(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ｉ）一端に開口部を有し、他端に底を有する容器を準備する工程、
（ｉｉ）第１物質を準備し、容器内に導入する工程、
（ｉｉｉ）第２物質を準備する工程、
（ｉv）該第２物質が担持された、所定の物質に容易に溶解するフィルムを準備する工程、および
（ｖ）該フィルムの下から第１物質が転置することを実質的に防ぐために第１物質の上に重なるように該フィルムを容器に導入する工程、
を含む、アッセイで使用するための容器内に第１物質を導入する方法であって、
第２物質が、磁気反応性粒子を含み、第１物質が該フィルムを溶解しないことを特徴とする方法。
【請求項２】
第２物質は、フィルムを形成する溶液またはスラリー中に該第２物質を導入する工程、および該第２物質を該フィルムの少なくとも１の表面に塗布する工程の少なくとも１つによって該フィルムに担持されることを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項３】
フィルムは、ヒドロキシアルキルメチルセルロース、カルボキシメチルセルロース、カルボン酸ヒドロキシアルキルエステルモノマー、エトキシル化ヒドロキシアルキル（メタ）アクリレート、プロポキシル化ヒドロキシアルキル（メタ）アクリレート、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリビニルアルコール（ＰＶＡ）、およびそれらの組合せの少なくとも１種を含む材料から形成されていることを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項４】
フィルムは、香料を含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項５】
第１物質は、溶解剤、タンパク質変性剤、非プロトン性溶媒、アルカリ化剤、中和緩衝液、塩、金属、酵素、オリゴヌクレオチド、プライマー、核酸、タンパク質、安定化成分、および媒体成分、ならびにそれらの組合せの少なくとも１種を含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項６】
磁気反応性粒子は、酸化鉄、水酸化第二鉄、四酸化三鉄、硫化鉄、および塩化鉄の少なくとも１種を含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項７】
第２物質は、シリカ、シリカ被覆粒子、シリカ被覆膜、シリカゲル、水和およびヒドロキシル化シリカ表面、ガラス粉末、ガラス繊維マット、ガラス膜、ゼオライト、セラミック、金属酸化物または金属塩を被覆したポリマー粒子、およびそれらの組合せの少なくとも１種をさらに含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項８】
容器は、底を有する閉管、マイクロウェル、マイクロウェルのアレイ、ビン、およびペトリ皿の少なくとも１種を含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項９】
工程（ｉｉ）は、第１物質を容器の底に配置する工程をさらに含むことを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
工程（ｖ）は、フィルムを容器の開口部の上に配置する工程、そのフィルムを移動できるプランジャーで係合する工程、および容器に対して第１の長軸方向にプランジャーを動かすことによって開口部を通してフィルムを容器中に押し込む工程をさらに含むことを特徴とする請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
フィルムは、容器の開口部に及ぶ大きさのセグメントの形態であることを特徴とする請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
フィルムは、連続したウェブまたはロールの形態をしており、工程（ｖ）は、そのフィルムを容器の開口部の上に供給する工程、および容器に導入する際にそのロールからそのフィルム部分を切断する工程をさらに含むことを特徴とする請求項１０に記載の方法。
【請求項１３】
工程（ｖ）は、フィルムを容器の開口部上に配置する工程、およびそのフィルムを重力送りにより容器中に導入する工程をさらに含むことを特徴とする請求項１０に記載の方法。
【請求項１４】
工程（ｖ）は、フィルムを容器の開口部の上に配置する工程、およびそのフィルムを加圧および減圧の少なくとも１種により容器中に導入する工程をさらに含むことを特徴とする請求項１０に記載の方法。
【請求項１５】
請求項１から１４のいずれか一項に記載の方法により前記工程（ｉ）から（ｖ）を実施する工程、および
（ｖｉ）材料または混合物を容器に導入する工程を含むことを特徴とする材料または混合物を処理する方法。
【請求項１６】
材料または混合物は、生物試料を含むことを特徴とする請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
生物試料は、尿、臨床尿、膣スワブ、およびそれらの組合せの少なくとも１種を含むことを特徴とする請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
（ｖｉｉ）フィルムを溶解する工程、および
（ｖｉｉｉ）第１および第２物質、ならびに生物試料を含む混合物を作り出す工程
をさらに含むことを特徴とする請求項１６に記載の方法。
【請求項１９】
（ｉｘ）第１物質と第２物質とを互いに結合させ、それによって複合体を形成する工程、
（ｘ）容器に磁場を加え、それによって複合体を容器の所定の領域に引き寄せる工程、
（ｘｉ）生物試料の少なくとも一部を容器から取り除く工程、
（ｘｉｉ）磁場を容器から取り除く工程、
（ｘｉｉｉ）第１物質と第２物質とを互いから引き離す工程、
（ｘｉｖ）磁場を容器に再び加え、それによって、第１物質を容器の所定の領域に引き寄せる工程、および
（ｘｖ）第１物質を容器から取り除く工程
をさらに含むことを特徴とする請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
（ｘｖｉ）オリゴヌクレオチドに増幅処置を施す工程、および
（ｘｖｉｉ）オリゴヌクレオチドの存在および／または濃度を検出するアッセイを実施する工程
の少なくとも１種をさらに含むことを特徴とする請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
工程（ｉ）から（ｘｖｉｉ）の少なくとも１種を、自動化ロボット装置により実施することを特徴とする請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
容器、
容器中の第１物質、および
第１物質が転置することを実質的に防ぐために第１物質上に重なるように配置されている、第２物質が担持された、所定の物質に容易に溶解するフィルム
を含む、アッセイを実施するためのキットであって、
第２物質が磁気反応性粒子を含み、該フィルムが、容器から分離した独立したフィルムであり、
第１物質が該フィルムを溶解しないことを特徴とするキット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本出願は、参照により本明細書に組み込まれている２００４年６月２８日に出願した米国特許仮出願第６０／５８２，８２１号の優先権を主張するものである。
【０００２】
本発明は、溶解性の膜もしくはフィルムおよびそれを含む方法に関する。例えば、本発明は、容器、物質および溶解性の膜を含む装置ならびにそれを含む方法に関する。
【背景技術】
【０００３】
以下の論議においては、いくつかの物品および方法を、背景および序文のために記載する。ここに含まれるものはいずれも従来技術の「是認」と解釈すべきではない。出願人は、適用できる法による規定のもとで、その物品および方法が、従来技術を構成しないことを適宜明らかにする権利を明確に留保する。
