(57)【要約】本発明は、よりＣａｓ９の発現が高く、複数の異なる遺伝子又は同一遺伝子内の複数箇所を同時に高効率で編集可能な遺伝子改変非ヒト生物を提供する。本発明の遺伝子改変非ヒト生物は、Ｃａｓ９（ＣＲＩＳＰＲ−ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ９）をコードする遺伝子が核ゲノム中に少なくとも３コピーを有する。本発明の卵細胞は、Ｃａｓ９をコードする遺伝子が少なくとも３コピー導入された核ゲノムを有する遺伝子改変非ヒト生物由来である。本発明の受精卵は、前記卵細胞と、同種の生物由来の精子とを受精させてなる。本発明の標的遺伝子の改変方法は、前記遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、前記卵細胞、又は前記受精卵にガイドＲＮＡを導入する工程を備える。【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｃａｓ９（ＣＲＩＳＰＲ−ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ９）をコードする遺伝子が核ゲノム中に少なくとも３コピーを有することを特徴とする遺伝子改変非ヒト生物。
【請求項２】
前記Ｃａｓ９が改変体である、請求項１に記載の遺伝子改変非ヒト生物。
【請求項３】
前記Ｃａｓ９が標的配列を含む標的遺伝子の一方又は両方の鎖を切断する活性を欠如している改変体である、請求項２に記載の遺伝子改変非ヒト生物。
【請求項４】
さらに、前記核ゲノムが前記Ｃａｓ９をコードする遺伝子に作動可能に連結された、ＣＡＧプロモーター、発現誘導性プロモーター、ウイルス性プロモーター又は組織特異的プロモーターを含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載の遺伝子改変非ヒト生物。
【請求項５】
非ヒト生物が哺乳動物である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の遺伝子改変非ヒト生物。
【請求項６】
前記核ゲノムに前記Ｃａｓ９をコードする遺伝子がタンデムに導入された、請求項１〜５のいずれか一項に記載の遺伝子改変非ヒト生物。
【請求項７】
Ｃａｓ９をコードする遺伝子が少なくとも３コピー導入された核ゲノムを有する遺伝子改変非ヒト生物由来であることを特徴とする卵細胞。
【請求項８】
前記卵細胞が核にＣａｓ９をコードする遺伝子が導入された核ゲノムを有さない、請求項７に記載の卵細胞。
【請求項９】
請求項７又は８に記載の卵細胞と、同種の生物由来の精子とを受精させてなることを特徴とする受精卵。
【請求項１０】
前記卵細胞が核にＣａｓ９をコードする遺伝子が導入された核ゲノムを有さない、請求項９に記載の受精卵。
【請求項１１】
前記精子が野生型の前記同種の生物由来である、請求項９又は１０に記載の受精卵。
【請求項１２】
請求項１〜６のいずれか一項に記載の遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、請求項７又は８に記載の卵細胞、又は請求項９〜１１のいずれか一項に記載の受精卵にガイドＲＮＡを導入する工程を備えることを特徴とする標的遺伝子の改変方法。
【請求項１３】
請求項１〜６のいずれか一項に記載の遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、請求項７又は８に記載の卵細胞、又は請求項９〜１１のいずれか一項に記載の受精卵にガイドＲＮＡを導入する工程と、
前記遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、前記遺伝子改変非ヒト生物由来の卵細胞、又は前記遺伝子改変非ヒト生物由来の受精卵内において発現しているＣａｓ９がＰＡＭ（Ｐｒｏｔｏ−ｓｐａｃｅｒ  Ａｄｊａｃｅｎｔ  Ｍｏｔｉｆ）配列の上流に位置する切断部位で前記標的遺伝子を切断する工程と、
前記ガイドＲＮＡと前記標的遺伝子の相補的結合によって決定される領域において、改変された前記標的遺伝子を得る工程と、を備え、
前記標的遺伝子は前記ＰＡＭ配列を有し、
前記ガイドＲＮＡは、前記標的遺伝子中の前記ＰＡＭ配列の上流の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドを含むものであることを特徴とする標的遺伝子の改変方法。
【請求項１４】
請求項１〜６のいずれか一項に記載の遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、請求項７又は８に記載の卵細胞、又は請求項９〜１１のいずれか一項に記載の受精卵にガイドＲＮＡを導入する工程と、
前記遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、前記遺伝子改変非ヒト生物由来の卵細胞、又は前記遺伝子改変非ヒト生物由来の受精卵内において発現しているＣａｓ９がＰＡＭ配列の３塩基上流に位置する切断部位で前記標的遺伝子を切断する工程と、
前記ガイドＲＮＡと前記標的遺伝子の相補的結合によって決定される領域において、改変された前記標的遺伝子を得る工程と、を備え、
前記標的遺伝子はＮＧＧ（Ｎは、アデニン、シトシン、チミン及びグアニンからなる群から選択された任意の１塩基）からなるＰＡＭ配列を有し、
前記ガイドＲＮＡは、前記標的遺伝子中の前記ＰＡＭ配列の１塩基上流から２０塩基以上２４塩基以下上流までの塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドを含むものであることを特徴とする標的遺伝子の改変方法。
【請求項１５】
前記導入工程において、導入対象が遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞であるとき、生きた遺伝子改変非ヒト生物にガイドＲＮＡを導入する、請求項１２〜１４のいずれか一項に記載の標的遺伝子の改変方法。
【請求項１６】
前記導入工程において、導入対象が遺伝子改変非ヒト動物由来の受精卵であるとき、さらに、前記受精卵を同種の非ヒト動物の子宮又は卵管へ移植し、発生させる工程を備える、請求項１２〜１４のいずれか一項に記載の標的遺伝子の改変方法。
【請求項１７】
前記導入工程において、２種類以上の前記ガイドＲＮＡを導入する、請求項１２〜１６のいずれか一項に記載の標的遺伝子の改変方法。
【請求項１８】
前記導入工程において、前記ガイドＲＮＡとともに外来遺伝子を導入する、請求項１２〜１７のいずれか一項に記載の標的遺伝子の改変方法。
【請求項１９】
前記外来遺伝子がＰＡＭ配列を有さない、請求項１８に記載の標的遺伝子の改変方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、遺伝子改変非ヒト生物、卵細胞、受精卵、及び標的遺伝子の改変方法に関する。
本願は、２０１５年１２月１８日に、日本に出願された特願２０１５−２４７９６０号に基づき優先権を主張し、その内容をここに援用する。
【背景技術】
【０００２】
疾患のメカニズムの研究や新しい医薬品の開発研究において、その疾患の病態を反映した疾患モデル動物の存在は、研究の成否の鍵を握っている。ヒト疾患の遺伝的要因に関しては、近年の急速なゲノム解析技術の発達により、数百万ヶ所に及ぶＳＮＰ座位について比較的容易に遺伝情報を得ることができるようになってきた。この技術を用いて多数の疾患について、数多くの疾患関連遺伝子座位が同定され、報告された。その一方で、こうした疾患候補遺伝子の遺伝子改変マウスを作製しても、表現型を呈さないことがほとんどである。これは、単一遺伝子の異常では、生活習慣病の様な多因子が関与する病態を説明できるとは限らないためである。従って、これらの各々の候補遺伝子を標的にした創薬もその効果に限界があると考えられる。こうした問題の解決のためには、多遺伝子座改変疾患モデル動物を迅速、かつ体系的に準備・活用する体制を整える必要性があるが、従来のＥＳ細胞を介した遺伝子改変法では、１操作、１遺伝子座、１カ所の遺伝子改変しかできないため、その実現は困難であった。【０００３】
近年、ＣＲＩＳＰＲ（Ｃｌｕｓｔｅｒｅｄ  Ｒｅｇｕｌａｒｌｙ  Ｉｎｔｅｒｓｐａｃｅｄ  Ｓｈｏｒｔ  Ｐａｌｉｎｄｒｏｍｉｃ  Ｒｅｐｅａｔｓ）システムによる遺伝子改変技術が登場した。ＣＲＩＳＰＲシステムは、従来のＥＳ細胞を介した遺伝子改変技術を超越する斬新なポテンシャルを持つ。ＣＲＩＳＰＲシステムでは、３種類のＲＮＡ又はＤＮＡ、すなわち標的遺伝子の切断をガイドするガイドＲＮＡ、実際に切断に携わるヌクレアーゼであるＣａｓ９（ＣＲＩＳＰＲ−ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ９）のｍＲＮＡ、切断される遺伝子領域に相同的に組み込まれる改変遺伝子の３種類を受精卵へ顕微注入して、その胚を成体まで発生させることで、遺伝子改変マウスが得られる。【０００４】
非特許文献１には、ＣＲＩＳＰＲシステムを用いて、ＥＳ細胞のＲＯＳＡ２６遺伝子領域にＣａｓ９をコードする遺伝子をノックインすることにより、Ｃａｓ９ノックインマウスを作製できることが記載されている。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００５】
【非特許文献１】Randall J. Platt, et al., Cell, vol.159, p.440-455, 2014.
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
従来のＣＲＩＳＰＲシステムを活用した遺伝子改変マウスの作製方法では、Ｃａｓ９のｍＲＮＡが大きく、顕微注入されるその他のガイドＲＮＡ及び改変遺伝子の量に制限があった。
また、非特許文献１に記載されているＣａｓ９ノックインマウスでは、Ｃａｓ９の遺伝子が１コピーしか導入されていないため、複数の異なる遺伝子又は同一遺伝子内の複数箇所を同時に編集することが難しかった。【０００７】
本発明は、上記事情に鑑みてなされたものであって、よりＣａｓ９の発現が高く、複数の異なる遺伝子又は同一遺伝子内の複数箇所を同時に高効率で編集可能な遺伝子改変非ヒト生物を提供する。また、前記遺伝子改変非ヒト生物を利用した簡便且つ迅速で標的遺伝子に部位特異的な遺伝子改変技術を提供する。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
すなわち、本発明は、以下の態様を含む。
［１］Ｃａｓ９（ＣＲＩＳＰＲ−ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ９）をコードする遺伝子が核ゲノム中に少なくとも３コピーを有することを特徴とする遺伝子改変非ヒト生物。
［２］前記Ｃａｓ９が改変体である、［１］に記載の遺伝子改変非ヒト生物。
［３］前記Ｃａｓ９が標的配列を含む標的遺伝子の一方又は両方の鎖を切断する活性を欠如している改変体である、［２］に記載の遺伝子改変非ヒト生物。
［４］さらに、前記核ゲノムが前記Ｃａｓ９をコードする遺伝子に作動可能に連結された、ＣＡＧプロモーター、発現誘導性プロモーター、ウイルス性プロモーター又は組織特異的プロモーターを含む、［１］〜［３］のいずれか一つに記載の遺伝子改変非ヒト生物。
［５］非ヒト生物が哺乳動物である、［１］〜［４］のいずれか一つに記載の遺伝子改変非ヒト生物。
［６］前記核ゲノムに前記Ｃａｓ９をコードする遺伝子がタンデムに導入された、［１］〜［５］のいずれか一つに記載の遺伝子改変非ヒト生物。
［７］Ｃａｓ９をコードする遺伝子が少なくとも３コピー導入された核ゲノムを有する遺伝子改変非ヒト生物由来であることを特徴とする卵細胞。
［８］前記卵細胞が核にＣａｓ９をコードする遺伝子が導入された核ゲノムを有さない、［７］に記載の卵細胞。
［９］［７］又は［８］に記載の卵細胞と、同種の生物由来の精子とを受精させてなることを特徴とする受精卵。
［１０］前記卵細胞が核にＣａｓ９をコードする遺伝子が導入された核ゲノムを有さない、［９］に記載の受精卵。
［１１］前記精子が野生型の前記同種の生物由来である、［９］又は［１０］に記載の受精卵。
［１２］［１］〜［６］のいずれか一つに記載の遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、［７］又は［８］に記載の卵細胞、又は［９］〜［１１］のいずれか一つに記載の受精卵にガイドＲＮＡを導入する工程を備えることを特徴とする標的遺伝子の改変方法。
［１３］［１］〜［６］のいずれか一つに記載の遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、［７］又は［８］に記載の卵細胞、又は［９］〜［１１］のいずれか一つに記載の受精卵にガイドＲＮＡを導入する工程と、
前記遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、前記遺伝子改変非ヒト生物由来の卵細胞、又は前記遺伝子改変非ヒト生物由来の受精卵内において発現しているＣａｓ９がＰＡＭ（Ｐｒｏｔｏ−ｓｐａｃｅｒ  Ａｄｊａｃｅｎｔ  Ｍｏｔｉｆ）配列の上流に位置する切断部位で前記標的遺伝子を切断する工程と、
前記ガイドＲＮＡと前記標的遺伝子の相補的結合によって決定される領域において、改変された前記標的遺伝子を得る工程と、を備え、
前記標的遺伝子は前記ＰＡＭ配列を有し、
前記ガイドＲＮＡは、前記標的遺伝子中の前記ＰＡＭ配列の上流の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドを含むものであることを特徴とする標的遺伝子の改変方法。
［１４］［１］〜［６］のいずれか一つに記載の遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、［７］又は［８］に記載の卵細胞、又は［９］〜［１１］のいずれか一つに記載の受精卵にガイドＲＮＡを導入する工程と、
前記遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、前記遺伝子改変非ヒト生物由来の卵細胞、又は前記遺伝子改変非ヒト生物の受精卵内において発現しているＣａｓ９がＰＡＭ配列の３塩基上流に位置する切断部位で前記標的遺伝子を切断する工程と、
