【手続補正書】
【提出日】平成17年1月20日(2005.1.20)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）（ｉ）コア粒子、及び、
（ｉｉ）少なくとも１つの第１の付着部位を有するオーガナイザー
を含んでなる非天然分子骨格であって、
前記オーガナイザーが前記コア粒子に少なくとも１つの共有結合により連結され、前記コア粒子がバクテリオファージの組換えタンパク質、又はその断片を含むウイルス様粒子である非天然分子骨格、
（ｂ）少なくとも１つの第２の付着部位を持つ抗原又は抗原決定基であって、前記第２の付着部位が、
（ｉ）前記抗原又は抗原決定基で自然発生しない付着部位、及び、
（ｉｉ）前記抗原又は抗原決定基で自然発生する付着部位
からなる群から選択される抗原又は抗原決定基、
を含んでなる組成物において、
前記第２の付着部位が、少なくとも１つの非ペプチド結合を介して前記第１の付着部位に結合することができ、そして、
前記抗原又は抗原決定基及び前記骨格が前記結合を介して相互作用して、規則正しく繰り返される抗原アレイを形成する組成物。
【請求項２】
前記結合が、少なくとも１つの共有結合による、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
前記第１の付着部位がリジン残基であり、前記第２の付着部位がシステイン残基である、請求項１に記載の組成物。
【請求項４】
前記第２の付着部位がスルフヒドリル基又はシステイン残基であるか、それを含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項５】
前記バクテリオファージがＲＮＡ-ファージであり、好ましくは、前記ＲＮＡ-ファージが、
ａ）バクテリオファージＱβ；
ｂ）バクテリオファージＲ１７；
ｃ）バクテリオファージｆｒ；
ｄ）バクテリオファージＧＡ；
ｅ）バクテリオファージＳＰ；
ｆ）バクテリオファージＭＳ２；
ｇ）バクテリオファージＭ１１；
ｈ）バクテリオファージＭＸ１；
ｉ）バクテリオファージＮＬ９５；
ｋ）バクテリオファージｆ２；及び
ｌ）バクテリオファージＰＰ７；
からなる群から選択される、請求項１に記載の組成物。
【請求項６】
前記組換えタンパク質が、
ａ）配列番号：１５９のアミノ酸配列；
ｂ）配列番号：１６０のアミノ酸配列；
ｃ）配列番号：１６１のアミノ酸配列；
ｄ）配列番号：１６２のアミノ酸配列；
ｅ）配列番号：１６３のアミノ酸配列；
ｆ）配列番号：１６４のアミノ酸配列；
ｇ）配列番号：１６５のアミノ酸配列；
ｈ）配列番号：１６６のアミノ酸配列；
ｉ）配列番号：１６７のアミノ酸配列；
ｊ）配列番号：２１５のアミノ酸配列；
ｋ）配列番号：２５３のアミノ酸配列；
ｌ）配列番号：２１７及びその変異体のアミノ酸配列；
ｍ）配列番号：２５４のアミノ酸配列；
からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するコートタンパク質を含む、請求項５に記載の組成物。
【請求項７】
前記組換えタンパク質が、変異体コートタンパク質を含み、好ましくは、前記変異体コートタンパク質が、置換による少なくとも１つのリジン残基の除去により、又は置換による少なくとも１つのリジン残基の追加により修飾されているか、又は、好ましくは、前記変異体コートタンパク質が、少なくとも１つのリジン残基の欠失により、又は少なくとも１つのリジン残基の挿入を介する付加により修飾されている、請求項５に記載の組成物。
【請求項８】
前記バクテリオファージがバクテリオファージＱβ又はバクテリオファージｆｒである、請求項１に記載の組成物。
【請求項９】
前記組換えタンパク質が、配列番号：１５９のアミノ酸配列を有するコートタンパク質、又は配列番号：１５９及び配列番号：２１７又は配列番号：２１７の変異体のアミノ酸配列を有するコートタンパク質の混合物を含む、請求項８に記載の組成物。
【請求項１０】
