【手続補正書】
【提出日】平成17年3月24日(2005.3.24)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  ２つまたはそれ以上の成分ポリマーから形成される組成物であって、該組成物は、
ａ．成分プローブ用ポリマーは、標的配列にハイブリダイズするプローブ用セグメントと、少なくとも１つの他の成分ポリマーと複合体を形成するのに適した１つまたはそれ以上の相互作用性の基とを含んでなる、少なくとも１つの成分プローブ用ポリマー；
ｂ．少なくとも、１つまたはそれ以上の相互作用性の基を含む、少なくとも１つの成分アニーリングポリマー（この成分ポリマーの相互作用性の基は、複合体を形成しこれを安定化させる）；および
ｃ．複合体の形成が、セットのドナー残基とアクセプター残基との間のエネルギー移動を促進するように、少なくとも２つの成分ポリマーの各々は、そのセットの少なくとも１つの残基で結合している、ドナー残基とアクセプター残基の少なくとも１つのセット；
を含むが、ただし、組成物の成分ポリマーの少なくとも１つは、非核酸ポリマーである、上記組成物。
【請求項２】  ａ．成分ポリマーはそれぞれ、組成物を形成しこれを安定化させる相互作用性の基を含む、少なくとも２つの成分ポリマー；および
ｂ．成分ポリマーが複合体形成していない時と比較して、検出可能な形で異なるように、複合体の形成が、セットのドナー残基とアクセプター残基との間のエネルギー移動を促進するように、少なくとも２つの成分ポリマーは、そのセットの少なくとも１つの残基で結合している、ドナー残基とアクセプター残基の少なくとも１つのセット；
を含む組成物であるが、ただし、酵素が作用すると解離する基質を形成することをさらに特徴とする、上記組成物。
【請求項３】  成分ポリマーの少なくとも１つは、表面に固定化されているかまたはつながれている、請求項１または２に記載の組成物。
【請求項４】  すべての成分ポリマーは非核酸ポリマーである、請求項１から３のいずれかに記載の組成物。
【請求項５】  成分ポリマーの少なくとも１つはＰＮＡである、請求項１から３のいずれかに記載の組成物。
【請求項６】  すべての成分ポリマーはＰＮＡである、請求項１から３のいずれかに記載の組成物。
【請求項７】  成分ポリマーのＰＮＡサブユニットは、式：
2002507434.tif 000001
［式中、
各Ｊは、同一であるかまたは異なり、かつＨ、Ｒ1、ＯＲ1、ＳＲ1、ＮＨＲ1、ＮＲ12、Ｆ、Ｃｌ、ＢｒおよびＩよりなる群から選択され；
各Ｋは、同一であるかまたは異なり、かつＯ、Ｓ、ＮＨおよびＮＲ1よりなる群から選択され；
各Ｒ1は、同一であるかまたは異なり、かつ場合によりヘテロ原子または置換もしくは非置換アリール基を含有してもよい、１〜５個の炭素原子を有するアルキル基であり；
各Ａは、単結合、式：−（ＣＪ2）s−の基、および式（ＣＪ2）sＣ（Ｏ）−の基（ここで、Ｊは、上記と同義であり、そして各ｓは、１〜５の整数である）よりなる群から選択され；
各ｔは、１または２であり；
各ｕは、１または２であり；そして
各Ｌは、同一であるかまたは異なり、かつＪ、アデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウリジン、５−メチルシトシン、２−アミノプリン、２−アミノ−６−クロロプリン、２，６−ジアミノプリン、ヒポキサンチン、シュードイソシトシン、２−チオウラシル、２−チオチミジン、他の天然の核塩基類似体、他の非天然の核塩基、置換および非置換芳香族残基、ビオチン、フルオレセイン、およびダブシル（dabcyl）よりなる群から独立に選択される］を有するものである、請求項５または６に記載の組成物。
【請求項８】  各ＰＮＡサブユニットは、メチレンカルボニル結合によりＮ−［２−（アミノエチル）］グリシン基本骨格のアザ窒素に結合している天然の核塩基からなる、請求項７に記載の組成物。
【請求項９】  成分ポリマーは、プライマー伸長反応でプライマーとして作用することができる、請求項１から３のいずれかに記載の組成物。
