【事件の表示】
　特許第６０３８３７４号発明「高純度ＰＴＨ含有凍結乾燥製剤およびその製造方法」の特許異議申立事件について、次のとおり決定する。
【結　論】
　特許第６０３８３７４号の請求項１ないし９に係る特許を維持する。
【理　由】
１．手続の経緯
　特許第６０３８３７４号の請求項１〜９に係る特許についての出願は、２０１２年（平成２４年）５月３１日（国内優先権主張　平成２３年６月７日）を国際出願日として出願した特願２０１３―５１９４６７号の一部を、平成２７年９月１１日に新たに出願した特願２０１５―１７９９１９号の一部を、さらに平成２８年４月４日に新たに出願した特願２０１６―０７５０４３号の一部を、さらに同年６月２３日に新たに特許出願したものであって、同年１１月１１日にその特許権の設定登録がされ、その後、特許異議申立人により請求項１〜９に対して特許異議の申立てがされたものである。
２．本件特許発明  
　特許第６０３８３７４号の請求項１〜９に係る発明（以下、「本件特許発明１」〜「本件特許発明９」という。）は、特許請求の範囲の請求項１〜９に記載された事項により特定される、次のとおりのものであると認める。
「【請求項１】
　ＰＴＨペプチド含有凍結乾燥製剤の検査方法であって、該ＰＴＨペプチド含有凍結乾燥製剤から調製した試料を以下の測定条件で行われる高速液体クロマトグラフィーに付して、下記の類縁物質１’乃至１１’から選ばれる少なくとも１種のＰＴＨ類縁物質を検出及び／又は定量することを特徴とする方法。
＜測定条件＞
検出器：紫外吸光光度計（測定波長：２１４ｎｍ）
カラム：内径４．６ｍｍ、長さ１５０ｍｍのステンレス管に、粒子径３．５μｍの液体クロマトグラフィー用オクタデシル化シリカゲルを充填
カラム温度：４０℃
移動相Ａ：０．２Ｍ硫酸緩衝液（ｐＨ２．３）／アセトニトリル＝９／１（ｖ/ｖ）
移動相Ｂ：０．２Ｍ硫酸緩衝液（ｐＨ２．３）／アセトニトリル＝１／１（ｖ/ｖ）
移動相の送液：移動相Ａ及び移動相Ｂの混合比を表のように変えて濃度勾配制御する
【表１】
流量：毎分１．０ｍＬ
検出時間：試料注入後４５分間
１）類縁物質１’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位および１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が下記構造式（ａ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
【化１】
２）類縁物質２’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位および１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が下記構造式（ｂ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
【化２】
３）類縁物質３’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位および１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
４）類縁物質４’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ａ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
５）類縁物質５’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ａ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
６）類縁物質６’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ｂ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
７）類縁物質７’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
８）類縁物質８’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
９）類縁物質９’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ａ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
１０）類縁物質１０’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の２３位トリプトファンに対応する残基が下記構造式（ｃ−１）又は（ｃ−２）で示されるトリプトファン一酸化物残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
【化３】
１１）類縁物質１１’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ｂ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
【請求項２】
　ＰＴＨ類縁物質が、類縁物質１’乃至６’及び類縁物質９’乃至１１’から選ばれる少なくとも１種である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
　ＰＴＨ類縁物質が、類縁物質４’乃至６’及び類縁物質９’乃至１１’から選ばれる少なくとも１種である、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
　ＰＴＨ類縁物質が、類縁物質９’乃至１１’から選ばれる少なくとも１種である、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
　ＰＴＨ類縁物質が、類縁物質９’である、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
　ＰＴＨペプチド含有凍結乾燥製剤中のＰＴＨペプチド量と全ＰＴＨ類縁物質量の和に対するいずれのＰＴＨ類縁物質の量も１．０％以下、及び、ＰＴＨペプチド量と全ＰＴＨ類縁物質量の和に対する全ＰＴＨ類縁物質量が５．０％以下である製剤を良品と判断する、請求項１〜５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
　更に、高速液体クロマトグラフィー質量分析計を用いて前記ＰＴＨ類縁物質の質量数を検出することを含む、請求項１〜６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８】
