【手続補正書】
【提出日】平成29年10月25日(2017.10.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
非天然メタン生成古細菌であって、調節解除されたアスパルトキナーゼを発現し、前記調節解除されたアスパルトキナーゼは、任意選択で過剰発現され、（ａ）リジン、トレオニンおよびメチオニンのうちの１つまたはそれを超えるものによるフィードバック阻害に対して耐性の調節解除された内因性アスパルトキナーゼ突然変異体酵素、または（ｂ）リジン、トレオニンおよびメチオニンのうちの１つまたはそれを超えるものによるフィードバック阻害に対して耐性の調節解除された外因性アスパルトキナーゼ突然変異体から選択され、前記非天然メタン生成古細菌は、Ｈ２／ＣＯｘ基質を代謝して、親メタン生成古細菌よりも高レベルで１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸を産生する、非天然メタン生成古細菌。
【請求項２】
前記調節解除されたアスパルトキナーゼ突然変異体酵素が、残基Ｉ２７２、Ｄ２７４、Ｇ２７７、Ｅ２７８、Ａ２７９、Ｆ２８３、Ｉ２９１、Ｉ２９３、Ｄ２９４、Ｑ２９８、Ｎ２９９、Ｓ３０１、Ｓ３０２、Ｔ３０８、Ｔ３１１、Ｔ３６１、Ｔ３３６、Ｇ３５９、Ｆ３６４、Ｍ３６５、Ｎ３７２、Ｎ３７４、Ｉ３７５、Ｔ３８０、Ｓ３８１、Ｅ３８２、Ｒ３８４、Ｓ３８６に対応する突然変異またはそれらの任意の組み合わせを含む突然変異体ｌｙｓＣ遺伝子によってコードされ、ここで、前記残基ナンバリングが、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍ  ＡＴＣＣ１３０３２のｌｙｓＣによってコードされる残基位置に対応する、請求項１に記載の非天然メタン生成古細菌。
【請求項３】
前記調節解除されたアスパルトキナーゼ突然変異体酵素が、残基Ｉ２９１、Ｉ２９３、Ｄ２９４、Ｔ３６１、Ｓ３８１、Ｅ３８２に対応する突然変異またはそれらの任意の組み合わせを含む突然変異体ｌｙｓＣ遺伝子によってコードされ、ここで、前記残基ナンバリングが、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍ  ＡＴＣＣ１３０３２のｌｙｓＣによってコードされる残基位置に対応する、請求項１に記載の非天然メタン生成古細菌。
【請求項４】
前記調節解除されたアスパルトキナーゼ突然変異体酵素が、残基Ｆ２８３、Ｎ２９９、Ｓ３０１、Ｓ３０２、Ｔ３０８、Ｔ３１１、Ｔ３３６、Ｇ３５９、Ｆ３６４、Ｍ３６５、Ｔ３８０、Ｒ３８４、Ｓ３８６に対応する突然変異またはそれらの任意の組み合わせを含む突然変異体ｌｙｓＣ遺伝子によってコードされ、ここで、前記残基ナンバリングが、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍ  ＡＴＣＣ１３０３２のｌｙｓＣによってコードされる残基位置に対応する、請求項１に記載の非天然メタン生成古細菌。
【請求項５】
前記内因性または外因性の調節解除されたアスパルトキナーゼ突然変異体酵素が、Ｍ．ｍａｒｉｐａｌｕｄｉｓのＬｙｓＣタンパク質に対して７５％またはそれを超える同一性を有する、請求項１に記載の非天然メタン生成古細菌。
【請求項６】
アスパルトキナーゼ、アスパルチルセミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、ジヒドロジピコリン酸シンターゼ、ジヒドロジピコリン酸レダクターゼ、ＬＬ−ジアミノピメリン酸アミノトランスフェラーゼ、ジアミノピメリン酸エピメラーゼ、メソ−ジアミノピメリン酸デヒドロゲナーゼ、ジアミノピメリン酸デカルボキシラーゼまたはそれらの任意の組み合わせから選択される、１つまたはそれを超えるポリペプチドをコードする外因性核酸分子をさらに含み、前記親メタン生成古細菌よりも高レベルでリジンを産生し、
前記外因性核酸分子がジヒドロジピコリン酸シンターゼをコードする場合、ジヒドロジピコリン酸シンターゼが任意選択で過剰発現され、
任意選択で、（ａ）トレオニン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有し、かつ／または
（ｂ）メチオニン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、
請求項１〜５のいずれか一項に記載の非天然メタン生成古細菌。
【請求項７】
アスパルトキナーゼ、アスパルチルセミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、ホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンキナーゼ、トレオニンシンターゼまたはそれらの任意の組み合わせから選択される、１つまたはそれを超えるポリペプチドをコードする外因性核酸分子をさらに含み、前記親メタン生成古細菌よりも高レベルでトレオニンを産生し、
前記外因性核酸分子がホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンキナーゼまたはそれらの両方をコードする場合、前記ホモセリンデヒドロゲナーゼおよび／またはホモセリンキナーゼが任意選択で過剰発現され、かつ／または調節解除され、
任意選択で、（ａ）リジン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有し、かつ／または
（ｂ）メチオニン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有し、かつ／または
（ｃ）イソロイシン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有し、または
グリシン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、
請求項１〜５のいずれか一項に記載の非天然メタン生成古細菌。
【請求項８】
アスパルトキナーゼ、アスパルチルセミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、ホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンＯ−アセチルトランスフェラーゼ、ホモセリンＯ−トランススクシニルトランスフェラーゼ、Ｏ−スクシニルホモセリンリアーゼ、シスタチオニンγ−シンターゼ、シスタチオニンβ−リアーゼ、Ｏ−アセチルホモセリンスルフヒドリラーゼ、ホモシステインＳ−メチルトランスフェラーゼ、メチオニンシンターゼ（コバラミン依存性または非依存性）またはそれらの任意の組み合わせから選択される、１つまたはそれを超えるポリペプチドをコードする外因性核酸分子をさらに含み、前記親メタン生成古細菌よりも高レベルでメチオニンを産生し、
前記外因性核酸分子がホモセリンデヒドロゲナーゼ、セリンアセチルトランスフェラーゼまたはそれらの両方をコードする場合、前記ホモセリンデヒドロゲナーゼおよび／またはセリンアセチルトランスフェラーゼが任意選択で過剰発現され、かつ／または調節解除され、
前記外因性核酸分子がＯ−アセチルトランスフェラーゼ、Ｏ−アセチルホモセリンスルフヒドリラーゼまたはそれらの両方をコードする場合、前記Ｏ−アセチルトランスフェラーゼおよび／またはＯ−アセチルホモセリンスルフヒドリラーゼが任意選択で過剰発現され、かつ／または調節解除され、
任意選択で、（ａ）リジン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有し、かつ／または
（ｂ）トレオニン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、
請求項１〜５のいずれか一項に記載の非天然メタン生成古細菌。
【請求項９】
（ａ）低いホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性、高いピルビン酸キナーゼ活性またはそれらの両方、および／または
（ｂ）高いピルビン酸カルボキシラーゼ活性、高いピルビン酸シンターゼ、高いアセチル−ＣｏＡシンターゼ、高いアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ活性またはそれらの任意の組み合わせ
を有する、請求項１〜８のいずれか一項に記載の非天然メタン生成古細菌。
【請求項１０】
前記メタン生成古細菌がシトクロムを産生しない、請求項１〜９のいずれか一項に記載の非天然メタン生成古細菌。
【請求項１１】
前記メタン生成古細菌がシトクロムを産生する、請求項１〜９のいずれか一項に記載の非天然メタン生成古細菌。
【請求項１２】
１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸のエクスポーターを発現または過剰発現し、任意選択で前記エクスポーターが、外因性核酸によってコードされる、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の非天然メタン生成古細菌。
【請求項１３】
アスパラギン酸経路アミノ酸を生産するための方法であって、１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸を産生するために十分な時間にわたって、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の非天然メタン生成古細菌を培養することを含む、方法。
【請求項１４】
前記アスパラギン酸経路アミノ酸が、メチオニン、リジンまたはトレオニンである、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
アスパラギン酸経路アミノ酸を生産するためのシステムであって、
（ａ）Ｈ２／ＣＯｘ基質を含むガスの供給源；
（ｂ）請求項１〜１２のいずれか一項に記載の非天然メタン生成古細菌を含むバイオリアクター；および
（ｃ）前記バイオリアクターへの前記ガスの流入を可能にするように、前記ガス供給源と前記バイオリアクターとの間に配置されたコネクター
を含み、
前記非天然メタン生成古細菌が、親メタン生成古細菌と比較して、前記Ｈ２／ＣＯｘ基質を代謝して１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸を過剰産生し、
前記バイオリアクターが、任意選択で液相バイオリアクター、気泡塔バイオリアクターまたはトリクルベッドバイオリアクターであり、
前記Ｈ２／ＣＯｘ基質が、任意選択で合成ガスまたは水性ガスシフト合成ガスである、システム。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１１】
さらなる態様では、本開示は、アスパラギン酸経路アミノ酸を生産するためのシステムであって、Ｈ２／ＣＯｘ基質を含むガスの供給源；（ａ）親水素資化微生物と比較して高い活性を有する１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路酵素を発現し；（ｂ）１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路酵素を過剰発現し；または（ｃ）１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路酵素についての改変された調節を含む、本開示の非天然または組換え水素資化微生物のいずれか１つまたはそれを超えるものを含むバイオリアクター；および前記バイオリアクターへの前記ガスの流入を可能にするように、前記ガス供給源と前記バイオリアクターとの間に配置されたコネクターを含み、前記非天然水素資化微生物が、親水素資化微生物と比較して、前記Ｈ２／ＣＯｘ基質を代謝して１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸（例えば、リジン、トレオニン、メチオニン）を過剰産生するシステムを提供する。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