前記コア粒子が、配列番号：１５９のアミノ酸配列を有するコートタンパク質から実質的になるか、又は配列番号：２１７、又はその変異体、及び配列番号：１５９のアミノ酸配列を有するコートタンパク質の混合物から実質的になるバクテリオファージＱβのウイルス様粒子である、請求項１に記載の組成物。
【請求項１１】
前記組換えタンパク質が変異体Ｑβコートタンパク質を含み、好ましくは、前記変異体Ｑβコートタンパク質が、置換による少なくとも１つのリジン残基の除去により、又は置換による少なくとも１つのリジン残基の付加により修飾されているか、又は、好ましくは、前記変異体コートタンパク質が、少なくとも１つのリジン残基の欠失により、又は挿入による少なくとも１つのリジン残基の付加により修飾されている、請求項９に記載の組成物。
【請求項１２】
前記変異体Ｑβコートタンパク質が、
ａ）配列番号：２５５のアミノ酸配列；
ｂ）配列番号：２５６のアミノ酸配列；
ｃ）配列番号：２５７のアミノ酸配列；
ｄ）配列番号：２５８のアミノ酸配列；及び
ｅ）配列番号：２５９のアミノ酸配列；
からなる群から選択されるアミノ酸配列を有するタンパク質を含む、請求項１１に記載の組成物。
【請求項１３】
前記コア粒子が、
ａ）配列番号：２５５のアミノ酸配列；
ｂ）配列番号：２５６のアミノ酸配列；
ｃ）配列番号：２５７のアミノ酸配列；
ｄ）配列番号：２５８のアミノ酸配列；
ｅ）配列番号：２５９のアミノ酸配列；及び
ｆ）ａ）−ｅ）の何れか及び対応するＡ１タンパク質の混合物から成る群から選択されるアミノ酸配列を有する変異体Ｑβコートタンパク質から実質的に成るバクテリオファージＱβのウイルス様粒子である、請求項１に記載の組成物。
【請求項１４】
前記オーガナイザーが、前記バクテリオファージＱβ又は前記バクテリオファージｆｒの一体部分である、請求項８に記載の組成物。
【請求項１５】
前記コア粒子が、バクテリオファージの組換えタンパク質からなるウイルス様粒子である、請求項１に記載の組成物。
【請求項１６】
前記第１及び／又は第２の付着部位が、
（ａ）抗原及びそれに対する抗体又は抗体断片；
（ｂ）ビオチン及びアビジン；
（ｃ）ストレプトアビジン及びビオチン；
（ｄ）レセプター及びそのリガンド；
（ｅ）リガンド結合性タンパク質及びそのリガンド；
（ｆ）相互作用するロイシンジッパーポリペプチド；
（ｇ）アミノ基及びそれと反応性の化学基；
（ｈ）カルボキシル基及びそれと反応性の化学基；
（ｉ）スルフヒドリル基及びそれと反応性の化学基；又は
（ｊ）これらの組み合わせ
を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項１７】
前記第１の付着部位がアミノ基であり、前記第２の付着部位がスルフヒドリル基である、請求項１に記載の組成物。
【請求項１８】
前記第２の付着部位が、前記抗原又は抗原決定基内で自然発生せず、好ましくは、前記第１の付着部位がアミノ基であり、前記第２の付着部位がスルフヒドリル基であるか、又は、前記第１の付着部位がリジン残基であり、前記第２の付着部位がシステイン残基であるか、又は、前記第２の付着部位が、スルフヒドリル基又はシステイン残基である又はそれを含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項１９】
前記組成物がアミノ酸リンカーを含み、好ましくは、前記アミノ酸リンカーが、少なくとも１つの共有結合によって前記抗原又は前記抗原決定基に結合した、請求項１８に記載の組成物。
【請求項２０】
前記アミノ酸リンカーが、前記第２の付着部位を含むか、あるいはそれからなり、好ましくは、前記アミノ酸リンカーが、スルフヒドリル基又はシステイン残基を含み、好ましくは、前記アミノ酸リンカーが、
（ａ）ＣＧＧ
（ｂ）Ｎ-末端ガンマ１-リンカー；
（ｃ）Ｎ-末端ガンマ３-リンカー；
（ｄ）Ｉｇヒンジ領域；
（ｅ）Ｎ-末端グリシンリンカー；
（ｆ）ｎ＝０−１２かつｋ＝０−５である場合の(Ｇ)ｋＣ(Ｇ)ｎ；
（ｇ）Ｎ-末端グリシン-セリンリンカー；
（ｈ）ｎ＝０−３、ｋ＝０−５、ｍ＝０−１０，ｌ＝０−２である場合の(Ｇ)ｋＣ(Ｇ)ｍ(Ｓ)ｌ(ＧＧＧＧＳ)ｎ；