【請求項１０】  成分ポリマーは、核酸、およびポリメラーゼ伸長を促進するように修飾されているＰＮＡよりなる群から選択される、請求項９に記載の組成物。
【請求項１１】  ２つまたはそれ以上の異なる複合体のアレイであって、アレイの少なくとも２つの複合体のそれぞれは、
ａ．プローブ用ポリマーは、ユニークな標的配列にハイブリダイズするプローブ用セグメントと、少なくとも１つの他の成分ポリマーと複合体を形成するのに適した１つまたはそれ以上の相互作用性の基とを含んでなる、少なくとも１つの成分プローブ用ポリマー；
ｂ．少なくとも、１つまたはそれ以上の相互作用性の基を含む、少なくとも１つの成分アニーリングポリマー（この成分ポリマーの相互作用性の基は、複合体を形成しこれを安定化させる）；および
ｃ．複合体の形成が、セットのドナー残基とアクセプター残基との間のエネルギー移動を促進するように、少なくとも２つの成分ポリマーは、そのセットの少なくとも１つの残基で結合している、ドナー残基とアクセプター残基の少なくとも１つのセット；
を含むが、ただし、複合体の成分ポリマーの少なくとも１つは、非核酸ポリマーであり、各異なる複合体の成分ポリマーの少なくとも１つは、アレイの表面に固定化されているかまたはつながれている、上記アレイ。
【請求項１２】  それぞれの複合体のすべての成分ポリマーは非核酸ポリマーである、請求項１１に記載のアレイ。
【請求項１３】  それぞれの複合体の少なくとも１つの成分ポリマーはＰＮＡである、請求項１１に記載のアレイ。
【請求項１４】  それぞれの複合体のすべての成分ポリマーはＰＮＡである、請求項１１に記載のアレイ。
【請求項１５】  成分ポリマーのＰＮＡサブユニットは、式：
2002507434.tif 000002
［式中、
各Ｊは、同一であるかまたは異なり、かつＨ、Ｒ1、ＯＲ1、ＳＲ1、ＮＨＲ1、ＮＲ12、Ｆ、Ｃｌ、ＢｒおよびＩよりなる群から選択され；
各Ｋは、同一であるかまたは異なり、かつＯ、Ｓ、ＮＨおよびＮＲ1よりなる群から選択され；
各Ｒ1は、同一であるかまたは異なり、かつ場合によりヘテロ原子または置換もしくは非置換アリール基を含有してもよい、１〜５個の炭素原子を有するアルキル基であり；
各Ａは、単結合、式：−（ＣＪ2）s−の基、および式（ＣＪ2）sＣ（Ｏ）−の基（ここで、Ｊは、上記と同義であり、そして各ｓは、１〜５の整数である）よりなる群から選択され；
各ｔは、１または２であり；
各ｕは、１または２であり；そして
各Ｌは、同一であるかまたは異なり、かつＪ、アデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウリジン、５−メチルシトシン、２−アミノプリン、２−アミノ−６−クロロプリン、２，６−ジアミノプリン、ヒポキサンチン、シュードイソシトシン、２−チオウラシル、２−チオチミジン、他の天然の核塩基類似体、他の非天然の核塩基、置換および非置換芳香族残基、ビオチン、フルオレセイン、およびダブシルよりなる群から独立に選択される］を有するものである、請求項１３または１４に記載のアレイ。
【請求項１６】  各ＰＮＡサブユニットは、メチレンカルボニル結合によりＮ−［２−（アミノエチル）］グリシン基本骨格のアザ窒素に結合している天然の核塩基からなる、請求項１５に記載のアレイ。
【請求項１７】  成分ポリマーの少なくとも１つは、プライマーである、請求項１１に記載のアレイ。
【請求項１８】  成分ポリマーは、核酸、およびポリメラーゼ伸長を促進するように修飾されているＰＮＡよりなる群から選択される、請求項１７に記載のアレイ。
【請求項１９】  同じニーリングポリマーは、アレイの複合体の少なくとも２つの異なる固定化成分ポリマーの共通の相互作用性の基にアニーリングする、請求項１１に記載のアレイ。
【請求項２０】  同じアニーリングポリマーは、アレイの複合体のすべてを形成する請求項１９に記載のアレイ。
【請求項２１】  同じアニーリングポリマーは、消光残基を含むPNAポリマーである請求項２０に記載のアレイ。
【請求項２２】  少なくとも１つの結合アクセプター残基を有し、結合ドナー残基は有しない非核酸ポリマー。
【請求項２３】  ポリマーがPNAである請求項２２に記載の非核酸ポリマー。