【０００４】
極めて正確な量の１または複数の物質の容器中への導入を必要とする多くの科学的および産業上の装置および方法が存在する。導入される物質の性質、容器の構成および特性、ならびにこれらの物質を導入するために用いられる技法等のさまざまな要因によって、容器に導入される物質の幾分かが、その容器中の他の物質と混合および／または相互作用することを防ぐように容器の壁にくっつくことは、よく見受けられることである。さまざまな物質が正確な量で混合されることを方法の本質が必要とするとき、上記の「くっつき」の問題は、その方法の望ましい結果に対して重大かつ好ましくない影響を与え得る。
【０００５】
さらに、物質の導入の自動化は望ましいけれども、少量の物質を正確に供給することは困難であることが分かる。したがって、物質の正確な量が要求されるときは、これらの物質を手動で測定して容器に導入するのが一般的なやり方である。この手間のかかる手順は、能率の立場からは明らかに理想的とは言えない。
【０００６】
前記の科学的または産業的方法の様式の一例は、試料からの生物学的要素の単離および／または分離である。この単離および／または分離を達成する１種の方法には、生物学的試料、磁化できる粒子、および場合によりその他の物質を、通常は重量測定法によるかまたはピペットによって管に導入することが含まれる。管中に存在する１または複数の生物学的要素は、磁化できる粒子と結合するようになる。そのとき磁石を管の壁（１または複数）に緊密に接近した状態にさせ、磁化できる粒子が、結合している生物学的要素（１または複数）と共に管の壁（１または複数）に引き寄せられるようになる。次いで、管に存在する残りの成分を除去し、その結果、生物学的要素（１または複数）を分離することができる。さまざまなさらなる方法の工程を、所望の目標を達成するために用いることができる。
【０００７】
管の壁およびピペットの先端は、そこに物質を引き寄せることができる表面電荷をしばしば持つ。したがって、例えば、磁化できる粒子の管中への導入によって、管内の残りの成分と該粒子自体が結合することを妨げる方法で、該粒子が管の壁またはピペットに、しばしばくっつき得るという上記の問題を引き起こす。その上、粒子を最初に導入するときに、そのくっつきの問題を防ぐための配慮をしたとしても、粒子が入っている管のその後の移動によって、粒子が管の壁にまき散らされて、壁にくっつくことが起こり得る。上記のような方法は、望ましい結果もしくは正確な結果を得るために、しばしば小さなサンプルサイズを必要とし、および／または、一緒に混合する正確な量のさまざまな物質に依存するため、くっつきの現象は、上記の単離および／または分離技術の正確性および信頼性における重大な問題を引き起こす。
【０００８】
それ故、一般に、物質のより正確な導入および容器内での結合を容易にする装置および方法を提供する必要性が当技術分野には存在する。また、試料からの生物学的要素の単離および／または分離で必要とされる物質のより正確で効率的な導入および結合を促進する装置および方法に対する必要性も当技術分野には存在する。
【０００９】
【特許文献１】米国特許第６，４１９，９０３号明細書
【特許文献２】米国特許第５，９７３，１３８号明細書
【特許文献３】米国特許第６，４３３，１６０号明細書
【特許文献４】米国特許出願第１０／３５９，１７９号明細書
【特許文献５】米国特許出願第１０／３５９，１８０号明細書
【特許文献６】米国特許第６，６７２，４５８号明細書
【非特許文献１】"Hansen Solubility Parameter System," DuPont Nylon Intermediates and Specialties, publication W-400473, 12/2000
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【００１０】
本発明は、１または複数の物質が容器中の他の物質および構成要素と適切に結合することを妨げる方法で容器の壁にくっつくことを除去するとはいかないまでも減少させる装置および方法を提供することによって上記の必要性などを満足させる。本発明は、また、自動化を容易にする装置および技術を提供する。本発明は、さらに、正確な量の物質を容器内に導入することを可能にする装置および方法を提供する。
【課題を解決するための手段】
【００１１】
一態様によれば、本発明の方法は、（ｉ）容器を準備する工程、（ｉｉ）該容器に第１物質を導入する工程、および（ｉｉｉ）容易に溶解するフィルムを該容器内に導入し、その溶解性フィルムが容器中の第１物質の上に重なるようにする工程を含む。
【００１２】
さらなる態様によれば、本発明は、（ｉ）容器を準備する工程、（ｉｉ）第１物質を担持している容易に溶解するフィルムを準備する工程、および（ｉｉｉ）該フィルムを容器内に導入する工程を含む。
【００１３】
本発明の別の態様によれば、上記方法のいずれもが、第２物質を容器に加える工程、ならびに以下の、（ｖ）フィルムを溶解する工程、および（ｖｉ）第１および第２物質を含む混合物を作り出す工程、（ｖｉｉ）第１物質と第２物質とを互いに結合させ、それによって複合体を形成する工程、（ｖｉｉｉ）容器に磁場を加え、それによって複合体を容器の所定の領域に引き寄せる工程、（ｉｘ）生物試料の少なくとも一部を容器から取り除く工程、（ｘ）磁場を容器から取り除く工程、（ｘｉ）第１物質と第２物質とを互いから引き離す工程、（ｘｉｉ）磁場を容器に再び加え、それによって、第１物質を容器の所定の領域に引き寄せる工程、（ｘｉｉｉ）第２物質を容器から取り除く工程、（ｉｘ）第２物質に増幅処置を施す工程、ならびに（ｘ）第２物質中の標的検体の存在および／または濃度を検出するアッセイを実施する工程の１または複数をさらに含み得る。上記工程の１または複数は、自動化ロボット装置により実施することができる。
【００１４】
さらなる態様によれば、本発明は、ｉ）容器、ｉｉ）該容器中の第１物質、およびｉｉｉ）該容器中にあって該第１物質にかぶせてある容易に溶解するフィルムを含むキットを提供する。さらに別の態様によれば、本発明は、ｉ）容器、およびｉｉ）容易に溶解するフィルムにより担持されている第１物質を含むアッセイを実施するためのキットを提供する。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１５】
上記その他の本発明の特徴、態様および利点は、以下の記述、添付の特許請求の範囲および下記に簡単に説明されている図面に示されている典型的な実施形態から明らかになろう。他に特記されていない限り、同じ要素は同一の記号を有していることに注意されたい。
【００１６】
本発明の原理を、その原理の説明のための特定の実施形態の以下の論議および後掲の図面を参照することにより、これからさらに説明する。
【００１７】
本明細書で使用するとき、「生物試料」とは、血液、血漿、血清、尿、骨髄穿刺液、脳脊髄液、細胞組織、細胞、食物、糞、唾液、毛髪、口内分泌物、鼻汁、頬側細胞、気管支洗浄液、頚管粘液、リンパ液、痰、および前記のいずれかを含むスワブを含むがこれらには限定されない体液または身体物質を含む任意の物質を意味する。上記の体液または身体物質は、任意の供給源から採取することができる。例えば、その供給源はヒトには限定されない。
【００１８】
本明細書で使用するとき、「磁気反応性粒子」とは、与えられた磁気モーメントを有することができる粒子、さもなければ、磁場の作用で可動する粒子を意味する。
【００１９】
本明細書で使用するとき、「上に重なる」とは、関係する普通の使用または場の中で、関係する対象または物質の真上にある幾何学的配置を意味する。
【００２０】
