【手続補正書】
【提出日】平成17年2月10日(2005.2.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
膀胱癌を有していると疑われる被験者から得られた生物学的サンプルにおけるヒトＨＵＲＰ遺伝子の発現を検出すること、該検出されたヒトＨＵＲＰ遺伝子の発現が膀胱癌の存在を示すことを含む、ヒト被験者における膀胱癌のｉｎ  ｖｉｔｒｏ検出方法。
【請求項２】
膀胱癌が膀胱の移行上皮癌（ＴＣＣ）である請求項１に記載の方法。
【請求項３】
生物学的サンプルが尿路上皮癌細胞、膀胱癌細胞又はそれらの組み合わせからなる群から選ばれる細胞を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
生物学的サンプルが尿、尿路上皮生検、血液、血漿及び血清からなる群から選ばれる請求項１に記載の方法。
【請求項５】
生物学的サンプルが尿である請求項４に記載の方法。
【請求項６】
ヒトＨＵＲＰ遺伝子が配列番号１に示すヌクレオチド配列を有する請求項１に記載の方法。
【請求項７】
ヒトＨＵＲＰ遺伝子の発現の検出が、生物学的サンプル中のヒトＨＵＲＰ遺伝子のｍＲＮＡ転写物の存在を検出することによって行われる、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
ヒトＨＵＲＰ遺伝子のｍＲＮＡ転写物の存在の検出が以下の方法論：
ハイブリダイゼーション、サイクリングプローブ反応（ｃｙｃｌｉｎｇ  ｐｒｏｂｅ  ｒｅａｃｔｉｏｎ）、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、ネスティッド（ｎｅｓｔｅｄ）ＰＣＲ、逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）、マルチプレックスＰＣＲポリメラーゼ連鎖反応−一本鎖コンフォーメーション多型、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）、制限断片長多型核酸配列ベースの増幅（ＮＡＳＢＡ）、及び転写仲介増幅（ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ−ｍｅｄｉａｔｅｄ  ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ）（ＴＭＡ）の少なくとも１つを用いて行われる請求項７に記載の方法。
【請求項９】
ヒトＨＵＲＰ遺伝子のｍＲＮＡ転写物の存在の検出がＲＴ−ＰＣＲを用いて行われる請求項７に記載の方法。
【請求項１０】
ヒトＨＵＲＰ遺伝子のｍＲＮＡ転写物の存在の検出を、以下により行う請求項７に記載の方法：
（ａ）生物学的サンプルから全ＲＮＡを抽出すること；
（ｂ）工程（ａ）で抽出されたＲＮＡを、フォーワードプライマー及びリバースプライマーの少なくとも１つのプライマー対を用いて逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）処理に供すること、各プライマーは、配列番号１に対応するヌクレオチド配列を有するヒトＨＵＲＰ遺伝子の少なくとも１３ヌクレオチドにハイブリダイズするヌクレオチド配列を有する；および、
（ｃ）ヒトＨＵＲＰ遺伝子のヌクレオチド配列の一部と同一か又は相補的なヌクレオチド配列を有するＲＴ−ＰＣＲ産物が、工程（ｂ）のＲＴ−ＰＣＲ処理から産生されたかどうかを検出すること、前記ＲＴ−ＰＣＲ産物の存在が膀胱癌の存在を示す。
【請求項１１】
工程（ｂ）で使用される少なくとも１つのプライマー対が、配列番号２及び配列番号４で示される配列から選ばれるヌクレオチド配列を有するフォーワードプライマーと、配列番号３及び配列番号５で示される配列から選ばれるヌクレオチド配列を有するリバースプライマーとを含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
工程（ｂ）で使用される少なくとも１つのプライマー対が、配列番号４に対応するヌクレオチド配列を有するフォーワードプライマーと配列番号５に対応するヌクレオチド配列を有するリバースプライマーとを含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１３】
工程（ｂ）におけるＲＴ−ＰＣＲ処理が、配列番号２に対応するヌクレオチド配列を有する第１フォーワードプライマーと配列番号３に対応するヌクレオチド配列を有する第１リバースプライマーとを含む第１プライマー対を用いる第１増幅反応、及び配列番号４に対応するヌクレオチド配列を有する第２フォーワードプライマーと配列番号５に対応するヌクレオチド配列を有する第２リバースプライマーとを含む第２プライマー対を用いる第２増幅反応を含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１４】
膀胱癌を有していると疑われる被験者から定期的に得られた生物学的サンプルにおけるヒトＨＵＲＰ遺伝子の発現を検出すること、該検出されたヒトＨＵＲＰ遺伝子の発現が、膀胱癌の存在を示すことを含む、ヒト被験者における膀胱癌のｉｎ  ｖｉｔｒｏモニタリング方法。
【請求項１５】
膀胱癌が膀胱の移行上皮癌（ＴＣＣ）である請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
生物学的サンプルが尿路上皮癌細胞、膀胱癌細胞又はそれらの組み合わせからなる群から選ばれる細胞を含む、請求項１４に記載の方法。
【請求項１７】
生物学的サンプルが尿、尿路上皮生検、血液、血漿及び血清からなる群から選ばれる請求項１４に記載の方法。
【請求項１８】
生物学的サンプルが尿である請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