【請求項２４】  アクセプター残基がダブシル（dabcyl）である請求項２２または２３記載の非核酸ポリマー。
【請求項２５】  試料中の少なくとも１つの標的配列を含む標的分子の有無または量の検出または同定方法であって、
ａ．試料を少なくとも１つの複合体と接触させ（ここで該複合体は、
（ｉ）プローブ用ポリマーは、標的配列にハイブリダイズするプローブ用セグメントと、少なくとも１つの他の成分ポリマーと複合体を形成するのに適した１つまたはそれ以上の相互作用性の基とを含んでなる、少なくとも１つの成分プローブ用ポリマー；
（ii）少なくとも、１つまたはそれ以上の相互作用性の基を含む、少なくとも１つの成分アニーリングポリマー（この成分ポリマーの相互作用性の基の相互作用は、複合体を形成しこれを安定化させる）；および
（iii）成分ポリマーが複合体を形成している時またはプローブ用セグメントが標的配列にハイブリダイズしている時と比較して検出可能な形で異なるように、複合体の形成が、セットのドナー残基とアクセプター残基との間のエネルギー移動を促進するように、少なくとも２つの成分ポリマーのそれぞれは、そのセットの少なくとも１つの残基で結合している、ドナー残基とアクセプター残基の少なくとも１つのセット；
を含むが、ただし、組成物の成分ポリマーの少なくとも１つは、非核酸ポリマーである）、そして
ｂ．複合体の解離またはプローブ用セグメントの標的配列へのハイブリダイゼーションによる、セットのドナー残基とアクセプター残基の間のエネルギー移動の変化に起因する検出可能なシグナルの変化を検出、同定または定量し、シグナルの変化を試料中の標的分子の有無または量と相関付ける、
ことを含んでなる、上記方法。
【請求項２６】  検出可能なシグナルは、プローブ用ポリマーのプローブ用セグメントが、複合体の直接または間接的解離なしに、標的分子の標的配列にハイブリダイズした結果として産生される、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】  検出可能なシグナルは、プローブ用ポリマーのプローブ用セグメントが、標的分子の標的配列にハイブリダイズした結果（これが、複合体の直接の解離を引き起こす）として産生される、請求項２５に記載の方法。
【請求項２８】  検出可能なシグナルは、プローブ用ポリマーのプローブ用セグメントが、標的分子の標的配列にハイブリダイズした結果（これが、複合体の間接的解離を引き起こす二次引き金事象を促進する）として産生される、請求項２５に記載の方法。
【請求項２９】  標的分子の有無または量の検出または同定方法であって、
ａ．標的分子の標的配列に酵素を固定化し；
ｂ．試料を少なくとも１つの複合体と接触させ（ここで該複合体は、
（ｉ）少なくとも２つの成分ポリマー（成分ポリマーのそれぞれは、複合体を形成しこれを安定化させる相互作用性の基を含む）；および
（ii）成分ポリマーが複合体形成していない時と比較して、検出可能な形で異なるように、複合体の形成が、セットのドナー残基とアクセプター残基との間のエネルギー移動を促進するように、少なくとも２つの成分ポリマーは、そのセットの少なくとも１つの残基で結合している、ドナー残基とアクセプター残基の少なくとも１つのセット；を含んでなる）、
ここで該複合体は、酵素が作用すると解離する基質を形成することをさらに特徴とし；そして
ｃ．複合体の解離によるセットのドナー残基とアクセプター残基の間のエネルギー移動に起因する検出可能なシグナルの変化を検出、同定または定量し、シグナルを試料中の目的の標的分子の有無または量と相関付ける、
ことを含んでなる、上記方法。
【請求項３０】  複合体の少なくとも１つの成分ポリマーは、非核酸ポリマーである、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】  閉鎖チューブアッセイにおいて存在するまたは産生される核酸標的分子を分析する請求項２５から３０のいずれかに記載の方法。