　更に、前記クロマトグラム上で単一ピークを与える物質を分取し、当該物質をトリプシン消化して生じるフラグメントの質量数を同定することを含む、請求項１〜７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項９】
　請求項１〜８のいずれか１項に記載の検査方法を実施する工程を含む、ＰＴＨペプチド含有凍結乾燥製剤から成る医薬品の製造方法。」  
３．申立理由の概要  
　特許異議申立人は、証拠として、以下の甲第１号証〜甲第５号証（以下、「甲１」〜「甲５」という。）を提出し、本件特許発明１、６〜９は、甲１〜甲３に記載された技術的事項に基づき、また、本件特許発明１〜９は、甲１〜甲４に記載された技術的事項に基づき、当業者が容易に発明をすることができたものであり、特許法第２９条第２項の規定に違反してされたものであるから、同法第１１３条第２号に該当し、請求項１〜９に係る特許を取り消すべきものである旨主張している。 
  
（証拠一覧） 
甲１：国際公開第２００２／００２１３６号
甲２：James E.Zull et al.、”Characterization of Parathyroid Hormone Fragments Produced by Cathepsin D＊”、THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY、Vo1．260、No．3、pp．1608-1613、1985年
甲３：Char1es A.Fro1ik et al.、“Comparison of Recombinant Human PTH(1-34)(LY333334) with a C-Termina1ly Substituted Ana1og of Human PTH-Related Protein(1-34)(RS-66271)：In Vitro Activity and In Vivo Pharmacological Effects in Rats”、JOURNAL OF BONE AND MINERAL RESEARCH、Vo1ume 14、Number 2、pp．163-172、1999年
甲４：Junyan A.Ji et a1.、“Methionine、Tryptophan、and Histidine Oxidation in a Mode1 Protein、PTH：Mechanism and Stabi1ization”JOURNAL OF PHARMACEUTICAL SCIENCES、VOL．98、NO．12、p．4485-4500、2009年 
甲５：液クロを上手に使うコツ、中村洋監修、丸善株式会社、2005年10月10日第3版発行
４．甲各号証の記載等 
（１）甲１記載の事項 
　甲１には、以下の記載がある。（下線は、当審において付加したもの。以下、同様。）  
  
ア　第１６頁第２３行〜第１７頁第６行
「１．hPTHのHPLCによる分析 
　ペプチドの含量と分解（副成）物の検索に
以下の機器と条件で逆相HPLC
機器：島津LC-9Aシステム 
カラム：YMC PROTEIN-RP(4.6 mmφ×150 mm)
カラム温度：40℃
溶出液：0.1%トリフルォロ酢酸中、アセトニトリル濃度を30分間で25%から40%に直線的に変化させた。
流速：1 mL/分 
検出：UV(210 nm) 
注入量：50μL
イ　第３２頁第３〜１９行
　「試験例１．hPTH(l- 34)の安定性 （ 1 ) 
　hPTHとの塩または付着物として含まれる酢酸を除去したhPTHの安定性について検討した。 
　ガラスバイアルに充填、密閉した参考例１で得られた
hPTH(l- 34)150 mgを含む酢酸含量9.5%の凍結乾燥品を
保管庫で40±1℃の条件下、6ヶ月保存し、保存開始時、保存後に逆相HPLCを行い、保存開始時に存在する分解（副成）物及び保存後に生じる分解（副成）物を単離し、それらの構造を調べた。結果を表２に示す。
　また、保存後の逆相HPLCクロマトグラムを図１に示す。hPTH(l - 3 4)ピークの後方（保持時間１３分〜１７分）にB、CおよびDの３本のピークが現れた。これらのピーク面積％は、表 2に示すように、それぞれB; 3.9%、C; 6.9%、D; 3.0%で、合計13.8%になりhPTH(1-34)劣化の主因であった。また、それぞれのピークの構造解析を行った結果、Bが[Nε-acetyl-Lys 13 ]-hPTH(l-34)と[Nε-acetyl - Lys 26 ]- hPTH (1-34)の混合物、Cが[Nα- acetyl- Ser1 ]-hPTH(1-34)、Dが[Nε- acetyl-Lys 27]-hPTH(l-34)であった。」
ウ
エ
（２）甲１に記載された発明の認定 
　上記（１）の記載を総合すると、甲１には、次の発明が記載されていると認められる。 
  
 「hPTH(l- 34)150 mgを含む酢酸含量9.5%の凍結乾燥品を保管庫で40±1℃の条件下、6ヶ月保存し、保存開始時、保存後に以下の＜機器と条件＞で逆相HPLCを行い、保存開始時に存在する分解（副成）物及び保存後に生じる分解（副成）物を単離し、それらの構造を調べ、結果を表２に示す、方法。
＜機器と条件＞
機器：島津LC-9Aシステム 
カラム：YMC PROTEIN-RP(4.6 mmφ×150 mm)
カラム温度：40℃
溶出液：0.1%トリフルォロ酢酸中、アセトニトリル濃度を30分間で25%から40%に直線的に変化させた。
流速：1 mL/分 
検出：UV(210 nm) 
注入量：50μL　」（以下、「甲１発明」という。）  
  
（３）甲２記載の事項 
　甲２には、以下の事項が記載されている。  
ア　第１６０８頁右欄第４３〜４７行　　
　「HPLC―ALL HPLC separations were done on C-18 μBondapak columns with acetonitrile/water solvent systems. The solvents all contained 0.1% trifluoroacetic acid. Detection of peptides was by UV(214 nm) and fluorescence (excitation 254 nm/emission 338 nm). Details of the various systems are given in the figure legends. 」
（当審訳） 
　「HPLC−すべてのHPLC分離は、アセトニトリル／水溶媒系を用いたC-18マイクロボンダパック（μBondapak）カラムで行った。溶媒はすべて0.1％トリフルオロ酢酸を含んでいた。ペプチドの検出は、UV（214nm）および蛍光（励起254nm／発光338nm）によって行った。様々なシステムの詳細は、図の凡例に示している。」
イ　第１６１１頁Ｆｉｇ．５の説明（左欄第１〜１１行）
