【手続補正書】
【提出日】平成16年12月10日(2004.12.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
試料中の微生物を特異的に検出するためのｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーション装置であって、
−  少なくとも１つの開口部（２）を有する容器（１）、
−  ハイブリダイゼーション溶液用支持台（３）、
−  スライド（４）、および
−  スライド（４）用固定手段（５）を有し、かつ容器（１）の開口部（２）を密閉するのに適した蓋（６）
を備えた装置。
【請求項２】
蓋（６）が、スライド（４）用固定手段（５）として、スライド（４）の一方の端部（７）を挿し込み得るスロット（５）を有する、請求項１に記載の装置。
【請求項３】
スライド（４）が水平に配置されているときに、固定スライド（４）を有する蓋（６）を、蓋（６）のない装置から離れて安定させ得る構造部品（８）を蓋（６）が備えている、請求項１または２に記載の装置。
【請求項４】
スライド（４）が水平、垂直または横向き配置されているときに、固定スライド（４）を有する蓋（６）が、蓋（６）のない装置から離れて立っていられるように蓋（６）が構成されている、請求項１〜３のいずれか１項に記載の装置。
【請求項５】
蓋（６）が閉鎖されているときも閉鎖されていないときも、スライド（４）が水平、垂直または横向き配置されているときに装置を安定させ得るように、容器（１）および蓋（６）の少なくともいずれかが構成されている、請求項１〜４のいずれか１項に記載の装置。
【請求項６】
スライド（４）が、分析試料と、場合により、ネガティブコントロールとなる試料またはポジティブコントロールとなる試料とを互いに別々に加え得るウエル（９）を備えている、請求項１〜５のいずれか１項に記載の装置。
【請求項７】
スライド（４）上のウエル（９）が他のウエル（９）に一次元でのみ隣接している、請求項１〜６のいずれか１項に記載の装置。
【請求項８】
容器（１）が、容器（１）内でスライド（４）を安定化させるためにスライド（４）用の横軸受（１０）を備えている、請求項１〜７のいずれか１項に記載の装置。
【請求項９】
ハイブリダイゼーション溶液用支持台（３）が取外し可能または挿し込み可能である、請求項１〜８のいずれか１項に記載の装置。
【請求項１０】
ハイブリダイゼーション溶液用支持台（３）を容器（１）内に完全に挿し込み得る、請求項１〜９のいずれか１項に記載の装置。
【請求項１１】
ハイブリダイゼーション溶液用支持台（３）を容器（１）内に部分的に挿し込み得る、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の装置。
【請求項１２】
容器（１）が、ハイブリダイゼーション溶液用支持台（３）を容器（１）内で安定化させるためにハイブリダイゼーション溶液用支持台（３）用の横軸受（１１）を備えている、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の装置。
【請求項１３】
ハイブリダイゼーション溶液用支持台（３）が容器（１）の固定部品である、請求項１〜８のいずれか１項に記載の装置。
【請求項１４】
ハイブリダイゼーション溶液用支持台（３）が容器（１）内のウエルである、請求項１３に記載の装置。
【請求項１５】
ハイブリダイゼーション溶液用支持台（３）が、トレイ（３）、特に、液体取り込み用および液浸パッド取り込み用の少なくともいずれかのウエル（１２）を備えたトレイ（３）である、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の装置。
【請求項１６】
スライド（４）を除く装置の全部品の材料が、プラスチック、特に、ポリエチレンおよびポリプロピレンの少なくともいずれかを含んでなる、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の装置。
【請求項１７】
スライド（４）が、ガラス、特に、ＤＩＮ  １２１１１に基づく加水分解等級１〜４に相当するガラス製である、請求項１〜１６のいずれか１項に記載の装置。
【請求項１８】
ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションにより試料中の微生物を特異的に検出する方法であって、以下のステップ：
（ａ）試料中に含まれている微生物を固定するステップ、
（ｂ）固定細胞を検出可能な核酸プローブ分子と共にインキュベートするステップ、
（ｃ）ハイブリダイズしなかった核酸プローブ分子を除去または洗い落とすステップ、および
（ｄ）核酸プローブ分子とハイブリダイズした細胞を検出するステップ
を含んでなり、
ステップ（ａ）〜（ｃ）と、場合により、ステップ（ｄ）が、請求項１〜１７のいずれか１項に記載のｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーション装置で実施される方法。
【請求項１９】
スライド（４）上で固定ステップおよび場合により乾燥ステップの少なくともいずれかを実施する、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
スライド（４）が横向きに配置されているときにスライド（４）の乾燥、特に最終乾燥を行う、請求項１８または１９に記載の方法。
【請求項２１】
スライド（４）が水平に配置されているときにインキュベーションを行う、請求項１８〜２０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２２】
スライド（４）が垂直配置されているときに洗浄を行う、請求項１８〜２１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２３】
方法のステップ（ｂ）で、ハイブリダイゼーション溶液と核酸プローブ分子溶液との混合物をスライド（４）に加える、請求項１８〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２４】
