【手続補正書】
【提出日】平成16年6月23日(2004.6.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  試料中の少なくとも１つのターゲット核酸分子を増幅するための方法であって、
（i） デバイスのチャンバ内に反応化合物を導入し、ここで、前記チャンバを、開放端を有したものとするとともに、前記デバイスを、前記開放端を通して前記チャンバから延在しかつ前記チャンバの外部に位置した開放第１端と前記チャンバ内に位置した開放第２端とを有した中空の長尺部材と、該長尺部材と前記チャンバの内表面との間のシールをもたらすシール手段と、を具備するものとし、さらに、前記シール手段を、前記長尺部材の前記開放第２端と前記チャンバの前記開放端との間に配置し、この場合、前記長尺部材を前記チャンバ内において相対移動可能なものとし、前記開放第２端を前記チャンバの前記開放端に向けて移動させることによって、前記チャンバ内において圧力変化を引き起こし、この圧力変化を、前記長尺部材を通しての前記チャンバ内への流体の取込を引き起こすに十分な圧力変化とし、また、前記反応化合物を、前記ターゲットシークエンスの増幅のための反応剤を有するものとし；
（ii）前記長尺部材の前記開放第１端に対して試料を導入し；
（iii） 前記長尺部材の前記開放第２端を前記チャンバの前記開放端に向けて移動させることによって、前記チャンバ内の圧力を減少させ、これにより、前記長尺部材の前記相対移動時に前記長尺部材を通して前記チャンバ内へと前記試料を取り込み、これにより、前記試料と前記反応化合物とから反応性混合物を形成し；
（iv）前記チャンバを、前記ターゲットシークエンスの増幅が起こり得る状態とする；
ことを特徴とする方法。
【請求項２】  請求項１記載の方法において、
前記チャンバ内における前記長尺部材の前記相対移動によって、前記長尺部材を通して前記チャンバ内へと前記反応化合物を導入することを特徴とする方法。
【請求項３】  請求項１または２記載の方法において、
前記チャンバの遠心分離を行うことを特徴とする方法。
【請求項４】  請求項１〜３のいずれかに記載の方法において、
前記試料を、生物学的材料を有したものとすることを特徴とする方法。
【請求項５】  請求項４記載の方法において、
前記生物学的材料を、細胞またはウィルス粒子とすることを特徴とする方法。
【請求項６】  試料中の少なくとも１つのターゲット核酸分子を増幅するための方法であって、
（i） デバイスのチャンバ内に反応化合物を導入し、ここで、前記チャンバを、開放端を有したものとするとともに、前記デバイスを、前記開放端を通して前記チャンバから延在しかつ前記チャンバの外部に位置した開放第１端と前記チャンバ内に位置した開放第２端とを有した中空の長尺部材と、該長尺部材と前記チャンバの内表面との間のシールをもたらすシール手段と、を具備するものとし、さらに、前記シール手段を、前記長尺部材の前記開放第２端と前記チャンバの前記開放端との間に配置し、この場合、前記長尺部材を前記チャンバ内において相対移動可能なものとし、前記開放第２端を前記チャンバの前記開放端に向けて移動させることによって、前記チャンバ内において圧力変化を引き起こし、この圧力変化を、前記長尺部材を通しての前記チャンバ内への流体の取込を引き起こすに十分な圧力変化とし、また、前記反応化合物を、前記ターゲットシークエンスの増幅のための反応剤と、前記試料と前記反応化合物とから形成される反応性混合物によって放出される電磁放射のレベルが前記反応化合物だけによって放出される電磁放射のレベルと比較して相違するものであるようにして、前記増幅されたシークエンスと相互作用し得る少なくとも１つの反応剤と、を有するものとし；
（ii）前記長尺部材の前記開放第１端に対して試料を導入し；
（iii） 前記長尺部材の前記開放第２端を、第１位置から、前記チャンバの前記開放端に向けて、移動させることによって、前記チャンバ内の圧力を減少させ、これにより、前記長尺部材の前記相対移動時に前記長尺部材を通して前記チャンバ内へと前記試料を取り込み、これにより、前記試料と前記反応化合物とから反応性混合物を形成し；
（iv）付加的に、前記反応性混合物を、電磁放射によって励起し；
（v） 前記チャンバを、前記ターゲットシークエンスの増幅が起こり得る状態とし；
（vi）前記反応性混合物から放出される電磁放射を検出する；
ことを特徴とする方法。
【請求項７】  請求項６記載の方法において、
前記チャンバ内における前記長尺部材の前記相対移動によって、前記長尺部材を通して前記チャンバ内へと前記反応化合物を導入することを特徴とする方法。
【請求項８】  請求項６または７記載の方法において、
前記チャンバの遠心分離を行うことを特徴とする方法。
