(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
細胞から高度に精製された疎水性タンパク質を得るための方法であって、
（ｉ）細胞ホモジネートを精密濾過にかける工程と、
（ｉｉ）少なくとも１つの洗浄剤を含有する緩衝溶液を使用した精密ダイア濾過により該精密濾過から得た未透過物を抽出する工程と、
（ｉｉｉ）該精密ダイア濾過から得た濾液をヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィーにかける工程であって、任意選択で、該ＨＡカラムクロマトグラフィーの前に該精密ダイア濾過から得た濾液を追加のクロマトグラフィー工程にかける工程と
を含む方法。
【請求項２】
抽出工程（ｉｉ）の前に、前記細胞ホモジネートを、Ｔｒｉｓ緩衝液、ＨＥＰＥＳ緩衝液、クエン酸緩衝液、およびリン酸緩衝液からなる群より選択される適切な緩衝液を使用して洗浄する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｉｉｉ）の前に、前記抽出工程（ｉｉ）から得た濾液をイオン交換クロマトグラフィーにかける、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｉｉｉ）の前に、前記抽出工程（ｉｉ）から得た濾液を、膜吸着体を使用した陰イオン交換濾過にかける、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
精製される前記疎水性タンパク質が組換え合成Ｌｙｍｅ抗原（ｒＳＬＡ）である、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
精製される前記疎水性タンパク質が、脂質付加タンパク質である、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
精製される前記疎水性タンパク質がＢｏｒｒｅｌｉａ由来のリポタンパク質である、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
精製される前記疎水性タンパク質が、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質の配列の少なくとも１３０個の連続したアミノ酸にわたってＢｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と少なくとも５０％の同一性を有するリポタンパク質である、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記疎水性タンパク質を含有する細胞が、Ｅ．ｃｏｌｉ、酵母、植物細胞、昆虫細胞、トリ細胞および哺乳動物細胞からなる群より選択される宿主細胞である、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
前記工程（ｉｉ）において使用される緩衝液が、陰イオン洗浄剤、陽イオン洗浄剤、双性イオン洗浄剤および非イオン洗浄剤からなる群より選択される洗浄剤を含有し、
該陰イオン洗浄剤が、コール酸およびその誘導体、Ｎ，Ｎ−ジメチルドデシルアミンＮ−オキシド、１−アルキルスルホン酸ナトリウム、Ｎ−ラウロイルサルコシン、ならびに脂肪酸塩からなる群より選択され、
該陽イオン洗浄剤が、アルキルトリメチルアンモニウムブロミドおよびその誘導体、ならびに塩化ベンザルコニウムからなる群より選択され、
該双性イオン洗浄剤が、ドデシルベタイン、アルキルジメチルアミンオキシドおよびその誘導体、ならびに３−（Ｎ，Ｎ−ジメチルアルキル−アンモニオ）−プロパンスルホン酸塩からなる群より選択され、
該非イオン洗浄剤が、オクチルフェノールエトキシレート、ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート、アルキルポリ（エチレンオキシド）およびその誘導体、アルキルポリグルコシド、ならびに脂肪アルコールからなる群より選択される、
請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
前記洗浄剤が０．５％から３．０％までの量で存在する、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記洗浄剤が１％から１．５％までの量で存在する、請求項１０に記載の方法。
【請求項１３】
前記工程（ｉｉ）で使用される緩衝液がＴｒｉｓ緩衝液である、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
前記工程（ｉｉ）で使用される緩衝液が、洗浄剤としてオクチルフェノールエトキシレートを含有する、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
前記抽出工程（ｉｉ）の工程の後、０．２μｍポアサイズ精密濾過カセットを使用して精密濾過および／または精密ダイア濾過工程を実施する、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
前記緩衝液濃度が０．１ｍＭから１．０Ｍまでの範囲にある、請求項１に記載の方法。
【請求項１７】
前記緩衝液濃度が１．０ｍＭから６００ｍＭまでの範囲にある、請求項１に記載の方法。
【請求項１８】
前記緩衝液のｐＨが３．０から１０．０までの範囲にある、請求項１に記載の方法。
【請求項１９】
前記緩衝液のｐＨが６．０から８．０までの範囲にある、請求項１に記載の方法。
【請求項２０】
室温で前記方法を実施する、請求項１に記載の方法。
【請求項２１】
０℃から１５℃までの温度で前記方法を実施する、請求項１に記載の方法。
【請求項２２】
細胞から高度に精製された脂質付加タンパク質を得るための方法であって、
（ｉ）該脂質付加タンパク質を含有する細胞を提供する工程と、
（ｉｉ）該細胞をホモジナイズする工程と、
（ｉｉｉ）そのようにして得られたホモジネートを、
（ａ）精密濾過により該ホモジネートを濃縮する工程、
（ｂ）濃縮された該ホモジネートを精密ダイア濾過により洗浄し、それによって精密ダイア濾液−１および精密ダイア未透過物−１を得る工程、
（ｃ）該精密ダイア未透過物−１から、洗浄剤を含有する緩衝液を使用した精密ダイア濾過により該脂質付加タンパク質を抽出し、それによって精密ダイア濾液−２および精密ダイア未透過物−２を得る工程
を含む精密ダイア濾過にかける工程と、
（ｉｖ）該抽出された脂質付加タンパク質を含有する該精密ダイア濾液−２を、イオン交換クロマトグラフィーにかける工程であって、その溶出液が該精製された脂質付加タンパク質を含有する、工程と、
（ｖ）該工程（ｉｖ）におけるイオン交換クロマトグラフィーから得られた溶出液を、残留内毒素除去のために陰イオン交換濾過にかける工程と、
（ｖｉ）該脂質付加タンパク質を含有する、（ｉｖ）で得られたタンパク質溶液を、ヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィーにかける工程と
を含む方法。
【請求項２３】
抽出工程（ｉｉｉ）（ｃ）の前に、前記細胞ホモジネートを、Ｔｒｉｓ緩衝液、ＨＥＰＥＳ緩衝液、クエン酸緩衝液、およびリン酸緩衝液からなる群より選択される適切な緩衝液を使用して洗浄する、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｖｉ）の前に、前記抽出工程（ｉｉｉ）（ｃ）から得られた濾液をイオン交換クロマトグラフィーにかける、請求項２２に記載の方法。
【請求項２５】
ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｖｉ）の前に、前記抽出工程（ｉｉｉ）（ｃ）から得られた濾液を、膜吸着体を使用した陰イオン交換濾過にかける、請求項２２に記載の方法。
【請求項２６】
前記脂質付加タンパク質を含有する細胞が、Ｅ．ｃｏｌｉ、酵母、植物細胞、昆虫細胞、トリ細胞および哺乳動物細胞からなる群より選択される宿主細胞である、請求項２２に記載の方法。
【請求項２７】
前記工程（ｉｉｉ）（ｃ）において使用される緩衝液が、陰イオン洗浄剤、陽イオン洗浄剤、双性イオン洗浄剤および非イオン洗浄剤からなる群より選択される洗浄剤を含有し、
該陰イオン洗浄剤が、コール酸およびその誘導体、Ｎ，Ｎ−ジメチルドデシルアミンＮ−オキシド、１−アルキルスルホン酸ナトリウム、Ｎ−ラウロイルサルコシン、ならびに脂肪酸塩からなる群より選択され、
該陽イオン洗浄剤が、アルキルトリメチルアンモニウムブロミドおよびその誘導体、ならびに塩化ベンザルコニウムからなる群より選択され、
該双性イオン洗浄剤が、ドデシルベタイン、アルキルジメチルアミンオキシドおよびその誘導体、ならびに３−（Ｎ，Ｎ−ジメチルアルキル−アンモニオ）−プロパンスルホン酸塩からなる群より選択され、
該非イオン洗浄剤が、オクチルフェノールエトキシレート、ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート、アルキルポリ（エチレンオキシド）およびその誘導体、アルキルポリグルコシド、ならびに脂肪アルコールからなる群より選択される、
請求項２２に記載の方法。
【請求項２８】
前記洗浄剤が０．５％から３．０％までの量で存在する、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
前記洗浄剤が１％から１．５％までの量で存在する、請求項２７に記載の方法。
【請求項３０】
前記工程（ｉｉｉ）（ｃ）において使用される緩衝液がＴｒｉｓ緩衝液である、請求項２２に記載の方法。
【請求項３１】
前記工程（ｉｉｉ）（ｃ）において使用される緩衝液が、洗浄剤としてオクチルフェノールエトキシレートを含有する、請求項２２に記載の方法。
【請求項３２】
前記抽出工程（ｉｉｉ）（ｃ）の工程の後、０．２μｍポアサイズ精密濾過カセットを使用して精密濾過および／または精密ダイア濾過工程を実施する、請求項２２に記載の方法。
【請求項３３】
前記緩衝液濃度が０．１ｍＭから１．０Ｍまでの範囲にある、請求項２２に記載の方法。
【請求項３４】
前記緩衝液濃度が１．０ｍＭから６００ｍＭまでの範囲にある、請求項２２に記載の方法。
【請求項３５】
前記緩衝液のｐＨが３．０から１０．０までの範囲にある、請求項２２に記載の方法。
【請求項３６】
前記緩衝液のｐＨが６．０から８．０までの範囲にある、請求項２２に記載の方法。
【請求項３７】
室温で前記方法を実施する、請求項２２に記載の方法。
【請求項３８】
０℃から１５℃までの温度で前記方法を実施する、請求項２２に記載の方法。
【請求項３９】
細胞から高度に精製された組換え合成Ｌｙｍｅ抗原（ｒＳＬＡ）を得るための方法であって、
（ｉ）該ｒＳＬＡを含有する細胞を提供する工程と、
（ｉｉ）該細胞をホモジナイズする工程と、
（ｉｉｉ）そのようにして得られたホモジネートを、
（ａ）精密濾過により該ホモジネートを濃縮する工程、
（ｂ）濃縮された該ホモジネートを精密ダイア濾過により洗浄し、それによって精密ダイア濾液−１および精密ダイア未透過物−１を得る工程、
（ｃ）該精密ダイア未透過物−１から、少なくともオクチルフェノールエトキシレートを含有する緩衝液を使用した精密ダイア濾過によりｒＳＬＡを抽出し、それによって精密ダイア濾液−２および精密ダイア未透過物−２を得る工程
を含む精密ダイア濾過にかける工程と、
（ｉｖ）抽出されたｒＳＬＡを含有する該精密ダイア濾液−２を、陰イオン交換クロマト
グラフィーにかける工程であって、その溶出液が精製されたｒＳＬＡを含有する、工程と、
