【誤訳訂正書】
【提出日】平成29年8月14日(2017.8.14)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】特許請求の範囲
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
患者の皮膚組織試料におけるバイオマーカー発現プロファイルのスペクトル配列パターンを検出する方法であって、
（ｉ）健康な皮膚と関連する正常皮膚表皮でバイオマーカーのピークが検出されないことと比較した場合に、ある皮膚腫瘍の種類に関連する良性、前悪性、又は悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中の、特徴的な吸収波数である１０５５ｃｍ−１でのＤＮＡ／ＲＮＡのピークに対応する、バイオマーカーの存在を識別する工程；
（ｉｉ）ある皮膚腫瘍の種類に関連する良性、前悪性、又は悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、その変動範囲内で低、中、又は高として相違する前記バイオマーカーの発現ピーク値を検出する工程；
（ｉｉｉ）ある皮膚腫瘍の種類に関連する良性、前悪性、又は悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中の、特徴的な吸収波数である１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１でのＤＮＡ／ＲＮＡのピークに対応する、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中のピークのパターン化された出現を識別する工程；
（ｉｖ）正常皮膚表皮に特異的な前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の発現ピーク値と比較した場合に、ある皮膚腫瘍の種類に関連する良性、前悪性、又は悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、その変動範囲内で低、中、又は高として、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の発現ピーク値を検出する工程；並びに、
（ｖ）ある皮膚腫瘍の種類に関連する良性、前悪性、又は悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的なスペクトルパターンを伴う、腫瘍性皮膚表皮におけるＤＮＡ及びＲＮＡの核酸の特異的発現に対応する、ＩＲスペクトルにおけるＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中のピークを伴う連続的に検出されたバイオマーカーのＤＮＡ／ＲＮＡピークのスペクトルパターンを決定する工程；
を含む、方法。
【請求項２】
患者の組織試料において良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患をインビトロで検出するために；並びに／又は、組織試料において皮膚癌の発症リスクがある患者若しくは組織試料において皮膚癌の進行リスクがある患者をインビトロで識別するために；並びに／又は、患者の組織試料において皮膚癌の治療の有効性をインビトロで評価するために；並びに／又は、患者の組織試料において皮膚癌治療の最も効果的な投薬量をインビトロで評価するために、バイオマーカー発現プロファイルのスペクトル配列パターンを監視する方法を更に含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１でのＤＮＡ／ＲＮＡトライアドで発現されたピークのパターン化された出現を伴う１０５５ｃｍ−１でのバイオマーカーのピーク発現のスペクトル配列パターンの決定が、良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患に特異的である、ボーエン病に関連する前悪性の腫瘍性皮膚疾患、悪性黒色腫に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的である、基底細胞癌に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的である、扁平上皮癌に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的である、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４】
良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患のバイオマーカー発現プロファイルの前記スペクトル配列パターンは更に、
ＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピーク中の約１０７１ｃｍ−１及び１０８４／１０８５ｃｍ−１での２つのピーク又は約１０８４／１０８５ｃｍ−１での１つのピークを伴う１〜２の間のバイオマーカーのスペクトル配列パターンの検出、ここで、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンは優勢であり；
約１０５５ｃｍ−１での、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中のバイオマーカーの非定常ピークの発現の検出；
約１０８４／１０８５ｃｍ−１での、前記両方のバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける最も優勢且つ安定なピーク発現の検出；
数値範囲が０．１７〜０．２４の範囲内である及び／若しくは０．２１の平均値である、約１０５５ｃｍ−１でのバイオマーカーの平均ピーク発現値の検出；
数値範囲が０．１６〜０．２２の範囲内である及び／若しくは０．１９の平均値である、約１０７１ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出；
数値範囲が０．１９〜０．２７の範囲内である及び／若しくは０．２３の平均値である、約１０８４／１０８５ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出；並びに／又は、
約１０５３〜１０５５ｃｍ−１での、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中のバイオマーカーの最も優勢な左へシフトした平均ピーク位置の検出；
を含む、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項５】
ボーエン病に関連する前悪性の腫瘍性皮膚疾患のバイオマーカー発現プロファイルの前記スペクトル配列パターンは更に、
ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の約１０８４／１０８５ｃｍ−１での１つのピークを伴う１つのバイオマーカーのスペクトル配列パターンの検出；
約１０５５ｃｍ−１での、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中のバイオマーカーの非定常ピークの発現の検出；
数値範囲が０．１５〜０．２６の範囲内である及び／若しくは０．２１の平均値である、約１０５５ｃｍ−１でのバイオマーカーの平均ピーク発現値の検出；
約１０８４／１０８５ｃｍ−１での、前記１つのバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける最も優勢且つ安定なピーク発現の検出；
数値範囲が０．１８〜０．２９の範囲内である及び／若しくは０．２４の平均値である、約１０８４／１０８５ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出；並びに／又は、
約１０５２〜１０５３ｃｍ−１内での、腫瘍性表皮の全体に渡り測定されたＩＲスペクトル中のバイオマーカーの最も優勢な左へシフトした平均ピーク位置の検出；
を含む、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項６】
悪性黒色腫に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患のバイオマーカー発現プロファイルの前記スペクトル配列パターンは更に、
ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の、約１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１での３つのピーク又は１０８４／１０８５ｃｍ−１及び１０９５ｃｍ−１での２つのピークを伴う１〜２の間のバイオマーカーのスペクトル配列パターンの検出；
約１０５５ｃｍ−１での、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中のバイオマーカーの定常ピークの発現の検出；
数値範囲が０．１４〜０．２６の範囲内である及び／若しくは０．２１の平均値である、約１０５５ｃｍ−１でのバイオマーカーの平均ピーク発現値の検出、ここで、最も高いピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンの特徴であり、最も低いピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンの特徴であり；
約１０８４／１０８５ｃｍ−１での、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける最も優勢なピーク発現の検出；
約１０９５ｃｍ−１での、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける最も優勢なピーク発現の検出；
約１０８４／１０８５ｃｍ−１での、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける０．２９の平均ピーク発現値、及び前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける０．２７の平均ピーク発現値の検出；
約１０７１ｃｍ−１での、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける０．２７の平均ピーク発現値の検出；
約１０９５ｃｍ−１での、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける０．３０の平均ピーク発現値、及び前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける０．１８の平均ピーク発現値の検出；並びに／又は、
約１０５０〜１０５４ｃｍ−１内での、腫瘍性表皮の全体に渡り測定されたＩＲスペクトル中の最もバイオマーカーの優勢な左へシフトした平均ピーク位置の検出；
を含む、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項７】
