(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヒトＤＬＬ４に特異的に結合可能な抗体であって、
（ａ）アミノ酸配列ＲＡＳＳＳＶＳＦＭＨ（配列番号６）を含む軽鎖ＣＤＲ１；
（ｂ）アミノ酸配列ＡＴＳＮＬＴＳ（配列番号７）を含む軽鎖ＣＤＲ２；
（ｃ）アミノ酸配列ＱＱＷＳＳＮＰＦＴ（配列番号８）を含む軽鎖ＣＤＲ３；
（ｄ）アミノ酸配列ＳＹＶＭＨ（配列番号３）を含む重鎖ＣＤＲ１；
（ｅ）アミノ酸配列ＹＩＩＰＹＮＤＧＴＫＹＮＥＫＦＫＧ（配列番号４）を含む重鎖ＣＤＲ２；および
（ｆ）アミノ酸配列ＳＥＤＹＤＨＦＤＹ（配列番号５）を含む重鎖ＣＤＲ３；
を含む抗体。
【請求項２】
前記抗体が、配列番号１のアミノ酸配列を有するＶHドメイン、および／または配列番号２のアミノ酸配列を有するＶLドメインを含む請求項１に記載の抗体。
【請求項３】
前記抗体が、１つまたはそれ以上の、配列番号９、１０、１１、１２、１３、１４、１５もしくは１６にて開示されたフレームワーク領域を含む請求項１または２に記載の抗体。
【請求項４】
前記抗体が、ヒトＣＨ１重鎖定常ドメインおよびヒトκ軽鎖定常ドメインを含むキメラ化抗体である請求項１〜３の何れか一項に記載の抗体。
【請求項５】
前記抗体が、ＤＬＬ４の機能を阻害するもしくは有意に低減する、または１つ以上のＤＬＬ４の天然リガンドおよび／またはレセプターとＤＬＬ４が相互作用することを阻止する、請求項１〜４の何れか一項に記載の抗体。
【請求項６】
請求項１〜５の何れか一項の抗体をコードする配列、または当該抗体をコードする配列の相補配列を含む核酸分子。
【請求項７】
前記核酸分子が、配列番号１７もしくは配列番号１８またはこれらの相補核酸配列にて規定された核酸分子を含む請求項６に記載の核酸分子。
【請求項８】
１またはそれ以上の、請求項６または７の核酸分子と、前記核酸分子にてコードされる蛋白質配列の転写および翻訳のための制御配列とを含む組換え型発現ベクター。
【請求項９】
請求項６または７の核酸分子、または請求項８の組換え型発現ベクターを含む宿主細胞。
【請求項１０】
請求項１〜５の何れか一項に記載の抗体と、
さらに、ポリペプチド配列または、生物学的に活性な分子もしくは医療関連の薬剤とを含む融合蛋白質または接合体。
【請求項１１】
前記ポリペプチド配列または、生物学的に活性な分子もしくは医療関連の薬剤が、細胞毒性ポリペプチド、放射性ヌクレオチド、サイトカイン、抗体分子、免疫グロブリン、ホルモン、成長因子、レクチン、インスリン、低密度リポ蛋白質、グルカゴン、エンドルフィン、トランスフェリン、ボンベシン、アシアロ糖蛋白質、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、赤血球凝集素（ＨＡ）、切断型ｍｙｃ、酵素、またはＴ細胞受容体シグナル系における構成因子から選択されるものである、請求項１０に記載の融合蛋白質または接合体。
【請求項１２】
ＤＬＬ４の異常なシグナリングおよび／または異常血管新生を特徴とする疾患または症状の治療または診断のための薬剤の製造における、請求項１〜５の何れか一項に記載の抗体、請求項１０もしくは１１の融合蛋白質もしくは接合体、請求項６もしくは７の核酸分子、または請求項８のベクターの使用。
【請求項１３】
前記疾患または症状が、アテローム性動脈硬化、関節炎、眼性血管新生、子宮内膜症、子宮筋腫、妊娠中毒症および癌から選択されるものである、請求項１２に記載の使用。
【請求項１４】
避妊時に使用するための組成物の製造における、請求項１〜５の何れか一項に記載の抗体、請求項１０もしくは１１の融合蛋白質もしくは接合体、請求項６もしくは７の核酸分子、または請求項８のベクターの使用。
【請求項１５】
ＤＬＬ４の水準および／または機能を調節するｉｎ ｖｉｔｒｏの方法であって、
請求項１〜５の何れか一項に記載の抗体、請求項１０もしくは１１に記載の融合蛋白質もしくは接合体、請求項６もしくは７に記載の核酸分子、または請求項８に記載のベクターが、組織試料、細胞培養液または細胞に投与されるｉｎ ｖｉｔｒｏの方法。
【請求項１６】
移植手術後における異常血管新生を低減または阻止するための薬剤の製造における、請求項１〜５の何れか一項に記載の抗体、請求項１０もしくは１１の融合蛋白質もしくは接合体、請求項６もしくは７の核酸分子、または請求項８のベクターの使用。
【請求項１７】
請求項１〜５の何れか一項に記載の抗体、請求項１０もしくは１１に記載の融合蛋白質もしくは接合体、請求項６もしくは７に記載の核酸分子、または請求項８に記載のベクターと、
薬理学的に許容できる、賦形剤、担体、希釈剤、緩衝剤または安定剤と
を含む組成物。
【請求項１８】
新規の結合蛋白質を形成するために、原型抗体のアミノ酸配列において、１以上のアミノ酸を付加、欠失、置換および／または挿入して、新規の抗体を形成すること、および
得られた新規の抗体のヒトＤＬＬ４への結合性を試験することを含む、ヒトＤＬＬ４に結合可能な抗体を産生する方法であって、
当該原型抗体は、請求項１〜５の何れか一項に記載の抗体である方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、抗血管新生の結合蛋白質およびその使用すべてに関する。特に、本発明はデルタ様リガンド４（delta-like ligand 4）（ＤＬＬ４）に特異的な抗体または抗体断片およびにそれらの使用に関する。
【背景技術】
【０００２】
血管新生 、すなわち既に存在する血管からの新規の血管形成は、胚発生、創傷治癒および生殖機能の間において、基本的な役割を有する複雑な工程である。健常な対象においては、血管新生は、高度に制御されており、必要ある場合に短時間活性化し、その後、完全に阻害される。血管新生の制御における破綻は、アテローム性動脈硬化、関節炎、眼性血管新生などの有害な結果および多くの疾病を招来し得、癌は典型的には継続的な血管新生を特徴とする。
【０００３】
充実性腫瘍の場合、栄養物および酸素を腫瘍細胞に輸送するための十分な血管系の構築が非常に重要である。充実性腫瘍細胞は、正常細胞に比べて、増殖のためにより血管新生に依存するものであり、この腫瘍は、血管新生できる場合に限り、進行的に増殖できる。
【０００４】
Ｎｏｔｃｈ経路は、細胞の運命決定、細胞分化、増殖、生存、アポトーシスを含めた様々な生物学的工程に関与する、進化的に保存された細胞内シグナリング経路である。Ｎｏｔｃｈ受容体は、血管新生において重要な役割を有するものと考えられている。４つの異なる哺乳類Ｎｏｔｃｈ受容体ならびに、デルタ様−１、デルタ様−４（ＤＬＬ４）、Ｊａｇｇｅｄ１およびＪａｇｇｅｄ２を含めたいくつかの異なるＮｏｔｃｈリガンドがある。
【０００５】
ＤＬＬ４は、約６８５アミノ酸の膜貫通型蛋白質であり、Ｎｏｔｃｈリガンドに特徴的な、８つのＥＧＦ様リピートおよびＤＳＬドメインを含有する細胞外領域を含む。ＤＬＬ４は、膜貫通ドメインおよびどのような触媒モチーフもなさそうな 細胞質側末端も有する。ヒトＤＬＬ４は、マウスＤＬＬ４と８７％の同一性を有している。また、ＤＬＬ４は、本技術分野では、「Ｄｌｌ４」とも称され、本明細書において「ＤＬＬ４」と「Ｄｌｌ４」とは同じ意味で使用される。
【０００６】
マウスＤＬＬ４をコードする遺伝子は配列決定されており、アクセッション番号ＮＭ＿０１９４５４にて寄託されている。この配列は、本明細書において、配列番号１９との名称を有する。相当する蛋白質の配列は、同一のアクセッション番号において見られ、本明細書においては配列番号２０との名称を有する。  ヒトＤＬＬ４をコードする遺伝子は配列決定されており、アクセッション番号ＮＭ＿０１９０７４にて寄託されている。この配列は、本明細書において、配列番号２１との名称を有する。相当する蛋白質の配列は、同一のアクセッション番号において見られ、本明細書において、配列番号２２との名称を有する。
【０００７】
ＤＬＬ４は、とりわけ、Ｎｏｔｃｈ１、Ｎｏｔｃｈ２、Ｎｏｔｃｈ３およびＮｏｔｃｈ４との名称を有する受容体と相互作用する。マウスにおいては、デルタ様リガンドのハプロ不全は、動脈発生および血管発生においての深刻な欠陥のために、胚性致死に至る。それゆえ、ＤＬＬ４は、血管新生において重要な役割を有するようである。
【０００８】
ＤＬＬ４の活性は、主に、遺伝子発現の水準（レベル）で制御されている。主な制御因子は、ホスホファチジルイノシトール３−キナーゼ／Ａｋｔ経路を介した血管上皮増殖因子（ＶＥＧＦ）である。
【０００９】
初期の上皮細胞におけるＤＬＬ４の生物学的機能および腎臓癌におけるＤＬＬ４の発現は、Ｐａｔｅｌらによって調査されている（Cancer Research 2005; 65:19, 8690-8697頁）。この調査者らは、ヒト腫瘍内でのＤＬＬ４発現の選択的な調節が、抗血管新生治療に十分な可能性があること示唆している。
【００１０】
おそらく、抗血管新生治療について、最も研究され、かつ最も発展した方法は、ＶＥＧＦ阻害である。ヒト型化されたモノクローナル抗体（ｍＡｂ）であるベバシズマブ（アバスチン）は、我々が知る限りでは、癌治療のための、唯一の抗血管新生の抗体の手法である（Presta L. G. “Humanization of an anti-vascular endothelial growth factor monoclonal antibody for the therapy of solid tumour and other disorder”. Cancer Res., 57: 4593-4599, 1997 および Ferrara N. “VEGF as a therapeutic target in cancer.” Oncology, 69: 11-16, 2005）。ベバシズマブは、マウスｍＡｂからヒトＶＥＧＦにも展開されており、抗血管新生活性および抗腫瘍活性を示す臨床前所見に基づいて、臨床上での発展のために選択されている（Borgstrom P. “Complete inhibition of angiogenesis and growth of microtumours by anti-vascular endothelial growth factor neutralizing antibody: Novel concepts of angiostatic therapy from intravital videomicroscopy.” Cancer Res., 56: 4032-4039, 1996）。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１１】
血管新生を、特に、癌治療の関係における血管新生を調節できるさらなる薬剤に対する要求が依然として残っている。
【課題を解決するための手段】
【００１２】
本発明者らは、ＢＡＬＢ／ｃマウスを、実施例の項において説明されるように、可溶性のある組換え型ヒトＤＬＬ４（ネイティブヒトＤＬＬ４の細胞外ドメインのセリン２７からプロリン５２４まで。R&D Systems, Inc. 614 McKinley Place NE, Minneapolis, MN  ５５４１３，米国、から入手。）で免疫することによって、ヒトＤＬＬ４に対する中和モノクローナル抗体（ｍＡｂｓ）３種類を作成した。
【００１３】
本発明者らは、前記抗体をクローン化し、配列決定の操作をして、さらに、上記抗体の軽鎖および重鎖における可変領域（ＶＨおよびＶＬ）、ならびに相補性決定領域（ＣＤＲ）１，２および３の配列を決定した。
【図面の簡単な説明】
【００１４】
本発明を、以下の図面に照らしながら、後述するような、限定するものではない実施例において、より詳細に説明する。
【図１】図１は、フローサイトメトリーによる、本発明にかかる新規抗ＤＬＬ４抗体の特性を示す。このフローサイトメトリーを用いて、マウスＤＬＬ４でトランスフェクトされたチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞（図１ａ）、偽トランスフェクトされた（mock-transfected）ＣＨＯ細胞（ヌルコントロール、図１ｂ）、またはヒトＤＬＬ４でトランスフェクトされたＣＨＯ細胞（図１ｃ）に対する新規抗体の結合性を分析した。
【００１５】
上記細胞を、ビオチン化された新規抗ＤＬＬ４抗体およびオチン化されたマウスＩｇＧ１とともにインキュベートしたが、このマウスＩｇＧ１はコントロールとして供されたものである。次いで、この細胞をＰＥラベル化されたストレプトアビジンとともにインキュベートした。太線のヒストグラムは抗ＤＬＬ４抗体でラベル化された細胞を示し、細線のヒストグラムはマウスＩｇＧ１でラベル化された細胞を示す。
【図２】図２は、フローサイトメトリーによる、本発明に係る新規抗ＤＬＬ４抗体の特性を示す。ヒトＤＬＬ４でトランスフェクトされたチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞を、コントロールマウスＩｇＧ１（細線のヒストグラム）または本発明の抗ＤＬＬ４抗体（太線のヒストグラム）とともに前培養し、Ｎｏｔｃｈ１−Ｆｃで染色し、次いで抗ヒトＩｇＧ１ｍＡＢおよびＰＥでラベル化されたストレプトアビジンで染色した。点線のヒストグラムは、ビオチン化された抗ヒトＩｇＧ１ｍＡＢおよびＰＥでラベル化されたストレプトアビジンによるバックグラウンド染色を示す。
【図３】図３は、本発明者らによって調製された抗ＤＬＬ４抗体の、腫瘍体積に対する効果を示すグラフである（実施例４参照）。ｙ軸は腫瘍体積をｍｍ３で示し、ｘ軸は時間を日数で示す。
【図４】図４は、実施例６のＮｏｔｃｈシグナリング分析の結果を要約したグラフである。ｙ軸はルミノメーターで測定された光単位を指す。当該光単位は、Ｎｏｔｃｈ依存的な遺伝子転写の間接的な測定値である。ｘ軸は、左から右にかけて、ａ）添加Ｄｌｌ４または添加抗ＤＬＬ４抗体の不存在下における、光（ルシフェラーゼ転写）の基底水準ｂ）添加ＤＬＬ４の不存在下における、ＳＴＬ４抗体の添加効果ｃ）添加Ｄｌｌ４の存在下における（抗体なし）、光（ルシフェラーゼ転写）の水準ｄ）添加Ｄｌｌ４の存在下における、ＳＴＬ４抗体の添加効果である。
