【手続補正書】
【提出日】平成16年11月1日(2004.11.1)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
第１固定化成分をもつ第１表面または表面の領域および第２固定化成分をもつ第２表面または表面の領域を、固定化スピーシーズをもつコロイド粒子に曝すこと；および
当該第１または第２表面または領域への当該コロイド粒子の固定化を決定すること：
を含む方法。
【請求項２】
当該第１表面および第２表面が接続されている請求項１の方法。
【請求項３】
当該第１表面および第２表面の少なくとも１つが実質的に平坦である請求項１の方法。
【請求項４】
当該第１表面が当該第２表面から分離している請求項１の方法。
【請求項５】
当該第１表面および当該第２表面の少なくとも１つがビーズを含む請求項１の方法。
【請求項６】
当該ビーズがイオン交換樹脂を含む請求項５の方法。
【請求項７】
当該ビーズがポリスチレン含む請求項５の方法。
【請求項８】
当該ビーズが荷電スピーシーズでコートされている請求項５の方法。
【請求項９】
前記第１固定化成分が当該ビーズに非特異的に吸着される請求項５の方法。
【請求項１０】
当該第１固定化成分が当該ビーズに共有結合的に付着される請求項５の方法。
【請求項１１】
当該第１固定化成分がEDC／NHS化学を経て当該ビーズに付着される請求項１０の方法。
【請求項１２】
当該ビーズが結合パートナーのアフィニティータグと結合できる成分を含んでなる請求項５の方法。
【請求項１３】
前記コロイド粒子が金属結合タグ／金属／キレート連結を経て前記第１または第２表面または領域へ固定化されている請求項５の方法。
【請求項１４】
当該第１および第２表面または表面の領域が、１つの表面の空間的にアドレス可能な異なる領域である請求項２の方法。
【請求項１５】
前記第１固定化成分が当該第１表面または表面の領域に共有結合的に付着される請求項２の方法。
【請求項１６】
当該第１固定化成分がアミノ酸を含み、そしてEDC／NHS化学を経て付着される請求項１５の方法。
【請求項１７】
当該第１固定化成分が金属結合タグ／金属／キレート連結を経て当該表面に付着される請求項２の方法。
【請求項１８】
当該第１表面または表面の領域がチップである請求項１の方法。
【請求項１９】
当該第１表面または表面の領域がＳＡＭを含む請求項１の方法。
【請求項２０】
前記コロイド粒子がＳＡＭｓを含む請求項１の方法。
【請求項２１】
当該コロイド粒子がEDC／NHS化学を経て前記固定化スピーシーズに付着される請求項２０の方法。
【請求項２２】
当該コロイド粒子がヒスチジン標識プロテインＧを経て当該固定化スピーシーズに付着される請求項２０の方法。
【請求項２３】
当該コロイド粒子がシグナル伝達構成要素を含む請求項１の方法。
【請求項２４】
当該シグナル伝達構成要素がメタロセンである請求項２３の方法。
【請求項２５】
当該メタロセンがフェロセンである請求項２４の方法。
【請求項２６】
当該シグナル伝達構成要素が酵素である請求項２３の方法。
【請求項２７】
前記コロイド粒子が比色計的に決定される請求項１の方法。
【請求項２８】
前記露出工程の前に、混合物の少なくとも第１および第２成分を分離すること、および当該第１成分の少なくとも一部を第１表面または表面の領域にそして当該第２成分の少なくとも一部を第２表面または表面の領域に固定化すること、を含む請求項１の方法。
【請求項２９】
当該混合物がクロマトグラフィーにより分離される請求項２８の方法。
【請求項３０】
当該第１表面または表面の領域がビーズを含む請求項２９の方法。
【請求項３１】
当該ビーズが当該混合物をクロマトグラフィーにより分離するために固定相として使用されたビーズと同じタイプのものである請求項３０の方法。
【請求項３２】
当該混合物が細胞可溶化物を含む請求項２８の方法。
【請求項３３】
当該混合物が天然物の源を含む請求項２８の方法。
【請求項３４】
当該混合物が医薬物を含むと伝えられる物質を含む請求項２８の方法。
【請求項３５】
当該混合物が土壌抽出物を含む請求項２８の方法。
【請求項３６】
当該混合物が植物抽出物を含む請求項２８の方法。
【請求項３７】
前記露出工程の前に、混合物の少なくとも第１および第２成分を分離すること、および当該第１成分の少なくとも一部を第１コロイド粒子上にそして当該第２成分の少なくとも一部を第２コロイド粒子上に固定化すること、を含む請求項１の方法。
