(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
試料からの２つ以上の異なる波長または波長の範囲の光学放射を検出する検出器であって、２つ以上の異なる波長の放射は、該試料内の２つ以上の対象検体の存在、量または状態を示し、該検出器は、
該試料および互いに対して固定された２つ以上の励起チャネルであって、各励起チャネルは、規定の異なる励起波長または励起波長範囲の励起信号を、該試料に方向付けるように適合されており、
各励起チャネルは、
励起光を放射するように適合されている発光素子と、
励起光学軸を有する励起光学経路を画定する励起光学素子であって、該励起光学素子は、該規定の励起波長または励起波長範囲を有する、該発光素子によって放射された光の少なくとも一部分を該試料に向けて伝送するように構成および配置されている、励起光学素子と
を備えている、２つ以上の励起チャネルと、
該試料、該励起チャネルおよび互いに対して固定された２つ以上の放射チャネルであって、各放射チャネルは、該試料からの規定の異なる放射波長または放射波長範囲の放射信号を受容し、検出するように適合されており、
各放射チャネルは、
放射光学軸を有する放射光学経路を画定する放射光学素子であって、該放射光学素子は、該規定の放射波長または放射波長範囲を有する、該試料によって放射された任意の光の少なくとも一部分を伝送するように構成および配置されている、放射光学素子と、
該放射光学素子によって伝送された光を検出し、該検出された光を該検出された光の存在および強度のうちの少なくとも１つを示す電気信号に変換するように適合された光検出素子と
を備えている、２つ以上の放射チャネルと、
固体の非分割の光学レンズであって、該光学レンズは、（１）各励起チャネルによって伝送された励起光を規定の位置に方向付けることであって、各励起チャネルによって伝送された励起光は、他の励起チャネルによって伝送された励起光によって入射された該光学レンズの部分とは異なる該光学レンズの部分に入射する、ことと、（２）該試料の内容物によって放射された放射信号を受容し、該受容された放射信号の少なくとも一部分を該放射チャネルの各々に方向付けることとを行うように、該励起チャネルおよび該放射チャネルに対して構成および配置されている、光学レンズと、
信号識別回路と
を備え、
該信号識別回路は、
所定の励起周波数において、各励起チャネルの該励起信号を変量するように構成および配置された励起変調回路であって、該励起チャネルのうちの少なくとも２つの励起周波数は異なる、励起変調回路と、
実質的に該励起周波数において存在する該検出された光の部分を識別するように構成および配置された検出回路と
を備えている、検出器。
【請求項２】
前記励起光学素子は、前記規定の励起波長または励起波長範囲を有する、前記発光素子によって放射された前記光の少なくとも一部を、前記試料が処理されるコンテナに向けて伝送するように構成および配置され、前記放射光学素子は、該コンテナ内から該試料によって放射された前記規定の放射波長または放射波長範囲を有する任意の光の少なくとも一部を伝送するように構成および配置され、該検出器は、該コンテナまたは互いに対して前記励起チャネルまたは前記放射チャネルを動かすことなしに、該励起チャネルの各々を用いて該コンテナにおいて固有の励起波長または励起波長範囲を有する光を方向付けることと、該放射チャネルの各々の光検出素子を用いて、該コンテナから放射された固有の放射波長または放射波長範囲を有する光を検出することとを行うように適合されている、請求項１に記載の検出器。
【請求項３】
前記励起チャネルの励起光学軸および前記放射チャネルの放射光学軸は、それらの延長部を通って互いに平行である、請求項１または２に記載の検出器。
【請求項４】
前記光学レンズは、前記励起チャネルおよび前記放射チャネルの外側に位置し、前記検出器は、該励起チャネルおよび該放射チャネルの外側の該光学レンズ以外のレンズを含まない、請求項１に記載の検出器。
【請求項５】
前記発光素子が、発光ダイオードを含む、請求項１〜４のいずれかに記載の検出器。
【請求項６】
各励起チャネルの前記励起光学素子はレンズと励起フィルタとを含み、該励起フィルタは、前記規定の励起波長または励起波長範囲を有する光のみを伝達するように構成および配置されている、請求項１〜５のいずれかに記載の検出器。
【請求項７】
前記発光素子は光ダイオードを含む、請求項１〜６のいずれかに記載の検出器。
【請求項８】
各放射チャネルの前記放射光学素子は、レンズと放射フィルタとを含み、該放射フィルタは、前記規定の放射波長または放射波長範囲を有する光のみを伝達するように構成および配置されている、請求項１〜７のいずれかに記載の検出器。
【請求項９】
前記励起チャネルの前記発光素子および前記放射チャネルの前記光検出素子は、同一面上に据え付けられる、請求項１〜８のいずれかに記載の検出器。
【請求項１０】
２つの励起チャネルおよび２つの放射チャネルを備え、さらに筐体を備えており、該励起チャネルおよび該放射チャネルの各々は、該筐体内の異なる導管内に配置され、該励起チャネルおよび該放射チャネルの導管は、円形のパターンに配置され、各導管は、隣接する導管から等しい間隔で配置されている、請求項１〜９のいずれかに記載の検出器。
【請求項１１】
前記励起光学素子および前記放射光学素子は、光ファイバーを含まない、請求項１〜１０のいずれかに記載の検出器。
【請求項１２】
前記検出器は、前記試料または互いに対して前記励起チャネルまたは前記放射チャネルを動かすことなしに、該励起チャネルの各々を用いて該試料において固有の励起波長または励起波長範囲を有する光を方向付けることと、該放射チャネルの各々の光検出素子を用いて、該試料から放射された固有の放射波長または放射波長範囲を有する光を検出することとを行うように適合されている、請求項１〜１１のいずれかに記載の検出器。
【請求項１３】
前記検出器は、前記入射光の入射方向とは異なる方向において反射要素に入射する全ての光を再方向付けする反射要素を含まず、
該検出器は、該入射光の入射方向とは異なる方向において第１の光特性を有する分離要素に入射する光の一部を再方向付けし、第２の光特性を有する該分離要素に入射する光の一部を伝達する光特性分離要素を含まない、請求項１〜１２のいずれかに記載の検出器。
【請求項１４】
試料中の２つ以上の検体の存在、量または状態を示す光学信号を検出する方法であって、該方法は、
第１の励起経路に沿って第１の励起波長または励起波長範囲を有する第１の励起信号を生成し、該第１の励起信号の一部を伝達することと、
光学レンズの第１の部分を用いて該試料において該第１の励起信号を集束することと、
該光学レンズの第２の部分を用いて、第１の放射経路に、該試料によって放射された信号の一部を方向付け、該第１の放射経路に沿って、第１の放射波長または放射波長範囲を有する光を伝達し、該第１の放射波長または放射波長範囲を有する光を検出することと、
所定の第１の励起周波数において、該第１の励起信号を変調することと、
実質的に該第１の励起周波数に存在する該第１の放射波長または放射波長範囲において、該検出された光の一部を識別することと、
第２の励起経路に沿って第２の励起波長または励起波長範囲を有する第２の励起信号を生成し、該第２の励起信号の一部を伝達することと、
該光学レンズの第３の部分を用いて該試料において該第２の励起信号を集束することと、
該光学レンズの第４の部分を用いて、第２の放射経路に、該試料によって放射された信号の一部を方向付け、該第２の放射経路に沿って、第２の放射波長または放射波長範囲を有する光を伝達し、該第２の放射波長または放射波長範囲を有する光を検出することと、
該第１の励起周波数とは異なる所定の第２の励起周波数において、該第２の励起信号を変調することと、
実質的に該第２の励起周波数に存在する該第２の放射波長または放射波長範囲において、該検出された光の一部を識別することと
を包含し、
該光学レンズは、固体の非分割レンズを含む、方法。
【請求項１５】
前記第１の励起経路に沿って前記第１の励起信号を伝達すること、前記第２の励起経路に沿って前記第２の励起信号を伝達すること、前記第１の放射経路に沿って光を伝達すること、および（１）入射光の入射方向とは異なる方向において反射要素に入射する全ての光を再方向付けする反射要素または（２）該入射光の入射方向とは異なる方向において第１の光特性を有する分離要素に入射する光の一部を再方向付けし、第２の光特性を有する該分離要素に入射する光の一部を伝達する光特性分離要素を使用することなしに、該第１の放射経路に沿って光を伝達することを包含する、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記光学レンズは、前記第１の励起経路および前記第２の励起経路ならびに前記第１の放射経路および前記第２の放射経路の外側に位置し、前記集束および方向付けるステップは、該第１の励起経路および該第２の励起経路ならびに該第１の放射経路および該第２の放射経路の外側の単一のレンズ以外の任意の光学素子を用いることなしに達成される、請求項１４〜１５のいずれかに記載の方法。
【請求項１７】
前記第１の励起経路に沿って、前記第１の励起波長または励起波長範囲を有する前記第１の励起信号の一部を伝達することは、該第１の励起波長または励起波長範囲以外の該第１の励起信号の波長を除去するために、該第１の励起信号をフィルタリングすることを含み、
前記第１の放射経路に沿って、前記第１の放射波長または放射波長範囲を有する光を伝達することは、該第１の放射波長または放射波長範囲以外の該第１の放射信号の波長を除去するために、前記第１の放射経路に方向付けられた放射信号の一部をフィルタリングすることを含み、
前記第２の励起経路に沿って、前記第２の励起波長または励起波長範囲を有する前記第２の励起信号の一部を伝達することは、該第２の励起波長または励起波長範囲以外の該第２の励起信号の波長を除去するために、該第２の励起信号をフィルタリングすることを含み、
前記第２の放射経路に沿って、前記第２の放射波長または放射波長範囲を有する光を伝達することは、該第１の放射波長または放射波長範囲以外の第２の放射信号の波長を除去するために、前記第２の放射経路に方向付けられた放射信号の一部をフィルタリングすることを含む、請求項１４〜１６のいずれかに記載の方法。
【請求項１８】
前記第１の波長を有する前記第１の励起信号の一部を伝達すること、前記第２の励起波長を有する前記第２の励起信号の一部を伝達すること、前記第１の放射経路に沿って前記第１の放射波長を有する光を伝達すること、および前記第２の経路に沿って前記第２の放射波長を有する光を伝達することは、光ファイバーに沿って光を伝達することを含まない、請求項１４〜１７のいずれかに記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
（優先権主張／関連出願の相互参照）
本願は、米国仮特許出願第６０／９４５，５２０号（２００７年６月２１日出願）の米国特許法第１１９条第（ｅ）項の利益を主張し、この出願の開示はその全体が本明細書に参考として援用される。
【０００２】
（発明の分野）
本発明は、多室型容器および関連する機器、ならびに複雑な処理を実行する際に使用する検出装置に関する。
【背景技術】
【０００３】
本明細書で参照されているすべての文書、または指示されている部分は、参照により本明細書に組み込まれる。ただし、いかなる文書も、請求項に記載の発明対象に対する先行技術であるとは認められない。
【０００４】
複数の処理ステップが同時に、また互いに独立に実行されることを必要とする複雑な検定を実行するための高度に精巧な機器が開発されている。このような機器は、化学分析、免疫検定、分子ベースの検査、および同様の分析を実行するために使用できる。このような機器のうちの最先端のものは、ウォークアウェイ試験を可能にする試料抽出から結果取得までの核酸増幅検査（「ＮＡＡＴ」）を実行することができる。非特許文献１および非特許文献２を参照されたい。完全自動化されたＮＡＡＴ試験は、汚染またはユーザーエラーが入り込む可能性を低くするものであり、ＮＡＡＴ検査などのより複雑な検定を実施する訓練を受けている医療技術者が国内に不足しているため、次第に重要になってきている。完全自動化した機器によって人の介入を最小限に抑えつつ、検定の必要なすべてのステップを実行する。ＮＡＡＴ検定では、これらのステップは、注目する１つまたは複数の核酸を抽出し、潜在的に干渉する材料から核酸を分離するために生試料を処理すること、ポリメラーゼベースの伸長反応などの増幅反応を実行して検定の感度を高めること（例えば、ＴＭＡ、ＳＤＡ、またはＰＣＲ）、および注目する核酸を検出することを含む。しかし、一般に、ＮＡＡＴ検定を実行するために使用される機器は、持ち運びしにくく、その有用性は、典型的には、制御された環境下における大規模試験に限定される。そこで、現在、現場試験または臨床用途などのポイントオブユース試験において、試料抽出から結果取得までのＮＡＡＴ検定を実行できるコンパクトなシステムが必要とされている。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００５】
【非特許文献１】Ｆｒｉｅｄｅｎｂｅｒｇ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｄｅｖｅｌｏｐｉｎｇ  ａ  Ｆｕｌｌｙ  Ａｕｔｏｍａｔｅｄ  Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ  ｆｏｒ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃ  Ａｓｓａｙｓ”，ＩＶＤ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ（２００５）１１（６）：４７−５３
【非特許文献２】Ｈｉｌｌ，“Ａｕｔｏｍａｔｉｎｇ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  Ｔｅｓｔｓ”，ＩＶＤ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ（２０００）６（７）：３６−４５
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
本発明は、コンパクトな機器、検出器、および関連する容器、ならびに従来の大規模計装システムに対して大幅なコスト削減となる形でポイントオブユース試験を可能にする、試料抽出から結果取得までのＮＡＡＴ検定などの複雑な検査手順を実行するための処理を実現する。容器は、検定を実行するために必要な試薬すべてを収める単位用量形態でプリパッケージされうる相互接続された室を備える。容器は、汚染の発生機会を最小限に抑える閉鎖系である。
【課題を解決するための手段】
【０００７】
第１の実施形態では、複数の処理ステップまたは処理を独立に、および／または同時に実行することを可能にする多室型容器が形成される。一実施形態では、容器は、（ｉ）第１の開放可能な接続部によって接続される第１および第２の室であって、第１および第２の室ならびに第１の開放可能な接続部は、物質を移動する力が第１の室の内容物に付与され、第１の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態へ変更されたときに第１の室から第２の室への物質移動が可能になるように構成されている、第１および第２の室と、第２の開放可能な接続部によって接続される第３および第４の室であって、第３および第４の室ならびに第２の開放可能な接続部は、物質を移動する力が第３の室の内容物に付与され、第２の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態へ変更されたときに第３の室から第４の室への物質移動が可能になるように構成されている、第３および第４の室と、第２の室と第４の室との間の中間の室とを備える複数の開放可能な接続部によって相互接続される室の第１の直線経路と、（ｉｉ）試料を試料収容室に収容するための試料吸入口とを備えるが、ただし、試料収容室が第１の直線経路の室である場合に試料収容室は第２の室と第４の室との間にあることを前提条件とする。試料吸入口は、例えば、ルアー接続で閉じることができる。中間の室は、第３の開放可能な接続部によって第２の室に直接的に、または間接的に接続され、第２の室、中間の室、および第３の開放可能な接続部は、物質を移動する力が第２の室の内容物に付与され、第３の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態へ変更されたときに、第２の室から中間の室に、または中間の室の方へ物質移動が可能になるように構成される。中間の室は、さらに、第４の開放可能な接続部によって第４の室に直接的に、または間接的に接続され、第４の室、中間の室、および第４の開放可能な接続部は、物質を移動する力が第４の室の内容物に付与され、第４の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態へ変更されたときに、第４の室から中間の室に、または中間の室の方へ物質移動が可能になるように構成される。室の第１の直線経路は、物質を移動する力が第１の室の内容物に付与された場合に、第３の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態に変更されないように構成される。室の第１の直線経路は、さらに、物質を移動する力が第３の室の内容物に付与された場合に、第４の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態に変更されないように構成される。第２および第４の室は、中間の室を含まない室の配列構成によって相互接続されることはない。好ましい一態様では、複数の相互接続された室はそれぞれ、容器の少なくとも１つの他の室に隣接する（分離している室だけを封止する）。それに加えて、容器の室は、放射状配列構成をとることができ、末端室（つまり、室の直線経路の一番外側の室）は、非円形配列構成をとる。
【０００８】
一態様では、容器は、室の第２および第３の直線経路を備え、第２および第３の直線経路のそれぞれの直線経路の室は、複数の開放可能な接続部によって相互接続され、第５の開放可能な接続部によって第１の処理室に接続された第６の室を備え、第１の処理室は、第１の室と第３の室との間に配置されている第１の直線経路の任意の室であり、第６の処理室、第１の処理室、および第５の開放可能な接続部は、物質を移動する力が第６の室の内容物に付与され、第５の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態に変更されたときに、第６の室から第１の処理室への物質異動が可能になるように構成されている。この態様の第２の直線経路は、第１の室を含むが、第１の直線経路の第３の室を含まず、第３の直線経路は、第３の室を含むが、第１の直線経路の第１の室を含まない。中間の室は、第１の処理室または試料収容室とすることができる。その代わりに、第６の室は、試料収容室とすることもできる。
【０００９】
他の態様では、容器は、第６の開放可能な接続部によって第６の室に接続された第７の室を備え、第６の室、第７の室、および第６の開放可能な接続部は、物質を移動する力が第７の室の内容物に付与され、第６の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態へ変更されたときに、第７の室から第６の室に物質移動が可能になるように構成される。この態様では、第６の室は、試料収容室とすることもできる。
【００１０】
第２および第３の直線経路の１つまたは複数の室は、試料中の分析対象を固定化するための固相担体を収納できる。固相担体は、注目する分析対象を固定化することができる自然または修飾形態の任意の材料としてもよい。好ましい固相担体は、印加磁場によって操作されうる磁気応答性粒子またはビーズである。固相担体は、例えば、第６、第７、および第１の処理室のいずれかに供給できる。室内の固相担体を濃縮する（つまり、室へ供給される固相担体材料の総量を増やさずに室の一領域内の固相担体材料の密度を高める）ために、固相担体を室の他の成分と反応しない（つまり、不活性の）非混和性液とともに室に供給することができる。非混和性液は、油、好ましくは鉱物油とすることができる。
【００１１】
さらに他の態様では、容器は、複数の開放可能な接続部によって相互接続された室の第４の直線経路を備え、第７の開放可能な接続部によって第２および第３の直線経路のうちの少なくとも１つの第２の処理室に接続された第８の室であって、第８の室、第２の処理室、および第７の開放可能な接続部は、物質を移動する力が第８の室の内容物に付与され、第７の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態へ変更されたときに、第８の室から第２の処理室に物質移動が可能になるように構成されている、第８の室と、第８の開放可能な接続部によって第２の処理室に接続された第９の室であって、第９の室、第２の処理室、および第８の開放可能な接続部は、物質を移動する力が第２の処理室の内容物に付与され、第８の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態へ変更されたときに、第２の処理室から第９の室に物質移動が可能になるように構成され、第４の直線経路は、第２の処理室以外の第２または第３の直線経路の室を含まない、第９の室とを備える。第２の処理室は、試料収容室に隣接するか、または試料収容室であるものとしてもよい。試料中の１つまたは複数の分析対象を精製するために、第８の室には、試料から不要な材料を取り除くための洗浄溶液を収納し、第９の室は、使用済み洗浄溶液用の廃液室として機能することができるように実質的に空にしておくとよい。
【００１２】
他の態様では、容器は、第９の開放可能な接続部によって中間の室に接続された第１０の室を備え、第１０の室、中間の室、および第９の開放可能な接続部は、物質を移動する力が第１０の室の内容物に付与され、第９の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態へ変更されたときに、第１０の室から中間の室に物質移動が可能になるように構成される。この態様の第１の直線経路は、第１０の室を含まない。
【００１３】
室に柔軟な部分を持たせ適度の外力（つまり、室を定める部材を破裂させたり、あるいは容器を他の何らかの形で破損して、意図されている目的にかなった動作をさせなくしたりすることのない力）が加わったときにたわむようにすることで、室と室との間の物質移動をしやすくできる。したがって、容器は、上部および底部の、または対向する部材を備え、それらの部材の少なくとも１つは軟質シートとすることができる。軟質シートは、許容可能な光、水、および／または酸素透過特性を呈示する複数の層（所望の結合特性を有するように選択された１つまたは複数のプラスチック層を含む）を有するものとすることができる。対向する部材のそれぞれは、軟質シートから形成できる。これらの軟質シートの少なくとも１つは、箔層を含むことができる。
【００１４】
結合される材料の種類に応じて、相互接続された室の境界は、接着剤またはヒートシール、超音波溶接、または高周波（「ＲＦ」）溶接を含む、任意の封止手段によって定められうる。容器の部材の１つが、露出プラスチック層を有する軟質シートである場合、相互接続された室の境界を定めるためにヒートシールが使用されうる。それぞれの開放可能な接続部は、閉鎖状態のときに室と室との間の物質移動を防ぐために、接続部に施されるシール、弁、または外力（例えば、アクチュエータ）を含む、１つの障壁または障壁の組み合わせにより遮断できる。シールは、破裂性シール（例えば、山形またはＶ字型シールなどの剥離可能なヒートシール）とすることができる。室と室を定めるシールとの間の接続部を遮断するシールは、好ましくは、力を開放可能な接続部に付与して閉鎖状態から開放状態に変えるときに室を定めるシールが剥離または破裂に抵抗するように異なる条件の下で形成される。この点で、室を定めるシールは、「永久シール」と称される。
【００１５】
容器の開放可能な接続部のうちの少なくとも１つは、物質を移動する力が隣接する室に付与されることによって閉鎖状態から開放状態に変えられるように構成されうる。物質を移動する力は、例えば、内部圧縮機、真空、または隣接する室の柔軟な、少なくとも部分的に圧縮可能な部分を圧接するローラーもしくはアクチュエータの形をとるものとすることができる。外部アクチュエータの例として、室またはその柔軟な部分の形状に概ね適合するような形状にされた圧縮パッドを有する空気圧式アクチュエータまたはアクチュエータのグループが挙げられる。その代わりに、物質を移動する力は、手動のデジタルな力とすることもできる。
【００１６】
大きな試料を処理するために、試料収容室の容積容量は、末端室とは別の試料収容室に直接接続された室の容積容量より大きいものとすることができる。試料の一部を順次処理することにより、望ましくない試料および処理材料を取り除いて、廃棄物室に、またはすでに処理材料が取り除かれている室に移すことができ、また試料中の分析対象を、分析のために取り扱いやすい大きさにまで濃縮することができる。分析対象を濃縮できることにより、容器の必要寸法が制限され、このことは、容器が大きければ試料を処理するのに必要な機器の大きさも大きく、重いものとなるため、特に、現場用途にとって有利である。分析対象の濃縮は、柔軟な部材を有する容器、および一定分量の試料を漸増しつつ移動して処理できる連携アクチュエータアレイを使用して実行できる。
【００１７】
検出構成要素を有する処理では、これらの室のうちの少なくとも１つは、試料の特性を検出することを可能にするように構成されうる。検出されるのは、例えば、分析対象の存在、化学反応、または試料もしくは試料成分の特性の変化とすることができる。一態様では、検出は、試料の特性を示す信号の存在もしくは量を測定することを含みうる。このような信号の例としては、光（例えば、ルミネッセンス発光または蛍光発光）、濁度、放射能、および電流が挙げられる。光検出の場合、検出室の少なくとも一部は、光透過材料（例えば、透明または半透明の材料）で形成される必要がある。
【００１８】
試料または試料の成分を調製するか、試料または試料の成分を修飾するか、試料または試料の成分と反応するか、または他の何らかの形で試料または試料の成分に影響を及ぼす際に使用する処理材料を容器の任意の室に供給できる。処理材料は、第１および第２の室のうちの少なくとも１つに供給されうる。同じ、または異なる処理材料を第１および第２の室に供給することができ、例えば、乾燥された試薬（例えば、凍結乾燥された、またはタブレット状にされた試薬）を第２の室に供給し、乾燥された試薬を再構成するために再構成試薬を第１の室に供給することができる。処理材料のこの特定の組み合わせでは、非混和性液（例えば、鉱物油などの油）を乾燥された試薬の再構成を促進するために十分な量だけ第１の室にさらに入れることが望ましい場合がある。（再構成試薬および非混和性液は、第２の室から一緒に供給されるか、または異なる室から第１の室に供給されうる。）この態様では、非混和性液と再構成試薬との比は、好ましくは、約１：１０から約１０：１、より好ましくは約１：３から約１０：１までである。非混和性液は、乾燥された試薬または再構成試薬との反応性を有しているべきでない。同様に、第３および第４の室には、再構成試薬および乾燥された試薬をそれぞれ供給することができ、乾燥された試薬の再構成形態を１つにまとめて複合効果を得ることができる。例えば、第２および第４の室の乾燥された試薬は、それぞれ、核酸増幅反応に必要な成分を有する増幅試薬および酵素試薬とすることができる。また非混和性液を第３の室の再構成試薬と組み合わせることで、第４の室に収納されている乾燥された試薬の再構成を促進することもできる。
【００１９】
第２および第４の室内に存在する乾燥された試薬の１つは、核酸増幅反応の産物とのプローブ：標的複合体を形成するためのプローブなどの、結合剤を含むことができる。プローブは、核酸増幅反応の増幅産物に特異的にハイブリダイズする（つまり、試料中の非標的核酸には検出可能な形でハイブリダイズしない）オリゴヌクレオチド成分を有するものとすることができる。検出については、プローブは、蛍光発光部分、ルミネッセンス発光部分、または放射能を持つ部分などの標識に関連するものとしてもよい。その代わりに、反応に、インターカレーティング式（例えば、臭化エチジウムまたはＳＹＢＲ（登録商標）Ｇｒｅｅｎ）などのプローブ：標的複合体の形成を認識する標識を含めるか、またはプローブ：標的複合体の形成に関連する電気信号または質量変化を検出することなどによって、標識の助けを借りずに検出を行うことができる。核酸増幅反応でリアルタイム検出を行えるようにするために、プローブは、ハイブリダイズされていない状態のときよりもハイブリダイズされている状態のときに異なる、検出可能な立体配座をとることができる。このようなプローブは、プローブが増幅産物と複合体を形成するときに検出可能な信号変化が生じる相互作用する標識を含むことができる。
【００２０】
乾燥された試薬を備える室では、それらの室を構成するために使用される材料の全部または一部は、容器の少なくとも１つの他の室、特に、液体を収納している直接接続された室を構成するために使用される材料に比べて大きな水蒸気透過速度（「ＷＶＴＲ」）を呈示しうる。例えば、直接接続された室は、１つまたは複数の軟質プラスチック層で形成され、液体収納室は、さらに、直接接続された室のそれぞれを形成するために使用されるプラスチック層に比べて低い水蒸気透過速度を有する１つまたは複数の箔層を備えることができる。一態様では、乾燥された試薬を収納している室の少なくとも一部は、室の内容物が光学センサー（例えば、蛍光光度計または照度計）によって調べられるように光透過材料で構成される。
【００２１】
乾燥された試薬を収納している室の中の水分レベルをさらに制御するために、容器を、使用するようになるまで封止された容器内に保管しておくとよい。封止された容器には、容器から水分を抜き取り、乾燥された試薬の安定性を最大にするための乾燥剤を入れることができる。
【００２２】
この実施形態の容器は、本明細書で説明されている他の実施形態のどれかで使用できるか、または使用するように適合されうる。
【００２３】
他の実施形態では、複数の相互接続された室を有する容器内にある試料を処理する第１の方法が提供され、この方法は、試料を容器の第１の室に供給するステップと、容器の別々の室内で（ｉ）容器の第１の室の中に収納されている試料の少なくとも一部および容器の第２の室の中に収納されている試料処理試薬の少なくとも一部と、（ｉｉ）第３の室の中に収納されている物質の少なくとも一部および第４の室の中に収納されている物質の少なくとも一部と、（ｉｉｉ）第５の室の中に収納されている物質の少なくとも一部および第６の室の中に収納されている物質の少なくとも一部と独立に組み合わせるステップと、部分ステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）を実行した後に、容器の室の中で、試料の成分と部分ステップ（ｉｉ）および（ｉｉｉ）の結果として得られる組み合わせのそれぞれの少なくとも一部と組み合わせるステップとを含む。好ましい一態様では、複数の相互接続された室はそれぞれ、容器の少なくとも１つの他の室に隣接する（分離している室だけを封止する）。それに加えて、容器の室は、放射状配列構成をとることができ、容器の末端室（つまり、室の直線経路の一番外側の室）は、非円形配列構成をとる。
【００２４】
一態様では、第１および第２の室は、互いに直接接続され、第３および第４の室は、互いに直接接続され、第５および第６の室は、直接互いに接続される。他の態様では、この方法は、さらに、部分ステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）のうちの少なくとも１つの結果として得られる組み合わせを、容器内の一対の直接接続された室の間でこの組み合わせを交互に移動することにより混合するステップを含む。さらに他の態様では、第１の室は、第４の室と第６の室との間の中間にあり、容器は、試料を第１の室の中に収容するための試料吸入口を備える。さらに他の態様では、部分ステップ（ｉ）の結果として得られる組み合わせは、第１の室と第４の室および第６の室のうちの少なくとも１つとの間の中間にある第７の室に移動され、その後に、試料の成分を部分ステップ（ｉｉ）および（ｉｉｉ）の結果として得られる組み合わせのそれぞれの少なくとも一部と組み合わせる。他の態様では、第４の室と第６の室は、それぞれ、第１の室に直接接続されるが、互いに直接接続されることはない。さらに他の態様では、試料のどの成分も、第３または第４の室に移動されないし、あるいはその代わりにこの方法を実行するときに第５または第６の室に移動されることもない。試料処理室は、第１の室であるか、または第１の室に直接接続されてもよい。
【００２５】
試料中に存在する分析対象を固定化するために、固相担体が試料処理試薬に含まれていてもよい。固相担体上に固定化され、試料処理室内に収納されている間に、試料の１つまたは複数の非分析対象成分を取り除いて、試料処理室に直接接続されている第８の室とすることもできる容器の廃棄物室に移すことができる。非分析対象成分を除去するときに磁力に曝される磁気応答性粒子またはビーズなどの、好ましい固相担体が液状媒質中に分散可能である。
【００２６】
他の態様では、この方法は、さらに、洗浄溶液を試料処理室に供給するステップと、試料処理室内の固相担体と洗浄溶液とを混合するステップと、分析対象が試料処理室の中の固相担体によって固定化されたままである間に試料処理室から洗浄溶液を取り出して第８の室に移すステップとを含む。洗浄溶液は、試料処理室に直接接続されている第９の室から供給される非反応性の緩衝溶液とすることができる。それに加えて、洗浄溶液が容器内の所望の反応を阻害することが知られている１つまたは複数の成分を含むとき（例えば、核酸増幅反応を阻害する洗浄剤）など、試料処理室の中の残留洗浄溶液を除去するために必要であるか、または有用であるときに、試料処理室に直接接続されている第１０の室からすすぎ溶液を供給することができる。
【００２７】
乾燥された試薬は、部分ステップ（ｉｉ）および（ｉｉｉ）のうちの少なくとも一方で再構成されうるが、ただし、これら２つの部分ステップの室のうちの少なくとも１つに、対応する乾燥された試薬を再構成するために調製された溶液を入れる。乾燥された試薬は、例えば、凍結乾燥された、またはタブレット状にされた形態のものとすることができる。
【００２８】
さらに他の態様では、この実施形態の方法は、さらに、試料の成分と部分ステップ（ｉｉ）および（ｉｉｉ）の結果として得られる組み合わせの少なくとも一部とを組み合わせた後に、容器の検出室の内容物の特性を検出するステップを含む。検出するステップは、試料の成分の存在もしくは量を示す信号の存在または量を測定することを含みうる。検出室の少なくとも一部は、光透過材料で構成することができ、このため、検出室の内容物を検出室に隣接する位置に配置されるか、またはその位置に移動された光センサーによって調べることが可能である。検出室は、第３の室、第４の室、第５の室、または第６の室とすることができる。
【００２９】
検出室内で検出されるものは、増幅反応の産物であるものとしてよい。増幅反応は、核酸増幅反応（例えば、標的もしくは信号増幅）とすることができる。このような用途のために、部分ステップ（ｉｉ）において、乾燥された酵素試薬を再構成することができる。乾燥された酵素試薬を部分ステップ（ｉｉ）において再構成することに加えて、乾燥された増幅試薬を部分ステップ（ｉｉｉ）において再構成することができる。増幅試薬および酵素試薬のうちの少なくとも一方は、核酸増幅反応の産物との検出可能なプローブ：標的複合体を形成することができるプローブ（例えば、ハイブリダイジングプローブ）を含むことができる。プローブは、検出を補助するための１つまたは複数の標識を含むことができる。核酸増幅反応の産物は、増幅反応の終結時に、またはリアルタイムで、例えば、反応産物にハイブリダイズされるときに異なる形で検出可能な立体配座をとるプローブを使用して、検出されうる。
【００３０】
この実施形態の容器は、圧縮力が加わるとたわむ柔軟な部分を備えることができ、これにより、室と室の間の物質移動が容易になる。容器は、対向する部材を備え、それらの部材の少なくとも１つは軟質シートを含むことができる。室、および関連する相互接続部は、結合される材料に応じて、上述のように、接着剤またはヒートシール、超音波溶接またはＲＦ溶接を含む、任意の封止手段によって形成できる、対向する部材の間の封止係合によって定められうる。対向する部材のそれぞれは、軟質シートを含むことができる。軟質シートは、許容可能な光、水、および／または酸素透過特性を呈示する複数の層（所望の結合特性を有するように選択された１つまたは複数のプラスチック層を含む）を有するものとすることができる。これらの軟質シートの少なくとも１つは、箔層を含むことができる。
【００３１】
容器の室は、複数の開放可能な接続部によって接続することができ、それぞれの開放可能な接続部は、物質を移動する力が直接接続された室のうちの少なくとも１つの室の内容物に付与され、開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態に変更されたときに直接接続された室の間の物質移動が可能になるように構成されている。閉鎖状態にある接続部は、接続部に施されるシール、弁、または外力（例えば、アクチュエータ）を含む、１つの閉塞物または閉塞物の組み合わせにより遮断できる。シールは、破裂性シール（例えば、山形またはＶ字型シールなどの剥離可能なヒートシール）とすることができる。
【００３２】
さらに他の態様では、この実施形態の方法は、さらに、物質を移動する力を複数の室のそれぞれに付与するステップを含み、物質を移動する力は、１つまたは複数のアクチュエータを含み、複数の室のそれぞれは、複数の室の間の物質移動の際にアクチュエータと連携するように適合されている。アクチュエータは、室の柔軟な部分の形状に概ね適合する圧縮パッドを備えることができる。１つまたは複数のアクチュエータは、空気圧式アクチュエータとすることができる。その代わりに、物質を移動する力は、外部ローラーによる力または容器内で付与される正もしくは負の力を含みうる。
【００３３】
さらに他の実施形態では、複数の相互接続された室を有する容器内にある試料を処理するための第２の方法が提供され、この方法は、試料を容器の第１の室に供給するステップと、容器の別々の室内で（ｉ）容器の第１の室の中に収納されている試料の少なくとも一部および容器の第２の室の中に収納されている試料処理試薬の少なくとも一部と、（ｉｉ）第３の室の中に収納されている物質の少なくとも一部および第４の室の中に収納されている物質の少なくとも一部とを独立に組み合わせるステップと、部分ステップ（ｉ）および（ｉｉ）を実行した後に、容器の室の中で、試料の成分と部分ステップ（ｉｉ）の結果として得られる組み合わせの少なくとも一部および第５の室の中に収納されている１つの物質または複数の物質の組み合わせの少なくとも一部と組み合わせるステップとを含むが、ただし、試料のどの成分も、第５の室が第４の室に直接接続されている場合にこの方法の実行時に第３および第５の室のうちの少なくとも一方に移動されないことを条件とし、また試料のどの成分も、第５の室が第３および第４の室のいずれかに直接接続されていない場合にこの方法の実行時に第３および第５の室のうちの少なくとも一方に移動されないことを条件とし、さらに試料のどの成分も、第５の室が第３の室に直接接続されているが、第４の室には直接接続されていない場合にこの方法の実行時に第５の室に移動されないことを条件とする。容器の室は、放射状配列構成をとることができ、容器の末端室は、非円形配列構成をとる。
【００３４】
一態様では、第１および第２の室は、互いに直接接続され、第３および第４の室は、互いに直接接続される。他の態様では、この実施形態の方法は、さらに、部分ステップ（ｉ）および（ｉｉ）のうちの少なくとも一方の結果として得られる組み合わせを、容器内の一対の直接接続された室の間でこの組み合わせを交互に移動することにより混合するステップを含む。さらに他の態様では、第１の室は、第４の室と第５の室との間の中間にあり、容器は、試料を第１の室の中に収容するための試料吸入口を備える。さらに他の態様では、第４の室と第５の室は、それぞれ、第１の室に直接接続される。他の態様では、部分ステップ（ｉ）の結果として得られる組み合わせは、第１の室と第４の室との間の中間にある第６の室に移動される。さらに他の態様では、第４の室と第５の室は、第７の室に直接接続される。他の態様では、第５の室は、第３の室に直接接続されるが、第４の室には直接接続されない。さらに他の態様では、第３の室と第５の室のそれぞれは、第４の室に直接接続される。試料処理室は、第１の室であるか、または第１の室に直接接続されうる。
【００３５】
他の態様では、この実施形態の方法は、さらに、試料中に存在する分析対象が容器の試料処理室に収納されている固相担体によって固定化されたままである間に試料の１つまたは複数の非分析対象成分を取り出して容器の廃棄物室に移すステップを含む。試料処理試薬中の固相担体を容器に供給することができる。好ましくは、非分析対象成分を除去するときに磁場に曝される磁気応答性粒子またはビーズなどの、固相担体が液状媒質中に分散可能である。廃棄物室は、試料処理室に直接接続されている第７の室とすることができる。
【００３６】
さらに他の態様では、この実施形態の方法は、さらに、洗浄溶液を試料処理室に供給するステップと、試料処理室内の固相担体と洗浄溶液とを混合するステップと、分析対象が試料処理室の中の固相担体によって固定化されたままである間に試料処理室から洗浄溶液を取り出して第７の室に移すステップとを含む。洗浄溶液は、試料処理室に直接接続されている第８の室から供給されうる。
【００３７】
第１の乾燥された試薬は、部分ステップ（ｉｉ）で再構成され、第５の室は、第２の乾燥された試薬の再構成形態を収納することができる。第１の乾燥された試薬は、核酸増幅反応の産物との検出可能なプローブ：標的複合体を形成することができるプローブを含むことができる。第１の乾燥された試薬は、酵素試薬であり、第５の室は、増幅試薬を収納することができる。乾燥された試薬は、凍結乾燥形態のものとしてよい。
【００３８】
この実施形態の方法で使用されうる容器の他の処理ステップおよび詳細は、複数の相互接続された室を有する容器内で試料を処理する方法の第１の実施形態の上の説明の中で述べられている。
【００３９】
さらに他の実施形態では、本明細書で説明されている方法に従って試料を処理するようにプログラムされている機器が実現される。機器は、この機器に関連する静止している容器受容領域内で相互接続された室の非直線的配列構成を有する容器を収容し、位置を揃えるように適合される。機器は、これらの室の少なくとも一部の配列構成に従うように、またこれらの室の柔軟な部分に圧力を選択的に付与し、これにより流体物質を直接接続されている室と室との間に移動するようにアレイ状に配置された複数のアクチュエータを備える容器受容領域に関して動作可能なように配置されているアクチュエータシステムを備える。機器は、さらに、機器に備えられる容器内に収納されている検出室に動作可能な形で近接するように容器受容領域に隣接して動作可能な形で配置されている検出器を備え、検出器は検出室の内容物の特性を検出することができる。機器は、さらに、アクチュエータシステム、検出器、および熱素子を含む、機器の動作を制御するようにプログラムされたコントローラを備える。
【００４０】
他の実施形態では、試料を処理するための上述の機器および容器受容領域内に配置されている容器を備えるシステムが実現される。好ましい一態様では、容器は、複数の相互接続された室を定めるように互いに結合されている第１および第２の対向する部材から形成される。いくつかの用途では、容器は、最低でも５つの室を有する直線経路を備える。対向する部材のうちの少なくとも一方は、柔軟な部分を備え、通路の少なくとも一部は、流体障壁を備える。
【００４１】
さらに他の実施形態では、試料中の１つまたは複数の分析対象の存在、量、または状態を示すことができる光信号を検出するための検出器は、それぞれが規定の励起光学特性の励起信号を試料に向けて送るように適合されている１つまたは複数の励起チャネルを備える。それぞれの励起チャネルは、励起光を放射するように適合された発光素子および励起光軸を有する励起光路を定める励起光学素子を備える。励起光学素子は、規定された励起光学特性を有する発光素子によって試料に向けて放射される光の少なくとも一部を透過するように構成され、配列される。検出器は、さらに、それぞれが試料から放射信号を受信するように適合された１つまたは複数の放射チャネルを備える。それぞれの放射チャネルは、放射光軸を有する放射光路を定める放射光学素子を備え、放射光学素子は、規定された放射光学特性を有する試料によって放射される光の少なくとも一部を透過するように構成され、配列される。それぞれの放射チャネルは、さらに、放射光学素子によって透過される光を検出し、検出された光を検出された光の存在および強度のうちの少なくとも一方を示す電子信号に変換するように適合された光検出素子および関連回路を備える。発光素子および光検出素子は、単一の回路基板に動作可能なように接続される。検出器は、さらに、それぞれの励起チャネルから励起信号を受信してそれぞれの励起信号の少なくとも一部を規定された位置に向け、また規定された位置で試料から放射された放射信号を受信し、受信された放射信号の少なくとも一部をそれぞれの放射チャネルに向けるように構成され、配列された１つまたは複数の光学素子を備える。検出器は、反射要素上に当たったすべての光の方向を当たった光の入射方向と異なる方向に変えるための反射要素を備えず、また検出器は、第１の光特性を有する分離要素上に当たった光の一部の方向を当たった光の入射方向と異なる方向に変え、第２の光特性を有する分離要素上に当たった光の一部を透過するための光特性分離要素を備えない。
【００４２】
他の態様では、それぞれの励起チャネルの励起光軸およびそれぞれの放射チャネルの放射光軸は、それらの広がり全体にわたって互いに平行である。
【００４３】
他の態様では、１つまたは複数の光学素子は、（１）それぞれの励起チャネルから励起信号を受信し、励起信号の少なくとも一部を処理される試料が入っている容器上の規定された位置に向け、（２）容器内の試料から放射された放射信号を受信し、受信された放射信号の少なくとも一部をそれぞれの放射チャネルに向けるように構成され、配列される。
【００４４】
他の態様では、検出器は、２つ以上の励起チャネルおよび２つ以上の放射チャネルを備える。
【００４５】
他の態様では、１つまたは複数の光学素子は、単一の非分割レンズからなる。
【００４６】
さらに他の実施形態では、試料から試料中の１つまたは複数の分析対象の存在、量、または状態を示しうる光信号を検出するための検出器は、１つまたは複数の励起チャネルを備え、それぞれの励起チャネルは規定された励起波長または励起波長の範囲の励起信号を試料および１つまたは複数の放射チャネルに向けるように適合され、またそれぞれの励起チャネルは試料から放射信号を受信し、規定された放射波長または放射波長の範囲を有する放射信号を検出するように適合されている。それぞれの励起チャネルは、励起光を放射するように適合された発光素子および励起光軸を有する励起光路を定める励起光学素子を備える。励起光学素子は、規定された励起波長または励起波長の範囲を有する発光素子によって試料に向けて放射される光の少なくとも一部を透過するように構成され、配列される。それぞれの放射チャネルは、放射光軸を有する放射光路を定める放射光学素子を備える。放射光学素子は、規定された放射波長または放射波長の範囲を有する試料によって放射される光の少なくとも一部を透過するように構成され、配列される。それぞれの放射チャネルは、さらに、放射光学素子によって透過される光を検出し、検出された光を検出された光の存在および強度のうちの少なくとも一方を示す電子信号に変換するように適合された光検出素子を備える。励起光軸および放射光軸は、それらの広がり全体にわたって互いに平行である。また、検出器は、さらに、（１）それぞれの励起チャネルによって透過され、光学レンズの異なる部分に当たった励起光を規定された位置に向け、（２）規定された位置で試料によって放射された放射信号を受信し、受信された放射信号の少なくとも一部をそれぞれの放射チャネルに向けるように励起チャネルおよび放射チャネルに関して構成され、配列された光学レンズを備える。
【００４７】
他の態様では、発光素子は、発光ダイオードを含む。
【００４８】
他の態様では、それぞれの励起チャネルの励起光学素子は、レンズと規定された励起波長または励起波長の範囲を有する光のみを透過するように構成され、配列された励起フィルタとを備える。
【００４９】
他の態様では、光検出素子は、光ダイオードを含む。
【００５０】
他の態様では、それぞれの放射チャネルの放射光学素子は、レンズと規定された放射波長または放射波長の範囲を有する光のみを透過するように構成され、配列された放射フィルタとを備える。
【００５１】
他の態様では、励起チャネルの発光素子および放射チャネルの光検出素子は、同じ平面上に取り付けられる。
【００５２】
他の態様では、検出器は、さらに、筺体を備え、励起チャネルおよび放射チャネルはそれぞれ、その筺体内に定められた異なる導管内に配置される。
【００５３】
他の態様では、検出器は、２つの励起チャネルと２つの放射チャネルを備え、励起チャネルおよび放射チャネルの導管は、円形パターンで配置され、これらの導管は約９０°隔てて並べられる。
【００５４】
他の態様では、検出器は、さらに、少なくとも１つのプリント基板を含む基部を備え、筺体はこの基部に取り付けられ、励起チャネルの発光素子および放射チャネルの光検出素子は、プリント基板に動作可能なように接続される。
【００５５】
他の態様では、検出器は、さらに、励起変調回路および検出回路を備える周辺光フィルタリング回路を具備する。励起変調回路は、所定の励起周波数でそれぞれの励起チャネルの励起信号を変調するように構成され、配列され、検出回路は、実質的に励起周波数である検出された光のその部分を識別するように構成され、配列される。
【００５６】
他の態様では、検出器は、２つ以上の励起チャネルを備え、励起周波数は、それぞれの励起チャネルの励起信号に対し異なる。
【００５７】
他の態様では、検出器は、２つ以上の励起チャネルを備え、励起周波数は、それぞれの励起チャネルの励起信号に対し同じである。
【００５８】
他の態様では、励起光学素子および放射光学素子は、光ファイバーを含まない。
【００５９】
さらに他の実施形態では、試料からの２つ以上の異なる波長または波長の範囲の光の放射を検出する検出器が実現され、２つ以上の異なる波長の放射は、試料中の注目する２つ以上の分析対象の存在、量、または状態を示すことができ、またこれらの放射は、試料に関して検出器の構成要素を移動することなく検出される。検出器は、試料および互いに関して固定された２つ以上の励起チャネルと試料、励起チャネル、および互いに関して固定された２つ以上の放射チャネルを備える。それぞれの励起チャネルは、異なる規定された励起波長または励起波長の範囲の励起信号を試料に向けるように適合され、それぞれの励起チャネルは、励起光を放射するように適合された発光素子および励起光軸を有する励起光路を定める励起光学素子を備える。励起光学素子は、規定された励起波長または励起波長の範囲を有する発光素子によって試料に向けて放射される光の少なくとも一部を透過するように構成され、配列される。それぞれの放射チャネルは、試料から異なる規定された放射波長または放射波長の範囲の放射信号を受信し、検出するように適合され、それぞれの放射チャネルは、放射光軸を有する放射光路を定める放射光学素子を備え、放射光学素子は、規定された放射波長または放射波長の範囲を有する試料によって放射される光の少なくとも一部を透過するように構成され、配列される。それぞれの放射チャネルは、さらに、放射光学素子によって透過される光を検出し、検出された光を検出された光の存在および強度のうちの少なくとも一方を示す電子信号に変換するように適合された光検出素子を備える。検出器は、試料または互いに関して励起チャネルまたは放射チャネルを移動することなく、励起チャネルのそれぞれを用いて固有の励起波長または励起波長の範囲を有する光を試料に向け、放射チャネルのそれぞれを用いて試料から放射される固有の放射波長または放射波長の範囲を有する光を検出するように適合される。
【００６０】
他の態様では、励起光学素子は、規定された励起波長または励起波長の範囲を有する発光素子によって処理される試料が入っている容器に向けて放射される光の少なくとも一部を透過するように構成され、配列される。放射光学素子は、容器内からの試料によって放射される規定された放射波長または放射波長の範囲を有する光の少なくとも一部を透過するように構成され、配列される。検出器は、容器または互いに関して励起チャネルまたは放射チャネルを移動することなく、励起チャネルのそれぞれを用いて固有の励起波長または励起波長の範囲を有する光を容器に向け、放射チャネルのそれぞれを用いて容器から放射される固有の放射波長または放射波長の範囲を有する光を検出するように適合される。
【００６１】
さらに他の実施形態では、試料中の１つまたは複数の分析対象の存在、量、または状態を示すことができる光信号を検出するための方法は、第１の励起信号を発生し、第１の励起経路にそって第１の励起波長または励起波長の範囲を有する第１の励起信号の一部を透過することと、光学レンズの第１の部分を用いて第１の励起信号を試料に集束させることと、光学レンズの第２の部分を使用してもしあれば試料によって放射される信号の一部を第１の放射経路に向け、第１の放射経路にそって第１の放射波長または放射波長の範囲を有する光を透過し、第１の放射波長または放射波長の範囲を有する光を検出することとを含む。第１の励起経路および第１の放射経路は、それらの広がり全体にわたって互いに平行である。
【００６２】
他の態様では、この方法は、さらに、第２の励起信号を発生し、第２の励起経路にそって第２の励起波長または励起波長の範囲を有する第２の励起信号の一部を透過することと、光学レンズの第３の部分を用いて第２の励起信号を試料に集束させることと、光学レンズの第４の部分を使用してもしあれば試料によって放射される信号の一部を第２の放射経路に向け、第２の放射経路にそって第２の放射波長または放射波長の範囲を有する光を透過し、第２の放射波長または放射波長の範囲を有する光を検出することとを含む。第１および第２の励起経路ならびに第１および第２の放射経路は、それらの広がり全体にわたって互いに平行である。
【００６３】
他の態様では、第１の励起信号を試料に集束させることは、処理される試料が入っている容器の内容物に第１の励起信号を集束させることを含む。
【００６４】
他の態様では、試料によって放射される信号の一部を第１の放射経路内に向けることは、容器内の試料によって放射される信号の方向を決めることを含む。
【００６５】
他の態様では、光学レンズは、固体の非分割レンズを含む。
【００６６】
他の態様では、この方法は、（１）反射要素上に当たったすべての光の方向を当たった光の入射方向と異なる方向に変えるための反射要素または（２）第１の光特性を有する分離要素上に当たった光の一部の方向を当たった光の入射方向と異なる方向に変え、第２の光特性を有する分離要素上に当たった光の一部を透過するための光特性分離要素を使用せずに、第１の励起経路にそって第１の励起信号を伝送することおよび第１の放射経路にそって光を透過することを含む。
【００６７】
