(57)【要約】舌癌の悪性度を客観的かつ正確に判定することが可能な舌癌の判定方法と、舌癌組織検体の分析方法と、舌癌組織検体の分析用キットとを提供する。舌癌組織検体におけるインテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量を測定し、インテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量／対照遺伝子のｍＲＮＡ量の比により舌癌の悪性度を判定することを特徴とする舌癌の判定方法と、舌癌組織検体におけるインテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量を測定するステップと、インテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量／対照遺伝子のｍＲＮＡ量の比を臨床データと関連づけるステップとを含むことを特徴とする舌癌組織検体の分析方法と、舌癌組織検体の分析用キットとを提供する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
舌癌組織検体におけるインテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量を測定し、インテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量／対照遺伝子のｍＲＮＡ量の比により舌癌の悪性度を判定することを特徴とする舌癌の判定方法。
【請求項２】
前記インテグリンファミリー遺伝子は、インテグリンα３及び／又はインテグリンβ４及び／又はインテグリンβ５であることを特徴とする請求項１に記載の舌癌の判定方法。
【請求項３】
前記インテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量の測定をリアルタイムＰＣＲ法によって行うことを特徴とする請求項１又は２に記載の舌癌の判定方法。
【請求項４】
前記インテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量の測定をノザンブロット法又は固相ハイブリダイゼーション法によって行うことを特徴とする請求項１又は２に記載の舌癌組織検体の分析方法。
【請求項５】
前記対照遺伝子は、ハウスキーピング遺伝子及び／又は細胞骨格分子遺伝子及び／又はアンカー蛋白遺伝子及び／又は細胞外基質遺伝子であることを特徴とする請求項１〜４のいずれか１つに記載の舌癌の判定方法。
【請求項６】
前記対照遺伝子はＡＣＴＢであることを特徴とする請求項５に記載の舌癌の判定方法。
【請求項７】
前記対照遺伝子はＫＲＴ５であることを特徴とする請求項５に記載の舌癌の判定方法。
【請求項８】
前記対照遺伝子は、ＪＵＰ及び／又はＰＸＮであることを特徴とする請求項５に記載の舌癌の判定方法。
【請求項９】
前記舌癌が舌扁平上皮癌であることを特徴とする請求項１〜８のいずれか１つに記載の舌癌の判定方法。
【請求項１０】
舌癌組織検体におけるインテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量を測定するステップと、インテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量／対照遺伝子のｍＲＮＡ量の比を臨床データと関連づけるステップとを含むことを特徴とする舌癌組織検体の分析方法。
【請求項１１】
前記臨床データは、ＴＮＭ分類と、Ｙ−Ｋ分類と、化学療法へのレスポンスと、放射線療法へのレスポンスと、予後とからなるグループから選択される、１種類または２種類以上のデータであることを特徴とする請求項１０に記載の舌癌組織検体の分析方法。
【請求項１２】
前記インテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量の測定はリアルタイムＰＣＲ法によって行うことを特徴とする請求項１０又は１１に記載の舌癌組織検体の分析方法。
【請求項１３】
前記インテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量の測定はノザンブロット法又は固相ハイブリダイゼーション法によって行うことを特徴とする請求項１０又は１１に記載の舌癌組織検体の分析方法。
【請求項１４】
前記インテグリンファミリー遺伝子は、インテグリンα３及び／又はインテグリンβ４及び／又はインテグリンβ５であることを特徴とする請求項９〜１３のいずれか１つに記載の舌癌組織検体の分析方法。
【請求項１５】
前記対照遺伝子は、ハウスキーピング遺伝子及び／又は細胞骨格分子遺伝子及び／又はアンカー蛋白遺伝子及び／又は細胞外基質遺伝子であることを特徴とする請求項９〜１４のいずれか１つに記載の舌癌組織検体の分析方法。
【請求項１６】
前記対照遺伝子はＡＣＴＢであることを特徴とする請求項１５に記載の舌癌組織検体の分析方法。
【請求項１７】
前記対照遺伝子はＫＲＴ５であることを特徴とする請求項１５に記載の舌癌組織検体の分析方法。
【請求項１８】
前記対照遺伝子は、ＪＵＰ及び／又はＰＸＮであることを特徴とする請求項１５に記載の舌癌組織検体の分析方法。
【請求項１９】
前記舌癌は舌扁平上皮癌であることを特徴とする請求項９〜１８のいずれか１つに記載の舌癌組織検体の分析方法。
【請求項２０】
インテグリンα３、インテグリンβ４及びインテグリンβ５からなるグループから選択される１個又は２個以上のインテグリンファミリー遺伝子の舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量の測定を行うためのプライマー対と、ＡＣＴＢ、ＫＲＴ５、ＪＵＰ及びＰＸＮからなるグループから選択される１個又は２個以上の対照遺伝子の舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量の測定を行うためのプライマー対と、請求項１０、１１又は１２に記載の舌癌組織検体の分析方法を説明した取扱い説明書とからなることを特徴とする舌癌組織検体の分析用キット。
【請求項２１】
インテグリンα３及びＫＲＴ５と、インテグリンα３及びＪＵＰと、インテグリンβ４及びＪＵＰと、インテグリンβ４及びＫＲＴと、インテグリンβ５及びＡＣＴＢと、インテグリンβ５及びＰＸＮとからなるグループから選択される１組又は２組以上のインテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子の組合せの舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量の測定を行うためのプライマー対の組合せと、請求項１０、１１又は１２に記載の舌癌組織検体の分析方法を説明した取扱い説明書とからなることを特徴とする舌癌組織検体の分析用キット。
【請求項２２】
インテグリンα３、インテグリンβ４及びインテグリンβ５からなるグループから選択される１個又は２個以上のインテグリンファミリー遺伝子の舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量の測定を行うためのプローブと、ＡＣＴＢ、ＫＲＴ５、ＪＵＰ及びＰＸＮからなるグループから選択される１個又は２個以上の対照遺伝子の舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量の測定を行うためのプローブと、請求項１０、１１又は１３に記載の舌癌組織検体の分析方法を説明した取扱い説明書とからなることを特徴とする舌癌組織検体の分析用キット。
【請求項２３】
インテグリンα３及びＫＲＴ５と、インテグリンα３及びＪＵＰと、インテグリンβ４及びＪＵＰと、インテグリンβ４及びＫＲＴと、インテグリンβ５及びＡＣＴＢと、インテグリンβ５及びＰＸＮとからなるグループから選択される１組又は２組以上のインテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子の組合せの舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量の測定をノザンブロット法又は固相ハイブリダイゼーション法によって行うためのプローブの組合せと、請求項１０、１１又は１３に記載の舌癌組織検体の分析方法を説明した取扱い説明書とからなることを特徴とする舌癌組織検体の分析用キット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、舌癌の悪性度を判定する舌癌の判定方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
舌癌は口腔癌の中で最も頻度が高く、リンパ節転移も高頻度で認められ、またその５年生存率は、転移陰性症例で５０％前後、後発転移を含む陽性症例では１１％前後との報告もある(非特許文献１)。また、臨床経過において他の部位を原発とする口腔扁平上皮癌と比べて早期に転移を起こす傾向がある。そのため、腫瘍の大きさに関わらず、舌癌の悪性度を正確に判定し、それに基づいた治療方針を決定することは癌の制御という観点からのみならず、治療後の摂食嚥下や発音の障害によって影響されるＱＯＬの観点からも重要である。【０００３】
そして、従来、舌癌の予後の推定因子として、病理組織学的な分化度(非特許文献２)、浸潤性(非特許文献２)、リンパ節転移（非特許文献２及び３）、原発巣の大きさ（非特許文献２）、血清中の腫瘍マーカー（非特許文献４）、などが使用されている。
【非特許文献１】Jan Nyman et al.Prognotic factors for local control and survival of cancer of the oral tongue .ActOncologia;1993:667-73
【非特許文献２】Kurokawa H et al.The high prognostic valueof the histologic grade at the deep invasive front of tongue squamous cell carcinoma .J Oral Pathol Med2005;34:329-33
【非特許文献３】Okamoto M et al.Prediction of delayed neck metastasis in patients with stage I/II squamous cell carcinoma of the tongue.J Oral Pathol Med2002;15:227-233
【非特許文献４】Xin Huang  et al.Serum proteomics study of the squamous cell carcinoma antigen1 in tongue cancer.J.oraloncology.2006 Jan;42(1):25-30.
