(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
膀胱腫瘍、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、唾液腺の腺様嚢胞癌、バーキットリンパ腫、多発性骨髄腫、膵管腺癌、ヘアリー細胞白血病、転移性前立腺癌、メラノーマ、及び結腸直腸癌からなる群より選択される、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌の処置のためのＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ阻害剤を含む薬学的組成物であって、
阻害剤が、ＴＹＲＯ３の細胞外ドメインに対する抗体、ＴＹＲＯ３発現に特異的に干渉する核酸分子、キナーゼデッドドメインを提示するドミナントネガティブ受容体ＴＹＲＯ３、及びＴＹＲＯ３可溶性ベイトからなる群より選択される、薬学的組成物。
【請求項２】
ＴＹＲＯ３発現に特異的に干渉する核酸分子が、ＲＮＡｉ、アンチセンス核酸、又はリボザイムである、請求項１記載の薬学的組成物。
【請求項３】
ＲＮＡｉが、ｓｉＲＮＡである、請求項２記載の薬学的組成物。
【請求項４】
ｓｉＲＮＡが、配列番号１の配列を含む、請求項３記載の薬学的組成物。
【請求項５】
ＴＹＲＯ３可溶性ベイトが、受容体の細胞外ドメインの少なくとも１つのＩｇ様又はフィブロネクチンＩＩＩドメインで構成される組換えＴＹＲＯ３受容体である、請求項１記載の薬学的組成物。
【請求項６】
ＴＹＲＯ３可溶性ベイトが、Ｇａｓ６及び／又はプロテインＳに対する抗体である、請求項１記載の薬学的組成物。
【請求項７】
ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤が、別の活性成分と組み合わせて使用される、請求項１〜６のいずれか一項記載の薬学的組成物。
【請求項８】
ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤が、抗腫瘍薬物と組み合わせて使用される、請求項１〜６のいずれか一項記載の薬学的組成物。
【請求項９】
抗腫瘍薬物が、タモキシフェン、アロマターゼ阻害剤、トラスツズマブ、ＧｎＲＨアナログ、ゲムシタビン、ドセタキセル、パクリタキセル、マイトマイシン、シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ドセタキセル、シクロホスファミド、エピルビシン、フルオロウラシル、メトトレキセート、ミトキサントロン、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビノレルビン、ブレオマイシン、エストラムスチンリン酸、及びエトポシドリン酸からなる群から選択される、請求項８記載の薬学的組成物。
【請求項１０】
膀胱腫瘍、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、唾液腺の腺様嚢胞癌、バーキットリンパ腫、多発性骨髄腫、膵管腺癌、ヘアリー細胞白血病、転移性前立腺癌、メラノーマ、及び結腸直腸癌からなる群より選択される、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌を処置するために適した分子をスクリーニング又は同定するための方法であって、方法が以下の工程：（ｉ）候補分子をＴＹＲＯ３受容体と接触させること、ならびに（ｉｉ）ＴＹＲＯ３受容体に結合し、及び／又はＴＹＲＯ３受容体のリガンドと及び／又はリガンドについて競合し、及び／又はＴＹＲＯ３基質のリン酸化もしくはＴＹＲＯ３自己リン酸化を減少させる能力を有する分子を選択すること、
を含む方法。
【請求項１１】
膀胱腫瘍、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、唾液腺の腺様嚢胞癌、バーキットリンパ腫、多発性骨髄腫、膵管腺癌、ヘアリー細胞白血病、転移性前立腺癌、メラノーマ、及び結腸直腸癌からなる群より選択される、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌を処置するために適した分子をスクリーニング又は同定するための方法であって、方法が以下の工程：（ｉ）候補分子を、ＴＹＲＯ３受容体を発現する細胞と接触させること、ならびに（ｉｉ）ＴＹＲＯ３受容体に結合し、及び／又はＴＹＲＯ３受容体のリガンドと及び／又はリガンドについて競合し、及び／又はＴＹＲＯ３遺伝子発現を減少させ、及び／又はＴＹＲＯ３基質のリン酸化もしくはＴＹＲＯ３自己リン酸化を減少させる能力を有する分子を選択すること、
を含む方法。
【請求項１２】
ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌の非ヒト動物モデルにおいて請求項１０又は１１記載の方法により選択される分子を投与し、疾患進行に対する効果を分析する工程をさらに含む、請求項１０又は１１記載の方法。
【請求項１３】
ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌が膀胱腫瘍であり、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌の非ヒト動物モデルが膀胱腫瘍の非ヒト動物モデルである、請求項１２記載の方法。
【請求項１４】
ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌が、膀胱癌である、請求項１〜９のいずれか一項記載の薬学的組成物。
【請求項１５】
ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌が、膀胱癌である、請求項１０〜１３のいずれか一項記載の方法。
【請求項１６】
ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤が、別の膀胱腫瘍処置と組み合わせて使用される、請求項１４記載の薬学的組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
発明の分野
本発明は、医学の分野、特に癌の処置に関する。それは、癌の処置の新たな方法及び癌の処置における有用な分子のスクリーニングの方法に関する。
【０００２】
発明の背景
癌は、細胞分裂が制御から外に出た場合に生じ、ＤＮＡ修復経路の欠陥、正常遺伝子の癌遺伝子への形質転換、又は腫瘍抑制遺伝子の機能障害に起因する。多くの異なる形態の癌が存在する。これらの癌の発生率は変動する。しかし、それは最も発展した国において、心臓病に続き２番目に高い死亡原因を表す。
【０００３】
膀胱癌は発生率に関して５番目の癌である。それは、表在性病変として尿路上皮（Ｔａ及び上皮内癌（ＣＩＳ））又は固有層（Ｔ１）又は筋肉浸潤性病変（Ｔ２−Ｔ４）に限定していると思われる。腫瘍進行の２つの異なる経路が、今までに膀胱癌において記載されている：Ｔａ経路及びＣＩＳ経路。Ｔａ腫瘍は、最初の提示で膀胱腫瘍の５０%を構成し、通常、基底膜に浸潤しない低悪性度の表在性乳頭腫瘍である。上皮内癌（ＣＩＳ）も、基底膜に浸潤しないが、しかし、常に高悪性度の表在性腫瘍である。Ｔａ腫瘍は、ＢＣＧ（バシラス属カルメット・ゲラン）治療に関連する又はしない外科的切除術にもかかわらず、しばしば再発するが、しかし、稀に筋肉浸潤性疾患（Ｔ２−Ｔ４）に進行するのに対し、ＣＩＳはしばしばＴ２−Ｔ４腫瘍に進行する。筋肉浸潤性膀胱癌に関して、標準処置は嚢胞切除術である。この根治処置にもかかわらず、筋肉浸潤性膀胱癌は、大半の患者にとって依然として致命的な疾患である。
【０００４】
今日までに、多くの再発性の染色体変化が膀胱癌において記載されている場合でさえ、少数の遺伝子だけが腫瘍進行に関係していることが実証されている（ｐ５３遺伝子、ＣＤＫＮ２Ａ、ＲＢ１、Ｅ２Ｆ３、ＦＧＦＲ３）。
【０００５】
したがって、適切な膀胱腫瘍処置、特に新たなより効果的な治療剤についての有意な必要がある。
【０００６】
発明の要約
本発明者らは、驚くべきことに、本明細書において、ＴＹＲＯ３がいくつかの型の腫瘍（膀胱腫瘍を含む）において過剰発現され、腫瘍細胞の生存に関与することを実証する。さらに、本発明者らは、ＴＹＲＯ３の阻害又は枯渇を誘導する化合物を使用して、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌を処置できることを示す。
【０００７】
本発明は、癌、特に膀胱癌を処置するための新たな治療剤を提供する。
【０００８】
第１の局面において、本発明は、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌の処置における使用のためのＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤に関する。特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は、膀胱腫瘍、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、唾液腺の腺様嚢胞癌、バーキットリンパ腫、多発性骨髄腫、膵管腺癌、ヘアリー細胞白血病、転移性前立腺癌、メラノーマ、及び結腸直腸癌からなる群より選択される。好ましい実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は膀胱腫瘍である。
【０００９】
本発明は、また、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌の処置おける使用のための、ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤及び医薬的に許容可能な担体／賦形剤を含む医薬的組成物に関する。特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は、膀胱腫瘍、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、唾液腺の腺様嚢胞癌、バーキットリンパ腫、多発性骨髄腫、膵管腺癌、ヘアリー細胞白血病、転移性前立腺癌、メラノーマ、及び結腸直腸癌からなる群より選択される。好ましい実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は膀胱腫瘍である。
【００１０】
ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ阻害剤は、好ましくは、ＴＹＲＯ３の細胞外ドメインに対する抗体、ＴＹＲＯ３発現に特異的に干渉する核酸分子、ＴＹＲＯ３可溶性ベイト（bait）、キナーゼデッドドメインを提示するドミナントネガティブ受容体、及びＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ活性を阻害する小分子からなる群より選択される。好ましい実施態様において、ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ阻害剤は、ＴＹＲＯ３の細胞外ドメインに対する抗体、ＴＹＲＯ３発現に特異的に干渉する核酸分子、ＴＹＲＯ３可溶性ベイト、及びキナーゼデッドドメインを提示するドミナントネガティブ受容体からなる群より選択される。特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ阻害剤は、ＲＮＡｉ、ＴＹＲＯ３発現に特異的に干渉するアンチセンス核酸又はリボザイムである。
【００１１】
好ましい実施態様において、阻害剤は、ｓｉＲＮＡ、特に配列番号１の配列を含むｓｉＲＮＡである。
【００１２】
別の実施態様において、阻害剤はＴＹＲＯ３可溶性ベイトである。特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３可溶性ベイトは、受容体の少なくとも細胞外ドメイン又はそのドメインの１つ（Ｉｇ様又はフィブロネクチン）で構成される組換えＴＹＲＯ３受容体である。別の特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３可溶性ベイトはＧａｓ−６に対する抗体である。
【００１３】
一実施態様において、ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ阻害剤を、別の活性成分、特に抗腫瘍性薬物と組み合わせて使用する。特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ阻害剤を、膀胱腫瘍の処置と組み合わせて使用する。
【００１４】
別の局面において、本発明は、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌を処置するために適した分子をスクリーニング又は同定するための方法に関し、それにおいて、方法は以下の工程を含む：（ｉ）候補分子をＴＹＲＯ３受容体と接触させること、ならびに（ｉｉ）ＴＹＲＯ３受容体に結合し、及び／又はＴＹＲＯ３受容体のリガンドと及び／又はリガンドについて競合し、及び／又はＴＹＲＯ３基質のリン酸化もしくはＴＹＲＯ３自己リン酸化を減少させる能力を有する分子を選択すること。好ましい実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は膀胱腫瘍である。
【００１５】
本発明は、また、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌を処置するために適した分子をスクリーニング又は同定するための方法に関し、それにおいて、方法は以下の工程を含む：（ｉ）候補分子を、ＴＹＲＯ３受容体を発現する細胞と接触させること、ならびに（ｉｉ）ＴＹＲＯ３受容体に結合し、及び／又はＴＹＲＯ３受容体のリガンドと及び／又はリガンドについて競合し、及び／又はＴＹＲＯ３遺伝子発現を減少させ、及び／又はＴＹＲＯ３基質のリン酸化もしくはＴＹＲＯ３自己リン酸化を減少させる能力を有する分子を選択すること。好ましい実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は膀胱腫瘍である。
【００１６】
ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌を処置するために適した分子をスクリーニング又は同定するためのこれらの方法は、場合によりさらに、ＴＹＲＯ３を過剰発現する腫瘍の非ヒト動物モデルにおいてインビトロで選択された分子を投与し、疾患進行に対する効果を分析する工程を含みうる。特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は膀胱腫瘍であり、ＴＹＲＯ３を過剰発現する腫瘍の非ヒト動物モデルは、膀胱腫瘍の非ヒト動物モデルである。
【００１７】
本発明は、さらに、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌を被験者において処置するための方法に関し、それにおいて、方法は、治療的有効量のＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ阻害剤を被験者に投与する工程を含む。特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は、膀胱腫瘍、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、唾液腺の腺様嚢胞癌、バーキットリンパ腫、多発性骨髄腫、膵管腺癌、ヘアリー細胞白血病、転移性前立腺癌、メラノーマ、及び結腸直腸癌からなる群より選択される。好ましい実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は膀胱腫瘍である。
【００１８】
最後に、本発明は、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌の処置のための医薬の調製のためのＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ阻害剤の使用に関する。特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は、膀胱腫瘍、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、唾液腺の腺様嚢胞癌、バーキットリンパ腫、多発性骨髄腫、膵管腺癌、ヘアリー細胞白血病、転移性前立腺癌、メラノーマ、及び結腸直腸癌からなる群より選択される。好ましい実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は膀胱腫瘍である。
【図面の簡単な説明】
【００１９】
【図１Ａ】図１は、膀胱腫瘍及び膀胱癌細胞株におけるＴＹＲＯ３発現を示す。ヒト膀胱癌腫瘍におけるｍＲＮＡ発現レベルを、Affymetrix U95A DNAマイクロアレイを使用して評価した（図１Ａ）。異なる群間での発現における差を、ＡＮＯＶＡ検定を使用して比較した（図１Ｂ）。
【図１Ｂ】図１は、膀胱腫瘍及び膀胱癌細胞株におけるＴＹＲＯ３発現を示す。ヒト膀胱癌腫瘍におけるｍＲＮＡ発現レベルを、Affymetrix U95A DNAマイクロアレイを使用して評価した（図１Ａ）。異なる群間での発現における差を、ＡＮＯＶＡ検定を使用して比較した（図１Ｂ）。
【図２Ａ】図２は、膀胱腫瘍及び膀胱癌細胞株におけるＧＡＳ６発現を示す。ヒト膀胱癌腫瘍におけるｍＲＮＡ発現レベルをAffymetrix U95A DNAマイクロアレイを使用して評価し（図２Ａ）、異なる群間での発現における差を、ＡＮＯＶＡ検定を使用して比較した（図２Ｂ）。
【図２Ｂ】図２は、膀胱腫瘍及び膀胱癌細胞株におけるＧＡＳ６発現を示す。ヒト膀胱癌腫瘍におけるｍＲＮＡ発現レベルをAffymetrix U95A DNAマイクロアレイを使用して評価し（図２Ａ）、異なる群間での発現における差を、ＡＮＯＶＡ検定を使用して比較した（図２Ｂ）。
【図３】図３は、Ｑ−ＲＴ−ＰＣＲにより評価された、ヒト膀胱癌細胞株Ｔ２４、ＭＧＨ−Ｕ３、ＲＴ４、ＫＫ４７、ＴＣＣＳＵＰ、ＥＪ１３８、Ｊ８２、及びＲＴ１１２における、ならびにＮＨＵ正常尿路上皮由来細胞株におけるＴＹＲＯ３及びＧＡＳ６のｍＲＮＡ発現レベルを示す。
【図４】図４は、ＭＧＨ−Ｕ３細胞におけるＴＹＲＯ３サイレンシングの効率を示す。細胞を５０nM  ｓｉＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ抗ＴＹＲＯ３（配列番号１）又はコントロールｓｉＲＮＡ（スクランブル、配列番号２））を用いてトランスフェクトし、ＴＹＲＯ３サイレンシングの効率をウエスタンブロットによりトランスフェクションの７２時間後に評価した。
【図５】図５は、膀胱癌細胞の生存率に対するＴＹＲＯ３ノックダウンの効果を表わすグラフを示す。図４の説明文に記載されるトランスフェクション後、細胞を、トランスフェクションから７２時間後にトリプシンを用いて処理し、トリパンブルーを用いて染色し、生存細胞を３通りにMalassez血球計数器を使用してカウントした。結果は、３重で行われた２つの独立した実験での平均値±ＳＤである。
【図６】図６は、膀胱癌細胞の生存率に対するＴＹＲＯ３抗体の効果を示す。細胞を、ＴＹＲＯ３の細胞外ドメインに対する種々の濃度のポリクローナル抗体（ヤギ抗Ｒｓｅ（Ｎ１８）、Santa-Cruz biotechnology）の存在において７２時間インキュベートし、細胞生存率をＭＴＴアッセイにより測定した。
【図７】図７は、細胞生存率に対する組換え可溶性ＴＹＲＯ３受容体の効果を示す。２つのＩｇ様ドメイン（ａａ１−２２０）及び２つのフィブロネクチンＩＩＩドメイン（ａａ２２０−４２１）で構成されるＴＹＲＯ３の細胞外ドメイン（４２１ａａ）を細菌中で産生させ、精製した。細胞を、種々の量のこの可溶性受容体の存在において７２時間インキュベートし、細胞生存率をＭＴＴ取り込みにより測定した。
【図８】図８は、トランスフェクト膀胱癌細胞でのＴＵＮＥＬアッセイの結果を示す。３×１０４個細胞／ウェルを、２４ウェルプレート中のガラススライドに播種し、５０nM  ｓｉＲＮＡを用いてトランスフェクトした。ＤＮＡフラグメント化を、トランスフェクションから７２時間後、製造者の指示に従って、ＴＵＮＥＬ（デオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼ（Ｔｄｔ）媒介性ニック末端標識）アッセイ検出キット（Roche Diagnostic, Meylan, France）を使用して評価した。本発明者らは、光学顕微鏡下で６００個の細胞を分析し、標識細胞の割合を決定した。
【図９】図９は、ｓｉＲＮＡトランスフェクションから７２時間後のフローサイトメトリーによる細胞周期分析を示す。結果を、フィッシャー検定を使用して分析した（＊＊＊ｐ＜０．００１、＊０．０１＜ｐ＜０．０５）。