他の態様では、光を集束するステップおよび光を向けるステップは、第１の励起経路および第１の放射経路の外にある単一レンズ以外の光学素子を使用せずに実行される。
【００６８】
他の態様では、信号を発生するステップは、発光によって実行される。
【００６９】
他の態様では、第１の励起経路にそって第１の励起波長または励起波長の範囲を有する第１の励起信号の部分を伝送することは、第１の励起信号のフィルタリングを行って第１の励起波長または励起波長の範囲以外の第１の励起信号の波長を除去することを含み、第１の放射経路にそって第１の放射波長または放射波長の範囲を有する光を透過することは、第１の放射経路内に向けられた放射信号の部分のフィルタリングを行って第１の放射波長または放射波長の範囲以外の第１の放射信号の波長を除去することを含む。
【００７０】
他の態様では、この方法は、さらに、励起信号を所定の励起周波数で変調することと、実質的に励起周波数である検出された光のその部分を識別することとを含む。
【００７１】
第１の励起波長を有する第１の励起信号の部分を伝送することおよび第１の放射経路にそって第１の放射波長を有する光を透過することは、光ファイバーに光を透過させることを含まない。
【００７２】
次に、本発明による容器の製造法および特殊用途について説明する。説明されている実施形態に関して、容器は、複数の相互接続されている室を定めるように構成された対向する部材を備えることができ、これらの室は、通路または開口部によって、隣接する室の間にあるように、またはチャネルまたは通路によって、隔てられている室の間にあるように、結合される。これらの複数の相互接続されている室は、例えば、接着剤またはヒートシール、超音波溶接またはＲＦ溶接などの封止手段によって対向する部材の間に形成されたシールによって定められうる。対向する部材のうちの少なくとも一方は、室の柔軟な、少なくとも部分的には圧縮可能な部分を備える軟質シートを含みうる。軟質シートは、所望の結合特性、さらには許容可能な光、水、および／または酸素透過特性を有するように選択された１つまたは複数のプラスチック層を含む、複数の層を有するものとすることができる。対向する部材は両方とも、軟質シートで形成することができ、その少なくとも一方は、箔層を含みうる。
【００７３】
これらの容器の直接接続された室は、物質を移動する力が室の内容物に付与されたときに閉鎖状態から開放状態に変えられる開放可能な接続部によって遮断できる。それぞれの物質を移動する力は、例えば、１つまたは複数のアクチュエータ（例えば、空気圧式アクチュエータ）またはローラーによる力などの室を押し付ける外力を含むことができ、または容器内に付与される正の力または負の力を含むことができる。物質を移動する力が、１つまたは複数のアクチュエータである場合、アクチュエータは、室壁などの室の柔軟な部分の形状に概ね適合する圧縮パッドを備えることができる。接続部は、接続部に施されるシール、弁、または外力（例えば、アクチュエータ）を含む、１つの閉塞物または閉塞物の組み合わせにより閉鎖状態で遮断できる。シールは、剥離可能なヒートシール（例えば、山形またはＶ字型シール）などの破裂性シールとすることができる。
【００７４】
他の実施形態では、複数の相互接続された室を有する容器内に液状物質を装填するための方法が提供され、この方法は、非混和性液および液状物質（液状物質は非混和性液の後に続く）を容器の開いた室に順次供給するステップであって、非混和性液は液状物質より低い密度を有し、非混和性液は開いた室内の液状物質のウィッキングを制御するのに十分な量だけ開いた室に供給される、ステップと、開いた室を閉じて実質的に流体密のシールを形成するステップとを含む。開いた室は、容器の側面に対して開いた、検定を実行する際に使用する物質を収容するように適合された複数の室のうちの１つとすることができる。密度が低い非混和性液は、液状物質上に浮かぶが、これは、隣接する室の内容物を汚染したり、または反応もしくは他の処理で使用される処理材料の濃度に影響を及ぼす可能性のある、開いた室内のウィッキングを制御することがわかっている。非混和性液は、好ましくは、その液状物質と反応せず、開いた室に供給される非混和性液の量は、少なくとも一部は、室の容積容量および開いた室に供給される液状物質の体積に依存する。それにもかかわらず、非混和性液と液状物質との比は、好ましくは最大約１０：１までである。どのような非混和性液も考えられるが、油（例えば、鉱物油）が、本質的に適している。
【００７５】
容器は、対向する部材からなり、それらの部材の少なくとも１つは軟質シートを含むことができる。軟質シートは、非混和性液および液状物質が開いた室に送られたときに供給するステップの実行時に対向する部材から引き離される開いた室の柔軟な部分を含みうる。対向する部材は、対向する軟質シートを備えることができ、対向する軟質シートは、供給するステップの実行時に互いから引き離される開いた室の対向する柔軟な部分を含む。非混和性液および液状物質を開いた室に送った後、開いた室は、開いた室の対向する部材の間に形成されるヒートシールなどの流体密シールを形成するのに十分な手段によって閉じることができる。この方法のステップは、好ましくは自動化される。
【００７６】
さらに他の実施形態では、液体と乾燥された物質を別々に収納するように複数の相互接続された室を有する容器を製造する方法が提供され、この方法は、少なくとも１つの液状物質を、容器の第１の側面に対して開いた１つまたは複数の第１の室に供給するステップと、第１の室を閉じて実質的に流体密のエンクロージャを形成するステップと、少なくとも１つの乾燥された物質を、容器の第２の側面に対して開いた１つまたは複数の第２の室に供給するステップと、第２の室を閉じて実質的に流体密のエンクロージャを形成するステップとを含み、容器の室は、流体障壁によって互いに隔てられ、乾燥された物質は、第１の側面に対して開いた室には供給されず、液状物質は、第２の側面に対して開いた室には供給されない。液状物質は、乾燥された物質を１つまたは複数の室に供給する前にその後閉じられる容器の１つまたは複数の室に供給することができ、またその逆も行える。容器の第１および第２の側面は、互いに隣接して、または好ましくは、互いに対向するように、配置される。
【００７７】
非混和性液は、液状物質を供給する前に容器の第１の室のうちの１つまたは複数に供給することができ、非混和性液は、容器に供給される液状物質よりも低い密度を有するように選択される。非混和性液は、好ましくは、液状物質のどれとも反応せず、また例えば、油（例えば、鉱物油）とすることもできる。非混和性液と液状物質との比は、好ましくは最大約１０：１までである。
【００７８】
液体と乾燥された物質は、検定を実行するために使用されうる。液状物質の少なくとも一部は、乾燥された物質の再構成、溶解、または再水和を行うために使用されうる。特に好ましい一実施形態では、乾燥された物質は、核酸増幅反応を行うための増幅試薬および酵素試薬を含み、液状物質は、対応する再構成試薬を含む。
【００７９】
容器は、対向する部材からなり、それらの部材の少なくとも１つは軟質シートを含むことができる。軟質シートは、供給するステップの実行時に対向する部材から引き離される開いた室の柔軟な部分を含んでいてもよい。対向する部材は、対向する軟質シートを備えることができ、対向する軟質シートは、供給するステップの実行時に互いから引き離される開いた室の、室壁などの対向する柔軟な部分を含む。供給するステップのそれぞれに続いて、第１の室および／または第２の室は、開いた室の対向する部材の間に形成されるヒートシールなどの流体密シールを形成するのに十分な手段によって閉じられる。この方法のステップは、好ましくは自動化される。
【００８０】
さらに他の実施形態では、複数の相互接続された室を有する容器に送られる試料に含まれる分析対象を濃縮するための方法が提供される。この方法は、容器の第１の室の中に、試料および固相担体が入る第１の容積を形成するステップと、固相担体上に分析対象を固定化するステップと、分析対象から試料の非分析対象成分を取り除くステップと、分析対象を含む第２の容積を第１の室の分割された区画または容器の第２の室に移動するステップであって、第２の容積と第１の室の分割された区画または第２の室の容積容量がそれぞれ第１の容積より小さい、ステップとを含む。第１の室は、試料添加口を有する試料収容室とすることができる。
【００８１】
第１の容積の固相担体は、この実施形態の方法が開始されたときに第１の室の中に存在するか、または形成するステップの前に、または形成するステップにおいて、第３の室から第１の室に移動されうる。試料の非分析対象成分は、分析対象が第１の室または第１の室以外の室の中で固相担体上に固定化されている間に分析対象から除去できる。室と室との間の第２の容積の移動を容易にするために、または固相担体が室と室との間の接続を塞ぐのを防止するために、第１の容積には、さらに、非反応性の非混和性液を入れてもよい。非混和性液は、例えば、油（例えば、鉱物油）とすることができる。非混和性液と第１の室の中の第１の容積の残り部分との比は、好ましくは、約１：１０から約１０：１、より好ましくは約１：３から約１０：１までである。
【００８２】
第２の容積を第２の室に移動することは、圧縮可能な室壁などの第１の室の柔軟な部分に物質を移動する力を付与することによって行われ、これにより、第２の容積を第２の室との接続部に力ずくで通すことができる。接続部は、物質を移動する力が第１の室の柔軟な部分に付与されたときに閉鎖状態から開放状態に変えることができる、シールなどの開放可能な接続部とすることができる。
【００８３】
その代わりに、またはシールと組み合わせて、移動するステップの前に接続部に付与される引き込み可能な外力によって第１および第２の室を互いから分離することができる。閉鎖する外力は、単独で、またはシールと組み合わせて、実質的に流体密のシールを形成し、また接続部上に広がる圧縮パッドを有する、空気圧式アクチュエータなどの１つまたは複数のアクチュエータを備えることができる。
【００８４】
この実施形態の固相担体は、粒子またはビーズの形態をとるものとしてよい。固相担体は、試料の非分析対象成分が分析対象から除去されるときに磁場に曝される磁気応答性材料とすることができる。
【００８５】
固定化するステップは、分析対象に対し特異的であるか、または部分的に特異的であるか、または非特異的であるものとすることができる。例えば、分析対象が標的核酸である場合、固相担体を使用して、試料中に存在する本質的に任意の核酸、標的核酸が属する核酸−有機体の系統発生学的グループ分けから得られるものなど−のグループ、または試料中に存在する他の核酸ではない、標的核酸を固定化することができる。分析対象は、移動するステップにおいて固相担体によって固定化されたままであるか、または最初に溶離され、次いで固相担体と無関係に移動されうる。後者の場合、固相担体は、分析対象が第２の室に移動されている間、第１の室内に留まりうる。
【００８６】
他の実施形態では、複数の相互接続された室を有する容器に送られる試料に含まれる分析対象を濃縮するための方法が提供される。この方法は、容器の第１の室の中に、試料および固相担体が入る第１の容積部を形成するステップと、固相担体上に分析対象を固定化するステップと、第１の容積の一定分量を第１の室から、第１の室に直接接続されている容器の第２の室に移動するステップであって、第２の室の容積容量は、第１の容積より小さい、ステップと、第２の室の中で固相担体を分離するステップと、試料の非分析対象成分を取り出して、第２の室に直接接続されている、容器の廃棄物室に移すステップと、移動するステップ、分離するステップ、および取り除くステップを１回または複数回繰り返すステップとを含む。圧縮可能な室壁などの第１の室の柔軟な部分に物質を移動する力を付与することによって、第１の容積の一定分量を第２の室に移動し、この一定分量が第２の室との接続部を通るようにできる。試料中に存在する分析対象を濃縮する際に使用するための上述の容器は、この実施形態の方法での使用に適合されうる。
【００８７】
さらに他の実施形態では、複数の相互接続された室を有する容器が形成され、容器の室は、第２の室に直接接続され、液状媒質中の分散可能な固相担体を含む試料処理試薬を収納する第１の室を備える。第１の室には、さらに、固相担体が接続部を塞ぐのを妨げるのに十分な量の非混和性液が収納される。非混和性液は、好ましくは、試料処理試薬の他の成分と反応せず、また例えば、油（例えば、鉱物油）とすることもできる。固相担体は、磁力の存在下で分離されうる磁気応答性粒子またはビーズなどの粒子またはビーズとすることができる。試料処理試薬が第１の室の中の液状試料と接触する場合、非混和性液と液状媒質／流体試料の組み合わせとの比は、好ましくは、約１：１０から約１０：１、より好ましくは約１：３から約１０：１までである。
【００８８】
容器が対向する部材からなる場合、容器の両側面は、対向する部材を結合することによって形成される。使用時に向きがあるため上端に示されているこれらの側面の一方は、試料を試料収容室内に収容するための試料添加口を持つ試料収容室を備えることができる。第２の室の少なくとも一部は、第１の室よりも容器の下端に近い位置に配置されうる。この構成をとる場合、第１の室から第２の室への接続部は、好ましくは、上端に関して一般的に下方の向きを有する（つまり、この接続部は、第１の室の下半分を第２の室の上半分に結合する）。試料収容室は、第１の室とすることもできる。
【００８９】
この実施形態の固相担体は、対応する保持室の容積容量に比べて小さい。したがって、固相担体は、それらの室の液状内容物中に分散可能であり、そのため、磁力の影響を受ける充填固相担体の場合のように、容器内での操作の影響を受けやすい。固相担体は、好ましくは、試料中に存在することが疑われる注目する１つまたは複数の分析対象を固定化するように適合され、これにより、分析対象を分離し、また非分析対象成分を試料から除去することができ、特に、結果または手順の実行に影響を及ぼしうる干渉材料から除去することができる。固相担体は、分析対象を固定化するために、捕捉プローブなどの捕捉剤と併用できる。
【００９０】
他の実施形態では、容器の室と室との間で流体物質の移動を行わせるために、上記の容器を使用する方法が提供される。この方法の第１のステップでは、流体試料は、容器の第１の処理室内で試料処理試薬および非混和性液と組み合わされ、非混和性液は第１の処理室内の固相担体を濃縮するのに十分な量だけ供給される。固相担体を濃縮することで、室の中での分散が制限され、固相担体は非混和性液が存在しない場合と比べてその分散は小さい。次いで、これにより、室の周辺部、特に室と室との間の接続部に隣接する部分における固相担体の存在が最小限に抑えられる。第２のステップでは、流体物質は、第１の処理室から容器の第２の室へ、室と室との間の通路またはチャネルなどの接続部を通して移動される。流体物質は、第１のステップの、結果としてもたらされる組み合わせであるか、または例えば、試料中に存在する場合に分析対象の精製された形態を含む緩衝液とすることができる。第１のステップで非混和性液が存在するため、接続部を通る流体物質の移動を固相担体が遮ることが防止される。
【００９１】
さらに他の実施形態では、液状物質と同じ容器内に保管されている乾燥された物質の安定性を改善するために容器が備えられる。容器は、互いに直接接続される第１および第２の室を備える複数の相互接続された室を有する。第１の室は、乾燥された物質を収納し、第２の室は、乾燥された物質の状態または特性を変化させることができる液状物質を収納する。液状物質は、接触後、乾燥された物質を再構成するか、溶解するか、または再水和するように調製されうる。乾燥された物質は、例えば、凍結乾燥された、またはタブレット状にされた試薬とすることができる。乾燥された物質および液状物質が互いに接触することが早すぎないようにするため、第１の室と第２の室との間の接続部は、通常、例えば、シール、弁、または外力を含む他の閉塞物によって遮断される。接続部は、物質を移動する力が第２の室の内容物に付与されたときに閉鎖状態から開放状態に変えることができる開放可能な接続部によって遮断されうる。物質を移動する力は、第２の室の柔軟な部分に付与される、１つまたは複数の空気圧式アクチュエータなどの、１つまたは複数の圧縮力であってもよい。
【００９２】
第１および第２の室は、水蒸気が、第２の室から移動してくる場合よりも高速に第１の室から移動してくるように構成される。この点で、水蒸気は、検定の安定性および性能に影響を及ぼすおそれのある乾燥された物質の実質的再水和を行うことなく、第２の室から引き出され、第１の室を通り、周囲環境内に運ばれると考えられる。複数の室が第１の室に直接接続されている場合、水蒸気は、直接接続されている液体保持室から、また好ましくは直接接続されている室から移動してくるのよりも高速に第１の室から移動してくる。この効果を引き出すために、第１の室は、好ましくは、容器の直接接続されている液体保持室の室壁に比べて大きな水蒸気透過速度を有する少なくとも１つの室を含む。
【００９３】
一態様では、第１および第２の室のそれぞれは、柔軟な室壁を備える。これらの柔軟な壁は、複数の層を備え、それらの層のうちの１つまたは複数は、プラスチック層であってもよい。光、蒸気、および／または酸素が室壁を透過するのを制限するために、これらの層のうちの少なくとも１つは、箔層を含むとよい。他の態様では、第２の室の柔軟な壁は、箔層を完全に含み、第１の室の柔軟な壁は、箔層を完全には含まない。第１の室の柔軟な壁は、第２の室の柔軟な壁の層のうちの１つまたは複数の、ただし全数未満の数の層を含むことができる。第１の室の内容物からの光信号の検出を容易にするために、第１の室の室壁は、光透過領域を備えることができる。他の態様では、第２の室は、室壁の水蒸気透過速度および乾燥された物質の安定性に影響を及ぼす可能性がある、光透過領域を有する室壁を含まないように構成される。
【００９４】
乾燥された物質の安定性に影響を及ぼす可能性のある周囲条件（例えば、光、水、および／または酸素）への曝露を制限するために、容器は、封止された容器内に収納するとよい。好ましくは、封止された容器に乾燥剤を入れておく。
【００９５】
さらに他の実施形態では、複数の室のうちの１つの室の内容物を移動するのに重力に依存する複数の相互接続された室を有する容器の第１および第２の室の中に収納されている物質を混合するための方法が提供される。この方法では、容器は、最初に、第１の室が第２の室の上に実質的に位置するように分析装置内で向き付けられ、これにより、第１の室と第２の室との間で流体的な連通が確立されたときに第１の室の内容物を重力（または負圧）によって引き出し第２の室の中に入れることができる。好ましい一実施形態では、第２の室の柔軟な部分に付与される１つまたは複数の圧縮力などの第２の室の内容物に付与される物質を移動する力によって第１の室と第２の室との間の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態に変えられたときに流体的な連通が確立される。第１の室と第２の室との間で流体的な連通を確立するために使用されるのと同じ力が、さらに、第２の室の内容物を第１の室に移動するために使用されうる。第２の室の内容物を第１の室の中に移動した後、物質を移動する力は、第１の室の内容物が第２の室の中に引き込まれうるように取り除かれる。この処理を１回またはそれ以上の回数繰り返すことで、この手順の開始前に第１および第２の室に保管されている物質の完全混合を果たすことができる。
【００９６】
第１および第２の室に、それぞれ流体物質が収納されるか、あるいは第１の室に、凍結乾燥された、またはタブレット状にされた試薬などの乾燥された物質が収納されうる。乾燥された物質が第１の室の中に収納されている場合、乾燥された物質を再構成するか、または溶解するか、または再水和するために第２の室の流体物質が供給される。第２の室の流体物質と反応しない非混和性液を入れると、特に乾燥された物質が水和されている場合に、組み合わせるべき物質のより完全な混合が促進されることが発見された。非混和性液は、鉱物油などの油としてもよく、非混和性液と流体物質との比は、好ましくは、約１：１０から約１０：１、より好ましくは約１：３から約１０：１までである。
【００９７】
他の実施形態では、複数の相互接続された室を有する容器の第１および第２の室に収納されている物質の重力支援混合を実行するためのシステムが実現される。このシステムは、上述の容器のうちの１つおよび容器を動作可能な位置で支持する分析装置を備える。分析装置は、圧縮力を第２の室に付与してこれにより第２の室の内容物の少なくとも一部を第１の室の中に移動するための１つまたは複数のアクチュエータを備える。第２の室から圧縮力を取り除くと、圧縮力を第１の室の内容物に付与しなくても、第１の室の内容物は重力によって第２の室の中に流れ込むことができる。分析装置は、アクチュエータの動作を制御して、第２の室の内容物を第１の室と第２の室との間に複数回移動させ、これにより、第１および第２の室の組み合わされた内容物を混合するようにプログラムされる。アクチュエータは、空気圧式アクチュエータとすることができ、また好ましくは、第２の室の形状、または少なくとも第２の室の柔軟な部分に概ね適合するように配列されている圧縮パッドを有する。
【００９８】
好ましい一態様では、容器の室のそれぞれは、室と室との間で物質が移動しやすいようにする少なくとも部分的に圧縮可能な室である。この態様によれば、分析装置は、複数のアクチュエータを備え、それぞれのアクチュエータは、容器の複数の室のうちの少なくとも１つに関連付けられ、コントローラは、アクチュエータの動作を制御し、アクチュエータがアクチュエータによる外力の選択的付与によってさまざまな室の間に物質を移動することを行わせるようにプログラムされる。コントローラは、分析装置に圧縮力を第１の室の内容物に付与することを行わせるようにプログラムされないか、またはその代わりに、分析装置は、第１の室に関連付けられているアクチュエータを備えない。いくつかの態様では、アクチュエータを収納するために備えられているアクチュエータプレートは、第１の室に隣接する開口部を備え、これにより、検出器は、光信号など、第１の室の内容物の特性を検出することができる。
【００９９】
さらに他の実施形態では、収納されている液状物質の蒸発を制限するように処理された少なくとも１つの室を含む複数の相互接続された室を有する容器が形成される。室は、圧縮可能な室壁などの柔軟な部分を有し、液状物質に加えて、非混和性液を収納する。非混和性液は、室の内面を被覆し、これにより、室から液状物質が蒸発するのを制限する。非混和性液は、好ましくは、室の他の内容物と反応せず、また例えば、油（例えば、鉱物油）とすることもできる。非混和性液と室の他の液状内容物との比は、好ましくは、約１：１０から約１０：１、より好ましくは約１：３から約１０：１までである。
【０１００】
他の実施形態では、複数の相互接続された室を有する容器に収納されている物質を混合するための方法が提供される。この実施形態の第１の態様では、この方法は、容器の第１の室の中に、第１および第２の物質ならびに第１および第２の物質と好ましくは反応しない非混和性液を含む容積を形成するステップと、この容積を容器の第１の室と第２の室との間の接続部に１回または複数回通して非混和性液の存在下での第１および第２の物質の混合を促進するステップとを含む。この態様の第１および第２の室は、物質を移動する力の作用によってたわむ柔軟な部分を備えることができる。この実施形態の第２の態様では、この方法は、物質を移動する力の作用によってたわむ柔軟な部分を備える容器の閉鎖された室の中に、第１および第２の物質ならびに好ましくは非反応性の非混和性液を含む容積を形成するステップと、室を閉じて実質的に流体密のシールを形成するステップと、閉じられた室の中の非混和性液の存在下で第１および第２の物質を混合するために交互に行う形で物質を移動する力を柔軟な部分の異なるいくつかの部分に付与するステップとを含む。好ましいいくつかの態様では、非混和性液は、とりわけ、室の中心に向けて混合される物質を一般的に濃縮することによって混合を改善することが判明した。室の中の非混和性液と他の液状物質との比は、好ましくは、約１：１０から約１０：１、より好ましくは約１：３から約１０：１までである。
【０１０１】
この実施形態の第１の態様において混合を行わせるために、物質を移動する力が移動するステップにおいて第１および第２の室の柔軟な部分に交互に付与されることが好ましい。（接続部および／または第２の室は、さらに、第１の室から移動されるときに物質の乱流および混合が促進されるように構成されうる。）この態様では、物質を移動する力は、第１および第２の室のそれぞれの、室壁などの柔軟な部分の形状に概ね適合する圧縮パッドを有する１つまたは複数のアクチュエータによって付与されうる圧縮力である。この実施形態の第２の態様では、物質を移動する力は、閉じられた室の柔軟な部分の形状に概ね適合するように配列されている圧縮パッドを有する２つ以上のアクチュエータを含んでいてもよい圧縮力である。アクチュエータは、好ましくは空気圧式アクチュエータである。
【０１０２】
その代わりに、または内部障壁（例えば、シール）と組み合わせて、移動するステップの前に接続部に付与される引き込み可能な圧縮性の外力によって第１および第２の室を互いから分離することができる。閉鎖する外力は、単独で、または内部閉塞物と併せて、実質的に流体密のシールを形成し、また接続部上に広がる圧縮パッドを有する１つまたは複数のアクチュエータを備えることができる。空気圧式アクチュエータが、特に好ましい。
【０１０３】
混合するこの方法の容積を形成するために使用される物質は、典型的には液体であり、非混和性液は、例えば、油（例えば、鉱物油）とすることができる。
【０１０４】
さらに他の実施形態では、複数の相互接続された室を有する容器が実現され、これらの室のうちの１つは、処理材料、および第１の室の内面を実質的に被覆する、したがって処理材料が内面に固着するのを防ぐ十分な量の好ましくは非反応性の非混和性液を収納した第１の室である。処理材料は、好ましくは、再構成試薬などの液体であり、非混和性液は、好ましくは油（例えば、鉱物油）である。非混和性液と処理材料との比は、好ましくは、約１：１０から約１０：１、より好ましくは約１：３から約１０：１までである。第１の室は、容器の第２の室に直接接続され、物質を移動する力の作用によってたわむ、圧縮可能な室壁などの柔軟な部分を備えることができる。
【０１０５】
さらに他の実施形態では、複数の相互接続された室を有する容器内にある処理材料を移動する方法が提供され、この方法は、容器の第１の室の中に、処理材料と第１の室の内面を実質的に被覆する、したがって処理材料が第１の室の内面に固着するのを防ぐのに十分な量の非混和性液とが入る容積を形成するステップと、その容積を第１の室から容器の第２の室に、第１の室と第２の室との間の接続部を通して移動するステップとを含む。室の内面を被覆する際に使用する上述の容器は、この方法で使用できる。
【０１０６】
他の実施形態では、液状物質を第１の室から容器の第２の室に移動する方法が提供され、第１および第２の室は、開放可能な接続部によって互いに直接接続される。この方法は、液状物質および好ましくは非反応性の非混和性液を入れた第１の室の中に容積を形成するステップと、開放可能な接続部を閉鎖状態から開放状態に変更し、第１の室の容積を第２の室に移動するのには十分であるが、非混和性液の不在下では開放可能な接続部を閉鎖状態から開放状態に変更するのには不十分である第１の室の容積に物質を移動する力を付与するステップとを含む。非混和性液は、例えば、油（例えば、鉱物油）とすることができる。
【０１０７】
さらに他の実施形態では、容器の室に収納されている液状物質の温度を変える方法が提供される。この方法は、第１の室壁の柔軟な部分が広がって第１の室に隣接して配置される静的熱要素と接触するように容器の第１の室の中に容積を形成する第１のステップを含む。第１の室の中の容積は、液状物質および対応する非混和性液を含み、非混和性液が存在することで、第１の室の柔軟な部分は、非混和性液が第１の室に存在していなかった場合に比べて広い範囲にわって熱要素と接触する。第２のステップでは、第１の室の中の液状物質の温度は、熱要素と容積との間の熱エネルギーの伝達によって変更される。この方法の液状物質は、検定を実行するための試薬であってもよく、また非混和性液は、好ましくは、検定のどの成分とも反応しないような不活性を有する。非混和性液と第１の室の中の残留容積との比は、好ましくは最大約１０：１までである。好適な非混和性液としては、例えば、油（例えば、鉱物油）が挙げられる。
【０１０８】
第１の室を容器の１つまたは複数の他の室に結合するために１つまたは複数の接続部を備えることができ、これらの接続部は、変更するステップにおいて少なくとも流体容積の所定の温度に達するまで遮断されたままである。これらの接続部のうちの少なくとも１つは、物質を移動する力が処理室の内容物に付与されたときに閉鎖状態から開放状態に変更することができる開放可能な接続部とすることができる。閉鎖状態では、少なくとも１つの接続部は、内部障壁および／またはアクチュエータなどの閉じる外力によって遮断されうる。
【０１０９】
第１の室は、さらに、物質を移動する力の作用によってたわむ第２の室壁の柔軟な部分を備えることもできる。第２の柔軟な部分は、熱要素の向かい側に配置されている、物質を移動する力に隣接する位置に配置されうる。物質を移動する力としては、第２の柔軟な部分の形状に概ね適合する圧縮パッドを有する１つまたは複数のアクチュエータを挙げることができる。１つまたは複数のアクチュエータは、空気圧式アクチュエータとすることができる。この態様では、物質を移動する力は、この方法の実行時に第２の柔軟な部分と接触する。第２の柔軟な部分は、流体容積形成ステップの実行中に拡大できるが、必ず拡大する必要があるわけではない。
【０１１０】
熱要素は、単独で機能するか、または物質を移動する力と連携して、変更するステップで流体容積の温度を変更することができる（例えば、物質を移動する力は、熱伝導媒質としても機能しうる）。例えば、Ｄｅｖａｎｅｙらの「Ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ  Ｃｏｎｔｒｏｌ  Ｄｅｖｉｃｅ  ａｎｄ  Ｒｅａｃｔｉｏｎ  Ｖｅｓｓｅｌ」という表題の米国特許第５，４６０，７８０号を参照のこと。熱要素としては、アルミニウムまたは他の金属または金属の組み合わせなどの熱伝導材料から形成された熱伝達要素を挙げることができる。熱伝達要素は、温度変化をもたらすように熱電装置と熱で接触する状態に置かれうる。熱伝達要素の温度を増減するために、熱電装置はペルチェ効果に基づく動作を行うことができる。流体容積の温度は、一般に、温度変更ステップにおいて上昇し、いくつかの用途では、異なる温度の間で上昇下降を繰り返しうる（例えば、一本鎖核酸鋳型の存在下でのプライマーの結合および伸長ならびに二本鎖伸長産物の溶融をもたらすＰＣＲ温度循環）。
【０１１１】
さらに他の実施形態では、複数の相互接続された室を有する容器内で試料を処理するための機器は、処理時に動作可能な位置で容器を支持するように構成され配列される。機器は、１つまたは多室熱ゾーンを定める１つまたは複数の熱要素を備える。多室熱ゾーンは、容器と熱的に連通しており、それぞれの多室熱ゾーンと容器の関連領域との間で熱エネルギーを伝達するように構成され配列され、容器の関連領域は、容器の２つまたはそれ以上の、ただし全数未満の数の室のうちのそれぞれの室の全部または一部を包含する。機器は、さらに、多室熱ゾーンに関連付けられている領域内に包含される室を選択的に加熱または冷却するように多室熱ゾーンを定める１つまたは複数の熱要素の動作を制御するようにプログラムされたコントローラを備える。
【０１１２】
他の態様では、機器は、さらに、容器と熱的に連通するように配置され、それぞれの単一室熱ゾーンと容器の１つの室の全部または一部を包含する容器の関連領域との間で熱エネルギーを伝達するように構成され配列されている１つまたは複数の単一室熱ゾーンを定める１つまたは複数の熱要素を備える。コントローラは、さらに、単一室熱ゾーンに関連付けられている領域内に包含される室を選択的に加熱または冷却するように単一室熱ゾーンを定める熱要素の動作を制御するようにプログラムされる。
【０１１３】
機器は、すべての多室熱ゾーンまたは多室熱ゾーンと単一室熱ゾーンの組み合わせを含む１個から５個の熱ゾーンのうちのどれかの場所を有することができる。
【０１１４】
他の態様では、熱要素は、ペルチェ装置が熱的接触している本体を選択的に加熱または冷却するためにコントローラによって制御される１つまたは複数のペルチェ装置を備える。
【０１１５】
他の態様では、熱要素は、熱伝達要素によって定められる多室熱ゾーンの所定の形状に対応する周辺形状を有する、熱伝導性材料から形成される熱伝達要素を備える。熱伝達要素は、アルミニウムで形成できる。
【０１１６】
他の態様では、機器は、さらに、熱伝達要素と熱的に連通する温度センサーを備える。センサーは、熱伝達要素の温度を感知し、感知された温度をコントローラに伝えるように適合されている。
【０１１７】
熱伝達要素は、機器内で、容器に関して固定された位置に保持できる。
【０１１８】
他の態様では、熱要素は、ペルチェ装置が熱的接触している本体を選択的に加熱または冷却するためにコントローラによって制御される１つまたは複数のペルチェ装置、およびそれぞれの多室熱ゾーンに関連付けられている熱伝達要素を備える。熱伝達要素は、熱伝導性材料から形成され、略平坦な表面を有し、また熱伝達要素によって定められる多室熱ゾーンの所定の形状に対応する周辺形状を有し、ペルチェ装置は、熱伝達要素と熱的接触している。
【０１１９】
他の態様では、それぞれの多室熱ゾーンは、非熱伝導性材料を含む構造を分離することによって他の多室熱ゾーンから分離される。熱伝達要素および断熱構造は、機器内で、容器に関して固定された位置に保持できる。
【０１２０】
機器は、さらに、ペルチェ装置から熱を放散するように構成され配列されている熱放散要素を備えることができる。また、熱放散要素は、伝導性材料から形成され、少なくとも１つのペルチェ装置と熱的に連通する一方の側と熱放散フィンがブロックから伸びている反対の側を有するブロックを備えるヒートシンクを具備することができる。一実施形態では、ヒートシンクは、アルミニウムで構成することもできる。
【０１２１】
他の態様では、熱放散要素は、さらに、ヒートシンクに隣接して配置され、ヒートシンクの熱放散フィン上に空気流を発生するように構成されているファンを備えることができる。ファンの動作は、コントローラによって制御できる。
【０１２２】
他の態様では、機器は、それぞれの熱ゾーンの温度を感知し、感知された温度をコントローラに伝達するための１つまたは複数の温度センサーを備えることができる。
【０１２３】
他の態様では、コントローラは、熱要素の動作を制御し規定された温度範囲内で周囲温度を確定するように構成される。規定された温度範囲は、約２０℃から４０℃まで、または約２５℃から３７℃までとすることができる。
【０１２４】
他の態様では、コントローラは、熱要素の動作を制御し１つまたは複数の室を加熱して規定された温度範囲内の温度にするように構成される。室の規定された温度範囲は、温度機器を必要とする処理を実行するのに要求される温度を包含しうる。規定された温度範囲は、約５℃から９５℃までとすることができる。
【０１２５】
他の態様では、この処理は、ＰＣＲ増幅反応であるものとすることができる。
【０１２６】
他の態様では、コントローラは、熱要素の動作を制御し多室熱ゾーンに関連付けられている領域に包含される室の内容物を加熱または冷却して所定の時間内に所定の温度にするように構成できる。
【０１２７】
他の態様では、容器が機器内の動作可能位置で支持されているときに、多室熱ゾーンに関連付けられている領域内に包含されている室に流体を充填することで、室と多室熱ゾーンとの間の熱的連通が高まる。
【０１２８】
さらに他の実施形態では、複数の相互接続された室を有する容器内の物質を加熱または冷却するための方法は、分析装置内に収納されている１つまたは複数の多室熱ゾーンと熱的に連通するように容器を配置するステップを含む。それぞれの多室熱ゾーンは、容器の２つまたはそれ以上の、ただし全数未満の数の室のうちのそれぞれの室の全部または一部を包含する容器の領域に関連付けられている。この方法は、さらに、それぞれの多室熱ゾーンと、多室熱ゾーンに関連付けられている領域によって包含されている室との間に熱エネルギーを伝達し、包含されている室の中に収納されている物質を選択的に加熱または冷却して少なくとも１つの他の領域によって包含される室の温度と異なる温度にすることを含む。
【０１２９】
他の態様では、この方法は、さらに、分析装置内に収納されている１つまたは複数の単一室熱ゾーンと熱的に連通するように容器を配置することを含み、それぞれの単一室熱ゾーンは容器の１つの室の全部または一部を包含する容器の領域に関連付けられる。
【０１３０】
他の態様では、伝達するステップは、１つまたは複数のペルチェ装置を使って熱ゾーンを加熱または冷却することを含む。
【０１３１】
他の態様では、分析装置の周囲温度は、この方法の実行時にそれぞれの熱ゾーンに関連付けられている容器の領域によって包含される室の中に収納されている物質の温度と異なる。
【０１３２】
他の態様では、伝達するステップは、多室熱ゾーンの少なくとも１つの加熱および冷却を交互に行うことを含む。
【０１３３】
他の態様では、この方法は、さらに、それぞれの熱ゾーンを他の熱ゾーンから熱的に分離することを含む。
【０１３４】
他の態様では、この方法は、さらに、熱ゾーンから熱を放散することを含む。
【０１３５】
他の態様では、この方法は、さらに、それぞれの熱ゾーンの温度を感知することを含む。
【０１３６】
他の態様では、この方法は、さらに、多室熱ゾーンに関連付けられている容器の領域によって包含される室を拡大し、拡大した室と関連する多室熱ゾーンとの間の熱的な連通を高めることを含む。
【０１３７】
他の態様では、分析装置は、少なくとも３つの多室熱ゾーンを収納している。
【０１３８】
他の態様では、複数の相互接続された室はそれぞれ、容器の少なくとも１つの他の室に隣接する。
【０１３９】
本発明のこれら、および他の特徴、態様、および利点は、以下の詳細な説明、付属の請求項、および付属の図面を考察した後、当業者にとってさらに明らかなものとなるであろう。
例えば、本発明は以下の項目を提供する。
（項目１）
試料を処理する際に使用するための多室型容器であって、
複数の開放可能な接続部によって相互接続される室の第１の直線経路であって、
第１の開放可能な接続部によって接続される第１および第２の室であって、該第１および第２の室ならびに該第１の開放可能な接続部は、物質を移動する力が該第１の室の内容物に付与され、該第１の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態まで変更されたときに該第１の室から該第２の室までの物質移動が可能になるように構成、配列されている、第１および第２の室と、
第２の開放可能な接続部によって接続される第３および第４の室であって、該第３および第４の室ならびに該第２の開放可能な接続部は、物質を移動する力が該第３の室の内容物に付与され、該第２の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態まで変更されたときに該第３の室から該第４の室までの物質移動が可能になるように構成、配列されている、第３および第４の室と、
該第２の室と該第４の室との間の中間の室と
を備える、室の第１の直線経路を備え、
該中間の室は、第３の開放可能な接続部によって該第２の室に直接的に、または間接的に接続され、該第２の室、該中間の室、および該第３の開放可能な接続部は物質を移動する力が該第２の室の内容物に付与され、該第３の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態まで変更されたときに、該第２の室から該中間の室まで、または該中間の室の方へ物質移動が可能になるように構成、配列され、
該中間の室は、第４の開放可能な接続部によって該第４の室に直接的に、または間接的に接続され、該第４の室、該中間の室、および該第４の開放可能な接続部は物質を移動する力が該第４の室の内容物に付与され、該第４の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態まで変更されたときに、該第４の室から該中間の室まで、または該中間の室の方へ物質移動が可能になるように構成、配列され、
該室の第１の直線経路は、物質を移動する力が該第１の室の内容物に付与された場合に、該第３の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態まで変更されないように構成、配列され、
該室の第１の直線経路は、物質を移動する力が該第３の室の内容物に付与された場合に、該第４の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態まで変更されないように構成、配列され、
該第２および第４の室は、該中間の室を含まない室の配置構成によって相互接続されることはなく、
さらに、試料を試料収容室に受容するための試料吸入口を備えるが、該試料収容室が該第１の直線経路の室である場合に、該試料収容室は該第２の室と該第４の室との間にあることを前提条件とする、多室型容器。
（項目２）
室の第２および第３の直線経路をさらに備え、該第２および第３の直線経路の各々の該室は複数の開放可能な接続部によって相互接続され、第５の開放可能な接続部によって第１の処理室に接続される第６の室を備え、該第１の処理室は上記第１の室と第３の室との間に配置されている上記第１の直線経路の任意の室であり、該第６の室、該第１の処理室、および該第５の開放可能な接続部は、物質を移動する力が該第６の室の内容物に付与され、該第５の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態まで変更されたときに、該第６の室から該第１の処理室までの物質移動が可能になるように構成、配列され、該第２の直線経路は、該第１の室を備えるが、該第１の直線経路の該第３の室を備えず、該第３の直線経路は、該第３の室を備えるが、該第１の直線経路の該第１の室を備えない、項目１に記載の容器。
（項目３）
上記第２および第３の直線経路の１つまたは複数の室は、上記試料中の分析対象を固定化するための固相担体を備える、項目２に記載の容器。
（項目４）
上記固相担体は、磁気応答性粒子またはビーズを備える、項目３に記載の容器。
（項目５）
上記第６の室は、固相担体を備える、項目３または４に記載の容器。
（項目６）
上記第１の処理室は、固相担体を備える、項目３または４に記載の容器。
（項目７）
上記中間の室は、上記第１の処理室である、項目２から６のいずれか一項に記載の容器。
（項目８）
上記中間の室は、上記試料収容室である、項目２から７のいずれか一項に記載の容器。
（項目９）
上記第６の室は、上記試料収容室である、項目２から７のいずれか一項に記載の容器。
（項目１０）
第６の開放可能な接続部によって上記第６の室に接続される第７の室をさらに備え、該第６の室と、該第７の室と、該第６の開放可能な接続部とは、物質を移動する力が該第７の室の内容物に付与され、該第６の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態まで変更されたときに、該第７の室から該第６の室まで物質移動が可能になるように構成、配列される、項目２に記載の容器。
（項目１１）
上記第２および第３の直線経路の１つまたは複数の室は、上記試料中の分析対象を固定化するための固相担体を備える、項目１０に記載の容器。
（項目１２）
上記固相担体は、磁気応答性粒子またはビーズを含む、項目１１に記載の容器。
（項目１３）
上記第６の室は、固相担体を備える、項目１１または１２に記載の容器。
（項目１４）
上記第７の室は、固相担体を備える、項目１１または１２に記載の容器。
（項目１５）
上記第６の室は、上記試料収容室である、項目１０から１４のいずれか一項に記載の容器。
（項目１６）
複数の開放可能な接続部によって相互接続される室の第４の直線経路をさら備え、
第７の開放可能な接続部によって上記第２および第３の直線経路のうちの少なくとも１つの第２の処理室に接続される第８の室であって、該第８の室、該第２の処理室、および該第７の開放可能な接続部は物質を移動する力が該第８の室の内容物に付与され、該第７の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態まで変更されたときに該第８の室から該第２の処理室まで物質移動が可能になるように構成、配列される、第８の室と、
第８の開放可能な接続部によって該第２の処理室に接続される第９の室であって、該第９の室、該第２の処理室、および該第８の開放可能な接続部は物質を移動する力が該第２の処理室の内容物に付与され、該第８の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態まで変更されたときに該第２の処理室から該第９の室まで物質移動が可能になるように構成、配列され、該第４の直線経路は、該第２の処理室以外の該第２または第３の直線経路の室を含まない、第９の室と
を備える、項目１０から１４のいずれか一項に記載の容器。
（項目１７）
上記第２の処理室は、上記試料収容室に隣接する、項目１６に記載の容器。
（項目１８）
上記第２の処理室は、上記試料収容室である、項目１６に記載の容器。
（項目１９）
上記第８の室は、不要な材料を上記試料から取り除くための洗浄溶液を含む、項目１６から１８のいずれか一項に記載の容器。
（項目２０）
上記第９の室は、実質的に空である、項目１６から１９のいずれか一項に記載の容器。
（項目２１）
第９の開放可能な接続部によって上記中間の室に接続される第１０の室をさらに備え、該第１０の室、該中間の室、および該第９の開放可能な接続部は物質を移動する力が該第１０の室の内容物に付与され、該第９の開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態まで変更されたときに該第１０の室から該中間の室に物質移動が可能になるように構成、配列され、上記第１の直線経路は該第１０の室を備えない、項目１６から２０のいずれか一項に記載の容器。
（項目２２）
上記容器の上記室の各々は、室と室との間の物質移動を促進する柔軟な部分を備える、項目１から２１のいずれか一項に記載の容器。
（項目２３）
上記容器は、対向する部材を備え、該部材の少なくとも１つは軟質シートを備える、項目２２に記載の容器。
（項目２４）
上記対向する部材の各々は、軟質シートを備える、項目２３に記載の容器。
（項目２５）
上記軟質シートの少なくとも１つは箔層を備える、項目２４に記載の容器。
（項目２６）
上記開放可能な接続部は、室と室との間の物質移動を防ぐため破裂性シールによって閉鎖状態に遮断される、項目２３から２５のいずれか一項に記載の容器。
（項目２７）
上記室は、恒久的シールによって画定される、項目２６に記載の容器。
（項目２８）
上記破裂性シールおよび恒久的シールは、ヒートシールである、項目２７に記載の容器。
（項目２９）
上記破裂性シールおよび恒久的シールは、破裂性シールが恒久的シールに比べて弱いシールとなるように異なる条件の下で形成される、項目２８に記載の容器。
（項目３０）
上記破裂性シールは、山形シールである、項目２９に記載の容器。
（項目３１）
上記開放可能な接続部のうちの少なくとも１つは、物質を移動する力が隣接する室の柔軟な部分に付与されることによって上記閉鎖状態から上記開放状態に変えられるように構成され、配列される、項目１から３０のいずれか一項に記載の容器。
（項目３２）
上記試料収容室の容積容量は、末端室とは別の該試料収容室に直接接続された室の容積容量より大きい、項目１から３１のいずれか一項に記載の容器。
（項目３３）
上記室の少なくとも１つは、試料の特性を検出可能にするように構成され、配列される、項目１から３２のいずれか一項に記載の容器。
（項目３４）
上記検出は、上記試料の上記特性を示す信号の存在もしくは量を測定することを備える、項目３３に記載の容器。
（項目３５）
上記検出室は、該検出室の内面に固定化される１つまたは複数のプローブを含み、該プローブの各々は標的核酸によって検出可能なプローブ：標的複合体を形成することができる、項目３３または３４に記載の容器。
（項目３６）
上記プローブの各々は、検出可能な標識を含む、項目３５に記載の容器。
（項目３７）
上記プローブの各々は、結合されたプローブと結合されていないプローブとを区別することができる一対の相互作用標識を含む、項目３６に記載の容器。
（項目３８）
上記第１および第２の室のうちの少なくとも１つは、処理材料を含む、項目１から３７のいずれか一項に記載の容器。
（項目３９）
上記第１の室は、第１の処理材料を含み、上記第２の室は、第２の処理材料を含む、項目３８に記載の容器。
（項目４０）
上記第２の処理材料は、第１の乾燥された試薬であり、上記第１の処理材料は、該第１の乾燥された試薬を再構成するための第１の再構成試薬である、項目３９に記載の容器。
（項目４１）
上記第１の乾燥された試薬は、凍結乾燥された試薬である、項目４０に記載の容器。
（項目４２）
上記第２の室の少なくとも部分は、光学的に透明な材料で構成され、これにより、該第２の室の内容物を光センサーで調べることができる、項目３８から４１のいずれか一項に記載の容器。
（項目４３）
上記第３および第４の室のうちの少なくとも１つは、処理材料を含む、項目３８から４２のいずれか一項に記載の容器。
（項目４４）
上記第３の室は、第３の処理材料を含み、上記第４の室は、第４の処理材料を含む、項目４３に記載の容器。
（項目４５）
上記第４の処理材料は、第２の乾燥された試薬であり、上記第３の処理材料は、該第２の乾燥された試薬を再構成するための第２の再構成試薬である、項目４４に記載の容器。
（項目４６）
上記第２の乾燥された試薬は、凍結乾燥された試薬である、項目４５に記載の容器。
（項目４７）
上記第１の乾燥された試薬は、増幅試薬であり、上記第２の乾燥された試薬は、酵素試薬であり、該第１および第２の乾燥された試薬は核酸増幅反応を実行するために使用できる、項目４５または４６に記載の容器。
（項目４８）
上記増幅および酵素試薬のうちの少なくとも一方は、１つまたは複数のプローブを含み、該プローブの各々は上記核酸増幅反応の産物によって検出可能なプローブ：標的複合体を形成することができる、項目４７に記載の容器。
（項目４９）
上記酵素試薬は、上記１つまたは複数のプローブを備える、項目４８に記載の容器。
（項目５０）
上記プローブの各々は、検出可能な標識を備える、項目４８に記載の容器。
（項目５１）
上記プローブの各々は、結合されたプローブと結合されていないプローブとを区別することができる一対の相互作用標識を含む、項目５０に記載の容器。
（項目５２）
上記容器は、封止されたコンテナ内に保持される、項目１から５１のいずれか一項に記載の容器。
（項目５３）
上記コンテナはさらに、乾燥剤を保持する、項目５２に記載の容器。
（項目５４）
上記容器の上記室は、放射状の配列構成をとり、該容器の上記末端室は、非円形の配列構成をとる、項目１から５３のいずれか一項に記載の容器。
（項目５５）
上記複数の相互接続された室の各々は、上記容器の少なくとも１つの他の室に隣接する、項目１から５４のいずれか一項に記載の容器。
（項目５６）
上記試料吸入口は、ルアー接続部によって閉じられる、項目１から５５のいずれか一項に記載の容器。
（項目５７）
上記複数の相互接続された室を有する容器内にある試料を処理する方法であって、
（ａ）試料を該容器の第１の室に供給するステップと、
（ｂ）該容器の別々の室内において、
（ｉ）該容器の該第１の室の中に含まれる該試料の少なくとも一部および該容器の第２の室の中に含まれる試料処理試薬の少なくとも一部と、
（ｉｉ）第３の室の中に含まれる物質の少なくとも一部および第４の室の中に含まれる物質の少なくとも一部と、
（ｉｉｉ）第５の室の中に含まれる物質の少なくとも一部および第６の室の中に含まれる物質の少なくとも一部と
を独立に組み合わせるステップと、
（ｃ）ステップ（ｂ）の後に、該容器の室の中において、該試料の成分を部分ステップ（ｉｉ）および（ｉｉｉ）の組み合わせの各々の少なくとも一部と組み合わせるステップと
を備える、方法。
（項目５８）
上記第１および第２の室は、互いに直接接続され、上記第３および第４の室は、互いに直接接続され、上記第５および第６の室は、互いに直接接続される、項目５７に記載の方法。
（項目５９）
部分ステップ（ｉ）〜（ｉｉｉ）のうちの少なくとも１つの組み合わせを、上記容器内の一対の直接接続された室の間でこの組み合わせを交互に移動することにより混合するステップをさらに含む、項目５７または５８に記載の方法。
（項目６０）
上記第１の室は、上記第４の室と上記第６の室との間の中間にあり、上記容器は、上記試料を該第１の室の中に受容するための試料吸入口を備える、項目５７から５９のいずれか一項に記載の方法。
（項目６１）
部分ステップ（ｉ）の上記組み合わせは、ステップ（ｃ）の前に上記第１の室と上記第４および第６の室のうちの少なくとも一方との間の中間にある第７の室に移動される、項目５７から６０のいずれか一項に記載の方法。
（項目６２）
上記第４および第６の室は、各々、上記第１の室に直接接続されるが、互いに直接接続されることはない、項目５７から５９のいずれか一項に記載の方法。
（項目６３）
上記試料のどの成分も、上記第３若しくは第４の室に、またはその代わりに、上記第５または第６の室に、移動されない、項目５７から６２のいずれか一項に記載の方法。
（項目６４）
上記試料処理試薬は、上記試料中に存在することが疑われる分析対象を固定化するための固相担体を含む、項目５７から６３のいずれか一項に記載の方法。
（項目６５）
上記固相担体は、磁気応答性粒子またはビーズを備える、項目６４に記載の方法。
（項目６６）
上記分析対象が上記容器の試料処理室内で上記固相担体によって固定化されたままである間に、上記試料の１つまたは複数の非分析対象成分を容器の廃棄物室に移動するステップをさらに備える、項目６４または６５に記載の方法。
（項目６７）
上記廃棄物室は、上記試料処理室に直接接続されている第８の室である、項目６６に記載の方法。
（項目６８）
上記非分析対象成分は、上記試料処理室から上に向かって上記廃棄物室に移動される、項目６７に記載の方法。
（項目６９）
洗浄溶液を上記試料処理室に供給するステップと、
該試料処理室内の上記固相担体と該洗浄溶液とを混合するステップと、
上記分析対象が該試料処理室の中の該固相担体によって固定化されたままである間に、該試料処理室から該洗浄溶液を取り出して上記廃棄物室に移すステップと
を含む、項目６６から６８のいずれか一項に記載の方法。
（項目７０）
上記洗浄溶液は、上記試料処理室に直接接続されている第９の室から供給される、項目６９に記載の方法。
（項目７１）
上記試料処理室は、上記第１の室である、項目６６から７０のいずれか一項に記載の方法。
（項目７２）
上記試料処理室は、上記第１の室に直接接続される、項目６６から７０のいずれか一項に記載の方法。
（項目７３）
第１の乾燥された試薬は、部分ステップ（ｉｉ）で再構成される、項目５７から７２のいずれか一項に記載の方法。
（項目７４）
第２の乾燥された試薬は、部分ステップ（ｉｉｉ）で再構成される、項目７３に記載の方法。
（項目７５）
上記第１および第２の乾燥された試薬の各々は、凍結乾燥された試薬である、項目７４に記載の方法。
（項目７６）
ステップ（ｃ）の後に、上記容器の検出室の内容物の少なくとも１つの特性を検出するステップをさらに備える、項目５７から７５のいずれか一項に記載の方法。
（項目７７）
