(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
３−ヒドロキシ酪酸と乳酸とからなる共重合ポリエステルの製造方法であって、
１）プロピオン酸及び／又は乳酸にＣｏＡが転移される反応を触媒する配列番号４に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質、２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒する配列番号６に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質、アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒する配列番号８に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質、及びポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒する配列番号２に示されるアミノ酸配列の３２５番目のＳｅｒがＴｈｒに、４８１番目のＧｌｎがＬｙｓにそれぞれ置換されたアミノ酸配列からなるタンパク質を有する組み換え微生物を、炭素源を含む培地で培養する工程：及び、
２）工程１）の培養物から前記共重合ポリエステルを回収する工程を含む、前記共重合ポリエステルの製造方法。
【請求項２】
前記タンパク質のいずれもが、微生物に導入された組み換え発現ベクターにコードされているタンパク質である、請求項１に記載の製造方法。
【請求項３】
組み換え微生物の培養が嫌気条件下に行われる、請求項１又は２に記載の製造方法。
【請求項４】
微生物が乳酸蓄積能を有する微生物である、請求項１〜３の何れかに記載の製造方法。
【請求項５】
高乳酸蓄積能を有する微生物が、大腸菌Ｊｗ２２９３株、Ｊｗ０８８５株又はＪｗ０８８６株である、請求項４に記載の製造方法。
【請求項６】
３−ヒドロキシ酪酸と乳酸を含む共重合ポリエステルの製造方法であって、
１）プロピオン酸及び／又は乳酸にＣｏＡが転移される反応を触媒する配列番号４に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質、２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒する配列番号６に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質、アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒する配列番号８に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質、及びポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒する配列番号２に示されるアミノ酸配列の３２５番目のＳｅｒがＴｈｒに、４８１番目のＧｌｎがＬｙｓにそれぞれ置換されたアミノ酸配列からなるタンパク質を有する組み換え微生物を、３−ヒドロキシ酪酸と乳酸以外のヒドロキシアルカン酸及び炭素源を含む培地で培養する工程：及び、
２）工程１）の培養物から前記共重合ポリエステルを回収する工程を含む、前記共重合ポリエステルの製造方法。
【請求項７】
前記タンパク質のいずれもが、微生物に導入された組み換え発現ベクターにコードされているタンパク質である、請求項６に記載の製造方法。
【請求項８】
３−ヒドロキシ酪酸と乳酸以外のヒドロキシアルカン酸の前駆体が、プロピオン酸、吉草酸、ドデカン酸、４−ヒドロキシ酪酸及び４−ヒドロキシ吉草酸よりなる群から選ばれる一種以上の前駆体である、請求項６又は７に記載の製造方法。
【請求項９】
組み換え微生物の培養が嫌気条件下に行われる、請求項６〜８の何れかに記載の製造方法。
【請求項１０】
微生物が乳酸蓄積能を有する微生物である、請求項６〜９の何れかに記載の製造方法。
【請求項１１】
高乳酸蓄積能を有する微生物が、大腸菌Ｊｗ２２９３株、Ｊｗ０８８５株又はＪｗ０８８６株である、請求項１０に記載の製造方法。
【請求項１２】
プロピオン酸及び／又は乳酸にＣｏＡが転移される反応を触媒する配列番号４に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質、２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒する配列番号６に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質、アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒する配列番号８に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質、及びポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒する配列番号２に示されるアミノ酸配列の３２５番目のＳｅｒがＴｈｒに、４８１番目のＧｌｎがＬｙｓにそれぞれ置換されたアミノ酸配列からなるタンパク質を発現する組み換え微生物。
【請求項１３】
前記タンパク質のいずれもが、微生物に導入された組み換え発現ベクターにコードされているタンパク質である、請求項１２に記載の組み換え微生物。
【請求項１４】
微生物が乳酸蓄積能を有する微生物である、請求項１２又は１３に記載の組み換え微生物。
【請求項１５】
高乳酸蓄積能を有する微生物が、大腸菌Ｊｗ２２９３株、Ｊｗ０８８５株又はＪｗ０８８６株である、請求項１４に記載の組み換え微生物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、組み換え微生物を用いた共重合ポリエステルの製造方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
糖を炭素源としてポリエステルを生産する能力を有する微生物は、これまでにも多数報告されている（非特許文献１）。微生物が生産するポリエステルは、自然界で容易に分解される生分解性プラスチックとして、また糖や植物油などの再生可能な炭素資源から合成することができる“グリーン”プラスチックとして、注目されている。【０００３】
微生物が生産する生分解性プラスチックの代表例は、３−ヒドロキシ酪酸（３ＨＢ）をモノマーとするポリ−３−ヒドロキシ酪酸（ｐｏｌｙｈｙｄｏｒｏｘｙｂｕｔｙｌａｔｅ、ＰＨＢ）である。ＰＨＢは、１８０℃程度に融解温度をもつ熱可塑性高分子であり、生分解性に加えて溶融加工性に優れるという利点を有する。その一方、ＰＨＢは、結晶性が高いために、硬くて脆い、すなわち耐衝撃性に劣るという物性上の問題を抱えている。【０００４】
ＰＨＢの物性上の問題を解消する方法の一つとして、３ＨＢとその他のヒドロキシアルカン酸とからなる共重合ポリエステルを、微生物を用いて製造する方法が開発されている。【０００５】
例えば、特許文献１には３ＨＢと３−ヒドロキシ吉草酸（３ＨＶ）とからなる共重合体の製造方法が開示されている。また特許文献２には、メチロバクテリウム属（Ｍｅｔｈｙｌｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．）、パラコッカス属（Ｐａｒａｃｏｃｃｕｓ ｓｐ．）、アルカリゲネス属（Ａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓ ｓｐ．）、シュードモナス属（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｓｐ．）の微生物を、炭素数３から７の第一アルコールに接触させることにより、３ＨＢと３ＨＶとの共重合体を生産させる方法が開示されている。【０００６】
この３ＨＢと３ＨＶとの共重合体はＰＨＢに比べると柔軟性に富み、また共重合ポリエステル中の３ＨＶの含有率が増加すると柔軟性が高まることが確認されている。上記の微生物を用いた３ＨＢと３ＨＶとの共重合体の製造法では、例えば前記特許文献１ではプロピオン酸を、また特許文献３ではプロパン−１−オールをそれぞれ培地に添加することで、共重合ポリエステル中の３ＨＶの含有率を制御している。【０００７】
３ＨＢと３−ヒドロキシヘキサン酸（以下、３ＨＨと略す）との２成分共重合ポリエステルであるＰ（３ＨＢ−ｃｏ−３ＨＨ）およびその製造方法も、例えば、特許文献４及び特許文献５にそれぞれ記載されている。これらの公報のＰ（３ＨＢ−ｃｏ−３ＨＨ）共重合体の製造方法は、土壌より単離されたアエロモナス・キャビエ（Ａｅｒｏｍｏｎａｓ ｃａｖｉａｅ）を用い、オレイン酸等の脂肪酸やオリーブオイル等の油脂から発酵生産するものである。また、このＡ．ｃａｖｉａｅのＰＨＡシンターゼ遺伝子をクローニングし、この遺伝子をアルカリゲネス  ユートロファス（Ａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓ ｅｕｔｒｏｐｈｕｓ）に導入した組換え株を用いて、脂肪酸を炭素源としてＰ（３ＨＢ−ｃｏ−３ＨＨ）を生産する報告もなされている（特許文献６）。【０００８】
また、上記の共重合ポリエステルの微生物を用いた製造法では、何れの場合にも、直接ポリマーを合成する活性を有する酵素タンパク質であるポリヒドロキシアルカン酸合成酵素を使用することが必要であるが、この合成酵素を改変して、モノマー単位のモル分率を調節する試みも行われている。例えば特許文献７は、シュードモナス・スピーシーズ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｓｐ．）６１−３として同定されている微生物のポリヒドロキシアルカン酸合成酵素のアミノ酸配列を変換して、３ＨＢの含有率が高いＰＨＢを生産する変異酵素を開示している。【０００９】
以上は、３−ヒドロキシアルカン酸をモノマー単位とする共重合ポリエステルと、微生物を用いたその製造法である。一方、３−ヒドロキシアルカン酸以外の成分をモノマー単位とする共重合ポリエステルは、上記の共重合ポリエステルとは異なる物性を有することが期待される。特許文献８は、その様な３−ヒドロキシアルカン酸以外のモノマー単位を含む共重合ポリエステルの例として、クロストリジウム  プロピオニウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｐｒｏｐｉｏｎｉｃｕｍ）のプロピオニルＣｏＡトランスフェラーゼをコードする核酸を組み込んだラルストニア・ユートロファ（Ｒａｌｓｔｏｎｉａ  ｅｕｔｒｏｐｈａ、旧名アルカリゲネス  ユートロファス（Ａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓ ｅｕｔｒｏｐｈｕｓ））を、培地に乳酸を添加しながら培養して、３ＨＢと乳酸（ＬＡ）とからなる共重合ポリエステルを製造する方法を開示している。また、同文献は、Ｃ．ｐｒｏｐｉｏｎｉｕｍ由来のプロピオニルＣｏＡトランスフェラーゼをコードする核酸と、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｓｐ．６１−３由来のポリヒドロキシアルカン酸合成酵素をコードする核酸とを組み込んだ大腸菌を、培地に乳酸とデセノイン酸を添加しながら培養して、３−ヒドロキシヘキサノエート、３−ヒドロキシオクタノエート、３−ヒドロキシデカノエート及び乳酸からなるコポリマーを製造する方法も開示している。【００１０】