前記ガイドＲＮＡと前記標的遺伝子の相補的結合によって決定される領域において、改変された前記標的遺伝子を得る工程と、を備え、
前記標的遺伝子はＮＧＧ（Ｎは、アデニン、シトシン、チミン及びグアニンからなる群から選択された任意の１塩基）からなるＰＡＭ配列を有し、
前記ガイドＲＮＡは、前記標的遺伝子中の前記ＰＡＭ配列の１塩基上流から２０塩基以上２４塩基以下上流までの塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドを含むものであることを特徴とする標的遺伝子の改変方法。
［１５］前記導入工程において、導入対象が遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞であるとき、生きた遺伝子改変非ヒト生物にガイドＲＮＡを導入する、［１２］〜［１４］のいずれか一つに記載の標的遺伝子の改変方法。
［１６］前記導入工程において、導入対象が遺伝子改変非ヒト動物由来の受精卵であるとき、さらに、前記受精卵を同種の非ヒト動物の子宮又は卵管へ移植し、発生させる工程を備える、［１２］〜［１４］のいずれか一つに記載の標的遺伝子の改変方法。
［１７］前記導入工程において、２種類以上の前記ガイドＲＮＡを導入する、［１２］〜［１６］のいずれか一つに記載の標的遺伝子の改変方法。
［１８］前記導入工程において、前記ガイドＲＮＡとともに外来遺伝子を導入する、［１２］〜［１７］のいずれか一つ記載の標的遺伝子の改変方法。
［１９］前記外来遺伝子がＰＡＭ配列を有さない、［１８］に記載の標的遺伝子の改変方法。
【発明の効果】
【０００９】
本発明の遺伝子改変非ヒト生物、卵細胞、及び受精卵によれば、複数の異なる遺伝子又は同一遺伝子内の複数箇所を同時に高効率で編集することができる。また、本発明の卵細胞及び受精卵によれば、遺伝子改変非ヒト生物を迅速かつ低コストで作製することができる。さらに、本発明の遺伝子改変非ヒト生物、卵細胞、及び受精卵は、多数の遺伝子の異常が関与する心臓病や癌等の生活習慣病又はゲノムワイドアソシエーション研究（ＧＷＡＳ）から明らかとなった疾患関連遺伝子の研究に活用することができる。
【図面の簡単な説明】
【００１０】
【図１Ａ】実施例１におけるＮＦＣａｓ９（ＮＬＳ及びＦｌａｇタグを有するＣａｓ９遺伝子）及びＦＣａｓ９（Ｆｌａｇタグのみを有するＣａｓ９遺伝子）のそれぞれの構造を示す模式図である。
【図１Ｂ】試験例１におけるＮＦＣａｓ９−２ラインのマウスの各組織における５０ｎｇＲＮＡ中のＣａｓ９ｍＲＮＡのコピー数を比較したグラフである。
【図１Ｃ】試験例１におけるＮＦＣａｓ９−２ラインの遺伝型が異なる雄又は雌マウス（４週齢から１０週齢まで）の体重の変化を示すグラフである。
【図１Ｄ】試験例１におけるＮＦＣａｓ９−２ラインの遺伝型が異なるマウス（１０週齢）の各組織切片をヘマトキシリン及びエオシン染色した結果の画像である。
【図１Ｅ】試験例１におけるＮＦＣａｓ９−２ラインの遺伝型が異なるマウス（１０週齢）の血清中の生理学的マーカーの量を検出した結果を示すグラフである。
【図２Ａ】実施例１における樹立されたＮＦＣａｓ９マウス４ライン及びＦＣａｓ９マウス５ラインでのＣａｓ９遺伝子の導入コピー数、性別、Ｆ１世代での遺伝型、Ｆ１世代へのＣａｓ９の導入有無及びＣａｓ９の発現量を示した表である。
【図２Ｂ】実施例１における樹立されたＮＦＣａｓ９マウス４ライン及びＦＣａｓ９マウス５ラインでの導入されたＣａｓ９のコピー数を算出するための検量線を示したグラフである。
【図２Ｃ】実施例１における樹立されたＮＡＣａｓ９マウス及びＦＣａｓ９マウスでのＣａｓ９タンパク質の発現について、Ｆｌａｇタグを利用したウェスタンブロッティング解析を行った結果を示す画像である。
【図３Ａ】実施例１におけるＮＦＣａｓ９−２ラインのゲノムＤＮＡを用いたｓｐＰＣＲのＰＣＲ産物を１％アガロースゲル電気泳動で検出した結果を示す画像である。
【図３Ｂ】実施例１におけるＮＦＣａｓ９−２ラインのＮＦＣａｓ９が挿入された位置を示す模式図である。
【図３Ｃ】実施例１における図３Ｂの結果を確認するための部位特異的プライマーを用いたＰＣＲ産物を１％アガロースゲル電気泳動で検出した結果を示す画像である。
【図４Ａ】試験例２における様々な交配ペアの人工授精で得た受精卵での遺伝型を示す図である。
【図４Ｂ】試験例２における様々な交配ペアの人工授精で得た受精卵での生存数及びｉｎｄｅｌ変異数を示す表である。
【図４Ｃ】試験例２におけるＲａｍｐ２遺伝子の改変に用いたガイドＲＮＡの配列を示す模式図である。
【図４Ｄ】試験例２におけるＴ７  ｅｎｄｏｎｕｃｌｅａｓｅ  Ｉ（Ｔ７ＥＩ）アッセイの結果を示す画像である。
【図５Ａ】試験例３における胚盤胞の生存数及びｉｎｄｅｌ変異数を示す表である。
【図５Ｂ】試験例３における胚盤胞のＴ７ＥＩアッセイの結果を示す画像である。
【図６Ａ】試験例３における移植から１３．５日〜１５．５日後の胎児の生存数及びｉｎｄｅｌ変異数を示す表である。
【図６Ｂ】試験例３における移植から１３．５日後の１０匹の胎児の形態を示す画像である。
【図６Ｃ】試験例３における移植から１３．５日後の胎児の胚盤胞のＴ７ＥＩアッセイの結果を示す画像である。
【図６Ｄ】試験例３における移植から１３．５日後の１０匹の胎児のＲａｍｐ１遺伝子のシークエンスの結果を示す図である。
【図６Ｅ】試験例３における移植から１３．５日後の１０匹の胎児のＲａｍｐ１遺伝子及びＲａｍｐ２遺伝子のＲＮＡの相対的な発現量を示す図である。
【図７Ａ】試験例４における遺伝型及び変異の有無の判定結果を示す表及びグラフである。
【図７Ｂ】試験例４における胚盤胞のＴ７ＥＩアッセイの結果を示す画像である。
【図８】試験例５における遺伝子の改変に用いたガイドＲＮＡの配列を示す模式図である。
【図９Ａ】試験例５における本発明の方法を用いた場合の遺伝型及び変異の有無の判定結果を示す表である。
【図９Ｂ】試験例５における本発明の方法を用いた胚盤胞１０胚のＴ７ＥＩアッセイの結果を示す画像である。
【図９Ｃ】試験例５における対照群である従来法を用いた場合の遺伝型及び変異の有無の判定結果を示す表である。
【図１０Ａ】試験例６におけるプロトコールを示す概略図である。
【図１０Ｂ】試験例６におけるＧｇａｔ１遺伝子の改変に用いたガイドＲＮＡの配列を示す模式図である。
【図１０Ｃ】試験例６における線維芽細胞のＴ７ＥＩアッセイの結果を示す画像である。
【図１０Ｄ】試験例６におけるＦＩＴＣ−標識ｉｓｏｌｅｃｔｉｎ、ＢＳ−Ｉ−Ｂ４（ＩＢ４）がα−Ｇａｌエピトープと特異的に認識することを活用したＦＡＣＳ解析の結果を示すグラフである。
【図１０Ｅ】試験例６におけるｓａｐｏｒｉｎコンジュゲートＩＢ４  （ＩＢ４ＳＡＰ）で処理による生存アッセイ後の線維芽細胞を撮影した画像である。
【図１１Ａ】試験例７におけるプロトコールを示す概略図である。
【図１１Ｂ】試験例７におけるＡｌｂ１遺伝子の改変に用いたガイドＲＮＡの配列を示す模式図である。
【図１１Ｃ】試験例７におけるＣａｓ９マウス又は野生型マウスのＥＧＦＰ陽性又は陰性の肝細胞のＴ７ＥＩアッセイの結果を示す画像である。
【図１２Ａ】試験例８における１２．５〜１３日齢の胎児でのｉｎｄｅｌ変異率を示す表である。
【図１２Ｂ】試験例８における１２．５〜１３日齢のエンドセリン１（ＥＴ−１）遺伝子ノックアウト表現型マウス胎児及び野生型マウス胎児の顎形成状態を示す画像である。
【図１２Ｃ】試験例８における各受精卵由来の胎児におけるモザイク率を示すグラフである。
【図１３】試験例９におけるガイドＲＮＡの導入時間が異なる各受精卵由来の胎児でのモザイク率を示すグラフである。
【図１４】試験例１０におけるガイドＲＮＡの導入濃度が異なる各受精卵由来の胎児でのＩｎｄｅｌ変異率及びモザイク率を示すグラフである。
【図１５Ａ】試験例１１における遺伝子の改変に用いたガイドＲＮＡ及びノックイン断片の配列を示す模式図である。
【図１５Ｂ】試験例１１におけるＣａｓ９マウス受精卵由来の胚盤胞から調製された溶液を用いたＰＣＲでのＫｌｆ５遺伝子を鋳型としたＰＣＲ産物をアガロースゲル電気泳動した結果を示す画像である。
【図１５Ｃ】試験例１１におけるＣａｓ９マウス又は野生型マウスの受精卵由来の胚盤胞でのノックイン効率を示す表である。
【発明を実施するための形態】
【００１１】
＜遺伝子改変非ヒト生物＞
一実施形態として、本発明は、Ｃａｓ９（ＣＲＩＳＰＲ−ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ９）をコードする遺伝子が核ゲノム中に少なくとも３コピーを有する、遺伝子改変非ヒト生物を提供する。
【００１２】
本実施形態の遺伝子改変非ヒト生物は、全身又はいずれかの細胞においてＣａｓ９が過剰に発現されている。本発明者らにより、Ｃａｓ９の過剰発現状態は、非ヒト生物生体内に影響がないことが明らかとなった。また、予めＣａｓ９が過剰に発現しているため、ガイドＲＮＡを導入するだけで、標的遺伝子を簡便且つ迅速に改変することができる。
【００１３】
本明細書において、「遺伝子改変」とは、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９システムやＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ  Ａｃｔｉｖａｔｏｒ−Ｌｉｋｅ  Ｅｆｆｅｃｔｏｒ  Ｎｕｃｌｅａｓｅｓ（ＴＡＬＥＮ）等の技術により、標的化された遺伝子組換え又は標的化された変異（例えば、ＳＮＰや部分変異等の挿入を含む。）を実行することにより、特異的な遺伝子破壊やレポーター遺伝子のノックイン等を行うことを意味する。
【００１４】
本明細書において、「非ヒト生物」としては、例えば、大腸菌、枯草菌、酵母、昆虫、植物（例えば、単子葉植物又は双子葉植物等）、ニワトリ等の鳥類の動物、マウス、ラット、ハムスター、モルモット、ウサギ、イヌ、ネコ、ウマ、ウシ、ヒツジ、ブタ、ヤギ、マーモセット、サル等の哺乳動物が挙げられ、これらに限定されない。中でも、哺乳動物が好ましく、マウス、ラット、モルモット、ハムスター、ウサギなどの齧歯目の哺乳動物が好ましい。
【００１５】
マウスとしては、例えば、純系としてはＣ５７ＢＬ／６系統、ＤＢＡ２系統等が挙げられ、交雑系としてはＢ６Ｃ３Ｆ１系統、ＢＤＦ１系統、Ｂ６Ｄ２Ｆ１系統、ＢＡＬＢ／ｃ系統、ＩＣＲ系統等が挙げられ、これらに限定されない。ラットの具体例としては、例えば、Ｗｉｓｔａｒ、ＳＤ等が挙げられ、これらに限定されない。
【００１６】
［Ｃａｓ９］
「Ｃａｓ９」とは、細菌及び古細菌において侵入外来核酸に対する獲得耐性を提供する適応免疫系を構成するＣａｓタンパク質ファミリーの一つであり、外来侵入性ＤＮＡ中のＰＡＭ配列を認識して、その上流で二本鎖ＤＮＡを平滑末端になるように切断するエンドヌクレアーゼである。本明細書において、Ｃａｓ９は、ガイドＲＮＡと複合体を形成し、ＤＮＡ切断活性を有するものを意味する。
【００１７】
本明細書において、Ｃａｓタンパク質ファミリーとしては、例えば、Ｃａｓ１、Ｃａｓ１Ｂ、Ｃａｓ２、Ｃａｓ３、Ｃａｓ４、Ｃａｓ５、Ｃａｓ６、Ｃａｓ７、Ｃａｓ８、Ｃａｓ９（Ｃｓｎ１及びＣｓｘ１２としても公知)、Ｃａｓ１０、Ｃｓｙ１、Ｃｓｙ２、Ｃｓｙ３、Ｃｓｅ１、Ｃｓｅ２、Ｃｓｃ１、Ｃｓｃ２、Ｃｓａ５、Ｃｓｎ２、Ｃｓｍ２、Ｃｓｍ３、Ｃｓｍ４、Ｃｓｍ５、Ｃｓｍ６、Ｃｍｒ１、Ｃｍｒ３、Ｃｍｒ４、Ｃｍｒ５、Ｃｍｒ６、Ｃｓｂ１、Ｃｓｂ２、Ｃｓｂ３、Ｃｓｘ１７、Ｃｓｘ１４、Ｃｓｘ１０、Ｃｓｘ１６、ＣｓａＸ、Ｃｓｘ３、Ｃｓｘ１、Ｃｓｘ１５、Ｃｓｆ１、Ｃｓｆ２、Ｃｓｆ３、Ｃｓｆ４、それらのホモログ、又はそれらの改変されたもの等が挙げられる。中でも、本実施形態の遺伝子改変非ヒト生物は、Ｃａｓ９遺伝子、それらのホモログ、又はそれらの改変されたものが導入されていることが特に好ましい。
【００１８】
Ｃａｓ９は、標的遺伝子中のＰＡＭ配列の最初又は最後のヌクレオチドから、例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５、５０、１００、２００、５００又はそれ以上の塩基対以内での、一方又は両方の鎖の切断を指向する。ＰＡＭ配列の上流の何ｂｐのところを切断するかはＣａｓ９の由来となる細菌種によって異なるが、化膿性連鎖球菌（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｙｏｇｅｎｅｓ：Ｓ．ｐｙｏｇｅｎｅｓ）を含め大部分のＣａｓ９はＰＡＭ配列の３塩基上流を切断する。
【００１９】
また、本実施形態で用いられるＣａｓ９としては、標的配列を含む標的遺伝子の一方又は両方の鎖を切断する能力を欠如している改変体であってよい。例えば、Ｓ．ｐｙｏｇｅｎｅｓ由来のＣａｓ９のＲｕｖＣ  Ｉ触媒ドメイン中のアスパラギン酸からアラニンへの置換（Ｄ１０Ａ）は、Ｃａｓ９を、両方の鎖を切断するヌクレアーゼからニッカーゼ(一本鎖を切断する)に変換する。Ｃａｓ９をニッカーゼにする変異の他の例には、Ｈ８４０Ａ、Ｎ８５４Ａ及びＮ８６３Ａが含まれ、これらに限定されない。また、Ｃａｓ９の２つ以上の触媒ドメイン(ＲｕｖＣ  Ｉ、ＲｕｖＣ  ＩＩ及びＲｕｖＣ  ＩＩＩ)は、全てのＤＮＡ切断活性を実質的に欠く変異したＣａｓ９を生産することができる。この場合、その他のＤＮＡ切断活性を有する酵素と融合したキメラ酵素であることが好ましい。Ｄ１０Ａ変異は、全てのＤＮＡ切断活性を実質的に欠くＣａｓ９を生産するために、Ｈ８４０Ａ、Ｎ８５４Ａ又はＮ８６３Ａ変異のうち１つ又は複数と組み合わされていてもよい。変異したＣａｓ９のＤＮＡの切断活性が、その非変異形態に対して約２５％、１０％、５％、１％、０．１％又は０．０１％未満の場合に、全てのＤＮＡ切断活性を実質的に欠くとみなされる。
【００２０】