【請求項３８】
当該混合物がクロマトグラフィーにより分離される請求項３７の方法。
【請求項３９】
混合物の少なくとも第１および第２成分を分離すること、ならびに当該第１成分の少なくとも一部を第１コロイドの上に固定化し、および当該第２成分の少なくとも一部を第２コロイドの上に固定化すること、を含む請求項１の方法。
【請求項４０】
前記第１表面および第２表面の少なくとも１つが電極を含む請求項１の方法。
【請求項４１】
当該電極がＳＡＭを含む請求項４０の方法。
【請求項４２】
当該ＳＡＭがアフィニティータグの結合パートナーを含む請求項４１の方法。
【請求項４３】
当該アフィニティータグがＤＮＡでない請求項４２の方法。
【請求項４４】
第１スピーシーズを第１コロイド上に固定化し、および第２スピーシーズを第２コロイド上に固定化すること；
当該第１および第２コロイドを少なくとも１つの表面に曝すこと；および
当該表面上への当該第１または第２コロイドの固定化を決定すること：
を含む方法。
【請求項４５】
当該第１および第２コロイドが、２つの異なる表面または表面の領域に曝され、当該表面または表面の領域がその上に固定化されている共通の結合パートナーを有する、請求項４４の方法。
【請求項４６】
当該固定化工程の前に、混合物から前記第１および第２スピーシーズを分離することを含む請求項４４の方法。
【請求項４７】
当該混合物が細胞可溶化物を含む請求項４５の方法。
【請求項４８】
被疑結合パートナーが前記表面上に固定化される請求項４４の方法。
【請求項４９】
前記コロイドがシグナル伝達構成要素を含む請求項４４の方法。
【請求項５０】
前記第１および第２スピーシーズがタンパク質である請求項４４の方法。
【請求項５１】
前記第１および第２コロイド粒子を第２表面または表面の領域に曝すことをさらに含む、請求項４４の方法。
【請求項５２】
当該コロイドの少なくとも１つと当該表面との間の相互作用を決定することを含む、請求項４４の方法。
【請求項５３】
混合物の少なくとも第１および第２成分を、ビーズを含むクロマトグラフィーカラムでクロマトグラフィー的に分離すること；
当該第１成分を当該クロマトグラフィーカラムで使われたタイプの第１ビーズに付着させ、そして当該第２成分を当該クロマトグラフィーカラムで使われたタイプの第２ビーズに付着させること；および
当該第１および第２ビーズを、固定化スピーシーズを有するコロイド粒子に曝すこと：
を含む方法。
【請求項５４】
当該第１ビーズまたは第２ビーズと付着されたスピーシーズをもつコロイド粒子の固定化を決定すること、を含む請求項５３の方法。
【請求項５５】
前記混合物が天然物である請求項５４の方法。
【請求項５６】
当該混合物が植物材料である請求項５５の方法。
【請求項５７】
当該混合物が細胞可溶化物である請求項５５の方法。
【請求項５８】
当該混合物が土壌抽出物である請求項５５の方法。
【請求項５９】
ＳＡＭを含むコロイド粒子を含む第１パッケージ；および
当該コロイド粒子へ結合パートナーを固定化するための説明書：
を含むキット。
【請求項６０】
当該ＳＡＭが、当該ＳＡＭへの当該結合パートナーの連結を容易にするように誘導体化される請求項５９のキット。
【請求項６１】
当該ＳＡＭがＮＴＡを取込む請求項６０のキット。
【請求項６２】
当該ＳＡＭがグルタチオンを取込む請求項６０のキット。
【請求項６３】
当該ＳＡＭがビオチンを取込む請求項６０のキット。
【請求項６４】
前記コロイド粒子に固定化されるように適応された少なくとも１つの結合パートナーを含むパッケージを含む請求項５９のキット。
【請求項６５】
当該結合パートナーがタンパク質である請求項６４のキット。
【請求項６６】
結合パートナーが前記コロイド粒子上に固定化される請求項５９のキット。
【請求項６７】
当該結合パートナーがタンパク質である請求項６６のキット。
【請求項６８】
前記コロイド粒子が金を含む請求項５９のキット。
【請求項６９】
コロイド粒子；
コロイド粒子に対して固定化された、またはコロイド粒子に対して固定化されるように適応された、第１スピーシーズを含む第１パッケージ；および
コロイド粒子に対して固定化された、またはコロイド粒子に対して固定化されるように適応された、第２スピーシーズを含む第２パッケージ：
を含むキット。
【請求項７０】
当該第１スピーシーズが当該粒子に対して固定化されるコロイド粒子を含む第１パッケージ；
