【手続補正書】
【提出日】平成16年5月10日(2004.5.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
複数の場合、前記キャピラリーゲルアレイは、一つ以上のキャピラリーにおいて未知サンプルのサイズに基づいた分離と、他の複数のキャピラリーにおいて標準品のサイズに基づいた分離とを行い、
前記複数の未知サンプルの結果を、前記複数の標準品の結果と比較し、
前記標準品の結果の特徴における変化が経時的であり、かつ
所定の位置の外での前記特徴の変化が、前記アレイ上の情報を供する、
ことを特徴とする、キャピラリーゲルアレイの性能をモニターする方法。
【請求項２】
前記性能は、キャピラリーにおいて、経時的な、標準品の移動速度又は移動距離であることを特徴とする請求項１に記載の方法。
【請求項３】
複数の場合、前記キャピラリーゲルアレイは、一つ以上のキャピラリーにおいて未知サンプルのサイズに基づいた分離と、他の複数のキャピラリーにおいて標準品のサイズに基づいた分離とを行い、
前記複数の未知サンプルの結果を、分析結果を得るように、前記複数の標準品の結果と比較し、
前記標準品の結果の特徴における変化が経時的であり、かつ
所定の位置の外での前記特徴の変化が、前記アレイ上の情報を供する、
ことを特徴とする、キャピラリーゲルアレイを用いたＤＮＡを含有するサンプルの分析方法。
【請求項４】
前記特徴は、前記標準品の一つ以上の成分に関する前記距離又は前記速度であることを特徴とする請求項１乃至３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
前記標準品の前記一つ以上の成分に関する、前記移動速度及び／又は前記移動距離及び／又は成分のサイズが、標準偏差として表されていることを特徴とする請求項１乃至４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
変化は、閾値をまたぐ前記特徴を生じる前記特徴における変更であることを特徴とする請求項１乃至５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
前記閾値は、絶対値であり、且つ、前もってセットされた速度、前もってセットされた距離又は前もってセットされた標準偏差であることを特徴とする請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記変化は、前記特徴の変化率の変更であり、特に、閾値を超える変更率であることを特徴とする請求項１乃至７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記変化は、使用の後、あるいは、前記使用に由来する結果により同定されることを特徴とする請求項１乃至８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
前記変化は、前記アレイの一つ以上のキャピラリーから得られた前記標準品に関する前記結果から同定されることを特徴とする請求項１乃至９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記アレイ上の前記情報は、一つ以上のキャピラリーが低下した性能を供する表示であることを特徴とする請求項１乃至１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記アレイ上の前記情報は、一つ以上のキャピラリーが必要とされるパラメーター内で機能しないことの表示であることを特徴とする請求項１乃至１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記アレイ上の前記情報は、一つ以上のキャピラリーの性能が、適切な制御のために必要なパラメーターの限度に接近していることの警告であることを特徴とする請求項１乃至１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
分析用途でのキャピラリーゲルアレイの設定方法であって、
分析用途において、前記キャピラリーゲルアレイは、一つ以上のキャピラリーにおいて未知サンプルのサイズに基づいた分離と、他の複数のキャピラリーにおいて標準品のサイズに基づいた分離とを行い、
前記複数の未知サンプルの結果を、分析結果を得るように、前記複数の標準品の結果と比較し、
当該設定方法は、分析用途にて、標準品のサイズに基づいた分離が行われるべきキャピラリーの数を同定し、
当該設定方法は、前記標準品の一つ以上の成分に関して：
前記成分に関する平均サイズにおける標的となる標準偏差を同定し；