（ｉ）ＧＧＣ
（ｋ）ＧＧＣ-ＮＨ２
（ｌ）Ｃ-末端ガンマ１-リンカー
（ｍ）Ｃ-末端ガンマ３-リンカー；
（ｎ）Ｃ-末端グリシンリンカー；
（ｏ）ｎ＝０−１２かつｋ＝０−５である場合の(Ｇ)ｎＣ(Ｇ)ｋ；
（ｐ）Ｃ-末端グリシン-セリンリンカー；
（ｑ）ｎ＝０−３、ｋ＝０−５、ｍ＝０−１０，ｌ＝０−２及びｏ＝０−８である場合
の(Ｇ)ｍ(Ｓ)ｌ(ＧＧＧＧＳ)ｎ(Ｇ)ｏＣ(Ｇ)ｋ
からなる群から選択される、請求項１９に記載の組成物。
【請求項２１】
前記抗原又は前記抗原決定基が、自己抗原又はその断片である、請求項１に記載の組成物。
【請求項２２】
前記抗原又は前記抗原決定基が、抗-イディオタイプ抗体又は抗-イディオタイプ抗体断片である、請求項１に記載の組成物。
【請求項２３】
前記自己抗原が、
ａ）リンホトキシン；
ｂ）リンホトキシンレセプター；
ｃ）ＲＡＮＫＬ；
ｄ）ＶＥＧＦ；
ｅ）ＶＥＧＦＲ；
ｆ）インターロイキン５；
ｇ）インターロイキン１７；
ｈ）インターロイキン１３；
ｉ）アンギオテンシン；
ｊ）ＣＣＬ２１；
ｋ）ＣＸＣＬ１２；
ｌ）ＳＤＦ-１；
ｍ）ＭＣＰ-１；
ｎ）エンドグリン(Endoglin)；
ｏ）レジスチン(Resistin)；
ｐ）ＧＨＲＨ；
ｑ）ＬＨＲＨ；
ｒ）ＴＲＨ；
ｓ）ＭＩＦ；
ｔ）エオタキシン(Eotaxin)；
ｕ）ブラジキニン；
ｖ）ＢＬＣ；
ｗ）腫瘍壊死因子α（ＴＮＦα）；及び
ｘ）ヒトＩｇＥ
からなる群から選択されるタンパク質、ペプチド又はそれらの断片である、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２４】
前記自己抗原が、アンギオテンシンペプチド又はその断片であり、好ましくは、前記第２の付着部位を持つ前記アンギオテンシンペプチドが、
ａ）ＣＧＧＤＲＶＹＩＨＰＦのアミノ酸配列；
ｂ）ＣＧＧＤＲＶＹＩＨＰＦＨＬのアミノ酸配列；
ｃ）ＤＲＶＹＩＨＰＦＨＬＧＧＣのアミノ酸配列；及び
ｄ）ＣＤＲＶＹＩＨＰＦＨＬのアミノ酸配列
からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２５】
前記自己抗原が、ＶＥＧＦＲ-ＩＩペプチド又はその断片であり、好ましくは、前記第２の付着部位を持つ前記ＶＥＧＦＲ-ＩＩペプチドが、ＣＴＡＲＴＥＬＮＶＧＩＤＦＮＷＥＹＰＳＳＫＨＱＨＫＫのアミノ酸配列を有する、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２６】
前記自己抗原が、腫瘍壊死因子α（ＴＮＦ-α）、その断片又はＴＮＦ-αのペプチドであり、好ましくは、前記第２の付着部位を持つ前記腫瘍壊死因子α（ＴＮＦ-α）、その断片又はＴＮＦ-αのペプチドが、
ａ）ＣＳＳＲＴＰＳＤＫＰＶＡＨＶＶＡＮＰＱＡＥＧＱのアミノ酸配列；及び
ｂ）ＳＳＲＴＰＳＤＫＰＶＡＨＶＶＡＮＰＱＡＥＧＱＧＧＣのアミノ酸配列；
からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２７】
前記自己抗原が、レジスチン又はその断片であり、好ましくは、前記第２の付着部位を持つ前記レジスチンタンパク質又はその断片が、
ａ）配列番号：３２５のアミノ酸配列；
ｂ）配列番号：３２６のアミノ酸配列；及び
ｃ）配列番号：３２７のアミノ酸配列；
からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２８】
前記自己抗原が、
ａ）リンホトキシンα（ＬＴα）
ｂ）リンホトキシンβ（ＬＴβ）
ｃ）ＬＴα及びＬＴβの混合物又は組み合わせ
からなる群から選択されるリンホトキシン又はその断片である、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２９】
前記自己抗原がリンホトキシンβ又はその断片であり、前記第２の付着部位を持つ前記リンホトキシンβが、
ａ）配列番号：３４６のアミノ酸配列；及び
ｂ）配列番号：３４７のアミノ酸配列；
からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３０】
前記自己抗原が、ヒト-ＭＩＦ又はその断片であり、好ましくは、前記第２の付着部位を持つ前記ヒト-ＭＩＦタンパク質又はその断片が、
ａ）配列番号：３１０のアミノ酸配列；
ｂ）配列番号：３１１のアミノ酸配列；
ｃ）配列番号：３１２のアミノ酸配列；
ｄ）配列番号：３１３のアミノ酸配列；
ｅ）配列番号：３１４のアミノ酸配列；及び
ｆ）配列番号：３１５のアミノ酸配列；
からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、請求項２１に記載の組成物。
【請求項３１】
前記自己抗原が、ヒト-ＲＡＮＫＬ又はその断片であり、好ましくは、前記自己抗原が、ヒト-ＲＡＮＫＬの細胞外部分又はその断片である、請求項２１に記載の組成物。
【請求項３２】
前記第２の付着部位を持つ前記ヒト-ＲＡＮＫＬ又はその断片が、配列番号：３２０のアミノ酸配列又はその断片を有する、請求項３１に記載の組成物。
【請求項３３】
前記抗原がタンパク質又はその断片であって、
（ｉ）癌細胞に対する免疫反応を誘発するのに適したタンパク質；
（ｉｉ）感染性疾患に対する免疫反応を誘発するのに適したタンパク質；
（ｉｉｉ）アレルゲンに対する免疫反応を誘発するのに適したタンパク質；及び、
（ｉｖ）家畜又はペットにおける免疫反応を誘発するのに適したタンパク質；
からなる群から選択され、好ましくは、前記抗原が、
（ａ）ＨＩＶの組換えタンパク質；
（ｂ）インフルエンザウイルスの組換えタンパク質；
（ｃ）Ｃ型肝炎ウイルスの組換えタンパク質；
（ｄ）トキソプラズマの組換えタンパク質；
（ｅ）熱帯熱マラリア原虫の組換えタンパク質；
（ｆ）三日熱マラリア原虫の組換えタンパク質；
（ｇ）卵形マラリア原虫の組換えタンパク質；
（ｈ）四日熱マラリア原虫の組換えタンパク質；
（ｉ）乳癌細胞の組換えタンパク質；
（ｊ）腎臓癌細胞の組換えタンパク質；
（ｋ）前立腺癌細胞の組換えタンパク質；
（ｌ）皮膚癌細胞の組換えタンパク質；
（ｍ）脳癌細胞の組換えタンパク質；
（ｎ）白血病細胞の組換えタンパク質；
（ｏ）組換えプロフィリン；
（ｐ）ハチ刺されアレルギーの組換えタンパク質；
（ｑ）ナッツアレルギーの組換えタンパク質；
（ｒ）食物アレルギーの組換えタンパク質；
（ｓ）喘息の組換えタンパク質；又は
（ｔ）クラミジア属の組換えタンパク質；
である、請求項１に記載の組成物。
【請求項３４】
前記抗原又は前記抗原決定基がヒトＩｇＥ、又はその断片又はポリぺプチド、好ましくは、前記ヒトＩｇＥが配列番号：１７６のアミノ酸配列を有する、請求項１に記載の組成物。
【請求項３５】
前記抗原又は前記抗原決定基がＤｅｒ ｐＩペプチド、又はその断片又はペプチド、好ましくは、前記第２の付着部位を持つ前記Ｄｅｒ ｐ Ｉペプチドが、
ａ）ＣＧＮＱＳＬＤＬＡＥＱＥＬＶＤＣＡＳＱＨＧＣＨ；及び
ｂ）ＣＱＩＹＰＰＮＡＮＫＩＲＥＡＬＡＱＴＨＳＡ
からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、請求項１に記載の組成物。
【請求項３６】
前記抗原又は前記抗原決定基が、ホスホリパーゼＡ２タンパク質、又はその断片又はペプチドであり、好ましくは、前記ホスホリパーゼＡ２タンパク質が、
ａ）配列番号：１６８のアミノ酸配列；
ｂ）配列番号：１６９のアミノ酸配列；
ｃ）配列番号：１７０のアミノ酸配列；
ｄ）配列番号：１７１のアミノ酸配列；
ｅ）配列番号：１７２のアミノ酸配列；
ｆ）配列番号：１７３のアミノ酸配列；
ｇ）配列番号：１７４のアミノ酸配列；及び
ｈ）配列番号：１７５のアミノ酸配列；
からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、請求項１に記載の組成物。
【請求項３７】
前記抗原又は前記抗原決定基が、インフルエンザＭ２タンパク質、又はその断片又はペプチドである、請求項１に記載の組成物。
【請求項３８】
ａ）請求項１の組成物；及び
ｂ）許容可能な製薬担体