非天然水素資化微生物であって、調節解除された内因性アスパルトキナーゼ活性を発現し、Ｈ２／ＣＯｘ基質を代謝して、親水素資化微生物よりも高レベルで１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸を産生する、非天然水素資化微生物。
（項目２）
前記調節解除された内因性アスパルトキナーゼ活性が、リジン、トレオニンおよびメチオニンのうちの１つまたはそれを超えるものによるフィードバック阻害に対して耐性のアスパルトキナーゼ突然変異体である、項目１に記載の非天然水素資化微生物。
（項目３）
前記調節解除された内因性アスパルトキナーゼ活性が、自然突然変異、ランダム突然変異、部位特異的突然変異またはそれらの任意の組み合わせをそれぞれが含む突然変異体ｔｈｒＡ遺伝子、ｍｅｔＬ遺伝子、ｌｙｓＣ遺伝子またはそれらの組み合わせによってコードされる、項目１または２に記載の非天然水素資化微生物。
（項目４）
前記調節解除された内因性アスパルトキナーゼ活性が、トレオニン結合部位において突然変異を含む突然変異体ｌｙｓＣ遺伝子によってコードされる、項目１〜３のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目５）
前記トレオニン結合部位の突然変異が、残基Ｉ２７２、Ｄ２７４、Ｇ２７７、Ｅ２７８、Ａ２７９、Ｄ２９４、Ｑ２９８、Ｎ３７２、Ｎ３７４、Ｉ３７５またはそれらの任意の組み合わせにあり、前記残基ナンバリングが、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍ  ＡＴＣＣ１３０３２のｌｙｓＣによってコードされる残基位置に対応する、項目４に記載の非天然水素資化微生物。
（項目６）
前記調節解除された内因性アスパルトキナーゼ活性が、リジン結合部位において突然変異を含む突然変異体ｌｙｓＣ遺伝子によってコードされる、項目１〜３のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目７）
前記リジン結合部位の突然変異が、残基Ｉ２９１、Ｉ２９３、Ｄ２９４、Ｔ３６１、Ｓ３８１、Ｅ３８２またはそれらの任意の組み合わせにあり、前記残基ナンバリングが、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍ  ＡＴＣＣ１３０３２のｌｙｓＣによってコードされる残基位置に対応する、項目６に記載の非天然水素資化微生物。
（項目８）
前記調節解除された内因性アスパルトキナーゼ活性が、リジンおよびトレオニン結合部位において突然変異を含む突然変異体ｌｙｓＣ遺伝子によってコードされる、項目１〜３のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目９）
前記リジンおよびトレオニン結合部位の突然変異が残基Ｄ２９４にあり、前記残基ナンバリングが、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍ  ＡＴＣＣ１３０３２のｌｙｓＣによってコードされる残基位置に対応する、項目８に記載の非天然水素資化微生物。
（項目１０）
前記調節解除された内因性アスパルトキナーゼ活性が、リジンまたはトレオニン結合部位以外の部位において突然変異を含む突然変異体ｌｙｓＣ遺伝子によってコードされる、項目１〜３のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目１１）
前記リジンおよびトレオニン結合部位以外の部位の突然変異が、残基Ｆ２８３、Ｎ２９９、Ｓ３０１、Ｓ３０２、Ｔ３０８、Ｔ３１１、Ｔ３３６、Ｇ３５９、Ｆ３６４、Ｍ３６５、Ｔ３８０、Ｒ３８４、Ｓ３８６またはそれらの任意の組み合わせにあり、前記残基ナンバリングが、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍ  ＡＴＣＣ１３０３２のｌｙｓＣによってコードされる残基位置に対応する、項目１０に記載の非天然水素資化微生物。
（項目１２）
リジン生合成経路からの１つまたはそれを超えるポリペプチドをコードする第１の外因性核酸分子をさらに含み、前記親水素資化微生物よりも高レベルでリジンを産生する、項目１〜１１のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目１３）
前記リジン生合成経路からの１つまたはそれを超えるポリペプチドが、アスパルトキナーゼ、アスパルチルセミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、ジヒドロジピコリン酸シンターゼ、ジヒドロジピコリン酸レダクターゼ、ＬＬ−ジアミノピメリン酸アミノトランスフェラーゼ、ジアミノピメリン酸エピメラーゼ、ジアミノピメリン酸デカルボキシラーゼまたはそれらの任意の組み合わせから選択される、項目１２に記載の非天然水素資化微生物。
（項目１４）
前記リジン生合成経路からの１つまたはそれを超えるポリペプチドが、アスパルトキナーゼ、アスパルチルセミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、ジヒドロジピコリン酸シンターゼ、ジヒドロジピコリン酸レダクターゼ、メソ−ジアミノピメリン酸デヒドロゲナーゼ、ジアミノピメリン酸デカルボキシラーゼまたはそれらの任意の組み合わせから選択される、項目１２に記載の非天然水素資化微生物。
（項目１５）
前記第１の外因性核酸分子がジヒドロジピコリン酸シンターゼをコードする、項目１２〜１４のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目１６）
前記ジヒドロジピコリン酸シンターゼが過剰発現されている、項目１５に記載の非天然水素資化微生物。
（項目１７）
トレオニン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目１２〜１６のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目１８）
メチオニン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目１２〜１７のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目１９）
ホモセリンデヒドロゲナーゼをコードする核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性のホモセリンデヒドロゲナーゼ突然変異体をコードする、項目１７または１８に記載の非天然水素資化微生物。
（項目２０）
前記外因性核酸分子が、前記非天然水素資化微生物のゲノムに組み込まれている、項目１２〜１９のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目２１）
前記外因性核酸分子が、前記非天然水素資化微生物内の自己複製ベクター中にある、項目１２〜１９のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目２２）
ホモセリン栄養要求体、メチオニン栄養要求体、トレオニン栄養要求体またはそれらの任意の組み合わせである、項目１２〜２１のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目２３）
トレオニン生合成経路からの１つまたはそれを超えるポリペプチドをコードする第１の外因性核酸分子をさらに含み、前記親水素資化微生物よりも高レベルでトレオニンを産生する、項目１〜１１のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目２４）
前記トレオニン生合成経路からの１つまたはそれを超えるポリペプチドが、アスパルトキナーゼ、アスパルチルセミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、ホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンキナーゼ、トレオニンシンターゼまたはそれらの任意の組み合わせから選択される、項目２３に記載の非天然水素資化微生物。
（項目２５）
前記第１の外因性核酸分子が、ホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンキナーゼまたはそれらの両方をコードする、項目２３に記載の非天然水素資化微生物。
（項目２６）
前記ホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンキナーゼまたはそれらの両方が過剰発現されている、項目２５に記載の非天然水素資化微生物。
（項目２７）
前記ホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンキナーゼまたはそれらの両方が調節解除されている、項目２５または２６に記載の非天然水素資化微生物。
（項目２８）
リジン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目２３〜２７のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目２９）
メチオニン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目２３〜２８のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目３０）
イソロイシン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目２３〜２９のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目３１）
グリシン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目２３〜２９のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目３２）
ホモセリンＯ−アセチルトランスフェラーゼ、ジヒドロジピコリン酸シンターゼ、トレオニンデヒドラターゼ、トレオニンアルドラーゼ、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼまたはそれらの任意の組み合わせをコードするリジンまたはイソロイシン生合成経路核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性のホモセリンＯ−アセチルトランスフェラーゼ突然変異体、ジヒドロジピコリン酸シンターゼ突然変異体、トレオニンデヒドラターゼ突然変異体、トレオニンアルドラーゼ突然変異体、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ突然変異体もしくはそれらの任意の組み合わせをコードする、項目２８〜３１のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目３３）