本実施形態において、Ｃａｓ９をコードする塩基配列は、真核生物細胞等の特定の細胞における発現のためにコドン最適化されていてもよい。真核生物細胞としては、特定の生物、例えば、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、イヌ、ブタ又は非ヒト霊長類等が挙げられ、これらに限定されない。一般に、コドン最適化とは、ネイティブのアミノ酸配列を維持しつつ、ネイティブの配列の少なくとも１つのコドンを、導入される生物種の遺伝子においてより頻繁に又は最も頻繁に使用されるコドンで置き換えることによって、導入される生物種における増強された発現のために核酸配列を改変するプロセスを指す。種々の種が、特定のアミノ酸の特定のコドンについて特定のバイアスを示す。コドンバイアス(生物間のコドン使用頻度における差異)は、ｍＲＮＡの翻訳効率と相関する場合が多く、これは、翻訳されているコドンの特性及び特定のｔＲＮＡの利用可能性にとりわけ依存すると考えられている。細胞中の選択されたｔＲＮＡの優勢は、一般に、ペプチド合成において最も頻繁に使用されるコドンの反映である。従って、遺伝子は、コドン最適化に基づいて、所与の生物における最適な遺伝子発現のために個別化され得る。コドン使用頻度表は、例えば、www.kazusa.or.jp/codon/（２０１５年１２月１６日に訪問）に掲載されている「Codon  Usage  Database」において容易に入手可能であり、これらの表を用いて、コドンを最適化することができる（例えば、Nakamura,Y.ら「Codon usage tabulated from the international DNA sequence databases:status for the year 2000」Nucl. Acids Res. 28:292 (2000)、参照）。特定の生物種における発現のために特定の配列をコドン最適化するためのコンピューターアルゴリズムについても、例えば、Gene Forge（Aptagen社;Jacobus、PA）等において入手可能である。本実施形態において、Ｃａｓ９をコードする配列中の１つ又は複数のコドンは、特定のアミノ酸について最も頻繁に使用されるコドンに対応する。
【００２１】
細胞内におけるＣａｓ９の発現量が多いほど、Ｃａｓ９を外部から導入する必要がなく、その分ガイドＲＮＡを大量に導入できる。そのため、ＣＲＩＳＰＲシステムを用いて、一遺伝子を１箇所若しくは複数箇所における遺伝子改変を効率よく行うことができ、さらに一遺伝子のみならず複数の遺伝子を一度の操作で同時に改変することができる。本実施形態において、導入されたＣａｓ９遺伝子のコピー数は３コピー以上であることが好ましい。Ｃａｓ９遺伝子が導入される遺伝子座やプロモーターの影響も受けるが、一般的には、導入されたＣａｓ９遺伝子のコピー数が多いほど、Ｃａｓ９の発現量が多くなる傾向にあるためである。導入されたＣａｓ９をコードする遺伝子のコピー数は、例えば、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、５０又はそれ以上の数であってもよい。
【００２２】
本明細書において、「核ゲノム」とは、核内に含まれる全ての染色体を意味する。例えば、ヒトの場合、核ゲノムを構成する染色体数は２２対の常染色体と２本の性染色体の合計４６本あり、ウシの場合、２９対の常染色体と２本の性染色体の合計６０本あり、マウスの場合、１９対の常染色体と２本の性染色体の合計４０本である。
【００２３】
本明細書において、「コピー数」とは、核ゲノム中に存在する特定の遺伝子の塩基配列の数を意味し、例えば、核ゲノムを構成する１つの染色体に特定の遺伝子が１つ存在する場合、コピー数は１である。また、１つの染色体及びその相同染色体の両方に特定の遺伝子が１つずつ存在する場合（すなわち、ホモ接合体の場合）、コピー数は２である。
【００２４】
本実施形態において、Ｃａｓ９遺伝子は同じ染色体上に複数導入されていてもよく、異なる染色体上に１つずつ又は複数導入されていてもよい。また、Ｃａｓ９遺伝子は同じ染色体上の同じ遺伝子座にタンデムに導入されていてもよい。
【００２５】
本実施形態において、Ｃａｓ９遺伝子が導入される遺伝子座は、恒常的且つ安定的に発現が行われている遺伝子領域であり、かつ当該領域に本来コードされている遺伝子が欠損又は改変された場合であっても、生命の維持が可能な領域であればよい。また、Ｃａｓ９遺伝子を導入する際にＣＲＩＳＰＲシステムを活用する場合には、近傍にＰＡＭ配列を有することが好ましい。Ｃａｓ９遺伝子が導入される遺伝子座としては、例えば、ＧＴＰ−ｂｉｎｄｉｎｇ  ｐｒｏｔｅｉｎ  １０遺伝子座、Ｒｏｓａ２６遺伝子座、ｂｅｔａ−Ａｃｔｉｎ遺伝子座等が挙げられる。
【００２６】
[プロモーター] 
本実施形態において、核ゲノムに導入されたＣａｓ９遺伝子は、該Ｃａｓ９遺伝子に作動可能に連結された、プロモーターを含んでいてもよい。プロモーターとしては、例えば、ウイルス性プロモーター、発現誘導性プロモーター、組織特異的プロモーター又はエンハンサー配列やプロモーター配列を融合させたプロモーター等が挙げられる。上記プロモーターは、Ｃａｓ９遺伝子の上流（５’側）に連結されていることが好ましい。
【００２７】
本明細書において、「ウイルス性プロモーター」とは、ウイルス由来のプロモーターを意味する。由来となるウイルスとしては、例えばサイトメガロウイルス、モロニー白血病ウイルス、ＪＣウイルス、乳癌ウイルス、シミアンウイルス、レトロウイルス等が挙げられる。
【００２８】
本明細書において、「発現誘導性プロモーター」とは、化学薬剤、物理的ストレス等の特定の刺激を与えたときに発現させたい遺伝子（本実施形態においては、Ｃａｓ９遺伝子）を発現することができ、刺激の非存在下では発現活性を示さないプロモーターを意味する。発現誘導性プロモーターとしては、例えば、ＴｅｔＯ（テトラサイクリンオペレーター）プロモーター、メタロチオネイン（ｍｅｔａｌｌｏｔｈｉｏｎｉｎｅ）プロモーター、ＩＰＴＧ／ｌａｃＩプロモーター系、エクジソンプロモーター系、及び翻訳又は転写についての阻害配列を不可逆的に欠失させるための「ｌｏｘ  ｓｔｏｐ  ｌｏｘ」系等が挙げられ、これらに限定されない。
【００２９】
本明細書において、「組織特異的プロモーター」とは、特定の組織においてのみ活性を有するプロモーターを意味する。組織特異的プロモーターとしては、例えば、黒色腫細胞又はメラニン細胞の場合は、チロシナーゼプロモーター又はＴＲＰ２プロモーター；乳房細胞又は乳癌の場合は、ＭＭＴＶプロモーター又はＷＡＰプロモーター；腸細胞又は腸癌の場合は、ビリンプロモーター又はＦＡＢＰプロモーター；膵細胞の場合は、ＰＤＸプロモーター；膵ベータ細胞の場合は、ＲＩＰプロモーター；ケラチノサイトの場合は、ケラチンプロモーター；前立腺上皮の場合は、プロバシンプロモーター；中枢神経系（ＣＮＳ）の細胞又は中枢神経系の癌の場合は、ネスチンプロモーター又はＧＦＡＰプロモーター；ニューロンの場合は、チロシンヒドロキシラーゼプロモーター、Ｓ１００プロモーター、又は神経フィラメントプロモーター；Edlundら、Science, 230:912-916(1985)に記載される、膵臓特異的プロモーター；肺癌の場合は、クラーラ細胞分泌タンパク質プロモーター；心細胞の場合は、αミオシンプロモーター等が挙げられ、これらに限定されない。
【００３０】
エンハンサー配列やプロモーター配列を融合させたプロモーターとしては、例えば、シミアンウイルス４０（ＳＶ４０）の初期遺伝子のプロモーターとヒトＴ細胞白血病ウイルス１のロング・ターミナル・リピートの一部の配列からなるＳＲαプロモーター、サイトメガロウイルスの前初期（ＩＥ）遺伝子エンハンサーとニワトリβ−アクチンプロモーターからなるＣＡＧプロモーター等が挙げられる。特に、ＣＡＧプロモーターは、発現させたい遺伝子（本実施形態においては、Ｃａｓ９遺伝子）の３’末端にウサギのβ−グロビン遺伝子のｐｏｌｙＡ  ｓｉｇｎａｌサイトを有することにより、発現させたい遺伝子（本実施形態においては、Ｃａｓ９遺伝子）をほぼ全身で過剰発現させることができる。
【００３１】
中でも、プロモーターとしては、全身で恒常的に高発現させたい場合においては、ウイルス性プロモーター又はＣＡＧプロモーターであることが好ましい。また、Ｃａｓ９の発現する時期又は発現する組織を調整した場合においては、発現誘導性プロモーター又は組織特異的プロモーターであることが好ましい。
【００３２】
本明細書において、「作動可能に連結」とは、遺伝子発現制御配列（例えば、プロモーター又は一連の転写因子結合部位）と発現させたい遺伝子（本実施形態においては、Ｃａｓ９遺伝子）との間の機能的連結を意味する。ここで、「発現制御配列」とは、その発現させたい遺伝子（本実施形態においては、Ｃａｓ９遺伝子）の転写を指向するものを意味する。
【００３３】
本実施形態において、核ゲノムに導入されたＣａｓ９遺伝子は、該Ｃａｓ９遺伝子の下流（３’側）に、ｍＲＮＡの３’末端のポリアデニル化に必要なポリアデニル化シグナルが作動可能に連結されていてもよい。ポリアデニル化シグナルとしては、上記のウイルス由来、各種ヒト又は非ヒト生物由来の各遺伝子に含まれるポリアデニル化シグナル、例えば、ＳＶ４０の後期遺伝子又は初期遺伝子、ウサギβグロビン遺伝子、ウシ成長ホルモン遺伝子、ヒトＡ３アデノシン受容体遺伝子等のポリアデニル化シグナル等を挙げることができる。その他Ｃａｓ９遺伝子をさらに高発現させるために、各遺伝子のスプライシングシグナル、エンハンサー領域、イントロンの一部をプロモーター領域の５’上流、プロモーター領域と翻訳領域間或いは翻訳領域の３’下流に連結してもよい。
【００３４】
本実施形態において、核ゲノムに導入されたＣａｓ９遺伝子は、該Ｃａｓ９遺伝子の上流（５’側）又は下流（３’側）に、１つ又は複数の核局在化配列（ＮＬＳ）が作動可能に連結されていてもよい。
【００３５】
ＮＬＳとしては、例えば、アミノ酸配列ＰＫＫＫＲＫＶ（配列番号１）を有する、ＳＶ４０ウイルスラージＴ抗原のＮＬＳ;ヌクレオプラスミン由来のＮＬＳ（例えば、配列ＫＲＰＡＡＴＫＫＡＧＱＡＫＫＫＫ（配列番号２）を有するヌクレオプラスミンの二分ＮＬＳ);アミノ酸配列ＰＡＡＫＲＶＫＬＤ（配列番号３）又はＲＱＲＲＮＥＬＫＲＳＰ（配列番号４）を有するｃ−ｍｙｃ  ＮＬＳ;配列ＮＱＳＳＮＦＧＰＭＫＧＧＮＦＧＧＲＳＳＧＰＹＧＧＧＧＱＹＦＡＫＰＲＮＱＧＧＹ（配列番号５）を有するｈＲＮＰＡ１  Ｍ９  ＮＬＳ;インポーチン−アルファ由来のＩＢＢドメインの配列ＲＭＲＩＺＦＫＮＫＧＫＤＴＡＥＬＲＲＲＲＶＥＶＳＶＥＬＲＫＡＫＫＤＥＱＩＬＫＲＲＮＶ（配列番号６）;筋腫Ｔタンパク質の配列ＶＳＲＫＲＰＲＰ（配列番号７）及びＰＰＫＫＡＲＥＤ（配列番号８）;ヒトｐ５３の配列ＰＱＰＫＫＫＰＬ（配列番号９）;マウスｃ−ａｂｌ  ＩＶの配列ＳＡＬＩＫＫＫＫＫＭＡＰ（配列番号１０）;インフルエンザウイルスＮＳ１の配列ＤＲＬＲＲ（配列番号１１）及びＰＫＱＫＫＲ（配列番号１２）;肝炎ウイルスデルタ抗原の配列ＲＫＬＫＫＫＩＫＫＬ（配列番号１３）;マウスＭｘ１タンパク質の配列ＲＥＫＫＫＦＬＫＲＲ（配列番号１４）;ヒトポリ（ＡＤＰ−リボース）ポリメラーゼの配列ＫＲＫＧＤＥＶＤＧＶＤＥＶＡＫＫＫＳＫＫ（配列番号１５）;ステロイドホルモンレセプター（ヒト）グルココルチコイドの配列ＲＫＣＬＱＡＧＭＮＬＥＡＲＫＴＫＫ（配列番号１６）等が挙げられ、これらに限定されない。
【００３６】
本実施形態において、核ゲノムに導入されたＣａｓ９遺伝子は、該Ｃａｓ９遺伝子の上流（５’側）又は下流（３’側）に、１つ又は複数の蛍光タンパク質等のマーカー遺伝子が作動可能に連結されていてもよい。蛍光タンパク質としては、例えば、緑色蛍光タンパク質（Ｇｒｅｅｎ Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｔ Ｐｒｏｔｅｉｎ：ＧＦＰ）、黄色蛍光タンパク質（Ｙｅｌｌｏｗ  Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｔ Ｐｒｏｔｅｉｎ：ＹＦＰ）、青色蛍光タンパク質（Ｂｌｕｅ Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｔ Ｐｒｏｔｅｉｎ：ＢＦＰ）、シアン蛍光蛋白質（Ｃｙａｎ  Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｔ  Ｐｒｏｔｅｉｎ）、赤色蛍光蛋白質（Ｒｅｄ  ＦｌｕｏｒｅｓｃｅｎｔＰｒｏｔｅｉｎ）等が挙げられる。
【００３７】
［遺伝子改変非ヒト生物の作製方法］
本実施形態の遺伝子改変非ヒト生物は、外来遺伝子を核ゲノムに導入した遺伝子改変非ヒト生物を作製する公知の遺伝子改変技術（例えば、ＣＲＩＳＰＲシステム、Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ  Ａｃｔｉｖａｔｏｒ−Ｌｉｋｅ  Ｅｆｆｅｃｔｏｒ  Ｎｕｃｌｅａｓｅｓ（ＴＡＬＥＮ）を用いた方法、ジンクフィンガーヌクレアーゼを用いた方法等）を用いて作製することができる。また、Ｃａｓ９遺伝子（好ましくは、線状化状態のもの）を対象となる非ヒト哺乳動物の受精卵、胚性幹細胞、精子又は未受精卵へ導入し、これらの細胞を用いて発生させた個体から、Ｃａｓ９遺伝子が胚芽細胞を含むすべての細胞の染色体上に組み込まれた個体を選択する方法によっても作製することができる。中でも、本実施形態の遺伝子改変非ヒト生物は、従来のＣＲＩＳＰＲシステムを活用した遺伝子改変非ヒト生物の作製方法により、効率よく得ることができる。より具体的には、後述の＜標的遺伝子を選択的且つ部位特異的に改変するための方法＞において示す方法が挙げられ、外来遺伝子として、上述のＣａｓ９遺伝子と該Ｃａｓ９遺伝子の上流（５’側）及び下流（３’側）に標的遺伝子の挿入を行う遺伝子座と相同な配列を有する遺伝子を含むベクターを用いることで、対象となる非ヒト生物に導入することによって作製できる。
また、本実施形態の遺伝子改変非ヒト生物は、さらにＣａｓ９遺伝子以外の外来遺伝子を同時に導入し、Ｃａｓ９遺伝子及びＣａｓ９遺伝子以外の外来遺伝子が導入された核ゲノムを有する遺伝子改変非ヒト生物であってもよい。
【００３８】
得られた遺伝子改変非ヒト生物の胚芽細胞においてＣａｓ９遺伝子が存在することは、得られた生物の子孫がその胚芽細胞及び体細胞の全てに該導入遺伝子を有することで確認することができる。個体の選択は、個体を構成する組織、例えば、血液組織、上皮組織、結合組織、軟骨組織、骨組織、筋組織、口腔内組織又は骨格系組織の一部から調製したゲノムＤＮＡにＣａｓ９遺伝子が存在することをＤＮＡレベルで確認することによって行われる。
