【手続補正書】
【提出日】平成15年5月27日(2003.5.27)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）配列番号１または配列番号３のいずれかに示されるヌクレオチド配列；
（ｂ）ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２６６５またはＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２６６６におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｄ）少なくとも中程度にストリンジェントな条件下で（ａ）〜（ｃ）のいずれかのヌクレオチド配列の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列；および
（ｅ）（ａ）〜（ｃ）のいずれかのヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
【請求項２】
単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドに少なくとも約７０パーセント同一のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該コードされたポリペプチドが、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｂ）ヌクレオチド配列であって、配列番号１もしくは配列番号３のいずれかに示されるヌクレオチド配列、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２６６５もしくはＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２６６６におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列、または（ａ）のヌクレオチド配列の、対立遺伝子改変体またはスプライス改変体をコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号１もしくは配列番号３のヌクレオチド配列、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２６６５もしくはＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２６６６におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列、または少なくとも約２５アミノ酸残基のポリペプチドフラグメントをコードする（ａ）もしくは（ｂ）のヌクレオチド配列のいずれかの領域であって、該ポリペプチドフラグメントが、配列番号２もしくは配列番号４のいずれかに示される該コードされたポリペプチドの活性を有するか、または抗原性である、領域；
（ｄ）配列番号１もしくは配列番号３のヌクレオチド配列、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２６６５またはＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２６６６におけるＤＮＡ挿入物の該ヌクレオチド配列、または少なくとも約１６ヌクレオチドのフラグメントを含む（ａ）〜（ｃ）のいずれかのヌクレオチド配列の領域；
（ｅ）ヌクレオチド配列であって、少なくとも中程度にストリンジェントな条件下で（ａ）〜（ｄ）のいずれかのヌクレオチド配列の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列；および
（ｆ）（ａ）〜（ｄ）のいずれかのヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
【請求項３】
単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）少なくとも１つの保存的アミノ酸置換を有する配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該コードされたポリペプチドが、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｂ）少なくとも１つのアミノ酸挿入を有する配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該コードされたポリペプチドが、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｃ）少なくとも１つのアミノ酸欠失を有する配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該コードされたポリペプチドが、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｄ）Ｃ末端短縮化および／またはＮ末端短縮化を有する配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該コードされたポリペプチドが、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｅ）アミノ酸置換、アミノ酸挿入、アミノ酸欠失、Ｃ末端短縮化およびＮ末端短縮化からなる群より選択される少なくとも１つの改変を有する配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該コードされたポリペプチドが、配列番号２または配列番号４のいずれかに示される該ポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｆ）少なくとも約１６ヌクレオチドのフラグメントを含む、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのヌクレオチド配列；
（ｇ）少なくとも中程度にストリンジェントな条件下で（ａ）〜（ｆ）のいずれかのヌクレオチド配列の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列；および
（ｈ）（ａ）〜（ｅ）のいずれかのヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
【請求項４】
請求項１、２または３のいずれかに記載の核酸分子を含む、ベクター。
【請求項５】
請求項４に記載のベクターを含む、宿主細胞。
【請求項６】
真核生物細胞である、請求項５に記載の宿主細胞。
【請求項７】
原核生物細胞である、請求項５に記載の宿主細胞。
【請求項８】
ＴＧＦ−β−Ｒポリペプチドを産生するプロセスであって、請求項５に記載の宿主細胞を、該ポリペプチドを発現するために適切な条件下で培養する工程、および必要に応じて、該ポリペプチドを該培養物から単離する工程を包含する、プロセス。
