非限定的に、（a）微小胞を単離するように構成された試薬（任意で、微小胞を単離するように構成された少なくとも一つの試薬は、微小胞抗原への結合物質、カラム、基体、ろ過ユニット、ポリマー、ポリエチレングリコール、PEG4000、PEG8000、粒子またはビーズを含む）；（b）オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドを増幅、配列決定、ハイブリダイズまたは検出するためにプライマーまたはプローブとして働くように構成された少なくとも一つのオリゴヌクレオチド；および（c）試料から1種または複数種の豊富なタンパク質を除去するように構成された試薬（任意で、1種または複数種の豊富なタンパク質は、アルブミン、免疫グロブリン、フィブリノーゲンおよびフィブリンのうち少なくとも1種を含む）の少なくとも一つをさらに含み得る。
[本発明1001]
SEQ ID NO: 10558に対して少なくとも50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99または100％相同であるオリゴヌクレオチド。
[本発明1002]
少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、125、150、175、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、2000、3000、4000、5000、6000、7000、8000、9000、10000、20000、30000、40000、50000、60000、70000、80000、90000、100000、200000、300000、400000、500000、106、107、108、109、1010、1011、1012、1013、1014、1015、1016、1017または少なくとも1018個の異なるオリゴヌクレオチド配列を含み、各オリゴヌクレオチド配列またはその部分がSEQ ID NO: 10558に対して少なくとも50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99または100％相同である、複数のオリゴヌクレオチド。
[本発明1003]
少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、125、150、175、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、2000、3000、4000、5000、6000、7000、8000、9000、10000、20000、30000、40000、50000、60000、70000、80000、90000、100000、200000、300000、400000または500000個の異なるオリゴヌクレオチド配列を含み、各オリゴヌクレオチド配列またはその部分がSEQ ID NO: 10559〜510558から選択される配列に対して少なくとも50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99または100％相同である、複数のオリゴヌクレオチド。
[本発明1004]
SEQ ID NO: 10559〜510558にリストされたオリゴヌクレオチドの少なくとも50％、60％、70％、80％、90％、95％、96％、97％、98％または少なくとも99％を含む、オリゴヌクレオチドプローブライブラリー。
[本発明1005]
SEQ ID NO: 510559〜510578から選択される配列に対して少なくとも50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99または100％相同である核酸配列またはその部分を含む、オリゴヌクレオチド。
[本発明1006]
少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20個の異なるオリゴヌクレオチド配列を含み、各オリゴヌクレオチド配列またはその部分がSEQ ID NO: 510559〜510578に対して少なくとも50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99または100％相同である、複数のオリゴヌクレオチド。
[本発明1007]
SEQ ID NO: 510579〜510598から選択される配列に対して少なくとも50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99または100％相同である核酸配列またはその部分を含む、オリゴヌクレオチド。
[本発明1008]
少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20個の異なるオリゴヌクレオチド配列を含み、各オリゴヌクレオチド配列またはその部分がSEQ ID NO: 510579〜510598に対して少なくとも50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99または100％相同である、複数のオリゴヌクレオチド。
[本発明1009]
SEQ ID NO: 510599〜510763から選択される配列に対して少なくとも50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99または100％相同である核酸配列またはその部分を含む、オリゴヌクレオチド。
[本発明1010]
少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、110、120、125、130、140、150、160または165個の異なるオリゴヌクレオチド配列を含み、各オリゴヌクレオチド配列またはその部分がSEQ ID NO: 510599〜510763に対して少なくとも50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99または100％相同である、複数のオリゴヌクレオチド。
[本発明1011]
少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、110、120、125、130、140、150、160または165個の異なるオリゴヌクレオチド配列を含み、各オリゴヌクレオチド配列またはその部分が表16中の行中の配列番号に対して少なくとも50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99または100％相同である、複数のオリゴヌクレオチド。
[本発明1012]
DNA、RNA、非天然のヌクレオチド、欠失、挿入、付加、および化学的修飾からなる群より選択される少なくとも一つの機能的修飾を含む、本発明1001〜1012のいずれかのオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチド。
[本発明1013]
オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドを試料と接触させる工程および試料中の標的へのオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドの結合の存在またはレベルを検出する工程を含み、任意で、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが本発明1001〜1012のいずれかのものである、方法。
[本発明1014]
試料が、生物学的試料、有機試料、無機試料、組織、細胞培養物、体液、血液、血清、細胞、微小胞、タンパク質複合体、脂質複合体、糖質またはそれらの任意の組み合わせ、部分もしくは変種を含む、本発明1013の方法。
[本発明1015]
標的が、細胞、オルガネラ、タンパク質複合体、リポタンパク質、糖質、微小胞、膜断片、小分子、重金属、毒素または薬物を含む、本発明1013の方法。
[本発明1016]
（a）微小胞を含む生物学的試料をオリゴヌクレオチドプローブライブラリーと接触させる工程であって、任意で、オリゴヌクレオチドプローブライブラリーが、本発明1001〜1012のいずれかのオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドを含む、工程；
（b）微小胞の少なくとも一部分に結合したオリゴヌクレオチドを同定する工程；および
（c）同定されたオリゴヌクレオチドのプロファイルに基づいて試料を特徴決定する工程