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００４】
しかし、病理組織学的検査方法は、癌組織の形態分析によって、口腔癌の存在を把握できるが、その生物学的性質に関する客観的情報と信頼性は乏しく、実際の治療法決定上において、生物学的性質（悪性度）が極めて多岐にわたる口腔癌の個別的情報源としては十分な検査方法ではなかった。【０００５】
そして、腫瘍マーカーを用いた検査方法は、客観的な定量データであるものの、検査時の病態把握に留まり、偽陽性あるいは偽陰性の頻度が高く、治療法を決定するための情報としての信頼性は不十分であった。【０００６】
そこで、近年、分子レベルで腫瘍の性格を特徴付けられるバイオマーカーの実用化が期待されているが、具体的な判定システムの構築はいまだ途上にある。【０００７】
現在、口腔癌の分子生物学的バイオマーカーの候補としてマトリックスメタプロテナーゼ（matrix metalloproteinase）ファミリー、カドヘリン（cadherin）ファミリー、インテグリン（integrin）ファミリー、などが挙げられている。上記の如く、舌癌の予後・転帰は疫学的にリンパ節転移の数と深い関係があり、腫瘍の悪性度を予測する上で単純かつ現実的な指標である。【０００８】
したがって、前述の組織改造、細胞接着、細胞運動または脈管新生などに関与する適切な分子をバイオマーカーとして用いることにより、転移を来たしていない、さらに早期の段階における舌癌悪性度の精密判定が可能となる。そして、早期に癌の生物学的性質を精密に把握することは、それに応じた最適の治療を可能にし、もたらされる恩恵は非常に大きい。【０００９】
しかし、従来、遺伝子発現レベルを用いた舌癌の悪性度判定の実用例はない。【００１０】
そこで、本発明は、インテグリンファミリー遺伝子をバイオマーカーとして用い、インテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量を測定することにより、より客観的かつ正確に舌癌の悪性度を判定することが可能な舌癌の判定方法を提供することを目的とする。【００１１】
本発明者らが先立って行った口腔扁平上皮癌のマイクロアレイ遺伝子発現解析の結果において、インテグリンα３とインテグリンβ４は転移陽性腫瘍において有意に高い発現傾向を示した。【００１２】
インテグリン（ＩＴＧ）はα鎖とβ鎖からなる細胞膜貫通型のヘテロダイマーの構造を持ち、細胞質と細胞外マトリックスをつなぐ受容体である。細胞膜表面のＩＴＧはフィブロネクチン、コラーゲンやラミニンなどの細胞外基質蛋白、もしくは血小板や白血球の接着に関与する受容体として、スーパーファミリーを形成する。現在のところＩＴＧはヒトで、α鎖の１８種、β鎖の８種がクローニングされており、α鎖とβ鎖が組み合わされた受容体として２４種が確認されている。それぞれのレセプターの細胞外ドメイン（domain）は特定の細胞外マトリックスに特異的な結合を形成する。α鎖、β鎖はともに９０％が細胞外ドメインで、残りの短い細胞内ドメインにはタリン、パキシリン、α-アクニチンといった細胞内アンカー蛋白を介して細胞骨格のアクチンファイバーが結合する。細胞外リガンドと細胞骨格とを結びつける接着分子としての働きとともに、細胞外マトリックスからのシグナリングに対し、チロシンリン酸化、細胞内カルシウム濃度の変化、イノシトールリン脂質合成、サイクリン合成、初期遺伝子発現を引き起こすことで細胞運動、細胞の増殖・分化・アポトーシスに関与することが知られている。その他、ＩＴＧとリガンド間の反応をブロックすることによる細胞分化やアポトーシスの抑制が報告されている。腫瘍組織においては、高い浸潤・転移能に対応してＩＴＧ分子の分布の規則性が失われることが知られている。これらを考え合わせるとＩＴＧの仲介する接着とシグナリングの不秩序化は腫瘍細胞の発生、増殖、アポトーシス、運動性、浸潤性といった病態にさまざまの形で関与することが予想される。【００１３】
そこで、本発明者らは、先立つマイクロアレイ遺伝子発現解析の結果に基づき、舌扁平上皮癌の転移性や生命予後のバイオマーカー候補分子としてインテグリンファミリー遺伝子に着目した。これまでに、腫瘍細胞における接着、運動、分化の制御機能への関与が記述されてきたＩＴＧα−１、−２、−３、−５、−６、−ｖおよびＩＴＧβ−１、−３、−４、−５、−６についてリアルタイムＰＣＲ法を用いた遺伝子発現定量解析を行った。【００１４】
ところで腫瘍組織は、腫瘍細胞と、周囲の癌間質(cancer stroma)にある繊維芽細胞、炎症系細胞など多様な細胞とを含む細胞構成を有している。したがって、癌組織の細胞構成が、定量される遺伝子のｍＲＮＡ量を大きく左右することが予想される。そのため、適切な遺伝子のｍＲＮＡ量によるＩＴＧ遺伝子発現レベルの標準化がバイオマーカーの解析において重要である。標準化に用いる分子の候補としては、いわゆるハウスキーピング遺伝子のみならず、上皮細胞骨格をコードするＫＲＴ５、アンカー蛋白質をコードするＪＵＰ、ＰＬＥＣ１、ＰＸＮ、ＩＴＧに対するリガンド（Ligand）分子をコードするＬＡＭＡ３、ＬＡＭＡ４、ＬＡＭＡ５、Ｃｏｌ１Ａ１、ＶＴＮを同様に定量した。そして、機能的あるいは組織内局在の側面から関連する遺伝子のｍＲＮＡ量でＩＴＧ遺伝子のｍＲＮＡ量を標準化することによって、上記の臨床検体のばらつきに起因する問題点の回避を試みた。【００１５】
このように、上記課題に鑑みて鋭意検討した結果、インテグリンファミリー遺伝子と対照遺伝子のｍＲＮＡ量を測定し、両者の比により、インテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量を標準化した数値により、舌癌の悪性度を客観的かつ正確に判定できることを見出し、本発明に想到した。
【課題を解決するための手段】
【００１６】
本発明は、舌癌組織検体におけるインテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量を測定し、インテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量／対照遺伝子のｍＲＮＡ量の比により舌癌の悪性度を判定することを特徴とする舌癌の判定方法を提供する。【００１７】
本発明の舌癌の判定方法における前記インテグリンファミリー遺伝子は、インテグリンα３及び／又はインテグリンβ４及び／又はインテグリンβ５の場合がある。【００１８】
本発明の舌癌の判定方法における前記インテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量の測定をリアルタイムＰＣＲ法により行う場合がある。
本発明の舌癌の判定方法における前記インテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量の測定をノザンブロット法又は固相ハイブリダイゼーション法により行う場合がある。【００１９】
