【手続補正書】
【提出日】令和3年11月10日(2021.11.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】追加
【補正の内容】
【配列表】
2021092573000001.app
【手続補正２】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
タンパク質を含むサンプルに対して1つ以上のイムノアッセイを実施して、キチナーゼ3様1 (軟骨糖タンパク質39)(CHI3L1)；C反応性タンパク質、ペントラキシン関連(CRP)；上皮成長因子(β-ウロガストロン)(EGF)；インターロイキン6 (インターフェロン、β2)(IL6)；レプチン(LEP)；マトリックスメタロペプチダーゼ1 (間質コラゲナーゼ)(MMP1)；マトリックスメタロペプチダーゼ3 (ストロメライシン1、プロゼラチナーゼ)(MMP3)；レジスチン(RETN)；血清アミロイドA1 (SAA1)；腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー1A (TNFRSF1A)；血管細胞接着分子1 (VCAM1)；および血管内皮成長因子A (VEGFA)を含むセットから選択される少なくとも4種類のタンパク質マーカーのデータセットを作成することを含む、タンパク質レベルデータを作成するための方法。
【請求項２】
少なくとも4種類のタンパク質マーカーの１つが、SAA1である、請求項1記載の方法。
【請求項３】
CHI3L1が、NCBI RefSeq NP_001267.2（配列番号1）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、CRPが、NCBI RefSeq NP_000558.2（配列番号2）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、EGFが、NCBI RefSeq NP_001954.2（配列番号3）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、IL6が、NCBI RefSeq NP_000591.1（配列番号4）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、LEPが、NCBI RefSeq NP_000221.1（配列番号5）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP1が、NCBI RefSeq NP_002412.1（配列番号6）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP3が、NCBI RefSeq NP_002413.1（配列番号7）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、RETNが、NCBI RefSeq NP_065148.1（配列番号8）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、SAA1が、NCBI RefSeq NP_000322.2（配列番号9）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、TNFRSF1Aが、NCBI RefSeq NP_001056.1（配列番号10）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VCAM1が、NCBI RefSeq NP_001069.1（配列番号11）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VEGFAがNCBI RefSeq NP_001020539.2（配列番号12）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一である、請求項1記載の方法。
【請求項４】
サンプルが、体液、全血、血小板、血清、血漿、赤血球、および白血球の１以上を含む生物学的サンプルである、請求項1乃至3のいずれか一項記載の方法。
【請求項５】
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、およびVEGFAから選択される少なくとも5種類、6種類、7種類、8種類、9種類、10種類または11種類のマーカーを含む、請求項1乃至4のいずれか一項記載の方法。
【請求項６】
タンパク質マーカーが、多くとも500種類、250種類、100種類、50種類、25種類、または12種類のタンパク質マーカーを含む、請求項1乃至5のいずれか一項記載の方法。
【請求項７】
少なくとも4種類のタンパク質マーカーのタンパク質レベルデータを組み合わせて、タンパク質レベルスコアを作成することをさらに含む、請求項1乃至6のいずれか一項記載の方法。
【請求項８】
少なくとも4種類のタンパク質マーカーのタンパク質レベルデータに解釈機能を適用して、単独でまたは１つ以上の臨床パラメーターおよび／または臨床評価と組み合わせて定量的な疾患活動性スコアを作成することをさらに含む、請求項1乃至7のいずれか一項記載の方法。
【請求項９】
疾患活動性スコアが、１以上の臨床評価を予測する、請求項8記載の方法。
【請求項１０】
臨床パラメーターが、治療レジメン、TJC、SJC、朝のこわばり、3箇所以上の関節領域の関節炎、手関節の関節炎、乾癬、対称性関節炎、リウマチ結節、X線画像の変化および他のイメージング、性別、性、年齢、人種、民族、罹病期間、血圧、心拍数、身長、体重、体格指数、家族歴、RF状態、RF力価、ESR、CRP力価、閉経状態、ならびに喫煙者/非喫煙者であるかの１つ以上である、請求項8記載の方法。
【請求項１１】
臨床パラメーターが、DAS、DAS28、DAS28-ESR、DAS28-CRP、HAQ、mHAQ、MDHAQ、医師による全般的評価VAS、患者による全般的評価VAS、疼痛VAS、疲労VAS、全体的VAS、睡眠VAS、SDAI、CDAI、RAPID3、RAPID4、RAPID5、ACR20、ACR50、ACR70、SF-36、RA MRIスコア(RAMRIS)、総Sharpスコア(TSS)、van der Heijde改変TSS、van der Heijde改変Sharpスコア (SHS)、Larsenスコア、TJC、腫脹関節数(SJC)、CRP力価、ESR、医師による全般的評価、HAQスコア、および皮膚BSAの１つ以上である、請求項8記載の方法。
【請求項１２】
疾患活動性スコアが、乾癬性関節炎(PsA)についての疾患活動性の高低を識別する、請求項8記載の方法。
【請求項１３】
疾患活動性スコアが、ROC曲線を提供する、請求項8記載の方法。
【請求項１４】
疾患活動性スコアが、乾癬性関節炎(PsA)について少なくとも0.8のAUROCを提供する、請求項8記載の方法。
【請求項１５】
疾患活動性スコアにおける変化を決定することにより、乾癬性関節炎(PsA)の治療を推奨するための、請求項8の疾患活動性スコアの使用。
【請求項１６】
疾患活動性スコアにおける増加を決定することにより、乾癬性関節炎(PsA)の治療を推奨するための、請求項8の疾患活動性スコアの使用。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００６】