【請求項９】  請求項６〜８のいずれかに記載の方法において、
前記試料を、生物学的材料を有したものとすることを特徴とする方法。
【請求項１０】  請求項９記載の方法において、
前記生物学的材料を、細胞またはウィルス粒子とすることを特徴とする方法。
【請求項１１】  請求項１〜１０のいずれかに記載の方法において、
前記チャンバ内へと、
第１反応化合物と；
該第１反応化合物上においてシールをもたらす第１ワックス層と；
該第１ワックス層に隣接して配置されるとともに、前記第１ワックス層を介して前記第１反応化合物から隔離された、第２反応化合物と；
該第２反応化合物を実質的に被覆する第２ワックス層と；
を導入し、
ここで、前記第２ワックス層を、前記第１ワックス層の融点よりも低い融点を有するものとし、
これにより、前記第２ワックス層の融点において、前記第１ワックス層を固体とすることを特徴とする方法。
【請求項１２】  請求項１１記載の方法において、
前記第１ワックス層の融点を、７０℃とすることを特徴とする方法。
【請求項１３】  請求項１１または１２記載の方法において、
前記第２ワックス層の融点を、５５℃とすることを特徴とする方法。
【請求項１４】  請求項１１〜１３のいずれかに記載の方法において、
前記第１反応化合物を、ターゲット核酸分子の増幅に必要な反応剤を有したものとすることを特徴とする方法。
【請求項１５】  請求項１１〜１４のいずれかに記載の方法において、
前記第２反応化合物を、細胞の分解、蛋白質の消化および／または変更、または、ＤＮＡの消化および／または変更を引き起こすような反応剤を有したものとすることを特徴とする方法。
【請求項１６】  請求項１１〜１５のいずれかに記載の方法において、
前記チャンバを、さらに、前記第２ワックス層に隣接して配置された第３反応化合物を収容したものとすることを特徴とする方法。
【請求項１７】  請求項１１〜１６のいずれかに記載の方法において、
前記チャンバを、さらに、前記第３反応化合物に隣接して配置された第３ワックス層を収容したものとすることを特徴とする方法。
【請求項１８】  請求項１〜１０のいずれかに記載の方法において、
前記チャンバを、
第１ワックスキャリアと混合された第１反応化合物と；
第２ワックスキャリアと混合された第２反応化合物と；
を収容したものとし、
前記第２反応化合物を、前記第１反応化合物上において、少なくとも部分的にコーティングしまたはカバーしまたは層状とし、
前記第２ワックスキャリアを、前記第１ワックスキャリアの融点よりも低い融点を有したものとし、
これにより、前記第２ワックスキャリアの融点において、前記第１ワックスキャリアを固体とすることを特徴とする方法。
【請求項１９】  請求項１８記載の方法において、
前記第１ワックスキャリアの融点を、７０℃とすることを特徴とする方法。
【請求項２０】  請求項１８または１９記載の方法において、
前記第２ワックスキャリアの融点を、５５℃とすることを特徴とする方法。
【請求項２１】  請求項１８〜２０のいずれかに記載の方法において、
前記第１反応化合物を、ターゲット核酸分子の増幅に必要な反応剤を有したものとすることを特徴とする方法。
【請求項２２】  請求項１８〜２１のいずれかに記載の方法において、
前記第２反応化合物を、細胞の分解、蛋白質の消化および／または変更、または、ＤＮＡの消化および／または変更を引き起こすような反応剤を有したものとすることを特徴とする方法。
【請求項２３】  請求項１８〜２２のいずれかに記載の方法において、
前記チャンバを、さらに、第３ワックスキャリアと混合された第３反応化合物を収容したものとし、
該第３反応化合物を、前記第２反応化合物上において、少なくとも部分的にコーティングするまたはカバーするまたは層状とすることを特徴とする方法。
【請求項２４】  容器内において反応を行うための方法であって、
（i） デバイスのチャンバ内に反応化合物を導入し、ここで、前記チャンバを、開放端を有したものとするとともに、前記デバイスを、前記開放端を通して前記チャンバから延在しかつ前記チャンバの外部に位置した開放第１端と前記チャンバ内に位置した開放第２端とを有した中空の長尺部材と、該長尺部材と前記チャンバの内表面との間のシールをもたらすシール手段と、を具備するものとし、さらに、前記シール手段を、前記長尺部材の前記開放第２端と前記チャンバの前記開放端との間に配置し、この場合、前記長尺部材を前記チャンバ内において相対移動可能なものとし、前記開放第２端を前記チャンバの前記開放端に向けて移動させることによって、前記チャンバ内において圧力変化を引き起こし、この圧力変化を、前記長尺部材を通しての前記チャンバ内への流体の取込を引き起こすに十分な圧力変化とし；
