【手続補正書】
【提出日】令和3年3月15日(2021.3.15)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
Fcドメインに連結した１つのポリペプチドを含む精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質であって、該１つのポリペプチドがバリアントＣＤ８０ポリペプチドであり、該バリアントＣＤ８０ポリペプチドがＩｇＶドメインを含み、該バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、ＩｇＶドメインまたはその特異的結合フラグメントが該バリアントＣＤ８０ポリペプチドの唯一の部分であるＣＤ８０の細胞外ドメインの一部分であり、該バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置の番号付けに基づいたアミノ酸改変Ｅ３５Ｄを含み、該バリアントＣＤ８０ポリペプチドがヒトＰＤ−Ｌ１のエクトドメインへの非改変ＣＤ８０の結合親和性と比較してヒトＰＤ−Ｌ１のエクトドメインへの増加した結合親和性を示す、前記ＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項２】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、アミノ酸改変H18Y/E35D、E35D/D46E、E35D/D46V、E35D/M47I、E35D/M47L、E35D/M47V、E35D/V68M、E35D/L85M、E35D/L85Qを含む、および／または前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、アミノ酸改変E35D/M47L/V68MまたはE35D/M47V/V68Mを含む、請求項１に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項３】
前記ヒトＰＤ−Ｌ１のエクトドメインへの前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドの前記結合親和性が、前記ヒトＰＤ−Ｌ１のエクトドメインへの前記非改変ＣＤ８０の結合親和性と比較して１．２倍、１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、２０倍、３０倍、４０倍、５０倍、６０倍、８０倍、１００倍、１５０倍、２００倍、２５０倍、３００倍、４００倍、または４５０倍より多く増加する、請求項１または２に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項４】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置の番号付けに基づいたアミノ酸改変E35D/M47I/L65P/D90N、L25S/E35D/M47I/D90N、E35D/A71D、E35D/M47I、E35D/T57I/L70Q/A71D、E35D/A71D、E35D/I67L/A71D、E35D/M47I/L70M、E35D/A71D/L72V、E35D/M43L/L70M、A26P/E35D/M43I/L85Q/E88D、E35D/D46V/L85Q、H18Y/A26T/E35D/A71D/L85Q、E35D/M47L、E35D/M43I/A71D、E23G/A26S/E35D/T62N/A71D/L72V/L85M、V22L/E35D/M43L/A71G/D76H、A26E/E35D/M47L/L85Q、D46E/A71D、Y31H/E35D/T41S/V68L/K93R/R94W、A26E/Q33R/E35D/M47L/L85Q/K86E、A26E/Q33R/E35D/M47L/L85Q、E35D/M47L/L85Q、A26E/Q33L/E35D/M47L/L85Q、A26E/Q33L/E35D/M47L、H18Y/A26E/Q33L/E35D/M47L/L85Q、Q33L/E35D/M47I、H18Y/Q33L/E35D/M47I、Q33L/E35D/D46E/M47I、Q33R/E35D/D46E/M47I、H18Y/E35D/M47L、Q33L/E35D/M47V、Q33L/E35D/M47V/T79A、Q33L/E35D/T41S/M47V、Q33L/E35D/M47I/L85Q、Q33L/E35D/M47I/T62N/L85Q、Q33L/E35D/M47V/L85Q、A26E/E35D/M43T/M47L/L85Q/R94Q、Q33R/E35D/K37E/M47V/L85Q、V22A/E23D/Q33L/E35D/M47V、E24D/Q33L/E35D/M47V/K54R/L85Q、S15P/Q33L/E35D/M47L/L85Q、E7D/E35D/M47I/L97Q、Q33L/E35D/T41S/M43I、E35D/M47I/K54R/L85E、Q33K/E35D/D46V/L85Q、Y31S/E35D/M47L/T79L/E88G、H18L/V22A/E35D/M47L/N48T/L85Q、Q27H/E35D/M47L/L85Q/R94Q/E95K、Q33K/E35D/M47V/K89E/K93R、E35D/M47I/E77A/L85Q/R94W、A26E/E35D/M43I/M47L/L85Q/K86E/R94W、Q27H/Q33L/E35D/M47V/N55D/L85Q/K89N、H18Y/V20A/Q33L/E35D/M47V/Y53F、Q33L/E35D/M47L/A71G/F92S、V22A/R29H/E35D/D46E/M47I、Q33L/E35D/M43I/L85Q/R94W、H18Y/E35D/V68M/L97Q、Q33L/E35D/M47L/V68M/L85Q/E88D、Q33L/E35D/M43V/M47I/A71G、E35D/M47L/A71G/L97Q、E35D/M47V/A71G/L85M/L97Q、H18Y/Y31H/E35D/M47V/A71G/L85Q、E35D/D46E/M47V/L97Q、E35D/D46V/M47I/A71G/F92V、E35D/M47V/T62A/A71G/V83A/Y87H/L97M、Q33L/E35D/N48K/L85Q/L97Q、E35D/L85Q/K93T/E95V/L97Q、E35D/M47V/N48K/V68M/K89N、Q33L/E35D/M47I/N48D/A71G、Q27H/E35D/M47I/L85Q/D90G、E35D/M47I/L85Q/D90G、E35D/M47I/T62S/L85Q、A26E/E35D/M47L/A71G、E35D/M47I/Y87Q/K89E、V22A/E35D/M47I/Y87N、H18Y/A26E/E35D/M47L/L85Q/D90G、E35D/M47L/A71G/L85Q、E35D/M47V/A71G/E88D、E35D/A71G、E35D/M47V/A71G、I30V/E35D/M47V/A71G/A91V、V22D/E35D/M47L/L85Q、H18Y/E35D/N48K、E35D/T41S/M47V/A71G/K89N、E35D/M47V/N48T/L85Q、E35D/D46E/M47V/A71D/D90G、E35D/T41S/M43I/A71G/D90G、E35D/T41S/M43I/M47V/A71G、E35D/T41S/M43I/M47L/A71G、H18Y/V22A/E35D/M47V/T62S/A71G、H18Y/A26E/E35D/M47L/V68M/A71G/D90G、E35D/K37E/M47V/N48D/L85Q/D90N、Q27H/E35D/D46V/M47L/A71G、V22L/Q27H/E35D/M47I/A71G、E35D/D46V/M47L/V68M/L85Q/E88D、E35D/T41S/M43V/M47I/L70M/A71G、E35D/D46E/M47V/N63D/L85Q、E35D/D46E/M47V/V68M/D90G/K93E、E35D/M43I/M47V/K89N、E35D/M47L/A71G/L85M/F92Y、V22D/E35D/M47L/L70M/L97Q、E35D/T41S/M47V/L97Q、E35D/Y53H/A71G/D90G/L97R、Q33L/E35D/M43I/Y53F/T62S/L85Q、E35D/M38T/D46E/M47V/N48S、Q33R/E35D/M47V/N48K/L85M/F92L、E35D/M38T/M43V/M47V/N48R/L85Q、T28Y/Q33H/E35D/D46V/M47I/A71G、E35D/N48K/L72V、E35D/T41S/N48T、E35D/M43I/M47L/L85M、E35D/M43I/D46E/A71G/L85M、H18Y/E35D/M47L/A71G/A91S、E35D/M47I/N48K/I61F、E35D/M47V/T62S/L85Q、E35D/M47V、E35D/M47L/A71G/L85M、V22A/E35D/M47L/A71G、E35D/M47L/A71G、E35D/D46E/M47I、Q27H/E35D/M47I、E35D/D46E/L85M、E35D/D46E/A91G、E35D/D46E、E35D/L97R、H18Y/E35D、Q27L/E35D/M47V/I61V/L85M、E35D/M47V/I61V/L85M、E35D/M47V/L85M/R94Q、E35D/M47V/N48K/L85M、H18Y/E35D/M47V/N48K、A26E/Q27R/E35D/M47L/N48Y/L85Q、E35D/D46E/M47L/V68M/L85Q/F92L、E35D/M47I/T62S/L85Q/E88D、E24D/Q27R/E35D/T41S/M47V/L85Q、S15T/H18Y/E35D/M47V/T62A/N64S/A71G/L85Q/D90N、E35D/M47L/V68M/A71G/L85Q/D90G、H18Y/E35D/M47I/V68M/A71G/R94L、H18Y/V22A/E35D/T41S/M47V/T62