前記外因性核酸分子が、前記非天然水素資化微生物のゲノムに組み込まれている、項目２３〜３２のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目３４）
前記外因性核酸分子が、前記非天然水素資化微生物内の自己複製ベクター中にある、項目２３〜３２のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目３５）
リジン栄養要求体、メチオニン栄養要求体、イソロイシン栄養要求体、グリシン栄養要求体またはそれらの任意の組み合わせである、項目２３〜３４のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目３６）
メチオニン生合成経路からの１つまたはそれを超えるポリペプチドをコードする第１の外因性核酸分子をさらに含み、前記親水素資化微生物よりも高レベルでメチオニンを産生する、項目１〜１１のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目３７）
前記メチオニン生合成経路からの１つまたはそれを超えるポリペプチドが、アスパルトキナーゼ、アスパルチルセミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、ホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンＯ−アセチルトランスフェラーゼ、ホモセリンＯ−トランススクシニルトランスフェラーゼ、Ｏ−スクシニルホモセリンリアーゼ、シスタチオニンγ−シンターゼ、シスタチオニンβ−リアーゼ、Ｏ−アセチルホモセリンスルフヒドリラーゼ、ホモシステインＳ−メチルトランスフェラーゼ、メチオニンシンターゼ（コバラミン依存性または非依存性）またはそれらの任意の組み合わせから選択される、項目３６に記載の非天然水素資化微生物。
（項目３８）
前記第１の外因性核酸分子が、ホモセリンデヒドロゲナーゼ、セリンアセチルトランスフェラーゼもしくはそれらの両方をコードするか、または前記第１の外因性核酸分子が、ホモセリンＯ−アセチルトランスフェラーゼ、Ｏ−アセチルホモセリンスルフヒドリラーゼもしくはそれらの両方をコードする、項目３６に記載の非天然水素資化微生物。
（項目３９）
前記ホモセリンデヒドロゲナーゼ、セリンアセチルトランスフェラーゼもしくはそれらの両方が過剰発現されているか、または前記ホモセリンＯ−アセチルトランスフェラーゼ、Ｏ−アセチルホモセリンスルフヒドリラーゼもしくはそれらの両方が過剰発現されている、項目３８に記載の非天然水素資化微生物。
（項目４０）
前記ホモセリンデヒドロゲナーゼ、セリンアセチルトランスフェラーゼもしくはそれらの両方が調節解除されているか、または前記ホモセリンＯ−アセチルトランスフェラーゼ、Ｏ−アセチルホモセリンスルフヒドリラーゼもしくはそれらの両方が調節解除されている、項目３８または３９に記載の非天然水素資化微生物。
（項目４１）
リジン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目３６〜４０のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目４２）
トレオニン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目３６〜４１のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目４３）
ジヒドロジピコリン酸シンターゼ、トレオニンデヒドラターゼ、トレオニンアルドラーゼ、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼまたはそれらの任意の組み合わせをコードする核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性のジヒドロジピコリン酸シンターゼ突然変異体、トレオニンデヒドラターゼ突然変異体、トレオニンアルドラーゼ突然変異体、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ突然変異体もしくはそれらの任意の組み合わせをコードする、項目４１または４２に記載の非天然水素資化微生物。
（項目４４）
前記外因性核酸分子が、前記非天然水素資化微生物のゲノムに組み込まれている、項目３６〜４３のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目４５）
前記外因性核酸分子が、前記非天然水素資化微生物内の自己複製ベクター中にある、項目３６〜４３のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目４６）
リジン栄養要求体、トレオニン栄養要求体またはそれらの両方である、項目３６〜４５のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目４７）
低いホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性、高いピルビン酸キナーゼ活性またはそれらの両方を有する、項目１〜４６のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目４８）
高いピルビン酸カルボキシラーゼ活性、高いピルビン酸シンターゼ、高いアセチル−ＣｏＡシンターゼ、高いアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ活性またはそれらの任意の組み合わせを有する、項目１〜４７のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目４９）
前記Ｈ２／ＣＯｘ基質が、Ｈ２、ＣＯおよびＣＯ２である、項目１〜４８のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目５０）
前記Ｈ２／ＣＯｘ基質が、合成ガスまたは水性ガスシフト合成ガスである、項目１〜４９のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目５１）
ＣＯ２とＨ２との比が、それぞれ約１：５０〜約１０：１の範囲である、項目４９または５０に記載の非天然水素資化微生物。
（項目５２）
ＣＯ２とＨ２との比が、それぞれ約１：２〜約１：４の範囲である、項目４９または５０に記載の非天然水素資化微生物。
（項目５３）
ＣＯの総量が約１％以下である、項目４９〜５２のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目５４）
細菌である、項目１〜５３のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目５５）
前記細菌が合成ガス代謝細菌である、項目５４に記載の非天然水素資化微生物。
（項目５６）
前記合成ガス代謝細菌が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ、Ｍｏｏｒｅｌｌａ、Ｐｙｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｄｅｓｕｌｆｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｃａｒｂｏｘｙｄｏｔｈｅｒｍｕｓ、Ａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ａｃｅｔｏａｎａｅｒｏｂｉｕｍ、Ｂｕｔｙｒｉｂａｃｅｔｅｒｉｕｍ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓまたはそれらの任意の組み合わせから選択される、項目５５に記載の非天然水素資化微生物。
（項目５７）
前記合成ガス代謝細菌が、Ｂｕｔｙｒｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｍｅｔｈｙｌｏｔｒｏｐｈｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ａｕｔｏｅｔｈａｎｏｇｅｎｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｊｕｎｇｄａｈｌｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｒａｇｓｄａｌｅｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃａｒｂｏｘｙｄｉｖｏｒａｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｗｏｏｄｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｅｏｐｒｏｐａｎｏｌｏｇｅｎまたはそれらの任意の組み合わせから選択される、項目５５に記載の非天然水素資化微生物。
（項目５８）
前記細菌が水素酸化細菌である、項目５４に記載の非天然水素資化微生物。
（項目５９）
前記水素酸化細菌が、Ｃｕｐｒｉａｖｉｄｕｓ  ｎｅｃａｔｏｒ、Ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｂａｃｔｅｒ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ、Ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｖｉｂｒｉｏ  ｍａｒｉｎｕｓまたはＨｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉである、項目５８に記載の非天然水素資化微生物。
（項目６０）
メタン生成古細菌である、項目１〜５３のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目６１）