一態様においては、第1の対象についてのタンパク質レベルデータを作成するための方法が提供される。この方法は、第1の対象由来の第1の血液サンプルに対して少なくとも1つのイムノアッセイを実施して、少なくとも4種類のタンパク質マーカーのタンパク質レベルデータを含む第1のデータセットを作成することを含み、ここで、該少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、キチナーゼ3様1 (軟骨糖タンパク質39)(CHI3L1)；C反応性タンパク質、ペントラキシン関連(CRP)；上皮成長因子(β-ウロガストロン)(EGF)；インターロイキン6 (インターフェロン、β2)(IL6)；レプチン(LEP)；マトリックスメタロペプチダーゼ1 (間質コラゲナーゼ)(MMP1)；マトリックスメタロペプチダーゼ3 (ストロメライシン1、プロゼラチナーゼ)(MMP3)；レジスチン(RETN)；血清アミロイドA1 (SAA1)；腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー1A (TNFRSF1A)；血管細胞接着分子1 (VCAM1)；または血管内皮成長因子A (VEGFA)から選択される少なくとも4種類のマーカーを含み、ここで、第1の対象は乾癬性関節炎(PsA)と以前に診断されている。別の態様において、少なくとも1つのイムノアッセイの実施は、第1の血液サンプルを取得する段階であって、第1の血液サンプルが該タンパク質マーカーを含む、段階；第1の血液サンプルを複数の異なる試薬と接触させる段階；該試薬と該マーカーとの間に複数の異なる複合体を生成させる段階；および該複合体を検出して前記データを作成する段階を含む。一態様では、少なくとも1つのイムノアッセイはマルチプレックスアッセイを含む。一態様では、少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも5種類のマーカーを含む。一態様では、少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも6種類のマーカーを含む。一態様では、少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも7種類のマーカーを含む。一態様では、少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも8種類のマーカーを含む。一態様では、少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも9種類のマーカーを含む。一態様では、少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも10種類のマーカーを含む。一態様では、少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも11種類のマーカーを含む。一態様では、該複数のタンパク質マーカーは、多くとも500種類のタンパク質マーカーからなる。一態様では、該複数のタンパク質マーカーは、多くとも250種類のタンパク質マーカーからなる。一態様では、該複数のタンパク質マーカーは、多くとも100種類のタンパク質マーカーからなる。一態様では、該複数のタンパク質マーカーは、多くとも50種類のタンパク質マーカーからなる。一態様では、該複数のタンパク質マーカーは、多くとも25種類のタンパク質マーカーからなる。一態様では、該複数のタンパク質マーカーは、多くとも12種類のタンパク質マーカーからなる。一態様において、CHI3L1はNCBI RefSeq NP_001267.2（配列番号1）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、CRPはNCBI RefSeq NP_000558.2（配列番号2）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、EGFはNCBI RefSeq NP_001954.2（配列番号3）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、IL6はNCBI RefSeq NP_000591.1（配列番号4）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、LEPはNCBI RefSeq NP_000221.1（配列番号5）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP1はNCBI RefSeq NP_002412.1（配列番号6）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP3はNCBI RefSeq NP_002413.1（配列番号7）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、RETNはNCBI RefSeq NP_065148.1（配列番号8）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、SAA1はNCBI RefSeq NP_000322.2（配列番号9）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、TNFRSF1AはNCBI RefSeq NP_001056.1（配列番号10）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VCAM1はNCBI RefSeq NP_001069.1（配列番号11）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、かつVEGFAはNCBI RefSeq NP_001020539.2（配列番号12）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一である。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００７】
別の態様においては、タンパク質レベルスコアを作成するための方法が提供される。この方法は、以下の段階を含む：乾癬性関節炎(PsA)と以前に診断された対象由来の第1の血液サンプルに対して少なくとも1つのイムノアッセイを実施して、複数のタンパク質マーカーの各タンパク質マーカーに関するタンパク質レベルデータを作成する段階であって、該複数のタンパク質マーカーが、キチナーゼ3様1 (軟骨糖タンパク質39)(CHI3L1)；C反応性タンパク質、ペントラキシン関連(CRP)；上皮成長因子(β-ウロガストロン)(EGF)；インターロイキン6 (インターフェロン、β2)(IL6)；レプチン(LEP)；マトリックスメタロペプチダーゼ1 (間質コラゲナーゼ)(MMP1)；マトリックスメタロペプチダーゼ3 (ストロメライシン1、プロゼラチナーゼ)(MMP3)；レジスチン(RETN)；血清アミロイドA1 (SAA1)；腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー1A (TNFRSF1A)；血管細胞接着分子1 (VCAM1)；または血管内皮成長因子A (VEGFA)から選択される少なくとも4種類のマーカーを含む複数の試験マーカーを含む、段階；および各試験マーカーのタンパク質レベルデータを組み合わせて、タンパク質レベルスコアを作成する段階。一態様において、少なくとも1つのイムノアッセイの実施は、第1の血液サンプルを取得する段階であって、第1の血液サンプルが前記タンパク質マーカーを含む、段階；第1の血液サンプルを複数の異なる試薬と接触させる段階；該試薬と該マーカーとの間に複数の異なる複合体を生成させる段階；および該複合体を検出して前記データを作成する段階を含む。