【図５】図５は、実施例７のＨＵＶＥＣ遊走アッセイ の結果を要約したグラフである。遊走した細胞の個数はＹ軸に示され、Ｘ軸は左から右にかけてａ）５％仔牛血清（ＦＣＳ）ｂ）ＦＣＳなしｃ）およびｄ）ＦＣＳおよびＳＴＬ４ｅ）およびｆ）ＳＴＬ４との前培養 、次いでＦＣＳである。
【００１６】
すべての分析を通常酸素条件下での細胞（灰色バー）および低酸素条件下での細胞（黒色バー）を用いて実施した。
【図６】図６は、プラスミドベクターｐＣＡｃｃの概略地図である。
【図７】図７は、ＶＬおよびＣκ軽鎖が挿入されている プラスミドベクターｐＣＡｃｃ（本明細書にてｐＣＡｃｃＬとの名称を有する。）の概略地図である。
【図８】図８は、ＶＨおよびＣＨ１−Ｈ−ＣＨ２−ＣＨ２重鎖が挿入されているプラスミドベクターｐＣＡｃｃ（本明細書にてｐＣＡｃｃＨとの名称を有する。）の概略地図である。
【図９】図９は、ヒトＤＬＬ４でトランスフェクトされたチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞（図９ａ）または偽トランスフェクトされたＣＨＯ細胞（ヌルコントロール、図９ｂ）を用いたフローサイトメトリーによるｃＳＴＬ４の特性を示す。
【図１０】図１０は、固定化Ｄｌｌ４へのキメラ化抗ＤＬＬ４抗体の結合親和性を評価するために使用されたＢｉａｃｏｒｅ分析（実施例９）の結果を示す。
【発明を実施するための形態】
【００１７】
ヒトＤＬＬ４に特異的に結合可能な抗体分子のアミノ酸および／またはＤＮＡ配列と、それらのＶＨドメインおよびＶＬドメインならびにＣＤＲ、または、これらをコードするヌクレオチド配列とを、本明細書にて列挙された種々の配列番号において説明する。
【００１８】
一態様においては、本発明は、ヒトＤＬＬ４に結合可能な結合蛋白質を提供し、該結合蛋白質は、
アミノ酸配列ＲＡＳＳＳＶＳＦＭＨ（配列番号６）もしくはこの配列と実質的に相同な配列を含む、またはこれらの配列からなる軽鎖ＣＤＲ２を含む；および／または
アミノ酸配列ＡＴＳＮＬＴＳ（配列番号７）もしくはこの配列と実質的に相同な配列を含む、またはこれらの配列からなる軽鎖ＣＤＲ２を含む；および／または
アミノ酸配列ＱＱＷＳＳＮＰＦＴ（配列番号８）もしくはこの配列と実質的に相同な配列を含む、またはこれらの配列からなる軽鎖ＣＤＲ３を含む；および／または
アミノ酸配列ＳＹＶＭＨ（配列番号３）もしくはこの配列と実質的に相同な配列を含む、またはこれらの配列からなる重鎖ＣＤＲ１を含む；および／または
アミノ酸配列ＹＩＩＰＹＮＤＧＴＫＹＮＥＫＦＫＧ（配列番号４）もしくはこの配列と実質的に相同な配列を含む、またはこれらの配列からなる重鎖ＣＤＲ２を含む；および／または
アミノ酸配列ＳＥＤＹＤＨＦＤＹ（配列番号５）もしくはこの配列と実質的に相同な配列を含む、またはこれらの配列からなる重鎖ＣＤＲ３を含む。
【００１９】
「軽鎖ＣＤＲ」および「重鎖ＣＤＲ」との用語は、本明細書においては、学術用語としての目的で使用されているのであって、結合蛋白質が、限定的な軽鎖および／または重鎖を有する旨や、あるいは重鎖または軽鎖において、これらの識別可能な部分が存在している場合、特定のＣＤＲが見られる旨を意味するものではない。
【００２０】
好適な結合蛋白質は、２つまたはそれよりも多い、本発明の軽鎖ＣＤＲ、または上述したようなこの配列と実質的に相同な配列を含む。特に好適な結合分子は、３つの、本発明の軽鎖ＣＤＲ、または上述したようなこの配列と実質的に相同な配列（すなわち、軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３のそれぞれの１つの配列）を含む。
【００２１】
その他の好適な結合蛋白質は、２つまたはそれよりも多い、本発明の重鎖ＣＤＲ、または上述したようなこの配列と実質的に相同な配列を含む。特に好適な結合分子は、３つの、本発明の軽鎖ＣＤＲ、または上述したような（すなわち、重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３の何れかの１つ）、この配列と実質的に相同な配列を含む。
【００２２】
好ましくは、結合蛋白質は、本発明の少なくとも１つの重鎖ＣＤＲおよび少なくとも１つの軽鎖ＣＤＲ、またはこれらの配列と実質的に相同な配列を含む。より好ましくは、結合蛋白質は、本発明の少なくとも２つの重鎖ＣＤＲおよび少なくとも２つの軽鎖ＣＤＲ、またはこれらの配列と実質的に相同な配列を含む。
【００２３】
特に好適な結合分子は、配列番号３の重鎖ＣＤＲ１ドメイン、配列番号４の重鎖ＣＤＲ２ドメインおよび配列番号５の重鎖ＣＤＲ３ドメイン、またはこれらの配列と実質的に相同な配列と、配列番号６の軽鎖ＣＤＲ１ドメイン、配列番号７のＣＤＲ２ドメインおよび配列番号８のＣＤＲ３ドメインまたはこれらの配列と実質的に相同な配列とを含む。
【００２４】
更なる好適な実施態様は、上述したような本発明の重鎖ＣＤＲまたはこの配列と実質的に相同な配列を、１またはそれよりも多く有するＶＨ（可変重鎖ドメイン）、および／または上述したような本発明の軽鎖ＣＤＲまたはこの配列と実質的に相同な配列を、１またはそれよりも多く有するＶＬ（可変軽鎖ドメイン）を含む、ヒトＤＬＬ４に結合可能な結合蛋白質を提供する。
【００２５】
軽鎖における好適な可変領域（ＶＬドメイン）は、上述したような本発明の軽鎖ＣＤＲまたはこの配列に実質的に相同な配列を、２つまたはそれよりも多く含む。特に好適なＶＬドメインは、上述したような（すなわち、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３の何れか１つ）、本発明の軽鎖ＣＤＲまたはこの配列に実質的に相同な配列を３つ含む。重鎖における好適な可変領域（ＶＨドメイン）は、上述したような本発明の重鎖ＣＤＲまたはこの配列に実質的に相同な配列を、２つまたはそれよりも多く含む。特に好適なＶＨドメインは、上述したような（すなわち、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３の何れか１つ）本発明の重鎖ＣＤＲまたはこの配列と実質的相同な配列を３つ含む。最も好適な結合蛋白質は、上述したような本発明の軽鎖ＣＤＲまたはこの配列に実質的に相同な配列を３つと、上述したような本発明の重鎖ＣＤＲまたはこの配列に実質的に相同な配列３つとを含む。
【００２６】
上記にて議論したようなＶＬドメインおよびＶＨドメインのいかなる組み合わせでも本発明の結合蛋白質に存在し得る。このように、本発明の好適な結合蛋白質は、ＣＤＲ１（配列番号６）および／またはＣＤＲ２（配列番号７）および／またはＣＤＲ３（配列番号８）もしくはこれらの配列と実質的に相同な配列を有するＶＬドメインと、ＣＤＲ１（配列番号３）および／またはＣＤＲ２（配列番号４）および／またはＣＤＲ３（配列番号５）もしくはこれらの配列と実質的に相同な配列を有するＶＨドメインとを含む。
【００２７】
また、更なる本発明の実施態様では、配列番号１のアミノ酸配列またはこの配列に実質的に相同な配列を有するＶＨドメインと、配列番号２のアミノ酸配列またはこの配列に実質的に相同な配列を有するＶＬドメインとを含む結合蛋白質が提供される。
【００２８】
配列番号１のアミノ酸配列を有するＶＨドメインと、配列番号２のアミノ酸配列を有するＶＬドメインとを有する抗体は、本明細書では、「ＳＴＬ４」との名称を有する。
本明細書で使用される「結合蛋白質」との用語は、他の物質へ特異的に結合する蛋白質を指す。好適な実施態様において、結合蛋白質は、キメラ化されているか、ヒト型化されている。好適なキメラ化蛋白質は、キメラ化抗体であり、好ましくは、この抗体は、ヒト重鎖定常ドメインおよびヒト軽鎖定常ドメインを含む。好ましくは、結合蛋白質は、抗体または抗体断片であるか、あるいは、抗体または抗体断片を含むものである。ヒト型化抗体または抗体断片は、特に好適である。
【００２９】
本発明者らは、ヒト重鎖定常ドメインＣＨ１−Ｈ−ＣＨ２−ＣＨ２およびヒト軽鎖定常ドメインκ（カッパ）の他に、配列番号３の重鎖ＣＤＲ１ドメイン、配列番号４の重鎖ＣＤＲ２ドメインおよび配列番号５の重鎖ＣＤＲ３ドメイン、ならびに配列番号６の軽鎖ＣＤＲ１ドメイン、配列番号７の軽鎖ＣＤＲ２ドメインおよび配列番号８の軽鎖ＣＤＲ３ドメインを含むキメラ化抗体を調製した。本明細書にてｃＳＴＬ４と称されるこの抗体に関する詳細は、実施例８にて見られる。
【００３０】
別の好適な実施態様において、結合蛋白質は、アフィボディである。アフィボディは、本技術分野においては周知であり、典型的には、３重ヘリックスバンドルから構成される、たとえば約６ｋＤａの小さな蛋白質であり、元々はブドウ球菌プロテインＡに由来する。
【００３１】
本発明の結合蛋白質は、ヒトＤＬＬ４もしくはヒトＤＬＬ４断片、またはヒトＤＬＬ４もしくはその断片を含む実体(entities)に特異的に結合できる。「特異的に結合する」とは、ＤＬＬ４に対しては有意な結合であるが、その他の（コントロールの）抗原に対しては、より小さいもしくは弱い結合であるかまたは結合が皆無であること、好ましくは有意に小さいもしくは弱い結合であるかまたは結合が皆無であることを意味する。適当なコントロール抗原は、たとえば、ＤＬＬ１、Ｊａｇｇｅｄ１およびＪａｇｇｅｄ２から選択されてもよい。好ましくは、ＤＬＬ４を除いては、典型的にヒトの体内に存在する、いかなる抗原に対しても有意な結合がない。その他の抗原に対する結合性がある場合、その結合性は、有意なものではなく、診断、イメージングまたは治療の用途を禁止するものではないことが好ましい。
【００３２】
ここで、「有意な結合」とは、標準的な技術によって測定され、かつ少なくとも統計学的に有意である結合を意味する。
「有意でない結合」とは、測定不可能な結合または、標準的な技術を用いて測定可能であるものの、統計学的におよび／または生理学的に有意または関連性がない結合を意味する。
【００３３】
結合蛋白質の結合特異性を評価する適当な技術は、当業者にとっては公知なものである。当業者ならば、結合性が分析される際に、結合蛋白質および標的抗原の適切な濃度を使用すべきことが理解されるであろう。非常に高い濃度では、一般的には、部分的にまたは一様に有意な非特異的な結合があるだろうから、当業者であれば、結合特異性を分析するために使用されるべき適切な濃度が認識される。この適切な技術の例は、フローサイトメトリーを含む。たとえば、ＤＬＬ４でトランスフェクトされたＣＨＯ細胞のへの結合性を、トランスフェクトされていないＣＨＯ細胞および／または異なる抗原で、たとえば、ＤＬＬ１、Ｊａｇｇｅｄ１またはＪａｇｇｅｄ２でトランフェクトされたＣＨＯ細胞とで、比較してもよい。その他の適切な技術は、ＥＬＩＳＡ、ウェスタンブロット、放射性免疫分析を含む。
【００３４】
好ましくは、結合蛋白質は、５、４、３、２または１μＭ未満のＫｄに，より好ましくは５００、４００または３００ｎＭ未満のＫｄに、さらに好ましくは２００、１９０、１８０、１７０、１６０、１５０、１４０、１３０、１２０、１１０または１００ｎＭ未満のＫｄに、最も好ましくは９０、８０、７０、６０、５０、４０、３０、２０、１０、５または１ｎＭ未満のＫｄに相当するＤＬＬ４への結合親和性を有する。最も好ましくは、Ｋｄが１０ｘ１０−１０Ｍ未満であり、より好ましくは５ｘ１０−１０Ｍ未満、たとえば約４ｘ１０−１０Ｍ未満である。ここで、Ｋｄを決定する、いかなる適当な方法が使用されてもよい。しかしながら、好ましくは、Ｋｄは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏにおいて、ＤＬＬ４（または、ＤＬＬ４がトランスフェクトされた細胞）の特定量に対して、様々な濃度での結合蛋白質を評価して、たとえば、ラインウェーバー・バーク法または好ましくは、ＢＩＡｃｏｒｅＴＭソフトウェアのような市販されている結合モデルソフトウェアを使用して、飽和曲線を確立して、決定される。適切な分析方法は、実施例９において記載されている。「Ｋｄ」は、算出された解離定数を意味し、本技術分野においては、「ＫＤ」とも称される。
【００３５】
比較可能な条件下、特に、それぞれの分析において、結合蛋白質および抗原（またはＤＬＬ４もしくはコントロール抗原でトランスフェクトされた細胞）の同一の添加量を用いて、結合親和性を分析した場合、結合蛋白質は、好ましくはその他の抗原よりも、たとえばヒトＤＬＬ１、ヒトＪａｇｇｅｄ１またはヒトＪａｇｇｅｄ２に対するＫｄよりも、少なくとも０．５または１桁分、より好ましくは、少なくとも２、３、４または５桁分小さい、ＤＬＬ４に対するＫｄを有する。
【００３６】
好ましくは、結合蛋白質は、ＤＬＬ４の機能を阻害もしくは有意に低減できるか、１またはそれより多くの天然リガンド／受容体、特にＮｏｔｃｈとのＤＬＬ４の相互作用を阻止できる。結合蛋白質は、好ましくはＤＬＬ４のアンタゴニストとして作用する。リガンドまたは受容体への結合性、たとえばＮｏｔｃｈへの結合性は、当業者にとっては公知の標準的な技術を用いて分析される。特定のリガンドまたは受容体への遊離ＤＬＬ４の結合性は、本発明の結合蛋白質と接触したＤＬＬ４の結合性と比較され得る。適切な分析方法は、フローサイトメトリーおよびＥＬＩＳＡを含む。たとえば、フローサイトメトリーは、ＮｏｔｃｈでトランスフェクトされたＣＨＯ細胞へのＤＬＬ４の結合性を、ＮｏｔｃｈでトランスフェクトされたＣＨＯ細胞への、本発明の結合蛋白質と接触したＤＬＬ４の結合性と比較するために使用されてもよい。
【００３７】
また別の、Ｎｏｔｃｈシグナリングにおける抗ＤＬＬ４抗体の作用を分析するための適切な方法は、実施例６にて記載される。簡潔にいえば、Ｎｏｔｃｈ／ＣＳＬ受容体のようなＮｏｔｃｈ介在シグナリングによって活性化されるレポーターシステムが使用されてもよく、レポーターシステムの出力における抗ＤＬＬ４抗体の作用を分析できる。Ｎｏｔｃｈ／ＣＳＬレポーターシステムの場合、ルシフェラーゼ活性の減少は、Ｎｏｔｃｈ介在シグナリングにおける減少の指標であり、Ｎｏｔｃｈ介在シグナリングにおいて、抗体が阻害効果を有することを示している。
【００３８】
特に別段の定めをした場合を除き、本明細書における「ＤＬＬ４」との呼称は、ＤＬＬ４のヒト型を意味することを意図する。
本明細書における「Ｎｏｔｃｈ」との呼称は、Ｎｏｔｃｈ１、Ｎｏｔｃｈ２、Ｎｏｔｃｈ３および／またはＮｏｔｃｈ４を含む。好ましくは、「Ｎｏｔｃｈ」は、Ｎｏｔｃｈ１である。
