(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
プロモーターの下流に乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子が連結された乳酸脱水素酵素発現カセットであって、
前記プロモーターは、以下の（ａ）〜（ｃ）より選択される塩基配列からなるプロモーターである、乳酸脱水素酵素発現カセット。
（ａ）配列番号１に示す塩基配列からなるプロモーター
（ｂ）配列番号１に示す塩基配列を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなるプロモーター
（ｃ）配列番号１に記載の塩基配列において、１個の塩基が欠失、置換および／または付加された塩基配列からなるプロモーター
【請求項２】
以下の（ａ）群から選ばれるプロモーターおよび以下の（ｂ）群から選ばれる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子を含む、乳酸脱水素酵素発現カセット。
（ａ）
（１）配列番号１に示す塩基配列からなるプロモーター
（２）配列番号１に示す塩基配列を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなるプロモーター
（３）配列番号１に記載の塩基配列において、１個の塩基が欠失、置換および／または付加された塩基配列からなるプロモーター
（ｂ）
（１）配列番号４〜６いずれかに示す塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
（２）配列番号４〜６いずれかに示す塩基配列を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
（３）配列番号４〜６いずれかに記載の塩基配列において、１個の塩基が欠失、置換および／または付加された塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
【請求項３】
請求項１または２のいずれかに記載の乳酸脱水素酵素発現カセットを少なくとも一つ染色体中に有する、形質転換酵母。
【請求項４】
前記形質転換酵母は、そのサプレッション・オブ・エクスポネンシャル・ディフェクト１遺伝子（ＳＥＤ１遺伝子）が、請求項１または２いずれかに記載の乳酸脱水素酵素発現カセットで置換されている、請求項３に記載の形質転換酵母。
【請求項５】
前記形質転換酵母は、サッカロミセス属（Ｇｅｎｕｓ Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）に属する、請求項３または４に記載の形質転換酵母。
【請求項６】
前記形質転換酵母は、サッカロミセス・セレビセ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）である、請求項３または４に記載の形質転換酵母。
【請求項７】
請求項３〜６いずれかに記載の形質転換酵母を培養する培養工程を含む、乳酸の製造方法。
【請求項８】
前記培養工程は、培養液を分離膜で濾過し、濾液から乳酸を回収し、さらに未濾過液を培養液に保持または還流し、かつ、培地を培養液に追加する連続発酵である、請求項７に記載の乳酸の製造方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、乳酸脱水素酵素発現カセット、該カセットを有する形質転換酵母ならびに該酵母を培養することを含む乳酸の製造方法、より詳しくは、乳酸の生産能力の高い乳酸脱水素酵素発現カセット、該カセットを有する形質転換酵母ならびに該酵母を培養することを含む乳酸の製造方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
近年、資源循環型社会の構築に向け、植物などのバイオマスを原料としたポリマーに注目が集まっている。その中でも、ポリ乳酸（以下、「ＰＬＡ」と略すことがある）が、バイオマス原料のポリマーとして優れた性質を有することが明らかになってきた。【０００３】
ＰＬＡの原料である乳酸は、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）属やラクトコッカス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ）属に代表される、いわゆる乳酸菌と総称される微生物を培養することにより、製造されている。乳酸菌を用いる乳酸の生産は、糖からの乳酸収率や乳酸生産速度は優れている。しかし、得られる乳酸は、Ｌ−乳酸とＤ−乳酸との混合物である。このため、光学純度に課題がある。ＰＬＡの生産に用いる乳酸には、高い光学純度が要求される。【０００４】
光学純度の高い乳酸を製造することが試みられている。例えば、形質転換酵母を用いて、Ｌ−乳酸およびＤ−乳酸を生産することが試みられている（例えば、特許文献１−３、非特許文献１）。酵母は、本来乳酸を生産する能力を有していない。これらの文献では、遺伝子組換え技術により、ピルビン酸を乳酸へと変換する乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子を酵母に導入することで、光学純度が非常に高い乳酸が得られることが報告されている。一方、酵母による乳酸生産では、乳酸収率、乳酸生産速度は、乳酸菌に比較して劣っている。このため、酵母を用いて低コストで乳酸を生産するためには、乳酸収率、乳酸生産速度を共に向上させる必要がある。【０００５】
乳酸収率、乳酸生産速度を共に向上させるために、乳酸生産能力を有する酵母を分離膜でろ過しながら、培養する技術が開発されている（例えば、特許文献４参照）。しかし、この技術を用いても、培養の途中から乳酸収率、乳酸生産速度ともに低下してくるという課題があった。
【特許文献１】特表２００１−５１６５８４号公報
【特許文献２】特開２００３−９３０６０号公報
【特許文献３】特開２００５−１３７３０６号公報
【特許文献４】国際公開第２００７／９７２６０号パンフレット
【非特許文献１】イシダ、タカハシ（Ｉｓｈｉｄａ，Ｔａｋａｈａｓｈｉ）ら、「ジャーナル  オブ  バイオサイエンス  アンド  バイオエンジニアリング（Ｊ．Ｂｉｏｓｃｉ．Ｂｉｏｅｎｇ）」、１０１（２）、ｐ．１７２−１７７、（２００６）
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
本発明は、上記問題に鑑みなされたものであり、その目的は、高い光学純度、乳酸収率ならびに乳酸生産速度を同時に達成することが可能となる、乳酸生産能力を有する酵母を分離膜で濾過しながら行う連続培養において、乳酸収率ならびに乳酸生産速度の低下を防ぐために必要となる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子発現カセット、該カセットを有する酵母ならびに該酵母を培養することによる乳酸の製造方法を提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【０００７】
本発明者らは、上記課題を解決するために鋭意検討をした結果、乳酸生産能力を有する酵母を分離膜で濾過しながら行う連続培養において、培養開始後５０時間以降における遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の５倍以上である遺伝子のプロモーターを含む乳酸脱水素酵素発現カセットを有する酵母を分離膜で濾過しながら培養することにより、乳酸収率および乳酸生産速度の低下を招くことなく、安定に長期間の連続培養が可能であることを見出し、本発明を完成させるに至った。【０００８】
すなわち本発明は、プロモーターの下流に乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子が連結された乳酸脱水素酵素発現カセットであって、このプロモーターは、乳酸生産能力を有する酵母を分離膜で濾過しながら行う連続培養において、培養開始後５０時間以降における遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の５倍以上である遺伝子のプロモーターであることを特徴とする、乳酸脱水素酵素発現カセットである。好ましくは、前記プロモーターは、サプレッション・オブ・エクスポネンシャル・ディフェクト１遺伝子（ＳＥＤ１遺伝子）、細胞壁関連タンパク質２遺伝子（ＣＷＰ２遺伝子）又はエノラーゼ１遺伝子（ＥＮＯ１遺伝子）のプロモーターであり、より好ましくは、以下の（ａ）〜（ｃ）より選択される塩基配列からなるプロモーターである。
（ａ）配列番号１〜３いずれかに示す塩基配列からなるプロモーター
（ｂ）配列番号１〜３いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなるプロモーター
（ｃ）配列番号１〜３いずれかに記載の塩基配列において、１あるいは複数個の塩基が欠失、置換および／または付加された塩基配列からなるプロモーター【０００９】
本発明の別の好ましい態様によれば、以下の（ａ）群から選ばれるプロモーターおよび（ｂ）群から選ばれる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子を含む乳酸脱水素酵素発現カセットである。
（ａ）
（１）配列番号１〜３いずれかに示す塩基配列からなるプロモーター
（２）配列番号１〜３いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなるプロモーター
（３）配列番号１〜３いずれかに記載の塩基配列において、１あるいは複数個の塩基が欠失、置換および／または付加された塩基配列からなるプロモーター
（ｂ）
（１）配列番号４〜６いずれかに示す塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
（２）配列番号４〜６いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
（３）配列番号４〜６いずれかに記載の塩基配列において、１あるいは複数個の塩基が欠失、置換および／または付加された塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子【００１０】
本発明の別の好ましい態様によれば、上述したいずれかの乳酸脱水素酵素発現カセットを少なくとも一つ染色体中に有する形質転換酵母である。好ましくは、サプレッション・オブ・エクスポネンシャル・ディフェクト１遺伝子（ＳＥＤ１遺伝子）、細胞壁関連タンパク質２遺伝子（ＣＷＰ２遺伝子）又はエノラーゼ１遺伝子（ＥＮＯ１遺伝子）から選ばれる遺伝子の少なくとも一つが、上記乳酸脱水素酵素発現カセットで置換されている酵母である。【００１１】
上記形質転換酵母は、サッカロミセス属（Ｇｅｎｕｓ  Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）に属すると好ましい。上記形質転換酵母は、サッカロミセス・セレビセ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）であると、さらに好ましい。【００１２】
また本発明は、上記形質転換酵母を培養する培養工程を含む乳酸の製造方法を提供する。好ましくは、前記培養工程が培養液を分離膜で濾過し、濾液から乳酸を回収し、さらに未濾過液を培養液に保持または還流し、かつ、培地を培養液に追加する連続培養である。
【発明の効果】
【００１３】
本発明では、乳酸生産能力を有する酵母を分離膜で濾過しながら行う連続培養において、培養開始後５０時間以降における遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の５倍以上である遺伝子のプロモーターを含む乳酸脱水素酵素発現カセットを有する酵母を分離膜で濾過しながら培養する。この結果、高光学純度の乳酸の生産を、高収率、高生産速度で、長時間安定して行うことが可能となる。
【図面の簡単な説明】
【００１４】
【図１】図１は、本発明で用いられる膜分離型の連続発酵装置の一つの実施の形態を説明するための概略側面図である。
【図２】図２は、本発明で用いることができる他の膜分離型の連続発酵装置の一つの実施の形態を説明するための概略側面図である。
【図３】図３は、本発明で用いられる分離膜エレメントの一つの実施の形態を説明するための概略斜視図である。
【図４】図４は、本発明で用いられる別の分離膜エレメントの他の実施の形態を説明するための概略斜視図である。
【図５】図５は、発現ベクターｐＴＲＳ１１を説明するための図である。
【符号の説明】
【００１５】
１    発酵反応槽
２    分離膜エレメント２
３    水頭差制御装置
４    第２のタグ配列
５    攪拌機
６    レベルセンサ
７    培地供給ポンプ
８    ｐＨ調整溶液供給ポンプ
９    ｐＨセンサ・制御装置
１０    温度調節器
１１    発酵培養液循環ポンプ
１２    膜分離槽
１３    支持板
１４    流路材
１５    分離膜
１６    凹部
１７    集水パイプ
１８    分離膜束
１９    上部樹脂封止層
２０    下部樹脂封止層
２１    支持フレーム
２２    集水パイプ
【発明を実施するための最良の形態】
【００１６】
［乳酸脱水素酵素発現カセット］
本発明の乳酸脱水素酵素発現カセットは、プロモーターの下流に乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子（ｌｄｈ遺伝子）が連結された乳酸脱水素酵素（ＬＤＨ：ｌａｃｔａｔｅ  ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ、以下、「ＬＤＨ」という）発現カセットであって、乳酸生産能力を有する酵母を分離膜で濾過しながら行う連続培養において、前記プロモーターは、培養開始後５０時間以降における遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の５倍以上である遺伝子のプロモーターである、乳酸脱水素酵素発現カセットである。【００１７】
本明細書中において「ｌｄｈ遺伝子」とは、還元型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド（ＮＡＤＨ）とピルビン酸を酸化型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド（ＮＡＤ＋）とＬ−乳酸またはＮＡＤ＋とＤ−乳酸とに変換する活性を持つＬＤＨをコードしている遺伝子をいう。【００１８】