【図１０】図１０は、足場非依存性コロニー形成に対するＴＹＲＯ３ノックダウンの効果を表わすグラフを示す。１０%ＦＣＳ及び０．３%アガーを添加したＤＭＥＭ中の２．１０４個の５０nM  ｓｉＲＮＡトランスフェクト細胞を、１２ウェルプレート上で培地及び０．８%アガーを含む３重のウェルに加えた。プレートを２週間インキュベートし、５０μmより大きい直径を伴うコロニーを、測定格子を備えた位相差顕微鏡を使用して陽性とスコア化した。結果は、３重に行われた２つの独立した実験での平均値±ＳＤである。
【図１１Ａ】図１１は、異種移植Ｊ８２腫瘍の増殖に対するＴＹＲＯ３  ｓｉＲＮＡの効果を示す。腫瘍を持つマウスを、４μgのｓｉＲＮＡ（コントロール又はＴＹＲＯ３）の腹腔内注射により１週間に３回処置した（６匹のマウス及び１２個の腫瘍／群）（最初の注射が０日に対応する）。腫瘍容積の変動を、図１１Ａのグラフに表わす。（ウィルコクソン順位和検定：＊，０．０５＜ｐ＜０．０１；＊＊，０．０１＜ｐ＜０．００１；＊＊＊，ｐ＜０．００１）。挿入は、処置の終わりに観察された代表的な腫瘍の像である。上線の腫瘍は、コントロールｓｉＲＮＡ処置マウスのものである。下線の腫瘍は、ＴＹＲＯ３  ｓｉＲＮＡ処置マウスのものである。腫瘍を実験の終わりに秤量した（図１１Ｂ）。
【図１１Ｂ】図１１は、異種移植Ｊ８２腫瘍の増殖に対するＴＹＲＯ３  ｓｉＲＮＡの効果を示す。腫瘍を持つマウスを、４μgのｓｉＲＮＡ（コントロール又はＴＹＲＯ３）の腹腔内注射により１週間に３回処置した（６匹のマウス及び１２個の腫瘍／群）（最初の注射が０日に対応する）。腫瘍容積の変動を、図１１Ａのグラフに表わす。（ウィルコクソン順位和検定：＊，０．０５＜ｐ＜０．０１；＊＊，０．０１＜ｐ＜０．００１；＊＊＊，ｐ＜０．００１）。挿入は、処置の終わりに観察された代表的な腫瘍の像である。上線の腫瘍は、コントロールｓｉＲＮＡ処置マウスのものである。下線の腫瘍は、ＴＹＲＯ３  ｓｉＲＮＡ処置マウスのものである。腫瘍を実験の終わりに秤量した（図１１Ｂ）。
【図１２Ａ】図１２は、異種移植Ｊ８２腫瘍の増殖に対するＴＹＲＯ３  ｓｉＲＮＡの効果を示す。腫瘍を持つマウスを、４μgのｓｉＲＮＡ（コントロール又はＴＹＲＯ３）の腹腔内注射により１週間に３回処置した（６匹のマウス及び１２個の腫瘍／群）（最初の注射が０日に対応する）。腫瘍容積の変動を、図１２Ａのグラフに表わす。（ウィルコクソン順位和検定：＊，０．０５＜ｐ＜０．０１，＊＊，０．０１＜ｐ＜０．００１，＊＊＊，ｐ＜０．００１）。挿入は、処置の終わりに観察された代表的な腫瘍の像である。上線の腫瘍は、ＴＹＲＯ３  ｓｉＲＮＡ処置マウスのものである。中線の腫瘍は、コントロールｓｉＲＮＡ処置マウスのものである。下線の腫瘍は、ＰＢＳ処置マウスのものである。腫瘍を実験の終わりに秤量した（図１２Ｂ）。
【図１２Ｂ】図１２は、異種移植Ｊ８２腫瘍の増殖に対するＴＹＲＯ３  ｓｉＲＮＡの効果を示す。腫瘍を持つマウスを、４μgのｓｉＲＮＡ（コントロール又はＴＹＲＯ３）の腹腔内注射により１週間に３回処置した（６匹のマウス及び１２個の腫瘍／群）（最初の注射が０日に対応する）。腫瘍容積の変動を、図１２Ａのグラフに表わす。（ウィルコクソン順位和検定：＊，０．０５＜ｐ＜０．０１，＊＊，０．０１＜ｐ＜０．００１，＊＊＊，ｐ＜０．００１）。挿入は、処置の終わりに観察された代表的な腫瘍の像である。上線の腫瘍は、ＴＹＲＯ３  ｓｉＲＮＡ処置マウスのものである。中線の腫瘍は、コントロールｓｉＲＮＡ処置マウスのものである。下線の腫瘍は、ＰＢＳ処置マウスのものである。腫瘍を実験の終わりに秤量した（図１２Ｂ）。
【図１３】図１３は、Ｑ−ＲＴ−ＰＣＲにより評価された、処置腫瘍及びコントロール腫瘍におけるＴＢＰ（ＴＡＴＡ結合タンパク質）のｍＲＮＡレベル±ＳＤにより割った、最後のｓｉＲＮＡ注射から３日後でのＭＧＨ−Ｕ３異種移植についてのＴＹＲＯ３  ｍＲＮＡレベルを示すグラフである。
【図１４Ａ】図１４は、細菌において産生されたＴＹＲＯ３の組換え細胞外ドメインからなるＴＹＲＯ３組換え可溶性受容体の異種移植ＭＧＨ−Ｕ３腫瘍の増殖に対する効果を示す。腫瘍を持つマウスを、８０μgのＴＹＲＯ３可溶性受容体又はＰＢＳの腫瘍内注射により１週間に３回処置した（７匹のマウス及び１４個の腫瘍／群）（最初の注射が０日に対応する）。腫瘍容積の変動を、図１４Ａのグラフに表わす。（ウィルコクソン順位和検定：＊，０．０５＜ｐ＜０．０１；＊＊，０．０１＜ｐ＜０．００１；＊＊＊，ｐ＜０．００１）処置の終わりに観察された代表的な腫瘍の像を図１４Ｂに示す。
【図１４Ｂ】図１４は、細菌において産生されたＴＹＲＯ３の組換え細胞外ドメインからなるＴＹＲＯ３組換え可溶性受容体の異種移植ＭＧＨ−Ｕ３腫瘍の増殖に対する効果を示す。腫瘍を持つマウスを、８０μgのＴＹＲＯ３可溶性受容体又はＰＢＳの腫瘍内注射により１週間に３回処置した（７匹のマウス及び１４個の腫瘍／群）（最初の注射が０日に対応する）。腫瘍容積の変動を、図１４Ａのグラフに表わす。（ウィルコクソン順位和検定：＊，０．０５＜ｐ＜０．０１；＊＊，０．０１＜ｐ＜０．００１；＊＊＊，ｐ＜０．００１）処置の終わりに観察された代表的な腫瘍の像を図１４Ｂに示す。
【図１５】図１５は、ＴＹＲＯ３可溶性受容体又はＰＢＳを用いて処置された異種移植ＭＧＨ−Ｕ３腫瘍でのＴＵＮＥＬアッセイの結果を示す。処置の開始から１８日後にマウスを屠殺し、腫瘍をパラフィン包埋した。ＤＮＡフラグメント化を、次に、製造者の指示に従って、ＴＵＮＥＬ（デオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼ（Ｔｄｔ）媒介性ニック末端標識）アッセイ検出キット（Roche Diagnostic, Meylan, France）を使用して評価した。観察された代表的な視野の像を示す。
【図１６Ａ】図１６は、異なる癌におけるＴＹＲＯ３過剰発現を示す。Oncomineのウェブサイトを使用したヒト腫瘍におけるＴＹＲＯ３の差次的発現分析（Rhodes et al., 2004）。正常（白色、左パネル）組織と比較した、腫瘍（灰色、右パネル）でのＴＹＲＯ３遺伝子発現レベルの有意な上方調節（ｐ＜０．０１）を示す試験を表わす（図１６Ａ）。この分析のために使用されるデータについての詳細を図１６Ｂに提供する。
【図１６Ｂ】図１６は、異なる癌におけるＴＹＲＯ３過剰発現を示す。Oncomineのウェブサイトを使用したヒト腫瘍におけるＴＹＲＯ３の差次的発現分析（Rhodes et al., 2004）。正常（白色、左パネル）組織と比較した、腫瘍（灰色、右パネル）でのＴＹＲＯ３遺伝子発現レベルの有意な上方調節（ｐ＜０．０１）を示す試験を表わす（図１６Ａ）。この分析のために使用されるデータについての詳細を図１６Ｂに提供する。
【図１７】図１７は、GeneSapiens DataBase（Kilpinen et al., 2008）より抽出された正常組織（図１６Ｂ）の大スペクトルにわたるＴＹＲＯ３遺伝子発現のプロットを示す。
【図１８】図１８は、GeneSapiens DataBase（Kilpinen et al., 2008）より抽出された腫瘍組織の大スペクトルにわたるＴＹＲＯ３遺伝子発現のプロットを示す。
【００２０】
発明の詳細な説明
一連の８０の膀胱癌、５つの正常膀胱尿路上皮、及び１０の膀胱腫瘍細胞株においてトランスクリプトームを分析することにより、本発明者らは：
−  正常尿路上皮サンプルと比較し、膀胱癌のほぼ７０%において過剰発現されるチロシンキナーゼ受容体ＴＹＲＯ３を同定し、この過剰発現は病期及び悪性度に非依存的であり；
−  ＴＹＲＯ３リガンドの１つであるＧＡＳ６が、正常尿路上皮及び表在性腫瘍と比較し、浸潤癌においても過剰発現されることに注目し；そして
−  膀胱腫瘍細胞の生存におけるＴＹＲＯ３の重要性を機能的に実証した。
【００２１】
ＱＰＣＲ分析によってAffymetrixトランスクリプトームデータが検証され、そのようにして、大半の膀胱腫瘍サンプルにおいてＴＹＲＯ３の過剰発現が示された。ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションによって、ＴＹＲＯ３が膀胱腫瘍上皮細胞により発現されるのに対し、ＧＡＳ６が間質細胞により主に発現されることが実証された。遺伝子発現をノックダウンするためのｓｉＲＮＡ又は組換えＴＹＲＯ３可溶性受容体（受容体の細胞外ドメインで構成される）を使用した４つの膀胱腫瘍細胞株（２つがＴＹＲＯ３だけを発現し、２つがＴＹＲＯ３とＧＡＳ６の両方を発現する）におけるＴＹＲＯ３の機能試験では、ＴＹＲＯ３がインビトロでの膀胱癌細胞の生存に必要であることが示された。これらの結果は、異種移植されたヒト膀胱腫瘍由来の細胞株を使用することによりインビボで確認された。実際に、ＴＹＲＯ３１の不活化によって、１）細胞アポトーシスの誘導により細胞生存が阻害される；２）足場非依存性増殖が阻害され、ＴＹＲＯ３がクローン化可能細胞の細胞生存を調節することが実証される；３）ヌードマウスに異種移植された膀胱腫瘍細胞の増殖を阻害し、腫瘍のサイズがさらに低下する。興味深いことに、本発明者らは、その細胞外ドメインに対するポリクローナル抗ＴＹＲＯ３抗体を使用し、ＴＹＲＯ３活性阻害を通じた同じインビトロ効果を観察した。
【００２２】
さらに、本発明者らは、ＴＹＲＯ３が膀胱腫瘍だけでなく、いくつかの他の型の癌、例えばびまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、唾液腺の腺様嚢胞癌、バーキットリンパ腫、多発性骨髄腫、膵管腺癌、ヘアリー細胞白血病、転移性前立腺癌、メラノーマ、及び結腸直腸癌などでも過剰発現されることを実証した。
【００２３】
したがって、ＴＹＲＯ３は、本発明者により、大半の膀胱腫瘍及びいくつかの他の型の癌において過剰発現されるチロシンキナーゼであり、腫瘍細胞の生存を誘導することが実証されている。従って、本発明は、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌、特に膀胱癌における新たな興味深い治療標的を提供する。
【００２４】
今日までに、ＴＹＲＯ３が、少数のヒト腫瘍型（子宮の子宮筋腫（Sun et al., 2003a）、子宮の子宮体癌及び卵巣子宮内膜症（Sun et al., 2002, Sun et al., 2003b）、肺癌（Wimmel at al., 1999））において、そのリガンドと共に過剰発現又は同時発現していると記載されているが、しかし、腫瘍進行における、特に腫瘍細胞の生存におけるその役割は示唆も実証もされていない。
【００２５】
その発現によってラット２線維芽細胞及びＲａｔＢ１線維芽細胞が形質転換されて以来、その発癌での役割が示唆されている（lai et al., 2004; Taylor et al., 1995）。さらに、これらの発癌特性も示唆されている。なぜなら、ＥＧＦ受容体の細胞外及びＴＹＲＯ３の細胞内部分で構成されるハイブリッド受容体が、ＥＧＦの存在においてＮＩＨ３Ｔ３細胞を形質転換できるからである（lan et al., 2000）。