一態様では、少なくとも1つのイムノアッセイはマルチプレックスアッセイを含む。一態様では、少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも5種類のマーカーを含む。一態様では、少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも6種類のマーカーを含む。一態様では、少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも7種類のマーカーを含む。一態様では、少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも8種類のマーカーを含む。一態様では、少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも9種類のマーカーを含む。一態様では、少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも10種類のマーカーを含む。一態様では、少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも11種類のマーカーを含む。一態様では、該複数の試験マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、およびVEGFAを含む。一態様において、CHI3L1はNCBI RefSeq NP_001267.2（配列番号1）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、CRPはNCBI RefSeq NP_000558.2（配列番号2）のアミノ酸配列��少なくとも90％同一であり、EGFはNCBI RefSeq NP_001954.2（配列番号3）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、IL6はNCBI RefSeq NP_000591.1（配列番号4）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、LEPはNCBI RefSeq NP_000221.1（配列番号5）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP1はNCBI RefSeq NP_002412.1（配列番号6）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP3はNCBI RefSeq NP_002413.1（配列番号7）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、RETNはNCBI RefSeq NP_065148.1（配列番号8）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、SAA1はNCBI RefSeq NP_000322.2（配列番号9）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、TNFRSF1AはNCBI RefSeq NP_001056.1（配列番号10）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VCAM1はNCBI RefSeq NP_001069.1（配列番号11）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、かつVEGFAはNCBI RefSeq NP_001020539.2（配列番号12）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一である。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００８】
別の態様においては、乾癬性関節炎(PsA)と以前に診断された対象においてPsAの疾患活動性の定量的尺度を提供するための方法が提供される。この方法は、乾癬性関節炎(PsA)と以前に診断された対象においてPsAの疾患活動性の定量的尺度を提供することを含み、以下の段階を含む：該対象由来の第1のサンプルに対して少なくとも1つのイムノアッセイを実施して、キチナーゼ3様1 (軟骨糖タンパク質39)(CHI3L1)；C反応性タンパク質、ペントラキシン関連(CRP)；上皮成長因子(β-ウロガストロン)(EGF)；インターロイキン6 (インターフェロン、β2)(IL6)；レプチン(LEP)；マトリックスメタロペプチダーゼ1 (間質コラゲナーゼ)(MMP1)；マトリックスメタロペプチダーゼ3 (ストロメライシン1、プロゼラチナーゼ)(MMP3)；レジスチン(RETN)；血清アミロイドA1 (SAA1)；腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー1A (TNFRSF1A)；血管細胞接着分子1 (VCAM1)；または血管内皮成長因子A (VEGFA)から選択される少なくとも4種類のマーカーを含む定量的データを含む第1のデータセットを作成する段階；および第1のデータセットにアルゴリズムを適用して、第1の疾患活動性スコアを決定する段階であって、第1の疾患活動性スコアが該対象におけるPsA疾患活動性の定量的尺度を提供する、段階。一態様において、この方法は、以下の段階をさらに含む：該対象から取得した第2のサンプルに関連する第2のデータセットを受け取る段階であって、第1のサンプルと第2のサンプルが異なる時期に該対象から取得したものである、段階；第2のデータセットにアルゴリズムを適用して、第2の疾患活動性スコアを決定する段階；および第1の疾患活動性スコアと第2の疾患活動性スコアを比較して、疾患活動性スコアの変化を決定する段階であって、その変化が該対象における乾癬性関節炎の疾患活動性の変化を示す、段階。一態様では、該少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも5種類、6種類、7種類、8種類、9種類、10種類、または11種類のマーカーを含む。一態様において、CHI3L1はNCBI RefSeq NP_001267.2（配列番号1）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、CRPはNCBI RefSeq NP_000558.2（配列番号2）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、EGFはNCBI RefSeq NP_001954.2（配列番号3）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、IL6はNCBI RefSeq NP_000591.1（配列番号4）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、LEPはNCBI RefSeq NP_000221.1（配列番号5）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP1はNCBI RefSeq NP_002412.1（配列番号6）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP3はNCBI RefSeq