【手続補正書】
【提出日】平成16年10月7日(2004.10.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】    内皮細胞の遊走を阻害し、そして配列番号１２のアミノ酸２８７から３６５までの長さにわたって少なくとも９５％アミノ酸同一性を共有するアミノ酸配列を含んでなる、実質的に精製したポリペプチド。
【請求項２】    ネクチン−１に結合し、そして配列番号１２のアミノ酸２８７から３６５までの長さにわたって少なくとも９５％アミノ酸同一性を共有するアミノ酸配列を含んでなる、実質的に精製したポリペプチド。
【請求項３】    ポリペプチドが、配列番号１２のアミノ酸７４から３６５までの長さにわたって９５％または９９％アミノ酸同一性を共有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項１または２に記載のポリペプチド。
【請求項４】    ポリペプチドが、配列番号１２のアミノ酸５８から３６５まで、および配列番号１２のアミノ酸７４から３６５まで、からなる群から選択されるアミノ酸配列を含んでなる、請求項１ないし３のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項５】    ポリペプチドが、さらにＦｃポリペプチド、ロイシンジッパー、またはペプチドリンカーを含んでなる、請求項１ないし４のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項６】    ポリペプチドが、
（ａ）配列番号１２のアミノ酸５８からＣ末端までにわたるアミノ酸配列：
（ｂ）配列番号１４のアミノ酸５８からＣ末端までにわたるアミノ酸配列；
（ｃ）配列番号１６のアミノ酸５８からＣ末端までにわたるアミノ酸配列；および
（ｄ）配列番号３１のアミノ酸５８からＣ末端までにわたるアミノ酸配列；
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含んでなる、請求項１ないし４に記載のポリペプチド。
【請求項７】    請求項１ないし６のいずれか１項に記載のポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチド。
【請求項８】    （ａ）配列番号７、９、１１、または３０の配列を含んでなるポリヌクレオチド；
（ｂ）配列番号９または１１のほぼヌクレオチドｘ1から１０９８、ここでｘ1は１および１１５の間のヌクレオチドである、配列番号９または１１のほぼヌクレオチド１７２から４５６、配列番号９または１１のほぼヌクレオチド１７２から７５０、配列番号９または１１のほぼヌクレオチド１７２から１０２６、配列番号９または１１のほぼヌクレオチド１７２から１０９８、配列番号９または１１のほぼヌクレオチド２２２から４５６、配列番号９または１１のほぼヌクレオチド２２２から７５０、配列番号９または１１のほぼヌクレオチド２２２から１０２６、配列番号９または１１のほぼヌクレオチド２２２から１０９８、配列番号９または１１のほぼヌクレオチド５６７から７５０、配列番号９または１１のほぼヌクレオチド５６７から１０２６、配列番号９または１１のほぼヌクレオチド５６７から１０９８、配列番号９または１１のほぼヌクレオチド８６１から１０２６、および配列番号９または１１のほぼヌクレオチド８６１から１０９８からなる群より選択される配列を含んでなるポリヌクレオチド；
（ｃ）内皮細胞の遊走を阻害するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであって、前記ポリヌクレオチドは、（ａ）または（ｂ）のポリヌクレオチドの相補鎖に非常に（ｈｉｇｈｌｙ）ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、前記ポリヌクレオチド；
（ｄ）ネクチン−１に結合するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであって、前記ポリヌクレオチドは（ａ）、（ｂ）または（ｃ）のポリヌクレオチドの相補鎖に非常に（ｈｉｇｈｌｙ）ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、前記ポリヌクレオチド；
（ｅ）配列番号７、９、１１、または３０の配列に相補的な核酸配列を含んでなるポリヌクレオチド；および