【００２６】
しかし、ＴＹＲＯ３の潜在的な発癌での役割は、腫瘍細胞の生存におけるこの受容体の役割を開示も示唆もしない。
【００２７】
最近、Kiener et al.による撤回された特許出願（WO2005000207）で、ＴＹＲＯ３がＰＣＤＧＦ（ＰＣ細胞由来の増殖因子）の受容体であることが示唆される。ＰＣＤＧＦが様々な癌において過剰発現されるため、この文書は、ＴＹＲＯ３に対するＰＣＤＧＦ結合の阻害が、ＰＣＤＧＦを過剰発現するいくつかの癌における治療的アプローチでありうることを示唆する。しかし、この文書は、それらのアプローチを支持するデータを含まない。実際に、ＴＹＲＯ３がＰＣＤＧＦの受容体であること、及びＴＹＲＯ３に対するＰＣＤＧＦの潜在的な結合を阻害する分子が癌細胞に対する効果を有しうることを実証するデータはない。
【００２８】
したがって、初めて、腫瘍細胞の生存におけるＴＹＲＯ３の役割が記載及び証明されており、この役割は、存在するＴＹＲＯ３を過剰発現する癌、特に膀胱腫瘍を処置するための新たな手段を提供する。
【００２９】
チロシンキナーゼ受容体は、細胞外ドメイン（特異的リガンドに結合できる）、膜通過ドメイン、及び細胞内触媒ドメイン（選択された細胞内基質に結合し、それをリン酸化できる）で構成される。細胞外領域へのリガンドの結合は、その酵素活性化に導くチロシンキナーゼ受容体における一連の構造的な再配列を起こし、最終的に細胞外シグナルを核に伝達する細胞内タンパク質のリン酸化を通じた事象のカスケードを誘発し、遺伝子発現における変化を起こす。
【００３０】
ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼは、ＡＸＬ／Ｕｆｏ／Ｍｅｒチロシンキナーゼ受容体ファミリーのメンバーである。ＴＹＲＯ３は、ＢＹＫ、Ｂｒｔ、Ｄｔｋ、Ｒｓｅ、Ｓｋｙ、又はＴｉｆとしても公知である。Ｇａｓ６（増殖停止特異的遺伝子６）及びプロテインＳが、ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ活性を活性化することが記載されている。
【００３１】
ポリヌクレオチド及びアミノ酸配列が、当技術分野において周知である。参照配列は、それぞれＧｅｎｂａｎｋ  Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ  Ｎｏｓ  ＭＮ＿００６２９３．２及びＮＰ＿００６２８４．２である。トランスクリプトームデータベースUniGeneにおけるヒトＴＹＲＯ３についての参照エントリーは、Ｈｓ．３８１２８２である。
【００３２】
本発明において、「ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤」は、ＴＹＲＯ３受容体の活性を阻害又は低下する分子である。このように、阻害剤は、ＴＹＲＯ３受容体を通じた細胞中への細胞外シグナルの伝達の抑制又は低下を誘導する。
【００３３】
ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ活性の活性は、当技術分野において公知の任意の方法により容易にアッセイできる。第１のアッセイは、ＴＹＲＯ３受容体に結合する阻害剤の能力の決定でありうる。第２のアッセイは、この受容体又はこのリガンドの結合についてＴＹＲＯ３受容体のリガンドと競合する阻害剤の能力の決定でありうる。第３のアッセイは、ＴＹＲＯ３発現レベルを減少させる阻害剤の能力の決定でありうる。第４のアッセイは、ＴＹＲＯ３基質のリン酸化又はＴＹＲＯ３自己リン酸化を減少させる阻害剤の能力の決定でありうる。これらの異なる方法を、本文書において以下に記載し、合わせることができる。
【００３４】
阻害は、受容体の細胞外ドメイン上での分子の結合に起因しうる。この場合において、阻害剤は、受容体のリガンド結合ドメイン又は別のドメインに結合するアンタゴニスト、又は立体障害もしくは改変により受容体の活性を改変する分子でありうる。この阻害剤は、例えば、小分子、アプタマー、又は受容体の細胞外ドメインに対する抗体でありうる。阻害活性は、結合アッセイ、競合結合アッセイ、又はリン酸化アッセイを通じて決定できる。
【００３５】
阻害は、例えば、細胞表面の受容体数の減少ひいては細胞外シグナル伝達の低下を誘導する特異的なＲＮＡｉ、アンチセンス、又はリボザイムを使用することによる、受容体をコードする遺伝子の発現の低下又は抑制にも起因しうる。阻害活性は、タンパク質レベル又はＲＮＡレベルでのＴＹＲＯ３の発現レベルの測定を通じてアッセイできる。阻害活性は、また、ＴＹＲＯ３又はＴＹＲＯ３基質のリン酸化を通じてアッセイできる。
【００３６】
ＴＹＲＯ３受容体のリガンドに結合するベイトの使用によって、これらのリガンドについての競合によるこの受容体の活性の低下又は抑制を誘導することもできる。実際に、ＴＹＲＯ３のこれらのベイトトラップリガンドは、結果的に、ＴＹＲＯ３活性化のための利用可能なリガンドの濃度を減少させる。これらのベイトは、膜中（例えばドミナントネガティブ受容体など）又は細胞外液中（例えば可溶性受容体など）に配置できる。これらのベイトは、また、ＴＹＲＯ３リガンドに対する抗体でありうる。阻害活性は、機能的ＴＹＲＯ３受容体とそのリガンドの間での結合の減少を決定するために、競合アッセイを通じて決定できる。阻害活性は、また、ＴＹＲＯ３又はＴＹＲＯ３基質のリン酸化を通じてアッセイできる。
【００３７】
本発明の特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤は、好ましくは、チロシンキナーゼ活性を阻害する小分子、ＴＹＲＯ３の細胞外ドメインに対する抗体、ＴＹＲＯ３発現に特異的に干渉する核酸分子、キナーゼデッドドメインを提示するドミナントネガティブ受容体、及びＴＹＲＯ３可溶性ベイトからなる群より選択される。
【００３８】
好ましい実施態様において、ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤は、好ましくは、ＴＹＲＯ３発現に特異的に干渉する核酸分子、ＴＹＲＯ３の細胞外ドメインに対する抗体、キナーゼデッドドメインを提示するドミナントネガティブ受容体、及びＴＹＲＯ３可溶性ベイトからなる群より選択される。
【００３９】
本明細書で使用する「チロシンキナーゼ活性を阻害する小分子」という用語は、有機又は無機化合物でありうる小分子を指し、通常、１０００ダルトン未満で、ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの活性を阻害又は低下させる能力を伴う。この小分子は、任意の公知の生物（限定はされないが、動物、植物、細菌、真菌、及びウイルスを含む）又は合成分子のライブラリーに由来しうる。チロシンキナーゼ活性を阻害する小分子は、本文書にさらに記載する方法を用いて同定できる。
【００４０】
特定の実施態様において、この分子は、ＣＨＩＲ−２５８／ＴＫＩ−２５８（Novartis Pharmaceuticals）、ＣＩ−１０３３（Pfizer Pharmaceuticals）、ＥＫＢ−５６９（Wyeth Pharmaceuticals）、エルロチニブ／タルセバ（登録商標）（OSI Pharmaceuticals）、ＭＬＮ−８０５４（Millennium Pharmaceuticals）、スタウロスポリン（Calbiochem）、ＳＵ−１４８１３（Pfizer Pharmaceuticals）、スニチニブ／スーテント（登録商標）（Pfizer Pharmaceuticals）、及びＺＤ−６４７４（AstraZeneca Pharmaceuticals）からなる群より選択される（Karaman et al., 2008も参照のこと）。
【００４１】
本明細書において使用する「抗体」という用語は、広く、任意の免疫学的結合剤、例えばＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＤ、及びＩｇＥ、ならびにヒト化抗体又はキメラ抗体などを指すことを意図する。特定の実施態様において、ＩｇＧ及び／又はＩｇＭが好ましい。なぜなら、それらは生理学的状況において最も一般的な抗体であり、それらは最も容易に製造されるからである。「抗体」という用語を使用し、抗原結合領域を有する任意の抗体様分子を指し、抗体フラグメント、例えばＦａｂ’、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、単一ドメイン抗体（ＤＡＢ）、Ｆｖ、ｓｃＦｖ（単鎖Ｆｖ）、及び同様のものなどを含む。種々の抗体ベースの構築物及びフラグメントを調製及び使用するための技術は、当技術分野において周知である。抗体を調製し、特徴付けるための手段も当技術分野において周知である（例、Harlow and Lane, 1988を参照のこと）。
【００４２】
「ヒト化」抗体は、１つ又は複数のヒト免疫グロブリンの定常及び可変フレームワーク領域を動物免疫グロブリンの結合領域（例、ＣＤＲ）と融合した抗体である。本発明において考慮する「ヒト化」抗体は、マウス、ラット、又は他の種からのキメラ抗体であり、ヒト定常及び／又は可変領域ドメイン、二重特異性抗体、組換え抗体及び改変抗体、ならびにそのフラグメントを持つ。そのようなヒト化抗体は、結合領域が由来する非ヒト抗体の結合特異性を保持するが、しかし、非ヒト抗体に対する免疫反応を回避するよう設計される。
【００４３】
「キメラ」抗体は、（ａ）定常領域、又はその部分が変化、置換、又は交換されて、抗原結合部位（可変領域）が異なる又は変化したクラス、エフェクター機能及び／又は種の定常領域あるいはキメラ抗体に新たな特性を与える完全に異なる分子（例、酵素、毒素、ホルモン、増殖因子、薬物など）に連結される；あるいは（ｂ）可変領域、又はその部分が異なる又は変化した抗原特異性を有する可変領域と変化、置換、又は交換される抗体分子である。
【００４４】
特に、「ＴＹＲＯ３の細胞外ドメインに対する抗体」という用語は、ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの細胞外ドメインに結合し、その活性を遮断又は低下させることができる上記の抗体を指摘する。この阻害は、結合リガンドを妨げる立体障害又は改変に起因しうる。
【００４５】
好ましい実施態様において、ＴＹＲＯ３の細胞外ドメインに対する抗体は、抗Ｒｓｅ（Ｎ−１８）抗体（Santa-Cruz biotechnology）である。
