(57)【要約】【課題】ＡＨＡＳ阻害性除草剤に対する、改善されたレベルの耐性を有するトランスジェニック植物または非トランスジェニック植物の提供。【解決手段】請求項１に記載の植物。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬポリペプチドをコードするアセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニット（ＡＨＡＳＬ）ポリヌクレオチドの少なくとも１つのコピーをそのゲノム中に含むアブラナ属植物であって、前記ＡＨＡＳＬポリペプチドは、
ａ）配列番号１の位置６５３または配列番号２の位置６３８または配列番号３の位置６３５に対応する位置にアスパラギンを有するポリペプチド、
ｂ）配列番号１の位置１２２または配列番号４の位置１０７または配列番号５の位置１０４に対応する位置にトレオニンを有するポリペプチド、および
ｃ）配列番号１の位置５７４または配列番号６の位置５５７に対応する位置にロイシンを有するポリペプチド
からなる群から選択されるアブラナ属植物。
【請求項２】
セイヨウカラシナ、セイヨウアブラナ、カブ、アビシニアガラシ、キャベツ、およびクロガラシからなる群から選択される、請求項１に記載のアブラナ属植物。
【請求項３】
植物が、除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬポリペプチドをコードするアセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニット（ＡＨＡＳＬ）ポリヌクレオチドの少なくとも２つのコピーを含み、ＡＨＡＳＬポリペプチドが、
ａ）配列番号１の位置６５３または配列番号２の位置６３８または配列番号３の位置６３５に対応する位置にアスパラギンを有するポリペプチド、
ｂ）配列番号１の位置１２２または配列番号４の位置１０７または配列番号５の位置１０４に対応する位置にトレオニンを有するポリペプチド、および
ｃ）配列番号１の位置５７４または配列番号６の位置５５７に対応する位置にロイシンを有するポリペプチド
からなる群から選択される、請求項１に記載のアブラナ属植物。
【請求項４】
配列番号１の位置６５３または配列番号２の位置６３８または配列番号３の位置６３５に対応する位置にアスパラギンを有するポリペプチドおよび配列番号１の位置５７４または配列番号６の位置５５７に対応する位置にロイシンを有するポリペプチドを含む、請求項３に記載のアブラナ属植物。
【請求項５】
セイヨウカラシナ、セイヨウアブラナ、カブ、アビシニアガラシ、キャベツ、およびクロガラシからなる群から選択される、請求項４に記載のアブラナ属植物。
【請求項６】
セイヨウカラシナである、請求項５に記載のアブラナ属植物。
【請求項７】
植物が以下のとおりである請求項６に記載のアブラナ属植物：
ａ）Ｊ０５Ｚ−０７８０１と命名された植物系であるか、
ｂ）Ｊ０５Ｚ−０７８０１と命名された植物系の後代であるか、
ｃ）ａ）〜ｂ）の植物のうち１つの突然変異体、組み換え体、もしくは遺伝子操作された誘導体であるか、または
ｄ）ａ）〜ｃ）の植物の少なくとも１つの後代である植物である。
【請求項８】
ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドの少なくとも１つのコピーをそのゲノム中に含む、請求項１から７までのいずれか一項に記載のアブラナ属植物の種子。
【請求項９】
除草剤が、イミダゾリノン、スルホニルウレア、トリアゾロピリミジン、およびピリミジニルオキシベンゾエートからなる群から選択される、請求項１に記載のアブラナ属植物。
【請求項１０】
除草剤が、イミダゾリノンである、請求項９に記載のアブラナ属植物。
【請求項１１】
アブラナ属植物の近縁である雑草をコントロールするための方法であって、該雑草およびアブラナ属植物に、有効量のイミダゾリノン除草剤、スルホニルウレア除草剤、トリアゾロピリミジン除草剤、ピリミジニルオキシベンゾエート除草剤、またはその混合物を適用するステップを含み、アブラナ属植物は、除草剤抵抗性のアセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニット（ＡＨＡＳＬ）ポリペプチドをコードするＡＨＡＳＬコードポリヌクレオチドの少なくとも１つのコピーをそのゲノム中に含み、前記ＡＨＡＳＬポリペプチドが、
ａ）配列番号１の位置６５３または配列番号２の位置６３８または配列番号３の位置６３５に対応する位置にアスパラギンを有するポリペプチド、
ｂ）配列番号１の位置１２２または配列番号４の位置１０７または配列番号５の位置１０４に対応する位置にトレオニンを有するポリペプチド、および
ｃ）配列番号１の位置５７４または配列番号６の位置５５７に対応する位置にロイシンを有するポリペプチド
からなる群から選択される方法。
【請求項１２】
植物が、配列番号１の位置６５３または配列番号２の位置６３８または配列番号３の位置６３５に対応する位置にアスパラギンを有するポリペプチドおよび配列番号１の位置５７４または配列番号６の位置５５７に対応する位置にロイシンを有するポリペプチドを含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
アブラナ属植物が、セイヨウカラシナ、セイヨウアブラナ、カブ、アビシニアガラシ、キャベツ、およびクロガラシからなる群から選択される、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
植物が、セイヨウカラシナである、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
アブラナ属植物が以下のとおりである請求項１４に記載の方法：
ａ）Ｊ０５Ｚ−０７８０１と命名された植物系であるか、
ｂ）Ｊ０５Ｚ−０７８０１と命名された植物系の後代であるか、
ｃ）ａ）〜ｂ）の植物のうち１つの突然変異体、組み換え体、もしくは遺伝子操作された誘導体であるか、または
ｄ）ａ）〜ｃ）の植物の少なくとも１つの後代である植物である。
【請求項１６】
除草剤が、イミダゾリノン、スルホニルウレア、トリアゾロピリミジン、およびピリミジニルオキシベンゾエートからなる群から選択される、請求項１１に記載の方法。
【請求項１７】
以下からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド分子をコードする単離ＡＨＡＳＬ：
ａ）配列番号３に示すヌクレオチド配列、
ｂ）配列番号４に示すヌクレオチド配列、
ｃ）配列番号５に示すヌクレオチド配列、
ｄ）配列番号３に示すヌクレオチド配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を有するヌクレオチド配列であって、そのタンパク質は、配列番号１の位置６５３または配列番号２の位置６３８または配列番号３の位置６３５に対応する位置にアスパラギンを有するヌクレオチド配列、
ｅ）配列番号４に示すヌクレオチド配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を有するヌクレオチド配列であって、そのタンパク質は、配列番号１の位置１２２または配列番号４の位置１０７または配列番号５の位置１０４に対応する位置にトレオニンを有するヌクレオチド配列、
ｆ）配列番号５に示すヌクレオチド配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を有するヌクレオチド配列であって、そのタンパク質は、配列番号１の位置１２２または配列番号４の位置１０７または配列番号５の位置１０４に対応する位置にトレオニンを有するヌクレオチド配列、
ｇ）ａ）〜ｆ）に示すヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列、および
ｈ）ａ）〜ｇ）に示すヌクレオチド配列からなる群から選択される少なくとも１つのヌクレオチド配列に完全に相補的なヌクレオチド配列。
【請求項１８】
コードされたＡＨＡＳＬタンパク質が、
ａ）配列番号１の位置６５３または配列番号２の位置６３８または配列番号３の位置６３５に対応する位置のアスパラギン、
ｂ）配列番号１の位置１２２または配列番号４の位置１０７または配列番号５の位置１０４に対応する位置のトレオニン、および
ｃ）配列番号１の位置５７４または配列番号６の位置５５７に対応する位置のロイシン
からなる群から選択される少なくとも１つの突然変異をさらに含む、請求項１７に記載の単離ポリヌクレオチド分子。
【請求項１９】
請求項１７または１８に記載のポリヌクレオチド分子に作動可能に連結されたプロモーターを含む発現ベクター。
【請求項２０】
請求項１９に記載の発現ベクターを用いて形質転換された形質転換植物。
【請求項２１】
イミダゾリノン、スルホニルウレア、トリアゾロピリミジン、およびピリミジニルオキシベンゾエートからなる群から選択される除草剤に対する抵抗性が増加している、請求項２０に記載の植物。
【請求項２２】
セイヨウカラシナ、セイヨウアブラナ、カブ、アビシニアガラシ、キャベツ、およびクロガラシからなる群から選択される、請求項２１に記載の植物。
【請求項２３】
トランスジェニック植物を生産するための方法であって、
ａ）請求項１９に記載の発現ベクターを用いて植物細胞を形質転換するステップ、および
ｂ）植物細胞から、ＡＨＡＳＬポリペプチドを発現するトランスジェニック植物を産生するステップ
を含む方法。
【請求項２４】
以下のステップを含む、形質転換された植物細胞、植物組織、植物、またはその一部分を同定するまたは選択するための方法：
ａ）形質転換された植物細胞、植物組織、植物、またはその一部分を提供するステップであって、形質転換された植物細胞、植物組織、植物、またはその一部分は、請求項１７または１８に記載のポリヌクレオチドを含み、ポリヌクレオチドは、選択マーカーとして使用されるＡＨＡＳＬ突然変異ポリペプチドをコードし、形質転換された植物細胞、植物組織、植物、またはその一部分は、さらなる単離ポリヌクレオチドを含んでもよいステップ、
ｂ）形質転換された植物細胞、植物組織、植物、またはその一部分を、少なくとも１つのＡＨＡＳ阻害剤またはＡＨＡＳ阻害性化合物と接触させるステップ、
ｃ）植物細胞、植物組織、植物、またはその一部分が、阻害剤または阻害性化合物によって影響を受けるかどうかを決定するステップ、および
ｄ）形質転換された植物細胞、植物組織、植物、またはその一部分を同定するかまたは選択するステップ。
【請求項２５】
除草剤抵抗性の植物を生産するための方法であって、除草剤に抵抗性である第１の植物を除草剤に抵抗性ではない第２の植物と交雑させるステップを含み、第１の植物は、請求項１〜７、９〜１０、および２０〜２２までのいずれか一項に記載の植物である方法。
【請求項２６】
除草剤に抵抗性の後代植物を選択するステップをさらに含む、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
請求項２５または２６に記載の方法によって生産される除草剤抵抗性の植物。
【請求項２８】
第１の植物の除草剤抵抗性の特徴を含む、請求項２７に記載の植物の種子。
【請求項２９】
植物の除草剤抵抗性を増加させるための方法であって、第１の植物を第２の植物と交雑させるステップを含み、第１の植物は、請求項１〜７まで、９〜１０まで、２０〜２２まで、および２７のいずれか一項に記載の植物である方法。
【請求項３０】
第２の植物の除草剤抵抗性と比較した場合に、増加した除草剤抵抗性を含む後代植物を選択するステップをさらに含む、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
請求項２９または３０に記載の方法によって生産される植物。
【請求項３２】
増加した除草剤抵抗性を含む、請求項３１に記載の植物の種子。
【請求項３３】
請求項１〜７まで、９〜１０まで、２０〜２２まで、２７、および３１に記載の植物のいずれか１つのアブラナ属植物の近くの雑草をコントロールするための方法であって、雑草およびアブラナ属植物に、有効量のイミダゾリノン除草剤、スルホニルウレア除草剤、トリアゾロピリミジン除草剤、ピリミジニルオキシベンゾエート除草剤、またはその混合物を適用するステップを含む方法。
【請求項３４】
ＡゲノムおよびＢゲノム、ならびにＡゲノム上の第１の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬポリペプチドをコードする第１のポリヌクレオチドおよびＢゲノム上の第２の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬポリペプチドをコードする第２のポリヌクレオチドを含む植物を生産することができるセイヨウカラシナ植物の種子であって、第２のポリヌクレオチドは、ｂＲ突然変異をコードし、第１および第２の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬポリペプチドは、ＡＨＡＳ阻害性除草剤に対する相乗的なレベルの抵抗性を提供する種子。
【請求項３５】
植物が、第１のポリヌクレオチドを含有する植物および第２のポリヌクレオチドを含有する植物の抵抗性の相加的なレベルと比較して、少なくとも約１０％高い抵抗性を有する、請求項３４に記載の種子。
【請求項３６】
植物が、第１のポリヌクレオチドを含有する植物および第２のポリヌクレオチドを含有する植物の抵抗性の相加的なレベルと比較して、少なくとも約２０％高い抵抗性を有する、請求項３５に記載の種子。
【請求項３７】
植物が、第１のポリヌクレオチドを含有する植物および第２のポリヌクレオチドを含有する植物の抵抗性の相加的なレベルと比較して、少なくとも約３０％高い抵抗性を有する、請求項３６に記載の種子。
【請求項３８】
植物が、以下のとおりである請求項３４に記載の種子。
ａ）Ｊ０５Ｚ−０７８０１と命名された植物系であるか、
ｂ）Ｊ０５Ｚ−０７８０１と命名された植物系の後代であるか、
ｃ）ａ）〜ｂ）の植物のうち１つの突然変異体、組み換え体、もしくは遺伝子操作された誘導体であるか、または
ｄ）ａ）〜ｃ）の植物の少なくとも１つの後代である植物である。
【請求項３９】
以下のステップを含むセイヨウカラシナ種子を生産するための方法：
第１のセイヨウカラシナ系を第２のセイヨウカラシナ系と交雑するステップであって、第１のアブラナ属植物系は、第１の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬポリペプチドをコードする第１のアセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニット（ＡＨＡＳＬ）ポリヌクレオチドの少なくとも１つのコピーをそのゲノム中に含み、第１のＡＨＡＳＬポリペプチドが、
ａ）配列番号１の位置６５３または配列番号２の位置６３８または配列番号３の位置６３５に対応する位置にアスパラギンを有するポリペプチド、
ｂ）配列番号１の位置１２２または配列番号４の位置１０７または配列番号５の位置１０４に対応する位置にトレオニンを有するポリペプチド、および
ｃ）配列番号１の位置５７４または配列番号６の位置５５７に対応する位置にロイシンを有するポリペプチド
からなる群から選択されるステップ、および
種子を得るステップ。
【請求項４０】
第２のアブラナ属植物系が、第２の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬポリペプチドをコードする第２のアセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニット（ＡＨＡＳＬ）ポリヌクレオチドの少なくとも１つのコピーをそのゲノム中に含み、第２のＡＨＡＳＬポリペプチドが、
ａ）配列番号１の位置６５３または配列番号２の位置６３８または配列番号３の位置６３５に対応する位置にアスパラギンを有するポリペプチド、
ｂ）配列番号１の位置１２２または配列番号４の位置１０７または配列番号５の位置１０４に対応する位置にトレオニンを有するポリペプチド、および
ｃ）配列番号１の位置５７４または配列番号６の位置５５７に対応する位置にロイシンを有するポリペプチド
からなる群から選択される、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
第１および第２のＡＨＡＳＬポリヌクレオチドが、異なるゲノム上に位置する、請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】
第１のセイヨウカラシナ系が以下のとおりである、  請求項３９に記載の方法：
ａ）Ｊ０５Ｚ−０７８０１と命名された植物系であるか、
ｂ）Ｊ０５Ｚ−０７８０１と命名された植物系の後代であるか、
ｃ）ａ）〜ｂ）の植物のうち１つの突然変異体、組み換え体、もしくは遺伝子操作された誘導体であるか、または
ｄ）ａ）〜ｃ）の植物の少なくとも１つの後代である植物である。
【請求項４３】
種子のサンプルが、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−８３０５の下で寄託されている、Ｊ０５Ｚ−０７８０１と命名されたセイヨウカラシナ植物系の種子。
【請求項４４】
請求項４３に記載の種子から成長させた植物。
【請求項４５】
請求項４４に記載の植物からの植物の一部分。
【請求項４６】
花粉、プロトプラスト、胚珠、および細胞からなる群から選択される、請求項４５に記載の植物の一部分。
【請求項４７】
以下のステップを含む、セイヨウカラシナ植物を育種するための方法：
第１の系を、第２のセイヨウカラシナ系と交雑させるステップであって、第１のセイヨウカラシナ系は、突然変異系Ｊ０５Ｚ−０７８０１の種子を成長させることから得られたセイヨウカラシナ植物であり、種子のサンプルは、ＡＴＣＣ委託番号ＰＴＡ−８３０５の下で寄託されているステップ、および
種子を得るステップ。
【請求項４８】
種子が、ＡＨＡＳ除草剤抵抗性について評価される、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
少なくとも１つのＡＨＡＳ除草剤に対する抵抗性を示す種子を選択するステップをさらに含む、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
シロイヌナズナＡＨＡＳＬ１ポリペプチドのアミノ酸位置１２２に対応する、Ａゲノム上のＡＨＡＳＬポリペプチドの位置にトレオニンを有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む非天然セイヨウカラシナ植物。
【請求項５１】
以下のとおりである、請求項５０に記載の非天然セイヨウカラシナ植物： 
ａ）Ｊ０４Ｅ−０１２２と命名された植物系であるか、
ｂ）Ｊ０４Ｅ−０１２２と命名された植物系の後代であるか、
ｃ）ａ）〜ｂ）の植物のうち１つの突然変異体、組み換え体、もしくは遺伝子操作された誘導体であるか、または
ｄ）ａ）〜ｃ）の植物の少なくとも１つの後代である植物である。
【請求項５２】
シロイヌナズナＡＨＡＳＬ１ポリペプチドのアミノ酸位置１２２に対応する、Ｂゲノム上のＡＨＡＳＬポリペプチドの位置にトレオニンを有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む非天然セイヨウカラシナ植物。
【請求項５３】
以下のとおりである、請求項５２に記載の非天然セイヨウカラシナ植物：
ａ）Ｊ０４Ｅ−０１３０と命名された植物系である、
ｂ）Ｊ０４Ｅ−０１３０と命名された植物系の後代であるか、
ｃ）ａ）〜ｂ）の植物のうち１つの突然変異体、組み換え体、もしくは遺伝子操作された誘導体であるか、または
ｄ）ａ）〜ｃ）の植物の少なくとも１つの後代である植物である。
【請求項５４】
シロイヌナズナＡＨＡＳＬ１ポリペプチドのアミノ酸位置６５３に対応する、Ａゲノム上のＡＨＡＳＬポリペプチドの位置にアスパラギンを有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む非天然セイヨウカラシナ植物。
【請求項５５】
以下のとおりである、請求項５４に記載の非天然セイヨウカラシナ植物：
ａ）Ｊ０４Ｅ−０１３９と命名された植物系であるか、
ｂ）Ｊ０４Ｅ−０１３９と命名された植物系の後代であるか、
ｃ）ａ）〜ｂ）の植物のうち１つの突然変異体、組み換え体、もしくは遺伝子操作された誘導体であるか、または
ｄ）ａ）〜ｃ）の植物の少なくとも１つの後代である植物である。
【請求項５６】
ＡゲノムおよびＢゲノム、ならびにＡゲノム上の第１の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬポリペプチドをコードする第１のポリヌクレオチドおよびＢゲノム上の第２の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬポリペプチドをコードする第２のポリヌクレオチドを含む植物を生産することができるセイヨウカラシナ植物の種子であって、第１のポリヌクレオチドは、ａＲ突然変異をコードし、第１および第２の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬポリペプチドは、ＡＨＡＳ阻害性除草剤に対する相乗的なレベルの抵抗性を提供する種子。
【請求項５７】
第２の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬポリペプチドが、シロイヌナズナＡＨＡＳＬ１ポリペプチドのアミノ酸位置１２２に対応する、Ｂゲノム上のＡＨＡＳＬポリペプチドの位置にトレオニンを有する、請求項５６に記載の種子。
【請求項５８】
植物が、第１のポリヌクレオチドを含有する植物および第２のポリヌクレオチドを含有する植物の抵抗性の相加的なレベルと比較して、少なくとも約１０％高い抵抗性を有する、請求項５６に記載の種子。
【請求項５９】
植物が、第１のポリヌクレオチドを含有する植物および第２のポリヌクレオチドを含有する植物の抵抗性の相加的なレベルと比較して、少なくとも約２０％高い抵抗性を有する、請求項５８に記載の種子。
【請求項６０】
植物が、第１のポリヌクレオチドを含有する植物および第２のポリヌクレオチドを含有する植物の抵抗性の相加的なレベルと比較して、少なくとも約３０％高い抵抗性を有する、請求項５９に記載の種子。
【請求項６１】
請求項４３、５０、５２、５４、または５６に記載の植物のいずれか１つのセイヨウカラシナ植物の近くの雑草をコントロールするための方法であって、雑草およびセイヨウカラシナ植物に、有効量のイミダゾリノン除草剤、スルホニルウレア除草剤、トリアゾロピリミジン除草剤、ピリミジニルオキシベンゾエート除草剤、またはその混合物を適用するステップを含む方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願に対する相互参照
本出願は、２００７年４月４日に出願された米国仮出願第６０／９１０，００８号の利益を主張し、その全体は、本明細書に参照によって組み込まれる。
【０００２】
本発明は、除草剤抵抗性のアブラナ属植物ならびに野生型およびイミダゾリノン抵抗性アブラナ属アセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニットタンパク質をコードする新規なポリヌクレオチド配列、種子、ならびにそのような植物を使用する方法に関する。
【０００３】
本発明の背景
アセトヒドロキシ酸シンターゼ（ＡＨＡＳ；ＥＣ  ４．１．３．１８、アセトラクテートシンターゼまたはＡＬＳとしても知られている）は、分枝鎖アミノ酸バリン、ロイシン、およびイソロイシンの生化学的合成を触媒する第１の酵素である（Ｓｉｎｇｈ（１９９９年）Ｐｌａｎｔ  Ａｍｉｎｏ  Ａｃｉｄ中の「バリン、ロイシン、およびイソロイシンの生合成（Ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  ｏｆ  ｖａｌｉｎｅ，ｌｅｕｃｉｎｅ  ａｎｄ  ｉｓｏｌｅｕｃｉｎｅ）」、Ｓｉｎｇｈ，Ｂ．Ｋ．編、Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ  Ｉｎｃ．Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、２２７〜２４７ページ）。ＡＨＡＳは、スルホニルウレア（Ｔａｎら（２００５年）Ｐｅｓｔ  Ｍａｎａｇ．Ｓｃｉ．６１：２４６〜５７ページ；Ｍａｌｌｏｒｙ−ＳｍｉｔｈおよびＲｅｔｚｉｎｇｅｒ（２００３年）Ｗｅｅｄ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  １７：６２０〜６２６ページ；’ＬａＲｏｓｓａおよびＦａｌｃｏ（１９８４年）Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２：１５８〜１６１ページ）、イミダゾリノン（Ｓｈａｎｅｒら（１９８４年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．７６：５４５〜５４６ページ）、トリアゾロピリミジン（ＳｕｂｒａｍａｎｉａｎおよびＧｅｒｗｉｃｋ（１９８９年）Ｂｉｏｃａｔａｌｙｓｉｓ  ｉｎ  Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ中の「トリアゾロピリミジンによるアセトラクテートシンターゼの阻害（Ｉｎｈｉｂｉｔｉｏｎ  ｏｆ  ａｃｅｔｏｌａｃｔａｔｅ  ｓｙｎｔｈａｓｅ  ｂｙ  ｔｒｉａｚｏｌｏｐｙｒｉｍｉｄｉｎｅｓ）」、Ｗｈｉｔａｋｅｒ，Ｊ．Ｒ．およびＳｏｎｎｅｔ，Ｐ．Ｅ．編、ＡＣＳ  Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ  Ｓｅｒｉｅｓ、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｓｏｃｉｅｔｙ、Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｄ．Ｃ．、２７７〜２８８ページ）、Ｔａｎら（２００５年）Ｐｅｓｔ  Ｍａｎａｇ．Ｓｃｉ．６１：２４６〜５７ページ；Ｍａｌｌｏｒｙ−ＳｍｉｔｈおよびＲｅｔｚｉｎｇｅｒ（２００３年）Ｗｅｅｄ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  １７：６２０〜６２６ページ、スルホニルアミノ−カルボニルトリアゾリノン（Ｔａｎら（２００５年）Ｐｅｓｔ  Ｍａｎａｇ．Ｓｃｉ．６１：２４６〜５７ページ；Ｍａｌｌｏｒｙ−ＳｍｉｔｈおよびＲｅｔｚｉｎｇｅｒ（２００３年）Ｗｅｅｄ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  １７：６２０〜６２６ページ）を含む、５つの構造的に多様な除草剤ファミリーの作用部位である。イミダゾリノン除草剤およびスルホニルウレア除草剤は、非常に低い適用量でのそれらの有効性および動物での相対的な非毒性の理由から、現代の農業で広く使用されている。ＡＨＡＳ活性を阻害することによって、除草剤のこれらのファミリーは、多くの雑草種を含む感受性の植物がさらに生育することおよび伸長することを阻害する。市販で入手可能なイミダゾリノン除草剤のいくつかの例は、ＰＵＲＳＵＩＴ（登録商標）（イマゼタピル（Ｉｍａｚｅｔｈａｐｙｒ））、ＳＣＥＰＴＥＲ（登録商標）（イマザキン（ｉｍａｚａｑｕｉｎ））、およびＡＲＳＥＮＡＬ（登録商標）（イマザピル）である。スルホニルウレア除草剤の例は、クロルスルフロン、メトスルフロンメチル、スルホメツロンメチル、クロリムロンエチル、チフェンスルフロンメチル、トリベヌロン���チル、ベンスルフロンメチル、ニコスルフロン、エタメツルフロンメチル、リムスルフロン、トリフルスルフロンメチル、トリアスルフロン、プリミスルフロンメチル、シノスルフロン、アミドスルフロン、フラザスルフロン、イマゾスルフロン、ピラゾスルフロンエチル、およびハロスルフロンである。
【０００４】
それらの高度な有効性および低毒性の理由から、イミダゾリノン除草剤は、広いエリアの植生の上部に対して噴霧することによる適用にとって好ましい。広範囲の植生の上部に対して除草剤を噴霧することができると、農場の造成および維持に関連する費用は減少し、そのような化学物質の使用に先立った地ごしらえの必要性は減少する。望ましい耐性種の上部に対して噴霧することにより、競合種の不在の理由から、望ましい種の最大の生産力を達成することもできる。しかしながら、そのような噴霧技術を使用することができるかは、噴霧エリア中の望ましい植生のイミダゾリノン抵抗性種の存在に依存する。
【０００５】
主な農業作物の中で、ダイズなどのようないくつかのマメ科の種は、それらが除草剤化合物を速やかに代謝することができる理由から、イミダゾリノン除草剤に本来抵抗性である（ＳｈａｎｅｒおよびＲｏｂｉｎｓｏｎ（１９８５年）Ｗｅｅｄ  Ｓｃｉ．３３：４６９〜４７１ページ）。トウモロコシなどのような他の作物（Ｎｅｗｈｏｕｓｅら（１９９２年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．１００：８８２８８６）およびイネ（Ｂａｒｒｅｔｔら（１９８９年）Ｃｒｏｐ  Ｓａｆｅｎｅｒｓ  ｆｏｒ  Ｈｅｒｂｉｃｉｄｅｓ、Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、１９５〜２２０ページ）は、イミダゾリノン除草剤にやや感受性である。イミダゾリノン除草剤に対する異なる感受性は、特定の除草剤の化学的性質およびそれぞれの植物での毒性形態から非毒性形態への化合物の異なる代謝に依存する（Ｓｈａｎｅｒら（１９８４年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．７６：５４５〜５４６ページ；Ｂｒｏｗｎら、（１９８７年）Ｐｅｓｔｉｃ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｐｈｙｓｉｏｌ．２７：２４〜２９ページ）。吸収および転流などのような他の、植物の生理学的な差異もまた、感受性で重要な役割を果たす（ＳｈａｎｅｒおよびＲｏｂｉｎｓｏｎ（１９８５年）Ｗｅｅｄ  Ｓｃｉ．３３：４６９〜４７１ページ）。
【０００６】
イミダゾリノン、スルホニルウレア、およびトリアゾロピリミジンに抵抗性の植物は、トウモロコシ（Ｚｅａ  ｍａｙｓ）、シロイヌナズナ、セイヨウアブラナ（つまりキャノーラ）ダイズ（Ｇｌｙｃｉｎｅ  ｍａｘ）、タバコ（Ｎｉｃｏｔｉａｎａ  ｔａｂａｃｕｍ）、およびイネ（Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ）で、種子、小胞子、花粉、およびカルスの突然変異誘発を使用して上手く生産されてきた（Ｓｅｂａｓｔｉａｎら（１９８９年）Ｃｒｏｐ  Ｓｃｉ．２９：１４０３〜１４０８ページ；Ｓｗａｎｓｏｎら、１９８９年  Ｔｈｅｏｒ．Ａｐｐｌ．Ｇｅｎｅｔ．７８：５２５〜５３０ページ；Ｎｅｗｈｏｕｓｅら（１９９１年）Ｔｈｅｏｒ．Ａｐｐｌ．Ｇｅｎｅｔ．８３：６５〜７０ページ；Ｓａｔｈａｓｉｖａｎら（１９９１年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．９７：１０４４〜１０５０ページ；Ｍｏｕｒａｎｄら（１９９３年）Ｊ．Ｈｅｒｅｄｉｔｙ  ８４：９１〜９６ページ；米国特許第５，５４５，８２２号）。すべての場合において、単一の不完全優性核内遺伝子は抵抗性を付与した。４つのイミダゾリノン抵抗性コムギ植物もまた、以前に、コムギ（Ｔｒｉｔｉｃｕｍ  ａｅｓｔｉｖｕｍ  Ｌ．）栽培品種Ｆｉｄｅｌの種子突然変異誘発の後に単離された（Ｎｅｗｈｏｕｓｅら（１９９２年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．１００：８８２〜８８６ページ）。遺伝研究により、単一の不完全優性遺伝子が抵抗性を付与することを確証した。対立遺伝子研究に基づいて、著者らは、４つの同定された系の突然変異が同じ座に位置すると結論づけた。Ｆｉｄｅｌ栽培品種抵抗性遺伝子のうち１つはＦＳ−４と命名された（Ｎｅｗｈｏｕｓｅら（１９９２年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．１００：８８２〜８８６ページ）。
【０００７】
ＡＨＡＳ阻害剤複合体の三次元コンホメーションのコンピューターベースのモデリングは、誘発突然変異がイミダゾリノンに対する選択的な抵抗性をおそらく付与すると思われる部位として提唱される阻害剤結合ポケット中のいくつかのアミノ酸を予測する（Ｏｔｔら（１９９６年）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２６３：３５９〜３６８ページ）。ＡＨＡＳ酵素の提唱される結合部位にこれらの合理的に設計された突然変異のうちいくつかを用いて生産されたコムギ植物は、単一のクラスの除草剤に対して特異的な抵抗性を実際に示した（Ｏｔｔら（１９９６年）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２６３：３５９〜３６８ページ）。
【０００８】
イミダゾリノン除草剤に抵抗性の植物もまた多くの特許で報告されている。米国特許第４，７６１，３７３号、第５，３３１，１０７号、第５，３０４，７３２号、第６，２１１，４３８号、第６，２１１，４３９号、および第６，２２２，１００号は、全体として、植物中で除草剤抵抗性を誘発するように改変されたＡＨＡＳ遺伝子の使用を記載し、具体的には、ある種のイミダゾリノン抵抗性のトウモロコシ系を開示する。米国特許第５，０１３，６５９号は、１つまたは複数の保存領域中の少なくとも１つのアミノ酸中の突然変異の理由から除草剤抵抗性を示す植物を開示する。そこに記載される突然変異は、イミダゾリノンおよびスルホニルウレアについての交差抵抗性またはスルホニルウレアに特異的な抵抗性のいずれかをコードするが、イミダゾリノンに特異的な抵抗性は記載されていない。米国特許第５，７３１，１８０号および米国特許第５，７６７，３６１号は、イミダゾリノンに特異的な抵抗性をもたらす、野生型単子葉植物ＡＨＡＳアミノ酸配列中に単一アミノ酸置換を有する単離遺伝子について論じている。加えて、ＡＨＡＳを阻害する除草剤に抵抗性のイネ植物は、突然変異育種によって、また葯培養によって生産されたイネ植物のプールからの除草剤抵抗性の植物の選択によっても開発されている。米国特許第５，５４５，８２２号、第５，７３６，６２９号、第５，７７３，７０３号、第５，７７３，７０４号、第５，９５２，５５３号、および第６，２７４，７９６号を参照されたい。
【０００９】
植物では、検査された他のすべての生物と同様に、ＡＨＡＳ酵素は２つのサブユニット：大サブユニット（触媒的な役割）および小サブユニット（調節性の役割）を含む（ＤｕｇｇｌｅｂｙおよびＰａｎｇ（２０００年）Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３３：１〜３６ページ）。ＡＨＡＳ大サブユニット（本明細書でＡＨＡＳＬとも呼ばれる）は、シロイヌナズナ属およびイネの場合と同様に単一遺伝子によってコードされている可能性もあり、またはトウモロコシ、キャノーラ、およびワタと同様に複数の遺伝子ファミリーメンバーによってコードされている可能性もある。大サブユニット中での特異的な単一ヌクレオチド置換は、１つまたは複数のクラスの除草剤に対するある程度の非感受性を酵素に付与する（ＣｈａｎｇおよびＤｕｇｇｌｅｂｙ（１９９８年）Ｂｉｏｃｈｅｍ  Ｊ．３３３：７６５〜７７７ページ）。
【００１０】
