【手続補正書】
【提出日】平成17年4月8日(2005.4.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
疾患がインスリン依存型糖尿病でない、免疫関連疾患患者における抗体特異的プロファイルを決定する方法であって、以下の段階を含む方法：
(a)少なくとも2種の疾患関連抗原エレメントを含む抗原アレイを調製する段階であり、各抗原エレメントが少なくとも1種の免疫学的エピトープを更に含む段階；
(b)段階(a)の抗原アレイを、抗体を含有する患者試料と物理的に接触させる段階；
(c)段階(b)の患者試料中の抗体に結合しているアレイ内の疾患関連抗原を同定する段階；ならびに
(d)段階(c)の疾患関連抗原に結合した抗体を、(1)段階(a)のアレイ内の疾患関連抗原に結合している抗体と比較する段階であり、抗体が疾患に関連することがわかっている段階、および、(2)段階(a)のアレイ内の疾患関連抗原に結合している抗体と比較する段階であり、抗体が疾患に関連しない段階。
【請求項２】
免疫関連疾患が、自己免疫疾患である、請求項1記載の方法。
【請求項３】
免疫関連疾患が、アレルギーである、請求項1記載の方法。
【請求項４】
免疫関連疾患が、移植片拒絶反応である、請求項1記載の方法。
【請求項５】
患者が、臨床症状を発症していない、請求項1記載の方法。
【請求項６】
患者が、臨床症状を有する、請求項1記載の方法。
【請求項７】
自己免疫疾患が、慢性関節リウマチである、請求項2記載の方法。
【請求項８】
自己免疫疾患が、多発性硬化症である、請求項2記載の方法。
【請求項９】
抗原が、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、DNA、RNA、脂質、グリコシル化された分子、リン酸化修飾を伴うポリペプチド、シトルリン修飾を伴うポリペプチド、多糖または他の分子からなる群より選択される、請求項1記載の方法。
【請求項１０】
抗原アレイが、マイクロアレイである、請求項1記載の方法。
【請求項１１】
抗原アレイが、アドレス指定可能なエレメントを有する、請求項1記載の方法。
【請求項１２】
抗原アレイが、低密度アレイである、請求項1記載の方法。
【請求項１３】
抗原アレイが、高密度アレイである、請求項1記載の方法。
【請求項１４】
患者試料が、血液試料である、請求項1記載の方法。
【請求項１５】
患者試料が、脳脊髄液試料である、請求項1記載の方法。
【請求項１６】
患者試料が、滑液試料である、請求項1記載の方法。
【請求項１７】
患者試料が、自己免疫疾患病変から採取される、請求項1記載の方法。
【請求項１８】
抗体特異的パネルを含む、抗体に結合された抗原を1種または複数含有する治療的物質を投与することにより、患者を治療する段階を更に含む、請求項1記載の方法。
【請求項１９】
免疫関連疾患患者における抗体特異的プロファイルを決定する方法であって、以下の段階を含む方法：
(a)少なくとも1種のエピトープエレメントを含むエピトープエレメントアレイを調製する段階；
(b)段階(a)のエピトープアレイを、抗体を含有する患者試料と物理的に接触させる段階；
(c)段階(b)の患者試料中の抗体に結合しているアレイ内の疾患関連エピトープを同定する段階；ならびに
(d)段階(c)の疾患関連エピトープに結合した抗体を、(1)段階(a)のアレイ内の疾患関連エピトープに結合している抗体と比較する段階であり、抗体が疾患に関連することがわかっている段階、および(2)段階(a)のアレイ内の疾患関連エピトープに結合している抗体と比較する段階であり、抗体が疾患に関連しないような段階。
【請求項２０】
アレイが、マイクロアレイである、請求項19記載の方法。
【請求項２１】
免疫関連疾患が、自己免疫疾患である、請求項19記載の方法。
【請求項２２】
免疫関連疾患が、アレルギーである、請求項19記載の方法。
【請求項２３】
免疫関連疾患が、移植片拒絶反応である、請求項19記載の方法。
【請求項２４】
患者が、臨床症状を発症していない、請求項19記載の方法。
【請求項２５】
患者が、臨床症状を有する、請求項19記載の方法。
【請求項２６】
自己免疫疾患の治療法であって、以下の段階を含む方法：
(a)(1)少なくとも2種の疾患関連抗原を含む抗原アレイを調製する段階であり、ここで各抗原エレメントが少なくとも1種の免疫学的エピトープを更に含む段階、(2)段階(1)の抗原アレイを、抗体を含有する患者試料と物理的に接触させる段階、(3)段階(2)の患者試料内の抗体に結合するアレイ内の疾患関連抗原を同定する段階、(4)段階(3)の疾患関連抗原に結合した抗体を、(i)段階(1)のアレイ内の疾患関連抗原に結合している抗体と比較する段階であり、抗体が疾患に関連することがわかっている段階、および、(ii)段階(1)のアレイ内の疾患関連抗原に結合している抗体と比較する段階であり、抗体が疾患に関連しない段階
を含む、患者の抗原特異的プロファイルを決定する段階；
(b)段階(a)の抗原特異的プロファイルを基に、患者に特異的な治療法を設計する段階であり、(1)患者試料中の抗体に結合された抗原を決定する段階、および(2)1種または複数の抗原を患者に投与する段階。
【請求項２７】
患者に投与される抗原が、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、DNA、RNA、脂質、グリコシル化された分子、リン酸化修飾を伴うポリペプチド、シトルリン修飾を伴うポリペプチド、多糖または他の分子からなる群より選択される、請求項26記載の方法。
