(57)【要約】【課題】アポリポタンパク質Ｂ発現を調節するための組成物および方法を提供すること。【解決手段】アンチセンス化合物、組成物および方法が、アポリポタンパク質Ｂの発現を調節するために提供される。この組成物は、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸に対して標的化されたアンチセンス化合物（特に、アンチセンスオリゴヌクレオチド）を含む。本発明の化合物を含む、薬学的組成物および他の組成物もまた提供される。この細胞中のアポリポタンパク質Ｂの発現を調節する方法がさらに提供される。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
本明細書中に記載の化合物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本願は、米国仮出願番号：６０／４２６，２３４（２００３年１１月１３日出願）に対する優先権を主張するＰＣＴ出願ＵＳ０３／１５４９３（２００３年５月１５日出願）の一部継続出願である。この米国仮出願番号：６０／４２６，２３４は、米国出願番号１０／１４７，１９６（２００２年５月１５日出願）（代理人整理番号ＩＳＰＨ−０６６４）の一部継続出願であり、これは、米国出願番号１０／１３５，９８５（２００２年４月３０日出願）（代理人整理番号ＩＳＰＨ−０６６３）の一部継続出願であり、これは、米国出願番号０９／９２０，０３３（２００１年８月１日出願）の（代理人整理番号ＩＳＰＨ−０５９２）の一部継続出願である。
【０００２】
（発明の分野）
本発明は、アポリポタンパク質Ｂの発現を調節するための組成物および方法を提供する。特に、本発明は、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸と特異的にハイブリダイズし得る化合物（特に、オリゴヌクレオチド）に関する。このような化合物は、アポリポタンパク質Ｂの発現を調節することが示されている。
【背景技術】
【０００３】
リポタンパク質は、タンパク質、リン脂質およびコレステロールの両親媒性コーティングによって取り囲まれた、アシルグリセロールおよびコレステリルエステルの非極性コアから構成される、球状のミセル様粒子である。リポタンパク質は、それらの機能的特性および物理的特性に基づいて、以下の５つの広範の範疇に分類されている：カイロミクロン（これは、食物脂質を腸から組織へと輸送する）；超低密度リポタンパク質（ＶＬＤ）；中間密度リポタンパク質（ＩＤＬ）；低密度リポタンパク質（ＬＤＬ）（これらは全て、トリアシルグリセロールおよびグリセロールを肝臓から組織へと輸送する）；および高密度リポタンパク質（ＨＤＬ）（これは、内在性コレステロールを組織から肝臓へと輸送する）。
【０００４】
リポタンパク質粒子は、連続代謝プロセシングを受け、そして非常に多様な特性および組成を有する。リポタンパク質の密度は、粒子直径を低減することなく増大する。なぜなら、これらの外側のコーティングの密度が、内側の密度よりも小さいからである。リポタンパク質のタンパク質成分は、アポリポタンパク質（ａｐｏｌｉｐｒｏｔｅｉｎ）として公知である。少なくとも９つのアポリポタンパク質が、種々のヒトリポタンパク質において顕著な量で分布している。
【０００５】
アポリポタンパク質Ｂ（ＡｐｏＢ、アポリポタンパク質Ｂ−１００；ＡｐｏＢ−１００、アポリポタンパク質Ｂ−４８；ＡｐｏＢ−４８およびＡｇ（ｘ）抗原としても公知）は、脂質のアセンブリおよび分泌において、ならびに別個のクラスのリポタンパク質の輸送およびレセプター媒介取り込みおよび送達において必須の役割を果たす、大きな糖タンパク質である。アポリポタンパク質Ｂの重要性は、食物脂質の吸収およびプロセシングから循環するリポタンパク質のレベルの調節まで、種々の機能にまたがる（非特許文献１）。この後者の特性は、アテローム性動脈硬化症感受性に関するその関連性の基礎であり、アテローム性動脈硬化症感受性は、アポリポタンパク質Ｂ含有リポタンパク質の周囲濃度と高度に関連している（非特許文献１）。
【０００６】
２つの形態のアポリポタンパク質Ｂが、哺乳動物において存在する。ＡｐｏＢ−１００は、ヒト肝臓においてもっぱら合成される、４５３６アミノ酸残基を含む、全長タンパク質を表す（非特許文献１）。ＡｐｏＢ−４８として公知の短縮形態は、アミノ末端の２１５２残基と対応する部分が同一線形順序に並んでおり、そして全ての哺乳動物の小腸において合成される（非特許文献１）。
【０００７】
ＡｐｏＢ−１００は、ＬＤＬの主なタンパク質成分であり、そしてこのリポタンパク質種とＬＤＬレセプターとの相互作用に必要とされるドメインを含む。さらに、ＡｐｏＢ−１００は、アポリポタンパク質（ａ）との相互作用を媒介して、Ｌｐ（ａ）と呼ばれる別の異なるアテローム発生リポタンパク質を生成する、不対のシステイン残基を含む（非特許文献１）。
【０００８】
ヒトでは、ＡｐｏＢ−４８は、カイロミクロンと会合して循環し、そしてカイロミクロンのレムナントおよびこれらの粒子は、ＬＤＬレセプター関連タンパク質として公知の別個のレセプターによって浄化される（非特許文献１）。ＡｐｏＢ−４８は、ＡｐｏＢ−１００が、内在性血漿コレステロールの輸送および送達に関与する一方で、食物脂質が小腸から肝臓へと送達される重大な順応とみなされ得る（非特許文献１）。
【０００９】
アポリポタンパク質Ｂについての共通の構造遺伝子が２つの別個のタンパク質アイソフォームを産生する基礎は、ＲＮＡ編集として公知のプロセスである。部位特異的シトシン−ウラシル編集反応は、ＵＡＡ停止コドン、そしてアポリポタンパク質Ｂの翻訳終結を生じて、ＡｐｏＢ−４８を産生する（非特許文献１）。
【００１０】
アポリポタンパク質Ｂは、１９８５年にクローニングされ（非特許文献２）、そして１９８６年に染色体２ｐ２３−２ｐ２４にマッピングされた（非特許文献３）。
【００１１】
特許文献１において開示および特許請求されるのは、アポリポタンパク質Ｂ−１００のエピトープ領域をコードする単離されたＤＮＡ配列を含む、血漿中での低密度リポタンパク質（ＬＤＬ）のレベルを決定するための方法および組成物である（Ｓｍｉｔｈら，１９９８）。
【００１２】
ヒトアポリポタンパク質Ｂを発現し、高脂肪食餌を給餌されたトランスジェニックマウスは、高血漿コレステロールレベルを発達させることが見出され、そしてアテローム性動脈硬化症の病巣の、非トランスジェニック同腹仔に対して１１倍の増加を提示した（ＫｉｍおよびＹｏｕｎｇ，Ｊ．Ｌｉｐｉｄ  Ｒｅｓ．，１９９８，３９，７０３−７２３；Ｎｉｓｈｉｎａら，Ｊ．Ｌｉｐｉｄ  Ｒｅｓ．，１９９０，３１，８５９−８６９）。
【００１３】
さらに、短縮形態のヒトアポリポタンパク質Ｂを発現するトランスジェニックマウスを用いて、アポリポタンパク質（ａ）と相互作用してＬｐ（ａ）リポタンパク質粒子を生成するために必要とされる、ＡｐｏＢ−１００のカルボキシル末端の構造的特徴が同定されており、ＡｐｏＢ−１００のＬＤＬレセプター結合領域の構造的特徴が調査されている（ＫｉｍおよびＹｏｕｎｇ，Ｊ．Ｌｉｐｉｄ  Ｒｅｓ．，１９９８，３９，７０３−７２３；ＭｃＣｏｒｍｉｃｋら，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，１９９７，２７２，２３６１６−２３６２２）。
【００１４】
高脂肪食餌を給餌した場合に高コレステロール血症を発達させることから保護される、アポリポタンパク質Ｂノックアウトマウス（ＡｐｏＢ−１００およびＡｐｏＢ−４８の両方が破壊されている）が作製されている（Ｆａｒｅｓｅら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．，１９９５，９２，１７７４−１７７８；ＫｉｍおよびＹｏｕｎｇ，Ｊ．Ｌｉｐｉｄ  Ｒｅｓ．，１９９８，３９，７０３−７２３）。ＡｐｏＢ１００またはＡｐｏＢ−４８を排他的に発現するマウスにおいてアテローム性動脈硬化症の発生率が調査されており、そしてアテローム性動脈硬化症に対する感受性は、総コレステロールレベルに依存することが見出された。マウスによって合成されたＡｐｏＢ−１００またはＡｐｏＢ−４８がアテローム性動脈硬化症の程度に影響を与えようが与えまいが、おそらく、ＡｐｏＢ−１００とＡｐｏＢ−４８とでは、固有のアテローム発生性に主な相違はないことを示す（ＫｉｍおよびＹｏｕｎｇ，Ｊ．Ｌｉｐｉｄ  Ｒｅｓ．，１９９８，３９，７０３−７２３；Ｖｅｎｉａｎｔら，Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔ．，１９９７，１００，１８０−１８８）。
【００１５】
ＡｐｏＢ−１００含有リポタンパク質Ｌｐ（ａ）の血漿レベルの上昇は、アテローム性動脈硬化症およびその発現の危険性の増大と関連し、これらは、高コレステロール血症（Ｓｅｅｄら，Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．，１９９０，３２２，１４９４−１４９９）、心筋梗塞（Ｓａｎｄｋａｍｐら，Ｃｌｉｎ．Ｃｈｅｍ．，１９９０，３６，２０−２３）、および血栓症（Ｎｏｗａｋ−Ｇｏｔｔｌら，Ｐｅｄｉａｔｒｉｃｓ，１９９７，９９，Ｅ１１）を包含し得る。
【００１６】
Ｌｐ（ａ）の血漿濃度は、遺伝的因子によって強く影響され、そして大部分の薬物および食物操作に対して治療不応性である（ＫａｔａｎおよびＢｅｙｎｅｎ，Ａｍ．Ｊ．Ｅｐｉｄｅｍｉｏｌ．，１９８７，１２５，３８７−３９９；Ｖｅｓｓｂｙら，Ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ，１９８２，４４，６１−７１）。上昇したＬｐ（ａ）レベルの薬理学的治療は、ほんのわずかにしか好首尾ではなく、そしてアフェレーシスが最も有効な治療様式のままである（ＨａｊｊａｒおよびＮａｃｈｍａｎ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｍｅｄ．，１９９６，４７，４２３−４４２）。
【００１７】
特許文献２および対応するＰＣＴ公開ＷＯ  ９９／１８９８６において開示および特許請求されるのは、アポリポタンパク質Ｂのアミノ末端領域に結合し得、従って、血管マトリクスに対する低密度リポタンパク質の結合を阻害し得る、有効量の抗体またはそのフラグメントを被験体に投与することを包含する、被験体における血管マトリクスに対するＬＤＬの結合を阻害するための方法である（ＧｏｌｄｂｅｒｇおよびＰｉｌｌａｒｉｓｅｔｔｉ，２０００；ＧｏｌｄｂｅｒｇおよびＰｉｌｌａｒｉｓｅｔｔｉ，１９９９）。
【００１８】
特許文献３において開示および特許請求されるのは、心臓血管疾患の診断および処置の目的のための、ヒトＡｐｏＢ−１００に結合するマウス組換え抗体をコードするｃＤＮＡを含むベクターである（Ｋｗａｋら，２０００）。
【００１９】
ＰＣＴ公開ＥＰ  ９１１３４４において開示および特許請求されるのは、ＡｐｏＢ−４８に特異的に結合し、そしてＡｐｏＢ−１００特異的に結合せず、高脂血症および動脈硬化の診断および治療のために有用である、モノクローナル抗体である（ＵｃｈｉｄａおよびＫｕｒａｎｏ，１９９８）。
【００２０】
ＰＣＴ公開ＷＯ  ０１／３０３５４において開示および特許請求されるのは、治療有効量の化合物を患者に投与する工程を包含する、心臓血管障害を有する患者を処置する方法であり、ここで、この化合物は、アポリポタンパク質Ｂ分解経路を刺激することによって、アポリポタンパク質Ｂまたはアポリポタンパク質Ｂを含有するリポタンパク質の血漿濃度を低下させるように一定期間にわたって作用する（ＦｉｓｈｅｒおよびＷｉｌｌｉａｍｓ，２００１）。
【００２１】
米国特許第５，２２０，００６号において開示および特許請求されるのは、アテローム発生アポリポタンパク質Ｂの抑制を媒介する、クローニングされたシス作用性ＤＮＡ配列である（Ｒｏｓｓら，１９９３）。
【００２２】
ＰＣＴ公開ＷＯ  ０１／１２７８９において開示および特許請求されるのは、ＡｐｏＢ−１００  ｍＲＮＡを６６７９位で特異的に切断するリボザイムである（Ｃｈａｎら，２００１）。
【００２３】
今日までに、アポリポタンパク質Ｂの機能を阻害することを目的としたストラテジーは、Ｌｐ（ａ）アフェレーシス、抗体、抗体フラグメントおよびリボザイムに制限されている。
【先行技術文献】
【特許文献】
【００２４】
【特許文献１】米国特許第５，７８６，２０６号明細書
【特許文献２】米国特許第６，１５６，３１５号明細書
【特許文献３】米国特許第６，０９６，５１６号明細書
【非特許文献】
【００２５】
【非特許文献１】ＤａｖｉｄｓｏｎおよびＳｈｅｌｎｅｓｓ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｎｕｔｒ．（２０００）２０，１６９−１９３
【非特許文献２】Ｌａｗら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．（１９８５）８２，８３４０−８３４４
【非特許文献３】Ｄｅｅｂら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．（１９８６）８３，４１９−４２２
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００２６】
アンチセンス技術は、特定の遺伝子産物の発現を低減する有効な手段として出現しており、それゆえ、アポリポタンパク質Ｂの発現調節に関連する多数の治療適用、診断適用および研究適用において独特に有用であると証明され得る。
【００２７】
本発明は、アポリポタンパク質Ｂ発現を調節する（アポリポタンパク質Ｂの選択的アイソフォームであるＡｐｏ−４８の阻害を含む）ための組成物および方法を提供する。
【課題を解決するための手段】
【００２８】
（発明の要旨）
本発明は、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸を標的化して、アポリポタンパク質Ｂの発現を調節する化合物（特に、アンチセンスオリゴヌクレオチド）に関する。本発明の化合物を含む、薬学的組成物および他の組成物もまた提供される。細胞または組織と、１以上の本発明のアンチセンス化合物または組成物とを接触させる工程を包含する、この細胞中または組織中のアポリポタンパク質Ｂの発現を調節する方法がさらに提供される。治療有効量または予防有効量の１以上の本発明のアンチセンス化合物または組成物を投与することによる、アポリポタンパク質Ｂの発現に関連する疾患もしくは状態を有する疑いがあるか、またはこのような疾患もしくは状態になる傾向がある疑いがある動物（特に、ヒト）を処置する方法がさらに提供される。
【００２９】
特に本発明は、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸分子に標的化された、長さが８〜５０個の核化合物を提供し、ここで、その化合物は、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸分子に特異的にハイブリダイズし、かつアポリポタンパク質Ｂをコードする核酸分子の発現を阻害する。その化合物は、配列番号１２７〜１３４、配列番号１３６、配列番号１３８〜１７４、配列番号１７６〜３１７、配列番号３１９〜３２１、配列番号３２３〜３３３、配列番号３３５〜３３９、配列番号３４１〜３７４、配列番号３７６〜４１６、配列番号４１８〜５００、配列番号５０２〜５１０、配列番号５１２〜８０４、配列番号８１５、配列番号８１６、配列番号８１９〜８２１、配列番号８２４、配列番号８２５、配列番号８２７、配列番号８２８、配列番号８３０、配列番号８３１、配列番号８３３〜８３５、配列番号８３７〜８３９、配列番号８４２、配列番号８４３、および配列番号８４５〜８５４のいずれか１つのうちの少なくとも８個の連続した核酸塩基を含む。
【００３０】
本発明はさらに、長さが８〜５０個の核酸塩基である化合物を提供し、これは、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸分子における活性部位の少なくとも８個の核酸塩基部分に特異的にハイブリダイズする。この化合物は、配列番号１２７〜１３４、配列番号１３６、配列番号１３８〜１７４、配列番号１７６〜３１７、配列番号３１９〜３２１、配列番号３２３〜３３３、配列番号３３５〜３３９、配列番号３４１〜３７４、配列番号３７６〜４１６、配列番号４１８〜５００、配列番号５０２〜５１０、配列番号５１２〜８０４、配列番号８１５、配列番号８１６、配列番号８１９〜８２１、配列番号８２４、配列番号８２５、配列番号８２７、配列番号８２８、配列番号８３０、配列番号８３１、配列番号８３３〜８３５、配列番号８３７〜８３９、配列番号８４２、配列番号８４３、および配列番号８４５〜８５４のいずれか１つのうちの少なくとも８個の連続した核酸塩基を含み、この活性部位は、この核酸中の領域であり、ここで、その部位への化合物の結合は、コントロールと比較して、アポリポタンパク質Ｂの発現を有意に阻害する。
【００３１】
本発明はまた、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸分子に標的化された、長さが８〜５０個の核酸塩基である化合物を提供し、ここで、この化合物は、その核酸に対して十分にハイブリダイズし、そしてアポリポタンパク質Ｂの発現を阻害し、ここで、このアポリポタンパク質Ｂは、以下：
（ａ）配列番号３、および
（ｂ）ストリンジェントな条件下で（ａ）のポリヌクレオチドの相補体にハイブリダイズする、天然に存在する改変体アポリポタンパク質Ｂをコード化するポリヌクレオチド
からなる群より選択されるポリヌクレオチドによってコードされる。この化合物は、配列番号１２７〜１３４、配列番号１３６、配列番号１３８〜１７４、配列番号１７６〜３１７、配列番号３１９〜３２１、配列番号３２３〜３３３、配列番号３３５〜３３９、配列番号３４１〜３７４、配列番号３７６〜４１６、配列番号４１８〜５００、配列番号５０２〜５１０、配列番号５１２〜８０４、配列番号８１５、配列番号８１６、配列番号８１９〜８２１、配列番号８２４、配列番号８２５、配列番号８２７、配列番号８２８、配列番号８３０、配列番号８３１、配列番号８３３〜８３５、配列番号８３７〜８３９、配列番号８４２、配列番号８４３、および配列番号８４５〜８５４のいずれか１つのうちの少なくとも８個の連続した核酸塩基を含む。
【００３２】
別の局面において、本発明は、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸分子に標的化された、長さが８〜５０個の核酸塩基である化合物を提供し、ここで、この化合物は、その核酸に特異的にハイブリダイズし、そしてアポリポタンパク質Ｂの発現を阻害し、ここで、このアポリポタンパク質Ｂは、配列番号３および配列番号１７からなる群より選択されるポリヌクレオチドによってコードされる。この化合物は、配列番号１２７〜１３４、配列番号１３６、配列番号１３８〜１７４、配列番号１７６〜３１７、配列番号３１９〜３２１、配列番号３２３〜３３３、配列番号３３５〜３３９、配列番号３４１〜３７４、配列番号３７６〜４１６、配列番号４１８〜５００、配列番号５０２〜５１０、配列番号５１２〜８０４、配列番号８１５、配列番号８１６、配列番号８１９〜８２１、配列番号８２４、配列番号８２５、配列番号８２７、配列番号８２８、配列番号８３０、配列番号８３１、配列番号８３３〜８３５、配列番号８３７〜８３９、配列番号８４２、配列番号８４３、および配列番号８４５〜８５４のいずれか１つのうちの少なくとも８個の連続した核酸塩基を含む。
【００３３】
本発明はまた、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸に標的化された、長さが８〜５０個の核酸塩基である化合物を提供し、ここで、この化合物は、その核酸の活性部位に特異的にハイブリダイズし、そしてアポリポタンパク質Ｂの発現を阻害する。この化合物は、配列番号１２７〜１３４、配列番号１３６、配列番号１３８〜１７４、配列番号１７６〜３１７、配列番号３１９〜３２１、配列番号３２３〜３３３、配列番号３３５〜３３９、配列番号３４１〜３７４、配列番号３７６〜４１６、配列番号４１８〜５００、配列番号５０２〜５１０、配列番号５１２〜８０４、配列番号８１５、配列番号８１６、配列番号８１９〜８２１、配列番号８２４、配列番号８２５、配列番号８２７、配列番号８２８、配列番号８３０、配列番号８３１、配列番号８３３〜８３５、配列番号８３７〜８３９、配列番号８４２、配列番号８４３、および配列番号８４５〜８５４のいずれか１つのうちの少なくとも８個の連続した核酸塩基を含み、この活性部位は、その核酸中の領域であり、ここで、その部位への化合物の結合は、コントロールと比較して、アポリポタンパク質Ｂの発現を有意に阻害される。
【００３４】
別の局面において、本発明は、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸分子に標的化された、長さが８〜５０個の核酸塩基である化合物を提供し、ここで、この化合物は、その核酸と十分にハイブリダイズし、そしてアポリポタンパク質Ｂの発現を阻害する。この化合物は、配列番号１２７〜１３４、配列番号１３６、配列番号１３８〜１７４、配列番号１７６〜３１７、配列番号３１９〜３２１、配列番号３２３〜３３３、配列番号３３５〜３３９、配列番号３４１〜３７４、配列番号３７６〜４１６、配列番号４１８〜５００、配列番号５０２〜５１０、配列番号５１２〜８０４、配列番号８１５、配列番号８１６、配列番号８１９〜８２１、配列番号８２４、配列番号８２５、配列番号８２７、配列番号８２８、配列番号８３０、配列番号８３１、配列番号８３３〜８３５、配列番号８３７〜８３９、配列番号８４２、配列番号８４３、および配列番号８４５〜８５４のいずれか１つのうちの少なくとも８個の連続した核酸塩基を含む。
【００３５】
別の局面において、本発明は、長さが８〜５０個の核酸塩基であるアンチセンス化合物を提供し、ここで、この化合物は、配列番号３に示されるヌクレオチド２９２０〜３４２０に特異的にハイブリダイズし、そして１５０ｎＭの濃度での培養物中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、１６〜２４時間後に少なくとも３０％までヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡの発現を阻害する。好ましい実施形態において、長さが８〜５０個の核酸塩基であるアンチセンス化合物は、配列番号３に示されるヌクレオチド３２３０〜３２８８に特異的にハイブリダイズし、そして１５０ｎＭの濃度での培養物中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、１６〜２４時間後に少なくとも３０％までヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡの発現を阻害する。別の局面において、この化合物は、１５０ｎＭの濃度での培養物中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、１６〜２４時間後に少なくとも５０％までヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡの発現を阻害する。
【００３６】
１つの局面において、本発明の化合物は、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸分子に対して標的化され、ここで、この化合物は、アポリポタンパク質Ｂの長形態（ｌｏｎｇ  ｆｏｒｍ）であるＡｐｏＢ−１００に特異的にハイブリダイズし、そしてＡｐｏＢ−１００の発現を阻害する。別の局面において、この化合物は、その核酸に特異的にハイブリダイズし、そして最適濃度での培養物中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、少なくとも５％までアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡの発現を阻害する。なお別の局面において、この化合物は、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、または少なくとも５０％まで、アポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡの発現を阻害する。
【００３７】
１つの局面において、上記化合物は、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、１つの実施形態において、この化合物は、配列番号２２４を含む配列を含み、このアンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号２２４、配列番号２２４を含む化合物、本質的に配列番号２２４からなる化合物、または配列番号２２４からなる化合物に対して相補的な領域にハイブリダイズする。
【００３８】
別の局面において、上記化合物は、配列番号２４７を含む配列を有し、このアンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号２４７、配列番号２４７を含む化合物、配列番号２４７からなる化合物、または配列番号２４７からなる化合物に対して相補的な領域にハイブリダイズする。
【００３９】
別の局面において、上記化合物は、配列番号３１９を含む配列を有し、このアンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号３１９、配列番号３１９を含む化合物、配列番号３１９からなる化合物、または配列番号３１９からなる化合物に対して相補的な領域にハイブリダイズする。
【００４０】
１つの実施形態において、上記化合物は、少なくとも１つの修飾されたヌクレオチド間結合を含み、別の実施形態において、この修飾されたヌクレオチド間結合は、ホスホロチオエート結合である。
【００４１】
別の局面において、上記化合物は、少なくとも１つの修飾された糖部分を含み、１つの局面において、この修飾された糖部分は、２’−Ｏ-メトキシエチル糖部分である。
【００４２】
別の実施形態において、上記化合物は、少なくとも１つの修飾された核酸塩基を含み、１つの局面において、この修飾された核酸塩基は、５−メチルシトシンである。
【００４３】
さらに別の局面において、上記化合物は、キメラオリゴヌクレオチドである。好ましいキメラ化合物としては、１以上のホスホロチオエート結合を有し、さらに２’−メトキシエトキシヌクレオチドウイングと１０個の核酸塩基２’−デオキシヌクレオチドギャップを含むキメラ化合物が挙げられる。
【００４４】
別の局面において、上記化合物は、アポリポタンパク質の代替的スプライス形態をコードする核酸分子に特異的にハイブリダイズし、そしてその発現を阻害する。
【００４５】
本発明はまた、本発明の化合物と、薬学的に許容可能な担体もしくは希釈剤とを含む組成物を提供する。１つの局面において、この組成物は、コロイド分散系をさらに含み、別の局面において、この組成物中の化合物は、アンチセンスオリゴヌクレオチドである。特定の実施形態において、この組成物は、相補鎖にハイブリダイズされた本発明のアンチセンス化合物を含む。アンチセンス鎖のハイブリダイゼーションは、１以上の平滑末端または１以上の突出末端を形成し得る。いくつかの実施形態において、この突出末端は、修飾塩基を含む。
【００４６】
本発明はさらに、細胞または組織におけるアポリポタンパク質Ｂの発現を阻害する方法を提供し、この方法は、アポリポタンパク質Ｂの発現が阻害されるように、その細胞または組織を、本発明の化合物と接触させる工程を包含する。方法はまた、アポリポタンパク質Ｂに関連する疾患または状態を有する動物を処置するために提供され、これらの方法は、アポリポタンパク質Ｂの発現が阻害されるように、治療有効量または予防有効量の本発明の化合物を、その動物に投与する工程を包含する。種々の局面において、状態は脂質代謝異常に関連し、状態はコレステロール代謝異常に関連し、状態は代謝状態異常に関連し、この代謝状態異常は高脂血症であり、疾患は糖尿病であり、この糖尿病は２型糖尿病であり、状態は肥満であり、および／または疾患は心疾患である。
【００４７】
本発明はまた、動物におけるグルコースレベルを調節する方法を提供し、その方法は、その動物に本発明の化合物を投与する工程を包含し、１つの局面において、その動物は、ヒトである。種々の実施形態において、グルコースレベルは、血漿グルコースレベルであり、グルコースレベルは、血清グルコースレベルであり、そして／またはその動物は、糖尿病の動物である。
【００４８】
本発明はまた、動物におけるアポリポタンパク質Ｂに関連する疾患または状態の発生を予防または遅延させる方法を提供し、その方法は、この動物に、本発明の化合物の治療有効量または予防有効量を投与する工程を包含する。１つの局面において、その動物は、ヒトである。他の局面において、上記状態は、代謝状態異常であり、その代謝状態異常は、高脂血症であり、上記疾患は、糖尿病であり、その糖尿病は２型糖尿病であり、上記状態は、肥満であり、上記状態は、アテローム性動脈硬化症であり、上記状態は、脂質代謝異常を含み、そして／または上記状態は、コレステロール代謝異常を含む。
【００４９】
本発明はまた、動物におけるグルコースレベルの増加を予防または遅延させる方法を提供し、その方法は、この動物に、本発明の化合物の治療有効量または予防有効量を投与する工程を包含する。１つの局面において、上記動物は、ヒトである。他の局面において、上記グルコースレベルは、血清グルコースレベルであり、そして／または上記グルコースレベルは、血漿グルコースレベルである。
【００５０】
本発明はまた、動物におけるコレステロールレベルを調節する方法を提供し、その方法は、この動物に、本発明の化合物の治療有効量または予防有効量を投与する工程を包含する。１つの局面において、上記動物は、ヒトである。
【００５１】
本発明はまた、動物におけるリポタンパク質レベルを調節する方法を提供し、その方法は、この動物に、本発明の化合物の治療有効量または予防有効量を投与する工程を包含する。１つの局面において、上記動物は、ヒトである。他の局面において、上記リポタンパク質は、ＶＬＤＬであり、上記タンパク質は、ＨＤＬであり、そして／または上記リポタンパク質は、ＬＤＬである。
【００５２】
本発明はまた、動物におけるトリグリセリドレベルを調節する方法を提供し、その方法は、この動物に、本発明の化合物の治療有効量または予防有効量を投与する工程を包含する。１つの局面において、上記動物は、ヒトである。
【００５３】
本発明はまた、アポリポタンパク質Ｂ発現に関連する疾患または状態の処置のための医薬、脂質代謝異常に関連する状態の処置のための医薬、コレステロール代謝異常に関連する状態の処置のための医薬、アテローム性動脈硬化症の処置のための医薬、高脂血症の処置のための医薬、糖尿病の処置のための医薬、２型糖尿病の処置のための医薬、肥満の処置のための医薬、心血管疾患の処置のための医薬、グルコースレベル増加の発生を予防または遅延させるための医薬、血清グルコースレベル増加の発生を予防または遅延させるための医薬、血漿グルコースレベル増加の発生を予防または遅延させるための医薬、血清コレステロールレベルの調節のための医薬、血清リポタンパク質レベルの調節のための医薬、血清ＶＬＤＬレベルの調節のための医薬、血清ＨＤＬレベルの調節のための医薬、および／または血清ＬＤＬレベルの調節のための医薬、血清トリグリセリドレベルの調節のための医薬の製造ための本発明の化合物の使用を証明する。
【００５４】
別の局面において、本発明は、循環リポタンパク質レベルを減少させる方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。別の局面において、本発明は、リポタンパク質輸送を減少させる方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。本発明はまた、リポタンパク質吸収／吸収を減少させる方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。
【００５５】
別の局面において、本発明は、循環トリグリセリドレベルを減少させる方法を意図し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。また、トリグリセリド輸送を減少させる方法が提供され、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。本発明はさらに、トリグリセリド吸収／吸収を減少させる方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。
【００５６】
別の局面において、本発明は、循環コレステロールレベル（コレステリルエステルおよび／または非エステル化コレステロールを含む）を減少させる方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。また、コレステロール輸送を減少させる方法が意図され、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。本発明はまた、コレステロール吸収／吸収を減少させる方法提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。
【００５７】
別の局面において、本発明は、循環脂質レベルを減少させる方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。本発明はまた、血漿中の脂質輸送を減少させる方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。さらに、本発明は、脂質吸収／吸収を減少させる方法提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。
【００５８】
本発明はさらに、循環する食物脂質を減少させる方法を意図し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。また、食物脂質輸送を減少させる方法、ならびに食物脂質吸収／吸収を減少させる方法が提供され、それらの方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。
【００５９】
別の局面において、本発明は、循環脂肪酸レベルを減少させる方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。本発明はまた、脂肪酸輸送を減少させる方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。また、脂肪酸吸収を減少させるための方法が意図され、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。
【００６０】
本発明はまた、循環急性期反応物質を減少させる方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。別の局面において、本発明は、急性期反応物質輸送を減少させる方法、ならびに急性期反応物質吸収を減少させる方法を提供し、それらの方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。
【００６１】
別の局面において、本発明は、循環カイロミクロンを減少させる方法、カイロミクロン輸送を減少させる方法、およびカイロミクロン吸収を減少させる方法を提供し、それらの方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。
【００６２】
本発明はさらに、循環カイロミクロン残留粒子を減少させる方法、カイロミクロン残留物輸送を減少させる方法、およびカイロミクロン残留物吸収を減少させる方法を提供し、それらの方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。
【００６３】
本発明はさらに、循環ＶＬＤＬ、ＩＤＬ、ＬＤＬおよび／またはＨＤＬを減少させる方法を意図し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。同様に、本発明は、ＶＬＤＬ輸送、ＩＤＬ輸送、ＬＤＬ輸送および／またはＨＤＬ輸送を減少させる方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。さらに、ＶＬＤＬ吸収、ＩＤＬ吸収、ＬＤＬ吸収および／またはＨＤＬ吸収を減少させる方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を減少させるのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。
【００６４】
なお別の局面において、本発明は、アポリポタンパク質Ｂに関連する状態を処置する方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を阻害するのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。上記状態は、高リポタンパク血症、家族性３型高リポタンパク血症（家族性高リポタンパク血症）、および家族性高アルファリポタンパク血症；高脂質血症、混合型高脂質血症、多発性リポタンパク質型高脂質血症、および家族性複合高脂質血症；トリグリセリド過剰血症、家族性トリグリセリド過剰血症、および家族性リポタンパク質リパーゼ；高コレステロール血症、家族性高コレステロール血症、多遺伝子性高コレステロール血症、および家族性欠損アポリポタンパク質Ｂ；心血管疾患（アテローム性動脈硬化症および冠動脈疾患が挙げられる）；末梢血管疾患；フォンギールケ病（グリコーゲン蓄積症、Ｉ型）；リポジストロフィー（先天的形態および後天的形態）；クッシング症候群；性器発育正常性小人症（ｓｅｘｕａｌ  ａｔｅｌｏｉｔｉｃ  ｄｗａｒｆｉｓｍ）（成長ホルモン単独欠損症）；真性糖尿病；ウェルナー症候群；急性間欠性ポルフィリン症；原発性胆汁性肝硬変；肝外胆汁性障害；急性肝炎；肝臓癌；全身性エリテマトーデス；単クローン性免疫グロブリン血症（骨髄腫、多発性骨髄腫、マクログロブリン血症、およびリンパ腫が挙げられる）；内分泌障害；肥満；ネフローゼ症候群；代謝症候群；炎症；甲状腺機能低下症；尿毒症（高尿酸血症）；インポテンス；閉塞性肝疾患；特発性高カルシウム血症；異常グロブリン血症（ｄｙｓｇｌｏｂｕｌｉｎｅｍｉａ）；インスリンレベルの上昇；Ｘ症候群；デュピィトレン拘縮；ならびにアルツハイマー病および痴呆から選択される。
【００６５】
本発明はまた、状態の危険性を減少させる方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を阻害するのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含し、上記状態は、妊娠；間欠性跛行；通風；ならびに水銀毒性およびアマルガム病から選択される。
【００６６】
本発明はさらに、血管内皮へのコレステロール粒子の結合を阻害する方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を阻害するのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含し、そして結果として、本発明はまた、以下：
（ｉ）コレステロール粒子酸化；
（ｉｉ）血管内皮への単球の結合；
（ｉｉｉ）単球のマクロフェージへの分化；
（ｉｖ）酸化した脂質粒子のマクロファージ摂取およびサイトカイン（ＩＬ−１、ＴＮＦ−α、ＴＧＦ−βが挙げられるが、これらに限定されない）の放出；
（ｖ）線維の線維脂肪障害および炎症の血小板形成；
（ｖｉ）血栓をもたらす内皮障害；および
（ｖｉｉ）心筋梗塞または脳卒中をもたらす血栓の危険性を減少させる方法を提供し、その方法はまた、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を阻害するのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。
【００６７】
本発明はまた、アルコール依存症、喫煙、経口避妊の使用、糖質コルチコイドの使用、βアドレナリン遮断剤の使用、またはイソトレチノイン（１３−シス−レチノール酸）の使用に関連する高脂質血症を軽減する方法を提供し、その方法は、個体に、アポリポタンパク質Ｂ発現を阻害するのに十分な量の本発明の化合物を投与する工程を包含する。
【００６８】
特定の局面において、本発明は、配列番号２４７の少なくとも８個の連続したヌクレオチドを含み、かつ少なくとも１２もしくは少なくとも１４〜３０核酸塩基の長さを有する、長さが８〜５０個の核酸塩基であるアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物を提供する。
【００６９】
さらなる局面において、本発明は、配列番号２４７に示されるような核酸塩基の配列を有し、かつ核酸塩基２、３、５、９、１２、１５、１７、１９、および２０にて５−メチルシチジンを含む、長さが２０核酸塩基であるアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供し、ここで、各ヌクレオシド間結合は、ホスホチオエート結合であり、核酸塩基１〜５および１６〜２０は、２’−メトキシエトキシ改変体を含み、そして核酸塩基６〜１５は、デオキシヌクレオチドである。
【００７０】
別の局面において、本発明は、第２の核酸塩基鎖にハイブリダイズされた第１の核酸塩基鎖を含む化合物を提供し、この第１の核酸塩基鎖は、長さが８〜５０個の核酸塩基であり、配列番号３に示される配列のうちの少なくとも８個の連続した核酸塩基を含み、この第２の核酸塩基鎖は、長さが８〜５０個の核酸塩基であり、安定なハイブリダイゼーションが可能になるように上記第１の鎖と十分に相補的な配列を含む。上記化合物は、１００ｎＭの濃度での培養物中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、１６〜２４時間後に少なくとも３０％までかまたは少なくとも５０％までヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡの発現を阻害する。
【００７１】
さらに、本発明の化合物または組成物を含む小胞（例えば、リポソーム）が提供される。
【００７２】
動物に対する本発明の化合物または組成物の投与の好ましい方法は、血管内、皮下、または経口である、。投与は繰り返され得る。
【００７３】
別の局面において、本発明は、肝細胞によるリポタンパク質（ａ）分泌を減少させる方法を提供し、その方法は、以下：
（ａ）ヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡに特異的にハイブリダイズし、かつ１００ｎＭの濃度での培養物中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、１６〜２４時間後に少なくとも３０％までかまたは少なくとも５０％までヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡの発現を阻害する、長さが８〜５０個の核酸塩基である非触媒化合物を含む組成物のある量と、肝細胞とを接触させる工程；および
（ｂ）上記肝細胞によるリポタンパク質（ａ）の分泌を測定する工程
を包含する。
【００７４】
本発明はさらに、霊長類におけるアポリポタンパク質Ｂに関連する状態を処置する方法を提供し、その方法は、この霊長類に、ヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡに特異的にハイブリダイズし、かつ１００ｎＭの濃度での培養物中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、１６〜２４時間後に少なくとも３０％までかまたは少なくとも５０％までヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡの発現を阻害する、長さが８〜５０個の核酸塩基である非触媒化合物の治療有効量または予防有効量を投与する工程を包含する。
【００７５】
本発明は、動物の肝臓においてアポリポタンパク質Ｂの発現を減少させる方法を提供し、その方法は、この動物に、ヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡに特異的にハイブリダイズし、かつ１００ｎＭの濃度での培養物中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、１６〜２４時間後に少なくとも３０％までかまたは少なくとも５０％までヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡの発現を阻害する、長さが８〜５０個の核酸塩基である非触媒化合物の２ｍｇ／ｋｇと２０ｍｇ／ｋｇとの間の量を投与する工程を包含する。
【００７６】
また、インビトロで第２の核酸塩基鎖に特異的にハイブリダイズする第１の核酸塩基鎖を含む本発明の化合物を作製する方法が提供され、この第１の鎖は、配列番号３に示される配列のうち少なくとも８個の連続した核酸塩基を含み、この第２の鎖は、安定なハイブリダイゼーションを可能にするために上記第１の鎖と十分に相補的な配列を含む。
【００７７】
本発明はさらに、本明細書中で開示される任意の状態およびすべての状態の処置のための医薬の製造における、本発明の化合物の使用を提供する。
本発明はまた、以下の項目を提供する。
（項目１）
長さが８〜５０個の核酸塩基であるアンチセンス化合物であって、該化合物は、配列番号３に示されるようなヌクレオチド２９２０〜３４２０と特異的にハイブリダイズし、そして１５０ｎＭの濃度での培養物中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、１６〜２４時間後に少なくとも３０％までヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡの発現を阻害する、アンチセンス化合物。
（項目２）
前記化合物は、配列番号３に示されるヌクレオチド３２３０〜３２８８と特異的にハイブリダイズし、そして１５０ｎＭの濃度での培地物中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、１６〜２４時間後に少なくとも３０％までがヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡの発現を阻害する、項目１に記載のアンチセンス化合物。
（項目３）
アンチセンスオリゴヌクレオチドである、項目２に記載のアンチセンス化合物。
（項目４）
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチド模倣化合物である、項目３に記載のアンチセンス化合物。
（項目５）
長さが１２〜３０個の核酸塩基である、項目２に記載のアンチセンス化合物。
（項目６）
長さが１４〜２０個の核酸塩基である、項目５に記載のアンチセンス化合物。
（項目７）
前記オリゴヌクレオチド模倣化合物は、少なくとも１つのホスホロチオエート結合を含む、項目４に記載のアンチセンス化合物。
（項目８）
前記オリゴヌクレオチド模倣化合物は、少なくとも１つの２’−Ｏ−メトキシエチル糖部分を含む、項目４に記載のアンチセンス化合物。
（項目９）
前記オリゴヌクレオチド模倣化合物は、少なくとも１つの５−メチルシトシンを含む、項目４に記載のアンチセンス化合物。
（項目１０）
前記アンチセンス化合物は、キメラアンチセンス化合物である、項目２に記載のアンチセンス化合物。
（項目１１）
前記キメラアンチセンス化合物は、キメラホスホロチオエートアンチセンス化合物である、項目１０に記載のアンチセンス化合物。
（項目１２）
前記キメラホスホロチオエートアンチセンス化合物は、２’−メトキシエトキシヌクレオチドウイングおよび２’−デオキシヌクレオチドギャップを含む、項目１１に記載のアンチセンス化合物。
（項目１３）
前記キメラホスホロチオエートアンチセンス化合物は、１０個の２’−デオキシヌクレオチドを含む、項目１２に記載のアンチセンス化合物。
（項目１４）
前記アンチセンス化合物は、１５０ｎＭの濃度での培養物中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、１６〜２４時間後に少なくとも５０％までヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡの発現を阻害する、項目１〜１３のいずれか１項に記載のアンチセンス化合物。
（項目１５）
少なくとも１つの核酸塩基は、結合体に共有結合されている、項目１〜１３のいずれか１項に記載のアンチセンス化合物。
（項目１６）
項目１〜１３のいずれか１項に記載のアンチセンス化合物と、薬学的に許容可能な担体もしくは希釈剤とを含む、組成物。
（項目１７）
コロイド分散系をさらに含む、項目１６に記載の組成物。
（項目１８）
相補鎖にハイブリダイズされた項目１〜１３のいずれか１項に記載のアンチセンス化合物を含む、組成物。
（項目１９）
前記アンチセンス化合物の相補鎖へのハイブリダイゼーションは、少なくとも１つの平滑末端を形成する、項目１８に記載の組成物。
（項目２０）
前記アンチセンス化合物の相補鎖へのハイブリダイゼーションは、２つの平滑末端を形成する、項目１９に記載の組成物。
（項目２１）
長さが８〜５０個の核酸塩基であり、配列番号２４７の少なくとも８個の連続したヌクレオチドを含む、アンチセンスオリゴヌクレオチド化合物。
（項目２２）
前記アンチセンスオリゴヌクレオチド化合物は、配列番号２４７を含む配列を有する、項目２１に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物。
（項目２３）
長さが１２〜３０個の核酸塩基である、項目２２に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物。
（項目２４）
長さが１４〜２０個の核酸塩基である、項目２３に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物。
（項目２５）
前記アンチセンスオリゴヌクレオチド化合物は、配列番号２４７からなる配列を有する、項目２４に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物。
（項目２６）
前記アンチセンスオリゴヌクレオチド化合物は、オリゴヌクレオチド模倣化合物である、項目２５に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物。
（項目２７）
前記オリゴヌクレオチド模倣化合物は、キメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチド化合物である、項目２６に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物。
（項目２８）
前記キメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチド化合物は、２’−メトキシエトキシヌクレオチドウイングおよび２’−デオキシヌクレオチドギャップを含む、項目２７に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物。
（項目２９）
前記キメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチド化合物は、１０個の２’−デオキシヌクレオチドを含む、項目２８に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物。
（項目３０）
少なくとも１つのオリゴヌクレオチドは、結合体に共有結合されている、項目２１〜２９のいずれか１項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物。
（項目３１）
項目２１〜２９のいずれか１項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物と、薬学的に許容可能な担体もしくは希釈剤とを含む、組成物。
（項目３２）
コロイド分散系をさらに含む、項目３１に記載の組成物。
（項目３３）
相補鎖にハイブリダイズされた項目２２〜２９のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド化合物を含む、組成物。
（項目３４）
前記オリゴヌクレオチド化合物の相補鎖へのハイブリダイゼーションは、少なくとも１つの平滑末端を形成する、項目３３に記載の組成物。
（項目３５）
前記オリゴヌクレオチド化合物の相補鎖へのハイブリダイゼーションは、２つの平滑末端を形成する、項目３４に記載の組成物。
（項目３６）
細胞または組織中でのアポリポタンパク質Ｂの発現を阻害する方法であって、該細胞または組織を、アポリポタンパク質Ｂの発現が阻害されるような条件下で、項目２に記載の化合物と接触させる工程を包含する、方法。
（項目３７）
細胞または組織中でのアポリポタンパク質Ｂの発現を阻害する方法であって、該細胞または組織を、アポリポタンパク質Ｂの発現が阻害されるような条件下で、項目２１に記載の化合物と接触させる工程を包含する、方法。
（項目３８）
前記細胞または組織は、インビボで接触される、項目３６または項目３７に記載の方法。
（項目３９）
前記接触させる工程は、前記化合物を動物に投与する工程を包含する、項目３８に記載の方法。
（項目４０）
前記動物はヒトである、項目３９に記載の方法。
（項目４１）
前記ヒトは、アポリポタンパク質Ｂの発現に関連する疾患または状態を有し、治療有効量または予防有効量の前記化合物が投与される、項目４０に記載の方法。
（項目４２）
前記ヒトは、脂質代謝異常に関連する状態を有する、項目４１に記載の方法。
（項目４３）
前記ヒトは、コレステロール代謝異常に関連する状態を有する、項目４１に記載の方法。
（項目４４）
前記ヒトは、心疾患を有する、項目４１に記載の方法。
（項目４５）
前記心疾患は、アテローム性動脈硬化症である、項目４４に記載の方法。
（項目４６）
前記ヒトは、アポリポタンパク質Ｂの発現に関連する代謝異常状態を有する、項目４１に記載の方法。
（項目４７）
前記代謝異常状態は、高脂血症である、項目４６に記載の方法。
（項目４８）
前記ヒトは、糖尿病を有する、項目４１に記載の方法。
（項目４９）
前記ヒトは、肥満である、項目４１に記載の方法。
（項目５０）
有効量の前記化合物は、アポリポタンパク質Ｂの発現に関連する疾患または状態を予防するために投与される、項目４０に記載の方法。
（項目５１）
有効量の前記化合物は、アポリポタンパク質Ｂの発現に関連する疾患または状態を遅延させるために投与される、項目４０に記載の方法。
（項目５２）
動物におけるグルコースレベルの上昇開始を予防または遅延させる方法であって、治療有効量または予防有効量の項目１に記載の化合物を、該動物に投与する工程を包含する、方法。
（項目５３）
動物におけるグルコースレベルの上昇開始を予防または遅延させる方法であって、治療有効量または予防有効量の項目２２に記載の化合物を、該動物に投与する工程を包含する、方法。
（項目５４）
前記動物は、ヒトである、項目５２または項目５３に記載の方法。
（項目５５）
前記グルコースレベルは、血清グルコースレベルまたは血漿グルコースレベルである、項目５４に記載の方法。
（項目５６）
動物における血清コレステロールレベルを調節する方法であって、治療有効量または予防有効量の項目１または２１に記載の化合物を、該動物に投与する工程を包含する、方法。
（項目５７）
前記動物は、ヒトである、項目５６に記載の方法。
（項目５８）
動物におけるリポタンパク質レベルを調節する方法であって、治療有効量または予防有効量の項目１に記載の化合物を、該動物に投与する工程を包含する、方法。
（項目５９）
動物におけるリポタンパク質レベルを調節する方法であって、治療有効量または予防有効量の項目２２に記載の化合物を、該動物に投与する工程を包含する、方法。
（項目６０）
前記動物は、ヒトである、項目５８または項目５９に記載の方法。
（項目６１）
前記リポタンパク質は、ＶＬＤＬである、項目６０に記載の方法。
（項目６２）
前記リポタンパク質は、ＨＤＬである、項目６０に記載の方法。
（項目６３）
前記リポタンパク質は、ＬＤＬである、項目６０に記載の方法。
（項目６４）
前記化合物は、静脈投与される、項目３９、５２、５３、５６、５８および５９のいずれか１項に記載の方法。
（項目６５）
前記化合物は、皮下投与される、項目３９、５２、５３、５６、５８および５９のいずれか１項に記載の方法。
（項目６６）
配列番号２４７に示される核酸塩基配列を有し、かつ核酸塩基２、３、５、９、１２、１５、１７、１９および２０に５−メチルシチジンを含む、長さが２０個の核酸塩基であるアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物であって、ここで、各ヌクレオチド間結合はフォスフォチオエート結合であり、核酸塩基１〜５および１６〜２０は、２’−メトキシエトキシル修飾を含み、そして核酸塩基６〜１５はデオキシヌクレオチドである、アンチセンスオリゴヌクレオチド化合物。
（項目６７）
少なくとも１つのオリゴヌクレオチドは、結合体に共有結合されている、項目６６に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物。
（項目６８）
項目６６に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物と、薬学的に許容可能な担体もしくは希釈剤とを含む、組成物。
（項目６９）
コロイド分散系をさらに含む、項目６８に記載の組成物。
（項目７０）
相補鎖にハイブリダイズされた項目６６に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物を含む、組成物。
（項目７１）
細胞または組織においてアポリポタンパク質Ｂの発現を阻害する方法であって、該細胞または組織を、アポリポタンパク質Ｂの発現が阻害されるように、項目６６に記載の化合物と接触させる工程を包含する、方法。
（項目７２）
前記細胞または組織は、インビボで接触される、項目７１に記載の方法。
（項目７３）
前記接触させる工程は、前記化合物を動物に投与する工程を包含する、項目７２に記載の方法。
（項目７４）
前記動物はヒトである、項目７３に記載の方法。
（項目７５）
前記ヒトは、アポリポタンパク質Ｂの発現に関連する疾患または状態を有し、そして治療有効量または予防有効量の前記化合物が投与される、項目７４に記載の方法。
（項目７６）
前記ヒトは、脂質代謝異常に関連する状態を有する、項目７５に記載の方法。
（項目７７）
前記ヒトは、コレステロール代謝異常に関連する状態を有する、項目７５に記載の方法。
（項目７８）
前記ヒトは、心疾患を有する、項目７５に記載の方法。
（項目７９）
前記心疾患は、アテローム性動脈硬化症である、項目７８に記載の方法。
（項目８０）
前記ヒトは、アポリポタンパク質Ｂの発現に関連する代謝異常状態を有する、項目７５に記載の方法。
（項目８１）
前記代謝異常状態は、高脂血症である、項目８０に記載の方法。
（項目８２）
前記ヒトは、糖尿病を有する、項目７５に記載の方法。
（項目８３）
前記ヒトは、肥満である、項目７５に記載の方法。
（項目８４）
有効量の前記化合物は、アポリポタンパク質Ｂの発現に関連する疾患または状態を予防するために投与される、項目７４に記載の方法。
（項目８５）
有効量の前記化合物は、アポリポタンパク質Ｂの発現に関連する疾患または状態を遅延させるために投与される、項目７４に記載の方法。
（項目８６）
動物におけるグルコースレベルの上昇開始を予防または遅延させる方法であって、治療有効量または予防有効量の項目６６に記載の化合物を、該動物に投与する工程を包含する、方法。
（項目８７）
グルコースレベルは、血清グルコースレベルである、項目８６に記載の方法。
（項目８８）
グルコースレベルは、血漿グルコースレベルである、項目８６に記載の方法。
（項目８９）
ヒトにおける血清コレステロールレベルを調節する方法であって、治療有効量または予防有効量の項目６６に記載の化合物を、該ヒトに投与する工程を包含する、方法。
（項目９０）
ヒトにおけるリポタンパク質レベルを調節する方法であって、治療有効量または予防有効量の項目６６に記載の化合物を、該ヒトに投与する工程を包含する、方法。
（項目９１）
前記リポタンパク質は、ＶＬＤＬである、項目９０に記載の方法。
（項目９２）
前記リポタンパク質は、ＨＤＬである、項目９０に記載の方法。
（項目９３）
前記リポタンパク質は、ＬＤＬである、項目９０に記載の方法。
（項目９４）
前記化合物は、静脈投与される、項目７３〜９３のいずれか１項に記載の方法。
（項目９５）
前記化合物は、皮下投与される、項目７３〜９３のいずれか１項に記載の方法。
（項目９６）
前記化合物は、経口投与される、項目７３〜９３のいずれか１項に記載の方法。
（項目９７）
項目１〜１５、項目２１〜３０、および項目６６〜６７のいずれか１項に記載の化合物を含む、キット。
（項目９８）
第２の核酸塩基鎖にハイブリダイズされた第１の核酸塩基鎖を含む化合物であって、各鎖は長さが８〜５０個の核酸塩基であり、該第１の核酸塩基鎖は、配列番号３に示される配列の少なくとも８個の連続した核酸塩基の配列を含み、該第２の核酸塩基鎖は、安定したハイブリダイゼーションを可能にするように該第１の鎖に対して十分に相補的な配列を含み、該化合物は、１００ｎＭの濃度での培養物中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、１６〜２４時間後に少なくとも３０％までヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡの発現を阻害する、化合物。
（項目９９）
前記第１の鎖は、配列番号３に示される配列の１２〜３０個の連続した核酸塩基の配列を含む、項目９８に記載の化合物。
（項目１００）
前記第１の鎖は、配列番号３に示された配列の２０個の連続した核酸塩基の配列を含む、項目９８に記載の化合物。
（項目１０１）
前記第２の鎖は、配列番号３に示された配列の少なくとも８個の連続した核酸塩基に対して完全に相補的な配列を含む、項目９８、９９または１００に記載の化合物。
（項目１０２）
前記第２の鎖は、配列番号３に示される配列の１２〜３０個の連続した核酸塩基に対して完全に相補的な配列を含む、項目１０１に記載の化合物。
（項目１０３）
前記第２の核酸塩基鎖は、配列番号３に示される配列の２０個の連続した核酸塩基に対して完全に相補的な配列を含む、項目１０１に記載の化合物。
（項目１０４）
少なくとも１つの鎖は、ＲＮＡを含む、項目９８〜１０３のいずれかに記載の化合物。
（項目１０５）
少なくとも１つの鎖は、１つまたはそれ以上のデオキシヌクレオシドを含む、項目９８〜１０４のいずれかに記載の化合物。
（項目１０６）
前記ハイブリダイズした鎖は、少なくとも１つの突出末端を形成する、項目９８〜１０５のいずれかに記載の化合物。
（項目１０７）
前記突出末端は、少なくとも１つの修飾塩基を含む、項目１０６に記載の化合物。
（項目１０８）
前記化合物は、１５０ｎＭの濃度での培養物中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、少なくとも１６〜２４時間後に、少なくとも５０％までヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡの発現を阻害する、項目９８〜１０７のいずれかに記載の化合物。
（項目１０９）
項目９８〜項目１０８のいずれかに記載の化合物を含む、ベシクル。
（項目１１０）
前記ベシクルは、リポソームである、項目１０９に記載のベシクル。
（項目１１１）
項目９８〜１０８のいずれか１項に記載の化合物と、薬学的に許容可能な担体もしくは希釈剤とを含む、組成物。
（項目１１２）
コロイド分散系をさらに含む、項目１１１に記載の組成物。
（項目１１３）
細胞または組織におけるアポリポタンパク質Ｂの発現を阻害する方法であって、該細胞または組織を、アポリポタンパク質Ｂの発現が阻害されるような条件下で、項目９８〜１０８のいずれか１項に記載の化合物と接触させる工程を包含する、方法。
（項目１１４）
前記細胞または組織はインビボで接触される、項目１１３に記載の方法。
（項目１１５）
前記接触させる工程は、前記化合物を動物に投与する工程を包含する、項目１１４に記載の方法。
（項目１１６）
前記動物はヒトである、項目１１５に記載の方法。
（項目１１７）
前記ヒトは、アポリポタンパク質Ｂの発現に関連する疾患または状態をし、そして治療有効量または予防有効量の前記化合物が投与される、項目１１６に記載の方法。
（項目１１８）
前記状態は、脂質代謝異常に関連する、項目１１７に記載の方法。
（項目１１９）
前記状態は、コレステロール代謝異常に関連する、項目１１７に記載の方法。