【請求項３２】  核酸標的分子が増幅反応において産生される請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】  核酸標的分子は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）、鎖置換増幅（Strand Displacement Amplification）（ＳＤＡ）、転写介在性増幅（Transcription-Mediated Amplification）（ＴＭＡ）、Ｑ−ベータレプリカーゼ増幅（Q-beta）および回転環増幅（Rolling Circle Amplification）（ＲＣＡ）よりなる群から選択される、請求項３１に記載の方法。
【請求項３４】  複合体形成を促進する条件下で２つまたはそれ以上の成分ポリマーを一緒に混合することを含んでなる、複合体の形成方法であって、該複合体は、
ａ．プローブ用ポリマーは、標的配列にハイブリダイズするプローブ用セグメントと、少なくとも１つの他の成分ポリマーと複合体を形成するのに適した１つまたはそれ以上の相互作用性の基とを含んでなる、少なくとも１つの成分プローブ用ポリマー；
ｂ．少なくとも、１つまたはそれ以上の相互作用性の基を含む、少なくとも１つの成分アニーリングポリマー（この成分ポリマーの相互作用性の基の相互作用は、複合体を形成しこれを安定化させる）；および
ｃ．成分ポリマーが複合体形成していないか、またはプローブ用セグメントが標的配列にハイブリダイズしている時と比較して、検出可能な形で異なるように、複合体の形成が、セットのドナー残基とアクセプター残基との間のエネルギー移動を促進するように、少なくとも２つの成分ポリマーのそれぞれは、そのセットの少なくとも１つの残基で結合している、ドナー残基とアクセプター残基の少なくとも１つのセット；
を含むが、ただし、複合体の成分ポリマーの少なくとも１つは、非核酸ポリマーである、上記方法。
【請求項３５】  すべての成分ポリマーは非核酸ポリマーである、請求項２５から３４のいずれかに記載の方法。
【請求項３６】  少なくとも１つの成分ポリマーはＰＮＡである、請求項２５から３４記載の方法。
【請求項３７】  全ての成分ポリマーはＰＮＡである、請求項２５から３４記載の方法。
【請求項３８】  成分ポリマーのＰＮＡサブユニットは、式：
2002507434.tif 000003
［式中、
各Ｊは、同一であるかまたは異なり、かつＨ、Ｒ1、ＯＲ1、ＳＲ1、ＮＨＲ1、ＮＲ12、Ｆ、Ｃｌ、ＢｒおよびＩよりなる群から選択され；
各Ｋは、同一であるかまたは異なり、かつＯ、Ｓ、ＮＨおよびＮＲ1よりなる群から選択され；
各Ｒ1は、同一であるかまたは異なり、かつ場合によりヘテロ原子または置換もしくは非置換アリール基を含有してもよい、１〜５個の炭素原子を有するアルキル基であり；
各Ａは、単結合、式：−（ＣＪ2）s−の基、および式（ＣＪ2）sＣ（Ｏ）−の基（ここで、Ｊは、上記と同義であり、そして各ｓは、１〜５の整数である）よりなる群から選択され；
各ｔは、１または２であり；
各ｕは、１または２であり；そして
各Ｌは、同一であるかまたは異なり、かつＪ、アデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウリジン、５−メチルシトシン、２−アミノプリン、２−アミノ−６−クロロプリン、２，６−ジアミノプリン、ヒポキサンチン、シュードイソシトシン、２−チオウラシル、２−チオチミジン、他の天然の核塩基類似体、他の非天然の核塩基、置換および非置換芳香族残基、ビオチン、フルオレセイン、およびダブシルよりなる群から独立に選択される］を有するものである、請求項３６まは３７に記載の方法。
【請求項３９】  各ＰＮＡサブユニットは、メチレンカルボニル結合によりＮ−［２−（アミノエチル）］グリシン基本骨格のアザ窒素に結合している天然の核塩基からなる、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】  試料中の目的の核酸標的分子を検出、同定、または定量する方法であって、該標的分子は少なくとも１つのプライミング部位を有し、該方法は、
ａ．試料を
Ｉ．２つまたはそれ以上の成分ポリマーから形成される少なくとも１つの複合体（ここで該複合体は、