滴下容器を用いて混合物を加える、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
滴下容器が、使い捨て滴下容器または複数回使用可能な滴下容器である、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
ハイブリダイゼーション溶液用支持台（３）内に配置されたハイブリダイゼーション溶液浸漬パッドを介して、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の装置にハイブリダイゼーション溶液を導入する、請求項１８〜２３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２７】
核酸プローブ分子が、検出対象微生物の染色体もしくはエピソームのＤＮＡ、ｍＲＮＡまたはｒＲＮＡと相補的である、請求項１８〜２６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２８】
核酸プローブ分子が検出可能なマーカーに共有結合している、請求項１８〜２７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２９】
検出可能なマーカーが、以下のマーカー：
−  蛍光マーカー、
−  化学発光マーカー、
−  放射性マーカー、
−  酵素活性を有する基、
−  ハプテン、
−  ハイブリダイゼーションにより検出可能な核酸
からなる群から選択される、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
微生物が単細胞微生物である、請求項１８〜２９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３１】
微生物が、酵母、細菌、藻類または真菌類である、請求項１８〜３０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３２】
微生物が廃水細菌である、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
試料が、水、土壌または空気から採取された環境試料である、請求項１８〜３２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３４】
試料が食品試料である、請求項１８〜３２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３５】
試料が、牛乳もしくは乳製品、飲用水、飲料、パン製品または肉製品から採取される、請求項３４に記載の方法。
【請求項３６】
試料が医学試料である、請求項１８〜３２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３７】
試料が、組織、分泌物または糞便から採取される、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
試料が廃水から採取される、請求項１８〜３２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３９】
試料が、活性汚泥、消化汚泥または嫌気性汚泥から採取される、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
試料がバイオフィルムから採取される、請求項１８〜３２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４１】
バイオフィルムが、産業施設から採取されるか、廃水処理工程中に生成されるか、または天然バイオフィルムである、請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】
試料が医薬品または化粧品から採取される、請求項１８〜３２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４３】
ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションにより微生物を特異的に検出するためのキットであって、
−  微生物を特異的に検出するための少なくとも１種の核酸プローブ分子、
−  少なくとも１種のハイブリダイゼーション溶液、
−  場合により、ネガティブコントロールとするための核酸プローブ分子、
−  場合により、ポジティブコントロールとするための核酸プローブ分子、
−  場合により、洗浄溶液、
−  場合により、固定溶液、および
−  請求項１〜１７のいずれか１項に記載のｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーション装置を含んでなるキット。
【請求項４４】
核酸プローブ分子が、検出対象微生物の染色体もしくはエピソームのＤＮＡ、ｍＲＮＡまたはｒＲＮＡと相補的である、請求項４３に記載のキット。
【請求項４５】
核酸プローブ分子が検出可能なマーカーに共有結合している、請求項４３または４４に記載のキット。
【請求項４６】
検出可能なマーカーが、以下のマーカー：
−  蛍光マーカー、
−  化学発光マーカー、
−  放射性マーカー、
−  酵素活性を有する基、
−  ハプテン、
−  ハイブリダイゼーションにより検出可能な核酸
からなる群から選択される、請求項４５に記載のキット。
【請求項４７】
ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションにより微生物を特異的に検出するための、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の装置の利用法。
【請求項４８】
請求項１８〜４２のいずれか１項に記載の方法における請求項４３〜４６のいずれか１項に記載のキットの利用法。