【手続補正書】
【提出日】平成16年11月8日(2004.11.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
線虫の生存および／または成長および／または生殖に必要なポリペプチドまたはそのフラグメントをコードする単離された核酸分子であって，以下の核酸配列：
ａ）  配列番号１，３，５，７，９，１１，１４，１６，１８，２０，２２，２４，２６，２７，２９，３１，３３，３５，３７，３９，４１，４３，４５，４７または４９に記載される核酸配列およびそのフラグメントおよびその相補鎖；
ｂ）  配列番号２，４，６，８，１０，１２，１３，１５，１７，１９，２１，２３，２５，３０，３２，３４，３６，３８，４０，４２，４４，４６，４８および５０からなる群より選択される配列のいずれかと，１００残基にわたり少なくとも２５％の配列同一性を示すか，および／または，ｂｌａｓｔ配列分析プログラムを用いるコンピュータ支援検索において最大で１０-30のｅ値で検出可能であるポリペプチドをコードする核酸配列；
ｃ）  中／高ストリンジェンシーの条件下でａ）またはｂ）の核酸配列とハイブリダイズしうる核酸；
ｄ）  遺伝コードの結果としてａ），ｂ）またはｃ）に記載される配列のいずれかと縮重している核酸；
からなる群より選択される核酸配列を含む核酸分子。
【請求項２】
検出可能な標識を含む，請求項１記載の核酸配列を含むプローブ。
【請求項３】
少なくとも１５ヌクレオチドを含むポリヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドである請求項２記載のプローブ。
【請求項４】
請求項１記載の単離された核酸分子またはそのフラグメントが組み込まれている組換えベクターまたは核酸構築物。
【請求項５】
発現ベクターである，請求項４記載のベクター。
【請求項６】
請求項１記載の単離された核酸分子を組み込むよう遺伝子工学的に改変されている宿主細胞。
【請求項７】
請求項４記載の組換えベクターまたは核酸構築物を組み込むよう遺伝子工学的に改変されている宿主細胞。
【請求項８】
組換えベクターとして発現ベクターが組み込まれている請求項７記載の宿主細胞。
【請求項９】
請求項１記載の単離された核酸分子またはそのフラグメントを適当な容器中に含むアッセイキット。
【請求項１０】
生存、成長および生殖からなる群より選択される少なくとも１つの線虫の機能に必要なポリペプチドを宿主細胞において製造する方法であって，
ａ）  請求項５記載の発現ベクターを適当な宿主細胞に移し，そして
ｂ）  工程ａ）の宿主細胞を，前記ポリペプチドまたはそのフラグメントの発現を可能とする条件下で培養し，そして
ｃ）  任意に，発現されたポリペプチドを培地に分泌させる
の各工程を含む方法。
【請求項１１】
線虫が，Ｃ．ｅｌｅｇａｎｓおよびヒト，家畜または植物に寄生する線虫からなる群より選択される，請求項１０記載の方法。
【請求項１２】