を含む、方法。
[本発明1017]
（a）溶解状態の混合物を形成するために、試料を、少なくとも106、107、108、109、1010、1011、1012、1013、1014、1015、1016、1017または少なくとも1018個の異なるオリゴヌクレオチド配列のオリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチドプローブライブラリーと接触させる工程であって、オリゴヌクレオチドが、試料中の複数の実体に結合して複合体を形成することができ、任意で、オリゴヌクレオチドプローブライブラリーが、本発明1001〜1012のいずれかのオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドを含む、工程；
（b）工程（a）で形成された複合体を混合物から分割する工程；および
（c）試料に関するオリゴヌクレオチドプロファイルを同定するために、工程（b）で分割された複合体中に存在するオリゴヌクレオチドを検出する工程
を含む、方法。
[本発明1018]
検出する工程が、複合体中のすべてもしくはいくつかのオリゴヌクレオチドの配列決定、複合体中のすべてもしくはいくつかのオリゴヌクレオチドの増幅、および/または、複合体中のすべてもしくはいくつかのオリゴヌクレオチドの、アレイへのハイブリダイゼーションを実施する工程を含む、本発明1017の方法。
[本発明1019]
（a）第一のオリゴヌクレオチドライブラリーを生物学的試験試料および生物学的対照試料と接触させる工程であって、生物学的試料中に存在する生物学的実体と、第一のオリゴヌクレオチドライブラリー中に存在する複数のオリゴヌクレオチドとの間に複合体が形成される、工程；
（b）生物学的試験試料および生物学的対照試料それぞれに関してオリゴヌクレオチドのサブセットを生成するために、工程（a）で形成された複合体を分割して、複合体中のオリゴヌクレオチドを単離する工程；
（c）（b）におけるオリゴヌクレオチドのサブセットを生物学的試験試料および生物学的対照試料と接触させる工程であって、生物学的試料中に存在する生物学的実体と、オリゴヌクレオチドのサブセット中に存在する第二の複数のオリゴヌクレオチドとの間に複合体が形成されて、オリゴヌクレオチドの第二のサブセット群を生成する、工程；ならびに
（d）オリゴヌクレオチドのそれぞれ第三、第四、第五またはそれ以降のサブセット群を生成するために、任意で、工程（b）〜（c）を一回、二回、三回またはより多く繰り返して、それによって、富化されたオリゴヌクレオチドプローブライブラリーを生成する工程
を含む、富化されたオリゴヌクレオチドプローブライブラリーを生成する方法。
[本発明1020]
少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、125、150、175、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、2000、3000、4000、5000、6000、7000、8000、9000、10000、20000、30000、40000、50000、60000、70000、80000、90000、100000、200000、300000、400000または500000個の異なるオリゴヌクレオチド配列を含む複数のオリゴヌクレオチドであって、該複数が、本発明1019の方法から得られ、ライブラリーが第一の表現型を第二の表現型と区別することができる、複数のオリゴヌクレオチド。
[本発明1021]
第一の表現型が疾患もしくは障害を含み、第二の表現型が健康な状態を含む；または第一の表現型が疾患もしくは障害を含み、第二の表現型が異なる疾患もしくは障害を含む；または第一の表現型が疾患もしくは障害のある病期もしくは進行を含み、第二の表現型が同じ疾患もしくは障害の異なる病期もしくは進行を含む；または第一の表現型が治療に対する正の応答を含み、第二の表現型が同じ治療に対する負の応答を含む、本発明1020の複数。
[本発明1022]
（a）生物学的試験試料を本発明1001〜1012のいずれかのオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドと接触させる工程；
（b）工程（a）で本発明1001〜1012のいずれかのオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドと生物学的試験試料中の標的との間に形成された複合体の存在またはレベルを検出する工程；および
（c）工程（b）で検出された存在またはレベルを、生物学的対照試料からの参照レベルと比較し、それによって疾患または障害を特徴決定する工程
を含む、疾患または障害を特徴決定する方法。
[本発明1023]
検出する工程が、複合体中のすべてもしくはいくつかのオリゴヌクレオチドの配列決定、複合体中のすべてもしくはいくつかのオリゴヌクレオチドの増幅、および/または複合体中のすべてもしくはいくつかのオリゴヌクレオチドの、アレイへのハイブリダイゼーションを実施する工程を含み得る、本発明1022の方法。
[本発明1024]
配列決定がハイスループット配列決定を含む、本発明1023の方法。
[本発明1025]
生物学的試験試料および生物学的対照試料がそれぞれ、組織試料、細胞培養物、または生物学的流体を含む、本発明1019または1022〜1024のいずれかの方法。
[本発明1026]
生物学的流体が体液を含む、本発明1025の方法。
[本発明1027]
体液が、末梢血、血清、血漿、腹水、尿、脳脊髄液（CSF）、痰、唾液、骨髄、滑液、眼房水、羊水、耳垢、母乳、気管支肺胞洗浄液、精液、前立腺液、カウパー腺液もしくは尿道球腺液、女性射精液、汗、糞便、体毛、涙液、嚢胞液、胸膜液および腹膜液、心膜液、リンパ液、糜粥、乳糜、胆汁、間質液、月経分泌物、膿、皮脂、嘔吐物、膣分泌液、粘膜分泌液、水便、膵液、鼻腔からの洗浄液、気管支肺吸引液、胚盤胞腔液、または臍帯血を含む、本発明1026の方法。
[本発明1028]
体液が、血液、血清、または血漿を含む、本発明1026の方法。
[本発明1029]
生物学的流体が微小胞を含む、本発明1025の方法。
[本発明1030]
複合体が、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドと少なくとも一つの微小胞との間で形成される、本発明1029の方法。
[本発明1031]
生物学的試験試料および生物学的対照試料が、単離された微小胞を含み、任意で、微小胞が、クロマトグラフィー、ろ過、限外ろ過、遠心分離、超遠心分離、フローサイトメトリー、アフィニティー捕捉（たとえば平面、カラムまたはビーズへの）、ポリマー沈殿の少なくとも一つを使用しかつマイクロ流体工学を使用して単離される、本発明1019または1022〜1030のいずれかの方法。
[本発明1032]
オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドがポリペプチドまたはその断片に結合する、本発明1022〜1031のいずれかの方法。
[本発明1033]
ポリペプチドまたはその断片が可溶性または膜結合状態であり、任意で、膜が微小胞膜を含む、本発明1032の方法。
[本発明1034]
ポリペプチドまたはその断片が表3または表4中のバイオマーカーを含む、本発明1033の方法。
[本発明1035]
オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、生物学的試料中の微小胞表面抗原に結合する、本発明1022〜1034のいずれかの方法。
[本発明1036]
疾患または障害が、乳癌、アルツハイマー病、気管支喘息、膀胱移行上皮癌、巨細胞オステオブラストクラストーマ、脳腫瘍、結腸直腸腺癌、慢性閉塞性肺疾患（COPD）、子宮頸部扁平上皮癌、急性心筋梗塞（AMI）/急性心不全、クローン病、II型糖尿病、食道癌、喉頭扁平上皮癌、急性および慢性骨髄白血病、肺癌、悪性リンパ腫、多発性硬化症、卵巣癌、パーキンソン病、前立腺腺癌、乾癬、関節リウマチ、腎細胞癌、皮膚有棘細胞癌、胃腺癌、甲状腺癌、精巣癌、潰瘍性大腸炎または子宮腺癌を含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1037]
疾患または障害が、癌、前癌状態、炎症性疾患、免疫疾患、自己免疫疾患もしくは障害、心血管疾患もしくは障害、神経疾患もしくは障害、感染症、または疼痛を含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1038]
