【手続補正書】
【提出日】平成17年3月7日(2005.3.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下からなる群より選択される1つまたは複数の成分を含有する、インビトロタンパク質合成系またはインビトロ核酸合成系：
高エネルギーリン酸結合の加水分解またはホスホジエステル結合の加水分解もしくは形成を触媒する少なくとも一種の酵素の活性が減少した細胞由来の、少なくとも一種の抽出物；
高エネルギーリン酸結合の加水分解またはホスホジエステル結合の加水分解もしくは形成を触媒する少なくとも一種の酵素の、少なくとも一種のインヒビター；および
合成のための化学的エネルギーを供給する、少なくとも二種のエネルギー源。
【請求項２】
細胞由来の少なくとも一種の抽出物について、少なくとも一種のヌクレアーゼの活性が減少している、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項３】
細胞由来の少なくとも一種の抽出物について、少なくとも一種のホスファターゼの活性が減少している、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項４】
細胞由来の少なくとも一種の抽出物について、少なくとも一種のポリメラーゼの活性が減少している、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項５】
少なくとも一種のインヒビターが少なくとも一種のヌクレアーゼを阻害する、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項６】
少なくとも一種のインヒビターが少なくとも一種のホスファターゼを阻害する、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項７】
少なくとも一種のインヒビターが少なくとも一種のポリメラーゼを阻害する、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項８】
鋳型がDNA鋳型であり、ヌクレアーゼがDNaseである、請求項2記載のインビトロ合成系。
【請求項９】
DNaseがDNAエキソヌクレアーゼである、請求項8記載のインビトロ合成系。
【請求項１０】
DNaseがDNAエンドヌクレアーゼである、請求項8記載のインビトロ合成系。
【請求項１１】
DNAエンドヌクレアーゼがエンドヌクレアーゼAである、請求項10記載のインビトロ合成系。
【請求項１２】
ヌクレアーゼがRNaseである、請求項2記載のインビトロ合成系。
【請求項１３】
RNaseがRNAエキソヌクレアーゼである、請求項12記載のインビトロ合成系。
【請求項１４】
RNaseがRNAエンドヌクレアーゼである、請求項12記載のインビトロ合成系。
【請求項１５】
エンドヌクレアーゼがRNase Eである、請求項14記載のインビトロ合成系。
【請求項１６】
DNA鋳型およびRNA鋳型からなる群より選択される少なくとも一種の核酸鋳型をさらに含む、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項１７】
少なくとも一種のDNA鋳型を含み、かつインビトロ転写/翻訳系である、請求項16記載のインビトロ合成系。
【請求項１８】
ホスファターゼがアルカリホスファターゼである、請求項3記載のインビトロ合成系。
【請求項１９】
少なくとも二種のエネルギー源が高エネルギー三リン酸化合物を生成または再生する、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項２０】
ピルビン酸、ホスホエノールピルビン酸（PEP）、カルバモイルリン酸、アセチルリン酸、クレアチンリン酸、ホスホピルビン酸、グリセルアルデヒド-3-リン酸、およびグルコース-6-リン酸からなる群より選択される少なくとも一種または複数の化合物を含む、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項２１】
細胞由来の少なくとも一種の抽出物について、OmpT、RNase E、アルカリホスファターゼ、およびエンドヌクレアーゼIからなる群より選択される少なくとも一種の酵素の活性が減少している、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項２２】
