【手続補正書】
【提出日】平成15年11月6日(2003.11.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の化学式１
【化１】
2004525196.tif 000001
を有する色素フォスフォアミダイトであって、
この化学式において、各点線は、縮合した置換または非置換芳香族環を形成するために必要な炭素原子を表し、ｍは１から１８までの整数であり、ＹおよびＺは、Ｓ、Ｏ、Ｎ、ＣＨ２およびＣ（ＣＨ３）２からなるグループから独立に選択され、Ｒ１はアルキル基であり、（ＰＡＭ）はフォスフォアミダイト基であり、Ｘ（−）は陰イオンであり、Ｑは、以下の化学式（Ｑ−２）
【化２】
2004525196.tif 000002
である、色素フォスフォアミダイト。
【請求項２】
前記芳香族環は、フェニル基、ナフチル基または複素環である、請求項１に記載の色素フォスフォアミダイト。
【請求項３】
前記アルキル基は、１から１８個までの炭素原子を有する、請求項１に記載の色素フォスフォアミダイト。
【請求項４】
前記アルキル基はエチル基である、請求項３に記載の色素フォスフォアミダイト。
【請求項５】
前記色素はシアニン色素である、請求項１に記載の色素フォスフォアミダイト。
【請求項６】
前記シアニン色素は、環状Ｃｙ７、環状ベンゾＣｙ７および環状ジベンゾＣｙ７からなるグループから選択される、請求項５に記載の色素フォスフォアミダイト。
【請求項７】
前記陰イオンは、Ｉ（−）またはＢｒ（−）である、請求項１に記載の色素フォスフォアミダイト。
【請求項８】
前記フォスフォアミダイト基は、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル−Ｏ−β−シアノエチル  フォスフォアミダイト基である、請求項１に記載の色素フォスフォアミダイト。
【請求項９】
色素フォスフォアミダイトの合成方法であって、
（ａ）以下の化学式２
【化３】
2004525196.tif 000003
を有する前記色素の水酸基誘導体を形成するステップであって、
この化学式において、各点線は、縮合した置換または非置換芳香族環を形成するために必要な炭素原子を表し、ｍは１から１８までの整数であり、ＹおよびＺは、Ｓ、Ｏ、Ｎ、ＣＨ２およびＣ（ＣＨ３）２からなるグループから独立に選択され、Ｒ１はアルキル基であり、Ｘ（−）は陰イオンであり、Ｑは以下の化学式（Ｑ−７）
【化４】
2004525196.tif 000004
である、色素の水酸基誘導体を形成するステップと、
（ｂ）前記水酸基の水素をフォスフォアミダイトで置換するステップとを含む、色素フォスフォアミダイトの合成方法。
【請求項１０】
前記芳香族環は、フェニル基、ナフチル基または複素環である、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記アルキル基は、１から１２個までの炭素原子を有する、請求項９に記載の方法。
【請求項１２】
前記アルキル基はエチル基である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記陰イオンは、I（−）またはＢｒ（−）である、請求項９に記載の方法。
【請求項１４】
前記フォスフォアミダイト基は、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル−Ｏ−β−シアノエチル  フォスフォアミダイト基である、請求項９に記載の方法。
【請求項１５】
前記色素はシアニン色素である、請求項９に記載の方法。
【請求項１６】
前記シアニン色素は、環状Ｃｙ７、環状ベンゾＣｙ７および環状ジベンゾＣｙ７からなるグループから選択される、請求項１５に記載の色素フォスフォアミダイト。
【請求項１７】
前記色素の水酸基誘導体を形成するステップは、該水酸基誘導体の形成を可能にする条件下で、以下の化学式
【化５】
2004525196.tif 000005
を有する化合物（ＸＩ）と、
化学式Ｐｈ−Ｒ３−Ｐｈを有し、Ｐｈはフェニル基で、Ｒ３は以下の化学式
【化６】
2004525196.tif 000006
の物質である、化合物（ＸＩＩ）と、
以下の化学式
【化７】
2004525196.tif 000007
を有する化合物（ＸＩＩＩ）とを反応させることを含み、
これらの化学式において、各点線は、縮合した置換または非置換芳香族環を形成するために必要な炭素原子を表し、ｍは１から１８までの整数であり、ＹおよびＺは、Ｓ、Ｏ、Ｎ、ＣＨ２およびＣ（ＣＨ３）２からなるグループから独立に選択され、Ｒ１はアルキル基であり、Ｘ（−）は陰イオンである、請求項９に記載の方法。
【請求項１８】
前記芳香族環は、フェニル基、ナフチル基または複素環である、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記陰イオンはＢｒ（−）である、請求項１７に記載の方法。
【請求項２０】
前記アルキル基は、１から１８個までの炭素原子を有する、請求項１７に記載の方法。
【請求項２１】
前記アルキル基はエチル基である、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
化合物（ＸＩＩＩ）は、化合物（ＸＩＩＩ）の形成を可能にする条件下で、以下の化学式
【化８】
2004525196.tif 000008
