(57)【要約】      （修正有）【課題】ＰＤＧＦＲＡ遺伝子の増幅又は過剰発現を伴う肺癌の診断と治療のための方法と組成物の提供。【解決手段】哺乳動物における肺癌細胞の存在を検出する方法であって、コントロール試料と比較して該哺乳動物の被験肺試料においてＰＤＧＦＲＡ遺伝子が増幅されているかどうかを検出する。ＰＤＧＦＲＡ遺伝子の増幅が該哺乳動物における肺癌細胞の存在を示す。ＰＤＧＦＲＡ遺伝子が増幅されているかどうかの検出が、ＰＤＧＦＲＡ遺伝子のコピー数が少なくとも５倍増加しているかどうかを検出する。ＰＤＧＦＲＡアンタゴニストが抗ＰＤＧＦＲＡ抗体でありＰＤＧＦＲＡ遺伝子の増幅に伴う肺癌の治療に用いられる。同様にＫＩＴ遺伝子の増幅の検出及びＫＩＴアンタゴニストを肺癌の検出治療に用いる。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
哺乳動物における肺癌の存在を診断する方法であって、コントロール試料と比較して該哺乳動物の被験肺試料においてＰＲＯ遺伝子が増幅されているかどうかを検出することを含み、ＰＲＯ遺伝子の増幅が該哺乳動物における肺癌の存在を示す方法。
【請求項２】
ＰＲＯ遺伝子が増幅されているかどうかの検出が、ＰＲＯ遺伝子のコピー数が少なくとも５倍増加しているかどうかを検出することを含む請求項１に記載の方法。
【請求項３】
哺乳動物における肺癌の存在を診断する方法であって、該哺乳動物の被験肺試料中におけるＰＲＯ遺伝子の発現を検出することを含み、コントロール試料より高い被験肺試料中におけるＰＲＯ遺伝子発現のレベルが、該哺乳動物における肺癌の存在を示す方法。
【請求項４】
ＰＲＯ遺伝子の発現の検出が、ＰＲＯ遺伝子からのｍＲＮＡ転写のレベルを決定することを含む請求項３に記載の方法。
【請求項５】
高レベルのＰＲＯ遺伝子の発現が、被験肺試料中におけるＰＲＯ遺伝子からのｍＲＮＡ転写に、コントロール試料の少なくとも５倍の増加を含む請求項４に記載の方法。
【請求項６】
ＰＲＯ遺伝子の発現の検出が、ＰＲＯのレベルを決定することを含む請求項３に記載の方法。
【請求項７】
ＰＲＯ遺伝子の発現の検出が、被験肺試料を抗ＰＲＯ抗体に接触させ、被験肺試料中におけるＰＲＯの発現レベルを、ＰＲＯへの抗ＰＲＯ抗体の結合を検出することにより決定することを含む請求項６に記載の方法。
【請求項８】
高レベルのＰＲＯ遺伝子の発現がＰＲＯレベルの少なくとも５倍の増加を含む請求項６に記載の方法。
【請求項９】
肺癌細胞の増殖を阻害する方法であって、ＰＲＯアンタゴニストに細胞をさらすことを含む方法。
【請求項１０】
ＰＲＯアンタゴニストが抗ＰＲＯ抗体である請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
抗ＰＲＯ抗体がＰＲＯの細胞外ドメインに結合する請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
抗ＰＲＯ抗体が抗体断片である請求項１０に記載の方法。
【請求項１３】
抗ＰＲＯ抗体がキメラ抗体又はヒト化抗体である請求項１０に記載の方法。
【請求項１４】
抗ＰＲＯ抗体がヒト抗体である請求項１０に記載の方法。
【請求項１５】
ＰＲＯアンタゴニストが、ＰＲＯに結合する有機分子である請求項９に記載の方法。
【請求項１６】
ＰＲＯアンタゴニストが、ＰＲＯに結合するオリゴペプチドである請求項９に記載の方法。
【請求項１７】
ＰＲＯアンタゴニストがＰＲＯの可溶型である請求項９に記載の方法。
【請求項１８】
ＰＲＯアンタゴニストが、ＰＲＯをコードする核酸に結合して同核酸の発現を低減させる１０〜３０ヌクレオチド長のアンチセンス核酸である請求項９に記載の方法。
【請求項１９】
肺癌細胞の増殖を阻害する方法であって、細胞を、（ａ）細胞障害性の抗ＰＲＯ抗体又は（ｂ）抗ＰＲＯ抗体及び細胞障害剤からなる免疫複合体にさらすことを含む方法。
【請求項２０】
細胞を細胞障害性の抗ＰＲＯ抗体にさらすことを含む請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
細胞を、抗ＰＲＯ抗体及び細胞障害性剤からなる免疫複合体にさらすことを含む請求項１９に記載の方法。
【請求項２２】
細胞障害剤がメイタンシノイド又はオーリスタチンである請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
ＰＲＯ遺伝子の増幅又は過剰発現を伴う肺癌の治療方法であって、ＰＲＯアンタゴニストを含む薬学的製剤の有効量を、肺癌を有する個体に投与することを含む方法。
【請求項２４】
ＰＲＯアンタゴニストが抗ＰＲＯ抗体である請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
抗ＰＲＯ抗体がＰＲＯの細胞外ドメインに結合する請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
抗ＰＲＯ抗体が抗体断片である請求項２４に記載の方法。
【請求項２７】
抗ＰＲＯ抗体キメラ抗体又はヒト化抗体である請求項２４に記載の方法。
【請求項２８】
抗ＰＲＯ抗体がヒト抗体である請求項２４に記載の方法。
【請求項２９】
ＰＲＯアンタゴニストが、ＰＲＯに結合する有機分子である請求項２３に記載の方法。
【請求項３０】
ＰＲＯアンタゴニストが、ＰＲＯに結合するオリゴペプチドである請求項２３に記載の方法。
【請求項３１】
ＰＲＯアンタゴニストがＰＲＯの可溶型である請求項２３に記載の方法。
【請求項３２】
ＰＲＯアンタゴニストが、ＰＲＯをコードする核酸に結合して同核酸の発現を低減させる１０〜３０ヌクレオチド長のアンチセンス核酸である請求項２３に記載の方法。
【請求項３３】
ＰＲＯ遺伝子の増幅又は過剰発現を伴う肺癌の治療方法であって、肺癌を有する個体に、（ａ）細胞障害性の抗ＰＲＯ抗体又は（ｂ）抗ＰＲＯ抗体及び細胞障害剤からなる免疫複合体を含む薬学的製剤の有効量を投与することを含む方法。
【請求項３４】
肺癌を有する個体に、細胞障害性の抗ＰＲＯ抗体を含む薬学的製剤の有効量を投与することを含む請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
肺癌を有する個体に、抗ＰＲＯ抗体及び細胞障害剤からなる免疫複合体を含む薬学的製剤の有効量を投与することを含む請求項３３に記載の方法。
【請求項３６】
細胞障害剤がメイタンシノイド又はオーリスタチンである請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
肺癌を有する個体がＰＲＯ又はＰＲＯ遺伝子を標的とする治療剤に応答するかどうかを決定する方法であって、ＰＲＯ遺伝子が肺癌において増幅されるかどうかを決定することを含み、ＰＲＯ遺伝子の増幅が、個体が治療剤に応答することを示す方法。
【請求項３８】
治療剤が、（ａ）ＰＲＯアンタゴニスト、（ｂ）細胞障害性の抗ＰＲＯ抗体、又は（ｃ）抗ＰＲＯ抗体及び細胞障害剤からなる免疫複合体から選択される請求項３７に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
この出願は、開示の全体が出典明示によりここに援用される２００６年９月１２日出願の米国仮出願第６０／８２５３６９号の優先権を主張する。
【０００２】
本発明は、遺伝子増幅を伴っている癌の診断及び治療のための方法及び組成物に関する。
【背景技術】
【０００３】
癌は、増殖し、ある環境下で隣接組織に浸潤し、最終的に血液又はリンパ系を介して転移する正常な組織から誘導された異常な、又は腫瘍形成性の細胞の数の増加を特徴とする。遺伝子発現の変化は制御不能な細胞増殖及び脱分化に密接に関連しており、これは癌に共通する特徴である。ある種の癌はある種の遺伝子、例えばオンコジーンの過剰発現によって特徴付けられる。癌細胞における遺伝子過剰発現の良く知られたメカニズムは遺伝子増幅である。遺伝子増幅は、細胞の染色体において一又は複数の遺伝子の多重コピーが生成されるプロセスである。ある例では、該プロセスは、その遺伝子を含む染色体領域の計画性のない複製と、続く複製セグメントが染色体へ戻る組換えを含む（Alitalo等, Adv. Cancer Res. 47: 235-281 [1986]）。ある場合には、遺伝子の過剰発現は、遺伝子増幅に相関し、例えば作製されるコピー数に比例する。
【０００４】
ある種のプロトオンコジーン、例えば成長因子及び成長因子レセプターをコードするもの増幅及び／又は過剰発現は、様々なヒトの悪性腫瘍の原因に重要な役割を担っている。ある場合には、増幅及び／又は過剰発現は、癌のより悪性の形態に伴い、よって臨床的結果の手掛かりとして作用しうる（Schwab等, Genes Chromosome Cancer, 1 : 181-193 [1990]；上掲のAlitalo等）。例えば、上皮成長因子レセプターＥＧＦＲに関連した１８５-ｋｄの膜貫通糖タンパク質レセプター(ｐ１８５ＨＥＲ２又はＨＥＲ２）をコードするヒトｅｒｂＢ２遺伝子(ｈｅｒ２又はｃ-ｅｒｂＢ-２としても知られている)は、ヒトの乳癌の約２５％〜３０％で過剰発現されている(Slamon等, Science, 235:177-182[1987]；Slamon等, Science, 244:707-712[1989])。ｅｒｂＢ２の過剰発現は、特に腋窩のリンパ節に関与する原発性疾患を持つ患者において、不完全な予後の前兆と考えられる（上掲のSlamon等, [1987]及び[1989]；Ravdin及びChamness, Gene, 159: 19-27 [1995]；及びHynes及びStern, Biochem Biophys Acta, 1198: 165-184 [1994]）。ｅｒｂＢ２の過剰発現は、あるホルモン療法及びＣＭＦ（シクロホスファミド、メトトレキセート、及びフルオロウラシル）を含む化学治療薬に対する感受性及び／又は耐性とまた関連付けられていた（Baselga等, Oncology, 11 (3 Suppl 1): 43-48 [1997]）。しかしながら、ｅｒｂＢ２を過剰発現する患者はタキサンでの治療に対して大きな応答を示している。同文献。
【０００５】
ｅｒｂＢ２の過剰発現は標的の乳癌治療に対する基礎を提供した。組換えヒト化抗ＥｒｂＢ２（抗ＨＥＲ２）モノクローナル抗体（ハーセプチンＴＭ、Genentech社）は、ＥｒｂＢ２を過剰発現する転移性乳癌の患者の治療に成功裡に使用されている。（Baselga等, J. Clin. Oncol., 14: 737-744[1996]）。
癌の診断及び治療における増幅遺伝子及びその遺伝子産物を標的とする組成物及び方法に対する絶えない必要性が存在する。
【０００６】
肺癌の診断及び／又は治療に対する組成物及び方法に対する絶えない需要がまた存在する。米国では、毎年１７万人を超える人口が肺の原発性細胞腫に罹患し、そのうちの８６％が診断から５年以内に死亡している。肺癌は、男女共に癌による死亡の筆頭原因であり、癌による死亡例全体の２８％の死因となっている。Minna (2005) "Neoplasms of the Lung," in Harrison's Principles of Internal Medicine, 第16版、Kasperら編（MacGraw-Hill, USA）、第75章を参照されたい。
ここに記載される発明は上述の必要性に合致し他の恩恵をもたらす。
【発明の概要】
【０００７】
一態様では、ＰＲＯ遺伝子の増幅及び／又は過剰発現を伴う肺癌の診断及び治療のために提供される。
一態様では、哺乳動物における肺癌の存在を診断する方法であって、該哺乳動物の被験肺試料においてコントロール試料に対してＰＲＯ遺伝子が増幅されているかどうかを検出することを含み、ＰＲＯ遺伝子の増幅が該哺乳動物における肺癌の存在を示す方法が提供される。一実施態様では、ＰＲＯ遺伝子が増幅されているかどうかの決定が、ＰＲＯ遺伝子のコピー数が少なくとも５倍増加しているかどうかを検出することを含む。
【０００８】
他の態様では、哺乳動物における肺癌の存在を診断する方法であって、該哺乳動物の被験肺試料中におけるＰＲＯ遺伝子の発現を検出することを含み、コントロール試料に対して被験肺試料中におけるＰＲＯ遺伝子発現の高いレベルが、該哺乳動物における肺癌の存在を示す方法が提供される。一実施態様では、ＰＲＯ遺伝子の発現の検出が、ＰＲＯ遺伝子からのｍＲＮＡ転写のレベルを決定することを含む。一実施態様では、高レベルのＰＲＯ遺伝子の発現が、コントロール試料に対して被験肺試料中におけるＰＲＯ遺伝子からのｍＲＮＡ転写に少なくとも５倍の増加を含む。一実施態様では、ＰＲＯ遺伝子の発現の検出が、ＰＲＯのレベルを決定することを含む。一実施態様では、ＰＲＯ遺伝子の発現の検出が、被験肺試料を抗ＰＲＯ抗体に接触させ、被験肺試料中におけるＰＲＯの発現レベルを、ＰＲＯへの抗ＰＲＯ抗体の結合を検出することにより決定することを含む。一実施態様では、高レベルのＰＲＯ発現がＰＲＯレベルの少なくとも５倍の増加を含む。
【０００９】
他の態様では、肺癌細胞の増殖を阻害する方法であって、ＰＲＯアンタゴニストに細胞をさらすことを含む方法が提供される。一実施態様では、ＰＲＯアンタゴニストは抗ＰＲＯ抗体である。一実施態様では、抗ＰＲＯ抗体がＰＲＯの細胞外ドメインに結合する。一実施態様では、抗ＰＲＯ抗体が抗体断片である。一実施態様では、抗ＰＲＯ抗体がキメラ抗体又はヒト化抗体である。一実施態様では、抗ＰＲＯ抗体がヒト抗体である。一実施態様では、ＰＲＯアンタゴニストが、ＰＲＯに結合する有機分子である。一実施態様では、ＰＲＯアンタゴニストが、ＰＲＯに結合するオリゴペプチドである。一実施態様では、ＰＲＯアンタゴニストがＰＲＯの可溶型である。一実施態様では、ＰＲＯアンタゴニストが、ＰＲＯをコードする核酸に結合してその発現を低減させる１０〜３０ヌクレオチド長のアンチセンス核酸である。
【００１０】
他の態様では、肺癌細胞の増殖を阻害する方法であって、細胞を、（ａ）細胞障害性の抗ＰＲＯ抗体又は（ｂ）抗ＰＲＯ抗体及び細胞障害性剤からなる免疫複合体にさらすことを含む方法が提供される。一実施態様では、本方法は、細胞障害性の抗ＰＲＯ抗体に細胞をさらすことを含む。一実施態様では、本方法は、抗ＰＲＯ抗体及び細胞障害性剤からなる免疫複合体に細胞をさらすことを含む。一実施態様では、細胞障害性剤がメイタンシノイド又はオーリスタチン（auristatin）である。
【００１１】
他の態様では、ＰＲＯ遺伝子の増幅又は過剰発現を伴う肺癌の治療方法であって、ＰＲＯアンタゴニストを含む薬学的製剤の有効量を、肺癌を有する個体に投与することを含む方法が提供される。一実施態様では、ＰＲＯアンタゴニストが抗ＰＲＯ抗体である。一実施態様では、抗ＰＲＯ抗体がＰＲＯの細胞外ドメインに結合する。一実施態様では、抗ＰＲＯ抗体が抗体断片である。一実施態様では、抗ＰＲＯ抗体がキメラ抗体又はヒト化抗体である。一実施態様では、抗ＰＲＯ抗体がヒト抗体である。一実施態様では、ＰＲＯアンタゴニストが、ＰＲＯに結合する有機分子である。一実施態様では、ＰＲＯアンタゴニストが、ＰＲＯに結合するオリゴペプチドである。一実施態様では、ＰＲＯアンタゴニストがＰＲＯの可溶型である。一実施態様では、ＰＲＯアンタゴニストが、ＰＲＯをコードする核酸に結合してその発現を低減する１０〜３０ヌクレオチド長のアンチセンス核酸である。
【００１２】
他の態様では、ＰＲＯ遺伝子の増幅又は過剰発現を伴う肺癌の治療方法であって、肺癌を有する個体に、（ａ）細胞障害性の抗ＰＲＯ抗体又は（ｂ）抗ＰＲＯ抗体及び細胞障害剤からなる免疫複合体を含む薬学的製剤の有効量を投与することを含む方法が提供される。一実施態様では、本方法は、肺癌を有する個体に、細胞障害性の抗ＰＲＯ抗体を含む薬学的製剤の有効量を投与することを含む。一実施態様では、本方法は、肺癌を有する個体に、抗ＰＲＯ抗体及び細胞障害剤からなる免疫複合体を含む薬学的製剤の有効量を投与することを含む。一実施態様では、細胞障害剤はメイタンシノイド又はオーリスタチンである。
【００１３】
他の態様では、肺癌を有する個体がＰＲＯ又はＰＲＯ遺伝子を標的とする治療剤に応答するかどうかを決定する方法であって、ＰＲＯ遺伝子が肺癌において増幅されるかどうかを決定することを含み、ＰＲＯ遺伝子の増幅が、個体が治療剤に応答することを示す方法が提供される。一実施態様では、治療剤が、（ａ）ＰＲＯアンタゴニスト、（ｂ）細胞障害性の抗ＰＲＯ抗体、又は（ｃ）抗ＰＲＯ抗体及び細胞障害性剤からなる免疫複合体から選択される。
【図面の簡単な説明】
【００１４】
【図１】図１は、５つの肺腫瘍の試料における第４染色体のＤＮＡコピー数の解析を示す。
【図２】図２は、図１に示す５つの肺癌試料に含まれる約５０，０００，０００〜６０，０００，０００のヌクレオチド由来の第４染色体の領域ついての、ＤＮＡコピー数の解析を示す。図２は、図に示される第４染色体の領域内に生じるオープンリーディングフレームの位置も示している。
