【手続補正書】
【提出日】平成29年2月28日(2017.2.28)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ｐ４０タンパク質に特異的に結合する抗体の単離された調製物であって、前記抗体がペプチド配列番号３におけるエピトープに結合する、調製物。
【請求項２】
ｐ４０タンパク質に特異的に結合する抗体の単離された調製物であって、前記抗体がペプチド配列番号４におけるエピトープに結合する、調製物。
【請求項３】
配列番号２の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、および配列番号１の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む、請求項１または２に記載の抗体の単離された調製物。
【請求項４】
少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントを含む組成物であって、前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの少なくとも１つがｐ４０タンパク質に特異的に結合し、ペプチド配列番号３または配列番号４におけるエピトープに結合する抗体またはそのフラグメントを含む、組成物。
【請求項５】
前記組成物が一次抗体カクテルを含む、請求項４に記載の組成物。
【請求項６】
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントが少なくとも２つの異なる種に由来する、請求項５に記載の組成物。
【請求項７】
前記少なくとも２つの異なる種が、マウス、ウサギ、ヤギ、ウマ、ニワトリ、ヒト、およびこれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、請求項６に記載の組成物。
【請求項８】
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントが二重染色手順を含む、請求項４に記載の組成物。
【請求項９】
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つの他方が、ＤＳＧ−３、ＣＫ４、ナプシンＡ、ＨＭＷＣＫ、ｐ５０４ｓ、ＣＫ５／１４、ＣＫ７／１８、ＣＫ８／１８、ウロプラキンＩＩ、ウロプラキンＩＩＩ、ＧＡＴＡ−３、およびこれらの任意の組み合わせからなる群より選択されるタンパク質に特異的に結合する、請求項４に記載の組成物。
【請求項１０】
請求項４に記載の組成物であって、少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントが、
−ｐ４０およびＤＳＧ−３およびＣＫ５およびナプシンＡ、
−ｐ４０およびＤＳＧ−３およびＣＫ５、
−ｐ４０およびナプシンＡ、
−ｐ４０およびＨＭＷＣＫおよびｐ５０４ｓ、
−ｐ４０およびｐ５０４ｓおよびＣＫ５／１４、
−ｐ４０およびＣＫ５／１４およびＣＫ７／１８、
−ｐ４０およびＣＫ５／１４およびＣＫ８／１８
−ｐ４０およびウロプラキンＩＩおよびウロプラキンＩＩＩ、ならびに
−ｐ４０およびウロプラキンＩＩおよびウロプラキンＩＩＩおよびＧＡＴＡ−３
からなる群より選択されるタンパク質に各々特異的に結合する、組成物。
【請求項１１】
請求項４に記載の組成物であって、少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントが、
−ｐ４０およびＤＳＧ−３およびナプシンＡ、
−ｐ４０およびＤＳＧ−３、ならびに
−ｐ４０およびＣＫ５
からなる群より選択されるタンパク質に各々特異的に結合する、組成物。
【請求項１２】
請求項４に記載の組成物であって、前記組成物が、ＳＣＣ癌腫検出組成物、膀胱検出組成物、乳癌検出組成物、前立腺癌検出組成物、およびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される検出組成物を含む、組成物。
【請求項１３】
前記抗体またはそのフラグメントに結合しれた標識をさらに含む、請求項１または２に記載の抗体の単離された調整物。
【請求項１４】
前記標識が、放射性元素、磁気粒子、ラジオアイソトープ、蛍光色素、酵素、毒素、シグナル、染料、検出酵素、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、β−ガラクトシダーゼ、色素原、ファストレッド、３，３’−ジアミノベンジジン、３−アミノ−９−エチルカルバゾール、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリルホスフェート、３，３’，５，５’−テトラメチルベンジジン、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリル−β−Ｄ−グルクロニド、およびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、請求項１３に記載の抗体の単離された調整物。
【請求項１５】
診断または予後診断テストキットであって、
−ｐ４０タンパク質に特異的に結合し、ペプチド配列番号３または配列番号４におけるエピトープに結合する抗体またはそのフラグメントの単離された調整物、および
−抗原に結合したときの前記抗体または前記そのフラグメントの抗体検出エレメント
を含む、キット。
【請求項１６】
請求項１５に記載のキットを使用して生物学的サンプル中のｐ４０を検出するための方法であって、
−生物学的サンプルを前記抗体またはそのフラグメントと接触させる工程、および
−前記抗体検出エレメントを使用して、前記生物学的サンプル中の抗原との前記抗体または前記そのフラグメントの結合を検出する工程
を包含する、方法。
【請求項１７】