しかし、培地に乳酸やデセノイン酸などのモノマー成分を添加してポリヒドロキシアルカン酸を合成する方法は、原料コストの面で不利である。また一般に共重合ポリエステルの微生物による製造は、ポリマー生産性及び炭素源収率が低いため、安価な天然物等を炭素源として利用した場合においても、生産性乃至収率の向上は製造コストの削減にとって重要な課題である。
【非特許文献１】「生分解性プラスチックハンドブック」、生分解性プラスチック研究会編、１９９５年、第１７８−１９７頁、（株）エヌ・ティー・エス発行）
【特許文献１】特開昭５７−１５０３９３号公報
【特許文献２】特開平５−７４４９２号公報
【特許文献３】特公平７−７９７０５号公報
【特許文献４】特開平５−９３０４９号公報
【特許文献５】特開平７−２６５０６５号公報
【特許文献６】特開平１０−１０８６８２号公報
【特許文献７】国際公開公報ＷＯ２００３／１０００５５
【特許文献８】国際公開公報ＷＯ２００６／１２６７９６
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【００１１】
本発明は、３ＨＢと３ヒドロキシアルカン酸以外のモノマー単位であるＬＡとを含む共重合ポリエステルを、糖を原料とした微生物発酵によって効率よく生産する方法を提供することを目的とする。また、ポリエステル中の３ＨＢのモル分率を、使用される酵素の特性によって制御し、又は特定の宿主を選択したり培養条件を調節したりすることで、ＬＡを様々なモル分率で有する共重合ポリエステルの製造方法を提供することを目的とするものである。また本発明は、ＬＡと３ＨＢ以外のモノマー単位をさらに含む共重合ポリエステルを、糖を原料とした微生物発酵によって効率よく生産する方法を提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【００１２】
本発明者らは、前記非特許文献７に記載のポリヒドロキシアルカン酸合成酵素の変異体をコードする核酸を導入した組み換え微生物が、糖から直接的に３ＨＢとＬＡとからなる共重合ポリエステルを効率的に製造することができることを見いだし、共重合中のＬＡのモル分率を調節できること、さらには培地中に３ＨＢとＬＡ以外のモノマー成分の前駆体を供給することでＬＡと３ＨＢ以外のモノマー単位をさらに含む共重合ポリエステルを効率的に製造することができることを見いだし、下記の各発明を完成した。【００１３】
（１）３−ヒドロキシ酪酸と乳酸とからなる共重合ポリエステルの製造方法であって、１）プロピオン酸及び／又は乳酸にＣｏＡが転移される反応を触媒するタンパク質、２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質、アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒するタンパク質、及び下記のａ）又はｂ）のアミノ酸配列からなるポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質を有する組み換え微生物を、炭素源を含む培地で培養する工程：
ａ）配列番号２に示されるアミノ酸配列の１３０番目、３２５番目、４７７番目及び４８１番目のアミノ酸の少なくとも１以上が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列
ｂ）ａ）に規定されるタンパク質において、さらに１３０番目、３２５番目、４７７番目及び４８１番目以外の少なくとも１以上のアミノ酸が欠失若しくは置換され、又は1以上のアミノ酸残基が挿入されたアミノ酸配列、
及び、２）工程１）の培養物から前記共重合ポリエステルを回収する工程を含む、前記共重合ポリエステルの製造方法。【００１４】
（２）プロピオン酸及び／又は乳酸にＣｏＡが転移される反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号４に示されるアミノ酸配列、又は配列番号４に示されるアミノ酸配列において１若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列である、（１）に記載の製造方法。【００１５】
（３）２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号６に示されるアミノ酸配列、又は配列番号６に示されるアミノ酸配列において１若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列である、（１）に記載の製造方法。【００１６】
（４）アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号８に示されるアミノ酸配列、又は配列番号８に示されるアミノ酸配列において１又は数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列である、（１）に記載の製造方法。【００１７】
（５）ポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号２に示されるアミノ酸配列の３２５番目及び４８１番目のアミノ酸がそれぞれ他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列である、（１）に記載の製造方法。【００１８】
（６）ポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号２に示されるアミノ酸配列の３２５番目と４８１番目のアミノ酸が同時に置換されたアミノ酸配列である、（５）に記載の製造方法。【００１９】
（７）ポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号２に示されるアミノ酸配列の３２５番目のＳｅｒがＴｈｒに、４８１番目のＧｌｎがＬｙｓにそれぞれ置換されたアミノ酸配列である、（６）に記載の製造方法。【００２０】
（８）前記タンパク質のいずれもが、微生物に導入された組み換え発現ベクターにコードされているタンパク質である、（１）に記載の製造方法。【００２１】
（９）組み換え微生物の培養が嫌気条件下に行われる、（１）〜（８）の何れかに記載の製造方法。【００２２】
（１０）微生物が乳酸蓄積能を有する微生物である、（１）〜（９）の何れかに記載の製造方法。【００２３】
（１１）高乳酸蓄積能を有する微生物が、大腸菌Ｊｗ２２９３株、Ｊｗ０８８５株又はＪｗ０８８６株である、（１０）に記載の製造方法。【００２４】
（１２）３−ヒドロキシ酪酸と乳酸を含む共重合ポリエステルの製造方法であって、１）プロピオン酸及び／又は乳酸にＣｏＡが転移される反応を触媒するタンパク質、２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質、アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒するタンパク質、及び下記のａ）又はｂ）のアミノ酸配列からなるポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質を有する組み換え微生物を、３−ヒドロキシ酪酸と乳酸以外のヒドロキシアルカン酸及び炭素源を含む培地で培養する工程：
ａ）配列番号２に示されるアミノ酸配列の１３０番目、３２５番目、４７７番目及び４８１番目のアミノ酸の少なくとも１以上が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列
ｂ）ａ）に規定されるタンパク質において、さらに１３０番目、３２５番目、４７７番目及び４８１番目以外の少なくとも１以上のアミノ酸が欠失若しくは置換され、又は1以上のアミノ酸残基が挿入されたアミノ酸配列、
及び、２）工程１）の培養物から前記共重合ポリエステルを回収する工程を含む、前記共重合ポリエステルの製造方法。【００２５】
（１３）プロピオン酸及び／又は乳酸にＣｏＡが転移される反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号４に示されるアミノ酸配列、又は配列番号４に示されるアミノ酸配列において１若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列である、（１２）に記載の製造方法。【００２６】
（１４）２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号６に示されるアミノ酸配列、又は配列番号６に示されるアミノ酸配列において１若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列である、（１２）に記載の製造方法。【００２７】
（１５）アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号８に示されるアミノ酸配列、又は配列番号８に示されるアミノ酸配列において１又は数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列である、（１２）に記載の製造方法。【００２８】
（１６）ポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号２に示されるアミノ酸配列の３２５番目及び４８１番目のアミノ酸がそれぞれ他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列である、（１２）に記載の製造方法。【００２９】
（１７）ポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号２に示されるアミノ酸配列の３２５番目と４８１番目のアミノ酸が同時に置換されたアミノ酸配列である、（１２）に記載の製造方法。【００３０】
（１８）ポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号２に示されるアミノ酸配列の３２５番目のＳｅｒがＴｈｒに、４８１番目のＧｌｎがＬｙｓにそれぞれ置換されたアミノ酸配列である、（１６）又は（１７）に記載の製造方法。【００３１】
（１９）前記タンパク質のいずれもが、微生物に導入された組み換え発現ベクターにコードされているタンパク質である、（１２）に記載の製造方法。【００３２】