サイズに基づいた多重的な設定の分離により、前記成分に関する平均サイズにおける実験的な標準偏差と、前記標準品のサイズに基づいた分離に使用されるキャピラリーの数との関係を同定し；かつ
前記実験的な標準偏差に関して、前記関係により、キャピラリーの境界数を示す前記の標的となる標準偏差と同等とみなし；
分析用途にて前記標準品のサイズに基づいた分離に使用されるキャピラリーの前記数は、全数であり、かつ少なくとも前記境界数と同じである、
ことを特徴とする、好ましく請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
キャピラリーゲルアレイを用いたサンプル中のＤＮＡの分析方法であって、
前記キャピラリーゲルアレイは、一つ以上のキャピラリーにおいて未知サンプルのサイズに基づいた分離と、他の複数のキャピラリーにおいて標準品のサイズに基づいた分離とを行い、
前記複数の未知サンプルの結果を、分析結果を得るように、前記複数の標準品の結果と比較し、
当該分析方法は、分析用途にて、標準品のサイズに基づいた分離が行われるべきキャピラリーの数を同定することを有する設定方法を有し、
前記設定方法は、前記標準品の一つ以上の成分に関して：
前記成分に関する平均サイズにおける標的となる標準偏差を同定し；
サイズに基づいた多重的な設定の分離により、前記成分に関する平均サイズにおける実験的な標準偏差と、前記標準品のサイズに基づいた分離に使用されるキャピラリーの数との関係を同定し；かつ
前記実験的な標準偏差に関して、前記関係により、キャピラリーの境界数を示す前記の標的となる標準偏差と同等とみなし；
分析用途にて前記標準品のサイズに基づいた分離に使用されるキャピラリーの前記数は、全数であり、かつ少なくとも前記境界数と同じである、
ことを特徴とする、好ましく請求項３に記載の方法。
【請求項１６】
分析用途において、前記キャピラリーゲルアレイは、一つ以上のキャピラリーにおいて未知サンプルのサイズに基づいた分離と、他の複数のキャピラリーにおいて標準品のサイズに基づいた分離とを行い、
前記複数の未知サンプルの結果を、前記複数の標準品の結果と比較し、
前記アレイの一方又は両方の端部におけるキャピラリーのグループが、前記アレイの次なる使用において、前記標準品のためのキャピラリーとして使用されることから除外されることを特徴とする、好ましく請求項１４に記載された分析用途でのキャピラリーゲルアレイの設定方法。
【請求項１７】
前記キャピラリーゲルアレイは、一つ以上のキャピラリーにおいて未知サンプルのサイズに基づいた分離と、他の複数のキャピラリーにおいて標準品のサイズに基づいた分離とを行い、
前記複数の未知サンプルの結果を、分析結果を得るように、前記複数の標準品の結果と比較し、
前記アレイの一方又は両方の端部におけるキャピラリーのグループが、前記アレイの次なる使用において、前記標準品のためのキャピラリーとして使用されることから除外されることを特徴とする、好ましく請求項１５に記載された、キャピラリーゲルアレイを用いたＤＮＡを含有するサンプルの分析方法。
【請求項１８】
分析用途において、前記キャピラリーゲルアレイは、一つ以上のキャピラリーにおいて未知サンプルのサイズに基づいた分離と、他の複数のキャピラリーにおいて標準品のサイズに基づいた分離とを行い、
前記複数の未知サンプルの結果を、前記複数の標準品の結果と比較し、
サイズに基づいた分離は、複数のキャピラリーのそれぞれにおいて、既知の材料にて行われ、該複数のキャピラリーにおける該既知の材料の特徴に関連した移動速度を同定し、かつ
前記複数のキャピラリーの中で、所定の範囲外の特徴値を有するキャピラリーは、前記アレイの次なる使用において、前記標準品のためのキャピラリーとして使用されることから除外される、
ことを特徴とする、好ましく請求項１４に記載された分析用途でのキャピラリーゲルアレイの設定方法。
【請求項１９】
前記キャピラリーゲルアレイは、一つ以上のキャピラリーにおいて未知サンプルのサイズに基づいた分離と、他の複数のキャピラリーにおいて標準品のサイズに基づいた分離とを行い、
前記複数の未知サンプルの結果を、分析結果を得るように、前記複数の標準品の結果と比較し、
サイズに基づいた分離は、複数のキャピラリーのそれぞれにおいて、既知の材料にて行われ、該複数のキャピラリーにおける該既知の材料の特徴に関連した移動速度を同定し、かつ
前記複数のキャピラリーの中で、所定の範囲外の特徴値を有するキャピラリーは、前記アレイの次なる使用において、前記標準品のためのキャピラリーとして使用されることから除外される、
ことを特徴とする、好ましく請求項１５に記載された、キャピラリーゲルアレイを用いたＤＮＡを含有するサンプルの分析方法。