本明細書で使用するとき、「容易に溶解する」とは、材料またはフィルムが、選択された物質（１または複数）と接触したとき、その材料が、所望の科学的または産業的方法において過度の遅れを引き起こすことなく容易に利用することができるように、一定の速度で、一定の程度まで分解することができることを指す。例えば、「容易に溶解する」とは、選択された溶媒に対するハンセンパラメータが、ハンセン溶解度マップにプロットしたとき、その材料に対する溶解度容積もしくは面積内にあることを意味する。例えば、非特許文献１を参照。
【００２１】
本明細書で使用するとき、「非特異的に結合した」とは、特定の標的物質と選択的に結合する受容体、捕捉剤などを介して起こらない結合機構を意味する。
【００２２】
本明細書で使用するとき、「特異的に結合した」とは、特定の標的物質と選択的に結合する受容体、捕捉剤、または同種のものを介しては起こる結合機構を意味する。
【００２３】
本明細書で使用するとき、「フィルム」とは、対立する主要な表面をもった部材を意味する。用語「フィルム」は、特定の幾何学的配置または形状に限定することを意図してはいない。例えば、本発明では、フィルムは、実質的に平面であってもよく、あるいは中実多角形もしくは中空多角形、球形、または矩形体の形で提供されてもよいと考えられる。用語「フィルム」と「膜」は、本明細書では同じ意味で用いられる。
【００２４】
前述のように、本発明は、容易に溶解するフィルムおよびそれを含む方法に関する。本発明により利用される溶解性フィルムは、本明細書に記載されている機能的な目的を達成する限り、任意の適切な組成を有することができる。本発明の容易に溶解するフィルムは、少なくとも部分的には既知の溶解する物質から形成することができる。例えば、容易に溶解することを特徴とする有機または無機の任意のポリマー材料または１または複数のそのような材料から誘導された材料を利用することができよう。そのような物質としては、低粘度ヒドロキシアルキルメチルセルロースまたはカルボキシメチルセルロース等のセルロース系またはセルロースから誘導された物質が挙げられる。その他の適当な材料としては、カルボン酸ヒドロキシアルキルエステルモノマーと、エトキシル化またはプロポキシル化ヒドロキシアルキル（メタ）アクリレートと、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、およびポリビニルアルコール（ＰＶＡ）の組合せが挙げられる。上記の物質のさまざまな量または組合せを含有する配合も考えられる。
【００２５】
上記の既知物質は、例えば、口臭消臭剤のための担体として使用される溶解性フィルムを作製するために利用される。そのようなフィルムの１種は、その全体の内容が参照により本明細書に組み込まれている特許文献１に記載されている。そこに記載されているフィルムは、低粘度のヒドロキシアルキルメチルセルロース、デンプンおよび着香料の組合せから一般に構成されている。本発明との関連で利用されるフィルムは、場合により、香味料、着色料、抗菌剤および口臭消臭剤などの成分を省いてもよい。
【００２６】
本発明との関連で使用するのが適切なフィルムは、当業者にはよく知られている技術、例えば、特許文献１に記載されている技術等によって作製することができる。適当な技術は、フィルムの構成要素を含有している溶液またはスラリーを形成する工程、その溶液またはスラリーを注型して乾燥し、フィルムを形成する工程を一般に含む。一旦乾燥したらフィルムはセグメントに切断することができる。別法では、フィルムは、連続的に注型し、ロール状に蓄積することができる。物質または成分をフィルムに組み込むための任意の技術は、あらゆる適当な技術によりフィルムを生産する工程、および表面塗装技術によって成分または物質をフィルム中に組み込む工程を含み得る。例えば、フィルムは、完全には乾燥または硬化していない状態であってよく、成分または物質を、次にその表面上に導入し、乾燥または硬化の方法を完了させる。得られたフィルムは、フィルムの表面上またはその近くに該成分を含む。この技術の修正も可能である。例えば、完全に乾燥または硬化したフィルムが出発材料を形成することができる。乾燥または硬化したフィルムを、次に、加熱または湿潤等の方法にかけ、表面を改質して成分または物質をより容易に受け入れられるようにすることができる。次いで、成分または物質を改質した表面に加え、フィルムを乾燥または冷却し、フィルムの表面でその中に組み込まれた成分または物質を含むフィルムを与えることができる。別法では、物質またはさらなる成分は、完全に乾燥または硬化したフィルムの表面に単純に塗布することができる。本発明の１種の利点は、フィルムから放出され、周囲の媒体中に導入される物質の量を、フィルム中に存在する物質の濃度および利用するフィルムの断片の大きさを調節することによって正確に制御できることである。
【００２７】
本発明との関連で利用されるフィルムは、場合によって香料を含むことができる。生物試料の分析等のある一定の方法において、芳香剤の包含は上記試料によってしばしば放たれる臭いを隠し、それによって作業環境を改善することができる。
【００２８】
溶解性フィルムと一緒に任意の適当な物質を使用または提供することができることが本発明により理解される。一実施形態によれば、フィルムは磁気反応性粒子と共に利用される。この実施形態においては、磁気反応性粒子は任意の適当な方法でフィルムから分離するかまたはフィルム中に導入することができる。例えば、上記のように、フィルムが、成型および乾燥の際に溶解性基質中に分散され捕捉された磁気反応性粒子を含むように、粒子はフィルムを形成する溶液またはスラリー中に導入することができる。別法では、粒子は、上記タイプの表面塗装技術のいずれかによってフィルム中に組み込むことができる。フィルムを溶解した際、磁気粒子は開放され、例えば、溶媒として作用する物質または混合物中に分散することができる。
【００２９】
磁気反応性粒子は、被覆または脱被覆、処理または脱処理することができ、および／またはいかなるタイプの表面改質を欠いてもよい。本発明の磁気反応性粒子は、標的物質に特定的にまたは非特定的に結合するように設計することができる。磁気反応性粒子は、標的物質に静電気引力等の任意の適当な機構によって結合させることができる。そのような結合技術は、例えば、全体の内容が参照により本明細書に組み込まれている特許文献２、および特許文献３に記載されている。
【００３０】
適当な磁気反応性粒子は、水性の環境で低い溶解性を有する水酸化第二鉄および四酸化三鉄等の形態の酸化鉄からなることができる。硫化鉄および塩化鉄等のその他の鉄粒子もまた標的物質への結合に適している。さらに、その粒子は、シリカを被覆した磁気反応性粒子からなることもできる。
【００３１】
該物質は、溶解剤またはタンパク質変性剤、非プロトン性溶媒、アルカリ化剤、あるいは中和緩衝液等の１または複数の試薬を含むことができる。その試薬（１または複数）は、液体または乾燥した形態のいずれかで利用することができる。該物質は、また、塩、金属、酵素、オリゴヌクレオチド、プライマー、追加の核酸、またはタンパク質等の１または複数の反応成分を含むことができる。典型的な塩としては、ＥＤＴＡ、塩化ナトリウムおよび塩化カリウムが挙げられる。金属の例としては、マグネシウム、マンガン、カルシウムその他の微量金属が挙げられる。さらに、該物質は、安定化成分または媒体成分を含むことができる。
【００３２】
該物質は、核酸その他の生物剤を、純化、抽出、増幅または検出するために使用する材料（磁気反応性粒子以外）を含むことができる。上記方法および物質は、例えば、全体の内容が参照により本明細書に組み込まれている特許文献４および特許文献５に記載されている。この関連で、該物質は、シリカ粒子、シリカ被覆粒子、シリカ被覆膜、シリカゲル、水和およびヒドロキシル化シリカ表面、ガラス粉末、ガラス繊維マット、ガラス膜、ゼオライト、セラミック、金属酸化物または金属塩を被覆したポリマー粒子等の核酸に可逆的に結合させるために使用する材料を含むことができる。
【００３３】
１または複数の物質の組合せを、容易に溶解するフィルムと一緒に利用することができることが、本発明により理解される。例えば、上記の物質の１または複数の組合せを利用することができる。
