【手続補正書】
【提出日】平成29年3月13日(2017.3.13)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
線維性肺疾患を有する、またはそれを発症するリスクを有する対象における、表３Ａまたは表３Ｂに記載される線維性肺疾患マーカータンパク質の発現レベルを決定する方法であって、前記対象から得られた生体試料における表３Ａまたは表３Ｂに記載される線維性肺疾患マーカータンパク質の発現レベルを決定するステップを含む、方法。
【請求項２】
線維性肺疾患を有する、またはそれを発症するリスクを有する対象を選択することをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記線維性肺疾患は、特発性肺線維症または家族性間質性肺炎である、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記線維性肺疾患マーカータンパク質は、進行性線維性肺疾患マーカータンパク質である、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記対象は、進行性線維性肺疾患を有する、またはそれを発症するリスクを有する、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記進行性線維性肺疾患は、進行性特発性肺線維症である、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記生体試料は、前記対象の血液由来生体試料である、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記血液由来生体試料は、全血、血清または血漿である、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記生体試料は、尿、唾液、肺組織、気管支肺胞洗浄試料、または呼気凝縮液である、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
表３Ａに記載される線維性肺疾患マーカータンパク質の発現レベルが決定される、請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
表３Ｂに記載される線維性肺疾患マーカータンパク質の発現レベルが決定される、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
対象が線維性肺疾患を有する、またはそれを発症するリスクを有するかどうかを決定するためのデータを提供するための方法であって、
（ｉ）対象における表３Ａまたは表３Ｂに記載される１つ以上の線維性肺疾患マーカータンパク質の発現レベルを検出するステップと、
（ｉｉ）前記発現レベルが、標準対照に対して上昇または減少しているかどうかを決定するステップと
を含み、
前記標準対照に対する表３Ａ中の線維性肺疾患マーカータンパク質の上昇した発現レベル、または表３Ｂ中の線維性肺疾患マーカータンパク質の減少した発現レベルは、前記対象が線維性肺疾患を有する、またはそれを発症するリスクを有することを示す、方法。
【請求項１３】
線維性肺疾患を有する、またはそれを発症するリスクを有する対象を選択するステップをさらに含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記線維性肺疾患は、特発性肺線維症または家族性間質性肺炎である、請求項１２に記載の方法。
【請求項１５】
前記１つ以上の線維性肺疾患マーカータンパク質は、進行性線維性肺疾患マーカータンパク質である、請求項１２に記載の方法。
【請求項１６】
前記対象は、進行性線維性肺疾患を有する、またはそれを発症するリスクを有する、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
前記進行性線維性肺疾患は、進行性特発性肺線維症である、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
表３Ａまたは表３Ｂに記載される１つ以上の線維性肺疾患マーカータンパク質の前記発現レベルは、前記対象の生体試料から検出される、請求項１２に記載の方法。
【請求項１９】
前記生体試料は、前記対象の血液由来生体試料である、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記血液由来生体試料は、全血、血清または血漿である、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記生体試料は、尿、唾液、肺組織、気管支肺胞洗浄試料、または呼気凝縮液である、請求項１８に記載の方法。
【請求項２２】
線維性肺疾患患者が線維性肺疾患の進行のリスクを有するかどうかを決定するためのデータを提供するための方法であって、
（ｉ）第１の時点で、前記患者における表３Ａまたは表３Ｂに記載されるタンパク質の第１の発現レベルを決定するステップと、
（ｉｉ）第２の時点で、前記患者における表３Ａまたは表３Ｂに記載されるタンパク質の第２の発現レベルを決定するステップと、