たとえば、パン用のコムギであるコムギ（Ｔｒｉｔｉｃｕｍ  ａｅｓｔｉｖｕｍ  Ｌ．）は、３つの相同性のアセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニット遺伝子を含有している。遺伝子のそれぞれは、３つの遺伝子のそれぞれの突然変異体からの、除草剤に対する応答および生化学的データに基づいた著しい発現を示す（Ａｓｃｅｎｚｉら（２００３年）Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｓｏｃｉｅｔｙ  ｏｆ  Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｉｓｔｓ  Ｃｏｎｇｒｅｓｓ、Ｂａｒｃｅｌｏｎａ、Ｓｐａｉｎ、Ｒｅｆ．Ｎｏ．Ｓ１０−１７）。３つの遺伝子すべてのコード配列は、ヌクレオチドレベルで広範囲な相同性を共有する（国際公開第０３／０１４３５７号）。数種類のコムギ（Ｔｒｉｔｉｃｕｍ  ａｅｓｔｉｖｕｍ）からのＡＨＡＳＬ遺伝子の配列決定を通して、多くのＩＭＩ耐性（イミダゾリノン耐性）系の除草剤耐性の分子的基盤は、シロイヌナズナのアミノ酸６５３のセリンと等価な位置でのアスパラギンへのセリンの置換を示す突然変異Ｓｅｒ６５３（Ａｔ）ＡＳＮであることが分かった（国際公開第０３／０１４３５７）。この突然変異は、ＡＨＡＳＬタンパク質をコードするＤＮＡ配列中の一塩基多型（ＳＮＰ）によるものである。
【００１１】
複数のＡＨＡＳＬ遺伝子はまた、双子葉植物種で存在することも知られている。最近では、Ｋｏｌｋｍａｎら（（２００４年）Ｔｈｅｏｒ．Ａｐｐｌ．Ｇｅｎｅｔ．１０９：１１４７〜１１５９ページ）は、ヒマワリ（Ｈｅｌｉａｎｔｈｕｓ  ａｎｎｕｕｓ  Ｌ．）の除草剤抵抗性の遺伝子型および野生型遺伝子型からの３つのＡＨＡＳＬ遺伝子（ＡＨＡＳＬ１、ＡＨＡＳＬ２、およびＡＨＡＳＬ３）の同定、クローニング、および配列決定を報告した。Ｋｏｌｋｍａｎらは、除草剤抵抗性は、ＡＨＡＳＬ１タンパク質中のＰｒｏ１９７Ｌｅｕ（シロイヌナズナ属ＡＨＡＳＬアミノ酸位置の呼称を使用）置換またはＡｌａ２０５Ｖａｌ置換のいずれかによるものであったことならびにこれらの置換のそれぞれは、イミダゾリノン除草剤およびスルホニルウレア除草剤の両方に対して抵抗性を提供したことを報告した。
【００１２】
それらの高度な有効性および低毒性を考慮すると、イミダゾリノン除草剤は農業による使用にとって好ましい。しかしながら、特定の作物生産システムでイミダゾリノン除草剤を使用することができるかは、対象とする作物のイミダゾリノン抵抗性の品種が入手可能かに依存する。農業者が使用するイミダゾリノン除草剤およびスルホニルウレア除草剤のタイプおよび量の適応性をより高くするために、より強い除草剤耐性が望まれることが多い。さらに、除草剤耐性の品種を開発する植物育種家は、より高い除草剤耐性をもたらす突然変異を取り扱って、彼らが品種を開発するために使用する生殖質のバックグラウンドの適応性をより高くする必要がある。そのようなイミダゾリノン抵抗性品種を生産するために、植物育種家は、好ましくはイミダゾリノン抵抗性が増加した、さらなる育種系を開発する必要がある。したがって、作物のさらなるイミダゾリノン抵抗性育種系およびイミダゾリノン抵抗性品種ならびにイミダゾリノン抵抗性育種系およびイミダゾリノン抵抗性品種の生産および使用のための方法および組成物が必要とされる。
【００１３】
発明の概要
本発明は、野生型アブラナ属植物と比較した場合に、除草剤に対する抵抗性が増加したアブラナ属植物を提供する。具体的には、本発明のアブラナ属植物は、野生型アブラナ属植物と比較した場合に、ＡＨＡＳ酵素の活性を阻害する少なくとも１つの除草剤に対する抵抗性が増加している。除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬポリペプチドをコードするアセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニット（ＡＨＡＳＬ）ポリヌクレオチドの少なくとも１つのコピーをそのゲノム中に含むアブラナ属植物であって、ＡＨＡＳＬポリペプチドは、ａ）配列番号１の位置６５３または配列番号２の位置６３８または配列番号３の位置６３５に対応する位置にアスパラギンを有するポリペプチド、ｂ）配列番号１の位置１２２または配列番号４の位置１０７または配列番号５の位置１０４に対応する位置にトレオニンを有するポリペプチド、およびｃ）配列番号１の位置５７４または配列番号６の位置５５７に対応する位置にロイシンを有するポリペプチドからなる群から選択される。本発明はまた、セイヨウカラシナ植物中の異なるゲノム上のＡＨＡＳ突然変異を組み合わせた場合に達なされる増強された除草剤耐性も提供する。一例では、ｂＲ（ＡＨＡＳ１）突然変異（セイヨウカラシナのＢゲノム上）を、遺伝子移入ＰＭ２（ＡＨＡＳ３）突然変異（セイヨウカラシナに遺伝子移入されたセイヨウアブラナのＡゲノム上）と組み合わせた植物である。結果として生じる除草剤耐性は、著しく増強され、ＰＭ２とＰＭ１を組み合わせた現行の市販製品で観察されるものに対して驚くべき相乗効果を有する。他の例では、ＰＭ１突然変異およびＰＭ２突然変異を組み合わせた植物と比較して、相乗的なレベルの除草剤耐性をも提供する、ａＲ（ＡＨＡＳ１）突然変異（セイヨウカラシナのＡゲノム上）をＡ１０７Ｔ突然変異（セイヨウカラシナのＢゲノム上）と組み合わせたセイヨウカラシナ植物が提供される。
【００１４】
一態様では、本発明は、Ｊ０５Ｚ−０７８０１と命名されたアブラナ属系由来である除草剤抵抗性の二重突然変異体アブラナ属植物を提供する。他の態様では、本発明は、Ｊ０４Ｅ−０１３９と命名されたアブラナ属系由来である除草剤抵抗性のアブラナ属植物を提供する。他の態様では、本発明は、Ｊ０４Ｅ−０１３０と命名されたアブラナ属系由来である除草剤抵抗性のアブラナ属植物を提供する。他の態様では、本発明は、Ｊ０４Ｅ−０１２２と命名されたアブラナ属系由来である除草剤抵抗性のアブラナ属植物を提供する。
【００１５】
本発明の除草剤抵抗性のアブラナ属植物は、本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質をコードする遺伝子またはポリヌクレオチドの１つ、２つ、３つ、４つ、またはそれ以上のコピーを含有することができる。本発明の除草剤抵抗性のアブラナ属植物は、単一、二重、またはそれ以上の突然変異を含有する除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質をコードする遺伝子またはポリヌクレオチドを含有してもよい。本発明のアブラナ属植物はまた、本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質をコードする遺伝子またはポリヌクレオチドの少なくとも１つのコピーを含む種子および後代植物をも含む。単一、二重、もしくはそれ以上の突然変異を含有するＡＨＡＳＬポリペプチドをコードする１つのポリヌクレオチドまたはＡＨＡＳＬ単一突然変異ポリペプチド植物をコードする２つ以上のポリヌクレオチドを含む種子またはそれから生じる後代植物は、単一植物中のＡＨＡＳＬ単一突然変異ポリペプチドから予測されるものよりも、ＡＨＡＳ阻害性除草剤、たとえばイミダゾリノン除草剤またはスルホニルウレア除草剤に対する、予想外により高度なレベルの耐性を示す。その植物およびその後代は、除草剤耐性の相加効果ではなく相乗効果を示し、それによって、複数の突然変異を含むその植物およびその後代の除草剤耐性のレベルは、ＡＨＡＳＬ単一突然変異タンパク質を含む植物の除草剤耐性よりも高い。
【００１６】
本発明は、本発明の非トランスジェニック除草剤抵抗性の植物およびトランスジェニック除草剤抵抗性の植物の近くの雑草をコントロールするための方法を提供する。そのような植物は、たとえば、上記に記載される除草剤抵抗性のアブラナ属植物および本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質をコードするポリヌクレオチド分子を用いて形質転換された植物を含む。形質転換植物は、それらのゲノム中に、植物細胞中で遺伝子発現を駆動するプロモーターを含む少なくとも１つの発現カセットを含み、プロモーターは、本発明のＡＨＡＳＬポリヌクレオチドに作動可能に連結される。方法は、雑草および除草剤抵抗性の植物に有効量の除草剤を適用するステップを含み、除草剤抵抗性の植物、植物は、野生型植物または非形質転換植物と比較した場合に、少なくとも１つの除草剤、具体的にはイミダゾリノン除草剤またはスルホニルウレア除草剤に対する抵抗性が増加している。本発明は、植物のＡＨＡＳ活性を増加させ、除草剤抵抗性の植物を生産し、除草剤耐性の植物の除草剤耐性を増強するための方法を提供する。本発明のいくつかの態様では、方法は、植物細胞中で発現を駆動するプロモーターに作動可能に連結されたヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド構築物を用いて植物細胞を形質転換するステップと、形質転換植物細胞から形質転換植物を再生するステップとを含む。ヌクレオチド配列は、本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質をコードするそれらのヌクレオチド配列から選択される。他の態様では、方法は、他の植物と本発明の除草剤抵抗性の植物の他家受粉を含む従来の植物育種を含み、本発明の除草剤抵抗性の植物である親植物の除草剤抵抗性の特徴を含む後代植物を選択するステップをさらに含んでもよい。
【００１７】
本発明は、アブラナ属ＡＨＡＳＬタンパク質の単離ポリヌクレオチド分子および単離ポリペプチドをさらに提供する。本発明のポリヌクレオチド分子は、本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む。本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質は、ａ）配列番号１３に示すヌクレオチド配列、ｂ）配列番号１４に示すヌクレオチド配列、ｃ）配列番号１５に示すヌクレオチド配列、ｄ）配列番号１３に示すヌクレオチド配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を有するヌクレオチド配列であって、そのタンパク質は、配列番号１の位置６５３または配列番号２の位置６３８または配列番号３の位置６３５に対応する位置にアスパラギンを有するヌクレオチド配列、ｅ）配列番号１４に示すヌクレオチド配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を有するヌクレオチド配列であって、そのタンパク質は、配列番号１の位置１２２または配列番号４の位置１０７または配列番号５の位置１０４に対応する位置にトレオニンを有するヌクレオチド配列、ｆ）配列番号１５に示すヌクレオチド配列に対して少なくとも９０％の配列同一性を有するヌクレオチド配列であって、そのタンパク質は、配列番号１の位置１２２または配列番号４の位置１０７または配列番号５の位置１０４に対応する位置にトレオニンを有するヌクレオチド配列、からなる群から選択されるヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドを含む。前述のＡＨＡＳＬタンパク質は、ａ）配列番号１の位置６５３または配列番号２の位置６３８または配列番号３の位置６３５に対応する位置のアスパラギン、ｂ）配列番号１の位置１２２または配列番号４の位置１０７または配列番号５の位置１０４に対応する位置のトレオニン、およびｃ）配列番号１の位置５７４または配列番号６の位置５５７に対応する位置のロイシンからなる群から選択される少なくとも１つの突然変異をさらに含む。
【００１８】
本発明の１つまたは複数のポリヌクレオチド分子を含む発現カセット、形質転換ベクター、形質転換非ヒト宿主細胞、および形質転換植物、植物の一部分、ならびに種子もまた提供される。
【図面の簡単な説明】
【００１９】
【図１】シロイヌナズナからの野生型ＡＨＡＳＬ遺伝子（ＡｔＡＨＡＳＬ、配列番号１１）、Ｊ０４Ｅ−００４４系からのセイヨウカラシナの除草剤抵抗性のＢｊＡＨＡＳＬ１Ｂ−Ｓ６５３Ｎ遺伝子（Ｊ０４Ｅ−００４４、配列番号１２）、Ｊ０４Ｅ−０１３９系からのセイヨウカラシナの除草剤抵抗性のＢｊＡＨＡＳＬ１Ａ−Ｓ６５３Ｎ遺伝子（Ｊ０４Ｅ−０１３９、配列番号１３）、Ｊ０４Ｅ−０１３０系からのセイヨウカラシナの除草剤抵抗性のＢｊＡＨＡＳＬ１Ｂ−Ａ１２２Ｔ遺伝子（Ｊ０４Ｅ−０１３０、配列番号１４）、Ｊ０４Ｅ−０１２２系からのセイヨウカラシナの除草剤抵抗性のＢｊＡＨＡＳＬ１Ａ−Ａ１２２Ｔ遺伝子（ＢｊＡＨＡＳＬ１Ａ、配列番号１５）、ＰＭ２系からのセイヨウアブラナの除草剤抵抗性のＢｎＡＨＡＳＬ１Ａ−Ｗ５７４Ｌ遺伝子（ＢｎＡＨＡＳＬ１Ａ、配列番号１６）、セイヨウカラシナの野生型ＢｊＡＨＡＳＬ１Ａ遺伝子（ＢｊＡＨＡＳＬ１Ａ、配列番号１７）、セイヨウカラシナの野生型ＢｊＡＨＡＳＬ１Ｂ遺伝子（ＢｊＡＨＡＳＬ１Ｂ、配列番号１８）、セイヨウアブラナの野生型ＢｎＡＨＡＳＬ１Ａ遺伝子（ＢｎＡＨＡＳＬ１Ａ、配列番号１９）、セイヨウアブラナの野生型ＢｎＡＨＡＳＬ１Ｃ遺伝子（ＢｎＡＨＡＳＬ１Ｃ、配列番号２０）のコード領域のヌクレオチド配列のアラインメントを示す図である。分析は、Ｆａｓｔ  Ａｌｇｏｒｉｔｈｍを使用して、Ｖｅｃｔｏｒ  ＮＴＩソフトウェアスイートで行なった。（ギャップ開始１５、ギャップ伸長６．６６、およびギャップ分離８、マトリックスはｓｗｇａｐｄｎａｍｔとする）。
【図２】シロイヌナズナからの野生型ＡＨＡＳＬ遺伝子（ＡｔＡＨＡＳＬ、配列番号１）、Ｊ０４Ｅ−００４４系からのセイヨウカラシナの除草剤抵抗性のＢｊＡＨＡＳＬ１Ｂ−Ｓ６５３Ｎ遺伝子（Ｊ０４Ｅ−００４４、配列番号２）、Ｊ０４Ｅ−０１３９系からのセイヨウカラシナの除草剤抵抗性のＢｊＡＨＡＳＬ１Ａ−Ｓ６５３Ｎ遺伝子（Ｊ０４Ｅ−０１３９、配列番号３）、Ｊ０４Ｅ−０１３０系からのセイヨウカラシナの除草剤抵抗性のＢｊＡＨＡＳＬ１Ｂ−Ａ１２２Ｔ遺伝子（Ｊ０４Ｅ−０１３０、配列番号４）、Ｊ０４Ｅ−０１２２系からのセイヨウカラシナの除草剤抵抗性のＢｊＡＨＡＳＬ１Ａ−Ａ１２２Ｔ遺伝子（Ｊ０４Ｅ−０１２２、配列番号５）、ＰＭ２系からのセイヨウアブラナの除草剤抵抗性のＢｎＡＨＡＳＬ１Ａ−Ｗ５７４Ｌ遺伝子（ＢｎＡＨＡＳＬ１Ａ、配列番号６）、セイヨウカラシナの野生型ＢｊＡＨＡＳＬ１Ａ遺伝子（ＢｊＡＨＡＳＬ１Ａ、配列番号７）、セイヨウカラシナの野生型ＢｊＡＨＡＳＬ１Ｂ遺伝子（ＢｊＡＨＡＳＬ１Ｂ、配列番号８）、セイヨウアブラナの野生型ＢｎＡＨＡＳＬ１Ａ遺伝子（ＢｎＡＨＡＳＬ１Ａ、配列番号９）、セイヨウアブラナの野生型ＢｎＡＨＡＳＬ１Ｃ遺伝子（ＢｎＡＨＡＳＬ１Ｃ、配列番号１０）のアミノ酸配列のアラインメントを示す図である。分析は、Ｖｅｃｔｏｒ  ＮＴＩソフトウェアスイートで行なった（ギャップ開始ペナルティー＝１０、ギャップ伸長ペナルティー＝０．０５、ギャップ分離ペナルティー＝８、ｂｌｏｓｕｍ  ６２ＭＴ２マトリックス）。
【図３】セイヨウカラシナ植物系のＡＨＡＳ酵素活性アッセイ結果を示す棒グラフである。
【図４】セイヨウカラシナ植物系の温室噴霧アッセイ結果を示す図である。
【図５】対応するＤＮＡ配列またはタンパク質配列に対する配列番号を示す表である。
【図６】１００μＭのＩｍａｚａｍｏｘでの、互いにおよびセイヨウカラシナの遺伝子移入ＰＭ２突然変異と積み重ねられたａＲ、ｂＲ、Ａ１０７Ｔ、およびＡ１０４Ｔセイヨウカラシナ突然変異の組み合わせを含有するホモ接合性セイヨウカラシナ系から単離されたタンパク質抽出物中のＡＨＡＳ酵素活性を提供する図である。
【図７】３５ｇ  ａｉ／ｈａのＩｍａｚａｍｏｘを用いた温室中での噴霧２週間後の、ａＲおよびＡ１０７Ｔ  ＡＨＡＳ突然変異の異なる接合性および組み合わせを含有するセイヨウカラシナＦ２系に対する植物傷害（薬害）の平均を提供する図である。
【図８】３５ｇ  ａｉ／ｈａの等価なＩｍａｚａｍｏｘ（Ｒａｐｔｏｒ（登録商標））を用いて噴霧した２週間後の、互いにおよびセイヨウカラシナの遺伝子移入ＰＭ２突然変異と積み重ねられたａＲ、ｂＲ、Ａ１０７Ｔ、およびＡ１０４Ｔセイヨウカラシナ突然変異の組み合わせを含有するホモ接合性セイヨウカラシナＤＨ系植物に対する薬害の平均を提供する図である。
【００２０】
本発明の詳細な説明
本発明は、野生型アブラナ属植物と比較した場合に、除草剤に対する抵抗性が増加したアブラナ属植物に関する。除草剤抵抗性のアブラナ属植物は、単離野生型（除草剤抵抗性に関して）アブラナ属小胞子を突然変異原に曝露し、有効量のイミダゾリノン除草剤の存在下で小胞子を培養し、且つ生存する胚を選択することによって、下記に詳細に記載されるように生産した。生存する胚から、半数体アブラナ属植物を生産し、次いで、染色体を倍加して、野生型アブラナ属植物の抵抗性と比較して、イミダゾリノン除草剤に対する増強された抵抗性を示す稔性倍加半数体アブラナ属植物を産出した。一態様では、本発明は、下記に詳細に記載されるように小胞子の突然変異誘発から生産したＪ０４Ｅ−０１３９と本明細書で呼ばれる除草剤抵抗性のアブラナ属系を提供する。他の態様では、本発明は、小胞子の突然変異誘発から生産したＪ０４Ｅ−０１３０と本明細書で呼ばれる除草剤抵抗性のアブラナ属系を提供する。他の態様では、本発明は、小胞子の突然変異誘発から生産したＪ０４Ｅ−０１２２と本明細書で呼ばれる除草剤抵抗性のアブラナ属系を提供する。他の態様では、本発明は、ｂＲセイヨウカラシナ突然変異体系（米国特許出願公開第２００５／０２８３８５８号）をセイヨウアブラナからセイヨウカラシナに最初に遺伝子移入されたＰＭ２突然変異体系（米国特許出願公開第２００４／０１４２３５３号および米国特許出願公開第２００４／０１７１０２７号を参照されたい；Ｈａｔｔｏｒｉら、Ｍｏｌ．Ｇｅｎ．Ｇｅｎｅｔ．２４６：４１９〜４２５ページ、１９９５年もまた参照されたい）と交雑させることによって生産したＪ０５Ｚ−０７８０１と本明細書で呼ばれる除草剤抵抗性のアブラナ属系を提供する。
【００２１】
したがって、本発明は、ＡＨＡＳ阻害性除草剤に対して抵抗性を有するセイヨウカラシナの植物を提供する。少なくとも１つのＡＨＡＳＬポリヌクレオチド中に単一突然変異を含有するセイヨウカラシナ系が提供され、単一突然変異は、シロイヌナズナＡＨＡＳＬ１配列の位置６５３のアミノ酸に対応するＧからＡへの塩基転換およびシロイヌナズナＡＨＡＳＬ１配列の位置１２２のアミノ酸に対応するＧからＡへの塩基転換の群から選択される。
【００２２】
Ｊ０４Ｅ−０１３９除草剤抵抗性のセイヨウカラシナ植物および野生型セイヨウカラシナ植物の両方から、アセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニット遺伝子（ＡＨＡＳＬ１として命名された）のコード領域を、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）による増幅によって単離し、配列決定した。除草剤抵抗性のアブラナ属植物および野生型アブラナ属植物のポリヌクレオチド配列を比較することによって、除草剤抵抗性のアブラナ属植物からのＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列のコード領域は、セイヨウカラシナのＡゲノム上に位置し、単一ヌクレオチド、ＧからＡへの塩基転換で、野生型植物のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列と異なることが発見された（図１）。ＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列中のこのＧからＡへの塩基転換は、野生型ＡＨＡＳＬ１タンパク質のアミノ酸配列と比較して、ＡＨＡＳＬ１タンパク質の予測されるアミノ酸配列の保存領域中で、アミノ酸６３５（シロイヌナズナＡＨＡＳＬ１のアミノ酸６５３に対応する）の新規なＳｅｒ−Ａｓｎの置換をもたらす（図２）。
【００２３】
Ｊ０４Ｅ−０１３０除草剤抵抗性のセイヨウカラシナ植物および野生型セイヨウカラシナ植物の両方から、アセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニット遺伝子（ＡＨＡＳＬ１と命名された）のコード領域を、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）による増幅によって単離し、配列決定した。除草剤抵抗性のアブラナ属植物および野生型アブラナ属植物のポリヌクレオチド配列を比較することによって、除草剤抵抗性のアブラナ属植物系Ｊ０４Ｅ−０１３０からのＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列のコード領域は、セイヨウカラシナのＢゲノム上に位置し、単一ヌクレオチド、ＧからＡへの塩基転換で、野生型植物のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列と異なることが発見された（図１）。ＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列中のこのＧからＡへの塩基転換は、野生型ＡＨＡＳＬ１タンパク質のアミノ酸配列と比較して、ＡＨＡＳＬ１タンパク質の予測されるアミノ酸配列の保存領域中で、アミノ酸１０７（シロイヌナズナＡＨＡＳＬ１のアミノ酸１２２に対応する）の新規なＡｌａからＴｈｒへの置換をもたらす（図２）。
【００２４】
Ｊ０４Ｅ−０１２２除草剤抵抗性のセイヨウカラシナ植物および野生型セイヨウカラシナ植物の両方から、アセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニット遺伝子（ＡＨＡＳＬ１と命名された）のコード領域を、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）による増幅によって単離し、配列決定した。除草剤抵抗性のアブラナ属植物および野生型アブラナ属植物のポリヌクレオチド配列を比較することによって、除草剤抵抗性のアブラナ属植物系Ｊ０４Ｅ−０１２２からのＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列のコード領域は、セイヨウカラシナのＡゲノム上に位置し、単一ヌクレオチド、ＧからＡへの塩基転換で、野生型植物のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列と異なることが発見された（図１）。ＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列中のこのＧからＡへの塩基転換は、野生型ＡＨＡＳＬ１タンパク質のアミノ酸配列と比較して、ＡＨＡＳＬ１タンパク質の予測されるアミノ酸配列の保存領域中で、アミノ酸１０４（シロイヌナズナＡＨＡＳＬ１のアミノ酸１２２に対応する）の新規なＡｌａからＴｈｒへの置換をもたらす（図２）。
【００２５】
本開示はまた、少なくとも２つの突然変異ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドを含有するセイヨウカラシナ植物をも提供する。そのような植物はまた、本明細書で、「積み重ねられた」突然変異を含有する植物とも呼ばれる。突然変異は、セイヨウカラシナ植物の同じまたは異なるゲノム上にあってもよい。セイヨウカラシナ植物は、任意の数の突然変異ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドおよび配列番号１の位置６５３、配列番号２の位置６３８、配列番号３の位置６３５、配列番号１の位置１２２、配列番号４の位置１０７、配列番号５の位置１０４、配列番号１の位置５７４、または配列番号６の位置５５７に対応する突然変異を含むが、これらに限定されない任意の組み合わせの突然変異を含有してもよい。
【００２６】
異なるゲノム上の２つの突然変異ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドを有するセイヨウカラシナ植物もまた本明細書で提供され、一方の突然変異ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドは、Ａゲノム上にあり、第２の突然変異ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドは、Ｂゲノム上にある。２つの突然変異ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドを有するそのようなセイヨウカラシナ植物は、ｂＲ突然変異およびＰＭ２突然変異を含有する植物を含む。そのような植物は、セイヨウカラシナ系Ｊ０５Ｚ−０７８０１の植物およびその種子ならびにセイヨウカラシナ系Ｊ０５Ｚ−０７８０１との交雑から得られた後代および子孫を含む。他の側面では、２つの突然変異ＡＨＡＳＬ突然変異を有するセイヨウカラシナ植物は、後代セイヨウカラシナ系で、Ａ１２２Ｔ突然変異（たとえばＪ０４Ｅ−０１３０系から）とａＲ突然変異（たとえばＪ０４Ｅ−０１３９系から）を組み合わせた植物を含む。一側面では、２つのＡＨＡＳＬ１突然変異を組み合わせたそのような植物は、それぞれの個々の突然変異を含有する相加的な除草剤耐性レベルのセイヨウカラシナ植物と比較して、相乗的なレベルの除草剤耐性を示す。
【００２７】
ＰＭ１およびＰＭ２の突然変異は、Ｓｗａｎｓｏｎら（Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｒｅｐｏｒｔｓ  ７：８３〜８７ページ（１９８９年））によって記載されるように、セイヨウアブラナの小胞子突然変異誘発を使用して開発された。ＰＭ２突然変異は、セイヨウアブラナのＡゲノム上にあると考えられるＡＨＡＳ３遺伝子の３’端末の単一ヌクレオチド変化（ＧからＴ）によって特徴づけられ（ＲｕｔｌｅｄｇｅらＭｏｌ．Ｇｅｎ．Ｇｅｎｅｔ．２２９：３１〜４０ページ（１９９１年））、ＴｒｐからＬｅｕへのアミノ酸変化、Ｔｒｐ５５６（Ｂｎ）Ｌｅｕをもたらす（Ｈａｔｔｏｒｉら、Ｍｏｌ．Ｇｅｎ．Ｇｅｎｅｔ．２４６：４１９〜４２５ページ、１９９５年）。セイヨウアブラナのＣゲノム上にあると考えられるＰＭ１突然変異（ＲｕｔｌｅｄｇｅらＭｏｌ．Ｇｅｎ．Ｇｅｎｅｔ．２２９：３１〜４０ページ（１９９１年））は、ＡＨＡＳ１遺伝子の単一ヌクレオチド変化（ＧからＡ）によって特徴づけられ、ＳｅｒからＡｓｎへのアミノ酸変化、Ｓｅｒ６３８（Ｂｎ）ＡＳＮをもたらす（Ｓａｔｈａｓｉｖａｎら、Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．９７：１０４４〜１０５０ページ、１９９１年およびＨａｔｔｏｒｉら、Ｍｏｌ．Ｇｅｎ．Ｇｅｎｅｔ．２３２：１６７〜１７３ページ、１９９２年を参照されたい；米国特許公開第２００４／０１４２３５３号および米国特許公開第２００４／０１７１０２７号もまた参照されたい）。突然変異ＰＭ１（ＡＨＡＳ１）遺伝子および突然変異ＰＭ２（ＡＨＡＳ３）遺伝子は、イミダゾリノン除草剤に対して耐性を提供するように相加的に作用することが報告された（Ｓｗａｎｓｏｎら、Ｔｈｅｏｒ．Ａｐｐｌ．Ｇｅｎｅｔ．７８：５２５〜５３０ページ、１９８９年）。
【００２８】
ＰＭ２は、セイヨウアブラナのＡゲノム上に位置すると考えられ、セイヨウカラシナおよびカブの両方はＡゲノムを含有するので、セイヨウカラシナまたはカブのいずれかへのセイヨウアブラナからのＰＭ２突然変異遺伝子の移入は、種を交雑させ（遺伝子移入）、低レベルの除草剤選択下で選択することによって実行することができる。ＰＭ１は、セイヨウアブラナのＣゲノム上に位置すると考えられるので、セイヨウカラシナ（Ａ、Ｂ）またはカブ（Ａ、Ａ）へのセイヨウアブラナからのこの突然変異の遺伝子移入は、生じるのにまれな染色体転座イベント（セイヨウアブラナのＣゲノムおよびセイヨウカラシナのＡゲノムまたはＢゲノムの間）に依存するため、非常により困難となる。そのような染色体転座イベントは、この方法を使用する場合に生じることが多い安定性の欠如および連結抗力を取り除くことができないといったことによってわずらわされ得ることが多い。米国特許第６，６１３，９６３号は、この遺伝子移入方法を使用して生産された除草剤耐性のＰＭ１／ＰＭ２セイヨウカラシナの植物を開示する。セイヨウアブラナのＰＭ１およびＰＭ２によって提供された相加的な耐性に基づいて、２つの突然変異、ＰＭ１およびＰＭ２のセイヨウカラシナへの遺伝子移入もまた、相加的な除草剤耐性を提供することが期待され得る。
【００２９】
カブおよび／またはセイヨウカラシナのＡゲノムまたはＢゲノム上にセイヨウアブラナのＣゲノムからの除草剤耐性の形質を移入することに関連する問題を克服するために、望ましいゲノム中で突然変異を直接生じさせることが好都合となる。米国特許出願第２００５／０２８３８５８号は、除草剤耐性のセイヨウカラシナＡＨＡＳ１突然変異、ｂＲを開示し、これは、Ｂゲノム上のＡＨＡＳＬ遺伝子でＳｅｒ６３８Ａｓｎ（シロイヌナズナ属ＡＨＡＳＬアミノ酸位置呼称を使用する位置６５３）の置換を引き起こす、ＡＨＡＳ１遺伝子上にＳＮＰをもたらす直接的な突然変異誘発によって生じた。
【００３０】
本明細書で提供される２つ以上のＡＨＡＳＬ突然変異を有するセイヨウカラシナ植物は、個々の突然変異の抵抗性の相加的なレベルと比較して、除草剤抵抗性のレベルが増加している可能性がある。２つ以上のＡＨＡＳＬ突然変異を有する植物は、個々のＡＨＡＳＬ突然変異によってもたらされる抵抗性の相加的なレベルと比較して１０％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、またはそれ以上高い抵抗性のレベルを有する可能性がある。
【００３１】
抵抗性の増加は、ＡＨＡＳ抵抗性を決定するための任意の方法を使用して測定することができる。たとえば、抵抗性は、ＡＨＡＳ阻害性除草剤を用いる処理の後の１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、もしくは２８日またはそれ以上の期間にセイヨウカラシナで抵抗性パーセントを決定することにより測定することができる。次いで、抵抗性パーセントは、それぞれの個々のＡＨＡＳＬ突然変異を含有する植物の抵抗性パーセントを加算することによって得られたレベルと比較することができる。一側面では、抵抗性は、ＡＨＡＳ阻害性除草剤の２×量を用いる処理の１４日後の植物で抵抗性パーセントを測定することによって決定される。
【００３２】
本発明は、さらに、アセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニット（ＡＨＡＳＬ）タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む単離ポリヌクレオチド分子およびそのようなＡＨＡＳＬタンパク質に関する。本発明は、野生型アブラナ属植物の化学的突然変異誘発によって生産された除草剤抵抗性のアブラナ属植物からの除草剤抵抗性のアブラナ属ＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするポリヌクレオチドの単離およびヌクレオチド配列を開示する。本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１タンパク質は、Ａゲノム上に位置するセイヨウカラシナＡＨＡＳＬ１遺伝子の位置６３５でのセリンからアスパラギンへの置換またはＢゲノム上に位置するセイヨウカラシナＡＨＡＳＬ１遺伝子の位置１０７でのアラニンからトレオニンへの置換またはＡゲノム上に位置するセイヨウカラシナＡＨＡＳＬ１遺伝子の位置１０４でのアラニンからトレオニンへの置換を保有する。本発明は、さらに、野生型アブラナ属ＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするポリヌクレオチド分子の単離およびヌクレオチド配列を開示する。
【００３３】
本発明は、アブラナ属、具体的にはセイヨウカラシナからのＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードする単離ポリヌクレオチド分子を提供する。具体的には、本発明は、配列番号１３に示すヌクレオチド配列、配列番号３に示すアミノ酸配列を含むＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするヌクレオチド配列、配列番号１４に示すヌクレオチド配列、配列番号４に示すアミノ酸配列を含むＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするヌクレオチド配列、配列番号１５に示すヌクレオチド配列、配列番号５に示すアミノ酸配列を含むＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするヌクレオチド配列、ならびに機能的ＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするそのようなヌクレオチド配列の断片および変異体を含む単離ポリヌクレオチド分子を提供する。
【００３４】
本発明の単離除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド分子は、除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む。そのようなポリヌクレオチド分子は、除草剤、具体的にはＡＨＡＳ活性を阻害することが知られている除草剤、より具体的にはイミダゾリノン除草剤に対する植物の抵抗性を増強するために、植物、具体的には作物の形質転換のためのポリヌクレオチド構築物で使用することができる。そのようなポリヌクレオチド構築物は、発現カセット、発現ベクター、形質転換ベクター、プラスミド、およびその他同種のもので使用することができる。そのようなポリヌクレオチド構築物を用いる形質転換の後に得られたトランスジェニック植物は、たとえばイミダゾリノン除草剤およびスルホニルウレア除草剤などのようなＡＨＡＳ阻害性除草剤に対する抵抗性の増加を示す。
【００３５】
本発明の組成物は、ＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む。具体的には、本発明は、ＡＨＡＳ活性を含むポリペプチドをコードする配列番号３、４、または５に示されるアミノ酸配列ならびにその断片および変異体をコードするヌクレオチド配列を含む単離ポリヌクレオチド分子を提供する。本明細書で記載されるポリヌクレオチド分子、たとえば、ＡＨＡＳ活性を含むポリペプチドをコードする配列番号１３、１４、または１５に記載されるヌクレオチド配列ならびにその断片および変異体によってコードされるアミノ酸配列を有するポリペプチドがさらに提供される。
【００３６】
本発明は、本明細書で開示されるアブラナ属ＡＨＡＳＬタンパク質の保存領域内の特定のアミノ酸位置のアミノ酸置換を有するＡＨＡＳＬタンパク質を提供する。他に本明細書で示されない限り、特定のアミノ酸位置は、配列番号１に記載される完全長シロイヌナズナＡＨＡＳＬアミノ酸配列中のそのアミノ酸の位置を指す。そのうえ、当業者らは、たとえばアミノ酸配列のＮ末端端末にアミノ酸が追加されるかまたはそれからアミノ酸が除去されるかどうかに依存してそのようなアミノ酸位置が変わり得ることを認識するであろう。したがって、本発明は、記載される位置または等価な位置（たとえば「アミノ酸位置６５３または等価な位置」）のアミノ置換を包含する。「等価な位置」によって、例示されるアミノ酸位置と同じ保存領域内にある位置を意味することが意図される。たとえば、配列番号１のアミノ酸１２２は、配列番号４のアミノ酸１０７に等価な位置および配列番号５のアミノ酸１０４に等価な位置である。同様に、配列番号１に記載されるアミノ酸配列を有するシロイヌナズナＡＨＡＳＬタンパク質のアミノ酸６５３は、それぞれ配列番号２および３に示すアミノ酸配列を有するアブラナ属ＡＨＡＳＬ１Ｂのアミノ酸６３８およびアブラナ属ＡＨＡＳＬ１Ａタンパク質のアミノ酸６３５に等価な位置である。
