(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
温室効果の一因となる硫黄酸化物（ＳＯx）、揮発性有機化合物（ＶＯＣ）、メタン（ＣＨ4）、炭素酸化物、窒素酸化物（ＮＯx）、炭素−ハロゲン含有化合物および硫黄−ハロゲン含有化合物よりなる群から選択される気体の微生物による処理方法において、
温室効果の一因となる該気体を捕捉する工程であって、捕捉された気体の移送および気体の再生を可能にする捕捉手段を用いる、工程、
捕捉された該気体を泥炭地またはその近くに配置された処理施設に移送する工程、
泥炭地内への該気体の導入前に気体を再生する工程、かつ
該気体を微生物が捕捉しそして変化させる泥炭の奥底に温室効果の一因となる該気体を一方向注入により導入する工程
を含んでなる、方法。
【請求項２】
炭素酸化物が一酸化炭素（ＣＯ）および二酸化炭素（ＣＯ2）よりなる群から選択される請求項１に記載の方法。
【請求項３】
窒素酸化物がＮＯ3-、ＮＯ2-、ＮＯ、Ｎ2Ｏ、Ｎ2Ｏ2、Ｎ2Ｏ3、Ｎ2Ｏ4、およびＮ2Ｏ5よりなる群から選択される請求項１に記載の方法。
【請求項４】
炭素−ハロゲン含有化合物がヒドロフルオロカーボン（ＨＦＣ）、クロロフルオロカーボン（ＣＦＣ）、およびペルフルオロカーボン（ＰＦＣ）よりなる群から選択される請求項１に記載の方法。
【請求項５】
ペルフルオロカーボン（ＰＦＣ）がＣＦ4およびＣ2Ｆ6よりなる群から選択される請求項４に記載の方法。
【請求項６】
炭素−ハロゲン含有化合物が臭化メチル（ＣＨ3Ｂｒ）および四塩化炭素（ＣＣｌ4）よりなる群から選択される請求項１に記載の方法。
【請求項７】
硫黄−ハロゲン含有化合物が六弗化硫黄（ＳＦ6）である請求項１に記載の方法。
【請求項８】
硫黄酸化物が二酸化硫黄（ＳＯ2）、三酸化硫黄（ＳＯ3）、および硫酸塩（ＳＯ4-2）よりなる群から選択される請求項１に記載の方法。
【請求項９】
揮発性有機化合物が非メタン炭化水素、アルコール、アルデヒドおよび有機酸よりなる群から選択される請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
捕捉手段が温室効果気体を吸収、会合、キレート化、ストリッピング、溶解、改質または精製することである請求項２に記載の方法。
【請求項１１】
温室効果の一因となる気体を捕捉するための捕捉手段が水溶液を含んでなる請求項２に記載の方法。
【請求項１２】
温室効果の一因となる気体を捕捉するための捕捉手段がアルカリ性溶液を含んでなる請求項２に記載の方法。
【請求項１３】
温室効果の一因となる気体を捕捉するための捕捉手段がアミン溶液を含んでなる請求項２に記載の方法。
【請求項１４】
アミン溶液がアルカノールアミンを含んでなる請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
アルカノールアミンがモノエタノールアミン（ＭＥＡ）、ジエタノールアミン（ＤＥＡ）、トリエタノールアミン、メチルジエタノールアミン（ＭＤＥＡ）、および２−アミノ−２−メチル−１−プロパノールアミン（ＡＭＰ）よりなる群から選択される請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
気体が捕捉溶液の熱脱着により再生される請求項２の方法。
【発明の詳細な説明】
【背景技術】
【０００１】
人間の影響のない環境では、地球と大気温室気体との間に均衡があった。工業的な時代以降、人間に基づく活動が温室効果（ｇｒｅｅｎｈｏｕｓｅ  ｅｆｆｅｃｔ）として知られる事象を生じた。温室効果の一因は、
・メタン
・炭素酸化物
〇  一酸化炭素ＣＯおよび二酸化炭素ＣＯ２
・窒素酸化物（ＮＯｘ）
〇  非反応性気体状窒素、Ｎ２
〇  反応性ＮＯ３−、ＮＯ２−、ＮＯ、Ｎ２ＯおよびＮＯｘ
・硫黄酸化物（ＳＯｘ）
〇  主としてＳＯ２およびＳＯ３
・揮発性有機化合物（ＶＯＣ）
・粒状物質（ＰＭ）
・炭素−ハロゲン化合物
・硫黄ハロゲン化合物
二酸化炭素は最も普遍的な温室気体である。「米国環境保護省によるとメタンは二酸化炭素の２１倍の効力がある」（非特許文献１）。「吸収赤外線中でＮ２ＯはＣＯ２より分子当たり２００倍も効果的な温室気体である。Ｎ２Ｏは大気中のその長い滞在時間（１５０年間）およびその比較的他界赤外吸収（二酸化炭素のものの＞２００倍）のために地球温暖化に対する推定５％寄与度の有力な温室気体である。」（非特許文献２）。さらに、大気中のＮ２Ｏは紫外線の存在下で励起された酸素と反応してＮＯを生成し、それが大気オゾン（Ｏ３）の破壊に触媒作用を与える。大気がすでに７８％Ｎ２である場合には、脱ニトロ化による大気へのＮ２放出は有意な大気効果を有さないが、これらの損失は形態系窒素プールに影響を与えうる。大気Ｎ２は数千年の代謝時間を有する」（非特許文献３）。紫外線は地球の大気に針そして通常はオゾン層を通して逆に反射される。ＮＯｘ放出はオゾン層内で反応して紫外線を捕捉して温室効果として知られる地球温暖化をもたらす。
【非特許文献１】Ｓｅｇｅｌｋｅｎ，  Ｒｏｇｅｒ．  “Ｃｏｒｎｅｌｌ  ｂｉｏｌｏｇｉｓｔｓ  ａｉｍ  ｔｏ  ｇｒｏｗ  ‘ｂｕｇｓ’  ｒｅｓｐｏｎｓｉｂｌｅ  ｆｏｒ  ｇｒｅｅｎｈｏｕｓｅ  ｇａｓ，  ｍｅｔｈａｎｅ，  ｉｎ  ＮＦＳ−ｆｕｎｄｅｄ  ｍｉｃｒｏｂｉａｌ  ｏｂｓｅｒｖａｔｏｒｙ．”  Ｃｏｒｎｅｌｌ  Ｎｅｗｓ  ８  Ｆｅｂ．  ２００２
【非特許文献２】Ａｐｅｌ，  Ｗｉｌｌｉａｍ  Ａ．，  Ｔｕｒｉｃｋ，  Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｅ．  “Ｔｈｅ  ｕｓｅ  ｏｆ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉａ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  ｒｅｍｏｖａｌ  ｏｆ  ｎｉｔｒｏｇｅｎ  ｏｘｉｄｅｓ  ｆｒｏｍ  ｃｏｍｂｕｓｔｉｏｎ  ｇａｓｅｓ，  “Ｆｕｅｌ，  Ｖｏｌ７２，  Ｉｓｓｕｅ  １２，  ｐｇ．１７１５−１７１８，  １９９３
【非特許文献３】“Ｃｈａｐｔｅｒ  ８．  Ｔｅｒｒｅｓｔｒｉａｌ  Ｎｕｔｒｉｅｎｔ  Ｃｙｃｌｉｎｇ．”  Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ｏｆ  Ｔｅｒｒｅｓｔｒｉａｌ  Ｅｃｏｓｙｓｔｅｍ  Ｅｃｏｌｏｇｙ  Ｃｈａｐｉｎ  ＩＩＩ，  Ｆ．  Ｓｔｕａｒｔ，  Ｍａｔｓｏｎ，  Ｐａｍｅｌａ，  Ｍｏｏｎｅｙ，  Ｈａｒｏｌｄ  Ａ．  １ｓｔ  ｅｄ．  ２００２  Ｃｏｒｒ．  ２ｎｄ  ｐｒｉｎｔｉｎｇ，  ２００４，  ＸＩＶ，  ４３６ｐ．  １９９  ｉｌｌｕｓ
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００２】
発明の要旨
本発明は温室効果の一因となる気体の生物隔離（ｂｉｏｓｅｑｕｅｓｔｒａｔｉｏｎ）および有機同化に関する。
【課題を解決するための手段】
【０００３】
これらの方法は、温室効果の一因となる気体を泥炭地に導入し、そこでそれをその後に隔離しそして有機的に同化させることを含んでなる。この方法は、捕獲した気体の移送および気体の再生を可能にする捕獲手段を用いて温室気体を捕獲し、捕獲された気体を泥炭地またはその近くに配置された処理施設に移送し、そして泥炭地内への気体の導入前に気体を再生することをさらに含んでなる。
【０００４】
本発明の概念では、温室効果の一因となる気体は温室気体（ＣＨＧ）、硫黄酸化物（ＳＯｘ）気体、および揮発性有機化合物（ＶＯＣ）よりなる群から選択される。温室気体はさらにメタン（ＣＨ４）、炭素酸化物、窒素酸化物（ＮＯｘ）、炭素−ハロゲン含有気体、および硫黄−ハロゲン含有気体よりなる群から選択することができる。炭素酸化物は一酸化炭素（ＣＯ）および二酸化炭素（ＣＯ２）よりなる群から選択することができる。窒素酸化物はＮＯ３−、ＮＯ２−、ＮＯ、Ｎ２Ｏ、Ｎ２Ｏ２、Ｎ２Ｏ３、Ｎ２Ｏ４、およびＮ２Ｏ５よりなる群から選択することができる。炭素−ハロゲン含有気体はヒドロフルオロカーボン（ＨＦＣ）、クロロフルオロカーボン（ＣＦＣ）、およびペルフルオロカーボン（ＰＦＣ）よりなる群から選択することができる。ペルフルオロカーボン（ＰＦＣ）はＣＦ４およびＣ２Ｆ６よりなる群から選択することができる。炭素−ハロゲン含有気体は臭化メチル（ＣＨ３Ｂｒ）および四塩化炭素（ＣＣｌ４）よりなる群から選択することができる。硫黄−ハロゲン含有気体は六弗化硫黄（ＳＦ６）を含んでなりうる。
【０００５】
温室効果が酸性雨である場合には、本発明の方法は二酸化硫黄（ＳＯ２）、三酸化硫黄（ＳＯ３）、および硫酸塩（ＳＯ４−２）を生物隔離しそして有機同化するために使用することができる。さらに、本発明の方法は非メタン炭化水素、アルコール、アルデヒドおよび有機酸を生物隔離しそして有機同化するために使用することができる。
【０００６】
工業的場所における気体の捕獲は、温室気体を吸収、会合、破砕、キレート化、ストリッピング、解離、溶解、捕捉、改質、沈殿、または精製する能力により特徴づけられうる。捕獲は水、アミン、アルカリ、および／またはアルカノールアミン溶液を用いて達成できる。アルカノールアミン溶液はモノエタノールアミン（ＭＥＡ）、ジエタノールアミン（ＤＥＡ）、トリエタノールアミン、メチルジエタノールアミン（ＭＤＥＡ）、および／または２−アミノ−２−メチル−１−プロパノールアミン（ＡＭＰ）、並びに／或いはそれらの水性配合物を含んでなりうる。
【０００７】
捕獲されたら、気体は例えば捕獲溶液の熱脱着の如き方法により再生されうる。再生されたら、気体を泥炭地に例えば一方向射出の如き方法により気相または液相で泥炭の奥底に導入することができる。
図面の簡単な記述
図１は温室気体捕獲の簡素化された例を示す。
【０００８】
図２は温室気体再生の簡素化された例を示す。
【０００９】
図３はＮ２Ｏ２、Ｎ２Ｏ３、ＮＯ２、Ｎ２Ｏ４、およびＮ２Ｏ５を含有するＮＯｘ気体混合物のクロマトグラムを示す。クロマトグラムは５個のピークを含有し、そこで各ピークは５種の気体のそれぞれに起因する。
【００１０】
図４は泥炭を用いるＮＯｘ気体の２０分間の処理後の上部空間のクロマトグラムを示す。５種のＮＯｘ気体の４種に相当するピークは泥炭処理後の混合物には不在である。
【００１１】
図５は泥炭処理後に残存するＮ２Ｏ５ピークを囲むクロマトグラフ領域の拡大尺を表わす。Ｎ２Ｏ５は泥炭処理後に検出可能な唯一の気体であり、ピーク下面積の減少により示されるように濃度が６８％減少して存在する。
発明の詳細な記述
本発明は工業廃棄物からの１種もしくはそれ以上の環境汚染物の生物隔離および有機同化方法に関する。本発明は工業廃棄物から１種もしくは複数の有毒気体および／または粒状物質を捕獲しそして同化するための費用効果的手段を提供する。
【００１２】
一面で、本発明は温室効果の一因となる気体の生物隔離および有機同化方法に関する。この方法は、温室効果の一因となる気体を泥炭地に入れ、そこでそれをその後に隔離しそして有機的に同化することを含んでなる。本発明の方法では、泥炭地は地理学的位置とは無関係ないずれの泥炭地でもよく、そして多雨性（ｏｍｂｒｏｔｒｏｐｉｃ）または多鉱性（ｍｉｎｅｒｏｔｒｏｐｉｃ）のいずれであってもよい。泥炭地はいずれの規模であってもよくそして天然または人工環境中に存在しうる。泥炭地が導入された気体の有効な生物隔離のためのシステムを含んでなることが本発明の条件である。好ましい態様では、泥炭地はキャップすなわち一団として約５０ｃｍの深さに達するミズゴケ−スゲの層を含んでなる表面を含んでなる。
【００１３】
本発明の温室気体は温室効果の一因となるいずれの気体であっってもよい。用語「温室効果」は、ここでは地球温暖化および／または酸性雨の環境効果を包括することを意図する。温室気体はメタン（ＣＨ４）、炭素酸化物（ＣＯｘ）または窒素酸化物（ＮＯｘ）気体を含んでなりうる。本発明の炭素酸化物は一酸化炭素（ＣＯ）または二酸化炭素（ＣＯ２）を含んでなりうる。本発明の窒素酸化物はＮＯ３−、ＮＯ２−、ＮＯ、Ｎ２Ｏ、Ｎ２Ｏ２、Ｎ２Ｏ３、Ｎ２Ｏ４、またはＮ２Ｏ５を含んでなりうる。
【００１４】
温室気体はさらに炭素−ハロゲンまたは硫黄−ハロゲン含有気体を含んでなりうる。炭素−ハロゲン含有気体臭化メチル（ＣＨ３Ｂｒ）または四塩化炭素（ＣＣｌ４）を含んでなりうる。炭素−ハロゲン含有気体はヒドロフルオロカーボン（ＨＦＣ）、クロロフルオロカーボン（ＣＦＣ）、およびペルフルオロカーボン（ＰＦＣ）よりなる群から選択することができる気体を含んでなりうる。ペルフルオロカーボン（ＰＦＣ）の具体例はＣＦ４およびＣ２Ｆ６を包含する。硫黄−ハロゲン含有気体は六弗化硫黄（ＳＦ６）を含んでなりうる。
【００１５】
温室効果が酸性雨である場合には、本発明の方法による生物隔離および有機同化用の気体はさらに硫黄酸化物（ＳＯｘ）気体および／または揮発性有機化合物（ＶＯＣ）を含んでなりうる。硫黄酸化物気体は二酸化硫黄（ＳＯ２）、三酸化硫黄（ＳＯ３）および硫酸塩（ＳＯ４−２）を含んでなりうる。本発明の揮発性有機化合物の非限定例は非メタン炭化水素、アルコール、アルデヒドおよび有機酸を包含する。
【００１６】
温室効果の一因となる気体の生物隔離および有機同化方法はさらに温室気体の捕獲を含んでなりうる。捕獲は大気中への一時的温室気体の逃げを不可能にする。さらに、捕獲は泥炭地から離れて発生した捕獲された気体の移送を可能にする。気体の捕獲は当該技術で既知である多くの捕獲手段のいずれかを用いて行いうる。捕獲手段は、温室気体を吸収、会合、破砕、キレート化、ストリッピング、解離、溶解、捕捉、改質、沈殿、または精製する能力により特徴づけられうる。捕獲手段は水またはアルカリ性溶液を含んでなりうる。当該技術で使用される捕獲技術の非限定例は、米国特許第６，５９２，８２９号、第３，９６１，０１９号、第４，０３６，５９３号、第４，０８１，５０９号、第５，０３２，２５２号、第５，１６０，４２６号、第６，５７９，５０７号、および第６，５７９，５０８号明細書に記載されており、それらは全て引用することにより本発明の内容となる
。
【００１７】
温室気体は最も普遍的にはアミンまたはアルカノールアミン溶液を用いる化学反応で吸着される。これらの反応は最も費用効果的であり且つ最も良く立証された操作記録を有すると考えられている。当該技術で既知であるアルカノールアミン溶液の非限定例は、モノエタノールアミン（ＭＥＡ）、ジエタノールアミン（ＤＥＡ）、トリエタノールアミン、メチルジエタノールアミン（ＭＤＥＡ）、および２−アミノ−２−メチル−１−プロパノールアミン（ＡＭＰ）を包含する。アミン溶液の組み合わせ、および／またはアルカノールアミン／水溶液配合物を使用する方法は本発明の範囲内に入る。当該技術で既知であるアルカノールアミン／水溶液配合物の例は、Ｈ２Ｏ／ＭＥＡ、Ｈ２Ｏ／ＤＥＡ、Ｈ２Ｏ／ＭＤＥＡ、Ｈ２Ｏ／ＡＭＰ、ＡＭＰ／ＭＤＥＡ／Ｈ２Ｏ、ＡＭＰ／ＤＥＡ／Ｈ２Ｏ、ＤＥＡ／ＭＤＥＡ／Ｈ２Ｏ、ＭＤＥＡ／ＭＥＡ／Ｈ２Ｏ、およびＡＭＰ／ＭＥＡ／Ｈ２Ｏを包含する。いずれか特定の捕獲溶液を本発明の方法と共に使用することは必要条件ではないが、高い温室気体吸収能力並びに低い蒸気圧、高い分解耐性、および低い腐食性を有する捕獲溶液が好ましい。
【００１８】
捕獲用の多くの有効な専用溶媒が開発されておりそしていずれも本発明に関して使用することができる。溶媒選択基準の必須要素は、原料気体特性（組成、圧力、温度など）および捕獲された気体の明細（すなわち工程条件）である。捕獲溶媒の作用能力が捕獲場所におけるその循環速度を制定する。溶媒循環速度は吸収剤塔の寸法、配管システム、循環ポンプおよび必要な施設の寸法に直接的な影響を有する。原料気体中の温室気体の分圧がまず溶媒循環速度をほぼ決める。向流カラムが原料気体と完全に充填された富裕溶媒との接触を与える。従って、最低でも、原料中の所望する温室気体の全てを吸収しそして接触場所における吸収用の推進力を与えるのに充分な溶媒が存在していなければならない。
【００１９】
生成物中の温室気体の分圧が、要求される再生度を決める。溶媒中の温室気体の平衡分圧は生成物気体の分圧より低くなければならない。圧力差が吸収剤の上部における吸収用の推進力を与える。従って、２つの最も重要な費用要素である循環速度および再生エネルギー効率は、原料および生成物中の温室気体分圧によりかなりの程度まで立証される。さらに、化学反応システムの投資のかなりの部分は再生エネルギー効率に依存する。
【００２０】