前記メタン生成古細菌が、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ、Ｍｅｔｈａｎｏｃａｌｃｕｌｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃａｌｄｏｃｏｃｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｅｌｌａ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｏｉｄｅｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｒｐｕｓｃｕｌｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｕｌｌｅｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｆｏｌｌｉｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｇｅｎｉｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｈａｌｏｂｉｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｈａｌｏｐｈｉｌｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｌａｃｉｎｉａ、Ｍｅｔｈａｎｏｌｏｂｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｍｅｔｈｙｌｏｖｏｒａｎｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｍｉｃｒｏｂｉｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｐｌａｎｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｐｙｒｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｒｅｇｕｌａ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｅｔａ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｌｓｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ、Ｍｅｔｈａｎｏｓｐｈａｅｒａ、Ｍｅｔｈａｎｏｓｐｉｒｉｌｌｉｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｂａｃｔｅｒ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｃｏｃｃｕｓ、ＭｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｕｓまたはＭｅｔｈａｎｏｔｏｒｒｉｓから選択される、項目６０に記載の非天然水素資化微生物。
（項目６２）
前記メタン生成古細菌が、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｌｃａｌｉｐｈｉｌｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｙａｎｔｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｃｏｎｇｏｌｅｎｓｅ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｅｆｌｕｖｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｅｓｐａｎｏｌａｅ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｆｏｒｍｉｃｉｃｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｖａｎｏｖｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐａｌｕｓｔｒｅ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｈｅｒｍａｇｇｒｅｇａｎｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｕｌｉｇｉｎｏｓｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ａｃｉｄｉｄｕｒａｎｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ａｒｂｏｒｉｐｈｉｌｉｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ｇｏｔｔｓｃｈａｌｋｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ｏｌｌｅｙａｅ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ｒｕｍｉｎａｎｔｉｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ｓｍｉｔｈｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ｗｏｅｓｅｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ｗｏｌｉｎｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｅｌｌａ  ａｒｖｏｒｙｚａｅ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｅｌｌａ  ｃｏｎｒａｄｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｅｌｌａ  ｐａｌｕｄｉｃｏｌａ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｂａｃｔｅｒ  ｍａｒｂｕｒｇｅｎｓｉｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｂａｃｔｅｒ  ｔｈｅｒｍａｕｔｏｔｒｏｐｈｉｃｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｂａｃｔｅｒ  ｔｈｅｒｍｏｆｌｅｘｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｂａｃｔｅｒ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｂａｃｔｅｒ  ｗｏｌｆｅｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｕｓ  ｓｏｃｉａｂｉｌｉｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｒｐｕｓｃｕｌｕｍ  ｂａｖａｒｉｃｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｒｐｕｓｃｕｌｕｍ  ｐａｒｖｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｕｌｌｅｕｓ  ｃｈｉｋｕｏｅｎｓｉｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｕｌｌｅｕｓ  ｓｕｂｍａｒｉｎｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｇｅｎｉｕｍ  ｆｒｉｇｉｄｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｇｅｎｉｕｍ  ｌｉｍｉｎａｔａｎｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｇｅｎｉｕｍ  ｍａｒｉｎｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｂｌａｔｔｉｃｏｌａ、Ｍｅｔｈａｎｏｐｌａｎｕｓ  ｅｎｄｏｓｙｍｂｉｏｓｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｐｌａｎｕｓ  ｌｉｍｉｃｏｌａ、Ｍｅｔｈａｎｏｐｌａｎｕｓ  ｐｅｔｒｏｌｅａｒｉｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｐｙｒｕｓ  ｋａｎｄｌｅｒｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｒｅｇｕｌａ  ｂｏｏｎｅｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｅｔａ  ｃｏｎｃｉｌｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｅｔａ  ｈａｒｕｎｄｉｎａｃｅａ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｅｔａ  ｐｅｌａｇｉｃａ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｅｔａ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌａ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ａｃｅｔｉｖｏｒａｎｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ｂａｒｋｅｒｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ｍａｚｅｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌａ、Ｍｅｔｈａｎｏｍｉｃｒｏｂｉｕｍ  ｍｏｂｉｌｅ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ  ａｅｏｌｉｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｍａｒｉｐａｌｕｄｉｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｖａｎｎｉｅｌｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｖｏｌｔａｅ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｌｉｔｈｏｔｒｏｐｈｉｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｐｙｒｕｓ  ｋａｎｄｌｅｒｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｂａｃｔｅｒ  ｔｈｅｒｍｏａｕｔｏｔｒｏｉｐｈｉｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃａｌｄｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｖｅｎｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃａｌｄｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｄｉｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃａｌｄｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｆｅｒｎｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃａｌｄｏｃｏｃｃｕｓ  ｊａｎｎａｓｃｈｉｉおよびＭｅｔｈａｎｏｃａｌｄｏｃｏｃｃｕｓ  ｖｕｌｃａｎｉｕｓからなる群より選択される、項目６１に記載の非天然水素資化微生物。
（項目６３）
前記メタン生成古細菌がシトクロムを産生しない、項目６０〜６２のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目６４）
シトクロムを産生しない前記メタン生成古細菌が、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｍａｒｉｐａｌｕｄｉｓまたはＭｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｖａｎｎｉｅｌｉｉである、項目６３に記載の非天然水素資化微生物。
（項目６５）