癌が、急性リンパ芽球性白血病；急性骨髄性白血病；副腎皮質癌；AIDS関連癌；AIDS関連リンパ腫；肛門癌；虫垂癌；星状細胞腫；非定型奇形腫様/ラブドイド腫瘍；基底細胞癌；膀胱癌；脳幹神経膠腫；脳腫瘍（脳幹神経膠腫、中枢神経系非定型奇形腫様/ラブドイド腫瘍、中枢神経系胚芽腫、星状細胞腫、頭蓋咽頭腫、上衣芽腫、上衣腫、髄芽腫、髄上皮種、中間型松果体実質腫瘍、テント上原始神経外胚葉性腫瘍、および松果体芽腫を含む）；乳癌；気管支腫瘍；バーキットリンパ腫；原発不明癌；カルチノイド腫瘍；原発不明癌腫；中枢神経系非定型奇形腫様/ラブドイド腫瘍；中枢神経系胚芽腫；子宮頸癌；小児癌；脊索腫；慢性リンパ球性白血病；慢性骨髄性白血病；慢性骨髄増殖性障害；結腸癌；結腸直腸癌；頭蓋咽頭腫；皮膚T細胞リンパ腫；内分泌膵島細胞腫瘍；子宮内膜癌；上衣芽腫；上衣腫；食道癌；鼻腔神経芽細胞腫；ユーイング肉腫；頭蓋外胚細胞腫瘍；性腺外胚細胞腫瘍；肝外胆管癌；胆嚢癌；胃癌；消化管カルチノイド腫瘍；消化管間質細胞腫瘍；消化管間質腫瘍（GIST）；妊娠性絨毛性腫瘍；神経膠腫；毛様細胞性白血病；頭頸部癌；心臓癌；ホジキンリンパ腫；下咽頭癌；眼内黒色腫；膵島腫瘍；カポジ肉腫；腎臓癌；ランゲルハンス細胞組織球症；喉頭癌；口唇癌；肝臓癌；肺癌；悪性線維性組織球腫；骨癌；髄芽腫；髄上皮種；黒色腫；メルケル細胞癌；メルケル細胞皮膚癌；中皮腫；原発不明転移性扁平上皮性頸部癌；口腔癌；多発性内分泌腫瘍症候群；多発性骨髄腫；多発性骨髄腫/形質細胞腫瘍；菌状息肉腫；骨髄異形成症候群；骨髄増殖性腫瘍；鼻腔癌；鼻咽頭癌；神経芽細胞腫；非ホジキンリンパ腫；非黒色腫皮膚癌；非小細胞肺癌；口腔癌；口腔癌；口腔咽頭癌；骨肉腫；その他の脳および脊髄の腫瘍；卵巣癌；卵巣上皮癌；卵巣胚細胞腫瘍；卵巣低悪性度腫瘍；膵臓癌；乳頭腫症；副鼻腔癌；副甲状腺癌；骨盤癌；陰茎癌；咽頭癌；中間型松果体実質腫瘍；松果体芽腫；下垂体腫瘍；形質細胞腫瘍/多発性骨髄腫；胸膜肺芽腫；原発性中枢神経系（CNS）リンパ腫；原発性肝細胞肝癌；前立腺癌；直腸癌；腎臓癌；腎細胞（腎臓）癌；腎細胞癌；気道癌；網膜芽細胞腫；横紋筋肉腫；唾液腺癌；セザリー症候群；小細胞肺癌；小腸癌；軟部組織肉腫；扁平上皮癌；扁平上皮性頸部癌；胃癌；テント上原始神経外胚葉性腫瘍；T細胞リンパ腫；精巣癌；咽喉癌；胸腺癌；胸腺腫；甲状腺癌；移行上皮癌；腎盂尿管移行上皮癌；絨毛性腫瘍；尿管癌；尿道癌；子宮癌；子宮肉腫；膣癌；外陰癌；ワルデンシュトレームマクログロブリン血症；またはウィルムス腫瘍を含む、本発明1037の方法。
[本発明1039]
前癌状態がバレット食道を含む、本発明1037の方法。
[本発明1040]
自己免疫疾患が、炎症性腸疾患（IBD）、クローン病（CD）、潰瘍性大腸炎（UC）、骨盤炎症、血管炎、乾癬、糖尿病、自己免疫性肝炎、多発性硬化症、重症筋無力症、I型糖尿病、関節リウマチ、乾癬、全身性エリテマトーデス（SLE）、橋本甲状腺炎、グレーブス病、強直性脊椎炎、シェーグレン病、CREST症候群、強皮症、リウマチ性疾患、臓器拒絶反応、原発性硬化性胆管炎、または敗血症を含む、本発明1037の方法。
[本発明1041]
心血管疾患が、アテローム性動脈硬化症、うっ血性心不全、不安定プラーク、脳卒中、虚血、高血圧症、狭窄症、血管閉塞、または血栓性イベントを含む、本発明1037の方法。
[本発明1042]
神経疾患が、多発性硬化症（MS）、パーキンソン病（PD）、アルツハイマー病（AD）、統合失調症、双極性障害、うつ病、自閉症、プリオン病、ピック病、認知症、ハンチントン病（HD）、ダウン症候群、脳血管疾患、ラズムッセン脳炎、ウイルス性髄膜炎、神経精神全身性エリテマトーデス（NPSLE）、筋萎縮性側索硬化症、クロイツフェルト-ヤコブ病、ゲルストマン・ストロイスラー・シャインカー病、伝達性海綿状脳症、虚血再灌流傷害（例えば脳卒中）、脳損傷、微生物感染、または慢性疲労症候群を含む、本発明1037の方法。
[本発明1043]
疼痛が、線維筋痛症、慢性神経因性疼痛、または末梢性神経因性疼痛を含む、本発明1037の方法。
[本発明1044]
感染症が、細菌感染、ウイルス感染、酵母菌感染、ウィップル病、プリオン病、肝硬変、メチシリン耐性黄色ブドウ球菌、HIV、HCV、肝炎、梅毒、髄膜炎、マラリア、結核、インフルエンザを含む、本発明1037の方法。
[本発明1045]
疾患または障害が乳癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 510559〜510598のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30または少なくとも40個を含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1046]
疾患または障害がアルツハイマー病を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000001
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1047]
疾患または障害がアルツハイマー病を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000002
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1048]
疾患または障害が気管支喘息を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000003
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1049]
疾患または障害が気管支喘息を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000004
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1050]
疾患または障害が膀胱移行上皮癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000005
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1051]
疾患または障害が巨細胞オステオブラストクラストーマを含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000006
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1052]
疾患または障害が脳腫瘍を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000007
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1053]
疾患または障害が結腸直腸腺癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000008
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1054]
疾患または障害が慢性閉塞性肺疾患（COPD）を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000009
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1055]
疾患または障害が慢性閉塞性肺疾患（COPD）を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000010
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1056]
疾患または障害が子宮頸部扁平上皮癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000011
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1057]
疾患または障害が急性心筋梗塞（AMI）または急性心不全を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000012
