【手続補正書】
【提出日】平成16年11月26日(2004.11.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
所定の生物学的症状に関連するターゲットを特定するための、コンピュータにより実行される方法であって、以下の：
上記コンピュータを使用して、集団の病歴に関する保存データを分析し；
上記コンピュータを使用して、上記集団の医学的検査結果に関する保存データを分析し；
上記病歴に関するデータと上記医学的検査結果に関するデータのコンピュータ分析に基づき、上記集団を所定の生物学的症状によるリスクあり、かつ、罹患ありと規定された表現型亜集団（ARA）、又は所定の生物学的症状によるリスクあり、かつ、罹患なしと規定された表現型亜集団（ARU）に分類し；
上記ARA表現型亜集団及び上記ARU表現形式亜集団由来の遺伝学的データのコンピュータ分析を実施して、それらの間の遺伝的差異を特定し；
上記のARA表現型亜集団とARU表現形式亜集団の間の特定された遺伝的差異に関するデータを使用して、所定の生物学的症状に関連するターゲットを特定する；
を含む前記方法。
【請求項２】
前記の病歴データと医学的検査結果データのコンピュータ分析が、病歴と医学的検査結果に関連する統計データを作成することをさらに含み、ここで、前記の集団の分類が、上記統計データを分析することを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記の病歴のコンピュータ分析が、所定の生物学的症状に関連する所定の症状に対して数値スコアを割り当てることを含む、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４】
前記の医学的検査結果のコンピュータ分析が、所定の生物学的症状に関連する所定の医学的検査に対して数値スコアを割り当てることを含む、請求項１〜3のいずれか1項に記載の方法。
【請求項５】
前記の集団の分類が、病歴と医学的検査結果の数値スコアを評価することを含む、請求項３又は４に記載の方法。
【請求項６】
前記の集団の分類が、病歴と医学的検査結果の数値スコアを組み合わせ、そしてその組み合わせた数値スコアに基づき上記集団を分類することを含む、請求項３〜５のいずれか1項に記載の方法。
【請求項７】
前記の病歴と医学的検査結果の数値スコアに関する統計データを作成することをさらに含み、ここで、前記の集団の分類が、上記統計データを分析することを含む、請求項３〜６のいずれか1項に記載の方法。
【請求項８】
前記統計データが、病歴と医学的検査結果の数値スコアに関する度数分布プロットの作成を含む、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記のARUに分類された亜集団の病歴及び医学的検査結果と、前記のARAに分類された亜集団の病歴及び医学的検査結果とを比較することを含む、請求項１〜８のいずれか1項に記載の方法。
【請求項１０】
前記のARAに分類された亜集団の一部を選び、そしてその選択された一部を対照群として使用することをさらに含む、請求項１〜９のいずれか1項に記載の方法。
【請求項１１】
前記の集団の分類が、前記ARA亜集団、前記ARU亜集団、又は所定の生物学的症状によるリスク不明、かつ、罹患なしに分類される亜集団（URU）に上記集団を分類することをさらに含む、請求項１〜１０のいずれか1項に記載の方法。
【請求項１２】
前記のARUに分類された亜集団の病歴及び医学的検査結果と、前記のURUに分類された亜集団の病歴及び医学的検査結果とを比較することをさらに含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記医学的検査結果が、遺伝子検査結果を含み、当該方法が、前記のARUに分類された亜集団の遺伝子検査結果と、前記のURUに分類された亜集団の遺伝子検査結果とを比較することをさらに含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１４】
前記のARUに分類された亜集団の遺伝子検査結果と、前記のURUに分類された亜集団の遺伝子検査結果の間の遺伝的差異を決定することをさらに含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記のARUに分類された亜集団の遺伝子検査結果と、前記のURUに分類された亜集団の遺伝子検査結果の間の遺伝的差異に基づき、遺伝子治療薬のターゲットを特定することをさらに含む、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記ターゲットの特定が、前記のARUに分類された被検者群の遺伝子検査結果と、前記のARAに分類された被検者群の遺伝子検査結果の間の遺伝的差異に基づき遺伝子治療薬のターゲットを特定することを含む、請求項１〜１５のいずれか1項に記載の方法。
【請求項１７】