上記検出するステップは、上記試料の成分の存在もしくは量を示す少なくとも１つの信号の存在または量を測定するステップを含む、項目７６に記載の方法。
（項目７８）
上記検出室は、１つまたは複数のプローブを含み、該プローブの各々は該検出室の内面に固定され、該プローブの各々は標的核酸によって検出可能なプローブ：標的複合体を形成することができる、項目７７に記載の方法。
（項目７９）
上記プローブの各々は、検出可能な標識を含む、項目７８に記載の方法。
（項目８０）
上記検出室は、複数のプローブを収納し、該プローブの各々は、異なる標的核酸によって検出可能なプローブ：標的複合体を形成することができる、項目７８または７９に記載の方法。
（項目８１）
上記検出室の少なくとも一部は、光学的に透明な材料で構成され、これにより、該検出室の内容物を光センサーで調べることができる、項目７６から８０のいずれか一項に記載の方法。
（項目８２）
上記検出室は、上記第３、第４、第５、および第６の室のうちの１つである、項目７６から８１のいずれか一項に記載の方法。
（項目８３）
増幅反応と同じかまたは異なる産物が検出される、項目７６から８２のいずれか一項に記載の方法。
（項目８４）
上記増幅反応は、核酸増幅反応である、項目８３に記載の方法。
（項目８５）
乾燥された酵素試薬は、部分ステップ（ｉｉ）で再構成される、項目８４に記載の方法。
（項目８６）
上記乾燥された酵素試薬は、１つまたは複数のプローブを含み、該プローブの各々は上記核酸増幅反応の産物によって検出可能なプローブ：標的複合体を形成することができる、項目８５に記載の方法。
（項目８７）
乾燥された酵素試薬は、部分ステップ（ｉｉ）で再構成され、乾燥された増幅試薬は、部分ステップ（ｉｉｉ）で再構成される、項目８４に記載の方法。
（項目８８）
上記酵素および増幅試薬のうちの少なくとも一方は、１つまたは複数のプローブを含み、該プローブの各々は上記核酸増幅反応の産物によって検出可能なプローブ：標的複合体を形成することができる、項目８７に記載の方法。
（項目８９）
上記プローブの各々は、検出可能な標識を含む、項目８８に記載の方法。
（項目９０）
上記核酸増幅反応の上記産物は、リアルタイムで検出される、項目８４から８９のいずれか一項に記載の方法。
（項目９１）
上記容器の上記室は、複数の開放可能な接続部によって接続され、該開放可能な接続部の各々は、物質を移動する力が一対の直接接続された室のうちの少なくとも１つの室の内容物に付与され、該開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態まで変更されたときに、該一対の直接接続された室の間の物質移動が可能になるように構成され、配列される、項目５７から９０のいずれか一項に記載の方法。
（項目９２）
上記容器の上記複数の室の各々は、室と室との間の物質移動を促進する柔軟な部分を備える、項目９１に記載の方法。
（項目９３）
上記容器は、対向する部材を備え、該対向する部材の少なくとも１つは軟質シートを含む、項目９２に記載の方法。
（項目９４）
上記対向する部材の各々は、軟質シートを含む、項目９３に記載の方法。
（項目９５）
上記開放可能な接続部は、室と室との間の物質移動を防ぐために破裂性シールによって閉鎖状態に遮断される、項目９２から９４のいずれか一項に記載の方法。
（項目９６）
上記室は、恒久的シールによって定められる、項目９５に記載の方法。
（項目９７）
上記破裂性シールおよび恒久的シールは、ヒートシールである、項目９６に記載の方法。
（項目９８）
上記破裂性シールおよび恒久的シールは、該破裂性シールが該恒久的シールよりも弱いシールとなるように異なる条件の下で形成される、項目９７に記載の方法。
（項目９９）
上記破裂性シールは、山形シールである、項目９８に記載の方法。
（項目１００）
上記物質を移動する力は、圧縮力である、項目９１から９９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０１）
物質を移動する力を上記複数の室の各々に付与するステップをさらに含み、該複数の室の各々に対して該物質を移動する力は１つまたは複数のアクチュエータを含み、該複数の室の各々は該複数の室の間の物質移動の際に該対応するアクチュエータと連携するように適合される、項目９１から９９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０２）
上記１つまたは複数のアクチュエータは、空気圧式アクチュエータである、項目１０１に記載の方法。
（項目１０３）
上記容器の上記室は、放射状の配列構成をとり、該容器の上記末端室は、非円形の配列構成をとる、項目５７から１０２のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０４）
上記複数の相互接続された室の各々は、上記容器の少なくとも１つの他の室に隣接する、項目５７から１０３のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０５）
上記複数の相互接続された室を有する容器内にある試料を処理する方法であって、
（ａ）試料を該容器の第１の室に供給するステップと、
（ｂ）該容器の別々の室内において、
（ｉ）該容器の第１の室の中に含まれている該試料の少なくとも一部および該容器の第２の室の中に含まれている試料処理試薬の少なくとも一部と、
（ｉｉ）第３の室の中に含まれている物質の少なくとも一部および第４の室の中に含まれている物質の少なくとも一部と
を独立に組み合わせるステップと、
（ｃ）ステップ（ｂ）の後に、該容器の室の中において、該試料の成分を部分ステップ（ｉｉ）と第５の室に含まれる物質または物質の組み合わせの少なくとも一部との該組み合わせの少なくとも一部と組み合わせるステップとを含み、
該第５の室が該第４の室に直接接続されている場合に、該試料のどの成分も該第３および第５の室の少なくとも一方の中に移動されないことを前提条件とし、
該第５の室が該第３および第４の室のいずれかに直接接続されていない場合に、該試料の成分はどれも該第３および第５の室の少なくとも一方の中に移動されないことを前提条件とし、
該第５の室が該第３の室に直接接続されているが、該第４の室には接続されていない場合に、該試料のどの成分も該第５の室の中に移動されないことを前提条件とする、方法。
（項目１０６）
上記第１および第２の室は、互いに直接接続され、上記第３および第４の室は、互いに直接接続される、項目１０５に記載の方法。
（項目１０７）
部分ステップ（ｉ）および（ｉｉ）のうちの少なくとも１つの組み合わせを、上記容器内の一対の直接接続された室の間において、この組み合わせを交互に移動することによって混合するステップを含む、項目１０５または１０６に記載の方法。
（項目１０８）
上記第１の室は、上記第４の室と上記第５の室との間の中間にあり、上記容器は、上記試料を該第１の室の中に受容するための試料吸入口を備える、項目１０５から１０７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０９）
上記第４の室および第５の室は、各々、上記第１の室に直接接続される、項目１０８に記載の方法。
（項目１１０）
部分ステップ（ｉ）の組み合わせは、上記第１の室と上記第４の室との中間にある第６の室に移動される、項目１０５から１０７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１１）
上記第４の室および第５の室は、上記第６の室に直接接続される、項目１１０に記載の方法。
（項目１１２）
上記第５の室は、上記第３の室に直接接続されるが、上記第４の室には接続されない、項目１０５から１０７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１３）
上記第３および第５の室の各々は、上記第４の室に直接接続される、項目１０５から１０７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１４）
上記試料処理試薬は、上記試料中に存在することが疑われる分析対象を固定化するための固相担体を含む、項目１０５から１１３のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１５）
上記固相担体は、磁気応答性粒子またはビーズを備える、項目１１４に記載の方法。
（項目１１６）
上記分析対象が上記容器の試料処理室内で上記固相担体によって固定化されたままである間に、上記試料の１つまたは複数の非分析対象成分を取り出して容器の廃棄物室に移すステップをさらに備える、項目１１４または１１５に記載の方法。
（項目１１７）
上記廃棄物室は、上記試料処理室に直接接続されている第７の室である、項目１１６に記載の方法。
（項目１１８）
上記非分析対象成分は、上記試料処理室から上に向かって上記廃棄物室に移動される、項目１１７に記載の方法。
（項目１１９）
洗浄溶液を上記試料処理室に供給するステップと、
該試料処理室内の上記固相担体と該洗浄溶液とを混合するステップと、
上記分析対象が該試料処理室の中の該固相担体によって固定化されたままである間に、該試料処理室から該洗浄溶液を取り出して上記廃棄物室に移すステップと
を含む、項目１１６から１１８のいずれか一項に記載の方法。
（項目１２０）
上記洗浄溶液は、上記試料処理室に直接接続されている第８の室から供給される、項目１１９に記載の方法。
（項目１２１）
上記試料処理室は、上記第１の室である、項目１１６から１２０のいずれか一項に記載の方法。
（項目１２２）
上記試料処理室は、上記第１の室に直接接続される、項目１１６から１２０のいずれか一項に記載の方法。
（項目１２３）
第１の乾燥された試薬は、部分ステップ（ｉｉ）で再構成される、項目１０５から１２２のいずれか一項に記載の方法。
（項目１２４）
第５の室は、再構成された形態の第２の乾燥された試薬を含む、項目１２３に記載の方法。
（項目１２５）
上記第１および第２の乾燥された試薬の各々は、凍結乾燥された試薬である、項目１２３または１２４に記載の方法。
（項目１２６）
ステップ（ｃ）の後に、上記容器の検出室の内容物の少なくとも１つの特性を検出するステップをさらに含む、項目１０５から１２５のいずれか一項に記載の方法。
（項目１２７）
上記検出するステップは、上記試料の成分の存在もしくは量を示す少なくとも１つの信号の存在または量を測定するステップを含む、項目１２６に記載の方法。
（項目１２８）
上記検出室は、１つまたは複数のプローブを含み、該プローブの各々は該検出室の内面に固定され、該プローブの各々は標的核酸によって検出可能なプローブ：標的複合体を形成することができる、項目１２６または１２７に記載の方法。
（項目１２９）
上記プローブの各々は、検出可能な標識を含む、項目１２８に記載の方法。
（項目１３０）
上記検出室は、複数のプローブを収納し、該プローブの各々は、異なる標的核酸によって検出可能なプローブ：標的複合体を形成することができる、項目１２８または１２９に記載の方法。
（項目１３１）
上記検出室の少なくとも一部は、光学的に透明な材料で構成され、これにより、該検出室の内容物を光センサーで調べることができる、項目１２６から１３０のいずれか一項に記載の方法。
（項目１３２）
上記検出室は、上記第３、第４、および第５の室のうちの１つである、項目１２６から１３１のいずれか一項に記載の方法。
（項目１３３）
増幅反応と同じかまたは異なる産物が検出される、項目１２６から１３２のいずれか一項に記載の方法。
（項目１３４）
上記増幅反応は、核酸増幅反応である、項目１３３に記載の方法。
（項目１３５）
乾燥された試薬は、部分ステップ（ｉｉ）において再構成される、項目１３４に記載の方法。
（項目１３６）
部分ステップ（ｉｉ）において再構成された上記乾燥された試薬は、１つまたは複数のプローブを含み、該プローブの各々は上記核酸増幅反応の産物によって検出可能なプローブ：標的複合体を形成することができる、項目１３５に記載の方法。
（項目１３７）
上記乾燥された試薬は、酵素試薬であり、上記第５の室は、増幅試薬を含む、項目１３６に記載の方法。
（項目１３８）
上記乾燥された試薬は、酵素試薬であり、上記第５の室は、再構成された形態の増幅試薬を含む、項目１３６に記載の方法。
（項目１３９）
上記プローブの各々は、検出可能な標識を含む、項目１３６から１３８のいずれか一項に記載の方法。
（項目１４０）
上記核酸増幅反応の上記産物は、リアルタイムで検出される、項目１３６から１３９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１４１）
上記容器の上記室は、複数の開放可能な接続部によって接続され、該開放可能な接続部の各々は物質を移動する力が一対の室のうちの少なくとも１つの室の内容物に付与され、該開放可能な接続部が閉鎖状態から開放状態まで変更されたときに該一対の直接接続された室の間の物質移動が可能になるように構成され、配列される、項目１０５から１４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目１４２）
上記容器の複数の上記室の各々は、室と室との間の物質移動を促進する柔軟な部分を備える、項目１３５から１４１のいずれか一項に記載の容器。
（項目１４３）
上記容器は、対向する部材を備え、該対向する部材の少なくとも１つは軟質シートを含む、項目１４２に記載の方法。
（項目１４４）
上記対向する部材の各々は、軟質シートを含む、項目１４３に記載の方法。
（項目１４５）
上記開放可能な接続部は、室と室との間の物質移動を防ぐため破裂性シールによって閉鎖状態に遮断される、項目１４２から１４４のいずれか一項に記載の方法。
（項目１４６）
上記室は、恒久的シールによって定められる、項目１４２から１４４のいずれか一項に記載の方法。
（項目１４７）
上記破裂性シールおよび恒久的シールは、ヒートシールである、項目１４６に記載の方法。
（項目１４８）
上記破裂性シールおよび恒久的シールは、該破裂性シールが該恒久的シールよりも弱いシールとなるように異なる条件の下で形成される、項目１４７に記載の方法。
（項目１４９）
上記破裂性シールは、山形シールである、項目１４８に記載の方法。
（項目１５０）
上記物質を移動する力は、圧縮力である、項目１４１から１４９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５１）
物質を移動する力を上記複数の室の各々に付与するステップをさらに含み、該複数の室の各々に対する該物質を移動する力は１つまたは複数のアクチュエータを含み、該複数の室の各々は該複数の室の間の物質移動の際に該対応するアクチュエータと連携するように適合されている、項目１４１から１４９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５２）
上記１つまたは複数のアクチュエータは、空気圧式アクチュエータである、項目１５１に記載の方法。
（項目１５３）
上記容器の上記室は、放射状の配列構成をとり、該容器の上記末端室は、非円形の配列構成をとる、項目１０５から１５２のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５４）
上記複数の相互接続された室の各々は、上記容器の少なくとも１つの他の室に隣接する、項目１０５から１５３のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５５）
試料を処理する際に使用するための機器であって、
複数の相互接続された室を有する容器を受容するための容器受容領域であって、該室の少なくとも一部の各々が柔軟な部分を備える、容器受容領域と、
該容器受容領域に関して動作可能に配置され、少なくとも５個の室の直線経路を含む該容器内の室の非直線的な配列構成に適合するように、かつ、圧力を該室に選択的に付与して、流体物質が直接接続されている室と室との間を移動することを強制するようにアレイ状に配置される複数のアクチュエータを含むアクチュエータシステムと、
該容器内に含まれる検出室に動作可能な近傍の該容器受容領域に隣接して動作可能に配置される検出器であって、該検出室の内容物の特性を検出することができる、検出器と
を備える、機器。
（項目１５６）
試料を処理する際に使用するためのシステムであって、
相互接続された室の非直線的な配列構成を備える容器であって、該容器は、該室および複数の接続通路を画定するように互いに連結される対向する部材から形成され、該室のうちの少なくとも５個の室の直線的経路を含み、該部材のうちの少なくとも１つは柔軟な部分を備え、該通路のうちの少なくとも一部は流体障壁を含む、容器と、
該容器を関連付けられる静止している容器受容領域内に受容し、位置合わせするように適合される処理機器であって、
該容器受容領域に関して動作可能に配置され、該室の少なくとも一部の配列構成に適合するように、かつ、圧力を該室の柔軟な部分に選択的に付与して、流体物質が直接接続されている室と室との間で移動することを強制するようにアレイ状に配置される複数のアクチュエータを備えるアクチュエータシステムと、
該容器内に含まれる検出室に動作可能な近傍に該容器受容領域に隣接して動作可能に配置される検出器であって、該検出室の内容物の特性を検出することができる、検出器と
を備える、処理機器と
を備える、システム。
（項目１５７）
複数の相互接続された室を有する容器に供給される流体試料中に含まれる分析対象を濃縮する方法であって、
（ａ）該容器の第１の室の中に、該流体試料と固相担体を含む液体試薬とが入る第１の容積を形成するステップと、
（ｂ）該固相担体上に該分析対象を固定化するステップと、
（ｃ）該分析対象から該試料の非分析対象成分を取り除くステップと、
（ｄ）該分析対象を含む第２の容積を該第１の室の分割された区画または該容器の第２の室まで移動するステップであって、該第２の容積および該第１の室または該第２の室の該分割された区画の容積容量が各々第１の容積より小さい、ステップと
を含む、方法。
（項目１５８）
上記第２の容積部は、ステップ（ｄ）において上記第２の室に移動される、項目１５７に記載の方法。
（項目１５９）
上記第１の室は、試料添加口を有する試料収容室である、項目１５７または１５８に記載の方法。
（項目１６０）
上記液体試薬は、ステップ（ａ）において第３の室から上記第１の室に移動される、項目１５７から１５９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１６１）
上記第１の容積部は、さらに、非混和性液を含む、項目１５７から１６０のいずれか一項に記載の方法。
（項目１６２）
上記非混和性液は、油である、項目１６１に記載の方法。
（項目１６３）
上記油は、鉱物油である、項目１６２に記載の方法。
（項目１６４）
上記非混和性液と上記液体試薬との比は、約１：１０から約１０：１までである、項目１５７から１６３のいずれか一項に記載の方法。
（項目１６５）
上記非混和性液と上記液体試薬との比は、約１：３から約１０：１までである、項目１５７から１６３のいずれか一項に記載の方法。
（項目１６６）
上記分析対象は、ステップ（ｄ）において上記第１の室の中の上記固相担体上に固定される、項目１５７から１６５のいずれか一項に記載の方法。
（項目１６７）
ステップ（ｃ）は、上記第１の室以外の上記容器の室内で行われる、項目１５７から１６６のいずれか一項に記載の方法。
（項目１６８）
ステップ（ｄ）は、物質を移動する力を上記第１の室の柔軟な部分に付与するステップを含む、項目１５７から１６７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１６９）
上記物質を移動する力は、上記第１の室の上記柔軟な部分に付与される１つまたは複数の圧縮力である、項目１６８に記載の方法。
（項目１７０）
上記容器は、上記複数の相互接続された室を定めるように構成された対向する部材を備える、項目１６９に記載の方法。
（項目１７１）
上記対向する部材のうちの少なくとも１つは、軟質シートを含み、該軟質シートは上記第１の室の上記柔軟な部分を含む、項目１７０に記載の方法。
（項目１７２）
上記対向する部材の各々は、軟質シートを含む、項目１７１に記載の方法。
（項目１７３）
上記第１室と上記第２の室とを直接接続する開放可能な接続部を、上記物質を移動する力が該第１の室の上記柔軟な部分に付与されたとき、または圧縮力が該接続部から取り除かれたときに、閉鎖状態から開放状態に変更するステップをさらに含む、項目１７０から１７２のいずれか一項に記載の方法。
（項目１７４）
上記複数の相互接続された室は、上記対向する部材の間に形成されるシールによって定められる、項目１７３に記載の方法。
（項目１７５）
上記第１および第２の室は互いに隣接し、上記開放可能な接続部は、上記物質を移動する力が上記第１の室の上記柔軟な部分に付与されたときに、上記閉鎖状態から上記開放状態まで変更される破裂性シールによって遮断される開口部である、項目１７３または１７４に記載の方法。
（項目１７６）
上記破裂性シールは、ヒートシールである、項目１７５に記載の方法。
（項目１７７）
上記開放可能な接続部は、上記物質を移動する力が上記第１の室の上記柔軟な部分に付与されたときに、上記閉鎖状態から上記開放状態まで変更され、該物質を移動する力は、該第１の室の形状に全体として適合するように配列されている圧縮パッドを有する１つまたは複数のアクチュエータによって付与される、項目１７３から１７６のいずれか一項に記載の方法。
（項目１７８）
上記アクチュエータは、空気圧式アクチュエータである、項目１７７に記載の方法。
（項目１７９）
上記開放可能な接続部は、圧縮力が上記接続部から取り除かれたときに、上記閉鎖状態から上記開放状態まで変更される、項目１７３または１７４に記載の方法。
（項目１８０）
上記固相担体は、粒子またはビーズである、項目１５７から１７９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１８１）
ステップ（ｃ）の間に上記固相担体を磁場に曝すステップをさらに含み、該固相担体は磁気応答性である、項目１８０に記載の方法。
（項目１８２）
上記分析対象は、ステップ（ｄ）の間に上記固相担体上に固定されたままである、項目１５７から１８１のいずれか一項に記載の方法。
（項目１８３）
上記分析対象は、標的核酸である、項目１５７から１８２のいずれか一項に記載の方法。
（項目１８４）
上記第２の室の中で、上記分析対象を増幅試薬および増幅条件に曝すステップをさらに含む、項目１８３に記載の方法。
（項目１８５）
さらに、上記第２の室の中の増幅産物を検出するステップを含む、項目１８４に記載の方法。
（項目１８６）
上記複数の相互接続された室の各々は、上記容器の少なくとも１つの他の室に隣接するように配置される、項目１５７から１８５のいずれか一項に記載の方法。
（項目１８７）
複数の相互接続された室を有する容器に供給される流体試料中に存在する分析対象を濃縮する方法であって、
（ａ）該容器の第１の室の中に、該流体試料と固相担体を含む液体試薬とが入る第１の容積を形成するステップと、
（ｂ）該固相担体上に該分析対象を固定化するステップと、
（ｃ）該第１の容積の一定分量を該第１の室から、該容器の直接接続されている第２の室に移動するステップであって、該第２の室の容積容量は該第１の容積の容積容量よりも小さい、ステップと、
（ｄ）該第２の室の中で該固相担体を分離するステップと、
（ｅ）該試料の非分析対象成分を該容器の廃棄物室まで取り除くステップであって、該廃棄物室は該第２の室に直接接続されている、ステップと、
（ｆ）ステップ（ｅ）の後に、該第２の室の中の分析対象を直接接続されている第３の室に移動するステップと、
（ｇ）ステップ（ｃ）〜（ｆ）を１回または複数回繰り返すステップと
を含む、方法。
（項目１８８）
ステップ（ｃ）〜（ｆ）は、複数回繰り返される、項目１８７に記載の方法。
（項目１８９）
上記第１の室は、試料添加口を有する試料収容室である、項目１８７または１８８に記載の方法。
（項目１９０）
上記液体試薬は、ステップ（ａ）において第４の室から上記第１の室まで移動される、項目１８７から１８９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１９１）
上記第１の容積は、非混和性液をさらに含む、項目１８７から１９０のいずれか一項に記載の方法。
（項目１９２）
上記非混和性液は、油である、項目１９１に記載の方法。
（項目１９３）
上記油は、鉱物油である、項目１９２に記載の方法。
（項目１９４）
上記非混和性液と上記液体試薬との比は、約１：１０から約１０：１までである、項目１８７から１９３のいずれか一項に記載の方法。
（項目１９５）
上記非混和性液と上記液体試薬との比は、約１：３から約１０：１までである、項目１８７から１９４のいずれか一項に記載の方法。
（項目１９６）
ステップ（ｃ）は、物質を移動する力を上記第１の室の柔軟な部分に付与するステップを備える、項目１８７から１９５のいずれか一項に記載の方法。
（項目１９７）
上記物質を移動する力は、上記第１の室の上記柔軟な部分に付与される１つまたは複数の圧縮力である、項目１９６に記載の方法。
（項目１９８）
上記容器は、上記複数の相互接続された室を定めるように構成された対向する部材からなる、項目１９７に記載の方法。
（項目１９９）
上記対向する部材のうちの少なくとも１つは、軟質シートを含み、該軟質シートは上記第１の室の上記柔軟な部分を備える、項目１９８に記載の方法。
（項目２００）
上記対向する部材の各々は、軟質シートを備える、項目１９９に記載の方法。
（項目２０１）
上記第１室と上記第２の室とを直接接続する開放可能な接続部を、上記物質を移動する力が該第１の室の上記柔軟な部分に付与されたとき、または圧縮力が該接続部から取り除かれたときに閉鎖状態から開放状態まで変更するステップをさらに含む、項目１９８から２００のいずれか一項に記載の方法。
（項目２０２）
上記複数の相互接続された室は、上記対向する部材の間に形成されるシールによって確定される、項目２０１に記載の方法。
（項目２０３）
上記第１および第２の室は互いに隣接し、上記開放可能な接続部は、上記物質を移動する力が該第１の室の上記柔軟な部分に付与されたときに、上記閉鎖状態から上記開放状態まで変更される破裂性シールによって遮断される開口部である、項目２０１または２０２に記載の方法。
（項目２０４）
上記破裂性シールは、ヒートシールである、項目２０３に記載の方法。
（項目２０５）
上記開放可能な接続部は、上記物質を移動する力が上記第１の室の上記柔軟な部分に付与されたときに、上記閉鎖状態から上記開放状態まで変更され、該物質を移動する力は、該第１の室の形状に全体として適合するように配列される圧縮パッドを有する１つまたは複数のアクチュエータによって付与される、項目２０１から２０４のいずれか一項に記載の方法。
（項目２０６）
上記アクチュエータは、空気圧式アクチュエータである、項目２０５に記載の方法。
（項目２０７）
上記開放可能な接続部は、圧縮力が該接続部から取り除かれたときに上記閉鎖状態から上記開放状態まで変更される、項目２０１または２０２に記載の方法。
（項目２０８）
上記固相担体は、粒子またはビーズである、項目１８７から２０７のいずれか一項に記載の方法。
（項目２０９）
ステップ（ｄ）の間に上記固相担体を磁場に曝すステップをさらに備え、該固相担体は磁気応答性である、項目２０８に記載の方法。
（項目２１０）
上記分析対象は、ステップ（ｆ）の間、上記固相担体上に固定されたままである、項目１８７から２０９のいずれか一項に記載の方法。
（項目２１１）
上記分析対象は、標的核酸である、項目１８７から２１０のいずれか一項に記載の方法。
（項目２１２）
上記第３の室の中で、上記分析対象を増幅試薬および増幅条件に曝すステップをさらに備える、項目２１１に記載の方法。
（項目２１３）
上記第３の室の中の増幅産物を検出するステップをさらに備える、項目２１２に記載の方法。
（項目２１４）
上記複数の相互接続された室の各々は、上記容器の少なくとも１つの他の室に隣接するように配置される、項目１８７から２１３のいずれか一項に記載の方法。
（項目２１５）
複数の相互接続された室を有する容器内にある試料を処理するための機器であって、
該容器を受容するための容器受容領域と、
該容器が該容器受容領域内に動作方向に配置されたときに、該容器の検出室の内容物からの光信号を検出するように配置される構成要素を有する検出器と、
該検出室に隣接するように配置され、該容器受容領域と該検出器のレンズとの間に配置される移動可能な圧縮要素と、
該圧縮要素を移動して該検出室の柔軟な部分と係合させ、これにより該柔軟な部分を押圧して、該検出室の内容物を攪拌するか、または該検出室の内容物を該容器と隣接して接続されている室の中に移動するようにプログラムされているコントローラと
を備える、機器。
（項目２１６）
上記圧縮要素を移動するように構成 、配列されているアクチュエータをさらに備え、上記コントローラは、該アクチュエータを活性化して該圧縮要素を移動して、上記検出室の上記柔軟な部分と係合させるようにプログラムされる、項目２１５に記載の機器。
（項目２１７）
上記アクチュエータは、空気圧式アクチュエータである、項目２１６に記載の機器。
（項目２１８）
上記圧縮要素は、上記光信号を上記検出器の上記レンズに通すことができる窓を備える、項目２１５から２１７のいずれか一項に記載の機器。
（項目２１９）
上記圧縮要素は、上記検出器に対して相対的に移動するように構成され、配列される、項目２１５から２１８のいずれか一項に記載の機器。
（項目２２０）
上記検出器は、上記機器内に固定される、項目２１９に記載の機器。
（項目２２１）
上記圧縮要素は、上記検出器の導光導管とスライドして係合するチューブ体を有する、項目２１９に記載の機器。
（項目２２２）
上記圧縮要素は、上記検出器の固定要素であり、したがって、該検出器の全部または一部は、該圧縮要素が該検出室の上記柔軟な部分と係合したときに移動する、項目２１５から２１８のいずれか一項に記載の機器。
（項目２２３）
上記圧縮要素の端面は、上記検出室の上記形状に概して適合する、項目２１５から２２２のいずれか一項に記載の機器。
（項目２２４）
上記圧縮要素は、上記容器の複数の上記室と係合するように配列される複数の圧縮要素のうちの１つである、項目２１５から２２３のいずれか一項に記載の機器。
（項目２２５）
上記圧縮要素は、上記検出器に対して固定されており、
該検出器が取り付けられ、前後に往復して移動するように適合される平行移動する取り付けプラットフォームと、
該取り付けプラットフォームに結合されるアクチュエータであって、該アクチュエータは、該取り付けプラットフォームを前後に選択的に移動させるように上記コントローラによって制御され、これにより、該検出器に対して固定される該圧縮要素を後退位置と該検出室に係合する伸長位置との間で前後に移動させる、アクチュエータと
を備える、項目２１５に記載の機器。
（項目２２６）
上記平行移動する取り付けプラットフォームは、該取り付けプラットフォームを支持する表面から上方に延びる２つのピンをスライド可能な形で受容するように構成された２つの長手方向溝が形成されている基部を含む、項目２２５に記載の機器。
（項目２２７）
上記圧縮要素は、上記光信号を上記検出器の上記レンズに通すことができる窓を備える、項目２２５または２２６に記載の機器。
（項目２２８）
上記アクチュエータは、空気圧式ピストンを備える、項目２２５から２２７のいずれか一項に記載の機器。
（項目２２９）
上記圧縮要素は、上記検出器の導光導管とスライドして係合するチューブ体を有し、上記容器は、該容器と該検出器との間に配置されるアクチュエータプレートに隣接するように載せられ、該圧縮要素は該アクチュエータプレートを通して形成される開口部と位置を合わせて該検出室は該開口部に隣接して配置されており、
該アクチュエータプレートから延びるブラケットと、
該ブラケット上に載せられ、選択的に往復運動するように該コントローラによって制御されるアクチュエータと、
該圧縮要素から該アクチュエータまで延び、該アクチュエータの往復運動によって後退位置と該検出室に係合する伸長位置との間の該圧縮チューブの対応する往復運動が引き起こされるように、該アクチュエータの該圧縮要素への移動を変換するように適合されるアクチュエータバーと
をさらに備える、項目２１５に記載の機器。
（項目２３０）
上記アクチュエータプレートから延びて、上記作動バーの一部と係合し、上記圧縮チューブの移動時に上記圧縮チューブを誘導するように適合されているガイドロッドをさらに備える、項目２２９に記載の機器。
（項目２３１）
上記圧縮要素は、上記光信号を上記検出器の上記導光導管に通すことができる窓を備える、項目２２９または２３０に記載の機器。
（項目２３２）
上記アクチュエータは、空気圧式ピストンを備える、項目２２９から２３１のいずれか一項に記載の機器。
（項目２３３）
上記容器は、該容器と上記検出器との間に配置されるアクチュエータプレートに隣接するように載せられ、上記圧縮要素は、該アクチュエータプレートを通して形成される開口部と位置を合わせて該検出室が該開口部に隣接して配置されており、
該圧縮要素は、チューブ状部分を備え、放射状ラグが該チューブ状部分から延びており、該チューブ状部分は該アクチュエータプレートを通して形成される開口部内に配置され、該放射状ラグは該アクチュエータプレート内に形成される放射状開口部内に受容され、該アクチュエータプレートを通して形成される該開口部から延びており、該放射状開口部は該アクチュエータプレートを通して形成される該開口部内での軸方向の該圧縮要素の制限された移動を可能にするように構成され、
圧力マニホールドは、ガス圧力を該放射状ラグに付与して該アクチュエータプレートを通して形成される該開口部内で圧縮要素の軸方向移動を行わせるように構成、配列される、項目２１５に記載の機器。
（項目２３４）
上記検出室に隣接する上記圧縮要素の上記チューブ状部分の端部に取り付けられている光学的に透明な窓をさらに備える、項目２３３に記載の機器。
（項目２３５）
上記マニホールドは、２つの盛り上がった円筒状突出部を備え、各々、上記放射状ラグ、上記円筒状突出部のうちの各々の端部から出ている圧力導管、および各々の円筒状突出部上に載せられ、該円筒状突出部と該放射状ラグとの間に空気圧シールを形成するＯリングのうちの関連するものの中に形成されている開口部内に配置される、項目２３３または２３４に記載の機器。
（項目２３６）
上記チューブ状部分は、上記チューブ状部分の対称軸に関して中心を外れている貫通孔を備える、項目２３３から２３５のいずれか一項に記載の機器。
（項目２３７）
上記複数の相互接続された室を有する容器内にある試料を処理する方法であって、
（ａ）該容器と検出器のレンズとの間に配置される圧縮要素を移動して該検出室の柔軟な部分に係合させ、これにより該柔軟な部分を押圧して、該検出室の内容物を攪拌するか、または該検出室の内容物を該容器の直接接続されている室の中に移動するステップと、
（ｂ）該検出器によって該検出室の内容物からの光信号を検出するステップと
を含む、方法。
（項目２３８）
アクチュエータは、ステップ（ａ）の間に上記圧縮要素を移動する、項目２３７に記載の方法。
（項目２３９）
上記アクチュエータは、空気圧式アクチュエータである、項目２３８に記載の方法。
（項目２４０）
上記光信号は、ステップ（ｂ）の間に上記圧縮要素の光学的に透明な窓を通して検出される、項目２３６から２３９のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４１）
上記圧縮要素は、ステップ（ａ）の間に上記検出器に対して移動される、項目２３７から２４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４２）
上記検出器は、この方法の間において静止したままである、項目２４１に記載の方法。
（項目２４３）
上記圧縮要素は、上記検出器の導光導管とスライドして係合するチューブ体を有する、項目２４１に記載の方法。
（項目２４４）
上記検出器の全部または一部は、ステップ（ａ）の間に上記圧縮要素が上記検出室の上記柔軟な部分と係合したときに該圧縮要素とともに移動される、項目２３７から２４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４５）
上記検出室の上記内容物は、ステップ（ａ）の間に上記直接接続されている室に移動される、項目２３７から２４４のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４６）
上記検出室の上記内容物によって放射される１つまたは複数の蛍光発光信号は、ステップ（ａ）の間に検出される、項目２３７から２４５のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４７）
液体と乾燥された物質とを別々に含むように複数の相互接続された室を有する容器を製造する方法であって、
（ａ）少なくとも１つの液状物質を、該容器の第１の側面に対して開いた該容器の１つまたは複数の第１の室に供給するステップと、
（ｂ）該第１の室を閉じて実質的に流体密のエンクロージャを形成するステップと、
（ｃ）少なくとも１つの乾燥された物質を、該容器の第２の側面に対して開いた該容器の１つまたは複数の第２の室に供給するステップと、
（ｄ）該第２の室を閉じて実質的に流体密のエンクロージャを形成するステップと
を含み、
該容器の該室は、流体障壁によって互いに隔てられ、
乾燥された物質は、該容器の該第１の側面に開かれている室には供給されず、液状物質は、該容器の該第２の側面に開かれている室には供給されない、方法。
（項目２４８）
上記容器の上記第１の側面は、上部側であり、上記容器の第２の側面は、底部側である、項目２４７に記載の方法。
（項目２４９）
ステップ（ａ）および（ｂ）は、ステップ（ｃ）および（ｄ）の前に実行される、項目２４７または２４８に記載の方法。
（項目２５０）
ステップ（ａ）および（ｂ）は、ステップ（ｃ）および（ｄ）の後に実行される、項目２４７または２４８に記載の方法。
（項目２５１）
非混和性液は、上記液状物質を供給する前に上記第１の室のうちの１つまたは複数に供給され、該非混和性液は、該液状物質よりも低い密度を有する、項目２４７から２５０のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５２）
上記非混和性液は、上記液状物質とは反応しない、項目２５１に記載の方法。
（項目２５３）
上記非混和性液は、油である、項目２５１または２５２に記載の方法。
（項目２５４）
上記油は、鉱物油である、項目２５３に記載の方法。
（項目２５５）
上記第１の室のどれかの中の上記非混和性液と上記液状物質との比は、最大約１０：１までである、項目２５１から２５４のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５６）
上記容器は、上記複数の相互接続された室を画定するように構成された対向する部材を備える、項目２４７から２５５のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５７）
上記対向する部材のうちの１つは、軟質シートを含み、該軟質シートはステップ（ａ）および（ｃ）の間に該対向する部材から引き離される上記第１および第２の室の柔軟な部分を備える、項目２５６に記載の方法。
（項目２５８）
上記柔軟な部分は、上記第１および第２の室の室壁である、項目２５７に記載の方法。
（項目２５９）
上記複数の相互接続された室は、上記対向する部材の間に形成されるシールによって画定される、項目２５６から２５８のいずれか一項に記載の方法。
（項目２６０）
上記シールは、ヒートシールである、項目２５９に記載の方法。
（項目２６１）
上記対向する部材は、対向する軟質シートを含む、項目２５６に記載の方法。
（項目２６２）
上記対向する軟質シートは、上記第１および第２の室の対向する柔軟な部分を含み、該対向する柔軟な部分は、ステップ（ａ）および（ｃ）の間に互いから引き離される、項目２６１に記載の方法。
（項目２６３）
上記対向する柔軟な部分は、上記第１および第２の室の対向する室壁である、項目２６２に記載の方法。
（項目２６４）
上記複数の相互接続された室は、上記対向する部材の間に形成されるシールによって画定される、項目２６１から２６３のいずれか一項に記載の方法。
（項目２６５）
上記シールは、ヒートシールである、項目２６４に記載の方法。
（項目２６６）
上記第１および第２の室は、ステップ（ｂ）および（ｄ）の間にヒートシールによって閉じられる、項目２４７から２６５のいずれか一項に記載の方法。
（項目２６７）
上記液状物質および乾燥された物質は、検定を実行するための試薬を含む、項目２４７から２６６のいずれか一項に記載の方法。
（項目２６８）
上記複数の相互接続された室の各々は、上記容器の少なくとも１つの他の室に隣接する、項目２４７から２６７のいずれか一項に記載の方法。
（項目２６９）
上記隣接する室は、破裂性シールによって隔てられる、項目２６８に記載の方法。
（項目２７０）
上記破裂性シールは、ヒートシールである、項目２６９に記載の方法。
（項目２７１）
上記方法のステップは自動化される、項目２４７から２７０のいずれか一項に記載の方法。
（項目２７２）
複数の相互接続された室を有する閉じた容器であって、該室は直接接続されている第１および第２の室を含み、水蒸気は該第１の室から、該第２の室から伝わる速度よりも速い速度で伝わり、該第１の室は、乾燥された物質を含み、該第２の室は、該乾燥された物質の状態または特性を変更できる液状物質を含む、閉じた容器。
（項目２７３）
上記液状物質は、上記乾燥された物質を再構成するか、溶解するか、または再水和することができる、項目２７２に記載の容器。
（項目２７４）
上記乾燥された物質は、凍結乾燥された試薬である、項目２７２または２７３に記載の容器。
（項目２７５）
上記第１の室は、上記第２の室の室壁に比べて大きな水蒸気透過速度を有する少なくとも１つの室壁を有する、項目２７２から２７４のいずれか一項に記載の容器。
（項目２７６）
上記第１の室の上記室壁は、光学的に透明な領域を備える、項目２７２から２７５のいずれか一項に記載の容器。
（項目２７７）
上記第２の室は、光学的に透明な領域を有する室壁を備えない、項目２７２から２７６のいずれか一項に記載の容器。
（項目２７８）
複数の液体保持室は、上記第１の室に直接接続され、水蒸気は該第１の室から、上記複数の室から伝わる速度よりも速い速度で伝わり、該液体保持室は該複数の室に直接接続される、項目２７２から２７７のいずれか一項に記載の容器。
（項目２７９）
上記第１の室は、直接接続されている上記複数の液体保持室の室壁に比べて大きな水蒸気透過速度を有する少なくとも１つの室壁を有する、項目２７８に記載の容器。
（項目２８０）
複数の室は、上記第１の室に直接接続され、水蒸気は該第１の室から、直接接続されている該複数の室から伝わる速度よりも速い速度で伝わる、項目２７２から２７７のいずれか一項に記載の容器。
（項目２８１）
上記第１の室は、直接接続されている上記複数の室の室壁に比べて大きな水蒸気透過速度を有する少なくとも１つの室壁を有する、項目２８０に記載の容器。
（項目２８２）
上記第１および第２の室は、遮断された接続部によって互いに直接接続される、項目２７２から２８１のいずれか一項に記載の容器。
（項目２８３）
上記接続部は、物質を移動する力が上記第２の室の内容物に付与されたときに、閉鎖状態から開放状態まで変更されうる開放可能な接続部である、項目２８２に記載の容器。
（項目２８４）
上記物質を移動する力は、上記第２の室の柔軟な部分に付与される１つまたは複数の圧縮力である、項目２８３に記載の容器。
（項目２８５）
上記第１の室の上記室壁は、柔軟であり、上記第２の室の上記柔軟な部分は、室壁である、項目２８４の容器。
（項目２８６）
上記容器は、上記複数の相互接続された室を画定するように構成された対向する部材を備える、項目２８５に記載の容器。
（項目２８７）
上記対向する部材のうちの少なくとも１つは、軟質シートを含み、該軟質シートは上記第１および第２の室の上記柔軟な壁を含み、該第１および第２の室の該柔軟な壁は、該第１の室と上記第２の室との間の物質移動を促進する、項目２８６に記載の容器。
（項目２８８）
上記対向する部材の各々は、軟質シートを含む、項目２８７に記載の容器。
（項目２８９）
上記軟質シートの各々は、複数のプラスチック層を含む、項目２８８に記載の容器。
（項目２９０）
上記軟質シートの各々は、箔層を含む、項目２８８または２８９に記載の容器。
（項目２９１）
上記箔層は、上記第２の室を覆い、該箔層は、上記第１の室を完全には覆わない、項目２９０に記載の容器。
（項目２９２）
上記複数の相互接続された室は、上記対向する部材の間に形成されるシールによって画定される、項目２８６から２９１のいずれか一項に記載の容器。
（項目２９３）
上記第１および第２の室は互いに隣接し、上記開放可能な接続部は、上記物質を移動する力が該第２の室の上記柔軟な部分に付与されたときに、上記閉鎖状態から上記開放状態まで変更される破裂性シールによって遮断されている開口部である、項目２９２に記載の容器。
（項目２９４）
上記破裂性シールは、ヒートシールである、項目２９３に記載の容器。
（項目２９５）
上記容器は、封止された乾燥剤保持容器内に収納される、項目２７２から２９４のいずれか一項に記載の容器。
（項目２９６）
上記複数の相互接続された室の各々は、上記容器の少なくとも１つの他の室に隣接して位置する、項目２７２から２９５のいずれか一項に記載の容器。
（項目２９７）
物質を混合するためのシステムであって、
複数の相互接続された室を有する容器であって、少なくとも部分的に圧縮可能な第２の室に直接接続されている第１の室を含む、容器と、
動作可能な位置において該容器を支持する分析装置であって、
圧縮力を該第２の室に付与するように構成、配列される１つまたは複数のアクチュエータであって、該容器は該第１の室と該第２の室との間で流体連通が確立されたときに重力によって流体が該第１の室から該第２の室の中に引き込まれるように該分析装置内に配置される、１つまたは複数のアクチュエータと、
該１つまたは複数のアクチュエータの動作を制御し、かつ、該１つまたは複数のアクチュエータに、
（ａ）圧縮力を該第２の室に付与して、これにより、該第２の室の内容物の少なくとも一部を該第１の室の中に変位させることと、
（ｂ）該第２の室から該圧縮力を取り除いて、これにより、圧縮力を該第１の室に付与しなくとも、押し出される該内容物が重力によって該第１の室から該第２の室まで流れることができるようにすることと、
（ｃ）ステップ（ａ）および（ｂ）を１回または複数回繰り返すことと
を実行させるようにプログラムされているコントローラと
を備える、分析装置と
を備える、システム。
（項目２９８）
上記１つまたは複数のアクチュエータは、上記第２の室の上記形状に概して適合するように配列されている圧縮パッドを有する、項目２９７に記載のシステム。
（項目２９９）
上記１つまたは複数のアクチュエータは、空気圧式アクチュエータである、項目２９７または２９８に記載のシステム。
（項目３００）
上記圧縮力を上記第２の室に付与する前に、上記第１の室は、乾燥された物質を含み、上記第２の室は、該乾燥された物質を再構成するか、溶解するか、または再水和するための液状物質を含み、該第１の室と該第２の室との間の接続部は、最初に遮断され、これにより、該液状物質が該乾燥された物質に接触することを防止する、項目２９７から２９９のいずれか一項に記載のシステム。
（項目３０１）
上記乾燥された物質は、凍結乾燥された試薬を含む、項目３００に記載のシステム。
（項目３０２）
上記第２の室は、非混和性液をさらに含み、該非混和性液は上記液状物質と反応しない、項目３００または３０１に記載のシステム。
（項目３０３）
上記非混和性液は、油である、項目３０２に記載のシステム。
（項目３０４）
上記油は、鉱物油である、項目３０３に記載のシステム。
（項目３０５）
上記容器の上記室の各々は、室と室との間の物質移動を促進するために少なくとも部分的に圧縮可能な室であり、
上記分析装置は、複数のアクチュエータを備え、該アクチュエータの各々は該室のうちの少なくとも１つに関連付けられ、
上記コントローラは、該アクチュエータの動作を制御し、かつ、該アクチュエータに該アクチュエータによる外力をそれらの関連する室に選択的に付与して該関連する室を圧縮し、該室の内容物を相互接続された室の中に押し込むことによって該相互接続された室の間で物質を移動させるようにプログラムされる、項目２９７から３０４のいずれか一項に記載のシステム。
（項目３０６）
上記容器は、対向する部材を備え、該対向する部材の少なくとも１つは軟質シートを備える、項目２９７から３０５のいずれか一項に記載のシステム。
（項目３０７）
上記対向する部材の各々は、軟質シートを備える、項目３０６に記載のシステム。
（項目３０８）
上記第１室と上記第２の室を直接接続する開放可能な接続部は、上記圧縮力が該第２の室に付与されたときに、閉鎖状態から開放状態まで変更され、該接続部の該開放状態は該第１の室と該第２の室との間に流体連通をもたらす、項目２９７から３０７のいずれか一項に記載のシステム。
（項目３０９）
上記第１と第２の室とは互いに隣接し、上記開放可能な接続部は、上記圧縮力が該第２の室に付与されたときに、上記閉鎖状態から上記開放状態まで変更される破裂性シールによって遮断されている開口部である、項目３０８に記載のシステム。
（項目３１０）
上記破裂性シールは、ヒートシールである、項目３０９に記載のシステム。
（項目３１１）
上記複数の相互接続された室の各々は、上記容器の少なくとも１つの他の室に隣接するように配置される、項目３０８から３１０のいずれか一項に記載のシステム。
（項目３１２）
上記分析装置は、上記第１の室と上記第２の室との間の上記接続部に隣接するアクチュエータをさらに備え、上記コントローラは、該アクチュエータの動作を制御して該アクチュエータに、ステップ（ｃ）の後に該第１の室と該第２の室との間の該接続部を遮断させるようにプログラムされる、項目３０８から３１１のいずれか一項に記載のシステム。
（項目３１３）
上記分析装置は、上記第１の室に関連付けられているアクチュエータを備えない、項目２９７から３１２のいずれか一項に記載のシステム。
（項目３１４）
上記容器に対して複数のアクチュエータを動作可能に配置するためのアクチュエータプレートを備え、かつ、開口部を有するアクチュエータシステムと、
上記第１の室の内容物の特性を検出できるように該開口部と隣接する位置にある検出器と
をさらに備える、項目３１３に記載のシステム。
（項目３１５）
上記検出器は、光検出器である、項目３１４に記載のシステム。
（項目３１６）
上記検出器は、蛍光光度計である、項目３１５に記載のシステム。
（項目３１７）
複数の相互接続された室を有する容器内で物質を混合する方法であって、
（ａ）該容器の第１の室と第２の室との間に流体連通が確立されたときに重力によって該第１の室の内容物を該第２の室の中に引き込むように、分析装置内において該容器を配向するステップと、
（ｂ）該第１の室と該第２の室との間の流体連通を確立するステップと、
（ｃ）該第２の室の内容物が該第１の室の中に移動されるように物質を移動する力を該第２の室の内容物に付与するステップと、
（ｄ）重力が該第１の室の内容物を該第２の室の中に引き込むように、ステップ（ｃ）の物質を移動する力を取り除くステップと、
（ｅ）ステップ（ｃ）および（ｄ）を１回または複数回繰り返すステップと
を含む、方法。
（項目３１８）
上記容器は、この方法の間は静止したままである、項目３１７に記載の方法。
（項目３１９）
上記流体連通は、上記第１の室と上記第２の室との間に狭い開口部を形成することによって確立される、項目３１７または３１８に記載の方法。
（項目３２０）
ステップ（ｂ）の前に、上記第１の室は、乾燥された物質を含み、上記第２の室は、該乾燥された物質を再構成するか、溶解するか、または再水和するための液状物質を含む、項目３１７から３１９のいずれか一項に記載の方法。
（項目３２１）
上記乾燥された物質は、凍結乾燥された物質である、項目３２０に記載の方法。
（項目３２２）
上記第１の室に含まれている上記乾燥された物質を再構成するか、溶解するか、または再水和するステップをさらに含む、項目３２０または３２１に記載の方法。
（項目３２３）
上記第２の室は、非混和性液をさらに含み、該非混和性液は上記液状物質と反応しない、項目３２０から３２２のいずれか一項に記載の方法。
（項目３２４）
上記非混和性液は、油である、項目３２３に記載の方法。
（項目３２５）
上記油は、鉱物油である、項目３２４に記載の方法。
（項目３２６）
上記物質を移動する力は、上記第２の室の柔軟な部分に付与される１つまたは複数の圧縮力である、項目３１７から３２５のいずれか一項に記載の方法。
（項目３２７）
上記容器は、上記複数の相互接続された室を画定するように構成された対向する部材を備える、項目３２６に記載の方法。
（項目３２８）
上記対向する部材のうちの少なくとも１つは、軟質シートを含み、該軟質シートは上記第２の室の上記柔軟な部分を含む、項目３２７に記載の方法。
（項目３２９）
上記対向する部材の各々は、軟質シートを含む、項目３２８に記載の方法。
（項目３３０）
ステップ（ｂ）は、上記物質を移動する力が上記第２の室に付与されたときに、上記第１の室と該第２の室との間の開放可能な接続部を閉鎖状態から開放状態まで変更するステップを含む、項目３２６から３２９のいずれか一項に記載の方法。
（項目３３１）
上記複数の相互接続された室は、上記対向する部材の間に形成されるシールによって画定される、項目３３０に記載の方法。
（項目３３２）
上記第１と第２の室とは互いに隣接し、上記開放可能な接続部は、上記物質を移動する力が上記第２の室に付与されたときに、上記閉鎖状態から上記開放状態まで変更される破裂性シールによって遮断されている開口部である、項目３３１に記載の方法。
（項目３３３）
上記破裂性シールは、ヒートシールである、項目３３２に記載の方法。
（項目３３４）
上記物質を移動する力は、上記第２の室の上記形状に概して適合するように配列されている圧縮パッドを有する１つまたは複数のアクチュエータによって付与される、項目３３０から３３３のいずれか一項に記載の方法。
（項目３３５）
上記アクチュエータは、空気圧式アクチュエータである、項目３３４に記載の方法。
（項目３３６）
ステップ（ｅ）の後に、上記第１の室と上記第２の室との間の上記接続部を遮断して、該第１の室と該第２の室との間の物質の移動を防止するステップをさらに含む、項目３３０から３３５のいずれか一項に記載の方法。
（項目３３７）
上記第１の室と上記第２の室との間の上記接続部は、該接続部に付与される１つまたは複数の圧縮力によって遮断される、項目３３６に記載の方法。
（項目３３８）
上記複数の相互接続された室の各々は、上記容器の少なくとも１つの他の室の隣に隣接するように配置される、項目３１７から３３７のいずれか一項に記載の方法。
（項目３３９）
上記第１の室の上記内容物の少なくとも１つの特性を検出器によって検出するステップをさらに含む、項目３１７から３３８のいずれか一項に記載の方法。
（項目３４０）
項目３３９に記載の方法であって、上記検出器は該方法の間、上記第１の室に隣接する静止位置にある、方法。
（項目３４１）
上記検出器は、蛍光光度計である、項目３４０に記載の方法。
（項目３４２）
複数の相互接続された室を有する容器内で試料を処理するための機器であって、該機器は、処理の間に動作可能な位置において該容器を支持するように構成、配列され、かつ、
