【手続補正書】
【提出日】平成16年10月29日(2004.10.29)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の段階を含む、個体においてインスリン非依存型糖尿病（ＮＩＤＤＭ）を発症するリスクを決定する方法：
ａ）個体のインスリンＨｐｈＩ座と連鎖不平衡にある少なくとも１つのマーカーの多型塩基のアイデンティティを決定する段階；および
ｂ）段階ａ）のアイデンティティ、該個体の体脂肪値、ならびに、該アイデンティティ、該体脂肪値、およびＮＩＤＤＭ発症リスクを相関させる事前に決められた値、に基づいてリスク値を割り当てる段階。
【請求項２】
以下の段階を含む、個体においてインスリン非依存型糖尿病（ＮＩＤＤＭ）を発症するリスクを決定する方法：
ａ）個体のインスリン遺伝子のＶＮＴＲクラスを決定する段階；および
ｂ）段階ａ）のＶＮＴＲクラス、該個体の体脂肪値、ならびに、該ＶＮＴＲクラス、該体脂肪値、およびＮＩＤＤＭ発症リスクを相関させる事前に決められた値、に基づいてリスク値を割り当てる段階。
【請求項３】
以下の段階を含む、個体のインスリン非依存型糖尿病（ＮＩＤＤＭ）の亜型を決定する方法：
ａ）個体のインスリンＨｐｈＩ座と連鎖不平衡にある少なくとも１つのマーカーの多型塩基のアイデンティティを決定する段階；および
ｂ）段階ａ）のアイデンティティ、該個体の体脂肪値、ならびに該アイデンティティ、該体脂肪値、およびＮＩＤＤＭの特定の亜型を持つ可能性を相関させる事前に決められた値、に基づいて亜型を割り当てる段階。
【請求項４】
以下の段階を含む、個体のインスリン非依存型糖尿病（ＮＩＤＤＭ）の亜型を決定する方法：
ａ）個体のインスリン遺伝子のＶＮＴＲクラスを決定する段階；および
ｂ）段階ａ）のＶＮＴＲクラス、該個体の体脂肪値、ならびに、該ＶＮＴＲクラス、該体脂肪値、およびＮＩＤＤＭの特定の亜型を持つ可能性を相関させる事前に決められた値、に基づいて亜型を割り当てる段階。
【請求項５】
以下の段階を含む、インスリン関連疾患に関する臨床試験または相関解析に含まれるものについて個体を選択する方法：
ａ）個体のインスリンＨｐｈＩ座と連鎖不平衡にある少なくとも１つのマーカーの多型の塩基のアイデンティティを決定する段階；および
ｂ）段階ａ）のアイデンティティ、該個体の体脂肪値、ならびに、該アイデンティティ、該体脂肪値、およびインスリン関連疾患発症リスクを相関させる事前に決められた値、に基づいて該個体を該試験に含める段階。
【請求項６】
以下の段階を含む、インスリン関連疾患に関する臨床試験または相関解析に含まれるものについて個体を選択する方法：
ａ）個体のインスリン遺伝子のＶＮＴＲクラスを決定する段階；および
ｂ）段階ａ）のＶＮＴＲクラス、該個体の体脂肪値、ならびに、該ＶＮＴＲクラス、該体脂肪値、およびインスリン関連疾患発症リスクを相関させる事前に決められた値、に基づいて該個体を試験に含める段階。
【請求項７】
マーカーの多型塩基のアイデンティティが、個体のゲノム中に存在するマーカーの両方のコピーについて決定される、請求項１、請求項３、または請求項５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
インスリン遺伝子のＶＮＴＲクラスが、個体のゲノム中に存在するＶＮＴＲの両方のコピーについて決定される、請求項２、請求項４、または請求項６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
以下の段階を含む、若年性肥満患者群における遺伝子マーカーセットに関するハプロタイプの頻度の推定方法：
ａ）患者群の各個体のゲノムに存在するマーカーの両方のコピーについて、該マーカーにおけるヌクレオチドのアイデンティティを決定することにより、インスリンＨｐｈＩ座と連鎖不平衡にあるマーカーの遺伝子型同定をする段階；
ｂ）該患者群の各個体のゲノムに存在する第２のマーカーの両方のコピーについて、該第２の遺伝子マーカーにおけるヌクレオチドのアイデンティティを決定することにより、該第２のマーカーの遺伝子型同定をする段階；