（ｉ）プライマー伸長反応でプライマーとして作用することができる、少なくとも１つの成分プローブ用ポリマー（ここで、プローブ用ポリマーは、少なくとも、
１．第１のプライミング部位にハイブリダイズするプローブ用セグメント；および
２．少なくとも１つの他の成分ポリマーと複合体を形成するのに適した１つまたはそれ以上の相互作用性の基とを含む）；
（ii）少なくとも、１つまたはそれ以上の相互作用性の基を含む、少なくとも１つの成分アニーリングポリマー（この成分ポリマーの相互作用性の基は、複合体を形成しこれを安定化させる）；および
（iii）成分ポリマーが独立に存在するかまたは結合していない時とは、検出可能な形で異なるように、複合体の形成が、セットのドナー残基とアクセプター残基との間のエネルギー移動を促進するように、少なくとも２つの成分ポリマーのそれぞれは、そのセットの少なくとも１つの残基で結合している、ドナー残基とアクセプター残基の少なくとも１つのセット；
を含む）と
II．プライマー伸長反応を行うのに必要なすべての他の成分、
と接触させ；
ｂ．プライマー伸長反応を行い、こうしてプライマー伸長反応により産生される核酸の量に比例して複合体の解離を引き起こし；そして
ｃ．複合体の解離によるセットのドナー残基とアクセプター残基の間のエネルギー移動に起因する検出可能なシグナルの変化を検出、同定または定量し、そしてシグナルを試料中の目的の核酸標的分子の有無または量と相関付ける、
ことを含んでなる、上記方法。
【請求項４１】  第２のプライマーは標的分子の第２のプライマー部位にハイブリダイズする第２の複合体であり、該第２の複合体は、
（ａ）少なくとも
１．ＰＣＲプロセスにおける第２のプライマーとして作用するプローブ用成分；および
２．少なくとも１つの他の成分ポリマーと第２の複合体を形成するのに適した１つまたはそれ以上の相互作用性の基
とを含んでなる、少なくとも１つの第２の成分プローブ用ポリマー；
（ｂ）少なくとも、１つまたはそれ以上の相互作用性の基を含む、少なくとも１つの第２の成分アニーリングポリマー（ここで、成分ポリマーの相互作用性の基は、第２の複合体を形成しこれを安定化させる）；および
（ｃ）第２の複合体の成分ポリマーが独立に存在するかまたは結合していない時とは、検出可能な形で異なるように、第２の複合体の形成が、セットのドナー残基とアクセプター残基との間のエネルギー移動を促進するように、第２の複合体の少なくとも２つの成分ポリマーのそれぞれは、第２のセットの少なくとも１つの残基で結合している、ドナー残基とアクセプター残基の少なくとも１つの第２のセット；
を含む、請求項４０の方法。
【請求項４２】  複合体のすべての成分ポリマーは核酸である請求項４０または４１に記載の方法。
【請求項４３】  複合体の少なくとも１つの成分ポリマーは非核酸ポリマーである請求項４０または４１に記載の方法。
【請求項４４】  複合体の少なくとも１つの成分ポリマーはＰＮＡである請求項４０または４１に記載の方法。
【請求項４５】  １つまたは両者の複合体のプローブ用ポリマーは、核酸、およびポリメラーゼ伸長を促進するように修飾されているＰＮＡよりなる群から選択される、請求項４０または４１に記載の方法。
【請求項４６】  請求項４５に記載の方法であって、
（ｉ）プローブ用ポリマーまたはポリマーは、適当なプライミング部位と配列特異的に相互作用しない相互作用性の基を含有する核塩基を含み；そして
（ii）アニーリングポリマーまたはポリマーは、プローブ用ポリマーの相互作用性の基の正確な相補体である相互作用性の基を含有する核塩基を含む、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】  伸長反応分子は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）、鎖置換増幅（Strand Displacement Amplification）（ＳＤＡ）、転写介在性増幅（Transcription-Mediated Amplification）（ＴＭＡ）、Ｑ−ベータレプリカーゼ増幅（Q-beta）および回転環増幅（Rolling Circle Amplification）（ＲＣＡ）よりなる群から選択されるプロセスの成分である、請求項４０または４６に記載の方法。
