(57)【要約】【課題】  複数の観察画像の各々について所定の解析処理を施す場合に、簡易な操作で効率的に解析処理後の観察画像を得ることができる撮影解析装置を提供する。【解決手段】  解析パラメータに基づいて解析処理を実行する解析処理手段と、解析処理の実行後の観察画像を解析画像として保持する解析画像記憶手段と、解析画像の特徴量を計測する特徴量計測手段と、特徴量を解析画像と対応付けて表示する特徴量表示手段と、編集画像を選択する編集画像選択手段と、ユーザ操作に基づいて解析パラメータを変更するパラメータ調整手段と、編集画像に対応する観察画像に対し、変更後の解析パラメータに基づいて解析処理を実行したときの解析画像を表示する解析画像表示手段と、再処理画像を選択する再処理画像選択手段により構成される。解析処理手段は、再処理画像に対応する観察画像に対し、変更後の解析パラメータを用いて解析処理を実行する。【選択図】  図３
2014063043.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
観察対象物を撮影して取得された複数の観察画像を保持する観察画像記憶手段と、
上記複数の観察画像を解析するための解析処理に用いられる解析パラメータを指定するパラメータ指定手段と、
上記パラメータ指定手段により指定された解析パラメータに基づいて、上記複数の観察画像の各々に対して解析処理を実行する解析処理手段と、
上記解析処理手段により解析処理が実行された後の観察画像を解析画像として保持する解析画像記憶手段と、
複数の上記解析画像のそれぞれの特徴量を計測する特徴量計測手段と、
上記特徴量計測手段により計測された特徴量を上記解析画像と対応付けて表示する特徴量表示手段と、
複数の上記解析画像の中から編集対象となる上記解析画像を編集画像として選択する編集画像選択手段と、
ユーザ操作に基づいて、上記解析パラメータを変更するパラメータ調整手段と、
上記編集画像選択手段により選択された編集画像に対応する観察画像に対し、上記パラメータ調整手段により変更された変更後の解析パラメータに基づいて解析処理を実行したときの解析画像を表示する解析画像表示手段と、
上記変更後の解析パラメータを用いて解析処理を再実行する解析画像を、再処理画像として選択する再処理画像選択手段とを備え、
上記解析処理手段は、上記再処理画像選択手段により選択された上記再処理画像に対応する上記観察画像に対し、上記変更後の解析パラメータを用いて解析処理を実行することを特徴とする撮影解析装置。
【請求項２】
同一の観察対象物の互いに異なる部位をそれぞれ撮影し、２以上の上記観察画像を取得する撮影手段を備えたことを特徴とする請求項１に記載の撮影解析装置。
【請求項３】
上記特徴量計測手段は、上記解析画像に含まれるブロブ領域の数を計測し、
上記再処理画像選択手段は、上記ブロブ領域の数が一定値以下の解析画像を上記再処理画像として選択することを特徴とする請求項１又は２に記載の撮影解析装置。
【請求項４】
上記解析画像の識別情報からなる解析画像リストを表示する解析画像リスト表示手段を備え、
上記再処理画像選択手段は、ユーザ操作に基づいて、上記解析画像リスト上で選択された解析画像を上記再処理画像として選択することを特徴とする請求項１〜３のいずれかに記載の撮影解析装置。
【請求項５】
上記特徴量表示手段は、上記解析画像に含まれるブロブ領域の数を上記解析画像の識別情報に対応づけて表示することを特徴とする請求項４に記載の撮影解析装置。
【請求項６】
上記特徴量表示手段は、上記ブロブ領域の数が一定値以下の解析画像と、上記ブロブ領域の数が一定値を上回る解析画像とを識別するためのシンボルを上記解析画像の識別情報に対応づけて表示することを特徴とする請求項５に記載の撮影解析装置。
【請求項７】
上記解析画像の更新回数を当該解析画像の識別情報に対応づけて表示する更新回数表示手段を備えたことを特徴とする請求項４〜６のいずれかに記載の撮影解析装置。
【請求項８】
上記解析パラメータは、輝度閾値であり、
上記抽出画像生成手段は、上記輝度閾値を用いて上記観察画像を二値化することを特徴とする請求項１〜７のいずれかに記載の撮影解析装置。
【請求項９】
上記変更後の解析パラメータを用いて解析処理が実行された解析画像と、当該解析処理が実行されなかった解析画像とを区別するための実行状況を表示する実行状況表示手段を備えたことを特徴とする請求項１〜８のいずれかに記載の撮影解析装置。
【請求項１０】
観察対象物を撮影して取得された複数の観察画像を保持する観察画像記憶ステップと、
上記複数の観察画像を解析するための解析処理に用いられる解析パラメータを指定するパラメータ指定ステップと、
上記パラメータ指定ステップにおいて指定された解析パラメータに基づいて、上記複数の観察画像の各々に対して解析処理を実行する解析処理ステップと、
上記解析処理ステップにおいて解析処理が実行された後の観察画像を解析画像として保持する解析画像記憶ステップと、
複数の上記解析画像のそれぞれの特徴量を計測する特徴量計測ステップと、
上記特徴量計測ステップにおいて計測された特徴量を上記解析画像と対応付けて表示する特徴量表示ステップと、
複数の上記解析画像の中から編集対象となる上記解析画像を編集画像として選択する編集画像選択ステップと、
ユーザ操作に基づいて、上記解析パラメータを変更するパラメータ調整ステップと、
上記編集画像選択ステップにおいて選択された編集画像に対応する観察画像に対し、上記パラメータ調整ステップにおいて変更された変更後の解析パラメータに基づいて解析処理を実行したときの解析画像を表示する解析画像表示ステップと、
上記変更後の解析パラメータを用いて解析処理を再実行する解析画像を、再処理画像として選択する再処理画像選択ステップとを備え、
上記解析処理ステップは、上記再処理画像選択ステップにおいて選択された上記再処理画像に対応する上記観察画像に対し、上記変更後の解析パラメータを用いて解析処理を実行することを特徴とする撮影解析装置の制御方法。
【請求項１１】
観察対象物を撮影して取得された複数の観察画像を保持する観察画像記憶手順と、
上記複数の観察画像を解析するための解析処理に用いられる解析パラメータを指定するパラメータ指定手順と、
上記パラメータ指定手順において指定された解析パラメータに基づいて、上記複数の観察画像の各々に対して解析処理を実行する解析処理手順と、
上記解析処理手順において解析処理が実行された後の観察画像を解析画像として保持する解析画像記憶手順と、
複数の上記解析画像のそれぞれの特徴量を計測する特徴量計測手順と、
上記特徴量計測手順において計測された特徴量を上記解析画像と対応付けて表示する特徴量表示手順と、
複数の上記解析画像の中から編集対象となる上記解析画像を編集画像として選択する編集画像選択手順と、
ユーザ操作に基づいて、上記解析パラメータを変更するパラメータ調整手順と、
上記編集画像選択手順において選択された編集画像に対応する観察画像に対し、上記パラメータ調整手順において変更された変更後の解析パラメータに基づいて解析処理を実行したときの解析画像を表示する解析画像表示手順と、
上記変更後の解析パラメータを用いて解析処理を再実行する解析画像を、再処理画像として選択する再処理画像選択手順とをコンピュータに実行させ、