（２０）３−ヒドロキシ酪酸と乳酸以外のヒドロキシアルカン酸の前駆体が、プロピオン酸、吉草酸、ドデカン酸、４−ヒドロキシブタン酸及び４−ヒドロキシ吉草酸よりなる群から選ばれる一種以上の前駆体である、（１２）〜（１９）のいずれかに記載の製造方法。【００３３】
（２１）組み換え微生物の培養が嫌気条件下に行われる、（１２）〜（２０）の何れかに記載の製造方法。【００３４】
（２２）微生物が乳酸蓄積能を有する微生物である、（１２）〜（２１）の何れかに記載の製造方法。【００３５】
（２３）高乳酸蓄積能を有する微生物が、大腸菌Ｊｗ２２９３株、Ｊｗ０８８５株又はＪｗ０８８６株である、（２２）に記載の製造方法。【００３６】
（２４）プロピオン酸及び／又は乳酸にＣｏＡが転移される反応を触媒するタンパク質、２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質、アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒するタンパク質、及び下記のａ）又はｂ）のアミノ酸配列からなるポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質を発現する組み換え微生物。【００３７】
ａ）配列番号２に示されるアミノ酸配列の１３０番目、３２５番目、４７７番目及び４８１番目のアミノ酸の少なくとも１以上が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列
ｂ）ａ）に規定されるタンパク質において、さらに１３０番目、３２５番目、４７７番目及び４８１番目以外の少なくとも１以上のアミノ酸が欠失若しくは置換され、又は1以上のアミノ酸残基が挿入されたアミノ酸配列
（２５）プロピオン酸及び／又は乳酸にＣｏＡが転移される反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号４に示されるアミノ酸配列、又は配列番号４に示されるアミノ酸配列において１若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列である、（２４）に記載の組み換え微生物。【００３８】
（２６）２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号６に示されるアミノ酸配列、又は配列番号６に示されるアミノ酸配列において１若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列である、（２４）に記載の組み換え微生物。【００３９】
（２７）アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号８に示されるアミノ酸配列、又は配列番号８に示されるアミノ酸配列において１又は数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列である、（２４）に記載の組み換え微生物。【００４０】
（２８）ポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号２に示されるアミノ酸配列の３２５番目及び４８１番目のアミノ酸がそれぞれ他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列である、（２４）に記載の組み換え微生物。【００４１】
（２９）ポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号２に示されるアミノ酸配列の３２５番目と４８１番目のアミノ酸が同時に置換されたアミノ酸配列である、（２４）に記載の組み換え微生物。【００４２】
（３０）ポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質のアミノ酸配列が、配列番号２に示されるアミノ酸配列の３２５番目のＳｅｒがＴｈｒに、４８１番目のＧｌｎがＬｙｓにそれぞれ置換されたアミノ酸配列である、（２８）又は（２９）に記載の組み換え微生物。【００４３】
（３１）前記タンパク質のいずれもが、微生物に導入された組み換え発現ベクターにコードされているタンパク質である、（２４）に記載の組み換え微生物。【００４４】
（３２）微生物が乳酸蓄積能を有する微生物である、（２４）〜（３１）のいずれかに記載の組み換え微生物。【００４５】
（３３）高乳酸蓄積能を有する微生物が、大腸菌Ｊｗ２２９３株、Ｊｗ０８８５株又はＪｗ０８８６株である、（３２）に記載の組み換え微生物。
【発明の効果】
【００４６】
本発明の製造方法は、安価な炭素源を原料として、３ＨＢとＬＡとからなる共重合ポリエステルを効率的に製造することができ、生分解性プラスチックの製造コストを低くすることができる。また、使用される酵素を選択したり、ＬＡの高生産性微生物を宿主としたり、微生物の培養を嫌気条件下で行ったりすることで３ＨＢとＬＡとからなる共重合ポリエステルにおけるモノマー単位の含有率を調節することができる。また、培地に３ＨＢとＬＡ以外のヒドロキシアルカン酸を培地に加えることにより、３ＨＢとＬＡ以外のモノマー単位をさらに含む共重合ポリエステル製造することができる。【００４７】
本明細書は本願の優先権の基礎である日本国特許出願2008-113127号、2008-298765号の明細書および／または図面に記載される内容を包含する。
【図面の簡単な説明】
【００４８】
【図１】組換えプラスミドｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ１（ＳＴ／ＱＫ）ＡＢの構成を示す概略図である。図中、ｐｈａＡはＲ．ユートロファ（Ｒ．ｅｕｔｒｏｐｈａ）由来のβＫＴ遺伝子を、ｐｈａＢはＲ．ユートロファ（Ｒ．ｅｕｔｒｏｐｈａ）由来のＡＡＣｏＡ−Ｒ遺伝子を、ｐｈａＣ１（ＳＴ／ＱＫ）はＳＴＱＫ遺伝子を、ＰＣＴはＭ．エルスデニ（Ｍ．ｅｌｓｄｅｎｉｉ）由来のＰｃｔ遺伝子を、ＰＲｅはＲ．ユートロファ（Ｒ．ｅｕｔｒｏｐｈａ）由来プロモーターを、及びＰｌａｃは大腸菌ラクトースオペロンプロモーターを、それぞれ表す。
【図２】実施例１で調製したポリマーの分子量分布曲線である。
【図３】実施例１で調製したポリマーの熱分析の測定結果を表わすグラフである。
【図４】実施例１で調製したポリマーのＧＣ／ＭＳ分析の結果を表わすチャートである。
【図５】実施例１で調製したポリマーの１Ｈ−ＮＭＲスペクトル分析の結果を表わすチャートである。
【図６】実施例１で調製したポリマーの１３Ｃ−ＮＭＲスペクトル分析の結果を表わすチャートである。
【図７】実施例１で調製したポリマーの１Ｈ１Ｈ−ＮＭＲスペクトル分析の結果を表わすチャートである。
【図８】実施例１で調製したポリマーの１３Ｃ１Ｈ−ＮＭＲスペクトル分析の結果を表わすチャートである。
【図９】組換えプラスミドｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ（Ｒｅ）ＡＢ、ｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ（Ｂｃ）ＡＢ、ｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ１（ＷＴ）ＡＢ、ｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ２ＡＢの構成を示す概略図である。
【図１０】比較例で調製されたｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ（Ｒｅ）ＡＢ及びｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ（Ｂｃ）の各ポリマーのＧＣ／ＭＳ分析の結果を表わすチャートである。パネルＡがｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ（Ｒｅ）ＡＢのチャート、パネルＢがｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ（Ｂｃ）のチャート、パネルＣがｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ２ＡＢのチャートである。
【図１１ａ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ２２９３株由来のポリマーの分子量分布曲線である。
【図１１ｂ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ０８８５株由来のポリマーの分子量分布曲線である。
【図１１ｃ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ０８８６株由来のポリマーの分子量分布曲線である。
【図１２ａ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ２２９３株由来のポリマーの熱分析の測定結果を表わすグラフである。
【図１２ｂ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ０８８５株由来のポリマーの熱分析の測定結果を表わすグラフである。
【図１２ｃ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ０８８６株由来のポリマーの熱分析の測定結果を表わすグラフである。
【図１３ａ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ２２９３株由来のポリマーのＧＣ／ＭＳ分析の結果を表わすチャートである。
【図１３ｂ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ０８８５株由来のポリマーのＧＣ／ＭＳ分析の結果を表わすチャートである。
【図１３ｃ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ０８８６株由来のポリマーのＧＣ／ＭＳ分析の結果を表わすチャートである。
【図１４ａ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ２２９３株由来のポリマーの１Ｈ−ＮＭＲスペクトル分析の結果を表わすチャートである。
【図１４ｂ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ０８８５株由来のポリマーの１Ｈ−ＮＭＲスペクトル分析の結果を表わすチャートである。
【図１４ｃ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ０８８６株由来のポリマーの１Ｈ−ＮＭＲスペクトル分析の結果を表わすチャートである。