NP_002413.1（配列番号7）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、RETNはNCBI RefSeq NP_065148.1（配列番号8）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、SAA1はNCBI RefSeq NP_000322.2（配列番号9）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、TNFRSF1AはNCBI RefSeq NP_001056.1（配列番号10）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VCAM1はNCBI RefSeq NP_001069.1（配列番号11）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、かつVEGFAはNCBI RefSeq NP_001020539.2（配列番号12）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一である。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００９】
別の態様においては、サンプルをスコアリングするためのシステムが提供される。このシステムは、以下を含む：乾癬性関節炎(PsA)と以前に診断された対象から取得した第1のサンプルに関連する第1のデータセットを保存するための記憶用メモリであって、第1のデータセットが、キチナーゼ3様1 (軟骨糖タンパク質39)(CHI3L1)；C反応性タンパク質、ペントラキシン関連(CRP)；上皮成長因子(β-ウロガストロン)(EGF)；インターロイキン6 (インターフェロン、β2)(IL6)；レプチン(LEP)；マトリックスメタロペプチダーゼ1 (間質コラゲナーゼ)(MMP1)；マトリックスメタロペプチダーゼ3 (ストロメライシン1、プロゼラチナーゼ)(MMP3)；レジスチン(RETN)；血清アミロイドA1 (SAA1)；腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー1A (TNFRSF1A)；血管細胞接着分子1 (VCAM1)；または血管内皮成長因子A (VEGFA)から選択される少なくとも4種類のマーカーの定量的データを含む、記憶用メモリ；および該記憶用メモリに通信可能に接続されたプロセッサであって、該プロセッサが、第1のデータセットにアルゴリズムを適用して第1の疾患活動性スコアを決定するように構成されており、ここで、第1の疾患活動性スコアが、該対象におけるPsA疾患活動性の定量的尺度を提供し、該アルゴリズムは、既知のPsA疾患活動性を有する対象由来のサンプル中の少なくとも4種類のマーカーを表すデータを用いてトレーニングされる、プロセッサ。一態様では、該少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも5種類、6種類、7種類、8種類、9種類、10種類、または11種類のマーカーを含む。一態様において、CHI3L1はNCBI RefSeq NP_001267.2（配列番号1）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、CRPはNCBI RefSeq NP_000558.2（配列番号2）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、EGFはNCBI RefSeq NP_001954.2（配列番号3）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、IL6はNCBI RefSeq NP_000591.1（配列番号4）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、LEPはNCBI RefSeq NP_000221.1（配列番号5）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP1はNCBI RefSeq NP_002412.1（配列番号6）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP3はNCBI RefSeq NP_002413.1（配列番号7）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、RETNはNCBI RefSeq NP_065148.1（配列番号8）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、SAA1はNCBI RefSeq NP_000322.2（配列番号9）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、TNFRSF1AはNCBI RefSeq NP_001056.1（配列番号10）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VCAM1はNCBI RefSeq NP_001069.1（配列番号11）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、かつVEGFAはNCBI RefSeq NP_001020539.2（配列番号12）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一である。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１０】
別の態様においては、乾癬性関節炎(PsA)と以前に診断された対象において治療レジメンを推奨するための方法が提供される。この方法は、以下の段階を含む：a) 第1の時点で、該対象由来の第1のサンプルに対して第1のイムノアッセイを実施して、定量的データの第1のセットに基づいて第1のスコアを作成する段階であって、定量的データの第1のセットが、キチナーゼ3様1 (軟骨糖タンパク質39)(CHI3L1)；C反応性タンパク質、ペントラキシン関連(CRP)；上皮成長因子(β-ウロガストロン)(EGF)；インターロイキン6 (インターフェロン、β2)(IL6)；レプチン(LEP)；マトリックスメタロペプチダーゼ1 (間質コラゲナーゼ)(MMP1)；マトリックスメタロペプチダーゼ3 (ストロメライシン1、プロゼラチナーゼ)(MMP3)；レジスチン(RETN)；血清アミロイドA1 (SAA1)；腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー1A (TNFRSF1A)；血管細胞接着分子1 (VCAM1)；または血管内皮成長因子A (VEGFA)から選択される少なくとも4種類のバイオマーカーの発現データを含む、段階；b) 第1の時点後の第2の時点で、該対象由来の第2のサンプルに対して第2のイムノアッセイを実施して、定量的データの第2のセットに基づいて第2のスコアを作成する段階であって、定量的データの第2のセットが該少なくとも4種類のバイオマーカーの発現データを含む、段階；c) 第1のスコアと第2のスコアとの間に差があるかどうかを判定する段階；およびd) 第1のスコアと第2のスコアとの間の差に基づいて、治療レジメンを推奨するか、または既存の治療レジメンを変更する段階。一態様において、第1のスコアと第2のスコアとの間の差がPsA疾患活動性の低下または変化なしを示す場合には、非生物学的治療レジメンが推奨される。