基底細胞癌に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患のバイオマーカー発現プロファイルの前記スペクトル配列パターンは更に、
ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の、約１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１での３つのピーク、１０８４／１０８５ｃｍ−１及び１０９５ｃｍ−１での２つのピーク、若しくは１０８４／１０８５ｃｍ−１での１つのピークを伴う１〜３の間のバイオマーカーのスペクトル配列パターンの検出、ここで、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の１０８４／１０８５ｃｍ−１での１つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンは優勢であり；
約１０５５ｃｍ−１での、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中のバイオマーカーの定常ピークの発現の検出；
数値範囲が０．０９〜０．４７の範囲内である及び／若しくは０．２９の平均値である、約１０５５ｃｍ−１でのバイオマーカーの平均ピーク発現値の検出、ここで、低、中及び高ピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の１つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンの特徴であり、中ピーク値は、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンの特徴であり、及び高ピーク値は、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンの特徴であり；
約１０８４／１０８５ｃｍ−１での、前記バイオマーカーの３つのスペクトル配列パターンの全てにおける最も優勢なピーク発現の検出；
前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターン中の０．４８である；前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターン中の０．２３である；又は前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の１つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターン中の０．１６〜０．４５の数値範囲内である、約１０８４／１０８５ｃｍ−１でのバイオマーカーの平均ピーク発現値の検出；
前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うスペクトル配列パターン中の０．３６である、約１０７１ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出；
前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターン中の０．３６である；及び前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターン中の０．０８である、約１０９５ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出；並びに／又は、
１０６１ｃｍ−１までの間の、腫瘍性表皮の全体に渡り測定されたＩＲスペクトル中のバイオマーカーの優勢な右へシフトした平均ピーク位置の検出；
を含む、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項８】
扁平上皮癌に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患のバイオマーカー発現プロファイルの前記スペクトル配列パターンは更に、
ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の、約１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１での３つのピーク、約１０８４／１０８５ｃｍ−１及び１０９５ｃｍ−１での２つのピーク、若しくは約１０８４／１０８５ｃｍ−１での１つのピークを伴う１〜３の間のバイオマーカーのスペクトル配列パターンの検出；
約１０５５ｃｍ−１での、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中のバイオマーカーの定常ピークの発現の検出；
０．１３〜０．６６の数値範囲内である及び／若しくは０．３６の平均値である、約１０５５ｃｍ−１でのバイオマーカーの平均ピーク発現値の検出、ここで、０．６６の高ピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の１つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンの特徴であり、０．１３の低ピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンの特徴であり、及び０．３０の中ピーク値は、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンの特徴であり；
約１０５５ｃｍ−１での、前記高平均ピーク値０．６６を伴うＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の１つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトルパターン中のバイオマーカーの最も優勢なピーク発現の検出；
０．１６〜０．６５の数値範囲内である及び／若しくは０．３７の平均値である、約１０８４／１０８５ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出、ここで、０．６５の最も高いピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の１つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンの特徴であり、０．２９の中ピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンの特徴であり、及び０．１６の最も低いピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンの特徴であり；
前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターン中の低平均ピーク値０．１６を伴う、約１０８４／１０８５ｃｍ−１でのバイオマーカーの最も優勢なピーク発現の検出；
前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターン中の中平均ピーク値０．３５を伴う、約１０７１ｃｍ−１でのバイオマーカーの最も優勢なピーク発現の検出；
前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターン中の０．１１〜０．３５の範囲内である、約１０７１ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出；
０．１４〜０．３４の数値範囲内である及び／若しくは０．２４の平均値である、約１０９５ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出、ここで、０．３４の最も高いピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴う、バイオマーカー発現のスペクトル配列パターンの特徴であり、及び０．１４の最も低いピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴う、バイオマーカーのスペクトル配列パターンの特徴であり；並びに／又は、
１０６０ｃｍ−１までの間の、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトル中のバイオマーカーの最も優勢な右へシフトした平均ピーク位置の検出；
を含む、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項９】
任意に入手した、腫瘍性表皮の全体に渡るバイオマーカー発現のスペクトル配列パターン中のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの平均発現値と、皮膚組織試料の健常表皮からのスペクトル配列パターン中のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの平均発現値と、を対比する工程を更に含み、
ここで、１０７１ｃｍ−１でのピークの０．５０の平均発現値を伴う、バイオマーカーの非ピーク発現、１０８４／１０８５ｃｍ−１でのピークの０．３０の平均発現値、及び１０９５ｃｍ−１でのピークの０．５０の平均発現値が、比較のための正常コントロールとして用いられる、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項１０】
患者の組織試料における良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患をインビトロで診断するために、及び／又は組織試料における皮膚癌の発症リスクがある患者をインビトロで識別するために、及び／又は組織試料における皮膚癌の進行リスクがある患者をインビトロで識別するために、及び／又は患者の組織サンプルにおける皮膚癌の治療の有効性をインビトロで評価するために、請求項１又は２に記載の前記バイオマーカー発現プロファイルのスペクトル配列パターン及びその特性を検出するための、ＦＴＩＲマイクロ分光器の使用。
【請求項１１】
患者の組織試料における良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患のインビトロでの診断のための、及び／又は組織試料における皮膚癌の発症リスクがある患者のインビトロでの識別のための、及び／又は組織試料における皮膚癌の進行リスクがある患者のインビトロでの識別のための、及び／又は患者の組織サンプルにおける皮膚癌の治療の有効性のインビトロでの評価のための分子バイオマーカーとして用いるための、ＦＴＩＲ分光法において１０５５ｃｍ−１で有意なスペクトルパラメーターを有するＤＮＡ及びＲＮＡの核酸分子であって、
（ｉ）試料における腫瘍性表皮皮膚組織中、良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、ＦＴＩＲ分光法による１０５５ｃｍ−１での特徴的な吸収波数を伴うＤＮＡ及びＲＮＡの分子に対応する、ＩＲスペクトル中でのＤＮＡ及びＲＮＡの２つのスペクトルラインの多重項、