【００３７】
本発明は、単離されたまたは実質的に精製された核酸またはタンパク質組成物を包含する。「単離された」または「精製された」ポリヌクレオチド分子またはタンパク質またはその生物学的活性部分は、その天然に存在する環境に見つけられるようなポリヌクレオチド分子またはタンパク質に通常付随するまたはそれと相互作用する構成成分が実質的にまたは本質的に含まれない。したがって、単離されたかまたは精製されたポリヌクレオチド分子またはタンパク質は、他の細胞性の物質もしくは組み換え技術によって生産された場合、培地は実質的に含まれず、または化学的に合なされた場合、化学物質前駆体もしくは他の化学物質は実質的にない。好ましくは、「単離された」核酸は、核酸が由来する生物のゲノムＤＮＡ中で本来、核酸の側面に位置する配列（つまり核酸の５’端末および３’端末に位置する配列）（好ましくはタンパク質コード配列）がない。たとえば、様々な態様では、単離ポリヌクレオチド分子は、核酸が由来する細胞のゲノムＤＮＡ中で本来、ポリヌクレオチド分子の側面に位置する約５ｋｂ、４ｋｂ、３ｋｂ、２ｋｂ、１ｋｂ、０．５ｋｂ、または０．１ｋｂ未満のヌクレオチド配列を含有し得る。細胞性の物質が実質的に含まれないタンパク質は、約３０％、２０％、１０％、５％、または１％（乾燥重量で）未満の混在タンパク質を有するタンパク質の調製物を含む。本発明のタンパク質またはその生物学的活性部分が組み換えで生産される場合、好ましくは、培地は、化学物質前駆体または対象とするタンパク質ではない化学物質の約３０％、２０％、１０％、５％、または１％（乾燥重量で）未満に相当する。
【００３８】
本発明は、ＡＨＡＳＬ１タンパク質を含む単離ポリペプチドを提供する。単離ポリペプチドは、配列番号３、４、または５に記載されるアミノ酸配列、配列番号１３、１４、または１５に記載されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列、ならびにＡＨＡＳ活性を含むＡＨＡＳＬ１ポリペプチドをコードする上述のアミノ酸配列の機能的断片および変異体からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。「機能的断片および変異体」によって、ＡＨＡＳ活性を含む例示されたポリペプチドの断片および変異体が意図される。
【００３９】
本発明のある態様では、方法は、除草剤耐性の植物または除草剤抵抗性の植物の使用を含む。「除草剤耐性の」植物または「除草剤抵抗性の」植物とは、植物が、正常植物または野生型植物を通常死滅させるかまたはその成長を阻害するとレベルの、少なくとも１つの除草剤に耐性であるかまたは抵抗性であることを意味することを意図している。本発明の一態様では、本発明の除草剤耐性の植物は、除草剤耐性のＡＨＡＳＬタンパク質または除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質を含む。「除草剤耐性のＡＨＡＳＬタンパク質」または「除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質」によって、そのようなＡＨＡＳＬタンパク質は、ＡＨＡＳ活性を阻害することが知られている少なくとも１つの除草剤の存在下でおよび野生型ＡＨＡＳＬタンパク質のＡＨＡＳ活性を阻害することが知られている、除草剤の濃度またはレベルで、野生型ＡＨＡＳＬタンパク質のＡＨＡＳ活性と比較して、より高度なＡＨＡＳ活性を示すことが意図される。そのうえ、そのような除草剤耐性のＡＨＡＳＬタンパク質または除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質のＡＨＡＳ活性は、「除草剤耐性の」ＡＨＡＳ活性または「除草剤抵抗性の」ＡＨＡＳ活性と本明細書で呼ぶことができる。
【００４０】
本発明について、「除草剤耐性の」および「除草剤抵抗性の」という用語は、交換可能に使用され、等価な意味および等価な範囲を有することが意図される。同様に、「除草剤耐性の」および「除草剤抵抗性の」という用語は、交換可能に使用され、等価な意味および等価な範囲を有することが意図される。同じく、「イミダゾリノン抵抗性の」および「イミダゾリノン抵抗性」という用語は、交換可能に使用され、それぞれ、「イミダゾリノン耐性の」および「イミダゾリノン耐性」という用語と等価な意味および等価な範囲であることが意図される。
【００４１】
本発明は、除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチドおよび除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１タンパク質を包含する。「除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド」によって、除草剤抵抗性のＡＨＡＳ活性を含むタンパク質をコードするポリヌクレオチドが意図される。「除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１タンパク質」によって、除草剤抵抗性のＡＨＡＳ活性を含むタンパク質またはポリペプチドが意図される。
【００４２】
さらに、除草剤耐性のＡＨＡＳＬタンパク質または除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質をコードするヌクレオチド配列を用いて植物またはその祖先を形質転換することによって除草剤耐性のＡＨＡＳＬタンパク質または除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質を植物に導入することができることが認識される。そのような除草剤耐性のＡＨＡＳＬタンパク質または除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質は、除草剤耐性のＡＨＡＳＬポリヌクレオチドまたは除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬポリヌクレオチドによってコードされる。その代わりに、除草剤耐性のＡＨＡＳＬタンパク質または除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質は、植物またはその先祖のゲノム中の内在性ＡＨＡＳＬ遺伝子の天然に存在する突然変異または誘発突然変異の結果として、植物中で生じてもよい。
【００４３】
本発明は、少なくとも１つの除草剤、具体的には、ＡＨＡＳ酵素の活性を阻害する除草剤、より具体的には、イミダゾリノン除草剤またはスルホニルウレア除草剤に対する抵抗性または耐性が増加したおよび／または増強した植物、植物組織、植物細胞、および宿主細胞を提供する。「増強」という用語は、期待されるものを超える、抵抗性または耐性の量の増加を指す。除草剤の好ましい量または濃度は、「有効量」または「有効濃度」である。「有効量」および「有効濃度」によって、同様の野生型植物、植物組織、植物細胞、小胞子、または宿主細胞を死滅させるまたはその成長を阻害するのに十分であるが、その上述の量は、本発明の除草剤抵抗性の植物、植物組織、植物細胞、小胞子、および宿主細胞を同じように極度に死滅させないまたはその成長を阻害しない量および濃度がそれぞれ意図される。典型的には、除草剤の有効量は、対象とする雑草を死滅させるために農業生産システムで日常的に使用される量である。そのような量は、当業者らに知られているまたは当技術分野で知られている方法を使用して容易に決定することができる。そのうえ、農業生産システムでの除草剤の有効量は、たとえば小胞子培養システムなどのような植物培養システムのための除草剤の有効量と実質的に異なる可能性があることが認識される。
【００４４】
本発明の除草剤は、ＡＨＡＳ活性が除草剤の存在下で低下するようにＡＨＡＳ酵素の活性を阻害する除草剤である。そのような除草剤はまた、「ＡＨＡＳ阻害性除草剤」または単に「ＡＨＡＳ阻害剤」と本明細書で呼ぶことができる。本明細書で使用されるように、「ＡＨＡＳ阻害性除草剤」または「ＡＨＡＳ阻害剤」は、ＡＨＡＳ酵素の活性を阻害する単一の除草剤に限定されることを意味しない。したがって、他に述べられない限りまたは文脈から明白でない限り、「ＡＨＡＳ阻害性除草剤」または「ＡＨＡＳ阻害剤」は、１つの除草剤または２つ、３つ、４つ、またはそれ以上の除草剤の混合物とすることができ、それらのそれぞれは、ＡＨＡＳ酵素の活性を阻害する。
【００４５】
「同様の野生型植物、植物組織、植物細胞、または宿主細胞」によって、除草剤抵抗性の特徴および／または本明細書で開示される本発明の特定のポリヌクレオチドを欠く植物、植物組織、植物細胞、または宿主細胞がそれぞれ意図される。そのため、「野生型」という用語の使用によって、植物、植物組織、植物細胞、または他の宿主細胞が、そのゲノム中で組み換えＤＮＡを欠くおよび／または本明細書で開示される特徴とは異なる除草剤抵抗性の特徴を保有しないということを意味するように意図されない。
【００４６】
他に明確に示されない限り、本明細書で使用されるように、「植物」という用語は、任意の発達期の植物および完全な無傷の植物に取りつけられるまたはそれから分離してもよい植物の任意の１つまたは複数の一部分を意味するように意図される。植物のそのような一部分は、植物を再生することができる植物カルス、植物の凝集塊、植物プロトプラスト、および植物細胞組織培養物を含む植物の器官、組織、および細胞を含むが、これらに限定されない。特定の植物の一部分の例は、茎、葉、根、花序、花、小花、果実、小花梗、花柄、雄しべ、葯、柱頭、花柱、子房、花弁、がく片、心皮、根端、根冠、根毛、葉毛、種子毛、花粉粒、小胞子、胚、胚珠、子葉、胚軸、上胚軸、木部、師部、柔組織、胚乳、伴細胞、孔辺細胞、ならびに植物の任意の他の知られている器官、組織、および細胞を含む。そのうえ、種子は植物であることが認識される。
【００４７】
本発明の植物は、非トランスジェニック植物およびトランスジェニック植物の両方を含む。「非トランスジェニック植物」によって、そのゲノム中に組み換えＤＮＡを欠く植物を意味することが意図される。「トランスジェニック植物」によって、そのゲノム中に組み換えＤＮＡを含む植物を意味することが意図される。そのようなトランスジェニック植物は、植物のゲノムに組み換えＤＮＡを導入することによって生産することができる。そのような組み換えＤＮＡがトランスジェニック植物のゲノムに組み込まれる場合、植物の後代もまた組み換えＤＮＡを含むことができる。少なくとも１つの先祖トランスジェニック植物の組み換えＤＮＡの少なくとも１つの部分を含む後代植物もまたトランスジェニック植物である。
【００４８】
本発明は、Ｊ０４Ｅ−０１２２と本明細書で呼ばれる除草剤抵抗性のアブラナ属系を提供する。アブラナ属系Ｊ０４Ｅ−０１２２からの少なくとも２５００個の種子の、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）、Ｍａｎｓａｓｓａｓ、ＶＡ  ２０１１０  ＵＳＡのＰａｔｅｎｔ  Ｄｅｐｏｓｉｔｏｒｙへの寄託は、２００６年１０月１９日になされ、ＡＴＣＣ特許寄託番号ＰＴＡ−７９４４に指定された。本発明は、Ｊ０４Ｅ−０１３０と本明細書で呼ばれる除草剤抵抗性のアブラナ属系を提供する。アブラナ属系Ｊ０４Ｅ−０１３０からの少なくとも２５００個の種子の寄託は、２００６年１０月１９日になされ、ＡＴＣＣ特許寄託番号ＰＴＡ−７９４５に指定された。本発明は、Ｊ０４Ｅ−０１３９と本明細書で呼ばれる除草剤抵抗性のアブラナ属系を提供する。アブラナ属系Ｊ０４Ｅ−０１３９からの少なくとも２５００個の種子の寄託は、２００６年１０月１９日になされ、ＡＴＣＣ特許寄託番号ＰＴＡ−７９４６に指定された。本発明は、Ｊ０５Ｚ−０７８０１と本明細書で呼ばれる除草剤抵抗性の二重突然変異体アブラナ属系を提供する。アブラナ属系Ｊ０５Ｚ−０７８０１からの少なくとも６２５個の種子の寄託は、２００７年４月２日になされ、残りの１８７５個の種子は、２００８年１月１５日に寄託され、ＡＴＣＣ特許寄託番号ＰＴＡ−８３０５に指定された。寄託物は、特許手続上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約の条項の下で維持される。アブラナ属系Ｊ０４Ｅ−０１２２、Ｊ０４Ｅ−０１３０、Ｊ０４Ｅ−０１３０、およびＪ０５Ｚ−０７８０１の寄託は、寄託物のサンプルの分譲の最も最近の依頼がＡＴＣＣによって受領された後、少なくとも３０年および少なくとも５年の期間の間、なされた。加えて、出願人らは、サンプルの生存率の表示を提供することを含む、３７  Ｃ．Ｆ．Ｒ．§§１．８０１〜１．８０９の条件をすべて満たした。
【００４９】
本発明の単一突然変異除草剤抵抗性のアブラナ属系Ｊ０４Ｅ−０１２２、Ｊ０４Ｅ−０１３０、およびＪ０４Ｅ−０１３９は、突然変異育種によって生産した。野生型アブラナ属小胞子は、突然変異原、具体的には化学的突然変異原、より具体的にはエチルニトロソウレア（ＥＮＵ）への曝露によって突然変異誘発した。しかしながら、本発明は、化学的突然変異原ＥＮＵを含む突然変異誘発方法によって生産される除草剤抵抗性のアブラナ属植物に限定されない。当技術分野で知られている任意の突然変異誘発方法は、本発明の除草剤抵抗性のアブラナ属植物を生産するために使用することができる。そのような突然変異誘発方法は、たとえば、以下の突然変異原の任意の１つまたは複数の使用を含むことができる：Ｘ線、ガンマ線（たとえばコバルト６０またはセシウム１３７）、中性子（たとえば、原子炉中でのウラン２３５による核分裂の産物）、ベータ放射線（たとえば、リン３２または炭素１４などのような放射性同位元素から放出される）、および紫外線（好ましくは２５０〜２９０ｎｍ）などのような放射線ならびにエチルメタンスルホン酸（ＥＭＳ）、塩基類似体（たとえば５−ブロモウラシル）、関連化合物（たとえば８−エトキシカフェイン）、抗生物質（たとえばストレプトニグリン）、アルキル化剤（たとえばサルファマスタード、ナイトロジェンマスタード、エポキシド、エチレンアミン、硫酸、スルホン酸、スルホン、ラクトン）、アジ化物、ヒドロキシルアミン、亜硝酸、またはアクリジンなどのような化学的突然変異原。除草剤抵抗性の植物はまた、除草剤抵抗性の突然変異を含む植物細胞を選択するために組織培養法を使用し、次いで、それから除草剤抵抗性の植物を再生することによって生産することもできる。たとえば、米国特許第５，７７３，７０２号および第５，８５９，３４８号を参照されたい、これらの両方は、参照によってそれらの全体が本明細書に組み込まれる。突然変異育種のさらなる詳細は、「主要な、栽培品種の開発（Ｐｒｉｎｃｉｐａｌｓ  ｏｆ  Ｃｕｌｔｉｖａｒ  Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ）」Ｆｅｈｒ、１９９３年  Ｍａｃｍｉｌｌａｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏｍｐａｎｙに見つけることができ、その開示は、参照によって本明細書に組み込まれる。
【００５０】
Ｊ０４Ｅ−０１３９系のアブラナ属植物のＡＨＡＳＬ１遺伝子の分析は、Ａゲノム上のセイヨウカラシナＡＨＡＳＬ遺伝子のアミノ酸位置６３５に見つけられるセリンに対するアスパラギンの置換をもたらし、除草剤に対する抵抗性の増加を付与する突然変異を明らかにした。したがって、本発明は、位置６３５（シロイヌナズナＡＨＡＳＬ１のアミノ酸６５３に対応する）のセリンに対して他のアミノ酸を置換することは、アブラナ属植物の、除草剤、具体的にはイミダゾリノン除草剤および／またはスルホニルウレア除草剤に対する抵抗性を増加させ得ることを開示する。本発明の除草剤抵抗性のアブラナ属植物は、アミノ酸位置６３５または等価な位置にアスパラギンを含む除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチドの少なくとも１つのコピーをそれらのゲノム中に含むそれらのアブラナ属植物を含むが、これらに限定されない。
【００５１】
Ｊ０４Ｅ−０１３０系のアブラナ属植物のＡＨＡＳＬ１遺伝子の分析は、Ｂゲノム上のセイヨウカラシナＡＨＡＳＬ遺伝子のアミノ酸位置１０７に見つけられるアラニンに対するトレオニンの置換をもたらし、除草剤に対する抵抗性の増強を付与する突然変異を明らかにした。したがって、本発明は、位置１０７（シロイヌナズナＡＨＡＳＬ１のアミノ酸１２２に対応する）のアラニンに対して他のアミノ酸を置換することは、アブラナ属植物の、除草剤、具体的にはイミダゾリノン除草剤および／またはスルホニルウレア除草剤に対する抵抗性を増加させ得ることを開示する。本発明の除草剤抵抗性のアブラナ属植物は、アミノ酸位置１０７または等価な位置にトレオニンを含む除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチドの少なくとも１つのコピーをそれらのゲノム中に含むそれらのアブラナ属植物を含むが、これらに限定されない。
【００５２】
Ｊ０４Ｅ−０１２２系のアブラナ属植物のＡＨＡＳＬ１遺伝子の分析は、Ａゲノム上のセイヨウカラシナＡＨＡＳＬ遺伝子のアミノ酸位置１０４に見つけられるアラニンに対するトレオニンの置換をもたらし、除草剤に対する抵抗性の増加を付与する突然変異を明らかにした。したがって、本発明は、位置１０４（シロイヌナズナＡＨＡＳＬ１のアミノ酸１２２に対応する）のアラニンに対して他のアミノ酸を置換することは、アブラナ属植物の、除草剤、具体的にはイミダゾリノン除草剤および／またはスルホニルウレア除草剤に対する抵抗性を増加させ得ることを開示する。本発明の除草剤抵抗性のアブラナ属植物は、アミノ酸位置１０４または等価な位置にトレオニンを含む除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチドの少なくとも１つのコピーをそれらのゲノム中に含むそれらのアブラナ属植物を含むが、これらに限定されない。
【００５３】
本発明のアブラナ属植物は、野生型ＡＨＡＳＬ１タンパク質について、アミノ酸位置６５３がアスパラギンであり（シロイヌナズナという）、アミノ酸位置１２２がトレオニンであり（シロイヌナズナという）、および野生型ＡＨＡＳＬ１タンパク質についてＡＨＡＳＬ１タンパク質中に１つまたは複数のさらなるアミノ酸置換を含む植物を含むところ、野生型アブラナ属植物と比較した場合に、そのようなアブラナ属植物は、少なくとも１つの除草剤に対する抵抗性が増加している。
【００５４】
本発明は、植物ならびにＡＨＡＳ除草剤抵抗性のアブラナ属植物、ＡＨＡＳ除草剤に対する耐性が増加したアブラナ属植物、およびそのような植物の種子を調製するための方法を提供する。したがって、本明細書で例示される植物は、セイヨウカラシナの市販品種などのような、さらなる除草剤抵抗性のセイヨウカラシナ植物を開発するために育種プログラムで使用することができる。そのような方法に従って、第１のアブラナ属親植物は、第２のアブラナ属親植物との交雑で使用することができ、第１または第２のアブラナ属親植物の少なくとも１つは、少なくとも１つのＡＨＡＳ除草剤抵抗性の突然変異を含有する。プロセスの１つの適用はＦ１雑種植物の生産中とする。このプロセスの他の重要な側面は、プロセスを新規な親、二ゲノム性半数体、または近交系の開発に使用することができるということである。たとえば、本明細書で記載されるようなアブラナ属系は、任意の第２の植物と交雑させることができ、結果として生じる雑種後代は、それぞれ、約５〜７またはそれ以上の世代の間、自家受粉させておよび／または同胞受粉させて、それによって多数の別個の親系がもたらされる。次いで、これらの親系は、他の系と交雑させることができ、結果として生じる雑種後代は、有益な特徴について分析される。このような方法で、望ましい特徴を付与する新規な系は同定することができる。様々な育種方法は、半数性、系統育種、単粒系統、改変された単粒系統、循環選択、および戻し交雑を含む方法で使用することができる。
【００５５】
アブラナ属系は、自然なまたは機械的な技術によって交雑することができる。機械的な受粉は、柱頭上に移入することができる花粉のタイプをコントロールすることによってまたは手で受粉することによって達成することができる。
【００５６】
子孫アブラナ属植物および／または後代アブラナ属植物は、突然変異ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドまたは突然変異ＡＨＡＳＬポリペプチドの存在を決定するための任意の方法で評価することができる。そのような方法は、表現型の評価、遺伝子型の評価、またはその組み合わせを含む。後代アブラナ属植物は、除草剤抵抗性および他の望ましい形質について続く世代で評価することができる。ＡＨＡＳ阻害剤除草剤に対する抵抗性は、１つまたは複数の適切なＡＨＡＳ阻害剤除草剤に植物を曝露し、除草剤による傷害を評価することによって評価することができる。倒伏抵抗性および草丈などのようないくつかの形質は、植物の目視検査を通して評価することができるが、成熟度についての早生は、さや（長角果）内の種子の目視検査によって評価することができる。種子の含油率、タンパク質率、および総グルコシノレートなどのような他の形質は、近赤外線分光法ならびに／または液体クロマトグラフィーおよび／もしくはガスクロマトグラフィーなどのような技術を使用して評価することができる。
【００５７】
アブラナ属植物の遺伝子型の評価は、アイソザイム電気泳動、制限断片長多型（ＲＦＬＰ）、ランダム増幅多型ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）、任意プライムポリメラーゼ連鎖反応（Ａｒｂｉｔｒａｒｉｌｙ  Ｐｒｉｍｅｄ  Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ  Ｃｈａｉｎ  Ｒｅａｃｔｉｏｎ）（ＡＰ−ＰＣＲ）、ＤＮＡ増幅フィンガープリント法（ＤＡＦ）、配列特徴的増幅領域（Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚｅｄ  Ａｍｐｌｉｆｉｅｄ  Ｒｅｇｉｏｎ）（ＳＣＡＲ）、増幅断片長多型（ＡＦＬＰ）、「マイクロサテライト」とも呼ばれる単純配列反復（ＳＳＲ）などのような技術を使用することを含む。本明細書で提供されるアブラナ属植物の遺伝子型を分析するためのさらなる組成物および方法は、米国特許公開第２００４／０１７１０２７号公報、米国特許公開第２００５／０２０８０５０６号公報、および米国特許公開第２００５／０２８３８５８号公報に開示される方法を含み、これらの全体は、参照によって組み込まれる。
【００５８】
評価および操作（１つまたは複数の適切なＡＨＡＳ阻害剤除草剤への曝露を通して）は、数世代にわたって行なうことができる。新しい系の生産力は、比較品種に対する比較での客観的な基準を使用して評価することができる。形質の望ましい組み合わせを示す系は、他の系と交雑するまたは自家受粉して、種子を生産する。自家受粉は、ある花からの同じ花または同じ植物の他の花への花粉の移入を指す。何世代もの間、自家受粉し、タイプを選択している植物は、ほとんどすべての遺伝子座でホモ接合性になり、純粋育種後代の均一な集団を生産する。
【００５９】
任意の育種方法を、本発明の方法で使用することができる。一例では、本発明の除草剤抵抗性の植物は、半数体法を使用して育種することができる。そのような方法では、特徴の望ましい補足物について遺伝的根拠を有する親は、単純なまたは複雑な交雑で交雑させる。交雑（または他家受粉）は、ある植物から異なる植物への花粉の移入を指す。交雑の後代は、成長させ、小胞子（未成熟の花粉粒）は、当業者らに知られている技術を使用して分離し、選別する［（たとえばＳｗａｎｓｏｎ，Ｅ．Ｂ．ら、「セイヨウアブラナでの小胞子の効率的な単離および小胞子由来の胚の生産（Ｅｆｆｉｃｉｅｎｔ  ｉｓｏｌａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｍｉｃｒｏｓｐｏｒｅｓおよびｔｈｅ  ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ  ｏｆ  ｍｉｃｒｏｓｐｏｒｅ−ｄｅｒｉｖｅｄ  ｅｍｂｒｙｏｓ  ｉｎ  Ｂｒａｓｓｉｃａ  ｎａｐｕｓ，Ｌ．）」Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｒｅｐｏｒｔｓ，６：９４〜９７ページ（１９８７年）およびＭｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、第６巻、Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  ａｎｄ  Ｔｉｓｓｕｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ、Ｈｕｍａｎａ  Ｐｒｅｓｓ、（１９９０年）中のＳｗａｎｓｏｎ，Ｅ．Ｂ．、Ｍｉｃｒｏｓｐｏｒｅ  ｃｕｌｔｕｒｅ  ｉｎ  Ｂｒａｓｓｉｃａ、１５９〜１６９ページ］。これらの小胞子は、遺伝子が分離されている。小胞子は、除草剤に対する抵抗性を担う突然変異を欠く小胞子を死滅させる、イマゼタピル（Ｉｍａｚｅｔｈａｐｙｒ）（たとえばＰＵＲＳＵＩＴ（商標））、イマザモックス（たとえばＲＡＰＴＯＲ（商標））、またはイマゼタピル（Ｉｍａｚｅｔｈａｐｙｒ）およびイマザモックスの５０／５０ミックス（たとえばＯＤＹＳＳＥＹ（商標））などのような適切なＡＨＡＳ阻害剤除草剤の存在下で培養される。除草剤に対する抵抗性を担う遺伝子を運搬する小胞子は、存在し続け、胚を生産し、これは半数体植物を生成する。次いで、それらの染色体は、倍加させて、倍加半数体を生産する。
【００６０】
他の育種方法もまた本発明に従って使用することができる。たとえば、系統育種は、アブラナ属およびキャノーラなどのような大規模自家受粉作物の改良に使用することができる。系統育種は、２つの遺伝子型の交雑から始まり、これらのそれぞれは、他方で欠いているまたは他方を補足する１つまたは複数の望ましい特徴を有してもよい。２つの最初の親が、望ましい特徴のすべてを提供しない場合、さらなる親を、交雑計画に含むことができる。
【００６１】
これらの親は、単純なまたは複雑なＦ１を生産するために単純なまたは複雑な様式で交雑させてもよい。Ｆ２集団は、１つもしくはいくつかのＦ１植物を自家受粉させることによってまたは２つのＦ１植物を相互交雑することによって（つまり同胞交配）Ｆ１から生産される。最良の個体の選択は、Ｆ２世代で開始してもよく、Ｆ３で開始して、最良のファミリーおよび最良のファミリー内の最良の個体が選択される。ファミリーの再現試験は、低遺伝率を有する形質の選択の有効性を改善するために、Ｆ４世代で開始することができる。同系交配の進んだ段階（つまりＦ６とＦ７）で、最良の系または表現型的に同様の系の混合物は、新しい栽培品種としての発売の可能性について試験することができる。しかしながら、植物は複数の世代で分離されており、望ましい形質の回収は比較的低いので、系統育種法は、改善されたＡＨＡＳ除草剤抵抗性の植物を開発するための半数性の方法よりも多くの時間を要する。
【００６２】
単粒系統（ＳＳＤ）手順もまた、改良品種を育種するために使用することができる。厳密な意味のＳＳＤ手順は、分離集団を栽培すること、植物当たり１つの種子のサンプルを収穫すること、および次の世代を栽培するために単一の種子の集団を使用することを指す。集団をＦ２から同系交配の望ましいレベルまで進めた場合、系が由来する植物はそれぞれ、異なるＦ２個体にさかのぼるであろう。集団の植物の数は、いくつかの種子が発芽することができないまたはいくつかの植物が少なくとも１つの種子を生産することができない理由から、それぞれの世代で減少する。その結果として、世代の進行が終了した場合に、Ｆ２集団で最初にサンプリングされた植物のすべてが後代によって表わされるとは限らないであろう。
【００６３】
複数の種子による手順では、キャノーラ育種家は、一般に、集団のそれぞれの植物から１つまたは複数のさやを収穫し、それらを共に脱穀して、バルクを作る。バルクの一部分は、次の世代を栽培するために使用し、一部分は貯蔵する。その手順は、改変された単粒系統またはさやバルク技術と呼ばれてきた。複数の種子による手順は、収穫時の労力を省くために使用されてきた。単粒手順のために手でそれぞれから１つの種子を取り出すよりも機械を用いてさやを脱穀するほうが相当に速い。複数の種子による手順はまた、同系交配のそれぞれの世代で、集団の同じ数の種子を栽培することを可能にする。発芽しなかったまたは種子を生産しなかったそれらの植物を補うために十分な種子が収穫される。
【００６４】
戻し交雑育種は、供給源となる品種または系（ドナー親）からの、単純に遺伝する、高度に遺伝性の形質の１つまたは複数の遺伝子を他の望ましい栽培品種または近交系（反復親）に移入するために使用することができる。初めの交雑の後に、ドナー親の表現型を保有する個体は選択され、反復親に繰り返し交雑させる（戻し交雑させる）。戻し交雑が終了した場合に、結果として生じる植物は、反復親の特質およびドナー親から移入された望ましい形質を有することが期待される。
【００６５】
改良品種もまた、循環選択を通して開発することができる。ヘテロ接合性の個体の遺伝的変異集団は、いくつかの異なる親の相互交雑によって同定されるまたは作り出される。最良の植物は、個々の優性、優れた後代、または良好な組み合わせ能力に基づいて選択される。選択された植物は、相互交雑して、選択のさらなるサイクルが継続される新しい集団を生産する。
【００６６】
他の側面では、本発明は、ＡＨＡＳ除草剤に対する抵抗性を有するアブラナ属植物を生産するための方法であって、（ａ）第１のアブラナ属系を第２のアブラナ属系と交雑させて、分離集団を生成するステップであって、第１のアブラナ属系は、ＡＨＡＳ除草剤抵抗性のアブラナ属植物であるステップと、（ｂ）ＡＨＡＳ除草剤抵抗性が増加した集団をスクリーニングするステップと、（ｃ）野生型アブラナ属植物と比較してＡＨＡＳ抵抗性が増加した集団の１つまたは複数のメンバーを選択するステップとを含む方法を提供する。
【００６７】
他の側面では、本発明は、ＡＨＡＳ除草剤抵抗性の形質をアブラナ属植物に遺伝子移入するための方法であって、（ａ）少なくとも第１のＡＨＡＳ除草剤抵抗性のアブラナ属系を第２のアブラナ属系と交雑させて、分離集団を生成するステップと、（ｂ）ＡＨＡＳ除草剤抵抗性が増加した集団をスクリーニングするステップと、（ｃ）ＡＨＡＳ除草剤抵抗性が増加した集団の少なくとも１つのメンバーを選択するステップとを含む方法を提供する。
【００６８】
その代わりに、本発明の他の側面では、第１および第２の親アブラナ属植物の両方は、本明細書で記載されるように、ＡＨＡＳ除草剤抵抗性のアブラナ属植物とすることができる。したがって、本明細書で記載されるようにＡＨＡＳ除草剤抵抗性が増加したアブラナ属植物を使用して生産された任意のアブラナ属植物は、本発明の一部分を形成する。本明細書で使用されるように、交雑は、自家受粉、同胞受粉、戻し交雑、他のまたは同じ親系への交雑、集団への交雑、およびその他同種のものを意味することができる。
【００６９】
本発明はまた、有性生殖を含む従来の植物育種を通して、除草剤抵抗性の植物、具体的には除草剤抵抗性のアブラナ属植物を生産するための方法を提供する。方法は、除草剤に抵抗性である第１の植物を除草剤に抵抗性ではない第２の植物と交雑させるステップを含む。第１の植物は、たとえば、除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬをコードする本発明のポリヌクレオチドの少なくとも１つを含むトランスジェニック植物およびＪ０５Ｚ−０７８０１、Ｊ０４Ｅ−０１３９、Ｊ０４Ｅ−０１３０、またはＪ０４Ｅ−０１２２のアブラナ属植物の除草剤抵抗性の特徴を含む非トランスジェニックアブラナ属植物を含む、本発明の除草剤抵抗性の植物のいずれかとすることができる。第２の植物は、第１の植物と交雑させた場合に、成育可能な後代植物（つまり種子）を生産することができる任意の植物とすることができる。典型的には、しかし、必ずではないが、第１および第２の植物は同じ種とする。本発明の方法は、さらに、第１の交雑の後代植物を、第１または第２の植物のいずれかと同じ系または遺伝子型の植物に戻し交雑した１つまたは複数の世代を含むことができる。その代わりに、第１の交雑または任意の続く交雑の後代は、第１または第２の植物のいずれかと異なる系または遺伝子型である第３の植物と交雑させることができる。本発明の方法は、加えて、第１の植物の除草剤抵抗性の特徴を含む植物を選択するステップを含むことができる。
【００７０】
本発明は、有性生殖を含む従来の植物育種を通して、植物、具体的には除草剤抵抗性のアブラナ属植物の除草剤抵抗性を増加させるための方法をさらに提供する。方法は、除草剤に抵抗性である第１の植物を、除草剤に抵抗性であってもよくまたは抵抗性でなくてもよくまたは第１の植物と異なる１つもしくは複数の除草剤に抵抗性であってもよい第２の植物と交雑させるステップを含む。第１の植物は、たとえば、除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬをコードする本発明のポリヌクレオチドの少なくとも１つを含むトランスジェニック植物およびＪ０５Ｚ−０７８０１、Ｊ０４Ｅ−０１３９、Ｊ０４Ｅ−０１３０、またはＪ０４Ｅ−０１２２のアブラナ属植物の除草剤抵抗性の特徴を含む非トランスジェニックアブラナ属植物を含む、本発明の除草剤抵抗性の植物のいずれかとすることができる。第２の植物は、第１の植物と交雑させた場合に、成育可能な後代植物（つまり種子）を生産することができる任意の植物とすることができる。典型的には、しかし、必ずではないが、第１および第２の植物は同じ種とし、同様に、第１および第２の植物は、異なる種であるが同じ属内の種由来のものとすることができ（例：セイヨウカラシナ×セイヨウアブラナ、セイヨウカラシナ×カブ、セイヨウカラシナ×キャベツ、セイヨウカラシナ×クロガラシなど）、さらに、第１および第２の植物は異なる属（例：アブラナ属×シロガラシ属）とする。本発明のこの方法で生産される後代植物は、第１もしくは第２の植物のいずれかまたはその両方と比較した場合に、除草剤に対する抵抗性が増加している。第１および第２の植物が異なる除草剤に抵抗性である場合、後代植物は、第１および第２の植物の、組み合わせられた除草剤抵抗性の特徴を有する。本発明の方法は、さらに、第１の交雑の後代植物を、第１または第２の植物のいずれかと同じ系または遺伝子型の植物に戻し交雑した１つまたは複数の世代を含むことができる。その代わりに、第１の交雑または任意の続く交雑の後代は、第１または第２の植物のいずれかと異なる系または遺伝子型である第３の植物と交雑させることができる。本発明の方法は、加えて、第１の植物、第２の植物、または第１および第２の植物の両方の除草剤抵抗性の特徴を含む植物を選択するステップを含むことができる。
【００７１】
本発明の植物は、トランスジェニック植物または非トランスジェニック植物とすることができる。イミダゾリノン除草剤および／またはスルホニルウレア除草剤に対する抵抗性が増加した非トランスジェニックアブラナ属植物の例は、Ｊ０５Ｚ−０７８０１、Ｊ０４Ｅ−０１３９、Ｊ０４Ｅ−０１３０、もしくはＪ０４Ｅ−０１２２のアブラナ属植物またはＪ０５Ｚ−０７８０１、Ｊ０４Ｅ−０１３９、Ｊ０４Ｅ−０１３０、もしくはＪ０４Ｅ−０１２２の植物のまたはＪ０５Ｚ−０７８０１、Ｊ０４Ｅ−０１３９、Ｊ０４Ｅ−０１３０、もしくはＪ０４Ｅ−０１２２の植物の任意の後代の突然変異体、組み換え体、または遺伝子操作された誘導体またはこれらの植物のいずれかの後代である植物またはＪ０５Ｚ−０７８０１、Ｊ０４Ｅ−０１３９、Ｊ０４Ｅ−０１３０、もしくはＪ０４Ｅ−０１２２の植物の除草剤抵抗性の特徴を含む植物を含む。