一態様において、第1のスコアと第2のスコアとの間の差がPsA疾患活動性の増加を示す場合には、生物学的治療レジメンが推奨される。一態様において、少なくとも1つのイムノアッセイの実施は、第1のサンプルを取得する段階であって、第1のサンプルが前記タンパク質マーカーを含む、段階；第1のサンプルを複数の異なる試薬と接触させる段階；該試薬と該マーカーとの間に複数の異なる複合体を生成させる段階；および該複合体を検出して前記データを作成する段階を含む。一態様では、第1および第2のイムノアッセイはマルチプレックスアッセイを含む。一態様では、該少なくとも4種類のタンパク質マーカーは、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも5種類、6種類、7種類、8種類、9種類、10種類、または11種類のマーカーを含む。一態様において、CHI3L1はNCBI RefSeq NP_001267.2（配列番号1）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、CRPはNCBI RefSeq NP_000558.2（配列番号2）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、EGFはNCBI RefSeq NP_001954.2（配列番号3）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、IL6はNCBI RefSeq NP_000591.1（配列番号4）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、LEPはNCBI RefSeq NP_000221.1（配列番号5）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP1はNCBI RefSeq NP_002412.1（配列番号6）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP3はNCBI RefSeq NP_002413.1（配列番号7）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、RETNはNCBI RefSeq NP_065148.1（配列番号8）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、SAA1はNCBI RefSeq NP_000322.2（配列番号9）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、TNFRSF1AはNCBI RefSeq NP_001056.1（配列番号10）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VCAM1はNCBI RefSeq NP_001069.1（配列番号11）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、かつVEGFAはNCBI RefSeq NP_001020539.2（配列番号12）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一である。
[本発明1001]
第1の対象由来の第1の血液サンプルに対して少なくとも1つのイムノアッセイを実施して、少なくとも4種類のタンパク質マーカーのタンパク質レベルデータを含む第1のデータセットを作成すること
を含む、第1の対象についてのタンパク質レベルデータを作成するための方法であって、
該少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、キチナーゼ3様1 (軟骨糖タンパク質39)(CHI3L1)；C反応性タンパク質、ペントラキシン関連(CRP)；上皮成長因子(β-ウロガストロン)(EGF)；インターロイキン6 (インターフェロン、β2)(IL6)；レプチン(LEP)；マトリックスメタロペプチダーゼ1 (間質コラゲナーゼ)(MMP1)；マトリックスメタロペプチダーゼ3 (ストロメライシン1、プロゼラチナーゼ)(MMP3)；レジスチン(RETN)；血清アミロイドA1 (SAA1)；腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー1A (TNFRSF1A)；血管細胞接着分子1 (VCAM1)；または血管内皮成長因子A (VEGFA)から選択される少なくとも4種類のマーカーを含み、
第1の対象が乾癬性関節炎(PsA)と以前に診断されている、
前記方法。
[本発明1002]
少なくとも1つのイムノアッセイの実施が、
第1の血液サンプルを取得する段階であって、第1の血液サンプルが前記タンパク質マーカーを含む、段階；
第1の血液サンプルを複数の異なる試薬と接触させる段階；
該試薬と該マーカーとの間に複数の異なる複合体を生成させる段階；および
該複合体を検出して前記データを作成する段階
を含む、本発明1001の方法。
[本発明1003]
少なくとも1つのイムノアッセイがマルチプレックスアッセイを含む、本発明1001の方法。
[本発明1004]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも5種類のマーカーを含む、本発明1001の方法。
[本発明1005]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも6種類のマーカーを含む、本発明1001の方法。
[本発明1006]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも7種類のマーカーを含む、本発明1001の方法。
[本発明1007]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも8種類のマーカーを含む、本発明1001の方法。
[本発明1008]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも9種類のマーカーを含む、本発明1001の方法。
[本発明1009]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも10種類のマーカーを含む、本発明1001の方法。
[本発明1010]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも11種類のマーカーを含む、本発明1001の方法。
[本発明1011]
前記複数のタンパク質マーカーが多くとも500種類のタンパク質マーカーからなる、本発明1001の方法。
[本発明1012]
前記複数のタンパク質マーカーが多くとも250種類のタンパク質マーカーからなる、本発明1001の方法。
[本発明1013]
前記複数のタンパク質マーカーが多くとも100種類のタンパク質マーカーからなる、本発明1001の方法。
[本発明1014]
前記複数のタンパク質マーカーが多くとも50種類のタンパク質マーカーからなる、本発明1001の方法。
[本発明1015]
前記複数のタンパク質マーカーが多くとも25種類のタンパク質マーカーからなる、本発明1001の方法。
[本発明1016]
前記複数のタンパク質マーカーが多くとも12種類のタンパク質マーカーからなる、本発明1001の方法。
[本発明1017]