（項目１２０）
前記状態は、心疾患である、項目１１７に記載の方法。
（項目１２１）
前記心疾患は、アテローム性動脈硬化症である、項目１２０に記載の方法。
（項目１２２）
前記状態は、アポリポタンパク質Ｂの発現に関連する代謝異常状態である、項目１１７に記載の方法。
（項目１２３）
前記アポリポタンパク質のＢ発現に関連する代謝異常状態は、高脂血症である、項目１２２に記載の方法。
（項目１２４）
前記状態は、糖尿病である、項目１１７に記載の方法。
（項目１２５）
前記状態は、肥満である、項目１１７に記載の方法。
（項目１２６）
有効量の前記化合物は、アポリポタンパク質Ｂの発現に関連する状態を予防するために投与される、項目１１６に記載の方法。
（項目１２７）
有効量の前記化合物は、アポリポタンパク質Ｂの発現に関連する状態を遅延させるために投与される、項目１２６に記載の方法。
（項目１２８）
肝細胞によるリポタンパク質（ａ）分泌を減少させる方法であって、以下：
（ａ）該肝細胞を、ヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡと特異的なハイブリダイズし、かつ１５０ｎＭの濃度での培養物中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、１６〜２４時間後に、少なくとも３０％まで該ｍＲＮＡの発現を阻害する、長さが８〜５０個の核酸塩基である非触媒化合物を含む組成物のある量と接触させる工程であって、ここで、該量は、該肝細胞におけるアポリポタンパク質Ｂの発現を阻害するのに有効である、工程；および
（ｂ）該肝細胞によるリポタンパク質（ａ）分泌を測定する工程
を包含する、方法。
（項目１２９）
前記非触媒化合物は、配列番号３に示されるヌクレオチド３２３０〜３２８８と特異的にハイブリダイズする、項目１２８に記載の方法。
（項目１３０）
前記非触媒化合物は、配列番号２４７に示される核酸塩基の配列を含む、項目１２９に記載の方法。
（項目１３１）
前記非触媒化合物は、アンチセンスオリゴヌクレオチド模倣物である、項目１２８〜１３０のいずれかに記載の方法。
（項目１３２）
霊長類におけるアポリポタンパク質Ｂに関連する状態を処置する方法であって、ヒトアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡと特異的なハイブリダイズし、かつ１５０ｎＭの濃度での培養中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、１６〜２４時間後に、少なくとも３０％まで該ｍＲＮＡの発現を阻害する、長さが８〜５０個の核酸塩基である非触媒化合物の治療有効量または予防有効量を、該霊長類に投与する工程を包含する、方法。
（項目１３３）
前記霊長類は、ヒトである、項目１３２に記載の方法。
（項目１３４）
前記状態は、脂質代謝異常、コレステロール代謝異常、心疾患、高脂血症、糖尿病および肥満からなる群より選択される、項目１３３に記載の方法。
（項目１３５）
動物の肝臓におけるアポリポタンパク質Ｂの発現を減少させる方法であって、１５０ｎＭの濃度での培養中の８０％コンフルエントなＨｅｐＧ２細胞において、少なくとも３０％までアポリポタンパク質ＢをコードするｍＲＮＡと特異的にハイブリダイズする長さが８〜５０個の核酸塩基である非触媒化合物を、２ｍｇ／ｋｇと２０ｍｇ／ｋｇとの間の量で、該動物に投与する工程を包含する、方法。
（項目１３６）
前記化合物は、皮下投与される、項目１３５に記載の方法。
（項目１３７）
前記化合物は、静脈投与される、項目１３５に記載の方法。
（項目１３８）
前記化合物は、経口投与される、項目１３５に記載の方法。
（項目１３９）
前記動物への投与は、繰り返される、項目１３５〜１３８のいずれか１項に記載の方法。
（項目１４０）
前記動物は、ヒトである、項目１３５〜１３９のいずれか１項に記載の方法。
（項目１４１）
医薬の製造における、項目１〜１５、項目２１〜３０、項目６６〜６７、および項目９８〜１０８のいずれか１項に記載の化合物の使用。
（項目１４２）
脂質代謝を変化させるための医薬における、項目１〜１５、項目２１〜３０、項目６６〜６７、および項目９８〜１０８のいずれか１項に記載の化合物の使用。
（項目１４３）
アポリポタンパク質Ｂの発現に関連する疾患または状態に対する医薬における、項目１〜１５、項目２１〜３０、項目６６〜６７、および項目９８〜１０８のいずれか１項に記載の化合物の使用。
（項目１４４）
項目９８〜１０８のいずれか１項に記載の化合物を作製する方法であって、インビトロで第１の核酸塩基鎖を第２の核酸塩基鎖に特異的にハイブリダイズさせる工程を含み、該第１の核酸塩基鎖は配列番号３に示される配列の少なくとも８個の連続する核酸塩基の配列を含み、該第２の核酸塩基鎖は安定したハイブリダイゼーションを可能にするように該第１の鎖に対して十分に相補的な配列を含む、方法。
【発明を実施するための形態】
【００７８】
（発明の詳細な説明）
本発明は、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸分子の機能を調節する際に、最終的には、産生されるアポリポタンパク質Ｂの量を調節するために、オリゴマー化合物（特に、アンチセンスオリゴヌクレオチド）を用いる。これは、アポリポタンパク質Ｂをコードする１以上の核酸に特異的にハイブリダイズするアンチセンス化合物を提供することによって達成される。本明細書中で使用される場合、用語「標的核酸」および「アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸」は、アポリポタンパク質ＢをコードするＤＮＡ、このようなＤＮＡから転写されたＲＮＡ（プレ−ｍＲＮＡおよびｍＲＮＡを包含する）、およびこのようなＲＮＡから誘導されたｃＤＮＡもまた包含する。オリゴマー化合物の、その標的核酸との特異的ハイブリダイゼーションは、その核酸の正常な機能を妨害する。標的核酸に特異的にハイブリダイズする化合物による標的核酸の機能のこの調節は、一般に、「アンチセンス」といわれる。妨害されるべきＤＮＡの機能としては、複製および転写が挙げられる。妨害されるべきＲＮＡの機能としては、生命維持に必要な全ての機能（例えば、タンパク質翻訳部位へのＲＮＡのトランスロケーション、ＲＮＡからのタンパク質の翻訳、１以上のｍＲＮＡ種を生じるＲＮＡスプライシング、およびＲＮＡに関与し得るかまたはＲＮＡによって促進され得る触媒活性など）が挙げられる。標的核酸機能のこのような妨害の全体的効果は、アポリポタンパク質Ｂの発現調節である。本発明に関連しては、「調節」とは、遺伝子発現の増大（刺激）または減少（阻害）のいずれかを意味する。本発明に関連しては、阻害は、遺伝子発現の好ましい調節形態であり、そしてｍＲＮＡが好ましい標的である。
【００７９】
アンチセンスに関して特定の核酸を標的とすることが好ましい。アンチセンス化合物を特定の核酸に対して「標的化」することは、本発明に関連しては、複数工程のプロセスである。このプロセスは通常、その機能が調節されるべき核酸配列の同定に始まる。これは、例えば、その発現が特定の障害状態もしくは疾患状態と関連している細胞性遺伝子（またはこの遺伝子から転写されるｍＲＮＡ）または感染性因子由来の核酸分子であり得る。本発明では、この標的は、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸分子である。この標的化プロセスはまた、所望の効果（例えば、このタンパク質の検出またはこのタンパク質の発現の調節）をもたらすように、この遺伝子内での、アンチセンス相互作用が生じる部位の決定を包含する。本発明に関連しては、好ましい遺伝子内部位は、その遺伝子のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）の翻訳開始コドンまたは翻訳終結コドンを包含する領域である。当該分野で公知であるように、翻訳開始コドンは代表的には５’−ＡＵＧ（転写されたｍＲＮＡ分子において；対応するＤＮＡ分子においては５’−ＡＴＧ）であるので、翻訳開始コドンはまた、「ＡＵＧコドン」、「開始コドン」または「ＡＵＧ開始コドン」ともいわれる。少数の遺伝子は、ＲＮＡ配列５’−ＧＵＧ、５’−ＵＵＧまたは５’−ＣＵＧを有する翻訳開始コドンを有し、そして５’−ＡＵＡ、５’−ＡＣＧおよび５’−ＣＵＧがインビボで機能することが示されている。従って、用語「翻訳開始コドン」および「開始コドン」は、各例における開始アミノ酸は代表的には、メチオニン（真核生物において）またはホルミルメチオニン（原核生物において）とはいえ、多くのコドン配列を包含し得る。真核生物遺伝子および原核生物遺伝子が、２以上の代替的開始コドンを有し得、これらのうちの任意のものが、特定の細胞型もしくは組織において、または特定のセットの条件下で、翻訳開始に関して優先的に利用され得ることもまた当該分野で公知である。本発明に関しては、「開始コドン」および「翻訳開始コドン」とは、このようなコドンの配列にかかわらず、アポリポタンパク質Ｂをコードする遺伝子から転写されたｍＲＮＡ分子の翻訳を開始するためにインビボで用いられるコドンをいう。
【００８０】
遺伝子の翻訳終結コドン（または「停止コドン」）が、３つの配列（すなわち、５’−ＵＡＡ、５’−ＵＡＧおよび５’−ＵＧＡ（対応するＤＮＡ配列は、それぞれ、５’−ＴＡＡ、５’−ＴＡＧおよび５’−ＴＧＡである）のうちの１つを有し得ることもまた、当該分野で公知である。用語「開始コドン領域」および「翻訳開始コドン領域」とは、このようなｍＲＮＡまたは遺伝子のうちの、翻訳開始コドンからいずれかの方向（すなわち、５’または３’）にある約２５〜約５０連続したヌクレオチドを含む部分をいう。同様に、用語「停止コドン領域」および「翻訳終結コドン領域」とは、このようなｍＲＮＡまたは遺伝子のうちの、翻訳終結コドンからいずれかの方向（すなわち、５’または３’）にある約２５〜約５０連続したヌクレオチドを含む部分をいう。
【００８１】
オープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）または「コード領域」は、翻訳開始コドンと翻訳終結コドンとの間の領域をいうことが当該分野で公知であり、効果的に標的化され得る領域でもある。他の標的領域としては、５’非翻訳領域（５’ＵＴＲ）（これは、ｍＲＮＡのうちの翻訳開始コドンから５’方向にある部分をいうことが当該分野で公知であり、従って、ｍＲＮＡの５’キャップ部位と翻訳開始コドンとの間のヌクレオチドまたは遺伝子上の対応するヌクレオチドを包含する）および３’非翻訳領域（３’ＵＴＲ）（これは、ｍＲＮＡのうちの翻訳終結コドンから３’方向にある部分をいうことが当該分野で公知であり、従って、ｍＲＮＡの翻訳終結コドンと３’末端との間のヌクレオチドまたは遺伝子上の対応するヌクレオチドを包含する）が挙げられる。ｍＲＮＡの５’キャップは、５’−５’三リン酸結合を介してｍＲＮＡの最も５’側の残基に連結されたＮ７−メチル化グアノシン残基を包含する。ｍＲＮＡの５’キャップ領域は、５’キャップ構造自体ならびにキャップに隣接する最初の５０ヌクレオチドを包含すると考えられる。５’キャップ領域はまた、好ましい標的領域であり得る。
【００８２】
いくつかの真核生物ｍＲＮＡ転写産物は、直接的に翻訳されるが、多くのものは、転写産物から翻訳前に切り出される、「イントロン」として公知の１以上の領域を含む。残りの（それゆえ翻訳された）領域は、「エキソン」として公知であり、そして一緒にスプライシングされて、連続したｍＲＮＡ配列を形成する。ｍＲＮＡスプライス部位、すなわち、イントロン−エキソン連結部はまた、好ましい標的領域であり得、そして異常なスプライシングが疾患に関与する状況または特定のｍＲＮＡスプライス産物の過剰発現が疾患に関与する状況で特に有用である。再編成または欠失に起因した異常な融合連結部もまた、好ましい標的である。イントロンもまた、例えば、ＤＮＡまたはプレ−ｍＲＮＡに対して標的化されるアンチセンス化合物についての効果的な（それゆえ、好ましい）標的領域であり得ることが見出されている。
【００８３】
一旦、１以上の標的部位が同定されたら、その標的に対して充分に相補的である、すなわち、充分によく、そして充分な特異性を有してハイブリダイズし、所望の効果を与えるオリゴヌクレオチドが選択される。
【００８４】
本発明に関しては、「ハイブリダイゼーション」とは、相補的ヌクレオシド塩基間または相補的ヌクレオチド塩基間での水素結合（これは、Ｗａｔｓｏｎ−Ｃｒｉｃｋ水素結合、Ｈｏｏｇｓｔｅｅｎ水素結合または逆Ｈｏｏｇｓｔｅｅｎ水素結合であり得る）を意味する。例えば、アデニンおよびチミンは、水素結合の形成を介して対合する、相補的核酸塩基である。「相補的」とは、本明細書中で使用される場合、２つのヌクレオチド間で正確に対合する能力をいう。例えば、オリゴヌクレオチドの特定の位置のヌクレオチドは、ＤＮＡ分子またはＲＮＡ分子の同じ位置でヌクレオチドと水素結合し得る場合、このオリゴヌクレオチドとＤＮＡまたはＲＮＡとは、その位置で互いに相補的であると考えられる。このオリゴヌクレオチドとこのＤＮＡまたはＲＮＡとは、各分子における充分な数の対応する位置が、互いに水素結合し得るヌクレオチドによって占められている場合、互いに相補的である。従って、「特異的にハイブリダイズし得る」および「相補的」は、安定かつ特異的な結合がこのオリゴヌクレオチドとこのＤＮＡ標的またはＲＮＡ標的との間で生じるような充分な程度の相補性または正確な対合を示すために用いられる用語である。アンチセンス化合物の配列は、特異的にハイブリダイズ可能であるために、その標的核酸の配列に対して１００％相補的である必要はないことが当該分野で理解される。アンチセンス化合物は、この標的ＤＮＡ分子または標的ＲＮＡ分子に対するこの化合物の結合が、この標的ＤＮＡまたはこのＲＮＡの正常な機能を妨害して有用性の喪失を引き起こし、そして特異的結合が所望される条件下で（すなわち、インビボアッセイまたは治療処置の場合は生理学的条件下で、そしてインビトロアッセイの場合はアッセイが実施される条件下で）非標的配列に対するこのアンチセンス化合物の非特異的結合を回避するに充分な程度の相補性が存在する場合、特異的にハイブリダイズし得る。
【００８５】
標的にハイブリダイズしてその標的の発現を阻害する、本発明のアンチセンスおよび他の化合物は、実験によって同定され、そしてこれらの化合物の配列は、本明細書中以下で、本発明の好ましい実施形態として同定される。これらの好ましい配列が相補的である標的部位は、本明細書中以下で、「活性部位」といわれ、それゆえ、標的化のために好ましい部位である。それゆえ、本発明の別の実施形態は、これらの活性部位にハイブリダイズする化合物を包含する。
【００８６】
アンチセンス化合物は通常、研究試薬および診断剤として用いられる。例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチド（これは、遺伝子発現を鋭敏な特異性で阻害し得る）はしばしば、特定の遺伝子の機能を解明するために当業者によって用いられる。アンチセンス化合物はまた、例えば、生物学的経路の種々のメンバーの機能を識別するために用いられる。それゆえ、アンチセンス調節は、研究用途のために利用されている。
【００８７】
キットおよび診断における使用に関して、本発明のアンチセンス化合物は、単独で、または他のアンチセンス化合物もしくは治療剤との組合せのいずれかで、細胞内および組織内で発現される遺伝子の構成要素の一部または全体の発現パターンを解明するために、示差的分析および／またはコンビナトリアル分析においてツールとして用いられ得る。
【００８８】
１以上のアンチセンス化合物で処理された細胞内または組織内での発現パターンは、アンチセンス化合物で処理されていない、コントロールの細胞または組織と比較され、そして生じたパターンは、例えば、調べられる遺伝子の、疾患との関連、シグナル伝達経路、細胞局在、発現レベル、サイズ、構造または機能に関連するので、示差的レベルの遺伝子発現について分析される。これらの分析は、刺激された細胞または刺激されていない細胞において、そして発現パターンに影響を及ぼす他の化合物の存在下または非存在下で実施され得る。
【００８９】
当該分野で公知の遺伝子発現分析方法の例としては、以下が挙げられる：ＤＮＡアレイまたはマイクロアレイ（ＢｒａｚｍａおよびＶｉｌｏ，ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．，２０００，４８０，１７−２４；Ｃｅｌｉｓら，ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．，２０００，４８０，２−１６）、ＳＡＧＥ（遺伝子発現の連続分析）（Ｍａｄｄｅｎら，Ｄｒｕｇ  Ｄｉｓｃｏｖ．Ｔｏｄａｙ，２０００，５，４１５−４２５）、ＲＥＡＤＳ（消化したｃＤＮＡの制限酵素増幅）（ＰｒａｓｈａｒおよびＷｅｉｓｓｍａｎ，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．，１９９９，３０３，２５８−７２）、ＴＯＧＡ（総遺伝子発現分析）（Ｓｕｔｃｌｉｆｆｅら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．，２０００，９７，１９７６−８１）、タンパク質アレイおよびプロテオミクス（Ｃｅｌｉｓら，ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．，２０００，４８０，２−１６；Ｊｕｎｇｂｌｕｔら，Ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ，１９９９，２０，２１００−１０）、発現配列タグ（ＥＳＴ）の配列決定（Ｃｅｌｉｓら，ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．，２０００，４８０，２−１６；Ｌａｒｓｓｏｎら，Ｊ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２０００，８０，１４３−５７）、差引きＲＮＡフィンガープリント（ＳｕＲＦ）（Ｆｕｃｈｓら，Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，２０００，２８６，９１−９８；Ｌａｒｓｏｎら，Ｃｙｔｏｍｅｔｒｙ，２０００，４１，２０３−２０８）、差引きクローニング、ディファレンシャルディスプレイ（ＤＤ）（ＪｕｒｅｃｉｃおよびＢｅｌｍｏｎｔ，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．，２０００，３，３１６−２１）、比較ゲノムハイブリダイゼーション（Ｃａｒｕｌｌｉら，Ｊ．Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｓｕｐｐｌ．，１９９８，３１，２８６−９６）、ＦＩＳＨ（蛍光インサイチュハイブリダイゼーション）技術（ＧｏｉｎｇおよびＧｕｓｔｅｒｓｏｎ，Ｅｕｒ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ，１９９９，３５，１８９５−９０４）および質量分析法（Ｔｏ，Ｃｏｍｂ．Ｃｈｅｍ．Ｈｉｇｈ  Ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ  Ｓｃｒｅｅｎ，２０００，３，２３５−４１において概説される）。
【００９０】
アンチセンスの特異性および感度はまた、治療的用途に関して、当業者によって利用される。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、動物およびヒトの疾患状態の処置において治療部分として用いられている。アンチセンスオリゴヌクレオチド薬物（リボザイムを含む）は、ヒトに対して安全かつ有効に投与されており、そして多数の臨床試験が現在行われている。従って、オリゴヌクレオチドが、細胞、組織および動物（特に、ヒト）の処置に関する処置レジメにおいて有用であるように構成され得る有用な治療様式であり得ることが確立されている。
【００９１】
本発明に関しては、用語「オリゴヌクレオチド」とは、リボ核酸（ＲＮＡ）もしくはデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）またはそれらの模倣物のオリゴマーまたはポリマーをいう。この用語は、天然に存在する核酸塩基、糖および共有結合性ヌクレオシド間（骨格）結合から構成されるオリゴヌクレオチド、ならびに同様に機能する、天然に存在しない部分を有するオリゴヌクレオチドを包含する。このような改変または置換されたオリゴヌクレオチドはしばしば、ネイティブな形態よりも好ましい。なぜなら、所望の特性（例えば、増強された細胞取り込み、増強された核酸標的親和性およびヌクレアーゼの存在下での増大した安定性など）があるからである。
【００９２】
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、好ましい形態のアンチセンス化合物であるが、本発明は、以下で記載されるようなオリゴヌクレオチド模倣物を包含するがこれらに限定されない、他のオリゴマーアンチセンス化合物を包含する。本発明によるアンチセンス化合物は好ましくは、約８〜約５０個の核酸塩基（すなわち、約８〜約５０個連結されたヌクレオシド）を含む。特に好ましいアンチセンス化合物はアンチセンスオリゴヌクレオチドであり、さらにより好ましくは、約１２〜約３０個の核酸塩基を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドである。アンチセンス化合物としては、標的核酸にハイブリダイズしてその発現を調節する、リボザイム、外部ガイド配列（ＥＧＳ）オリゴヌクレオチド（オリゴザイム（ｏｌｉｇｏｚｙｍｅ）、および他の短い触媒性ＲＮＡまたは触媒性オリゴヌクレオチドが挙げられる。
【００９３】
当該分野で公知のように、ヌクレオシドは、塩基と糖との組合せである。ヌクレオシドの塩基部分は、通常、複素環式塩基である。２つの最も一般的なクラスのこのような複素環式塩基は、プリンおよびピリミジンである。ヌクレオチドは、ヌクレオシドの糖部分に共有結合したリン酸基をさらに含むヌクレオシドである。ペントフラノシル糖を含むヌクレオシドに関して、リン酸基は、糖の２’ヒドロキシル部分、３’ヒドロキシル部分または５’ヒドロキシル部分のいずれかへと連結され得る。オリゴヌクレオチドを形成する際に、リン酸基は、隣のヌクレオシドを別のヌクレオシドへと共有結合的に連結して、直鎖状のポリマー化合物を形成する。次いで、この直鎖状ポリマー構造体のそれぞれの末端は、さらに連結されて、環状構造体を形成し得る。しかし、開いた直鎖状構造体が一般的に好ましい。このオリゴヌクレオチド構造においては、リン酸基は通常、オリゴヌクレオチドのヌクレオシド間骨格を形成するといわれる。ＲＮＡおよびＤＮＡの正常な結合または骨格は、３’−５’ホスホジエステル結合である。
【００９４】
本発明において有用な好ましいアンチセンス化合物の特定の例としては、改変された骨格または天然に存在しないヌクレオシド間結合を含むオリゴヌクレオチドが挙げられる。本明細書中で定義する場合、改変された骨格を有するオリゴヌクレオチドとしては、リン原子をその骨格中に保持するオリゴヌクレオチドおよびリン原子をその骨格中に有さないオリゴヌクレオチドが挙げられる。本明細書の目的に関して、そしてときどき当該分野で参照されるように、リン原子をそれらのヌクレオシド間骨格に有さない、改変されたオリゴヌクレオチドもまた、オリゴヌクレオシドであるとみなされ得る。
【００９５】
好ましい改変されたオリゴヌクレオチド骨格としては、例えば、正常な３’−５’結合を有する、ホスホロチオエート、キラルホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホトリエステル、アミノアルキルホスホトリエステル、メチルホスホネートおよび他のアルキルホスホネート（３’−アルキレンホスホネート、５’−アルキレンホスホネートおよびキラルホスホネートを含む）、ホスフィネート、ホスホロアミデート（３’−アミノホスホロアミデートおよび３’−アミノアルキルホスホロアミデートを含む）、チオノホスホロアミデート、チオノアルキルホスホネート、チオノアルキルホスホトリエステル、セレノホスフェートならびにボラノホスフェート；これらの２’−５’連結アナログ；ならびに１以上のヌクレオチド間結合が、３’−３’結合、５’−５’結合または２’−２’結合である、逆の極性を有するオリゴヌクレオチド骨格が挙げられる。逆の極性を有する好ましいオリゴヌクレオチドは、最も３’側のヌクレオチド間結合での単一の３’−３’結合を含む、すなわち、無塩基性（核酸塩基が失われているかまたはその代わりにヒドロキシル基を有する）であり得る単一の逆ヌクレオシド残基を含む。種々の塩、混合塩および遊離酸の形態もまた含まれる。
【００９６】
上記のリン含有結合の調製を教示する代表的な米国特許としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない：米国特許第３，６８７，８０８号；同第４，４６９，８６３号；同第４，４７６，３０１号；同第５，０２３，２４３号；同第５，１７７，１９６号；同第５，１８８，８９７号；同第５，２６４，４２３号；同第５，２７６，０１９号；同第５，２７８，３０２号；同第５，２８６，７１７号；同第５，３２１，１３１号；同第５，３９９，６７６号；同第５，４０５，９３９号；同第５，４５３，４９６号；同第５，４５５，２３３号；同第５，４６６，６７７号；同第５，４７６，９２５号；同第５，５１９，１２６号；同第５，５３６，８２１号；同第５，５４１，３０６号；同第５，５５０，１１１号；同第５，５６３，２５３号；同第５，５７１，７９９号；同第５，５８７，３６１号；同第５，１９４，５９９号；同第５，５６５，５５５号；同第５，５２７，８９９号；同第５，７２１，２１８号；同第５，６７２，６９７号および同第５，６２５，０５０号。これらのうちの特定のものは、本願と共有に係っており、そしてこれらのうちの各々は、本明細書中に参考として援用される。
【００９７】
リン原子を含まない、好ましい改変されたオリゴヌクレオチド骨格は、短鎖アルキルヌクレオシド間結合もしくは短鎖シクロアルキルヌクレオシド間結合、混合へテロ原子およびアルキルヌクレオシド間結合もしくはシクロアルキルヌクレオシド間結合、または１以上の短鎖へテロ原子ヌクレオシド間結合もしくは短鎖複素環式ヌクレオシド間結合によって形成される骨格を有する。これらとしては、以下が挙げられる：モルホリノ結合を有する骨格（ヌクレオシドの糖部分から部分的に形成される）；シロキサン骨格；スルフィド骨格、スルホキシド骨格およびスルホン骨格；ホルムアセチル骨格およびチオホルムアセチル骨格；メチレンホルムアセチル骨格およびチオホルムアセチル骨格；リボアセチル骨格；アルケン含有骨格；スルファメート骨格；メチレンイミノ骨格およびメチレンヒドラジノ骨格；スルホネート骨格およびスルホンアミド骨格；アミド骨格；ならびに混合したＮ構成要素部分、Ｏ構成要素部分、Ｓ構成要素部分およびＣＨ２構成要素部分を有する他の骨格。
【００９８】
上記のオリゴヌクレオシドの調製を教示する代表的米国特許としては、以下の米国特許が挙げられるがこれらに限定されない：第５，０３４，５０６号；第５，１６６，３１５号；第５，１８５，４４４号；第５，２１４，１３４号；第５，２１６，１４１号；第５，２３５，０３３号；第５，２６４，５６２号；第５，２６４，５６４号；第５，４０５，９３８号；第５，４３４，２５７号；第５，４６６，６７７号；第５，４７０，９６７号；第５，４８９，６７７号；第５，５４１，３０７号；第５，５６１，２２５号；第５，５９６，０８６号；第５，６０２，２４０号；第５，６１０，２８９号；第５，６０２，２４０号；第５，６０８，０４６号；第５，６１０，２８９号；第５，６１８，７０４号；第５，６２３，０７０号；第５，６６３，３１２号；第５，６３３，３６０号；第５，６７７，４３７号；第５，７９２，６０８号；第５，６４６，２６９号および第５，６７７，４３９号。これらのうちの特定のものは、本願と共有に係っており、そしてこれらの各々は、本明細書中に参考として援用される。
【００９９】
他の好ましいオリゴヌクレオチド模倣物において、ヌクレオチド単位の糖およびヌクレオシド間結合の両方（すなわち、骨格）が、新規の基で置き換えられる。塩基単位は、適切な核酸標的化合物とのハイブリダイゼーションのために維持される。１つのそのようなオリゴマー化合物（優れたハイブリダイゼーション特性を有することが示されているオリゴヌクレオチド模倣物）は、ペプチド核酸（ＰＮＡ）といわれる。ＰＮＡ化合物では、オリゴヌクレオチドの糖骨格は、アミド含有骨格、特にアミノエチルグリシン骨格で置き換えられる。この核酸塩基は、維持され、そして骨格のアミド部分のアザ窒素原子に直接的または間接的に結合する。ＰＮＡ化合物の調製を教示する代表的な米国特許としては、米国特許第５，５３９，０８２号；米国特許第５，７１４，３３１号；および米国特許第５，７１９，２６２号が挙げられるが、これらに限定されず、これらの各々は、本明細書中で参考として援用される。ＰＮＡ化合物のさらなる教示は、Ｎｉｅｌｓｅｎら、Ｓｃｉｅｎｃｅ，１９９１，２５４，１４９７〜１５００に見出され得る。
【０１００】
本発明の最も好ましい実施形態は、ホスホロチオエート骨格を有するオリゴヌクレオチドおよびヘテロ原子骨格（特に上記で参照した米国特許第５，４８９，６７７号の−ＣＨ２−ＮＨ−Ｏ−ＣＨ２−、−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｏ−ＣＨ２−［メチレン（メチルイミノ）またはＭＭＩ骨格として公知］、−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（ＣＨ３）−ＣＨ２−、−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｎ（ＣＨ３）−ＣＨ２−ならびに−Ｏ−Ｎ（ＣＨ３）−ＣＨ２−ＣＨ２−［ここでネイティブホスホジエステル骨格は、−Ｏ−Ｐ−Ｏ−ＣＨ２−と表される］、ならびに上記で参照した米国特許第５，６０２，２４０号のアミド骨格）を有するオリゴヌクレオシドである。上記で参照した米国特許第５，０３４，５６０号のモルホリノ骨格構造を有するオリゴヌクレオチドもまた好ましい。
【０１０１】
改変されたオリゴヌクレオチドはまた、１つ以上の置換された糖部分を含み得る。好ましいオリゴヌクレオチドは、２’位に以下のうち１つを含む：ＯＨ；Ｆ；Ｏ−アルキル、Ｓ−アルキル、もしくはＮ−アルキル；Ｏ−アルケニル、Ｓ−アルケニル、もしくはＮ−アルケニル；Ｏ−アルキニル、Ｓ−アルキニルもしくはＮ−アルキニル；またはＯ−アルキル−Ｏ−アルキル（ここで、アルキル、アルケニル、およびアルキニルは、置換または非置換の、Ｃ１〜Ｃ１０アルキルまたはＣ２〜Ｃ１０アルケニルおよびＣ２〜Ｃ１０アルキニルであり得る）。特に好ましくは、Ｏ［（ＣＨ２）ｎＯ］ｍＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）ｎＯＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）ｎＮＨ２、Ｏ（ＣＨ２）ｎＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）ｎＯＮＨ２およびＯ（ＣＨ２）ｎＯＮ［（ＣＨ２）ｎＣＨ３）］２であり、ここでｎおよびｍは、１〜約１０である。他の好ましいオリゴヌクレオチドは、２’位に以下のうちの１つを含む：Ｃ１〜Ｃ１０の低級アルキル、置換された低級アルキル、置換された低級アルケニル、置換された低級アルキニル、置換された低級アルカリール、置換された低級アラルキル、置換された低級Ｏ−アルカリールもしくは置換された低級Ｏ−アラルキル、ＳＨ、ＳＣＨ３、ＯＣＮ、Ｃｌ、Ｂｒ、ＣＮ、ＣＦ３、ＯＣＦ３、ＳＯＣＨ３、ＳＯ２ＣＨ３、ＯＮＯ２、ＮＯ２、Ｎ３、ＮＨ２、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリール、アミノアルキルアミノ、ポリアルキルアミノ、置換されたシリル、ＲＮＡ切断基、レポーター基、インターカレーター、オリゴヌクレオチドの薬物動態学的特性を改善するための基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を改善するための基、および同様の性質を有する他の置換基。好ましい改変としては、２’−メトキシエトキシ（２’−Ｏ−（２−メトキシエチル）または２’−ＭＯＥとしても公知の２’−Ｏ−ＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３）（Ｍａｒｔｉｎら，Ｈｅｌｖ．Ｃｈｉｍ．Ａｃｔａ，１９９５，７８，４８６−５０４）（すなわち、アルコキシアルコキシ基）が挙げられる。さらに好ましい改変としては、２’−ジメチルアミノオキシエトキシ（すなわち、本明細書後述でも記載したような、２’−ＤＭＡＯＥとしても公知の、Ｏ（ＣＨ２）２ＯＮ（ＣＨ３）２基）、および２’−ジメチルアミノエトキシエトキシ（当該分野で、２’−Ｏ−ジメチルアミノエトキシエチルまたは２’−ＤＭＡＥＯＥとしても公知）（すなわち、本明細書後述の実施例にも記載される、２’−Ｏ−ＣＨ２−Ｏ−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ２）２）が挙げられる。
【０１０２】
さらに好ましい改変としては、ロックされた核酸（Ｌｏｃｋｅｄ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ）（ＬＮＡ）が挙げられ、ここで２’−ヒドロキシル基は、糖環の３’または４’の炭素原子と連結しており、それにより二環式糖部分が形成されている。この結合は、好ましくは、２’酸素原子と４’炭素原子とを架橋するメチレン（−ＣＨ２−）ｎ基であり、ここでｎは、１または２である。ＬＮＡおよびその調製は、ＷＯ９８／３９３５２およびＷＯ９９／１４２２６に記載される。
【０１０３】
他の好ましい改変としては、２’−メトキシ（２’−Ｏ−ＣＨ３）、２’−アミノプロポキシ（２’−ＯＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＮＨ２）、２’−アリル（２’−ＣＨ２−ＣＨ＝ＣＨ２）、２’−Ｏ−アリル（２’−Ｏ−ＣＨ２−ＣＨ＝ＣＨ２）および２’−フルオロ（２’−Ｆ）が挙げられる。２’−改変は、アラビノ（上）位またはリボ（下）位においてであり得る。好ましい２’−アラビノ改変は、２’−Ｆである。同様の改変もまた、オリゴヌクレオチド上の他の位置（特に、３’末端ヌクレオチド上または２’−５’結合オリゴヌクレオチド中の糖の３’位および５’末端ヌクレオチドの５’位）でなされ得る。オリゴヌクレオチドはまた、糖模倣物（例えば、ペントフラノシル糖の代わりのシクロブチル部分）を有し得る。このような改変された糖構造体の調製を教示する代表的な米国特許としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない：米国特許第４，９８１，９５７号；同第５，１１８，８００号；同第５，３１９，０８０号；同第５，３５９，０４４号；同第５，３９３，８７８号；同第５，４４６，１３７号；同第５，４６６，７８６号；同第５，５１４，７８５号；同第５，５１９，１３４号；同第５，５６７，８１１号；同第５，５７６，４２７号；同第５，５９１，７２２号；同第５，５９７，９０９号；同第５，６１０，３００号；同第５，６２７，０５３号；同第５，６３９，８７３号；同第５，６４６，２６５号；同第５，６５８，８７３号；同第５，６７０，６３３号；同第５，７９２，７４７号；および同第５，７００，９２０号。これらのうちの特定のものは、本願と共有に係っており、そしてこれらのうちの各々は、その全文が、本明細書中に参考として援用される。
【０１０４】
オリゴヌクレオチドはまた、核酸塩基（しばしば、当該分野において単に「塩基」といわれる）の改変または置換を含み得る。本明細書中で用いられる場合、「非改変」または「天然」の核酸塩基は、プリン塩基である、アデニン（Ａ）およびグアニン（Ｇ）、ならびにピリミジン塩基である、チミン（Ｔ）、シトシン（Ｃ）およびウラシル（Ｕ）を包含する。改変核酸塩基としては、例えば、以下の他の合成核酸塩基および天然核酸塩基が挙げられる：５−メチルシトシン（５−ｍｅ−Ｃ）、５−ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの６−メチル誘導体および他のアルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの２−プロピル誘導体および他のアルキル誘導体、２−チオウラシル、２−チオチミンおよび２−チオシトシン、５−ハロウラシルおよび５−ハロシトシン、５−プロピニル（−Ｃ≡Ｃ−ＣＨ３）ウラシルおよび５−プロピニル（−Ｃ≡Ｃ−ＣＨ３））シトシン、ならびにピリミジン塩基の他のアルキニル誘導体、６−アゾウラシル、６−アゾシトシンおよび６−アゾチミン、５−ウラシル（プソイドウラシル）、４−チオウラシル、８−ハロアデニン、８−ハログアニン、８−アミノアデニン、８−アミノグアニン、８−チオールアデニン、８−チオールグアニン、８−チオアルキルアデニン、８−チオアルキルグアニン、８−ヒドロキシルアデニン、８−ヒドロキシルグアニン、ならびに他の８−置換アデニンおよび８−置換グアニン、５−ハロ（特に、５−ブロモ）ウラシル、５−ハロ（特に、５−ブロモ）シトシン、５−トリフルオロメチルウラシル、５−トリフルオロメチルシトシン、ならびに他の５−置換ウラシルおよび５−置換シトシン、７−メチルグアニンおよび７−メチルアデニン、２−Ｆ−アデニン、２−アミノ−アデニン、８−アザグアニンおよび８−アザアデニン、７−デアザグアニンおよび７−デアザアデニンならびに３−デアザグアニンおよび３−デアザアデニン。さらなる改変核酸塩基としては、三環式ピリミジン（例えば、フェノキサジンシチジン（１Ｈ−ピリミド［５，４−ｂ］［１，４］ベンゾキサジン−２（３Ｈ）−オン）、フェノチアジンシチジン（１Ｈ−ピリミド［５，４−ｂ］［１，４］ベンゾチアジン−２（３Ｈ）−オン）、Ｇ−クランプ（例えば、置換されたフェノキサジンシチジン（例えば、９−（２−アミノエトキシ）−Ｈ−ピリミド［５，４−ｂ］［１，４］ベンゾキサジン−２（３Ｈ）−オン））、カルバゾールシチジン（２Ｈ−ピリミド［４，５−ｂ］インドール−２−オン）、ピリドインドールシチジン（Ｈ−ピリド［３’，２’：４，５］ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン−２−オン）が挙げられる。改変核酸塩基はまた、プリン塩基またはピリミジン塩基が、他の複素環に置き換えられている核酸塩基（例えば、７−デアザ−アデニン、７−デアザグアノシン、２−アミノピリジンおよび２−ピリドン）を包含し得る。さらなる核酸塩基としては、米国特許第３，６８７，８０８号に開示される核酸塩基、Ｔｈｅ  Ｃｏｎｃｉｓｅ  Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ  Ｏｆ  Ｐｏｌｙｍｅｒ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ａｎｄ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，８５８−８５９頁，Ｋｒｏｓｃｈｗｉｔｚ，Ｊ．Ｉ���編，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，１９９０に開示される核酸塩基、Ｅｎｇｌｉｓｃｈら，Ａｎｇｅｗａｎｄｔｅ  Ｃｈｅｍｉｅ，国際版，１９９１，３０，６１３により開示される核酸塩基、およびＳａｎｇｈｖｉ，Ｙ．Ｓ．，第１５章，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ａｎｄ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，２８９−３０２頁，Ｃｒｏｏｋｅ，Ｓ．Ｔ．およびＬｅｂｌｅｕ，Ｂ．編，ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ，１９９３により開示される核酸塩基が挙げられる。これらの核酸塩基のうちの特定のものは、本発明のオリゴマー化合物の結合親和性を増強するために特に有用である。これらとしては、５−置換ピリミジン、６−アザピリミジン、ならびにＮ−２置換プリン、Ｎ−６置換プリンおよびＯ−６置換プリンが挙げられ、これには２−アミノプロピルアデニン、５−プロピニルウラシルおよび５−プロピニルシトシンが含まれる。５−メチルシトシン置換は、核酸二重鎖の安定性を０．６〜１．２℃上昇させることが示されており（Ｓａｎｇｈｖｉ，Ｙ．Ｓ．，Ｃｒｏｏｋｅ，Ｓ．Ｔ．およびＬｅｂｌｅｕ，Ｂ．編，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ａｎｄ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ，Ｂｏｃａ  Ｒａｔｏｎ，１９９３，２７６−２７８頁）、そしてこれらは現在好ましい塩基置換であり、２’−Ｏ−メトキシエチル糖改変と合わせた場合、なおさら特に好ましい。
【０１０５】
上記の改変核酸塩基ならびに他の改変核酸塩基の特定のものの調製を教示する代表的な米国特許としては、上記の米国特許第３，６８７，８０８号、ならびに以下の米国特許が挙げられるがこれらに限定されない：米国特許第４，８４５，２０５号；同第５，１３０，３０２号；同第５，１３４，０６６号；同第５，１７５，２７３号；同第５，３６７，０６６号；同第５，４３２，２７２号；同第５，４５７，１８７号；同第５，４５９，２５５号；同第５，４８４，９０８号；同第５，５０２，１７７号；同第５，５２５，７１１号；同第５，５５２，５４０号；同第５，５８７，４６９号；同第５，５９４，１２１号、同第５，５９６，０９１号；同第５，６１４，６１７号；同第５，６４５，９８５号；同第５，８３０，６５３号；同第５，７６３，５８８号；同第６，００５，０９６号；および同第５，６８１，９４１号（これらのうちの特定のものは、本願と共有に係っており、そしてこれらのうちの各々は、本明細書中に参考として援用される）、ならびに米国特許第５，７５０，６９２号（これは、本願と共有に係っており、そしてまた本明細書中に参考として援用される）。
【０１０６】
本発明のオリゴヌクレオチドの別の改変は、オリゴヌクレオチドの活性、細胞分布または細胞取込みを増強する１つ以上の部分または結合体をオリゴヌクレオチドに対して化学的に連結することを含む。本発明の化合物は、官能基（例えば、一級ヒドロキシル基または二級ヒドロキシル基）と共有結合した結合基を包含し得る。本発明の結合基としては、インターカレーター、レポーター分子、ポリアミン、ポリアミド、ポリエチレングリコール、ポリエーテル、オリゴマーの薬力学的特性を増強する基、およびオリゴマーの薬物動態学的特性を増強する基が挙げられる。代表的な結合基としては、コレステロール、脂質、リン脂質、ビオチン、フェナジン、葉酸、フェナントリジン、アントラキノン、アクリジン、フルオレセイン、ローダミン、クマリン、および染料が挙げられる。本発明に関連して、薬力学的特性を増強する基としては、オリゴマー取込みを改善する基、分解に対するオリゴマーの耐性を増強する基、および／またはＲＮＡとの配列特異的ハイブリダイゼーションを強化する基が挙げられる。本発明に関連して、薬物動態学的性質を増強する基としては、オリゴマーの取込み、分布、代謝または排出を改善する基が挙げられる。代表的な結合基は、１９９２年１０月２３日に出願され、その開示の全体が参考として本明細書中に援用される、国際特許出願ＰＣＴ／ＵＳ９２／０９１９６において開示される。結合部分としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：脂質部分（例えば、コレステロール部分）（Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，１９８９，８６，６５５３−６５５６）、コール酸（Ｍａｎｏｈａｒａｎら，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔ．，１９９４，４，１０５３−１０６０）、チオエーテル（例えば、ヘキシル−Ｓ−トリチルチオール）（Ｍａｎｏｈａｒａｎら，Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．，１９９２，６６０，３０６−３０９；Ｍａｎｏｈａｒａｎら，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔ．，１９９３，３，２７６５−２７７０）、チオコレステロール（Ｏｂｅｒｈａｕｓｅｒら，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．，１９９２，２０，５３３−５３８）、脂肪族鎖（例えば、ドデカンジオール残基またはウンデシル残基）（Ｓａｉｓｏｎ−Ｂｅｈｍｏａｒａｓら，ＥＭＢＯ  Ｊ．，１９９１，１０，１１１１−１１１８；Ｋａｂａｎｏｖら，ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．，１９９０，２５９，３２７−３３０；Ｓｖｉｎａｒｃｈｕｋら，Ｂｉｏｃｈｉｍｉｅ，１９９３，７５，４９−５４）、リン脂質（例えば、ジ−ヘキサデシル−ｒａｃ−グリセロールまたはトリエチルアンモニウム１，２−ジ−Ｏ−ヘキサデシル−ｒａｃ−グリセロ−３−Ｈ−ホスホネート）（Ｍａｎｏｈａｒａｎら，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  Ｌｅｔｔ．，１９９５，３６，３６５１−３６５４；Ｓｈｅａら，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．，１９９０，１８，３７７７−３７８３）、ポリアミンまたはポリエチレングリコール鎖（Ｍａｎｏｈａｒａｎら，Ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅｓ  ＆  Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ，１９９５，１４，９６９−９７３）、またはアダマンタン酢酸（Ｍａｎｏｈａｒａｎら，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  Ｌｅｔｔ．，１��９５，３６，３６５１−３６５４）、パルミチル部分（Ｍｉｓｈｒａら，Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ，１９９５，１２６４，２２９−２３７）、またはオクタデシルアミンもしくはヘキシルアミノ−カルボニル−オキシコレステロール部分（Ｃｒｏｏｋｅら，Ｊ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｅｘｐ．Ｔｈｅｒ．，１９９６，２７７，９２３−９３７）。本発明のオリゴヌクレオチドはまた、活性薬物物質（例えば、アスピリン、ワルファリン、フェニルブタゾン、イブプロフェン、スプロフェン、フェンブフェン、ケトプロフェン、（Ｓ）−（＋）−プラノプロフェン、カルプロフェン、ダンシルサルコシン、２，３，５−トリヨード安息香酸、フルフェナム酸、フォリン酸、ベンゾチアジアジド、クロロチアジド、ジアゼピン、インドメチシン、バルビツレート、セファロスポリン、サルファ剤、抗糖尿病剤、抗細菌剤または抗生物質）に対して結合体化され得る。オリゴヌクレオチド−薬物結合体およびそれらの調製は、その全体が参考として本明細書中に援用される、米国特許出願第０９／３３４，１３０号（１９９９年６月１５日に出願）に記載される。
【０１０７】
そのようなオリゴヌクレオチド結合体の調製を教示する、代表的な米国特許としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない：米国特許第４，８２８，９７９号；同第４，９４８，８８２号；同第５，２１８，１０５号；同第５，５２５，４６５号；同第５，５４１，３１３号；同第５，５４５，７３０号；同第５，５５２，５３８号；同第５，５７８，７１７号，同第５，５８０，７３１号；同第５，５８０，７３１号；同第５，５９１，５８４号；同第５，１０９，１２４号；同第５，１１８，８０２号；同第５，１３８，０４５号；同第５，４１４，０７７号；同第５，４８６，６０３号；同第５，５１２，４３９号；同第５，５７８，７１８号；同第５，６０８，０４６号；同第４，５８７，０４４号；同第４，６０５，７３５号；同第４，６６７，０２５号；同第４，７６２，７７９号；同第４，７８９，７３７号；同第４，８２４，９４１号；同第４，８３５，２６３号；同第４，８７６，３３５号；同第４，９０４，５８２号；同第４，９５８，０１３号；同第５，０８２，８３０号；同第５，１１２，９６３号；同第５，２１４，１３６号；同第５，０８２，８３０号；同第５，１１２，９６３号；同第５，２１４，１３６号；同第５，２４５，０２２号；同第５，２５４，４６９号；同第５，２５８，５０６号；同第５，２６２，５３６号；同第５，２７２，２５０号；同第５，２９２，８７３号；同第５，３１７，０９８号；同第５，３７１，２４１号，同第５，３９１，７２３号；同第５，４１６，２０３号，同第５，４５１，４６３号；同第５，５１０，４７５号；同第５，５１２，６６７号；同第５，５１４，７８５号；同第５，５６５，５５２号；同第５，５６７，８１０号；同第５，５７４，１４２号；同第５，５８５，４８１号；同第５，５８７，３７１号；同第５，５９５，７２６号；同第５，５９７，６９６号；同第５，５９９，９２３号；同第５，５９９，９２８号および同第５，６８８，９４１号。これらのうちの特定のものは、本願と共有に係っており、そしてこれらのうちの各々は、本明細書中に参考として援用される。
【０１０８】
所定の化合物内の全ての位置に対して、一様に改変する必要はなく、実際、単一の化合物において、またはオリゴヌクレオチド内の単一のヌクレオシドにおいてすら、１を超える上述の改変が組み込まれ得る。本発明はまた、キメラの化合物であるアンチセンス化合物を包含する。本発明に関連して、「キメラの」アンチセンス化合物または「キメラ」は、２以上の化学的に異なる領域を含み、これらの領域の各々が、少なくとも１つのモノマー単位（すならち、オリゴヌクレオチド化合物の場合、ヌクレオチド）で構成される、アンチセンス化合物（特に、オリゴヌクレオチド）である。これらのオリゴヌクレオチドは、代表的に、ヌクレアーゼ分解に対する増強した耐性、増大した細胞取込み、そして／または標的核酸に対する増大した結合親和性をオリゴヌクレオチドに対して与えるようにオリゴヌクレオチドが改変されている、少なくとも１つの領域を含む。オリゴヌクレオチドのさらなる領域は、ＲＮＡ：ＤＮＡハイブリッドまたはＲＮＡ：ＲＮＡハイブリッドを切断し得る酵素に対する基質として役立ち得る。例として、ＲＮａｓｅＨは、ＲＮＡ：ＤＮＡ二重鎖のＲＮＡ鎖を切断する細胞性エンドヌクレアーゼである。それゆえ、ＲＮａｓｅＨの活性化は、ＲＮＡ標的の切断を生じ、それにより、遺伝子発現のオリゴヌクレオチド阻害効率を大いに高める。結果として、キメラオリゴヌクレオチドを用いた場合、同じ標的領域にハイブリダイズするホロチオエートデオキシオリゴヌクレオチドと比較して、より短いオリゴヌクレオチドを用いて、匹敵する結果がしばしば得られ得る。ＲＮＡ標的の切断は、ゲル電気泳動、および必要に応じて、当該分野で公知である関連した核酸ハイブリダイゼーション技術により慣用的に検出され得る。
【０１０９】
本発明のキメラアンチセンス化合物は、上記のような２つ以上のオリゴヌクレオチド、改変されたオリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオシドおよび／またはオリゴヌクレオチド模倣物の複合構造体とし形成され得る。このような化合物はまた、当該分野において、ハイブリッドまたはギャップマー（ｇａｐｍｅｒ）といわれている。このようなハイブリッド構造体の調製を教示する代表的な米国特許としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：米国特許第５，０１３，８３０号；同第５，１４９，７９７号；同第５，２２０，００７号；同第５，２５６，７７５号；同第５，３６６，８７８号；同第５，４０３，７１１号；同第５，４９１，１３３号；同第５，５６５，３５０号；同第５，６２３，０６５号；同第５，６５２，３５５号；同第５，６５２，３５６号；および同第５，７００，９２２号。これらのうちの特定のものは、本願と共有に係っており、そしてこれらのうちの各々は、その全体が本明細書中に参考として援用される。
【０１１０】
本発明に従って使用されるアンチセンス化合物は、周知の固相合成技術を通して、好都合にかつ慣用的に作製され得る。そのような合成のための装置は、いくつかの販売者（例えば、Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ（Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）が挙げられる）によって販売される。当該分野において公知のそのような合成のための任意の他の手段が、追加的にまたは代替的に用いられ得る。オリゴヌクレオチド（例えば、ホスホロチオエートおよびアルキル化誘導体）の調製のために同様の技術を使用することは周知である。
【０１１１】
本発明のアンチセンス化合物は、インビトロで合成され、生物学的起源のアンチセンス組成物もアンチセンス分子のインビボでの合成を指示するように設計した遺伝的ベクター構築物も含まない。
【０１１２】
本発明の化合物はまた、取込み、分布および／または吸収の補助のために、他の分子、分子構造体、または化合物の混合物と（例えば、リポソーム、レセプター標的化分子、経口処方物、直腸処方物、局所的処方物または他の処方物として）混合され得るか、カプセル化され得るか、結合体化され得るか、さもなければ、会合され得る。そのような取込み、分布および／または吸収を補助する処方物の調製を教示する代表的な米国特許としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない：米国特許第５，１０８，９２１号；同第５，３５４，８４４号；同第５，４１６，０１６号；同第５，４５９，１２７号；同第５，５２１，２９１号；同第５，５４３，１５８号；同第５，５４７，９３２号；同第５，５８３，０２０号；同第５，５９１，７２１号；同第４，４２６，３３０号；同第４，５３４，８９９号；同第５，０１３，５５６号；同第５，１０８，９２１号；同第５，２１３，８０４号；同第５，２２７，１７０号；同第５，２６４，２２１号；同第５，３５６，６３３号；同第５，３９５，６１９号；同第５，４１６，０１６号；同第５，４１７，９７８号；同第５，４６２，８５４号；同第５，４６９，８５４号；同第５，５１２，２９５号；同第５，５２７，５２８号；同第５，５３４，２５９号；同第５，５４３，１５２号；同第５，５５６，９４８号；同第５，５８０，５７５号；および同第５，５９５，７５６号。これらは各々、本明細書中に参考として援用される。
【０１１３】
本発明のアンチセンス化合物は、任意の薬学的に受容可能な塩、エステル、もしくはそのようなエステルの塩、またはヒトを含む動物へと投与されたら、生物学的に活性な代謝産物またはその残基を（直接的または間接的に）供給し得る、任意の他の化合物を含む。従って、例えば、この開示はまた、本発明の化合物のプロドラッグおよび本発明の化合物の薬学的に受容可能な塩、そのようなプロドラッグの薬学的に受容可能な塩、ならびに他の生体等価物に関する。
【０１１４】
用語「プロドラッグ」は、内在性酵素もしくは他の化学物質および／または状態の作用によって、体内もしくはその細胞内で活性形態（すなわち、薬物）に転換される、不活性形態で調製される治療薬剤を示す。特に、本発明のオリゴヌクレオチドのプロドッグ版は、Ｇｏｓｓｅｌｉｎらに対するＷＯ  ９３／２４５１０（１９９３年１２月９日公開）またはＩｍｂａｃｈらに対するＷＯ  ９４／２６７６４および米国特許第５，７７０，７１３号に開示される方法に従って、ＳＡＴＥ［（Ｓ−アセチル−２−チオエチル）ホスフェート］誘導体として調製される。
【０１１５】
用語「薬学的に受容可能な塩」とは、本発明の化合物の、生理学的および薬学的に受容可能な塩（すなわち、親化合物の所望の生物学的活性を保持し、その上さらに所望しない毒物学的影響を与えない塩）をいう。
【０１１６】
薬学的に受容可能な塩基付加塩は、金属またはアミン（例えば、アルカリ金属およびアルカリ土類金属または有機アミン）を用いて形成される。カチオンとして用いられる金属の例は、ナトリウム、カリウム、マグネシウム、カルシウムなどである。適切なアミンの例は、Ｎ，Ｎ’−ジベンジルエチレンジアミン、クロロプロカイン、コリン、ジエタノールアミン、ジシクロヘキシルアミン、エチレンジアミン、Ｎ−メチルグルカミン、およびプロカインである（例えば、Ｂｅｒｇｅら，「Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓａｌｔｓ」、Ｊ．ｏｆ  Ｐｈａｒｍａ  Ｓｃｉ．，１９７７，６６，１−１９を参照のこと）。上記酸性化合物の塩基付加塩は、遊離酸形態と十分量の所望の塩基とを接触させて従来の様式でその塩を生成することにより、調製される。この遊離酸形態は、塩形態と酸とを接触させ、そして従来の様式で遊離酸を単離することによって、再生され得る。この遊離酸形態は、極性溶媒中での溶解度のような特定の物理的特性がいくらかそれらの各々の塩形態とは異なるが、他の点ではこれらの塩は、本発明の目的のためにはそれらの各々の遊離酸と等価である。本明細書中に使用される場合、「薬学的付加塩」は、本発明の組成物の成分の一つの酸形態の薬学的に受容可能な塩を包含する。これらとしては、アミンの有機酸塩または無機酸塩が挙げられる。好ましい酸性塩は、塩酸塩、酢酸塩、サリチル酸塩、硝酸塩およびリン酸塩である。他の適切な薬学的に受容可能な塩は、当業者に周知であり、そして以下を包含する：種々の無機酸および有機酸の塩基性塩（例えば、無機酸（例えば、塩酸、臭化水素酸、硫酸またはリン酸）との塩基性塩；有機カルボン酸、スルホン酸、スルホ酸もしくはホスホ酸、またはＮ−置換スルファミン酸（例えば、酢酸、プロピオン酸、グリコール酸、コハク酸、マレイン酸、ヒドロキシマレイン酸、メチルマレイン酸、フマル酸、リンゴ酸、酒石酸、乳酸、シュウ酸、グルコン酸、グルカル酸、グルクロン酸、クエン酸、安息香酸、ケイ皮酸、マンデル酸、サリチル酸、４−アミノサリチル酸、２−フェノキシ安息香酸、２−アセトキシ安息香酸、エムボン酸（ｅｍｂｏｎｉｃ  ａｃｉｄ）、ニコチン酸またはイソニコチン酸）との塩基性塩；およびアミノ酸（例えば、天然におけるタンパク質合成に関与する２０種のαアミノ酸（例えば、グルタミン酸またはアスパラギン酸））との塩基性塩、ならびにまた、フェニル酢酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、２−ヒドロキシエタンスルホン酸、エタン−１，２−ジスルホン酸、ベンゼンスルホン酸、４−メチルベンゼンスルホン酸、ナフタレン−２−スルホン酸、ナフタレン−１，５−ジスルホン酸、２−ホスホグリセレートもしくは３−ホスホグリセレート、グルコース−６−ホスフェート、Ｎ−シクロヘキシルスルファミン酸（シクラメートの形成を伴う）との塩基性塩、または他の酸性有機化合物（例えば、アスコルビン酸）との塩基性塩）。化合物の薬学的に受容可能な塩はまた、薬学的に受容可能なカチオンを用いて調製され得る。適切な薬学的に受容可能なカチオンは、当業者に周知であり、アルカリ金属カチオン、アルカリ土類金属カチオン、アンモニウムカチオンおよび四級アンモニウムカチオンを��含する。炭酸塩または炭酸水素塩もまた可能である。
【０１１７】
オリゴヌクレオチドに関して、薬学的に受容可能な塩の好ましい例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：（ａ）ナトリウム、カリウム、アンモニウム、マグネシウム、カルシウム、ポリアミン（例えば、スペルミンおよびスペルミジン）などのようなカチオンで形成される塩；（ｂ）例えば、塩酸、臭化水素酸、硫酸、リン酸、硝酸などのような無機酸で形成される酸付加塩；（ｃ）例えば、酢酸、シュウ酸、酒石酸、コハク酸、マレイン酸、フマル酸、グルコン酸、クエン酸、リンゴ酸、アスコルビン酸、安息香酸、タンニン酸、パルミチン酸、アルギン酸、ポリグルタミン酸、ナフタレンスルホン酸、メタンスルホン酸、ｐ−トルエンスルホン酸、ナフタレンジスルホン酸、ポリガラクツロン酸などのような有機酸で形成される塩；ならびに（ｄ）塩素、臭素、およびヨウ素のような元素のアニオンから形成される塩。
【０１１８】
本発明のアンチセンス化合物は、診断、治療、予防のために、ならびに研究試薬およびキットとして利用され得る。治療について、アポリポタンパク質Ｂの発現を調節することによって処置され得る疾患または障害を有することが疑われる動物（好ましくは、ヒト）が、本発明によるアンチセンス化合物を投与することによって処置される。本発明の化合物は、適切な、薬学的に受容可能な希釈剤またはキャリアに有効量のアンチセンス化合物を添加することによって、薬学的組成物において利用され得る。本発明のアンチセンス化合物および方法の使用もまた、例えば、感染、炎症または腫瘍形成を予防または遅延させるために、予防的に有用であり得る。
【０１１９】
本発明のアンチセンス化合物は、研究および診断に有用である。なぜなら、これらの化合物は、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸にハイブリダイズし、サンドウィッチアッセイおよびその他のアッセイが、この事実を活用するように容易に構築されることを可能にするからである。本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドの、アポリポタンパク質Ｂをコードする核酸とのハイブリダイゼーションは、当該分野で公知の手段によって検出され得る。このような手段としては、オリゴヌクレオチドへの酵素の結合体化、オリゴヌクレオチドの放射性標識化または任意の他の適切な検出手段が挙げられ得る。サンプル中のアポリポタンパク質Ｂのレベルを検出するための、このような検出手段を使用するキットがまた、調製され得る。
【０１２０】
本発明はまた、本発明のアンチセンス化合物を含有する薬学的組成物および薬学的処方物を含む。本発明の薬学的組成物は、局所処置または全身処置のいずれが望まれているか、および処置される領域に依存して、多くの経路で投与され得る。投与は、局部（眼への投与、ならびに膣送達および直腸送達を含む粘膜への投与を含む）、肺（例えば、パウダーまたはエアロゾルの吸入（ｉｎｈａｌａｔｉｏｎ）または吸入（ｉｎｓｕｆｆｌａｔｉｏｎ）（噴霧器によるものを含む）；気管支内、鼻腔内、上皮および経皮、経口または非経口であり得る。非経口投与としては、静脈内、動脈内、皮下、腹腔内もしくは筋肉内への注射または注入；あるいは頭蓋内（例えば、くも膜下腔内投与または脳室内投与）が挙げられる。少なくとも１つの２’−Ｏ−メトキシエチル改変を有するオリゴヌクレオチドは、経口投与に特に有用であると考えられている。
【０１２１】
局所投与のための薬学的組成物および薬学的処方物としては、経皮パッチ、軟膏、ローション、クリーム、ゲル、ドロップ、坐薬、スプレー、液体およびパウダーが挙げられ得る。従来の薬学的キャリア、水性のベース、パウダーベースまたは油ベース、増粘剤などもまた必要であるか、または望まれ得る。被覆コンドーム、手袋などもまた、有用であり得る。好ましい局所処方物としては、本発明のオリゴヌクレオチドが、局所送達剤（例えば、脂質、リポソーム、脂肪酸、脂肪酸エステル、ステロイド、キレート剤および界面活性剤）とともに混合物中にある局所処方物が挙げられる。好ましい脂質およびリポソームとしては、中性（例えば、ジオレオイルホスファチジルＤＯＰＥエタノールアミン、ジミリストイルホスファチジルコリンＤＭＰＣ、ジステアロイルホスファチジルコリン）、ネガティブ（例えば、ジミリストイルホスファチジルグリセロールＤＭＰＧ）およびカチオン性（例えば、ジオレオイルテトラメチルアミノプロリルＤＯＴＡＰおよびジオレオイルホスファチジルエタノールアミンＤＯＴＭＡ）が挙げられる。本発明のオリゴヌクレオチドは、リポソーム内にカプセル化され得るか、またはリポソーム（特に、カチオン性リポソーム）に複合体を形成し得る。あるいは、オリゴヌクレオチドは、脂質（特に、カチオン性脂質）に複合体化され得る。好ましい脂肪酸および脂肪酸エステルとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：アラキドン酸、オレイン酸、エイコサン酸、ラウリン酸、カプリル酸、カプリン酸、ミリスチン酸、パルミチン酸、ステアリン酸、リノール酸、リノレン酸、ジカプレート、トリカプレート、モノオレイン、ジラウリン、グリセリル１−モノカプレート、１−ドデシルアザシクロヘプタン−２−オン、アシルカルニチン、アシルコリン、またはＣ１−１０アルキルエステル（例えば、イソプロピルミリステート  ＩＰＭ）、モノグリセリド、ジグリセリドあるいは薬学的に受容可能なそれらの塩。局所処方物は、米国特許出願０９／３１５，２９８（１９９９年５月２０日に出願され、全体が本明細書中に参考として援用される）に詳細に記載される。