N/A71G/A91G、E24D/E35D/M47L/V68M/E95V/L97Q、E35D/D46E/M47I/T62A/V68M/L85M/Y87C、E35D/D46E/M47I/V68M/L85M、E35D/D46E/M47L/V68M/A71G/Y87C/K93R、E35D/D46E/M47L/V68M/T79M/L85M、E35D/D46E/M47L/V68M/T79M/L85M/L97Q、E35D/D46E/M47V/V68M/L85Q、E35D/M43I/M47L/V68M、E35D/M47I/V68M/Y87N、E35D/M47L/V68M/E95V/L97Q、E35D/M47L/Y53F/V68M/A71G/K93R/E95V、E35D/M47V/N48K/V68M/A71G/L85M、E35D/M47V/N48K/V68M/L85M、E35D/M47V/V68M/L85M、E35D/M47V/V68M/L85M/Y87D、E35D/T41S/D46E/M47I/V68M/K93R/E95V、H18Y/E35D/D46E/M47I/V68M/R94L、H18Y/E35D/D46E/M47I/V68M/R94L、H18Y/E35D/M38I/M47L/V68M/L85M、H18Y/E35D/M47I/V68M/Y87N、H18Y/E35D/M47I/V68M/Y87N、H18Y/E35D/M47L/V68M/A71G/L85M、H18Y/E35D/M47L/V68M/A71G/L85M、H18Y/E35D/M47L/V68M/E95V/L97Q、H18Y/E35D/M47L/V68M/E95V/L97Q、H18Y/E35D/M47L/Y53F/V68M/A71G、H18Y/E35D/M47L/Y53F/V68M/A71G、H18Y/E35D/M47L/Y53F/V68M/A71G/K93R/E95V、H18Y/E35D/M47L/Y53F/V68M/A71G/K93R/E95V、H18Y/E35D/M47V/V68M/L85M、H18Y/E35D/M47V/V68M/L85M、H18Y/E35D/V68M/A71G/R94Q/E95V、H18Y/E35D/V68M/A71G/R94Q/E95V、H18Y/E35D/V68M/L85M/R94Q、H18Y/E35D/V68M/L85M/R94Q、H18Y/E35D/V68M/T79M/L85M、H18Y/V22D/E35D/M47V/N48K/V68M、Q27L/Q33L/E35D/T41S/M47V/N48K/V68M/L85M、Q33L/E35D/M47V/T62S/V68M/L85M、Q33R/E35D/M38I/M47L/V68M、R29C/E35D/M47L/V68M/A71G/L85M、S21P/E35D/K37E/D46E/M47I/V68M、S21P/E35D/K37E/D46E/M47I/V68M/R94L、T13R/E35D/M47L/V68M、T13R/Q27L/Q33L/E35D/T41S/M47V/N48K/V68M/L85M、T13R/Q33L/E35D/M47L/V68M/L85M、T13R/Q33L/E35D/M47V/T62S/V68M/L85M、T13R/Q33R/E35D/M38I/M47L/V68M、T13R/Q33R/E35D/M38I/M47L/V68M/E95V/L97Q、T13R/Q33R/E35D/M38I/M47L/V68M/L85M、T13R/Q33R/E35D/M38I/M47L/V68M/L85M/R94Q、T13R/Q33R/E35D/M47L/V68M、T13R/Q33R/E35D/M47L/V68M/L85M、V22D/E24D/E35D/M47L/V68M、V22D/E24D/E35D/M47L/V68M/L85M/D90G、V22D/E24D/E35D/M47V/V68M、H18Y/E35D/M47V/V68M/A71G、H18C/A26P/E35D/M47L/V68M/A71G、H18I/A26P/E35D/M47V/V68M/A71G、H18L/E35D/M47V/V68M/A71G/D90G、H18T/A26N/E35D/M47L/V68M/A71G、H18V/A26K/E35D/M47L/V68M/A71G、H18V/A26N/E35D/M47V/V68M/A71G、H18V/A26P/E35D/M47V/V68L/A71G、H18V/A26P/E35D/M47L/V68M/A71G、H18V/E35D/M47V/V68M/A71G/D90G、H18Y/A26P/E35D/M47I/V68M/A71G、H18Y/A26P/E35D/M47V/V68M/A71G、H18Y/E35D/M47V/V68L/A71G/D90G、H18Y/E35D/M47V/V68M/A71G/D90G、A26P/E35D/M47I/V68M/A71G/D90G、H18V/A26G/E35D/M47V/V68M/A71G/D90G、H18V/A26S/E35D/M47L/V68M/A71G/D90G、H18V/A26R/E35D/M47L/V68M/A71G/D90G、H18V/A26D/E35D/M47V/V68M/A71G/D90G、H18V/A26Q/E35D/M47V/V68L/A71G/D90G、H18A/A26P/E35D/M47L/V68M/A71G/D90G、H18A/A26N/E35D/M47L/V68M/A71G/D90G、H18F/A26P/E35D/M47I/V68M/A71G/D90G、H18F/A26H/E35D/M47L/V68M/A71G/D90G、H18F/A26N/E35D/M47V/V68M/A71G/D90K、H18Y/A26N/E35D/M47F/V68M/A71G/D90G、H18Y/A26P/E35D/M47Y/V68I/A71G/D90G、H18Y/A26Q/E35D/M47T/V68M/A71G/D90G、H18R/A26P/E35D/D46N/M47V/V68M/A71G/D90P、またはH18F/A26D/E35D/D46E/M47T/V68M/A71G/D90Gを含む、請求項１〜３のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項５】
前記非改変ＣＤ８０が、
（ｉ）ＩｇＶドメインを含む前記ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のアミノ酸の配列の一部分、または
（ｉｉ）前記ＩｇＶドメインを含む前記ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２のアミノ酸の配列の一部分に対して少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸の配列、
を含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項６】
Fcドメインに連結した１つのポリペプチドを含む精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質であって、該１つのポリペプチドがバリアントＣＤ８０ポリペプチドであり、該バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載の位置の番号付けに基づいた、非改変ＣＤ８０におけるアミノ酸置換
E35D/M47I/L65P/D90N、L25S/E35D/M47I/D90N、E35D/A71D、E35D/M47I、E35D/T57I/L70Q/A71D、E35D/A71D、E35D/I67L/A71D、E35D/M47I/L70M、E35D/A71D/L72V、E35D/M43L/L70M、A26P/E35D/M43I/L85Q/E88D、E35D/D46V/L85Q、H18Y/A26T/E35D/A71D/L85Q、E35D/M47L、E35D/M43I/A71D、E23G/A26S/E35D/T62N/A71D/L72V/L85M、V22L/E35D/M43L/A71G/D76H、A26E/E35D/M47L/L85Q、D46E/A71D、Y31H/E35D/T41S/V68L/K93R/R94W、A26E/Q33R/E35D/M47L/L85Q/K86E、A26E/Q33R/E35D/M47L/L85Q、E35D/M47L/L85Q、A26E/Q33L/E35D/M47L/L85Q、A26E/Q33L/E35D/M47L、H18Y/A26E/Q33L/E35D/M47L/L85Q、Q33L/E35D/M47I、H18Y/Q33L/E35D/M47I、Q33L/E35D/D46E/M47I、Q33R/E35D/D46E/M47I、H18Y/E35D/M47L、Q33L/E35D/M47V、Q33L/E35D/M47V/T79A、Q33L/E35D/T41S/M47V、Q33L/E35D/M47I/L85Q、Q33L/E35D/M47I/T62N/L85Q、Q33L/E35D/M47V/L85Q、A26E/E35D/M43T/M47L/L85Q/R94Q、Q33R/E35D/K37E/M47V/L85Q、V22A/E23D/Q33L/E35D/M47V、E24D/Q33L/E35D/M47V/K54R/L85Q、S15P/Q33L/E35D/M47L/L85Q、E7D/E35D/M47I/L97Q、Q33L/E35D/T41S/M43I、E35D/M47I/K54R/L85E、Q33K/E35D/D46V/L85Q、Y31S/E35D/M47L/T79L/E88G、H18L/V22A/E35D/M47L/N48T/L85Q、Q27H/E35D/M47L/L85Q/R94Q/E95K、Q33K/E35D/M47V/K89E/K93R、E35D/M47I/E77A/L85Q/R94W、A26E/E35D/M43I/M47L/L85Q/K86E/R94W、Q27H/Q33L/E35D/M47V/N55D/L85Q/K89N、H18Y/V20A/Q33L/E35D/M47V/Y53F、Q33L/E35D/M47L/A71G/F92S、V22A/R29H/E35D/D46