　「Fig. 5. CNBr fragmentation of synthetic 1-34, peak 4，and peak 5. The peptides were purified on HPLC and subjected to CNBr cleavage as described above. The CNBr-generated fragments were separated on HPLC using a linear gradient of 0-67% solvent B. Solvent A was 1.6％acetonitrile and solvent B was 60％acetonitrile  (each contained 0.1% trifluoroacetic acid). The position of 1-8 (ho-moserine), 9-18 (homoserine), and 19-34 are indicated. The satellite peaks associated with 1-8 and 9-18 are characteristic (24)and probably represent formylated forms produced by reaction of the solvent  with PTH. Panel A is synthetic 1-34; panel B, peak 4; and panel C,  peak 5.」
（当審訳）
　「図5　合成1-34、ピーク4、ピーク5のCNBr断片化 ペプチドをHPLCで精製し、上記のとおりCNBr切断した。CNBr生成フラグメントを、0〜67％の溶媒Bの直線勾配を用いてHPLCで分離した。溶媒Aは1.6％アセトニトリルであり、溶媒Bは60％アセトニトリル（各々0.1％トリフルオロ酢酸を含有する）であった。1-8（ホモセリン）、9-18（ホモセリン）、および19-34の位置が示されている。1-8および9-18に関連するサテライトピークは特徴的であり（24）、おそらく溶媒とPTHとの反応によって生成されるホルミル化形態を表しているのであろう。パネルAは合成1−34であり、パネルBはピーク4であり、パネルCはピーク5である。」
（４）甲３記載の事項 
　甲３には、以下の事項が記載されている。  
  
　第１６５頁右欄第１２〜３４行
 「Materials
　Human PTH（l-34）（LY333334；Eli Lilly and Company，Indianapolis，IN，U.S.A.）was prepared recombinantly and was greater than 97％ pure as determined by high-performance liquid chromatography analysis．The gradient separation was performed on a Thermo Separation Products（San Jose，CA，U.S.A.）instrument with UV detection  at 214 nm and a Vydac C-18 column（The Separation Group，Hesperia，CA，U.S.A.）（4.6×150 mm，temperature 60℃）．Solvent A was 90％0.2 M sodium sulfate buffer，adjusted to pH 2.3 with phosphoric acid，and 10％acetonitrile．Solvent B was 60％ 0.2 M sodium sulfate buffer．pH 2.3，and 40％acetonitrile．Using a flow rate of  l ml/minute，the column was equilibrated at 43％B，and then elution was performed with linear gradients 43-53％ B in 36 minutes and 53-80％ B in 14 minutes．RS-66271，prepared by chemical synthesis，was＞98％pure as determined by high-perfonnance liquid chromatography analysis（Vydac Protein C4 column[200 A，5μm，10×250 mm]，room temperature，27％ acetonitrile，73％water，0.1％ trifluroacetic acid ［isocratic］with UV detection［214 nm]）．The RS-66271 sequence was verified by complete protein sequencing and by amino acid analysis．」
（当審訳）
 「材料
　ヒトPTH（l-34）（LY333334；イーライリリー・アンド・カンパニー（Eli Lilly and Company）、アメリカ合衆国インディアナ州インディアナポリス）を組換えにより調製して、高速液体クロマトグラフィー分析によって測定したところ、純度97％以上であった。勾配分離は、214nmでのUV検出およびバイダック（Vydac）C-18カラム（ザ・セパレーション・グループ（The Separation Group）、アメリカ合衆国カリフォルニア州ヘスペリア）を用いて、サーモ・セパレーション・プロダクツ（Thermo Separation Products）（アメリカ合衆国カリフォルニア州サンノゼ）装置で行った（4.6×150mm、温度60℃）。溶媒Aは、90％0.2M硫酸ナトリウム緩衝液（リン酸でpH2.3に調整した）および10％アセトニトリルであった。溶媒Bは、60％0.2M硫酸ナトリウム緩衝液（pH2.3）および40％アセトニトリルであった。lmL/分の流速にて、カラムを43％溶媒Bで平衡化し、次いで36分間、43〜53％溶媒B、14分間、53〜80％溶媒Bの直線勾配で溶出を行った。化学合成により調製したRS-66271は、高速液体クロマトグラフィー分析で測定したところ、純度98％超であった（バイダック・プロテイン（Vydac　Protein）C4カラム［200A、5mm、10×250min］、室温、27％アセトニトリル、73％水、0.1％トリフルオロ酢酸［アイソクラチック］、UV検出［214nm］）。RS-66271配列は、全タンパク質配列決定およびアミノ酸分析によって確認した。」
（５）甲４記載の事項 
　甲４には、以下の事項が記載されている。 
 
　第４４９０頁左欄第２４行〜第４４９２頁左欄第２１行
　「Met and Trp Oxidation in PTH 