【００４６】
本明細書において使用する「キナーゼデッドドメインを提示するドミナントネガティブ受容体」は、リガンドに結合できるが、しかし、シグナルの伝達が欠損している受容体である。結果的に、ドミナントネガティブ受容体の過剰発現は、シグナル伝達を遮断することにより受容体シグナルに影響を及ぼす。細胞表面でのそのようなドミナントネガティブ受容体の存在は、リガンドについての競合を誘導し、活性受容体のために利用可能なリガンドの量を減少させ、ひいてはこの受容体の活性化を妨げる。本発明において、ドミナントネガティブ受容体ＴＹＲＯ３は、ＴＹＲＯ３のリガンドに結合する機能的な細胞外ドメイン及び細胞内基質のリン酸化を介して細胞内にシグナルを伝達することができない非機能的なキナーゼドメインを提示する。
【００４７】
本明細書において使用する「ＴＹＲＯ３可溶性ベイト」という用語は、ＴＹＲＯ３リガンドに結合し、ひいてはそのリガンドについての競合により又は野生型の内因性受容体とのヘテロ二量体化によりＴＹＲＯ３受容体の活性の低下又は抑制を誘導することができる細胞外分子を指摘する。この可溶性ベイトは、ＴＹＲＯ３受容体のリガンド又は受容体の細胞外ドメインに結合する能力を有する任意のペプチドで構成されうる。
【００４８】
一実施態様において、ＴＹＲＯ３可溶性ベイトは、受容体の細胞外ドメイン、又はＴＹＲＯ３リガンド又はＴＹＲＯ３細胞外ドメイン（例、Ｉｇ様又はフィブロネクチンドメイン）に結合できるそのフラグメントで構成される組換えＴＹＲＯ３受容体である。好ましい実施態様において、ＴＹＲＯ３可溶性ベイトはＴＹＲＯ３受容体の全細胞外ドメインである。ＴＹＲＯ３の細胞外ドメイン（４２１ａａ）は、２つのＩｇ様ドメイン（ａａ１−２２０）及び２つのフィブロネクチンＩＩＩドメイン（ａａ２２０−４２１）で構成される。別の実施態様において、ＴＹＲＯ３可溶性ベイトは、１つ又は２つのＩｇ様ドメインあるいは１つ又は２つのフィブロネクチンＩＩＩドメインで構成される組換えＴＹＲＯ３受容体である。必要な場合、ＴＹＲＯ３受容体ドメインをＦｃフラグメントに共役させ、受容体を安定化してもよい。
【００４９】
特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３可溶性ベイトはＧａｓ６及び／又はプロテインＳに結合できる。
【００５０】
別の特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３可溶性ベイトはＧａｓ６及び／又はプロテインＳに対する、好ましくはＧａｓ６に対する抗体である。Ｇａｓ６及びプロテインＳは、ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ活性を活性化すると記載されている。例えば、Ｇａｓ６に対する抗体は、以下の抗体又はそのキメラ、ヒト化、もしくはヒト派生物の１つでありうる：モノクローナル抗体ＣＮＴＯ３００（Fisher et al., 2005）、遮断抗ヒトＧＡＳ６  ｓｃ１９３５（Gould et al., 2005）、中和ポリクローナルｇａｓ６抗体（Stenhoff et al.,2004）、及び他の市販の抗Ｇａｓ６抗体（Santa Cruz Biotechnology：カタログナンバー：ｓｃ−１９３５、ｓｃ−２２７５９、ｓｃ−７４０３５、ｓｃ−１９３６、ｓｃ−１６６６０；R&D Systems：カタログ参照：ＭＡＢ８８５及びAF885;Novus Biologicals：カタログ参照：Ｈ００００２６２１−Ｄ０１Ｐ、ＮＢＰ１−００８４３、Ｈ００００２６２１−Ａ０１、Ｈ００００２６２１−Ｂ０１；IBL-America（Immuno-Biological Laboratories）：カタログ参照ＢＷ０２５６３；Bioworld Technology：カタログナンバー：ＢＳ２５６３；Atlas Antibodies：カタログナンバー：ＨＰＡ００８２７５；Acris Antibodies GmbH：カタログナンバー：ＡＰ０１１７８ＰＵ−Ｎ；Abcam：カタログナンバー：ａｂ６７０９９；及びSigma Aldrich：カタログナンバー：ＨＰＡ００８２７５）。
【００５１】
本発明のＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤は、また、核酸分子でもよい。「核酸分子」という用語は、限定はされないが、ＲＮＡｉ、アンチセンス、及びリボザイム分子を含む。
【００５２】
本発明において、「ＴＹＲＯ３発現に特異的に干渉する核酸分子」は、ＴＹＲＯ３受容体をコードする遺伝子の発現を、特異的な方法で、低下又は抑制することができる核酸分子である。
【００５３】
「ＲＮＡｉ」又は「干渉ＲＮＡ」という用語は、標的タンパク質の発現を下方制御することが可能である任意のＲＮＡを意味する。それは、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、一本鎖ＲＮＡ（ｓｓＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、及びショートヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）分子を包含する。ＲＮＡ干渉は、それによりｄｓＲＮＡが標的遺伝子の発現を翻訳後レベルで特異的に抑制する現象を指す。正常な条件において、ＲＮＡ干渉は、数千塩基対の長さの二重鎖ＲＮＡ分子（ｄｓＲＮＡ）により開始される。インビボで、細胞中に導入されたｄｓＲＮＡは、ｓｉＲＮＡと呼ばれるショートｄｓＲＮＡ分子の混合物に切断される。切断を触媒する酵素であるＤｉｃｅｒは、ＲＮａｓｅ  ＩＩＩドメインを含むエンドＲＮａｓｅである（Bernstein, Caudy et al., 2001）。哺乳動物細胞において、Ｄｉｃｅｒにより産生されるｓｉＲＮＡは、２１〜２３bp長であり、１９又は２０ヌクレオチド二本鎖配列、２ヌクレオチド３’オーバーハング及び５’三リン酸末端を伴う（Zamore, Tuschl et al., 2000; Elbashir, Lendeckel et al., 2001; Elbashir, Martinez et al., 2001）。
【００５４】
多くの特許及び特許出願において、一般的な用語で、遺伝子発現を阻害するｓｉＲＮＡ分子の使用が記載されている。例えば、WO 99/32619、US 20040053876、US 20040102408、及びWO 2004/007718である。
【００５５】
ｓｉＲＮＡは、通常、翻訳開始コドンから５０〜１００ヌクレオチド下流の領域に対して設計されるのに対し、５’ＵＴＲ（非翻訳領域）及び３’ＵＴＲは通常回避される。選ばれたｓｉＲＮＡ標的配列を、ＥＳＴデータベースに対するＢＬＡＳＴサーチに供し、所望の遺伝子だけが標的化されることを確実にすべきである。種々の産物が市販されており、ｓｉＲＮＡの調製及び使用を助ける。
【００５６】
好ましい実施態様において、ＲＮＡｉ分子は、少なくとも約１５〜５０ヌクレオチド長、好ましくは約２０〜３０塩基ヌクレオチド、好ましくは約２０〜２５ヌクレオチド長のｓｉＲＮＡである。
【００５７】
特定の実施態様において、ｓｉＲＮＡ分子は配列番号１の配列を含む。
【００５８】
ＲＮＡｉは、天然ＲＮＡ、合成ＲＮＡ、又は組換え産生されたＲＮＡ、ならびに１つ又は複数のヌクレオチドの付加、欠失、置換、及び／又は変化により天然ＲＮＡとは異なる、変化したＲＮＡを含みうる。そのような変化は、例えば分子の末端にあるいはＲＮＡｉの１つ又は複数の内部ヌクレオチドなどへの非ヌクレオチド材料の付加を含むことができる（ＲＮＡｉをヌクレアーゼ消化に対して耐性にする改変を含む）。
【００５９】
ＲＮＡｉを、遊離（ネイキッド）形態で、あるいは、安定性及び／又は標的化を増強する送達系（例、リポソーム）の使用により投与してもよく、あるいは、他の賦形剤、例えばヒドロゲル、シクロデキストリン、生物分解性ナノカプセル、生物接着性ミクロスフェア、又はタンパク性ベクター（WO 00/53722）などに取り込ませてもよく、又は、陽イオンペプチドと組み合わせてもよい（US 2007275923）。それらは、また、それらの前駆体又はコードＤＮＡの形態で投与してもよい。
【００６０】
特定の実施態様において、ＲＮＡｉを小胞内、好ましくはリポソーム内にカプセル化する。
【００６１】
アンチセンス核酸を使用して、ＴＹＲＯ３受容体の発現を下方調節することもできる。アンチセンス核酸は、ＴＹＲＯ３受容体ポリペプチドをコードするセンス核酸の全て又は一部に相補的でありうる。例えば、二本鎖ｃＤＮＡ分子のコード鎖と相補的、又はｍＲＮＡ配列と相補的でありうる。それは、標的ｍＲＮＡの翻訳に干渉すると考えられる。
【００６２】
好ましい実施態様において、アンチセンス核酸は、ＴＹＲＯ３受容体ポリペプチドをコードする標的ｍＲＮＡに相補的なＲＮＡ分子である。
【００６３】
アンチセンス核酸は、例えば、約５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、又は５０ヌクレオチド長でありうる。特に、アンチセンスＲＮＡ分子は、通常、１８〜５０ヌクレオチド長である。
【００６４】
本発明の方法における使用のためのアンチセンス核酸を、当技術分野において公知の手順を使用した化学合成及び酵素ライゲーション反応を使用して構築できる。特に、アンチセンスＲＮＡを化学合成でき、直鎖テンプレート（例、ＰＣＲ産物）又は環状テンプレート（例、ウイルスベクター又は非ウイルスベクター）からインビトロ転写により産生でき、あるいはウイルスベクター又は非ウイルスベクターからインビボ転写により産生できる。
【００６５】
アンチセンス核酸を改変し、増強した安定性、ヌクレアーゼ耐性、標的特異性及び改善された薬理学的特性を有してもよい。例えば、アンチセンス核酸は、アンチセンス核酸とセンス核酸の間に形成される二本鎖の物理的安定性を増加させるように設計された改変ヌクレオチド（例、ホスホロチオネート誘導体及びアクリジン置換ヌクレオチド）を含みうる。
【００６６】
リボザイム分子を使用し、機能的ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼのレベルを減少させることもできる。リボザイムはリボヌクレアーゼ活性を伴う触媒的ＲＮＡ分子であり、それらは相補的領域を有する一本鎖核酸（例えばｍＲＮＡなど）を切断することが可能である。このように、リボザイムを使用して、ｍＲＮＡ転写物を触媒的に切断し、それによりｍＲＮＡによりコードされるタンパク質の翻訳を阻害できる。機能的ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼに特異的なリボザイム分子を、当技術分野で一般に公知である方法により設計、産生、及び投与できる（例、Fanning and Symonds, 2006を参照のこと。ハンマーヘッドリボザイム及びショートヘアピンＲＮＡの治療的使用を総説している）。