【００３９】
抗体分子および結合蛋白質に関して、本明細書で使用される「キメラ化」との用語は、ある種(spicies)において見られる配列に由来するまたはそれに相当する抗体定常領域と、別種に由来する抗体可変領域（たとえば、ＶＨ、ＶＬ、ＣＤＲまたはＦＲ領域）とを有する結合蛋白質を指す。好ましくは、抗体定常領域は、ヒトに、たとえば、ヒト生殖細胞系列もしくは体細胞において見られる配列に由来するまたはそれに相当するものであって、さらに、抗体可変領域（たとえば、ＶＨ、ＶＬ、ＣＤＲまたはＥＦ領域）は、非ヒト系動物、たとえば、マウス、ラット、ウサギまたはハムスターにおいて見られる配列に由来するものである。
【００４０】
抗体分子および結合蛋白質に関して、本明細書で使用される「ヒト型化された」との用語は、１またはそれより多くの可変領域（たとえば、ＶＨ、ＶＬ、ＣＤＲまたはＦＲ領域）および／またはヒト、たとえば、ヒトにおける生殖細胞系列もしくは体細胞において見られる配列に由来するまたはそれに相当する抗体定常領域を有する結合蛋白質を指す。本明細書で使用される「ヒト型化された」結合蛋白質との用語は、改変して、ヒトにおける免疫原性を低減させた、いかなる結合蛋白質も含む。
【００４１】
抗体をヒト型化させるための様々な技術は、本技術分野において公知である。一例としては、Roguska et al. “Humanization of murine monoclonal antibodies through variable domain resurfacing.” Proc Natl Acad Sci U S A. 1994 Feb 1;91(3):969-73に記載された再表面化法（resurfaceing method）が含まれる。かかる再表面化は、マウス抗体のＦｖ（可変断片）領域において、表面に接近し得る残基のパターンを変更して、ヒト抗体配列のＦｖ領域において見られるパターンと類似化させるために使用される。別の技術は、ＣＤＲグラフト化に関し、この技術において、マウス抗体のＣＤＲ領域は、ヒトフレームワーク領域（ＦＲｓ）と結合される。ヒトＦＲは、たとえば、ヒトのコンセンサス配列からの選択または個々のヒト抗体からの選択によって、選ばれてもよい。
【００４２】
本発明の「ヒト型化された」結合蛋白質は、ヒトの配列をコードしないアミノ酸残基を含んでいてもよく、たとえば、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでのランダムまたは部位特異的な変異（特に、保存的置換が関わっている変異、または結合蛋白質の少数の残基、たとえば結合蛋白質の１またはそれより多くのＣＤＲを構成する残基の１、２、３、４または５つの変異）を含んでいてもよい。さらに、本発明のヒト結合蛋白質は、ヒトの配列から特定されたヒトコンセンサス配列を有する蛋白質を含む。
【００４３】
本発明のヒト型化された結合蛋白質は、それら自体はヒト抗体分子において組み合わせで見られる、ＶＨ、ＶＬ、ＣＤＲまたはＦＲ領域の組み合わせに限定されるものではない。このように、本発明のヒト型化された結合蛋白質は、ヒトにおいては、天然に必ずしも存在しない領域の組み合わせを含むもの、またはそれに相当するものであってもよい。
【００４４】
本明細書で使用される「抗体」または「抗体分子」との用語は、免疫グロブリン分子を指す。
本明細書で使用される「抗体」または「抗体分子」との用語は、したがって、すべての抗体（たとえば、ＩｇＧ、ＩｇＡ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、またはＩｇＤ）、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、ヒト型化およびキメラ化抗体およびＦｃ領域を改変した抗体を含むことを意図している。また、抗原結合ドメインを含む抗体断片も包含される。
【００４５】
本明細書で使用される「抗体断片」との用語は抗原結合機能を示す適当な抗体断片、たとえばＦａｂ、Ｆａｂ´、Ｆ（ａｂ´）２、ｓｃＦｖ、Ｆｖ、ｄｓＦｖ、ｄｓ−ｓｃＦｖ、Ｆｄ、ｄＡｂｓ、ラクダ化抗体、ＴａｎｄＡｂｓダイマー、ミニボディ、二量体ならびにそれらの多量体および二重特異性抗体断片を含むことを意図する。抗体は、一般的な方法を用いて断片化され得る。たとえば、Ｆ（ａｂ´）２断片は、当該抗体をペプシンで処理することによって、生成され得る。また、得られたＦ（ａｂ´）２断片は、ジスルフィド架橋を低減する処理がなされて、Ｆａｂ´断片を生成する。さらに、パパイン消化は、Ｆａｂ断片の形成に至らしめることができる。Ｆａｂ、Ｆａｂ´ならびにＦ（ａｂ´）２、ｓｃＦｖ、Ｆｖ、ｄｓＦｖ、Ｆｄ、ｄＡｂｓ、ＴａｎｄＡｂｓ、ｄｓ−ｓｃＦｖ、ダイマー、ミニボディ、二量体、二重特異性抗体断片およびその他の断片も、組み換え技術で合成され得るし、あるいは化学的に合成され得る。抗体断片を産生する技術は、本技術分野において周知であり、記載されているものである。
【００４６】
抗体または抗体断片は、天然に産生され得、または全体もしくは部分的に合成的に産生され得る。このように、上記抗体は、適当な供給源、たとえば、組換え型の供給源に由来するものおよび／またはトランスジェニック動物またはトランスジェニック植物から産生されるものであってもよい。このように、抗体分子を、ｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはｉｎ  ｖｉｖｏにおいて産生できる。
【００４７】
好ましくは、抗体または抗体断片は、一般的に抗原結合部位を含む抗体軽鎖可変領域（ＶＬ）および抗体重鎖可変領域（ＶＨ）を含む。ある実施態様においては、抗体および抗体断片は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、ＩｇＥ、ＩｇＭまたはＩｇＤの定常領域のような、重鎖定常領域の一部またはすべてを含む。好ましくは、重鎖定常領域は、ＩｇＧ１重鎖定常領域である。Ｆｃ領域をいくつかの方法によって、たとえば、Ｆｃ受容体または補体のＣ１成分のような免疫エフェクター機能と相互作用するように改変して、機能を変化させてもよい。さらには、抗体および抗体断片は、κ軽鎖定常領域またはλ軽鎖定常領域のすべてまたは一部を含むことができる。好ましくは、軽鎖定常領域はκ軽鎖定常領域である。定常領域のすべてまたは一部は、天然に産生されたものであっても、そのすべてまたは一部において合成されたものであってもよい。定常領域の適当な配列は、本技術分野においては周知であり、文書化されている。
【００４８】
本明細書で使用される「断片」との用語は、生物学的関連性（biological relevance）、たとえば、抗原結合に寄与できる断片、抗原結合部位の一部を形成している断片、抗原の機能の阻害もしくは低減に寄与できる断片、または、抗原の天然受容体との相互作用の阻止に寄与する断片を指す。好適な断片は、本発明の抗体における重鎖可変領域（ＶＨ）ドメインおよび／または軽鎖可変領域（ＶＬ）ドメインである。その他の好適な断片は、本明細書にて開示された、１またはそれより多くの重鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）および／または、本明細書にて開示された、１またはそれより多くの軽鎖相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む。
【００４９】
本発明の結合蛋白質が、規定された配列の何れかを含む（たとえば、配列番号１または２の断片を含む）、たとえば、本発明のＶＨおよび／またはＶＬドメインを含む結合蛋白質である、または本発明の１またはそれより多くのＣＤＲを含む結合蛋白質である本発明の実施態様においては、これらの領域／ドメインは、各領域／ドメインが生物学的機能を発揮でき、かつ抗原結合への貢献が保持されるように、一般的に結合蛋白質の内部においては分離されている。ＶＨおよびＶＬドメインは、適当なスキャホールド配列／リンカー配列によって分離されてもよく、ＣＤＲは、天然に存在する抗体において見られるフレームワーク領域などの、適当なフレームワーク領域で分離されていてもよい。本願発明の、ＶＨ、ＶＬおよび個々のＣＤＲ配列は、適当なフレームワークまたはスキャホールド内部に供されて、すなわち組込まれて、抗原の結合を可能にする。このようなフレームワークまたは領域は、天然に存在するフレームワーク領域、ＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３および／またはＦＲ４に一致し、必要に応じて、適当なスキャホールドを形成するものか、あるいは、たとえばappropriate、種々の天然に存在するフレームワーク領域を対比することで特定されるコンセンサスフレームワーク領域に一致するものである。さもなくば、非抗体のスキャホールドまたはフレームワークが、たとえば、Ｔ細胞受容体フレームワークが使用され得る。スキャホールドは、通常抗原に結合しない蛋白質、たとえば細胞毒性Ｔリンパ球関連蛋白質４（cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4）（ＣＴＬＡ４）から、使用されてもよい。
【００５０】
フレームワーク領域に使用されることができる適当な配列は、本技術分野においては周知であり、文書化されており、これらの何れが使用されてもよい。フレームイワーク領域の好適な配列は、１またはそれより多くの、本発明のＶＨおよび／またはＶＬドメインを構成するフレームワーク領域、すなわち、１またはそれより多くの、配列番号９、１０、１１，１２、１３、１４、１５もしくは１６にて開示されたフレームワーク領域またはこれらの配列と実質的に相同なフレームワーク領域、特に、抗原特異性の維持を可能にするフレームワーク領域、たとえば、結果として結合蛋白質の３次元構造と実質的に同一になるフレームワーク領域である。好適な実施態様においては、配列番号９、１０、１１および１２の４つすべてのＦＲ領域またはこれらの配列と実質的に相同なＦＲ領域、および／または配列番号１３、１４、１５および１６の４つすべてのＦＲ領域は、本発明の結合蛋白質において見られる。
【００５１】
さらに、本発明の好適な結合蛋白質は、本発明のＶＨ、ＶＬまたはＣＤＲから構成されているが、ＤＬＬ４へ結合する特性が依然として存在する場合に限り、本発明の結合蛋白質は、１またはそれより多くの、本発明ではないその他のＶＨ、ＶＬまたはＣＤＲとの組み合わせを伴った、１またはそれより多くの本発明のＶＨ、ＶＬまたはＣＤＲも包含することも注意されたい。ここで、好ましくは、抗原ＤＬＬ４に対する結合特異性が依然として存在する。最も好ましくは、ＤＬＬ４がＮｏｔｃｈと相互作用することを阻止する特性も存在する。
【００５２】
本明細書で使用される「重鎖相補性決定領域」との用語は、抗体分子における重鎖可変領域（ＶＨドメイン）内部における超可変性領域を指す。重鎖可変領域は、アミノ末端からカルボキシ末端にかけて、重鎖相補性決定領域１、重鎖相補性決定領域２および重鎖相補性決定領域３と呼ばれる３つの相補性決定領域を有する。重鎖可変領域は、４つのフレームワーク領域（アミノ末端からカルボキシ末端にかけて、ＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３およびＦＲ４）も有する。これらの領域は、各ＣＤＲを分離している。
【００５３】
本明細書で使用される「重鎖可変領域」（ＶＨドメイン）との用語は、抗体分子の重鎖における可変領域を指す。
本明細書で使用される「軽鎖相補性決定領域」との用語は、抗体分子の軽鎖可変領域（ＶＬドメイン）内における超可変領域を指す。軽鎖可変領域は、アミノ末端からカルボキシ末端にかけて、軽鎖相補性決定領域１、軽鎖相補性決定領域２および軽鎖相補性決定領域３と称される３つの相補性決定領域を有する。軽鎖可変領域は、４つのフレームワーク領域（アミノ末端からカルボキシ末端にかけて、ＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３およびＦＲ４）も有する。これらの領域は、各ＣＤＲを分離している。
【００５４】
本明細書で使用される「軽鎖可変領域」（ＶＬドメイン）との用語は、抗体分子の軽鎖における可変領域を指す。
上記にて規定したような本発明の結合蛋白質をコードする配列またはこの配列と実質的に相同な配列を含む核酸分子は、本発明のさらに別の態様を形成するものである。好適な核酸分子は、配列番号１７もしくは１８にて規定された配列、またはこれらの配列と実質的に相同な核酸分子である。
【００５５】
本発明の核酸分子は、抗体産生に使用されてもよく、発現宿主における好ましいコドン使用頻度（codon usage）に適合させるために、一層、配列を最適化してもよい。このような最適化は、頻繁に使用されないコドンからより頻繁に使用されるコドンへの置換、そのため、コードされたポリペプチドのアミノ酸配列に影響がない核酸配列への変更に関する。発現宿主における好適なコドン使用頻度に関する情報は、広く入手可能であり、核酸配列を変更する標準的な方法を使用して、最適化された配列へ到達してもよい。コドンが最適化された配列番号１７または１８に基づく配列は、本発明のさらなる好適な実施態様を含む。
【００５６】
上記にて規定したような本発明の結合蛋白質の断片またはこれらの配列と実質的に相同な配列は、本発明のさらに別の態様を形成するものである。
したがって、本発明は、上記にて規定された本発明のＶＬドメインもしくはこれらの配列と実質的に相同な配列を含むまたはそれらからなるポリペプチド、あるいは上記にて規定された本発明のＶＨドメインもしくはこれらの配列と実質的に相同な配列を含むまたはそれらからなるポリペプチドであって、ＤＬＬ４に結合可能なポリペプチドを提供する。
【００５７】
本発明は、さらに、上記にて規定されたような本発明の、１もしくはそれより多くのＣＤＲ領域またはこれらの配列と実質的に相同な配列を含み、ＤＬＬ４に結合可能であるポリペプチドを提供する。
【００５８】
