【手続補正書】
【提出日】平成16年7月6日(2004.7.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
２つの別々のポリペプチド、サイトケラチン８ポリぺプチドおよびサイトケラチン１８ポリペプチドを含む単離された癌関連エピトープであって、該サイトケラチン８ポリペプチドが、配列番号３または配列番号５から本質的になり、そして該サイトケラチン１８ポリペプチドが、配列番号４または配列番号６から本質的になる、単離された癌関連エピトープ。
【請求項２】
請求項１に記載の単離されたエピトープであって、前記サイトケラチン８ポリペプチドが、約４７５アミノ酸よりも短く、そして前記サイトケラチン１８ポリペプチドが、約４２５アミノ酸よりも短い、単離されたエピトープ。
【請求項３】
請求項１に記載の単離されたエピトープであって、前記癌関連エピトープが、腺癌細胞の線維状細胞質構造において検出されるが、正常細胞において実質的に検出されない、単離されたエピトープ。
【請求項４】
請求項１に記載の単離されたエピトープであって、前記癌関連エピトープが、結腸腺癌細胞、卵巣腺癌細胞、腎腺癌細胞、乳腺癌細胞、肺腺癌細胞、膵臓腺癌細胞および非セミノーマ精巣癌細胞の線維状細胞質構造において検出される、単離されたエピトープ。
【請求項５】
２つの別々のポリペプチド、サイトケラチン８ポリぺプチドおよびサイトケラチン１８ポリペプチドを含む癌関連エピトープを含む腺癌を予防または処置するためのワクチン組成物であって、該サイトケラチン８ポリぺプチドが、配列番号３または配列番号５から本質的になり、そしてサイトケラチン１８ポリペプチドが、配列番号４または配列番号６から本質的になる、ワクチン組成物。
【請求項６】
請求項５に記載のワクチン組成物であって、前記サイトケラチン８ポリペプチドが、約４７５アミノ酸よりも短く、そして前記サイトケラチン１８ポリペプチドが、約４２５アミノ酸よりも短い、ワクチン組成物。
【請求項７】
請求項５に記載のワクチン組成物であって、前記腺癌が、結腸腺癌、卵巣腺癌、腎腺癌、乳腺癌、肺腺癌、膵臓腺癌または非セミノーマ精巣癌である、ワクチン組成物。
【請求項８】
２つの別々のポリペプチド、サイトケラチン８ポリぺプチドおよびサイトケラチン１８ポリペプチドを含む癌関連エピトープに結合し得る単離された結合実体ポリペプチドであって、該サイトケラチン８ポリペプチドが、配列番号３または配列番号５から本質的になり、そして該サイトケラチン１８ポリペプチドが、配列番号４または配列番号６から本質的になる、単離された結合実体ポリペプチド。
【請求項９】
請求項８に記載の単離された結合実体ポリペプチドであって、前記サイトケラチン８ポリペプチドが、約４７５アミノ酸よりも短く、そして前記サイトケラチン１８ポリペプチドが、約４２５アミノ酸よりも短い、単離された結合実体ポリペプチド。
【請求項１０】
請求項８に記載の単離された結合実体ポリペプチドであって、該結合実体ポリペプチドが、約４２５アミノ酸よりも短い、単離された結合実体ポリペプチド。
【請求項１１】
請求項８に記載の単離された結合実体ポリペプチドであって、該結合実体ポリペプチドが、約２００アミノ酸よりも短い、単離された結合実体ポリペプチド。
【請求項１２】
請求項８に記載の単離された結合実体ポリペプチドであって、該結合実体ポリペプチドが、抗体である、単離された結合実体ポリペプチド。
【請求項１３】
請求項８に記載の単離された結合実体ポリペプチドであって、該結合実体ポリペプチドが、腺癌細胞の線維状細胞質構造において癌関連エピトープを検出し得るが、正常細胞の線維状構造において実質的に検出し得ない、単離された結合実体ポリペプチド。
【請求項１４】
請求項８に記載の結合実体であって、該結合実体ポリペプチドが、結腸腺癌細胞、卵巣腺癌細胞、腎腺癌細胞、乳腺癌細胞、肺腺癌細胞、膵臓腺癌細胞および非セミノーマ精巣癌細胞の線維状細胞質構造において癌関連エピトープを検出し得る、結合実体。
【請求項１５】
請求項８に記載の結合実体であって、該結合実体ポリペプチドが、配列番号７〜３５のいずれか１つに少なくとも９８％相同なアミノ酸配列を有するポリペプチドから本質的になる、結合実体。
【請求項１６】
請求項８に記載の結合実体であって、該結合実体が、配列番号７〜３５または配列番号４７〜４９のいずれか１つを有するポリペプチドから本質的になる、結合実体。
【請求項１７】