上記解析処理手順は、上記再処理画像選択手順において選択された上記再処理画像に対応する上記観察画像に対し、上記変更後の解析パラメータを用いて解析処理を実行することを特徴とする撮影解析装置用のプログラム。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、撮影解析装置、その制御方法及び撮影解析装置用のプログラムに係り、さらに詳しくは、観察対象物を撮影して取得された複数の観察画像を解析する撮影解析装置の改良に関する。
【背景技術】
【０００２】
蛍光観察は、試薬を付与した観察対象物に励起光を照射し、観察対象物から発せられる蛍光を利用して観察対象物を撮影し、得られた撮影画像を閲覧することにより行われる（例えば、特許文献１）。試薬は、励起光を吸収して蛍光を放射する蛍光色素からなり、細胞や生体組織に取り込まれることにより、無色透明の細胞、生体組織、細胞内の器官を蛍光によって識別することができる。
【０００３】
通常、蛍光の強さや位置を正確に特定するといった定量測定には、カラーカメラよりも感度が高いモノクロカメラが用いられ、観察対象物には、試薬に対応する波長の励起光が照射される。モノクロカメラにより取得される撮影画像は、観察対象物上における試薬の分布を示すモノクロ階調画像からなる。例えば、細胞の数を測定する場合、細胞や細胞内の組織を染色する試薬が用いられる。試薬による染色部位は、輝度閾値を用いてモノクロ階調画像を二値化することにより、互いに隣接する画素からなるブロブ領域として識別することができる。
【０００４】
また、同一の観察対象物の互いに異なる部位をそれぞれ撮影した複数のモノクロ階調画像を連結することにより、カメラの実視野よりも視野の広い１枚の広視野画像を作成し、広視野画像を用いて細胞の様子を観察することが行われる。この様な場合には、連結対象の複数のモノクロ階調画像が同一の輝度閾値を用いて一括処理される。
【０００５】
ところが、モノクロ階調画像のような撮影画像には、レンズ性能や観察対象物の状態の影響により、画像中央部が周辺部に比べて明るいといった明るさのむらが生じる場合が少なくない。このため、撮影部位によっては輝度閾値が適切でなく、一括処理後の二値化画像には、ブロブ領域が正しく抽出されていないものが含まれることがある。
【０００６】
従来の撮影解析装置では、一括処理後の二値化画像に不具合があれば、最初に二値化閾値を設定するために利用したモノクロ階調画像を開いて、輝度閾値を適切な値に変更して、連結対象の全てのモノクロ階調画像を再度一括処理しなければならなかった。この様な方法では、各モノクロ階調画像に共通の輝度閾値を用いることから、何度一括処理を繰り返しても、全てのモノクロ階調画像について、効率的に、所望の二値化画像が得られない場合があった。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００７】
【特許文献１】特開２００８−１３９７９５号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００８】
本発明は、上記の事情に鑑みてなされたものであり、複数の観察画像の各々について所定の解析処理を施す場合に、簡易な操作で効率的に解析処理後の観察画像を得ることができる撮影解析装置を提供することを目的とする。特に、観察画像に明るさのむらがある場合であっても、解析パラメータを変更しながら観察画像の二値化を繰り返すことにより、所望の二値化画像を得ることができる撮影解析装置を提供することを他の目的とする。
【０００９】
また、本発明は、連結対象の複数のモノクロ階調画像について、所望の二値化画像を得ることができる撮影解析装置を提供することを他の目的とする。また、本発明は、再処理対象の解析画像を自動的に選択することができる撮影解析装置を提供することを他の目的とする。
【００１０】
また、本発明は、上述した撮影解析装置の制御方法を提供することを目的とする。さらに、本発明は、コンピュータを上述した撮影解析装置として機能させることができるプログラムを提供することを他の目的とする。
【課題を解決するための手段】
【００１１】
第１の本発明による撮影解析装置は、観察対象物を撮影して取得された複数の観察画像を保持する観察画像記憶手段と、上記複数の観察画像を解析するための解析処理に用いられる解析パラメータを指定するパラメータ指定手段と、上記パラメータ指定手段により指定された解析パラメータに基づいて、上記複数の観察画像の各々に対して解析処理を実行する解析処理手段と、上記解析処理手段により解析処理が実行された後の観察画像を解析画像として保持する解析画像記憶手段と、複数の上記解析画像のそれぞれの特徴量を計測する特徴量計測手段と、上記特徴量計測手段により計測された特徴量を上記解析画像と対応付けて表示する特徴量表示手段と、複数の上記解析画像の中から編集対象となる上記解析画像を編集画像として選択する編集画像選択手段と、ユーザ操作に基づいて、上記解析パラメータを変更するパラメータ調整手段と、上記編集画像選択手段により選択された編集画像に対応する観察画像に対し、上記パラメータ調整手段により変更された変更後の解析パラメータに基づいて解析処理を実行したときの解析画像を表示する解析画像表示手段と、上記変更後の解析パラメータを用いて解析処理を再実行する解析画像を、再処理画像として選択する再処理画像選択手段とを備え、上記解析処理手段が、上記再処理画像選択手段により選択された上記再処理画像に対応する上記観察画像に対し、上記変更後の解析パラメータを用いて解析処理を実行するように構成される。
【００１２】
この様な構成によれば、ユーザは、複数の観察画像に対して一括して解析処理（バッチ処理）を行った後、解析画像の各々の特徴量を確認し、解析ＮＧと判断される編集画像を選択し、その編集画像を用いて解析パラメータを調整し、調整結果をモニタ上で確認することで、解析パラメータを適切なパラメータに調整できる。これにより、この適切なパラメータ（変更後の解析パラメータ）を用いて再処理画像に対応する観察画像に対して解析処理を実行できるので、簡易な操作で効率的に所望の解析画像を得ることができる。また、このような一連の操作を繰り返し行うことによって、全ての観察画像に対し、それぞれ適切な解析パラメータを用いた解析処理が実行された解析画像を効率良く得ることができる。
【００１３】
第２の本発明による撮影解析装置は、上記構成に加え、同一の観察対象物の互いに異なる部位をそれぞれ撮影し、２以上の上記観察画像を取得する撮影手段を備えて構成される。この様な構成によれば、連結対象の複数の観察画像について、所望の二値化画像を得ることができる。
【００１４】
第３の本発明による撮影解析装置は、上記構成に加え、上記特徴量計測手段が、上記解析画像に含まれるブロブ領域の数を計測し、上記再処理画像選択手段が、上記ブロブ領域の数が一定値以下の解析画像を上記再処理画像として選択するように構成される。この様な構成によれば、同一の解析パラメータを用いて一括処理された複数の解析画像の中から、再処理対象の解析画像を自動的に選択することができる。
【００１５】
第４の本発明による撮影解析装置は、上記構成に加え、上記解析画像の識別情報からなる解析画像リストを表示する解析画像リスト表示手段を備え、上記再処理画像選択手段が、ユーザ操作に基づいて、上記解析画像リスト上で選択された解析画像を上記再処理画像として選択するように構成される。この様な構成によれば、ユーザは、同一の解析パラメータを用いて一括処理された複数の解析画像の中から、不具合のあった解析画像を再処理画像として選択することができる。