　Figure l shows the rp-HPLC chromatograms of PTH reacted with H2O2，in which Metl8［O］-PTH，Met8［0］-PTH，and doubly oxidized PTH species were detected； their identities were confirmed by LC/MS．Reaction conditions，pH 5 and 40℃ were chosen because most peptide and protein formulations are in the pH range of 5-6，thus pH5 is a representative pH for this range，and most of the stability studies carried out in the industry were using 40℃ as the highest temperature tested．This trend is consistent with data generated by Chu et al., 28,29　who reported the three Metoxidized species detected by rp-HPLC，with Metl8 oxidized more than Met8，followed by the doubly oxidized species．Figure 2 shows the rp-HPLC chromatograms of  PTH reacted with AAPH and reveals a pattern very different from that shown in Figure 1．Two sets of triplet peaks appeared at retention times between the PTH and Met［O］peaks．Although the individual peaks were not fully characterized，it was later confirmed by tryptic digestion，followed by LC/MS/MS，that these new peaks were Trp［O］-modified PTH species．Tryptic peptide mapping of the PTH digests showed that，in addition to the Met oxidation products，three tryptic peptide species with molecular masses of M+4，M+32，and M+16（where M  is the mass of tryptic peptide VGWLR　of PTH）were produced when PTH was treated with AAPH．Analysis of MS/MS spectra of the peptide species resulted in their assignment as three Trp oxidation derivatives―namely，kynurenine（M+4），N-formylkynurenine（M+32），and 5-hydroxytryptophan，or ox-indole alanine（M+16)．Their chemical structures are shown in Figure 3．
　PTH was oxidized by three model oxidants（H2O2，H2O2+Fe(II），and AAPH）．Table l summarizes the overall oxidation of Met8 and Trp23 of PTH in these degraded samples．Altogether，43％ and 84％ of the Trp residues of PTH were oxidized by APPH when treated for 6 and 24 h respectively．Hence，the new peaks shown in Figure 2 were identified as Trp［O］-modified PTH species．Oxidized Metl8 containing tryptic peptide was not retained on the reversed-phase column；therefore，no data related to Metl8 oxidation are provided．
　The key observations are as follows：
1．Three conditions−t-BHP with iron，t-BHP without iron，and H2O2−resulted in a minimal amount of Trp oxidation．
2．None of the three His residues was affected．
3．Only AAPH and the Fenton reaction，H2O2+Fe(II），generated Trp oxidation．
4．More M+16 Trp［O］than other species （M+4 and M+32）was generated．
5．To reach a comparable degree of Trp oxidation，AAPH treatment for 6h generated 43%  Trp［O］and 29% Met［O］at Met8，whereas H2O2/Fe(II）treatment for 24 h generated 35%  Trp［O］but a much larger amount （91％）of Met［O］at Met8．This comparison shows that AAPH treatment is more specific for Trp oxidation than is the Fenton reaction．