当該第２スピーシーズが当該粒子に対して固定化されるコロイド粒子を含む第２パッケージ：
を含む請求項６９のキット。
【請求項７１】
当該第１または第２スピーシーズの少なくとも１つが当該粒子に非特異的に固定化されない請求項７０のキット。
【請求項７２】
当該第１スピーシーズをもつ当該コロイド粒子がＳＡＭを含む請求項７０のキット。
【請求項７３】
当該コロイド粒子が金を含む請求項６９のキット。
【請求項７４】
当該第１スピーシーズがEDC／NHS化学を経て当該コロイド粒子上に固定化される請求項７２のキット。
【請求項７５】
当該コロイド粒子の少なくとも１つがシグナル伝達構成要素を含む請求項６９のキット。
【請求項７６】
ある試料に対して異なる化学的、生化学的、または生物学的機能性を提示する、少なくとも２つの表面領域を曝すこと；
少なくとも２つの当該表面領域と当該試料との相互作用パターンを決定することであって、少なくとも２つの当該表面領域と当該試料の少なくとも１つの成分との間の特徴的な相互作用が示されること；
を含む方法であって、
当該試料が、同じ固定化シグナル伝達構成要素を有する少なくとも２つの成分を含み、および／または、決定工程が、少なくとも２つの表面領域との相互作用の後、当該少なくとも１つの成分を同定せずに、行われる、上記方法。
【請求項７７】
各々が異なる化学的、生化学的、または生物学的機能性を曝す少なくとも３つの表面領域を提示すること；
少なくとも３つの当該表面領域を当該試料に曝すこと；および
少なくとも３つの当該表面領域の各々と当該試料の少なくとも２つの成分との間の特徴的な相互作用を示す、少なくとも３つの当該表面領域の当該試料との相互作用パターンを決定すること：
を含む請求項７６の方法。
【請求項７８】
少なくとも３つの成分の少なくとも２つの各々が、当該相互作用パターンを示す、表面領域で固定化されるようになる、請求項７７の方法。
【請求項７９】
少なくとも３つの表面領域を曝すことであって、表面領域の各々は異なる化学的、生化学的、または生物学的機能性を第２試料に曝すのもであること；
当該第２試料が曝された少なくとも３つの表面領域と当該第２試料の相互作用パターンを決定することであって、当該第２試料の少なくとも２つの成分と少なくとも３つの当該表面領域の各々との間に特徴的な相互作用が示されること；および
当該第１試料の相互作用パターンと当該第２試料の相互作用パターンとを比較すること：
をさらに含み、当該試料が第１試料である、請求項７７の方法。
【請求項８０】
当該第１試料が曝される少なくとも３つの当該表面領域が、当該第２試料が曝される少なくとも３つの当該表面領域と本質的に同一である、請求項７９の方法。
【請求項８１】
当該第２試料が曝される少なくとも３つの当該表面領域の各々が、当該第１試料が曝された少なくとも３つの当該表面領域の１つに相当するように配置される、請求項７９の方法。
【請求項８２】
当該試料が、既知薬剤、推定薬剤、細胞可溶化物、ｃＤＮＡライブラリーまたはその産物、天然物、およびそれらの混合物から選択される、請求項７６の方法。
【請求項８３】
当該試料が、薬剤または推定薬剤に曝されたことがある細胞の少なくとも一部を含む、請求項８２の方法。
【請求項８４】
前記相互作用パターンが少なくとも２つの前記表面領域でのシグナルを検出することにより決定される、請求項７６の方法。
【請求項８５】
当該シグナルが光放射である、請求項８４の方法。
【請求項８６】
当該シグナルが電気的である、請求項８４の方法。
【請求項８７】
前記相互作用パターンがＱＣＭにより決定される、請求項７６の方法。
【請求項８８】
当該相互作用パターンがＳＰＲにより決定される、請求項７６の方法。
【請求項８９】
前記第１試料および第２試料の少なくとも１つが、タンパク質、既知薬剤、推定薬剤、細胞可溶化物、ｃＤＮＡライブラリー、天然物、およびそれらの混合物に由来する、請求項７９の方法。
【請求項９０】
当該第１試料および第２試料の少なくとも１つが、薬剤または推定薬剤で処理されたことがある細胞からの細胞可溶化物である、請求項８９の方法。
【請求項９１】
前記相互作用パターンが少なくとも２つの前記表面領域の各々におけるまたは近くのシグナルを検出することにより決定される、請求項８９の方法。
【請求項９２】
当該シグナルが光放射である、請求項９１の方法。
【請求項９３】
当該シグナルが電気的である、請求項９１の方法。
【請求項９４】
前記相互作用パターンがＱＣＭにより決定される、請求項７９の方法。