E/M47I、Q33L/E35D/M43I/L85Q/R94W、H18Y/E35D/V68M/L97Q、Q33L/E35D/M47L/V68M/L85Q/E88D、Q33L/E35D/M43V/M47I/A71G、E35D/M47L/A71G/L97Q、E35D/M47V/A71G/L85M/L97Q、H18Y/Y31H/E35D/M47V/A71G/L85Q、E35D/D46E/M47V/L97Q、E35D/D46V/M47I/A71G/F92V、E35D/M47V/T62A/A71G/V83A/Y87H/L97M、Q33L/E35D/N48K/L85Q/L97Q、E35D/L85Q/K93T/E95V/L97Q、E35D/M47V/N48K/V68M/K89N、Q33L/E35D/M47I/N48D/A71G、Q27H/E35D/M47I/L85Q/D90G、E35D/M47I/L85Q/D90G、E35D/M47I/T62S/L85Q、A26E/E35D/M47L/A71G、E35D/M47I/Y87Q/K89E、V22A/E35D/M47I/Y87N、H18Y/A26E/E35D/M47L/L85Q/D90G、E35D/M47L/A71G/L85Q、E35D/M47V/A71G/E88D、E35D/A71G、E35D/M47V/A71G、I30V/E35D/M47V/A71G/A91V、V22D/E35D/M47L/L85Q、H18Y/E35D/N48K、E35D/T41S/M47V/A71G/K89N、E35D/M47V/N48T/L85Q、E35D/D46E/M47V/A71D/D90G、E35D/T41S/M43I/A71G/D90G、E35D/T41S/M43I/M47V/A71G、E35D/T41S/M43I/M47L/A71G、H18Y/V22A/E35D/M47V/T62S/A71G、H18Y/A26E/E35D/M47L/V68M/A71G/D90G、E35D/K37E/M47V/N48D/L85Q/D90N、Q27H/E35D/D46V/M47L/A71G、V22L/Q27H/E35D/M47I/A71G、E35D/D46V/M47L/V68M/L85Q/E88D、E35D/T41S/M43V/M47I/L70M/A71G、E35D/D46E/M47V/N63D/L85Q、E35D/D46E/M47V/V68M/D90G/K93E、E35D/M43I/M47V/K89N、E35D/M47L/A71G/L85M/F92Y、V22D/E35D/M47L/L70M/L97Q、E35D/T41S/M47V/L97Q、E35D/Y53H/A71G/D90G/L97R、Q33L/E35D/M43I/Y53F/T62S/L85Q、E35D/M38T/D46E/M47V/N48S、Q33R/E35D/M47V/N48K/L85M/F92L、E35D/M38T/M43V/M47V/N48R/L85Q、T28Y/Q33H/E35D/D46V/M47I/A71G、E35D/N48K/L72V、E35D/T41S/N48T、E35D/M43I/M47L/L85M、E35D/M43I/D46E/A71G/L85M、H18Y/E35D/M47L/A71G/A91S、E35D/M47I/N48K/I61F、E35D/M47V/T62S/L85Q、E35D/M47V、E35D/M47L/A71G/L85M、V22A/E35D/M47L/A71G、E35D/M47L/A71G、E35D/D46E/M47I、Q27H/E35D/M47I、E35D/D46E/L85M、E35D/D46E/A91G、E35D/D46E、E35D/L97R、H18Y/E35D、Q27L/E35D/M47V/I61V/L85M、E35D/M47V/I61V/L85M、E35D/M47V/L85M/R94Q、E35D/M47V/N48K/L85M、H18Y/E35D/M47V/N48K、A26E/Q27R/E35D/M47L/N48Y/L85Q、E35D/D46E/M47L/V68M/L85Q/F92L、E35D/M47I/T62S/L85Q/E88D、E24D/Q27R/E35D/T41S/M47V/L85Q、S15T/H18Y/E35D/M47V/T62A/N64S/A71G/L85Q/D90N、E35D/M47L/V68M/A71G/L85Q/D90G、H18Y/E35D/M47I/V68M/A71G/R94L、H18Y/V22A/E35D/T41S/M47V/T62N/A71G/A91G、E24D/E35D/M47L/V68M/E95V/L97Q、E35D/D46E/M47I/T62A/V68M/L85M/Y87C、E35D/D46E/M47I/V68M/L85M、E35D/D46E/M47L/V68M/A71G/Y87C/K93R、E35D/D46E/M47L/V68M/T79M/L85M、E35D/D46E/M47L/V68M/T79M/L85M/L97Q、E35D/D46E/M47V/V68M/L85Q、E35D/M43I/M47L/V68M、E35D/M47I/V68M/Y87N、E35D/M47L/V68M/E95V/L97Q、E35D/M47L/Y53F/V68M/A71G/K93R/E95V、E35D/M47V/N48K/V68M/A71G/L85M、E35D/M47V/N48K/V68M/L85M、E35D/M47V/V68M/L85M、E35D/M47V/V68M/L85M/Y87D、E35D/T41S/D46E/M47I/V68M/K93R/E95V、H18Y/E35D/D46E/M47I/V68M/R94L、H18Y/E35D/D46E/M47I/V68M/R94L、H18Y/E35D/M38I/M47L/V68M/L85M、H18Y/E35D/M47I/V68M/Y87N、H18Y/E35D/M47I/V68M/Y87N、H18Y/E35D/M47L/V68M/A71G/L85M、H18Y/E35D/M47L/V68M/A71G/L85M、H18Y/E35D/M47L/V68M/E95V/L97Q、H18Y/E35D/M47L/V68M/E95V/L97Q、H18Y/E35D/M47L/Y53F/V68M/A71G、H18Y/E35D/M47L/Y53F/V68M/A71G、H18Y/E35D/M47L/Y53F/V68M/A71G/K93R/E95V、H18Y/E35D/M47L/Y53F/V68M/A71G/K93R/E95V、H18Y/E35D/M47V/V68M/L85M、H18Y/E35D/M47V/V68M/L85M、H18Y/E35D/V68M/A71G/R94Q/E95V、H18Y/E35D/V68M/A71G/R94Q/E95V、H18Y/E35D/V68M/L85M/R94Q、H18Y/E35D/V68M/L85M/R94Q、H18Y/E35D/V68M/T79M/L85M、H18Y/V22D/E35D/M47V/N48K/V68M、Q27L/Q33L/E35D/T41S/M47V/N48K/V68M/L85M、Q33L/E35D/M47V/T62S/V68M/L85M、Q33R/E35D/M38I/M47L/V68M、R29C/E35D/M47L/V68M/A71G/L85M、S21P/E35D/K37E/D46E/M47I/V68M、S21P/E35D/K37E/D46E/M47I/V68M/R94L、T13R/E35D/M47L/V68M、T13R/Q27L/Q33L/E35D/T41S/M47V/N48K/V68M/L85M、T13R/Q33L/E35D/M47L/V68M/L85M、T13R/Q33L/E35D/M47V/T62S/V68M/L85M、T13R/Q33R/E35D/M38I/M47L/V68M、T13R/Q33R/E35D/M38I/M47L/V68M/E95V/L97Q、T13R/Q33R/E35D/M38I/M47L/V68M/L85M、T13R/Q33R/E35D/M38I/M47L/V68M/L85M/R94Q、T13R/Q33R/E35D/M47L/V68M、T13R/Q33R/E35D/M47L/V68M/L85M、V22D/E24D/E35D/M47L/V68M、V22D/E24D/E35D/M47L/V68M/L85M/D90G、V22D/E24D/E35D/M47V/V68M、H18Y/E35D/M47V/V68M/A71G、H18C/A26P/E35D/M47L/V68M/A71G、H18I/A26P/E35D/M47V/V68M/A71G、H18L/E35D/M47V/V68M/A71G/D90G、H18T/A26N/E35D/M47L/V68M/A71G、H18V/A26K/E35D/M47L/V68M/A71G、H18V/A26N/E35D/M47V/V68M/A71G、H18V/A26P/E35D/M47V/V68L/A71G、H18V/A26P/E35D/M47L/V68M/A71G、H18V/E35D/M47V/V68M/A71G/D90G、H18Y/A26P/E35D/M47I/V68M/A71G、H18Y/A26P/E35D/M47V/V68M/A71G、H18Y/E35D/M47V/V68L/A71G/D90G、H18Y/E35D/M47V/V68M/A71G/D90G、A26P/E35D/M47I/V68M/A71G/D90G、H18V/A26G/E35D/M47V/V68M/A71G/D90G、H18V/A26S/E35D/M47L/V68M/A71G/D90G、H18V/A26R/E35D/M47L/V68M/A71G/D90G、H18V/A26D/E35D/M47V/V68M/A71G/D90G、H18V/A26Q/E35D/M47V/V68L/A71G/D90G、H18A/A26P/E35D/M47L/V68M/A71G/D90G、H18A/A26N/E35D/M47L/V68M/A71G/D90G、H18F/A26P/E35D/M47I/V68M/A71G/D90G、H18F/A26H/E35D/M47L/V68M/A71G/D90G、H18F/A26N/E35D/M47V/V68M/A71G/D90K、H18Y/A26N/E35D/M47F/V68M/A71G/D90G、H18Y/A26P/E35D/M47Y/V68I/A71G/D90G、H18Y/A26Q/E35D/M47T/V68M/A71G/D90G、H18R/A26P/E35D/D46N/M47V/V68M/A71G/D90P、またはH18F/A26D/E35D/D46E/M47T/V68M/A71G/D90G