ここで、測定されたＩＲスペクトルの全数中の多重項の非定常的検出は、良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患又はボーエン病に関連する前悪性の腫瘍性皮膚の特徴であり、並びに測定されたＩＲスペクトルの全数中の多重項の定常的検出は、基底細胞癌、扁平上皮癌、及び悪性黒色腫に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり；
（ｉｉ）試料における腫瘍性表皮皮膚組織中、良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、ＦＴＩＲ分光法による１０５５ｃｍ−１でのＤＮＡ及びＲＮＡの核酸分子の特異的な定性的ピーク発現、
ここで、左へシフトしたバイオマーカーのピークの平均位置は、良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患、ボーエン病に関連する前悪性の腫瘍性皮膚疾患、又は悪性黒色腫に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり、並びに右へシフトしたバイオマーカーのピークの平均位置は、基底細胞癌及び扁平上皮癌の特徴であり；
（ｉｉｉ）試料における腫瘍性表皮皮膚組織中、良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、ＦＴＩＲ分光法による１０５５ｃｍ−１での、ＤＮＡ及びＲＮＡの核酸分子の特異的な定量的ピーク発現、
ここで、約０．２０の平均ピーク発現値は、良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患、ボーエン病に関連する前悪性の腫瘍性皮膚疾患、又は悪性黒色腫に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり、約０．２９の平均ピーク発現値は、基底細胞癌に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり、及び約０．３６の平均ピーク発現値は、扁平上皮癌に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり、
（ｉｖ）試料における腫瘍性表皮皮膚組織中、良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、ＤＮＡ及びＲＮＡトライアド中の１０７１、１０８４／１０８５、及び１０９５ｃｍ−１での特徴的な吸収波数を伴うＤＮＡ及びＲＮＡの核酸分子の特異的な発現、
ここで、１０５５ｃｍ−１、１０７１ｃｍ−１、及び１０８４／１０８５ｃｍ−１で区別された特有のＩＲ検出を伴う、腫瘍性表皮皮膚組織中で発現したＤＮＡ及びＲＮＡの分子は、良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり、
１０５５ｃｍ−１及び１０８４／１０８５ｃｍ−１で区別された特有のＩＲ検出を伴う、腫瘍性表皮皮膚組織中で発現したＤＮＡ及びＲＮＡの分子は、良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患、ボーエン病に関連する前悪性の腫瘍性皮膚疾患、並びに基底細胞癌及び扁平上皮癌に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり、
１０５５ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１で区別された特有のＩＲ検出を伴う、腫瘍性表皮皮膚組織中で発現したＤＮＡ及びＲＮＡの分子は、基底細胞癌、扁平上皮癌、及び悪性黒色腫に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり、並びに／又は、
１０５５ｃｍ−１、１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１で区別された特有のＩＲ検出を伴う、腫瘍性表皮皮膚組織中で発現したＤＮＡ及びＲＮＡの分子は、基底細胞癌、扁平上皮癌、及び悪性黒色腫に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴である、
により特徴付けられる、ＤＮＡ及びＲＮＡの核酸分子。
【請求項１２】
インビトロで各患者におけるある皮膚腫瘍の種類及び／又は悪性度を示すのに用いるための、請求項１１に記載の核酸。
【請求項１３】
インビトロで各患者に最も効果的な治療法及び／又は各患者に最も効果的な投薬量の決定に用いるための、請求項１１に記載の核酸。
【請求項１４】
前記良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患が、良性色素性母斑、ボーエン病、基底細胞癌、扁平上皮癌、悪性黒色腫からなる群から選択され、他の良性、前悪性及び悪性の腫瘍性皮膚疾患も含まれる、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項１５】
他のヒト器官からの組織試料も使用される、請求項１又は２に記載の方法。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【発明の詳細な説明】
【発明の名称】赤外線分光法による皮膚癌バイオマーカーの検出
【技術分野】
【０００１】
本発明は、一般に、１０５５ｃｍ−１への多重項のＩＲ（赤外線）スペクトルの割り当てにより、生検から得られたヒト皮膚表皮腫瘍組織におけるバイオマーカーの確認の分野に関する。より詳細には、本発明は、扁平上皮癌（ＳＣＣ）、基底細胞癌（ＢＣＣ）、及び悪性黒色腫（ＭＭ）に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、ボーエン病（ＢＤ）に関連する前悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、並びに良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、ヒト表皮におけるＤＮＡ／ＲＮＡ比ピークの存在を確認するための検出方法であるＩＲ分光法を包含する。バイオマーカーバンドの特異性及び感受性は、皮膚腫瘍の種類及びその進行と相関しており、患者における治療の予後及び予測を決定する。ヒト皮膚表皮腫瘍組織におけるバイオマーカーの定性及び定量評価は、全て共に、表皮の皮膚癌及び前癌状態の予後、診断、及び予測を示す。１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１でのＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの出現パターンと共に多重項を検出することは更に、ある種類の腫瘍及び悪性腫瘍との関係を示し、また、悪性腫瘍の進行及び悪性腫瘍への進行を示す。
【０００２】
皮膚組織が代表的な組織として使用されるが、当該バイオマーカー検出方法は、皮膚表皮組織の測定に限らず、当業者にとって明白である他の組織にも利用可能である。
【背景技術】
【０００３】
表皮皮膚癌の臨床診断の特異性及び感受性は、およそ４０〜８０％の間で様々である。診断精度は主に訓練の長さおよび臨床医の経験に依存するものであり、訓練を受けた皮膚科医の場合は８０％、シニアレジスタ（ｓｅｎｉｏｒ  ｒｅｇｉｓｔａｒｓ）の場合は６２％、レジスタ（ｒｅｇｉｓｔａｒｓ）の場合は５６％、及び非皮膚科医の場合はおよそ４０％であると報告されている。それ故、最も一般的な皮膚がんである基底細胞がん（ＢＣＣ）の臨床診断精度は、熟練の（ｐｒａｃｔｉｓｉｎｇ）皮膚科医の場合でも僅か６５％である。表皮の中間部分から生じる別の皮膚癌である扁平上皮癌（ＳＣＣ）は、典型的な臨床症例では診断が容易であるが、生殖器及び唇に位置する際には診断が難しい場合があり、誤診及び急激な転移に繋がり、患者の約７５％が死亡する。ボーエン病（上皮内癌）及び他の多くの疾患等の前癌性皮膚病は、他の多くの皮膚病変がそれらに類似した症状を呈するため、皮膚科臨床での診断が難しい場合が多い。悪性黒色腫（ＭＭ）の臨床診断は、多くの場合、良性色素性病変と混同される可能性があり、最大で生検の８０％は不必要なものである。重要なことに、ＭＭと診断された患者は、その残りの寿命の間監視され、局所再発、転移、及び新たな悪性病変に関して検査されるべきである。
【０００４】
ダーモスコピーは、形態パターン認識を確立するための多数の特性に基づき、表皮皮膚癌及び前癌状態の診断精度を向上するものと報告されている。それにもかかわらず、これらパターンの認識は皮膚科の長い訓練を必要とし、未だ多くの症例が専門家の間で大きく異なって解釈されている。
【０００５】
共焦点顕微鏡検査は、表皮におけるケラチノサイトの細胞画像の解釈に基づく、また、標準的な組織学との相関関係と関連する病理関連パターンの細胞形態認識に基づく表皮皮膚癌及び前癌状態の診断において有用であり得る。この技術は表皮皮膚癌及び前癌状態の診断精度を向上させるが、ある皮膚病変については限界があると記載されている。
【０００６】
形態パターン認識による生検から得られたがん組織の従来の組織病理的同定は、依然として皮膚腫瘍の臨床診断の究極的な基準であるが、組織病理的評価の主要な欠点は診断の遅れ及び病理学者間の解釈のばらつきである。
【０００７】
偽陰性の結果を低減するために、より短い時間枠で「症例を決定するのが困難である」診断潜在性を向上させる新規かつ補足的な（ｃｏｍｐｌｉｍｅｎｔａｒｙ）診断技術に対する要求が増大していると感じられる。よって、皮膚腫瘍の臨床診断を補足し（ｃｏｍｐｌｉｍｅｎｔ）、理想的にはヒトの解釈に代わる、リアルタイムの一次及び追跡スクリーニングに適用可能な、新規且つ迅速な非侵襲的診断技術に対する緊急の必要性が今日の臨床的皮膚科学には存在する。
【０００８】
赤外線（ＩＲ）顕微分光法は、いずれかの解剖学的位置にある生検から得られた未染色組織の分光評価ツールである。外部の対比誘導剤を必要としない、固有の特性及び化学組成に基づく細胞成分の可視化が容易になると、この技術によって、試料特異的な分子情報、核酸、タンパク質、脂質、水の分子に独特なスペクトルフィンガープリントが得られ、それにより、疾病に関する診断マーカーを得るための潜在的なルートが得られる。
【０００９】
癌組織の分光分析は、様々なヒトの癌から得られた試料における生化学的ばらつきに対する感受性のために、診断技術としてかなりの注目を集めている。
【００１０】
皮膚組織ＩＲ吸光度スペクトルは、臨床的に有用なバイオマーカー開発のための全ての特性に適合する。細胞において最も豊富な種であるタンパク質は、皮膚を含む細胞及び組織で観察されたスペクトルにおいて優位を占めるが、その理由は、それらにおけるタンパク質のコンシステンスが約６０％であるからである。良性、前癌性、及び悪性皮膚癌からのＩＲスペクトルにおける核酸は、常にタンパク質の存在下で観察されている。核酸ＤＮＡ及びＲＮＡは、タンパク質の同一性及び構造を決定する遺伝情報をその構造内に有するため、特に重要である。中ＩＲ吸収スペクトルは、核酸の構造及びそれらの構造遷移に対する高い感受性、塩基組成の同定、塩基対相互作用効果及び塩基積み重ね効果に対する感受性等のため、細胞の全プロテオミクスを表す最も情報に富んだ簡潔な方法の１つである。これにより、ＩＲ分光技術は、個々のヌクレオチドに関連する情報が得られるに過ぎない別の振動分光技術であるラマン分光法よりも有利である。
