【手続補正書】
【提出日】平成17年4月12日(2005.4.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
M. tuberculosisペプチド、または該ペプチドのフラグメントもしくは誘導体もしくは改変体を含む、マイコバクテリア感染の治療剤であって、該ペプチドが、M. tuberculosis遺伝子によってコードされ、該遺伝子の発現が、栄養飢餓ではなくそしてマイコバクテリアの対数増殖を支持する培養条件と比較した場合に、栄養飢餓でありそしてマイコバクテリアの潜伏性を維持する培養条件下で誘導またはアップレギュレートされ、該条件が、接種後少なくとも４０日間のM. tuberculosisマイコバクテリアのバッチ発酵によって得られ得、そして該ペプチドが、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、および２８１からなる群より選択される、治療剤。
【請求項２】
マイコバクテリア潜伏中に発現が誘導またはアップレギュレートされるマイコバクテリア遺伝子を同定する方法であって、該方法が、
栄養飢餓でありそしてマイコバクテリア潜伏性を維持する培養条件下で第１のマイコバクテリアを培養する工程であって、該条件が、接種後少なくとも４０日間該第１のマイコバクテリアのバッチ発酵によって得られ得る、工程；
栄養飢餓ではなくそして第２のマイコバクテリアの対数増殖を支持する培養条件下で、該第２のマイコバクテリアを培養する工程；
該第１および第２のマイコバクテリアから、第１および第２のｍＲＮＡ集団をそれぞれ得る工程であって、該第１のｍＲＮＡ集団が、接種後少なくとも２０日間該第１のマイコバクテリアのバッチ発酵によって得られ得る栄養飢餓条件下で培養された該第１のマイコバクテリアから得られ、そして該第２のｍＲＮＡ集団が、栄養飢餓ではなくそして該第２のマイコバクテリアの対数増殖を支持する条件下で培養された該第２のマイコバクテリアから得られる、工程；
該第１および第２のｍＲＮＡ集団から、第１および第２のｃＤＮＡ集団をそれぞれ調製する工程であって、該ｃＤＮＡ調製中に、検出可能な標識が、該第１および第２のｃＤＮＡ集団のｃＤＮＡ分子に導入される、工程；
該第１および第２のｃＤＮＡ集団から、対応する第１および第２のｃＤＮＡ分子をそれぞれ単離する工程；
該単離された第１および第２のｃＤＮＡ分子に存在する標識から放出される標識または対応するシグナルの相対量を比較する工程；
該単離された第２のｃＤＮＡ分子によって提供されるよりも多い量の該単離された第１のｃＤＮＡ分子によって提供される標識またはシグナルを同定する工程；および
該第１のｃＤＮＡ、および潜伏条件下でのマイコバクテリアの培養中に誘導またはアップレギュレートされる該対応するマイコバクテリア遺伝子を同定する工程、
を含む、方法。
【請求項３】
前記対応する第１および第２のｃＤＮＡ分子が、マイコバクテリアゲノムＤＮＡから生成され、増幅して固定化されたＤＮＡ配列を含むアレイプレートへのハイブリダイゼーションによって、前記第１および第２のｃＤＮＡ集団からそれぞれ単離され、該固定化された配列が、該マイコバクテリアゲノムの各公知の遺伝子の代表であり、そして各代表的配列が、該プレート上の同定された位置に固定化されている、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記第１のマイコバクテリアが、接種後少なくとも３０日、好ましくは少なくとも４０日で採取される、請求項２または３に記載の方法。
【請求項５】
前記培養条件が、前記マイコバクテリアの増殖に対して炭素飢餓である、請求項２から４のいずれかの項に記載の方法。
【請求項６】
前記第１のマイコバクテリアが、３７℃で測定した場合に１０％空気飽和以下、好ましくは７％空気飽和以下、より好ましくは５％空気飽和以下の溶存酸素圧によって規定される培養条件下で培養され、そして該第１のマイコバクテリアが、該培養条件下で採取される、請求項２から５のいずれかの項に記載の方法。
【請求項７】