【００７２】
本発明はまた、本発明の少なくとも１つのポリヌクレオチド分子、発現カセット、または形質転換ベクターを用いて形質転換された植物、植物器官、植物組織、植物細胞、種子、および非ヒト宿主細胞をも提供する。そのような形質転換植物、植物器官、植物組織、植物細胞、種子、および非ヒト宿主細胞は、それぞれ非形質転換植物、植物組織、植物細胞、または非ヒト宿主細胞を死滅させるまたはその成長を阻害する除草剤のレベルで、少なくとも１つの除草剤に対する耐性または抵抗性が増強している。好ましくは、本発明の形質転換植物、植物組織、植物細胞、および種子は、アブラナ属および作物である。
【００７３】
本発明はまた、本発明の方法によって生産されるアブラナ属植物から得られる、ＡＨＡＳ除草剤抵抗性を有するアブラナ属植物を生産することができるアブラナ属植物の種子をも提供する。
【００７４】
他の側面では、本発明はまた、除草剤抵抗性の形質を有する種子用に成長させたアブラナ属植物から得られたＡＨＡＳ除草剤抵抗性を有するアブラナ属植物の種子から成長させた植物ならびにそのような植物からの植物の一部分および組織培養物をも提供する。
【００７５】
種子がＡＨＡＳ除草剤抵抗性のアブラナ属植物を生産することができる、アブラナ属種子の容器もまた本明細書で提供される。アブラナ属種子の容器は、任意の数、重量、または容量の種子を含有してもよい。たとえば、容器は、少なくとも約１０、２５、５０、７５、１００、２００、３００、４００、５００、６００、７００、８００、９００、１０００、１５００、２０００、２５００、３０００、３５００、４０００、４５００、５０００、もしくはそれ以上のまたはそれよりも多数の種子を含有することができる。その代わりに、容器は、少なくとも約１オンス、５オンス、１０オンス、１ポンド、２ポンド、３ポンド、４ポンド、５ポンド、もしくはそれ以上のまたはそれよりも多数の種子を含有することができる。
【００７６】
アブラナ属種子の容器は、当技術分野で入手可能な任意の容器であってもよい。非限定的な例の目的で、容器は、箱、バッグ、小包、小袋、テープロール、バケツ、ホイル、またはチューブであってもよい。
【００７７】
他の側面では、アブラナ属種子の容器中に含有される種子は、処理された種子または未処理の種子とすることができる。一側面では、種子は、たとえば種子を刺激することによってまたは種子伝染性の病原菌から防御するための消毒によって、発芽を改善するために処理することができる。他の側面では、種子は、たとえば、栽培可能性、種子出芽、および種子伝染性の病原菌からの防御を改善するために、任意の入手可能なコーティングを用いてコーティングすることができる。種子コーティングは、ペレッティング、フィルムコーティング、および外層を含むが、これらに限定されない種子コーティングの任意の形態とすることができる。
【００７８】
本発明はまた、本発明のＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列に作動可能に連結されたプロモーターを含むポリヌクレオチド構築物を用いて植物を形質転換するステップを含む、植物のＡＨＡＳ活性を増加させるための方法を提供する。方法は、少なくとも１つの植物細胞に本発明のポリヌクレオチド構築物を導入するステップと、形質転換植物をそれから再生するステップとを含む。ポリヌクレオチド構築物は、本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質をコードする少なくとも１つのヌクレオチド、具体的には配列番号１３、１４、または１５に記載されるヌクレオチド配列、配列番号３、４、または５に記載されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列、ならびにその断片および変異体を含む。方法は、植物細胞中で遺伝子発現を駆動することができるプロモーターの使用をさらに含む。好ましくは、そのようなプロモーターは、構成的なプロモーターまたは組織にとって好ましいプロモーターである。この方法によって生産される植物は、非形質転換植物と比較した場合に、増加されたＡＨＡＳ活性、具体的には除草剤耐性のＡＨＡＳ活性を含む。したがって、方法は、ＡＨＡＳ酵素の触媒活性を阻害する少なくとも１つの除草剤、具体的にはイミダゾリノン除草剤に対する植物の抵抗性を増強するまたは増加させる際に使用を見出す。
【００７９】
本発明は、除草剤抵抗性の植物を生産するための方法であって、植物細胞中で発現を駆動するプロモーターに作動可能に連結されたヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド構築物を用いて植物細胞を形質転換するステップと、上述の形質転換植物細胞から形質転換植物を再生するステップとを含む方法を提供する。ヌクレオチド配列は、本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質をコードするそれらのヌクレオチド配列、具体的には配列番号１３、１４、または１５に記載されるヌクレオチド配列、配列番号３、４、または５に記載されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列、ならびにその断片および変異体から選択される。この方法によって生産される除草剤抵抗性の植物は、非形質転換植物と比較して、少なくとも１つの除草剤、具体的にはたとえばイミダゾリノン除草剤またはスルホニルウレア除草剤などのような、ＡＨＡＳ酵素の活性を阻害する除草剤に対して増強された抵抗性を含む。
【００８０】
本発明は、植物、植物細胞、および他の非ヒト宿主細胞中で本発明のポリヌクレオチド分子を発現するための発現カセットを提供する。発現カセットは、除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質をコードする本発明のポリヌクレオチド分子に作動可能に連結された、対象とする植物、植物細胞、または他の宿主細胞中で発現可能なプロモーターを含む。葉緑体への発現を標的とするのに必要であれば、発現カセットはまた、発現されたＡＨＡＳＬタンパク質を葉緑体に向けるための葉緑体輸送ペプチドをコードする、作動可能に連結された葉緑体標的配列をも含むことができる。
【００８１】
本発明の発現カセットは、植物または宿主細胞の除草剤耐性を増強するための方法での使用を見出す。方法は、本発明の発現カセットを用いて植物または宿主細胞を形質転換するステップを含み、発現カセットは、対象とする植物または宿主細胞中で発現可能なプロモーターを含み、プロモーターは、本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む本発明のポリヌクレオチドに作動可能に連結される。方法は、形質転換植物細胞から形質転換植物を再生するステップをさらに含む。
【００８２】
本明細書での「ポリヌクレオチド構築物」という用語の使用は、ＤＮＡを含むポリヌクレオチド構築物に本発明を限定するように意図されない。当業者らは、リボヌクレオチドならびにリボヌクレオチドおよびデオキシリボヌクレオチドの組み合わせを含むポリヌクレオチド構築物、具体的にはポリヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチドもまた、本明細書で開示される方法で使用できることを認識するであろう。したがって、本発明のポリヌクレオチド構築物は、デオキシリボヌクレオチド、リボヌクレオチド、およびその組み合わせを含むポリヌクレオチド構築物を含むが、これらに限定されない、植物の形質転換のために本発明の方法で使用することができるポリヌクレオチド構築物をすべて包含する。そのようなデオキシリボヌクレオチドおよびリボヌクレオチドは、天然に存在する分子および合成類似体の両方を含む。本発明のポリヌクレオチド構築物はまた、一本鎖形態、二本鎖形態、ヘアピン、ステムアンドループ構造、およびその他同種のものを含むが、これらに限定されない、ポリヌクレオチド構築物のすべての形態をも包含する。そのうえ、本明細書で開示されるそれぞれのヌクレオチド配列はまた、その例示されるヌクレオチド配列の相補体をも包含することが当業者らによって理解される。
【００８３】
そのうえ、本発明の方法は、少なくとも１つのタンパク質またはたとえば、ｍＲＮＡの少なくとも１つの部分に相補的であるアンチセンスＲＮＡなどのような少なくとも１つのＲＮＡの発現を形質転換植物中で指示することができるポリヌクレオチド構築物を使用してもよいことが認識される。典型的には、そのようなポリヌクレオチド構築物は、タンパク質のコード配列または５’および３’転写調節領域に作動可能に連結されたＲＮＡを含む。その代わりに、本発明の方法は、タンパク質またはＲＮＡの発現を形質転換植物中で指示することができないポリヌクレオチド構築物を使用してもよいこともまた認識される。
【００８４】
さらに、対象とする宿主細胞中での本発明のポリヌクレオチドの発現については、ポリヌクレオチドは、典型的には、対象とする宿主細胞中で遺伝子発現を駆動することができるプロモーターに作動可能に連結されることが認識される。宿主細胞中でポリヌクレオチドを発現するための本発明の方法は、特定のプロモーターに依存しない。方法は、当技術分野で知られており、且つ対象とする宿主細胞中で遺伝子発現を駆動することができる任意のプロモーターの使用を包含する。
【００８５】
本発明は、ＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド分子ならびにその断片および変異体を包含する。これらのヌクレオチド配列の断片であるポリヌクレオチド分子もまた本発明によって包含される。「断片」によって、本発明のＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするヌクレオチド配列の部分が意図される。本発明のＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列の断片は、ＡＨＡＳＬ１タンパク質の生物学的活性部分をコードしてもよく、またはそれは下記に開示される方法を使用するハイブリダイゼーションプローブまたはＰＣＲプライマーとして使用することができる断片であってもよい。ＡＨＡＳＬ１タンパク質の生物学的活性部分は、本発明のＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列のうち１つの部分を単離すること、ＡＨＡＳＬ１タンパク質のコードされた部分を発現すること（たとえば、インビトロでの組み換え体発現によって）、およびＡＨＡＳＬ１タンパク質のコードされた部分の活性を評価することによって調製することができる。ＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列の断片であるポリヌクレオチド分子は、意図される使用に依存して、少なくとも約１５、２０、５０、７５、１００、２００、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００、６５０、７００、７５０、８００、８５０、もしくは９００個のヌクレオチドまたは本明細書で開示される完全長ヌクレオチド配列中に存在するヌクレオチドの数までのヌクレオチドを含む。
【００８６】
本発明のＡＨＡＳＬ１タンパク質の生物学的活性部分をコードするＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列の断片は、少なくとも約１５、２５、３０、５０、７５、１００、１２５、１５０、１７５、２００、２２５、もしくは２５０個の隣接するアミノ酸または本発明の完全長ＡＨＡＳＬ１タンパク質中に存在するアミノ酸の総数までのアミノ酸をコードする。ＰＣＲプライマーのためのハイブリダイゼーションプローブとして有用な、ＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列の断片は、一般的に、ＡＨＡＳＬ１タンパク質の生物学的活性部分をコードする必要はない。
【００８７】
本明細書で開示されるヌクレオチド配列の変異体であるポリヌクレオチド分子もまた本発明によって包含される。本発明のＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列の「変異体」は、本明細書で開示されるＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするが、遺伝コードの縮重のために保存的に異なるそれらの配列を含む。これらの天然に存在する対立遺伝子変異体は、下記に概説されるようなポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）技術およびハイブリダイゼーション技術などのようなよく知られている分子生物学技術の使用により同定することができる。変異体ヌクレオチド配列はまた、たとえば、下記に論じられるように、部位特異的突然変異誘発を使用することによって産生されたが、本発明で開示されるＡＨＡＳＬ１タンパク質をなおコードする、合成的に誘導されたヌクレオチド配列をも含む。一般的に、本発明のヌクレオチド配列変異体は、本明細書で開示される特定のヌクレオチド配列に対して少なくとも約７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％の同一性を有する。変異体ＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列は、本明細書で開示されるＡＨＡＳＬ１タンパク質のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％の同一性を有するアミノ酸配列を有するＡＨＡＳＬ１タンパク質をそれぞれコードする。
【００８８】
加えて、当業者は、さらに、変化を、突然変異によって本発明のヌクレオチド配列の中に導入して、それによって、ＡＨＡＳＬ１タンパク質の生物学的活性を改変することなく、コードされたＡＨＡＳＬ１タンパク質のアミノ酸配列の変化をもたらすことができることを十分に理解するであろう。したがって、配列番号１１の配列と異なる配列を有するＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードする単離ポリヌクレオチド分子は、１つまたは複数のアミノ酸の置換、付加、または欠失がコードされたタンパク質の中に導入されるように、本明細書で開示される対応するヌクレオチド配列の中に１つまたは複数のヌクレオチドの置換、付加、または欠失を導入することによって作り出すことができる。突然変異は、部位特異的突然変異誘発およびＰＣＲ媒介性の突然変異誘発などのような標準的な技術によって導入することができる。そのような変異体ヌクレオチド配列もまた本発明によって包含される。
【００８９】
たとえば、好ましくは、保存的アミノ酸置換は、１つまたは複数の予測される非必須アミノ酸残基で成すことができる。「非必須」アミノ酸残基は、生物学的活性を改変することなくＡＨＡＳＬ１タンパク質の野生型配列（たとえば配列番号１の配列）から改変することができる残基であるのに対して、「必須」アミノ酸残基は、生物学的活性に必要とされる。「保存的アミノ酸置換」は、同様の側鎖を有するアミノ酸残基とアミノ酸残基が交換される置換である。同様の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは当技術分野で定義されている。これらのファミリーは、塩基性側鎖（たとえばリシン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖（たとえばアスパラギン酸、グルタミン酸）、無電荷極性側鎖（たとえばグリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン）、無極性側鎖（たとえばアラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン）、ベータ分岐側鎖（たとえばトレオニン、バリン、イソロイシン）、および芳香族側鎖（たとえばチロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）を有するアミノ酸を含む。そのような置換は、保存アミノ酸残基または保存モチーフ内に存在するアミノ酸残基にはなされない。
【００９０】
本発明のタンパク質は、アミノ酸置換、欠失、切断、および挿入を含む様々な方法で改変することができる。そのような操作のための方法は、当技術分野で一般的に知られている。たとえば、ＡＨＡＳＬ１タンパク質のアミノ酸配列変異体は、ＤＮＡ中での突然変異によって調製することができる。突然変異誘発およびヌクレオチド配列の改変のための方法は、当技術分野でよく知られている。たとえばＫｕｎｋｅｌ（１９８５年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８２：４８８〜４９２ページ；Ｋｕｎｋｅｌら（１９８７年）Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．１５４：３６７〜３８２ページ；米国特許第４，８７３，１９２号；ＷａｌｋｅｒおよびＧａａｓｔｒａ編（１９８３年）Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（ＭａｃＭｉｌｌａｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏｍｐａｎｙ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）、ならびにそこに引用される参考文献を参照されたい。対象とするタンパク質の生物学的活性に影響を与えない適切なアミノ酸置換に関するガイダンスは、参照によって本明細書に組み込まれるＤａｙｈｏｆｆら（１９７８年）Ａｔｌａｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ（Ｎａｔｌ．Ｂｉｏｍｅｄ．Ｒｅｓ．Ｆｏｕｎｄ．、Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｄ．Ｃ．）のモデルに見つけることができる。同様の特性を有する他のアミノ酸とのあるアミノ酸の交換などのような保存的置換は好ましい可能性がある。
【００９１】
その代わりに、変異体ＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列は、飽和突然変異誘発によってなどのように、ＡＨＡＳＬ１コード配列のすべてまたは一部分に沿って突然変異を無作為に導入することによって作製することができ、結果として生じる突然変異体は、除草剤抵抗性のＡＨＡＳ活性を含むＡＨＡＳ活性を保持する突然変異体を同定するためにＡＨＡＳ活性についてスクリーニングすることができる。突然変異誘発に続いて、コードされたタンパク質は、組み換えで発現させることができ、タンパク質の活性は、標準的なアッセイ技術を使用して決定することができる。
【００９２】
したがって、本発明のヌクレオチド配列は、本明細書で開示される配列ならびにその断片および変異体を含む。本発明のＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列ならびにその断片および変異体は、他の植物でＡＨＡＳＬ相同体を同定するおよび／またはクローニングするためのプローブおよび／またはプライマーとして使用することができる。そのようなプローブは、同じまたは同一のタンパク質をコードする転写物またはゲノム配列を検出するために使用することができる。
【００９３】
このように、ＰＣＲ、ハイブリダイゼーション、およびその他同種のものなどのような方法は、本発明の配列に対して実質的な同一性を有するそのような配列を同定するために使用することができる。たとえばＳａｍｂｒｏｏｋら（１９８９年）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（第２版、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ、Ｐｌａｉｎｖｉｅｗ、ＮＹ）およびＩｎｎｉｓら（１９９０年）ＰＣＲ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ：Ａ  Ｇｕｉｄｅ  ｔｏ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ａｎｄ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ、ＮＹ）を参照されたい。本明細書に記載されるＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列またはその断片および変異体に対する配列同一性に基づいて単離されたＡＨＡＳＬヌクレオチド配列は、本発明によって包含される。
【００９４】
ハイブリダイゼーション法では、知られているＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列のすべてまたは一部分は、ｃＤＮＡまたはゲノムライブラリーをスクリーニングするために使用することができる。そのようなｃＤＮＡおよびゲノムライブラリーの構築のための方法は、当技術分野で一般的に知られており、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（１９８９年）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（第２版、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ、Ｐｌａｉｎｖｉｅｗ、ＮＹ）に開示される。いわゆるハイブリダイゼーションプローブは、ゲノムＤＮＡ断片、ｃＤＮＡ断片、ＲＮＡ断片、または他のオリゴヌクレオチドであってもよく、３２Ｐなどのような検出可能なグループまたは他の放射性同位元素、蛍光性化合物、酵素、もしくは酵素補因子などのような他の検出可能なマーカーを用いて標識することができる。ハイブリダイゼーションのためのプローブは、本明細書で開示される、知られているＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列に基づいて合成オリゴヌクレオチドを標識することによって作製することができる。知られているＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列またはコードされたアミノ酸配列中の保存ヌクレオチドまたは保存アミノ酸残基に基づいて設計される縮重プライマーは加えて使用することができる。プローブは、典型的には、本発明のＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列またはその断片もしくは変異体の少なくとも約１２、好ましくは約２５、より好ましくは約５０、７５、１００、１２５、１５０、１７５、２００、２５０、３００、３５０、４００、５００、６００、７００、８００、または９００個の連続ヌクレオチドにストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列の領域を含む。ハイブリダイゼーションのプローブの調製は、当技術分野で一般的に知られており、参照によって本明細書に組み込まれるＳａｍｂｒｏｏｋら（１９８９年）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（２ｄ編、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ、Ｐｌａｉｎｖｉｅｗ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）に開示される。
【００９５】
たとえば、本明細書で開示される全ＡＨＡＳＬ１配列またはその１つもしくは複数の部分は、対応するＡＨＡＳＬ１配列およびメッセンジャーＲＮＡに特異的にハイブリダイズすることができるプローブとして使用することができる。ハイブリダイゼーション技術は、平板培養したＤＮＡライブラリーのハイブリダイゼーションスクリーニングを含む（プラークまたはコロニーのいずれか；たとえば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（１９８９年）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（第２版、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ、Ｐｌａｉｎｖｉｅｗ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋを参照されたい）。
【００９６】
そのような配列のハイブリダイゼーションはストリンジェントな条件下で実行することができる。「ストリンジェントな条件」または「ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件」によって、プローブが、他の配列よりも検出可能に高い程度まで（たとえばバックグラウンドに対して少なくとも２倍）その標的配列にハイブリダイズする条件が意図される。ストリンジェントな条件は、配列依存的であり、異なる状況では異なる。
【００９７】
典型的には、ストリンジェントな条件は、塩濃度が、ｐＨ７．０〜８．３で、約１．５Ｍ  Ｎａイオン未満、典型的には約０．０１〜１．０Ｍ  Ｎａイオン濃度（または他の塩）であり、温度が、短いプローブ（たとえば１０〜５０ヌクレオチド）について少なくとも約３０℃および長いプローブ（たとえば５０ヌクレオチドよりも長い）について少なくとも約６０℃である条件となる。ストリンジェントな条件はまた、ホルムアミドなどのような不安定化剤を追加して達成することができる。例示的な低ストリンジェンシー条件は、３０〜３５％ホルムアミド、１Ｍ  ＮａＣｌ、１％ＳＤＳ（ドデシル硫酸ナトリウム）の緩衝溶液を用いる３７℃でのハイブリダイゼーションおよび１×〜２×ＳＳＣ（２０×ＳＳＣ＝３．０Ｍ  ＮａＣｌ／０．３Ｍクエン酸三ナトリウム）中での５０〜５５℃での洗浄を含む。例示的な中程度のストリンジェンシー条件は、４０〜４５％ホルムアミド、１．０Ｍ  ＮａＣｌ、１％ＳＤＳ中での３７℃でのハイブリダイゼーションおよび５５〜６０℃での０．５×〜１×ＳＳＣ中での洗浄を含む。例示的な高度なストリンジェンシー条件は、５０％ホルムアミド、１Ｍ  ＮａＣｌ、１％ＳＤＳ中での３７℃でのハイブリダイゼーションおよび６０〜６５℃での０．１×ＳＳＣ中での洗浄を含む。任意選択で、洗浄緩衝液は、約０．１％〜約１％ＳＤＳを含んでもよい。ハイブリダイゼーションの継続期間は、一般的に約２４時間未満、普通約４〜約１２時間である。
【００９８】
特異性は、典型的には、ハイブリダイゼーション後の洗浄の関数であり、決定的な因子は、最終洗浄溶液のイオン強度および温度である。ＤＮＡ−ＤＮＡ雑種については、Ｔｍは、ＭｅｉｎｋｏｔｈおよびＷａｈｌ（１９８４年）Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１３８：２６７〜２８４ページ：Ｔｍ＝８１．５℃＋１６．６（ｌｏｇＭ）＋０．４１（％ＧＣ）−０．６１（％ｆｏｒｍ）−５００／Ｌの方程式から概算することができ、ここで、Ｍは、一価カチオンのモル濃度であり、％ＧＣは、ＤＮＡ中のグアノシンヌクレオチドおよびシトシンヌクレオチドの百分率であり、％ｆｏｒｍは、ハイブリダイゼーション溶液中のホルムアミドの百分率であり、Ｌは、塩基対の雑種の長さである。Ｔｍは、相補的な標的配列の５０％が、完全に一致するプローブにハイブリダイズする温度である（規定されたイオン強度およびｐＨ下）。Ｔｍは、１％の不一致毎に約１℃低下し、したがって、Ｔｍ、ハイブリダイゼーション、および／または洗浄の条件は、望ましい同一性の配列にハイブリダイズするために調整することができる。たとえば、＞９０％の同一性を有する配列が要求される場合、Ｔｍは、１０℃減少させることができる。一般的に、ストリンジェントな条件は、規定されたイオン強度およびｐＨで、特異的配列およびその相補体の熱的融点（Ｔｍ）よりも約５℃低くなるように選択される。しかしながら、極度にストリンジェントな条件は、熱的融点（Ｔｍ）よりも１、２、３、または４℃低いハイブリダイゼーションおよび／または洗浄を利用することができ、中程度にストリンジェントな条件は、熱的融点（Ｔｍ）よりも６、７、８、９、または１０℃低いハイブリダイゼーションおよび／または洗浄を利用することができ、低ストリンジェンシー条件は、熱的融点（Ｔｍ）よりも１１、１２、１３、１４、１５、または２０℃低いハイブリダイゼーションおよび／または洗浄を利用することができる。方程式、ハイブリダイゼーション組成物および洗浄組成物、ならびに望ましいＴｍを使用すると、当業者らは、ハイブリダイゼーション溶液および／または洗浄溶液のストリンジェンシーの変化が本質的に説明されることを理解するであろう。不一致の望ましい程度が、４５℃（水溶液）または３２℃（ホルムアミド溶液）未満のＴｍをもたらす場合、より高い温度を使用することができるようにＳＳＣ濃度を増加させることが好ましい。核酸のハイブリダイゼーションの広範囲なガイドは、Ｔｉｊｓｓｅｎ（１９９３年）Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ｉｎ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ−Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ  ｗｉｔｈ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｐｒｏｂｅｓ、第Ｉ部、第２章（Ｅｌｓｅｖｉｅｒ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）；およびＡｕｓｕｂｅｌら編（１９９５年）Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、第２章（Ｇｒｅｅｎｅ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  ａｎｄ  Ｗｉｌｅｙ−Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）に見つけられる。Ｓａｍｂｒｏｏｋら（１９８９年）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（第２版、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ、Ｐｌａｉｎｖｉｅｗ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）を参照されたい。
【００９９】
本発明のポリヌクレオチド分子およびタンパク質は、配列番号１３、１４、および／もしくは１５のヌクレオチド配列または配列番号３、４、および／もしくは５のアミノ酸配列と十分に同一であるヌクレオチドまたはアミノ酸配列を含むポリヌクレオチド分子およびタンパク質を包含することが認識される。「十分に同一」といった用語は、第１および第２のアミノ酸配列またはヌクレオチド配列が共通の構造ドメインおよび／または共通の機能的活性を有するように、第２のアミノ酸配列またはヌクレオチド配列に対して、十分なまたは最小限の数の、同一または等価である（たとえば同様の側鎖を有する）アミノ酸残基またはヌクレオチドを含有する第１のアミノ酸配列またはヌクレオチド配列を指すために本明細書で使用される。たとえば、少なくとも約４５％、５５％、または６５％の同一性、好ましくは７５％の同一性、より好ましくは８５％、９５％、または９８％の同一性を有する共通の構造ドメインを含有するアミノ酸配列またはヌクレオチド配列は、十分に同一のものとして本明細書で定義される。
【０１００】
２つのアミノ酸配列または２つの核酸の同一性パーセントを決定するために、配列は最適な比較目的のためにアラインメントする。２つの配列の間の同一性パーセントは、配列によって共有される同一の位置の数の関数である（つまり、同一性パーセント＝同一の位置の数／位置の総数（たとえば重なる位置）×１００）。一態様では、２つの配列は同じ長さである。２つの配列の間の同一性パーセントは、ギャップを割り当ててまたは割り当てずに、下記に記載される技術に同様の技術を使用して決定することができる。同一性パーセントを計算する際に、典型的には、正確に一致するものが数えられる。
【０１０１】
２つの配列の間の同一性パーセントの決定は、数学的アルゴリズムを使用して実行することができる。２つの配列の比較のために利用される数学的アルゴリズムの好ましい非限定的な例は、ＫａｒｌｉｎおよびＡｌｔｓｃｈｕｌ（１９９３年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９０：５８７３〜５８７７ページと同様に改変されたＫａｒｌｉｎおよびＡｌｔｓｃｈｕｌ（１９９０年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８７：２２６４のアルゴリズムである。そのようなアルゴリズムは、Ａｌｔｓｃｈｕｌら（１９９０年）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３のＮＢＬＡＳＴおよびＸＢＬＡＳＴのプログラムの中に組み込まれる。ＢＬＡＳＴヌクレオチド検索は、本発明のポリヌクレオチド分子に相同性であるヌクレオチド配列を得るために、ＮＢＬＡＳＴプログラム、スコア＝１００、ワード長＝１２を用いて行なうことができる。ＢＬＡＳＴタンパク質検索は、本発明のタンパク質分子に相同性のアミノ酸配列を得るために、ＸＢＬＡＳＴプログラム、スコア＝５０、ワード長＝３を用いて行なうことができる。比較目的のためにギャップアラインメントをするために、Ｇａｐｐｅｄ  ＢＬＡＳＴは、Ａｌｔｓｃｈｕｌら（１９９７年）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２５：３３８９に記載されるように利用することができる。その代わりに、ＰＳＩ−Ｂｌａｓｔは、分子間の遠縁の関連性を検出する繰り返しの検索を行なうために使用することができる。Ａｌｔｓｃｈｕｌら（１９９７年）前掲を参照されたい。ＢＬＡＳＴプログラム、Ｇａｐｐｅｄ  ＢＬＡＳＴプログラム、およびＰＳＩ−Ｂｌａｓｔプログラムを利用する場合、それぞれのプログラム（たとえばＸＢＬＡＳＴおよびＮＢＬＡＳＴ）のデフォルトパラメーターを使用することができる。配列の比較のために利用される数学的アルゴリズムの他の好ましい非限定的な例は、ＭｙｅｒｓおよびＭｉｌｌｅｒ（１９８８年）ＣＡＢＩＯＳ  ４：１１〜１７ページのアルゴリズムである。そのようなアルゴリズムは、ＡＬＩＧＮプログラム（バージョン２．０）の中に組み込まれており、これは、ＧＣＧ配列アラインメントソフトウェアパッケージの一部分である。アミノ酸配列を比較するためにＡＬＩＧＮプログラムを利用する場合、ＰＡＭ１２０重み残基表、１２のギャップ長ペナルティー、および４のギャップペナルティーを使用することができる。アラインメントはまた、検査によって手作業で行なわれてもよい。
【０１０２】