【請求項２８】
患者に投与される抗原が、前記抗原をコードする核酸である、請求項26記載の方法。
【請求項２９】
核酸がDNAである、請求項28記載の方法。
【請求項３０】
自己免疫疾患を治療する方法であって、以下の段階を含む方法：
(a)(1)エピトープアレイを調製する段階、(2)段階(1)のエピトープアレイを、抗体を含有する患者試料と物理的に接触させる段階、(3)段階(2)の患者試料中の抗体に結合するアレイ内の疾患関連エピトープを同定する段階、(4)段階(3)の疾患関連エピトープに結合した抗体を、(i)段階(1)のアレイ内の疾患関連エピトープに結合している抗体と比較する段階であり、抗体が疾患に関連することがわかっている段階、および、(ii)段階(1)のアレイ内の疾患関連エピトープに結合している抗体と比較する段階であり、抗体が疾患に関連しない段階
を含む、患者のエピトープ特異的プロファイルを決定する段階；
(b)段階(a)のエピトープ特異的プロファイルを基に、患者に特異的な治療法を設計する段階であり(1)患者試料中の抗体に結合されたエピトープを決定する段階、および(2)1種または複数のエピトープを患者に投与する段階。
【請求項３１】
患者に投与されるエピトープが、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、DNA、RNA、脂質、グリコシル化された分子、リン酸化修飾を伴うポリペプチド、シトルリン修飾を伴うポリペプチド、多糖または他の分子からなる群より選択される、請求項30記載の方法。
【請求項３２】
患者に投与されるエピトープが、抗原をコードする核酸の形態である、請求項30記載の方法。
【請求項３３】
核酸がDNAである、請求項32記載の方法。
【請求項３４】
インスリン依存型糖尿病(IDDM、自己免疫性糖尿病)患者において抗体特異的プロファイルを決定する方法であって、以下の段階を含む方法：
(a)少なくとも4種のIDDM関連抗原を含む抗原アレイを調製する段階であり、各抗原エレメントが少なくとも1種の免疫学的エピトープを更に含む段階；
(b)段階(a)のIDDM抗原アレイを、抗体を含有する患者試料と物理的に接触させる段階；
(c)段階(b)の患者試料中の抗体に結合するアレイ内のIDDM関連抗原を同定する段階；
(d)段階(c)の疾患関連抗原に結合した抗体を、(1)段階(a)のアレイ内のIDDM関連抗原に結合している抗体と比較する段階であり、抗体がIDDMに関連することがわかっている段階、および(2)段階(a)のアレイ内の疾患関連抗原に結合している抗体と比較する段階であり、抗体がIDDMに関連しない段階。
【請求項３５】
インスリン依存型糖尿病(IDDM、自己免疫性糖尿病)患者において抗体特異的プロファイルを決定する方法であって、以下の段階を含む方法：
(a)少なくとも4種のIDDM関連エピトープエレメントを含むエピトープアレイを調製する段階；
(b)段階(a)のエピトープアレイを、抗体を含有する患者試料と物理的に接触させる段階；
(c)段階(b)の患者試料中の抗体に結合するアレイ内のIDDM関連エピトープを同定する段階；
(d)段階(c)のIDDM関連エピトープに結合した抗体を、(1)段階(a)のアレイ内の疾患関連エピトープに結合している抗体と比較する段階であり、抗体がIDDMに関連しない段階。
【請求項３６】
インスリン依存型糖尿病(IDDM、自己免疫糖尿病)を治療する方法であって、以下の段階を含む方法：
(a)(1)少なくとも4種のIDDM関連抗原を含む抗原アレイを調製する段階であり、各抗原エレメントが少なくとも1種の免疫学的抗原を更に含む段階、(2)段階(1)の抗原アレイを、抗体を含有する患者試料と物理的に接触させる段階、(3)段階(2)の患者試料中の抗体に結合するアレイ内のIDDM関連抗原を同定する段階、(4)段階(3)のIDDM関連抗原に結合した抗体を、(i)段階(1)のアレイ内のIDDM関連抗原に結合している抗体と比較する段階であり、抗体がIDDMに関連することがわかっている段階、および(ii)段階(1)のアレイ内のIDDM関連抗原に結合している抗体と比較する段階であり、抗体がIDDMに関連しない段階
を含む、患者の抗原特異的プロファイルを決定する段階；
(b)段階(a)の抗原特異的プロファイルを基に、患者に特異的な治療法を設計する段階であり、(1)患者試料中の抗体に結合された抗原を決定する段階、および(2)1種または複数の抗原を患者に投与する段階。
【請求項３７】
インスリン依存型糖尿病(IDDM、自己免疫糖尿病)を治療する方法であって、以下の段階を含む方法：
(a)(1)少なくとも4種のIDDM関連エピトープエレメントを含むエピトープアレイを調製する段階、(2)段階(1)のエピトープアレイを、抗体を含有する患者試料と物理的に接触させる段階、(3)段階(2)の患者試料中の抗体に結合するアレイ内のIDDM関連エピトープを同定する段階、(4)段階(3)のIDDM関連エピトープに結合した抗体を、(i)段階(1)のアレイ内のIDDM関連エピトープに結合している抗体と比較する段階であり、抗体がIDDMに関連することがわかっている段階、および(ii)段階(1)のアレイ内のIDDM関連エピトープに結合している抗体と比較する段階であり、抗体がIDDMに関連しない段階
を含む、患者のエピトープ特異的プロファイルを決定する段階；
(b)段階(a)のエピトープ特異的プロファイルを基に、患者に特異的な治療法を設計する段階であり、(1)患者試料中の抗体に結合されたエピトープを決定する段階、および(2)1種または複数のエピトープを患者に投与する段階。