【図１５ａ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ２２９３株由来のポリマーの１３Ｃ−ＮＭＲスペクトル分析の結果を表わすチャートである。
【図１５ｂ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ０８８６株由来のポリマーの１３Ｃ−ＮＭＲスペクトル分析の結果を表わすチャートである。
【図１５ｃ】実施例２で調製したＬＡ高蓄積性大腸菌Ｊｗ０８８６株由来のポリマーの１３Ｃ−ＮＭＲスペクトル分析の結果を表わすチャートである。
【図１６】組換えプラスミドｐＡＣＹＣ１１７ＡＢの構成を示す概略図である。
【図１７】実施例３で調製したポリマーの分子量分布曲線である。
【図１８】実施例３で調製したポリマーの熱分析の測定結果を表わすグラフである。
【図１９】実施例３で調製したポリマーのＧＣ／ＭＳ分析の結果を表わすチャートである。
【図２０】実施例３で調製したポリマーの１Ｈ−ＮＭＲスペクトル分析の結果を表わすチャートである。
【図２１】実施例３で調製したポリマーの１３Ｃ−ＮＭＲスペクトル分析の結果を表わすチャートである。
【図２２】実施例３で調製したポリマーの１Ｈ１３Ｃ−ＮＭＲスペクトル分析の結果を表わすチャートである。
【図２３】標準物質であるポリ乳酸のＨＰＬＣチャートである。
【図２４】標準物質であるポリ［ヒドロキシ酪酸（ＨＢ）−ｃｏ−ヒドロキシ吉草酸（ＨＶ）−ｃｏ−ヒドロキシヘキサン酸（ＨＨｘ）]（ＨＢ：７０ｍｏｌ％、ＨＶ：２３ｍｏｌ％、ＨＨｘ：７ｍｏｌ％）のＨＰＬＣチャートである。
【図２５】実施例４で得られたポリマーのＨＰＬＣチャートである。
【符号の説明】
【００４９】
ｐｈａＡ：Ｒ．ユートロファ由来βＫＴ遺伝子
ｐｈａＢ：Ｒ．ユートロファ由来ＡＡＣｏＡ−Ｒ遺伝子
ｐｈａＣ（Ｒｅ）：Ｒ．ユートロファ由来ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素遺伝子
ｐｈａＣ（Ｂｃ）：Ｂ．セレウス由来ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素遺伝子
ｐｈａＣ１（ＷＴ）：シュードモナスｓｐ．６１−３由来ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素遺伝子（野生型）
ｐｈａＣ２：シュードモナスｓｐ．６１−３由来ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素２遺伝子
ＰＣＴ：Ｍ．エルスデニ由来Ｐｃｔ遺伝子
ＰＲｅ：アルカリゲネス・ユウトロファス由来プロモーター
Ｐｌａｃ：ラクトースオペロンプロモーター
【発明を実施するための最良の形態】
【００５０】
本発明は、１）プロピオン酸及び／又は乳酸にＣｏＡが転移される反応を触媒するタンパク質と、２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質、アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒するタンパク質と、下記のａ）又はｂ）のアミノ酸配列からなるポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質を有する組み換え微生物を、炭素源を含む培地で培養する工程：
ａ）配列番号２に示されるアミノ酸配列の１３０番目、３２５番目、４７７番目及び４８１番目のアミノ酸の少なくとも１以上が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列
ｂ）ａ）に規定されるタンパク質において、さらに１３０番目、３２５番目、４７７番目及び４８１番目以外の少なくとも１以上のアミノ酸が欠失若しくは置換され、又は1以上のアミノ酸残基が挿入されたアミノ酸配列、
及び２）前記工程１）の培養物から前記共重合ポリエステルを回収する工程を含む、３ＨＢとＬＡとからなる共重合ポリエステルの製造方法である。以下、本発明で使用されるタンパク質、組み換え微生物、及び本発明の製造方法の諸条件について、説明する。【００５１】
１）プロピオン酸及び／又は乳酸（ＬＡ）にＣｏＡが転移される反応を触媒するタンパク質
本発明で使用される「プロピオン酸及び／又はＬＡにＣｏＡが転移される反応を触媒するタンパク質」は、適当なＣｏＡ基質からプロピオン酸及び／又はＬＡにＣｏＡが転移される反応を触媒する活性を有するタンパク質である。かかる活性を有するタンパク質は、一般にプロピオニルＣｏＡトランスフェラーゼ（ＰｒｏｐｉｏｎｙｌＣｏＡ  Ｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅ、Ｐｃｔ）と称されている。以下、本発明では、当該タンパク質をＰｃｔと表すこととする。【００５２】
表１に、これまでに報告されたＰｃｔの由来（微生物名）の代表例と、それをコードする塩基配列情報を開示した文献情報を示す。
【表１】
0005625905.tif 000002
【００５３】
本発明では、上記表１の他にも、これまでに報告されたＰｃｔのいずれも利用することができる。また、「プロピオン酸及び／又はＬＡにＣｏＡが転移される反応を触媒するタンパク質」であるかぎり、既知のＰｃｔのアミノ酸配列において1個又は数個、例えば１〜数十個、好ましくは１〜十数個、より好ましくは１０個以下のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなるタンパク質であっても利用することができる。【００５４】
プロピオン酸及び／又はＬＡにＣｏＡが転移される反応の触媒活性は、例えばＡ．Ｅ．Ｈｏｆｍｅｉｓｔｅｒら（Ｅｕｒ．Ｊ． Ｂｉｏｃｈｅｍ．、第２０６巻、第５４７−５５２頁）に記載された方法に従って測定することができる。【００５５】
本発明における好ましいＰｃｔは、メガスファエラ  エルスデニ（Ｍｅｇａｓｐｈａｅｒａ ｅｌｓｄｅｎｉｉ）由来のＰｃｔであり、そのアミノ酸配列を配列番号４に、当該アミノ酸配列をコードする核酸（ＤＮＡ）の塩基配列の例を配列番号３に示す。【００５６】
２）２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質
本発明で使用される「２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質」は、２分子のアセチルＣｏＡが縮合してアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質であり、一般的には、βケトチオラーゼ又はアセチル−ＣｏＡ−ＣｏＡ−Ｃ−アセチルトランスフェラーゼと称されている。以下、本発明では、「２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質」を、βＫＴと表すこととする。【００５７】
表２に、これまでに報告されたβＫＴの由来（微生物名）の代表例と、それをコードする塩基配列情報を開示した文献情報を示す。
【表２】
0005625905.tif 000003
【００５８】
本発明では、上記表２の他にも、これまでに報告されたβＫＴのいずれも利用することができる。また、「２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質」であるかぎり、既知のβＫＴのアミノ酸配列において1個又は数個、例えば１〜数十個、好ましくは１〜十数個、より好ましくは１０個以下のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなるタンパク質であっても、使用することができる。【００５９】
２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応の触媒活性は、例えばＳｌａｔｅｒら（Ｊ． Ｂａｃｔｅｒｉｏｌｏｇｙ、１９９８年、第１８０巻、第１９７９−１９８７頁）に記載された方法によって測定することができる。【００６０】
本発明における好ましいβＫＴは、Ｒ．ユートロファ（Ｒ．ｅｕｔｒｏｐｈａ）由来のβＫＴであり、そのアミノ酸配列を配列番号６に、当該アミノ酸配列をコードする核酸（ＤＮＡ）の塩基配列の例を配列番号５に示す。【００６１】
３）アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒するタンパク質
本発明で使用される「アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒するタンパク質」は、アセトアセチルＣｏＡのＮＡＤＰ等の補酵素の存在下で生じる還元反応によって、Ｄ（−）−β−ヒドロキシブチリル−ＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質であり、一般的にはアセトアセチルＣｏＡリダクターゼと称されている。以下、本発明では、「アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒するタンパク質」を、ＡＡＣｏＡ−Ｒと表すこととする。【００６２】
表３に、これまでに報告されたＡＡＣｏＡ−Ｒの由来（微生物名）の例と、それをコードする塩基配列情報を開示した文献又はデータベース登録番号を示す。
【表３】
0005625905.tif 000004
【００６３】
本発明では、上記表３の他にも、これまでに報告されたＡＡＣｏＡ−Ｒのいずれも使用することができる。また、「アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒するタンパク質」であるかぎり、既知のＡＡＣｏＡ−Ｒのアミノ酸配列において1個又は数個、例えば１〜数十個、好ましくは１〜十数個、より好ましくは１０個以下のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなるタンパク質であっても、使用することができる。【００６４】
アセトアセチルＣｏＡの還元反応の触媒活性は、例えばＧ．Ｗ．Ｈａｙｗｏｏｄら（ＦＥＭＳ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ Ｌｅｔｔｅｒｓ，１９８８年、第５２巻、第２５９−２６４頁）に記載された方法によって測定することができる。【００６５】
本発明における好ましいＡＡＣｏＡ−Ｒは、Ｒ．ユートロファ（Ｒ．ｅｕｔｒｏｐｈａ）由来のＡＡＣｏＡ−Ｒであり、そのアミノ酸配列を配列番号８に、当該アミノ酸配列をコードする核酸（ＤＮＡ）の塩基配列の例を配列番号７に示す。【００６６】
その他、これまでに知られているβＫＴとＡＡＣｏ−Ｒとそのアクセッション番号を表４に示す。
【表４】
0005625905.tif 000005
【００６７】
４）ポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質