本発明で使用するｌｄｈ遺伝子としては、上述した活性を有するＬＤＨをコードしているｌｄｈ遺伝子であればいずれも使用できるが、好ましくは、乳酸菌や枯草菌などの細菌由来のｌｄｈ遺伝子やヒト、ウシ、カエル、マラリアなどの真核生物由来のｌｄｈ遺伝子である。これらの中でも、細菌由来としては、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ），ラクトバチルス・プランタルム（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐｌａｎｔａｒｕｍ），ラクトバチルス・ブルガリカス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ），ラクトバチルス・サケイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓａｓｅｉ），ラクトバチルス・デルブルッキ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ），ラクトバチルス・ジョンソニ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｊｏｈｎｓｏｎｉｉ），ラクトバチルス・ヘルベティカス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｈｅｌｖｅｔｉｃｕｓ），ラクトバチルス・カーバタス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃｕｒｖａｔｕｓ），ラクトバチルス・アシドフィラス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ），ロイコノストック・メセンテロイデス（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ  ｍｅｓｅｎｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ロイコノストック・ラクティス（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ  ｌａｃｔｉｓ）、ラクトコッカス・ラクティス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｌａｃｔｉｓ），ペディオコッカス・ペントサセウス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｅｎｔｏｓａｃｅｕｓ），ペディオコッカス・アシディラクティシ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ  ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ），バチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ），バチルス・ステアロサーモフィルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｔｅａｒｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）由来のｌｄｈ遺伝子を好適に用いることが出来る。また、真核生物由来としては、リゾプス・オリザエ（Ｒｈｉｚｏｐｕｓ  ｏｒｙｚａｅ），ホモ・サピエンス（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ），ボス・タウラス（Ｂｏｓ  ｔａｕｒｕｓ），ゼノプス・レービス（Ｘｅｎｏｐｕｓ  ｌａｅｖｉｓ），カニス・ファミリアリス（Ｃａｎｉｓ  ｆａｍｉｌｉａｒｉｓ）、アリゲーター・ミシシッピエンシス（Ａｌｌｉｇａｔｏｒ  ｍｉｓｓｉｓｓｉｐｐｉｅｎｓｉｓ）、モノデルフィス・ドメスティカ（Ｍｏｎｏｄｅｌｐｈｉｓ  ｄｏｍｅｓｔｉｃａ）、ペロディスカス・シネンシス（Ｐｅｌｏｄｉｓｃｕｓ  ｓｉｎｅｎｓｉｓ）、スクアラス・アカンティアス（Ｓｑｕａｌｕｓ  ａｃａｎｔｈｉａｓ）、プラスモディウム・ファルシパルム（Ｐｌａｍｏｄｉｕｍ  ｆａｌｃｉｐａｒｕｍ）、プラスモディウム・ビバックス（Ｐｌａｍｏｄｉｕｍ  ｖｉｖａｘ）、プラスモディウム・マラリア（Ｐｌａｍｏｄｉｕｍ  ｍａｒａｒｉａｅ）、プラスモディウム・オバール（Ｐｌａｍｏｄｉｕｍ  ｏｖａｌｅ）由来のｌｄｈ遺伝子を好適に用いることができる。【００１９】
本発明で使用するｌｄｈ遺伝子には、遺伝的多型性や、変異誘発などによる変異型の遺伝子も含まれる。ここでいう遺伝的多型性とは、遺伝子上の自然突然変異により遺伝子の塩基配列が一部変化しているものである。また、変異誘発とは、人工的に遺伝子に変異を導入することをいい、例えば、部位特異的変異導入用キット（Ｍｕｔａｎ−Ｋ（タカラバイオ社製））を用いる方法や、ランダム変異導入用キット（ＢＤ  Ｄｉｖｅｒｓｉｆｙ  ＰＣＲ  Ｒａｎｄｏｍ  Ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ（ＣＬＯＮＴＥＣＨ社製））を用いる方法などによる。【００２０】
本発明で使用するｌｄｈ遺伝子をクローニングする方法としては特に制限はなく、既知の手法を用いることができる。例えば、既知の遺伝子情報に基づき、ＰＣＲ（Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ  Ｃｈａｉｎ  Ｒｅａｃｔｉｏｎ）法を用いて必要な遺伝領域を増幅取得する方法や、ゲノムライブラリーやｃＤＮＡライブラリーより相同性や酵素活性を指標としてクローニングする方法などが挙げられる。また、既知のタンパク質情報に基づき化学合成的又は遺伝子工学的に合成する方法も可能である。【００２１】
本発明で使用する乳酸脱水素酵素（ＬＤＨ）発現カセットとしては、このＬＤＨ発現カセットを有する細胞内において、ｌｄｈ遺伝子からｍＲＮＡを介してＬＤＨを発現しうる塩基配列であれば特に制限はない。好ましくは、プロモーター、ｌｄｈ遺伝子ならびにターミネーターを連続して有する塩基配列である。ここで、ターミネーターとは、遺伝子からのｍＲＮＡ転写を終結させる配列を意味し、通常、染色体中に存在する遺伝子の３末端側の下流配列を指す。【００２２】
本発明で使用する「乳酸生産能力を有する酵母」とは、グルコース、スクロース、フルクトース等の糖を資化して乳酸を生産可能な酵母であり、好ましくは、遺伝子組換えによりｌｄｈ遺伝子を導入した酵母である。【００２３】
ここで、酵母へのｌｄｈ遺伝子の導入方法について説明する。酵母へのｌｄｈ遺伝子の導入方法としては、発現ベクターにｌｄｈ遺伝子を組み込んだｌｄｈ遺伝子発現ベクターを酵母に形質転換する方法、ｌｄｈ遺伝子を染色体上の目的箇所に相同組換えで挿入する方法、または、ｌｄｈ遺伝子を色体中にランダムに非相同組み換えで挿入する方法などが挙げられる。【００２４】
ｌｄｈ遺伝子を組み込む発現ベクターとしては、酵母で汎用的に利用される発現ベクターを用いることができる。酵母で汎用的に利用される発現ベクターとは、酵母細胞内での自立的複製に必要な配列、大腸菌細胞内での自立的複製に必要な配列、酵母選択マーカー及び大腸菌選択マーカーを有しており、また、組み込んだｌｄｈ遺伝子を発現させるために、その発現を調節するオペレーター、プロモーター、ターミネーター又はエンハンサー等のいわゆる調節配列をも有していることが望ましい。【００２５】
ここで、酵母細胞内での自立的複製に必要な配列とは、例えば、酵母の自立複製開始点（ＡＲＳ１）とセントロメア配列のセット、もしくは酵母の２μｍプラスミドの複製開始点である配列である。大腸菌内での自立的複製に必要な配列とは、例えば、大腸菌のＣｏｌＥ１複製開始点である配列である。また、酵母選択マーカーとしては、ＵＲＡ３又はＴＲＰ１等の栄養要求性相補的遺伝子もしくはＧ４１８耐性遺伝子又はネオマイシン耐性遺伝子等の薬剤耐性遺伝子が挙げられる。大腸菌の選択マーカーとしては、アンピシリン耐性遺伝子又はカナマイシン耐性遺伝子等の抗生物質耐性遺伝子が挙げられる。調節配列としては、ｌｄｈ遺伝子を発現可能なものであれば特に制限はないが、一例として酸性フォスファターゼ遺伝子（ＰＨＯ５）、グリセルアルデヒド−３−リン酸デヒドロゲナーゼ遺伝子（ＴＤＨ１，２，３）、アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子（ＡＤＨ１，２，３，４，５，６，７）遺伝子、ガラクトース代謝系遺伝子（ＧＡＬ１，７，１０）、シトクロムｃ遺伝子（ＣＹＣ１）、トリオースリン酸イソメラーゼ遺伝子（ＴＰＩ１）、ホスホグリセレートキナーゼ遺伝子（ＰＧＫ１）、ホスホフルクトースキナーゼ遺伝子（ＰＦＫ１）、ピルビン酸デカルボキシラーゼ遺伝子（ＰＤＣ１，５，６）などのプロモーター配列及びＴＤＨ３遺伝子などのターミネーター配列が挙げられる。しかしながら、発現ベクターはこれらに限定されるものではない。【００２６】
上記発現ベクターのプロモーター下流にｌｄｈ遺伝子を導入することにより、ｌｄｈ遺伝子を発現可能なベクターが得られる。得られたｌｄｈ遺伝子発現ベクターを、後述する方法により酵母に形質転換することにより、ｌｄｈ遺伝子を酵母に導入することができる。【００２７】
また、ｌｄｈ遺伝子を染色体上に挿入することで、ｌｄｈ遺伝子を酵母に導入することができる。ｌｄｈ遺伝子を染色体中に挿入する方法に特に制限はないが、ｌｄｈ遺伝子を含むＤＮＡを後述する方法により酵母に形質転換し、ｌｄｈ遺伝子を非相同組み換えによって染色体中のランダムな位置に挿入する方法や、ｌｄｈ遺伝子を含むＤＮＡを相同組み換えにより目的とする箇所に挿入する方法などがある。好ましくは、相同組み換えによる方法である。【００２８】
ｌｄｈ遺伝子を含むＤＮＡを染色体中の目的箇所に相同組み換えで挿入する方法としては、ｌｄｈ遺伝子を含むＤＮＡの上流及び下流に、導入目的箇所に相同的な部分を付加するようにデザインしたプライマーを用いてＰＣＲを行い、得られたＰＣＲ断片を後述する方法により酵母に形質転換する方法が挙げられるが、これに限定されるものではない。また、形質転換株の選択を容易にするために、上記ＰＣＲ断片には酵母選択マーカーが含まれることが好ましい。【００２９】
ここで用いるＰＣＲ断片を調整する方法は、例えば、下記（１）〜（３）のステップ１〜３の工程により行うことができる。なお、ここではｌｄｈ遺伝子をピルビン酸脱炭酸酵素１遺伝子（ＰＤＣ１遺伝子）プロモーター下流に導入する方法に関して例示する。【００３０】
（１）ステップ１：ｌｄｈ遺伝子の下流にターミネーターがつながったプラスミドを鋳型とし、プライマー１，２をセットとしてｌｄｈ遺伝子及びターミネーターを含む断片をＰＣＲで増幅する。ここで、プライマー１は、ＰＤＣ１遺伝子の上流側に相同的な配列４０ｂｐ以上を付加するようデザインし、プライマー２は、ターミネーターより下流のプラスミド由来の配列をもとにデザインする。【００３１】
（２）ステップ２：酵母選択マーカーを持つプラスミド、例えばｐＲＳ４２４、ｐＲＳ４２６等を鋳型として、プライマー３，４をセットとして酵母選択マーカーを含む断片をＰＣＲで増幅する。ここで、プライマー３は、ステップ１のＰＣＲ断片のターミネーターより下流の配列と相同性のある配列が３０ｂｐ以上を付加するようにデザインし、プライマー４には、ＰＤＣ１遺伝子の下流側に相同的な配列４０ｂｐ以上を付加するようデザインする。【００３２】
（３）ステップ３：ステップ１，２で得られたＰＣＲ断片を混合したものを鋳型とし、プライマー１，４をセットとしてＰＣＲを行うことにより、両末端にＰＤＣ１遺伝子の上流側及び下流側に相当する配列が付加された、ｌｄｈ遺伝子、ターミネーター及び酵母選択マーカーを含むＰＣＲ断片が得られる。【００３３】
また、ＬＤＨ発現カセットとして染色体に導入するには、上記ステップ１で使用するＰＣＲ鋳型プラスミドとして、任意のプロモーター、ｌｄｈ遺伝子、ターミネーターが搭載されているものを用い、プライマー１のデザインを導入目的箇所に相同的な配列４０ｂｐ以上が付加され、かつ、プロモーター、ｌｄｈ遺伝子、ターミネーターを増幅しうるデザインにすればよい。【００３４】
上記で得られたｌｄｈ遺伝子発現ベクターまたはＰＣＲ断片を酵母に導入するには、形質転換、形質導入、トランスフェクション、コトランスフェクションまたはエレクトロポレーション等の方法を用いることができる。具体的には、例えば、酢酸リチウムを用いる方法やプロトプラスト法等がある。【００３５】
得られた形質転換株の培養方法としては、例えば、「Ｍ．Ｄ．  Ｒｏｓｅ  ｅｔ  ａｌ．，“Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｉｎ  Ｙｅａｓｔ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ”，  Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ  （１９９０）」等に記載されている既知の方法を用いることができる。ｌｄｈ遺伝子発現ベクター又はＰＣＲ断片が導入された酵母は、発現ベクター又はＰＣＲ断片が有する酵母選択マーカーによって、栄養非添加培地又は薬剤添加培地で培養することにより選択することができる。【００３６】
本発明の「分離膜で濾過しながら行う連続培養」とは、培養液を分離膜で濾過し濾液から生産物を回収すると共に未濾過液を前記の培養液に保持または還流し、かつ、発酵原料を前記の培養液に追加する連続培養を意味する。使用する分離膜は、好ましくは多孔性膜であり、培養に使用される酵母による目詰まりが起こりにくく、かつ、濾過性能が長期間安定に継続する性能を有するものであることが望ましい。本発明において使用する分離膜の材質はセラミックスまたは有機高分子であり、好ましくは有機高分子である。【００３７】
次に、本発明における「遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の５倍以上な遺伝子」について説明する。本発明における遺伝子発現量とは、遺伝子から転写されるメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）量を意味しており、全遺伝子の平均相対発現量とは、好ましくはサッカロマイセス  ゲノムデータベース（http://www.yeastgenome.org/）に登録されている全遺伝子の平均発現量であるが、１あるいは複数個の遺伝子が欠落していても構わない。すなわち、「遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の５倍以上な遺伝子」とは、ｍＲＮＡ量が全遺伝子の平均ｍＲＮＡ量の５倍以上である遺伝子を意味する。また、本発明の本質が、遺伝子発現量のより多い遺伝子のプロモーターを使用することにあることから、好ましくは、遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の７倍以上、より好ましくは１０倍以上の遺伝子である。【００３８】
本発明において、全遺伝子の平均相対発現量を測定する方法としては、ノーザンブロット法、ｑＰＣＲ（定量ＰＣＲ）法、リアルタイムＰＣＲ法またはＤＮＡマイクロアレイ法などが挙げられる。先の３つの方法が、通常、個々の遺伝子発現量を測定する方法であるのに対し、ＤＮＡマイクロアレイ法では、アレイ上に固定されているプローブと、予め蛍光標識されたｍＲＮＡとのハイブリダイゼーションを行い、専用スキャナで蛍光強度を測定することにより、アレイ上に搭載されている全遺伝子の発現量を同時に測定可能であることから、ＤＮＡマイクロアレイ法が好ましい。スキャナによる蛍光強度の測定では、蛍光強度のサチュレーションが起こるスポット数を出来る限り少なくし、かつ、全体の蛍光強度を高くするレーザー強度による測定が望ましい。このようなレーザー強度は測定サンプル毎に異なり、簡単な検討によって決定することが出来る。【００３９】
本発明において使用するＤＮＡマイクロアレイとしては、酵母全遺伝子を搭載したものであれば特に制限はなく、アフィメトリクス社製の「ＧｅｎｅＣｈｉｐ」や東レ社製の「３Ｄ−Ｇｅｎｅ」などを好適に利用することができる。好ましくは「３Ｄ−Ｇｅｎｅ」である。【００４０】
ここで、ＤＮＡマイクロアレイを使用して全遺伝子の蛍光強度を測定し、それらの平均値よりも５倍以上大きな値を示した遺伝子を「遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の５倍以上である遺伝子」と定義する。また、７倍以上大きな値を示した遺伝子を「遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の７倍以上である遺伝子」と定義する。さらに、１０倍以上大きな値を示した遺伝子を「遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の１０倍以上である遺伝子」と定義する。【００４１】
本発明における、乳酸生産能力を有する酵母を分離膜で濾過しながら行う連続培養において、培養開始後５０時間以降における遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の５倍以上である遺伝子のプロモーターとは、乳酸生産能力を有する酵母を分離膜で濾過しながら行う連続培養において、培養開始後５０時間以降のある時点における酵母をサンプリングして、該酵母より抽出した全ＲＮＡを使用して、上述したＤＮＡマイクロアレイで測定することにより決定することができる遺伝子のプロモーターである。【００４２】
本発明において「プロモーター」とは、遺伝子からのｍＲＮＡの転写開始に関与する塩基配列を意味し、通常、染色体中に存在する遺伝子の５末端側の上流配列を指す。プロモーターの塩基配列長としては、好ましくは１〜３０００ｂｐ、より好ましくは１〜１０００ｂｐであるが、下流に存在する遺伝子のｍＲＮＡの転写を開始し得る塩基配列であれば特に制限はない。また、プロモーターの転写活性を向上させる変異や操作は既知であり、本発明には既知の手法により改変されたプロモーターも含む。【００４３】