【００６７】
「癌」又は「腫瘍」という用語は、本明細書において使用する通り、癌の原因となる細胞に典型的な特徴、例えば無制御な増殖、不死化、転移能、及び特定の特徴的な形態特性などを保有する細胞の存在を指す。この用語は任意の型の悪性腫瘍（原発性又は転移性）を指す。
【００６８】
「ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌」という用語は、本明細書において使用する通り、ＴＹＲＯ３が上方調節されている任意の型の癌又は腫瘍を指す。ＴＹＲＯ３の発現レベルを、当業者に周知の種々の技術により癌サンプルから決定できる。ＴＹＲＯ３の発現レベルを、ＴＹＲＯ３タンパク質又はＴＹＲＯ３  ｍＲＮＡの量を測定することにより、あるいはＴＹＲＯ３活性を評価することにより決定できる。ＴＹＲＯ３発現を、定量的ＲＴ−ＰＣＲにより又は当業者に公知の任意の方法を使用してアッセイできる。腫瘍組織におけるＴＹＲＯ３発現を、正常な増殖細胞株、好ましくは腫瘍と同じ組織から提供される正常細胞における発現と比較すべきである。特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は、膀胱腫瘍、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、唾液腺の腺様嚢胞癌、バーキットリンパ腫、多発性骨髄腫、膵管腺癌、ヘアリー細胞白血病、転移性前立腺癌、メラノーマ、及び結腸直腸癌からなる群より選択される。好ましい実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は膀胱腫瘍である。
【００６９】
「膀胱腫瘍」により、本明細書において、尿路膀胱腫瘍、膀胱癌又は尿路膀胱癌、及び膀胱新生物又は尿路膀胱新生物を意図する。膀胱腫瘍は膀胱癌又は膀胱腺腫でありうる。膀胱腫瘍についての最も一般的な病期分類システムは、ＴＮＭ（腫瘍、結節、転移）システムである。この病期分類システムでは、腫瘍が膀胱中にどれくらい深く増殖するか、リンパ節における癌があるか否か、及び癌が体の任意の他の部分に広がっているか否かを考慮に入れる。好ましい実施態様において、膀胱腫瘍は膀胱癌である。好ましい実施態様において、処置される膀胱癌はＴ病期である。また、Ｔ病期の膀胱癌は以下のサブステージを有しうる：
ＣＩＳ  −  非常に初期の癌細胞が膀胱内膜の最内層だけで検出される；
Ｔａ  −  癌が膀胱内膜の最内層だけにある；
Ｔ１  −  癌が膀胱内膜下の結合組織中に増殖し始めている；
Ｔ２  −  癌が結合組織を通じて筋肉中に増殖している；
Ｔ２ａ  −  癌が表層筋中に増殖している；
Ｔ２ｂ  −  癌がより深い筋肉中に増殖している；
Ｔ３  −  癌が筋肉を通じて脂肪層中に増殖している；
Ｔ３ａ  −  脂肪層中の癌を顕微鏡下でだけ見ることができる；
Ｔ３ｂ  −  脂肪層中の癌を検査で見ることができる、又は医師が触れることができる；
Ｔ４  −  癌が膀胱外に広がっている；
Ｔ４ａ  −  癌が前立腺、子宮、又は腟に広がっている；
Ｔ４ｂ  −  癌が骨盤及び腹部の壁に広がっている。
【００７０】
したがって、本発明により処置できる膀胱腫瘍又は癌は、表在性（Ｔａ、Ｔ１）又は浸潤性（Ｔ２〜Ｔ４）でありうる。特定の実施態様において、本発明により処置できる膀胱癌は、任意の及び全てのＴサブステージがでありうる。
【００７１】
好ましい実施態様において、処置される被験者からのサンプル、特に膀胱腫瘍サンプルを、ＴＹＲＯ３の過剰発現についてアッセイする。したがって、ＴＹＲＯ３阻害剤を用いた処置は、ＴＹＲＯ３を過剰発現する腫瘍、特にＴＹＲＯ３を過剰発現する膀胱腫瘍を有する被験者に特に適切である。
【００７２】
本明細書において使用する疾患の「処置」という用語は、患者の寿命を延長させることを意図する任意の行為、例えば疾患の治療及び遅延などを指す。処置は、腫瘍を根絶させ、腫瘍の進行を止め、転移の発生を予防し、腫瘍の退縮を促進し、及び／又は癌の筋肉浸潤を予防するように設計できる。処置される患者は、任意の哺乳動物、好ましくはヒトである。
【００７３】
本発明の医薬的組成物を用いたＴＹＲＯ３を過剰発現する癌の処置は、他の治療、例えば外科手術、放射線治療、又は他の化学療法などに関連しうる。
【００７４】
「治療的有効量」とは、上で定義するＴＹＲＯ３を過剰発現する癌の処置を構成するために十分である患者に投与される、治療剤、ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤の量が意図される。
【００７５】
ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤を含む医薬的阻害剤を、当業者に公知である標準的な医薬的慣行に従い製剤化する（例、Remington: The Science and Practice of Pharmacy (20th ed.), ed. A. R. Gennaro, Lippincott Williams & Wilkins, 2000 and Encyclopedia of Pharmaceutical Technology, eds. J. Swarbrick and J. C. Boylan, 1988-1999, Marcel Dekker, New Yorkを参照のこと）。
【００７６】
可能な医薬的組成物は、経口、直腸、膀胱内、局所（経皮的、バッカル、及び舌下を含む）、又は非経口（皮下、筋肉内、静脈内、及び皮内を含む）投与に適するものを含む。これらの製剤のために、従来の賦形剤を、当業者に周知の技術に従って使用できる。
【００７７】
非経口投与のための組成物は、一般的に、生理学的に適合する無菌溶液、又は、場合により使用直前に固体又は凍結乾燥形態から調製できる懸濁剤である。アジュバント、例えば局所麻酔剤、保存剤、緩衝剤などを賦形剤中に溶解でき、界面活性剤又は湿潤剤を組成物中に含め、活性成分の均一分布を促進できる。
【００７８】
経口投与のために、組成物を、従来の経口投薬の形態、例えば錠剤、カプセル、粉末、果粒、及び液状調製物（例えばシロップ、エリキシル、及び濃縮点滴）などに製剤化できる。非毒性の固形担体又は希釈剤を使用してもよく、例えば、医薬グレードのマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、タルク、セルロース、グルコース、スクロース、マグネシウム、炭酸塩などを含む。圧縮錠剤のために、結合剤（粉末材料に粘着質を与える薬剤である）も必要である。例えば、デンプン、ゼラチン、糖（例えばラクトース又はデキストロースなど）、及び天然ガム又は合成ガムを結合剤として使用できる。崩壊剤も錠剤中に必要であり、錠剤の分解を促進させる。崩壊剤は、デンプン、粘土、セルロース、アルギン、ガム、及び架橋ポリマーを含む。さらに、潤滑剤及び流動促進剤も錠剤中に含まれ、製造プロセス中での錠剤材料の表面への付着を予防し、製造中での粉末材料の流動特徴を改善する。コロイド状二酸化ケイ素が、流動促進剤として最も一般的に使用される。化合物、例えばタルク又はステアリン酸が、滑沢剤として最も一般的に使用される。
【００７９】
経皮投与のために、組成物を、軟膏、クリーム、又はゲルの形態に製剤化でき、適切な浸透剤又は界面活性剤を使用し、浸透を促進させることができうる（例えばジメチルスルホキシド、ジメチルアセトアミド、及びジメチルホルムアミドなど）。
【００８０】
経粘膜投与のために、点鼻薬、直腸、又は膣坐剤を使用できる。活性化合物を、当技術分野において公知の方法により、公知の坐剤基剤のいずれかに取り入れることができる。そのような基剤の例は、カカオバター、ポリエチレングリコール（カーボワックス）、ポリオキシエチレンソルビタンモノステアレート、及び融点又は溶解速度を改変する他の適合材料を伴うこれらの混合物を含む。
【００８１】
本発明の医薬的組成物を、投与して実質的に直ぐに又は投与後の事前に決められた任意の時間又は期間に活性薬物を放出するように製剤化してもよい。
【００８２】
本発明の医薬的組成物は、医薬的に許容可能な賦形剤及び／又は担体に関連する１つ又は複数のＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ阻害剤を含むことができる。これらの賦形剤及び／又は担体は、上に記載する投与の形態に従って選ばれる。他の活性化合物は、また、ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ阻害剤、特に抗腫瘍薬物、例えばタモキシフェン、アロマターゼ阻害剤、トラスツズマブ、ＧｎＲＨアナログ、ゲムシタビン、ドセタキセル、パクリタキセル、マイトマイシン、シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ドセタキセル、シクロホスファミド、エピルビシン、フルオロウラシル、メトトレキセート、ミトキサントロン（mitozantrone）、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビノレルビン、ブレオマイシン、エストラムスチンリン酸、又はエトポシドリン酸などに関連しうる。特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ阻害剤は、膀胱癌の処置のために使用される他の分子（例、シスプラチン、アドリアマイシン、マイトマイシンＣ、ゲムシタビン、パクリタキセル、又はドセタキセル）に関連しうる。
【００８３】
特定の実施態様において、医薬的組成物は、チロシンキナーゼ活性を阻害する小分子、ＴＹＲＯ３の細胞外ドメインに対する抗体、ＴＹＲＯ３に特異的なＲＮＡｉ分子、特にｓｉＲＮＡ、キナーゼデッドドメインを提示するドミナントネガティブ受容体、Ｇａｓ６に対する抗体、及びＴＹＲＯ３可溶性受容体からなる群より選択されるＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの１つ又は複数の阻害剤を含む。
【００８４】
好ましい実施態様において、医薬的組成物は、ＴＹＲＯ３の細胞外ドメインに対する抗体、ＴＹＲＯ３に特異的なＲＮＡｉ分子、特にｓｉＲＮＡ、キナーゼデッドドメインを提示するドミナントネガティブ受容体、Ｇａｓ６に対する抗体、及びＴＹＲＯ３可溶性受容体からなる群より選択されるＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの１つ又は複数の阻害剤を含む。