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1058]
疾患または障害が急性心筋梗塞（AMI）または急性心不全を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000013
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1059]
疾患または障害がクローン病を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000014
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1060]
疾患または障害がクローン病を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000015
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1061]
疾患または障害がII型糖尿病を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000016
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1062]
疾患または障害がII型糖尿病を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000017
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1063]
疾患または障害が食道癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000018
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1064]
疾患または障害が喉頭扁平上皮癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000019
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1065]
疾患または障害が急性または慢性骨髄白血病を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000020
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1066]
疾患または障害が肺癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000021
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1067]
疾患または障害が悪性リンパ腫を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000022
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1068]
疾患または障害が多発性硬化症を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000023
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1069]
疾患または障害が多発性硬化症を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000024
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1070]
疾患または障害が卵巣癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000025
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1071]
疾患または障害がパーキンソン病を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000026
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1072]
疾患または障害がパーキンソン病を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000027
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1073]
疾患または障害が前立腺腺癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000028
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1074]
疾患または障害が乾癬を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000029
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1075]
疾患または障害が乾癬を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000030
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1076]
疾患または障害が関節リウマチを含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000031
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1077]
疾患または障害が関節リウマチを含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000032
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1078]
疾患または障害が腎細胞癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000033
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1079]
疾患または障害が皮膚有棘細胞癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000034
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1080]
疾患または障害が胃腺癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000035
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1081]
疾患または障害が甲状腺癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000036
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1082]
疾患または障害が精巣癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000037
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1083]
疾患または障害が潰瘍性大腸炎を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000038
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1084]
疾患または障害が潰瘍性大腸炎を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000039
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1085]
疾患または障害が子宮腺癌を含み、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO: 