請求項８に記載の結合実体であって、該結合実体が、配列番号３６〜３９のいずれか１つを含む核酸によってコードされる、結合実体。
【請求項１８】
癌を検出するためのキットであって、該キットは、癌関連エピトープに結合し得る結合実体ポリペプチドを含む容器を備え、該癌関連エピトープが、２つの別々のポリペプチド、サイトケラチン８ポリぺプチドおよびサイトケラチン１８ポリペプチドを含み、該サイトケラチン８ポリペプチドが、配列番号３または配列番号５から本質的になり、そして該サイトケラチン１８ポリペプチドが、配列番号４または配列番号６から本質的になる、キット。
【請求項１９】
請求項１８に記載のキットであって、前記サイトケラチン８ポリペプチドが、約４７５アミノ酸よりも短く、そして前記サイトケラチン１８ポリペプチドが、約４２５アミノ酸よりも短い、キット。
【請求項２０】
請求項１８に記載のキットであって、前記結合実体ポリペプチドが、約４２５アミノ酸よりも短い、キット。
【請求項２１】
請求項１８に記載のキットであって、前記結合実体ポリペプチドが、約２００アミノ酸よりも短い、キット。
【請求項２２】
請求項１８に記載のキットであって、前記結合実体ポリペプチドが、抗体である、キット。
【請求項２３】
請求項１８に記載のキットであって、前記癌が、腺癌である、キット。
【請求項２４】
請求項１８に記載のキットであって、前記癌が、結腸腺癌、卵巣腺癌、腎腺癌、乳腺癌、肺腺癌、膵臓腺癌または非セミノーマ精巣癌である、キット。
【請求項２５】
請求項１８に記載のキットであって、前記結合実体ポリペプチドが、標識または診断画像化剤をさらに含む、キット。
【請求項２６】
請求項１８に記載のキットであって、前記結合実体ポリペプチドが、硫酸バリウム、ヨーセタム酸、ヨーパン酸、イポデートカルシウム、ジアトリゾエートナトリウム、ジアトリゾエートメグルミン、メトリザマイド、チロパノエートナトリウム、フッ素−１８、炭素−１１、ヨウ素−１２３、テクネチウム−９９ｍ、ヨウ素−１３１、インジウム−１１１、フッ素、ガドリニウム、フルオレセイン、イソチオシアレート、ローダミン、フィコエリトリン、フィコシアニン、アロフィコシアニン、オプトアルデヒド、フルオレサミン、ルミナル、イソルミナル、ルシフェリン、ルシフェラーゼ、またはエクオリンをさらに含む、キット。
【請求項２７】
請求項１８に記載のキットであって、前記結合実体が、配列番号７〜３５のいずれか１つに少なくとも９８％相同性を有するアミノ酸配列を有するポリペプチドから本質的になる、キット。
【請求項２８】
請求項１８に記載のキットであって、前記結合実体が、配列番号７〜３５または配列番号４７〜４９のいずれか１つを有するポリペプチドから本質的になる、キット。
【請求項２９】
請求項１８に記載のキットであって、前記結合実体が、配列番号３６〜３９のいずれか１つを含む核酸によってコードされる、キット。
【請求項３０】
結合実体ポリペプチドおよび薬学的に受容可能なキャリアを含有する治療組成物であって、該結合実体ポリペプチドが、２つの別々のポリペプチド、サイトケラチン８ポリぺプチドおよびサイトケラチン１８ポリペプチドを含む癌関連エピトープに結合し得、該サイトケラチン８ポリペプチドが、配列番号３または配列番号５を含み、そして該サイトケラチン１８ポリペプチドが、配列番号４または配列番号６を含む、治療組成物。
【請求項３１】
請求項３０に記載の治療組成物であって、前記サイトケラチン８ポリペプチドが、約４７５アミノ酸よりも短く、そして前記サイトケラチン１８ポリペプチドが、約４２５アミノ酸よりも短い、治療組成物。
【請求項３２】
請求項３０に記載の治療組成物であって、前記結合実体ポリペプチドが、約４２５アミノ酸よりも短い、治療組成物。
【請求項３３】
請求項３０に記載の治療組成物であって、前記結合実体ポリペプチドが、約２００アミノ酸よりも短い、治療組成物。
【請求項３４】
請求項３０に記載の治療組成物であって、前記結合実体ポリペプチドが、抗体である、治療組成物。
【請求項３５】
請求項３０に記載の治療組成物であって、前記結合実体が、腺癌細胞の線維状細胞質構造において前記癌関連エピトープに結合し得るが、正常細胞の線維状構造において実質的に結合し得ない、治療組成物。
【請求項３６】
請求項３０に記載の治療組成物であって、前記結合実体が、結腸腺癌細胞、卵巣腺癌細胞、腎腺癌細胞、乳腺癌細胞、肺腺癌細胞、膵臓腺癌細胞および非セミノーマ精巣癌細胞の線維状細胞質構造において、前記癌関連エピトープに結合し得る、治療組成物。