【０１２２】
経口投与のための組成物および処方物としては、パウダーまたは顆粒、マイクロ粒子、ナノ粒子、水または非水性媒体中の懸濁液または溶液、カプセル、ゲルカプセル、小袋（ｓａｃｈｅｔ）、錠剤またはミニ錠剤（ｍｉｎｉｔａｂｌｅｔ）が挙げられる。増粘剤、香料添加剤、希釈剤、乳化剤、分散補助剤または結合剤は、望ましくあり得る。好ましい経口処方物は、本発明のオリゴヌクレオチドが、１つ以上の浸透増強剤、界面活性剤およびキレート剤と併用して投与される経口処方物である。好ましい界面活性剤としては、脂肪酸および／またはそのエステルもしくは塩、胆汁酸および／またはその塩が挙げられる。好ましい胆汁酸／塩としては、ケノデオキシコール酸（ＣＤＣＡ）およびウルソデオキシケノデオキシコール酸（ＵＤＣＡ）、コール酸、デヒドロコール酸、デオキシコール酸、グルコール酸（ｇｌｕｃｈｏｌｉｃ  ａｃｉｄ）、グリコール酸（ｇｌｙｃｈｏｌｉｃ  ａｃｉｄ）、グリコデオキシコール酸、タウロコール酸、タウロデオキシコール酸、タウロ−２４，２５−ジヒドロ−フシジン酸ナトリウム、グリコジヒドロフシジン酸ナトリウムが挙げられる。好ましい脂肪酸としては、アラキドン酸、ウンデカン酸、オレイン酸、ラウリン酸、カプリル酸、カプリン酸、ミリスチン酸、パルミチン酸、ステアリン酸、リノール酸、リノレン酸、ジカプレート、トリカプレート、モノオレイン、ジラウリン、グリセリル１−モノカプレート、１−ドデシルアザシクロヘプタン−２−オン、アシルカルニチン、アシルコリン、モノグリセリド、ジグリセリドあるいは薬学的に受容可能なそれらの塩（例えば、ナトリウム）が挙げられる。浸透増強剤の組合せ（例えば、胆汁酸／塩と組み合わせた脂肪酸／塩）もまた好ましい。特に好ましい組合せは、ラウリン酸、カプリン酸およびＵＤＣＡのナトリウム塩である。さらなる浸透増強剤としては、ポリオキシエチレン−９−ラウリルエーテル、ポリオキシエチレン−２０−セチルエーテルが挙げられる。本発明のオリゴヌクレオチドは、スプレーされる乾燥粒子を含む顆粒形態またはミクロ粒子またはナノ粒子を形成するように複合体化された顆粒形態で、経口で送達され得る。オリゴヌクレオチド複合体化剤としては、ポリ−アミノ酸；ポリイミン；ポリアクリレート；ポリアルキルアクリレート、ポリオキセタン（ｐｏｌｙｏｘｅｔｈａｎｅｓ）、ポリアルキルシアノアクリレート；カチオン化ゼラチン、アルブミン、デンプン、アクリレート、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）およびデンプン；ポリアルキルシアノアクリレート；ＤＥＡＥ−誘導体化ポリイミン、プルラン（ｐｏｌｌｕｌａｎ）、セルロースおよびデンプンが挙げられる。特に好ましい複合体化剤としては、キトサン、Ｎ−トリメチルキトサン、ポリ−Ｌ−リジン、ポリヒスチジン、ポリオルニチン、ポリスペルミン、プロタミン、ポリビニルピリジン、ポリチオジエチルアミノメチルエチレンＰ（ＴＤＡＥ）、ポリアミノスチレン（例えば、ｐ−アミノ）、ポリ（メチルシアノアクリレート）、ポリ（エチルシアノアクリレート）、ポリ（ブチルシアノアクリレート）、ポリ（イソブチルシアノアクリレート）、ポリ（イソヘキシルシアノアクリレート）、ＤＥＡＥ−メタクリレート、��ＥＡＥ−ヘキシルアクリレート、ＤＥＡＥ−アクリルアミド、ＤＥＡＥ−アルブミンおよびＤＥＡＥ−デキストラン、ポリメチルアクリレート、ポリヘキシルアクリレート、ポリ（Ｄ，Ｌ−乳酸）、ポリ（ＤＬ−乳酸−ｃｏ−グリコール酸（ＰＬＧＡ）、アルギナート、およびポリエチレングリコール（ＰＥＧ）が挙げられる。オリゴヌクレオチドのための経口処方物およびそれらの調製は、米国特許出願０８／８８６，８２９（１９９７年７月１日出願）、０９／１０８，６７３（１９９８年７月１日出願）、０９／２５６，５１５（１９９９年２月２３日出願）、０９／０８２，６２４（１９９８年５月２１日出願）および０９／３１５，２９８（１９９９年５月２０日出願）（各々は、その全体が本明細書中に参考として援用される）に詳細に記載される。
【０１２３】
非経口投与、くも膜下腔内投与または脳室内投与のための組成物および処方物としては、滅菌水溶液（これはまた、緩衝剤、希釈剤および他の適切な添加物（例えば、浸透増強剤、キャリア化合物および他の薬学的に受容可能なキャリアまたは賦形剤が挙げられるがこれらに限定されない）を含み得る）が挙げられ得る。
【０１２４】
本発明の薬学的組成物としては、溶液、エマルジョン、およびリポソーム含有処方物が挙げられるが、これらに限定されない。これらの組成物は、種々の成分（前もって成形された（ｐｒｅｆｏｒｍｅｄ）液体、自己乳化固体および自己乳化半固体が挙げられるが、これらに限定されない）から作製され得る。
【０１２５】
本発明の薬学的処方物（単位投薬形態で便利に与えられ得る）は、製薬業界で周知の従来の技術に従って調製され得る。このような技術としては、活性成分を薬学的キャリアまたは賦形剤と結合させる工程が挙げられる。一般的に、この処方物は、活性成分を液体キャリアまたは細かく分割された固体キャリアまたは両方と均一かつ密接に結合させることおよび次いで、必要に応じて、この製品を成形することによって調製される。
【０１２６】
本発明の組成物は、多くの可能な投薬形態（例えば、錠剤、カプセル、ゲルカプセル、液体シロップ、軟性ゲル、坐薬および浣腸が挙げられるがこれらに限定されない）のいずれかに処方され得る。本発明の組成物はまた、水性媒体、非水性媒体または混合媒体中の懸濁液として処方され得る。水性懸濁液は、懸濁液の粘性を増やす物質（例えば、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ソルビトールおよび／またはデキストランを含む）をさらに含み得る。この懸濁液はまた、安定剤を含み得る。
【０１２７】
本発明の１つの実施形態において、薬学的組成物は、泡として処方され、そして使用され得る。薬学的泡としては、エマルジョン、マイクロエマルジョン、クリーム、ゼリーおよびリポソームのような処方物が挙げられるが、これらに限定されない。これらの処方物は、性質において基本的に類似しているが、最終産物の成分および濃度において異なる。このような組成物および処方物の調製は、薬学および処方の分野における、当業者に一般的に公知であり、そして本発明の組成物の処方に適用され得る。
【０１２８】
（エマルジョン）
本発明の組成物は、エマルジョンとして調製および処方され得る。エマルジョンは、代表的には、通常直径０．１μｍを越える液滴の形態で別の液体中に分散される、ある液体の不均一系である。（Ｉｄｓｏｎ、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ，ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編），１９８８，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，１巻、１９９頁；Ｒｏｓｏｆｆ，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ，ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編），１９８８，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，１巻、２４５頁；Ｂｌｏｃｋ、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ，ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編），１９８８，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，２巻、３３５頁；Ｈｉｇｕｃｈｉら、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ，１９８５，３０１頁）。エマルジョンは、しばしば、互いで完全に混合および分散された２つの不混和性の液体相で構成される二相系である。一般的に、エマルジョンは、油中水（ｗ／ｏ）または水中油（ｏ／ｗ）種のいずれかであり得る。水相が、大量の油相に細かく分割され、そして微細な液滴として分散される場合、生じた組成物は、油中水（ｗ／ｏ）エマルジョンと呼ばれる。あるいは、油相が、大量の水相に細かく分割され、そして微細な液滴として分散される場合、生じた組成物は、水中油（ｏ／ｗ）エマルジョンと呼ばれる。エマルジョンは、分散された相および活性薬物（これは、水相、油相中で、またはそれ自体が別の相としてのいずれかで、溶液として存在し得る）に加えて、さらなる成分を含み得る。乳化剤、安定剤、色素、および抗酸化剤のような薬学的賦形剤もまた、必要に応じて、エマルジョン中に存在し得る。薬学的エマルジョンはまた、（例えば、油中水中油（ｏ／ｗ／ｏ）エマルジョンおよび例えば、水中油中水（ｗ／ｏ／ｗ）エマルジョンの場合のような）２つより多くの相で構成される複合エマルジョンであり得る。このような複雑な処方物は、しばしば単純な２成分のエマルジョンが成さない特定の利点を提供する。ｏ／ｗエマルジョンの個々の油滴が、小さい水滴を囲む複合エマルジョンは、ｗ／ｏ／ｗエマルジョンを構成する。同様に、油の連続中に安定化された水の小球中に囲まれた油滴の系は、ｏ／ｗ／ｏエマルジョンを提供する。
【０１２９】
エマルジョンは、熱力学的安定性がほとんどまたは全くないことによって特徴付けられる。しばしば、エマルジョンの分散された相または不連続相は、外側の相または連続相にうまく分散され、そして乳化剤の手段または処方物の粘性により、この形態で維持される。エマルジョン型の軟膏基剤およびクリームの場合、エマルジョンの相のいずれかは、半固体または固体であり得る。エマルジョンを安定化する他の手段は、エマルジョンのいずれかの相に組み込まれ得る乳化剤の使用を必要とする。乳化剤は、４つのカテゴリーに広く分類され得る：合成界面活性剤、天然に存在する乳化剤、吸着基剤、および細かく分散された固体（Ｉｄｓｏｎ、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ，ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編），１９８８，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，１巻、１９９頁）。
【０１３０】
合成の界面活性剤（ｓｕｒｆａｃｔａｎｔ）（界面活性剤（ｓｕｒｆａｃｅ  ａｃｔｉｖｅ  ａｇｅｎｔ）としても知られる）は、エマルジョンの処方物における広い適用性を有が見出されており、そして文献中で概説されている（Ｒｉｅｇｅｒ，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ，ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編）、１９８８，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，１巻、２８５頁；Ｉｄｓｏｎ，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ，ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編）、Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，１９８８，１巻、１９９頁）。界面活性剤は、代表的には両親媒性であり、親水性の部分および疎水性の部分を含む。界面活性剤の疎水性の性質に対する親水性の性質の割合は、親水／親油バランス（ＨＬＢ）と呼ばれ、処方物の調製において、界面活性剤を分類および選択する際の価値のある道具である。界面活性剤は、親水基の性質：非イオン性、アニオン性、カチオン性、および両親媒性に基づいて異なるクラスに分類され得る（Ｒｉｅｇｅｒ，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ  ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編），１９８８，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，１巻、２８５頁）。
【０１３１】
乳化処方物において使用される天然に存在する乳化剤としては、ラノリン、蜜蝋、ホスファチド、レシチンおよびアカシアが挙げられる。吸着基剤は、吸着基剤が水を吸い上げて、無水ラノリンおよび親水性ワセリンのような、吸着基剤の半固体の粘度をなお維持するｗ／ｏエマルジョンを形成し得るように、親水性の性質を有する。細かく分割された固体はまた、特に界面活性剤との併用において、および粘稠性の調製物における良い乳化剤として使用されている。これらとしては、極性の無機固体（例えば、重金属水酸化物、非膨張性の粘土（例えば、ベントナイト、アタパルガイト、ヘクトライト、カオリン、モンモリロナイト、コロイド状のケイ酸アルミニウムおよびコロイド状のケイ酸マグネシウムアルミニウム）、顔料および非極性固体（例えば、カーボンまたはグリセリルトリステアレート）が挙げられる。
【０１３２】
多種の非乳化物質もまた、エマルジョン処方物中に含まれ、エマルジョンの性質に寄与する。これらとしては、脂肪、油、蝋、脂肪酸、脂肪アルコール、脂肪酸エステル、湿潤剤、親水性コロイド、保存剤および抗酸化剤が挙げられる（Ｂｌｏｃｋ，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ，ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編），１９８８，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，１巻、３３５頁；Ｉｄｓｏｎ，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ，ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編），１９８８，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，１巻、１９９頁）。
【０１３３】
親水性コロイドまたはヒドロコロイドとしては、天然に存在するゴムおよび合成ポリマー（例えば、多糖（例えば、アカシア、寒天、アルギン酸、カラギナン、グアールゴム、カラヤゴム、およびトラガカント））、セルロース誘導体（例えば、カルボキシメチルセルロースおよびカルボキシプロピルセルロース）、ならびに合成ポリマー（例えば、カルボマー、セルロースエーテル、およびカルボキシビニルポリマー）が挙げられる。これらは、水中で分散または膨潤し、コロイド状溶液を形成し、これは分散相の液滴の周りに強い界面フィルムを形成することおよび外部の相の粘性を増すことによってエマルジョンを安定化する。
【０１３４】
エマルジョンは、しばしば微生物の増殖を容易に支え得る多くの成分（例えば、炭水化物、タンパク質、ステロールおよびホスファチド）を含むので、これらの処方物は、しばしば保存剤を取り入れる。エマルジョン処方物中に含まれる一般的に使用される保存剤としては、メチルパラベン、プロピルパラベン、４級アンモニウム塩、塩化ベンザルコニウム、ｐ−ヒドロキシ安息香酸のエステルおよびホウ酸が挙げられる。抗酸化剤がまた、処方物の変質を抑制するためにエマルジョン処方物に一般的に添加される。使用される抗酸化剤はフリーラジカルスカベンジャー（例えば、トコフェロール、アルキルギャレット、ブチル化ヒドロキシアニソール、ブチル化ヒドロキシトルエン、または還元剤（例えば、アスコルビン酸およびメタ重亜硫酸ナトリウム）、および抗酸化共力剤（例えば、クエン酸、酒石酸、およびレシチン））であり得る。
【０１３５】
皮膚科学的経路、経口経路および非経口経路を介したエマルジョン処方物の適用およびそれらの製造方法は、文献に概説されている（Ｉｄｓｏｎ，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ，ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編），１９８８，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，１巻、１９９頁）。経口送達のためのエマルジョン処方物は、処方の容易さ、吸収の有効性およびバイオアベイラビリティーの見地の理由で、非常に広く使用されている。（Ｒｏｓｏｆｆ，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ，ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編），１９８８，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，１巻，２４５頁；Ｉｄｓｏｎ，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ，ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編），１９８８，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，１巻，１９９頁）。ｏ／ｗエマルジョンとして一般的に経口で投与されている物質中には、鉱油ベースの下剤、油溶性ビタミンおよび高脂肪栄養調製物がある。
【０１３６】
本発明の１つの実施形態において、オリゴヌクレオチドおよび核酸の組成物は、マイクロエマルジョンとして処方される。マイクロエマルジョンは、単一で光学的に等方性であり、熱力学的に安定な液体溶液である、水、油および両親媒性物質の系として定義され得る（Ｒｏｓｏｆｆ，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ，ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編），１９８８，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，第１巻，２４５頁）。代表的には、マイクロエマルジョンは、界面活性剤水溶液中の油をまず分散し、次いで十分量の第４の成分（一般的には中間の鎖長のアルコール）を透明な系を形成するように添加することによって調製される系である。従って、マイクロエマルジョンは、熱力学的に安定で等方的に透明な、２つの混合できない液体の分散物としてもまた記載され、これらの液体は、表面活性分子の界面フィルムによって安定化される（ＬｅｕｎｇおよびＳｈａｈ：Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  Ｒｅｌｅａｓｅ  ｏｆ  Ｄｒｕｇｓ：Ｐｏｌｙｍｅｒｓ  ａｎｄ  Ａｇｇｒｅｇａｔｅ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｒｏｓｏｆｆ，Ｍ．編，１９８９，ＶＣＨ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１８５頁−２１５頁）。マイクロエマルジョンは、３〜５の成分の組み合わせによって一般に調製され、これらの成分としては、油、水、界面活性剤、補助界面活性剤および電解質が挙げられる。マイクロエマルジョンが油中水（ｗ／ｏ）型であるかまたは水中油（ｏ／ｗ）型であるかは、使用される油および界面活性剤の特徴ならびに界面活性剤分子の極性頭部および炭化水素尾部の構造および幾何学的パッキングに依存する（Ｓｃｈｏｔｔ，Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ．，１９８５，２７１頁）。
【０１３７】
状態図を使用した現象論的アプローチは、広範に研究されており、そして当業者に、どのようにマイクロエマルジョンを処方するかという包括的な知見を与えてきた（Ｒｏｓｏｆｆ，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ，ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編），１９８８，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，第１巻，２４５頁；Ｂｌｏｃｋ，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ，ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編），１９８８，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，第１巻，３３５頁）。従来のエマルジョンと比較すると、マイクロエマルジョンは、自発的に形成される、熱力学的に安定な小滴の処方物中に、水不溶性薬物を溶解するという利点を提供する。
【０１３８】
マイクロエマルジョンの調製物において使用される界面活性剤としては、単独でまたは補助界面活性剤との組み合わせての、イオン性界面活性剤、非イオン性界面活性剤、Ｂｒｉｊ９６、ポリオキシエチレンオレイルエーテル、脂肪酸ポリグリセロールエステル、モノラウリン酸テトラグリセロール（ＭＬ３１０）、モノオレイン酸テトラグリセロール（ＭＯ３１０）、モノオレイン酸ヘキサグリセロール（ＰＯ３１０）、ペンタオレイン酸ヘキサグリセロール（ＰＯ５００）、モノカプリン酸デカグリセロール（ＭＣＡ７５０）、モノオレイン酸デカグリセロール（ＭＯ７５０）、デカグリセロールセスキオレアート（ｓｅｑｕｉｏｌｅａｔｅ）（ＳＯ７５０）、デカオレイン酸デカグリセロール（ＤＡＯ７５０）が挙げられるがこれらに限定されない。補助界面活性剤（通常、短鎖アルコール（例えば、エタノール、１−プロパノール、および１−ブタノール））は、界面活性剤分子間に生成された間隙空間に起因して、界面活性剤フィルムに浸透し、それ故に無秩序なフィルムを作製することによって界面の流動性を増加するように作用する。しかし、マイクロエマルジョンは、補助界面活性剤を使用せずに調製され得、無アルコールの自己乳化マイクロエマルジョン系は、当該分野で公知である。水相は、代表的に、水、薬物の水溶液、グリセロール、ＰＥＧ３００、ＰＥＧ４００、ポリグリセロール、プロピレングリコール、およびエチレングリコールの誘導体であり得るが、これらに限定されない。油相は、Ｃａｐｔｅｘ  ３００、Ｃａｐｔｅｘ  ３５５、Ｃａｐｍｕｌ  ＭＣＭ、脂肪酸エステル、中鎖（Ｃ８〜Ｃ１２）のモノグリセリド、ジグリセリド、およびトリグリセリド、ポリオキシエチレン化脂肪酸グリセリルエステル、脂肪アルコール、ポリグリコール化グリセリド、飽和ポリグリコール化Ｃ８〜Ｃ１０グリセリド、植物油およびシリコーンオイルのような材料が挙げられ得るが、これらに限定されない。
【０１３９】
マイクロエマルジョンは、薬物可溶化および薬物の増大された吸収の観点から特に重要である。脂質ベースのマイクロエマルジョン（ｏ／ｗおよびｗ／ｏの両方）は、ペプチドを含む、薬物の経口バイオアベイラビリティーを増大するために提案されている（Ｃｏｎｓｔａｎｔｉｎｉｄｅｓら、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ、１９９４、１１、１３８５−１３９０；Ｒｉｔｓｃｈｅｌ、Ｍｅｔｈ．Ｆｉｎｄ．Ｅｘｐ．Ｃｌｉｎ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．、１９９３、１３、２０５）。マイクロエマルジョンは、改善された格物可溶性、酵素的加水分解からの薬物の保護、膜流動性および透過性における界面活性剤で誘導された改変に起因する薬物吸収の可能な増大、調製の容易、固形投与量形態よりも経口投与が容易、改善された臨床的効目、および低減された毒性（Ｃｏｎｓｔａｎｔｉｎｉｄｅｓら、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ、１９９４、１１、１３８５；Ｈｏら、Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｓｃｉ．、１９９６、８５、１３８−１４３）の利点を与える。しばしば、マイクロエマルジョンは、それらの成分が周囲温度で一緒にされるとき、自然に形成され得る。これは、熱不安定性の薬物、ペプチドまたはオリゴヌクレオチドを処方するとき特に有利であり得る。マイクロエマルジョンはまた、化粧品および薬学的適用の両方において活性成分の経皮送達に有効である。本発明のマイクロエマルジョン組成物および処方物は、胃腸管からのオリゴヌクレオチドおよび核酸の増大した全身吸収を容易にし、および胃腸管、膣、頬側口腔および投与のその他の領域内のオリゴヌクレオチドおよび核酸の局所細胞摂取を改善する。
【０１４０】
本発明のマイクロエマルジョンはまた、ソルビタンモノステアレート（Ｇｒｉｌｌ  ３）、ラブラゾールおよび浸透促進剤のような添加成分および添加剤を含み得、処方物の性質を改善し、そして本発明のオリゴヌクレオチドおよび核酸の吸収を増大する。本発明のマイクロエマルジョンで用いられる浸透促進剤は、５つの広範なカテゴリー−界面活性剤、脂肪酸、胆汁酸塩、キレート剤、および非キレート非界面活性剤（Ｌｅｅら、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、１９９１、９２頁）の１つに属するとして分類され得る。これら分類の各々は上述されている。
【０１４１】
（リポソーム）
マイクロエマルジョンの他に、薬物の処方物のために研究され、かつ用いられている、多くの組織化された界面活性剤構造がある。これらは、単層、ミセル、二重層およびビヒクルを含む。リポソームのようなビヒクルは、薬物送達の観点からそれらが提供する、それらの特異性および持続期間のため、大きな興味を引き付ける。本発明で用いられるとき、用語「リポソーム」は、球状二重層または二重層中に配列された両親媒性脂質で構成されるビヒクルを意味する。
【０１４２】
リポソームは、親油性材料および水性の内側から形成された膜を有する、単層または多層のヒビクルである。水性部分は、送達されるべき組成物を含む。カチオン性リポソームは、細胞壁に融合し得る利点を所有する。非カチオン性リポソームは、細胞壁と効率的に融合することはできないが、インビボでマクロファージにより摂取される。
【０１４３】
インタクトな哺乳動物皮膚を横切るために、脂質ビヒクルは、適切な経皮グラディエントの影響下で、各々が５０ｎｍより小さい直径をもつ、一連の微細な穴を通過しなければならない。したがって、高度に変形可能であり、このような微細な穴を通過し得るリポソームを用いることが所望され得る。
【０１４４】
リポソームのさらなる利点は以下を含む；天然のリン脂質から得られたリポソームは、生体適合性かつ生分解性である；リポソームは、広範な範囲の水および脂質可溶性薬物を取り込み得る；リポソームは、それらの内部区画において、代謝および分解からカプセル化された薬物を保護し得る（Ｒｏｓｏｆｆ、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ、Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ、ＲｉｅｇｅｒおよびＢａｎｋｅｒ（編）、１９８８、Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ、Ｉｎｃ．、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ．、第１巻、２４５頁）。リポソーム処方物の調製における重要な考慮は、脂質表面電荷、ビヒクルサイズおよびリポソームの水の容積である。
【０１４５】
リポソームは、作用の部位への活性成分の移入および送達に有用である。リポソーム膜は、生物学的膜に構造的に類似しているので、リポソームを組織に適用するとき、リポソームは、細胞膜と融合することを開始する。リポソームと細胞の融合が進行するにつれ、リポソーム内容物は、活性成分が作用し得る細胞中へと、空にされる。
【０１４６】
リポソーム処方物は、多くの薬物のための送達のモードとして、広範な調査の焦点である。局所投与には、リポソームがその他の処方物に対しいくつかの利点を提示するという証拠が増加している。このような利点は、投与された薬物の高全身吸収に関連する低減された副作用、所望の標的における投与された薬物の増加した蓄積、および、皮膚への疎水性および親水性両方の広範な薬物を投与するための能力を含む。
【０１４７】
いくつかの報告は、高分子量ＤＮＡを含む薬剤を皮膚に送達するためのリポソームの能力の詳細を記載している。鎮痛剤、抗体、ホルモンおよび高分子量ＤＮＡを含む化合物が皮膚に投与されている。適用の大部分は、上部表皮の標的化を生じた。
【０１４８】
リポソームは、２つの広範なクラスに分類される。カチオン性リポソームは、負に荷電したＤＮＡ分子と相互作用し、安定な複合体を形成する正に荷電したリポソームである。正に荷電したＤＮＡ／リポソーム複合体は、負に荷電した細胞表面に結合し、そしてエンドソーム中に内部移行する。エンドソーム内の酸性ｐＨに起因して、リポソームは破裂し、それらの内容物を細胞の細胞質中に放出する（Ｗａｎｇら、Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍｕｎ．、１９８７、１４７、９８０−９８５）。
【０１４９】
ｐＨ感受性であるか、負に荷電したリポソームは、ＤＮＡとの複合体よりもむしろそれを包括する。ＤＮＡおよび脂質の両方は同様に荷電されるので、複合体形成よりもむしろ反発が起こる。それにもかかわらず、特定のＤＮＡは、これらのリポソームの水のある内側の中に包括される。ｐＨ感受性リポソームを用いて、培養中の細胞単層にチミジンキナーゼ遺伝子をコードするＤＮＡが送達されている。外来遺伝子の発現は、標的細胞中で検出された（Ｚｈｏｕら、Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  Ｒｅｌｅａｓｅ、１９９２、１９、２６９−２７４）。
【０１５０】
リポソーム組成物の１つの主要なタイプは、天然由来のホスファチジルコリン以外のリン脂質を含む。天然リポソーム組成物は、例えば、ジミリストイルホスファチジルコリン（ＤＭＰＣ）またはジパルミトイルホスファチジルコリン（ＤＰＰＣ）から形成され得る。一般に、アニオン性リポソーム組成物は、ジミリストイルホスファチジルグリセロールから形成され、その一方、アニオン性の紡錘形成性（ｆｕｓｏｇｅｎｉｃ）リポソームは、主に、ジオレオイルホスファチジルエタノールアミン（ＤＯＰＥ）から形成される。別のタイプのリポソーム組成物は、ホスファチジルコリン（ＰＣ）（例えば、大豆ＰＣ、および卵ＰＣなど）から形成される。別のタイプは、リン脂質および／またはホスファチジルコリンおよび／またはコレステロールの混合物から形成される。
【０１５１】
いくつかの研究は、リポソーム薬物処方物の皮膚への局所送達を評価した。モルモット皮膚へのインターフェロンを含むリポソームの適用は、皮膚ヘルペスただれの減少をもたらした。その一方、その他の手段によるインターフェロンの送達（例えば、溶液として、またはエマルジョンとして）は、有効でなかった（Ｗｅｉｎｅｒら、Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｄｒｕｇ  Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ、１９９２、２、４０５−４１０）。さらに、さらなる研究は、水系を用いるインターフェロンの投与へのリポソーム処方物の一部として投与されたインターフェロンの効目を試験し、そしてこのリポソーム組成物は、水投与より優れていたことを結論付けた（ｄｕ  Ｐｌｅｓｓｉｓら、Ａｎｔｉｖｉｒａｌ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ、１９９２、１８、２５９−２６５）。
【０１５２】
非イオンリポソーム系もまた、非イオン性界面活性剤およびコレステロールを含む特定の系において、皮膚への薬物の送達におけるそれらの有用性を決定するために試験された。ＮｏｖａｓｏｍｅＴＭＩ（グリセロールジラウレート／コレステロール／ポリオキシエチレン−１０−ステアリルエーテル）およびＮｏｖａｓｏｍｅＴＭＩＩ（グリセロールジステアレート／コレステロール／ポリオキシエチレン−１０−ステアリルエーテル）を含む、非イオン性リポソーム処方物を用いて、マウス皮膚の真皮中にシクロスポリンＡが送達された。結果は、このような非イオン性リポソーム系が、皮膚の異なる層中へのシクロスポリンＡの沈着を容易にすることで有効であったことを示した（Ｈｕら、Ｓ．Ｔ．Ｐ．Ｐｈａｒｍａ．Ｓｃｉ．、１９９４、４、６、４６６）。
【０１５３】
リポソームはまた、「立体的に安定化された」リポソームを含み、この用語は、本明細書で用いられるとき、リポソーム中に取り込まれたとき、このような特別な脂質を欠くリポソームに対して増加した循環寿命を生じる、１つ以上の特別な脂質を含むリポソームをいう。立体的に安定化されたリポソームの例は、リポソームのベシクル形成性脂質部分の一部分が、（Ａ）モノシアロガングリオシドＧＭ１のような１つ以上のグリコリピドを含むか、または（Ｂ）ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）部分のような、１つ以上の親水性ポリマーで誘導体化されているものである。任意の特定の理論により拘束されることを望まないが、当該分野では、少なくとも、ガングリオシド、スフィンゴミエリン、またはＰＥＧ−誘導体化脂質を含む、立体的に安定化されたリポソームについては、これら立体的に安定化されたリポソームの増加した循環半減期は、細網内皮系（ＲＥＳ）の細胞中への低下した取込みに由来すると考えられている（Ａｌｌｅｎら、ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔｅｒｓ、１９８７、２２３、４２；Ｗｕら、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ、１９９３、５３、３７６５）。
【０１５４】
１つ以上のグリコリピドを含む種々のリポソームが当該分野で公知である。Ｐａｐａｈａｄｊｏｐｏｕｌｏｓら（Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．、１９８７、５０７、６４）は、モノシアロガングリオシドＧＭ１、ガラクトセレブロシドサルフェートおよびホスファチジルイノシトールがリポソームの血液半減期を改良する能力を報告した。これらの知見は、Ｇａｂｉｚｏｎらにより（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．、１９８８、８５、６９４９）詳細に説明された。両方ともＡｌｌｅｎらによる、米国特許第４，８３７，０２８号およびＷＯ  ８８／０４９２４は、（１）スフィンゴミエリンおよび（２）ガングリオシドＧＭ１またはガラクトセレブロシドサルフェートエステルを含む、リポソームを開示している。米国特許第５，５４３，１５２号（Ｗｅｂｂら）は、スフィンゴミエリンを含むリポソームを開示している。１，２−ｓｎ−ジミリストイルホスファチジルコリンを含むリポソームは、ＷＯ９７／１３４９９（Ｌｉｍら）に開示されている。
【０１５５】
１つ以上の親水性ポリマーで誘導体化された脂質を含む多くのリポソーム、およびその調製の方法は、当該分野で公知である。Ｓｕｎａｍｏｔｏら（Ｂｕｌｌ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．Ｊｐｎ．、１９８０、５３、２７７８）は、非イオン性界面活性剤、２Ｃ１２１５Ｇを含み、ＰＥＧ成分を含むリポソームを記載した。Ｉｌｌｕｍら（ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．、１９８４、１６７、７９）は、ポリマー性グリコールでのポリスチレン粒子の親水性被覆が、有意に増加した血液半減期を生じることを記載した。ポリアルキレングリコール（例えば、ＰＥＧ）のカルボン酸基の付着によって改変された合成リン脂質はＳｅａｒｓ（米国特許第４，４２６，３３０号および同第４，５３４，８９９号）によって記載されている。Ｋｌｉｂａｎｏｖら（ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．、１９９０、２６８、２３５）は、ＰＥＧまたはＰＥＧステアレートで誘導体化されたホスファチジルエタノールアミン（ＰＥ）を含むリポソームの血液循環半減期が有意に増加することを示す実験を記載した。Ｂｌｕｍｅら（Ｂｉｏｃｈｉｍｉｃａ  ｅｔ  Ｂｉｏｐｈｙｓｉｃａ  Ａｃｔａ、１９９０、１０２９、９１）は、このような観察を、他のＰＥＧ−誘導体化リン脂質、例えば、ジステアロイルホスファチジルエタノールアミン（ＤＳＰＥ）とＰＥＧとの組合せから形成される、ＤＳＰＥ−ＰＥＧに拡張した。Ｆｉｓｈｅｒによる欧州特許第ＥＰ  ０４４５１３１Ｂ１およびＷＯ９０／０４３８４には、それらの外表面上に共有結合したＰＥＧ成分を有するリポソームが記載されている。１〜２０モル％のＰＥＧで誘導体化されたＰＥを含むリポソーム組成物、およびその使用の方法は、Ｗｏｏｄｌｅら（米国特許第５，０１３，５５６号および同５，３５６，６３３号）およびＭａｒｔｉｎら（米国特許第５，２１３，８０４号および欧州特許第ＥＰ  ０４９６８１３Ｂ１）によって記載されている。多くのその他の脂質−ポリマー複合体を含むリポソームが、ＷＯ９１／０５５４５および米国特許第５，２２５，２１２号（両方ともＭａｒｔｉｎらによる）およびＷＯ９４／２００７３（Ｚａｌｉｐｓｋｙら）に記載されている。ＰＥＧ−改変セラミドリピドを含むリポソームは、ＷＯ９６／１０３９１（Ｃｈｏｉら）に記載されている。米国特許第５，５４０，９３５号（Ｍｉｙａｚａｋｉら）および同第５，５５６，９４８号（Ｔａｇａｗａら）は、それらの表面上で官能成分によりさらに誘導体化され得るＰＥＧ含有リポソームを記載している。
【０１５６】
核酸を含む限定数のリポソームが当該分野で知られている。ＴｈｉｅｒｒｙらによるＷＯ９６／４００６２は、リポソーム中に高分子量核酸をカプセル化するための方法を記載する。Ｔａｇａｗａらによる、米国特許第５，２６４，２２１は、タンパク質が結合したリポソームを開示し、そしてこのようなリポソームの内容物は、アンチセンスＲＮＡを含み得ることを主張している。Ｒａｈｍａｎらによる米国特許第５，６６５，７１０号は、リポソーム中にオリゴデオキシヌクレオチドをカプセル化する特定の方法を記載している。ＬｏｖｅらによるＷＯ９７／０４７８７は、ｒａｆ遺伝子を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドを含むリポソームを開示している。
【０１５７】
トランスフェロソーム（Ｔｒａｎｓｆｅｒｏｓｏｍｅ）は、なお別のタイプのリポソームであり、そして薬物送達ビヒクルの魅力的な候補である高度に変形可能な脂質凝集物である。トランスフェロソームは脂質小滴であり、それらがこの小滴より小さな穴を容易に通過し得るように高度に変形可能である脂質小滴として記載され得る。トランスフェロソームは、それらが用いられる環境に適合可能であり、例えば、それらは、自己適合性（皮膚中の穴の形状に適合可能）であり、自己修復性であり、フラグメント化なくしてそれらの標的に頻繁に到達し、そしてしばしば自己充填性である。トランスフェロソームを作製するために、標準的なリポソーム組成物に、通常界面活性剤である、表面エッジ活性化剤を添加することが可能である。トランスフェロソームは、皮膚に血清アルブミンを送達するために用いられている。血清アルブミンのトランスフェロソーム媒介送達は、血清アルブミンを含む溶液の皮下注入と同様に有効であることが示されている。
【０１５８】
界面活性剤は、エマルジョン（マイクロエマルジョンを含む）およびリポソームのような処方物において、広範な適用を見出している。天然および合成の両方の多くのタイプの界面活性剤の性質を分類かつランク分けする最も一般的な方法は、親水性／親油性バランス（ＨＬＢ）の使用による。親水性基の性質（「頭部」としても知られる）は、処方物で用いられる異なる界面活性剤をカテゴリーに分類するための最も有用な手段を提供する（Ｒｉｅｇｅｒ、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ、Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ、Ｉｎｃ．、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、ＮＹ、１９８８、２８５頁）。
【０１５９】
界面活性剤分子がイオン化されていないとき、非イオン性界面活性剤として分類される。非イオン性界面活性剤は、薬学的製品および化粧品に広範な適用を見出し、そして広範な範囲のｐＨ値に亘って使用可能である。一般に、それらのＨＬＢ値は、それらの構造に依存して、２〜約１８の範囲である。非イオン性界面活性剤は、エチレングリコールエステル、プロピレングリコールエステル、グリセリルエステル、ポリグリセリルエステル、ソルビタンエステル、スクロースエステル、およびエトキシ化エステルのような非イオン性エステルを含む。脂肪アルコールエトキシレート、プロポキシル化アルコール、およびエトキシル化／プロポキシル化ブロックポリマーのような、非イオン性アルカノールアミドおよびエーテルもまた、このクラスに含まれる。ポリオキシエチレン界面活性剤は、非イオン性界面活性剤クラスの最も一般的なメンバーである。
【０１６０】
界面活性剤が水に溶解または分散されるとき、それが負電荷を保持する場合、この界面活性剤は、アニオン性として分類される。アニオン性界面活性剤は、石鹸、アシルラクチレート、アミノ酸のアシルアミドのようなカルボキシレート、アルキル硫酸およびエトキシル化アルキルサルフェートのような硫酸のエステル、アルキルベンゼンスルホネート、アシルイセチオネート、アシルタウレートおよびスルホサクシネートのようなスルホネート、およびホスフェートを含む。アニオン性界面活性剤クラスの最も重要なメンバーは、アルキルサルフェートおよび石鹸である。
【０１６１】
界面活性剤が水に溶解または分散されるとき、それが正電荷を保持する場合、この界面活性剤は、カチオン性として分類される。カチオン性界面活性剤は、第四級アンモニウム塩およびエトキシ化アミンを含む。この第四級アンモニウム塩は、このクラスで最も使用されるメンバーである。
【０１６２】
界面活性剤分子が、正または負電荷のいずれかを保持する能力を有する場合、この界面活性剤は両性として分類される。両性界面活性剤は、アクリル酸誘導体、置換アルキルアミド、Ｎ−アルキルベタインおよびホスファチドを含む。
【０１６３】
薬物製品、処方物における、およびエマルジョンにおける界面活性剤の使用が総説されている（Ｒｉｅｇｅｒ、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ、Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ、Ｉｎｃ．、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、ＮＹ、１９８８、２８５頁）。
【０１６４】
（透過エンハンサー）
１つの実施形態では、本発明は、種々の透過エンハンサーを採用し、動物の皮膚に、核酸、特にオリゴヌクレオチドの効率的な送達を行う。大部分の薬物は、イオン化形態および非イオン化形態の両方で存在する。しかし、通常、脂質可溶性または親油性薬物のみが容易に細胞膜を横切る。横切られるべき膜が透過エンハンサーで処理される場合、非親油性薬物でさえ、細胞膜を横切り得ることが発見された。細胞膜を横切る非親油性薬物の拡散を補助することに加え、透過エンハンサーはまた、親油性薬物の透過性を増大する。
【０１６５】
透過エンハンサーは、５つの広範なカテゴリー、すなわち、界面活性剤、脂肪酸、胆汁酸塩、キレート剤、および非キレート非界面活性剤剤（Ｌｅｅら、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、１９９１、９２頁）の１つに属するとして分類され得る。透過エンハンサーの上記のクラスの各々は、以下により詳細に記載される。
【０１６６】
界面活性剤：本発明に関連して、界面活性剤（または「表面活性薬剤」）は、水溶液に溶解されるとき、この溶液の表面張力、または水溶液と別の液体との間の界面間の張力を低減する化学的実体であり、粘膜を通るオリゴヌクレオチドの吸収が増大される。胆汁酸塩および脂肪酸に加え、これらの透過エンハンサーは、例えば、ラウリル硫酸ナトリウム、ポリオキシエチレン−９−ラウリルエステル、およびポリオキシエチレン−２０−セチルエーテル（Ｌｅｅら、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、１９９１、９２頁）；およびＦＣ−４３のような、水素をフッ素で置換した化合物（ｐｅｒｆｌｕｏｒｏｃｈｅｍｉｃａｌ）のエマルジョン（Ｔａｋａｈａｓｈｉら、Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．、１９８８、４０、２５２）を含む。
【０１６７】
脂肪酸：透過エンハンサーとして作用する、種々の脂肪酸およびそれらの誘導体は、例えば、オレイン酸、ラウリン酸、カプリン酸（ｎ−デカン酸）、ミリスチン酸、パルミチン酸、ステアリン酸、リノール酸、リノレン酸、ジカプレート、トリカプレート、モノオレイン（１−モノオレイル−ｒａｃ−グリセロール）、ジラウリン、カプリル酸、アラキドン酸、グリセロール１−モノカプレート、１−ドデシルアザシクロヘプタン−２−オン、アシルカルニチン、アシルコリン、それらのＣ１−１０アルキル（例えば、メチル、イソプロピルおよびｔ−ブチル）エステル、およびそれらのモノおよびジグリセリド（例えば、オレエート、ラウレート、カプレート、ミリステート、パルミテート、ステアレート、リノリエートなど）を含む（Ｌｅｅら、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、１９９１、９２頁；Ｍｕｒａｎｉｓｈｉ、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、１９９０、７、１−３３；Ｅｌ  Ｈａｒｉｒｉら、Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．、１９９２、４４、６５１−６５４）。
【０１６８】
胆汁酸塩：胆汁の生理学的役割としては、脂質および脂溶性ビタミンの分散および吸収の促進が挙げられる（Ｂｒｕｎｔｏｎ、第３８章：Ｇｏｏｄｍａｎ  ＆  Ｇｉｌｍａｎ’ｓ  Ｔｈｅ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｂａｓｉｓ  ｏｆ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ、第９版、Ｈａｒｄｍａｎら編、ＭｃＧｒａｗ−Ｈｉｌｌ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、１９９６、９３４−９３５頁）。種々の天然の胆汁酸塩およびその合成の誘導体は、浸透増強剤として作用する。従って、用語「胆汁酸塩」は、胆汁の任意の天然に存在する成分、およびそれらの任意の合成誘導体を含む。本発明の胆汁酸塩としては、例えば、以下が挙げられる：コール酸（またはその薬学的に受容可能なナトリウム塩、コール酸ナトリウム）、デヒドロコール酸（デヒドロコール酸ナトリウム）、デオキシコール酸（デオキシコール酸ナトリウム）、グルコール酸（グルコール酸ナトリウム）、グリコール酸（グリコール酸ナトリウム）、グリコデオキシコール酸（グリコデオキシコール酸ナトリウム）、タウロコール酸（タウロコール酸ナトリウム）、タウロデオキシコール酸（タウロデオキシコール酸ナトリウム）、ケノデオキシコール酸（ケノデオキシコール酸ナトリウム）、ウルソデオキシコール酸（ＵＤＣＡ）、タウロー２４，２５−ジヒドロ−フシジン酸ナトリウム（ＳＴＤＨＦ）、グリコジヒドロフシジン酸ナトリウムおよびポリオキシエチレン−９−ラウリルエーテル（ＰＯＥ）（Ｌｅｅら、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、１９９１、９２頁；Ｓｗｉｎｙａｒｄ、第３９章：Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、第１８版、Ｇｅｎｎａｒｏ編、Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，Ｐａ．、１９９０、７８２−７８３頁；Ｍｕｒａｎｉｓｈｉ，Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、１９９０、７、１−３３；Ｙａｍａｍｏｔｏら、Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｅｘｐ．Ｔｈｅｒ．、１９９２、２６３、２５；Ｙａｍａｓｈｉｔａら、Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｓｃｉ．、１９９０、７９、５７９−５８３）
キレート剤：本発明に関して使用される場合、キレート剤は、金属イオンと錯体を形成することによって溶液から金属イオンを除去し、その結果、粘膜を介するオリゴヌクレオチドの吸収が促進される化合物として定義され得る。本発明における浸透増強剤としてのそれらの使用に関して、キレート剤は、ＤＮａｓｅインヒビターとしても作用するというさらなる利点を有する。なぜなら、最も特徴付けられたＤＮＡヌクレアーゼは、触媒のために二価の金属イオンを必要とし、従って、キレート剤によって阻害されるからである（Ｊａｒｒｅｔｔ、Ｊ．Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒ．、１９９３、６１８、３１５−３３９）。本発明のキレート剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）二ナトリウム、クエン酸、サリチレート（例えば、サリチル酸ナトリウム、５−メトキシサリチレートおよびホモバニレート（ｈｏｍｏｖａｎｉｌａｔｅ））、コラーゲンのＮ−アシル誘導体、ラウレス（ｌａｕｒｅｔｈ）−９およびβ−ジケトンのＮ−アミノアシル誘導体（エナミン）（Ｌｅｅら、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、１９９１、９２頁；Ｍｕｒａｎｉｓｈｉ，Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、１９９０、７、１−３３；Ｂｕｕｒら、Ｊ．Ｃｏｎｔｒｏｌ  Ｒｅｌ．、１９９０、１４、４３−５１）。
【０１６９】
非キレート性非界面活性剤：本明細書中で使用される場合、非キレート性非界面活性剤浸透促進化合物は、キレート剤または界面活性剤としてわずかな活性しか実証しないにもかかわらず、消化粘膜を通るオリゴヌクレオチドの吸収を促進する化合物として規定され得る（Ｍｕｒａｎｉｓｈｉ、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、１９９０、７、１−３３）。この種類の浸透増強剤としては、例えば、不飽和環式尿素、１−アルキル−アルカノン誘導体および１−アルケニルアザシクロ−アルカノン誘導体（Ｌｅｅら、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、１９９１、９２頁）；ならびに非ステロイド抗炎症剤（例えば、ジクロフェナクナトリウム、インドメタシンおよびフェニルブタゾン（Ｙａｍａｓｈｉｔａら、Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．、１９８７、３９、６２１−６２６）が挙げられる。
【０１７０】
細胞レベルでのオリゴヌクレオチドの取り込みを促進する薬剤はまた、本発明の薬学的組成物および他の組成物に添加され得る。例えば、カチオン性脂質（例えば、リポフェクチン（Ｊｕｎｉｃｈｉら、米国特許第５，７０５，１８８号））、カチオン性グリセロール誘導体、およびポリカチオン性分子（例えば、ポリリジン（Ｌｏｌｌｏら、ＰＣＴ出願ＷＯ  ９７／３０７３１））はまた、オリゴヌクレオチドの細胞取り込みを促進することが知られている。
【０１７１】
他の薬剤が、投与された核酸の浸透を促進するために利用され得る。これらの薬剤としては、グリコール（例えば、エチレングリコールおよびプロピレングリコール）、ピロール（例えば、２−ピロール）、アゾン（ａｚｏｎｅ）およびテルペン（例えば、リモネンおよびメントン）が挙げられる。
【０１７２】
（キャリア）
本発明の特定の組成物はまた、処方物中にキャリア化合物を含む。本明細書中で使用される場合、「キャリア化合物」または「キャリア」とは、核酸またはそれらのアナログをいい得、これは、不活性（すなわち、それ自体生物活性を有さない）であるが、例えば、生物学的に活性な核酸を分解すること、または循環から生物学的に活性な核酸を除去することを促進することによって、生物学的活性を有する核酸のバイオアベイラビリティーを減少させるインビボプロセスにより、核酸として認識される。核酸とキャリア化合物との同時投与（典型的に、後者の物質過剰である）は、おそらく、共通のレセプターについてのキャリア化合物と核酸との間の競合に起因して、肝臓、腎臓または他の体外循環レザバにおいて回収される核酸の量の実質的な減少を生じ得る。例えば、肝臓組織における部分的なホスホロチオエートオリゴヌクレオチドの回収は、ポリイノシン酸、硫酸デキストラン、ポリシチジン酸または４−アセトアミド−４’イソチオシアノ−スチルベン−２，２’−ジスルホン酸と同時投与される場合に減少され得る（Ｍｉｙａｏら、Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｒｅｓ．Ｄｅｖ．、１９９５、５、１１５−１２１；Ｔａｋａｋｕｒａら、Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  ＆  Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｖ．、１９９６、６、１７７−１８３）。
【０１７３】
（賦形剤）
キャリア化合物とは対照的に、「薬物学的キャリア」または「賦形剤」は、薬学的に受容可能な溶媒、懸濁剤または動物に１つ以上の核酸を送達するための他の任意の薬物学的に不活性なビヒクルである。賦形剤は、液体でも固体でもよく、核酸と所定の薬学的組成物の他の成分とが組み合わされる場合、所望のバルク、粘稠度などが提供されるように考慮して計画された投与様式によって選択され得る。代表的な薬学的キャリアとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：結合剤（例えば、予めゼラチン化したトウモロコシデンプン、ポリビニルピロリドンまたはヒドロキシプロピルメチルセルロースなど）；充填剤（例えば、ラクトースおよび他の糖、微結晶性セルロース、ペクチン、ゼラチン、硫酸カルシウム、エチルセルロース、ポリアクリレートまたはリン酸水素カルシウムなど）；滑沢剤（例えば、ステアリン酸マグネシウム、タルク、シリカ、コロイド状二酸化ケイ素、ステアリン酸、ステアリン酸金属、水素化植物油、トウモロコシデンプン、ポリエチレングリコール、安息香酸ナトリウム、酢酸ナトリウムなど）；崩壊剤（例えば、デンプン、デンプングリコール酸ナトリウムなど）；および湿潤剤（例えば、ラウリル硫酸ナトリウムなど）。
【０１７４】
核酸と有害に反応しない、非腸管外投与に適切な薬学的に受容可能な有機賦形剤または無機賦形剤もまた、本発明の組成物を処方するために使用され得る。適切な薬学的に受容可能なキャリアとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：水、塩溶液、アルコール、ポリエチレングリコール、ゼラチン、ラクトース、アミロース、ステアリン酸マグネシウム、タルク、ケイ酸、粘性パラフィン、ヒドロキシメチルセルロース、ポリビニルピロリドンなど。
【０１７５】
核酸の局所投与のための処方物としては、以下が挙げられ得る：滅菌水溶液および非滅菌水溶液、アルコールのような一般的な溶媒中の非水溶液、または液体油ベースもしくは固体油ベース中の核酸溶液。これらの溶液はまた、緩衝剤、希釈剤、および他の適切な添加剤を含み得る。核酸と有害な反応をしない、非腸管外投与に適切な薬学的に受容可能な有機賦形剤または無機賦形剤が、使用され得る。
【０１７６】
適切な薬学的に受容可能な賦形剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：水、塩溶液、アルコール、ポリエチレングリコール、ゼラチン、ラクトース、アミロース、ステアリン酸マグネシウム、タルク、ケイ酸、粘性パラフィン、ヒドロキシメチルセルロース、ポリビニルピロリドンなど。
【０１７７】
（拍動性送達）
本発明の化合物はまた、拍動性送達によって投与され得る。「拍動性送達」とは、浸透増強剤と組み合わせた薬物の第１のパルスと浸透増強剤の第２のパルスを送達して、浸透増強剤の第１のパルスでの放出の際に吸収されない薬物の吸収を促進する薬学的処方物をいう。
【０１７８】
本発明の１つの実施形態は、腸の薬物吸収を増強するための遅延放出経口処方物であり、この処方物は、以下：
（ａ）上記薬物と浸透増強剤とを含有するキャリア粒子の第１の集団であって、上記薬物および上記浸透増強剤は、腸の第１の位置において放出される、第１の集団；ならびに
（ｂ）浸透増強剤と遅延放出コーティングもしくはマトリクスとを含有するキャリア粒子の第２の集団であって、浸透増強剤が第１の位置よりも下流にある腸の第２の位置において放出され、それによって、薬物が第２の位置に到達する場合に、薬物の吸収を増強する、第２の集団
を含む。
【０１７９】
あるいは、（ａ）および（ｂ）における浸透増強剤は別個のものである。
【０１８０】
この増強は、少なくとも２つのキャリア粒子の集団をカプセル化することによって得られる。キャリア粒子の第１の集団は、生物学的に活性な物質および浸透増強剤を含み、そして、キャリア粒子の第２の（そして必要に応じて追加の）集団は、浸透増強剤および遅延放出コーティングもしくはマトリクスを含む。
【０１８１】
経口投与された薬物に適用する「初回通過効果」は、胃酸および種々の消化酵素の作用による分解である。初回通過効果を緩和する１つの手段は、薬物の投与用量を増やし、それによって、薬物の集団の初回通過クリアランスに対する損失を補うことである。このことは、例えば、単純に、より多くの薬物を動物に与えることによってｉ．ｖ．投与で容易に達成され得るが、他の因子が、非経口手段により投与される薬物のバイオアベイラビリティに影響を及ぼす。例えば、薬物は、消化管もしくは血流において酵素的もしくは化学的に分解され得、そして／または、種々の粘膜に対して不浸透性もしくは半透性であり得る。
【０１８２】
これらの薬学的組成物は、直腸、膣、鼻腔もしくは肺の経路を介して投与される場合に、生物学的に活性な物質の吸収を増強し得ることがまた意図される。生物学的に活性な物質の放出は、腸管の任意の部分において達成され得ることがまた意図される。
【０１８３】
オリゴヌクレオチドの液体薬学的組成物は、適切なビヒクル（例えば、滅菌の発熱物質を含まない水または生理食塩水溶液）とオリゴヌクレオチドを合わせることによって調製され得る。他の治療用化合物が、必要に応じて含められ得る。
【０１８４】
本発明はまた、固体粒子状組成物の使用を意図する。このような組成物は、好ましくは、吸入可能なサイズのオリゴヌクレオチドの粒子を含む。このような粒子は、例えば、従来の手段により、乳鉢および乳棒を用いて、乾燥オリゴヌクレオチドをすりつぶし、次いで、得られた粉末組成物を、４００メッシュ篩を通して大きな粒子および塊を分離することによって調製され得る。活性なオリゴヌクレオチドから構成される固体粒子状組成物は、必要に応じて、エアロゾルの形成を促進するように機能する分散剤（例えば、ラクトース）を含み得る。
【０１８５】
本発明に従って、オリゴヌクレオチド組成物が、エアロゾル化され得る。液体粒子のエアロゾル化は、ネブライザーのような任意の適切な手段によって生成され得る。例えば、米国特許第４，５０１，７２９号を参照のこと。ネブライザーは、溶液もしくは懸濁液を、狭いベンチュリオリフィスを通る圧縮ガス（代表的には空気もしくは酸素）の加速によってか、または、超音波振動によって、治療用エアロゾルミストに変換する、市販のデバイスである。適切なネブライザーとしては、ＰＡＲＩ  ＬＣ  ＰＬＵＳ，ＰＡＲＩ  ＤＵＲＡ−ＮＥＢ  ２０００，ＰＡＲＩ−ＢＡＢＹ  Ｓｉｚｅ，ＰＡＲＩ  ＰＲＯＮＥＢ  Ｃｏｍｐｒｅｓｓｏｒ  ｗｉｔｈ  ＬＣ  ＰＬＵＳ，ＰＡＲＩ  ＷＡＬＫＨＡＬＥＲ  Ｃｏｍｐｒｅｓｓｏｒ／Ｎｅｂｕｌｉｚｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍ，ＰＡＲＩ  ＬＣ  ＰＬＵＳ  Ｒｅｕｓａｂｌｅ  ＮｅｂｕｌｉｚｅｒおよびＰＡＲＩ  ＬＣ  Ｊｅｔ＋ｅＮｅｂｕｌｉｚｅｒの名でＢｌａｉｒｅより販売されているものが挙げられる。
【０１８６】
ネブライザーにおいて使用するための例示的な処方物は、滅菌の発熱物質を含まない水または生理食塩水溶液のような液体中のオリゴヌクレオチドから構成され、ここで、このオリゴヌクレオチドは、処方物の約４０％ｗ／ｗまでを構成する。好ましくは、オリゴヌクレオチドは、２０％ｗ／ｗ未満を構成する。所望される場合、保存料（例えば、メチルヒドロキシ安息香酸エステル）、抗酸化剤および矯味剤のようなさらなる添加物が、この組成物に添加され得る。
【０１８７】
オリゴヌクレオチドを含む固体粒子は、当該分野で公知の任意の固体粒子状医薬のエアロゾル生成器を用いてエアロゾル化され得る。このようなエアロゾル生成器は、上記のように吸入可能な粒子を生成し、そしてさらに、エアロゾルの単位容量あたりの再現性の定量を生成する。適切な固体粒子状エアロゾル生成器としては、吸入器および定量吸入器が挙げられる。定量吸入器は、当該分野で用いられ、本発明において有用である。
【０１８８】
好ましくは、液体もしくは固体のエアロゾルが、約１０〜１５０リットル／分の速度、より好ましくは、約３０〜１５０リットル／分の速度、そして最も好ましくは約６０リットル／分の速度で生成される。
【０１８９】
生物学的に活性な物質のバイオアベイラビリティの増強はまた、組成物の経口投与および本発明の方法によって達成される。用語「バイオアベイラビリティ」とは、非経口の投与様式を用いて、動物に薬物を導入する場合に、投与される薬物のどの部分が循環系に到達するかの指標をいう。
【０１９０】
浸透増強剤としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない：界面活性剤、脂肪酸、胆汁酸、キレート化剤および非キレート化非界面活性分子のような分子分類のメンバー（Ｌｅｅら、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，１９９１，ｐ．９２）。キャリアは、本発明の組成物内に含められて、生物利用可能な薬物のレベルの減少を生じるプロセスを妨害し得る、不活性な分子である。
【０１９１】
（他の成分）
本発明の組成物は、薬学的組成物中に慣習的に見出される他のアジュバント成分を、当該分野で確立された使用レベルでさらに含み得る。したがって、例えば、組成物は、さらなる適合性の薬学的に活性な物質（例えば、かゆみ止め、収れん薬、局所麻酔剤または抗炎症剤）を含み得るか、あるいは本発明の組成物の、種々の投薬形態を生理学的に処方することにおいて有用なさらなる物質（例えば、色素、矯味剤、保存剤、酸化防止剤、乳白剤、増粘剤および安定剤）を含み得る。しかし、このような材料は、添加される場合に、本発明の組成物の成分の生物学的活性を過度に阻害するべきではない。これらの処方物は、安定化され得、そして所望される場合、処方物の核酸と有害に相互作用しない補助剤（例えば、滑沢剤、保存剤、安定剤、湿潤剤、乳化剤、浸透圧に影響する塩、緩衝剤、着色料、矯味物質および／または芳香物質など）と混合され得る。
【０１９２】
水性懸濁液は、懸濁液の粘性を増加させる物質（例えば、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ソルビトールおよび／またはデキストランが挙げられる）を含み得る。懸濁液はまた、安定剤を含み得る。
【０１９３】
