【手続補正書】
【提出日】平成14年4月18日(2002.4.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
未知タンパク質分子の特徴づけの方法であって、該方法は次のステップを含んでなる：
（ａ）  未知タンパク質分子を単離すること；
（ｂ）  標識された未知タンパク質分子を作出するために未知タンパク質分子を標識すること、ここで該標識ステップは次のステップを含んでなる：
（ｉ）  未知タンパク質分子中の各第一型アミノ酸残基に第一タグを付すること、ここで該第一タグは未知タンパク質分子が第一初期励起放射に曝露されるときに未知タンパク質分子中の各第一型アミノ酸残基に第一放出放射を対応する第一放出波長で生じさせる；
（ｉｉ）  未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸残基に第二タグを付すること、ここで該第二タグは未知タンパク質分子が第二初期励起放射に曝露されるときに未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸残基に第二放出放射を対応する第二放出波長で生じさせる；そして
（ｃ）  そのアミノ酸配列によって定義される未知タンパク質分子の物理的構造を反映する特徴づけを未知タンパク質分子に関して確定すること、ここで該確定ステップは以下を含んでなる：
（ｉ）  該標識された未知タンパク質分子を該第一初期励起放射および該第二初期励起放射に曝露すること；
（ｉｉ）  該曝露ステップによって生じる該標識された未知タンパク質分子からの放出放射を検出すること；および
（ｉｉｉ）  該標識された未知タンパク質分子からの該放出放射をスペクトル分析に供してそのスペクトルパターンを作出すること、ここで該放出放射の該スペクトルパターンは
（Ａ）該第一初期励起放射に曝露された該未知タンパク質分子の各第一型アミノ酸残基に付した該第一タグからの該第一放出放射の強度を反映する該第一放出波長での第一スペクトルパターン構成要素；および
（Ｂ）該第二初期励起放射に曝露された該未知タンパク質分子の各第二型アミノ酸残基に付した該第二タグからの該第二放出放射の強度を反映する該第二放出波長での第二スペクトルパターン構成要素
を含んでなる。
【請求項２】
該第一タグが蛍光色素を含んでなる、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
第一タグを各第一型アミノ酸残基に付する該ステップにおいて
（ａ）  該第一タグを各第一型アミノ酸残基に付するために化学前駆体を利用し；そして
（ｂ）  該第一タグが金属タグである、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
未知タンパク質分子中の該第一型アミノ酸残基がシステインおよびリジンからなる群から選択されるアミノ酸残基を含んでなる、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
該単離ステップを流体力学焦点装置、それを貫通して形成された開口を有する不透明分離プレート、電気泳動ゲル、および希薄溶液からなる群からの一つを用いて行う、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
線状化された未知タンパク質分子を作出するために未知タンパク質分子を線状化するステップをさらに含んでなる、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
未知タンパク質分子を線状化する該ステップが洗剤、ドデシル硫酸ナトリウムおよびカオトロピック塩からなる群からの一つを利用する、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
該検出ステップが電荷結合素子を用いて行われる、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
請求項１に記載の方法であって
（ａ）  該線状化された未知タンパク質分子の各第二型アミノ酸残基に付された該第二タグが、該線状化された未知タンパク質分子が第二初期励起放射に曝露されるときに、該線状化された未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸残基に第三放出放射を対応する第三放出波長でさらに加えて生じさせ；
（ｂ）  確定ステップが、該標識され線状化された未知タンパク質分子を該第二初期励起放射に曝露することをさらに含んでなり；そして