本発明における、乳酸生産能力を有する酵母を分離膜で濾過しながら行う連続培養において、培養開始後５０時間以降における遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の５倍以上、好ましくは７倍以上、より好ましくは１０倍以上である遺伝子のプロモーターとしては、ＣＤＣ１９（セル・デビジョン・サイクル１９）遺伝子，ＩＰＰ１（インオーガニック・ピロフォスファターゼ１）遺伝子、ＡＲＦ１（ＡＤＰ−リボシレーション・ファクター１）遺伝子，ＣＵＰ５遺伝子、ＲＰＬ２８（リボソーマル・プロテイン・エル２８）遺伝子、ＴＲＸ２（チオレドキシン２）遺伝子，ＨＳＰ１０４（ヒート・ショック・タンパク質１０４）遺伝子，ＡＨＰ１（アルキル・ハイドロパーオキサイド・リダクターゼ１）遺伝子，ＹＭＲ１２２Ｗ−Ａ，ＣＩＴ１（サイトレート・シンターゼ１）遺伝子，ＲＰＳ１５（リボソーマル・プロテイン・エス１５）遺伝子，ＡＬＤ４（アルデヒド・デヒドロゲナーゼ４）遺伝子，ＹＰＬ２２５Ｗ，ＨＳＰ２６（ヒート・ショック・プロテイン２６）遺伝子，ＰＧＫ１（フォスフォ・グリセレイト・キナーゼ１）遺伝子，ＳＥＤ１（サプレッション・オブ・エクスポネンシャル・ディフェクト１）遺伝子，ＭＦＡ１（メイティング・ファクター１）遺伝子，ＨＹＰ２（ハイプシン・コンテイニング・タンパク質２）遺伝子，ＨＳＰ１２（ヒート・ショック・プロテイン１２）遺伝子，ＱＣＲ６（ユビキノール・シトクロムＣ・レダクターゼ複合体６）遺伝子，ＨＸＫ１（ヘキソキナーゼ１）遺伝子，ＴＤＨ３（グリセロアルデヒド３リン酸脱水素酵素３）遺伝子，ＥＮＯ１（エノラーゼ１）遺伝子，ＢＧＬ２（ベータ・グルカナーゼ２）遺伝子，ＹＪＬ１３３Ｃ−Ａ，ＱＣＲ８（ユビキノール・シトクロムＣ・レダクターゼ複合体８）遺伝子，ＦＢＡ１（フルクトース・１，６−ビフォスフェート・アルドラーゼ１）遺伝子，ＣＷＰ２（細胞壁関連タンパク質２）遺伝子，ＣＣＷ１２（細胞壁関連タンパク質１２）遺伝子，ＴＭＡ１０（トランスレーション・マシナリー関連１０）遺伝子，ＳＩＰ１８遺伝子，ＨＯＲ７（高浸透圧応答7）遺伝子，ＣＣＷ１４（細胞壁関連タンパク質１４）遺伝子，ＰＩＲ３（プロテイン・コンテイニング・インターナル・リピート１３）遺伝子，ＣＹＳ３（シスタチオナーゼ３）遺伝子，ＣＤＣ４８（セル・デビジョン・サイクル４８）遺伝子，ＬＹＳ２０（ホモサイトレート・シンターゼ２０）遺伝子，ＨＳＰ３１（ヒート・ショック・プロテイン３１）遺伝子，ＡＲＧ５，６（アセチルグルタメート・キナーゼ５，６）遺伝子，ＲＰＳ２４Ａ（４０Ｓ・リボソーム・タンパク質Ｓ２４）遺伝子，ＲＰＬ２９（リボソーム・タンパク質Ｌ２９）遺伝子，ＲＰＬ２４Ａ（リボソーム・タンパク質Ｌ２４）遺伝子，ＡＤＨ４（アルコール・デヒドロゲナーゼ４）遺伝子，ＭＵＰ１（メチオニン・アップテイク１）遺伝子，ＲＰＬ１１Ｂ（リボソーム・タンパク質Ｌ１１Ｂ）遺伝子，ＴＨＩ４（チアミン生合成４遺伝子）遺伝子，ＲＰＬ２４Ｂ（リボソーム・タンパク質Ｌ２４Ｂ）遺伝子，ＲＰＳ０Ａ（４０Ｓ・リボソーム・タンパク質ＳＡ）遺伝子，ＲＰＬ２７Ａ（リボソーム・タンパク質Ｌ２７Ａ）遺伝子，ＲＰＬ１６Ａ（リボソーム・タンパク質Ｌ１６Ａ）遺伝子，��ＰＳ２１Ｂ（４０Ｓ・リボソーム・タンパク質Ｓ２１Ｂ）遺伝子，ＲＰＳ５（４０Ｓ・リボソーム・タンパク質Ｓ５）遺伝子，ＨＯＭ６（ホモセリン・デヒドロゲナーゼ６）遺伝子，ＰＤＣ５（ピルビン酸脱炭酸酵素５）遺伝子，ＴＨＩ７（チアミン生合成７）遺伝子，ＭＥＴ１７（システイン・シンターゼ１７）遺伝子，ＥＣＭ４０（アミノ酸・Ｎ−アセチルトランスフェレーゼ４０）遺伝子，ＡＲＧ１（アルギナーゼ１）遺伝子、ＺＰＳ１（ジンク・ｐＨ／レギュレイティッド・表層タンパク質１）遺伝子，ＩＤＨ２（イソサイトレート・デヒドロゲナーゼ２）遺伝子が挙げられ、特に好ましくは、ＳＥＤ１遺伝子、ＣＷＰ２遺伝子又はＥＮＯ１遺伝子のプロモーターである。【００４４】
より好ましくは、以下の（ａ）〜（ｃ）より選択される塩基配列からなるプロモーターである。【００４５】
（ａ）下記配列番号１〜３いずれかに示す塩基配列からなるプロモーター
（ｂ）下記配列番号１〜３いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなるプロモーター
（ｃ）下記配列番号１〜３いずれかに記載の塩基配列において、１あるいは複数個の塩基が欠失、置換および／または付加された塩基配列からなるプロモーター
配列番号１：（ＳＥＤ１遺伝子：Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ（サッカロマイセス・セレビシエ）由来）
aggattttaa  tctgttggag  ttaaggtgaa  tacgtttttc  catattgggg  tatgcagctc
gaacctaaag  tggtatgtac  acatcccctc  aagcacaccc  attaccctta  taggattaat
gtaagcaaca  gcttacacgg  aattggaaat  actattcaac  gatccatgca  tctgccagat
tcggacatgc  atattcccca  attggatata  gaaaattaac  gtaaggcagt  atcttttcac
aatgtacttg  caacgcggcg  acttaaagtt  gaagtacaac  ctgcagcagc  ggctttttgt
acggtacgcc  aaactgtcaa  tggataatat  tgcgtagacc  gaaaaaggta  atcctcaaca
ctacccgtgg  tggatgacct  aaagcagtaa  tattggttgg  aattatctcc  cagacggcac
cgtctccccg  agaaagctta  gccccgaggt  ctaccttcca  tacaccactg  attgctccac
gtcatgcggc  cttctttcga  ggacaaaaag  gcatatatcg  ctaaaattag  ccatcagaac
cgttattgtt  attatatttt  cattacgaaa  gaggagaggg  cccagcgcgc  cagagcacac
acggtcattg  attactttat  ttggctaaag  atccatccct  tctcgatgtc  atctctttcc
attcttgtgt  atttttgatt  gaaaatgatt  ttttgtccac  taatttctaa  aaataagaca
aaaagccttt  aagcagtttt  tcatccattt  tactacggta  aaatgaatta  gtacggtatg
gctcccagtc  gcattatttt  tagattggcc  gtaggggctg  gggtagaact  agagtaagga
acattgctct  gccctctttt  gaactgtcat  ataaatacct  gacctatttt  attctccatt
atcgtattat  ctcacctctc  tttttctatt  ctcttgtaat  tattgattta  tagtcgtaac
tacaaagaca  agcaaaataa  aatacgttcg  ctctattaag
配列番号２：（ＣＷＰ２遺伝子：Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ（サッカロマイセス・セレビシエ）由来）
ctaatagaca  aggtgctatg  agtgaattgc  tagcctcccc  tttttatttt  gtgcggtcac
cgcaagggac  aaagcttttc  ttagaaaacc  gtctgagaag  cataacgtac  gccatcccct
agacatatta  ataatgctac  agatactatg  ctgctcgtct  ttttttgacg  acccttttat
tgcaatgtgc  aactaatggc  aaacaaccac  atagtatcac  agtattacat  tgcctccacc
gatgcggatg  ttagggcgcc  aagtctgtca  tgaagcatgt  tcctgtcata  atcttgtatg
caaaataccg  cgttctgcgc  cactgatatg  ctaggcagca  gcaacctatg  cagaagattg
cttttcccac  gcctgtttta  cgtctccagg  gcacttgaaa  caatgcagcg  atcgccgcca
caacacgcca  aagagaagcg  aaagtgggcc  tgggcggcct  cagtttcggc  agaggtaaac
aacacgaact  gaactgcctt  agctccgaag  ggcaattcca  caggcactcc  gcggggcccg
gccaaggccc  aaaaggcgtg  gaatatgcgc  gttttggggc  cataacaccc  agtaccacgg
ccggaacggg  ccatataata  agtttttcac  tctcaagaat  ggtaaacgta  aataggaaca
tcccactacc  ctagaaattg  cggaaatttc  gcgcttatca  ttagaaaatc  tggaaccgtc
ctttttcctc  tttcttgcat  ttccctttcc  gtattattgc  cattctttaa  ctgcatttgg
ggaaccgtag  accaaaagcc  aaacagagaa  atgtaacgtt  ctaaaaaaaa  aacaacgaaa
aaattgaaaa  ataagataca  ataatcgtat  ataaatcagg  cttcttgttc  atcattttca
attctcttct  tgccatccct  tttcctatct  ttgttctttt  cttctcataa  tcaagaataa
ataacttcat  cacattcgct  acacactaac  aagaaaaaaa
配列番号３：（ＥＮＯ１遺伝子：Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ（サッカロマイセス・セレビシエ）由来）
tagaaagcat  actatactat  tcgacacttc  ctttcaatcc  tggaattaac  agtcactttt
aaaaaagaca  tctaccgtga  aggtgccgta  gagtatcgcg  ttaccatatc  gccaaaaact
gatatacgcc  gcggaaacca  ggcaaacaat  tgaaaagaaa  aattttgagg  aactctctgc
atcgaagccg  tctagagtta  ccactagtca  gatgccgcgg  gcacttgagc  acctcatgca
cagcaataac  acaacacaat  ggttagtagc  aacctgaatt  cggtcattga  tgcatgcatg
tgccgtgaag  cgggacaacc  agaaaagtcg  tctataaatg  ccggcacgtg  cgatcatcgt
ggcggggttt  taagagtgca  tatcacaaat  tgtcgcatta  ccgcggaacc  gccagatatt
cattacttga  cgcaaaagcg  tttgaaataa  tgacgaaaaa  gaaggaagaa  aaaaaaagaa
aaataccgct  tctaggcggg  ttatctactg  atccgagctt  ccactaggat  agcacccaaa
cacctgcata  tttggacgac  ctttacttac  accaccaaaa  accactttcg  cctctcccgc
ccctgataac  gtccactaat  tgagcgatta  cctgagcggt  cctcttttgt  ttgcagcatg
agacttgcat  actgcaaatc  gtaagtagca  acgtctcaag  gtcaaaactg  tatggaaacc
ttgtcacctc  acttaattct  agctagccta  ccctgcaagt  caagaggtct  ccgtgattcc
tagccacctc  aaggtatgcc  tctccccgga  aactgtggcc  ttttctggca  cacatgatct
ccacgatttc  aacatataaa  tagcttttga  taatggcaat  attaatcaaa  tttattttac
ttctttcttg  taacatctct  cttgtaatcc  cttattcctt  ctagctattt  ttcataaaaa
accaagcaac  tgcttatcaa  cacacaaaca  ctaaatcaaa【００４７】
本発明は、上述したいずれかのプロモーターを含む乳酸脱水素酵素発現カセットである。【００４８】
また、本発明は、以下の（ａ）群から選ばれるプロモーターおよび（ｂ）群から選ばれる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子を含む乳酸脱水素酵素発現カセットである。
（ａ）
（１）上記配列番号１〜３いずれかに示す塩基配列からなるプロモーター
（２）上記配列番号１〜３いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなるプロモーター
（３）上記配列番号１〜３いずれかに記載の塩基配列において、１あるいは複数個の塩基が欠失、置換および／または付加された塩基配列からなるプロモーター
（ｂ）
（１）下記配列番号４〜６いずれかに示す塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
（２）下記配列番号４〜６いずれかに示す塩基配列もしくはその一部を含む塩基配列とストリンジェントな条件でハイブリダイズする塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
（３）下記配列番号４〜６いずれかに記載の塩基配列において、１あるいは複数個の塩基が欠失、置換および／または付加された塩基配列からなる乳酸脱水素酵素をコードする遺伝子
【００４９】
配列番号４：ゼノプス・レービス（Ｘｅｎｏｐｕｓ  ｌａｅｖｉｓ）由来
atggcaactg  tgaaggataa  actcatccac  aatgtggtca  aggaggagtc  gctcccccag
aacaaggtca  ccattgtggg  tgtgggggcc  gtgggcatgg  cctgtgccat  cagtgtcctg
cagaaggatt  tggcagatga  gcttgcactt  gttgatgtga  tagaagacaa  actgaagggg
gaaatgatgg  atctccagca  tggcagtctg  ttccttcgta  cccccaagat  tgtctcaggg
aaagattaca  gcgtcactgc  aaactccaag  ctggtagttg  tgacggccgg  ggcccgtcag
caggagggag  agagtcgcct  gaatctggtt  cagcgcaatg  tcaacatctt  caaattcatc
attcccaaca  ttgtcaagta  cagccccaac  tgcaccctgc  tcatcgtctc  caacccagtg
gacattctga  catatgtggc  ctggaagatc  agtggattcc  ccaaaaaccg  tgtcattggc
agcggctgca  atttggactc  tgcccgtttc  cgttacctca  tggggcagaa  gtttgggatc
cacacccaga  gctgccacgg  ttgggtcatt  ggggaacacg  gagactcgag  tgtgccagtg
tggagtgggg  tgaatgtggc  tggcgtgtcc  ctgaaaaccc  tgcaccccga  tattgggagt
gacgcagaca  aggagaactg  gaaggaggtg  cacaagcagg  ttgtggacag  cgcctatgaa
gtgatcaagc  tgaagggcta  cacctcctgg  gctattggcc  tgtccgtagc  tgacctgtct
gagagtatcc  tgaagaacct  ccgccgagtc  catcccattt  ccacaatggt  caagggcatg
tacggcgtga  ataatgatgt  tttcctcagt  gtcccctgtg  tgttgggcaa  cttgggcatc
acagacgtgg  ttaacatgac  gctgaaggca  gatgaagagg  atcgcttacg  caagagcgca
gacaccctgt  gggccatcca  gaaggagctg  cagttctag
配列番号５：ホモ・サピエンス（Ｈｏｍｏ  ｓａｐｉｅｎｓ）由来
atggcaactc  taaaggatca  gctgatttat  aatcttctaa  aggaagaaca  gaccccccag
aataagatta  cagttgttgg  ggttggtgct  gttggcatgg  cctgtgccat  cagtatctta
atgaaggact  tggcagatga  acttgctctt  gttgatgtca  tcgaagacaa  attgaaggga