本発明におけるポリヒドロキシアルカン酸の合成を触媒するタンパク質は、ａ）配列番号２に示されるアミノ酸配列の１３０番目、３２５番目、４７７番目及び４８１番目のアミノ酸の少なくとも１以上が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列、又はｂ）ａ）に規定されるタンパク質において、さらに１３０番目、３２５番目、４７７番目及び４８１番目以外の少なくとも１以上のアミノ酸が欠失若しくは置換され、又は1以上のアミノ酸残基が挿入されたアミノ酸配列からなるタンパク質である。このタンパク質は、前記特許文献７に記載されている、シュードモナス・スピーシーズ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｓｐ．）６１−３由来のポリヒドロキシアルカン酸合成酵素のアミノ酸配列の一部を変異させたタンパク質である。以下、本発明におけるポリヒドロキシアルカン酸の合成を触媒するタンパク質をＰｈａＣｍと表し、また特許文献７の記載を全て本明細書に取り込むこととする。【００６８】
ＰｈａＣｍの好適な具体例は、特許文献７の表６及び表７に記載されている、配列番号２に示されるアミノ酸配列の１３０番目、３２５番目、４７７番目及び４８１番目のアミノ酸が、それぞれ単独で置換された単独変異、任意の２つのアミノ酸が置換された二重変異、任意の３つのアミノ酸が置換された三重変異、４つ全てのアミノ酸が置換された四重変異を挙げることができる。好ましいタンパク質は、任意の２つのアミノ酸が置換された二重変異であり、特に好ましくは３２５番目のＳｅｒがＴｈｒに、及び４８１番目のＧｌｎがＬｙｓに置換された二重変異（以下、ＳＴＱＫと表す）である。【００６９】
ＰｈａＣｍをコードするＤＮＡは、シュードモナス・スピーシーズ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｓｐ．）６１−３由来のポリヒドロキシアルカン酸合成酵素のアミノ酸配列（配列番号２）及びそれをコードするＤＮＡの塩基配列（配列番号１）を基に、当業者に知られた部位特異的変異導入法によって組み換え的に作製することができる。また、特許文献７に記載されている通り、ＰｈａＣｍのポリヒドロキシアルカン酸の合成を触媒する活性は、前記ＰｈａＣｍを発現可能な核酸で形質転換された宿主細胞を得、当該宿主細胞のポリヒドロキシアルカン酸の蓄積能によって確認することができる。【００７０】
ＰｈａＣｍを種々選択して使用することにより、製造される共重合ポリエステル中の３ＨＢの含有率を調節することができる。例えば、前記ＳＴＱＫを使用した場合には、３ＨＢ：乳酸＝９４：６の、乳酸がランダムに取り込まれたランダムコポリマーが製造される。【００７１】
また、ＰｈａＣｍの選択以外に、例えば大腸菌株Ｊｗ２２９３、Ｊｗ０８８５、Ｊｗ０８８６などの乳酸高蓄積性微生物を宿主として使用することで、製造される共重合ポリエステル中のＬＡのモル分率を高めることができる。例えば、前記の乳酸高蓄積性大腸菌株を宿主として好気的に培養することで、共重合体ポリエステル中のＬＡのモル分率を３０％程度に高めることができる。【００７２】
さらに、微生物によるＬＡの産生量を高める工夫を施すことにより、共重合体ポリエステル中のＬＡのモル分率をさらに高めることができる。例えば、前記タンパク質をコードする遺伝子で形質転換された宿主微生物を嫌気条件下で培養することにより、宿主微生物自身のＬＡ産生量を増加させることで、製造される共重合ポリエステル中のＬＡのモル分率を高めることができる。大腸菌を宿主として嫌気条件下に培養することで、共重合体ポリエステル中のＬＡのモル分率を５０％程度に高めることができる。【００７３】
５）タンパク質をコードする核酸
上記１）〜４）の各タンパク質は、それらをコードする核酸を微生物に導入して、当該微生物内でタンパク質に転写翻訳させて使用することが好ましい。微生物に導入される核酸は、ベクターに組み込まれた形態にあることが好ましい。【００７４】
前記の核酸を微生物に導入するためのベクターは、宿主中で自立複製可能なものであればよく、プラスミドＤＮＡ、ファージＤＮＡの形態にあることが好ましい。核酸を大腸菌に導入するためのベクターの例としては、ｐＢＲ３２２、ｐＵＣ１８、ｐＢＬｕｅｓｃｒｉｐｔＩＩ等のプラスミドＤＮＡを、ＥＭＢＬ３、Ｍ１３、λｇｔＩＩ等のファージＤＮＡ等を、それぞれ挙げることができる。また酵母に導入するためのベクターの例としては、ＹＥｐ１３、ＹＣｐ５０等を挙げることができる。【００７５】
また、核酸をラルストニア（Ｒａｌｓｔｏｎｉａ）属細菌やシュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）属細菌に導入するためのベクターの例としては、広範囲の宿主において複製・保持されるＲＫ２複製起点を有するｐＬＡ２９１７（ＡＴＣＣ３７３５５）やＲＳＦ１０１０複製起点を有するｐＪＲＤ２１５（ＡＴＣＣ ３７５３３）等を挙げることができる。【００７６】
上記１）〜４）の各タンパク質をコードする核酸、好ましくはＤＮＡのベクターへの挿入は、当業者に知られた遺伝子組み換え技術を用いて行うことができる。また組み換えに際して、ベクターに挿入されるＤＮＡからの各タンパク質の転写翻訳を調節することのできるプロモーターの下流に、前記ＤＮＡを連結することが好ましい。プロモーターとしては、宿主中で遺伝子の転写を調節できるものであればいずれを用いてもよい。例えば、大腸菌を宿主として用いる場合には、ｔｒｐプロモーター、ｌａｃプロモーター、ＰＬプロモーター、ＰＲプロモーター、Ｔ７プロモーターなどを、酵母を宿主として用いる場合には、ｇａｌ1プロモーター、ｇａｌ１０プロモーターなどを用いることができる。また、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）属細菌を本発明の微生物として用いる場合には、プロモーターとして、ｐｈａＣ１Ｐｓ遺伝子上流やｐｈｂＣＡＢＲｅオペロン上流のプロモーターを含むと考えられる領域などを用いることができる。【００７７】
また、本発明のベクターには、必要に応じて、核酸を導入しようとする微生物において利用可能なターミネーター配列、エンハンサー配列、スプライシングシグナル配列、ポリＡ付加シグナル配列、リボゾーム結合配列（ＳＤ配列）、選択マーカー遺伝子などを連結することができる。選択マーカー遺伝子の例としては、アンピシリン耐性遺伝子、テトラサイクリン耐性遺伝子、ネオマイシン耐性遺伝子、カナマシン耐性遺伝子、クロラムフェニコール耐性遺伝子等の薬剤耐性遺伝子の他、アミノ酸や核酸等の栄養素の細胞内生合成に関与する遺伝子、あるいはルシフェラーゼとうの蛍光タンパク質をコードする遺伝子などを挙げることができる。【００７８】
上記の核酸、好ましくはベクターの形態にある核酸は、当業者に知られた方法によって、微生物に導入される。微生物へのベクターの組み換え方法としては、例えばリン酸カルシウム法、エレクトロポレーション法、スフェロプラスト法、酢酸リチウム法、接合伝達法、カルシウムイオンを用いる方法や等が挙げられる。【００７９】
６）微生物
本発明における組み換え微生物としては、上記１）〜４）のタンパク質を発現している微生物、好ましくは上記１）〜４）のタンパク質を機能的に発現し得る核酸の導入によって形質転換された微生物である。好適な微生物としては、シュードモナス・エスピー（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｓｐ．）６１−３株などのシュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）属細菌、Ｒ．ユートロファなどのラルストニア（Ｒａｌｓｔｏｎｉａ）属細菌、バチルス・ズブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）などのバチルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）属細菌、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）などのエシェリヒア（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）属細菌、コリネバクテリウム（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属細菌、サッカロマイセス・セレビシー（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）などのサッカロマイセス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）属酵母、カンジダ・マルトーサ（Ｃａｎｄｉｄａ ｍａｌｔｏｓａ）などのカンジダ(Ｃａｎｄｉｄａ）属酵母などを挙げることができる。中でも大腸菌、コリネバクテリウム属細菌、及びＲ．ユートロファが好ましく、特に好ましくは大腸菌、コリネバクテリウム属細菌である。【００８０】
Ｒ．ユートロファなどの、それ自体が固有のポリヒドロキシアルカン酸合成酵素を持つ微生物の場合には、当該固有のポリヒドロキシアルカン酸合成酵素の発現能を失った微生物を使用することが好ましい。かかる発現能を失った微生物は、ニトロソグアニジンなどの化学変異源やＵＶ等の物理的変異源によって微生物を処理したり、ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素をコードする核酸を改変して当該酵素の機能的な発現を不能とした変異核酸を微生物に導入し、「相同的組み換え」（ｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓ  ｒｅｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ）を行わせたりして、作製することができる。ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素遺伝子が破壊されていることの確認は、該遺伝子の一部をプローブとして用いるサザンハイブリダイゼーションによって、ハイブリダイズするバンドが、野性株由来のバンドに比べて予想される位置にシフトしていることを調べることによって行うことができる。【００８１】
６）ヒドロキシ酪酸と乳酸とからなる共重合ポリエステルの製造
ヒドロキシ酪酸と乳酸とからなる共重合ポリエステルの製造は、前記の核酸が導入された組み換え微生物を、炭素源を含む培地で培養し、培養菌体又は培養物中に共重合ポリエステルを生成蓄積させ、該培養菌体又は培養物から該共重合ポリエステルを回収することにより行われる。【００８２】
本発明の組み換え微生物の培養は、培地組成を除き、組み換え微生物の種類に応じて、それぞれの微生物についての一般的な培養条件で行うことが好ましい。特に、組み換え微生物を嫌気条件下に培養することで、共重合体ポリエステル中のＬＡのモル分率を高めることができる点で有利である。【００８３】
