【手続補正書】
【提出日】平成17年4月26日(2005.4.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
イネの遺伝子において、配列番号１〜１７で表されるＳＳＲ配列を含む塩基配列から１種以上を増幅遺伝子マーカーとして選択して、各々の増幅遺伝子マーカーにて、下記（Ｂ）に示す品種の識別をすることにより、被験イネが、下記（Ａ）に示す品種から選ばれるいずれかの品種であることを識別する、イネの品種の識別方法。
（Ａ）
i)欧州品種として、「Italica Livorno」、「Dunghan Shali」、「Arroz Da Terra」「Ｆａｎｙ」または「USSR22」
ii)インド品種として、「Kasalath」
iii)日本品種として、「きたいぶき」、「はやまさり」、「日本晴」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、「彩」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、「栄光」、「マツマエ」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「農林１１号」、「北海早生」、「胆振早生」、「赤毛」、「はくちょうもち」または「たんねもち」
（Ｂ）
（１）配列番号１で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜iii)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「Kasalath」
ii）「きたいぶき」または「はやまさり」
iii)「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Arroz Da Terra」、「Ｆａｎｙ」、「USSR22」、「日本晴」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほのか224」、「彩」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、「栄光」、「マツマエ」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「農林１１号」、「北海早生」、「胆振早生」、「赤毛」、「はくちょうもち」または「たんねもち」
（２）配列番号２で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜iii)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「Kasalath」
ii）「はくちょうもち」または「たんねもち」
iii)「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Arroz Da Terra」、「Ｆａｎｙ」、「USSR22」、「日本晴」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほのか224」、「彩」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、「栄光」、「マツマエ」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「農林１１号」、「北海早生」、「胆振早生」または「赤毛」
（３）配列番号３で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜v)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「USSR22」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、「きらら397」、「ほしのゆめ」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、「栄光」、「マツマエ」、「農林１１号」、「北海早生」、「はくちょうもち」または「たんねもち」
ii)「Kasalath」
iii)「Italica Livorno」または「Arroz Da Terra」
iv)「Dunghan Shali」
v）「Ｆａｎｙ」、「日本晴」、「彩」、「ゆきまる」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「胆振早生」または「赤毛」
（４）配列番号４で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜iv)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「ほのか224 」または「はやまさり」
ii)「Kasalath」
iii)「Italica Livorno 」、「Ｆａｎｙ」、「USSR22」、「日本晴」、「コシヒカリ」、「亀の尾」、「彩」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「きたいぶき」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、「栄光」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「農林１１号」、「北海早生」、「赤毛」、「はくちょうもち」または「たんねもち」
iv)「Dunghan Shali 」または「Arroz Da Terra」
（５）配列番号５で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜iv)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「Kasalath」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、「きらら397」、「ほしのゆめ」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「マツマエ」、「農林１１号」、「北海早生」、「はくちょうもち」または「たんねもち」
ii) 「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Ｆａｎｙ」、「日本晴」、「彩」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、「栄光」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「胆振早生」または「赤毛」
iii)「Arroz Da Terra」
iv)「USSR22」
（６）配列番号６で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜iv)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「USSR22」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、「きらら397」、「ほしのゆめ」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「マツマエ」、「農林１１号」、「北海早生」、「はくちょうもち」または「たんねもち」
ii)「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Kasalath」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、「栄光」または「キヨカゼ」
iii)「Ｆａｎｙ」、「日本晴」または「彩」
iv)「Arroz Da Terra」
（７）配列番号７で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜iv)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「Kasalath」
ii）「はくちょうもち」または「たんね」
iii）「ほのか224 」、「きらら397 」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「栄光」、「農林１１号」または「北海早生」
iv)「Italica Livorno 」、「Dunghan Shali 」、「Arroz Da Terra」、「Ｆａｎｙ」、「USSR22」、「日本晴」、「コシヒカリ」、「亀ノ尾」、「彩」、「ほしのゆめ」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「巴まさり」、「マツマエ」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「胆振早生」または「赤毛」
（８）配列番号８で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜iv)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「Kasalath」
ii）「Italica Livorno 」
iii ）「Ｆａｎｙ」、「日本晴」または「彩」
iv) 「Dunghan Shali 」、「Arroz Da Terra」、「USSR22」、「コシヒカリ」
、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、「マツマエ」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「農林１１号」、「北海早生」、「胆振早生」、「赤毛」、「はくちょうもち」または「たんねもち」
（９）配列番号９で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜vi)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「Dunghan Shali 」、「Arroz Da Terra」、「USSR22」、「日本晴」、「亀ノ尾」、「ほのか224 」、「彩」、「はやまさり」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、はくちょうもち」または「たんねもち」
ii)「Kasalath」
iii)「コシヒカリ」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「きたいぶき」、「ゆきまる」、「巴まさり」、「栄光」、「マツマエ」または「キヨカゼ」
iv)「USSR22」、「農林３３号」、「農林２０号」、「農林１１号」、「胆振早生」または「赤毛」
ｖ）「北海早生」
vi)「Ｆａｎｙ」
（１０）配列番号１０で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜vii)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「Italica Livorno 」または「赤毛」
ii)「Dunghan Shali 」
iii)「Arroz Da Terra」
iv)「Ｆａｎｙ」、「Kasalath」、「日本晴」、「彩」、「キヨカゼ」または「北海早生」
ｖ)「コシヒカリ」、「亀の尾」、「巴まさり」または「マツマエ」
vi)「ほのか224 」または「キタヒカリ」
vii)「USSR22」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「きたいぶき」、「はやまさり」、「ゆきまる」、「キタアケ」、「栄光」、「農林３３号」、「農林２０号」、「農林１１号」、「胆振早生」、「はくちょうもち」または「たんねもち」