前記メタン生成古細菌がシトクロムを産生する、項目６０〜６２のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目６６）
シトクロムを産生する前記メタン生成古細菌が、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ｂａｒｋｅｒｉまたはＭｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ｍａｚｅｉである、項目６５に記載の非天然水素資化微生物。
（項目６７）
１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸のエクスポーターを発現または過剰発現する、項目１〜６６のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目６８）
１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸のエクスポーターをコードする外因性核酸分子をさらに含む、項目１〜６７のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物。
（項目６９）
前記エクスポーターがｒｈｔＡまたはｌｙｓＥ遺伝子である、項目６７または６８に記載の非天然水素資化微生物。
（項目７０）
アスパルトキナーゼ活性を有するポリペプチドをコードする第１の外因性核酸分子を含む組換え水素資化微生物であって、Ｈ２／ＣＯｘ基質を同化して、非遺伝子改変親水素資化微生物よりも高レベルで１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸を産生することができる、組換え水素資化微生物。
（項目７１）
調節解除された内因性アスパルトキナーゼ活性を発現する、項目７０に記載の組換え水素資化微生物。
（項目７２）
前記調節解除された内因性アスパルトキナーゼ活性が、リジン、トレオニンおよびメチオニンのうちの１つまたはそれを超えるものによるフィードバック阻害に対して耐性のアスパルトキナーゼ突然変異体である、項目７１に記載の組換え水素資化微生物。
（項目７３）
アスパルトキナーゼ活性を有するポリペプチドをコードする前記核酸分子が、調節解除されたアスパルトキナーゼ突然変異体をコードする、項目７０〜７２のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目７４）
前記調節解除されたアスパルトキナーゼ突然変異体が、リジン、トレオニンおよびメチオニンのうちの１つまたはそれを超えるものによるフィードバック阻害に対して耐性である、項目７０〜７２のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目７５）
前記核酸分子が、アスパルトキナーゼ活性を有するポリペプチドを過剰発現する、項目７０〜７４のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目７６）
前記外因性、内因性もしくはそれらの両方のアスパルトキナーゼ活性が突然変異体ｌｙｓＣ遺伝子によって個別にコードされるか、または前記外因性アスパルトキナーゼ活性が、自然突然変異、ランダム突然変異、部位特異的突然変異もしくはそれらの任意の組み合わせをそれぞれが含む突然変異体ｔｈｒＡ遺伝子、ｍｅｔＬ遺伝子、ｌｙｓＣ遺伝子もしくはそれらの組み合わせによって個別にコードされる、項目７０〜７５のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目７７）
前記外因性、内因性またはそれらの両方のアスパルトキナーゼ活性が、トレオニン結合部位において突然変異を含む突然変異体ｌｙｓＣ遺伝子によってコードされる、項目７０〜７６のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目７８）
前記トレオニン結合部位の突然変異が、残基Ｉ２７２、Ｄ２７４、Ｇ２７７、Ｅ２７８、Ａ２７９、Ｄ２９４、Ｑ２９８、Ｎ３７２、Ｎ３７４、Ｉ３７５またはそれらの任意の組み合わせにあり、前記残基ナンバリングが、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍ  ＡＴＣＣ１３０３２のｌｙｓＣによってコードされる残基位置に対応する、項目７７に記載の組換え水素資化微生物。
（項目７９）
前記外因性、内因性またはそれらの両方のアスパルトキナーゼ活性が、リジン結合部位において突然変異を含む突然変異体ｌｙｓＣ遺伝子によって個別にコードされる、項目７０〜７６のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目８０）
前記リジン結合部位の突然変異が、残基Ｉ２９１、Ｉ２９３、Ｄ２９４、Ｔ３６１、Ｓ３８１、Ｅ３８２またはそれらの任意の組み合わせにあり、前記残基ナンバリングが、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍ  ＡＴＣＣ１３０３２のｌｙｓＣによってコードされる残基位置に対応する、項目７９に記載の組換え水素資化微生物。
（項目８１）
前記外因性、内因性またはそれらの両方のアスパルトキナーゼ活性が、リジンおよびトレオニン結合部位において突然変異を含む突然変異体ｌｙｓＣ遺伝子によって個別にコードされる、項目７０〜７６のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目８２）
前記リジンおよびトレオニン結合部位の突然変異が残基Ｄ２９４にあり、前記残基ナンバリングが、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍ  ＡＴＣＣ１３０３２のｌｙｓＣによってコードされる残基位置に対応する、項目８１に記載の組換え水素資化微生物。
（項目８３）
前記外因性、内因性またはそれらの両方のアスパルトキナーゼ活性が、リジンまたはトレオニン結合部位以外の部位において突然変異を含む突然変異体ｌｙｓＣ遺伝子によって個別にコードされる、項目７０〜７６のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目８４）
前記リジンおよびトレオニン結合部位以外の部位の突然変異が、残基Ｆ２８３、Ｎ２９９、Ｓ３０１、Ｓ３０２、Ｔ３０８、Ｔ３１１、Ｔ３３６、Ｇ３５９、Ｆ３６４、Ｍ３６５、Ｔ３８０、Ｒ３８４、Ｓ３８６またはそれらの任意の組み合わせにあり、前記残基ナンバリングが、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍ  ＡＴＣＣ１３０３２のｌｙｓＣによってコードされる残基位置に対応する、項目８３に記載の組換え水素資化微生物。
（項目８５）
リジン生合成経路からの１つまたはそれを超えるポリペプチドをコードする第２の外因性核酸分子をさらに含み、前記親水素資化微生物よりも高レベルでリジンを産生する、項目７０〜８４のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目８６）
前記リジン生合成経路からの１つまたはそれを超えるコードされるポリペプチドが、アスパルトキナーゼ、アスパルチルセミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、ジヒドロジピコリン酸シンターゼ、ジヒドロジピコリン酸レダクターゼ、ＬＬ−ジアミノピメリン酸アミノトランスフェラーゼ、ジアミノピメリン酸エピメラーゼ、ジアミノピメリン酸デカルボキシラーゼまたはそれらの任意の組み合わせから選択される、項目８５に記載の組換え水素資化微生物。
（項目８７）
前記リジン生合成経路からの１つまたはそれを超えるコードされるポリペプチドが、アスパルトキナーゼ、アスパルチルセミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、ジヒドロジピコリン酸シンターゼ、ジヒドロジピコリン酸レダクターゼ、メソ−ジアミノピメリン酸デヒドロゲナーゼ、ジアミノピメリン酸デカルボキシラーゼまたはそれらの任意の組み合わせから選択される、項目８５に記載の組換え水素資化微生物。
（項目８８）
前記第２の外因性核酸分子がジヒドロジピコリン酸シンターゼをコードする、項目８５〜８７のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目８９）
前記ジヒドロジピコリン酸シンターゼをコードする前記第２の外因性核酸分子が、核酸発現制御配列に作動可能に連結されている、項目８８に記載の組換え水素資化微生物。
（項目９０）
前記ジヒドロジピコリン酸シンターゼが過剰発現されている、項目８８または８９に記載の組換え水素資化微生物。
（項目９１）
トレオニン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える内因性核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目８５〜９０のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目９２）
メチオニン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える内因性核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目８５〜９１のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目９３）
ホモセリンデヒドロゲナーゼをコードする内因性核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性のホモセリンデヒドロゲナーゼ突然変異体をコードする、項目９１または９２に記載の組換え水素資化微生物。
（項目９４）
前記第１の外因性核酸分子が、前記組換え水素資化微生物のゲノムに組み込まれている、項目８５〜９３のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目９５）
前記第１の外因性核酸分子が、前記組換え水素資化微生物内の自己複製ベクター中にある、項目８５〜９３のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目９６）
ホモセリン栄養要求体、メチオニン栄養要求体、トレオニン栄養要求体またはそれらの任意の組み合わせである、項目８５〜９５のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目９７）
トレオニン生合成経路からの１つまたはそれを超えるポリペプチドをコードする第２の外因性核酸分子をさらに含み、前記親水素資化微生物よりも高レベルでトレオニンを産生する、項目７０〜８４のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目９８）
前記トレオニン生合成経路からの１つまたはそれを超えるコードされるポリペプチドが、アスパルトキナーゼ、アスパルチルセミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、ホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンキナーゼ、トレオニンシンターゼまたはそれらの任意の組み合わせから選択される、項目９７に記載の組換え水素資化微生物。
（項目９９）