【００１１】
最近の報告は、形態変化が出現する前に培養中の癌細胞における生物学的活性のスペクトル変化を同定する結果に基づくＦＴ（フーリエ変換）ＩＲ分光法を、潜在的に強力な高感度分析法として実証し、それにより、良性、前癌性、及び悪性皮膚病変からのＩＲスペクトルに現れた核酸及びタンパク質に関する分子内及び分子間相互作用の分析に基づいてヒト皮膚腫瘍における皮膚癌発生を一般的且つ特異的に特徴付けている。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１２】
方法論的利点により、本発明の目的は、表皮皮膚癌及び前癌状態の予後、診断、及び予測に有用な、ヒト皮膚組織中の正常な（健康で変化していない）細胞と癌細胞とを明らかに区別することができる矛盾のない有意なスペクトルパラメータ（バイオマーカー）を決定し且つ検証することである。
【００１３】
ヒト皮膚組織からのＩＲスペクトルにおける皮膚癌バイオマーカーバンドの照合及び検証は、更に、各患者における最も有効な療法の決定及び薬物の最も有効な投薬量の決定にさえ影響を及ぼす可能性があり、個別化医療の分野を支援するものである。
【課題を解決するための手段】
【００１４】
本発明は、１０５５ｃｍ−１での多重項を検出するために、ＦＴＩＲ顕微分光法を使用する方法を提示するものであり、表皮皮膚組織における当該多重項の存在及び発現の増大は、表皮皮膚癌及び前癌状態の診断及び経過観察のための標示である。本発明の方法は、生検された腫瘍皮膚組織試料のＩＲスペクトルにおいて、核酸、即ちＤＮＡ及びＲＮＡの２つのバンドの強度比を同定することに基づいている。より詳細には、提供されるバイオマーカー検出方法は、正常な表皮皮膚組織では検出されない、表皮腫瘍皮膚組織において同定された１０５５ｃｍ−１での多重項の定性及び定量分析のための、試薬を使わない高速法である。１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１でのＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの出現パターンと共に多重項を検出することは更に、ある種類の腫瘍及び悪性腫瘍との関係を示し、また、悪性腫瘍の進行及び悪性腫瘍への進行を示している。
【００１５】
本方法は手動で行うことができ、且つ以下の工程を含む：
●試料の表皮における多数の組織病理学的に証明された病理部位、理想的には全病理部分の至る所でＦＴＩＲスペクトルを得る工程；
●個体の各試料内の病理部位とのスペクトル比較のために、変化していない健康な表皮全体にわたって対照測定値を得る工程；
●スペクトルの各々をアミドＩピーク（１６５０ｃｍ−１）に対して正規化する工程；
●全ての表皮測定値を平均して試料の平均を得る工程；
●９００〜１３００ｃｍ−１間の核酸に特異的な領域において、１０５５ｃｍ−１に多重項を割り当てる工程；
●前記９００〜１３００ｃｍ−１間の核酸に特異的な領域において、１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１でのＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中のピークを割り当てる工程；
●前記割り当てられたＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークのパターン化された出現と共に、バイオマーカーの割り当てられたＤＮＡ／ＲＮＡ比のピークのスペクトル配列パターンを決定する工程。
【００１６】
上記方法では、以下の工程により、ＦＴＩＲ顕微分光法を用いることによる測定のために、組織病理学的診断が確立された生検組織試料を調製する：
●６μｍの厚さを有する厳密に連続する２つの試料カット；
●組織病理学的評価を行うために、１つの試料カットをヘマトキシリン及びエオシンで染色する工程；
●ＦＴＩＲスペクトルを収集するために、１つの試料カットをＣａＦ２スライドガラス上で風乾させる工程。
【００１７】
本発明の上記特性及び他の特性及び利点の全てを更に説明する。
【発明を実施するための形態】
【００１８】
ここで、本発明の方法を更に説明する。
【００１９】
皮膚組織試料からのＩＲスペクトルを得るために、ＪＥＯＬ社（日本、東京）製ＦＴＩＲ顕微分光器（型式ＩＲ−ＭＡＵ２００）を用いた。各測定の前に、製造業者による機器を用いて準備した試料を使用して較正を行い、ＦＴＩＲ顕微分光器の適切な操作条件を確認した。
【００２０】
ＦＴＩＲ顕微分光法のために用いられる組織試料は乾燥状態であったが、病理関連組織構造を同定するために、光学顕微鏡により観察される対応スライドをヘマトキシリン及びエオシンで染色した。
【００２１】
最初に、バックグラウンドスペクトルを収集した。可視光を用いて測定部位を選択した後、顕微鏡をＩＲモードに変更した。高い信号対雑音比を達成するために、共添加スキャン数を１２７に上げて、測定に使用した開口サイズは２５μｍ×２５μｍであった。４ｃｍ−１の分解能で測定したスペクトルは、８００〜４０００ｃｍ−１の波数範囲に及んだ。
【００２２】
測定された全てのＦＴＩＲスペクトルに適用されるスペクトル前処理方法は、以下の事項を含んでいる：
●必要である場合には、高周波機器のノイズを低減するためのスパイク除去及び平滑化；
●ベースラインのシフトに起因するスペクトル間の相違を排除するためのベースライン補正；
●ペプチド基の水素結合及び分子配座の僅かな変化に対する高い感受性に起因する、約１６５０ｃｍ−１でのアミドＩ正規化；
●９００〜１７００ｃｍ−１領域における選択（ｐｉｃｋ）ピークの割り当て。
【００２３】
本発明の方法は、表皮皮膚癌組織の１０５５ｃｍ−１付近の多重項において、核酸、即ちＤＮＡ及びＲＮＡの２つのバンドの強度比を検出するための以下の工程を含んでいる：
●１０５５ｃｍ−１付近に多重項を割り当てる工程；
●１０５５ｃｍ−１付近に割り当てられた多重項の平均値を算出する工程；
●強度比Ｉ１０５５／Ｉ１２４５を算出する工程。
【００２４】
以下の例で使用されるデータは、徳島大学（日本、徳島）医学部皮膚科学科の生検アーカイブからの組織病理学的に確認された組織試料から得られたものである。
【００２５】
共に、皮膚腫瘍組織試料に使用したデータは、２２名の被験者から抽出した。
【００２６】
表皮皮膚癌患者１１名から測定された８０個のスペクトルからなるデータベースは、４名の健康な被験者の正常な表皮から測定された２１個のスペクトルからなるデータベースと比較して、ＢＣＣ患者６名、ＳＣＣ患者３名、ＭＭ患者２名を含むものであった。
【００２７】
実施例では、前癌性皮膚病であるボーエン病患者２名から測定された６０個のスペクトルからなるデータベース、及び良性複合型である色素性母斑患者４名から測定された４８個のスペクトルからなるデータベースも使用した。
【実施例】
【００２８】
提供された以下の表は、悪性の腫瘍性皮膚疾患（ＢＣＣ、ＳＣＣ、ＭＭ）、前癌性の腫瘍性皮膚疾患（ボーエン病）、及び良性の腫瘍性皮膚疾患（良性色素性母斑）の患者から用いたデータの概要である。
【００２９】
表皮皮膚癌における多重項の検出
皮膚腫瘍バイオマーカー、即ち、１０５５ｃｍ−１でのピークレベルによって表される多重項は、正常な皮膚組織表皮では出現しないので、測定された全ての表皮皮膚がん（ＢＣＣ、ＳＣＣ、及びＭＭ）において有意であった。約１０５５ｃｍ−１でのピークの平均強度は、ＢＣＣ患者では０．０９〜０．４７、ＳＣＣ患者では０．１３〜０．６６、ＭＭ患者では０．１４〜０．２６の範囲でばらつきがあり、よって、それらのばらつき範囲内で低、中、及び高と異なっていた。
【００３０】
実施例１
基底細胞癌（ＢＣＣ）
表１は、ＢＣＣ患者６名における、１０５５ｃｍ−１での多重項の平均値（ばらつきあり）、平均強度比（Ｉ１０５５／Ｉ１２４５）（ばらつきあり）、及び１０５５ｃｍ−１での平均ピーク位置（ばらつきあり）の分析による、バイオマーカーバンドのＩＲスペクトル検出をまとめたものである。
【００３１】
【表１】
2015521024.tif 000001
【００３２】
ＢＣＣ患者６名から提示された５２個のスペクトルにおいて、強度比Ｉ１０５５／Ｉ１２４５によるバイオマーカーバンドの強度は、０．５９〜０．９６の範囲でばらつきがあった。
【００３３】
４名の患者において、バイオマーカーの強度レベルとは無関係に、多重項の平均ピーク位置が右にシフトしていることが観察された。にもかかわらず、バイオマーカーの平均ピーク位置のばらつきの右へのシフトは、全ＢＣＣ患者で見られた。
【００３４】
実施例２
扁平上皮がん（ＳＣＣ）
表２は、ＳＣＣ患者３名における、１０５５ｃｍ−１での多重項の平均値（ばらつきあり）、平均強度比（Ｉ１０５５／Ｉ１２４５）（ばらつきあり）、及び１０５５ｃｍ−１での平均ピーク位置（ばらつきあり）の分析による、バイオマーカーバンドのＩＲスペクトル検出をまとめたものである。
【００３５】
【表２】
2015521024.tif 000002
【００３６】
ＳＣＣ患者３名からの提示された１７個のスペクトルにおいて、強度比Ｉ１０５５／Ｉ１２４５によるバイオマーカーバンドの強度は、０．７７〜１．００の範囲でばらつきがあった。
【００３７】
ＳＣＣ患者３名において、１０５５ｃｍ−１での多重項の平均ピーク位置のばらつきが右にシフトしていることが観察されたが、平均ピーク位置の右へのシフトは、異なる強度レベルでＳＣＣ患者２名において検出された。
【００３８】
実施例３
悪性黒色腫（ＭＭ）
表３は、ＭＭ患者２名における、１０５５ｃｍ−１の多重項の平均値（ばらつきあり）、平均強度比（Ｉ１０５５／Ｉ１２４５）（ばらつきあり）、及び１０５５ｃｍ−１での平均ピーク位置（ばらつきあり）の分析による、バイオマーカーバンドのＩＲスペクトル検出をまとめたものである。
【００３９】
【表３】
2015521024.tif 000003
【００４０】
ＭＭ患者２名の表皮で得られた１１個のスペクトルにおいて、強度比Ｉ１０５５／Ｉ１２４５によるバイオマーカーバンドの強度は、０．４７〜０．６９の範囲でばらつきがあった。
【００４１】
ＭＭ患者２名において検出可能な多重項の平均ピーク位置の左へのシフトは、１０４３〜１０６４ｃｍ−１間で大きなばらつきを示した。
【００４２】
実施例４
ＢＣＣ対ＳＣＣ対ＭＭ対健康な表皮
表４は、全ての測定された表皮皮膚癌（ＢＣＣ、ＳＣＣ、ＭＭ）患者対健康な被験者における、１０５５ｃｍ−１の多重項の平均値（ばらつきあり）、平均強度比（Ｉ１０５５／Ｉ１２４５）（ばらつきあり）、及び１０５５ｃｍ−１での平均ピーク位置（ばらつきあり）の分析によるバイオマーカーバンドのＩＲスペクトル検出をまとめたものである。
【００４３】
【表４】
2015521024.tif 000004
【００４４】
１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーバンドの有意な平均値は、健康な表皮ではピークが出現しなかったことに対して、ＭＭの場合には０．２０、ＢＣＣの場合には０．３０、及びＳＣＣの場合には０．３６と算出された。