　The mechanism of thioether（Met）oxidation by peroxides（H2O2，t-BHP，or other ROOH species）is a one-step nucleophilic attack of sulfide on a peroxide-protic solvent complex，followed by a series of concerted electronic displacements that leads to the transfer of oxygen to the sulfur atom，resulting in Met［O］.2　The fact that the oxidation level of Met was not affected by the addition of Fe(II）to the H2O2，as shown in Table l，is evidence  that Met oxidation is a nucleophilic reaction and that it does not involve free radical．This reaction mechanism implies that the opposite reactant，peroxide oxygen，is electrophilic．Thus，electron-donating groups such as t-butyl decelerate the reaction by decreasing the electrophilicity of oxygen．For this reason，the fact that t-BHP was associated with less oxidation（Tab．1）than H2O2　is not surprising．It should be pointed out that t-BHP offers the advantage of oxidizing only the exposed Met，as Keck 20  reported when recombinant interferon gamma（Actimmune）and recombinant tissue plasminogen activator（alteplase，Activase R）were investigated．Since there is little tertiary structure in PTH，we do not expect any Met in PTH to be selectively oxidized by t-BHP．
　Although the mechanism of nucleophilic attack predicts a specific acid catalysis component，the reaction rate does not vary significantly within a pH range of 2-8，as shown with PTH.28　For this reason，data generated using pH 5 in acetate buffer would be applicable to the typical pH range，pH 5-7，found in protein formulations．
　Only AAPH and the Fenton reaction resulted in Trp oxidation．This finding supports the notion that nucleophilic reaction of H2O2 alone cannot cause oxidation of Trp．」
（当審訳）
「PTHにおけるMetおよびTrp酸化体
　図1は、過酸化水素（H2O2）と反応したPTHのrp-HPLCクロマトグラムを示す。Metl8［O］-PTH、Met8［O］-PTHおよび二重酸化されたPTH種を検出した。それらの同一性をLC/MSで確認した。反応条件はpH5および40℃を選択した。その理由は、ほとんどのペプチドおよびタンパク質製剤はpH5〜6の範囲にあり、それゆえpH5はこの範囲の代表的なpHであったためである。また、業界で行われた安定性試験のほとんどで、最高試験温度40℃を用いていたためである。この傾向は、Chuら28，29によってもたらされたデータと一致している。彼らはrp-HPLCによって検出した3種類のメチオニン酸化種（Metoxidized species）、つまりMet8以上に酸化されたMetl8と、続いて二重酸化種を報告した。図2は、AAPHと反応したPTHのrp-HPLCクロマトグラムを示し、図1に示すパターンとは非常に異なるパターンを示している。PTHピークとMet［O］ピークの保持時間の間に2組の三重ピークが現れた。個々のピークは完全に特定されていないが、後に、トリプシン消化後、LC/MS/MSにより、Trp［O］-修飾PTH種であることが確認された。PTH消化物のトリプシンペプチドマツピングは、PTHをAAPHで処理した際、Met酸化生成物に加えて、分子量M+4、M+32、およびM+16（ここで、MはPTHのトリプシンペプチドVGWLRの質量である）を有する3種のトリプシンペプチド種が生成されていることを示している。ペプチド種のMS/MSスペクトルの分析より結果的に、3つのTrp酸化誘導体、すなわちキヌレニン（M+4）、N-ホルミルキヌレニン（M+32）、および5-ヒドロキシトリプトファン、またはオキシ−インドールアラニン（M+16）が割り当てられた。それらの化学構造を図3に示す。
　PTHは、3種のモデル酸化剤（過酸化水素（H2O2）、過酸化水素＋Fe（II）、およびAAPH）によって酸化された。表1は、これらの分解サンプルにおけるPTHのMet8およびTrp23の酸化体の全体像を要約したものである。全体として、6時間および24時間処理されたときそれぞれで、PTHのTrp残基の43％および84％がAPPHによって酸化された。したがって、図2に示す新しいピークは、Trp［O］-修飾PTH種として同定された。トリプシンペプチドを含む酸化Metl8は、逆相カラムに保持されなかった。したがって、Metl8酸化体に関連するデータは提供されていない。
　主要な観察は以下のである。：
1．鉄を含むt-BHP、鉄を含まないt-BHP、および過酸化水素（H2O2）の3つの条件は、最小量のTrp酸化体をもたらした。
2．3つのHis残基のいずれも影響を受けなかった。
3．AAPHおよびフェントン反応、過酸化水素+Fe（II）のみがTrp酸化体を生じた。
4．他の種（M+4およびM+32）より多くのM+16Trp［O］が生成した。
5．同程度のTrp酸化体を達成するために、6時間のAAP/H処理によって43％のTrp［O］およびMet8で29％のMet［O］が生成した。一方、24時間の過酸化水素/Fe（II）処理によって35％のTrp［O］を生成したが、Met8では非常に多い量（91％）のMet［O］を生成した。この比較は、AAPH処理がフェントン反応よりもTrp酸化に特異的であることを示している。