本発明の舌癌の判定方法における前記対照遺伝子は、ハウスキーピング遺伝子及び／又は細胞骨格分子遺伝子及び／又はアンカー蛋白遺伝子及び／又は細胞外基質遺伝子の場合がある。【００２０】
本発明の舌癌の判定方法における前記対照遺伝子はＡＣＴＢの場合がある。【００２１】
本発明の舌癌の判定方法における前記対照遺伝子はＫＲＴ５の場合がある。【００２２】
本発明の舌癌の判定方法における前記対照遺伝子は、ＪＵＰ及び／又はＰＸＮの場合がある。【００２３】
本発明の判定方法は、舌扁平上皮癌の判定方法の場合がある。【００２４】
本発明は、舌癌組織検体におけるインテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量を測定するステップと、インテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量／対照遺伝子のｍＲＮＡ量の比を臨床データと関連づけるステップとを含むことを特徴とする舌癌組織検体の分析方法を提供する。【００２５】
本発明の舌癌組織検体の分析方法における前記臨床データは、ＴＮＭ分類と、Ｙ−Ｋ分類と、化学療法へのレスポンスと、放射線療法へのレスポンスと、予後とからなるグループから選択される、１種類または２種類以上のデータの場合がある。【００２６】
本発明の舌癌組織検体の分析方法における前記インテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量の測定は、リアルタイムＰＣＲ法により行う場合がある。【００２７】
本発明の舌癌組織検体の分析方法における前記インテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量の測定は、ノザンブロット法又は固相ハイブリダイゼーション法により行う場合がある。【００２８】
本発明の舌癌組織検体の分析方法における前記インテグリンファミリー遺伝子は、インテグリンα３及び／又はインテグリンβ４及び／又はインテグリンβ５の場合がある。【００２９】
本発明の舌癌組織検体の分析方法における前記対照遺伝子は、ハウスキーピング遺伝子及び／又は細胞骨格分子遺伝子及び／又はアンカー蛋白遺伝子及び／又は細胞外基質遺伝子の場合がある。【００３０】
本発明の舌癌組織検体の分析方法における前記対照遺伝子はＡＣＴＢの場合がある。【００３１】
本発明の舌癌組織検体の分析方法における前記対照遺伝子はＫＲＴ５の場合がある。【００３２】
本発明の舌癌組織検体の分析方法における前記対照遺伝子は、ＪＵＰ及び／又はＰＸＮの場合がある。【００３３】
本発明の舌癌組織検体の分析方法における前記舌癌は舌扁平上皮癌の場合がある。【００３４】
本発明は、インテグリンα３、インテグリンβ４及びインテグリンβ５からなるグループから選択される１個又は２個以上のインテグリンファミリー遺伝子の舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量の測定を行うためのプライマー対と、ＡＣＴＢ、ＫＲＴ５、ＪＵＰ及びＰＸＮからなるグループから選択される１個又は２個以上の対照遺伝子の舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量の測定を行うためのプライマー対と、本発明の舌癌組織検体の分析方法を説明した取扱い説明書とからなることを特徴とする舌癌組織検体の分析用キットを提供する。【００３５】
本発明は、インテグリンα３及びＫＲＴ５と、インテグリンα３及びＪＵＰと、インテグリンβ４及びＪＵＰと、インテグリンβ４及びＫＲＴと、インテグリンβ５及びＡＣＴＢと、インテグリンβ５及びＰＸＮとからなるグループから選択される１組又は２組以上のインテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子の組合せの舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量の測定を行うためのプライマー対の組合せと、本発明の舌癌組織検体の分析方法を説明した取扱い説明書とからなることを特徴とする舌癌組織検体の分析用キットを提供する。【００３６】
本発明は、インテグリンα３、インテグリンβ４及びインテグリンβ５からなるグループから選択される１個又は２個以上のインテグリンファミリー遺伝子の舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量を行うためのプローブと、ＡＣＴＢ、ＫＲＴ５、ＪＵＰ及びＰＸＮからなるグループから選択される１個又は２個以上の対照遺伝子の舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量の測定を行うためのプローブと、本発明の舌癌組織検体の分析方法を説明した取扱い説明書とからなることを特徴とする舌癌組織検体の分析用キットを提供する。【００３７】
本発明は、インテグリンα３及びＫＲＴ５と、インテグリンα３及びＪＵＰと、インテグリンβ４及びＪＵＰと、インテグリンβ４及びＫＲＴと、インテグリンβ５及びＡＣＴＢと、インテグリンβ５及びＰＸＮとからなるグループから選択される１組又は２組以上のインテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子の組合せの舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量の測定を行うためのプライマー対と、本発明の舌癌組織検体の分析方法を説明した取扱い説明書とからなることを特徴とする舌癌組織検体の分析用キットを提供する。
【発明の効果】
【００３８】
本発明の舌癌の判定方法によれば、舌癌組織検体におけるインテグリンファミリー遺伝子と対照遺伝子の発現量、すなわちｍＲＮＡ量を測定し、両者の比により、舌癌、特に舌扁平上皮癌の悪性度を客観的かつ正確に判定することができる。舌癌組織検体の分析方法によれば、舌癌組織検体におけるインテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量／対照遺伝子のｍＲＮＡ量の比を臨床データと関連づけることにより、舌癌、特に舌扁平上皮癌の悪性度を客観的かつ正確に判定する上で有用な分析をすることができる。本発明の舌癌組織検体の分析用キットは、舌癌、特に舌扁平上皮癌の悪性度を客観的かつ正確に判定する上で有用な分析をすることを可能にする。【００３９】
それにより、データから予後不良と判定された症例については、従来臨床的に予後良好と判断されていた症例に対しても、より強力な術前術後の化学療法・放射線療法、手術における切除範囲の拡大、術前術後の経過観察における各種検査の判定を綿密に行うといった集中的な治療方針を行うことにより、癌制御率の改善が可能となる。また、予後良好と判定された症例については、過剰な治療・検査を避けることで、それぞれの患者に最良の医療サービスを提供することができる。【００４０】