（ｃ）  該放出放射の該スペクトルパターンが、該第二初期励起放射に曝露された該線状化された未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸に付した該第二タグからの該第三放出放射の強度を反映する該第三放出波長での第三スペクトルパターン構成要素をさらに含んでなる、方法。
【請求項１０】
該標識され線状化された未知タンパク質分子を該第一初期励起放射に曝露する該ステップおよび該標識され線状化された未知タンパク質分子を該第二初期励起放射に曝露する該ステップが同時に行われる、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
少なくとも一つの第一型アミノ酸残基および少なくとも一つの第二型アミノ酸残基を有する未知タンパク質分子の特徴づけの方法であって、ここで未知タンパク質分子中の第一型アミノ酸残基はトリプトファンアミノ酸残基であってしたがって第一初期励起放射に曝露されたときに対応する第一放出波長の第一放出放射を生じさせることができ、そして未知タンパク質分子中の第二型アミノ酸残基はトリプトファンとは異なる第二アミノ酸残基であり、該方法は次のステップを含んでなる：
（ａ）  未知タンパク質分子を単離すること；
（ｂ）  標識された未知タンパク質分子を作出するために未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸残基をタグで標識すること、ここで該タグは
（ｉ）  該タグが第一放出放射に曝露されるときに、そして
（ｉｉ）  該タグが第一放出波長の第二初期励起放射に曝露されるときに未知タンパク質分子の各第二型アミノ酸残基に第二放出放射を対応する第二放出波長で生じさせる；
（ｃ）  そのアミノ酸配列によって定義される未知タンパク質分子の物理的構造を反映する未知タンパク質分子に関する特徴づけを確定すること、ここで該確定ステップは以下を含んでなる：
（ｉ）  該標識された未知タンパク質分子を第一初期励起放射および該第二初期励起放射に曝露すること；
（ｉｉ）  該曝露ステップによって生じる該標識された未知タンパク質分子からの放出放射を検出すること；および
（ｉｉｉ）  該標識されたタンパク質分子からの該放出放射をスペクトル分析に供し、それによってそのスペクトルパターンを作出すること、ここで該放出放射の該スペクトルパターンは
（Ａ）第一初期励起放射に曝露された未知タンパク質分子のトリプトファンアミノ酸残基からの第一放出放射の強度を反映する該第一放出波長での第一スペクトルパターン構成要素；および
（Ｂ）第一放出放射および該第二初期励起放射に曝露された未知タンパク質分子の各第二型アミノ酸残基に付した該タグからの該第二放出放射の強度を反映する該第二放出波長での第二スペクトルパターン構成要素
を含んでなる。
【請求項１２】
未知タンパク質分子を線状化するステップをさらに含んでなる、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
該線状化ステップが該単離ステップに先行する、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
該線状化ステップが該標識ステップに先行する、請求項１２に記載の方法。
【請求項１５】
該単離ステップを流体力学焦点装置、それを貫通して形成された開口を有する不透明分離プレート、電気泳動ゲルおよび希薄溶液からなる群からの一つを用いて行う、請求項１１に記載の方法。
【請求項１６】
該線状化ステップが洗剤、ドデシル硫酸ナトリウムおよびカオトロピック塩からなる群からの一つを利用する、請求項１２に記載の方法。
【請求項１７】
該標識された未知タンパク質分子を第一初期励起放射および該第二初期励起放射に曝露する該ステップが次のステップ、すなわち
（ａ）  該標識された未知タンパク質分子を第一初期励起放射で照射すること；および
（ｂ）  該ステップ（ａ）と同時に、該標識された未知タンパク質分子を該第二初期励起放射で照射すること
を含んでなる、請求項１５に記載の方法。
【請求項１８】
未知タンパク質分子の特徴づけの方法であって、ここで未知タンパク質分子は少なくとも一つの第一型アミノ酸残基、少なくとも一つの第二型アミノ酸残基および少なくとも一つの第三型アミノ酸残基を有し、未知タンパク質分子中の第一型アミノ酸残基はトリプトファンアミノ酸残基であってしたがって第一励起放射に曝露されるときに対応する第一放出波長の第一放出放射を生じさせることができ、未知タンパク質分子中の第二型アミノ酸残基および第三型アミノ酸残基はトリプトファンとは異なりかつ相互に異なるアミノ酸残基であり、そして該方法は次のステップを含んでなる：