【請求項３７】
請求項３０に記載の治療組成物であって、ここで、前記結合実体が、配列番号７〜３５のいずれか１つに対して少なくとも９８％相同なアミノ酸配列を有するポリペプチドから本質的になる、治療組成物。
【請求項３８】
請求項３０に記載の治療組成物であって、ここで、前記結合実体が、配列番号７〜３５または配列番号４７〜４９のいずれか１つを有するポリペプチドから本質的になる、治療組成物。
【請求項３９】
請求項３０に記載の治療組成物であって、ここで、前記結合実体が、配列番号３６〜３９のいずれか１つを含む核酸によってコードされる、治療組成物。
【請求項４０】
腺癌を処置するための治療組成物であって、該組成物は、Ｘａａ１ＳＲ↓Ｘａａ４（配列番号４０）を切断するプロテアーゼのインヒビターおよび薬学的に受容可能なキャリアを含有し、ここで、Ｘａａ１は、セリン、フェニルアラニンまたはバリンであり、そしてＸａａ４は、セリンまたはバリンである、治療組成物。
【請求項４１】
請求項４０に記載の治療組成物であって、ここで、前記プロテアーゼは、トリプシン様プロテアーゼである、治療組成物。
【請求項４２】
請求項４０に記載の治療組成物であって、ここで、前記インヒビターは、ダイズトリプシンインヒビター、α−２−マクログロブリン、α−１−アンチトリプシン、アプロチニン、膵分泌性トリプシンインヒビター、コーントリプシンインヒビター、カボチャトリプシンインヒビターまたはヒトアミロイドβ−タンパク質前駆体インヒビターである、治療組成物。
【請求項４３】
請求項４０に記載の治療組成物であって、ここで、前記腺癌が、結腸腺癌、卵巣腺癌、直腸腺癌、乳腺癌、肺腺癌、膵臓腺癌または非セミノーマ精巣癌である、治療組成物。
【請求項４４】
腺癌を検出する方法であって、該方法は、
試験サンプルと結合実体ポリペプチドを接触させる工程、および
該結合実体ポリペプチドが、サイトケラチン８ポリペプチドおよびサイトケラチン１８ポリペプチドの２つの別々のポリペプチドを含むエピトープに結合するかどうかを検出する工程
を包含し、ここで、該サイトケラチン８ポリペプチドは、配列番号３または配列番号５から本質的になり、そして該サイトケラチン１８ポリペプチドは、配列番号４または配列番号６から本質的になる、方法。
【請求項４５】
請求項４４に記載の方法であって、ここで、前記サイトケラチン８ポリペプチドが、約４７５アミノ酸より短く、そして前記サイトケラチン１８ポリペプチドが、約４２５アミノ酸より短い、方法。
【請求項４６】
請求項４４に記載の方法であって、ここで、前記結合実体ポリペプチドが、約４２５アミノ酸より短い、方法。
【請求項４７】
請求項４４に記載の方法であって、ここで、前記結合実体ポリペプチドが、約２００アミノ酸より短い、方法。
【請求項４８】
請求項４４に記載の方法であって、ここで、前記結合実体ポリペプチドが、抗体である、方法。
【請求項４９】
請求項４４に記載の方法であって、ここで、前記結合実体が、配列番号７〜３５のいずれか１つに対して少なくとも９８％相同なアミノ酸配列を有するポリペプチドから本質的になる、方法。
【請求項５０】
請求項４４に記載の方法であって、ここで、前記結合実体が、配列番号７〜３５または配列番号４７〜４９のいずれか１つを有するポリペプチドから本質的になる、方法。
【請求項５１】
請求項４４に記載の方法であって、ここで、前記結合実体が、配列番号３６〜３９のいずれか１つを含む核酸によってコードされる、方法。
【請求項５２】
請求項４４に記載の方法であって、ここで、前記腺癌が、結腸腺癌、卵巣腺癌、直腸腺癌、乳腺癌、肺腺癌、膵臓腺癌または非セミノーマ精巣癌である、方法。
【請求項５３】
請求項４４に記載の方法であって、ここで、前記結合実体が、標識薬剤または診断画像化剤をさらに含む、方法。
【請求項５４】
請求項４４に記載の方法であって、ここで、前記結合実体が、硫酸バリウム、ヨーセタム酸、ヨーパン酸、イポデートカルシウム、ジアトリゾエートナトリウム、メグルミンジアトリゾエート、メトリザマイド、チロパノエートナトリウム、フッ素−１８、炭素−１１、ヨウ素−１２３、テクネチウム−９９ｍ、ヨウ素−１３１、インジウム−１１１、フッ素、ガドリニウム、フルオレセイン、イソチオシアネート、ローダミン、フィコエリトリン、アロフィコシアニン、オプトアルデヒド、フルオレスカミン、ルミナル、イソルミナル、ルシフェリン、ルシフェラーゼまたはエクオリンをさらに含む、方法。
【請求項５５】