そして、遺伝子レベルでの検討を加味して判定を行うことにより、高精度な判定を行うことができるため、医療費や背指針的な不安などの患者の負担を軽減することができる。結果として、社会的にも適正な医療が行われることによる医療費の削減をもたらすことが可能である。
【図面の簡単な説明】
【００４１】
【図１】本発明の実施例１における、主成分分析における第１主成分と第２主成分を用いた各変数の因子負荷量散布図である。
【図２】本発明の実施例１における、コックスの比例ハザードモデルにおける、舌扁平上皮癌組織内のITGB4/JUPの高低による２群間のカプランマイヤー生存曲線を示すグラフである。
【発明を実施するための最良の形態】
【００４２】
以下、本発明について詳細に説明する。【００４３】
本発明の舌癌の判定方法は、舌癌組織検体におけるインテグリンファミリー遺伝子の発現量、すなわちｍＲＮＡ量を測定し、インテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量／対照遺伝子のｍＲＮＡ量の比により、インテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量を標準化した数値により舌癌の悪性度を判定することを特徴とする。【００４４】
そして、前記インテグリンファミリー遺伝子は、ＩＴＧＡ３及び／又はＩＴＧＢ４及び／又はＩＴＧＢ５である。【００４５】
そして、前記インテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量の測定は、特定の方法に限定されるものではないが、リアルタイムＰＣＲ法がより好適に用いられる。本発明のｍＲＮＡ量の測定には、ノザンブロット法又は固相ハイブリダイゼーション法が用いられる場合がある。固相ハイブリダイゼーション法は、異なる遺伝子についてのプローブが２次元的に整列したアレイにｍＲＮＡ又はｍＲＮＡ由来の標識核酸をハイブリダイゼーションさせるマルチアレイハイブリダイゼーション法と、異なる遺伝子についてのプローブが不動化されたビーズにｍＲＮＡ又はｍＲＮＡ由来の標識核酸をハイブリダイゼーションさせるビーズハイブリダイゼーション法を含むが、これらに限定されない。【００４６】
本発明の舌癌の判定方法を実施するには、舌癌組織の一部からＲＮＡを抽出し、ｃＤＮＡを合成する。このｃＤＮＡを鋳型としてタックマン（TaqMan）（登録商標）プローブを用いた定量的リアルタイムＰＣＲによりインテグリンファミリー遺伝子群の発現定量を行う。つぎに、同時に対照に用いる各種遺伝子の発現定量を行う。そして、ＩＴＧＡ３、ＩＴＧＢ４、ＩＴＧＢ５遺伝子のｍＲＮＡ量を、各種対照遺伝子のｍＲＮＡ量を分母にとって標準化し、数値データを作成する。そして、この標準化した数値データを用いて、舌癌の悪性度を判定する。このように、インテグリン遺伝子のｍＲＮＡ量／対照遺伝子のｍＲＮＡ量の比により、癌の生物学的・臨床的性質を正確に把握、予測することができ、舌癌の臨床判定に用いることができる。【００４７】
そして、前記対照遺伝子はハウスキーピング遺伝子及び／又は細胞骨格分子遺伝子及び／又はアンカー蛋白遺伝子及び／又は細胞外基質遺伝子である。【００４８】
そして、前記対照遺伝子は、中でも、ＡＣＴＢが好適に用いられる。【００４９】
そして、前記対照遺伝子は、中でも、ＫＲＴ５が好適に用いられる。【００５０】
そして、前記対照遺伝子は、中でも、ＪＵＰ及び／又はＰＸＮが好適に用いられる。【００５１】
本発明に用いる、インテグリンファミリー遺伝子及び／又は対照遺伝子のｍＲＮＡ量をリアルタイムＰＣＲ法によって行うためのプライマー対は、国立遺伝学研究所の日本ＤＮＡデータバンク（ＤＤＢＪ）その他の機関のホームページから得られるそれぞれの遺伝子のｃＤＮＡのヌクレオチド配列に基づいて、本発明の技術分野の通常の技量を有する者に周知の方法により設計することができる。【００５２】
本発明に用いる、インテグリンファミリー遺伝子及び／又は対照遺伝子のｍＲＮＡをノザンブロット法又は固相ハイブリダイゼーション法によって行うためのプローブは、国立遺伝学研究所の日本ＤＮＡデータバンク（ＤＤＢＪ）その他の機関のホームページから得られるそれぞれの遺伝子のｃＤＮＡのヌクレオチド配列に基づいて、本発明の技術分野の通常の技量を有する者に周知の方法により設計することができる。【００５３】
このように、本発明における舌癌の判定方法により、舌癌、特に舌扁平上皮癌の悪性度をより客観的かつ正確に判定することができる。【００５４】
以下に本発明の実施例によって、本発明を詳細に説明するが、本発明はこれらの実施例により何ら制限されるものではない。なお、以下の実施例１における実験方法等は次の通りである。【００５５】
（対象症例）
遺伝子発現解析に用いた腫瘍検体は１９９９年から２００５年までに新潟大学医歯学総合病院歯科口腔外科、長岡赤十字病院歯科口腔外科、信州大学医学部歯科口腔外科において治療を施行した舌癌６６症例の生検あるいは手術切除時に採取した。それらは組織学的に扁平上皮癌の診断がなされており、ＴＮＭ分類、浸潤様式（Ｙ−Ｋ分類）、その他の詳細のデータを表１に示す。本発明における研究の実施計画は新潟大学歯学部倫理委員会で承認を受けるとともに、研究遂行に際しては日本文部科学省公布の臨床研究に関する倫理規定の内容を遵守した。患者の研究協力に際しては研究の主旨を説明し、インフォームドコンセントを得たうえで同意書を作成した。【００５６】
【表１】
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【００５７】
（ＲＮＡの抽出）
腫瘍組織はＲＮＡ  レイター(RNA Later)（アンビオン、ＴＥ、ＵＳＡ）に浸漬保存された。それらの腫瘍組織は特別な解剖（dissection）をせず、腫瘍実質細胞と線維芽細胞、血管内皮細胞、炎症細胞など多様な間質構成細胞から構成されていた。トータルＲＮＡ抽出はＴＲＩゾル  リージェント（TRIzol reagent）（インビトロジェン株式会社、カールスバッド、Ｃａ、ＵＳＡ）中でホモジェナイズの後（ウルトラツーラックス（Ultra―Turrax）Ｔ８、ＩＫＡ  ラボテクニック（Labortechinik）、スタウフェン、ドイツ)、同試薬の標準プロトコールに２回のフェノール沈殿処理（ＰＣＩ  シグマアルドリッチ株式会社、セントルイス、 ＵＳＡ)を付加して行われた。トータルＲＮＡ  ２μｇを鋳型として逆転写反応によって（スーパースクリプトII（Super Scropt II）、インビトロジェン株式会社、カールスバッド、Ｃａ、ＵＳＡ：標準プロトコールに従い）１本鎖ｃＤＮＡを合成した。【００５８】
（リアルタイムＰＣＲによる相対的遺伝子発現定量）