もしくはＩｇＶドメインを含むそれらの一部分
を含む、精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項７】
前記非改変ＣＤ８０が、
（ｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載のアミノ酸の配列、
（ｉｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に対して少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸の配列、または
（ｉｉｉ）（ｉ）もしくは（ｉｉ）の一部分
を含む、請求項６に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項８】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、前記アミノ酸改変Ｅ３５Ｄ／Ｍ４７Ｉ／Ｌ７０Ｍを含む、請求項１〜７のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項９】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、前記アミノ酸改変Ｅ３５Ｄ／Ｍ４７Ｖ／Ｎ４８Ｋ／Ｖ６８Ｍ／Ｋ８９Ｎを含む、請求項１〜７のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項１０】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、前記アミノ酸改変Ｈ１８Ｙ／Ａ２６Ｅ／Ｅ３５Ｄ／Ｍ４７Ｌ／Ｖ６８Ｍ／Ａ７１Ｇ／Ｄ９０Ｇを含む、請求項１〜７のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項１１】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、前記アミノ酸改変Ｅ３５Ｄ／Ｄ４６Ｅ／Ｍ４７Ｖ／Ｖ６８Ｍ／Ｄ９０Ｇ／Ｋ９３Ｅを含む、請求項１〜７のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項１２】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、前記アミノ酸改変Ｅ３５Ｄ／Ｄ４６Ｖ／Ｍ４７Ｌ／Ｖ６８Ｍ／Ｌ８５Ｑ／Ｅ８８Ｄを含む、請求項１〜７のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項１３】
前記非改変ＣＤ８０ポリペプチドの前記ＩｇＶドメインが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１の３５〜１３５、３５〜１３８、３７〜１３８、または３５〜１４１のアミノ酸の配列を有する、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項１４】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、最大１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個のアミノ酸改変、任意で、アミノ酸置換、挿入および／または欠失を含み、および／または
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載された配列に対して少なくとも８５％、９０％、または９５％の配列同一性または前記ＩｇＶドメインを含むそれらの一部分を有する、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。。
【請求項１５】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９３、９４、１０２、１０３、１１１、１２０、１２１、１２４〜１３０、１３２、１３３、１３４、１３８、１４２、１４３、１４４、１４７、１４９、１６７、１６８、１７７、１７８、１８５、１９４、１９５、１９８〜２０８、２１２、２１６、２１７、２１８、２２１、２２３、２１０５〜２２９６、２５０８、２５０９、２５１２〜２５１６、２５１８〜２５４０、２５４３〜２６０１、２６０６、２６０７、２６０８、２６１５〜２６１８、２６２３、２６２４、２６２５、２６３０、２６３１、２６３８〜２６４３、２６４８、２６４９、２６５０、２６５２〜２６５８、２６６０〜２６６４、２６６７、２６６８、２６６９、２６７１〜２６７８、２６８２、２６８３、２６８４、２６８８〜２６９３、２６９８〜２７０２、２７０６〜２７１１、２７１７〜２７１８、２７１９〜２７２０、２７２１、２７２３〜２７２７、２７２９〜２７５１、２７５４〜２８１２、２８１７、２８１８、２８１９、２８２６、２８２７、２８２８、２８２９、２８３４、２８３５、２８３６、２８４１、２８４２、２８４９〜２８５４、２８５９、２８６０、２８６１、２８６３〜２８６９、２８７１〜２８７５、２８７８、２８７９、２８８０、２８８２〜２８８９、２８９３、２８９４、２８９５、２８９９〜２９０４、２９０９〜２９１３、２９１７〜２９２２、２９２８、２９２９、２９６１〜２９６３、２９６５〜２９９４、２９９６〜３０２２のいずれかに記載のアミノ酸の配列、または
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９３、９４、１０２、１０３、１１１、１２０、１２１、１２４〜１３０、１３２、１３３、１３４、１３８、１４２、１４３、１４４、１４７、１４９、１６７、１６８、１７７、１７８、１８５、１９４、１９５、１９８〜２０８、２１２、２１６、２１７、２１８、２２１、２２３、２１０５〜２２９６、２５０８、２５０９、２５１２〜２５１６、２５１８〜２５４０、２５４３〜２６０１、２６０６、２６０７、２６０８、２６１５〜２６１８、２６２３、２６２４、２６２５、２６３０、２６３１、２６３８〜２６４３、２６４８、２６４９、２６５０、２６５２〜２６５８、２６６０〜２６６４、２６６７、２６６８、２６６９、２６７１〜２６７８、２６８２、２６８３、２６８４、２６８８〜２６９３、２６９８〜２７０２、２７０６〜２７１１、２７１７〜２７１８、２７１９〜２７２０、２７２１、２７２３〜２７２７、２７２９〜２７５１、２７５４〜２８１２、２８１７、２８１８、２８１９、２８２６、２８２７、２８２８、２８２９、２８３４、２８３５、２８３６、２８４１、２８４２、２８４９〜２８５４、２８５９、２８６０、２８６１、２８６３〜２８６９、２８７１〜２８７５、２８７８、２８７９、２８８０、２８８２〜２８８９、２８９３、２８９４、２８９５、２８９９〜２９０４、２９０９〜２９１３、２９１７〜２９２２、２９２８、２９２９、２９６１〜２９６３、２９６５〜２９９４、２９９６〜３０２２
のいずれかに対して少なくとも９５％の配列同一性を示すアミノ酸の配列を含み、
かつ１つまたは複数のそれらのアミノ酸改変を含有する、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項１６】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１９９、２０８、２２５０、２２７６、２２８０、または２２８４のいずれかに記載のアミノ酸の配列である、もしくはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１９９、２０８、２２５０、２２７６、２２８０、または２２８４のいずれかに記載のアミノ酸の配列を含む、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項１７】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２７６に記載のアミノ酸の配列である、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２７６に記載のアミノ酸の配列を含む、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項１８】
前記Ｆｃドメインが、低下したエフェクター機能を有するバリアントＦｃドメインである、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項１９】
前記Ｆｃドメインが、低下したエフェクター機能を有するバリアントヒトＩｇＧ１ Ｆｃドメインである、請求項１８に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項２０】
前記Ｆｃドメインが、それぞれＥＵ番号付けによるＥ２３３Ｐ、Ｌ２３４Ａ、Ｌ２３４Ｖ、Ｌ２３５Ａ、Ｌ２３５Ｅ、Ｇ２３６ｄｅｌ、Ｇ２３７Ａ、Ｓ２６７Ｋ、およびＮ２９７Ｇの中から選択される１つまたは複数のアミノ酸改変を含む、請求項１〜１９のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項２１】
前記Ｆｃドメインが、ＥＵ番号付けによるアミノ酸置換Ｎ２９７Ｇを含む、請求項１〜２０のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項２２】
前記Ｆｃドメインが、ＥＵ番号付けによるアミノ酸置換Ｒ２９２Ｃ／Ｎ２９７Ｇ／Ｖ３０２Ｃを含む、請求項１〜２１のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項２３】
前記Ｆｃドメインが、ＥＵ番号付けによるアミノ酸置換Ｌ２３４Ａ／Ｌ２３５Ｅ／Ｇ２３７Ａを含む、請求項１〜２０のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項２４】
