【手続補正書】
【提出日】平成16年4月12日(2004.4.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  ライブラリー中の発現クローンを同定するスクリーニング方法であって、
ヌクレオチド配列の供給源を準備すること；
マーカーを含む発現ベクターを準備すること；
ヌクレオチド配列を発現ベクターに導入すること；
発現ベクターを宿主細胞に形質転換し、発現ライブラリーを創製すること；および
発現タンパク質と同時に発現されるマーカーを含んでなる融合タンパク質の発現を検出することにより発現クローンの所在を確認すること；
を含んでなる方法。
【請求項２】  発現したヌクレオチド配列を同定するためにヌクレオチド配列ライブラリーをスクリーニングする方法であって、
ヌクレオチド配列の供給源を準備すること；
マーカーを含む発現ベクターを準備すること；
ヌクレオチド配列を発現ベクターに導入することによりライブラリーを創製すること；
ヌクレオチド配列により翻訳される発現タンパク質と同時に発現されるマーカーを含んでなる融合タンパク質の存在を決定することにより、該発現ベクターにより発現される発現タンパク質遺伝子を同定すること；および
発現タンパク質のヌクレオチド配列を決定すること；
の工程を含む方法。
【請求項３】  ヌクレオチド配列サンプルからの抗原遺伝子配列を同定する方法であって、
マーカーを含む発現ベクターを準備すること；
サンプルからのヌクレオチド配列を発現ベクターに導入すること；
ヌクレオチド配列により翻訳される発現タンパク質と同時に発現されるマーカーを含んでなる融合タンパク質の存在を決定することにより、該発現ベクターにより発現される抗原発現タンパク質を同定すること；
抗原発現タンパク質を同定すること；および
発現ベクターによりエンコードされる抗原発現タンパク質の遺伝子配列を決定すること；
の工程を含んでなる方法。
【請求項４】  疾患の治療用抗原タンパク質をエンコードする治療用抗原遺伝子配列をヌクレオチド配列のサンプルから同定する方法であって、
マーカーを含む発現ベクターを準備すること；
サンプルからのヌクレオチド配列を発現ベクターに導入すること；
ヌクレオチド配列により翻訳される発現タンパク質と同時に発現されるマーカーを含んでなる融合タンパク質の存在を決定することにより、該発現ベクターにより発現される抗原発現タンパク質を同定すること；
抗原発現タンパク質を発現する該発現ベクターを動物に接種すること；
該動物に該疾患をチャレンジすること；
予防接種により誘発される治療効果を備えている発現ベクターと発現タンパク質を同定すること；および
発現ベクターによりエンコードされる抗原発現タンパク質の配列を決定すること；
の工程を含んでなる方法。
【請求項５】  該ライブラリーがマイコプラズマのポリペプチドに翻訳するヌクレオチド配列のライブラリーであって、当該方法が、
マイコプラズマのサンプルからヌクレオチド配列の供給源を準備すること；
マーカーを含む発現ベクターを準備すること；
ヌクレオチド配列を発現ベクターに導入すること；
ヌクレオチド配列により翻訳される発現タンパク質と同時に発現されるマーカーを含んでなる融合タンパク質の存在を決定することにより、発現ベクターにより発現されるマイコプラズマ発現タンパク質を同定すること；および
マイコプラズマの発現タンパク質のヌクレオチド配列を決定すること；
の工程を含んでなる請求項１ないし４のいずれかに記載の方法。
【請求項６】  マイコプラズマがマイコプラズマ・ハイオニューモニエ（Mycoplasma hyopneumoniae）である請求項５記載の方法。
【請求項７】  該マーカーがポリＨｉｓタグである請求項１ないし６のいずれか１つに記載方法。
【請求項８】  請求項２ないし７のいずれか１つに記載の方法により同定されるヌクレオチド配列。
【請求項９】  図１ないし４２、または配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７、配列番号７９、配列番号８１または配列番号８３のいずれか１つに記載の配列、またはその突然変異体、類似体、誘導体または機能的活性フラグメントを有するマイコプラズマのヌクレオチド配列。
【請求項１０】  請求項８記載のヌクレオチド配列を含む組換えベクター。
【請求項１１】  請求項９記載のヌクレオチド配列を含む組換えベクター。
【請求項１２】  請求項１０記載の組換えベクターを含む宿主細胞。
【請求項１３】  請求項１１記載の組換えベクターを含む宿主細胞。
【請求項１４】  図１ないし４２、または配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８、配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７２、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８、配列番号８０、配列番号８２または配列番号８４のいずれか１つに記載の配列、またはその突然変異体、類似体、誘導体または機能的活性フラグメントを有するマイコプラズマのアミノ酸配列。
【請求項１５】  請求項１４記載のアミノ酸配列によりエンコードされる単離精製ポリペプチド。
【請求項１６】  請求項８記載のヌクレオチド配列から翻訳される単離精製ポリペプチド。
【請求項１７】  請求項９記載のヌクレオチド配列から翻訳される単離精製ポリペプチド。
【請求項１８】  請求項１５記載のポリペプチドに特異的な抗体。
【請求項１９】  請求項１６記載のポリペプチドに特異的な抗体。
【請求項２０】  請求項１７記載のポリペプチドに特異的な抗体。
【請求項２１】  モノクローナル抗体である請求項１８、１９または２０記載の抗体。
【請求項２２】  感染の治療方法であって、請求項１５ないし１７のいずれかに記載の抗原性ポリペプチドの有効量を投与することを含む方法。
【請求項２３】  感染の治療方法であって、請求項８記載のヌクレオチド配列を含むＤＮＡ分子の有効量を必要とする動物に投与することを含む方法。
【請求項２４】  感染の治療方法であって、請求項９記載のヌクレオチド配列を含むＤＮＡ分子の有効量を必要とする動物に投与することを含む方法。
【請求項２５】  該ＤＮＡ分子が請求項１０または１１記載の組換えベクターを介して投与される請求項２３記載の方法。
【請求項２６】  感染の治療方法であって、請求項１８ないし２１のいずれか１つに記載の、ポリペプチドに特異的な抗体の有効量を投与することを含む方法。
【請求項２７】  該感染がマイコプラズマによる感染である請求項２２ないし２６のいずれかに記載の方法。
【請求項２８】  該感染がマイコプラズマ・ハイオニューモニエ（Mycoplasma hyopneumoniae）による感染である請求項２７記載の方法。
【請求項２９】  該ヌクレオチド配列が図１ないし４２、または配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７、配列番号７９、配列番号８１または配列番号８３のいずれか１つに記載の配列、またはその突然変異体、類似体、誘導体または機能的活性フラグメントを含んでなる請求項２３ないし２５、２７または２８のいずれか１つに記載の方法。
【請求項３０】  該ポリペプチドが図１ないし４２のいずれか、または配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８、配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７２、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８、配列番号８０、配列番号８２または配列番号８４のいずれか１つに記載のアミノ酸配列、またはその突然変異体、類似体、誘導体または機能的活性フラグメントによりエンコードされている請求項２２、２６ないし２８のいずれか１つに記載の方法。