舌扁平上皮癌組織より合成されたｃＤＮＡを鋳型とし、定量的リアルタイムＰＣＲ（スマートサイクラー（Smart Cycler）、セフェイド、サニーベール、ＣＡ、ＵＳＡ）による遺伝子発現定量を行った。リアルタイムモニタリング（Real time monitoring）はタックマン（TaqMan）（登録商標）プローブ（タックマン（登録商標）ジーンエクスプレッションアッセイズ（Gene Expression Assays）、アプライドバイオシステムズ（Applied Biosystems）、ＣＡ、ＵＳＡ）を用い、タックマン（登録商標）ユニバーサルＰＣＲマスターミックス（Universal PCR Master Mix）（アプライドバイオシステムズ）にてＡＢＩ社標準プロトコール（９５℃／６００秒、９５℃／１５秒＋６０℃／６０秒×温度サイクル）で行った。標準となる舌癌組織のｃＤＮＡを鋳型として数段階の希釈系列(１:１０:１００:１０００:１００００:１０００００)を作成し、各濃度サンプルについて同様のプロトコールによるリアルタイムＰＣＲ（real time PCR）を行い、各遺伝子のスタンダードカーブを描記した。遺伝子のｍＲＮＡ量はスレッシホウルドサイクル（threshold cycle）（Ct値）からそれぞれのスタンダードカーブに基づいて定量された。【００５９】
解析の対象遺伝子としてＩＴＧファミリー遺伝子１１種、いわゆるハウスキーピング遺伝子(ＨＫＧ)３種、ＩＴＧのリガンドを含む細胞外基質遺伝子（ＥＣＭ）７種、ＩＴＧレセプターの細胞質側で機能するいわゆるアンカー蛋白(ＡＮＫ)および細胞骨格分子(ＣＳＫ)からなる４種を選定した（表２）。【００６０】
【表２】
2008044504.tif 000003
【００６１】
（統計学的解析）
臨床データと遺伝子発現データからなる各変数に基本統計量として平均値、標準偏差、歪度、尖度を算出し分布型を評価した後、各変数間の相関係数行列を算出した。前述の１１種のＩＴＧファミリー(ＩＴＧ)遺伝子の発現レベルをその他のＨＫＧ、ＥＣＭ、ＡＮＫおよびＣＳＫ遺伝子１４種の発現レベルで標準化した数値データについて、臨床的悪性度の指標としての頚部リンパ節転移の有無および死の転帰との関連をマンホイットニー（Mann-Whitney）検定で単変量的に解析した。この結果をもとに、多変量回帰分析における変数選択をステップワイズ法により行い、頚部リンパ節転移と転帰について高い関連（p≦0.01）が示唆されたＩＴＧ遺伝子発現比を続く多変量的な解析に用いた。臨床的パラメーターとして対象症例の年齢、性別、腫瘍の進展範囲に関しては腫瘍の大きさ、転移に関する項目として頚部リンパ節転移の有無と数、遠隔臓器転移、治療に関する情報として化学療法の有無と放射線治療の有無、臨床的経過として死の転帰の情報を用いた。【００６２】
多変量解析として全変数を用いた主成分分析を行い、変数間の関連性を検討した。ついで頸部リンパ節転移を目的変数とした多重ロジスティック回帰分析による関連因子検出と共に頸部転移に関する予測モデルの評価を行った。さらに生死の有無である転帰をエンドポイントとしたコックス（Cox）の比例ハザードモデルによる分析を行った。【００６３】
（組織学的観察）
遺伝子発現解析に用いたものと同一の腫瘍検体についてパラフィン切片のよるＨＥ組織染色所見を観察した。標本は１０％ホルマリン固定の後、通法に従い作成された。統計学的に臨床的悪性度と有意な関連が示唆された複数のマーカーについて、臨床的な経過と共に、その高低による形態学的所見を検討した。
【実施例１】
【００６４】
（統計学的解析）
１．単変量解析
各変数間の相関係数行列の所見では、背景要因間では、頸部リンパ節転移と放射線照射（r＝0.54）、遠隔臓器転移と死の転帰の間（r＝0.67）において比較的高い相関がみられた。ＩＴＧ遺伝子比の間では、ITGA3/JUPとITGA3/KRT5（r＝0.75）、ITGB5/LAMA3とITGB5/TNC（r＝0.52）、ITGB4/JUPとITGA3/GAPD（r＝0.57）ならびにITGB4/KRT5（0.91）、ITGB5/ACTBとITGB5/TNC（r＝0.64）、ITGB5/LAMA3（r＝0.69）ならびにITGB5/LAMA5（0.59）、ITGB5/LAMA4とITGB5/FN1（r＝0.60）の間でそれぞれ高い相関が示された。また背景要因と遺伝子との間では、転帰とITGB4/JUP（r＝0.53）との間でそれぞれ比較的高い相関が認められた。【００６５】
１４種の関連遺伝子によりそれぞれ１１種のＩＴＧ遺伝子発現レベルを標準化することにより算出した１５１項目の遺伝子発現比と頚部リンパ節転移の有無ならびに死の転帰の関係について行ったマンホイットニー（Mann-Whitney）検定の結果を表３と表４に示す。【００６６】
【表３】
2008044504.tif 000004
【００６７】
【表４】
2008044504.tif 000005
【００６８】
頚部リンパ節転移に関してはITGA3とITGB5において有意性を示す遺伝子比が多く認められた。標準化に用いる遺伝子種ではKRT5とJUPによる場合に有意性を示す遺伝子比項目が多く見られた。ＩＴＧファミリー遺伝子とＥＣＭ遺伝子群、アンカー蛋白のＰＸＮの遺伝子発現レベルはリンパ節転移や転帰の悪傾向に伴い概して上昇する傾向が見られた。唯一ITGB5のみは臨床経過の悪化に伴い発現レベルを低下する傾向があり、結果的にITGB5が悪性所見に伴い転写量を上昇するＥＣＭ分子とアンカー蛋白遺伝子でまとまった有意性を示すことが予想された。死の転帰についてはITGB4とITGB5に有意性を示す遺伝子比が集中した。この結果において、頚部リンパ節転移あるいは死の転帰において有意水準１％以下を示したITGA3/GAPD、ITGA3/KRT5、ITGA3/JUP、ITGB4/KRT5、ITGB4/JUP、ITGB5/ACTB、ITGB5/FN1、ITGB5/TNC、ITGB5/LAMA3、ITGB5/LAMA4、ITGB5/LAMA5、ITGB5/PXNを多変量的統計解析に用いた。【００６９】
２．多変量解析
主成分分析：臨床データおよび遺伝子発現データを変数とした主成分分析の結果では固有値が１以上の主成分は第１主成分から第７主成分まであり、累積寄与率は７２．９％を示した。各主成分と変数との因子負荷量が０．５以上を示した変数を２つ以上含む主成分は第１主成分から第３主成分までで、固有値はいずれも２以上だった（表５）。【００７０】
【表５】
2008044504.tif 000006
【００７１】
第１主成分（Z-1）はITGB3〜5に関する各種遺伝子比ならびに死の転帰の因子負荷量が高い絶対値を示した。プラス符号で大きな値はITGB4/JUP、ITGB4/KRT5、ITGA3/GAPD、マイナス符号ではITGB5/ACTB、ITGB5/LAMA5の遺伝子発現情報において検出された。第２主成分(Z-2)ではITGA3の遺伝子比とともに頸部リンパ節転移の有無に関する要因の因子負荷量が高い値を示した。死の転帰を反映する第一主成分とは対照的にＩＴＧ遺伝子発現比の中でITGA3/JUPとITGA3/KRT5が孤立的にプラス符号で高い因子負荷量値を示すと共に腫瘍長径（サイズ）、化学療法が比較的高い因子負荷量値を示した。第３主成分(Z-3)では遠隔臓器転移と死の転帰が大きな因子負荷量値を示し、一方でＩＴＧ遺伝子発現比には高い値を示すものはなく、この成分が臨床パラメーター間の関連を表すことが理解された。この第３主成分では化学療法の因子がマイナス符号で大きな因子負荷量値を示した。【００７２】