１つまたは複数の熱要素であって、該容器と熱的に連通するように配置され、各々の多室熱ゾーンと該容器の関連領域との間で熱エネルギーを伝達するように構成、配列される１つまたは複数の多室熱ゾーンを画定し、該容器の該関連領域は、該容器の２つまたはそれ以上の、ただし全数未満の該数の室のうちの各々の全部または一部を包含する、１つまたは複数の熱要素と、
該多室熱ゾーンに関連付けられる該領域内に包含される該室を選択的に加熱または冷却するように、該多室熱ゾーンを画定する該１つまたは複数の熱要素の動作を制御するようにプログラムされるコントローラと
を備える、機器。
（項目３４３）
上記容器と熱的に連通するように配置され、各々の単一室熱ゾーンと該容器の１つの室の全部または一部を包含する該容器の関連領域との間で熱エネルギーを伝達するように構成、配列される１つまたは複数の単一室熱ゾーンを画定する１つまたは複数の熱要素を備え、上記コントローラは、該単一室熱ゾーンを画定する該熱要素の動作を制御して該単一室熱ゾーンに関連付けられる該領域内に包含される該室を選択的に加熱または冷却するようにプログラムされる、項目３４２に記載の機器。
（項目３４４）
上記熱要素は、上記コントローラによって制御される１つまたは複数のペルチェ装置を備え、これにより、該ペルチェ装置が熱的接触している本体を選択的に加熱または冷却する、項目３４２または３４３に記載の機器。
（項目３４５）
上記熱要素は、熱伝導性材料から形成される熱伝達要素を備え、該熱伝達要素は、該熱伝達要素によって定められる多室熱ゾーンの所定の形状に対応する周辺形状を有する、項目３４２から３４４のいずれか一項に記載の機器。
（項目３４６）
上記熱伝達要素と熱的に連通しており、該熱伝達要素の温度を感知し、かつ、該感知された温度を上記コントローラに伝達するように適合されている温度センサーをさらに備える、項目３４５に記載の機器。
（項目３４７）
上記熱伝達要素は、上記機器内に、上記容器に対して固定された位置に保持される、項目３４５または３４６に記載の機器。
（項目３４８）
上記熱伝達要素は、アルミニウムから形成される、項目３４５から３４７のいずれか一項に記載の機器。
（項目３４９）
上記熱要素は、
１つまたは複数のペルチェ装置であって、該ペルチェ装置が熱的接触している本体を選択的に加熱または冷却するように上記コントローラによって制御される、ペルチェ装置と、
各々の多室熱ゾーンに関連付けられる熱伝達要素であって、熱伝導性材料から形成され、概して平坦な表面と該熱伝達要素によって画定される多室熱ゾーンの所定の形状に対応する周辺形状とを有する、熱伝達要素と
を備え、
該ペルチェ装置は、該熱伝達要素と熱的に接触している、項目３４２または３４３に記載の機器。
（項目３５０）
各々の多室熱ゾーンは、非熱伝導性材料を含む構造を分離することによって他の多室熱ゾーンから隔てられる、項目３４２から３４９のいずれか一項に記載の機器。
（項目３５１）
上記熱伝達要素および上記分離構造は、上記機器内で、上記容器に関して固定された位置に保持される、項目３５０に記載の機器。
（項目３５２）
上記ペルチェ装置から熱を放散するように構成、配列される熱放散要素をさらに備える、項目３４４または３４９に記載の機器。
（項目３５３）
上記熱放散要素は、伝導性材料から形成され、少なくとも１つのペルチェ装置と熱的に連通する一方の側と熱放散フィンがブロックから伸びている反対の側とを有する遮断を含むヒートシンクを備える、項目３５２に記載の機器。
（項目３５４）
上記熱放散要素は、上記ヒートシンクに隣接して配置され、該ヒートシンクの上記熱放散フィン上に空気流を発生するように構成されているファンをさらに備える、項目３５３に記載の機器。
（項目３５５）
上記ファンの動作は、上記コントローラによって制御される、項目３５４に記載の機器。
（項目３５６）
上記ヒートシンクは、アルミニウムから形成される、項目３５３から３５５のいずれか一項に記載の機器。
（項目３５７）
各々の熱ゾーンの温度を感知し、該感知された温度を上記コントローラに伝達するための１つまたは複数の温度センサーをさらに備える、項目３４２から３５６のいずれか一項に記載の機器。
（項目３５８）
上記コントローラは、上記熱要素の動作を制御し、規定された温度範囲内に周囲温度を確定するように構成される、項目３４２から３５７のいずれか一項に記載の機器。
（項目３５９）
上記規定された温度範囲は、約２０℃から４０℃までである、項目３５８に記載の機器。
（項目３６０）
上記規定された温度範囲は、約２５℃から３７℃までである、項目３５８に記載の機器。
（項目３６１）
上記コントローラは、上記熱要素の動作を制御し、１つまたは複数の室を加熱して規定された温度範囲内の温度にするように構成される、項目３４２から３６０のいずれか一項に記載の機器。
（項目３６２）
上記規定された温度範囲は、温度循環を必要とする処理を実行するのに要求される温度を包含する、項目３６１に記載の機器。
（項目３６３）
上記規定された温度範囲は、約５℃から９５℃までである、項目３６２に記載の機器。
（項目３６４）
上記処理は、ＰＣＲ増幅反応である、項目３６２に記載の機器。
（項目３６５）
上記コントローラは、上記熱要素の動作を制御し、多室熱ゾーンに関連付けられる領域に包含される室の内容物を加熱または冷却して所定の時間内に所定の温度にするように構成される、項目３４２から３６４のいずれか一項に記載の機器。
（項目３６６）
上記１つまたは複数の熱要素は、少なくとも２つの多室熱ゾーンを画定する、項目３４２から３６５のいずれか一項に記載の機器。
（項目３６７）
容器が上記機器内の上記動作可能位置において支持されているときに、上記多室熱ゾーンに関連付けられる上記領域内に包含されている室に流体を充填して、該室と該多室熱ゾーンとの間の熱的連通を増加させる、項目３４２から３６６のいずれか一項に記載の機器。
（項目３６８）
複数の相互接続された室を有する容器内で物質を加熱または冷却する方法であって、
分析装置に含まれる１つまたは複数の多室熱ゾーンと熱的に連通するように該容器を配置するステップであって、各々の多該室熱ゾーンは該容器の２つまたはそれ以上の、ただし全数未満の該室のうちの各々の全部または一部を包含する該容器の領域に関連付けられる、ステップと、
各々の多室熱ゾーンと、該多室熱ゾーンに関連付けられる該領域によって包含される該室との間で熱エネルギーを伝達することにより、該包含される室の中に含まれる物質を選択的に加熱または冷却して、少なくとも１つの他の領域によって包含される該室の温度と異なる温度にするステップと
を含む、方法。
（項目３６９）
上記分析装置内に含まれる１つまたは複数の単一室熱ゾーンと熱的に連通する上記容器を配置するステップをさらに備え、各々の単一室熱ゾーンは該容器の１つの室の全部または一部を包含する該容器の領域に関連付けられる、項目３６８に記載の方法。
（項目３７０）
上記伝達するステップは、１つまたは複数のペルチェ装置を使って多室熱ゾーンを加熱または冷却するステップを備える、項目３６８または３６９に記載の方法。
（項目３７１）
上記分析装置の上記周囲温度は、上記方法の間に各々の多室熱ゾーンに関連付けられる上記容器の上記領域によって包含される室の中に収納される物質の温度と異なる、項目３６８から３７０のいずれか一項に記載の方法。
（項目３７２）
上記伝達するステップは、上記多室熱ゾーンの少なくとも１つを加熱および冷却することを交互に行うステップを備える、項目３６８から３７１のいずれか一項に記載の方法。
（項目３７３）
各々の多室熱ゾーンを他の熱ゾーンから熱的に分離するステップをさらに備える、項目３６８から３７２のいずれか一項に記載の方法。
（項目３７４）
上記多室熱ゾーンから熱を放散するステップをさらに備える、項目３６８から３７３のいずれか一項に記載の方法。
（項目３７５）
各々の多室熱ゾーンの温度を感知するステップをさらに備える、項目３６８から３７４のいずれか一項に記載の方法。
（項目３７６）
多室熱ゾーンに関連付けられる上記容器の上記領域によって包含される室を拡大して、該拡大した室と該関連する多室熱ゾーンとの間の熱的な連通を増加させるステップをさらに備える、項目３６８から３７５のいずれか一項に記載の方法。
（項目３７７）
上記分析装置は、少なくとも３つの多室熱ゾーンを含む、項目３６８から３７６のいずれか一項に記載の方法。
（項目３７８）
上記複数の相互接続される室の各々は、上記容器の少なくとも１つの他の室に隣接する、項目３６８から３７７のいずれか一項に記載の方法。
【図面の簡単な説明】
【０１４０】
【図１Ａ】図１Ａ〜１Ｃは、本発明の態様を具現化する多室型容器を例示する平面図である。
【図１Ｂ】図１Ａ〜１Ｃは、本発明の態様を具現化する多室型容器を例示する平面図である。
【図１Ｃ】図１Ａ〜１Ｃは、本発明の態様を具現化する多室型容器を例示する平面図である。
【図２】図２は、本発明の態様を具現化するシステムの機能アーキテクチャの概略ブロック図である。
【図３】図３は、本発明の態様を具現化する自動化機器の分解斜視図である。
【図４】図４は、機器の圧力機構クラスタの圧縮パッドの配列構成を例示する略図である。
【図５】図５は、機器のドアアセンブリの前側の平面図である。
【図６】図６は、本発明の態様を具現化する蛍光光度計の分解斜視図である。
【図７】図７は、蛍光光度計の後部筺体の斜視図である。
【図８Ａ】図８Ａは、蛍光光度計の後部筺体の端面図である。
【図８Ｂ】図８Ｂは、図８Ａの直線８Ｂ−８Ｂにそって切り取った後部筺体の断面図である。
【図８Ｃ】図８Ｃは、図８Ｂの直線８Ｃ−８Ｃにそって切り取った後部筺体の断面図である。
【図９Ａ】図９Ａは、蛍光光度計の端面図である。
【図９Ｂ】図９Ｂは、図９Ａの直線９Ｂ−９Ｂにそって切り取った蛍光光度計の断面図である。
【図９Ｃ】図９Ｃは、図９Ｂの直線９Ｃ−９Ｃにそって切り取った蛍光光度計の断面図である。
【図１０Ａ】図１０Ａおよび１０Ｂは、それぞれ信号検出器と一体化されている圧縮パッドの一実施形態の側面図および上面図である。
【図１０Ｂ】図１０Ａおよび１０Ｂは、それぞれ信号検出器と一体化されている圧縮パッドの一実施形態の側面図および上面図である。
【図１１】図１１は、信号検出器と一体化されている圧縮パッドの一代替実施形態の斜視図である。
【図１２Ａ】図１２Ａは、本発明の態様を具現化する多室型容器の一代替実施形態を例示する平面図である。
【図１２Ｂ】図１２Ｂは、図１２Ａの容器の分解斜視図である。
【図１３】図１３は、本発明の態様を具現化する自動化機器の一代替実施形態の正面斜視図である。
【図１４】図１４は、筺体の内部を示すために外部筺体の上部分が取り除かれている、図１３の機器の後面斜視図である。
【図１５】図１５は、外部筺体の上部分が取り除かれている、図１３の機器の正面斜視図である。
【図１６】図１６は、図１３の機器の圧力機構クラスタの圧縮パッドの配列構成を例示する正面略図である。
【図１７Ａ】図１７Ａは、図１３の機器の空気分流板および取り付けられている構成要素の後面斜視図である。
【図１７Ｂ】図１７Ｂは、機器の空気圧システムの回路図である。
【図１８】図１８は、信号検出器と一体化されている圧縮パッドの一代替実施形態の断面図である。
【図１９】図１９は、磁石アクチュエータと一体化されている圧縮パッドの一代替実施形態の断面図である。
【図２０】図２０は、図１３の機器の温度制御システムの分解斜視図である。
【図２１】図２１は、図６〜９Ｃの蛍光光度計用の相互接続回路および電源の略図である。
【図２２】図２２は、蛍光光度計用の制御、処理、および通信回路の略図である。
【図２３】図２３は、蛍光光度計の電圧測定およびＬＥＤ制御を行うための回路の略図である。
【図２４】図２４は、蛍光光度計用のＬＥＤ、ＲＦ遮蔽、および電力フィルタリング回路の略図である。
【図２５Ａ】図２５Ａは、蛍光光度計用の第１のフロントエンド増幅器回路の略図である。
【図２５Ｂ】図２５Ｂは、蛍光光度計用の第２のフロントエンド増幅器回路の略図である。
【図２６】図２６は、蛍光光度計用の復調回路の略図である。
【図２７】図２７は、一組の手動で実行されるリアルタイム増幅反応に対する検出された相対蛍光単位と時間との関係を示すグラフである。
【図２８】図２８は、本発明の態様を具現化する液体試薬および容器および機器を使用して実行される一組のリアルタイム増幅反応に対する検出された相対蛍光単位と時間との関係を示すグラフである。
【図２９】図２９は、本発明の態様を具現化する、尿試料、液体試薬および容器および機器を使用して実行される一組のリアルタイム増幅反応に対する検出された相対蛍光単位と時間との関係を示すグラフである。
【図３０】図３０は、本発明の態様を具現化する乾燥された試薬および容器および機器を使用して実行される一組のリアルタイム増幅反応に対する検出された相対蛍光単位と時間との関係を示すグラフである。
【図３１】図３１は、増幅および／または酵素試薬に油を入れた場合と入れない場合に実行される一組のリアルタイム増幅反応に対する検出された相対蛍光単位と時間との関係を示すグラフである。
【発明を実施するための形態】
【０１４１】
本発明は、物質の化学組成を決定する、一群の代謝酵素の活性を測定する、または試料中に１つまたは複数の分析対象が存在するかどうかを検査することなどの、注目する試料を使って１つまたは複数の手動の、もしくは自動化された処理を実行するために使用されうる多室型容器に関するものである。容器の室のうちのいくつかまたはすべては、室と室との間に物質を移動できるように恒久的に、または一時的に開放できる遮断または封止されている通路を使って相互接続される。容器内の室の配列構成は、１つまたは複数の処理の異なるステップを非順次的に、および／または同時に実行できるようにすることによって複合処理を実行できるようにするものである。
【０１４２】
本発明の容器は、柔軟な、または剛性のある材料、さらにはその組み合わせで構成できるが、ただし、これらの容器では室と室との間で物質を圧入または吸引できることを条件とする。これらの室のうちの少なくともいくつかは、試料材料を装填するのに先立って、処理材料（例えば、試薬）が事前充填され、次いで、封入または密封で環境から遮断されるようにできる。処理材料および試料材料は、液体、固体、気体、またはこれらの組み合わせから構成されうる。試料材料が１つまたは複数の室の中に装填された後、容器を封止するか、または他の何らかの方法で閉じて、手順実行中に容器内のすべての材料を保持するようにできる。その代わりに、手順の開始後に試料材料の一部または全部が容器に加えられるように手順が開始された後に試料室を開いたままにしておいてもよい。
【０１４３】
室と室とを相互接続する通路は、隣接する室の間を物質が通過可能な大きさを有し、配列される。物質は、好ましくは流体または流動化された物質であり、例えば、ゲル、乳濁液、懸濁液、および固形物を含むものとすることができ、固形物は、通路だけを通って、または例えば、不活性油などの流体担体を使用して運ぶことができる。物質が通路を通って移動することを、このような移動が望ましい状況になるまで遮断しておく障壁が形成される。容器、または自動化機器と連携する容器は、１つまたは複数の種類の障壁を備えることができる。このような障壁は、容器の材料で構成されるか（例えば、開放可能なシール）、または通路に隣接する位置に配置されるか、または通路内に挿入される固定された、または移動可能な、または変更可能な構成要素または物質であるか（例えば、弁、磁気応答性粒子、または感熱ワックスプラグ）、または可逆圧縮力を通路に付与する自動化機器の構成要素とすることができる（例えば、アクチュエータ）。
【０１４４】
隣接する室の間の障壁を変更するか、または取り外すことで、一方の室の中に存在する物質を隣接する室の中に押し込むか、または引き込むことができる。この移動は、例えば、圧力を室の外側に付与して室を潰すか、または部分的に潰して材料の全部または一部を室と室との間に押し込むように適合されているアクチュエータまたは一群のアクチュエータなどの圧力源の作用によって達成されうる。材料は、例えば、組み合わされた材料の混合が望ましい場合に室と室との間で一方向に、または双方向に移動させることができる。
【０１４５】
室は、処理の複数のステップを互いに独立に実行できるようにする少なくとも２つの非直線的経路があるように容器内に配列される。これは、２つまたはそれ以上の組の室の物質が混合されるか、または組み合わされてから、その結果として得られる混合または組み合わせ、または別の組の室の基礎をなす物質が互いに接触するようにできるという点で大きなメリットをもたらす。処理ステップを互いに独立に実行できるようにすることにより、直線的に実行できない、または好ましくは直線的に実行されない一連のステップ（つまり、ステップは順次実行される）を有する複合手順は、本発明の容器を使って実行できる。
【０１４６】
本発明の容器およびシステムの設計はコンパクトであるため、ポイントオブケアおよび現場用途で使用するのに特に適している。処理を実行するために必要な処理材料を事前充填された室を密封することにより、汚染およびユーザーエラーの問題が実質的に最小限に抑えられる。本発明の容器は、さらに、単位用量試験には理想的であり、容器の室は、検査を実施するために必要な正確な量の処理材料を事前装填される。
【０１４７】
本発明は、さまざまな形態で具現化することができるが、以下の説明および付属の図面は、これらの形態のうちのいくつかを本発明の特定の例としてのみ開示することを意図されている。したがって、本発明は、そのように説明され例示されている形態もしくは実施形態に限定されることを意図されていない。
【０１４８】
（定義）
以下の用語は、別に明記されていない限り以下の意味を有する。「１つの」（付けない場合もある）（英語原文中の「ａ」または「ａｎ」という語）実体は、その実体の１つまたは複数を指し、例えば、「１つの分析対象」は、１つまたは複数の分析対象を表すものと理解されることに留意されたい。したがって、「１つの」、「１つまたは複数の」、および「少なくとも１つの」（「ａ」、「ａｎ」、および「ａｔ  ｌｅａｓｔ  ｏｎｅ」）という語は、本明細書では入れ替えて使用することができる。
【０１４９】
隣接する／隣接して。室を参照する場合、「隣接する」（「ａｄｊａｃｅｎｔ」）または「隣接して」（「ａｄｊａｃｅｎｔｌｙ」）という語は、参照されている室が互いに隣接していることを意味する（つまり、これらの室は、容器内で互いに直接隣り合うように位置する）。処理が開始されたときに容器の隣接する室を分離する唯一の構造は、シールである。したがって、隣接して配置される室は、チャネルまたは通路によって互いに接続されることはない。
【０１５０】
増幅／増幅反応。「増幅」または「増幅反応」とは、試料中の分析対象の存在を示す物質の量、濃度、または検出可能性を高めるための手順を意味する。
【０１５１】
増幅条件。「増幅条件」は、増幅反応をもたらすのに適した温度条件を意味する。
【０１５２】
増幅オリゴヌクレオチド。「増幅オリゴヌクレオチド」は、標的核酸、またはその相補体に結合し、核酸増幅反応に関与するオリゴヌクレオチドを意味する。
【０１５３】
増幅産物。「増幅産物」は、検出対象の標的配列を含む核酸増幅反応で生成される核酸を意味する。
【０１５４】
増幅試薬。「増幅試薬」は、増幅反応に必要な１つまたは複数の成分を含む材料を意味する。核酸増幅反応では、このような成分として、増幅オリゴヌクレオチド（例えば、プライマーおよび／またはプロモータープライマー）、ヌクレオシド三リン酸、および／または標的核酸配列の増幅に必要な補因子（例えば、Ｍｇ＋＋などの二価陽イオン）を挙げることができる。
【０１５５】
分析対象。「分析対象」は、分析を受ける試料、または試料の成分を意味する。
【０１５６】
検定。「検定」は、１つまたは複数の分析対象の定性的または定量的分析を意味する。
【０１５７】
障壁。「障壁」は、空間と空間との間の物質の移動を妨げるか、または防ぐ構造もしくは材料を意味する。
【０１５８】
遮断（される）。「遮断（される）」は、物質の移動に対して閉ざされていることを意味する。
【０１５９】
結合剤。「結合剤」は、試料または反応混合物の成分に結合できる分子または分子複合体を意味する。結合剤は、例えば、抗体、抗原、ペプチド、タンパク質、核酸またはその類似体、有機分子、または前記の物質の複合体（例えば、抗体：核酸複合体）とすることができる。
【０１６０】
破裂性シール。「破裂性シール」は、十分な圧力がシールに付与されたときに破裂または剥離するシールを意味する。
【０１６１】
捕捉剤。「捕捉剤」は、分析対象に結合することができ、また固相担体に直接または間接的に結合されうる結合剤を意味する。
【０１６２】
捕捉プローブ。「捕捉プローブ」は、核酸分析対象に結合できる結合剤を意味する。
【０１６３】
室。「室」は、容器内の明確に区別できる区画または空間を意味する。
【０１６４】
室を定める部材。「室を定める部材」は、室の容積を決定するものの全体（例えば、膀胱）または一部分（例えば、壁）を意味する。室を定める部材は、単一構成要素（例えば、１つの層）または複数の構成要素（例えば、一緒に結合されている複数の層）からなるものとすることができる。
【０１６５】
閉じられる／閉じる（または閉鎖）。室を参照する場合、「閉じられる（閉鎖される）」または「閉じる（閉鎖する）」は、容器の室が、流体的に連通していないか、または室が容器の他のどの室とも流体的に連通していない状態に置かれることを意味する。試料保持容器を参照する場合、「閉じられる（閉鎖される）」は、容器のすべての室が、周囲環境に関して実質的に気密状態の環境に保持されることを意味する。試料を加える前の容器を参照する場合、「閉じられる（閉鎖される）」は、試料収容室を除く容器のすべての室が、周囲環境に関して実質的に気密状態の環境に保持されることを意味する。
【０１６６】
濃縮（する）。「濃縮（する）」は、室の中の１つまたは複数の成分の分散を制限することを意味する。
【０１６７】
室の隣接経路。「室の隣接経路」は、一連の隣接して接続されている室を意味する。
【０１６８】
直接接続（される）。「直接接続（される）」は、２つの参照されている室の間の接続にどのような室も介在していないことを意味する。
【０１６９】
明確に区別できる接続部。「明確に区別できる接続部」は、容器の他の接続部から隔てられ、重なり合わない接続部を意味する。
【０１７０】
末端室。「末端室」は、室の直線経路の一番外側の室を意味する。
【０１７１】
酵素試薬。「酵素試薬」という語句は、処理に関与する少なくとも１つの酵素を含む材料を指す。核酸増幅反応では、酵素試薬は、ＤＮＡまたはＲＮＡの既存の鎖を鋳型として使用してＤＮＡおよび／またはＲＮＡポリヌクレオチドの合成を触媒する１つまたは複数の酵素を含むことができる。このような酵素の例としては、ＤＮＡ依存性ＤＮＡポリメラーゼ（例えば、大腸菌のＤＮＡポリメラーゼＩおよびバクテリオファージＴ７  ＤＮＡポリメラーゼ）、ＤＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼまたは転写酵素（例えば、大腸菌のＤＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼおよびバクテリオファージＴ７、Ｔ３、およびＳＰ６）、ＲＮＡ依存性ＤＮＡポリメラーゼまたは逆転写酵素、およびＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼ（例えば、ＲＮＡレプリカーゼ）が挙げられる。
【０１７２】
柔軟な（または軟質）。「柔軟な（または軟質）」は、引き裂いたり破いたりせずに合理的な力の作用で撓みうる材料の特性を意味する。
【０１７３】
流体。「流体」は、流れる傾向を有するか、または容器の形状に適合する傾向を有する物質（例えば、液体または気体）を意味する。流体は、乳濁液などの液体または気体の流動化された物質または混合物とすることもできる。本明細書で使用されているように、「流体」という用語は、さらに、その形状を変化させることによって圧力の作用に従う、ペーストなどの物質を指す。
【０１７４】
流動化。「流動化」は、流体特性を有する形態または媒質となるように変更された物質を意味する。
【０１７５】
非混和性流体。「非混和性流体」は、容器内に収納されている１つまたは複数の液体と混合しない流体を意味する。
【０１７６】
免疫検定。「免疫検定」は、抗体−抗原相互作用を伴う検定を意味する。
【０１７７】
独立に組み合わせる。「独立に組み合わせる」という語句は、容器の明確に区別できる室の中で２つまたはそれ以上の組の物質を別々に組み合わせて、その際に物質の別々の組み合わせが互いに接触しないようにすることを意味する。
【０１７８】
間接的に接続（される）。「間接的に接続（される）」は、２つの参照されている室の間の接続に１つまたは複数の室が介在していることを意味する。
【０１７９】
相互接続（される）。「相互接続（される）」という語は、開放可能な接続部の場合のように、流体的に接続されているか、または接続可能である室を指す。
【０１８０】
〜との間の中間にある。「〜との間の中間にある」という語句は、参照されている室が、２つの他の識別された室の間に、それらの室のそれぞれと同じ直線経路内で配置されているか、または参照されている室が、２つの他の識別された室の間に、それらの室のそれぞれと異なる直線経路内に配置されていることを意味する。
【０１８１】
中間の室。「中間の室」は、少なくとも２つの他の室への開放可能な接続部によって接続されている室を意味する。
【０１８２】
分離（される）。「分離（される）」は、試料の１つまたは複数の成分が、その試料の１つまたは複数の他の成分から隔離されることを意味する。
【０１８３】
標識。「標識」は、検出可能な特性を有する物質を意味する。
【０１８４】
直線経路。「直線経路」は、複数の開放可能な接続部によって相互接続され、最初の末端室、最後の末端室、および最初の末端室と最後の末端室との間に配置されている１つまたは複数の中間の室によって定められる連続的に順序付けられている室の隣接経路を意味する。
【０１８５】
非円形配列構成。「非円形配列構成」という語句は、２つまたはそれ以上の直線経路を含む相互接続された室の、直線経路の末端室が中央にある室を中心として円形に配列されていない、配列構成を指す。
【０１８６】
非直線的。「非直線的」は、全数未満の数の室を共有する連続的に順序付けられている室の少なくとも２つの隣接経路を意味する。
【０１８７】
非順次的。「非順次的」は、処理の特定のいくつかのステップが、順序通りにではなく、互いに無関係に実行されることを意味する。
【０１８８】
核酸増幅。「核酸増幅」は、核酸の存在に依存する増幅反応を意味する。
【０１８９】
オリゴヌクレオチド。「オリゴヌクレオチド」は、少なくとも２つ、一般的には約５から約１００個までの化学的サブユニットのポリマー鎖を意味し、それぞれのサブユニットはヌクレオチド塩基部分、糖部分、および直線的空間構成でサブユニット同士を結合する結合部分を含んでいる。一般的なヌクレオチド塩基部分は、グアニン（Ｇ）、アデニン（Ａ）、シトシン（Ｃ）、チミン（Ｔ）、およびウラシル（Ｕ）であるが、水素結合できる他の微量の、または修飾されたヌクレオチド塩基も、当業者によく知られている。オリゴヌクレオチドは、適宜、糖部分、塩基部分、および骨格構成要素のうちのどれかの類似体を含みうる。本発明の好ましいオリゴヌクレオチドは、大きさに関して、約１０から約１００個までの残基を含む。オリゴヌクレオチドは、天然のものから精製してもよいが、好ましくは、さまざまなよく知られている酵素法または化学的な方法を用いて合成される。
【０１９０】
開放可能な接続部。「開放可能な接続部」は、接続部が障壁によって遮断されている「閉鎖」状態から物質が通路内の開口部を通過できるように障壁が修正または移動されている「開放」状態に一時的に、または恒久的に変更できる通路を意味する。
【０１９１】
光透過。「光透過」という語句は、光の通過を許す材料を指す言葉であり、これらの材料の一方の側で放射される光は、これらの材料の反対側に位置する光学装置によって検出可能である。
【０１９２】
プライマー。「プライマー」は、鋳型に依存してポリメラーゼの存在下その３’末端を延長できる増幅オリゴヌクレオチドを意味する。
【０１９３】
プローブ。「プローブ」は、反応混合物中の分析対象または他の物質に結合して処理の条件の下で試料中の分析対象の存在を示す検出可能なプローブ：標的複合体を形成する結合剤を意味する。核酸に基づく反応では、プローブは、検出可能なプローブ：標的複合体を形成するために標的核酸の存在を示す核酸配列に十分相補的な塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを含む。プローブは、さらに、固相担体上にプローブを固定化するための配列、プロモーター配列、ＲＮＡ転写のための結合部位、制限エンドヌクレアーゼ認識部位、または検出および／または増幅を促進するために使用できる、触媒活性部位もしくはヘアピン構造などの所望の二次もしくは三次構造を与える配列などの非相補的配列を含むことができる。定義されている配列のプローブは、化学合成および組み換え核酸分子からのｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはｉｎ  ｖｉｖｏ発現などの、当業者に知られている技術によって生成できる。
【０１９４】
処理。「処理」は、結果を引き起こすために物質に対し実行される、または物質とともに実行される一連の作用、変化、または機能を意味する。
【０１９５】
精製（される）。「精製（される）」は、試料の１つまたは複数の成分が、その試料の１つまたは複数の他の成分から除去されることを意味する。
【０１９６】
試薬。「試薬」は、化学的反応、生化学的反応、または生物学的反応における反応物、希釈剤、溶媒、洗浄材料、すすぎ材料、緩衝液、および同様の材料を含む、処理で使用される非試料物質を意味する。
【０１９７】
リアルタイム。「リアルタイム」という語句は、反応の特性が、反応が生じて続いているときに検出されるか、または検出できることを意味する。
【０１９８】
容器。「容器」は、物質を収容および／または保持することができる複数の相互接続された室を有する装置を意味する。
【０１９９】
再構成試薬。「再構成試薬」は、非流体処理材料を流体または流動化状態に変更するために使用される試薬を意味する。
【０２００】
試料。「試料」は、処理に全部または一部曝すことができる物質を意味する。
【０２０１】
試料処理試薬。「試料処理試薬」は、試料の元の状態を変える、または変えるために使用される試薬を意味する。
【０２０２】
試料収容室。「試料収容室」は、処理すべき試料を収容するために開いたか、または開放可能な容器の室を意味する。
【０２０３】
シール。「シール」は、隣接する室の間に形成される障壁を意味する。シールは、例えば、対向する熱可塑性シートの間に形成されるヒートシールとすることができる。
【０２０４】
標的核酸。「標的核酸」は、核酸分析対象を意味する。
【０２０５】
標的配列。「標的配列」は、標的核酸または検出検定において増幅され、および／または検出されるその相補体内に含まれる核酸配列を意味する。
【０２０６】
水蒸気透過速度。「水蒸気透過速度」または「ＷＶＴＲ」は、水蒸気が温度および相対湿度の指定条件で材料を透過する定常状態速度を意味する。水蒸気透過速度の値は、ｇ／ｍ２／２４時間単位で表される。ミネソタ州ミネアポリス所在のＭＯＣＯＮ，Ｉｎｃ．社から市販されているＰＥＲＭＡＴＲＡＮ−Ｗ（登録商標）水蒸気透過速度計測器（モデル３／３３）は、ＡＳＴＭ  Ｆ１２４９に従ってＷＶＴＲを測定するために使用できる。
【０２０７】
（多室型容器）
本発明による容器は、１つまたは複数の処理を実行するようにアレイ状に並ぶ複数の相互接続された非直線状に配列された室を備える。容器の正確な寸法は、室の数および配列構成、さらにはそれらの室に装填または移動される物質の量に依存する。容器は、好ましくは、その厚さに関して比較的広い表面積を有するが、これは必須条件というわけではない。容器は、好ましくは上部および底部から形成され、それぞれ剛性のある、および／または柔軟な材料で作ることができる。好ましい様式では、好ましい容器の上部および底部のうちの少なくとも一方は、少なくとも部分的に柔軟である。
【０２０８】
室の非直線的な配列構成により、容器内の試料を非順次的に処理することができる。室の正確な数、構成、大きさ、および配列構成は、実行される特定の１つまたは複数の処理に依存する。周囲の容器材料と明確に異なり、これらの室は、剛性のある、または柔軟な材料、またはそれらの組み合わせで構成できる。材料の選択は、室が室と室との間で物質を移動するために外力の作用でたわまなければならないかどうかに一部は依存する。これらの室は、室と室との間の物質の移動に干渉しない形状のものとすることができ、これは、半球形および球形を含む、概ね平面状の、または気泡状の形状を含む。好ましい一実施形態では、これらの室は、概ね平坦であり、また物質を開いた接続通路を通して隣接する室に流し込む涙滴形状を有する。涙滴形状の室は、さらに、圧力を接続通路に集中させ、これにより、隣接する室へのアクセスを一時的に遮断するために使用されるシールおよび弁などの障壁をより容易に開けるため有利である。これらの室は、同じ、または異なる形状および／または大きさを有することができる。
【０２０９】
容器の室を接続するために使用される通路は、例えば、処理内で使用される物質を室と室との間で移動させることができる寸法を有する入口または通路とすることができる。入口の場合、隣接する室を隔てるのは、シールまたは他の障壁が実質的にすべてである。その一方、通路は、室と室との間に延びる導管を含む。入口が好ましいのは、容器の設計がコンパクト化され、さまざまな室の間の材料の移動距離が小さくて済むからである。廃棄物室に至る通路など通路の一部は、処理全体を通じて開いたままであってよいが、他の通路は、室と室との間で物質を移動する必要が生じるまで障壁によって遮断される。障壁は、物質移動接続部を形成するために「閉鎖」状態から「開放」状態に選択的に変更することができ、この物質移動接続部は好ましくは流体および物質を流動化形態で移動するための流体移動接続部である。障壁は、例えば締め付け装置によってもたらされる圧縮力などの外力とすることができるか（例えば、締め付けパッドを有する空気圧駆動アクチュエータ）、あるいは室と室との間に開口部を形成するように圧力の作用を受けて曲がるか、または機械的に作動されるか、または例えば、熱、レーザー切断、もしくは化学的もしくは生化学的反応によって変化するシールもしくは弁とすることができるか、あるいは外力／シールの組み合わせとすることができる。好ましい一実施形態では、通路は、使用時に圧縮力で強化されるＶ字型または山形シールなどのヒートシールで遮断される。いくつかの障壁の遮断特性は、熱などの条件の影響を受けるように設計されるか（例えば、ワックスプラグ）、または室の中に移動されるか、または形成される化学薬剤の影響を受けうるが、容器内に形成されるか、または配置される障壁は別に環境条件または室の中に収納される物質の影響を受けるべきではない。
【０２１０】
隣接する室を隔てる障壁が、取り除かれるか、または変更されて開口部を形成した後、重力などによって、物質を隣の室の中に押し込むか、圧縮して入れるか、引き込むか、または他の何らかの方法で移動させることができる。ローラーまたはアクチュエータ駆動圧縮パッドなどの押付力を室に作用させて、室と室との間で物質を移動させる場合には、室は、押付力の圧力の作用でたわむ少なくとも１つの柔軟な表面を有するように形成される。他の場合には、これらの室は、パッドまたは真空を用いて物質を隣接する室の中に押し込むか、または引き込む場合のように、剛性のある材料で構成することができる。これは、重力が収容室の上に位置する室から物質を引き出す場合に成り立つことであるが、いくつかの用途では、物質を室と室との間で往復させて２つの物質を混合できるように少なくとも１つの柔軟な表面を両方の室に持たせることが望ましい。
【０２１１】
これらの室は、少なくとも２つの明確に区別できる直線経路があるように容器内に配列される。これらの経路のそれぞれは、少なくとも３つの、隣接して接続される室を備え、これらの経路のうちの少なくとも１つは好ましくは５つまたはそれ以上の、隣接して接続される室を備える。本明細書で使用されているように、「隣接して接続される室」という語句は、一方の室が次の室の後に来る形で室が次々につながって配列されている一連の直接接続されている室を指す。これらの経路のそれぞれは、少なくとも１つの、ただし全数未満の数の室を容器内の他の経路と共有することができる。室のこのような配列構成により、処理のいくつかのステップを独立に、および／または同時に実行することができる。この方法では、複合処理で使用される物質は準備され、組み合わせるのが望ましい状況になるまで隔離状態に置かれるようにできる。このような独立の活動としては、例えば、物質を溶解すること、希釈すること、混合すること、組み合わせること、または反応させることを挙げることができる。例に過ぎないが、一組の隣接する室は、試料中に存在する標的核酸配列を増幅する際に使用するための乾燥されたプライマー含有増幅試薬、および増幅試薬を再構成するための試薬を収納することができるが、他方の一組の隣接する室は、標的核酸配列を増幅し、検出する際に使用するための乾燥された酵素／プローブ試薬、および酵素試薬を再構成するための試薬を収納することができる。この特定の例において、増幅試薬および酵素／プローブ試薬を再構成形態に組み合わせるのが早すぎた場合、標的に無関係の増幅が標的の増幅に干渉するか、または増幅には十分でない試薬を消費してしまう危険性がある。例えば、Ａｄａｍｓらの「Ｄｅｃｏｙ  Ｐｒｏｂｅｓ」という表題の米国特許第６，２９７，３６５号を参照のこと。したがって、これらの試薬を別々に再構成し、次いで、標的核酸の存在下で組み合わせることが望ましい。
【０２１２】
例示することのみを目的としているが、図１Ｃは、多数の明確に区別できる直線経路を定める室の非直線的配列構成を有する容器１０を示している。この容器の可能な直線経路のいくつかは、英字で識別され、直線経路のそれぞれの室は同じ英字を有し（つまり、Ａ、Ｂ、Ｃ、またはＤ）、直線経路のそれぞれの室は明確に区別できる番号を割り当てられている。これらの経路の配列構成は、処理のステップが非順次的に実行されうるような構成である。例えば、試料材料は、室Ａ３内で分析対象を分離し精製する前に、室Ａ２に加えられ、室Ａ１から供給される結合剤と混合されうる。同時に、または異なるときに、室Ｂ２内の第１の乾燥された、または固形の処理材料が、室Ｂ１から供給された第１の再構成試薬（例えば、第１の溶媒）と一緒に再構成されうる。また、同時に、または異なるときに、室Ｂ４内の第２の乾燥された、または固形の処理材料が、室Ｂ５から供給された第２の再構成試薬（例えば、第２の溶媒）と一緒に再構成されうる。最後に、分析対象を検出するために、精製された分析対象ならびに再構成された第１および第２の処理材料が、室Ｂ３またはＢ４内で組み合わされるようにできる。図１Ｃには４つの明確に区別できる直線経路しか明示されていないが、他の可能な直線経路および直線経路の組み合わせも利用できることはただちにわかる。
【０２１３】
容器内の室が非直線的配列構成であるため、同じ、または異なる種類の複数の処理を実行する際にこれらの室を利用しやくできる。これは、物質および／または処理間で共有されない室が処理の実行中に分離されたままであるように、これらの室を配列できるからである。したがって、本発明は、複数の用途のために、処理材料を事前装填することを含む単一の容器の設計および製造が可能な「ユニバーサル」容器にも関係する。この方法では、エンドユーザーは、実行される処理毎に異なる容器を用意する必要も、また特定の処理の容積要件を予め予測しておく必要もない。本発明の室および障壁を形成するために使用される材料は、処理を実行するために使用されるさまざまな物質の許容可能な安定性および反応性のレベルを維持するように選択されるべきである。このような材料は、例えば、水分によって変化したり、劣化したり、または水分の何らかの影響を受ける物質に対する水分障壁を形成できる。代替えの、または補完的なアプローチでは、酸化カルシウムなどの乾燥剤を乾燥された処理材料とともに装填し、室の中の水分の影響を最小限に抑えることができる。容器内で処理が実行されているときに、乾燥された処理材料を伴う反応に干渉したり、または変化させることがないように乾燥剤を隔離しておくことが望ましいことがある。乾燥剤は、例えば、乾燥された処理材料を収納する室の一区画に配置するか、または乾燥された処理材料を保持している室との開いた接続部を有する隣接する室の中に乾燥剤を配置することによって隔離できる。再構成された処理材料との不要な相互作用を防ぐために、乾燥された処理材料を再構成した後、この開いた接続部を遮断しておくことが望ましいことがある。さらに他のアプローチでは、水分障壁を形成し、および／または乾燥剤を含む１つまたは複数の材料から形成された容器内に容器を保管する。一般的な乾燥剤としては、粘土、シリカゲル、酸化カルシウム、および合成分子篩が挙げられる。分子篩の一例として、直径０．４５”、高さ０．１２５”のＴｙｐｅ  ４Ａ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｓｉｅｖｅ  Ｍｕｌｔｉｆｏｒｍ（登録商標）Ｔａｂｌｅｔが挙げられるが、ただし、「Ｔｙｐｅ  ４Ａ」は、細孔大きさ４オングストロームを示している（ニューヨーク州バッファロー所在のＭｕｌｔｉｓｏｒｂ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．社。製品番号０２−００６７４ＡＨ０１）。
【０２１４】
同様に、容器の材料は、酸素または電磁放射線に曝露されたときの環境影響から物質を保護するように選択できる。その代わりに、容器を形成するために使用される材料は、容器内で使用することを意図されている液体、固体、または気体の透過に対する障壁を形成する材料を選択することによって保管されている物質が互いに悪影響を生じる形で相互作用するのを防ぐように選択されうる。また、物質の活性が変化するのを防ぐため物質の蒸発を保護する材料を容器を構成する際に使用することが望ましい場合もある。さらに、使用のため選択された材料は、保管されている物質の意図された機能を著しく変化させてはならず、また１つまたは複数の処理に関与する能力に著しい影響を及ぼす形で反応物に付着したり、または他の何らかの形で反応物を結合することがあってはならない。
【０２１５】
手順が、室の中、または室と室との間で磁性粒子を濃縮または移動することを必要とする試料操作を伴う場合、容器の少なくとも一部は、隣接する位置にある磁石によって発生する磁場の作用に実質的に干渉しない材料で構成される必要がある。連続的に、または正確な期間にわたって、室の全部または一部の加熱および／または冷却を必要とする処理の場合、容器は、加熱および／または冷却を必要とする室の内容物の熱的状態に影響を及ぼすことができる容器の少なくとも一方の側にエネルギー伝達を行うことができなければならない。それに加えて、容器は、色または濁度などの試料の物理的特性の変化を検出するために、または注目する分析対象の存在を示す標識を検出することができるようにするために、可視スペクトル、赤外線スペクトル、および／または紫外線スペクトルの光を透過できる光学的に透明な部分を備えることができる。
【０２１６】
本発明の容器は、ポリマー、ガラス、シリコン、金属、セラミック、およびこれらの組み合わせなどの材料から構成することができる。使用される材料は、一部は、室と室との間で物質を移動するために選択された手段、試料中の物理的変化が視覚化されるのか、または検出された光信号でなければならないかどうか、および磁性粒子などの容器内に存在する物質を操作する方法に依存する。容器を作成するために使用される材料は、予想される輸送、保管、および使用条件の下で安定していなければならない。このような条件としては、温度、圧力、湿度、および保管時間がある。また、容器の柔軟な室を形成するために使用される材料は、破ったり、穿刺したり、破裂させたりすることなく室と室との間で物質を移動するために選択された圧力の作用によってたわまなければならない。
【０２１７】
好ましい一実施形態では、容器は、同じ、または異なる材料である柔軟な上側シートおよび下側シートから形成され、また多くの薄層からなるものとしてよい。それぞれのシートは、好ましくは、少なくとも１つの液体不浸透層を有し、これらのシートは、好ましくは、約０．０５ｍｍから２．０ｍｍの間であってよい比較的一様な厚さを有する。また、多くの薄層のうちの１つの選択領域は、好ましくは光学的に透明または半透明である。これらのシートは、例えば、箔−必要に応じて検出窓が形成されるように箔に１つまたは複数の孔を開ける−および／またはポリプロピレン（例えば、テキサス州ダラス所在のＲｅｘｅｎｅ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ社から市販されているＲｅｆｌｅｘ（登録商標）ポリオレフィン）、ポリエステル、ポリエチレン（例えば、ポリエチレンテレフタレート（「ＰＥＴ」）、およびポリエチレンナフタレート（「ＰＡＮ」））、ポリ塩化ビニル、ポリ塩化ビニリデン、ポリカーボネート樹脂（例えば、ポリフッ化ビニルフィルム）、およびポリウレタンなどの熱可塑性プラスチック材料から形成できる。特に好ましい一実施形態では、上側シートおよび下側シートは、それぞれ多くの薄層であり、これの例は、Ｐｅｒｆｌｅｘ（登録商標）箔層（ウィスコンシン州オシュコッシュ所在のＰｅｒｆｅｃｓｅａｌ社。製品番号３５７８６）に結合されたＳｃｏｔｃｈｐａｋ（登録商標）フィルム層（ミネソタ州セントポール所在の３Ｍ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ社。カタログ番号ＥＳ−４８）である。この実施形態の軟質シートを形成するために適している他の材料については、当業者によって理解されるであろう。例えば、Ｂｕｒｋｅ（１９９２年）ＷＡＡＣ  Ｎｅｗｓｌｅｔｔｅｒ１４巻（２号）：１３〜１７頁を参照のこと。
【０２１８】
例示的なラミネートとしては、Ｓｕｒｌｙｎ（登録商標）ブレンド剥離層を使用した箔被覆ＰＥＴ（４．５ミル）、共押し出し剥離層を使用した低密度ポリエチレン（「ＬＰＤＥ」）上の透明二重ＡｌＯｘ被覆ＰＥＴ（４．５ミル）、共押出し剥離層を使用した箔被覆ＬＤＰＥ（４．５ミル）、箔被覆ＬＤＰＥシール層（３．５ミル）、剥離層を使用した二軸延伸ポリアミド上の透明単一ＡｌＯｘ被覆ＰＥＴ（４ミル）、ゾーンコートで定められた壊れやすいシールを使用したＬＤＰＥシール層上の透明ＡｌＯｘ被覆ＰＥＴ（２．５ミル）、剥離シーラントを使用した箔障壁（３．５ミル）、ＬＤＰＥシール層上の透明なＡｌＯｘ被覆ＰＥＴ（２．５ミル）、ＬＤＰＥシール層上の透明なＡｌＯｘ被覆ＰＥＴ（４ミル）、ＨＤＰＥシール層を使用したＰＥＴ被覆箔、ＥＶＡベースの剥離層を使用した透明なＡｌＯｘ被覆ＰＥＴ（３ミル）、およびＳｕｒｌｙｎ（登録商標）ブレンド剥離層を使用した箔被覆ＰＥＴ（４．５ミル）、さらには不透明なポリエチレンテレフタレート（「ＯＰＥＴ」）、インク、白色ＬＤＰＥ、アルミニウム箔、ポリエチレン（「ＰＥ」）、鎖状低密度ポリエチレン（「ＬＬＤＰＥ」）、ならびにナイロンおよびＯＰＥＴのラミネート、白色ＰＥ、箔、接着剤、およびＥＺ  Ｐｅｅｌ（登録商標）Ｓｅａｌａｎｔが挙げられる。
【０２１９】
好ましい容器内の上側シートおよび下側シートの対向する内側熱封止層が結合され、当技術分野で知られている熱封止技術を使用してこれらの室の壁および隣接する室を分離する開放可能なシール（例えば、山形シール）を形成する。室の壁を定める結合部は、押付力が室に付与されたときに室の壁を剥がすのではなくむしろ室と室との間に材料が押し込まれるように室を隔てる開放可能なシールよりも強力である。室のシールに対する目標シール強度は、約９〜１０ｌｂ／インチのオーダーとしてよく、剥離可能シールに対する目標シール強度は、２．２〜２．３ｌｂ／インチのオーダーとすることができる。
【０２２０】
より具体的には、柔軟な、または半剛体の容器、あるいはパウチ−室、通路、恒久的および半恒久的（例えば、破壊可能、破裂可能、剥離可能、壊れやすいなど）シールなどの容器の特徴を含む−は、加熱フィラメント、熱封止ダイ、インパルス溶接機、または超音波溶接機もしくは他の知られている技術を使用して２つのフィルムを溶接することによって形成できる。その代わりに、差動シール強度の結合部を形成することができる接着剤、または他の結合技術も使用できる。
【０２２１】
本発明の範囲内で実装のために構成される容器は、好ましくは、結合部の剥離またはクリープを回避するために室の周辺に形成されている恒久的フィルム間結合部によって定められる室を含む。隣接する室を相互接続する通路または入口を最初に遮断するために使用される半恒久的シールは、所定の、好ましくは一貫した力の作用を受けたときに破壊または破裂して隣接する室の間に流体連通をもたらすように構成され、配列される。圧縮力を室に付与すると、力の方向に対し横断的な方向で室に収納されている流体または他の物質が横方向に膨張する。室を定める恒久的および半恒久的なフィルム間結合部は、破裂圧力、またはシール強度を好ましくは有し、これにより膨張する流体は、半恒久的シールを流体圧力で剥離または破壊する十分な力を発生するが、室の周囲の残り部分を定める恒久的結合部を剥離するのに十分な力を発生することはない。当技術分野でよく知られているように、知られている技術によって形成されたシールまたは結合部の破裂圧力、またはシール強度は、結合される材料の性質、材料の界面における温度、材料に付与される圧力、および組み立てられたフィルムが高温および高圧に曝される際の滞留時間または期間を含む、多数の因子によって決まる。
【０２２２】
差動シール強度の結合部を有するそのような容器を形成するための方法は、当技術分野でよく知られている。例示的な開示は、Ｊｏｈｎｓｏｎらの「Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ  Ｔｅｓｔ  Ｐａｃｋ  ａｎｄ  Ｐｒｏｃｅｓｓ  ｆｏｒ  Ａｎａｌｙｓｉｓ」という表題の米国特許第３，４７６，５１５号、第３段の３６〜５６行、Ｆｒｅｓｈｏｕｒらの「Ｆｌｅｘｉｂｌｅ  Ｐａｃｋａｇｅｓ  Ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  Ｎｏｎｆｕｓｉｂｌｅ  Ｈｉｇｈ  Ｐｅｅｌ  Ｓｔｒｅｎｇｔｈ  Ｈｅａｔ  Ｓｅａｌｓ」という表題の米国特許第３，４９６，０６１号、第２段の６〜５２行、および第７段の５０〜５９行、Ｆａｒｍｅｒの「Ｐａｃｋａｇｉｎｇ  Ｄｅｖｉｃｅ」という表題の米国特許第５，１３１，７６０号、第４段の２５〜３４行、Ｒｏｂｉｎｓｏｎらの「Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ  Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ」という表題の米国特許第５，３７４，３９５号、第３１段の２７〜５８行、およびＲｅｅｓらの「Ｍｅｔｈｏｄ  ａｎｄ  Ａｐｐａｒａｔｕｓ  ｆｏｒ  Ｆｏｒｍｉｎｇ  Ｈｅａｔ  Ｓｅａｌｓ  ｗｉｔｈ  Ｆｉｌｍｓ」という表題の米国特許第６，３４２，１２３号（開示は、単一ダイによる差動シールの形成を対象とする）に見ることができる。
【０２２３】
驚いたことに、水分透過度を容器の周辺部より大きくできる領域を含むように、乾燥された処理材料などの水分の影響を受けやすい材料を保持するために指定されている室を構成することは有利であるあることが発見された。例えば、上述の柔軟な容器のシートは、熱可塑性および箔で形成される層を含むことができ、シートのうちの少なくとも１つは、水分の影響を受けやすい材料を収納する室の周りの箔層内に切り欠きを備える。（切り欠きは、さらに、検出または他の目的のために光透過を必要とする室に対し必要になる場合がある。）水分の影響受けやすい材料を乾燥した状態に保つために、容器は封止された、乾燥剤入りの容器に置かれ、水分は、水分の影響を受けやすい材料を保持する室から引き出され、容器内に引き込まれて、そこで乾燥剤によって吸収される。乾燥剤が入っている容器は、デラウェア州ウィルミントン所在のＤｕｐｏｎｔ  Ｐａｃｋａｇｉｎｇ  ａｎｄ
Ｉｎｄｕｓｔｒｉａｌ  Ｐｏｌｙｍｅｒｓ社から市販されているＭｙｌａｒ（登録商標）ＯＢ１２ポリエステル製包装フィルムなどの低水分水蒸気透過速度を有する材料で構成すべきである。
【０２２４】
機器内の容器の位置を決めるために、容器に、機器内の対応する取り付け支柱に位置を揃えられる取り付け用穴を設けることができる。その代わりに、容器は、フック、ループ、接着剤、および他の同様の取り付け用材料を使用して機器内での正確な位置を決めることができる。機器が、容器を収容し、配置するためのスロットを備えている場合、柔軟な材料で構成された容器は、好ましくは、機器内の容器の位置を正確に決めるためその周囲のところで剛性のあるフレームで支持される。また、いくつかの実施形態では、位置決め構造が不要になることも考えられる。
【０２２５】
人間および／または機械が読み取ることができるか、または認識することができる情報をもたらす１つまたは複数の標識または装置を、試料の処理に干渉しない領域内で容器に貼り付けるか、または他の何らかの形で関連付けることができる。これらの標識および／または装置は、試料の種類または供給源および／または実行すべき試験プロトコルまたは他の処理に関係する情報を提供することができる。標識上のマーキングは、好ましくは、走査可能なバーコードを含む。このような標識は、例えば、関連するチャートまたはファイルに移すことができる剥離標識とすることができる。その代わりに、情報を容器を作成するために使用される材料上にプリントするか、または材料内に形成することができる。
【０２２６】
（容器内で使用される物質）
これらの室に、単一の処理、同じ処理の複数の用途、または同じもしくは異なる種類の複数の処理（例えば、核酸ベースの検査および／または免疫検定）で使用するための試薬、化合物、組成物、または他の物質を装填することができる。これらの室の中に装填できる物質の種類としては、液体、固体、気体、およびこれらのさまざまな組み合わせが挙げられる。いくつかの処理では、さらに、例えば、容器内の試料室、廃棄物室、換気室、混合室、または検出室として使用できるように１つまたは複数の室を当初は空にしておくことが望ましい場合がある。複数の異なる手順のどれかを実行するために使用できる室の配列構成を有する容器は、特定の手順を実行するために装填される処理材料の数に応じて空の室を追加することができる。装填され、室と室との間で移動されうる液体としては、水性および非水性の物質、液状物質と乳濁液の混合物などの液状物質の組み合わせ（１つまたは複数の乳化剤を使用するものと使用しないもの）、および加熱して溶融した固形物または冷却して凝縮された気体などの液化物質が挙げられる。装填され、室と室との間で移動されうる固形物としては、ワックス、固形物の混合物、および懸濁液（例えば、ゲルを含むコロイド）およびスラリーなどの液体中の固形物が挙げられる。固形物は、天然元素または分子形態を含むさまざまな形態をとりうる。
【０２２７】
室の中に装填するときに乾燥された、または変化させた固形となるように、液体、部分的に液状および／または固形の物質を調製することができる。このような物質は、例えば、カプセル化、凍結乾燥、ペレット化、粉体化、タブレット化、乾燥、室の中での同じまたは異なる物質のスポッティングを含むスポッティング（アレイパターンの同じおよび／または異なる物質の複数のスポットを含む）、粒子、繊維、網状組織またはメッシュの形成、および室の内面を含む、担体上への吸収および／または乾燥の産物とすることができる。これらの物質には、安定性または耐久性の改善、有効性の向上、製造および取り扱いのしやすさ、物質の正確な計量、温度、水分、酸素、および電磁放射線を含む環境および他のストレスからの保護、室の空間的に隔てられている区画内への装填、および試料材料と処理材料との間の意図しない相互作用を含む容器内の異なる物質の早すぎる、また悪影響のある相互作用からの保護などの利点を提供しうる。
