【手続補正書】
【提出日】平成15年1月17日(2003.1.17)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
単離されたポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドは、配列番号２、６、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１もしくは３３、または配列番号２、６、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１もしくは３３の対立遺伝子改変体をコードするヌクレオチド配列を含む、ポリヌクレオチド。
【請求項２】
前記ヌクレオチド配列が、配列番号２もしくは配列番号１５、または配列番号２もしくは配列番号１５の対立遺伝子改変体から選択されるアミノ酸配列をコードする、請求項１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項３】
前記ポリヌクレオチドが、配列番号１もしくは配列番号１４、または配列番号１もしくは配列番号１４の対立遺伝子改変体から選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項４】
前記ポリヌクレオチドが、配列番号３、４、５、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０もしくは３２のいずれか１つ、または配列番号３、４、５、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０もしくは３２のいずれか１つの対立遺伝子改変体から選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５】
前記ヌクレオチド配列に作動可能に連結された転写調節配列をさらに含む、請求項１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項６】
異種ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列をさらに含む、請求項１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項７】
請求項１に記載のポリヌクレオチドであって、該ポリヌクレオチドが配列番号１、３、または１４のいずれか１つに相補的であるヌクレオチド配列を含む、ポリヌクレオチド。
【請求項８】
請求項１に記載のポリヌクレオチドの相補的配列。
【請求項９】
請求項１のポリヌクレオチドを含む、ベクター。
【請求項１０】
プラスミドベクターである、請求項９に記載のベクター。
【請求項１１】
ウイルスベクターである、請求項９に記載のベクター。
【請求項１２】
バキュロウイルスベクターである、請求項１１に記載のベクター。
【請求項１３】
アデノウイルス、パルボウイルス、ヘルペスウイルス、ポックスウイルス、アデノ随伴ウイルス、Ｓｅｍｌｉｋｉ  Ｆｏｒｅｓｔウイルス、ワクシニアウイルス、レンチウイルス、およびレトロウイルスからなる群から選択される、請求項１１に記載のベクター。
【請求項１４】
請求項１に記載のポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
【請求項１５】
前記宿主細胞が、細菌細胞、昆虫細胞、酵母細胞、植物細胞および哺乳動物細胞からなる群から選択される、請求項１４に記載の宿主細胞。
【請求項１６】
前記宿主細胞がヒト細胞である、請求項１４に記載の宿主細胞。
【請求項１７】
請求項１に記載のポリヌクレオチドによってコードされる、単離されたポリペプチド。
【請求項１８】
請求項１７に記載のポリペプチドであって、配列番号２もしくは配列番号１５、または配列番号２もしくは配列番号１５の対立遺伝子改変体を含む、ポリペプチド。
【請求項１９】
配列番号１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１もしくは３３、または配列番号１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１もしくは３３の対立遺伝子改変体を含む、請求項１７に記載のポリペプチド。
【請求項２０】
異種配列をさらに含む、請求項１７〜１９のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項２１】
請求項１に記載のポリヌクレオチドおよび薬学的に受容可能なキャリアを含む、組成物。
【請求項２２】
請求項１７〜１９のいずれか１項に記載のポリペプチドおよび薬学的に受容可能なキャリアを含む、組成物。
【請求項２３】
請求項１７〜１９のいずれか１項に記載のポリペプチドに結合する、抗体。
【請求項２４】
前記抗体が、モノクローナル抗体である、請求項２３に記載の抗体。
【請求項２５】
前記抗体が、ヒト化抗体または完全にヒト抗体である、請求項２４に記載の抗体。
【請求項２６】
ｇｐ２８６スプライス改変体に特異的である、請求項２３に記載の抗体。
【請求項２７】
ｇｐ２８６ａスプライス改変体に特異的である、請求項２３に記載の抗体。
【請求項２８】
請求項２３〜２７のいずれか１項に記載の抗体および薬学的に受容可能なキャリアを含む、組成物。
【請求項２９】
ポリペプチドを産生する方法であって、該方法が、
請求項１４に記載の宿主細胞を、前記ポリヌクレオチドが発現される条件下で培地中で培養する工程、および
該細胞または該培養培地から該ポリペプチドを回収する工程、
を包含する、方法。
【請求項３０】
サンプル中のｇｐ２８６コード配列の存在を決定する方法であって、該方法が、以下の工程：