第１主成分と第２主成分の因子負荷量散布図で、前述のごとく横軸Z-1の第１主成分は「死の転帰」に関する遺伝子の要因軸、縦軸Z-2の第２主成分は「頸部リンパ節転移」に関する遺伝子の要因軸と解釈された（図１）。転帰の要因軸（横軸Z-1）において、相関を示すプラス符号の因子負荷量はITGB4とITGA3の遺伝子比群に認められ、逆相関を示すマイナス符合の因子負荷量はITGB5の遺伝子比からなり、それぞれ図の右半球と左半球に分布した。一方、頸部リンパ節転移の要因軸（縦軸Z-2）においてＩＴＧ遺伝子比の多くは０の周囲に分布するなかで、ITGA3/JUPとITGA3/KRT5のみが頚部リンパ節転移と同じレベルの因子負荷量域に分布した。加えて、腫瘍の長径（サイズ）は第２主成分（縦軸）において頚部リンパ節転移の要因に近接するものの、第１主成分（横軸）においては比較的小さな絶対値の因子負荷量域に位置した。【００７３】
頸部リンパ節転移に関する多重ロジスティック回帰分析：単変量解析ならびに主成分分析の結果を元に、頸部リンパ節転移の有無を目的変数とした多重ロジスティック回帰分析を行った。その結果、頸部リンパ節転移に有意に影響している要因として、ITGA3/JUPとITGB5/PXNが検出された（表６）。【００７４】
【表６】
2008044504.tif 000007
【００７５】
この内、頚部リンパ節転移に対し前者の遺伝子は正の方向、後者の遺伝子は負の方向に影響していた。これらの内、ITGA3/JUPの偏回帰係数ならびにオッズ比が最も大きな値を示した。頸部リンパ節転移の有無に関する予測精度の評価では、本モデルによる有病正診率は７４．３％、無病正診率は７１．０％、正確度は７２．７％を示した（表７）。【００７６】
【表７】
2008044504.tif 000008
【００７７】
生死の転帰についてのコックス（Cox）の比例ハザードモデル：転帰、すなわち生死をエンドポイントとしたコックス（Cox）の比例ハザードモデルによる回帰分析を行った結果、死の転帰に有意に影響している要因としてITGB4/JUPが検出された（表８）。【００７８】
【表８】
2008044504.tif 000009
【００７９】
ＲＯＣ曲線を用いてITGB4/JUPの最適カットオフ（cut-off）値を求めて２値化し、カプランマイヤー（Kaplan-Meier）法により各群の生存曲線を描出した（図２）。２群間における生存関数のログ・ランク検定およびウィルコクスン（Wilcoxon）検定で、ITGB4/JUPが０．１５未満の群がそれ以上の群より高い生存率を示し、いずれも有意水準０．１％未満で有意差が認められた。【００８０】
（遺伝子発現解析結果に基づく組織学的所見の検討）
遺伝子発現解析の結果よりITGB4/JUPとITGA3/JUPの値に基づき症例を選択した。ITGB4/JUPが高値を示した腫瘍は頚部リンパ節多発転移の後、遠隔臓器転移の結果死亡の経過をたどる場合が多かった。生存症例でも原発腫瘍切除後に頚部後発転移を来たすなど臨床的後悪性を示す経過が観察された。組織所見にはすべてが一定の組織所見を示さなかったが、小細胞包巣から単一細胞が拡散性に浸潤する所見がITGB4/JUPが高値の腫瘍でのみ観察された組織学的特徴だった。細胞の分化レベルは全般に低分化と判断される腫瘍実質からなるものから高分化領域と低分化領域を混在するものが含まれた。炎症系細胞の浸潤が強い場合などに腫瘍浸潤像を判別することが困難であるが、全般に浸潤先端部における高浸潤所見では一致しており、組織学的には高悪性を示した。ITGA3/JUPが高値を示した腫瘍は小細胞包巣レベルでの浸潤所見が主に観察された。ITGB4/JUP高値を併発する場合以外に遠隔臓器転移は認められなかった。細胞の分化度は低分化から高分化を混在したが、ITGB4/JUP高値の腫瘍より概して分化度は高いといえた。上皮細胞として未分化で比較的均質な腫瘍細胞を有するITGB4/JUP高値の腫瘍組織と比較すると、腫瘍細胞の異型性はむしろさまざまであるものの、小腫瘍細胞包巣単位での潤様式についてはほぼ一定の組織学的傾向として観察された。ITGB4/JUP、ITGA3/JUPともに低値の組織像で浸潤所見は認められず、基底膜構造や細胞間橋構造など上皮の基本的所見は維持されていた。【００８１】
（考察）
舌癌組織における遺伝子の発現レベルを基にした、悪性度精密判定システムの確立を目的として、ＩＴＧレセプターのαおよびβサブユニットをコードする１１種類のＩＴＧ遺伝子についてバイオマーカー候補遺伝子の検討を行った。遺伝子発現データの統計学的処理からITGA3、ITGB4およびITGB5の３遺伝子の発現データが舌癌の臨床経過によく対応する可能性が示された。統計学的にいずれのＩＴＧ遺伝子発現レベルもリンパ節転移の成立に関与が認められ、組織学的悪性所見ともある程度の相関を示していた。本発明における研究の結果において着目すべき点は舌癌の経過に伴い見出されるリンパ節転移には臨床的に頚部リンパ節転移のレベルで制御可能なものと将来的に遠隔臓器転移から死の転帰に深く結びつくものが共に存在し、前者はITGA3、後者はITGB4とITGB5の遺伝子発現レベルにより定義される可能性が示された点にある。【００８２】
本発明者らが行った遺伝子発現定量は細胞成分の分離を行わず、バイオプシー時や手術時に切除された全腫瘍組織を対象とした。そのため、はじめの段階で遺伝子検体を一定の条件に整えることが困難だった。集められた遺伝子検体はさまざまな濃度、分解レベル、組織構成の違い、採取部位の偏りを内包することを前提としていた。そのような条件下で臨床上有効な遺伝子発現情報を採取するための工夫は、実用上避けることの出来ない課題と思われた。条件が異なる遺伝子発現定量結果を効率的に比較する方法として、従来、組織一般に発現しているいわゆるハウスキーピング遺伝子(ＨＫＧ)発現レベルに対する比化、すなわち標準化がなされてきた。しかし昨今、定量的リアルタイムＰＣＲの一般化に伴い、それらＨＫＧの発現レベルは組織間あるいは組織内採取部位において大きなばらつきを有し、標準化に用いる遺伝子として必ずしも適さないことが指摘されるようになった。このような背景に加え、扁平上皮癌（ＳＣＣ）組織を構成する上皮および腫瘍細胞、繊維芽細胞、炎症性浸潤細胞などで特徴的な局在を示す各種ＩＴＧファミリー遺伝子群の発現レベル変動を効率的に抽出する組み合わせを選定することを目的に複数の遺伝子発現による標準化を試みた。ＨＫＧに加えて、ＩＴＧ分子との間の共局在性や機能的かかわりを基に細胞間基質を構成する各種間質（ＥＣＭ）分子、細胞骨格分子(ＣＳＫ)やアンカー蛋白遺伝子(ＡＮＫ)による標準化を検討した。その結果、頚部リンパ節転移および死の転帰についてのマンホイットニー（Mann Whitney）検定による単変量的な解析で、ITGA3、ITGB4とITGB5においてKRT5、JUPおよびPXNによる標準化データにおいて高い有意性が検出された。ITGA3とITGB4は口腔粘膜において主に上皮内に局在する分子であり、その標準化において上皮系細胞のＣＳＫや細胞膜上のＩＴＧやカドヘリンなどの接着分子と細胞内フィラメントをつなぐＡＮＫであるＫＲＴ５やＪＵＰが症例間の遺伝子発現データの比較に際しての標準化分子として有用である可能性が示された。将来的にそれらの分子間の局在性を詳細に検討することによって、提示された有意性の機能的な裏づけをもとめる必要が残されている。【００８３】