捕獲されたら、温室気体を次に泥炭地またはその近くに位置する処理施設に送ることができる。捕獲により、適宜、貨物、列車またはトラックによる塊状での移送が可能になる。移送されたら、気体を次に閉鎖システム内で再生しそしてその後に泥炭地に導入することができ、そこでそれが隔離されそして有機的に同化される。導入された温室気体は、特に泥炭地が乱されてなく且つキャップが除去されていなかった場合には、泥炭の窪みの中に物理的に捕獲される。再生手段は多様であることができ、そして使用される具体的な捕獲手段に依存する。好ましい態様では、アミン溶液を用いる化学方法での吸収により捕獲される気体は熱脱着により再生される。再生段階中に気体アミン複合体を破壊するのに必要な熱の程度は反応熱に部分的に依存する。比較的低い熱反応を有する溶媒は比較的高い反応熱を有するものより再生のために少ないエネルギーを必要とする。専用溶媒を包含する種々の溶媒の溶媒作用能力は充分に記述されている（Ｓｏｌｕｂｉｌｉｔｙ  ｏｆ  ｎｉｔｒｏｕｓ  ｏｘｉｄｅ  ｉｎ  ａｍｉｎｅ  ｓｏｌｕｔｉｏｎｓ；  Ｚ．  Ｂｅｎｓｅｔｉｔｉ，  Ｉ．  Ｉｌｉｕｔａ，  Ｆ．  Ｌａｒａｃｈｉ，  Ｂ．Ｐ．Ａ．  Ｇｒａｎｄｊｅａｎ，  Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ  ｏｆ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ  ＆  ＣＥＲＰＩＣ，  Ｌａｖａｌ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，    Ｓａｉｎｔｅ  Ｆｏｙ  （Ｑｕｅｂｅｃ）  Ｃａｎａｄａ  Ｇ１ｋ  ＆ｐ４，  Ｉｎｄｕｓｔｒｉａｌ  ＆
Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ３８，  ３２８−３３２  （１９９９）；  ｔｈｅ  Ｓｅｃｏｎｄ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ  ｏｎ  Ｃａｒｂｏｎ  Ｄｉｏｘｉｄｅ  Ｒｅｍｏｖａｌ  ｉｎ  Ｊａｐ
ａｎ；  ａｎｄ  ｔｈｅ  Ｆｏｕｒｔｈ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ  ｏｎ  Ｇｒｅｅｎｈｏｕｓｅ  Ｇａｓ  Ｃｏｎｔｒｏｌ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ  ｉｎ  Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ）。
【００２１】
再生されたら、気体は泥炭地の窪みの中にポンプ注入され、そこで気体は在留微生物による同化前に最初に有機物質と化学的に結合する。好ましい態様では、気体は泥炭地に例えば泥炭の窪み中への気体または液体相での一方向注入の如き方法により導入される。気体の同化が泥炭を構成する天然有機物質内への気体の導入をもたらす。温室気体と泥炭との間の化学反応が起きたら、微生物が有機物質の急速分解および鉱化において主要な役割を演ずる。有機同化に主として寄与する微生物は、真菌、細菌、および／またはアンチノマイセテス（ａｎｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｓ）を含んでなる。温室気体は泥炭の有機化合物並びに炭素、窒素、酸素、および硫黄の元素に付加する。微生物水準における増減を調整してその後の同化を増減させうる。泥炭中でのその後の同化を行うために酸性度基準を緩和することができる。温室気体が再生されたら、捕獲溶液をさらなる捕獲および再生サイクル用に再循環することができる。
【００２２】
この方法の簡単な例を発電により説明することができる。燃焼サイクル中で標的燃料気体ＮＯｘをそれがアミン溶液を通って燃焼室から出て行く際に泡立たせる。例えば、モノエタノールアミン（ＭＥＡ）、ジエタノールアミン（ＤＥＡ）のアミン水溶液は、１モルのアミン溶液当たり約４５％モルのＮＯｘを吸収しうる。アミン溶液を次に泥炭指定地に隣接する施設に移送することができる。アミン溶媒は閉鎖ループシステム内の温室気体の熱分解により再生される。ＮＯｘ気体を地下配管の一方向グリッドシステムを用いて泥炭窪みに注入することができる。ＮＯｘ放出のないアミン溶液は電気利用施設で泡立て場所に戻されてサイクルを再び繰り返すことができる。
【００２３】
泥炭の窪み内での温室気体の有機同化は、泥炭内で起きる既知の化学反応により行われる。いくつかの代表的な反応を以下に示す。炭素、窒素および硫黄はそれらが大気および土壌と反応する際に同様なサイクルを有する。植物は絶えず空気から二酸化炭素を摂取しそしてそれを酸素と置換する。植物はこのＣＯ２を水と反応させてデンプンおよび酸素を生成する。この炭素サイクルに関する式は、
６ＣＯ２＋５Ｈ２Ｏ  ＞  Ｃ６Ｈ１０Ｏ５（デンプン）＋６Ｏ２
である。
【００２４】
ＣＯ２はさらに泥炭中の微生物との他の反応を受けてＣＯ（一酸化炭素）を生物学的に製造しそして最終的に酢酸塩および／またはメタンを製造する。三酸化硫黄（ＳＯ３）は同様に二酸化硫黄（ＳＯ２）になりそして次に最終的に硫化水素になり、そして次に不完全な燃焼で硫黄および酸素になる。ＳＯ４２−＞ＳＯ３＞ＳＯ２＞Ｈ２Ｓ＞Ｓ。これらの炭素、窒素および硫黄サイクルは同時に行うことができそして互いに似ている。
【００２５】
硝化（Ｎｉｔｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ）は、ＮＨ４＋がＮＯ２−にそして引き続きＮＯ３−に酸化される工程である。硝化剤の１種である独立栄養硝化剤はＮＨ４＋酸化からのエネルギー放射を用いて、光合成により炭素を固定するために植物が太陽エネルギーを使用する方法と同様にして、成長および維持において使用される炭素を固定する。第二の種類の硝化剤である独立栄養硝化剤はそれらのエネルギーを有機物質の分解から得る。独立栄養硝化剤は、２つの群、すなわちアンモニウムを亜硝酸塩に転化させるもの、例えばニトロソロブス（Ｎｉｔｒｏｓｏｌｏｂｕｓ）および他の「ニトロソ−」属、並びに亜硝酸塩を硝酸塩に転化させる他のもの、例えばニトロバクター（Ｎｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ）および他の「ニトロ−」属、を包含する。これらの独立栄養硝化剤は、ＮＨ４＋またはＮＯ２−酸化からのエネルギーを使用してＣＯ２を還元してＣＯ２固定を行うことにより構造および代謝炭素化合物を合成する偏性好気性菌である。独立栄養硝化は多くの生態系におい
て優勢を占めるが、従属栄養硝化も低い窒素アベイラビリティーまたは酸性土壌を有する生態系において重要でありうる。アンチノマイセテスを包含する多くの従属栄養真菌および細菌は、ＮＨ４＋からＮＯ２−またはＮＯ３−を製造する。一部は工程において有機窒素も使用する。最後に、一酸化窒素（ＮＯ）および一酸化二窒素（Ｎ２Ｏ）が硝化中に製造される（”Ｃｈａｐｔｅｒ  ８．  Ｔｅｒｒｅｓｔｒｉａｌ  Ｎｕｔｒｉｅｎｔ  Ｃｙｃｌｉｎｇ．”  Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ｏｆ  Ｔｅｒｒｅｓｔｒｉａｌ  Ｅｃｏｓｙｓｔｅｍ  Ｅｃｏｌｏｇｙ  Ｃｈａｐｉｎ  ＩＩＩ，  Ｆ．  Ｓｔｕａｒｔ，  Ｍａｔｓｏｎ，  Ｐａｍｅｌａ，  Ｍｏｏｎｅｙ，  Ｈａｒｏｌｄ  Ａ．  １ｓｔ  ｅｄ．  ２００２  Ｃｏｒｒ．  ２ｎｄ  ｐｒｉｎｔｉｎｇ，  ２００４，  ＸＩＶ，  ４３６  ｐ．  １９９  ｉｌｌｕｓ．）。（ＮＨ４＋＋１．５Ｏ２＝ＮＯ２−＋Ｈ２Ｏ＋２Ｈ＋）（”Ｎｉｔｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ．”  Ｈｅｎｒｉｋｓｅｎ，  Ｋ，  ａｎｄ  Ｋｅｍｐ，  Ｗ．Ｍ．  １９８８．  Ｎｉｔｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｉｎ  Ｅｓｔｕａｒｉｎｅ  ａｎｄ
Ｃｏａｓｔａｌ  Ｍａｒｉｎｅ  Ｓｅｄｉｍｅｎｔｓ，  ｐｐ．２０７−２４９  ｉｎ
Ｔ．Ｈ．  Ｂｌａｃｋｂｕｒｎ  ａｎｄ  Ｊ．  Ｓｏｒｅｎｓｅｎ  （ｅｄｓ．），  Ｎｉｔｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｉｎ  Ｅｓｔｕａｒｉｎｅ  ａｎｄ  Ｃｏａｓｔａｌ  Ｍａｒｉｎｅ  Ｓｅｄｉｍｅｎｔｓ．  Ｎｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃｙｃｌｉｎｇ  ｉｎ  Ｃｏａｓｔａｌ  Ｍａｒｉｎｅ  Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ，  Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ
Ｓｏｎｓ  Ｌｔｄ．  Ｂｅｒｏｕｎｓｋｙ，  Ｖ．Ｍ．  ａｎｄ  Ｎｉｘｏｎ，  Ｓ．Ｗ．  １９９０．  Ｔｅｍｐｅｒｔｕｒｅ  ａｎｄ  ｔｈｅ  ａｎｎｕａｌ  ｃｙｃｌｅ
ｏｆ  ｎｉｔｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｉｎ  ｗａｔｅｒｓ  ｏｆ  Ｎａｒｒａｇａｎｓｅｔｔ  Ｂａｙ．  Ｌｉｍｎｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  Ｏｃｅａｎｏｇｒａｐｈｙ  ３５，  １６１０−１６１７）。
【００２６】
「用語脱窒（ｄｅｎｉｔｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ）（または完全脱窒）は大気酸素および窒素の酸化物への硝酸塩の完全な還元を示すべきであるが、硝酸塩の消滅を包含する他の方法を硝酸塩還元および硝酸塩同化と称してもよい」（Ｗａｋｓｍａｎ，  Ｓｅｌｍａｎ
Ａ．  Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ｏｆ  Ｓｏｉｌ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ．  Ｂａｌｔｉｍｏｒｅ：  Ｔｈｅ  Ｗｉｌｌｉａｍｓ  ＆  Ｗｉｌｋｉｎｓ  Ｃｏｍｐａｎｙ，  １９３２）．「脱窒微生物は多様な群であり、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）、パラコッカス（Ｐａｒａｃｏｃｃｕｓ）、フラボバクテリウム（Ｆｌａｖｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、チオバシルス（Ｔｈｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ヒフォミクロビウム（Ｈｙｐｈｏｍｉｃｒｏｂｉｕｍ）、アゾスピリルム（Ａｚｏｓｐｉｒｉｌｌｕｍ）、アルカリゲネス（Ａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓ）、ニトロソモナス（Ｎｉｔｒｏｓｏｍｏｎａｓ）およびアクロモバクター（Ａｃｈｒｏｍｏｂａｃｔｅｒ）を包含する多くの属が脱窒種を含有することが知られている。これらの属からの種は種々の生態的地位を占めそして独立栄養生物、従属栄養生物、有機栄養生物および脂肪栄養生物より構成される」（Ａｐｅｌ，  Ｗｉｌｌｉａｍ  Ａ．，  Ｔｕｒｉｃｋ，  Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｅ．  “Ｔｈｅ  ｕｓｅ  ｏｆ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉａ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  ｒｅｍｏｖａｌ
ｏｆ  ｎｉｔｒｏｇｅｎ  ｏｘｉｄｅｓ  ｆｒｏｍ  ｃｏｍｂｕｓｔｉｏｎ  ｇａｓｅｓ．”  Ｆｕｅｌ，  Ｖｏｌ．  ７２，  Ｉｓｓｕｅ  １２，  ｐｇ．１７１５−１７１８，  １９９３）。脱窒方法は異化熱電子受容体として作用するＮＯｘを用いる偏性嫌気性呼吸方法であると思われていた。脱窒は好気性条件下でも起きうる（Ａｐｅｌ，  Ｗｉｌｌｉａｍ  Ａ．，  Ｔｕｒｉｃｋ，  Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｅ．  “Ｔｈｅ  ｕｓｅ  ｏｆ
ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉａ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  ｒｅｍｏｖａｌ  ｏｆ  ｎｉｔｒｏｇｅｎ  ｏｘｉｄｅｓ  ｆｒｏｍ  ｃｏｍｂｕｓｔｉｏｎ  ｇａｓｅｓ．”  Ｆｕｅｌ，  Ｖｏｌ．  ７２，  Ｉｓｓｕｅ  １２，  ｐｇ．１７１５−１７１８，
１９９３）。嫌気性脱窒では、植物（腐敗した有機物質）が必要なエネルギー用の炭素を与える。反応は熱力学的に有利でありそしてこの反応に介在する適切な細菌が存在する時には容易に起きる（Ｅｓｌｉｃｋ，  Ｊａｃｋ  Ｃ．  “Ｂｏｇｓ：  Ａ  Ｗｅｂ  Ｐｒｅｓｅｎｔａｔｉｏｎ．”  ＥＳ７６７  Ｑｕａｔｅｒｎａｒｙ  Ｇｅｏｌｏｇｙ  ２
００１．  Ａｎｄｅｒｓｏｎ，  Ｗ．Ｉ．，  １９９８，  Ｉｏｗａ’ｓ  Ｇｅｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｐａｓｔ：  Ｔｈｒｅｅ  Ｂｉｌｌｉｏｎ  Ｙｅａｒｓ  ｏｆ  Ｅａｒｔｈ  Ｈｉｓｔｏｒｙ，  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｉｏｗａ  Ｐｒｅｓｓ，  Ｉｏｗａ  Ｃｉｔｙ，  Ｉｏｗａ．  Ｂａｒｎｈａｒｔ，Ｒ．Ｋ．（ｅｄｉｔｏｒ），  １９８８，
Ｃｈａｍｂｅｒｓ  Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ  ｏｆ  Ｅｔｙｍｏｌｏｇｙ，  Ｃｈａｍｂｅｒｓ  Ｈａｒｒａｐ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，  Ｌｔｄ．，  Ｅｄｉｎｂｕｒｇｈ．  Ｂａｔｅｓ，  Ｒ．Ｌ．  ａｎｄ  Ｊａｃｋｓｏｎ，  Ｊ．Ａ．  （Ｅｄｉｔｏｒｓ），
１９８４，  Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ  ｏｆ  Ｇｅｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｔｅｒｍｓ，  ３ｒｄ  Ｅｄ．，  Ａｎｃｈｏｒ  Ｂｏｏｋｓ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ．  Ｃａｄｙ，  Ｇ．Ｈ．，  １９８７，  ｉｎ  ＭｃＧｒａｗ−Ｈｉｌｌ  Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ  ｏｆ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，  Ｐａｒｋｅｒ，  Ｓ．Ｐ．  （Ｅｄｉｔｏｒ），  ＭｃＧｒａｗ−Ｈｉｌｌ  Ｂｏｏｋ  Ｃｏｍｐａｎｙ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ．  Ｃｅｃｉｌ，  Ｃ．Ｂ，  Ｄｕｌｏｎｇ．  Ｆ．Ｔ．，  Ｃｏｂｂ，  Ｊ．Ｃ．，  ａｎｄ  Ｓｕｐａｒｄｉ，  １９９３，