本発明の特定の実施形態は、（ａ）１つ以上のアンチセンス化合物、および（ｂ）１つ以上の他の化学療法剤（これは、非アンチセンス機構によって機能する）を含む薬学的組成物を提供する。このような化学療法剤の例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：ダウノルビシン、ダウノマイシン、ダクチノマイシン、ドキソルビシン、エピルビシン、イダルビシン、エソルビシン、ブレオマイシン、マホスファミド（ｍａｆｏｓｆａｍｉｄｅ）、イホスファミド、シトシンアラビノシド、ビス−クロロエチルニトロソウレア（ｂｉｓ−ｃｈｌｏｒｏｅｔｈｙｌｎｉｔｒｏｓｕｒｅａ）、ブスルファン、マイトマイシンＣ、アクチノマイシンＤ、ミトラマイシン、プレドニゾン、ヒドロキシプレゲステロン、テストステロン、タモキシフェン、ダカルバジン、プロカルバジン、ヘキサメチルメラミン、ペンタメチルメラミン、ミトキサントロン、アムサクリン、クロラムブシル、メチルシクロへキシルニトロソウレア（ｍｅｔｈｙｌｃｙｃｌｏｈｅｘｙｌｎｉｔｒｏｓｕｒｅａ）、ナイトロジェンマスタード、メルファラン、シクロホスファミド、６−メルカプトプリン、６−チオグアニン、シタラビン、５−アザシチジン、ヒドロキシウレア、デオキシコホルマイシン（ｄｅｏｘｙｃｏｆｏｒｍｙｃｉｎ）、４−ヒドロキシペルオキシシクロホスホラミド、５−フルオロウラシル（５−ＦＵ）、５−フルオロデオキシウリジン（５−ＦＵｄＲ）、メトトレキサート（ＭＴＸ）、コルヒチン、タキソール、ビンクリスチン、ビンブラスチン、エトポシド（ＶＰ−１６）、トリメトレキサート、イリノテカン（ｉｒｉｎｏｔｅｃａｎ）、トポテカン（ｔｏｐｏｔｅｃａｎ）、ゲムシタビン、テニポシド、シスプラチンおよびジエチルスチルベストロール（ｄｉｅｔｈｙｌｓｔｉｌｂｅｓｔｒｏｌ（ＤＥＳ））。一般的に、Ｔｈｅ  Ｍｅｒｃｋ  Ｍａｎｕａｌ  ｏｆ  Ｄｉａｇｎｏｓｉｓ  ａｎｄ  Ｔｈｅｒａｐｙ、第１５版、１９８７、１２０６−１２２８頁、Ｂｅｒｋｏｗら編、Ｒａｈｗａｙ，Ｎ．Ｊ．を参照のこと。本発明の化合物と共に使用される場合、このような化学療法剤は、別個に（例えば、５−ＦＵおよびオリゴヌクレオチド）か、連続して（例えば、一定時間の５−ＦＵおよびオリゴヌクレオチド、引き続いてＭＴＸおよびオリゴヌクレオチド）か、あるいは１つ以上の他のこのような化学療法剤と組み合わせて（例えば、５−ＦＵ、ＭＴＸおよびオリゴヌクレオチド、または５−ＦＵ、放射線療法およびオリゴヌクレオチド）使用され得る。抗炎症薬物（非ステロイド抗炎症薬物およびコルチコステロイドが挙げられるが、これらに限定されない）、ならびに抗ウイルス薬物（リビビリン（ｒｉｂｉｖｉｒｉｎ）、ビダラビン、アシクロビルおよびガンシクロビルが挙げられるが、これらに限定されない）もまた、本発明の組成物と組み合わされ得る。一般的に、Ｔｈｅ  Ｍｅｒｃｋ  Ｍａｎｕａｌ  ｏｆ  Ｄｉａｇｎｏｓｉｓ  ａｎｄ  Ｔｈｅｒａｐｙ、第１５版、Ｂｅｒｋｏｗら編、１９８７、Ｒａｈｗａｙ，Ｎ．Ｊ．、それぞれ、２４９９−２５０６頁および４６−４９頁を参照のこと。他の非アンチセンス化学療法剤もまた、本発明の範囲内である。２つ以上組み合わせた化合物は、一緒にか、または連続して使用され得る。
【０１９４】
別の関連する実施形態において、本発明の組成物は、第１核酸に標的化された１つ以上のアンチセンス化合物（特にオリゴヌクレオチド）、および第２核酸標的に標的化された１つ以上のさらなるアンチセンス化合物を含み得る。アンチセンス化合物の多数の例は、当該分野で公知である。２つ以上組み合わせた化合物は、一緒にか、または連続して使用され得る。
【０１９５】
治療組成物の処方およびそれに続く投与は、当業者の技術の範囲内と考えられる。投与は、処置されるべき疾患状態の重篤度および応答性に依存して、数日から数ヶ月間まで続く処置過程で、あるいは治癒がもたらされるか、または疾患状態の縮小が達成されるまで続く。最適な投与スケジュールは、患者の身体における薬物蓄積の測定から計算され得る。当業者は、最適な投薬量、投与方法および繰り返し率を容易に決定し得る。最適な投薬は、個々のオリゴヌクレオチドの相対的な効力に非常に依存し得、そして一般的に、インビトロおよびインビボ動物モデルにおいて有効であることが見出されたＥＣ５０に基づいて評価され得る。一般的に、投薬量は、体重１ｋｇあたり０．０１μｇ〜１００ｇであり、そして１日に１回以上、一週間に１回以上、一ヶ月に１回以上、もしくは１年に１回以上、または２年〜２０年ごとに１回、与えられ得る。当業者は、測定された、身体の流体または組織における薬物の滞留時間および濃度に基づいて、投与のための繰り返し率を容易に決定し得る。首尾よい処置の後、患者は、疾患状態の再発を予防するために維持療法を受けることが所望され得、ここで、このオリゴヌクレオチドは、維持用量（体重１ｋｇあたり０．０１μｇ〜１００ｇ、１日に１回以上〜２０年毎に１回の範囲）で投与される。
【０１９６】
（併用療法）
本発明はまた、併用療法の方法も提供し、この方法において、１種以上の本発明の化合物および１種以上の他の治療／予防用化合物が投与されて、本明細書中に記載されるような状態および／または疾患状態を処置する。種々の局面において、本発明の化合物および治療／予防用化合物は、混合物として同時に投与されるか、または別々に投与される。１つの局面において、投与経路は、本発明の化合物および治療／予防用化合物について同じであるが、別の局面において、本発明の化合物および治療／予防用化合物は、異なる投与経路によって投与される。１つの実施形態において、本発明の化合物および治療／予防用化合物の投薬量は、別々に投与される場合に、各化合物について治療有効もしくは予防有効な量である。あるいは、併用投与は、別々に投与される場合の治療効果もしくは予防効果を達成するために必要とされるよりも低い投薬量の使用を可能にし、そして、このような方法は、化合物の用量を減らすことの１種以上の副作用を減らすことにおいて有用である。
【０１９７】
１つの局面において、本発明の化合物、およびある状態を処置する際に有効な１種以上の他の治療／予防用化合物が投与され、ここで、両方の化合物が、同じかまたは異なる機構により作用する。治療／予防用化合物としては以下が挙げられるがこれらに限定されない：胆汁酸金属イオン封鎖樹脂（例えば、コレスチラミン、コレスチポールおよびコレセベラム塩酸塩（ｃｏｌｅｓｅｖｅｌａｍ  ｈｙｄｒｏｃｈｌｏｒｉｄｅ））、ＨＭＧＣｏＡ−レダクターゼインヒビター（例えば、ロバスタチン、セリバスタチン、プレバスタチン、アトルバスタチン（ａｔｏｒｖａｓｔａｔｉｎ）、シンバスタチンおよびフルバスタチン）、ニコチン酸、フィブリン酸誘導体（例えば、クロフィブレート、ゲムフィブロジル、フェノフィブレート、ベザフィブレートおよびシプロフィブレート）、プロブコール、ネオマイシン、デキストロチロキシン、植物−スタノールエステル（ｐｌａｎｔ−ｓｔａｎｏｌ  ｅｓｔｅｒ）、コレステロール吸収インヒビター（例えば、エゼチミブ（ｅｚｅｔｉｍｉｂｅ））、インプリタピド（ｉｍｐｌｉｔａｐｉｄｅ）、胆汁酸トランスポーターのインヒビター（先端の（ａｐｉｃａｌ）ナトリウム依存性胆汁酸トランスポーター）、肝臓ＣＹＰ７ａのレギュレーター、エストロゲン置換療法（例えば、タモキシゲン）、および抗炎症剤（例えば、糖質コルチコイド）。
【０１９８】
従って、本発明はさらに、本明細書中に記載される疾患もしくは状態の処置および／または予防のための医薬の製造における、本発明の化合物および本明細書中に記載される１種以上の他の治療／予防用化合物の使用を提供する。
【０１９９】
（標的化送達）
別の局面において、本発明の化合物を、体内の特定の組織、器官または位置に標的化するための方法が提供される。例示的な標的としては、肝臓、肺、腎臓、心臓および血管内のアテローム性動脈硬化プラークが挙げられる。化合物を標的化する方法は、当該分野で周知である。
【０２００】
１つの実施形態において、化合物は、直接投与もしくは局所投与によって標的化される。例えば、血管を標的化する場合、化合物は、例えば、単一バルーンもしくは二重バルーンのカテーテルによって、脈管の管腔の内側から管の関連部位に直接投与されるか、または、例えば、Ｓｉｍｏｎｓら、Ｎａｔｕｒｅ  ３５９：６７−７０（１９９２）によって記載された肺ゲルシステムによって化合物の徐放を補助する物質を含む外膜を通して投与される。化合物の脈管への局所送達のための他の徐放技術としては、化合物を用いるステントのコーティングが挙げられる。アンチセンス化合物の血管への送達方法は、米国特許第６，１５９，９４６号に記載され、この特許は、その全体が参考として援用される。
【０２０１】
特定の組織または器官を標的化する場合、化合物は、その組織もしくは器官の中またはその周囲に投与され得る。例えば、米国特許第６，５４７，７８７号（その全体が参考として本明細書中に援用される）は、治療剤を心臓に標的かするための方法およびデバイスを開示する。１つの局面において、投与は、組織もしくは器官につながる血管への直接注射または注射によって生じる。例えば、肝臓を標的化する場合、化合物は、門脈を解する注射または注入によって投与され得る。
【０２０２】
別の局面において、化合物を標的化する方法が提供され、この方法は、１種以上の細胞型による化合物の取り込みを指向する薬剤とこの化合物を会合させる工程を包含する。例示的な薬剤としては、例えば、米国特許第６，４９５，５３２号（その開示は、その全体が参考として本明細書中に援用される）に記載されるような抗体、細胞表面レセプター、細胞表面レセプターに対するリガンド、ポリッリポサッカリド、薬物、ホルモン、ハプテン、特異的な脂質および核酸のような、器官特異的もしくは組織特異的標的か部分と一般に組み合せられる、脂質および脂質ベースの構造（例えば、リポソーム）が挙げられる。米国特許第５，３９９，３３１号（その開示は、その全体が参考として本明細書中に援用される）は、少なくとも１腫のマレイミド基とアミノ反応性機能を有する架橋化剤の使用による、タンパク質のリポソームへのカップリングを記載する；米国特許第４，８８５，１７２号、同第５，０５９，４２１号および同第５，１７１，５７８号（これらの開示は、その全体が参考として本明細書中に援用される）は、糖タンパク質ストレプトアビジンの使用によってタンパク質をリポソームに連結すること、そして、標的化リポソームをポリサッカリドを用いてコーティングすることを記載する。他の脂質ベースの標的化剤としては、例えば、米国特許第６，２１７，８８６号（その開示は、その全体が参考として本明細書中に援用される）に記載されるようなミセル生成物および結晶性生成物が挙げられる。
【０２０３】
別の局面において、標的化剤としては、米国特許第４，８１８，５４２号（その開示は、その全体が参考として本明細書中に援用される）に記載されるような、加水分解可能なエステル結合を含むコポリマーおよびホモポリマーのポリエステルに由来する多孔性のポリマーミクロスフェアが挙げられる。代表的なポリエステルとしては、ポリグリコール酸（ＰＧＡ）およびポリ乳酸（ＰＬＡ）、ならびに、グリコリドおよびＬ（−ラクチド）のコポリマー（ＰＧＬ）が挙げられ、これらは、ヒトに対して低い毒性を示し、生分解性である点で、本発明の方法および組成物に特に適している。ミクロスフェアのポリマーマトリクスとして利用される特定のポリエステルまたは他のポリマーもしくはコポリマーは、重要ではなく、種々のポリマーが、所望の多孔度、粘度、形状およびサイズ分布に依存して利用され得る。他の生分解性もしくは生物腐食性のポリマーもしくはコポリマーとしては、例えば、以下が挙げられる：ゼラチン、デンプン、アラビノガラクタン、アルブミン、コラーゲン、天然および合成の物質もしくはポリマー（例えば、ポリ（ε-カプロラクトン)、ポリ（ε-カプロラクトン−ＣＯ−乳酸）、ポリ（ε−カプロラクトン−ＣＯ−グリコール酸）、ポリ（β−ヒドロキシ酪酸）、ポリエチレンオキシド、ポリエチレン、ポリ（アルキル−２−シアノアクリレート）（例えば、メチル、エチル、ブチル）、ヒドロゲル（例えば、ポリ（ヒドロキシエチルメタクリレート））、ポリアミド（例えば、ポリアクリルアミド）、ポリ（アミノ酸）（すなわち、Ｌ−ロイシン、Ｌ−アスパラギン酸、β−メチル−Ｌ−アスパラギン酸、β−ベンジル−Ｌ−アスパラギン酸塩、グルタミン酸）、ポリ（２−ヒドロキシエチルＤＬ−アスパラギン酸アミド）、ポリ（エステルウレア）、ポリ（Ｌ−フェニルアラニン／エチレングリコール／１，６−ジイソシアナトヘキサン）およびポリ（メチルメタクリレート））。標的化送達に適切な例示的な天然および合成のポリマーは、容易に市販に入手可能であるか、または、適切なモノマーもしくはコモノマーもしくはオリゴマーからの縮合重合反応によって得られ得るかのいずれかである。
【０２０４】
なお別の実施形態において、米国特許第６，５６２，８６４号（その開示は、その全体が参考として本明細書中に援用される）は、カテキン（エピおよび他の炭素カチオン性アイソマーおよびその誘導体を含む）を記載し、これは、モノマー、ダイマーおよび高次のマルチマーとして、求核性かつカチオン性生物活性薬剤と、送達薬剤としての使用のための複合体を形成し得る。カテキンマルチマーは、脈管内皮内、および細胞膜／細胞小器官膜上に存在するものなどの極性タンパク質に対して強い親和性を有し、そして、インビボで選択された部位へと生物活性薬剤を標的化送達するために特に有用である。脈管の疾患および障害（例えば、アテローム性動脈硬化症および冠動脈疾患）の処置において、送達性薬剤としては、持続性カテキンマルチマー（カテキンと窒素含有部分（例えばアンモニア）との間の反応から形成されるアミド化カテキンマルチマーを含む）が挙げられる。
【０２０５】
本発明の他の標的化ストラテジーとしては、米国特許第６，４３３，０１２号（その開示は、その全体が参考として本明細書中に援用される）に記載されるようなＡＤＥＰＴ（抗体指向型酵素プロドラッグ療法）、ＧＤＥＰＴ（遺伝子指向型ＥＰＴ）およびＶＤＥＰＴ（ウイルス指向型ＥＰＴ）が挙げられる。
【０２０６】
本発明はさらに、標的化送達のための医療用デバイスおよびキットを提供し、ここで、このデバイスは、例えば、シリンジ、ステントまたはカテーテルである。キットは、化合物を投与するためのデバイス、および本発明の化合物を含む容器を備える。１つの局面において、化合物は、デバイスに予め充填されている。他の実施形態において、キットは、化合物の投与方法および投薬量のための指示書を提供する。アンチセンス化合物を送達するための医療用デバイスおよびキットを記載する米国特許としては、米国特許第６，３６８，３５６；６，３４４，０３５号；同第６，３４４，０２８号；同第６，２８７，２８５号；同第６，２００，３０４号；同第５，８２４，０４９号；同第５，７４９，９１５号；同第５，６７４，２４２号；同第５，６７０，１６１号；同第５，６０９，６２９号；同第５，５９３，９７４号；および同第５，４７０，３０７号（これら全ては、その全体が参考として本明細書中に援用される）が挙げられる。
【０２０７】
本発明は、特定の実施形態に従って特異性を伴って記載されてきたが、以下の実施例は、本発明を例示するためだけに機能し、そして、本発明を制限することを意図しない。
【実施例】
【０２０８】
（実施例１）
（オリゴヌクレオチド合成のためのヌクレオシドホスホルアミダイト）
（デオキシアミダイトおよび２’−アルコキシアミダイト）
２’−デオキシβ−シアノエチルジイソプロピルホスホルアミダイトおよび２’−メトキシβ−シアノエチルジイソプロピルホスホルアミダイトを、業者（例えば、Ｃｈｅｍｇｅｎｅｓ，Ｎｅｅｄｈａｍ，ＭＡ、またはＧｌｅｎ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｉｎｃ．、Ｓｔｅｒｌｉｎｇ，Ｖａ．）から購入した。他の２’−Ｏ−アルコキシ置換されたヌクレオシドアミダイトを、米国特許第５，５０６，３５１号（本明細書中に参考として援用される）に記載されたように調製する。２’−アルコキシアミダイトを使用して合成されたオリゴヌクレオチドについて、テトラゾールおよび塩基のパルス送達後の待ち工程を３６０秒まで長くしたことを除いて、非改変オリゴヌクレオチドについての標準的なサイクルを利用した。
【０２０９】
５−メチル−２’−デオキシシチジン（５−Ｍｅ−Ｃ）ヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチドを、公開された方法（Ｓａｎｇｈｖｉ  ｅｔ  ａｌ．、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ、１９９３、２１、３１９７−３２０３）に従って、市販のホスホルアミダイト（Ｇｌｅｎ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｓｔｅｒｌｉｎｇ，ＶＡ，またはＣｈｅｍＧｅｎｅｓ，Ｎｅｅｄｈａｍ，ＭＡ）を使用して、合成した。
【０２１０】
（２’−フルオロアミダイト）
（２’−フルオロデオキシアデノシンアミダイト）
２’−フルオロオリゴヌクレオチドを、以前に記載されるように［Ｋａｗａｓａｋｉら，Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．，１９９３，３６，８３１−８４１および米国特許第５，６７０，６３３号（本明細書中に参考として援用される）］合成した。簡潔には、保護ヌクレオシドＮ６−ベンゾイル−２’−デオキシ−２’−フルオロアデノシンを、文献の手順を改変し、それによりこの２’−α−フルオロ原子を２’−β−トリチル基のＳＮ２−置換により導入することによって、出発物質として市販の９−β−Ｄ−アラビノフラノシルアデニンを利用して合成した。従って、Ｎ６−ベンゾイル−９−β−Ｄ−アラビノフラノシルアデニンを、３’，５’−ジテトラヒドロピラニル（ＴＨＰ）中間体として、中程度の収量において選択的に保護した。ＴＨＰ基およびＮ６−ベンゾイル基の脱保護を、標準的な方法論を使用して達成し、そして標準的な方法を使用して、５’−ジメトキシトリチル（ＤＭＴ）中間体および５’−ＤＭＴ−３’−ホスホルアミダイト中間体を得た。
【０２１１】
（２’−フルオロデオキシグアノシン）
２’−デオキシ−２’−フルオログアノシンの合成を、テトライソプロピルジシロキサニル（ＴＰＤＳ）保護９−β−Ｄ−アラビノフラノシルグアニンを出発物質として使用して、その中間体ジイソブチリルアラビノフラノシルグアノシンへの変換により達成した。ＴＰＤＳ基の脱保護の次に、そのヒドロキシル基をＴＨＰで保護して、ジイソブチリルジ−ＴＨＰ保護アラビノフラノシルグアニンを得た。選択的Ｏ−脱アシル化およびトリフレート化（ｔｒｉｆｌａｔｉｏｎ）の次に、フッ素で粗製生成物を処理し、次いで、ＴＨＰ基の脱保護を行った。
【０２１２】
標準的な方法論を使用して、その５’−ＤＭＴ−ホスホルアミダイトおよび５’−ＤＭＴ−３’−ホスホルアミダイトを得た。
【０２１３】
（２’−フルオロウリジン）
２’−デオキシ−２’−フルオロウリジンの合成を、文献の手順の改変によって達成した。この手順において、２，２’−無水−１−β−Ｄ−アラビノフラノシルウラシルを、７０％  フッ化水素−ピリジンで処理した。標準的な手順を使用して、その５’−ＤＭＴホスホルアミダイトおよび５’−ＤＭＴ−３’ホスホルアミダイトを得た。
【０２１４】
（２’−フルオロデオキシシチジン）
２’−デオキシ−２’−フルオロシチジンを、２’−デオキシ−２’−フルオロウリジンのアミノ化を介して合成し、続いて、選択的に保護して、Ｎ４−ベンゾイル−２’−デオキシ−２’−フルオロシチジンを得た。標準的な手順を使用して、その５’−ＤＭＴホスホルアミダイトおよび５’−ＤＭＴ−３’ホスホルアミダイトを得た。
【０２１５】
（２’−Ｏ−（２−メトキシエチル）修飾アミダイト）
２’−Ｏ−メトキシエチル置換ヌクレオシドアミダイトを以下のように調製するか、または代わりに、Ｍａｒｔｉｎ，Ｐ．，Ｈｅｌｖｅｔｉｃａ  Ｃｈｉｍｉｃａ  Ａｃｔａ，１９９５，７８，４８６−５０４の方法に従って調製する。
【０２１６】
（２，２’−無水［１−（β−Ｄ−アラビノフラノシル）−５−メチルウリジン］）
５−メチルウリジン（Ｙａｍａｓａ，Ｃｈｏｓｈｉ，Ｊａｐａｎから市販されるリボシルチミン）（７２．０ｇ、０．２７９Ｍ）、ジフェニルカーボネート（９０．０ｇ、０．４２０Ｍ）および重炭酸ナトリウム（２．０ｇ、０．０２４Ｍ）をＤＭＦ（３００ｍＬ）に添加した。この混合物を、攪拌しながら加熱して還流し、発生した二酸化炭素ガスを制御された様式にて放出させた。１時間後、わずかに色が濃くなった溶液を、減圧下で濃縮した。この得られたシロップを、攪拌しながらジエチルエーテル（２．５Ｌ）に注いだ。この生成物はガム状物質を形成した。エーテルをデカントし、残渣を、最小量のメタノール（約４００ｍＬ）に溶解した。この溶液を、新たなエーテル（２．５Ｌ）に注いで、硬いガム状物質を得た。このエーテルをデカントし、このガム状物質を、真空オーブンで乾燥して（６０℃、１ｍｍＨｇにて２４時間）、固体を得、これを、淡い黄褐色粉末（５７ｇ、８５％粗収率）に粉にした。そのＮＭＲスペクトルは、その構造と一致し、そのナトリウム塩としてフェノールが混入していた（約５％）。さらなる反応のために、この物質を使用した（または酢酸エチル中のメタノール勾配（１０〜２５％）を使用するカラムクロマトグラフィーによりさらに精製されて、白色固体を獲得し得る（ｍｐ  ２２２〜４℃））。
【０２１７】
（２’−Ｏ−メトキシエチル−５−メチルウリジン）
２，２’−無水−５−メチルウリジン（１９５ｇ、０．８１Ｍ）、トリス（２−メトキシエチル）ボレート（２３１ｇ、０．９８Ｍ）および２−メトキシエタノール（１．２Ｌ）を、２Ｌのステンレス鋼圧力容器に添加し、予め加熱した１６０℃の油浴に入れた。１５５〜１６０℃にて４８時間加熱した後、この容器を開け、その溶液を乾燥するまでエバポレートし、ＭｅＯＨ（２００ｍＬ）で摩砕した。その残渣を、熱アセトン（１Ｌ）中に再懸濁した。不溶性の塩を濾過し、アセトン（１５０ｍＬ）で洗浄し、濾液をエバポレートした。その残渣（２８０ｇ）をＣＨ３ＣＮ（６００ｍＬ）中に溶解し、エバポレートした。シリカゲルカラム（３ｋｇ）を、０．５％  Ｅｔ３ＮＨを含有するＣＨ２Ｃｌ２／アセトン／ＭｅＯＨ（２０：５：３）中にパックした。残渣を、ＣＨ２Ｃｌ２（２５０ｍＬ）中に溶解し、このカラムに装填する前に、シリカ（１５０ｇ）に吸着させた。生成物を、パックした溶媒を用いて溶出して、１６０ｇ（６３％）の生成物を得た。さらなる物質を、不純物質画分を、再度作業することにより得た。
【０２１８】
（２’−Ｏ−メトキシエチル−５’−Ｏ−ジメトキシトリチル−５−メチルウリジン）
２’−Ｏ−メトキシエチル−５−メチルウリジン（１６０ｇ、０．５０６Ｍ）を、ピリジン（２５０ｍＬ）とともに同時にエバポレートし、その乾燥した残渣を、ピリジン（１．３Ｌ）中に溶解した。ジメトキシトリチルクロリド（９４．３ｇ、０．２７８Ｍ）の第１のアリコートを添加し、その混合物を、室温にて１時間攪拌した。ジメトキシトリチルクロリドの第２のアリコート（９４．３ｇ、０．２７８Ｍ）を添加し、その反応系を、さらに１時間攪拌した。次いで、メタノール（１７０ｍＬ）を添加して、その反応系を停止させた。ＨＰＬＣにより、約７０％の生成物の存在が示された。その溶媒をエバポレートし、ＣＨ３ＣＮ（２００ｍＬ）で摩砕した。その残渣を、ＣＨＣｌ３（１．５Ｌ）中に溶解し、２×５００ｍＬの飽和ＮａＨＣＯ３および２×５００ｍＬの飽和ＮａＣｌで抽出した。その有機相をＮａ２ＳＯ４で乾燥し、濾過し、エバポレートした。２７５ｇの残渣を得た。この残渣を、充填され、０．５％  Ｅｔ３ＮＨを含有するＥｔＯＡｃ／ヘキサン／アセトン（５：５：１）で溶出される３．５ｋｇのシリカゲルカラムで精製した。この純粋画分をエバポレートして、１６４ｇの生成物を得た。さらに約２０ｇを、不純物質画分から得て、合計収量１８３ｇ（５７％）を得た。
【０２１９】
（３’−Ｏ−アセチル−２’−Ｏ−メトキシエチル−５’−Ｏ−ジメトキシトリチル−５−メチルウリジン）
２’−Ｏ−メトキシエチル−５’−Ｏ−ジメトキシトリチル−５−メチルウリジン（１０６ｇ、０．１６７Ｍ）、ＤＭＦ／ピリジン（５６２ｍＬのＤＭＦと１８８ｍＬのピリジンから調製した、７５０ｍＬの３：１混合物）および、無水酢酸（２４．３８ｍＬ、０．２５８Ｍ）を合わせ、室温にて２４時間攪拌した。この反応系を、最初にＭｅＯＨの添加によりＴＬＣサンプルをクエンチすることによって、ＴＬＣによりモニターした。ＴＬＣにより判断した場合に、反応が完了した際に、ＭｅＯＨ（５０ｍＬ）を添加し、この混合物を、３５℃でエバポレートした。その残渣を、ＣＨＣｌ３（８００ｍＬ）中に溶解し、２×２００ｍＬの飽和重炭酸ナトリウムおよび２×２００ｍＬの飽和ＮａＣｌで抽出した。その水層を、２００ｍＬのＣＨＣｌ３で逆抽出（ｂａｃｋ  ｅｘｔｒａｃｔ）した。合わせた有機物質を、硫酸ナトリウムで乾燥し、エバポレートして、１２２ｇの残渣（約９０％生成物）を得た。その残渣を、３．５ｋｇのシリカゲルカラムで精製し、ＥｔＯＡｃ／ヘキサン（４：１）を使用して溶出した。純粋な生成物画分をエバポレートして、９６ｇ（８４％）を得た。さらに１．５ｇを残りの画分から回収した。
【０２２０】
（３’−Ｏ−アセチル−２’−Ｏ−メトキシエチル−５’−Ｏ−ジメトキシトリチル−５−メチル−４−トリアゾールウリジン）
第１の溶液を、ＣＨ３ＣＮ（７００ｍＬ）中に３’−Ｏ−アセチル−２’−Ｏ−メトキシエチル−５’−Ｏ−ジメトキシトリチル−５−メチルウリジン（９６ｇ、０．１４４Ｍ）を溶解することによって調製し、とっておいた。トリエチルアミン（１８９ｍＬ、１．４４Ｍ）を、ＣＨ３ＣＮ（１Ｌ）中のトリアゾール（９０ｇ、１．３Ｍ）の溶液に添加し、−５℃まで冷却し、オーバーヘッドスターラーを用いて０．５時間攪拌した。０〜１０℃に維持した攪拌溶液に３０分かけてＰＯＣｌ３を滴下し、得られた混合物を、さらに２時間攪拌した。第１の溶液を、後者の溶液に４５分かけて滴下した。得られた反応混合物を低温室に一晩保存した。塩を反応混合物から濾過し、その溶液をエバポレートした。その残渣をＥｔＯＡｃ（１Ｌ）に溶解し、不溶性固体を、濾過により除去した。その濾液を、１×３００ｍＬのＮａＨＣＯ３および２×３００ｍＬの飽和ＮａＣｌで洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、エバポレートした。その残渣を、ＥｔＯＡｃで粉砕して、標題化合物を得た。
【０２２１】
（２’−Ｏ−メトキシエチル−５’−Ｏ−ジメトキシトリチル−５−メチルシチジン）
ジオキサン（５００ｍＬ）およびＮＨ４ＯＨ（３０ｍＬ）中の３’−Ｏ−アセチル−２’−Ｏ−メトキシエチル−５’−Ｏ−ジメトキシトリチル−５−メチル−４−トリアゾールウリジン（１０３ｇ、０．１４１Ｍ）の溶液を、室温にて２時間攪拌した。このジオキサン溶液をエバポレートし、その残渣を、ＭｅＯＨ（２×２００ｍＬ）で共沸した。その残渣をＭｅＯＨ（３００ｍＬ）中に溶解し、２ｌのステンレス鋼圧力容器に移した。ＮＨ３ガスで飽和させたＭｅＯＨ（４００ｍＬ）を添加し、この容器を、１００℃まで２時間加熱した（ＴＬＣにより、完全な変換が示された）。この容器の内容物を、乾燥するまでエバポレートし、その残渣を、ＥｔＯＡｃ（５００ｍＬ）中に溶解し、飽和ＮａＣｌ（２００ｍＬ）で１回洗浄した。この有機物質を硫酸ナトリウムで乾燥し、溶媒をエバポレートして、８５ｇ（９５％）の標題化合物を得た。
【０２２２】
（Ｎ４−ベンゾイル−２’−Ｏ−メトキシエチル−５’−Ｏ−ジメトキシトリチル−５−メチルシチジン）
２’−Ｏ−メトキシエチル−５’−Ｏ−ジメトキシトリチル−５−メチル−シチジン（８５ｇ、０．１３４Ｍ）をＤＭＦ（８００ｍＬ）中に溶解し、無水安息香酸（３７．２ｇ、０．１６５Ｍ）を攪拌しながら添加した。３時間攪拌した後、ＴＬＣにより、反応が約９５％完了したことが示された。溶媒をエバポレートし、その残渣をＭｅＯＨ（２００ｍＬ）で共沸した。残渣をＣＨＣｌ３（７００ｍＬ）中に溶解し、飽和ＮａＨＣＯ３（２×３００ｍＬ）および飽和ＮａＣｌ（２×３００ｍＬ）で抽出し、ＭｇＳＯ４で乾燥し、エバポレートして、残渣（９６ｇ）を得た。その残渣を、溶出溶媒として０．５％  Ｅｔ３ＮＨを含有するＥｔＯＡｃ／ヘキサン（１：１）を使用して１．５ｋｇのシリカカラムでクロマトグラフィーにかけた。純粋な生成物画分をエバポレートして、９０ｇ（９０％）の標題化合物を得た。
【０２２３】
（Ｎ４−ベンゾイル−２’−Ｏ−メトキシエチル−５’−Ｏ−ジメトキシトリチル−５−メチルシチジン−３’−アミダイト）
Ｎ４−ベンゾイル−２’−Ｏ−メトキシエチル−５’−Ｏ−ジメトキシトリチル−５−メチルシチジン（７４ｇ、０．１０Ｍ）を、ＣＨ２Ｃｌ２（１Ｌ）中に溶解した。テトラゾールジイソプロピルアミン（７．１ｇ）および亜リン酸２−シアノエトキシ−テトラ（イソプロピル）（４０．５ｍＬ、０．１２３Ｍ）を、窒素雰囲気下で攪拌しながら添加した。得られた混合物を、室温にて２０時間攪拌した（ＴＬＣにより、反応が９５％完了したことが示された）。反応混合物を、飽和ＮａＨＣＯ３（１×３００ｍＬ）および飽和ＮａＣｌ（３×３００ｍＬ）で抽出した。この水性洗浄液を、ＣＨ２Ｃｌ２（３００ｍＬ）で逆抽出し、その抽出物を合わせて、ＭｇＳＯ４で乾燥し、濃縮した。得られた残渣を、溶出溶媒としてＥｔＯＡｃ／ヘキサン（３：１）を使用して１．５ｋｇのシリカカラムでクロマトグラフィーにかけた。純粋画分を合わせて、９０．６ｇ（８７％）の標題化合物を得た。
【０２２４】
（２’−Ｏ−（アミノオキシエチル）ヌクレオシドアミダイトおよび２’−Ｏ−（ジメチルアミノオキシエチル）ヌクレオシドアミダイト）
（２’−（ジメチルアミノオキシエトキシ）ヌクレオシドアミダイト）
２’−（ジメチルアミノオキシエトキシ）ヌクレオシドアミダイト（当該分野で２’−Ｏ−（ジメチルアミノオキシエチル）ヌクレオシドアミダイトとしても公知）を、以下の段落に記載されるように調製する。アデノシン、シチジンおよびグアノシンのヌクレオシドアミダイトを、アデノシンおよびシチジンの場合には環外アミンをベンゾイル部分で保護し、グアノシンの場合にはイソブチリルで保護することを除いて、チミジン（５−メチルウリジン）と同様に調製する。
【０２２５】
（５’−Ｏ−ｔｅｒｔ−ブチルジフェニルシリル−Ｏ２−２’−無水−５−メチルウリジン）
Ｏ２−２’−無水−５−メチルウリジン（Ｐｒｏ．Ｂｉｏ．Ｓｉｎｔ．，Ｖａｒｅｓｅ，Ｉｔａｌｙ，１００．０ｇ、０．４１６ｍｍｏｌ）、ジメチルアミノピリジン（０．６６ｇ、０．０１３当量、０．００５４ｍｍｏｌ）を、機械的に攪拌しながらアルゴン雰囲気下で周囲温度にて乾燥ピリジン（５００ｍｌ）中に溶解した。ｔｅｒｔ−ブチルジフェニルクロロシラン（１２５．８ｇ、１１９．０ｍＬ、１．１当量、０．４５８ｍｍｏｌ）を一部添加した。その反応系を、周囲温度にて１６時間攪拌した。ＴＬＣ（Ｒｆ  ０．２２、酢酸エチル）により、完全な反応が示された。この溶液を、減圧下で濃オイルになるまで濃縮した。これを、ジクロロメタン（１Ｌ）と、飽和重炭酸ナトリウム（２×１Ｌ）と、ブライン（１Ｌ）との間で分配した。その有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、減圧下で濃オイルになるまで濃縮した。このオイルを、酢酸エチルとエチルエーテルの１：１混合物（６００ｍＬ）中に溶解し、この溶液を−１０℃まで冷却した。得られた結晶生成物を、濾過により回収し、エチルエーテル（３×２００ｍＬ）で洗浄し、１４９ｇ（７４．８％）の白色固体になるまで乾燥した（４０℃、１ｍｍＨｇ、２４時間）。ＴＬＣおよびＮＭＲは、純粋生成物と一致した。
【０２２６】
（５’−Ｏ−ｔｅｒｔ−ブチルジフェニルシリル−２’−Ｏ−（２−ヒドロキシエチル）−５−メチルウリジン）
２Ｌのステンレス鋼の攪拌されない圧力反応器中に、テトラヒドロフラン（１．０Ｍ、２．０当量、６２２ｍＬ）中のボランを添加した。換気フードにおいて、手動で攪拌しながら、まず、水素ガスの蒸発が静まるまでエチレングリコール（３５０ｍＬ、過剰）を慎重に添加した。５’−Ｏ−ｔｅｒｔ−ブチルジフェニルシリル−Ｏ２−２’−無水−５−メチルウリジン（１４９ｇ、０．３１１ｍｏｌ）および重炭酸ナトリウム（０．０７４ｇ、０．００３当量）を、手動で攪拌しながら添加した。反応器を封鎖し、内部温度が１６０℃に達するまで油浴中で加熱し、次いで、１６時間維持した（圧力＜１００ｐｓｉｇ）。この反応容器を周囲温度まで冷却し、開けた。ＴＬＣ（所望の生成物についてＲｆ  ０．６７およびａｒａ−Ｔ副生成物についてＲｆ  ０．８２、酢酸エチル）により、生成物の約７０％の変換が示された。さらなる副生成物形成を避けるために、反応を停止し、より極端な条件を、エチレングリコールを除去するために用いて、温水浴（４０〜１００℃）中、減圧下（１０〜１ｍｍＨｇ）で濃縮した（あるいは、一旦、低温での溶媒沸騰を行い、残りの溶液を、酢酸エチルと水との間で分配し得る。その生成物は、有機相中にある）。その残渣を、カラムクロマトグラフィー（２ｋｇのシリカゲル、１：１〜４：１の酢酸エチル−ヘキサン勾配）により精製した。適切な画分を合わせ、ストリッピングし（ｓｔｒｉｐ）、白色の砕けやすい泡沫（ｃｒｉｓｐ  ｆｏａｍ）（８４ｇ、５０％）、混入した出発物質（１７．４ｇ）および純粋な再利用可能な出発物質（２０ｇ）として生成物を乾燥した。出発物資、あまり純粋でない回収された出発物質に基づく収率は、５８％であった。ＴＬＣおよびＮＭＲは、９９％の純粋物質と一致した。
【０２２７】
（２’−Ｏ−（［２−フタルイミドオキシ）エチル］−５’−ｔ−ブチルジフェニルシリル−５−メチルウリジン）
５’−Ｏ−ｔｅｒｔ−ブチルジフェニルシリル−２’−Ｏ−（２−ヒドロキシエチル）−５−メチルウリジン（２０ｇ、３６．９８ｍｍｏｌ）を、トリフェニルホスフィン（１１．６３ｇ、４４．３６ｍｍｏｌ）およびＮ−ヒドロキシフタルイミド（７．２４ｇ、４４．３６ｍｍｏｌ）と混合した。次いで、これを、４０℃にて２日間、高減圧下で、Ｐ２Ｏ５で乾燥した。この反応混合物を、アルゴンでフラッシュし、乾燥ＴＨＦ（３６９．８ｍＬ、Ａｌｄｒｉｃｈ、しっかりした封鎖瓶）を添加して、透明な溶液を得た。ジエチル−アゾジカルボキシレート（６．９８ｍＬ、４４．３６ｍｍｏｌ）を、反応混合物に滴下した。添加速度を、得られた濃赤色の着色が、次の滴下の前にちょうど脱色されるように維持した。添加を完了した後、この反応系を４時間攪拌した。そのときまでには、ＴＬＣにより、反応の完了が示される（６０：４０の酢酸エチル：ヘキサン）。溶媒を、真空中でエバポレートした。得られた残渣を、フラッシュカラムに配置し、酢酸エチル：ヘキサン（６０：４０）で溶出して、２’−Ｏ−（［２−フタルイミドオキシ）エチル］−５’−ｔ−ブチルジフェニルシリル−５−メチルウリジンを白色泡沫（２１．８１９ｇ、８６％）として得た。
【０２２８】
（５’−Ｏ−ｔｅｒｔ−ブチルジフェニルシリル−２’−Ｏ−［（２−ホルムアドキシイミノオキシ（ｆｏｒｍａｄｏｘｉｍｉｎｏｏｘｙ））エチル］−５−メチルウリジン）
２’−Ｏ−（［２−フタルイミドオキシ）エチル］−５’−ｔ−ブチルジフェニルシリル−５−メチルウリジン（３．１ｇ、４．５ｍｍｏｌ）を、乾燥ＣＨ２Ｃｌ２（４．５ｍＬ）中に溶解し、メチルヒドラジン（３００ｍＬ、４．６４ｍｍｏｌ）を−１０℃〜０℃にて滴下した。１時間後、この混合物を濾過し、その濾液を、氷冷ＣＨ２Ｃｌ２で洗浄し、合わせた有機相を、水、ブラインで洗浄し、無水Ｎａ２ＳＯ４で乾燥した。この溶液を濃縮して、２’−Ｏ−（アミノオキシエチル）チミジンを得た。次いで、これを、ＭｅＯＨ（６７．５ｍＬ）中に溶解した。これに、ホルムアルデヒド（２０％水溶液、ｗ／ｗ、１．１当量）を添加し、得られた混合物を、１時間攪拌した。溶媒を、真空下で除去し；残渣をクロマトグラフィーにかけて、５’−Ｏ−ｔｅｒｔ−ブチルジフェニルシリル−２’−Ｏ−［（２−ホルムアドキシイミノオキシ）エチル］−５−メチルウリジンを白色泡沫（１．９５ｇ、７８％）として得た。
【０２２９】
（５’−Ｏ−ｔｅｒｔ−ブチルジフェニルシリル−２’−Ｏ−［Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノオキシエチル］−５−メチルウリジン）
５’−Ｏ−ｔｅｒｔ−ブチルジフェニルシリル−２’−Ｏ−［（２−ホルムアドキシイミノオキシ）エチル］−５−メチルウリジン（１．７７ｇ、３．１２ｍｍｏｌ）を、乾燥ＭｅＯＨ（３０．６ｍＬ）中の１Ｍ  ｐ−トルエンスルホン酸ピリジニウム（ＰＰＴＳ）の溶液に溶解した。シアノホウ化水素ナトリウム（０．３９ｇ、６．１３ｍｍｏｌ）を、１０℃にて不活性雰囲気下でこの溶液に添加した。この反応混合物を、１０℃にて１０分間攪拌した。その後、反応容器を氷浴から取り出し、室温にて２時間攪拌し、この反応系を、ＴＬＣ（ＣＨ２Ｃｌ２中の５％  ＭｅＯＨ）によりモニターした。ＮａＨＣＯ３水溶液（５％、１０ｍＬ）を添加し、酢酸エチル（２×２０ｍＬ）で抽出した。酢酸エチル相を、無水Ｎａ２ＳＯ４で乾燥し、乾燥するまでエバポレートした。残渣を、ＭｅＯＨ（３０．６ｍＬ）中の１Ｍ  ＰＰＴＳの溶液に溶解した。ホルムアルデヒド（２０％  ｗ／ｗ、３０ｍＬ、３．３７ｍｍｏｌ）を添加し、この反応混合物を、室温にて１０分間攪拌した。この反応混合物を、氷浴中で１０℃まで冷却し、シアノホウ化水素ナトリウム（０．３９ｇ、６．１３ｍｍｏｌ）を添加し、反応混合物を、１０℃にて１０分間攪拌した。１０分後、この反応混合物を、氷浴から取り出し、室温にて２時間攪拌した。この反応混合物に、５％  ＮａＨＣＯ３（２５ｍＬ）溶液を添加し、酢酸エチル（２×２５ｍＬ）で抽出した。酢酸エチル層を、無水Ｎａ２ＳＯ４で乾燥し、乾燥するまでエバポレートした。その得られた残渣を、フラッシュカラムクロマトグラフィーにより精製し、ＣＨ２Ｃｌ２中の５％  ＭｅＯＨで溶出して、５’−Ｏ−ｔｅｒｔ−ブチルジフェニルシリル−２’−Ｏ−［Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノオキシエチル］−５−メチルウリジンを白色泡沫（１４．６ｇ、８０％）として得た。
【０２３０】
（２’−Ｏ−（ジメチルアミノオキシエチル）−５−メチルウリジン）
トリエチルアミントリヒドロフルオリド（３．９１ｍＬ、２４．０ｍｍｏｌ）を、乾燥ＴＨＦおよびトリエチルアミン（１．６７ｍＬ、１２ｍｍｏｌ、乾燥、ＫＯＨで維持）中に溶解した。次いで、トリエチルアミン−２ＨＦのこの混合物を、５’−Ｏ−ｔｅｒｔ−ブチルジフェニルシラン−２’−Ｏ−［Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノオキシエチル］−５−メチルウリジン（１．４０ｇ、２．４ｍｍｏｌ）に添加し、室温にて２４時間攪拌した。反応系を、ＴＬＣ（ＣＨ２Ｃｌ２中の５％  ＭｅＯＨ）によりモニターした。溶媒を真空下で除去し、その残渣を、フラッシュカラムに配置し、ＣＨ２Ｃｌ２中の１０％  ＭｅＯＨで溶出して、２’−Ｏ−（ジメチルアミノオキシエチル）−５−メチルウリジン（７６６ｍｇ、９２．５％）を得た。
【０２３１】
（５’−Ｏ−ＤＭＴ−２’−Ｏ−（ジメチルアミノオキシエチル）−５−メチルウリジン）
２’−Ｏ−（ジメチルアミノオキシエチル）−５−メチルウリジン（７５０ｍｇ、２．１７ｍｍｏｌ）を、Ｐ２Ｏ５で、高い減圧下で４０℃にて一晩乾燥した。次いで、これを、無水ピリジン（２０ｍＬ）とともに同時エバポレートした。得られた残渣を、アルゴン雰囲気下でピリジン（１１ｍＬ）中に溶解した。４−ジメチルアミノピリジン（２６．５ｍｇ、２．６０ｍｍｏｌ）、４，４’−ジメトキシトリチルクロリド（８８０ｍｇ、２．６０ｍｍｏｌ）を、この混合物に添加し、この反応混合物を、出発物質のすべてがなくなるまで、室温にて攪拌した。ピリジンを真空下で除去し、その残渣を、クロマトグラフィーにかけ、ＣＨ２Ｃｌ２中の１０％  ＭｅＯＨ（数滴のピリジンを含有する）で溶出して、５’−Ｏ−ＤＭＴ−２’−Ｏ−（ジメチルアミノ−オキシエチル）−５−メチルウリジン（１．１３ｇ、８０％）を得た。
【０２３２】
（５’−Ｏ−ＤＭＴ−２’−Ｏ−（２−Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノオキシエチル）−５−メチルウリジン−３’−［（２−シアノエチル）−Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホルアミダイト］）
５’−Ｏ−ＤＭＴ−２’−Ｏ−（ジメチルアミノオキシエチル）−５−メチルウリジン（１．０８ｇ、１．６７ｍｍｏｌ）を、トルエン（２０ｍＬ）と同時エバポレートした。この残渣に、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルアミンテトラゾニド（０．２９ｇ、１．６７ｍｍｏｌ）を添加し、そして高い減圧下、４０℃で一晩、Ｐ２Ｏ５上で乾燥させた。次いで、この反応混合物を、無水アセトニトリル（８．４ｍＬ）に溶解し、そして２−シアノエチル−Ｎ，Ｎ，Ｎ１，Ｎ１−テトライソプロピルホスホルアミダイト（２．１２ｍＬ、６．０８ｍｍｏｌ）を添加した。この反応混合物を、周囲温度で、４時間、不活性雰囲気下で撹拌した。この反応の進行を、ＴＬＣ（ヘキサン：酢酸エチル  １：１）でモニタリングした。溶媒をエバポレートし、次いで、残渣を、酢酸エチル（７０ｍＬ）に溶解し、そして５％ＮａＨＣＯ３水溶液（４０ｍＬ）で洗浄した。酢酸エチル層を、無水Ｎａ２ＳＯ４で乾燥し、そして濃縮した。得られた残渣を、クロマトグラフィー（溶出液として酢酸エチル）にかけて、５’−Ｏ−ＤＭＴ−２’−Ｏ−（２−Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノオキシエチル）−５−メチルウリジン−３’−［（２−シアノエチル）−Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホルアミダイト］を泡状物として得た（１．０４ｇ、７４．９％）。
【０２３３】
（２’−（アミノオキシエトキシ）ヌクレオシドアミダイト）
２’−（アミノオキシエトキシ）ヌクレオシドアミダイト（２’−Ｏ−（アミノオキシエチル）ヌクレオシドアミダイトとしても当該分野で公知）を、以下のパラグラフにおいて記載するようにして調製する。アデノシンヌクレオシドアミダイト、シチジンヌクレオシドアミダイトおよびチミジンヌクレオシドアミダイトを、同じようにして調製する。
（Ｎ２−イソブチリル−６−Ｏ−ジフェニルカルバモイル−２’−Ｏ−（２−エチルアセチル）−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）グアノシン−３’−［（２−シアノエチル）−Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホルアミダイト］）
２’−Ｏ−アミノオキシエチルグアノシンアナログは、ジアミノプリンリボシドの選択的２’−Ｏ−アルキル化によって得られ得る。数グラム量のジアミノプリンリボシドを、Ｓｃｈｅｒｉｎｇ  ＡＧ（Ｂｅｒｌｉｎ）から購入して、少量の３’−Ｏ−異性体と共に、２’−Ｏ−（２−エチルアセチル）ジアミノプリンリボシドを提供し得る。２’−Ｏ−（２−エチルアセチル）ジアミノプリンリボシドを溶解し得、そしてアデノシンデアミナーゼを用いる処理によって、２’−Ｏ−（２−エチルアセチル）グアノシンに変換し得る（ＭｃＧｅｅ，Ｄ．Ｐ．Ｃ．，Ｃｏｏｋ，Ｐ．Ｄ．，Ｇｕｉｎｏｓｓｏ，Ｃ．Ｊ．，ＷＯ  ９４／０２５０１  Ａ１  ９４０２０３）。標準的な保護手順により、２’−Ｏ−（２−エチルアセチル）−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）グアノシンおよび２−Ｎ−イソブチリル−６−Ｏ−ジフェニルカルバモイル−２’−Ｏ−（２−エチルアセチル）−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）グアノシンを得、これらを還元して、２−Ｎ−イソブチリル−６−ジフェニルカルバモイル−２’−Ｏ−（２−ヒドロキシエチル）−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）グアノシンを提供し得る。上記のように、ヒドロキシル基を、Ｍｉｔｓｕｎｏｂｕ反応によってＮ−ヒドロキシフタルイミドで置換し得、そしてこの保護されたヌクレオシドを、従来どおり、亜リン酸化して、２−Ｎ−イソブチリル−６−Ｏ−ジフェニルカルバモイル−２’−Ｏ−（［２−フタルイミドキシ（ｐｈｔｈａｌｍｉｄｏｘｙ）］エチル）−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）グアノシン−３’−［（２−シアノエチル）−Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホルアミダイト］を得ることができる。
【０２３４】
（２’−ジメチルアミノエトキシエトキシ（２’−ＤＭＡＥＯＥ）ヌクレオシドアミダイト）
２’−ジメチルアミノエトキシエトキシヌクレオシドアミダイト（２’−Ｏ−ジメチルアミノエトキシエチル（すなわち、２’−Ｏ−ＣＨ２−Ｏ−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ２）２）または２’−ＤＭＡＥＯＥヌクレオシドアミダイトとしても当該分野で公知）を、以下のようにして調製する。他のヌクレオシドアミダイトも、同じようにして調製する。
【０２３５】
（２’−Ｏ−［２（２−Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノエトキシ）エチル］−５−メチルウリジン）
２［２−（ジメチルアミノ）エトキシ］エタノール（Ａｌｄｒｉｃｈ，６．６６ｇ，５０ｍｍｏｌ）を、１００ｍＬの容器（ｂｏｍｂ）中で撹拌しながら、ボランのテトラヒドロフラン溶液（１Ｍ，１０ｍＬ，１０ｍｍｏｌ）にゆっくりと添加する。この固体が溶解するにつれて、水素ガスが発生する。Ｏ２−，２’−アンヒドロ−５−メチルウリジン（１．２ｇ，５ｍｍｏｌ）および炭酸水素ナトリウム（２．５ｍｇ）を添加し、そしてこの容器を密閉し、油浴に入れ、そして１５５℃で２６時間加熱する。この容器を、室温まで冷却し、そして開ける。粗溶液を濃縮し、そして残渣を水（２００ｍＬ）とヘキサン（２００ｍＬ）との間で分配する。過剰のフェノールをヘキサン層に抽出する。水層を、酢酸エチル（３×２００ｍＬ）で抽出し、そして合わせた有機層を、水で１回洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、そして濃縮する。残渣を、１：２０のメタノール／塩化メチレン（これは２％のトリエチルアミンを含む）を溶出液として使用するシリカゲルカラムにかける。このカラムの画分を濃縮すると、無色の固体が形成され、これを回収して、表題化合物を白色固体として得る。
【０２３６】
（５’−Ｏ−ジメトキシトリチル−２’−Ｏ−［２（２−Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノエトキシ）−エチル）］−５−メチルウリジン）
無水ピリジン（８ｍＬ）中の０．５ｇ（１．３ｍｍｏｌ）の２’−Ｏ−［２（２−Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノ−エトキシ）エチル）］−５−メチルウリジンに、トリエチルアミン（０．３６ｍＬ）およびジメトキシトリチルクロリド（ＤＭＴ−Ｃｌ，０．８７ｇ、２当量）を添加し、１時間撹拌する。この反応混合物を、水（２００ｍＬ）に注ぎ入れ、そしてＣＨ２Ｃｌ２（２×２００ｍＬ）で抽出する。合わせたＣＨ２Ｃｌ２層を、飽和ＮａＨＣＯ３溶液で洗浄し、続いて、飽和ＮａＣｌ溶液で洗浄し、そして無水硫酸ナトリウムで乾燥する。溶媒をエバポレートし、続いて、ＭｅＯＨ：ＣＨ２Ｃｌ２：Ｅｔ３Ｎ（２０：１，ｖ／ｖ，１％のトリエチルアミンを含む）を使用するシリカゲルクロマトグラフィーにかけて、表題化合物を得る。
【０２３７】
（５’−Ｏ−ジメトキシトリチル−２’−Ｏ−［２（２−Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノエトキシ）エチル）］−５−メチルウリジン−３’−Ｏ−（シアノエチル−Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）ホスホルアミダイト）
ジイソプロピルアミノテトラゾリド（０．６ｇ）および２−シアノエトキシ−Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホルアミダイト（１．１ｍＬ、２当量）を、アルゴン雰囲気下で、ＣＨ２Ｃｌ２（２０ｍＬ）に溶解した５’−Ｏ−ジメトキシトリチル−２’−Ｏ−［２（２−Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノエトキシ）エチル）］−５−メチルウリジン（２．１７ｇ，３ｍｍｏｌ）の溶液に添加する。この反応混合物を、一晩撹拌し、そして溶媒をエバポレートする。得られた残渣を、酢酸エチルを溶出液として使用するシリカゲルフラッシュカラムクロマトグラフィーにより精製して、表題化合物を得る。
【０２３８】
（実施例２）
（オリゴヌクレオチドの合成）
非置換および置換のホスホジエステル（Ｐ＝Ｏ）オリゴヌクレオチドを、ヨウ素による酸化を用いる標準的なホスホルアミダイト化学を使用して、自動ＤＮＡ合成機（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓモデル３８０Ｂ）で合成する。
【０２３９】
ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）を、ホスファイト結合の段階的チオ化（ｔｈｉａｔｉｏｎ）のために、標準的な酸化ボトルをアセトニトリル中０．２Ｍの３Ｈ−１，２−ベンゾジチオール−３−オン１，１−ジオキシド溶液で置き換えた以外は、ホスホジエステルオリゴヌクレオチドと同様に合成する。このチオ化を待つ工程を、６８秒までのばし、続いてキャッピング工程を行った。ＣＰＧカラムからの切断および濃水酸化アンモニウム中での５５℃における脱ブロック化（１８時間）の後、このオリゴヌクレオチドを、２．５容量のエタノールを用いて２回、０．５ＭのＮａＣｌ溶液から沈殿させることにより精製した。ホスフィネートオリゴヌクレオチドを、米国特許第５，５０８，２７０号（本明細書中で参考として援用される）に記載されるようにして調製する。
【０２４０】
アルキルホスホネートオリゴヌクレオチドを、米国特許第４，４６９，８６３号（本明細書中で参考として援用される）に記載されるようにして調製する。
【０２４１】
３’−デオキシ−３’−メチレンホスホネートオリゴヌクレオチドを、米国特許第５，６１０，２８９号または同第５，６２５，０５０号（本明細書中で参考として援用される）に記載されるようにして調製する。
【０２４２】
ホスホルアミダイトオリゴヌクレオチドを、米国特許第５，２５６，７７５号または米国特許第５，３６６，８７８号（本明細書中で参考として援用される）に記載されるようにして調製する。
【０２４３】
アルキルホスホノチオエートオリゴヌクレオチドを、公開ＰＣＴ出願ＰＣＴ／ＵＳ９４／００９０２およびＰＣＴ／ＵＳ９３／０６９７６（それぞれ、ＷＯ  ９４／１７０９３およびＷＯ  ９４／０２４９９として公開されている）（本明細書中で参考として援用される）に記載されるようにして調製する。
【０２４４】
３’−デオキシ−３’−アミノホスホルアミデートオリゴヌクレオチドを、米国特許第５，４７６，９２５号（本明細書中で参考として援用される）に記載されるようにして調製する。
【０２４５】
ホスホトリエステルオリゴヌクレオチドを、米国特許第５，０２３，２４３号（本明細書中で参考として援用される）に記載されるようにして調製する。
【０２４６】
ボラノ（ｂｏｒａｎｏ）ホスフェートオリゴヌクレオチドを、米国特許第５，１３０，３０２号および同第５，１７７，１９８号（この両方は本明細書中で参考として援用される）に記載されるようにして調製する。
【０２４７】
（実施例３）
（オリゴヌクレオシドの合成）
メチレンメチルイミノ結合オリゴヌクレオシド（ＭＭＩ結合オリゴヌクレオシドとしても特定される）、メチレンジメチルヒドラゾ結合オリゴヌクレオシド（ＭＤＨ結合オリゴヌクレオシドとしても特定される）、およびメチレンカルボニルアミノ結合オリゴヌクレオシド（アミド−３結合オリゴヌクレオシドとしても特定される）、およびメチレンアミノカルボニル結合オリゴヌクレオシド（アミド−４結合オリゴヌクレオシドとしても特定される）、ならびに例えば、ＭＭＩ結合とＰ＝Ｏ結合またはＰ＝Ｓ結合とを交互に有する混合骨格化合物を、米国特許第５，３７８，８２５号、同第５，３８６，０２３号、同第５，４８９，６７７号、同第５，６０２，２４０号および同第５，６１０，２８９号（これら全ては本明細書中で参考として援用される）に記載されるようにして調製する。
【０２４８】
ホルムアセタール（ｆｏｒｍａｃｅｔａｌ）結合オリゴヌクレオシドおよびチオホルムアセタール結合オリゴヌクレオシドを、米国特許第５，２６４，５６２号および同第５，２６４，５６４号（本明細書中で参考として援用される）に記載されるようにして調製する。
【０２４９】
エチレンオキシド結合オリゴヌクレオシドを、米国特許第５，２２３，６１８号（本明細書中で参考として援用される）に記載されるようにして調製する。
【０２５０】
（実施例４）
（ＰＮＡの合成）
ペプチド核酸（ＰＮＡ）を、以下に言及される様々な手順のいずれかに従って調製する：Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ（ＰＮＡ）：Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ  ａｎｄ  Ｐｏｔｅｎｔｉａｌ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ  ＆  Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，１９９６，４，５−２３。これらをまた、米国特許第５，５３９，０８２号、同第５，７００，９２２号および同第５，７１９，２６２号（本明細書中で参考として援用される）に従って調製し得る。
【０２５１】
（実施例５）
（キメラオリゴヌクレオチドの合成）
本発明のキメラオリゴヌクレオチド、キメラオリゴヌクレオシドまたは混合オリゴヌクレオチド／オリゴヌクレオシドは、いくつかの異なるタイプのものであり得る。これらとしては、第１のタイプ（結合ヌクレオシドの「ギャップ」セグメントが、結合ヌクレオシドの５’「ウイング」セグメントと３’「ウイング」セグメントとの間に位置する）、および第２の「開放端」タイプ（ここで「ギャップ」セグメントは、オリゴマー化合物の３’末端または５’末端のいずれかに位置する）が挙げられる。第１のタイプのオリゴヌクレオチドは、「ギャップマー（ｇａｐｍｅｒ）」またはギャップオリゴヌクレオチドとしても当該分野で公知である。第２のタイプのオリゴヌクレオチドは、「ヘミマー（ｈｅｍｉｍｅｒ）」または「ウイングマー（ｗｉｎｇｍｅｒ）」としても当該分野で公知である。
【０２５２】
（［２’−Ｏ−Ｍｅ］−−［２’−デオキシ］−−［２’−Ｏ−Ｍｅ］キメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチド）
２’−Ｏ−アルキルホスホロチオエートオリゴヌクレオチドセグメントおよび２’−デオキシホスホロチオエートオリゴヌクレオチドセグメントを有するキメラオリゴヌクレオチドを、上記のように、Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓの自動ＤＮＡ合成機モデル３８０Ｂを使用して合成する。オリゴヌクレオチドを、ＤＮＡ部分については２’−デオキシ−５’−ジメトキシトリチル−３’−Ｏ−ホスホルアミダイトを、５’ウイングおよび３’ウイングについては５’−ジメトキシトリチル−２’−Ｏ−メチル−３’−Ｏ−ホスホルアミダイトを使用して、自動合成機を使用して合成する。標準的な合成サイクルを、テトラゾールおよび塩基の送達の後に待つ工程を６００ｓまでのばし、ＲＮＡについては４回、２’−Ｏ−メチルについては２回繰り返すことによって改変する。完全に保護されたオリゴヌクレオチドを、支持体から切断し、そしてホスフェート基を、３：１のアンモニア／エタノール中、室温で一晩脱保護し、次いで乾固するまで凍結乾燥する。室温で２４時間、メタノール性アンモニアで処理して、全ての塩基を脱保護し、サンプルを再び、乾固するまで凍結乾燥する。このペレットを、ＴＨＦ中１ＭのＴＢＡＦに、室温で２４時間再懸濁して、２’位を脱保護する。次いで、この反応を、１Ｍ  ＴＥＡＡでクエンチし、次いで、このサンプルを、ｒｏｔｏｖａｃによって２分の１の容量になるまで減らし、その後Ｇ２５サイズ排除カラムで脱塩する。次いで、回収したオリゴを、収率においては分光光度計によって、そして純度についてはキャピラリー電気泳動および質量分析法によって分析する。
【０２５３】
（［２’−Ｏ−（２−メトキシエチル）］−−［２’−デオキシ］−−［２’−Ｏ−（メトキシエチル）］キメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチド）
［２’−Ｏ−（２−メトキシエチル）］−−［２’−デオキシ］−−［２’−Ｏ−（メトキシエチル）］キメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドを、２’−Ｏ−メチルアミダイトの代わりに２’−Ｏ−（メトキシエチル）アミダイトを使用したこと以外は、２’−Ｏ−メチルキメラオリゴヌクレオチドについて上で記載された手順に従って調製した。
【０２５４】
（［２’−Ｏ−（２−メトキシエチル）ホスホジエステル］−−［２’−デオキシホスホロチオエート］−−［２’−Ｏ−（２−メトキシエチル）ホスホジエステル］キメラオリゴヌクレオチド）
［２’−Ｏ−（２−メトキシエチル）ホスホジエステル］−−［２’−デオキシホスホロチオエート］−−［２’−Ｏ−（メトキシエチル）ホスホジエステル］キメラオリゴヌクレオチドを、２’−Ｏ−メチルアミダイトの代わりに２’−Ｏ−（メトキシエチル）アミダイトを使用したこと以外は、２’−Ｏ−メチルキメラオリゴヌクレオチドについて上で記載された手順に従って調製する。ヨウ素を用いる酸化により、ホスホジエステルヌクレオチド間結合をキメラ構造のウイング部分内に形成し、そして３，Ｈ−１，２ベンゾジチオール−３−オン１，１ジオキシド（Ｂｅａｕｃａｇｅ試薬）を利用する硫黄化により、中心ギャップについてホスホロチオエートヌクレオチド間結合を生成する。
【０２５５】
他のキメラオリゴヌクレオチド、キメラオリゴヌクレオシドおよび混合キメラオリゴヌクレオチド／オリゴヌクレオシドを、米国特許第５，６２３，０６５号（本明細書中で参考として援用される）に従って合成する。
【０２５６】
（実施例６）
（オリゴヌクレオチドの単離）
オリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオシドを、制御型多孔質ガラスカラム（ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  ｐｏｒｅ  ｇｌａｓｓ  ｃｏｌｕｍｎ）（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）から切断し、５５℃で１８時間、濃水酸化アンモニウム中で脱ブロック化した後、このオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオシドを、２．５容量のエタノールを用いて２回、０．５ＭのＮａＣｌから沈殿させることにより精製する。合成されたオリゴヌクレオチドを、変性ゲルを用いるポリアクリルアミドゲル電気泳動により分析し、全長の少なくとも８５％の物質であると判断した。合成で得られたホスホロチオエート結合およびホスホジエステル結合の相対量を、３１Ｐ核磁気共鳴分光法によって定期的にチェックし、そしていくつかの研究のために、オリゴヌクレオチドを、Ｃｈｉａｎｇら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．１９９１，２６６，１８１６２−１８１７１に記載されるようにＨＰＬＣによって精製した。ＨＰＬＣで精製した物質について得られた結果は、ＨＰＬＣで精製していない物質について得られた結果と類似していた。
【０２５７】
（実施例７）
（オリゴヌクレオチドの合成−９６ウェルプレート様式）
オリゴヌクレオチドを、固相Ｐ（ＩＩＩ）ホスホルアミダイト化学によって、標準的な９６ウェル様式で同時に９６の配列を構築し得る自動合成機で合成した。ホスホジエステルヌクレオチド間結合を、水性ヨウ素を用いて酸化することによって得た。無水アセトニトリル中で、３，Ｈ−１，２ベンゾジチオール−３−オン−１，１ジオキシド（Ｂｅａｕｃａｇｅ試薬）を利用して硫黄化することによって、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合を生成した。標準的な塩基保護されたβ−シアノエチルジイソプロピルホスホルアミダイトを、商業的販売業者（例えば、ＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ，Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ、またはＰｈａｒｍａｃｉａ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）から購入した。非標準的なヌクレオシドを、公知の文献または特許方法によって合成する。これらを、塩基保護されたβ−シアノエチルジイソプロピルホスホルアミダイトとして利用する。
【０２５８】
オリゴヌクレオチドを、支持体から切断し、そして高温（５５〜６０℃）で１２〜１６時間、濃ＮＨ４ＯＨを使用して脱保護し、次いで遊離した生成物を減圧下で乾燥した。次いで、この乾燥した生成物を滅菌水に再懸濁して、マスタープレートを得、次いで、このプレートから、全ての分析プレートサンプルおよび試験プレートサンプルを、ロボット式ピペッターを利用して希釈する。
【０２５９】
（実施例８）
（オリゴヌクレオチドの分析−９６ウェルプレート様式）
各ウェル中のオリゴヌクレオチドの濃度を、サンプルの希釈およびＵＶ吸収分光法によって評価した。個々の生成物の全長完全性を、キャピラリー電気泳動（ＣＥ）によって、９６ウェル様式（Ｂｅｃｋｍａｎ  Ｐ／ＡＣＥＴＭ  ＭＤＱ）、または別々の調製されたサンプルについては、市販のＣＥ装置（例えば、Ｂｅｃｋｍａｎ  Ｐ／ＡＣＥＴＭ  ５０００，ＡＢＩ  ２７０）のいずれかで評価した。塩基および骨格の組成を、エレクトロスプレー質量分光法を利用する化合物の質量分析により確認した。全てのアッセイ試験プレートを、シングルチャネルロボット式ピペッターおよびマルチチャネルロボット式ピペッターを使用して、マスタープレートから希釈した。このプレート上の化合物の少なくとも８５％が、全長の少なくとも８５％である場合、プレートを許容可能であると判断した。
【０２６０】
（実施例９）
（細胞培養およびオリゴヌクレオチド処理）
標的核酸が、測定可能なレベルで存在している限り、標的核酸発現に対するアンチセンス化合物の効果を、種々の細胞型の任意のものにおいて試験し得る。これは、例えば、ＰＣＲまたはノーザンブロット分析を使用して、慣用的に決定され得る。以下の７個の細胞型を、例示目的のために示すが、選択された細胞型で標的が発現される限り、他の細胞型が慣用的に使用され得る。これは、当該分野で慣用的な方法（例えば、ノーザンブロット分析、リボヌクレアーゼ保護アッセイまたはＲＴ−ＰＣＲ）によって容易に決定され得る。
【０２６１】
（Ｔ−２４細胞）
ヒト移行細胞の膀胱癌細胞株Ｔ−２４を、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）（Ｍａｎａｓｓａｓ，ＶＡ）から入手した。Ｔ−２４細胞を、ＭｃＣｏｙの５Ａ基本完全培地（Ｇｉｂｃｏ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）（１０％ウシ胎仔血清（Ｇｉｂｃｏ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）、１００単位／ｍＬのペニシリン、および１００μｇ／ｍＬのストレプトマイシン（Ｇｉｂｃｏ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）を補充）中で慣用的に培養した。細胞が９０％のコンフルエンスに達したら、トリプシン処理および希釈によって、慣用的に継代した。ＲＴ−ＰＣＲ分析で使用するために、細胞を、９６ウェルプレート（Ｆａｌｃｏｎ−Ｐｒｉｍａｒｉａ  ＃３８７２）に、７０００細胞／ウェルの密度で播種した。
【０２６２】
ノーザンブロットまたは他の分析のために、細胞を、１００ｍｍまたは他の標準的組織培養プレート上に播種し、そして適切な容量の培地およびオリゴヌクレオチドを使用して同様に処理し得る。
【０２６３】
（Ａ５４９細胞）
ヒト肺癌細胞株Ａ５４９を、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）Ｍａｎａｓｓａｓ，ＶＡ）から入手した。Ａ５４９細胞を、ＤＭＥＭ基本培地（Ｇｉｂｃｏ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）（１０％ウシ胎仔血清（Ｇｉｂｃｏ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）、１００単位／ｍＬのペニシリン、および１００μｇ／ｍＬのストレプトマイシン（Ｇｉｂｃｏ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）を補充）中で、慣用的に培養した。細胞が９０％のコンフルエンスに達したら、トリプシン処理および希釈によって、慣用的に継代した。