（ii）前記長尺部材の前記開放第１端に対して試料を導入し、前記長尺部材の前記開放第２端を前記チャンバの前記開放端に向けて移動させることによって、前記チャンバ内へと前記試料を取り込み、これにより、前記試料と前記反応化合物とから反応性混合物を形成し；
（iii） 前記チャンバを、前記反応性混合物が反応を起こし得る状態とする；
ことを特徴とする方法。
【請求項２５】  試料中の物質を検出するための方法であって、
（i） デバイスのチャンバ内に試料と反応化合物とを導入することにより、前記試料と前記反応化合物とから反応性混合物を形成し、この場合、前記チャンバを、開放端を有したものとするとともに、前記デバイスを、前記開放端を通して前記チャンバから延在しかつ前記チャンバの外部に位置した開放第１端と前記チャンバ内に位置した開放第２端とを有した中空の長尺部材と、該長尺部材と前記チャンバの内表面との間のシールをもたらすシール手段と、を具備するものとし、さらに、前記シール手段を、前記長尺部材の前記開放第２端と前記チャンバの前記開放端との間に配置し、この場合、前記長尺部材の前記開放第２端を、前記チャンバ内において前記開放端から離間した第１位置から、前記チャンバ内において前記開放端に近接した第２位置へと、移動可能なものとし、この第２位置への前記長尺部材の移動によって、前記チャンバ内において圧力変化を引き起こし、この圧力変化を、前記長尺部材を通しての前記チャンバ内への流体の取込を引き起こすに十分な圧力変化とし、そして、前記試料と反応剤との少なくとも一方を、前記長尺部材を通して前記チャンバ内へと導入し、さらに、前記反応化合物を、検出対象をなす物質と相互作用し得る少なくとも１つの反応剤を有するものとし、これにより、前記反応性混合物によって放出される電磁放射のレベルを、前記反応化合物だけによって放出される電磁放射のレベルと比較して、相違するものとし；
（ii）付加的に、前記反応性混合物を、電磁放射によって励起し；
（iii） 前記チャンバを、反応が起こり得る状態とし；
（iv）前記反応性混合物から放出される電磁放射を検出する；
ことを特徴とする方法。
【請求項２６】  請求項２４または２５記載の方法において、
前記反応化合物を、タンパク質消化および／または細胞破壊のための反応剤を有したものとすることを特徴とする方法。
【請求項２７】  請求項２４または２５記載の方法において、
前記反応化合物を、ターゲット核酸分子の増幅のための反応剤を有したものとすることを特徴とする方法。
【請求項２８】  請求項１〜２７のいずれかに記載された方法を実施するためのデバイスであって、
開放端を有したチャンバと；
前記開放端を通して前記チャンバから延在しかつ前記チャンバの外部に位置した開放第１端と前記チャンバ内に位置した開放第２端とを有した中空の長尺部材と；
該長尺部材と前記チャンバの内表面との間のシールをもたらすシール手段と；
を具備し、
前記シール手段を、前記長尺部材の前記開放第２端と前記チャンバの前記開放端との間に配置し、
前記長尺部材の前記開放第２端を、前記チャンバ内において前記開放端から離間した第１位置から、前記チャンバ内において前記開放端に近接した第２位置へと、移動可能なものとし、
この第２位置への前記長尺部材の移動によって、前記チャンバ内において圧力変化を引き起こすものとし、しかも、この圧力変化を、前記長尺部材を通しての前記チャンバ内への流体の取込を引き起こすに十分な圧力変化とすることを特徴とするデバイス。
【請求項２９】  請求項２８記載のデバイスにおいて、
前記チャンバが、長尺形状であることを特徴とするデバイス。
【請求項３０】  請求項２８または２９記載のデバイスにおいて、
前記シール手段が、前記長尺部材の外表面と前記チャンバの内表面との間のシールをもたらしていることを特徴とするデバイス。
【請求項３１】  請求項２８〜３０のいずれかに記載のデバイスにおいて、
前記長尺部材の前記第１端が、成形尖端を有していることを特徴とするデバイス。
【請求項３２】  請求項２８〜３１のいずれかに記載のデバイスにおいて、
前記シール手段が、前記長尺部材の前記第２端の近傍において前記長尺部材の外表面上に配置されたスリーブを備えていることを特徴とするデバイス。
【請求項３３】  請求項２８〜３２のいずれかに記載のデバイスにおいて、
前記チャンバが、さらに、前記チャンバの前記開放端の近傍に拡径カラーを有していることを特徴とするデバイス。
【請求項３４】  請求項３３記載のデバイスにおいて、
さらに、前記拡径カラー内に、ガイドを具備し、
該ガイドには、前記長尺部材を受領するための開口が設けられていることを特徴とするデバイス。
【請求項３５】  請求項３４記載のデバイスにおいて、
前記長尺部材と前記ガイドとの間にシールが形成されるようにして、前記長尺部材が前記開口によって受領されることを特徴とするデバイス。