2016533752.tif 000040
のうち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50個またはすべてを含む、本発明1022〜1035のいずれかの方法。
[本発明1086]
オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドのうちの少なくとも一つが、DNA、RNA、非天然のヌクレオチド、欠失、挿入、付加、および化学的修飾からなる群より選択される少なくとも一つの機能的修飾を含む、本発明1045〜1085のいずれかの方法。
[本発明1087]
本発明1013〜1019または1022〜1086のいずれかの方法を実施するための試薬を含むキット。
[本発明1088]
本発明1013〜1019または1022〜1086のいずれかの方法を実施するための試薬の使用。
[本発明1089]
試薬がオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドを含む、本発明1087のキットまたは本発明1088の使用。
[本発明1090]
オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが本発明1001〜1012のいずれかのものである、本発明1089のキットまたは使用。
[本発明1091]
試薬が、
（a）微小胞を単離するように構成された試薬であって、任意で、微小胞を単離するように構成された少なくとも一つの該試薬が、微小胞抗原への結合物質、カラム、基体、ろ過ユニット、ポリマー、ポリエチレングリコール、PEG4000、PEG8000、粒子またはビーズを含む、該試薬；
（b）オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドを増幅、配列決定、ハイブリダイズまたは検出するためにプライマーまたはプローブとして働くように構成された少なくとも一つのオリゴヌクレオチド；ならびに
（c）試料から1種または複数種の豊富なタンパク質を除去するように構成された試薬であって、任意で、1種または複数種の豊富なタンパク質が、アルブミン、免疫グロブリン、フィブリノーゲンおよびフィブリンのうち少なくとも1種を含む、該試薬
のうちの少なくとも一つをさらに含む、本発明1089または1090のキットまたは使用。
[本発明1092]
（a）表8に記載される、SEQ ID NO: 8〜21もしくはそれらの可変配列；
（b）表11に記載される、SEQ ID NO: 24〜43もしくはそれらの可変配列；
（c）SEQ ID NO: 44〜10527；
（d）表12に記載される、SEQ ID NO: 10528〜10557もしくはそれらの可変配列；または
（e）任意の上記配列の機能的断片
のいずれかと、少なくとも約50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、または100パーセント相同である核酸配列を含むアプタマー。
[本発明1093]
少なくとも一つの化学修飾を含むようにさらに改変されている、本発明1092のアプタマー。
[本発明1094]
前記修飾が、核酸の、糖位置での化学的置換；リン酸位置での化学的置換；および塩基位置での化学的置換からなる群より選択される、本発明1093のアプタマー。
[本発明1095]
前記修飾が、ビオチン化、蛍光標識の取り込み、修飾ヌクレオチドの取り込み、3'キャッピング、アミンリンカーへの結合、非免疫原性の高分子量化合物への結合、親油性化合物への結合、薬物への結合、細胞傷害性部分への結合、および放射性同位体を用いた標識からなる群より選択される、本発明1093のアプタマー。
[本発明1096]
ビオチン化、蛍光標識、または細胞傷害性部分が、前記アプタマーの5'末端に結合している、本発明1095のアプタマー。
[本発明1097]
ビオチン化、蛍光標識、または細胞傷害性部分が、前記アプタマーの3'末端に結合している、本発明1095のアプタマー。
[本発明1098]
細胞傷害性部分がナノ粒子中に封入されている、本発明1095のアプタマー。
[本発明1099]
ナノ粒子が、リポソーム、デンドリマー、および櫛形ポリマーからなる群より選択される、本発明1098のアプタマー。
[本発明1100]
細胞傷害性部分が小分子の細胞傷害性部分を含む、本発明1095のアプタマー。
[本発明1101]
小分子の細胞傷害性部分が、ビンブラスチンヒドラジド、カリチアマイシン、ビンカアルカロイド、クリプトフィシン、ツブリシン、ドラスタチン-10、ドラスタチン-15、アウリスタチンE、リゾキシン、エポチロンB、エポチロンD、タキソイド、メイタンシノイド、ならびにそれらの任意のバリアントおよび誘導体からなる群より選択される、本発明1100のアプタマー。
[本発明1102]
放射性同位体が、イットリウム-90、インジウム-111、ヨウ素-131、ルテチウム-177、銅-67、レニウム-186、レニウム-188、ビスマス-212、ビスマス-213、アスタチン-211、およびアクチニウム-225からなる群より選択される、本発明1095のアプタマー。
[本発明1103]
細胞傷害性部分がタンパク毒素である、本発明1095のアプタマー。
[本発明1104]
タンパク毒素が、ジフテリア毒素、リシン、アブリン、ゲロニン、およびシュードモナス外毒素Aからなる群より選択される、本発明1103のアプタマー。
[本発明1105]
非免疫原性の高分子量化合物がポリアルキレングリコールである、本発明1095のアプタマー。
[本発明1106]
ポリアルキレングリコールがポリエチレングリコールである、本発明1105のアプタマー。
[本発明1107]
γ線放出放射性同位体によって標識されている、本発明1092のアプタマー。
[本発明1108]
活性物質が前記アプタマーに結合している、本発明1092のアプタマー。
[本発明1109]
活性物質が治療物質または診断物質を含む、本発明1108のアプタマー。
[本発明1110]
治療物質または診断物質が、チロシンキナーゼ阻害剤、キナーゼ阻害剤、生物学的活性物質、生物学的分子、放射性核種、アドリアマイシン、アンサマイシン系抗生物質、アスパラギナーゼ、ブレオマイシン、ブスルファン、シスプラチン、カルボプラチン、カルムスチン、カペシタビン、クロラムブチル、シタラビン、シクロホスファミド、カンプトセシン、ダカルバジン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デクスラゾキサン、ドセタキセル、ドキソルビシン、エトポシド、エポチロン、フロクスウリジン、フルダラビン、フルオロウラシル、ゲムシタビン、ヒドロキシ尿素、イダルビシン、イホスファミド、イリノテカン、ロムスチン、メクロレタミン、メルカプトプリン、メルファラン、メトトレキサート、ラパマイシン（シロリムス）、マイトマイシン、ミトタン、ミトキサントロン、ニトロソ尿素、パクリタクセル、パミドロナート、ペントスタチン、プリカマイシン、プロカルバジン、リツキシマブ、ストレプトゾシン、テニポシド、チオグアニン、チオテパ、タキサン、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビノレルビン、タキソール、コンブレタスタチン、ディスコデルモリド、トランスプラチナ（transplatinum）、抗血管内皮成長因子化合物（「抗VEGF」）、抗上皮細胞成長因子受容体化合物（「抗EGFR」）、5-フルオロウラシルおよび誘導体、放射性核種、ポリペプチド毒素、アポトーシス誘導物質、治療増感物質、酵素またはその活性断片、ならびにこれらの組み合わせからなる群より選択される治療物質である、本発明1108〜1109のいずれかのアプタマー。
[本発明1111]
治療的有効量の本発明1092〜1110のいずれかのアプタマーまたはその塩、および薬学的に許容される担体または希釈剤を含む、薬学的組成物。
[本発明1112]
それを必要とする対象に本発明1111の組成物を投与する工程を含む、疾患または障害を治療するかまたは寛解させる方法。
[本発明1113]
対象に治療的有効量の前記組成物を投与する工程が以下をもたらす、本発明1112の方法：
（a）活性物質単独の送達と比較した、疾患部位への活性物質の送達の増大；または（b）微小胞クリアランスの増大による、アプタマーの標的となる微小胞の血中濃度の少なくとも10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、もしくは90%の低下；または（c）該アプタマーの標的となる微小胞の生物学的活性の、少なくとも10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、もしくは90%の低下。