【００８５】
投与されるＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤の量は、当業者に公知の標準的な手法により決定しなければならない。患者の生理学的データ（例、年齢、サイズ、及び体重）、投与経路、及び処置される疾患を、適切な投与量を決定するために考慮しなければならない。
【００８６】
ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤を、単一の用量又は複数の用量として投与してもよい。ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤がチロシンキナーゼ活性を阻害する小分子である場合、各単位用量は、例えば、２００〜１０００mg/kg体重、特に５００〜８００mg/kg体重を含みうる。ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤がＴＹＲＯ３の細胞外ドメインに対する抗体である場合、各単位用量は、例えば、０．１〜２０mg/kg体重、特に４〜１０mg/kg体重を含みうる。ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤がＴＹＲＯ３に特異的なＲＮＡｉ分子である場合、各単位用量は、例えば、２〜５０mg/kg体重、特に５〜２０mg/kg体重を含みうる。ＴＹＲＯ３チロシンキナーゼの阻害剤がキナーゼデッドドメインを提示するドミナントネガティブ受容体又はＴＹＲＯ３可溶性受容体である場合、各単位用量は、例えば、５〜１００mg/kg体重、特に１５〜７０mg/kg体重を含みうる。阻害剤がＧａｓ６又はプロテインＳに対する抗体である場合、各単位用量は、例えば、０．１〜２０mg/kg体重、特に４〜１０mg/kg体重を含みうる。
【００８７】
ＴＹＲＯ３阻害剤を、他の活性成分、特に、他のＴＹＲＯ３阻害剤と又は他の癌の処置と組み合わせて使用できる（例えばタモキシフェン、アロマターゼ阻害剤、トラスツズマブ、ＧｎＲＨアナログ、ゲムシタビン、ドセタキセル、パクリタキセル、マイトマイシン、シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ドセタキセル、シクロホスファミド、エピルビシン、フルオロウラシル、メトトレキセート、ミトキサントロン（mitozantrone）、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビノレルビン、ブレオマイシン、エストラムスチンリン酸、又はエトポシドリン酸など）。特に、ＴＹＲＯ３阻害剤は、膀胱癌の他の処置、例えばＢＣＧ処置（例、WO05/077411）又は抗癌薬物（例えば、シスプラチン、アドリアマイシン、マイトマイシンＣ、ゲムシタビン、パクリタキセル、又はドセタキセル）と組み合わせて使用できる。この場合において、ＴＹＲＯ３阻害剤及び他の分子を同時に又は連続的に投与できる。
【００８８】
本発明は、さらに、治療的有効量のＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ阻害剤を被験者に投与することを含む、被験者においてＴＹＲＯ３を過剰発現する癌を処置するための方法を提供する。特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は、膀胱腫瘍、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、唾液腺の腺様嚢胞癌、バーキットリンパ腫、多発性骨髄腫、膵管腺癌、ヘアリー細胞白血病、転移性前立腺癌、メラノーマ、及び結腸直腸癌からなる群より選択される。好ましい実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は膀胱腫瘍である。好ましくは、被験者はヒトである。
【００８９】
本発明は、また、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌の処置のための医薬の調製のためのＴＹＲＯ３チロシンキナーゼ阻害剤の使用に関する。
【００９０】
本発明は、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌を処置するために適した分子をスクリーニング又は同定するための方法を提供する。方法は、インビボ、エクスビボ、又はインビトロの方法、好ましくはインビトロの方法でありうる。
【００９１】
特定の実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は、膀胱腫瘍、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、唾液腺の腺様嚢胞癌、バーキットリンパ腫、多発性骨髄腫、膵管腺癌、ヘアリー細胞白血病、転移性前立腺癌、メラノーマ、及び結腸直腸癌からなる群より選択される。好ましい実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌は膀胱腫瘍である。
【００９２】
この方法は、ＴＹＲＯ３受容体に結合し、ＴＹＲＯ３受容体のリガンドと又はリガンドについて競合し、ＴＹＲＯ３遺伝子発現を減少させ、又はＴＹＲＯ３基質のリン酸化もしくはＴＹＲＯ３自己リン酸化を減少させる分子の能力の分析に基づく。
【００９３】
一実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌を処置するために適した分子をスクリーニング又は同定するための方法は、以下の工程を含む：（ｉ）候補分子をＴＹＲＯ３受容体と接触させること、ならびに（ｉｉ）ＴＹＲＯ３受容体に結合し、及び／又はＴＹＲＯ３受容体のリガンドと及び／又はリガンドについて競合し、及び／又はＴＹＲＯ３基質のリン酸化もしくはＴＹＲＯ３自己リン酸化を減少させる能力を有する分子を選択すること。方法は、ＴＹＲＯ３受容体に結合し、及び／又はＴＹＲＯ３受容体のリガンドと及び／又はリガンドについて競合し、及び／又はＴＹＲＯ３基質のリン酸化もしくはＴＹＲＯ３自己リン酸化を減少させる能力を決定する工程（ｉ’）を含みうる。
【００９４】
別の実施態様において、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌を処置するために適した分子をスクリーニング又は同定するための方法は、以下の工程を含む：（ｉ）候補分子をＴＹＲＯ３受容体を発現する細胞と接触させること、ならびに（ｉｉ）ＴＹＲＯ３受容体に結合し、及び／又はＴＹＲＯ３受容体のリガンドと及び／又はリガンドについて競合し、及び／又はＴＹＲＯ３遺伝子発現を減少させ、及び／又はＴＹＲＯ３基質のリン酸化もしくはＴＹＲＯ３自己リン酸化を減少させる能力を有する分子を選択すること。このスクリーニングのために使用される細胞は、高レベルの内因性ＴＹＲＯ３を発現する細胞、例えば大半の膀胱細胞株、特にＪ８２又はＲＴ１１２細胞株、あるいはＴＹＲＯ３を過剰発現する遺伝子改変細胞であり、チロシンキナーゼ活性の最適化された検出を可能にする。方法は、ＴＹＲＯ３受容体に結合し、及び／又はＴＹＲＯ３受容体のリガンドと及び／又はリガンドについて競合し、及び／又はＴＹＲＯ３基質のリン酸化もしくはＴＹＲＯ３自己リン酸化を減少させる能力を決定する工程（ｉ’）を含みうる。
【００９５】
ＴＹＲＯ３受容体への分子の結合は、周知の技術、例えば表面プラズモン共鳴、熱量測定、又はＢｉａｃｏｒｅ技術などにより測定できる。
【００９６】
ＴＹＲＯ３受容体のリガンドと又はリガンドについて競合する分子の能力は、例えば、標識リガンド、特に放射性標識リガンド、Ｂｉａｃｏｒｅ、又は分光学的観察を用いた競合実験により評価できる。
【００９７】
ＴＹＲＯ３遺伝子発現は、異なる周知の技術、例えば定量的ＲＴ−ＰＣＲ、ノーザンブロット、ＥＬＩＳＡ、又はウエスタンブロットなどを用いて評価できる。
【００９８】
ＴＹＲＯ３リン酸化レベルを、抗ホスホチロシン又は抗ホスホＴＹＲＯ３抗体を使用したウエスタンブロット、放射性ＦｌａｓｈＰｌａｔｅアッセイ、蛍光共鳴エネルギー移動（ＦＲＥＴ）アッセイ、又は解離増強ランタニド蛍光イムノアッセイ（ＤＥＬＦＩＡ）により評価できる。
【００９９】
上に記載するこの方法は、さらに、上で開示する本発明のインビトロの方法により以前に選択された分子を、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌の非ヒト動物モデル、特に膀胱腫瘍の非ヒト動物モデルにおいて投与すること、及び腫瘍進行に対する効果を分析することを含む続く工程を含みうる。分子の効率を、例えば、動物の寿命、転移の発生、腫瘍の進行、癌の筋肉浸潤の発生を分析することにより評価できる。全てのこれらの特徴を、処置を伴わない、ＴＹＲＯ３を過剰発現する癌の非ヒト動物モデル、例えば膀胱腫瘍の非ヒト動物モデルなどからなるコントロールのものと比較しなければならない。非ヒト動物モデルは、移植腫瘍を伴うヌードマウスでもよい。特定の実施態様において、移植腫瘍は膀胱腫瘍である。
【０１００】
以下の実施例は、例示の目的のために与えられ、限定のためではない。
【０１０１】
実施例
実施例１：膀胱腫瘍におけるＴＹＲＯ−３及びＧＡＳ６過剰発現
ＲＮＡレベルを、Affymetrix DNAマイクロアレイU95Aを使用し、８０の膀胱癌、５つの正常な膀胱尿路上皮において分析した。SAMソフトウェア（http://www-stat.stanford.edu/~tibs/SAM）を使用し、腫瘍サンプルと正常サンプルの間での差次的発現を示す遺伝子が同定された。パラメータ「偽発見率１０%」及び「少なくとも２のＳＡＭ倍変化」を伴うＳＡＭによって、正常尿路上皮と比較して腫瘍において有意により強く発現される８２３のプローブセット及び腫瘍においてあまり強く発現されない４７７のプローブセットが同定された。
【０１０２】
これらの上方制御された遺伝子の中で、ＴＹＲＯ−３キナーゼに焦点を合わせ、ＳＡＭを用いて得られた結果を、ＡＮＮＯＶＡ検定を使用して確認した（図１Ｂ）。各腫瘍サンプルにおけるＴＹＲＯ３  ＲＮＡのレベル（MAS 5 Affymetrix DNAチップデータ）を、次に、正常サンプルにおけるＴＹＲＯ３  ＲＮＡレベルの分布と比較し、差を、それが３つの標準偏差を超えた場合に有意と見なした（ｚスコア＞３，ｐ＜０．００１３）。ＴＹＲＯ３は５７／８０（７１%）の腫瘍において有意に発現された。この過剰発現は、腫瘍病期及び悪性度に非依存的であった（図１Ａ）。Affymetrixデータから得られたこれらの結果は、Ｑ−ＲＴ−ＰＣＲ分析により確認された（データ示さず）。