生存，成長，および生殖からなる群より選択される少なくとも１つの線虫の機能に必要なポリペプチドを製造する方法であって，請求項１記載の単離された核酸分子またはそのフラグメントを発現させる工程を含む方法。
【請求項１３】
成長，生存または生殖からなる群より選択される少なくとも１つの線虫の機能を阻害するか，刺激するかまたは引き起こす薬剤のスクリーニング方法であって，前記薬剤を請求項１で定義される核酸配列と接触させる工程を含む方法。
【請求項１４】
請求項１で定義される核酸分子を含む，線虫の感染または存在に伴う疾病を治療するための医薬組成物。
【請求項１５】
線虫が，Ｗｕｃｈｅｒｅｒｉａ  ｂａｎｃｒｏｆｔｉ，Ｂｒｕｇｉａ  ｍａｌａｙｉ，Ｌｏａ  ｌｏａ，またはＯｎｃｈｏｃｅｒｃａ  ｖｏｌｖｕｌｕｓからなる群より選択される線虫である，請求項１４記載の医薬組成物。
【請求項１６】
疾病が，カラバル腫脹，リンパ性フィラリア症（象皮病）またはオンコセルコーマからなる群より選択される，請求項１４記載の医薬組成物。
【請求項１７】
線虫を検出する方法であって，請求項１で定義される核酸分子をヒトまたは動物に由来する内因性核酸分子とハイブリダイズさせる工程を含む方法。
【請求項１８】
疾病が，カラバル腫脹，リンパ性フィラリア症（象皮病）またはオンコセルコーマからなる群より選択される，請求項１７記載の方法。
【請求項１９】
線虫の感染または存在に伴う植物疾病を診断または治療する方法であって，請求項１で定義される核酸分子またはこれに由来するポリペプチドを用いる工程を含む方法。
【請求項２０】
線虫が，Ｈｅｔｅｒｏｄｅｒａ，例えば，Ｈ．ｇｌｙｃｉｎｅｓ，Ｈ．ａｖｅｎａｅ，Ｈ．ｓｃｈａｃｈｔｉｉ，Ｈ．ｔｒｉｆｏｌｉｉ，Ｈ．ｇｏｔｔｉｎｇｉａｎａ，Ｈ．ｃａｊａｎｉ，Ｈ．ｚｅａｅ；Ｇｌｏｂｏｄｅｒａ，例えば，Ｇ．ｒｏｓｔｏｃｈｉｅｎｓｉｓ，Ｇ．ｐａｌｌｉｄａ，Ｇ．ｔａｂａｃｕｍ；Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ，例えば，Ｍ．ａｒｅｎａｒｉａ，Ｍ．ｉｎｃｏｇｎｉｔａ，Ｍ．ｊａｖａｎｉｃａ，Ｍ．ｈａｐｌａ，Ｍ．ｃｈｉｔｗｏｏｄｉ；Ｄｉｔｙｌｅｎｃｈｕｓ，例えば，Ｄ．ｄｅｓｔｒｕｃｔｏｒ，Ｄ．ｄｉｐｓａｃｉ，Ｄ．ａｎｇｕｓｔｕｓ；Ａｎｇｕｉｎａ，例えば，Ａ．ｔｒｉｔｉｃｉ，Ａ．ａｇｒｏｓｔｉｓ，Ａｆｒｉｎａ／Ａｎｇｕｉｎａ  ｗｅｖｅｌｌｉ；Ｐｒａｔｙｌｅｎｃｈｕｓ，例えば，Ｐ．ｐｅｎｅｔｒａｎｓ，Ｐ．ｂｒａｃｈｙｕｒｕｓ，Ｐ．ｃｏｆｆｅａｅ，Ｐ．ｚｅａｅ，Ｐ．ｇｏｏｄｅｙｉ，Ｐ．ｔｈｏｒｎｅｉ，Ｐ．ｖｕｌｎｕｓ；Ｒａｄｏｐｈｏｌｕｓ，例えば，Ｒ．ｓｉｍｉｌｉｓ；Ｈｉｒｓｃｈｍａｎｎｉｅｌｌａ，例えば，Ｈ．ｏｒｙｚａｅ，Ｈ．ｍｕｃｒｏｎａｔａ，Ｈ．ｓｐｉｎｉｃａｕｄａ；Ｈｏｐｌｏｌａｉｍｕｓ，例えば，Ｈ．ｃｏｌｕｍｂｕｓ，Ｈ．ｓｅｉｎｈｏｒｓｔｉ，Ｈ．ｉｎｄｉｃｕｓ；Ｒｏｔｙｌｅｎｃｈｕｌｕｓ，例えば，Ｒ．ｒｅｎｉｆｏｒｍｉｓ；Ｔｙｌｅｎｃｈｕｌｕｓ，例えば，Ｔ．