（１１）配列番号１１で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜vii)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「Italica Livorno 」、「Arroz Da Terra」または「Kasalath」
ii) 「Dunghan Shali 」
iii)「Ｆａｎｙ」、「日本晴」、「彩」、「きらら397 」、「きたいぶき」、
「はやまさり」、「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「栄光」または「キヨカゼ」
iv) 「USSR22」または「亀の尾」、「ほのか224 」、「マツマエ」、「農林３３号」、「農林１１号」、「胆振早生」、「はくちょうもち」または「たんねもち」
ｖ)「コシヒカリ」、「ほしのゆめ」または「農林２０号」
vi) 「北海早生」または「赤毛」
vii)「キタアケ」または「巴まさり」
（１２）配列番号１２で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜viii)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「Italica Livorno 」
ii) 「Dunghan Shali 」、「ほしのゆめ」、「巴まさり」または「キヨカゼ」
iii)「Arroz Da Terra」
iv) 「Ｆａｎｙ」、「日本晴」、「ほのか224 」、「彩」または「はやまさり」
ｖ)「USSR22」、「コシヒカリ」、「亀の尾」、「きらら397 」、「きたいぶき」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「栄光」、「マツマエ」、「農林１１号」、「赤毛」、「はくちょうもち」または「たんねもち」
vi)「Kasalath」
vii) 「ゆきまる」、「農林３３号」、「農林２０号」または「胆振早生」
viii)「北海早生」
（１３）配列番号１３又は１４で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜xi)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「コシヒカリ」、「ほのか224 」、「きらら397 」、「きたいぶき」または「はやまさり」
ii) 「Kasalath」
iii) 「Italica Livorno 」
iv) 「ゆきまる」、「キタヒカリ」、「キタアケ」、「巴まさり」、「栄光」
、「マツマエ」、「キヨカゼ」、「農林３３号」、「農林２０号」、「胆振早生」、「赤毛」、「はくちょうもち」または「たんねもち」
ｖ）「ほしのゆめ」
vi) 「日本晴」または「彩」
vii)「亀の尾」
viii) 「USSR22」
ix) 「Arroz Da Terra」または「農林１１号」
ｘ）「Dunghan Shali 」または「北海早生」
xi) 「Ｆａｎｙ」
（１４）配列番号１５で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜v)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「はやまさり」、「きたいぶき」または「農林２０号」
ii) 「Kasalath」
iii) 「Arroz Da Terra」、「Italica Livorno 」または「日本晴」
iv) 「きらら397」、「ほしのゆめ」または「キタアケ」
ｖ）「コシヒカリ」または「彩」
（１５）配列番号１６で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜v)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「はやまさり」、「きたいぶき」、「農林２０号」または「日本晴」
ii) 「Kasalath」
iii) 「Arroz Da Terra」または「Italica Livorno 」
iv) 「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「キタアケ」または「コシヒカリ」
ｖ）「彩」
（１６）配列番号１７で表される増幅遺伝子マーカーにより、被験イネが下記i)〜v)のいずれかの群に属する品種であることを識別する。
ｉ）「はやまさり」、「きたいぶき」、「きらら397 」、「ほしのゆめ」、「農林２０号」、「キタアケ」または「コシヒカリ」
ii)「Kasalath」
iii)「Italica Livorno 」
iv)「Arroz Da Terra」または「日本晴」
ｖ）「彩」
【請求項２】
前記品種の識別方法において、配列番号１〜１７で表されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を含む遺伝子領域の遺伝子増幅を行うためのセンスプライマーとアンチセンスプライマーとして、下記（１）〜（17）にて、センスプライマーの本質部分として示す配列番号のヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５'末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖をセンスプライマーとして用い、並びに、同じくアンチセンスプライマーの本質部分として示す配列番号のヌクレオチド鎖の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３'末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖をアンチセンスプライマーとして用いることにより得られる遺伝子増幅産物を指標として、被験イネの品種を識別することを特徴とする、請求項１記載のイネの品種の識別方法。
（１）配列番号１の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号１８に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号１９に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（２）配列番号２の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号２０に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号２１に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（３）配列番号３の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号２２に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号２３に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（４）配列番号４の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号２４に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号２５に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（５）配列番号５の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号２６に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号２７に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（６）配列番号６の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号２８に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号２９に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（７）配列番号７の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号３０に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号３１に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（８）配列番号８の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号３２に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号３３に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（９）配列番号９の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号３４に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号３５に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１０）配列番号１０の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号３６に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号３７に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１１）配列番号１１の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号３８に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号３９に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１２）配列番号１２の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号４０に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号４１に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１３）配列番号１３の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号４２に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号４３に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１４）配列番号１４の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号４４に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号４５に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１５）配列番号１５の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号４６に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号４７に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１６）配列番号１６の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号４８に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号４９に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１７）配列番号１７の遺伝子領域に対応するセンスプライマーの本質部分が配列番号５０に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーの本質部分が配列番号５１に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