【発明を実施するための形態】
【００１５】
遺伝子増幅を伴う癌の診断と治療のための方法及び組成物が提供される。一実施態様では、本発明は、ＰＲＯ遺伝子の増幅及び／又は過剰発現を伴う肺癌の治療のための方法及び組成物を提供する。
【００１６】
Ｉ．定義
「遺伝子増幅」及び「遺伝子複製」なる語句（及び「遺伝子の増幅」又は「遺伝子の複製」のような変形例）は交換可能に用いられ、遺伝子又は遺伝子断片の複数のコピーが特定の細胞又は細胞系で形成されるプロセスを意味する。複製された領域（増幅されたＤＮＡのストレッチ）は、しばしば「アンプリコン」と呼ばれる。通常は、生成されるメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）の量、つまり遺伝子発現レベルも、特定遺伝子の作成されたコピー数に比例して増加する。
【００１７】
ここで用いられる「ＰＤＧＦＲＡ」なる用語は、特段の記載がない場合には、霊長類（例えばヒト及びサル）及び齧歯類（例えばマウス及びラット）のような哺乳動物を含む任意の脊椎動物源由来の、任意の天然血小板から得られた増殖因子レセプターαを意味する。該用語は、「完全長」のプロセシングされていないＰＤＧＦＲＡ並びに細胞中のプロセシングから生じる任意の形態のＰＤＧＦＲＡを包含する。該用語はＰＤＧＦＲＡの天然に発生する変異体、例えばスプライス変異体、対立形質変異体、及びその他のアイソフォームも含む。該用語は、ＰＤＧＦＲＡの少なくとも一つの生物学的活性を維持する天然ＰＤＧＦＲＡの断片又は変異体を包含する。
ここで用いられる「ＫＩＴ」なる用語は、特段の記載がない場合には、霊長類（例えばヒト及びサル）及び齧歯類（例えばマウス及びラット）のような哺乳動物を含む任意の脊椎動物源由来の、任意の天然ｃ−Ｋｉｔを意味する。該用語は、「完全長」のプロセシングされていないＫＩＴ並びに細胞中のプロセシングから生じる任意の形態のＫＩＴを包含する。該用語は、ＫＩＴの天然に発生する変異体、例えばスプライス変異体、対立形質変異体、及びその他のアイソフォームも含む。該用語は、ＫＩＴの少なくとも一つの生物学的活性を維持する天然ＫＩＴの断片又は変異体を包含する。
【００１８】
ここで用いられる「ＫＤＲ」なる用語は、特段の記載がない場合には、霊長類（例えばヒト及びサル）及び齧歯類（例えばマウス及びラット）のような哺乳動物を含む任意の脊椎動物源由来の、任意の天然キナーゼ挿入ドメインレセプターを意味する。該用語は「完全長」のプロセシングされていないＫＤＲ並びに細胞中のプロセシングから生じる任意の形態のＫＤＲを包含する。該用語は、ＫＤＲの天然に発生する変異体、例えばスプライス変異体、対立形質変異体、及びその他のアイソフォームも含む。該用語は、ＫＤＲの少なくとも一つの生物学的活性を維持する天然ＫＤＲの断片又は変異体も包含する。
用語「ＰＲＯ」は、特に断らない限り、ＰＤＧＦＲＡ、ＫＩＴ、又はＫＤＲを意味する。
【００１９】
「細胞増殖性疾患」及び「増殖性疾患」なる用語は、ある程度の異常な細胞増殖を伴う疾患を意味する。一実施態様では、細胞増殖性疾患は癌である。
ここで用いられる「腫瘍」は、悪性又は良性に関わらず、全ての腫瘍形成細胞成長及び増殖、及び全ての前癌性及び癌性細胞及び組織を意味する。「癌」、「癌性」、「細胞増殖性疾患」及び「腫瘍」なる用語はここに言及される場合は相互に排他的ではない。
【００２０】
「癌」及び「癌性」なる用語は、典型的には調節されない細胞成長／増殖を特徴とする哺乳動物における生理学的状態を指すか記述する。癌の例には、限定されるものではないが、細胞腫、リンパ腫（例えばホジキンリンパ腫及び非ホジキンリンパ腫）、芽細胞腫、肉腫、及び白血病が含まれる。このような癌のより特定の例には、扁平上皮細胞癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺の腺癌、肺の扁平上皮細胞癌、腹膜の癌、肝細胞癌、胃腸癌、膵臓癌、神経膠腫、子宮頚癌、卵巣癌、肝臓癌、膀胱癌、肝細胞腫、乳癌、大腸癌、直腸癌、肺癌、子宮内膜又は子宮癌、唾液腺癌、腎臓癌、肝臓癌、前立腺癌、外陰癌、甲状腺癌、肝癌、白血病及び他のリンパ球増殖性疾患、及び様々なタイプの頭頚部癌が含まれる。
「肺癌」なる用語は、肺のあらゆる癌を意味し、小細胞肺細胞腫及び非小細胞肺細胞腫を含むがそれらに限定されず、非小肺細胞腫は、腺癌、扁平上皮癌、及び大細胞癌を含むが、それらに限定されない。
【００２１】
「新生物」又は「新生物細胞」なる用語は、対応する正常組織又は細胞よりもより速やかに増殖し、増殖を開始させた刺激の除去後も増殖を続ける異常な組織又は細胞を意味する。
「肺癌細胞」は、インビボであれインビトロであれ、肺の癌細胞を意味し、肺癌細胞から誘導された細胞株を包含する。
【００２２】
ここで使用される場合、「治療」（及び「治療する」又は「治療している」のような変形例）は、治療されている個体又は細胞の自然の過程を変える試みでの臨床的介入を意味し、予防のため又は臨床病理の過程中に実施されうる。治療の所望の効果は、疾患の発生又は再発の防止、徴候の軽減、疾患の直接的又は間接的病理事象の減少、転移の防止、疾患進行速度の減少、疾患状態の寛解又は緩和、及び緩解又は改善された予後を含む。
「個体」は脊椎動物である。ある実施態様では、脊椎動物は哺乳動物である。哺乳動物には、限定されないが、家畜（例えばウシ）、スポーツ動物、ペット（例えばネコ、イヌ、及びウマ）、霊長類、マウス及びラットが含まれる。ある実施態様では、哺乳動物はヒトである。
【００２３】
「有効量」は、所望される治療的又は予防的結果を達成するために、必要な時間、用量での有効な量を意味する。
本発明の物質／分子の「治療的有効量」は、例えば疾患状態、年齢、性別、個体の体重、及び個体において所望の応答を誘発する物質／分子の能力のような因子に従って変化しうる。治療的有効量は、物質／分子の任意の細胞毒性又は有害な効果よりも治療的に有益な効果が上回る量を包含する。「予防的に効果的な量」は、所望される予防的結果を達成するために、必要な時間、用量での有効な量を意味する。典型的には、必ずしもではないが、予防的に効果的な量は治療的有効量よりも少ないであろう。
【００２４】
ここで用いられる「細胞障害性剤」なる用語は、細胞の機能を阻害又は抑制し、及び／又は細胞死又は破壊を生ずる物質を意味する。該用語は、放射性同位体（例えば、Ａｔ２１１、Ｉ１３１、Ｉ１２５、Ｙ９０、Ｒｅ１８６、Ｒｅ１８８、Ｓｍ１５３、Ｂｉ２１２、Ｐ３２及びＬｕの放射性同位体）、化学療法剤（例えばメトトレキセート、アドリアマイシン、ビンカアルカロイド類（ビンクリスチン、ビンブラスチン、エトポシド）、ドキソルビシン、メルファラン、マイトマイシンＣ、クロラムブシル、ダウノルビシン又は他の挿入剤、酵素及びその断片、例えば核溶解性酵素、抗生物質、及び毒素、例えばその断片及び／又は変異体を含む小分子毒素又は細菌、糸状菌、植物又は動物起源の酵素的に活性な毒素、そして下記に開示する様々な抗腫瘍又は抗癌剤を含むことが意図される。他の細胞障害性剤は以下に記載されている。「殺腫瘍性」剤は、腫瘍細胞の破壊を引き起こす。
「毒素」は細胞の成長又は増殖に対する有害な効果を有し得る任意の物質である。
【００２５】
「化学療法剤」は、癌の治療に有用な化合物である。化学療法剤の例には、チオテパ及びシトキサン(CYTOXAN)(登録商標)シクロホスファミドのようなアルキル化剤；ブスルファン、インプロスルファン及びピポスルファンのようなスルホン酸アルキル類；ベンゾドーパ、カルボコン、メツレドーパ、及びウレドーパのようなアジリジン類；アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホラミド、トリエチレンチオホスホラミド及びトリメチローロメラミン(trimethylolomelamine)を含むエチレンイミン類及びメチラメラミン類；アセトゲニン類（特にブラタシン及びブラタシノン）；δ-９-テトラヒドロカンナビノール（ドロナビノール、マリノール(MARINOL)(登録商標)）；β-ラパコン；ラパコール；コルヒチン類；ベツリン酸；カンプトセシン（合成アナログトポテカン(HYCAMTIN(登録商標))、ＣＰＴ-１１（イリノテカン、CAMPTOSAR(登録商標)）、アセチルカンプトセシン、スコポレクチン(scopolectin)、及び９-アミノカンプトセシンを含む）；ブリオスタチン；カリスタチン；ＣＣ-１０６５（そのアドゼレシン、カルゼレシン及びビゼレシン合成アナログを含む）；ポドフィロトキシン；ポドフィリン(podophyllinic)酸；テニポシド；クリプトフィシン類（特にクリプトフィシン１及びクリプトフィシン８）；ドラスタチン；デュオカルマイシン(duocarmycin ）（合成類似体、KW-2189及びCB1-TM1を含む）； エレトロビン(eleutherobin）；パンクラチスタチン(pancratistatin）；サルコディクチン(sarcodictyin）；スポンジスタチン；クロランブシル、クロロナファジン(chlornaphazine)、チョロホスファミド(cholophosphamide)、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、メクロレタミンオキシドヒドロクロリド、メルファラン、ノベンビチン(novembichin)、フェネステリン(phenesterine)、プレドニムスチン(prednimustine)、トロフォスファミド(trofosfamide)、ウラシルマスタードなどのナイトロジェンマスタード；カルムスチン、クロロゾトシン(chlorozotocin)、フォテムスチン(fotemustine)、ロムスチン、ニムスチン、及びラニムスチンなどのニトロソウレア類(nitrosureas)；抗生物質、例えばエンジイン系抗生物質（例えばカリケアマイシン(calicheamicin)、特にカリケアマイシンγ１Ｉ及びカリケアマイシンωＩ１（例えば、Agnew, Chem Intl. Ed. Engl., 33: 183-186 (1994)参照）；ダイネミシンＡ(dynemicinＡ）を含むダイネミシン(dynemicin）；エスペラマイシン(esperamicin）； 並びにネオカルチノスタチン発光団及び関連色素蛋白エンジイン抗生物質発光団）、アクラシノマイシン(aclacinomysins)、アクチノマイシン、オースラマイシン(authramycin)、アザセリン、ブレオマイシン類(bleomycins)、カクチノマイシン(cactinomycin)、カラビシン(carabicin)、カルミノマイシン(carminomycin）、カルジノフィリン(carzinophilin)、クロモマイシン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン(detorubicin）、６-ジアゾ-５-オキソ-Ｌ-ノルロイシン、アドリアマイシン(登録商標)ドキソルビシン(モルホリノ-ドキソルビシン、シアノモルフォリノ-ドキソルビシン、２-ピロリノ-ドキソルビシン及びデオキシドキソルビシンを含む）、エピルビシン、エソルビシン(esorubicin）、イダルビシン、マセロマイシン(marcellomycin）、マイトマイシンＣなどのマイトマイシン(mitomycins）、マイコフェノール酸(mycophenolic acid)、ノガラマイシン(nogalamycin)、オリボマイシン(olivomycins)、ペプロマイシン、ポルフィロマイシン(porfiromycin)、ピューロマイシン、クエラマイシン(quelamycin)、ロドルビシン(rodorubicin)、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン(tubercidin)、ウベニメクス、ジノスタチン(zinostatin)、ゾルビシン(zorubicin)；メトトレキセート及び５-フルオロウラシル(５-ＦＵ）のような抗代謝産物；デノプテリン(denopterin)、メトトレキセート、プテロプテリン(pteropterin)、トリメトレキセート(trimetrexate)のような葉酸類似体；フルダラビン(fludarabine)、６-メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニンのようなプリン類似体；アンシタビン、アザシチジン(azacitidine)、６-アザウリジン(azauridine)、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン(enocitabine)、フロキシウリジン(floxuridine)のようなピリミジン類似体；カルステロン(calusterone)、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン(testolactone)のようなアンドロゲン類；アミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタンのような抗副腎剤；フロリン酸(frolinic acid)のような葉酸リプレニッシャー(replenisher)；アセグラトン；アルドホスファミドグリコシド；アミノレブリン酸；エニルウラシル(eniluracil)；アムサクリン(amsacrine)；ベストラブシル(bestrabucil)；ビサントレン(bisantrene)；エダトラキセート(edatraxate)；デフォファミン(defofamine)；デメコルシン(demecolcine)；ジアジコン(diaziquone)；エルフォルニチン(elfornithine)；酢酸エリプチニウム(elliptinium acetate)；エポチロン(epothilone)；エトグルシド(etoglucid)；硝酸ガリウム；ヒドロキシ尿素；レンチナン；ロニダミン(lonidamine)；メイタンシン(maytansine)及びアンサマイトシン(ansamitocin)のようなメイタンシノイド(maytansinoid)；ミトグアゾン(mitoguazone)；ミトキサントロン；モピダモール(mopidamol)；ニトラクリン(nitracrine)；ペントスタチン；フェナメット(phenamet)；ピラルビシン；ロソキサントロン(losoxantrone)；２-エチルヒドラジド；プロカルバジン；ＰＳＫ(登録商標)多糖類複合体(JHS Natural Products, Eugene, OR)；ラゾキサン(razoxane)；リゾキシン(rhizoxin)；シゾフィラン；スピロゲルマニウム(spirogermanium)；テニュアゾン酸(tenuazonic acid)；トリアジコン(triaziquone)；２,２',２''-トリクロロトリエチルアミン；トリコテセン(trichothecenes)(特にＴ-２トキシン、ベラキュリンＡ(verracurin A)、ロリジンＡ及びアングイジン(anguidine)）；ウレタン；ビンデシン（ELDISINE(登録商標)、FILDESIN(登録商標)）；ダカルバジン；マンノムスチン(mannomustine)；ミトブロニトール；ミトラクトール(mitolactol)；ピポブロマン(pipobroman)；ガシトシン(gacytosine)；アラビノシド（「Ara-C」）；チオテパ；タキソイド類、例えばタキソール(登録商標)パクリタキセル（Bristol-Myers Squibb Oncology, Princeton, NJ）、ＡＢＲＡＸＡＮＥＴＭパクリタキセルの無クレモホア(Cremophor)アルブミン操作ナノ粒子製剤（American Pharmaceutical Partners, Schaumberg, Illinois）、及びタキソテール(登録商標）ドキセタキセル（Rhone-Poulenc Rorer, Antony, France）；クロランブシル；ゲンシタビン(gemcitabine)（Gemzar(登録商標)）；６-チオグアニン；メルカプトプリン；シスプラチン及びカルボプラチンのようなプラチナアナログ；ビンブラスチン（VELBAN(登録商標)）；プラチナ；エトポシド(ＶＰ-１６）；イフォスファミド；ミトキサントロン；ビンクリスチン（ONCOVIN(登録商標)）；オキサリプラチン；ロイコボビン(leucovovin)；ビノレルビン(NAVELBINE(登録商標))；ノバントロン(novantrone)；エダトレキセート；ダウノマイシン；アミノプテリン；イバンドロネート(ibandronate)；トポイソメラーゼインヒビターＲＦＳ２０００；ジフルオロメチルオルニチン(ＤＭＦＯ)；レチノイン酸のようなレチノイド類；カペシタビン（XELODA(登録商標)）；上述したものの何れかの製薬的に許容可能な塩、酸又は誘導体；並びに上記のものの二以上の組合せ、例えばシクロホスファミド、ドキソルビシン、ビンクリスチン、及びプレドニゾロンの併用療法の省略形のＣＨＯＰ、及び５-ＦＵ及びロイコボリンと併用したオキサリプラチン（ＥＬＯＸＡＴＩＮＴＭ）での治療方法の省略形のＦＯＬＦＯＸが含まれる。