主成分分析による解析は多様な局面から因子間の結びつきを総覧する上で有用であった。死の転帰に対応する第一主成分において、遠隔臓器転移や頚部リンパ節多発転移とともにITGB4/JUPやITGB5/ACTBを代表とするＩＴＧ遺伝子発現比が大きい因子負荷量絶対値を示した。このことは、これらのＩＴＧ遺伝子発現レベルが死の転帰に対して正あるいは逆相関することを意味している。一方、頚部リンパ節転移に対応を示す第２主成分において、ITGA3/KRT5とITGA3/JUPが孤立的に高い因子負荷量を示したことは、これらが独立した因子として頚部リンパ節転移の成立に関連することを示唆している。これらの因子間における相互関係は第１主成分と第２主成分の因子負荷量散布図でよく表現される。腫瘍の長径（図1におけるサイズ:エ）が第２主成分軸（縦軸）付近で比較的大きな因子負荷量域に位置することは、腫瘍の大きさは死の転帰に直接結びつかないが、頚部リンパ節転移成立に有る程度影響することを示している。これに近接して同じく第２主成分軸の周囲に位置するITGA3/KRT5（シ）とITGA3/JUP（ス）によって表現される値は腫瘍の大きさに相関し、第１主成分軸（横軸）で示される死の転帰には関連していない。これらは頚部郭清など適切な治療が行われた場合に制御可能な頚部リンパ節転移能を反映するといえるであろう。その逆に第１主成分軸上において、ITGB4とITGB5の発現比レベルによって定義されるリンパ節転移能は同じく頚部リンパ節転移、とりわけ頚部リンパ節多発転移（カ）、に関わるが、同時に遠隔臓器転移や局所再発に強く関連するために最終的に死の転帰に結びついていると解釈される。第３主成分は第１主成分と同様に転帰と遠隔臓器転移の要因軸を表すが、化学療法の実施がマイナス符号で大きな因子負荷量を示したことは化学療法実施が遠隔臓器転移と転帰に逆相関すること、言い換えると化学療法実施が遠隔転移や死の転帰を抑制している可能性を意味している。【００８４】
多重ロジスティック回帰分析により頸部リンパ節転移に有意に影響する要因としてITGA3/JUPとITGB5/PXNが検出された。ITGA3/JUPは前述の主成分分析の結果で遠隔転移や死の転帰に関与しないリンパ節転移の傾向を示す因子の一つであり、一方ITGB5/PXNは遠隔臓器転移あるいは死の転帰に関連する要因軸を反映する因子である。これらの内、ITGA3/JUPの偏回帰係数ならびにオッズ比が最も大きな値を示し、リンパ節転移一般において大きな影響を持つことを示している。この所見はリンパ節転移のほとんどが遠隔転移や局所再発による制御困難に陥るものではなく、多くは頚部リンパ節レベルで抑止されるものであることに整合すると考えられる。【００８５】
このように、リンパ節転移は二つの独立した転移性に基づく効果の総和として表現される現象であることが多重ロジスティック解析においても示される結果となった。これら二つの要因をもとに算出される頚部リンパ節転移回帰モデルによる頸部リンパ節転移の予測精度は有病正診率７４．３％、無病正診率７１．０％、正確度７２．７％を示したものの、臨床応用に要する必要レベルを満たすものとは言い難い。しかしながら、多様な細胞成分によって構成される、きわめて複雑な生物学的作用の結果であるリンパ節転移において、ＩＴＧ分子に関係する２要因のみによる判定としては予想を超える高い正確度と思われる。将来的に他の生物学的現象に関与する多様な分子群を加えた予測モデルに発展させることによって、正確性を実用域に立ち上げることが今後の課題である。【００８６】
死の転帰にかかわる要因についての解析としておこなったコックス（Cox）の比例ハザードモデルにおいて、多変量的な解析にも関わらず唯一ITGB4/JUPのみが検出された。この結果は主成分分析の因子負荷量散布図において第一主成分(Z-1)、死の転帰に対応する要因軸に近接してITGB4とITGB5の遺伝子発現比の項目が分布したことに整合し、ITGB4とITGB5の項目が逆相関しつつ死の転帰あるいは遠隔臓器転移を説明する近似の要因として判定されたことを示している。それらを代表する主因子としてITGB4/JUPが示したハザード比1055671、有意確立p<0.0001、同様にカプランマイヤー法による累積生存率曲線とログ・ランク検定においても、この因子が持つ高い説明力が明らかにされた。【００８７】
ＩＴＧファミリー分子は従来腫瘍の性質に影響を及ぼす機能について比較的多くの報告がなされてきた。ＩＴＧＡ３はＩＴＧβ１サブユニットと対を形成し、組織内において間質分子フィブロネクチン（Fibronectin）（ＦＮ）、LAMA3を構成成分とするラミニン−５（Laminin-5）（ラミニン（Laminin）α3β１γ１）、LAMA5を構成成分とするラミニン−１０（Laminin-10）（ラミニン（Laminin）α5β1γ１）およびラミニン−１１（Laminin-11）（ラミニン（Laminin）α5β2γ1）に対するレセプターとして機能する。ＩＴＧＡ３発現は主に上皮基底細胞をはじめとし肺、子宮、食道、腎糸球体など広い分布が観られ、その機能は正常では細胞の接着、運動、アポトーシスに関与するといわれている。子宮癌や大腸癌においてＩＴＧＡ３をサブユニットとしてもつインテグリン（Integrin）α３β１発現状態は癌細胞の転移や病理組織学的グレードに影響することについて報告がなされている。一方ＩＴＧＢ４の発現も上皮細胞や間葉ではシュワン細胞、血管内皮細胞などで発現が認められ、インテグリン（Integrin）α６β４レセプターはラミニン−５（laminin-5）に対するレセプターとして機能する。細胞接着の他、創傷治癒や神経伸張時、胎児期にも発現が確認される事から、細胞の発生・分化・増殖において広く関与していると考えられる。ＩＴＧＢ５も上皮基底細胞に認められ、インテグリン（Integrin）αｖβ５のサブユニットを形成しＦＮ、ビトロネクチン（Vitronectin）とのレセプターとして機能する。正常細胞において細胞の接着、増殖、運動、脈管形成の機能に関わるとされ、浸潤性の高い胃癌において強く発現することが知られている。は腫瘍の増殖と転移の成立において腫瘍組織内への血管新生は重要な現象としてあげられる。これまでの研究においてITGB4が血管内皮細胞において発現し、その細胞遊走と浸潤をつかさどる因子として提示されている。そのノックアウトマウスにおいては腫瘍組織に隣接する血管の新生が著しく阻害されることが示されている。逆にＩＴＧＢ５についてはＩＴＧＢ５のノックアウトマウスでは腫瘍細胞周囲への血管の新生が増強されることから、腫瘍組織への血管新生に対し抑制作用が示されている。本発明における研究においてはＩＴＧＢ４発現比の上昇とＩＴＧＢ５発現比の低下が遠隔臓器転移と死の転帰にかかわることが示されたが、これらのインテグリン発現情報が血管新生の活発化による腫瘍の血管内への移行と腫瘍増殖活発化の現象を反映していることが可能性として想起される。今後これらのメカニズムについては精査が必要と考えている。【００８８】