特殊な組成を有する培地は特に必要とされないが、炭素源以外の窒素源、無機塩類その他の有機栄養源のいずれかを制限した培地を利用することが好ましい。例えば、ラルストニア（Ｒａｌｓｔｏｎｉａ）属細菌やシュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）属細菌等に核酸を組み込んだ組み換え微生物を培養する培地としては、例えば窒素源を０．０１〜０．１％に制限した培地が挙げられる。【００８４】
炭素源としては、例えばグルコース、フラクトース、スクロース、マルトース等の炭水化物が挙げられる。また、炭素数４以上の油脂関連物質を炭素源とすることもできる。炭素数４以上の油脂関連物質としては、コーン油、大豆油、サフラワー油、サンフラワー油、オリーブ油、ヤシ油、パーム油、ナタネ油、魚油、鯨油、豚油又は牛油などの天然油脂、ブタン酸、ペンタン酸、ヘキサン酸、オクタン酸、デカン酸、ラウリン酸、オレイン酸、パルミチン酸、リノレン酸、リノール酸若しくはミリスチン酸等の脂肪酸又はこれらの脂肪酸のエステル、オクタノール、ラウリルアルコール、オレイルアルコール若しくはパルミチルアルコール等又はこれらアルコールのエステル等が挙げられる。【００８５】
窒素源としては、例えばアンモニア、塩化アンモニウム、硫酸アンモニウム、リン酸アンモニウム等のアンモニウム塩の他、ペプトン、肉エキス、酵母エキス、コーンスティープリカー等が挙げられる。無機物としては、例えばリン酸第一カリウム、リン酸第二カリウム、リン酸マグネシウム、硫酸マグネシウム、塩化ナトリウム等が挙げられる。【００８６】
培養は、通常振盪培養などの好気的条件下、２５〜３７℃の範囲で、前記１）〜４）のタンパク質が転写発現されてから２４時間以上行うことが好ましい。嫌気条件下に培養を行うときは、前記時間は４８時間以上であることが好ましい。培養中は、カナマイシン、アンピシリン、テトラサイクリン等の抗生物質を培地に添加してもよい。前記１）〜４）のタンパク質をコードするＤＮＡのいずれか或いは全てを誘導性プロモーターの制御下に連結した場合には、当該プロモーターの転写に誘導する因子を培地に添加すればよい。【００８７】
本発明の好ましい態様は、Ｍ．エルスデニ（Ｍ．ｅｌｓｄｅｎｉｉ）由来のＰｃｔをコードする核酸（配列番号３）、Ｒ．ユートロファ（Ｒ．ｅｕｔｒｏｐｈａ）のβＫＴをコードする核酸（配列番号５）、Ｒ．ユートロファ（Ｒ．ｅｕｔｒｏｐｈａ）のＡＡＣｏＡ−Ｒをコードする核酸（配列番号７）及びＳＴＱＫをコードする核酸を有する発現ベクターを導入した組み換え大腸菌を培養し、３ＨＢとＬＡとからなる共重合ポリエステルを製造する方法である。特に大腸菌株Ｊｗ２２９３、Ｊｗ０８８５、Ｊｗ０８８６などの乳酸高蓄積性微生物を宿主として使用することで、共重合体ポリエステル中のＬＡのモル分率をより高めることができる。また、大腸菌を宿主として嫌気条件下で培養することで、共重合体ポリエステル中のＬＡのモル分率をさらに高めることができる。【００８８】
本発明の方法は、培地にＬＡ、３ＨＢなどの、目的とするポリマーを構成するモノマー成分を培地に添加しなくても、安価な廃糖蜜から、３ＨＢとＬＡとからなる共重合ポリエステルを製造することができ、製造コストの点で有利である。【００８９】
本発明において、ポリエステルの回収は、微生物から共重合ポリエステルあるいはＰＨＡを回収するための、当業者に公知の方法によって行えばよい。例えば、培養液から遠心分離によって集菌、洗浄した後、乾燥させ、クロロホルムに乾燥菌体を懸濁し、加熱することによって、目的とする共重合ポリエステルをクロロホルム画分に抽出し、さらにこのクロロホルム溶液にメタノールを加えてポリエステルを沈殿させ、濾過や遠心分離によって上澄み液を除去した後、乾燥することで、精製された共重合ポリエステルを得ることができる。【００９０】
回収されたポリエステルが３ＨＢとＬＡとからなる共重合ポリエステルであることの確認は、通常の方法、例えばガスクロマトグラフ法や核磁気共鳴法等により行えばよい。【００９１】
本発明はさらに、３ＨＢとＬＡを含む共重合ポリエステルの製造方法であって、１）プロピオン酸及び／又は乳酸にＣｏＡが転移される反応を触媒するタンパク質、２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質、アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒するタンパク質、及び下記のａ）又はｂ）のアミノ酸配列からなるポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質を有する組み換え微生物を、３ＨＢとＬＡ以外のヒドロキシアルカン酸及び炭素源を含む培地で培養する工程：
ａ）配列番号２に示されるアミノ酸配列の１３０番目、３２５番目、４７７番目及び４８１番目のアミノ酸の少なくとも１以上が他のアミノ酸に置換されたアミノ酸配列
ｂ）ａ）に規定されるタンパク質において、さらに１３０番目、３２５番目、４７７番目及び４８１番目以外の少なくとも１以上のアミノ酸が欠失若しくは置換され、又は1以上のアミノ酸残基が挿入されたアミノ酸配列、
及び、２）工程１）の培養物から前記共重合ポリエステルを回収する工程を含む、前記共重合ポリエステルの製造方法を提供する。【００９２】
かかる方法において、プロピオン酸及び／又は乳酸にＣｏＡが転移される反応を触媒するタンパク質、２分子のアセチルＣｏＡからアセトアセチルＣｏＡが形成される反応を触媒するタンパク質、アセトアセチルＣｏＡの還元反応を触媒するタンパク質、及び上記ａ）又はｂ）のアミノ酸配列からなるポリヒドロキシアルカン酸の合成反応を触媒するタンパク質と、これらを発現する組み換え微生物については、いずれも先に説明したとおりである。【００９３】
本発明の３ＨＢとＬＡを含む共重合ポリエステルの製造方法は、このようなタンパク質を有する組み換え微生物を、３ＨＢとＬＡ以外のヒドロキシアルカン酸及び炭素源を含む培地で培養することを特徴とする。組み換え微生物は自身が３ＨＢとＬＡを生産するが、３ＨＢとＬＡ以外の共重合ポリエステルのモノマー単位に変換され得る前駆体を培地に加えることで、３ＨＢとＬＡとこれら以外のモノマー単位を含む共重合ポリエステルが製造される。【００９４】
前記前駆体とそこから変換されるモノマー単位の例としては、プロピオン酸（３−ヒドロキシプロピオン酸）、吉草酸（３−ヒドロキシ吉草酸）、ドデカン酸（３−ヒドロキシヘキサン酸、３−ヒドロキシオクタン酸、３−ヒドロキシドデカン酸、３−ヒドロキシドデカン酸）、４−ヒドロキシ酪酸（４−ヒドロキシ酪酸）、４−ヒドロキシ吉草酸（４−ヒドロキシ吉草酸）などを挙げることができる。本発明ではこれらのいずれも利用することができ、培地に予め加えておいてもよく、また経時的に培地に添加してもよい。また、３ＨＢとＬＡとこれら以外のモノマー単位を含む共重合ポリエステルを製造する培養を嫌気条件下に行うことにより、ＬＡのモル分率を調節することができる。【００９５】
以下、非限定的な実施例を示して本発明をさらに詳細に説明する。なお、実施例における各実験操作は、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  ｃｌｏｎｉｎｇ：  ａ  ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  ｍａｎｕａｌ， ２ｎｄ  ｅｄ．  １９８９年、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，  Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，  Ｎ．Ｙ．）を初めとする各種の実験操作を紹介したマニュアル、又は各種試薬及びキットに添付された指示書の各記載に従い、行った。
【実施例】
【００９６】
＜実施例１＞  ＬＡ高蓄積性大腸菌を用いた共重合ポリエステルの製造
１）組み換え微生物の作製
Ｍ．エルスデニ（Ｍ．ｅｌｓｄｅｎｉｉ、ＡＴＣＣ１７７５３）からＤＮｅａｓｙ Ｔｉｓｓｕｅ Ｋｉｔ（Ｑｉａｇｅｎ社）を用いてゲノムＤＮＡを抽出後、プロピオニルＣｏＡトランスフェラーゼ（アクセッションＮｏ．Ｊ０４９８７）をコードする核酸をＰＣＲで増幅するために、ＥｃｏＲＩ認識配列を含むフォワードプライマーと、ＰｓｔＩ認識配列を含むリバースプライマーのプライマーＤＮＡを合成した。前記ゲノムＤＮＡを鋳型として、ｉＣｙｃｌｅｒ(ＢｉｏＲａｄ)を用い、ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ（１Ｕ）、ＰＣＲバッファー、１ｍＭ ＭｇＳＯ４、各プライマー１５ｐｍｏｌ、０．２ｍＭ ｄＮＴＰｓ（全て東洋紡株式会社製）を含む反応液中、９４℃２分を１サイクル、９４℃で１５秒、５５℃で３０秒、６８℃で２分を１サイクルとするＰＣＲ反応を３０サイクル行った後、約１，５００ｂｐの増幅断片を回収し、ＥｃｏＲＩ及びＰｓｔＩで消化して、ＤＮＡフラグメントを得た。【００９７】
プラスミドｐＴＶ１１８Ｎ（宝酒造）をＥｃｏＲＩ及びPｓｔＩを用いて消化し、アルカリホスファターゼを用いて脱リン酸化した後、前記ＤＮＡフラグメントを加えてライゲーションし、プロピオニルＣｏＡトランスフェラーゼをコードするＤＮＡを含む、約４．７ｋｂｐの組み換えプラスミドＰＴＶ１１８Ｎ Ｍ．Ｅ．−ＰＣＴを調製した。【００９８】
Ｔａｋａｓｅら（Ｊ． Ｂｉｏｃｈｅｍ．、２００３年、第１３３巻、第１３９−１４５頁）に記載されている方法に従い、Ｒ．ユートロファ（Ｒ．ｅｕｔｒｏｐｈａ）由来のβ−ケトチオラーゼをコードするＤＮＡ（配列番号５）、Ｒ．ユートロファ（Ｒ．ｅｕｔｒｏｐｈａ）由来のアセトアセチルＣｏＡレダクターゼをコードするＤＮＡ（配列番号７）、及びＳＴＱＫをコードするＤＮＡを全て含むプラスミドｐＧＥＭＣ１（ＳＴ／ＱＫ）ＡＢを調製した。【００９９】
ｐＧＥＭＣ１（ＳＴ／ＱＫ）ＡＢをＢａｍＨＩで消化して、約６ｋｂｐのＤＮＡ断片を回収し、６６ｍＭ酢酸カリウム、１０ｍＭ酢酸マグネシウム、０．５ｍＭ ＤＴＴ，０．１ｍｇ／ｍＬ ＢＳＡ、０．１ｍＭ ｄＮＴＰを含む３ｍＭ トリス酢酸緩衝液（ｐＨ７．９）中、２００ユニットのＴ４ポリメラーゼを３７℃で５分間作用させて、ＳＴＱＫをコードするＤＮＡ断片を得た。【０１００】
ｐＴＶ１１８Ｎ Ｍ．E．−ＰＣＴをＰｓｔＩで消化し、上記と同条件でＴ４ポリメラーゼを作用させた後、アルカリホスファターゼを用いて脱リン酸化し、前記ｐｈａＣｍをコードするＤＮＡ断片をライゲーションして、ｐＴＶ１１８Ｎ Ｍ．Ｅ．−ＰＣＴのＳａｌＩサイトにＳＴＱＫをコードするＤＮＡを導入した、約９．６ｋｂｐのプラスミドｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ１（ＳＴ／ＱＫ）ＡＢ（図１）を得た。大腸菌種ＪＭ１０９のコンピテントセルをｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ１（ＳＴ／ＱＫ）ＡＢを用いて形質転換した。【０１０１】