ｃ）段階ａ）およびｂ）で決定されたヌクレオチドのアイデンティティにハプロタイプ決定法を適用し、頻度の推定を行なう段階。
【請求項１０】
ハプロタイプ決定方法が、非対称ＰＣＲ増幅、特定のアリルの二重ＰＣＲ増幅、クラーク法、または期待値最大化アルゴリズムからなる群より選択される、請求項９記載の方法。
【請求項１１】
以下の段階を含む、個体においてインスリン非依存型糖尿病（ＮＩＤＤＭ）を発症するリスクを決定する方法：
ａ）個体のゲノムに存在するマーカーの両方のコピーについて、マーカーにおけるヌクレオチドのアイデンティティを決定することにより，インスリンＨｐｈＩ座と連鎖不平衡にあるマーカーの遺伝子型同定を行なう段階；および
ｂ）段階ａ）のアイデンティティ、該個体の体脂肪値、ならびに、該アイデンティティ、該体脂肪値、およびＮＩＤＤＭ発症リスクを相関させる事前に決められた値、に基づいてリスク値を割り当てる段階。
【請求項１２】
以下の段階を含む、個体のインスリン非依存型糖尿病（ＮＩＤＤＭ）の亜型を決定する方法：
ａ）個体のゲノムに存在するマーカーの両方のコピーについて、マーカーにおけるヌクレオチドのアイデンティティを決定することにより、インスリンＨｐｈＩ座と連鎖不平衡にあるマーカーの遺伝子型同定を行なう段階；および
ｂ）段階ａ）のアイデンティティ、該個体の体脂肪値、ならびに、該アイデンティティ、該体脂肪値、およびＮＩＤＤＭの特定の亜型を持つ可能性を相関させる事前に決められた値、に基づいて亜型を割り当てる段階。
【請求項１３】
以下の段階を含む、インスリン関連疾患に関する臨床試験または相関解析に含まれるものについて個体を選択する方法：
ａ）個体のゲノムに存在するマーカーの両方のコピーについて、マーカーにおけるヌクレオチドのアイデンティティを決定することにより、インスリンＨｐｈＩ座と連鎖不平衡にあるマーカーの遺伝子型同定を行なう段階；および
ｂ）段階ａ）のアイデンティティ、該個体の体脂肪値、ならびに、該アイデンティティ、該体脂肪値、およびインスリン関連疾患発症リスクを相関させる事前に決められた値、に基づいて該個体を該試験に含める段階。
【請求項１４】
第２のマーカーがインスリンＨｐｈＩ座と連鎖不平衡にある、請求項９、請求項１１、請求項１２、または請求項１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
以下の段階を含む、ハプロタイプとインスリン関連疾患との間の関連を検出する方法：
ａ）請求項９の方法にしたがって、インスリン関連疾患の患者集団における少なくとも１つのハプロタイプの頻度を推定する段階；
ｂ）請求項９の方法にしたがって、対照群におけるハプロタイプの頻度を推定する段階；ならびに
ｃ）該ハプロタイプとインスリン関連疾患の間に統計的に有意な関連があるかどうかを決定する段階。
【請求項１６】
インスリン関連疾患が、高インスリン血症または高インスリン血症の素因である、請求項５、請求項６、または請求項１５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７】
インスリンＨｐｈＩ座と連鎖不平衡にあるマーカーが、表Ｃに記載のマーカーからなる群より選択される、請求項１、請求項３、請求項５、請求項９、請求項１１、請求項１２、または請求項１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
インスリンＨｐｈＩ座と連鎖不平衡にあるマーカーが、−４２１７  ＰｓｔＩ、−２２２１  ＭｓｐＩ、−２３  ＨｐｈＩ、＋１４２８  ＦｏｋＩ、＋１１０００  ＡｌｕＩ、および＋３２０００  ＡｐａＩからなる群より選択される、請求項１、請求項３、請求項５、請求項９、請求項１１、請求項１２、または請求項１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
インスリンＨｐｈＩ座と連鎖不平衡にあるマーカーが、−２３ＨｐｈＩである、請求項１、請求項３、請求項５、請求項９、請求項１１、請求項１２、または請求項１３のいずれか一項に記載の方法。