gagatgatgg  atctccaaca  tggcagcctt  ttccttagaa  caccaaagat  tgtctctggc
aaagactata  atgtaactgc  aaactccaag  ctggtcatta  tcacggctgg  ggcacgtcag
caagagggag  aaagccgtct  taatttggtc  cagcgtaacg  tgaacatatt  taaattcatc
attcctaatg  ttgtaaaata  cagcccgaac  tgcaagttgc  ttattgtttc  aaatccagtg
gatatcttga  cctacgtggc  ttggaagata  agtggttttc  ccaaaaaccg  tgttattgga
agtggttgca  atctggattc  agcccgattc  cgttacctga  tgggggaaag  gctgggagtt
cacccattaa  gctgtcatgg  gtgggtcctt  ggggaacatg  gagattccag  tgtgcctgta
tggagtggaa  tgaatgttgc  tggtgtctct  ctgaagactc  tgcacccaga  tttagggact
gataaagata  aggaacagtg  gaaagaggtt  cacaagcagg  tggttgagag  tgcttatgag
gtgatcaaac  tcaaaggcta  cacatcctgg  gctattggac  tctctgtagc  agatttggca
gagagtataa  tgaagaatct  taggcgggtg  cacccagttt  ccaccatgat  taagggtctt
tacggaataa  aggatgatgt  cttccttagt  gttccttgca  ttttgggaca  gaatggaatc
tcagaccttg  tgaaggtgac  tctgacttct  gaggaagagg  cccgtttgaa  gaagagtgca
gatacacttt  gggggatcca  aaaggagctg  caattttaa
配列番号６：ロイコノストック・メセンテロイデス（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ  ｍｅｓｅｎｔｅｒｏｉｄｅｓ）由来
atgaagattt  ttgcttacgg  cattcgtgat  gatgaaaagc  catcacttga  agaatggaaa
gcggctaacc  cagagattga  agtggactac  acacaagaat  tattgacacc  tgaaacagct
aagttggctg  agggatcaga  ttcagctgtt  gtttatcaac  aattggacta  tacacgtgaa
acattgacag  ctttagctaa  cgttggtgtt  actaacttgt  cattgcgtaa  cgttggtaca
gataacattg  attttgatgc  agcacgtgaa  tttaacttta  acatttcaaa  tgttcctgtt
tattcaccaa  atgctattgc  agaacactca  atgcttcaat  tatctcgttt  gctacgtcgc
acgaaagcat  tggatgccaa  aattgctaag  cgagacttgc  gttgggcacc  aacaactgga
cgtgaaatgc  gtatgcaaac  agttggtgtt  attggtacag  gtcatattgg  ccgtgttgct
attaacattt  tgaaaggctt  tggggccaag  gttattgctt  atgacaagta  cccaaatgct
gaattacaag  cagaaggttt  gtacgttgac  acattagacg  aattatatgc  acaagctgat
gcaatttcat  tgtatgttcc  tggtgtacct  gaaaaccatc  atctaatcaa  tgcagatgct
attgctaaga  tgaaggatgg  tgtggttatc  atgaacgctg  cgcgtggtaa  tttgatggac
attgacgcta  ttattgatgg  tttgaattct  ggtaagattt  cagacttcgg  tatggacgtt
tatgaaaatg  aagttgcttg  ttcaatgaag  attggtctgg  taaagaattc  cccagatgct
aagattgctg  acttgattgc  acgcgaaaat  gttatgatca  ccccacacac  ggctttctat
acaactaaag  ctgttctaga  aatggttcac  caatcatttg  atgcagcagt  tgctttcgcc
aagggtgaga  agccagctat  tgctgttgaa  tattaa【００５０】
［形質転換酵母］
本発明は、上記乳酸脱水素酵素発現カセットを染色体中に少なくとも一つ含む形質転換酵母である。本発明における形質転換酵母は、乳酸脱水素酵素発現カセットからのＬＤＨの発現が起こりうる染色体中の任意の位置に該乳酸脱水素酵素発現カセットを導入することができる。好ましくは、ＳＥＤ１遺伝子、ＣＷＰ２遺伝子又はＥＮＯ１遺伝子から選ばれる遺伝子の少なくとも一つが上記乳酸脱水素酵素発現カセットにより置換されている酵母である。【００５１】
本発明で使用する酵母は、乳酸脱水素酵素発現カセットを導入しうる酵母であれば好適に用いることが出来る。一例としては、サッカロミセス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）属、シゾサッカロミセス（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）属、ジゴサッカロミセス（Ｚｙｇｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）属、クリベロミセス（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ）属又はカンジダ（Ｃａｎｄｉｄａ）属に属する酵母が挙げられる。好ましくは、サッカロミセス属に属する酵母である。より好ましくは、サッカロミセス・セレビセ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）である。【００５２】
［乳酸の製造方法］
本発明は、上記形質転換酵母を培養することを含む乳酸の製造方法である。培養には、バッチ培養、流加培養（フェドバッチ培養）、ケモスタット培養または連続培養のいずれも採用することができる。好ましくは連続培養である。より好ましくは、培養液を分離膜で濾過し、濾液から乳酸を回収し、さらに未濾過液を培養液に保持または還流し、かつ、培地を培養液に追加する連続培養である。【００５３】
本発明で使用される酵母の発酵原料としては、発酵培養する酵母の生育を促し、目的とする発酵生産物である乳酸を良好に生産させ得るものであれば良い。発酵原料としては、例えば、炭素源、窒素源、無機塩類、および必要に応じてアミノ酸、およびビタミンなどの有機微量栄養素を適宜含有する液体培地が好ましく用いられる。【００５４】
上記の炭素源としては、例えば、グルコース、シュークロース、フラクトース、ガラクトース、ラクトース等の糖類、これら糖類を含有する澱粉糖化液、甘藷糖蜜、甜菜糖蜜、ハイテストモラセス、サトウキビ搾汁、更には酢酸、フマル酸等の有機酸、エタノールなどのアルコール類およびグリセリン等が使用される。ここで糖類とは、多価アルコールの最初の酸化生成物であり、アルデヒド基またはケトン基をひとつ持ち、アルデヒド基を持つ糖をアルドース、ケトン基を持つ糖をケトースと分類される炭水化物のことを指す。【００５５】
また、上記の窒素源としては、例えば、アンモニアガス、アンモニア水、アンモニウム塩類、尿素、硝酸塩類、その他補助的に使用される有機窒素源、例えば、油粕類、大豆加水分解液、カゼイン分解物、その他のアミノ酸、ビタミン類、コーンスティープリカー、酵母または酵母エキス、肉エキス、ペプトン等のペプチド類、各種発酵菌体およびその加水分解物などが使用される。【００５６】
また、上記の無機塩類としては、例えば、リン酸塩、マグネシウム塩、カルシウム塩、鉄塩、およびマンガン塩等を適宜添加使用することができる。【００５７】
本発明で使用される酵母が生育のために特定の栄養素を必要とする場合には、その栄養物を標品もしくはそれを含有する天然物として添加することができる。また、消泡剤も必要に応じて添加使用することができる。【００５８】
本発明において、発酵培養液とは、発酵原料に酵母が増殖した結果得られる液のことをいう。追加する発酵原料の組成は、培養開始時の発酵原料組成から適宜変更しても良い。発酵原料組成から追加する発酵原料の組成に変更する場合、目的とする乳酸の生産性が高くなるような変更が好ましい。例えば、上記の炭素源に対する窒素源、無機塩類、アミノ酸およびビタミンなどの有機微量栄養素の重量比率を低下させることにより、乳酸の生産コストの低減、すなわち広義で乳酸の生産性の向上が実現できる場合もある。一方、上記炭素源に対する窒素源、無機塩類、アミノ酸およびビタミンなどの有機微量栄養素の重量比率を増加させることにより、乳酸の生産性を向上させることができる場合もある。【００５９】
本発明では、発酵培養液中の糖類など発酵原料の濃度は、５ｇ／Ｌ以下に保持されるようにすることが好ましい。より好ましくは３ｇ／Ｌ以下、さらに好ましくは１ｇ／Ｌ以下である。その理由は、発酵培養液の引き抜きによる発酵原料の流失を最小限にするためである。そのため発酵培養液中の発酵原料の濃度は、可能な限り小さいことが望ましい。【００６０】
酵母の発酵培養は、通常、ｐＨが３−８で温度が２０−４０℃の範囲で行われることが多い。発酵培養液のｐＨは、生産物質である乳酸が酸性物質であることから、アルカリ性物質、さらには尿素、炭酸カルシウムおよびアンモニアガスなどによって、上記範囲内のあらかじめ定められた値に調節される。【００６１】
酵母の発酵培養において、酸素の供給速度を上げる必要があれば、空気に酸素を加えて酸素濃度を２１％以上に保つ、発酵培養液を加圧する、攪拌速度を上げる、あるいは通気量を上げるなどの手段を用いて、酸素の供給速度を上げることができる。逆に、酸素の供給速度を下げる必要がある場合は、炭酸ガス、窒素およびアルゴンなど酸素を含まないガスを空気に混合して供給することも可能である。【００６２】
本発明においては、培養初期にバッチ培養またはフェドバッチ培養を行って酵母濃度を高くした後に連続培養（引き抜き）を開始しても良いし、高濃度の酵母菌体をシードし、培養開始とともに連続培養を行っても良い。適当な時期から、発酵原料液の供給および培養物の引き抜きを行うことが可能である。発酵原料液供給と培養物の引き抜きの開始時期は、必ずしも同じである必要はない。また、発酵原料液の供給と培養物の引き抜きは連続的であってもよいし、間欠的であってもよい。発酵原料液には、上記に示したような菌体増殖に必要な栄養素を添加し、菌体増殖が連続的に行われるようにすればよい。【００６３】
発酵培養液中の酵母の濃度は、効率よい生産性を得る上で、発酵培養液の環境が酵母の増殖にとって不適切となって死滅する比率が高くならない範囲で、高い状態で維持することが好ましい。一例として、酵母濃度を乾燥重量として５ｇ／Ｌ以上に維持することにより、より良好な生産効率が得られる。また、連続発酵装置の運転上の不具合や生産効率の低下を招かなければ、酵母の濃度の上限値は特に限定されない。【００６４】
発酵生産能力のあるフレッシュな菌体を増殖させつつ行う連続培養操作は、培養管理上、通常、単一の発酵反応槽で行うことが好ましい。しかしながら、菌体を増殖しつつ乳酸を生成する連続培養法であれば、発酵反応槽の数は問わない。発酵反応槽の容量が小さい等の理由から、複数の発酵反応槽を用いることもあり得る。この場合、複数の発酵反応槽を配管で並列または直列に接続して連続培養を行っても、発酵生産物の高生産性は得られる。【００６５】
本発明の乳酸の製造方法により製造された培養液に含まれる乳酸の分離・精製は、従来知られているイオン交換、濃縮、蒸留および晶析などの方法を組み合わせて行うこともできる。【００６６】
本発明の乳酸の製造方法で用いられる発酵装置の１つの例は、主に、本発明の形質転換酵母を保持し乳酸を製造するための発酵反応槽、および形質転換酵母と培養液を濾過分離するための多孔性膜を含む分離膜エレメントから構成される。分離膜エレメントは、発酵反応槽の内部または外部のいずれに設置されてもよい。【００６７】
本発明における培養液を分離膜で濾過し、濾液から乳酸を回収し、さらに未濾過液を培養液に保持または還流し、かつ、培地を培養液に追加する連続培養による乳酸の製造方法には、分離膜として平均細孔径が０.０１μｍ以上１μｍ未満の多孔性膜を使用し、濾過圧力である膜間差圧が０.１から２０ｋＰａの範囲で濾過処理することが好ましい。そのため、特別に発酵反応槽内を加圧状態に保つ必要がないことから、濾過分離装置と発酵反応槽間で発酵培養液を循環させる動力手段が不要となり、分離膜エレメントを発酵反応槽内部に設置して発酵培養装置をコンパクト化することもできる。【００６８】
本発明で分離膜として好適に用いられる多孔性膜の構成について説明する。本発明における多孔性膜は、被処理水の水質や用途に応じた分離性能と透水性能を有するものであり、阻止性能および透水性能や耐汚れ性という分離性能の点からは、多孔質樹脂層を含む多孔性膜であることが好ましい。このような多孔性膜は、多孔質基材の表面に、分離機能層として作用とする多孔質樹脂層を有している。多孔質基材は、多孔質樹脂層を支持して分離膜に強度を与えるものである。【００６９】
多孔質基材の材質は、有機材料および無機材料等で特に限定されないが、有機繊維が望ましく用いられる。好ましい多孔質基材は、セルロース繊維、セルローストリアセテート繊維、ポリエステル繊維、ポリプロピレン繊維およびポリエチレン繊維などの有機繊維を用いてなる織布や不織布であり、中でも、密度の制御が比較的容易であり製造も容易で安価な不織布が好ましく用いられる。【００７０】
また、多孔質樹脂層は、上述したように分離機能層として作用するものであり、有機高分子膜を好適に使用することができる。有機高分子膜の材質としては、例えば、ポリエチレン系樹脂、ポリプロピレン系樹脂、ポリ塩化ビニル系樹脂、ポリフッ化ビニリデン系樹脂、ポリスルホン系樹脂、ポリエーテルスルホン系樹脂、ポリアクリロニトリル系樹脂、セルロース系樹脂およびセルローストリアセテート系樹脂などが挙げられる。有機高分子膜は、これらの樹脂を主成分とする樹脂の混合物であってもよい。ここで主成分とは、その成分が５０重量％以上、好ましくは６０重量％以上含有することをいう。中でも、多孔質樹脂層を構成する素材としては、溶液による製膜が容易で物理的耐久性や耐薬品性にも優れているポリ塩化ビニル系樹脂、ポリフッ化ビニリデン系樹脂、ポリスルホン系樹脂、ポリエーテルスルホン系樹脂およびポリアクリロニトリル系樹脂が好ましく、ポリフッ化ビニリデン系樹脂またはそれを主成分とする樹脂が最も好ましく用いられる。【００７１】
ここで、ポリフッ化ビニリデン系樹脂としては、フッ化ビニリデンの単独重合体が好ましく用いられるが、その他、フッ化ビニリデンと共重合可能なビニル系単量体との共重合体も好ましく用いられる。フッ化ビニリデンと共重合可能なビニル系単量体としては、テトラフルオロエチレン、ヘキサフルオロプロピレンおよび三塩化フッ化エチレンなどが例示される。【００７２】
本発明で用いられる分離膜は、平膜であっても中空糸膜であっても良い。平膜の場合、その平均厚みは用途に応じて選択されるが、好ましくは２０μｍ以上５０００μｍ以下であり、より好ましくは５０μｍ以上２０００μｍ以下の範囲で選択される。【００７３】
上述のように、本発明で用いられる分離膜は、多孔質基材と多孔質樹脂層とから形成されている多孔性膜であることが望ましい。その際、多孔質基材に多孔質樹脂層が浸透していても、多孔質基材に多孔質樹脂層が浸透していなくてもどちらでも良く、用途に応じて選択される。多孔質基材の平均厚みは、好ましくは５０μｍ以上３０００μｍ以下の範囲で選択される。また、多孔性膜が中空糸膜の場合、中空糸の内径は好ましくは２００μｍ以上５０００μｍ以下の範囲で選択され、膜厚は好ましくは２０μｍ以上２０００μｍ以下の範囲で選択される。また、有機繊維または無機繊維を筒状にした織物や編物を中空糸の内部に含んでいても良い。【００７４】
まず、多孔性膜のうち平膜の作製法の概要について説明する。