前記第２の外因性核酸分子が、ホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンキナーゼまたはそれらの両方をコードする、項目９７に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１００）
前記ホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンキナーゼまたはそれらの両方をコードする前記第２の外因性核酸分子が、核酸発現制御配列に作動可能に連結されている、項目９９に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１０１）
前記ホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンキナーゼまたはそれらの両方が過剰発現されている、項目１００に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１０２）
前記ホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンキナーゼまたはそれらの両方が調節解除されている、項目９９〜１０１のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１０３）
リジン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目９７〜１０２のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１０４）
メチオニン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目９７〜１０３のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１０５）
イソロイシン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目９７〜１０４のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１０６）
グリシン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目９７〜１０４のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１０７）
ホモセリンＯ−アセチルトランスフェラーゼ、ジヒドロジピコリン酸シンターゼ、トレオニンデヒドラターゼ、トレオニンアルドラーゼ、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼまたはそれらの任意の組み合わせをコードするリジン生合成経路核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性のホモセリンＯ−アセチルトランスフェラーゼ突然変異体、ジヒドロジピコリン酸シンターゼ突然変異体、トレオニンデヒドラターゼ突然変異体、トレオニンアルドラーゼ突然変異体、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ突然変異体もしくはそれらの任意の組み合わせをコードする、項目１０３〜１０６のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１０８）
前記第１の外因性核酸分子が、前記組換え水素資化微生物のゲノムに組み込まれている、項目９７〜１０７のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１０９）
前記第１の外因性核酸分子が、前記組換え水素資化微生物内の自己複製ベクター中にある、項目９７〜１０７のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１１０）
リジン栄養要求体、メチオニン栄養要求体、イソロイシン栄養要求体、グリシン栄養要求体またはそれらの任意の組み合わせである、項目９７〜１０９のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１１１）
メチオニン生合成経路からの１つまたはそれを超えるポリペプチドをコードする第２の外因性核酸分子をさらに含み、前記親水素資化微生物よりも高レベルでメチオニンを産生する、項目７０〜８４のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１１２）
前記メチオニン生合成経路からの１つまたはそれを超えるコードされるポリペプチドが、アスパルトキナーゼ、アスパルチルセミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、ホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンＯ−アセチルトランスフェラーゼ、ホモセリンＯ−トランススクシニルトランスフェラーゼ、Ｏ−スクシニルホモセリンリアーゼ、シスタチオニンγ−シンターゼ、シスタチオニンβ−リアーゼ、Ｏ−アセチルホモセリンスルフヒドリラーゼ、ホモシステインＳ−メチルトランスフェラーゼ、メチオニンシンターゼ（コバラミン依存性または非依存性）またはそれらの任意の組み合わせから選択される、項目１１１に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１１３）
前記第２の外因性核酸分子が、ホモセリンデヒドロゲナーゼ、セリンアセチルトランスフェラーゼもしくはそれらの両方をコードするか、または前記第２の外因性核酸分子が、ホモセリンＯ−アセチルトランスフェラーゼ、Ｏ−アセチルホモセリンスルフヒドリラーゼもしくはそれらの両方をコードする、項目１１１に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１１４）
前記ホモセリンデヒドロゲナーゼ、ホモセリンキナーゼまたはそれらの両方をコードする前記第２の外因性核酸分子が、核酸発現制御配列に作動可能に連結されている、項目１１３に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１１５）
前記ホモセリンデヒドロゲナーゼ、セリンアセチルトランスフェラーゼもしくはそれらの両方が過剰発現されているか、または前記ホモセリンＯ−アセチルトランスフェラーゼ、Ｏ−アセチルホモセリンスルフヒドリラーゼもしくはそれらの両方が過剰発現されている、項目１１４に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１１６）
前記ホモセリンデヒドロゲナーゼ、セリンアセチルトランスフェラーゼもしくはそれらの両方が調節解除されているか、または前記ホモセリンＯ−アセチルトランスフェラーゼ、Ｏ−アセチルホモセリンスルフヒドリラーゼもしくはそれらの両方が調節解除されている、項目１１３〜１１５のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１１７）
リジン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目１１１〜１１６のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１１８）
トレオニン生合成経路からのポリペプチドをコードする１つまたはそれを超える核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性を有する、項目１１１〜１１７のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１１９）
ジヒドロジピコリン酸シンターゼ、トレオニンデヒドラターゼ、トレオニンアルドラーゼ、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼまたはそれらの任意の組み合わせをコードする核酸分子がノックアウトされているか、または低い活性のジヒドロジピコリン酸シンターゼ突然変異体、トレオニンデヒドラターゼ突然変異体、トレオニンアルドラーゼ突然変異体、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ突然変異体もしくはそれらの任意の組み合わせをコードする、項目１１７または１１８に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１２０）
前記外因性核酸分子が、前記非天然水素資化微生物のゲノムに組み込まれている、項目１１１〜１１９のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１２１）
前記外因性核酸分子が、前記組換え水素資化微生物内の自己複製ベクター中にある、項目１１１〜１１９のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１２２）
リジン栄養要求体、トレオニン栄養要求体またはそれらの両方である、項目１１１〜１２１のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１２３）
低いホスホエノールピルビン酸シンターゼ活性、高いピルビン酸キナーゼ活性またはそれらの両方を有する、項目７０〜１２２のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１２４）
高いピルビン酸カルボキシラーゼ活性、高いピルビン酸シンターゼ、高いアセチル−ＣｏＡシンターゼ、高いアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ活性またはそれらの任意の組み合わせを有する、項目７０〜１２３のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１２５）
前記Ｈ２／ＣＯｘ基質が、Ｈ２、ＣＯおよびＣＯ２である、項目１〜１２４のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１２６）
前記Ｈ２／ＣＯｘ基質が、合成ガスまたは水性ガスシフト合成ガスである、項目１〜１２５のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１２７）
ＣＯ２とＨ２との比が、それぞれ約１：５０〜約１０：１の範囲である、項目１２５または１２６に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１２８）
ＣＯ２とＨ２との比が、それぞれ約１：２〜約１：４の範囲である、項目１２５または１２６に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１２９）
ＣＯの総量が約１％以下である、項目１２５〜１２８のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１３０）
細菌である、項目７０〜１２９のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１３１）
前記細菌が合成ガス代謝細菌である、項目１３０に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１３２）