【請求項４８】  PCRのテンプレートである核酸標的分子を検出する請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】  複合体解離は、増幅プロセスの活性の結果として起き、複合体の解離により産生されるシグナルは、終点測定またはリアルタイム測定の両方を促進する閉鎖管測定法で監視される請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】  他の測定成分には、緩衝液、無機塩、マグネシウム、ヌクレオチド三リン酸、ポリメラーゼ酵素、および第２のプライマー（ここで、第２のプライマーと複合体は、ＰＣＲ反応の前進プライマーと逆進プライマーを含む）を含む、請求項４９に記載の方法。
【請求項５１】  同じアニーリングポリマーは、第１の複合体と第２の複合体の両方に共通である、請求項４１に記載の方法。
【請求項５２】  共通のアニーリングポリマーは、消光アクセプター残基を有するＰＮＡである、請求項５１に記載の方法。
【請求項５３】  第１および第２の複合体は、同じのドナー蛍光物質とアクセプター消光物質とを含む、請求項４１に記載の方法。
【請求項５４】  リアルタイムにまたは終点で監視することができる閉鎖管点突然変異分析を行うのに適するように、測定法を修飾するのにＰＣＲクランピング（clamping）が使用される、請求項４８から５３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５５】  少なくとも１つの独立に検出可能な単分子「ビーコン」プローブは、ＰＣＲ測定法にも含まれ、アンプリコン内でハイブリダイゼーション部位にハイブリダイズし、こうして、ＰＣＲ増幅の正しい作用を監視するために使用することができるか、または測定法で生成されるアンプリコンの特徴を独立に同定するために使用することができる独立に検出可能なシグナルを生成する、請求項４８から５４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５６】  測定法により決定される具体的特徴は、試料中に野生型、変異体、または野生型と変異体標的分子の両方が存在するかどうかである、請求項５５に記載の方法。
【請求項５７】  野生型と変異体標的分子のハイブリダイゼーション部位は、点突然変異として関連している、請求項５６に記載の方法。
【請求項５８】  具体的特徴は、リアルタイムにまたは測定法の終点で閉鎖管フォーマットで独立に検出することができる、請求項５６に記載の方法。
【請求項５９】  １つまたはそれ以上の検出複合体から、および測定法に存在する１つまたはそれ以上の単分子「ビーコン」プローブからのシグナルは、リアルタイムまたは測定法の終点で閉鎖管フォーマットで独立に検出される、請求項５６に記載の方法。
【請求項６０】  １つもしくはそれ以上のブロックプローブをアッセイに追加して、単分子「ビーコン」の非標的配列への結合を抑制する、請求項５５から５９のいずれかに記載の方法。
【請求項６１】  少なくとも２つまたはそれ以上の独立に検出可能な複合体は、同一の試料中かつ同一の測定法中の目的の２つまたはそれ以上の標的分子を検出、同定または定量するために使用される単一の多重測定法中に存在する、請求項４０から６０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６２】  独立に検出可能な複合体は、閉鎖管フォーマットで使用され、各独立に検出可能な複合体からのシグナルの検出可能な変化は、リアルタイムにまたは測定の終点で監視することができる、請求項６１に記載の方法。
【請求項６３】  成分ポリマーの少なくとも１つが、支持体に固定化またはつながれている請求項２５から６２のいずれかに記載の方法。