【請求項９】
請求項８に記載のプロセスによって産生される、ポリペプチド。
【請求項１０】
請求項８に記載のプロセスであって、前記核酸分子が、ＴＧＦ−β−ＲポリペプチドをコードするＤＮＡに作動可能に連結された、ネイティブなＴＧＦ−β−ＲポリペプチドについてのプロモーターＤＮＡ以外のプロモーターＤＮＡを含む、プロセス。
【請求項１１】
請求項２に記載の単離された核酸分子であって、前記パーセント同一性が、ＧＡＰ、ＢＬＡＳＴＮ、ＦＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＸ、ＢｅｓｔＦｉｔ、およびＳｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎアルゴリズムからなる群より選択されるコンピュータープログラムを使用して決定される、核酸分子。
【請求項１２】
化合物が、ＴＧＦ−β−Ｒポリペプチド活性またはＴＧＦ−β−Ｒポリペプチド産生を阻害するか否かを決定するためのプロセスであって、請求項５、６または７のいずれかに記載の細胞を、該化合物に曝露する工程、および該細胞中でのＴＧＦ−β−Ｒポリペプチド活性またはＴＧＦ−β−Ｒポリペプチド産生を測定する工程を包含する、プロセス。
【請求項１３】
単離されたポリペプチドであって、以下：
（ａ）配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるアミノ酸配列；
（ｂ）ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２６６５またはＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２６６６におけるＤＮＡ挿入物によってコードされる、アミノ酸配列、
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項１４】
単離されたポリペプチドであって、以下：
（ａ）配列番号２または配列番号４のいずれかのオルソログについてのアミノ酸配列；
（ｂ）配列番号２または配列番号４のいずれかのアミノ酸配列に少なくとも約７０パーセント同一のアミノ酸配列であって、該ポリペプチドが、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｃ）少なくとも約２５アミノ酸残基を含む配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるアミノ酸配列のフラグメントであって、該フラグメントが、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドの活性を有するか、または抗原性である、フラグメント；および
（ｄ）アミノ酸配列であって、配列番号２もしくは配列番号４のいずれかに示されるアミノ酸配列、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２６６５もしくはＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２６６６におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列、または（ａ）もしくは（ｂ）のいずれかのアミノ酸配列の、対立遺伝子改変体またはスプライス改変体のアミノ酸配列、
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項１５】
単離されたポリペプチドであって、以下：
（ａ）少なくとも１つの保存的アミノ酸置換を有する配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるアミノ酸配列であって、該ポリペプチドが、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｂ）少なくとも１つのアミノ酸挿入を有する配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるアミノ酸配列であって、該ポリペプチドが、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｃ）少なくとも１つのアミノ酸欠失を有する配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるアミノ酸配列であって、該ポリペプチドが、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｄ）Ｃ末端短縮化および／またはＮ末端短縮化を有する配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるアミノ酸配列であって、該ポリペプチドが、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；ならびに
（ｅ）アミノ酸置換、アミノ酸挿入、アミノ酸欠失、Ｃ末端短縮化およびＮ末端短縮化からなる群より選択される少なくとも１つの改変を有する、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるアミノ酸配列であって、該ポリペプチドが、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列、
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
【請求項１６】
請求項１、２、または３のいずれかの核酸分子によってコードされる、単離されたポリペプチドであって、該ポリペプチドが、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるポリペプチドの活性を有する、単離されたポリペプチド。
【請求項１７】
請求項１４に記載の単離されたポリペプチドであって、パーセント同一性が、ＧＡＰ、ＢＬＡＳＴＰ、ＦＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＸ、ＢｅｓｔＦｉｔおよびＳｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎアルゴリズムからなる群より選択されるコンピュータープログラムを使用して決定される、単離されたポリペプチド。
【請求項１８】
請求項１３、１４または１５のいずれかに記載のポリペプチドを特異的に結合する、選択的結合因子またはそのフラグメント。
【請求項１９】
請求項１８に記載の選択的結合因子またはそのフラグメントであって、配列番号２または配列番号４のいずれかに示されるアミノ酸配列を含むポリペプチド、またはそれらのフラグメントを特異的に結合する、選択的結合因子またはそのフラグメント。
【請求項２０】
抗体またはそのフラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２１】