【００２６】
この定義にまた含まれるものは、癌の増殖を促進しうるホルモンの効果を調節し、低減し、ブロックし、又は阻害し、しばしば全身性(systemic)又は身体全体(whole-body)の治療形態の抗ホルモン剤である。それらはホルモン自体でありうる。例には、抗エストロゲン及び選択的エストロゲンレセプターモジュレーター（ＳＥＲＭ）、例えばタモキシフェン(NOLVADEX（登録商標）タモキシフェンを含む)、EVISTA(登録商標)ラロキシフェン(raloxifene)、ドロロキシフェン、４-ヒドロキシタモキシフェン、トリオキシフェン(trioxifene)、ケオキシフェン(keoxifene)、ＬＹ１１７０１８、オナプリストーン(onapristone)、及びFARESTON(登録商標)トレミフェン；抗プロゲステロン類；エストロゲンレセプターダウンレギュレーター（ＥＲＤ）；卵巣を抑制し又はシャットダウンするように機能する薬剤、例えば黄体形成ホルモン放出ホルモン（LHRH）アゴニスト、例えばLUPRON（登録商標）及びELIGARD（登録商標）酢酸ロイプロリド、酢酸ゴセレリン、酢酸ブセレリン及びトリプテレリン(tripterelin)；他の抗アンドロゲン類、例えばフルタミド、ニルタミド及びビカルタミド；及び副腎におけるエストロゲン生産を調節する酵素アロマターゼを阻害するアロマターゼ阻害剤、例えば４（５）−イミダゾール類、アミノグルテチミド、ＭＥＧＡＳＥ（登録商標）酢酸メゲステロール、ＡＲＯＭＡＳＩＮ（登録商標）エキセメスタン、ホルメスタニー、ファドゾール、ＲＩＶＩＳＯＲ（登録商標）ボロゾール、ＦＥＭＡＲＡ（登録商標）レトロゾール、及びＡＲＩＭＩＤＥＸ（登録商標）アナストロゾールが含まれる。また、化学療法剤のかかる定義には、ビスホスホネート類、例えばクロドロネート（例えばＢＯＮＥＦＯＳ（登録商標）又はＯＳＴＡＣ（登録商標））、ＤＩＤＲＯＣＡＬ（登録商標）エチロロネート、ＮＥ−５８０９５、ＺＯＭＥＴＡ（登録商標）ゾレドロン酸／ゾレドロネート、ＦＯＳＡＭＡＸ（登録商標）アレンドロネート、ＡＲＥＤＩＡ（登録商標）パミドロネート、ＳＫＥＬＩＤ（登録商標）チルドロネート、又はＡＣＴＯＮＥＬ（登録商標）リセドロネート；並びにトロキサシタビン（１，３−ジオキソランヌクレオシドシトシン類縁体）；アンチセンスオリゴヌクレオチド、特に、例えばＰＫＣ−α、Ｒａｆ、Ｈ−Ｒａｓ及び上皮増殖因子受容体（ＥＧＦ−Ｒ）のような異常な細胞増殖に関与するとされるシグナル伝達経路内の遺伝子発現を阻害するもの；ワクチン類、例えばＴＨＥＲＡＴＯＰＥ（登録商標）ワクチン及び遺伝子療法ワクチン類、例えばＡＬＬＯＶＥＣＴＩＮ（登録商標）ワクチン、ＬＥＵＶＥＣＴＩＮ（登録商標）ワクチン及びＶＡＸＩＤ（登録商標）ワクチン；ＬＵＲＴＯＴＥＣＡＮ（登録商標）トポイソメラーゼ１阻害剤；ＡＢＡＲＥＬＩＸ（登録商標）ｒｍＲＨ；ラパチニブジトシレート（ＥｒｂＢ−２及びＥＧＦＲ二重チロシンキナーゼ小分子阻害剤、ＧＷ５７２０１６としても知られている）；及び上記の何れかの製薬上許容しうる塩、酸又は誘導体も含まれる。
【００２７】
ここで使用される場合、「増殖阻害剤」は、細胞（例えばＰＲＯを発現する細胞）の増殖をインビトロ又はインビボの何れかで阻害する化合物又は組成物を意味する。よって、増殖阻害剤はＳ期における細胞（例えばＰＲＯを発現する細胞）の割合を有意に低減するものでありうる。増殖阻害剤の例には、細胞周期の進行を（Ｓ期以外の位置において）ブロックする薬剤、例えばＧ１停止及びＭ期停止を誘導する薬剤が含まれる。伝統的なＭ期ブロッカーには、ビンカ類（ビンクリスチン及びビンブラスチン）、タキサン類及びトポイソメラーゼＩＩ阻害剤、例えばドキソルビシン、エピルビシン、ダウノルビシン、エトポシド、及びブレオマイシンが含まれる。Ｇ１を停止させる薬剤はまたＳ期停止にまで作用を派生させるものがあり、例えばＤＮＡアルキル化剤、例えばタモキシフェン、プレドニソン、ダカルバジン、メクロレタミン、シスプラチン、メトトレキセート、５−フルオロウラシル、及びａｒａ−Ｃが挙げられる。更なる情報は、The Molecular Basis of Cancer, Mendelsohn及びIsrael編, 第１章, 表題「Cell cycle regulation,oncogenes, and antineoplastic drug」, Murakami等, (WB Saunders: Philadelphia, 1995)の特に１３頁に記載されている。タキサン類（パクリタキセル及びドセタキセル）は共にイチイの木から誘導される抗癌剤である。ヨーロッパ産イチイから誘導されたドセタキセル（ＴＡＸＯＴＥＲＥ（登録商標）、Rhone-Poulenc Rorer）はパクリタキセル（ＴＡＸＯＬ（登録商標）、Bristol-Myers Squibb）の半合成類縁体である。パクリタキセル及びドセタキセルはチューブリン２量体からの微小管の組立てを促進し、脱重合を防止することにより微小管を安定化させ、これが細胞における有糸分裂の阻害を生じる。
【００２８】
ここで使用される場合、「ＥＧＦＲ阻害剤」なる用語は、ＥＧＦＲに結合し、又はＥＧＦＲと直接に相互作用等し、そのシグナル伝達活性を防止又は減少させる化合物を意味し、別名では「ＥＧＦＲアンタゴニスト」と呼ばれる。かかる薬剤の例には、ＥＧＦＲに結合する抗体及び小分子が含まれる。ＥＧＦＲに結合する抗体の例には、ＭＡｂ５７９(ATCC CRL HB8506)、ＭＡｂ４５５(ATCC CRL HB8507)、Ｍａｂ２２５(ATCC CRL 8508)、ＭＡｂ５２８(ATCC CRL HB8509)(米国特許第４９４３５３３号、Mendelsohn等を参照)及びその変異体、例えばキメラ化２２５(Ｃ２２５またはセツキシマブ(Cetuximab)；ＥＲＢＵＴＩＸ(登録商標))及び再構成ヒト２２５(Ｈ２２５)(WO96/40210, Imclone Systems社を参照)；ＩＩ型変異体ＥＧＦＲに結合する抗体(米国特許第５２１２２９０号)；米国特許第５８９１９９６号に記載のＥＧＦＲに結合するヒト化及びキメラ抗体；及びＡＢＸ−ＥＧＦ又はパニツムマブ（WO98/50433, Abgenix/Amgenを参照）（WO98/50433, Abgenixを参照）のようなＥＧＦＲに結合するヒト抗体；ＥＭＤ５５９００（Stragliotto等 Eur. J. Cancer 32A:636-640 (1996)）；ＥＭＤ７２００（マツズマブ(matuzumab)）ＥＧＦＲ結合に対してＥＧＦとＴＧＦ-αの双方と競合するＥＧＦＲに対するヒト化ＥＧＦＲ抗体（EMD/Merck）；ヒトＥＧＦＲ抗体，ＨｕＭａｘ−ＥＧＦＲ（GenMab）；Ｅｌ．１，Ｅ２．４，Ｅ２．５，Ｅ６．２，Ｅ６．４，Ｅ２．１１，Ｅ６．３及びＥ７．６．３として知られ米国特許第６２３５８８３号に記載される完全なヒト抗体；ＭＤＸ−４４７（Medarex Inc）；及びｍＡｂ８０６又はヒト化ｍＡｂ８０６（Johns等, J. Biol. Chem. 279(29):30375-30384 (2004)）が含まれる。抗ＥＧＦＲ抗体は細胞障害剤とコンジュゲートされ得、よって免疫複合体を生成する（例えばEP659439A2, Merck Patent GmbHを参照）。ＥＧＦＲアンタゴニストには、低分子、例えば米国特許第５６１６５８２号、第５４５７１０５
号、第５４７５００１号、第５６５４３０７号、第５６７９６８３号、第６０８４０９５号、第６２６５４１０号、第６４５５５３４号、第６５２１６２０号、第６５９６７２６号、第６７１３４８４号、第５７７０５９９号、第６１４０３３２号、第５８６６５７２号、第６３９９６０２号、第６３４４４５９号、第６６０２８６３号、第６３９１８７４号、第６３４４４５５号、第５７６００４１号、第６００２００８号、及び第５７４７４９８号、並びに次のＰＣＴ公報ＷＯ９８／１４４５１、ＷＯ９８／５００３８、ＷＯ９９／０９０１６、及びＷＯ９９／２４０３７に記載された化合物が含まれる。特定の低分子ＥＧＦＲアンタゴニストには、ＯＳＩ-７７４（CP-358774, エルロチニブ，ＴＡＲＣＥＶＡ(登録商標)Genentech/OSI Pharmaceuticals）；ＰＤ１８３８０５（ＣＩ１０３３，２-プロペンアミド，Ｎ-[４-[（３-クロロ-４-フルオロフェニル）アミノ]-７-[３-（４-モルホリニル）プロポキシ]-６-キナゾリニル]・二塩酸塩, Pfizer Inc.）；  ＺＤ１８３９，ゲフィチニブ(gefitinib)（IRESSA(TM)）４-（３’-クロロ-４’-フルオロアニリノ）-７-メトキシ-６-（３-モルホリノプロポキシ）キナゾリン，AstraZeneca）；ＺＭ１０５１８０（（６-アミノ-４-（３-メチルフェニル-アミノ）-キナゾリン，Zeneca）；ＢＩＢＸ-１３８２（Ｎ８-（３-クロロ-４-フルオロ-フェニル）-Ｎ２-（ｌ-メチル-ピペリジン-４-イル）-ピリミド[５，４-ｄ]ピリミジン-２，８-ジアミン，Boehringer Ingelheim）；ＰＫＩ-１６６（（Ｒ）-４-[４-[（ｌ-フェニルエチル）アミノ]-ｌＨ-ピロロ[２，３-ｄ]ピリミジン-６-イル]-フェノ-ル）；（Ｒ）-６-（４-ヒドロキシフェニル）-４-[（ｌ-フェニルエチル）アミノ]-７Ｈ-ピロロ[２，３-ｄ]ピリミジン）；ＣＬ-３８７７８５（Ｎ-[４-[（３-ブロモフェニル）アミノ]-６-キナゾリニル]-２-ブチナミド）；ＥＫＢ-５６９（Ｎ-[４-[（３-クロロ-４-フルオロフェニル）アミノ]-３-シアノ-７-エトキシ-６-キノリニル]-４-（ジメチルアミノ）-２-ブテナミド）（Wyeth）；ＡＧ１４７８（Pfizer）；ＡＧ１５７１（ＳＵ５２７１；Pfizer）；二重ＥＧＦＲ／ＨＥＲ２チロシンキナーゼ阻害剤、例えばラパチニブ(lapatinib)（TYKERB（Ｒ），ＧＳＫ５７２０１６又はＮ-[３-クロロ-４-[（３-フルオロフェニル）メトキシ]フェニル]６[５[[[２メチルスルホニル）エチル]アミノ]メチル]-２-フラニル]-４-キナゾリンアミン；Glaxo-SmithKline）が含まれる。
【００２９】
「チロシンキナーゼ阻害剤」は、ＨＥＲレセプターのようにチロシンキナーゼのチロシンキナーゼ活性を阻害する分子である。そのような阻害剤の例には、前の段落に記載したＥＧＦＲ標的薬；低分子ＨＥＲ２チロシンキナーゼ阻害剤、例えば武田から入手可能なＴＡＫ１６５；ＣＰ−７２４７１４、ＥｒｂＢ２レセプターチロシンキナーゼの経口選択的阻害剤(Pfizer及びOSI)；二重ＨＥＲ阻害剤、例えばＥＧＦＲに優先的に結合するがＨＥＲ２及びＥＧＦＲ過剰発現細胞を阻害するＥＫＢ−５６９(Wyethから入手可能)；ラパチニブ(lapatinib)(ＧＳＫ５７２０１６；Glaxo-SmithKlineから入手可能)、経口ＨＥＲ２及びＥＧＦＲチロシンキナーゼ阻害剤；ＰＫＩ−１６６(Novartisから入手可能)；パン-ＨＥＲ(pan-HER)阻害剤、例えばカネルチニブ(canertinib)(ＣＩ−１０３３；Pharmacia)：Ｒａｆ−１阻害剤、例えば inhibitors Ｒａｆ−１シグナル伝達を阻害するISIS Pharmaceuticalsから入手可能なアンチセンス剤ＩＳＩＳ−５１３２；非ＨＥＲ標的ＴＫ阻害剤、例えばメシル酸イマチニブ(GLEEVECTM, Glaxo SmithKlineから入手可能)；多標的チロシンキナーゼ阻害剤、例えばスニチニブ(sunitinib)(SUTENT(登録商標), Pfizerから入手可能)；ＶＥＧＦレセプターチロシンキナーゼ阻害剤、例えばバタラニブ(vatalanib)(ＰＴＫ７８７／ＺＫ２２２５８４, Novartis/Schering AGから入手可能)；ＭＡＰＫ細胞外調節キナーゼＩ阻害剤ＣＩ−１０４０(Pharmaciaから入手可能)；インドリノン（indolinones）（例えば、Mohammadiら（1997）Science 276:955-960参照）；ＰＤ１５３０３５、４-(３-クロロアニリノ)キナゾリン等のキナゾリン；ピリドピリミジン；ピリミドピリミジン；ＣＧＰ５９３２６、ＣＧＰ６０２６１、及びＣＧＰ６２７０６等のピロロピリミジン；ピラゾロピリミジン、４-(フェニルアミノ)-７Ｈ-ピロロ[２,３-d]ピリミジン、クルクミン(curcumin)(ジフェルロイルメタン、４,５-ビス(４-フルオロアニリノ)フタルイミド)、ニトロチオフェン部分を
含むトリホスチン(tyrphostines)；ＰＤ−０１８３８０５(Warner-Lamber)；１-ターシャル-ブチル-3-[6-(3,5-ジメトキシ-フェニル)-2-（4-ジエチルアミノ-ブチルアミノ）-ピリド[2,3-d]ピリミジン-7-yl]-ウレア（「ＰＤ１７３０７４」）（例えば、Moffaら（2004）Mol. Cancer Res. 2:643-652参照）；3-[3-(2-カルボキシエチル)-4-メチルピロール-2-メチルイデニル（methylidenyl）]-2-インドリノン（「ＳＵ５４０２」、Calbiochem）（例えば、Bernard-Pierrot（2004）Oncogene 23:9201-9211；アンチセンス分子(例えば、ＨＥＲコード化核酸に結合するもの)；キノキサリン(quinoxalines) (米国特許第５８０４３９６号)；トリホスチン(米国特許第５８０４３９６号)；ＺＤ６４７４(Astra Zeneca)；ＰＴＫ−７８７(Novartis/Schering AG)；ＣＩ−１０３３(Pfizer)等のパン-ＥｒｂＢ(pan-ErbB)阻害剤；Affmitac(ISIS3521; Isis/Lilly)；メシル酸イマチニブ(GLEEVECTM)；ＰＫＩ１６６(Novartis)；ＧＷ２０１６(Glaxo SmithKline)；ＣＩ−１０３３(Pfizer)；ＥＫＢ−５６９(Wyeth)；セマキシニブ(Semaxanib)(Pfizer)；ＺＤ６４７４ (AstraZeneca)；ＰＴＫ−７８７(Novartis/Schering AG)；１ＮＣ−１Ｃ１１(Imclone)；又は以下の特許刊行物の何れかに記載されているもの：米国特許第５８０４３９６号；ＷＯ１９９９／０９０１６(American Cyanimid)；ＷＯ１９９８／４３９６０ (American Cyanamid)；ＷＯ１９９７／３８９８３ (Warner Lambert)；ＷＯ１９９９／０６３７８(Warner Lambert)；ＷＯ１９９９／０６３９６(Warner Lambert)；ＷＯ１９９６／３０３４７(Pfizer, Inc)；ＷＯ１９９６／３３９７８(Zeneca)；ＷＯ１９９６／３３９７(Zeneca)；及びＷＯ１９９６／３３９８０ (Zeneca)が含まれる。
【００３０】
「アンタゴニスト」なる用語は最も広い意味で用いられ、ＰＲＯのようなポリペプチドの生物学的活性、又はその転写もしくは翻訳を部分的又は完全に阻止、阻害、又は中和する任意の分子を含む。好適なアンタゴニスト分子には、限定されないが、アンタゴニスト抗体、ポリペプチド断片、オリゴペプチド、有機分子（低分子を含む）、及びアンチセンス核酸が含まれる。
「抗体」（Ａｂｓ）及び「免疫グロブリン」（Ｉｇｓ）は同様の構造的特徴を有する糖タンパク質を意味する。抗体は特定の抗原に対して結合特異性を示す一方、免疫グロブリンは、抗体と抗原特異性を欠く他の抗体様分子の双方を含む。後者の種類のポリペプチドは例えばリンパ系によって低レベルで、またミエローマによって増加したレベルで生産される。
「抗体」及び「免疫グロブリン」という用語は、最も広い意味で互換性をもって使用され、モノクローナル抗体（例えば全長及び無傷のモノクローナル抗体）、ポリクローナル抗体、一価抗体、多価抗体、多特異性抗体（例えば、所望の生物学的活性を示す限りにおいて二重特異性抗体）を含み、またある種の抗体断片（ここにより詳細に記載）もまた含む。抗体はキメラ、ヒト、ヒト化及び／又は親和性成熟でありうる。
【００３１】
「抗ＰＲＯ抗体」又は「ＰＲＯに結合する抗体」なる用語は、抗体がＰＲＯを標的とする点で診断及び／又は治療薬剤として有用であるように十分な親和性でＰＲＯに結合することができる抗体を意味する。好ましくは、関連のない非ＰＲＯタンパク質に対する抗ＰＲＯ抗体の結合の度合いは、例えば放射免疫アッセイ（ＲＩＡ）によって測定して、ＰＲＯへの抗体の結合の約１０％未満である。ある実施態様では、ＰＲＯに結合する抗体は、≦１μＭ、≦１００ｎＭ、≦１０ｎＭ、≦１ｎＭ、又は≦０．１ｎＭの解離定数（Ｋｄ）を有している。ある実施態様では、抗ＰＲＯ抗体は、異なった種由来のＰＲＯの間で保存されているＰＲＯのエピトープに結合する。
「全長抗体」、「無傷抗体」及び「全抗体」なる用語は、以下に定義する抗体断片ではなく、その実質的に無傷の形態の抗体を意味するためにここでは交換可能に使用される。該用語は特にＦｃ領域を含む重鎖を持つ抗体を意味する。