【０１０３】
興味深いことに、ＧＡＳ６（ＴＹＲＯ３の唯一の公知のリガンド）も、正常又は表在性腫瘍と比較し、浸潤腫瘍において有意に過剰発現された（正常サンプルと浸潤サンプル又は表在性腫瘍と浸潤腫瘍の間で差次的に発現された遺伝子のＳＡＭ分析、ＡＮＮＯＶＡ検定により確認）（図２Ａ）。
【０１０４】
相関は、ＴＹＲＯ３又はＧＡＳ６遺伝子座でのｍＲＮＡ発現レベルとＤＮＡコピー数の間で観察されず、ＴＹＲＯ３及びＧＡＳ６の過剰発現がＤＮＡ増幅に起因しないことを示唆した。ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションによって、ＴＹＲＯ３が上皮細胞により発現されるのに対し、ＧＡＳ６が上皮細胞及び間質細胞の両方により発現され、それ故に、ＧＡＳ６によるＴＹＲＯ３の可能なオートクライン又はパラクリン活性化、及び、それ故に、それらの癌におけるＴＹＲＯ３の役割の強化が示唆された（データ示さず）。ＴＹＲＯ３の突然変異は、種々のレベルのＴＹＲＯ３  ｍＲＮＡを発現する１５の膀胱腫瘍サンプルのサブセットにおいて見出されなかった。
【０１０５】
実施例２：膀胱腫瘍細胞におけるＴＹＲＯ３活性の阻害効果
膀胱癌におけるＴＹＲＯ３の役割を探索するために、第１工程は、ＴＹＲＯ３だけを発現する表在性腫瘍及びＴＹＲＯ３及びＧＡＳ６の両方を発現する浸潤腫瘍を模倣する膀胱癌由来細胞株を同定することであった。ＴＹＲＯ３及びＧＡＳ６  ｍＲＮＡの発現レベルを、従って、８つの膀胱癌由来細胞株（Ｔ２４、ＲＴ４、ＫＫ４７、ＴＣＣＳＵＰ、ＥＪ１３８、Ｊ８２、及びＲＴ１１２細胞株（ＡＴＣＣ）ならびにＭＧＨ−Ｕ３細胞株（Lin et al., 1985））及び１つの正常尿路上皮細胞株ＮＨＵ（ＡＴＣＣ）においてＱ−ＲＴ−ＰＣＲにより研究した（図３）。全ての試験された細胞株が、正常な細胞株と比較し、ＴＹＲＯ３をより強く発現し、ＴＹＲＯ３発現が癌依存的であり、細胞増殖に関連しないことを示唆する。
【０１０６】
細胞増殖及び腫瘍特性におけるＴＹＲＯ３の役割を研究するために、ＴＹＲＯ３発現を、ＲＮＡ干渉技術を使用して遮断し、又は、ＴＹＲＯ３活性を、ＴＹＲＯ３の細胞外ドメインに対する遮断抗体又は細菌中で産生されたＴＹＲＯ３の組換え細胞外ドメインからなる可溶性受容体を使用して阻害した。ＴＹＲＯ３を発現する２つの細胞株（ＭＧＨ−Ｕ３、ＫＫ４７）、ＴＹＲＯ３及びＧＡＳ６の両方を発現する２つの細胞株（Ｊ８２、ＲＴ１１２）、及び非常に低いＴＹＲＯ３発現レベルを提示する１つのコントロールの乳癌由来細胞株（ＭＣＦ−７）を使用した。ＴＹＲＯ３免疫沈降後での抗ホスホチロシン抗体を使用したウエスタンブロットにより、（ＧＡＳ６を発現している又はしていない）各型の細胞株において、ＴＹＲＯが活性化されることが示された（データ示さず）。
【０１０７】
ＴＹＲＯ３  ｓｉＲＮＡを用いたＭＧＨ−Ｕ３、ＫＫ４７、Ｊ８２、及びＲＴ１１２細胞のトランスフェクションによって、ＴＹＲＯ３  ｍＲＮＡレベル及びタンパク質レベルが顕著に減少した（８０〜９０%阻害）（ＭＧＨ−Ｕ３細胞株についての結果を図４に提示する）。このＴＹＲＯ３のノックダウンによって、コントロールｓｉＲＮＡよりも少ない生きたＭＧＨ−Ｕ３、ＫＫ４７、Ｊ８２、及びＲＴ１１２細胞がもたらされたのに対し（図５）、それはＭＣＦ７細胞に対しては効果を有さず、特定のｓｉＲＮＡを用いたトランスフェクションに続いて観察された効果が、オフターゲットの効果ではなく特異的な遺伝子サイレンシングに起因することを示唆した。細胞増殖に対する同じ効果が、また、その細胞外ドメインに対するポリクローナル抗体（図６）又はＴＹＲＯ３の細胞外ドメイン全体（ａａ  １〜４２１）からなる組換え可溶性受容体（図７）を使用したＴＹＲＯ３の遮断により得られた。
【０１０８】
この生細胞数の減少は、増加したアポトーシス速度（図８）と細胞周期進行における有意な、しかし、低い変化（図９）に起因しうる。ＴＹＲＯ３ノックダウンは、また、軟寒天アッセイにおいてより少ない生きたＭＧＨ−Ｕ３、ＫＫ４７、ＲＴ１１２、及びＪ８２コロニーをもたらし、ＴＹＲＯ３がクローン化可能癌細胞の細胞生存を調節することを実証した（図１０）。
【０１０９】
実施例３：膀胱癌細胞増殖におけるＴＹＲＯ３の役割に関するインビボ試験
それ故に、本発明者らの結果は、ＴＹＲＯ３がインビトロで膀胱癌の細胞生存／増殖を調節することを明らかに実証した。インビボでの膀胱癌細胞増殖におけるこの遺伝子の役割を試験した。Ｊ８２及びＭＧＨ−Ｕ３細胞を無胸腺ヌードマウスに皮下移植した。一旦腫瘍が確立されると、マウスをコントロール又はＴＹＲＯ３特異的ｓｉＲＮＡｓを用いた処置のために無作為に選択した。Ｊ８２異種移植のために、処置の開始から２週間後に、１２の内のわずか３つの腫瘍が依然として観察された（図１１Ａ及び１１Ｂ）。ＭＧＨ−Ｕ３異種移植のために、処置の２１日後、腫瘍容積が、コントロールｓｉＲＮＡを用いて処置されたマウスより、ＴＹＲＯ３  ｓｉＲＮＡを用いて処置されたマウスにおいて７０%低かった（ウィルコクソン順位和検定，ｐ＜０．００１）（図１２Ａ及び１２Ｂ）。
【０１１０】
この腫瘍増殖の阻害は、（最後のｓｉＲＮＡ注射から３日後に）１回測定されたＴＹＲＯ３  ｍＲＮＡレベルにおける有意な減少（スチューデントのｔ検定，ｐ＜０，００１）に関連し、ここでこの減少が最も低いものであるはずである（図１３）。組織学的差異は、処置された腫瘍とコントロール腫瘍の間で観察されなかった（データ示さず）。しかし、ＴＵＮＮＥＬ分析によって腫瘍増殖阻害が処置された腫瘍におけるアポトーシスの増加に起因することが実証された（データ示さず）。
【０１１１】
細菌において産生されたＴＹＲＯ３の組換え細胞外ドメインからなる可溶性受容体が膀胱癌細胞増殖阻害を誘導する能力も、インビボで検査した。ＭＧＨ−Ｕ３細胞を無胸腺ヌードマウスに皮下移植した。一旦腫瘍が確立されると、マウスをＰＢＳ又はＴＹＲＯ３可溶性受容体を用いた処置のために無作為に選択した。処置の１８日後、腫瘍容積が、ＰＢＳを用いて処置されたマウスより、ＴＹＲＯ３可溶性受容体を用いて処置されたマウスにおいて７０%低かった（ウィルコクソン順位和検定，ｐ＜０．００１）（図１４Ａ及び１４Ｂ）。この腫瘍増殖の阻害は、処置された腫瘍におけるアポトーシスの増加に起因した（図１５）。
【０１１２】
まとめると、本発明者らの結果によって、膀胱癌に関係する主要遺伝子としてＴＹＲＯ３が同定され、腫瘍の病期及び／又は悪性度に非依存的に大半の症例（腫瘍の７０〜７５%）において上方調節されており、腫瘍細胞の生存に関与する。さらに、これらの実験によって、ＴＹＲＯ３の阻害又は枯渇を誘導する化合物が、膀胱腫瘍細胞の増強されたアポトーシスを惹起し、そして、結果的に、膀胱腫瘍を処置するために使用できることが実証される。
【０１１３】
実施例４：いくつかの型の腫瘍におけるＴＹＲＯ３過剰発現
ＴＹＲＯ３過剰発現が膀胱腫瘍において同定され、ＴＹＲＯ３の抗アポトーシス的役割がこれに関連して実証されたため、本発明者らはＴＹＲＯ３が他の癌に関与し、結果的に、それらの腫瘍を処置するための治療標的として使用できないか否かを疑問に思った。Oncomineウェブサイトに収集された公的に利用可能なデータを使用し、ＴＹＲＯ３が、正常サンプルと比較し、腫瘍において上方調節された７つの型の癌を特定した：膀胱腫瘍、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、唾液腺の腺様嚢胞癌、バーキットリンパ腫、多発性骨髄腫、膵管腺癌、及びヘアリー細胞白血病（図１６Ａ及び１６Ｂ）。本発明者は、また、前立腺癌と比較し、ＴＹＲＯ３発現が腫瘍進行中、即ち、転移性の前立腺癌において増加した別の癌を特定した（データ示さず）。正常組織（図１７）及び腫瘍組織（図１８）の大スペクトルにおいてＴＹＲＯ３発現のプロットを得るためのGeneSapiensデータベースを使用し、ＴＹＲＯ３過剰発現が２つの他の癌型（メラノーマ及び結腸直腸癌）においても特定された。
【０１１４】
【表１】
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【図１Ａ】
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【図１Ｂ】
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【図２Ａ】
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【図２Ｂ】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
0005611953.tif 000014
【図１１Ａ】
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【図１１Ｂ】
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【図１２Ａ】
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【図１２Ｂ】
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【図１３】
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【図１４Ａ】
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【図１４Ｂ】
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【図１５】
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【図１６Ａ】
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【図１６Ｂ】
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【図１７】
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【図１８】
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【配列表】
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