【００３４】
物質が微粒子の形態をしているとき、その粒子の形状は、本発明にとって重要ではない。その粒子は例えば、球形、立方体、楕円、カプセル型、錠剤型、特徴のないランダム形状などを含むさまざまな形状のものであってよく、均一な形状または不均一な形状であり得る。該粒子はまた任意の適当な大きさを有することができる。例えば、該粒子は、サブミクロンの寸法から数ミクロンの範囲の平均直径を有することができる。
【００３５】
本発明に関連して利用されるフィルムのさまざまな実施形態および特徴を説明してきたが、該フィルムを利用するさまざまな典型的な方法をこれから説明する。
【００３６】
本発明の第１の実施形態は、図１の１Ａ〜１Ｇに概略的に示されている。そこに示されているように、容器内に適当な開口部２０を含んでいてもよい容器１０を準備する。容器１０は、任意の適当な形状をとることができる。例示の実施形態によれば、容器１０は、一般に管の形状をしている。しかしながら、マイクロウェルもしくはマイクロウェルのアレイ、ビン、またはペトリ皿等のその他の構成も考えられる。物質３０は、最初に容器中に導入される（図１の１Ａ）。物質３０は、容易に溶解するフィルムと共に使用するための上記に特定したあらゆる材料の任意の適当な組成を有することができる。本発明の一実施形態によれば、物質３０は、上記説明に準じた組成および形態を有する磁気反応性粒子を含むことができる。物質３０を導入するために任意の適当な技術を利用することができる。例えば、物質３０は、手動または自動化ロボット装置により導入することができる。
【００３７】
容易に溶解するフィルム４０を、次に、容器１０の開口部２０の上に配置する（図１の１Ｂ）。フィルム４０は、例えば本明細書で先に説明した任意の組成および／または構造のあらゆる適当な組成および／または構成を有することができる。フィルム４０は、十分に長くて開口部２０にわたり、好ましくは、開口部２０の境界をはるかに越えて伸びるセグメントの形態をしていてもよい。あるいは、フィルム４０は、容器の開口部２０の上に供給されるようなフィルムの「連続した」ウェブまたはロールの形態をしていてもよい（図示されていない）。フィルム４０は、次いで任意の適当なメカニズムにより容器１０中に導入される（図１の１Ｃおよび１Ｄ）。一実施形態によれば、フィルム４０は、プランジャー／パンチ装置５０により容器中に導入される。
【００３８】
フィルム４０を容器１０内に配置する。フィルム４０は、容器１０内の任意の適切な場所に配置することができる。例示の実施形態によれば、フィルム４０は、物質３０の上に重なるように配置する。任意の適当なメカニズムまたは技術を、フィルム４０を容器１０内に位置付けるために利用することができる。例示の実施形態によれば、フィルム４０は、プランジャー／パンチ装置５０をＤ1として示されている長軸方向に移動させることによって容器中に押し下げる（図１の１Ｃおよび１Ｄ）。一旦フィルム４０が適切に置かれたら、プランジャー／パンチ装置５０は、反対の長軸方向Ｄ2にそのプランジャー／パンチ装置５０を引き出すことによって容器１０から引き出す（図１の１Ｅ）。フィルム４０を配置するためのその他の技術または機構も考えられる。例えば、フィルム４０を、適当な大きさを有する断片に切断し、任意で落とし口または漏斗を通して管内に重力送りをすることができる。フィルムは、また、管内に重力送りをする前に折りたたむこともできる。もう１つの別法では、フィルムを特定の寸法に切断し、次いで減圧または正の空気圧の１または複数の使用により管内に供給する。例えば、フィルムを管の上部で切断し、正の空気圧を用いてその切断したフィルムを管内に押し込む。あるいは、フィルムを管に対して離れた場所で切断し、減圧を用いる吸引装置を用いてフィルムを付着させ、管の開口部の近くにそれを移動させる。減圧を次いで逆転し、フィルムを正の空気圧で管内に押し込むことができる。
【００３９】
例示の実施形態に示されているように、フィルム４０は、物質３０が容器１０の底に実質的に閉じ込められ、それによって物質３０の転置を実質的に防ぎ、その結果、物質３０の容器１０の側壁に沿った望ましくない散乱を防ぐ形で物質３０の上に重なる（図１の１Ｅ）。
【００４０】
上記の実施形態との関連で、さらなる任意の工程を実施してもよい。例えば、材料または混合物６０を、また、容器１０の中に導入することができる（図１の１Ｆ）。材料または混合物６０は、第２物質７０を場合によって含む。材料または混合物６０は、第２物質７０に加えて他の物質を含んでもよいことが意図される。材料または混合物６０ならびに第２物質７０は、任意の適当な形態または組成を有することができる。一実施形態によれば、材料または混合物６０は、生物試料を含み、第２物質７０は、その構成要素、例えば、細胞、微生物、核酸、タンパク質、脂質または炭水化物を含む。材料または混合物６０は、溶媒として作用してフィルム４０を溶解する。材料または混合物６０は、それらと組み合わせた１または複数の添加試薬を場合によって含むことができる。フィルム４０が溶解したときに、容器１０の底に予め閉じ込めておいた物質３０は、自由となり、材料または混合物６０の中に分配され得る(図１の１Ｇ）。
【００４１】
上記方法の説明ならびに下記のさらなる方法の説明は、それらの方法が、本明細書に記載されている工程からなるかまたはもっぱらそれらに限定され得ること、本明細書に明確に記載されているものと別の工程を、記載されている方法に組み込むことができること、本明細書に記載されているさまざまな工程のサブコンビネーションを含む方法が実施できること、および本明細書に記載されているものと異なる順序で実施する工程を含む方法も実施できることが考えられることを理解して読むべきである。これらの変更のすべては本発明に包含される。
【００４２】
本発明の第２の実施形態は、図２の２Ａ〜２Ｇに概略的に示されている。一般的に言えば、この例示の本発明の実施形態は、前に記載した実施形態と実質的に類似している。したがって、上述した第１の実施形態との関連で上記した構成要素および工程は、以下の記述で特段にはっきりと指摘されていない限り、第２の実施形態にも同様にあてはまるべきである。図示されているように、好ましくは開口部２０を有する適当な容器１０を準備する。溶解性フィルム４０’を容器１０の開口部２０の上に重なるように位置付ける（図２の２Ｂ）。溶解性フィルム４０’は、以下の主要な差異はあるが、前記の溶解性フィルムと実質的には類似している。すなわち、溶解性フィルム４０’は、物質３０’がその中に組み込まれるように形成される。物質３０’は、物質３０と同じものであり得る。前記のように、この構成を有するフィルムは、任意の適当な技術によって形成することができる。例えば、物質３０’を含む溶解性フィルム４０’の構成要素を含むスラリー溶液を形成することができる。そのスラリーまたは溶液を注型して乾燥すると、溶解性基質中に捕捉されて閉じ込められた物質３０’を有する溶解性基質からなる溶解性フィルム４０’が提供される。別法では、物質３０は、前記の表面塗装技術のいずれかによってフィルム中に組み込むことができる。
【００４３】
溶解性フィルム４０’は、次に、容器１０の中の任意の適当な場所に、任意の適当なメカニズムまたは技術により導入し位置付ける。図示されているように、溶解性フィルム４０’は、長軸方向に移動できるプランジャー／パンチ装置５０により導入し位置付けることができる。プランジャー／パンチ装置５０は、第１の長軸方向Ｄ1に移動させる（図２の２Ｃおよび２Ｄ）。溶解性フィルム４０’を一旦容器１０内に適切に位置付けされたら、プランジャー／パンチ装置５０は、反対の長軸方向Ｄ2に移動させることにより引き出す（図２の２Ｅ）。フィルム４０’は、また、第１の実施形態との関連で、上記した別の技術のいずれかにより容器内に位置付けることができる。図２の２Ｅに示されているように、溶解性フィルム４０’を、容器１０の底に位置付け、それによってフィルム４０’の全体を、容器１０内に導入し得る追加の物質と確実に接触させる。