多孔質基材の表面に、前記の樹脂と溶媒とを含む原液の被膜を形成すると共に、その原液を多孔質基材に含浸させる。その後、被膜を有する多孔質基材の被膜側表面のみを、非溶媒を含む凝固浴と接触させて樹脂を凝固させると共に多孔質基材の表面に多孔質樹脂層を形成する。原液は、樹脂を溶媒に溶解させて調整する。原液に、さらに非溶媒を含ませることもできる。原液の温度は、製膜性の観点から、通常、１５〜１２０℃の範囲内で選定することが好ましい。【００７５】
ここで、原液には、開孔剤を添加することもできる。開孔剤は、凝固浴に浸漬された際に抽出されて、樹脂層を多孔質にする作用を持つものである。開孔剤を添加することにより、平均細孔径の大きさの制御することができる。開孔剤は、凝固浴に浸漬された際に抽出されて、樹脂層を多孔質にする作用を持つものである。開孔剤は、凝固浴への溶解性の高いものであることが好ましい。開孔剤としては、例えば、塩化カルシウムや炭酸カルシウムなどの無機塩を用いることができる。また、開孔剤として、ポリエチレングリコールやポリプロピレングリコールなどのポリオキシアルキレン類や、ポリビニルアルコール、ポリビニルブチラールおよびポリアクリル酸などの水溶性高分子化合物や、グリセリンを用いることができる。【００７６】
また、溶媒は、樹脂を溶解するものである。溶媒は、樹脂および開孔剤に作用してそれらが多孔質樹脂層を形成するのを促す。このような溶媒としては、Ｎ−メチルピロリジノン（ＮＭＰ）、Ｎ，Ｎ−ジメチルアセトアミド（ＤＭＡｃ）、Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、Ｎ−メチル−２−ピロリドン、メチルエチルケトン、テトラヒドロフラン、テトラメチル尿素、リン酸トリメチル、シクロヘキサノン、イソホロン、γ−ブチロラクトン、メチルイソアミルケトン、フタル酸ジメチル、プロピレングリコールメチルエーテール、プロピレンカーボネート、ジアセトンアルコール、グリセロールトリアセテート、アセトンおよびメチルエチルケトンなどを用いることができる。中でも、樹脂の溶解性の高いＮＭＰ、ＤＭＡｃ、ＤＭＦおよびＤＭＳＯを好ましく用いられる。これらの溶媒は、単独で用いても良いし２種類以上を混合して用いても良い。原液は、先述の樹脂を好ましくは５重量％以上６０重量％以下の濃度で、上述の溶媒に溶解させることにより調整することができる。【００７７】
また、例えば、ポリエチレングリコール、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドンおよびグリセリンなどの溶媒以外の成分を溶媒に添加しても良い。非溶媒は、樹脂を溶解しない液体である。非溶媒は、樹脂の凝固の速度を制御して細孔の大きさを制御するように作用する。非溶媒としては、水やメタノールおよびエタノールなどのアルコール類を用いることができる。中でも、価格の点から水やメタノールが好ましい。非溶媒は、これらの混合物であってもよい。【００７８】
次に、多孔性膜のうち、中空糸膜の作製法の概要について説明する。
中空糸膜は、樹脂と溶媒からなる原液を二重管式口金の外側の管から吐出すると共に、中空部形成用流体を二重管式口金の内側の管から吐出して、冷却浴中で冷却固化して作製することができる。【００７９】
原液は、上述の平膜の作成法で述べた樹脂を好ましくは２０重量％以上６０重量％以下の濃度で、上述の平膜の生成法で述べた溶媒に溶解させることにより調整することができる。また、中空部形成用流体には、通常気体もしくは液体を用いることができる。また、得られた中空糸膜の外表面に、新たな多孔性樹脂層をコーティング（積層）することもできる。積層は中空糸膜の性質、例えば、親水性・疎水性あるいは細孔径等を所望の性質に変化させるために行うことができる。積層される新たな多孔性樹脂層は、樹脂を溶媒に溶解させた原液を、非溶媒を含む凝固浴と接触させて樹脂を凝固させることによって作製することができる。その樹脂の材質は、例えば、上述有機高分子膜の材質と同様のものが好ましく用いられる。また、積層方法としては、原液に中空糸膜を浸漬してもよいし、中空糸膜の表面に原液を塗布してもよく、積層後、付着した原液の一部を掻き取ったり、エアナイフを用いて吹き飛ばしすることにより積層量を調整することもできる。【００８０】
本発明で用いられる分離膜は、支持体と組み合わせることによって分離膜エレメントとすることができる。支持体として支持板を用い、その支持板の少なくとも片面に、本発明で用いられる分離膜を配した分離膜エレメントは、本発明で用いられる分離膜を有する分離膜エレメントの好適な形態の一つである。この形態で、膜面積を大きくすることが困難な場合には、透水量を大きくするために、支持板の両面に分離膜を配することが好ましい。【００８１】
分離膜としての多孔性膜の平均細孔径が上記のように０．０１μｍ以上１μｍ未満の範囲内にあると、菌体や汚泥などがリークすることのない高い排除率と、高い透水性を両立させることができ、さらに目詰まりをしにくく、透水性を長時間保持することが、より高い精度と再現性を持って実施することができる。細菌類を用いた場合、多孔性膜の平均細孔径は好ましくは０.４μｍ以下であり、平均細孔径は０.２μｍ未満であればなお好適に実施することが可能である。平均細孔径は、小さすぎると透水量が低下することがあるので、本発明では、平均細孔径は０.０１μｍ以上であり、好ましくは０．０２μｍ以上であり、さらに好ましくは０．０４μｍ以上である。【００８２】
ここで、平均細孔径は、倍率１０，０００倍の走査型電子顕微鏡観察における、９．２μｍ×１０．４μｍの範囲内で観察できる細孔すべての直径を測定し、平均することにより求めることができる。【００８３】
上記の平均細孔径の標準偏差σは、０．１μｍ以下であることが好ましい。更に、平均細孔径の標準偏差が小さい、すなわち細孔径の大きさが揃っている方が均一な透過液を得ることができる。発酵運転管理が容易になることから、平均細孔径の標準偏差は小さければ小さい方が望ましい。【００８４】
平均細孔径の標準偏差σは、上述の９．２μｍ×１０．４μｍの範囲内で観察できる細孔数をＮとして、測定した各々の直径をＸｋとし、細孔直径の平均をＸ（ａｖｅ）とした下記の（式１）により算出される。
【数１】
0005532919.tif 000002
【００８５】
本発明で用いられる分離膜においては、発酵培養液の透過性が重要点の一つであり、透過性の指標として、使用前の分離膜の純水透過係数を用いることができる。本発明において、分離膜の純水透過係数は、逆浸透膜による２５℃の温度の精製水を用い、ヘッド高さ１ｍで透水量を測定し算出したとき、２×１０−９ｍ３／（ｍ２・ｓ・Ｐａ）以上であることが好ましい。純水透過係数が２×１０−９ｍ３／（ｍ２・ｓ・Ｐａ）以上６×１０−７ｍ３／（ｍ２・ｓ・Ｐａ）以下であれば、実用的に十分な透過水量が得られる。より好ましい純水透過係数は、２×１０−９ｍ３／（ｍ２・ｓ・Ｐａ）以上１×１０−７ｍ３／（ｍ２・ｓ・Ｐａ）以下である。【００８６】
本発明で用いられる分離膜の膜表面粗さは、分離膜の目詰まりに影響を与える因子である。膜表面粗さが好ましくは０.１μｍ以下のときに、分離膜の剥離係数や膜抵抗を好適に低下させることができ、より低い膜間差圧で連続発酵が実施可能である。従って、目詰まりを抑えることにより、安定した連続発酵が可能になることから、表面粗さは小さければ小さいほど好ましい。【００８７】
また、分離膜の膜表面粗さを低くすることにより、微生物の濾過において、膜表面で発生する剪断力を低下させることが期待でき、微生物の破壊が抑制され、分離膜の目詰まりも抑制されることにより、長期間安定な濾過が可能になると考えられる。【００８８】
ここで、膜表面粗さは、下記の原子間力顕微鏡装置（ＡＦＭ）を使用して、下記の装置と条件で測定することができる。また、使用する原子間力顕微鏡装置（ＡＦＭ）は、以下のものと同等以上であればよい。
・装置：原子間力顕微鏡装置（Digital  Instruments（株）製Nanoscope  IIIa）
・条件：探針        ＳｉＮカンチレバー（Digital  Instruments（株）製）
：走査モード  コンタクトモード（気中測定）
水中タッピングモード（水中測定）
：走査範囲    １０μｍ、２５μｍ  四方（気中測定）
５μｍ、１０μｍ  四方（水中測定）
：走査解像度  ５１２×５１２
・試料調製：測定に際し膜サンプルは、常温でエタノールに１５分浸漬後、ＲＯ水中に２４時間浸漬し洗浄した後、風乾し用いた。ＲＯ水とは、濾過膜の一種である逆浸透膜（ＲＯ膜）を用いて濾過し、イオンや塩類などの不純物を排除した水を指す。ＲＯ膜の孔の大きさは、概ね２ｎｍ以下である。
膜表面粗さｄｒｏｕｇｈは、上記のＡＦＭにより各ポイントのＺ軸方向の高さから、下記の（式２）により算出する。
【数２】
0005532919.tif 000003
【００８９】
本発明において、微生物を分離膜で濾過処理する際の膜間差圧は、微生物および培地成分が容易に目詰まりしない条件であればよいが、膜間差圧を０.１ｋＰａ以上２０ｋＰａ以下の範囲にして濾過処理することが重要である。膜間差圧は、好ましくは０.１ｋＰａ以上１０ｋＰａ以下の範囲であり、さらに好ましくは０.１ｋＰａ以上５ｋＰａの範囲である。上記の膜間差圧の範囲を外れた場合、微生物および培地成分の目詰まりが急速に発生し、透過水量の低下を招き、連続発酵運転に不具合を生じることがある。【００９０】
濾過の駆動力としては、発酵培養液と分離膜処理水の液位差（水頭差）を利用したサイホンにより分離膜に膜間差圧を発生させることが可能である。また、濾過の駆動力として分離膜処理水側に吸引ポンプを設置してもよいし、分離膜の発酵培養液側に加圧ポンプを設置することも可能である。膜間差圧は、発酵培養液と分離膜処理水の液位差を変化させることにより制御することができる。また、膜間差圧を発生させるためにポンプを使用する場合には、吸引圧力により膜間差圧を制御することができ、更に発酵培養液側の圧力を導入する気体または液体の圧力によっても膜間差圧を制御することができる。これら圧力制御を行う場合には、発酵培養液側の圧力と分離膜処理水側の圧力差をもって膜間差圧とし、膜間差圧の制御に用いることができる。【００９１】
また、本発明において使用される分離膜は、濾過処理する膜間差圧として、０．１ｋＰａ以上２０ｋＰａ以下の範囲で濾過処理することができる性能を有するものであることが好ましい。また、本発明で使用される分離膜は、上述のように、使用前の純水透過係数が、逆浸透膜による２５℃の温度の精製水を用い、ヘッド高さ１ｍで透水量を測定し算出したとき、２×１０−９ｍ３／（ｍ２・ｓ・Ｐａ）以上の範囲であることが好ましく、さらに２×１０−９ｍ３／（ｍ２・ｓ・Ｐａ）以上６×１０−７ｍ３／（ｍ２・ｓ・Ｐａ）以下の範囲にあることが好ましい。【００９２】
本発明の乳酸の製造方法で用いられる連続発酵装置のうち、分離膜エレメントが発酵反応槽の内部に設置された代表的な一例を図１に示す。図１は、本発明で用いられる膜分離型の連続発酵装置の一つの実施の形態を説明するための概略側面図である。図１において、膜分離型の連続発酵装置は、酵母を発酵培養させる発酵反応槽１と、その発酵反応槽１の中の発酵培養液の量を制御するための水頭差制御装置３で基本的に構成されている。発酵反応槽１内には分離膜エレメント２が配設されており、その分離膜エレメント２には多孔性膜が組み込まれている。この多孔性膜としては、例えば、国際公開第２００２／０６４２４０号パンフレットに開示されている分離膜および分離膜エレメントを使用することが好適である。【００９３】
次に、図１の膜分離型の連続発酵装置による連続発酵の形態について説明する。培地供給ポンプ７によって、培地を発酵反応槽１に連続的もしくは断続的に投入する。培地については、発酵反応槽１内に投入する前に、必要に応じて加熱殺菌、加熱滅菌あるいはフィルターを用いた滅菌処理を行うことができる。発酵生産時には、必要に応じて、発酵反応槽１内の攪拌機５で発酵反応槽１内の発酵液を攪拌することができる。また必要に応じて、気体供給装置４によって必要とする気体を発酵反応槽１内に供給することができる。このとき、供給した気体を回収リサイクルして再び気体供給装置４に供給することができる。また必要に応じて、ｐＨセンサ・制御装置９およびｐＨ調整溶液供給ポンプ８によって発酵反応槽１内の発酵液のｐＨを調整することができる。また必要に応じて、温度調節器１０によって発酵反応槽１内の発酵培養液の温度を調節することにより生産性の高い発酵生産を行うことができる。【００９４】
ここでは、計装・制御装置による発酵培養液の物理化学的条件の調節に、ｐＨおよび温度の調節を例示したが、必要に応じて、溶存酸素やＯＲＰ（Ｏｘｉｄａｔｉｏｎ−ｒｅｄｕｃｔｉｏｎ  Ｐｏｔｅｎｔｉａｌ：酸化還元電位）の制御を行うことができ、更にはオンラインケミカルセンサーなどの分析装置により発酵培養液中の乳酸の濃度を測定し、それを指標とした物理化学的条件の制御を行うことができる。また、培地の連続的もしくは断続的投入の形態に関しては、特に限定されるものではないが、上記の計装装置による発酵培養液の物理化学的環境の測定値を指標として、培地投入量および速度を適宜調節することができる。【００９５】
発酵培養液は、発酵反応槽１内に設置された分離膜エレメント２によって、酵母と発酵生産物に濾過・分離され装置系から取り出される。また、濾過・分離された酵母は装置系内に留まることにより装置系内の酵母濃度を高く維持することができ、生産性の高い発酵生産を可能としている。ここで、分離膜エレメント２による濾過・分離は発酵反応槽１の水面との水頭差圧によって行い、特別な動力を必要としない。また、必要に応じて、レベルセンサ６および水頭差圧制御装置３によって、分離膜エレメント２の濾過・分離速度および発酵反応槽１内の発酵液量を適当に調節することができる。上記の分離膜エレメント２による濾過・分離は水頭差圧によって行うことを例示したが、必要に応じて、ポンプや、液体や気体等による吸引濾過あるいは装置系内を加圧することにより、濾過・分離することもできる。【００９６】
次に、本発明の乳酸の製造方法で用いられる発酵装置のうち、分離膜エレメントが、発酵反応槽の外部に設置された代表的な一例を図２の概要図に示す。図２は、本発明で用いることができる他の膜分離型の連続発酵装置の一つの実施の形態を説明するための概略側面図である。【００９７】
図２において、膜分離型の連続発酵装置は、酵母を培養発酵させるための発酵反応槽１と、その発酵反応槽１に発酵培養液循環ポンプ１１を介して接続され内部に分離膜エレメント２を備えた膜分離槽１２と、発酵反応槽１内の発酵培養液の量を制御するための水頭差制御装置３で基本的に構成されている。ここで、分離膜エレメント２には、多孔性膜が組み込まれている。この多孔性膜としては、例えば、国際公開第２００２／０６４２４０号パンフレットに開示されている分離膜、および分離膜エレメントを使用することが好適である。【００９８】
図２において、培地供給ポンプ７によって培地を発酵反応槽１に投入し、必要に応じて、攪拌機５で発酵反応槽１内の発酵培養液を攪拌することができる。また必要に応じて、気体供給装置４によって必要とする気体を供給することができる。このとき、供給した気体を回収リサイクルして再び気体供給装置４で供給することができる。また、必要に応じて、ｐＨセンサ・制御装置９およびよびｐＨ調整溶液供給ポンプ８によって発酵培養液のｐＨを調整することができる。また必要に応じて、温度調節器１０によって発酵培養液の温度を調節することにより、生産性の高い発酵生産を行うことができる。さらに、装置内の発酵培養液は、発酵培養液循環ポンプ１１によって発酵反応槽１と膜分離槽１２の間を循環する。発酵生産物を含む発酵培養液は、分離膜エレメント２によって酵母と発酵生産物に濾過・分離され、発酵生産物である乳酸を装置系から取り出すことができる。【００９９】
また、濾過・分離された酵母は、装置系内に留まることにより装置系内の酵母濃度を高く維持することができ、生産性の高い発酵生産を可能としている。ここで、分離膜エレメント２による濾過・分離は膜分離槽１２の水面との水頭差圧によって行うことができ、特別な動力を必要としない。また、必要に応じて、レベルセンサ６および水頭差圧制御装置３によって、分離膜エレメント２の濾過・分離速度および装置系内の発酵培養液量を適当に調節することができる。また、必要に応じて、気体供給装置４によって必要とする気体を膜分離槽１２内に供給することができる。【０１００】
上記のように、分離膜エレメント２による濾過・分離は水頭差圧によって行うことができるが、必要に応じて、ポンプや、液体や気体等による吸引濾過あるいは装置系内を加圧することにより濾過・分離することもできる。このような手段により、膜間差圧を調整制御することができる。【０１０１】
次に、本発明で用いられる分離膜エレメントの好適な形態の例である国際公開第２００２／０６４２４０号パンフレットに開示されている分離膜および分離膜エレメントを、以下に図面を用いてその概略を説明する。図３は、本発明で用いられる分離膜エレメントの一つの実施の形態を説明するための概略斜視図である。【０１０２】