　過酸化物（過酸化水素（H2O2）、t-BHP、または他のROOH種）によるチオエーテル（Met）酸化のメカニズムは、過酸化物−プロトン性溶媒複合体上の硫化物についての一段階求核反応であり、次いで酸素原子から硫黄原子への一連の協調的な電子移動によりMet［O］が生成する。表1に示すように、過酸化水素にFe(II)を加えることでMetの酸化レベルが影響を受けなかったという事実は、Met酸化が求核反応であって、フリーラジカルが関わらないという証拠である。この反応メカニズムは、逆反応物、つまり過酸化物酸素が求電子性であることを意味している。したがって、t-ブチル基のような電子供与基は、酸素の求電子性を低下させることによって反応を減速させる。この理由から、t-BHPが過酸化水素よりもより少ない酸化に関わっているという事実（表1）は驚くべきことではない。組換えインターフェロンγ（アクティミューン（Actimnmne））および組換え組織プラスミノーゲンアクチベークー（アルテプラーゼ、アクチペーゼ（ActivaseR））を調べた際にKeck20が報告したように、t-BHPは暴露したMetだけを酸化するという利点を提供することを指摘すべきである。PTHは三次構造をほぼとらないので、PTH中のMetがt-BHPによって選択的に酸化されるとは考えられない。
　PTHで示されるように、求核反応のメカニズムは特定の酸触媒成分を予測するが、反応速度はpH2〜8の範囲内であまり大きくは変化しない28．この理由から、pH5の酢酸緩衝液でもたらされたデータは、タンパク質製剤中に見出される典型的なpH範囲、pH5〜7に適用可能であろう。
　AAPHおよびフェントン反応のみがTrp酸化体をもたらした。この発見は、過酸化水素の求核反応のみではTrpの酸化を引き起こすことができないという考えを裏付けている。」
（６）甲５記載の事項 
　甲５には、以下の事項が記載されている。
　第９３頁第４〜５行
「なお、Ｃ１８についてはＯＤＳ（octadecyl siliane）と表記される場合もある。」
５．判断 
（１）本件特許発明１について  
  
ア　対比 
　本件特許発明１と甲１発明とを対比する。 
 
（ア）甲１発明の「hPTH(l- 34)150 mgを含む酢酸含量9.5%の凍結乾燥品」を試料に「逆相HPLCを行い、保存開始時に存在する分解（副成）物及び保存後に生じる分解（副成）物を単離し、それらの構造を調べ」る「方法」は、本件特許発明１の「ＰＴＨペプチド含有凍結乾燥製剤の検査方法」に相当する。
（イ）甲１発明では、「hPTH(l- 34)150 mgを含む酢酸含量9.5%の凍結乾燥品」を試料に「逆相HPLCを行い」、その結果の「表２」において、X1ピークとして分解（副成）物の[Met(O)8]- hPTH (1-34)、X2ピークとして分解（副成）物の[Met(O)18]- hPTH (1-34)がそれぞれ現れ、それぞれのピーク面積を求めていることから、[Met(O)8]- hPTH (1-34)及び[Met(O)18]- hPTH (1-34)を検出し、定量していることが理解できる。
　ここで、甲１発明の「分解（副成）物の[Met(O)8]- hPTH (1-34)」及び「分解（副成）物の[Met(O)18]- hPTH (1-34)」が、それぞれ本件特許発明１の「７）類縁物質７’：ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物」及び「８）類縁物質８’：ヒトＰＴＨ（１−３４）の１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物」に相当する。
　したがって、甲１発明の、「hPTH(l- 34)150 mgを含む酢酸含量9.5%の凍結乾燥品」を試料に「逆相HPLCを行い」、その結果の「表２」において、X1ピークとして分解（副成）物の[Met(O)8]- hPTH (1-34)、X2ピークとして分解（副成）物の[Met(O)18]- hPTH (1-34)がそれぞれ現れ、それぞれのピーク面積を求めることは、本件特許発明１の「該ＰＴＨペプチド含有凍結乾燥製剤から調製した試料を」「高速液体クロマトグラフィーに付して、下記の類縁物質１’乃至１１’から選ばれる少なくとも１種のＰＴＨ類縁物質を検出及び／又は定量する」ことに相当する。
「１）類縁物質１’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位および１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が下記構造式（ａ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
【化１】
２）類縁物質２’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位および１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が下記構造式（ｂ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
【化２】
３）類縁物質３’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位および１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
４）類縁物質４’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ａ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
５）類縁物質５’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ａ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
６）類縁物質６’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ｂ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
７）類縁物質７’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
８）類縁物質８’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
９）類縁物質９’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ａ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
１０）類縁物質１０’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の２３位トリプトファンに対応する残基が下記構造式（ｃ−１）又は（ｃ−２）で示されるトリプトファン一酸化物残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
【化３】