[本発明1114]
微小胞の生物学的活性が、免疫抑制または遺伝情報の伝達を含む、本発明1113の方法。
[本発明1115]
疾患または障害が、新生物性の、増殖性の、または炎症性の疾患または障害を含む、本発明1112〜1114のいずれかの方法。
[本発明1116]
治療的有効量の本発明1103のアプタマーまたはその塩、および薬学的に許容される担体または希釈剤を含む、薬学的組成物。
[本発明1117]
本発明1092〜1110のいずれかのアプタマーまたはその薬学的組成物を含む、キット。
[本発明1118]
本発明1092〜1110のいずれかのアプタマーを生物学的試料と接触させる工程および該生物学的試料中の微小胞に対する該アプタマーの結合の有無を検出する工程を含む、方法。
[本発明1119]
生物学的試料が血液または血液成分を含む、本発明1118の方法。
[本発明1120]
アプタマーが、生物学的試料と接触させる工程の前に基体に結合している、本発明1118の方法。
[本発明1121]
基体がビーズを含む、本発明1120の方法。
[本発明1122]
アプタマーが、検出可能な標識に結合している、本発明1118の方法。
[本発明1123]
微小胞集団を含有することが疑われる生物学的試料中の該微小胞集団の存在またはレベルを検出する方法であって、該生物学的試料を、該微小胞集団に特異的な1種または複数種の結合物質および本発明1092〜1110のいずれかの1種または複数種のアプタマーと接触させる工程、ならびに、該1種または複数種の結合物質および該1種または複数種のアプタマーの両方によって認識された微小胞を検出し、それによって、該生物学的試料中の該微小胞集団の存在またはレベルを検出する工程を含む、方法。
[本発明1124]
1種または複数種の結合物質が、表3および表4から選択される微小胞表面抗原ならびにそれらの組み合わせに対する抗体またはアプタマーを含む、本発明1123の方法。
[本発明1125]
1種または複数種の結合物質が、生物学的試料と接触させる工程の前に基体に結合している、本発明1123の方法。
[本発明1126]
1種または複数種の結合物質が、検出可能な標識に結合している、本発明1123の方法。
[本発明1127]
1種または複数種のアプタマーが、生物学的試料と接触させる工程の前に基体に結合している、本発明1123の方法。
[本発明1128]
1種または複数種のアプタマーが、検出可能な標識に結合している、本発明1123の方法。
[本発明1129]
1種または複数種のアプタマーが、生物学的試料と接触させる工程の前に基体に結合している、本発明1126の方法。
[本発明1130]
1種または複数種のアプタマーが、検出可能な標識に結合している、本発明1125の方法。
[本発明1131]
生物学的試料中の微小胞集団の存在またはレベルを検出する工程が、疾患の診断、予後判定、またはセラノーシス（theranosis）を提供する、本発明1123〜1130のいずれかの方法。
[本発明1132]
疾患が癌を含む、本発明1131の方法。
[本発明1133]
癌が乳癌を含む、本発明1132の方法。
[本発明1134]
（a）生物学的試験試料を、本発明1092〜1110のいずれかの1種または複数種のアプタマーと接触させる工程； 
（b）工程（a）で形成された、該生物学的試験試料における1種または複数種のアプタマーと該1種または複数種のアプタマーに結合された標的との間の複合体の存在またはレベルを検出する工程；
（c）生物学的対照試料を、1種または複数種のアプタマーと接触させる工程； 
（d）工程（c）で形成された、該生物学的対照試料における1種または複数種のアプタマーと該1種または複数種のアプタマーに結合された標的との間の複合体の存在またはレベルを検出する工程；ならびに
（e）工程（b）および（d）で検出された存在またはレベルを比較し、それによって、疾患または障害を特徴決定する工程
を含む、疾患または障害を特徴決定する方法。
[本発明1135]
生物学的試験試料および生物学的対照試料がそれぞれ、組織試料、細胞培養物、または生物学的流体を含む、本発明1134の方法。
[本発明1136]
生物学的流体が体液を含む、本発明1135の方法。
[本発明1137]
体液が、末梢血、血清、血漿、腹水、尿、脳脊髄液（CSF）、痰、唾液、骨髄、滑液、眼房水、羊水、耳垢、母乳、気管支肺胞洗浄液、精液、前立腺液、カウパー腺液もしくは尿道球腺液、女性射精液、汗、糞便、体毛、涙液、嚢胞液、胸膜液および腹膜液、心膜液、リンパ液、糜粥、乳糜、胆汁、間質液、月経分泌物、膿、皮脂、嘔吐物、膣分泌液、粘膜分泌液、水便、膵液、鼻腔からの洗浄液、気管支肺吸引液、胚盤胞腔液、または臍帯血を含む、本発明1136の方法。
[本発明1138]
体液が、血液、血清、または血漿を含む、本発明1136の方法。
[本発明1139]
生物学的流体が微小胞を含む、本発明1135の方法。
[本発明1140]
1種または複数種のアプタマーがポリペプチドまたはその断片に結合する、本発明1134の方法。
[本発明1141]
ポリペプチドまたはその断片が可溶性であるか膜結合性である、本発明1134の方法。
[本発明1142]
ポリペプチドまたはその断片が表3または表4のバイオマーカーを含む、本発明1134の方法。
[本発明1143]
1種または複数種のアプタマーが、生物学的試料中の微小胞表面抗原に結合する、本発明1134または1139の方法。
[本発明1144]
特徴決定する工程が、疾患または障害の診断、予後判定、またはセラノーシスを含む、本発明1134〜1143のいずれかの方法。
[本発明1145]
疾患または障害が癌を含む、本発明1144の方法。
[本発明1146]
癌が乳癌を含む、本発明1145の方法。
[本発明1147]
本発明1118〜1146のいずれかの方法を実施するための試薬を含むキット。
[本発明1148]
本発明1118〜1146のいずれかの方法を実施するための試薬の使用。
[本発明1149]
試薬が本発明1092〜1110のいずれかのアプタマーを含む、本発明1147のキットまたは本発明1148の使用。
[本発明1150]
試薬が、
（a）微小胞を単離するように構成された試薬であって、任意で、微小胞を単離するように構成された少なくとも一つの該試薬が、微小胞抗原への結合物質、カラム、基体、ろ過ユニット、ポリマー、ポリエチレングリコール、PEG4000、PEG8000、粒子またはビーズを含む、該試薬；
（b）オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドを増幅、配列決定、ハイブリダイズまたは検出するためにプライマーまたはプローブとして働くように構成された少なくとも一つのオリゴヌクレオチド；ならびに
（c）試料から1種または複数種の豊富なタンパク質を除去するように構成された試薬であって、任意で、1種または複数種の豊富なタンパク質が、アルブミン、免疫グロブリン、フィブリノーゲンおよびフィブリンのうち少なくとも1種を含む、該試薬
のうちの少なくとも一つをさらに含む、本発明1149のキットまたは使用。
[本発明1151]
細胞のまたは細胞外の小胞試料を評価するための投入オリゴヌクレオチドライブラリーを含む組成物であって、投入オリゴヌクレオチドライブラリーを生成するための少なくとも二つのサブセットオリゴヌクレオチドライブラリーを含み、少なくとも二つのサブセットオリゴヌクレオチドライブラリーの少なくとも一つが、50％に等しくない全G+C含量（total G and C content）を有するヌクレオチドの量で製造される、組成物。
[本発明1152]
全G+C含量が50％未満である、本発明1151の組成物。
[本発明1153]
全G+C含量が50％超である、本発明1151の組成物。
[本発明1154]
少なくとも一つのサブセットライブラリーが、50％超の全G+C含量で製造され、もう一つのサブセットライブラリーが、50％未満の全G+C含量で製造される、本発明1151の組成物。
[本発明1155]
少なくとも二つのサブセットライブラリーが、それぞれ25％、50％および75％のG+C含量で製造された三つのサブセットライブラリーを含む、本発明1151の組成物。
[本発明1156]
少なくとも二つのサブセットライブラリーが、表13中の少なくとも二つの行に類似する、または等しい量のヌクレオチドで製造される、本発明1151の組成物。