【００３２】
「抗体断片」は無傷抗体の一部のみを含み、該部分は、無傷抗体に存在している場合にその部分に通常は付随する機能の少なくとも一つ、多くは殆ど又は全てを保持している。一実施態様では、抗体断片は、無傷抗体の抗原結合部位を含み、よって抗原に結合する能力を保持している。他の実施態様では、抗体断片、例えばＦｃ領域を含むものは、無傷抗体に存在している場合にＦｃ領域に通常は付随する生物学的機能の少なくとも一つ、例えばＦｃＲｎ結合性、抗体半減期調節性、ＡＤＣＣ機能及び補体結合性を保持している。一実施態様では、抗体断片は、無傷抗体と実質的に同様なインビボ半減期を有する一価抗体である。例えば、かかる抗体断片は、断片にインビボ安定性を付与することが可能なＦｃ配列に結合した抗原結合アームを有しうる。
【００３３】
抗体のパパイン消化は、「Ｆａｂ」断片と呼ばれる二つの同一の抗原結合断片を生成し、その各々は単一の抗原結合部位、及び残基「Ｆｃ」断片を持ち、この名称は容易に結晶化する能力を反映している。ペプシン処理はＦ（ａｂ’）２断片を生じ、それは二つの抗原結合部位を持ち、抗原を架橋することができる。
「Ｆｖ」は、完全な抗原結合部位を含む最小の抗体断片である。一実施態様では、二本鎖Ｆｖ種は、密接に非共有結合した一つの重鎖及び一つの軽鎖可変ドメインの二量体からなる。一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）種では、一つの重鎖及び一つの軽鎖可変ドメインを、軽鎖及び重鎖が二本鎖Ｆｖ種のものと類似した「二量体」構造で結合しうるように可動性ペプチドリンカーによって共有結合させることができる。各可変ドメインの３つのＣＤＲが相互作用してＶＨ-ＶＬ二量体の表面に抗原結合部位を形成するのはこの形態においてである。集合的には、６つのＣＤＲが抗体に対する抗原結合特異性を与える。しかしながら、単一の可変ドメイン（又は抗原に特異的な３つのＣＤＲのみを含んでなるＦｖの半分）でさえ、結合部位全体よりは低い親和性であるが、抗原を認識して結合する能力を有している。
【００３４】
Ｆａｂ断片は、重鎖及び軽鎖可変ドメインを含み、軽鎖の定常ドメインと重鎖の第一の定常ドメイン（ＣＨ１）をまた含む。Ｆａｂ’断片は、抗体ヒンジ領域からの一又は複数のシステインを含む重鎖ＣＨ１ドメインのカルボキシ末端に幾つかの残基が付加されていることによりＦａｂ断片と相違する。Ｆａｂ’-ＳＨは、定常ドメインのシステイン残基が遊離のチオール基を持つＦａｂ’に対するここでの標記である。Ｆ(ａｂ’)２抗体断片は、元々は、間にヒンジシステインを有するＦａｂ’断片の対として生成された。抗体断片の他の化学的結合もまた知られている。
「一本鎖Ｆｖ」又は「ｓＦｖ」抗体断片は、抗体のＶＨ及びＶＬドメインを含み、これらのドメインは単一のポリペプチド鎖に存在する。一般には、ｓｃＦｖポリペプチドは、ｓｃＦｖが抗原結合にとって望ましい構造の形成を可能にするポリペプチドリンカーをＶＨ及びＶＬドメイン間に更に含む。ｓＦｖの概説については、Pluckthun, The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg及びMoore編, Springer-Verlag, New York, pp. 269-315 (1994)を参照のこと。
【００３５】
「ダイアボディ」という用語は、二つの抗原結合部位を持つ小型の抗体断片を指し、その断片は同じポリペプチド鎖（ＶＨ-ＶＬ）内で軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）に結合した重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含む。同じ鎖の二つのドメイン間に対形成するには短すぎるリンカーを用いることにより、ドメインは強制的に他の鎖の相補的ドメインと対形成されて二つの抗原結合部位を生成する。ダイアボディは二価又は二重特異的でありうる。ダイアボディは、例えば、ＥＰ４０４０９７；ＷＯ９３／１１１６１；及びHollinger等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 6444-6448 (1993)により十分に記載されている。トリアボディ及びテトラボディはまたHudson等, (2003) Nat. Med. 9:129-134に記載されている。
【００３６】
ここで使用される「モノクローナル抗体」という用語は、実質的に均一な抗体の集団から得られる抗体を意味し、すなわち、集団を構成する個々の抗体が、可能な突然変異、例えば少量存在しうる自然に生じる突然変異を除いて同一である。よって、「モノクローナル」という形容詞は、別個の抗体の混合物ではないとの抗体の特徴を示すものである。ある実施態様では、そのようなモノクローナル抗体は典型的には標的に結合するポリペプチド配列を含む抗体を含み、ここで、標的結合ポリペプチド配列は、複数のポリペプチド配列からの単一標的結合ポリペプチド配列の選択を含む方法によって得られた。例えば、選択方法は、複数のクローン、例えばハイブリドーマクローン、ファージクローン、又は組換えＤＮＡクローンのプールからの独特のクローンの選択であり得る。選択された標的結合配列は、例えば標的に対する親和性を改善するため、標的結合配列をヒト化するため、細胞培養におけるその生産を改善するため、インビボでのその免疫原性を低減させるため、多重特異的抗体を作り出す等々のために更に変異させることができ、変異された標的結合配列を含む抗体もまた本発明のモノクローナル抗体であることが理解されなければならない。典型的には異なった決定基（エピトープ）に対する異なった抗体を含むポリクローナル抗体調製物とは異なり、モノクローナル抗体調製物の各モノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基に対するものである。その特異性に加えて、モノクローナル抗体調製物は、それらが典型的には他の免疫グロブリンによっては汚染されていない点で有利である。
【００３７】
「モノクローナル」との形容は、実質的に均一な抗体集団から得られたという抗体の性質を示し、特定の方法で抗体を生産しなければならないことを意味するものではない。例えば、本発明に従って使用されるモノクローナル抗体は、例えばハイブリドーマ法（例えばKohler等, Nature, 256:495 (1975)；Harlow等, Antibodies: A Laboratory Manual, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2版 1988)；Hammerling等, Monoclonal Antibodies and T-CeIl Hybridomas 563-681 (Elsevier, N.Y., 1981))、組換えＤＮＡ法(例えば米国特許第４８１６５６７号を参照)、ファージディスプレイ技術(例えばClackson等, Nature, 352: 624-628 (1991)；Marks等, J. MoI. Biol. 222: 581-597 (1992)；Sidhu等, J. MoI. Biol. 338(2): 299-310 (2004)；Lee等, J. MoI. Biol. 340(5): 1073-1093 (2004)；Fellouse, Proc. Natl. Acad. ScL USA 101(34): 12467-12472 (2004)；及びLee等, J. Immunol. Methods 284(1-2): 119-132(2004)を参照）、及びヒト免疫グロブリン座又はヒト免疫グロブリン配列をコードする遺伝子の一部又は全部を有する動物中においてヒト又はヒト様抗体を生産する技術（例えばＷＯ９８／２４８９３；ＷＯ９６／３４０９６；ＷＯ９６／３３７３５；ＷＯ９１／１０７４１；Jakobovits等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 2551 (1993)；Jakobovits等, Nature 362: 255-258 (1993)；Bruggemann等, Year in Immunol. 7:33 (1993)；米国特許第５５４５８０７号；第５５４５８０６号；第５５６９８２５号；第５６２５１２６号；第５６３３４２５号；第５６６１０１６号；Marks等 Bio. Technology 10: 779-783 (1992)；Lonberg等, Nature 368: 856-859 (1994)；Morrison, Nature 368: 812-813 (1994)；Fishwild等, Nature Biotechnol. 14: 845-851 (1996)；Neuberger, Nature Biotechnol. 14: 826 (1996)及びLonberg及びHuszar, Intern. Rev. Immunol. 13: 65-93 (1995)を参照）を含む様々な技術によって作製することができる。
【００３８】
ここで、モノクローナル抗体は、重鎖及び／又は軽鎖の一部が特定の種から誘導されたか又は特定の抗体クラス又はサブクラスに属する抗体の対応する配列と同一又は相同である一方、鎖の残りの部分は他の種から誘導されたか又は特定の抗体クラス又はサブクラスに属する抗体の対応する配列と同一又は相同である「キメラ」抗体、並びにそれらが所望の生物学的活性を示す限り、そのような抗体の断片を特に含む（米国特許第４８１６５６７号；Morrison等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81: 6851-6855 (1984)）。
【００３９】
非ヒト（例えばマウス）抗体の「ヒト化」型は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小配列を含むキメラ抗体である。一実施態様では、ヒト化抗体は、レシピエントの高頻度可変領域の残基が、所望の特異性、親和性及び／又は能力を有するマウス、ラット、ウサギ、又は非ヒト霊長類のような非ヒト種（ドナー抗体）の高頻度可変領域の残基によって置換されたヒト免疫グロブリン（レシピエント抗体）である。ある場合には、ヒト免疫グロブリンのＦｖフレームワーク領域（ＦＲ）残基が、対応する非ヒト残基によって置換される。更に、ヒト化抗体は、レシピエント抗体にもドナー抗体にも見出されない残基を含んでいてもよい。これらの変更は、抗体の性能を更に洗練させるために行なわれる。一般に、ヒト化抗体は、全てあるいは実質的に全ての高頻度可変ループが非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、全てあるいは実質的に全てのＦＲがヒト免疫グロブリン配列のものである少なくとも一つ、典型的には二つの可変ドメインの実質的に全てを含むであろう。ヒト化抗体は、場合によっては、免疫グロブリン定常領域(Ｆｃ)、典型的にはヒトの免疫グロブリンのものの少なくとも一部を含むであろう。更なる詳細については、Jones等, Nature, 321:522-525 (1986)；Riechmann等, Nature, 332:323-329 (1988)；及びPresta, Curr. Op Struct. Biol., 2:593-596 (1992)を参照のこと。また次の概説論文とそこで引用された文献を参照のこと：Vaswani及びHamilton, Ann. Allergy, Asthma & Immunol. 1 :105-115 (1998)；Harris, Biochem. Soc. Transactions 23:1035-1038 (1995)；Hurle及びGross, Curr. Op. Biotech. 5:428-433 (1994)。
【００４０】
「ヒト化抗体」は、ヒトによって生産された抗体のものに対応するアミノ酸配列を含むもの及び／又はここに開示されたヒト抗体の作成技術の何れかを使用して作製されたものである。そのような技術は、ファージディスプレイライブラリーのようなヒト由来コンビナトリアルライブラリーのスクリーニング（Marks等, J. Mol. Biol., 222:581-597(1991)及びHoogenboom等, Nucl. Acids Res., 19: 4133-4137 (1991)）；ヒトモノクローナル抗体の生産のためのヒトミエローマ及びマウス−ヒトヘテロミエローマ細胞株の使用（例えばKozbor J. Immunol, 133: 3001 (1984)；Brodeur等, Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp. 51-63 (Marcel Dekker, Inc., New York, 1987)；及びBoerner等, J. Immunol, 147: 86 (1991)を参照）；及び内因性免疫グロブリンの生産の不在下でヒト抗体の完全なレパートリーを生産することができるトランスジェニック動物（例えばマウス）におけるモノクローナル抗体の生産（例えばJakobovits等, Proc. Natl. Acad. Sci USA, 90: 2551 (1993)；Jakobovits等, Nature, 362: 255 (1993)；Bruggermann等, Year in Immunol, 7: 33 (1993)）を含む。ヒト抗体のこの定義は非ヒト動物由来の抗原結合残基を含むヒト化抗体を特に除外する。
【００４１】
「親和性成熟」抗体とは、その変異を有しない親抗体と比較し、抗原に対する抗体の親和性に改良を生じせしめる一又は複数の変異をその一又は複数のＣＤＲに持つものである。一実施態様では、親和性成熟抗体は、標的抗原に対してナノモル又はピコモルの親和性を有する。親和性成熟抗体は、当該分野において知られている方法によって生産される。Marks等 Bio/Technology, 10:779-783(1992)は、ＶＨ及びＶＬドメインシャッフリングによる親和性成熟化について記載している。ＨＶＲ及び／又はフレームワーク残基のランダム突然変異誘発は、Barbas等, Proc Nat Acad. Sci, USA 91: 3809-3813(1994)；Schier 等, Gene, 169:147-155(1995)；Yelton等, J. Immunol., 155:1994-2004(1995)；Jackson等, J. Immunol., 154(7):3310-9(1995)；及びHawkins等, J. Mol. Biol., 226:889-896(1992)に記載されている。
【００４２】
「阻止」抗体又は「アンタゴニスト」抗体は、それが結合する抗原の生物学的活性を阻害し又は減少させるものである。ある阻止抗体又はアンタゴニスト抗体は抗原の生物学的活性を部分的に又は完全に阻害する。
抗体「エフェクター機能」は抗体のＦｃ領域（天然配列Ｆｃ領域又はアミノ酸配列変異体Ｆｃ領域）に起因する生物学的活性を意味し、抗体アイソタイプと共に変わる。抗体エフェクター機能の例は、Ｃ１ｑ結合及び補体依存性細胞毒性；Ｆｃレセプター結合；抗体依存性細胞障害性（ＡＤＣＣ）；ファゴサイトーシス；細胞表面レセプター（例えばＢ細胞レセプター）のダウンレギュレーション；及びＢ細胞活性化を含む。  
【００４３】
「Ｆｃレセプター」又は「ＦｃＲ」は、抗体のＦｃ領域に結合するレセプターを記述する。ある実施態様では、ＦｃＲは天然ヒトＦｃＲである。ある実施態様では、ＦｃＲは、ＩｇＧ抗体（ガンマレセプター）と結合するもので、ＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ及びＦｃγＲＩＩＩサブクラスのレセプターを含み、これらのレセプターの対立遺伝子変異体、選択的にスプライシングされた形態も含まれる。ＦｃγＲＩＩレセプターには、ＦｃγＲＩＩＡ（「活性型レセプター」）及びＦｃγＲＩＩＢ（「阻害型レセプター」）が含まれ、これは、主としてその細胞質ドメインは異なるが、類似のアミノ酸配列を有するものである。活性型レセプターＦｃγＲＩＩＡは、その細胞質ドメインにチロシン依存性免疫レセプター活性化モチーフ（immunoreceptor tyrosine-based activation motif ;ＩＴＡＭ）を含んでいる。阻害型レセプターＦｃγＲＩＩＢは、その細胞質ドメインにチロシン依存性免疫レセプター阻害性モチーフ（immunoreceptor tyrosine-based inhibition motif ;ＩＴＩＭ）を含んでいる（Daeron, Annu. Rev. immunol. 15:203-234 (1997)を参照）。ＦｃＲは、 Ravetch及びKinet, Annu.Rev. Immunol. 9:457-492 (1991)；Capel等, Immunomethods 4:25-34 (1994)；及びde Haas等, J.Lab. Clin. Med. 126:330-41 (1995) に概説されている。将来的に同定されるものも含む他のＦｃＲはここでの「ＦｃＲ」なる用語に包含される。