【請求項３６】  請求項２８〜３５のいずれかに記載のデバイスにおいて、
前記チャンバの内表面と前記長尺部材の内表面との一方または双方には、少なくとも部分的に、反応防止剤がコーティングされていることを特徴とするデバイス。
【請求項３７】  請求項２８〜３６のいずれかに記載のデバイスにおいて、
前記チャンバが、
第１反応化合物と；
該第１反応化合物上においてシールをもたらす第１ワックス層と；
該第１ワックス層に隣接して配置されるとともに、前記第１ワックス層を介して前記第１反応化合物から隔離された、第２反応化合物と；
該第２反応化合物を実質的に被覆する第２ワックス層と；
を収容しており、
前記第２ワックス層が、前記第１ワックス層の融点よりも低い融点を有し、このため、前記第２ワックス層の融点において、前記第１ワックス層が固体であることを特徴とするデバイス。
【請求項３８】  請求項３７記載のデバイスにおいて、
前記第１ワックス層の融点が、７０℃であることを特徴とするデバイス。
【請求項３９】  請求項３７または３８記載のデバイスにおいて、
前記第２ワックス層の融点が、５５℃であることを特徴とするデバイス。
【請求項４０】  請求項３７〜３９のいずれかに記載のデバイスにおいて、
前記第１反応化合物が、ターゲット核酸分子の増幅に必要な反応剤を有していることを特徴とするデバイス。
【請求項４１】  請求項３７〜４０のいずれかに記載のデバイスにおいて、
前記第２反応化合物が、細胞の分解、蛋白質の消化および／または変更、または、ＤＮＡの消化および／または変更を引き起こすような反応剤を有していることを特徴とするデバイス。
【請求項４２】  請求項３７〜４１のいずれかに記載のデバイスにおいて、
前記チャンバが、さらに、前記第２ワックス層に隣接して配置された第３反応化合物を収容していることを特徴とするデバイス。
【請求項４３】  請求項４２記載のデバイスにおいて、
前記チャンバが、さらに、前記第３反応化合物に隣接して配置された第３ワックス層を収容していることを特徴とするデバイス。
【請求項４４】  請求項２８〜３６のいずれかに記載のデバイスにおいて、
前記チャンバが、
第１ワックスキャリアと混合された第１反応化合物と；
第２ワックスキャリアと混合された第２反応化合物と；
を収容しており、
前記第２反応化合物が、前記第１反応化合物上において、少なくとも部分的にコーティングされているまたはカバーしているまたは層状とされており、
前記第２ワックスキャリアが、前記第１ワックスキャリアの融点よりも低い融点を有し、このため、前記第２ワックスキャリアの融点において、前記第１ワックスキャリアが固体であることを特徴とするデバイス。
【請求項４５】  請求項４４記載のデバイスにおいて、
前記第１ワックスキャリアの融点が、７０℃であることを特徴とするデバイス。
【請求項４６】  請求項４４または４５記載のデバイスにおいて、
前記第２ワックスキャリアの融点が、５５℃であることを特徴とするデバイス。
【請求項４７】  請求項４４〜４６のいずれかに記載のデバイスにおいて、
前記第１反応化合物が、ターゲット核酸分子の増幅に必要な反応剤を有していることを特徴とするデバイス。
【請求項４８】  請求項４４〜４７のいずれかに記載のデバイスにおいて、
前記第２反応化合物が、細胞の分解、蛋白質の消化および／または変更、または、ＤＮＡの消化および／または変更を引き起こすような反応剤を有していることを特徴とするデバイス。
【請求項４９】  請求項４４〜４８のいずれかに記載のデバイスにおいて、
前記チャンバが、さらに、第３ワックスキャリアと混合された第３反応化合物を収容し、
該第３反応化合物は、前記第２反応化合物上において、少なくとも部分的にコーティングされているまたはカバーしているまたは層状とされていることを特徴とするデバイス。
【請求項５０】  請求項２８〜４９のいずれかに記載のデバイスにおいて、
前記長尺部材が、成形尖端を有し、この成形尖端の直径が、１μｍ〜２００μｍの範囲とされていることを特徴とするデバイス。
【請求項５１】  請求項２８〜５０のいずれかに記載されたデバイスを、細胞内への流体試料の注入のために使用することを特徴とする使用方法。
【請求項５２】  試料中の少なくとも１つのターゲット核酸分子を増幅するための方法であって、
添付図面を参照して実質的に説明されていることを特徴とする方法。
【請求項５３】  容器内において反応を行うための方法であって、
添付図面を参照して実質的に説明された各ステップを行うことを特徴とする方法。
【請求項５４】  請求項１〜２７のいずれかにまたは請求項５３にまたは請求項５４に記載された方法を実施するためのデバイスであって、
添付図面を参照して実質的に説明されていることを特徴とするデバイス。