【請求項２０】
前記設定方法は、前記アレイの分析用途の前に使用され、
前記設定方法は、機器上で使用される各アレイに使用され、及び／又は
前記設定は、前記分析方法に使用される前記標準品が変更された場合に使用される、
ことを特徴とする請求項１４乃至１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１】
前記設定方法は、前記標準品の一つの成分にのみ実施され、
該成分は、前記標準品に存在する最も分子量の大きい遺伝子座の成分である、
ことを特徴とする請求項１４又は１５に記載の方法。
【請求項２２】
前記設定方法は、前記標準品に存在する最も分子量の大きい遺伝子座の最も大きい分子量の成分に実施されることを特徴とする請求項１４、１５又は２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記設定方法は、前記標準品の一つの成分に実施され、
該成分は、前記標準品に存在する最もＡＴリッチな遺伝子座の成分である、
ことを特徴とする請求項１４又は１５に記載の方法。
【請求項２４】
前記の標的となる標準偏差は、一つ以上のファクターに基づいており、
該ファクターは、実際の平均サイズと成分に関して実験的に同定した平均サイズとの間の許容可能な不一致、必要とされる信憑性の程度、及び／若しくは、実験的に同定された対立遺伝子のサイズに配置された分布型のいずれか一つ又はそれ以上を含む、
ことを特徴とする請求項１４、１５及び２０乃至２３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５】
前記関係は、前記成分の平均サイズに関する標準偏差の変化と、実験的な、前記標準品を設けたキャピラリーの数とであることを特徴とする請求項１４、１５及び２０乃至２４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６】
前記の標的となる標準偏差値と等価な実験的な標準偏差値が取得され、かつ、前記関係に適用され、
前記実験的な標準偏差の適用は、標準品を設けたキャピラリーの数に関連し、
該数は、前記分析用途にて標準品を設けたキャピラリーの数の全数であり、かつ
該数は、分析用途にて前記標準品を設けたキャピラリーの数を与えるように丸められた全体ではない数である、
ことを特徴とする請求項１４、１５及び２０乃至２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
前記アレイの両方の端部由来のキャピラリーのグループが除外されていることを特徴とする請求項１６又は１７に記載の方法。
【請求項２８】
前記アレイの最初のキャピラリー又は最後のキャピラリーの少なくとも一方が除外され、かつ、理想的には両方が除外されていることを特徴とする請求項１６又は１７に記載の方法。
【請求項２９】
前記の除外されたキャピラリーが、未知サンプルの分析用途に使用されることを特徴とする請求項１６、１７、２８又は２９に記載の方法。
【請求項３０】
前記の除外されたキャピラリーが、請求項５又は６に記載の方法に従って除外されたキャピラリーに加えられるか、一つ以上の一般のキャピラリーを含んでいるかを特徴とする請求項１６、１７、及び２７乃至２９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１】
前記設定方法におけるサイズに基づいた分析は、前記アレイの前記キャピラリーのすべてにおいて実行され、
前記と同じ既知材料は、各キャピラリーにて使用され、かつ
前記特徴値は、前記キャピラリーにて前記材料が同時間移動された距離により同定される、
ことを特徴とする請求項１８又は１９に記載の方法。
【請求項３２】
前記所定の範囲は、上限度及び下限度により規定されることを特徴とする請求項１８、１９又は３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記限度は、平均値又は中央値などの標準値に相対して規定されることを特徴とする請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
前記の除外されたキャピラリーは、未知サンプルの分析用途に使用されることを特徴とする請求項１８、１９及び３１乃至３３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５】
特徴がさらなる所定の範囲外に存在する場合、前記キャピラリーは、前記アレイの次なる使用において、未知サンプルのキャピラリーとしての使用から除外されることを特徴とする請求項１８、１９及び３１乃至３３のいずれか一項に記載の方法。