CHI3L1がNCBI RefSeq NP_001267.2（配列番号1）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、CRPがNCBI RefSeq NP_000558.2（配列番号2）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、EGFがNCBI RefSeq NP_001954.2（配列番号3）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、IL6がNCBI RefSeq NP_000591.1（配列番号4）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、LEPがNCBI RefSeq NP_000221.1（配列番号5）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP1がNCBI RefSeq NP_002412.1（配列番号6）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP3がNCBI RefSeq NP_002413.1（配列番号7）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、RETNがNCBI RefSeq NP_065148.1（配列番号8）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、SAA1がNCBI RefSeq NP_000322.2（配列番号9）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、TNFRSF1AがNCBI RefSeq NP_001056.1（配列番号10）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VCAM1がNCBI RefSeq NP_001069.1（配列番号11）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VEGFAがNCBI RefSeq NP_001020539.2（配列番号12）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一である、本発明1001の方法。
[本発明1018]
タンパク質レベルスコアを作成するための方法であって、以下の段階を含む方法：
乾癬性関節炎(PsA)と以前に診断された対象由来の第1の血液サンプルに対して少なくとも1つのイムノアッセイを実施して、複数のタンパク質マーカーの各タンパク質マーカーに関するタンパク質レベルデータを作成する段階であって、
該複数のタンパク質マーカーが、キチナーゼ3様1 (軟骨糖タンパク質39)(CHI3L1)；C反応性タンパク質、ペントラキシン関連(CRP)；上皮成長因子(β-ウロガストロン)(EGF)；インターロイキン6 (インターフェロン、β2)(IL6)；レプチン(LEP)；マトリックスメタロペプチダーゼ1 (間質コラゲナーゼ)(MMP1)；マトリックスメタロペプチダーゼ3 (ストロメライシン1、プロゼラチナーゼ)(MMP3)；レジスチン(RETN)；血清アミロイドA1 (SAA1)；腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー1A (TNFRSF1A)；血管細胞接着分子1 (VCAM1)；または血管内皮成長因子A (VEGFA)から選択される少なくとも4種類のマーカーを含む複数の試験マーカーを含む、段階；および
各試験マーカーのタンパク質レベルデータを組み合わせて、タンパク質レベルスコアを作成する段階。
[本発明1019]
少なくとも1つのイムノアッセイの実施が、
第1の血液サンプルを取得する段階であって、第1の血液サンプルが前記タンパク質マーカーを含む、段階；
第1の血液サンプルを複数の異なる試薬と接触させる段階；
該試薬と該マーカーとの間に複数の異なる複合体を生成させる段階；および
該複合体を検出して前記データを作成する段階
を含む、本発明1018の方法。
[本発明1020]
少なくとも1つのイムノアッセイがマルチプレックスアッセイを含む、本発明1018の方法。
[本発明1021]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも5種類のマーカーを含む、本発明1018の方法。
[本発明1022]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも6種類のマーカーを含む、本発明1018の方法。
[本発明1023]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも7種類のマーカーを含む、本発明1018の方法。
[本発明1024]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも8種類のマーカーを含む、本発明1018の方法。
[本発明1025]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも9種類のマーカーを含む、本発明1018の方法。
[本発明1026]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも10種類のマーカーを含む、本発明1018の方法。
[本発明1027]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも11種類のマーカーを含む、本発明1018の方法。
[本発明1028]
前記複数の試験マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、およびVEGFAを含む、本発明1018の方法。
[本発明1029]
CHI3L1がNCBI RefSeq NP_001267.2（配列番号1）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、CRPがNCBI RefSeq NP_000558.2（配列番号2）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、EGFがNCBI RefSeq NP_001954.2（配列番号3）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、IL6がNCBI RefSeq NP_000591.1（配列番号4）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、LEPがNCBI RefSeq NP_000221.1（配列番号5）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP1がNCBI RefSeq NP_002412.1（配列番号6）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP3がNCBI RefSeq NP_002413.1（配列番号7）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、RETNがNCBI RefSeq NP_065148.1（配列番号8）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、SAA1がNCBI RefSeq NP_000322.2（配列番号9）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、TNFRSF1AがNCBI RefSeq NP_001056.1（配列番号10）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VCAM1がNCBI RefSeq NP_001069.1（配列番号11）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VEGFAがNCBI RefSeq NP_001020539.2（配列番号12）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一である、本発明1018の方法。