本発明に係る結合蛋白質の断片をコードする配列を含む核酸分子またはこれらの配列と実質的に相同な核酸分子は、本発明のまた別の態様を形成する。このような断片（たとえば、ＶＨドメイン、ＶＬドメインおよび各ＣＤＲ）をコードする好適な核酸配列は、配列番号１７または１８において見られる。
【００５９】
アミノ酸または核酸配列に関して、本明細書で使用される「実質的に相同な」との用語は、開示されたアミノ酸配列または核酸配列に対して、少なくとも５０％、好ましくは少なくとも６０％、より好ましくは少なくとも７０％、さらに好ましくは少なくとも８０％、最も好ましくは、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％を有する配列を含む。本発明の実質的に相同な配列は、本発明の配列に対する、単数のまたは複数の塩基またはアミノ酸の変異（付加、置換、挿入、または欠失）を含む。アミノ酸レベルおいては、好適な実質的に相同な配列は、本発明の配列を構成する、１もしくはそれより多くのフレームワーク領域および／または、１もしくはそれより多くのＣＤＲにおいて、５、４、３、２または１未満、好ましくは１または２だけの、変異したアミノ酸を含む。好ましくは、当該変異は、保存的アミノ酸置換である。
【００６０】
そのため、軽鎖ＣＤＲ１と実質的に相同な配列は、好ましくは、ＫＡＳＳＳＶＳＦＭＨ（配列番号２３）、ＲＡＳＳＴＶＳＦＭＨ（配列番号２４）、ＲＡＳＳＳＶＴＦＭＨ（配列番号２５）、ＲＡＴＳＳＶＳＦＭＨ（配列番号２６）、ＲＡＳＴＳＶＳＦＭＨ（配列番号２７）、ＲＡＳＳＳＡＳＦＭＨ（配列番号２８）、ＲＶＳＳＳＶＳＦＭＨ（配列番号２９）、ＲＶＳＳＳＡＳＦＭＨ（配列番号３０）、ＫＡＳＳＳＡＳＦＭＨ（配列番号３１）、ＲＶＳＳＴＶＳＦＭＨ（配列番号３２）、ＲＡＳＳＳＬＳＦＭＨ（配列番号３３）またはＲＡＳＳＳＶＳＷＭＨ（配列番号３４）から選択され；
軽鎖ＣＤＲ２と実質的に相同な配列は、好ましくは、ＶＴＳＮＬＴＳ（配列番号３５）、ＡＴＴＮＬＴＳ（配列番号３６）、ＡＴＳＮＬＴＴ（配列番号３７）、ＡＴＳＱＬＴＳ（配列番号３８）、ＡＴＳＮＩＴＳ（配列番号３９）、ＡＳＳＮＬＴＳ（配列番号４０）、ＡＴＳＮＬＳＳ（配列番号４１）またはＶＴＳＮＩＴＳ（配列番号４２）から選択され；
軽鎖ＣＤＲ３と実質的に相同な配列は、好ましくは、ＮＱＷＳＳＮＰＦＴ（配列番号４３）、ＱＮＷＳＳＮＰＦＴ（配列番号４４）、ＱＱＦＳＳＮＰＦＴ（配列番号４５）、ＱＱＷＴＳＮＰＦＴ（配列番号４６）、ＱＱＷＳＴＮＰＦＴ（配列番号４７）、ＱＱＷＳＳＱＰＦＴ（配列番号４８）、ＱＱＷＳＳＮＰＷＴ（配列番号４９）、ＱＱＷＳＳＮＰＦＳ（配列番号５０）、ＮＱＷＳＴＮＰＦＴ（配列番号５１）、ＮＮＷＳＳＮＰＦＴ（配列番号５２）またはＱＱＷＴＴＮＰＦＴ（配列番号５３）から選択され；
重鎖ＣＤＲ１と実質的に相同な配列は、好ましくは、ＴＹＶＭＨ（配列番号５４）、ＳＴＶＭＨ（配列番号５５）、ＳＹＡＭＨ（配列番号５６）、ＳＹＶＭＬ（配列番号５７）またはＴＹＡＭＨ（配列番号５８）から選択され；
重鎖ＣＤＲ２と実質的に相同な配列は、好ましくは、ＹＬＩＰＹＮＤＧＴＫＹＮＥＫＦＫＧ（配列番号５９）、ＹＩＬＰＹＮＤＧＴＫＹＮＥＫＦＫＧ（配列番号６０）、ＹＩＩＰＹＱＤＧＴＫＹＮＥＫＦＫＧ（配列番号６１）、ＹＩＩＰＹＮＥＧＴＫＹＮＥＫＦＫＧ（配列番号６２）、ＹＩＩＰＹＮＤＧＳＫＹＮＥＫＦＫＧ（配列番号６３）、ＹＩＩＰＹＮＤＧＴＲＹＮＥＫＦＫＧ（配列番号６４）、ＹＩＩＰＹＮＤＧＴＫＹＱＥＫＦＫＧ（配列番号６５）、ＹＩＩＰＹＮＤＧＴＫＹＮＤＫＦＫＧ（配列番号６６）、ＹＩＩＰＹＮＤＧＴＫＹＮＥＫＷＫＧ（配列番号６７）、ＹＩＩＰＹＮＤＧＴＫＹＮＥＫＦＲＧ（配列番号６８）、ＹＬＬＰＹＮＤＧＴＫＹＮＥＫＦＫＧ（配列番号６９）、ＹＩＬＰＹＱＤＧＴＫＹＮＥＫＦＫＧ（配列番号７０）またはＹＩＬＰＹＮＥＧＴＫＹＱＥＫＦＫＧ（配列番号７１）から選択され；
重鎖ＣＤＲ３と実質的に相同な配列は、好ましくは、ＴＥＤＹＤＨＦＤＹ（配列番号７２）、ＳＤＤＹＤＨＦＤＹ（配列番号７３）、ＳＥＥＹＤＨＦＤＹ（配列番号７４）、ＳＥＤＴＤＨＦＤＹ（配列番号７５）、ＳＥＤＹＥＨＦＤＹ（配列番号７６）、ＳＥＤＹＤＫＦＤＹ（配列番号７７）、ＳＥＤＹＤＨＷＤＹ（配列番号７８）、ＳＥＤＹＤＨＦＥＹ（配列番号７９）、ＳＥＤＹＤＨＦＤＴ（配列番号８０）、ＳＤＥＹＤＨＦＤＹ（配列番号８１）、ＳＤＥＹＤＨＦＥＹ（配列番号８２）、ＴＥＤＹＥＨＦＤＹ（配列番号８３）またはＴＤＥＹＥＨＦＤＹ（配列番号８４）から選択される。
【００６１】
実質的に相同な核酸配列は、開示された核酸配列（または、その相補配列）にハイブリダイズするヌクレオチド配列、たとえば、１またはそれより多くの、本発明の軽鎖ＣＤＲもしくは重鎖ＣＤＲ、本発明の軽鎖可変領域もしくは重鎖可変領域、または本発明の結合蛋白質をコードするヌクレオチド配列と、少なくとも、適度にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件、好ましくは非常にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件の下において、ハイブリダイズする（または、これらの相補配列とハイブリダイズする）配列を含む。
【００６２】
「実質的に相同」との用語は、本発明の蛋白質または核酸分子と、実質的に同様の方法において、実質的に同様に機能する、本発明のアミノ酸配列またはヌクレオチド配列における改変または化学的等価物を包含するものである。たとえば、実質的に相同な結合蛋白質は、ＤＬＬ４に対して、好ましくは、着目されている結合蛋白質によって認識されるものと同一のエピトープ、たとえば、本明細書にて記載された本発明のＣＤＲドメインまたは本発明のＶＨドメインやＶＬドメインによって認識される同一のエピトープまたは抗原に対して、特異的に結合する能力を保持していなければならない。同一のエピトープ／抗原への結合は、本技術分野において周知であり、開示されている方法、たとえば、競合アッセイによって、容易に評価され得る。遺伝的なアミノ酸に対する、非遺伝的にコードされた適切な等価物は、本技術分野において公知である。
【００６３】
本発明における蛋白質の実質的に相同な配列は、限定されるものではないが、保存的アミノ酸置換、または、たとえば、結合蛋白質のＶＨ、ＶＬもしくはＣＤＲドメインに影響しない変異を含み、例として、抗原の結合に寄与しないタグ配列またはその他の構成因子、あるいは抗体分子または断片の型またはフォーマットを他の型またはフォーマットに変換する変異（たとえば、ＦａｂからｓｃＦｖへの交換、またはその逆）が加えられた結合蛋白質を含む。
【００６４】
本明細書で使用される「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が、同様な側鎖を有する別のアミノ酸残基で置換されることである。同様な側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、本技術分野においては、塩基性側鎖（たとえば、リシン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖（たとえば、アスバラギン酸、グルタミン酸）、非電荷極性側鎖（たとえば、グリシン、アルパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン）、非極性側鎖（たとえば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン）、β分岐側鎖（たとえば、スレオニン、バリン、イソロイシン）および芳香族側鎖（たとえば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）を含めて、規定されている。
【００６５】
相同性は、任意の簡便な方法によって評価されてもよい。しかしながら、配列間の相同性の程度を決定するためには、配列のマルチプルアラインメントができるコンピュータープログラム、たとえば、Ｃｌｕｓｔａｌ  Ｗ（Thompson, J. D., D.G. Higginset al. (1994). “CLUSTAL W: Improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice.” Nucleic Acids Res 22: 4673-4680）が便利である。要望によっては、Ｃｌｕｓｔａｌ  Ｗのアルゴリズムは、ＢＬＯＳＵＭ  ６２  ｓｃｏｒｉｎｇ  ｍａｔｒｉｘ（Henikoff S.and Henikoff J.G., 1992, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: 10915-10919）ならびに１０のギャップ開始ペナルティおよび０．１のギャップ伸長ペナルティとともに使用することができ、これによって、１つの配列の全長の少なくとも５０％がアラインメントに関与した２配列間において、最も高いオーダーマッチが得られる。一般的には、上記コンピュータープログラムは、このような計算のために採用されるであろう。ペアの配列を比較したり、アラインメントを採ったりするプログラムは、ＡＬＩＧＮ（E. Myers and W. Miller, “Optical Alignments in Linear Space”, CABIOS (1988) 4: 11-17）、ＦＡＳＴＡ（W.R. Pearson  and D.J. Lipman (1988), “Improved tools for biological sequence analysis”, PNAS 85:2444-2448, および W.R. Pearson (1990) “Rapid and sensitive sequence comparison with FASTP and FASTA” Methods in Enzymology 183:63-98）およびギャップド（gapped）ＢＬＡＳＴ（Altschul, S.F., T.L. Madden, et al. (1997). “Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs”. Nucleic Acids Res. 25: 3389-3402)、ＢＬＡＳＴＰ、ＢＬＡＳＴＮまたはＧＣＧ（Devereux et al., Nucleic Acids Res., 1984, 12: 387）も本目的のためには有用である。さらには、欧州生命情報学研究所（European Bioinformatics institute）におけるDali serverは、蛋白質配列の構造に基づいたアラインメントを提供している（Holm, J. of Mol. Biology, 1993, Vol. 233: 123-38; Holm, Trends in Biochemical Sciences, 1995, Vol 20: 478-480; Holm, Nucleic Acid Research, 1998, Vol. 26: 316-9）。
【００６６】
「少なくとも適度にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件」とは、溶液中において２つの相補的な核酸分子の間における選択的なハイブリダイゼーションを促進する選択条件を意味する。ハイブリダイゼーションは、核酸配列分子のすべてまたは一部分にて生じ得る。ハイブリダイズした部分は、典型的には、少なくとも１５（たとえば、２０、２５、３０、４０または５０）のヌクレオチドの長さである。当業者にとっては、核酸２重鎖の安定性すなわちハイブリッドの安定性は、Ｔｍによって決定され、かかるＴｍは、ナトリウムを含む緩衝液においては、ナトリウムイオン濃度と温度との関数であることが認識されよう。したがって、ハイブリッドの安定性を決定する洗浄条件におけるパラメーターは、ナトリウムイオン濃度および温度である。既知の核酸分子に対して類似しているが同一でない分子を認識するために、１％のミスマッチはＴｍが約１℃減少する結果になると推定される。たとえば、９５％を超える同一性を有する核酸分子が要求される場合、最終的な洗浄温度は約５℃低減される。これらを考慮して、当業者ならば、容易に適当なハイブリダイゼーション条件を選択することができる。好適な実施態様においては、非常にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件が選択される。例としては、以下の条件を採用して、非常にストリンジェントなハイブリダイゼーションを達成してもよい：５ｘ塩化ナトリウム／クエン酸ナトリウム（ＳＳＣ）／５ｘデンハルト溶液／１．０％ＳＤＳ、上記方程式に基づいたＴｍ−５℃でのハイブリダイゼーション、次いで、６０℃での０．２ｘＳＳＣ／０．１％ＳＤＳの洗浄。適度にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件は、４２℃での３ｘＳＳＣの３回の洗浄工程を含む。
【００６７】
さらなる例として、「ハイブリダイズする」配列は、非ストリンジェントな条件（たとえば、室温における６ｘＳＣ、５０％ホルムアミド）の下で結合（ハイブリダイズ）し、低いストリンジェンンシー（たとえば、２ｘＳＳＣ、室温、より好ましくは２ｘＳＳＣ、４２℃）または高いストリンジェンンシー（たとえば、２ｘＳＳＣ、６５℃）（ここで、ＳＳＣ＝０．１５ＭＮａＣｌ、０．０１５Ｍクエン酸ナトリウム、ｐＨ７．２）の条件の下、洗浄される配列である。
【００６８】
しかしながら、等価であるストリンジェンシーは、別の緩衝液、塩および温度を用いて達成されてもよい。ハイブリダイゼーション条件に関する追加的な指針としては、たとえば、Sambrook et al., Molecular Cloning, a Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989, Vol.3.において見られる。
【００６９】