２）ポリマーの生産
得られた形質転換体を、アンピシリン１００μｇ／ｍＬ、２％グルコース、１０ｍＭパントテン酸を含むＬＢ培地１００ｍＬに植菌し、３７℃にて７２時間培養を行った。培養後４℃、３，１００ｒｐｍ、１５分間の条件で遠心して菌体を回収し、１０ｍＭトリス塩酸緩衝液（ｐＨ７．５）に懸濁させてから再度同条件で遠心分離した後、２日間、凍結乾燥した。【０１０２】
ガラス製耐圧反応管に乾燥菌体を移し、クロロホルム３ｍＬを加えて懸濁液としてから、１００℃のヒートブロック中で３時間保った後、室温まで冷却後、０．２μｍＰＴＦＥフィルター（ＡＤＶＡＮＴＥＣ）で濾過して、クロロホルム溶液と菌体を分離した。濾液を遠心用ガラス試験管に移し、６０℃でドライアップしてクロロホルムを留去した。試験管内に残った膜状のポリマーを、ヘキサンを用いて洗浄、乾燥し、再びクロロホルム３ｍＬを加え、ポリマーを含むクロロホルム溶液を得た。０．２μｍＰＴＦＥフィルター（ＡＤＶＡＮＴＥＣ）で濾過し、分取用ＧＰＣ（ＬＣ−９２０１）を用いてポリマー画分を分取した後、クロロホルムを留去して、ポリマー４８．６２ｍｇを回収した。ポリマーの菌体内含有率（培養後の乾燥菌体総重量に対して回収されたポリマー重量割合）は１６．６５％であった。【０１０３】
３）ポリマーの分析
i）ＧＰＣ
２）で回収されたポリマー約１ｍｇにクロロホルムを１ｍＬ加え、これを０．２μｍＰＴＦＥフィルター（ＡＤＶＡＮＴＥＣ）で濾過した溶液をサンプルとして、下記の条件でＧＰＣ測定を行った。【０１０４】
0005625905.tif 000006
測定された分子量分布曲線を図２に示す。分子量較正曲線は標準ポリスチレンを用いて作成し、標準ポリスチレン分子量の換算値で分子量を表した。その結果、ポリマーの分子量（ｍＷ）は３２万、平均分子量（Ｍｎ）は２３万、Ｍｗ／Ｍｎは１．３であった。【０１０５】
ii）熱分析（ＤＳＣ）
２）で回収されたポリマー約１ｍｇを、示差走査熱量計（ＤＳＣ３１００、マックサイエンス）を用い、−５０℃〜２１０℃：２０℃／分上昇、２１０℃〜−９０℃：４０℃／分下降、−９０℃：５分保持、−９０℃〜２１０℃：２０℃／分上昇の条件で分析した（図３）。【０１０６】
その結果、ガラス転移温度が０℃付近、結晶化度が８６．８℃、ポリマーのＴｍは１５７．３〜１５７．５ ℃であった。【０１０７】
iii）ＧＣ／ＭＳ
２）で回収されたポリマー約５０μｇを１ｍＬのクロロホルムに溶解した溶液２５０μＬ、エタノール８５０μＬ、塩酸１００μＬをガラス製耐圧反応管で混合し、１００℃のヒートブロック中で３時間、エタノリシス処理を行った。室温まで冷却後、０．６５Ｍリン酸および０．９ＭＮaＣｌを含む溶液１ｍｌと２５０ｍＭリン酸溶液５００μＬを加えて混合し、ｐＨを中性に調整した後、室温、１，２００ｒｐｍで５分間の条件で遠心し、水層とクロロホルム層を分離した。クロロホルム層を採取し、モレキュラーシーブスにより脱水を行って、ＧＣ分析用サンプルとした。【０１０８】
ＧＣ／ＭＳ分析は、下記の条件で行った。【０１０９】
0005625905.tif 000007
上記条件での分析結果及び乳酸エチルのＭＳスペクトルを図４に示す。ＧＣ／ＭＳの結果より、（２）で回収されたポリマーは３ＨＢとＬＡをモノマー単位として含むことが確認された。【０１１０】
iv）ＮＭＲ分析
（２）で回収されたポリマーを重水素化クロロホルムに溶解してサンプルとし、３００ＭＨｚで１Ｈ−ＮＭＲ（図５）、１３Ｃ−ＮＭＲ（図６）、１Ｈ１Ｈ−ＮＭＲ（図７）及び1３Ｃ１Ｈ−ＮＭＲ（図８）を測定した。その結果、（２）で回収されたポリマーは３ＨＢとＬＡをモノマー単位として含むこと、３ＨＢとＬＡの比が約9４：６であることが判明した。【０１１１】
＜比較例＞
実施例１で作製したプラスミドｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ１（ＳＴ／ＱＫ）ＡＢに含まれるＳＴＱＫをコードする塩基配列を、下記のタンパク質をコードする塩基配列に置き換えた発現ベクターを、それぞれ作製した。当該発現ベクターの構成を纏めて図９に示す。【０１１２】
ｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ（Ｒｅ）ＡＢ：Ｒ．ユートロファのポリヒドロキシアルカン酸合成酵素（アクセッション番号Ｊ０５００３）
ｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ（Ｂｃ）ＡＢ：Ｂ．セレウスのポリヒドロキシアルカン酸合成酵素（アクセッション番号ＤＱ４８６１３５）
ｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ１（ＷＴ）ＡＢ：シュードモナスｓｐ．６１−３のポリヒドロキシアルカン酸合成酵素（野性型、配列番号１）
ｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ２ＡＢ：シュードモナスｓｐ．６１−３のポリヒドロキシアルカン酸合成酵素２（アクセッション番号ＡＢ０１４７５８）
上記各発現ベクターを用いて形質転換した大腸菌ＪＭ１０９を、アンピシリン１００μｇ／ｍｌ、２％グルコース、１０ｍＭパントテン酸を含むＬＢ培地１００ｍｌに植菌し、３７℃にて７２時間培養を行った。菌体を集菌し、１０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．５）に懸濁させ、再度集菌してから２日間、凍結乾燥した。耐圧反応管（ガラス製）に乾燥菌体を移し、クロロホルム３mlを加えて懸濁液とし、１００℃のヒートブロック中で３時間保ったのち、室温まで冷却後、０．２μｍＰＴＦＥフィルター（ＡＤＶＡＮＴＥＣ）で濾過して、クロロホルム溶液と菌体とを分離した。濾液を遠心用ガラス試験管に移し、６０℃でドライアップしてクロロホルムを留去した。試験管内に残った膜状のポリマーを、ヘキサンを用いて洗浄した後に乾燥し、再びクロロホルム３ｍｌに溶解して、ポリマーのクロロホルム溶液を得た。【０１１３】
０．２μｍＰＴＦＥフィルター（ＡＤＶＡＮＴＥＣ社）で濾過し、分取用ＧＰＣ（Ｐｒｅｐａｒａｔｉｖｅ  ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ：ＬＣ−９２０１）によってポリマー画分を分取し、クロロホルムを留去して、ポリマーを得た。各ポリマーの量は、ｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ（Ｒｅ）ＡＢ：１３１．４１ｍｇ、ｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ（Ｂｃ）ＡＢ：１６０．６１ｍｇ、ｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ１（ＷＴ）ＡＢ：検出されず、ｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ２ＡＢ：極微量のため定量不能であった。【０１１４】
また、ｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ（Ｒｅ）ＡＢ及びｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ（Ｂｃ）のポリマー５０μｇを、またｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ２ＡＢについてはポリマー全量を、実施例１の３）のiii）と同様にしてＧＣ／ＭＳ分析を行ったところ、得られたポリマーはいずれも３ＨＢのみを構成モノマー単位とするホモポリマーＰＨＢであることが確認された（図１０）。【０１１５】
＜実施例２＞  高ＬＡ蓄積性微生物を用いた製造
１）ポリマーの生産
乳酸高蓄積大腸菌Ｊｗ２２９３株、Ｊｗ０８８５株、Ｊｗ０８８６株を、実施例１の１）で作製したｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ１（ＳＴ／ＱＫ）ＡＢ１を用いて形質転換した。【０１１６】
得られた形質転換体をアンピシリン１００μｇ／ｍｌ、２％グルコース、１０ｍＭパントテン酸を含むＬＢ培地１０００ｍｌに植菌し、３７℃にて７２時間培養を行った。培養後４℃、３，１００ｒｐｍ、１５分間の条件で遠心して菌体を回収し、１０ｍＭトリス塩酸緩衝液（ｐＨ７．５）に懸濁させてから再度同条件で遠心分離した後、２日間、凍結乾燥した。【０１１７】
ガラス製耐圧反応管に乾燥菌体を移し、クロロホルム４０ｍｌを加えて懸濁液としてから、１００℃のヒートブロック中で３時間保ったのち、室温まで冷却後、０．２μｍＰＴＦＥフィルター（ＡＤＶＡＮＴＥＣ）で濾過して、クロロホルム溶液と菌体を分離した。濾液を遠心用ガラス試験管ヘ移し、６０℃でドライアップしてクロロホルムを留去した。試験管内に残った膜状のポリマーをヘキサンを用いて洗浄、乾燥し、再びクロロホルム４０ｍｌに溶解してクロロホルム溶液をえた。０．２μｍＰＴＦＥフィルター（ＡＤＶＡＮＴＥＣ）で濾過し、分取用ＧＰＣ（ＬＣ−９２０１）によってポリマー画分を分取した。クロロホルムを留去してポリマーを得た。【０１１８】
回収されたポリマーの量は、８０２ｍｇ（Ｊｗ２２９３）、８０４ｍｇ（Ｊｗ０８８５）、８０６ｍｇ（Ｊｗ０８８６）であった。また、ポリマーの菌体内含有率（培養後の乾燥菌体重量に対して回収されたポリマー重量割合）は４１％（Ｊｗ２２９３）、５０％（Ｊｗ０８８５）、５４％（Ｊｗ０８８６）であった。【０１１９】
２）ポリマーの分析
i）ＧＰＣ
１）で回収されたポリマー約１ｍｇにクロロホルムを１ｍＬ加え、これを０．２μｍＰＴＦＥフィルター（ＡＤＶＡＮＴＥＣ）で濾過した溶液をサンプルとして、下記の条件でＧＰＣ測定を行った。【０１２０】
0005625905.tif 000008
測定された分子量分布曲線を図１１ａ〜ｃに示す。分子量較正曲線は標準ポリスチレンを用いて作成し、標準ポリスチレン分子量の換算値で分子量を表した。その結果、ポリマーの分子量（ｍＷ）は、Ｊｗ２２９３株由来のポリマーの分子量（Ｍｗ）＝２８万、Ｍｎ＝５８，０００、Ｊｗ０８８５株由来のポリマーのＭｗ＝２８万、Ｍｎ＝６６，０００、Ｊｗ０８８６株由来のポリマーのＭｗ＝２８万、Ｍｎ＝６４，０００であった。また、Ｍｗ／Ｍｎは全て４であった。【０１２１】
ii）熱分析（ＤＳＣ）
２）で回収されたポリマー約１ｍｇを、示差走査熱量計（ＤＳＣ３１００、マックサイエンス）を用い、−５０℃〜２１０℃：２０℃／分上昇、２１０℃〜−９０℃：４０℃／分下降、−９０℃：５分保持、−９０℃〜２１０℃：２０℃／分上昇の条件で分析した（図１２ａ〜ｃ）。【０１２２】
その結果、ポリマーのＴｍは１１１〜１６３℃であった。【０１２３】
iii）ＧＣ／ＭＳ