【０２２８】
室の中に装填されている固形物は、濾過、固定化、捕集、乾燥、検出（例えば、プローブ試薬、クロマトグラフィ、電気泳動法など）および増幅（例えば、増幅オリゴヌクレオチドおよび酵素試薬）などの機能にとって有用な場合がある。固体は、処理の進行中も無変化のままであるか、または処理を開始する前、または処理を開始した後に変化しうる。変化の種類としては、溶解、懸濁液、スラリー、またはゲルの形成、溶融、または化学的、生化学的、または生物学的反応を挙げることができる。このような変化は、例えば、隣接する室の中に装填された、または形成された流体との相互作用、室の１つまたは複数の固形物の加熱、冷却、放射線照射、超音波分解、および／または電流または磁場への曝露によって引き起こされうる。
【０２２９】
物質は、手動による、または半自動化された、または自動化された方法を使用して容器内に装填できる。容器内に装填できる特定の処理材料としては、例えば、結合試薬（例えば、核酸、抗体、抗原、受容体、および／またはリガンド）および信号発生因子を含む、乾燥された、および／または液体の試薬、洗浄試薬およびすすぎ試薬を含む溶媒、希釈剤、懸濁液、溶液、ならびに粒子、ビーズ、および濾過材を含む固相担体が挙げられる。装填は、注ぎ込み、ピペット操作、注入、スポッティング、引き込み（例えば、真空または注射器を利用）、排出、大気交換、および同様の操作などの手段によって実行されうる。室の中に存在する空気の量を最低限度に保つことは、一般に、好ましいことであり、再現性に関して、同様の室の中の空気／材料比は、同一の用途に用意された容器において実質的に一定に保たれなければならない。物質を柔軟な容器内に装填する場合、物質は、好ましくは、容器の１つまたは複数の縁から装填される室の中へ延びているアクセス開口部から装填される。図１Ｂは、以下でさらに詳しく説明されている例示的な容器１０内のアクセス開口部１９、２１、２３、２５、３１、３３、３５を示している。物質の装填をしやすくし、また部分的に封止されている室の側面を液状物質がウィックアップするのを制御するために、容器の対向する側面は、好ましくは吸引によって引き離される。乾燥された、または固形の物質は、好ましくは最初に装填され、そのように装填された室は、タックシールで一時的に封止され、これにより、実質的に流体密のシールを形成し、水分の存在の影響を受けやすい、または水分の存在によって変化する物質を保護する。次いで、液状物質が装填され、装填された物質とともに室に至るすべての開口部は、ヒートシールで封止される。
【０２３０】
いくつかの処理材料は、装填時に室の側面をウィックアップする強い傾向を呈示し、いくつかの場合において、隣接する室の中に移動し、そこで、他の処理材料の性質、濃度、および／または性能を変える可能性がある。例えば、増幅試薬および酵素試薬が入り交じるのが早すぎた場合、標的核酸に接触させる前に、これらの試薬の一部を消費する意図しない相互作用が発生するおそれがある。この問題に対処するために、処理材料を装填する前に室に油（例えば、軽鉱物油）を供給すると、ウィッキング効果が著しく低減され、処理の性能が改善されることが判明した。また、室が容量近くまで満たされていて、その室の中に軽油が入れられる場合、封止または閉鎖処理の実行時の材料の喪失は、活性のある処理材料ではなく不活性の油に典型的には限定される。さらに、熱に不安定な処理材料（例えば、酵素試薬）の上に配置された油層は、容器を封止閉鎖する際に使用される高温から処理材料を絶縁する。
【０２３１】
油の使用は、他にも利点があることが判明した。例えば、処理材料に、室の側面にそって、または室と室との間の通路に隣接して定着する傾向を有する粒子またはビーズ（例えば、磁気応答性粒子）が含まれる場合、油を使用すると、室の中心に向かって粒子またはビーズを集中させやすくなる。他の場合だと、粒子またはビーズを完全に再懸濁するのが困難になるか、または通路を詰まらせるおそれがあり、したがって、室と室との間の物質の移動を妨げるか、または干渉する可能性がある。それに加えて、油は、他の方法では圧力が室に付与されたときに隣接する通路内の障壁を完全に、または適度に開くのに処理材料の量が不十分である室の流体容積を増やすために使用できる。また、油は不活性であるため、組み合わされた処理材料の相対的濃度に影響を及ぼさない。油の他の利点としては、室からの液状物質の蒸発を妨げる点が挙げられる。剛体部分を含む容器では、物質を剛体部分の中に形成されているキャビティに供給するために、噴霧、スポッティング、または他の何らかの方法により物質をキャビティの表面に結合または接着する操作などの手段、または注ぎ込みもしくはピペット操作を用いることができる。その代わりに、処理材料は、ルアー接続部、隔壁、または弁などの再封止可能な開口部を通して、全部または一部、容器に供給される。この後者の実施形態では、物質は、手順が進行している間に容器に加えることができる。
【０２３２】
試料材料を除くすべての物質は、好ましくは、容器に供給され、環境に対して封止されてから、使用のため出荷される。そうすることにより、容器とともに実行される処理は、実行しやすくなり、オペレータが誤る機会が最小限に抑えられ、容器または関連する処理材料が汚染されるリスクも小さくなる。予め装填されている物質は、使用前に物質が安定する形態で供給され、またそのように安定する状態に保たれなければならない。とりわけ、これは、室を構成するために使用される材料が、装填される物質に悪影響を及ぼし、意図されている機能または性能を変えてしまうことがありえないことを意味している。同様に、装填されている物質は、それが保管されている室の機能または性能に実質的な影響を及ぼすべきでない。
【０２３３】
本発明の容器で試験できる試料材料の種類は、流体試料と固体試料の両方を含む。容器とともに試験できる流体試料としては、例えば、尿、血液、唾液、粘液、精液、羊水、脳脊髄液、滑液、培養液、液状化学品、凝縮気体、および水が挙げられる。容器とともに試験できる固体試料としては、例えば、組織、排泄物、土壌、植物、粉体、結晶、食物、および濾過材が挙げられる。試料材料は、未処理形態または処理済み形態で容器に供給できる。処理済み試料は、生試料の成分を取り除くか、または他の何らかの方法で材料をその元の状態から変えることなどの方法で修正された試料である。例えば、固体試料では、注目する分析対象が容器の室と室との間を自由に移動できるように、固体材料を試料室に加える前、または加えた後に試料に変更を加える必要がある場合がある。変更された状態では、固体試料は、例えば、懸濁液、スラリー、または均等質の一部を形成するか、または固体試料の液化された、または溶解された形態をとりうる。
【０２３４】
試料材料は、好ましくは、処理を開始する直前に、吸入口を通して容器の１つまたは複数の試料室内に導入されるが、処理のステップのうちのいくつかは、試料材料を容器に加える前に開始または完了することがある。吸入口は、アクセス開口部とすることができるか、または例えば、注射器またはオスルアー接続部を有する他のものを挿入するためのルアー接続部のメス部分を備えることができる。試料材料が、容器内で安定していれば、試料材料は、使用する直前に容器に加える必要がない場合もある。容器を自動的に使用するには、一般的に、手動で、または別の装填装置で、試料材料を容器の１つまたは複数の試料室内に装填することが好ましい。試料材料が、関連する測定機器によって保持されている容器内に直接装填される場合、偽陽性または変化した結果をもたらすおそれのある容器間の持ち越し汚染が生じる可能性が高まる。本発明の柔軟な容器とともに使用できる、または使用するように適合されうるこのような１つの装填装置は、ＦａｓｔＰａｃｋ（登録商標）Ｓａｍｐｌｅ  Ｄｉｓｐｅｎｓｅｒ（カリフォルニア州カールズバッド所在のＱｕａｌｉｇｅｎ，Ｉｎｃ．社）である。いくつかの用途では、分析対象が試料中にもし存在すればその分析対象の検出可能な量があることを確認するために、比較的大量の試料材料が必要になることがある。本発明の容器は、試料を処理するために使用される後続の室に比べて大きい試料室を備えるように設計されうる。手動で、または自動的に活性化される圧力手段を使用することで、１つまたは複数の隣接する室の中で一定分量の試料を順次処理して、試料の不要な成分を除去し、室と室との間で移動される試料の体積または大きさを低減することができる。不要な成分は、容器内の指定された廃棄物室に移すことができる。分析対象を試料の他の成分から分離することは、一般的に、室の中の分析対象を固定化し、未結合の材料を取り除き、さらに洗浄試薬で１回またはそれ以上の回数だけ洗浄することによって固定化された分析対象を精製することを伴う。
【０２３５】
（容器の内容物を操作するための機器）
本発明の容器は、好ましくは、容器の室の全部または一部に作用してその中に収納されている物質の配置または状態に影響を及ぼすことができる自動化機器とともに使用するように適合されている。このような作用としては、室と室との間で、または室の中で物質を移動すること、室と室との間の相互接続部を開閉すること、室と室との間の障壁を補強すること、局所的な、または全体的な加熱または冷却を行うこと、例えば、注目する１つまたは複数の分析対象の存在、量、または状態を示しうる１つまたは複数の信号または他の物理的、化学的、生化学的、または生物学的事象に関するスクリーニングを行うことが挙げられうる。このような作用の他の効果として、処理の物質の混合、組み合わせ、溶解、再構成、懸濁、単離、洗浄、またはすすぎ、乾燥された、または固形の物質の操作、廃棄物質の除去、および／または容器内の処理を容易にするための試料物質などの物質の体積の低減を行うことができる。機器は、単一の容器内で物質を処理するために使用されるか、または同時であることを含めて（つまり、並列処理）、独立に、また所望の順序で、複数の容器内の物質を処理するように適合されうる。機器は、単独で、またはシステム全体の一部として、好ましくは、処理の実行中、および／または処理が実行された後に、データの収集、分析、および／または提示を行う機能を有する。機器の動作の全部または一部は、コントローラが管理する。
【０２３６】
機器は、室と室との間で、および／または室の中で物質を移動するために容器と連携するように設計される。物質は、線形アクチュエータまたはローラーを使用するなど、１つまたは複数の押付外力を室の１つまたは複数の柔軟な表面に付与することによって、あるいは選択された室の内容物と空気で連通する、および／または流体的に連通するピストン室に収納されているピストンを使用するなど、押付内力を付与することによって、容器内で移動できる。その代わりに、真空を発生させて、室と室との間に物質を引き込むか、または室の異なる領域に物質を引くことができる。室の中の、また室と室との間の帯磁物質、さらにはそれらに関連する物質の移動の方向を決めるために磁場が使用されうる。室と室との間で、または室の中で物質を移動するための他の手段としては、遠心力、重力、電気力、毛管現象、対流、超音波処理、放射線照射、および同様の力が挙げられうる。特に好ましい一実施形態では、物質を隣接する室の中に押し込むか、または室の中で物質を移動するために、１つのアクチュエータパッドまたはアクチュエータパッドの組み合わせが使用される。アクチュエータの組み合わせを使用することで、隣接する室の中への物質の連続移動または室の中の物質の混合が容易に行える。
【０２３７】
好ましい一様式では、破裂性ヒートシールは、容器の隣接する室の少なくとも一部の間の接続通路を遮断し、室と室との間の物質の移動を妨げる障壁をなす。連携する機器のアクチュエータ駆動圧縮パッドを使用することで、室に圧力を付与し、これにより、シールを引き剥がし（例えば、破裂）、室の物質の一部または全部が隣接する室の中に入るようにできる。開いたシールによって物質が双方向に流れることができる場合、少なくとも１つのアクチュエータを、物質の逆流防止用の締め付け装置として使用することが望ましい場合がある。アクチュエータは、さらに、シールが開くのが早すぎないようにするクランプとして使用することもできる。例えば、室は、複数の他の室に直接接続できる。物質の流れを所望の室に集中させるために、アクチュエータをクランプとして使用して不要な室との封止されている相互接続部を補強することによって、利用されていない室を密封する。アクチュエータは、さらに、シールが備えられていない場合に物質の流れを制御するためにも使用できる。
【０２３８】
さまざまな能動的手段および受動的手段によって、１つの室または複数の室の中にある物質を機器内で混合することができる。物質を混合する「能動的」方法は、押付力などの機械力の付与を伴うが、物質を混合する「受動的」方法は、重力などの機械力の付与を伴わない。一方法では、物質は、一方の室の物質が第２の室の中に移動し、第２の室の物質と接触するときに流れの力によって混合される。他の方法では、物質は、２つの室をつなぐ通路の制約空間に物質の１つが力で通されるときに乱流によって混合される。その代わりに、２つの室の物質は、２つの室の間に組み合わされた物質を押し込んで行き来させることによって混合できる。混合するさらに他の方法は、室に隣接する複数のアクチュエータを使用して、室の異なる領域の間に組み合わされた物質を押しやることを伴う。この実施形態の一用途では、アクチュエータは、対応するリング部材とスライドする形で係合する光検出装置（例えば、蛍光光度計）の移動可能な光学素子であり、この光学素子およびリング部材は、一般的に、関連する室の形状に適合し、混合を行うために交互に室と係合する。他のアプローチでは、混合は、第１の室から第１の物質を押し上げて第２の室に入れることによって実行され、そこで、これは第２の物質と組み合わされ、次いで、重力の助けを借りて組み合わされた物質を第１の室に戻すことができる。この手順は、所望の程度の混合が得られるまで繰り返すことができる。混合するための他の手順としては、例えば、加熱および／または冷却を行って、固体粒子を使用して、または固体粒子を使用せずに、対流混合または超音波処理を実行する手順を挙げることができる。
【０２３９】
機器および容器は、さらに、物質の成分を操作するために連携することができる。例えば、容器の１つまたは複数の室は、機器が能動的にまたは受動的に物質を濾過材に通すときに物質の構成要素を取り除くための１つの濾過材、または一連の濾過材を備えることができる。物質から取り除かれる構成要素は、処理に干渉する可能性のある試料材料の成分またはビーズ、粒子、ロッド、繊維、および同様のものなどの試料材料を処理するために使用される固相担体を含みうる。これらの固相担体は、例えば、分析対象を直接的にまたは間接的に結合するために、または試料の成分を結合するために使用されうる。他のアプローチでは、機器は、容器に遠心力を与えることによって材料中の固相担体または固体物質を室の中で濃縮させるように適合されうる。代替アプローチでは、室の中に存在する磁気応答性粒子は、機器の構成要素によって加えられる磁力によって操作できる。特定の室の中にある磁性粒子を分離することによって、粒子に結合されている物質は室の中に留まるが、結合されていない物質は、室から取り除くことができる。不要な材料から必要な材料を分離することに加えて、試料材料の体積を減らしやすくするために、ビーズおよび粒子などの固相担体も、本発明の容器内で使用することができる。試料材料の初期体積は、検出および／または定量化のために注目する分析対象が十分にあるようにするために比較的大きなものとすることができる。しかし、いくつかの場合において、この初期体積は、容器内の試料材料の実用的な処理を行うには大きすぎる。本発明による機器および容器では、例えば、試料収容室の中の固相担体（例えば、磁気応答性粒子）上で分析対象を固定化し、その室の中の固相担体を分離し（例えば、粒子を磁場に曝露する）、次いで試料収容室から試料材料の残留物を取り除き、それを指定された廃棄物室に捨てる力を発生させることによってこの問題に対処することができる。その代わりに、この同じ手順は、試料材料を一定分量とって徐々に移動し、分離し、別々に処理することによって試料収容室より小さい容積容量を有する容器の隣接する室で実行できる。固相担体を小さな室に置くか、移動すると、試料材料の処理はより効率的なものとなり、また処理材料の消費量も少なくなる。
【０２４０】
分析対象を精製するために、指定された試料処理室で洗浄試薬を使用して固相担体を１回または複数回洗浄することができる。洗浄手順を実行するときに、機器によって１つまたは複数の力を加えることで、試料処理室の中で固相担体を分離されたままにするか、または他の何らかの方法で濃縮させるか、あるいは洗浄試薬中に再懸濁させることができる。洗浄試薬中に固相担体を再懸濁する場合、容器を攪拌するなどの混合操作、洗浄試薬室から試料処理室内への洗浄試薬の乱流による移動、または押付力を使用する試料処理室の内容物の混合が伴いうる。適切な滞留時間が経過した後、固相担体は、再び、分離されるか、または他の何らかの方法で濃縮され、洗浄試薬が試料処理室から廃棄物室に移動されるようにできる。この処理は、必要に応じて繰り返すことができる。
【０２４１】
機器は、１つまたは複数の室の熱的条件を制御するか、または機器内の温度を均一に保つための要素を備えることができる。特定の処理を実行する際に使用する熱的制御要素を選択するうえで考慮すべきこととして、所望の温度範囲、温度の変化率、温度の正確さ、精度、および安定性、ゾーン内の加熱および／または冷却もしくは均一温度が必要かどうか、ならびに温度制御機能に対する外部条件、さらには機器の熱発生構成要素（例えば、モーター）の影響を決定することが挙げられる。室または室の部分集団の加熱および／または冷却は、例えば、電気的変化、放射線、マイクロ波、超音波処理、対流、伝導、強制換気、化学反応（例えば、発熱反応および吸熱反応）、生物学的活動（例えば、熱を発生する成長）、循環流体（例えば、加熱された水またはフレオン）、および１つまたは複数の室の熱的条件を変化させる同様のものを使用する熱制御要素で行える。その代わりに、機器を、インキュベータまたは冷蔵庫などの温度制御環境内に配置して、均一温度を維持することもできる。
【０２４２】
好ましい機器は、容器が機器の中に適切に装填されたときに、室の集合体、または特定の１つの室または１つの室の領域に位置を揃える、銅またはアルミニウムプレートなどの熱伝導プレートを備える。それぞれのプレートの温度は、例えば、熱電素子の使用によって制御されうる。熱電素子中を流れる電流の方向に応じて、熱電素子中の異なる導体の接合部は熱を吸収するか、または放出する。したがって、熱電素子は、室または室の領域の加熱および／または冷却に使用できる。熱電素子の他の利点としては、その大きさ、可動部または振動がないこと、温度変化が速いこと、高精度の温度制御、およびＣＦＣまたは動流体がないことなどが挙げられる。
【０２４３】
実際、熱伝導プレートは、適切に装填された容器内で加熱または冷却される室または室の領域の概ね近くにあるように、好ましくは接触するように機器内に配置される。これらのプレートは、Ｕｌｔｅｍ（登録商標）ポリイミド熱可塑性樹脂またはＤｅｌｒｉｎ（登録商標）アセチル樹脂などの非伝導性材料を使用して互いから隔てられる。熱電素子を使用することで、熱は、伝導、対流、または輻射によって伝えられる。
【０２４４】
一代替実施形態では、熱制御要素の全部または一部は、室の局部的加熱または冷却を行うアクチュエータに関連付けることができる。
【０２４５】
機器は、好ましくは、信号または他の物理的、化学的、生化学的、または生物学的事象を検出するための少なくとも１つの検出器を備える。検出器は、１つまたは複数の分析対象が試料材料中に存在するかどうか、または変更された状態で存在するかどうかを検出するために使用されうる。検出器は、マイクロプロセッサと連携して、試料材料中に存在する１つまたは複数の分析対象の量に関する情報を提供することもできる。本発明で考えられる検出器としては、蛍光光度計、照度計、分光光度計、赤外線検出器、および電荷結合素子が挙げられる。これらの種類の検出器のそれぞれ、またはこれらの検出器に関連付けられている信号受信構成要素は、さまざまな種類の信号を検出できるように検出室に隣接する位置に置くことができる。検出器は、静止している容器の異なる室に隣接する位置に置けるように可動プラットフォーム上に取り付けることができる。その代わりに、複数の種類の検出器をプラットフォーム上に移動可能なように取り付けて、異なる処理に対し異なる検出方法を実行しやすくすることができる。機器は、さらに、同時に異なる室から放射される信号を検出するために同じ、または異なる種類の複数の検出器を備えることもできる。また、光ファイバーは、異なる位置から信号を収集し、この情報を容器から取り除かれた静止部位にある１つまたは複数の検出器に伝送するために使用できる。また、可動検出器と組み合わせた光ファイバー配列構成も考えられる。例えば、放射性標識、磁気標識、電子標識、ラマン散乱、表面プラズモン共鳴、気体、濁度、または質量、密度、温度、電子、もしくは色の変化を検出するために他の可能な検出器も使用可能であろう。
【０２４６】
（容器の使用）
本発明の容器は、さまざまな処理を実行するために、単独で、または連携する機器と組み合わせて使用することができる。このような処理としては、例えば、試料の他の成分から注目する分析対象を分けるか、または分離すること、試料または試料の成分を試料を分析するために必要な試薬および条件に曝すこと、および／または組成の変化、配列の変化、体積の変化、量の変化、質量の変化、伝導性の変化、濁度の変化、色の変化、温度変化、または同様の変化などの検出可能な変化をもたらす化学反応、生化学的反応、または生物学的反応を行わせることを挙げることができる。上述のように、容器は、非順次的に実行される作用を必要とする、または利用する用途において使用するのに特に適している。これらの種類の用途としては、限定はしないが、抗原−抗体、核酸−核酸、および受容体−リガンドの相互作用などの検出可能な結合相互作用を伴う複雑な検査または検定が挙げられる。
【０２４７】
本発明の容器内で実行可能な核酸ベースの検定は、標的核酸の直接的検出または試料中に標的核酸が存在することを示す増幅産物の検出に依存しうる。直接的検出では、例えば、遺伝子発現、染色体異常、または病原体に関連する標的配列の存在を高い感度で判定するために十分な量の標的核酸が試料中にあることが要求される。非ウイルス生命体にはリボソームＲＮＡ（ｒＲＮＡ）の細胞量が多く、生命体の系統発生学的に一貫しているグループを互いから区別することを可能にする配列保存があるため、ｒＲＮＡは、病原体（例えば、バクテリア、真菌、または酵母）の存在を判定するように設計されている直接的検出検定のための理想的な標的である。例えば、Ｋｏｈｎｅの「Ｍｅｔｈｏｄ  ｆｏｒ  Ｄｅｔｅｃｔｉｎｇ，  Ｉｄｅｎｔｉｆｙｉｎｇ，ａｎｄ  Ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｎｇ  Ｏｒｇａｎｉｓｍｓ  ａｎｄ  Ｖｉｒｕｓｅｓ」という表題の米国特許第５，２８８，６１１号、およびＨｏｇａｎらの「Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｐｒｏｂｅｓ  ｆｏｒ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  ａｎｄ／ｏｒ  Ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｎｏｎ−Ｖｉｒａｌ
Ｏｒｇａｎｉｓｍｓ」、米国特許第５，８４０，４８８号を参照のこと。標的とする核酸の種類に関係なく、直接的検出検定の感度は、標的核酸に結合する１つまたは複数のプローブ複合体が検出のための複数の標識を有する信号増幅手順によって改善でき、これにより、試料中の標的の量に影響を及ぼすことなく検定の信号を増大することができる。例えば、Ｈｏｇａｎらの「Ｂｒａｎｃｈｅｄ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ」という表題の米国特許第５，４２４，４１３号およびＵｒｄｅａらの「Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｍｕｌｔｉｍｅｒｓ  ａｎｄ  Ａｍｐｌｉｆｉｅｄ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ  Ａｓｓａｙｓ  Ｕｓｉｎｇ  ｔｈｅ  Ｓａｍｅ」という表題の米国特許第５，１２４，２４６号を参照のこと。標的核酸配列のコピー数を増やす必要のない他の増幅の形態としては、プローブ増幅があり、これは、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）などの手順を含む。ＬＣＲは、核酸配列の複数のコピーを生成するためにプローブのハイブリダイゼーションおよびライゲーションの繰り返しサイクルに依存する。例えば、Ｂｉｒｋｅｎｍｅｙｅｒらの「Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｔａｒｇｅｔ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｕｓｉｎｇ  Ｇａｐ  Ｆｉｌｌｉｎｇ  Ｌｉｇａｓｅ  Ｃｈａｉｎ  Ｒｅａｃｔｉｏｎ」という表題の米国特許第５，４２７，９３０号を参照のこと。他の考察される信号増幅手順としては、Ｔｈｉｒｄ  Ｗａｖｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ社のＩｎｖａｄｅｒ（登録商標）化学を利用するものが挙げられる。例えば、Ｋｗｉａｔｋｏｗｓｋｉらの「Ｃｌｉｎｉｃａｌ，Ｇｅｎｅｔｉｃ，ａｎｄ  Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｅｔｉｃ
Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｉｎｖａｄｅｒ  Ａｓｓａｙ」、Ｍｏｌ．
Ｄｉａｇｎ．（１９９９年）４巻（４号）：３５３〜６４頁を参照のこと。
【０２４８】
標的核酸増幅は、増幅オリゴヌクレオチド（例えば、プライマー）およびポリメラーゼを使用して増幅される鋳型核酸配列に相補的な、または相同的な配列を含む核酸増幅産物（コピー）を酵素的に合成することを伴う。増幅産物は、転写ベースの増幅手順で生成される伸長産物または転写物とすることができる。増幅オリゴヌクレオチドは、溶液中に遊離した反応混合物へと送られるか、または増幅オリゴヌクレオチドのうちの１つまたは複数が、容器内の１つまたは複数の室の内面を含む、固相担体上に固定化されうる。例えば、Ａｄａｍｓらの「Ｍｅｔｈｏｄ  ｆｏｒ  Ｐｅｒｆｏｒｍｉｎｇ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  ｗｉｔｈ  Ｔｗｏ  Ｐｒｉｍｅｒｓ  Ｂｏｕｎｄ  ｔｏ  ａ  Ｓｉｎｇｌｅ  Ｓｏｌｉｄ  Ｓｕｐｐｏｒｔ」という表題の米国特許第５，６４１，６５８号、およびＢｒｏｗｎｅの「Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ｍｅｔｈｏｄ」という表題の米国特許出願公開第２００５−０２８７５９１Ａ１号を参照のこと。当技術分野で実施される核酸増幅手順の例としては、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、鎖置換増幅（ＳＤＡ）、ヘリカーゼ依存性増幅（ＨＤＡ）、ループ媒介等温増幅（ＬＡＭＰ）、および転写媒介増幅（ＴＭＡ）、核酸配列ベース増幅（ＮＡＳＢＡ）、および自家持続配列複製法（３ＳＲ）を含むさまざまな転写ベースの増幅手順が挙げられる。例えば、Ｍｕｌｌｉｓの「Ｐｒｏｃｅｓｓ  ｆｏｒ  Ａｍｐｌｉｆｙｉｎｇ，Ｄｅｔｅｃｔｉｎｇ，  ａｎｄ／ｏｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ」という表題の米国特許第４，６８３，１９５号、Ｗａｌｋｅｒの「Ｓｔｒａｎｄ  Ｄｉｓｐｌａｃｅｍｅｎｔ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ」という表題の米国特許第５，４５５，１６６号、Ｋｏｎｇらの「Ｈｅｌｉｃａｓｅ  Ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ」という表題の米国特許第７，２８２，３２８号、Ｎｏｔｏｍｉらの「Ｐｒｏｃｅｓｓ  ｆｏｒ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｚｉｎｇ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ」という表題の米国特許第６，４１０，２７８号、Ｋａｃｉａｎらの「Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  Ｍｅｔｈｏｄｓ」という表題の米国特許第５，３９９，４９１号、Ｂｅｃｋｅｒらの「Ｓｉｎｇｌｅ−Ｐｒｉｍｅｒ
Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  Ｍｅｔｈｏｄｓ」という表題の米国特許第７，３７４，８８５号、Ｍａｌｅｋ  らの「Ｅｎｈａｎｃｅｄ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  Ｐｒｏｃｅｓｓ」という表題の米国特許第５，１３０，２３８号、およびＬｉｚａｒｄｉらの（１９８８年）ＢｉｏＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ６巻：１１９７頁を参照のこと。いくつかの手順では、検出可能な増幅産物の形成は、初期抗体／抗原相互作用に依存する。例えば、Ｃａｓｈｍａｎの「Ｂｌｏｃｋｅｄ−Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ  Ｐｏｌｙｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  Ｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙ  Ｍｅｔｈｏｄ  ａｎｄ  Ｋｉｔ」という表題の米国特許第５，８４９，４７８号を参照のこと。核酸増幅は、試料中に存在する分析対象（例えば、標的核酸、抗原、または抗体）の量がきわめて少ない場合に特に有用である。分析対象に関連付けられている標的配列を増幅し、合成された増幅産物を検出することによって、検定の感度は、大幅に改善されうるが、それは、分析対象の検出を確実に行ううえで検定の開始時に必要な分析対象が少なくて済むからである。
【０２４９】
標的核酸増幅反応の条件は、実質的に等温的であるか、またはＰＣＲ温度機器の場合のように、周期的温度変化を必要とすることがある。上述の機器は一定の温度または周囲温度を定めることができるか、または機器内、またはその代わりに、容器の特定の室に影響を及ぼす機器の特定のゾーン内の全体的な温度を変動させるように修正され、プログラムされうる。標的核酸増幅反応は、「リアルタイム」または「エンドポイント」検定のいずれかとすることができる。本発明の機器でリアルタイム検定を実行する際に使用するのに特に適しているコンパクトで軽量な多チャネル蛍光光度計について以下で説明する。リアルタイム増幅検定は、増幅反応が生じているときに標的増幅産物の量を定期的に測定することを伴い、これにより試料中に存在する分析対象（例えば、標的核酸）に関する定性的情報を簡単に供給することができるが、エンドポイント増幅では、増幅反応が発生した後に標的増幅産物の量を測定するため、一般的には、試料中に存在する分析対象に関する定性的情報を供給するにはこちらの方が役立つ。増幅反応の実行中に、または増幅反応の完了時に収集された信号情報に基づき試料中に元々存在していた標的核酸または他の分析対象の量を算出するためのアルゴリズムとしては、Ｗｉｔｔｗｅｒらの「ＰＣＲ  Ｍｅｔｈｏｄ  ｆｏｒ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｑｕａｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ  Ｕｔｉｌｉｚｉｎｇ  Ｓｅｃｏｎｄ  ｏｒ  Ｔｈｉｒｄ  Ｏｒｄｅｒ  Ｒａｔｅ  Ｃｏｎｓｔａｎｔｓ」という表題の米国特許第６，２３２，０７９号、Ｓａｇｎｅｒらの「Ｍｅｔｈｏｄ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  Ｅｆｆｉｃｉｅｎｃｙ−Ｃｏｒｒｅｃｔｅｄ  Ｒｅａｌ−Ｔｉｍｅ  Ｑｕａｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ」という表題の米国特許第６，６９１，０４１号、ＭｃＭｉｌｌａｎらの「Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｏｒ  Ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅ  Ａｎａｌｙｓｉｓ  ｏｆ  ａ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  Ｒｅａｃｔｉｏｎ」という表題の米国特許第６，９１１，３２７号、Ｌｉｇｈｔらの「Ｍｅｔｈｏｄ  ｆｏｒ  Ｄｅｔｅｒｍｉｎｉｎｇ  ｔｈｅ  Ａｍｏｕｎｔ  ｏｆ  ａｎ  Ａｎａｌｙｔｅ  ｉｎ  ａ  Ｓａｍｐｌｅ」という表題の米国特許出願公開第ＵＳ２００６−０２７６９７２Ａ１号、Ｃｈｉｓｍａｒらの「Ｍｅｔｈｏｄ  ａｎｄ  Ａｌｇｏｒｉｔｈｍ  ｆｏｒ  Ｑｕａｎｔｉｆｙｉｎｇ  Ｐｏｌｙｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ」という表題の米国特許出願公開第ＵＳ２００６−０２９２６１９Ａ１、およびＲｙｄｅｒらの「Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｏｒ  Ｄｅｔｅｒｍｉｎｉｎｇ  Ｐｒｅ−Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  Ｌｅｖｅｌｓ  ｏｆ  ａ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｔａｒｇｅｔ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ｆｒｏｍ  Ｐｏｓｔ−Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  Ｌｅｖｅｌｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｄｕｃｔ」という表題の米国特許第５，７１０，０２９号で開示されているものが挙げられる。また、増幅条件および試薬が、増幅に適していたことを確認するために、一般的には、核酸増幅反応の開始時に内部制御配列を用意することが望ましい。例えば、Ｗａｎｇらの「Ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ
Ｕｓｉｎｇ  ｔｈｅ  Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ  Ｃｈａｉｎ  Ｒｅａｃｔｉｏｎ」という表題の米国特許第５，４７６，７７４号を参照のこと。
【０２５０】
標的核酸の検出は、ｉｎ  ｓｉｔｕまたはｉｎ  ｖｉｔｒｏとすることができる。例えば、Ｇｒａｙらの「Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｏｒ  Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ−Ｓｐｅｃｉｆｉｃ
Ｓｔａｉｎｉｎｇ」という表題の米国特許第５，４４７，８４１号を参照のこと。ｉｎ
ｖｉｔｒｏ検定では、細胞を溶解するか、または透過化して、最初に標的核酸を遊離させ、検出プローブとのハイブリダイゼーションに利用できるようにする必要がある場合がある。例えば、Ｃｌａｒｋらの「Ｍｅｔｈｏｄ  ｆｏｒ  Ｅｘｔｒａｃｔｉｎｇ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  ｆｒｏｍ  ａ  Ｗｉｄｅ  Ｒａｎｇｅ  ｏｆ  Ｏｒｇａｎｉｓｍｓ」という表題の米国特許第５，７８６，２０８号を参照のこと。細胞が溶解すると、結果として得られる溶解物の内容物は、核酸に加えて、細胞小器官、タンパク質（プロテアーゼおよびヌクレアーゼなどの酵素を含む）、炭水化物類、および脂質を含む場合があり、このため核酸をさらに精製することが必要になることがある。それに加えて、病原体については、それらの病原体の化学的または熱的不活性も望ましい場合がある。細胞を、本発明の容器内に試料を装填する前に溶解または透過化するか、あるいは容器の試料室または他の室に、この機能を実行するための薬剤を事前充填することができる。細胞は、化学的手段、機械的手段（例えば、超音波処理）、および／または熱的手段を含む、当業者によく知られているさまざまな手段によって溶解または透過化することができる。好ましい細胞融解物質の１つが、以下の実施例の節で説明されている。
【０２５１】
遊離された核酸は、標的配列の検出および／または増幅に干渉する阻害剤として作用しうる他の試料成分から容器内で分離されうるか、または分けられうる。潜在的に干渉する成分の存在は、試料の種類に依存して変化し、遊離された核酸および標的にされた核酸を消化しうるヌクレアーゼなどの細胞溶解物の成分を含みうる。いくつかの不要な試料成分は、濾過材、ビーズ、繊維、膜、ガラスウール、濾紙、ポリマー、またはゲルなどの材料を室に供給することにより沈殿または固相捕捉を通じて標的核酸から分けることができる。好適な濾過材としては、ガラス、繊維ガラス、ナイロン、ナイロン誘導体、セルロース、セルロース誘導体、および他のポリマーが挙げられる。その代わりに、固相材料を使用することで、細胞、胞子、または微生物などを溶解するための試料成分を捕捉することができ、それらの成分は、物理的に保持することによって捕捉されうる（例えば、大きさ排除、親和性保持、または化学的選択）。
【０２５２】
核酸を捕捉するためのさまざまな固相方法が、当技術分野で知られており、本発明の容器で使用するように容易に適合されうる。これらの方法は、標的核酸に特異的である場合も、非特異的である場合もある。このような方法の１つは、固相可逆固定化であり、これは、カルボキシル基被覆表面を有する磁性微粒子上への核酸の選択的固定化に基づくものである。Ｈａｗｋｉｎｓの「ＤＮＡ  Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｉｓｏｌａｔｉｏｎ  Ｕｓｉｎｇ  Ｍａｇｎｅｔｉｃ  Ｐａｒｔｉｃｌｅｓ」という表題の米国特許第５，７０５，６２８号を参照のこと。他の方法では、ポリ（ｄＴ）配列が誘導体化されている磁性粒子は、５’ポリ（ｄＡ）テールおよび３’標的結合配列を有する捕捉プローブに結合する。例えば、Ｗｅｉｓｂｕｒｇらの「Ｔｗｏ−Ｓｔｅｐ  Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｃａｐｔｕｒｅ  ｏｆ  ａ  Ｐｏｌｙｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ」という表題の米国特許第６，５３４，２７３号を参照のこと。さらに他のよく使われる方法では、細胞を溶解し、ヌクレアーゼを不活性化する薬剤として知られているチオシアン酸グアニジニウムの存在下で核酸をシリカまたはガラス粒子に結合する。さらに他のアプローチは、ＣｈａｒｇｅＳｗｉｔｃｈ（登録商標）Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙに基づくものであり、これは、周りの緩衝液のｐＨに対し電荷依存性を有する切替可能な表面を形成して核酸精製を容易にする磁気ビーズベースの技術である（カリフォルニア州カールズバッド所在のＩｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ社。カタログ番号ＣＳ１２０００）。低ｐＨ条件では、ＣｈａｒｇｅＳｗｉｔｃｈ（登録商標）Ｍａｇｎｅｔｉｃ  Ｂｅａｄｓは、負に帯電した核酸骨格を結合する正電荷を有する。タンパク質および結合されない他の汚染物質を洗い落とすことができる。ｐＨを８．５に上げると、表面上の電荷は中性化され、結合されている核酸は溶離する。
【０２５３】
他のアプローチでは、標的核酸（または標的核酸にも結合している中間オリゴヌクレオチド）に結合することができる捕捉プローブは、容器の製造時に指定された試料処理室の内面に、共有結合で、または非共有結合で付着する。付着化学は、当業者によく知られており、オリゴヌクレオチドおよびビオチン標識オリゴヌクレオチドの共有結合のためのアミンおよびカルボン酸修飾表面、ならびに非共有結合のためのアビジンおよびストレプトアビジン被覆表面を含む。このアプローチを用いた場合、試料処理室に導入された標的核酸は、室の表面上に固定化することができ、また液体および他の未結合材料は、粒子もしくはビーズを固定化または捕捉せずとも取り除くことができる。試料を他の材料から分けた後、標的核酸は、増幅および検出のため表面上に固定化されたままとなるか、または捕捉プローブから最初に溶離されうる。その代わりに、捕捉プローブを、試料処理室に配置されている、スポンジなどの多孔質固相担体上に固定化することも可能である。
【０２５４】
本発明で使用するのに適している捕捉プローブは、標的核酸に対し特異的であるか、または非特異的であるものとすることができる。特異的捕捉プローブは、所定の一組の条件の下で標的核酸に結合し、試料中に存在しうる非標的核酸には結合しないように選択された標的結合領域を含む。非特異的捕捉プローブは、使用条件の下で標的核酸と非標的核酸とを区別しない。揺らぎ捕捉プローブは、非特異的捕捉プローブの一例であり、少なくとも１つのランダムまたは非ランダムポリ（Ｋ）配列を含むことができ、ただし、「Ｋ」は、グアニン塩基、チミン塩基、またはウラシル塩基を表すものとすることができる。これと共有を享受するＢｅｃｋｅｒらの「Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｏｆ  Ｎｏｎｓｐｅｃｉｆｉｃ  Ｔａｒｇｅｔ  Ｃａｐｔｕｒｅ  ｏｆ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ」という表題の米国特許出願第１１／８３２，３６７号を参照のこと。シトシンとの水素結合に加えて、そのピリミジン相補体であるグアニンは、さらに、チミンおよびウラシルと水素結合する。それぞれの「Ｋ」は、さらに、イノシンまたはネブラリンなどの縮重ヌクレオシド、３−ニトロピロール、５−ニトロインドール、または４−メチルインドン（４−ｍｅｔｈｙｌｉｎｄｏｎｅ)などのユニバーサル塩基、またはｄＰもしくはｄＫなどのピリミジンもしく
はプリン塩基類似体を表すこともある。揺らぎ捕捉プローブのポリ（Ｋ）配列は、標的核酸を非特異的に結合するのに十分な長さを持ち、その塩基長は好ましくは６から２５個である。
【０２５５】
標的核酸または関係する増幅産物を検出するためのフォーマットは、不均一と均一の２つの基本的カテゴリに分けられうる。これらの検出フォーマットは両方とも、本発明の容器で使用するように適合されうる。不均一検定は、未結合プローブから結合プローブを分離するためのステップを含むが、均一検定ではそのような物理的な分離ステップは使用されない。多数の不均一および均一の検出法が、当技術分野で知られている。例えば、Ｊｕｎｇ、Ｐ．ら、１９９７年、「Ｌａｂｅｌｓ  ａｎｄ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ｆｏｒｍａｔｓ  ｉｎ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  Ａｓｓａｙｓ」、Ｉｎ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、ｅｄｓ．Ｌｅｅ、Ｈ．ら、１３５〜１５０頁、Ｎａｔｉｃｋ、ＭＡ：ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅ  Ｂｏｏｋｓを参照のこと。
【０２５６】
物理的分離ステップを使用する検定方法は、分離処理でガラス、鉱物、または高分子材料などの固相マトリクスを使用する方法を含む。この分離は、プローブ：分析対象複合体を固相マトリクスに優先結合することを伴うが、関連していないプローブ分子を液相に残すことができる。このような結合は、例えばヒドロキシアパタイトの場合ように、非特異的であるか、あるいは、例えば固相担体上に直接的に、または間接的に固定化されている捕捉プローブと標的核酸との配列特異的相互作用を通して特異的であるものとすることができる。このような場合には、洗浄ステップの後の固相担体に結合されているプローブ残留物の量は、試料中の分析対象の量に比例する。
【０２５７】
その代わりに、検定は、ハイブリダイゼーションされていないプローブを優先結合することを伴いうるが、プローブ：分析対象複合体は、液相に残される。この場合、洗浄ステップの後の液相中のプローブの量は、元の試料中の分析対象の量に比例する。プローブが核酸またはオリゴヌクレオチドである場合、固相担体は、限定することなく、ヒドロキシアパタイトなどの吸着剤、ポリカチオン性部分、疎水性または「逆相」材料、ＤＥＡＥなどのイオン交換マトリクス、ゲル濾過マトリクス、あるいはこれらの固相材料のうちの１つまたは複数の材料の組み合わせを含みうる。固相担体は、１つまたは複数のオリゴヌクレオチド、または他の特異的結合部分を含み、プローブ、標的、またはその両方を直接的に、または間接的に捕捉することができる。ゲル濾過材、ポリアクリルアミドゲル、またはアガロースゲルなどの媒質の場合、分離は、オリゴヌクレオチドの結合によらないが、異なる大きさまたは形状の分子の分子篩によって引き起こされる。後者２つの場合において、分離は、電流をゲルに流して、二本鎖および一本鎖の核酸などの、異なる大きさまたは形状の核酸のゲルを通る示差泳動を引き起こすことによる電気泳動法で駆動されうる。
【０２５８】
不均一検定法は、さらに、注目する分析対象を含むと疑われる試料を加える前にプローブを固相マトリクスに結合することを伴いうる。所望の核酸が試料混合物中に存在すればその所望の核酸が標識されるであろう条件の下で試料を標識に接触させることができる。固相マトリクスは、プローブとマトリクスとの間に共有結合が形成されるように誘導体化または活性化できる。その代わりに、プローブは、限定はしないが、イオン性基質、疎水性基質、逆相基質、免疫結合基質、キレート基質、および酵素基質の相互作用を含む、強い非共有結合相互作用を通じて、マトリクスに結合することができる。マトリクス結合プローブが、ハイブリッドの形成を可能にする条件の下で標識された核酸に曝露された後、未結合の標識された分析対象を含まない固相マトリクスを洗浄することによって分離ステップが行われる。逆に、標識の検出前に過剰な遊離プローブをマトリクスから洗い落として、分析対象を固相マトリクスに結合し、標識されたプローブに接触させることができる。
【０２５９】
上記のように、均一検定は、固相分離ステップなしで溶液中において実行され、通常は、遊離プローブとプローブ：分析対象複合体との間の化学的相違を利用する。均一または不均一フォーマットで使用できる検定系の一例として、ハイブリダイゼーション保護検定（ＨＰＡ）が挙げられる。Ａｒｎｏｌｄらの「Ｈｏｍｏｇｅｎｏｕｓ  Ｐｒｏｔｅｃｔｉｏｎ  Ａｓｓａｙ」という米国特許第５，２８３，１７４号を参照のこと。ＨＰＡでは、プローブは、プローブ：分析対象複合体に結合されている化学発光試薬を変えることなくハイブリダイゼーションされていないプローブに結合されている化学発光試薬を変える条件の下で化学発光部分に結合され、試料と接触し、次いで、選択的化学分解または安定性の検出可能な変化に曝される。その後化学発光反応が開始すると、ハイブリッド関連標識が光を放射する。
【０２６０】
他の均一検定は、標的核酸の存在を示す検出可能な信号変化をもたらすために検出プローブまたは増幅プライマーに物理的変更を加えることに依存する。検出可能な物理的変更を受けることができるプローブおよびプライマーは、限定はしないが、分子ビーコンまたは分子トーチなどの自己ハイブリダイゼーションプローブ、二分子プローブ、Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社から市販されているＴａｑＭａｎ（登録商標）プローブ、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ社から市販されているＬｕｘ（商標）プライマー、および信号プライマーが挙げられる。例えば、Ｔｙａｇｉら、（１９９６年）Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ１４巻（３号）：３０３〜３０８頁、Ｂｅｃｋｅｒらの「Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｔｏｒｃｈｅｓ」という表題の米国特許第６，８４９，４１２号、Ｍｏｒｒｉｓｏｎの「Ｃｏｍｐｅｔｉｔｉｖｅ  Ｈｏｍｏｇｅｎｅｏｕｓ  Ａｓｓａｙ」という表題の米国特許第５，９２８，８６２号、Ｔａｐｐら、（２０００年）ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ２８巻（４号）：７３２〜７３８頁、Ｎａｚａｒｅｎｋｏ（２００６年）Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．３３５巻：９５〜１１４頁、およびＮａｚａｒｅｎｋｏ（１９９７年）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２５巻（１２号）：２５１６〜２５２１頁を参照のこと。これらのプローブおよびプライマーはそれぞれ、関連するレポーター部分（例えば、蛍光分子）の検出可能な変化をもたらすために標的核酸とのハイブリダイゼーションの後のプローブまたはプライマーの立体構造変化に依存する。ハイブリダイゼーションの前に、レポーター部分からの信号は、関連するクエンチャー部分によって変えられ、Ｌｕｘプライマーの場合には、このクエンチャー部分は、プライマー配列の３’末端の近くに配置されているグアニンである。
【０２６１】
リアルタイム増幅反応で使用するための特に好ましい検出プローブは、プローブが自己ハイブリダイゼーションしているままであるか、または増幅産物に結合するかに応じて示差検出可能な信号を放射する自己ハイブリダイゼーションプローブである。これらのプローブは、溶液中に遊離しているか、または固相担体上に固定化された反応混合物に供給されうる。例えば、Ｃａｓｓらの「Ｉｍｍｏｂｉｌｉｚｅｄ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ  Ｒｅａｇｅｎｔ  ａｎｄ  Ｍｅｔｈｏｄ」という表題の米国特許第６，３１２，９０６号を参照のこと。都合のよいことに、これらは、さらに、増幅反応が開始する前、開始した後、または開始時に、反応混合物に供給できる。これらのプローブが、固相担体上に供給される場合、固相担体は、さらに、標的核酸配列を増幅するために１つまたは複数の固定化された増幅オリゴヌクレオチドを含むことができる。好ましい自己ハイブリダイゼーションプローブは、分子ビーコンおよび分子トーチを含む。
【０２６２】
分子ビーコンは、標的相補配列、標的核酸配列が存在しない場合の閉鎖型立体配座内にプローブを保持する親和性対（または核酸もしくは核酸類似体のアームもしくはステム）、およびプローブが閉鎖型立体配座内にある場合に相互作用する標識対を有する核酸分子またはその類似体を含む。Ｔｙａｇｉらの「Ｄｅｔｅｃｔａｂｌｙ  Ｌａｂｅｌｅｄ  Ｄｕａｌ  Ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ  Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  Ｐｒｏｂｅｓ，Ａｓｓａｙｓ  ａｎｄ  Ｋｉｔｓ」という表題の米国特許第５，９２５，５１７号を参照のこと。標的核酸のハイブリダイゼーションおよび標的相補配列は、親和性対のメンバーを分けて、プローブを開放型立体配座にシフトする。開放型立体配座へのシフトは、例えば、蛍光プローブおよびクエンチャー（例えば、ＤＡＢＣＹＬおよびＥＤＡＮＳ）とすることができる、標識対の相互作用が低減されるため検出可能である。
【０２６３】
分子トーチは、「標的結合」および「標的閉鎖」ドメインと呼ばれる、自己相補性を持つ明確に区別できる領域を有する。これらのドメインは、連結領域によって結合され、所定のハイブリダイゼーション検定条件の下で互いにハイブリダイゼーションする十分な相補性を有する。変性条件に曝露された場合、相補領域が溶けて、所定のハイブリダイゼーション検定条件が復元されたときに標的配列とのハイブリダイゼーションに利用可能な標的結合ドメインが残される。また、鎖置換条件に曝露されたときに、標的配列の一部は標的結合ドメインに結合し、これにより、標的閉鎖ドメインが標的結合ドメインから移動される。分子トーチは、標的結合ドメインが標的閉鎖ドメイン上の標的配列とのハイブリダイゼーションに有利に働くように設計される。分子トーチの標的結合ドメインおよび標的閉鎖ドメインは、分子トーチが自己ハイブリダイゼーションされたときに、標的核酸にハイブリダイゼーションされるときと異なる信号が発生するように配置された相互作用標識を含み、これにより、存続可能な１つまたは複数の標識が関連付けられているハイブリダイゼーションされていないプローブの存在下で試験試料中のプローブ：標的複合体の検出を行うことができる。
【０２６４】
プローブが立体構造変化を受けたかどうかを判定するために、異なる種類の相互作用部分が使用されうる。例えば、相互作用部分は、ルミネッセンス発光／クエンチャー対、ルミネッセンス発光／付加体対、フォレスターエネルギー移動対、または色素二量体とすることができる。複数の種類の標識が、特定の分子上に存在しうる。
【０２６５】
ルミネッセンス発光／クエンチャー対は、化学発光または蛍光発光部分などの１つまたは複数のルミネッセンス発光部分と１つまたは複数のクエンチャーとで構成される。好ましくは、蛍光発光／クエンチャー対は、立体構造変化を受けたプローブを検出するために使用される。蛍光発光部分は、特定の波長、または波長帯の光を吸収し、特定の放射波長、または波長帯を持つ光を放射する。クエンチャー部分は、励起された蛍光発光部分から放射される信号を部分的にまたは完全に減衰する。クエンチャー部分は、異なる蛍光プローブから発生する信号を減衰することができる。例えば、ＤＡＢＣＬＹ（［４−（４’−ジメチルアミノフェニルアゾ）安息香酸］）は、ＥＤＡＮＳ（５−（２’−アミノエチル）アミノアフタリン−１−スルホン酸）、ローダミン、およびフルオレセインから発生する信号の約９５％をクエンチできる。
【０２６６】
異なる数および種類の蛍光発光およびクエンチャー部分を使用できる。例えば、複数の蛍光発光部分を使用することで、開放分子ビーコンまたはトーチからの信号発生を高めることができ、また複数のクエンチャー部分を使用することで、標的配列が存在しない場合に、励起された蛍光発光分子が信号をほとんどまたは全く発生しないことを確実にできる。蛍光プローブの例としては、アクリジン、フルオレセイン、スルホローダミン１０１、ローダミン、ＥＤＡＮＳ、Ｔｅｘａｓ  Ｒｅｄ、Ｅｏｓｉｎｅ、Ｂｏｄｉｐｙ、およびルシファーイエローが挙げられる。例えば、Ｔｙａｇｉら、（１９９８年）Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ１６巻：４９〜５３頁を参照のこと。クエンチャーの例としては、ＤＡＢＣＹＬ、タリウム、セシウム、およびｐ−キシレン−ｂｉｓ−臭化ピリジニウムが挙げられる。