（ｉｉｉ）表３Ａまたは表３Ｂに記載されるタンパク質の前記第２の発現レベルを、表３Ａまたは表３Ｂに記載されるタンパク質の前記第１の発現レベルと比較するステップと
を含み、
表３Ａに記載されるタンパク質の前記第２の発現レベルが、表３Ａに記載されるタンパク質の前記第１のレベルより高い場合、または表３Ｂに記載されるタンパク質の前記第２の発現レベルが、表３Ｂに記載されるタンパク質の前記第１のレベルより低い場合、前記患者は、線維性肺疾患の進行のリスクを有することが示唆される、方法。
【請求項２３】
前記比較の結果が、前記患者における前記線維性肺疾患の進行の速度の指標となる、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
表３Ａまたは表３Ｂに記載されるタンパク質の前記第１の発現レベル及び表３Ａまたは表３Ｂに記載されるタンパク質の前記第２の発現レベルを前記決定することは、表３Ａまたは表３Ｂに記載されるタンパク質の前記第１の発現レベル及び表３Ａまたは表３Ｂに記載されるタンパク質の前記第２の発現レベルを、前記患者における標準遺伝子から発現したタンパク質に対して正規化することを含む、請求項２２に記載の方法。
【請求項２５】
前記標準遺伝子は、ＧＡＰＤＨまたはベータ−アクチンである、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
前記第１の発現レベルは、前記対象の第１の生体試料から検出され、前記第２の発現レベルは、前記対象の第２の生体試料から検出される、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
前記第１の生体試料は、第１の体液試料であり、前記第２の生体試料は、第２の体液試料である、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
患者における線維性肺疾患活性を決定するためのデータを提供するための方法であって、
（ｉ）第１の時点で、前記患者における表３Ａまたは表３Ｂに記載されるタンパク質の第１の発現レベルを決定するステップと、
（ｉｉ）第２の時点で、前記患者における表３Ａまたは表３Ｂに記載されるタンパク質の第２の発現レベルを決定するステップと、
（ｉｉｉ）表３Ａまたは表３Ｂに記載されるタンパク質の前記第２の発現レベルを、表３Ａまたは表３Ｂに記載されるタンパク質の前記第１の発現レベルと比較するステップと
を含み、
前記第２の発現レベルと前記第１の発現レベルの比較により、前記患者における前記線維性肺疾患活性が示唆される、方法。
【請求項２９】
線維性肺疾患を治療するための医薬組成物であって、効果的な量の表３Ａまたは表３Ｂに記載される線維性肺疾患マーカータンパク質のモジュレーターを含む、医薬組成物。
【請求項３０】
効果的な量の表３Ａに記載の前記線維性肺疾患マーカータンパク質のモジュレーターを含む、請求項２９に記載の医薬組成物。
【請求項３１】
前記モジュレーターは、拮抗薬である、請求項３０に記載の医薬組成物。
【請求項３２】
前記拮抗薬は、ペプチド、小分子、核酸、抗体またはアプタマーである、請求項３１に記載の医薬組成物。
【請求項３３】
効果的な量の表３Ｂに記載の前記線維性肺疾患マーカータンパク質のモジュレーターを含む、請求項２９に記載の医薬組成物。
【請求項３４】
前記モジュレーターは、作動薬である、請求項３３に記載の医薬組成物。
【請求項３５】
前記作動薬は、ペプチド、小分子、核酸、抗体またはアプタマーである、請求項３４に記載の医薬組成物。
【請求項３６】
対象における線維性肺疾患を治療するための医薬組成物であって、線維性肺疾患治療薬、表３Ａに記載される線維性肺疾患マーカータンパク質の拮抗薬、または表３Ｂに記載される線維性肺疾患マーカータンパク質の作動薬を含み、
対象が、標準対照に対して、上昇したレベルの表３Ａに記載されるような線維性肺疾患マーカータンパク質、または減少したレベルの表３Ｂに記載されるような線維性肺疾患マーカータンパク質を発現するかどうかについて決定され、
前記標準対照に対して、表３Ａの前記線維性肺疾患マーカータンパク質の上昇した発現レベル、または表３Ｂの前記線維性肺疾患マーカータンパク質の減少した発現レベルが見られた場合に、前記医薬組成物が前記対象に投与される、医薬組成物。
【請求項３７】
前記線維性肺疾患治療薬は、粘液溶解薬である、請求項３６に記載の医薬組成物。
【請求項３８】
線維性肺疾患患者が線維性肺疾患の進行のリスクを有するかどうかを決定するためのデータを提供するための方法であって、
（ｉ）線維性肺疾患患者における表３Ａまたは表３Ｂに記載される１つ以上の線維性肺疾患マーカータンパク質の発現レベルを検出するステップと、
（ｉｉ）前記発現レベルが標準対照に対して変調しているかどうかを決定するステップを含み、
前記標準対照に対する表３Ａまたは３Ｂ中の線維性肺疾患マーカータンパク質の変調した発現レベルは、前記線維性肺疾患患者が前記線維性肺疾患の進行のリスクを有することを示す、方法。
【請求項３９】
前記発現レベルが標準対照に対して変調しているかどうかを前記決定することは、前記発現レベルが他の線維性肺疾患患者に対して上昇している、または抑制されているかどうかを決定することを含む、請求項３８に記載の方法。