前記生物学的サンプルが、正常組織、新生物組織、膀胱組織、腎臓組織、卵巣組織、甲状腺組織、子宮内膜組織、腎組織、扁桃腺組織、膵臓組織、結腸組織、リンパ節組織、新生物膵臓組織、胃組織、前立腺組織、肺組織、および乳房組織からなる群より選択される、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）にＡＴＣＣ特許寄託番号ＰＴＡ−１２０１６３のもとで寄託されたハイブリドーマにより産生される単離された抗体、または前記単離された抗体の単離された抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはその抗原結合フラグメントは、配列番号４を含むｐ４０に特異的に結合する、単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメント。
【請求項１９】
請求項１８に記載の単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメントと、少なくとも１つのさらなる単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメントとを含む組成物であって、少なくとも１つのさらなる単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメントは、ＤＳＧ−３、ＣＫ４、ＣＫ５、ナプシンＡ、ＨＭＷＣＫ、ｐ５０４Ｓ、ＣＫ５／１４、ＣＫ７／１８、ＣＫ８／１８、ウロプラキンＩＩ、ウロプラキンＩＩＩおよびＧＡＴＡ−３からなる群より選択される抗原に特異的に結合する、組成物。
【請求項２０】
配列番号２からなる核酸配列によりコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域と配列番号１からなる核酸配列によりコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域とを含む、請求項１８に記載の単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメント。
【請求項２１】
前記単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメントと、前記少なくとも１つのさらなる単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメントとが、少なくとも２つの異なる種に由来する、請求項１９に記載の組成物。
【請求項２２】
前記少なくとも２つの異なる種が、マウス、ウサギ、ヤギ、ウマ、ニワトリおよびヒトからなる群より選択される、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２３】
前記単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメント、および前記少なくとも１つのさらなる単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメントはそれぞれ、ｐ４０およびＤＳＧ−３およびＣＫ５およびナプシンＡ；ｐ４０およびＤＳＧ−３およびＣＫ５；ｐ４０およびナプシンＡ；ｐ４０およびＨＭＷＣＫおよびｐ５０４ｓ；ｐ４０およびｐ５０４ｓおよびＣＫ５／１４；ｐ４０およびＣＫ５／１４およびＣＫ７／１８；ｐ４０およびＣＫ５／１４およびＣＫ８／１８；ｐ４０およびウロプラキンＩＩおよびウロプラキンＩＩＩ；ならびにｐ４０およびウロプラキンＩＩおよびウロプラキンＩＩＩおよびＧＡＴＡ−３からなる群より選択されるタンパク質に特異的に結合する、請求項１９に記載の組成物。
【請求項２４】
前記単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメント、および前記少なくとも１つのさらなる単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメントはそれぞれ、ｐ４０およびＤＳＧ−３およびナプシンＡ；ｐ４０およびＤＳＧ−３；ならびにｐ４０およびＣＫ５からなる群より選択されるタンパク質に特異的に結合する、請求項１９に記載の組成物。
【請求項２５】
請求項１８に記載の単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメントと；ｐ４０抗原に結合したときの請求項１８に記載の単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメントの抗体検出試薬とを含むキット。
【請求項２６】
標識と結合体化された、請求項１８に記載の単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメント。
【請求項２７】
前記標識が、放射性元素、磁気粒子、ラジオアイソトープ、蛍光色素、酵素、毒素、シグナル、染料、検出酵素、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、β−ガラクトシダーゼ、色素原、ファストレッド、３，３’−ジアミノベンジジン、３−アミノ−９−エチルカルバゾール、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリルホスフェート、３，３’，５，５’−テトラメチルベンジジン、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリル−β−Ｄ−グルクロニド、およびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、請求項２６に記載の単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメント。
【請求項２８】
生物学的サンプル中のｐ４０を検出するための方法であって、
（ａ）請求項２５に記載のキットを提供する工程；および
（ｂ）免疫アッセイにより前記単離された抗体またはその単離された抗原結合フラグメントの結合を検出する工程であって、（ｉ）前記生物学的サンプルと、アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）にＡＴＣＣ特許寄託番号ＰＴＡ−１２０１６３のもとで寄託されたハイブリドーマにより産生される単離された抗体、またはその単離された抗原結合フラグメントであって、配列番号４を含むｐ４０に特異的に結合する、単離された抗体、またはその単離された抗原結合フラグメントとを接触させ、複合体を形成する工程、および（ｉｉ）前記キットにおいて提供される前記抗体検出試薬により複合体を検出する工程を含み、前記免疫アッセイが、免疫組織化学（ＩＨＣ）、ＦＦＰＥのＩＨＣ、凍結組織切片のＩＨＣ、免疫細胞化学、およびＥＬＩＳＡからなる群より選択される、工程