[本発明1157]
ヌクレオチドが、天然のヌクレオチドからなる、本発明1151の組成物。
[本発明1158]
ヌクレオチドが、修飾された天然のヌクレオチドを含む、本発明1151の組成物。
[本発明1159]
ヌクレオチドが、非天然のヌクレオチドを含む、本発明1151の組成物。
[本発明1160]
投入ライブラリーを生成するために少なくとも二つのサブセットライブラリーを接触させる工程を含む、本発明1151〜1159のいずれかの投入ライブラリーを生成する方法。
[本発明1161]
5'トランスポゾンアダプター領域と、トランスポゾンアダプター領域に対して5'に位置する0またはより多くのヌクレオチドを含むオフセット領域と、オフセット領域に対して5'に位置する可変領域と、可変領域に対して5'に位置する左プライマー領域とを含む配列を有するオリゴヌクレオチド。
[本発明1162]
少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、125、150、175、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、2000、3000、4000、5000、6000、7000、8000、9000、10000、20000、30000、40000、50000、60000、70000、80000、90000、100000、200000、300000、400000、500000、106、107、108、109、1010、1011、1012、1013、1014、1015、1016、1017または少なくとも1018個の異なるオリゴヌクレオチド配列を含み、各オリゴヌクレオチド配列が、5'トランスポゾンアダプター領域と、トランスポゾンアダプター領域に対して5'に位置する0またはより多くのヌクレオチドを含むオフセット領域と、オフセット領域に対して5'に位置する可変領域と、可変領域に対して5'に位置する左プライマー領域とを含む、複数のオリゴヌクレオチド。
[本発明1163]
（a）トランスポゾンアダプター領域が20〜40ヌクレオチドを含み；
（b）オフセット領域が0、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10ヌクレオチドを含み；
（c）可変領域が20〜50ヌクレオチドを含み；かつ/または
（d）左プライマー領域が20〜40ヌクレオチドを含む
、本発明1161〜1162のいずれかのオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチド。
[本発明1164]
（a）トランスポゾンアダプター領域が、配列
2016533752.tif 000041
に対して少なくとも約50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99または100％相同である核酸配列を含み；
（b）オフセット領域が、以下の配列：5'-T（SEQ ID NO: 510765）、5'-CT（SEQ ID NO: 510766）および5'-ACT（SEQ ID NO: 510767）の少なくとも一つに対して少なくとも約50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99または100％相同である1、2、3、4、5、6、7、8、9または10ヌクレオチドを含み；
（c）可変領域が15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49または50ヌクレオチドを含み；
（d）可変領域が本発明1151〜1159のいずれかの投入オリゴヌクレオチドライブラリーを含み；かつ/または
（e）左プライマー領域が、SEQ ID NO: 510768および510769から選択される配列に対して少なくとも約50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99または100％相同である核酸配列を含む
、本発明1161〜1163のいずれかのオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチド。
[本発明1165]
本発明1161〜1164のいずれかのオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドを使用してSELEX選択プロセスを実施する工程を含む、アプタマーを同定する方法。
[本発明1166]
選択プロセスが、関心対象の標的に対する少なくとも1ラウンドのポジティブ選択および任意で関心対象の標的以外の標的に対する少なくとも1ラウンドのネガティブ選択を含む、本発明1165の方法。
[本発明1167]
オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドを試料と接触させる工程、および試料中の標的へのオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドの結合の存在またはレベルを検出する工程を含み、任意で、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが本発明1161〜1164のいずれかのものである、方法。
[本発明1168]
試料が、生物学的試料、有機試料、無機試料、組織、細胞培養物、体液、血液、血清、細胞、微小胞、タンパク質複合体、脂質複合体、糖質またはそれらの任意の組み合わせ、部分もしくは変種を含む、本発明1167の方法。
[本発明1169]
標的が、細胞、オルガネラ、タンパク質複合体、リポタンパク質、糖質、微小胞、膜断片、小分子、重金属、毒素または薬物を含む、本発明1167の方法。
[本発明1170]
（a）微小胞を含む生物学的試料をオリゴヌクレオチドプローブライブラリーと接触させる工程であって、オリゴヌクレオチドプローブライブラリーが本発明1161〜1164のいずれかのオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドを含む、工程；
（b）微小胞の少なくとも一部分に結合したオリゴヌクレオチドを同定する工程；および
（c）同定されたオリゴヌクレオチドのプロファイルに基づいて試料を特徴決定する工程
を含む、方法。
[本発明1171]
（a）溶解状態の混合物を形成するために、試料を、少なくとも106、107、108、109、1010、1011、1012、1013、1014、1015、1016、1017または少なくとも1018個の異なるオリゴヌクレオチド配列のオリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチドプローブライブラリーと接触させる工程であって、オリゴヌクレオチドが、試料中の複数の実体に結合して複合体を形成することができ、オリゴヌクレオチドプローブライブラリーが本発明1161〜1164のいずれかのオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドを含む、工程；
（b）工程（a）で形成された複合体を混合物から分割する工程；および
（c）試料に関するオリゴヌクレオチドプロファイルを同定するために、工程（b）で分割された複合体中に存在するオリゴヌクレオチドを検出する工程
を含む、方法。
[本発明1172]
検出する工程が、複合体中のすべてもしくはいくつかのオリゴヌクレオチドの配列決定、複合体中のすべてもしくはいくつかのオリゴヌクレオチドの増幅、および/または複合体中のすべてもしくはいくつかのオリゴヌクレオチドの、アレイへのハイブリダイゼーションを実施する工程を含む、本発明1171の方法。
[本発明1173]
（a）生物学的試験試料を本発明1161〜1164のいずれかのオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドと接触させる工程；
（b）工程（a）で本発明1161〜1164のいずれかのオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドと生物学的試験試料中の標的との間に形成された複合体の存在またはレベルを検出する工程；および
（c）工程（b）で検出された存在またはレベルを、生物学的対照試料からの参照レベルと比較し、それによって疾患または障害を特徴決定する工程
を含む、疾患または障害を特徴決定する方法。
[本発明1174]