前記Ｆｃドメインが、ＥＵ番号付けによるアミノ酸置換Ｃ２２０Ｓを含む、および／または前記Ｆｃドメインが、ＥＵ番号付けによるアミノ酸置換Ｋ４４７ｄｅｌを含む、請求項１〜２３のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項２５】
前記Ｆｃドメインが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５６〜３５８、３７６、及び１７１２〜１７１５のいずれかに記載のアミノ酸の配列、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５６〜３５８、３７６、及び１７１２〜１７１５のいずれかに対して少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％の配列同一性を示し、かつ低下したエフェクター機能を示すアミノ酸配列を含む、請求項１〜２４のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項２６】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドが、リンカーを介して間接的にＦｃドメインに連結される、請求項１〜２５のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項２７】
前記ＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質が、リンカーを介して前記Ｆｃドメインに連結した前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドからなる、請求項１〜２５のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項２８】
前記リンカーが１〜２０個のアミノ酸残基を有する、請求項２６または２７に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項２９】
前記リンカーがＧＧＧＧＳ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１７１７）またはＧＳＧＧＧＧＳ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１７１６）である、請求項２６〜２８のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項３０】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２７６に記載され、前記リンカーがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１７１６に記載され、かつ前記ＦｃがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１７１２に記載される、請求項２６〜２９のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項３１】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２７６に記載され、前記リンカーがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１７１６に記載され、かつ前記ＦｃがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１７１３に記載される、請求項２６〜２９のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項３２】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２７６に記載され、前記リンカーがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１７１６に記載され、かつ前記ＦｃがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１７１４に記載される、請求項２６〜２９のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項３３】
前記バリアントＣＤ８０ポリペプチドがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２２７６に記載され、前記リンカーがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１７１６に記載され、かつ前記ＦｃがＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１７１５に記載される、請求項２６〜２９のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質。
【請求項３４】
請求項１〜３３のいずれか１項に記載のＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質２つを含む二量体である、精製された免疫調節タンパク質。
【請求項３５】
前記二量体がホモ二量体である、請求項３４に記載の精製された免疫調節タンパク質。
【請求項３６】
請求項１〜３３のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質もしくは請求項３４または３５に記載の精製された免疫調節タンパク質の産生方法であって、ＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質をコードする核酸分子を宿主細胞に、前記宿主細胞内で前記タンパク質を発現する条件下で導入することを含み、任意で前記宿主細胞から前記精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質または前記免疫調節タンパク質を単離または精製することをさらに含む、方法。
【請求項３７】
請求項１〜３３のいずれか１項に記載の精製されたＣＤ８０−Ｆｃ融合タンパク質もしくは請求項３４または３５に記載の免疫調節タンパク質を含む、薬学的組成物であって、任意で薬学的に許容し得る賦形剤を含む、薬学的組成物。
【請求項３８】
対象において免疫応答の調節における使用のための、請求項３７に記載の薬学的組成物であって、任意で前記免疫応答が増加する、薬学的組成物。
【請求項３９】
前記免疫応答を調節することにより、前記対象の疾患または状態を治療する、請求項３８に記載の薬学的組成物であって、任意で前記疾患または状態が腫瘍またはがんである、薬学的組成物。
【請求項４０】
前記使用が、表面ＰＤ−Ｌ１に陽性の細胞を含む腫瘍を有する治療のために選択された対象におけるものであり、任意で前記細胞が腫瘍細胞もしくは腫瘍浸潤免疫細胞である、および／または
前記使用が、ＣＤ２８に陽性の細胞表面を含む腫瘍を有する治療のために選択された対象におけるものであり、任意で前記細胞が腫瘍浸潤リンパ球であり、任意で、前記リンパ球がＴ細胞、任意でＣＤ８＋Ｔ細胞である、
請求項３８または３９に記載の薬学的組成物。
【請求項４１】
対象において免疫応答を調節するための薬剤の製造における、請求項３７に記載の薬学的組成物の使用であって、任意で前記免疫応答が増加する、使用。
【請求項４２】
前記免疫応答を調節することにより、前記対象の疾患または状態を治療する、請求項４１に記載の使用であって、任意で前記疾患または状態が腫瘍またはがんである、使用。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１１１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１１１】
いくつかの実施形態では、結合試薬は、検出可能部分である標識または検出することのできる部分に直接または間接的に連結される。いくつかの実施形態では、該部分はＦｃ領域であり、任意でマウスまたはウサギＦｃ領域など非ヒトである。いくつかの実施形態では、結合した結合試薬の存在の検出は、免疫組織化学、偽免疫組織化学、免疫蛍光、フローサイトメトリー、ＥＬＩＳＡ、または免疫ブロッティングによる。
[本発明1001]
ＩｇＶドメインもしくはその特異的結合断片、ＩｇＣドメインもしくはその特異的結合断片、またはその両方を含むバリアントＣＤ80ポリペプチドであって、
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2に記載の位置の番号付けに基づいた35、46、71、7、23、26、30、34、51、55、57、58、65、73、78、79、82、または84に対応する、非改変ＣＤ80またはその特異的結合断片の1つまたは複数の位置に、1つまたは複数のアミノ酸改変を含み、
最大14個のアミノ酸改変を含む、
前記バリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1002]
ＩｇＶドメインもしくはその特異的結合断片、ＩｇＣドメインもしくはその特異的結合断片、またはその両方を含むバリアントＣＤ80ポリペプチドであって、
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2に記載の位置の番号付けに基づいた35、46、71、7、23、26、30、34、51、55、57、58、65、73、78、79、82、または84に対応する、非改変ＣＤ80またはその特異的結合断片の1つまたは複数の位置に、1つまたは複数のアミノ酸改変を含み、
前記ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片が、バリアントＣＤ80ポリペプチドの唯一のＣＤ80部分である、