【請求項６４】  複合体が分離して少なくとも１つのラベル化成分ポリマーが溶液中に放出される請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】  共通のラベル化成分ポリマーが、該方法の実施によってアレイの１つまたはそれ以上の異なる固定化されたまたはつながれた複合体から放出される請求項６４に記載の方法。
【請求項６６】  放出される成分ポリマーは、消光残基でラベル化されたPNAポリマーである請求項６５に記載の方法。
【請求項６７】  アレイの複合体が、
ａ．支持体からいずれかのハイブリダイズした標的分子を除去し；そして
ｂ．アレイの全ての複合体を再生する必要に応じて、ある量の共通の標識された成分ポリマーに表面を接触させる、
ことを含んでなる方法によって再生される、請求項６６に記載の方法。
【請求項６８】  少なくとも１つの複合体の形成に適した２つまたはそれ以上の成分ポリマーを含んでなるキットであって、該キットは、
ａ．プローブ用ポリマーは、標的配列にハイブリダイズするプローブ用セグメントと、少なくとも１つの他の成分ポリマーと複合体を形成するのに適した１つまたはそれ以上の相互作用性の基とを含んでなる、少なくとも１つの成分プローブ用ポリマー；
ｂ．少なくとも、１つまたはそれ以上の相互作用性の基を含む、少なくとも１つの成分アニーリングポリマー（この成分ポリマーの相互作用性の基は、複合体を形成しこれを安定化させる）；および
ｃ．成分ポリマーが複合体形成していないか、またはプローブ用セグメントが標的配列にハイブリダイズしている時と比較して、検出可能な形で異なるように、複合体の形成が、セットのドナー残基とアクセプター残基との間のエネルギー移動を促進するように、少なくとも２つの成分ポリマーのそれぞれは、そのセットの少なくとも１つの残基で結合している、ドナー残基とアクセプター残基の少なくとも１つのセット；
を含むが、ただし、複合体の成分ポリマーの少なくとも１つは、非核酸ポリマーである、上記キット。
【請求項６９】  すべての成分ポリマーは非核酸ポリマーである、請求項６８に記載のキット。
【請求項７０】  少なくとも１つの成分ポリマーはＰＮＡである、請求項６８に記載のキット。
【請求項７１】  全ての成分ポリマーはＰＮＡである、請求項６８に記載のキット。
【請求項７２】  成分ポリマーのＰＮＡサブユニットは、式：
2002507434.tif 000004
［式中、
各Ｊは、同一であるかまたは異なり、かつＨ、Ｒ1、ＯＲ1、ＳＲ1、ＮＨＲ1、ＮＲ12、Ｆ、Ｃｌ、ＢｒおよびＩよりなる群から選択され；
各Ｋは、同一であるかまたは異なり、かつＯ、Ｓ、ＮＨおよびＮＲ1よりなる群から選択され；
各Ｒ1は、同一であるかまたは異なり、かつ場合によりヘテロ原子または置換もしくは非置換アリール基を含有してもよい、１〜５個の炭素原子を有するアルキル基であり；
各Ａは、単結合、式：−（ＣＪ2）s−の基、および式（ＣＪ2）sＣ（Ｏ）−の基（ここで、Ｊは、上記と同義であり、そして各ｓは、１〜５の整数である）よりなる群から選択され；
各ｔは、１または２であり；
各ｕは、１または２であり；そして
各Ｌは、同一であるかまたは異なり、かつＪ、アデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウリジン、５−メチルシトシン、２−アミノプリン、２−アミノ−６−クロロプリン、２，６−ジアミノプリン、ヒポキサンチン、シュードイソシトシン、２−チオウラシル、２−チオチミジン、他の天然の核塩基類似体、他の非天然の核塩基、置換および非置換芳香族残基、ビオチン、フルオレセイン、およびダブシルよりなる群から独立に選択される］を有するものである、請求項６９または７０に記載のキット。
【請求項７３】  成分ポリマーの各ＰＮＡサブユニットは、メチレンカルボニル結合によりＮ−［２−（アミノエチル）］グリシン基本骨格のアザ窒素に結合している天然の核塩基からなる、請求項７４に記載のキット。
【請求項７４】  １つもしくはそれ以上の複合体のアレイを再生する方法であって、
ａ．アレイ表面からいずれかのハイブリダイズしたを除去し；そして
ｂ．アレイの異なる複合体を再生する必要に応じて、ある量の共通の標識された成分ポリマーに表面を接触させる、
ことを含んでなる方法。