【００１６】
第５の本発明による撮影解析装置は、上記構成に加え、上記特徴量表示手段が、上記解析画像に含まれるブロブ領域の数を上記解析画像の識別情報に対応づけて表示するように構成される。この様な構成によれば、一括処理後の複数の解析画像のうち、不具合のあった解析画像を容易に識別することができる。
【００１７】
第６の本発明による撮影解析装置は、上記構成に加え、上記特徴量表示手段が、上記ブロブ領域の数が一定値以下の解析画像と、上記ブロブ領域の数が一定値を上回る解析画像とを識別するためのシンボルを上記解析画像の識別情報に対応づけて表示するように構成される。この様な構成によれば、一括処理後の複数の解析画像のうち、不具合のあった解析画像をさらに容易に識別することができる。
【００１８】
第７の本発明による撮影解析装置は、上記構成に加え、上記解析画像の更新回数を当該解析画像の識別情報に対応づけて表示する更新回数表示手段を備えて構成される。この様な構成によれば、複数の解析画像の中から再処理画像を選択する際に、ユーザは、各解析画像の更新回数を容易に識別することができる。
【００１９】
第８の本発明による撮影解析装置は、上記構成に加え、上記解析パラメータが、輝度閾値であり、上記抽出画像生成手段が、上記輝度閾値を用いて上記モノクロ階調画像を二値化するように構成される。この様な構成によれば、試薬による染色部位をブロブ領域として識別することができる。
【００２０】
第９の本発明による撮影解析装置は、上記構成に加え、上記変更後の解析パラメータを用いて解析処理が実行された解析画像と、当該解析処理が実行されなかった解析画像とを区別するための実行状況を表示する実行状況表示手段を備えて構成される。この様な構成によれば、ユーザは、変更後の解析パラメータに基づく解析処理が実行されたか否かを容易に識別することができる。
【００２１】
第１０の本発明による撮影解析装置の制御方法は、観察対象物を撮影して取得された複数の観察画像を保持する観察画像記憶ステップと、上記複数の観察画像を解析するための解析処理に用いられる解析パラメータを指定するパラメータ指定ステップと、上記パラメータ指定ステップにおいて指定された解析パラメータに基づいて、上記複数の観察画像の各々に対して解析処理を実行する解析処理ステップと、上記解析処理ステップにおいて解析処理が実行された後の観察画像を解析画像として保持する解析画像記憶ステップと、複数の上記解析画像のそれぞれの特徴量を計測する特徴量計測ステップと、上記特徴量計測ステップにおいて計測された特徴量を上記解析画像と対応付けて表示する特徴量表示ステップと、複数の上記解析画像の中から編集対象となる上記解析画像を編集画像として選択する編集画像選択ステップと、ユーザ操作に基づいて、上記解析パラメータを変更するパラメータ調整ステップと、上記編集画像選択ステップにおいて選択された編集画像に対応する観察画像に対し、上記パラメータ調整ステップにおいて変更された変更後の解析パラメータに基づいて解析処理を実行したときの解析画像を表示する解析画像表示ステップと、上記変更後の解析パラメータを用いて解析処理を再実行する解析画像を、再処理画像として選択する再処理画像選択ステップとを備え、上記解析処理ステップが、上記再処理画像選択ステップにおいて選択された上記再処理画像に対応する上記観察画像に対し、上記変更後の解析パラメータを用いて解析処理を実行するように構成される。
【００２２】
第１１の本発明による撮影解析装置用のプログラムは、観察対象物を撮影して取得された複数の観察画像を保持する観察画像記憶手順と、上記複数の観察画像を解析するための解析処理に用いられる解析パラメータを指定するパラメータ指定手順と、上記パラメータ指定手順において指定された解析パラメータに基づいて、上記複数の観察画像の各々に対して解析処理を実行する解析処理手順と、上記解析処理手順において解析処理が実行された後の観察画像を解析画像として保持する解析画像記憶手順と、複数の上記解析画像のそれぞれの特徴量を計測する特徴量計測手順と、上記特徴量計測手順において計測された特徴量を上記解析画像と対応付けて表示する特徴量表示手順と、複数の上記解析画像の中から編集対象となる上記解析画像を編集画像として選択する編集画像選択手順と、ユーザ操作に基づいて、上記解析パラメータを変更するパラメータ調整手順と、上記編集画像選択手順において選択された編集画像に対応する観察画像に対し、上記パラメータ調整手順において変更された変更後の解析パラメータに基づいて解析処理を実行したときの解析画像を表示する解析画像表示手順と、上記変更後の解析パラメータを用いて解析処理を再実行する解析画像を、再処理画像として選択する再処理画像選択手順とを備え、上記解析処理手順が、上記再処理画像選択手順において選択された上記再処理画像に対応する上記観察画像に対し、上記変更後の解析パラメータを用いて解析処理を実行するように構成される。
【発明の効果】
【００２３】
本発明による撮影解析装置では、複数の観察画像の各々について所定の解析処理を施す場合に、簡易な操作で効率的に解析処理後の観察画像を得ることができる。特に、観察画像に明るさのむらがある場合であっても、解析パラメータを変更しながら観察画像の二値化を繰り返すことにより、所望の二値化画像を得ることができる。
【００２４】
また、本発明による撮影解析装置では、連結対象の複数の観察画像について、所望の二値化画像を得ることができる。また、本発明による撮影解析装置では、同一の解析パラメータを用いて一括処理された複数の解析画像の中から、再処理対象の解析画像を自動的に選択することができる。
【００２５】
また、本発明によれば、上述した撮影解析装置の制御方法を提供することができる。さらに、本発明によれば、コンピュータを上述した撮影解析装置として機能させるプログラムを提供することができる。
【図面の簡単な説明】
【００２６】
【図１】本発明の実施の形態による撮影解析装置１００の一構成例を示したブロック図である。
【図２】図１のＰＣ１２０の動作の一例を示した図であり、連結対象の複数のモノクロ階調画像ＦＩに対しバッチ処理が行われる様子が示されている。
【図３】図１のＰＣ１２０の構成例を示したブロック図である。
【図４】図３のＰＣ１２０における染色部位の抽出時の動作の一例を示したフローチャートである。
【図５】図１のＰＣ１２０の動作の一例を示した図であり、表示部１２１上に表示される解析アプリ画面５０が示されている。
【図６】図１のＰＣ１２０の動作の一例を示した図であり、１回目のバッチ処理を実行した後の解析アプリ画面５０が示されている。
【図７】図１のＰＣ１２０の動作の一例を示した図であり、解析パラメータの編集時の解析アプリ画面６０が示されている。
【図８】図１のＰＣ１２０の動作の一例を示した図であり、解析パラメータを変更した後の解析アプリ画面５０が示されている。
【図９】図１のＰＣ１２０の動作の一例を示した図であり、２回目のバッチ処理を実行した後の解析アプリ画面５０が示されている。
【図１０】図１のＰＣ１２０の動作の一例を示した図であり、計測結果の確認時に表示される計測結果確認画面７０が示されている。
【発明を実施するための形態】
【００２７】
＜撮影解析装置１００＞