を含んでなる、製薬的組成物。
【請求項３９】
以下のものを含んでなる組成物：
検体へ投与することを含んでなる免疫化方法において使用するためであって、
（ａ）（ｉ）コア粒子、及び、
（ｉｉ）少なくとも１つの第１の付着部位を有するオーガナイザー
を含んでなる非天然分子骨格であって、
前記オーガナイザーが前記コア粒子に少なくとも１つの共有結合により連結され、前記コア粒子がバクテリオファージの組換えタンパク質、又はその断片を含むウイルス様粒子であり、
（ｂ）少なくとも１つの第２の付着部位を持つ抗原又は抗原決定基であって、前記第２の付着部位が、
（ｉ）前記抗原又は抗原決定基で自然発生しない付着部位、及び、
（ｉｉ）前記抗原又は抗原決定基で自然発生する付着部位
からなる群から選択され、
前記第２の付着部位が、少なくとも１つの非ペプチド結合を介して前記第１の付着部位に結合することができ、そして、
前記抗原又は抗原決定基及び前記骨格が前記結合を介して相互作用して、規則正しく繰り返される抗原アレイを形成することを含んでなる組成物。
【請求項４０】
以下のものを含んでなる組成物の使用：
前記組成物が検体へ投与される、検体を免疫化するための組成物の製造のためであって、
（ａ）（ｉ）コア粒子、及び、
（ｉｉ）少なくとも１つの第１の付着部位を有するオーガナイザー
を含んでなる非天然分子骨格であって、
前記オーガナイザーが前記コア粒子に少なくとも１つの共有結合により連結され、前記コア粒子がバクテリオファージの組換えタンパク質、又はその断片を含むウイルス様粒子であり、
（ｂ）少なくとも１つの第２の付着部位を持つ抗原又は抗原決定基であって、前記第２の付着部位が、
（ｉ）前記抗原又は抗原決定基で自然発生しない付着部位、及び、
（ｉｉ）前記抗原又は抗原決定基で自然発生する付着部位
からなる群から選択され、
前記第２の付着部位が、少なくとも１つの非ペプチド結合を介して前記第１の付着部位に結合することができ、そして、
前記抗原又は抗原決定基及び前記骨格が前記結合を介して相互作用して、規則正しく繰り返される抗原アレイを形成することを含んでなる組成物の使用。
【請求項４１】
好ましくは、前記ワクチン組成物が、更にアジュバントを含む、請求項１の組成物を含んでなるワクチン組成物。
【請求項４２】
非自然発生の、規則正しく繰り返された抗原アレイの製造方法において、
（ａ）（ｉ）コア粒子、及び、
（ｉｉ）少なくとも１つの第１の付着部位を有するオーガナイザー
を含んでなる非天然分子骨格であって、
前記オーガナイザーが前記コア粒子に少なくとも１つの共有結合により連結され、前記コア粒子がバクテリオファージの組換えタンパク質又はその断片を含むウイルス様粒子である非天然分子骨格を提供し、
（ｂ）少なくとも１つの第２の付着部位を持つ抗原又は抗原決定基であって、
前記第２の付着部位が、
（ｉ）前記抗原又は抗原決定基で自然発生しない付着部位、及び、
（ｉｉ）前記抗原又は抗原決定基で自然発生する付着部位
からなる群から選択され、
前記第２の付着部位が、少なくとも１つの非ペプチド結合を介して前記第１の付着部位に結合することができる抗原又は抗原決定基を提供し、
（ｃ）前記非天然分子骨格と前記抗原又は抗原決定基とを結合させることを含み、
前記抗原又は抗原決定基と前記骨格とが前記結合を介して相互作用して、規則正しく繰り返される抗原アレイを形成する方法。
【請求項４３】
前記結合が少なくとも１つの共有結合により、好ましくは、前記共有結合が非ペプチド結合である、請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】
ａ）配列番号：２５５のアミノ酸配列；
ｂ）配列番号：２５６のアミノ酸配列；
ｃ）配列番号：２５７のアミノ酸配列；
ｄ）配列番号：２５８のアミノ酸配列；及び
ｅ）配列番号：２５９のアミノ酸配列；
からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する変異体Ｑβコートタンパク質を含むキャプシドを形成することのできるコートタンパク質。