前記合成ガス代謝細菌が、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ、Ｍｏｏｒｅｌｌａ、Ｐｙｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｄｅｓｕｌｆｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｃａｒｂｏｘｙｄｏｔｈｅｒｍｕｓ、Ａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ａｃｅｔｏａｎａｅｒｏｂｉｕｍ、Ｂｕｔｙｒｉｂａｃｅｔｅｒｉｕｍ、Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓまたはそれらの任意の組み合わせから選択される、項目１３１に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１３３）
前記合成ガス代謝細菌が、Ｂｕｔｙｒｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｍｅｔｈｙｌｏｔｒｏｐｈｉｃｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ａｕｔｏｅｔｈａｎｏｇｅｎｕｍ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌｊｕｎｇｄａｈｌｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｒａｇｓｄａｌｅｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｃａｒｂｏｘｙｄｉｖｏｒａｎｓ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｗｏｏｄｉｉ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｎｅｏｐｒｏｐａｎｏｌｏｇｅｎまたはそれらの任意の組み合わせから選択される、項目１３１に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１３４）
前記細菌が水素酸化細菌である、項目１３０に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１３５）
前記水素酸化細菌が、Ｃｕｐｒｉａｖｉｄｕｓ  ｎｅｃａｔｏｒ、Ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｂａｃｔｅｒ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ、Ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｖｉｂｒｉｏ  ｍａｒｉｎｕｓまたはＨｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉである、項目１３４に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１３６）
メタン生成古細菌である、項目７０〜１２９のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１３７）
前記メタン生成古細菌が、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ、Ｍｅｔｈａｎｏｃａｌｃｕｌｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃａｌｄｏｃｏｃｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｏｉｄｅｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｒｐｕｓｃｕｌｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｕｌｌｅｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｆｏｌｌｉｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｇｅｎｉｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｈａｌｏｂｉｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｈａｌｏｐｈｉｌｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｌａｃｉｎｉａ、Ｍｅｔｈａｎｏｌｏｂｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｍｅｔｈｙｌｏｖｏｒａｎｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｍｉｃｒｏｂｉｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｐｌａｎｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｐｙｒｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｒｅｇｕｌａ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｅｔａ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｌｓｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ、Ｍｅｔｈａｎｏｓｐｈａｅｒａ、Ｍｅｔｈａｎｏｓｐｉｒｉｌｌｉｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｂａｃｔｅｒ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｃｏｃｃｕｓ、ＭｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｕｓまたはＭｅｔｈａｎｏｔｏｒｒｉｓから選択される、項目１３６に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１３８）
前記メタン生成古細菌が、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ａｌｃａｌｉｐｈｉｌｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｙａｎｔｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｃｏｎｇｏｌｅｎｓｅ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｄｅｆｌｕｖｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｅｓｐａｎｏｌａｅ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｆｏｒｍｉｃｉｃｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｉｖａｎｏｖｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐａｌｕｓｔｒｅ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｈｅｒｍａｇｇｒｅｇａｎｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｕｌｉｇｉｎｏｓｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ａｃｉｄｉｄｕｒａｎｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ａｒｂｏｒｉｐｈｉｌｉｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ｇｏｔｔｓｃｈａｌｋｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ｏｌｌｅｙａｅ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ｒｕｍｉｎａｎｔｉｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ｓｍｉｔｈｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ｗｏｅｓｅｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ  ｗｏｌｉｎｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｂａｃｔｅｒ  ｍａｒｂｕｒｇｅｎｓｉｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｂａｃｔｅｒ  ｔｈｅｒｍａｕｔｏｔｒｏｐｈｉｃｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｂａｃｔｅｒ  ｔｈｅｒｍｏｆｌｅｘｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｂａｃｔｅｒ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｂａｃｔｅｒ  ｗｏｌｆｅｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｕｓ  ｓｏｃｉａｂｉｌｉｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｒｐｕｓｃｕｌｕｍ  ｂａｖａｒｉｃｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｒｐｕｓｃｕｌｕｍ  ｐａｒｖｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｕｌｌｅｕｓ  ｃｈｉｋｕｏｅｎｓｉｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｕｌｌｅｕｓ  ｓｕｂｍａｒｉｎｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｇｅｎｉｕｍ  ｆｒｉｇｉｄｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｇｅｎｉｕｍ  ｌｉｍｉｎａｔａｎｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｇｅｎｉｕｍ  ｍａｒｉｎｕｍ、Ｍｅｔｈａｎｏｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｂｌａｔｔｉｃｏｌａ、Ｍｅｔｈａｎｏｐｌａｎｕｓ  ｅｎｄｏｓｙｍｂｉｏｓｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｐｌａｎｕｓ  ｌｉｍｉｃｏｌａ、Ｍｅｔｈａｎｏｐｌａｎｕｓ  ｐｅｔｒｏｌｅａｒｉｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｐｙｒｕｓ  ｋａｎｄｌｅｒｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｒｅｇｕｌａ  ｂｏｏｎｅｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｅｔａ  ｃｏｎｃｉｌｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｅｔａ  ｈａｒｕｎｄｉｎａｃｅａ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｅｔａ  ｐｅｌａｇｉｃａ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｅｔａ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌａ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ａｃｅｔｉｖｏｒａｎｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ｂａｒｋｅｒｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ｍａｚｅｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌａ、Ｍｅｔｈａｎｏｍｉｃｒｏｂｉｕｍ  ｍｏｂｉｌｅ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ  ａｅｏｌｉｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｍａｒｉｐａｌｕｄｉｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｖａｎｎｉｅｌｉｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｖｏｌｔａｅ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｌｉｔｈｏｔｒｏｐｈｉｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｐｙｒｕｓ  ｋａｎｄｌｅｒｉ、Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｂａｃｔｅｒ  ｔｈｅｒｍｏａｕｔｏｔｒｏｉｐｈｉｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃａｌｄｏｃｏｃｃｕｓ  ｆｅｒｖｅｎｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃａｌｄｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｄｉｃｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃａｌｄｏｃｏｃｃｕｓ  ｉｎｆｅｒｎｕｓ、Ｍｅｔｈａｎｏｃａｌｄｏｃｏｃｃｕｓ  ｊａｎｎａｓｃｈｉｉおよびＭｅｔｈａｎｏｃａｌｄｏｃｏｃｃｕｓ  ｖｕｌｃａｎｉｕｓからなる群より選択される、項目１３７に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１３９）
前記メタン生成古細菌がシトクロムを産生しない、項目６０〜６２のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１４０）
シトクロムを産生しない前記メタン生成古細菌が、Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｍａｒｉｐａｌｕｄｉｓまたはＭｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｖａｎｎｉｅｌｉｉである、項目６３に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１４１）
前記メタン生成古細菌がシトクロムを産生する、項目１３６〜１３８のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１４２）
シトクロムを産生する前記メタン生成古細菌が、Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ｂａｒｋｅｒｉまたはＭｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ｍａｚｅｉである、項目１４１に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１４３）
１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸のエクスポーターを発現または過剰発現する、項目７０〜１４２のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１４４）
１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸のエクスポーターをコードする外因性核酸分子をさらに含む、項目７０〜１４３のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１４５）
前記エクスポーターがｒｈｔＡまたはｌｙｓＥ遺伝子である、項目１４３または１４４に記載の組換え水素資化微生物。
（項目１４６）
アスパラギン酸経路アミノ酸を生産するための方法であって、１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸を産生するために十分な時間にわたって、項目１〜６９のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物を培養することを含み、前記非天然水素資化微生物が、（ａ）親水素資化微生物と比較して高い活性を有する１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路酵素を発現し；（ｂ）１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路酵素を過剰発現し；または（ｃ）１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路酵素についての改変された調節を含み、前記非天然水素資化微生物が、親水素資化微生物よりも高レベルで１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸を産生する、方法。
（項目１４７）
リジンを生産するための方法であって、リジンを産生するために十分な時間にわたって、項目１〜２２および４７〜６９のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物を培養することを含み、前記非天然水素資化微生物が、（ａ）親水素資化微生物と比較して高い活性を有する１つまたはそれを超えるリジン生合成経路酵素を発現し；（ｂ）１つまたはそれを超えるリジン生合成経路酵素を過剰発現し；または（ｃ）１つまたはそれを超えるリジン生合成経路酵素についての改変された調節を含み、前記非天然水素資化微生物が、親水素資化微生物よりも高レベルでリジンを産生する、方法。
（項目１４８）
トレオニンを生産するための方法であって、トレオニンを産生するために十分な時間にわたって、項目１〜１１、２３〜３５および４７〜６９のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物を培養することを含み、前記非天然水素資化微生物が、（ａ）親水素資化微生物と比較して高い活性を有する１つまたはそれを超えるトレオニン生合成経路酵素を発現し；（ｂ）１つまたはそれを超えるトレオニン生合成経路酵素を過剰発現し；または（ｃ）１つまたはそれを超えるトレオニン生合成経路酵素についての改変された調節を含み、前記非天然水素資化微生物が、親水素資化微生物よりも高レベルでトレオニンを産生する、方法。
（項目１４９）
メチオニンを生産するための方法であって、メチオニンを産生するために十分な時間にわたって、項目１〜１１および３６〜６９のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物を培養することを含み、前記非天然水素資化微生物が、（ａ）親水素資化微生物と比較して高い活性を有する１つまたはそれを超えるメチオニン生合成経路酵素を発現し；（ｂ）１つまたはそれを超えるメチオニン生合成経路酵素を過剰発現し；または（ｃ）１つまたはそれを超えるメチオニン生合成経路酵素についての改変された調節を含み、前記非天然水素資化微生物が、親水素資化微生物よりも高レベルでメチオニンを産生する、方法。
（項目１５０）
アスパラギン酸経路アミノ酸またはアスパラギン酸経路アミノ酸含有飼料添加物を作るためのプロセスであって、アスパラギン酸ファミリーアミノ酸の生合成のための１つまたはそれを超える経路からのポリペプチドをコードする外因性ポリヌクレオチドの発現を可能にするために十分な条件下および時間にわたって、Ｈ２／ＣＯｘ基質の存在下で、項目７０〜１４５のいずれか一項に記載の組換えアスパラギン酸経路アミノ酸分泌水素資化微生物を培養することを含み、１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸が、親水素資化微生物によって産生される１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸よりも高レベルで培養培地中に産生されて蓄積する、プロセス。
（項目１５１）
アスパラギン酸経路アミノ酸を生産するためのシステムであって、
（ａ）Ｈ２／ＣＯｘ基質を含むガスの供給源；
（ｂ）アスパラギン酸生合成経路ポリペプチドをコードする外因性核酸分子を含む、項目１〜６９のいずれか一項に記載の非天然水素資化微生物を含むバイオリアクター；および
（ｃ）前記バイオリアクターへの前記ガスの流入を可能にするように、前記ガス供給源と前記バイオリアクターとの間に配置されたコネクター
を含み、
前記非天然水素資化微生物が、親水素資化微生物と比較して、前記Ｈ２／ＣＯｘ基質を代謝して１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸を過剰産生する、システム。
（項目１５２）
アスパラギン酸経路アミノ酸を生産するためのシステムであって、
（ａ）Ｈ２／ＣＯｘ基質を含むガスの供給源；
（ｂ）アスパラギン酸生合成経路ポリペプチドをコードする外因性核酸分子を含む、項目７０〜１４５のいずれか一項に記載の組換え水素資化微生物を含むバイオリアクター；および
（ｃ）前記バイオリアクターへの前記ガスの流入を可能にするように、前記ガス供給源と前記バイオリアクターとの間に配置されたコネクター
を含み、
前記非天然水素資化微生物が、親水素資化微生物と比較して、前記Ｈ２／ＣＯｘ基質を代謝して１つまたはそれを超えるアスパラギン酸経路アミノ酸を過剰産生する、システム。
（項目１５３）
前記バイオリアクターが、液相バイオリアクター、気泡塔バイオリアクターまたはトリクルベッドバイオリアクターである、項目１５１または１５２に記載のシステム。
（項目１５４）
前記Ｈ２／ＣＯｘ基質が合成ガスまたは水性ガスシフト合成ガスである、項目１５１または１５２に記載のシステム。