図１は、本発明の実施の形態による撮影解析装置１００の一構成例を示したブロック図である。この撮影解析装置１００は、試薬を付与した観察対象物２に励起光１を照射し、観察対象物２が発する蛍光３を利用して観察対象物２を撮影する蛍光顕微鏡システムであり、撮影ユニット１１０及びＰＣ（パーソナルコンピュータ）１２０により構成される。
【００２８】
例えば、撮影解析装置１００は、撮影解析プログラムに基づいてコンピュータを動作させることにより実現することができる。また、その様な撮影解析プログラムは、ＣＤ−ＲＯＭなどのコンピュータ読み取り可能な記録媒体に記録して提供され、或いは、ネットワークを介して提供される。
【００２９】
撮影ユニット１１０は、観察対象物２を撮影してモノクロ階調画像ＦＩを取得する顕微鏡本体部であり、ＰＣ１２０により撮影制御が行われ、取得したモノクロ階調画像ＦＩをＰＣ１２０へ送信する。
【００３０】
ＰＣ１２０は、モノクロ階調画像ＦＩに基づいて定量測定を行う解析ユニットであり、表示部１２１、キーボード１２２及びマウス１２３により構成される。表示部１２１には、撮影画像、撮影条件の設定画面、定量測定の結果などが表示される。キーボード１２２及びマウス１２３は、ユーザ操作を受け付ける入力デバイスである。
【００３１】
この撮影ユニット１１０は、蛍光観察と、透過光４を利用した明視野観察とを切替可能であり、フィルタホルダ１１１、対物レンズ１１２、可動ステージ１１３、結像レンズ１１４、観察切替手段１１５、カラーフィルタ１１６、モノクロカメラ１１７、接眼レンズ１１８、カラーカメラ１１９、励起光源２０、光量調整部２１、コレクタレンズ２２、透過照明光源３０、透過照明レンズ３１、フィルタ切替部４０、ステージ駆動部４１、画像転送部４２及び制御部４３により構成される。
【００３２】
励起光源２０は、試薬に含まれる蛍光色素を励起するための励起光１を生成する蛍光観察用光源装置であり、試薬に対応する波長を含む励起光１が出射される。例えば、水銀ランプが励起光源２０として用いられ、可視光よりも波長の短い紫外光が励起光１として出射される。
【００３３】
光量調整部２１は、励起光１の透過光量を調整する。コレクタレンズ２２は、光量調整部２１を介して励起光源２０から入射された励起光１を平行な光束に変換し、フィルタホルダ１１１内の励起フィルタ１２に向けて出射する。
【００３４】
フィルタホルダ１１１は、２以上のフィルタユニット１０を保持し、所定方向に移動させることにより、フィルタユニット１０のいずれか一つを観察光の光路上に配置し、或いは、当該光路から退避させることができる。フィルタユニット１０は、励起フィルタ１１、ダイクロイックミラー１２及び吸収フィルタ１３からなる。
【００３５】
励起フィルタ１１は、所定の波長の励起光１を選択的に透過させる波長選択フィルタである。ダイクロイックミラー１２は、励起フィルタ１１を透過した励起光１を対物レンズ１１２に向けて反射する一方、観察対象物２から対物レンズ１１２を介して入射された観察光を吸収フィルタ１２側へ透過させる。
【００３６】
吸収フィルタ１３は、観察対象物２により散乱され、対物レンズ１１２及びダイクロイックミラー１４を介して入射された励起光１を吸収するとともに、所定の波長の蛍光３を選択的に透過させる波長選択フィルタである。励起光１は、観察対象物２に対し、観察光と同軸に対物レンズ１１２側から落射される。
【００３７】
可動ステージ１１３は、試薬を付与した観察対象物２を載置する載置台であり、ｘ，ｙ，ｚ方向に移動させることができる。ｚ方向は、対物レンズ１１２の光軸に平行な方向であり、ｘ，ｙ方向は、上記光軸に垂直な方向である。ステージ駆動部４１は、可動ステージ１１３の駆動を行う。可動ステージ１１３をｚ方向に移動させることにより、撮影画像のピント合わせを行うことができる。また、可動ステージ１１３をｘ又はｙ方向に移動させることにより、モノクロカメラ１１７の視野内へ観察対象物２を移動させ、或いは、同一の観察対象物２の異なる部位を撮影することができる。
【００３８】
試薬は、励起光を吸収して蛍光を放射する蛍光色素からなる。フィルタホルダ１１１には、試薬ごとのフィルタユニット１０が保持される。フィルタ切替部４０は、フィルタユニット１０の切替を行う。発光させる試薬に応じてフィルタユニット１０を変更することにより、観察対象物２に対し試薬に対応する波長の励起光１を照射することができる。
【００３９】
フィルタユニット１０を透過した蛍光３は、結像レンズ１１４、観察切替部１１５及びカラーフィルタ１１６を介して、モノクロカメラ１１７に入射される。観察切替部１１５は、蛍光観察時に、観察対象物２から結像レンズ１１４を介して入射された蛍光３をモノクロカメラ１１７側へ透過させ、透過光４による明視野観察時に、観察対象物２から結像レンズ１１４を介して入射された透過光４をカラーカメラ１１９に向けて反射する。
【００４０】
カラーフィルタ１１６は、モノクロカメラ１１７を用いて明視野観察を行う場合に使用されるフィルタであり、ＲＧＢの色成分を選択的に透過させる。モノクロカメラ１１７は、蛍光３を受光してモノクロ階調画像ＦＩを生成する蛍光観察用撮像装置であり、ＣＣＤ（Charge Coupled Devices：電荷結合素子）などの撮像素子により構成される。
【００４１】
透過照明光源３０は、明視野観察用の可視光を生成する光源装置である。透過照明レンズ３１は、透過照明光源３０から入射された可視光を可動ステージ１１３に向けて集光する。接眼レンズ１１８は、観察対象物２を透過し、結像レンズ１１４及び観察切替部１１５を介して入射された透過光４をカラーカメラ１１９に向けて集光する。カラーカメラ１１９は、透過光４を受光してカラー画像を生成する撮像装置である。
【００４２】
画像転送部４２は、モノクロカメラ１１７からモノクロ階調画像ＦＩを取得し、或いは、カラーカメラ１１９からカラー画像を取得し、撮影画像としてＰＣ１２０へ送信する。制御部４３は、光量調整部２１、フィルタ切替部４０、ステージ駆動部４１及び画像転送部４２を制御する。
【００４３】
ＰＣ１２０では、蛍光観察時に観察対象物２を撮影して取得されたモノクロ階調画像ＦＩから所望の染色部位を抽出するために、輝度閾値ＫＴを用いてモノクロ階調画像ＦＩを二値化することにより、１又は２以上のブロブ領域からなる二値化画像ＢＩが生成される。また、カメラの実視野よりも視野の広い１枚の広視野画像を作成するために、同一の観察対象物２の互いに異なる部位をそれぞれ撮影した複数のモノクロ階調画像ＦＩが連結される。
【００４４】
図２は、図１のＰＣ１２０の動作の一例を示した図であり、連結対象の複数のモノクロ階調画像ＦＩに対しバッチ処理が行われる様子が示されている。各モノクロ階調画像ＦＩは、同一の観察対象物２の互いに異なる部位を順に撮影して取得される。
【００４５】
このモノクロ階調画像ＦＩには、対物レンズ１１２などの光学系の特性や観察対象物２の状態の影響により、撮影部位に応じて、明るさのむらが生じている。この例では、広視野画像の左下部分が右上部分に比べて明るい。この様な場合には、輝度閾値ＫＴとしてどのような値を指定しても、１回のバッチ処理では、連結対象の全てのモノクロ階調画像ＦＩについて、所望の二値化画像ＢＩを得ることはできない。
【００４６】