相対誘導またはアップレギュレーションが、前記単離された第２のｃＤＮＡ分子によって提供される標識またはシグナルの量よりも、前記単離された第１のｃＤＮＡ分子によって提供される標識またはシグナルの量が、相対的に３倍、好ましくは相対的に４倍の増加によって同定される、請求項２から６のいずれかの項に記載の方法。
【請求項８】
M. tuberculosisペプチドのインヒビターであって、該ペプチドが、M. tuberculosis遺伝子によってコードされ、該遺伝子の発現が、栄養飢餓ではなくそしてマイコバクテリアの対数増殖を支持する培養条件と比較した場合に、栄養飢餓でありそしてマイコバクテリアの潜伏性を維持する培養条件下で誘導またはアップレギュレートされ、該条件が、接種後少なくとも４０日間のM. tuberculosisマイコバクテリアのバッチ発酵によって得られ得、該ペプチドが、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、および２８１からなる群より選択され、該インヒビターが、M. tuberculosisペプチドが有する本来の生物学的効果を発揮することを抑制または阻害し得る、インヒビター。
【請求項９】
前記インヒビターが、２−ニトロプロパンジオキシゲナーゼ、アセチルトランスフェラーゼ、酸化還元酵素、転写レギュレーター、アシルトランスフェラーゼ、ＵＤＰ−グルコースデヒドロゲナーゼ、ホスホリボシルグリシンアミドホルミルトランスフェラーゼ、１，４−ジヒドロキシ−２−ナフトエートオクタプレニル、ｇｍｃ型酸化還元酵素、３−ヒドロキシイソ酪酸デヒドロゲナーゼ、メチルマロン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、デヒドロゲナーゼ、水銀レダクターゼ、グルタチオンレダクターゼ、ジヒドロリポアミド、トランスポゼース、プロリンイミノペプチダーゼ、プロリルアミノペプチダーゼ、キノロン流出ポンプ、グリシンベタイントランスポーター、ホスファチジルエタノールアミンＮ−メチルトランスフェラーゼ、カルコンシンターゼ２、スルホトランスフェラーゼ、グリコシルトランスフェラーゼ、フマル酸レダクターゼフラビンタンパク質、８−アミノ−７−オキソノナン酸シンターゼ、アミノトランスフェラーゼクラスIIピリドキサールリン酸、バクテリオファージＨＫ９７プロヘッドプロテアーゼ、ペニシリン結合タンパク質、脂肪アシル−ＣｏＡラセマーゼ、ニトリロトリアセテートモノオキシゲナーゼ、ヒスチジンキナーゼ応答レギュレーター、ペプチダーゼ、ＬｙｓＲ転写レギュレーター、除去酵素、オルニチンアミノトランスフェラーゼ、リンゴ酸酸化還元酵素、チオ硫酸結合タンパク質、エノイル−ＣｏＡヒドラターゼ、アシル−ＣｏＡシンセターゼ、メチルトランスフェラーゼ、シロヘムシンターゼ、透過酵素、グルタリル７−ａｃａアシラーゼ、ｓｎ−グリセロール−３−リン酸輸送系透過酵素、エノイル−ＣｏＡヒドラターゼ／イソメラーゼ、アシル−ＣｏＡデヒドロゲナーゼ、エステラーゼ、リパーゼ、シチジンデアミナーゼ、クロトナーゼ、脂質輸送タンパク質、アセチル−ＣｏＡ  Ｃ−アセチルトランスフェラーゼ、アミノトランスフェラーゼ、ヒドロラーゼ、および２−アミノ−４−ヒドロキシ−６−ヒドロキシメチルジヒドロプテリンピロホスホキナーゼからなる群より選択されるタンパク質を阻害し得る、請求項８に記載のインヒビター。
【請求項１０】
前記誘導またはアップレギュレートされたマイコバクテリア遺伝子あるいはその遺伝子産物をターゲティングし得る抗生物質；および該誘導可能またはアップレギュレート可能な遺伝子の少なくとも一部に相補的であるアンチセンスまたは三重鎖形成核酸配列からなる群より選択される、請求項８または９に記載のインヒビター。
【請求項１１】
M. tuberculosis遺伝子によってコードされるペプチドに、または該ペプチドのフラグメントもしくは改変体もしくは誘導体に結合する抗体であって、該遺伝子の発現が、栄養飢餓ではなくそしてマイコバクテリアの対数増殖を支持する培養条件と比較した場合に、栄養飢餓でありそしてマイコバクテリアの潜伏性を維持する培養条件下で誘導またはアップレギュレートされ、該条件が、接種後少なくとも４０日間のM. tuberculosisマイコバクテリアのバッチ発酵によって得られ得、該M. tuberculosisペプチドが、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、および２８１からなる群より選択される、抗体。