【００４４】
さらなる任意の工程を上記の方法と共に実施することができる。すなわち、最初の例示の実施形態との関連で説明したように、材料または混合物６０を、容器１０内に導入することができる（図２の２Ｆ）。材料または混合物６０は、その中に含有される第２物質７０を含んでいてもよい。材料または混合物６０は、また、１または複数の試薬を場合によって含むことができる。材料または混合物６０ならびに第２物質７０は、任意の適当な組成または形態を有することができる。１の任意の実施形態によれば、材料または混合物６０は、生物試料を含み、第２物質７０は、それの構成要素、例えば、細胞、微生物、核酸、タンパク質、脂質、または炭水化物を含む。材料または混合物６０は、溶媒として作用し、それによって、フィルム４０’の溶解性基質を分裂させて、物質３０'を放出する。一旦放出されると、物質３０’は、材料または混合物６０の中に分配することができる。
【００４５】
本発明の上記の原理は、多くの様々な科学的および産業的な場面に用いることができる。一般的に言って、本発明の原理は、さまざまな構成要素の正確な量の組合せが必要であるかまたは望ましいあらゆる装置および／または方法においても有用である。
【００４６】
本発明の原理の１つの可能性のある用途は、生物試料中に含まれている構成要素の単離および／または分離である。これに関連して、容器１０は、抽出管を含み、物質３０（または３０’）は、磁気反応性粒子を含み、材料または混合物６０は、場合により追加の薬剤または成分と組み合わせて生物試料を含み、その結果、混合物を形成しており、第２物質７０は、混合物６０の中に存在する構成要素、例えば、細胞、微生物、または核酸を含む。
【００４７】
図１の１Ａ〜１Ｇおよび図２の２Ａ〜２Ｇで示した実施形態の記述と関連付けて上記に開示した方法は、上記の単離または分離技術の初期段階として用いることができる。図３の３Ａ〜３Ｆは、例証となる単離および／または分離技術を行うために前記の工程と関連して実施することができるさらなる工程を概略的に示している。本発明の原理は、非常に多くのタイプの抽出および／または単離技術と共に使用することができ、以下に記載されている例示の実施形態に限定されるものとして見るべきではないことを理解すべきである。
【００４８】
上記のようにして形成され、例えば図１の１Ｇおよび図２の２Ｇに示されている物質３０（または３０’）および生物試料７０の標的構成要素を含む混合物６０は、磁気反応性粒子３０と構成要素７０とが共に結合し、それによって複合体を形成するように処理する（図３の３Ａ）。磁気粒子３０を構成要素と結合させるためには任意の適当な技術を利用することができる。そのような１の技術には、混合物６０のｐＨを変更し、それによって磁気粒子３０および／または構成要素７０の間の相互の吸引力がその２つを一緒に結合させるのに十分であるように磁気粒子３０および／または構成要素７０の表面誘引特性を改めることが含まれる。次いで、１または複数の磁石８０を、容器の１または複数の壁に密着して導入し、それによって上記の複合体を、磁石８０によって磁界に置かれている容器１０の壁（１または複数）に引き寄せる（図３の３Ｂ）。次いで、混合物６０の残りは、図３の３Ｂに示されているように容器から除去することができる。複合体は、次いで、１または複数の洗浄工程にかけることができる。一旦、残りが除去されると（図３の３Ｃ）、第２の材料または混合物９０を次に容器１０内に導入することができる。第２の材料または混合物９０は、磁気粒子３０と構成要素７０とを解離させる溶離液または混合物を含むことができる（図３の３Ｄ）。磁石８０を次に、図３の３Ｅに示されるように容器１０の１または複数の壁と密着した状態に戻すことができる。構成要素７０は、次いで、容器から除去し、さらなる任意の方法の工程を受けることができる（図３の３Ｅ〜３Ｆ）。
【００４９】
図３の３Ｆに示されている工程の後、構成要素７０は、標的の検体を検出しおよび／または定量するための技術等のさらなる方法を受けることができる。例えば、任意の適当な増幅の方法を本発明の方法において使用することができる。そのような方法としては、例えば、ポリメラーゼ連鎖反応（「ＰＣＲ］）、ストランド置換増幅反応（「ＳＤＡ」）、好熱性ストランド置換増幅反応（「ｔＳＤＡ」）、自立配列複製（Ｓｅｌｆ−Ｓｕｓｔａｉｎｅｄ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ）（「３ＳＲ」）、核酸配列を基礎とした増幅法（Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ−Ｂａｓｅｄ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ）（「ＮＡＳＢＡ」）、Ｑβレプリカーゼシステム；リガーゼ連鎖反応（「ＬＣＲ」）、および転写介在増幅法（Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ−Ｍｅｄｉａｔｅｄ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ）（ＴＭＡ）が挙げられる。
【００５０】
培養または増幅の後、アッセイを行うことができる。例えば、クラミジアトラコマチス（ＣＴ）、淋菌（ＧＣ）、レジオネラニューモフィラ、肺炎マイコプラズマ、クラミジア科、単純ヘルペスウイルス１型、単純ヘルペスウイルス２型、エンテロウイルス、ＨＩＶ、ＨＣＶ、ＨＢＶ、ＨＰＶ、ウエストナイルウイルス、Ａ型インフルエンザ菌、Ｂ型インフルエンザ菌、呼吸器合胞体ウイルス、メタニューモウイルス、非定型抗酸菌複合体の直、Ｂ群連鎖球菌、ＣＭＶの定性、ＣＭＶの定量、パラインフルエンザ１／２／３、アデノウイルス、レジオネラ原基、レジオネラミクダディ（Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌ  ｍｉｃｄａｄｅｉ）、百日咳菌、パラ百日咳菌（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ  ｐａｒａｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）、結核菌、結核菌培養確認、非定型抗酸菌複合体培養確認およびカンサシー菌（Ｍ．Ｋａｎｓａｓｉｉ）培養確認等、分析を行って病原体の存在を判断することができる。この分析を実施するための適切な技術としては、Ｂｅｃｔｏｎ，Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ  ａｎｄ  Ｃｏｍｐａｎｙ社により製造されたＢＤＰｒｏｂｅＴｅｃ（商標）製品に具体化されている技術が挙げられる。また、試料中に存在する核酸の遺伝子検査を行うこともできる。
【００５１】
上記の図１の１Ａ〜１Ｇ、図２の２Ａ〜２Ｇおよび図３の３Ａ〜３Ｆの工程ならびに上記の増幅技術は、手動、自動化方式または手動と自動化の組合せの工程で行うことができる。その自動化工程は、自動化したピペッティング、混合、および磁石位置合わせ機能を含んでいてもよい含む自動化ロボット装置により実施することができる。自動化ロボット装置は、コンピュータ制御することができる。例えば、本発明は、その内容がすべて参照により本明細書に組み込まれている特許文献６に記載されているタイプのシステムおよび方法と関連付けて利用することができる。
【００５２】
本発明の方法で役立つキットは、例えば、容器、第１物質および容易に溶解するフィルムを含む本明細書に既に記載した成分の少なくともいくつかを含む。１種の実施形態においては、容易に溶解するフィルムは、第１物質を包含する。さらなる実施形態においては、第１物質と容易に溶解するフィルムは別々である。キットは、本明細書で前述した以下の成分；試薬、反応成分、安定化成分、媒体成分、磁気反応性粒子、および核酸を可逆的に結び付ける材料、の１または複数を場合によって含有することができる。場合によって上記キットには、製品の製造、使用または販売を統制する政府機関による所定の形式の通告が伴うことがあり得、その通告には、行政管理のための製造、使用または販売に対する政府機関による認可が示されている。そのパックまたはキットは、１回の使用単位の成分のものであるかまたはそれは複数回使用のものであり得る。