バッチ処理は、連結対象の撮影画像として選択された複数のモノクロ階調画像ＦＩに対して行われる一括処理であり、モノクロ階調画像ＦＩごとに、輝度閾値ＫＴを用いてモノクロ階調画像ＦＩを二値化する処理や、二値化画像ＢＩ上のブロブ領域を整形する処理が行われる。二値化処理に用いる輝度閾値ＫＴと、ブロブ領域の整形処理に用いる補正パラメータとは、解析パラメータとして予め設定される。例えば、解析パラメータは、先頭のモノクロ階調画像ＦＩに基づいて設定される。
【００４７】
１回目のバッチ処理は、この様にして設定された解析パラメータを用いて行われ、各モノクロ階調画像ＦＩから二値化画像ＢＩが生成される。この様なバッチ処理により、試薬による染色領域又は非染色領域を各モノクロ階調画像ＦＩからブロブ領域として抽出することができる。１回目のバッチ処理では、明るさのむらの影響により、広視野画像の左下部分に相当する二値化画像ＢＩについて、ブロブ領域が正しく抽出されていない。
【００４８】
そこで、本実施の形態では、上述した様なブロブ領域が正しく抽出されていないＮＧ画像を再処理画像として選択し、再処理画像に対応するモノクロ階調画像ＦＩについて、２回目のバッチ処理を行う。この２回目のバッチ処理において用いる解析パラメータは、１回目のバッチ処理時とは異なり、いずれかのＮＧ画像と、当該ＮＧ画像に対応するモノクロ階調画像ＦＩに基づいて設定される。
【００４９】
再処理画像は、２回目のバッチ処理によって得られた二値化画像ＢＩによって更新される。このため、モノクロ階調画像ＦＩに明るさのむらがある場合であっても、解析パラメータを変更しながらバッチ処理を繰り返すことにより、連結対象の全てのモノクロ階調画像ＦＩについて、所望の二値化画像ＢＩを得ることができる。
【００５０】
＜ＰＣ１２０＞
図３は、図１のＰＣ１２０の構成例を示したブロック図である。このＰＣ１２０は、操作部１０１、パラメータ指定部１０２、解析パラメータ記憶部１０３、パラメータ調整部１０４、解析処理部１０５、編集画像選択部１０６、再処理画像選択部１０７、マージ部１０８、特徴量計測部１０９、表示部１２１及び画像記憶部１２４により構成される。
【００５１】
操作部１０１は、キーボード１２２及びマウス１２３からなり、ユーザ操作に応じた操作信号を生成する。画像記憶部１２４には、観察対象物２を撮影して取得された２以上のモノクロ階調画像ＦＩが保持される。モノクロ階調画像ＦＩは、試薬に対応する波長の励起光１が照射された観察対象物２を撮影して取得された静止画像であり、画素ごとに保持される所定階調の輝度値、例えば、８ビットの輝度値からなる。表示部１２１は、ユーザ操作に基づいて、後述する解析アプリ画面やモノクロ階調画像ＦＩを表示する。
【００５２】
パラメータ指定部１０２は、解析パラメータを指定し、解析パラメータ記憶部１０３内に格納する。解析パラメータは、二値化処理に用いる輝度閾値ＫＴと、ブロブ領域の整形処理に用いる補正パラメータからなる。解析パラメータは、ユーザ操作に基づいて、任意に指定される。或いは、解析パラメータは、ユーザが条件ファイルとして指定した二値化画像ＢＩに基づいて、当該二値化画像ＢＩに対応づけられているパラメータ値を用いて自動的に指定される。
【００５３】
解析処理部１０５は、パラメータ指定部１０２により指定された解析パラメータに基づいて、複数のモノクロ階調画像ＦＩの各々に対して解析処理を実行する。具体的には、解析パラメータ記憶部１０３内の解析パラメータに基づいてモノクロ階調画像ＦＩを二値化し、１又は２以上のブロブ領域からなる二値化画像ＢＩを生成する二値化画像生成部からなる。例えば、画素ごとの輝度値を輝度閾値ＫＴと比較し、その比較結果に基づいて、輝度値が二値化される。ブロブ領域は、互いに隣接する画素からなる連続領域であり、二値化画像ＢＩにおける高輝度側の領域をブロブ領域とすることにより、染色部位を特定することができる。
【００５４】
また、補正パラメータに基づいて、二値化画像ＢＩに対しモルフォロジー演算を行い、ブロブ領域を整形する。モルフォロジー演算は、ブロブ領域の収縮又は膨張により、ブロブ領域の穴を埋めたり、欠けた領域を補正する画像処理であり、整形処理には、穴埋め、欠け補正の他、余分なブロブ領域を除去するものや、ブロブ領域を分離するものがある。
【００５５】
ブロブ領域の分離は、くびれ度などの特徴量に基づいて行われる。例えば、ウォーターシェッド（water-shed）法を利用した円形分離処理によって、１つのブロブ領域５が２以上のブロブ領域に分離される。この様なブロブ領域の整形処理を行うことにより、細胞や細胞内の器官を示す染色部位をブロブ領域として正しく識別することができる。整形処理の補正パラメータは、領域を膨張又は収縮させる程度を規定するパラメータである。
【００５６】
解析処理部１０５では、輝度閾値ＫＴに基づく二値化処理と、補正パラメータに基づく整形処理とが、モノクロ階調画像ＦＩごとに行われ、連結対象の撮影画像として指定された複数のモノクロ階調画像ＦＩがバッチ処理される。画像記憶部１２４には、解析処理部１０５により解析処理が実行された後のモノクロ階調画像ＦＩが解析画像として保持される。具体的には、同一の解析パラメータを用いて互いに異なるモノクロ階調画像ＦＩからそれぞれ生成された２以上の二値化画像ＢＩが解析画像として保持される。
【００５７】
特徴量計測部１０９は、複数の解析画像のそれぞれの特徴量を計測する。表示部１２１は、特徴量計測部１０９により計測された特徴量を解析画像と対応付けて表示する。
【００５８】
編集画像選択部１０６は、複数の解析画像の中から編集対象となる解析画像を編集画像として選択する。編集画像は、ユーザ操作に基づいて、解析画像の中から任意に選択される。パラメータ調整部１０４は、ユーザ操作に基づいて、解析パラメータ記憶部１０３内の解析パラメータを変更する。
【００５９】
表示部１２１は、編集画像選択部１０６により選択された編集画像に対応するモノクロ階調画像ＦＩに対し、パラメータ調整部１０４により変更された変更後の解析パラメータに基づいて解析処理を実行したときの解析画像を表示する。再処理画像選択部１０７は、変更後の解析パラメータを用いて解析処理を再実行する解析画像を、再処理画像として選択する。例えば、再処理画像は、ユーザ操作に基づいて、任意に選択される。
【００６０】
解析処理部１０５は、再処理画像選択部１０７により選択された再処理画像に対応するモノクロ階調画像ＦＩに対し、変更後の解析パラメータを用いて解析処理を実行する。すなわち、パラメータ調整部１０４による変更後の解析パラメータを用いて、再処理画像に対応するモノクロ階調画像ＦＩを二値化し、当該再処理画像として選択された解析画像を更新する。例えば、画像記憶部１２４内に保持されていた元の解析画像は、新たに作成された解析画像によって上書きされる。
【００６１】
マージ部１０８は、モノクロ階調画像ＦＩやモノクロ階調画像ＦＩから得られる解析画像をマージし、広視野の連結画像を生成する画像合成部である。すなわち、連結対象の２以上のモノクロ階調画像ＦＩをマージし、広視野モノクロ階調画像が生成される。また、連結対象のモノクロ階調画像ＦＩからそれぞれ得られた２以上の解析画像をマージし、広視野二値化画像が生成される。
【００６２】
広視野二値化画像は、複数の解析画像を画像間の相対位置に基づいて連結することによって作成される。例えば、可動ステージ１１３の位置を検出し、その検出結果から画像間の相対的位置関係を判断して、画像の張り合わせが行われる。画像間の相対的位置関係は、画像間のマッチングによって判断しても良い。広視野二値化画像は、観察対象物２上の細胞の数などを計測するのに用いられる。