を包含する方法。
【請求項２９】
前記生物学的サンプルが、肺組織、膀胱組織、乳房組織、および前立腺組織を含む、請求項２８に記載の生物学的サンプル中のｐ４０を検出するための方法。
【請求項３０】
前記生物学的サンプルが、正常組織、新生物組織、膀胱組織、腎臓組織、卵巣組織、甲状腺組織、子宮内膜組織、腎組織、扁桃腺組織、膵臓組織、結腸組織、リンパ節組織、新生物膵臓組織、胃組織、前立腺組織、肺組織、および乳房組織からなる群より選択される、請求項２８に記載の生物学的サンプル中のｐ４０を検出するための方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２３】
マウスモノクローナル抗ｐ４０抗体ＢＣ２８などの抗ｐ４０抗体は、組織サンプル中のｐ４０の検出のために有用であり得、おそらく、ＴＡｐ６３およびｐ４０アイソフォームに対する現在知られている抗体を超えたいくつかの顕著であるが予測されなかった利点を伴う。従来的な免疫組織化学手順において使用されるとき、マウス抗ｐ４０抗体ＢＣ２８などの抗ｐ４０抗体は、おそらく、知られている抗ｐ６３抗体および抗ｐ４０抗体と同様の感度で、ｐ４０の核染色を生じることができる。一方で、ＢＣ２８などの抗ｐ４０抗体は、おそらく、抗ｐ６３抗体および他の知られている抗ｐ４０抗体と比較した場合に、特異性の増加を示すことができ、これは有意な改善を提供し得る。モノクローナルの供給源に由来するという可能な利点に加えて、ＢＣ２８などの抗ｐ４０抗体はまた、他の知られている抗ｐ４０および抗ｐ６３抗体と比較したときに、より少ない人工物およびより高い細胞型特異性を伴って、例えば、おそらく、マクロファージを染色せずに、より明確な染色を提供することができる。ＢＣ２８などの抗ｐ４０抗体を用いると、サンプルの分析は単純化することができ、腫瘍細胞中のｐ４０発現を容易に同定可能にすることができ、さもなくば診断が困難、あいまい、または可能でないことさえあり得る場合において診断を可能にする。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
（項目１）
ｐ４０タンパク質に特異的に結合する抗体の単離された調製物であって、前記抗体がペプチド配列番号３におけるエピトープに結合する、調製物。
（項目２）
ｐ４０タンパク質に特異的に結合する抗体の単離された調製物であって、前記抗体がペプチド配列番号４におけるエピトープに結合する、調製物。
（項目３）
ｐ４０タンパク質に特異的に結合する抗体の単離された調製物であって、前記抗体が配列番号３および配列番号５の混合物を含むエピトープに結合する、調製物。
（項目４）
ｐ４０タンパク質に特異的に結合する抗体の単離された調製物であって、前記抗体が配列番号３および配列番号５の混合物からなるエピトープに結合する、調製物。
（項目５）
ｐ４０タンパク質に特異的に結合する抗体の単離された調製物であって、配列番号３からなるペプチドを免疫原として使用して前記抗体が生成される、調製物。
（項目６）
ｐ４０タンパク質に特異的に結合する抗体の単離された調製物であって、配列番号４からなるペプチドを免疫原として使用して前記抗体が生成される、調製物。
（項目７）
ｐ４０タンパク質に特異的に結合する抗体の単離された調製物であって、配列番号３および配列番号５の混合物を含むペプチドを免疫原として使用して前記抗体が生成される、調製物。
（項目８）
ｐ４０タンパク質に特異的に結合する抗体の単離された調製物であって、配列番号３および配列番号５の混合物からなるペプチドを免疫原として使用して前記抗体が生成される、調製物。
（項目９）
ペプチド配列番号３におけるエピトープに特異的に結合する抗体の単離された調製物。
（項目１０）
ペプチド配列番号４におけるエピトープに特異的に結合する抗体の単離された調製物。
（項目１１）
配列番号３および配列番号５の混合物を含むペプチドにおけるエピトープに特異的に結合する抗体の単離された調製物。
（項目１２）
配列番号３および配列番号５の混合物からなるペプチドにおけるエピトープに特異的に結合する抗体の単離された調製物。
（項目１３）
前記抗体がモノクローナルである、項目１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２に記載の抗体の単離された調製物。
（項目１４）
前記抗体がポリクローナルである、項目１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２に記載の抗体の単離された調製物。
（項目１５）
アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）にＡＴＣＣ特許寄託番号ＰＴＡ−１２０１６３で寄託されているハイブリドーマによって産生された抗体またはそのフラグメント。
（項目１６）
アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）にＡＴＣＣ特許寄託番号ＰＴＡ−１２０１６３で寄託されているハイブリドーマ細胞。
（項目１７）
前記ハイブリドーマ細胞によって産生される抗体またはそのフラグメントをさらに含む、項目１６に記載のハイブリドーマ細胞。
（項目１８）
項目１５に記載のモノクローナル抗体を産生するための方法であって、ｐ４０を特異的に認識することが可能なモノクローナル抗体を産生する前記ハイブリドーマを培養する工程、および
前記ハイブリドーマにモノクローナル抗体を産生させることを可能にする工程
を包含する、方法。
（項目１９）
配列番号１または配列番号２の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列のポリペプチドを含む、抗体またはそのフラグメント。
（項目２０）
配列番号２の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、および配列番号１の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む、抗ｐ４０抗体またはそのフラグメント。
