【手続補正書】
【提出日】平成16年3月31日(2004.3.31)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
下記の群より選択されるアミノ酸配列からなる単離ペプチド：
(a)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列；
(b)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列の対立変異体のアミノ酸配列であって、該対立変異体が、配列番号：1、および配列番号：5からなる群より選択される核酸分子の対向鎖に、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸分子によってコードされたアミノ酸配列；
(c)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列のオルソログのアミノ酸配列であって、該オルソログが、配列番号：1、および配列番号：5からなる群より選択される核酸分子の対向鎖に、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸分子によってコードされたアミノ酸配列；および
(d)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列の断片であって、少なくとも10個の連続するアミノ酸を含むアミノ酸配列の断片。
【請求項２】
下記の群より選択されるアミノ酸配列を含む単離ペプチド：
(a)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列；
(b)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列の対立変異体のアミノ酸配列であって、該対立変異体が、配列番号：1、および配列番号：5からなる群より選択される核酸分子の対向鎖に、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸分子によってコードされたアミノ酸配列；
(c)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列のオルソログのアミノ酸配列であって、該オルソログが、配列番号：1、および配列番号：5からなる群より選択される核酸分子の対向鎖に、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸分子によってコードされたアミノ酸配列；および
(d)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列の断片であって、少なくとも10個の連続するアミノ酸を含むアミノ酸配列の断片。
【請求項３】
請求項2記載のペプチドに選択的に結合する単離抗体。
【請求項４】
下記の群より選択されるヌクレオチド配列からなる単離核酸分子：
(a)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
(b)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列の対立変異体のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列であって、配列番号：1、および配列番号：5からなる群より選択される核酸分子の対向鎖に、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列；
(c)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列のオルソログをコードするヌクレオチド配列であって、配列番号：1、および配列番号：5からなる群より選択される核酸分子の対向鎖に、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列；
(d)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列の断片をコードするヌクレオチド配列であって、該断片が、少なくとも10個の連続するアミノ酸を含むヌクレオチド配列；および
(e)(a)〜(d)のヌクレオチド配列に相補的であるヌクレオチド配列。
【請求項５】
下記の群より選択されるヌクレオチド配列を含む単離核酸分子：
(a)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列；
(b)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列の対立変異体のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列であって、配列番号：1、および配列番号：5からなる群より選択される核酸分子の対向鎖に、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列；
(c)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列のオルソログをコードするヌクレオチド配列であって、配列番号：1、および配列番号：5からなる群より選択される核酸分子の対向鎖に、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列；
(d)配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列の断片をコードするヌクレオチド配列であって、該断片が、少なくとも10個の連続するアミノ酸を含むヌクレオチド配列；および
(e) (a)〜(d)のヌクレオチド配列に相補的であるヌクレオチド配列。
【請求項６】
請求項5記載の核酸分子を含む遺伝子チップ。
【請求項７】
請求項5記載の核酸分子を含むヒト以外のトランスジェニック動物。
【請求項８】
請求項5記載の核酸分子を含む核酸ベクター。
【請求項９】
請求項8記載のベクターを含む宿主細胞。
【請求項１０】
請求項1記載のいずれかのペプチドを製造する方法であって、(a)〜(d)のいずれかのアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を宿主細胞内に導入する段階、およびペプチドがヌクレオチド配列から発現される条件下で宿主細胞を培養する段階を含む方法。
【請求項１１】
請求項2記載のいずれかのペプチドを製造する方法であって、(a)〜(d)のいずれかのアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を宿主細胞に導入する段階、およびペプチドがヌクレオチド配列から発現される条件下で宿主細胞を培養する段階を含む方法。
【請求項１２】
試料中における請求項2記載のいずれかのペプチドの存在を検出する方法であって、試料中における該ペプチドの存在を特異的に検出する検出試薬と試料を接触させる段階、および該ペプチドの存在を検出する段階を含む方法。
【請求項１３】
試料中における請求項5記載の核酸分子の存在を検出する方法であって、ストリンジェントな条件下で該核酸分子にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドと試料を接触させる段階、および試料中の該核酸分子とオリゴヌクレオチドが結合するかどうかを判定する段階を含む方法。