前記バリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1003]
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2の番号付けに基づいた1つまたは複数の位置26、35、46、57、または71位に対応する1つまたは複数のアミノ酸改変を含む、本発明1001または本発明1002のバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1004]
ＩｇＶドメインもしくはその特異的結合断片、ＩｇＣドメインもしくはその特異的結合断片、またはその両方を含むバリアントＣＤ80ポリペプチドであって、
非改変ＣＤ80またはその特異的結合断片に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2に記載の位置の番号付けに基づいた
2020511143.tif 000001
に対応する1つまたは複数のアミノ酸改変を含み、
最大14個のアミノ酸改変を含む、
前記バリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1005]
ＩｇＶドメインもしくはその特異的結合断片、ＩｇＣドメインもしくはその特異的結合断片、またはその両方を含むバリアントＣＤ80ポリペプチドであって、
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、非改変ＣＤ80またはその特異的結合断片に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2に記載の位置の番号付けに基づいた
2020511143.tif 000002
に対応するアミノ酸改変を含み、
前記ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片が、バリアントＣＤ80ポリペプチドの唯一のＣＤ80部分である、
前記バリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1006]
アミノ酸改変Ａ26Ｅ、
アミノ酸改変Ｅ35Ｄ、
アミノ酸改変Ｄ46Ｅ、
アミノ酸改変Ｄ46Ｖ、または
アミノ酸改変Ａ71Ｇ
を含む、本発明1001〜1005のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド、
[本発明1007]
アミノ酸改変Ｍ47Ｌを含む、本発明1004または本発明1005のバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1008]
ＩｇＶドメインもしくはその特異的結合断片、ＩｇＣドメインもしくはその特異的結合断片、またはその両方を含むバリアントＣＤ80ポリペプチドであって、
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2に記載の位置の番号付けに基づいた
2020511143.tif 000003
2020511143.tif 000004
2020511143.tif 000005
2020511143.tif 000006
2020511143.tif 000007
2020511143.tif 000008
から選択されるアミノ酸改変を含む、
前記バリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1009]
アミノ酸改変
2020511143.tif 000009
を含む、本発明1001〜1008のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1010]
アミノ酸改変Ｅ35Ｄ／Ｍ47Ｉ、Ｅ35Ｄ／Ｍ47Ｌ、Ｅ35Ｄ／Ｍ47Ｖ、またはＥ35Ｄ／Ｖ68Ｍを含む、本発明1004〜1009のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1011]
アミノ酸改変Ｅ35Ｄ／Ｍ47Ｌ／Ｖ68ＭまたはＥ35Ｄ／Ｍ47Ｖ／Ｖ68Ｍを含む、本発明1004〜1010のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1012]
ヒトＰＤ−Ｌ1のエクトドメインへの非改変ＣＤ80の結合親和性と比較して、ヒトＰＤ−Ｌ1のエクトドメインに対して増加した結合親和性を示す、本発明1001〜1011のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1013]
前記親和性が、前記ＰＤ−Ｌ1のエクトドメインへの前記非改変ＣＤ80の結合親和性と比較して1．2倍、1．5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍、80倍、100倍、150倍、200倍、250倍、300倍、400倍、または450倍より多く増加する、本発明1012のバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1014]
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2に記載の位置の番号付けに基づいたアミノ酸改変
2020511143.tif 000010
2020511143.tif 000011
2020511143.tif 000012
2020511143.tif 000013
を含む、本発明1004〜1013のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1015]
前記アミノ酸改変が、Ｅ35Ｄ／Ｍ47Ｉ／Ｌ70Ｍを含む、本発明1004〜1009及び1011〜1013のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1016]
前記アミノ酸改変が、Ｅ35Ｄ／Ｍ47Ｖ／Ｎ48Ｋ／Ｖ68Ｍ／Ｋ89Ｎを含む、本発明1004〜1013のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1017]
前記アミノ酸改変が、Ｈ18Ｙ／Ａ26Ｅ／Ｅ35Ｄ／Ｍ47Ｌ／Ｖ68Ｍ／Ａ71Ｇ／Ｄ90Ｇを含む、本発明1004〜1013のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1018]
前記アミノ酸改変が、Ｅ35Ｄ／Ｄ46Ｅ／Ｍ47Ｖ／Ｖ68Ｍ／Ｄ90Ｇ／Ｋ93Ｅを含む、本発明1004〜1013のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1019]
前記アミノ酸改変が、Ｅ35Ｄ／Ｄ46Ｖ／Ｍ47Ｌ／Ｖ68Ｍ／Ｌ85Ｑ／Ｅ88Ｄを含む、本発明1004〜1013のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1020]
前記非改変ＣＤ80が、（ｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2に記載のアミノ酸の配列を含むか、（ｉｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2に対して少なくとも95％の配列同一性を有するアミノ酸の配列を含むか、または（ｉｉｉ）ＩｇＶドメインもしくはその特異的結合断片を含む（ｉ）もしくは（ｉｉ）の一部分である、本発明1001〜1019のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1021]
前記ＩｇＶドメインもしくはその特異的結合断片であるか、またはそれを含む、本発明1001〜1019のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1022]
前記ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片が、前記バリアントＣＤ80ポリペプチドの唯一のＣＤ80部分である、本発明1001〜1021のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1023]
最大1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、または13個のアミノ酸改変を含む、本発明1001〜1022のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1024]
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：3〜75、2009〜2104、2297〜2507、または2930〜2960のいずれかに記載のアミノ酸の配列もしくはその特異的結合断片、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：3〜75、2009〜2104、2297〜2507、または2930〜2960のいずれかに対して少なくとも95％の配列同一性を示し、かつ1つまたは複数のそれらのアミノ酸改変を含有する、アミノ酸の配列もしくはその特異的結合断片、または
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：77〜149、151〜223、2105〜2296、2508〜2929、もしくは2961〜3022のいずれかに記載のアミノ酸の配列もしくはその特異的結合断片、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：77〜149、151〜223、2105〜2296、2508〜2929、もしくは2961〜3022のいずれかに対して少なくとも95％の配列同一性を示し、かつ1つまたは複数のそれらのアミノ酸改変を含有する、アミノ酸の配列もしくはその特異的結合断片
を含む、本発明1001〜1023のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1025]