他に述べられない限り、本明細書で提供される配列同一性／類似性の値は、本発明の完全長配列を使用しておよびデフォルトパラメーターを使用する、ソフトウェアパッケージＶｅｃｔｏｒ  ＮＴＩスイートバージョン９（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ、ＵＳＡ）に含まれるプログラムＡｌｉｇｎＸまたはその任意の等価なプログラムを使用するアルゴリズムＣｌｕｓｔａｌ  Ｗ（Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２２（２２）：４６７３〜４６８０ページ、１９９４年）による複数のアラインメントを使用して得られる値を指す。「等価プログラム」によって、ソフトウェアパッケージＶｅｃｔｏｒ  ＮＴＩスイートバージョン９のＡｌｉｇｎＸによって生なされる対応するアラインメントと比較した場合に、問題の任意の２つの配列について、同一のヌクレオチドまたはアミノ酸残基の一致および同一の配列同一性パーセントを有するアラインメントを生成する任意の配列比較プログラムが意図される。
【０１０３】
本発明のＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列は、天然に存在する配列および突然変異形態、具体的には、除草剤抵抗性のＡＨＡＳ活性を含むＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードする突然変異形態の両方を含む。同じく、本発明のタンパク質は、天然に存在するタンパク質ならびにその変形および改変形態の両方を包含する。そのような変異体は、望ましいＡＨＡＳ活性を保有し続ける。言うまでもなく、変異体をコードするＤＮＡ中に作製される突然変異により、リーディングフレームの外にその配列が配置されてはならず、好ましくは、二次的ｍＲＮＡ構造物を生産することができる相補的な領域を作り出さない。欧州特許出願公開第７５，４４４号を参照されたい。
【０１０４】
本明細書で包含されるタンパク質配列の欠失、挿入、および置換は、タンパク質の特徴の根本的な変化をもたらすことは期待されない。しかしながら、置換、欠失、または挿入の正確な影響を、そうするのに先立って予測するのが困難である場合、当業者は、影響が、日常的なスクリーニングアッセイによって評価されることを十分に理解するであろう。すなわち、活性は、ＡＨＡＳ活性アッセイによって評価することができる。たとえば、参照によって本明細書に組み込まれるＳｉｎｇｈら（１９８８年）Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１７１：１７３〜１７９ページを参照されたい。
【０１０５】
変異ヌクレオチド配列および変異タンパク質はまた、ＤＮＡシャフリングなどのような突然変異誘発性手順および組み換え誘導手順から誘導される配列およびタンパク質を包含する。そのような手順を用いて、１つまたは複数の異なるＡＨＡＳＬコード配列は、望ましい特性を保有する新しいＡＨＡＳＬタンパク質を作り出すために操作することができる。このように、組み換えポリヌクレオチドのライブラリーは、実質的な配列同一性を有し、インビトロでまたはインビボで相同的に組み換えることができる配列領域を含む、関係のある配列ポリヌクレオチドの集団から産生される。たとえば、このアプローチを使用して、対象とするドメインをコードする配列モチーフは、本発明のＡＨＡＳＬ１遺伝子および他の知られているＡＨＡＳＬ遺伝子の間でシャッフルして、酵素の場合にＫｍの増加などのような、改善された対象とする特性を有するタンパク質をコードする新しい遺伝子が得られてもよい。そのようなＤＮＡシャフリングのための戦略は、当技術分野で知られている。たとえばＳｔｅｍｍｅｒ（１９９４年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９１：１０７４７〜１０７５１ページ；Ｓｔｅｍｍｅｒ（１９９４年）Ｎａｔｕｒｅ  ３７０：３８９〜３９１ページ；Ｃｒａｍｅｒｉら（１９９７年）Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈ．１５：４３６〜４３８ページ；Ｍｏｏｒｅら（１９９７年）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２７２：３３６〜３４７ページ；Ｚｈａｎｇら（１９９７年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９４：４５０４〜４５０９ページ；Ｃｒａｍｅｒｉら（１９９８年）Ｎａｔｕｒｅ  ３９１：２８８〜２９１ページ；ならびに米国特許第５，６０５，７９３号および第５，８３７，４５８号を参照されたい。
【０１０６】
本発明のヌクレオチド配列は、他の生物、具体的には他の植物、より具体的には他の双子葉類からの対応する配列を単離するために使用することができる。このように、ＰＣＲ、ハイブリダイゼーション、およびその他同種のものなどのような方法は、本明細書で記載される配列に対するそれらの配列相同性に基づいてそのような配列を同定するために使用することができる。本明細書で記載される全ＡＨＡＳＬ１配列またはその断片に対するそれらの配列同一性に基づいて単離される配列は、本発明によって包含される。したがって、ＡＨＡＳＬタンパク質をコードし、本明細書で開示される配列またはその断片にストリンジェントな条件下でハイブリダイズする単離配列は、本発明によって包含される。
【０１０７】
ＰＣＲアプローチでは、オリゴヌクレオチドプライマーは、任意の対象とする植物から抽出されるｃＤＮＡまたはゲノムＤＮＡから対応するＤＮＡ配列を増幅するためにＰＣＲ反応で使用するために設計することができる。ＰＣＲプライマーを設計するためのおよびＰＣＲクローニングのための方法は、当技術分野で一般的に知られており、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（１９８９年）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（第２版、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ、ＰＩａｉｎｖｉｅｗ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）に開示される。Ｉｎｎｉｓら編（１９９０年）ＰＣＲ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ：Ａ  Ｇｕｉｄｅ  ｔｏ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ａｎｄ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）；ＩｎｎｉｓおよびＧｅｌｆａｎｄ編（１９９５年）ＰＣＲ  Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）；ならびにＩｎｎｉｓおよびＧｅｌｆａｎｄ編（１９９９年）ＰＣＲ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｍａｎｕａｌ（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）もまた参照されたい。ＰＣＲの知られている方法は、対のプライマー、入れ子型プライマー、単一特異的プライマー、縮重プライマー、遺伝子特異的プライマー、ベクター特異的プライマー、部分的に不一致のプライマー、およびその他同種のものを使用する方法を含むが、これらに限定されない。
【０１０８】
本発明のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列は、対象とする植物の発現のために発現カセット中に提供される。カセットは、本発明のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列に作動可能に連結された５’調節配列および３’調節配列を含む。「作動可能に連結された」によって、プロモーターおよび第２の配列の間の機能的な連結が意図され、プロモーター配列は、第２の配列に対応するＤＮＡ配列の転写を開始し、媒介する。一般的に、作動可能に連結されたは、連結している核酸配列が、隣接していることを意味し、２つのタンパク質コード領域をつなぐのに必要な場合、隣接しており、同じリーディングフレーム中にあることを意味する。カセットは、加えて、生物の中に同時形質転換されるように少なくとも１つのさらなる遺伝子を含有してもよい。その代わりに、１つまたは複数のさらなる遺伝子は、複数の発現カセット上に提供することができる。
【０１０９】
そのような発現カセットは、調節領域の転写調節下となるように、ＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列の挿入のための複数の制限部位に提供される。発現カセットは、加えて、選択可能なマーカー遺伝子を含有してもよい。
【０１１０】
発現カセットは、転写の５’−３’方向に、植物で機能的な転写開始領域および翻訳開始領域（つまりプロモーター）、本発明のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列、ならびに転写終了領域および翻訳終了領域（つまり終了領域）を含む。プロモーターは、植物宿主に対しておよび／または本発明のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列に対して、本来のものまたは類似性のものまたは外来性のものもしくは異種性のものであってもよい。加えて、プロモーターは、自然の配列またはその代わりに合成配列であってもよい。プロモーターが、植物宿主に対して「外来性の」または「異種性の」ものである場合、プロモーターは、プロモーターが導入される本来の植物中に見つけられないことが意図される。プロモーターが、本発明のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列に対して「外来性の」または「異種性の」ものである場合、プロモーターは、本発明の作動可能に連結されたＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列に対して本来のまたは天然に存在するプロモーターではないことが意図される。本明細書で使用されるように、キメラ遺伝子は、コード配列に対して異種性の転写開始領域に作動可能に連結されたコード配列を含む。
【０１１１】
異種性のプロモーターを使用して、本発明のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチドを発現させることが好ましい可能性もあるが、本来のプロモーター配列を使用してもよい。そのような構築物は、植物または植物細胞中でＡＨＡＳＬ１タンパク質の発現レベルを変化させる。したがって、植物または植物細胞の表現型は改変される。
【０１１２】
終了領域は、転写開始領域と共に本来のものであってもよい、対象とする作動可能に連結されたＡＨＡＳＬ１配列と共に本来のものであってもよい、植物宿主と共に本来のものであってもよい、または他の供給源に由来してもよい（つまり、プロモーター、対象とするＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列、植物宿主、またはその任意の組み合わせに対して外来性のまたは異種性の）。好都合な終了領域は、オクトピンシンターゼ終了領域およびノパリンシンターゼ終了領域などのような、Ａ．ツメファシエンスのＴｉプラスミドから入手可能である。Ｇｕｅｒｉｎｅａｕら（１９９１年）Ｍｏｌ．Ｇｅｎ．Ｇｅｎｅｔ．２６２：１４１〜１４４ページ；Ｐｒｏｕｄｆｏｏｔ（１９９１年）Ｃｅｌｌ  ６４：６７１〜６７４ページ；Ｓａｎｆａｃｏｎら（１９９１年）Ｇｅｎｅｓ  Ｄｅｖ．５：１４１〜１４９ページ；Ｍｏｇｅｎら（１９９０年）Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  ２：１２６１〜１２７２ページ；Ｍｕｎｒｏｅら（１９９０年）Ｇｅｎｅ  ９１：１５１〜１５８ページ；Ｂａｌｌａｓら（１９８９年）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１７：７８９１〜７９０３ページ；およびＪｏｓｈｉら（１９８７年）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．１５：９６２７〜９６３９ページもまた参照されたい。
【０１１３】
適切な場合には、１つまたは複数の遺伝子は、形質転換植物中での発現の増加のために最適化することができる。すなわち、遺伝子は、発現の改善のために、植物にとって好ましいコドンを使用して合成することができる。宿主にとって好ましいコドン使用頻度の考察については、たとえばＣａｍｐｂｅｌｌおよびＧｏｗｒｉ（１９９０年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．９２：１〜１１ページを参照されたい。方法は、植物にとって好ましい遺伝子を合成するために当技術分野で入手可能である。たとえば、参照によって本明細書に組み込まれる米国特許第５，３８０，８３１号および第５，４３６，３９１号ならびにＭｕｒｒａｙら（１９８９年）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１７：４７７〜４９８ページを参照されたい。
【０１１４】
さらなる配列改変は、細胞性の宿主中の遺伝子発現を増強することが知られている。これらは、偽性のポリアデニル化シグナル、エキソン−イントロンスプライス部位シグナル、トランスポゾン様リピート、および遺伝子発現に対して有害性である可能性がある他のそのようなよく特徴づけられた配列をコードする配列の排除を含む。配列のＧ−Ｃ含有量は、宿主細胞中で発現される、知られている遺伝子に対する参照によって計算されるように、所与の細胞性の宿主にとって平均的なレベルに調整することができる。可能な場合、配列は、予測されるヘアピン二次的ｍＲＮＡ構造物を回避するために改変される。
【０１１５】
遺伝子発現を増強するためのヌクレオチド配列もまた植物発現ベクター中に使用することができる。これらは、トウモロコシＡｄｈＩ、イントロン１遺伝子のイントロン（Ｃａｌｌｉｓら  Ｇｅｎｅｓ  ａｎｄ  Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ  １：１１８３〜１２００ページ、１９８７年）ならびにタバコモザイクウイルス（ＴＭＶ）、トウモロコシクロロティックモトルウイルス、およびアルファルファモザイクウイルスからのリーダー配列（Ｗ配列）（Ｇａｌｌｉｅら  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．１５：８６９３〜８７１１ページ、１９８７年およびＳｋｕｚｅｓｋｉら  Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１５：６５〜７９ページ、１９９０年）を含む。トウモロコシのｓｈｒｕｎｋｅｎｔ−１座からの第１のイントロンは、キメラ遺伝子構築物中で遺伝子の発現を増加させることが示された。米国特許第５，４２４，４１２号および第５，５９３，８７４号は、遺伝子発現構築物中での特異的なイントロンの使用を開示し、Ｇａｌｌｉｅら（Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．１０６：９２９〜９３９ページ、１９９４年）もまた、イントロンが、組織特異的な方式で遺伝子発現を調節するのに有用であることを示した。ＡＨＡＳ小サブユニット遺伝子発現をさらに増強するためにまたは最適化するために、本発明の植物発現ベクターはまた、マトリックス付着領域（ＭＡＲ）を含有するＤＮＡ配列を含有してもよい。そのような改変された発現系を用いて形質転換された植物細胞は、次いで、本発明のヌクレオチド配列の過剰発現または構成的な発現を示し得る。
【０１１６】
発現カセットは、加えて、発現カセット構築物中に５’リーダー配列を含有してもよい。そのようなリーダー配列は、翻訳を増強するように作用することができる。翻訳リーダーは、当技術分野で知られており、ピコマウイルスリーダー、たとえばＥＭＣＶリーダー（脳心筋炎５’非コード領域）（Ｅｌｒｏｙ−Ｓｔｅｉｎら（１９８９年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８６：６１２６〜６１３０ページ）、ポティウイルスリーダー、たとえばＴＥＶリーダー（タバコエッチウイルス）（Ｇａｌｌｉｅら（１９９５年）Ｇｅｎｅ  １６５（２）：２３３〜２３８ページ）、ＭＤＭＶリーダー（トウモロコシ萎縮モザイクウイルス）（Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  １５４：９〜２０ページ）、およびヒト免疫グロブリン重鎖結合タンパク質（ＢｉＰ）（Ｍａｃｅｊａｋら（１９９１年）Ｎａｔｕｒｅ  ３５３：９０〜９４ページ）、アルファルファモザイクウイルスのコートタンパク質ｍＲＮＡからの非翻訳リーダー（ＡＭＶ  ＲＮＡ  ４）（Ｊｏｂｌｉｎｇら（１９８７年）Ｎａｔｕｒｅ  ３２５：６２２〜６２５ページ）、タバコモザイクウイルスリーダー（ＴＭＶ）（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ｏｆ  ＲＮＡ中のＧａｌｌｉｅら（１９８９年）、Ｃｅｃｈ編（Ｌｉｓｓ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）、２３７〜２５６ページ）、およびトウモロコシクロロティックモトルウイルスリーダー（ＭＣＭＶ）（Ｌｏｍｍｅｌら（１９９１年）Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ８１：３８２〜３８５ページ）を含む。Ｄｅｌｌａ−Ｃｉｏｐｐａら（１９８７年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．８４：９６５〜９６８ページもまた参照されたい。翻訳を増強することが知られている他の方法、たとえばイントロンおよびその他同種のものもまた利用することができる。
【０１１７】
発現カセットを調製する際に、様々なＤＮＡ断片は、適した配向でおよび必要に応じて、適したリーディングフレーム中にＤＮＡ配列を提供するために操作することができる。この目的のために、アダプターもしくはリンカーは、ＤＮＡ断片をつなぐために使用されてもよく、または他の操作は、好都合な制限部位、余分なＤＮＡの除去、制限部位の除去、もしくはその他同種のものを提供するために含まれてもよい。この目的のために、インビトロ突然変異誘発、プライマー修復、制限、アニーリング、再置換、たとえば転移、および塩基転換が含まれてもよい。
【０１１８】
多くのプロモーターは、本発明の実施において使用することができる。プロモーターは、望ましい結果に基づいて選択することができる。核酸は、植物中での発現のために、構成的なプロモーター、組織にとって好ましいプロモーター、または他のプロモーターと組み合わせることができる。
【０１１９】
そのような構成的なプロモーターは、たとえば、Ｒｓｙｎ７プロモーターのコアプロモーターならびに国際公開第９９／４３８３８号および米国特許第６，０７２，０５０号に開示される他の構成的なプロモーター、コアＣａＭＶ  ３５Ｓプロモーター（Ｏｄｅｌｌら（１９８５年）Ｎａｔｕｒｅ  ３１３：８１０〜８１２ページ）、イネアクチン（ＭｃＥｌｒｏｙら（１９９０年）Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  ２：１６３〜１７１ページ）、ユビキチン（Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎら（１９８９年）Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１２：６１９〜６３２ページおよびＣｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎら（１９９２年）Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１８：６７５〜６８９ページ）、ｐＥＭＵ（Ｌａｓｔら（１９９１年）Ｔｈｅｏｒ．Ａｐｐｌ．Ｇｅｎｅｔ．８１：５８１〜５８８ページ）、ＭＡＳ（Ｖｅｌｔｅｎら（１９８４年）ＥＭＢＯ  Ｊ．３：２７２３〜２７３０ページ）、ＡＬＳプロモーター（米国特許第５，６５９，０２６号）、ならびにその他同種のものを含む。他の構成的なプロモーターは、たとえば、米国特許第５，６０８，１４９号、第５，６０８，１４４号、第５，６０４，１２１号、第５，５６９，５９７号、第５，４６６，７８５号、第５，３９９，６８０号、第５，２６８，４６３号、第５，６０８，１４２号、および第６，１７７，６１１号を含む。
【０１２０】
組織にとって好ましいプロモーターは、特定の植物組織内でのＡＨＡＳＬ１発現の増強を標的とするために利用することができる。そのような組織にとって好ましいプロモーターは、葉にとって好ましいプロモーター、根にとって好ましいプロモーター、種子にとって好ましいプロモーター、および茎にとって好ましいプロモーターを含むが、これらに限定されない。組織にとって好ましいプロモーターは、Ｙａｍａｍｏｔｏら（１９９７年）Ｐｌａｎｔ  Ｊ．１２（２）：２５５〜２６５ページ；Ｋａｗａｍａｔａら（１９９７年）Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．３８（７）：７９２〜８０３ページ；Ｈａｎｓｅｎら（１９９７年）Ｍｏｔ．Ｇｅｎ  Ｇｅｎｅｔ．２５４（３）：３３７〜３４３ページ；Ｒｕｓｓｅｌｌら（１９９７年）Ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ  Ｒｅｓ．６（２）：１５７〜１６８ページ；Ｒｉｎｅｈａｒｔら（１９９６年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．１１２（３）：１３３１〜１３４１ページ；Ｖａｎ  Ｃａｍｐら（１９９６年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．１１２（２）：５２５〜５３５ページ；Ｃａｎｅｖａｓｃｉｎｉら（１９９６年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．１１２（２）：５１３〜５２４ページ；Ｙａｍａｍｏｔｏら（１９９４年）Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．３５（５）：７７３〜７７８ページ；Ｌａｍ（１９９４年）Ｒｅｓｕｌｔｓ  Ｐｒｏｂｌ．Ｃｅｌｌ  Ｄｉｆｆｅｒ  ２０：１８１〜１９６ページ；Ｏｒｏｚｃｏら（１９９３年）Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ．２３（６）：１１２９〜１１３８ページ；Ｍａｔｓｕｏｋａら（１９９３年）Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９０（２０）：９５８６〜９５９０ページ；およびＧｕｅｖａｒａ−Ｇａｒｃｉａら（１９９３年）Ｐｌａｎｔ  Ｊ．４（３）：４９５〜５０５ページを含む。そのようなプロモーターは、発現が弱いという理由で、必要であれば改変することができる。
【０１２１】
一態様では、対象とする核酸は、発現するために葉緑体を標的とする。このように、対象とする核酸が、葉緑体に直接挿入されない場合、発現カセットは、対象とする遺伝子産物を葉緑体に向けるために、加えて、葉緑体輸送ペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む葉緑体標的配列を含有する。そのような輸送ペプチドは当技術分野で知られている。葉緑体標的配列に関して、「作動可能に連結された」は、輸送ペプチドをコードする核酸配列（つまり葉緑体標的配列）は、２つの配列が隣接し、且つ同じリーディングフレーム中にあるように本発明のＡＨＡＳＬポリヌクレオチドに連結されることを意味する。たとえばＶｏｎ  Ｈｅｉｊｎｅら（１９９１年）Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．Ｒｅｐ．９：１０４〜１２６ページ；Ｃｌａｒｋら（１９８９年）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６４：１７５４４〜１７５５０ページ；Ｄｅｌｌａ−Ｃｉｏｐｐａら（１９８７年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．８４：９６５〜９６８ページ；Ｒｏｍｅｒら（１９９３年）Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍｕｎ．１９６：１４１４〜１４２１ページ；およびＳｈａｈら（１９８６年）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２３３：４７８〜４８１ページを参照されたい。本発明のＡＨＡＳＬ１タンパク質は、本来の葉緑体輸送ペプチドを含むが、当技術分野で知られている任意の葉緑体輸送ペプチドもまた、本発明の成熟ＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするヌクレオチド配列の５’端末に葉緑体標的配列を作動可能に連結することによって、本発明の成熟ＡＨＡＳＬ１タンパク質のアミノ酸配列に融合することができる。
【０１２２】
葉緑体標的配列は、当技術分野で知られており、リブロース−１，５−ビスリン酸カルボキシラーゼ（ルビスコ）の葉緑体小サブユニット（ｄｅ  Ｃａｓｔｒｏ  Ｓｉｌｖａ  Ｆｉｌｈｏら（１９９６年）Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３０：７６９〜７８０ページ；Ｓｃｈｎｅｌｌら（１９９１年）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６６（５）：３３３５〜３３４２ページ）；５−（エノールピルビル）シキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）（Ａｒｃｈｅｒら（１９９０年）Ｊ．Ｂｉｏｅｎｅｒｇ．Ｂｉｏｍｅｍｂ．２２（６）：７８９〜８１０ページ）；トリプトファンシンターゼ（Ｚｈａｏら（１９９５年）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７０（１１）：６０８１〜６０８７ページ）；プラストシアニン（Ｌａｗｒｅｎｃｅら（１９９７年）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７２（３３）：２０３５７〜２０３６３ページ）；コリスミ酸シンターゼ（Ｓｃｈｍｉｄｔら（１９９３年）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６８（３６）：２７４４７〜２７４５７ページ）；および集光性クロロフィルａ／ｂ結合タンパク質（ＬＨＢＰ）（Ｌａｍｐｐａら（１９８８年）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６３：１４９９６〜１４９９９ページ）を含む。Ｖｏｎ  Ｈｅｉｊｎｅら（１９９１年）Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．Ｒｅｐ．９：１０４〜１２６ページ；Ｃｌａｒｋら（１９８９年）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６４：１７５４４〜１７５５０ページ；Ｄｅｌｌａ−Ｃｉｏｐｐａら（１９８７年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．８４：９６５〜９６８ページ；Ｒｏｍｅｒら（１９９３年）Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍｕｎ．１９６：１４１４〜１４２１ページ；およびＳｈａｈら（１９８６年）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２３３：４７８〜４８１ページもまた参照されたい。
【０１２３】
葉緑体の形質転換のための方法は、当技術分野で知られている。たとえば、Ｓｖａｂら（１９９０年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８７：８５２６〜８５３０ページ；ＳｖａｂおよびＭａｌｉｇａ（１９９３年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９０：９１３〜９１７ページ；ＳｖａｂおよびＭａｌｉｇａ（１９９３年）ＥＭＢＯ  Ｊ．１２：６０１〜６０６ページを参照されたい。方法は、選択可能なマーカーを含有するＤＮＡのパーティクルガンデリバリーおよび相同組み換えを通しての色素体ゲノムに対するＤＮＡのターゲティングに依存する。加えて、色素体形質転換は、核コード色素体特異的ＲＮＡポリメラーゼの組織にとって好ましい発現による、サイレントな色素体由来の導入遺伝子のトランス活性化によって実行することができる。そのような系は、ＭｃＢｒｉｄｅら（１９９４年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９１：７３０１〜７３０５ページに報告されている。
【０１２４】
葉緑体を標的とする対象とする核酸は、植物の核およびこの細胞器官の間のコドン使用頻度の差異を明らかにするために、葉緑体中で発現のために最適化することができる。このように、対象とする核酸は、葉緑体にとって好ましいコドンを使用して合成することができる。たとえば、参照によって本明細書に組み込まれる米国特許第５，３８０，８３１号を参照されたい。
【０１２５】
本明細書で開示されるように、本発明のＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列は、それらのゲノム中に除草剤耐性のＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードする遺伝子を含む植物の除草剤耐性を増強する際の使用を見出す。そのような遺伝子は、内在性遺伝子または導入遺伝子であってもよい。加えて、ある態様では、本発明の核酸配列は、望ましい表現型を有する植物を作り出すために、対象とするポリヌクレオチド配列の任意の組み合わせと積み重ねることができる。たとえば、本発明のポリヌクレオチドは、たとえばバチルス・チューリンゲンシス毒素タンパク質などのような、農薬活性および／または殺虫活性を有するポリペプチドをコードする任意の他のポリヌクレオチドと積み重ねられてもよい（米国特許第５，３６６，８９２号；第５，７４７，４５０号；第５，７３７，５１４号；第５，７２３，７５６号；第５，５９３，８８１号；およびＧｅｉｓｅｒら（１９８６年）Ｇｅｎｅ  ４８：１０９に記載される）。生なされた組み合わせはまた、対象とするポリヌクレオチドのいずれか１つの複数のコピーをも含むことができる。
【０１２６】
これらのヌクレオチド配列を用いて、ＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド配列のメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）の少なくとも１つの部分に相補的なアンチセンス構築体を構築することができることが認識される。アンチセンスヌクレオチドは、対応するｍＲＮＡとハイブリダイズするために構築される。配列が、対応するｍＲＮＡにハイブリダイズし、その発現を阻害する限り、アンチセンスの配列の改変は成すことができる。このように、対応するアンチセンス配列に対して７０％、好ましくは８０％、より好ましくは８５％の配列同一性を有するアンチセンス構築体が使用することができる。そのうえ、アンチセンスヌクレオチドの部分は、標的遺伝子の発現を妨害するために使用することができる。一般的に、少なくとも５０のヌクレオチド、１００のヌクレオチド、２００のヌクレオチド、またはそれ以上の配列が使用することができる。
【０１２７】
本発明のヌクレオチド配列はまた、植物中での内在性遺伝子の発現を抑制するためにセンス配向で使用することができる。センス配向のヌクレオチド配列を使用して植物中での遺伝子発現を抑制するための方法は、当技術分野で知られている。方法は、一般的に、内在性遺伝子の転写物に対応するヌクレオチド配列の少なくとも１つの部分に作動可能に連結された、植物中での発現を駆動するプロモーターを含むＤＮＡ構築物を用いて植物を形質転換するステップを含む。典型的には、そのようなヌクレオチド配列は、好ましくは約６５％の配列同一性よりも高い、より好ましくは約８５％の配列同一性よりも高い、最も好ましくは約９５％の配列同一性よりも高い、内在性遺伝子の転写物の配列に対する実質的な配列同一性を有する。参照によって本明細書に組み込まれる米国特許第５，２８３，１８４号および第５，０３４，３２３号を参照されたい。
【０１２８】