（ｖ）該工程（ｉｖ）における陰イオン交換クロマトグラフィーから得られた溶出液を、残留内毒素除去のために陰イオン交換濾過にかける工程と、
（ｖｉ）ｒＳＬＡを含有する（ｉｖ）で得られたタンパク質溶液を、ヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィーにかける工程と
を含む方法。
【請求項４０】
抽出工程（ｉｉｉ）（ｃ）の前に、前記細胞ホモジネートを、Ｔｒｉｓ緩衝液、ＨＥＰＥＳ緩衝液、クエン酸緩衝液、およびリン酸緩衝液からなる群より選択される適切な緩衝液を使用して洗浄する、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｖｉ）の前に、前記抽出工程（ｉｉｉ）（ｃ）から得られた濾液をイオン交換クロマトグラフィーにかける、請求項３９に記載の方法。
【請求項４２】
ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｖｉ）の前に、前記抽出工程（ｉｉｉ）（ｃ）から得られた濾液を、膜吸着体を使用した陰イオン交換濾過にかける、請求項３９に記載の方法。
【請求項４３】
前記組換え合成Ｌｙｍｅ抗原を含有する細胞が、Ｅ．ｃｏｌｉ、酵母、植物細胞、昆虫細胞、トリ細胞および哺乳動物細胞からなる群より選択される宿主細胞である、請求項３９に記載の方法。
【請求項４４】
前記工程（ｉｉｉ）（ｃ）において使用される緩衝液が、陰イオン洗浄剤、陽イオン洗浄剤、双性イオン洗浄剤および非イオン洗浄剤からなる群より選択される洗浄剤を含有し、
該陰イオン洗浄剤が、コール酸およびその誘導体、Ｎ，Ｎ−ジメチルドデシルアミンＮ−オキシド、１−アルキルスルホン酸ナトリウム、Ｎ−ラウロイルサルコシン、ならびに脂肪酸塩からなる群より選択され、
該陽イオン洗浄剤が、アルキルトリメチルアンモニウムブロミドおよびその誘導体、ならびに塩化ベンザルコニウムからなる群より選択され、
該双性イオン洗浄剤が、ドデシルベタイン、アルキルジメチルアミンオキシドおよびその誘導体、ならびに３−（Ｎ，Ｎ−ジメチルアルキル−アンモニオ）−プロパンスルホン酸塩からなる群より選択され、
該非イオン洗浄剤が、オクチルフェノールエトキシレート、ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート、アルキルポリ（エチレンオキシド）およびその誘導体、アルキルポリグルコシド、ならびに脂肪アルコールからなる群より選択される、
請求項３９に記載の方法。
【請求項４５】
前記洗浄剤が０．５％から３．０％までの量で存在する、請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
前記洗浄剤が１％から１．５％までの量で存在する、請求項４４に記載の方法。
【請求項４７】
前記工程（ｉｉｉ）（ｃ）において使用される緩衝液がＴｒｉｓ緩衝液である、請求項３９に記載の方法。
【請求項４８】
前記工程（ｉｉｉ）（ｃ）において使用される緩衝液が、洗浄剤としてオクチルフェノールエトキシレートを含有する、請求項３９に記載の方法。
【請求項４９】
前記抽出工程（ｉｉｉ）（ｃ）の工程の後、０．２μｍポアサイズ精密濾過カセットを使用して精密濾過および／または精密ダイア濾過工程を実施する、請求項３９に記載の方法。
【請求項５０】
前記緩衝液濃度が０．１ｍＭから１．０Ｍまでの範囲にある、請求項３９に記載の方法。
【請求項５１】
前記緩衝液濃度が１．０ｍＭから６００ｍＭまでの範囲にある、請求項３９に記載の方法。
【請求項５２】
前記緩衝液のｐＨが３．０から１０．０までの範囲にある、請求項３９に記載の方法。
【請求項５３】
前記緩衝液のｐＨが６．０から８．０までの範囲にある、請求項３９に記載の方法。
【請求項５４】
室温で前記方法を実施する、請求項３９に記載の方法。
【請求項５５】
０℃から１５℃までの温度で前記方法を実施する、請求項３９に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願への相互参照
この出願は、２００７年２月２２日に出願された米国仮特許出願第６０／９０２，８０３号（これは、その全体が参考として本明細書に援用される）への優先権を主張する。
【０００２】
連邦支援の研究または開発の下で行われた発明に対する権利に関する陳述
該当なし。
【０００３】
「配列表」、表、またはコンパクトディスクで提出されたコンピュータプログラム表付属書への言及
該当なし。
【０００４】
本発明は、洗浄剤を含有する緩衝液を使用した抽出およびヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィーによる前記洗浄剤の除去によって細胞から高度に精製された疎水性タンパク質を得るための方法に関する。
【背景技術】
【０００５】
膜タンパク質、特に疎水性タンパク質の抽出および可溶化のための有望な構想は、洗浄剤の使用である。洗浄剤は両親媒性分子であり、これは極性および非極性化学基を含有する。したがって、洗浄剤は水中で独自の特性を示す。洗浄剤は水に可溶性であり、疎水性ドメイン（たとえば、膜貫通領域）と相互作用をすることにより疎水性タンパク質を可溶化することができる。多数の洗浄剤が公知であるが、原理上、洗浄剤は、非イオン、イオンおよび双性イオン洗浄剤に分類することができる。洗浄剤の可溶化能は、分子内の両親媒性基の親水性／親油性均衡（ＨＬＢ）により変化する。（ドデシル硫酸ナトリウム−ＳＤＳのような）高可溶化能力を有する洗浄剤は、可溶化されるタンパク質の構造に対して変性効果も及ぼす。したがって、目的の用途に適した洗浄剤の選択は、標的タンパク質の特性およびそのプロセスの技術的条件に依存している（たとえば、非特許文献１を参照されたい）。
【０００６】
タンパク質などの生体分子を可溶化するために洗浄剤を使用する主要な欠点の１つは、目的の生体分子が洗浄剤自体に汚染されることである。洗浄剤を完全に除去するのは、通常、時間がかかって面倒であり、または一部の場合では不可能でさえある。さらに、多数の抽出後精製工程を必要とすることにより、目的の産物の得られる全収率は不経済的な程度にまで減少することがある。
【０００７】
さらに、細胞残屑分離のための当技術分野で公知のもっとも一般的な方法は遠心分離である。しかし、遠心分離は、特に工業的大量生産規模工程を考慮すると、高価な工業規模の遠心分離機および微粒子の場合の低有効性などの種々の欠点を示す。
【０００８】
したがって、細胞から高度に精製された疎水性タンパク質を得るのに使用することができて、上記の欠点を克服する方法への強い必要性が存在する。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００９】
【非特許文献１】Ｌ．Ｍ．ＨｊｅｌｍｅｌａｎｄおよびＡ．Ｃｈｒａｍｂａｃｈ、「Ｓｏｌｕｂｉｌｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ  Ｍｅｍｂｒａｎｅ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ」、Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．、１９８４年、１０４巻、Ｐａｒｔ  Ｃ、３０５〜３２８頁
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１０】
したがって、膜タンパク質、特に疎水性タンパク質など、細胞から高度に精製されたタンパク質を得るための新規の方法を提供することが本発明の目的である。
【課題を解決するための手段】
【００１１】
本発明は、細胞から高度に精製された疎水性タンパク質を得るための方法であって、前記タンパク質を可溶化する洗浄剤、およびその後洗浄剤を除去するためのヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程を使用する方法に関する。
【００１２】
本発明に従った方法は、原核生物または真核生物の種の膜結合タンパク質として天然に存在するタンパク質などの脂質付加タンパク質を精製するのに極めて有効である。たとえば、宿主細胞由来の目的の疎水性タンパク質を可溶化する洗浄剤を使用することにより、標的タンパク質は効率的に単離される。たとえば、本発明の方法を使用して、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐの２つの別々の遺伝子型由来の外表面タンパク質（ＯｓｐＡ）タンパク質のドメインを含む組換え合成Ｌｙｍｅ抗原（「ｒＳＬＡ」）を精製することができる。
【００１３】
本発明はさらに、本発明に従った方法から得られる脂質付加タンパク質などの疎水性タンパク質を含む医薬組成物に関する。本発明は以下をも提供する。
（１）  細胞から高度に精製された疎水性タンパク質を得るための方法であって、
（ｉ）細胞ホモジネートを精密濾過にかける工程と、
（ｉｉ）少なくとも１つの洗浄剤を含有する緩衝溶液を使用した精密ダイア濾過により該精密濾過から得た未透過物を抽出する工程と、
（ｉｉｉ）該精密ダイア濾過から得た濾液をヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィーにかける工程であって、任意選択で、該ＨＡカラムクロマトグラフィーの前に該精密ダイア濾過から得た濾液を追加のクロマトグラフィー工程にかける工程と
を含む方法。
（２）  抽出工程（ｉｉ）の前に、前記細胞ホモジネートを、Ｔｒｉｓ緩衝液、ＨＥＰＥＳ緩衝液、クエン酸緩衝液、およびリン酸緩衝液からなる群より選択される適切な緩衝液を使用して洗浄する、項目１に記載の方法。
（３）  ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｉｉｉ）の前に、前記抽出工程（ｉｉ）から得た濾液をイオン交換クロマトグラフィーにかける、項目１に記載の方法。
（４）  ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｉｉｉ）の前に、前記抽出工程（ｉｉ）から得た濾液を、膜吸着体を使用した陰イオン交換濾過にかける、項目１に記載の方法。
（５）  精製される前記疎水性タンパク質が組換え合成Ｌｙｍｅ抗原（ｒＳＬＡ）である、項目１に記載の方法。
（６）  精製される前記疎水性タンパク質が、脂質付加タンパク質である、項目１に記載の方法。
（７）  精製される前記疎水性タンパク質がＢｏｒｒｅｌｉａ由来のリポタンパク質である、項目１に記載の方法。
（８）  精製される前記疎水性タンパク質が、一次配列の少なくとも１３０個の連続したアミノ酸にわたってＢｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と少なくとも５０％の同一性を有するリポタンパク質である、項目１に記載の方法。
（９）  前記疎水性タンパク質を含有する細胞が、Ｅ．ｃｏｌｉ、酵母、植物細胞、昆虫細胞、トリ細胞または哺乳動物細胞からなる群より選択される宿主細胞である、項目１に記載の方法。
（１０）  前記工程（ｉｉ）において使用される緩衝液が、陰イオン洗浄剤、陽イオン洗浄剤、双性イオン洗浄剤および非イオン洗浄剤からなる群より選択される洗浄剤を含有し、
該陰イオン洗浄剤が、コール酸およびその誘導体、Ｎ，Ｎ−ジメチルドデシルアミンＮ−オキシド、１−アルキルスルホン酸ナトリウム、Ｎ−ラウロイルサルコシンまたは脂肪酸塩からなる群より選択され、
該陽イオン洗浄剤が、アルキルトリメチルアンモニウムブロミドおよびその誘導体、または塩化ベンザルコニウムからなる群より選択され、