【００４５】
強度比Ｉ１０５５／Ｉ１２４５によるバイオマーカーバンドの強度は、ＭＭの場合には０．５８、互いに同様に、ＢＣＣの場合には０．８３及びＳＣＣの場合には０．８６であった。
【００４６】
バイオマーカーバンドの平均ピーク位置の右へのシフトは、ＢＣＣ患者６名及びＳＣＣ患者３名において同様であり、それぞれ１０５７ｃｍ−１及び１０５８ｃｍ−１であった。ＭＭ患者２名におけるバイオマーカーバンドの大きく変動して左へシフトした平均ピーク位置は、１０５２ｃｍ−１で検出された。
【００４７】
表皮皮膚前癌状態における多重項の検出
前癌性皮膚病であるボーエン病は、皮膚癌の最も初期の形態であり、いわゆる上皮内癌である。未処置の症例は浸潤がんへと進行していくことが報告されている。
【００４８】
実施例１
ボーエン病
表５は、ボーエン病患者２名における、１０５５ｃｍ−１の多重項の平均値（ばらつきあり）、平均強度比（Ｉ１０５５／Ｉ１２４５）（ばらつきあり）、及び１０５５ｃｍ−１での平均ピーク位置（ばらつきあり）の分析によるバイオマーカーバンドのＩＲスペクトル検出をまとめたものである。
【００４９】
【表５】
2015521024.tif 000005
【００５０】
ボーエン病患者２名の表皮で測定された６０個のスペクトルにおいて、患者２名における１３個のスペクトルのみが、バイオマーカーバンド、即ち１０５５ｃｍ−１の多重項の出現を選択的に検出した。
【００５１】
よって、組織病理学的に証明されたボーエン病患者１名において、３個のＩＲスペクトルに基づいて算出されたバイオマーカーバンドの平均値は０．１５であり、０．１３〜０．１６の間で小さなばらつきがあった。強度比Ｉ１０５５／Ｉ１２４５によるバイオマーカーバンドの強度は０．６６であり、０．６３〜０．６９の間でばらつきがあった。１０５３ｃｍ−１の左に位置する平均ピークは、１０５１〜１０５６ｃｍ−１の間でばらつきがあった。
【００５２】
別の組織病理学的に証明されたボーエン病患者において、１０個のＩＲスペクトルに基づいて算出されたバイオマーカーバンドの平均値は０．２６であり、０．２２〜０．２９の間でばらつきがあった。強度比Ｉ１０５５／Ｉ１２４５によるバイオマーカーバンドの強度は０．７７であり、０．６３〜１．００の間でばらつきがあった。他の測定された患者と同様、１０５２ｃｍ−１の左に位置する平均ピークは、１０５０〜１０５７ｃｍ−１の間でばらつきがあった。
【００５３】
実施例２
ボーエン病対ＳＣＣ対健康な表皮
表６は、全ての測定されたＳＣＣ患者、ボーエン病患者対健康な被験者における、１０５５ｃｍ−１の多重項の平均値（ばらつきあり）、平均強度比（Ｉ１０５５／Ｉ１２４５）（ばらつきあり）、及び１０５５ｃｍ−１での平均ピーク位置（ばらつきあり）の分析によるバイオマーカーバンドのＩＲスペクトル検出をまとめたものである。
【００５４】
【表６】
2015521024.tif 000006
【００５５】
検出したバイオマーカーバンドは、ＳＣＣ（ＳＣＣ患者２名において測定された全スペクトルにおいて）と比較すると、ボーエン病患者において測定されたＩＲスペクトル（患者２名の６０個のスペクトルのうち患者２名の１３個のスペクトルにおいてのみ）における出現時には一定ではなく、顕著であった。ボーエン病の場合のバイオマーカーの平均値は０．２１であり、０．１５〜０．２６の間でばらつきがあるが、ＳＣＣの場合のバイオマーカーの平均値は０．３６であり、０．１３〜０．６６の間でばらつきがあった。
【００５６】
強度比Ｉ１０５５／Ｉ１２４５によるバイオマーカーバンドの強度はボーエン病ではより低く、ＳＣＣの場合のバイオマーカーの算出された平均強度が０．８６であり、０．７７〜１．００の間でばらつきがあったのと比べて、平均は０．７２と算出され、０．６６〜０．８１の間でばらつきがあった。
【００５７】
ＳＣＣ患者では平均ピーク位置が１０５７ｃｍ−１と右へシフトしたのと比べて、ボーエン病患者では平均ピーク位置が１０５３ｃｍ−１と左へシフトしていることが明らかに検出される。
【００５８】
良性皮膚腫瘍における多重項の検出
組織病理学的に、母斑細胞（メラノサイト）は通常、表皮の基底層に局在する。それらの増殖は、表皮（境界母斑）、表皮及び真皮（複合母斑）、又は真皮のみ（真皮内母斑）において出現し得る。全ての種類の母斑は、色素性（母斑細胞性、色素細胞性（ｍｅｌａｎｏｃｅｌｌｕｌａｒ））の良性母斑である。
【００５９】
故に、患者４名における良性色素性母斑のＩＲスペクトルの比較表皮を獲得するために、複合母斑の組織病理学的に確認された試料を使用した。
【００６０】
実施例１
良性色素性母斑
表７は、良性色素性母斑、複合母斑型患者４名における、１０５５ｃｍ−１の多重項の平均値（ばらつきあり）、平均強度比（Ｉ１０５５／Ｉ１２４５）（ばらつきあり）、及び１０５５ｃｍ−１での平均ピーク位置（ばらつきあり）の分析によるバイオマーカーバンドのＩＲスペクトル検出をまとめたものである。
【００６１】
【表７】
2015521024.tif 000007
【００６２】
１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーバンドは、全ての良性色素性母斑、複合母斑型患者において検出されたが、一定ではなかった。表皮において、バイオマーカーバンドは、色素性母斑患者４名において得られた合計４８個のスペクトルのうち２６個のスペクトルで、患者１において測定された１２個のスペクトルのうち５個のスペクトルで、患者２において測定された１０個のスペクトル全てで、患者３において測定された８個のスペクトルのうち２個のスペクトルで、及び患者４において測定された１８個のスペクトルのうち９個のスペクトルで検出された。
【００６３】
色素性母斑患者４名において、検出されたバイオマーカーの平均値は０．１７〜０．２４の間でばらつきがあった。
【００６４】
平均強度比Ｉ１０５５／Ｉ１２４５による検出されたバイオマーカーバンドの平均強度は、色素性母斑患者の間では０．５９〜０．７５の範囲であった。
【００６５】
色素性母斑患者において、バイオマーカーの平均ピーク位置は１０５３〜１０５５ｃｍ−１の間と決定され、よってその位置は左にシフトしていた。
【００６６】
実施例２
ＭＭ対ＭＮ対健康な表皮
表８は、全ての測定されたＭＭ、色素性母斑（ＭＮ）（良性複合母斑）患者対健康な被験者における、１０５５ｃｍ−１の多重項の平均値（ばらつきあり）、平均強度比（Ｉ１０５５／Ｉ１２４５）（ばらつきあり）、及び１０５５ｃｍ−１での平均ピーク位置（ばらつきあり）の分析によるバイオマーカーバンドのＩＲスペクトル検出をまとめたものである。
【００６７】
【表８】
2015521024.tif 000008
【００６８】
検出したバイオマーカーバンドは、ＳＣＣ（ＭＭ患者２名において測定された全スペクトルにおいて）と比較すると、色素性母斑患者において測定されたＩＲスペクトル（患者４名において測定された合計４８個のスペクトルのうち２６個のスペクトルのみにおいて）における出現時には一定ではなく、顕著であった。
【００６９】
ＭＭの場合のバイオマーカーの平均値が０．２０であり、０．１４〜０．２６の間でばらつきがあったのと同様、色素性母斑の場合のバイオマーカーの平均値は０．２０であり、０．１７〜０．２４の間でばらつきがあった。
【００７０】
強度比Ｉ１０５５／Ｉ１２４５によるバイオマーカーバンドの強度は、色素性母斑及びＭＭ患者において同様であった。
【００７１】
色素性母斑患者では１０５３ｃｍ−１及びＭＭ患者では１０５２ｃｍ−１と同様に、平均ピーク位置が左にシフトしていることが検出された。唯一の差異は、色素性母斑患者での平均ピークは１０５３〜１０５５ｃｍ−１の間でばらつきがあったが、ＭＭ患者での平均ピークは１０４３〜１０６４ｃｍ−１の間で大きくばらつきがあることである。
【００７２】
ＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピーク（１０７１、１０８４、１０９５ｃｍ−１）パターンを有する多重項（１０５５ｃｍ−１）の腫瘍関連検出
良性、前癌性、及び悪性皮膚腫瘍組織からのＩＲ吸収スペクトルにおいて、１０５５ｃｍ−１の多重項は常に、病理タイプの皮膚腫瘍に関連した、異なる形状及び強度での１０７１、１０８４、及び１０９５ｃｍ−１のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークと結び付いている。
【００７３】
更に、多重項の活性は、異なる表皮皮膚癌の患者のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークにおける最も顕著なピークの活性と相互作用すると報告されている［ＷＯ２０１３／１２３９５０］。
【００７４】
実施例１
基底細胞癌（ＢＣＣ）
表９は、ＢＣＣ患者６名において、表皮で測定された１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーの平均値並びに１０７１、１０８４／１０８５、及び１０９５ｃｍ−１のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの平均値をまとめたものである。
【００７５】
【表９】
2015521024.tif 000009
【００７６】
ＢＣＣ患者全員において、検出された１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーバンドは、１０７１、１０８４／１０８５、及び１０９５ｃｍ−１のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの出現と明らかに関係している。
【００７７】
表９に示された結果は、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークを伴うバイオマーカーの３つのスペクトル配列パターンを同定している：
・１０８４／１０８５ｃｍ−１を伴う１０５５ｃｍ−１（患者４名）
・１０７１、１０８４／１０８５、１０９５ｃｍ−１を伴う１０５５ｃｍ−１（患者１名）
・１０８４／１０８５、１０９５ｃｍ−１を伴う１０５５ｃｍ−１（患者１名）。
【００７８】
実施例２
扁平上皮癌（ＳＣＣ）
表１０は、ＳＣＣ患者３名において、表皮で検出された１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーの平均値並びに１０７１、１０８４／１０８５、及び１０９５ｃｍ−１のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの平均値をまとめたものである。
【００７９】
【表１０】
2015521024.tif 000010
【００８０】
ＳＣＣ患者全員において、検出された１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーバンドは、１０７１、１０８４／１０８５、及び１０９５ｃｍ−１のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの出現と明らかに関係している。
【００８１】