（ａ）  未知タンパク質分子を試料中の他のタンパク質分子から単離すること；
（ｂ）  標識された未知タンパク質分子を作出するために未知タンパク質分子を標識すること、ここで該標識ステップは次のステップを含んでなる：
（ｉ）  未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸残基に第一タグを付すること、ここで該第一タグは
（Ａ）  該第一タグが第一放出放射に曝露されるときに；そして
（Ｂ）  該第一タグが第一励起波長で第二初期励起放射に曝露されるときに未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸残基に第二放出放射を対応する第二放出波長で生じさせる；そして
（ｉｉ）  未知タンパク質分子中の各第三型アミノ酸残基に第二タグを付すること、ここで該第二タグは
（Ａ）  該第二タグが第二放出放射に曝露されるときに；そして
（Ｂ）  該第二タグが第二放出波長で第三初期励起放射に曝露されるときに未知タンパク質分子中の各第三型アミノ酸残基に第三放出放射を対応する第三放出波長で生じさせる；そして
（ｃ）  そのアミノ酸配列によって定義される未知タンパク質分子の物理的構造を反映する特徴づけを未知タンパク質分子に関して確定すること、ここで該確定ステップは次のステップを含んでなる：
（ｉ）  該標識された未知タンパク質分子を第一初期励起放射、該第二初期励起放射および該第三初期励起放射に曝露すること；
（ｉｉ）  該曝露ステップによって生じる該標識された未知タンパク質分子からの放出放射を検出すること；および
（ｉｉｉ）  該標識された未知タンパク質分子からの該放出放射をスペクトル分析に供し、それによってそのスペクトルパターンを作出すること、ここで該放出放射の該スペクトルパターンは
（Ａ）第一初期励起放射に曝露された未知タンパク質分子のトリプトファンアミノ酸残基からの該第一放出放射の強度を反映する該第一放出波長での第一スペクトルパターン構成要素；
（Ｂ）第一放出放射および該第二初期励起放射に曝露された未知タンパク質分子の各第二型アミノ酸残基に付した該第一タグからの該第二放出放射の強度を反映する該第二放出波長での第二スペクトルパターン構成要素；および
（Ｃ）該第二放出放射および該第三初期励起放射に曝露された未知タンパク質分子の各第三型アミノ酸残基に付した該第二タグからの該第二放出放射の強度を反映する該第三放出波長での第二スペクトルパターン構成要素
を含んでなる。
【請求項１９】
該単離ステップを流体力学焦点装置、それを貫通して形成された開口を有する不透明分離プレート、電気泳動ゲルおよび希薄溶液からなる群からの一つを用いて行う、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
該標識された未知タンパク質分子を第一初期励起放射、該第二初期励起放射および該第三初期励起放射に曝露する該ステップが次のステップ、すなわち
（ａ）  該標識された未知タンパク質分子を第一初期励起放射で照射すること；
（ｂ）  該ステップ（ａ）と同時に、該標識された未知タンパク質分子を該第二初期励起放射で照射すること；および
（ｃ）  該ステップ（ｂ）と同時に、該標識された未知タンパク質分子を該第三初期励起放射で照射すること
を含んでなる、請求項１８に記載の方法。
【請求項２１】
少なくとも一つの第一型アミノ酸残基、少なくとも一つの第二型アミノ酸残基および少なくとも一つの第三型アミノ酸残基を有する未知タンパク質分子の特徴づけの方法であって、ここで未知タンパク質分子中の第一型アミノ酸残基はトリプトファンアミノ酸残基であってしたがって第一励起放射に曝露されたときに対応する第一放出波長の第一放出放射を生じさせることができ、未知タンパク質分子中の第二型アミノ酸残基および第三型アミノ酸残基はトリプトファンとは異なりかつ相互に異なるアミノ酸残基であり、そして該方法は次のステップを含んでなる：
（ａ）  未知タンパク質分子を単離すること；
（ｂ）  線状化された未知タンパク質分子を作出するために未知タンパク質分子を線状化すること；
（ｃ）  標識され線状化された未知タンパク質分子を作出するために未知タンパク質分子を標識すること、ここで該標識ステップは次のステップを含んでなる：
（ｉ）  該線状化された未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸残基に第一タグを付すること、ここで該第一タグは
（Ａ）  該第一タグが第一放出放射に曝露されるときに；そして