【００４４】
「Ｆｃレセプター」又は「ＦｃＲ」なる用語には、母性ＩｇＧｓが胎児に受け継がれる要因（Guyer等, J. Immunol. 117:587 (1976) Kim等, J. Immunol.24:249 (1994))及び免疫グロブリンのホメオスタシスの調節の要因となっている新生児性レセプターＦｃＲｎも含まれる。ＦｃＲｎへの結合を測定する方法は知られている。インビボでのヒトＦｃＲｎへの結合及びヒトＦｃＲｎ高親和性結合ポリペプチドの血清半減期は、例えばヒトＦｃＲｎを発現するトランスジェニックマウス又は形質移入ヒト細胞株、又はＦｃ変異体ポリペプチドを投与された霊長類において、アッセイできる。
国際公開第００／４２０７２号（Presta）はＦｃＲへの結合が改善された又は減少した抗体変異体を記載している。該特許刊行物の内容は出典明示により特にここに援用される。またShields等 J. Biol. Chem. 9(2): 6591-6604 (2001)も参照のこと。
「ヒトエフェクター細胞」は、一又は複数のＦｃＲを発現し、エフェクター機能をなす白血球である。ある実施態様では、該細胞は少なくともＦｃγＲＩＩＩを発現し、ＡＤＣＣエフェクター機能をなす。ＡＤＣＣを媒介するヒト白血球の例には、末梢血液単核細胞（ＰＢＭＣ）、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、単球、細胞毒性Ｔ細胞及び好中球が含まれる。エフェクター細胞は天然源、例えば血液から単離できる。
【００４５】
「抗体依存性細胞媒介性細胞障害性」又は「ＡＤＣＣ」とは、ある種の細胞障害細胞(例えば、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、好中球及びマクロファージ）上に存在するＦｃレセプター(ＦｃＲ)と結合した免疫グロブリンにより、これらの細胞障害エフェクター細胞が抗原担持標的細胞に特異的に結合し、続いて細胞毒素により標的細胞を死滅させることを可能にする細胞毒性の形態を意味する。ＡＤＣＣを媒介する一次細胞のＮＫ細胞はＦｃγＲＩＩＩのみを発現するのに対し、単球はＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ及びＦｃγＲＩＩＩを発現する。造血細胞でのＦｃＲの発現は、Ravetch及びKinet, Annu. Rev. Immunol 9:457-92(1991)の４６４頁の表３に要約されている。対象の分子のＡＤＣＣ活性をアッセイするために、米国特許第５５００３６２号又は同５８２１３３７号又はPrestaの米国特許第６７３７０５６号に記載されているようなインビトロＡＤＣＣアッセイを実施することができる。このようなアッセイにおいて有用なエフェクター細胞には、末梢血液単核細胞（ＰＢＭＣ）及びナチュラルキラー細胞（ＮＫ細胞）が含まれる。別法として、もしくは付加的に、対象の分子のＡＤＣＣ活性は、例えば、Clynes等, (USA) 95:652-656 (1998)において開示されているような動物モデルにおいて、インビボで評価することができる。
【００４６】
「補体依存性細胞障害」もしくは「ＣＤＣ」は、補体の存在下で標的を溶解することを意味する。古典的な補体経路の活性化は補体系(Ｃｌｑ)の第１補体が、同族抗原と結合した(適切なサブクラスの)抗体に結合することにより開始される。補体の活性化を評価するために、ＣＤＣアッセイを、例えばGazzano-Santoro等, J. Immunol. Methods 202:163 (1996)に記載されているようにして、実施することができる。
変異されたＦｃ領域アミノ酸配列を有しＣ１ｑ結合能が増加又は減少したポリペプチド変異体は米国特許第６１９４５５１Ｂ１号及び国際公開第９９／５１６４２号に記載されている。その特許刊行物の内容はここに出典明示により特に援用される。またIdusogie等J. Immunol. 164: 4178-4184 (2000)を参照のこと。
【００４７】
「Ｆｃ領域含有ポリペプチド」なる用語はＦｃ領域を含む抗体又はイムノアドヘシンのようなポリペプチドを意味する。Ｆｃ領域のＣ末端リジン（ＥＵ番号付け系による残基４４７）を、例えばポリペプチドの精製中に、又はポリペプチドをコードする核酸を組換え操作することによって、取り除くことができる。従って、本発明に係るＦｃ領域を有するポリペプチドを含有する組成物は、Ｋ４７７を持つポリペプチド、全てのＫ４７７が取り除かれたもの、真野はＫ４４７残基を持つポリペプチドと持たないものの混合物を含みうる。
「細胞障害性抗体」はエフェクター機能を示すことができ、及び／又はその抗原への結合時に細胞死を誘発することができる抗体である。
「免疫複合体」は一又は複数の細胞障害性剤にコンジュゲートされた抗体を意味する。
【００４８】
ここで用いられる場合、「イムノアドヘシン」という用語は、免疫グロブリン定常ドメインのエフェクター機能と異種タンパク質（「アドヘシン」）の結合特異性を組み合わせた抗体様分子を指す。構造的には、イムノアドヘシンは、抗体の抗原認識及び結合部位以外の所望の結合特異性（つまり「異種性」である）を持つアミノ酸配列と免疫グロブリン定常ドメイン配列との融合物を含んでなる。イムノアドヘシン分子のアドへシン部分は、典型的にはレセプター又はリガンドの結合部位を少なくとも含む近接アミノ酸配列である。イムノアドヘシンの免疫グロブリン定常ドメイン配列は、ＩｇＧ-１、ＩｇＧ-２、ＩｇＧ-３、又はＩｇＧ-４サブタイプ、ＩｇＡ（ＩｇＡ-１及びＩｇＡ-２を含む）、ＩｇＥ、ＩｇＤ又はＩｇＭなどの任意の免疫グロブリンから得ることができる。
「小分子」又は「小有機分子」はここでは約５００ダルトン以下の分子量を有する有機分子として定義される。
【００４９】
「ＰＲＯ結合オリゴペプチド」又は「ＰＲＯに結合するオリゴペプチド」は、オリゴペプチドがＰＲＯを標的とする点で診断及び／又は治療薬剤として有用であるように十分な親和性でＰＲＯに結合することができるオリゴペプチドを意味する。ある実施態様では、関連のない非ＰＲＯタンパク質に対するＰＲＯ結合オリゴペプチドの結合の度合いは、例えば表面プラズモン共鳴法によって測定して、ＰＲＯ結合オリゴペプチドのＰＲＯへの結合の約１０％未満である。ある実施態様では、ＰＲＯ結合オリゴペプチドは、≦１μＭ、≦１００ｎＭ、≦１０ｎＭ、≦１ｎＭ、又は≦０．１ｎＭの解離定数（Ｋｄ）を有している。
「ＰＲＯ結合有機分子」又は「ＰＲＯに結合する有機分子」は、有機分子がＰＲＯを標的とする点で診断及び／又は治療薬剤として有用であるように十分な親和性でＰＲＯに結合することができるここに定義されたオリゴペプチド又は抗体以外の有機分子を意味する。ある実施態様では、関連のない非ＰＲＯタンパク質に対するＰＲＯ結合有機分子の結合の度合いは、例えば表面プラズモン共鳴法によって測定して、ＰＲＯ結合有機分子のＰＲＯへの結合の約１０％未満である。ある実施態様では、ＰＲＯ結合有機分子は、≦１μＭ、≦１００ｎＭ、≦１０ｎＭ、≦１ｎＭ、又は≦０．１ｎＭの解離定数（Ｋｄ）を有している。
【００５０】
標的ポリペプチドに結合する任意の分子の解離定数（Ｋｄ）は表面プラズモン共鳴法を使用して簡便に測定することができる。このようなアッセイは、〜１０応答単位（ＲＵ）で固定化標的ポリペプチドＣＭ５チップと共に２５℃にてＢＩＡｃｏｒｅＴＭ−２０００又はＢＩＡｃｏｒｅＴＭ−３０００(BIAcore, Inc., Piscataway, NJ)を用いることができる。簡単に言えば、カルボキシメチル化デキストランバイオセンサーチップ(CM5, BIAcore Inc.)を供給者の指示に従って、Ｎ-エチル-Ｎ'-(３-ジメチルアミノプロピル)-カルボジイミド塩酸塩(ＥＤＣ)及びＮ-ヒドロキシスクシンイミド(ＮＨＳ)を用いて活性化した。標的ポリペプチドを５μｌ／分の流量での注入前に１０ｍＭの酢酸ナトリウム、ｐＨ４．８で５μｇ／ｍｌ（〜０．２μＭ）まで希釈して、およそ１０応答単位（ＲＵ）の結合タンパク質を得た。標的ポリペプチドの注入後、１Ｍのエタノールアミンを注入して未反応基をブロックした。動態測定のために、２倍連続希釈の結合分子（０．７８ｎＭから５００ｎＭ）を、およそ２５μｌ／分の流量で２５℃にてＴｗｅｅｎ２０（ＰＢＳＴ）を含むＰＢＳ中に注入する。結合速度（ｋｏｎ）及び解離速度（ｋｏｆｆ）を、結合及び解離センサーグラムを同時に当てはめて単純な一対一のラングミュア結合モデル(BIAcore Evaluation Software version 3.2)を用いて計算する。平衡解離定数（Ｋｄ）は比ｋｏｆｆ／ｋｏｎとして計算する。例えばChen, Y.等(1999) J. MoL Biol. 293:865-881を参照のこと。抗体のｏｎ速度が上記の表面プラズモン共鳴法によって１０６Ｍ−１ｓ−１を超える場合は、ｏｎ速度は、例えば撹拌キュベットと共にストップフロー装備分光計（Aviv Instruments）又は８０００シリーズＳＬＭ-Ａｍｉｎｃｏ分光計（ThermoSpectronic）のような分光計で測定して増加する濃度の抗原の存在下で、ＰＢＳ、ｐＨ７．２中の２０ｎＭ抗体（Ｆａｂ型）の２５℃での蛍光発光強度（励起＝２９５ｎｍ；発光＝３４０ｎｍ、１６ｎｍバンド-パス）の増加又は減少を測定する蛍光消光法を使用することによって決定することができる。
【００５１】
「リポソーム」は、哺乳動物へ例えば薬物のような薬剤を送達するのに有用である様々なタイプの脂質、リン脂質及び／又は界面活性剤からなる小ベジクルである。リポソームの成分は、生体膜の脂質配置と同様に、二重層形成に一般的に配置されている。
ここで使用される場合「標識」なる語句は検出可能な化合物又は組成物を意味する。標識はそれ自体が検出可能であり得（例えば放射性同位体標識又は蛍光標識）、又は酵素標識の場合には、検出可能な産物を生じる基質化合物又は組成物の化学的変化を触媒しうる。検出可能な標識となりうる放射性核種は例えばＩ−１３１、Ｉ−１２３、Ｉ−１２５、Ｙ−９０、Ｒｅ−１８８、Ｒｅ−１８６、Ａｔ−２１１、Ｃｕ−６７、Ｂｉ−２１２、及びＰｄ−１０９を含む。
「単離された」生物学的分子、例えば核酸、ポリペプチド、又は抗体は、その天然環境の少なくとも一成分から同定され、分離され、及び／又は回収されたものである。
【００５２】
ＩＩ．発明の実施態様
遺伝子増幅を伴う癌の診断及び治療のための方法及び組成物が提供される。一態様では、肺癌の診断及び治療のための方法及び組成物が提供される。該方法及び組成物は、ＰＲＯ遺伝子を含む第４染色体の領域が特定の肺癌試料において増幅されるとの発見に部分的に基づいている。
本明細書に記載される各ＰＲＯポリペプチドは、レセプター型チロシンキナーゼである。各ＰＲＯポリペプチドの追加的な特徴は以下の通りである：
・ＰＤＧＦＲＡは血小板由来増殖因子（ＰＤＧＦ）ファミリーのメンバーである。
・ＫＩＴはウイルス癌遺伝子の細胞の対応物である。従って、ＫＩＴは、癌遺伝子の形態に変換されうる「癌原遺伝子」である。ＫＩＴのリガンドは幹細胞因子（ＳＣＦ）である。
・ＫＤＲは、内皮細胞分裂促進因子である血管内皮増殖因子（ＶＥＧＦ）のレセプターである。ＶＥＧＦとＫＤＲは、特定の腫瘍によって誘発される血管新生に寄与する。
レセプター型チロシンキナーゼは、通常、細胞外リガンド結合ドメイン、膜貫通ドメイン、及びチロシンキナーゼ活性を有する細胞内ドメインを含んでいる。
【００５３】
Ａ．診断及び検出の方法
一態様では、肺癌の診断方法が提供される。以下の実施例に記載されるように、第４染色体の領域が増幅されている肺腫瘍が発見された。図１及び２に示すように、ＰＲＯ遺伝子は増幅領域内に収まり、よってＰＲＯは肺癌の診断及び治療のための魅力的な標的である。
従って、一態様では、哺乳動物における肺癌の存在を診断する方法であって、該哺乳動物の被験肺試料においてコントロール試料に対してＰＲＯ遺伝子が増幅されているかどうかを検出することを含み、ＰＲＯ遺伝子の増幅が該哺乳動物における肺癌の存在を示す方法が提供される。ここで使用される場合、「検出する」なる用語は定量的又は定性的検出を包含する。「被験肺試料」は、癌性であっても又は癌性でなくともよい肺組織から取り出された生物学的試料、例えば癌性であることが疑われる肺細胞の試料又は肺細胞から取り出された全細胞抽出物又は分画細胞抽出物（例えば膜標本）である。「コントロール試料」は、（ａ）正常組織、例えば正常肺細胞又はそのような細胞から取り出された全細胞抽出物又は分画細胞抽出物（例えば膜標本）、又は（ｂ）ＰＲＯ遺伝子が増幅又は過剰発現されていないことが分かっている肺癌組織、又はそれから取り出された全細胞抽出物又は分画細胞抽出物から得られた生物学的試料である。ＰＲＯは遺伝子は、ＰＲＯ遺伝子のコピー数が被験肺試料においてコントロール試料に対して少なくとも２倍、３倍、５倍、７倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、３０倍、３５倍、４０倍、４５倍、又は５０倍増加していれば、「増幅した」と言われる。
【００５４】
ある実施態様では、ＰＲＯ遺伝子の増幅の検出は、当業者に知られているある種の技術を使用して達成される。例えば、比較ゲノムハイブリダイゼーションを用いて、染色体位置の関数としてＤＮＡ配列コピー数のマップをつくる。例えばKallioniemi等(1992) Science 258:818-821を参照のこと。ＰＲＯ遺伝子の増幅は、例えば、ＰＲＯ遺伝子に特異的なプローブを用いるサザンハイブリダイゼーションにより又はリアルタイム定量ＰＣＲによって、検出することもできる。
ある実施態様では、ＰＲＯ遺伝子の増幅の検出は、例えばＰＲＯ遺伝子にハイブリダイズするプローブを使用して、ＰＲＯ遺伝子のコピー数を直接評価することによって達成される。ある実施態様では、ＰＲＯ遺伝子の増幅の検出は、例えば、ＰＲＯ遺伝子の外側にあるがＰＲＯ遺伝子と同時増幅される染色体領域のコピー数を評価することによって、ＰＲＯ遺伝子のコピー数を間接的に評価することによって達成される。そのような領域を選択するための手引きは例えば図２に提供される。
【００５５】
他の態様では、哺乳動物における肺癌の存在を診断する方法であって、該哺乳動物の被験肺試料におけるＰＲＯ遺伝子の発現を検出することを含み、コントロール試料に対して被験肺試料におけるＰＲＯ遺伝子の高レベルの発現が該哺乳動物における肺癌の存在を示す方法が提供される。ある実施態様では、ＰＲＯ遺伝子の発現は、ＰＲＯ遺伝子からのｍＲＮＡの転写レベルを決定することにより検出される。ｍＲＮＡの転写レベルは、定量的又は定性的に、当業者に知られた様々な方法によって決定することができる。ｍＲＮＡの転写レベルはまたｍＲＮＡから生成されたｃＤＮＡのレベルを検出することによって直接的に又は間接的に決定することもできる。ＲＮＡの転写レベルを決定するための例示的方法には、限定されるものではないが、リアルタイム定量ＲＴ−ＰＣＲ及びハイブリダイゼーションベースアッセイで、マイクロアレイベースアッセイ及びノーザンブロットのようなフィルターベースアッセイを含むものが含まれる。ある実施態様では、「ＰＲＯ遺伝子の高レベルの発現」は、ＰＲＯ遺伝子からのｍＲＮＡ転写の少なくとも２倍、３倍、５倍、７倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、３０倍、３５倍、４０倍、４５倍、又は５０倍の増加を意味する。
【００５６】
他の実施態様では、ＰＲＯ遺伝子の発現は、ＰＲＯのレベルを決定することにより検出される。ＰＲＯのレベルは、定量的又は定性的に、抗体ベース検出法を含む、当業者に知られたある種の方法によって決定することができる。一実施態様では、被験肺試料におけるＰＲＯ遺伝子の発現の検出は、被験肺試料を抗ＰＲＯ抗体に接触させ、ＰＲＯへの抗ＰＲＯ抗体の結合を検出することによって被験肺試料中におけるＰＲＯの発現のレベルを（定量的又は定性的に）決定することを含む。ある実施態様では、ＰＲＯへの抗ＰＲＯ抗体の結合は、限定するものではないが、蛍光標示式細胞分取、ウェスタンブロット、ラジオイムノアッセイ、ＥＬＩＳＡ等々を含む当業者に知られた様々な方法によって検出することができる。ある実施態様では、「ＰＲＯ遺伝子の高レベルの発現」は、ＰＲＯレベルの少なくとも２倍、３倍、５倍、７倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、３０倍、３５倍、４０倍、４５倍、又は５０倍の増加を意味する。
【００５７】