【請求項３】
前記品種の識別方法において、配列番号１〜１７で表されるＳＳＲ配列を含む塩基配列を含む遺伝子領域の遺伝子増幅を行うためのセンスプライマーとアンチセンスプライマーとして、下記（１）〜（17）にて、センスプライマーとして示す配列番号のヌクレオチド鎖をセンスプライマーとして用い、並びに、同じくアンチセンスプライマーとして示す配列番号のヌクレオチド鎖をアンチセンスプライマーとして用いることにより得られる遺伝子増幅産物を指標として、被験イネの品種を識別することを特徴とする、請求項１又は２記載のイネの品種の識別方法。
（１）配列番号１の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号１８に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号１９に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（２）配列番号２の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号２０に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号２１に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（３）配列番号３の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号２２に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号２３に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（４）配列番号４の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号２４に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号２５に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（５）配列番号５の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号２６に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号２７に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（６）配列番号６の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号２８に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号２９に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（７）配列番号７の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号３０に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号３１に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（８）配列番号８の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号３２に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号３３に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（９）配列番号９の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号３４に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号３５に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１０）配列番号１０の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号３６に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号３７に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１１）配列番号１１の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号３８に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号３９に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１２）配列番号１２の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号４０に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号４１に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１３）配列番号１３の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号４２に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号４３に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１４）配列番号１４の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号４４に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号４５に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１５）配列番号１５の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号４６に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号４７に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１６）配列番号１６の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号４８に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号４９に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
（１７）配列番号１７の遺伝子領域に対応するセンスプライマーが配列番号５０に示す塩基配列のヌクレオチド鎖であり、アンチセンスプライマーが配列番号５１に示す塩基配列のヌクレオチド鎖である；
【請求項４】
イネの品種識別マーカーとして、配列番号１３、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１０及び配列番号１５を含む塩基配列を選択し、かつ、下記のステップ１〜５によりイネの品種の識別を行うことを特徴とする、請求項１〜３のいすれかに記載のイネの品種の識別方法。
（１）配列番号１３を含む塩基配列を第１のマーカーとして選択して、「カサラス」、「ＩＬ」、「ＦＡＮＹ」、「ほしのゆめ」、「亀の尾」および「Ｕ２２」を、それぞれ単独で識別するステップ１；
（２）ステップ１の識別結果を前提として、配列番号１１を含む塩基配列を第２のマーカーとして選択して、「北海早生」、「ＤＳ」、「ＡＤＴ」、「農林１１号」、「赤毛」、「農林２０号」、「コシヒカリ」および「ほのか224 」を、それぞれ単独で識別するステップ２；
（３）ステップ１〜２の識別結果を前提として、配列番号１２を含む塩基配列を第３のマーカーとして選択して、「キタアケ」、「巴まさり」、「キヨカゼ」、「ゆきまる」および「はやまさり」を、それぞれ単独で識別するステップ３；
（４）ステップ１〜３の識別結果を前提として、配列番号１０を含む塩基配列を第４のマーカーとして選択して、「キタヒカリ」、「栄光」、「マツマエ」、「はくちょうもち・たんねもち」の組、および、「農林３３号・胆振早生」の組を、それぞれ識別するステップ４；
（５）ステップ１〜４の識別結果を前提として、配列番号１５を含む塩基配列を第５のマーカーとして選択して、「きたいぶき」、「きらら397」、「日本晴」および「彩」を、それぞれ単独で識別するステップ５；
【請求項５】
イネの品種識別マーカーとして、配列番号１２、配列番号１１及び配列番号１５を含む塩基配列を選択し、かつ、下記のステップ１〜３によりイネの品種の識別を行うことを特徴とする、請求項１〜３のいずれかに記載のイネの品種の識別方法。
（１）配列番号１２を含む塩基配列を第１のマーカーとして選択して、「ほしのゆめ」および「ゆきまる」を、それぞれ単独で識別するステップ１；
（２）ステップ１の識別結果を前提として、配列番号１１を含む塩基配列を第２マーカーとして、「ほのか224 」、「きらら397 」、「はくちょうもち」および「コシヒカリ」を、それぞれ単独で識別するステップ２；
（３）ステップ１〜２の識別結果を前提として、配列番号１５を含む塩基配列を第３マーカーとして、「彩」および「日本晴」を、それぞれ単独で識別するステップ３；
【請求項６】
配列番号１〜１７で示す遺伝子領域を増幅するための遺伝子増幅用プライマーとして用いるための、下記（１）〜（17）にて、センスプライマーの本質部分として示す配列番号の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を５'末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖、並びに、同じくアンチセンスプライマーの本質部分として示す配列番号の塩基配列から選ばれる、連続した１５〜２０塩基のヌクレオチド鎖を３'末端側に含み、かつ、全体の塩基長が、１５〜５０塩基のヌクレオチド鎖の組、からなることを特徴とするプライマーセット。