又は、Ｃａｓ９遺伝子が存在することは、Ｃａｓ９遺伝子導入後の単一胚盤胞を用いた遺伝型決定法により確認することができる（参考資料：Ｓａｋｕｒａｉ  Ｔ．，  ｅｔ  ａｌ．，  “Ａ  ｓｉｎｇｌｅ  ｂｌａｓｔｏｃｙｓｔ  ａｓｓａｙ  ｏｐｔｉｍｉｚｅｄ  ｆｏｒ  ｄｅｔｅｃｔｉｎｇ  ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９  ｓｙｓｔｅｍ−ｉｎｄｕｃｅｄ  ｉｎｄｅｌ  ｍｕｔａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  ｍｉｃｅ”，  ＢＭＣ  Ｂｉｏｔｅｃｈ．，１４：６９，２０１４．）。この方法によれば、従来よりも迅速にＣａｓ９遺伝子の存在の成否を判定することができる。
このようにして選択された個体は通常、相同染色体の片方にＣａｓ９遺伝子を有するヘテロ接合体であるため、ヘテロ接合体の個体同士を交配することにより、子孫の中からＣａｓ９遺伝子を相同染色体の両方に持つホモ接合体生物を取得することができる。このホモ接合体の雌雄の生物を交配することにより、すべての子孫がＣａｓ９遺伝子を安定に保持するホモ接合体となるので、通常の飼育環境で、本実施形態の遺伝子改変非ヒト生物を繁殖継代することができる。
【００３９】
＜卵細胞＞
一実施形態において、本発明は、Ｃａｓ９をコードする遺伝子が少なくとも３コピー導入された核ゲノムを有する遺伝子改変非ヒト生物由来である卵細胞を提供する。
【００４０】
本実施形態の卵細胞は、複数の異なる遺伝子又は同一遺伝子内の複数箇所を同時に高効率で編集することができる。また、本実施形態の卵細胞と同種の生物由来の精子と受精させて得られた受精卵によれば、遺伝子改変非ヒト生物を迅速かつ低コストで作製することができる。
【００４１】
本実施形態の卵細胞は、上述の遺伝子改変非ヒト生物の雌由来のものである。
【００４２】
なお、本明細書において、「卵細胞」とは、雌性の生殖細胞を意味し、卵母細胞及び未受精卵を包含する。
【００４３】
本実施形態における遺伝子改変非ヒト生物由来の卵細胞としては、遺伝子改変非ヒト生物が核ゲノム中の相同染色体の片方にＣａｓ９遺伝子を有するヘテロ接合体である場合、該卵細胞の核内にＣａｓ９遺伝子が少なくとも３コピー導入された核ゲノムを有するものと、Ｃａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さないものとが存在する。しかしながら、いずれの卵細胞も標的遺伝子の改変に活用することができる。これは、卵形成期において母性由来のＣａｓ９（以下、ｍａＣａｓ９と呼ぶ。）のｍＲＮＡ又はタンパク質が卵細胞に蓄積されており、受精卵から２細胞期まで機能した後に、徐々に分解されるためである。よって、外来遺伝子を有さず標的遺伝子が改変された遺伝子改変非ヒト生物を作製したい場合においては、核内にＣａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さない卵細胞を用いることが好ましい。
【００４４】
本実施形態における卵細胞の由来となる遺伝子改変非ヒト生物は、Ｃａｓ９遺伝子が少なくとも３コピー導入された核ゲノムを有していればよく、卵形成期においてｍａＣａｓ９のｍＲＮＡ又はタンパク質が卵母細胞に蓄積され得る。また、導入されたＣａｓ９遺伝子のコピー数は多いほど、蓄積されるｍａＣａｓ９のｍＲＮＡ又はタンパク質が多くなるため好ましい。導入されたＣａｓ９遺伝子のコピー数は、例えば、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、５０又はそれ以上の数であってもよい。
【００４５】
＜受精卵＞
一実施形態において、本発明は、Ｃａｓ９をコードする遺伝子が少なくとも３コピー導入された核ゲノムを有する遺伝子改変非ヒト生物由来の卵細胞と、同種の生物由来の精子とを受精させてなる、受精卵を提供する。
【００４６】
本実施形態の受精卵によれば、複数の異なる遺伝子又は同一遺伝子内の複数箇所を同時に高効率で編集することができる。また、本発明の受精卵によれば、遺伝子改変非ヒト生物を迅速かつ低コストで作製することができる。
【００４７】
本実施形態の受精卵は、上述の遺伝子改変非ヒト生物の雌由来の卵細胞と、同種の生物由来の精子とを人工授精させることにより得られる。
【００４８】
本実施形態における遺伝子改変非ヒト生物由来の卵細胞としては、遺伝子改変非ヒト生物が核ゲノム中の相同染色体の片方にＣａｓ９遺伝子を有するヘテロ接合体である場合、該卵細胞の核内にＣａｓ９遺伝子が少なくとも１コピー導入された核ゲノムを有するものと、Ｃａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さないものとが存在する。しかしながら、いずれの卵細胞も標的遺伝子の改変に活用することができる。これは、卵形成期においてｍａＣａｓ９のｍＲＮＡ又はタンパク質が卵細胞に蓄積されており、受精卵から２細胞期まで機能した後に、徐々に分解されるためである。よって、外来遺伝子を有さず標的遺伝子が改変された遺伝子改変非ヒト生物を作製したい場合においては、核内にＣａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さない卵細胞を用いることが好ましい。
【００４９】
本実施形態における卵細胞の由来となる遺伝子改変非ヒト生物は、Ｃａｓ９遺伝子が少なくとも３コピー導入された核ゲノムを有していればよく、核ゲノム卵形成期においてｍａＣａｓ９のｍＲＮＡ又はタンパク質が卵母細胞に蓄積され得る。また、導入されたＣａｓ９遺伝子のコピー数は多いほど、蓄積されるｍａＣａｓ９のｍＲＮＡ又はタンパク質が多くなるため好ましい。導入されたＣａｓ９遺伝子のコピー数は、例えば、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、５０又はそれ以上の数であってもよい。
【００５０】
本実施形態における精子としては、卵細胞を得た生物種と同種のものであればよく、該精子の核内にＣａｓ９遺伝子を少なくとも１コピー導入された核ゲノムを有する遺伝子改変非ヒト生物由来のものでもよく、Ｃａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さない遺伝子改変非ヒト生物由来のものでもよく、野生型の生物由来のものでもよい。Ｃａｓ９遺伝子を有さず標的遺伝子が改変された遺伝子改変非ヒト生物を作製したい場合においては、核内にＣａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さない生物、又は野生型の生物由来の精子であることが好ましい。
【００５１】
前記核内にＣａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さない卵細胞では、上述のとおり、ｍａＣａｓ９のｍＲＮＡ又はタンパク質が蓄積されている。よって、核内にＣａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さない卵細胞と、核内にＣａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さない生物、又は野生型の生物由来の精子とを受精させてなる受精卵である場合、ｍａＣａｓ９のｍＲＮＡ又はタンパク質は、受精卵から２細胞期までの短期間において一過的に過剰に存在している。そのため、後述の実施例に示すとおり、モザイク型変異が従来の合成されたＣａｓ９ｍＲＮＡとガイドＲＮＡを受精卵に顕微注入するゲノム編集法よりも大幅に低くなる。
【００５２】
＜標的遺伝子の改変方法＞
一実施形態において、本発明は、上述の遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、上述の卵細胞、又は上述の受精卵にガイドＲＮＡを導入する工程を備える標的遺伝子の改変方法を提供する。
【００５３】
また、一実施形態において、本発明は、上述の遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、上述の卵細胞、又は上述の受精卵にガイドＲＮＡを導入する工程と、
前記遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、前記遺伝子改変非ヒト生物由来の卵細胞、又は前記遺伝子改変非ヒト生物由来の受精卵内において発現しているＣａｓ９がＰＡＭ（Ｐｒｏｔｏ−ｓｐａｃｅｒ  Ａｄｊａｃｅｎｔ  Ｍｏｔｉｆ）配列の上流に位置する切断部位で前記標的遺伝子を切断する工程と、
前記ガイドＲＮＡと前記標的遺伝子の相補的結合によって決定される領域において、改変された前記標的遺伝子を得る工程と、を備え、
前記標的遺伝子は前記ＰＡＭ配列を有し、
前記ガイドＲＮＡは、前記標的遺伝子中の前記ＰＡＭ配列の上流の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドを含むものである標的遺伝子の改変方法を提供する。
【００５４】
本実施形態の方法によれば、ｉｎ ｖｉｔｒｏ及びｉｎ  ｖｉｖｏにおいて、簡便且つ効率的に標的遺伝子を編集することができる。さらに、遺伝子改変非ヒト生物を迅速かつ低コストで作製することができる。
【００５５】
本明細書において、「標的遺伝子」としては、ＰＡＭ配列を有する遺伝子であれば特別な限定はなく、例えば、心臓病や癌等の生活習慣病関連の遺伝子等の研究対象となり得る遺伝子が挙げられる。
【００５６】
本明細書において、「ＰＡＭ配列」とはＣａｓ９により認識され得る配列であって、ＰＡＭ配列の長さや塩基配列はＣａｓ９の由来となる細菌種によってさまざまである。例えば、Ｓ．ｐｙｏｇｅｎｅｓでは「ＮＧＧ」(Ｎは任意の塩基を表す)の３塩基を認識する。
Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ（Ｓ．ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）は２つのＣａｓ９を持っており、それぞれ「ＮＧＧＮＧ」又は「ＮＮＡＧＡＡ」(Ｎは任意の塩基を表す)の５〜６塩基をＰＡＭ配列として認識する。認識するＰＡＭ配列が短く編集可能な標的遺伝子が制限されにくいことから、ＰＡＭ配列は「ＮＧＧ」であることが好ましい。
【００５７】
本実施形態において、前記遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、前記遺伝子改変非ヒト生物由来の卵細胞、又は前記遺伝子改変非ヒト生物由来の受精卵内において発現しているＣａｓ９はＰＡＭ配列「ＮＧＧ」を認識可能であるものであればよく、例えばＳ．ｐｙｏｇｅｎｅｓ由来のＣａｓ９等が挙げられる。また、上述の＜遺伝子改変非ヒト生物＞に記載のとおり、Ｃａｓ９は改変されていてもよく、コドンが最適化された塩基配列からなるＣａｓ９遺伝子を発現させてものでもよい。
【００５８】
本明細書において、「ガイドＲＮＡ」とは細菌及び古細菌において侵入外来核酸に対する獲得耐性を提供する適応免疫系を構成する、外来配列（ガイド配列）を含む小さなＲＮＡ断片（ＣＲＩＳＰＲ−ＲＮＡ：ｃｒＲＮＡ）と該ｃｒＲＮＡと一部相補的なＲＮＡ（ｔｒａｎｓ−ａｃｔｉｖａｔｉｎｇ  ｃｒＲＮＡ：ｔｒａｃｒＲＮＡ）とを融合させたｔｒａｃｒＲＮＡ−ｃｒＲＮＡキメラのヘアピン構造を模倣したものである。
本実施形態で用いられるガイドＲＮＡは、ガイド配列を含むｃｒＲＮＡとｔｒａｃｒＲＮＡとが融合した状態で合成されたｔｒａｃｒＲＮＡ−ｃｒＲＮＡキメラであってもよく、ガイド配列を含むｃｒＲＮＡとｔｒａｃｒＲＮＡとを別々に作製し、導入前にアニーリングしてｔｒａｃｒＲＮＡ−ｃｒＲＮＡキメラとしたものであってもよい。
本実施形態におけるガイドＲＮＡは、標的遺伝子中のＰＡＭ配列の１塩基上流から、好ましくは２０塩基以上２４塩基以下、より好ましくは２２塩基以上２４塩基以下までの塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドを５’末端領域に含むものである。さらに、標的遺伝子と非相補的な塩基配列を含み、一点を軸として対称に相補的な配列になるように並び、ヘアピン構造をとり得る塩基配列からなるポリヌクレオチドを１つ以上含んでいてもよい。
本実施形態の方法について、以下に詳細に説明する。
【００５９】
［導入工程］
まず、上述の遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、上述の卵細胞、又は上述の受精卵にガイドＲＮＡを導入する。ガイドＲＮＡの導入方法としては、公知の遺伝子導入の手法（例えば、リン酸カルシウム法、エレクトロポレーション法、リポフェクション法、凝集法、マイクロインジェクション法、パーティクルガン法、ＤＥＡＥ−デキストラン法等）を用いることができる。中でも、操作が簡便であることから、エレクトロポレーション法であることが好ましい。従来のＣＲＩＳＰＲシステムを活用した遺伝子改変方法では、Ｃａｓ９のｍＲＮＡが大きく、導入効率が悪かった。しかしながら、本実施形態の方法においては、Ｃａｓ９が発現され得る遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、卵細胞、又は受精卵を使用するため、エレクトロポレーション法等により簡便且つ効率よくガイドＲＮＡを導入することができる。
【００６０】
導入対象が前記遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞である場合、生きた遺伝子改変非ヒト生物にガイドＲＮＡを導入することができる。この場合の導入方法は、動脈内注射、静脈内注射、皮下注射、鼻腔内的導入、経気管支的導入、筋内的導入、経皮的導入又は経口的導入等の当業者に公知の方法が挙げられ、静脈内注射が好ましい。
【００６１】
また、Ｃａｓ９遺伝子の上流（５’側）に組織特異的プロモーターが作動可能に連結されている場合、ガイドＲＮＡを遺伝子改変非ヒト生物の全身又は目的の組織に直接導入することにより、目的の組織においてのみガイドＲＮＡ及びＣａｓ９による遺伝子改変が行われ、疾患の動態を観察することができる。