【００６３】
特徴量計測部１０９は、解析画像に含まれるブロブ領域の数を特徴量として計測し、その計測結果を再処理画像選択部１０７へ出力する。再処理画像選択部１０７は、ブロブ領域の数が一定値以下の解析画像を再処理画像として選択する。例えば、抽出されたブロブ領域が０個の解析画像が再処理画像として選択され、ブロブ領域が１個以上の解析画像は再処理画像として選択されない。この様に構成することにより、同一の解析パラメータを用いてバッチ処理された複数の解析画像の中から、再処理対象の解析画像を自動的に選択することができる。
【００６４】
表示部１２１は、解析画像の識別情報からなる解析画像リストを表示するとともに、解析画像の更新回数や、特徴量計測部１０９により計測されたブロブ領域の数を解析画像の識別情報に対応づけて表示する。或いは、表示部１２１は、ブロブ領域の数が一定値以下の解析画像と、ブロブ領域の数が一定値を上回る解析画像とを識別するためのシンボルを解析画像の識別情報に対応づけて表示する。
【００６５】
再処理画像選択部１０７は、ユーザ操作に基づいて、解析画像リスト上で選択された解析画像を再処理画像として選択する。この様に構成することにより、ユーザは、同一の解析パラメータを用いてバッチ処理された複数の解析画像の中から、不具合のあった解析画像を容易に識別することができ、再処理画像として選択することができる。
【００６６】
図４のステップＳ１０１〜Ｓ１１１は、図３のＰＣ１２０における染色部位の抽出時の動作の一例を示したフローチャートである。まず、パラメータ指定部１０２は、ユーザ操作に基づいて解析パラメータを設定し、或いは、ユーザが条件ファイルとして指定した二値化画像ＢＩに基づいて解析パラメータを設定する（ステップＳ１０１）。
【００６７】
次に、解析処理部１０５は、連結対象として選択された２以上のモノクロ階調画像ＦＩに対し、解析パラメータを用いて二値化処理を行い、二値化画像ＢＩを生成するとともに、ブロブ領域の整形処理を行う（ステップＳ１０２〜Ｓ１０４）。このとき、得られた２以上の二値化画像ＢＩは、解析画像として保持される。これらの解析画像の中にＮＧ画像がなければ、解析画像がマージされ、広視野二値化画像が作成される（ステップＳ１０５，Ｓ１１１）。
【００６８】
一方、解析画像の中にＮＧ画像が存在する場合、編集画像選択部１０６は、ユーザ操作に基づいて、解析画像のいずれか一つを編集画像として選択し、表示部１２１は、編集画像を表示する（ステップＳ１０５，Ｓ１０６）。次に、パラメータ調整部１０４は、ユーザ操作に基づいて、解析パラメータを変更する（ステップＳ１０７）。また、再処理画像選択部１０７は、ユーザ操作に基づいて、１又は２以上の解析画像を再処理画像として選択する（ステップＳ１０８）。
【００６９】
解析処理部１０５は、変更後の解析パラメータを用いて、再処理画像に対応するモノクロ階調画像ＦＩに対し二値化処理を行い、二値化画像ＢＩを生成するとともに、ブロブ領域の整形処理を行い、得られた二値化画像ＢＩによって、当該再処理画像として選択された解析画像を更新する（ステップＳ１０９，Ｓ１１０）。
【００７０】
ステップＳ１０６からステップＳ１１０までの処理手順は、解析画像の中からＮＧ画像が存在しなくなるまで繰り返され、ＮＧ画像が無くなれば、解析画像がマージされ、広視野二値化画像が作成される。
【００７１】
＜解析アプリ画面５０＞
図５は、図１のＰＣ１２０の動作の一例を示した図であり、表示部１２１上に表示される解析アプリ画面５０が示されている。この解析アプリ画面５０は、蛍光観察時に定量測定を行うための操作画面であり、条件ファイルの設定欄５１と、対象ファイルの設定欄５３と、バッチ処理の操作領域５５と、編集ボタン５６が設けられている。
【００７２】
設定欄５１は、条件ファイルとして指定された二値化画像ＢＩを用いて、解析パラメータを設定するための操作領域であり、開くボタン５１ａ、入力欄５１ｂ、表示欄５２及び詳細ボタン５１ｃが配置されている。開くボタン５１ａは、画像ファイルのファイル名からなる画像ファイルリストを表示させるための操作アイコンである。
【００７３】
入力欄５１ｂには、条件ファイルとして指定する画像ファイルのファイル名が入力される。表示欄５２には、条件ファイルとして指定された二値化画像ＢＩが表示される。詳細ボタン５１ｃは、条件ファイルとして指定された二値化画像ＢＩの詳細を表示させるための操作アイコンである。図中の表示欄５２には、ブロブ領域が、赤色の表示色を示すドットによる網掛けによって表された二値化画像ＢＩが表示されている。
【００７４】
設定欄５３は、連結対象のモノクロ階調画像ＦＩを対象ファイルとして指定し、編集画像や再処理画像を選択するための操作領域であり、画像リスト５４と、計測結果の表示欄、追加ボタン、読込ボタン、削除ボタン、全て削除ボタン、全てチェックボタン、全てＯＦＦボタンが設けられている。対象ファイルは、追加ボタンを操作することにより、画像リスト５４に追加し、また、削除ボタンを操作することにより、画像リスト５４から削除することができる。
【００７５】
また、読込ボタンを操作することにより、ファイルフォルダ内の全ての画像ファイルを一括して対象ファイルに指定することができる。また、全て削除ボタンを操作することにより、画像リスト５４内の全ての対象ファイルを削除することができる。
【００７６】
画像リスト５４には、モノクロ階調画像ＦＩの識別情報を示すファイル名に対応づけて、ステータス、カウント値、面積及び輝度が表示される。ステータス欄には、バッチ処理が行われたか否かや更新回数が表示される。カウント値欄には、抽出されたブロブ領域の数が表示される。面積欄には、抽出されたブロブ領域の面積の積算値が表示される。輝度欄には、抽出されたブロブ領域の輝度の積算値が表示される。
【００７７】
各ファイル名には、バッチ処理の対象として選択するためのチェックボックス５４ａが設けられている。チェックボックス５４ａにチェックマークを入力することにより、バッチ処理対象として選択することができる。
【００７８】
全てチェックボタンを操作することにより、全てのチェックボックス５４ａにチェックマークを入力することができる。また、全てＯＦＦボタンを操作することにより、全ての対象ファイルをバッチ処理対象から除外することができる。
【００７９】
１回目のバッチ処理時には、全てのチェックボックス５４ａにチェックマークが入力され、全ての対象ファイルがバッチ処理対象として自動的に指定される。この例では、ファイル名「モノクロ０６１」〜「モノクロ０６４」の４つのモノクロ階調画像ＦＩが対象ファイルとして指定され、ステータス欄には、待機状態であることを示す文字列「スタンバイ」が表示されている。
【００８０】
操作領域５５には、バッチ処理を実行するための実行ボタン５５ａと、プレビューボタン５５ｂ及び計測結果ボタン５５ｃが配置されている。バッチ処理は、画像リスト５４上で選択された対象ファイルに対し行われる。バッチ処理の実行後にプレビューボタン５５ｂを操作すれば、バッチ処理によって得られた二値化画像ＢＩを表示させることができる。また、計測結果ボタン５５ｃを操作することにより、カウント値などの計測結果を表示させることができる。
【００８１】