該双性イオン洗浄剤が、ドデシルベタイン、アルキルジメチルアミンオキシドおよびその誘導体または３−（Ｎ，Ｎ−ジメチルアルキル−アンモニオ）−プロパンスルホン酸塩からなる群より選択され、
該非イオン洗浄剤が、オクチルフェノールエトキシレート、ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート、アルキルポリ（エチレンオキシド）およびその誘導体、アルキルポリグルコシドまたは脂肪アルコールからなる群より選択される、
項目１に記載の方法。
（１１）  前記洗浄剤が約０．５％から約３．０％までの量で存在する、項目１０に記載の方法。
（１２）  前記洗浄剤が約１％から約１．５％までの量で存在する、項目１０に記載の方法。
（１３）  前記工程（ｉｉ）で使用される緩衝液がＴｒｉｓ緩衝液である、項目１に記載の方法。
（１４）  前記工程（ｉｉ）で使用される緩衝液が、洗浄剤としてオクチルフェノールエトキシレートを含有する、項目１に記載の方法。
（１５）  前記抽出工程（ｉｉ）の工程の後、０．２μｍポアサイズ精密濾過カセットを使用して精密濾過および／または精密ダイア濾過工程を実施する、項目１に記載の方法。
（１６）  前記緩衝液濃度が約０．１ｍＭから約１．０Ｍまでの範囲にある、項目１に記載の方法。
（１７）  前記緩衝液濃度が約１．０ｍＭから約６００ｍＭまでの範囲にある、項目１に記載の方法。
（１８）  前記緩衝液のｐＨが約３．０から約１０．０までの範囲にある、項目１に記載の方法。
（１９）  前記緩衝液のｐＨが約６．０から約８．０までの範囲にある、項目１に記載の方法。
（２０）  室温で前記方法を実施する、項目１に記載の方法。
（２１）  約０℃から約１５℃までの温度で前記方法を実施する、項目１に記載の方法。
（２２）  項目１に記載の方法によって得られる疎水性タンパク質ならびに少なくとも１つの薬学的に許容可能な担体および／または希釈剤を含む医薬組成物。
（２３）  前記高度に精製された疎水性タンパク質が、ヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィー工程の後に１％未満の不純物含有量を有する、項目２２に記載の医薬組成物。
（２４）  前記高度に精製された疎水性タンパク質が、ヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィー工程の後に０．５％未満の不純物含有量を有する、項目２２に記載の医薬組成物。
（２５）  細胞から高度に精製された脂質付加タンパク質を得るための方法であって、
（ｉ）該脂質付加タンパク質を含有する細胞を提供する工程と、
（ｉｉ）該細胞をホモジナイズする工程と、
（ｉｉｉ）そのようにして得られたホモジネートを、
（ａ）精密濾過により該ホモジネートを濃縮する工程、
（ｂ）該バイオマスを精密ダイア濾過により洗浄し、それによって精密ダイア濾液−１および精密ダイア未透過物−１を得る工程、
（ｃ）該精密ダイア未透過物−１から、洗浄剤を含有する緩衝液を使用した精密ダイア濾過により該脂質付加タンパク質を抽出し、それによって精密ダイア濾液−２および精密ダイア未透過物−２を得る工程
を含む精密ダイア濾過にかける工程と、
（ｉｖ）該抽出された脂質付加タンパク質を含有する該精密ダイア濾液−２を、イオン交換クロマトグラフィーにかける工程であって、その溶出液が該精製された脂質付加タンパク質を含有する、工程と、
（ｖ）該工程（ｉｖ）におけるイオン交換クロマトグラフィーから得られた溶出液を、残留内毒素除去のために陰イオン交換濾過にかける工程と、
（ｖｉ）該脂質付加タンパク質を含有するそのようにして得られたタンパク質溶液を、ヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィーにかける工程と
を含む方法。
（２６）  抽出工程（ｉｉ）の前に、前記細胞ホモジネートを、Ｔｒｉｓ緩衝液、ＨＥＰＥＳ緩衝液、クエン酸緩衝液、およびリン酸緩衝液からなる群より選択される適切な緩衝液を使用して洗浄する、項目２５に記載の方法。
（２７）  ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｉｉｉ）の前に、前記抽出工程（ｉｉ）から得られた濾液をイオン交換クロマトグラフィーにかける、項目２５に記載の方法。
（２８）  ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｉｉｉ）の前に、前記抽出工程（ｉｉ）から得られた濾液を、膜吸着体を使用した陰イオン交換濾過にかける、項目２５に記載の方法。
（２９）  前記疎水性タンパク質を含有する細胞が、Ｅ．ｃｏｌｉ、酵母、植物細胞、昆虫細胞、トリ細胞または哺乳動物細胞からなる群より選択される宿主細胞である、項目２５に記載の方法。
（３０）  前記工程（ｉｉ）において使用される緩衝液が、陰イオン洗浄剤、陽イオン洗浄剤、双性イオン洗浄剤および非イオン洗浄剤からなる群より選択される洗浄剤を含有し、
該陰イオン洗浄剤が、コール酸およびその誘導体、Ｎ，Ｎ−ジメチルドデシルアミンＮ−オキシド、１−アルキルスルホン酸ナトリウム、Ｎ−ラウロイルサルコシンまたは脂肪酸塩からなる群より選択され、
該陽イオン洗浄剤が、アルキルトリメチルアンモニウムブロミドおよびその誘導体、または塩化ベンザルコニウムからなる群より選択され、
該双性イオン洗浄剤が、ドデシルベタイン、アルキルジメチルアミンオキシドおよびその誘導体または３−（Ｎ，Ｎ−ジメチルアルキル−アンモニオ）−プロパンスルホン酸塩からなる群より選択され、
該非イオン洗浄剤が、オクチルフェノールエトキシレート、ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート、アルキルポリ（エチレンオキシド）およびその誘導体、アルキルポリグルコシドまたは脂肪アルコールからなる群より選択される、
項目２５に記載の方法。
（３１）  前記洗浄剤が約０．５％から約３．０％までの量で存在する、項目３０に記載の方法。
（３２）  前記洗浄剤が約１％から約１．５％までの量で存在する、項目３０に記載の方法。
（３３）  前記工程（ｉｉ）において使用される緩衝液がＴｒｉｓ緩衝液である、項目２５に記載の方法。
（３４）  前記工程（ｉｉ）において使用される緩衝液が、洗浄剤としてオクチルフェノールエトキシレートを含有する、項目２５に記載の方法。
（３５）  前記抽出工程（ｉｉ）の工程の後、０．２μｍポアサイズ精密濾過カセットを使用して精密濾過および／または精密ダイア濾過工程を実施する、項目２５に記載の方法。
（３６）  前記緩衝液濃度が約０．１ｍＭから約１．０Ｍまでの範囲にある、項目２５に記載の方法。
（３７）  前記緩衝液濃度が約１．０ｍＭから約６００ｍＭまでの範囲にある、項目２５に記載の方法。
（３８）  前記緩衝液のｐＨが約３．０から約１０．０までの範囲にある、項目２５に記載の方法。
（３９）  前記緩衝液のｐＨが約６．０から約８．０までの範囲にある、項目２５に記載の方法。
（４０）  室温で前記方法を実施する、項目２５に記載の方法。
（４１）  約０℃から約１５℃までの温度で前記方法を実施する、項目２５に記載の方法。
（４２）  項目２５に記載の方法によって得られる脂質付加タンパク質ならびに少なくとも１つの薬学的に許容可能な担体および／または希釈剤を含む医薬組成物。
（４３）  前記高度に精製された疎水性タンパク質が、ヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィー工程の後に１．０％未満の不純物含有量を有する、項目４２に記載の医薬組成物。
（４４）  前記高度に精製された疎水性タンパク質が、ヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィー工程の後に０．５％未満の不純物含有量を有する、項目４２に記載の医薬組成物。
（４５）  細胞から高度に精製された組換え合成Ｌｙｍｅ抗原（ｒＳＬＡ）を得るための方法であって、
（ｉ）該ｒＳＬＡを含有する細胞を提供する工程と、
（ｉｉ）該細胞をホモジナイズする工程と、
（ｉｉｉ）そのようにして得られたホモジネートを、
（ａ）精密濾過により該ホモジネートを濃縮する工程、
（ｂ）該バイオマスを精密ダイア濾過により洗浄し、それによって精密ダイア濾液−１および精密ダイア未透過物−１を得る工程、
（ｃ）該精密ダイア未透過物−１から、少なくともオクチルフェノールエトキシレートを含有する緩衝液を使用した精密ダイア濾過によりｒＳＬＡを抽出し、それによって精密ダイア濾液−２および精密ダイア未透過物−２を得る工程
を含む精密ダイア濾過にかける工程と、
（ｉｖ）抽出されたｒＳＬＡを含有する該精密ダイア濾液−２を、陰イオン交換クロマト
グラフィーにかける工程であって、その溶出液が精製されたｒＳＬＡを含有する、工程と、
（ｖ）該工程（ｉｖ）における陰イオン交換クロマトグラフィーから得られた溶出液を、残留内毒素除去のために陰イオン交換濾過にかける工程と、
（ｖｉ）ｒＳＬＡを含有するそのようにして得られたタンパク質溶液を、ヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィーにかける工程と
を含む方法。
（４６）  抽出工程（ｉｉ）の前に、前記細胞ホモジネートを、Ｔｒｉｓ緩衝液、ＨＥＰＥＳ緩衝液、クエン酸緩衝液、およびリン酸緩衝液からなる群より選択される適切な緩衝液を使用して洗浄する、項目４５に記載の方法。
（４７）  ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｉｉｉ）の前に、前記抽出工程（ｉｉ）から得られた濾液をイオン交換クロマトグラフィーにかける、項目４５に記載の方法。
（４８）  ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｉｉｉ）の前に、前記抽出工程（ｉｉ）から得られた濾液を、膜吸着体を使用した陰イオン交換濾過にかける、項目４５に記載の方法。
（４９）  前記疎水性タンパク質を含有する細胞が、Ｅ．ｃｏｌｉ、酵母、植物細胞、昆虫細胞、トリ細胞または哺乳動物細胞からなる群より選択される宿主細胞である、項目４５に記載の方法。
（５０）  前記工程（ｉｉ）において使用される緩衝液が、陰イオン洗浄剤、陽イオン洗浄剤、双性イオン洗浄剤および非イオン洗浄剤からなる群より選択される洗浄剤を含有し、
該陰イオン洗浄剤が、コール酸およびその誘導体、Ｎ，Ｎ−ジメチルドデシルアミンＮ−オキシド、１−アルキルスルホン酸ナトリウム、Ｎ−ラウロイルサルコシンまたは脂肪酸塩からなる群より選択され、
該陽イオン洗浄剤が、アルキルトリメチルアンモニウムブロミドおよびその誘導体、または塩化ベンザルコニウムからなる群より選択され、
該双性イオン洗浄剤が、ドデシルベタイン、アルキルジメチルアミンオキシドおよびその誘導体または３−（Ｎ，Ｎ−ジメチルアルキル−アンモニオ）−プロパンスルホン酸塩からなる群より選択され、
該非イオン洗浄剤が、オクチルフェノールエトキシレート、ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート、アルキルポリ（エチレンオキシド）およびその誘導体、アルキルポリグルコシドまたは脂肪アルコールからなる群より選択される、
項目４５に記載の方法。
（５１）  前記洗浄剤が約０．５％から約３．０％までの量で存在する、項目５０に記載の方法。
（５２）  前記洗浄剤が約１％から約１．５％までの量で存在する、項目５０に記載の方法。
（５３）  前記工程（ｉｉ）において使用される緩衝液がＴｒｉｓ緩衝液である、項目４５に記載の方法。