本発明におけるポリペプチド、結合蛋白質および核酸分子は、ヒトもしくは動物の身体内にてｉｎ  ｓｉｔｕにて、またはヒトもしくは動物の身体に由来する組織試料にて、存在しない場合においては、好ましくは「単離された（isolated）」分子である。しかしながら、該配列は、ヒトもしくは動物の身体において見られるような配列に一致してもよく、または実質的に相同であってもよい。このように、核酸分子、蛋白質またはポリペプチドに関して、本明細書で使用される「単離された」との用語は、天然の環境から単離されたまたは実質的に離れた上記の分子、たとえば、ヒトもしくは動物の身体から単離された上記の分子（実際、上記分子が天然にある場合）を指し、あるいは、技術的方法により生産された上記の分子を指す、つまり組換え的または合成的に生産された分子を含む。
【００７０】
このように、「単離された」との用語は，その他の核酸やポリペプチドのような天然に付随する材料が実質的になく、および／または組換えＤＮＡ技術によって産生される際における細胞材料もしくは培養液が実質的にないか、または化学的に合成された際における化学的前駆体もしくはその他の化学物質が実質的にない核酸やポリペプチドを指す。単離された核酸は、当該核酸が由来する核酸に元々隣接する配列（つまり、当該核酸において、５´位および３´位の末端に位置する配列）、または、たとえば遺伝子工学によって、当該核酸に隣接させられた配列（たとえば、タグ配列または治療的価値を有さないその他の配列）を実質的に有していなくてもよい。
【００７１】
単離された蛋白質は、単離された核酸分子に対して、上述のような隣接する配列を有さないものであってもよい。
本明細書で使用される「核酸配列」または「核酸分子」との用語は、天然に存在する塩基、糖および糖間（骨格）結合からなるヌクレオシドはまたはヌクレオチドモノマーの配列を指す。この用語は、非天然のモノマーや部分を含む改変配列または置換配列も包含する。本発明の核酸配列は、デオキシリボ核酸配列（ＤＮＡ）またはリボ核酸配列（ＲＮＡ）であってもよいし、たとえばアデニン、グアニン、シトシン、チミンおよびウラシルを含む天然の塩基を含んでいてもよい。当該配列は、改変された塩基を含んでいてもよい。改変された塩基の例は、アザ型およびデアザ型である、アデニン、グアニン、シトシン、チミンおよびウラシル、ならびにキサンチンならびにヒポキサンチンを含む。核酸分子は、二重鎖または単鎖であってもよい。上記核酸分子は、全部または一部にて合成されたものまたは組み換えられたものであってもよい。
【００７２】
当業者であれば、軽鎖および重鎖の相補性決定領域、軽鎖および重鎖の可変領域、結合蛋白質、抗体および抗体断片、ならびに免疫接合体のような本発明における蛋白質およびポリペプチドは、本技術分野において周知であり記載されている幾つかの方法の何れによって調製されてもよいが、最も好ましくは組換え方法を用いて調製される。
【００７３】
したがって、本発明の核酸分子を、任意の適当な方法によってクローニングしてもよいし、合成してもよく、さらには、本発明の蛋白質の良好な発現を確実にする適当な発現ベクターに公知手段にて組込んでもよい。可能な発現ベクターは、使用された宿主細胞と適合可能である限り、限定されるものではないが、コスミド、プラスミドまたは改変ウイルス（たとえば、複製欠損型レトロウイルス、アデノウイルスおよびアデノ随伴ウイルス）を含む。発現ベクターは、「宿主細胞の形質転換に適し」ているものであって、このことは、発現ベクターが、本発明の核酸分子と、当該核酸分子に動作可能に結合している、発現に使用される宿主細胞に基づいて選択される制御配列とを含むことを意味している。動作可能に結合していることとは、核酸の発現が可能なように、核酸が制御配列に結合していることを意図する。
【００７４】
それゆえ、本発明は、本発明の核酸分子またはその断片、および本発明の核酸分子によりコードされた蛋白質配列の転写および翻訳に必要な制御配列を含む組換え型発現ベクターを意図する。
【００７５】
適切な制御配列は、バクテリア遺伝子、菌類遺伝子、ウイルス遺伝子、哺乳類遺伝子または昆虫遺伝子を含めた、様々な供給源に由来するものであってもよい（たとえば、Coeddel, Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA (1990)に記載された制御配列を参照）。適当な制御配列の選択は、以下に議論されるように、選択された宿主細胞に依存し、当業者によって容易に達成される。このような制御配列の例は、転写プロモーターおよびエンハンサー、または翻訳開始シグナルを含むＲＮＡポリメラーゼ結合配列、リボソーム結合配列を包含する。さらには、選択された宿主細胞および採用されたベクターに応じて、複製起点、追加的なＤＮＡ制限部位、エンハンサー、および転写誘導性を付与する配列のような、その他の配列が発現ベクターに組込まれてもよい。
【００７６】
本発明の組換え型発現ベクターは、形質転換した宿主または本発明の組換え型分子でトランスフェクトされた宿主の選択を容易にする選択マーカー遺伝子を含んでいてもよい。選択マーカー遺伝子遺伝子の例は、特定の薬剤に対する耐性を付与するネオマイシンおよびハイグロマイシンや、β−ガラクトシダーゼ、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼまたはホタルルシフェラーゼなどの蛋白質をコードする遺伝子である。選択マーカー遺伝子の転写は、β−ガラクトシダーゼ、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ、またはホタルルシフェラーゼのような選択マーカー蛋白質の濃度変化によって観察される。選択マーカー遺伝子が、ネオマイシン耐性のような抗生物質耐性を付与する蛋白質をコードする場合、形質転換細胞はＧ４１８で選択することができる。ここで、選択マーカー遺伝子が組み込まれた細胞は生存するものの、その他の細胞は死滅する。このことは、本発明の組換え型発現ベクターの発現を可視化および分析することができ、そして、特に、発現および表現型における変異の効果を究明することができる。選択マーカーは、目的の核酸から別個のベクターに導入され得ることが理解されよう。
【００７７】
組換え型発現ベクターは、組換え蛋白質の発現上昇や、組換え蛋白質の可溶性の向上を賦与する、および／またはアフィニティー精製おいてリガンドとしての役割を有することによって、目的の組換え蛋白質の精製を補助する、融合部分をコードする遺伝子を含んでいてもよい。たとえば、タンパク質開裂部位が目的の組換え蛋白質に付加されて、融合蛋白質の精製後に、かかる融合部分（fusion moiety）から組換え型蛋白質を分離できるようになっていてもよい。一般的な融合型の発現ベクターは公知であり、ｐＧＥＸ（Amrad Corp.、Melbourne、Australia）を包含する。このｐＧＥＸは、組換え蛋白質へグルタチオンＳトランスフェラーゼ（ＧＳＴ）を融合させる。
【００７８】
一つの実施態様において、組換え型発現ベクターは、膜アンカーを与える融合部分をコードする核酸配列と、細胞表面移行シグナルを与える融合部分をコードする核酸配列とを含んでいてもよい。本発明の結合蛋白質は、発現宿主細胞の細胞膜に移行して、該細胞膜に留まる融合蛋白質として、発現されてもよい。適切な膜アンカー部分は、本技術分野において公知であるものだが、例としては、枯草菌（Bacillus subtilis）に由来するＰｇｓＡアンカー蛋白質が、本明細書では挙げられる。適切な細胞表面移行シグナル（分泌シグナル）も本技術分野において公知である。このような発現ベクターが使用されて、本発明の結合蛋白質が、発現宿主細胞の表面にて発現されてもよく、この細胞の表面において、結合蛋白質がＤＬＬ４と、好ましくは該宿主細胞によって発現されたＤＬＬ４と相互作用することができる。
【００７９】
また別の実施態様としては、組換え型発現ベクターは、融合蛋白質が発現宿主細胞の細胞内区画、たとえば小胞体において、融合蛋白質を係留せしめるシグナル配列を与える融合部分をコードする核酸配列を含んでいてもよい。適切なシグナル配列は、本技術分野において公知であるが、カルボキシ末端配列ＨＤＥＦが、例として、本明細書では挙げられる。本発明の結合蛋白質を細胞内区画において発現させて、そこで結合蛋白質が該宿主細胞によって発現されたＤＬＬ４と相互作用することができるようにするために、このような発現ベクターが使用されてもよい
したがって、さらなる態様において、本発明は遺伝子治療の方法を提供するものであって、ここで本明細書中に記載の組換え型発現ベクターは、対象とする細胞を形質転換するために使用され、上記融合蛋白質の発現は、ＤＬＬ４がその天然受容体および／または天然リガンド、好ましくはＮｏｔｃｈに結合することを阻止する。
【００８０】
形質転換された宿主細胞を産生するために、組換え型発現ベクターを宿主細胞に導入することができる。「〜を用いて形質転換された」，「〜を用いてトランスフェクトされた」，「形質転換」および「トランスフェクト」という用語は、当該分野において公知の 実施できる多くの技術のうち一つを用いて、核酸（例えば、ベクター）を細胞に導入することを包含する。核酸を用いて、例えば、電気穿孔法または塩化カルシウムを媒介した形質転換によって、原核細胞を形質転換することができる。リン酸カルシウムもしくは塩化カルシウム共沈殿，ＤＥＡＥ−デキストランを媒介したトランスフェクト，リポフェクチン，電気穿孔法または微量注入法などの従来技術によって哺乳動物細胞に核酸を導入することができる。宿主細胞を形質転換およびトランスフェクトする好適な方法は、Goeddel, Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA (1990))および他の実験室用教科書から見出すことができる。
【００８１】
好適な宿主細胞として、多種多様の真核宿主細胞および原核細胞が挙げられる。本発明の蛋白質は、例えば、酵母細胞または哺乳類動物細胞に発現させてもよい。他の好適な宿主細胞は、Goeddel, Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA (1991)から見出せる。さらに、本発明の蛋白質は、Escherichia coli（Zhang et al., Science 303(5656): 371-3 (2004)）などの原核細胞に発現させることもできる。
【００８２】
本発明を実施するのに好適な酵母および真菌の宿主細胞として、これらの限定されるものではないが、Saccharomyces cerevisiaeおよびピキア(Picha)属が挙げられる。酵母および真菌ならびに好適な発現ベクターによる形質転換のプロトコールは、当業者に周知である。
【００８３】
本発明を実施するのに好適な哺乳類動物細胞としては、とりわけＨｅＬａ細胞（例えば、ATCC No.CCL2）が挙げられる。
本明細書中に提供された教示を鑑みれば、プロモーター，ターミネーター，ならびに，適切なタイプの発現ベクターを植物細胞，トリ細胞および昆虫細胞に導入する方法も容易に成し遂げることができる。
【００８４】
代わりに、本発明の蛋白質は、ラット，ウサギ，ヒツジおよびブタなどのヒト以外のトランスジェニック動物に発現させてもよい。一態様として、本発明の蛋白質は、ヒトに発現させる。
【００８５】
本発明の蛋白質は、固相合成などの、蛋白質の化学において周知の技術を用いた化学合成によって調製することもできる。
蛋白質などの他の分子に接合された本発明の蛋白質を含む、Ｎ末端またはＣ末端の融合蛋白質は、組換え技術を介して、融合によって調製してもよい。その結果得られた融合蛋白質は、選択した蛋白質またはマーカー蛋白質と融合された本発明の蛋白質を含む。
【００８６】
また、本発明の蛋白質は、公知技術によって他の蛋白質と接合してもよい。例えば、国際公開第９０／１０４５７号パンフレットに記載されているようなヘテロ二官能性のチオール基含有リンカーであるＮ−サクシニミジル−３−（ピリジルジチオプロプリオネート）またはＮ−サクシニミジル−５チオアセテートを用いて該蛋白質と連結させてもよい。融合蛋白質または接合体を調製するために用いてもよい蛋白質の例として、細胞毒性ポリペプチド，放射性ヌクレオチド，サイトカイン，抗体分子，免疫グロブリンなどの細胞結合蛋白質，ホルモン，増殖因子，レクチン，インシュリン，低密度リポ蛋白質，グルカゴン，エンドルフィン，トランスフェリン，ボンベシン，アシアロ糖蛋白質，グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ），赤血球凝集素（ＨＡ），切断型ｍｙｃおよびあらゆる種類の酵素が挙げられる。好ましい態様において、本発明の蛋白質は、Ｔ細胞受容体情報伝達系の成分と接合または融合される。これによって、該融合蛋白質を発現するエフェクター細胞に新しい特異性が与えられる。
【００８７】
したがって、本発明の１以上の 核酸配列、または本発明の蛋白質（軽鎖および重鎖の相補性決定領域，軽鎖および重鎖の可変領域，もしくは抗体および抗体断片等の上記結合蛋白質など）をコードする１以上の核酸配列を含む組換え型発現ベクターを、本発明は提供する。
【００８８】
本発明の、１以上の組換え型発現ベクターもしくは１以上の核酸配列を含む宿主細胞、または本発明の１以上の蛋白質（軽鎖および重鎖の相補性決定領域，軽鎖および重鎖の可変領域，もしくは抗体および抗体断片等の上記結合蛋白質など）を発現している宿主細胞を、さらに本発明は提供する。
【００８９】
本発明のさらなる態様は、本発明の宿主細胞を培養する段階を含む本発明の蛋白質を製造する方法を提供する。好ましい方法は、該蛋白質の発現に好適な条件下で、本発明の、１以上の組換え型発現ベクターまたは１以上の核酸配列を含む宿主細胞を培養する段階（ｉ）を含み；該宿主細胞または成長培地／上清から該蛋白質を分離する段階（ｉｉ）を任意で含む。このような製造方法は、該蛋白質産物を精製する段階および／または少なくとも１つの追加成分（薬学的に許容し得る担体もしくは賦形剤など）を含む組成物に該産物を処方する段階も含んでもよい。
【００９０】
本発明の蛋白質が１以上のポリペプチド鎖（例えば、Ｆａｂ断片などの特定の断片）から構成されている態様において、完全蛋白質、例えば本発明の結合蛋白質、が上記宿主細胞中で会合して該細胞から分離できるように、同じかまたは異なる発現ベクターからすべてのポリペプチドが該宿主細胞中で発現されることが好ましい。
【００９１】