【０２６４】
（ＮＨＤＦ細胞）：
ヒト新生児皮膚線維芽細胞（ＮＨＤＦ）を、Ｃｌｏｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ（Ｗａｌｋｅｒｓｖｉｌｌｅ、ＭＤ）から得た。ＮＨＤＦを、供給業者によって推奨されるように、補充された線維芽細胞増殖培地（Ｃｌｏｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ、Ｗａｌｋｅｒｓｖｉｌｌｅ、ＭＤ）中で慣用的に維持した。細胞を、供給業者によって推奨されるように、１０継代まで維持した。
【０２６５】
（ＨＥＫ細胞）：
ヒト胚性ケラチノサイト（ＨＥＫ）を、Ｃｌｏｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ（Ｗａｌｋｅｒｓｖｉｌｌｅ、ＭＤ）から得た。ＨＥＫを、供給業者によって推奨されるように処方した、ケラチノサイト増殖培地（Ｃｌｏｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ、Ｗａｌｋｅｒｓｖｉｌｌｅ、ＭＤ）において慣用的に維持した。細胞を、供給業者によって推奨されるように、１０継代まで慣用的に維持した。
【０２６６】
（ＨｅｐＧ２細胞）：
ヒト肝芽細胞腫細胞株ＨｅｐＧ２を、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（Ｍａｎａｓｓａｓ，ＶＡ）から得た。ＨｅｐＧ２細胞を、１０％ウシ胎仔血清、非必須アミノ酸、および１ｍＭピルビン酸ナトリウムを補充したＥａｇｌｅのＭＥＭ（Ｇｉｂｃｏ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ、ＭＤ）中で慣用的に培養した。細胞が、９０％コンフルエンスに達したら、トリプシン処理および希釈によって、慣用的に継代した。細胞を、ＲＴ−ＰＣＲ分析における使用のために７０００細胞／ウェルの密度で、９６ウェルプレート（Ｆａｌｃｏｎ−Ｐｒｉｍａｒｉａ  ＃３８７２）に播種した。
【０２６７】
ノーザンブロットまたは他の分析のために、細胞を、１００ｍｍまたは他の標準的組織培養プレート上に播種し、そして適切な容量の培地およびオリゴヌクレオチドを使用して同様に処理し得る。
【０２６８】
（ＡＭＬ１２細胞）
ＡＭＬ１２（αマウス肝臓１２）細胞株を、ＴＧＦαについてトランスジェニックであるマウス（ＣＤ１系統、系列ＭＴ４２）由来の肝細胞から樹立した。細胞を、０．００５ｍｇ／ｍｌインスリン、０．００５ｍｇ／ｍｌトランスフェリン、５ｎｇ／ｍｌセレン、および４０ｎｇ／ｍｌデキサメタゾンならびに９０％；１０％ウシ胎仔血清を含む、Ｄｕｌｂｅｃｃｏ改変Ｅａｇｌｅ培地とＨａｍのＦ１２培地との１：１混合物中で培養する。継代培養するために、使用済培地を除去し、そして０．２５％トリプシン、０．０３％ＥＤＴＡ溶液の新鮮培地を添加する。新鮮トリプシン溶液（１〜２ｍｌ）を添加し、そしてこの培養物を、細胞が剥がれるまで室温で静置する。
【０２６９】
細胞が９０％コンフルエンスに達したら、トリプシン処理および希釈によって、慣用的に継代した。細胞を、ＲＴ−ＰＣＲ分析における使用のために７０００細胞／ウェルの密度で、９６ウェルプレート（Ｆａｌｃｏｎ−Ｐｒｉｍａｒｉａ  ＃３８７２）に播種した。
【０２７０】
ノーザンブロットまたは他の分析のために、細胞を、１００ｍｍまたは他の標準的組織培養プレート上に播種し、そして適切な容量の培地およびオリゴヌクレオチドを使用して同様に処理し得る。
【０２７１】
（初代マウス肝細胞）
初代マウス肝細胞を、Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｒｉｖｅｒ  Ｌａｂｓ（Ｗｉｌｍｉｎｇｔｏｎ，ＭＡ）から購入したＣＤ−１マウスから調製し、そして１０％ウシ胎仔血清（Ｇｉｂｃｏ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ、ＭＤ）、２５０ｎＭデキサメタゾン（Ｓｉｇｍａ）、および１０ｎＭウシインスリン（Ｓｉｇｍａ）を補充したＨｅｐａｔｏｃｙｔｅ  Ａｔｔａｃｈｍｅｎｔ  Ｍｅｄｉａ（Ｇｉｂｃｏ）中で慣用的に培養した。細胞を、ＲＴ−ＰＣＲ分析における使用のために１００００細胞／ウェルの密度で、９６ウェルプレート（Ｆａｌｃｏｎ−Ｐｒｉｍａｒｉａ  ＃３８７２）に播種した。
【０２７２】
ノーザンブロットまたは他の分析のために、細胞を、ラット尾コラーゲン（２００μｇ／ｍＬ）（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ）でコートした１００ｍｍまたは他の標準的培養プレート上にプレーティングし、そして適切な容量の培地およびオリゴヌクレオチドを使用して同様に処理し得る。
【０２７３】
（Ｈｅｐ３Ｂ細胞）
ヒト肝細胞癌細胞株Ｈｅｐ３Ｂを、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（Ｍａｎａｓｓａｓ，ＶＡ）から入手した。Ｈｅｐ３Ｂ細胞を、１０％ウシ胎仔血清、Ｌ−グルタミンおよびピリドキシンヒドロクロリドを補充したＤｕｌｂｅｃｃｏｓ  ＭＥＭ高グルコース（Ｇｏｂｃｏ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）中で慣用的に培養した。９０％コンフルエントに達した場合に、細胞を、トリプシン化および希釈によって慣用的に継代させた。細胞を、ＲＴ−ＰＣＲ分析における使用のために、５０，０００細胞／ウェルの密度で、２４ウェルプレート（Ｆａｌｃｏｎ−Ｐｒｉｍａｒｉａ  ＃３８４６）に播種した。
【０２７４】
ノーザンブロット分析または他の分析のために、細胞を、１００ｍｍまたは他の標準的な組織培養プレート上に播種し得、適切な容積の培地およびオリゴヌクレオチドを使用して同様に処理し得る。
【０２７５】
（ウサギ初代肝細胞）
初代ウサギ肝細胞を、Ｉｎｖｉｔｒｏ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ（Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）から購入し、Ｄｕｌｂｅｃｃｏ改変Ｅａｇｌｅ培地（Ｇｉｂｃｏ）中で維持した。購入したときに、細胞を、ＲＴ−ＰＣＲにおいて使用するために、９６ウェルプレートに播種しており、それらはコンフルエントであった。
【０２７６】
ノーザンブロット分析または他の分析のために、細胞を、１００ｍｍまたは他の標準的な組織培養プレート上に播種し得、適切な容積の培地およびオリゴヌクレオチドを使用して同様に処理し得る。
【０２７７】
（ＨａＬａ細胞）
ヒト上皮細胞癌細胞株ＨａＬａを、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（Ｍａｎａｓｓａｓ，ＶＡ）から入手した。ＨａＬａ細胞を、１０％ウシ胎仔血清（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｃａｒｓｂａｄ，ＣＡ）を補充したＤｕｌｂｅｃｃｏｓ  ＭＥＭ高グルコース（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｃａｒｓｂａｄ，ＣＡ）中で慣用的に培養した。細胞を、ＲＴ−ＰＣＲ分析における使用のために、５０，０００細胞／ウェルの密度で、２４ウェルプレート（Ｆａｌｃｏｎ−Ｐｒｉｍａｒｉａ  ＃３８４６）に播種した。９０％コンフルエントに達した場合に、細胞を、トリプシン化および希釈によって慣用的に継代させた。細胞を、ＲＴ−ＰＣＲ分析における使用のために、５０，０００細胞／ウェルの密度で、９６ウェルプレート（Ｆａｌｃｏｎ−Ｐｒｉｍａｒｉａ  ＃３８７２）に播種した。ノーザンブロット分析または他の分析のために、細胞を、１００ｍｍまたは他の標準的な組織培養プレート上に播種し得、適切な容積の培地およびオリゴヌクレオチドを使用して同様に処理し得る。
【０２７８】
（ヒト乳房上皮細胞）
正常なヒト乳房上皮細胞（ＨＭＥＣ）を、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（Ｍａｎａｓｓａｓ，ＶＡ）から入手した。ＨＭＥＣを、１０％ウシ胎仔血清（Ｇｉｂｃｏ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）を補充したＤｕｌｂｅｃｃｏｓ  ＭＥＭ低グルコース（Ｇｉｂｃｏ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）中で慣用的に培養した。９０％コンフルエントに達した場合に、細胞を、トリプシン化および希釈によって慣用的に継代させた。細胞を、ＲＴ−ＰＣＲ分析における使用のために、７０００細胞／ウェルの密度で、９６ウェルプレート（Ｆａｌｃｏｎ−Ｐｒｉｍａｒｉａ  ＃３５３８７２，ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｅｄｆｏｒｄ，ＭＡ）に播種した。ノーザンブロット分析または他の分析のために、細胞を、１００ｍｍまたは他の標準的な組織培養プレート上に播種し得、適切な容積の培地およびオリゴヌクレオチドを使用して同様に処理し得る。
【０２７９】
（アンチセンス化合物での処理）
細胞が８０％コンフルエンスに達したときに、これらを、オリゴヌクレオチドで処理した。９６ウェルプレートで増殖された細胞に関して、ウェルを一度２００μＬ  ＯＰＴＩ−ＭＥＭＴＭ−１低血清培地（Ｇｉｂｃｏ  ＢＲＬ）で洗浄し、次いで、３．７５μｇ／ｍＬ  ＬＩＰＯＦＥＣＴＩＮＴＭ（Ｇｉｂｃｏ  ＢＲＬ）および所望の濃度のオリゴヌクレオチドを含む１３０μＬのＯＰＴＩ−ＭＥＭＴＭ−１で処理した。４〜７時間の処理後、培地を、新鮮な培地と置き換えた。細胞をオリゴヌクレオチド処理の１６〜２４時間後に収穫した。
【０２８０】
使用されるオリゴヌクレオチドの濃度は、細胞株間で異なる。特定の細胞株に対して最適なオリゴヌクレオチド濃度を決定するために、細胞を、ある範囲の濃度でポジティブコントロールオリゴヌクレオチドを用いて処理する。ヒト細胞について、ポジティブコントロールオリゴヌクレオチドは、ヒトＨ−ｒａｓを標的化するホスホロチオエート骨格を有する、ＩＳＩＳ  １３９２０、
【０２８１】
【化１】
2014087368.tif 000002
配列番号１、２’−Ｏ−メトキシエチルギャップマー（ｇａｐｍｅｒ）（２’−Ｏ−メトキシエチルが太字で示される））である。マウス細胞またはラット細胞について、ポジティブコントロールオリゴヌクレオチドは、マウスｃ−ｒａｆおよびラットｃ−ｒａｆの両方を標的とするホスホロチオエート骨格を有する、ＩＳＩＳ  １５７７０、
【０２８２】
【化２】
2014087368.tif 000003
配列番号２、２’−Ｏ−メトキシエチルギャップマー（２’−Ｏ−メトキシエチルが太字で示される）である。次いで、ｃ−Ｈａ−ｒａｓ  ｍＲＮＡ（ＩＳＩＳ  １３９２０に対して）またはｃ−ｒａｆ  ｍＲＮＡ（ＩＳＩＳ  １５７７０に対して）の８０％阻害を生じるポジティブコントロールオリゴヌクレオチドの濃度を、その細胞株についての、後の実験における新規オリゴヌクレオチドのスクリーニング濃度として利用する。８０％阻害に達しない場合、Ｈ−ｒａｓ  ｍＲＮＡまたはｃ−ｒａｆ  ｍＲＮＡの６０％阻害を生じるポジティブコントロールオリゴヌクレオチドの最低濃度を、その細胞株についての、後の実験におけるオリゴヌクレオチドスクリーニング濃度として利用する。６０％阻害が達成されない場合、その特定の細胞株を、オリゴヌクレオチドトランスフェクション実験に適さないとみなす。
【０２８３】
（実施例１０）
（アポリポタンパク質Ｂ発現のオリゴヌクレオチド阻害の分析）
アポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス調節を、当該分野で公知の種々の方法でアッセイし得る。例えば、アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルを、例えば、ノーザンブロット分析、競合的ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、またはリアルタイムＰＣＲ（ＲＴ−ＰＣＲ）によって定量し得る。リアルタイム定量的ＰＣＲが、ここでは好ましい。ＲＮＡ分析を、全細胞ＲＮＡまたはポリ（Ａ）＋ｍＲＮＡに対して実施し得る。ＲＮＡ単離の方法は、例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．ら，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，第１巻，４．１．１〜４．２．９頁および４．５．１〜４．５．３頁，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，１９９３に教示される。ノーザンブロット分析は、当該分野において慣用的であり、例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．ら，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，第１巻，４．２．１〜４．２．９頁，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，１９９６に教示される。リアルタイム定量的（ＰＣＲ）は、市販のＡＢＩ  ＰＲＩＳＭＴＭ  ７７００  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ｓｙｓｔｅｍ（ＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ，Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡから入手可能であり、そして製造業者の指示に従って使用される）を使用して簡便に達成し得る。
【０２８４】
アポリポタンパク質Ｂのタンパク質レベルは、当該分野で周知の種々の方法（例えば、免疫沈降法、ウェスタンブロット分析（イムノブロッティング）、ＥＬＩＳＡまたは蛍光細胞分析分離（ＦＡＣＳ））で定量し得る。アポリポタンパク質Ｂに対する抗体を、同定し、種々の供給源（例えば、ＭＳＲＳ抗体カタログ（Ａｅｒｉｅ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｂｉｒｍｉｎｇｈａｍ，ＭＩ））から入手し得るか、または従来の抗体産生方法によって調製し得る。ポリクローナル抗血清の調製のための方法は、例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．ら，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，第２巻，１１．１２．１〜１１．１２．９頁，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，１９９７に教示される。モノクローナル抗体の調製は、例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．ら，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，第２巻，１１．４．１〜１１．１１．５頁，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，１９９７に教示される。
【０２８５】
免疫沈降方法は、当該分野において標準的であり、そして例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．ら，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，第２巻，１０．１６．１〜１０．１６．１１頁，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，１９９８に見出され得る。ウェスタンブロット（イムノブロット）分析は、当該分野において標準的であり、そして例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．ら，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，第２巻，１０．８．１〜１０．８．２１頁，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，１９９７に見出され得る。酵素結合イムノソルベント検定法（ＥＬＩＳＡ）は、当該分野において標準的であり、そして例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．ら，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，第２巻，１１．２．１〜１１．２．２２頁，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，１９９１に見出され得る。
【０２８６】
（実施例１１）
（ポリ（Ａ）＋ｍＲＮＡ単離）
ポリ（Ａ）＋ｍＲＮＡを、Ｍｉｕｒａら，Ｃｌｉｎ．Ｃｈｅｍ，，１９９６，４２，１７５８−１７６４に従って単離した。ポリ（Ａ）＋ｍＲＮＡ単離のための他の方法は、例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．ら，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，第１巻，４．５．１〜４．５．３頁，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，１９９３に教示される。簡単に述べると、９６ウェルプレートで増殖された細胞について、増殖培地を、その細胞から除去し、そして各ウェルを、２００μＬの冷ＰＢＳで洗浄した。６０μＬの溶解緩衝液（１０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、ｐＨ７．６、１ｍＭ  ＥＤＴＡ、０．５Ｍ  ＮａＣｌ、０．５％  ＮＰ−４０、２０ｍＭ  バナジル−リボヌクレオシド複合体）を各ウェルに添加し、そのプレートを穏やかに攪拌し、次いで、室温で５分間インキュベートした。５５μＬの溶解物を、Ｏｌｉｇｏ  ｄ（Ｔ）コーティング済み９６ウェルプレート（ＡＧＣＴ  Ｉｎｃ．，Ｉｒｖｉｎｅ  ＣＡ）に移した。プレートを６０分間室温でインキュベートし、２００μＬの洗浄緩衝液（１０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、ｐＨ７．６、１ｍＭ  ＥＤＴＡ、０．３Ｍ  ＮａＣｌ）で３回洗浄した。最後の洗浄の後、プレートをペーパータオル上で吸い取らせて過剰な洗浄緩衝液を除去し、次いで、５分間風乾した。６０μＬの溶出緩衝液（５ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ  ｐＨ７．６）（７０℃まで予備加熱した）を、各ウェルに添加し、そのプレートを、９０℃のホットプレート上で５分間インキュベートし、次いで、その溶出物を、新しい９６ウェルプレートに移した。
【０２８７】
１００ｍｍプレート上または他の標準的なプレート上で増殖した細胞を、適切な容量の全ての溶液を使用して、同様に処理し得る。
【０２８８】
（実施例１２）
（全ＲＮＡ単離）
全ＲＮＡを、Ｑｉａｇｅｎ  Ｉｎｃ．（Ｖａｌｅｎｃｉａ，ＣＡ）から購入したＲＮＥＡＳＹ  ９６ＴＭキットおよび緩衝液を製造業者の推奨する手順に従って使用して、単離した。簡単に述べると、９６ウェルプレート上で増殖した細胞に対して、増殖培地を、その細胞から除去し、そして各ウェルを２００μＬの冷ＰＢＳで洗浄した。１００μＬの緩衝液ＲＬＴを各ウェルに添加し、そしてそのプレートを２０秒間激しく攪拌した。次いで、１００μＬの７０％エタノールを各ウェルに添加し、そして内容物を、３回ピペッティングして出し入れすることによって混合した。次いで、そのサンプルを、廃液収集トレイを備え減圧供給源に取り付けられたＱＩＡＶＡＣＴＭマニホルドに取り付けられた、ＲＮＥＡＳＹ９６ＴＭウェルプレートに移した。減圧を１５秒間適用した。１ｍＬの緩衝液ＲＷ１を、ＲＮＥＡＳＹ９６ＴＭプレートの各ウェルに添加し、そして再び減圧を１５秒間適用した。次いで、１ｍＬの緩衝液ＲＰＥをＲＮＥＡＳＹ９６ＴＭプレートの各ウェルに添加し、そして減圧を１５秒間適用した。次いで、緩衝液ＲＰＥ洗浄を繰り返し、そして減圧をさらに１０分間適用した。次いで、そのプレートをＱＩＡＶＡＣＴＭマニホルドから取り外し、そしてペーパータオル上にて吸い取らせて乾かした。次いで、そのプレートを、１．２ｍＬコレクションチューブを備えるコレクションチューブラックを備え付けたＱＩＡＶＡＣＴＭマニホルドに、再び取り付けた。次いで、各ウェルに６０μＬの水をピペッティングし、１分間インキュベートし、次いで、３０秒間減圧を適用することによって、ＲＮＡを溶出した。この溶出工程を、さらに６０μＬの水を用いて繰り返した。
【０２８９】
反復するこのピペッティング工程および溶出工程を、ＱＩＡＧＥＮ  Ｂｉｏ−Ｒｏｂｏｔ  ９６０４（Ｑｉａｇｅｎ，Ｉｎｃ．，Ｖａｌｅｎｃｉａ，ＣＡ）を使用して自動化し得る。基本的に、培養プレート上で細胞を溶解させた後、そのプレートをロボットデッキに移し、このロボットデッキにおいて、ピペッティング工程、ＤＮａｓｅ処理工程および溶出工程を実施する。
【０２９０】
（実施例１３）
（アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルのリアルタイム定量的ＰＣＲ分析）
アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの定量を、ＡＢＩ  ＰＲＩＳＭＴＭ  ７７００  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ｓｙｓｔｅｍ（ＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ，Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）を製造業者の指示に従って使用して、リアルタイム定量的ＰＣＲによって決定した。これは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）生成物をリアルタイムでハイスループット定量することを可能にする、閉鎖管式で非ゲルベースの蛍光検出システムである。ＰＣＲが完了した後に増幅生成物を定量する標準的なＰＣＲに対して、リアルタイム定量的ＰＣＲにおける生成物は、それらが蓄積するにつれて定量される。これは、順方向ＰＣＲプライマーと逆方向ＰＣＲプライマーとの間で特異的にアニールしかつ２つの蛍光色素を含むオリゴヌクレオチドプローブを、このＰＣＲ反応において含むことによって達成される。レポーター色素（例えば、Ｏｐｅｒｏｎ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ  Ｉｎｃ．，Ａｌａｍｅｄａ，ＣＡまたはＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ，Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡのいずれかから入手される、ＪＯＥ、ＦＡＭ、またはＶＩＣ）を、そのプローブの５’末端に結合させ、そしてクエンチャー色素（例えば、Ｏｐｅｒｏｎ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ  Ｉｎｃ．，Ａｌａｍｅｄａ，ＣＡまたはＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ，Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡのいずれかから入手される、ＴＡＭＲＡ）を、そのプローブの３’末端に結合させる。そのプローブおよび色素がインタクトである場合、レポーター色素発光は、３’クエンチャー色素が近いことにより、クエンチされる。増幅の間、そのプローブが標的配列にアニールすることによって、Ｔａｑポリメラーゼの５’エキソヌクレアーゼ活性によって切断され得る基質が、生成される。ＰＣＲ増幅サイクルの伸長期の間、Ｔａｑポリメラーゼによりそのプローブが切断されると、そのプローブの残りから（それ故、クエンチャー部分から）レポーター色素が遊離され、そして配列特異的蛍光シグナルが生成される。各サイクルに伴い、さらなるレポーター色素分子が、それらの個々のプローブから切断される。そしてその蛍光強度を、ＡＢＩ  ＰＲＩＳＭＴＭ７７００  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ｓｙｓｔｅｍに組み込まれたレーザーオプティクスによって、規則的間隔でモニターする。各アッセイにおいて、未処理のコントロールサンプル由来のｍＲＮＡの系列希釈物を含む一連の並行反応を使用して、試験サンプルのアンチセンスオリゴヌクレオチド処理後の阻害％を定量するために使用する標準曲線を作成する。
【０２９１】
定量的ＰＣＲ分析の前に、測定している標的遺伝子に特異的なプライマー−プローブセットを、そのセットがＧＡＰＤＨ増幅反応によって「多重化（ｍｕｌｔｉｐｌｅｘ）」される能力について評価する。多重化において、その標的遺伝子と内部標準遺伝子ＧＡＰＤＨとの両方が、単一のサンプル中で同時に増幅される。この分析において、未処理細胞から単離したｍＲＮＡを、系列希釈する。各希釈物を、ＧＡＰＤＨのみに特異的なプライマー−プローブセット、標的遺伝子のみに特異的なプライマー−プローブセット（「一重化（ｓｉｎｇｌｅ−ｐｌｅｘｉｎｇ）」）、または両方に特異的なプライマー−プローブセット（多重化）の存在下で増幅する。ＰＣＲ増幅に続いて、希釈の関数としてのＧＡＰＤＨ  ｍＲＮＡシグナルおよび標的ｍＲＮＡシグナルの標準曲線を、一重化サンプルおよび多重化サンプルの両方から作成する。多重化サンプルから作成したＧＡＰＤＨシグナルおよび標的シグナルの傾きおよび補正係数の両方が、一重化サンプルから作成したそれらの対応する値の１０％以内に入る場合、その標的に特異的なプライマー−プローブセットは、多重化可能であるとみなされる。他のＰＣＲ方法もまた、当該分野において公知である。
【０２９２】
ＰＣＲ試薬を、ＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ，Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡから得た。２５μＬ  ＰＣＲカクテル（１×ＴＡＱＭＡＮＴＭ緩衝液Ａ、５．５ｍＭ  ＭｇＣｌ２、３００μＭのｄＡＴＰ、３００μＭのｄＣＴＰおよび３００μＭのｄＧＴＰ、６００μＭのｄＵＴＰ、１００ｎＭの順方向プライマー、１００ｎＭの逆方向プライマー、および１００ｎＭのプローブ、２０単位のＲＮＡｓｅインヒビター、１．２５単位のＡＭＰＬＩＴＡＱ  ＧＯＬＤＴＭ、および１２．５単位のＭｕＬＶ逆転写酵素）を、９６ウェルプレート（２５μＬの全ＲＮＡ溶液を含む）に添加することによって、ＲＴ−ＰＣＲ反応を行った。このＲＴ反応を、４８℃で３０分間インキュベーションすることによって、実行した。ＡＭＰＬＩＴＡＱ  ＧＯＬＤＴＭを活性化するために９５℃で１０分間インキュベーションした後、４０サイクルの２工程ＰＣＲプロトコルを実行した。この２工程ＰＣＲプロトコルは、９５℃にて１５秒間（変性）、その後、６０℃にて１．５分間（アニーリング／伸長）であった。
【０２９３】
リアルタイムＲＴ−ＰＣＲによって得られる遺伝子標的量を、ＧＡＰＤＨの発現レベル（この遺伝子の発現は一定である）を使用すること、またはＲｉｂｏＧｒｅｅｎＴＭ（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｐｒｏｂｅｓ，Ｉｎｃ．Ｅｕｇｅｎｅ，ＯＲ）を使用して全ＲＮＡを定量することのいずれかによって、正規化する。ＧＡＰＤＨ発現を、標的と同時に実施するか、多重化するか、または別々に実施することによって、リアルタイムＲＴ−ＰＣＲによって定量する。全ＲＮＡを、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  ＰｒｏｂｅｓからのＲｉｂｏＧｒｅｅｎＴＭＲＮＡ定量試薬を使用して定量する。ＲｉｂｏＧｒｅｅｎＴＭによるＲＮＡ定量の方法は、Ｊｏｎｅｓ，Ｌ．Ｊ．ら，Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，１９９８，２６５，３６８−３７４に教示される。
【０２９４】
このアッセイにおいて、１７５μＬのＲｉｂｏＧｒｅｅｎＴＭ作業試薬（１０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、１ｍＭ  ＥＤＴＡ、ｐＨ７．５中で、１：２８６５に希釈したＲｉｂｏＧｒｅｅｎＴＭ試薬）を、２５μＬの精製細胞ＲＮＡを含む９６ウェルプレートにピペッティングする。このプレートを、４８０ｎｍでの励起および５２０ｎｍでの発光を用いてＣｙｔｏＦｌｕｏｒ  ４０００（ＰＥ  Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）で読み取る。
【０２９５】
ヒトアポリポタンパク質Ｂに対するプローブおよびプライマーを、公開された配列情報（ＧｅｎＢａｎｋ登録番号ＮＭ ０００３８４（本明細書中において、配列番号３として援用される））を使用して、ヒトアポリポタンパク質Ｂ配列にハイブリダイズするように設計した。ヒトアポリポタンパク質Ｂについて、そのＰＣＲプライマーは、
【０２９６】
【化３】
2014087368.tif 000004
であり、そしてそのＰＣＲプローブは、
【０２９７】
【化４】
2014087368.tif 000005
（配列番号６）であった。ここで、ＦＡＭ（ＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）は、蛍光レポーター色素であり、そしてＴＡＭＲＡ（ＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）は、クエンチャー色素である。ヒトＧＡＰＤＨについて、そのＰＣＲプライマーは：
【０２９８】
【化５】
2014087368.tif 000006
であり、そしてそのＰＣＲプローブは：
【０２９９】
【化６】
2014087368.tif 000007
（配列番号９）であった、ここで、ＪＯＥ（ＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）は、蛍光レポーター色素であり、そしてＴＡＭＲＡ（ＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）は、クエンチャー色素である。
【０３００】
マウスアポリポタンパク質Ｂに対するプローブおよびプライマーを、公開された配列情報（ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｍ３５１８６（本明細書中において、配列番号１０として援用される））を使用して、マウスアポリポタンパク質Ｂ配列にハイブリダイズするように設計した。マウスアポリポタンパク質Ｂについて、そのＰＣＲプライマーは：
【０３０１】
【化７】
2014087368.tif 000008
であり、そしてＰＣＲプローブは：
【０３０２】
【化８】
2014087368.tif 000009
（配列番号１３）であった。ここで、ＦＡＭ（ＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）は、蛍光レポーター色素であり、そしてＴＡＭＲＡ（ＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）は、クエンチャー色素である。マウスＧＡＰＤＨについて、そのＰＣＲプライマーは：
【０３０３】
【化９】
2014087368.tif 000010
であり、そしてそのＰＣＲプローブは、
【０３０４】
【化１０】
2014087368.tif 000011
であった。ここで、ＪＯＥ（ＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）は、蛍光レポーター色素であり、そしてＴＡＭＲＡ（ＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）は、クエンチャー色素である。
【０３０５】
（実施例１４）
（アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルのノーザンブロット分析）
アンチセンス処理の１８時間後、細胞単層を、冷ＰＢＳで２回洗浄し、そして１ｍＬ  ＲＮＡＺＯＬＴＭ（ＴＥＬ−ＴＥＳＴ  ”Ｂ”  Ｉｎｃ．，Ｆｒｉｅｎｄｓｗｏｏｄ，ＴＸ）中に溶解させた。全ＲＮＡを、製造業者の推奨するプロトコルに従って、調製した。２０μｇの全ＲＮＡを、ＭＯＰＳ緩衝液系（ＡＭＲＥＳＣＯ，Ｉｎｃ．Ｓｏｌｏｎ，ＯＨ）を使用して、１．１％ホルムアルデヒドを含む１．２％アガロースゲルを通す電気泳動によって分画した。ＲＮＡを、ノーザン／サザントランスファー緩衝液系（ＴＥＬ−ＴＥＳＴ  ”Ｂ”  Ｉｎｃ．，Ｆｒｉｅｎｄｓｗｏｏｄ，ＴＸ）を使用する一晩のキャピラリートランスファーによって、そのゲルからＨＹＢＯＮＤＴＭ−Ｎ＋ナイロン膜（Ａｍｅｒｓｈａｍ  Ｐｈａｒｍａｃｉａ  Ｂｉｏｔｅｃｈ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）に移した。ＲＮＡトランスファーを、ＵＶ可視化によって確認した。膜を、ＳＴＲＡＴＡＬＩＮＫＥＲＴＭ  ＵＶ  Ｃｒｏｓｓｌｉｎｋｅｒ  ２４００（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ，Ｉｎｃ，Ｌａ  Ｊｏｌｌａ，ＣＡ）を使用するＵＶ架橋によって固定し、次いで、ストリンジェントな条件についての製造業者の推奨を使用して、ＱＵＩＣＫＨＹＢＴＭハイブリダイゼーション溶液（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ，Ｌａ  Ｊｏｌｌａ，ＣＡ）を使用してプロービングした。
【０３０６】
ヒトアポリポタンパク質Ｂを検出するために、ヒトアポリポタンパク質Ｂ特異的プローブを、
【０３０７】
【化１１】
2014087368.tif 000012
を使用するＰＣＲによって、調製した。ローディング効率およびトランスファー効率における変動を正規化するために、膜をストリッピングし、そしてヒトグリセルアルデヒド−３−リン酸デヒドロゲナーゼ（ＧＡＰＤＨ）ＲＮＡ（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ，Ｐａｌｏ  Ａｌｔｏ，ＣＡ）についてプロービングした。
【０３０８】
マウスアポリポタンパク質Ｂを検出するために、ヒトアポリポタンパク質Ｂ特異的プローブを、
【０３０９】
【化１２】
2014087368.tif 000013
を使用するＰＣＲによって、調製した。ローディング効率およびトランスファー効率における変動を正規化するために、膜をストリッピングし、そしてマウスグリセルアルデヒド−３−リン酸デヒドロゲナーゼ（ＧＡＰＤＨ）ＲＮＡ（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ，Ｐａｌｏ  Ａｌｔｏ，ＣＡ）についてプロービングした。
【０３１０】
ハイブリダイズした膜を、ＰＨＯＳＰＨＯＲＩＭＡＧＥＲＴＭおよびＩＭＡＧＥＱＵＡＮＴＴＭ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ  Ｖ３．３（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｙｎａｍｉｃｓ，Ｓｕｎｎｙｖａｌｅ，ＣＡ）を使用して可視化し、そして定量した。データを、未処理コントロールにおけるＧＡＰＤＨレベルに対して正規化した。
【０３１１】
（実施例１５）
（２’−ＭＯＥウィングとデオキシギャップとを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによる、ヒトアポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害）
本発明に従って、公開された配列（ＧｅｎＢａｎｋ登録番号ＮＭ＿０００３８４（本明細書中で配列番号３として援用される）を使用して、ヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡの異なる領域を標的とするように、一連のオリゴヌクレオチドを設計した。それらのオリゴヌクレオチドを表１に示す。「標的部位」とは、そのオリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上で最初の（最も５’側の）ヌクレオチド番号を示す。表１におけるすべての化合物が、２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（「ギャップマー（ｇａｐｍｅｒ）」）であり、これは、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中心「ギャップ」領域と、それに両方の側（５’方向および３’方向）で隣接する５ヌクレオチドの「ウィング（ｗｉｎｇ）」から構成されている。このウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成されている。ヌクレオシド間（骨格）結合は、そのオリゴヌクレオチド全体にわたってホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）結合である。シチジン残基はすべて５’−メチルシチジンである。これらの化合物を、ＨｅｐＧ２細胞におけるヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する効果について、本明細書中の他の実施例に記載されるような定量的リアルタイムＰＣＲによって分析した。データは、２回の実験からの平均である。「Ｎ．Ｄ．」が存在する場合、それは「データなし」を示す。
【０３１２】
（表１）
（２’−ＭＯＥウィングとデオキシギャップとを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害）
【０３１３】
【表１−１】
2014087368.tif 000014
【０３１４】
【表１−２】
2014087368.tif 000015
表１に示されるように、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号３１、配列番号３８、配列番号４３、配列番号４６、配列番号５１、配列番号５２、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号６２、配列番号６３、および配列番号６６は、このアッセイにおいてヒトアポリポタンパク質Ｂ発現の少なくとも３０％の阻害を示した。従って、これらの配列が好ましい。これらの好ましい配列が相補的である標的部位は、本明細書中において「活性部位」と呼ばれており、従って、本発明の化合物により標的化される好ましい部位である。アポリポタンパク質Ｂは、哺乳動物において２つの形態（ＡｐｏＢ−４８およびＡｐｏＢ−１００）で存在し、これらの形態は、アミノ末端が共直線性であるので、ヌクレオチド１〜６５３０を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、両方の形態にハイブリダイズし、一方、ヌクレオチド６５３１〜１４１２１を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、アポリポタンパク質Ｂの長い方の形態に特異的である。
【０３１５】
（実施例１６）
（２’−ＭＯＥウィング（ｗｉｎｇ）とデオキシギャップとを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害−用量応答研究）
本発明に従って、実施例１５におけるアンチセンスオリゴヌクレオチドの部分集合を、用量応答研究においてさらに調査した。処理用量は、５０ｎＭ、１５０ｎＭおよび２５０ｎＭであった。これらの化合物を、ＨｅｐＧ２細胞におけるヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する効果について、本明細書中の他の実施例に記載されるような定量的リアルタイムＰＣＲによって分析した。データは、２回の実験からの平均であり、そのデータを表２に示す。
【０３１６】
（表２）
（２’−ＭＯＥウィングとデオキシギャップとを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害）
【０３１７】
【表２】
2014087368.tif 000016
（実施例１７）
（２’−ＭＯＥウィングとデオキシギャップとを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるマウスアポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害）
本発明に従って、公開された配列（ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｍ３５１８６（本明細書中で配列番号１０として援用される）を使用して、マウスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡの異なる領域を標的とする、一連のオリゴヌクレオチドを設計した。それらのオリゴヌクレオチドを表３に示す。「標的部位」とは、そのオリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上で最初の（最も５’側の）ヌクレオチド番号を示す。表３におけるすべての化合物が、２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（「ギャップマー（ｇａｐｍｅｒ）」）であり、これは、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中心「ギャップ」領域と、それに両方の側（５’方向および３’方向）で隣接する５ヌクレオチドの「ウィング（ｗｉｎｇ）」から構成されている。このウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成されている。ヌクレオシド間（骨格）結合は、そのオリゴヌクレオチド全体にわたってホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）結合である。シチジン残基はすべて５’−メチルシチジンである。これらの化合物を、初代肝細胞におけるマウスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する効果について、本明細書中の他の実施例に記載されるような定量的リアルタイムＰＣＲによって分析した。データは、２回の実験からの平均である。「Ｎ．Ｄ．」が存在する場合、それは「データなし」を示す。
【０３１８】
（表３）
（２’−ＭＯＥウィングとデオキシギャップとを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるマウスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害）
【０３１９】
【表３−１】
2014087368.tif 000017
【０３２０】
【表３−２】
2014087368.tif 000018
表３に示されるように、配列番号７１、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８、配列番号８１、配列番号８３、配列番号８４、配列番号８７、配列番号８８、配列番号９０、配列番号１０１、配列番号１０２、配列番号１０３、配列番号１０９、配列番号１１１、配列番号１１４、配列番号１１５、配列番号１１６、配列番号１１７、配列番号１１８、配列番号１１９、配列番号１２０および配列番号１２１は、このアッセイにおいてマウスアポリポタンパク質Ｂ発現の少なくとも５０％の阻害を示した。従って、これらの配列が好ましい。これらの好ましい配列が相補的である標的部位は、本明細書中において「活性部位」と呼ばれており、従って、本発明の化合物により標的化される好ましい部位である。
【０３２１】
（実施例１８）
（２’−ＭＯＥウィングとデオキシギャップとを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるマウスアポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害−用量応答研究）
本発明に従って、実施例１７におけるアンチセンスオリゴヌクレオチドの部分集合を、用量応答研究においてさらに調査した。処理用量は、５０ｎＭ、１５０ｎＭおよび３００ｎＭであった。これらの化合物を、初代肝細胞におけるヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する効果について、本明細書中の他の実施例に記載されるような定量的リアルタイムＰＣＲによって分析した。データは、２回の実験からの平均であり、そのデータを表４に示す。
【０３２２】
（表４）
（２’−ＭＯＥウィングとデオキシギャップとを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるマウスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害）
【０３２３】
【表４】
2014087368.tif 000019
（実施例１９）
（アポリポタンパク質Ｂタンパク質レベルのウェスタンブロット分析）
ウェスタンブロット分析（イムノブロット分析）を、標準的方法を使用して行った。細胞をオリゴヌクレオチド処理の１６〜２０時間後に採集し、ＰＢＳで１回洗浄し、Ｌａｅｍｍｌｉ緩衝液（１００μｌ／ウェル）中に懸濁し、５分間沸騰させ、そして１６％  ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲル上にローディングした。ゲルを１５０Ｖにて１．５時間泳動させ、そしてウェスタンブロッティング用の膜にトランスファーした。アポリポタンパク質Ｂに対する適切な一次抗体を、その一次抗体種に対する放射標識二次抗体または蛍光標識二次抗体とともに使用した。バンドを、ＰＨＯＳＰＨＯＲＩＭＡＧＥＲＴＭ（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｙｎａｍｉｃｓ，Ｓｕｎｎｙｖａｌｅ  ＣＡ）を使用して可視化した。
【０３２４】
（実施例２０）
（Ｃ５７ＢＬ／６マウスにおけるアポリポタンパク質Ｂ（ＩＳＩＳ  １４７７６４）のアンチセンス阻害の効果：やせた動物対高脂肪食動物）
高脂血症誘導性アテローム性動脈硬化症性プラーク形成に対して感受性であると報告されている系統であるＣ５７ＢＬ／６マウスを、以下の研究において使用して、やせたマウス対高脂肪食マウスにおける潜在的脂質減少化合物としてのアンチセンスオリゴヌクレオチドを評価した。
【０３２５】
雄性Ｃ５７ＢＬ／６マウスを、２つの同等の群（（１）野生型コントロールマウス（やせた動物）および（２）高脂肪食（６０％  ｋｃａｌ脂肪）を与えられる動物）に分割した。コントロール動物には、生理食塩水処理を与え、そして通常の齧歯類用食餌にて維持した。一晩絶食させた後、各群からのマウスに、生理食塩水または５０ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）を３日間ごとに６週間、腹腔内投与した。研究の終了時に、最後の注射の４８時間後に、動物を屠殺し、肝臓中の標的ｍＲＮＡレベル、コレステロールレベルおよびトリグリセリドレベル、肝臓酵素レベルおよび血清中グルコースレベルについて評価した。
【０３２６】
この比較研究の結果を、表５に示す。
【０３２７】
（表５）
（やせたマウスおよび高脂肪マウスにおける、アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベル、コレステロールレベル、脂質レベル、トリグリセリドレベル、肝臓酵素レベルおよびグルコースレベルに対するＩＳＩＳ  １４７７６４処理の効果）
【０３２８】
【表５】
2014087368.tif 000020
ＩＳＩＳ  １４７７６４による処理が、やせたマウスおよび高脂肪マウスの両方において、コレステロールならびにＬＤＬリポタンパク質およびＨＤＬリポタンパク質ならびに血清中グルコールを低下させたこと、ならびに示された効果が、実際には、ｍＲＮＡレベルの減少により支持されるアポリポタンパク質Ｂ発現の阻害に起因することが、これらのデータから明らかである。肝臓酵素レベルの有意な変化は観察されなかった。このことは、このアンチセンスオリゴヌクレオチドが、いずれの処理群に対しても毒性ではなかったことを示す。
【０３２９】
（実施例２１）
（高脂肪食マウスに対するアポリポタンパク質Ｂ（ＩＳＩＳ  １４７７６４）のアンチセンス阻害効果；６週間時間経過研究）
本発明に従って、６週間の時間経過研究を実施して、高脂肪食マウスにおける脂質代謝およびグルコース代謝に対するＩＳＩＳ  １４７７６４の効果をさらに調査した。
【０３３０】
高脂肪食（６０％  ｋｃａｌ脂肪）を与えた雄性Ｃ５７ＢＬ／６マウス（ｎ＝８）を、アンチセンスオリゴヌクレオチド（ＩＳＩＳ  １４７７６４）による処理の効果について６週間の時間経過にわたって評価した。コントロール動物には、生理食塩水処理（５０ｍｇ／ｋｇ）を与えた。動物の部分集合に、１日経口用量（２０ｍｇ／ｋｇ）のアトロバスタチンカルシウム（Ｌｉｐｉｔｏｒ（登録商標），Ｐｆｉｚｅｒ  Ｉｎｃ．）を与えた。すべてのマウス（アトロバスタチン処理動物を除く）に、一晩絶食させた後に、５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、２５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、５０ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）または生理食塩水（５０ｍｇ／ｋｇ）を、３日間ごと（１週間に２回）に６週間、腹腔内投与した。血清中コレステロールおよびリポタンパク質を、０週間目、２週間目、および６週間目の暫定時点にて分析した。研究終了時に、最後の注射の４８時間後に動物を屠殺し、そして肝臓中の標的ｍＲＮＡレベル、コレステロールレベル、リポタンパク質レベル、トリグリセリドレベル、肝臓酵素（ＡＳＴおよびＡＬＴ）レベルおよび血清中グルコースレベル、ならびに体重、肝臓重量、脾臓重量および脂肪パッド重量について評価した。
【０３３１】
（実施例２２）
（高脂肪食マウスにおけるアポリポタンパク質Ｂ（ＩＳＩＳ  １４７７６４）のアンチセンス阻害の効果−肝臓におけるｍＲＮＡ発現）
高脂肪食（６０％  ｋｃａｌ脂肪）を与えた雄Ｃ５７ＢＬ／６マウス（ｎ＝８）を、ｍＲＮＡ発現に対するＩＳＩＳ  １４７７６４の効果について６週間の時間経過にわたって評価した。コントロール動物には、生理食塩水処理（５０ｍｇ／ｋｇ）を与えた。マウスに、一晩絶食させた後に、５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、２５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、５０ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）または生理食塩水（５０ｍｇ／ｋｇ）を、３日間ごと（１週間に２回）に６週間、腹腔内投与した。研究終了時に、最後の注射の４８時間後に動物を屠殺し、そして肝臓中の標的ｍＲＮＡレベルについて評価した。ＩＳＩＳ  １４７７６４は、５ｍｇ／ｋｇ用量、２５ｍｇ／ｋｇ用量、および５０ｍｇ／ｋｇ用量において、ｍＲＮＡレベルをそれぞれ１５％、７５％、および８８％減少させる、用量応答効果を示した。
【０３３２】
処置期間の終わりに収集した肝臓タンパク質サンプルを、マウスアポリポタンパク質Ｂ（Ｇｌａｎｄｓｔｏｎｅ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ，Ｓａｎ  Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）に指示された抗体を使用する免疫ブロット分析に供した。これらのデータは、ＩＳＩＳ  １４７７６４での処置が、ｍＲＮＡレベルを減少させることに加えて、肝臓中のアポリポタンパク質Ｂの発現を、用量依存性の様式で減少させることを実証する。
【０３３３】
（実施例２３）
（血清中コレステロールレベルおよびトリグリセリドレベルに対するアポリポタンパク質Ｂ（ＩＳＩＳ  １４７７６４）のアンチセンス阻害の効果）
高脂肪食（６０％  ｋｃａｌ脂肪）を与えた雄Ｃ５７ＢＬ／６マウス（ｎ＝８）を、血清中コレステロールレベルおよびトリグリセリドレベルに対するＩＳＩＳ  １４７７６４の効果について６週間の時間経過にわたって評価した。コントロール動物には、生理食塩水処理（５０ｍｇ／ｋｇ）を与えた。マウスに、一晩絶食させた後に、５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、２５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、５０ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）または生理食塩水（５０ｍｇ／ｋｇ）を、３日間ごと（１週間に２回）に６週間、腹腔内投与した。
【０３３４】
血清中コレステロールレベルを、０週間目、２週間目、および６週間目に測定した。このデータを表６に示す。この表の値は、阻害パーセントとして表されており、生理食塩水コントロールに対して正規化されている。
【０３３５】
血清中コレステロールに加えて、研究終了時に、最後の注射の４８時間後に動物を屠殺し、そしてトリグリセリドレベルについて評価した。
【０３３６】
ＩＳＩＳ  １４７７６４により処理したマウスは、研究終了までに、正常レベルに対して、血清中コレステロール（コントロール動物について２４０ｍｇ／ｄＬ、そして５ｍｇ／ｋｇ用量、２５ｍｇ／ｋｇ用量、および５０ｍｇ／ｋｇ用量について、それぞれ２２５ｍｇ／ｄＬ、１２５ｍｇ／ｄＬおよび１１０ｍｇ／ｄＬ）ならびにトリグリセリド（コントロール動物について１１５ｍｇ／ｄＬ、そして５ｍｇ／ｋｇ用量、２５ｍｇ／ｋｇ用量、および５０ｍｇ／ｋｇ用量について、それぞれ１２５ｍｇ／ｄＬ、１５０ｍｇ／ｄＬおよび８５ｍｇ／ｄＬ）の両方の減少を示した。これらのデータを、２０ｍｇ／ｋｇ経口用量でのアトロバスタチンカルシウムの効果ともまた比較した。このアトロバスタチンカルシウムの効果は、研究終了時に、血清中コレステロールの極小の減少（２０％）しか示さなかった。
【０３３７】
（表６）
（ＩＳＩＳ  １４７７６４によるマウスアポリポタンパク質Ｂコレステロールレベルの阻害パーセント）
【０３３８】
【表６】
2014087368.tif 000021
（実施例２４）
（リポタンパク質レベルに対するアポリポタンパク質Ｂ（ＩＳＩＳ  １４７７６４）のアンチセンス阻害の効果）
高脂肪食（６０％  ｋｃａｌ脂肪）を与えた雄Ｃ５７ＢＬ／６マウス（ｎ＝８）を、リポタンパク質（ＶＬＤＬ、ＬＤＬ、およびＨＤＬ）レベルに対するＩＳＩＳ  １４７７６４の効果について６週間の時間経過にわたって評価した。コントロール動物には、生理食塩水処理（５０ｍｇ／ｋｇ）を与えた。マウスに、一晩絶食させた後に、５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、２５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、５０ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）または生理食塩水（５０ｍｇ／ｋｇ）を、３日間ごと（１週間に２回）に６週間、腹腔内投与した。
【０３３９】
リポタンパク質レベルを、０週間目、２週間目、および６週間目に測定した。このデータを表７に示す。この表の値は、阻害パーセントとして表されており、生理食塩水コントロールに対して正規化されている。負の値は、観察されたリポタンパク質レベル増加を示す。
【０３４０】
これらのデータを、０週間目、２週間目、および６週間目での、一日経口用量２０ｍｇ／ｋｇのアトロバスタチンカルシウムの効果ともまた比較した。
【０３４１】
これらのデータは、５０ｍｇ／ｋｇ用量のＩＳＩＳ  １４７７６４が、アトロバスタチンよりも大きな程度まで、調査した血清中リポタンパク質部類すべてを減少可能であることを、示す。
【０３４２】
（表７）
（アトロバスタチンと比較した、ＩＳＩＳ  １４７７６４によるマウスアポリポタンパク質Ｂリポタンパク質レベルの阻害パーセント）
【０３４３】
【表７】
2014087368.tif 000022
（実施例２５）
（血清中ＡＳＴレベルおよび血清中ＡＬＴレベルに対するアポリポタンパク質Ｂ（ＩＳＩＳ  １４７７６４）のアンチセンス阻害の効果）
高脂肪食（６０％  ｋｃａｌ脂肪）を与えた雄Ｃ５７ＢＬ／６マウス（ｎ＝８）を、肝臓酵素（ＡＳＴおよびＡＬＴ）レベルに対するＩＳＩＳ  １４７７６４の効果について６週間の時間経過にわたって評価した。コントロール動物には、生理食塩水処理（５０ｍｇ／ｋｇ）を与えた。マウスに、一晩絶食させた後に、５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、２５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、５０ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）または生理食塩水（５０ｍｇ／ｋｇ）を、３日間ごと（１週間に２回）に６週間、腹腔内投与した。ＡＳＴレベルおよびＡＬＴレベルを、６週間目に測定した。
【０３４４】
ＩＳＩＳ  １４７７６４により処理したマウスは、生理食塩水コントロールと比較して、この研究の期間にわたって有意なＡＳＴレベル変化を何ら示さなかった（生理食塩水コントロールについての６５ＩＵ／Ｌと比較して、５ｍｇ／ｋｇ用量、２５ｍｇ／ｋｇ用量、および５０ｍｇ／ｋｇ用量について、それぞれ１０５ＩＵ／Ｌ、７０ＩＵ／Ｌおよび８０ＩＵ／Ｌ）。一日経口用量２０ｍｇ／ｋｇのアトロバスタチンにより処理したマウスは、ＡＳＴレベル８５ＩＵ／Ｌを有した。
【０３４５】
ＡＬＴレベルは、生理食塩水コントロールと比較して、この研究の期間にわたってすべての処理によって増加した（生理食塩水コントロールについての２５ＩＵ／Ｌと比較して、５ｍｇ／ｋｇ用量、２５ｍｇ／ｋｇ用量、および５０ｍｇ／ｋｇ用量について、それぞれ５０ＩＵ／Ｌ、７０ＩＵ／Ｌおよび１００ＩＵ／Ｌ）。一日経口用量２０ｍｇ／ｋｇのアトロバスタチンにより処理したマウスは、ＡＳＴレベル４０ＩＵ／Ｌを有した。
【０３４６】
（実施例２６）
（血清中グルコースレベルに対するアポリポタンパク質Ｂ（ＩＳＩＳ  １４７７６４）のアンチセンス阻害の効果）
高脂肪食（６０％  ｋｃａｌ脂肪）を与えた雄Ｃ５７ＢＬ／６マウス（ｎ＝８）を、血清中グルコースレベルに対するＩＳＩＳ  １４７７６４の効果について６週間の時間経過にわたって評価した。コントロール動物には、生理食塩水処理（５０ｍｇ／ｋｇ）を与えた。マウスに、一晩絶食させた後に、５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、２５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、５０ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）または生理食塩水（５０ｍｇ／ｋｇ）を、３日間ごと（１週間に２回）に６週間、腹腔内投与した。
【０３４７】
研究終了時に、最後の注射の４８時間後に動物を屠殺し、そして血清中グルコースレベルについて評価した。ＩＳＩＳ  １４７７６４は、生理食塩水コントロールについての３００ｍｇ／ｄＬと比較して、５ｍｇ／ｋｇ用量、２５ｍｇ／ｋｇ用量、および５０ｍｇ／ｋｇ用量について、それぞれ２２５ｍｇ／ｄＬ、１９０ｍｇ／ｄＬおよび１８０ｍｇ／ｄＬにまで血清中グルコースレベルを減少させる、用量応答効果を示した。一日経口用量２０ｍｇ／ｋｇのアトロバスタチンにより処理したマウスは、血清中グルコースレベル２１５ｍｇ／ｄＬを有した。これらのデータは、ＩＳＩＳ  １４７７６４が、高脂肪食マウスにおいて血清中グルコースレベルを減少可能であることを示す。
【０３４８】
（実施例２７）
（体重、脾臓重量、肝臓重量および脂肪パッド重量に対するアポリポタンパク質Ｂ（ＩＳＩＳ  １４７７６４）のアンチセンス阻害の効果）
高脂肪食（６０％  ｋｃａｌ脂肪）を与えた雄Ｃ５７ＢＬ／６マウス（ｎ＝８）を、体重、脾臓重量、肝臓重量および脂肪パッド重量に対するＩＳＩＳ  １４７７６４の効果について６週間の時間経過にわたって評価した。コントロール動物には、生理食塩水処理（５０ｍｇ／ｋｇ）を与えた。マウスに、一晩絶食させた後に、５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、２５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、５０ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）または生理食塩水（５０ｍｇ／ｋｇ）を、３日間ごと（１週間に２回）に６週間、腹腔内投与した。
【０３４９】
研究終了時に、最後の注射の４８時間後に動物を屠殺し、そして体重、脾臓重量、肝臓重量および脂肪パッド重量を測定した。これらのデータを表８に示す。値は、生理食塩水処理したコントロール動物と比較した体重または器官重量の変化パーセントとして表している。一日経口用量２０ｍｇ／ｋｇのアトロバスタチンにより処理したマウスからのデータもまた、この表に示している。負の値は、重量の減少を示した。
【０３５０】
（表８）
（体重または器官重量に対するマウスアポリポタンパク質Ｂのアンチセンス阻害の効果）
【０３５１】
【表８】
2014087368.tif 000023
これらのデータは、脾臓重量および肝臓重量の両方の増加により相殺されたＩＳＩＳ  １４７７６４の投与範囲にわたる脂肪減少を示し、用量が増加するにつれて全体重の全体的減少が生じている。
【０３５２】
（実施例２８）
（Ｂ６．１２９Ｐ−Ａｐｏｅｔｍ１Ｕｎｃノックアウトマウスにおけるアポリポタンパク質Ｂ（ＩＳＩＳ  １４７７６４）のアンチセンス阻害の効果：やせた動物対高脂肪食動物）
Ｊａｃｋｓｏｎ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ（Ｂａｒ  Ｈａｒｂｏｒ，ＭＥ）から得たＢ６．１２９Ｐ−Ａｐｏｅｔｍ１Ｕｎｃノックアウトマウス（本明細書中でＡｐｏＥノックアウトマウスと呼ぶ）は、Ａｐｏｅｔｍ１Ｕｎｃ変異についてホモ接合性であり、年齢によっても性別によっても影響を受けない全血漿コレステロールレベルの顕著な増加を示す。これらの動物は、３ヶ月齢にて、近位大動脈中に脂肪線条を示す。これらの病変は、年齢とともに増加し、そして脂質が少ないがより細長い細胞を含む病変（アテローム性動脈硬化症性病変のより進行した病期特有である）へと進行する。
【０３５３】
これらのマウスにおける変異は、アポリポタンパク質Ｅ（ＡｐｏＥ）遺伝子中に存在する。ＡｐｏＥタンパク質の主要な目的は、コレステロールおよびトリグリセリドを身体全体へと輸送することである。アポリポタンパク質Ｅは、リポタンパク質構造を安定化させ、低密度リポタンパク質レセプター（ＬＤＬＲ）および関連タンパク質に結合し、そしてＨＤＬサブクラス中に存在し、ＨＤＬにＬＤＬＲ結合能を提供する。ＡｐｏＥは、肝臓および脳において最も豊富に発現される。雌Ｂ６．１２９Ｐ−Ａｐｏｅｔｍ１Ｕｎｃノックアウトマウス（ＡｐｏＥノックアウトマウス）を以下の研究に使用して、潜在的脂質減少化合物としてのアンチセンスオリゴヌクレオチドを評価した。
【０３５４】
雌ＡｐｏＥノックアウトマウスは、５週齢〜７週齢の範囲であった。これらの雌ＡｐｏＥノックアウトマウスに、研究開始前の２週間、通常の食餌を与えた。その後、ＡｐｏＥノックアウトマウスに、６０％脂肪食（０．１５％コレステロール添加）を無制限に与えて、高脂血症および肥満を誘導した。コントロール動物には、コレステロールを添加していない高脂肪食を与えて維持した。一晩絶食させた後、各群からのマウスに、生理食塩水、５０ｍｇ／ｋｇのコントロールアンチセンスオリゴヌクレオチド（ＩＳＩＳ  ２９８３７  ＴＣＧＡＴＣＴＣＣＴＴＴＴＡＴＧＣＣＣＧ；配列番号１２４）、あるいは５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、２５ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）、５０ｍｇ／ｋｇ  ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）を、３日間ごとに６週間、腹腔内投与した。