【００６２】
導入対象が前記卵細胞を受精してなる受精卵又は前記受精卵である場合、受精後４時間以上２４時間以内、好ましくは６時間以上１２時間以内、より好ましくは６時間以上８時間以下の雄性前核が出現している受精卵を用いることが好ましい。受精後の時間が上記範囲内であることにより、ｍａＣａｓ９のｍＲＮＡ又はタンパク質が高発現しており、標的遺伝子が改変されている細胞と標的遺伝子が改変されていない細胞とが混在する、所謂モザイク型の胚となることを防ぎ、高効率で標的遺伝子を改変することができる。
【００６３】
また、上述の＜受精卵＞に記載したように、核内にＣａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さずに、標的遺伝子が改変された遺伝子改変非ヒト生物を作製したい場合においては、使用する受精卵は核内にＣａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さない卵細胞と、核内にＣａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さない生物、又は野生型の生物由来の精子とを受精させてなる受精卵であることが好ましい。前記核内にＣａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さない卵細胞では、ｍａＣａｓ９のｍＲＮＡ又はタンパク質が蓄積されている。よって、使用する受精卵が、核内にＣａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さない卵細胞と、核内にＣａｓ９遺伝子が導入された核ゲノムを有さない生物、又は野生型の生物由来の精子とを受精させてなる受精卵である場合、ｍａＣａｓ９のｍＲＮＡ又はタンパク質は、受精卵から２細胞期までの短期間において一過的に過剰に存在している。そのため、後述の実施例に示すとおり、モザイク型変異が従来の合成されたＣａｓ９ｍＲＮＡとガイドＲＮＡを受精卵に顕微注入するゲノム編集法よりも大幅に低くなる。
【００６４】
受精卵においてガイドＲＮＡを導入する場合、ガイドＲＮＡの濃度としては、特別な限定はないが、濃度が濃いほど、遺伝子改変を高確率で行うことができる。ガイドＲＮＡの濃度としては、例えば、１ｎｇ／μＬ以上３００ｎｇ／μＬ以下であればよい。
【００６５】
また、前記受精卵が遺伝子改変非ヒト動物（特に、非ヒト哺乳動物）由来である場合、ガイドＲＮＡの導入後、前記受精卵を対応する非ヒト動物の子宮又は卵管へ移植し、発生させることで、遺伝子改変非ヒト動物を簡便に得ることができる。
【００６６】
１つの標的遺伝子の２箇所以上を改変する場合、又は２つ以上の複数の遺伝子を標的遺伝子とする場合は、それぞれの遺伝子の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドを５’末端領域に含むガイドＲＮＡを２種類以上設計し、導入すればよい。これにより、複数の異なる遺伝子又は同一遺伝子内の複数箇所を同時に高効率で編集することができる。
【００６７】
本実施形態の方法において、ガイドＲＮＡとともに外来遺伝子を導入してもよい。外来遺伝子を一緒に導入することにより、標的遺伝子が切断後、相同組換えにより標的遺伝子に外来遺伝子が挿入された核ゲノムを有する遺伝子改変非ヒト生物を得ることができる。
【００６８】
また、外来遺伝子は、ＰＡＭ配列を有さないことが好ましい。外来遺伝子において、例えば、アミノ酸配列を変更しない１塩基置換等により、ＰＡＭ配列をｎｏｎＰＡＭ配列に変更した場合、核ゲノム上に外来遺伝子を相同組換えにより挿入することができ、さらに、挿入された外来遺伝子が再度内在するＣａｓ９により切断されることを防ぐことができる。
【００６９】
外来遺伝子は、該外来遺伝子を含むベクターを用いて導入することが好ましい。また、外来遺伝子を含むベクターは、外来遺伝子の５’末端及び３’末端に、標的遺伝子の挿入を行う部位と相同な配列を有するＤＮＡが連結されていることが好ましい。標的遺伝子の挿入を行う部位と相同な配列を有するＤＮＡの塩基数としては、１００塩基以上３００塩基以下であることが好ましい。外来遺伝子を含むベクターは、外来遺伝子の５’末端又は３’末端に、上述の＜遺伝子改変非ヒト生物＞に記載のプロモーター、ポリアデニル化シグナル、ＮＬＳ、蛍光タンパク質のマーカー遺伝子等が作動可能に連結されていてもよい。
【００７０】
本明細書で使用する場合、「ベクター」は１つの環境から別の環境への実体の移行を可能にする又は促進するツールである。例として、組換えＤＮＡ技術において使用されるいくつかのベクターは、ＤＮＡのセグメント(例えば、異種ＤＮＡセグメント、例えば、異種ｃＤＮＡセグメント)等の実体が非ヒト生物の細胞中に移行されるのを可能にする。本実施形態において、ベクターは、ウイルスベクター（例えば、レンチウイルスベクター、バキュロウイルスベクター、アデノウイルス/アデノ随伴ウイルスベクター等）、細菌ベクター、原生動物ベクター、ＤＮＡベクター又はそれらの組換えを含み得る組換えベクターを包含する。
【００７１】
［切断工程］
前記遺伝子改変非ヒト生物由来の細胞、前記遺伝子改変非ヒト生物由来の卵細胞、又は前記遺伝子改変非ヒト動物由来の受精卵内において発現しているＣａｓ９と、前記ガイドＲＮＡは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ又はｉｎ  ｖｉｖｏにおいて、温和な条件で混合することで、Ｃａｓ９−ガイドＲＮＡ複合体を形成する。温和な条件とは、タンパク質が分解又は変性しない程度の温度及びｐＨを示しており、温度は４℃以上４０℃以下であればよく、ｐＨは４以上１０以下であればよい。よって、生きた遺伝子改変非ヒト生物の生体内においても、前記Ｃａｓ９−ガイドＲＮＡ複合体を形成することができる。
【００７２】
前記Ｃａｓ９−ガイドＲＮＡ複合体は、ガイドＲＮＡの一部が標的遺伝子に結合し、Ｃａｓ９が標的遺伝子中のＰＡＭ配列を認識する。続いて、３塩基上流に位置する切断部位で前記標的遺伝子を切断し、平滑末端を作製する。より具体的には、Ｃａｓ９がＰＡＭ配列を認識し、ＰＡＭ配列を起点として、標的遺伝子の二重らせん構造が引き剥され、ガイドＲＮＡ中の標的遺伝子に相補的な塩基配列とアニーリングすることで、標的遺伝子の二重らせん構造が部分的にほぐれる。このとき、Ｃａｓ９は、ＰＡＭ配列の３塩基上流に位置する切断部位で、標的遺伝子のリン酸ジエステル結合を切断し、平滑末端を作出する。
【００７３】
［改変工程］
続いて、前記ガイドＲＮＡと前記標的遺伝子の相補的結合によって決定される領域において、目的に応じた改変が施された標的遺伝子を得ることができる。
【００７４】
本明細書中において、「改変」とは、標的遺伝子の塩基配列が変化することを意味する。例えば、標的遺伝子の切断、切断後の外因性配列の挿入（物理的挿入又は相同指向修復を介する複製による挿入）による標的二本鎖ポリヌクレオチドの塩基配列の変化、切断後の非相同末端連結（ＮＨＥＪ：切断により生じたDNA末端どうしが再び結合すること）による標的遺伝子の塩基配列の変化等が挙げられる。本実施形態における標的遺伝子の改変により、標的遺伝子への変異の導入、又は、標的遺伝子の機能を破壊することができる。
よって、本実施形態において、前記受精卵を用いた場合、標的遺伝子の機能が破壊（ノックアウト）又は置換（ノックイン）された遺伝子改変非ヒト生物を容易に作製することができる。
【００７５】
＜用途及び活用方法＞
一実施形態において、本発明は、遺伝子改変を実行するための方法及び組成物を提供する。以前に知られている標的化された遺伝子組換えの方法と対照的に、本発明は、実行が、効率的かつ安価であり、そして任意の細胞又は生物に適応可能である。細胞又は生物の標的遺伝子の任意のセグメントは、本発明の方法により改変され得る。この方法は、全ての細胞に内在性である相同組換えプロセス及び非相同組換えプロセスの両方を利用する。
【００７６】
また、一実施形態において、本発明は、標的化されたＤＮＡ挿入又は標的化されたＤＮＡ欠失を行う方法を提供する。この方法は、ドナーＤＮＡを含む核酸構築物を用いて、細胞を形質転換する工程を包含する。標的遺伝子切断後のＤＮＡ挿入及びＤＮＡ欠失に関するスキームについては、公知の方法に従って当業者が決定できる。
【００７７】
また、一実施形態において、本発明は、体細胞及び生殖細胞の両方で利用され、特定の遺伝子座で遺伝子操作を提供する。
【００７８】
また、一実施形態において、本発明は、体細胞において遺伝子を壊すための方法を提供する。ここで、遺伝子は、細胞又は生物に対して有害な産物を過剰発現し、細胞又は生物に対して有害な産物を発現する。このような遺伝子は、疾患において生じる１つ以上の細胞型において過剰発現され得る。本発明の方法による、前記過剰発現した遺伝子の破壊は、前記過剰発現した遺伝子に起因する疾患を被る個体に、より良い健康をもたらし得る。
すなわち、細胞のほんの小さな割合の遺伝子の破壊が働き、発現レベルを減少し、治療効果を生じ得る。
【００７９】
また、一実施形態において、本発明は、生殖細胞において遺伝子を壊すための方法を提供する。特定の遺伝子が破壊された細胞は、特定の遺伝子の機能を有さない生物を作製するために選択され得る。前記遺伝子が破壊された細胞において、遺伝子は完全にノックアウトされ得る。この特定の細胞における機能の欠損は、治療効果を有し得る。
【００８０】
また、一実施形態において、本発明は、遺伝子産物をコードするドナーＤＮＡの挿入をさらに提供する。この遺伝子産物は、構成的に発現された場合、治療効果を有する。
例えば、膵細胞の個体群において、活性プロモーター及びインシュリン遺伝子をコードするドナーＤＮＡの挿入を引き起こすために、前記ドナーＤＮＡを、糖尿病を被る個体に挿入する方法が挙げられる。次いで、外因性ＤＮＡを含む膵細胞の前記個体群は、インシュリンを生成し、糖尿病を被る個体を治療することができる。
【００８１】
また、前記ドナーＤＮＡは作物に挿入され、薬剤的関連遺伝子産物の生成を引き起こし得る。タンパク質産物の遺伝子（例えば、インシュリン、リパーゼ、ヘモグロビン等）は、制御エレメント（構成的活性プロモーター、又は誘導性プロモーター）と一緒に植物に挿入され、植物中で大量の医薬品を生成し得る。次いで、このようなタンパク質産物は、植物から単離され得る。遺伝子改変植物又は遺伝子改変生物は、核酸移入技術（ＭｃＣｒｅａｔｈ，Ｋ．Ｊ．ら（２０００）Ｎａｔｕｒｅ  ４０５：１０６６−１０６９；Ｐｏｌｅｊａｅｖａ，Ｉ．Ａ．ら，（２０００）Ｎａｔｕｒｅ  ４０７：８６−９０）を用いる方法で作製され得る。組織型特異的ベクター又は細胞型特異的ベクターは、選択した細胞内でのみ遺伝子発現を提供するために利用され得る。
【００８２】
また、一実施形態において、本発明は、生殖細胞内で利用され、計画された様式で挿入が生じ、後の全ての細胞分裂が、設計された遺伝的変更を有する細胞を生成する細胞を選択し得る。
【００８３】
また、一実施形態において、本発明は、すべての生物、培養細胞、培養組織、培養核（インタクトな生物を再生するために使用され得る細胞、組織又は核を含む）、配偶子（例えば、それらの発達の様々な段階の卵又は精子）において適用され得る。
また、一実施形態において、本発明は、任意の生物（昆虫、真菌、げっ歯類、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ニワトリ、及び他の農業上重要な動物、並びに他の哺乳動物（イヌ、ネコ及びヒトが挙げられるが、これらに限定されない）が挙げられ、これらに限定されない）に由来する細胞に適用され得る。
また、一実施形態において、本発明は病態モデル動物（例えば、病態モデルマウス）の作製において適用され得る。
【００８４】
また、一実施形態において、本発明は、植物において使用され得る。植物としては、特別な限定はなく、任意の様々な植物種（例えば、単子葉植物又は双子葉植物等）において使用され得る。
【実施例】
【００８５】
以下、実施例等を挙げて本発明をさらに詳述するが、本発明はこれらの実施例等に限定されるものではない。【００８６】
［実験材料］
本実施例において使用した、ガイドＲＮＡ及びプライマーの塩基配列について、以下の表１〜３に示す。表１において、太字（塩基配列の３’側の３塩基）は標的遺伝子上のＰＡＭ配列に相同な塩基配列を示している。【００８７】
【表１】
2017104404.tif 000002
【００８８】
【表２】
2017104404.tif 000003
【００８９】
【表３】
2017104404.tif 000004
【００９０】
【表４】
2017104404.tif 000005
【００９１】
また、上記ガイドＲＮＡは以下の方法により調製した。
まず、ｐｇＲＮＡ−ＧＦＰ−Ｔ１ベクター（＃４１８１９、Ａｄｄｇｅｎｅ社製）を鋳型として用いて、５’末端にＴＴＴＴＴＴサイトが付加されたガイドＲＮＡをＰＣＲで増幅した。続いて、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ  ＩＩベクター（Ａｇｉｌｅｎｔ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ社製）へガイドＲＮＡを挿入し、ｐＢＳ−Ｔ７−ｇＲＮＡプラスミドを得た。得られたプラスミド上のガイドＲＮＡの塩基配列はシークエンシングにより確認した。
続いて、ＭＥＧＡｓｈｏｒｔｓｃｒｉｐｔ（登録商標）  Ｔ７  ｋｉｔ（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ社製）を用いて、ＥｃｏＲＩで線状化したプラスミドからガイドＲＮＡを調製した。【００９２】
［実施例１］Ｃａｓ９高発現マウスラインの樹立
（１）Ｃａｓ９遺伝子挿入用コンストラクトの設計
遺伝子合成によりコドンが最適化されたＣａｓ９遺伝子（塩基配列：配列番号１７）を含むｐｈＣａｓ９（Ａｄｄｇｅｎｅ社製）を鋳型として、Ｃａｓ９ＡＴＧ−Ｓプライマー及びＣａｓ９Ｃｌａ−Ａを用いてＰＣＲを行い、増幅した遺伝子産物を得た。続いて、ＰＣＲにより、ＳＶ４０  ｎｕｃｌｅａｒ  ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ  ｓｉｇｎａｌ（ＮＬＳ）及びＦｌａｇタグの塩基配列又はＦｌａｇタグのみの塩基配列をＣａｓ９遺伝子の開始コドン（ＡＴＧ）のすぐ後に挿入した。これにより、ＮＦＣａｓ９（ＮＬＳ及びＦｌａｇタグを有するＣａｓ９遺伝子）及びＦＣａｓ９（Ｆｌａｇタグのみを有するＣａｓ９遺伝子）を得た。