RNase IまたはRNase I*からなる群より選択される少なくとも一種の活性がさらに減少している、請求項21記載のインビトロ合成系。
【請求項２３】
合成のための化学的エネルギーを供給する少なくとも二種のエネルギー源を含む、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項２４】
ヌクレアーゼ、ポリメラーゼ、およびホスファターゼからなる群より選択される少なくとも一種の酵素の活性が減少した細胞由来の、少なくとも一種の抽出物をさらに含む、請求項23記載のインビトロ合成系。
【請求項２５】
ヌクレアーゼ、ポリメラーゼ、およびホスファターゼからなる群より選択される少なくとも一種の酵素の少なくとも一種のインヒビターをさらに含む、請求項23記載のインビトロ合成系。
【請求項２６】
少なくとも一種の酵素がRecBCDから選択され、少なくとも一種のインヒビターが少なくともGamである、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項２７】
少なくとも一種のインヒビターが少なくとも可溶性Gamである、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項２８】
一種または複数の核酸鋳型ならびに以下からなる群より選択される1つまたは複数の成分を含む、請求項1記載のインビトロ合成系：
鋳型を分解する酵素の少なくとも一種のインヒビター；および
鋳型に対する分解効果が減少した細胞の少なくとも一種の抽出物。
【請求項２９】
少なくとも一種のエネルギー源を含む、請求項28記載のインビトロ合成系。
【請求項３０】
少なくとも一種のエネルギー源が少なくとも二種の異なるエネルギー源を含み、その各々が合成のための高エネルギー三リン酸化合物を生成または再生する、請求項23記載のインビトロ合成系。
【請求項３１】
少なくとも二種の異なる化学的エネルギー源が、ピルビン酸、ホスホエノールピルビン酸（PEP）、カルバモイルリン酸、アセチルリン酸、クレアチンリン酸、ホスホピルビン酸、グリセルアルデヒド-3-リン酸、およびグルコース-6-リン酸からなる群より選択される、請求項30記載のインビトロ合成系。
【請求項３２】
少なくとも二種の異なる化学的エネルギー源が、少なくともPEPおよびアセチルリン酸を含む、請求項31記載のインビトロ合成系。
【請求項３３】
少なくとも一種の抽出物、少なくとも一種の核酸鋳型、および少なくとも一種のエネルギー源を含む、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項３４】
少なくとも一種のインヒビター、少なくとも一種の核酸鋳型、および少なくとも一種のエネルギー源を含む、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項３５】
少なくとも一種の核酸鋳型および少なくとも二種のエネルギー源を含む、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項３６】
少なくとも一種の抽出物を含む、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項３７】
少なくとも一種のインヒビターを含む、請求項1記載のインビトロ合成系。
【請求項３８】
以下からなる群より選択される1つまたは複数の成分を含有する組成物：
高エネルギーリン酸結合の加水分解またはホスホジエステル結合の加水分解もしくは形成を触媒する少なくとも一種の酵素の活性が減少した細胞由来の、少なくとも一種の抽出物；
高エネルギーリン酸結合の加水分解またはホスホジエステル結合の加水分解もしくは形成を触媒する少なくとも一種の酵素の、少なくとも一種のインヒビター；および
合成のための化学的エネルギーを供給する、少なくとも二種のエネルギー源。
【請求項３９】
以下からなる群より選択される1つまたは複数の成分を含有する組成物：
ヌクレアーゼ、ポリメラーゼ、およびホスファターゼからなる群より選択される少なくとも一種の酵素の活性が減少した細胞由来の、少なくとも一種の抽出物；
ヌクレアーゼ、ポリメラーゼ、およびホスファターゼからなる群より選択される少なくとも一種の酵素の、少なくとも一種のインヒビター；ならびに
合成のための化学的エネルギーを供給する、少なくとも二種のエネルギー源。
【請求項４０】