ｓｅｍｉｐｅｎｅｔｒａｎｓ；Ｈｅｌｉｃｏｔｙｌｅｎｃｈｕｓ，例えば，Ｈ．ｍｕｌｔｉｃｉｎｃｔｕｓ，Ｈ．ｍｕｃｒｏｎａｔｕｓ，Ｈ．ｄｉｈｙｓｔｅｒａ，Ｈ．ｐｓｅｕｄｏｒｏｂｕｓｔｕｓ；Ｃｒｉｃｏｎｅｍｅｌｌａ，例えば，Ｃ．ｘｅｎｏｐｌａｘ，Ｃ．ａｘｅｓｔｉｓ，Ｃ．ｓｐｈａｒｏｃｅｐｈａｌｕｍ；Ｘｉｐｈｉｎｅｍａ，例えば，Ｘ．ａｍｅｒｉｃａｎｕｍ，Ｘ．ｅｌｏｎｇａｔｕｍ；Ｌｏｎｇｉｄｏｒｕｓ，例えば，Ｌ．ａｆｒｉｃａｎｕｓ；Ｔｒｉｃｈｏｄｏｒｕｓ；Ｐａｒａｔｒｉｃｈｏｄｏｒｕｓ，例えば，Ｐ．ｍｉｎｏｒ；Ａｐｈｅｌｅｎｃｈｓ，例えば，Ａ．ｆｒａｇａｒｉａｅ，Ａ．ｂｅｓｓｅｙｉ，Ａ．ｒｉｔｚｅｍａｂｏｓｉ，Ｂｕｒｓａｐｈｅｌｅｎｃｈｕｓ  ｘｙｌｏｐｈｉｌｕｓからなる群より選択される線虫である，請求項１９記載の方法。
【請求項２１】
生存，成長および生殖からなる群より選択される少なくとも１つの線虫の機能に必要なポリペプチドまたはそのフラグメントであって，
ａ）  配列番号２，４，６，８，１０，１２，１３，１５，１７，１９，２１，２３，２５，３０，３２，３４，３６，３８，４０，４２，４４，４６，４８および５０に記載されるアミノ酸配列およびそのフラグメント；
ｂ）  ａ）の配列と、１００残基にわたり少なくとも２５％の配列同一性を示すか，および／またはｂｌａｓｔ配列分析プログラムを用いるコンピュータ支援検索において最大で１０-30のｅ値で検出可能であるアミノ酸配列；
ｃ）  請求項１記載の核酸配列ｃ）−ｄ）のいずれかによりコードされるアミノ酸配列
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはそのフラグメント。
【請求項２２】
請求項２１記載のポリペプチドまたはその免疫原性部分と特異的に結合しうる，ポリクローナル抗体またはモノクローナル抗体，またはそのフラグメント。
【請求項２３】
生存，成長および生殖からなる群より選択される少なくとも１つの線虫の機能を阻害するか、刺激するか、または引き起こす相互作用薬剤のスクリーニング方法であって，前記薬剤を請求項２１記載のポリペプチドと接触させる工程を含む方法。
【請求項２４】
以下の工程：
１．  宿主細胞において前記ポリペプチドを組換え的に発現させ；
２．  工程１において組換え的に発現させたポリペプチドを単離し，および任意に精製し；
３．  前記ポリペプチドとの相互作用について試験される薬剤を任意に標識し，および／または，組換え的に発現させたポリペプチドを標識し；
４．  組換え的に発現させたポリペプチドを固相に固定化し；
５．  潜在的相互作用パートナーまたはその変種をポリペプチドに結合させ；
６．  任意に１回またはそれ以上洗浄し；
７．  特に，固相に結合したまま残る標識の量をバックグラウンドレベルに対してモニターすることにより，相互作用を検出および／または定量する
を含む，請求項２３記載のスクリーニング方法。
【請求項２５】
請求項２１記載のポリペプチドを含む，線虫の感染または存在に伴う疾病を治療するための医薬組成物。