編集ボタン５６は、画像リスト５４上で選択された対象ファイルを編集画像とし、編集画像の解析パラメータを編集するための操作アイコンである。編集ボタン５６を操作することにより、編集画像として選択された対象ファイルの二値化画像ＢＩや対応するモノクロ階調画像ＦＩを表示させ、解析パラメータを変更することができる。
【００８２】
図６は、図１のＰＣ１２０の動作の一例を示した図であり、１回目のバッチ処理を実行した後の解析アプリ画面５０が示されている。この解析アプリ画面５０では、画像リスト５４内の全てのチェックボックス５４ａがオフ状態（非選択状態）であり、ステータス欄には、１回目のバッチ処理が終了したことを示す文字列「０１−完了」が表示されている。
【００８３】
また、画像リスト５４内のカウント値欄、面積欄及び輝度欄には、バッチ処理によって得られた解析画像ごとの計測結果が表示されている。さらに、計測結果の表示欄には、カウント値、面積及び輝度の総計や平均値といった統計情報が表示されている。
【００８４】
この例では、ファイル名「モノクロ０６３」の対象ファイルが編集画像として選択されている。ここで、ユーザが何故「モノクロ０６３」の対象ファイルを編集画像として選択したかについて詳しく説明する。図６の解析アプリ画面５０では、「モノクロ０６１」の対象ファイルと「モノクロ０６４」の対象ファイルのカウント値は１であり、「モノクロ０６２」の対象ファイルと「モノクロ０６３」の対象ファイルのカウント値は０となっている。カウント値が０になる、ということは、解析画像の中にブロブ領域が全くないか（正しい計測結果）、或いは、解析画像の中にブロブ領域が幾つかあるものの、「モノクロ０６１」や「モノクロ０６４」の対象ファイル中にあるブロブ領域と比べて暗いことから現在の二値化閾値では抽出できていないか（誤った計測結果）、である。
【００８５】
そこで、ユーザは、「モノクロ０６３」の対象ファイルが反転表示された状態でプレビューボタン５５ｂを操作すれば、編集画像として選択されている対象ファイル「モノクロ０６３」の解析画像を表示欄５２に表示させることができる。
【００８６】
ユーザは、表示欄５２に表示された解析画像を確認すれば、「モノクロ０６３」の対象ファイルで示される解析画像が、正しい計測結果なのか、或いは、誤った計測結果なのかを判断することができる。ユーザは、誤った計測結果であると判断した場合、すなわち、解析画像の中にブロブ領域は存在するが暗いためにカウント値が０となっており、解析パラメータとしての二値化閾値を下げる必要があると判断した場合、編集ボタン５６を操作すれば、編集画像として選択されている対象ファイルの解析画像を編集するための操作画面を表示し、解析画像の解析パラメータを編集することができる。
【００８７】
図７は、図１のＰＣ１２０の動作の一例を示した図であり、解析パラメータの編集時の解析アプリ画面６０が示されている。この解析アプリ画面６０は、二値化結果をプレビュー表示させ、編集画像の解析パラメータを編集するための操作画面であり、編集ボタン５６の操作に基づいて表示される。この解析アプリ画面６０には、解析フローの表示欄６１と、編集画像や編集画像に対応するモノクロ階調画像ＦＩをプレビュー表示するための表示欄６２と、輝度閾値の入力欄６３と、表示設定欄６４が設けられている。
【００８８】
表示欄６１には、ブロブ領域の指定から計測結果の確認までの処理手順が表示される。表示欄６２には、モノクロ階調画像ＦＩや編集画像（二値化画像ＢＩ）が表示される。図中の表示欄６２には、編集画像として選択された対象ファイルの解析画像が表示されている。
【００８９】
入力欄６３は、モノクロ階調画像ＦＩを二値化する際に用いる輝度閾値ＫＴの値を調整するための操作領域であり、輝度閾値ＫＴを０以上２５５以下の範囲内で任意に指定することができる。輝度閾値ＫＴを変更すれば、変更後の輝度閾値ＫＴを用いて、編集画像に対応するモノクロ階調画像ＦＩが二値化され、新たな解析画像として表示欄６２内に表示される。従って、変更後の輝度閾値ＫＴが適切であるか否かを表示欄６２内の解析画像によって容易に識別することができる。
【００９０】
本実施形態では、「モノクロ０６３」の対象ファイルで示される解析画像にてブロブ領域が正しく抽出されるように、輝度閾値ＫＴを変えながら、「モノクロ０６３」の対象ファイルで示される解析画像に対応するモノクロ階調画像ＦＩに対して二値化処理を仮実行する。本実施形態では、輝度閾値ＫＴをより小さな値に設定すれば、適切にブロブ領域を抽出できるようになる。
【００９１】
表示設定欄６４は、抽出結果を表示欄６２に表示するか否かを選択し、或いは、抽出されたブロブ領域に割り当てる表示色を抽出色として指定するための操作領域である。この例では、抽出結果を表示欄６２に表示することが選択され、かつ、赤色を抽出色とすることが指定されている。
【００９２】
表示欄６２内の解析画像を閲覧することにより、ユーザは、所望の明るさの染色部位がブロブ領域として正しく抽出されているか否かを容易に識別することができる。ブロブ領域には、抽出色が割り当てられ、ドットによる網掛けによって表されている。
【００９３】
なお、領域の整形モードを選択すれば、解析画像上のブロブ領域を整形することができる。また、領域の整形モードでは、整形処理の補正パラメータを変更することができる。また、上述のように、図７に示す解析アプリ画面６０によれば、編集画像に対応するモノクロ階調画像ＦＩで二値化結果をプレビューしながらパラメータ調整することができる。さらに、図７に示す解析アプリ画面６０を用いて設定された新たな輝度閾値は、次の解析処理で用いる解析パラメータとして一旦保持される。
【００９４】
図８は、図１のＰＣ１２０の動作の一例を示した図であり、解析パラメータを変更した後の解析アプリ画面５０が示されている。この解析アプリ画面５０では、編集画像として選択された対象ファイルの解析画像が表示欄５２に表示されている。
【００９５】
図８では、「モノクロ０６３」の対象ファイルで示される解析画像が表示されている。ユーザは、「モノクロ０６３」の対象ファイルで示される解析画像を用いて二値化閾値の設定し直しをしたい場合には、開くボタン５１ａをクリックし、再び図７に例示する編集画面で二値化閾値の設定し直しを行うことができる。設定し直された二値化閾値（解析パラメータ）は、再び一旦保持される。また、画像リスト５４内のチェックボックス５４ａにチェックマークが入力されている。
【００９６】
チェックマークは、ファイル名「モノクロ０６２」及び「モノクロ０６３」のチェックボックス５４ａに入力され、これらの対象ファイルが再処理画像として選択されている。これは、ユーザが、編集画像として選択した「モノクロ０６３」に加えて、同じくカウント値が０であった「モノクロ０６２」の対象ファイルについても、新たな二値化閾値を用いた解析処理を実行すべきと判断したからである。
【００９７】
再処理画像のステータス欄には、待機状態であることを示す文字列「スタンバイ」が表示されている。２回目のバッチ処理は、これらの再処理画像に対し行われる。なお、図８では、文字列「スタンバイ」が表示された対象ファイルについて、カウント、面積、及び輝度の各値が非表示となっている。これは、これから再び解析処理を行う対象ファイルであることを分かり易くするためである。もちろん、これらの各値を表示させておき、解析処理が行われた後に、新たに算出された各値で表示を更新してもよい。
【００９８】