【請求項１２】
遺伝子が改変されてマイコバクテリアが実質的に非病原性になる弱毒化M. tuberculosisマイコバクテリアであって、該遺伝子が、栄養飢餓ではなくそしてマイコバクテリアの対数増殖を支持する培養条件と比較した場合に、栄養飢餓でありそしてマイコバクテリアの潜伏性を維持する培養条件下で、発現が誘導またはアップレギュレートされる遺伝子であり、該条件が、接種後少なくとも４０日間のM. tuberculosisマイコバクテリアのバッチ発酵によって得られ得、該改変されるべきM. tuberculosis遺伝子が、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、および２８２からなる群の１つに対応する野生型コード配列を有する、弱毒化M. tuberculosisマイコバクテリア。
【請求項１３】
M. tuberculosis遺伝子によってコードされるM. tuberculosisペプチド、または該ペプチドのフラグメントもしくは改変体もしくは誘導体を含む、弱毒化微生物キャリアであって、該M. tuberculosis遺伝子の発現が、栄養飢餓ではなくそしてマイコバクテリアの対数増殖を支持する培養条件と比較した場合に、栄養飢餓でありそしてマイコバクテリアの潜伏性を維持する培養条件下で誘導またはアップレギュレートされ、該条件が、接種後少なくとも４０日間のM. tuberculosisマイコバクテリアのバッチ発酵によって得られ得、該M. tuberculosisペプチドが、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、および２８１からなる群より選択される、弱毒化微生物キャリア。
【請求項１４】
前記弱毒化微生物キャリアが、弱毒化サルモネラ菌、弱毒化ワクシニアウイルス、弱毒化鶏痘ウイルス、または弱毒化M. bovis（例えば、ＢＣＧ株）である、請求項１３に記載の弱毒化微生物キャリア。
【請求項１５】
プロモーター、ポリアデニル化シグナル、およびM. tuberculosis遺伝子のコード配列または該コード配列のフラグメントもしくは改変体もしくは誘導体であるＤＮＡ配列を含むＤＮＡプラスミドであって、該遺伝子の発現が、栄養飢餓ではなくそしてマイコバクテリアの対数増殖を支持する培養条件と比較した場合に、栄養飢餓でありそしてマイコバクテリアの潜伏性を維持する培養条件下で誘導またはアップレギュレートされ、該条件が、接種後少なくとも４０日間のM. tuberculosisマイコバクテリアのバッチ発酵によって得られ得、該プロモーターおよびポリアデニル化シグナルが、該ＤＮＡ配列に作動可能に連結され、該ＤＮＡ配列が、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、および２８２からなる群より選択される、ＤＮＡプラスミド。
【請求項１６】
前記プロモーターが、ＣＭＶプロモーターおよびＳＶ４０プロモーターからなる群より選択され、および／または前記ポリアデニル化シグナルが、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナルおよびウシ成長ホルモンポリアデニル化シグナルから選択される、請求項１５に記載のＤＮＡプラスミド。
【請求項１７】
ＤＮＡ配列によってコードされる単離されたＲＮＡ配列であって、該ＤＮＡ配列が、M. tuberculosis遺伝子のコード配列、または該ＤＮＡコード配列のフラグメントもしくは改変体もしくは誘導体であり、該M. tuberculosis遺伝子が、栄養飢餓ではなくそしてマイコバクテリアの対数増殖を支持する培養条件と比較した場合に、栄養飢餓でありそしてマイコバクテリアの潜伏性を維持する培養条件下でのM. tuberculosisマイコバクテリアの培養中に誘導またはアップレギュレートされ、該条件が、接種後少なくとも４０日間のM. tuberculosisマイコバクテリアのバッチ発酵によって得られ得、該ＤＮＡ配列が、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、および２８２からなる群より選択される、単離されたＲＮＡ配列。