表１０に示された結果は、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークを伴うバイオマーカーの２つのスペクトル配列パターンを同定している：
・１０８４／１０８５ｃｍ−１を伴う１０５５ｃｍ−１（患者１名）
・１０７１、１０８４／１０８５、１０９５ｃｍ−１を伴う１０５５ｃｍ−１（患者１名）
・１０８４／１０８５、１０９５ｃｍ−１を伴う１０５５ｃｍ−１（患者１名）。
【００８２】
実施例３
悪性黒色腫（ＭＭ）
表１１は、ＭＭ患者２名において、表皮で検出された１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーの平均値並びに１０７１、１０８４／１０８５、及び１０９５ｃｍ−１のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの平均値をまとめたものである。
【００８３】
【表１１】
2015521024.tif 000011
【００８４】
ＭＭ患者全員において、検出された１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーバンドは、１０７１、１０８４／１０８５、及び１０９５ｃｍ−１のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの出現と明らかに関係している。
【００８５】
表１１に示された結果は、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークを伴うバイオマーカーの２つのスペクトル配列パターンを同定している：
・１０７１、１０８４／１０８５、１０９５ｃｍ−１を伴う１０５５ｃｍ−１（患者１名）
・１０８４／１０８５、１０９５ｃｍ−１を伴う１０５５ｃｍ−１（患者１名）
【００８６】
実施例４
ボーエン病
表１２は、ボーエン病患者２名において、表皮で検出された１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーの平均値並びに１０７１、１０８４／１０８５、及び１０９５ｃｍ−１のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの平均値をまとめたものである。
【００８７】
【表１２】
2015521024.tif 000012
【００８８】
ボーエン病患者全員において、検出された１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーバンドは、１０８４／１０８５ｃｍ−１のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの出現と明らかに関係している。
【００８９】
表１２に示された結果は、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークを伴うバイオマーカーの１つのスペクトル配列パターンを同定している：
・１０８４／１０８５ｃｍ−１を伴う１０５５ｃｍ−１（患者２名）
【００９０】
実施例５
良性色素性母斑
表５は、良性色素性母斑患者４名において、表皮で検出された１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーの平均値並びに１０７１、１０８４／１０８５、及び１０９５ｃｍ−１のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの平均値をまとめたものである。
【００９１】
【表１３】
2015521024.tif 000013
【００９２】
色素性母斑患者全員において、検出された１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーバンドは、１０７１及び１０８４／１０８５の２つのＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの出現と明らかに関係している。
【００９３】
表１３に示された結果は、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークを伴うバイオマーカーの２つのスペクトル配列パターンを同定している：
・１０８４／１０８５ｃｍ−１を伴う１０５５ｃｍ−１（患者１名）
・１０７１、１０８４／１０８５ｃｍ−１を伴う１０５５ｃｍ−１（患者３名）。
【００９４】
実施例６
健康な表皮対ＢＤ対ＭＮ対ＭＭ対ＢＣＣ対ＳＣＣ
表６は、健康な被験者４名、ボーエン病患者２名、色素性母斑患者４名、ＭＭ患者２名、ＳＣＣ患者３名、及びＢＣＣ患者６名において、表皮で検出された１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーの平均値並びに１０７１、１０８４／１０８５、及び１０９５ｃｍ−１のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの平均値をまとめたものである。
【００９５】
【表１４】
2015521024.tif 000014
【００９６】
表６に示された結果は、表皮で測定された全ての病理（ＢＣＣ、ＳＣＣ、ＭＭ、ボーエン病、良性色素性母斑）において１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーバンドを検出しているが、健康な非病理表皮ではバイオマーカーバンドは検出されていない。
【００９７】
検出された１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーバンドの平均値は、良性の場合には０．２１、前癌状態の場合には０．２１、並びに悪性皮膚腫瘍のＭＭの場合には０．２０、ＢＣＣの場合には０．２９及びＳＣＣの場合には０．３６が有意である。
【００９８】
しかしながら、ＢＣＣ患者６名及びＳＣＣ患者２名におけるバイオマーカーの平均値だけが、ＭＭ患者２名、ＭＮ患者４名、及びボーエン病患者３名におけるバイオマーカーの平均値よりもはるかに高い。
【００９９】
重要なことに、ＭＭ患者２名の表皮で検出されたバイオマーカーバンドは、良性色素性母斑（良性複合母斑）及びボーエン病（前癌性皮膚病）患者には見られない、１０７１、１０８４／１０８５、及び１０９５ｃｍ−１のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピーク全ての出現と強く関連している。ＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピーク全ての出現と共にバイオマーカーバンド検出の同パターンがＳＣＣ及びＢＣＣ患者において観察される。
【０１００】
よって、表皮を測定された良性色素性母斑（良性複合母斑）患者では、１０５５ｃｍ−１のバイオマーカーバンドの検出は、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークのうちの２つである１０７１ｃｍ−１及び１０８４／１０８５ｃｍ−１の出現と関連しているが、１０９５ｃｍ−１とは関連していない。
【０１０１】
ボーエン病患者２名では、検出されたバイオマーカーバンドの平均値０．２０は、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークのうちの１つである１０８４／１０８５ｃｍ−１の出現と関連している。
【０１０２】
特許請求される本発明の方法は、以下の通りである。
１．患者の皮膚組織試料におけるバイオマーカー発現プロファイルのスペクトル配列パターンを検出する方法であって、
（ｉ）健康な皮膚と関連する正常皮膚表皮でバイオマーカーのピークが検出されないことと比較した場合に、ある皮膚腫瘍の種類に関連する良性、前悪性、又は悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中の、特徴的な吸収波数である１０５５ｃｍ−１でのＤＮＡ／ＲＮＡのピークに対応する、バイオマーカーの存在を識別する工程；
（ｉｉ）ある皮膚腫瘍の種類に関連する良性、前悪性、又は悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、その変動範囲内で低、中、又は高として相違する前記バイオマーカーの発現ピーク値を検出する工程；
（ｉｉｉ）ある皮膚腫瘍の種類に関連する良性、前悪性、又は悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中の、特徴的な吸収波数である１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１でのＤＮＡ／ＲＮＡのピークに対応する、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中のピークのパターン化された出現を識別する工程；
（ｉｖ）正常皮膚表皮に特異的な前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の発現ピーク値と比較した場合に、ある皮膚腫瘍の種類に関連する良性、前悪性、又は悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、その変動範囲内で低、中、又は高として、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の発現ピーク値を検出する工程；並びに、
（ｖ）ある皮膚腫瘍の種類に関連する良性、前悪性、又は悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的なスペクトルパターンを伴う、腫瘍性皮膚表皮におけるＤＮＡ及びＲＮＡの核酸の特異的発現に対応する、ＩＲスペクトルにおけるＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中のピークを伴う連続的に検出されたバイオマーカーのＤＮＡ／ＲＮＡピークのスペクトルパターンを決定する工程；
を含む、方法。
【０１０３】
２．患者の組織試料において良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患をインビトロで検出するために；並びに／又は、組織試料において皮膚癌の発症リスクがある患者若しくは組織試料において皮膚癌の進行リスクがある患者をインビトロで識別するために；並びに／又は、患者の組織試料において皮膚癌の治療の有効性をインビトロで評価するために；並びに／又は、患者の組織試料において皮膚癌治療の最も効果的な投薬量をインビトロで評価するために、バイオマーカー発現プロファイルのスペクトル配列パターンを監視する方法を更に含む、請求項１に記載の方法。
【０１０４】
３．１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１でのＤＮＡ／ＲＮＡトライアドで発現されたピークのパターン化された出現を伴う１０５５ｃｍ−１でのバイオマーカーのピーク発現のスペクトル配列パターンの決定が、良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患に特異的である、ボーエン病に関連する前悪性の腫瘍性皮膚疾患、悪性黒色腫に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的である、基底細胞癌に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的である、扁平上皮癌に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的である、請求項１又は２に記載の方法。