【請求項１４】
請求項2記載のペプチドのモジュレータを同定する方法であって、該ペプチドを試薬と接触させる段階、および該試薬が該ペプチドの機能または活性を調節したかどうかを判定する段階を含む方法。
【請求項１５】
試薬がペプチドを発現する発現ベクターを含む宿主細胞に投与される、請求項14記載の方法。
【請求項１６】
請求項2記載のいずれかのペプチドに結合する試薬を同定する方法であって、ペプチドと試薬を接触させる段階、および接触混合物をアッセイして、ペプチドと試薬との複合体が形成されるかどうかを判定する段階を含む方法。
【請求項１７】
請求項16記載の方法により同定された試薬と、薬学的に許容されるそれらの担体とを含む薬学的組成物。
【請求項１８】
ヒト輸送体タンパク質により媒介される疾患または症状を治療する方法であって、薬学的に有効な量の請求項16記載の方法で同定された試薬を患者に投与する段階を含む方法。
【請求項１９】
請求項2記載のペプチドの発現のモジュレータを同定する方法であって、該ペプチドを発現する細胞と試薬とを接触させる段階、および該試薬が該ペプチドの発現を調節したかどうかを判定する段階を含む方法。
【請求項２０】
配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも70％の相同性を持つアミノ酸配列を有する、単離ヒト輸送体ペプチド。
【請求項２１】
配列番号：3および配列番号：4からなる群より選択されるアミノ酸配列と少なくとも90％の相同性を持つアミノ酸配列を有する、請求項20記載のペプチド。
【請求項２２】
ヒト輸送体ペプチドをコードする単離核酸分子であって、配列番号：1、および配列番号：5からなる群より選択される核酸分子と少なくとも80％の相同性を有する核酸分子。
【請求項２３】
配列番号：1、および配列番号：5からなる群より選択される核酸分子と少なくとも90％の相同性を有している、請求項22記載の核酸分子。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６４】
したがって、本発明は、図2に示されるアミノ酸配列 (配列番号：3および配列番号：4)からなるタンパク質、例えば、図1に示される転写/cDNA核酸配列 (配列番号：1)ならびに図3に示されるゲノム配列 (配列番号：5）によりコードされるタンパク質を提供するものである。このようなタンパク質のアミノ酸配列を図2に示す。このようなタンパク質の最終的なアミノ酸配列がこのアミノ酸配列である場合、タンパク質はアミノ酸配列からなる。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６５】
本発明はさらに、図2に示されるアミノ酸配列 (配列番号：3および配列番号：4)から実質的になるタンパク質、例えば、図1に示される転写/cDNA核酸配列 (配列番号：1)ならびに図3に示されるゲノム配列 (配列番号：5）によりコードされるタンパク質を提供するものである。このようなアミノ酸配列に数個の付加アミノ酸残基、例えば、最終的なタンパク質中に約1個〜約100個程度の付加残基、一般的には1個〜約20個の付加残基が存在する場合、タンパク質はアミノ酸配列から実質的になる。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６６】
本発明はさらに、図2に示されるアミノ酸配列 (配列番号：3および配列番号：4)を含むタンパク質、例えば、図1に示される転写/cDNA核酸配列 (配列番号：1）ならびに図3に示されるゲノム配列（配列番号：5）によりコードされるタンパク質を提供するものである。このアミノ酸配列が、タンパク質の最終的なアミノ酸配列の少なくとも一部である場合、タンパク質はアミノ酸配列を含む。このような場合、タンパク質はペプチドのみであるか、またはタンパク質と天然に結合しているアミノ酸残基（連続するコード配列）もしくは非相同アミノ酸残基/ペプチド配列のような付加アミノ酸分子を有することができる。このようなタンパク質は、数個の付加アミノ酸残基を有するか、または数百もしくはそれ以上の付加アミノ酸を含むことができる。本発明の輸送体ペプチドが含まれるタンパク質の好ましい種として、天然の成熟タンパク質がある。これらの様々な種のタンパク質を調製/単離する方法について、以下に簡単に述べる。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１３４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１３４】
したがって、本発明は、図1もしくは図3（配列番号：1、転写配列、ならびに配列番号：5、ゲノム配列）に記載のヌクレオチド配列からなる核酸分子、または図2（配列番号：3および配列番号：4）に記載のタンパク質をコードする任意の核酸分子を提供するものである。ヌクレオチド配列がこの核酸分子の完全なヌクレオチド配列であるとき、核酸分子はヌクレオチド配列からなる。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１３５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１３５】
本発明はさらに、図1もしくは図3（配列番号：1、転写配列、ならびに配列番号：5、ゲノム配列）に記載のヌクレオチド配列から実質的になる核酸分子、または図2（配列番号：3および配列番号：4）に記載のタンパク質をコードする任意の核酸分子を提供するものである。最終的な核酸分子において、このようなヌクレオチド配列がごくわずかの付加核酸残基とともに存在するとき、核酸分子はヌクレオチド配列から実質的になる。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１３６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１３６】
本発明はさらに、図1または図3（配列番号：1、転写配列、ならびに配列番号：5、ゲノム配列）に記載のヌクレオチド配列を含む核酸分子、または図2（配列番号：3および配列番号：4）に記載のタンパク質をコードする任意の核酸分子を提供するものである。ヌクレオチド配列が核酸分子の最終的なヌクレオチド配列の少なくとも一部である場合、核酸分子はヌクレオチド配列を含む。これによると、核酸分子は、そのヌクレオチド配列だけであるか、または付加的な核酸残基、例えば、それに天然に関連する核酸残基、または非相同性のヌクレオチド配列を有することもできる。このような核酸分子は、ごくわずかの付加的なヌクレオチドを有するか、または数百もしくはそれ以上の付加的なヌクレオチドを含むこともできる。これらの種々のタイプの核酸分子を容易に生成/単離する方法について、以下に簡単に述べる。
【手続補正８】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図１Ｂ
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図１Ｂ】
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