【０２６７】
ルミネッセンス発光／付加体対は、１つまたは複数のルミネッセンス発光部分および（複数の）ルミネッセンス発光分子とともに印加体を形成し、したがって（複数の）ルミネッセンス発光分子からの信号発生を弱めることができる１つまたは複数の分子で構成される。溶液中に遊離しているリガンドを使用してルミネッセンス発光分子からの信号を変えるために印加体形成を使用することについては、Ｂｅｃｋｅｒらの「Ａｄｄｕｃｔ  Ｐｒｏｔｅｃｔｉｏｎ  Ａｓｓａｙ」という表題の米国特許第５，７３１，１４８号において開示されている。
【０２６８】
フォレスターエネルギー移動対は、２つの部分からなり、第１の部分の発光スペクトルは第２の部分の励起スペクトルと重なる。第１の部分を励起することができ、第２の部分の放射特性を測定して、これらの部分が相互作用しているかどうかを判定することができる。フォレスターエネルギー移動対の例としては、フルオレセインとローダミン、ニトロベンズ−２−オキサ−１，３−ジアゾールとローダミン、フルオレセインとテトラメチルローダミン、フルオレセインとフルオレセイン、ＩＡＥＤＡＮＳとフルオレセイン、およびＢＯＤＩＰＹＦＬとＢＩＯＤＩＰＹＦＬを伴う対が挙げられる。
【０２６９】
色素二量体は、二量体の形成後に相互作用する２つの色素を含み、色素が二量体立体配座でない場合と異なる信号を発生する。例えば、Ｐａｃｋａｒｄら（１９９６年）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ９３巻：１１６４０〜１１６４５頁を参照のこと。
【０２７０】
均一検定は、一般的には好ましいが、特異的核酸ハイブリダイゼーションを監視するために使用できる標識および検出システムであれば本質的にどのようなものでも、本発明の容器とともに使用できる。有用な標識の集合体には、放射性標識、挿入色素、酵素、ハプテン、結合オリゴヌクレオチド、化学発光分子、および電子検出法に従う酸化還元活性部分が含まれる。好ましい化学発光分子としては、ハイブリダイゼーション保護検定（ＨＰＡ）とともに使用するＡｒｎｏｌｄらの「Ｈｏｍｏｇｅｎｅｏｕｓ  Ｐｒｏｔｅｃｔｉｏｎ  Ａｓｓａｙ」という表題の米国特許第５，２８３，１７４号で開示されている種類、および単一反応において複数の標的を定量化する検定とともに使用するＷｏｏｄｈｅａｄらの「Ｄｅｔｅｃｔｉｎｇ  ｏｒ  Ｑｕａｎｔｉｆｙｉｎｇ  Ｍｕｌｔｉｐｌｅ  Ａｎａｌｙｔｅｓ  Ｕｓｉｎｇ  Ｌａｂｅｌｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ」という表題の米国特許第５，６５６，２０７号で開示されている種類のアクリジニウムエステルが挙げられる。好ましい電子標識および検出アプローチは、Ｍｅａｄｅらの「Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｍｅｄｉａｔｅｄ  Ｅｌｅｃｔｒｏｎ  Ｔｒａｎｓｆｅｒ」という表題の米国特許第５，５９１，５７８号、およびＭｅａｄｅの「Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  ｏｆ  Ａｎａｌｙｔｅｓ  Ｕｓｉｎｇ  Ｒｅｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ  Ｅｎｅｒｇｙ」という表題の米国特許第６，０１３，１７０号で開示されている。標識として有用な酸化還元活性部分は、Ｃｄ、Ｍｇ、Ｃｕ、Ｃｏ、Ｐｄ、Ｚｎ、Ｆｅ、およびＲｕなどの遷移金属を含む。
【０２７１】
レポーター部分を核酸に結合し、レポーター部分を検出する合成技術および方法は、当技術分野でよく知られている。例えば、Ｊ．ＳＡＭＢＲＯＯＫ  ＥＴＡＬ．、「ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ  ＣＬＯＮＩＮＧ：Ａ  ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＹ  ＭＡＮＵＡＬ」、第１０章（第２版１９８９年）、Ｂｅｃｋｅｒらの米国特許第６，３６１，９４５号、Ｔｙａｇｉらの米国特許第５，９２５，５１７号、Ｔｙａｇｉらの「Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ｐｒｏｂｅｓ  Ｈａｖｉｎｇ  Ｎｏｎ−ＦＲＥＴ  Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ  Ｑｕｅｎｃｈｉｎｇ  ａｎｄ  Ｋｉｔｓ  ａｎｄ  Ａｓｓａｙｓ  Ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ  Ｓｕｃｈ  Ｐｒｏｂｅｓ」という表題の米国特許第６，１５０，０９７号、Ｎｅｌｓｏｎらの米国特許第５，６５８，７３７号、Ｗｏｏｄｈｅａｄらの米国特許第５，６５６，２０７号、Ｈｏｇａｎらの「Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｐｒｏｂｅｓ  ｆｏｒ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  ａｎｄ／ｏｒ  Ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｎｏｎ−Ｖｉｒａｌ  Ｏｒｇａｎｉｓｍｓ」という表題の米国特許第５，５４７，８４２号、Ａｒｎｏｌｄらの米国特許第５，２８３，１７４号、Ｋｏｕｒｉｌｓｋｙらの「Ｍｅｔｈｏｄ  ｏｆ
Ｄｅｔｅｃｔｉｎｇ  ａｎｄ  Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚｉｎｇ  ａ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  ｏｒ  Ｒｅａｃｔａｎｔ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｈｉｓ  Ｍｅｔｈｏｄ」という表題の米国特許第４，５８１，３３３号、およびＢｅｃｋｅｒらの米国特許第５，７３１，１４８号を参照のこと。
【０２７２】
処理材料は、乾燥形態または液状形態で容器の室に供給されうる。処理材料を乾燥形態で供給することは、処理材料がその液状形態では不安定であるか、生物学的または化学的に活性であるか、温度に敏感であるか、または互いに化学反応する場合に特に有利であるものとすることができる。乾燥は、微生物および酵素の活性を抑制し、処理材料の貯蔵寿命および保管条件を改善することができる（低温貯蔵とは反対に室温で）。乾燥された処理材料は、その反応性成分に加えて、凍結され、乾燥させられ、および／または再構成されているときに材料の生物活性を保存するのに役立つ凍結防止剤（例えば、サッカロース、マルトース、ラクトース、またはトレハロースなどの二糖類）および時間が経って材料の生物活性の喪失を予防または遅らせるための安定化剤（例えば、サッカロースおよびトレハロースを含むさまざまな糖類、糖アルコールおよびタンパク質）を含みうる。与えられた凍結防止剤または安定化剤が適しているかどうかは、乾燥させられる材料の性質によって決まる。乾燥された後、処理材料は、水分の再吸収を防止するために封止されなければならない。処理材料を乾燥させるための方法および装置は、当技術分野でよく知られており、凍結乾燥または冷凍乾燥を含む。例えば、Ｐｒｉｃｅらの「Ｐｅｌｌｅｔｉｚｅｄ
Ｐｒｅｇｎａｎｃｙ  Ｔｅｓｔ  Ｒｅａｇｅｎｔｓ」という表題の米国特許第３，８６２，３０２号、Ｔｅｍｐｌｅらの「Ｐｒｏｃｅｓｓ  ｆｏｒ  Ｆｒｅｅｚｉｎｇ  ｏｒ  Ｃｈｉｌｌｉｎｇ」という表題の米国特許第４，６５５，０４７号、Ｍｉｌａｎｋｏｖらの「Ｃｒｙｏｇｅｎｉｃ  Ａｐｐａｒａｔｕｓ」という表題の米国特許第４，９８２，５７７号、Ｓｈｅｎらの「Ｓｔａｂｉｌｉｚｅｄ  Ｅｎｚｙｍｅ  Ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎｓ  ｆｏｒ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ」という表題の米国特許第５，８３４，２５４号、Ｂｕｈｌらの「Ｄｒｉｅｄ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎｓ」という表題の米国特許第６，２５１，６８４号、およびＭｃＭｉｌｌａｎらの「Ｕｎｉｖｅｒｓａｌ  ａｎｄ  Ｔａｒｇｅｔ  Ｓｐｅｃｉｆｉｃ  Ｒｅａｇｅｎｔ  Ｂｅａｄｓ  ｆｏｒ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ」という表題の米国特許出願公開第２００６−００６８３９８Ａ１号を参照のこと。
【０２７３】
（例示的な実施形態）
本発明の態様を具現化する多室型容器の例示的な一実施形態は、図１Ａにおいて参照番号１０で示されている。この実施形態では、容器１０は、箔および／またはプラスチックなどの薄い柔軟材料から形成された柔軟な上側シートおよび下側シート、および使用時に容器の優先配向を示し、上方向および下方向を定める上側縁１２と下側縁１４を有する概ね平面状の容器である。例示的な容器１０は、約７．５インチ×約３．２インチの寸法を有し、厚さは約１／４インチ未満であるが（試料および処理材料を充填されている場合）、本明細書で説明されているように、手動操作または自動化システムとの併用に適した寸法であればどのような寸法でもよい。一般に、容器の寸法は、１つの処理または一組の処理を実行するために必要な物質を収容できるものでなければならない。当業者であれば、さまざまな大きさ、立体配座、形状、および同様の寸法がさまざまな処理に適合し、使用できると考えられることを理解するであろう。
【０２７４】
容器は、自動化機器に関して容器の取り付けおよび／または位置合わせを行うために自動化機器のフックまたはピンなどの構造と位置を合わせる１つまたは複数の取り付けもしくは位置合わせ孔７４を備えることができる。検査条件およびパラメータを含む、試料、患者、または注目する他の情報の識別用の１つまたは複数の標識は、適宜、容器表面に備えるか、または容器を構成するために使用される材料中に埋め込むことができる。このような標識は、人間が読み取れるしるし、機械で読み取れるしるし（例えば、バーコード）、光学式文字認識（ＯＣＲ）、無線識別（ＲＦＩＤ）、またはこれらの何らかの組み合わせを含みうる。図１Ａを参照すると、容器１０は、一体化されたシステムの一部を形成する多数の室を含み、これらの室は、全体として、選択的に開放可能な接続部を所々に配した複数の非直線的経路を定める。吸入口５２および首部分５１は、反応物を処理するか、試験するか、または反応物に曝さすための試料または他の材料を収容するためのチャネルとして使用され、試料もしくは他の材料を入れるための好適な構成を有するものとすることができる。試料材料は、好適な手段によって、例えば、吸入口５２に孔を開ける針を備える注射器を使用することによって容器１０に移すことができる。その代わりに、吸入口５２は、オスルアー接続部を有する注射器または他の容器を挿入するためのルアー接続部のメス部分、または試料材料を注ぎ込むか、またはピペットで移すか、または他の何らかの方法で挿入できる容器の上部にある未封止の開口部を備えることができる。吸入口５２は、好ましくは、容器１０の上側縁１２に、またはその付近に配置され、これにより、移した後に、または自動化機器内に容器を配置する前に、試料材料がこぼれてしまう危険性が低減される。しかし、吸入口５２は、例えば、適宜可逆的に封止されるスロットまたは他の開口部として、容器１０の縁、または中央寄りの位置のうちの都合のよい位置に配置することができる。例えば、吸入口は、試料材料を入れた後に容器１０の対向するシートをヒートシールで封止することによって閉じることができる。
【０２７５】
例示されている容器１０の一体化された室システムは、１１個の室Ｃ１６、Ｃ１８、Ｃ２０、Ｃ２２、Ｃ２４、Ｃ２６、Ｃ２８、Ｃ３０、Ｃ３２、Ｃ３４、およびＣ３６を備える。これらの室は、一般的に、物質が隣接する室の少なくとも一部の間を流れ、さらには一体化システムのさまざまな室の間を流れるように、１つまたは複数の隣接する室と（選択的に、一時的に、または恒久的に）接続されうる密閉された区画である。それぞれの室は、例えば、試料材料、さらなる分析用に試料材料を調製するための試料処理試薬、反応物、溶媒、希釈剤、洗浄試薬、および同様の物質などの、容器１０内で処理を行うために使用される物質を収納できる。さらに、室は、分析対象精製手順、混合、加熱／冷却、信号または視覚的特性（例えば、色の変化）の検出、廃棄物保管、および除去などの１つまたは複数の処理ステップを実行する場として、手動操作を通じて、または機器のさまざまな要素と連携して機能しうる。容器１０が機器内に配置されるときに、いくつかの室に物質、例えば、試料、反応試薬、緩衝液などを事前装填しておき、他の室は当初空にしておくことができるが、処理を実行するときに１つまたは複数の物質を当初空であった室の中に移動するか、またはその室に通すことができる。いくつかの室は、容器１０内で実行される特定の処理の要件によっては、全く使用されなくてもよい。
【０２７６】
容器１０の例示的な使用において、これらの室は、免疫検定または核酸ベースの反応などの、結合反応を実行するために必要な物質を充填することができる。容器１０のこのような用途では、室Ｃ１６は、試料材料を装填され、室Ｃ１８は、試料材料中に存在する分析対象を結合し、固相担体上に固定するための試料処理試薬を装填され、室Ｃ２６は、試料材料の他の成分から固定化された分析対象を分離するための試料処理室として機能し、室Ｃ２２は、乾燥された第１の処理材料を装填され、室Ｃ２０は、第１の処理材料を再構成するための試薬を装填され、室Ｃ２８は、乾燥された第２の処理材料を装填され、室Ｃ３０は、第２の処理材料を再構成するための試薬を装填され、室Ｃ３４は、洗浄試薬を装填され、室Ｃ３６は、処理を実行するときに破棄物質を移し、それらの破棄物質が処理の他の態様から相対的に分離する形で保管する廃棄物室として機能しうる。第２の処理材料を収納することに加えて、室Ｃ２８は、さらに、試料材料中に分析対象が存在することを示す反応混合物中の信号または変化を検出するための検出室として機能できる。容器１０の代替実装では、室Ｃ３２は、室Ｃ３０に収納されている乾燥された第２の処理材料を再構成するための試薬を収納することが可能であり、次いでこれは、室Ｃ２８内に収納されている乾燥された第３の処理材料を再構成するために使用することが可能である。その代わりに、乾燥された第２の処理材料を室Ｃ３０内に装填し、第２の処理材料を再構成するための試薬を室Ｃ３２内に装填することが可能であり、その場合、第１および第２の処理材料の再構成された形態が、室Ｃ２８内の分離された分析対象と組み合わせることが可能である。
【０２７７】
容器１０の他の限定しない用途については、本開示の実施例の節で説明される。
【０２７８】
例示されている実施形態では、室Ｃ３４は、洗浄試薬を収納するように空間的に設計され、上側部分３８、下側首部４０、垂直区画４２、および室Ｃ２６の方へ延びる横方向区画４４を備える。
【０２７９】
さらに、容器１０の例示されている実施形態において、室Ｃ３６は、室Ｃ２６から廃棄材料を収容するため廃棄物室として機能するように有利に構成され、室Ｃ２６から延びる初期垂直吸入口４８、上側首部４６、および捕集領域５０を備える。垂直吸入口４８は、室Ｃ２６の上に位置し、室Ｃ２６の上部に位置する入口７０を用いて室Ｃ２６に接続される。磁気分離手順などの分析対象分離手順が室Ｃ２６内で実行されると、例えば、反応混合物中に存在する洗浄剤（例えば、試料に供給される洗浄剤ベースの溶解剤または試料処理試薬中に存在する洗浄剤）によって気泡が室Ｃ２６内に形成されるか、または移動されうる。
【０２８０】
図１Ａに例示されているように、容器１０の室は、次のように相互接続される。室Ｃ１８は、入口５４によって室Ｃ１６に接続され、室Ｃ１６は、入口６２によって室Ｃ２６に接続され、室Ｃ２０は、入口５６によって室Ｃ２２に接続され、室Ｃ２２は、入口５８によって室Ｃ２６に接続され、室Ｃ２４は、入口６０によって室Ｃ２６に接続され、室Ｃ３２は、入口６８によって室Ｃ３０に接続され、室Ｃ３０は、入口６６によって室Ｃ２８に接続され、室Ｃ２８は、入口６４によって室Ｃ２６に接続され、室Ｃ３４は、入口７２によって室Ｃ２６に別々に接続され、上記のように、室Ｃ２６は、入口７０によって室Ｃ３６に接続される。いくつかの実施形態では、圧力が接続されている室に付与されたときに剥がれて開くヒートシールなどの開放可能シールによって中を通る流体の流れを防ぐために、入口５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、および７２のうちの１つまたは複数が、一時的に閉じられる。
【０２８１】
図１Ａの実施形態では、容器１０の室Ｃ１６は、好適な試料体積を保持するように構成される。一般的に、試料は、人間または他の動物から採取された流体試料などの、流体または流動化試料であり、これは、血液または血液製剤（つまり、血漿または血清）、脳脊髄液、結膜検体、呼吸器検体、鼻咽頭検体、または尿生殖路検体を含むか、または例えば、環境試料、工業試料、食物試料、飲料試料、または試水とすることができる。固体または粘着性試料材料（例えば、食物、糞便、および痰）は、一般的に、試料材料を室Ｃ１６に加える前に少なくとも部分的に可溶化される必要がある（ただし、そのような試料材料を直接容器内で可溶化することも可能である）。試料材料は、有機物でも無機物でもよく、処理もしくは分析用の材料または化学的反応、生化学的反応、または生物学的反応における反応物とすることができる。
【０２８２】
室Ｃ１６の容積容量は、好ましくは約１０μＬから約１ｍＬまで、より好ましくは最大約８５０μＬまで、最も好ましくは約６２５μＬである。この容積容量は、室Ｃ１６内に置かれることが予想される物質の全体積を収容することを意図されており、本明細書で説明されている例示的な用途では、室Ｃ１８からの試料処理試薬と組み合わせた試料材料の体積を含む。最も好ましい容積量では、これは、試料５００μＬと試料処理試薬１２５μＬとを組み合わせたものである。予想される容積範囲の下限では、室Ｃ１６に外部圧力を付与した後に入口６２でシールをこじ開けるのに十分な流体が室Ｃ１６内に必要である。予想される容積範囲の上限では、室Ｃ１６内に置かれる体積は、容器の伸長があり、おそらく室の壁の剥離または破裂が生じるほどに大きくなりえない。
【０２８３】
入口５４は、室Ｃ１８を室Ｃ１６に接続し、選択的に開放可能なシールによって一時的に閉じられる。一例が以下で説明されている加圧機構によって室Ｃ１８に十分な圧縮力を付与した後、シール閉鎖入口５４が開かれ、試料処理試薬が室Ｃ１８から室Ｃ１６に移動され、そこで、室Ｃ１６に供給される試料材料と混ぜ合わされる。試料処理試薬は、好ましくは、結合材および、分析対象を固定化するための磁気応答性粒子などの固相担体を含む。
【０２８４】
第１の処理材料は、室Ｃ２２内に収納され、第１の処理材料用の再構成試薬は、室Ｃ２０内に収納される。一実施形態では、第１の処理材料は、増幅試薬である。乾燥された、または固形物の増幅試薬が好ましいが、それは、液体増幅試薬に比べて安定しているからである。増幅試薬に適している担体は、化学的に不活性であるか、または親和性のある材料を含み、適宜、例えば、希釈剤、結合剤、潤滑剤、溶解補助剤、保存料、および同様の物質を含みうる。一実施形態では、増幅試薬は、低温流体で冷凍され、均一大きさのペレットを形成し、次いで、単位用量用途に使用するために凍結乾燥される。固体形態の増幅試薬は、さらに、ペレットまたはタブレット状に圧縮されうるが、粉末、顆粒、または他の便利な、安定した固形の形態をとってもよい。乾燥された増幅試薬も好ましいが、これは、偶発的破裂が発生する確率は、液体試薬に比べて乾燥された試薬の方が低く、また固形材料は試薬の投与を非常に正確に行えるからである。
【０２８５】
第１の処理材料が、増幅試薬である場合、増幅試薬は、プライマー、プロモーター−プライマー、および／または非伸長性プロモーター−プロバイダーオリゴヌクレオチドなどの少なくとも１つの増幅オリゴヌクレオチド、ヌクレオシド三リン酸塩、および好適な緩衝液中のマグネシウムイオンなどの補因子を含むことができる。増幅試薬の特異成分は、実施される増幅手順に依存する。転写ベースの増幅反応を実行するための例示的な増幅試薬は、本開示の実施例の部分において説明されている。
【０２８６】
いくつかの実施形態では、室Ｃ２０は、空のまま残されるか、または第１の処理材料が省かれるか、または室Ｃ２２内に流体形態で供給される場合にまとめて省かれる。その代わりに、室Ｃ２２は、空のままにしておき、室Ｃ２０内に液体を装填することも可能である。
【０２８７】
以下で説明されているような、加圧機構によって室Ｃ２０に十分な圧縮力を付与した後、シール閉鎖入口５６が開かれ、室Ｃ２０に収納されている再構成試薬が、室Ｃ２２に収納されている第１の処理材料に移動される。
【０２８８】
再構成試薬が供給されない実施形態では（例えば、室Ｃ２０が空であるか、または例示されている容器１０において省かれている）、第１の処理材料は、液体であるか、または室Ｃ２２内に装填する前に事前溶解されている固形物とすることができる。第１の処理材料が増幅試薬である場合、増幅オリゴヌクレオチドは好ましくはかなり過剰に存在する。適切な量のこれらおよび他の試薬は、当業者であれば決定することができ、また検定パラメータおよび検出すべき標的の量と種類に依存する。
【０２８９】
再構成試薬が、室Ｃ２０から室Ｃ２２に移された後、加圧機構が、外部圧力を室Ｃ２２に付与して、室Ｃ２２と室Ｃ２６との間のシール閉鎖入口５８を開き、これにより、第１の処理材料の再構成形態を室Ｃ２２から室Ｃ２６に流す。いくつかの実施形態では、室Ｃ２０およびＣ２２の内容物は、室Ｃ２０とＣ２２との間で組み合わされた材料を複数回移動してから、第１の処理材料の再構成形態を室Ｃ２６に移すことなどによって混合される。
【０２９０】
すすぎが使用される場合、すすぎは、洗浄ステップの後に行い、分析対象の処理に干渉するおそれのある洗浄試薬中に存在する物質を除去することが意図されている。すすぎ試薬は、室Ｃ２４に収納され、好ましくは、洗浄剤または機能的に類似している材料を含む水性緩衝液を含む。すすぎ試薬は、第１の処理材料の再構成形態とすることも可能である（例えば、ヌクレオシド三リン酸塩なしの増幅試薬）。その代わりに、すすぎ試薬は、洗剤を含まないか、または陰イオン洗剤を含まないか、または洗浄試薬に比べて低い濃度の陰イオン洗剤を含むか、または洗浄試薬中に存在する陰イオン洗剤の効果を弱める非イオン洗剤を含む緩衝液とすることができる。好ましい実施形態における室Ｃ２４内に収納されているすすぎ試薬の体積は、約１５０μＬから約５００μＬまでである。適切な時点において、加圧機構が、室Ｃ２４上に圧力を付与し、室Ｃ２４と室Ｃ２６との間の入口６０を閉じるシールを開く流体圧力を発生し、すすぎ試薬を室Ｃ２４から室Ｃ２６に流すようにできる。
【０２９１】
室Ｃ３０は、第２の処理材料を再構成するための試薬を収納する。好ましい実施形態では、室Ｃ３０内に収納されている再構成試薬の体積は、約２０から約１２５μＬまで、より好ましくは約２５から約１００μＬまでである。容器が、核酸増幅反応を実行するために使用される場合、第２の処理材料は、標的配列の伸長および／または転写を引き起こすためのポリメラーゼなどの１つまたは複数の酵素、および適宜、標的配列またはその相補体を含む増幅産物に特異的に、また検出可能なように結合するプローブを含むことができる。固相酵素および／またはプローブ試薬に適している担体は、化学的に不活性であるか、または親和性のある材料を含み、適宜、例えば、希釈剤、結合剤、潤滑剤、溶解補助剤、保存料、および同様の物質を含みうる。酵素および／またはプローブ試薬は、低温流体で冷凍して均一大きさのペレットを形成することができ、次いで、単位用量用途に使用するために凍結乾燥される。固体形態の酵素およびプローブ試薬は、さらに、取り扱いが容易なように好適な担体を使用したペレットまたはタブレット状に圧縮されうるが、粉末、顆粒、または何らかの便利な、安定した固形の形態をとってもよい。２つの固体組成物が、別々のペレットとして調製されるか、または単一の固形として組み合わされうる。さらに、乾燥されたプローブ試薬を、室Ｃ２８などの室の中に、例えば、ペレットもしくは顆粒の形態で装填するか、または室の壁に対し噴霧、プリント、または他の何らかの方法で塗布することができる。
【０２９２】
乾燥された処理材料を再構成する際に、再構成試薬が室の周囲にそって集中する傾向を有し（例えば、室壁を定めるヒートシールで封止された領域）、したがって室の中で中央寄りに配置される乾燥された処理材料は、溶解しないか、または完全に溶解しないことが観察された。この問題を解決しようとして、発明者は、鉱物油（例えば、シリコン油）などの軽質油を再構成試薬とともに供給することによって、室の中央に向かって再構成試薬を送り、これにより乾燥された処理材料の再構成を改善できることを発見した。この油は、さらに、油が本質的に室の壁にそってさっと動いてゆく「スキージ」効果を有することも判明し、これにより、物質のすべてまたは実質的にすべてが隣接する室の中へ移動する。これは、特に、処理材料の量または濃度の変化に敏感な単位用量用途において重要なものである。油は、さらに、水性物質を室の中心近くに集中させることによって物質の混じり具合をよくすることに関わることも判明しており、これがスキージ効果と組み合わさって、混合される物質のより多くが室と室との間に移動されることが確実になる。油のさらなる利点として、被覆能力が上げられ、これは、物質が室の表面に固着するのを妨げるか、または干渉する。油の代わりとして、類似の利点を有する他の不活性の非混和性液も使用できる。
【０２９３】
ここでは、本発明の態様を具現化する容器１０の利点は、室の非直線的配列構成による、非順次的に処理材料を再構成する能力にあると言及されなければならない。つまり、第２の処理材料を再構成する前に第１の処理材料を完全に再構成する必要がないということである。同時を含む、処理を実行するために必要な、または実行するのに都合のよい時点において、第１の処理材料を室Ｃ２２内で再構成し、第２の処理材料を室Ｃ２８内で再構成することができる。
【０２９４】
加圧機構は、室Ｃ３０を物理的に圧迫して、室Ｃ３０と室Ｃ２８との間の入口６６を閉じるシールを開く流体圧力を発生し、これで室と室との間で流体を流し、再構成試薬を室Ｃ３０から室Ｃ２８に移し、中に収納されている第２の処理材料を溶解することができる。室Ｃ２８に収納されている処理材料が、すでに液体形態である場合−例えば、酵素試薬および検出プローブが液体形態で調製されるか、または容器内に装填する前に再構成される場合、室Ｃ３０は空であってもよい。いくつかの液体処理材料では、ＴＲＩＴＯＮ（登録商標）Ｘ−１００（オクチルフェノールポリ（エチレングリコールエーテル）ｎ）などの洗剤を入れて、処理材料の成分が室の壁に固着するのを防止することが望ましいと思われる。さらに、液体または再構成形態で供給される処理材料が、電磁放射線の影響を受けやすい場合、これらの処理材料を保持する室（例えば、室Ｃ２８）は、光遮蔽材料を使用して構成するとよい。
【０２９５】
一方の室から隣接する室に移動された物質間の混合を行うことが望ましく、また必要になることが多い。例えば、再構成試薬を室Ｃ３０から室Ｃ２８に移動して、室Ｃ２８内に収納されている乾燥された処理材料を再構成する場合には、再構成試薬と乾燥された処理材料を混合することが望ましい。例示されている実施形態では、室Ｃ３０および室Ｃ２８は、２つの室の組み合わされた内容物の混合が重力の助けを借りて行いやすくなるような互いに関する位置および配向に設定される。重力の助けを借りて混合する場合、下方室（例えば、室Ｃ３０）から上方室（例えば、室Ｃ２８）へ物質（例えば、再構成試薬）を押しやるために圧力機構が使用される。重力の助けを借りた混合は、一般的に、（ｉ）隣接する位置にある上方室と下方室（または制限された区画によって接続されている室の上側領域と下側領域）を接続する比較的狭い通路に物質が力ずくで通されるときに発生する、上方室と下方室（または室の区画）内の物質が液体を含む、乱流、（ｉｉ）上方室の周囲での組み合わされた液体の移動、および（ｉｉｉ）上方室と下方室を接続する通路を通る物質の重力による移動の３つの機構のうちの少なくとも１つに依存する。重力の助けを借りた混合の利点の１つは、圧力機構が上方室（または室の上側領域）に関連付けられていなくてもよいことである。
【０２９６】
室Ｃ３４は、室Ｃ２６で実行される試料処理手順から不要な材料を取り除くために使用される洗浄試薬を収納する。好ましい実施形態における室Ｃ３４内に収納されている洗浄試薬の体積は、約４００μＬから約５，０００μＬまで、最も好ましくは約７００μＬから約２，０００μＬまでである。加圧機構は、室Ｃ３４の選択された部分を圧迫し、それにより、入口７２を閉じるシールを開く、室Ｃ２６、つまり試料処理室に洗浄試薬を力で押し込む、流体圧力を発生する。上述のように、室Ｃ３４は、上側部分３８、下側首部４０、垂直区画４２、および室Ｃ２６の方へ延びる横方向区画４４を備える。室Ｃ３４の配列構成のため、重力が上側部分３８からの洗浄試薬を下側首部４０に通すのを助けると考えられる。いくつかの実施形態では、機器は、上側部分３８に隣接する位置にあるスポンジまたは他の圧縮可能な物体などの受動的手段を備え、これにより、連続する、比較的穏やかな圧力を上側部分に付与して、物質を下側首部４０に向かわせる力をさらに補助することができる。下側首部から、実施例が以下で説明されている圧力機構は、力を加えて洗浄試薬を−通常は、一度に一部分ずつ−垂直および横方向区画４２、４４に通し、次いで入口７２に通して室Ｃ２６に送り込むために使用される。一実施例が以下で説明されている他の圧力機構は、洗浄試薬のさらなる移動を選択的に停止するためのクランプとして機能するように下側首部４０に配置される。
【０２９７】
室Ｃ３６は、廃棄物捕集用に使用される場合、手順を実行するのに先立って空であり、また例えば、試料材料を含む廃棄物、洗浄試薬、すすぎ試薬、および他の使用済み処理材料（例えば、試薬）を含む、手順によって必要になる全廃棄物体積を収納するように設計されている。一般に、室Ｃ３６の好ましい容量は、廃棄物室として使用される場合に約２ｍＬである。
【０２９８】
上で説明されているように、入口７０は、室Ｃ２６を室Ｃ３６に接続し、室Ｃ２６に関して上向きとなっている。この配向は、分離手順の実行時に室Ｃ２６内に形成されうる気泡が、場合によっては洗剤ベースの溶液が存在するため、室Ｃ２６の上部の近くにある入口７０に隣接するところで上昇し、蓄積する自然な傾向を有するため有利であることが発見された。そのため、気泡を含む廃棄物は、室Ｃ３６により容易に、また効率的に移され、したがって、その後の信号検出ステップに干渉する可能性が低くなる。室Ｃ２６の上部に隣接する入口７０の配置もまた、廃棄物が試料処理手順、特に磁気応答性粒子の使用を伴う手順において取り除かれるときに室Ｃ２６内に固相担体粒子を保持するのに役立つ。以下でさらに詳しく説明されるように、好ましい試料処理手順の実行時に、分析対象を結合するために使用される磁気応答性粒子は、室Ｃ２６の内容物に磁場が印加された場合に固定化される。試料処理時に室Ｃ２６内に形成する気泡は、室Ｃ２６の上部の付近に集まる傾向を有し、一般的には、廃棄物が室Ｃ２６から室Ｃ３６に移動されるときに中央寄りに配置されている磁気応答性粒子と接触しない。試料処理室と廃棄物室との間の接続部が、試料処理室の上部とは別の場所にある場合、少なくとも一部の気泡は、廃棄物が試料処理室から廃棄物室に移動されるときに試料処理室内に留まる。それに加えて、形成する気泡の少なくとも一部は、固定化された粒子を通り過ぎる可能性が高く、またいくつかの粒子をずらす十分に強い力を及ぼすことが可能であり、これにより、粒子の一部が廃棄物とともに廃棄物室に移される。そのため、処理の感度および繰り返し性は、例示されている容器１０内の室の設計によって改善されるが、それは、固相担体粒子が、分離手順の実行時に指定された試料処理室内に保持される可能性が高いからである。
【０２９９】
容器１０を使用する例示されている実施形態では、室Ｃ２６（試料処理室）は、６個の室に接続されており、これら６個の室は、室Ｃ１６（試料室）、室Ｃ２２（第１の処理材料室）、室Ｃ２４（すすぎ試薬室）、室Ｃ２８（第２の処理材料室）、室Ｃ３４（洗浄試薬室）、および室Ｃ３６（洗浄室）である。容器内で検定または他の処理を実行する前に、室Ｃ２６は空にすることができる。
【０３００】
容器１０が、自動化機器（後述）内に置かれると、室Ｃ２６は、除去可能な磁場が室Ｃ２６の領域に印加できるような向きにされる。一実施形態では、磁場は、永久磁石を室Ｃ２６に隣接する位置に移動するアクチュエータによって印加される。好適な磁石は、それぞれカンザス州ニュートン所在のＢｕｎｔｉｎｇ  Ｍａｇｎｅｔｓ  Ｃｏ．社からカタログ番号Ｎ５０Ｐ２５０２５０で市販されているような約４．０ｌｂｓの保持力を有する磁石である。この実施形態の好ましい一態様では、磁石は、容器が自動化機器内に配置されたときに容器の平面にそって磁石作動機構（以下でさらに詳しく説明される）によって適切な位置に移動される。磁石は、容器に相対的な方向に移動されうる。磁石は、磁場が印加されている間室Ｃ２６内の磁性粒子を保持するのに十分な強度を持つ磁場を室Ｃ２６およびその内容物に印加する。当業者には理解されるように、永久磁石が使用される場合、磁石は、必要なときに、試料処理室から磁場の効果を除去するために室Ｃ２６から十分に離れた場所に移動可能でなければならない。そのため、磁石は、（１）磁石が室Ｃ２６に隣接し、粒子保持磁場を室およびその内容物に印加できる十分な近さにある「オン」位置、および（２）磁石が、実質的強度を持つ磁場が室またはその内容物に印加されず、室の中に存在する磁性粒子がこれにより目立った影響を受けることのないように室Ｃ２６から十分に離れた位置にある「オフ」位置の少なくとも２つの位置に移動できる可動磁石作動手段上に配置される。
【０３０１】
磁場を所望の場所に印加するための代替手段は、自動化機器によって検定または処理の実行時に室Ｃ２６に隣接する位置に配置されるか、または活性化される前にそのような位置に移動される電磁石の選択的活性化を含みうる。磁場を選択的に印加するためのさらに他の手段は、室Ｃ２６への磁気的に影響を受ける近接位置に入り、またそこから出る形で容器１０の平面に関して横断する方向に移動可能なプラテン上に取り付けられている永久磁石を含む。好適な作動機構を使用して、好適なモーター電子、電子線形アクチュエータ、またはソレノイドに動作可能なように連結されたネジ棒などのプラテンを移動することができる。このような磁気分離手段は、それ自体当技術分野で知られており、当業者であれば、容器室の立体構造または配向に合わせて容易に修正できる。
【０３０２】
上述のように、室と室との間の通路を遮断するシールを開き、次いで、隣接して接続されている室と室との間で物質を移動する操作は、加圧機構によって行うことができる。自動化機器の加圧機構は、物理的力を容器の外側の選択された位置に、また特に、コンピュータコントローラによって制御されるような所定の場合に容器の個別の室の外側に加えることができる。本発明の文脈では、加圧機構という用語は、物理的押付力を容器の（複数の）外面に加えるための手段を指す。好ましくは、それぞれの加圧機構は、容器接触表面を有する圧縮パッドを備える。圧縮パッドはアクチュエータに結合され、アクチュエータは、容器の面に関して概ね垂直方向で、容器に対し相対的にこのパッドを移動して、パッドを容器に押し付け接触させることと、接触から外すこととを選択的に行う。その代わりに、ローラーバーまたはホイールで、物理的力を伝えることもできる。加圧機構は、さらに、アクチュエータに隣接する領域に熱的変化をもたらすなどの追加の機能も備えることができる。アクチュエータが、圧縮パッドを備える場合、このパッドは、容器を損傷することなく容器の表面に適切な力をかけるのに適した材料で構成できる。典型的には、圧縮パッドは、圧力を容器のいずれかの側面に付与するが、容器の反対側は、自動化機器内にあるときには、壁で支持される。したがって、加圧機構の圧縮パッドによる外力の付与によって、容器が選択された位置で締め付けられ、容器はその位置で圧縮され、すると容器の２つの側面を互いに流体封止接触させることで室の中の流体移動が力ずくで行われ、および／または一方の室と他方の室（または単一の室の一方の部分と他方の部分）が一時的に引き離される。その代わりに、容器の対向する側面上に配置され、両方とも容器に向かって、または離れる方向に移動可能である一対の圧縮パッドは、間にある容器とその内容物を締め付けることができる。
【０３０３】
本発明の態様を具現化するシステムの機能アーキテクチャ７００は、図２に概略図として示されている。システムは、反応容器、または容器１０（後述の３００であり、図１２Ａおよび１２Ｂを参照）上で動作するが、これの概略は、容器が横断面で示されているかのように一連の相互接続された矩形（つまり、室）として図２に表されている。システムの動作は、システムの動作およびデータの処理を制御するようにプログラムされる、制御および処理コンピュータ７３０として図２に表されている、コンピュータもしくは他のマイクロプロセッサによって制御される。示されているシステムの図は、略図であり、システム全体の動作は、複数のコンピュータによって制御されうる。制御および処理コンピュータ７３０は、容器を処理するため機器内に配置することができるか、または機器に動作可能なように−例えば、シリアルケーブル、ネットワーク接続、または無線で−接続されている独立した、スタンドアロンコンピュータとすることもできる。
【０３０４】
システム７００の第１の要素は、物質移動制御システム７０１である。物質移動制御システム７０１は、システム内の室から室への物質の移動を引き起こすことと、その移動を制御することの両方を行う。より具体的には、物質移動制御システム７０１は、物質移動力を個別の室に、または室の内容物に付与する物質移動部材７１０、入口または個別の室の間の通路を選択的に遮断し、遮断解除する通路遮断部材７０８、および例えば、縁の狭い分割部材で柔軟な室を圧迫して室の狭い部分を潰し、これにより２つの部分室を狭い潰される部分の対向する側面上に形成することによって個別の室を２つまたはそれ以上の部分室に選択的に分割する室分割部材７０６を備えることができる。物質移動部材７１０、通路遮断部材７０８、および室分割部材７０６は、空気圧部、空気圧式ピストン、油圧部、モーター、ソレノイドなどを備えることができるアクチュエータ駆動機構７０４によって、移動されるか、または作動される。アクチュエータ駆動機構７０４は、物質移動部材７１０、通路遮断部材７０８、および室分割部材７０６の移動、順序、およびタイミングを調節するためアクチュエータ駆動機構７０４の動作を制御するようにプログラムされているコンピュータまたは他のマイクロプロセッサ装置を備えるアクチュエータコントローラ７０２によって制御される。アクチュエータコントローラ７０２は、制御および処理コンピュータ７３０とともに、物質移動部材７１０、通路遮断部材７０８、および室分割部材７０６を選択された順序で選択的に活性化し、容器内で実行される検定または他の処理の実行時に容器全体を通る流体の移動を制御する。代替構成では、アクチュエータ駆動機構７０４の制御機能は、制御および処理コンピュータ７３０内に配置できる。
【０３０５】
アーキテクチャ７００は、さらに、加熱装置または冷却装置の近くにある容器の１つまたは複数の室の内容物を選択的に加熱および／または冷却するための加熱装置７２４および冷却装置７２６を備えることができる温度制御システム７２０を具備することができる。加熱装置７２４および冷却装置７２６は、ペルチェチップなどの単一熱素子を備えることができる。加熱装置７２４および冷却装置７２６の動作は、例えば加熱装置７２４および冷却装置７２６に供給される電力を調節することによって加熱装置７２４および冷却装置７２６の動作（温度、タイミング、および順序）を制御するようにプログラムされたコンピュータまたは他のマイクロプロセッサ装置を備えることができる温度コントローラ７２２によって制御される。温度センサー７２８は、加熱装置７２４および冷却装置７２６の温度を検出し、温度データを温度コントローラ７２２に供給して、所望の温度が得られるように加熱装置７２４および冷却装置７２６の動作を制御する。容器内で検定または他の処理を実行するために、温度コントローラ７２２は、制御および処理コンピュータ７３０とともに、所望の温度および一連の温度変化（例えば、温度機器）が得られるように加熱装置７２４および冷却装置７２６の動作を制御する。代替構成では、加熱装置７２４および冷却装置７２６の制御機能は、制御および処理コンピュータ７３０内に配置できる。
【０３０６】
注目する分析対象の存在および／または量を示すことができる、１つまたは複数の室の内容物からの出力信号を検出するために、検出器システム７１２が備えられている。検出器システム７１２は、励起信号を発生するための励起源７１４を備える、蛍光検出器、または蛍光光度計を具備することができる。励起信号は光学系およびフィルタ７１８を通過し、規定されている波長または他の光学特性を有するその結果得られる励起信号が、室の１つまたは複数に向けて送られる。室の内容物からの放射は、光学系およびフィルタ７１８（必ずしも励起信号が通過する同じ光学素子というわけではない）を通過し、検出器システム７１６に入り、そこで、光学系およびフィルタ７１８は、検出器要素７１６によって検出されるべき規定された波長の放射信号のみを通すことができる。検出器システム７１２の動作の制御、さらには検出器システムによって収集されるデータの処理は、制御および処理コンピュータ７３０によって実行されうる。
【０３０７】
本発明の態様を具現化する、容器１０などの多室型容器と連携して試料に計測手順を実行するための自動化機器は、図３において参照番号１００で指定されている。単一の多室型容器で処理の複数のステップのうちのすべてまたは一部を実行するために、処理または処理の複数のステップの稼動中に技術者による対話操作を行うことなく、自動化機器１００が使用できる。図３に示されている機器は、処理ユニット１０２およびドアアセンブリ２００を備える。いくつかの構成要素および表面パネルは、処理ユニット１０２から省かれており、また基礎となる構成要素および特徴が観察しやすいように例示されている実施形態ではドアアセンブリ２００から覆いが省かれている。
【０３０８】
処理ユニット１０２は、筺体１０４を含む。筺体の上部パネルは、図では省かれていることに留意されたい。筺体１０４は、機器１００を動作させるための電子機器、回路、および空気圧部を収納している。バーコードリーダーブラケット１０６および１０８は、バーコードリーダー（図に示されていない）を保持するものである。一実施形態では、バーコードラベルが容器１０に貼られており、機器上に配置されているバーコードリーダーは、このバーコードを読み取り、処理命令、期限切れ情報、較正情報、および試料識別などの情報を提供する。ブラケット１０６および１０８は、手で持ったまま容器のバーコードラベルを読み取るためのバーコードリーダーを保持する。
【０３０９】
ディスプレイパネル１１０は、筺体１０４から上方に突き出ており、ユーザーがパネル上に取り付けられている制御スイッチに簡単にアクセスでき、パネル上に取り付けられているディスプレイを容易に見られるように配置され、配向されている。
【０３１０】
筺体１０４は、さらに、処理ユニット１０２の機能構成要素の多くを搭載する前部１２０を備える。筺体１０４の前部１２０は、Ｄｅｌｒｉｎ（登録商標）またはアルミニウムから形成され（例えば、機械加工で）、Ｔｅｆｌｏｎ（登録商標）（ＰＴＦＥ）でコーティングされうる、アクチュエータプレート１２４とともに取り付けられている圧力機構クラスタ１８０（以下でさらに詳しく説明される）を備える。アクチュエータプレート１２４内に形成された陥凹部１３０は、ドアアセンブリ２００を閉じる前に計装ユニット１００内に配置されている容器１０を収容し、保持するための開口部を形成する。ドアアセンブリには蝶番が取り付けられるか、または筺体の前部１２０に関して何らかの方法で取り付けられ、容器受容開放位置と閉鎖位置との間でドアアセンブリ２００が移動するようにできる。掛け金または他の類似の機構（図に示されていない）は、筺体１０４に関して閉鎖位置に解放可能な形でドアアセンブリ２００を保持するように形成されうる。より具体的には、掛け金または他の機構は、ドアアセンブリ２００を閉鎖位置に保持するように形成され、ドアを解放し、妥当な量のドア開放力を付与した後に開放位置に移動できるように適合されうる。
【０３１１】
処理を開始するために、容器１０は、機器１００内に配置され、次いでドアアセンブリ２００は、閉じられる。容器１０は、位置合わせ孔７４および７５などの１つまたは複数の位置合わせ特徴を備えることができ、これは、機器の容器受容開口部とともに容器の位置決めおよび配向を適切に行うために機器１００内に設けられているフックまたは位置合わせピン（図に示されていない）などの機器内の嵌合特徴と連携する。図に例示されている実施形態の代わり、本発明の態様を組み込んだ機器は、容器が動作可能なように配置される溝または他の開口部を備えることができ、また枢動するドアアセンブリは、省くことができる。試料材料は、好ましくは、機器内に配置する前に容器に移される。機器内の容器の位置を決める前に試料材料を容器に追加することで、こぼれた試料材料で機器が汚染される機会が最小限に抑えられる。
【０３１２】
ドアアセンブリ２００の詳細は、図３および５に示されている。図中、覆い、または筺体、好ましくはドアアセンブリの被覆部分は、ドアアセンブリの基礎となる構成要素が見えるようにするため図に示されていない。
【０３１３】
図５は、ドアアセンブリ２００の前側、つまり、ドアアセンブリが閉じられたときの処理ユニット１０２および容器に面するドアアセンブリ２００の側面を示している。ドアアセンブリ２００は、熱ゾーンに近接する容器の加熱および／または冷却領域用の１つまたは複数の熱ゾーンを備えることができる。図４に示されている例示的なドアアセンブリ２００は、５つの熱ゾーン２６０、２６２、２６４、２６６、および２６８を備える。熱ゾーンは、容器の１つまたは複数の特定の室に対する加熱および／または冷却を行うように特別な配置にある。例示されている実施形態では、熱ゾーン２６０は、室Ｃ１６および首部分５１を覆っている。熱ゾーン２６２は、室Ｃ１８およびＣ２０を覆う。熱ゾーン２６４は、室Ｃ３４、Ｃ３２、Ｃ３０を、そしてＣ３６のほとんどを覆う。熱ゾーン２６６は、室Ｃ２８を覆う。熱ゾーン２６８は、磁石並進機構２０８（以下でさらに詳しく説明される）上に配置され、室Ｃ２６と室Ｃ２２およびＣ２４の一部を覆う。
【０３１４】
１つまたは複数の熱ゾーンは、容器の１つまたは複数の特定の室に対し局部加熱および／または冷却を行うか、または機器内の周囲温度を制御し、安定させるために使用されうる。周囲温度は、上述のように、処理または処理の特定のステップを最適な形で実行するために都合のよい温度とすることができる。例えば、周囲温度は、約２０℃から約４０℃までの範囲、または約２５℃から約３７℃までの範囲内とすることができる。
【０３１５】
熱ゾーンは、好ましくは、容器の一領域およびその内容物を急速加熱（および／または適宜急速冷却）して、所望の温度にするように設計される。ＰＣＲ増幅反応などの温度機器を必要とする処理には、急速な温度変化が必要になる場合がある。理想的には、熱ゾーンは、実行されるべき処理の間の変動に対応できる高い温度範囲を有する。したがって、熱ゾーンの温度範囲は、好ましくは、水ベースの流体に対しては約５℃から約９５℃までであり、油を含有するものなどの非水性流体に対してはかなり高い温度になる場合がある。
【０３１６】
図５に示されている熱ゾーン２６０、２６２、２６４、２６６、および２６８の一部分は、ペルチェ熱電素子などの熱エネルギー源から容器１０に熱エネルギー（加熱および／または冷却）を伝えるための銅またはアルミニウムなどの熱伝導性材料から作られた伝導体プレートである。図５に示されているように、それぞれの伝導体プレートの露出面は、熱ゾーンの影響を受けるようになっている容器の領域に適合する大きさおよび形状を有する。それぞれの伝導体プレートは、伝導性プレートの間を熱分離する非伝導性材料の複数のブロックで形成された適合する開口部内に取り付けられる。好ましくは、熱ゾーン２６０、２６２、２６４、２６６、および２６８に対する伝導体プレートのうちのそれぞれのプレートの露出面および分離ブロックの露出面は同一平面上にあり、これらが一緒になって、ドアアセンブリ２００が閉鎖位置にあるときに容器１０の側面と接触する平坦な表面を形成する。
【０３１７】
それぞれの熱ゾーンの伝導体プレートは、熱エネルギー源と熱的接触して、その熱エネルギー源から加熱または冷却エネルギーをプレートの露出面に、次いで容器に伝える。一実施形態では、熱エネルギー源は、熱電モジュールであるが、別にペルチェ装置とも呼ばれる。好ましい一実施形態では、熱電ユニットは、熱ゾーンと熱接触しているドアアセンブリ２００内に取り付けられる。好適なペルチェ装置は、熱ゾーン２６４に対してはＴＥＣ１−１２７０８Ｔ１２５、熱ゾーン２６０および２６２に対してはＴＥＣ１−１２７０５Ｔ１２５、および熱ゾーン２６６および２６８に対してはＴＥＳ１−１２７０４Ｔ１２５を備え、すべてタイ、バンコク所在のＰａｃｉｆｉｃ  Ｓｕｐｅｒｃｏｏｌ  Ｌｔｄ．社から入手可能である。
【０３１８】
発泡断熱材などの断熱材を、熱電モジュールの周りと伝導体プレートの部分の間に設けることができる。一般に当業者に知られているように、ドアアセンブリ２００内に、（複数の）ヒートシンクに関して対流空気流を発生するための１つまたは複数のファン機構と組み合わせることができる１つまたは複数の熱伝導性ヒートシンクなどの熱エネルギー源から過剰熱を放散するための手段を設けることができる。
【０３１９】
熱ゾーン２６０、２６２、２６４、２６６、および２６８は、熱ゾーンの影響を受ける、支持されている場合には温度機器を含む、熱的条件の大きさおよび持続時間を制御するためマイクロプロセッサの制御下に置かれる。また、熱ゾーンの１つまたは複数は、不活動状態の（複数の）熱ゾーンの領域内の加熱および／または冷却が不要な試験のときには非活性化されうる。したがって、熱ゾーンの制御は、さまざまな異なる処理要件に応じられるように構成されうる。
【０３２０】
特定の室への熱伝達を改善するために、油または他の不活性物質を使用することで室の中の空気（熱伝導性が非常によくない伝導体）の体積が低減され、それと同時に、室の圧力を高めることができることが判明した。室の圧力を高めると、室と対応する伝導体プレートとの間の接触を高めやすくなり、室の内容物はより完全に、また急速に加熱される。
【０３２１】
磁石並進機構２０８は、この説明のために、磁気分離室と呼ばれる、磁気分離手順が実行されている室（例えば、室Ｃ２６）に関して磁石−単一の永久磁石、永久磁石のクラスタ、および／または１つまたは複数の電磁石を含む−を移動するように構成され、配列される。より具体的には、磁石並進アセンブリ２０８は、磁気分離室に関して磁石を（１）磁石によって発生した磁場が磁気分離室の中で磁気応答性材料を実質的に固定化するのに十分な効果を磁気分離室の内容物に対しもたらすように磁石が磁気分離室に十分に近い「オン」位置と（２）磁石によって発生した磁場が磁気分離室の中で磁気応答性材料を実質的に固定化するのには不十分な効果を磁気分離室の内容物に対しもたらすように磁石が磁気分離室から十分に離されている「オフ」位置との間で移動するように構成され、配列される。
【０３２２】
図５に示されている実施形態では、磁石並進機構２０８は、磁石または磁石のクラスタを支持する磁石キャリアおよびオン位置とオフ位置との間でドアアセンブリ２００に関してキャリアを上下に移動するためキャリアに結合されているアクチュエータを備える。例示されている実施形態では、磁石並進機構２０８は、３つの磁石２１０からなるクラスタを運ぶが、磁石は機構２０８上の頂部または「１２時」位置から省かれている。１２時位置は、磁気分離室２１０を廃棄物室Ｃ３６の吸入口４８と接続する入口７０に最も近い。この位置から磁石を省くことによって、この位置の磁性粒子の蓄積が回避される。これにより、磁気分離手順のすすぎステップおよび洗浄ステップの際に廃棄物室Ｃ３６にうっかり運び込まれる磁性粒子の数を最小限に抑えられる。
【０３２３】
図４を参照すると、圧力機構クラスタ１８０の圧縮パッドは、図１に示されている例示的な容器１０の室および流体経路の配置に適合するパターンで配置され、本明細書で説明されている処理関係の機能のうちのさまざまな機能を実行するように成形される。自動化機器は、適切な圧力機構、磁石、および／または熱ゾーンを、内部マイクロプロセッサコントローラによって制御されるとおりに、適切な順序で活性化する。
【０３２４】
圧力機構クラスタ１８０は、アクチュエータプレート１２４内に設置され、これは図４に概略が示されている。クラスタ１８０は、外面アクチュエータプレート１２４に対し横方向に往復移動して圧力を容器１０の選択された部分に選択的に付与するように構成され、配列されている複数の個別の圧縮パッドを備える。圧力機構クラスタ１８０は、容器１０のさまざまな室および入口と位置を合わせるように大きさを決められ、配列されている複数の圧縮パッドを備える。それぞれの圧縮パッドは、パッドを移動して容器１０の対応する部分と圧縮係合させ、また収容位置に戻すために往復運動する空気圧式アクチュエータ、磁気アクチュエータ、ソレノイド、または他の好適な機械的、電気機械的、または他のアクチュエータ（図に示されていない）に動作可能なように取り付けられているヘッドを備える。
【０３２５】
圧縮パッドＰ５１−１は、容器１０の首５１の上部と位置を合わせるように配置される。圧縮パッドＰ５１−２は、容器１０の首５１の下側部分と位置を合わせるように配置され、首５１は室Ｃ１６の中に入る。圧縮パッドＰ１６−１、Ｐ１６−２、Ｐ１６−３、およびＰ１６−４は、すべて、容器１０の室Ｃ１６の異なる部分と位置を合わせるように配置される。圧縮パッドＰ１６−１は、室Ｃ１６に対する底部圧縮パッドであり、圧縮パッドＰ１６−２は、室Ｃ１６に対する上部圧縮パッドであり、圧縮パッドＰ１６−３は、室Ｃ１６に対する仕切りであり、圧縮パッドＰ１６−４は、室Ｃ１６に対する前部圧縮パッドである。
【０３２６】
複数のパッドＰ１６−１、Ｐ１６−２、Ｐ１６−３、およびＰ１６−４を、試料室として使用できる大きな室Ｃ１６と組み合わせることで、分析される試料の大きさを柔軟に変えられる。仕切りパッドＰ１６−３は、室Ｃ１６を２つのさらに小さな室に分割するために使用できる。室Ｃ２６およびＣ２８は、室Ｃ１６に比べてかなり小さく、したがって、室Ｃ１６の内容物全体は、もし実質的に最大容量まで充填されているとすれば、室Ｃ２６および／または室Ｃ２８内に収まりきらないことは自明であることに留意されたい。いくつかの用途では、分析対象が試料中にもし存在すればその分析対象の検出可能な量があることを確認するために、比較的大量の試料材料が必要になることがあるが、試料の処理のための室Ｃ２６およびＣ２８などの後続の室は、試料材料のそのような大きな体積を受容することができない。室Ｃ１６の異なる部分を圧縮するように適合されている複数のパッドを使用することで、試料を室Ｃ１６から室Ｃ２６に、一度に１つの部分ずつ、または一定分量ずつ移動することができる。