[本発明1030]
乾癬性関節炎(PsA)と以前に診断された対象においてPsAの疾患活動性の定量的尺度を提供するための方法であって、以下の段階を含む方法：
該対象由来の第1のサンプルに対して少なくとも1つのイムノアッセイを実施して、キチナーゼ3様1 (軟骨糖タンパク質39)(CHI3L1)；C反応性タンパク質、ペントラキシン関連(CRP)；上皮成長因子(β-ウロガストロン)(EGF)；インターロイキン6 (インターフェロン、β2)(IL6)；レプチン(LEP)；マトリックスメタロペプチダーゼ1 (間質コラゲナーゼ)(MMP1)；マトリックスメタロペプチダーゼ3 (ストロメライシン1、プロゼラチナーゼ)(MMP3)；レジスチン(RETN)；血清アミロイドA1 (SAA1)；腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー1A (TNFRSF1A)；血管細胞接着分子1 (VCAM1)；または血管内皮成長因子A (VEGFA)から選択される少なくとも4種類のマーカーを含む定量的データを含む第1のデータセットを作成する段階；および
第1のデータセットにアルゴリズムを適用して、第1の疾患活動性スコアを決定する段階であって、第1の疾患活動性スコアが該対象におけるPsA疾患活動性の定量的尺度を提供する、段階。
[本発明1031]
前記対象から取得した第2のサンプルに関連する第2のデータセットを受け取る段階であって、第1のサンプルと第2のサンプルが異なる時期に該対象から取得したものである、段階；
第2のデータセットにアルゴリズムを適用して、第2の疾患活動性スコアを決定する段階；および
第1の疾患活動性スコアと第2の疾患活動性スコアを比較して、疾患活動性スコアの変化を決定する段階であって、その変化が該対象における乾癬性関節炎の疾患活動性の変化を示す、段階
をさらに含む、本発明1030の方法。
[本発明1032]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも5種類、6種類、7種類、8種類、9種類、10種類、または11種類のマーカーを含む、本発明1030の方法。
[本発明1033]
CHI3L1がNCBI RefSeq NP_001267.2（配列番号1）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、CRPがNCBI RefSeq NP_000558.2（配列番号2）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、EGFがNCBI RefSeq NP_001954.2（配列番号3）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、IL6がNCBI RefSeq NP_000591.1（配列番号4）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、LEPがNCBI RefSeq NP_000221.1（配列番号5）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP1がNCBI RefSeq NP_002412.1（配列番号6）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP3がNCBI RefSeq NP_002413.1（配列番号7）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、RETNがNCBI RefSeq NP_065148.1（配列番号8）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、SAA1がNCBI RefSeq NP_000322.2（配列番号9）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、TNFRSF1AがNCBI RefSeq NP_001056.1（配列番号10）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VCAM1がNCBI RefSeq NP_001069.1（配列番号11）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VEGFAがNCBI RefSeq NP_001020539.2（配列番号12）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一である、本発明1030の方法。
[本発明1034]
サンプルをスコアリングするためのシステムであって、以下を含むシステム：
乾癬性関節炎(PsA)と以前に診断された対象から取得した第1のサンプルに関連する第1のデータセットを保存するための記憶用メモリであって、
第1のデータセットが、キチナーゼ3様1 (軟骨糖タンパク質39)(CHI3L1)；C反応性タンパク質、ペントラキシン関連(CRP)；上皮成長因子(β-ウロガストロン)(EGF)；インターロイキン6 (インターフェロン、β2)(IL6)；レプチン(LEP)；マトリックスメタロペプチダーゼ1 (間質コラゲナーゼ)(MMP1)；マトリックスメタロペプチダーゼ3 (ストロメライシン1、プロゼラチナーゼ)(MMP3)；レジスチン(RETN)；血清アミロイドA1 (SAA1)；腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー1A (TNFRSF1A)；血管細胞接着分子1 (VCAM1)；または血管内皮成長因子A (VEGFA)から選択される少なくとも4種類のマーカーの定量的データを含む、記憶用メモリ；および
該記憶用メモリに通信可能に接続されたプロセッサであって、
該プロセッサが、第1のデータセットにアルゴリズムを適用して第1の疾患活動性スコアを決定するように構成されており、ここで、第1の疾患活動性スコアが、該対象におけるPsA疾患活動性の定量的尺度を提供し、該アルゴリズムが、既知のPsA疾患活動性を有する対象由来のサンプル中の少なくとも4種類のマーカーを表すデータを用いてトレーニングされる、プロセッサ。
[本発明1035]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも5種類、6種類、7種類、8種類、9種類、10種類、または11種類のマーカーを含む、本発明1034のシステム。
[本発明1036]