【請求項２６】
線虫が，Ｗｕｃｈｅｒｅｒｉａ  ｂａｎｃｒｏｆｔｉ，Ｂｒｕｇｉａ  ｍａｌａｙｉ，Ｌｏａ  ｌｏａおよびＯｎｃｈｏｃｅｒｃａ  ｖｏｌｖｕｌｕｓからなる群より選択される線虫である，請求項２５記載の医薬組成物。
【請求項２７】
疾病が，カラバル腫脹，リンパ性フィラリア症（象皮病）またはオンコセルコーマからなる群より選択される，請求項２５記載の医薬組成物。
【請求項２８】
線虫の感染または存在に伴う植物疾病を治療または診断する方法であって，請求項２１に記載のポリペプチドを用いる工程を含む方法。
【請求項２９】
線虫が，Ｈｅｔｅｒｏｄｅｒａ，例えば，Ｈ．ｇｌｙｃｉｎｅｓ，Ｈ．ａｖｅｎａｅ，Ｈ．ｓｃｈａｃｈｔｉｉ，Ｈ．ｔｒｉｆｏｌｉｉ，Ｈ．ｇｏｔｔｉｎｇｉａｎａ，Ｈ．ｃａｊａｎｉ，Ｈ．ｚｅａｅ；Ｇｌｏｂｏｄｅｒａ，例えば，Ｇ．ｒｏｓｔｏｃｈｉｅｎｓｉｓ，Ｇ．ｐａｌｌｉｄａ，Ｇ．ｔａｂａｃｕｍ；Ｍｅｌｏｉｄｏｇｙｎｅ，例えば，Ｍ．ａｒｅｎａｒｉａ，Ｍ．ｉｎｃｏｇｎｉｔａ，Ｍ．ｊａｖａｎｉｃａ，Ｍ．ｈａｐｌａ，Ｍ．ｃｈｉｔｗｏｏｄｉ；Ｄｉｔｙｌｅｎｃｈｕｓ，例えば，Ｄ．ｄｅｓｔｒｕｃｔｏｒ，Ｄ．ｄｉｐｓａｃｉ，Ｄ．ａｎｇｕｓｔｕｓ；Ａｎｇｕｉｎａ，例えば，Ａ．ｔｒｉｔｉｃｉ，Ａ．ａｇｒｏｓｔｉｓ，Ａｆｒｉｎａ／Ａｎｇｕｉｎａ  ｗｅｖｅｌｌｉ；Ｐｒａｔｙｌｅｎｃｈｕｓ，例えば，Ｐ．ｐｅｎｅｔｒａｎｓ，Ｐ．ｂｒａｃｈｙｕｒｕｓ，Ｐ．ｃｏｆｆｅａｅ，Ｐ．ｚｅａｅ，Ｐ．ｇｏｏｄｅｙｉ，Ｐ．ｔｈｏｒｎｅｉ，Ｐ．ｖｕｌｎｕｓ；Ｒａｄｏｐｈｏｌｕｓ，例えば，Ｒ．ｓｉｍｉｌｉｓ；Ｈｉｒｓｃｈｍａｎｎｉｅｌｌａ，例えば，Ｈ．ｏｒｙｚａｅ，Ｈ．ｍｕｃｒｏｎａｔａ，Ｈ．ｓｐｉｎｉｃａｕｄａ；Ｈｏｐｌｏｌａｉｍｕｓ，例えば，Ｈ．ｃｏｌｕｍｂｕｓ，Ｈ．ｓｅｉｎｈｏｒｓｔｉ，Ｈ．ｉｎｄｉｃｕｓ；Ｒｏｔｙｌｅｎｃｈｕｌｕｓ，例えば，Ｒ．ｒｅｎｉｆｏｒｍｉｓ；Ｔｙｌｅｎｃｈｕｌｕｓ，例えば，Ｔ．ｓｅｍｉｐｅｎｅｔｒａｎｓ；Ｈｅｌｉｃｏｔｙｌｅｎｃｈｕｓ，例えば，Ｈ．ｍｕｌｔｉｃｉｎｃｔｕｓ，Ｈ．ｍｕｃｒｏｎａｔｕｓ，Ｈ．ｄｉｈｙｓｔｅｒａ，Ｈ．ｐｓｅｕｄｏｒｏｂｕｓｔｕｓ；Ｃｒｉｃｏｎｅｍｅｌｌａ，例えば，Ｃ．ｘｅｎｏｐｌａｘ，Ｃ．ａｘｅｓｔｉｓ，Ｃ．ｓｐｈａｒｏｃｅｐｈａｌｕｍ；Ｘｉｐｈｉｎｅｍａ，例えば，Ｘ．ａｍｅｒｉｃａｎｕｍ，Ｘ．ｅｌｏｎｇａｔｕｍ；Ｌｏｎｇｉｄｏｒｕｓ，例えば，Ｌ．ａｆｒｉｃａｎｕｓ；Ｔｒｉｃｈｏｄｏｒｕｓ；Ｐａｒａｔｒｉｃｈｏｄｏｒｕｓ，例えば，Ｐ．ｍｉｎｏｒ；Ａｐｈｅｌｅｎｃｈｓ，例えば，Ａ．ｆｒａｇａｒｉａｅ，Ａ．ｂｅｓｓｅｙｉ，Ａ．ｒｉｔｚｅｍａｂｏｓｉ，Ｂｕｒｓａｐｈｅｌｅｎｃｈｕｓ  ｘｙｌｏｐｈｉｌｕｓからなる群より選択される，請求項２８記載の方法。
【請求項３０】
請求項２０記載のポリペプチドの薬剤結合および効力を評価する方法であって，請求項２１において定義される核酸配列を用いるコンピュータモデル，構造モデルまたは他のモデルを開発する工程を含む方法。