１１）類縁物質１１’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ｂ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物」
（ウ）甲１発明の「逆相HPLC」の測定条件である
「＜機器と条件＞
機器：島津LC-9Aシステム 
カラム：YMC PROTEIN-RP(4.6 mmφ×150 mm)
カラム温度：40℃
溶出液：0.1%トリフルォロ酢酸中、アセトニトリル濃度を30分間で25%から40%に直線的に変化させた。
流速：1 mL/分 
検出：UV(210 nm) 
注入量：50μL　」と、
　本件特許発明１の「高速液体クロマトグラフィー」の条件である
「＜測定条件＞
検出器：紫外吸光光度計（測定波長：２１４ｎｍ）
カラム：内径４．６ｍｍ、長さ１５０ｍｍのステンレス管に、粒子径３．５μｍの液体クロマトグラフィー用オクタデシル化シリカゲルを充填
カラム温度：４０℃
移動相Ａ：０．２Ｍ硫酸緩衝液（ｐＨ２．３）／アセトニトリル＝９／１（ｖ/ｖ）
移動相Ｂ：０．２Ｍ硫酸緩衝液（ｐＨ２．３）／アセトニトリル＝１／１（ｖ/ｖ）
移動相の送液：移動相Ａ及び移動相Ｂの混合比を表のように変えて濃度勾配制御する
【表１】
流量：毎分１．０ｍＬ
検出時間：試料注入後４５分間」（なお、上記「液体クロマトグラフィー用オクタデシル化シリカゲル」は、「液体クロマトグラフィー用オクタデシル
シリル
「＜測定条件＞
検出器：紫外吸光光度計
カラム：内径４．６ｍｍ、長さ１５０ｍｍの管に、液体クロマトグラフィー用シリカゲルを充填
カラム温度：４０℃
流量：毎分１．０ｍＬ」
の点で共通する。
イ　一致点、相違点 
　よって、本件特許発明１と甲１発明とは、次の点で一致し、次の点で相違する。 
  
（一致点） 
　「ＰＴＨペプチド含有凍結乾燥製剤の検査方法であって、該ＰＴＨペプチド含有凍結乾燥製剤から調製した試料を以下の測定条件で行われる高速液体クロマトグラフィーに付して、下記の類縁物質１’乃至１１’から選ばれる少なくとも１種のＰＴＨ類縁物質を検出及び／又は定量することを特徴とする方法。
＜測定条件＞
検出器：紫外吸光光度計
カラム：内径４．６ｍｍ、長さ１５０ｍｍの管に、液体クロマトグラフィー用シリカゲルを充填
カラム温度：４０℃
流量：毎分１．０ｍＬ
１）類縁物質１’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位および１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が下記構造式（ａ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
【化１】
２）類縁物質２’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位および１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が下記構造式（ｂ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
【化２】
３）類縁物質３’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位および１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
４）類縁物質４’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ａ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
５）類縁物質５’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ａ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
６）類縁物質６’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に、並びに２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ｂ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
７）類縁物質７’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
８）類縁物質８’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の１８位メチオニンに対応する残基がメチオニンスルホキシド残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
９）類縁物質９’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ａ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
１０）類縁物質１０’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の２３位トリプトファンに対応する残基が下記構造式（ｃ−１）又は（ｃ−２）で示されるトリプトファン一酸化物残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物
【化３】
１１）類縁物質１１’：
　ヒトＰＴＨ（１−３４）の２３位トリプトファンに対応する残基が上記構造式（ｂ）で示される残基に変化した前記ＰＴＨペプチドの酸化物」 
  
（相違点） 
　測定条件が、本件特許発明１では、
「＜測定条件＞
検出器：紫外吸光光度計（測定波長：２１４ｎｍ）
カラム：内径４．６ｍｍ、長さ１５０ｍｍのステンレス管に、粒子径３．５μｍの液体クロマトグラフィー用オクタデシル化シリカゲルを充填
カラム温度：４０℃
移動相Ａ：０．２Ｍ硫酸緩衝液（ｐＨ２．３）／アセトニトリル＝９／１（ｖ/ｖ）
移動相Ｂ：０．２Ｍ硫酸緩衝液（ｐＨ２．３）／アセトニトリル＝１／１（ｖ/ｖ）
移動相の送液：移動相Ａ及び移動相Ｂの混合比を表のように変えて濃度勾配制御する
【表１】
流量：毎分１．０ｍＬ
検出時間：試料注入後４５分間」であるのに対し、甲１発明では、
「＜機器と条件＞
機器：島津LC-9Aシステム 
カラム：YMC PROTEIN-RP(4.6 mmφ×150 mm)
カラム温度：40℃
溶出液：0.1%トリフルォロ酢酸中、アセトニトリル濃度を30分間で25%から40%に直線的に変化させた。
流速：1 mL/分 
検出：UV(210 nm) 
注入量：50μL」である点。
ウ　判断  
　上記相違点について検討する。