【０３２７】
圧縮パッドＰ１８−１およびＰ１８−２は、室Ｃ１８に位置を合わせるように配置される。圧縮パッドＰ１８−１は、室Ｃ１８に対する後部圧縮パッドであり、圧縮パッドＰ１８−２は、室Ｃ１８に対する前部圧縮パッドである。
【０３２８】
圧縮パッドＰ２０は、室Ｃ２０に位置を合わせるように配置される。圧縮パッドＰ２２は、室Ｃ２２に位置を合わせるように配置される。圧縮パッドＰ２４は、室Ｃ２４に位置を合わせるように配置される。圧縮パッドＰ３０は、室Ｃ３０に位置を合わせるように配置される。圧縮パッドＰ３２は、室Ｃ３２に位置を合わせるように配置される。
【０３２９】
例示されている実施形態では、室Ｃ２８に関連付けられている、または室Ｃ３６の領域５０もしくは室Ｃ３４の領域３８に関連付けられている圧縮パッドはないことに留意されたい。しかし、機器は、以下でさらに詳しく説明するように、室またはその一部に力を加えるための他の機構を備えることもできる。さらに、例示されている実施形態は、例であり、本発明のいくつかの態様を包含する他の実施形態は、室Ｃ２８、さらには領域５０および／または３８に対する圧縮パッドを形成できるか、または他の室および／またはその領域に対する圧縮パッドを省くことができる。
【０３３０】
圧縮パッドＰ３４−１、Ｐ３４−２、およびＰ３４−３は、室Ｃ３４の横区画４４に位置を合わせる。圧縮パッドＰ３４−１は、＃１洗浄圧縮パッドであり、圧縮パッドＰ３４−２は、＃２洗浄圧縮パッドであり、圧縮パッドＰ３４−３は、＃３洗浄圧縮パッドである。
【０３３１】
圧縮パッドＰ３４−４は、＃４洗浄圧縮パッドであり、洗浄試薬室Ｃ３４の垂直区画４２に位置を合わせる。
【０３３２】
圧縮パッドＰ３４−５は、＃５洗浄圧縮パッドであり、洗浄試薬室Ｃ３４の下側首部４０に位置を合わせる。＃５洗浄パッドパッドＰ３４−５は、さらに、圧縮パッド上に広がる平行な隆起したリブＰ３４−５ａを備える。リブＰ３４−５ａは、容器１０の首部４０を閉鎖し、流体が洗浄試薬室３４の上側部分３８から室３４の垂直区画４２および横区画４４内に流れ込むのを防ぐための密封圧縮シールを形成する。圧縮パッドＰ３６−１、Ｐ３６−２、およびＰ３６−３は、室Ｃ３６の垂直吸入口４８に位置合わせされている。圧縮パッドＰ３６−３は、圧縮パッドＰ３６−３の一部が室Ｃ３６の首４６を覆うように圧縮パッドＰ３６−１およびＰ３６−２よりも広くなっていることに留意されたい。圧縮パッドＰ３６−１は、＃１廃液圧縮パッドであり、圧縮パッドＰ３６−２は、＃２廃液圧縮パッドであり、パッドＰ３６−３は、＃３廃液圧縮パッドである。
【０３３３】
圧縮パッドＰ７２は、入口７２に位置合わせされたクランプである。同様に、圧縮パッドＰ７０は、入口７０に位置を合わせるクランプであり、圧縮パッドＰ６２は、入口６２に位置を合わせるクランプであり、圧縮パッドＰ５８は、入口５８に位置を合わせるクランプであり、圧縮パッドＰ６０は、入口６０に位置を合わせるクランプであり、圧縮パッドＰ６６は、入口６６に位置を合わせるクランプであり、圧縮パッドＰ６８は、入口６８に位置を合わせるクランプであり、圧縮パッドＰ５６は、入口５６に位置を合わせるクランプであり、圧縮パッドＰ５４は、入口５４に位置を合わせるクランプである。圧縮パッドＰ６４は、入口６４に位置合わせされたクランプである。
【０３３４】
圧縮パッドヘッドは、デラウェア州ウィルミントン所在のＤｕＰｏｎｔ社によりブランド名Ｄｅｌｒｉｎ（登録商標）で販売されている黒色アセタール樹脂を使用して形成できる。
【０３３５】
圧縮パッドＰ２６は、室Ｃ２６に位置を合わせるように配置される。好ましい一実施形態では、パッドＰ２６は、スクリューアクチュエータまたは他の比較的移動速度が遅いアクチュエータに結合される。スクリューアクチュエータは、空気圧作動圧縮パッドで発生する急激に付与される圧縮力ではなく、ゆっくりとした一様な圧力を加える。この制御された動作には、いくつかの利点がある。例えば、スクリューアクチュエータを使用すると、ユーザーは、圧縮パッドＰ２６が移動する速度および範囲を制御することができ、したがって、圧縮される室の中の乱流を制限または防止することが可能になる。乱流を回避することは、例えば、乱流条件の下で気泡を生じる傾向がある洗剤ベースの試薬を使用したとき、または磁気分離洗浄手順の実行時に室から洗浄試薬を除去するときに望ましい。洗浄試薬が、固定化された磁気応答性粒子を収納している室から除去されているときに、室の中の乱流が、粒子をずらし、粒子を廃棄物室に洗い流してしまう可能性がある。圧縮パッドＰ２６の制御された移動は、結果として室の壁を剥がしたり、または裂いてしまったりする可能性のある、室の過剰圧縮を防ぐのにも役立ちうる。
【０３３６】
図１２Ａおよび１２Ｂは、本発明による他の容器３００を示している。上述の容器１０のように、容器３００は、箔および／またはプラスチックなどの薄い柔軟な材料から形成された柔軟な上部および底部シートを有し、袋状の容器を定める略平面状の容器を備える。容器３００は、使用時に容器の好ましい向きを示し、上方向および下方向を定める上縁３０２および下縁３０４を有する。図１２Ａに示されている種類の例示的な容器は、約５．５インチ×約３．４〜４．０インチの寸法を有し、厚さは約０．４インチであるが（試料および処理材料を充填されている場合）、本明細書で説明されているものと同様に、手動操作または自動化システムとの併用に適した寸法であればどのような寸法でもよい。容器３００を構成するための好ましい材料は、容器１０について上で説明されているのと同じである。容器３００は、試料材料、または他の物質を、容器３００に装填するための吸入口３０６を備える。容器３００は、９個の室Ｃ３２０、Ｃ３２２、Ｃ３２４、Ｃ３２８、Ｃ３３２、Ｃ３３４、Ｃ３３６、Ｃ３３８、およびＣ３４０を備える。
【０３３７】
図１２Ａに示されているように、容器３００は、垂直部分３８１および３８３、上部水平部分３８４、および底部水平部分３８５を備える剛体フレーム３８０を具備することができる。パネル３８２は、バーコードまたは人間または機械が読み取れる他のしるしなどの識別標識を受け取ることができる。このようなラベルに付けられる情報としては、ロット番号、シリアル番号、検定の種類、有効期限などが挙げられる。
【０３３８】
突出タブ３８６は、上部３８４の上に突き出て、袋３００を掴み、それを機器内に挿入し、また機器内から取り出すための付加物を形成する。試料を吸入チャネルＣ３２８Ｃに通し試料室Ｃ３２８Ａ内に導入するための吸入口カバー３８８（例えば、一方向弁）が備えられる。突出タブ３８６および試料カバー３８８を含むフレーム３８０は、好ましくは、プラスチックなどの適度の剛性を持つ材料から形成される。
【０３３９】
容器３００のさらなる詳細は、容器の分解図である図１２Ｂに示されている。フレーム３８０は、後部フレーム構成要素３８０ａおよび前部フレーム構成要素３８０ｂを備え、これらの間に、軟質の袋３０１がサンドイッチ状に挟まれている。後部フレーム構成要素３８０ａは、垂直部分３８１ａ、３８３ａ、上部水平部分３８４ａ、底部水平部分３８５、および突出タブ３８６ａを備える。前部フレーム構成要素３８０ｂは、垂直部分３８１ｂ、３８３ｂ、上部水平部分３８４ｂ、および突出タブ３８６ｂを備えるが、底部水平部分を備えていない。
【０３４０】
それぞれのフレーム構成要素３８０ａおよび３８０ｂは、射出成型され、これら２つの構成要素は、超音波溶接によってフレームアセンブリに互いに接続されうる。容器３００の軟質の袋部分３０１は、袋の周囲に形成された孔を貫通するフレーム構成要素３８０ａ、３８０ｂ上のピンでフレーム３８０内に配置され固定されている。
【０３４１】
容器３００の例示的な使用において、これらの室は、結合反応を実行するために必要な物質を充填することができる。例えば、試料材料は、吸入口３０６を通じて室Ｃ３２８の中に装填されうる。室Ｃ３２８は、下側領域が上側領域から隔離されるように加圧機構によって閉鎖できる制限された区画３６４により接続されている上側領域Ｃ３２８Ａと下側領域Ｃ３２８Ｂからなる。室Ｃ３３２は、固相担体上の試料材料中に存在する分析対象を結合し固定化するための試料処理試薬を装填され、室Ｃ３２８の下側領域Ｃ３２８Ｂは、試料材料を収容することに加えて、試料材料の他の成分から固定化された分析対象を分離するための室Ｃ３２８の試料処理領域として機能し、室Ｃ３３４は、乾燥された第１の処理材料を装填され、室Ｃ３４０は、第１の処理材料を再構成するための試薬を装填され、室Ｃ３２２は、乾燥された第２の処理材料を装填され、室Ｃ３２４は、第２の処理材料を再構成するための試薬を装填され、室Ｃ３３６は、洗浄試薬を装填され、室Ｃ３３８は、洗浄試薬の阻害成分を除去するためのすすぎ試薬を装填され、室Ｃ３２０は、反応の他の態様から相対的に分離する形で廃棄物質を収容し、保管するための廃棄物室として機能しうる。第２の処理材料を収納することに加えて、室Ｃ３２２の下側領域Ｃ３２２Ｂは、さらに、試料材料中に注目する少なくとも１つの分析対象が存在することを示す反応混合物中の信号または変化を検出するための室Ｃ３２２の検出領域として機能できる。
【０３４２】
室Ｃ３２０は、室Ｃ３２８から廃棄材料を収容するように構成されており、室Ｃ３２８から延びている最初の概ね垂直の吸入口３７０、上側首部３７２、および捕集領域３７４を備える。垂直吸入口３７０は、一般的に室Ｃ３２８の下側領域Ｃ３２８Ｂの上に位置し、室Ｃ３２８の下側領域Ｃ３２８Ｂの上部の近くに位置する入口３６０を用いて室Ｃ３２８に接続される。室Ｃ３２８に関する室Ｃ３２０の配列構成により、廃棄材料が室Ｃ３２８から室Ｃ３２０に移動されるときに室Ｃ３２８に入っている気泡を室Ｃ３２０に直接移すことができる。さらに、上側首部３７２は、室Ｃ３２０の捕集領域３７４の上に位置しているため、廃棄材料は、上側首部３７２を封止するためにクランプまたは他の手段を用いずに、重力によって捕集領域３７４内に保持できる。
【０３４３】
図１２に例示されているように、容器３００の相互接続された室システム内で、室Ｃ３２４は、入口３５０によって室Ｃ３２２の下側領域Ｃ３２２Ｂに接続され、室Ｃ３２２の下側領域Ｃ３２２Ｂは、入口３５６によって室Ｃ３２８に接続され、室Ｃ３４０は、入口３４４によって室Ｃ３３４に接続され、室Ｃ３３４は、入口３４６によって室Ｃ３２８の下側領域Ｃ３２８Ｂに接続され、室Ｃ３３２は、入口３４８によって室Ｃ３２８の下側領域Ｃ３２８Ｂに接続され、室Ｃ３３８は、入口３６２によって室Ｃ３２８の下側領域Ｃ３２８Ｂに接続され、室Ｃ３３６は、入口３４２によって室Ｃ３２８の下側領域Ｃ３２８Ｂに接続される。壁３７６は、室Ｃ３３６内に斜めに突き出ており、これにより、洗浄手順実行時に室Ｃ３３６の上側部分に捕集された気泡が入口３４２を通り、室Ｃ３２８内に移動するのを防ぐ。一実施形態では、入口３４２、３４４、３４６、３４８、３５０、３５６、３６０、および３６２のそれぞれは、解放可能なシールまたは他の障壁によって一時的に閉じられ、流体が流れ込むのを防ぐ。容器１０と同様に、容器３００は、試料の非順次的処理を必要とするか、またはそのような処理が有利である複合手順を実行するために使用される室の非直線的配列構成を定める。
【０３４４】
室Ｃ３２２は、上述の下側領域Ｃ３２２Ｂおよび制限されている区画３５８によって接続されている上側領域Ｃ３２２Ａを含む。例示されている配列構成において、室Ｃ３２４とＣ３２２の組み合わされた物質（室Ｃ３２８からの物質と組み合わせる前、または後）は、物質が室Ｃ３２４およびＣ３２８内に移動するのを防ぐために入口３５０および３５６のそれぞれが加圧機構によって締め付けられている間に、室Ｃ３２２の上側領域Ｃ３２２Ａと下側領域Ｃ３２２Ｂとの間でこれら組み合わされた物質を前後に動かすことによって室Ｃ３２２内で混合されうる。室Ｃ３２２の上側領域Ｃ３２２Ａと下側領域Ｃ３２２Ｂの相対的な向きにより、下側領域Ｃ３２２Ｂに付与される圧力が取り除かれたときに、組み合わされた物質が上側領域Ｃ３２２Ａから下側領域Ｃ３２２Ｂ内に移動するのを重力が補助する。したがって、示されている実施形態では、室Ｃ３２２の上側領域Ｃ３２２Ａから下側領域Ｃ３２２Ｂに物質を移動するのに外部圧力を必要としない。
【０３４５】
容器３００は、室と室との間で物質を選択的に移動し、１つまたは複数の選択された室に対し加熱および／または冷却を選択的に行うため加圧機構−圧縮パッドなど−および容器３００の室に適合するように大きさ、形状、および位置が定められた熱ゾーンの配列構成を有する機器（図に示されていない）内で処理される。
【０３４６】
本発明のいくつかの態様を具現化する、図１２Ａおよび１２Ｂに示されているような、容器３００を処理するように構成されている機器の第２の実施形態は、図１３において参照番号１０００によって指定されている。機器１０００は、上部１００２および底部１００２ｂを有する筺体１００２を備える。筺体１００２は、さらにハンドル１００４を備える。ハンドル１００４は、準備する際に容器３００を保持するための対向する溝１００９を備えている。機器１０００は、さらに、好ましくは好適な濾過材で覆われている空気取り入れ口１００８、および排気口１０１０を備える。ステータス画面１０１２は、ステータスおよびオペレータにとって有用な他の情報を表示し、操作ボタンは、例えば、図に示されているように、画面１０１２の下に設けることができる。筺体の上部１００２ａの容器挿入溝１０１４は、図１３に示されているように、容器３００を受容するように構成されている。容器挿入溝１０１４は、こぼれた液体が溝の中に入るのではなく、筺体１００２から流れ出るようにするため、好ましくは凸状である。溝カバースライド１０１６は、溝１０１４の上を塞ぐように容器３００が溝１０１４内に挿入された後手動で操作され、また容器３００を取り出せるように再び開くことができる。ファン１０１１は、電子部品、および筺体１００２の内部にある他の構成要素に冷却用空気を送る。
【０３４７】
図１４および１５の筺体１００２の内部を見るとわかるように、機器１０００は、空気圧縮機１０２０および空気だめ１０２４を備えている。機器は、さらに、蛍光光度計５００（以下でさらに詳しく説明される）などの検出器、および磁石を容器に関して動作可能な位置に移動することおよび動作可能な位置から移動することを選択的に行うための磁石アクチュエータ１０９０を備える。機器１０００は、さらに、空気マニホールド１０８２およびアクチュエータプレート１０８０を備える。機器１０００は、さらに、合体エアフィルタ１０２２を備えることもできる。温度制御システムの態様もいくつか知られており、熱的分離フレーム１０４８とファン１０７０、覆い１０６８、およびヒートシンク１０６４を含む、熱放散システムとを備える。ファン１０７０は、空気を空気取り入れ口１００８から機器内に引き込み、加熱された空気が、ヒートシンク１０６４の上を流れた後、排気口１０１０を通って筺体１００２から出る。
【０３４８】
図９に示されている容器３００に圧力を選択的に付与するための機器１０００の圧力機構クラスタが、図１６に示されている。このクラスタは、Ｔｅｆｌｏｎ（登録商標）（ＰＴＦＥ）で被覆されうる、Ｄｅｌｒｉｎ（登録商標）またはアルミニウムで形成できる（例えば、機械加工で）、アクチュエータプレート１０８０内に取り付けられる。上述のクラスタ１８０の場合と同様に、図１６のクラスタは、アクチュエータプレート１０８０に対し横方向に往復移動して圧力を容器３００の選択された部分に選択的に付与するように構成され、配列されている複数の個別の圧縮パッドを備える。圧力機構クラスタは、容器３００のさまざまな室および入口と位置を合わせるように大きさを決められ、配列されている複数の圧縮パッドを備える。それぞれの圧縮パッドは、パッドを移動して容器３００の対応する部分と圧縮係合させ、次いで収容位置に戻すために往復運動する空気圧式アクチュエータ、磁気アクチュエータ、ソレノイド、または他の好適な機械的、電気機械的、または他のアクチュエータ（図に示されていない）に動作可能なように取り付けられているヘッドを備える。
【０３４９】
一実施形態では、それぞれの圧縮パッドは、加圧された空気をパッドに送り、パッドを伸長位置に移動する、マニホールド１０８２内に形成されている空気導管に結合される。より具体的には、それぞれの圧縮部材は、係合したときに加圧されたシステム空気を圧力調節器（図に示されていない）が取り付けられている入口に向かう経路に接続するソレノイド弁によって制御され、この調節器の出力は、マニホールド１０８２上の他の入口に戻される形で接続され、現在調節され加圧されている空気を圧縮部材に供給する。システム内の圧力を監視するために、圧力センサーを備えることができる。
【０３５０】
圧縮パッドＰ３２８−１およびＰ３２８−２は、容器３００の試料室Ｃ３２８Ａの下側部分と上側部分にそれぞれ位置合わせされる。圧縮パッドＰ３２８−３は、上側首部Ｃ３２８Ｃに位置合わせされる。圧縮パッドＰ３６４は、室Ｃ３２８Ａと室Ｃ３２８Ｂとの間の制限された領域Ｐ３６４に位置合わせされ、室Ｃ３２８ＡとＣ３２８Ｂとの間の流体流を制御するため制限部３６４を選択的に開閉するための手段を形成する。
【０３５１】
圧縮パッドＰ３３８−２は、すすぎ室Ｃ３３８の上側部分に位置合わせされた円形パッドであり、圧縮パッドＰ３３８−１は、室Ｃ３３８の下側部分に位置を合わせる。圧縮パッドＰ３６２は、Ｃ３３８を含むすすぎ室を磁気分離室Ｃ３２８Ｂと接続する入口３６２と位置を合わせ、室と室との間の流体流を制御するため入口３６２を選択的に開閉する（最初に閉じられている破裂性シールが開放された後）手段を形成する。
【０３５２】
圧縮パッドＰ３２０−１、Ｐ３２０−２、およびＰ３２０−３は、廃棄物室Ｃ３２０の異なる部分に位置を合わせる。圧縮パッドＰ３２０−１およびＰ３２０−２は、室Ｃ３２８Ｂを廃棄物室Ｃ３２０に接続する吸入口通路の下側部分および上側部分にそれぞれ位置を合わせ、通路を上に辿り流体を室Ｃ３２０の上側首部３７２内に移動するように適合されている。圧縮パッドＰ３２０−３は、上側首部３７２を通る流体の移動を制御し、特に、流体が廃棄物室Ｃ３２０から室Ｃ３２８Ｂへ逆流するのを防止する。圧縮パッド３６０は、廃棄物室Ｃ３２０を室Ｃ３２８Ｂに接続する入口３６０に位置合わせされ、室と室との間の流体流を制御するため入口３６０を選択的に開閉するための手段を形成する。
【０３５３】
圧縮パッドＰ３５６は、室Ｃ３２２Ｂと室Ｃ３２８Ｂを接続する入口３５６に位置合わせされ、室と室との間の流体流を制御するため入口を開閉するための手段を形成する。圧縮パッドＰ３２２−１は、室Ｃ３２２Ａに位置合わせされ、圧縮パッドＰ３５８は、室Ｃ３２２の領域Ｃ３２２ＡとＣ３２２Ｂを接続する制限された区画３５８に位置合わせされる。圧縮パッドＰ３５８は、室と室との間の流体流を制御するため制限された区画３５８を開閉するための手段を形成する。
【０３５４】
圧縮パッドＰ３２２−２は、室Ｃ３２２Ｂに位置合わせされる。一実施形態では、室Ｃ３２２の下側領域Ｃ３２２Ｂは、試料材料中に注目する少なくとも１つの分析対象が存在することを示す反応混合物中の信号または変化を検出するための検出室として機能する。したがって、いくつかの実施形態では、圧縮パッドＰ３２２は、圧縮パッドを光が透過することができ、これにより室領域Ｃ３２２Ｂの内容物によって放射される光信号を検出できるように構成される。
【０３５５】
圧縮パッドＰ３２４−１およびＰ３２４−２は、室Ｃ３２４の上側部分および下側部分にそれぞれ位置合わせされる。圧縮パッドＰ３５０は、室Ｃ３２４と室Ｃ３２２Ｂを接続する入口３５０に位置合わせされ、室と室との間の流体流を制御するため入口を開閉するための手段を形成する。
【０３５６】
圧縮パッドＰ３３２−１およびＰ３３２−２は、室Ｃ３３２の上側部分および下側部分にそれぞれ位置合わせされる。圧縮パッドＰ３４８は、室Ｃ３３２と室Ｃ３２８Ｂを接続する入口３４８に位置合わせされ、室と室との間の流体流を制御するため入口３４８を選択的に開閉するための手段を形成する。
【０３５７】
圧縮パッドＰ３４０は、室Ｃ３４０に位置合わせされ、圧縮パッドＰ３３４は、室Ｃ３３４に位置合わせされる。圧縮パッドＰ３４４は、室Ｃ３４０と室Ｃ３３４を接続する入口３４４に位置合わせされ、室と室との間の流体流を制御するため入口３４４を選択的に開閉するための手段を形成する。圧縮Ｐ３４６は、室Ｃ３３４と室Ｃ３２８Ｂを接続する入口３４６に位置合わせされ、室と室との間の流体流を制御するため入口３４６を開閉するための手段を形成する。
【０３５８】
圧縮パッドＰ３３６−１は、洗浄室Ｃ３３６の一部に位置合わせされ、圧縮パッドＰ３３６−２は、洗浄室Ｐ３３６の他方の部分に位置合わせされる。圧縮パッドＰ３３６−２は、室Ｃ３３６の斜めの壁３７６および周側壁の端部から延びる洗浄室Ｐ３３６の一部と位置を合わせ、室Ｃ３３６を２つの部分室に分割するための手段を形成する。圧縮パッドＰ３４２は、室Ｃ３３６と室Ｃ３２８Ｂを接続する入口３４２に位置を合わせ、室と室との間の流体流を制御するため入口３４２を選択的に開閉するための手段を形成する。
【０３５９】
圧縮パッドＰ３３６−３は、洗浄室Ｃ３３６の一部に位置合わせされ、アクチュエータプレート１０８０内に形成された陥凹部の縁のところで固定された、柔軟な比較的孔のない材料のシートによって形成された空気袋である。空気袋Ｐ３３６−３は、マニホールド１０８２内に形成されている空気導管と連通しており、調節器によって制御できる。空気を充填されると、空気袋Ｐ３３６−３は膨らんで（膨張して）、圧力を室Ｃ３３６の一部に付与し、室から洗浄流体を押し出す。空気袋Ｐ３３６−３は、この配置について往復運動する圧縮パッドに優先するが、それは、空気袋の膨張は、室Ｃ３３６のゆっくりとした一様な変位を生じさせるように制御できるからである。
【０３６０】
空気袋Ｐ３３６−３の機能は、一定分量の洗浄緩衝液試薬を入口３４２に隣接するチャネル領域内に移動できるよう十分緩やかに洗浄室Ｃ３３６を加圧することである。圧縮パッドＰ３３６−２は、室Ｃ３２８Ｂに移動されるまで一定分量の洗浄液を適所に保持するため単一の盛り上がった薄い表面を有する。空気袋Ｐ３３６−３は、係合したときに加圧されたシステム空気を圧力調節器が取り付けられている入口に向かう経路に接続するソレノイド弁によって制御される、他の圧縮部材とほぼ同様に作動され、この調節器の出力は、マニホールド１０８２上の他の入口に戻される形で接続され、現在調節され加圧されている空気を空気袋に供給する。空気袋Ｐ３３６−３の好適な動作圧力は、約１０ｐｓｉである。
【０３６１】
圧力機構クラスタは、圧縮パッドが動作できるように伸長し、圧縮パッドを覆い、例えば、こぼれた流体から圧縮パッドを保護する弾性シールド（図１８および１９の参照番号１０８１を参照のこと）で覆うことができる。シールドは、１つの開口部を備え、この開口部を通して検出器（例えば、蛍光光度計５００）はこの開口部に隣接して配置されている室の内容物から放射される光信号を検出することができる。シールドは、処理後に機器１０００からの容器３００の挿入および取り外しが容易に行えるように、固着しない特性を備えるとよい（例えば、こびり付かないコーティングを施される）。
【０３６２】
図１７Ａに示されているように、空気マニホールド１０８２は、アクチュエータプレート１０８０に取り付けられている。空気だめ１０２４は、磁石アクチュエータ１０９０および検出器５００のようにマニホールド１０８２に接続される。窓１０８６を通して、容器３００のパネル３８２に設けられているバーコードまたは他の標識を見ることができ（図１２Ａを参照）、またバーコードリーダー１０８８は、容器上のバーコードを読み取るように構成され、配列される。弁１０８４（例えば、ソレノイド弁）は、マニホールドのさまざまな導管への圧力分配を制御し、これらの導管はそれぞれ、図１６に示されている空気圧式圧縮パッドのうちの１つに接続される。
【０３６３】
より具体的には、図１７Ｂは、機器１０００の空気圧システムの回路図を示している。図１７Ｂに示されているシステムは、図１７Ａに示されている構造といくぶん異なる。例えば、図１７Ｂに示されているシステムには、空気だめが欠けている。空気圧システムは、逆止弁１０３０、水トラップ１０３２、および空気乾燥機１０３４（例えば、圧縮空気から水分を除去するための乾燥装置）に接続されているポンプ１０２０を備える。弁１０２８（例えば、ソレノイド弁）は、ポンプを大気「ＡＴＭ」に通気することによって空気圧システムとポンプの接続を選択的に外すように構成され、配列される。圧力センサー１０３６は、システム内の圧力を検出し、制御および処理コンピュータ７３０と通信することができる（図２を参照のこと）。システムは、さらに、アキュムレータ１０３８を備えることもできる。システムは、次に、弁１０８４および圧縮部材を備える（例えば、図１６に示されているように）。図１７Ｂには、３つの弁１０８４ａ、１０８４ｂ、１０８４ｃのみと３つの関連する圧縮部材Ｐ３３２−２、Ｐ３３２−１、およびＰ３４８が示されている。図からわかるように、それぞれの弁１０８４ａ、１０８４ｂ、１０８４ｃは、選択的に、関連する圧縮パッドを圧力源（ポンプ１０２０またはアキュムレータ１０３８）に接続し、関連する圧縮パッドを大気「ＡＴＭ」に接続して圧縮パッドを通気するか（圧縮パッドの完全な引き込みを阻害するおそれのある圧力を取り除くため）、または空気圧回路の残り部分からの圧縮部材の分岐を遮断することができる。
【０３６４】
図１９に断面が示されている磁石アクチュエータ１０９０は、送りネジ１０９６に結合されているシャフト１０９４を介して磁石１１３２、１１３４を保持する磁石ホルダー１１３６を移動するモーター１０９２を備える。磁石アクチュエータ１０９０は、さらに、圧縮カップ１１３０を往復運動させるためのアクチュエータフィッティング１１４０に結合されているシリンダー１１１０、１１１２を備える。モーター１０９２およびシリンダー１１１０、１１１２は、マニホールド１０８２に取り付けられた取り付けブロック１１２０の上に装着される。
【０３６５】
より具体的には、モーター１０９２は、ベアリング１１００、１１０２内に回転可能なように取り付けられているカプラー１０９８によって送りネジ１０９６に結合されているシャフト１０９４を備える。送りネジ１０９６は、カプラー１０９８内で軸方向にスライドすることができ、また図に示されている磁石１１３２、１１３４を含む、多数の磁石を保持する磁石ホルダー１１３６に螺合されている。好ましい一実施形態では、磁石ホルダー１１３６は、３つのそのような磁石を保持する。磁石ホルダー１１３６は、アクチュエータプレート１０８０を横方向に貫通するように形成された円形の孔の中に配置されている、圧縮カップ１１３０の中空部分の中に配置される。カプラー１０９８内に挿入された送りネジ１０９６の端部は、正方形または他の形状の断面図を有し、これにより、送りネジ１０９６がカプラー１０９８に関して回転するのを防ぐ。さらに、磁石ホルダー１１３６は、磁石ホルダー１１３６が圧縮カップ１１３０内で回転するのを防ぐために中空の圧縮カップ１１３０の内壁に適合する突出しているリッジまたは非円形周形状を有する。これにより、モーター１０９２による送りネジ１０９６の回転で、磁石ホルダー１１３６の対応する平行移動が生じる。
【０３６６】
それに加えて、オン位置とオフ位置との間で磁石ホルダー１１３６を単純に移動することで、磁石ホルダー１１３６がオン位置からオフ位置に移動する、またその逆に移動する速度を変化させ、さらにはオン位置とオフ位置を変えるようにモーター１０９２を制御することができる。当業者であれば、速度と位置の組み合わせを使用することで、磁場強度およびその変化率を最適化し、磁性粒子保持を最大にできる。
【０３６７】
シリンダー１１１０、１１１２のそれぞれは、往復運動するピストン１１１６が配置されているシリンダー筺体１１１４を備える。（注意：シリンダー１１１０および１１１２は同一であり、したがって、図中、シリンダー１１１０の特徴のみに番号が振られている。）シリンダー１１１０を空気圧源に結合するために空気口１１１８が設けられている。シリンダー１１１０、１１１２のそれぞれのピストンは、アクチュエータフィッティング１１４０に結合される。
【０３６８】
アクチュエータフィッティング１１４０は、圧縮カップ１１３０が嵌め込まれる同じ孔の一部に嵌る円形中心部、および圧縮カップ１１３０を受容する円形開口部に隣接するアクチュエータプレート１０８０内に形成された、開口部１１４６、１１４８にそれぞれ嵌め込まれる２つの半径方向突出部１１４２、１１４４を備える。ピストン１１１６は、径方向突出部１１４２、１１４４に取り付けられる。
【０３６９】
図に示されているように、磁石ホルダー１１３６に載せられた磁石１１３２、１１３４は、「オン」位置にある。つまり、磁石は、アクチュエータプレート１０８０を覆う弾性シールド１０８１に近接しており、したがって、磁気分離手順が実行されている容器の室に近接している。磁石は、モーター１０９２を介して送りネジ１０９６を回転することによって「オフ」位置に移動させられて、磁石ホルダー１１３６が平行移動し圧縮カップ１１３０の中空部分内のシールド１０８１から遠ざかるようにできる（図において右へ）。モーター１０９２および送りネジ１０９６の回転を逆転することで、磁石ホルダー１１３６は圧縮カップ１１３０の末端の「オン」位置まで延びる。送りネジ１０９６の回転を続けると、磁石ホルダー１１３６および圧縮カップ１１３０は押し出されて（図において左へ）弾性シールド１０８１に当たり、圧縮力を圧縮カップ１１３０に隣接する室に付与する。これにより、例えば、磁気分離手順のすすぎステップで、磁石が「オン」位置にある間に室が圧縮されて室から液体が押し出され、室の中に磁性粒子を保持し維持する。
【０３７０】
圧縮カップ１１３０が、送りネジ１０９６と磁石ホルダー１１３６によって伸長されると、圧縮カップに堅く取り付けられている（例えば、２つの構成要素が螺合している）アクチュエータフィッティング１１４０も、伸長位置まで移動する（図において右へ）。シリンダー１１１０、１１１２のピストン１１１６は、アクチュエータフィッティング１１４０につられて受動的に移動する。磁石ホルダー１１３６が、送りネジ１０９６によって引っ込められる場合、シリンダー１１１０、１１１２内のバネ（図に示されていない）は、アクチュエータフィッティング１１４０および圧縮カップ１１３０を図に示されている後退位置まで戻す。
【０３７１】
磁石アクチュエータ１０９０は、さらに、磁石が「オフ」位置にあるときに圧縮力を容器の室に付与して室から流体内容物を押し出すための圧縮パッドとして機能する。これは、送りネジ１０９６を回して磁石ホルダー１１３６を「オフ」位置まで引き出し（図において右へ）、次いで、シリンダー１１１０、１１１２のピストン１１１６に圧力を加えてピストンを伸長し、これによりアクチュエータフィッティング１１４０および圧縮カップ１１３０を延ばして（図において左へ）、カップ１１３０の往復する突出に応じて伸長および偏向を生じるシールド１０８１に当て、圧縮カップ１１３０に隣接する室を圧縮することによって行われる。アクチュエータフィッティング１１４０が伸長すると、（右へ）引き戻されてアクチュエータフィッティング１１４０と接触してしまった磁石ホルダー１１３６も、伸長方向に移動される。磁石ホルダー１１３６のこの移動に対応するために、送りネジ１０９６の端部は、カプラー１０９８とともにスライドすることができる（つまり、送りネジ１０９６は、カプラー１０９８内で「浮いている」）。シリンダー１１１０、１１１２内のバネは、圧力がピストン１１１６から取り除かれるとアクチュエータフィッティング１１４０および圧縮カップ１１３０を引っ込める。
【０３７２】
機器１０００の温度制御システムは、図２０に示されており、熱的分離フレーム１０４８内に配置される熱伝導要素１０４０、１０４２、１０４４を備える。熱伝導要素は、好ましくは、銅またはアルミニウムなどの熱伝導性材料から作られ、分離フレーム１０４８は、好ましくは、Ｕｌｔｅｍ（登録商標）またはＤｅｌｒｉｎ（登録商標）などの断熱材料から形成される。例示されている実施形態では、伝導性要素１０４０、１０４２、１０４４のそれぞれは、複数の室を包含する容器３００の領域と熱で連通するような大きさおよび形状を有する。さらに、それぞれの伝導性要素１０４０、１０４２、１０４４の少なくとも一部は、１つの伝導性要素によって包含される室が隣接する伝導性要素によって包含される室に近接するように隣接する伝導性要素の少なくとも一部に近接し、これら２つの室は、２つの室の間に延びる通路を持たない入口によって接続される。隣接する伝導性要素の間に熱漏れのない隣接する伝導性要素の間のこのような近接近は、分離フレーム１０４８によってもたらされる断熱によって容易になる。
【０３７３】
容器３００は、アクチュエータプレート１０８０と分離フレーム１０４８との間の機器１０００内の動作可能な位置に保持される（図１４および１５を参照のこと）。機器１０００内に分離フレーム１０４８とアクチュエータプレート１０８０とを配置することで、その間に容器を受容するギャップが生じ、そのギャップは、伝導性要素１０４０、１０４２、１０４４のうちの１つに隣接する容器の室に流体が充填されたときに、室が膨張して室の表面と隣接する導電性要素との間の熱的接触が高まるように容器３００に関して寸法が決定される。
【０３７４】
ペルチェ装置１０５０、１０５２、１０５４は、それぞれ伝導性要素１０４０、１０４４、１０４２と熱的接触する位置に置かれる。温度センサー１０５６、１０５８、１０６０は、それぞれの熱伝導性要素の温度を感知するように、それぞれ伝導性要素１０４０、１０４２、１０４４と熱的接触する位置に置かれる。センサー１０５６、１０５８、１０６０は、ＲＴＤセンサーを備えることができ、ペルチェ装置の動作を制御するためのコントローラ（例えば、温度コントローラ７２２）に結合される。箔抵抗発熱体などのペルチェ装置以外の加熱素子も使用できる。
【０３７５】
ペルチェ装置１０５０、１０５２、１０５４（または他の加熱もしくは冷却素子）は、好ましくは、第１の平面状側部にペルチェ装置が取り付けられている第１の部分１０６４と対向する側から突き出ている放熱フィン１０６６を有するアルミニウムブロックを備えることができるヒートシンク１０６２上に取り付けられる。覆い１０６８は、ヒートシンク１０６２の放熱フィン１０６６を部分的に覆い、ファン筺体１０７０内に取り付けられている冷却ファンは、空気を覆い１０６８内に引き込み、放熱フィン１０６６を通り越させる位置に置かれる。
【０３７６】
ペルチェ装置１０５０、１０５２、１０５４は、伝導性要素１０４０、１０４４、１０４２を加熱または冷却し、したがって、任意の室およびそれぞれの伝導性要素に近接する容器３００の室の一部の内容物を加熱または冷却するように選択的に動作可能である。伝導性要素１０４０、１０４２、１０４４、さらには分離フレーム１０４８は、袋３００に関して固定された位置にある。袋３００が、機器１０００の溝１０１４内に挿入されると、袋３００は、伝導性要素１０４０、１０４２、および１０４４に非常に近い位置に配置される。室に物質が充填されると、軟質の袋の室が膨張して伝導性要素の中に入り、これにより、その室に隣接する位置にある伝導性要素とより完全な物理的さらには熱的接触をする。
【０３７７】
容器１０または３００および機器１００または１０００で実行された分析手順の結果は、蛍光発光またはルミネッセンス発光などの、試料の光出力を測定することによって決定される。したがって、光検出器は、処理ユニット１０２の前部１２０内に形成された開口部１７６を通って突き出るレンズを備える。例示されている実施形態では、光検出器は、蛍光光度計５００である。代替え検出器は、電気的変化または質量、色、または濁度などの物理的特性の変化を感知する検出器を含む、例示されている機器とともに使用するように容易に適合されうる。
【０３７８】
本発明の態様を具現化する蛍光光度計の詳細は、図６、７、８ａ〜ｃ、および９ａ〜ｃに示されている。蛍光光度計５００は、基部５８０に一緒に取り付けられている前部筺体５０２および後部筺体５２０を備える。
【０３７９】
前部筺体５０２は、内部レンズ室５０６を部分的に取り囲み、略円柱状の形を有する上側バレル５０４を備える。上側バレル５０４は、機器１００内のアクチュエータプレート１２４（図３を参照のこと）内に形成された開口部１７６内に延びるか、または機器３０００（図１４、１８を参照のこと）のマニホールド１０８２内に形成された開口部上に延びる。前部筺体５０２は、さらに、蛍光光度計５００を機器１００内のアクチュエータプレート１２４に、または機器１０００内のマニホールド１０８２に固定するための３つの取付脚部５１０を備える。
【０３８０】
後部筺体５２０は、前部筺体５０２の下で、機械的留め具または同様のものによって基部５８０に取り付けられる。例示されている実施形態では、後部筺体５２０は、一方の端部からその対向する端部に延びている４つの光導管を備える。特に、後部筺体は、第１の放射導管５２２、第２の放射導管５２４、第１の励起導管５２６、および第２の励起導管５２８を備える。筺体５２０は例示的であり、蛍光光度計５００は、１つまたは複数の放射導管および１つまたは複数の励起導管を備えることができる。
【０３８１】
後部筺体５２０の詳細は、図６および７ａ〜ｃに示されている。筺体５２０内にある２つの励起導管５２６および５２８は、同一のものであり、２つの放射導管５２２および５２４も同一のものである。
【０３８２】
それぞれの励起導管５２６、５２８は、丸角と凸状に丸い斜辺を持つ直角三角形の一般的形状の断面を有する第１の部分５３２を備える。この形状の目的は、後部筺体５２０の重量を制限することである。この形状は、単に好ましいだけであり、他の断面形状も、導管の特徴が光の通過に干渉しない限り導管−円形または矩形を含む−に使用できる。励起導管５２６、５２８は、さらに、略円筒形状の第２の部分５３４を備える。円形の通路５３６は、第１の部分５３２を第２の部分５３４に接続し、通路５３６の直径は、第２の部分５３４の直径より小さく、したがって第２の部分５３４内に環状のレンズ棚５４０を形成する。最後に、励起導管５２６、５２８は、第２の部分５３４の端部に形成されたＯリング座５３８を備える。
【０３８３】
それぞれの放射導管５２２、５２４は、丸角と凸状に丸い斜辺を持つ直角三角形の一般的形状の断面を有する第１の部分５５２を備える。放射導管５２２、５２４は、さらに、略円筒形状の第２の部分５５４を備える。円形の通路５５６は、第１の部分５５２を第２の部分５５４に接続し、通路５５６の直径は、第２の部分５５４の直径より小さく、したがって第２の部分５５４内に環状のレンズ棚５６０を形成する。放射導管５２２、５２４も、第２の部分５５４の端部に形成されたＯリング座５５８を備える。最後に、円形のフォトダイオード座５６２は、放射導管５２２、５２４のそれぞれの第１の部分５５２の端部内に重ね合わされる。
【０３８４】
前部筺体５０２および後部筺体５２０は、好ましくは、６０６１  Ｔ６アルミニウムから機械加工で形成され、黒色陽極酸化仕上げされる。その代わりに、前部および後部の筺体は、機器内の温度環境に耐えることができる材料から別々に、または単一の一体化ユニットとして、成形または鋳造することができ、中断のない光導管を形成する。
【０３８５】
基部５８０は、前部プリント基板（「ＰＣＢ」）５８２および後部プリント基板（「ＰＣＢ」）５８６を備える。前部ＰＣＢ  ５８２および後部ＰＣＢ  ５８６は、円筒状のスペーサー要素５８４を貫通する機械的留め具（例えば、ボルト、ネジ）によって、固定され相隔てて並ぶ関係を保ちつつ一緒に保持される。ＰＣＢ  ５８２、５８４に対する例示的な回路の詳細について、以下で説明する。
【０３８６】
図９ｂを参照すると、後部筺体５２０の第１の励起導管５２６内に、第１の励起光学素子が取り付けられている。第１の励起光学素子は、第１の励起導管５２６の第１の部分５３２の一方の端部に配置され、基部５８０の前部ＰＣＢ  ５８２に取り付けられている第１の発光ダイオード（「ＬＥＤ」）６１６を備える。照準レンズであってもよい、第１の励起レンズ６１８は、第１の励起導管５２６の第２の部分５３４内のレンズ座５４０上に装着される。第１の励起フィルタ６２２は、第１の励起導管５２６の端部に配置され、第１の励起レンズ６１８と直列に並ぶように（そのレンズの光軸にそって）位置合わせされる。第１の励起フィルタ６２２および第１の励起レンズ６１８は、好ましくは黒色陽極酸化仕上げでアルミニウムから作られたスペーサー６２０で互いから隔てられる。第１の励起導管５２６は、関連する光学素子とともに、第１の励起チャネルと総称される。
【０３８７】
同様に、第２の励起光学素子は、後部筺体５２０の第２の励起導管５２８内に取り付けられている。第２の励起光学素子は、第２の励起導管５２８の第１の部分５３２の一方の端部に配置され、基部５８０の前部ＰＣＢ  ５８２に取り付けられている第２のＬＥＤ  ６３２を備える。照準レンズであってもよい、第２の励起レンズ６３４は、第２の励起導管５２８の第２の部分５３４のレンズ座５４０上に装着される。第２の励起フィルタ６３８は、第２の励起導管５２８の端部に配置され、第２の励起レンズ６３４と直列に並ぶように（そのレンズの光軸にそって）位置合わせされる。第２の励起フィルタ６３８および第２の励起レンズ６３４は、好ましくは黒色陽極酸化仕上げでアルミニウムから作られたスペーサー６３６で互いから隔てられる。第２の励起導管５２８は、関連する光学素子とともに、第２の励起チャネルと総称される。
【０３８８】
図９ｃを参照すると、第１の放射光学素子が、後部筺体５２０の第１の放射導管５２２内に取り付けられている。第１の放射光学素子は、第１の放射導管５２２の第１の部分５５２内のフォトダイオード座５６２に配置されているフォトダイオード取付部６４８内に取り付けられ、基部５８０の前部ＰＣＢ  ５８２に取り付けられている第１のフォトダイオード６６０を備える。照準レンズであってもよい、第１の放射レンズ６５０は、第１の放射導管５２２の第２の部分５５４のレンズ座５６０上に装着される。第１の放射フィルタ６５４は、第１の放射導管５２２の端部の近くに配置され、第１の放射レンズ６５０と直列に並ぶように（そのレンズの光軸にそって）位置合わせされる。第１の放射フィルタ６５４および第１の放射レンズ６５０は、好ましくは黒色陽極酸化仕上げでアルミニウムから作られたスペーサー６５２で互いから隔てられる。さらに、第１の放射フィルタ６５４は、これもまた好ましくは黒色陽極酸化仕上げでアルミニウムから作られた追加のスペーサー６５６で第１の放射導管５２２の端部から隔てられる。第１の放射導管５２２は、関連する光学素子とともに、第１の放射チャネルと総称される。
【０３８９】
同様に、第２の放射光学素子は、後部筺体５２０の第２の放射導管５２４内に取り付けられている。第２の放射光学素子は、第２の放射導管５２４の第１の部分５５２内のフォトダイオード座５６２に配置されているフォトダイオード取付部６６８内に取り付けられ、基部５８０の前部ＰＣＢ  ５８２に取り付けられている第２のフォトダイオード６６２を備える。照準レンズであってもよい、第２の放射レンズ６７０は、第２の放射導管５２４の第２の部分５５４のレンズ座５６０上に装着される。第２の放射フィルタ６７４は、第１の放射導管５２４の端部の近くに配置され、第２の放射レンズ６７０と直列に並ぶように（そのレンズの光軸にそって）位置合わせされる。第２の放射フィルタ６７４および第２の放射レンズ６７０は、好ましくは黒色陽極酸化仕上げでアルミニウムから作られたスペーサー６７２で互いから隔てられる。さらに、第２の放射フィルタ６７４は、これもまた好ましくは黒色陽極酸化仕上げでアルミニウムから作られた追加のスペーサー６７６で第２の放射導管５２４の端部から隔てられる。第２の放射導管５２４は、関連する光学素子とともに、第２の放射チャネルと総称される。
【０３９０】
前部筺体カバーディスク６００は、前部筺体５０２と後部筺体５２０との間に配置される（図６を参照のこと）。前部筺体カバーディスク６００は、上側筺体５０２のレンズ室５０６内にわずかに突き出る盛り上がった円形リッジ６０２を備える（図８ｂおよび８ｃを参照のこと）。前部筺体カバーディスク６００は、さらに、４つの円形光開口部６０６を備え、それぞれの円形光開口部はカバーディスク６００が取り付けられるときに後部筺体５２０内に形成された光導管５２２、５２４、５２６、および５２８のうちの１つに位置合わせされる。
【０３９１】
共通レンズ６８０は、前部筺体５０２のレンズ室５０６内に収納される。一実施形態では、蛍光光度計５００は、励起導管および放射導管の外にある蛍光光度計の唯一の光学素子を備える単一の分割されていない共通レンズ６８０のみを備える。この文脈において、「分割されていない」というのは、共通レンズが専ら光透過材料（例えば、ガラス）から作られており、レンズを物理的にまた光学的に２つまたはそれ以上の部分に分割するためにレンズの表面に埋め込まれた、および／または施された光学的に不透明な構造などの光の方向を変える、または光を妨げる構造をいっさい含まないことを意味する。
【０３９２】
Ｏリング６８２は、レンズ室５０６の端部に装着され、前部筺体カバーディスク６００の盛り上がった円形リッジ６０２は、レンズ室５０６内に突き出てＯリング６８２を圧迫し、これで前部筺体５０２と前部筺体カバーディスク６００との間の光を通さない接続部を確実に形成する。Ｏリング６２４は、第１の励起導管５２６の端部のＯリング座５３８内に設けられ、前部筺体カバーディスク６００の後側を圧迫して光を通さない接続部を形成する。同様に、Ｏリング６４０は、第２の励起導管のＯリング座５３８内に設けられ、Ｏリング６５８は、第１の放射導管５２２のＯリング座５５８内に設けられ、Ｏリング６７８は、第２の放射導管５２４のＯリング座５５８内に設けられる。Ｏリング６２４、６４０、６５８、６７８は、それぞれ、光導管５２６、５２８、５２２、５２４内への光の侵入を防ぐ。Ｏリングは、指定された許容誤差範囲内で機械加工されたパーツの寸法変動を補正し、また温度要因によって引き起こされる変形を補正することによって光の侵入を防ぐ。
【０３９３】
動作時に、励起光信号が、発光ダイオード６１６および６３２によって放射される。信号は、好ましくは検出すべき色素に対応する規定の波長のものである。ダイオード６１６から出た光は、第１の励起導管５２６を透過して、光の少なくとも一部を第１の励起フィルタ６２２に集束させるレンズ６１８に当たる。第１の励起フィルタ６２２は、規定された波長（または波長の規定された範囲）のみの光を通し、透過光から望ましくない波長を除去する。フィルタに通された光は、光の少なくとも一部を前部筺体５０２の上側バレル５０４を通して集束させる共通レンズ６８０を通って進行し、そこで、励起光が機器１００内の容器１０の室（例えば、室Ｃ２８）に当たる。その室の中に第１の分析対象または分析対象のグループが存在すると仮定すると、試料と混合され、（複数の）第１の分析対象の存在を検出するように適合された第１の結合剤または結合剤のグループの色素は蛍光発光する。蛍光発光の一部は、上側バレル５０４の中に入り、次いで、蛍光発光の少なくとも一部を第１の放射導管５２２内に送り込む共通レンズ６８０を透過する。第１の放射導管５２２に入った光は、第１の放射フィルタ６５４を通過し、このフィルタは放射光の望ましくない波長を除去する。次いでフィルタに通された放射光は、レンズ６５０を通過し、最終的に、フォトダイオード６６０上に当たり、規定された波長の光の存在を検出する。
【０３９４】
同様に、ダイオード６３２から出た励起光信号は、第２の励起導管５２８を透過して、光の少なくとも一部を第２の励起フィルタ６３８に集束させるレンズ６３４に当たる。第２の励起フィルタ６３８は、規定された波長（または波長の規定された範囲）のみの光を通し、透過光から望ましくない波長を除去する。フィルタに通された光は、光の少なくとも一部を前部筺体５０２の上側バレル５０４を通して集束させる共通レンズ６８０を通って進行し、そこで、励起光が機器１００内の容器１０の室（例えば、室Ｃ２８）に当たる。その室の中に第２の分析対象または分析対象のグループが存在すると仮定すると、試料と混合され、（複数の）分析対象の存在を検出するように適合された第２の結合剤または結合剤のグループの色素は蛍光発光する。蛍光発光の一部は、上側バレル５０４の中に入り、次いで、蛍光発光の少なくとも一部を第２の放射導管５２４内に送り込む共通レンズ６８０を透過する。第２の放射導管５２４に入った光は、第２の放射フィルタ６７４を通過し、このフィルタは放射光の望ましくない波長を除去する。次いでフィルタに通された放射光は、レンズ６７０を通過し、最終的に、フォトダイオード６６２上に当たり、規定された波長の光の存在を検出する。
【０３９５】
フォトダイオードによって検出された光放射は、知られているアルゴリズムを使用して試料中の１つまたは複数の分析対象の存在または量に関する定性的または定量的情報を提供できる信号に変換される。定量化アルゴリズムの実施例は、上記の「使用」の節に明記されている。
【０３９６】
例示されている実施形態では、励起導管５２６、５２８は、互いに対向する形で配置され、放射導管５２２、５２４は、放射フィルタを通過する励起光からの暗雑音を最小限に抑えるように後部筺体５２０内で互いに対向する形で配置される。しかし、励起導管５２６、５２８および放射導管５２２、５２４は、互いの隣に配置することが可能である。
【０３９７】
蛍光光度計５００は、２つの励起チャネルと２つの放射チャネルを備え、これにより、蛍光光度計は異なる波長で励起される２つの色素またはレポーター部分を示差検出することができる。これらの異なる色素から出る光放射は、一般的に標的（例えば、分析対象、対照、またはいずれかの存在を表す増幅産物）が存在しない場合にクエンチされる。このような色素としては、例えば、Ｎ，Ｎ，Ｎ’Ｎ’−テトラメチル−６−カルボキシローダミン（「ＴＡＭＲＡ」）および６−カルボキシフルオレセイン（「ＦＡＭ」）または６−カルボキシ−Ｘ−ローダミン（「ＲＯＸ」）および２’７’−ジメトキシ−４’５−ジクロロ−６−カルボキシフルオレセイン（「ＪＯＥ」）が挙げられる。ＤＡＢＣＹＬは、標的が存在しない場合にこれらの色素のどれかから光放射のクエンチングを行うために有用なクエンチャー部分である。したがって、機器は、２つの異なる分析対象または一群の分析対象を区別するか、または内部対照から１つの分析対象または一群の分析対象を区別することができる。しかし、本発明の態様を具現化する蛍光光度計は、２つより多いまたは少ない励起チャネルおよび放射チャネルを備えることができ、励起チャネルの数と放射チャネルの数は等しいと考えられる。
【０３９８】
（複数の）励起および放射チャネルについて選択された特定の光学構成要素は、検出される色素蛍光の波長に依存する。色素ＦＡＭについては、例えば、励起チャネルに適したＬＥＤは、カリフォルニア州ブレア所在のＫｉｎｇｂｒｉｇｈｔ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ社が部品番号Ｌ７１１３ＰＢＣＨとして市販しているものであり、これと同じ色素に適した励起フィルタは、ニューヨーク州ロチェスター所在のＳｅｍｒｏｃｋ社が部品番号ＦＦ０１−４８５／２０−９．０−Ｄとして市販しているものである。これと同じ色素に関して、放射チャネルに適した光検出器は、カリフォルニア州ホーソーン所在のＯＳＩ  Ｏｐｔｏｅｌｅｃｔｒｏｎｉｃｓ，Ｉｎｃ．社がモデル番号ＰＩＮ−４４ＤＩとして市販しているものであり、好適な放射フィルタは、Ｓｅｍｒｏｃｋ社が部品番号ＦＦ０１−５３１／２２−９．０−Ｄとして市販しているものである。色素ＴＡＭＲＡについては、例えば、励起チャネルに適したＬＥＤは、カリフォルニア州トランス所在のＮｉｃｈｉａ  Ａｍｅｒｉｃａ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ社がモデル番号ＮＳＰＧ５００Ｓとして市販しているものであり、好適な励起フィルタは、Ｓｅｍｒｏｃｋ社が部品番号ＦＦ０１−５４３／２２−９．０−Ｄとして市販しているものである。これと同じ色素に関して、放射チャネルに適した光検出器は、ＯＳＩ  Ｏｐｔｏｅｌｅｃｔｒｏｎｉｃｓ，Ｉｎｃ．社がモデル番号ＰＩＮ−４４ＤＩとして市販しているものであり、好適な放射フィルタは、Ｓｅｍｒｏｃｋ社が部品番号ＦＦ０１−５８７／１１−９．０−Ｄとして市販しているものである。
【０３９９】
したがって、本発明の態様を具現化する蛍光光度計は、試料に関して移動することなく、または互いに関して異なる励起および放射チャネルが移動することなく、複数の異なる信号（異なる波長などの）を励起し、検出することができる。さらに、アクチュエータプレート、および機器内で運ばれる容器の検出室に関する蛍光光度計の配列構成によって、蛍光光度計は光ファイバーを使用せずに励起信号を検出室に向け、検出室からの放射を検出することができる。さらに、蛍光光度計によって定められた光チャネル（励起および放射）は、その範囲全体にわたって平行であり、したがって励起光は試料に向けて伝えられ、試料からの放射は、要素に当たった実質的にすべての光の方向を変える反射要素（例えば、鏡）または第１の光学特性（例えば、波長）を有する光信号の一部の方向を変え、２色性ビームスプリッタなどの第２の光学特性を有する光信号の他の部分を伝える光学特性分離要素を使用せずに検出されうる。
【０４００】
図２１〜２６は、好適な回路の一実施形態を例示している。この回路は、選択された動作モード、行われた測定、およびシリアルインターフェースを介して離れた場所から伝達されたマクロコマンドに対する応答として報告される結果を用いて蛍光光度計５００の局所的制御を行う。
【０４０１】
図２１は、相互接続手段および多数の電源回路を備える回路を表す。図２２は、制御、処理、および伝達手段を備える回路、プロセッサをプログラムし、デバッグするための手段を備える回路、および安定した電圧基準を供給する回路を表している。図２３は、電圧測定回路を含む回路ならびにＬＥＤ強度および変調をプロセッサで制御するための手段を表している。図２４は、励起手段（ＬＥＤ）、ＲＦシールド、および高感度前置増幅器回路用の補助電源フィルタリング機能を備える回路を表している（次の図で説明する）。図２５Ａおよび図２５Ｂは、室の内容物からの変調された光信号を変調された電圧に変換するフロントエンド前置増幅器回路の２つの類似の実施形態（違いについては、以下で説明する）を表す。図２６は、変調され、増幅された信号を変調された光信号の振幅に比例するアナログ電圧に変換する復調回路を表している。
【０４０２】
この実施形態は、フォトダイオードＤ１（６６０）（図２５Ａ）およびＤ２（６６２）（図２５Ｂ）と問い合わせが行われている室との間に物理的に置かれている光学フィルタのバンドパス範囲内に収まる波長を持つ背景周辺光を変化させる効果を回路で除去できるようにする変調／復調方式を組み込んでいる。マイクロプロセッサＵ４（図２２）は、アナログスイッチＵ７（図２６）の極性を制御しつつ、ＬＥＤ１（６１６）とＬＥＤ２（６３２）とを交互に変調するために使用されるクロック（この実施形態では２７５Ｈｚに設定される）を発生する。同じ周波数で、ＬＥＤ（ＬＥＤ１（６１６）またはＬＥＤ２（６３２）のいずれか）の変調と同相となるようにアナログスイッチＵ７の極性を交互に切り替えることによって、整合送信機／受信機対が形成される。同じ周波数で、このクロックと同相となるように到着した光信号のみが、フルゲインで増幅され、すべての周辺光および異なる周波数で変調された他の光信号は抑制される。
【０４０３】
図２１において、Ｊ１は、回路との主相互接続手段を形成する。装置Ｄ１およびＤ６は、外部回路とのこの接続を介して回路に印加される過渡電圧を吸収することによって回路を保護する。集積回路Ｕ１および関連する構成要素（Ｃ１、Ｃ３〜Ｃ５、およびＲ４〜Ｒ７）は、この回路用の正のアナログ電源となる調節可能電圧調整器を形成する。集積回路Ｕ１６および関連する構成要素（Ｃ２、Ｃ５１〜Ｃ５２、およびＲ５８〜Ｒ５９）は、この回路用の負のアナログ電源となる調節可能電圧調整器を形成する。別の＋５Ｖ電源（Ｕ２および関連する構成要素Ｃ７およびＣ１０〜Ｃ１１）は、デジタル電源を形成する。最後に、それぞれの電源からの電圧レベルをマイクロプロセッサ（Ｕ４）に見られるＡ／Ｄコンバータの変換範囲内の電圧に変えるため、複数の抵抗分圧回路対が備えられる（Ｒ４／Ｒ５、Ｒ８／Ｒ９、Ｒ１０／Ｒ１１、およびＲ５６／Ｒ５７）。