分離膜エレメントは、図３に示すように、剛性を有する支持板１３の両面に、流路材１４と前記の分離膜１５をこの順序で配し構成されている。支持板１３は、両面に凹部１６を有している。分離膜１５は、発酵培養液を濾過する。流路材１４は、分離膜１５で濾過された濾液を効率よく支持板１３に流すためのものである。支持板１３に流れた濾液は、支持板１３の凹部１６を通り、集水パイプ１７を介して連続発酵装置外部に取り出される。濾液を取り出すための動力として、水頭差圧、ポンプ、液体や気体等による吸引濾過、あるいは装置系内を加圧するなどの方法を用いることができる。【０１０３】
図４は、本発明で用いられる別の分離膜エレメントの他の実施の形態を説明するための概略斜視図である。分離膜エレメントは、図４に示すように、中空糸膜（多孔性膜）で構成された分離膜束１８と上部樹脂封止層１９と下部樹脂封止層２０によって主に構成されている。分離膜束１８は、上部樹脂封止層１９および下部樹脂封止層２０よって束状に接着・固定化されている。下部樹脂封止層２０による接着・固定化は、分離膜束１８の中空糸膜（多孔性膜）の中空部を封止しており、培養液の漏出を防ぐ構造になっている。一方、上部樹脂封止層１９は、分離膜束１８の中空糸膜（多孔性膜）の内孔を封止しておらず、集水パイプ２２に濾液が流れる構造となっている。この分離膜エレメントは、支持フレーム２１を介して連続発酵装置内に設置することが可能である。分離膜束１８によって濾過された発酵生産物を含む濾液は、中空糸膜の中空部を通り、集水パイプ２２を介して連続発酵装置外部に取り出される。濾液を取り出すための動力として、水頭差圧、ポンプ、液体や気体等による吸引濾過、あるいは装置系内を加圧するなどの方法を用いることができる。【０１０４】
本発明の乳酸の製造方法で用いられる連続発酵装置の分離膜エレメントを構成する部材は、高圧蒸気滅菌操作に耐性の部材であることが好ましい。連続発酵装置内が滅菌可能であれば、連続発酵時に好ましくない微生物による汚染の危険を回避することができ、より安定した連続発酵が可能となる。分離膜エレメントを構成する部材は、高圧蒸気滅菌操作の条件である、１２１℃で１５分間に耐性であることが好ましい。分離膜エレメント部材には、例えば、ステンレスやアルミニウムなどの金属、ポリアミド系樹脂、フッ素系樹脂、ポリカーボネート系樹脂、ポリアセタール系樹脂、ポリブチレンテレフタレート系樹脂、ＰＶＤＦ、変性ポリフェニレンエーテル系樹脂およびポリサルホン系樹脂等の樹脂を好ましく選定することができる。【０１０５】
本発明の乳酸の製造方法で用いられる連続発酵装置では、分離膜エレメントは、図１のように発酵反応槽内に設置しても良いし、図２のように発酵反応槽外に設置しても良い。分離膜エレメントを発酵反応槽外に設置する場合には、別途、膜分離槽を設けてその内部に分離膜エレメントを設置することができ、発酵反応槽と膜分離槽の間で培養液を循環させながら、分離膜エレメントにより培養液を連続的に濾過することができる。【０１０６】
本発明の乳酸の製造方法で用いられる連続発酵装置では、膜分離槽は、高圧蒸気滅菌可能であることが望ましい。膜分離槽が高圧蒸気滅菌可能であると、雑菌による汚染回避が容易である。【０１０７】
本発明の連続発酵による乳酸の製造方法に従って連続発酵を行った場合、バッチ式の発酵と比較して、高い体積生産速度が得られ、極めて効率のよい発酵生産が可能となる。ここで、連続培養における発酵生産速度は、次の（式３）で計算される。
発酵生産速度（ｇ／Ｌ／ｈｒ）＝抜き取り液中の生産物濃度（ｇ／Ｌ）×発酵培養液抜き取り速度（Ｌ／ｈｒ）÷装置の運転液量（Ｌ）        ・・・・（式３）【０１０８】
また、バッチ式培養による発酵生産速度は、原料炭素源をすべて消費した時点の生産物量（ｇ）を、炭素源の消費に要した時間（ｈ）とその時点の発酵培養液量（Ｌ）で除して求められる。【０１０９】
また、本発明の本質が、上述してきた乳酸生産能力を有する酵母を分離膜で濾過しながら行う連続培養において、培養開始後５０時間以降における遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の５倍以上、好ましくは７倍以上、より好ましくは１０倍以上である遺伝子のプロモーターを含む乳酸脱水素酵素発現カセットを有する酵母を分離膜で濾過しながら培養することにより、乳酸収率および乳酸生産速度の低下を招くことなく、安定に長期間の連続培養を行うことにあることから、上記連続培養は少なくとも１００時間以上、好ましくは２００時間以上、さらに好ましくは３００時間以上であることが望ましい。【０１１０】
また、本発明ではＤ−乳酸、Ｌ−乳酸のどちらも生産しうる。【０１１１】
本発明の乳酸の製造方法で得られる乳酸は、主に、ポリ乳酸原料として提供することが可能となる。
【実施例】
【０１１２】
以下、実施例をもって本発明の実施の態様を説明するが、これらは例示であり、実施例によって本発明が限定されるものではない。【０１１３】
（参考例１）乳酸生産能力を有する酵母の作製
本発明では、乳酸生産能力を有する酵母として、配列番号４に記載の塩基配列を有するゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子がＰＤＣ１プロモーターの下流の導入された酵母を使用した。ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子のクローニングはＰＣＲ法により行った。ＰＣＲには、ゼノプス・レービスの腎臓由来ｃＤＮＡライブラリー（ＳＴＲＡＴＡＧＥＮＥ社製）より付属のプロトコールに従い調製したファージミドＤＮＡを鋳型とした。【０１１４】
ＰＣＲ増幅反応には、ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ  ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ（東洋紡社製）を用い、反応バッファー、ｄＮＴＰｍｉｘなどは付属のものを使用した。上記のように付属のプロトコールに従い調整したファージミドＤＮＡを５０ｎｇ／サンプル、プライマーを５０ｐｍｏｌ／サンプル、及びＫＯＤ−Ｐｌｕｓ  ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅを１ユニット／サンプルになるように５０μlの反応系に調製した。反応溶液をＰＣＲ増幅装置ｉＣｙｃｌｅｒ（ＢＩＯ−ＲＡＤ社製）により９４℃の温度で５分熱変成させた後、９４℃（熱変成）：３０秒、５５℃（プライマーのアニール）：３０秒、６８℃（相補鎖の伸張）：１分を１サイクルとして３０サイクル行い、その後４℃の温度に冷却した。なお、遺伝子増幅用プライマー（配列番号７，８）には、５末端側にはＳａｌＩ認識配列、３末端側にはＮｏｔＩ認識配列がそれぞれ付加されるようにして作製した。
配列番号７：
gtcgacatgg  caactgtgaa  ggataa
配列番号８：
gcggccgcct  agaactgcag  ctcctt【０１１５】
ＰＣＲ増幅断片を精製し、末端をＴ４  ｐｏｌｙｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  Ｋｉｎａｓｅ（タカラバイオ社製）によりリン酸化後、ｐＵＣ１１８ベクター（制限酵素ＨｉｎｃＩＩで切断し、切断面を脱リン酸化処理したもの）にライゲーションした。ライゲーションは、ＤＮＡ  ｌｉｇａｔｉｏｎ  ｋｉｔ  Ｖｅｒ．２（タカラバイオ社製）を用いて行った。ライゲーション溶液を大腸菌ＤＨ５αのコンピテント細胞（タカラバイオ社製）に形質転換し、抗生物質アンピシリンを５０μｇ／ｍＬを含むＬＢプレートに蒔いて一晩培養した。生育したコロニーについて、ミニプレップでプラスミドＤＮＡを回収し、制限酵素ＳａｌＩ及びＮｏｔＩで切断し、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が挿入されているプラスミドを選抜した。これら一連の操作は、全て付属のプロトコールに従い、行った。【０１１６】
上記ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が挿入されたｐＵＣ１１８ベクターを制限酵素ＳａｌＩ及びＮｏｔＩで切断し、ＤＮＡ断片を１％アガロースゲル電気泳動により分離、定法に従いゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子を含む断片を精製した。得られたｌｄｈ遺伝子を含む断片を、図５に示す発現ベクターｐＴＲＳ１１のＸｈｏＩ／ＮｏｔＩ切断部位にライゲーションし、上記と同様な方法でプラスミドＤＮＡを回収し、制限酵素ＸｈｏＩ及びＮｏｔＩで切断することにより、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が挿入された発現ベクターを選抜した。以後、このようにして作製したゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子を組み込んだ発現ベクターをｐＴＲＳ１０２とする。【０１１７】
このｐＴＲＳ１０２を増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号９，１０）をプライマーセットとしたＰＣＲにより、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子及びＴＤＨ３ターミネーター配列を含む１．３ｋｂのＰＣＲ断片を増幅した。ここで、配列番号９は、ＰＤＣ１遺伝子の開始コドンから上流６０ｂｐに相当する配列が付加されるようデザインした。
配列番号９：
tctcaattat  tattttctac  tcataacctc  acgcaaaata  acacagtcaa  atcaatcaaa
atggcaactg  tgaaggataa  actca
配列番号１０：
aggcgtatca  cgaggccctt【０１１８】
次に、プラスミドｐＲＳ４２４を増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号１１，１２）をプライマーセットとしたＰＣＲにより、酵母選択マーカーであるＴＲＰ１遺伝子を含む１．２ｋｂのＰＣＲ断片を増幅した。ここで、配列番号１２は、ＰＤＣ１遺伝子の終始コドンから下流６０ｂｐに相当する配列が付加されるようデザインした。
配列番号１１：
gaattaattc  ttgaagacga  aagggcctcg  tgatacgcct  agattgtact  gagagtgcac
配列番号１２：
tatttttcgt  tacataaaaa  tgcttataaa  actttaacta  ataattagag  attaaatcgc
ctgtgcggta  tttcacaccg【０１１９】
それぞれのＤＮＡ断片を１％アガロースゲル電気泳動により分離、常法に従い精製した。ここで得られた各１．３ｋｂ断片、１．２ｋｂ断片を混合したものを増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号９，１２）をプライマーセットとしたＰＣＲ法によって、５末端・３末端にそれぞれＰＤＣ１遺伝子の上流・下流６０ｂｐに相当する配列が付加された、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子、ＴＤＨ３ターミネーター及びＴＲＰ１遺伝子が連結された約２．５ｋｂのＰＣＲ断片を増幅した。【０１２０】
上記のＰＣＲ断片を１％アガロースゲル電気泳動により分離、常法に従い精製後、酵母サッカロミセス・セレビセＮＢＲＣ１０５０５株に形質転換し、トリプトファン非添加培地で培養することにより、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が染色体上のＰＤＣ１遺伝子プロモーターの下流に導入されている形質転換株を選択した。【０１２１】
上記のようにして得られた形質転換株が、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が染色体上のＰＤＣ１遺伝子プロモーターの下流に導入されている酵母であることの確認は下記のように行った。まず、形質転換株のゲノムＤＮＡをゲノムＤＮＡ抽出キットＧｅｎとるくん（タカラバイオ社製）により調製し、これを増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号１２，１３）をプライマーセットとしたＰＣＲにより、約２．８ｋｂの増幅ＤＮＡ断片が得られることで確認した。なお、非形質転換株では、上記ＰＣＲによって約２．１ｋｂの増幅ＤＮＡ断片が得られる。以下、上記ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が染色体上のＰＤＣ１遺伝子プロモーターの下流に導入された形質転換株を、Ｂ２株とする。なお、ＰＤＣ１遺伝子の上流及び下流配列は、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  Ｇｅｎｏｍｅ  Ｄａｔａｂａｓｅ（URL:http://www.yeastgenome.org/）より取得することができる。
配列番号１３：
caaatatcgt  ttgaatattt  ttccg
【０１２２】
次に、国際公開ＷＯ２００７／０４３２５３号パンフレットに記載されている、ｐｄｃ１遺伝子がＴＲＰ１マーカーと置換され、かつ、ｐｄｃ５遺伝子に温度感受性変異を有する酵母ＳＷ０１５株と上記得られたＢ２株とを接合させ２倍体細胞を得た。該２倍体細胞を子嚢形成培地で子嚢形成させた。マイクロマニピュレーターで子嚢を解剖し、それぞれの一倍体細胞を取得し、それぞれ一倍体細胞の栄養要求性を調べた。取得した一倍体細胞の中から、ｐｄｃ１遺伝子座にゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が挿入され、かつ、ｐｄｃ５遺伝子に温度感受性変異を有する（３４℃で生育不能）株を選択した。得られた酵母株をＳＵ０１４株とした。【０１２３】
また、ＳＵ０１４株が乳酸生産能力を持つかどうかは、ＳＣ培地（ＭＥＴＨＯＤＳ  ＩＮ  ＹＥＡＳＴ  ＧＥＮＥＴＩＣＳ  ２０００  ＥＤＩＴＩＯＮ、  ＣＳＨＬ  ＰＲＥＳＳ）で形質転換細胞を培養した培養上清に乳酸が含まれていることを下記に示す条件でＨＰＬＣ法により測定することで確認した。【０１２４】
カラム：Ｓｈｉｍ−Ｐａｃｋ  ＳＰＲ−Ｈ（島津社製）
移動相：５ｍＭ  ｐ−トルエンスルホン酸（流速０．８ｍＬ／ｍｉｎ）
反応液：５ｍＭ  ｐ−トルエンスルホン酸、２０ｍＭ  ビストリス、０．１ｍＭ  ＥＤＴＡ・２Ｎａ（流速０．８ｍＬ／ｍｉｎ）
検出方法：電気伝導度
温度：４５℃【０１２５】
また、Ｌ−乳酸の光学純度測定は、以下の条件でＨＰＬＣ法により測定した。
カラム：ＴＳＫ−ｇｅｌ  Ｅｎａｎｔｉｏ  ＬＩ（登録商標：東ソー社製）
移動相：１ｍＭ  硫酸銅水溶液
流速：１．０ｍｌ／ｍｉｎ
検出方法：ＵＶ２５４ｎｍ
温度：３０℃【０１２６】
なお、Ｌ−乳酸の光学純度は次式で計算される。
光学純度（％）＝１００×（Ｌ−Ｄ）／（Ｌ＋Ｄ）
ここで、ＬはＬ−乳酸の濃度、ＤはＤ−乳酸の濃度を表す。
ＨＰＬＣ分析の結果、Ｌ−乳酸が検出され、Ｄ−乳酸は検出限界以下であった。以上の検討により、このＳＵ０１４株がＬ−乳酸生産能力を持つことを確認した。【０１２７】
（参考例２）分離膜の作製方法
本発明では、分離膜として以下の方法で作製した多孔性膜を使用した。
樹脂としてポリフッ化ビニリデン（ＰＶＤＦ）樹脂を、また開孔剤として分子量が約２０，０００のポリエチレングリコール（ＰＥＧ）を、溶媒としてＮ，Ｎ−ジメチルアセトアミド（ＤＭＡｃ）を、そして非溶媒として純水をそれぞれ用い、これらを９０℃の温度下に十分に攪拌し、次の組成を有する原液を得た。
・ＰＶＤＦ：１３．０重量％
・ＰＥＧ：５．５重量％
・ＤＭＡｃ：７８．０重量％
・純水：３．５重量％【０１２８】
次に、上記の原液を２５℃の温度に冷却した後、密度が０．４８ｇ／ｃｍ３、厚みが２２０μｍのポリエステル繊維製不織布（多孔質基材）に塗布し、塗布後、直ちに２５℃の温度の純水中に５分間浸漬し、さらに８０℃の温度の熱水に３回浸漬してＤＭＡｃおよびＰＥＧを洗い出し、多孔質樹脂層を有する多孔性膜（分離膜）を得た。この分離膜の原液を塗布した側における、多孔質樹脂層表面の９．２μｍ×１０．４μｍの範囲内を、倍率１０，０００倍で走査型電子顕微鏡観察を行ったところ、観察できる細孔すべての直径の平均は０．０２μｍであった。この分離膜について純水透水量を評価したところ、２×１０−９ｍ３／（ｍ２・ｓ・Ｐａ）であった。透水量の測定は、逆浸透膜による２５℃の温度の精製水を用い、ヘッド高さ１ｍで行った。平均細孔径の標準偏差は０．００５５μｍで、膜表面粗さは０．１μｍであった。【０１２９】
（参考例３）乳酸生産能力を有する酵母の分離膜による濾過連続培養
