【手続補正書】
【提出日】平成17年6月22日(2005.6.22)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドと特異的に結合する単離された抗体。 
【請求項２】
モノクローナル抗体である請求項１に記載の抗体。 
【請求項３】
非ヒト相補性決定部位（ＣＤＲ）又は枠組み構造領域（ＦＲ）を含む、請求項２に記載の抗体。 
【請求項４】
標識された請求項１に記載の抗体。 
【請求項５】
抗体断片又は一本鎖抗体である、請求項１に記載の抗体。 
【請求項６】
製薬的に許容可能な担体との混合である請求項１に記載の抗体を含む製造品。 
【請求項７】
前記抗体の治療的有効量を含む、請求項６の製造品。 
【請求項８】
細胞毒性又は化学療法薬剤をさらに含む、請求項６の製造品。 
【請求項９】
請求項１の抗体をコードする単離された核酸。 
【請求項１０】
請求項９の核酸分子を含んでなるベクター。 
【請求項１１】
請求項１０のベクターを含んでなる宿主細胞。 
【請求項１２】
配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドと特異的に結合する抗体を生産する方法であって、前記抗体の発現を可能にならしめるのに十分な条件下で請求項１１の宿主細胞を培養すること、及び、細胞培養から前記抗体を回収することを含んでなる前記方法。 
【請求項１３】
配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチド又はその相補鎖をコードする核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイゼーションする、単離された核酸。 
【請求項１４】
配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０に示されるポリペプチドを含有すると思われる試料において前記ポリペプチドの存在を確定する方法であって、この試料を前記ポリペプチドに対する抗体へ曝露し、前記試料における前記抗体の前記ポリペプチドとの結合を確定することを含んでなる方法。 
【請求項１５】
前記試料が、配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドを発現する思われる細胞を含む、請求項１４の方法。 
【請求項１６】
前記細胞が癌細胞である、請求項１５の方法。 
【請求項１７】
（ａ）哺乳動物から得た組織細胞の試験試料、及び、（ｂ）同じ細胞型の既知の正常細胞のコントロール試料から配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドをコードする遺伝子の発現のレベルを検出することを含んでなり、コントロール試料と比較して試験試料でのより高い発現レベルが、試験組織細胞が得られた哺乳動物における腫瘍の存在を示す、哺乳動物における腫瘍を診断する方法。 
【請求項１８】
前記試験試料が腫瘍細胞の成長又は増殖があると疑われる個体から得られた、請求項１７の方法。 
【請求項１９】
配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドに対する抗体及び適切な包装体中の担体を含んでなる、ガン診断用キット。 
【請求項２０】
同じ組織型の正常細胞と比較して、配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドを過剰発現する肺及び結腸腫瘍細胞の成長を阻害する方法であって、前記腫瘍細胞を、前記ポリペプチドをコードする核酸又はその相補鎖とハイブリダイゼーションするアンチセンスオリゴヌクレオチドの有効量に曝露することを含んでなり、前記腫瘍細胞の成長がそれによって阻害される前記方法。 
【請求項２１】
前記腫瘍細胞が、さらに放射線治療、細胞毒性剤又は化学療法剤へ曝露される、請求項２０の方法。 
【請求項２２】
容器； 
容器上のラベル；及び 
容器内に含有される配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドの活性及び／又は発現を阻害する抗体を含む組成物を含んでなり、 
該組成物が腫瘍細胞の成長を阻害に有効であり、容器上のラベルが、同じ組織型の正常細胞と比較して、前記腫瘍細胞において前記ポリペプチドの過剰発現によって特徴付けられる症状の治療に効果的であることを示す製造品。 
【請求項２３】
配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドを発現する細胞において、前記ポリペプチドの発現を阻害する化合物を同定する方法であって、前記方法が、前記細胞を候補化合物と接触させ、及び、前記ポリペプチドの発現が阻害されるか否かを確定する前記方法。 
【請求項２４】
前記候補化合物がアンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項２３の方法。 
【請求項２５】
以下の(a)又は(b)のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなる単離された核酸。 
(a) 配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるアミノ酸配列、及び 
(b) １若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失又は付加された(a)のアミノ酸配列からなり、肺腫瘍において過剰発現しているポリペプチド。 
【請求項２６】
以下の(a)又は(b)のヌクレオチド配列からなる単離された核酸。 
(a)配列番号：１，配列番号：３，配列番号：９，配列番号：１１，配列番号：１３，配列番号：１７又は配列番号：１９で示されるヌクレオチド配列、及び 
(b) １若しくは数個のヌクレオチドが置換、欠失又は付加された(a)のヌクレオチド配列からなり、そのコードされているポリペプチドが肺又は結腸において過剰発現しているヌクレオチド配列。 
【請求項２７】
以下の(a)又は(b)のヌクレオチド配列からなる単離された核酸。 
(a)配列番号：１，配列番号：３，配列番号：９，配列番号：１１，配列番号：１３，配列番号：１７又は配列番号：１９で示される完全長コード化配列；及び 
(b)１若しくは数個のヌクレオチドが置換、欠失又は付加された(a)のヌクレオチド配列からなり、そのコードされているポリペプチドが肺腫瘍で過剰発現しているヌクレオチド配列。 