Ａｌｌｏｇｅｎｉｃ  ａｎｄ  ａｕｔｏｇｅｎｉｃ  ｃｏｎｔｒｏｌｓ  ｏｎ  ｓｅｄｉｍｅｎｔａｔｉｏｎ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｃｅｎｔｒａｌ  Ｓｕｍａｔｒａ  ｂａｓｉｎ  ａｓ  ａｎ  ａｎａｌｏｇｕｅ  ｆｏｒ  Ｐｅｎｎｓｙｌｖａｎｉａｎ  ｃｏａｌ−ｂｅａｒｉｎｇ  ｓｔｒａｔａ  ｉｎ  ｔｈｅ  Ａｐｐａｌａｃｈｉａｎ  ｂａｓｉｎ，  ｉｎ；  Ｃｏｂｂ，  Ｊ．Ｃ．，  ａｎｄ  Ｃｅｃｉｌ，  Ｃ．Ｂ．，  ｅｄｓ．，  Ｍｏｄｅｒｎ  ａｎｄ  Ａｎｃｉｅｎｔ  Ｃｏａｌ−Ｆｏｒｍｉｎｇ  Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ，  Ｂｏｕｌｄｅｒ，  Ｃｏｌｏｒａｄｏ，  Ｇｅｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｓｏｃｉｅｔｙ  ｏｆ  Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｓｐｅｃｉａｌ  Ｐａｐｅｒ  ２８６．  Ｃｈａｐｅｌｌ，  Ｆ．Ｈ．，  ２００１，  Ｇｒｏｕｎｄ−Ｗａｔｅｒ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  Ｇｅｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，  ２ｎｄ  Ｅｄ．，  Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ  Ｉｎｃ．，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ．  Ｄａｍｍｏｎ，  Ａ．Ｗ．Ｈ．，  ａｎｄ  Ｆｒｅｎｃｈ，  Ｔ．Ｗ．，  １９８７，  Ｔｈｅ  Ｅｃｏｌｏｇｙ  ｏｆ  Ｐｅａｔ  Ｂｏｇｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｇｌａｃｉａｔｅｄ  Ｎｏｒｔｈｅａｓｔｅｒｎ  Ｕｎｉｔｅｄ  Ｓｔａｔｅｓ，  Ｕ．Ｓ．  Ｆｉｓｈ  ａｎｄ  Ｗｉｌｄｌｉｆｅ  Ｓｅｒｖｉｃｅ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｒｅｐｏｒｔ  ８５（７．１６）  Ｓｕｐｔ．  ｏｆ  Ｄｏｃｕｍｅｎｔｓ，  Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ  Ｄ．Ｃ．  Ｄａｖｉｓ，  Ｊ．Ｈ．，  １９４６，  Ｔｈｅ  Ｐｅａｔ  Ｄｅｐｏｓｉｔｓ  ｏｆ  Ｆｌｏｒｉｄａ：  Ｔｈｅｉｒ  Ｏｃｃｕｒｒｅｎｃｅ，  Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ，  ａｎｄ  Ｕｓｅｓ，  Ｇｅｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｂｕｌｌｅｔｉｎ  Ｎｏ．３０，  Ｔｈｅ  Ｆｌｏｒｉｄａ  Ｇｅｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｓｕｒｖｅｙ，  Ｔａｌｌａｈａｓｓｅｅ，  Ｆｌｏｒｉｄａ．  Ｇｌｏｂ，  Ｐ．Ｖ．，  １９６５，  Ｔｈｅ  Ｂｏｇ  Ｐｅｏｐｌｅ，  Ｉｒｏｎ−ａｇｅ  Ｍａｎ  Ｐｒｅｓｅｒｖｅｄ，  Ｂａｌｌａｎｔｉｎｅ  Ｂｏｏｋｓ，
Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ．  Ｅａｓｔｍａｎ，  Ｊ．，  １９９５，  Ｔｈｅ  Ｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｓｗａｍｐ  ａｎｄ  Ｂｏｇ  Ｔｒｅｅｓ，  Ｓｈｒｕｂｓ，
ａｎｄ  Ｗｉｌｄｆｌｏｗｅｒｓ  ｏｆ  Ｅａｓｔｅｒｎ  Ｆｒｅｓｈｗａｔｅｒ  Ｗｅｔｌａｎｄｓ，  Ｓｔａｃｋｐｏｌｅ  Ｂｏｏｋｓ，  Ｍｅｃｈａｎｉｃｓｂｕｒｇ，
Ｐｅｎｎｓｙｌｖａｎｎｉａ．  Ｅｉｃｈｅｒ，  Ｄ．Ｌ．，  １９７６，  Ｇｅｏｌｏｇｉｃ  Ｔｉｍｅ，  ２ｎｄ  Ｅｄ．，  Ｐｒｅｎｔｉｃｅ−Ｈａｌｌ，  Ｉｎｃ．  Ｅｎｇｌｅｗｏｏｄ  Ｃｌｉｆｆｓ，  Ｎｅｗ  Ｊｅｒｓｅｙ．  Ｈａｎｓｅｎ，  Ｈ．Ｐ．，  １９４１，  Ｐａｌｅｏｅｃｏｌｏｇｙ  ｏｆ  Ｔｗｏ  Ｐｅａｔ  Ｄｅｐｏｓｉｔｓ  ｏｎ  ｔｈｅ  Ｏｒｅｇｏｎ  Ｃｏａｓｔ，  Ｏｒｅｇｏｎ  Ｓｔａｔｅ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，  Ｃｏｒｖａｌｌｉｓ，  Ｏｒｅｇｏｎ．  Ｌｏｗｅ，  Ｊ．Ｊ．  ａｎｄ  Ｗａｌｋｅｒ，  Ｍ．Ｊ．Ｃ．，  １９９７，  Ｒｅｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｎｇ
Ｑｕａｔｅｒｎａｒｙ  Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ，  ２ｎｄ  ｅｄ．，  Ａｄｄｉｓｏｎ  Ｗｅｓｌｙ  Ｌｏｎｇｍａｎ  Ｌｉｍｉｔｅｄ，  Ｅｓｓｅｘ，  Ｅｎｇｌａｎｄ．  Ｍａｎａｈａｎ，  Ｓ．Ｅ．，  １９９１，  Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ  Ｃｈｅ
ｍｉｓｔｒｙ，  ５ｔｈ  Ｅｄ．，  Ｌｅｗｉｓ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，  Ｉｎｃ．，
Ｃｈｅｌｓｅａ，  Ｍｉｃｈｉｇａｎ．  Ｎｉｅｒｉｎｇ，  Ｗ．Ａ．，  １９９８，
Ｗｅｔｌａｎｄｓ，  Ａｌｆｒｅｄ  Ａ．  Ｋｎｏｐｆ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，  Ｍｅｎｏｎ，  Ｓ．，  １９９７，  Ｔｈｅ  Ｐｅｏｐｌｅ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｂｏｇ，  Ｄｉｓｃｏｖｅｒ  Ｍａｇａｚｉｎｅ，  Ｖｏｌ．１８  Ｎｏ．８，  ｐ．６０−８．  Ｐａｒｋｅｒ，  Ｓ．Ｐ．  （Ｅｄｉｔｏｒ），  １９８９，  Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ  ｏｆ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ  ａｎｄ  Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ  Ｔｅｒｍｓ，  ５ｔｈ  Ｅｄ．，  ＭｃＧｒａｗ−Ｈｉｌｌ  Ｂｏｏｋ  Ｃｏｍｐａｎｙ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ．  Ｓｔａｒｒ，  Ｃ．  ａｎｄ  Ｔａｇｇａｒｔ，
Ｒ．，  １９９２，  Ｂｉｏｌｏｇｙ：  Ｔｈｅ  Ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｌｉｆｅ，  ５ｔｈ  Ｅｄ．，  Ｗａｄｓｗｏｒｔｈ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏｍｐａｎｙ，  Ｂｅｌｍｏｎｔ，  Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ）。
【００２７】
ＮＯ２−の脱窒還元は２つの酵素段階でＮＯを必須中間体として用いて起きる。脱窒経路は、ＮＯを遊離中間体として用いて、２種の酵素である硝酸レダクターゼおよび酸化窒素レダクターゼを包含する継続的な経路を記述している（ＮＯ２−  →  ＮＯ  →  Ｎ２Ｏ）。これは間接経路として知られる。生成されたＮＯは急速に二量化してＮ２Ｏを製造し、この提案はＮＯレダクターゼによるＮＯの１−電子還元後の自発的な非酵素化学反応によりＮ２ＯのＮ＝Ｎ結合が生成することを示唆している（Ｙｅ，  Ｒｉｃｋ  Ｗ．，  Ａｖｅｒｉｌｌ，  Ｂｒｕｃｅ  Ａ．，  Ｔｉｅｄｊｅ，  Ｊａｍｅｓ  Ｍ．  “Ｄｅｎｉｔｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ：  Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｃｏｎｓｕｍｐｔｉｏｎ
ｏｆ  Ｎｉｔｒｉｃ  Ｏｘｉｄｅ．”  Ａｐｐｌｉｅｄ  ａｎｄ  Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ，  Ａｐｒ．  １９９４，  Ｖｏｌ．６０，  Ｎｏ．４，  ｐｇ．１０５３−１０５８）。亜硝酸塩還元および酸化窒素還元は２つの別個であるが関連する方法である。制限遺伝子がＮＯ２およびＮＯの還元を生ずる。ＮＯの還元はエネルギー保存性である。ＮＯの１つの重要な機能は電子受容体として作用し且つエネルギーを保存することである。
【００２８】
【化１】
0005478805.tif 000002
【００２９】
より少なく認められている直接経路は、ＮＯ２−  からＮＯへの転化が全て亜硝酸レダクターゼにより、ＮＯ２−の脱水により生成した酵素−結合されたニトロシル（ＮＯ＋）が第二の亜硝酸塩による親核性攻撃を受けて酵素−結合されたＮ２Ｏ５を生成するような方法を介して、行えることを示唆している。直接経路ではＮＯは必須遊離中間体でない。（Ｙｅ，  Ｒｉｃｋ  Ｗ．，  Ａｖｅｒｉｌｌ，  Ｂｒｕｃｅ  Ａ．，  Ｔｉｅｄｊｅ，
Ｊａｍｅｓ  Ｍ．  “Ｄｅｎｉｔｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ：  Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｃｏｎｓｕｍｐｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｎｉｔｒｉｃ  Ｏｘｉｄｅ．”  Ａｐｐｌｉｅｄ
ａｎｄ  Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ，  Ａｐｒ．  １９９４，  Ｖｏｌ．６０，  Ｎｏ．４，  ｐｇ．１０５３−１０５８）。直接経路（ＮＯ２−  →  Ｎ２Ｏ）は、
ＮＯ３−＞ＮＯ２−＞ＮＯ＋＋ＮＯ２−                    ＞Ｎ２Ｏ３＞Ｎ２Ｏ＞Ｎ２
亜硝酸レダクターゼ酵素−結合されたニトロシル（ＮＯ＋）の存在下
である。
「ほとんどの脱窒剤は全ての還元工程を行うための酵素能力を有する。」有意な脱窒に必要な３つの条件は、低酸素、高い硝酸塩濃度、および有機炭素の供給である。酸素供給は高い土壌水含有量により減じられ、それは土壌孔内での酸素の拡散を妨害する（”Ｃｈａｐｔｅｒ  ８．  Ｔｅｒｒｅｓｔｒｉａｌ  Ｎｕｔｒｉｅｎｔ  Ｃｙｃｌｉｎｇ．”  Ｅｃｏｓｙｓｔｅｍ  ｅｃｏｌｏｇｙ  ｔｅｘｔ．  Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ｏｆ  Ｔｅｒｒｅｓｔｒｉａｌ  Ｅｃｏｓｙｓｔｅｍ  Ｅｃｏｌｏｇｙ  Ｃｈａｐｉｎ  ＩＩＩ，  Ｆ．  Ｓｔｕａｒｔ，  Ｍａｔｓｏｎ，  Ｐａｍｅｌａ，  Ｍｏｏｎｅｙ，  Ｈａｒｏｌｄ
Ａ．  １ｓｔ  ｅｄ．  ２００２．  Ｃｏｒｒ．  ２ｎｄ  ｐｒｉｎｔｉｎｇ，  ２０
０４，  ＸＩＶ，  ４３６ｐ．  １９９  ｉｌｌｕｓ．）。脱窒は主として嫌気性工程である。簡素化された一般化された脱窒経路は（ＮＯ３−→ＮＯ２−  →ＮＯ→Ｎ２Ｏ→Ｎ２）である（Ａｐｅｌ，  Ｗｉｌｌｉａｍ  Ａ．，  Ｔｕｒｉｃｋ，  Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｅ．  “Ｔｈｅ  ｕｓｅ  ｏｆ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉａ  ｆｏｒ
ｔｈｅ  ｒｅｍｏｖａｌ  ｏｆ  ｎｉｔｒｏｇｅｎ  ｏｘｉｄｅｓ  ｆｒｏｍ  ｃｏｍｂｕｓｔｉｏｎ  ｇａｓｅｓ．”  Ｆｕｅｌ，  Ｖｏｌ．７２，  Ｉｓｓｕｅ  １２，  ｐｇ．１７１５−１７１８，  １９９３）。
脱窒の最終生成物は気体状窒素Ｎ２である。ここで、
・ＮＯ３−−は硝酸塩を意味し、
・ＮＯ２−は亜硝酸塩を意味し、
・ＮＯは一酸化窒素を意味し、
・Ｎ２Ｏは一酸化二窒素を意味し、そして
・Ｎ２は二窒素または気体状窒素を意味する。
【００３０】
泥炭の窪み内の硝化／脱窒工程に影響を与えうる最も重要な変数は水の水準である。多雨地は約９８％水分である。多雨地は一般的にその水を主として降雨量から受容しそしてその水の水準を毛管作用により維持する。上部３０ｃｍは、好気性呼吸または硝化が起きる領域である。それより下では、水飽和点は９８％水準に達する。高い水含有量により、比較的低い酸素水準が存在する。それ故、そこが脱窒が起きる領域である。
【００３１】
泥炭の窪み内の硝化／脱窒工程に影響を与えうる第二の最も重要な変数は有機化合物のアベイラビリティーである。多雨泥炭地内の有機化合物は５０％を越える溶解物質の炭素含有量を有する。このことは、それがエネルギー源でありそして脱窒が起きる物理的空間であるため、重要である。硝化はアンモニウムおよび酸素を利用して（そのエネルギーをそこから受容して）微生物が亜硝酸塩を生成可能にし、それらを次に脱窒サイクル中で使用して最終的に気体状窒素を製造する。
【００３２】
硝化に最適な温度は摂氏１０°〜３０°の範囲である。硝化は温度が低下するにつれてより多く制限され始めるが、脱窒は比較的低い温度によってわずかに影響を受けるにもかかわらずそれは実質的な速度で続くであろう。これは異なる温度における一般的な脱窒剤の作用によることがある。例えば、シュードモナス脱窒剤を用いるＮ２Ｏ還元の最高速度は３５℃で、そしてパラコッカス脱窒剤を用いると３０℃で、起きた（Ａｐｅｌ，  Ｗｉｌｌｉａｍ  Ａ．，  Ｔｕｒｉｃｋ，  Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｅ．  “Ｔｈｅ  ｕｓｅ  ｏｆ
ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉａ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  ｒｅｍｏｖａｌ  ｏｆ  ｎｉｔｒｏｇｅｎ  ｏｘｉｄｅｓ  ｆｒｏｍ  ｃｏｍｂｕｓｔｉｏｎ  ｇａｓｅｓ．”  Ｆｕｅｌ，  Ｖｏｌ．７２，  Ｉｓｓｕｅ  １２，  ｐｇ．１７１５−１７１８，  １９９３）。
【００３３】
微生物活性が泥炭内の物質の有機同化における重要な因子である。１グラムの土壌中の微生物の数は平均２００，０００である。例えば栄養分のアベイラビリティーの如きある種の条件下では、微生物数は１グラム当たり７５００万以上に達しうる。微生物は平均で毎秒２０，０００個の新しい蛋白質を製造しうる酵素を製造しうることに留意すべきである。微生物数は栄養源（例えば、人工的なＮＯｘ放出）において増加を受けるまで休止状態にある。これらの微生物数は互いに競合しながら文字通り開花しうる。これが脱窒工程にとって重要である。
【００３４】
窒素流束能力（ｎｉｔｒｏｇｅｎ  ｆｌｕｘ  ｃａｐａｃｉｔｙ）に関する別の重要な変数は植物キャップ（ｖｅｇｅｔａｔｉｖｅ  ｃａｐ）である。植物キャップが妨害されない場合には、大気中への逃避放出速度は５０％減じられる（Ｉｋｋｏｎｅｎ，  Ｅ．Ｎ．，  Ｋｕｒｅｔｓ，  Ｖ．Ｋ．，  Ｇｒａｂｏｖｉｋ，  Ｓ．Ｉ．，  Ｄｒｏｚｄｏｖ
，  Ｓ．Ｎ．  “Ｔｈｅ  Ｒａｔｅ  ｏｆ  Ｃａｒｂｏｎ  Ｄｉｏｘｉｄｅ  Ｅｍｉｓｓｉｏｎ  ｉｎｔｏ  ｔｈｅ  Ａｔｍｏｓｐｈｅｒｅ  ｆｒｏｍ  ａ  Ｓｏｕｔｈｅｒｎ  Ｄａｒｅｌｉａｎ  Ｍｅｓｏｏｌｉｇｏｔｒｏｐｈｉ  Ｂｏｇ．”  Ｒｕｓｓｉｎａ  Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｅｃｏｌｏｇｙ，  Ｖｏｌ．３２，  Ｎｏ．６，  ２００１，，  ｐｐ３８２−３８５）．  窒素固定の多くは多雨泥炭地の上部３０ｃｍ内で、特に根構造の節内で、起きる。硝化は土地の上層内の大きい好気性および小さい嫌気性区域で置きる。脱窒は土地の下層内の小さい空間領域内で起きる。泥炭の組成が巨大な表面積を与え、そこで細胞周辺レダクターゼ蛋白質が硝酸塩の気体状酸素への受容体還元を可能にする。脱窒に関する空間条件すなわち微細部位は非常に小さくそして泥炭の窪み全体にわたり分布されている。脱窒工程は気体状窒素の１００％生成を達成し、それは次に拡散により大気に移される（Ｗａｋｓｍａｎ，  Ｓｅｌｍａｎ  Ａ．  Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ｏｆ  Ｓｏｉｌ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ．  Ｂａｌｔｉｍｏｒｅ：  Ｔｈｅ  Ｗｉｌｌｉａｍｓ  ＆  Ｗｉｌｋｉｎｓ  Ｃｏｍｐａｎｙ，  １９３２）。
【００３５】
メタノゲネシス、すなわちＣＯ２からのメタンの生物学的製造、は無毒条件下で起きそして嫌気性呼吸のタイプとみなしうる。ＡＴＰの合成は電気化学的Ｈ＋電位中間体を伴う化学浸透機構に関連する。ＡＤＰのホスホリル化は補酵素Ｍ−補酵素Ｂヘテロ二硫化物の還元と連結される。基本的な反応式は以下の通りである：
４Ｈ２＋ＣＯ２＝ＣＨ４＋２Ｈ２Ｏ