【０３５５】
このコントロールオリゴヌクレオチドは、２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（「ギャップマー（ｇａｐｍｅｒ）」）であり、これは、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中心「ギャップ」領域と、それに両方の側（５’方向および３’方向）で隣接する５ヌクレオチドの「ウィング（ｗｉｎｇ）」から構成されている。このウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成されている。ヌクレオシド間（骨格）結合は、そのオリゴヌクレオチド全体にわたってホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）結合である。シチジン残基はすべて５’−メチルシチジンである。
【０３５６】
研究終了時に、最後の注射の４８時間後に動物を屠殺し、そして肝臓中の標的ｍＲＮＡレベルについてＲＴ−ＰＣＲ法により評価しノーザンブロット分析により確認した。そしてその動物を、グルコースレベル、コレステロールレベルおよび脂質レベルについてＨＰＬＣ分離法により評価し、トリグリセリドレベルおよび肝臓酵素レベルについて評価した（ＬａｂＣｏｒｐ  Ｐｒｅｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｓｅｒｖｉｃｅｓ；Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，ＣＡが実施した）。一日経口用量２０ｍｇ／ｋｇのアトロバスタチンにより処理したマウスからのデータもまた、比較のための表に示している。
【０３５７】
この比較研究の結果を表９に示す。データは、生理食塩水コントロールに対して正規化している。
【０３５８】
（表９）
（ＡｐｏＥノックアウトマウスにおけるアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベル、コレステロールレベル、グルコースレベル、脂質レベル、トリグリセリドレベルおよび肝臓酵素レベルに対する、ＩＳＩＳ  １４７７６４処理の効果）
【０３５９】
【表９】
2014087368.tif 000024
ＩＳＩＳ  １４７７６４による処理が、ＡｐｏＥノックアウトマウスにおいて、グルコースおよびコレステロールならびに調査したすべてのリポタンパク質（ＨＤＬ、ＬＤＬおよびＶＬＤＬ）を低下させたことが、これらのデータから明らかである。さらに、これらの減少は、アポリポタンパク質Ｂタンパク質レベルおよびアポリポタンパク質ＲＮＡレベルの両方の減少と相関した。このことは、アンチセンス作用機構を示す。肝臓効果レベルの有意な変化は観察されなかった。このことは、このアンチセンスオリゴヌクレオチドが、いずれの処理群に対しても毒性ではなかったことを示す。
【０３６０】
（実施例２９）
（２’−ＭＯＥウィングおよびデオキシギャップを持つキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害：追加オリゴヌクレオチド）
本発明によれば、公開されている配列（ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＭ０００３８４．１、本明細書では配列番号３として援用する）を用いて、別系列のオリゴヌクレオチドを設計してヒトアポリポタンパク質Ｂ  ＲＮＡの異なる領域を標的にする。オリゴヌクレオチドを表１０に示す。「標的部位（ｔａｒｇｅｔ  ｓｉｔｅ）」は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上の第１の（５’最末端の）ヌクレオチド番号を示す。表１０のすべての化合物が２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー（ｇａｐｍｅｒ））であり、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中央「ギャップ」領域から構成され、該領域の両側（５’方向および３’方向）に５ヌクレオチドの「ウィング」が隣接している。これらのウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。全てのシチジン残基は、５−メチルシチジンである。これらの化合物を、本明細書中の他の実施例で述べられるように、定量的リアルタイムＰＣＲによってＨｅｐＧ２細胞でのヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する該化合物の効果について分析した。データは、ＨｅｐＧ２細胞を表１０に示す１５０ｎＭの化合物で処理した２回の実験から得られた平均値である。「Ｎ．Ｄ．」が表示されている場合、これは「データ無し」を示す。
【０３６１】
（表１０）
（２’−ＭＯＥウィングおよびデオキシギャップを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害）
【０３６２】
【表１０−１】
2014087368.tif 000025
【０３６３】
【表１０−２】
2014087368.tif 000026
【０３６４】
【表１０−３】
2014087368.tif 000027
【０３６５】
【表１０−４】
2014087368.tif 000028
【０３６６】
【表１０−５】
2014087368.tif 000029
（実施例３０）
（アポリポタンパク質Ｂのアンチセンス阻害−ジーンウオーク（ｇｅｎｅ  ｗａｌｋ））
本発明にもとづいて、別系列のオリゴヌクレオチドを設計してヒトアポリポタンパク質Ｂ  ＲＮＡ（ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＭ０００３８４．１、本明細書では配列番号３として援用）の複数の領域（配列番号が２２４または２４７である標的部位の近傍）を標的にする「ジーンウオーク（ｇｅｎｅ  ｗａｌｋ）」を実施した。上記オリゴヌクレオチドを表１１に示す。「標的部位（ｔａｒｇｅｔ  ｓｉｔｅ）」は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上の第１（５’−末端）のヌクレオチド番号を示す。表１１のすべての化合物が２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー（ｇａｐｍｅｒ））であり、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中央「ギャップ」領域から構成され、該領域の両側（５’方向および３’方向）に５ヌクレオチドの「ウィング」が隣接している。これらのウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。全てのシチジン残基は、５−メチルシチジンである。これらの化合物を、本明細書中の他の実施例で述べられるように、定量的リアルタイムＰＣＲによってＨｅｐＧ２細胞でのヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する該化合物の効果について分析した。処理用量は、５０ｎＭおよび１５０ｎＭであり、表１１に示される。データは、２回の実験から得られた平均値である。「Ｎ．Ｄ．」が表示されている場合、これは「データ無し」を示す。
【０３６７】
（表１１）
（２’−ＭＯＥウィングおよびデオキシギャップを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害  −  ジーンウオーク）
【０３６８】
【表１１−１】
2014087368.tif 000030
【０３６９】
【表１１−２】
2014087368.tif 000031
図１０および１１に示すように、配列番号１２４、１２８、１２９、１３２、１３３、１３４、１３８、１４０、１４１、１４２、１４４、１４５、１４７、１４８、１４９、１５０、１５２、１５３、１５５、１５６、１５８、１５９、１６０、１６１、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７２、１７６、１７７、１７８、１８１、１８３、１８４、１８５、１８６、１８７、１８８、１８９、１９０、１９１、１９２、１９３、１９４、１９５、１９６、１９７、１９８、１９９、２００、２０１、２０２、２０３、２０４、２０５、２０６、２０７、２０８、２０９、２１０、２１１、２１２、２１３、２１４、２１５、２１６、２１７、２１８、２１９、２２０、２２１、２２２、２２３、２２４、２２５、２２６、２２７、２２８、２２９、２３０、２３１、２３２、２３３、２３４、２３５、２３６、２３７、２３８、２３９、２４０、２４１、２４３、２４４、２４５、２４６、２４７、２４８、２４９、２５０、２５１、２５２、２５３、２５４、２５５、２５６、２５７、２５８、２６０、２６１、２６２、２６３、２６４、２６５、２６６、２６７、２６８、２６９、２７０、２７１、２７２、２７３、２７４、２７５、２７６、２７７、２７８、２７９、２８０、２８１、２８２、２８３、２８４、２８５、２８６、２８７、２８８、２８９、２９０、２９１、２９２、２９３、２９４、２９５、２９６、２９７、２９８、２９９、３００、３０１、３０２、３０３、３０４、３０５、３０６、３０７、３０８、３０９、３１０、３１１、３１２、３１３、３１４、３１５、３１６、および３１７は、このアッセイでヒトアポリポタンパク質Ｂ発現を少なくとも３０％阻害したことから、好ましい。より好ましくは、配列番号２２４、２４７、および２６２である。これらの好ましい配列に対して相補的である標的領域を、本明細書では「好ましい標的セグメント」という。したがって、該標的領域は本明細書の化合物による標的化にとって好ましい。これらの好ましい標的セグメントを、表１８に示す。これらの配列は、表１０および１１に示す好ましいアンチセンス化合物の逆相補体を表す。「標的部位」は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上の第１の（５’最末端の）ヌクレオチド番号を示す。表１８にさらに示されているものが、好ましい標的セグメントの各々が見いだされた種類である。
【０３７０】
（実施例３１）
（２’−ＭＯＥウィングおよびデオキシギャップを持つキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害：ＧｅｎＢａｎｋ受託番号Ｍ１４１６２．１の標的化）
本発明によれば、公開されている配列（ＧｅｎＢａｎｋ受託番号Ｍ１４１６２．１、本明細書では配列番号３１８として援用する）を用いて、別系列のオリゴヌクレオチドを設計してヒトアポリポタンパク質Ｂ  ＲＮＡの異なる領域を標的にする。オリゴヌクレオチドを表１２に示す。「標的部位」は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上の第１の（５’最末端の）ヌクレオチド番号を示す。表１２のすべての化合物が２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー）であり、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中央「ギャップ」領域から構成され、該領域の両側（５’方向および３’方向）に５ヌクレオチドの「ウィング」が隣接している。これらのウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。全てのシチジン残基は、５−メチルシチジンである。これらの化合物を、本明細書中の他の実施例で述べられるように、定量的リアルタイムＰＣＲによってＨｅｐＧ２細胞でのヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する該化合物の効果について分析した。データは、ＨｅｐＧ２細胞を表１２に示す１５０ｎＭの化合物で処理した２回の実験から得られた平均値である。「Ｎ．Ｄ．」が表示されている場合、これは「データ無し」を示す。
【０３７１】
（表１２）
（２’−ＭＯＥウィングおよびデオキシギャップを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害）
【０３７２】
【表１２】
2014087368.tif 000032
（実施例３２）
（ヒトアポリポタンパク質Ｂのアンチセンス阻害−ＧｅｎＢａｎｋ受託番号Ｍ１４１６２．１を標的とするジーンウオーク）
本発明にもとづいて、別系列のオリゴヌクレオチドを設計してヒトアポリポタンパク質Ｂ  ＲＮＡ（ＧｅｎＢａｎｋ受託番号１４１６２．１、本明細書では配列番号３１８として援用）の複数の領域（配列番号が３１９である標的部位の近傍）を標的にする「ジーンウオーク（ｇｅｎｅ  ｗａｌｋ）」を実施した。上記オリゴヌクレオチドを表１３に示す。「標的部位」は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上の第１（５’−末端）のヌクレオチド番号を示す。表１３のすべての化合物が２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー）であり、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中央「ギャップ」領域から構成され、該領域の両側（５’方向および３’方向）に５ヌクレオチドの「ウィング」が隣接している。これらのウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。全てのシチジン残基は、５−メチルシチジンである。これらの化合物を、本明細書中の他の実施例で述べられるように、定量的リアルタイムＰＣＲによってＨｅｐＧ２細胞でのヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する該化合物の効果について分析した。処理用量は、５０ｎＭおよび１５０ｎＭであり、表１３に示される。データは、２回の実験から得られた平均値である。「Ｎ．Ｄ．」が表示されている場合、これは「データ無し」を示す。
【０３７３】
（表１３）
（２’−ＭＯＥウィングおよびデオキシギャップを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害）
【０３７４】
【表１３】
2014087368.tif 000033
図１２および１３に示すように、配列番号３１９、３２３、３２４、３２５、３２６、３２７、３２８、３２９、３３０、３３１、３３２、および３３３は、このアッセイでヒトアポリポタンパク質Ｂ発現を少なくとも３０％阻害したことから、好ましい。より好ましくは、配列番号３１９である。これらの好ましい配列に対して相補的である標的領域を、本明細書では「好ましい標的セグメント」という。したがって、該標的領域は本明細書の化合物による標的化にとって好ましい。これらの好ましい標的セグメントを、表１８に示す。これらの配列は、表１２および１３に示す好ましいアンチセンス化合物の逆相補体を表す。「標的部位」は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上の第１の（５’最末端の）ヌクレオチド番号を示す。表１８にさらに示されているものが、好ましい標的セグメントの各々が見いだされた種類である。
【０３７５】
（実施例３３）
（２’−ＭＯＥウィングおよびデオキシギャップを持つキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害：ゲノム配列の標的化）
本発明によれば、公開されている配列（ゲノム配列を表すＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＭＴ＿０２２２２７．９のヌクレオチド３９８３５ないし８３２７９の相補体、本明細書では配列番号３３４として援用する）を用いて、別系列のオリゴヌクレオチドを設計してヒトアポリポタンパク質Ｂ  ＲＮＡの異なる領域を標的にする。オリゴヌクレオチドを表１４に示す。「標的部位」は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上の第１の（５’最末端の）ヌクレオチド番号を示す。表１４のすべての化合物が２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー）であり、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中央「ギャップ」領域から構成され、該領域の両側（５’方向および３’方向）に５ヌクレオチドの「ウィング」が隣接している。これらのウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。全てのシチジン残基は、５−メチルシチジンである。これらの化合物を、本明細書中の他の実施例で述べられるように、定量的リアルタイムＰＣＲによってＨｅｐＧ２細胞でのヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する該化合物の効果について分析した。データは、ＨｅｐＧ２細胞を表１４に示す１５０ｎＭの化合物で処理した２回の実験から得られた平均値である。「Ｎ．Ｄ．」が表示されている場合、これは「データ無し」を示す。
【０３７６】
（表１４）
（２’−ＭＯＥウィングおよびデオキシギャップを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害）
【０３７７】
【表１４−１】
2014087368.tif 000034
【０３７８】
【表１４−２】
2014087368.tif 000035
【０３７９】
【表１４−３】
2014087368.tif 000036
【０３８０】
【表１４−４】
2014087368.tif 000037
【０３８１】
【表１４−５】
2014087368.tif 000038
【０３８２】
【表１４−６】
2014087368.tif 000039
表１４に示すように、配列番号３３５、３３９、３４１、３４２、３４３、３４７、３４９、３５０、３５１、３５２、３５３、３５４、３５５、３５６、３５７、３５８、３５９、３６０、３６１、３６２、３６３、３６７、３６８、３７０、３７２、３７３、３７４、３７６、３７７、３７９、３８１、３８３、３８４、３８６、３８７、３８８、３９０、３９５、３９６、３９９、４０１、４０２、４０３、４０４、４０５、４０６、４０８、４１０、４１１、４１３、４１４、４１５、４２３、４２４、４２５、４２６、４２７、４２８、４２９、４３０、４３１、４３４、４３５、４３６、４３８、４４０、４４１、４４２、４４３、４４５、４４６、４４７、４４９、４５０、４５１、４５２、４５４、４５６、４５８、４６０、４６２、４６３、４６４、４６８、４６９、４７０、４７１、４７２、４７３、４７５、４７９、４８０、４８２、４８６、４８９、４９０、４９１、４９５、４９６、４９８、４９９、および５０２は、このアッセイでヒトアポリポタンパク質Ｂ発現を少なくとも３０％阻害したことから、好ましい。これらの好ましい配列に対して相補的である標的領域を、本明細書では「好ましい標的セグメント」という。したがって、該標的領域は本明細書の化合物による標的化にとって好ましい。これらの好ましい標的セグメントを、表１８に示す。これらの配列は、表１４に示す好ましいアンチセンス化合物の逆相補体を表す。「標的部位」は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上の第１の（５’最末端の）ヌクレオチド番号を示す。表１８にさらに示されているものが、好ましい標的セグメントの各々が見いだされた種類である。
【０３８３】
（実施例３４）
（２’−ＭＯＥウィングおよびデオキシギャップを持つキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害  −  ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＡＩ２４９０４０．１）
本発明によれば、公開されている配列（ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＡＩ２４９０４０．１を持つ配列の相補体、本明細書では配列番号５０３として援用する）を用いて、別系列のオリゴヌクレオチドを設計してヒトアポリポタンパク質Ｂ  ＲＮＡの異なる領域を標的にする。オリゴヌクレオチドを表１５に示す。「標的部位」は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上の第１の（５’最末端の）ヌクレオチド番号を示す。表１５のすべての化合物が２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー）であり、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中央「ギャップ」領域から構成され、該領域の両側（５’方向および３’方向）に５ヌクレオチドの「ウィング」が隣接している。これらのウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。全てのシチジン残基は、５−メチルシチジンである。これらの化合物を、本明細書中の他の実施例で述べられるように、定量的リアルタイムＰＣＲによってＨｅｐＧ２細胞でのヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する該化合物の効果について分析した。データは、ＨｅｐＧ２細胞を表１５に示す１５０ｎＭの化合物で処理した２回の実験から得られた平均値である。「Ｎ．Ｄ．」が表示されている場合、これは「データ無し」を示す。
【０３８４】
（表１５）
（２’−ＭＯＥウィングおよびデオキシギャップを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害）
【０３８５】
【表１５】
2014087368.tif 000040
表１５に示すように、配列番号５０５、５０６、５０７、５１０、および５１２は、このアッセイでヒトアポリポタンパク質Ｂ発現を少なくとも３０％阻害したことから、好ましい。これらの好ましい配列に対して相補的である標的領域は、本明細書では「好ましい標的セグメント」と呼ばれることから、本明細書の化合物による標的化にとって好ましい。これらの好ましい標的セグメントを、表１８に示す。これらの配列は、表１５に示す好ましいアンチセンス化合物の逆相補体を表す。「標的部位」は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上の第１の（５’最末端の）ヌクレオチド番号を示す。表１８にさらに示されているものが、好ましい標的セグメントの各々が見いだされた種類である。
【０３８６】
（実施例３５）
（２’−ＭＯＥウィングおよびデオキシギャップを持つキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害  −  ギャップの位置での変異）
本発明によれば、公開されている配列（ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＭ＿０００３８４．１、本明細書では配列番号３として援用する）を用いて、別系列のオリゴヌクレオチドを設計してヒトアポリポタンパク質Ｂ  ＲＮＡの異なる領域を標的にする。化合物を表１６に示す。「標的部位」は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上の第１の（５’最末端の）ヌクレオチド番号を示す。表１６のすべての化合物が２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー）である。「ギャップ」領域は、２’−デオキシヌクレオチドから構成され、該領域の片側または両側（５’方向および３’方向）に２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される「ウィング」が隣接している。２’−ＭＯＥヌクレオチドの全数が常に１０に等しく、かつキメラオリゴヌクレオチドの全長が２０ヌクレオチドである。「ギャップ構造」および「２’−デオキシヌクレオチド」を太字で示すことで、各オリゴヌクレオチドの正確な構造を表１６に示した。例えば、８〜１０〜２の設計は、第１の（５’最末端の）８ヌクレオチドおよび最後の（３’最末端の）２ヌクレオチドが２’−ＭＯＥヌクレオチドであり、ギャップにある１０ヌクレオチドが２’−デオキシヌクレオチドである。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。全てのシチジン残基は、５−メチルシチジンである。これらの化合物を、本明細書中の他の実施例で述べられるように、定量的リアルタイムＰＣＲによってＨｅｐＧ２細胞でのヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する該化合物の効果について分析した。データ（表１６に示す）は、ＨｅｐＧ２細胞を５０ｎＭおよび１５０ｎＭの用量の本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理した３回の実験から得られた平均値である。「Ｎ．Ｄ．」が表示されている場合、これは「データ無し」を示す。
【０３８７】
（表１６）
（２’−ＭＯＥウィングおよび可変デオキシギャップを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害）
【０３８８】
【表１６】
2014087368.tif 000041
表１６に示すように、このアッセイでは、配列番号２２４、２４７、および５１４が、両用量でヒトアポリポタンパク質Ｂ発現を少なくとも３０％阻害した。これらのデータが示すことは、オリゴヌクレオチドがギャップ置換においていくつかの変異によって効果的であることを示唆している。これらの好ましい配列に対して相補的である標的領域を、本明細書では「好ましい標的セグメント」という。したがって、該標的領域は本明細書の化合物による標的化にとって好ましい。これらの好ましい標的セグメントを、表１８に示す。これらの配列は、表１６に示す好ましいアンチセンス化合物の逆相補体を表す。「標的部位」は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上の第１の（５’最末端の）ヌクレオチド番号を示す。表１８にさらに示されているものが、好ましい標的セグメントの各々が見いだされた種類である。
【０３８９】
（実施例３６）
（２’−ＭＯＥウィングおよびデオキシギャップを持つキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害  −配列番号３１９および５１５の位置での変異）
本発明に従って、ギャップ構造に変異を持つ一連のアンチセンス化合物を配列番号３１９および５１５を基づいて設計した。これらの化合物を表１７に示す。「標的部位」は、化合物が結合する特定の標的配列上の第１の（５’最末端の）ヌクレオチド番号を示す。表１７のすべての化合物が２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー）である。「ギャップ」領域は、２’−デオキシヌクレオチドからなり、２’−メトキエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される「ウィング」が、片方または両側（５’および３’方向）に隣接している。ギャップの各々の側にある２’−ＭＯＥヌクレオチドの数は、２’−ＭＯＥヌクレオチドの合計が常に１０に等しく、かつキメラオリゴヌクレオチドの全長が２０ヌクレオチドとなるように、変動する。「ギャップ構造」および「２’−デオキシヌクレオチド」を太字で示すことで、各オリゴヌクレオチドの正確な構造を表１７に示した。例えば、８〜１０〜２の設計は、第１の（５’最末端の）８ヌクレオチドおよび最後の（３’最末端の）２ヌクレオチドが２’−ＭＯＥヌクレオチドであり、ギャップにある１０ヌクレオチドが２’−デオキシヌクレオチドであることを示す。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。全てのシチジン残基は、５−メチルシチジンである。これらの化合物を、本明細書中の他の実施例で述べられるように、定量的リアルタイムＰＣＲによってＨｅｐＧ２細胞でのヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する該化合物の効果について分析した。データ（表１７に示す）は、ＨｅｐＧ２細胞を５０ｎＭおよび１５０ｎＭの用量の本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理した３回の実験から得られた平均値である。「Ｎ．Ｄ．」が表示されている場合、これは「データ無し」を示す。
【０３９０】
（表１７）
（２’−ＭＯＥウィングおよび可変デオキシギャップを有するキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害）
【０３９１】
【表１７】
2014087368.tif 000042
表１７に示すように、このアッセイでは、配列番号３１９および５１５が、両用量でヒトアポリポタンパク質Ｂ発現を少なくとも４４％阻害した。これらのデータが示すことは、オリゴヌクレオチドがギャップ置換においていくつかの変異によって効果的であることを示唆している。これらの好ましい配列に対して相補的である標的領域を、本明細書では「好ましい標的セグメント」という。したがって、該標的領域は本明細書の化合物による標的化にとって好ましい。これらの好ましい標的セグメントを、表１８に示す。これらの配列は、表１７に示す好ましいアンチセンス化合物の逆相補体を表す。「標的部位」は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上の第１の（５’最末端の）ヌクレオチド番号を示す。表１８にさらに示されているものが、好ましい標的セグメントの各々が見いだされた種類である。
【０３９２】
（表１８）
（アポリポタンパク質Ｂで同定された好ましい標的セグメントの配列および位置）
【０３９３】
【表１８−１】
2014087368.tif 000043
【０３９４】
【表１８−２】
2014087368.tif 000044
【０３９５】
【表１８−３】
2014087368.tif 000045
【０３９６】
【表１８−４】
2014087368.tif 000046
【０３９７】
【表１８−５】
2014087368.tif 000047
【０３９８】
【表１８−６】
2014087368.tif 000048
【０３９９】
【表１８−７】
2014087368.tif 000049
これらの「好ましい標的セグメント」が本発明のアンチセンス化合物とのハイブリダイゼーションについて公開され、かつ利用可能となったことから、これらの好ましい標的セグメントに特異的にハイブリダイズすることでアポリポタンパク質Ｂの発現を阻害する本発明のさらなる実施形態を、ルーチンの実験しか使用しないで、本発明の実施形態を認識または確認することが可能である。本発明によれば、アンチセンス化合物として、アンチセンスオリゴマー化合物、アンチセンスオリゴヌクレオチド、リボザイム、外部誘導配列（ｅｘｔｅｒｎａｌ  ｇｕｉｄｅ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ，ＥＧＳ）オリゴヌクレオチド、代わりのスプライサー、プライマー、プローブ、および標的核酸の少なくとも一部にハイブリダイズする他の短いオリゴマー化合物が挙げられる。
【０４００】
（実施例３７）
（ヒトアポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害  −  オリゴヌクレオチドの用量応答）
本発明に従って、実施例２９および３１に記載した１２オリゴヌクレオチドを、用量応答試験でさらに調べた。この試験で用いた対照オリゴヌクレオチドは、ＩＳＩＳ  １８０７６（配列番号８０５）およびＩＳＩＳ  １３６５０（配列番号８０６）であった。
【０４０１】
対照群を含むこの試験のすべての化合物が２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー）であり、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中央「ギャップ」領域から構成され、該領域の両側（５’方向および３’方向）に５ヌクレオチドの「ウィング」が隣接している。これらのウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。全てのシチジン残基は、５−メチルシチジンである。
【０４０２】
用量反応実験では、指標としてのｍＲＮＡレベルで、ＨｅｐＧ２細胞を、用量が３７、７５、１５０、および３００ｎＭオリゴヌクレオチドの用量で、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたは対照オリゴヌクレオチドによって処理した。データは、本明細書の他の実施例に記載したように定量的リアルタイムＰＣＲによって得られたもので、未処理対照群に対して正規化されている処理群のｍＲＮＡレベルによる２回の実験から平均したものである。データを用１９に示す。
【０４０３】
（表１９）
（２’−ＭＯＥウィングおよびデオキシギャップを持つキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害  −  用量応答）
【０４０４】
【表１９】
2014087368.tif 000050
（実施例３８）
（ヒトアポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害  −  用量応答  −  低用量範囲）
本発明に従って、実施例２９、３１、３５、および３６に記載した７オリゴヌクレオチドを、用量応答試験でさらに調べた。この試験で用いた対照オリゴヌクレオチドは、ＩＳＩＳ  １８０７６（配列番号８０５）、ＩＳＩＳ  １３６５０（配列番号８０６）、およびＩＳＩＳ  １２９６９５（配列番号８０７）であった。
【０４０５】
対照群を含むこの試験のすべての化合物が２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー）であり、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中央「ギャップ」領域から構成され、該領域の両側（５’方向および３’方向）に５ヌクレオチドの「ウィング」が隣接している。これらのウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。全てのシチジン残基は、５−メチルシチジンである。
【０４０６】
用量反応実験では、指標としてのｍＲＮＡレベルで、ＨｅｐＧ２細胞を、用量が１２．５、３７、７５、１５０、および３００ｎＭオリゴヌクレオチドの用量で、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたは対照オリゴヌクレオチドによって処理した。本明細書の他の実施例に記載したように定量的リアルタイムＰＣＲによってデータを得て、該データを未処理の対照群に対して正規化されている処理群でのｍＲＮＡレベルによる２回の実験から平均化した。データを表２０に示す。
【０４０７】
（表２０）
（２’−ＭＯＥウィングおよびデオキシギャップを持つホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡのレベルの阻害  −  用量応答）
【０４０８】
【表２０】
2014087368.tif 000051
（実施例３９）
（ＲＮＡ合成）
一般に、ＲＮＡ合成化学は、戦略的中間反応での種々の保護基の選択的取り込みに基づいている。有機合成で保護基を使用することは、当業者が理解することではあるが、保護基の有用な種類としてシリルエーテル類があげられる。特に、大きなシリルエーテル類は２’−ヒドロキシル上の酸に不安定なオルトエステル保護基との組み合わせで５’−ヒドロキシルを保護するのに用いられる。このような組みを成した保護基を次に標準固相合成技術とともに用いる。他の全ての合成ステップの後、最後に酸性の不安定なオルソエステル保護基を除去することが重要である。さらに、合成過程でシリル保護基を早めに使用することで、望ましくない２’−ヒドロキシルの脱保護を生ずることなく、必要に応じた容易な除去が確実になる。
【０４０９】
このような手順は、差次的に除去され、かつ差次的に化学的に不安定である保護基による２’−ヒドロキシルの保護と組み合わせた５’−ヒドロキシルの逐次保護のためのものであって、該手順の後に、ＲＮＡオリゴヌクレオチドの合成をおこなった。
【０４１０】
ＲＮＡオリゴヌクレオチドを段階的に合成する。各々のヌクレオチドを順次（３’から５’方向）、固相結合オリゴヌクレオチドに添加する。鎖の３’末端にある第１のヌクレオシドが固体担体に共有結合する。ヌクレオチド前駆体であるリボヌクレオシドホスホラミダイトとアクティベーターとを添加し、第２の塩基を第１のヌクレオシドの５’末端に連結させる。担体を洗い、いっさいの未反応５′ヒドロキシル基に無水酢酸をかぶせて５’−アセチル部分を生じさせる。つぎに、この結合部分を酸化して、より安定かつ究極的に所望されるＰ（Ｖ）結合にする。ヌクレオチド添加サイクルの終わりに、５’−シリル基をフッ化物で切断する。このサイクルを引き続くヌクレオチドの各々に対して繰り返す。
【０４１１】
合成後、リン酸塩上のメチル保護基を、１Ｍの二ナトリウム−２−カルバモイル−２ーシアノエチレン−１，１−ジチオレート三水酸基化合物（Ｓ２Ｎａ２）含有ＤＭＦを用いて３０分で切断する。水を使って、脱保護溶液を固相担体結合オリゴヌクレオチドから洗い落とす。つぎに、担体を４０％メチルアミンを含む水で、５５℃、１０分間処理する。これによって、ＲＮＡオリゴヌクレオチドが溶液中に放出されることで、環外アミンが脱保護されて、２’の基が修飾される。この段階で、アニオン交換ＨＰＬＣでオリゴヌクレオチドの分析をおこなうことができる。
【０４１２】
２’−オルトエステル基は、除去すべき最後の保護基である。Ｄｈａｒｍａｃｏｎ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｉｎｃ．（Ｌａｆａｙｅｔｔｅ，ＣＯ）によって開発されたエチレングリコールモノアセテートオルトエステル保護は、有用なオルトエステル保護基の一例であり、以下の重要な特性を有する。すなわち、それがヌクレオシドホスホラミダイト合成およびオリゴヌクレオチド合成の条件に対して安定であることである。しかし、オリゴヌクレオチド合成後、このオリゴヌクレオチドをメチルアミンで処理する。このメチルアミンは、固体担体からオリゴヌクレオチドを切り離すだけではなく該オルトエステルからアセチル基も除去してしまう。オルトエステル上に結果として生ずる２−エチル−ヒドロキシ置換基はアセチル化前駆体よりも電子求引性が低い。その結果、修飾オルトエステルが酸接触加水分解に対して、よりいっそう不安定になる。具体的には、アセチル基が除去された後、切断速度が約１０倍速くなる。したがって、このオルトエステルは、オリゴヌクレオチド合成に十分に対応しており、またその一方で、その後修飾された場合、最終ＲＮＡオリゴヌクレオチド産物に対応する相対的に穏やかな水性条件下で脱保護を実施することが可能である。
【０４１３】
さらに、ＲＮＡ合成の方法は、当技術分野で周知である  （Ｓｃａｒｉｎｇｅ，Ｓ．Ａ．Ｐｈ．Ｄ．Ｔｈｅｓｉｓ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｃｏｌｏｒａｄｏ，１９９６；Ｓｃａｒｉｎｇｅ，Ｓ．Ａ．ら、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，１９９８，１２０，１１８２０−１１８２１；Ｍａｔｔｅｕｃｃｉ，Ｍ．Ｄ．およびＣａｒｕｔｈｅｒｓ，Ｍ．Ｈ．Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，１９８１，１０３，３１８５−３１９１；Ｂｅａｕｃａｇｅ，Ｓ．Ｌ．およびＣａｒｕｔｈｅｒｓ，Ｍ．Ｈ．Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  Ｌｅｔｔ．，１９８１，２２，１８５９−１８６２；Ｄａｈｌ，Ｂ．Ｊ．ら、Ａｃｔａ  Ｃｈｅｍ．Ｓｃａｎｄ，．１９９０，４４，６３９−６４１；Ｒｅｄｄｙ，Ｍ．Ｐ．ら、Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  Ｌｅｔｔ．，１９９４，２５，４３１１−４３１４；Ｗｉｎｃｏｔｔ，Ｆ．ら、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．，１９９５，２３，２６７７−２６８４；Ｇｒｉｆｆｉｎ，Ｂ．Ｅ．ら、Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９６７，２３，２３０１−２３１３；Ｇｒｉｆｆｉｎ，Ｂ．Ｅ．ら、Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９６７，２３，２３１５−２３３１）。
【０４１４】
本発明のＲＮＡアンチセンス化合物（ＲＮＡオリゴヌクレオチド）を本明細書の方法によって合成またはＤｈａｒｍａｃｏｎ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｉｎｃ  （Ｌａｆａｙｅｔｔｅ，ＣＯ）から購入することができる。ひとたび合成すると、当技術分野で周知の方法によって相補的ＲＮＡアンチセンス化合物のアニーリングが安定的におこなわれ、二本鎖（二重鎖）のアンチセンス化合物が形成される。例えば、二重鎖は、ＲＮＡオリゴヌクレオチド（５０μＭＲＮＡオリゴヌクレオチド溶液）の相補鎖の各々３０μｌと５ｘアニーリング緩衝液（１００ｍＭ酢酸カリウム、３０ｍＭＨＥＰＥＳ−ＫＯＨ（ｐＨ７．４）、２ｍＭ酢酸マグネシウム）１５μｌとを混ぜ合わせ、その後、９０℃で１分間、続いて３７℃で１時間の加熱をおこなうことによって、形成される。得られた二重鎖アンチセンス化合物をキット、アッセイ、スクリーニング、または他の方法で用いて、標的核酸の役割を調べることができる。
【０４１５】
（実施例４０）
（アポリポタンパク質Ｂを標的とする二重鎖アンチセンス化合物の設計およびスクリーニング）
本発明に従って、本発明のアンチセンス化合物を含む一連の核酸二重鎖とそれらの相補体とを、アポリポタンパク質Ｂを標的とするために設計する。二重鎖のアンチセンス鎖の核酸塩基配列は、本明細書に記載したオリゴヌクレオチドの少なくとも一部を含む。１種類以上の天然または修飾核酸塩基を付加することで、上記鎖の末端を修飾して突出部分を形成することができる。つぎに、ｄｓＲＮＡのセンス鎖をアンチセンスの相補体として設計および合成する。このセンス鎖は、いずれかの末端に対する修飾または付加を含むものであってもよい。例えば、一実施形態では、ｄｓＲＮＡ二重鎖の両鎖が、中心にある複数の核酸塩基にわたって相補的であり、各々が一方の終端または両方の終端で突出部分を持つことになる。二重鎖のアンチセンスおよびセンス鎖は、約１７ないし２５ヌクレオチド、または約１９ないし２３ヌクレオチドから構成される。あるいは、アンチセンスおよびセンス鎖は、２０、２１、または２２ヌクレオチドから構成される。
【０４１６】
例えば、ＣＧＡＧＡＧＧＣＧＧＡＣＧＧＧＡＣＣＧ配列を有し、かつデオキシチミジン（ｄＴ）の２塩基突出部分を持つアンチセンス鎖を含む二重鎖は、以下の構造を有するだろう。すなわち、
ｃｇａｇａｇｇｃｇｇａｃｇｇｇａｃｃｇＴＴ    アンチセンス鎖
｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜
ＴＴｇｃｔｃｔｃｃｇｃｃｔｇｃｃｃｔｇｇｃ            相補体
。
【０４１７】
別の実施形態では、同一配列ＣＧＡＧＡＧＧＣＧＧＡＣＧＧＧＡＣＣＧを持つアンチセンス鎖を含む二重鎖を以下のように調製して平滑末端を持たせてもよい（単一鎖になった突出部分無し）：
ｃｇａｇａｇｇｃｇｇａｃｇｇｇａｃｃｇ      アンチセンス鎖
｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜｜
ｇｃｔｃｔｃｃｇｃｃｔｇｃｃｃｔｇｇｃ      相補体
。
【０４１８】
上記二重鎖のＲＮＡ鎖は、本明細書に開示した方法によって合成することができ、あるいはＤｈａｒｍａｃｏｎ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｉｎｃ．，（Ｌａｆａｙｅｔｔｅ，ＣＯ）より購入することができる。ひとたび合成すると、相補的鎖のアニーリングが安定的におこなわれる。単一鎖を等分し、さらに５０μＭの濃度まで希釈する。ひとたび希釈すると、鎖の各々３０μｌと５ｘアニーリング緩衝液１５μｌとが混ざり合う。上記緩衝液の最終濃度は、１００ｍＭ酢酸カリウム、３０ｍＭＨＥＰＥＳ−ＫＯＨ（ｐＨ７．４）、および２ｍＭ酢酸マグネシウムである。最終容量は７５μｌである。この溶液を９０℃で１分間インキュベートし、つぎに１５分間遠心した。試験管を、ｄｓＲＮＡ二重鎖が実験に用いられる時点で、３７℃で１時間、静置する。ｄｓＲＮＡ二重鎖の最終濃度は、２０μＭである。この溶液を凍結保存（−２０℃）し、最大５回まで凍結融解する。
【０４１９】
調製するとすぐに、アポリポタンパク質Ｂ発現を修飾する能力について、二重鎖アンチセンス化合物の評価をおこなった。
【０４２０】
細胞が８０％密集度に達した場合、該細胞を本発明の二重鎖アンチセンス化合物で処理する。９６穴プレートで増殖する細胞のために、ウエルを２００μｌのＯＰＴＩ−ＭＥＭ−１還元血清培地（Ｇｉｂｃｏ  ＢＲＬ）で一回洗浄し、続いてＬＩＰＯＦＥＣＴＩＮ（Ｇｉｂｃｏ  ＢＲＬ）を１２μｇ／ｍｌ含有した１３０μｌのＯＰＴＩ−ＭＥＭ−１および最終濃度２００ｎＭで所望の二重鎖アンチセンス化合物による処理を施す。５時間処理した後に、培地を新鮮な培地に置き換える。処理後１６時間で細胞を集め、その時点でＲＮＡを単離し、かつ標的還元をＲＴ−ＰＣＲで測定した。
【０４２１】
（実施例４１）
（アポリポタンパク質Ｂ阻害剤を使用するための表現型アッセイの設計および生体内（ｉｎ  ｖｉｖｏ）試験）
（表現型アッセイ）
アポリポタンパク質Ｂ阻害剤が本明細書に開示された方法によって同定され次第、該化合物を１種類以上の表現型アッセイでさらに調べ、各々が特定の症状または状態の処理に有効であることを予示する測定可能な指標を持つ。表現型アッセイ、該アッセイの使用のためのキットおよび試薬は、当業者に周知であり、本明細書では健康および疾患状態でのアポリポタンパク質Ｂの役割および／または関連を調べるために用いられる。代表的な表現型アッセイ（いくつかの製造業者のいずれからでも購入することができる）として、細胞生存率、細胞毒性、増殖、または細胞の生存を測定するもの（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｐｒｏｂｅｓ，Ｅｕｇｅｎｅ，ＯＲ；ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ，Ｂｏｓｔｏｎ，ＭＡ）、酵素アッセイ等のタンパク質をベースとしたアッセイ（Ｐａｎｖｅｒａ，ＬＬＣ，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ；ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｆｒａｎｋｌｉｎ  Ｌａｋｅｓ，ＮＪ；Ｏｎｃｏｇｅｎｅ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｐｒｏｄｕｃｔｓ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）、細胞制御、シグナル伝達、炎症、酸化的プロセス、およびアポトーシス  （Ａｓｓａｙ  Ｄｅｓｉｇｎｓ  Ｉｎｃ．，Ａｎｎ  Ａｒｂｏｒ，ＭＩ）、トリグリセリドアキュミュレーション（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）、血管形成アッセイ、管形成アッセイ、サイトカインおよびホルモンアッセイ、ならびに代謝アッセイ（Ｃｈｅｍｉｃｏｎ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｃ．，Ｔｅｍｅｃｕｌａ，ＣＡ；Ａｍｅｒｓｈａｍ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）が挙げられる。  
【０４２２】
非限定的な一実施例で、特定の表現型アッセイに適当であると判断された細胞（すなわち、乳癌試験のために選択されたＭＣＦ−７細胞、肥満試験のための脂肪細胞）を、上記した方法によって決定される最適濃度で、対照化合物と同様に、インビトロ試験で同定されたアポリポタンパク質Ｂ阻害剤によって処理する。処理期間の終わりに、処理細胞および未処理細胞を、表現型の結果および指標を決定する上で特異的な１種類以上の方法によって分析する。
【０４２３】
表現型の指標として、時間経過または処理用量に応じた細胞形態の変化と、細胞構成成分（例えば、タンパク質、脂質、核酸、ホルモン、糖類、または金属）の濃度の変化とが挙げられる。細胞状態（例えば、ｐＨ、細胞周期の段階、細胞による生物指標の取り込みまたは分泌）の測定もまた、対象とする指標である。
【０４２４】
処理後の細胞の遺伝子型を分析（細胞の１種類以上の遺伝子の発現を測定）することも、アポリポタンパク質Ｂ阻害剤の有効性または効力の指標として用いられる。ホールマーク遺伝子または特異的疾患に関連していると考えられる遺伝子も、処理細胞および未処理細胞の両方で測定する。
【０４２５】
（インビボ研究）
本明細書に記載したインビボ試験の個々の被験体は、温血脊椎動物であり、ヒトも含まれる。
【０４２６】
臨床試験は、個人が不必要に危険にさらされることなく、また試験でのその個人の役割について完全に伝えられることを確実にするために、厳密な規制を受ける。
【０４２７】
処置を受ける心理的効果を説明するために、ボランティアに対してランダムにプラセボまたはアポリポタンパク質Ｂ阻害剤を投与する。さらに、医師が偏った処置をおこなうことを防ぐために、投与されている薬物がアポリポタンパク質Ｂ阻害剤であるか、またはプラセボであるかについての情報は医師には伝えられてはいない。この無作為化アプローチを用いて、各々のボランティアに新規処置またはプラセボが与えられるチャンスは等しい。
【０４２８】
適応症状または状態に関連した生物学的パラメーターで、ボランティアに対して、アポリポタンパク質Ｂ阻害剤またはプラセボを８週間にわたって投与する。ここで、生物学的パラメーターは、開始時（いっさいの処置に先立つ基線測定）、終了時（最終的な処置の後）、および試験期間中一定の間隔で測定される。そのような測定として、前処理濃度と比較したアポリポタンパク質Ｂをコードする核酸分子の濃度、体液、組織、もしくは器官に含まれるアポリポタンパク質Ｂタンパク質濃度が挙げられる。他の測定として、限定されるものではないが、他の測定として、限定されるものではないが、処置している疾患症状または状態の指標、体重、血圧、疾患または毒性の薬理学的指標である血清力価、ならびにＡＤＭＳ（吸収、分布、代謝、および排泄  ）測定が挙げられる。
【０４２９】
各々の患者に関して記録される情報として、年齢（歳）、性別、身長（ｃｍ）、症状または状態の家族歴（はい／いいえ）、動機付け評価（小／中／大）、ならびに指標疾患または状態に対する以前の処置療法の数および種類が挙げられる。
【０４３０】
本試験に参加しているボランティアは、健康な成人（年齢１８歳から６５歳まで）であり、試験に参加している男性および女性の数はほぼ等しい。特定の特徴を持つボランティアを、プラセボおよびアポリポタンパク質Ｂ阻害剤による処置に対して等しく分ける。一般に、プラセボによる処置を受けたボランティアは、処理に対してほとんど反応しない。一方、アポリポタンパク質Ｂ阻害剤による処置を受けたボランティアは、本試験の判定で、疾患症状または状態のインデックスで好ましい傾向を示す。
【０４３１】
（実施例４２）
（２’−ＭＯＥウィングとデオキシギャップとを持つキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるウサギアポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害）
本発明に従って、ウサギアポリポタンパク質Ｂの異なる領域を標的とするために、一連のオリゴヌクレオチドを設計した。この設計にあたっては、公開された配列を用いた（ＧｅｎＢａｎｋ受託番号Ｘ０７４８０．１（本明細書では配列番号８０８として援用）、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号Ｍ１７７８０．１（本明細書では配列番号８０９として援用））、さらに既に記載したウサギアポリポタンパク質ＢのｍＲＮＡを表現するプライマー（Ｔａｎａｋａ，Ｊｏｕｒｎ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，１９９３，２６８，１２７１３−１２７１８）を用いて一配列を誘導した（本明細書では配列番号８１０として援用））。オリゴヌクレオチドを表２１に示す。「標的部位」は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上の第１の（５’最末端の）ヌクレオチド番号を示す。表２１のすべての化合物が２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー）であり、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中央「ギャップ」領域から構成され、該領域の両側（５’方向および３’方向）に５ヌクレオチドの「ウィング」が隣接している。これらのウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。全てのシチジン残基は、５−メチルシチジンである。これらの化合物を、本明細書中の他の実施例で述べられるように、定量的リアルタイムＰＣＲによってウサギ一次肝細胞でのアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する該化合物の効果について分析した。ウサギ一次肝細胞を表２１に示す１５０ｎＭの化合物で処理した。ウサギアポリポタンパク質Ｂに関して、ＰＣＲプライマーを、順方向プライマー：ＡＡＧＣＡＣＣＣＣＣＡＡＴＧＴＣＡＣＣ（配列番号８１１）および逆方向プライマー：ＧＧＧＡＴＧＧＣＡＧＡＧＣＣＡＡＴＧＴＡ（配列番号８１２）とし、さらにＰＣＲプローブをＦＡＭ−ＴＣＣＴＧＧＡＴＴＣＡＡＧＣＴＴＣＴＡＴＧＴＧＣＣＴＴＣＡ−ＴＡＭＲＡ（配列番号８１３）とした。ここで、ＦＡＭ（ＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）は蛍光レポーター色素であり、ＴＡＭＲＡ（ＰＥ−Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）はクエンチャー色素である。データは、２回の実験から得られた平均値である。「Ｎ．Ｄ．」が表示されている場合、これは「データ無し」を示す。
【０４３２】
（表２１）
（２’−ＭＯＥウィングとデオキシギャップとを持つキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるウサギアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの阻害）
【０４３３】
【表２１】
2014087368.tif 000052
（実施例４３）
（２’−ＭＯＥウィングとデオキシギャップとを持つキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるウサギアポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害  −  用量応答試験）
本発明に従って、実施例４２のアンチセンスオリゴヌクレオチドのサブセットを、用量応答試験でさらに調べた。処理用量を１０、５０、１５０、および３００ｎＭとした。ＩＳＩＳ  ２３３１６０（配列番号３２４）、ＩＳＩＳ  ２３３１６６（配列番号８３０）、ＩＳＩＳ  ２３３１７２（配列番号８３５）、ＩＳＩＳ  ２３３１７５（配列番号８３８）、およびＩＳＩＳ  ２３３１８３（配列番号８４６）を、本明細書中の他の実施例で述べられるように、定量的リアルタイムＰＣＲによってウサギ一次肝細胞でのアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する該化合物の効果について分析した。データは、２回の実験から得られた平均値であり、表２２に示す。
【０４３４】
（表２２）
（２’−ＭＯＥウィングとデオキシギャップとを持つキメラホスホロチオエートオリゴヌクレオチドによるウサギアポリポタンパク質Ｂ発現の阻害）
【０４３５】
【表２２】
2014087368.tif 000053
（実施例４４）
（ＬＤＬｒ−／−マウスでのアポリポタンパク質Ｂのアンチセンス阻害の効果  −  用量応答）
アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡを修飾できないことから全くアポリポタンパク質Ｂ−１００のみ合成する株であるＬＤＬ受容体欠損マウス（ＬＤＬｒ（−／−）マウス）は、著しく上昇したＬＤＬコレステロールおよびアポリポタンパク質Ｂ−１００のレベルが著しく上昇し、広範囲にわたるアテローム性動脈硬化を呈する。
【０４３６】
Ｔａｃｏｎｉｃ（Ｇｅｒｍａｎｔｏｗｎ、ＮＹ）より購入したＬＤＬｒ（−／−）マウスを用い、アンチセンスオリゴヌクレオチドの評価を、アポリポタンパク質ＢメッセンジャーＲＮＡまたはタンパク質レベルを低下させる該アンチセンスオリゴヌクレオチドの潜在能力と、アポリポタンパク質Ｂに伴う表現型指標とについて、おこなった。ＬＤＬｒ（−／−）マウスをオスの群とメスの群とに分けた。ＬＤＬｒ（−／−）マウス  に対して、１０、２５、または５０ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）またはＩＳＩＳ  １４７７６４と４塩基不一致であるＩＳＩＳ  ２７０９０６（配列番号８５６）、あるいは生理食塩水もしくは２０ｍｇ／ｋｇのアトルバスタチン  を、６週間にわたり週２回、腹腔内投与した。試験終了時に、動物を犠牲にしていくつかの表現型マーカーについて評価した。
【０４３７】
ＩＳＩＳ  １４７７６４は、オスおよびメスマウスの両方で、用量依存的な方法で、コレステロール、トリグリセリド、およびｍＲＮＡのレベルを低下させることができた。一方、４塩基不一致ＩＳＩＳ  ２７０９０６をこのことをおこなうことができなかった。検討の結果を表２３にまとめた。
【０４３８】
（表２３）
（アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ、肝臓酵素、コレステロール、およびトリグリセリドのレベルに対するオスおよびメスのＬＤＬｒ−／−マウスでのＩＳＩＳ  １４７７６４処理の効果）
【０４３９】
【表２３】
2014087368.tif 000054
（実施例４５）
（カニクイザルでのアポリポタンパク質Ｂのアンチセンス阻害の効果）
アテローム誘発食を与えられたカニクイザルは、ヒトのアテローム性動脈硬化と多くの類似性があるアテローム性動脈硬化を発症する。メスのカニクイザルは、リポタンパク質および心血管系でヒトといくつかの類似性を共有する。これらの特徴に加え、類似点が生殖生物学にある。カニクイザルのメスは、女性の場合と同様に月経周期が２８日である。血漿ホルモン濃度の測定は、カニクイザルの月経周期全体を通じておこない、卵胞期および黄体期の継続期間、該周期中の血漿エストラジオールおよびプロゲステロン濃度もまた、女性のものと著しく類似している。
【０４４０】
カニクイザル（オスまたはメス）を用いて、アンチセンスオリゴヌクレオチドの評価を、該アンチセンスオリゴヌクレオチドがアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡまたはタンパク質のレベルを下げる可能性について、またアポリポタンパク質Ｂに関連した表現型指標（限定されるものではないが、心血管指標、アテローム性動脈硬化、脂質疾患、肥満、およびプラーク形成が挙げられる）についてもおこなった。１回の試験で、通常または高脂質かつ高コレステロールの餌を与えられた正常および誘発性高コレステロール血症のサルを含むこともあり得る。カニクイザルに対して、種々の処方計画で投薬することができ、１〜２ヶ月間にわたってオリゴマー化合物１０〜２０ｍｇ／ｋｇが皮下に投与される。試験期間中に観察可能なパラメータとして、全血漿コレステロール、ＬＤＬ−コレステロール、ＨＤＬ−コレステロール、トリグリセリド、動脈壁コレステロール含有量、および冠状内膜肥厚を挙げることができるだろう。
【０４４１】
（実施例４６）
（カニクイザル（Ｍａｃａｃａ  ｆａｓｃｉｃｕｌａｒｉｓ）アポリポタンパク質Ｂの好ましい標的セグメントの配列決定）
本発明に従って、当技術分野で入手不可能なカニクイザルアポリポタンパク質Ｂの一部分を増幅した。ヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ配列（ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＭ＿０００３８４．１、本明細書では配列番号３として援用）の位置２９２０ないし３４２０は、ＩＳＩＳ  ３０１０１２がハイブリダイズする好ましい標的セグメントを含むことから、カニクイサルのアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡの対応セグメントを増幅して、その配列を決定した。ヒトアポリポタンパク質ＢにおいてＩＳＩＳ  ３０１０１２にハイブリダイズする部位の増幅を、５’側位置２９２０と３’側位置３４２０とにプライマーを置くことよって、おこなった。カニクイザル肝細胞をＩｎ  Ｖｉｔｒｏ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ  （Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）から購入した。５００ｂｐフラグメントをヒトおよびカニクイザル１°肝細胞ｃＤＮＡを用いて生産し、また精製された全ＲＮＡの逆転写とそれに続く４０ラウンドのＰＣＲ増幅によって生産した。ヒトおよびカニクイザルの単位複製配列のゲル精製に続いて、各生成物の正方向および逆方向の配列決定反応をＲｅｔｒｏｇｅｎ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎのキットを用いて単鎖ｃＤＮＡを生成し、Ａｍｐｌｉｔａｑ  ＰＣＲ反応のための試薬を提供）によっておこなった。本明細書では、このカニクイザル配列を配列番号８５５として援用するもので、該カニクイザル配列はヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡの位置２９２０ないし３４２０と９６％相同である。
【０４４２】
（実施例４７）
（Ｃ５７ＢＬ／６ＮＴａｃ−ＴｇＮ（ＡＰＯＢ１００）標的マウスでのヒトアポリポタンパク質Ｂ遺伝子のアンチセンス阻害の効果（ＩＳＩＳ  ２８１６２５および３０１０１２））
Ｃ５７ＢＬ／６ＮＴａｃ−ＴｇＮ（ＡＰＯＢ１００）トランスジェニックマウスは、導入（「ノックイン」）されたヒトアポリポタンパク質Ｂ遺伝子を有する。該マウスは、高レベルのヒトアポリポタンパク質Ｂ１００を発現し、ＬＤＬコレステロールの血清レベルが上昇したマウスを生ずる。これらのマウスは、上昇したＬＤＬコレステロールレベルとアテローム性動脈硬化のリスクとを減少させる化合物の同定および評価に有用である。高脂肪コレステロール食餌を与えた場合、これらのマウスは、内皮の下に横たわり、かつ中膜内にある泡末細胞の著しい蓄積を生じ、対照群の動物よりも著しく複雑なアテローム硬化型の病変を持つ。
【０４４３】