【請求項２８】
以下の(a)又は(b)のヌクレオチド配列からなる単離された核酸。 
(a) ＡＴＣＣ受入番号ＰＴＡ−１２４，ＰＴＡ−３８３，ＰＴＡ−５２０，ＰＴＡ−５４８，ＰＴＡ−５５２，ＰＴＡ−６１９，ＰＴＡ−６１２で寄託されたＤＮＡの完全長コード化配列、及び 
(b) １若しくは数個のヌクレオチドが置換、欠失又は付加された(a)のヌクレオチド配列からなり、そのコードされているポリペプチドが肺腫瘍において過剰発現しているヌクレオチド配列。 
【請求項２９】
請求項２５〜２８の何れか一項の核酸を含んでなるクローニングベクター。 
【請求項３０】
ベクターで形質転換された宿主細胞によって認識される制御配列と作用可能に連結している請求項２９のベクター。 
【請求項３１】
請求項３０のベクターを含んでなる宿主細胞。 
【請求項３２】
前記細胞がCHO細胞である、請求項３１の宿主細胞。 
【請求項３３】
前記細胞が大腸菌である、請求項３１の宿主細胞。 
【請求項３４】
前記細胞が酵母細胞である、請求項３１の宿主細胞。 
【請求項３５】
前記細胞がバキュロウイルス感染昆虫細胞である、請求項３１の宿主細胞。 
【請求項３６】
配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドの発現に適した条件下で請求項３１の宿主細胞を培養すること、及び、細胞培養から前記ポリペプチドを回収することを含んでなる、前記ポリペプチドを生産する方法。 
【請求項３７】
以下の(a)又は(b)のアミノ酸配列からなる単離されたポリペプチド。 
(a)配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるアミノ酸配列、及び 
(b) １若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失又は付加された(a)のアミノ酸配列からなり、肺又は直腸腫瘍で過剰発現しているポリペプチド。 
【請求項３８】
以下の(a)又は(b)のアミノ酸配列からなる単離されたポリペプチド。 
(a) ＡＴＣＣ受入番号ＰＴＡ−１２４，ＰＴＡ−３８３，ＰＴＡ−５２０，ＰＴＡ−５４８，ＰＴＡ−５５２，ＰＴＡ−６１９，ＰＴＡ−６１２で寄託されたＤＮＡによってコードされているアミノ酸配列、及び 
(b) １若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失又は付加された(a)のアミノ酸配列からなり、肺又は直腸腫瘍で過剰発現しているポリペプチド。 
【請求項３９】
異種アミノ酸配列と融合している請求項３７〜３８の何れか一項に示されるポリペプチドを含んでなるキメラ分子。 
【請求項４０】
前記異種アミノ酸配列がエピトープタグ配列である、請求項３９のキメラ分子。 
【請求項４１】
前記異種アミノ酸配列が免疫グロブリンのＦｃ領域である、請求項３９のキメラ分子。
【請求項４２】
請求項３７〜３９の何れか一項に記載のポリペプチドと特異的に結合する抗体。 
【請求項４３】
前記抗体が、モノクローナル抗体、ヒト化抗体又は一本鎖抗体である、請求項４２の抗体。 
【請求項４４】
以下の(a)，(b)，(c)，(d)，(e)又は(f)のヌクレオチド配列からなる単離された核酸。   (a)シグナルペプチドを欠く配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、及び 
(b) １若しくは数個のアミノ酸残基が置換、欠失又は付加されたシグナルペプチドを欠く配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、それによりコードされているポリペプチドが肺又は直腸腫瘍細胞で過剰発現しているヌクレオチド配列、又は 
(c) シグナルペプチドを有する配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドの細胞外ドメインをコードするヌクレオチド配列、及び 
(d) １若しくは数個のアミノ酸残基が置換、欠失又は付加されたシグナルペプチドを有する配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドの細胞外ドメインをコードするヌクレオチド配列であって、それによりコードされているポリペプチドが肺又は直腸腫瘍細胞で過剰発現しているヌクレオチド配列、又は 
(e) シグナルペプチドを欠く配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドの細胞外ドメインをコードするヌクレオチド配列、及び 
(f) １若しくは数個のアミノ酸残基が置換、欠失又は付加されたシグナルペプチドを欠く配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリペプチドの細胞外ドメインをコードするヌクレオチド配列であって、そのアミノ酸配列からなるポリペプチドが肺又は直腸腫瘍細胞で過剰発現しているヌクレオチド配列。 
【請求項４５】
以下の(a)，(b)，(c)，(d)，(e)又は(f)のアミノ酸配列からなる単離されたポリペプチド。 
(a) シグナルペプチドを欠く配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるアミノ酸配列、及び 
(b) １若しくは数個のアミノ酸残基が置換、欠失又は付加された(a)のアミノ酸配列であって、そのアミノ酸配列からなるポリペプチドが肺又は直腸腫瘍細胞で過剰発現している前記アミノ酸配列、又は 
(c) シグナルペプチドを有する配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリぺプチドをの細胞外ドメインをコードするアミノ酸配列；及び 
(d) １若しくは数個のアミノ酸残基が置換、欠失又は付加された(c)のアミノ酸配列であって、そのアミノ酸配列からなるポリペプチドが肺又は直腸腫瘍細胞で過剰発現している前記アミノ酸配列、又は 
(e) シグナルペプチドを欠く配列番号：２，配列番号：４，配列番号：１０，配列番号：１２，配列番号：１４，配列番号：１８又は配列番号：２０で示されるポリぺプチドの細胞外ドメインをコードするアミノ酸配列；及び 
(f)１若しくは数個のアミノ酸残基が置換、欠失又は付加された(e)のアミノ酸配列であって、そのアミノ酸配列からなるポリペプチドが肺又は直腸腫瘍細胞で過剰発現している前記アミノ酸配列。