（１）配列番号１の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号１８に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号１９に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（２）配列番号２の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号２０に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号２１に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（３）配列番号３の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号２２に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号２３に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（４）配列番号４の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号２４に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号２５に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（５）配列番号５の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号２６に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号２７に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（６）配列番号６の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号２８に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号２９に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（７）配列番号７の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号３０に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号３１に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（８）配列番号８の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号３２に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号３３に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（９）配列番号９の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号３４に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号３５に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１０）配列番号１０の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号３６に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号３７に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１１）配列番号１１の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号３８に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号３９に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１２）配列番号１２の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号４０に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号４１に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１３）配列番号１３の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号４２に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号４３に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１４）配列番号１４の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号４４に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号４５に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１５）配列番号１５の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号４６に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号４７に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１６）配列番号１６の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号４８に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号４９に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１７）配列番号１７の遺伝子領域を増幅するための、本質部分が配列番号５０に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、本質部分が配列番号５１に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
【請求項７】
配列番号１〜１７で示す遺伝子領域を増幅するための遺伝子増幅用プライマーとして用いるための、下記（１）〜（17）にて、センスプライマーとして示す配列番号の塩基配列のヌクレオチド鎖、並びに、同じくアンチセンスプライマーとして示す配列番号の塩基配列のヌクレオチド鎖の組、からなることを特徴とするプライマーセット。
（１）配列番号１の遺伝子領域を増幅するための、配列番号１８に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号１９に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（２）配列番号２の遺伝子領域を増幅するための、配列番号２０に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号２１に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（３）配列番号３の遺伝子領域を増幅するための、配列番号２２に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号２３に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（４）配列番号４の遺伝子領域を増幅するための、配列番号２４に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号２５に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（５）配列番号５の遺伝子領域を増幅するための、配列番号２６に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号２７に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（６）配列番号６の遺伝子領域を増幅するための、配列番号２８に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号２９に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（７）配列番号７の遺伝子領域を増幅するための、配列番号３０に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号３１に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（８）配列番号８の遺伝子領域を増幅するための、配列番号３２に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号３３に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（９）配列番号９の遺伝子領域を増幅するための、配列番号３４に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号３５に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１０）配列番号１０の遺伝子領域を増幅するための、配列番号３６に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号３７に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１１）配列番号１１の遺伝子領域を増幅するための、配列番号３８に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号３９に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１２）配列番号１２の遺伝子領域を増幅するための、配列番号４０に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号４１に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１３）配列番号１３の遺伝子領域を増幅するための、配列番号４２に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号４３に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１４）配列番号１４の遺伝子領域を増幅するための、配列番号４４に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号４５に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１５）配列番号１５の遺伝子領域を増幅するための、配列番号４６に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号４７に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１６）配列番号１６の遺伝子領域を増幅するための、配列番号４８に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号４９に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；
（１７）配列番号１７の遺伝子領域を増幅するための、配列番号５０に示す塩基配列のセンスプライマー用のヌクレオチド鎖、及び、配列番号５１に示す塩基配列のアンチセンスプライマー用のヌクレオチド鎖からなるプライマーセット；