（項目２１）
配列番号１または配列番号２の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも約７０％同一であるアミノ酸配列を含む抗体。
（項目２２）
配列番号１または配列番号２に対して少なくとも約７０％同一である核酸配列を含む、単離および精製された核酸配列。
（項目２３）
前記配列番号１または配列番号２に対して少なくとも約７０％同一が、配列番号１および配列番号２に対して少なくとも約７０％同一を含む、項目２１または２２に記載の配列。
（項目２４）
前記少なくとも約７０％同一が、少なくとも約７１％、少なくとも約７２％、少なくとも約７３％、少なくとも約７４％、少なくとも約７５％、少なくとも約７６％、少なくとも約７７％、少なくとも約７８％、少なくとも約７９％、少なくとも約８０％、少なくとも約８１％、少なくとも約８２％、少なくとも約８３％、少なくとも約８４％、少なくとも約８５％、少なくとも約８６％、少なくとも約８７％、少なくとも約８８％、少なくとも約８９％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、および少なくとも約９９％からなる群より選択されるパーセンテージを含む、項目２３に記載の配列。
（項目２５）
配列番号３の残基を含むアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、抗体またはそのフラグメント。
（項目２６）
少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントを含む組成物であって、前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの少なくとも１つが少なくともｐ４０に特異的に結合する、組成物。
（項目２７）
少なくともｐ４０に特異的に結合する前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つが、ｐ４０［ＢＣ２８］抗体またはそのフラグメントを含む、項目２６に記載の組成物。
（項目２８）
少なくともｐ４０に特異的に結合する前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つが、ｐ４０に特異的に結合する前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの少なくとも１つを含み、かつ染色細胞の約５％より大きい陽性指示カットオフ値を有する、項目２６に記載の組成物。
（項目２９）
項目２６に記載の組成物であって、ｐ４０に特異的に結合する前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つが、ｐ４０に特異的に結合する前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの少なくとも１つを含み、かつ以下の陽性指示カットオフ値：
−染色細胞の約２％より大きい
−染色細胞の約３％より大きい
−染色細胞の約４％より大きい
−染色細胞の約５％より大きい
−染色細胞の約６％より大きい
−染色細胞の約７％より大きい
−染色細胞の約８％より大きい
−染色細胞の約９％より大きい、および
−染色細胞の約１０％より大きい
からなる群より選択される陽性指示カットオフ値を有する、組成物。
（項目３０）
項目２６に記載の組成物であって、前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つが、配列番号２の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、および配列番号１の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む、組成物。
（項目３１）
項目２６に記載の組成物であって、前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つが、配列番号２の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列の少なくとも約７０％に対して同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、および配列番号１の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列の少なくとも約７０％であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む、組成物。
（項目３２）
項目３１に記載の組成物であって、前記少なくとも約７０％同一が、少なくとも約７１％、少なくとも約７２％、少なくとも約７３％、少なくとも約７４％、少なくとも約７５％、少なくとも約７６％、少なくとも約７７％、少なくとも約７８％、少なくとも約７９％、少なくとも約８０％、少なくとも約８１％、少なくとも約８２％、少なくとも約８３％、少なくとも約８４％、少なくとも約８５％、少なくとも約８６％、少なくとも約８７％、少なくとも約８８％、少なくとも約８９％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、および少なくとも約９９％からなる群より選択されるパーセンテージを含む、組成物。
（項目３３）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つが、配列番号３、配列番号４、および配列番号３と配列番号４の混合物からなる群より選択される残基を含むアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、項目２６に記載の組成物。
（項目３４）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つが、配列番号３、配列番号４、および配列番号３と配列番号４の混合物からなる群より選択される残基に対して少なくとも約７０％同一であるアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、項目２６に記載の組成物。
（項目３５）