（Ｂ）  該第一タグが第一放出波長の第二初期励起放射に曝露されるときに
該線状化された未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸残基に第二放出放射を対応する第二放出波長で生じさせる；
（ｉｉ）  線状化された未知タンパク質分子中の各第三型アミノ酸残基に第二タグを付すること、ここで該第二タグは該第二タグが第三放出放射に曝露されるときに、線状化された未知タンパク質分子中の各第三型アミノ酸残基に第三放出放射を対応する第三放出波長で生じさせる；そして
（ｄ）  そのアミノ酸配列によって定義される未知タンパク質分子の物理的構造を反映する特徴づけを未知タンパク質分子に関して確定すること、ここで該確定ステップは次のステップを含んでなる：
（ｉ）  該標識され線状化された未知タンパク質分子を第一初期励起放射および該第二初期励起放射に曝露すること；
（ｉｉ）  該曝露ステップによって生じる該標識され線状化された未知タンパク質分子からの放出放射を検出すること；そして
（ｉｉｉ）  該標識されたタンパク質分子からの該放出放射をスペクトル分析に供し、それによってそのスペクトルパターンを作出すること、ここで該放出放射の該スペクトルパターンは
（Ａ）  第一初期励起放射に曝露された未知タンパク質分子のトリプトファンアミノ酸残基からの第一放出放射の強度を反映する該第一放出波長での第一スペクトルパターン構成要素；
（Ｂ）  第一放出放射および該第二初期励起放射に曝露された未知タンパク質分子の各第二型アミノ酸残基に付した該第一タグからの該第二放出放射の強度を反映する該第二放出波長での第二スペクトルパターン構成要素；および
（Ｃ）  該第二放出放射に曝露された未知タンパク質分子の各第三型アミノ酸残基に付した該第二タグからの該第三放出放射の強度を反映する該第三放出波長での第三スペクトルパターン構成要素
を含んでなる。
【請求項２２】
該標識され線状化された未知タンパク質分子を第一初期励起放射および該第二初期励起放射に曝露する該ステップが
（ａ）  該標識され線状化された未知タンパク質分子を第一初期励起放射で照射すること；および
（ｂ）  該ステップ（ａ）と同時に、該標識され線状化された未知タンパク質分子を該第二初期励起放射で照射すること
を含んでなる、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
少なくとも一つの第一型アミノ酸残基および少なくとも一つの第二型アミノ酸残基を有する未知タンパク質分子の特徴づけのためのシステムであって、ここで第一型アミノ酸残基は第一励起放射に曝露されたときに対応する第一放出波長の第一放出放射を生じさせることができ、該システムは次を含んでなる：
（ａ）  実質上一次元の線状化された未知タンパク質分子を作出するために未知タンパク質分子を線状化するための変性手段；
（ｂ）  標識され線状化された未知タンパク質分子を作出するために該線状化された未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸残基にタグを付するための標識手段、ここで該タグは該タグが第二初期励起放射に曝露されるときに該線状化された未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸残基に第二放出放射を対応する第二放出波長で生じさせる；
（ｃ）  該標識され線状化された未知タンパク質分子を第一初期励起放射および該第二初期励起放射に曝露するための放射手段；
（ｄ）  該放射手段によって生じた該標識され線状化された未知タンパク質分子からの放出放射を検出するための観察手段；および
（ｅ）  該観察手段によって検出された該放出放射をスペクトル分析に供しそれによってそのスペクトルパターンを作出する分析手段、ここで該放出放射の該スペクトルパターンがそのアミノ酸配列によって定義される未知タンパク質分子の物理的構造を反映することによって未知タンパク質分子を特徴づけ、そして該放出放射の該スペクトルパターンは
（ｉ）  第一初期励起放射に曝露された該標識され線状化された未知タンパク質分子中の各第一型アミノ酸残基からの第一放出放射の強度を反映する第一放出波長での第一スペクトルパターン構成要素；および
（ｉｉ）  該第二初期励起放射に曝露された該標識され線状化された未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸残基に付した該タグからの該第二放出放射の強度を反映する該第二放出波長での第二スペクトルパターン構成要素
を含んでなる。