（５４）  前記工程（ｉｉ）において使用される緩衝液が、洗浄剤としてオクチルフェノールエトキシレートを含有する、項目４５に記載の方法。
（５５）  前記抽出工程（ｉｉ）の工程の後、０．２μｍポアサイズ精密濾過カセットを使用して精密濾過および／または精密ダイア濾過工程を実施する、項目４５に記載の方法。
（５６）  前記緩衝液濃度が約０．１ｍＭから約１．０Ｍまでの範囲にある、項目４５に記載の方法。
（５７）  前記緩衝液濃度が約１．０ｍＭから約６００ｍＭまでの範囲にある、項目４５に記載の方法。
（５８）  前記緩衝液のｐＨが約３．０から約１０．０までの範囲にある、項目４５に記載の方法。
（５９）  前記緩衝液のｐＨが約６．０から約８．０までの範囲にある、項目４５に記載の方法。
（６０）  室温で前記方法を実施する、項目４５に記載の方法。
（６１）  約０℃から約１５℃までの温度で前記方法を実施する、項目４５に記載の方法。
（６２）  項目４５に記載の方法によって得られるｒＳＬＡならびに少なくとも１つの薬学的に許容可能な担体および／または希釈剤を含む医薬組成物。
（６３）  前記高度に精製された疎水性タンパク質が、ヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィー工程の後に１．０％未満の不純物含有量を有する、項目６２に記載の医薬組成物。
（６４）  前記高度に精製された疎水性タンパク質が、ヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィー工程の後に０．５％未満の不純物含有量を有する、項目６２に記載の医薬組成物。
【図面の簡単な説明】
【００１４】
【図１】異なったＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００濃度を試験した、細菌細胞抽出物を示すクマシーゲルの写真を示す図である。血清型５／３の精製キメラｒＳＬＡを基準として使用した（レーン２）。増加するＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００濃度（０．５パーセントの増分で０．５％〜３．０％）を抽出法に使用した（レーン９〜１３）。ＳＤＳ  ＰＡＧＥは、増加するＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００濃度に応じて抽出効率の依存度を示した（レーン９〜１３）。ＤＥ５３陰イオン交換クロマトグラフィー後、上清中のＥ．ｃｏｌｉタンパク質（「ＳＮ  ＤＥ５３」）のバルクは樹脂上に結合しており、ｒＳＬＡは結合しなかった（レーン１５〜１９）。容認できる純度と組み合わせた最高収率は１．５％ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００で観察された（レーン１７）。
【図２】遠心分離および精密濾過を使用した精製プロトコルの比較を示す図である。
【図３】遠心分離または精密濾過のいずれかにより精製され、ｒＳＬＡにより誘導される高抗体価の発生の比較図である。１０マウスのグループを、マウスあたり０．１μｇ、０．０３μｇおよび０．０１μｇのｒＳＬＡで皮下免疫した（０日目）。ｒＳＬＡ特異的抗体の作製には、各場合で単一用量で十分であった。３週間（２１日目）後著しい応答が検出された。精密濾過または遠心分離のいずれかにより精製された３つのキメラｒＳＬＡタンパク質すべてが並行して比較された。「新」は精密濾過の使用を示し、「旧」は遠心分離されたｒＳＬＡを示した。免疫原性特性は両調製物で等価であった。したがって、精密濾過はｒＳＬＡの免疫原性に悪影響を与えなかった。
【図４】ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００を使用した精密ダイア濾過（ｄｉａｆｉｌｔｒａｔｉｏｎ）によるｒＳＬＡの抽出の実施可能性を立証するクマシーゲルおよびウェスタンブロットを示す図である。ｒＳＬＡ血清型６／４を産生している細菌細胞を懸濁し、ホモジナイズした（レーン２、３、１０および１１）。先ず、バイオマスの濃縮は精密濾過により実施し、続いて濃縮物をＴｒｉｓ緩衝液の３容積変化で洗浄した。小可溶性タンパク質は洗い落され、精密濾液中に見出された（レーン４）。ｒＳＬＡの損失は最小であり、ウェスタンブロット法により確認された（レーン１２）。ダイア濾過緩衝液−１が洗浄剤を全く含有していなかったので、濃縮した未透過物（ｒｅｔｅｎｔａｔｅ）は標的タンパク質の大部分を含有していた。精密ダイア濾液（microdiafiltrate）−１により、洗浄によるタンパク質の除去が確認された（レーン５）。可溶性ｒＳＬＡのごく一部が濾液中に失われた（レーン１３）。ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００含有緩衝液（ダイア濾過緩衝液−２）に変更することにより、かなりの量のｒＳＬＡが精密ダイア濾液−２中で検出可能であった（レーン６および１４、矢印を参照）。
【図５】ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００を使用した精密ダイア濾過による血清型１／２のｒＳＬＡの抽出が再現可能であることを立証するクマシーゲルおよびウェスタンブロットを示す図である。この実験は、血清型６／４のｒＳＬＡの抽出に類似した形で実施された。クマシー染色ゲルおよびウェスタンブロット法により、精密ダイア濾過緩衝液−２中の標的タンパク質の蓄積により示された、血清型１／２のｒＳＬＡは精密濾過を使用したＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００により有効に抽出することができるという最初の実験で得られた結果が立証された（レーン７、矢印を参照）。これは、精密ダイア濾過緩衝液−１では違っていた（レーン５、矢印を参照）。
【図６】最初の精密ダイア未透過物(microdiaretentate)からｒＳＬＡを定量的に抽出するための、精密ダイア濾過緩衝液−２（＋ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００）を使用した容積変化の数を決定するためのゲルの写真を示す図である。懸濁液およびホモジナイゼートはレーン２および３により表されている。精密濾過により、ｒＳＬＡが著しく損失されることなく不純物は除去された（レーン４）。精密ダイア濾液−１に同じことが当てはまった（レーン５）。標的タンパク質は精密ダイア未透過物−１中に存在していた（レーン６）。ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００含有緩衝液での精密ダイア濾過によりｒＳＬＡは可溶化され、これは精密ダイア濾液−２中に見出された（レーン７、矢印）。精密ダイア濾過緩衝液−２でのそれぞれの容積変化後、ＳＤＳ−ゲル解析のために試料を採取した。標的タンパク質の量は、それぞれの容積変化後にわずかに減少した。精密ダイア濾過緩衝液−２での約６容積変化後、ｒＳＬＡはほぼ定量的に抽出され、精密ダイア濾過による抽出はこの時点で停止させた（レーン１２、矢印）。最終的に１０画分すべてを貯蔵した（レーン１７）。比較のために、精密ダイア未透過物−２は、定量的抽出を実証するために、濃縮した形および１対１０希釈した形でゲル上に負荷した（矢印を参照）。
【図７】０．２μｍ膜を使用した実験のクマシーゲルおよびウェスタンブロットの写真を示す図である（ゲル１）：精密濾過中のＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００抽出によるｒＳＬＡ濃縮の有効性。精密未透過物（ＭＲ）は、２の倍数で濃縮されて作業容積を減少させた（レーン４）。精密濾液（ＭＦ）中に失われたｒＳＬＡの量は検出可能であったが中程度であった（レーン５）。精密ダイア濾過により、標的タンパク質の同一損失が示されたが、精製するに値するだけの十分なｒＳＬＡがまだ存在していた（レーン６および７）。矢印で示されるように、ｒＳＬＡの濃縮およびＥ．ｃｏｌｉタンパク質からの分離は精密ダイア濾液−２（ＭＤＦ−２）においては０．２μｍポアサイズ膜で効率的であった。最小量のｒＳＬＡのみが精密ダイア未透過物−２において、各自のサイズで見出された（レーン８）。
【図８】１０００ｋＤ膜を使用した実験のゲルの写真を示す図である（ゲル２）：１０００ｋＤ膜でのＥ．ｃｏｌｉタンパク質の保持率は著しく高くなっていた（レーン１１および１３）。その結果、精密ダイア濾液中のｒＳＬＡの損失は最小であった（レーン１２および１４）。ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００でのｒＳＬＡの抽出は可能であった（レーン１６）が、不完全であり、精密ダイア未透過物−２（ＭＤＲ−２）中のまだ多量のｒＳＬＡにより示された（レーン１５）。さらに、ＭＤＦ−２中のＥ．ｃｏｌｉ由来バルクタンパク質の枯渇は、それが０．２μｍポアサイズ膜で実施された時には、はるかに効率が低かった（図７参照）。
【図９】キメラｒＳＬＡ血清型５／３に対するＨＡ  ＵＬＴＲＯＧＥＬ（商標）での精製スキームのクロマトグラムを示す図である。この精製スキームは、原理上は、３つのｒＳＬＡキメラすべてに適用可能である。開始最初の大きなピークは試料適用を特徴付けている。試料負荷の初めで、強力なＵＶシグナルは主に溶液中のＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００に起因していた。試料負荷後、ＵＶ線はゼロに近いレベルにまで減るはずである。溶出工程は、１８％および２５％緩衝液−Ｂ工程の２工程モードで、続いて開始され、緑色線により示された。その後、直線勾配が１００％緩衝液Ｂまで続いた。両工程（１８％および２５％）は、Ｅ．ｃｏｌｉタンパク質の除去を示していた。１８％緩衝液Ｂでのタンパク質ピークは明確に視認でき、２５％緩衝液Ｂでのピークはごく小さなこぶであった（矢印）。残留するＥ．ｃｏｌｉタンパク質の枯渇により、非常に高純度のｒＳＬＡが可能になった。
【図１０】ｒＳＬＡ精製に適用された処理工程のフローチャートを示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００１５】
本発明の一態様は、本発明に従って細胞から高度に精製された疎水性タンパク質を得るための方法であって、
（ｉ）細胞ホモジネートを精密濾過にかける工程と、
（ｉｉ）少なくとも１つの洗浄剤を含有する緩衝溶液を使用した精密ダイア濾過により前記精密濾過から得られた未透過物を抽出する工程と、
（ｉｉｉ）前記精密ダイア濾過から得た濾液を、ヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィーにかける工程と
を含む方法に関する。
【００１６】
工程（ｉ）における本発明の方法に従って、細胞ホモジネートを精密濾過にかけ、可溶性の不純物を除去する（洗浄工程）。本発明に従った上記の方法の工程（ｉｉｉ）は、ＨＡカラムクロマトグラフィーに加えて、洗浄剤および追加の不純物を除去するための１つまたは複数工程のカラムクロマトグラフィーを含んでいてよい。
【００１７】
本明細書では、語句「高度に精製された」は、たとえば、ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー後の前記疎水性タンパク質の９９％より高い純度を意味し、ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー後、不純物の含有量は、たとえば、１％未満、好ましくは０．５％未満である。
【００１８】