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：199、208、2250、2276、2280、または2284のいずれかに記載のアミノ酸の配列を含む、本発明1001〜1024のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1026]
ＣＤ80膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを欠き、かつ／または
細胞表面に発現することができない、
実施形態1001〜1025のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1027]
前記ポリペプチドの生物学的半減期を延長する部分に連結された、本発明1001〜1026のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1028]
多量体化ドメインに連結された、本発明1001〜1027のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1029]
前記多量体化ドメインが、Ｆｃドメインであるか、または低下したエフェクター機能を有するバリアントＦｃドメインである、本発明1028のバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1030]
膜貫通ドメイン及び／または細胞質シグナル伝達ドメインをさらに含む、膜貫通型免疫調節タンパク質である本発明1001〜1029のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1031]
第1の多量体化ドメインに連結された本発明1001〜1029のいずれかの第1のバリアントＣＤ80ポリペプチド及び第2の多量体化ドメインに連結された本発明1001〜1029のいずれかの第2のバリアントＣＤ80ポリペプチドを含む多量体であり、前記第1及び第2の多量体化ドメインが、相互作用して第1及び第2のバリアントＣＤ80ポリペプチドを含む多量体を形成する、免疫調節タンパク質。
[本発明1032]
前記多量体が、二量体、任意でホモ二量体である、本発明1031の免疫調節タンパク質。
[本発明1033]
前記第1のバリアントＣＤ80ポリペプチド及び第2のバリアントＣＤ80ポリペプチドが同一である、本発明1031または本発明1032の免疫調節タンパク質。
[本発明1034]
前記多量体化ドメインが、免疫グロブリンのＦｃ領域であるかまたはそれを含み、任意で、前記免疫グロブリンタンパク質がヒトである、及び／または前記Ｆｃ領域がヒトである、本発明1031〜1033のいずれかの免疫調節タンパク質。
[本発明1035]
前記Ｆｃ領域が、免疫グロブリンＧ1（ＩｇＧ1）または免疫グロブリンＧ2（ＩｇＧ2）タンパク質のものである、本発明1034の免疫調節タンパク質。
[本発明1036]
前記Ｆｃ領域が、1つまたは複数のエフェクター機能を示す、本発明1034または本発明1035の免疫調節タンパク質。
[本発明1037]
Ｆｃ依存性ＣＤ28共刺激を示す、本発明1031〜1036のいずれかの免疫調節タンパク質。
[本発明1038]
前記Ｆｃ領域が、野生型Ｆｃ領域に1つまたは複数のアミノ酸置換を含むバリアントＦｃ領域であり、前記バリアントＦｃ領域が、前記野生型Ｆｃ領域と比較して低下した1つまたは複数のエフェクター機能を示し、任意で、野生型ヒトＦｃがヒトＩｇＧ1のものである、本発明1031〜1034のいずれかの免疫調節タンパク質。
[本発明1039]
前記Ｆｃ領域が、アミノ酸置換Ｎ297Ｇを含み、前記残基が、ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って番号付けされる、本発明1038の免疫調節タンパク質。
[本発明1040]
前記Ｆｃ領域が、アミノ酸置換Ｒ292Ｃ／Ｎ297Ｇ／Ｖ302Ｃを含み、前記残基が、ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って番号付けされる、本発明1038の免疫調節タンパク質。
[本発明1041]
前記Ｆｃ領域が、アミノ酸置換Ｌ234Ａ／Ｌ235Ｅ／Ｇ237Ａを含み、前記残基が、ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って番号付けされる、本発明1038の免疫調節タンパク質。
[本発明1042]
前記バリアントＦｃ領域が、アミノ酸置換Ｃ220Ｓをさらに含み、前記残基が、ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って番号付けされる、本発明1039〜1041のいずれかの免疫調節タンパク質。
[本発明1043]
前記Ｆｃ領域が、Ｋ447ｄｅｌを含み、前記残基が、ＫａｂａｔのＥＵインデックスに従って番号付けされる、本発明1038〜1042のいずれかの免疫調節タンパク質。
[本発明1044]
本発明1012〜1029のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチドを含む、本発明1038〜1043のいずれかの免疫調節タンパク質。
[本発明1045]
ＰＤ−Ｌ1依存性ＣＤ28共刺激を示す、本発明1038〜1044のいずれかの免疫調節タンパク質。
[本発明1046]
免疫グロブリンスーパーファミリー（ＩｇＳＦ）メンバーのＩｇＳＦドメインを含む第2のポリペプチドに直接的またはリンカーを介して間接的に連結された本発明1001〜1029のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチドを含む、免疫調節タンパク質。
[本発明1047]
前記ＩｇＳＦドメインが、親和性改変ＩｇＳＦドメインであり、前記親和性改変ＩｇＳＦドメインが、前記ＩｇＳＦファミリーメンバーの非改変または野生型ＩｇＳＦドメインと比較して1つまたは複数のアミノ酸改変を含む、本発明1046の免疫調節タンパク質。
[本発明1048]
前記ＩｇＳＦドメインが、前記ＩｇＳＦファミリーメンバーの非改変または野生型ＩｇＳＦドメインの同一の1つまたは複数のコグネイト結合パートナー（複数可）への結合と比較して、1つまたは複数のそのコグネイト結合パートナー（複数可）への増加した結合を示す親和性改変ＩｇＳＦドメインである、本発明1047の免疫調節タンパク質。
[本発明1049]
細胞表面の分子に特異的に結合するターゲティング部分に連結された本発明1001〜1029のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチドを含む、コンジュゲート。
[本発明1050]
前記細胞が、免疫細胞または腫瘍細胞である、本発明1049のコンジュゲート。
[本発明1051]
前記部分が、タンパク質、ペプチド、核酸、小分子またはナノ粒子である、本発明1049または本発明1050のコンジュゲート。
[本発明1052]
前記部分が、抗体または抗原結合断片である、本発明1049〜1051のいずれかのコンジュゲート。
[本発明1053]
融合タンパク質である、本発明1050〜1052のいずれかのコンジュゲート。
[本発明1054]
本発明1001〜1030のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド、本発明1031〜1048のいずれかの免疫調節タンパク質、または本発明1049〜1053のいずれかの融合タンパク質であるコンジュゲート、をコードする核酸分子。
[本発明1055]
本発明1054の核酸分子を含む、ベクター。
[本発明1056]
発現ベクターである、本発明1055のベクター。
[本発明1057]
本発明1055または本発明1056のベクターを含む、細胞。
[本発明1058]
バリアントＣＤ80ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質の産生方法であって、本発明1054の核酸分子または本発明1055もしくは本発明1056のベクターを宿主細胞に、前記細胞内で前記タンパク質を発現する条件下で導入することを含む、前記産生方法。
[本発明1059]
前記細胞からバリアントＣＤ80ポリペプチドまたは免疫調節タンパク質を単離または精製することをさらに含む、本発明1058の方法。
[本発明1060]
バリアントＣＤ80バリアントポリペプチドを発現する細胞を操作する方法であって、実施形態1001〜1030のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチドをコードする核酸分子を宿主細胞に、前記ポリペプチドが前記細胞内で発現される条件下で導入することを含む、前記方法。
[本発明1061]
本発明1001〜1030のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド、本発明1031〜1048のいずれかの免疫調節タンパク質、本発明1049〜1053のいずれかの融合タンパク質であるコンジュゲート、本発明1054の核酸分子、または本発明1055もしくは1056のベクターを含む、操作された細胞。
[本発明1062]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、膜貫通ドメインを含まない、及び／または前記細胞の表面に発現しない；及び／または
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、発現した際に前記操作された細胞から分泌されることができる、
本発明1061の操作された細胞。
[本発明1063]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、膜貫通ドメインを含むか、本発明1029の膜貫通型免疫調節タンパク質であり；及び／または
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、前記細胞の表面に発現する、
本発明1061の操作された細胞。
[本発明1064]