（ア）甲１〜甲５（上記４参照。）には、いずれも、本件特許発明１の「測定条件」と同様の条件についての記載はない。
（イ）甲１発明において、本件特許発明１の「測定条件」にすることが当業者が適宜になし得る設定事項であるかどうか検討する。
　本件特許明細書には、ＰＴＨ類縁物質の検出と定量に関し、次の記載がある。
「　【００８４】
　
上記の類縁物質１’乃至１１’では、いずれもメチオニンやトリプトファンが酸化して生じる変性アミノ酸残基が導入されるようにＰＴＨペプチドが変化している。
・・・
　【００８６】
（３）　ＰＴＨ類縁物質の検出と定量
　ＰＴＨ含有凍結乾燥製剤中のＰＴＨ類縁物質は、当該製剤を適当な溶媒（塩化ベンザルコニウムを含む燐酸緩衝液など）に溶液して試料を作製し、当該試料を、例えば下記の条件下のＨＰＬＣに付すことにより、検出または定量できる。
　【００８７】
＜ＨＰＬＣの条件＞
ａ）検出器：紫外吸光光度計（測定波長：２１４ｎｍ）
ｂ）カラム：内径４．６ｍｍ、長さ１５０ｍｍのステンレス管に３．５μｍの液体クロマトグラフィー用オクタデシルシリル化シリカゲルを充填（Ａｇｉｌｅｎｔ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ社製のＺｏｒｂａｘ ３００ＳＢ−Ｃ１８、又は同等品）
ｃ）カラム温度：４０℃付近の一定温度
ｄ）移動相：
　移動相Ａ：無水硫酸ナトリウム２８．４ｇを水９００ｍＬに溶かし、リン酸を加えてｐＨ２．３に調整した後、水を加えて１０００ｍＬとする。この液９００ｍＬにアセトニトリル１００ｍＬを加える。
　【００８８】
　移動相Ｂ：無水硫酸ナトリウム２８．４ｇを水９００ｍＬに溶かし、リン酸を加えてｐＨ２．３に調整した後、水を加えて１０００ｍＬとする。この液５００ｍＬにアセトニトリル５００ｍＬを加える。
　【００８９】
ｅ）移動相の送液：移動相Ａ及び移動相Ｂの混合比を表２のように変えて濃度勾配制御する。
　　【表２】
ｆ）流量：毎分１．０ｍＬ
ｇ）検出時間：試料溶液注入後４５分間。ただし溶媒ピークの後ろからとする。
・・・
　【００９１】
　上記のＨＰＬＣを実施して得られるクロマトグラムに基づく各ＰＴＨの類縁物質量及びＰＴＨペプチド量は、当該クロマトグラム上の各々のピーク面積を（例えば、自動積分法により）算出することで求めることができる。そして、当該算出値に基づいて、下記の式１および２により、それぞれ、各ＰＴＨ類縁物質量（％）及び全ＰＴＨ類縁物質量（％）を定量及び比較できる。なお、式中の「総ピーク面積」とは、上記クロマトグラム上のＰＴＨペプチドのピーク面積とそれ以外に検出された全てのＰＴＨ類縁物質のピーク面積を足すことで求められる値である。従って、当該「総ピーク面積」は、「ＰＴＨペプチド量と全ＰＴＨ類縁物質量の和」に相当する。また、本発明において特に断りのない場合、「％」は下記式の意味を有する。
　【００９２】
＜式１＞
各ＰＴＨ類縁物質量（％）＝（各類縁物質のピーク面積／総ピーク面積）×１００
＜式２＞
全ＰＴＨ類縁物質量（％）＝（各類縁物質のピーク面積の総和／総ピーク面積）×１００
　なお、
上記の条件下でＨＰＬＣを実施した場合に、
ヒト−ＰＴＨ（１−３４）から生成する
（類縁物質３'と４’）は単一のピークとして溶出されてくるが、その場合には当該単一ピークを１つの類縁物質と見做しても製剤の純度確認乃至測定の用に供する際には結果に影響を与えないから、当該類縁物質３と４（類縁物質３'と４’）の混合ピークを１つの類縁物質と見做してもよい。
（類縁物質１０'と１１’）についても同様である。
　【００９３】
　
下記の表３に、ヒトＰＴＨ（１−３４）を含有する凍結乾燥製剤に由来する試料に対し上記の条件下でＨＰＬＣを実施した場合の典型的な測定例を示す。
【表３】
（ウ）上記（イ）の記載（特に、下線箇所）及び表３を踏まえると、本件特許発明１で特定されている「測定条件」は、類縁物質１'乃至１１’が、メチオニンやトリプトファンが酸化して生じる変性アミノ酸残基が導入されるようにＰＴＨペプチドが変化している物質であることを認識した上で、類縁物質１'、２'、３'と４’、５'、６’、７'、８’９’、１０'と１１’を、それぞれ分離できる条件として設定したことが理解できる。
（エ）一方、ヒトＰＴＨ酸化物として、甲１には８位メチオニン酸化物（類縁物質７'）及び１８位メチオニン酸化物（類縁物質８’）、及び、甲４には２３位トリプトファン酸化物（類縁物質９’）が、それぞれ記載されているものの、甲１〜甲５には、いずれも、ヒトＰＴＨ酸化物として、類縁物質１'乃至１１’が、メチオニンやトリプトファンが酸化して生じる変性アミノ酸残基が導入されるようにＰＴＨペプチドが変化している物質であることを、網羅的に認識した点について記載も示唆もされていない以上、類縁物質１'乃至１１’を分離できる条件として設定できないことは明らかであるから、甲１〜甲５は、いずれも本件特許発明１の測定条件を設定するための前提を欠くものといえる。
（オ）上記（イ）〜（エ）を踏まえると、甲１発明において、甲１〜甲５の記載事項を斟酌しても、本件特許発明１の「測定条件」にすることは、当業者が適宜になし得る設計事項であるとはいえない。
（カ）また、甲１には、「保存後の逆相HPLCクロマトグラムを図１に示す。hPTH(l - 3 4)ピークの後方（保持時間１３分〜１７分）にB、CおよびDの３本のピークが現れた。これらのピーク面積％は、表 2に示すように、
それぞれB; 3.9%、C; 6.9%、D; 3.0%で、合計13.8%になりhPTH(1-34)劣化の主因であった。また、それぞれのピークの構造解析を行った結果、Bが[Nε-acetyl-Lys 
13
 ]-hPTH(l-34)と[Nε-acetyl - Lys 
26
 ]- hPTH (1-34)の混合物、Cが[Nα- acetyl- Ser
1
 ]-hPTH(1-34)、Dが[Nε- acetyl-Lys 
27
]-hPTH(l-34)であった
（キ）以上のことから、甲１発明において、甲１〜５に記載された技術事項に基づいて、上記相違点に係る本件特許発明１の発明特定事項のように構成することは、当業者が容易に想到し得たことではない。 
 
（ク）小括 
　以上のとおりであるから、本件特許発明１は、甲１発明及び甲１〜５に記載された技術的事項に基づいて当業者が容易に発明をすることができたものであるということはできない。  
 
（２）本件特許発明２〜９について 
　本件特許発明２〜９は、本件特許発明１の構成を全て含むものであるから、本件特許発明２〜９も、上記（１）と同様の理由により、当業者が容易に発明をすることができたものであるということはできない。 
６．むすび  
　したがって、特許異議の申立ての理由及び証拠によっては、請求項１〜９に係る特許を取り消すことはできない。　  
　また、他に請求項１〜９に係る特許を取り消すべき理由を発見しない。
　よって、結論のとおり決定する。
【異議決定日】
平成２９年７月２７日（２０１７．７．２７）