本明細書で使用する用語「不純物」は、疎水性タンパク質の産生に由来する任意の不純物を含み、たとえば、宿主細胞タンパク質、宿主細胞核酸、緩衝液および塩類などのプロセス関連不純物、細胞培地に由来する不純物ならびに多量体またはフラグメントなどの産物関連不純物を含んでいてよい。不純物は、目的の最終組成物成分、たとえば、最終緩衝液製剤成分、または最終治療組成物のために精製されたタンパク質に添加されることもあるアジュバンド、賦形剤、もしくは保存剤などの添加物は除外される。
【００１９】
本発明によれば、用語「疎水性タンパク質」は特定の制限下にはなく、上記の方法を使用することにより細胞から精製することができる任意の疎水性タンパク質を含む。さらに、前記用語は特定の値または範囲の疎水性には関係しないが、標的タンパク質を細胞構造体との会合または自己会合により水溶液中で不溶性にして、上記方法による前記タンパク質の精製を可能にする任意の疎水性を意味する。前記用語「疎水性タンパク質」は、タンパク質それ自体、たとえば、膜タンパク質、ならびにその任意の生物学的活性誘導体をさらに含む。本発明によれば、用語「生物学的活性誘導体」は、結合特性などの前記疎水性タンパク質の実質的に同じ機能的および／もしくは生物学的特性、ならびに／またはペプチド骨格などの同じ構造的基礎を有するタンパク質、タンパク質複合体またはポリペプチドの任意の誘導体を含む。前記ポリペプチドの生物活性を改変していない標的タンパク質のポリペプチド配列のアミノ酸の軽微な欠失、付加および／または置換も、生物学的活性誘導体として本願に含まれる。
【００２０】
本発明によれば、本発明の方法を使用して精製された疎水性タンパク質は、原核生物または真核生物の一種の膜結合タンパク質として天然に存在するタンパク質などの脂質付加タンパク質でよい。たとえば、脂質付加タンパク質は細菌種中に膜結合タンパク質として天然に存在してもよい。本発明の別の例によれば、精製される疎水性タンパク質はＢｏｒｒｅｌｉａ由来のリポタンパク質である。
【００２１】
本明細書で使用する用語「脂質付加タンパク質」は、脂質と共有結合または非共有結合している任意のペプチドまたはタンパク質を意味する。脂質付加タンパク質の一例は、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐの外表面タンパク質（Ｏｓｐタンパク質）のグループである。
【００２２】
本発明に従った方法は、脂質付加されたＯｓｐ様タンパク質を精製することに特に有用であることが明らかにされた。本発明の方法により精製されるＯｓｐ様タンパク質には、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐのＯｓｐＡタンパク質に構造的に類似する脂質付加タンパク質が挙げられる。構造的類似性は、たとえば、Ａｌｔｓｃｈｕｌ、Ｓｔｅｐｈｅｎ  Ｆ．、Ｔｈｏｍａｓ  Ｌ．Ｍａｄｄｅｎ、Ａｌｅｊａｎｄｒｏ  Ａ．Ｓｃｈａｆ−ｆｅｒ、Ｊｉｎｇｈｕｉ  Ｚｈａｎｇ、Ｚｈｅｎｇ  Ｚｈａｎｇ、Ｗｅｂｂ  Ｍｉｌｌｅｒ、ａｎｄ  Ｄａｖｉｄ  Ｊ．Ｌｉｐｍａｎ、「Ｇａｐｐｅｄ  ＢＬＡＳＴ  ａｎｄ  ＰＳＩ−ＢＬＡＳＴ：  ａ  ｎｅｗ  ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｄａｔａｂａｓｅ  ｓｅａｒｃｈ  ｐｒｏｇｒａｍｓ」、Ｎｕｃ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．、１９９７年、２５巻、３３８９〜３４０２頁；  およびＳｃｈａｆｆｅｒ、Ａｌｅｊａｎｄｒｏ  Ａ．、Ｌ．Ａｒａｖｉｎｄ、Ｔｈｏｍａｓ  Ｌ．Ｍａｄｄｅｎ、Ｓｅｒｇｅｉ  Ｓｈａｖｉｒｉｎ、Ｊｏｈｎ  Ｌ．Ｓｐｏｕｇｅ、Ｙｕｒｉ  Ｉ．Ｗｏｌｆ、Ｅｕｇｅｎｅ  Ｖ．Ｋｏｏｎｉｎ、ａｎｄ  Ｓｔｅｐｈｅｎ  Ｆ．Ａｌｔｓｃｈｕｌ、「Ｉｍｐｒｏｖｉｎｇ  ｔｈｅ  ａｃｃｕｒａｃｙ  ｏｆ  ＰＳＩ−ＢＬＡＳＴ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｄａｔａｂａｓｅ  ｓｅａｒｃｈｅｓ  ｗｉｔｈ  ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎ−ｂａｓｅｄ  ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ  ａｎｄ  ｏｔｈｅｒ  ｒｅｆｉｎｅｍｅｎｔｓ」、２００１年、Ｎｕｃ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．、２９巻、２９９４〜３００５頁に記載の方法に従って、精製されたタンパク質のタンパク質配列とＯｓｐＡタンパク質とのタンパク質−タンパク質ＢＬＡＳＴ比較により決定してもよい。ＢＬＡＳＴ解析を実施するためのソフトウェアはｔｈｅ  Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ  ｗｅｂｓｉｔｅ  （ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ）を通じて公的に入手可能である。このアルゴリズムは、先ず、データベース配列中の同一長の文字列と整列させるとある種のポジティブ値閾値スコアＴに適合するまたは満たすクエリー配列中の長さＷの短い文字列を同定することにより高スコア化配列対（ＨＳＰ）を同定することを含む。Ｔは隣接文字列スコア閾値と呼ばれる（Ａｌｔｓｃｈｕｌら、上記を参照）。これらの最初の隣接文字列ヒットは、それを含有するさらに長いＨＳＰを見つけるための検索を開始するための種として働く。文字列ヒットは、累積アラインメントスコアを増加させることができる限り、各配列に沿って両方向に延長される。累積スコアは、ヌクレオチド配列ではパラメータＭ（適合残基の対に対するリワードスコア；常に＞０）およびＮ（ミスマッチ残基に対するペナルティースコア；常に＜０）を使用して計算される。アミノ酸配列では、スコア化行列を使用して累積スコアを計算する。累積アラインメントスコアが、その最大達成値から量Ｘ低下する；１つもしくは複数のネガティブスコア化残基アラインメントの蓄積により、累積スコアが０以下になる；またはどちらかの配列の末端に到達すると、各方向への文字列ヒットの延長は停止される。ＢＬＡＳＴアルゴリズムパラメータＷ、Ｔ、およびＸはアラインメントの感度および速度を決定する。ＢＬＡＳＴＮプログラム（ヌクレオチド配列では）はデフォルトとして、文字列長（Ｗ）１１、期待値（Ｅ）１０、Ｍ＝５、Ｎ＝−４および両鎖の比較を使用する。アミノ酸配列では、ＢＬＡＳＴＰプログラムはデフォルトとして、文字列長（Ｗ）３、期待値（Ｅ）１０、およびＢＬＯＳＵＭ６２スコア化行列（Ｈｅｎｉｋｏｆｆ  ａｎｄ  Ｈｅｎｉｋｏｆｆ、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９巻、１０９１５頁、１９８９年を参照されたい）アラインメント（Ｂ）５０、期待値（Ｅ）１０、Ｍ＝５、Ｎ＝−４および両鎖の比較を使用する。
【００２３】
ＢＬＡＳＴアルゴリズムは２つの配列間の類似性の統計分析も実施する（たとえば、Ｋａｒｌｉｎ  ａｎｄ  Ａｌｔｓｃｈｕｌ、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９０巻、５８７３〜８７頁、１９９３年を参照されたい）。ＢＬＡＳＴアルゴリズムにより提供される類似性の一尺度は、最小計確率（Ｐ（Ｎ））であり、これは２つのヌクレオチドまたはアミノ酸配列間の適合が偶然起きると考えられる確率という指標を提供する。たとえば、試験核酸と基準核酸の比較における最少計確率が、約０．２未満、典型的には約０．０１未満、さらに典型的には約０．００１未満の場合には、核酸は基準配列と類似していると見なされる。
【００２４】
一部の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、配列の少なくとも１３０個の連続したアミノ酸にわたってＢｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と少なくとも５０％の同一性を有する。他の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、配列の少なくとも１３０個の連続したアミノ酸にわたってＢｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と少なくとも６０％の同一性を有する。他の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、配列の少なくとも１３０個の連続したアミノ酸にわたってＢｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と少なくとも７０％の同一性を有する。他の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、配列の少なくとも１３０個の連続したアミノ酸にわたってＢｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と少なくとも７５％の同一性を有する。他の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、配列の少なくとも１３０個の連続したアミノ酸にわたってＢｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と少なくとも８０％の同一性を有する。他の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、配列の少なくとも１３０個の連続したアミノ酸にわたってＢｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と少なくとも８５％の同一性を有する。他の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、配列の少なくとも１３０個の連続したアミノ酸にわたってＢｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と約８７％の同一性を有する。
【００２５】
本発明の一実施形態によれば、本発明の方法により精製されたタンパク質は、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と比べた場合、最小３６０のＢＬＡＳＴスコアを有する。他の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と比べた場合、最小４００のＢＬＡＳＴスコアを有する。他の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と比べた場合、最小４４０のＢＬＡＳＴスコアを有する。他の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と比べた場合、最小４８０のＢＬＡＳＴスコアを有する。他の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と比べた場合、最小５２０のＢＬＡＳＴスコアを有する。他の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と比べた場合、最小５６０のＢＬＡＳＴスコアを有する。他の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と比べた場合、最小５８０のＢＬＡＳＴスコアを有する。他の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と比べた場合、最小６００のＢＬＡＳＴスコアを有する。他の実施形態では、本発明の方法により精製されたタンパク質は、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．のＯｓｐＡタンパク質と比べた場合、最小６２０のＢＬＡＳＴスコアを有する。