本発明の結合蛋白質は、上記細胞の表面に発現しているＤＬＬ４に対して特異性を有する。したがって、本発明の結合蛋白質は、ｉｎ  ｖｉｖｏまたはｉｎ  ｖｉｔｒｏ において、ＤＬＬ４を発現している細胞またはＤＬＬ４が異常発現している部位を検出するために使用することができる。このようにして、本発明の結合タンパク質は、ＤＬＬ４を発現している細胞が存在する身体部位を標的にし、すぐに該結合蛋白質が標的部位（例えば、標的組織，器官または細胞）に作用するようにすることができる。
【００９２】
さらに、本発明の結合蛋白質は、他の実体に接合することができ、そしてＤＬＬ４を発現している細胞が存在する身体部位に対して、これら他の実体を標的にするために使用することもできる。（該結合蛋白質が抗体分子の場合、このような接合体は免疫接合体とも呼ばれる。）
このような他の実体は、標識または他の検出可能成分であってもよく、この場合、これら接合分子は、身体部位、特に異常血管新生で悪化した身体部位、例えば癌 、のｉｎ  ｖｉｖｏまたはｉｎ  ｖｉｔｒｏでの診断またはイメージングに有用である。適切な標識および検出可能成分は当該分野において公知であるが、ここでは例として、放射性ヌクレオチドまたは常磁性粒子を挙げる。検出は、公知技術を用いて実施することができ、例えば、該検出可能成分が常磁性粒子である場合、磁気共鳴映像法（ＭＲＩ）を用いて該粒子を検出することができる。該検出可能成分が放射性物質である場合、ＰＥＴ画像法またはＰＥＴスキャンとも呼ばれる陽電子放出断層撮影法をイメージングのために用いてもよい。超音波画像診断または光学的画像も、適切なら用いることができる。
【００９３】
代わりに、本発明の結合蛋白質は、毒素，酵素，薬物，プレドラッグ、プロドラッグもしくは他の低分子量成分などの生物学的に活性な分子あるいは医療関連の薬剤、組織因子，サイトカインなどの凝固を制御する分子、または核酸分子、例えば、アンチセンス分子もしくはウイルスと接合できるかもしれず 、その場合、ＤＬＬ４を発現している細胞（好ましくは上皮性悪性腫瘍細胞）が存在する身体部位または細胞に対して、例えば、上記の薬物，毒素または酵素などを標的にすることにより、これら接合分子は標的治療に有用であろう。このような生物学的に活性な分子または医療関連の薬剤は、例えば、身体の中において、活性型であっても活性化される予定の型であってもよい。特に、このような分子はＤＬＬ４を発現している細胞、例えば癌細胞を標的にするために使用できる。当業者は、好適な分子、例えば好適な細胞毒性分子の例について熟知している。上記結合蛋白質と接合してもよい好適な分子として、例えば、サポリン，リシン，ゲムシタビン 、およびサマリウム（Ｑｕａｄｒａｍｅｔ（商標 ）の名称で入手可能）などの放射性ヌクレオチド，緑膿菌外毒素，ジフテリア毒素，炭疽，破傷風毒素，アブリン，カプサイシン ならびにクロモリンが挙げられる。
【００９４】
結合蛋白質の接合体は、よって本発明の好ましい結合蛋白質である。接合体に用いられるべき結合蛋白質は、完全長（全部）抗体，Ｆ（ａｂ’）2，ＦａｂまたはｓｃＦｖが好ましい。
【００９５】
本発明の結合蛋白質とこのような他の実体とを接合させる方法は、当該分野において周知であり記載もされており、そして適切な方法は、接合される該結合蛋白質と該他の実体との性質に応じて容易に選択することができる。よって、該他の実体は、直接または媒介物、例えば適切なリンカーを介して本発明の結合蛋白質と接合することができる。該接合体は、例えば、共有結合性であっても非共有結合性であってもよい（例えば、該結合蛋白質と、より好都合なことには化学基やペプチドタグなどの中間を繋ぐ実体と複合体を形成することによって、該他の実体は該結合蛋白質と接合することができる）。複合体のような結合は、例えば、多くの放射性同位元素にとって適切である。  このような態様において、上記結合蛋白質（例えば、上記の抗体または抗体断片）は、上記接合された実体とともに、例えば、ミセル，リポソーム，気泡またはナノ粒子などの人工粒子を形成している人工膜に含まれるか、または取り込まれることができるかもしれない。これら粒子は、該結合蛋白質により標的身体部位に導かれ、その後、該標的部位で上記細胞と融合するか、またはエンドソーム経路を介して内在化することができ、その結果、該人工粒子から該標的細胞（例えば、腫瘍細胞）へ上記接合実体（例えば、上記の生物学的に活性な分子または医薬関連の薬剤）が放出される。さらに、このような人工膜内に分子を取り込む方法は、当該分野において周知であり記載もある。本発明者らは、ヒト膵癌および正常な膵臓組織内でのＤＬＬ４の発現を詳細に調べた。本実施例の項目に記載されているように、１０個の膵癌のケースからなる臨床材料中でのＤＬＬ４の発現を研究するために、市販の抗ヒトＤＬＬ４  ｍＡｂ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍ社）を用いた免疫染色を実施した。リンパ節転移を含む主な腫瘍病変の切片を、「正常な」膵臓組織と同等であると考えられる、腫瘍がない病変の切片と比較した。 すべてのケースにおいて、ＤＬＬ４の発現は、正常なランゲルハンス島および癌細胞の相当の部分でもっとも高く、続いて排出微細管，脂肪組織，小血管，および動脈であった。主膵管および成熟静脈では、陽性の染色細胞は、たとえあるとしてもほとんど、認められなかった。血管系内においては、ＤＬＬ４の発現は比較的、動脈および毛細血管に限定されていた。動脈では、ＤＬＬ４発現の優勢な部位は、周皮またはその周辺であり、内皮ではなかった。  商業的供給源から組換え型可溶性の形態のＤＬＬ４を容易に入手できたことから、当業者はそれを使用したことを充分理解している。本発明の結合蛋白質は未変性ＤＬＬ４に結合することができるため、本発明は、組換え型可溶性ＤＬＬ４に対する結合蛋白質に決して限定されるものではない。  図１に示すように、このようにして得られた新規抗ＤＬＬ４  ｍＡｂは、ヒトＤＬＬ４をトランスフェクトしたＣＨＯ細胞と反応したが、モックをトランスフェクトしたＣＨＯ細胞（ネガティブコントロール）には反応せず、組換え型可溶性マウスＤＬＬ４をトランスフェクトしたＣＨＯ細胞にも反応しなかった。図１は、該ｍＡｂがヒトＤＬＬ４に対して高い特異性を有することを示している。  さらに、ヒトＪａｇｇｅｄ１ ，Ｊａｇｇｅｄ２，またはＤＬＬ１をトランス��ェクトしたＣＨＯ細胞に対して、３種類の抗ＤＬＬ４  ｍＡｂはいずれも交差反応を示さなかった（データを示さず）。これによって、該ｍＡｂのヒトＤＬＬ４に対する特異性がさらに裏付けられた。  該抗体は、ＤＬＬ４をトランスフェクトしたＣＨＯ細胞に対するヒトＮｏｔｃｈ１ −Ｆｃの結合阻害能によってもスクリーニングされた。図２に示すように、該抗ＤＬＬ４  ｍＡｂは、ヒトＤＬＬ４をトランスフェクトしたＣＨＯ細胞に対してＮｏｔｃｈ１−Ｆｃの結合を阻害した。  上記ＳＴＬ４抗体も、Ｎｏｔｃｈを媒介したシグナリングの阻害能によって、Ｎｏｔｃｈ／ＣＳＬレポーターを用いてスクリーニングされた。Ｎｏｔｃｈを媒介したシグナリングにおけるＳＴＬ４の阻害効果を図４に示す。  本発明者らは、ＳＴＬ４抗体がＨＵＶＥＣ（ヒト臍帯静脈内皮細胞）の遊走に対して阻害効果を有することも実証した（実施例７を参照）。したがって、上記結合蛋白質は、内皮細胞、好ましくはヒト内皮細胞，もっとも好ましくはＨＵＶＥＣ細胞の走化性を調節する、例えば阻害する）か有意に低減させることが好ましい。  したがって、本発明のさらなる側面は、治療，診断またはイメージングにおける使用のための、本明細書に定義する本発明の結合蛋白質を提供する。好ましくは、上記結合蛋白質は、異常なＤＬＬ４シグナリングシグナリングおよび／または異常血管新生によって特徴付けられる疾患または症状 の処置あるいは診断において使用される。別の見方によると、該結合蛋白質は、ＤＬＬ４のレベルおよび／または機能を調節するために使用される。一態様において、該結合蛋白質は、血管新生を調節するために使用される。
【００９６】
「異常なＤＬＬ４シグナリングシグナリング」とは、同じ発育段階にある健康な個体の同じ組織と比較して、ＤＬＬ４および／またはそのリガンドもしくは受容体のいずれかの発現および／または活性の増加または低下を意味する。好ましくは、異常なＤＬＬ４シグナリングは、ＤＬＬ４の発現および／または活性の増加または低下を意味する。ＤＬＬ４の発現および／または活性が増加することが好ましい。
【００９７】
発現レベルを測定する方法は当該分野において公知であり、その方法として、定性的なウェスタンブロット解析，免疫沈降，放射性学的アッセイ，ポリペプチド精製，分光光度的解析，アクリルアミドゲルのクーマシー染色，ＥＬＩＳＡ，ｒｔ−ＰＣＲ，二次元ゲル電気泳動，マイクロアレイ解析，インシチュー・ハイブリダイゼーション，化学発光，銀染色，酵素試験，ポンソーＳ染色，免疫組織化学的アッセイ，放射免疫アッセイ，比色分析，免疫放射定量測定法，陽電子放出断層撮影，ノーザンブロッティング，蛍光分析およびＳＡＧＥが挙げられるが、これらに限定されない。例えば、Ausubel et al, eds. (2002) Current Protocols in Molecular Biology, Wiley-Interscience, New York,を参照される。
【００９８】
「血管新生」とは、血管、特に毛細血管の成長を含む組織の血管新生反応のプロセスを意味する。血管新生は、内皮細胞の増殖および／または分化を含んでもよい。よって、血管新生は、血管の発生，成長，伸長，または持続を包含する。
【００９９】
「異常血管新生」とは、毛細血管（ただし、これに限定されない）などの血管の、不規則な発生，成長，伸長，もしくは持続を含む、任意の疾患，疾病，または発育上の症状を意図する。
【０１００】
「ＤＬＬ４レベルの調節」とは、標的領域または組織に存在するＤＬＬ４のレベルが、少なくとも１％，５％、好ましくは少なくとも１０％，２０％、より好ましくは少なくとも３０％，４０％，５０％，６０％，７０％，８０％，９０％，９９％変化することを意図する。
【０１０１】
「血管新生の調節」とは、標的領域または組織に存在するその容積もしくは血管内皮細胞の数および／または血管密度が、少なくとも１％，５％、好ましくは少なくとも１０％，２０％、より好ましくは少なくとも３０％，４０％，５０％，６０％，７０％，８０％，９０％，９９％変化することを意図する。
【０１０２】
結合蛋白質の血管新生調節能は、当該分野で周知の技術を用いてアッセイすることができる。例えば、ＨＵＶＥＣ（ヒト臍帯静脈内皮細胞）フィブリンゲルビーズ（fibrin gel bead）アッセイは、はっきりとわかる管腔様構造を有する出芽の形成および増殖を詳細に調べるために用いることができる。
血管密度は、好適な抗体、例えば内皮細胞特異的抗体を用いた免疫組織化学染色によって定量化できる。簡潔に言えば、組織試料をまず好適な一次抗体に接触させ、次に適切な標識二次抗体に接触させる。該二次抗体が視覚化され、得られるシグナルの位置および強度が記録される。ｉｎ  ｖｉｖｏで血管新生を観測するために皮下チャンバーモデル（skinfold chamber model）を用いることができる。
【０１０３】
上記の疾患および症状は、アテローム性動脈硬化，関節炎，眼性血管新生，子宮内膜症，子宮筋腫，妊娠中毒症および癌から選択されることが好ましく、特に癌が好ましい。癌が処置される態様において、該癌は、子宮頚癌，子宮癌，卵巣癌，膵癌，腎癌，胆嚢癌，肝癌，頭頚部癌，扁平上皮癌，胃腸癌，乳癌（例えば、乳管の，小葉の，および乳頭の癌腫），前立腺癌，精巣癌，肺癌，非小細胞肺癌，非ホジキンリンパ腫，多発性骨髄腫，白血病（例えば、急性リンパ性白血病，慢性リンパ性白血病，急性骨髄性白血病，および慢性骨髄性白血病），脳癌（例えば、星細胞腫，神経膠芽腫，髄芽腫），神経芽細胞腫，肉腫，結腸癌，直腸癌，胃癌，肛門癌，腎癌，膀胱癌，膵癌，子宮内膜癌，形質細胞腫，リンパ腫，網膜芽細胞腫，カポジ肉腫，ウィルムス腫瘍，ユーイング肉腫，黒色腫および他の皮膚癌から好ましく選択される。これら癌のうち前立腺癌または膵癌が好ましい。充実性腫瘍が治療される態様が特に好ましい。転移が阻止される態様も好ましい。
【０１０４】
本発明のさらなる側面は、避妊法における使用のための、本明細書中に定義する本発明の結合蛋白質を提供する。黄体（ＣＬ）は血管新生が著しい部位であり、密集した毛細血管網が形成されることによって、ホルモン産生細胞は、妊娠早期の成立および維持に必要な大量のプロゲステロンの合成および放出に必須の酸素，栄養素およびホルモン前駆体を得易くなる。これによって、本発明の結合蛋白質を避妊薬として使用する可能性が広がる。
【０１０５】
本発明のさらなる態様は、移植手術後の異常血管新生を低減または阻止することにおける使用のための、本明細書中に定義する本発明の結合蛋白質の使用を提供する。移植手術部位での高レベルの血管新生が問題とされることがあり、そのため血管新生のレベルを調節することが望ましく、ある場合には、例えば、角膜またはその一部が移植されるときには、その移植手術部位の血管新生を最小限に抑えることが望ましいとされる。したがって、本発明は、移植治療の結果 を改善する方法を提供し、該方法は、前記の結合蛋白質または発現ベクターの好適量を、移植手術を実施する前，途中および／または後に、患者に投与することを含む。移植手術後の血管新生を低減させるために、移植手術前に好適量の本発明の結合蛋白質を用いて、移植のｉｎ  ｖｉｔｒｏでの処置方法も提供される。
【０１０６】
さらに、本発明は、抗体および抗体断片などの本発明の結合蛋白質，および／または本発明の発現ベクターを、１以上の薬学的に許容し得る賦形剤，担体，希釈剤，緩衝液もしくは安定剤とともに含む組成物を提供する。
【０１０７】
このような組成物は、結合蛋白質または発現ベクターを使用する、本明細書中に記載されている本発明の任意の側面において用いることができ、例えば、本明細書中に記載されている任意の該方法，使用またはキットに用いることができる。  本発明のさらなる側面は、本明細書中に記載の任意の治療または診断の技術における使用のための組成物または医薬の製造における、本明細書中に定義する本発明の結合蛋白質および／または発現ベクターの使用を提供する。
【０１０８】