哺乳動物において癌を処置または予防するための組成物であって、該組成物が、抗新生物形成剤に連結された治療有効量の結合実体ポリペプチドを含有し、ここで、該結合実体ポリペプチドが、サイトケラチン８ポリペプチドおよびサイトケラチン１８ポリペプチドの２つの別個のポリペプチドを含む癌関連エピトープに結合し得、そしてここで、該サイトケラチン８ポリペプチドが、配列番号３または配列番号５を含み、そして該サイトケラチン１８ポリペプチドが、配列番号４または配列番号６を含む、組成物。
【請求項５６】
請求項５５に記載の組成物であって、ここで、前記サイトケラチン８ポリペプチドが、約４７５アミノ酸より短く、そして前記サイトケラチン１８ポリペプチドが、約４２５アミノ酸より短い、組成物。
【請求項５７】
請求項５５に記載の組成物であって、ここで、前記結合実体ポリペプチドが、約４２５アミノ酸より短い、組成物。
【請求項５８】
請求項５５に記載の組成物であって、ここで、前記結合実体ポリペプチドが、約２００アミノ酸より短い、組成物。
【請求項５９】
請求項５５に記載の組成物であって、ここで、前記結合実体ポリペプチドが、抗体である、組成物。
【請求項６０】
請求項５５に記載の組成物であって、ここで、前記抗新生物薬剤が、放射性ヨウ素化化合物、毒素、細胞増殖抑制性薬物、または細胞分解性薬物である、組成物。
【請求項６１】
請求項５５に記載の組成物であって、ここで、前記抗新生物薬剤が、アミノグルテチミド、アザチオプリン、硫酸ブレオマイシン、ブスルファン、カルムスチン、クロラムブシル、シスプラチン、シクロホスファミド、シクロスポリン、シタラビン、ダカルバジン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、タキソール、エトポシド、フルオロウラシル、インターフェロン−α、ロムスチン、メルカプトプリン、メトトレキサート、ミトーテン、プロカルバジンＨＣｌ、チオグアニン、硫酸ビンブラスチン、硫酸ビンクリスチン、アメリカヤマゴボウ抗ウイルスタンパク質、コレラ毒素、百日咳毒素、リシン、ゲロニン、アブリン、ジフテリア外毒素、シュードモナス外毒素またはコバルト６０である、組成物。
【請求項６２】
請求項５５に記載の組成物であって、ここで、前記結合実体が、配列番号２０〜３５のいずれか１つに対して少なくとも９８％相同なアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む、組成物。
【請求項６３】
請求項５５に記載の組成物であって、ここで、前記結合実体が、配列番号７〜３５または配列番号４７〜４９のいずれか１つを有するポリペプチドを含む、組成物。
【請求項６４】
請求項５５に記載の組成物であって、ここで、前記結合実体が、配列番号３６〜３９のいずれか１つを含む核酸によってコードされる、組成物。
【請求項６５】
変異体結合実体を同定するための方法であって、該方法は、
配列番号７〜３５のいずれか１つを有するポリペプチドをコードする核酸を、提示タンパク質をコードする核酸に融合し、融合タンパク質をコードする組換え核酸を生成する工程；
該融合タンパク質をコードする組換え核酸を変異させ、変異融合タンパク質をコードする変異核酸を生成する工程；
該変異融合タンパク質を発現する工程；および
２つの別個のポリペプチドを含む癌関連エピトープに結合し得る変異融合タンパク質を選択する工程であって、該２つの別個のポリペプチドが、配列番号３のサイトケラチン８を含む第１のポリペプチドおよび配列番号４のサイトケラチン１８を含む第２のポリペプチドを含む、工程、
を包含する、方法。
【請求項６６】
請求項６５に記載の方法であって、ここで、前記結合実体が、ＣＤＲフラグメントまたはＦａｂフラグメントである、方法。
【請求項６７】
請求項６５に記載の方法であって、ここで、前記提示タンパク質が、ファージ提示タンパク質、レトロウイルス提示タンパク質、またはリボソーム提示タンパク質である、方法。
【請求項６８】
哺乳動物において癌を処置および／または予防する医薬の調製のための請求項３０の治療組成物の使用。
【請求項６９】
哺乳動物において癌を処置および／または予防する医薬の調製のための請求項４０の治療組成物の使用。
【請求項７０】
哺乳動物において癌を処置および／または予防するための医薬であって、請求項３０に記載の治療組成物を含有する、医薬。
【請求項７１】
哺乳動物において癌を処置および／または予防するための医薬であって、請求項４０に記載の治療組成物を含有する、医薬。