前記ターゲットの特定が、前記のARUに分類された被検者群の遺伝子検査結果と、前記のARAに分類された被検者群の遺伝子検査結果の間の遺伝的差異に基づき診断アッセイを特定することを含む、請求項１〜１６のいずれか1項に記載の方法。
【請求項１８】
前記ターゲットの特定が、前記のARUに分類された被検者群の遺伝子検査結果と、前記のARAに分類された被検者群の遺伝子検査結果の間の遺伝的差異に基づきワクチン成分を特定することを含む、請求項１〜１７のいずれか1項に記載の方法。
【請求項１９】
前記の所定の生物学的症状に関連した医学的検査を含んだ所定の生物学的症状の疾患特性の規定をさらに含む、請求項１〜１８のいずれか1項に記載の方法。
【請求項２０】
前記の所定の生物学的症状のリスク特性を規定し、そしてそのリスク特性に基づき複数の被検者のそれぞれのリスク状態を決定することをさらに含む、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記の所定の生物学的症状の規定された特徴に関して、複数の被検者由来の生物学的サンプルに対して実施された医学的検査に基づき、医学的検査結果を分析することをさらに含む、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
前記生物学的サンプルに対する医学的検査に基づく医学的検査結果の分析に基づき複数の被検者のそれぞれの罹患状態を決定し、そして上記罹患状態と前記リスク状態に基づき上記の複数の被検者のそれぞれを所定の生物学的症状について所定のカテゴリーに分類することをさらに含む、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記の所定の生物学的症状の規定された疾患特性が、関連付けられた数値スコアを有し、かつ、前記の複数の被検者のそれぞれの罹患状態の決定が、前記医学的検査結果の分析に基づき数値スコアを決定することを含む、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記の所定の生物学的症状の規定されたリスク特性が、関連付けられた数値スコアを有し、かつ、複数の被検者のそれぞれのリスク状態の決定が、数値スコアを決定することを含む、請求項２２に記載の方法。
【請求項２５】
前記の所定の生物学的症状の規定された疾患特性が、関連付けられた数値スコアを有し、かつ、上記の所定の生物学的症状の規定されたリスク特性が、関連付けられた数値スコアを有し、前記の複数の被検者のそれぞれの所定のカテゴリーへの分類が、罹患状態とリスク状態についての数値スコアに基づく、請求項２２に記載の方法。
【請求項２６】
罹患状態とリスク状態についての数値スコアが、組み合わされて総合数値スコアを形成し、前記の複数の被検者のそれぞれの所定のカテゴリーへの分類が、罹患状態とリスク状態についての総合数値スコアに基づく、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
前記生物学的症状についての医学的検査が、疾患特性を規定する上で種々の重要度を有し、当該方法が、重要度に基づき医学的検査に重要度の重み因子を割り当てるステップをさらに含み、罹患状態が、この重み付けされた上記医学的検査に基づく、請求項２２に記載の方法。
【請求項２８】
前記罹患状態と前記リスク状態に関する統計データを作成することをさらに含み、ここで、前記の複数の被検者のそれぞれを所定のカテゴリーへの分類が、上記統計データの分析を含む、請求項２２に記載の方法。
【請求項２９】
前記の複数の被検者が、リスクあり、かつ、罹患あり（ARA）、及びリスクあり、かつ、罹患なし（ARU）から選ばれるカテゴリーに分類される、請求項２２に記載の方法。
【請求項３０】
前記リスク状態が、前記の複数の被検者の病歴の少なくとも一部から決定され、当該方法が、前記のARUに分類された被検者群の病歴及び医学的検査結果と、前記のARAに分類された被検者群の病歴及び医学的検査結果とを比較することをさらに含む、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
前記医学的検査結果が、遺伝子検査結果を含み、当該方法が、前記のARUに分類される被検者群の遺伝子検査結果と、前記のARAに分類される被検者群の遺伝子検査結果とを比較することをさらに含む、請求項２９に記載の方法。
【請求項３２】
前記のARUに分類された被検者群の遺伝子検査結果と、前記のARAに分類された被検者群の遺伝子検査結果との間の遺伝的差異を決定することをさらに含む、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記のARUに分類された被検者群の遺伝子検査結果と、前記のARAに分類された被検者群の遺伝子検査結果の間の遺伝的差異に基づき遺伝子治療薬のターゲットを特定することをさらに含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