【請求項１８】
請求項１７に記載のＲＮＡ配列および宿主細胞の染色体への組込み部位を含む、ＲＮＡベクター。
【請求項１９】
マイコバクテリア感染を治療または予防するための医薬品の製造における、
M. tuberculosisペプチドまたは該ペプチドのフラグメントもしくは改変体もしくは誘導体であって、該ペプチドが、M. tuberculosis遺伝子によってコードされ、該遺伝子の発現が、栄養飢餓ではなくそしてマイコバクテリアの対数増殖を支持する培養条件と比較した場合に、栄養飢餓でありそしてマイコバクテリアの潜伏性を維持する培養条件下で誘導またはアップレギュレートされ、該条件が、接種後少なくとも４０日間のM. tuberculosisマイコバクテリアのバッチ発酵によって得られ得、該ペプチドが、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、および２８１からなる群より選択される、M. tuberculosisペプチドまたは該ペプチドのフラグメントもしくは改変体もしくは誘導体；
請求項８から１０のいずれかに記載のインヒビター；
請求項１１に記載の抗体；
請求項１２に記載の弱毒化M. tuberculosisマイコバクテリア；
請求項１３または１４に記載の弱毒化微生物キャリア；
M. tuberculosis遺伝子のコード配列または該コード配列のフラグメントもしくは改変体もしくは誘導体であるＤＮＡ配列であって、該M. tuberculosis遺伝子が、栄養飢餓ではなくそして該マイコバクテリアの対数増殖を支持する培養条件と比較した場合に、栄養飢餓でありそしてマイコバクテリアの潜伏性を維持する培養条件下で誘導またはアップレギュレートされ、該条件が、接種後少なくとも４０日間のM. tuberculosisマイコバクテリアのバッチ発酵によって得られ得、該ＤＮＡ配列が、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、および２８２からなる群より選択される、ＤＮＡ配列；
請求項１５または１６に記載のＤＮＡプラスミド；
請求項１７に記載のＲＮＡ配列；および／または
請求項１８に記載のＲＮＡベクター；
の使用。
【請求項２０】
マイコバクテリア感染を同定するための診断試薬の製造における、
M. tuberculosisペプチドまたは該ペプチドのフラグメントもしくは改変体もしくは誘導体であって、該ペプチドが、M. tuberculosis遺伝子によってコードされ、該遺伝子の発現が、栄養飢餓ではなくそしてマイコバクテリアの対数増殖を支持する培養条件と比較した場合に、栄養飢餓でありそしてマイコバクテリアの潜伏性を維持する培養条件下で誘導またはアップレギュレートされ、該条件が、接種後少なくとも４０日間のM. tuberculosisマイコバクテリアのバッチ発酵によって得られ得、該ペプチドが、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、および２８１からなる群より選択される、M. tuberculosisペプチドまたは該ペプチドのフラグメントもしくは改変体もしくは誘導体；
請求項１１に記載の抗体；または
少なくとも８ヌクレオチドを含むポリヌクレオチドプローブであって、該プローブが、M. tuberculosis遺伝子の少なくとも一部に結合し、該遺伝子が、栄養飢餓ではなくそしてマイコバクテリアの対数増殖を支持する培養条件と比較した場合に、栄養飢餓でありそしてマイコバクテリアの潜伏性を維持する培養条件下で誘導またはアップレギュレートされ、該条件が、接種後少なくとも４０日間のM. tuberculosisマイコバクテリアのバッチ発酵によって得られ得、該遺伝子が、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、および２８２からなる群より選択されるＤＮＡ配列によってコードされる、プローブ；
の使用。