微生物種のデータは、アルカエバクテリア（Ａｒｃｈａｅｂａｃｔｅｒｉａ）、メタノバクテリウム・サーモオートトロフィクム（Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｔｈｅｒｍｏａｕｔｏｔｒｏｐｈｉｃｕｍ）、メタノブレビバクター（Ｍｅｔｈａｎｏｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒ）、メタノサームス（Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｕｓ）、メタノコッカス（Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｃｃｕｓ）、メタノミクロビウム（Ｍｅｔｈａｎｏｍｉｃｒｏｂｉｕｍ）、メタノゲニウム（Ｍｅｔｈａｎｏｇｅｎｉｕｍ）、メタノスピリルム（Ｍｅｔｈａｎｏｓｐｉｒｉｌｌｕｍ）、メタノプラヌス（Ｍｅｔｈａｎｏｐｌａｎｕｓ）、メタノクレウス（Ｍｅｔｈａｎｏｃｕｌｌｅｕｓ）、メタノピルス（Ｍｅｔｈａｎｏｐｙｒｕｓ）、メタノコルプスクルム（Ｍｅｔｈａｎｏｃｏｒｐｕｓｃｕｌｕｍ）、メタノバクテリウム（Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、メタノサルシナ（Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ）、メタノサルシナ・バルケリ（Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ｂａｒｋｅｒｉ）、およびメタノサルシナ・サーモフィラ（Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌａ）に関して入手可能である。
【００３６】
ＣＯ２からのメタノゲネシスに関する経路は以下の通りに表わすことができる（Ｍａｔｈｅｗｓ９５：  Ｍａｔｈｅｗｓ  ＣＫ，  ｖａｎ  Ｈｏｌｄｅ  ＫＥ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，  Ｓｅｃｏｎｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ  Ｔｈｅ  Ｂｅｎｊａｍｉｎ／Ｃｕｍｍｉｎｇｓ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏｍｐａｎｙ  Ｍｅｎｌｏ  Ｐａｒｋ，  ＣＡ  １９９５．  Ｏｖｅｒｂｅｅｋ９８：  Ｏｖｅｒｂｅｅｋ，  Ｒ，  Ｌａｒｓｅｎ，  Ｎ，  Ｓｅｌｋｏｖ，  ＥＥ，  Ｍａｌｔｓｅｖ，  Ｍ  “Ｔｈｅ  ＷＩＴ  Ｄａｔａｂｅｓｅ．”  １９９８  ＷＷＷ  ＵＲＬ  ｈｔｔｐ：／ｗｗｗ．ｃｍｅ．ｍｓｕ．ｅｄｕ／ＷＩＴ／．  Ｔｈａｕｅｒ９８：  Ｔｈａｕｅｒ  ＲＫ  （１９９８）．  “Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ｏｆ  ｍｅｔｈａｎｏｇｅｎｅｓｉｓ：  ａ  ｔｒｉｂｕｔｅ  ｔｏ  Ｍａｒｊｏｒｙ  Ｓｔｅｐｈｅｎｓｏｎ．  １９９８  Ｍａｒｊｏｒｙ  Ｓｔｅｐｈｅｎｓｏｎ  Ｐｒｉｚｅ  Ｌｅｃｔｕｒｅ．”  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  １９９８；  １４４（Ｐｔ９）；  ２３７７−４０６．  ＰＭＩＤ：  ９７８２４８７）：
【００３７】
【化２】
0005478805.tif 000003
【００３８】
一酸化炭素デヒドロゲナーゼ（基質からの水素の除去および酸化−還元反応における受容体への水素の移送に触媒作用を与える酵素）経路は以下の通りである：（２００１−２００２  ＳＲＩ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  ＳＲＩ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｐａｔｈｗａｙ  Ｔｏｏｌｓ  ｓｏｆｔｗａｒｅ，  ｐａｇｅ  ｇｅｎｅｒａｔｅｄ  ｏｎ  Ｔｈｕ  Ｍａｙ  １３，  ２００４．  Ｔｈｅ  ｒｅｓｕｌｔｉｎｇ  ｄａｔａ  ｓｅｔ  ｗａｓ  ｄｅｒｉｖｅｄ  ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌｌｙ  ｕｓｉｎｇ  Ｐａｔｈｏｌｏｇｉｃ；  ａ  ｓｏｆｔｗａｒｅ  ｍｏｄｕｌｅ  ｉｎｃｌｕｄｅｄ  ｗｉｔｈ
Ｐａｔｈｗａｙ  Ｔｏｏｌｓ  ｆｏｒ  ｃｒｅａｔｉｎｇ  ａ  ｐａｔｈｗａｙ／ｇｅｎｏｍｅ  ｄａｔａｂａｓｅ  ｆｒｏｍ  ａｎ  ａｎｎｏｔａｔｅｄ  ｇｅｎｏｍｅ．  ＰｓｕｅｄｏＣｙｃ  ｉｓ  ｈｏｓｔｅｄ  ｂｙ  ｔｈｅ  Ｂｒｉｎｋｍａｎ  Ｌａｂ，
（Ｓｉｍｏｎ  Ｆｒａｓｅｒ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，  Ｇｒｅａｔｅｒ  Ｖａｎｃｏｕｖｅｒ，  ＢＣ，  Ｃａｎａｄａ）  ａｎｄ  ｉｓ  ｃｏｎｔｉｎｕａｌｌｙ  ｂｅｉｎｇ  ｕｐｄａｔｅｄ  ｂｙ  ｔｈｅ  Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  Ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ  Ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ  Ｐｒｏｊｅｃｔ  （ＰｓｅｕｄｏＣＡＰ））：
【００３９】
【化３】
0005478805.tif 000004
【００４０】
ホモアセトジェニック（Ｈｏｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｃ）細菌は、Ｈ２およびＯ２から酢酸塩を合成しうる真正嫌気性菌である。種のデータはクロストリジウム・サーモアセチクム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｉｃｕｍ）に関して入手可能である。酢酸塩からのメタンの生合成は以下の通りである：
【００４１】
【化４】
0005478805.tif 000005
【００４２】
天然のメタンのほとんどは酢酸塩から発生するが、２種だけのメタノジェニック・アセトトロフ（ｍｅｔｈａｎｏｇｅｎｉｃ  ａｃｅｔｏｔｒｏｐｈｓ）：メタノサルシナ（Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ）およびメタノスリックス（Ｍｅｔｈａｎｏｔｈｒｉｘ）  が知られている。酢酸塩はＣ−ＣおよびＣ−Ｓ結合の分裂前にアセチル−ＣｏＡに活性化されるはずである。カルボニル基はＣＯ２に酸化され、メチル基はテトラヒドロサルシナプテリンを介して補酵素Ｍに移される。メチル−補酵素Ｍは補酵素Ｍおよび補酵素Ｂからの電子を有するメタンに還元的に脱メチル化される。生じた補酵素Ｍおよび補酵素Ｂの複素二硫化物は次にそれらのスルフヒドリル形態に還元される。ＣＨ４およびＣＯ２への酢酸塩の転化は発酵である。
【００４３】
基本的な反応式は、酢酸塩＋Ｈ＋＝メタン＋ＣＯ２である。
【００４４】
種のデータはメタノサルシナ・サーモフィラ（Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ｔｈｅ
ｒｍｏｐｈｉｌａ）に関して入手可能である（Ｆｅｒｒｙ９２：  Ｆｅｒｒｙ  ＪＧ  （１９９２）．  “Ｍｅｔｈａｎｅ  ｆｒｏｍ  ａｃｅｔａｔｅ．”  Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  １９９２；  １７４（１７）；  ５４８９−９５．  ＰＭＩＤ：  １５１２１８６
Ｆｅｒｒｙ９７：  Ｆｅｒｒｙ  ＪＧ  （１９９７）．  “Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｆｅｒｍｅｎｔａｔｉｏｎ  ｏｆ  ａｃｅｔａｔｅ  ｔｏ  ｍｅｔｈａｎｅ
ｂｙ  Ｍｅｔｈａｎｏｓａｒｃｉｎａ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌａ．”  Ｂｉｏｆａｃｔｏｒｓ  １９９７；  ６（１）；  ２５−３５．  ＰＭＩＤ：  ９２３３５３７  Ｊａｍｅｓ９３：  Ｊａｍｅｓ  Ｇ．  Ｆｅｒｒｙ，  ｅｄｉｔｏｒ  Ｍｅｔｈａｎｏｇｅｎｅｓｉｓ  Ｅｃｏｌｏｇｙ，  Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ，  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ＆  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｈａｐｍａｎ  ＆  Ｈａｌｌ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ  １９９３．  Ｔｈａｕｅｒ９８：  Ｔｈａｕｅｒ  ＲＫ  （１９９８）．  “Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ｏｆ  ｍｅｔｈａｎｏｇｅｎｅｓｉｓ：  ａ  ｔｒｉｂｕｔｅ  ｔｏ  Ｍａｒｊｏｒｙ  Ｓｔｅｐｈｅｎｓｏｎ．  １９９８  Ｍａｒｊｏｒｙ  Ｓｔｅｐｈｅｎｓｏｎ  Ｐｒｉｚｅ  Ｌｅｃｔｕｒｅ．”  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  １９９８；  １４４（Ｐｔ９）；  ２３７７−４０６．  ＰＭＩＤ：  ９７８２４８７）。
【００４５】
酸化硫黄経路は泥炭中で以下の通りにして同化される：
ＳＯ４−２＞ＳＯ３−２＞Ｈ２Ｓ
微生物シュードモナス・アウルギノサ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ）経路は発表されている（Ｃｏｐｙｒｉｇｈｔ  ２００１−２００２  ＳＲＩ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  ＳＲＩ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｐａｔｈｗａｙ  Ｔｏｏｌｓ  ｓｏｆｔｗａｒｅ，  ｐａｇｅ  ｇｅｎｅｒａｔｅｄ  ｏｎ  Ｔｈｕ  Ｍａｙ  １３，  ２００４．  Ｔｈｅ  ｒｅｓｕｌｔｉｎｇ  ｄａｔａ  ｓｅｔ  ｗａｓ  ｄｅｒｉｖｅｄ  ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌｌｙ  ｕｓｉｎｇ  Ｐａｔｈｏｌｏｇｉｃ；  ａ  ｓｏｆｔｗａｒｅ  ｍｏｄｕｌｅ  ｉｎｃｌｕｄｅｄ  ｗｉｔｈ  Ｐａｔｈｗａｙ  Ｔｏｏｌｓ  ｆｏｒ  ｃｒｅａｔｉｎｇ  ａ  ｐａｔｈｗａｙ／ｇｅｎｏｍｅ  ｄａｔａｂａｓｅ  ｆｒｏｍ  ａｎ  ａｎｎｏｔａｔｅｄ  ｇｅｎｏｍｅ．  ＰｓｕｅｄｏＣｙｃ  ｉｓ  ｈｏｓｔｅｄ  ｂｙ  ｔｈｅ  Ｂｒｉｎｋｍａｎ  Ｌａｂ，  （Ｓｉｍｏｎ  Ｆｒａｓｅｒ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，  Ｇｒｅａｔｅｒ  Ｖａｎｃｏｕｖｅｒ，  ＢＣ，  Ｃａｎａｄａ）  ａｎｄ  ｉｓ  ｃｏｎｔｉｎｕａｌｌｙ  ｂｅｉｎｇ  ｕｐｄａｔｅｄ  ｂｙ  ｔｈｅ  Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  Ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ  Ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ  Ｐｒｏｊｅｃｔ  （ＰｓｅｕｄｏＣＡＰ））：
【００４６】
【化５】
0005478805.tif 000006
【００４７】
硫化物を、チオカプサ（Ｔｈｉｏｃａｐｓａ）、デスルホビブリオ（Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｂｒｉｏ）、テオバシリウス（Ｔｈｅｏｂａｃｉｌｌｉｕｓ）およびクロマチウム（Ｃｈｒｏｍａｔｉｕｍ）を包含する細菌により嫌気的に硫黄に酸化させることができる。これは以下の通りに示すことができる（Ｂｏｔｈｅ：  Ｂｏｔｈｅ  Ｈ．，  ｅｄｉｔｏｒ，  Ｔｒｅｂｓｔ  Ａ．，  ｅｄｉｔｏｒ  “Ｂｉｏｌｏｇｙ  ｏｆ  ｉｎｏｒｇａｎｉｃ  Ｎｉｔｒｏｇｅｎ  ａｎｄ  Ｓｕｌｆｕｒ．  Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ，  Ｂｅｒｌｉｎ  Ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇ  １９８１．”）：
【００４８】
【化６】
0005478805.tif 000007
【００４９】
さらに硫黄酸化物は種々の細菌により酸化されそして還元される。例は以下の通りである：チオバシルス・テピダリウス（Ｔｈｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｅｐｉｄａｒｉｕｓ）は成長のために広範囲のポリチオン酸塩を利用することができる。Ｔ．テピダリウスはトリチオン酸塩をチオ硫酸塩に酸化し、それを次に中間体として亜硫酸塩を包含しうる経路により硫酸塩に酸化するが、この反応は充分には同定されていない（Ｆｒｉｅｄｒｉｃｈ９８：  Ｆｒｉｅｄｒｉｃｈ  ＣＧ  （１９９８）．  “Ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ  ａｎｄ
ｇｅｎｅｔｉｃｓ  ｏｆ  ｓｕｌｆｕｒ−ｏｘｉｄｉｚｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉａ．”
Ａｄｖ  Ｍｉｃｒｏｂ  Ｐｈｙｓｉｏｌ  １９９８；  ３９；  ２３５−８９．  ＰＭＩＤ：  ９３２８６４９．  Ｋｅｌｌｙ９３：  Ｋｅｌｌｙ  ＤＰ，  Ｌｕ  Ｗ−Ｐ，  Ｐｏｏｌｅ  ＲＫ  “Ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅｓ  ｉｎ  Ｔｈｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｅｐｉｄａｒｉｕｓ  ａｎｄ  ｔｈｅ  ｒｅｓｐｉｒａｔｏｒｙ  ｃｈａｉｎ  ｉｎｖｏｌｖｅｄ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｏｘｉｄａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｈｉｏｓｕｌｐｈａｔｅ  ａｎｄ
ｔｅｔｒａｔｈｉｏｎａｔｅ．”  Ａｒｃｈｉｖｅｓ  ｏｆ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  １６０：８７−９５  （１９９３）．  Ｋｅｌｌｙ９７：  Ｋｅｌｌｙ  ＤＰ，  Ｓｈｅｒｇｉｌｌ  ＪＫ，  Ｌｕ  ＷＰ，  Ｗｏｏｄ  ＡＰ  （１９９７）．  “Ｏｘｉｄａｔｉｖｅ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｏｆ  ｉｎｏｒｇａｎｉｃ  ｓｕｌｆｕｒ  ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ  ｂｙ  ｂａｃｔｅｒｉａ．”  Ａｎｔｏｎｉｅ  Ｖａｎ  Ｌｅｅｕｗｅｎｈｏｅｋ  １９９７；  ７１（１−２）；  ９５−１０７．  ＰＭＩＤ：  ９０４９０２１．  Ｌｕ８８：  Ｌｕ  Ｗ−Ｐ，  Ｋｅｌｌｙ  ＤＰ  “Ｋｉｎｅｔｉｃ  ａｎｄ  ｅｎｅｒｇｅｔｉｃ  ａｓｐｅｃｔｓ  ｏｆ  ｉｎｏｒｇａｎｉｃ  ｓｕｌｐｈｕｒ  ｃｏｍｐｏｕｎｄ  ｏｘｉｄａｔｉｏｎ  ｂｙ  Ｔｈｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｅｐｉｄａｒｉｕｓ．”  Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｇｅｎｅｒａｌ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  １３４：  ８６５−８７６  （１９８８）．  Ｌｕ８８ａ：  Ｌｕ  Ｗ−Ｐ，  Ｋｅｌｌｙ  ＤＰ  “Ｃｅｌｌｕｌａｒ  ｌｏｃａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｐａｒｔｉａｌ  ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｈｅ  ‘ｔｈｉｏｓｕｌｐｈａｔｅ−ｏｘｉｄｉｚｉｎｇ  ｅｎｚｙｍｅ’  ａｎｄ  ‘ｔｒｉｔｈｉｏｎａｔｅ  ｈｙｄｒｏｌｙａｓｅ’  ｆｒｏｍ  Ｔｈｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｔｅｐｉｄａｒｉｕｓ．”  Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｇｅｎｅｒａｌ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  １３４：  ８７７−８８５（１９８８））。