【００２６】
実施例では、本発明の方法を使用して、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．の２つの別々の遺伝子型由来のＯｓｐＡタンパク質のドメイン、ならびに安定化点突然変異を含む組換え合成Ｌｙｍｅ抗原（「ｒＳＬＡ」）を精製する。本発明で使用するのに適したＯｓｐＡタンパク質は当技術分野では公知である。本発明で使用するのに適した非限定的な例示的ＯｓｐＡタンパク質配列は、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｂｕｒｇｄｏｒｆｅｒｉｓｓ（ジェンバンク受託番号Ｑ４５０５０）、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ａｆｚｅｌｉｉ（ジェンバンク受託番号Ｑ０ＳＬＺ０）、ならびにＢｏｒｒｅｌｉａ  ｇａｒｉｎｉｉ（ジェンバンク受託番号Ｑ１ＨＬＩ９、Ｑ４４９５９、Ｑ４４９６１、およびＱ９３２Ｒ４）から得ることができる。ジェンバンクのＯｓｐＡ配列と比べた場合、ｒＳＬＡは配列の少なくとも１３０個の連続したアミノ酸にわたって、約５６％から約８７％までの範囲のＯｓｐＡ配列との同一性を有し、Ｂｏｒｒｅｌｉａ  ｓｐ．の種々のＯｓｐＡタンパク質と比べた場合、約３６０から約６２０までの範囲のＢＬＡＳＴスコアを有する。
【００２７】
本発明に従った疎水性タンパク質は、当技術分野で公知の任意の方法により作製することができる。これには当技術分野で公知の任意の方法、（ｉ）遺伝子工学により、たとえば、ＲＮＡの逆転写および／またはＤＮＡの増幅を介しての組換えＤＮＡの作製、（ｉｉ）トランスフェクションにより、たとえば、化学的に媒介されたトランスフェクション、エレクトロポレーションまたはマイクロインジェクションを介した組換えＤＮＡの原核または真核細胞への導入、（ｉｉｉ）たとえば、連続的にまたはバッチ式での前記形質転換された細胞の培養、（ｉｖ）たとえば、構成的または誘導での疎水性タンパク質の発現、ならびに（ｖ）疎水性タンパク質を得るための、たとえば、培地からのまたは形質転換された細胞の回収によるタンパク質の単離が含まれていてよい。さらに、前記疎水性タンパク質をコードする組換えＤＮＡ、たとえば、プラスミドは、組換えＤＮＡで首尾よくトランスフェクトされた細胞を選択するための選択可能マーカーをコードするＤＮＡ配列も含有していてよい。本発明の一例によれば、疎水性タンパク質は、当技術分野で公知の任意の方法に従って、回収された培養細胞から得られる。
【００２８】
語句「細胞ホモジナイゼート」は、本発明によれば、当業者に公知の任意の均質化および／または細胞破壊工程により得られるあらゆる種類の細胞ホモジナイゼートを意味する。本発明に従って細胞ホモジナイゼートを調製するためのこれらの工程には、たとえば、粉砕、高速混合、ミンチ、細断、超音波処理、圧力変化、浸透圧ショック、凍結解凍、ならびに、酵素もしくは洗浄剤などの細胞破壊剤の添加、またはそのような工程の任意の組合せが挙げられる。
【００２９】
本発明において使用する用語「緩衝溶液」は、当業者に公知のタンパク質の精製に使用可能な任意の緩衝液、ならびに、２つ以上のそのような緩衝液の任意の混合物を含む。そのような緩衝溶液の例は、水、Ｔｒｉｓ緩衝液、リン酸緩衝液、またはクエン酸緩衝液である。しかし、本発明の方法において使用可能な緩衝液は特定の形で限定されてはおらず、タンパク質安定剤などの、タンパク質の精製に有用な任意の物質または物質の混合物をさらに含有することができる。さらに、本発明に従った方法の工程それぞれにおいて使用される各自の緩衝液の濃度は特に限定されてはおらず、すなわち、前記緩衝液濃度は、各自の工程それぞれにおいて、その必要条件に応じて、同一でもよくまたは異なっていてもよい。たとえば、緩衝液濃度は、約０．１ｍＭから約１．０Ｍまでの範囲にあってもよく、または約１ｍＭから約６００ｍＭまでの範囲にあってもよい。さらに、本発明に従った方法において使用される緩衝液のｐＨ値は、それが上記方法の実現可能性を許容する範囲にある限り、特定の制限下にはない。本発明の一例によれば、各自の緩衝液のｐＨ値は、約３から約１０まで、または約６から約８までの範囲である。
【００３０】
本発明の具体例によれば、上記方法の精密濾過工程（ｉ）で使用される緩衝液は、Ｔｒｉｓ緩衝液である。本発明の追加の例では、上記の方法の抽出工程（ｉｉ）において使用される緩衝液は、洗浄剤を含有するＴｒｉｓ緩衝液である。本発明に従った方法の別の例によれば、ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｉｉｉ）において使用される緩衝液は、リン酸ナトリウム緩衝液である。
【００３１】
本発明に従って使用される用語「洗浄剤」は、任意の両親媒性物質または両親媒性物質の混合物を含み、たとえば、水溶液中での疎水性物質の溶解または分散性を増加することができる。洗浄剤という用語は通常、疎水性基と親水性基の両方を含有する有機化合物に関する。本発明の方法において使用可能な洗浄剤は、たとえば、イオン性、双性イオン性、または非イオン性でもよい。本発明の方法において使用可能な洗浄剤は、それが前記疎水性タンパク質の精製にマイナスの影響を及ぼさない限り、特定の制限下にはなく、さらに２つまたはいくつかの異なる洗浄剤を含む混合物からなるものでもよい。
【００３２】
本発明の一例によれば、上記の方法において、細胞ホモジネートは、抽出工程（ｉｉ）の前に、適切な緩衝液を使用して洗浄する。
【００３３】
本明細書で使用する用語「適切な緩衝液」は、特定の制限下にはなく、目的の疎水性タンパク質を好ましくない程度にまで溶解することなくホモジナイゼートを洗浄することを可能にする任意の緩衝液を含む。ホモジネートを洗浄するのに適した緩衝液の例には、Ｔｒｉｓ緩衝液、ＨＥＰＥＳ緩衝液、クエン酸緩衝液またはリン酸緩衝液が挙げられる。
【００３４】
本発明の別の例によれば、上記方法において、前記抽出工程（ｉｉ）から得られた濾液を、ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｉｉｉ）の前に、イオン交換クロマトグラフィーにかける。
【００３５】
本発明の方法において使用されるイオン交換クロマトグラフィー材料（樹脂）は、高度に精製された疎水性タンパク質が得られるように上記不純物が除去される限り、特定の制限下にはない。本発明によれば、イオン交換樹脂には、イオン交換クロマトグラフィーに適した任意の材料が挙げられる。本発明の具体例では、イオン交換樹脂は正に荷電した基を含有し、したがって、陰イオン交換材料である。好ましい選択肢は、ＤＥ−５３、すなわちセルロース材料を主成分とする陰イオン交換樹脂である。
【００３６】
イオン交換クロマトグラフィー工程において使用可能な緩衝液は特定の形で限定されておらず、イオン交換クロマトグラフィーにおいて使用可能な当技術分野で公知の任意の緩衝液が挙げられる。適切な緩衝液は、Ｔｒｉｓ緩衝液、ＨＥＰＥＳ緩衝液、クエン酸緩衝液もしくはリン酸緩衝液、またはその混合物からなる。
【００３７】
本発明によれば、上記方法の抽出工程（ｉｉ）は、濃縮工程、洗浄工程等などの追加の工程を含んでいてよく、それはいかなる順番および／またはいかなる組合せでもよい。本発明の具体例によれば、上記方法の抽出工程（ｉｉ）は、（ａ）バイオマスを洗浄し、精密ダイア濾過により再利用する工程、および（ｂ）少なくとも１つの洗浄剤を含有する緩衝液を使用した精密濾過により、上記工程（ａ）において得られた未透過物から疎水性タンパク質を抽出する工程を含む。別の具体例によれば、抽出工程は、上記工程（ａ）および（ｂ）に加えて、上記工程（ｂ）から得られた濾液を、０．２μｍポアサイズ精密濾過カセットを使用した精密濾過および／または精密ダイア濾過にかける工程（ｃ）を含む。
【００３８】
本発明に従ったヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｉｉｉ）は特定の形で制限されておらず、当業者には公知のすべてのヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー材料およびプロトコルを含む。
【００３９】
上記の方法の具体例では、ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィーにおいて使用されるヒドロキシアパタイトカラム材料は、ＨＡ  ＵＬＴＲＯＧＥＬ（商標）など市販されている。
【００４０】
上記方法のヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｖｉ）において使用可能な緩衝液は、特に限定されてはおらず、ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィーにおいて使用することができる当技術分野では公知の任意の緩衝液を含む。本発明の具体例では、前記ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィーにおいて使用される緩衝液は、リン酸ナトリウム緩衝液であり、約１ｍＭから約６００ｍＭまでの範囲にある濃度および約６から約８までの範囲にあるｐＨ値を有する。
【００４１】
本発明の追加の例によれば、上記の方法において、前記抽出工程（ｉｉ）から得られる濾液を、ヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィー工程（ｉｉｉ）の前に、膜吸着体（ｍｅｍｂｒａｎｅ  ａｄｓｏｒｂｅｒ）を使用したイオン交換濾過にかける。適切な吸収体は、Ｐａｌｌ社またはＳａｒｔｏｒｉｕｓ社から入手可能である。本発明の具体例では、使用される陰イオン交換膜吸着体は、Ｍｕｓｔａｎｇ  Ｑ（Ｐａｌｌ社）である。
【００４２】
上記の方法の一例によれば、精製される疎水性タンパク質は組換え合成Ｌｙｍｅ抗原（ｒＳＬＡ）である。
【００４３】
本発明に従った方法の追加の例では、工程（ｉ）において提供される前記疎水性タンパク質を含有する宿主細胞は、Ｅ．ｃｏｌｉからなる群より選択される宿主細胞であるが、酵母細胞、植物細胞、昆虫細胞、トリ細胞または哺乳動物細胞のような、組換え疎水性タンパク質を発現することができるいかなる宿主細胞も記載された工程にかけることができる。
【００４４】
本発明の具体例によれば、上記の方法において使用される洗浄剤は、コール酸およびその誘導体、Ｎ，Ｎ−ジメチルドデシルアミンＮ−オキシド、１−アルキルスルホン酸ナトリウム、Ｎラウロイルサルコシンもしくは脂肪酸塩などの陰イオン性でも、アルキルトリメチルアンモニウムブロミドおよびその誘導体もしくは塩化ベンザルコニウムなどの陽イオン性でも、ドデシルベタイン、アルキルジメチルアミンオキシドおよびその誘導体もしくは３−（Ｎ，Ｎ−ジメチルアルキルアンモニオ）プロパンスルホン酸などの双性イオン性でも、またはオクチルフェノールエトキシレート、ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート、アルキルポリ（エチレンオキシド）およびその誘導体、アルキルポリグルコシドもしくは脂肪アルコールなどの非イオン性でもよい。