以下からなる群より選択される1つまたは複数の成分を含む、インビトロ合成のためのキット：
ヌクレアーゼ、ポリメラーゼ、およびホスファターゼからなる群より選択される少なくとも一種の酵素の活性が減少した細胞由来の、少なくとも一種の抽出物；
ヌクレアーゼ、ポリメラーゼ、およびホスファターゼからなる群より選択される少なくとも一種の酵素の、少なくとも一種のインヒビター；ならびに
合成のための化学的エネルギーを供給する、少なくとも二種のエネルギー源。
【請求項４１】
以下からなる群より選択される1つまたは複数の成分を含む、請求項40記載のキット：
少なくとも一種のRecBCDインヒビター；
ヌクレアーゼ、ポリメラーゼ、およびホスファターゼからなる群より選択される少なくとも一種の遺伝子に変異を有する少なくとも一種の細胞；
ヌクレアーゼ、ポリメラーゼ、およびホスファターゼからなる群より選択される少なくとも一種の遺伝子に変異を有する細胞の、少なくとも一種の抽出物；
ヌクレアーゼ、ポリメラーゼ、およびホスファターゼからなる群より選択される少なくとも一種の酵素のインヒビター；
合成のための少なくとも一種のエネルギー源；ならびに
少なくとも一種の細胞を増殖させるための培地。
【請求項４２】
インビトロ系において核酸鋳型からタンパク質または核酸を産生するための方法であって、以下の段階を含む方法：
高エネルギーリン酸結合の加水分解またはホスホジエステル結合の加水分解もしくは形成を触媒する少なくとも一種の酵素の活性が減少した細胞由来の、少なくとも一種の抽出物、
高エネルギーリン酸結合の加水分解またはホスホジエステル結合の加水分解もしくは形成を触媒する少なくとも一種の酵素の少なくとも一種のインヒビター、および
合成のための化学的エネルギーを供給する、少なくとも二種のエネルギー源
からなる群より選択される少なくとも1つの成分と鋳型とを接触させて、混合物を形成する段階；ならびに
混合物を、鋳型によってコードされる少なくとも一種のタンパク質を産生するのに十分な条件下でインキュベートする段階。
【請求項４３】
少なくとも一種の酵素が、OmpT、RNase E、アルカリホスファターゼ、およびエンドヌクレアーゼIからなる群より選択される、請求項42記載の方法。
【請求項４４】
インヒビターがGamである、請求項42記載の方法。
【請求項４５】
少なくとも二種のエネルギー源の各々が、タンパク質合成のための高エネルギー三リン酸化合物を生成または再生する、請求項40記載の方法。
【請求項４６】
少なくとも二種のエネルギー源が、ピルビン酸、ホスホエノールピルビン酸（PEP）、カルバモイルリン酸、アセチルリン酸、クレアチンリン酸、ホスホピルビン酸、グリセルアルデヒド-3-リン酸、およびグルコース-6-リン酸からなる群より選択される、請求項45記載の方法。
【請求項４７】
酵素がヌクレアーゼ、ホスファターゼ、およびポリメラーゼからなる群より選択される、請求項42記載の方法。
【請求項４８】
インビトロ合成系を構築するための方法であって、以下の段階を含む方法：
少なくとも一種の細胞抽出物を入手する段階；ならびに
高エネルギーリン酸結合の加水分解またはホスホジエステル結合の加水分解もしくは形成を触媒する、少なくとも一種の酵素の少なくとも一種のインヒビター、および
合成のための化学的エネルギーを供給する、少なくとも二種のエネルギー源
からなる群より選択される1つまたは複数の成分と、細胞抽出物とを混合する段階。
【請求項４９】
少なくとも一種の酵素が、ヌクレアーゼ、ホスファターゼ、およびポリメラーゼからなる群より選択される、請求項48記載の方法。
【請求項５０】
以下からなる群より選択される1つまたは複数の成分を含有する組成物：
i）高エネルギーリン酸結合の加水分解またはホスホジエステル結合の加水分解もしくは形成を触媒する少なくとも一種の酵素の活性が減少した細胞由来の、少なくとも一種の抽出物；
ii）高エネルギーリン酸結合の加水分解またはホスホジエステル結合の加水分解もしくは形成を触媒する少なくとも一種の酵素の少なくとも一種のインヒビター；および
iii）合成のための化学的エネルギーを供給する少なくとも2つのエネルギー源；ならびに
少なくとも一種の核酸鋳型の少なくとも部分的な合成生成物の存在下における、該少なくとも一種の核酸鋳型。
【請求項５１】
生成物が核酸生成物である、請求項50記載の組成物。
【請求項５２】
核酸生成物がDNAである、請求項51記載の組成物。
【請求項５３】
核酸生成物がRNAである、請求項51記載の組成物。