【００５３】
（実施例）
本発明の原理をこれから以下の説明のためであって非限定の実施例を参照しながら記述する。
【実施例１】
【００５４】
標的検体を検出する方法に溶解性フィルムを組み込むことの実施可能性を判断するために実験を行った。特にクラミジアトラコマチス（ＣＴ）または淋菌（ＧＣ）についてのアッセイを下記のようにして行い、溶解性フィルムを当該方法に包含させることの効果の解析を行った。
【００５５】
以下の手法により抽出管の形態をした容器に鉄粒子の形態の磁気反応性粒子を供給した：（１）約８ｍｇの磁気反応性粒子を複数の抽出管に手で分配し（対照として）、（２）約８ｍｇの磁気反応性粒子を複数の抽出管に手動のピペットで取り、次いで以下の市販品から得た溶解性フィルム：（ａ）Ｌｉｓｔｅｒｉｎｅ  Ｃｏｏｌ  Ｍｉｎｔ（登録商標）細片、（ｂ）Ｌｉｓｔｅｒｉｎｅ  Ｆｒｅｓｈ  Ｂｕｒｓｔ（登録商標）細片、（ｃ）Ｌｉｓｔｅｒｉｎｅ  Ｃｉｎｎａｍｏｎ（登録商標）細片の形態の溶解性フィルムで覆い、（３）溶解性カルボキシメチルセルロース材料から形成された溶解性フィルムに酸化鉄粒子を充填した。フィルム中に存在する酸化鉄粒子の密度は、約８．８９ｍｇ／１．５ｃｍ2である。この充填フィルムを次にパンチ／プランジャー型装置のついた抽出管内に導入した。
【００５６】
水酸化カリウム（ＫＯＨ）の溶液を、磁気反応性粒子を含有する各抽出管に分配した。ｐＨの高いＫＯＨ溶液は、自動化ロボット装置、すなわち、ＢＤバイパー（Ｖｉｐｅｒ）（商標）自動化抽出装置により分配した。
【００５７】
次に、尿の試料を同じく自動化ロボット装置により抽出管に分配した。その尿試料は、２５０ＣＴ  Ｅｂｓ〜２５０ＧＣパーツ／ｍｌのレベルにスパイクし、高いｐＨの溶液と混合して試料中に含まれている目的の有機体（１または複数）を溶解し、それによって核酸を放出させた。低いｐＨの第２の溶液をその試料に加え、放出された核酸を磁気反応性粒子に結び付けた。この溶液は、硫酸を含んでいた。
【００５８】
抽出管の内容物に磁界を適用した。自動化ロボット装置により、一対の対向する磁石を管の外側に密着するように持ってゆき、それによって複合体を管内部の周辺に引き寄せた。自動化ロボット装置は、次に、複合体を管内に残して管の内容物を吸引し、磁界を容器から取り除いた。
【００５９】
その複合体を、次に０．０１％のＴｗｅｅｎ（登録商標）２０を含む１ｍＭ濃度の溶液で洗浄した。洗浄後、磁界を再びかけて管内部周辺に複合体を引き寄せ、洗浄液を管から吸引した。
【００６０】
次に溶離緩衝液を抽出管に加え、混合して複合体から核酸を溶離した。その溶離緩衝液は、ＫＯＨとビシン（Ｂｉｃｉｎｅ）の組合せに基づく混合物を含んでいた。その溶離バッファーは、自動化ロボット装置により加え、混合した。次に、溶離された試料の核酸を分離し、次いでストランド置換増幅反応法（ＳＤＡ法）を行った。
【００６１】
検体の特異的結合部分をオリゴヌクレオチド部分に結合し、上記の溶離バッファーと混合した。標的を含有する溶離バッファーを、ＳＤＡプライマーＣＴｐＢ４．Ｓ２．３、ＣＴｐＢ４．Ｓ１．３、またはＧＣＩＮＴ３．ＡＰＲ１、ＧＣＩＮＴ３．ＡＰＬ２、アダプターＩＣＡｄｐｔ．ｌ０、ＧＣＩＮＴ３．Ｒ２、またはＣＴＡｄｐｔ−Ｆ５、バンパーＧＣＩＮＴ３．ＢＲ３、ＧＣＩＮＴ３．ＢＬ２、またはＣＴｐＢ４．Ｂ６、ＣＴｐＢ４．Ｂ７およびレポータープローブＭＰＣ−ＤＲ、ＭＰＣ３．ＦＤ、またはＭＰＣ−ＦＤを含有するプライミングマイクロウェルに加えた。室温で２０分後、その混合物を、次に７２〜７３℃に１０分間加熱した。１００μｌのその混合物を次に５３．５〜５４．５℃の増幅ウェルに加えた。具体的には、市販のＢＤＰｒｏｂｅＴｅｃ（商標）増幅ウェルを使用した。
【００６２】
ＢｓｏＢ１制限エンドヌクレアーゼおよびＢｓｔ  ＤＮＡポリメラーゼをその増幅ウェルに加え、等温増幅を５１．２〜５２．８℃で６０分間行った。増幅方法は、レポータープローブの変化に伴う蛍光の増加を検出するＢＤＰｒｏｂｅＴｅｃ（商標）の読み取り機で監視した。その読み取り機は、増幅方法の間、上記の蛍光の検出に基づいてＭＯＴＡ値を生み出す。上記の試料に対してもたらされたＭＯＴＡ値を、以下の表Ｉおよび表ＩＩに記載する。
【００６３】
【表１】
0005449671.tif 000002
【００６４】
【表２】
0005449671.tif 000003
【００６５】
上記のアッセイの場合には、２，０００を超えるＭＯＴＡ値が、ＣＴまたはＧＣの標的に対して陽性の結果を示すと考えられる。これらの基準を念頭に置くと、上記のデータは、溶解性フィルムの当該方法への包含により、アッセイ中に標的の存在の陽性表示を得る際に標的配列の抽出または増幅が顕著には阻害されなかったことを示している。
【実施例２】
【００６６】
ＲＮＡ標的、すなわちＳＡＲＳ  Ｃｏ−Ｖ標的配列を増幅および検出する方法に溶解性フィルムを組み込むことの実施可能性を判断するために、下記のようにして実験を行った。
【００６７】
ＳＡＲＳ  Ｃｏ−Ｖの陽性対照管を、ＲＴ−ＳＤＡアッセイに対する標的として使用した。ＳＡＲＳ  Ｃｏ−Ｖの陽性対照管は、ＳＡＲ  Ｃｏ−Ｖの陽性対照ＲＮＡ転写物、酵母ＲＮＡ、およびＲＮアーゼ阻害剤を包含した。酵母ＲＮＡ、およびＲＮアーゼ阻害剤を包含している陰性のＳＡＲＳ  Ｃｏ−Ｖの対照も用いた。各ＳＡＲＳ  Ｃｏ−Ｖの対照管を、ヌクレアーゼを含まない９５０μｌの水で再水和し、ボルテックスした。
【００６８】
ワーキングストックのＲＴバッファーを、主要成分のヌクレアーゼを含まない水、ＲＮアーゼ阻害剤、ＳＡＲＳ  Ｃｏ−Ｖ内部増幅対照、逆転写酵素、ＫＯＨおよびビシンを混合することによって調製した。
【００６９】
この実験で用いた溶解性フィルムは、透明なカルボキシメチルセルロース（酸化鉄なし）である。そのフィルムを異なる大きさのセグメントに切断し、ヌクレオチドｄＣｓＴＰ、ｄＡＴＰ、ｄＧＴＰ、ｄＴＴＰ、ＳＤＡプライマーＳＡＲＳｒｐＣ、ＳＡＲｆｐＣ、アダプターＳＡＲＳｉａｃａｄＣ、ＳＡＲＳｍｐｃａｄＣ、バンパーＳＡＲＳＣｒｔＢ２４、およびレポータープローブＭＰＣ−ＤＲおよびＭＰＣ２．ＦＤを含有するＳＡＲＳ  Ｃｏ−Ｖ  ＲＴプライミングマイクロウェル中に配置した。
【００７０】
陽性または陰性の対照およびワーキングストックのＲＴバッファーを、それぞれのＳＡＲＳ  Ｃｏ−Ｖ  ＲＴプライミングマイクロウェルごとに加えた。そのＳＡＲＳ  Ｃｏ−Ｖ  ＲＴプライミングマイクロウェルを４８℃で２０分間加熱した後、主としてビシンおよびＫＯＨからなる第２のバッファーを各反応系に加えた。そのＳＡＲＳ  Ｃｏ−Ｖ  ＲＴプライミングマイクロウェルを、次に７２〜７３℃に１０分間加熱した。１００μｌのその混合物を次に５３．５〜５４．５℃の増幅ウェルに加えた。
【００７１】
ＢｓｏＢ１制限エンドヌクレアーゼおよびＢｓｔ  ＤＮＡポリメラーゼをその増幅ウェルに加え、等温増幅を５１．２〜５２．８℃で６０分間行った。増幅方法は、レポータープローブの変化に伴う蛍光の増加を検出するＢＤＰｒｏｂｅＴｅｃ（商標）読み取り機で監視した。その読み取り機は、増幅方法中の上記の蛍光の検出に基づいてＭＯＴＡ値を生み出す。これらの値は、増幅の開始から３〜７分後に測定を開始する。上記の試料に対してもたらされたＭＯＴＡ値を、以下の表ＩＩＩに記載する。
【００７２】
【表３】
0005449671.tif 000004
【００７３】
上記のデータは、ＲＴ−ＳＤＡ反応への溶解性フィルムの包含により、アッセイ中に標的の存在の陽性表示を得る際に標的配列のＲＮＡのＤＮＡへの逆転写または増幅が阻害されなかったことを示している。
【実施例３】
【００７４】