続いて、ＮＦＣａｓ９及びＦＣａｓ９それぞれをｐＣＡＧＧＳベクターのＥｃｏＲＩサイトに挿入し、ｐＣＡＧ−ＮＦＣａｓ９ｐＡ及びｐＣＡＧ−ＦＣａｓ９ｐＡを構築した。
これらをＮｏｔＩでそれぞれ線状化しＣＡＧ−ＮＦＣａｓ９ｐＡ及びＣＡＧ−ＦＣａｓ９ｐＡ部位を精製した（図１Ａ参照）。【００９３】
（２）マウス受精卵へのインジェクション
本実施例では、ＢＤＦ１系統、Ｃ５７ＢＬ６／Ｊ−Ｊｃｌ系統（以下、「Ｂ６」と呼ぶ。）及びＩＣＲ系統のマウスをクレアジャパン株式会社より購入し、使用した。
使用する受精卵は、雄のＢ６マウスの精子と、雌のＢＤＦ１マウスの卵細胞とを、一般的な体外受精（ｉｎ  ｖｉｔｒｏ  ｆｅｒｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ：ＩＶＦ）方法により受精させて作製した。
続いて、（１）で調製した２種類のＣａｓ９遺伝子を含むベクターそれぞれを、２ｎｇ／μＬとなるようにインジェクション溶液を調製した。続いて、インジェクション溶液をマウス受精卵（ＮＦＣａｓ９は５６個、ＦＣａｓ９は８３個）の前核にインジェクションした。続いて、遺伝子を導入した受精卵を雌の偽妊娠ＩＣＲマウスの卵管に移植し、Ｃａｓ９トランスジェニックマウスのＦ１世代を得た。Ｃａｓ９の導入の同定は、ＣＡＧ１６２０−Ｓプライマー及びＣＡＳ９２１５−Ａプライマーを用いたＰＣＲにより行った。この結果、ＮＦＣａｓ９マウスを４ライン、ＦＣａｓ９を５ライン樹立した。各ラインの特徴を図２Ａに示す。【００９４】
図２Ａから、ＮＦＣａｓ９マウスの２ラインとＦＣａｓ９マウスの５ラインすべてにおいてＣａｓ９導入遺伝子が仔マウスに伝わっていることが確かめられた。【００９５】
また、これら全７ラインのＦ１仔から単離した線維芽細胞でのＣａｓ９発現は、定量的リアルタイムＰＣＲ、ＲＴ−ＰＣＲ及びウェスタンブロッティング解析（図２Ｃ参照。）で確認した。【００９６】
なお、定量的リアルタイムＰＣＲでのＣａｓ９の検量線（図２Ｂ参照）の作成方法は以下の通りである。
１００ｎｇのゲノムＤＮＡとｐＣＡＧ−ＮＦＣａｓ９ベクター又はｐＣＡＧ−ＦＣａｓ９ベクターの希釈系列（１００ｎｇゲノムＤＮＡあたり１、２、４、８、１６、３２、６４及び１２８倍のコピー）とを鋳型として含むＤＮＡ溶液を用いてＰＣＲを行い、得られたＰＣＲ産物の量から検量線を引いた。【００９７】
図２Ａから、樹立したマウスのうち、ＮＦＣａｓ９−２ラインがＣａｓ９高発現であり、今後の解析に用いることにした。【００９８】
（３）ＮＦＣａｓ９−２ラインでのＣａｓ９が導入された遺伝子座の確認
ＮＦＣａｓ９−２ラインのＣａｓ９が導入された遺伝子座は、ＥｃｏＲＶ  ｓｐｌｉｎｋｅｒｅｔｔｅ  オリゴヌクレオチド（ｓｐ−ＥＶ  Ｔｏｐプライマー及びｓｐ−Ｂｏｔｔｏｍプライマー）を用いたｓｐｌｉｎｋｅｒｅｔｔｅ  ＰＣＲ（ｓｐＰＣＲ）（Potter, C. J. & Luo, L. Splinkerette PCR for mapping transposable elements in Drosophila. PloS One 5, e10168 (2010).参照。）により、同定した。さらに、ｓｓｐＰＣＲの結果を確実にするために、Ｇｔｐｂｐ１０−Ｓプライマー、Ｓｐ＃２プライマー、Ｃａｓ９Ｅ−Ｓプライマー、ＣＡＧＧＳ−Ａプライマー及びＧｔｐｂｐ１０−Ａプライマーを用いて、ＮＦＣａｓ９−２ラインのゲノムＤＮＡのＰＣＲ産物を得た。結果を図３Ａ〜図３Ｃに示す。【００９９】
図３Ａ〜図３Ｃから、ＮＦＣａｓ９−２ラインは、細胞内に９個のＮＦＣａｓ９導入遺伝子を持ち、それらはＧｔｐｂｐ１０遺伝子に挿入されていることが判明した。【０１００】
[試験例１] ＮＦＣａｓ９−２ラインマウスの遺伝学的、形態学的及び生理学的性質確認試験
（１）ＮＦＣａｓ９−２ラインのマウスを用いた交配
ＮＦＣａｓ９−２ラインの雄又は雌のマウスを、ＮＦＣａｓ９−２ラインのマウス、野生型のＢＤＦ１系統又は野生型のＢ６系統のマウスと掛け合わせた交配を行った。結果、詳細なデータは示さないが、導入遺伝子の仔への伝搬率はメンデルの法則に従っていた。
また、ＮＦＣａｓ９−２ラインは、ＮＦＣａｓ９がホモで導入された個体でも普通に成育し、その平均産仔数は、ＢＤＦ１系統の野生型マウスと同等であった(６仔／出産)。【０１０１】
（２）恒常的なＣａｓ９ｍＲＮＡの発現量の確認
ＮＦＣａｓ９−２ラインのマウスから単離した各組織におけるＣａｓ９ｍＲＮＡを定量的リアルタイムＰＣＲで確認した。結果を図１Ｂに示す。【０１０２】
図１Ｂから、特に心臓、筋肉及び精巣で、Ｃａｓ９ｍＲＮＡの発現が高いことが明らかとなった。【０１０３】
（３）ＮＦＣａｓ９−２ラインのマウスの形態的変化の確認
ＮＦＣａｓ９−２ラインの雌のマウスと、野生型のＢＤＦ１系統のマウスと掛け合わせた交配を行った。続いて、得られた同腹仔である、ＮＦＣａｓ９がヘテロ接合型（以下、「Ｔｇ／＋マウス」と呼ぶ。）のマウス及びＮＦＣａｓ９を有さないマウス（以下、「＋／＋マウス」と呼ぶ。）、それぞれの４週齢から１０週齢までの体重を計測した。結果を図１Ｃに示す。【０１０４】
図１Ｃから、Ｔｇ／＋マウス及び＋／＋マウスにおいて、体重の増加は同じ傾向であり、形態的な変化における差は認められなかった。【０１０５】
また、Ｔｇ／＋マウス及び＋／＋マウスにおいて、各組織を取り出し、組織切片を作製した。続いて、一般的な方法により、ヘマトキシリン及びエオシン染色を行った。結果を図１Ｄに示す。【０１０６】
図１Ｄから、Ｔｇ／＋マウスでＣａｓ９ｍＲＮＡの高発現が認められた心臓、筋肉及び精巣において、＋／＋マウスとの形態的な差は認められなかった。【０１０７】
（４）ＮＦＣａｓ９−２ラインのマウスの生理学的なマーカーの確認
１０週齢のＴｇ／＋マウス及び＋／＋マウスから血液を採取し、ＳＲＬ株式会社に血清中の生理学的なマーカーとして一般的に知られているｂｌｏｏｄ  ｕｒｅａ  ｎｉｔｒｏｇｅｎ（ＢＵＮ）、ｃｒｅａｔｉｎｉｎｅ（Ｃｒ）、ａｓｐａｒｔａｔｅ  ａｍｉｎｏｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅ  （ＡＳＴ）、及びａｌａｎｉｎｅ  ａｍｉｎｏｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅ（ＡＬＴ）を委託検査した。結果を図１Ｅに示す。
図１Ｅから各種生理学的なマーカーが確認された。【０１０８】
［試験例２］Ｒａｍｐ２遺伝子改変試験
Ｃａｓ９マウス由来の受精卵は、母性因子としてＣａｓ９のｍＲＮＡとタンパク質 (両方とも、又はいずれか一方)（以下、ｍａＣａｓ９と呼ぶ。）を細胞内に蓄積しており、ゲノム編集にＣａｓ９導入遺伝子は必要ないと考え、以下のような試験を行った。【０１０９】
（１）ガイドＲＮＡの導入
様々な交配ペアの人工授精で得た受精卵の前核にＲａｍｐ２遺伝子改変に対するＲ２−ｇＲＮＡ（配列番号２７）のみを顕微注入した。交配により作製した受精卵における遺伝型を図４Ａに示す。また、Ｒ２−ｇＲＮＡ中のＲａｍｐ２遺伝子に相同な塩基配列を図４Ｃに示す。図４Ａにおいて、続いて、注入した受精卵をｐｏｔａｓｓｉｕｍ−ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔｓ  ｓｉｍｐｌｅｘ−ｏｐｔｉｍｉｚｅｄ  ｍｅｄｉｕｍ（ＫＳＯＭ）中で胚盤胞まで培養した。【０１１０】
（２）Ｃａｓ９遺伝型判定
胚盤胞のうち１胚を、実施例１の（３）と同様の方法を用いて、Ｃａｓ９遺伝型を判定した。結果を図４Ｂに示す。【０１１１】
（３）Ｔ７  ｅｎｄｏｎｕｃｌｅａｓｅ  Ｉ（Ｔ７ＥＩ）アッセイ
胚盤胞のうち１胚の核抽出液から、Ｒａｍｐ２−５Ｓプライマー及びＲａｍｐ２−６Ａを用いてＰＣＲを行い、ＰＣＲ産物を得る。ＰＣＲ産物をＴ７  ｅｎｄｏｎｕｃｌｅａｓｅ  Ｉ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ  Ｊａｐａｎ社製）を加えて、ＤＮＡ断片を得た。続いて、アガロース電気泳動により切断断片を確認した。結果を図４Ｄに示す。【０１１２】
図４Ｂ及び図４Ｄから、Ｔｇ／＋マウス同士又はＴｇ／＋の雌マウスと＋／＋の雄マウスとで人工授精した場合、ｉｎｄｅｌ変異（塩基の挿入又は欠損による遺伝的変異）が９２〜９４％の高率で生じることが判明した。よって、Ｔｇ受精卵内のＣａｓ９により、高率なゲノム編集が可能となっていることが明らかとなった。【０１１３】
一方で、＋／＋の雌マウスとＴｇ／＋の雄マウスとで人工授精した場合、ｉｎｄｅｌ変異は２３％と低率であった。さらに我々は、胚盤胞の遺伝型とゲノム編集能の関係性の検討により、Ｃａｓ９導入遺伝子が存在しない胚盤胞でもｉｎｄｅｌ変異が高率で生じていることを見出した。【０１１４】
また、図４Ｂら、Ｔｇ／＋マウス同士又はＴｇ／＋の雌マウスと＋／＋の雄マウス間で体外受精を実施した場合、全ての＋／＋の胚盤胞は、Ｒａｍｐ２遺伝子座（５＋７／５＋７）に変異を有していた。受精卵期の細胞では、ゲノム上の遺伝子はまだ発現していないことが知られている。ゲノム上の遺伝子の転写物は、２細胞期までに徐々に作られる様になる。
よって、今回の結果から、ｍａＣａｓ９のｍＲＮＡとタンパク質（両方とも、又はいずれか一方）が、受精卵でのゲノム編集を担っていると考えられる。【０１１５】
また、図４Ｂに示したとおり、別のラインでありＦＣａｓ９−１３でもこの現象を確認することができた。【０１１６】
［試験例３］Ｒａｍｐ１遺伝子及びＲａｍｐ２遺伝子改変試験
（１）ガイドＲＮＡの導入
Ｔｇ／＋の雌マウスと＋／＋の雄マウスとで人工授精した受精卵の前核にＲａｍｐ１遺伝子改変に対するＲ１−ｇＲＮＡ（配列番号２６）、Ｒａｍｐ２遺伝子改変に対するＲ２−ｇＲＮＡ（配列番号２７）のいずれか又は両方を顕微注入した。続いて、注入した受精卵をｐｏｔａｓｓｉｕｍ−ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔｓ  ｓｉｍｐｌｅｘ−ｏｐｔｉｍｉｚｅｄ  ｍｅｄｉｕｍ（ＫＳＯＭ）中で胚盤胞まで培養した。Ｒ１−ｇＲＮＡ及びＲ２−ｇＲＮＡを同時に導入した胚盤胞の一部については、雌の偽妊娠のＩＣＲ系統マウスの子宮に移植した。移植から１３．５日〜１５．５日後の胎児を得た。移植から１３．５日後の１０匹の胎児の形態を図６Ｂに示す。【０１１７】
（２）変異の有無の判定
胚盤胞のうち１胚の核抽出液又は移植から１３．５日後の胎児の尾或いは手から調製したＤＮＡ溶液について、Ｒａｍｐ１−２Ｓプライマー及びＲａｍｐ１−２Ａプライマーと、Ｒａｍｐ２−５Ｓプライマー及びＲａｍｐ２−６Ａとを用いてＰＣＲを行い、ＰＣＲ産物を得た。続いて、ＰＣＲ産物をＢｉｇＤｙｅ  Ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒ  ｖ．３．１  及びＡＢＩ  Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ａｎａｌｙｚｅｒ  ３１３０Ｒａｍｐ１を用いて、シークエンシングした。Ｒａｍｐ１遺伝子及びＲａｍｐ２遺伝子の変異の有無を判定した。結果を図５Ａ（胚盤胞）、並びに図６Ａ及び図６Ｄ（移植から１３．５日後の胎児）に示す。【０１１８】
（３）Ｔ７ＥＩアッセイ
胚盤胞のうち１胚の核抽出液又は移植から１３．５日後の胎児の尾或いは手から調製したＤＮＡ溶液について、試験例２の（３）と同様の方法を用いて、Ｔ７ＥＩアッセイを行った。Ｒ１−ｇＲＮＡを導入した胚盤胞については、Ｒａｍｐ１−２Ｓプライマー及びＲａｍｐ１−２Ａプライマーを用いた。結果を図５Ｂ（胚盤胞）又は図６Ｃ（移植から１３．５日後の胎児）に示す。【０１１９】
図５Ａ及び図５Ｂから、Ｒ１−ｇＲＮＡのみを受精卵に注入した場合、ｉｎｄｅｌ変異はＲａｍｐ１遺伝子座のみで認められた。同様の結果は、Ｒ２−ｇＲＮＡのみを受精卵に注入した場合にも確認された。Ｒ１−ｇＲＮＡとＲ２−ｇＲＮＡを同時に注入した場合、両遺伝子座で同時の変異誘発が観察された。【０１２０】
以上のことから、ガイドＲＮＡのみ注入された受精卵でのゲノム編集は、標的遺伝子座に特異的に働くことが胚盤胞で確認できた。【０１２１】
さらに、Ｒ１−ｇＲＮＡとＲ２−ｇＲＮＡを同時に注入した受精卵（Ｔｇ／＋の雌マウス ×＋／＋の雄マウス）由来の胎児期でのｉｎｄｅｌ変異を調べたところ、ほとんどすべてがヘテロ又はホモ遺伝子改変胎児であった（図６Ａ参照）。【０１２２】
また、Ｒａｍｐ１遺伝子及びＲａｍｐ２遺伝子にそれぞれ想定される３種類のオフターゲット部位での変異の有無を、得られた胎児１０匹（図６Ａに記載のＥｘｐｅｒｉｍｅｎｔ１を使用。）の尾或いは手から調製したＤＮＡ溶液について、上記表に示したオフターゲット分析用のプライマーを用いたＰＣＲで調べた。その結果、１つの変異も認められなかった。【０１２３】
［試験例４］従来法との比較試験１
続いて、合成されたＣａｓ９ｍＲＮＡとガイドＲＮＡを受精卵に顕微注入するゲノム編集法と、本発明のｍａＣａｓ９によるゲノム編集法の比較検討を実施した。【０１２４】
（１）ガイドＲＮＡの導入
Ｔｇ／＋の卵細胞と＋／＋の精子を用いた人工授精で、ｍａＣａｓ９を含有する受精卵を作製した。続いて、ｍａＣａｓ９含有受精卵（遺伝型；Ｔｇ／＋又は＋／＋）の細胞質及び前核にＲ２−ｇＲＮＡ（２５ｎｇ／μＬ）のみを顕微注入した。対照として合成Ｃａｓ９ｍＲＮＡ（５０ｎｇ／μＬ）及びＲ２−ｇＲＮＡ（２５ｎｇ／μＬ）の両者を野生型受精卵（ｍａＣａｓ９含有なし; 遺伝型＋／＋）の細胞質及び前核に注入した。これら受精卵を胚盤胞まで培養した。【０１２５】
（２）遺伝型及び変異の有無の判定
実施例１の（３）と同様の方法を用いて、遺伝型を判定した。さらに、試験例３の（２）と同様の方法を用いて、変異の有無を判定した。結果を図７Ａに示す。【０１２６】
（３）Ｔ７ＥＩアッセイ
ヘテロ変異体（ｍｏｎｏａｌｌｅｌｉｃ又はｍｕｌｔｉａｌｌｅｌｉｃ）を持つ胚盤胞について、試験例２の（３）と同様の方法を用いて、Ｔ７ＥＩアッセイを行なった。結果を図７Ｂに示す。【０１２７】