を有する化合物（ＸＩＶ）を、Ｂｒ（ＣＨ２）ｍ−ＯＨに反応させることにより形成され、
上記の化学式において、各点線は、縮合した置換または非置換芳香族環を形成するために必要な炭素原子を表し、Ｙは、Ｓ、Ｏ、Ｎ、ＣＨ２およびＣ（ＣＨ３）２からなるグループから選択され、ｍは１から１８までの整数である、請求項１７に記載の方法。
【請求項２３】
前記色素は環状Ｃｙ７であり、化合物（ＸＩ）はヨウ化１−エチル−２，３，３−トリメチル−（３Ｈ）−インドールニウムで、化合物（ＸＩＩＩ）は臭化１−（６−ヒドロキシルヘキシル）−１，１，２−トリメチル−（３Ｈ）−インドールニウムである、請求項１７に記載の方法。
【請求項２４】
前記色素は環状ＤＢＣｙ７であり、化合物（ＸＩ）はヨウ化１−エチル−１，１，２−トリメチル−Ｈ−ベンゾインドールニウムで、化合物（ＸＩＩＩ）は臭化１−（６−ヒドロキシヘキシル）−１，１，２−トリメチル−Ｈ−ベンゾインドールニウムである、請求項１７に記載の方法。
【請求項２５】
前記色素の水酸基誘導体を形成するステップは、
（ａ１）以下の化学式３
【化９】
2004525196.tif 000009
を有する前記色素のアセトキシル基誘導体を形成するステップであって、
上記の化学式において、各点線は、縮合した置換または非置換芳香族環を形成するために必要な炭素原子を表し、ｍは１から１８までの整数であり、ＹおよびＺは、Ｓ、Ｏ、Ｎ、ＣＨ２およびＣ（ＣＨ３）２からなるグループから独立に選択され、Ｒ１はアルキル基であり、Ｘ（−）は陰イオンであり、Ｑは以下の化学式（Ｑ−９）
【化１０】
2004525196.tif 000010
であり、Ｒ２は、ハロゲンまたは水素である、アセトキシル基誘導体を形成するステップと、
（ａ２）前記色素のアセトキシル基を水酸基に転換するステップとを含む、請求項９に記載の方法。
【請求項２６】
前記芳香族環は、フェニル基、ナフチル基または複素環である、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
前記アルキル基は、１から１２個までの炭素原子を有する、請求項２５に記載の方法。
【請求項２８】
前記アルキル基はエチル基である、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
前記色素はシアニン色素である、請求項２５に記載の方法。
【請求項３０】
前記シアニン色素は、環状Ｃｙ７、環状ベンゾＣｙ７および環状ジベンゾＣｙ７からなるグループから選択される、請求項２５に記載の色素フォスフォアミダイト。
【請求項３１】
前記陰イオンはＩ（−）である、請求項２５に記載の方法。
【請求項３２】
前記ハロゲンは塩素である、請求項２５に記載の方法。
【請求項３３】
前記シアニン色素のアセトキシル基誘導体を形成するステップは、該アセトキシル誘導体を形成することを可能にする条件下で、以下の化学式を有する化合物（ＸＩ）
【化１１】
2004525196.tif 000011
と、
以下の化学式
【化１２】
2004525196.tif 000012
を有する化合物（ＸＸＩＩ）と、
以下の化学式
2004525196.tif 000013
を有する化合物（ＸＸＩＩＩ）とを反応させることを含み、
上記の化学式において、各点線は、縮合した置換または非置換芳香族環を形成するために必要な炭素原子を表し、ｍは１から１８までの整数であり、ＹおよびＺは、Ｓ、Ｏ、Ｎ、ＣＨ２およびＣ（ＣＨ３）２からなるグループから独立に選択され、Ｒ１はアルキル基であり、Ｘ（−）は陰イオンである、請求項２５に記載の方法。
【請求項３４】
前記芳香族環は、フェニル基、ナフチル基または複素環である、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
前記陰イオンはＩ（−）である、請求項３３に記載の方法。
【請求項３６】
前記アルキル基は、１から１２個までの炭素原子を有する、請求項３３に記載の方法。
【請求項３７】
前記アルキル基はエチル基である、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
前記シアニン色素は環状Ｃｙ７であり、化合物（ＸＩ）はヨウ化１−エチル−２，３，３−トリメチル−（３Ｈ）−インドールニウムであり、化合物（ＸＸＩＩＩ）はヨウ化１−（１’−アセトキシプロピル）−２，３，３’−トリメチル−（３Ｈ）−インドールニウムである、請求項３６に記載の方法。
【請求項３９】
前記シアニン色素は環状ＤＢＣｙ７であり、化合物（ＸＩ）はヨウ化１−エチル−１，１，２−トリメチル−Ｈ−ベンゾインドールニウムであり、化合物（ＸＸＩＩＩ）はヨウ化１−（１’−アセトキシプロピル）−２，３，３’−トリメチル−Ｈ−ベンゾインドールニウムである、請求項３６に記載の方法。
【請求項４０】
請求項１に記載の色素フォスフォアミダイトとオリゴヌクレオチドとの結合を可能にする条件下で、前記色素フォスフォアミダイトを前記オリゴヌクレオチドに反応させることを含む、オリゴヌクレオチドの標識方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６１】
【化２０】
2004525196.tif 000014
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８２】
【化２８】
2004525196.tif 000015