本明細書中に定義する本発明の結合蛋白質の有効量を、対象に投与する、または対象から採取した試料（例えば、血液試料）に投与し、その後当該試料を前記対象に戻すことを含む対象の処置方法は、本発明のさらなる態様を提供する。
【０１０９】
本明細書中に記載のｉｎ  ｖｉｖｏの方法は、一般的に哺乳動物に対して実施される。任意の哺乳動物を処置することができ、例えば、ヒトおよび任意の家畜類（livestock），家畜動物（domestic animal）または実験動物である。具体例として、マウス，ラット，ブタ，ネコ，イヌ，ヒツジ，ウサギ，ウシ，およびサルが挙げられる。しかしながら、該哺乳動物として、好ましくはヒトである。
【０１１０】
本明細書中で用いられる「治療」または「処置」という用語は、予防的治療を包含し、それによって疾病が阻止されることがある。「治療」および「処置」という用語は、疾病に対抗し治す以外に、疾病または該疾病に関連する１以上の症候の抑制，軽減または緩和も包含する。
【０１１１】
本明細書中に用いられる「有効量」は、処置の性質に応じて治療効果のある量もしくは予防効果のある量、または避妊，診断もしくはイメージングに有効な量に言及することができる。治療効果のある量は、望ましい治療結果を達成するために（適切な量および投薬計画で）必要な量であると考えることができる。予防効果のある量は、望ましい予防結果を達成するために（適切な量および投薬計画で）必要な量であると考えることができる。以下に示すように、該当量は、該患者の体重，年齢および性別、該疾病の重症度ならびに個人における望ましい反応を引き出す上記結合蛋白質の能力に応じて変化するだろう。
【０１１２】
本発明の組成物は、当該分野において公知であり、かつ広く文献に記載されている任意の従来法に従って処方することができる。よって、組成物の特定の使用に適切な１以上の従来薬学的に許容し得る担体，希釈剤および／または賦形剤などと、任意で他の活性物質（それらの例は後述する）とともに、投与に好適なまたは投与に好適にさせることができる従来の調製品を製造するために、上記活性成分（すなわち、上記結合蛋白質）を含むことができる。該組成物は、例えば、溶液，分散液，懸濁液，錠剤，丸薬，粉末，小袋，カプセル，エリキシル剤，乳液，シロップ，軟膏，リポソーム，座薬などのように、液体として，半固体としてまたは固体として処方してもよい。好ましい形態は、投与および治療に適応した所望する様式によって決まる。本発明の結合蛋白質を含む組成物は、注射剤または点滴剤の形態で調製されることが好ましい。
【０１１３】
他の適切な任意の様式、例えば経口投与を用いてもよいが、投与の好ましい様式は、例えば、腹腔内，静脈内，皮下，筋肉内，腔内または経皮などの非経口的なものである。静脈内注射または点滴は特に好ましい。適切な任意の部位への投与を用いてもよい。例えば、上記組成物を、措置が必要な部位に局所的に直接投与してもよく、または身体の適切な位置に対して狙い易くする実体と付着、でなければ結合、例えば接合させてもよい。
【０１１４】
生理的に適合する任意の担体，賦形剤，希釈剤，緩衝剤または安定剤を、本発明の組成物に使用することができる。適切な担体，賦形剤，希釈剤，緩衝剤および安定剤の例として、１以上の水，生理食塩水，リン酸緩衝生理食塩水，Ｄ形グルコース（dextrose），グリセロール，エタノールなど，およびそれらの組み合わせが挙げられる。場合によっては、例えば、糖類，多価アルコール（マンニトール，ソルビトール等）のような等張剤，または塩化ナトリウムを含んでもよい。該組成物は、平滑剤，湿潤剤，乳化剤，懸濁化剤，保存剤，甘味剤，香味剤などをさらに含むことができる。本発明の組成物は、当該分野において周知の手段を採用することによって、対象に投与した後、上記活性成分の迅速な，持続した，または遅発性の放出を提供するために処方することができる。上述したように、該組成物は注射するのに好適な形態であることが好ましく、好適な担体は、適切な任意の濃度で存在してもよいが、典型的な濃度は１％から２０％まで、好ましくは５％から１０％までである。
【０１１５】
治療組成物は、製造および保管の条件下で、典型的には、無菌かつ安定でなくてはならない。このような無菌かつ安定な状態を獲得する適切な方法は、当該分野において周知であり記載もある。
【０１１６】
本発明の結合蛋白質に加えて、該組成物は、異常なＤＬＬ４シグナリングに関連した疾病またはＤＬＬ４活性が有害である疾病、例えば、癌，アテローム性動脈硬化症，関節炎または眼性血管新生を処置するために有効な薬剤のような、１以上の他の活性成分をさらに含むことができる。哺乳動物の処置において使用されるべき組成物に含まれる適切な追加活性薬剤は、当業者に公知であり、該組成物を用いて処置されるべき疾病の性質に応じて選択することができる。癌処置に好適な追加薬剤として、他の標的物質に結合する抗体，サイトカイン，および化学薬品、例えば、副作用を抑制する標準的な化学療法剤（小分子量薬物）または薬物が挙げられる。
【０１１７】
本発明の結合蛋白質および他の活性成分（含まれている場合）の好適な投与量は患者によって異なるものであり、特定の疾患の性質によっても決まることとなる。好ましくは、該投与量は、関連する処置の性質にもよるが、治療上有効な量または予防上有効な量からなる。好適な投与量は、該患者の体重，年齢および性別ならびに該疾病の重篤度に従って当業者または医師によって決定することができる。該結合蛋白質の、個人から望ましい反応を引き出す能力も要因となる。典型的な１日の用量は：０．１〜２５０ｍｇ／ｋｇ、好ましくは０．１〜２００または１００ｍｇ／ｋｇ、より好ましくは１〜５０または１〜１０ｍｇ／ｋｇ、例として、該活性成分を約５ｍｇ／ｋｇで用いる。単独の単位用量として、または１日に１度以上投与される複数の単位用量として、これを投与することができる。適切な投与量を患者次第で変えることができるが、任意の特定の対象において、特定の投与計画は、患者個々の必要量に従い時間とともに調整されるべきであることを注意すべきである。よって、本明細書で説明した該投与量の範囲は、典型的なものであるとみなされるべきであり、クレームした組成物の範囲または実施を限定する意図はない。
【０１１８】
本発明は、本発明の１以上の結合蛋白質もしくは組成物、および／または本発明の結合蛋白質をコードする１以上の核酸分子、および／または本発明の核酸配列を含む１以上の組換え型発現ベクター、および／または本発明の組換え型発現ベクターもしくは核酸配列を含む１以上の宿主細胞を含むキットをさらに包含する。該キットは、本明細書中に記載したような方法および使用において用いられることが好ましい。該キットは、キットを構成する部品を使用するための取扱説明書を含むことが好ましい。
【０１１９】
本明細書中で定義された結合蛋白質は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはｉｎ  ｖｉｖｏでの利用およびアッセイのための分子ツールとしても使用することができる。該結合蛋白質は抗原結合部位を有することから特異的な結合対のメンバーとして機能することができ、これらの分子は特定の結合対メンバーを必要とする任意のアッセイに用いることができる。例えば、結合蛋白質がＤＬＬ４のような特定の抗原に結合できる抗体または抗体断片である態様において、これらの分子は、特定の抗原に特異的な抗体を必要とする任意のアッセイにおいて用いることができる。例えば、ＤＬＬ４の検出が必要とされるか、または望ましいとされる任意のアッセイにおいて該結合蛋白質が用いられる。本明細書中に開示した該結合蛋白質を含む診断方法および使用は、本発明のさらなる側面を含む。
【０１２０】
したがって、本発明のさらなる側面は、本明細書中で定義した本発明の結合蛋白質（例えば、結合蛋白質接合体）の適切量を対象に投与すること，ならびに本発明の結合蛋白質もしくは結合蛋白質接合体の、対象中における存在および／または量および／または位置を検出することを含む、対象に対する診断またはイメージングの方法である。
【０１２１】
さらなる側面において、本発明の結合蛋白質は、血管新生を調節するためにｉｎ  ｖｉｔｒｏで使用することができる。
したがって、本発明は、ＤＬＬ４および／またはＮｏｔｃｈの活性を調節するための、本発明の結合蛋白質のｉｎ  ｖｉｔｒｏでの使用を含む。例えば、本発明の結合蛋白質は、ＤＬＬ４および／またはＮｏｔｃｈの活性を阻害または抑制するために使用することができる。
【０１２２】
本発明の結合蛋白質は、ＤＬＬ４に特異的なさらなる結合蛋白質を製造するためにも使用することができる。このような使用は、例えば、原型結合蛋白質のアミノ酸配列において、、１以上のアミノ酸を付加，欠失，置換または挿入して、新規の結合タンパク質を形成すること、ここで該原型結合蛋白質は本明細書中の他の個所で定義した本発明の結合蛋白質の一つである、および得られた新規の結合蛋白質がＤＬＬ４特異的結合蛋白質であることを確認するための試験をすることを伴う。このような方法は、ＤＬＬ４結合能を有することがすべてについて試験される、複数の新しい結合蛋白質を形成するために用いられる。上記の１以上のアミノ酸の付加，欠失，置換または挿入が、１以上の上記ＣＤＲドメインに対して起こることが好ましい。
【０１２３】
原型結合蛋白質に対するこのような変更または突然変異は、当該分野において周知であり記載もされている技術を用いて適切な任意の方法において実施でき、例えば、ランダム変異誘発または部位特異的変異誘発の方法を実施できる。部位特異的変異誘発を用いる場合、適切な残基が突然変異したことを確認する一つの戦略とは、抗原結合に関与する重要な残基を特定するために該結合蛋白質−抗原複合体の結晶構造の分解能を利用することである（Davies D.R., Cohen G.H. 1996. Interactions of protein antigens with antibodies. Proc Natl. Acad. Sci. U.S A. 93, 7-12）。続いて、この相互作用を促進させるために、これら残基を突然変異させることができる。もう一つの方法として、１以上のアミノ酸残基を、単に定方向突然変異の標的とすることもでき、そしてＤＬＬ４に対する結合への作用を評価する。
【０１２４】
ランダム変異誘発は、適切な任意の方法、例えば、変異性（error-prone）ＰＣＲ，チェイン・シャフリング（chain shuffling）または突然変異誘発大腸菌株（mutator E.coli strain）によって実施できる。
【０１２５】
よって、本発明の１以上のＶHドメインは、適切な任意の供給源から得られた単独のＶLドメインまたはＶLドメインのレパートリーと組み合わせることができ、その結果得られた新しい結合蛋白質をＤＬＬ４特異的結合蛋白質であると確認するために試験する。逆に、本発明の１以上のＶLドメインは、適切な任意の供給源から得られた単独のＶHドメインまたはＶHドメインのレパートリーと組み合わせることができ、その結果得られた新しい結合蛋白質をＤＬＬ４特異的結合蛋白質であると確認するために試験する。
【０１２６】
同様に、本発明のＶHおよび／またはＶLドメインのうち１以上のＣＤＲが、あるいは好ましくは３つすべてのＣＤＲが、ＶHおよび／またはＶLドメイン単独、あるいはＶHおよび／またはＶLドメインのレパートリーと適切になるように接合することができ、その結果得られた新しい結合蛋白質をＤＬＬ４特異的結合蛋白質であると確認するために試験する。
【０１２７】
上記ＣＤＲの標的突然変異は、抗体との親和性を上げるための特に有効な技術であり、好ましいものである。該ＣＤＲ３の３〜４アミノ酸のブロックを突然変異誘発の標的とすることが好ましい。
【０１２８】
突然変異のための好ましい標的部位は、露出したアミノ酸をコードする部位、好ましくは上記抗原との結合部位の一部を形成するアミノ酸をコードする部位である。突然変異のための他の好ましい標的部位は、非保存的アミノ酸をコードする部位である。
【０１２９】
アミノ酸および蛋白質ドメインの上述した操作を実施する方法は、当業者に周知である。例えば、該操作は、核酸レベルでの遺伝子工学によって実施されることが好都合だろう。該遺伝子工学において、適切な結合蛋白質およびそのドメインをコードする核酸分子は、その結果得られた発現蛋白質のアミノ酸配列が続いて適切な方法で修飾されるように、修飾される。
【０１３０】
１以上の新しい結合蛋白質をＤＬＬ４に特異的に結合できるか試験することは、当該分野において周知であり記載もある適切な任意の方法で実施することができる。組換え型可溶性ヒトＤＬＬ４は市販されており（本実施例を参照）、例えば、ＥＬＩＳＡ，親和性クロマトグラフィーなどのような従来法によって結合をアッセイするために、該組換え型可溶性ヒトＤＬＬ４を容易に用いることができる。
【０１３１】
これら方法によって製造された新しい結合蛋白質は、ＤＬＬ４に対して、少なくとも上記原型結合蛋白質と同等の親和性を有することが好ましく、本明細書中の他の個所で記載したような本発明の結合蛋白質と同じ方法で処理 され使用される（例えば、治療のため、組成物中に含有など）。ある態様においては、新しい結合蛋白質は原型結合蛋白質よりＤＬＬ４に対する親和性が低い。
【０１３２】
これら方法によって製造された，得られたまたは得られる新しい結合蛋白質は、本発明のさらなる側面を形成する。
本発明の他の特徴および利点は上述の詳細な記載から明確である。しかしながら、本発明の趣旨と範囲内における様々な変化および変更がこの詳細な記載から当業者にとって明確であるから、上述の詳細な記載および以下の具体例は、本発明の好ましい態様を示すものであるが、例としてのみ示されていることを理解されるべきである。
【実施例】
【０１３３】
材料および方法
細胞および培養条件