該サンプルを、高度にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチドと接触させる工程、および
該単離されたポリヌクレオチドの、該サンプル中のポリヌクレオチドに対するハイブリダイゼーションを検出する工程であって、ここで、該ハイブリダイゼーションの存在が、該サンプル中のｇｐ２８６コード配列の存在を示す工程、
を包含する、方法。
【請求項３１】
前記ポリヌクレオチドが、ｇｐ２８６スプライス改変体に特異的である、請求項３０に記載の方法。
【請求項３２】
前記ポリヌクレオチドが、ｇｐ２８６ａスプライス改変体に特異的である、請求項３０に記載の方法。
【請求項３３】
サンプル中のＧＰ２８６タンパク質の存在を決定する方法であって、該方法が以下の工程：
該サンプルを、請求項２３〜２７のいずれか１項に記載の抗体と接触させる工程；および
抗原に対する該抗体の特異的結合を検出する工程であって、ここで、該特異的結合の存在が、該サンプル中のＧＰ２８６タンパク質の存在を示す工程、
を包含する、方法。
【請求項３４】
前記抗体が、ｇｐ２８６スプライス改変体に特異的である、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
前記抗体が、ｇｐ２８６ａスプライス改変体に特異的である、請求項３３に記載の方法。
【請求項３６】
ＧＰ２８６タンパク質を結合する化合物を同定する方法であって、該方法は、以下の工程：
ＧＰ２８６タンパク質を、試験化合物と接触させる工程；および
該ＧＰ２８６タンパク質および該試験化合物によって形成された複合体を検出する工程であって、ここで、該複合体の存在が、該試験化合物が該ＧＰ２８６タンパク質に結合することを示す工程、
を包含する、方法。
【請求項３７】
ＧＰ２８６タンパク質の活性を調節する化合物を同定する方法であって、該方法は、以下の工程：
該ＧＰ２８６タンパク質を、試験化合物と接触させる工程；および
該ＧＰ２８６タンパク質の活性に対する該試験化合物の効果を決定する工程であって、ここで、接触工程後の該活性の変化が、該試験化合物が該ＧＰ２８６タンパク質の活性を調節することを示す工程、
を包含する、方法。
【請求項３８】
被験体における疾患の状態を診断する方法であって、該方法が、該被験体からの組織サンプル中のＧＰ２８６タンパク質の量または活性を、コントロールサンプル中のＧＰ２８６ポリペプチドの量または活性と比較する工程を包含し、
ここで、該コントロールサンプル中のＧＰ２８６ポリペプチドの量または活性と比較した該組織サンプル中のＧＰ２８６ポリペプチドの量または活性の有意な相違が、該被験体が疾患状態を有することを示す、方法。
【請求項３９】
前記疾患状態が、免疫系に関する、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
前記疾患状態が、Ｔ細胞に関する、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
被験体における疾患の状態を診断する方法であって、該方法が、該被験体からの組織サンプル中のｇｐ２８６  ｍＲＮＡの量を、コントロールサンプル中のｇｐ２８６  ｍＲＮＡの量と比較する工程を包含し、
ここで、該コントロールサンプル中の該ｇｐ２８６  ｍＲＮＡの量と比較した該組織サンプル中の該ｇｐ２８６  ｍＲＮＡの量の有意な相違が、該被験体が疾患状態を有することを示す、方法。
【請求項４２】
前記疾患状態が、免疫系に関する、請求項４１に記載の方法。
【請求項４３】
前記疾患状態が、Ｔ細胞に関する、請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】
試験細胞中の遺伝的な病変または変異の存在または非存在を同定する診断アッセイであって、該遺伝的な病変または変異は、以下：（ｉ）ＧＰ２８６タンパク質をコードする遺伝子の異常な改変もしくは変異；（ｉｉ）ＧＰ２８６タンパク質をコードする遺伝子の調節不良；および（ｉｉｉ）ＧＰ２８６タンパク質の異常な翻訳後修飾、のうちの少なくとも１つによって特徴付けられ、
該アッセイが、以下の工程：
該試験細胞、および該遺伝的な病変または変異を欠く参照細胞からのポリヌクレオチドを、配列番号１、配列番号１４もしくは少なくとも１７ヌクレオチドから構成されるそれらの一部を含むポリヌクレオチドプローブと、高度にストリンジェントな条件下で別々にハイブリダイズさせる工程；および
該ポリヌクレオチドハイブリッドを、高度にストリンジェントな洗浄条件下で別々に洗浄し、該ハイブリッドを解離させる工程；および
該参照細胞のポリヌクレオチドと比較して、該ポリヌクレオチドプローブが、該試験細胞のポリヌクレオチドからより容易に解離されるか否かを決定する工程、
を包含する、診断アッセイ。
【請求項４５】
免疫系に関する疾患状態を処置するための、請求項２１または２２に記載の組成物の使用。
【請求項４６】
請求項４５に記載の使用であって、前記疾患状態が、以下：移植障害、自己免疫疾患、癌、多発性硬化症、対宿主性移植片病、川崎病、免疫不全障害および炎症障害からなる群から選択される、使用。
【請求項４７】
請求項４６に記載の使用であって、前記自己免疫疾患が、以下：慢性関節リウマチ、全身性エリテマトーデス、乾癬、シェーグレン症候群、甲状腺炎、グレーヴズ病、肺線維症、閉塞性細気管支炎、溶血性貧血およびヴェーゲナー肉芽腫症からなる群から選択される、使用。
【請求項４８】
前記癌が、白血病またはリンパ腫である、請求項４６に記載の使用。
【請求項４９】
前記免疫不全障害が、ＡＩＤＳである、請求項４６に記載の使用。
【請求項５０】
前記炎症障害が、以下：喘息、アレルギー、成人呼吸促進症候群ならびに急性膵炎および慢性膵炎からなる群から選択される、請求項４６に記載の使用。
【請求項５１】
Ｔ細胞に関連する疾患状態を処置するための、請求項２１または２２に記載の組成物の使用。