（ｆ）ＴがＵであることも可能である、（ａ）から（ｅ）のヌクレオチド配列のいずれかを含んでなるポリヌクレオチド；
からなる群から選択される、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項９】    Ｆｃポリペプチド、ロイシンジッパーポリペプチド、およびペプチドリンカーからなる群から選択されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドに、機能可能であるように連結した、請求項８の配列を含んでなる、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１０】    請求項７ないし９のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドを含んでなる、発現ベクター。
【請求項１１】    請求項７ないし９のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドまたは請求項１０に記載の発現ベクターを含有するように、遺伝子工学的に処理した、組換え宿主細胞。
【請求項１２】    請求項７ないし９のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドにコードされるポリペプチドを産生する方法であって、請求項１１に記載の宿主細胞をそのポリペプチドの発現を促進する条件下で培養することを含んでなる、前記方法。
【請求項１３】    さらに、ポリペプチドを実質的に精製することを含んでなる、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】    請求項１ないし６のいずれか１項に記載のポリペプチドを産生する方法であって：
（ａ）前記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含んでなる組換え宿主細胞を培養し；
（ｂ）前記ポリペプチドを実質的に精製する；
ことを含んでなる、前記方法。
【請求項１５】    請求項１２ないし１４のいずれか１項に記載の方法により産生されるポリペプチド。
【請求項１６】    請求項１ないし６および１５のいずれか１項に記載のポリペプチドおよび医薬的に許容可能なキャリアーを含んでなる、組成物。
【請求項１７】    請求項１ないし６および１５のいずれか１項に記載のポリペプチドに特異的に結合する、実質的に精製した抗体。
【請求項１８】    モノクローナル抗体である、請求項１７に記載の抗体。
【請求項１９】    ヒトまたはヒト化抗体である、請求項１７に記載の抗体。
【請求項２０】    請求項１ないし６および１５のいずれか１項に記載のポリペプチドの生物学的活性を遮断する、請求項１７に記載の抗体。
【請求項２１】    請求項１ないし６および１５のいずれか１項に記載のポリペプチドの活性を変調する剤を同定する方法であって、
（ａ）剤およびポリペプチドが相互作用するような条件下で、剤と、請求項１ないし６および１５のいずれか１項に記載のポリペプチドを接触させ；そして
（ｂ）対照に比較して、剤の存在下でのポリペプチドの活性を測定する、ここで活性の変化が、ポリペプチドの活性を変調する剤の指標となる；
ことを含んでなる、前記方法。
【請求項２２】    剤が、抗体、小分子、ペプチド、およびペプチド疑似体（ｐｅｐｔｉｄｏｍｉｍｅｔｉｃ）からなる群より選択される、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】    活性が、ネクチン−１結合活性、細胞接着活性、接着結合形成活性、上皮性もしくは内皮性関門機能活性、内皮、上皮、もしくは平滑筋細胞増殖または遊走活性、およびウイルスポリペプチド結合活性からなる群より選択される、請求項２１に記載の方法。
【請求項２４】    ネクチン−１ポリペプチドを、請求項１ないし６および１５のいずれか１項に記載のポリペプチドと接触させることを含んでなる、ネクチン−１ポリペプチドの活性を変調する方法。
【請求項２５】    ネクチン−１ポリペプチドおよび請求項１ないし６および１５のいずれか１項に記載のポリペプチド間の結合を変調する剤を同定する方法であって、ネクチン−１ポリペプチドを含有する試料を、剤と接触させ、そして対照試料に比較して、ネクチン−１ポリペプチドと該ポリペプチドの相互作用を測定する、ここで対照と比較した、ネクチン−１ポリペプチドおよび該ポリペプチド間の結合の変化が、結合を変調する剤の指標となる、前記方法。