【請求項９５】
当該相互作用パターンがＳＰＲにより決定される、請求項７９の方法。
【請求項９６】
当該相互作用パターンを既知相互作用パターンのライブラリーに比較することをさらに含む、請求項７６の方法。
【請求項９７】
２つの前記表面領域の少なくとも１つが、タンパク質、核酸、ペプチド、薬剤、低分子またはそれらの混合物を提示する、請求項７６の方法。
【請求項９８】
当該試料の成分にコロイドを固定化することをさらに含む、請求項７６の方法。
【請求項９９】
混合物の少なくとも２つの成分を固定相上で分離すること；
流体で当該固定相から少なくとも第１成分を溶出すること；
当該流体を変更すること；
表面へ当該第１成分の少なくとも一部を固定化すること；
推定結合パートナーへ当該表面を曝すこと；および
当該第１成分の少なくとも一部と当該推定結合パートナーとの間の結合相互作用を決定すること：
を含む方法。
【請求項１００】
当該表面が固定相材料を含む請求項９９の方法。
【請求項１０１】
前記変更工程が、前記第１流体を第２流体と交換すること、それにより前記第１成分を当該第２流体中に提供すること、を含む請求項９９の方法。
【請求項１０２】
当該流体が透析を経て交換される請求項１０１の方法。
【請求項１０３】
前記混合物が天然物である請求項９９の方法。
【請求項１０４】
当該混合物が植物材料である請求項９９の方法。
【請求項１０５】
当該混合物が細胞可溶化物である請求項９９の方法。
【請求項１０６】
当該混合物が土壌抽出物である請求項９９の方法。
【請求項１０７】
混合物の少なくとも２つの成分を固定相上で分離すること；
流体で当該固定相から少なくとも第１成分を溶出すること；
コロイドへ当該第１成分の少なくとも一部を固定化すること；
表面上に固定化された推定結合パートナーへ当該コロイドを曝すこと；および
当該第１成分の少なくとも一部と当該推定結合パートナーとの間の結合相互作用を決定すること：
を含む方法。
【請求項１０８】
当該混合物が天然物である請求項１０７の方法。
【請求項１０９】
当該混合物が植物材料である請求項１０７の方法。
【請求項１１０】
当該混合物が細胞可溶化物である請求項１０７の方法。
【請求項１１１】
当該混合物が土壌抽出物である請求項１０７の方法。
【請求項１１２】
第１固定化成分をもつある表面を、第２成分へ固定化されたコロイド粒子および連結構成要素へ曝すこと；
当該コロイド粒子を架橋化合物へ曝すこと；
当該連結構成要素および当該架橋化合物を経て、当該第１成分へ固定化されたコロイド粒子のネットワークを形成すること；および
当該表面上への当該コロイド粒子の固定化を決定すること：
を含む方法。
【請求項１１３】
当該コロイド粒子がシグナル伝達構成要素を含む請求項１１２の方法。
【請求項１１４】
当該架橋化合物がシグナル伝達構成要素を含む請求項１１２の方法。
【請求項１１５】
当該架橋化合物が第２コロイド粒子へ固定化される請求項１１２の方法。
【請求項１１６】
当該第２コロイド粒子がある連結構成要素へ固定化される請求項１１５の方法。
【請求項１１７】
当該シグナル伝達構成要素が蛍光成分を含んでなる、請求項２３の方法。
【請求項１１８】
少なくとも１０の成分を含むある試料に対して、各々が異なる化学的、生化学的、または生物学的機能性を提示する、少なくとも１０の表面領域を曝すこと；
少なくとも１０の当該表面領域と当該試料との相互作用パターンを決定することであって、少なくとも１０の当該表面領域と当該試料の少なくとも１０の成分との間の特徴的な相互作用が示されること；
を含む方法であって、
当該試料の少なくとも１０の成分が、同じ固定化シグナル伝達構成要素を有し、および／または、決定工程が、少なくとも２つの表面領域との相互作用の後、当該少なくとも１０の成分の少なくとも１つを同定することなく、行われる、請求項７６の方法。
【請求項１１９】
決定工程が、少なくとも２つの表面領域との相互作用の後、当該少なくとも１０の成分のいずれをも同定することなく、行われる、請求項１１８の方法。
【請求項１２０】
ある試料に対して、各々が異なる化学的、生化学的、または生物学的機能性を提示する、少なくとも２つの表面領域を曝すこと；
少なくとも２つの当該表面領域と当該試料との相互作用パターンを決定することであって、少なくとも２つの当該表面領域と当該試料の少なくとも１つの成分との間の特徴的な相互作用が示されること；
を含む方法。