下記のようにして実施されるＰＣＲ増幅法の中に溶解性フィルムを包含させることの実施可能性を判断するために実験を行った。ＰＣＲ法に対する鋳型としてプラスミドコンストラクトｐＵＣ１９−トリコモナスバジナリス（Ｔ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ）を用いた。
【００７５】
実験で用いたフィルムは、カルボキシメチルセルロースであった。フィルムをさまざまな大きさのセグメントに切断し、次いでＰＣＲサーモウェル管中に配置し、以下に示すラベル付けをした。
【００７６】
一連のＰＣＲ管を、表ＩＶに示す以下の反応を実施するために用意した。
【００７７】
【表４】
0005449671.tif 000005
【００７８】
１回のＰＣＲ反応の溶液を調製して、各管に加えた。その溶液は、表Ｖの組成に従って調製した。
【００７９】
【表５】
0005449671.tif 000006
【００８０】
１回の溶液の９８．８８μＬのアリコートを、８個の反応管のそれぞれに導入した。ＴＶ１の１．１２μＬ分量を、管１、４、５、６、７および８に加え、１．１２μＬの水を管２および３のそれぞれに加えた。その管を、次に、ＭＪ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｐｅｌｔｉｅｒ  Ｔｈｅｒｍａｌ  Ｃｙｃｌｅｒ（モデルＰＴＣ−２００）中に入れ、表ＶＩに詳しく記されている条件下で培養した。
【００８１】
【表６】
0005449671.tif 000007
【００８２】
ＰＣＲ反応生成物のゲル解析を次に実施し、ＰＣＲ増幅方法の結果を評価した。これに関連して、１％アガロースゲルを調製した。臭化エチジウムを加えて０．５μｇ／ｍＬの最終濃度にした（５ｍｇ／ｍＬのストックの場合、１００ｍＬのアガロース混合物中に１０μｇ）。表ＶＩＩに示したスケジュールに従って４０ｍｌ量のゲルを注ぎ、９０Ｖで１時間、１×ＴＢＥ中で運転した。
【００８３】
【表７】
0005449671.tif 000008
【００８４】
ゲル実験の結果は、図４に示されていてＰＣＲ法が成功したことを指し示しており、それによって溶解性フィルムの存在が、阻害物質として作用しなかったことまたはＰＣＲ法を中断させなかったことを示している。図４に示されているように、３０ｍｍ2までの大きさの溶解性フィルムの存在は、ＰＣＲ法を阻害しない。
【実施例４】
【００８５】
ＤＮＡ標的、すなわちクラミジアトラコマチス（ＣＴ）または淋菌（ＧＣ）の標的配列を増幅および検出する方法に溶解性フィルムを組み込むことの実施可能性を判断するために下記のようにして実験を行った。
【００８６】
ＣＴ／ＧＣ  Ｄｉｐｌｅｘ  ＳＤＡアッセイに対する標的としてはＣＴ／ＧＣ陽性対照管を用いた。ＣＴ／ＧＣ陽性対照管は、ＣＴ／ＧＣ陽性対照プラスミド、サケ精子のＤＮＡ、およびドライダウンした対照希釈剤を含んだ。ＣＴ／ＧＣ陰性対照管も、サケ精子のＤＮＡ、およびドライダウンした対照希釈剤を含むものを用いた。各ＣＴ／ＧＣ対照管は、２ｍｌの試料希釈剤により再水和し、ボルテックスした。
【００８７】
すべての対照管を１１４℃で３０分間加熱溶解した。各対照管は、次いでテスト前の少なくとも１５分間、放冷した。
【００８８】
この実験で用いた溶解性フィルムは、透明なカルボキシメチルセルロース（酸化鉄なし）である。そのフィルムを異なる大きさのセグメントに切断し、ＳＤＡプライマーＣＴｐＢ４．Ｓ２．３、ＣＴｐＢ４．Ｓ１．３、またはＧＣＩＮＴ３．ＡＰＲｌ、ＧＣＩＮＴ３．ＡＰＬ２、アダプターＩＣＡｄｐｔ．１０、ＧＣＩＮＴ３．Ｒ２、またはＣＴＡｄｐｔ−Ｆ５、バンパーＧＣＩＮＴ３．ＢＲ３、ＧＣＩＮＴ３．ＢＬ２、ＣＴｐＢ４．ＢまたはＣＴｐＢ４．Ｂ７およびレポータープローブＭＰＣ−ＤＲ、ＭＰＣ３．ＦＤ、またはＭＰＣ−ＦＤを含有するＣＴ／ＧＣプライミングマイクロウェル中に配置した。
【００８９】
陽性および陰性対照をそれぞれのＣＴ／ＧＣプライミングマイクロウェルごとに加えた。そのＣＴ／ＧＣプライミングマイクロウェルを、次いで７２〜７３℃に１０分間加熱した。その混合物の１００μｌを、次に５３．５〜５４．５℃のＣＴ／ＧＣ増幅マイクロウェルに加えた。
【００９０】
その増幅マイクロウェルを、次にＢＤ  ＰｒｏｂｅＴｅｃ（商標）モデル１３３４読み取り機に加え、そこで５１．２〜５２．８℃で６０分間、等温増幅反応を行った。増幅方法は、探知したレポーターの変換に伴う蛍光の増加を観察することによって監視された。その読み取り機は、増幅方法中の上記の基準値の検出に基づいてＭＯＴＡ値を生み出す。これらの値は、増幅を開始してから３〜７分後に測定を開始する。上記の試料に対してもたらされたＭＯＴＡ値を、以下の表ＶＩＩＩ（ＣＴ）および表ＩＸ（ＧＣ）に記載する。
【００９１】
【表８】
0005449671.tif 000009
【００９２】
【表９】
0005449671.tif 000010
【００９３】
上に示されているデータは、溶解性フィルムを直接Ｄｉｐｌｅｘ  ＳＤＡ反応で使用することの実施可能性を明らかにしている。ＳＤＡ増幅マイクロウェル中にフィルムを直接挿入しても反応は阻害されない。
【実施例５】
【００９４】
溶解性フィルムが抽出処置を妨害するかどうかを判定するために実験を行った。抽出対照（ＥＣ）は、抽出混合物を含む標識オリゴヌクレオチドである。抽出方法が成功するかどうかを判定するためにその標識の蛍光を監視する。２つの溶解性フィルム（酸化鉄を含有する）および２種類の酸化鉄粒子について、抽出方法におけるそれらの効果があるか否かの測定するテストをした。
【００９５】
磁気反応性粒子を含む抽出管の形態の容器を以下の方法により準備した。（１）約９ｍｇの鉄粒子（粒子試料Ａまたは粒子試料Ｂ）を抽出管内に分配するか、または（２）溶解性フィルム（フィルム試料Ａまたはフィルム試料Ｂ）に９．９ｍｇ／１．７７ｃｍ2の濃度で鉄粒子を充填した。陽性対照管には、蛍光標識した抽出対照のオリゴヌクレオチドを含ませ、一方、陰性対照には、抽出対照を含有させなかった。抽出方法のその他は実施例１で記載したようにして完了させた。標識されたＥＣオリゴヌクレオチドの蛍光を次に測定し、抽出が成功したかどうかを判定した。試料に対して増幅工程は実施しなかった。
【００９６】
抽出の結果を、表Ｘ（ＣＴ）およびＸＩ（ＧＣ）に示す。これらの表は、陽性の結果に対して０．５の値を用いるＥＣ測定基準を表示している。０．５より低い値は、陰性の結果としてみなす。
【００９７】
【表１０】
0005449671.tif 000011
【００９８】
【表１１】
0005449671.tif 000012
【００９９】
データを、溶解性フィルムに埋め込むか遊離した鉄粒子のどちらの場合においても、鉄粒子が組み込まれた抽出対照を抽出する能力に対して悪影響はないことを示している。すべての溶解性フィルム試料に対して陽性の平均値（０．７および０．８）が記録されたことは、抽出方法がうまくいくことを示している。
【実施例６】
【０１００】
異なる種類の試料中の標的検体を検出する方法に溶解性フィルムを組み込むことの実現可能性を判断するために実験を行った。特に、ＣＴまたはＧＣに対するアッセイを下記のようにして行った。溶解性フィルムの影響の解析を行った。
【０１０１】
本アッセイにおいては４種類の試料、尿、試料希釈剤、臨床尿、膣スワブを用いた。「尿」試料は、健康なドナーから採取した組織内試料プールである。「試料希釈剤」とは、スワブを発現する対照管ならびに基質を再水和するために使用する現下のＢＤ  ＰｒｏｂｅＴｅｃ（商標）試料バッファーを指す。「臨床尿」とは、健康状態または病気の診断を受けた人から得た尿検体を指す。抽出管に、酸化鉄粒子をそれぞれ９．７ｍｇ／１．７７ｃｍ2および１０．６ｍｇ／ｃｍ2の濃度で充填した２種類の溶解性フィルム（試料フィルムＡおよび試料フィルムＢ）のうちの１の形態で磁気反応性粒子を供給した。試料は、実施例１に記したようにして抽出および増幅をした。上記の試料に対して生じたＭＯＴＡ値を、以下の表ＸＩＩおよびＸＩＩＩに記す。
【０１０２】
【表１２】