【００４５】
本発明の別の具体例によれば、上記の方法において使用される洗浄剤は、オクチルフェノールエトキシレート（たとえば、ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００もしくはＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１１４）、ポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート（たとえば、ＴＷＥＥＮ（商標）８０）またはＮ−アルキル−Ｎ，Ｎ−ジメチル−３−アミノ−１−プロパンスルホン酸（たとえば、ＺＷＩＴＴＥＲＧＥＮＴ（商標）３−１４）など市販されている。
【００４６】
上記の方法の別の例では、工程（ｉｉ）において使用される緩衝液は、洗浄剤としてオクチルフェノールエトキシレート（Ｔｒｉｔｏｎ（商標）Ｘ１００）を含有している。
【００４７】
本発明の追加の例によれば、上記の方法において、精密濾過および／または精密ダイア濾過工程は、たとえば、０．２μｍポアサイズ精密濾過カセットを使用して、抽出工程（ｉｉ）後に実施する。
【００４８】
本発明に従った方法において使用される作動温度は特定の制限下にはなく、たとえば、約室温または約０から約１５℃までの範囲でなど、室温未満でもよい。
【００４９】
上記の方法の一例によれば、高度に精製された脂質付加タンパク質は、
（ｉ）前記脂質付加タンパク質を含有する細胞を提供する工程と、
（ｉｉ）前記細胞をホモジナイズする工程と、
（ｉｉｉ）そのようにして得られたホモジネートを、
（ａ）精密濾過により前記ホモジネートを濃縮する工程、
（ｂ）バイオマスを精密ダイア濾過により洗浄し、それによって精密ダイア濾液−１および精密ダイア未透過物−１を得る工程、
（ｃ）前記精密ダイア未透過物−１から洗浄剤を含有する緩衝液を使用した精密ダイア濾過により脂質付加タンパク質を抽出し、それによって精密ダイア濾液−２および精密ダイア未透過物−２を得る工程
を含む精密（ダイア）濾過にかける工程と、
（ｉｖ）抽出された脂質付加タンパク質を含有する前記精密ダイア濾液−２をイオン交換クロマトグラフィーにかける工程であって、その溶出液が精製された脂質付加タンパク質を含有する、工程と、
（ｖ）工程（ｉｖ）におけるイオン交換クロマトグラフィーから得られた溶出液を、残留内毒素除去のために陰イオン交換濾過にかける工程と、
（ｖｉ）脂質付加タンパク質を含有するそのようにして得られたタンパク質溶液をヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィーにかける工程と
を含めて、細胞から得ることができる。
【００５０】
上記の方法の具体例によれば、高度に精製された組換え合成Ｌｙｍｅ抗原（ｒＳＬＡ）は、
（ｉ）前記ｒＳＬＡを含有する細胞を提供する工程と、
（ｉｉ）前記細胞をホモジナイズする工程と、
（ｉｉｉ）そのようにして得られたホモジネートを、
（ａ）精密濾過により前記ホモジネートを濃縮する工程、
（ｂ）バイオマスを精密ダイア濾過により洗浄し、それによって精密ダイア濾液−１および精密ダイア未透過物−１を得る工程、
（ｃ）前記精密ダイア未透過物−１から洗浄剤を含有する緩衝液を使用した精密ダイア濾過によりｒＳＬＡを抽出し、それによって精密ダイア濾液−２および精密ダイア未透過物−２を得る工程
を含む精密（ダイア）濾過にかける工程と、
（ｉｖ）抽出されたｒＳＬＡを含有する前記精密ダイア濾液−２をイオン交換クロマトグラフィーにかける工程であって、その溶出液が精製されたｒＳＬＡを含有する、工程と、
（ｖ）工程（ｉｖ）におけるイオン交換クロマトグラフィーから得られた溶出液を、残留内毒素除去のために陰イオン交換濾過にかける工程と、
（ｖｉ）ｒＳＬＡを含有するそのようにして得られたタンパク質溶液をヒドロキシアパタイト（ＨＡ）カラムクロマトグラフィーにかける工程と
を含めて、細胞から得ることができる。
【００５１】
本発明に従った方法の上記の例は、抽出工程（ｉｉｉ）（ｃ）後に、たとえば、０．２μｍポアサイズ精密濾過カセットを使用した、精密濾過および／または精密ダイア濾過工程をさらに含んでいてよい。
【００５２】
本発明の追加の態様は、上記方法により得られる疎水性タンパク質および少なくとも薬学的に許容可能な担体を含む医薬組成物に関する。
【００５３】
本発明の別の例では、上記の医薬組成物は、上記の方法により精製された治療効果のある量の疎水性タンパク質、ならびに、任意選択で、薬学的に許容可能な担体、薬剤的に許容可能な塩、補助剤、希釈剤および溶剤、またはその任意の組合せからなる群より選択される１つまたは複数の追加の成分を含む。
【００５４】
一例によれば、上記の医薬組成物は、上記の方法により得られる脂質付加タンパク質ならびに少なくとも薬学的に許容可能な担体および／または希釈剤を含む。
【００５５】
上記の医薬組成物の別の具体例では、前記医薬組成物は、上記の方法により得られるｒＳＬＡならびに少なくとも薬学的に許容可能な担体および／または希釈剤を含む。
【００５６】
本発明の方法により、調製物に有利に使用され、医薬品および診断への適用に使用することができる高度に精製された疎水性タンパク質への到達がもたらされる。特に、前記疎水性タンパク質を可溶化するための洗浄剤の適用および本発明において特定されるパラメータの下でヒドロキシアパタイトカラムクロマトグラフィーによる前記洗浄剤の連続的除去により、疎水性タンパク質の驚くほど効率的で多用途の精製が可能になり、前記疎水性タンパク質を作製するために使用される細胞培養および精製工程に由来する不純物は有利に少量になる。
【００５７】
以下の実施例において、本発明を、限定することなくさらに例証する。
【実施例】
【００５８】
（実施例１）
ｒＳＬＡ抽出のためのＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００の濃度
細胞膜からのｒＳＬＡの抽出の有効性を、異なるＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００濃度を使用して試験した。Ｅ．ｃｏｌｉタンパク質および膜脂質の可溶化はＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００濃度が上昇する結果として増加するために、それに続く精製工程の効率に対するマイナス影響が生じる可能性がある。したがって、最適ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００濃度を見つけるために、ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００濃度が異なる画分を、Ｅ．ｃｏｌｉタンパク質のバルクを除去するのに強力な陰イオン交換クロマトグラフィー手順の前および後で比較した。
【００５９】
再懸濁緩衝液中の次の濃度のＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００を試験した（０．５％、１．０％、１．５％、２．０％および３．０％）。ペレットを各自のＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００含有緩衝液に再懸濁し、室温で１時間攪拌した。懸濁液は１６，０００ｒｐｍで（ＪＡ２０ローターをＢｅｃｋｍａｎ遠心分離機で）２０分間遠心分離した。こうして得られる上清は続いて分析し、Ｅ．ｃｏｌｉタンパク質のバルクを除去するために、試料の一定分量を陰イオン交換樹脂でさらに精製した。これは、陰イオン交換クロマトグラフィー後のｒＳＬＡの純度に対するＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００濃度の影響を評価するのに必要であった。異なるＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００濃度を使用した、全タンパク質およびｒＳＬＡ含有量の判定により測定される抽出手順の有効性は表１に収載している。
【００６０】
表１：陰イオン交換樹脂ＤＥ−５３は、ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００抽出後の遠心分離した上清からＥ．ｃｏｌｉタンパク質の大部分を除去した。ｒＳＬＡタンパク質のＤＥ−５３樹脂への結合は最小であったために、ｒＳＬＡは、上清画分に高度に残された。ＤＥ−５３バッチインキュベーション後、１．０〜１．５％のＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００（ボールド）での抽出物ではｒＳＬＡの割合は最大であった。
【００６１】
【表１−１】
0005443175.tif 000002
【００６２】
【表１−２】
0005443175.tif 000003
ＤＥ−５３樹脂での精製後、全タンパク質レベルは減少したが、抽出物の遠心分離後の上清と比べると、ｒＳＬＡ−タンパク質は著しく濃縮された。溶液中の全タンパク質（μｇ／ｍｌで測定）由来のｒＳＬＡの割合は、それぞれ１．５および１．０％のＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００濃度で、約７５％からほぼ８０％までのレベルに到達した。ｒＳＬＡの収率のわずかな向上により、後者の濃度に有利に働いた。どれくらいのＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００濃度が好ましいかを明確に決定するために、クマシー染色ＰＡＧＥを実施した（図１を参照されたい）。
【００６３】
（実施例２）
精密濾過対遠心分離の比較
混濁液の遠心分離は通常、細胞残渣分離のための第一選択である。工業的製造規模工程の樹立に関しては、工業規模の遠心分離機の高コストおよび作動流体の面倒な取扱いにより、代替方法が有利な投資になると思われる。代替分離戦略は精密濾過により提供される。したがって、遠心分離が精密濾過により代用される精製戦略が調査された（図２を参照されたい）。
【００６４】
精密濾過または遠心分離のいずれかにより精製されたｒＳＬＡの収率および純度の比較
表２に収載されている次のデータにより、精密濾過は遠心分離の代わりになりうることが実証された。したがって、精密濾過はｒＳＬＡハイブリッドタンパク質のための精製工程に有効に組み込むことができる。
【００６５】
表２：３種類のキメラすべてに対するｒＳＬＡの純度を示す。精製は遠心分離または精密濾過のいずれかにより実施された。精密濾過されたｒＳＬＡの収率および純度は、遠心分離を使用することにより精製された前臨床ロットにおけるよりもさらに高かった。
【００６６】
【表２】
0005443175.tif 000004
精製工程へ精密濾過を組み込むことにより、３種類のキメラ構築物すべてに対して高純度ｒＳＬＡが生産される。精密濾過されたｒＳＬＡ由来の免疫原性特性が前臨床ロット由来のｒＳＬＡと同じであることを証明するために、３種類すべてのｒＳＬＡキメラ由来のマウスにおける免疫原性研究が実施された。
遠心分離または精密濾過を使用した精製されたｒＳＬＡの免疫原性の比較
遠心分離が精密濾過で代用される工程で精製されたｒＳＬＡの免疫原性が減少されていないことを立証するために、両精製戦略からの産物が免疫原性研究において比較された。精密濾過されたｒＳＬＡ（「新」）由来の材料で高抗体力価を生じる効率は、遠心分離の使用により精製されたｒＳＬＡ（「旧」）と等価であった（図３を参照されたい）。
【００６７】
（実施例３）
精密濾過の工程