前記のARUに分類された被検者群の遺伝子検査結果と、前記のARAに分類された被検者群の遺伝子検査結果の間の遺伝的差異に基づき診断アッセイを特定することをさらに含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３５】
前記のARUに分類された被検者群の遺伝子検査結果と、前記のARAに分類された被検者群の遺伝子検査結果の間の遺伝的差異に基づきワクチン成分を特定することをさらに含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３６】
前記の複数の被検者が、リスクあり、かつ、罹患あり（ARA）、リスク不明、かつ、罹患なし（URU）、及びリスクあり、かつ、罹患なし（ARU）から選ばれるカテゴリーに分類される、請求項２２に記載の方法。
【請求項３７】
前記リスク状態が、前記の複数の被検者の病歴の少なくとも一部から決定され、当該方法が、前記のARUに分類された被検者群の病歴及び医学的検査結果と、前記のURUに分類された被検者群の病歴及び医学的検査結果とを比較することを含む、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
前記医学的検査結果が、遺伝子検査結果を含み、当該方法が、前記のARUに分類される被検者群の遺伝子検査結果と、前記のURUに分類される被検者群の遺伝子検査結果とを比較することをさらに含む、請求項３６に記載の方法。
【請求項３９】
前記のARUに分類された被検者群の遺伝子検査結果と、前記のURUに分類された被検者群の遺伝子検査結果の間の遺伝的差異を決定することをさらに含む、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
前記のARUに分類された被検者群の遺伝子検査結果と、前記のURUに分類された被検者群の遺伝子検査結果の間の遺伝的差異に基づき遺伝子治療薬のターゲットを特定することをさらに含む、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
前記のARUに分類された被検者群の遺伝子検査結果と、前記のURUに分類された被検者群の遺伝子検査結果の間の遺伝的差異に基づき診断アッセイを特定することをさらに含む、請求項４０に記載の方法。
【請求項４２】
前記のARUに分類された被検者群の遺伝子検査結果と、前記のURUに分類された被検者群の遺伝子検査結果の間の遺伝的差異に基づきワクチン成分を特定することをさらに含む、請求項４０に記載の方法。
【請求項４３】
所定の集団を特定するデータ分析用装置であって、以下の：
所定の生物学的症状に関連した医学的検査を含めた所定の生物学的症状の疾患特性を規定する数値データを含む罹患状態データ構造；
所定の生物学的症状の疾患リスク特性を規定する数値データを含む疾患リスク・データ構造；及び
以下の：
複数の被検者の医学的検査結果を受け入れ、そして所定の生物学的症状の疾患特性を規定する数値データに基づき上記医学的検査結果に罹患状態の数値スコアを割り当て；
各被検者についての罹患状態の数値スコアを上記罹患状態のデータ構造内に記憶し；
複数の被検者からの病歴データを受け入れ、そして所定の生物学的症状の疾患リスク特性を規定する数値データに基づき上記病歴に疾患リスクの数値スコアを割り当て；
各被検者についての疾患リスクの数値スコアを疾患リスク・データ構造内に記憶し；そして
罹患状態の数値スコアと疾患リスクの数値スコアそれぞれに基づき各被検者についての罹患状態とリスク状態を決定する；
ためのプロセッサ；
を含む前記装置。
【請求項４４】
前記プロセッサが、罹患状態とリスク状態の数値スコアを組み合わせて総合数値スコアを作成し、前記の複数の被検者のそれぞれを、罹患状態とリスク状態についての総合数値スコアに基づき、所定のカテゴリーに分類することをさらに含む、請求項４３に記載の装置。
【請求項４５】
前記の所定の生物学的症状に関連した医学的検査が、疾患特性を規定する上で種々の重要度を有し、前記プロセッサが、重要度に基づき上記医学的検査に重要度の重み因子をさらに割り当て、重み付けされた上記医学的検査に基づき罹患状態を決定する、請求項４３に記載の装置。
【請求項４６】
前記プロセッサが、罹患状態とリスク状態に関連した統計データをさらに作成し、前記の複数の被検者のそれぞれを、上記統計データの分析に基づく罹患状態とリスク状態のについての総合数値データに基づき所定のカテゴリーに分類する、請求項４３に記載の装置。
【請求項４７】
前記プロセッサが、前記の複数の被検者のそれぞれを、リスクあり、かつ、罹患なし（ARA）及びリスクあり、かつ、罹患なし（ARU）を含むカテゴリー群から選ばれる所定のカテゴリーに分類する、請求項４４に記載の装置。
【請求項４８】
前記のプロセッサが、前記の複数の被検者のそれぞれを、リスクあり、かつ、罹患なし（ARA）、リスク不明、かつ、罹患なし（URU）、及びリスクあり、かつ、罹患なし（ARU）を含むカテゴリー群から選ばれる所定のカテゴリーに分類する、請求項４４に記載の装置。