項目３４に記載の組成物であって、前記少なくとも約７０％同一が、少なくとも約７１％、少なくとも約７２％、少なくとも約７３％、少なくとも約７４％、少なくとも約７５％、少なくとも約７６％、少なくとも約７７％、少なくとも約７８％、少なくとも約７９％、少なくとも約８０％、少なくとも約８１％、少なくとも約８２％、少なくとも約８３％、少なくとも約８４％、少なくとも約８５％、少なくとも約８６％、少なくとも約８７％、少なくとも約８８％、少なくとも約８９％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、および少なくとも約９９％からなる群より選択されるパーセンテージを含む、組成物。
（項目３６）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つが、アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）にＡＴＣＣ特許寄託番号ＰＴＡ−１２０１６３で寄託されたハイブリドーマによって産生された抗体またはそのフラグメントを含む、項目２６に記載の組成物。
（項目３７）
前記組成物が一次抗体カクテルを含む、項目２６に記載の組成物。
（項目３８）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントが少なくとも２つの異なる種に由来する、項目２７に記載の組成物。
（項目３９）
前記少なくとも２つの異なる種が、マウス、ウサギ、ヤギ、ウマ、ニワトリ、ヒト、およびこれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、項目３８に記載の組成物。
（項目４０）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントが二重染色手順を含む、項目２６に記載の組成物。
（項目４１）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントが、異なる可視化結果を提供できる、項目２６に記載の組成物。
（項目４２）
前記可視化結果が色の結果を含む、項目４１に記載の組成物。
（項目４３）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つの他方が、ＤＳＧ−３、ＣＫ４、ナプシンＡ、ＨＭＷＣＫ、ｐ５０４ｓ、ＣＫ５／１４、ＣＫ７／１８、ＣＫ８／１８、ウロプラキンＩＩ、ウロプラキンＩＩＩ、ＧＡＴＡ−３、およびこれらの任意の組み合わせからなる群より選択されるタンパク質に特異的に結合する、項目２６に記載の組成物。
（項目４４）
項目２６に記載の組成物であって、少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントが、
−ｐ４０およびＤＳＧ−３およびＣＫ５およびナプシンＡ、
−ｐ４０およびＤＳＧ−３およびＣＫ５、
−ｐ４０およびナプシンＡ、
−ｐ４０およびＨＭＷＣＫおよびｐ５０４ｓ、
−ｐ４０およびｐ５０４ｓおよびＣＫ５／１４、
−ｐ４０およびＣＫ５／１４およびＣＫ７／１８、
−ｐ４０およびＣＫ５／１４およびＣＫ８／１８
−ｐ４０およびウロプラキンＩＩおよびウロプラキンＩＩＩ、ならびに
−ｐ４０およびウロプラキンＩＩおよびウロプラキンＩＩＩおよびＧＡＴＡ−３
からなる群より選択されるタンパク質に各々特異的に結合する、組成物。
（項目４５）
項目２６に記載の組成物であって、少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントが、
−ｐ４０およびＤＳＧ−３およびナプシンＡ、
−ｐ４０およびＤＳＧ−３、ならびに
−ｐ４０およびＣＫ５
からなる群より選択されるタンパク質に各々特異的に結合する、組成物。
（項目４６）
項目２６に記載の組成物であって、前記組成物が、ＳＣＣ癌腫検出組成物、膀胱検出組成物、乳癌検出組成物、前立腺癌検出組成物、およびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される検出組成物を含む、組成物。
（項目４７）
ｐ４０に特異的に結合し、かつ染色細胞の１％より大きい陽性指示カットオフ値を有する、モノクローナル抗体またはそのフラグメント。
（項目４８）
項目４７に記載のモノクローナル抗体またはそのフラグメントであって、前記陽性指示カットオフ値が、
−染色細胞の約２％より大きい
−染色細胞の約３％より大きい
−染色細胞の約４％より大きい
−染色細胞の約５％より大きい
−染色細胞の約６％より大きい
−染色細胞の約７％より大きい
−染色細胞の約８％より大きい
−染色細胞の約９％より大きい、および
−染色細胞の約１０％より大きい
からなる群より選択される、モノクローナル抗体またはそのフラグメント。
（項目４９）
項目１９、２０、２５、２６、または４７に記載の抗体であって、前記抗体またはそのフラグメントが、アメリカンタイプカルチャーコレクションにＡＴＣＣ特許寄託番号ＰＴＡ−１２０１６３で寄託されているハイブリドーマ細胞によって産生される、抗体。
（項目５０）
項目１５、１７、２５、または４７に記載の抗体であって、前記抗体またはそのフラグメントが、配列番号１または配列番号２の核酸配列によってコードされているアミノ酸配列のポリペプチドを含む、抗体。
（項目５１）
項目１５、１７、２５、または４７に記載の抗体であって、前記抗体またはそのフラグメントが、配列番号１および配列番号２の核酸配列によってコードされているアミノ酸配列のポリペプチドを含む、抗体。
（項目５２）
項目１５、１７、２５、または４７に記載の抗体であって、前記抗体またはそのフラグメントが、配列番号１または配列番号２の核酸配列によってコードされているアミノ酸配列に対して少なくとも約７０％同一であるポリペプチドを含む、抗体。
（項目５３）
項目１５、１７、２５、または４７に記載の抗体であって、前記抗体またはそのフラグメントが、配列番号１および配列番号２の核酸配列によってコードされているアミノ酸配列に対して少なくとも約７０％同一であるポリペプチドを含む、抗体。
（項目５４）
項目１５、１７、２５、または４７に記載の抗体であって、前記抗体またはそのフラグメントが、配列番号３、配列番号４、および配列番号３と配列番号５の混合物からなる群より選択される残基を含むアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、抗体。