図７Ｂにおいて、レーン２の「＜Ｉｎｄｅｌ  ５０％」は、２つの切断されたバンドの合計強度は、親のバンドよりも小さい。また、レーン１及び４の「Ｉｎｄｅｌ  ５０％」は、２つの切断されたバンドの合計強度は、親のバンドとほぼ同様である。レーン３の「Ｍｕｌｔｉａｌｌｅｌｉｃ  ｍｕｔａｔｉｏｎ」は、２つ以上の切断されたバンドが生成されている。【０１２８】
図７Ａから、標的部位の変異の誘発率及びｉｎｄｅｌ変異型（ｈｏｍｏｚｙｇｏｕｓ  （ｂｉａｌｌｅｌｉｃ）、  ｍｏｎｏａｌｌｅｌｉｃ又はｍｕｌｔｉａｌｌｅｌｉｃ  ＫＯ）は、３種類の実験群（ｍａＣａｓ９保持＋／＋及びＴｇ／＋受精卵と、対照群（ｍａＣａｓ９非保持＋／＋受精卵)）とも統計的には同等であった（ｐ＞０．０５、ｏｎｅｗａｙ−ＡＮＯＶＡ）。また、ｍａＣａｓ９保持＋／＋及びＴｇ／＋受精卵での非モザイク変異型（５０％  ｉｎｄｅｌ  ｍｕｔａｔｉｏｎ）とモザイク型（＜５０％  ｍｏｎｏａｌｌｅｌｉｃ  ｉｎｄｅｌ  ｍｕｔａｔｉｏｎ及びｍｕｌｔｉａｌｌｅｌｉｃ変異)も対照群のそれと統計的には同等であった（ｐ＞０．０５、ｏｎｅ ｗａｙ−ＡＮＯＶＡ）。さらに、ｍａＣａｓ９保持＋／＋受精卵でのｍｕｌｔｉａｌｌｅｌｉｃモザイク型変異の誘発率は、ｍａＣａｓ９保持Ｔｇ／＋受精卵と対照群のそれと比較すると、低い傾向が認められたが、その非モザイク型変異（５０％  ｉｎｄｅｌ  ｍｕｔａｔｉｏｎ）は高い傾向であった。【０１２９】
また、Ｒ２−ｇＲＮＡを注入したｍａＣａｓ９保持受精卵から発生した胚盤胞で、想定される３種類のオフターゲット部位での塩基配列変異の有無を、上記表に示したオフターゲット分析用のプライマーを用いたＰＣＲで調べた。結果、一カ所の変異も生じていなかった。【０１３０】
以上のことから、ｍａＣａｓ９によるゲノム編集能は、受精卵への合成Ｃａｓ９注入法のそれと同等であると考えられる。また、ｍａＣａｓ９によるゲノム編集では、従来の受精卵への合成Ｃａｓ９注入法よりも、モザイク型変異が大幅に減少することが明らかとなった。【０１３１】
［試験例５］同時複数遺伝子変異の確認試験
続いて、ｍａＣａｓ９がＣａｓ９導入遺伝子の非存在下の胚において、同時に誘発できる変異の数を調べた。【０１３２】
（１）ガイドＲＮＡの導入
Ｔｇ／＋の雌マウスと＋／＋の雄マウスの体外受精で準備した受精卵に、異なる９種類のガイドＲＮＡを顕微注入した。ターゲットとした遺伝子は、Ｒａｍｐ１遺伝子、Ｒａｍｐ２遺伝子、Ａｍｙ遺伝子、Ｃｒｌｒ遺伝子、Ｅｔ−１遺伝子、Ｈｐｒｔ遺伝子、Ｉｍｄｎ遺伝子及びＫｌｆ５遺伝子の９種類である。ガイドＲＮＡの配列については上表の「ガイドＲＮＡ」、図４Ｃ、及び図８に示した通りである。対照として＋／＋の雌マウスと＋／＋の雄マウスの体外受精で準備した受精卵に、この９種類のガイドＲＮＡと合成したＣａｓ９ｍＲＮＡとを顕微注入した（図９Ｃ参照）。【０１３３】
（２）遺伝型及び変異の有無の判定
実施例１の（３）と同様の方法を用いて、遺伝型を判定した。さらに、試験例３の（２）と同様の方法を用いて、変異の有無を判定した。このときプライマーとして、上記表＜プライマー＞に示した、Ａｍｙ−１Ｓプライマー及びＡｍｙ−１Ａプライマー、Ｃｒｌｒ−５Ｓプライマー及びＣｒｌｒ−５Ａプライマー、Ｅｔ−１−１Ｓプライマー及びＥｔ−１−１Ａプライマー、Ｈｐｒｔ−１Ｓプライマー及びＨｐｒｔ−１Ａプライマー、Ｉｍｄｎ−１Ｓプライマー及びＩｍｄｎ−１Ａプライマー、Ｋｌｆ５−１Ｓプライマー及びＫｌｆ５−１Ａプライマー、Ｒａｍｐ１−２Ｓプライマー及びＲａｍｐ１−２Ａ、Ｒａｍｐ２−５Ｓプライマー及びＲａｍｐ２−６Ａを使用した。結果を図９Ａに示す。【０１３４】
（３）Ｔ７ＥＩアッセイ
試験例２の（３）と同様の方法を用いて、Ｔ７ＥＩアッセイを行なった。結果を図９Ｂに示す。使用したプライマーは本試験例の（２）に挙げたものと同様である。【０１３５】
図９Ａ及び図９Ｃから、本発明の方法を用いた胚盤胞は、平均７．３遺伝子座で同時にｉｎｄｅｌ変異を生じることが確認でき、それは対照群のそれと同等であった。また、同時９種のｉｎｄｅｌ変異は、ｍａＣａｓ９保持＋／＋及びＴｇ／＋受精卵由来の胚盤胞でそれぞれ２例が観察された。
さらに、重要なことに、本発明の方法を用いた胚盤胞発生率は４２〜５０％であったが、対照群の胚盤胞発生率は、５〜１９％と、仔を得るためには大変低いものであった。【０１３６】
以上のことから、ｍａＣａｓ９を含有する受精卵は、多遺伝子座に同時に変異を導入でき、多遺伝子の遺伝子改変マウスの作製に極めて有用であるといえる。【０１３７】
［試験例６］ｉｎ  ｖｉｔｒｏでの遺伝子改変試験
次に、ｉｎ ｖｉｔｒｏでの遺伝子改変に対するＣａｓ９マウスの実用性を実証するために、細胞表面のα−Ｇａｌエピトープの合成に関わるＧｇａｔ１遺伝子の破壊を試みた。図１０Ａに本試験のプロトコールを示す。【０１３８】
（１）ガイドＲＮＡの導入
Ｃａｓ９マウスのＴｇ／＋及び＋／＋仔の尻尾から、線維芽細胞を初代培養した。培養には１０％ウシ血清含有ＤＭＥＭ（Ｄｕｌｂｅｃｃｏ‘ｓ  ｍｏｄｉｆｉｅｄ  Ｅａｇｌｅ’ｓ  ｅｓｓｅｎｔｉａｌ  ｍｅｄｉｕｍ）を用いて、５日間培養した。続いて、培養した線維芽細胞５×１０６個に、リン酸緩衝生理食塩水（カルシウム及びマグネシウム不不含、ｐＨ７．４）に溶解した１００μｇ／ｍＬのＧｇｔａ１ｇＲＮＡ（配列番号２２）をＧｅｎｅ−Ｐｕｌｓｅｒ  ＩＩ（Ｂｉｏｒａｄ社製）を用いたエレクトロポレーション法により一過的に導入した。Ｇｇｔａ１ｇＲＮＡ中のＧｇａｔ１遺伝子に相同な塩基配列を図１０Ｂに示す。【０１３９】
（２）Ｔ７ＥＩアッセイ
ガイドＲＮＡ導入後の線維芽細胞の破砕液からＧｇｔａ１−Ｓプライマー及びＧｇｔａ１−Ａプライマーを用いたＰＣＲにより、ＰＣＲ産物を作製した。続いて、試験例２の（３）と同様の方法を用いて、Ｔ７ＥＩアッセイを行なった。結果を図１０Ｃに示す。【０１４０】
図１０Ｃから、Ｇｇｔａ１遺伝子内だけにｉｎｄｅｌ変異が生じていることが確かめられた。【０１４１】
（３）ＦＡＣＳ解析
ガイドＲＮＡ導入後の線維芽細胞を用いて、ＦＩＴＣ−標識ｉｓｏｌｅｃｔｉｎ、ＢＳ−Ｉ−Ｂ４（ＩＢ４）がα−Ｇａｌエピトープと特異的に認識することを活用したＦＡＣＳ解析を行った。結果を図１０Ｄに示す。【０１４２】
図１０Ｄから、標的としたα−Ｇａｌエピトープ発現減少（野生型細胞に比べて〜３０％減少）が確認できた。【０１４３】
（４）生存アッセイ
ガイドＲＮＡ導入後の線維芽細胞をｓａｐｏｒｉｎコンジュゲートＩＢ４（ＩＢ４ＳＡＰ）で処理した。Ｇｇｔａ１を２遺伝子有する（＋／＋型）細胞及びＧｇｔａ１が１遺伝子ノックアウトされた（ＫＯ／＋型）細胞の死滅が認められた。一方で、ｂｉａｌｌｅｌｉｃ  Ｇｇｔａ１  ＫＯと思われる細胞の生存が観察された（図１０Ｅ参照）。その生存率は、５×１０５細胞あたり２０個（コロニー）で、これから推定される遺伝子欠損の誘発効率は、〜０．００４％と推定された。【０１４４】
以上のことから、Ｃａｓ９マウスラインから調整された初代培養細胞はガイドＲＮＡを導入するだけでＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９によるゲノム編集を起こすことが確認された。【０１４５】
［試験例７］ｉｎ  ｖｉｖｏでの遺伝子改変試験
Ｃａｓ９マウスはガイドＲＮＡ投与でｉｎ  ｖｉｖｏゲノム編集が可能であることを証明するために、ハイドロダイナミックガイドＲＮＡ導入法で肝細胞の遺伝子破壊を試みた。本試験のプロトコールを図１１Ａに示す。【０１４６】
（１）ガイドＲＮＡの導入
Ｃａｓ９マウス及び野生型マウスの尾静脈に、ＴｒａｎｓＩＴ−ＱＲ  Ｈｙｄｒｏｄｙｎａｍｉｃ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ  Ｓｏｌｕｔｉｏｎ  ｋｉｔ（Ｍｉｒｕｓ  Ｂｉｏ社製）を用いて、１２０μｇのａｌｂｕｍｉｎ（Ａｌｂ）ｇＲＮＡ（配列番号１８）と４μｇのｐＣＡＧ−ＥＧＦＰｐＡとを同時注入した。ＡｌｂｇＲＮＡ中のＡｌｂ１遺伝子に相同な塩基配列を図１１Ｂに示す。
その後、それぞれのマウスから肝細胞を単離した。この方法で、０．１％（１／１０００細胞）の比率でＥＧＦＰ陽性細胞を得た。【０１４７】
（２）Ｔ７Ｅ１アッセイ
Ｃａｓ９マウス由来の肝細胞から３０個のＥＧＦＰ陽性細胞及び３０個の陰性細胞を単離した。同様に野生型マウス由来の肝細胞からも３０個のＥＧＦＰ陽性細胞及び３０個の陰性細胞を単離した。続いて、これら細胞一つ一つの破砕液からＡｌｂ−７Ｓプライマー及びＡｌｂ−７Ａプライマーを用いたＰＣＲにより、ＰＣＲ産物を作製した。続いて、試験例２の（３）と同様の方法を用いて、Ｔ７ＥＩアッセイにかけ、ｉｎｄｅｌ変異の有無を調べた。結果を図１１Ｃに示す。【０１４８】
図１１Ｃから、ＥＦＧＰ陽性のＣａｓ９マウス由来の肝細胞だけに、約５０％（１５／３０）の率でＡｌｂ１遺伝子ｉｎｄｅｌ変異が認められ、その変異を起こした肝細胞の比率は０．０５％（１／２０００細胞）と算定された。ＥＧＦＰ陰性のＣａｓ９マウス由来の肝細胞、ＥＧＦＰ陽性の野生型マウス由来の肝細胞及びＥＧＦＰ陰性の野生型マウス由来の肝細胞ではＡｌｂ１遺伝子ｉｎｄｅｌ変異が認められなかった。【０１４９】
以上の結果からｉｎ  ｖｉｖｏでのガイドＲＮＡ投与はＣａｓ９マウスに内在する標的遺伝子のｉｄｅｎｌ変異 となることが明らかとなった。【０１５０】
［試験例８］従来法との比較試験２
上述の試験例４から、Ｒａｍｐ２ｇＲＮＡの受精卵注入とその胚盤胞期での解析からｍａＣａｓ９によるゲノム編集能は、受精卵への合成Ｃａｓ９ｍＲＮＡ注入法のそれと同等であること、そしてｍａＣａｓ９保持＋／＋受精卵でのｍｕｌｔｉａｌｌｅｌｉｃモザイク型ゲノム変異の誘発率は、ｍａＣａｓ９保持Ｔｇ／＋受精卵と対照群のそれと比較すると低い傾向があることが示された。この知見をより強固に証明するために、別の遺伝子のｇＲＮＡとしてＥＴ−１−ｇＲＮＡの受精卵導入、その受精卵を１２．５−１３日齢の胎児まで発生させてＩｎｄｅｌ変異率及びモザイク率を調べた。【０１５１】
（１）ガイドＲＮＡの導入
Ｔｇ／＋の卵細胞と＋／＋の精子を用いた人工授精で、ｍａＣａｓ９を含有する受精卵を作製した。続いて、ｍａＣａｓ９含有受精卵（遺伝型；Ｔｇ／＋又は＋／＋）の細胞質及び前核にＥＴ−１−ｇＲＮＡ（２００ｎｇ／μＬ）のみをエレクトロポレーション法を用いて導入した。対照群として合成Ｃａｓ９ｍＲＮＡ（１００ｎｇ／μＬ）及びＥＴ−１−ｇＲＮＡ（２００ｎｇ／μＬ）の両者を野生型受精卵（ｍａＣａｓ９含有なし; 遺伝型＋／＋）にエレクトロポレーション法を用いて導入した。これら受精卵を胚盤胞まで培養した。ＥＴ−１−ｇＲＮＡを導入した各胚盤胞を、雌の偽妊娠のＩＣＲ系統マウスの子宮に移植した。移植から１２．５〜１３日後の胎児を得た。移植から１２．５〜１３日後の１０匹の胎児の形態を図１２Ｂに示す。【０１５２】
（２）遺伝型及び変異の有無の判定
実施例１の（３）と同様の方法を用いて、遺伝型を判定した。さらに、Ｅｔ−１−１Ｓプライマー及びＥｔ−１−１Ａプライマーを用いた以外は、試験例３の（２）と同様の方法を用いて、変異の有無を判定した。また、Ｔｇ／＋及び＋／＋、並びに対照群のうち、Ｅｔ−１ＫＯ表現型の胎児（各Ｎ＝５）をランダムに選んで解析し、モザイク率を算出した。結果を図１２Ｃに示す。【０１５３】
図１２Ａから、Ｉｎｄｅｌ変異は、対照群７５％に対し、Ｃａｓ９マウスのＴｇ／＋及び＋／＋胎児はともに１００％であり、高率であった。
また、図１２Ｂから、Ｅｔ−１ノックアウト（ＫＯ）表現型では、顎の形成異常が見られた。
図１２Ａから、このＥｔ−１ＫＯ表現型は、対照群では５０％であるのに対し、Ｃａｓ９マウスのＴｇ／＋及び＋／＋胎児では、それぞれ５０%及び４４%であった。
また、図１２Ｃから、モザイク率は、Ｃａｓ９マウスのＴｇ／＋及び＋／＋胎児では、Ｉｎｄｅｌ変異が２種のものが大半であったが、１種のもの（ｈｏｍｏｚｙｇｏｕｓ：同一の変異ゲノムのみ）が得られた。一方、対照群では、３種のものが大半であった。【０１５４】
以上の結果からｍａＣａｓ９によるゲノム編集能は、受精卵への合成Ｃａｓ９ｍＲＮＡ注入法のそれと同等であるが、従来のＣａｓ９ｍＲＮＡ／ｇＲＮＡ注入法に比べモザイク率は低いことが示され、ｍａＣａｓ９によるゲノム編集能の特性（高率性と低モザイク率）がＥｔ−１遺伝子においても改めて証明された。【０１５５】
［試験例９］ｇＲＮＡ導入時期の検討試験
Ｃａｓ９マウス由来の受精卵へのｇＲＮＡ導入時期差によるＩｎｄｅｌ率及びモザイク率へ影響を検討した。【０１５６】
（１）ガイドＲＮＡの導入
Ｔｇ／＋の卵細胞と＋／＋の精子を用いた人工授精で、ｍａＣａｓ９を含有する受精卵を作製した。続いて、媒精から６〜８時間後、又は１０〜１２時間後のｍａＣａｓ９含有受精卵（遺伝型；Ｔｇ／＋又は＋／＋）の細胞質及び前核にＥＴ−１−ｇＲＮＡ（２００ｎｇ／μＬ）のみをエレクトロポレーション法を用いて導入した。これら受精卵を胚盤胞まで培養した。【０１５７】
（２）遺伝型及び変異の有無の判定
実施例１の（３）と同様の方法を用いて、遺伝型を判定した。さらに、Ｅｔ−１−１Ｓプライマー及びＥｔ−１−１Ａプライマーを用いた以外は、試験例３の（２）と同様の方法を用いて、変異の有無を判定した。また、Ｔｇ／＋及び＋／＋のうち、Ｅｔ−１ＫＯ表現型の胎児（各Ｎ＝５）をランダムに選んで解析し、モザイク率を算出した。結果を図１３に示す。【０１５８】
図１３から、媒精後６〜８時間後、及び１０〜１２時間後にｇＲＮＡを導入した受精卵いずれにおいても、高Ｉｎｄｅｌ率（いずれの条件においても１００%）であった。
Ｔｇ／＋胚盤胞で、媒精から６〜８時間後、及び１０〜１２時間後の条件での比較においては、１０〜１２時間後の条件では単一Ｉｎｄｅｌゲノム変異比率が減少し、ｍｕｌｔｉａｌｌｅｌｉｃモザイク型変異の増加が認められた。
一方、媒精から６〜８時間後、及び１０〜１２時間後の条件の＋／＋胚盤胞では単一Ｉｎｄｅｌゲノム変異及びｍｕｌｔｉａｌｌｅｌｉｃモザイク型変異の比率について変化が認められなかった。これは、後期に導入されたｇＲＮＡは初期に導入されたｇＲＮＡよりも分解せず長く存在するためであると推察された。さらに、遺伝型がＴｇ／＋胚であることから、接合子由来のＣａｓ９が転写及び翻訳され働いた可能性が考えられた。【０１５９】