精密濾過は、２工程で実施し、すなわち、
１）精密濾過工程の最初に、ホモジネートの濃縮を精密濾過により実施し、続いてバイオマスをＴＲＩＳ緩衝液で洗浄する（＝精密ダイア濾過−１）。
２）続いて、精密ダイア濾過による精密ダイア未透過物から、ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００含有緩衝液によりｒＳＬＡを抽出した。
【００６８】
最初の実験的精密濾過では、脂質付加されたｒＳＬＡ血清型６／４を使用した。原理上、精密濾過は、小可溶性タンパク質を除去し、試料を濃縮するために実施された。初回の精密濾過では、２の濃縮係数が最適であることが確立された。この濃縮係数は、続く精製工程をさらに損なうことはない。比較的初期の実験では濃縮係数４が使用されたが、精密ダイア未透過物−１のあまりに高い粘度により、後にはこの数字は放棄された。精密濾過による濃縮後、ダイア濾過緩衝液−１（ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００なし）の３容積変化での精密ダイア濾過が実施された。ある割合の可溶性タンパク質が洗い流された。
精密ダイア濾過によるｒＳＬＡのＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００抽出
精密ダイア濾過−１の後に、抽出手順が行われる。精密ダイア未透過物−１の濃縮後、ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００が最終濃度１．５％まで添加された。バイオマスはマグネチックスターラ上で攪拌された。３０分のインキュベーション時間は抽出に十分であった。次に、精密ダイア濾過−２（ＭＤＦ−２）を、ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００を含有する抽出緩衝液で実施した。精密ダイア濾液−２は抽出されたｒＳＬＡを含有していた（図１、図４）。精密ダイア濾過緩衝液での容積変化中の一定のＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００濃度は、抽出を可能にし、ｒＳＬＡを濾液中に可溶化しておくのに重要であった。
【００６９】
ｒＳＬＡ血清型６／４で得られた結果を再現し、精密濾過によるｒＳＬＡ抽出の方法を立証するために、同じ手順を脂質付加されたｒＳＬＡ血清型１／２で実施した（図５を参照されたい）。
【００７０】
抽出手順の最適化のために、ｒＳＬＡの定量的抽出に必要な精密ダイア濾過緩衝液−２での容積変化（ＶＣ）の数を調査した。試料は、各容積変化（ＶＣ）後に精密ダイア濾液−２から収集し、ＳＤＳ  ＰＡＧＥによるｒＳＬＡ含有量を調べるために解析した（図６）。
【００７１】
最適化実験により、ダイア濾過緩衝液−２での６容積変化でｒＳＬＡの定量的抽出に十分であることが明らかになった。
【００７２】
（実施例４）
正確なカセットポアサイズを選択することによる精密濾過の最適化
Ｅ．ｃｏｌｉタンパク質のバルクの最適除去および標的タンパク質の十分な保持を評価するために、２つの異なるポアサイズを有する精密濾過カセットを研究した。これらの精密濾過実験では、Ｐａｌｌ社製のポリエーテルスルホン膜（ｓｕｐｏｒ  ＴＦＦ）を使用した。寸法（０．１ｍ２濾過面積）は実験室規模容積としては適切である。２つのポアサイズ、すなわち０．２μｍおよび１０００ｋＤを比較した。画分はクマシー染色ＰＡＧＥゲルおよびウェスタンブロット解析により分析した（図７を参照されたい）。
【００７３】
同一濾過面積のＰａｌｌ社製１０００ｋＤ膜で、同じ手順を実施した。１０００ｋＤ膜でのＥ．ｃｏｌｉタンパク質の保持は有意に高かった（図８、レーン１１および１３を参照されたい）。その結果、精密ダイア濾液でのｒＳＬＡの損失は最小であった（レーン１２および１４）。ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００でのｒＳＬＡの抽出は可能であった（レーン１６）が、精密ダイア未透過物−２（ＭＤＲ−２）中のまだ多量のｒＳＬＡにより示されるように不完全であった（レーン１５）。さらに、ＭＤＦ−２中のＥ．ｃｏｌｉ由来バルクタンパク質の枯渇は、それを０．２μｍポアサイズ膜で実現した時にははるかに効率が低かった（図７を参照されたい）。
【００７４】
ｒＳＬＡの抽出は０．２μｍポアサイズ膜ではもっと効率がよく、したがってこのサイズの膜はその後の精密濾過実験すべてに使用された（図７、レーン９および２０参照）
（実施例５）
ヒドロキシアパタイトによる洗浄剤除去
ヒドロキシアパタイト（ＨＡ）ＵＬＴＲＯＧＥＬ（商標）クロマトグラフィー
ＤＥ−５３でのネガティブクロマトグラフィー工程後、大半のＥ．ｃｏｌｉタンパク質はｒＳＬＡ溶液から除去された。ヒトワクチンでは、純度は最優先である。したがって、残留する細菌細胞タンパク質を除去する最終研磨工程が必要であった。
【００７５】
ＨＡ  ＵＬＴＲＯＧＥＬ（商標）にはいくつかの利点がある。ＨＡは、優れた化学的および機械的安定性、広いｐＨ値作動範囲、室温で保存できる可能性を示し、０．１Ｎから１ＮまでのＮａＯＨ溶液での簡単な再生およびデピロゲネーションを提供する。
【００７６】
ＨＡクロマトグラフィーの展開中の一中心的作業は、洗浄剤ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００を除去し、高純度のｒＳＬＡを生産することであった。プロセス展開の初めでの最初の試用により、洗浄剤除去が機能していることが立証された。この方法は、ｒＳＬＡの抽出および可溶化に欠かせない溶液からのＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００の除去に非常に効率的であることが判明した。３種類のｒＳＬＡハイブリッドタンパク質すべての精製により、ＨＡ工程後の最小量の残留ＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００が明らかにされた。ＨＡクロマトグラフィー手順の展開中の第２の戦略は、溶出条件を修正することにより標的タンパク質の純度を改善することであった。そのアプローチは、増大したイオン強度の長期の工程を適用することにより溶出条件の厳密さを高めることであった。
ヒドロキシアパタイトＵＬＴＲＯＧＥＬ（商標）でのクロマトグラフィー工程
この実施例は、使用前のヒドロキシアパタイトの適切な調製を含むＨＡクロマトグラフィー手順を説明している。ＡＫＴＡエクスプローラ制御システム（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ社）により制御することができるカラムクロマトグラフィー工程を実施するために、ヒドロキシアパタイトＵＬＴＲＯＧＥＬ（商標）（ＨＡ）をカラムに充填した。長期保存のため、ＨＡは２０％ＥｔＯＨと１Ｍ  ＮａＣｌに入れた。ＨＡゲルの再生およびデピロゲネーションでは、カラムは２カラム容量の０．５Ｎ  ＮａＣｌで洗い流した。クロマトグラフィー手順から始めるためには、カラムを一組の異なった液体ですすがなければならなかった。先ず、充填したカラムを２カラム容量（ＣＶ）の水（ＷＦＩ、注射用蒸留水）で洗い流し、続いて２ＣＶの０．５Ｎ  ＮａＯＨで、および最終的に８ＣＶのＷＦＩで再度洗い流し、これには初回のすすぎ手順が含まれていた。これにより、クロマトグラフィー工程の開始時にすべての残留汚染物質および考えられる発熱性物質が除去されたことが保証された。これに続く平衡手順は３すすぎ工程からなっていた。樹脂は１ＣＶのｐＨ＝６．８の１０ｍＭリン酸ナトリウム緩衝液（平衡緩衝液）で洗い流し、続いて２ＣＶの５００ｍＭリン酸ナトリウム緩衝液（溶出緩衝液または緩衝液−Ｂ）、ｐＨ＝６．８で、および再度３ＣＶの平衡緩衝液で洗い流した。中間の５００ｍＭ工程は、このクロマトグラフィー工程において用いられる最大イオン強度をシミュレートしていた。これにより、最大溶出条件下で、残留タンパク質は、タンパク質溶液を適用する前に樹脂から洗い流された。
【００７７】
この時点で、カラムは試料適用の準備が整った。試料の量が負荷時間を規定した（負荷の速度はｍｌ  ｐｅｒ  分で与えられる；高速負荷はシステム圧力により制限され、最大値６ｂａｒ）。タンパク質はＵＶ光により２８０ｎｍで検出された。試料負荷中、負荷ピークは非常に高かった。これは、ＴＲＩＴＯＮ（商標）１００が、同様に２８０ｎｍで吸収することが知られているタンパク質溶液に溶解されるという事実を反映していた（図９を参照されたい）。試料負荷の終了後、カラムは再度平衡緩衝液で洗い流した。洗い流しは、２８０ｎｍシグナルが無変化のままになるまで続けられた。これは約３ＣＶの平衡緩衝液後に起こった。
【００７８】
ＵＶシグナルがベースラインで安定化した後、溶出プログラムが開始された。このプログラムは少数の別々の工程からなっていた。先ず、溶出緩衝液の連続添加で、これは徐々にイオン強度を増加させ、約１８％の溶出緩衝液（「緩衝液Ｂ」）での小ピークによりクロマトグラムにおいて目に見える不純物が枯渇した。この工程は、タンパク質ピークのＵＶ線が再度ベースラインにくるまで延長された。２５％緩衝液Ｂでは、勾配は、直線勾配が続く前にＵＶシグナルが再度ベースラインレベルに出会うまで再度延長された。一般に、約３０〜３５％緩衝液Ｂでは、ｒＳＬＡは溶出しはじめピークを形成したが、これは約６０％緩衝液Ｂでは中断した。この画分は別々のバイアルに収集され、これはこの時点で精製産物を含有していた。
【００７９】
ｒＳＬＡ溶出では、緩衝液Ｂの割合の幅は狭くなるよう選択された（３０〜６０％の代わりに３５〜５５％緩衝液Ｂ）。標的タンパク質のわずかな損失は避けられなかったが、キメラｒＳＬＡの３つすべての場合で高純度の最終産物が得られた。
【００８０】
（実施例６）
完全なｒＳＬＡ精製プロトコルの具体例
具体例によれば、本発明の方法は以下の通りに実施された。
【００８１】
ｒＳＬＡを発現しているＥ．ｃｏｌｉの湿潤細胞塊を再懸濁しホモジナイズして細菌細胞を破壊した。次にこの細胞懸濁液を精密濾過し、微小粒子および可溶性Ｅ．ｃｏｌｉタンパク質を洗い流すためにＴｒｉｓ緩衝液で洗浄（精密ダイア濾過）した。抽出は、Ｅ．ｃｏｌｉ細胞膜由来のｒＳＬＡを可溶化するＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００含有第２精密ダイア濾過緩衝液により実施した。次に、このタンパク質溶液を、それに続く陰イオン交換カラムを無菌状態に保っておくために０．２μｍ濾過した。陰イオン交換クロマトグラフィーはネガティブクロマトグラフィー工程として使用した。Ｅ．ｃｏｌｉタンパク質はかなり結合していた。これとは対照的に、ｒＳＬＡは大部分がカラムを通過し、したがって通過流中に見出された。次に、標的タンパク質を含有する通過流を、残留内毒素除去のために膜吸着体を通過させた（陰イオン交換濾過）。それに続く最終クロマトグラフィー工程のために緩衝液条件を変えるために、限外濾過を実施した。次に、大量のｒＳＬＡおよびＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００のあるタンパク質溶液をＨＡカラム上に負荷し、このカラムは残留Ｅ．ｃｏｌｉタンパク質およびＴＲＩＴＯＮ（商標）Ｘ１００を枯渇させた。最終限外濾過を実施してｒＳＬＡを生理的緩衝系に移した。最終滅菌濾過により精製工程は終了した。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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