【請求項２４】
該変性手段が洗剤、ドデシル硫酸ナトリウムおよびカオトロピック塩からなる群からの一つを利用する、請求項２３に記載のシステム。
【請求項２５】
該標識手段によって各第二型アミノ酸残基に付された該タグが蛍光色素を含んでなる、請求項２３に記載のシステム。
【請求項２６】
該観察手段が電荷結合素子、カメラおよび顕微鏡からなる群からの一つを含んでなる、請求項２３に記載のシステム。
【請求項２７】
該放射手段が電磁放射源を含んでなる、請求項２３に記載のシステム。
【請求項２８】
（ａ）  化学前駆体が該線状化された未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸残基に該タグを付すための該標識手段によって利用され；そして
（ｂ）  該タグが金属タグである、
請求項２３に記載のシステム。
【請求項２９】
該線状化された未知タンパク質分子中の第二型アミノ酸残基がシステインおよびリジンからなる群から選択されるアミノ酸残基を含んでなる、請求項２３に記載のシステム。
【請求項３０】
該線状化された未知タンパク質分子中の第一型アミノ酸残基がトリプトファンを含んでなる、請求項２３に記載のシステム。
【請求項３１】
（ａ）  複数のタンパク質分子を含む試料中の他の線状化されたタンパク質分子から線状化された未知タンパク質分子を分離するための単離手段；および
（ｂ）  未知タンパク質分子に関する該スペクトルパターンを既知タンパク質分子に関する同様に確定されたスペクトルパターンのライブラリーと比較するための照合手段
をさらに含んでなる、請求項２３に記載のシステム。
【請求項３２】
該単離手段が流体力学焦点装置、それを貫通して形成された開口を有する不透明分離プレート、電気泳動ゲルおよび希薄溶液からなる群からの一つを含んでなる、請求項２３に記載のシステム。
【請求項３３】
該照合手段がコンピュータプロセッサーを含んでなる、請求項２３に記載のシステム。
【請求項３４】
少なくとも一つの第一型アミノ酸残基および少なくとも一つの第二型アミノ酸残基を有する未知タンパク質分子の特徴づけのためのシステムであって、ここで第一型アミノ酸残基は第一初期励起放射に曝露されたときに対応する第一放出波長の第一放出放射を生じさせることができ、該システムは次を含んでなる：
（ａ）  未知タンパク質分子がそこで実質上一次元の線状化された未知タンパク質分子に変換されるタンパク質分子線状化領域；
（ｂ）  該線状化領域と流体連合してその下流に位置する標識づけ領域、ここで該標識づけ領域において該線状化された未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸残基にタグが付され、それによってタグ付きの線状化された未知タンパク質分子が作出され、該タグは該タグが第二初期励起放射に曝露されるときに該線状化された未知タンパク質分子中の各第二型アミノ酸残基に第二放出放射を対応する第二放出波長で生じさせる；
（ｃ）  該線状化領域および該標識づけ領域と流体連合してその下流に位置するタンパク質分子特徴づけ領域、ここで該特徴づけ領域において
（ｉ）  該標識され線状化された未知タンパク質分子が第一初期励起放射および該第二初期励起放射に曝露され；そして
（ｉｉ）  放出放射が第一初期励起放射および該第二初期励起放射に曝露された標識され線状化された未知タンパク質分子から検出される；そして
（ｄ）  該タンパク質分子特徴づけ領域において検出された該放出放射を受信し該発光をスペクトル分析に供するための分析手段であり、それによってそのスペクトルパターンを作出し、ここで該放出放射の該スペクトルパターンがそのアミノ酸配列によって定義される未知タンパク質分子の物理的構造を反映することによって未知タンパク質分子を特徴づけ、そして該放出放射の該スペクトルパターンは
（ｉ）  第一初期励起放射に曝露された標識され線状化された未知タンパク質分子中の各第一型アミノ酸残基からの第一放出放射の強度を反映する第一放出波長での第一スペクトルパターン構成要素；および
（ｉｉ）  該第二初期励起放射に曝露された該標識され線状化された未知タンパク質分子の各第二型アミノ酸残基に付した該タグからの該第二放出放射の強度を反映する該第二放出波長での第二スペクトルパターン構成要素
を含んでなる。
【請求項３５】
一連の既知タンパク質分子に関する特徴づけのライブラリーであって、該ライブラリーは次を含んでなる：
（ａ）  一連既知タンパク質分子の各タンパク質分子の同定特性（アイデンティティー）の一覧；および
（ｂ）  そのアミノ酸配列によって定義された一連既知タンパク質分子の各タンパク質分子の物理的構造を反映する特徴づけ、ここで各該特徴づけは、