Ｃ５７ＢＬ／６ＮＴａｃ−ＴｇＮ（ＡＰＯＢ１００）マウスを２つの群（一群をオリゴヌクレオチド処理とし、対照群動物を生理食塩水処理とする）に分けた。一晩絶食させた後、マウスに対して生理食塩水または２５ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  ２８１６２５（配列番号２２４）もしくはＩＳＩＳ  ３０１０１２（配列番号２４７）を８週間にわたり週に２回、腹腔内に投薬した。試験終了時および最終注射の４８時間後に、動物を犠牲にして肝臓内の標的ｍＲＮＡレベル、コレステロールおよびトリグリセリドレベル、ならびに肝臓酵素レベルを評価した。加えて、内因性の肝臓内マウスアポリポタンパク質Ｂレベルを測定して、ヒトアポリポタンパク質Ｂを標的化したそれらのアンチセンスオリゴヌクレオチドのすべての効果を評価した。
【０４４４】
ＩＳＩＳ  ２８１６２５またはＩＳＩＳ  ３０１０１２で処理するやいなや、ＡＳＴおよびＡＬＴレベルが上昇したが、正常のレベル（〜３００ＩＵ／Ｌ）を超えるものではなかった。コレステロールレベルは生理食塩水処理と比べてわずかに増加し、その一方でトリグリセリドレベルがわずかに減少した。それらのマウスで発現されるヒトアポリポタンパク質Ｂを標的化したそれらのオリゴヌクレオチドのいずれかによる処理は、ヒトアポリポタンパク質のｍＲＮＡレベルを顕著に減少させる一方で、内因性マウスアポリポタンパク質Ｂのレベルには影響を及ぼさなかった。このことは、それらのオリゴヌクレオチドがヒトアポリポタンパク質Ｂに対して特異性を示すことを示している。比較試験の結果を表２４に示す。
【０４４５】
（表２４）
（マウスでのＩＳＩＳ  ２８１６２５および３０１０１２処理のアポリポタンパク質Ｂ
ｍＲＮＡ、肝臓酵素、コレステロール、およびトリグリセリドレベルに対する効果）
【０４４６】
【表２４】
2014087368.tif 000055
ＩＳＩＳ  ３０１０１２による２週間および４週間の処理の後、ＬＤＬ−コレステロールのレベルがそれぞれ２２ｍｇ／ｄＬおよび１７ｍｇ／ｄＬまで減少した。
【０４４７】
肝臓に含まれるアポリポタンパク質Ｂのタンパク質レベルも８週間にわたる処理の終わりに評価した。肝臓タンパク質を単離して、ヒトまたはマウスアポリポタンパク質Ｂタンパク質に特異的な抗体（それぞれ、ＵＳ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｓ，Ｓｗａｍｐｓｃｏｔｔ，ＭＡ  およびＳａｎｔａ  Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．，Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ，ＣＡ）を用いて、免疫ブロット法による分析をおこなった。肝臓タンパク質試料の免疫ブロット分析は、ヒトアポリポタンパク質Ｂの両形態（アポリポタンパク質Ｂ−１００およびアポリポタンパク質Ｂ‐４８）の発現の減少を明らかにする。マウスの肝臓内アポリポタンパク質Ｂレベルは、免疫ブロット分析で判断されるように、著しくは変化しなかった。
【０４４８】
血清試料も、２、４、６、および８週目で採取し、ヒトアポリポタンパク質Ｂ特異的ＥＬＩＳＡキット（ＡＬｅｒＣＨＥＫ  Ｉｎｃ．，Ｐｏｒｔｌａｎｄ，ＭＥ）を用いて、ヒトアポリポタンパク質Ｂ発現について評価した。ＥＬＩＳＡによるヒト血清アポリポタンパク質Ｂタンパク質の定量によって、ＩＳＩＳ  ２８１６２５による処理で、２、４、６、および８週目でそれぞれ３１、２６、１１、および２６％まで減少したことが明らかになった。ＩＳＩＳ  ３０１０１２による処理では、生理的食塩水で処理された対照群の動物と比較して、２、４、６、および８週目でそれぞれ７０、８７、８１、および４１％までヒト血清アポリポタンパク質Ｂタンパク質が減少した。トランスジェニックマウスから得た血清も、ヒトおよびマウス特異的アポリポタンパク質Ｂ抗体（それぞれＵＳ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｓ，Ｓｗａｍｐｓｃｏｔｔ，ＭＡおよびＳａｎｔａ  Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．，Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ，ＣＡ）を用いた免疫ブロット分析にかけた。動物から得た血清試料の免疫ブロット分析は、ヒトアポリポタンパク質Ｂ発現と類似したパターンを示し、血清アポリポタンパク質Ｂタンパク質が処理２、４、および６週目後に著しく減少し、８週目では僅かに減少した。血清中のマウスアポリポタンパク質Ｂは、免疫ブロット分析によって評価されたように、著しくは変化しなかった。
【０４４９】
（実施例４８）
（Ｃ５７ＢＬ／６マウスでのアポリポタンパク質Ｂ（ＩＳＩＳ  ２３３１７２、２３３１７５、２８１６２５、３０１０１２、および３０１０２７）のアンチセンス阻害の効果）
Ｃ５７ＢＬ／６マウス（高脂血症によって誘発されたアテローム硬化型プラーク形成に感受性であると報告された株）を、ヒトまたはウサギのアポリポタンパク質Ｂを標的とするいくつかのアンチセンスオリゴヌクレオチドのマウスでの毒性を評価する以下の試験に用いた。
【０４５０】
Ｃ５７ＢＬ／６マウスを２つの群（一群をオリゴヌクレオチド処理とし、対照群動物を生理食塩水処理とする）に分けた。一晩絶食させた後、マウスに対して生理食塩水または２５ｍｇ／ｋｇのいくつかのオリゴヌクレオチドを２週間にわたり週に２回、腹腔内に投薬した。本試験に用いたアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＩＳＩＳ  ２３３１７２（配列番号８３５）およびＩＳＩＳ  ２３３１７５（配列番号８３８）（両方ともウサギアポリポタンパク質Ｂを標的化）と、ＩＳＩＳ  ２８１６２５（配列番号２２４）、ＩＳＩＳ  ３０１０１２（配列番号２４７）およびＩＳＩＳ  ３０１０２７（配列番号２６２）（ヒトアポリポタンパク質Ｂを標的化）とである。試験終了時および最終注射の４８時間後に、動物を犠牲にして、肝臓酵素レベル、体重、肝重量、および脾臓重量を評価した。
【０４５１】
３種類のアンチセンスオリゴヌクレオチドに対して、マウスでの肝臓酵素のレベルが生理食塩水処理と比較して減少した。しかし、ウサギオリゴヌクレオチドＩＳＩＳ  ２３３１７５とヒトオリゴヌクレオチドＩＳＩＳ  ３０１０２７の両方ともこれらの肝臓酵素のレベルを大幅に増加させたことから、毒性があることが示された。試験したオリゴヌクレオチドの全てについて、体重、肝重量、および脾臓重量の変化は軽度であった。比較試験の結果を表２５に示す。
【０４５２】
（表２５）
（マウスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ、肝臓酵素、コレステロール、トリグリセリドレベルに対するヒトまたはウサギアポリポタンパク質Ｂを標的化したアンチセンスオリゴヌクレオチドの効果）
【０４５３】
【表２５】
2014087368.tif 000056
（実施例４９）
（２つの異なる用量でのオリゴヌクレオチドの経時的評価）
Ｃ５７ＢＬ／６マウス（高脂血症によって誘発されたアテローム硬化型プラーク形成に感受性であると報告された株）を、ヒトアポリポタンパク質Ｂを標的とするいくつかのアンチセンスオリゴヌクレオチドのマウスでの毒性を評価する以下の試験に用いた。
【０４５４】
メスＣ５７ＢＬ／６マウスを２つの群（一群をオリゴヌクレオチド処理とし、対照群動物を生理食塩水処理とする）に分けた。一晩絶食させた後、マウスに対して生理食塩水または２５ｍｇ／ｋｇもしくは５０ｍｇ／ｋｇＩＳＩＳ  ２８１６２５（配列番号２２４）、ＩＳＩＳ  ３０１０１２（配列番号２４７）、またはＩＳＩＳ  ３０１０２７（配列番号２６２）を２週間にわたり週に２回、腹腔内に投薬した。２週間後、血液試料をマウスの尾から採取し、肝臓酵素について評価した。４週間後、試験を終了し、動物を犠牲にして肝臓酵素レベルについての評価をおこなった。
【０４５５】
ＩＳＩＳ  ２８１６２５およびＩＳＩＳ  ３０１０１２に関して、２週間後、どの用量でもＡＳＴおよびＡＬＴレベルが生理食塩水のものに近いままであった。４週間後、ＡＳＴおよびＡＬＴレベルは、低用量に関しては生理食塩水処理の動物を上回る適度な増加を示したが、高用量では大きく増加した。ＩＳＩＳ  ３０１０２７（いずれの用量でも投与される）は、２週間後にＡＳＴおよびＡＬＴレベルがわずかに増加し、４週間後にＡＳＴおよびＡＬＴレベルがかなり増加したことが示された。試験の結果を表２６にまとめた。
【０４５６】
（表２６）
（２および４週間後のＩＳＩＳ  ２８１６２５、３０１０１２、または３０１０２７で処理したマウスでのＡＳＴおよびＡＴＬレベル）
【０４５７】
【表２６】
2014087368.tif 000057
（実施例５０）
（ｏｂ／ｏｂマウスでのアポリポタンパク質Ｂ（ＩＳＩＳ  １４７４８３および１４７７６４）のアンチセンス阻害の効果）
レプチンは、食欲を調整する脂肪によって生産されるホルモンである。このホルモンがヒトおよびヒト以外の動物で欠乏すると肥満なる。ｏｂ／ｏｂマウスは、肥満および高血糖が生ずるレプチン遺伝子の突然変異を有する。それなりに、これらのマウスは、肥満および糖尿病の試験、さらにはそれらの状態を処理するように設計された処理にとって、有用なモデルである。
【０４５８】
高脂肪高コレステロール食餌（０．１５％コレステロールが補充された６０％ｋｃａｌ脂肪）を、いくつかのオリゴヌクレオチドの１つと反応させ、ｏｂ／ｏｂマウスでのアポリポタンパク質Ｂ関連表現型指標に対する効果を評価した。一晩絶食させた後、各群のマウスに対して５０ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  １４７４８３（配列番号７９）もしくは１４７７６４（配列番号１０９）、または対照群ＩＳＩＳ  １１６８４７（配列番号８５７）もしくは１４１９２３（配列番号８５８）、あるいは生理食塩水を、６週間にわたって、週に２回、腹腔内に投薬した。試験終了時および最終注射の４８時間後に、動物を犠牲にして肝臓内の標的ｍＲＮＡレベル、コレステロールおよびトリグリセリドレベル、肝臓酵素レベル、血清グルコースレベル、ならびにＰＴＥＮレベルを評価した。
【０４５９】
ＩＳＩＳ  １４７４８３および１４７７６４を両方ともアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルのみならず、グルコース、コレステロール、およびトリグリセリドのレベルも下げることが可能である。比較試験の結果を表２７に示す。
【０４６０】
（表２７）
（ｏｂ／ｏｂマウスでのＩＳＩＳ  １４７４８３および１４７７６４処理のアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ、コレステロール、脂質、トリグリセリド、肝臓酵素、グルコース、およびＰＴＥＮレベルの効果）
【０４６１】
【表２７】
2014087368.tif 000058
（実施例５１）
（高脂肪摂食マウスでのアポリポタンパク質Ｂのアンチセンス阻害：時間依存効果）
本発明の別の実施形態では、マウスでのアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルを、肝臓オリゴヌクレオチド濃度、全コレステロール、ＬＤＬコレステロール、およびＨＤＬコレステロールと比較した。高脂肪食餌（６０％）を与えられたオスＣ５７Ｂ１／６マウスを、６週間にわたって、５０ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）または５０ｍｇ／ｋｇの対照オリゴヌクレオチドＩＳＩＳ  １４１９２３（配列番号８５８）を腹腔内に週に２回注射することによる処理の効果について評価した。対照動物に対して、生理食塩水による処理を施した。２日間の処理後ならびに１、２、４、および６週間の処理後に、動物を犠牲にした。各時点での各処理群のマウスの数を８匹とした。
【０４６２】
肝臓での標的発現の測定は、本明細書の他の実施例に記載したように、リアルタイムＰＣＲによっておこない、該標的発現を生理的食塩水処理マウスと比較したパーセント阻害として表した。Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ  （Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ａｍｅｒｉｃａ  Ｉｎｃ．，Ｍｅｌｖｉｌｌｅ，ＮＹ）を用いた日常的な臨床分析によって、総コレステロールレベル、ＬＤＬコレステロールレベル、およびＨＤＬコレステロールレベルを測定してｍｇ／ｄＬで表した。生理食塩水処理動物で得られた結果を比較のために示す。肝臓組織内のインタクトなオリゴヌクレオチドの測定は、キャピラリーゲル電気泳動によっておこない、組織１グラムあたりのオリゴヌクレオチドのマイクログラムとして表す。全ての結果は８匹の動物の平均値であり、該結果を表２８に示す。
【０４６３】
（表２８）
（ＩＳＩＳ  １４７７６４処理中の肝臓薬物濃度と、アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ発現と、血清脂質との相関関係）
【０４６４】
【表２８】
2014087368.tif 000059
これらの結果は、ＩＳＩＳ  １４７７６４によるアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡの阻害が処理２日以内に生じ、引き続く処理で阻害が増大し、６週間の処理まで持続していたことを示している。肝臓オリゴヌクレオチドレベルの定量によって、標的阻害の程度と肝臓薬物濃度とのあいだに強い相互関係があることがあきらかになる。さらに、１、２、３、および４週間の処理で、標的ｍＲＮＡの阻害とコレステロールレベル（総、ＨＤＬ、およびＬＤＬ）とのあいだに、アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡのパーセント阻害が大きくなり始めるとコレステロールレベルが低下するという、逆相関が観察される。血清試料を、マウスアポリポタンパク質Ｂタンパク質に対する抗体（Ｇｌａｄｓｔｏｎｅ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ，Ｓａｎ  Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）を用いた免疫ブロット分析にかけた。タンパク質の発現は、血清中のアポリポタンパク質Ｂタンパク質が４８時間以内に著しく減少し、６週間の処理期間を通して低下することで、ｍＲＮＡのものとｍＲＮＡのもと同じパターンになる。
【０４６５】
この例に記載されているオリゴヌクレオチド処理を繰り返しておこない、ＩＳＩＳ  １４７７６４の効果が処理停止の後で持続する程度を調べた。この例に記載されているオリゴヌクレオチド処理を繰り返しておこない、ＩＳＩＳ  １４７７６４の効果が処理停止の後で持続する程度を調べた。記載したようにマウスを処理し、オリゴヌクレオチド処理を停止した後、１、２、４、６、および８週目で犠牲にした。同じパラメータを分析し、結果を表２９に示した。
【０４６６】
（表２９）
（投薬停止後の肝臓薬物濃度と、アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ発現と、血清脂質との相関）
【０４６７】
【表２９】
2014087368.tif 000060
これらのデータは、オリゴヌクレオチド処理終了後、アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ阻害およびコレステロール低下を含むＩＳＩＳ  １４７７６４の効果が８週間持続することを示す。免疫ブロット分析によって、アポリポタンパク質Ｂタンパク質／レベルが、ｍＲＮＡ発現レベルで観察されたパターンに類似のパターンをたどることが示される。
【０４６８】
（実施例５２）
（Ｃ５７ＢＬ／６ＮＴａｃ−ＴｇＮ（ＡＰＯＢ１００）トランスジェニックマウスでの３０１０１２によるヒトアポリポタンパク質Ｂ遺伝子のアンチセンス阻害の効果：投薬試験）
Ｃ５７ＢＬ／６ＮＴａｃ−ＴｇＮ（ＡＰＯＢ１００）トランスジェニックマウスは、導入（「ノックイン」）されたヒトアポリポタンパク質Ｂ遺伝子を有する。該マウスは、高レベルのヒトアポリポタンパク質Ｂ１００を発現し、ＬＤＬコレステロールの血清レベルが上昇したマウスを生ずる。これらのマウスは、上昇したＬＤＬコレステロールレベルとアテローム性動脈硬化のリスクとを減少させる化合物の同定および評価に有用である。高脂肪コレステロール食餌を与えた場合、これらのマウスは、内皮の下に横たわり、かつ中膜内にある泡末細胞の著しい蓄積を生じ、対照群の動物よりも著しく複雑なアテローム斑の病変を持つ。
【０４６９】
Ｃ５７ＢＬ／６ＮＴａｃ−ＴｇＮ（ＡＰＯＢ１００）マウス（Ｔａｃｏｎｉｃ，Ｇｅｒｍａｎｔｏｗｎ，ＮＹ）でのＩＳＩＳ３０１０１２によるヒトアポリポタンパク質Ｂの阻害に関する長期にわたる試験を、３ヶ月間にわたって実施した。マウスに対して、１０または２５ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  ３０１０１２（配列番号２４７）を週に２回、１２週間にわたって腹腔内投与した。生理食塩水を注射した動物を対照群とした。各処理群を４匹の動物からなるものとした。
【０４７０】
２週間、４週間、６週間、８週間、および１２週間にわたる処理の後、ヒトアポリポタンパク質Ｂタンパク質を測定することを目的として血清試料を採取した。血清タンパク質の定量を、ヒトアポリポタンパク質Ｂに特異的なＥＬＩＳＡキット（ＡＬｅｒＣＨＥＫ  Ｉｎｃ．，Ｐｏｒｔｌａｎｄ，ＭＥ）を用いておこなった。データを表３０に示した。各々の結果は動物４匹の平均値である。データの正規化は、生理食塩水処理した対照動物に対しておこなう。
【０４７１】
（表３０）
（ＩＳＩＳ  ３０１０１２処理後のトランスジェニックマウス血清でのヒトアポリポタンパク質Ｂタンパク質の減少）
【０４７２】
【表３０】
2014087368.tif 000061
これらのデータは、ＩＳＩＳ  ３０１０１２による２、４、６、または１２週間の処理後に、トランスジェニック／マウスから得た血清に含まれるヒトアポリポタンパク質Ｂタンパク質のレベルが約８０％まで低下することを示しており、ｍＲＮＡ発現の阻害に加えて、ＩＳＩＳ  ３０１０１２がヒトアポリポタンパク質Ｂトランス遺伝子を持つマウスでのヒトアポリポタンパク質Ｂタンパク質発現を効果的に阻害することが示される。血清中のアポリポタンパク質Ｂタンパク質の評価も、ヒトアポリポタンパク質Ｂタンパク質に対する抗体（ＵＳ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｓ，Ｓｗａｍｐｓｃｏｔｔ，ＭＡ）を用いた免疫ブロット分析によっておこなわれる。  この分析によって、ヒトアポリポタンパク質Ｂタンパク質（アポリポタンパク質Ｂ１００およびアポリポタンパク質Ｂ−４８の形態）が処理の２、４、６、および１２週目で低下することが示される。マウスアポリポタンパク質Ｂ特異的抗体（Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．，Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ，ＣＡ）を用いた免疫ブロット分析によって、血清中のマウスタンパク質の発現に著しい変化がないことが明らかである。
【０４７３】
処理が開始された時点（開始）および処理２週目、４週目、６週目、および８週目で、血清試料を採取し、総コレステロールレベル、ＬＤＬコレステロールレベル、およびＨＤＬコレステロールレベルを、Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ  （Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ａｍｅｒｉｃａ  Ｉｎｃ．，Ｍｅｌｖｉｌｌｅ，ＮＹ）を用いた日常的な臨床分析によって測定し、それらのデータを表３１に示す。結果を血清中のｍｇ／ｄＬとして表し、動物４匹の平均値として表示する。生理食塩水対照動物の結果も示す。
【０４７４】
（表３１）
（ヒトアポリポタンパク質Ｂトランス遺伝子マウスの血清脂質に対するＩＳＩＳ  ３０１０１２の効果）
【０４７５】
【表３１】
2014087368.tif 000062
これらのデータは、最初の４週間の処理中、１０または２５ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  １４７７６４による処理によって、ＬＤＬコレステロールが減少することを示している。
【０４７６】
この試験は、処理の第８週目での最終注射から４８時間後、動物を犠牲にして肝臓の標的ｍＲＮＡレベル、肝臓のアポリポタンパク質Ｂタンパク質レベル、ならびに血清コレステロールおよび肝臓酵素レベルを評価した時に終了した。また、マウスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ発現に対するＩＳＩＳ  ３０１０１２のいっさいの効果を評価するために、肝臓での内因性マウスアポリポタンパク質Ｂレベルの発現を測定した。
【０４７７】
１２週間にわたって処理した動物の肝臓におけるヒトおよびマウスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルを、本明細書に記載したようにリアルタイムＰＣＲによって測定した。各々の結果は、動物４匹から得たデータの平均値である。これらのデータを、生理的食塩水の対照群に対して正規化して表３２に示す。
【０４７８】
（表３２）
（トランスジェニックマウスでのヒトおよびマウスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対するＩＳＩＳ  ３０１０１２の効果）
【０４７９】
【表３２】
2014087368.tif 000063
これらのデータは、ＩＳＩＳ  ３０１０１２による処理を１２週間おこなった後、ヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡがトランスジェニックマウスの肝臓で７５％ほど減少する一方で、マウス肝臓アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡは影響を受けなかったことを示している。さらに、トランスジェニックマウスの肝臓におけるアポリポタンパク質Ｂタンパク質のＥＬＩＳＡ分析は、１０および２０ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  ３０１０１２による処理後に、それぞれヒトタンパク質が８０％および８２％減少することを明らかにしている。ヒトアポリポタンパク質Ｂに対する抗体を用いた免疫ブロット分析もまた、トランスジェニックマウスの肝臓におけるヒトアポリポタンパク質Ｂ（アポリポタンパク質Ｂ−１００およびアポリポタンパク質Ｂ−４８の形態）の発現の減少を示している。マウスアポリポタンパク質Ｂタンパク質（Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．，Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ，ＣＡ）に対する抗体を用いた免疫ブロット分析では、肝臓でのマウスタンパク質の発現に有意な変化はない。
【０４８０】
血清中のＡＬＴおよびＡＳＴレベルもまた、Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ  （Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ａｍｅｒｉｃａ  Ｉｎｃ．，Ｍｅｌｖｉｌｌｅ，ＮＹ）を用いて測定したところ、ＩＳＩＳ  ３０１０１２による処理の後、ＡＳＴおよびＡＬＴレベルが上昇したが正常のレベル（〜３００ＩＵ／Ｌ）を超えるものではないことが示された。このことは、ＩＳＩＳ  ３０１０１２処理による毒性の欠如を示している。
【０４８１】
（実施例５３）
（ＩＳＩＳ  ３０１０１２のインビトロ免疫活性化効果の評価）
免疫活性化活性は、炎症誘発性因子への暴露に対するサイトカインの生産によって定義される。本発明のさらに別の実施形態では、ＩＳＩＳ  ３０１０１２を免疫活性化（または炎症誘発性）活性について試験した。これらの試験は、ＭＤＳ  Ｐｈａｒｍａ  Ｓｅｒｖｉｃｅｓ  （Ｓａｉｎｔ  Ｇｅｒｍａｉｎ  ｓｕｒ  ｌ’Ａｒｂｒｅｓｌｅ，Ｆｒａｎｃｅ）によっておこなわれた。ウイルス、化学、または放射線による処理を故意に受けていない野生型Ｂ６Ｃ３Ｆ１マウスから全血を採取した。培養血液細胞を０．５、５、または５０μＭのＩＳＩＳ  ３０１０１２に対して、１４ないし１６時間にわたって晒した。炎症誘発活性を持つことが知られているアンチセンスオリゴヌクレオチドを正の対照群として用いた。各々の処理を三回繰り返しておこなった。処理期間が終わる時点で、上清を採取し、マウス炎症ＣＢＡキット（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ，Ｆｒａｎｋｌｉｎ  Ｌａｋｅｓ，ＮＪ）によってフローサイトメトリー法を用いて、サイトカイン分析をおこなった。結果は、ＩＳＩＳ  ３０１０１２は、試験したサイトカイン（インターロイキン−１２ｐ７０（ＩＬ−１２ｐ７０）、腫瘍壊死因子アルファ（ＴＮＦ−α）、インターフェロンγ（ＩＦＮ−γ）、インターロイキン６（ＩＬ−６）、マクロファージ走化因子タンパク質−１（ＭＣＰ−１）、およびインターロイキンー１０（ＩＬ−１０））のいずれの放出も刺激しないことを明らかにした。したがって、ＩＳＩＳ  ３０１０１２は、インビトロ免疫活性化アッセイで決定されたように、免疫活性化作用を持たない。
【０４８２】
（実施例５４）
（アポリポタンパク質Ｂの比較ゲノム分析）
本発明に従って、ヒト、マウス、およびサルに由来するアポリポタンパク質Ｂ配列の比較ゲノム分析をおこなったところ、アポリポタンパク質Ｂ配列は種を超えて保存される。ヒトおよびマウスのアポリポタンパク質Ｂ遺伝子の組織化もまた、高度に保存される。ヒトおよびマウス遺伝子は、２９および２６個のエキソンからそれぞれ構成されている。マウスｍＲＮＡは、ヒト配列に対して約８１％相同性である。ヒト以外の霊長類におけるアポリポタンパク質Ｂの完全配列および遺伝子構造は同定されていなかった。しかし、実施例４６に説明したように、ＩＳＩＳ  ３０１０１２標的配列を含む５００塩基対フラグメントは、ヒト配列に対して約９６％同一性を示す。
【０４８３】
ＩＳＩＳ  ３０１０１２の結合部位は、コーディング領域内にあり、ヒトアポリポタンパク質ＢｍＲＮＡのエキソン２２内である。ヒト、マウス、およびサルのＩＳＩＳ  ３０１０１２結合部位を比較したところ、重要な配列多様性が観察された。５００ヌクレオチド領域にわたるヒトとサルとの全体的な配列保存が約９６％であるが、サル配列のＩＳＩＳ  ３０１０１２結合部位には、ヒト配列と比較してミスマッチが２つ含まれる。同様に、マウスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ配列がヒトに対して約８１％相同性であり、ＩＳＩＳ  ３０１０１２結合部位内で、５ヌクレオチドが異なる。ヒト、マウス、およびサルのアポリポタンパク質Ｂ配列に対するＩＳＩＳ  ３０１０１２結合部位についての配列比較を表３３に示す。ＩＳＩＳ  ３０１０１２標的配列に関連するミスマッチをしたヌクレオチドに下線が引かれている。
【０４８４】
（表３３）
（ヒト、サル、およびマウスのアポリポタンパク質Ｂ配列のあいだでのＩＳＩＳ  ３０１０１２結合部位の比較）
【０４８５】
【表３３】
2014087368.tif 000064
マウスアンチセンスオリゴヌクレオチドＩＳＩＳ  １４７７６４がハイブリダイズする標的配列は、マウスアポリポタンパク質Ｂ遺伝子のエキソン２４内にある。マウスおよびヒトアポリポタンパク質Ｂ配列でのＩＳＩＳ  １４７７６４結合部位についての配列比較を表３４に示す。ＩＳＩＳ  １４７７６４標的配列に関連したミスマッチのヌクレオチドに下線を付した。
【０４８６】
（表３４）
マウスアポリポタンパク質Ｂ配列とヒトアポリポタンパク質Ｂ配列とのあいだのＩＳＩＳ
１４７７６４結合部位の比較
【０４８７】
【表３４】
2014087368.tif 000065
（実施例５５）
（ＩＳＩＳ  ３０１０１２のＢＬＡＳＴ分析）
本発明に従って、ＩＳＩＳ  ３０１０１２が完全な相補性でハイブリダイズするヒトゲノム内の領域の数を測定した。標的核酸の一領域とのアンチセンス化合物のパーセント相補性の測定は、当業者に公知のＢＬＡＳＴプログラム（ベーシックローカルアラインメントサーチツール）およびＰｏｗｅｒＢＬＡＳＴプログラム（Ａｌｔｓｃｈｕｌら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，１９９０，２１５，４０３−４１０；Ｚｈａｎｇ  ａｎｄ  Ｍａｄｄｅｎ，Ｇｅｎｏｍｅ  Ｒｅｓ．，１９９７，７，６４９−６５６）を用いておこなった。この分析は、ゲノムまたはプレｍＲＮＡ領域およびコード配列での配列相補性を評価した。
【０４８８】
ゲノム領域では、ＩＳＩＳ  ３０１０１２では、アポリポタンパク質Ｂ遺伝子のみに対して相補的な完全配列を示す。ＩＳＩＳ  ３０１０１２に関連した１つのミスマッチを持つ標的配列は見つけられていない。ＩＳＩＳ  ３０１０１２標的配列とヘパラナーゼ遺伝子とのあいだに２つのミスマッチが見いだされ、ＩＳＩＳ  ３０１０１２標的配列と２８ユニークゲノム部位とのあいだに３つのミスマッチが見いだされる。
【０４８９】
ＲＮＡ配列では、完全な配列相補性がＩＳＩＳ  ３０１０１２と、アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡおよび３つの発現配列タグ（ヒトアポリポタンパク質Ｂ前駆体に対する適度な類似性を持つ）とのあいだに見いだされる。単一のミスマッチがＩＳＩＳ  ３０１０１２と、ミオシン軽鎖のかたちの平滑筋に対して類似した発現配列タグとのあいだに見いだされる。
【０４９０】
（実施例５６）
（ヒト一次肝細胞でのアポリポタンパク質Ｂのアンチセンス阻害：用量応答試験）
本発明によれば、ヒト一次肝細胞における用量応答試験で、ヒトアポリポタンパク質Ｂを標的化したアンチセンスオリゴヌクレオチドを試験した。プレ培養ヒト一次肝細胞を、ＩｎＶｉｔｒｏ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ  （Ｂａｌｔｉｍｏｒｅ，ＭＤ）から購入した。細胞の培養は、高１０％ウシ胎仔血清（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）と１００単位／ｍＬおよび１００μｇ／ｍＬのストレプトマイシン（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）とを添加した高グルコースＤＭＥＭ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）で、おこなった。
【０４９１】
ヒト一次肝細胞を、１０、５０、１５０、または３００ｎＭのＩＳＩＳ  ３０１０１２（配列番号２４７）で処理した。未処理細胞およびクランブル対照オリゴヌクレオチドＩＳＩＳ  １１３５２９  （ＣＴＣＴＴＡＣＴＧＴＧＣＴＧＴＧＧＡＣＡ、配列番号８５９）で処理した細胞を２つの対照細胞群とした。ＩＳＩＳ  １１３５２９は、２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー（ｇａｐｍｅｒ））であり、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中央「ギャップ」領域から構成され、該領域の両側（５’方向および３’方向）に５ヌクレオチドの「ウィング」が隣接している。これらのウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。全てのシチジン残基は、５−メチルシチジンである。
【０４９２】
オリゴヌクレオチドを、本明細書の他の実施例に記載したように、ＬＩＰＯＥＦＥＣＴＩＮ媒介トランスフェクションによって、細胞に導入した。細胞を、オリゴヌクレオチドによる処理後２４および４８時間目に収集し、ＲＮＡおよびタンパク質両方とも単離した。さらに、アポリポタンパク質Ｂタンパク質分泌のＥＬＩＳＡ分析用に、処理細胞の培養液を回収した。
【０４９３】
アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ発現の測定は、本明細書の他の実施例に記載したように、ＲＮＡ試料のリアルタイムＰＣＲによって、おこなった。各々の結果は、６回の実験を表す。データを未処理対照細胞に対して正規化し、表３５に示す。
【０４９４】
（表３５）
（ヒト一次細胞でのアンチセンスオリゴヌクレオチドによるアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡの阻害）
【０４９５】
【表３５】
2014087368.tif 000066
これらのデータは、ＩＳＩＳ  ３０１０１２がヒト一次肝細胞で用量依存的にアポリポタンパク質Ｂ発現を阻害することを示している。
【０４９６】
培養細胞の培地に分泌されたアポリポタンパク質Ｂの測定を、標的タンパク質特異的ＥＬＩＳＡキット（ＡＬｅｒＣＨＥＫ  Ｉｎｃ．，Ｐｏｒｔｌａｎｄ，ＭＥ）を用いて、５０および１５０ｎＭのオリゴヌクレオチドで処理した試料でおこなった。各々の結果は、３回の実験を表す。データを未処理対照細胞に対して正規化し、表３６に示す。
【０４９７】
（表３６）
（ＩＳＩＳ３０１０１２によるヒト一次肝細胞からのアポリポタンパク質Ｂタンパク質分泌の阻害）
【０４９８】
【表３６】
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２４時間後の５０、１５０、および３００ｎＭ用量から得たタンパク質試料と４８時間後の１５０および３００ｎＭ用量から得たタンパク質試料とを、本明細書の他の実施例に記載したように、ＵＳ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  （Ｓｗａｍｐｓｃｏｔｔ，ＭＡ）から購入したヒトアポリポタンパク質Ｂタンパク質特異的抗体を用いて、イムノブロット分析にかけた。イムノブロット分析は、さらに、ＩＳＩＳ  ３０１０１２によるアンチセンスオリゴヌクレオチド処理後、ヒト肝細胞のアポリポタンパク質Ｂタンパク質が用量依存的に減少することを示している。
【０４９９】
ヒト一次肝細胞のヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡに対するＩＳＩＳ  ２７１００９（配列番号３１９）、ＩＳＩＳ  ２８１６２５（配列番号２２４）、およびＩＳＩＳ  ３０１０２７（配列番号２６２）の効果を調べるために、追加の実験をおこなった。細胞を、本明細書に記載したように培養し、５、１０、５０、または１５０ｎＭのＩＳＩＳ  ２７１００９、ＩＳＩＳ  ２８１６２５、またはＩＳＩＳ  ３０１０２７によって、２４時間処理した。対照オリゴヌクレオチドＩＳＩＳ  １３６５０  （配列番号８０６）およびＩＳＩＳ  １１３５２９（配列番号８５９）を、５０または１５０ｎＭで用いた。ヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ発現の評価を、本明細書の他の実施例で説明したように、リアルタイムＰＣＲによっておこなった。培養細胞の培地に分泌されたアポリポタンパク質Ｂの測定を、標的タンパク質特異的ＥＬＩＳＡキット（ＡＬｅｒＣＨＥＫ  Ｉｎｃ．，Ｐｏｒｔｌａｎｄ，ＭＥ）を用いて、５０および１５０ｎＭのオリゴヌクレオチドで処理した試料でおこなった。
【０５００】
表３７に示すデータは、２回の実験の平均値を表し、未処理対照細胞に対して正規化したものである。存在する場合、「＋」は遺伝子発現が増加したことを示す。
【０５０１】
（表３７）
（ＩＳＩＳ  ２７１００９、ＩＳＩＳ  ２８１６２５、およびＩＳＩＳ  ３０１０２７によるヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡのアンチセンス阻害）
【０５０２】
【表３７】
2014087368.tif 000068
これらのデータは、ＩＳＩＳ  ２７１００９、ＩＳＩＳ  ２８１６２５、およびＩＳＩＳ  ３０１０２７がヒト一次肝細胞で用量依存的にアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡを阻害することを示している。ＩＳＩＳ  ２７１００９およびＩＳＩＳ  ３０１０２７は、細胞からのアポリポタンパク質Ｂタンパク質の分泌を用量依存的に阻害する。
【０５０３】
（実施例５７）
（アポリポタンパク質（ａ）発現に対するアポリポタンパク質Ｂ−１００  アンチセンスオリゴヌクレオチドの効果）
リポタンパク質（ａ）［Ｌｐ（ａ）］は、ジスフィルド結合した２つの異なるタンパク質であるアポリポタンパク質（ａ）とアポリポタンパク質Ｂとを含む（Ｒａｉｎｗａｔｅｒ  ａｎｄ  Ｋａｍｍｅｒｅｒ，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｚｏｏｌ．，１９９８，２８２，５４−６１）。本発明に従って、アポリポタンパク質Ｂを標的化したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、ヒト一次肝細胞に含まれるリポタンパク質（ａ）のアポリポタンパク質（ａ）成分の発現に対する効果について調べた。
【０５０４】
ヒト一次肝細胞（ＩｎＶｉｔｒｏ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｂａｌｔｉｍｏｒｅ，ＭＤ）（本明細書に記載したように培養およびトランスフェクションした）を５、１０、５０、または１５０ｎＭのＩＳＩＳ  ２７１００９（配列番号３１９）、２８１６２５（配列番号２２４）、３０１０１２（配列番号２４７）、または３０１０２７（配列番号２６２）によって処理した。細胞は、５０または１５０ｎＭの対照オリゴヌクレオチドＩＳＩＳ  １１３５２９（配列番号８５９）またはＩＳＩＳ  １３６５０（配列番号８０６）によっても処理した。未処理細胞を対照とした。２４時間のオリゴヌクレオチド処理の後、アポリポタンパク質（ａ）ｍＲＮＡ発現の測定を、本明細書の他の実施例に記載したように、定量的リアルタイムＰＣＲによっておこなった。
【０５０５】
ヒトアポリポタンパク質（ａ）に対するプローブおよびプライマーを、ヒトアポリポタンパク質（ａ）配列にハイブリダイズするように設計した。この際、公開されている配列情報を用いた（ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＭ＿００５５７７．１、本明細書では配列番号８６０として援用）。ヒトアポリポタンパク質（ａ）に関して、ＰＣＲプライマーを、
順方向プライマー：ＣＡＧＣＴＣＣＴＴＡＴＴＧＴＴＡＴＡＣＧＡＧＧＧＡ（配列番号８６１）および
逆方向プライマー：ＴＧＣＧＴＣＴＧＡＧＣＡＴＴＧＣＧＴ（配列番号８６２）
とし、ＰＣＲプローブをＦＡＭ−ＣＣＣＧＧＴＧＴＣＡＧＧＴＧＧＧＡＧＴＡＣＴＧＣ−ＴＡＭＲＡ（配列番号８６３）とした。ここで、ＦＡＭは蛍光色素、またＴＡＭＲＡはクエンチャー色素である。
【０５０６】
データは、３回の実験の平均値であり、未処理対照と比較したパーセント阻害として表されている。結果を表３８に示す。番号の頭に付けられた「＋」または「−」は、アンチセンスオリゴヌクレオチドによる処理後、アポリポタンパク質（ａ）発現が増加または減少したことを、それぞれ示している。
【０５０７】
（表３８）
（アポリポタンパク質（ａ）発現に対するアポリポタンパク質Ｂアンチセンスオリゴヌクレオチドの効果）
【０５０８】
【表３８】
2014087368.tif 000069
これらの結果は、ＩＳＩＳ  ３０１０１２がヒト一次肝細胞でアポリポタンパク質（ａ）の発現を損害しなかったことを示している。ＩＳＩＳ  ２７１００９は、最も高い用量でアポリポタンパク質（ａ）発現を阻害した。ＩＳＩＳ  ２８１６２５およびＩＳＩＳ  ３０１０２７は、アポリポタンパク質（ａ）ｍＲＮＡのレベルを減少させた。
【０５０９】
（実施例５８）
（アポリポタンパク質Ｂ−１００を標的化したアンチセンスオリゴヌクレオチドによるリポタンパク質（ａ）粒子分泌の阻害）
本発明に従って、１つのアポリポタンパク質Ｂ分子に共有結合した１つのアポリポタンパク質（ａ）分子から構成されるリポタンパク質（ａ）粒子の評価をリポタンパク質（ａ）のアポリポタンパク質Ｂ成分に対して標的化されたアンチセンスオリゴヌクレオチドにより処理したヒト一次肝細胞でおこなった。
【０５１０】
ヒト一次肝細胞（ＩｎＶｉｔｒｏ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｂａｌｔｉｍｏｒｅ，ＭＤ）は、本明細書に記載したように培養およびトランスフェクションしたものであり、２４時間にわたって５０または１５０ｎＭのＩＳＩＳ  ２７１００９（配列番号３１９）、２８１６２５（配列番号２２４）、３０１０１２（配列番号２４７）、または３０１０２７（配列番号２６２）によって処理した。細胞は、５０または１５０ｎＭの対照オリゴヌクレオチドＩＳＩＳ  １１３５２９（配列番号８５９）またはＩＳＩＳ  １３６５０（配列番号８０６）によっても処理した。未処理細胞を対照とした。２４時間のオリゴヌクレオチド処理の後、処理細胞から回収した培地に含まれるリポタンパク質（ａ）の量を、市販のＥＬＩＳＡキット（ＡＬｅｒＣＨＥＫ  Ｉｎｃ．，Ｐｏｒｔｌａｎｄ，ＭＥ）を用いて測定した。これらの結果は、３回の実験の平均値であり、未処理の対照と比較したリポタンパク質（ａ）分泌のパーセント変化として、表されている。データを表３９に示す。番号の頭に付けられた「＋」または「−」は、アポリポタンパク質Ｂを標的化しているアンチセンスオリゴヌクレオチドによる処理後、リポタンパク質（ａ）粒子の発現が増加または減少したことを、それぞれ示している。
【０５１１】
（表３９）
（アポリポタンパク質Ｂを標的化したアンチセンスオリゴヌクレオチドによるリポタンパク質（ａ）粒子分泌の阻害）
【０５１２】
【表３９】
2014087368.tif 000070
これらのデータは、リポタンパク質（ａ）粒子の一成分であるアポリポタンパク質Ｂのアンチセンス阻害が、ヒト一次肝細胞からのリポタンパク質（ａ）の分泌を減少しうることを示している。また、このようなリポタンパク質（ａ）分泌の減少は、実施例５７に示すように、アポリポタンパク質（ａ）ｍＲＮＡ発現の減少と必ずしも両立するというわけではない。
【０５１３】
（実施例５９）
（ＩＳＩＳ  ３０１０１２のミスマッチおよび切断誘導体）
本明細書で示すように、ＩＳＩＳ  ３０１０１２（配列番号２４７）は、ヒト一次肝細胞と同様に培養ヒト細胞系統のアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルを減少させる。本発明のさらに別の実施形態では、ＩＳＩＳ  ３０１０１２のヌクレオチド配列誘導体を用いて、試験をおこなった。ＩＳＩＳ  ３０１０１２配列の中心から開始して１ないし７塩基がミスマッチしている一連のオリゴヌクレオチドを設計した。この系列は、ＩＳＩＳ  ３０１０１２とその標的ｍＲＮＡ配列とのあいだでワトソンクリック塩基対形成の連続的損失が導入されるように設計された。これらの化合物を表４０に示す。ＩＳＩＳ  ３０１２と比較してミスマッチしたヌクレオチドを持つアンチセンス化合物は、２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー）であり、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中央「ギャップ」領域から構成され、該領域の両側（５’方向および３’方向）に５ヌクレオチドの「ウィング」が隣接している。これらのウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。
【０５１４】
ＩＳＩＳ  ３０１０１２の付加的な誘導体を設計した。この誘導体は、オリゴヌクレオチド全体にわたって２’−ＭＯＥヌクレオチドを有するＩＳＩＳ  ３０１０１２を含む（均一２’−ＭＯＥ）。この化合物は、長さが２０ヌクレオチドであり、オリゴヌクレオチド全体にホスホロチオエート結合を有する。この化合物もまた、表４０に示す。
【０５１５】
ＨｅｐＧ２細胞を、表４０の化合物５０または１５０ｎＭで２４時間にわたって処理し、その後、ＲＮＡを単離し、標的発現を本明細書に記載したようにリアルタイムＰＣＲで測定した。未処理細胞を対照とした。結果を表４０に示し、未処理の対照試料に対して正規化する。
【０５１６】
（表４０）
（ＨｅｐＧ２細胞でのアポリポタンパク質Ｂ発現に対するＩＳＩＳ  ３０１０１２ミスマッチオリゴヌクレオチドと均一２’−ＭＯＥオリゴヌクレオチドとの効果）
【０５１７】
【表４０】
2014087368.tif 000071
表４０の化合物でＨｅｐＧ２細胞を処理した結果から、親ＩＳＩＳ  ３０１０１２配列による処理の後に、どの化合物も用量依存的阻害を示さないことが明らかである。オリゴヌクレオチドの中心に単一のチミジン−シトシン置換のみを持つＩＳＩＳ  ３３２７７０は、ＩＳＩＳ  ３０１０１２よりも３倍効果が弱かった。さらにヌクレオチド置換をおこなうことで、アポリポタンパク質Ｂ発現のアンチセンス阻害が抑制された。
【０５１８】
ホスホロチオエートキメラオリゴヌクレオチドは、エンドヌクレアーゼ的切断によって優先的にインビボで代謝される。本発明に従って、ＩＳＩＳ  ３０１０１２配列を５’および／または３’末端から１または２塩基区切りで切断することで、一連のオリゴヌクレオチドを設計した。切断オリゴヌクレオチドは、エンドヌクレアーゼ的切断によって生ずる予想生成物を表す。これらの化合物を表４１に示す。表４１の化合物は、いろいろな長さのキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー）であり、２’−デオキシヌクレオチドからなる中央「ギャップ」領域から構成され、該領域の両側に２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドが隣接している。各キメラオリゴヌクレオチドの正確な構造を「キメラ構造」として表４１に示す。例えば、４〜１０−４の表示は、最初の４（５’最末端）および最後の４（３’最末端）ヌクレオチドが２’−ＭＯＥヌクレオチドであり、ギャップにある１０ヌクレオチドが２’−デオキシヌクレオチドである。２’−ＭＯＥヌクレオチドを太字で示す。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、下線を引いたヌクレオチド間のホスホジエステル（Ｐ＝Ｏ）である。すなわち、他の全てのヌクレオシド間結合はホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。
【０５１９】
これらの化合物を、アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡの発現を減少させる能力について、調べた。ＨｅｐＧ２細胞を、２４時間にわたって表４１の各々のアンチセンス化合物１０、５０、または１５０ｎＭで処理し、その後、ＲＮＡを単離して、本明細書に記載したようにリアルタイムＰＣＲによって標的発現の測定をおこなった。未処理細胞を対照とした。結果を表４１に示すとともに、未処理対照試料に対して正規化する。
【０５２０】
（表４１）
（ＨｅｐＧ２細胞でのアポリポタンパク質Ｂ発現に対するＩＳＩＳ  ３０１０１２の効果）
【０５２１】
【表４１】
2014087368.tif 000072
表４１の結果は、アポリポタンパク質Ｂの阻害が、配列相補性および用量のみならず配列長に依存している。しかし、表４１に示すように、  ＩＳＩＳ  ３０１０１２の切断型では、有る程度、アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ発現を阻害することができる。
【０５２２】
（実施例６０）
（ｄｓＲＮＡ標的ヒトアポリポタンパク質Ｂの設計およびスクリーニング）
本発明によれば、本発明のアンチセンス化合物とその相補体とを含む一連の核酸二本鎖を、標的アポリポタンパク質Ｂを標的とするために設計し、表４２に示す。表４２にある全ての化合物は、２０ヌクレオチドのオリゴリボヌクレオチドであり、化合物全体にわたってホスホジエステルヌクレオシド間結合（主鎖）を有する。該化合物を、平滑末端を持つものとして調製した。表４１は、ｄｓＲＮＡのアンチセンス鎖であり、該センス鎖をアンチセンス鎖の相補体として合成した。これらの配列は、ウラシル（Ｕ）を含むものとして表されているが、当業者はウラシル（Ｕ）がＤＮＡ配列のチミン（Ｔ）によって概ね置き換えられることを容易に理解する。「標的部位」は、化合物が結合する特定の標的配列上の第１の（５’最末端）ヌクレオチド番号を示している。表４２で複数の化合物からなるサブセットは、本明細書で記載したＤＮＡアンチセンスオリゴヌクレオチドのＲＮＡ等価物であり、必要に応じて、このことは「ＩＳＩＳ番号のＲＮＡ等価物」欄にあるＤＮＡオリゴヌクレオチドのＩＳＩＳ番号によって示される。
【０５２３】
（表４２）
（ヒトアポリポタンパク質Ｂを標的とするｄｓＲＮＡ）
【０５２４】
【表４２】
2014087368.tif 000073
表４２のｄｓＲＮＡ化合物を、ＨｅｐＧ２細胞でのヒトアポリポタンパク質ｍＲＮＡに対する効果について調べた。ＨｅｐＧ２細胞を、５μｇ／ｍＬのＬＩＰＯＦＥＣＴＩＮ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）と混合した１００ｎＭのｄｓＲＮＡによって１６時間にわたって処理した。同一の実験で、ＨｅｐＧ２細胞に対して、３．７５μｇ／ｍＬのＬＩＰＯＦＥＣＴＩＮと混合した本明細書に記載の複数のアンチセンスオリゴヌクレオチド（これらの混合物を表４３に列挙）からなるサブセット１５０ｎＭによる処理も、おこなった。対照オリゴヌクレオチドとして、ＩＳＩＳ  １８０７８（ＧＴＧＣＧＣＧＣＧＡＧＣＣＣＧＡＡＡＴＣ，配列番号８８８）も挙げられ、ＩＳＩＳ  １８０７８は、２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー）であり、９個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中央「ギャップ」領域から構成され、該領域の両側、すなわち５’方向および３’方向に、５ヌクレオチドの「ウィング」および６ヌクレオチドの「ウィング」がそれぞれ隣接している。これらのウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。全てのシチジンは、５−メチルシチジンである。ＩＳＩＳ  ２６３１８８（ＣＵＵＣＵＧＧＣＡＵＣＣＧＧＵＵＵＡＧＴＴ、配列番号８８９）とその相補体とからなる二重鎖もまた、対照として用いた。ＩＳＩＳ  ２６３１８８は、３’末端上の２ヌクレオチドがオリゴデオキシリボヌクレオチド（ＴＴ）であり、かつ化合物全体にわたってホスホジエステルヌクレオシド間結合（主鎖）を有する２１ヌクレオチド長のオリゴリボヌクレオチドである。
【０５２５】
細胞を４時間処理し、その後、本明細書の実施例に説明されるように、ヒトアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ発現を測定した。結果は、ＬＩＰＯＦＥＣＴＩＮまたはオリゴヌクレオチドで処理していない未処理対照細胞に対して正規化した。データは、４回の実験の平均値であり、該結果を表４３に示す。
【０５２６】
（表４３）
（ＨｅｐＧ２細胞でのｄｓＲＮＡによるアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡの阻害）
【０５２７】
【表４３】
2014087368.tif 000074
（実施例６１）
（カニクイザル一次肝細胞でのアポリポタンパク質Ｂのアンチセンス阻害）
実施例４６で示したように、ＩＳＩＳ  ３０１０１２がハイブリダイズする標的部位を含む領域は、カニクイザルアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ配列の対応領域と９６％の同一性を共有する。ＩＳＩＳ  ３０１０１２は、それがハイブリダイズするカニクイザルアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡに関連した２つのミスマッチ配列を含む。本発明の別の実施形態では、オリゴヌクレオチドの設計は、このサルのアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡの領域を標的とするためにおこなわれ、本明細書に記載した部分的なカニクイザルアポリポタンパク質Ｂ配列（配列番号８５５）とカニクイザルアポリポタンパク質Ｂ  ＲＮＡ配列の別の部分（配列番号８９０として本明細書に援用）とが用いられる。標的部位は、オリゴヌクレオチドが結合する特定の標的配列上にある第１の（５’最末端）ヌクレオチド番号を示す。ＩＳＩＳ  ３２６３５８（ＧＣＣＴＣＡＧＴＣＴＧＣＴＴＴＡＣＡＣＣ、配列番号８９１）に関しては、標的部位は配列番号８５５のヌクレオチド１６８であり、ＩＳＩＳ  ３１５０８９（ＡＧＡＴＴＡＣＣＡＧＣＣＡＴＡＴＧＣＡＧ、配列番号８９２）に関しては、標的部位は配列番号８９０のヌクレオチド１９である。ＩＳＩＳ  ３２６３５８およびＩＳＩＳ  ３１５０８９は、２０ヌクレオチド長のキメラオリゴヌクレオチド（ギャップマー）であり、１０個の２’−デオキシヌクレオチドからなる中央「ギャップ」領域から構成され、該領域の両側（５’方向および３’方向）に、５ヌクレオチドの「ウィング」が隣接している。これらのウィングは、２’−メトキシエチル（２’−ＭＯＥ）ヌクレオチドから構成される。ヌクレオシド間（主鎖）結合は、オリゴヌクレオチドの全体にわたって、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。全てのシチジンは、５−メチルシチジンである。ＩＳＩＳ  ３２６３５８およびＩＳＩＳ  ３１５０８９は、それぞれヒトアポリポタンパク質ＢアンチセンスオリゴヌクレオチドＩＳＩＳ  ３０１０１２（配列番号２４７）およびＩＳＩＳ  ２８１６２５（配列番号２２４）のカニクイザル等価物である。
【０５２８】
ＩＳＩＳ  ３０１０１２によるアンチセンス阻害を、ＩＳＩＳ  ３０１０１２がハイブリダイズするカニクイザルアポリポタンパク質Ｂ配列と完全に一致するＩＳＩＳ  ３２６３５８のものと比較した。化合物の分析を、Ｉｎ  Ｖｉｔｒｏ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ  （Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）から購入したカニクイザル一次肝細胞のカニクイザルアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルに対する該化合物の効果について、おこなった。プレ培養したカニクイザル一次肝細胞を、ＩｎＶｉｔｒｏ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ  （Ｂａｌｔｉｍｏｒｅ，ＮＤ）から購入した。細胞の培養は、高１０％ウシ胎仔血清（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）と１００単位／ｍＬおよび１００μｇ／ｍＬのストレプトマイシン（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）とを添加した高グルコースＤＭＥＭ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）で、おこなった。
【０５２９】
カニクイザル一次肝細胞を、１０、５０、１５０、または３００ｎＭのアンチセンスオリゴヌクレオチドで４８時間処理した。ＩＳＩＳ  １１３５２９（配列番号８５９）を対照オリゴヌクレオチドとして用いた。未処理細胞もまた、対照とした。カニクイザルアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの定量を、ヒトアポリポタンパク質Ｂと、本明細書の他の実施例に記載したＧＡＰＤＨプライマーおよびプローブとを用いたリアルタイムＰＣＲによっておこなった。表４４に示す結果は、６回の実験の平均値を示し、未処理対照細胞に対して正規化されたアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡのパーセント阻害として表される。
【０５３０】
（表４４）
（ＩＳＩＳ  ３０１０１２およびＩＳＩＳ  ３２６３５８によるカニクイザルアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡの阻害）
【０５３１】
【表４４】
2014087368.tif 000075
これらのデータは、ＩＳＩＳ  ３２６３５９およびＩＳＩＳ  ３０１０１２の両方（カニクイザルアポリポタンパク質Ｂ配列によるミスマッチが２つあるにもかかわらず）が、カニクイザル一次肝細胞でのアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡの発現を用量および時間依存的に阻害しうることを示している。
【０５３２】
１５０および３００ｎＭのオリゴヌクレオチドで処理したカニクイザル一次肝細胞から分泌されるアポリポタンパク質Ｂタンパク質の測定は、アポリポタンパク質Ｂタンパク質特異的キット（ＡＬｅｒＣＨＥＫ  Ｉｎｃ．，Ｐｏｒｔｌａｎｄ，ＭＥ）を用いたＥＬＩＳＡによって、おこなった。各々の結果は、３回の実験の平均値を表す。データを未処理対照細胞に対して正規化し、表４５に示す。
【０５３３】
（表４５）
（アンチセンスオリゴヌクレオチド処理後のカニクイザル肝細胞から分泌されたアポリポタンパク質Ｂの減少）
【０５３４】
【表４５】
2014087368.tif 000076
これらの結果は、ＩＳＩＳ  ３０１０１２およびＩＳＩＳ  ３２６３５８によるアンチセンス阻害が培養カニクイザル一次肝細胞からのアポリポタンパク質Ｂの分泌の減少をもたらすことを示している。
【０５３５】
また、アポリポタンパク質Ｂタンパク質発現の評価をさらにおこなうために、オリゴヌクレオチド処理カニクイザル一次肝細胞からタンパク質を単離してイムノブロット分析にかけた。イムノブロッティングを、ヒトアポリポタンパク質Ｂタンパク質  （ＵＳ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｓ，Ｓｗａｍｐｓｃｏｔｔ，ＭＡ）を用いて、本明細書の記載どおりにおこなった。ＩＳＩＳ  ３２６３５８およびＩＳＩＳ  ３０１０１２によるアンチセンスオリゴヌクレオチド処理に続くアポリポタンパク質Ｂ発現のイムノブロット分析によって、アポリポタンパク質Ｂ発現の実質的な減少が明らかになる。
【０５３６】
本発明のさらなる実施形態では、ＩＳＩＳ  ２８１６２５によるアンチセンス阻害を、ＩＳＩＳ  ２８１６２５とハイブリダイズするカニクイザルアポリポタンパク質Ｂに完全一致するＩＳＩＳ  ３１５０８９によるアンチセンス阻害と比較した。本明細書に記載したように培養したカニクイザル一次肝細胞を、１０、５０、１５０、または３００ｎＭのＩＳＩＳ  ３１５０８９またはＩＳＩＳ  ２８１６２５と２４時間にわたって培養した。細胞を、１５０または３００ｎＭで対照オリゴヌクレオチドＩＳＩＳ  １３６５０（配列番号８０６）あるいは３００ｎＭでＩＳＩＳ  １１３５２９（配列番号８５９）で処理した。未処理細胞もまた、対照とした。カニクイザル一次肝細胞のカニクイザルアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの定量を、本明細書の他の実施例に記載したように、ヒトプライマーおよびプローブによるリアルタイムＰＣＲを用いて、おこなった。表４６に示す結果は、３回の実験の平均値であり、未処理対照細胞に対して正規化されたアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡのパーセント阻害として表される。存在する場合、存在する場合、「＋」はｍＲＮＡ発現が増加したことを示す。
【０５３７】
（表４６）
（カニクイザル一次肝細胞でのアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ発現のアンチセンス阻害）
【０５３８】
【表４６】
2014087368.tif 000077
これらのデータは、ＩＳＩＳ  ３１５０８９およびＩＳＩＳ  ２８１６２５が、用量依存的に、カニクイザル一次肝細胞でのアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡの発現を阻害しうることを示している。
【０５３９】
５０および１５０ｎＭのＩＳＩＳ  ３１５０８９およびＩＳＩＳ  ２８１６２５で処理したカニクイザル一次肝細胞から分泌されたアポリポタンパク質Ｂタンパク質の測定は、アポリポタンパク質Ｂタンパク質特異的キット（ＡＬｅｒＣＨＥＫ  Ｉｎｃ．，Ｐｏｒｔｌａｎｄ，ＭＥ）を用いたＥＬＩＳＡによって、おこなった。各々の結果は、３回の実験の平均値を示す。データを未処理対照細胞に対して正規化して表４７に示す。
【０５４０】
（表４７）
（アンチセンスオリゴヌクレオチド処理に続いてカニクイザル肝細胞から分泌されたアポリポタンパク質Ｂタンパク質の減少）
【０５４１】
【表４７】
2014087368.tif 000078
これらの結果は、１５０ｎＭのＩＳＩＳ  ３１５０８９によるアンチセンス阻害が培養カニクイザル一次肝細胞からのアポリポタンパク質Ｂタンパク質分泌の減少をもたらすことを示している。
【０５４２】
ＩＳＩＳ  ２７１００９（配列番号３１９）およびＩＳＩＳ  ３０１０２７（配列番号２６２）に対しても、カニクイザル一次肝細胞でのアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡおよびタンパク質発現に対する効果ついて試験した。本明細書に記載したように培養した細胞を、１０、５０、および１５０ｎＭのＩＳＩＳ  ２７１００９またはＩＳＩＳ  ３０１０２７で２４時間にわたり処理した。細胞を１５０ｎＭの対照オリゴヌクレオチドＩＳＩＳ  １１３５２９（配列番号８５９）で処理した。未処理細胞も対照とした。カニクイザル一次肝細胞のカニクイザルアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルの定量を、本明細書の他の実施例によって説明されたように、ヒトプライマーおよびプローブによるリアルタイムＰＣＲを用いておこなった。表４８に示す結果は、２回の実験の平均値であり、未処理対照細胞に対して正規化されたアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡのパーセント阻害として表される。
【０５４３】
（表４８）
（カニクイザル肝細胞でのアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ発現のアンチセンス阻害）
【０５４４】
【表４８】
2014087368.tif 000079
これらのデータは、ＩＳＩＳ  ２７１００９およびＩＳＩＳ  ３０１０２７の両方がカニクイザル一次肝細胞でのアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡの発現を用量依存的に阻害しうることを示している。
【０５４５】
５０および１５０ｎＭのＩＳＩＳ  ２７１００９およびＩＳＩＳ  ３０１０２７によって処理されたカニクイザル一次肝細胞から分泌されたアポリポタンパク質Ｂタンパク質の測定は、アポリポタンパク質Ｂタンパク質特異的キット（ＡＬｅｒＣＨＥＫ  Ｉｎｃ．，Ｐｏｒｔｌａｎｄ，ＭＥ）を用いたＥＬＩＳＡ分析によっておこなった。各々の結果は、３回の実験の平均値を示す。データを、分泌されたタンパク質のパーセント減少として表すとともに、未処理対照細胞に対して正規化し、表４９に示す。存在する場合、「＋」はタンパク質分泌が増加したことを示す。
【０５４６】
（表４９）
（アンチセンスオリゴヌクレオチド処理に続くカニクイザル肝細胞から分泌されたアポリポタンパク質Ｂタンパク質の減少）
【０５４７】
【表４９】
2014087368.tif 000080
これらの結果は、ＩＳＩＳ  ３１５０８９およびＩＳＩＳ  ２８１６２５によるアンチセンス阻害が、培養カニクイザル一次肝細胞からのアポリポタンパク質Ｂタンパク質の分泌の減少をもたらすことを示している。
【０５４８】
（実施例６２）
（肝脂肪症を評価する方法）