２）で回収されたポリマー約５０μｇを１ｍＬのクロロホルムに溶解した溶液２５０μＬ、エタノール８５０μＬ、塩酸１００μＬをガラス製耐圧反応管で混合し、１００℃のヒートブロック中で３時間、エタノリシス処理を行った。室温まで冷却後、０．６５Ｍリン酸および０．９ＭＮaＣｌを含む溶液１ｍｌと２５０ｍＭリン酸溶液５００μＬを加えて混合し、ｐＨを中性に調整した後、室温、１，２００ｒｐｍで５分間の条件で遠心し、水層とクロロホルム層を分離した。クロロホルム層を採取し、モレキュラーシーブスにより脱水を行って、ＧＣ分析用サンプルとした。【０１２４】
ＧＣ／ＭＳ分析は、下記の条件で行った。【０１２５】
0005625905.tif 000009
上記条件での分析結果及び乳酸エチルのＭＳスペクトルを図１３ａ〜ｃに示す。ＧＣ／ＭＳの結果より、（２）で回収されたポリマーは３ＨＢとＬＡをモノマー単位として含むことが確認された。【０１２６】
iv）ＮＭＲ分析
（２）で回収されたポリマーを重水素化クロロホルムに溶解してサンプルとし、３００ＭＨｚで１Ｈ−ＮＭＲ（図１４ａ〜ｃ）及び１３Ｃ−ＮＭＲ（図１５ａ〜ｃ）を測定した。その結果、（２）で回収されたポリマーは３ＨＢとＬＡをモノマー単位として含むこと、３ＨＢとＬＡの比が約３２：６８（Ｊｗ２２９３）、 約３０：７０（Ｊｗ０８８５）、 約３２：６８（Ｊｗ０８８６）であることが判明した。【０１２７】
＜実施例３＞  嫌気条件下での培養による共重合ポリエステルの製造
１）ベクターの構築
実施例１の１）で作製したｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ１（ＳＴ／ＱＫ）ＡＢを鋳型にして、βＫＴをコードする遺伝子及びＡＡＣｏＡ−Ｒをコードする遺伝子が取り除かれた直鎖状プラスミドが得られる様にＰＣＲを行い、得られた増幅断片を閉環させて、ｐＴＶ１１８ＮにＰｃｔをコードする遺伝子とＰｈａＣｍをコードする遺伝子を有するプラスミドｐＴＶ１１８ＮｐｃｔＣ１（ＳＴ／ＱＫ）（図１６左）を作製した。【０１２８】
実施例１の１）で作製したｐＧＥＭＣ１ＡＢを制限酵素ＢａｍＨＩで消化して得られる約３，２００塩基対のＤＮＡ断片と、低コピープラスミドであるｐＡＣＹＣ１７７ＤＮＡを制限酵素ＢａｍＨＩで消化した直鎖状ベクタープラスミドとを連結して、ｐＡＣＹＣ１７７ＤＮＡのＢａｍＨＩサイトにβＫＴをコードする遺伝子及びＡＡＣｏＡ−Ｒをコードする遺伝子を導入したプラスミドｐＡＣＹＣ１７７ＡＢを得た（図１６右）に示す。【０１２９】
２）ポリマーの製造
ｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ１（ＳＴ／ＱＫ）とｐＡＣＹＣ１７７ＡＢを用いて大腸菌Ｗ３１１０株を形質転換した。【０１３０】
得られた形質転換体をアンピシリン１００μｇ／ｍｌ、２％グルコース、１０ｍＭパントテン酸を含むＬＢ培地１００ｍｌに植菌し、３７℃にて７２時間培養を行った。培養後４℃、３，１００ｒｐｍ、１５分間の条件で遠心して菌体を回収し、１０ｍＭトリス塩酸緩衝液（ｐＨ７．５）に懸濁させてから再度同条件で遠心分離した後、２日間、凍結乾燥した。【０１３１】
ガラス製耐圧反応管に乾燥菌体を移し、クロロホルム６０ｍｌを加えて懸濁液としてから、１００℃のヒートブロック中で３時間保ったのち、室温まで冷却後、０．２μｍＰＴＦＥフィルター（ＡＤＶＡＮＴＥＣ）で濾過して、クロロホルム溶液と菌体を分離した。濾液を遠心用ガラス試験管ヘ移し、６０℃でドライアップしてクロロホルムを留去した。試験管内に残った膜状のポリマーを、ヘキサンを用いて洗浄、乾燥し、再びクロロホルム６０ｍｌに溶解してクロロホルム溶液をえた。０．２μｍＰＴＦＥフィルター（ＡＤＶＡＮＴＥＣ）で濾過し、分取用ＧＰＣ（ＬＣ−９２０１）によってポリマー画分を分取した。クロロホルムを留去してポリマーを得た。【０１３２】
回収されたポリマーの量は、１２２８ｍｇであった。また、ポリマーの菌体内含有率（培養後の乾燥菌体重量に対して回収されたポリマー重量割合）は２．３％であった。【０１３３】
３）ポリマーの分析
i）ＧＰＣ
２）で回収されたポリマー約１ｍｇにクロロホルムを１ｍＬ加え、これを０．２μｍＰＴＦＥフィルター（ＡＤＶＡＮＴＥＣ）で濾過した溶液をサンプルとして、下記の条件でＧＰＣ測定を行った。【０１３４】
0005625905.tif 000010
測定された分子量分布曲線を図１７に示す。分子量較正曲線は標準ポリスチレンを用いて作成し、標準ポリスチレン分子量の換算値で分子量を表した。その結果、ポリマーの分子量（ｍＷ）は２８，０００、Ｍｎは２２，０００、Ｍｗ／Ｍｎは１．５であった。【０１３５】
ii）熱分析（ＤＳＣ）
２）で回収されたポリマー約１ｍｇを、示差走査熱量計（ＤＳＣ３１００、マックサイエンス）を用い、−５０℃〜２１０℃：２０℃／分上昇、２１０℃〜−９０℃：４０℃／分下降、−９０℃：５分保持、−９０℃〜２１０℃：２０℃／分上昇の条件で分析した（図１８）。【０１３６】
その結果、ポリマーの融点（Ｔｍ）は１５７．０〜１６１．４ ℃であった。【０１３７】
iii）ＧＣ／ＭＳ
２）で回収されたポリマー約５０μｇを１ｍＬのクロロホルムに溶解した溶液２５０μＬ、エタノール８５０μＬ、塩酸１００μＬをガラス製耐圧反応管で混合し、１００℃のヒートブロック中で３時間、エタノリシス処理を行った。室温まで冷却後、０．６５Ｍリン酸および０．９ＭＮaＣｌを含む溶液１ｍｌと２５０ｍＭリン酸溶液５００μＬを加えて混合し、ｐＨを中性に調整した後、室温、１，２００ｒｐｍで５分間の条件で遠心し、水層とクロロホルム層を分離した。クロロホルム層を採取し、モレキュラーシーブスにより脱水を行って、ＧＣ分析用サンプルとした。【０１３８】
ＧＣ／ＭＳ分析は、下記の条件で行った。【０１３９】
0005625905.tif 000011
上記条件での分析結果及び乳酸エチルのＭＳスペクトルを図１９に示す。ＧＣ／ＭＳの結果より、（２）で回収されたポリマーは３ＨＢとＬＡをモノマー単位として含むことが確認された。【０１４０】
iv）ＮＭＲ分析
（２）で回収されたポリマーを重水素化クロロホルムに溶解してサンプルとし、３００ＭＨｚで１Ｈ−ＮＭＲ（図２０）、１３Ｃ−ＮＭＲ（図２１）及び１Ｈ１３Ｃ−ＮＭＲ（図２２）を測定した。その結果、（２）で回収されたポリマーは３ＨＢとＬＡをモノマー単位として含むこと、３ＨＢとＬＡの比が約５３：４７であることが判明した。【０１４１】
＜実施例４＞  ３ＨＢ、ＬＡ及び３ＨＶをモノマー単位とする共重合ポリエステルの製造
１）ポリマーの生産
実施例１で作製したｐＴＶ１１８ＮＰＣＴＣ１（ＳＴ／ＱＫ）ＡＢを用いて乳酸高蓄積大腸菌株Ｊｗ０８８５を形質転換した。得られた形質転換体をアンピシリン１００μｇ／ｍｌ、２％グルコース、１０ｍＭパントテン酸、０．５％プロピオン酸ナトリウムを含むＬＢ培地（表１に示す）１００ｍｌに植菌し、３０℃にて７２時間培養を行った。この培養物を４℃、３，１００ｒｐｍ、１５分間の条件で遠心して菌体を回収し、１０ｍＭトリス塩酸緩衝液（ｐＨ７．５）に懸濁させてから再度同条件で遠心分離した後、２日間、凍結乾燥した。【０１４２】
ガラス製耐圧反応管に乾燥菌体を移し、クロロホルム５ｍｌを加えて懸濁液としてから、６０℃のヒートブロック中で４８時間保ったのち、室温まで冷却後、０．２μｍＰＴＦＥフィルター（ＡＤＶＡＮＴＥＣ）で濾過して、クロロホルム溶液と菌体を分離した。次に濾液に１００ｍｌのメタノールを加え、ポリマーを析出させた。析出したポリマーを０．２μｍＰＴＦＥフィルター（ＡＤＶＡＮＴＥＣ）で濾過してポリマーを得た。【０１４３】
回収されたポリマーの量は、１２ｍｇであった。また、ポリマーの菌体内含有率（培養後の乾燥菌体重量に対して回収されたポリマー重量割合）は８．５％であった。【０１４４】
２）ポリマーの分析
ｉ）ＨＰＬＣ分析
回収されたポリマー約１０ｍｇに１Ｎ水酸化ナトリウムを５００μｌ加え、１００℃で３時間加熱し水和分解した。反応後１Ｎ塩酸を５００μｌ加えて中和し、０．２μｍＰＴＦＥフィルター（ＡＤＶＡＮＴＥＣ）で濾過したものを検液と、下記の条件下でＨＰＬＣ分析を行った。【０１４５】
0005625905.tif 000012
検量線はモノマー組成既知のポリ乳酸（ＬＡ１００ｍｏｌ％）およびポリ［ヒドロキシ酪酸（ＨＢ）−ｃｏ−ヒドロキシ吉草酸（ＨＶ）−ｃｏ−ヒドロキシヘキサン酸（ＨＨｘ）]（ＨＢ：７０ｍｏｌ％、ＨＶ：２３ｍｏｌ％、ＨＨｘ：７ｍｏｌ％）を用いて作成した。【０１４６】
その結果（図２３〜２５）、得られたポリマーは４０ｍｏｌ％程度の乳酸、４８ｍｏｌ％程度の３−ヒドロキシ酪酸、１１ｍｏｌ％程度の３−ヒドロキシ吉草酸からなることが確認された。【０１４７】
本明細書で引用した全ての刊行物、特許および特許出願をそのまま参考として本明細書にとり入れるものとする。
【図１】
0005625905.tif 000013
【図２】
0005625905.tif 000014
【図３】
0005625905.tif 000015
【図４】
0005625905.tif 000016
【図５】
0005625905.tif 000017
【図６】
0005625905.tif 000018
【図７】
0005625905.tif 000019
【図８】
0005625905.tif 000020
【図９】
0005625905.tif 000021
【図１０】
0005625905.tif 000022
【図１１ａ】
0005625905.tif 000023
【図１１ｂ】
0005625905.tif 000024
【図１１ｃ】
0005625905.tif 000025
【図１２ａ】
0005625905.tif 000026
【図１２ｂ】
0005625905.tif 000027
【図１２ｃ】
0005625905.tif 000028
【図１３ａ】
0005625905.tif 000029
【図１３ｂ】
0005625905.tif 000030
【図１３ｃ】
0005625905.tif 000031
【図１４ａ】
0005625905.tif 000032
【図１４ｂ】
0005625905.tif 000033
【図１４ｃ】
0005625905.tif 000034
【図１５ａ】
0005625905.tif 000035
【図１５ｂ】
0005625905.tif 000036
【図１５ｃ】
0005625905.tif 000037
【図１６】
0005625905.tif 000038
【図１７】
0005625905.tif 000039
【図１８】
0005625905.tif 000040
【図１９】
0005625905.tif 000041
【図２０】
0005625905.tif 000042
【図２１】
0005625905.tif 000043
【図２２】
0005625905.tif 000044
【図２３】
0005625905.tif 000045
【図２４】
0005625905.tif 000046
【図２５】
0005625905.tif 000047
【配列表】
0005625905000001.app