【０４０４】
図２２では、マイクロプロセッサＵ４が、回路用の一次制御および処理手段を提供する。多数のキャパシタ（Ｃ１５〜Ｃ１９）が、この装置用の電源バイパス機能を実現する。回路のパワーオンリセットは、マイクロプロセッサ内に組み込まれている回路によって実行されるが、マイクロプロセッサは、プッシュボタンスイッチＳＷ１を（プルアップ抵抗器Ｒ１５と組み合わせて）使用することにより手動リセットできる。リセットスイッチとの接地されていない接触に関連する潜在的静電放電から回路を保護するために、ダイオードＤ３が備えられる。水晶Ｙ１および関連する構成要素（Ｃ２０およびＣ２１）は、回路に安定したタイムベースおよびクロックを供給する。マイクロプロセッサ（Ｕ４）と外部回路との間の通信は、マイクロプロセッサに送り込まれ、マイクロプロセッサから送り出されるＴＴＬレベルのシリアル信号をＲＳ−２３２規格に準拠する信号に変換する、集積回路Ｕ５および関連する構成要素（Ｃ２３〜Ｃ２５）を使用することで行われる。回路のプログラミングおよびデバッギングは、ＰＲＯＧＲＡＭＭＩＮＧ  ＩＮＴＥＲＦＡＣＥ（構成要素Ｊ２、Ｃ２２、およびＤ４〜Ｄ５）を使用して行われる。「パワーオン」（構成要素ＬＥＤ１およびＲ１３）と「ステータス」（マイクロプロセッサＵ４によってオン／オフ制御が行われる構成要素ＬＥＤ２およびＲ１４）を示すビジュアルインジケータが備えられる。最後に、Ａ／Ｄコンバータ（マイクロプロセッサＵ４内に組み込まれている）用の安定した基準を確定し、外部Ａ／ＤコンバータＵ１１およびＤ／ＡコンバータＵ１２に供給するために高精度電圧基準回路（構成要素Ｕ３、Ｃ９、およびＣ１２〜Ｃ１３）が備えられる。
【０４０５】
図２３において、集積回路Ｕ１１およびＵ１２は、装置のアナログ回路とマイクロプロセッサＵ４との間のインターフェースを形成している。これらの装置は両方とも、シリアル周辺インターフェース（ＳＰＩ）を介してマイクロプロセッサＵ４によって制御され、マイクロプロセッサＵ４と通信する。Ａ／Ｄ  ＣＯＮＶＥＲＴＥＲ  Ｕ１１は、ＤＥＭＯＤＵＬＡＴＯＲ  ＦＩＬＴＥＲ（図２６）から送られる差分アナログ信号を２４ビット分解能のデジタル結果（符号付き、１ビット当たり約０．５μＡの分解能）に変換する。Ｄ／Ａ  ＣＯＮＶＥＲＴＥＲ  Ｕ１２は、マイクロプロセッサからのデジタル設定を受け取って、対応するアナログ電圧をその出力上に設定し、次いでこれの電圧を使用してＬＥＤ電流を調節する。ＤＡＣ出力電圧は、この出力制御電圧を下げる低域通過フィルタを持つ抵抗分圧器（構成要素Ｃ４５およびＲ３７〜Ｒ３８）に接続され、その結果、回路は２０μＡ／ビットの分解能により０〜８０ｍＡの範囲でＬＥＤ電流を制御することができる。２つの同一回路が続き、１つはＦＡＭ  ＬＥＤ  ＤＲＩＶＥ用、もう１つはＴＡＭ  ＬＥＤ  ＤＲＩＶＥ用である。
【０４０６】
図２３および２４において、励起ＬＥＤ（ＬＥＤ１（６１６）およびＬＥＤ２（６３２））を通る電流の流れを直接調節し、変調する回路が備えられている。ＬＥＤへの電力は、＋１２Ｖ電源が供給元である。ＬＥＤ電流は、最初に電源の電位を下げる抵抗器Ｒ３を通って流れ、キャパシタＣ３と併せて、変調されたＬＥＤへ切り替えられた電流負荷のフィルタリングを行う。次いで、電流は、ＬＥＤ（ＬＥＤ１（６１６）またはＬＥＤ２（６３２））を通り、次にＦＥＴトランジスタのドレインソースチャネル（Ｑ３またはＱ４）を通って流れる。最後に、ＬＥＤ電流は、ＬＥＤを通る電流に比例する電圧を発生するフィードバック抵抗器（Ｒ５３またはＲ５４）を通過する。
【０４０７】
図２３を参照すると、ＬＥＤを通る電流の制御は、演算増幅器（Ｕ１３またはＵ１４）、ＦＥＴトランジスタ（Ｑ３またはＱ４）、およびフィードバック抵抗器（Ｒ５３またはＲ５４）からなる従来のフィードバック回路を使用することによって行われる。制御は、電位が演算増幅器の両方の入力に等しくなったときに行われる。演算増幅器の反転入力の電圧が非反転入力の電圧より低くなった場合に、演算増幅器の出力の電圧は高くなる。このように出力電圧が高くなるのは、ＦＥＴトランジスタのゲートで発生しがちであり、その後、さらに電流が流れ始める。フィードバック抵抗器を通る電流が増大すると、その結果、その抵抗器にかかっている電圧も高くなり、それに対応して、演算増幅器の反転入力の電圧が高くなり、フィードバックループを完了する。
【０４０８】
それに加えて、ＬＥＤのスイッチング（変調またはパワーオン／オフ）を制御するために、演算増幅器を強制的に飽和させたり飽和をなくしたりする回路が備えられ（Ｑ１またはＱ２および関連する構成要素）、これにより、それぞれ、制御ＦＥＴトランジスタ（Ｑ３またはＱ４）のオン、オフを切り替える。ＬＥＤ電流を「抑制」するために、ＦＥＴトランジスタ（Ｑ１またはＱ２）のゲートの電位は、ＦＥＴのソース端子の電圧より数ボルト引き下げられる。これにより、電流がＦＥＴを通って、演算増幅器の反転入力のところに形成されている回路ノード内に流れ込み、これにより、電圧はそのノードにおいて約２．５Ｖまで上昇する。演算増幅器の出力電圧は、その後、ゼロボルトまで降下し、ＦＥＴトランジスタ（Ｑ３またはＱ４）は、それぞれのＬＥＤとともに、オフにされる。ＬＥＤ電流を「有効に」するために、ＦＥＴトランジスタ（Ｑ１またはＱ２）のゲートの電位は、トランジスタのソースの電圧に等しい電圧またはわずかに低い電圧に保たれる。これにより、トランジスタはオフにされたままとなり、ＦＥＴを通り増幅器の反転入力のところの回路ノード内に流れ込む電流はなくなる。そこで、演算増幅器の反転入力の電圧は、フィードバック抵抗器（Ｒ５３またはＲ５４）にかかる電圧に等しくなり、そこで、この電圧は、ＤＡＣ回路によって演算増幅器の非反転入力に印加される電圧に追随する。ＬＥＤ電流は、この付与電圧に比例するように制御される。
【０４０９】
図２３において、ＬＥＤが正常に動作しているかどうかは、ＬＥＤにかかっている電圧およびＬＥＤを通る電流を調べる回路を使用して監視される。抵抗器Ｒ５１およびＲ５２は、マイクロプロセッサＵ４（図２２を参照のこと）のＡ／Ｄコンバータと各フィードバック抵抗器（Ｒ５３およびＲ５４）との間にローインピーダンス経路を形成し、これらの抵抗器にかかるＡ／Ｄ回路によって測定される電圧は、ＬＥＤ電流に比例する。それに加えて、ＬＥＤ電圧は、演算増幅器Ｕ１５および関連する構成要素によって形成される電圧緩衝回路を使用して決定されうる。抵抗分割回路（Ｒ４７／Ｒ４９またはＲ４８／Ｒ５０）は、緩衝増幅器の後に続き、電圧をＡ／Ｄコンバータの変換範囲内のレベルに引き下げる。ＬＥＤ電圧は、緩衝増幅器からの下げられた電圧と各フィードバック抵抗器にかかっている測定された電圧（ドロッピング抵抗器Ｒ３にかかる電圧に等しい）をとり、これらを＋１２Ｖ電源の測定された値から引いて（測定毎に特定の重みを付けて）算出される。
【０４１０】
図２３には、過渡的刺激（内部発生と外部発生の両方）の回路除去を改善する追加の特徴が例示されている。図２５Ａおよび２５Ｂに示されている回路を電磁および無線周波数干渉から保護するＲＦシールドＥ１が備えられる。ＬＥＤ（ＬＥＤ１（６１６）およびＬＥＤ２（６３２））に電流を流す導体と図２５Ａおよび２５Ｂに示されている高感度回路との間の漏電を防ぐために、２つの保護回路（Ｅ８およびＥ９）が備えられる。これらの保護回路は、ＬＥＤに接続されている露出パッドおよびトレースに隣接し、取り囲む、ボードの外側層上の露出グランドトレースからなる。最後に、前置増幅器（Ｕ１およびＵ２、図２５Ａおよび２５Ｂ）に使用される電源上の電源ノイズをさらに減衰させるために、４つの低域通過フィルタ（Ｒ１／Ｃ１、Ｒ２／Ｃ２、Ｒ２６／Ｃ２０、およびＲ２７／Ｃ２１）が使用される。
【０４１１】
そこで図２５Ａおよび２５Ｂを参照すると、フォトダイオード（Ｄ１（６６０）またはＤ２（６６２））は、入射光（背景照明と調べられる室の内容物から出る変調された蛍光信号の両方）を演算増幅器（Ｕ１またはＵ２）の反転入力に接続されている回路ノードに供給される電流に変換する。構成要素Ｄ３およびＲ４〜Ｒ６（図２５Ａ、ならびに図２５ＢのＤ４およびＲ７〜Ｒ９）は、このフォトダイオードのアノードにバイアス電圧を発生し、バイアス電圧が高ければ高いほどダイオードを通る暗電流が増え、その一方でフォトダイオードノイズは減少する。次に、周辺光に起因するフォトダイオードから出る電流に相当するオフセット電流を発生する補償回路（Ｕ３ＡおよびＵ４Ａおよび関連する構成要素）が備えられる。この補償は、周辺光が変調された蛍光信号に起因する電流より何桁も大きいフォトダイオードからの電流を発生させることができるので重要である。補正しないと、周辺光のレベルが変動すると、その結果、測定に対するオフセットが生じうる。それに加えて、補償がないと、周辺光に関連するフォトダイオードから出る電流は、前置増幅器回路の出力を飽和させる可能性が高くなる。最後に、フォトダイオードからさらに電流を吐き出し／吸い込むのに十分な電圧を発生するトランスインピーダンス増幅器回路（Ｕ１またはＵ２および関連する構成要素）が形成される。この増幅器（Ｕ１またはＵ２）からの電圧は、調べられる室の内容物からの変調された光信号に起因するフォトダイオードから出る電流に比例する。それに加えて、周辺背景光（後続の復調器回路によって除去される）の変化に関連する信号が少量存在する。
【０４１２】
トランスインピーダンス前置増幅器の利得が高く、小さい信号が測定されるため、前の段落で説明された回路は、温度および湿度が変化する結果生じるドリフトの影響をきわめて受けやすい。これらの効果を最小限に抑えるために、回路基板５８２、５８６を準備する際に、多くの設計および処理の規定事項が実装される。第１に、すべての回路トレースおよび構成要素は、他の回路からできる限り離されて配置されている。第２に、プリント回路ソルダーマスクは、構成要素Ｒ１２〜Ｒ１５およびＣ１６〜Ｃ１７の下から取り除かれている。これにより、回路基板と構成要素との間のクリアランスが広がり、試料処理手順実行時に洗浄およびすすぎ試薬をそこに通すことができる。第３に、Ｒ１２〜Ｒ１５で使用するためシリンダー状抵抗器（ＭＥＬＦ型）が選択されている（ここでもまた、構成要素と回路基板との間のクリアランスを最大にする）。最後に、組み立て後に回路基板上に残る汚染物質および残留フラックスの量を最小限に抑えるため、最初に基板をハンダ付け処理で使用されるハンダ／フラックスに適している鹸化剤で洗浄し、その後、脱イオン水ですすぐ。フォトダイオードＤ１（６６０）およびＤ２（６６２）は、好ましくは、「無洗浄フラックス」コアハンダで（上記組み立て処理の完了後に）回路基板にハンダ付けする。この最後のハンダ付け処理の後に回路基板上に残っている残留フラックスは、保護障壁を形成し、したがって、好ましくは取り除かれない。
【０４１３】
ここでもまた図２５Ａおよび２５Ｂを参照すると、増幅器Ｕ３ＢおよびＵ４Ｂ（および関連する構成要素）は、信号の追加増幅を行うことがわかる。それに加えて、フィードバック構成要素Ｒ２２およびＣ１８は、その増幅器回路内に単純な低域通過フィルタを形成する（３４ＫＨｚより高い信号を減衰する）。補償フィードバック回路（図２５Ａおよび２５Ｂにおいて「ＳＥＲＶＯ  ＦＥＥＤＢＡＣＫ」と明示されている）に関して、演算増幅器Ｕ３ＡおよびＵ３Ｂ（および関連する構成要素）は、約５Ｈｚの遮断周波数を持つ積分増幅器として構成される。これらの増幅器の出力電圧は、回路内の背景周辺光および他の自然なＤＣオフセットに起因するフォトダイオード（Ｄ１（６６０）またはＤ２（６６２））からの電流のその部分を無効にするＤＣバイアス電流を発生する。この結果、出力信号（Ｕ３ＢまたはＵ４Ｂの）はゼロのＤＣ電圧成分を持つ、つまり、この信号は０Ｖを中心とする。
【０４１４】
図２５Ａでは、構成要素Ｒ２８およびＣ２２（マイクロプロセッサからのデジタル制御信号「ＳＥＲＶＯ＿ＥＮＡＢＬＥ」と組み合わせる）は、ＴＡＭ回路（図２５Ｂ）が使用されているときに補償増幅器（Ｕ３Ａのみ）が何回も積分するのを無効にするために使用される。これは、ＬＥＤ２（６３２）（ＴＡＭ）の出力スペクトルがフォトダイオードＤ１（６６０）の前にある光学フィルタのバンドパスと重なるからである。この無効化機能がないと、ＦＡＭ検出器／増幅器回路（図２５Ａ）は、ＴＡＭ回路（図２５Ｂ）に使用される励起信号を積分することになり、その結果、ＦＡＭ応答を測定するために回路がスイッチバックされたときに回路静定時間が長くなる。ＦＡＭ補償回路（Ｕ３Ａおよび関連する構成要素）内の積分機能の無効化は、マイクロプロセッサＵ４からの「ＳＥＲＶＯ＿ＥＮＡＢＬＥ」出力をアクティブグランドに設定することによって行われる。他のときには、マイクロプロセッサからのこのデジタル信号は、トライステートであり、構成要素Ｒ２８およびＣ２２は、回路の動作に影響を及ぼさない。
【０４１５】
図２６を参照すると、回路全体が、各ＬＥＤと同じ周波数で変調される、入力ＡＣ信号を受け取り、この信号を、ピークツーピークのＡＣ電圧の６倍の振幅を有するＤＣ電圧（回路グランドを基準とする）に変換する。２つの信号「ＰＲＥＡＭＰ  Ａ」および「ＰＲＥＡＭＰ  Ｂ」（それぞれ図２５Ａおよび２５Ｂ内の回路からの出力）は、ソリッドステート、単極、双投アナログスイッチ（Ｕ６）の２つの接点に接続される。「ＦＥ  ＳＥＬ」は、信号「ＰＲＥＡＭＰ  Ａ」または「ＰＲＥＡＭＰ  Ｂ」がスイッチＵ６を通じてその後のアナログスイッチＵ７に接続されるかどうかを決定する論理信号である。アナログスイッチＵ７は、一種のバッファ／インバータとして働き、その２つの入力（選択された前置増幅器出力および回路グランド）を復調器フィルタの正の入力と負の入力（演算増幅器Ｕ８、Ｕ９および関連する構成要素）のいずれかに交互に切り替える。この実装では、ＤＥＭＯＤＵＬＡＴＯＲ  ＳＷＩＴＣＨ（Ｕ７）は、ＬＥＤと同相で切り替えられ、ＬＥＤが通電すると、前置増幅器から出るより正の信号は、復調器フィルタの正の入力に切り替えられ（Ｒ２０を通じて）、より負の信号は、復調器フィルタの負の入力に切り替えられる（Ｒ２１を通じて）。ＤＥＭＯＤＵＬＡＴＯＲ  ＦＩＬＴＥＲへの接続は、ＬＥＤがオフにされると逆になる。このようにして、復調器およびフィルタ回路から最大の正利得が得られる。
【０４１６】
図２６を続けると、アナログスイッチＵ７の出力は、遮断周波数が約９Ｈｚである低域通過フィルタ（構成要素Ｒ２０、Ｒ２１、およびＣ３０からなる）に接続される。このフィルタのキャパシタＣ３０は、アナログスイッチＵ７を通じて前置増幅器信号の切り替えの結果として前置増幅器から出る変調された信号のピークツーピーク振幅の約１／２の振幅のＤＣ電圧まで充電される。後続のアクティブフィルタ（演算増幅器Ｕ８Ａ／ＢおよびＵ９Ａ／Ｂおよび関連する構成要素）は、利得が約１２である多極低域通過フィルタを含む。このフィルタの第１の部分では、演算増幅器Ｕ８Ａ／Ｂ（および関連する構成要素）は、ＤＣ利得が４である差動増幅器を形成する。このフィルタの出力は、遮断周波数が約３Ｈｚである低域通過フィルタ（構成要素Ｒ２４、Ｒ２５、およびＣ３５）を通る。このフィルタの第２のアクティブステージは、演算増幅器Ｕ９Ａ／Ｂ（および関連する構成要素）からなり、ＤＣ利得が３である差動増幅器を形成する。構成要素Ｒ３２およびＣ３６は、このフィルタの正側に対しフィードフォワード補償経路を形成し、構成要素Ｒ３３およびＣ３７は、このフィルタの負側に対しフィードフォワード補償経路を形成する。このフィルタは、ＬＥＤの動作周波数（この実施例では２７５Ｈｚ）を中心とする１０Ｈｚ範囲を外れる前置増幅器からのあらゆる信号を減衰するために使用される。
【０４１７】
最後に、図２６において、ＤＥＭＯＤＵＬＡＴＯＲ  ＦＩＬＴＥＲの出力は、単位利得を持つ差動増幅器回路（Ｕ１０）に送り込まれる。この機能は、差動フィルタから出る２つの信号の電圧差を、回路グランドを基準とする正電圧に変換することである。２つの出力信号「ＦＬＵＯＲＯ＋」および「ＦＬＵＯＲＯ−」は、上述のＡ／Ｄコンバータに接続される。
【０４１８】
いくつかの状況では、容器の検出室から物質を外に出す必要があるか、またはそうすることが望ましい。このような状況下では、上述の蛍光光度計５００などの検出器を備える室圧縮部材を組み込むことが必要になることがある。検出器とともに組み込む圧縮部材のこのような一実施形態が、図１０Ａおよび１０Ｂに示されている。圧縮機構、または検出器アクチュエータは、参照番号１１５０で指定され、アクチュエータプレート１２４に接続され、アクチュエータプレート１２４から突き出ているブラケット１１５２を備える。検出器５００のレンズの前に、圧縮チューブ１１５４が配置され、またアクチュエータプレート内の開口部を貫通する。圧縮チューブ１１５４は、検出器５００に関する遠位端に透明窓１１６４を取り付けておくことができる。作動バー１１５６は、圧縮チューブ１１５４から反対方向に横へ延びている。作動機構、例えば、空気圧管路１１６０によって圧力源に接続されているロッド１１６２によって代表される空気圧ピストンがブラケット１１５２上に載せられ、圧縮チューブ１１５４を移動するように作動バー１１５６と係合する。ガイドロッド１１５８は、アクチュエータプレート１２４から作動バー１１５６の下側端部内の開口部を貫通して延びる。
【０４１９】
作動機構１１６２を延ばして作動バー１１５６に当てると、圧縮チューブ１１５４が伸長位置（図１０ｂに示されているように左）に移動し、室Ｃをドアアセンブリ２００に圧接する。作動バー１１５６を貫通するガイドロッド１１５８は、圧縮チューブ１１５４をまっすぐな向きに保つのを補助し、また作動機構１１６２によってチューブが移動しているときに圧縮チューブ１１５４が斜めになるのを防ぐのを補助する。ガイドロッド１１５８は、圧縮チューブ１１５４が斜めになるのが問題にならない場合には省くことができる。
【０４２０】
検出器とともに圧縮部材を組み込むための代替機構は、図１１に示されている。図１１において、検出器５００は、ガイドピン１１７６および１１７８がそれぞれ長手方向溝１１８４および１１８２を貫通している基部１１７４を有する平行移動する取り付けプラットフォームまたは橇状部１１７２上に取り付けられている。ピストン（例えば、空気圧ピストン）１１８０は、橇状部１１７２および検出器５００の往復運動を引き起こし、検出器全体を動かして容器室と係合させたり、係合を外したりするための手段を実現する。
【０４２１】
図１８は、信号検出器５００と一体化されている圧縮パッド１１８０の一代替実施形態の横断面を示している。圧縮パッド１１８０は、アクチュエータプレート１０８０を通じて形成されている開口部１０８３内に配置されるアクチュエータカップ１１８２を備える。透明窓、または検出レンズ１１８４は、弾性シールド１０８１内に形成されている開口部内のアクチュエータ１１８２の前に配置される。アクチュエータカップ１１８２の対称軸に関して中心外れの位置でカップ１１８２を通して略円形の貫通孔１１８６が形成され、これにより、カップ１１８２の下側部分１１９０より厚いアクチュエータカップ１１８２の上側部分１１８８が形成される。中心外れに配置する理由は、室と室に隣接して配置される発熱素子との間の熱的接触を高めやすくするために検出処理において検出室内に余分な空気があってもよく、液体の量が少ない室からの流体移動にも役立つという事実である。余分な空気があると、液体は「アクチュエータ領域」の底部の方へ下って溜まる（空気が上部に上昇する）ので、蛍光光度計５００の中心外れ検出レンズおよび焦点は、液体が多量に集まっている（したがって、蛍光発光が多い）検出領域の下側部分の蛍光発光を読み取るように構成される。代替実装では、例えば、検出室が液体で完全に満たされている場合に、アクチュエータカップ１１８２の中心を通して孔１１８６を形成することができる。
【０４２２】
アクチュエータカップ１１８２は、さらに、アクチュエータカップ１１８２上の対角線上で対向する位置から延びる第１の放射状ラグ１１９２および第２の放射状ラグ１１９４を備える。放射状ラグ１１９２は、開口部１０８３から延びる放射状開口部１１９６内に備えられ、放射状ラグ１１９４は、開口部１０８３から延びる放射状開口部１１９８内に備えられている。円形止まり穴１２００は、放射状開口部１１９６から延び、また円形止まり穴１２０２は、放射状開口部１１９８から延びている。止まり穴１２００および１２０２は、図に示されているように、後退位置で放射状ラグ１１９２および１１９４を押し付けてカップ１１８２にバイアスをかける圧縮コイルバネ（図に示されていない）を保持する。
【０４２３】
検出器５００は、マニホールドを通じて形成されている開口部１０８５をまたぎマニホールド１０８２に取り付けられる。第１および第２の円筒状突出部１２０４および１２０６は、開口部１０８５の対向する側部上のマニホールド１０８２から延びている。Ｏリング１２０８は、円筒状突出部１２０４上に位置し、Ｏリング１２１０は、円筒状突出部１２０６上に位置する。円筒状突出部１２０４は、放射状ラグ１１９２内に形成されたカップ状止まり穴内に貫入し、円筒状突出部１２０６は、放射状ラグ１１９４内に形成されたカップ状止まり穴内に貫入する。空気圧導管１２１２は、円筒状突出部１２０４内に貫入し、突出部の上部に出る。同様に、空気導管１２１４は、円筒状突出部１２０６内に貫入し、突出部の上部から出る。アクチュエータカップ１１８２は、導管１２１２および１２１４に圧力を付与することによって、図１８に示されている後退位置から伸長位置（図に示されているように左）に移動され、これにより、放射状突出部１１９２および１１９４が上へ押されてそれぞれ放射状開口部１１９６および１１９８内に入り、アクチュエータ１１８２が左に移動される。円形止まり穴１２００および１２０２の深さは、圧縮されたバネ（図に示されていない）の長さが収まる程度であり、これにより、放射状ラグ１１９２、１１９４は放射状開口部１１９６、１１９８の端部に完全に移動する。
【実施例】
【０４２４】
本明細書で述べた容器およびシステムの用途の一部を説明する実施例を以下に示す。当業者であれば、これらの実施例は、本発明を本明細書で説明されている特定の用途に限定することを意図されていないことを理解するであろう。それに加えて、当業者であれば、他の種類の反応、処理、または検査を実行する際に使用できるように本明細書で述べられている容器およびシステムを容易に適合させることが可能であろう。
【０４２５】
以下の実施例は、液状または乾燥増幅および酵素試薬のいずれかを使用して、手動のリアルタイム転写媒介増幅（「ＴＭＡ」）反応と自動化されたリアルタイムＴＭＡ反応とを比較するように実施された多数の実験をまとめたものである。ＴＭＡ反応は、アンチセンスプライマーまたはプロモーター−プライマーを備える相補的ＤＮＡ伸長産物を生成した後にＲＮＡ鋳型を消化するＲＮａｓｅのＨ活性をもたらす逆転写酵素に依存する２つの酵素転写ベースの増幅反応である。ＴＭＡ反応の実施例は、ＭｃＤｏｎｏｕｇｈらの米国特許第５，７６６，８４９号、Ｋａｃｉａｎらの米国特許第５，８２４，５１８号、およびＢｅｃｋｅｒらの米国特許第７，３７４，８８５号において開示されている。この実験の目標は、クラミジアトラコマチス２３ＳリボソームＲＮＡであり、これはこれ以降「標的核酸」と称される。
【０４２６】
それぞれの実験では、試験試料中の標的核酸を非特異的に結合するために「揺らぎ」捕捉プローブを使用した。揺らぎ捕捉プローブは、３０個のデオキシアデニン残基（ポリ（ｄＡ）３０）を有する５’テールに結合されている１８個の２’−メトキシグアニンおよび２’−メトキシウリジン残基（ポリ（Ｋ）１８）を無作為に配列した３’領域から成り立っていた。揺らぎ捕捉プローブおよび結合された標的核酸を含む複合体を、誘導体化された１４個のデオキシチミン残基（ポリ（ｄＴ）１４）からなるオリゴヌクレオチドテールを有する磁気応答性粒子上に固定化し、次いで、洗浄手順を実行して、試験試料から干渉物質を除去した。
【０４２７】
洗浄手順を実行した後、標的核酸をＴＭＡ試薬および条件に曝露し、蛍光標識された分子ビーコンプローブを使用して、その結果得られた増幅産物をリアルタイムで検出した。Ｋａｃｉａｎらの米国特許第５，８２４，５１８号を参照のこと。またＴｙａｇｉらの米国特許第５，９２５，５１７号も参照のこと。増幅に使用されるプライマーは、３’標的結合配列および５’Ｔ７プロモーター配列およびセンスプライマーを有するアンチセンスプロモーター−プライマーを含んでいた。分子ビーコンプローブは、２’−Ｏ−メチルリボヌクレオチドから成り立っており、標的核酸配列に結合するための内部配列を有していた。フルオレセインホスホラミダイト（カリフォルニア州サンラモン所在のＢｉｏＧｅｎｅｘ社、カタログ番号ＢＴＸ−３００８）および３’−ＤＡＢＣＹＬ  ＣＰＧ（ペンシルバニア州アストン所在のＰｒｉｍｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，Ｉｎｃ．社、カタログ番号ＣＰＧ  １００  ２Ｎ１２ＤＡＢＸＳ）を使用して、相互作用するＦＡＭおよびＤＡＢＣＹＬレポーターならびにクエンチャー部分を含むように分子ビーコンプローブを合成した。この実験のプローブおよびプライマーを合成するのに、Ｅｘｐｅｄｉｔｅ（登録商標）８９０９  ＤＮＡ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｚｅｒ（マサチューセッツ州フレーミングハム所在のＰｅｒＳｅｐｔｉｖｅ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社）を使用する、さまざまな方法が当技術分野でよく知られている標準的なホスホラミダイト化学を使用した。例えば、Ｃａｒｒｕｔｈｅｒｓら、１５４  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ、２８７頁（１９８７年）を参照のこと。
【０４２８】
（実施例１）
（手動増幅反応）
この実験のために、１２×７５ｍｍのポリプロピレン反応管（カリフォルニア州サンジエゴ所在のＧｅｎ−Ｐｒｏｂｅ  Ｉｎｃｏｒｐｏｒａｔｅｄ社、カタログ番号２４４０）において手動ＴＭＡ反応をセットアップし、それぞれの反応管に、ポリ（ｄＴ）１４で誘導体化され、ｐＨ７．５に調整された２５０ｍＭのＨＥＰＥＳ、３１０ｍＭのＬｉＯＨ、１．８８ＭのＬｉＣＩ、１００ｍＭのＥＤＴＡ、および揺らぎ捕捉プローブの１反応あたり１０ｐｍｏｌを含有する溶液中に懸濁された１ミクロンの磁性粒子Ｓｅｒａ−Ｍａｇ（登録商標）ＭＧ−ＣＭ修飾カルボン酸塩（インディアナ州インディアナポリス所在のＳｅｒａｄｙｎ，Ｉｎｃ．社、カタログ番号２４１５２１０５−０５０４５０）１６０μｇ／ｍＬを含む標的捕捉試薬１２５μＬを入れた。それぞれの反応管に、試料輸送媒体（ｐＨ７．５に調整された、１５０ｍＭのＨＥＰＥＳ、２９４ｍＭのラウリル硫酸リチウム（ＬＬＳ）、および１００ｍＭの硫酸アンモニウム）と水を１対１の割合で含む混合物の５００ＦＬを入れた。この混合物は、標的核酸の１０５個のコピーを含むか（試験試料）、または標的核酸を全く含まなかった（陰性標準試料）。反応管を封止カードで覆って、その内容物を１５秒間ボルテックスして混合し、次いで、水槽の中で２５℃の温度を保ち、５分間インキュベートし、標的核酸への揺らぎ捕捉プローブの結合を促進した。（揺らぎ捕捉プローブは、標的捕捉試薬が調製されるときに誘導体化されたポリ（ｄＴ）１４に結合する。）
結合されている標的核酸を精製するために、ＤＴＳ（登録商標）４００標的捕捉システム（Ｇｅｎ−Ｐｒｏｂｅ社、カタログ番号５２１０）を使用して、磁性粒子の分離および洗浄を行った。ＤＴＳ  ４００標的捕捉システムは、反応管を位置決めし、磁場を付与するための試験管ベイを有する。反応管を、磁場の存在下で約３分間試験管ベイ内に置いておき、反応管内で磁性粒子を分離し、その後、浮遊物を吸い取った。次いで、それぞれの反応管に、洗浄緩衝液（ｐＨ７．５に調整された１０ｍＭのＨＥＰＥＳ、６．５ｍＭのＮａＯＨ、１ｍＭのＥＤＴＡ、０．３％（ｖ／ｖ）のエタノール、０．０２％（ｗ／ｖ）のメチルパラベン、０．０１％（ｗ／ｖ）プロピルパラベン、１５０ｍＭのＮａＣｌ、および０．１％（ｗ／ｖ）のラウリル硫酸ナトリウム）１ｍＬを入れ、封止カードで覆い、１５秒間ボルテックスして磁性粒子を再懸濁させた。反応管を試験管ベイに戻し、３分間室温に置いてから、洗浄緩衝液を吸い込んだ。洗浄ステップを１回繰り返した。
【０４２９】
標的核酸の精製の後、１反応につき１１．９ｐｍｏｌのＴ７プロモーター−プライマー、１反応につき９．３５ｐｍｏｌの非Ｔ７プライマー、および１反応につき１０ｐｍｏｌの分子ビーコンプローブを含む増幅／検出試薬（２３℃でｐＨ７．７に調整された４４．１ｍＭのＨＥＰＥＳ、２．８２％（ｗ／ｖ）のトレハロース、３３ｍＭのＫＣＩ、０．０１％（ｖ／ｖ）のＴＲＩＴＯＮ（登録商標）Ｘ−１００洗剤、３０．６ＭＭのＭｇＣｌ２、０．３％（ｖ／ｖ）のエタノール、０．１％のメチルパラベン、０．０２％の（ｗ／ｖ）プロピルパラベン、０．４７ｍＭのｄＡＴＰ、０．４７ｍＭのｄＣＴＰ、０．４７ｍＭのｄＧＴＰ、０．４７ｍＭのｄＴＴＰ、１．７６ｍＭのｒＣＴＰ、１．７６ｍＭのＵＴＰ、９．４１ｍＭのｒＡＴＰ、および１１．７６ｍＭのｒＧＴＰ）７５ＦＬをそれぞれの反応管に加えた。反応管を、封止カードで覆い、１５秒間のボルテックスで混合した。混合した後、反応管の内容物を白色９６ウェルマイクロプレート（マサチューセッツ州ウォルサム所在のＴｈｅｒｍｏ  Ｅｌｅｃｔｒｏｎ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ社、製品番号９５０２８８７）の別の反応ウェルに移したが、ただし、それぞれの反応ウェルには油試薬（シリコーン油（ペンシルバニア州ブリストル所在のＵｎｉｔｅｄ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．社、カタログ番号ＰＳ０３８））７５μＬを入れた。マイクロプレートを、ＴｈｅｒｍａｌＳｅａｌフィルム（ミズーリ州セントルイス所在のＳｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ  Ｃｏ．社、カタログ番号Ｚ３６９６７５）で覆い、Ｓｏｌｏ  ＨＴマイクロプレートインキュベータ（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｅｌｅｃｔｒｏｎ社、カタログ番号５１６１５８０）内で６０℃の温度により５分間インキュベートし、次いで、Ｓｏｌｏマイクロプレートインキュベータ（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｅｌｅｃｔｒｏｎ社、カタログ番号ＷＩ０３６）内で４２℃の温度により５分間インキュベートした。第２のインキュベータ内にある間に、封止カードをマイクロタイタープレートから取り外し、酵素試薬（ｐＨ７．０に調整された５８ｍＭのＨＥＰＥＳ、５０ｍＭのＮ−アセチル−Ｌ−システイン、１．０ｍＭのＥＤＴＡ、１０％（ｖ／ｖ）のＴＲＩＴＯＮ（登録商標）Ｘ−１００洗剤、３％（ｗ／ｖ）のトレハロース、１２０ｍＭのＫＣＩ、２０％（ｗ／ｖ）のグリセロール、１２０ＲＴＵ／μＬのモロニーマウス白血病ウイルス逆転写酵素（「ＭＭＬＶ−ＲＴ」）、および８０Ｕ／μＬのＴ７  ＲＮＡポリメラーゼ）２５μＬをそれぞれの反応ウェルに加えた。（ＭＭＬＶ−ＲＴに対する活性の１逆転写酵素単位（「ＲＴＵ」）は、（ポリ（ｒＡ）−ｐ（ｄＴ）１２−１８）を基質として使用して３７℃の温度で２０分以内に１ナノモルのｄＴＭＰをＤＥ８１フィルタ結合産物を組み込むものとして定義され、Ｔ７  ＲＮＡポリメラーゼについては、活性の１単位（「Ｕ」）は、３７℃の温度で２０分以内に５．０ｆモルのＲＮＡ転写物を生成するものとして定義される。）酵素試薬を追加した直後に、８チャネルマルチピペッターによって係合され、酵素試薬をマイクロタイタープレートに移すために使用される標準２００μＬピペットの先端で反応ウェルの内容物を混合した。次いで、マイクロタイタープレートを透明封止カードで再封止した。
【０４３０】
反応ウェル内の増幅産物の存在を検出するために、封止されたプレートを、４２℃に予め温めておいたＦｌｕｏｒｏｓｋａｎ  Ａｓｃｅｎｔ（登録商標）１００マイクロプレート蛍光光度計（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｅｌｅｃｔｒｏｎ社、製品番号５２１０４８０）内に置き、３０秒間隔で５０分間にわたって蛍光読み取りを行った。検出は、分子ビーコンプローブが増幅産物にハイブリダイゼーションされるときの分子ビーコンプローブの立体構造変化に依存し、その結果、検出可能な蛍光信号が放射された。分子ビーコンプローブがヘアピン形状を維持している限り、つまり、標的核酸の増幅産物にハイブリダイゼーションされない限り、フルオレセインレポーター部分からの蛍光発光は、全般的にＤＡＢＣＹＬクエンチャー部分によってクエンチされた。しかし、分子ビーコンプローブの複数が反応ウェル内で単位複製配列にハイブリダイゼーションしたので、検出可能な蛍光信号が増大した。そのため、時間の経過とともに増大する蛍光発光が、標的核酸の標的領域の増幅活性化の指標となった。この実験結果は、図２７に示されており、そこでは、蛍光光度計からの生データが、それぞれの反応ウェルについて蛍光発光単位をｙ軸にとり、時間（分）をｘ軸にとってプロットされている。標的核酸を含む試料は、背景から約１５分間にわたって反応内に出現する強い蛍光信号を発したが、対照試料は、背景よりも高い有意な信号は発生しなかった。
【０４３１】
（実施例２）
液体試薬を使用する多室型軟質容器内の自動化増幅反応
この実験では、この図１Ａおよび３に例示されている容器１０および機器１００を使用して、本実施例の第１節のＴＭＡ反応を行わせた。図１Ｂに例示されている容器１０に試薬を事前に装填したが、その手順として、（ｉ）標的捕捉試薬１２５μＬを室Ｃ１８に加え、（ｉｉ）洗浄緩衝液３ｍＬを室Ｃ３４に加え、（ｉｉｉ）油試薬２５μＬを、続いて、増幅／検出試薬８５μＬを室Ｃ２０に加え、そして（ｉｖ）油試薬３５μＬを、続いて、酵素試薬２５μＬを室Ｃ３２に加えた。試薬の装填後、ヒートシールで室Ｃ１６を除く容器１０のすべての室を閉じた。標的核酸の１０５個のコピーを有する試験試料５００μＬを、上の実施例１で説明されているように、室Ｃ１６、つまり試料室内にピペットで入れ、その後、ヒートシールで閉じた。
【０４３２】
初期セットアップでは、封止された容器１０を筺体１０４の前部分１２０上に取り付け、ドアアセンブリ２００を閉じて、容器１０の室をドアアセンブリ２００の圧力機構クラスタ１８０と熱ゾーン２６０、２６２、２６４、２６６、および２６８との間でサンドイッチ状に挟んだ。熱ゾーンを３０℃で隣接する室を加熱するように設定した。容器１０の室と室との間での材料の移動を、後述の圧力機構クラスタ１８０を構成する圧縮パッドによって制御した。試験を開始する前に、圧縮パッドＰ７２、Ｐ７０、Ｐ６２、Ｐ５１−１、Ｐ５６、Ｐ５８、Ｐ６０、Ｐ６４、Ｐ６６およびＰ６８をすべて活性化して、入口（または首部）７２、７０、６２、５１、５６、５８、６０、６４、６６、および６８に関連する対応するシールがそれぞれ開くのが早すぎないように、または漏れのないように締め付けて、保護した。室Ｃ３４、つまり洗浄緩衝液室の垂直および横区画４２、４４から洗浄緩衝液および気泡を取り除き、（ｉ）圧縮パッドＰ３４−１およびＰ３６−１、（ｉｉ）圧縮パッドＰ３４−２およびＰ３６−２、（ｉｉｉ）圧縮パッドＰ３４−３およびＰ３６−３、（ｉｖ）圧縮パッドＰ３４−４、および（ｖ）圧縮パッドＰ３４−５の指示された順序で圧縮パッドを係合させることにより、室Ｃ３６、つまり洗浄室の垂直吸入口４８を同時に閉じた。
【０４３３】
初期セットアップの後に、圧縮パッドＰ６８を引き込んで、圧縮パッドＰ３２およびＰ６８を順次活性化し、室Ｃ３２および入口６８を圧迫し、これにより、封止されている入口６８を押し開き、室Ｃ３２から室Ｃ３０へ酵素および油試薬を移動した。それと同時に、圧縮パッドＰ５６を引き込んで、圧縮パッドＰ２０およびＰ５６を順次活性化し、室Ｃ２０および入口５６を圧迫し、これにより、封止されている入口５６を押し開き、室Ｃ２０から室Ｃ２２へ増幅／検出および油試薬を移動した。圧縮パッドＰ６８およびＰ５６はそれぞれ入口６８および５６を締め付けるように活性化されたままであり、これにより、酵素および増幅／検出試薬が室Ｃ３２およびＣ２０に逆流するのを防いだ。
【０４３４】
酵素および増幅／検出試薬を移動した後、圧縮パッドＰ１８−１、Ｐ１８−２およびＰ５４を順次活性化し、室Ｃ１８および入口５４を圧迫し、これにより、封止されている入口５４を押し開き、室Ｃ１８から室Ｃ１６へ標的捕捉試薬（「ＴＣＲ」）を移動した。室Ｃ１６およびＣ１８に関連付けられている圧縮パッドを使用し、組み合わされた内容物を室Ｃ１６とＣ１８との間で前後に２回移動することによって、ＴＣＲおよび試料を混合した。混合が完了した後、圧縮パッドＰ５４を活性化して、入口５４を締め付け、これにより、ＴＣＲ／試料混合物を室Ｃ１６内に保持し、そこで、５分間、熱ゾーン２６０を３０℃の温度に加熱することによってインキュベートした。このインキュベートステップは、標的核酸の揺らぎ捕捉プローブへの非特異的結合およびＴＣＲ中に存在する磁気応答性粒子上の揺らぎ捕捉プローブの固定化を促進するために実行された。
【０４３５】
標的核酸を試験試料中の他の材料から分離するために、磁石並進機構２０８を活性化し、磁石を室Ｃ２６、初期セットアップ時の磁気分離室１０２に隣接する位置（本明細書では「オン」位置と称する）に移動した。圧縮パッドＰ６２を引き込み、圧縮パッドＰ１６−３、Ｐ１６−４、およびＰ６２を順次活性化して、室Ｃ１６の一部を圧迫し、これにより、封止されている入口６２を押し開き、室Ｃ１６から室Ｃ２６へ第１の一定分量のＴＣＲ／試料混合物を移動した。第１の一定分量のＴＣＲ／試料混合物を室Ｃ２６に移動した後、圧縮パッドＰ６２は、入口６２を締め付けるため活性化されたままであり、これにより、室Ｃ１６とＣ２６との間で材料が移動するのを防ぎ、圧縮パッドＰ１６−３およびＰ１６−４を順次引っ込めた。室Ｃ２６内で、磁気応答性粒子に、熱ゾーン２６８によってもたらされる３０℃の温度で１分間磁石による磁場をかけた。磁石が「オン」位置に留まっている間に、圧縮パッドＰ２６、Ｐ７０、Ｐ３６−１、Ｐ３６−２、およびＰ３６−３を順次活性化して、室Ｃ２６、入口７０、および室Ｃ３６、つまり廃棄物室の垂直吸入口４８を圧迫し、室Ｃ２６から室Ｃ３６に液体を移動した。
【０４３６】
室Ｃ１６およびＣ１８に関連付けられている圧縮パッドの異なる配列構成を活性化することによって、室Ｃ１６およびＣ１８から室Ｃ２６に、３つの追加の一定分量のＴＣＲ／試料混合物を移動した。室Ｃ２６に移動された第２の一定分量のＴＣＲ／試料混合物については、圧縮パッドの順序動作は、Ｐ１８−１（＋）、Ｐ１８−２（＋）、Ｐ１８−２（−）、Ｐ６２（−）、Ｐ１６−３（＋）、Ｐ１６−４（＋）、Ｐ６２（＋）、Ｐ１６−３（−）、およびＰ１６−４（−）の順序であった。室Ｃ２６に移動された第３の一定分量のＴＣＲ／試料混合物については、圧縮パッドの順序動作は、Ｐ５１−２（＋）、Ｐ１８−１（−）、Ｐ１６−４（＋）、Ｐ１６−３（＋）、Ｐ１６−２（＋）、Ｐ１６−１（＋）、Ｐ１６−１（−）、Ｐ１６−２（−）、Ｐ１６−３（−）、Ｐ１６−４（−）、Ｐ１８−１（＋）、Ｐ１８−２（＋）、Ｐ５４（＋）、Ｐ６２（−）、Ｐ１６−３（＋）、Ｐ１６−４（＋）、Ｐ６２（＋）、Ｐ１６−３（−）、およびＰ１６−４（−）の順序であった。そして、室Ｃ２６に移動された第４の一定分量のＴＣＲ／試料混合物については、圧縮パッドの順序動作は、Ｐ１６−２（＋）、Ｐ１６−１（＋）、Ｐ６２（−）、Ｐ１６−３（＋）、Ｐ１６−４（＋）、Ｐ１６−３（−）、およびＰ１６−４（−）の順序であった。指示記号（＋）は、参照されている圧縮パッドが、室の対応する入口または部分を圧迫するように活性化されたことを示し、指示記号（−）は、参照されている圧縮パッドが、室の対応する入口または部分から引っ込められたことを示す。すべてのＴＣＲ／試料混合物が処理され、試料が容器１０内でさらに処理できる管理可能な大きさにまで縮小されてしまうまで、一定分量を加える毎に固定化および液状廃棄物除去ステップを繰り返した。
【０４３７】
次いで、洗浄手順を開始して、磁石が「オン」位置に留まっている間に、固定化された核酸から不要な、また干渉する可能性のある材料を除去した。洗浄手順の開始時に、圧縮パッドＰ３４−５、Ｐ３４−４、Ｐ３４−３、Ｐ３４−２、およびＰ３４−１を動作させて、室３４の垂直および横の区画４２、４４（「首部領域」）のプライミングを行い、圧縮パッドＰ７２を引き込んだ後に、室３４の首部領域を圧迫して、封止されている入口７２を開き、室Ｃ３４から洗浄緩衝液約２００μＬを室Ｃ２６に移動した。次いで、圧縮パッドＰ７２で入口７２を締め付け、圧縮パッドＰ６２、Ｐ１６−４、およびＰ２６の作用によって洗浄緩衝液を室Ｃ２６と室Ｃ１６の圧縮パッドＰ６２およびＰ１６−４によって覆われている領域との間で前後に３回移動し、開いた入口６２に滞留している残りのＴＣＲ／試料混合材料を除去し、結合されている核酸を精製した。このステップで、Ｐ２６は、圧縮パッドＰ６２およびＰ１６−４によって覆われている室Ｃ１６の領域を過剰充填するのを防ぎ、泡立ちを最小限度に抑えるように部分的にのみ活性化される。液体はすべて、最終的に、室Ｃ２６内に集められ、磁気応答性粒子を固定化するために約３０℃の温度で１分間磁石による磁場に曝露された。次いで、洗浄緩衝液が、圧縮パッドＰ２６、Ｐ７０、Ｐ３６−１、Ｐ３６−２、およびＰ３６−３の作用によって室Ｃ２６から室Ｃ３６内に移動された。室Ｃ３４の首部領域に関連付けられている圧縮パッドを動作させて、さらなる一定分量約２００μＬの洗浄緩衝液を室Ｃ３４から室Ｃ２６に移動し、圧縮パッドＰ７２を活性化して、開いた入口７２を締め付け、洗浄緩衝液が圧縮パッドＰ６２によって覆われている室Ｃ１６のその部分の中に移動されるだけであり、室Ｃ２６と室Ｃ１６との間の移動が２回だけ実行されることを除く洗浄処理を繰り返した。最後に、室Ｃ３４の首部領域に関連付けられている圧縮パッドを動作させて、圧縮パッドＰ７２を活性化して、開いた入口７２を締め付け、第３の一定分量約２００μＬの洗浄緩衝液を室Ｃ３４から室Ｃ２６に移動し、押しのけられた磁気応答性粒子を固定化するために磁気応答性粒子を３０℃の温度で１分間磁石の磁場に曝した。その後、圧縮パッドＰ７０、Ｐ３６−１、Ｐ３６−２、およびＰ３６−３の作用によって液体を室Ｃ２６から室Ｃ３４に移動した。洗浄手順が完了した後、磁石を室Ｃ２６との整列から外し（「オフ」位置）、熱ゾーン２６８を室Ｃ２６と整列するように移動した。
【０４３８】
標的核酸を分離した後、圧縮パッドＰ２２およびＰ５８を順次活性化し、室Ｃ２２および入口５８を圧迫し、これにより、封止されている入口５８を押し開き、室Ｃ２２から室Ｃ２６へ増幅／検出試薬を移動した。磁性粒子が、増幅／検出試薬中に完全に懸濁されることを確実にするために、圧縮パッドＰ２６、Ｐ５８、およびＰ２２を動作させて増幅／検出試薬を室Ｃ２２とＣ２６との間で２回移動した。室Ｃ２６内で、５分間６２℃（例えば±１．５℃の許容誤差で）の熱ゾーン２６８を使用して増幅／検出試薬をインキュベートして、プロモーター−プライマーと標的核酸との結合を促進した。それと同時に、熱ゾーン２６４および２６６で、室Ｃ２８およびＣ３０の温度を、ＴＭＡの最適な温度である４２℃（例えば、±０．４５℃の許容誤差で）にした。６２℃でインキュベートした後、室Ｃ２６の内容物を４２℃でさらに５分間インキュベートし、その後、圧縮パッドＰ２６およびＰ６４を順次活性化し、室Ｃ２６および入口６４を圧迫し、これにより、封止されている入口６４を押し開き、室Ｃ２６から室Ｃ２８へ加熱された増幅／検出試薬と磁性粒子の混合物を移動した。室Ｃ２８内に入ったら、圧縮パッドＰ３０およびＰ６６を順次活性化し、室Ｃ３０および入口６６を圧迫し、これにより、封止されている入口６６を押し開き、室Ｃ３０から室Ｃ２８へ加熱された酵素試薬を移動した。酵素試薬を室Ｃ２８に移動した後、熱ゾーン２６６の温度を３８℃±１℃に調節した。増幅／検出試薬、酵素試薬、および磁性粒子を混合するために、重力の助けを借りて、室Ｃ２８の内容物を開かれている入口６６を通して室Ｃ３０内に排出し、次いで、圧縮パッドＰ３０およびＰ６６を使って室Ｃ３０および入口６６を順次圧迫することによって内容物を室Ｃ２８内に戻した。この処理を３回繰り返して、試薬の混合が標的配列の増幅に適したものとなるようにし、その後、混合圧縮パッドＰ６６を活性化して、開いた入口６６を締め付け、開いた入口６６から室Ｃ２８に残留試薬を移動した。
【０４３９】
この混合物中に生成された増幅産物を検出するために、室Ｃ２８の透明窓に隣接して配置されている蛍光光度計５００を用いて２７分間にわたって５秒間隔で蛍光発光の読み取り値を取得し、それぞれの読み取りは平均して４秒を少し超えるくらいであった。この実験結果は、図２８に表されており、これは、室Ｃ２８から検出された蛍光発光単位をｙ軸にとり、時間（分）をｘ軸にとったグラフである。これらの結果から、本明細書で説明されている機器１００および容器１０を使用して実行されたリアルタイムＴＭＡ反応から、上の実施例１の手動でフォーマットされたリアルタイムＴＭＡ反応と同等の結果が得られたことがわかる。
【０４４０】
（実施例３）
液体試薬および尿試料を使用する多室型軟質容器内の自動化増幅反応
この実験は、標的核酸の１０５個のコピーを添加した尿試料を使用してリアルタイムＴＭＡ反応を評価するように設計された。この実験の材料および方法は、実施例２で説明されているリアルタイムＴＭＡ反応と同じであったが、ただし、（ｉ）室Ｃ１８には、水１００μＬと併せて１０ｐモルの揺らぎ捕捉プローブを含む標的捕捉試薬１５０μＬを装填したこと、（ｉｉ）室Ｃ３４に、洗浄緩衝液２ｍＬを装填したこと、（ｉｉｉ）増幅／検出および酵素試薬を室Ｃ２０または室Ｃ３２に装填する前に、油試薬を室Ｃ２０または室Ｃ３２に装填しなかったこと、（ｉｖ）試験試料に、健常人ドナーからの尿２５０μＬおよび試料輸送媒体２５０μＬを入れたこと、（ｖ）磁性粒子を固定化しながら室Ｃ１６からＴＣＲ／試料混合物を室Ｃ２６に移動し、室Ｃ２６内に収納されている磁性粒子を磁石の磁場に曝し、室Ｃ２６から液体を室Ｃ３６に移動するステップを２回だけ繰り返したことが異なっていた。この実験結果は、図２９に例示されており、これは、室Ｃ２８から検出された蛍光発光単位をｙ軸にとり、時間（分）をｘ軸にとったグラフである。この実験のこれらの結果から、リアルタイムＴＭＡ反応で、本明細書で説明されている機器１００および容器１０を使用して尿試料中に供給された標的核酸を検出したことがわかる。
【０４４１】
（実施例４）
乾燥試薬を使用する多室型軟質容器内の自動化増幅反応
この実験の目的は、乾燥形態の増幅および酵素／プローブ試薬を使用して実施例２の自動化されたリアルタイムＴＭＡ反応を評価することであった。容器１０に試薬を事前に装填したが、その手順として、（ｉ）標的捕捉試薬１２５μＬを室Ｃ１８に加え、（ｉｉ）洗浄緩衝液３ｍＬを室Ｃ３４に加え、（ｉｉｉ）油試薬２５μＬを、続いて、増幅再構成試薬（０４％（ｖ／ｖ）のエチルアルコール（絶対）の８５μＬ、０．１０％（ｗ／ｖ）のメチルパラベン、０．０２％（ｗ／ｖ）のプロピルパラベン、３３ｍＭのＫＣｌ、３０．６ｍＭのＭｇＣｌ２、および０．００３％のフェノールレッド）をＣ−２０に加え、（ｉｖ）増幅試薬ペレット（２５０ｍＭのＨＥＰＥＳ、１６％（ｗ／ｖ）のトレハロース、５３．４ｍＭのＡＴＰ、１０ｍＭのＣＴＰ、６６．６ｍＭのＧＴＰ、１０ｍＭのＵＴＰ、ｐＨ７．０に調整された２．６６ｍＭのｄＡＴＰ、ｄＣＴＰ、ｄＧＴＰ、およびｄＴＴＰのそれぞれ、アンチセンスＴ７プロモーター−プライマー０．６ｎモル／Ｌ、およびセンス非Ｔ７プライマー０．４７ｎモル／Ｌを含む液滴１４μＬから形成されたもの）、ただし、この液滴を液体窒素中に分注し、その結果得られる凍結ペレットを凍結乾燥した）を室Ｃ２２に加え、（ｖ）油試薬３５μＬを、続いて、酵素／プローブ再構成試薬（ｐＨ７．０に調整した５０ｍＭのＨＥＰＥＳ、１ｍＭのＥＤＴＡ、１０％（ｖ／ｖ）のＴＲＩＴＯＮ（登録商標）Ｘ−１００洗剤、および１２０ｍＭのＫＣＩ）２５μＬを室Ｃ３２に加え、（ｖｉ）酵素／プローブ試薬ペレット（２０ｍＭのＨＥＰＥＳ、１２５ｍＭのＮ−アセチル−Ｌ−システイン、０．１ｍＭのＥＤＴＡ、０．０１％（ｖ／ｖ）のＴＲＩＴＯＮ（登録商標）Ｘ−１００洗剤、２０％（ｗ／ｖ）のトレハロース、４１２ＭＲ／ＬのＭＭＬＶ−ＲＴ（透析）、６８７ＭＵ／ＬのＴ７  ＲＮＡポリメラーゼ（透析）、（ただし「Ｍ」は、１００万を表す）、および分子ビーコンプローブ２．２０ｎｍｏｌ／Ｌを含む液滴７．２８μＬから形成された）を室Ｃ３０に加えた。試薬の装填後、ヒートシールで室Ｃ１６を除く容器１０のすべての室を閉じた。標的核酸の１０５個のコピーを有する試験試料５００μＬを、上の実施例１で説明されているように、室Ｃ１６内にピペットで入れ、その後、ヒートシールで閉じた。初期セットアップは、上記の実施例２と同じであった。
【０４４２】
初期セットアップの後に、圧縮パッドＰ３２およびＰ６８を順次活性化し、室Ｃ３２および入口６８を圧迫し、これにより、封止されている入口６８を押し開き、室Ｃ３２から室Ｃ３０へ酵素／プローブ再構成試薬および油試薬の組み合わせを移動し、酵素／プローブ試薬ペレットを２分かけて酵素／プローブ再構成試薬中に溶解させた。次いで、圧縮パッドＰ２０およびＰ５６を順次活性化して、室Ｃ２０および入口Ｐ２０を圧迫し、これにより、封止されている入口５６を押し開き、室Ｃ２０から室Ｃ２２に増幅再構成試薬および油試薬の組み合わせを移動し、圧縮パッドＰ２０およびＰ２２を活性化して、室Ｃ２２の内容物を室Ｃ２０とＣ２２との間で４回前後に移動し、増幅試薬を完全に再構成し、その後、圧縮パッドＰ５６を活性化して入口５６を締め付けた。室Ｃ３０内に２分間滞留させた後、圧縮パッドＰ３０およびＰ３２を活性化し、室Ｃ３０の内容物を室Ｃ３０とＣ３２との間で２回前後に移動して、酵素／プローブ試薬を完全に再構成し、その後、圧縮パッドＰ６８を活性化して入口６８を締め付けた。これらのステップの残りは、実施例２と同じであった。
【０４４３】
この実験結果は、図３０に例示されており、これは、室Ｃ２８から検出された蛍光発光単位をｙ軸にとり、時間（分）をｘ軸にとったグラフである。これらの結果から、オンボードで再構成されるペレット状にされた増幅および酵素／プローブ試薬を使用する、このリアルタイムＴＭＡ反応は、本明細書で説明されている機器１００および容器１０を使用して標的転写物を検出したことがわかる。
【０４４４】
（実施例５）
油試薬が存在する場合、または存在しない場合に液体試薬を使用する自動化増幅反応
この実験は、ＴＭＡ反応を実行するために液体試薬を装填するのに先立ち多室型容器の室を開くために非混和性液を用意する利点を評価することを目的として設計された。この実験では、図４に例示されている種類の容器を、２コピー分用意し、（ｉ）対照では、増幅／検出試薬を収納する（室Ｃ２０）または酵素試薬を収納する（室Ｃ３２）室に油試薬を加えず、（ｉｉ）酵素試薬を加える前に、油試薬２５μＬを室Ｃ３２に加え、室Ｃ２０には油を加えず、（ｉｉｉ）増幅／検出および酵素試薬を加える前に、油試薬２５μＬを室Ｃ２０およびＣ３２のそれぞれ加えた。室Ｃ１８には、１０ｐモルの揺らぎ捕捉プローブおよび水１００μＬを含む標的捕捉試薬２５０μＬを装填した。この実験の材料および方法は、他の点では、増幅反応を４０分間かけて約４０℃の温度で実施したことを除き、実施例２で説明されている反応のものと実質的に同じであった。図３１は、室Ｃ２８から検出された蛍光発光単位をｙ軸にとり、時間（分）をｘ軸にとった、この実験結果を例示するグラフである。これらの結果から、この実験のリアルタイムＴＭＡ反応は、増幅／検出および酵素試薬のうちの少なくとも１つを油試薬と組み合わせたときに著しくよい成果をもたらしたことがわかる。
【０４４５】
本発明は、いくつかの例示的な実施形態を参照しつつかなり詳しく説明され、示されているが、当業者であれば、本発明の他の実施形態を容易に思い付くであろう。したがって、本発明は、付属の請求項の精神と範囲内に包含されるすべての修正形態および変更形態を含むとみなされる。
【図１Ａ】
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【図１Ｂ】
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【図１Ｃ】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８Ａ】
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【図８Ｂ】
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【図８Ｃ】
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【図９Ａ】
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【図９Ｂ】
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【図９Ｃ】
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【図１０Ａ】
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【図１０Ｂ】
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【図１１】
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【図１２Ａ】
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【図１２Ｂ】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７Ａ】
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【図１７Ｂ】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２】
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【図２３】
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【図２４】
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【図２５Ａ】
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【図２５Ｂ】
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【図２６】
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【図２７】
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【図２８】
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【図２９】
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【図３０】
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【図３１】
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