【０１０５】
４．良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患のバイオマーカー発現プロファイルの前記スペクトル配列パターンは更に、
ＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピーク中の約１０７１ｃｍ−１及び１０８４／１０８５ｃｍ−１での２つのピーク又は約１０８４／１０８５ｃｍ−１での１つのピークを伴う１〜２の間のバイオマーカーのスペクトル配列パターンの検出、ここで、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンは優勢であり；
約１０５５ｃｍ−１での、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中のバイオマーカーの非定常ピークの発現の検出；
約１０８４／１０８５ｃｍ−１での、前記両方のバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける最も優勢且つ安定なピーク発現の検出；
数値範囲が０．１７〜０．２４の範囲内である及び／若しくは０．２１の平均値である、約１０５５ｃｍ−１でのバイオマーカーの平均ピーク発現値の検出；
数値範囲が０．１６〜０．２２の範囲内である及び／若しくは０．１９の平均値である、約１０７１ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出；
数値範囲が０．１９〜０．２７の範囲内である及び／若しくは０．２３の平均値である、約１０８４／１０８５ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出；並びに／又は、
約１０５３〜１０５５ｃｍ−１での、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中のバイオマーカーの最も優勢な左へシフトした平均ピーク位置の検出；
を含む、請求項１又は２に記載の方法。
【０１０６】
５．ボーエン病に関連する前悪性の腫瘍性皮膚疾患のバイオマーカー発現プロファイルの前記スペクトル配列パターンは更に、
ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の約１０８４／１０８５ｃｍ−１での１つのピークを伴う１つのバイオマーカーのスペクトル配列パターンの検出；
約１０５５ｃｍ−１での、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中のバイオマーカーの非定常ピークの発現の検出；
数値範囲が０．１５〜０．２６の範囲内である及び／若しくは０．２１の平均値である、約１０５５ｃｍ−１でのバイオマーカーの平均ピーク発現値の検出；
約１０８４／１０８５ｃｍ−１での、前記１つのバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける最も優勢且つ安定なピーク発現の検出；
数値範囲が０．１８〜０．２９の範囲内である及び／若しくは０．２４の平均値である、約１０８４／１０８５ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出；並びに／又は、
約１０５２〜１０５３ｃｍ−１内での、腫瘍性表皮の全体に渡り測定されたＩＲスペクトル中のバイオマーカーの最も優勢な左へシフトした平均ピーク位置の検出；
を含む、請求項１又は２に記載の方法。
【０１０７】
６．悪性黒色腫に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患のバイオマーカー発現プロファイルの前記スペクトル配列パターンは更に、
ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の、約１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１での３つのピーク又は１０８４／１０８５ｃｍ−１及び１０９５ｃｍ−１での２つのピークを伴う１〜２の間のバイオマーカーのスペクトル配列パターンの検出；
約１０５５ｃｍ−１での、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中のバイオマーカーの定常ピークの発現の検出；
数値範囲が０．１４〜０．２６の範囲内である及び／若しくは０．２１の平均値である、約１０５５ｃｍ−１でのバイオマーカーの平均ピーク発現値の検出、ここで、最も高いピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンの特徴であり、最も低いピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンの特徴であり；
約１０８４／１０８５ｃｍ−１での、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける最も優勢なピーク発現の検出；
約１０９５ｃｍ−１での、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける最も優勢なピーク発現の検出；
約１０８４／１０８５ｃｍ−１での、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける０．２９の平均ピーク発現値、及び前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける０．２７の平均ピーク発現値の検出；
約１０７１ｃｍ−１での、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける０．２７の平均ピーク発現値の検出；
約１０９５ｃｍ−１での、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける０．３０の平均ピーク発現値、及び前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンにおける０．１８の平均ピーク発現値の検出；並びに／又は、
約１０５０〜１０５４ｃｍ−１内での、腫瘍性表皮の全体に渡り測定されたＩＲスペクトル中の最もバイオマーカーの優勢な左へシフトした平均ピーク位置の検出；
を含む、請求項１又は２に記載の方法。
【０１０８】
７．基底細胞癌に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患のバイオマーカー発現プロファイルの前記スペクトル配列パターンは更に、
ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の、約１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１での３つのピーク、１０８４／１０８５ｃｍ−１及び１０９５ｃｍ−１での２つのピーク、若しくは１０８４／１０８５ｃｍ−１での１つのピークを伴う１〜３の間のバイオマーカーのスペクトル配列パターンの検出、ここで、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の１０８４／１０８５ｃｍ−１での１つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンは優勢であり；
約１０５５ｃｍ−１での、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中のバイオマーカーの定常ピークの発現の検出；
数値範囲が０．０９〜０．４７の範囲内である及び／若しくは０．２９の平均値である、約１０５５ｃｍ−１でのバイオマーカーの平均ピーク発現値の検出、ここで、低、中及び高ピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の１つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンの特徴であり、中ピーク値は、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンの特徴であり、及び高ピーク値は、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターンの特徴であり；
約１０８４／１０８５ｃｍ−１での、前記バイオマーカーの３つのスペクトル配列パターンの全てにおける最も優勢なピーク発現の検出；
前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターン中の０．４８である；前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターン中の０．２３である；又は前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の１つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターン中の０．１６〜０．４５の数値範囲内である、約１０８４／１０８５ｃｍ−１でのバイオマーカーの平均ピーク発現値の検出；
前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うスペクトル配列パターン中の０．３６である、約１０７１ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出；
前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターン中の０．３６である；及び前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターン中の０．０８である、約１０９５ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出；並びに／又は、
１０６１ｃｍ−１までの間の、腫瘍性表皮の全体に渡り測定されたＩＲスペクトル中のバイオマーカーの優勢な右へシフトした平均ピーク位置の検出；
を含む、請求項１又は２に記載の方法。
【０１０９】
８．扁平上皮癌に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患のバイオマーカー発現プロファイルの前記スペクトル配列パターンは更に、
ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の、約１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１での３つのピーク、約１０８４／１０８５ｃｍ−１及び１０９５ｃｍ−１での２つのピーク、若しくは約１０８４／１０８５ｃｍ−１での１つのピークを伴う１〜３の間のバイオマーカーのスペクトル配列パターンの検出；