検出する工程が、複合体中のすべてもしくはいくつかのオリゴヌクレオチドの配列決定、複合体中のすべてもしくはいくつかのオリゴヌクレオチドの増幅、および/または複合体中のすべてもしくはいくつかのオリゴヌクレオチドの、アレイへのハイブリダイゼーションを実施する工程を含み得る、本発明1173の方法。
[本発明1175]
配列決定がハイスループット配列決定を含む、本発明1174の方法。
[本発明1176]
生物学的試験試料および生物学的対照試料がそれぞれ、組織試料、細胞培養物、または生物学的流体を含む、本発明1173の方法。
[本発明1177]
生物学的流体が体液を含む、本発明1176の方法。
[本発明1178]
体液が、末梢血、血清、血漿、腹水、尿、脳脊髄液（CSF）、痰、唾液、骨髄、滑液、眼房水、羊水、耳垢、母乳、気管支肺胞洗浄液、精液、前立腺液、カウパー腺液もしくは尿道球腺液、女性射精液、汗、糞便、体毛、涙液、嚢胞液、胸膜液および腹膜液、心膜液、リンパ液、糜粥、乳糜、胆汁、間質液、月経分泌物、膿、皮脂、嘔吐物、膣分泌液、粘膜分泌液、水便、膵液、鼻腔からの洗浄液、気管支肺吸引液、胚盤胞腔液、または臍帯血を含む、本発明1177の方法。
[本発明1179]
体液が、血液、血清、または血漿を含む、本発明1177の方法。
[本発明1180]
生物学的流体が微小胞を含む、本発明1176の方法。
[本発明1181]
複合体が、オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドと少なくとも一つの微小胞との間で形成される、本発明1180の方法。
[本発明1182]
生物学的試験試料および生物学的対照試料が、単離された微小胞を含み、任意で、微小胞が、クロマトグラフィー、ろ過、限外ろ過、遠心分離、超遠心分離、フローサイトメトリー、アフィニティー捕捉（たとえば平面、カラムまたはビーズへの）、ポリマー沈殿の少なくとも一つを使用しかつマイクロ流体工学を使用して単離される、本発明1173の方法。
[本発明1183]
オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドがポリペプチドまたはその断片に結合する、本発明1173の方法。
[本発明1184]
ポリペプチドまたはその断片が可溶性または膜結合状態であり、任意で、膜が微小胞膜を含む、本発明1183の方法。
[本発明1185]
ポリペプチドまたはその断片が表3または表4中のバイオマーカーを含む、本発明1184の方法。
[本発明1186]
オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、生物学的試料中の微小胞表面抗原に結合する、本発明1173の方法。
[本発明1187]
疾患または障害が、乳癌、アルツハイマー病、気管支喘息、膀胱移行上皮癌、巨細胞オステオブラストクラストーマ、脳腫瘍、結腸直腸腺癌、慢性閉塞性肺疾患（COPD）、子宮頸部扁平上皮癌、急性心筋梗塞（AMI）/急性心不全、クローン病、II型糖尿病、食道癌、喉頭扁平上皮癌、急性および慢性骨髄白血病、肺癌、悪性リンパ腫、多発性硬化症、卵巣癌、パーキンソン病、前立腺腺癌、乾癬、関節リウマチ、腎細胞癌、皮膚有棘細胞癌、胃腺癌、甲状腺癌、精巣癌、潰瘍性大腸炎または子宮腺癌を含む、本発明1173の方法。
[本発明1188]
疾患または障害が、癌、前癌状態、炎症性疾患、免疫疾患、自己免疫疾患もしくは障害、心血管疾患もしくは障害、神経疾患もしくは障害、感染症、または疼痛を含む、本発明1173の方法。
[本発明1189]
癌が、急性リンパ芽球性白血病；急性骨髄性白血病；副腎皮質癌；AIDS関連癌；AIDS関連リンパ腫；肛門癌；虫垂癌；星状細胞腫；非定型奇形腫様/ラブドイド腫瘍；基底細胞癌；膀胱癌；脳幹神経膠腫；脳腫瘍（脳幹神経膠腫、中枢神経系非定型奇形腫様/ラブドイド腫瘍、中枢神経系胚芽腫、星状細胞腫、頭蓋咽頭腫、上衣芽腫、上衣腫、髄芽腫、髄上皮種、中間型松果体実質腫瘍、テント上原始神経外胚葉性腫瘍、および松果体芽腫を含む）；乳癌；気管支腫瘍；バーキットリンパ腫；原発不明癌；カルチノイド腫瘍；原発不明癌腫；中枢神経系非定型奇形腫様/ラブドイド腫瘍；中枢神経系胚芽腫；子宮頸癌；小児癌；脊索腫；慢性リンパ球性白血病；慢性骨髄性白血病；慢性骨髄増殖性障害；結腸癌；結腸直腸癌；頭蓋咽頭腫；皮膚T細胞リンパ腫；内分泌膵島細胞腫瘍；子宮内膜癌；上衣芽腫；上衣腫；食道癌；鼻腔神経芽細胞腫；ユーイング肉腫；頭蓋外胚細胞腫瘍；性腺外胚細胞腫瘍；肝外胆管癌；胆嚢癌；胃癌；消化管カルチノイド腫瘍；消化管間質細胞腫瘍；消化管間質腫瘍（GIST）；妊娠性絨毛性腫瘍；神経膠腫；毛様細胞性白血病；頭頸部癌；心臓癌；ホジキンリンパ腫；下咽頭癌；眼内黒色腫；膵島腫瘍；カポジ肉腫；腎臓癌；ランゲルハンス細胞組織球症；喉頭癌；口唇癌；肝臓癌；肺癌；悪性線維性組織球腫；骨癌；髄芽腫；髄上皮種；黒色腫；メルケル細胞癌；メルケル細胞皮膚癌；中皮腫；原発不明転移性扁平上皮性頸部癌；口腔癌；多発性内分泌腫瘍症候群；多発性骨髄腫；多発性骨髄腫/形質細胞腫瘍；菌状息肉腫；骨髄異形成症候群；骨髄増殖性腫瘍；鼻腔癌；鼻咽頭癌；神経芽細胞腫；非ホジキンリンパ腫；非黒色腫皮膚癌；非小細胞肺癌；口腔癌；口腔癌；口腔咽頭癌；骨肉腫；その他の脳および脊髄の腫瘍；卵巣癌；卵巣上皮癌；卵巣胚細胞腫瘍；卵巣低悪性度腫瘍；膵臓癌；乳頭腫症；副鼻腔癌；副甲状腺癌；骨盤癌；陰茎癌；咽頭癌；中間型松果体実質腫瘍；松果体芽腫；下垂体腫瘍；形質細胞腫瘍/多発性骨髄腫；胸膜肺芽腫；原発性中枢神経系（CNS）リンパ腫；原発性肝細胞肝癌；前立腺癌；直腸癌；腎臓癌；腎細胞（腎臓）癌；腎細胞癌；気道癌；網膜芽細胞腫；横紋筋肉腫；唾液腺癌；セザリー症候群；小細胞肺癌；小腸癌；軟部組織肉腫；扁平上皮癌；扁平上皮性頸部癌；胃癌；テント上原始神経外胚葉性腫瘍；T細胞リンパ腫；精巣癌；咽喉癌；胸腺癌；胸腺腫；甲状腺癌；移行上皮癌；腎盂尿管移行上皮癌；絨毛性腫瘍；尿管癌；尿道癌；子宮癌；子宮肉腫；膣癌；外陰癌；ワルデンシュトレームマクログロブリン血症；またはウィルムス腫瘍を含む、本発明1188の方法。
[本発明1190]
前癌状態がバレット食道を含む、本発明1188の方法。
[本発明1191]
自己免疫疾患が、炎症性腸疾患（IBD）、クローン病（CD）、潰瘍性大腸炎（UC）、骨盤炎症、血管炎、乾癬、糖尿病、自己免疫性肝炎、多発性硬化症、重症筋無力症、I型糖尿病、関節リウマチ、乾癬、全身性エリテマトーデス（SLE）、橋本甲状腺炎、グレーブス病、強直性脊椎炎、シェーグレン病、CREST症候群、強皮症、リウマチ性疾患、臓器拒絶反応、原発性硬化性胆管炎、または敗血症を含む、本発明1188の方法。
[本発明1192]
心血管疾患が、アテローム性動脈硬化症、うっ血性心不全、不安定プラーク、脳卒中、虚血、高血圧症、狭窄症、血管閉塞、または血栓性イベントを含む、本発明1188の方法。
[本発明1193]
神経疾患が、多発性硬化症（MS）、パーキンソン病（PD）、アルツハイマー病（AD）、統合失調症、双極性障害、うつ病、自閉症、プリオン病、ピック病、認知症、ハンチントン病（HD）、ダウン症候群、脳血管疾患、ラズムッセン脳炎、ウイルス性髄膜炎、神経精神全身性エリテマトーデス（NPSLE）、筋萎縮性側索硬化症、クロイツフェルト-ヤコブ病、ゲルストマン・ストロイスラー・シャインカー病、伝達性海綿状脳症、虚血再灌流傷害（例えば脳卒中）、脳損傷、微生物感染、または慢性疲労症候群を含む、本発明1188の方法。
[本発明1194]
疼痛が、線維筋痛症、慢性神経因性疼痛、または末梢性神経因性疼痛を含む、本発明1188の方法。
[本発明1195]
感染症が、細菌感染、ウイルス感染、酵母菌感染、ウィップル病、プリオン病、肝硬変、メチシリン耐性黄色ブドウ球菌、HIV、HCV、肝炎、梅毒、髄膜炎、マラリア、結核、インフルエンザを含む、本発明1188の方法。
[本発明1196]
本発明1165〜1195のいずれかの方法を実施するための試薬を含むキット。
[本発明1197]
本発明1165〜1195のいずれかの方法を実施するための試薬の使用。
[本発明1198]
試薬がオリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドを含む、本発明1196のキットまたは本発明1197の使用。
[本発明1199]
オリゴヌクレオチドまたは複数のオリゴヌクレオチドが、本発明1151〜1159または1161〜1164のいずれかのオリゴヌクレオチドまたはライブラリーに由来するオリゴヌクレオチドの少なくとも一つを含む、本発明1198のキットまたは使用。