本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチドは、植物形質転換の選択可能なマーカー遺伝子としての使用を見出すが、本発明の発現カセットは、形質転換細胞の選択のための他の選択可能なマーカー遺伝子を含むことができる。本発明の選択可能なマーカー遺伝子を含む選択可能なマーカー遺伝子は、形質転換細胞または形質転換組織の選択のために利用される。マーカー遺伝子は、ネオマイシンホスホトランスフェラーゼＩＩ（ＮＥＯ）およびヒグロマイシンホスホトランスフェラーゼ（ＨＰＴ）をコードする遺伝子などのような、抗生物質抵抗性をコードする遺伝子ならびにグルホシネートアンモニウム、ブロモキシニル、イミダゾリノン、および２，４−ジクロロフェノキシアセテート（２，４−Ｄ）などのような除草性化合物に対する抵抗性を付与する遺伝子を含むが、これらに限定されない。一般的にＹａｒｒａｎｔｏｎ（１９９２年）Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．３：５０６〜５１１ページ；Ｃｈｒｉｓｔｏｐｈｅｒｓｏｎら（１９９２年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：６３１４〜６３１８ページ；Ｙａｏら（１９９２年）Ｃｅｌｌ  ７１：６３〜７２ページ；Ｒｅｚｎｉｋｏｆｆ（１９９２年）Ｍｏｌ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．６：２４１９〜２４２２ページ；Ｔｈｅ  Ｏｐｅｒｏｎ中のＢａｒｋｌｅｙら（１９８０年）、１７７〜２２０ページ；Ｈｕら（１９８７年）Ｃｅｌｌ  ４８：５５５〜５６６ページ；Ｂｒｏｗｎら（１９８７年）Ｃｅｌｌ  ４９：６０３〜６１２ページ；Ｆｉｇｇｅら（１９８８年）Ｃｅｌｌ  ５２：７１３〜７２２ページ；Ｄｅｕｓｃｈｌｅら（１９８９年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ａｃｉ．ＵＳＡ  ８６：５４００〜５４０４ページ；Ｆｕｅｒｓｔら（１９８９年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８６：２５４９〜２５５３ページ；Ｄｅｕｓｃｈｌｅら（１９９０年）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４８：４８０〜４８３ページ；Ｇｏｓｓｅｎ（１９９３年）Ｐｈ．Ｄ．Ｔｈｅｓｉｓ、Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ；Ｒｅｉｎｅｓら（１９９３年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９０：１９１７〜１９２１ページ；Ｌａｂｏｗら（１９９０年）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１０：３３４３〜３３５６ページ；Ｚａｍｂｒｅｔｔｉら（１９９２年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：３９５２〜３９５６ページ；Ｂａｉｍら（１９９１年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８８：５０７２〜５０７６ページ；Ｗｙｂｏｒｓｋｉら（１９９１年）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１９：４６４７〜４６５３ページ；Ｈｉｌｌｅｎａｎｄ−Ｗｉｓｓｍａｎ（１９８９年）Ｔｏｐｉｃｓ  Ｍｏｌ  Ｓｔｒｕｃ．  Ｂｉｏｌ．１０：１４３〜１６２ページ；Ｄｅｇｅｎｋｏｌｂら（１９９１年）Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂ．Ａｇｅｎｔｓ  Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒ．３５：１５９１〜１５９５ページ；Ｋｌｅｉｎｓｃｈｎｉｄｔら（１９８８年）Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ２７：１０９４〜１１０４ページ；Ｂｏｎｉｎ（１９９３年）Ｐｈ．Ｄ．Ｔｈｅｓｉｓ、Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ；Ｇｏｓｓｅｎら（１９９２年）Ｐｒｏｃ．��ａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：５５４７〜５５５１ページ；Ｏｌｉｖａら（１９９２年）Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂ．Ａｇｅｎｔｓ  Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒ．３６：９１３〜９１９ページ；Ｈｌａｖｋａら（１９８５年）Ｈａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ、第７８巻（Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ、Ｂｅｒｌｉｎ）；Ｇｉｌｌら（１９８８年）Ｎａｔｕｒｅ  ３３４：７２１〜７２４ページを参照されたい。そのような開示は、参照によって本明細書に組み込まれる。
【０１２９】
選択可能なマーカー遺伝子の上記の一覧は、限定することを意味するものではない。任意の選択可能なマーカー遺伝子もまた本発明で使用することができる。
【０１３０】
本発明のＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む単離ポリヌクレオチド分子は、作り出される植物の、除草剤、具体的にはイミダゾリノン除草剤に対する抵抗性が増強するように植物を形質転換するためにベクター中に使用することができる。本発明の単離ＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド分子は、植物の除草剤抵抗性を付与する際に、単独でまたはＡＨＡＳ酵素の小サブユニット（ＡＨＡＳＳ）をコードするヌクレオチド配列と組み合わせてベクター中で使用することができる。参照によって本明細書に組み込まれる米国特許第６，３４８，６４３号を参照されたい。
【０１３１】
したがって、本発明は、本発明の選択可能なマーカー遺伝子を含む形質転換ベクターを提供する。選択可能なマーカー遺伝子は、本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドに作動可能に連結された、宿主細胞中での発現を駆動するプロモーターを含む。形質転換ベクターは、加えて、宿主細胞中で発現する対象とする遺伝子を含むことができ、望ましい場合、本発明のポリヌクレオチドに作動可能に連結された葉緑体標的配列を含むこともできる。
【０１３２】
本発明は、対象とする遺伝子を用いて形質転換された細胞を選択するために、本発明の形質転換ベクターを使用するための方法をさらに提供する。そのような方法では、形質転換ベクターを用いて宿主細胞を形質転換し、非形質転換宿主細胞を死滅させるまたはその成長を阻害するレベルのイミダゾリノン除草剤またはスルホニルウレア除草剤に細胞を曝露し、除草剤の存在下で成長するその能力によって形質転換宿主細胞を同定する。本発明の一態様では、宿主細胞は、植物細胞であり、選択可能なマーカー遺伝子は、植物細胞中で発現を駆動するプロモーターを含む。
【０１３３】
本発明の形質転換ベクターは、対象とする遺伝子を用いて形質転換された植物を生産するために使用することができる。形質転換ベクターは、本発明の選択可能なマーカー遺伝子および導入され、典型的には形質転換植物中で発現する対象とする遺伝子を含む。そのような選択可能なマーカー遺伝子は、宿主細胞中での発現を駆動するプロモーターに作動可能に連結された本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチドを含む。植物および植物細胞中で使用するために、形質転換ベクターは、植物細胞中での発現を駆動するプロモーターに作動可能に連結された本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチドを含む選択可能なマーカー遺伝子を含む。
【０１３４】
本発明はまた、本発明の単離ポリヌクレオチド分子に作動可能に連結された、植物中での発現を駆動するプロモーターを含む植物発現ベクターに関する。単離ポリヌクレオチド分子は、配列番号２、３、４、５、もしくは６に記載されるアミノ配列またはその機能的断片および変異体を含むＡＨＡＳＬ１タンパク質、具体的にはＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む。本発明の植物発現ベクターは特定のプロモーターに依存しない、ただ、そのようなプロモーターは植物細胞中で遺伝子発現を駆動することができる。好ましいプロモーターは、構成的なプロモーターおよび組織にとって好ましいプロモーターを含む。
【０１３５】
本発明の対象とする遺伝子は、望ましい結果に依存して変わる。たとえば、植物中の脂肪酸組成物の改変、植物のアミノ酸含有量の改変、植物の昆虫および／または病原菌に対する防衛メカニズムの改変、ならびにその他同種のものを含む、表現型の様々な変化は、対象とするものとなり得る。これらの結果は、異種性の産物の発現または植物中の内在性産物の発現の増加をもたらすことによって達成することができる。その代わりに、結果は、植物中の１つまたは複数の内在性産物、具体的には酵素または補因子の発現の低下をもたらすことによって達成することができる。これらの変化は、形質転換植物の表現型の変化をもたらす。
【０１３６】
本発明の一態様では、対象とする遺伝子は、たとえばバチルス・チューリンゲンシス毒素タンパク質遺伝子などのような昆虫抵抗性遺伝子を含む（米国特許第５，３６６，８９２号；第５，７４７，４５０号；第５，７３６，５１４号；第５，７２３，７５６号；第５，５９３，８８１号；およびＧｅｉｓｅｒら（１９８６年）Ｇｅｎｅ  ４８：１０９）。
【０１３７】
本発明のＡＨＡＳＬ１タンパク質またはポリペプチドは、たとえばアブラナ属植物から精製することができ、組成物中に使用することができる。さらに、本発明のＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードする単離ポリヌクレオチド分子は、大腸菌または酵母などのような微生物中で本発明のＡＨＡＳＬ１タンパク質を発現させるために使用することができる。発現されたＡＨＡＳＬ１タンパク質は、当業者らに知られている任意の方法によって大腸菌または酵母の抽出物から精製することができる。
【０１３８】
本発明はまた、除草剤に抵抗性のトランスジェニック植物を作り出すための方法であって、本発明の単離ポリヌクレオチド分子に作動可能に連結された、植物中での発現を駆動するプロモーターを含む植物発現ベクターを用いて植物を形質転換するステップを含む方法にも関する。単離ポリヌクレオチド分子は、本発明のＡＨＡＳＬ１タンパク質、具体的には、配列番号２、３、４、５、もしくは６に記載されるアミノ酸配列、配列番号１２、１３、１４、１５、もしくは１６によってコードされるアミノ酸配列、または上述のアミノ酸配列の機能的断片および変異体を含むＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む。
【０１３９】
本発明はまた、非トランスジェニックアブラナ属植物、本発明の方法によって生産されるトランスジェニック植物、ならびにそのような非トランスジェニック植物およびトランスジェニック植物の後代および他の子孫に関し、これらの植物は、ＡＨＡＳ酵素を阻害する除草剤、具体的にはイミダゾリノン除草剤およびスルホニルウレア除草剤に対する抵抗性の増強または増加を示す。
【０１４０】
本発明のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド、具体的には、除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１タンパク質コードするポリヌクレオチドは、除草剤耐性の植物の抵抗性を増強するための方法での使用を見出す。本発明の一態様では、除草剤耐性の植物は、除草剤耐性のＡＨＡＳＬタンパク質または除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬタンパク質を含む。除草剤耐性の植物は、除草剤耐性のＡＨＡＳＬヌクレオチド配列を用いて形質転換された植物および除草剤耐性のＡＨＡＳＬタンパク質をコードする内在性遺伝子をそれらのゲノム中に含む植物の両方を含む。そのような除草剤耐性の植物は、除草剤耐性について遺伝子操作された除草剤耐性の植物またはたとえば本発明のアブラナ属植物などのような組み換えＤＮＡを含まない手段によって開発された除草剤耐性の植物とすることができる。除草剤耐性のＡＨＡＳＬタンパク質をコードするヌクレオチド配列ならびに除草剤耐性のＡＨＡＳＬタンパク質をコードする内在性遺伝子を含む除草剤耐性の植物は、本発明のポリヌクレオチドおよび植物ならびに当技術分野で知られているものを含む。たとえば、米国特許第５，０１３，６５９号、第５，７３１，１８０号、第５，７６７，３６１号、第５，５４５，８２２号、第５，７３６，６２９号、第５，７７３，７０３号、第５，７７３，７０４号、第５，９５２，５５３号、および第６，２７４，７９６号を参照されたい、これらのすべては、参照によって本明細書に組み込まれる。除草剤耐性の植物の抵抗性を増強するそのような方法は、本発明の除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１ポリヌクレオチド、具体的には、配列番号１２、１３、１４、１５、または１６に記載される除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードするポリヌクレオチド、配列番号２、３、４、５、または６に記載されるアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド、ならびに除草剤抵抗性のＡＨＡＳ活性を含むポリペプチドをコードする上述のポリヌクレオチドの断片および変異体に作動可能に連結された、植物細胞中での発現を駆動するプロモーターを含む少なくとも１つのポリヌクレオチド構築物を用いて除草剤耐性の植物を形質転換するステップを含む。この方法によって生産された植物は、本発明のポリヌクレオチド構築物を用いる形質転換前の除草剤抵抗性の植物と比較した場合に、少なくとも１つの除草剤に対する抵抗性が増強している。
【０１４１】
多数の植物形質転換ベクターおよび植物を形質転換するための方法は、入手可能である。たとえば、Ａｎ，Ｇ．ら（１９８６年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｙｓｉｏｌ．，８１：３０１〜３０５ページ；Ｆｒｙ，Ｊ．ら（１９８７年）Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｒｅｐ．６：３２１〜３２５ページ；Ｂｌｏｃｋ，Ｍ．（１９８８年）Ｔｈｅｏｒ．Ａｐｐｌ  Ｇｅｎｅｔ．７６：７６７〜７７４ページ；Ｈｉｎｃｈｅｅら（１９９０年）Ｓｔａｄｌｅｒ．Ｇｅｎｅｔ．Ｓｙｍｐ．２０３２１２．２０３〜２１２ページ；Ｃｏｕｓｉｎｓら（１９９１年）Ａｕｓｔ．Ｊ．Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．１８：４８１〜４９４ページ；Ｃｈｅｅ，Ｐ．Ｐ．およびＳｌｉｇｈｔｏｍ，Ｊ．Ｌ．（１９９２年）Ｇｅｎｅ．１１８：２５５〜２６０ページ；Ｃｈｒｉｓｔｏｕら（１９９２年）Ｔｒｅｎｄｓ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１０：２３９〜２４６ページ；Ｄ’Ｈａｌｌｕｉｎら（１９９２年）Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌ．１０：３０９〜３１４ページ；Ｄｈｉｒら（１９９２年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．９９：８１〜８８ページ；Ｃａｓａｓら（１９９３年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ  Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９０：１１２１２〜１１２１６ページ；Ｃｈｒｉｓｔｏｕ，Ｐ．（１９９３年）Ｉｎ  Ｖｉｔｒｏ  Ｃｅｌｌ．Ｄｅｖ．Ｂｉｏｌ．−Ｐｌａｎｔ；２９Ｐ：１１９〜１２４ページ；Ｄａｖｉｅｓら（１９９３年）Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｒｅｐ．１２：１８０〜１８３ページ；Ｄｏｎｇ，Ｊ．Ａ．およびＭｃｈｕｇｈｅｎ，Ａ．（１９９３年）Ｐｌａｎｔ  Ｓｃｉ．９１：１３９〜１４８ページ；Ｆｒａｎｋｌｉｎ，Ｃ．Ｉ．およびＴｒｉｅｕ，Ｔ．Ｎ．（１９９３年）Ｐｌａｎｔ．Ｐｈｙｓｉｏｌ．１０２：１６７；Ｇｏｌｏｖｋｉｎら（１９９３年）Ｐｌａｎｔ  Ｓｃｉ．９０：４１〜５２ページ；Ｇｕｏ  Ｃｈｉｎ  Ｓｃｉ．Ｂｕｌｌ．３８：２０７２〜２０７８ページ；Ａｓａｎｏら（１９９４年）Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｒｅｐ．１３；Ａｙｅｒｅｓ  Ｎ．Ｍ．およびＰａｒｋ，Ｗ．Ｄ．（１９９４年）Ｇｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｐｌａｎｔ．Ｓｃｉ．１３：２１９〜２３９ページ；Ｂａｒｃｅｌｏら（１９９４年）Ｐｌａｎｔ．Ｊ．５：５８３〜５９２ページ；Ｂｅｃｋｅｒら（１９９４年）Ｐｌａｎｔ．Ｊ．５：２９９〜３０７ページ；Ｂｏｒｋｏｗｓｋａら（１９９４年）Ａｃｔａ．ＰｈｙｓｉｏｌＰｌａｎｔ．１６：２２５〜２３０ページ；Ｃｈｒｉｓｔｏｕ，Ｐ．（１９９４年）Ａｇｒｏ．Ｆｏｏｄ．Ｉｎｄ．Ｈｉ  Ｔｅｃｈ．５：１７〜２７ページ；Ｅａｐｅｎら（１９９４年）Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｒｅｐ．１３：５８２〜５８６ページ；Ｈａｒｔｍａｎら（１９９４年）Ｂｉｏ−Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  １２：９１９９２３；Ｒｉｔａｌａら（１９９４年）Ｐｌａｎｔ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２４：３１７〜３２５ページ；ならびにＷａｎ，Ｙ．Ｃ．およびＬｅｍａｕｘ，Ｐ．Ｇ．（１９９４年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．１０４：３７４８を参照されたい。
【０１４２】
本発明の方法は、植物の中にポリヌクレオチド構築物を導入するステップを含む。「導入する」によって、植物の細胞の内部に構築物が侵入するようにポリヌクレオチド構築物を植物に提示することが意図される。本発明の方法は、ポリヌクレオチド構築物を植物に導入するための特定の方法に依存せず、ただ、ポリヌクレオチド構築物は、植物の少なくとも１つの細胞の内部に侵入する。安定的な形質転換方法、一過性の形質転換方法、およびウイルス媒介性の方法を含むが、これらに限定されない、植物の中にポリヌクレオチド構築物を導入するための方法は、当技術分野で知られている。
【０１４３】
「安定的な形質転換」によって、植物の中に導入されたポリヌクレオチド構築物は、植物のゲノムの中に統合され、その後代によって遺伝することができることが意図される。「一過性の形質転換」によって、植物の中に導入されたポリヌクレオチド構築物は、植物のゲノムの中に統合されないことが意図される。
【０１４４】
植物および植物細胞の形質転換について、本発明のヌクレオチド配列は、植物または植物細胞中でのヌクレオチド配列の発現に適した、当技術分野で知られている任意のベクターの中に標準的な技術を使用して挿入される。ベクターの選択は、好ましい形質転換技術および形質転換される標的植物種に依存する。本発明の一態様では、ＡＨＡＳＬ１ヌクレオチド配列は、植物細胞中での高レベルの発現で知られている植物プロモーターに作動可能に連結され、この構築物は、次いで、イミダゾリノン除草剤に感受性の植物およびそれが再生した形質転換植物の中に導入される。形質転換植物は、非形質転換植物を死滅させるまたは著しく傷害を与えるレベルのイミダゾリノン除草剤の曝露に耐性である。この方法は、任意の植物種に適用することができるが、作物、具体的には、少なくとも１つの除草剤、具体的にはイミダゾリノン除草剤の存在下で典型的には成長させる作物に適用された場合に、最も有益である。
【０１４５】
植物発現カセットを構築し、植物の中に外来性の核酸を導入するための方法論は、当技術分野で一般的に知られており、以前に記載されている。たとえば、外来性ＤＮＡは、腫瘍誘発（Ｔｉ）プラスミドベクターを使用して植物の中に導入することができる。アグロバクテリウムに基づいた形質転換技術は、当技術分野でよく知られている。アグロバクテリウム株（たとえばアグロバクテリウム・ツメファシエンスまたはアグロバクテリウム・リゾゲネス）は、プラスミド（ＴｉプラスミドまたはＲｉプラスミド）およびアグロバクテリウムによる感染に続いて植物に移入されるＴ−ＤＮＡエレメントを含む。Ｔ−ＤＮＡ（移入されたＤＮＡ）は、植物細胞のゲノムの中に統合される。Ｔ−ＤＮＡは、ＲｉプラスミドもしくはＴｉプラスミド上に配置してもよく、またはいわゆるバイナリーベクター中に別々に含まれる。アグロバクテリウム媒介性の形質転換のための方法は、たとえばＨｏｒｓｃｈ  ＲＢら（１９８５年）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２２５：１２２９ｆに記載される。アグロバクテリウム媒介性の形質転換は、双子葉植物および単子葉植物の両方で使用することができる。アグロバクテリウムによる植物の形質転換は、Ｗｈｉｔｅ  ＦＦ、Ｖｅｃｔｏｒｓ  ｆｏｒ  Ｇｅｎｅ  Ｔｒａｎｓｆｅｒ  ｉｎ  Ｈｉｇｈｅｒ  Ｐｌａｎｔｓ；Ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ  Ｐｌａｎｔｓ、第１巻中のＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ  ａｎｄ  Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ、Ｓ．Ｄ．ＫｕｎｇおよびＲ．Ｗｕ編、Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ、１９９３年、１５〜３８ページ；Ｊｅｎｅｓ  Ｂら（１９９３年）Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ｆｏｒ  Ｇｅｎｅ  Ｔｒａｎｓｆｅｒ，ｉｎ：  Ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ  Ｐｌａｎｔｓ、第１巻、Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ  ａｎｄ  Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ、Ｓ．Ｄ．ＫｕｎｇおよびＲ．Ｗｕ編、Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ、１２８〜１４３ページ；Ｐｏｔｒｙｋｕｓ（１９９１年）Ａｎｎｕ  Ｒｅｖ  Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ  Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌｅｃ  Ｂｉｏｌ  ４２：２０５〜２２５ページに記載される。外来性ＤＮＡデリバリーのために利用される他の方法は、直接的なＤＮＡ取り込みのためのＰＥＧ媒介性のプロトプラスト形質転換、エレクトロポレーション、マイクロインジェクションウィスカー（ｍｉｃｒｏｉｎｊｅｃｔｉｏｎ  ｗｈｉｓｋｅｒ）、および遺伝子銃または微粒子銃の使用を含む。そのような方法は当技術分野で知られている。（Ｖａｓｉｌらに対する米国特許第５，４０５，７６５号；Ｂｉｌａｎｇら（１９９１年）Ｇｅｎｅ  １００：２４７〜２５０ページ；Ｓｃｈｅｉｄら（１９９１年）Ｍｏｌ．Ｇｅｎ．Ｇｅｎｅｔ．，２２８：１０４〜１１２ページ；Ｇｕｅｒｃｈｅら（１９８７年）Ｐｌａｎｔ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ５２：１１１〜１１６ページ；Ｎｅｕｈａｕｓｅら（１９８７年）Ｔｈｅｏｒ．Ａｐｐｌ  Ｇｅｎｅｔ．７５：３０〜３６ページ；Ｋｌｅｉｎら（１９８７年）Ｎａｔｕｒｅ  ３２７：７０〜７３ページ；Ｈｏｗｅｌｌら（１９８０年）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２０８：１２６５；Ｈｏｒｓｃｈら（１９８５年）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２２７：１２２９〜１２３１ページ；ＤｅＢｌｏｃｋら（１９８９年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ  ９１：６９４〜７０１ページ；Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｏｒ  Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（ＷｅｉｓｓｂａｃｈおよびＷｅｉｓｓｂａｃｈ編）Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．（１９８８年）ならびにＭｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（ＳｃｈｕｌｅｒおよびＺｉｅｌｉｎｓｋｉ編）Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．（１９８９年）。形質転換の方法は、形質転換される植物細胞、使用されるベクターの安定性、遺伝子産物の発現レベル、および他のパラメーターに依存する。
【０１４６】
植物細胞の中にヌクレオチド配列を導入し、植物ゲノムの中への続く挿入のための他の適した方法は、Ｃｒｏｓｓｗａｙら（１９８６年）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ４：３２０〜３３４ページのようなマイクロインジェクション、Ｒｉｇｇｓら（１９８６年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８３：５６０２〜５６０６ページによって記載されるようなエレクトロポレーション、Ｔｏｗｎｓｅｎｄら、米国特許第５，５６３，０５５号、Ｚｈａｏら、米国特許第５，９８１，８４０号によって記載されるようなアグロバクテリウム媒介性の形質転換、Ｐａｓｚｋｏｗｓｋｉら（１９８４年）ＥＭＢＯ  Ｊ．３：２７１７〜２７２２ページによって記載されるような遺伝子直接移入、ならびにたとえばＳａｎｆｏｒｄら、米国特許第４，９４５，０５０号；Ｔｏｍｅｓら、米国特許第５，８７９，９１８号；Ｔｏｍｅｓら、米国特許第５，８８６，２４４号；Ｂｉｄｎｅｙら、米国特許第５，９３２，７８２号；Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ，Ｔｉｓｓｕｅ，ａｎｄ  Ｏｒｇａｎ  Ｃｕｌｔｕｒｅ：Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ  Ｍｅｔｈｏｄｓ中のＴｏｍｅｓら（１９９５年）「微粒子銃を介しての無傷植物細胞への直接的なＤＮＡ移入（Ｄｉｒｅｃｔ  ＤＮＡ  Ｔｒａｎｓｆｅｒ  ｉｎｔｏ  Ｉｎｔａｃｔ  Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌｓ  ｖｉａ  Ｍｉｃｒｏｐｒｏｊｅｃｔｉｌｅ  Ｂｏｍｂａｒｄｍｅｎｔ）、ＧａｍｂｏｒｇおよびＰｈｉｌｌｉｐｓ編（Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ、Ｂｅｒｌｉｎ）；ＭｃＣａｂｅら（１９８８年）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ６：９２３〜９２６ページ）；およびＬｅｃ１形質転換（国際公開第００／２８０５８号）に示す弾道粒子加速を含む。Ｗｅｉｓｓｉｎｇｅｒら（１９８８年）Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｇｅｎｅｔ．２２：４２１〜４７７ページ；Ｓａｎｆｏｒｄら（１９８７年）Ｐａｒｔｉｃｕｌａｔｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ５：２７〜３７ページ（タマネギ）；Ｃｈｒｉｓｔｏｕら（１９８８年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．８７：６７１〜６７４ページ（ダイズ）；ＭｃＣａｂｅら（１９８８年）Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ６：９２３〜９２６ページ（ダイズ）；ＦｉｎｅｒおよびＭｃＭｕｌｌｅｎ（１９９１年）Ｉｎ  Ｖｉｔｒｏ  Ｃｅｌｌ  Ｄｅｖ．Ｂｉｏｌ．２７Ｐ：１７５〜１８２ページ（ダイズ）；Ｓｉｎｇｈら（１９９８年）Ｔｈｅｏｒ．Ａｐｐｌ．Ｇｅｎｅｔ．９６：３１９〜３２４ページ（ダイズ）；Ｄａｔｔａら（１９９０年）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ８：７３６〜７４０ページ（イネ）；Ｋｌｅｉｎら（１９８８年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８５：４３０５〜４３０９ページ（トウモロコシ）；Ｋｌｅｉｎら（１９８８年）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ６：５５９〜５６３ページ（トウモロコシ）；Ｔｏｍｅｓ、米国特許第５，２４０，８５５号；Ｂｕｉｓｉｎｇら、米国特許第５，３２２，７８３号、および第５，３２４，６４６号；Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ，Ｔｉｓｓｕｅ，ａｎｄ  Ｏｒｇａｎ  Ｃｕｌｔｕｒｅ：Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ  Ｍｅｔｈｏｄｓ中のＴｏｍｅｓら（１９９５年）「微粒子銃を介しての無傷植物細胞への直接的なＤＮＡ移入（Ｄｉｒｅｃｔ  ＤＮＡ  Ｔｒａｎｓｆｅｒ  ｉｎｔｏ  Ｉｎｔａｃｔ  Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌｓ  ｖｉａ  Ｍｉｃｒｏｐｒｏｊｅｃｔｉｌｅ  Ｂｏｍｂａｒｄｍｅｎｔ）」、Ｇａｍｂｏｒｇ編（Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ、Ｂｅｒｌｉｎ）（トウモロコシ）；Ｋｌｅｉｎら（１９８８年）Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．９１：４４０〜４４４ページ（トウモロコシ）；Ｆｒｏｍｍら（１９９０年）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ８：８３３〜８３９ページ（トウモロコシ）；Ｈｏｏｙｋａａｓ−Ｖａｎ  Ｓｌｏｇｔｅｒｅｎら（１９８４年）Ｎａｔｕｒｅ（Ｌｏｎｄｏｎ）３１１：７６３〜７６４ページ；Ｂｏｗｅｎら、米国特許第５，７３６，３６９号（穀物）；Ｂｙｔｅｂｉｅｒら（１９８７年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８４：５３４５〜５３４９ページ（ユリ科）；Ｔｈｅ  Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ  Ｍａｎｉｐｕｌａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｏｖｕｌｅ  Ｔｉｓｓｕｅｓ中のＤｅ  Ｗｅｔら（１９８５年）、Ｃｈａｐｍａｎら編（Ｌｏｎｇｍａｎ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）、１９７〜２０９ページ（花粉）；Ｋａｅｐｐｌｅｒら（１９９０年）Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｒｅｐｏｒｔｓ  ９：４１５〜４１８ページおよびＫａｅｐｐｌｅｒら  （１９９２年）Ｔｈｅｏｒ．Ａｐｐｌ．Ｇｅｎｅｔ．８４：５６０〜５６６ページ（ウィスカー媒介性の形質転換）；Ｄ’Ｈａｌｌｕｉｎら（１９９２年）Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  ４：１４９５〜１５０５ページ（エレクトロポレーション）；Ｌｉら（１９９３年）Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｒｅｐｏｒｔｓ  １２：２５０〜２５５ページおよびＣｈｒｉｓｔｏｕおよびＦｏｒｄ（１９９５年）Ａｎｎａｌｓ  ｏｆ  Ｂｏｔａｎｙ  ７５：４０７〜４１３ページ（イネ）；Ｏｓｊｏｄａら（１９９６年）Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  １４：７４５〜７５０ページ（アグロバクテリウム・ツメファシエンスを介してのトウモロコシ）もまた参照されたい。これらのすべては、参照によって本明細書に組み込まれる。
【０１４７】
本発明のポリヌクレオチドは、ウイルスまたはウイルス核酸と植物を接触させることによって植物の中に導入することができる。一般的に、そのような方法は、ウイルスＤＮＡ分子またはウイルスＲＮＡ分子内に本発明のポリヌクレオチド構築物を組み込むステップを含む。本発明のＡＨＡＳＬ１タンパク質は、ウイルスポリタンパク質の一部分として最初に合成されてもよく、これは、後に、インビボまたはインビトロで、タンパク質分解によって処理されて、望ましい組み換えタンパク質を生産してもよいことが認識される。さらに、本発明のプロモーターはまた、ウイルスＲＮＡポリメラーゼによる転写に利用されるプロモーターをも包含することが認識される。ウイルスＤＮＡ分子またはウイルスＲＮＡ分子を伴って、植物の中にポリヌクレオチド構築物を導入し、その中でコードされるタンパク質を発現させるための方法は、当技術分野で知られている。たとえば、参照によって本明細書に組み込まれる米国特許第５，８８９，１９１号、第５，８８９，１９０号、第５，８６６，７８５号、第５，５８９，３６７号、および第５，３１６，９３１号を参照されたい。
【０１４８】
形質転換された細胞は、従来の方法に従って植物に成長させてもよい。たとえばＭｃＣｏｒｍｉｃｋら（１９８６年）Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｒｅｐｏｒｔｓ  ５：８１〜８４ページを参照されたい。次いで、これらの植物は、成長させ、同じ形質転換された株または異なる株と受粉させてもよく、望ましい表現型の特徴の構成的な発現を有する結果として生じる雑種は同定される。２世代以上の世代は、望ましい表現型の特徴の発現が、安定して維持され、遺伝することを確認するために成長させてもよく、次いで、望ましい表現型の特徴の発現を確認するために収穫された種子が得られてきた。このように、本発明は、本発明のポリヌクレオチド構築物、たとえば、それらのゲノムの中に安定して組み込まれた本発明の発現カセットを有する形質転換された種子（「トランスジェニック種子」とも呼ばれる）を提供する。
【０１４９】
本発明は、単子葉植物および双子葉類を含むが、これらに限定されない任意の植物種の形質転換に使用することができる。対象とする植物種の例は、コーンまたはトウモロコシ（Ｚｅａ  ｍａｙｓ）、アブラナ属種（たとえばセイヨウアブラナ、カブ、セイヨウカラシナ）、具体的には種子油の供給源として有用なそれらのアブラナ属種、アルファルファ（ムラサキウマゴヤシ（Ｍｅｄｉｃａｇｏ  ｓａｔｉｖａ））、イネ（イネ（Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ））、ライ麦（ライムギ（Ｓｅｃａｌｅ  ｃｅｒｅａｌｅ））、モロコシ（モロコシ（Ｓｏｒｇｈｕｍ  ｂｉｃｏｌｏｒ）、ソルガム（Ｓｏｒｇｈｕｍ  ｖｕｌｇａｒｅ））、キビ（たとえばトウジンビエ（トウジンビエ（Ｐｅｎｎｉｓｅｔｕｍ  ｇｌａｕｃｕｍ））、プロソミレット（ｐｒｏｓｏ  ｍｉｌｌｅｔ）（キビ（Ｐａｎｉｃｕｍ  ｍｉｌｉａｃｅｕｍ））、アワ（アワ（Ｓｅｔａｒｉａ  ｉｔａｌｉｃａ））、シコクビエ（シコクビエ（Ｅｌｅｕｓｉｎｅ  ｃｏｒａｃａｎａ））、ヒマワリ（ヒマワリ（Ｈｅｌｉａｎｔｈｕｓ  ａｎｎｕｕｓ））、ベニバナ（ベニバナ（Ｃａｒｔｈａｍｕｓ  ｔｉｎｃｔｏｒｉｕｓ））、コムギ（コムギ（Ｔｒｉｔｉｃｕｍ  ａｅｓｔｉｖｕｍ）、イギリスコムギ亜種  デュラム小麦）、ダイズ（ダイズ（Ｇｌｙｃｉｎｅ  ｍａｘ））、タバコ（タバコ（Ｎｉｃｏｔｉａｎａ  ｔａｂａｃｕｍ））、ジャガイモ（ジャガイモ（Ｓｏｌａｎｕｍ  ｔｕｂｅｒｏｓｕｍ））、ピーナッツ（ピーナッツ（Ａｒａｃｈｉｓ  ｈｙｐｏｇａｅａ））、ワタ（カイトウメン（Ｇｏｓｓｙｐｉｕｍ  ｂａｒｂａｄｅｎｓｅ）、ワタ（Ｇｏｓｓｙｐｉｕｍ  ｈｉｒｓｕｔｕｍ））、サツマイモ（サツマイモ（Ｉｐｏｍｏｅａ  ｂａｔａｔｕｓ））、キャッサバ（キャッサバ（Ｍａｎｉｈｏｔ  ｅｓｃｕｌｅｎｔａ））、コーヒー（コーヒー属種）、ココナッツ（ココヤシ（Ｃｏｃｏｓ  ｎｕｃｉｆｅｒａ））、パイナップル（パイナップル（Ａｎａｎａｓ  ｃｏｍｏｓｕｓ））、柑橘類の木（ミカン属種）、ココア（カカオ（Ｔｈｅｏｂｒｏｍａ  ｃａｃａｏ））、茶（茶（Ｃａｍｅｌｌｉａ  ｓｉｎｅｎｓｉｓ））、バナナ（バショウ属種）、アボカド（アボカド（Ｐｅｒｓｅａ  ａｍｅｒｉｃａｎａ））、イチジク（イチジク（Ｆｉｃｕｓ  ｃａｓｉｃａ））、グアバ（グアバ（Ｐｓｉｄｉｕｍ  ｇｕａｊａｖａ（登録商標）））、マンゴー（マンゴー（Ｍａｎｇｉｆｅｒａ  ｉｎｄｉｃａ））、オリーブ（オリーブ（Ｏｌｅａ  ｅｕｒｏｐａｅａ））、パパイヤ（パパイヤ（Ｃａｒｉｃａ  ｐａｐａｙａ））、カシュー（カシューノキ（Ａｎａｃａｒｄｉｕｍ  ｏｃｃｉｄｅｎｔａｌｅ））、マカダミア（マカダミア（Ｍａｃａｄａｍｉａ  ｉｎｔｅｇｒｉｆｏｌｉａ））、アーモンド（アーモンド（Ｐｒｕｎｕｓ  ａｍｙｇｄａｌｕｓ））、サトウダイコン（サトウダイコン（Ｂｅｔａ  ｖｕｌｇａｒｉｓ））、サトウキビ（サトウキビ属種）、カラスムギ、オオムギ、野菜、観賞植物、および針葉樹を含むが、これらに限定されない。好ましくは、本発明の植物は、作物（たとえばヒマワリ、アブラナ属種、ワタ、砂糖、テンサイ、ダイズ、ピーナッツ、アルファルファ、ベニバナ、タバコ、トウモロコシ、イネ、コムギ、ライ麦、オオムギ、ライコムギ、モロコ���、キビなど）である。