【請求項２６】    剤が、ポリペプチド、ペプチド、抗体、ペプチド擬似体、および小分子からなる群より選択される、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】    細胞増殖または遊走を変調する方法であって、ネクチン−１活性または発現を変調する剤と細胞を、細胞および剤が相互作用するような条件下で接触させることを含んでなる、前記方法。
【請求項２８】    細胞が、内皮細胞、上皮細胞、および平滑筋細胞からなる群より選択される、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】    平滑筋細胞が血管平滑筋細胞である、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】    剤が、ペプチド、ポリペプチド、ペプチド擬似体、ポリヌクレオチド、抗体、および小分子からなる群より選択される、請求項２７に記載の方法。
【請求項３１】    ポリペプチドが、請求項１ないし６および１５のいずれか１項に記載の可溶性ポリペプチドである、請求項３０に記載の方法。
【請求項３２】    血管形成を阻害するための、請求項１ないし６および１５のいずれか１項に記載のポリペプチドまたは請求項１６に記載の組成物。
【請求項３３】    ポリペプチドが、
（ａ）配列番号１２のほぼアミノ酸ｘ1から３６５、ここでｘ1は１および３９の間のアミノ酸である、配列番号１２のほぼアミノ酸５８から３６５、配列番号１２のほぼアミノ酸７４から３６５、配列番号１２のほぼアミノ酸１８９から３６５、および配列番号１０または１２のほぼアミノ酸２８７から３６５、からなる群より選択される配列を含んでなるポリペプチド；および
（ｂ）ネクチン−１に結合する、（ａ）のフラグメント；
からなる群より選択される、請求項３２に記載のポリペプチドまたは組成物。
【請求項３４】    内皮増殖、遊走、または血管形成状態を治療するための、請求項１ないし６および１５のいずれか１項に記載のポリペプチドまたは請求項１６に記載の組成物。
【請求項３５】    治療される内皮増殖、遊走、または血管形成状態が、虚血、アテローム性動脈硬化症、虚血−再灌流傷害、脳卒中、血栓症、再狭窄、および腫瘍増殖からなる群より選択される、請求項３４に記載のポリペプチドまたは組成物。
【請求項３６】    ウイルス感染を治療するための、請求項１ないし６および１５のいずれか１項に記載のポリペプチドまたは請求項１６に記載の組成物。
【請求項３７】    治療されるウイルス感染がヘルペスウイルス感染である、請求項３６に記載のポリペプチドまたは組成物。
【請求項３８】    細胞接着活性、接着結合形成活性、上皮性もしくは内皮性関門機能活性、内皮、上皮、もしくは平滑筋細胞増殖または遊走活性、あるいはウイルスポリペプチド結合活性を減少させるための、請求項１ないし６および１５のいずれか１項に記載のポリペプチドまたは請求項１６に記載の組成物。
【請求項３９】    細胞接着活性、接着結合形成活性、上皮性もしくは内皮性関門機能活性、内皮増殖もしくは遊走活性；ウイルスポリペプチド結合活性、または血管形成に関連する疾患または障害を治療するための請求項１ないし６および１５のいずれか１項に記載のポリペプチド、請求項１６に記載の組成物、または請求項１７に記載の抗体。
【請求項４０】    治療される上皮性または内皮性関門機能障害が、炎症、敗血症、浮腫、糖尿病網膜症、喘息、アレルギー、同種移植片拒絶、癌細胞転移、腎臓におけるマグネシウム輸送欠陥などの傍細胞輸送障害、および炎症性腸疾患からなる群より選択される、請求項３９に記載のポリペプチド、組成物または抗体。
【請求項４１】    ポリペプチドが、配列番号１４または１６に示す配列を含んでなる、請求項２５ないし３１のいずれか１項に記載の方法、または請求項３２ないし４０のいずれか１項に記載のポリペプチドもしくは組成物。
【請求項４２】    ポリペプチドが多量体の形である、請求項２５ないし３１のいずれか１項に記載の方法、または請求項３２ないし４０のいずれか１項に記載のポリペプチドもしくは組成物。
【請求項４３】    多量体が二量体または三量体である、請求項４２に記載の方法、ポリペプチドまたは組成物。
【請求項４４】    多量体が、Ｆｃポリペプチド、ロイシンジッパー、またはペプチドリンカーを含んでなる、請求項４２に記載の方法、ポリペプチドまたは組成物。