ＰＫ−１ヒト膵臓腺癌細胞株を、既に記載されたようにして確立し（Kobari M. Establishment of a human pancreatic cancer cell line and detection of pancreatic cancer associated antigen. Tohoku J. Exp. Med., 143: 33-46, 1984）、その他の膵癌 細胞株を、３７℃、加湿された５％ＣＯ２雰囲気下で、１０％仔牛血清（ＦＣＳ）、１００単位／ｍｌペニシリンおよび０．１ｍｇ／ｍｌストレプトマイシンが添加されたＲＰＭＩ１６４０にて、維持した。不死化正常ヒト膵臓管細胞株（immortalized normal human pancreatic suct cell）はフルカワ博士（東北大学医学部病理学科、日本、仙台）の好意により提供され、ＨＥＫ２９３細胞株、繊維芽細胞株および上皮細胞内皮細胞株を１０％ＦＣＳを含む低グルコースＤＭＥＭにて培養し、上記癌細胞株と同様の条件にて維持した。これらの細胞は、６継代を超えては使用しなかった。
【０１３４】
ＣＨＯ細胞を、マウスＤｌｌ４かヒトＤｌｌ４かをコードするプラスミドで、またはコントロール（空）プラスミドでトランスフェクトした。また、安定細胞株（stable cell line）を選択し、クローン化した。  
【０１３５】
動物
オスＳＣＩＤマウス（６週齢または８週齢）を、ニッポンクレア株式会社（Nippon Clea Co）（日本、東京）またはチャールス・リバー株式会社（Charles River Co.）（日本、東京）より購入し、特定病原体除去環境において飼育し、餌および水は自由に摂取可能にした。動物の世話および処置に関するＮＩＨガイドラインを遵守した。
【０１３６】
統計学的分析
本実験はすべて、２反復または３反復で実施した。各実験からの代表的なデータを表示した（平均値±ＳＤまたはＳＥ）。両側スチューデント法によるｔ検定を統計学的分析に使用した。０．０５以下のＰ値を有意とみなした。
【０１３７】
実施例１
臨床材料および免疫組織化学染色
１０個のヒト膵癌の試料を外科的手術により得た。すべての患者は、自己の組織が科学的調査に使用される旨の署名付きのインフォームドコンセントを提供した。それらの正常領域および腫瘍領域を特定した。ヒト組織試料を、４℃の１０％ホルマリン中に固定し、パラフィンで包埋し、４℃で保存した。切片（５μｍ）を免疫組織化学染色用に個々に切除した。パラフィン切片をキシレン中で５分間、脱パラフィン操作を行い、段階的に一連のアルコール（１００％、９５％、および８０％エタノール／二重蒸留水（ｖ／ｖ））で処理し、各回５分間で３回、ＰＢＳ中で再水和した。
【０１３８】
３０％メタノールにおける０．３％のＨ２Ｏ２溶液中で、１５分間スライドをインキュベートすることで、内在性ペルオキシターゼ活性をブロッキングした後、抗原回復剤（Pharmingen,Retrivagen A）で、電子レンジにて１０分間８９℃で処理することによって、抗原活性を得た。該切片を、加湿チャンバー中で、一昼夜４℃にて適当な一次抗体（１％ＦＢＳを含むＰＢＳで希釈されているもの）とともにインキュベートし、各回５分間で３回、ＰＢＳでリンスした。次いで、該切片を室温で適当な二次抗体とともに、６０分間インキュベートした。
【０１３９】
ヒトＤＬＬ４の発現を、一次ＡｂとしてのラットｍＡｂ（R&D Systems）および、二次Ａｂとしてのビオチン化抗ラットＩｇＧ抗体（R&D Systems）を用いて検出した。さらに、室温３０分間におけるペルオキシターゼでラベル化されたストレプトアビジンとのインキュベーションの後、陽性反応を、３，３´−ジアミノベンジダインとともにスライドを５〜１５分間インキュベートすることで、可視化した。本反応を、蒸留水でスライドをリンスすることで終了させた。該スライドをヘマトキシリンで対比染色し、ユニバーサルマウント（Universal Mount）でマウントして、室温で乾燥させた。
【０１４０】
結果−膵癌におけるＤＬＬ４の発現
リンパ節転移を含む主な腫瘍病巣の切片および、腫瘍がない病変箇所（「正常」膵臓組織）の切片を、上述のように染色した。すべての場合において、ＤＬＬ４の発現は、正常なランゲルハンス島および癌細胞の相当な部分 （substantial part of cancer cells）で最も高く、続いて、排出微細管(small excretory duct)、脂肪組織、小血管、動脈であった。主膵管および成熟静脈では、陽性の染色細胞は、たとえあるとしてもほとんど、認められなかった。血管系内においては、ＤＬＬ４の発現は比較的、動脈および毛細血管に限定されていた。動脈では、ＤＬＬ４発現の優性な部位は、外縁部側であり、内皮ではなかった。
【０１４１】
実施例２
ヒトＤＬＬ４に対する中和ｍＡｂの作成
ヒトＤＬＬ４に対する中和ｍＡｂを、組換え型可溶性ヒトＤＬＬ４（R&D Systems）でＢＡＬＢ／ｃマウスを免疫することで、産生した。その免疫脾臓細胞をＰ３Ｕ１メラノーマと融合し、フローサイトリーによって、マウスＤＬＬ４またはヒトＤＬＬ４でトランスフェクトされたＣＨＯ（チャイニーズハムスター卵巣）細胞に対する抗体の活性を分析した。プリスタンで刺激されたヌードマウス（pristan primed nude mice）において産生された腹水からカプリル酸／硫酸アンモニウム沈降法によって、ヒトＤＬＬ４について陽性の結果を示したがマウスＤＬＬについては示さなかった抗体を精製した。
【０１４２】
実施例３
ヒトＤＬＬ４に対する中和ｍＡｂの特性決定
３種類の、ヒトＤＬＬ４に対する新規の中和ｍＡｂを、実施例２に記載のように、産生した。すべての３種類の抗ヒトＤＬＬ４ｍＡｂは、ヒトＤＬＬ４がトランスフェクトされたＣＨＯ細胞には反応したが、偽トランスフェクトされたＣＨＯ細胞またはマウスＤＬＬ４がトランスフェクトされたＣＨＯ細胞には反応しなかった（図１における一つの抗体にて例示される。）。さらに、当該３種類の抗ＤＬＬ４ｍＡｂはいずれも、ヒトＪａｇｇｅｄ１、Ｊａｇｇｅｄ２またはＤＬＬ１がトランスフェクトされたＣＨＯ細胞とは交差反応しなかった（データを示さず。）。すべての３種類の抗ＤＬＬ４ｍＡｂは、ＤＬＬ４でトランスフェクトされたＣＨＯ細胞へのＮｏｔｃｈ１−Ｆｃの結合を阻害した（図２における一つの抗体にて例示される。）。これらのデータは、新規抗体が、Ｄｌｌ４におけるＮｏｔｃｈ結合部位に近接した、または重なり合ったエピトープと反応することを示している。
【０１４３】
一連の培養上清希釈液中における、ＤＬＬ４とのより強力な反応性に基づいて、これらの抗体の１つであるＳＴＬ４と称される抗体を、さらなる特性決定のために選択した。
実施例４
腫瘍増殖における抗ＤＬＬ４抗体の効果
ＰＫ−１細胞（１ｘ１０７／１００μｌ  ＲＰＭＩ）を、マウスの背側側腹領域内に皮下注射して導入した。この操作は、マウス内において、ヒト細胞からなる腫瘍を増殖させる。接種の１週間後に、これらのマウスを、それぞれ１０匹のマウス群に無作為に分けた。次いで、ある一群は、ヒトＤＬＬ４に対するモノクローナル抗体での処置を受けた。一方の一群は、ネガティブコントロールとして供され、コントロールのハムスターＩｇＧ（ジャックソンイムノリサーチ（Jackson ImmunoResearch））を受けた。
【０１４４】
当該処置は、５週間にわたる、週２回の腹膜内部の注射からなる。また、腫瘍の直径を、キャリパーを用いて、１週間につき２回測定し、腫瘍体積を、式：Ｖ＝Ｄ×ｄ２×０．４（ここで、Ｖ＝腫瘍体積、Ｄ＝最大直径およびｄ＝最小直径）によって決定した。
【０１４５】
上記結果を図３にて示す。この結果から、抗ヒトＤＬＬ４抗体が腫瘍増殖の阻害を引き起こしたことが分かる。
本実験はマウスモデルにおいて実施されたものだから、血管新生が主としてマウスＤＬＬ４によって調節されており、抗ヒトＤＬＬ４は明らかにマウスＤＬＬ４を阻害しない（上記実施例にて示される。）。ヒトの対象においては、すべてのＤＬＬ４はヒトのものだらか、抗ＤＬＬ４抗体はさらに良好な結果をもたらすことが予想される。
【０１４６】
これらのデータは、腫瘍の血管新生の制御における、血管由来のＤｌｌ４の重要性を強調するものである。
この動物モデルにおいて、抗Ｄｌｌ４抗体（ＳＴＬ４）が効果を発揮する服用量には、まったく毒性作用がない旨が示された。
【０１４７】
実施例５
ヒトの細胞および組織におけるＤＬＬ４の発現
ＤＬＬ４は、様々なヒトの腫瘍細胞において発現されていることが、以前より示されている。ＳＴＬ４の反応性を、乳癌に由来する様々なヒト細胞株におけるフローサイトメトリー分析、および膵臓腫瘍サンプル、前立腺腫瘍サンプルまたはヒト膀胱癌サンプルにおける免疫組織化学分析を用いて評価した。また、これらすべてのサンプルにて、ＳＴＬ４の反応性を実証した。
【０１４８】
実施例６
Ｎｏｔｃｈシグナリング分析
本分析を実施して、ＳＴＬ４が、ＤＬＬ４を介在するＮｏｔｃｈシグナリングに干渉するかを究明した。
【０１４９】
プレートを、組換え型ＤＬＬ４リガンドを１μｇ／ｍｌで添加したか、あるいは添加していない、フィルター滅菌済みの０．２％ゼラチン溶液で（一昼夜）コーティングした。ＨＥＫ２９３ａ細胞（Ｎｏｔｃｈを発現している）を、これらのプレート上に播種した。翌日、該細胞を、Ｎｏｔｃｈ／ＣＳＬレポーターでトランスフェクトした。該Ｎｏｔｃｈ／ＣＳＬレポーターは、内在性ＣＢＦ−１が結合して遺伝子転写を抑制することとなる、複数のＣＢＦ−１ＤＮＡ結合部位を有するプロモーターを含む。Ｎｏｔｃｈ受容体へのＮｏｔｃｈリガンド（たとえば、ＤＬＬ４）の結合の後に、Ｎｏｔｃｈ受容体の切断が生じ、Ｎｏｔｃｈ細胞内ドメインの放出に至る。このＮｏｔｃｈ細胞内ドメインはＣＢＦ−１に結合して、転写リプレッサーから転写アクチベーターにＣＢＦ−１を変化させて、ルシフェラーゼレポーター分子を駆動させる。１時間経過後、適当なウェルに、ＳＴＬ４を１２５μ／ｍＬで添加した。翌日、全プレートを、ＯＮＥ  ＧＬＯ試薬を用いて読み取って、ルシフェラーゼ活性を測定し、当該プレートをルミノメーターにて読み取った。
【０１５０】
本結果を図４に示す。この図からわかるように、ＨＥＫ２９３細胞は、ＤＬＬ４でコーティングされたウェルにおいて、Ｎｏｔｃｈシグナリングカスケードの活性化が示されたが、コントロールのウェルにおいては示されなかった。このシグナリングは、ＳＴＬ４によって阻止された。アイソタイプのコントロール抗体は、ＤＬＬ４を介在としたＮｏｔｃｈの活性化において、全く効果を発揮しなかった（図示せず）。これらのデータは、ＳＴＬ４が、ＮｏｔｃｈとのＤＬＬ４の相互作用を阻止し、そのためＮｏｔｃｈ介在シグナリングに干渉することができることを示している。
【０１５１】
実施例７
ＨＵＶＥＣ遊走アッセイ
ＨＵＶＥＣ（ＴＣＳセルワークス（TCS CellWorks）、英国、クライドン（Claydon）、より購入）を、大血管上皮細胞用増殖培液にて培養した。セルトラッカーグリーンダイＣＭＦＤＡ（CellTracker Green dye CMFDA）（Molecular Probesより購入）を、細胞培養用フラスコ培液に添加し、当該ダイが５μＭの最終濃度になるようにし、１時間インキュベーターに放置した。次いで、細胞をトリプシン処理して、細胞数を計測した。
【０１５２】
トランスウェルインサート（transwell insert）（３mｍ細孔、ＢＤバイオサイエンスズ（BD Biosciences）から購入したＢＤフルオロブロック（BD FluoroBlok））に、３００μｌ中に３×１０４の希釈率で細胞を加えた。当該ウェルの底部に、化学誘引物質（５％ＦＣＳ）を含む８００μｌの無血清培養液を添加した。当該細胞を放置して、４時間遊走させた。遊走した細胞を、ＵＶ照射の下、リアルタイムで視察した。遊走データを、イメージプロプラスソフトウェア（Image Pro Plus Software）（メディアサイバーネティクス（MediaCybernetics）英国）を用いて、処理した。
【０１５３】
結果
ヒト内皮細胞の培養液へのＳＴＬ４の添加は、これらの細胞の増殖においては、有意な効果を有していなかった（データを示さず。）。しかしながら、遊走アッセイにおいて使用された場合、正常酸素圧条件および低酸素条件のどちらにおいても、ＳＴＬ４はＦＣＳに対するＨＵＶＥＣの遊走を阻止することができた（図５）。これらのデータは、ＳＴＬ４が血管新生を阻害できることを示している。
【０１５４】
実施例８
キメラ化抗体の調製
本実施例でｃＳＴＬ４と称されるキメラ化抗体は、配列番号１のＶＨドメインおよび配列番号２のＶＬドメインを含むものであり、この抗体は標準的な手順で調製された。簡潔に言えば、ＶＨおよびＶＬドメインをコードする核酸配列をＰＣＲ（ポリメラーゼ連鎖反応）によって増幅した。ｐＣＡｃｃプラスミドベクターにクローニングすることによって、ＶＨドメインを、ヒトＩｇＧ重鎖定常領域であるＣＨ１−Ｈ−ＣＨ２−ＣＨ３に融合させ、ＶＬドメインをヒト軽鎖定常領域であるκに融合させた。
【０１５５】
ｐＣＡｃｃは、ＣＭＶ−エンハンサーおよびβアクチン−プロモーターによって駆動される強力な哺乳類細胞用の発現ベクターである。当該ベクターは、一過性発現（transient expression）に適したものである。ｐＣＡｃｃのマップを図６に示す。
【０１５６】
図７および８は、軽鎖および重鎖が各ｐＣＡｃｃベクターのどこにクローニングされたかを示す。
ＤＬＬ４に対するｃＳＴＬ４の特異的な結合は、ヒトＤＬＬ４でトランスフェクトされたチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞またはトランスフェクトされていないＣＨＯ細胞を使用したフローサイトメトリーによって確認された（図９）。  
【０１５７】
実施例９
親和性の測定
ＢｉａｃｏｒｅＡ１００分析器を使用して、キメラ化抗ＤＬＬ４抗体であるｃＳＴＬ４の結合親和性を評価した。組換え型Ｄｌｌ４純品への結合を、２０、１０、５、２．５および１．２mｇ／ｍｌの抗体濃度を用いて評価した。結合曲線を図１０に示す。ＫＤは、４．０８ｘ１０−１０Ｍと算出された。Ｋａは２．４５ｘ１０９１／Ｍであり、Ｋｄは８．７９ｘ１０−５１／Ｓであった。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図９】
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【図１０】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【配列表】
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