ヒトＨＵＲＰ遺伝子が配列番号１に示すヌクレオチド配列を有する請求項１４に記載の方法。
【請求項２０】
ヒトＨＵＲＰ遺伝子の発現の検出が、生物学的サンプル中のヒトＨＵＲＰ遺伝子のｍＲＮＡ転写物の存在を検出することによって行われる、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
ヒトＨＵＲＰ遺伝子のｍＲＮＡ転写物の存在の検出が、以下の方法論：
ハイブリダイゼーション、サイクリングプローブ反応（ｃｙｃｌｉｎｇ  ｐｒｏｂｅ  ｒｅａｃｔｉｏｎ）、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、ネスティッド（ｎｅｓｔｅｄ）ＰＣＲ、逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）、マルチプレックスＰＣＲポリメラーゼ連鎖反応−一本鎖コンフォーメーション多型、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）、制限断片長多型核酸配列ベースの増幅（ＮＡＳＢＡ）、及び転写仲介増幅（ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ−ｍｅｄｉａｔｅｄ  ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ）（ＴＭＡ）の少なくとも１つを用いて行われる請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
ヒトＨＵＲＰ遺伝子のｍＲＮＡ転写物の存在の検出がＲＴ−ＰＣＲを用いて行われる請求項２０に記載の方法。
【請求項２３】
ヒトＨＵＲＰ遺伝子のｍＲＮＡ転写物の存在の検出を、以下により行う請求項２０に記載の方法：
（ａ'）生物学的サンプルから全ＲＮＡを抽出すること；
（ｂ'）工程（ａ'）で抽出されたＲＮＡを、フォーワードプライマー及びリバースプライマーの少なくとも１つのプライマー対を用いて逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）処理に供すること、各プライマーは、配列番号１に対応するヌクレオチド配列を有するヒトＨＵＲＰ遺伝子の少なくとも１３ヌクレオチドにハイブリダイズするヌクレオチド配列を有する；及び、
（ｃ'）ヒトＨＵＲＰ遺伝子のヌクレオチド配列の一部と同一か又は相補的なヌクレオチド配列を有するＲＴ−ＰＣＲ産物が、工程（ｂ'）のＲＴ−ＰＣＲ処理で産生されたかどうかを検出し、前記ＲＴ−ＰＣＲ産物の存在が膀胱癌の存在を示す。
【請求項２４】
工程（ｂ'）で使用される少なくとも１つのプライマー対が、配列番号２及び配列番号４で示される配列から選ばれるヌクレオチド配列を有するフォーワードプライマーと配列番号３及び配列番号５で示される配列から選ばれるヌクレオチド配列を有するリバースプライマーとを含む、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
工程（ｂ'）で使用される少なくとも１つのプライマー対が、配列番号４に対応するヌクレオチド配列を有するフォーワードプライマーと配列番号５に対応するヌクレオチド配列を有するリバースプライマーとを含む、請求項２３に記載の方法。
【請求項２６】
工程（ｂ'）におけるＲＴ−ＰＣＲ処理が、配列番号２に対応するヌクレオチド配列を有する第１フォーワードプライマーと配列番号３に対応するヌクレオチド配列を有する第１リバースプライマーを含む第１プライマー対を用いた第１増幅反応、及び配列番号４に対応するヌクレオチド配列を有する第２フォーワードプライマーと配列番号５に対応するヌクレオチド配列を有する第２リバースプライマーとを含む第２プライマー対を用いた第２増幅反応を含む、請求項２３に記載の方法。
【請求項２７】
配列番号２から５で示される配列から選ばれるヌクレオチド配列を有するＤＮＡ配列。
【請求項２８】
配列番号２及び配列番号４で示される配列から選ばれるヌクレオチド配列を有するフォーワードプライマーと、配列番号３及び配列番号５で示される配列から選ばれるヌクレオチド配列を有するリバースプライマーとを含む、ヒト被験者における膀胱癌を検出するためのプライマーセット。
【請求項２９】
フォーワードプライマーが配列番号２で示されるヌクレオチド配列を有する請求項２８に記載のプライマーセット。
【請求項３０】
フォーワードプライマーが配列番号４で示されるヌクレオチド配列を有する請求項２８に記載のプライマーセット。
【請求項３１】
リバースプライマーが配列番号３で示されるヌクレオチド配列を有する請求項２８に記載のプライマーセット。
【請求項３２】
リバースプライマーが配列番号５で示されるヌクレオチド配列を有する請求項２８に記載のプライマーセット。
【請求項３３】
配列番号１に対応するヌクレオチド配列を有するヒトＨＵＲＰ遺伝子に基づいてデザインされた少なくとも１つのプライマー対を含み、前記少なくとも１つのプライマー対が配列番号２及び配列番号４に記載の配列から選択されるヌクレオチド配列を有するフォーワードプライマー、ならびに配列番号３及び配列番号５に記載される配列から選択されるヌクレオチド配列を有するリバースプライマーを含む、ヒト被験者における膀胱癌の検出のための診断キット。
【請求項３４】
配列番号２に対応するヌクレオチド配列を有する第１フォーワードプライマーと配列番号３に対応するヌクレオチド配列を有する第１リバースプライマーとを含む第１プライマー対、及び配列番号４に対応するヌクレオチド配列を有する第２フォーワードプライマーと配列番号５に対応するヌクレオチド配列を有する第２リバースプライマーを含む第２プライマー対を含む、請求項３３に記載の診断キット。