【００５０】
【化７】
0005478805.tif 000008
【００５１】
として表わされる。
【００５２】
細菌デスルホビブリオ（Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｂｒｉｏ）は重亜硫酸塩をトリチオン酸塩およびチオ硫酸塩を介して還元して硫黄および亜硫酸塩を生成する（Ｌｅｅ７３：  Ｌｅｅ  ＪＰ，  ＬｅＧａｌｌ  Ｊ，  Ｐｅｃｋ  ＨＤ  （１９７３）．  “Ｉｓｏｌａｔｉ
ｏｎ  ｏｆ  ａｓｓｉｍｉｌａｔｏｒｙ−  ａｎｄ  ｄｉｓｓｉｍｉｌａｔｏｒｙ−ｔｙｐｅ  ｓｕｌｆｉｔｅ  ｒｅｄｕｃｔａｓｅｓ  ｆｒｏｍ  Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｂｒｉｏ
ｖｕｌｇａｒｉｓ．”  Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  １９７３；  １１５（２）；  ５２９−４２．  ＰＭＩＤ：  ４７２５６１５）。
【００５３】
【化８】
0005478805.tif 000009
【００５４】
として表わされる。
【００５５】
異化硫酸塩還元は細菌デススルホビブリオを使用する。硫酸塩−還元剤は硫酸塩を末端電子受容体として使用することが可能である。硫酸塩はアデノシン−ホスホ硫酸塩（ＡＰＳ）に活性化される。ＡＰＳは亜硫酸塩に還元され、それはまた硫化水素に還元され、それが排泄される（Ｇｏｔｔｓｃｈａｌｋ８６：  Ｇｏｔｔｓｃｈａｌｋ，  Ｇ  “Ｂａｃｔｅｒｉａｌ  Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ，  Ｓｅｃｏｎｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ．  “Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ．  １９８６．  Ｈａｎｓｅｎ９４：  Ｈａｎｓｅｎ  ＴＡ  （１９９４）．  “Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｏｆ  ｓｕｌｆａｔｅ−ｒｅｄｕｃｉｎｇ  ｐｒｏｋａｒｙｏｔｅｓ．”  Ａｎｔｏｎｉｅ  Ｖａｎ  Ｌｅｅｕｗｅｎｈｏｅｋ  １９９４；  ６６（１−３）；  １６５−８５．  ＰＭＩＤ：  ７７４７９３０）。
【００５６】
【化９】
0005478805.tif 000010
【００５７】
として表わされる。
【００５８】
揮発性有機化合物（ＶＯＣ）は泥炭中で好気的および嫌気的に分解されそして同化されうる。ＶＯＣは直接温室気体としては比較的重要でない。ＶＯＣはオゾンのような大気中で有機エーロゾルを製造し、それら自体が直接温室気体である（ｗｗｗ．ｇｈｇｏｎｌｉｎｅ．  ｏｒｇ／ｏｔｈｅｒｖｏｃｓ．ｈｔｍ．，  Ｄａｖｅ  Ｒｅａｙ，  ＧｒｅｅｎＨｏｕｓｅ  Ｇａｓ  Ｏｎｌｉｎｅ．  ｏｒｇゥ２００２  ａｎｄ  ２００３）。ある種のＶＯＣは窒素酸化物と結合してオゾンを生成する。まとめてＢＴＥＸとして知られる単環式芳香族炭化水素であるベンゼン、トルエン、エチルベンゼン、並びにキシレン異性体（ｏ−、ｍ−、およびｐ−）は最も水溶性である揮発性有機化合物の一部である。芳香族化合物、例えばＢＴＥＸ、は微生物のための重要な成長基質である。最初は、これらの化合物は好気性条件下で、すなわち分子酸素の存在下で、のみ分解されうることが信じられ
ている。特定の微生物は嫌気的にそのような芳香族化合物に分解しうる。そのようにして単離されたトルエン−分解細菌は、プロテオバクテリア（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）のβ−副群のアゾアルクス／タウエラ（Ａｚｏａｒｃｕｓ／Ｔｈａｕｅｒａ）分枝内に群生する硝酸塩−還元細菌から２種の硫酸塩−還元細菌（デスルホバキュラ・トルオリカ（Ｄｅｓｕｌｆｏｂａｃｕｌａ  ｔｏｌｕｏｌｉｃａ）および菌株ＰＲＴＯＬ１並びに１種の第二鉄還元細菌（プロテオバクテリアのδ−副群に属するゲオバクター・メタリレデュセンス（Ｇｅｏｂａｃｔｅｒ  ｍｅｔａｌｌｉｒｅｄｕｃｅｎｓ）ないしプロテオバクテリアのα−副群に属する１種のトルエン−利用光栄養細菌（ブラストクロリス・スルホビリジス（Ｂｌａｓｔｏｃｈｌｏｒｉｓ  ｓｕｌｆｏｖｉｒｉｄｉｓ））まで系統発生的に広範囲にわたる（Ａｎｄｅｒｓ９５：  Ａｎｄｅｒｓ  ＨＪ，  Ｋａｅｔｚｋｅ  Ａ，
Ｋａｍｐｆｅｒ  Ｐ，  Ｌｕｄｗｉｇ  Ｗ，  Ｆｕｃｈｓ  Ｇ  （１９９５）．  “Ｔａｘｏｎｏｍｉｃ  ｐｏｓｉｔｉｏｎ  ｏｆ  ａｒｏｍａｔｉｃ−ｄｅｇｒａｄｉｎｇ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｄ  ｓｔｒａｉｎｓ  Ｋ  １７２  ａｎｄ  ＫＢ  ７４０  ａｎｄ  ｔｈｅｉｒ  ｄｅｓｃｒｉｐｔｉｏｎ  ａｓ  ｎｅｗ  ｍｅｍｂｅｒｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｇｅｎｅｒａ  Ｔｈａｕｅｒａ，  ａｓ  Ｔｈａｕｅｒａ
ａｒｏｍａｔｉｃａ  ｓｐ．  Ｎｏｖ．，  ａｎｄ  Ａｚｏａｒｃｕｓ，  ａｓ  Ａｚｏａｒｃｕｓ  ｅｖａｎｓｉｌ  ｓｐ．  ｎｏｖ．，  ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ，  ｍｅｍｂｅｒｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｂｅｔａ  ｓｕｂｃｌａｓｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ．  “Ｉｎｔ  Ｊ  Ｓｙｓｔ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  １９９５；  ５６（２）；  ３２７−３３．  ＰＭＩＤ：  ７５３７０６７．  Ｂｅｌｌｅｒ９６：  Ｂｅｌｌｅｒ  ＨＲ，  Ｓｐｏｒｍａｎｎ  ＡＭ，  Ｓｈａｒｍａ  ＰＫ，  Ｃｏｌｅ  ＪＲ，  Ｒｅｉｎｈａｒｄ  Ｍ  （１９９６）．  “Ｉｓｏｌａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  ａ  ｎｏｖｅｌ  ｔｏｌｕｅｎｅ−ｄｅｇｒａｄｉｎｇ，  ｓｕｌｆａｔｅ−ｒｅｄｕｃｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ．  “Ａｐｐｌ  Ｅｎｖｉｒｏｎ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９９６；  ６２（４）；  １１８８−９６．  ＰＭＩＤ：  ８９１９７８０．  Ｂｅｌｌｅｒ９７：  Ｂｅｌｌｅｒ  ＨＲ，  Ｓｐｏｒｍａｎｎ  ＡＭ  （１９９７）．  “Ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｏｌｕｅｎｅ  ａｎｄ  ｏ−ｘｙｌｅｎｅ  ｂｙ  ａｄｄｉｔｉｏｎ  ｔｏ  ｆｕｍａｒａｔｅ  ｉｎ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｓｔｒａｉｎ  Ｔ．”  Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  １９９７；  １７９（３）；  ６７０−６．  ＰＭＩＤ：  ９００６０１９．  Ｂｅｌｌｅｒ９７ａ：  Ｂｅｌｌｅｒ，  ＨＲ，  Ｓｐｏｒｍａｎｎ，  ＡＭ  “Ｂｅｎｚｙｌｓｕｃｃｉｎａｔｅ  ｆｏｒｍａｔｉｏｎ  ａｓ  ａ  ｍｅａｎｓ  ｏｆ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｔｏｌｕｅｎｅ  ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ  ｂｙ  ｓｕｌｆａｔｅ−ｒｅｄｕｃｉｎｇ  ｓｔｒａｉｎ  ＰＲＴＯＬ１．”  Ａｐｐｌ  Ｅｎｖｉｒｏｎ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  （１９９７）  ６３，  ３７２９−２７３１．  Ｂｉｅｇｅｒｔ９６：  Ｂｉｅｇｅｒｔ  Ｔ，  Ｆｕｃｈｓ  Ｇ，  Ｈｅｉｄｅｒ  Ｊ  （１９９６）．  “Ｅｖｉｄｅｎｃｅ  ｔｈａｔ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｏｘｉｄａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｏｌｕｅｎｅ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ  Ｔｈａｕｅｒａ  ａｒｏｍａｔｉｃａ  ｉｓ  ｉｎｉｔｉａｔｅｄ  ｂｙ  ｆｏｒｍａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｂｅｎｚｙｌｓｕｃｃｉｎａｔｅ  ｆｒｏｍ  ｔｏｌｕｅｎｅ  ａｎｄ  ｆｕｍａｒａｔｅ．”
Ｅｕｒ  Ｊ  Ｂｉｏｃｈｅｍ  １９９６；  ２３８（３）；  ６６１−８．  ＰＭＩＤ：  ８７０６６６５．  Ｃｏｓｃｈｉｇａｎｏ９７：  Ｃｏｓｃｈｉｇａｎｏ  ＰＷ，  Ｙｏｕｎｇ  ＬＹ  （１９９７）．  “Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ａｎａｌｙｓｉｓ  ｏｆ  ｔｗｏ  ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ  ｇｅｎｅｓ  ｉｎｖｏｌｖｅｄ  ｉｎ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｔｏｌｕｅｎｅ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｂｙ  ｓｔｒａｉｎ  Ｔ１．”  Ａｐｐｌ  Ｅｎｖｉｒｏｎ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９９７；  ６３（２）；  ６５２−６０．  ＰＭＩＤ：  ９０２３９４３．  Ｈａｒｗｏｏｄ９９：  Ｈａｒｗｏｏｄ，  Ｃ．Ｓ．，  Ｂｕｒｃｈｈａｒｄｔ，  Ｇ．，  Ｈｅｒｍａｎｎ，  Ｈ，  Ｆｕｃｈｓ，  Ｇ．  “Ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｏｆ  ａｒｏｍａｔｉｃ  ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ  ｖｉａ  ｔｈｅ  ｂｅｎｚｏｙｌ−Ｃｏ
Ａ  ｐａｔｈｗａｙ．”  ＦＥＭＳ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ    Ｒｅｖ  （１９９９）  ２２，  ４３９−４５８．  Ｈｅｉｄｅｒ９７：  Ｈｅｉｄｅｒ  Ｊ，  Ｆｕｃｈｓ  Ｇ  （１９９７）．  “Ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｏｆ  ａｒｏｍａｔｉｃ  ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ．”  Ｅｕｒ  Ｊ  Ｂｉｏｃｈｅｍ  １９９７；  ２４３（３）；  ５７７−９６．  ＰＭＩＤ：  ９０５７８２０．  Ｈｅｉｄｅｒ９９：  Ｈｅｉｄｅｒ，  Ｊ，  Ｓｐｏｒｍａｎｎ，  ＡＭ，  Ｂｅｌｌｅｒ，  ＨＲ，  Ｗｉｄｄｅｌ，  Ｆ  “Ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｂａｃｔｅｒｉａｌ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｏｆ  ｈｙｄｒｏｃａｒｂｏｎｓ．”  ＦＥＭＳ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  Ｒｅｖ  （１９９９）  ２２：  ４５９−４７３．  Ｌｅｕｔｈｎｅｒ００：  Ｌｅｕｔｈｎｅｒ  Ｂ，  Ｈｅｉｄｅｒ  Ｊ  （２０００）．  “Ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｔｏｌｕｅｎｅ  ｃａｔａｂｏｌｉｓｍ  ｏｆ  Ｔｈａｕｅｒａ  ａｒｏｍａｔｉｃａ：  ｔｈｅ  ｂｂｓ  ｏｐｅｒｏｎ  ｃｏｄｅｓ  ｆｏｒ  ｅｎｚｙｍｅｓ  ｏｆ  ｂｅｔａ  ｏｘｉｄａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｉｎｔｅｒｍｅｄｉａｔｅ  ｂｅｎｚｙｌｓｕｃｃｉｎａｔｅ．”  Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  ２０００；  １８２（２）；  ２７２−７．  ＰＭＩＤ：  １０６２９１７０．  Ｌｏｖｌｅｙ９３：  Ｌｏｖｌｅｙ  ＤＲ，  Ｇｉｏｖａｎｎｏｎｉ  ＳＪ，  Ｗｈｉｔｅ  ＤＣ，  Ｃｈａｍｐｉｎｅ  ＪＥ，  Ｐｈｉｌｌｉｐｓ  ＥＪ，  Ｇｏｒｂｙ  ＹＡ，  Ｇｏｏｄｗｉｎ  Ｓ  （１９９３）．  “Ｇｅｏｂａｃｔｅｒ  ｍｅｔａｌｌｉｒｅｄｕｃｅｎｓ  ｇｅｎ．  ｎｏｖ．  ｓｐ．  ｎｏｖ．，  ａ  ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍ  ｃａｐａｂｌｅ  ｏｆ  ｃｏｕｐｌｉｎｇ  ｔｈｅ  ｃｏｍｐｌｅｔｅ  ｏｘｉｄａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｏｒｇａｎｉｃ  ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ  ｔｏ  ｔｈｅ  ｒｅｄｕｃｔｉｏｎ  ｏｆ  ｉｒｏｎ  ａｎｄ  ｏｔｈｅｒ  ｍｅｔａｌｓ．”  Ａｒｃｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９９３；  １５９（４）；  ３３６−４４．  ＰＭＩＤ：  ８３８７２６３．  Ｒａｂｕｓ９３：  Ｒａｂｕｓ  Ｒ，  Ｎｏｒｄｈａｕｓ  Ｒ，  Ｌｕｄｗｉｇ  Ｗ，  Ｗｉｄｄｅｌ  Ｆ  （１９９３）．  “Ｃｏｍｐｌｅｔｅ  ｏｘｉｄａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｏｌｕｅｎｅ  ｕｎｄｅｒ  ｓｔｒｉｃｔｌｙ  ａｎｏｘｉｃ  ｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓ  ｂｙ  ａ  ｎｅｗ  ｓｕｌｆａｔｅ−ｒｅｄｕｃｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ．”  Ａｐｐｌ  Ｅｎｖｉｒｏｎ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９９３；  ５９（５）；  １４４４−５１．  ＰＭＩＤ：  ７６８６０００．  Ｒａｂｕｓ９５：  Ｒａｂｕｓ  Ｒ，  Ｗｉｄｄｅｌ  Ｆ  （１９９５）．  “Ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ  ｆｏ  ｅｔｈｙｌｂｅｎｚｅｎｅ  ａｎｄ  ｏｔｈｅｒ  ａｒｏｍａｔｉｃ  ｈｙｄｒｏｃａｒｂｏｎｓ  ｂｙ  ｎｅｗ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉａ．”
Ａｒｃｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９９５；  １６３（２）；  ９６−１０３．  ＰＭＩＤ：  ７７１０３３１．  Ｒａｂｕｓ９８：  Ｒａｂｕｓ，  Ｒ，  Ｈｅｉｄｅｒ，  Ｊ  “Ｉｎｉｔｉａｌ  ｒｅａｃｔｉｏｎｓ  ｏｆ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｏｆ  ａｌｋｙｌｂｅｎｚｅｎｅｓ  ｉｎ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ａｎｄ  ｓｕｌｆａｔｅ−ｒｅｄｕｃｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉａ．”  Ａｒｃｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  （１９９８）  １７０，  ３７７−３８４．  Ｓｍｉｔｈ９０：  Ｓｍｉｔｈ
ＭＲ  （１９９０）．  “Ｔｈｅ  ｂｉｏｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ  ｏｆ  ａｒｏｍａｔｉｃ  ｈｙｄｒｏｃａｒｂｏｎｓ  ｂｙ  ｂａｃｔｅｒｉａ．”  Ｂｉｏｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ  １９９０；  １（２−３）；  １９１−２０６．  ＰＭＩＤ：  １３６８１４７．  Ｚｅｎｇｌｅｒ９９：  Ｚｅｎｇｌｅｒ  Ｋ．  Ｈｅｉｄｅｒ  Ｊ，  Ｒｏｓｓｅｌｌｏ−Ｍｏｒａ  Ｒ，  Ｗｉｄｄｅｌ  Ｆ  （１９９９）．  “Ｐｈｏｔｏｔｒｏｐｈｉｃ  ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｏｌｕｅｎｅ  ｕｎｄｅｒ  ａｎｏｘｉｃ  ｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓ  ｂｙ  ａ  ｎｅｗ  ｓｔｒａｉｎ  ｏｆ  ｂｌａｓｔｏｃｈｌｏｒｉｓ  ｓｕｌｆｏｖｉｒｉｄｉｓ．”  Ａｒｃｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９９９；  １７２（４）；  ２０４−１２．  ＰＭＩＤ：  ００１０５２５７３６．  Ｚｈｏｕ９５：  Ｚｈｏｕ  Ｊ，  Ｆｒｉｅｓ  ＭＲ，  Ｃｈｅｅ−Ｓａｎｆｏｒｄ  ＪＣ，  Ｔｉｅｄｊｅ  ＪＭ  （１９９５）．  “Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ  ａｎａｌｙｓｅｓ  ｏｆ
ａ  ｎｅｗ  ｇｒｏｕｐ  ｏｆ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｉｅｒｓ  ｃａｐａｂｌｅ  ｏｆ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｇｒｏｗｔｈ  ｏｆ  ｔｏｌｕｅｎｅ  ａｎｄ  ｄｅｓｃｒｉｐｔ
ｉｏｎ  ｏｆ  Ａｚｏａｒｃｕｓ  ｔｏｌｕｌｙｔｉｃｕｓ  ｓｐ．  ｎｏｖ．”  Ｉｎｔ  Ｊ  Ｓｙｓｔ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  １９９５；  ４５（３）；  ５００−６．  ＰＭＩＤ：  ８５９０６７７）。
【００５９】
【化１０】
0005478805.tif 000011
【００６０】
として表わされる。
【００６１】
シュードモナス・メンドシナ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｍｅｎｄｏｃｉｎａ）を介するトルエン分解は、以下に表わされるように、オルト環分割の工程を含む（Ｂｏｓｓｅｒｔ８９：  Ｂｏｓｓｅｒｔ  ＩＤ，  Ｗｈｉｔｅｄ  Ｇ，  Ｇｉｂｓｏｎ  ＤＴ，  Ｙｏｕｎｇ  ＬＹ  （１９８９）．  “Ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｏｘｉｄａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｐ−ｃｒｅｓｏｌ  ｍｅｄｉａｔｅｄ  ｂｙ  ａ  ｐａｒｔｉａｌｌｙ  ｐｕｒｉｆｉｅｄ
ｍｅｔｈｙｌｈｙｄｒｏｘｙｌａｓｅ  ｆｒｏｍ  ａ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ．”  Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  １９８９；  １７１（６）；  ２９５６−６２．  ＰＭＩＤ：  ２７２２７３９．  ＭｃＩｎｔｉｒｅ８６：  ＭｃＩｎｔｅｒｅ  Ｗ．  Ｓｉｎｇｅｒ  ＴＰ，  Ｓｍｉｔｈ  ＡＪ，  Ｍａｔｈｅｗｓ  ＦＳ  （１９８６）．  “Ａｍｉｎｏ  ａｃｉｄ  ａｎｄ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ａｎａｌｙｓｉｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ  ａｎｄ  ｆｌａｖｏｐｒｏｔｅｉｎ  ｓｕｂｕｎｉｔｓ  ｏｆ  ｐ−ｃｒｅｓｏｌ  ｍｅｔｈｙｌｈｙｄｒｏｘｙｌａｓｅ．”  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  １９８６；  ２５（２０）；  ５９７５−８１．  ＰＭＩＤ：  ３７９０５００．  Ｗｈｉｔｅｄ９１：  Ｗｈｉｔｅｄ  ＧＭ，  Ｇｉｂｓｏｎ  ＤＴ  （１９９１）．  “Ｓｅｐａｒａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｐａｒｔｉａｌ  ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｅｎｚｙｍｅｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｔｏｌｕｅｎｅ−４−ｍｏｎｏｏｘｙｇｅｎａｓｅ  ｃａｔａｂｏｌｉｃ  ｐａｔｈｗａｙ  ｉｎ  Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｍｅｎｄｏｃｉｎａ  ＫＲ１．”  Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  １７３（９）；
３０１７−２０．  ＰＭＩＤ：  ２０１９５６４．  Ｙｅｎ９１：  Ｙｅｎ  ＫＭ，  
Ｋａｒｌ  ＭＲ，  Ｂｌａｔｔ  ＬＭ，  Ｓｉｍｏｎ  ＭＪ，  Ｗｉｎｔｅｒ  ＲＢ，  Ｆａｕｓｓｅｔ  ＰＲ，  Ｌｕ  ＨＳ，  Ｈａｒｃｏｕｒｔ  ＡＡ，  Ｃｈｅｎ  ＫＫ  （１９９１）．  “Ｃｌｏｎｉｎｇ  ａｎｄ  ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ
ａ  Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｍｅｎｄｏｃｉｎａ  ＫＲ１  ｇｅｎｅ  ｃｌｕｓｔｅｒ  ｅｎｃｏｄｉｎｇ  ｔｏｌｕｅｎｅ−４−ｍｏｎｏｏｘｙｇｅｎａｓｅ．”  Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  １９９１；  １７３（１７）；  ５３１５−２７．  ＰＭＩＤ：  １８８５５１２）：
【００６２】
【化１１】
0005478805.tif 000012
【００６３】
以下に表わされるような、ロードシュードモナス・パルストリス（Ｒｈｏｄｏｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｐａｌｕｓｔｒｉｓ）によるベンゾイル−ＣｏＡの環分割による嫌気性分解（Ｂｒｅｅｓｅ９８：  Ｂｒｅｅｓｅ  Ｋ，  Ｂｏｌｌ  Ｍ，  Ａｌｔ−Ｍｏｒｂｅ
Ｊ，  Ｓｃｈａｇｇｅｒ  Ｈ，  Ｆｕｃｈｓ  Ｇ  （１９９８）．  “Ｇｅｎｅｓ  ｃｏｄｉｎｇ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  ｂｅｎｚｏｙｌ−ＣｏＡ  ｐａｔｈｗａｙ  ｏｆ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ａｒｏｍａｔｉｃ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ  Ｔｈａｕｅｒａ  ａｒｏｍａｔｉｃａ．”  Ｅｕｒ  Ｊ  Ｂｉｏｃｈｅｍ  １９９８；  ２５６（１）；  １４８−５４．  ＰＭＩＤ：  ９７４６３５８．  Ｅｇｌａｎｄ９７：  Ｅｇｌａｎｄ  ＰＧ，  Ｐｅｌｌｅｔｉｅｒ  ＤＡ，  Ｄｉｓｐｅｎｓａ  Ｍ，  Ｇｉｂｓｏｎ  Ｊ，  Ｈａｒｗｏｏｄ  ＣＳ  （１９９７）．  “Ａ  ｃｌｕｓｔｅｒ  ｏｆ  ｂａｃｔｅｒｉａｌ  ｇｅｎｅｓ  ｆｏｒ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｂｅｎｚｅｎｅ  ｒｉｎｇ  ｂｉｏｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ．”  Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  Ｕ  Ｓ  Ａ  １９９７；  ９４（１２）；  ６４８４−９．  ＰＭＩＤ：  ９１７７２４４．  Ｈａｒｔｅｌ９３：  Ｈａｒｔｅｌ  Ｕ，  Ｅｃｋｅｌ  Ｅ，  Ｋｏｃｈ
Ｊ，  Ｆｕｃｈｓ  Ｇ，  Ｌｉｎｄｅｒ  Ｄ，  Ｂｕｃｋｅｌ  Ｗ  （１９９３）．  “Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｇｌｕｔａｒｙｌ−ＣｏＡ  ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ  ｆｒｏｍ  Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｓｐ．，  ａｎ  ｅｎｚｙｍｅ  ｉｎｖｏｌｖｅｄ  ｉｎ  ｔｈｅ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｂｅｎｚｏａｔｅ．”  Ａｒｃｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９９３；  １５９（２）；  １７４−８１．  ＰＭＩＤ：  ８４３９２３７．  Ｈａｒｗｏｏｄ９９ａ：  Ｈａｒｗｏｏｄ  ＣＳ，  Ｂｕｒｃｈｈａｒｄｔ  Ｇ，  Ｈｅｒｒｍａｎｎ  Ｈ，  Ｆｕｃｈｓ  Ｇ  “Ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｏｆ  ａｒｏｍａｔｉｃ  ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ  ｖｉａ  ｔｈｅ  ｂｅｎｚｏｙｌ−ＣｏＡ  ｐａｔｈｗａｙ．”  ＦＥＭＳ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ２２：４３９−４５８  （１９９９）．  Ｈｅｉｄｅｒ９８：  Ｈｅｉｄｅｒ  Ｊ，  Ｂｏｌｌ  Ｍ，  Ｂｒｅｅｓｅ  Ｋ，  Ｂｒｅｉｎｉｇ  Ｓ，  Ｅｂｅｎａｕ−Ｊｅｈｌｅ  Ｃ，  Ｆｅｉｌ  Ｕ，  Ｇａｄ’ｏｎ  Ｎ，  Ｌａｅｍｐｅ  Ｄ，  Ｌｅｕｔｈｎｅｒ  Ｂ，  Ｍｏｈａｍｅｄ  ＭＥ，  Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ  Ｓ，  Ｂｕｒｃｈｈａｒｄｔ  Ｇ，  Ｆｕｃｈｓ  Ｇ  （１９９８）．  “Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ  ｉｎｄｕｃｔｉｏｎ  ｏｆ  ｅｎｚｙｍｅｓ  ｉｎｖｏｌｖｅｄ
ｉｎ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｏｆ  ａｒｏｍａｔｉｃ  ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ  Ｔｈａ
ｕｅｒａ  ａｒｏｍａｔｉｃａ．”  Ａｒｃｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９９８；  １７０（２）；  １２０−３１．  ＰＭＩＤ：  ９６８３６４９．  Ｌａｅｍｐｅ９９：  Ｌａｅｍｎｐｅ  Ｄ，  Ｊａｈｎ  Ｍ，  Ｆｕｃｈｓ  Ｇ  （１９９９）．  “６−Ｈｙｄｒｏｘｙｃｙｃｌｏｈｅｘ−１−ｅｎｅ−１−ｃａｒｂｏｎｙｌ−ＣｏＡ  ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ  ａｎｄ  ６−ｏｘｏｃｙｃｌｏｈｅｘ−１−ｅｎｅ−１−ｃａｒｂｏｎｙｌ−ＣｏＡ  ｈｙｄｒｏｌａｓｅ，  ｅｎｚｙｍｅｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｂｅｎｚｏｙｌ−ＣｏＡ  ｐａｔｈｗａｙ  ｏｆ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ａｒｏｍａｔｉｃ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ  Ｔｈａｕｅｒａ  ａｒｏｍａｔｉｃａ．”  Ｅｕｒ  Ｊ  Ｂｉｏｃｈｅｍ  １９９９；  ２６３（２）；  ４２０−９．  ＰＭＩＤ：  １０４０６９５０．  Ｐｅｌｌｅｔｉｅｒ００：  Ｐｅｌｌｅｔｉｅｒ  ＤＡ，  Ｈａｒｗｏｏｄ  ＣＳ  （２０００）．  “２−Ｈｙｄｒｏｘｙｃｙｃｌｏｈｅｘａｎｅｃａｒｂｏｘｙｌ  ｃｏｅｎｚｙｍｅ  Ａ  ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ，  ａｎ  ｅｎｚｙｍｅ  ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃ  ｏｆ  ｔｈｅ
ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｂｅｎｚｏａｔｅ  ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ  ｐａｔｈｗａｙ  ｕｓｅｄ  ｂｙ  Ｒｈｏｄｏｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｐａｌｕｓｔｒｉｓ．”  Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  ２０００；  １８２（１０）；  ２７５３−６０．  ＰＭＩＤ：  １０７８１５４３．  Ｐｅｌｌｅｔｉｅｒ９８：  Ｐｅｌｌｅｔｉｅｒ  ＤＡ，  Ｈａｒｗｏｏｄ  ＣＳ  （１９９８）．  “２−Ｋｅｔｏｃｙｃｌｏｈｅｘａｎｅｃａｒｂｏｘｙｌ  ｃｏｅｎｚｙｍｅ  Ａ  ｈｙｄｒｏｌａｓｅ，  ｔｈｅ  ｒｉｎｇ  ｃｌｅａｖａｇｅ  ｅｎｚｙｍｅ  ｒｅｑｕｉｒｅｄ  ｆｏｒ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｂｅｎｚｏａｔｅ
ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ  ｂｙ  Ｒｈｏｄｏｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｐａｌｕｓｔｒｉｓ．”  Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  １９９８：  １８０（９）；  ２３３０−６．  ＰＭＩＤ：  ９５７３１８２）。
【００６４】
【化１２】
0005478805.tif 000013
【００６５】
ｂ−副群プロテオバクテリア（ＥＢＮ１、ＥＢ１）内の細菌アゾアルクス（Ａｚｏａｒｃｕｓ）の存在下におけるガソリンの水溶性成分であるエチルベンゼンの嫌気性酸化は以下の通りに表わすことができる（Ｂａｌｌ９６：  Ｂａｌｌ  ＨＡ，  Ｊｏｈｎｓｏｎ  ＨＡ，  Ｒｅｉｎｈａｒｄ  Ｍ，  Ｓｐｏｒｍａｎｎ  ＡＭ  （１９９６）．  “Ｉｎｉｔｉａｌ  ｒｅａｃｔｉｏｎｓ  ｉｎ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｅｔｈｙｌｂｅｎｚｅｎｅ
ｏｘｉｄａｔｉｏｎ  ｂｙ  ａ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ，  ｓｔｒａｉｎ  ＥＢ１．”  Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  １９９６；  １７８（１９）；  ５７５５−６１．  ＰＭＩＤ：  ８８２４６２２．  Ｂｒｅｅｓｅ９８：  Ｂｒｅｅｅｓ