図９は、図１のＰＣ１２０の動作の一例を示した図であり、２回目のバッチ処理を実行した後の解析アプリ画面５０が示されている。なお、２回目のバッチ処理は、図８に示す解析アプリ画面５０において、実行ボタン５５ａをクリックすることによって行われる。このとき、上述したように一旦保持されている二値化閾値（解析パラメータ）を用いて、「モノクロ０６２」及び「モノクロ０６２」の対象ファイルに対応するモノクロ階調画像ＦＩに対して二値化処理（解析処理）が実行される。
【００９９】
図９に示す解析アプリ画面５０では、画像リスト５４内の全てのチェックボックス５４ａがオフ状態であり、ファイル名「モノクロ０６２」及び「モノクロ０６３」のステータス欄には、２回目のバッチ処理が終了したことを示す文字列「０２−完了」が表示されている。また、画像リスト５４内のカウント値欄、面積欄及び輝度欄には、２回目のバッチ処理によって得られた計測結果が表示されている。
【０１００】
具体的には、「モノクロ０６２」及び「モノクロ０６３」の対象ファイルのカウント値は、いずれも１となり、適切にブロブ抽出されたことが分かる。つまり、図７に示す解析アプリ画面６０を用いて設定された新たな輝度閾値によって、正しくブロブ抽出が行われていることが分かる。
【０１０１】
なお、上述のように、「０１−完了」と「０２−完了」とを区別することで、対象ファイルに対して何回解析処理が実行されたかを識別することができる。また、ユーザは、このステータス欄を見ることによって、次に再処理画像として選択する必要のない画像を認識することができる。例えば、「０１−完了」と表示された「モノクロ０６１」と「モノクロ０６２」の対象ファイルは、最初にバッチで実行した解析処理によって、既に所望の解析画像が得られているものである（所望の解析画像が得られていなければ、２度目の解析処理を行って、ステータスが「０２−完了」に変更されているはずである）。したがって、今後ユーザは、「０１−完了」と表示された対象ファイルに解析処理を再実行する必要はなく、すなわち、再度の解析処理が必要のない対象ファイルを無駄に開くことがなく、ひいては全ての観察画像に対して効率的に所望の解析画像を得ることができる。このように、変更後の解析パラメータを用いて解析処理が実行された解析画像と、解析画像が実行されなかった観察画像とを区別するための実行状況を表示するのが好ましい。
【０１０２】
また、本実施の形態では、ユーザはカウント値が１か０かによって、更なる解析処理が必要か否かを判断することとしたが、他にも例えば、カウント値が異常に大きい値になっていないか否かによっても判断できる。例えば、本来カウント値が１とならなければならないところ、解析画像に色むらやノイズが多いため、カウント値が１５００や２０００になってしまう場合がある（色むらやノイズを多数のブロブ領域として検出してしまう場合がある）。この場合、ユーザはカウント値が異常に大きい値になっている複数の対象ファイルから、いずれか一つを編集画像として選択して解析パラメータを編集し、また、これらの対象ファイルを再処理画像として選択する。これにより、選択された再処理画像に対し、編集後の解析パラメータを用いた解析処理が実行される。
【０１０３】
＜計測結果確認画面７０＞
図１０は、図１のＰＣ１２０の動作の一例を示した図であり、計測結果の確認時に表示される計測結果確認画面７０が示されている。この計測結果確認画面７０は、所定のユーザ操作に基づいて表示されるウィンドウ画面であり、画像リスト５４上で選択された対象ファイルについて、染色部位を示すブロブ領域ごとの計測結果が表形式により表示される。ブロブ領域には、シリアル番号が自動的に割り付けられる。
【０１０４】
計測結果確認画面７０には、ブロブ領域の面積、周囲長、長径、短径及び輝度が計測結果として表示されている。輝度は、元のモノクロ階調画像ＦＩにおける画素ごとの輝度値の積算値である。また、面積、周囲長、長径、短径及び輝度の各計測値に対し、各種の統計処理を行った結果が表示されている。具体的には、平均値、標準偏差、最大値、最小値、総計が統計処理結果として表示されている。
【０１０５】
本実施の形態によれば、複数の観察画像の各々について所定の解析処理を施す場合に、簡易な操作で効率的に解析処理後の観察画像を得ることができる。また、同一の解析パラメータを用いてバッチ処理された２以上の解析画像のうち、再処理画像として選択された１又は２以上の解析画像は、変更後の解析パラメータを用いて対応するモノクロ階調画像ＦＩを二値化して更新される。つまり、明るさのむらなどの影響によってブロブ領域が正しく抽出されていない解析画像を再処理画像として選択することにより、各解析画像について所望の二値化画像ＢＩを得ることができる。従って、モノクロ階調画像ＦＩに明るさのむらがある場合であっても、解析パラメータを変更しながらモノクロ階調画像ＦＩの二値化を繰り返すことにより、連結対象の複数のモノクロ階調画像ＦＩについて、所望の二値化画像ＢＩを得ることができる。
【０１０６】
また、抽出されたブロブ領域の数やバッチ処理による更新回数を解析画像の識別情報、すなわち、ファイル名に対応づけて表示するので、バッチ処理後の複数の解析画像のうち、不具合のあった解析画像を容易に識別することができる。
【０１０７】
なお、図８では、ユーザが画像リスト５４上で指定した解析画像が再処理画像として選択される場合の例について説明したが、段落００６０において説明した通り、ブロブ領域の数が一定値以下の解析画像を再処理画像として自動的に選択しても良い。また、例えば、ブロブ領域の面積又は輝度の積算値が一定レベル以下の解析画像を再処理画像として選択するような構成であっても良い。
【０１０８】
また、本実施の形態では、励起光１を照射した際の蛍光３を利用して観察対象物２を撮影する蛍光顕微鏡システムに本発明を適用する場合の例について説明した。しかし、本発明は、その様な蛍光顕微鏡システムに限らず、可視光を利用して観察対象物を撮影する光学顕微鏡システムにも適用することができる。また、共焦点顕微鏡、特に、レーザー光を走査させる共焦点顕微鏡システムにも本発明は適用することができる。
【符号の説明】
【０１０９】
１００  撮影解析装置
１１０  撮影ユニット
１２０  ＰＣ
１２１  表示部
１２４  画像記憶部
１０１  操作部
１０２  パラメータ指定部
１０３  解析パラメータ記憶部
１０４  パラメータ調整部
１０５  解析処理部
１０６  編集画像選択部
１０７  再処理画像選択部
１０８  マージ部
１０９  特徴量計測部
５０，６０  解析アプリ画面
５４  画像リスト
７０  計測結果確認画面
１  励起光
２  観察対象物
３  蛍光
ＦＩ  モノクロ階調画像
ＢＩ  二値化画像
【図１】
2014063043.tif 000003
【図２】
2014063043.tif 000004
【図３】
2014063043.tif 000005
【図４】
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【図５】
2014063043.tif 000007
【図６】
2014063043.tif 000008
【図７】
2014063043.tif 000009
【図８】
2014063043.tif 000010
【図９】
2014063043.tif 000011
【図１０】
2014063043.tif 000012