以上のことから、Ｔｇ／＋の受精卵へのｇＲＮＡ導入時期差によるＩｎｄｅｌゲノム変異数の変化が認められた。ｍｕｌｔｉａｌｌｅｌｉｃモザイク型変異を減らすためには、早い時期の受精卵にｇＲＮＡを導入することが良いことが示唆された。一方で、ｍｕｌｔｉａｌｌｅｌｉｃモザイク型変異を多数持つ個体を得たい目的には後期受精卵を活用すればよいことが示唆された。【０１６０】
［試験例１０］ｇＲＮＡ濃度の検討試験
導入するｇＲＮＡ濃度の変化によるＩｎｄｅｌ変異能への影響を検討した。【０１６１】
（１）ガイドＲＮＡの導入
Ｔｇ／＋の卵細胞と＋／＋の精子を用いた人工授精で、ｍａＣａｓ９を含有する受精卵を作製した。続いて、媒精から６〜８時間後のｍａＣａｓ９含有受精卵（遺伝型；Ｔｇ／＋又は＋／＋）の細胞質及び前核にＥＴ−１−ｇＲＮＡのみを、２５ｎｇ／μＬ、８０ｎｇ／μＬ、及び２００ｎｇ／μＬと３種類の異なる濃度にてエレクトロポレーション法を用いて導入した。これら受精卵を胚盤胞まで培養した。【０１６２】
（２）遺伝型及び変異の有無の判定
実施例１の（３）と同様の方法を用いて、遺伝型を判定した。さらに、Ｅｔ−１−１Ｓプライマー及びＥｔ−１−１Ａプライマーを用いた以外は、試験例３の（２）と同様の方法を用いて、変異の有無を判定した。また、Ｔｇ／＋及び＋／＋のうち、Ｅｔ−１ＫＯ表現型の胎児（各Ｎ＝５）をランダムに選んで解析し、モザイク率を算出した。結果を図１４に示す。【０１６３】
図１４から、Ｉｎｄｅｌ変異は、２５ｎｇ／μＬ、８０ｎｇ／μＬ、及び２００ｎｇ／μＬのいずれの濃度の条件においても、９０〜１００％と高率であった。非Ｉｎｄｅｌ変異（Ｗｉｌｄ）は２００ｎｇ／μＬのＥＴ−１−ｇＲＮＡ導入条件では認められず、Ｉｎｄｅｌ変異ゲノムだけの胚は、４０％まで達した。
また、胚あたりのＩｎｄｅｌ変異数は、濃度依存性で増加が認められた。すなわち、２５ｎｇ／μＬのＥＴ−１−ｇＲＮＡ導入条件では、実に８０％が１種のＩｎｄｅｌ変異（ｈｏｍｏｚｙｇｏｕｓ（同一の変異型ゲノムのみ）及びｈｅｔｅｒｏｚｙｇｏｕｓ（Ｗｉｌｄ型と１種のＩｎｄｅｌ変異型ゲノムのみ）を含む）であった。一方、８０ｎｇ／μＬ及び２００ｎｇ／μＬのＥＴ−１−ｇＲＮＡ導入条件では、それぞれ６０％及び２０％まで減少した。
また、２種のＩｎｄｅｌ変異（２種のＩｎｄｅｌ変異型ゲノムのみ、及びＷｉｌｄ型と２種のＩｎｄｅｌ変異型ゲノムとを含む）の増加が認められた。【０１６４】
以上のことから、導入するｇＲＮＡ濃度を変えることで、胚Ｉｎｄｅｌ変異ゲノム数を変えることが可能であることが明らかとなった。
低濃度条件（２５ｎｇ／μＬ）では、殆どがＷｉｌｄ型と１種のＩｎｄｅｌ変異型ゲノムからなる胚であった。これらはホモ型変異が生じた場合、致死性となる変異を避けて遺伝子改変個体を得たい場合や、むしろｈｅｔｅｒｏｚｙｇｏｕｓ変異個体を優先的に望む場合に好都合な特性であると考えられる。【０１６５】
［試験例１１］Ｋｌｆ５遺伝子への外来遺伝子のノックイン試験
外来遺伝子のノックインがＣａｓ９マウス由来の受精卵においても可能であるかをＫｌｆ５遺伝子への外来遺伝子のノックイン試験により検証した。【０１６６】
（１）ガイドＲＮＡ及び外来遺伝子（ＫＩ断片）の設計
図１５Ａに示すようにＫｌｆ５遺伝子の翻訳開始のａｔｇ塩基近傍にｇＲＮＡを設計した（Ｋｌｆ５  ｇＲＮＡ２：配列番号７９）。さらに、その領域に５’及び３’方向に約５００ｂｐの相同なＤＮＡ配列をつなげたＦｌａｇ−ｔａｇ配列を含む約１００ｂｐの外来遺伝子（合計約１ｋｂ）をノックイン配列（ＫＩ断片）として合成した（ＫＩ断片：配列番号８０）。
（２）ガイドＲＮＡの導入
Ｔｇ／＋の卵細胞と＋／＋の精子を用いた人工授精で、ｍａＣａｓ９を含有する受精卵を作製した。また、＋／＋の卵細胞と＋／＋の精子を用いた人工授精で、対照群の受精卵を作製した。続いて、媒精から１０〜１２時間後のｍａＣａｓ９含有受精卵（遺伝型；Ｔｇ／＋又は＋／＋）の細胞質及び前核に（１）で作製したＫｌｆ５  ｇＲＮＡ２（１０ｎｇ／μＬ）と（１）で作製したＫＩ断片（３．３ｎｇ／μＬ）とを顕微注入した。また、同時期の対照群の受精卵の細胞質及び前核に（１）で作製したＫｌｆ５  ｇＲＮＡ２（１０ｎｇ／μＬ）と（１）で作製したＫＩ断片（３．３ｎｇ／μＬ）とＣａｓ９  ｍＲＮＡ（３３ｎｇ／μＬ）とを顕微注入した。これら受精卵を胚盤胞まで培養した。【０１６７】
（２）遺伝型及び変異の有無の判定
実施例１の（３）と同様の方法を用いて、遺伝型を判定した。また、各胚盤胞からＰＣＲ用の溶解液を調製し、ＫＩ断片の相同配列から外のゲノムＤＮＡ配列に設定されたＰＣＲプライマー(Ｋｌｆ５−１Ｓプライマー（配列番号５２）及びＫｌｆ５−１Ａプライマー（配列番号５３）)を用いて、ＰＣＲを実施した。ノックインされたＫｌｆ５遺伝子は、野生型ＰＣＲ産物(約１．１ｋｂ)から約０．１ｋｂサイズの大きいＰＣＲ産物（約１．２ｋｂ）の有無により判定した。結果を図１５Ｂ及び図１５Ｃに示す。【０１６８】
図１５Ｂから、Ｎｏ．１およびＮｏ．１０のサンプルにおいて、約１．２ｋｂの野生型ＰＣＲ産物よりも大きいＰＣＲ産物が検出された。
また、図１５Ｃから、Ｃａｓ９マウス受精卵由来の胚盤胞３０胚中、７胚がノックイン胚（２３％）であった。一方、対照受精卵由来の胚盤胞１９胚中、４胚がノックイン胚（２１％）であった。
以上のことから、ｍａＣａｓ９を含有する受精卵を用いて外来遺伝子のノックインを行うことは可能であり、その効率は従来のＣａｓ９ｍＲＮＡ／ｇＲＮＡ注入法と同等であることが明らかとなった。【０１６９】
［実施例２］Ｎｉｃｋａｓｅ Ｃａｓ９（Ｄ１０Ａ）を全身発現するマウスラインの樹立
上述のＣａｓ９マウスの特性に加えて、Ｏｆｆ−ｔａｒｇｅｔ率の低減加工能や、ゲノムＮｉｃｋ加工能を併せ持つＮｉｃｋａｓｅ Ｃａｓ９を全身発現するトランスジェニックマウスであるＮｉｃｋａｓｅ  Ｃａｓ９（Ｄ１０Ａ）マウスの樹立を行った。【０１７０】
（１）Ｃａｓ９遺伝子挿入用コンストラクトの設計
実施例１において構築したｐＣＡＧ−ＮＦＣａｓ９ｐＡ及びｐＣＡＧ−ＦＣａｓ９ｐＡを鋳型として、ＮＦＬ（Ｄ１０Ａ）Ｓプライマー（配列番号８１）及びＮＦＬ（Ｄ１０Ａ）Ａプライマー（配列番号８２）を用いてＰＣＲを行い、Ｃａｓ９の１０番目のアミノ酸をＤからＡに置換したＣａｓ９（Ｄ１０Ａ）ベクターを構築した。【０１７１】
（２）マウス受精卵へのインジェクション
使用する受精卵は、雄のＢ６マウスの精子と、雌のＢＤＦ１マウスの卵細胞とを、一般的な体外受精（ｉｎ  ｖｉｔｒｏ  ｆｅｒｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ：ＩＶＦ）方法により受精させて作製した。
続いて、（１）で調製した２種類のＣａｓ９（Ｄ１０Ａ）ベクターそれぞれを、２ｎｇ／μＬとなるようにインジェクション溶液を調製した。続いて、インジェクション溶液をマウス受精卵の前核にインジェクションした。続いて、遺伝子を導入した受精卵を雌の偽妊娠ＩＣＲマウスの卵管に移植し、Ｎｉｃｋａｓｅ  Ｃａｓ９（Ｄ１０Ａ）トランスジェニックマウスのＦ１世代を得た。【０１７２】
（３）遺伝型の判定
実施例１の（３）と同様の方法を用いて、成長したＦ１世代の仔マウス３０匹の遺伝型を判定した。Ｃａｓ９（Ｄ１０Ａ）の導入の同定は、ＣＡＧ１６２０プライマー（配列番号３２）及びＣａｓ９  ２１５−Ａプライマー（配列番号３４）を用いたＰＣＲにより行った。その結果、６匹がＴｇ個体であった。上記６匹は、Ｃａｓ９マウスと同様に現時点で発生や生存に影響は認められなかった。【０１７３】
また、上記６匹のうち交配を進めることで、２ラインのＮｉｃｋａｓｅ  Ｃａｓ９（Ｄ１０Ａ）マウスを樹立した。この２ラインのＮｉｃｋａｓｅ  Ｃａｓ９（Ｄ１０Ａ）マウスの仔から肺や卵巣等の主要臓器からｃＤＮＡを調整して、該ｃＤＮＡを用いてＲｅａｌ ｔｉｍｅ ＰＣＲによりＣａｓ９（Ｄ１０Ａ）の発現を検討したところ、Ｃａｓ９（Ｄ１０Ａ）の発現が確認された。
【産業上の利用可能性】
【０１７４】
本発明の標的遺伝子の改変方法によれば、複数の異なる遺伝子又は同一遺伝子内の複数箇所を同時に高効率で編集することができる。また、本発明の標的遺伝子の改変方法によれば、遺伝子改変非ヒト生物を迅速かつ低コストで作製することができる。さらに、本発明の標的遺伝子の改変方法は、多数の遺伝子の異常が関与する心臓病や癌等の生活習慣病又はゲノムワイドアソシエーション研究（ＧＷＡＳ）から明らかとなった疾患関連遺伝子の研究に活用することができる。
【図１Ａ】
2017104404.tif 000006
【図１Ｂ】
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【図１Ｃ】
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【図１Ｄ】
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【図１Ｅ】
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【図２Ａ】
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【図２Ｂ】
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【図２Ｃ】
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【図３Ａ】
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【図３Ｂ】
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【図３Ｃ】
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【図４Ａ】
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【図４Ｂ】
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【図４Ｃ】
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【図４Ｄ】
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【図５Ａ】
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【図５Ｂ】
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【図６Ａ】
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【図６Ｂ】
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【図６Ｃ】
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【図６Ｄ】
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【図６Ｅ】
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【図７Ａ】
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【図７Ｂ】
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【図８】
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【図９Ａ】
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【図９Ｂ】
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【図９Ｃ】
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【図１０Ａ】
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【図１０Ｂ】
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【図１０Ｃ】
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【図１０Ｄ】
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【図１０Ｅ】
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【図１１Ａ】
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【図１１Ｂ】
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【図１１Ｃ】
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【図１２Ａ】
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【図１２Ｂ】
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【図１２Ｃ】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５Ａ】
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【図１５Ｂ】
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【図１５Ｃ】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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