【０１５０】
本発明の除草剤抵抗性の植物は、雑草をコントロールするための方法での使用を見出す。したがって、本発明は、本発明の除草剤抵抗性の植物の近くの雑草をコントロールするための方法をさらに提供する。方法は、雑草および除草剤抵抗性の植物に有効量の除草剤を適用するステップを含み、植物は、野生型植物と比較した場合に、少なくとも１つの除草剤、具体的にはイミダゾリノン除草剤またはスルホニルウレア除草剤に対する抵抗性が増加している。雑草をコントロールするためのそのような方法では、本発明の除草剤抵抗性の植物は、好ましくは、ヒマワリ、アルファルファ、アブラナ属種、ダイズ、ワタ、ベニバナ、ピーナッツ、タバコ、トマト、ジャガイモ、コムギ、イネ、トウモロコシ、モロコシ、オオムギ、ライ麦、キビ、およびモロコシを含むが、これらに限定されない作物である。
【０１５１】
除草剤、具体的にはイミダゾリノン除草剤およびスルホニルウレア除草剤に対する抵抗性が増加している植物を提供することによって、種々様々の配合物は、植物の成長を増強し、栄養分についての競争を低下させるために、雑草から植物を防御するために使用することができる。除草剤は、本明細書で記載される植物の周囲のエリアの雑草の、出芽前、出芽後完熟前、栽培前、および栽培時のコントロールのために単独で使用することができるまたは他の添加剤を含有するイミダゾリノン除草剤配合物を使用することができる。除草剤はまた、種子の処理として使用することもできる。すなわち、有効濃度もしくは有効量の除草剤または有効濃度もしくは有効量の除草剤を含む組成物は、種子の播種前にまたはその間に種子に直接適用することができる。イミダゾリノン除草剤またはスルホニルウレア除草剤の配合物または組成物中に見つけられる添加剤は、他の除草剤、洗浄剤、補助剤、展着剤、固着剤、安定化剤、またはその他同種のものを含む。除草剤配合物は、湿性調製物または乾燥調製物とすることができ、流動性粉末、乳化性濃縮物、および液体濃縮物を含むことができるが、これらに限定されない。除草剤および除草剤配合物は、たとえば、噴霧、灌漑、散布、コーティング、およびその他同種のものによって、従来の方法に従って適用することができる。
【０１５２】
本発明は、ＡＨＡＳ阻害性除草剤の使用を含む方法を提供する。これらの方法では、ＡＨＡＳ阻害性除草剤は、種子の処理、土壌の処理、および葉面の処理を含むが、これらに限定されない当技術分野で知られている任意の方法によって適用することができる。
【０１５３】
本発明は、ＡＨＡＳ酵素の活性を阻害する少なくとも１つの除草剤に対する植物、植物組織、植物細胞、または他の宿主細胞の耐性または抵抗性を増強するための方法を提供する。好ましくは、そのようなＡＨＡＳ阻害性除草剤は、イミダゾリノン除草剤、スルホニルウレア除草剤、トリアゾロピリミジン除草剤、ピリミジニルオキシベンゾエート除草剤、スルホニルアミノ−カルボニルトリアゾリノン除草剤、またはその混合物である。より好ましくは、そのような除草剤は、イミダゾリノン除草剤、スルホニルウレア除草剤、そのまたは混合物である。本発明について、イミダゾリノン除草剤は、ＰＵＲＳＵＩＴ（登録商標）（イマゼタピル（Ｉｍａｚｅｔｈａｐｙｒ））、ＣＡＤＲＥ（登録商標）（イマザピック）、ＲＡＰＴＯＲ（登録商標）（ｉｍａｚａｍｏｘ）、ＳＣＥＰＴＥＲ（登録商標）（イマザキン（ｉｍａｚａｑｕｉｎ））、ＡＳＳＥＲＴ（登録商標）（イマゼサベンズ（ｉｍａｚｅｔｈａｂｅｎｚ））、ＡＲＳＥＮＡＬ（登録商標）（イマザピル）、前述の除草剤のいずれかの誘導体、２つ以上の前述の除草剤の混合物、たとえばイマザピル／ｉｍａｚａｍｏｘ（ＯＤＹＳＳＥＹ（登録商標））を含むが、これらに限定されない。より具体的には、イミダゾリノン除草剤は、２−（４−イソプロピル−４−メチル−５−オキソ−２−イミダゾリン−２−イル）−ニコチン酸、［２−（４−イソプロピル）−４−］［メチル−５−オキソ−２−イミダゾリン−２−イル）−３−キノリンカルボン］酸、［５−エチル−２−（４−イソプロピル−］４−メチル−５−オキソ−２−イミダゾリン−２−イル）−ニコチン酸、２−（４−イソプロピル−４−メチル−５−オキソ−２−イミダゾリン−２−イル）−５−（メトキシメチル）−ニコチン酸、［２−（４−イソプロピル−４−メチル−５−オキソ−２−］イミダゾリン−２−イル）−５−メチルニコチン酸、ならびにメチル［６−（４−イソプロピル−４−］メチル−５−オキソ−２−イミダゾリン−２−イル）−ｍ−トルイル酸およびメチル［２−（４−イソプロピル−４−メチル−５−］オキソ−２−イミダゾリン−２−イル）−ｐ−トルイル酸の混合物から選択することができるが、これらに限定されない。５−エチル−２−（４−イソプロピル−４−メチル−５−オキソ−２−イミダゾリン−２−イル）−ニコチン酸および［２−（４−イソプロピル−４−メチル−５−オキソ−２−イミダゾリン−２−］イル）−５−（メトキシメチル）−ニコチン酸の使用は好ましい。［２−（４−イソプロピル−４−］メチル−５−オキソ−２−イミダゾリン−２−イル）−５−（メトキシメチル）−ニコチン酸の使用は特に好ましい。
【０１５４】
本発明について、スルホニルウレア除草剤は、クロルスルフロン、メトスルフロンメチル、スルホメツロンメチル、クロリムロンエチル、チフェンスルフロンメチル、トリベヌロンメチル、ベンスルフロンメチル、ニコスルフロン、エタメツルフロンメチル、リムスルフロン、トリフルスルフロンメチル、トリアスルフロン、プリミスルフロンメチル、シノスルフロン、アミドスルフロン（ａｍｉｄｏｓｕｌｆｌｕｏｎ）、フルザスルフロン（ｆｌｕｚａｓｕｌｆｕｒｏｎ）、イマゾスルフロン、ピラゾスルフロンエチル、ハロスルフロン、アジムスルフロン、シクロスルフロン（ｃｙｃｌｏｓｕｌｆｕｒｏｎ）、エトキシスルフロン、フラザスルフロン、フルピルスルフロンメチル、ホラムスルフロン、ヨードスルフロン、オキサスルフロン、メソスルフロン、プロスルフロン、スルホスルフロン、トリフロキシスルフロン、トリトスルフロン、前述の除草剤のいずれかの誘導体、および２つ以上の前述の除草剤の混合物を含むが、これらに限定されない。本発明のトリアゾロピリミジン除草剤は、クロランスラム、ジクロスラム、フロラスラム、フルメトスラム、メトスラム、およびペノキススラムを含むが、これらに限定されない。本発明のピリミジニルオキシベンゾエート除草剤は、ビスピリバック、ピリチオバック、ピリミノバック、ピリベンゾキシム、およびピリフタリドを含むが、これらに限定されない。スルホニルアミノ−カルボニルトリアゾリノン除草剤は、フルカルバゾンおよびプロポキシカルバゾンを含むが、これらに限定されない。
【０１５５】
ピリミジニルオキシベンゾエート除草剤は、ピリミジニルチオベンゾエート除草剤と密接に関係し、Ｗｅｅｄ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ｓｏｃｉｅｔｙ  ｏｆ  Ａｍｅｒｉｃａによって後者の名称の見出し語で普及していることが認識されている。したがって、本発明の除草剤は、上記に記載されるピリミジニルオキシベンゾエート除草剤を含むが、これに限定されないピリミジニルチオベンゾエート除草剤をさらに含む。
【０１５６】
適用前に、ＡＨＡＳ阻害性除草剤は、通例の配合物、たとえば溶液、乳濁液、懸濁液、粉体、粉末、ペースト、および顆粒に変換することができる。使用形態は、特定の意図される目的に依存し、それぞれの場合で、本発明による化合物の細かく均一な分散を確実にするべきである。
【０１５７】
配合物は、たとえば、溶媒および／またはキャリヤー、望ましい場合、乳化剤、界面活性剤および分散剤、防腐剤、消泡剤、凍結防止剤、種子の処理の配合のために、さらに任意選択で着色剤および／または結合剤および／またはゲル化剤などのような農薬の配合に適した助剤を用いて活性化合物を増量することによって知られている様式で調製される（たとえば、検討のために、米国特許第３，０６０，０８４号、ＥＰ−Ａ  ７０７４４５（液体濃縮物について）、Ｂｒｏｗｎｉｎｇ、「凝集（Ａｇｇｌｏｍｅｒａｔｉｏｎ）」、Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ、１９６７年１２月４日、１４７〜４８ページ、Ｐｅｒｒｙ’ｓ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒ’ｓ  Ｈａｎｄｂｏｏｋ、第４版、ＭｃＧｒａｗ−Ｈｉｌｌ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、１９６３年、８〜５７ページを参照、ならびに以下を参照のこと。国際公開第９１／１３５４６号公報、米国特許第４，１７２，７１４号、米国特許第４，１４４，０５０号、米国特許第３，９２０，４４２号、米国特許第５，１８０，５８７号、米国特許第５，２３２，７０１号、米国特許第５，２０８，０３０号、英国特許第２，０９５，５５８号、米国特許第３，２９９，５６６号、Ｋｌｉｎｇｍａｎ、Ｗｅｅｄ  Ｃｏｎｔｒｏｌ  ａｓ  ａ  Ｓｃｉｅｎｃｅ、Ｊｏｈｎ  ＷｉｌｅｙおよびＳｏｎｓ，Ｉｎｃ．、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、１９６１年、Ｈａｎｃｅら、Ｗｅｅｄ  Ｃｏｎｔｒｏｌ  Ｈａｎｄｂｏｏｋ、第８版、Ｂｌａｃｋｗｅｌｌ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎｓ、Ｏｘｆｏｒｄ、１９８９年、およびＭａｌｌｅｔ，Ｈ．、Ｇｒｕｂｅｍａｎｎ，Ａ．、Ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎ  ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、Ｗｉｌｅｙ  ＶＣＨ  Ｖｅｒｌａｇ  ＧｍｂＨ、Ｗｅｉｎｈｅｉｍ（Ｇｅｒｍａｎｙ）、２００１年、２．、Ｄ．Ａ．Ｋｎｏｗｌｅｓ、Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ｏｆ  Ａｇｒｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎｓ、Ｋｌｕｗｅｒ  Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ、Ｄｏｒｄｒｅｃｈｔ、１９９８年（ＩＳＢＮ  ０−７５１４−０４４３−８））。
【０１５８】
適した溶媒の例は、水、芳香族溶媒（たとえばＳｏｌｖｅｓｓｏ産物、キシレン）、パラフィン（たとえば鉱油画分）、アルコール（たとえばメタノール、ブタノール、ペンタノール、ベンジルアルコール）、ケトン（たとえばシクロヘキサノン、ガンマ−ブチロラクトン）、ピロリドン（ＮＭＰ、ＮＯＰ）、アセテート（二酢酸グリコール）、グリコール、脂肪酸ジメチルアミド、脂肪酸、および脂肪酸エステルである。原則として、溶媒混合物もまた使用することができる。
【０１５９】
適したキャリヤーの例は、粉砕された天然鉱物（たとえばカオリン、粘土、タルク、チョーク）および粉砕された合成鉱物（たとえば高度に分散させたシリカ、ケイ酸）である。
【０１６０】
適した乳化剤は、非イオン性乳化剤および陰イオン性乳化剤（たとえばポリオキシエチレン脂肪族アルコールエーテル、スルホン酸アルキル、およびアリールスルホン酸）である。分散剤の例は、リグニン−亜硫酸パルプ廃液およびメチルセルロースである。
【０１６１】
使用される適した界面活性剤は、リグノスルホン酸、ナフタレンスルホン酸、フェノールスルホン酸、ジブチルナフタレンスルホン酸、アルキルアリールスルホン酸、硫酸アルキル、スルホン酸アルキル、脂肪族アルコールスルホン酸、脂肪酸、および硫酸化脂肪族アルコールグリコールエーテルのアルカリ金属塩、アルカリ土類金属塩、およびアンモニウム塩、そのうえ、ホルムアルデヒドとのスルホン化ナフタレンおよびナフタレン誘導体の縮合物、フェノールおよびホルムアルデヒドとのナフタレンまたはナフタレンスルホン酸の縮合物、ポリオキシエチレンオクチルフェノールエーテル、エトキシ化イソオクチルフェノール、オクチルフェノール、ノニルフェノール、アルキルフェノールポリグリコールエーテル、トリブチルフェニルポリグリコールエーテル、トリステアリールフェニルポリグリコールエーテル、アルキルアリールポリエーテルアルコール、アルコールおよび脂肪族アルコールエチレンオキシド縮合物、エトキシ化ヒマシ油、ポリオキシエチレンアルキルエーテル、エトキシ化ポリオキシプロピレン、ラウリルアルコールポリグリコールエーテルアセタール、ソルビトールエステル、リグノ亜硫酸廃液、ならびにメチルセルロースである。
【０１６２】
直接噴霧することができる溶液、乳濁液、ペースト、または油分散液の調製に適した物質は、灯油またはディーゼル油などのような中〜高沸点の鉱油画分、そのうえコールタール油および植物または動物起原の油、脂肪族炭化水素、環状炭化水素、および芳香族炭化水素、たとえばトルエン、キシレン、パラフィン、テトラヒドロナフタレン、アルキル化ナフタレン、またはそれらの誘導体、メタノール、エタノール、プロパノール、ブタノール、シクロヘキサノール、シクロヘキサノン、イソホロン、高極性溶媒、たとえばジメチルスルホキシド、Ｎ−メチルピロリドン、または水である。
【０１６３】
さらに、グリセリン、エチレングリコール、プロピレングリコールなどのような凍結防止剤およびなどのような殺菌剤は、配合物に追加することができる。
【０１６４】
適した消泡剤は、たとえば、ケイ素またはステアリン酸マグネシウムをベースとする消泡剤である。種子の処理配合物は、加えて、結合剤および任意選択で着色剤を含んでもよい。
【０１６５】
結合剤は、処理の後の種子上への活性物質の付着を改善するために追加することができる。適した結合剤は、ブロックコポリマーＥＯ／ＰＯ界面活性剤であるが、適した結合剤はまた、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリアクリル酸、ポリメタクリル酸、ポリブテン、ポリイソブチレン、ポリスチレン、ポリエチレンアミン、ポリエチレンアミド、ポリエチレンイミン（Ｌｕｐａｓｏｌ（登録商標）、Ｐｏｌｙｍｉｎ（登録商標）、ポリエーテル、ポリウレタン、ポリ酢酸ビニル、チロース、およびこれらのポリマーに由来するコポリマーでもある。
【０１６６】
任意選択で、着色剤もまた配合物中に含むことができる。種子の処理配合物に適した着色剤または染料は、ローダミンＢ、Ｃ．Ｉ．ピグメントレッド１１２、Ｃ．Ｉ．ソルベントレッド１、ピグメントブルー１５：４、ピグメントブルー１５：３、ピグメントブルー１５：２、ピグメントブルー１５：１、ピグメントブルー８０、ピグメントイエロー１、ピグメントイエロー１３、ピグメントレッド１１２、ピグメントレッド４８：２、ピグメントレッド４８：１、ピグメントレッド５７：１、ピグメントレッド５３：１、ピグメントオレンジ４３、ピグメントオレンジ３４、ピグメントオレンジ５、ピグメントグリーン３６、ピグメントグリーン７、ピグメントホワイト６、ピグメントブラウン２５、ベーシックバイオレット１０、ベーシックバイオレット４９、アシッドレッド５１、アシッドレッド５２、アシッドレッド１４、アシッドブルー９、アシッドイエロー２３、ベーシックレッド１０、ベーシックレッド１０８である。
【０１６７】
適したゲル化剤の例は、ヤハズツノマタ（Ｓａｔｉａｇｅｌ（登録商標））である。粉末、展着のための物質、および散布することができる産物は、固体キャリヤーと活性物質を混合するまたは同時に粉砕することによって調製することができる。
【０１６８】
顆粒、たとえばコーティングした顆粒、浸透性の顆粒、および均質の顆粒は、活性化合物を固体キャリヤーに結合することによって調製することができる。固体キャリヤーの例は、シリカゲル、ケイ酸、タルク、カオリン、アタクレイ（ａｔｔａｃｌａｙ）、石灰石、石灰、チョーク、ボール、黄土、粘土、ドロマイト、ケイ藻土、硫酸カルシウム、硫酸マグネシウム、酸化マグネシウムなどのような土類鉱物、粉砕された合成物質、たとえば硫酸アンモニウム、リン酸アンモニウム、硝酸アンモニウム、尿素、ならびに穀物粗びき粉、樹皮粗びき粉、木粗びき粉、および堅果殻粗びき粉などのような植物起原の産物などのような肥料、セルロース粉末、ならびに他の固体キャリヤーである。
【０１６９】
一般に、配合物は、０．０１〜９５重量％、好ましくは０．１〜９０重量％のＡＨＡＳ阻害性除草剤を含む。この場合、ＡＨＡＳ阻害性除草剤は、９０重量％〜１００重量％、好ましくは９５重量％〜１００重量％の純度で使用される（ＮＭＲスペクトルによる）。種子の処理の目的のために、それぞれの配合物は、２〜１０倍に希釈することができ、活性化合物重量で０．０１〜６０重量％、好ましくは０．１〜４０重量％の使用準備済の調製物の濃度をもたらす。
【０１７０】
ＡＨＡＳ阻害性除草剤は、それ自体、それらの配合物の形態またはそれから調製される使用形態で、たとえば、直接噴霧することができる溶液、粉末、懸濁液もしくは分散液、乳濁液、油分散液、ペースト、散布することができる産物、展着のための物質、または顆粒の形態で、噴霧、微粒化、散布、展着、または注入の手段によって使用することができる。使用形態は、もっぱら、意図される目的に依存し、それらは、それぞれの場合で、本発明によるＡＨＡＳ阻害性除草剤の可能な限り細かい分散を確実にすることが意図される。
【０１７１】
水性の使用形態は、水を追加することによって、乳濁液濃縮物、ペースト、または水和剤（噴霧することができる粉末、油分散液）から調製することができる。乳濁液、ペースト、または油分散液を調製するために、物質それ自体または油もしくは溶媒中で溶解された物質は、湿潤剤、粘着剤、分散剤、または乳化剤の手段によって水中で均質化することができる。しかしながら、活性物質、湿潤剤、粘着剤、分散剤、または乳化剤および適切な場合、溶媒または油から構成される濃縮物を調製することもまた可能であり、そのような濃縮物は、水を用いる希釈に適している。
【０１７２】
使用準備済の調製物の活性化合物濃度は、比較的広い範囲内で変えることができる。一般に、それらは、重量当たり０．０００１〜１０％、好ましくは０．０１〜１％である。
【０１７３】
ＡＨＡＳ阻害性除草剤はまた、極微量のプロセス（ＵＬＶ）で上手く使用することができ、９５重量％を超える活性化合物を含む配合物を適用することが可能であるまたは添加剤のない活性化合物を適用することが可能である。
【０１７４】
下記は、配合物の例である。
１．葉面適用のための、水を用いる希釈のための産物。種子の処理の目的のために、そのような産物は、希釈してまたは希釈せずに種子に適用することができる。
Ａ）水溶性濃縮物（ＳＬ、ＬＳ）
１０重量部のＡＨＡＳ阻害性除草剤は、９０重量部の水または水溶性溶媒中に溶解される。代替として、湿潤剤または他の助剤が追加される。ＡＨＡＳ阻害性除草剤は、水を用いる希釈に際して溶解し、それによって、１０％（重量／重量）のＡＨＡＳ阻害性除草剤を有する配合物が得られる。
Ｂ）分散性濃縮物（ＤＣ）
２０重量部のＡＨＡＳ阻害性除草剤は、１０重量部の分散剤、たとえばポリビニルピロリドンの追加と共に、７０重量部のシクロヘキサノン中に溶解される。水を用いる希釈によって分散液が生じ、それによって、２０％（重量／重量）のＡＨＡＳ阻害性除草剤を有する配合物が得られる。
Ｃ）乳化性濃縮物（ＥＣ）
１５重量部のＡＨＡＳ阻害性除草剤は、ドデシルベンゼンスルホン酸カルシウムおよびヒマシ油エトキシレート（それぞれの場合で、５重量部）の追加と共に、７重量部のキシレン中に溶解される。水を用いる希釈によって乳濁液が生じ、それによって、１５％（重量／重量）のＡＨＡＳ阻害性除草剤を有する配合物が得られる。
Ｄ）乳濁液（ＥＷ、ＥＯ、ＥＳ）
２５重量部のＡＨＡＳ阻害性除草剤は、ドデシルベンゼンスルホン酸カルシウムおよびヒマシ油エトキシレート（それぞれの場合で、５重量部）の追加と共に、３５重量部のキシレン中に溶解される。この混合物は、乳化機（たとえばＵｌｔｒａｔｕｒｒａｘ）の手段によって３０重量部の水の中に投入され、均質の乳濁液になる。水を用いる希釈によって乳濁液が生じ、それによって、２５％（重量／重量）のＡＨＡＳ阻害性除草剤を有する配合物が得られる。
Ｅ）懸濁液（ＳＣ、ＯＤ、ＦＳ）
激しく動かされるボールミル中で、２０重量部のＡＨＡＳ阻害性除草剤は、１０重量部の分散剤、湿潤剤、および７０重量部の水または有機溶媒の追加と共に粉末にされて、細かいＡＨＡＳ阻害性除草剤懸濁液が生じる。水を用いる希釈により、ＡＨＡＳ阻害性除草剤の安定的な懸濁液が生じ、それによって、２０％（重量／重量）のＡＨＡＳ阻害性除草剤を有する配合物が得られる。
Ｆ）水分散性顆粒および水溶性顆粒（ＷＧ、ＳＧ）
５０重量部のＡＨＡＳ阻害性除草剤は、５０重量部の分散剤および湿潤剤の追加と共に、細かく粉砕され、専門的な装置の手段によって（たとえば押出成形、噴霧塔、流動層）、水分散性顆粒または水溶性顆粒として作製される。水を用いる希釈により、ＡＨＡＳ阻害性除草剤の安定的な分散液または溶液が生じ、それによって、５０％（重量／重量）のＡＨＡＳ阻害性除草剤を有する配合物が得られる。
Ｇ）水分散性粉末および水溶性粉末（ＷＰ、ＳＰ、ＳＳ、ＷＳ）
７５重量部のＡＨＡＳ阻害性除草剤は、２５重量部の分散剤、湿潤剤、およびシリカゲルの追加と共にローターステーターミル（ｒｏｔｏｒ−ｓｔａｔｏｒ  ｍｉｌｌ）中で粉砕される。水を用いる希釈により、ＡＨＡＳ阻害性除草剤の安定的な分散液または溶液が生じ、それによって、７５％（重量／重量）のＡＨＡＳ阻害性除草剤を有する配合物が得られる。
Ｉ）ゲル配合物（ＧＦ）
激しく動かされるボールミル中で、２０重量部のＡＨＡＳ阻害性除草剤は、１０重量部の分散剤、１重量部のゲル化剤湿潤剤、および７０重量部の水または有機溶媒の追加と共に粉末にされ、細かいＡＨＡＳ阻害性除草剤懸濁液が生じる。水を用いる希釈により、ＡＨＡＳ阻害性除草剤の安定的な懸濁液が生じ、それによって、２０％（重量／重量）のＡＨＡＳ阻害性除草剤を有する配合物が得られる。このゲル配合物は、種子の処理としての使用に適している。
２．葉面適用のために希釈されずに適用される産物。種子の処理の目的のために、そのような産物は、希釈して種子に適用することができる。
Ａ）散布することができる粉末（ＤＰ、ＤＳ）
５重量部のＡＨＡＳ阻害性除草剤は、細かく粉砕され、９５重量部の細かく分けられたカオリンとよく混合される。これにより、５％（重量／重量）のＡＨＡＳ阻害性除草剤を有する、散布することができる産物が生じる。
Ｂ）顆粒（ＧＲ、ＦＧ、ＧＧ、ＭＧ）
２分の１重量部のＡＨＡＳ阻害性除草剤は、細かく粉砕され、９５．５重量部のキャリヤーと結合し、それによって、０．５％（重量／重量）のＡＨＡＳ阻害性除草剤を有する配合物が得られる。現行の方法は、押出成形、噴霧乾燥、または流動層である。これによって、葉の使用のために希釈されずに適用される顆粒が生じる。
【０１７５】
従来の種子の処理のための配合物は、たとえば流動性濃縮物ＦＳ、溶液ＬＳ、乾燥処理のための粉末ＤＳ、スラリー処理のための分散性水ＷＳ、水溶性粉末ＳＳおよび乳濁液ＥＳおよびＥＣおよびゲル配合物ＧＦを含む。これらの配合物は、希釈してまたは希釈せずに種子に適用することができる。種子への適用は、播種の前に、種子上に直接実行される。
【０１７６】
好ましい態様では、ＦＳ配合物は、種子の処理に使用される。典型的には、ＦＳ配合物は、１〜８００ｇ／ｌの活性成分、１〜２００ｇ／ｌの界面活性剤、０〜２００ｇ／ｌの凍結防止剤、０〜４００ｇ／ｌの結合剤、０〜２００ｇ／ｌのピグメント、および１リットルまでの溶媒、好ましくは水を含んでもよい。
【０１７７】
本発明は、本発明の除草剤抵抗性の植物の非トランスジェニック種子およびトランスジェニック種子を提供する。そのような種子は、たとえば、Ｊ０５Ｚ−０７８０１、Ｊ０４Ｅ−０１３９、Ｊ０４Ｅ−０１３０、またはＪ０４Ｅ−０１２２の植物の除草剤抵抗性の特徴を含む非トランスジェニックアブラナ属種子および除草剤抵抗性のＡＨＡＳＬ１タンパク質をコードする本発明のポリヌクレオチド分子を含むトランスジェニック種子を含む。
【０１７８】
種子の処理について、本発明による除草剤抵抗性の植物の種子は、除草剤、好ましくは、アミドスルフロン（ａｍｉｄｏｓｕｌｆｌｕｏｎ）、アジムスルフロン、ベンスルフロン、クロリムロン、クロルスルフロン、シノスルフロン、シクロスルファムロン、エタメトスルフロン、エトキシスルフロン、フラザスルフロン、フルピルスルフロン、ホラムスルフロン、ハロスルフロン、イマゾスルフロン、ヨードスルフロン、メソスルフロン、メトスルフロン、ニコスルフロン、オキサスルフロン、プリミスルフロン、プロスルフロン、ピラゾスルフロン、リムスルフロン、スルホメツロン、スルホスルフロン、チフェンスルフロン、トリアスルフロン、トリベヌロン、トリフロキシスルフロン、トリフルスルフロン、トリトスルフロン、イマザメタベンズ、ｉｍａｚａｍｏｘ、イマザピック、イマザピル、イマザキン（ｉｍａｚａｑｕｉｎ）、イマゼタピル（Ｉｍａｚｅｔｈａｐｙｒ）、クロランスラム、ジクロスラム、フロラスラム、フルメトスラム、メトスラム、ペノキススラム、ビスピリバック、ピリミノバック、プロポキシカルバゾン、フルカルバゾン、ピリベンゾキシム、ピリフタリド、ピリチオバック、およびその混合物またはＡＨＡＳ阻害性除草剤を含む配合物との混合物などのようなＡＨＡＳ阻害性除草剤からなる群から選択される除草剤を用いて処理される。
【０１７９】
種子の処理という用語は、種子ドレッシング、種子コーティング、種子散布、種子浸漬、および種子ペレッティングなどのような当技術分野で知られている適した種子の処理の技術をすべて含む。
【０１８０】
本発明の一変形に従って、本発明のさらなる主題は、具体的には種まき機の中への適用によって土を処理するための方法である：顆粒状配合物のいずれも、任意選択で１つもしくは複数の固体もしくは液体の農業的に許容できるキャリヤーと共におよび／または任意選択で１つもしくは複数の農業的に許容できる界面活性剤と共に、組成物／配合物、たとえば顆粒状配合物としてＡＨＡＳ阻害性除草剤を含有する。この方法は、たとえば、穀物、トウモロコシ、ワタ、およびヒマワリの苗床中に有利に使用される。
【０１８１】
本発明はまた、アミドスルフロン（ａｍｉｄｏｓｕｌｆｌｕｏｎ）、アジムスルフロン、ベンスルフロン、クロリムロン、クロルスルフロン、シノスルフロン、シクロスルファムロン、エタメトスルフロン、エトキシスルフロン、フラザスルフロン、フルピルスルフロン、ホラムスルフロン、ハロスルフロン、イマゾスルフロン、ヨードスルフロン、メソスルフロン、メトスルフロン、ニコスルフロン、オキサスルフロン、プリミスルフロン、プロスルフロン、ピラゾスルフロン、リムスルフロン、スルホメツロン、スルホスルフロン、チフェンスルフロン、トリアスルフロン、トリベヌロン、トリフロキシスルフロン、トリフルスルフロン、トリトスルフロン、イマザメタベンズ、ｉｍａｚａｍｏｘ、イマザピック、イマザピル、イマザキン（ｉｍａｚａｑｕｉｎ）、イマゼタピル（Ｉｍａｚｅｔｈａｐｙｒ）、クロランスラム、ジクロスラム、フロラスラム、フルメトスラム、メトスラム、ペノキススラム、ビスピリバック、ピリミノバック、プロポキシカルバゾン、フルカルバゾン、ピリベンゾキシム、ピリフタリド、およびピリチオバックからなる群から選択される少なくとも１つのＡＬＳ阻害剤を含む種子の処理の配合物を用いてコーティングされたまたはそれを含有する種子をも含む。
【０１８２】
種子という用語は、完全な種子、種子片、吸根、球茎、鱗茎、果実、塊茎、穀粒、さし木、カットした苗条、およびその他同種のものを含むが、これらに限定されないすべての種類の種子および植物珠芽を包含し、好ましい態様では完全な種子を意味する。
【０１８３】
「コーティングされ、且つ／または含有する」という用語は、一般的に、活性成分が、適用の方法に依存して、多かれ少なかれ、繁殖産物の中に浸透する可能性があるが、活性成分は、大部分は、適用の時に繁殖産物の表面上にあることを表わす。上述の繁殖産物が（再）栽培される場合、それは活性成分を吸収してもよい。
【０１８４】
ＡＨＡＳ阻害性除草剤またはＡＨＡＳ阻害性除草剤を含む配合物を用いる種子の処理の適用は、植物の播種および植物の出芽の前に種子に噴霧するまたは散布することによって実行される。
【０１８５】
種子の処理では、対応する配合物は、有効量のＡＨＡＳ阻害性除草剤またはＡＨＡＳ阻害性除草剤を含む配合物を用いて種子を処理することによって適用される。本明細書で、適用量は、一般的に、１００ｋｇの種子当たり、０．１ｇ〜１０ｋｇのａ．ｉ（またはａ．ｉ．もしくは配合物の混合物）、好ましくは、１００ｋｇの種子当たり、１ｇ〜５ｋｇ、具体的には、１００ｋｇの種子当たり、１ｇ〜２．５ｋｇである。レタスなどのような特定の作物については、量はより高くなり得る。
【０１８６】
本発明は、望ましくない植生を駆除するまたは雑草をコントロールするための方法であって、本発明による抵抗性の植物の種子を、播種の前および／または前発芽（ｐｒｅｇｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ）の後に、ＡＨＡＳ阻害性除草剤と接触させるステップを含む方法を提供する。方法は、たとえば、あるフィールドの土中にまたは温室の鉢植え培地（ｐｏｔｔｉｎｇ  ｍｅｄｉｕｍ）中に種子を播種するステップをさらに含むことができる。方法は、望ましくない植生を駆除するまたは種子のすぐ近くの雑草をコントロールする際に特定の使用を見出す。
【０１８７】
望ましくない植生のコントロールは、雑草を死滅させることおよび／または他の場合には雑草の正常な成長を遅らせるもしくは阻害することを意味するものとして理解される。雑草は、最も広い意味では、それらが望まれない位置に成長するそれらの植物すべてを意味するものとして理解される。
【０１８８】
本発明の雑草は、たとえば、双子葉および単子葉の雑草を含む。双子葉の雑草は、属：シロガラシ属、マメグンバイナズナ属、ヤエムグラ属、ハコベ属、シカギク属、ローマカツミレ属、ガリンソガ属、アカザ属、イラクサ属、キオン属、ヒユ属、スベリヒユ属、オナモミ属、セイヨウヒルガオ属、サツマイモ属、タデ属、ツノクサネム属、ブタクサ属、アザミ属、ヒレアザミ属、ノゲシ属、ナス属、イヌガラシ属、キカシグサ属、アゼナ属、オドリコソウ属、クワガタソウ属、イチビ属、エメクス属（Ｅｍｅｘ）、チョウセンアサガオ属、スミレ属、チシマオドリコソウ属、ケシ属、ヤグルマギク属、ジャジクソウ属、キンポウゲ属、およびタンポポ属の雑草を含むが、これらに限定されない。単子葉の雑草は、属：ヒエ属、セタリア属、キビ属、メヒシバ属、アワガエリ属、イチゴツナギ属、ウシノケグサ属、オヒシバ属、ビロードキビ属、ドクムギ属、スズメノチャヒキ属、カラスムギ属、カヤツリグサ属、モロコシ属、カモジグサ属、ギョウギシバ属、ミズアオイ属、フィムブリスチスリス属（Ｆｉｍｂｒｉｓｔｙｓｌｉｓ）、オモダカ属、ハリイ属、ホタルイ属、スズメノヒエ属、カモノハシ属、フェノクレア属（Ｓｐｈｅｎｏｃｌｅａ）、ダクティロクテニウム属（Ｄａｃｔｙｌｏｃｔｅｎｉｕｍ）、コヌカグサ属、スズメノテッポウ属、およびアペラ属（Ａｐｅｒａ）の雑草を含むが、これらに限定されない。
【０１８９】
加えて、本発明の雑草は、たとえば、望ましくない位置で成長している作物を含むことができる。たとえば、主にダイズ植物を含むフィールド中にある自生のトウモロコシ植物は、トウモロコシ植物がダイズ植物のフィールド中で望まれない場合は、雑草と考えることができる。
【０１９０】
冠詞「１つの（ａ）」および「１つの（ａｎ）」は、冠詞の文法上の１つまたは１つを超える（つまり少なくとも１つの）目的語を指すために本明細書で使用される。例として、「エレメント」（ａｎ  ｅｌｅｍｅｎｔ）は、１つまたは複数のエレメントを意味する。
【０１９１】
本明細書で使用されるように、単語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」または「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」もしくは「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」などのような変形は、述べられたエレメント、整数、もしくはステップまたはエレメント、整数、もしくはステップの群を包含することを意味するが、任意の他のエレメント、整数、もしくはステップまたはエレメント、整数、もしくはステップの群が除外されることを意味しないことが理解されるであろう。
【０１９２】
以下の例は、例証のために提供されるものであって、限定のために提供されるものではない。
【０１９３】
例１−ＡＨＡＳインビトロ酵素アッセイ
ＡＨＡＳ酵素アッセイは、Ｓｉｎｇｈら（Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１７１：１７３〜１７９ページ、１９８８年）によって記載されるように、ＡＨＡＳ阻害剤の存在下で、ＡＨＡＳ酵素の活性のレベルを測定することによって異なるサンプルの耐性レベルを定量するために使用される迅速な比色定量法である。２つのタイプの試験を使用した：たった１つの阻害剤を使用する基本的試験および２つの阻害剤の使用を必要とする集中的試験。両方の試験は、イミダゾリノン耐性のレベルを示し、集中的試験は、いくつかの植物系の間で明白な、わずかな耐性レベルの差異を正確に示すことができる。ＡＨＡＳアッセイストック溶液は、０．２Ｍのリン酸ナトリウム＋０．２Ｍのリン酸水素ナトリウム＋５０ｍＭ  １，１シクロプロパンジカルボン酸（ＣＰＣＡ）＋そのままの濃度のＭｕｒａｓｈｉｇｅ＆Ｓｋｏｏｇｓの基本的な塩＋１ｍＭ  Ｉｍａｚａｍｏｘ（ＡＣ  ２９９，２６３テクノロジー等級）＋５％Ｈ２ＳＯ４＋２Ｍ  ＮａＯＨ＋２．５％α−ナフトール＋０．２５％クレアチンを１Ｍリン酸緩衝液ｐＨ６．０中に含有する。
【０１９４】
最終的なＡＨＡＳアッセイ溶液は、３つのタイプの溶液を含む。溶液Ａは、１０ｍＭリン酸緩衝液＋１０％Ｍ＆Ｓ培地＋５００ｕＭ  ＣＰＣＡ＋０．５％Ｌ−アラニン＋５０ｍＭピルビン酸を含有する。溶液Ｂは、溶液Ａ＋２．５ｕＭ  Ｉｍａｚａｍｏｘを含有する。溶液Ｃは、溶液Ｂ＋０．２ｕＭクロルスルフロンを含有する。
【０１９５】
基本的ＡＨＡＳ試験：Ｉｍａｚａｍｏｘ阻害剤：