上記の方法の何れに対しても、「哺乳動物における肺癌の存在を診断する」という記載された目的は非限定的なものであって、コントロール試料に対して肺の被験試料においてＰＲＯ遺伝子が高レベルで増幅されているか及び／又は発現されているかどうかを検出することによって、哺乳動物において存在する肺癌のタイプを分類することを包含する。ＰＲＯ遺伝子が増幅されているか及び／又は発現されているか否かに基づいた肺癌の分類は、例えば、肺癌を有する個体がＰＲＯ又はＰＲＯ遺伝子を標的とする治療剤に応答するかどうかを決定するために有用であるので、以下に更に記載されるように、肺癌の治療に対する最適な療法を選択するために有用である。例えば、肺癌を有する個体がＰＲＯ又はＰＲＯ遺伝子を標的とする治療に応答するかどうかを決定するための方法であって、ＰＲＯ遺伝子が肺癌において増幅されているか及び／又は過剰発現されているかを（例えば上述の方法の何れかを使用して）決定することを含み、ここでＰＲＯ遺伝子の増幅及び／又は過剰発現が、該個体がその治療に応答することを示す方法が提供される。「ＰＲＯ又はＰＲＯ遺伝子を標的とする治療剤」は、限定するものではないが、以下のパートＢに記載したＰＲＯアンタゴニスト、細胞障害性抗体、又は免疫複合体の任意のものを含み、当該分野で既に知られているかかる治療剤並びに後に開発されるものを含むＰＲＯ又はＰＲＯ遺伝子の発現及び／又は活性に影響を及ぼす任意の薬剤を意味する。
【００５８】
Ｂ．組成物及び薬学的製剤
肺癌を治療するための薬学的製剤が提供される。ある実施態様では、薬学的製剤は少なくとも一種のＰＲＯアンタゴニスト、薬学的に許容可能な担体、及び場合によっては少なくとも一種の更なる治療剤を含有する。ある実施態様では、ＰＲＯアンタゴニストは、抗ＰＲＯ抗体；オリゴペプチド；有機分子；可溶性ＰＲＯレセプター；又はアンチセンス核酸を含む。ある実施態様では、薬学的製剤は、少なくとも一種の細胞障害性抗ＰＲＯ抗体、製薬的に許容可能な一種の担体、及び場合によっては少なくとも一種の更なる治療剤を含有する。ある実施態様では、薬学的製剤は、少なくとも一種の免疫複合体を含み、この場合、該免疫複合体は、細胞障害剤及びＰＲＯに結合する抗体；製薬的に許容可能な担体；及び場合によっては少なくとも一種の更なる治療剤を含む。
【００５９】
１．ＰＲＯアンタゴニスト
一態様では、ＰＲＯアンタゴニストは抗ＰＲＯ抗体である。ある実施態様では、抗ＰＲＯアンタゴニスト抗体は「阻止(ブロッキング)抗体」、例えばＰＲＯとそのリガンドとの相互作用を完全に又は部分的に阻止する抗体である。ある実施態様では、抗ＰＲＯ抗体はＰＲＯの細胞外ドメインに結合する。ある実施態様では、抗ＰＲＯ抗体は、ＰＲＯのリガンド結合ドメインの全部又は一部に結合するか、又は閉鎖する。
特定のアンタゴニスト抗ＰＲＯ抗体が従来技術に既知である。このような抗体は、例えば、Ludwigら（2003）Oncogene 22:9097-9106（ＩＭＣ−１Ｃ１１、抗ＫＤＲアンタゴニスト抗体について記載）；MacDonaldら（2001）Nat. Genet. 29:143-152（ＰＤＧＦＲＡに対するアンタゴニストモノクローナル抗体につて記載）；及びHinesら（1995）Cell Growth Diff. 6:769-779（ＫＩＴに対するアンタゴニスト抗体について記載）に記載されている。
【００６０】
本発明の様々な実施態様では、（以下の２部において検討されるアンタゴニスト抗ＰＲＯ抗体及び細胞障害性抗ＰＲＯ抗体を含む）抗ＰＲＯ抗体はモノクローナル抗体である。様々な実施態様では、抗ＰＲＯ抗体は抗体断片、例えばＦａｂ、Ｆａｂ'−ＳＨ、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、又は(Ｆａｂ')２断片、又は単一ドメイン抗体(Domantis, Inc., Waltham, MA；例えば米国特許第６２４８５１６Ｂｌ号を参照)である。ある実施態様では、抗ＰＲＯ抗体は二重特異性抗体(例えば国際公開第９４／０４６９０号及びSuresh等 (1986) Methods in Enzymology 121 :210を参照)である。ある実施態様では、抗ＰＲＯ抗体はキメラ、ヒト化、又はヒト抗体である。
他の態様では、ＰＲＯアンタゴニストはＰＲＯに結合するオリゴペプチドである。一実施態様では、オリゴペプチドはＰＲＯの細胞外ドメインに結合する。そのような一実施態様では、オリゴペプチドは、リガンド結合ドメインの一領域に結合するか、又は同領域を閉鎖する。別の実施態様では、オリゴペプチドは、ＰＲＯのチロシンキナーゼドメインに結合する及び／又はＰＲＯのチロシンキナーゼドメインの活性を低減する。
【００６１】
上記のオリゴペプチドは、既知のオリゴペプチド合成法を用いて化学的に合成することができ、あるいは組換え技術を用いて調製し精製することができる。そのようなオリゴペプチドは、通常は少なくとも約５のアミノ酸長であり、あるいは少なくとも約６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９、８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９又は１００のアミノ酸長である。このようなオリゴペプチドは、よく知られた技術を用いて過度の実験をすることなしに同定することができる。この点において、ポリペプチド標的に特異的に結合する能力のあるオリゴペプチドについてオリゴペプチドライブラリーをスクリーニングする技術は当該分野でよく知られていることを注記する（例えば、米国特許第５５５６７６２号、同第５７５０３７３号、同第４７０８８７１号、同第４８３３０９２号、同第５２２３４０９号、同第５４０３４８４号、同第５５７１６８９号、同第５６６３１４３号；ＰＣＴ公開第ＷＯ８４／０３５０６号、及びＷＯ８４／０３５６４号；Geysen等, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 81:3998-4002 (1984)；Geysen等, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 82:178-182 (1985)；Geysen等, Synthetic Peptides as Antigens, 130-149 (1986)；Geysen等, J. Immunol. Meth., 102:259-274 (1987)；Schoofs等, J. Immunol., 140:611-616 (1988), Cwirla,S.E.等(1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87:6378；Lowman,H.
B.等 (1991) Biochemistry, 30:10832；Clackson,T.等 (1991) Nature, 352:624；Marks,J.D.等 (1991) J. Mol. Biol., 222:581；Kang,A.S.等 (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88:8363、及びSmith, G.P. (1991) Current Opin. Biotechnol., 2:668参照）。ある実施態様では、オリゴペプチドは細胞障害剤にコンジュゲートされうる。
【００６２】
また別の態様では、ＰＲＯアンタゴニストは、ここに記載されたオリゴペプチド又は抗体以外の、ＰＲＯに結合する有機分子である。有機分子は例えば小分子でありうる。一実施態様では、有機分子はＰＲＯの細胞外ドメインに結合する。そのような一実施態様では、有機分子は、リガンド結合ドメインの一領域に結合するか、或いは同領域を閉鎖する。別の実施態様では、有機分子は、ＰＲＯのチロシンキナーゼドメインに結合する及び／又は同ドメインの活性を低減する。
ＰＲＯに結合する有機分子は、既知の方法（例えばＰＣＴ公開第ＷＯ００／００８２３号及び第ＷＯ００／３９５８５号を参照）を使用して同定し、化学的に合成してもよい。そのような有機分子は通常は約２０００ダルトン未満のサイズであるか、あるいは約１５００、７５０、５００、２５０又は２００ダルトン未満のサイズであり、ＰＲＯに対する結合能を有するこのような有機分子は、よく知られた技術を用いて過度の実験をすることなしに同定することができる。この点において、ポリペプチド標的に特異的に結合する能力のある分子について有機分子ライブラリーをスクリーニングする技術は当該分野でよく知られていることを注記する（例えば、ＰＣＴ公開第ＷＯ００／００８２３号及びＷＯ００／３９５８５号を参照）。ある実施態様では、有機分子は細胞障害剤にコンジュゲートされうる。
【００６３】
ＰＲＯに結合してＰＲＯのチロシンキナーゼ活性を阻害する特定の小分子アンタゴニストが従来技術に既知である。このような分子には、例えば、ＫＤＲ及びＫＩＴの阻害剤である、3-[2,4-ジメチルピロール-5-yl-メチリデン（methylidene）]-インドリン-2-ワン（「ＳＵ５４１６」）；及びイマチニブ、ＰＤＧＦＲＡ及びＫＩＴを阻害する2-フェニルアミノピリミジンが含まれる。ある実施態様では、ＰＲＯアンタゴニストは、ここに定義されるように、チロシンキナーゼ阻害剤である。
【００６４】
また別の態様では、ＰＲＯアンタゴニストはＰＲＯの可溶型、つまり細胞膜にアンカー（anchor）されていないＰＲＯの形態である。このようなＰＲＯの可溶型は、ＰＲＯリガンドへの結合について膜結合ＰＲＯと競合しうる。ある実施態様では、ＰＲＯの可溶型は、ＰＲＯの細胞外ドメインの全部又はリガンド結合部分を含むことができる。上記実施態様のいずれにおいても、ＰＲＯの可溶型は、更にチロシンキナーゼドメインを含んでも含まなくともよい。
【００６５】
更に別の態様では、ＰＲＯアンタゴニストはＰＲＯ遺伝子の発現を減少させる（つまり、ＰＲＯ遺伝子の転写及び／又はＰＲＯ ｍＲＮＡの翻訳を低減させる）アンチセンス核酸である。ある実施態様では、アンチセンス核酸はＰＲＯをコードする核酸（ＤＮＡ又はＲＮＡ）に結合する。ある実施態様では、アンチセンス核酸は約１０−３０ヌクレオチド長の（エンドポイント間の全てのポイントを含む）オリゴヌクレオチドである。ある実施態様では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、修飾された糖ホスホジエステル骨格（又はホスホロチオエート結合及び国際公開第９１／０６６２９号に記載されたような結合を含む他の糖連鎖）を含み、ここで、かかる修飾された糖ホスホジエステル骨格は内在性ヌクレアーゼに耐性がある。ある実施態様では、アンチセンス核酸はオリゴデオキシリボヌクレオチドであり、これにより、ＰＲＯ  ｍＲＮＡの分解、及び／又は転写又は翻訳の低減が生じる。
【００６６】
ある実施態様では、アンチセンス核酸は、「ＲＮＡ干渉」（「ＲＮＡｉ」）によって標的核酸の発現を減少させるＲＮＡである。ＲＮＡｉの概説については、例えばNovina等(2004) Nature 430:161-164を参照のこと。そのようなＲＮＡは例えば低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）及びマイクロＲＮＡから誘導される。ｓｉＲＮＡは、例えば長さが約１８−２６ヌクレオチドの二本鎖オリゴリボヌクレオチドとして合成することができる。同文献。よって、ＰＲＯの発現を減少させ宇アンチセンス核酸もまた当業者の技量の範囲内である。
【００６７】
２．細胞障害性抗体
一態様では、細胞障害性抗体が提供される。ある実施態様では、細胞障害性抗体は抗ＰＲＯ抗体、例えば上に提供したものであり、これはエフェクター機能を奏し及び／又は細胞死を誘導する。ある実施態様では、細胞障害性抗ＰＲＯ抗体はＰＲＯの細胞外ドメインに結合する。
【００６８】
３．免疫複合体
免疫複合体、又は「抗体−薬剤コンジュゲート」は癌の治療における細胞障害剤の局所的送達に有用である。例えばSyrigos等(1999) Anticancer Research 19:605-614；Niculescu-Duvaz等(1997) Adv. Drg Del. Rev. 26:151-172；米国特許第４９７５２７８号を参照のこと。免疫複合体は腫瘍への薬剤部分の標的化送達を可能にする一方、非コンジュゲート細胞障害性薬剤の全身性投与により正常細胞並びに除去しようとする腫瘍細胞への毒性が容認できないレベルとなりうる。Baldwin等, (1986) Lancet pp.(Mar.15,1986):603-05；Thorpe, (1985) 「Antibody Carriers Of Cytotoxic Agents In Cancer Therapy: A Review」 Monoclonal Antibodies '84: Biological and Clinical Applications (A.Pinchera等編), pp. 475-506を参照のこと。
一態様では、免疫複合体は、例えば上で提供されたもののようなＰＲＯ（又はその細胞外ドメイン）に結合する抗体、及び細胞障害性薬剤、例えば化学療法剤、増殖阻害剤、毒素（例えば酵素的に活性な細菌、真菌、植物、又は動物由来の毒素、又はその断片）、又は放射性同位体（つまり放射性コンジュゲート）を含む。
【００６９】
免疫複合体の作製に有用な化学療法剤は上に記載した。使用可能な酵素活性毒素及びその断片には、ジフテリアＡ鎖、ジフテリア毒素の非結合性活性断片、外毒素Ａ鎖(シュードモナス・アエルギノーサ(Pseudomonas aeruginosa)由来)、リシンＡ鎖、アブリンＡ鎖、モデシン(modeccin)Ａ鎖、アルファ-サルシン(sarcin)、アレウライツ・フォルディイ(Aleurites fordii)プロテイン、ジアンシン(dianthin)プロテイン、フィトラッカ・アメリカーナ(Phytolaca americana)プロテイン(PAPI、PAPII及びPAP-S)、モモルディカ・キャランティア(momordica charantia)インヒビター、クルシン(curcin)、クロチン、サパオナリア(sapaonaria)オフィシナリスインヒビター、ゲロニン(gelonin)、マイトゲリン(mitogellin)、レストリクトシン(restrictocin)、フェノマイシン、エノマイシン及びトリコセセンス(tricothecenes)が含まれる。例には、２１２Ｂｉ、１３１Ｉ、１３１Ｉｎ、９０Ｙ、及び１８６Ｒｅが含まれる。
【００７０】
抗体と細胞障害剤のコンジュゲートは、様々な二官能性タンパク質カップリング剤、例えばＮ-スクシンイミジル-３-(２-ピリジルジチオ)プロピオナート(ＳＰＤＰ)、イミノチオラン(ＩＴ)、イミドエステル類の二官能性誘導体(例えばジメチルアジピミダートＨＣＬ)、活性エステル類(例えば、スベリン酸ジスクシンイミジル)、アルデヒド類(例えば、グルタルアルデヒド)、ビスアジド化合物(例えば、ビス(ｐ-アジドベンゾイル)ヘキサンジアミン)、ビス-ジアゾニウム誘導体(例えば、ビス-(ｐ-ジアゾニウムベンゾイル)エチレンジアミン)、ジイソシアネート(例えば、トリエン-２,６-ジイソシアネート)、及び二活性フッ素化合物(例えば、１,５-ジフルオロ-２,４-ジニトロベンゼン)を使用して作製することができる。例えば、リシン免疫毒素は、Vitetta等, Science 238:1098(1987)に記載されているようにして調製することができる。炭素-１４標識１-イソチオシアナトベンジル-３-メチルジエチレン-トリアミン五酢酸(ＭＸ-ＤＴＰＡ)は抗体に放射性ヌクレオチドをコンジュゲートするためのキレート剤の例である。国際公開第９４／１１０２６号を参照のこと。
【００７１】
メイタンシン及びメイタンシノイド
一実施態様では、免疫複合体は一又は複数のメイタンシノイド分子と結合した抗ＰＲＯ抗体を含んでなる。メイタンシノイドは、チューブリン重合を阻害することによって作用する分裂阻害剤である。メイタンシンは、最初、東アフリカシラブMaytenus serrataから単離された(米国特許第３８９６１１１号)。その後、ある種の微生物がメイタンシノイド類、例えばメイタンシノール及びＣ-３メイタンシノールエステルを生成することが発見された(米国特許第４１５１０４２号)。合成メイタンシノール及びその誘導体及び類似体は、例えば米国特許第４１３７２３０号；同４２４８８７０号；同４２５６７４６号；同４２６０６０８号；同４２６５８１４号；同４２９４７５７号；同４３０７０１６号；同４３０８２６８号；同４３０８２６９号；同４３０９４２８号；同４３１３９４６号；同４３１５９２９号；同４３１７８２１号；同４３２２３４８号；同４３３１５９８号；同４３６１６５０号；同４３６４８６６号；同４４２４２１９号；同４４５０２５４号；同４３６２６６３号；及び同４３７１５３３号に開示されており、その開示は出典を明示してここに援用される。
【００７２】