従来、遠隔転移性の予想や生命予後の予測のうえで組織学的判定のみでは基準が不明確であった。組織学的所見によっても腫瘍が有する高悪性をある程度の割合で予想することが可能であるが、今回示したようにITGB4/JUPとITGA3/JUPの高低による分類で組織像は多様な形態を呈し、すなわち組織像のみでは遠隔転移の可能性や転帰について再現性のある予後判定が難しい場合がしばしばあった。今回示したように頚部リンパ節転移には遠隔転移に結びつきにくいものと、密接な関連を有する少なくとも２通りの因子が関与していることが示唆された。遺伝子発現データはいわば口腔癌の治療に際してもっとも苦慮するこれらの問題点にこれまでにない客観的な情報をもたらすことが期待できる。舌癌は口腔癌の約半数を占め、比較的早期から転移を生ずる性質を持っているため、Ｔ１−Ｔ２症例といえども潜在するリンパ節転移や遠隔転移を予測する手段の実用化による利益が非常に大きいと考えられる。従来の研究と共に本発明における研究において化学療法による遠隔転移の抑制効果の可能性が示されており、正確に腫瘍の性質を把握した上での治療計画は制御率向上の上できわめて重要な意味を有する。頚部リンパ節転移、遠隔臓器転移の危険性や腫瘍の浸潤性についての情報提供のシステム構築による総体的な利益、生存率やＱＯＬの改善、医療費の適正化等、もたらされる利益は非常に大きいと考えられる。
【図１】
2008044504.tif 000010
【図２】
2008044504.tif 000011
【手続補正書】
【提出日】平成20年11月17日(2008.11.17)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
インテグリンα３及びＪＵＰと、インテグリンβ４及びＪＵＰと、インテグリンβ５及びＰＸＮとからなるグループから選択される１組又は２組以上のインテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子の舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量を測定し、前記インテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量の比により舌癌の悪性度を判定することを特徴とする舌癌の判定方法。
【請求項２】
前記インテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量の測定をリアルタイムＰＣＲ法によって行うことを特徴とする請求項１に記載の舌癌の判定方法。
【請求項３】
前記インテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量の測定をノザンブロット法又は固相ハイブリダイゼーション法によって行うことを特徴とする請求項１に記載の舌癌の判定方法。
【請求項４】
インテグリンα３及びＪＵＰと、インテグリンβ４及びＪＵＰと、インテグリンβ５及びＰＸＮとからなるグループから選択される１組又は２組以上のインテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子の舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量を測定するステップと、前記インテグリンファミリー遺伝子のｍＲＮＡ量／対照遺伝子のｍＲＮＡ量の比を臨床データと関連づけるステップとを含むことを特徴とする舌癌組織検体の分析方法。
【請求項５】
前記臨床データは、ＴＮＭ分類と、Ｙ−Ｋ分類と、化学療法へのレスポンスと、放射線療法へのレスポンスと、予後とからなるグループから選択される、１種類または２種類以上のデータであることを特徴とする請求項４に記載の舌癌組織検体の分析方法。
【請求項６】
前記インテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量の測定はリアルタイムＰＣＲ法によって行うことを特徴とする請求項４又は５に記載の舌癌組織検体の分析方法。
【請求項７】
前記インテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子のｍＲＮＡ量の測定はノザンブロット法又は固相ハイブリダイゼーション法によって行うことを特徴とする請求項４又は５に記載の舌癌組織検体の分析方法。
【請求項８】
インテグリンα３及びＪＵＰと、インテグリンβ４及びＪＵＰと、インテグリンβ５及びＰＸＮとからなるグループから選択される１組又は２組以上のインテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子の組合せの舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量の測定を行うためのプライマー対の組合せと、請求項４、５又は６に記載の舌癌組織検体の分析方法を説明した取扱い説明書とからなることを特徴とする舌癌組織検体の分析用キット。
【請求項９】
インテグリンα３及びＪＵＰと、インテグリンβ４及びＪＵＰと、インテグリンβ５及びＰＸＮとからなるグループから選択される１組又は２組以上のインテグリンファミリー遺伝子及び対照遺伝子の組合せの舌癌組織検体におけるｍＲＮＡ量の測定をノザンブロット法又は固相ハイブリダイゼーション法によって行うためのプローブの組合せと、請求項４、５又は７に記載の舌癌組織検体の分析方法を説明した取扱い説明書とからなることを特徴とする舌癌組織検体の分析用キット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１４】
［００６６］
［表３］
2008044504.tif 000012
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１５】
［００６７］
［表４］
2008044504.tif 000013
【国際調査報告】
2008044504.tif 000014
2008044504.tif 000015
2008044504.tif 000016
2008044504.tif 000017
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