試験は、９６ウェルプレート中で行なった。それぞれの９６ウェルプレートは、コントロールを含む１９〜２１個のサンプルのためのスペースを含有した。それぞれのウェルは、下記に記載されるように１００ｕｌのＡＨＡＳ緩衝液を含有した。ラミナーフローフード中で、無菌ＡＨＡＳ緩衝液は、ＡおよびＢとマークした２つの溶液のたらいの中に無菌的に移入した。「Ｂ」たらいへ、ｉｍａｚａｍｏｘを、２．５ｕＭの濃度と等しいストック溶液から追加した。１００ｕｌの溶液Ａを、それぞれのプレートの奇数番号の列のすべてに移入し、１００ｕｌの溶液Ｂを、すべての偶数番号の列に移入した。
【０１９６】
フェーズ１：サンプリング
４つのディスクは、コルクボーラーを使用して、１０日齢の実生の中で最も小さな葉の根元から切り取った。他のＡＨＡＳ遺伝子が抽だい期の後に活性化され、したがって誤った結果を生む可能性があるので、植物は、この生育ステージ前にサンプリングした。切り取りに続いて、ディスクは、ＡおよびＢの溶液を含有するマイクロタイタープレートのウェルの中に移入した。
【０１９７】
全マイクロタイタープレートが一杯になったら、プレートは、１４〜１８時間、室温で蛍光灯下でインキュベートした。この時間の後にインキュベーションを停止させるために、プレートは−８０℃のフリーザー中で凍結した。
【０１９８】
フェーズ２：反応
ＡＨＡＳプレートは、−８０℃のフリーザーから取り出し、室温でまたは６０℃のインキュベーター中で解凍した。２５マイクロリットルの５％Ｈ２ＳＯ４をそれぞれのウェルに追加した。酸性化したプレートは、ディスクがすべて完全に褐色となるまで、約１５分間６０℃でインキュベートした。この時間の間に、ナフトール溶液を調製し、続いて、１５０ｕｌのα−ナフトール／クレアチン溶液をそれぞれのウェルに追加した。それぞれのプレートを１５分間６０℃でインキュベートした。インキュベーションの後に、ＡＨＡＳ活性の差異は、イミダゾリノンサンプルおよび非イミダゾリノンサンプルの間で視覚的に比較した。ＡＨＡＳ活性に起因する「赤」色の強度は、マイクロタイタープレートリーダーを使用して測定し、イミダゾリノンサンプルおよび非イミダゾリノンサンプルについての定量値を出した。
【０１９９】
それぞれのウェルの吸光度は５３０ｎｍで読み取った。この設定で、赤の強度の代表となる値を出した。赤のこの強度は、それぞれのウェル中でＡＨＡＳ活性の量となった。所与のサンプルのｉｍａｚａｍｏｘウェルのＡＨＡＳ活性を、コントロールのＡＨＡＳ活性によって割った場合、比は、「コントロールのＡＨＡＳ活性パーセント」に関して出した。
【０２００】
集中的なＡＨＡＳ試験：Ｉｍａｚａｍｏｘ阻害剤およびクロルスルフロン阻害剤
ＡＨＡＳ試験でのクロルスルフロン、ＳＵの組み込みは、ＰＭ１遺伝子およびｂＲ遺伝子の耐性の性質に基づくものである。ＰＭ１およびｂＲは、ＳＵに耐性ではないのに対して、ＰＭ２は、ＳＵに対していくらかの耐性を示す。ｉｍａｚａｍｏｘ活性によって割ったＳＵ活性の比は、４つすべての耐性レベルについて独自の値を出す（ＰＭ１／ＰＭ２、ＰＭ２、ＰＭ１、ＷＴ）。
【０２０１】
結果は、ｉｍａｚａｍｏｘおよびクロルスルフロンで阻害された場合のセイヨウカラシナで、ｂＲ、ＰＭ２、およびｂＲ／ＰＭ２について図３に示す。
【０２０２】
Ｉｍａｚａｍｏｘの存在下での異なるセイヨウカラシナ突然変異の組み合わせのＡＨＡＳ酵素活性
異なる突然変異の組み合わせ（ａＲ×ｂＲ、ＰＭ２×Ａ１０７Ｔ、ＰＭ２×ｂＲ、Ａ１０４Ｔ×ｂＲ）を含有するホモ接合性倍加半数体（ＤＨ）セイヨウカラシナ系からのタンパク質抽出物のＡＨＡＳ酵素活性は、未処理（０μＭ  ｉｍａｚａｍｏｘ）サンプルの活性の百分率として測定した。コントロールとして、３つのセイヨウアブラナ系からのタンパク質抽出物もまた含んだ：セイヨウアブラナＰＭ１、セイヨウアブラナＰＭ２、およびセイヨウアブラナＰＭ１／ＰＭ２。これらの突然変異の組み合わせについての結果およびｉｍａｚａｍｏｘの１００μＭでの比較を図６に示す。
【０２０３】
例２−温室中での除草剤耐性試験
第１の実験は、１つの遺伝子（ｂＲまたはＰＭ２）および２つの遺伝子（ｂＲ／ＰＭ２）を含有するセイヨウカラシナ系ならびに２つの遺伝子（ＰＭ１／ＰＭ２）を含有するセイヨウアブラナ系の間でイミダゾリノン除草剤耐性に差異があるかどうかを決定するために計画した。
【０２０４】
それぞれの系からの６つの個々の植物をそれぞれの噴霧処理にさらした。イミダゾリノン除草剤Ｏｄｙｓｓｅｙ（登録商標）は、２〜３葉期に、１×（１７ｇ  ａｉ／エーカー）、２×（３４ｇ  ａｉ／エーカー）、および３×（５１ｇ  ａｉ／エーカー）で適用した。植物は、２〜３葉期、栽培後約１４日目に噴霧した。噴霧室は、４０ｐｓｉに設定し、速度は、’８０’（３４．９８Ｌ／ａｃ）に設定した。以下の計算は、Ｏｄｙｓｓｅｙの２５ｍｌストック溶液を作製するためになされた：１７＊０．０２５／３４．９８＝０．１２１５ｇのＯｄｙｓｓｅｙ顆粒。これは以下の値の仮定に基づくものであった：エーカー当たり必要とされるＯｄｙｓｓｅｙの量は１７ｇであり、８．３３ｍｌの溶液を、噴霧室のそれぞれの流路中に出した。Ｍｅｒｇｅ（登録商標）は、０．５Ｌ／１００Ｌまたは０．０００１２５Ｌまたは１２５ｕＬの量で追加した。噴霧の後に、植物は、トレー内で無作為化した。植物は、以下の評価によって、視覚的な除草剤に対する損傷（噴霧後７〜１０日）について評価した：
１．いかなる損傷をも示さない植物
２．葉の変色または葉のわずかな湾曲を示す植物
３．目立つ葉の変色（たとえば黄色になるまたは紫色になる）を示すおよびいくつかの根元の分枝を示す植物。
４．死またはひどい障害をもたらす目立つ損傷を示す植物
【０２０５】
損傷が明らかとなった後に、草丈およびバイオマス（植物重量）を測定した。それぞれの品種について、噴霧処理およびコントロールを比較した。結果を表１に示す。
【表１】
2014195467.tif 000002
【０２０６】
第２の実験は、温室中で、異なる量のｉｍａｚａｍｏｘを用いて処理した場合に、セイヨウカラシナの異なる突然変異ｂＲ、ｂＲ／ＰＭ２、ＰＭ２、ａＲ、Ａ１０４Ｔ、およびＡ１０７Ｔを比較するために計画した。Ｉｍａｚａｍｏｘ噴霧試験（第２の温室実験）に使用したサンプルを下記の表２に示す。
表２：第２の温室実験で用いられたセイヨウカラシナ系
【表２】
2014195467.tif 000003
【０２０７】
系毎の１２個の個々の植物を表３に示されるようにそれぞれの処理レベルにさらした。Ｉｍａｚａｍｏｘ（Ｒａｐｔｏｒ（登録商標））＋０．５％容量／容量Ｍｅｒｇｅ（登録商標）の７回の処理とした。植物は、１〜２本葉期に処理した。結果を図４に示す。
表３  処理レベル
【表３】
2014195467.tif 000004
【０２０８】
他の温室実験では、セイヨウカラシナＤＨ系は、ＡゲノムＡＨＡＳ突然変異（ａＲ、Ａ１０４Ｔ、またはＰＭ２）を含有するセイヨウカラシナ系およびＢゲノムＡＨＡＳ突然変異（ｂＲ、Ａ１０７Ｔ）を含有するセイヨウカラシナ系の間の交雑から生産した。Ａゲノム突然変異およびＢゲノム突然変異（たとえば、ａＲ／ｂＲ、Ａ１０４Ｔ／ｂＲなど）の両方についてホモ接合性であることが確証されたそれらのＤＨ系は、０、３５、７０、および１００ｇ  ａｉ／ｈａのｉｍａｚａｍｏｘ（Ｒａｐｔｏｒ（登録商標）＋０．７５％Ｍｅｒｇｅ（登録商標））を用いる続く温室除草剤耐性試験のために選択した。薬害は、０〜９の段階で評価し、ここで、０は、作物傷害なしに等価であり、９は、植物死をもたらすひどい植物ネクローシスに等価である。これらの薬害曲線の結果を図８に示す。
【０２０９】
二重ホモ接合性ＤＨ系が同定されなかったそれらの組み合わせについては（ａＲ／Ａ１０７Ｔ突然変異の組み合わせの場合のように）、分離Ｆ２集団を温室中に定植した。それぞれのＦ２個体は、突然変異および接合性の性質を決定するために配列決定し、次いで、それぞれの傷害表現型を決定するために３５ｇ  ａｉ／ｈａのｉｍａｚａｍｏｘを噴霧した。ａＲおよびＡ１０７Ｔの突然変異について作物傷害表現型に対する遺伝子型の関連性の結果を図７に示す。
【０２１０】
例３−フィールドでの除草剤耐性試験
４つのセイヨウカラシナエントリーおよび１つのセイヨウアブラナエントリーを、除草剤耐性（様々な処理について表４を参照されたい）および収量について、Ｎｏｒｔｈ  Ｄａｋｏｔａの４つの位置にわたって、無作為化された分割ブロック計画（ｓｐｌｉｔ  ｂｌｏｃｋ  ｄｅｓｉｇｎ）トライアル（４回の反復）で試験した。プロットは最小限の１．５×５ｍの大きさとした。個々のプロットは、包囲し、成熟時に収穫した。４つのセイヨウカラシナエントリーのうち、１つのエントリーは、ホモ接合性セイヨウカラシナＰＭ１／ＰＭ２を生産するために自家受粉させる２世代が続く従来の戻し交雑技術によって、セイヨウアブラナからのＰＭ１およびＰＭ２の両方の突然変異をセイヨウカラシナに遺伝子移入することによって生産したＰＭ１／ＰＭ２セイヨウカラシナ系であった。他の３つのセイヨウカラシナエントリーは、ＰＭ２突然変異と共に積み重ねられたＢゲノムｂＲ突然変異を含有するセイヨウカラシナの異なる遺伝子型であった。ｂＲ／ＰＭ２セイヨウカラシナ系はすべて、両方の突然変異についてホモ接合性であった。セイヨウアブラナエントリーは、ＰＭ１／ＰＭ２突然変異についてホモ接合性のＣＬＥＡＲＦＩＥＬＤ（登録商標）市販比較品種であった。作物傷害評価（薬害％）は、処理の５〜７日後に（ＤＡＴ）および１８〜２４ＤＡＴに行なった。４つの位置の１つからの平均薬害パーセントを表５に示す。
【０２１１】
表４：除草剤の処理
【表４】
2014195467.tif 000005
（登録商標）ＣＬＥＡＲＦＩＥＬＤおよび唯一のＣＬＥＡＲＦＩＥＬＤ記号はＢＡＳＦの登録商標である。
【０２１２】
表５：Ｎｏｒｔｈ  Ｄａｋｏｔａ、Ｖｅｌｖａの１つの位置でのＯｄｙｓｓｅｙの１×除草剤適用に続いてのセイヨウカラシナＰＭ１／ＰＭ２エントリーおよびセイヨウカラシナｂＲ／ＰＭ２エントリーの平均薬害パーセントおよび平均収量
【表５】
2014195467.tif 000006
【０２１３】
表５の結果は、セイヨウカラシナのＰＭ１／ＰＭ２遺伝子移入突然変異が、商品化に適切な耐性を有していないことを示した。ＰＭ１／ＰＭ２セイヨウカラシナ系についての除草剤後（Ｏｄｙｓｓｅｙ（登録商標））薬害評価は、すべての試験した位置（Ｖｅｌｖａ、Ｍｏｈａｌｌ、Ｆａｒｇｏ、Ｈｅｔｔｉｎｇｅｒ）について２５〜５０％の範囲であったが、Ｏｄｙｓｓｅｙ（登録商標）処理ＰＭ１／ＰＭ２セイヨウカラシナエントリーについての収量は、噴霧していないＰＭ１／ＰＭ２セイヨウカラシナエントリーに対して、平均で５０％低下した。ｂＲ／ＰＭ２セイヨウカラシナエントリー（Ｓ００６、Ｓ００７、Ｓ００８）は、試験した位置のいずれについても１×Ｏｄｙｓｓｅｙ（登録商標）処理で薬害を示さず、収量の著しい減少を示さなかった。ｂＲ／ＰＭ２セイヨウカラシナエントリーはまた、すべての位置で、ＰＭ１／ＰＭ２セイヨウアブラナエントリーより低い薬害の量も示した。
【０２１４】
同様に、１つのセイヨウカラシナＰＭ２のみのエントリー（Ｊ０３Ｚ−１６４１３）およびＰＭ１／ＰＭ２の積み重ねられた突然変異を含有する１つの市販のＣＬＥＡＲＦＩＥＬＤ（登録商標）セイヨウアブラナ比較と共に、ｂＲ／ＰＭ２の積み重ねられた突然変異を含有する２８個の異なるセイヨウカラシナエントリー（遺伝子型）を３つの位置でフィールド試験した。平均的なプロットサイズが１．５ｍ×５ｍであった場合に、２つの反復からなる、無作為化された完全ブロック計画（ｃｏｍｐｌｅｔｅ  ｂｌｏｃｋ  ｄｅｓｉｇｎ）（１回の処理）を使用した。部分的なキャノーラ種子量を使用し、個々のプロット種子量は、それぞれのエントリーの１０００個の種子重量に基づいて、それぞれの位置について同じ播種密度に調整した。除草剤は、下記の表６に示されるようにこのトライアルのすべてのエントリーに適用した。
表６：除草剤の処理
【表６】
2014195467.tif 000007
（登録商標）ＣＬＥＡＲＦＩＥＬＤおよび唯一のＣＬＥＡＲＦＩＥＬＤ記号はＢＡＳＦの登録商標である
【０２１５】
表７：農業的評価
【表７】
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【０２１６】
表８：圃場試験結果
【表８−１】
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【表８−２】
2014195467.tif 000010
【０２１７】
ｂＲ／ＰＭ２の積み重ねられた突然変異を含有する２つのさらなる異なるセイヨウカラシナエントリー（遺伝子型）およびＰＭ１／ＰＭ２の積み重ねられた突然変異を含有する１つの市販のＣＬＥＡＲＦＩＥＬＤ（登録商標）セイヨウアブラナ比較を、連続する２年間にわたって複数の位置でフィールド試験した。部分的なキャノーラ種子量を使用し、個々のプロット種子量は、それぞれのエントリーの１０００個の種子重量に基づいて、それぞれの位置について同じ播種密度に調整した。除草剤（Ｂｅｙｏｎｄ（登録商標））は、下記の表９に示されるようにこのトライアルのすべてのエントリーに適用した。
表９：
【表９−１】
2014195467.tif 000011
【表９−２】
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【表９−３】
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【０２１８】
圃場における薬害のデータも、ｂＲおよびＰＭ２の両方の突然変異（ｂＲ／ＰＭ２についてホモ接合性）を含有する３つの異なる系から得て、ＰＭ１およびＰＭ２の両方の突然変異（ＰＭ１／ＰＭ２についてホモ接合性）を含有する市販のセイヨウアブラナ系に対する圃場における薬害と比較した。これらの系に、１×ＢＥＹＯＮＤ（登録商標）（３５ｇ  ａｉ／ｈａのｉｍａｚａｍｏｘ）を噴霧し、処理の７〜１０日後に（ＤＡＴ）薬害についてスコア化した。セイヨウカラシナ野生型系（つまり、いかなるＡＨＡＳ突然変異をも有していない）にコントロールとして１×ＢＥＹＯＮＤ（登録商標）を噴霧した。結果を下記の表１０に提供する。
表１０：
【表１０】
2014195467.tif 000014
【０２１９】
実験の同様のセットを、２×ＢＥＹＯＮＤ（商標）を噴霧したｂＲおよびＰＭ２の両方の突然変異（ホモ接合性ｂＲ／ＰＭ２）を含有する４つのさらなる中オレイン酸セイヨウカラシナ系で行なった。結果を下記の表１１に示す。
表１１：
【表１１】
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【０２２０】
それぞれの個々の突然変異に対するｂＲおよびＰＭ２の突然変異を共に積み重ねる効果を研究するために、除草剤耐性フィールド試験を、ＰＭ２突然変異単独、ｂＲ突然変異単独、またはｂＲおよびＰＭ２の両方の突然変異を含有するセイヨウカラシナエントリーで行なった。突然変異はすべて、すべてのエントリーでホモ接合性であった。３回の反復からなる、無作為化された完全ブロック計画（４回の処理）を１．５ｍ×５ｍの平均的なプロットサイズで使用した。部分的なキャノーラ種子量を使用し、個々のプロット種子量は、それぞれのエントリーの１０００個の種子重量に基づいて、それぞれの位置について同じ播種密度に調整した。除草剤（Ｂｅｙｏｎｄ（登録商標）、１×量は３５ｇ  ａｉ／ｈａである）は、下記の表１０に示されるように、このトライアルのすべてのエントリーに適用した。単一形質または組み合わせられた形質を含有するセイヨウカラシナ系は、０×、１×、２×、または４×レベルの除草剤を用いて処理し、処理の１０日、１２日、１４日、または２８日後に（ＤＡＴ）評価した。異なる二人の人間が、それぞれの量の除草剤を用いる処理の１０、１２、１４、および／または２８日後の薬害をスコア化した（表１０に示されるように：スコアラー１対スコアラー２）。結果を下記の表１２に示す。
表１２：
【表１２】
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【０２２１】
ｂＲ／ＰＭ２の積み重ねられた突然変異系の耐性は、個々の突然変異系の耐性の合計よりも高いことをより明確に示すために（作物傷害または植物毒性は表１２に示す）、ｂＲ／ＰＭ２積み重ねの実際の除草剤耐性パーセントを、単一ＰＭ２突然変異系および単一ｂＲ突然変異系の除草剤耐性パーセントの合計（予測される除草剤耐性）と比較した（表１３）。単一突然変異に対抗するまたはそれを圧倒する除草剤レベル（２×および４×量で最も顕著）で、ｂＲ／ＰＭ２の積み重ねられた突然変異系で観察された除草剤耐性のレベルは、２つの個々のｂＲ＋ＰＭ２耐性を共に加算した場合に観察された除草剤耐性を超える。ｂＲ／ＰＭ２の積み重ねられた突然変異系は、相加的なレベルではなく相乗的なレベルの除草剤耐性を示す。イミダゾリノン耐性のこの増強された（相乗的）レベルは、ｂＲ／ＰＭ２の積み重ねられた突然変異を含有するセイヨウカラシナの３０個を超える異なる遺伝子型で観察された。
表１３：
【表１３】
2014195467.tif 000017
【０２２２】
要約すると、セイヨウカラシナｂＲ／ＰＭ２系の耐性の相乗的なまたは増強されたレベルは、セイヨウアブラナＰＭ１／ＰＭ２の積み重ねられた突然変異系で観察された耐性のレベルよりも高いことを示し、さらに、セイヨウカラシナＰＭ１／ＰＭ２の積み重ねられた突然変異系で観察された耐性よりもはるかに高いことを示した（表５）。イミダゾリノン除草剤を用いて処理した場合、セイヨウカラシナｂＲ／ＰＭ２系はいかなる収量ペナルティーをも示さなかったが、市販の量のイミダゾリノン除草剤を用いて処理した場合、セイヨウカラシナＰＭ１／ＰＭ２系は著しい収量ペナルティーを示した。
【０２２３】
明細書に言及される刊行物および特許出願はすべて、本発明が属する当業者のレベルを示すものである。刊行物および特許出願はすべて、個々の刊行物または特許出願がそれぞれ具体的におよび個々に参照によって示された場合に組み込まれるのと同じ程度で、参照によって本明細書に組み込まれる。
【０２２４】
前述の発明は、理解の明瞭さの目的のために、図および例によってある程度詳細に記載したが、ある種の変更および改変が、添付された請求項の範囲内で実施することができることは明らかであろう。
【図１−１】
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【図１−２】
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【図１−３】
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【図１−４】
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【図１−５】
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【図１−６】
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【図１−７】
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【図１−８】
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【図１−９】
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【図１−１０】
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【図１−１１】
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【図２−１】
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【図２−２】
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【図２−３】
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【図２−４】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【配列表】
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【手続補正書】
【提出日】平成26年7月25日(2014.7.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
アセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニット（ＡＨＡＳＬ）ポリヌクレオチドを含むBrassicaであって、該ポリヌクレオチドは除草剤抵抗性ＡＨＡＳＬポリペプチドであって配列番号１の位置１２２に対応する位置、配列番号４の位置１０７に対応する位置または配列番号５の位置１０４に対応する位置にトレオニンを有するものをコードするBrassica。
【請求項２】
第一のポリヌクレオチドがＡゲノムの前記ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドである請求項１に記載のBrassica。
【請求項３】
除草剤抵抗性ＡＨＡＳＬポリペプチドをコードする第二のＡＨＡＳＬポリヌクレオチドを含むＢゲノムを有し、該ＡＨＡＳＬポリペプチドはアスパラギン置換を配列番号１の位置６５３に対応する位置又は配列番号２の位置６３８に対応する位置に有する、請求項２に記載のBrassica。
【請求項４】
第二のＡＨＡＳＬポリヌクレオチドがＢゲノムのＡＨＡＳＬ遺伝子である請求項３に記載のBrassica。
【請求項５】
Ｂゲノムを有し、ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドが該ＢゲノムのＡＨＡＳＬ遺伝子である請求項１に記載のBrassica。
【請求項６】
Brassicaがセイヨウカラシナ、セイヨウアブラナ（B.napus）、カブ（B.rapa）、アビシニアカラシ（B.carinata）、キャベツ（B.oleracea）およびクロガラシ（B.nigra）からなる群から選択される請求項１に記載のBrassica。
【請求項７】
ＡＴＣＣ  ＰＴＡ−７９４４で寄託されているラインＪ０４Ｅ−０１２２の植物の突然変異体、組み換え体もしくは遺伝子操作された誘導体または後代であるか、またはそれらの後代であり、前記ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドを含む請求項１に記載のBrassica。
【請求項８】
ＡＴＣＣ  ＰＴＡ−７９４５で寄託されているラインＪ０４Ｅ−０１３０の植物の突然変異体、組み換え体もしくは遺伝子操作された誘導体または後代であるか、またはそれらの後代であり、前記ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドを含む請求項１に記載のBrassica。
【請求項９】
Ａゲノムおよび該Ａゲノム上にアセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニット（ＡＨＡＳＬ）ポリヌクレオチドを含むBrassicaであって、該ポリヌクレオチドは第一の除草剤抵抗性ＡＨＡＳＬポリペプチドであって配列番号１の位置６５３に対応する位置または配列番号３の位置６３５に対応する位置にアスパラギンを有するものをコードするBrassica。
【請求項１０】
第一のポリヌクレオチドがＡゲノムの前記ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドである請求項９に記載のBrassica。
【請求項１１】
Ｂゲノムおよび第二の除草剤抵抗性ＡＨＡＳＬポリペプチドをコードしているポリヌクレオチドを、該Ｂゲノム上にさらに含むBrassicaであって、該ＡＨＡＳＬポリペプチドはトレオニン置換を配列番号１の位置１２２に対応する位置又は配列番号４の位置１０７に対応する位置に有し、前記第一および第二の除草剤抵抗性ＡＨＡＳＬポリペプチドは一緒にＡＨＡＳ阻害除草剤に対する相乗的な抵抗性のレベルを与える請求項９に記載のBrassica。
【請求項１２】
第一のポリヌクレオチドがＡゲノムの前記ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドであり、第二のポリヌクレオチドがＢゲノムの前記ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドである請求項１０に記載のBrassica。
【請求項１３】
セイヨウカラシナ、セイヨウアブラナおよびカブからなる群から選択される請求項９に記載のBrassica。
【請求項１４】
ＡＴＣＣ  ＰＴＡ−７９４６で寄託されているラインＪ０４Ｅ−０１３９の植物の突然変異体、組み換え体もしくは遺伝子操作された誘導体または後代であるか、またはそれらの後代であり、前記ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドを含む請求項９に記載のBrassica。
【請求項１５】
Brassicaの植物体、Brassicaの部分、Brassicaの細胞またはBrassicaの種子である請求項１〜１４のいずれかに記載のBrassica。
【請求項１６】
Brassicaの植物体である請求項１５に記載のBrassica。
【請求項１７】
請求項１〜１４のいずれかに記載のBrassicaの種子であって、ＡＨＡＳＬポリヌクレオチドを含む種子。
【請求項１８】
請求項３〜４および１１〜１２のいずれかに記載のBrassicaであって、少なくとも１０％高い抵抗性を、第一のポリヌクレオチドを含有しているBrassicaおよび第二のポリヌクレオチドを含有しているBrassicaにおける相加的な抵抗性のレベルに比較して有するBrassica。
【請求項１９】
請求項１８に記載のBrassicaであって、少なくとも２０％高い抵抗性を、第一のポリヌクレオチドを含有しているBrassicaおよび第二のポリヌクレオチドを含有しているBrassicaにおける相加的な抵抗性のレベルに比較して有するBrassica。
【請求項２０】
請求項１９に記載のBrassicaであって、少なくとも３０％高い抵抗性を、第一のポリヌクレオチドを含有しているBrassicaおよび第二のポリヌクレオチドを含有しているBrassicaにおける相加的な抵抗性のレベルに比較して有するBrassica。
【請求項２１】
Brassicaの近傍の雑草を制御する方法であって、有効量の除草剤を該雑草および該Brassicaに適用することを含み、該Brassicaは請求項１〜１４のいずれかに記載のBrassicaである方法。
【請求項２２】
除草剤がイミダゾリノン除草剤、スルホニルウレア除草剤、トリアゾピリミジン除草剤もしくはピリミジニルオキシベンゾエート除草剤を含む請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
除草剤がイミダゾリノンを含む請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
イミダゾリノンがイマゼタピルイマゼタピル、イマザピック、イマザモックス、イマザキン及びイマザピルの１つ又は２つ以上を含む請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
下記（Ａ）及び（Ｂ）の一つを含む、除草剤抵抗性植物を製造する方法：
（Ａ）除草剤に抵抗性である第一の植物を該除草剤に抵抗性でない第二の植物に交配せしめること、
該除草剤に抵抗性である後代を選抜することであって、ここで前記第一の植物は請求項１〜１４のいずれかに記載のBrassicaである； 
（Ｂ）除草剤に抵抗性である第一の植物を該除草剤に抵抗性である第二の植物に交配せしめること、および
該除草剤に抵抗性である後代を選抜すること；ここで前記第一の植物はＡＨＡＳＬヌクレオチドを含むＢゲノムを含む植物であり、該ＡＨＡＳＬヌクレオチドは配列番号１の位置１２２に対応する位置又は配列番号４の位置１０７に対応する位置にトレオニンを有する除草剤抵抗性ＡＨＡＳＬポリペプチドをコードし；
前記第二の植物はＡゲノムを含み、該Ａゲノムは第一の除草剤抵抗性ＡＨＡＳＬポリペプチドをコードするアセトヒドロキシ酸シンターゼ大サブユニット（ＡＨＡＳＬ）ポリヌクレオチドを有し、該ＡＨＡＳＬポリペプチドはアスパラギン置換を配列番号１の位置６５３に対応する位置又は配列番号３の位置６３５に対応する位置にＡゲノム上に有する植物である；又は
（Ｃ）除草剤に抵抗性である第一の植物を該除草剤に抵抗性である第二の植物に交配せしめること、および
該除草剤に抵抗性である後代を選抜すること；ここで前記第一の植物はＡＨＡＳＬヌクレオチドを含むＡゲノムを含む植物であり、該ＡＨＡＳＬヌクレオチドは配列番号１の位置１２２に対応する位置又は配列番号５の位置１０４に対応する位置にトレオニンを有する除草剤抵抗性ＡＨＡＳＬポリペプチドをコードするＡＨＡＳＬポリヌクレオチドを含み、
前記第二の植物はＡＨＡＳＬヌクレオチドを含むＢゲノムを含む植物であり、該ＡＨＡＳＬヌクレオチドは除草剤抵抗性ＡＨＡＳＬヌクレオチドでありｂＲ置換を有するポリヌクレオチドである。
【請求項２６】
Brassicaの種子を処理する方法であって、有効量の種子の処理の製剤を前記種子に適用することを含み、ここで前記Brassicaは請求項１〜１４のいずれかに記載のBrassicaである方法。
【請求項２７】
種子の処理の製剤が、イミダゾリノン除草剤、スルホニルウレア除草剤、トリアゾピリミジン除草剤もしくはピリミジニルオキシベンゾエート除草剤を含む請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
種子の処理の製剤が、イミダゾリノンを含む請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
イミダゾリノンがイマゼタピル、イマザピック、イマザモックス、イマザキン及びイマザピルの１つ又は２つ以上を含む請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
処理が、種子噴霧、種子ドレッシング、種子コーティング、種子散布、種子浸漬、種子ペレッティングまたはそれらの組み合わせである請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
処理が種子の播種前及び／又は種子の播種後に行われる請求項３０に記載の方法。
【請求項３２】
請求項２６〜３１のいずれかに記載の方法によって得られる処理された種子。
【請求項３３】
下記を含むBrassicaを選抜する方法：
該Brassicaを有効量の除草剤に曝露すること、および
該除草剤の存在下における、該Brassicaの生育能を特定すること、ここで該Brassicaは請求項１〜１４のいずれかに記載のBrassicaである。
【請求項３４】
除草剤が、イミダゾリノン除草剤、スルホニルウレア除草剤、トリアゾピリミジン除草剤もしくはピリミジニルオキシベンゾエート除草剤を含む請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
除草剤がイミダゾリノンを含む請求項３４に記載の方法。
【請求項３６】
イミダゾリノンがイマゼタピル、イマザピック、イマザモックス、イマザキン及びイマザピルの１つ又は２つ以上を含む請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
下記からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む単離された、組換えられた、突然変異された、または合成されたポリヌクレオチド：
ａ）配列番号４を含むいずれかのポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、
ｂ）配列番号５を含むいずれかのポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、
ｃ）配列番号４と少なくとも９０％の配列相同性を有するいずれかのポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該ポリペプチドは配列番号４の位置１０７に対応する位置にトレオニンを有する配列、
ｄ）配列番号５と少なくとも９０％の配列相同性を有するいずれかのポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該ポリペプチドは配列番号５の位置１０４に対応する位置にトレオニンを有する配列、および
ｅ）上記ａ）〜ｄ）に記載のヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列。
【請求項３８】
下記からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む単離された、組換えられた、突然変異された、または合成されたポリヌクレオチド：
ａ）配列番号３を含むいずれかのポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、
ｂ）配列番号３と少なくとも９０％の配列相同性を有するいずれかのポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該ポリペプチドは配列番号３の位置６３５に対応する位置にトレオニンを有する、および
ｃ）上記ａ）〜ｂ）に記載のヌクレオチド配列と相補的なヌクレオチド配列。
【請求項３９】
請求項１〜１４のいずれかに記載のBrassicaを加工することを含む、製品を製造する方法。
【請求項４０】
種子油である請求項４３に記載の方法。
【請求項４１】
Brassica属の植物の畑において雑草を制御する方法であって、請求項１〜１４のいずれかに記載のBrassicaの種子を、該種子の播種前及び／又は種子の播種後にＡＨＡＳ阻害除草剤と接触させることを含む方法。
【請求項４２】
除草剤がイミダゾリノン除草剤、スルホニルウレア除草剤、トリアゾピリミジン除草剤もしくはピリミジニルオキシベンゾエート除草剤を含む請求項４１に記載の方法。
【請求項４３】
除草剤がイミダゾリノンを含む請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】
イミダゾリノンがイマゼタピル、イマザピック、イマザモックス、イマザキン及びイマザピルの１つ又は２つ以上を含む請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
以下の工程を含む請求項１〜１４のいずれかに記載のBrassicaを特定するための方法：
（Ａ）Brassicaからの生物材料を提供する工程
（Ｂ）ＰＣＲ又はＡＨＡＳＬ遺伝子の交雑試験を前記生物材料に行い、（ｉ）そのＡゲノムが請求項１、２、９、１０及び１３のいずれかに記載のＡＨＡＳＬポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含んでいるか、及び（ｉｉ）そのＢゲノムが請求項１、３、４、５、１１及び１２のいずれかに記載のＡＨＡＳＬポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含んでいるかを決定する工程、ならびに
（Ｃ）前記工程（Ｂ）において得られた結果に基づいて、工程（Ａ）のBrassicaが請求項１〜１４のいずれかに記載のBrassicaであることを特定する工程。
【請求項４６】
生物材料が植物の種子である請求項４５に記載の方法。