（項目５５）
項目１５、１７、２５、または４７に記載の抗体であって、前記抗体またはそのフラグメントが、配列番号３、配列番号４、および配列番号３と配列番号５の混合物からなる群より選択される残基に対して少なくとも約７０％同一であるアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、抗体。
（項目５６）
項目５５に記載の抗体であって、前記少なくとも約７０％同一が、少なくとも約７１％、少なくとも約７２％、少なくとも約７３％、少なくとも約７４％、少なくとも約７５％、少なくとも約７６％、少なくとも約７７％、少なくとも約７８％、少なくとも約７９％、少なくとも約８０％、少なくとも約８１％、少なくとも約８２％、少なくとも約８３％、少なくとも約８４％、少なくとも約８５％、少なくとも約８６％、少なくとも約８７％、少なくとも約８８％、少なくとも約８９％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、および少なくとも約９９％からなる群より選択されるパーセンテージを含む、抗体。
（項目５７）
前記抗体がモノクローナル抗体を含む、項目１５、１７、１９、２０、２５、２６、または４７に記載の抗体。
（項目５８）
前記モノクローナル抗体が染色細胞の１％より大きい陽性指示カットオフ値を有する、項目５７に記載の抗体。
（項目５９）
項目５８に記載の抗体であって、前記陽性指示カットオフ値が、
−染色細胞の約２％より大きい
−染色細胞の約３％より大きい
−染色細胞の約４％より大きい
−染色細胞の約５％より大きい
−染色細胞の約６％より大きい
−染色細胞の約７％より大きい
−染色細胞の約８％より大きい
−染色細胞の約９％より大きい、および
−染色細胞の約１０％より大きい
からなる群より選択される、抗体。
（項目６０）
前記モノクローナル抗体が、マウスモノクローナル抗体、ウサギモノクローナル抗体、ヤギモノクローナル抗体、ウマモノクローナル抗体、ニワトリモノクローナル抗体、ヒト化モノクローナル抗体、キメラ抗体、およびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、項目５７に記載の抗体。
（項目６１）
前記抗体がポリクローナル抗体を含む、項目１５、１７、１９、２０、２５、２６、または４７に記載の抗体。
（項目６２）
前記ポリクローナル抗体が、ウサギポリクローナル抗体、マウスポリクローナル抗体、ヤギポリクローナル抗体、ウマポリクローナル抗体、ニワトリポリクローナル抗体、ヒト化ポリクローナル抗体、およびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、項目６１に記載の抗体。
（項目６３）
前記抗体が単離された抗体を含む、項目１５、１７、１９、２０、２５、２６、または４７に記載の抗体。
（項目６４）
前記そのフラグメントがその抗原結合フラグメントを含む、項目１５、１７、１９、２０、２５、２６、または４７に記載の抗体。
（項目６５）
前記抗体またはそのフラグメントに結合しれた標識をさらに含む、項目１５、１７、１９、２０、２５、２６、または４７に記載の抗体。
（項目６６）
標識と結合体化された項目１５、１７、１９、２０、２５、２６、または４７に記載の前記抗体またはそのフラグメントを含む癌診断剤。
（項目６７）
前記標識が、放射性元素、磁気粒子、ラジオアイソトープ、蛍光色素、酵素、毒素、シグナル、染料、検出酵素、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、β−ガラクトシダーゼ、色素原、ファストレッド、３，３’−ジアミノベンジジン、３−アミノ−９−エチルカルバゾール、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリルホスフェート、３，３’，５，５’−テトラメチルベンジジン、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリル−β−Ｄ−グルクロニド、およびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、項目６５に記載の抗体。
（項目６８）
前記標識が、放射性元素、磁気粒子、ラジオアイソトープ、蛍光色素、酵素、毒素、シグナル、染料、検出酵素、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、β−ガラクトシダーゼ、色素原、ファストレッド、３，３’−ジアミノベンジジン、３−アミノ−９−エチルカルバゾール、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリルホスフェート、３，３’，５，５’−テトラメチルベンジジン、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリル−β−Ｄ−グルクロニド、およびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、項目６６に記載の抗体。
（項目６９）
診断または予後診断テストキットであって、
−項目１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１５、１７、１９、２０、２５、２６、または４７に記載の抗体またはそのフラグメント、および
−抗原に結合したときの前記抗体または前記そのフラグメントの抗体検出エレメント
を含む、キット。
（項目７０）
項目６９に記載のキットを使用して生物学的サンプル中のｐ４０を検出するための方法であって、
−生物学的サンプルを前記抗体またはそのフラグメントと接触させる工程、および
−前記抗体検出エレメントを使用して、前記生物学的サンプル中の抗原との前記抗体または前記そのフラグメントの結合を検出する工程
を包含する、方法。
（項目７１）
前記抗体または前記そのフラグメントがｐ４０に特異的に結合する、項目１５、１７、１９、２０、または２５に記載の抗体。
（項目７２）
癌を検出するための、項目１５、１７、１９、２０、２５、または４７に記載の抗体あるいはそのフラグメントまたは組成物の使用。