Ｋ，  Ｂｏｌｌ  Ｍ，  Ａｌｔ−Ｍｏｒｂｅ  Ｊ，  Ｓｃｈａｇｇｅｒ  Ｈ，  Ｆｕｃｈｓ  Ｇ  （１９９８）．  “Ｇｅｎｅｓ  ｃｏｄｉｎｇ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  ｂｅｎｚｏｙｌ−ＣｏＡ  ｐａｔｈｗａｙ  ｏｆ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ａｒｏｍａｔｉｃ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ  Ｔｈａｕｅｒａ  ａｒｏｍａｔｉｃａ．”  Ｅｕｒ  Ｊ  Ｂｉｏｃｈｅｍ  １９９８；  ２５６（１）；  １４８−５４．
ＰＭＩＤ：  ９７４６３５８．  Ｃｈａｍｐｉｏｎ９９：  Ｃｈａｍｐｉｏｎ  ＫＭ，
Ｚｅｎｇｌｅｒ  Ｋ，  Ｒａｂｕｓ  Ｒ  （１９９９）．  “Ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｅｔｈｙｌｂｅｎｚｅｎｅ  ａｎｄ  ｔｏｕｅｎｅ  ｉｎ
ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｓｔｒａｉｎ  ＥｂＮ１  ｐｒｏｃｅｅｄｓ  ｖｉａ  ｉｎｄｅｐｅｎｄｅｎｔ  ｓｕｂｓｔｒａｔｅ−ｉｎｄｕｃｅｄ  ｐａｔｈｗａｙｓ．”  Ｊ  Ｍｏｌ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ  １９９９；  １（１）；  １
５７−６４．  ＰＭＩＤ：  １０９４１７９８．  Ｈａｒｔｅｌ９３：  Ｈａｒｔｅｌ  Ｕ，  Ｅｃｋｅｌ  Ｅ，  Ｋｏｃｈ  Ｊ，  Ｆｕｃｈｓ  Ｇ，  Ｌｉｎｄｅｒ  Ｄ，  Ｂｕｃｋｅｌ  Ｗ  （１９９３）．  “Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｇｌｕｔａｒｙｌ−ＣｏＡ  ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ  ｆｒｏｍ  Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｓｐ．，  ａｎ  ｅｎｚｙｍｅ  ｉｎｖｏｌｖｅｄ  ｉｎ  ｔｈｅ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｂｅｎｚｏａｔｅ．”  Ａｒｃｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９９３；  １５９（２）；  １７４−８１．  ＰＭＩＤ：  ８４３９２３７．  Ｈａｒｗｏｏｄ９９ａ：  Ｈａｒｗｏｏｄ  ＣＳ，  Ｂｕｒｃｈｈａｒｄｔ  Ｇ，  Ｈｅｒｒｍａｎｎ  Ｈ，  Ｆｕｃｈｓ  Ｇ  “Ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｏｆ  ａｒｏｍａｔｉｃ  ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ  ｖｉａ  ｔｈｅ  ｂｅｎｚｏｙｌ−ＣｏＡ  ｐａｔｈｗａｙ．”  ＦＥＭＳ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  ２２：  ４３９−４５８  （１９９９）．  Ｈｅｉｄｅｒ９８：  Ｈｅｉｄｅｒ  Ｊ，  Ｂｏｌｌ  Ｍ，  Ｂｒｅｅｅｓ  Ｋ，  Ｂｒｅｉｎｉｇ  Ｓ，  Ｅｂｅｎａｕ−Ｊｅｈｌｅ  Ｃ，  Ｆｅｉｌ  Ｕ，  Ｇａｄ’ｏｎ  Ｎ，  Ｌａｅｍｐｅ  Ｄ，  Ｌｅｕｔｈｎｅｒ  Ｂ，  Ｍｏｈａｍｅｄ  ＭＥ，  Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ  Ｓ，  Ｂｕｒｃｈｈａｒｄｔ  Ｇ，  Ｆｕｃｈｓ  Ｇ  （１９９８）．  “Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ  ｉｎｄｕｃｔｉｏｎ  ｏｆ
ｅｎｚｙｍｅｓ  ｉｎｖｏｌｖｅｄ  ｉｎ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｏｆ  ａｒｏｍａｔｉｃ  ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ  Ｔｈａｕｅｒａ  ａｒｏｍａｔｉｃａ．”  Ａｒｃｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９９８；  １７０（２）；  １２０−３１．  ＰＭＩＤ：  ９６８３６４９．  Ｊｏｈｎｓｏｎ０１：  Ｊｏｈｎｓｏｎ  ＨＡ，  Ｐｅｌｌｅｔｉｅｒ  ＤＡ，  Ｓｐｏｒｍａｎｎ  ＡＭ  （２００１）．  “Ｉｓｏｌａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｅｔｈｙｌｂｅｎｚｅｎｅ
ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ，  ａ  ｎｏｖｅｌ  Ｍｏ−Ｆｅ−Ｓ  ｅｎｚｙｍｅ．”
Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  ２００１；  １８３（１５）；  ４５３６−４２．  ＰＭＩＤ：  １１４４３０８８．  Ｊｏｈｎｓｏｎ９９：  Ｊｏｈｎｓｏｎ  ＨＡ，  Ｓｐｏｒｍａｎｎ  ＡＭ  （１９９９）．  “Ｉｎ  ｖｉｔｒｏ  ｓｔｕｄｉｅｓ  ｏｎ  ｔｈｅ
ｉｎｉｔｉａｌ  ｒｅａｃｔｉｏｎｓ  ｏｆ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｅｔｈｙｌｂｅｎｚｅｎｅ  ｍｉｎｅｒａｌｉｚａｔｉｏｎ．”  Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  １９９９；  １８１（１８）；  ５６６２−８．  ＰＭＩＤ：  １０４８２５０６．  Ｋｎｉｅｍｅｙｅｒ０１：  Ｋｎｉｅｍｅｙｅｒ  Ｏ，  Ｈｅｉｄｅｒ  Ｊ  （２００１）．  “（Ｓ）−１−ｐｈｅｎｙｌｅｔｈａｎｏｌ  ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ  ｏｆ  Ａｚｏａｒｃｕｓ  ｓｐ．  ｓｔｒａｉｎ  ＥｂＮ１，  ａｎ  ｅｎｚｙｍｅ  ｏｆ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｅｔｈｙｌｂｅｎｚｅｎｅ  ｃａｔａｂｏｌｉｓｍ．”  Ａｒｃｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  ２００１；  １７６（１−２）；  １２９−３５．  ＰＭＩＤ：  １１４７９７１２．  Ｌａｅｍｐｅ９９：  Ｌａｅｍｐｅ  Ｄ，  Ｊａｈｎ  Ｍ，  Ｆｕｃｈｓ  Ｇ  （１９９９）．  “６−Ｈｙｄｒｏｘｙｃｙｃｌｏｈｅｘ−１−ｅｎｅ−１−ｃａｒｂｏｎｙｌ−ＣｏＡ  ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ  ａｎｄ  ６−ｏｘｏｃｙｃｌｏｈｅｘ−１−ｅｎｅ−１−ｃａｒｂｏｎｙｌ−ＣｏＡ  ｈｙｄｒｏｌａｓｅ，  ｅｎｚｙｍｅｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｂｅｎｚｏｙｌ−ＣｏＡ  ｐａｔｈｗａｙ  ｏｆ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ａｒｏｍａｔｉｃ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ  Ｔｈａｕｅｒａ  ａｒｏｍａｔｉｃａ．”  Ｅｕｒ  Ｊ  Ｂｉｏｃｈｅｍ  １９９９；  ２６３（２）；  ４２０−９．  ＰＭＩＤ：  １０４０６９５０．
Ｐｌａｔｅｎ８９：  Ｐｌａｔｅｎ  Ｈ，  Ｓｃｈｉｎｋ  Ｂ  （１９８９）．  “Ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ  ｏｆ  ａｃｅｔｏｎｅ  ａｎｄ  ｈｉｇｈｅｒ  ｋｅｔｏｎｅｓ  ｖｉａ  ｃａｒｂｏｘｙｌａｔｉｏｎ  ｂｙ  ｎｅｗｌｙ  ｉｓｏｌａｔｅｄ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉａ．”  Ｊ  Ｇｅｎ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９８９；  １３５（Ｐｔ４）；  ８８３−９１．  ＰＭＩＤ：  ２５５７３７７．  Ｒａｂｕｓ９５：  Ｒａｂｕｓ  Ｒ，  Ｗｉｄｄｅｌ  Ｆ  （１９９５）．
“Ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｅｔｈｙｌｂｅｎｚｅｎｅ  
ａｎｄ  ｏｔｈｅｒ  ａｒｏｍａｔｉｃ  ｈｙｄｒｏｃａｒｂｏｎｓ  ｂｙ  ｎｅｗ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ｂａｃｔｅｒｉａ．”  Ａｒｃｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９９５；  １６３（２）；  ９６−１０３．  ＰＭＩＤ：  ７７１０３３１．  Ｒａｂｕｓ９８：  Ｒａｂｕｓ，  Ｒ，  Ｈｅｉｄｅｒ，  Ｊ  “Ｉｎｉｔｉａｌ  ｒｅａｃｔｉｏｎｓ  ｏｆ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｏｆ  ａｌｋｙｌｂｅｎｚｅｎｅｓ  ｉｎ  ｄｅｎｉｔｒｉｆｙｉｎｇ  ａｎｄ  ｓｕｌｆａｔｅ−ｒｅｄｕｃｉｎｇ
ｂａｃｔｅｒｉａ．”  Ａｒｃｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  （１９９８）  １７０，  ３７７−３８４．  Ｓｌｕｉｓ９６：  Ｓｌｕｉｓ  ＭＫ，  Ｓｍａｌｌ  ＦＪ，  Ａｌｌｅｎ  ＪＲ，  Ｅｎｓｉｇｎ  ＳＡ  （１９９６）．  “Ｉｎｖｏｌｖｅｍｅｎｔ  ｏｆ
ａｎ  ＡＴＰ−ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ  ｃａｒｂｏｘｙｌａｓｅ  ｉｎ  ａ  ＣＯ２−ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ  ｐａｔｈｗａｙ  ｏｆ  ａｃｅｔｏｎｅ  ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ  ｂｙ  Ｘａｎｔｈｏｂａｃｔｅｒ  ｓｔｒａｉｎ  Ｐｙ２．”  Ｊ  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ  １９９６；  １７８（１４）；  ４０２０−６．  ＰＭＩＤ：  ８７６３９２６．  Ｓｌｕｉｓ９７：  Ｓｌｕｉｓ  ＭＫ，  Ｅｎｓｉｇｎ  ＳＡ  （１９９７）．  “Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  ａｃｅｔｏｎｅ
ｃａｒｂｏｘｙｌａｓｅ  ｆｒｏｍ  Ｘａｎｔｈｏｂａｃｔｅｒ  ｓｔｒａｉｎ  Ｐｙ２．”  Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  Ｕ  Ｓ  Ａ  １９９７；  ９４（１６）；  ８４５６−６１．  ＰＭＩＤ：  ９２３７９９８）：
【００６６】
【化１３】
0005478805.tif 000014
【００６７】
ヒドロフルオロカーボン（ＨＦＣ）、ペルフルオロカーボン（ＰＦＣ）および六弗化硫黄（ＳＦ６）を包含する炭素−ハロゲン化合物は泥炭中で微細物作用により同化される。炭素並びに１種もしくはそれ以上の下記のハロゲン、すなわち弗素（Ｆ）、塩素（Ｃｌ）、臭素（Ｂｒ）、ヨウ素（Ｉ）およびアスタチン（Ａｔ）、を以下の通りに例示することができる：
広く使用されている農業燻蒸剤である臭化メチル（ＣＨ３Ｂｒ）は、成層圏オゾンを破壊する大気臭素ラジカルの重要な原料でありうる。臭化メチルの細菌仲介は急速でありそして地球大気中で見られる基準以下まで不可逆的に除去される（Ｎａｔｕｒｅ  ３７７，
７１７−７１９  （２００２）；  ｄｏｉ：  １０．１０３８／３７７７１７ａ０  Ｒ
ａｐｉｄ  ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ  ｏｆ  ａｔｍｏｓｐｈｅｒｉｃ  ｍｅｔｈｙｌ  ｂｒｏｍｉｄｅ  ｉｎ  ｓｏｉｌｓ，  Ｊ．Ｈ．  Ｓｈｏｒｔｅｒ，  Ｃ．Ｅ．  Ｋｏｌｂ，  Ｐ．Ｍ．  Ｃｒｉｌｌ，  Ｒ．Ａ．  Ｋｅｒｖｉｎ，  Ｒ．Ｗ．  Ｔａｌｂｏｔ，  Ｍ．Ｅ．  Ｈｉｎｅｓ  ＆  Ｒ．Ｃ．  Ｈａｒｒｉｓｓ）。
【００６８】
ブロモクロロメタン（ＢｒＣＨ２Ｃｌ）はシュードモナス・フルオレセンス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ）のヒドロラーゼの存在下でハライド結合に作用させることによりＢｒ−１＋Ｃｌ−１＋ホルムアルデヒド（ＣＨ２＝Ｏ）に還元される（ＳＲＩ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  １９９９−２００４，  Ｍａｒｉｎｅ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  １９９８−２００１，  Ｄｏｕｂｌｅ  Ｔｗｉｓｔ  Ｉｎｃ  １９９８−１９９９．  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．  ３０（１）：  ５６  ２００２）。
【００６９】
四塩化炭素（ＣＣｌ４）または（ＣＴ）は、クリーニング溶媒、燻蒸剤として、そして冷蔵剤の製造における中間体で使用される有毒化合物である。高度に塩素化された化合物、例えば四塩化炭素、は好気性条件下の方が嫌気性条件下より容易に分解される。しばしば脱塩素化であるＣＴの分解における第一段階は特定のハロ呼吸細菌により実施することができるが、アセトフェニックおよびメタノジェニック細菌も塩素化された化合物を非特異的反応により転換させることができる。アセトバクテリウム・ウーディイ（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｗｏｏｄｉｉ）は四塩化炭素を還元および置換機構により分解させることができる。これらの経路には酵素は関与しない。むしろ、金属補酵素、例えばコリノイド（ｃｏｒｒｉｎｏｉｄｓ）、シトクロムＰ４５０、および鉄（ＩＩ）ポルフィリンがＣＴの生変成において重要な役割を演ずることが知られている。アセトバクテリウムはアセチル補酵素Ａ（ＣｏＡ）経路および高水準のコリノイドを利用してＣＴを主としてクロロホルム、ジクロロメタン、および数種の可溶性の塩素化されていない生成物に分解させる。対照的に、アセチル−ＣｏＡ経路を欠いた有機体であるシェワネラ・アルガ（Ｓｈｅｗａｎｅｌｌ  ａｌｇａ）ＢｒＹにおいては、ＣＴは主として一酸化炭素に転化される（Ｅｇｌｉ８８：  Ｅｇｌｉ  Ｃ，  Ｔｓｃｈａｎ  Ｔ，  Ｓｃｈｏｌｔｚ  Ｒ，  Ｃｏｏｋ  ＡＭ，  Ｌｅｉｓｉｎｇｅｒ  Ｔ  （１９８８）．  “Ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｅｔｒａｃｈｌｏｒｏｍｅｔｈａｎｅ  ｔｏ  ｄｉｃｈｌｏｒｏｍｅｔｈａｎｅ  ａｎｄ  ｃａｒｂｏｎ  ｄｉｏｘｉｄｅ  ｂｙ  Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ
ｗｏｏｄｉｉ．”  Ａｐｐｌ  Ｅｎｖｉｒｏｎ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９８８；  ５４（１１）；  ２８１９−２４．  ＰＭＩＤ：  ３１４５７１２．  Ｅｇｌｉ９０：  Ｅｇｌｉ，  Ｃ，  Ｓｔｒｏｈｍｅｙｅｒ，  Ｓ，  Ｃｏｏｋ，  ＡＭ，  Ｌｅｉｓｉｎｇｅｒ，  Ｔ．  “Ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｅｔｒａ−  ａｎｄ  ｔｒｉｃｈｌｏｒｏｍｅｔｈａｎｅ  ｔｏ  ＣＯ２  ｂｙ  ａｎａｅｒｏｂｉｃ  ｂａｃｔｅｒｉａ  ｉｓ  ａ  ｎｏｎ−ｅｎｚｙｍａｔｉｃ  ｐｒｏｃｅｓｓ．”  ＦＥＭＳ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  Ｌｅｔｔｅｒｓ  ６７：  ２０７−２１２  （１９９０）．  Ｈａｓｈｓｈａｍ９９：  Ｈａｓｈｓｈａｍ  ＳＡ，  Ｆｒｅｅｄｍａｎ  ＤＬ  （１９９９）．  “Ｅｎｈａｎｃｅｄ  ｂｉｏｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｃａｒｂｏｎ
ｔｅｔｒａｃｈｌｏｒｉｄｅ  ｂｙ  Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｗｏｏｄｉｉ  ｕｐｏｎ  ａｄｄｉｔｉｏｎ  ｏｆ  ｈｙｄｒｏｘｏｃｏｂａｌａｍｉｎ  ａｎｄ  ｆｒｕｃｔｏｓｅ．”  Ａｐｐｌ  Ｅｎｖｉｒｏｎ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９９９；  ６５（１０）；  ４５３７−４２．  ＰＭＩＤ：  １０５０８０８６．  Ｖａｎ９８：  Ｖａｎ  Ｅｅｋｅｒｔ  ＭＨＡ，  Ｓｃｈｒｏｄｅｒ  ＴＪ，  Ｓｔａｍｓ  ＡＪＭ，  Ｓｃｈｒａａ  Ｇ，  Ｆｉｅｌｄ  ＪＡ  （１９９８）．  “Ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｆａｔｅ  ｏｆ  Ｃａｒｂｏｎ  Ｔｅｔｒａｃｈｌｏｒｉｄｅ  ｉｎ  Ｕｎａｄａｐｔｅｄ  Ｍｅｔｈａｎｏｇｅｎｉｃ  Ｇｒａｎｕｌａｒ  Ｓｌｕｄｇｅ．”  Ａｐｐｌ  Ｅｎｖｉｒｏｎ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９９８；  ６４（７）；  ２３５０−６，  ＰＭＩＤ：  ９６４７７９８）。
【００７０】
【化１４】
0005478805.tif 000015
【００７１】
として表わされる。
【００７２】
ハロアルカン、ハロアルコール、ハロアルケンおよび一部のハロ芳香族化合物は泥炭中で、数例を挙げるとキサントバクター・オートトロフィクス（Ｘａｎｔｈｏｂａｃｔｅｒ
ａｕｔｏｔｒｏｐｈｉｃｕｓ）、アルスロバクター・Ｊ・バクテリオール（Ａｒｔｈｒｏｂａｃｔｅｒ  Ｊ．  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ）およびコリネバクテリウム（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ）  の如き多くの微生物、により微生物的に同化されうる。
【００７３】
これに関する一般式は、Ｈ２Ｏ＋ハロアルカン＞Ｒ−ＯＨ＋ハライドである（ＳＲＩ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  １９９９−２００４，  Ｍａｒｉｎｅ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  １９９８−２００１，  Ｄｏｕｂｌｅ  Ｔｗｉｓｔ  Ｉｎｃ  １９９８−１９９９  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．  ３０（１）：  ５６
２００２；  Ｋｅｕｎｉｎｇ，  Ｓ．，  Ｊａｎｓｓｅｎ，  Ｄ．Ｂ．  ａｎｄ  Ｗｉｔｈｏｌｔ，  Ｂ．  Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｈｙｄｒｏｌｙｔｉｃ  ｈａｌｏａｌｋａｎｅ  ｄｅｈａｌｏｇｅｎａｓｅ  ｆｒｏｍ  Ｘａｎｔｈｏｂａｃｔｅｒ  ａｕｔｏｔｒｏｐｈｉｃｕｓ  ＧＪ１０．  Ｊ．  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．  １６３  （１９８６）  ６３５−６３９．  ［Ｍｅｄｌｉｎｅ  ＵＩ：  ８５２６１０７６：．  Ｓｃｈｏｌｔｚ，  Ｒ．，  Ｌｅｉｓｉｎｇｅｒ，  Ｔ．，  Ｓｕｔｅｒ，  Ｆ．  ａｎｄ  Ｃｏｏｋ，  Ａ．Ｍ．  Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  １−ｃｈｌｏｒｏｈｅｘａｎｅ  ｈａｌｉｄｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ，  ａ  ｄｅｈａｌｏｇｅｎａｓｅ  ｏｆ  ｗｉｄｅ  ｓｕｂｓｔｒａｔｅ  ｒａｎｇｅ  ｆｒｏｍ  ａｎ  Ａｒｔｈｒｏｂａｃｔｅｒ  ｓｐ．  Ｊ．  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．
１６９  （１９８７）  ５０１６−５０２１．  ［Ｍｅｄｌｉｎｅ  ＵＩ：  ８８０３２８１９］．  Ｙｏｋｏｔａ，  Ｔ．，  Ｏｍｏｒｉ，  Ｔ．  ａｎｄ  Ｋｏｄａｍａ，
Ｔ．  Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ  ｏｆ  ｈａｌｏａｌｋａｎｅ  ｄｅｈａｌｏｇｅｎａｓｅ  ｆｒｏｍ  Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐ．  ｓｔｒａｉｎ  ｍ１５−３．  Ｊ．  Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．  １６９  （１９８７）  ４０４９−４０５４．  ［Ｍｅｄｌｉｎｅ  ＵＩ：  ８７３０７９８１）。
【００７４】
別の態様では、本発明は工業廃棄物から環境汚染物として製造される金属の生物隔離および有機同化方法に関する。この方法は金属を泥炭地に入れ、そこでそれをその後に隔離しそして有機的に同化する。本発明の概念における金属は、アルカリ金属、軽金属、および／または重遷移金属を含んでなりうる。アルカリ金属の例は、リチウム、ナトリウム、カリウム、ルビジウム、セシウム、およびフランシウムを包含する。軽金属の例は、ベリリウム、マグネシウム、カルシウム、ストロンチウム、バリウムおよびラジウムを包含する。重遷移金属の非限定例は、クロム、水銀、および鉛を包含する。
【００７５】
数世紀にわたり、泥炭地には産業が大気中に放出する金属が滲み込み、それらを泥炭内で有機金属と結合させてきた。金属は泥炭内で同化される。例は、硫酸銅、鉛の酢酸塩に対する微生物作用および方鉛鉱の酸化である。この好例は方鉛鉱である。方鉛鉱は種々の環境において見出される最多の鉛鉱石である。方鉛鉱は硫化鉛鉱脈内で最も普遍的に見いだされ、そして火成岩および堆積岩に拡散されている。それはしばしば銀鉱石と共に見出され、そしてしばしば鉛および銀鉱山に存在する。チオバシルス・プランボフィルス（Ｔｈｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｌｕｍｂｏｐｈｉｌｕｓ）は成長のために方鉛鉱を酸化する。それはまたＨ２ＯおよびＨ２を酸化することもできる（Ｄｒｏｂｎｅｒ９２：  Ｄｒｏｂｎｅｒ  Ｅ，  Ｈｕｂｅｒ  Ｈ，  Ｒａｃｈｅｌ  Ｒ，  Ｓｔｅｔｔｅｒ  ＫＯ  （１９９２）．  “Ｔｈｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｌｕｍｂｏｐｈｉｌｕｓ  ｓｐｅｃ．  ｎｏｖ．，  ａ  ｎｏｖｅｌ  ｇａｌｅｎａ  ａｎｄ  ｈｙｄｒｏｇｅｎ  ｏｘｉｄｉｚｅｒ．”  Ａｒｃｈ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  １９９２；  １５７（３）；  ２１３−７．  ＰＭＩＤ：  １５１０５５２）。
【００７６】
【化１５】
0005478805.tif 000016
【００７７】
として表わされる。
【００７８】
泥炭中への大気水銀の沈着は１９世紀初めから倍増したかもしれない（Ｎａｔｕｒｅ  ３５５，  ４３４−４３７  （１９９２）；  ｄｏｉ：  １０．１０３８／３５５４３４ａ０  Ｉｎｃｒｅａｓｅ  ｉｎ  ｇｌｏｂａｌ  ａｔｍｏｓｐｈｅｒｉｃ  ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎｓ  ｏｆ  ｍｅｒｃｕｒｙ  ｉｎｆｅｒｒｅｄ  ｆｒｏｍ  ｍｅａｓｕｒｅｍｅｎｔｓ  ｏｖｅｒ  ｔｈｅ  Ａｔｌａｎｔｉｃ  Ｏｃｅａｎ，  Ｆ．  Ｓｌｅｍｒ
＆  Ｅ．  Ｌａｎｇｅｒ）。
【００７９】
シュードモナス・フルオレセンス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｌｕｏｒｅｓｅｎｓ）のある種は酢酸フェニル水銀を分解することができる。有毒なＨｇ２＋イオンはより毒性が少なく且つ揮発性であるＨｇ０に転化される（Ｍｉｒｇａｉｎ：  Ｍｉｒｇａｉｎ  Ｉ，  Ｗｅｒｎｅｂｕｒｇ  Ｂ，  Ｈａｒｆ  Ｃ，  Ｍｏｎｔｅｉｌ  Ｈ  “Ｐｈｅｎｙｌｍｅｒｃｕｒｉｃ  ａｃｅｔａｔｅ  ｂｉｏｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ  ｂｙ  ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ  ｓｔｒａｉｓ  ｏｆ  Ｐｓｕｅｄｏｍｏｎａｓ  ｓｐｅｃｉｅｓ．”
Ｒｅｓ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ  ＮＩＬ；  １４０（９）；  ６９５−７０７．  ＰＭＩＤ：  ２６２６５９７）。
【００８０】
【化１６】
0005478805.tif 000017
【００８１】
として表わされる。
【００８２】
有機水銀化合物は泥炭中で例えばセラチア・マルセセンス（Ｓｅｒｒａｔｉａ  ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ）の如き微生物により同化されうる（ＳＲＩ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  １９９９−２００４，  Ｍａｒｉｎｅ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  １９９８−２００１，  Ｄｏｕｂｌｅ  Ｔｗｉｓｔ  Ｉｎｃ  １９９８−１９９９．
Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．  ３０（１）：  ５６  ２００２）。
【００８３】
【化１７】
0005478805.tif 000018
【００８４】
として表わされる。
【００８５】
泥炭中の金属同化は泥炭中の磁性細菌の発生に一部依存する（Ｎａｔｕｒｅ  ３４３，
１６１−１６３  （１９９０）；  ｄｏｉ：  １０．１０３８／３４３１６１ａ０，  Ｏｃｃｕｒｒｅｎｃｅ  ｏｆ  ｍａｇｎｅｔｉｃ  ｂａｃｔｅｒｉａ  ｉｎ  ｓｏｉｌ，
Ｊｏｅｒｇ  Ｗ．Ｅ．  Ｆａｓｓｂｉｎｄｅｒ，  Ｈｅｌｇｅ  Ｓｔａｎｊｅｋｔ  ＆
Ｈｏｊａｔｏｌｌａｈ  Ｖａｌｉ）。これは泥炭中での金属元素または化合物の増加、遅滞、沈着または再流動化において重要な役割を演ずる。
【００８６】
さらに別の態様では、本発明は工業廃棄物から環境汚染物として製造される粒状物質の生物隔離および有機同化方法に関する。この方法は粒状物質を泥炭地に入れ、そこでそれをその後に生物隔離しそして有機的に同化する。本発明の概念における粒状物質は工業生産の副生物として製造される粒状物質を含んでなりうる。粒状物質の例は、煤、塵、汚物、およびエーロゾルを包含する。エーロゾルは、自動車、化粧品、食品、塗料およびワニス並びに抛射剤中での種々の製品として使用される。ある種の一般的な抛射剤はＣＯ２およびＮＯｘである。以上で説明したように、泥炭中の微生物はこれらのエーロゾルを還元および同化しうる。
【実施例】
【００８７】
実施例１．泥炭中でのＮＯｘ気体の有機同化
窒素酸化物の混合物を研究室内で発生させそして泥炭のカラム中に通した。空気試料を発生システムおよび後処理中に採取し、それらを引き続きガスクロマトグラフィー／質量分光法により分析して処理システムの効果を測定した。システムは硝化／脱窒サイクルにおける泥炭生物相のよく立証された能力を利用するように設計された。
【００８８】
１Ｌエルレンマイヤー側腕真空フラスコにゴム栓を装着した。クロマトグラフィーカラムを栓の中に入れてシステムを開けずに試薬を導入する手段を可能にした。真空口には短い長さのタイゴン（Ｔｙｇｏｎ）管が付いていた。この管が１Ｌフラスコを同様な５００
ｍＬフラスコに連結させた。このフラスコの目的は、液体トラップを提供してＮＯｘ発生反応が処理システムを越える場合に泥炭から反応フラスコおよび安全区域への液体の逆流を防止することであった。この第二フラスコに別の短い長さのラテックス管により付けられているものは、１．５インチの直径を有するガラス管であった。このガラス管の中に１８グラムの質量を有する２インチの湿った泥炭（湿っているがそこから絞られた過剰水分〜＝６５％固体）を入れた。５グラムの銅を１−Ｌフラスコ中に入れ、クロマトグラフィー管に１２．３ｍＬの７０％硝酸を充填した。クロマトグラフィー管上の止めコックを開いて硝酸を銅に接触させた。反応により大量の有毒な褐色の煙が発生した。酸に対する銅の相対的濃度によって異なるＮＯｘ気体が発生した。酸を銅に徐々に供給することにより、正常な燃焼工程を模するためにこの比を変えて種々の形態のＮＯｘの発生を確実にした。
【００８９】
反応は以下の通りである：
３ＣＵ＋８ＨＮＯ３  →  ３ＣＵ（ＮＯ３）２＋４Ｈ２Ｏ＋２ＮＯ
ＣＵ＋４ＨＮＯ３  →  ＣＵ（ＮＯ３）２＋２Ｈ２Ｏ＋２ＮＯ２
そして、過剰の硝酸が存在する時にはＮ２Ｏ５およびＮ２Ｏ３が製造される。水の存在下では：
Ｎ２Ｏ３＋Ｈ２Ｏ  →  ２ＨＮＯ２
Ｎ２Ｏ５＋Ｈ２Ｏ  →  ２ＨＮＯ３
ＮＯ２は二量化して四酸化二窒素、Ｎ２Ｏ４、を生成する。室温で２つの分子間に平衡が存在する。そして、室温より上では、Ｎ２Ｏ５は不安定でありそしてＮ２Ｏ４およびＯ２に分解する。
【００９０】
１ミリリットルのこのＮＯｘ気体を気密注射器内で採取しそしてバリアン・サターン・ＩＩ・イオン・トラップ（Ｖａｒｉａｎ  Ｓａｔｕｒｎ  ＩＩ  Ｉｏｎ  Ｔｒａｐ）質量分光計にインターフェースさせたバリアン３４００ガスクロマトグラフィーに注入した。クロマトグラフィー分離を０．３２ｍｍ内径のレステク・プロット−Ｑ（Ｒｅｓｔｅｋ  Ｐｌｏｔ−Ｑ）カラム上で行いそして質量分光計は電子衝撃方式で７０ｅｖにおいて３３−９６ダルトンから走査して操作された。この気体試料のクロマトグラムは下記の保持時間および質量を有するＮＯｘ種に起因した５個のピークを明らかに含有していた：
ピークＩＤ            保持時間          走査数          ピーク面積
１．Ｎ２Ｏ２          ７．７７          ４５９          １４５，５５０
２．Ｎ２Ｏ３          １１．６４        ６９８          ２７７，４６３
３．ＮＯ２            １１．８３        ７１１          ３２１，４９５
４．Ｎ２Ｏ４          １２．７０        ７６３          ２０５，３６２
５．Ｎ２Ｏ５          １３．７２        ８２７          １５６，９５４
（試料のいずれかが捕獲された空気である可能性を排除するために）気体をカラム中に２０分間にわたり通した後に、１ミリリットルの気体を泥炭上から直接採取した。試料を採取しながら気体を湿った泥炭の２インチ栓の中に活発に通した。この試料を同じ分析システムに注入した。この分析のクロマトグラムは、１つだけのピークがＮＯｘ種に属したことを示した。これは１３．８２分の保持時間および５０，３７８計数の面積におけるＮ２Ｏ５である。
【００９１】
実験は、気体が自然に固まった泥炭の２インチ部分を通るのにかかる時間の間にＮＯｘ気体の混合物が除去されることを示している。５種の気体の４種はこの実験で１００％除
去されそして第５の気体は６８％の濃度減少を示した。
【図面の簡単な説明】
【００９２】
【図１】図１は温室気体捕獲の簡素化された例を示す。
【図２】図２は温室気体再生の簡素化された例を示す。
【図３】図３はＮ２Ｏ２、Ｎ２Ｏ３、ＮＯ２、Ｎ２Ｏ４、およびＮ２Ｏ５を含有するＮＯｘ気体混合物のクロマトグラムを示す。
【図４】図４は泥炭を用いるＮＯｘ気体の２０分間の処理後の上部空間のクロマトグラムを示す。
【図５】図５は泥炭処理後に残存するＮ２Ｏ５ピークを囲むクロマトグラフ領域の拡大尺を表わす。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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