治療指標を改善する試みで、メイタンシン及びメイタンシノイドは、腫瘍細胞表面上の抗原に結合する抗体に結合された。メイタンシノイドからなる免疫複合体及びそれらの治療用途は、例えば米国特許第５２０８０２０号、同５４１６０６４号、欧州特許第０４２５２３５Ｂ１号に開示されており、その開示は出典を明示してここに援用される。Liu等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93：8618-8623(1996)には、ヒト肺癌に対するモノクローナル抗体Ｃ２４２に結合するＤＭ１と命名されたメイタンシノイドを含有する免疫複合体が記載されている。前記複合体は培養された大腸癌細胞に対して高い細胞障害性を有することが見出されており、インビボ腫瘍増殖アッセイにおいて抗腫瘍活性を示した。Chari等, Cancer Research, 52：127-131(1992)には、メイタンシノイドが、ジスルフィド結合を介して、ヒト結腸癌株化細胞の抗原に結合するマウス抗体Ａ７、又はＨＥＲ-２／ｎｅｕオンコジーンに結合する他のマウスモノクローナル抗体ＴＡ.１に結合している免疫複合体が記載されている。ＴＡ.１-メイタンシノイドコンジュゲートの細胞毒性はヒト乳癌株化細胞ＳＫ-ＢＲ-３についてインビトロで試験され、細胞当たり３×１０５ＨＥＲ-２表面抗原を発現した。薬剤複合体により、遊離のメイタンシノイド剤に類似した細胞障害度が達成され、該細胞障害度は、抗体分子当たりのメイタンシノイド分子の数を増加させることにより増加させうる。Ａ７-メイタンシノイドコンジュゲートはマウスにおいては低い全身性細胞障害を示した。
【００７３】
抗ＰＲＯ抗体-メイタンシノイドコンジュゲートは、抗体又はメイタンシノイド分子の何れの生物学的活性も有意には低減することなく、メイタンシノイド分子に抗ＰＲＯ抗体を化学的に結合させることにより、調製される。抗体当たり１分子の毒素さえ、裸抗体の使用に対して細胞毒性を高めることが予想されるが、抗体分子当たり、平均３−４のメイタンシノイド分子が結合したものは、抗体の機能又は溶解性に悪影響を与えることなく、標的細胞の細胞毒性を向上させる効力を示した。メイタンシノイドは当該分野でよく知られており、既知の技術で合成することも、天然源から単離することもできる。適切なメイタンシノイドは、例えば米国特許第５２０８０２０号、及び他の特許及び上述した非特許刊行物に開示されている。好ましいメイタンシノイドは、メイタンシノール、及び種々のメイタンシノールエステル等の、メイタンシノール分子の芳香環又は他の位置が修飾されたメイタンシノール類似体である。
例えば、米国特許第５２０８０２０号又は欧州特許第０４２５２３５Ｂ１号、及びChari等, Cancer Research, 52：127-131(1992)に開示されているもの等を含む、抗体-メイタンシノイドコンジュゲートを作製するために、当該分野で知られている多くの連結基がある。連結基には、上述の特許に開示されているようなジスルフィド基、チオエーテル基、酸不安定性基、光不安定性基、ペプチターゼ不安定性基、又はエステラーゼ不安定性基が含まれるが、ジスルフィド及びチオエーテル基が好ましい。
【００７４】
抗体とメイタンシノイドとのコンジュゲートは、種々の二官能性タンパク質カップリング剤、例えばＮ-スクシンイミジル-３-(２-ピリジルジチオ)プロピオナート(ＳＰＤＰ)、スクシンイミジル-４-(Ｎ-マレイミドメチル)シクロヘキサン-１-カルボキシラート、イミノチオラン(ＩＴ)、イミドエステル類の二官能性誘導体(例えばジメチルアジピミダートＨＣＬ)、活性エステル類(例えば、スベリン酸ジスクシンイミジル)、アルデヒド類(例えば、グルタルアルデヒド)、ビス-アジド化合物(例えば、ビス(ｐ-アジドベンゾイル)ヘキサンジアミン)、ビス-ジアゾニウム誘導体(例えば、ビス-(ｐ-ジアゾニウムベンゾイル)エチレンジアミン)、ジイソシアネート(例えば、トルエン-２,６-ジイソシアネート)、及びビス活性フッ素化合物(例えば、１,５-ジフルオロ-２,４-ジニトロベンゼン)を使用して作製することができる。Ｎ-スクシンイミジル-４-(２-ピリジルチオ)ペンタノアート(ＳＰＰ)(Carlsson等, Biochem. J. 173：723-737[1978])及びＮ-スクシンイミジル-３-(２-ピリジルジチオ)プロピオナート(ＳＰＤＰ)を含むある種のカップリング剤はジスルフィド結合をもたらす。
リンカーは、結合の種類に応じて、様々な位置でメイタンシノイド分子に結合されうる。例えば、一般的なカップリング技術を使用してヒドロキシル基と反応させることによりエステル結合を形成することができる。該反応は、ヒドロキシル基を有するＣ-３位、ヒドロキシメチルで修飾されたＣ-１４位、ヒドロキシル基で修飾されたＣ-１５位、及びヒドロキシル基を有するＣ-２０位で生じる。好ましい実施態様では、結合はメイタンシノール又はメイタンシノール類似体のＣ-３位で形成される。
【００７５】
オーリスタチン(auristatins)及びドラスタチン
ある実施態様では、免疫複合体はドラスタチン又はドラスタチンペプチド性維持体又は誘導体、例えばオーリスタチン（米国特許第５６３５４８３号；同第５７８０５８８号）にコンジュゲートした抗ＰＲＯ抗体を含んでなる。ドラスタチン及びオーリスタチンは微小管動態、ＧＴＰ加水分解、及び核及び細胞分裂を妨害し（Woyke等(2001) Antimicrob. Agents and Chemother. 45(12):3580-3584）、抗癌（米国特許第５６６３１４９号）及び抗真菌活性（Pettit等(1998) Antimicrob. Agents Chemother. 42:2961-2965)を有していることが知られている。ドラスタチン又はオーリスタチン薬剤部分はペプチド性薬剤部分のＮ(アミノ)末端又はＣ(カルボキシル)末端を介して抗体に結合されうる（国際公開第０２／０８８１７２号）。
例示的なオーリスタチン実施態様は、その開示の全体が出典明示により明示的に援用される米国特許出願公開第２００５−０２３８６４９Ａ１号「Monomethylvaline Compounds Capable of Conjugation to Ligands」に開示されたＮ末端結合モノメチルオーリスタチン薬剤部分ＤＥ及びＤＦを含む。
【００７６】
典型的には、ペプチド系薬剤部分は、二以上のアミノ酸及び／又はペプチド断片の間にペプチド結合を形成することによって調製することができる。そのようなペプチド結合は、例えばペプチド化学の分野でよく知られている液相合成法（E. Schroder及びK. Lubke, "The Peptides", 1巻, pp 76-136, 1965, Academic Press)に従って調製することができる。オーリスタチン／ドラスタチン薬剤部分は、米国特許第５６３５４８３号；同第５７８０５８８号；Pettit等(1989) J. Am. Chem. Soc. 111 :5463-5465；Pettit等(1998) Anti-Cancer Drug Design 13:243-277；Pettit, G.R.等 Synthesis, 1996, 719-725；及びPettit等(1996) J. Chem. Soc. Perkin Trans. 1 5:859-863の方法に従って調製することができる。その全体が出典明示によりここに援用されるDoronina (2003) Nat. Biotechnol. 21(7):778-784；米国特許出願公開第２００５−０２３８６４９Ａ１号（例えばリンカー、及びリンカーにコンジュゲートされるＭＭＡＥ及びＭＭＡＦのようなモノメチルバリン化合物を調製する方法を開示)を参照のこと。
【００７７】
カリケアマイシン
対象の他の免疫複合体には、一又は複数のカリケアマイシン分子と結合した抗ＰＲＯ抗体が含まれる。抗生物質のカリケアマイシンファミリーはサブ-ピコモルの濃度で二重鎖ＤＮＡ破壊を生じることができる。カリケアマイシンファミリーのコンジュゲートの調製については、米国特許第５７１２３７４号、同５７１４５８６号、同５７３９１１６号、同５７６７２８５号、同５７７０７０１号、同５７７０７１０号、同５７７３００１号、同５８７７２９６号(全て、American Cyanamid Company)を参照のこと。使用可能なカリケアマイシンの構造類似体には、限定するものではないが、γ１Ｉ、α２Ｉ、α３Ｉ、Ｎ-アセチル-γ１Ｉ、ＰＳＡＧ及びθＩ１(Hinman等, Cancer Research, 53：3336-3342(1993)、Lode等 Cancer Research, 58：2925-2928(1998)及び上述したAmerican Cyanamidの米国特許)が含まれる。抗体が結合可能な他の抗腫瘍剤は、葉酸代謝拮抗薬であるＱＦＡである。カリケアマイシン及びＱＦＡは双方とも、細胞内に作用部位を有し、原形質膜を容易には通過しない。よって、抗体媒介性インターナリゼーションによるこれらの薬剤の細胞への取込により、細胞障害効果が大きく向上する。
【００７８】
他の細胞障害剤
抗ＰＲＯ抗体と結合可能な他の抗腫瘍剤には、ＢＣＮＵ、ストレプトゾイシン、ビンクリスチン及び５-フルオロウラシル、米国特許第５０５３３９４号、同５７７０７１０号に記載されており、集合的にＬＬ-Ｅ３３２８８複合体として知られている薬剤のファミリー、並びにエスペラマイシン(esperamicine)(米国特許第５８７７２９６号)が含まれる。
使用可能な酵素活性毒及びその断片には、ジフテリアＡ鎖、ジフテリア毒素の非結合性活性断片、外毒素Ａ鎖(シュードモナス・アエルギノーサ(Pseudomonas aeruginosa))、リシンＡ鎖、アブリンＡ鎖、モデシン(modeccin)Ａ鎖、アルファ-サルシン(sarcin)、アレウライツ・フォルディイ(Aleurites fordii)プロテイン、ジアンシン(dianthin)プロテイン、フィトラッカ・アメリカーナ(Phytolaca americana)プロテイン(ＰＡＰＩ、ＰＡＰＩＩ及びＰＡＰ-Ｓ)、モモルディカ・キャランティア(momordica charantia)インヒビター、クルシン(curcin)、クロチン、サパオナリア(sapaonaria)オフィシナリスインヒビター、ゲロニン(gelonin)、マイトゲリン(mitogellin)、レストリクトシン(restrictocin)、フェノマイシン、エノマイシン及びトリコセセンス(tricothecenes)が含まれる。例えば、１９９３年１０月２８日公開の国際公開第９３／２１２３２号を参照のこと。
【００７９】
他の態様では、免疫複合体は、抗ＰＲＯ抗体と核酸分解活性を有する化合物(例えばリボヌクレアーゼ又はＤＮＡエンドヌクレアーゼ、例えばデオキシリボヌクレアーゼ；ＤＮエース)を含みうる。
腫瘍を選択的に破壊するため、免疫複合体は、抗ＰＲＯ抗体と高放射性原子を含みうる。放射性コンジュゲートした抗ＰＲＯ抗体を生成するために様々な放射性同位体が利用される。例には、Ａｔ２１１、Ｉ１３１、Ｉ１２５、Ｙ９０、Ｒｅ１８６、Ｒｅ１８８、Ｓｍ１５３、Ｂｉ２１２、Ｐ３２、Ｐｂ２１２及びＬｕの放射性同位体が含まれる。コンジュゲートが診断用に使用される場合、それはシンチグラフィー研究用の放射性原子、例えばｔｃ９９ｍ又はＩ１２３、又は核磁気共鳴(ＮＭＲ)映像(磁気共鳴映像、mriとしても知られている)用のスピン標識、例えばヨウ素-１２３、ヨウ素-１３１、インジウム-１１１、フッ素-１９、炭素-１３、窒素-１５、酸素-１７、ガドリニウム、マンガン又は鉄を含みうる。
【００８０】
放射-又は他の標識は、既知の方法でコンジュゲートに導入される。例えば、ペプチドは生合成されるか、又は水素の代わりにフッ素-１９を含む適切なアミノ酸前駆体を使用する化学的なアミノ酸合成により合成される。標識、例えばｔｃ９９ｍ又はＩ１２３、Ｒｅ１８６、Ｒｅ１８８及びＩｎ１１１は、ペプチドのシステイン残基を介して結合されうる。イットリウム-９０はリジン残基を介して結合されうる。IODOGEN法(Fraker等(1978) Biochem. Biophys. Res. Commun. 80：49-57)は、ヨウ素-１２３の導入に使用することができる。「Monoclonal Antibodies in Immunoscintigraphy」(Chatal, CRC Press 1989)は他の方法を詳細に記載している。
抗体と、一又は複数のカリケアマイシン、メイタンシノイド、トリコセン（trichothene）、及びＣＣ１６０５と、毒素活性を有するこれら毒素の誘導体などの小分子毒素とのコンジュゲートも、本明細書で考慮される。
【００８１】
４．更なる治療剤
薬学的製剤は、場合によっては少なくとも一つの更なる治療剤を（つまり、ＰＲＯアンタゴニスト、細胞障害性抗体、又は免疫複合体に加えて）含有してもよい。そのような更なる治療剤は以下のパートＣに更に詳細に記載される。
【００８２】
５．薬学的製剤の調製
上記薬剤の何れかを含有する薬学的製剤は、所望される程度の純度を持つ薬剤を、水溶液又は凍結乾燥もしくは他の乾燥製剤の形態で、任意成分の製薬上許容される担体、賦形剤又は安定化剤と混合することにより調製され保存される（Remington's Pharmaceutical Science 16版, Osol, A.編 (1980)）。許容される担体、賦形剤、又は安定化剤は、用いられる用量及び濃度で受容者に非毒性であり、リン酸塩、クエン酸塩、ヒスチジン及び他の有機酸などの緩衝液；アスコルビン酸及びメチオニンを含む酸化防止剤；保存料（例えば塩化オクタデシルジメチルベンジルアンモニウム、塩化ヘキサメトニウム、塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム）；フェノール；ブチル又はベンジルアルコール；メチル又はプロピルパラベン等のアルキルパラベン；カテコール；レゾルシノール；シクロヘキサノール；３-ペンタノール；及びｍ-クレゾール；低分子量（約１０残基未満）ポリペプチド；血清アルブミン、ゼラチン、又は免疫グロブリン等のタンパク質；ポリビニルピロリドン等の親水性ポリマー；グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、又はリジン等のアミノ酸；グルコース、マンノース、又はデキストリンを含む単糖類、二糖類、及び他の炭水化物；ＥＤＴＡ等のキレート剤；スクロース、マンニトール、トレハロース又はソルビトールなどの糖；ナトリウムなどの塩形成対イオン；金属錯体（例えば、Ｚｎ-タンパク質錯体）及び／又はトゥイーン（TWEENTM）、プルロニクス（PLURONICSTM）又はポリエチレングリコール（ＰＥＧ）等の非イオン性界面活性剤を含む。インビボ投与に使用される薬学的製剤は一般に無菌である。これは滅菌濾過膜による濾過によって直ぐに達成される。
【００８３】
薬剤は、例えばコアセルベーション法によって又は界面重合によって調製されたマイクロカプセル、例えば、それぞれヒドロキシメチルセルロース又はゼラチン-マイクロカプセル及びポリ-(メチルメタクリレート)マイクロカプセルに、コロイド状薬物送達系(例えば、リポソーム、アルブミンミクロスフィア、マイクロエマルション、ナノ粒子及びナノカプセル)又はマクロエマルションに捕捉することができる。このような技術はRemington's Pharmaceutical Sciences 16版, Osol, A.編(1980)に開示されている。
【００８４】
徐放性製剤を調製することができる。徐放性製剤の好適な例は、対象の薬剤を含む固形疎水性ポリマーの半透性マトリクスを含み、該マトリクスは成形品、例えばフィルム、又はマイクロカプセルの形態である。除放性マトリクスの例は、ポリエステル、ヒドロゲル（例えば、ポリ(２-ヒドロキシエチル-メタクリレート)又はポリ(ビニルアルコール)）、ポリラクチド（米国特許第３７７３９１９号）、Ｌ-グルタミン酸とγ-エチル-Ｌ-グルタマートのコポリマー、非分解性エチレン-酢酸ビニル、ＬＵＰＲＯＮ ＤＥＰＯＴＴＭ（乳酸-グリコール酸コポリマーと酢酸リュープロリドからなる注射可能なミクロスフィア）等の分解性乳酸-グリコール酸コポリマー、ポリ-(Ｄ)-３-ヒドロキシブチル酸を含む。エチレン-酢酸ビニル及び乳酸-グリコール酸などのポリマーは分子を１００日に亘って放出することができるが、ある種のヒドロゲルはより短時間でタンパク質を放出する。カプセル化された薬剤が身体内に長時間残ると、それらは３７℃の水分に露出されることにより変性又は凝集し、その結果、生物学的活性の低下、及び抗体の場合には、起こりうる免疫原性の変化をもたらす。合理的な方法は、関与する機構に依存して安定化について工夫することができる。例えば、凝集機序がチオ-ジスルフィド交換を通した分子間Ｓ-Ｓ結合形成であることが発見された場合、安定化はスルフヒドリル残基の修飾、酸性溶液からの凍結乾燥、水分含量の制御、適切な添加剤の付加、及び特異的ポリマーマトリクス組成物の開発によって達成されうる。
【００８５】
Ｃ．治療法及び関連方法