（項目７３）
癌を診断または予後診断するための、項目１５、１７、１９、２０、２５、または４７に記載の抗体あるいはそのフラグメントまたは組成物の使用。
（項目７４）
癌の治療の転帰を予測するための、項目１５、１７、１９、２０、２５、または４７に記載の抗体あるいはそのフラグメントまたは組成物の使用。
（項目７５）
癌の治療の効力を評価するための、項目１５、１７、１９、２０、２５、または４７に記載の抗体あるいはそのフラグメントまたは組成物の使用。
（項目７６）
癌の再発を予測するための、項目１５、１７、１９、２０、２５、または４７に記載の抗体あるいはそのフラグメントまたは組成物の使用。
（項目７７）
前記抗体またはそのフラグメントあるいは組成物の前記使用が、自動化染色デバイス上で実施される、項目７２に記載の抗体またはそのフラグメントあるいは組成物。
（項目７８）
前記検出が手動で行われる、項目７２に記載の抗体またはそのフラグメントあるいは組成物。
（項目７９）
前記検出が自動で行われる、項目７２に記載の抗体またはそのフラグメントあるいは組成物。
（項目８０）
前記検出が画像分析によって行われる、項目７２に記載の抗体またはそのフラグメントあるいは組成物。
（項目８１）
項目１５、１７、１９、２０、２５、２６、または４７に記載の抗体またはそのフラグメントが生物学的サンプル中で結合するタンパク質を検出するための方法であって、生物学的サンプルを前記抗体またはそのフラグメントと接触させる工程、および生物学的サンプル中のタンパク質に結合した抗体またはそのフラグメントの存在を検出する工程を包含する、方法。
（項目８２）
前記生物学的サンプルが肺組織、膀胱組織、乳房組織、および前立腺組織を含む、項目８１に記載の方法。
（項目８３）
前記生物学的サンプルが、正常組織、新生物組織、膀胱組織、腎臓組織、卵巣組織、甲状腺組織、子宮内膜組織、腎組織、扁桃腺組織、膵臓組織、結腸組織、リンパ節組織、新生物膵臓組織、胃組織、前立腺組織、肺組織、および乳房組織からなる群より選択される、項目８１に記載の方法。
（項目８４）
前記タンパク質に結合した抗体またはそのフラグメントの存在を前記検出する工程が自動染色デバイス上で実施される、項目８１に記載の方法。
（項目８５）
前記タンパク質に結合した抗体またはそのフラグメントの存在を検出する工程が手動で行われる、項目８１に記載の方法。
（項目８６）
前記タンパク質に結合した抗体またはそのフラグメントの存在を検出する工程が自動で行われる、項目８１に記載の方法。
（項目８７）
前記タンパク質に結合した抗体またはそのフラグメントの存在を検出する工程が画像分析によって行われる、項目８１に記載の方法。
（項目８８）
前記検出する工程が、免疫組織化学（ＩＨＣ）、ＦＦＰＥのＩＨＣ、凍結組織切片のＩＨＣ、免疫細胞化学、およびＥＬＩＳＡからなる群より選択される方法を含む、項目８１に記載の方法。
（項目８９）
生物学的サンプル中の少なくとも２つの異なるタンパク質を検出するための方法であって、
−前記生物学的サンプルを少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントを含む組成物と接触させる工程であって、前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの少なくとも１つが、少なくともｐ４０に特異的に結合して、抗原−抗体複合体を形成する工程、および
−前記抗原−抗体複合体を検出する工程
を包含する、方法。
（項目９０）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントのうちの前記少なくとも１つが少なくともｐ４０に特異的に結合することが、前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの少なくとも１つが少なくともｐ４０に特異的に結合し、そして染色細胞の約１％より大きい陽性指示カットオフ値を有することを含む、項目８９に記載の方法。
（項目９１）
項目９０に記載の方法であって、前記陽性指示カットオフ値が、
−染色細胞の約２％より大きい
−染色細胞の約３％より大きい
−染色細胞の約４％より大きい
−染色細胞の約５％より大きい
−染色細胞の約６％より大きい
−染色細胞の約７％より大きい
−染色細胞の約８％より大きい
−染色細胞の約９％より大きい、および
−染色細胞の約１０％より大きい
からなる群より選択される、方法。
（項目９２）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントが少なくとも１つの第１の一次抗体および少なくとも１つの第２の一次抗体を含む、項目８９に記載の方法。
（項目９３）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つが、配列番号２の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、および配列番号１の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む、項目８９に記載の方法。
（項目９４）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つが、配列番号２の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列の少なくとも約７０％と同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、および配列番号１の核酸配列によってコードされるアミノ酸配列の少なくとも約７０％であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む、項目８９に記載の方法。
（項目９５）
前記少なくとも約７０％同一が、少なくとも約７１％、少なくとも約７２％、少なくとも約７３％、少なくとも約７４％、少なくとも約７５％、少なくとも約７６％、少なくとも約７７％、少なくとも約７８％、少なくとも約７９％、少なくとも約８０％、少なくとも約８１％、少なくとも約８２％、少なくとも約８３％、少なくとも約８４％、少なくとも約８５％、少なくとも約８６％、少なくとも約８７％、少なくとも約８８％、少なくとも約８９％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、および少なくとも約９９％からなる群より選択されるパーセンテージを含む、項目９４に記載の方法。