約１０５５ｃｍ−１での、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトルの全数中のバイオマーカーの定常ピークの発現の検出；
０．１３〜０．６６の数値範囲内である及び／若しくは０．３６の平均値である、約１０５５ｃｍ−１でのバイオマーカーの平均ピーク発現値の検出、ここで、０．６６の高ピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の１つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンの特徴であり、０．１３の低ピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンの特徴であり、及び０．３０の中ピーク値は、ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンの特徴であり；
約１０５５ｃｍ−１での、前記高平均ピーク値０．６６を伴うＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の１つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトルパターン中のバイオマーカーの最も優勢なピーク発現の検出；
０．１６〜０．６５の数値範囲内である及び／若しくは０．３７の平均値である、約１０８４／１０８５ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出、ここで、０．６５の最も高いピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の１つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンの特徴であり、０．２９の中ピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンの特徴であり、及び０．１６の最も低いピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターンの特徴であり；
前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴うバイオマーカーのスペクトル配列パターン中の低平均ピーク値０．１６を伴う、約１０８４／１０８５ｃｍ−１でのバイオマーカーの最も優勢なピーク発現の検出；
前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターン中の中平均ピーク値０．３５を伴う、約１０７１ｃｍ−１でのバイオマーカーの最も優勢なピーク発現の検出；
前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴うバイオマーカー発現のスペクトル配列パターン中の０．１１〜０．３５の範囲内である、約１０７１ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出；
０．１４〜０．３４の数値範囲内である及び／若しくは０．２４の平均値である、約１０９５ｃｍ−１での平均ピーク発現値の検出、ここで、０．３４の最も高いピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の３つのピークを伴う、バイオマーカー発現のスペクトル配列パターンの特徴であり、及び０．１４の最も低いピーク値は、前記ＤＮＡ／ＲＮＡトライアド中の２つのピークを伴う、バイオマーカーのスペクトル配列パターンの特徴であり；並びに／又は、
１０６０ｃｍ−１までの間の、腫瘍性表皮の全体に渡るＩＲスペクトル中のバイオマーカーの最も優勢な右へシフトした平均ピーク位置の検出；
を含む、請求項１又は２に記載の方法。
【０１１０】
９．任意に入手した、腫瘍性表皮の全体に渡るバイオマーカー発現のスペクトル配列パターン中のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの平均発現値と、皮膚組織試料の健常表皮からのスペクトル配列パターン中のＤＮＡ／ＲＮＡトライアドピークの平均発現値と、を対比する工程を更に含み、
ここで、１０７１ｃｍ−１でのピークの０．５０の平均発現値を伴う、バイオマーカーの非ピーク発現、１０８４／１０８５ｃｍ−１でのピークの０．３０の平均発現値、及び１０９５ｃｍ−１でのピークの０．５０の平均発現値が、比較のための正常コントロールとして用いられる、請求項１又は２に記載の方法。
【０１１１】
１０．患者の組織試料における良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患をインビトロで診断するために、及び／又は組織試料における皮膚癌の発症リスクがある患者をインビトロで識別するために、及び／又は組織試料における皮膚癌の進行リスクがある患者をインビトロで識別するために、及び／又は患者の組織サンプルにおける皮膚癌の治療の有効性をインビトロで評価するために、請求項１又は２に記載の前記バイオマーカー発現プロファイルのスペクトル配列パターン及びその特性を検出するための、ＦＴＩＲマイクロ分光器の使用。
【０１１２】
１１．患者の組織試料における良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患のインビトロでの診断のための、及び／又は組織試料における皮膚癌の発症リスクがある患者のインビトロでの識別のための、及び／又は組織試料における皮膚癌の進行リスクがある患者のインビトロでの識別のための、及び／又は患者の組織サンプルにおける皮膚癌の治療の有効性のインビトロでの評価のための分子バイオマーカーとして用いるための、ＦＴＩＲ分光法において１０５５ｃｍ−１で有意なスペクトルパラメーターを有するＤＮＡ及びＲＮＡの核酸分子であって、
（ｉ）試料における腫瘍性表皮皮膚組織中、良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、ＦＴＩＲ分光法による１０５５ｃｍ−１での特徴的な吸収波数を伴うＤＮＡ及びＲＮＡの分子に対応する、ＩＲスペクトル中でのＤＮＡ及びＲＮＡの２つのスペクトルラインの多重項、
ここで、測定されたＩＲスペクトルの全数中の多重項の非定常的検出は、良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患又はボーエン病に関連する前悪性の腫瘍性皮膚の特徴であり、並びに測定されたＩＲスペクトルの全数中の多重項の定常的検出は、基底細胞癌、扁平上皮癌、及び悪性黒色腫に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり；
（ｉｉ）試料における腫瘍性表皮皮膚組織中、良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、ＦＴＩＲ分光法による１０５５ｃｍ−１でのＤＮＡ及びＲＮＡの核酸分子の特異的な定性的ピーク発現、
ここで、左へシフトしたバイオマーカーのピークの平均位置は、良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患、ボーエン病に関連する前悪性の腫瘍性皮膚疾患、又は悪性黒色腫に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり、並びに右へシフトしたバイオマーカーのピークの平均位置は、基底細胞癌及び扁平上皮癌の特徴であり；
（ｉｉｉ）試料における腫瘍性表皮皮膚組織中、良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、ＦＴＩＲ分光法による１０５５ｃｍ−１での、ＤＮＡ及びＲＮＡの核酸分子の特異的な定量的ピーク発現、
ここで、約０．２０の平均ピーク発現値は、良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患、ボーエン病に関連する前悪性の腫瘍性皮膚疾患、又は悪性黒色腫に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり、約０．２９の平均ピーク発現値は、基底細胞癌に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり、及び約０．３６の平均ピーク発現値は、扁平上皮癌に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり、
（ｉｖ）試料における腫瘍性表皮皮膚組織中、良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患に特異的な、ＤＮＡ及びＲＮＡトライアド中の１０７１、１０８４／１０８５、及び１０９５ｃｍ−１での特徴的な吸収波数を伴うＤＮＡ及びＲＮＡの核酸分子の特異的な発現、
ここで、１０５５ｃｍ−１、１０７１ｃｍ−１、及び１０８４／１０８５ｃｍ−１で区別された特有のＩＲ検出を伴う、腫瘍性表皮皮膚組織中で発現したＤＮＡ及びＲＮＡの分子は、良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり、
１０５５ｃｍ−１及び１０８４／１０８５ｃｍ−１で区別された特有のＩＲ検出を伴う、腫瘍性表皮皮膚組織中で発現したＤＮＡ及びＲＮＡの分子は、良性色素性母斑に関連する良性の腫瘍性皮膚疾患、ボーエン病に関連する前悪性の腫瘍性皮膚疾患、並びに基底細胞癌及び扁平上皮癌に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり、
１０５５ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１で区別された特有のＩＲ検出を伴う、腫瘍性表皮皮膚組織中で発現したＤＮＡ及びＲＮＡの分子は、基底細胞癌、扁平上皮癌、及び悪性黒色腫に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴であり、並びに／又は、
１０５５ｃｍ−１、１０７１ｃｍ−１、１０８４／１０８５ｃｍ−１、及び１０９５ｃｍ−１で区別された特有のＩＲ検出を伴う、腫瘍性表皮皮膚組織中で発現したＤＮＡ及びＲＮＡの分子は、基底細胞癌、扁平上皮癌、及び悪性黒色腫に関連する悪性の腫瘍性皮膚疾患の特徴である、
により特徴付けられる、ＤＮＡ及びＲＮＡの核酸分子。
【０１１３】
１２．インビトロで各患者におけるある皮膚腫瘍の種類及び／又は悪性度を示すのに用いるための、請求項１１に記載の核酸。
【０１１４】
１３．インビトロで各患者に最も効果的な治療法及び／又は各患者に最も効果的な投薬量の決定に用いるための、請求項１１に記載の核酸。
【０１１５】
１４．前記良性、前悪性、及び悪性の腫瘍性皮膚疾患が、良性色素性母斑、ボーエン病、基底細胞癌、扁平上皮癌、悪性黒色腫からなる群から選択され、他の良性、前悪性及び悪性の腫瘍性皮膚疾患も含まれる、請求項１又は２に記載の方法。
【０１１６】
１５．他のヒト器官からの組織試料も使用される、請求項１又は２に記載の方法。