ＰＲＯアンタゴニスト、細胞障害性抗体、又は免疫複合体を使用する治療方法が提供される。そのような方法には、別段の記載がない限り、インビトロ、エキソビボ、及び／又はインビボ治療法が含まれる。
本発明の一態様では、肺癌細胞の増殖を阻害する方法であって、細胞を、１）ＰＲＯアンタゴニスト、２）細胞障害性の抗ＰＲＯ抗体、又は３）抗ＰＲＯ抗体及び細胞障害剤からなる免疫複合体にさらすことを含む方法が提供される。ある実施態様では、肺癌細胞においてＰＲＯ遺伝子が増幅又は過剰発現される。ある実施態様では、肺癌細胞は、肺腫瘍、例えばＰＲＯ遺伝子が増幅又は過剰発現される肺腫瘍から誘導される。ある実施態様では、肺癌細胞は次の細胞株の何れかであり得る：ＮＣＩ−Ｈ１３９５、ＮＣＩ−Ｈ１４３７、ＮＣＩ−Ｈ２００９、ＮＣＩ−Ｈ２０８７、ＮＣＩ−Ｈ２１２２、ＮＣＩ−Ｈ２１２６、ＮＣＩ−Ｈ１７７０（非小細胞肺細胞腫由来）；並びにＮＣＩ−Ｈ８２、ＮＣＩ−Ｈ２０９、及びＮＣＩ−Ｈ２１７１（小細胞肺細胞腫由来）。細胞増殖の阻害は当業者に知られた方法を使用して測定することができる。例えば、細胞増殖の測定のための簡便なアッセイはCellTiter-GloTM Luminescent Cell Viability Assayであり、これはPromega（Madison, WI）から商業的に入手できる。そのアッセイは、代謝的に活性な細胞の指標である存在するＡＴＰの定量に基づき培養物中の生存細胞数を決定する。Crouch等 (1993) J. Immunol. Meth. 160:81-88, 米国特許第６６０２６７７号を参照。該アッセイは９６ウェル又は３８４ウェル形態で実施することができ、自動化高スループットスクリーニング（ＨＴＳ）に受け入れられるものとなる。Cree等(1995) Anticancer Drugs 6:398-404を参照。該アッセイ手順は培養した細胞に単一の試薬（CellTiter-Glo(登録商標)試薬）を直接添加することを含む。これは、細胞溶解と、ルシフェラーゼ反応によって得られる発光シグナルの発生を生じる。発光シグナルは、存在するＡＴＰの量に比例し、これは培養物中に存在する生存細胞の数に直接比例している。データはルミノメーター又はＣＣＤカメラ画像処理装置によって記録することができる。発光出力は相対光単位（ＲＬＵ）として表される。
【００８６】
他の態様では、肺癌の治療方法であって、肺癌を有する個体に、１）ＰＲＯアンタゴニスト、２）細胞障害性の抗ＰＲＯ抗体、又は３）抗ＰＲＯ抗体及び細胞障害剤からなる免疫複合体を含む薬学的製剤の有効量を投与することを含む方法が提供される。ある実施態様では、肺癌にＰＲＯ遺伝子の増幅又は過剰発現が伴う。ある実施態様では、個体は肺癌に対する非ヒト動物モデルである。肺癌のマウスモデルは、例えば、Meuwissenら（2005）Genes Dev. 19:643-664で詳細に検討されている。ある実施態様では、薬学的製剤の有効量は次のものの何れか一つを生じる：癌細胞数の減少又は癌細胞の除去；腫瘍サイズの減少；癌の軟部組織及び骨中への広がりを含む周囲器官中への癌細胞浸潤の完全な又は部分的な阻害；腫瘍増殖の完全な又は部分的な阻害；及び／又は癌に伴う一又は複数の徴候の完全な又は部分的な軽減；及び罹患率及び死亡率の減少。
【００８７】
ある実施態様では、少なくとも一つの更なる治療剤及び／又はアジュバントと併用して、１）ＰＲＯアンタゴニスト、２）細胞障害性の抗ＰＲＯ抗体、又は３）抗ＰＲＯ抗体及び細胞障害剤からなる免疫複合体を含む薬学的製剤を投与する。ある実施態様では、治療剤は細胞障害剤、化学療法剤、又は増殖阻害剤である。かかる実施態様の一つでは、化学療法剤は肺癌の治療に使用される薬剤又は薬剤の組合せである。かかる薬剤には、限定されるものではないが、例えば、単独で投与されるパクリタキセル、カルボプラチン、シスプラチン、及びビノレルビン、又はこれらの組み合わせ、例えばパクリタキセルとカルボプラチン、パクリタキセルとシスプラチン、及びビノレルビンとシスプラチンが含まれる。
上に記したかかる併用療法は、（二以上の薬剤が同じ又は別個の製剤中に含まれる）併用投与、及びＰＲＯアンタゴニスト、細胞障害性の抗体、又は免疫複合体の投与が更なる治療剤及び／又はアジュバントの投与の前、同時、及び／又は後に続いて生じうる別個の投与を包含する。ＰＲＯアンタゴニスト、細胞障害性の抗体、又は免疫複合体は放射線療法と併用して使用することもできる。
【００８８】
ＰＲＯアンタゴニスト、細胞障害性の抗体、又は免疫複合体（及び何らかの追加的な治療薬又はアジュバント）は、非経口投与、皮下投与、腹腔内投与、肺内投与、及び鼻腔内投与、並びに局所的治療に望ましい場合は病巣内投与を含め、あらゆる適切な手段によって投与することができる。非経口注入には、筋肉内投与、静脈内投与、動脈内投与、腹腔内投与、又は皮下投与が含まれる。加えて、ＰＲＯアンタゴニスト、細胞障害性の抗体、又は免疫複合体は、特にＰＲＯアンタゴニスト、細胞障害性の抗体、又は免疫複合体の用量を減らしながら投与する場合に、パルス注入により適切に投与することができる。投薬は、一つには一時的な投与か慢性投与かに応じて、あらゆる適切な経路によって、例えば静脈内注射又は皮下注射等の注射によって、行うことができる。
ＰＲＯアンタゴニストがアンチセンス核酸である場合、アンチセンス核酸の投与量及びインビボ投与のガイダンスをKhanら (2004) J. Drug Targeting 12:393-404に見ることができる。
【００８９】
治療剤が抗ＰＲＯ抗体又はその免疫複合体である場合、（単独で使用された場合又は化学療法剤などの一又は複数の他の追加的な治療剤と組み合わせて使用された場合の）抗体又は免疫複合体の適切な投与量は、抗体又は免疫複合体の特性、疾病の重度及び履歴、抗体又は免疫複合体の投与目的が予防であるか又は治療であるか、以前の治療法、患者の臨床履歴と抗体又は免疫複合体への応答、並びに主治医の判断に応じて決定される。抗体又は免疫複合体は、一度に、又は一連の治療として複数回に分けて、患者に適切に投与される。疾病の種類及び重度に応じて、約１μｇ／ｋｇ〜１５ｍｇ／ｋｇ（例えば０．１ｍｇ／ｋｇ−１０ｍｇ／ｋｇ）の抗体又は免疫複合体を、例えば一又は複数回の投与であるか、或いは持続点滴であるかに関わらず、患者に投与するための最初の候補投与量とすることができる。典型的な一日当たりの投与量は、上記の要因に応じて、約１μｇ／ｋｇ〜１００ｍｇ／ｋｇ以上とすることができる。複数日又は更に長期に亘って繰り返し投与をする場合、条件に応じて、通常、疾病の徴候に所望の沈静が生じるまで治療が続けられる。抗体又は免疫複合体の一つの例示的な投与量は、約０．０５ｍｇ／ｋｇ〜約１０ｍｇ／ｋｇである。このように、約０．５ｍｇ／ｋｇ、２．０ｍｇ／ｋｇ、４．０ｍｇ／ｋｇ又は１０ｍｇ／ｋｇ（或いはこれらのあらゆる組み合わせ）のうち一又は複数の投与量を患者に投与することができる。このような投与量は、断続的に、例えば毎週又は３週毎に（例えば、患者に、約２〜約２０回、或いは例えば約６回分の抗体又は免疫複合体が投与されるように）投与することができる。最初の投与量は多目にし、その後一又は複数回に亘ってそれよりも少ない投与量を投与してもよい。例示的な投与計画では、最初に約４ｍｇ／ｋｇの投与量で抗体又は免疫複合体を投与し、その後毎週約２ｍｇ／ｋｇの投与を続ける。しかしながら、他の投与計画も有用でありうる。
【００９０】
ＩＩＩ．実施例
それぞれ異なった患者から採取した９２の新鮮な凍結肺腫瘍試料を分析した。病理学者の推定では、各腫瘍試料の腫瘍性細胞の含有量は７５％を超えていた。それぞれの腫瘍試料から標準的な方法でＤＮＡを抽出、精製した。
【００９１】
Ａ．ＤＮＡコピー数解析
ＧｅｎｅＣｈｉｐ(登録商標)ヒトマッピング５００Ｋアレイセット（Affymetrix, Santa Clara, CA）を使用して、肺腫瘍試料中のＤＮＡコピー数変化を測定した。ＧｅｎｅＣｈｉｐ(登録商標)ヒトマッピング５００Ｋアレイセットは２つのアレイ（２５０Ｋ「ＳｔｙＩ」アレイ及び２５０Ｋ「ＮｓｐＩ」アレイ）からなり、それぞれがおよそ２５００００ＳＮＰで、全体でおよそ５０００００ＳＮＰに特異的なプローブを含んでいる。ＳＮＰはゲノム全体に分布しており、よってＤＮＡコピー数のゲノム全体の解析が可能になる。アレイセット中の各アレイは６５０万を超える特徴を含んでおり、各特徴は定まった配列の２５ｂｐのオリゴヌクレオチドの１００万を超えるコピーからなる。
各腫瘍試料から、ＤＮＡを増幅させ、標識し、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘの標準的なプロトコルによってＳｔｙ１又はＮｓｐ１で消化させ、得られた調製物を、ＧｅｎｅＣｈｉｐ(登録商標)ヒトマッピング５００Ｋアレイセットの双方のアレイにハイブリダイズさせた。
マイクロアレイへのハイブリダイゼーションは、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘの標準的なプロトコルに従って検出し、各特徴に対する強度値を得た。強度値を正常なゲノムＤＮＡの参照セットに対して正規化した。ついで、特徴をヒトゲノム中の対応するコード化領域（オープンリーディングフレーム）にマッピングした。しかして、正規化された強度値の各々は、特定のコード化領域のＤＮＡコピー数を反映させていた。
【００９２】
Ｂ．結果
分析した９２の肺腫瘍試料のうち、５つの非小細胞肺細胞腫は、第４染色体の特定の領域の増幅を示した。図１及び２は、第４染色体のコピー数の分析結果を示す。図２は、約ヌクレオチド５０，０００，０００〜６０，０００，０００由来の第４染色体の領域に焦点を当てて示す。腫瘍試料は、図１及び２のグラフ左側に示す番号（例えば「ＨＦ−１１７６３」）と、図２のグラフ右側に示す腫瘍種類（例えば「扁平上皮癌」）とによって記載されている。各図のグラフは、各腫瘍のＤＮＡコピー数の分析に基づく正規化された強度の値を示し、各特性は縦線で表わされている。各腫瘍について、横軸に沿って縦線が引かれており、これは各グラフ上方の目盛に示された第４染色体の領域を表わしている。各縦線の高さは正規化された強度の値を示し、これは染色体上の当該地点におけるＤＮＡコピー数の測定値である。信号強度の一時的な上昇が、各腫瘍の約５４，５００，０００〜約５７，０００，０００ヌクレオチドで観察された。この領域における正規化された強度の値は、少なくとも約２〜１０倍増大した。
図２の下部に示すように、ＰＤＧＦＲＡ、ＫＩＴ及びＫＤＲをコードする遺伝子は、コピー数が増大した領域内に含まれている。これら遺伝子の増幅は、コードされたレセプター型チロシンキナーゼの過剰発現によって肺腫瘍細胞の成長及び増殖が促されることを示唆している。
【００９３】
上記の発明は理解の明確化のために例示と実施例によってある程度詳細に記載したが、説明と実施例は発明の範囲を限定するものと解釈してはならない。ここで引用された全ての特許及び科学的文献の開示はその全体が出典明示によって明示的に援用される。
【図１】
2014144002.tif 000002
【図２】
2014144002.tif 000003
【手続補正書】
【提出日】平成26年4月2日(2014.4.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
哺乳動物における肺癌細胞の存在を検出する方法であって、コントロール試料と比較して該哺乳動物の被験肺試料においてＰＤＧＦＲＡ遺伝子が増幅されているかどうかを検出することを含み、ＰＤＧＦＲＡ遺伝子の増幅が該哺乳動物における肺癌細胞の存在を示す方法。
【請求項２】
ＰＤＧＦＲＡ遺伝子が増幅されているかどうかの検出が、ＰＤＧＦＲＡ遺伝子のコピー数が少なくとも５倍増加しているかどうかを検出することを含む請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ＰＤＧＦＲＡアンタゴニストの有効量を含む、ＰＤＧＦＲＡ遺伝子の増幅を伴う肺癌の治療するための組成物。
【請求項４】
ＰＤＧＦＲＡアンタゴニストが抗ＰＤＧＦＲＡ抗体である請求項３に記載の組成物。
【請求項５】
抗ＰＤＧＦＲＡ抗体がＰＤＧＦＲＡの細胞外ドメインに結合する請求項４に記載の組成物。
【請求項６】
抗ＰＤＧＦＲＡ抗体が抗体断片である請求項４に記載の組成物。
【請求項７】
抗ＰＤＧＦＲＡ抗体がキメラ抗体又はヒト化抗体である請求項４に記載の組成物。
【請求項８】
抗ＰＤＧＦＲＡ抗体がヒト抗体である請求項４に記載の組成物。
【請求項９】
ＰＤＧＦＲＡアンタゴニストが、ＰＤＧＦＲＡに結合する有機分子である請求項３に記載の組成物。
【請求項１０】
ＰＤＧＦＲＡアンタゴニストが、ＰＤＧＦＲＡに結合するオリゴペプチドである請求項３に記載の組成物。
【請求項１１】
ＰＤＧＦＲＡアンタゴニストがＰＤＧＦＲＡの可溶型である請求項３に記載の組成物。
【請求項１２】
ＰＤＧＦＲＡアンタゴニストが、ＰＤＧＦＲＡをコードする核酸に結合して同核酸の発現を低減させる１０〜３０ヌクレオチド長のアンチセンス核酸である請求項３に記載の組成物。
【請求項１３】
（ａ）細胞障害性の抗ＰＤＧＦＲＡ抗体又は（ｂ）抗ＰＤＧＦＲＡ抗体及び細胞障害剤を含む免疫複合体の有効量を含む、ＰＤＧＦＲＡ遺伝子の増幅を伴う肺癌の治療するための組成物。
【請求項１４】
細胞障害性の抗ＰＤＧＦＲＡ抗体の有効量を含む請求項１３に記載の組成物。
【請求項１５】
抗ＰＤＧＦＲＡ抗体及び細胞障害剤を含む免疫複合体の有効量を含む請求項１３に記載の組成物。
【請求項１６】
細胞障害剤がメイタンシノイド又はオーリスタチンである請求項１５に記載の組成物。
【請求項１７】
肺癌を有する個体がＰＤＧＦＲＡ又はＰＤＧＦＲＡ遺伝子を標的とする治療剤に応答するかどうかを決定する方法であって、ＰＤＧＦＲＡ遺伝子が肺癌において増幅されるかどうかを決定することを含み、ＰＤＧＦＲＡ遺伝子の増幅が、個体が治療剤に応答することを示す方法。
【請求項１８】
治療剤が、（ａ）ＰＤＧＦＲＡアンタゴニスト、（ｂ）細胞障害性の抗ＰＤＧＦＲＡ抗体、又は（ｃ）抗ＰＤＧＦＲＡ抗体及び細胞障害剤を含む免疫複合体から選択される請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
哺乳動物における肺癌細胞の存在を検出する方法であって、コントロール試料と比較して該哺乳動物の被験肺試料においてＫＩＴ遺伝子が増幅されているかどうかを検出することを含み、ＫＩＴ遺伝子の増幅が該哺乳動物における肺癌細胞の存在を示す方法。
【請求項２０】
ＫＩＴ遺伝子が増幅されているかどうかの検出が、ＫＩＴ遺伝子のコピー数が少なくとも５倍増加しているかどうかを検出することを含む請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
ＫＩＴアンタゴニストの有効量を含む、ＫＩＴ遺伝子の増幅を伴う肺癌の治療するための組成物。
【請求項２２】
ＫＩＴアンタゴニストが抗ＫＩＴ抗体である請求項２１に記載の組成物。
【請求項２３】
抗ＫＩＴ抗体がＫＩＴの細胞外ドメインに結合する請求項２２に記載の組成物。
【請求項２４】
抗ＫＩＴ抗体が抗体断片である請求項２２に記載の組成物。
【請求項２５】
抗ＫＩＴ抗体がキメラ抗体又はヒト化抗体である請求項２２に記載の組成物。
【請求項２６】
抗ＫＩＴ抗体がヒト抗体である請求項２２に記載の組成物。
【請求項２７】
ＫＩＴアンタゴニストが、ＫＩＴに結合する有機分子である請求項２１に記載の組成物。
【請求項２８】
ＫＩＴアンタゴニストが、ＫＩＴに結合するオリゴペプチドである請求項２１に記載の組成物。
【請求項２９】
ＫＩＴアンタゴニストがＫＩＴの可溶型である請求項２１に記載の組成物。
【請求項３０】
ＫＩＴアンタゴニストが、ＫＩＴをコードする核酸に結合して同核酸の発現を低減させる１０〜３０ヌクレオチド長のアンチセンス核酸である請求項２１に記載の組成物。
【請求項３１】
（ａ）細胞障害性の抗ＫＩＴ抗体又は（ｂ）抗ＫＩＴ抗体及び細胞障害剤を含む免疫複合体の有効量を含む、ＫＩＴ遺伝子の増幅を伴う肺癌の治療するための組成物。
【請求項３２】
細胞障害性の抗ＫＩＴ抗体の有効量を含む請求項３１に記載の組成物。
【請求項３３】
抗ＫＩＴ抗体及び細胞障害剤を含む免疫複合体の有効量を含む請求項３１に記載の組成物。
【請求項３４】
細胞障害剤がメイタンシノイド又はオーリスタチンである請求項３３に記載の組成物。
【請求項３５】
肺癌を有する個体がＫＩＴ又はＫＩＴ遺伝子を標的とする治療剤に応答するかどうかを決定する方法であって、ＫＩＴ遺伝子が肺癌において増幅されるかどうかを決定することを含み、ＫＩＴ遺伝子の増幅が、個体が治療剤に応答することを示す方法。
【請求項３６】
治療剤が、（ａ）ＫＩＴアンタゴニスト、（ｂ）細胞障害性の抗ＫＩＴ抗体、又は（ｃ）抗ＫＩＴ抗体及び細胞障害剤を含む免疫複合体から選択される請求項３５に記載の方法。
【外国語明細書】
2014144002000001.pdf