（ｉ）  一連既知タンパク質分子の各該タンパク質分子中の第一型アミノ酸残基の数を表す第一特徴づけ構成要素；および
（ｉｉ）  一連既知タンパク質分子の各該タンパク質分子中の第二型アミノ酸残基の数を表す第二特徴づけ構成要素
を含んでなる。
【請求項３６】
一連既知タンパク質分子の各該タンパク質分子中の第三型アミノ酸残基の数を表す第三特徴づけ構成要素をさらに含んでなる、請求項３５に記載のライブラリー。
【請求項３７】
該第一特徴づけ構成要素が一連既知タンパク質分子の各該タンパク質分子中の該第一型アミノ酸残基の配列をさらに表す、請求項３５に記載のライブラリー。
【請求項３８】
該第二特徴づけ構成要素が一連既知タンパク質分子の各該タンパク質分子中の該第二型アミノ酸残基の配列を表す、請求項３５に記載のライブラリー。
【請求項３９】
該第三特徴づけ構成要素が一連既知タンパク質分子の各該タンパク質分子中の該第三型アミノ酸残基の配列をさらに表す、請求項３６に記載のライブラリー。
【請求項４０】
検出可能な同定特性を有する同定可能なタンパク質分子であって、該タンパク質分子は次を含んでなる：
（ａ）  同定可能なタンパク質分子中のアミノ酸残基に数および配列で対応するアミノ酸残基の実質上一次元の線状化された鎖、ここで該線状化された鎖は
（ｉ）  少なくとも一つの第一型アミノ酸残基；および
（ｉｉ）  少なくとも一つの第二型アミノ酸残基
を含んでなる；
（ｂ）  該線状化された鎖中の各第一型アミノ酸残基に付される第一タグ、ここで該線状化された鎖中の各該第一型アミノ酸残基に付した該第一タグは該線状化された鎖にタンパク質分子に関する第一特徴づけ構成要素を集合的に与え、該第一特徴づけ構成要素は該線状化された鎖中の第一型アミノ酸残基の数を表す；そして
（ｃ）  該線状化された鎖中の各第二型アミノ酸残基に付される第二タグ、ここで該線状化された鎖中の各該第二型アミノ酸残基に付した該第二タグは該線状化された鎖にタンパク質分子に関する第二特徴づけ構成要素を集合的に与え、該第二特徴づけ構成要素は該線状化された鎖中の第二型アミノ酸残基の数を表す。
【請求項４１】
該線状化された鎖が少なくとも一つの第三型アミノ酸残基をさらに含んでなり、ここで該第三型アミノ酸残基は該線状化された鎖にタンパク質分子に関する第三特徴づけ構成要素を集合的に与え、該第三特徴づけ構成要素は該線状化された鎖中の第三型のアミノ酸残基の数を表す、請求項４０に記載のタンパク質分子。
【請求項４２】
該第三型アミノ酸残基がトリプトファンである、請求項４１に記載のタンパク質分子。
【請求項４３】
タンパク質分子に関する特徴づけであって、ここでタンパク質分子は少なくとも一つの第一型アミノ酸残基、少なくとも一つの第二型アミノ酸残基および少なくとも一つのトリプトファンアミノ酸残基を有し、該特徴づけは次を含んでなる：
（ａ）  各第一型アミノ酸残基上の第一タグによって該タンパク質分子に与えられる第一特徴づけ構成要素、ここで該第一特徴づけ構成要素は該第一タグが第一初期励起放射で刺激されるときに該第一タグによって生じる第一波長の放出放射を含んでなり；
（ｂ）  各第二型アミノ酸残基上の第二タグによって該タンパク質分子に与えられる第二特徴づけ構成要素、ここで該第二特徴づけ構成要素は該第二タグが第二初期励起放射で刺激されるときに該第二タグによって生じる第二波長の放出放射を含んでなり；
（ｃ）  各第一型アミノ酸残基上の該第一タグによって該タンパク質分子に与えられる第三特徴づけ構成要素、ここで該第三特徴づけ構成要素は該第一タグが該第二波長の該放出放射によって刺激されるときに該第一タグによって生じる該第一波長の第一二次放出放射を含んでなり；
（ｄ）  各トリプトファンアミノ酸残基によって該タンパク質分子に与えられる第四特徴づけ構成要素、ここで該第四特徴づけ構成要素はトリプトファンアミノ酸残基が第三初期励起放射で刺激されるときにトリプトファンアミノ酸残基によって生じる第三波長の放出放射を含んでなり；
（ｅ）  各第二型アミノ酸残基上の該第二タグによって該タンパク質分子に与えられる第五特徴づけ構成要素、ここで該第五特徴づけ構成要素は該第二タグが該第三波長の該放出放射によって刺激されるときに該第二タグによって生じる該第二波長の二次放出放射を含んでなり；そして
（ｆ）  各第一型アミノ酸残基上の該第一タグによって該タンパク質分子に与えられる第六特徴づけ構成要素、ここで該第六特徴づけ構成要素は該第一タグが該第二波長の該二次放出放射によって刺激されるときに該第一タグによって生じる該第一波長の第二二次放出放射を含んでなる。