ヒト化抗体である、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２２】
ヒト抗体またはそのフラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２３】
ポリクローナル抗体またはそのフラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２４】
モノクローナル抗体またはそのフラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２５】
キメラ抗体またはそのフラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２６】
ＣＤＲ−グラフト化された抗体またはそのフラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２７】
抗イディオタイプ抗体またはそのフラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２８】
可変領域フラグメントである、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項２９】
ＦａｂフラグメントまたはＦａｂ’フラグメントである、請求項２８に記載の可変領域フラグメント。
【請求項３０】
選択的結合因子またはそのフラグメントであって、配列番号２または配列番号４のいずれかのアミノ酸配列を有するポリペプチドについての特異性を有する少なくとも１つの相補性決定領域を含む、選択的結合因子またはそのフラグメント。
【請求項３１】
検出可能な標識に結合している、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項３２】
ＴＧＦ−β−Ｒポリペプチドの生物学的活性を拮抗する、請求項１８に記載の選択的結合因子。
【請求項３３】
ＴＧＦ−β−Ｒポリペプチドに関連する、疾患、状態または障害を処置、予防または改善するための組成物であって、請求項１８に記載の有効量の選択的結合因子を含有する、組成物。
【請求項３４】
動物を、配列番号２または配列番号４のいずれかのアミノ酸配列を含むポリペプチドで免疫することによって産生される、選択的結合因子。
【請求項３５】
請求項１３、１４または１５のいずれかに記載のポリペプチドを結合し得る選択的結合因子を産生する、ハイブリドーマ。
【請求項３６】
抗ＴＧＦ−β−Ｒ抗体または請求項１８に記載のフラグメントを使用して、ＴＧＦ−β−Ｒポリペプチドの量を検出または定量する方法。
【請求項３７】
生物学的サンプル中のＴＧＦ−β−Ｒポリペプチドの量を検出または定量するためのキットであって、請求項１８に記載の選択的結合因子を備える、キット。
【請求項３８】
請求項１３、１４または１５のいずれかに記載のポリペプチド、および薬学的に受容可能な処方剤を含む、組成物。
【請求項３９】
前記薬学的に受容可能な処方剤が、キャリア、アジュバント、可溶化剤、安定剤または抗酸化剤である、請求項３８に記載の組成物。
【請求項４０】
請求項１３、１４または１５のいずれかに記載のポリペプチドの誘導体を包含する、ポリペプチド。
【請求項４１】
水溶性ポリマーを用いて共有結合的に改変された、請求項４０に記載のポリペプチド。
【請求項４２】
前記水溶性ポリマーが、ポリエチレングリコール、モノメトキシ−ポリエチレングリコール、デキストラン、セルロース、ポリ−（Ｎ−ビニルピロリドン）ポリエチレングリコール、プロピレングリコールホモポリマー、ポリプロピレンオキシド／エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオールおよびポリビニルアルコールからなる群より選択される、請求項４１に記載のポリペプチド。
【請求項４３】
請求項１、２または３のいずれかに記載の核酸分子および薬学的に受容可能な処方剤を含む、組成物。
【請求項４４】
前記核酸分子が、ウイルスベクターに含まれる、請求項４３に記載の組成物。
【請求項４５】
請求項１、２または３のいずれかに記載の核酸分子を含む、ウイルスベクター。
【請求項４６】
異種アミノ酸配列に融合された、請求項１３、１４または１５のいずれかに記載のポリペプチドを含む、融合ポリペプチド。
【請求項４７】
前記異種アミノ酸配列が、ＩｇＧ定常ドメインまたはそのフラグメントである、請求項４６に記載の融合ポリペプチド。
【請求項４８】
医学的状態を処置、予防または改善するための組成物であって、請求項１３、１４もしくは１５のいずれかに記載のポリペプチド、または請求項１、２もしくは３のいずれかに記載の核酸によってコードされるポリペプチドを含有する、組成物。
【請求項４９】
被験体における病理学的状態または病理学的状態に対する感受性を診断ためのキットであって、以下：
（ａ）請求項１３、１４もしくは１５のいずれかに記載のポリペプチドまたは請求項１、２または３のいずれかに記載の核酸分子によってコードされるポリペプチドの発現の、サンプル中での存在または量を決定する手段；ならびに
（ｂ）該ポリペプチドの発現の存在または量に基づいて、病理学的状態または病理学的状態に対する感受性を診断する手段、
を備える、キット。
【請求項５０】
デバイスであって、以下：
（ａ）移植に適する膜；および
（ｂ）該膜内にカプセル化された細胞
を備え、該細胞が、請求項１３、１４または１５のいずれかに記載のタンパク質を分泌し、そして該膜が、該タンパク質に対して透過性であり、そして該細胞に対して有害な物質に対して不透過性である、デバイス。
【請求項５１】
ＴＧＦ−β−Ｒポリペプチドに結合する化合物を同定する方法であって、以下：
（ａ）請求項１３、１４または１５のいずれかに記載のポリペプチドを化合物と接触させる工程；および
（ｂ）該化合物に対する該ＴＧＦ−β−Ｒポリペプチドの結合の程度を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項５２】
該化合物に結合した場合のポリペプチドの活性を決定する工程をさらに包含する、請求項５１に記載の方法。
【請求項５３】
請求項１、２、または３のいずれかに記載の核酸分子を含有する、該動物におけるポリペプチドのレベルを調節するための組成物。
【請求項５４】
請求項１、２または３のいずれかに記載の核酸分子を含む、トランスジェニック非ヒト哺乳動物。
【請求項５５】
化合物が、ＴＧＦ−β−Ｒポリペプチド活性またはＴＧＦ−β−Ｒポリペプチド産生を阻害するか否かを決定するためのプロセスであって、請求項５４に記載のトランスジェニック哺乳動物を、該化合物に曝露する工程、および該哺乳動物中でのＴＧＦ−β−Ｒポリペプチド活性またはＴＧＦ−β−Ｒポリペプチド産生を測定する工程を包含する、プロセス。
【請求項５６】
固体支持体に付着された、請求項１、２または３のいずれかに記載の核酸分子。
【請求項５７】
少なくとも１つの、請求項１、２または３のいずれかに記載の核酸分子を含む核酸分子のアレイ。