0005449671.tif 000013
【０１０３】
【表１３】
0005449671.tif 000014
【０１０４】
上記のデータは、いずれの種類の溶解性フィルムを包含しても、標的配列の抽出または増幅を顕著に阻害することは４つの試料の種類のいずれにおいてもなかったことを示している。
【実施例７】
【０１０５】
鉄粉末または溶解性フィルムの形態の磁気反応性粒子が、標的検体を検出する方法において妨害するかどうかを判断するために実験を行った。実験は、ＳＤＡモノプレックス系およびダイプレックス系の両方の溶解性フィルムの影響を評価した。特に下記のようにして、試料希釈剤および尿プール試料を用いるＣＴに対するアッセイを行った。
【０１０６】
モノプレックスアッセイにおいては、標的のリアルタイム蛍光エネルギー伝達の検出のために万能型検出プローブを用いた。ダイプレックスアッセイは、その検出プローブに加えて内部増幅対照（ＩＡＣ）を用いる。このＩＡＣは、ＳＤＡ反応の阻害物質を含有することもあり得る試料を識別するために標的ＤＮＡと一緒に増幅させた。
【０１０７】
本実施例においては、抽出管に、遊離型の鉄粉末または鉄粒子を約９．０ｍｇ／１．７７ｃｍ2の濃度で充填した溶解性フィルムの形態の鉄粒子を供給した。その試料は、実施例１で前掲したようにして抽出および増幅をした。結果を表ＸＩＶおよびＸＶに示す。これらの表は、「ＰＡＴ」値を示している。「ＰＡＴ」とは、閾値後のパス（Ｐａｓｓｅｓ  Ａｆｔｅｒ  Ｔｈｒｅｓｈｏｌｄ）、すなわち陽性試料を判断するのに使用するアルゴリズムを指す。信号は予め定められた閾値に調節されるが、そのとき、ＢＤ  ＰｒｏｂｅＴｅｃ（商標）が実行するパスの数を差し引きする。より高い最終のＰＡＴ値は、試料が、より低い値の試料よりも速い速度で陽性の結果をもたらす閾値に到達したことを示す。ゼロに等しいＰＡＴは、陰性と考えられる。したがって、ゼロより大きい値は、陽性の結果を示す。
【０１０８】
【表１４】
0005449671.tif 000015
【０１０９】
【表１５】
0005449671.tif 000016
【０１１０】
表ＸＩＶおよびＸＶに示したデータは、溶解性フィルムが、遊離型の粉末と同様にモノプレックスアッセイおよびダイプレックスアッセイの両方で機能したことを示している。陽性のＰＡＴ値は、両方のアッセイにおいて標的の増幅が成功することを示している。
【実施例８】
【０１１１】
酸化鉄を組み込んだ溶解性フィルムの溶解を確実にするＢＤ  Ｖｉｐｅｒ（商標）自動抽出装置の最適な混合パラメータを決定するために実験を行った。この実験は、鉄粒子によって結合および捕捉されるのに十分な時間を標的ＤＮＡに与える。この実験により、ＢＤ  Ｖｉｐｅｒ（商標）器具についての多数の混合パラメータを評価した。
【０１１２】
本実験についての抽出手順は、実施例１で記載したのと同じものに以下の修正を付け足したものである。表ＸＶＩに記載の８個の異なる試料の条件をテストした。各条件用に６つの二重管を準備した。抽出管には、鉄粒子を９．８ｍｇ／１．７７ｃｍ2の濃度で含有する溶解性フィルムを供給した。次に、試料希釈剤を抽出管に加え、特定の容積およびスピードで混合した。この実験は、このＢＤ  Ｖｉｐｅｒ（商標）プログラム中の２０秒の中断を削除して行った。対照の抽出管は、ＫＯＨにさらし、５回混合した。その管を次に溶解させるために２０秒間インキュベートした。インキュベート後に、３．７５Ｍの硫酸および抽出対照を含有する結合酸混合物との１の混合工程を続けた。その後の試験条件においては、ＫＯＨの混合および溶解のための中断は取り除いた。混合スピードおよび混合の繰返しの数もまた表ＸＶＩに示したように変化させた。ＢＤ  Ｖｉｐｅｒ（商標）器具の試料チップ内の流動体の色を視覚的に記録した。酸化鉄粉末は黒であり、試料希釈剤は透明である。それ故、試料チップの流動体が完全に黒のときは完全な混合を示し、容認することができる混合結果が得られたことになる。チップ内で得られた色を、次のようにランク付けした：（０）＝劣る、（１）＝中程度、（２）＝良好、（３）＝非常に良好
【０１１３】
【表１６】
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【０１１４】
上の実験により、条件＃８（４３８μｌの混合容積で１５回の混合回数の後、７００μｌの混合容積で１０回の混合回数）が溶解性フィルムの完全な溶解に対して理想的であるものと判定した。この条件は、目視検査で「非常に良好」の結果を与えた。
【実施例９】
【０１１５】
実施例８で記載した最適化パラメータをテストするために実験を行った。特に、下記のようにＣＴアッセイを行った。
【０１１６】
抽出管に、鉄粉末（試料粉末Ａまたは試料粉末Ｂ）または鉄粒子を充填した溶解性フィルムのいずれかを供給した。その抽出管に膣スワブを加えた。その試料を実施例８で概説したように混合し（４３８μｌの混合容積で１５回の混合回数の後、７００μｌの混合容積で１０回の混合回数）、実施例１で記載したようにして増幅した。結果を表ＸＶＩＩに示し、ＰＡＣスコアとして表示した。
【０１１７】
【表１７】
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【０１１８】
上のデータは、実施例８で決定した最適化混合パラメータにより、標的およびＩＡＣの両方に対して陽性（＞０）のＰＡＴスコアが示されているように、抽出および増幅反応の成功がもたらされたことを示している。
【実施例１０】
【０１１９】
１カ月にわたるさまざまな温度における溶解性フィルムの安定性をテストするために実験を行った。フィルムを３つの一貫した温度範囲（２〜８℃、１５℃および３３℃）のうちの１種で１カ月間保存した。試薬を貯蔵庫から取り出し、周囲温度で抽出／増幅反応をテストした。表ＸＶＩＩＩ〜ＸＸＩＩＩは、各温度範囲で貯蔵した試薬について行ったＣＴおよびＧＣアッセイの結果を示す。実験は、実施例１で前記したようにして行った。陽性（標的）の値は、増幅したＣＴ標的を示す。陰性（ＩＡＣ）の値は、内部増幅対照の蛍光を示す。データは、ＰＡＴスコアとして記録されている。
【０１２０】
【表１８】
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【０１２１】
【表１９】
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【０１２２】
【表２０】
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【０１２３】
【表２１】
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【０１２４】
【表２２】
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【０１２５】
【表２３】
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【０１２６】
表ＸＶＩＩＩからＸＸＩＩＩに含まれているデータは、溶解性フィルムの２〜８℃、１５℃および３３℃での１カ月の保存後の増幅反応が成功したことを示している。
【図面の簡単な説明】
【０１２７】
【図１】本発明の第１の態様の原理による方法および装置の略図である。
【図２】本発明の第２の態様の原理による方法および装置の略図である。
【図３】本発明の原理の遂行により実施可能なさらなる方法および装置の略図である。
【図４】本発明の一態様により実施したＰＣＲ法の結果の画像である。
【符号の説明】
【０１２８】
１０  容器
２０  開口部
３０、３０’  物質
４０、４０’  フィルム
６０  材料または混合物
７０  第２物質
８０  磁石
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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