肝脂肪症は、肝臓への脂肪の蓄積または「脂肪肝」のことをいい、しばしばアルコール消費、糖尿病、および高脂血症に起因する脂質をいう。アポリポタンパク質Ｂを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドによって処置された動物の肝臓を、脂肪症の存在について評価した。脂肪症は、肝臓組織の組織学分析と肝臓トリグリセリドレベルの測定とによって評価される。
【０５４９】
肝臓から切除した組織を直ちにＴｉｓｓｕｅ  Ｔｅｋ  ＯＣＴ埋封材料（Ｔｅｄ  Ｐｅｌｌａ，Ｉｎｃ．，Ｒｅｄｄｉｎｇ，ＣＡ）に浸し、２−メチルーブタンドライアイスで凍らせる。組織切片を厚さ４〜５μｍに切断し、５％中性緩衝ホルマリンで固定する。組織切片を、核および細胞質をそれぞれ視覚化するために標準的な組織化学的手順の後にヘマトキシリン−エオシン染色し、さらに脂質を視覚化するために、製造元の指示書（Ｎｅｗｃｏｍｅｒｓ  Ｓｕｐｐｌｙ，Ｍｉｄｄｌｅｔｏｎ，ＷＩ）に従って、オイルレッドＯで染色する。
【０５５０】
あるいは、組織を１０％中性緩衝ホルマリンで固定し、パラフィンに包埋し、厚さ４〜５μｍに切断し、脱パラフィン化をおこない、さらにヘマトキシリン−エオシン染色をおこなうもので、すべてが標準的な組織化学的手順にもとづいている。
【０５５１】
肝臓トリグリセリド含有量の定量は、脂肪症を評価するのにも用いられる。組織トリグリセリドレベルの測定は、Ｔｒｉｇｌｙｃｅｒｉｄｅ  ＧＰＯ  Ａｓｓａｙ  （Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）を用いておこなわれる。
【０５５２】
（実施例６３）
（痩せたマウスでのＩＳＩＳ  ３０１０１２によるアンチセンス阻害の効果：長期試験）
本発明によれば、ＩＳＩＳ  ３０１０１２（配列番号２４７）の毒性をマウスで長期間（３ヶ月間）にわたって調べる。３ヶ月齢の雄および雌ＣＤ−１マウス（Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｒｉｖｅｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｗｉｌｍｉｎｇｔｏｎ，ＭＡ）に２、５、１２．５、２５、または５０ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  ３０１０１２を５週間にわたって週２回、さらにその後４日毎に投与する。マウスを標準的な齧歯目の食餌で飼育する。生理食塩水および対照オリゴヌクレオチド動物を対照とし、同一のスケジュールで注射をおこなった。各処理群は、各々の性のマウスを６ないし１０匹含み、また各処理群を複製し、一方の群では１ヶ月で試験を終了させ、他方の群では３ヶ月で試験を終了させた。１または３ヶ月の処理期間後、マウスを犠牲にして、肝臓内での標的発現、血清中の脂質レベル、および毒性の指標について、評価をおこなった。肝臓試料を生産し、ＲＮＡを単離してアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ発現を、本明細書の他の実施例で記載されたように、リアル／タイムＰＣＲで測定する。血清脂質（総コレステロール、ＬＤＬコレステロール、ＨＤＬコレステロール、およびトリグリセリドを含む）は、Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ  （Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ａｍｅｒｉｃａ  Ｉｎｃ．，Ｍｅｌｖｉｌｌｅ，ＮＹ）を用いて、日常的な臨床分析によって、評価される。ＬＤＬコレステロールとＨＤＬコレステロールとの比、ならびに総コレステロールとＨＤＬコレステロールとの比も計算する。血清ＡＬＴおよびＡＳＴ、組織の炎症性浸潤および組織中の好塩基顆粒は、上記処理に関連した毒性の評価をもたらす。肝脂肪症または肝臓への脂質の蓄積は、オイルレッドＯ染色による日常的な組織学的分析およびＴｒｉｇｌｙｃｅｒｉｄｅ  ＧＰＯ  Ａｓｓａｙ（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）を用いる肝臓組織トリグリセリドの測定によって評価される。
【０５５３】
毒性試験は、オリゴヌクレオチド処理の停止後に回復することが可能となる動物の群も含む。しかし、雄および雌のＣＤ−１マウス（Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｒｉｖｅｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｗｉｌｍｉｎｇｔｏｎ，ＭＡ）を、第１週目は１週あたり２回、それ以降は４日毎に、５、１０、５０ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  ３０１０１２で処置する。生理食塩水および対照オリゴヌクレオチドを注射された動物を対照として用いる。各々の処理群は、１つの性あたり６匹の動物を含む。３ヶ月の処理をおこなった後、動物はさらに３ヶ月間のあいだ未処理のままであり、その後に犠牲になる。３ヶ月の処理後に直ちに犠牲になったマウスの場合、同一パラメータで評価する。
【０５５４】
１ヶ月の処理後、リアル／タイムＰＣＲ定量化によって、肝臓内のマウスアポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルが５３％減少する。さらに、予想される用量応答毒性を観察した。日常的な臨床手順によってＯｌｙｍｐｕｓ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ  （Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ａｍｅｒｉｃａ  Ｉｎｃ．，Ｍｅｌｖｉｌｌｅ，ＮＹ）上で測定されるＡＬＴおよびＡＳＴレベルは、２５または５０ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  ３０１０１２で処理したマウスで増加する。日常的な組織学的手順による分析のために、組織を調製した。肝臓および腎臓組織中の好塩基顆粒は、１２．５ｍｇ／ｋｇを超えるＩＳＩＳ  ３０１０１２の用量で観察された。穏やかなリンパ組織球性浸潤が、ＩＳＩＳ  ３０１０２が１２．５ｍｇ／ｋｇを上回る用量で、種々の組織で観察される。オイルレッドＯによる組織切片の染色は、オリゴヌクレオチド処理のあとに脂肪症がみられないことを明らかにしている。
【０５５５】
（実施例６４）
（痩せたカニクイザルでのＩＳＩＳ  ３０１０１２によるアンチセンス阻害の効果：長期試験）
実施例４５で議論したように、アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡまたはタンパク質レベルを低下させるそれらの可能性に関連して、カニクイザル（雄または雌）を用いてアンチセンスオリゴヌクレオチド、同様にアポリポタンパク質Ｂに関連した表現型の指標を評価するために用いられ、該指標として心血管指標、アテローム性動脈硬化、脂質疾患、肥満、およびク形成が挙げられる。したがって、本発明の別の実施形態では、ＩＳＩＳ  ３０１０１２（配列番号２４７）に対するその効果について、およびカニクイザルの血清脂質について、調べられる。そのような長期試験もまた、アンチセンス化合物の毒性評価に用いられる。
【０５５６】
雄および雌のカニクイザルの処置は、第１週目は２日毎、その後４日毎の頻度で、１ヶ月および３ヶ月の処理期間にわたって、２、４、または１２ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  ３０１０１２を静脈内あるいは２または２０ｍｇ／ｋｇを皮下投与することでおこなわれる。生理食塩水処理動物を対照とする。各処理群として、各性の動物を２ないし３匹含む。
【０５５７】
１ヶ月の間隔で、また３ヶ月の試験終了で、動物を犠牲にして、肝臓における標的発現、血清中の血清濃度、および毒性の指標として評価する。肝臓試料を獲得し、ＲＮＡを単離し、アポリポタンパク質ＢのｍＲＮＡ発現を他の実施例に記載したとおりに、リアルタイムＰＣＲによって測定する。血清脂質（総コレステロール、ＬＤＨコレステロール、ＨＤＬコレステロール、およびトリグリセリドを含む）は、Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ  （Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ａｍｅｒｉｃａ  Ｉｎｃ．，Ｍｅｌｖｉｌｌｅ，ＮＹ）を用いた日常的な臨床分析によって、評価される。ＨＤＬコレステロールに対するＬＤＨコレステロールの比とＨＤＬコレステロールに対する総コレステロールの比も算出される。血清ＡＬＴおよびＡＳＴの血清の分析は、組織の炎症性浸潤および組織の好塩基顆粒が上記処理に関連した毒性の評価を提供してくれる。肝脂肪症または肝臓への脂肪蓄積は、オイルレッドＯ染色による日常的な組織学分析とＴｒｉｇｌｙｃｅｒｉｄｅ  ＧＰＯ  Ａｓｓａｙ（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）を用いた肝臓組織トリグリセリドの測定とによって評価される。
【０５５８】
１つの性あたり動物２匹からなる追加の処理群に対して、生理食塩水（０ｍｇ／ｋｇ）、１２または２０ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  ３０１０１２によって、第１週目は２日毎、その後４日毎の頻度で、３ヶ月の期間にわたって、処理をおこなう。処理期間の後、動物はさらに３ヶ月間にわたって何ら処理されていないことを確認する。これらの処理群は、処理終了後３ヶ月、アポリポタンパク質Ｂの効果を試験する目的のためである。３ヶ月の回復期間の終わりに、１および３ヶ月の処理後直ちに動物を犠牲にしたのと同じパラメータで評価される。
【０５５９】
１ヶ月間隔の長期処理からの結果は、表５０に示しており、またｍＲＮＡに関して生理食塩水処理動物に対して、さらに脂質レベルに関して未処理の基線値に対して、正規化される。総コレステロール、ＬＤＬコレステロール、ＨＤＬコレステロール、ＬＤＬ粒子濃度、および血清中のトリグリセリドレベルを、Ｌｉｐｏｓｃｉｅｎｃｅ  （Ｒａｌｅｉｇｈ，ＮＣ））による核磁気共鳴分光法によって、測定した。さらに、肝臓に含まれるインタクトなオリゴヌクレオチドの濃度をキャピラリーゲル電気泳動によって測定し、肝臓組織１グラムあたりのオリゴヌクレオチドのマイクログラムとして表す。各結果は、動物４匹（雄２匹および雌２匹）からのデータの平均値を表す。
【０５６０】
（表５０）
（痩せたカニクイザルでのＩＳＩＳ  ３０１０１２によるアンチセンス阻害の効果）
【０５６１】
【表５０】
2014087368.tif 000081
これらのデータは、霊長類の種でＩＳＩＳ  ３０１０１２が用量依存的なアポリポタンパク質Ｂ発現を阻害し、より高い用量のＩＳＩＳ  ３０１０１２で同時に脂質レベルを低下させることを示す。さらに、これらの結果は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが用量依存的に肝臓に蓄積していくことを示している。
【０５６２】
肝脂肪症または肝臓での脂質の蓄積は、示した用量による処理の４週間後に、観察されなかった。期待される用量関連毒性は、１２および２０ｍｇ／ｋｇのより高い用量で観察され、最初の４時間のあいだの活性部分的トロンボプラスチン時間（ＡＰＴＴ）の一時的な１．２ないし１．３倍の増加、ならびに肝臓および腎臓内の好塩基顆粒の増加を含む（組織試料の日常的な組織学的検査によって評価される）。腎臓では何ら機能的変化が観察されなかった。
【０５６３】
類似の実験では、雄および雌のカニクイザルに対して、第１週目は２日毎に、その後は４日毎に、４ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  ３０１０１２の静脈内用量が投与される。第１の用量および第４の用量の後に、同様に第４および最終の用量の後の１１、１５、および２３日間後に、動物群が犠牲になる。肝臓ＲＮＡを単離し、アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡレベルを、本明細書に記載したようにリアルタイムＰＣＲによって評価した。この実験の結果は、４ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  ３０１０１２の単一静脈内用量後、アポリポタンパク質Ｂ  ｍＲＮＡ発現での４０％減少を示している。さらに、４ｍｇ／ｋｇでＩＳＩＳ  ３０１０１２を４回投与した後に、標的ｍＲＮＡが約８５％に減少し、さらに標的ｍＲＮＡの５０％減少は、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理の終了後、１６日間まで持続した。
【０５６４】
（実施例６５）
（マイクロアレイ：高脂肪食餌マウスに対する痩せたマウスにおける遺伝子発現パターン）
雄Ｃ５７Ｂｌ／６マウスを次の群に分割した。この群は、（１）生理食塩水を注射した貧弱な食餌を与えられたマウス（痩せ対照）；（２）高脂肪食餌を与えられたマウス；（３）５０ｍｇ／ｋｇの対照オリゴヌクレオチド１４１９２３（配列番号８５８）を注射した高脂肪食餌を与えられたマウス；（４）２０ｍｇ／ｋｇのアトバスタチンカルシウム（Ｌｉｐｉｔｏｒ（登録商標）、Ｐｆｉｚｅｒ  Ｉｎｃ．）を投与された高脂肪食餌を与えられたマウス；（５）１０ｍｇ／ｋｇ、２５ｍｇ／ｋｇまたは５０ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）を注射された高脂肪食餌を与えられたマウスで構成され、各マウスは５体から構成されている。生理食塩水およびオリゴヌクレオチド処理では、６週間、週に２回、腹腔内に投与した。アトバスタチンを、６週間、毎日、投与した。試験終了時では、肝臓試料を各動物から分離し、ＲＮＡを定性的ノーザンブロット評価法、デオキシＲＮＡマイクロアレイおよび定量的リアルタイムＰＣＲで分離した。ノーザンブロット評価法および定量的リアルタイムＰＣＲを、この明細書に記載された他の実施例によって記述されているように実行した。
【０５６５】
ＤＮＡマイクロアレイ分析では、ハイブリダイゼーション試料を、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ  Ｅｚｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  Ａｎａｌｙｓｉｓ  Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ  Ｍａｎｕａｌ  （Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ，Ｉｎｃ．，Ｓａｎｔａ  Ｃｌａｒａ，ＣＡ）に従って、各マウス肝臓から分離された１０μｇの全ＲＮＡから調製した。試料を、約２２，０００個の遺伝子を含むマウス遺伝子断片にハイブリダイズし、次に、製造者のプロトコルによって規定されたように、Ｆｌｕｉｄｉｃｓ  Ｓｔａｔｉｏｎ  ４００（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ，Ｉｎｃ．，Ｓａｎｔａ  Ｃｌａｒａ，ＣＡ）を用いて、洗浄しかつ二重染色した。染色した遺伝子断片を、ＧｅｎｅＡｒｒａｙ  Ｓｃａｎｎｅｒ  （Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ，Ｉｎｃ．，Ｓａｎｔａ  Ｃｌａｒｅ，ＣＡ）によりプローブ細胞強度で走査した。各プローブの設定についての信号値を、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ  Ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ  Ｓｕｉｔｅ  ｖ５．０ソフトウエア（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ，Ｉｎｃ．，Ｓａｎｔａ  Ｃｌａｒａ，ＣＡ）を用いて算出した。各条件を、試料ごとに１つの断片を用い、群ごとに５個の生物学的試料から分布測定した。発現における倍（ｆｏｌｄ）変化を、Ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ  Ｓｕｉｔｅ  ｖ５．０によって生成されるような信号値の幾何学的平均値を用いて計算した。一方向（ｏｎｅ−ｗａｙ）Ａｎｏｖａを利用した統計的分析の後に、９回のペアワイズ比較を行った。全ての群を高脂肪群と比較し、ＩＳＩＳ  １４７７６４処理から得られる遺伝子発現変化を確認した。マイクロアレイデータを、階層的クラスタ分析を用いて解釈し、全遺伝子発現パターンを視覚化した。
【０５６６】
マイクロアレイの結果は、ＩＳＩＳ  １４７７６４処理が高脂肪食餌マウスにおける遺伝子発現プロファイルを痩せマウスにおいて観察されたプロファイルに伝達することを示している。リアルタイムＰＣＲ分析では、脂質代謝に含まれる次の遺伝子：肝性リパーゼ、脂肪酸合成アデノシン３リン酸結合カセット、サブファミリーＤ（ＡＬＤ）メンバー２、腸管脂肪酸結合タンパク質２、ステアロールコエンザイムＡデサチュラーゼ１およびヒドロキシメチルグルタリル−コエンザイムＡ還元酵素に関するｍＲＮＡの発現の緩和を確認した。
【０５６７】
この明細書に記述されているように測定されたマウスアポリポタンパク質ＢのｍＲＮＡおよび血清コレステロールレベルを評価して、ＩＳＩＳ  １４７７６４およびＩＳＩＳ  １４７４８３によるアンチセンス阻害を確認した。ｍＲＮＡおよびコレステロールの双方のレベルを、この明細書の他の実施例に示されているように、用量依存法によるＩＳＩＳ
１４７７６４またはＩＳＩＳ  １４７４８３処理で、低下させた。ＩＳＩＳ  １４７４８３の用量５０ｍｇ／ｋｇはＡＬＴおよびＡＳＴのレベルを上昇させた。ＩＳＩＳ  １４７７６４の用量１０ｍｇ／ｋｇ、２５ｍｇ／ｋｇおよび５０ｍｇ／ｋｇと、ＩＳＩＳ  １４７４８３の用量１０ｍｇ／ｋｇおよび２５ｍｇ／ｋｇは、ＡＬＴおよびＡＳＴのレベルを有意に上昇させなかった。
【０５６８】
（実施例６６）
（アポリポタンパク質Ｂアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理された動物における肝性脂肪症の評価）
アポリポタンパク質Ｂを標的にしたアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理された動物の肝臓を脂肪症の存在で評価した。脂肪症は、肝組織の組織学的分析および肝臓トリグリセリドレベルの測定によって評価される。
【０５６９】
（６週間、ＩＳＩＳ  １４７７６４で処理された高脂肪食餌マウスにおける脂肪症の評価）
ＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）および実施例２１で記述された対照処理動物からの肝組織を、その後に６週間処理を行う試験終了時において脂肪症で評価した。組織切片をオイルレッドＯおよびヘマトキシリンで染色して、脂質および核をそれぞれ視覚化した。また、組織切片をヘマトキシリン−エオシンで染色して、核および原形質をそれぞれ視覚化した。いずれかの方法で染色した組織切片の組織学的分析は、生理食塩水で処理された動物とＩＳＩＳ  １４７７６４で処理された動物とでは脂肪症において差異がないことを示し、ＩＳＩＳ  １４７７６４で６週間処理した切片が肝臓中への脂質の蓄積に至らないことを示している。
【０５７０】
（高脂肪食餌動物においてアポリポタンパク質Ｂで長期間、処理された脂肪症の評価）
雄Ｃ５７Ｂｌ／６マウスを、６週間、１２週間および２０週間、週に２回、２５ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）または２５ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  １４１９２３（配列番号８５８）の腹腔内注射で処理した。生理食塩水で処理した動物を対照として役立てた。各処理群には４匹の動物を含めた。動物を６週間、１２週間および２０週間後に殺処理し、組織学的分析および組織トリグリセリド含有量の測定のために調達した。その結果は、ＩＳＩＳ  １４７７６４で処理した動物を生理食塩水で処理した動物に比較したときに肝組織中のトリグリセリド含有量に有意な差異を示さない。さらに、肝組織の切片の組織学的分析は、高脂肪食餌を受けた生理食塩水による対照動物に比べて、ＩＳＩＳ  １４７７６４で処理された高脂肪食餌マウスの脂肪症が１２週および２０週で緩和されている。
【０５７１】
（痩せマウスにおける脂肪症の評価）
肝組織中への脂質の蓄積を痩せマウスに対しても評価した。生後６週から７週までの雄Ｃ６７Ｂｌ／６マウス（Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｒｉｖｅｒ  ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  （Ｗｉｌｍｉｎｇｔｏｎ，ＭＡ））を標準齧歯目用食餌で維持し、６週間、週に２回、２５ｍｇ／ｋｇまたは５０ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ  １４７７６４（配列番号１０９）またはＩＳＩＳ  １４７４８３（配列番号７９）の腹腔内注射で処理した。生理食塩水で処理した動物を対照として役立てた。各処理群を４匹の動物で構成した。動物を６週間後に、肝組織および血清を採取して殺処理した。
【０５７２】
アポリポタンパク質ＢのｍＲＮＡレベルを、この明細書の他の実施例によって記述されているように、リアルタイムＰＣＲによって測定した。表５１に示されたデータは、４匹の動物の平均を示し、生理食塩水で処理した対照を基準とした阻害として示されている。結果は、用量依存法で、痩せマウスにおけるＩＳＩＳ  １４７４８３およびＩＳＩＳ  １４７７６４が共にアポリポタンパク質ＢのｍＲＮＡの発現を阻害することを示している。
【０５７３】
（表５１）
（痩せマウスにおけるアポリポタンパク質ＢのｍＲＮＡのアンチセンス阻害）
【０５７４】
【表５１】
2014087368.tif 000082
血清中における総コレステロール、ＬＤＬコレステロール、ＨＤＬコレステロールおよびトリグリセリドを、Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ  （Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ａｍｅｒｉｃａ  Ｉｎｃ．，Ｍｅｌｖｉｌｌｅ，ＮＹ）を用いた日常的な臨床分析によって測定した。また、血清中の肝臓酵素ＡＬＴおよびＡＳＴをも、Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒを用いて測定した。これらの結果は、ＩＳＩＳ
１４７７６４が生理食塩水で処理した対照に対して血清脂質を下げることを示している。ＡＬＴおよびＡＳＴのレベルは、マウスの通常範囲（３００ＩＵ／Ｌ）を超えず、処理に関連した毒性の欠如を示している。結果は、４匹の動物からのデータの平均値であり、図５２に示されている。
【０５７５】
（表５２）
（ＩＳＩＳ  １４７７６４およびＩＳＩＳ  １４７４８３で処理した痩せマウスにおける血清脂質および肝臓酵素のレベル）
【０５７６】
【表５２】
2014087368.tif 000083
肝臓組織を組織学的ルーチン法によって調製し、この明細書に記述されているように、脂肪症を評価した。オイルレッドＯまたはヘマトキシリン−エオシンで染色した組織試料の実験は、アポリポタンパク質Ｂのアンチセンスオリゴヌクレオチドによる痩せマウスへの処理が脂肪症にならないことを示している。
【０５７７】
（アポリポタンパク質Ｂのアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理した痩せマウスにおける脂肪症をさらに評価するための６月間の研究）
アポリポタンパク質Ｂを標的にしたアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理されたマウスの長期間治療は、アンチセンス化合物での延長処理の毒性学的および薬理学的な効果を評価するのに使用される。月齢２ヶ月の雌雄Ｃ５７Ｂｌ／６マウスを、２ｍｇ／ｋｇ、５ｍｇ／ｋｇ、２５ｍｇ／ｋｇまたは５０ｍｇ／ｋｇのアポリポタンパク質Ｂのアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理する。処理は、第１週において２日ごとに、その後においては４日ごとに腹腔内に投与される。生理食塩水だけ、あるいは対照オリゴヌクレオチドで処理したマウスを対照群として役立てた。各処理群には２５から３０匹のマウスを含めている。６月間の処理後に、各処理群のマウスの一部を犠牲にする。残りのマウスには、処理しない３月間の回復期間を与え、その後に犠牲にする。肝臓におけるアポリポタンパク質ＢのｍＲＮＡの発現を、この明細書の他の方法によって記述されているように、リアルタイムＰＣＲによって測定する。肝組織は、Ｔｒｉｇｌｙｃｅｒｉｄｅ  ＧＰＯ  Ａｓｓａｙ  （Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）を用いたトリグリセリド含有量の測定用にも調製される。血清を採取しかつ、Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ（Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ａｍｅｒｉｃａ  Ｉｎｃ．，Ｍｅｌｖｉｌｌｅ，ＮＹ）を用いて、総コレステロール、ＬＤＬコレステロール、ＨＤＬコレステロールおよびトリグリセリドを含む脂質の含有量を評価する。また、血清中の肝臓酵素ＡＬＴおよびＡＳＴをも、Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒを用いて測定する。血清試料を、アポリポタンパク質Ｂ（Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．，Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ，ＣＡ）に対する抗体を用いて、免疫ブロット分析にかける。肝臓、腎臓および他の組織は組織学的分析用のルーチン処置によって調製される。組織は、好塩基顆粒および炎症性浸潤の存在を評価する。脂肪症は、肝組織切片のオイルレッドＯ染色剤によって評価される。
【０５７８】
（実施例６７）
（アテローム硬化型プラーク形成に対するマウスモデル：ＬＤＬ受容体遺伝子を持たないヒトアポリポタンパク質Ｂトランスジェニックマウス）
ＬＤＬ受容体は、アポリポタンパク質Ｂ含有ＬＤＬ粒子の除去を担っている。ＬＤＬ受容体を持たないと、動物は、アポリポタンパク質Ｂ含有ＬＤＬ粒子をプラズマから効果的に除去することができない。したがって、アポリポタンパク質ＢおよびＬＤＬコレステロールの血清レベルは著しく上昇する。ヒトアポリポタンパク質Ｂトランスジーンを発現するマウス（ＴｇＮ−ｈＡｐｏＢ＋／＋）およびＬＤＬ受容体欠損マウス（ＬＤＬｒ−／−）両方をアテローム硬化型プラーク発生の動物モデルとして用いる。ＬＤＬ受容体欠損遺伝子型をヒトアポリポタンパク質Ｂトランスジェニック遺伝子型と組み合わせる（ＴｇＮ−ｈＡｐｏＢ＋／＋；ＬＤＬｒ−／−）場合、アテローム硬化型プラークは急速に発生する。本発明にしたがって、このような遺伝的バックグラウンドであるマウスを用いて、アテローム性動脈硬化およびプラーク形成を防ぐ化合物の能力を調べる。
【０５７９】
オスＴｇＮ−ｈＡｐｏＢ＋／＋；ＬＤＬｒ−／−マウスに対して、１２週間にわたって週２回、ヒトアポリポタンパク質Ｂアンチセンスオリゴヌクレオチド１０または２０ｍｇ／ｋｇによる処理を施す。対照群に対しては、生理食塩水または対照オリゴヌクレオチドによる処理を施す。血清総コレステロール、ＨＤＬコレステロール、ＬＤＬコレステロール、およびトリグリセリドを、Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ（Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ａｍｅｒｉｃａ  Ｉｎｃ．，Ｍｅｌｖｉｌｌｅ，ＮＹ）を用いた日常的な臨床分析によって２、４、６、８、および１２週目に測定する。血清ヒトアポリポタンパク質Ｂタンパク質を、ＥＬＩＳＡキット（ＡＬｅｒＣＨＥＫ  Ｉｎｃ．，Ｐｏｒｔｌａｎｄ，ＭＥ）を用いて２、４、６、８、および１２週目に測定する。肝臓内のヒトおよびマウスアポリポタンパク質ｍＲＮＡを１２週目に測定する。１２週間の試験の結果は、二重トランスジェニックモデルでのＩＳＩＳ３０１０１２の薬理学的挙動を評価するのに役立つ。
【０５８０】
さらに、ＴｇＮ−ｈＡｐｏＢ＋／＋；ＬＤＬｒ−／−マウスに対して、１２週間の試験で用いた処理条件による４ヶ月間の試験をおこなう。マウスに対して、ヒトアポリポタンパク質Ｂを標的化したアンチセンスオリゴヌクレオチドによる４ヶ月にわたる処理を施して、アテローム硬化型プラーク形成を防ぐそのような化合物の能力を評価する。４ヶ月間の処理期間の終わりに、マウスに麻酔を施し、１０％ホルマリンで潅流する。潅流された動脈管を単離して、アテローム硬化型プラークの存在について調べる。動脈管の切片をパラフィンで包理し、日常的な方法を用いて組織学的分析のために調製する。血清総コレステロール、ＨＤＬコレステロール、ＬＤＬコレステロール、およびトリグリセリドを、Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｎａｌｙｚｅｒ（Ｏｌｙｍｐｕｓ  Ａｍｅｒｉｃａ  Ｉｎｃ．，Ｍｅｌｖｉｌｌｅ，ＮＹ）を用いた日常的な臨床分析によって２、４、６、８、１２、および１６週目に測定する。血清ヒトアポリポタンパク質Ｂタンパク質を、ＥＬＩＳＡキット（ＡＬｅｒＣＨＥＫ  Ｉｎｃ．，Ｐｏｒｔｌａｎｄ，ＭＥ）を用いて２、４、６、８、１２、および１６週目に測定する。肝臓内のヒトおよびマウスアポリポタンパク質ｍＲＮＡを、リアルタイムＰＣＲによって１６週目に測定する。
【０５８１】
（実施例６８）
（アテローム硬化型プラーク形成に対するウサギモデル）
ワタナベ遺伝性高脂血症（ＷＨＨＬ）系統のウサギをアテローム硬化型プラーク形成に対するモデルとして用いる。高脂肪食を与えたニュージーランド白ウサギもアテローム硬化型プラーク形成のモデルとして用いる。ＷＨＨＬまたは高脂血症食を与えたニュージーランド白ウサギに対するアポリポタンパク質Ｂアンチセンス化合物による処理を用いて、アテローム硬化型プラーク疾患に対する治療的または予防的処理としてのそれらの潜在能力について試験する。ウサギに、アポリポタンパク質Ｂを標的化したアンチセンスオリゴヌクレオチド５、１０、２５、または５０ｍｇ／ｋｇを注射する。生理食塩水のみまたは対照オリゴヌクレオチドによる処理を施した動物は、対照としての役割を果たす。処理全体を通して、血清試料を採取し、ＥＬＩＳＡキット（ＡＬｅｒＣＨＥＫ  Ｉｎｃ．，Ｐｏｒｔｌａｎｄ，ＭＥ）によってアポリポタンパク質Ｂタンパク質レベルを評価し、日常的な臨床分析によって血清脂質（コレステロール、ＬＤＬコレステロール、ＶＬＤＬコレステロール、ＨＤＬコレステロール、トリグリセリド）を評価する。肝臓組織トリグリセリド含有量を、Ｔｒｉｇｌｙｃｅｒｉｄｅ  ＧＰＯ  Ａｓｓａｙ（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）を用いて測定する。肝臓、腎臓、心臓、大動脈、および他の組織を入手し、日常的な手順を用いて組織学的分析のために調製する。好塩基性顆粒および炎症性湿潤の形跡について、肝臓および腎臓組織を調べる。オイルレッドＯ系統を用いて、脂肪変性について肝臓組織を評価する。さらに、オイルレッドＯ系統およびヘマトキシリンで染色した大動脈切片を試験して、アテローム硬化型の病変の形成について評価する。
【０５８２】
（実施例６９）
（アポリポタンパク質Ｂ阻害剤の経口送達）
インビボでの送達のために、許容される剤形で、例えば非経口または非非経口配合物としてオリゴヌクレオチドを配合することが可能である。非経口配合物としては、静脈内（ＩＶ）、皮下（ＳＣ）、腹腔内（ＩＰ）、硝子体内、および筋肉内（ＩＭ）配合物と、肺吸入、鼻腔内投与、局所的投与等を介した送達用の配合物が挙げられる。非非経口配合物としては、消化管、例えば経口投与、直腸投与、空腸内点滴注入等を介した送達用の配合物が挙げられる。直腸投与としては、浣腸剤または座剤としての投与が挙げられる。経口投与としては、カプセル、ゲルカプセル、丸薬、エリキシル剤等としての投与が挙げられる。
【０５８３】
いくつかの実施形態では、経口投薬経路を介して、オリゴヌクレオチドを被験体に投与することが可能である。被験体は、動物またはヒト（人類）でもよい。動物被験体は、マウス、ラット、マウス、ラット、イヌ、モルモット、サル、非ヒト霊長目動物、ネコ、またはブタ等の哺乳動物でもよい。非ヒト霊長目動物としては、サルおよびチンパンジーが挙げられる。適当な動物被験体は、マウス、ラット、マウス、ラット、イヌ、サル、非ヒト霊長目動物、ネコ、またはブタ等の実験動物とすることが可能である。
【０５８４】
いくつかの実施形態では、被験体はヒトでもよい。特定の実施形態では、被験体は、本明細書でより詳細に論じるように、治療的処理を必要とするヒト患者でもよい。特定の実施形態では、被験体は、本明細書でより詳細に論じるように、１種類以上の遺伝子の発現の調節を必要とする場合もある。いくつかの特定の実施形態では、被験体は、本明細書でより詳細に論じるように、１種類以上の遺伝子の発現の阻害を必要とする場合もある。特定の実施形態では、被験体は、本明細書でより詳細に論じる治療的表示を得るためにアポリポタンパク質Ｂの調節、すなわち阻害または増強を必要とする場合もある。
【０５８５】
いくつかの実施形態では、本発明にかかる非非経口（例えば、経口）オリゴヌクレオチド配合物は、オリゴヌクレオチドの増強された生物学的利用能を生じる。この文脈において、用語「生物学的利用能（ｂｉｏａｖａｉｌａｂｉｌｉｔｙ）」とは、特定の投与形態を用いて薬剤を送達する際の循環系（例えば、血液、特に血漿）に到達する投与薬剤の部分の測定値を指す。増強された生物学的利用能とは、別の投与形態と比べた、被験体の末梢血漿へオリゴヌクレオチドを送達する投与の能力の特定の形態を指す。例えば、非非経口投与形態（例えば、経口形態）を用いて薬剤を被験体に導入する場合、その投与形態に対する生物学的利用能を、異なる投与形態（例えば、ＩＶ投与形態）と比較することが可能である。いくつかの実施形態では、非非経口（例えば、経口、直腸、空腸内）投与後の化合物の血漿濃度曲線下面積（ＡＵＣ０）を、静脈内（ｉ．ｖ．）投与後の該薬剤の血漿濃度曲線下面積（ＡＵＣｉｖ）で除算して、ＩＶ経路と比較した経口経路を介して吸収された化合物の分数を表す無次元商（相対的生物学的利用能、ＲＢ）を与えることが可能である。第１の組成物の相対的生物学的利用能（ＲＢ１）が第２の組成物の相対的生物学的利用能（ＲＢ２）より大きいとき、組成物の生物学的利用能が別の組成物の生物学的利用能と比較して増強されたと言える。
【０５８６】
一般に、化合物の治療効果が、達成された化合物の血液濃度に関連する場合、薬剤の最終作用部位が細胞内であるとしても生物学的利用能は、治療効果と相関する（ｖａｎ  Ｂｅｒｇｅ−Ｈｅｎｅｇｏｕｗｅｎら、Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌ．，１９７７，７３，３００）。生物学的利用能研究を用いて、経口用量後の薬剤の末梢血レベルの変化を測定することによって薬剤の腸管吸収度を決定した（ＤｉＳａｎｔｏ，Ｃｈａｐｔｅｒ  ７６  Ｉｎ：Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ＝ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ  Ｅｄ．，Ｇｅｎｎａｒｏ，ｅｄ．，Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ，１９９０，ｐａｇｅｓ  １４５１−１４５８）。
【０５８７】
一般に、経口組成物の相対的生物学的利用能が、純粋なオリゴヌクレオチド（すなわち、浸透エンハンサーの不在下でのオリゴヌクレオチド）から実質的になる組成物の生物学的利用能より大きいとき、経口組成物の生物学的利用能が「増強された（ｅｎｈａｎｃｅｄ）」と言える。
【０５８８】
器官生物学的利用能とは、器官中の化合物の濃度を指す。器官生物学的利用能を、試験被験体で、全身Ｘ線撮影による手段等の多数の手段によって測定することが可能である。器官生物学的利用能を、本明細書でより詳細に論じるように、１種類以上の担体化合物または賦形剤等を用いたオリゴヌクレオチドへの１種類以上の修飾によって修飾、例えば増強することが可能である。一般に、生物学的利用能の増加は、器官生物学的利用能の増加を生じる。
【０５８９】
本発明にかかる経口オリゴヌクレオチド組成物は、「吸収エンハンサー（ａｂｓｏｒｐｔｉｏｎ  ｅｎｈａｎｃｅｒ）」または単に「浸透エンハンサー（ｐｅｎｅｔｒａｔｉｏｎ  ｅｎｈａｎｃｅｒ）」としても知られる１種類以上の「粘膜浸透エンハンサー（ｍｕｃｏｓａｌ  ｐｅｎｅｔｒａｔｉｏｎ  ｅｎｈａｎｃｅｒ）」を含むことが可能である。したがって、本発明のいくつかの実施形態は、少なくとも１種類の浸透エンハンサーと組み合わせた少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドを含む。一般に、浸透エンハンサーは、所望の投与形態に関連する粘膜（粘膜群）、例えば腸管上皮膜を越えた薬剤の輸送を促進する物質である。したがって、オリゴヌクレオチドの活性に緩衝することなく、さらに、許容できない副作用（例えば、毒性、刺激、またはアレルギー応答）なしにオリゴヌクレオチドが動物の体内に導入されうるように、オリゴヌクレオチドの取り込みを促進する１種類以上の浸透エンハンサーを選択することが望ましい。
【０５９０】
本発明の実施形態は、１種類以上の薬学的に受容可能な浸透エンハンサーを含む組成物と、そのような組成物を用いる方法とを提供するものであり、経口投与形態を介して投与されたオリゴヌクレオチドの生物学的利用能を向上させる。従来から、特定の浸透エンハンサーが、特定の薬剤の生物学的利用能を向上するために用いられてきた。Ｍｕｒａｎｉｓｈｉ，Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｔｈｅｒ．Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，１９９０，７，１およびＬｅｅら、Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｔｈｅｒ．Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，１９９１，８，９１を参照せよ。動物および人類に投与することが難しいことが知られている比較的複雑な分子であるオリゴヌクレオチドの取り込みおよび送達を、浸透エンハンサーの多数の異なるクラスを介した経口手段によって投与される場合であってさえ、非常に向上することができることが判明した。
【０５９１】
いくつかの実施形態では、経口投与用の組成物は、天然に存在するオリゴヌクレオチド（すなわち、完全なホスホジエステルデオキリボシルまたは完全なホスホジエステルリボシルオリゴヌクレオチド）からの１種類以上の修飾を含む。そのような修飾は、結合親和性、ヌクレアーゼ安定性、細胞または組織浸透性、組織分布、あるいは他の生物学的薬物動態学的特性を増加することが可能である。修飾を、オリゴヌクレオチド化学に関して本明細書でより詳細に論じるように、塩基、リンカー、または糖におこなうことが可能である。本発明のいくつかの実施形態では、被験体への投与用の組成物、特に動物またはヒト被験体への投与用の経口組成物は、親和性、安定性、組織分布、または他の生物学的特性を増強するための１種類以上の修飾を持つ修飾オリゴヌクレオチドを含むだろう。
【０５９２】
適当な修飾リンカーとしては、ホスホロチオエートリンカーが挙げられる。本発明にかかるいくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも１個のホスホロチオエートリンカーを持つ。ホスホロチオエートリンカーは、ヌクレアーゼ安定性と、オリゴヌクレオチドに対する血漿タンパク質結合特性とをもたらす。ヌクレアーゼ安定性は、オリゴヌクレオチドのインビボ生存期間を増加するために有用であり、それに対して、血漿タンパク質結合は、腎排泄を介してオリゴヌクレオチドの初回通過除去率を減少させる。本発明にかかるいくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも２個のホスホロチオエートリンカーを持つ。オリゴヌクレオチドが厳密にｎ個のヌクレオシドを持ついくつかの実施形態では、このオリゴヌクレオチドは、１個ないしｎ−１個のホスホロチオエート結合を持つ。オリゴヌクレオチドが厳密にｎ個のヌクレオシドを持ついくつかの実施形態では、このオリゴヌクレオチドは、ｎ−１個のホスホロチオエート結合を持つ。オリゴヌクレオチドが厳密にｎ個のヌクレオシドを持ち、ｎが偶数である他の実施形態では、このオリゴヌクレオチドは、１ないしｎ／２個のホスホロチオエート結合を持ち、あるいはｎが奇数である場合は、１ないし（ｎ−１）／２個のホスホロチオエート結合を持つ。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ホスホジエステル（ＰＯ）結合およびホスホロチオエート（ＰＳ）結合を交互に持つ。他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、２個以上の連続するＰＯ結合の少なくとも１つの一続きの配列（ストレッチ）と、２個以上のＰＳ結合の少なくとも１つのストレッチとを持つ。他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも１つのＰＳ結合が割り込んだ、ＰＯ結合の２個のストレッチを持つ。
【０５９３】
いくつかの実施形態では、ヌクレオシドのうちの少なくとも１個を、ヌクレアーゼ安定性、結合親和性、または他の有用な生物学的特性を糖に付与する修飾によってリボシル糖単位上で修飾する。いくつかの場合では、糖修飾は、２′修飾、例えば、リボシル糖の２′−ＯＨが置換される（ｒｅｐｌａｃｅｄまたはｓｕｂｓｔｉｔｕｅｄ）修飾を含む。２′−ＯＨに対する適した置換としては、２′−Ｆおよび２′−アラビノ−Ｆが挙げられる。ＯＨに対する適当な置換としては、２′−Ｏ−アルキル（例えば、２′−Ｏ−メチル）および２′−Ｏ置換アルキル（例えば、２′−Ｏ−メトキシエチル、２′−Ｏ−アミノプロピル）等が挙げられる。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも１種類の２′修飾を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも２種類の２′修飾を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、各末端に少なくとも１種類の２′修飾を持つ（すなわち、３′および５′末端ヌクレオシド各々が同じまたは異なる２′修飾を持つ）。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの各末端に少なくとも２種類の連続的な２′修飾を持つ。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも１個のデオキシヌクレオシドをさらに含む。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、デオキシヌクレオシドのストレッチを、該オリゴヌクレオチドがハイブリダイズすることが可能なＲＮＡのＲＮアーゼ（例えば、ＲＮアーゼＨ）切断を該ストレッチが活性化可能であるように含む。いくつかの実施形態では、ＲＮＡのＲＮアーゼ媒介切断を活性化することが可能なデオキシヌクレオシドのストレッチは、約６ないし約１６、例えば約８ないし約１６個の連続するデオキシヌクレオシドを含む。
【０５９４】
本発明の非経口オリゴヌクレオチド組成物の投与のための経口組成物を種々の剤形で配合することが可能であり、該剤形としては、限定はされないが、例えば、錠剤、カプセル、液体シロップ、軟性ゲル、座薬、および浣腸剤がある。用語「消化管送達（ａｌｉｍｅｎｔａｒｙ  ｄｅｌｉｖｅｒｙ）」とは、例えば、経口、直腸、内視鏡的、および舌下／頬側投与を包括する。この投与形態に共通する要件は、消化管のある部分または全てにわたる吸収であり、そのように投与された核酸（群）の効率的な粘膜浸透を必要とする。
【０５９５】
頬側および舌下投与の場合と同様に、口腔粘膜を介した薬剤の送達には、経口送達を介する送達より薬剤の血漿濃度が多くの場合急速に上昇することを含む複数の望ましい特徴がある（Ｈａｒｖｅｙ，Ｃｈａｐｔｅｒ  ３５  Ｉｎ：Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ＝ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ  Ｅｄ．，Ｇｅｎｎａｒｏ，ｅｄ．，Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ，１９９０，ｐａｇｅ  ７１１）。
【０５９６】
消化管の内部へ直接薬剤を送達するために、内視鏡検査を用いることが可能である。例えば、内視鏡的逆行性膵胆管造影法（ＥＲＣＰ）は、拡張された胃鏡検査を利用しており、胆道および膵管への選択的なアクセスが可能である（Ｈｉｒａｈａｔａら、Ｇａｎ  Ｔｏ  Ｋａｇａｋｕ  Ｒｙｏｈｏ，１９９２，１９（１０  Ｓｕｐｐｌ．），１５９１）。リポソーム配合物を含む薬学的組成物を、内視鏡的手段を介して、例えば、十二指腸（Ｓｏｍｏｇｙｉら、Ｐｈａｒｍ．Ｒｅｓ．，１９９５，１２，１４９）または胃粘膜下（Ａｋａｍｏら、Ｊａｐａｎｅｓｅ  Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．，１９９４，８５，６５２）等の消化管の部分中に直接送達することができる。胃洗浄装置（Ｉｎｏｕｅら、Ａｒｔｉｆ．Ｏｒｇａｎｓ，１９９７，２１，２８）および経皮内視鏡的供給装置（Ｐｅｎｎｉｎｇｔｏｎら、Ａｉｌｍｅｎｔ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｔｈｅｒ．，１９９５，９，４７１）も、薬学的組成物の直接消化管送達のために用いることができる。
【０５９７】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド配合物を、肛門を介して直腸またはより下部の腸へと投与することが可能である。直腸座剤、留置浣腸、または直腸カテーテルをこの目的のために用いることができ、特に患者の薬剤服用順守を達成するのが困難である場合に好ましいであろう（例えば、小児科学および老人病学用途において、あるいは患者が嘔吐してしまうかまたは意識がない場合）。直腸投与は、経口経路より迅速かつ高度の血漿レベルを生じうる（Ｈａｒｖｅｙ，Ｃｈａｐｔｅｒ  ３５  Ｉｎ：Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ＝ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ  Ｅｄ．，Ｇｅｎｎａｒｏ，ｅｄ．，Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ，１９９０，ｐａｇｅ  ７１１）。直腸から吸収される薬剤の約５０％が肝臓を迂回することから、この経路による投与は、初回通過代謝に対する潜在能力を有意に低減する（Ｂｅｎｅｔら、Ｃｈａｐｔｅｒ  １  Ｉｎ：Ｇｏｏｄｍａｎ  ＆  Ｇｉｌｍａｎ＝ｓ  Ｔｈｅ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｂａｓｉｓ  ｏｆ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ，９ｔｈ  Ｅｄ．，Ｈａｒｄｍａｎら、ｅｄｓ．，ＭｃＧｒａｗ−Ｈｉｌｌ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，ＮＹ，１９９６）。
【０５９８】
オリゴヌクレオチド組成物の経口投与に有利な一方法は、経口送達である。いくつかの実施形態は、粘膜および上皮膜を越えてオリゴヌクレオチドおよび他の核酸を輸送するために種々の浸透エンハンサーを用いる。浸透エンハンサーは、５つの広範なカテゴリー（界面活性剤、脂肪酸、胆汁酸塩、キレート化剤、および非キレート化剤非界面活性剤）のうちの１つに属するものとして分類されうる（Ｌｅｅら、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，１９９１，ｐ．９２）。したがって、いくつかの実施形態は、界面活性剤、脂肪酸、胆汁酸塩、キレート化剤、および非キレート化剤界面活性剤からなる群の少なくとも１つのメンバーを含む経口オリゴヌクレオチド組成物を含む。さらに別の実施形態は、少なくとも１種類の脂肪酸、例えば、カプリン酸、ラウリン酸、またはそれらの組み合わせ、あるいはそれらの塩を含む経口オリゴヌクレオチドを含む。他の実施形態は、オリゴヌクレオチドの経口生物学的利用能を増強する方法を含み、該方法は、オリゴヌクレオチドおよび少なくとも１種類の浸透エンハンサーの共投与を含む。
【０５９９】
経口オリゴヌクレオチド組成物に添加することが可能である他の賦形剤としては、界面活性剤（または「表面活性剤（ｓｕｒｆａｃｅ−ａｃｔｉｖｅ  ａｇｅｎｔ）」）が挙げられ、該界面活性剤は、水溶液に溶解された場合、該水溶液の表面張力または該水溶液と他の液体との間の界面張力を低減させ、その結果、消化管粘膜または他の上皮膜を介したオリゴヌクレオチドの吸収を増強する化学物質である。胆汁酸塩および脂肪酸以外に、界面活性剤としては、例えば、ラウリル硫酸ナトリウム、ポリオキシエチレン−９−ラウリルエーテル、およびポリオキシエチレン−２０−セチルエーテル（Ｌｅｅら、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，１９９１，ｐａｇｅ．９２）と、ＦＣ−４３等のパーフルオロケミカルエマルション（Ｔａｋａｈａｓｈｉら、Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｐｈａｍａｃｏｌ．，１９８８，４０，２５２）とが挙げられる。
【０６００】
浸透エンハンサーとして作用し、本発明の組成物に用いることが可能な脂肪酸およびそれらの誘導体としては、例えば、オレイン酸、ラウリン酸、カプリン酸（ｎ−デカン酸）、ミリスチン酸、パルミチン酸、ステアリン酸、リノール酸、リノレン酸、ジカプラート、トリカプラート、モノオレイン（１−モノオレオイル−ｒａｃ−グリセロール）、ジラウリン、カプリル酸、アラキドン酸、グリセリル１−モノカプラート、１−ドデシルアザシクロへプタン−２−ｏｎｅ、アシルカルニチン、アシルコリン、それらのモノグリセリドおよびジグリセリド、ならびに／またはそれらの生理学的に許容される塩（すなわち、オレイン酸塩、ラウリン酸塩、カプリン酸塩、ミリスチン酸塩、パルミチン酸塩、ステアリン酸塩、リノール酸塩等）が挙げられる（Ｌｅｅら、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，１９９１，ｐａｇｅ  ９２；Ｍｕｒａｎｉｓｈｉ，Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，１９９０，７，１；Ｅｌ−Ｈａｒｉｒｉら、Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．，１９９２，４４，６５１）。
【０６０１】
いくつかの実施形態では、経口送達用のオリゴヌクレオチド組成物は、少なくとも２種類の異なる相を含み、どちらの相も、粒子、カプセル、ゲルカプセル、ミクロスフェア等を含むことが可能である。各相は、１種類以上のオリゴヌクレオチド、浸透エンハンサー、界面活性剤、生体接着剤、発泡剤、あるいは他のアジュバント、賦形剤、または希釈剤を含有することが可能である。いくつかの実施形態では、一方の相は、少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドおよび少なくとも１種類の浸透エンハンサーを含む。いくつかの実施形態では、第１の相は、少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドおよび少なくとも１種類の浸透エンハンサーを含み、一方で、第２の相は、少なくとも１種類の浸透エンハンサーを含む。いくつかの実施形態では、第１の相は、少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドおよび少なくとも１種類の浸透エンハンサーを含み、一方で、第２の相は、少なくとも１種類の浸透エンハンサーを含み、実質的にオリゴヌクレオチドは含まない。いくつかの実施形態では、少なくとも一方の相は、その相の内容物を徐放するコーティングまたはマトリックス等の少なくとも１種類の分解遅延剤と混合する。いくつかの実施形態では、第１の相は、少なくとも１種類のオリゴヌクレオチドおよび少なくとも１種類の浸透エンハンサーを含み、一方で、第２の相は、少なくとも１種類の浸透エンハンサーおよび放出遅延剤を含む。特定の実施形態では、経口オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドおよび浸透エンハンサーを含有する粒子を含む第１の相と、放出遅延剤で被覆し、かつ浸透エンハンサーを含有する粒子を含む第２の相とを含む。
【０６０２】
種々の胆汁酸塩も、浸透エンハンサーとして機能して、薬剤の取り込みおよび生物学的利用能を促進する。胆汁の生理学的役割としては、脂質および脂肪可溶ビタミンの分散および吸収の促進が挙げられる（Ｂｒｕｎｔｏｎ，Ｃｈａｐｔｅｒ  ３８  ｉｎ：Ｇｏｏｄｍａｎ  ＆  Ｇｉｌｍａｎ＝ｓ  Ｔｈｅ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｂａｓｉｓ  ｏｆ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ，９ｔｈ  Ｅｄ．，Ｈａｒｄｍａｎら、ｅｄｓ．，ＭｃＧｒａｗ−Ｈｉｌｌ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，ＮＹ，１９９６，ｐａｇｅｓ  ９３４−９３５）。種々の天然胆汁酸塩およびそれらの合成誘導体は浸透エンハンサーとして作用する。したがって、用語「胆汁酸塩（ｂｉｌｅ  ｓａｌｔ）」とは、胆汁の天然発生の成分のいずれのものも含み、かつそれらの合成誘導体のいずれのものも含む。本発明の胆汁酸塩としては、例えば、コール酸（またはその薬学的に受容可能なナトリウム塩、コール酸塩）、デヒドロコール酸（デヒドロコール酸ナトリウム）、デオキシコール酸（デオキシコール酸ナトリウム）、グルコール酸（グルコール酸ナトリウム）、グリコール酸（グリコール酸ナトリウム）、グリコデオキシコール酸（グリコデコキシコール酸ナトリウム）、タウロコール酸（タウロコール酸塩）、タウロデオキシコール酸（タウロデオキシコール酸塩）、ケノデオキシコール酸（ＣＤＣＡ、ケノデオキシコール酸ナトリウム）、ウルソデオキシコール酸（ＵＤＣＡ）、タウロ−２４，２５−ジヒドロ−ヒシジン酸ナトリウム（ＳＴＤＨＦ）、グリコジヒドロヒシジン酸ナトリウム、およびポリオキシエチレン−９−ラウリルエーテルが挙げられる（Ｌｅｅら、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，１９９１，ｐａｇｅ  ９２；Ｓｗｉｎｙａｒｄ，Ｃｈａｐｔｅｒ  ３９  Ｉｎ：Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ＝ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ  Ｅｄ．，Ｇｅｎｎａｒｏ，ｅｄ．，Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ，１９９０，ｐａｇｅｓ  ７８２−７８３；Ｍｕｒａｎｉｓｈｉ，Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，１９９０，７，１；Ｙａｍａｍｏｔｏら、Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｅｘｐ．Ｔｈｅｒ．，１９９２，２６３，２５；Ｙａｍａｓｈｉｔａ  ら、Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｓｃｉ．，１９９０，７９，５７９）。
【０６０３】
いくつかの実施形態では、本発明のいくつかの実施形態で有用な浸透エンハンサーは、浸透増強化合物の混合物である。そのような浸透エンハンサーの１つには、ＵＤＣＡ（および／またはＣＤＣＡ）とカプリン酸および／ラウリン酸あるいはそれらの塩（例えば、ナトリウム）との混合物がある。そのような混合物は、粘膜、特に腸粘膜を越えた生物学的活性物質の送達を増強するために有用である。他の浸透エンハンサー混合物は、約５ないし９５％の胆汁酸または胆汁酸塩（類）ＵＤＣＡおよび／またはＣＤＣＡと、５ないし９５％のカプリン酸および／またはラウリン酸とを含む。特定の浸透エンハンサーは、ＵＤＣＡ、カプリン酸、およびラウリン酸のそれぞれ１：２：２の比率のナトリウム塩の混合物である。そのような浸透エンハンサーの別のものは、０．０１：１ないし１：０．０１の比率（モル基準）のカプリン酸およびラウリン酸（またはそれらの塩）の混合物である。特定の実施形態では、カプリン酸およびラウリン酸は、例えば、約０．１：１ないし約１：０．１のモル比率で、特に約０．５：１ないし約１：０．５のモル比率で存在する。
【０６０４】
他の賦形剤としては、キレート化剤、すなわち、金属イオンとの複合体を形成することによって溶液から金属イオンを除去し、その結果、消化管粘膜および他の粘膜を介したオリゴヌクレオチドの吸収を増強する化合物が挙げられる。キレート化剤の本発明における浸透エンハンサーとしての使用に関しては、最も特徴的なＤＮＡヌクレアーゼは、触媒作用に対して二価の金属イオンを必要とすることからキレート化剤によって阻害されるので、キレート化剤は、ＤＮアーゼ阻害剤としても機能するという付加的な利点を持つ（Ｊａｒｒｅｔｔ，Ｊ．Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒ．，１９９３，６１８，３１５）。本発明のキレート化剤としては、限定はされないが、エチレンジアミン四酢酸ニナトリウム（ＥＤＴＡ）、クエン酸、サルチル酸塩（例えば、サルチル酸ナトリウム、５−メトキシサルチル酸塩、およびホモバニリン酸塩）、コラーゲンのＮ−アシル誘導体、ラウレス−９、およびベータ−ジケトン（エナミン）のＮ−アミノアシル誘導体（Ｌｅｅ  ら、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，１９９１，ｐａｇｅ  ９２；Ｍｕｒａｎｉｓｈｉ，Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，１９９０，７，１；Ｂｕｕｒら、Ｊ．Ｃｏｎｔｒｏｌ  Ｒｅｌ．，１９９０，１４，４３）。
【０６０５】
本明細書で用いられるように、非キレート化非界面活性剤浸透エンハンサーは、キレート化剤または界面活性剤としては小さな活性しか示さないが、それにもかかわらず、消化管粘膜および他の粘膜を介したオリゴヌクレオチドの吸収を増強する化合物として定義されうる（Ｍｕｒａｎｉｓｈｉ，Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，１９９０，７，１）。浸透エンハンサーのこのクラスとしては、限定はされないが、不飽和環状尿素、１−アルキル−アルカノン誘導体、および１−アルケニルアザシクロ−アルカノン誘導体（Ｌｅｅら、Ｃｒｉｔｉｃａｌ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ｉｎ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，１９９１，ｐａｇｅ  ９２）と、ジクロフェナックナトリウム、インドメタシン、およびフェニルブタゾン等の非ステロイド性抗炎症剤（Ｙａｍａｓｈｉｔａら、Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．，１９８７，３９，６２１）とが挙げられる。
【０６０６】
オリゴヌクレオチドの取り込みを細胞レベルで増強する物質を、本発明の薬学的組成物および他の組成物に添加することも可能である。例えば、リポフェクチン（Ｊｕｎｉｃｈｉ  ｅｔ  ａｌ、米国特許第５，７０５，１８８号）等のカチオン性脂質、カチオン性グリセロール誘導体、およびポリリジン（Ｌｏｌｌｏら、ＰＣＴ出願ＷＯ  ９７／３０７３１）等のポリカチオン性分子を用いることができる。
【０６０７】
いくつかの経口オリゴヌクレオチド組成物は、その配合物中に担体化合物も組み込む。本明細書で用いられるように、「担体化合物（ｃａｒｒｉｅｒ  ｃｏｍｐｏｕｎｄ）」または「担体（ｃａｒｒｉｅｒ）」とは、不活性でありうる（すなわち、それ自体では生物学的活性を持たない）か、または輸送、認識、経路活性、もしくは経路媒介を必要としうる核酸またはその類似体のことを指すことができる。あるいは、担体化合物または担体は、例えば、生物学的に活性な核酸を分解することまたは循環からのその除去を促進することによって生物学的活性を持つ核酸の生物学的利用能を低減させるインビボ過程によって核酸として認識される。核酸および担体化合物（通常は、過剰の単体化合物）の共投与は、恐らく共通の受容体に対する担体化合物と核酸との競合が原因で、肝臓、腎臓、または他の循環外貯蔵所で回収される核酸の量の実質的な低減を生じうる。例えば、部分的ホスホロチオエートオリゴヌクレオチドを、ポリイノシン酸、硫酸デキストラン、ポリシチジン酸、または４−アセトアミド−４′−イソチオシアノ−スチルベン−２，２′−ニスルホン酸とともに共投与する際、肝臓組織での部分的ホスホロチオエートオリゴヌクレオチドの回収を低減することができる（Ｍｉｙａｏら、Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｒｅｓ．Ｄｅｖ．，１９９５，５，１１５；Ｔａｋａｋｕｒａら、Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  ＆  Ｎｕｃｉ．Ａｃｉｄ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｖ．，１９９６，６，１７７）。
【０６０８】
「薬学的担体（ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  ｃａｒｒｉｅｒ）」または「賦形剤（ｅｘｃｉｐｉｅｎｔ）」は、薬学的に受容可能な溶剤、懸濁剤、または１種類の以上の核酸を動物に送達するための任意のほかの薬理学的に不活性な媒体でもよい。賦形剤は、液体または固体でありえ、所定の薬学的組成物の核酸および他の成分と組み合わせる場合、計画された投与様式を考慮して所望の容量、粘度等を可能にするように選択される。通常の薬学的担体としては、限定はされないが、結合剤（例えば、アルファ化トウモロコシデンプン、ポリビニルピロリドン、またはヒドロキシプロピルメチルセルロース等）と、充填剤（例えば、ラクトースおよび他の糖、微結晶セルロース、ペクチン、ゼラチン、硫酸カルシウム、エチルセルロース、ポリアクリラート、またはリン酸水素カルシウム等）、潤滑剤（例えば、ステアリン酸マグネシウム、タルク、シリカ、コロイド状二酸化ケイ素、ステアリン酸、金属ステアラート、硬化植物油、コーンスターチ、ポリエチレングリコール、安息香酸ナトリウム、酢酸ナトリウム等）と、崩壊剤（例えば、デンプン、グリコール酸ナトリウムデンプン、ＥＸＰＬＯＴＡＢ）と、湿潤剤（例えば、ラウリル硫酸ナトリウム等）が挙げられる。
【０６０９】
経口オリゴヌクレオチド組成物は、薬学的組成物で見出される他の添加物成分を、それらの技術で確立されている使用レベルでさらに含むことが可能である。したがって、例えば、組成物は、例えば、鎮痒薬、収斂薬、局所麻酔薬、または抗炎症剤等の付加的で適合した薬学的的に活性な物質を含有することが可能であるか、あるいは、本発明の組成物の種々の剤形を物理的に配合する上で有用な、色素、香料添加剤、防腐剤、抗酸化剤、乳白剤、増粘剤、および安定剤等の物質を含有することが可能である。しかし、そのような物質が添加される場合、本発明の組成物の成分の生物学的活性に必要以上に干渉しないようにすべきである。
【配列表】
2014087368000001.app