本発明では、参考例１で作製したＳＵ０１４株を用い、図１に示す連続培養装置により濾過連続培養を行った。培地には表１に示す組成の乳酸発酵培地を用いた。この培地は、１２１℃の温度で１５分間、高圧（２気圧）蒸気滅菌処理して用いた。分離膜エレメント部材としては、ステンレス、及びポリサルホン樹脂の成型品を用い、分離膜としては参考例２で作製した多孔性膜を用いた。本実施例における運転条件は、特に断らない限り、以下のとおりである。【０１３０】
反応槽容量：２（Ｌ）
発酵反応槽容量：１．５（Ｌ）
使用分離膜：ＰＶＤＦ濾過膜（参考例２で作製）
膜分離エレメント有効濾過面積：１２０平方ｃｍ
温度調整：３０（℃）
発酵反応槽通気量：空気０．０１（Ｌ／ｍｉｎ）、窒素ガス０．１９（Ｌ／ｍｉｎ）
発酵反応槽攪拌速度：８００（ｒｐｍ）
ｐＨ調整：１Ｎ  ＮａＯＨによりｐＨ５に調整
消泡剤：３時間毎に滅菌した消泡剤ＰＥ−Ｌ（和光純薬社製）を２００μｌ添加
滅菌：分離膜エレメントを含む培養槽、および使用培地は総て１２１℃、２０ｍｉｎの
オートクレーブにより高圧蒸気滅菌
【表１】
0005532919.tif 000004
【０１３１】
まず、ＳＵ０１４株を試験管で１０ｍｌの乳酸発酵培地で一晩振とう培養した（前々々培養）。得られた培養液を新鮮な乳酸発酵培地１００ｍｌに植菌し、５００ｍｌ容坂口フラスコで２４時間、３０℃で振とう培養した（前々培養）。前々培養液を、図１に示した連続培養装置の１．５Ｌの乳酸発酵培地（グルコース濃度は７０ｇ/Ｌ）に植菌し、反応槽１を付属の攪拌機５によって４００ｒｐｍで攪拌し、反応槽１の通気量の調整、温度調整、ｐＨ調整を行い、２４時間培養を行った（前培養）。前培養完了後直ちに、乳酸発酵培地の連続供給を行い、連続培養装置の発酵液量を１．５Ｌとなるよう膜透過水量の制御を行いながら連続培養し、連続培養による乳酸の製造を行った。適宜、膜透過発酵液中の生産された乳酸濃度および残存グルコース濃度を測定した。また、該乳酸、及びグルコース濃度から算出された投入グルコースから算出された乳酸対糖収率、乳酸生産速度を求めた。なお、グルコース濃度の測定には、“グルコーステストワコーＣ”（登録商標）（和光純薬社製）を用いた。その結果、２００時間までは安定に連続培養可能であったが、２００時間を経過したあたりから、乳酸蓄積濃度の低下を原因とする乳酸対糖収率および乳酸生産速度の低下が確認された。【０１３２】
（実施例１）連続培養中の遺伝子発現変動
参考例３で行った連続培養中の遺伝子発現量の変化を検討するために、参考例３で行った連続培養開始から７０時間および２１０時間の培養液サンプルを取得し、酵母菌体から全ＲＮＡの抽出を行った。全ＲＮＡの抽出は、取得した酵母をＯＤ６００＝０．２になるように１０ｍｌの破砕用緩衝液（５０ｍＭ  酢酸ナトリウム（ｐＨ５．３）、１０ｍＭ  ＥＤＴＡ  ＤＥＰＣ  ｔｒｅａｔｅｄ）に懸濁し、５０ｍｌチューブに移した。５００μｌの２０％  ＳＤＳを加え、更に予め６５℃に保温しておいた１２ｍｌのフェノール（破砕緩衝液飽和）を加え、ボルテックスミキサーで5秒間攪拌した。６５℃で４分間保温した後、ドライアイス／エタノール浴で室温まで急冷した。室温で遠心分離（５  ｍｉｎ．  １２０００  Ｇ）し、水上清を新しい５０ｍｌチューブに移し、等量のＰＣＩ（ｐＨ５．３）を加え抽出した。その水上清を新しい５０ｍｌチューブに移し、等量のクロロホルムを加え抽出した。その水上清を新しい５０ｍｌチューブに移し、１／１０量の３Ｍ  酢酸ナトリウム（ｐＨ５．３）を加えエタノール沈殿した。ペレットを８０％エタノールで２回洗浄、乾固し、ＲＮＡフリー水で溶かしたものを全ＲＮＡサンプルとした。【０１３３】
上記得られた全ＲＮＡサンプルの濃度を吸光度計で測定し、その内１μｇを用いてＤＮＡマイクロアレイ解析に用いた。ＤＮＡマイクロアレイとしては、東レ社製の「３Ｄ−Ｇｅｎｅ」を用いて、詳細は付属のプロトコールに従った。スキャナは、ＳｃａｎＡｒｒａｙ  Ｅｘｐｒｅｓｓ（パーキンエルマー）を用い、スキャンは、Ｃｙａｎｉｎｅ  ５(ＰＭＴ値  ５５％)（培養開始後２１０時間経過後の平均蛍光光度測定用）、Ｃｙａｎｉｎｅ  ３(ＰＭＴ値  ７０％)  （培養開始後７０時間経過後の平均蛍光光度測定用）の条件で行い、画像を取得した。取得した画像からＧｅｎｅＰｉｘ  Ｐｒｏ  ５．０  ソフトウェア（Ａｘｏｎ  Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）で各スポットの蛍光強度を数値化し、その中央値を算出した。その後、各サンプルにおける全スポットの平均蛍光強度を算出した。【０１３４】
その結果、培養開始後７０時間のサンプルにおいて平均蛍光強度の１０倍以上の数値を示した遺伝子としてＣＤＣ１９遺伝子，ＩＰＰ１遺伝子、ＡＲＦ１遺伝子，ＣＵＰ５遺伝子、ＲＰＬ２８遺伝子、ＴＲＸ２遺伝子，ＨＳＰ１０４遺伝子，ＡＨＰ１遺伝子，ＹＭＲ１２２Ｗ−Ａ，ＣＩＴ１遺伝子，ＲＰＳ１５遺伝子，ＡＬＤ４遺伝子，ＹＰＬ２２５Ｗ、ＨＳＰ２６遺伝子，ＰＧＫ１遺伝子，ＳＥＤ１遺伝子，ＭＦＡ１遺伝子、ＨＹＰ２遺伝子，ＨＳＰ１２遺伝子，ＱＣＲ６遺伝子，ＨＸＫ１遺伝子，ＴＤＨ３遺伝子，ＥＮＯ１遺伝子，ＢＧＬ２遺伝子，ＹＪＬ１３３Ｃ−Ａ，ＱＣＲ８遺伝子，ＦＢＡ１遺伝子，ＣＷＰ２遺伝子，ＣＣＷ１２遺伝子，ＴＭＡ１０遺伝子，ＳＩＰ１８遺伝子，ＨＯＲ７遺伝子，ＣＣＷ１４遺伝子、ＰＩＲ３遺伝子が確認でき、また培養開始後２１０時間のサンプルにおいて平均蛍光強度の１０倍以上の数値を示した遺伝子としてＣＹＳ３遺伝子，ＣＤＣ４８遺伝子，ＬＹＳ２０遺伝子，ＨＳＰ３１遺伝子，ＡＲＧ５，６遺伝子，ＲＰＳ２４Ａ遺伝子，ＲＰＬ２９遺伝子，ＲＰＬ２４Ａ遺伝子，ＡＤＨ４遺伝子，ＭＵＰ１遺伝子，ＲＰＬ１１Ｂ遺伝子，ＴＨＩ４遺伝子，ＲＰＬ２４Ｂ遺伝子，ＲＰＳ０Ａ遺伝子，ＲＰＬ２７Ａ遺伝子，ＲＰＬ１６Ａ遺伝子，ＲＰＳ２１Ｂ遺伝子，ＲＰＳ５遺伝子，ＨＯＭ６遺伝子，ＰＤＣ５遺伝子，ＴＨＩ７遺伝子，ＭＥＴ１７遺伝子，ＥＣＭ４０遺伝子，ＡＲＧ１遺伝子、ＺＰＳ１遺伝子，ＩＤＨ２遺伝子，ＣＤＣ１９遺伝子、ＩＰＰ１遺伝子，ＡＲＦ１遺伝子，ＲＰＬ２８遺伝子，ＴＲＸ２遺伝子，ＨＳＰ１０４遺伝子，ＡＨＰ１遺伝子，ＣＩＴ１遺伝子，ＲＰＳ１５遺伝子，ＡＬＤ４遺伝子，ＹＰＬ２２５Ｘ，ＣＣＷ１２遺伝子が確認できた。その結果を表２に示す。
【表２】
0005532919.tif 000005
【０１３５】
この結果から、乳酸生産能力を有する酵母を分離膜で濾過しながら行う連続培養において、培養開始後５０時間以降における遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の１０倍以上である遺伝子が明らかになった。【０１３６】
（実施例２）ＳＥＤ１、ＣＷＰ２、ＥＮＯ１遺伝子座へのｌｄｈ遺伝子の導入
実施例１で得られた結果をもとに、配列番号４に記載のｌｄｈ遺伝子をＳＥＤ１遺伝子、ＣＷＰ２遺伝子およびＥＮＯ１遺伝子座に導入した。【０１３７】
ＳＥＤ１遺伝子座への導入は、参考例１で作製したｐＴＲＳ１０２を増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号１０，１４）をプライマーセットとしたＰＣＲにより、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子及びＴＤＨ３ターミネーター配列を含む１．３ｋｂのＰＣＲ断片を増幅した。ここで配列番号１４は、ＳＥＤ１遺伝子の開始コドンから上流６０ｂｐに相当する配列が付加されるようデザインした。
配列番号１４：
tattgattta  tagtcgtaac  tacaaagaca  agcaaaataa  aatacgttcg  ctctattaag
atggcaactg  tgaaggataa  actca
【０１３８】
次に、プラスミドｐＲＳ４２３を増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号１１，１５）をプライマーセットとしたＰＣＲにより、酵母選択マーカーであるＨＩＳ３遺伝子を含む約１．３ｋｂのＰＣＲ断片を増幅した。ここで、配列番号１８は、ＳＥＤ１遺伝子の終始コドンから下流６０ｂｐに相当する配列が付加されるようデザインした。
配列番号１５：
aaaaaataac  ataatactga  aagaaagcat  taagaaggcg  gatgtgtcaa  acaccaccgt
ctgtgcggta  tttcacaccg
【０１３９】
それぞれのＤＮＡ断片を１％アガロースゲル電気泳動により分離、常法に従い精製した。ここで得られた二種類の約１．３ｋｂ断片を混合したものを増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号１４，１５）をプライマーセットとしたＰＣＲ法によって、５末端・３末端にそれぞれＳＥＤ１遺伝子の上流・下流６０ｂｐに相当する配列が付加された、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子、ＴＤＨ３ターミネーター及びＨＩＳ３遺伝子が連結された約２．６ｋｂのＰＣＲ断片を増幅した。【０１４０】
上記のＰＣＲ断片を１％アガロースゲル電気泳動により分離、常法に従い精製後、ＳＵ０１４株に形質転換し、ヒスチジン非添加培地で培養することにより、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が染色体上のＳＥＤ１遺伝子プロモーターの下流に導入されている形質転換株を選択した。【０１４１】
上記のようにして得られた形質転換株が、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が染色体上のＳＥＤ１遺伝子プロモーターの下流に導入されている酵母であることの確認は下記のように行った。まず、形質転換株のゲノムＤＮＡをゲノムＤＮＡ抽出キットＧｅｎとるくん（タカラバイオ社製）により調製し、これを増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号１６，１７）をプライマーセットとしたＰＣＲにより、約２．９ｋｂの増幅ＤＮＡ断片が得られることで確認した。なお、非形質転換株では、上記ＰＣＲによって約１．４ｋｂの増幅ＤＮＡ断片が得られる。以下、上記ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が染色体上のＳＥＤ１遺伝子プロモーターの下流に導入された形質転換株を、ＳＵ０１５株とする。
配列番号１６：
tagattggcc  gtaggggctg
配列番号１７：
cacgcaacgc  gtaagaaaca
【０１４２】
次に、ＣＷＰ２遺伝子座への導入は、参考例１で作製したｐＴＲＳ１０２を増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号１０，１８）をプライマーセットとしたＰＣＲにより、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子及びＴＤＨ３ターミネーター配列を含む１．３ｋｂのＰＣＲ断片を増幅した。ここで配列番号２１は、ＣＷＰ２遺伝子の開始コドンから上流６０ｂｐに相当する配列が付加されるようデザインした。
配列番号１８：
cttctcataa  tcaagaataa  ataacttcat  cacattcgct  acacactaac  aagaaaaaaa
atggcaactg  tgaaggataa  actca
【０１４３】
次に、プラスミドｐＲＳ４２３を増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号１１，１９）をプライマーセットとしたＰＣＲにより、酵母選択マーカーであるＨＩＳ３遺伝子を含む１．３ｋｂのＰＣＲ断片を増幅した。ここで、配列番号１９は、ＣＷＰ２遺伝子の終始コドンから下流６０ｂｐに相当する配列が付加されるようデザインした。
配列番号１９：
ctagtaaaac  cgaaaatttt  gaaaaaagcc  atatagatat  tataaaaaat  cagagatttc
ctgtgcggta  tttcacaccg
【０１４４】
それぞれのＤＮＡ断片を１％アガロースゲル電気泳動により分離、常法に従い精製した。ここで得られた二種類の約１．３ｋｂ断片を混合したものを増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号１８，１９）をプライマーセットとしたＰＣＲ法によって、５末端・３末端にそれぞれＣＷＰ２遺伝子の上流・下流６０ｂｐに相当する配列が付加された、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子、ＴＤＨ３ターミネーター及びＨＩＳ３遺伝子が連結された約２．６ｋｂのＰＣＲ断片を増幅した。【０１４５】
上記のＰＣＲ断片を１％アガロースゲル電気泳動により分離、常法に従い精製後、ＳＵ０１４株に形質転換し、ヒスチジン非添加培地で培養することにより、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が染色体上のＣＷＰ２遺伝子プロモーターの下流に導入されている形質転換株を選択した。【０１４６】
上記のようにして得られた形質転換株が、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が染色体上のＣＷＰ２遺伝子プロモーターの下流に導入されている酵母であることの確認は下記のように行った。まず、形質転換株のゲノムＤＮＡをゲノムＤＮＡ抽出キットＧｅｎとるくん（タカラバイオ社製）により調製し、これを増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号２０，２１）をプライマーセットとしたＰＣＲにより、約２．９ｋｂの増幅ＤＮＡ断片が得られることで確認した。なお、非形質転換株では、上記ＰＣＲによって約０．７ｋｂの増幅ＤＮＡ断片が得られる。以下、上記ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が染色体上のＣＷＰ２遺伝子プロモーターの下流に導入された形質転換株を、ＳＵ０１６株とする。
配列番号２０：
aaacagagaa  atgtaacgtt
配列番号２１：
cattcgaaga  gaaatcacag
【０１４７】
次に、ＥＮＯ１遺伝子座への導入は、参考例１で作製したｐＴＲＳ１０２を増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号１０，２２）をプライマーセットとしたＰＣＲにより、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子及びＴＤＨ３ターミネーター配列を含む１．３ｋｂのＰＣＲ断片を増幅した。ここで配列番号２２は、ＥＮＯ１遺伝子の開始コドンから上流６０ｂｐに相当する配列が付加されるようデザインした。
配列番号２２：
ctagctattt  ttcataaaaa  accaagcaac  tgcttatcaa  cacacaaaca  ctaaatcaaa
atggcaactg  tgaaggataa  actca
【０１４８】
次に、プラスミドｐＲＳ４２６を増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号１１，２３）をプライマーセットとしたＰＣＲにより、酵母選択マーカーであるＵＲＡ３遺伝子を含む約１．３ｋｂのＰＣＲ断片を増幅した。ここで、配列番号２３は、ＥＮＯ１遺伝子の終始コドンから下流６０ｂｐに相当する配列が付加されるようデザインした。
配列番号２３：
gaaaatgaaa  taaatgacaa  aaaaacgtgt  tttttggact  agaaggctta  atcaaaagct
ctgtgcggta  tttcacaccg
【０１４９】
それぞれのＤＮＡ断片を１％アガロースゲル電気泳動により分離、常法に従い精製した。ここで得られた二種類の１．３ｋｂ断片を混合したものを増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号２２，２３）をプライマーセットとしたＰＣＲ法によって、５末端・３末端にそれぞれＥＮＯ１遺伝子の上流・下流６０ｂｐに相当する配列が付加された、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子、ＴＤＨ３ターミネーター及びＵＲＡ３遺伝子が連結された約２．６ｋｂのＰＣＲ断片を増幅した。【０１５０】
上記のＰＣＲ断片を１％アガロースゲル電気泳動により分離、常法に従い精製後、ＳＵ０１４株に形質転換し、ウラシル非添加培地で培養することにより、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が染色体上のＥＮＯ１遺伝子プロモーターの下流に導入されている形質転換株を選択した。【０１５１】