CHI3L1がNCBI RefSeq NP_001267.2（配列番号1）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、CRPがNCBI RefSeq NP_000558.2（配列番号2）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、EGFがNCBI RefSeq NP_001954.2（配列番号3）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、IL6がNCBI RefSeq NP_000591.1（配列番号4）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、LEPがNCBI RefSeq NP_000221.1（配列番号5）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP1がNCBI RefSeq NP_002412.1（配列番号6）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP3がNCBI RefSeq NP_002413.1（配列番号7）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、RETNがNCBI RefSeq NP_065148.1（配列番号8）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、SAA1がNCBI RefSeq NP_000322.2（配列番号9）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、TNFRSF1AがNCBI RefSeq NP_001056.1（配列番号10）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VCAM1がNCBI RefSeq NP_001069.1（配列番号11）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VEGFAがNCBI RefSeq NP_001020539.2（配列番号12）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一である、本発明1034のシステム。
[本発明1037]
乾癬性関節炎(PsA)と以前に診断された対象において治療レジメンを推奨するための方法であって、以下の段階を含む方法：
a) 第1の時点で、該対象由来の第1のサンプルに対して第1のイムノアッセイを実施して、定量的データの第1のセットに基づいて第1のスコアを作成する段階であって、
定量的データの第1のセットが、キチナーゼ3様1 (軟骨糖タンパク質39)(CHI3L1)；C反応性タンパク質、ペントラキシン関連(CRP)；上皮成長因子(β-ウロガストロン)(EGF)；インターロイキン6 (インターフェロン、β2)(IL6)；レプチン(LEP)；マトリックスメタロペプチダーゼ1 (間質コラゲナーゼ)(MMP1)；マトリックスメタロペプチダーゼ3 (ストロメライシン1、プロゼラチナーゼ)(MMP3)；レジスチン(RETN)；血清アミロイドA1 (SAA1)；腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー、メンバー1A (TNFRSF1A)；血管細胞接着分子1 (VCAM1)；または血管内皮成長因子A (VEGFA)から選択される少なくとも4種類のバイオマーカーの発現データを含む、段階；
b) 第1の時点後の第2の時点で、該対象由来の第2のサンプルに対して第2のイムノアッセイを実施して、定量的データの第2のセットに基づいて第2のスコアを作成する段階であって、
定量的データの第2のセットが該少なくとも4種類のバイオマーカーの発現データを含む、段階；
c) 第1のスコアと第2のスコアとの間に差があるかどうかを判定する段階；および
d) 第1のスコアと第2のスコアとの間の差に基づいて、治療レジメンを推奨するか、または既存の治療レジメンを変更する段階。
[本発明1038]
第1のスコアと第2のスコアとの間の差がPsA疾患活動性の低下または変化なしを示す場合には、非生物学的治療レジメンが推奨される、本発明1037の方法。
[本発明1039]
第1のスコアと第2のスコアとの間の差がPsA疾患活動性の増加を示す場合には、生物学的治療レジメンが推奨される、本発明1037の方法。
[本発明1040]
前記少なくとも1つのイムノアッセイの実施が、
第1のサンプルを取得する段階であって、第1のサンプルが前記タンパク質マーカーを含む、段階；
第1のサンプルを複数の異なる試薬と接触させる段階；
該試薬と該マーカーとの間に複数の異なる複合体を生成させる段階；および
該複合体を検出して前記データを作成する段階
を含む、本発明1037の方法。
[本発明1041]
第1および第2のイムノアッセイがマルチプレックスアッセイを含む、本発明1037の方法。
[本発明1042]
少なくとも4種類のタンパク質マーカーが、CHI3L1、CRP、EGF、IL6、LEP、MMP1、MMP3、RETN、SAA1、TNFRSF1A、VCAM1、またはVEGFAから選択される少なくとも5種類、6種類、7種類、8種類、9種類、10種類、または11種類のマーカーを含む、本発明1037の方法。
[本発明1043]
CHI3L1がNCBI RefSeq NP_001267.2（配列番号1）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、CRPがNCBI RefSeq NP_000558.2（配列番号2）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、EGFがNCBI RefSeq NP_001954.2（配列番号3）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、IL6がNCBI RefSeq NP_000591.1（配列番号4）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、LEPがNCBI RefSeq NP_000221.1（配列番号5）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP1がNCBI RefSeq NP_002412.1（配列番号6）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、MMP3がNCBI RefSeq NP_002413.1（配列番号7）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、RETNがNCBI RefSeq NP_065148.1（配列番号8）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、SAA1がNCBI RefSeq NP_000322.2（配列番号9）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、TNFRSF1AがNCBI RefSeq NP_001056.1（配列番号10）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VCAM1がNCBI RefSeq NP_001069.1（配列番号11）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一であり、VEGFAがNCBI RefSeq NP_001020539.2（配列番号12）のアミノ酸配列と少なくとも90％同一である、本発明1037の方法。