（項目９６）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つが、配列番号３、配列番号４、および配列番号３と配列番号５の混合物からなる群より選択される残基を含むアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、項目８９に記載の方法。
（項目９７）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つが、配列番号３、配列番号４、および配列番号３と配列番号５の混合物からなる群より選択される残基に少なくとも約７０％同一であるアミノ酸配列を有する少なくとも１つのポリペプチドに特異的に結合する、項目８９に記載の方法。
（項目９８）
前記少なくとも約７０％同一が、少なくとも約７１％、少なくとも約７２％、少なくとも約７３％、少なくとも約７４％、少なくとも約７５％、少なくとも約７６％、少なくとも約７７％、少なくとも約７８％、少なくとも約７９％、少なくとも約８０％、少なくとも約８１％、少なくとも約８２％、少なくとも約８３％、少なくとも約８４％、少なくとも約８５％、少なくとも約８６％、少なくとも約８７％、少なくとも約８８％、少なくとも約８９％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、および少なくとも約９９％からなる群より選択されるパーセンテージを含む、項目９７に記載の方法。
（項目９９）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントの前記少なくとも１つが、アメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ）にＡＴＣＣ特許寄託番号ＰＴＡ−１２０１６３で寄託されているハイブリドーマによって産生された抗体またはそのフラグメントを含む、項目８９に記載の方法。
（項目１００）
前記組成物が一次抗体カクテルを含む、項目８９に記載の方法。
（項目１０１）
前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントが少なくとも２つの異なる種に由来する、項目８９に記載の方法。
（項目１０２）
前記少なくとも２つの異なる種が、マウス、ウサギ、ヤギ、ウマ、ニワトリ、ヒト、およびこれらの任意の組み合わせからなる群より選択される、項目１０１に記載の方法。
（項目１０３）
前記生物学的サンプルを二重染色する工程をさらに含む、項目８９に記載の方法。
（項目１０４）
異なる可視化結果を提供する工程をさらに含む、項目８９に記載の方法。
（項目１０５）
前記可視化結果が色の結果を含む、項目１０４に記載の方法。
（項目１０６）
項目８９に記載の方法であって、前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントが、
−ｐ４０およびＤＳＧ−３およびＣＫ５およびナプシンＡ、
−ｐ４０およびＤＳＧ−３およびＣＫ５、
−ｐ４０およびナプシンＡ、
−ｐ４０およびＨＭＷＣＫおよびｐ５０４ｓ、
−ｐ４０およびｐ５０４ｓおよびＣＫ５／１４、
−ｐ４０およびＣＫ５／１４およびＣＫ７／１８、
−ｐ４０およびＣＫ５／１４およびＣＫ８／１８
−ｐ４０およびウロプラキンＩＩおよびウロプラキンＩＩＩ、ならびに
−ｐ４０およびウロプラキンＩＩおよびウロプラキンＩＩＩおよびＧＡＴＡ−３
からなる群より選択されるタンパク質に特異的に各々結合する、方法。
（項目１０７）
項目８９に記載の方法であって、前記少なくとも２種の抗体またはそれらのフラグメントが、
−ｐ４０およびＤＳＧ−３およびナプシンＡ、
−ｐ４０およびＤＳＧ−３、ならびに
−ｐ４０およびＣＫ５
からなる群より選択されるタンパク質に特異的に各々結合する、方法。
（項目１０８）
項目８９に記載の方法であって、前記抗原−抗体複合体を検出する前記工程が前記サンプル上の少なくとも２つの抗原−抗体複合体の形成を検出する工程を含み、ここで、前記第１の抗体がｐ４０に特異的に結合し、前記第２の抗体が、ＤＳＧ−３、ＣＫ４、ナプシンＡ、ＨＭＷＣＫ、ｐ５０４ｓ、ＣＫ５／１４、ＣＫ７／１８、ＣＫ８／１８、ウロプラキンＩＩ、ウロプラキンＩＩＩ、ＧＡＴＡ−３、およびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される抗原に特異的に結合する、方法。
（項目１０９）
動物またはヒトにおけるｐ４０タンパク質を検出するための免疫アッセイ方法であって、
−試験される動物またはヒトから組織を入手する工程、
−前記組織中に前記タンパク質が存在するならば、前記組織を項目１５、１７、１９、２０、２５、２６、または４７に記載の抗体またはそのフラグメントと、前記抗体またはそのフラグメントがｐ４０タンパク質に結合するような量および条件下で接触させる工程、および
−前記結合した抗体の存在を検出する工程
を包含する、方法。
（項目１１０）
前記組織を固定または凍結する工程をさらに包含する、項目１０９に記載の動物またはヒトにおいてｐ４０タンパク質を検出するための免疫アッセイ方法。
（項目１１１）
ｐ４０に対するエピトープをアンマスクするために前記固定組織または凍結組織を処理する工程をさらに含む、項目１１０に記載の動物またはヒトにおけるｐ４０タンパク質を検出するための免疫アッセイ方法。
（項目１１２）
免疫組織化学（ＩＨＣ）、ＦＦＰＥのＩＨＣ、凍結組織切片のＩＨＣ、免疫細胞化学、およびＥＬＩＳＡからなる群より選択される方法を用いて、前記動物またはヒトにおいて前記ｐ４０タンパク質を検出する工程をさらに包含する、項目１０９に記載のｐ４０タンパク質を検出するための免疫アッセイ方法。
（項目１１３）
ｐ４０タンパク質に特異的に結合する抗体の単離された調製物であって、前記抗体が、配列番号３、配列番号４、および配列番号３と配列番号５の混合物からなる群より選択されるエピトープに結合する、調製物。