上記のようにして得られた形質転換株が、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が染色体上のＥＮＯ１遺伝子プロモーターの下流に導入されている酵母であることの確認は下記のように行った。まず、形質転換株のゲノムＤＮＡをゲノムＤＮＡ抽出キットＧｅｎとるくん（タカラバイオ社製）により調製し、これを増幅鋳型とし、オリゴヌクレオチド（配列番号２４，２５）をプライマーセットとしたＰＣＲにより、約２．９ｋｂの増幅ＤＮＡ断片が得られることで確認した。なお、非形質転換株では、上記ＰＣＲによって約１．７ｋｂの増幅ＤＮＡ断片が得られる。以下、上記ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子が染色体上のＥＮＯ１遺伝子プロモーターの下流に導入された形質転換株を、ＳＵ０１７株とする。
配列番号２４：
aaggtatgcc  tctccccgga
配列番号２５：
cggatacacg  cgtcaccaca
【０１５２】
続いて、ゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子をＳＵ０１５株のＥＮＯ１遺伝子座に導入した。ＳＵ０１５株のＥＮＯ１遺伝子座へのゼノプス・レービス由来のｌｄｈ遺伝子の導入および確認は、上記ＳＵ０１７株を取得する際に行った方法において、ＳＵ０１４株のかわりにＳＵ０１５株を使用することを除いては、同様の方法で行った。得られた形質転換株をＳＵ０１８株とする。【０１５３】
（実施例３）乳酸生産酵母の作製２
３−１  ヒト由来およびロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子のクローニング
次に、配列番号５、６に記載のヒト由来およびロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子のクローニングを行った。まず、ヒト由来のｌｄｈ遺伝子のクローニング方法を下記に示す。【０１５４】
ヒト乳ガン株化細胞（ＭＣＦ−７）を培養回収後、ＴＲＩＺＯＬ  Ｒｅａｇｅｎｔ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社製）を用いてｔｏｔａｌ  ＲＮＡを抽出し、得られたｔｏｔａｌ  ＲＮＡを鋳型としてＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔ  Ｃｈｏｉｃｅ  Ｓｙｓｔｅｍ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社製）を用いた逆転写反応によりｃＤＮＡの合成を行った。これらの操作の詳細は、それぞれ付属のプロトコールに従った。得られたｃＤＮＡを続くＰＣＲの増幅鋳型とした。【０１５５】
上記操作で得られたｃＤＮＡを増幅鋳型とし、配列番号２６および配列番号２７で表されるオリゴヌクレオチドをプライマーセットとしたＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅによるＰＣＲによりｌｄｈ遺伝子のクローニングを行った。各ＰＣＲ増幅断片を精製し末端をＴ４  Ｐｏｌｙｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  Ｋｉｎａｓｅ（宝酒造株式会社製）によりリン酸化後、ｐＵＣ１１８ベクター（制限酵素ＨｉｎｃＩＩで切断し、切断面を脱リン酸化処理したもの）にライゲーションした。ライゲーションは、ＤＮＡ  ｌｉｇａｔｉｏｎ  ｋｉｔ  Ｖｅｒ．２（宝酒造株式会社製）を用いて行った。ライゲーションプラスミド産物で大腸菌ＤＨ５αを形質転換し、プラスミドＤＮＡを回収することによりヒト由来ｌｄｈ遺伝子（アクセッションナンバー；ＡＹ００９１０８、配列番号５）がサブクローニングされたプラスミドを得た。得られたｌｄｈ遺伝子が挿入されたｐＵＣ１１８プラスミドを制限酵素ＸｈｏＩおよびＮｏｔＩで消化し、得られた各ＤＮＡ断片を酵母発現用ベクターｐＴＲＳ１１のＸｈｏＩ／ＮｏｔＩ切断部位に挿入した。このようにしてヒト由来ｌｄｈ遺伝子発現プラスミドｐＴＲＳ４８を得た。【０１５６】
次にロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子のクローニング方法を下記に示す。
ロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子は、Ｒｅｓ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ，１４６，２９１−３０２（１９９５）に記されている配列（配列番号６）を参考にして、ＰＣＲ法を応用した遺伝子全合成によりクローニングした。全合成時に５末端側にはＸｈｏＩ認識配列、３末端側にはＮｏｔＩ認識配列を付加するように行い、ＰＣＲ断片をｐＴＡ２ベクターにＴＡクローニングした。ライゲーションは、ＤＮＡ  ｌｉｇａｔｉｏｎ  ｋｉｔ  Ｖｅｒ．２（宝酒造株式会社製）を用いて行った。ライゲーションプラスミド産物で大腸菌ＤＨ５αを形質転換し、プラスミドＤＮＡを回収することによりロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子（配列番号６）がサブクローニングされたプラスミドを得た。得られたｌｄｈ遺伝子が挿入されたｐＴＡ２プラスミドを制限酵素ＸｈｏＩおよびＮｏｔＩで消化し、得られた各ＤＮＡ断片を酵母発現用ベクターｐＴＲＳ１１のＸｈｏＩ／ＮｏｔＩ切断部位に挿入した。このようにしてロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子発現プラスミドｐＴＲＳ１５２を得た。【０１５７】
３−２  ヒト由来およびロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子の染色体への導入
次に、配列番号５および６に記載のｌｄｈ遺伝子をＰＤＣ１遺伝子、ＳＥＤ１遺伝子、ＣＷＰ２遺伝子およびＥＮＯ１遺伝子座に導入した。【０１５８】
プラスミドｐＴＲＳ４８およびｐＴＲＳ１５２を増幅鋳型とし、配列番号２８、１０（ｐＴＲＳ４８），配列番号２９、１０（ｐＴＲＳ１５２）で表されるオリゴヌクレオチドをプライマーセットとしたＰＣＲにより、それぞれ１．３ｋｂのヒト由来ｌｄｈ遺伝子及びサッカロミセス・セレビセ由来のＴＤＨ３遺伝子のターミネーター配列含むＤＮＡ断片、ならびにロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子及びをサッカロミセス・セレビセ由来のＴＤＨ３遺伝子のターミネーター配列含むＤＮＡ断片を増幅した。また、プラスミドｐＲＳ４２４を増幅鋳型として、配列番号１１および配列番号１２で表されるオリゴヌクレオチドをプライマーセットとしたＰＣＲにより１．２ｋｂのサッカロミセス・セレビセ由来のＴＲＰ１遺伝子を含むＤＮＡ断片を増幅した。それぞれのＤＮＡ断片を１．５％アガロースゲル電気泳動により分離、常法に従い精製した。ここで得られた１．３ｋｂ断片、１．２ｋｂ断片を混合したものを増幅鋳型とし、配列番号２８，１２および配列番号２９，１２で表されるオリゴヌクレオチドをプライマーセットとしたＰＣＲ法によって得られた産物をそれぞれ１．５％アガロースゲル電気泳動して、ヒト由来ＬＤＨ遺伝子にＴＲＰ１遺伝子が連結された２．５ｋｂのＤＮＡ断片、ロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子にＴＲＰ１遺伝子が連結された２．５ｋｂのＤＮＡ断片を常法に従い調製した。この２．５ｋｂのＤＮＡ断片で出芽酵母ＮＢＲＣ１０５０５株を常法に従いそれぞれトリプトファン非要求性に形質転換した。【０１５９】
上記のようにして得られた形質転換株が、ヒト由来ｌｄｈ遺伝子またはロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子が染色体上のＰＤＣ１遺伝子プロモーターの下流に導入された酵母であることの確認は参考例１に示す方法と同様の方法で行った。【０１６０】
次に、参考例１と同様の方法で、ヒト由来ｌｄｈ遺伝子またはロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子が染色体上のＰＤＣ１遺伝子プロモーターの下流に導入された酵母にｐｄｃ５遺伝子に温度感受性変異を有する酵母を作出した。それぞれＳＵ０１９株、ＳＵ０２４株とする。【０１６１】
ＳＥＤ１、ＣＷＰ２，ＥＮＯ１遺伝子座への導入は実施例２と同様な方法でプライマーを変更して行った。変更したプライマーを下記に示す。【０１６２】
ＳＥＤ１遺伝子座導入用プライマー
実施例２で用いた配列番号１４のプライマーの代わりにヒト由来ｌｄｈ遺伝子では配列番号３０、ロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子では配列番号３３のプライマーに変更して行い、得られたＰＣＲ断片を用いてＳＵ０１９，０２４株をそれぞれヒスチジン非要求に形質転換した。得られた形質転換株をそれぞれＳＵ０２０株（ヒト由来ｌｄｈ遺伝子導入株），ＳＵ０２５株（ロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子導入株）とする。【０１６３】
ＣＷＰ２遺伝子座導入用プライマー
実施例２で用いた配列番号１８のプライマーの代わりにヒト由来ｌｄｈ遺伝子では配列番号３１、ロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子では配列番号３４のプライマーに変更して行い、得られたＰＣＲ断片を用いてＳＵ０１９，０２４株をそれぞれヒスチジン非要求に形質転換した。得られた形質転換株をそれぞれＳＵ０２１株（ヒト由来ｌｄｈ遺伝子導入株），ＳＵ０２６株（ロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子導入株）とする。【０１６４】
ＥＮＯ１遺伝子座導入用プライマー
実施例２で用いた配列番号２２のプライマーの代わりにヒト由来ｌｄｈ遺伝子では配列番号３２、ロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子では配列番号３５のプライマーに変更して行い、得られたＰＣＲ断片を用いてＳＵ０１９，０２４株をそれぞれウラシル非要求に形質転換した。得られた形質転換株をそれぞれＳＵ０２２株（ヒト由来ｌｄｈ遺伝子導入株），ＳＵ０２７株（ロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子導入株）とする。さらに、ＳＵ０２０，０２５株を同様にウラシル非要求性に形質転換し、それぞれＳＵ０２３株（ヒト由来ｌｄｈ遺伝子導入株），ＳＵ０２８株（ロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子導入株）を得た。【０１６５】
（実施例４）バッチ培養による乳酸発酵試験
参考例１（ＳＵ０１４）および実施例２、３で得られたＳＵ０１５〜ＳＵ０２８株を用いてバッチ培養により乳酸発酵試験を行った。表１に示した乳酸発酵培地を１０ｍＬ試験管に取り、そこにそれぞれ少量のＳＵ０１４〜ＳＵ０２８株を植菌し、３０℃で一晩培養した（前々培養）。次に、新鮮な表１に示した乳酸発酵培地１００ｍＬを５００ｍｌ容三角フラスコにいれ、各前々培養液をそれぞれ全量植菌し、３０℃で２４時間振とう培養した（前培養）。続いて、表１に示した乳酸発酵培地を１Ｌ投入したミニジャーファメンター（丸菱バイオエンジ社製、容量５Ｌ）に、前培養開始から２４時間後の前培養液をそれぞれ全量植菌し、攪拌速度（１２０ｒｐｍ）、通気量（０．１Ｌ／ｍｉｎ）、温度（３０℃）、ｐＨ（ｐＨ５）を一定にして培養を行った（本培養）。なお、中和は１Ｎ  ＮａＯＨで行い、重量変化を天秤で測定することで投入量を計測した。本培養開始後４０時間の培養液を遠心分離し、得られた上清を膜濾過した後、参考例１に示した方法で、乳酸蓄積濃度を算出した。グルコース濃度の測定には、“グルコーステストワコーＣ”（登録商標）（和光純薬社製）を用いた。【０１６６】
測定結果から算出した乳酸の対糖収率を表３に示す。また、参考例１に示した方法で乳酸の光学純度を測定した結果、ＳＵ０１４〜０２３ではＬ−乳酸のみ検出されＤ−乳酸は検出限界以下であり、ＳＵ０２４〜０２８ではＤ−乳酸のみ検出されＬ−乳酸は検出限界以下であった。
【表３】
0005532919.tif 000006
【０１６７】
この結果から、乳酸生産能力を有する酵母を分離膜で濾過しながら行う連続培養において、培養開始後５０時間以降における遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の１０倍以上である遺伝子のプロモーターの下流にｌｄｈ遺伝子を有する乳酸脱水素酵素発現カセットを酵母に導入した、ＳＵ０１５〜ＳＵ０１８（ゼノプス・レービス由来ｌｄｈ遺伝子導入株）、ＳＵ０２０〜０２４（ヒト由来ｌｄｈ遺伝子導入株）、ＳＵ０２５〜０２８（ロイコノストック・メセンテロイデス由来ｌｄｈ遺伝子導入株）において、それぞれＳＵ０１４、ＳＵ０１９、ＳＵ０２４に比べ、高い乳酸収率が得られることが確認できた。【０１６８】
（実施例５）連続培養による乳酸発酵試験
実施例２、３で得られた形質転換酵母ＳＵ０１５〜０２８を用いて、図１に示す連続培養装置により濾過連続培養を行った。培地には表１に示す組成の乳酸発酵培地のグルコース濃度を７０ｇ/Ｌに変更した培地を用いた。この培地は、１２１℃の温度で１５分間、高圧（２気圧）蒸気滅菌処理して用いた。分離膜エレメント部材としては、ステンレス、及びポリサルホン樹脂の成型品を用いた。分離膜としては参考例２で作製した多孔性膜を用いた。本実施例における運転条件は、特に断らない限り、以下のとおりである。【０１６９】
反応槽容量：２（Ｌ）
発酵反応槽容量：１．５（Ｌ）
使用分離膜：ＰＶＤＦ濾過膜（参考例２で作製）
膜分離エレメント有効濾過面積：１２０平方ｃｍ
温度調整：３０（℃）
発酵反応槽通気量：空気０．０１（Ｌ／ｍｉｎ）、窒素ガス０．１９（Ｌ／ｍｉｎ）
発酵反応槽攪拌速度：８００（ｒｐｍ）
ｐＨ調整：５Ｎ  水酸化カルシウムによりｐＨ５に調整
消泡剤：３時間毎に滅菌した消泡剤ＰＥ−Ｌ（和光純薬社製）を２００μｌ添加
滅菌：分離膜エレメントを含む培養槽、および使用培地は総て１２１℃、２０ｍｉｎの
オートクレーブにより高圧蒸気滅菌【０１７０】
まず、ＳＵ０１５〜ＳＵ０２８株を試験管で１０ｍｌの表１に示した乳酸発酵培地で一晩振とう培養した（前々々培養）。得られた培養液を新鮮な表１に示した乳酸発酵培地１００ｍｌにそれぞれ全量植菌し、５００ｍｌ容坂口フラスコで２４時間、３０℃で振とう培養した（前々培養）。前々培養液を、図１に示した連続培養装置の１．５Ｌの乳酸発酵培地に植菌し、反応槽１を付属の攪拌機５によって４００ｒｐｍで攪拌し、反応槽１の通気量の調整、温度調整、ｐＨ調整を行い、２４時間培養を行った（前培養）。前培養完了後直ちに、乳酸発酵培地の連続供給を行い、連続培養装置の発酵液量を１．５Ｌとなるよう膜透過水量の制御を行いながら連続培養し、連続培養による乳酸の製造を行った。適宜、膜透過発酵液中の生産された乳酸濃度および残存グルコース濃度を測定した。乳酸蓄積濃度の測定は、参考例１に示した方法で行い、グルコース濃度の測定には、“グルコーステストワコーＣ”（登録商標）（和光純薬社製）を用いた。【０１７１】
また、該乳酸、及びグルコース濃度から算出された投入グルコースから算出された乳酸対糖収率、乳酸生産速度を参考例１の結果と合わせて表４、表５に示した。算出は式３に当てはめて行い、表中の時間は培養開始後からの経過時間を示す。
【表４】
0005532919.tif 000007
【表５】
0005532919.tif 000008
【０１７２】
その結果、乳酸生産能力を有する酵母を分離膜で濾過しながら行う連続培養において、培養開始後５０時間以降における遺伝子発現量が全遺伝子の平均相対発現量の１０倍以上である遺伝子のプロモーターの下流にｌｄｈ遺伝子を有する乳酸脱水素酵素発現カセットを酵母に導入した、ＳＵ０１５〜ＳＵ０１８、ＳＵ０２０〜０２３およびＳＵ０２５〜０２８株において、３００時間まで安定に高収率・高生産速度を維持できることが判明した。一方、参考例１（ＳＵ０１４）およびＳＵ０１９、ＳＵ０２４株では、２００時間を越すと急速に収率・乳酸生産速度が減少した。また、各サンプルの光学純度の参考例１に示した方法で測定したところ、ＳＵ０１４〜０２３ではＬ−乳酸のみ検出されＤ−乳酸は検出限界以下であり、ＳＵ０２４〜０２８ではＤ−乳酸のみ検出されＬ−乳酸は検出限界以下であった。
【図１】
0005532919.tif 000009
【図２】
0005532919.tif 000010
【図３】
0005532919.tif 000011
【図４】
0005532919.tif 000012
【図５】
0005532919.tif 000013
【配列表】
0005532919000001.app