前記細胞が免疫細胞であり、任意で抗原提示細胞（ＡＰＣ）またはリンパ球、任意でＴ細胞である、本発明1061〜1063のいずれかの操作された細胞。
[本発明1065]
キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）または操作されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）をさらに含む、本発明1061〜1064のいずれかの操作された細胞。
[本発明1066]
実施形態1001〜1030のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド、実施形態1031〜1047のいずれかの免疫調節タンパク質、または実施形態1048〜1052のいずれかの融合タンパク質であるコンジュゲート、をコードする核酸分子を含む、感染性物質。
[本発明1067]
細菌またはウイルスである、本発明1066の感染性物質。
[本発明1068]
前記感染性物質がウイルスであり、前記ウイルスが腫瘍溶解性ウイルスである、本発明1067の感染性物質。
[本発明1069]
本発明1001〜1030のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド、本発明1031〜1048のいずれかの免疫調節タンパク質、本発明1049〜1053のいずれかのコンジュゲート、本発明1061〜1065のいずれかの操作された細胞、または本発明1066〜1068のいずれかの感染性物質を含む、薬学的組成物。
[本発明1070]
薬学的に許容し得る賦形剤を含む、本発明1069の薬学的組成物。
[本発明1071]
前記薬学的組成物が無菌である、本発明1069または本発明1070の薬学的組成物。
[本発明1072]
バイアル内に本発明1069〜1071のいずれかの薬学的組成物を含む製造物品。
[本発明1073]
前記バイアルが密封された、本発明1072の製造物品。
[本発明1074]
本発明1069〜1071のいずれかの薬学的組成物、または本発明1072もしくは本発明1073の製造物品、及び使用説明書を含む、キット。
[本発明1075]
本発明1069〜1071のいずれかの薬学的組成物を投与することを含む、対象において免疫応答を調節する方法。
[本発明1076]
本発明1031〜1048のいずれかの免疫調節タンパク質を投与することを含む、対象において免疫応答を調節する方法。
[本発明1077]
前記免疫調節タンパク質が、Ｆｃ依存性ＣＤ28共刺激を示す本発明1037の免疫調節タンパク質である、本発明1076の方法。
[本発明1078]
前記免疫調節タンパク質が、ＰＤ−Ｌ1依存性ＣＤ28共刺激を示す本発明1044の免疫調節タンパク質であり、任意で前記免疫調節タンパク質が、本発明1012〜1029のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチドを含む、本発明1074の方法。
[本発明1079]
本発明1061〜1065のいずれかの操作された細胞を投与することを含む、対象において免疫応答を調節する方法。
[本発明1080]
前記操作された細胞が、前記対象に対して自家である、本発明1079の方法。
[本発明1081]
前記免疫応答を調節することにより、前記対象の疾患または状態を治療する、本発明1075〜1080のいずれかの方法。
[本発明1082]
前記免疫応答が増加される、本発明1075〜1081のいずれかの方法。
[本発明1083]
バリアントＣＤ80ポリペプチドを含む免疫調節タンパク質を投与することを含む、対象において免疫応答を増加させる方法であって、前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、非改変ＣＤ80またはその特異的結合断片のＩｇＶドメインまたはＩｇＣドメインまたはその特異的結合断片の1つまたは複数の位置に1つまたは複数のアミノ酸改変を含み、前記免疫調節タンパク質が、ＰＤ−Ｌ1依存性ＣＤ28共刺激を示す、前記方法。
[本発明1084]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、ＰＤ−Ｌ1のエクトドメインへの非改変ＣＤ80の結合親和性と比較して、ＰＤ−Ｌ1のエクトドメインに対して増加した結合親和性を示す、本発明1083の方法。
[本発明1085]
バリアントＣＤ80ポリペプチドを含む免疫調節タンパク質を投与することを含む、対象においてＰＤ−Ｌ1依存性ＣＤ28共刺激によりＣＤ28作動作用を媒介する方法であって、前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、非改変ＣＤ80またはその特異的結合断片のＩｇＶドメインまたはＩｇＣドメインまたはその特異的結合断片の1つまたは複数の位置に1つまたは複数のアミノ酸改変を含み、前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、ＰＤ−Ｌ1のエクトドメインへの非改変ＣＤ80の結合親和性と比較して、
ＰＤ−Ｌ1のエクトドメインに対して増加した結合親和性を示す、前記方法。
[本発明1086]
疾患または状態の治療に使用するためのものである、本発明1083〜1085のいずれかの方法。
[本発明1087]
前記投与の前に、表面ＰＤ−Ｌ1に陽性の細胞を含む腫瘍を有する治療対象を選択し、任意で、前記細胞が腫瘍細胞もしくは腫瘍浸潤免疫細胞である；または
前記対象がＰＤ−Ｌ1に陽性の細胞表面を含む腫瘍を有するものとして選択され、任意で、前記細胞が腫瘍細胞または腫瘍浸潤免疫細胞である、
本発明1075〜1086のいずれかの方法。
[本発明1088]
対象の選択が、
（ａ）対象由来の腫瘍組織試料を、ＰＤ−Ｌ1のエクトドメインに特異的に結合することができる結合試薬と接触させることと、
（ｂ）前記腫瘍組織試料の細胞内または細胞上に結合した結合試薬の存在を検出することであって、任意で前記細胞が腫瘍細胞または腫瘍浸潤免疫細胞である、前記検出することと、
（ｃ）前記腫瘍組織試料が検出可能レベルのＰＤ−Ｌ1に陽性の細胞表面を含む場合に、治療のために前記対象を選択することと
を含む、本発明1087の方法。
[本発明1089]
前記投与の前に、ＣＤ28に陽性の細胞表面を含む腫瘍を有する治療対象を選択し、任意で前記細胞が腫瘍浸潤リンパ球であり、任意で前記リンパ球がＴ細胞、任意でＣＤ8＋Ｔ細胞である；または
前記対象が、ＣＤ28に陽性の細胞表面を含む腫瘍を有するものとして選択され、任意で前記細胞が腫瘍浸潤リンパ球であり、任意で前記リンパ球がＴ細胞、任意でＣＤ8＋Ｔ細胞である、
本発明1075〜1088のいずれかの方法。
[本発明1090]
前記対象の選択が、
（ａ）対象由来の腫瘍組織試料を、ＣＤ28のエクトドメインに特異的に結合することができる結合試薬と接触させることと、
（ｂ）前記腫瘍組織試料の細胞内または細胞上に結合した結合試薬の存在を検出することであって、任意で前記細胞が腫瘍浸潤リンパ球であり、任意で前記リンパ球がＴ細胞、任意でＣＤ8＋Ｔ細胞である、前記検出することと、
（ｃ）前記腫瘍組織試料が検出可能レベルのＣＤ28に陽性の細胞表面を含む場合に、治療のために前記対象を選択することと
を含む、本発明1089の方法。
[本発明1091]
（ａ）対象由来の腫瘍組織試料を、ＰＤ−Ｌ1に特異的に結合することができる結合試薬と接触させることと、
（ｂ）前記腫瘍組織試料の細胞内または細胞上に結合した結合試薬の存在を検出することであって、任意で前記細胞が腫瘍細胞または腫瘍浸潤免疫細胞である、前記検出することと、
（ｃ）前記腫瘍試料が検出可能レベルのＰＤ−Ｌ1に陽性の細胞表面を含む場合、バリアントＣＤ80ポリペプチドを含む免疫調節タンパク質による治療のための対象を選択することであって、前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、非改変ＣＤ80またはその特異的結合断片のＩｇＶドメインまたはＩｇＣドメインまたはその特異的結合断片の1つまたは複数の位置に1つまたは複数のアミノ酸改変を含み、前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、ＰＤ−Ｌ1のエクトドメインへの非改変ＣＤ80の結合親和性と比較して、ＰＤ−Ｌ1のエクトドメインに対して増加した結合親和性を示す、前記選択することと
を含む、治療対象を選択する方法。
[本発明1092]
前記腫瘍組織試料を、ＣＤ28に特異的に結合することができる結合試薬と接触させることを含み、前記腫瘍組織試料が、検出可能レベルのＣＤ28に陽性の腫瘍浸潤リンパ球をさらに含む場合に、前記対象が選択され、任意で前記リンパ球がＴ細胞、任意でＣＤ8＋Ｔ細胞である、本発明1091の方法。
[本発明1093]
前記腫瘍組織試料が、腫瘍浸潤免疫細胞、腫瘍細胞、間質細胞、またはそれらの任意の組み合わせを含む、本発明1088及び1090〜1092のいずれかの方法。
[本発明1094]
前記結合試薬が、抗体もしくは抗原結合断片、タンパク質リガンドもしくは結合パートナー、アプタマー、アフィマー、ペプチド、またはハプテンである、本発明1088及び1090〜1093の方法。
[本発明1095]
前記結合試薬が、抗ＰＤ−Ｌ1抗体または抗原結合断片である、本発明1088、1091、1093または1094の方法。
[本発明1096]
前記結合試薬が、本発明1001〜1030のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチドを含む、本発明1088〜1094のいずれかの方法。
[本発明1097]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、前記ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片を含む、本発明1096の方法。
[本発明1098]
前記ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片が、前記結合試薬の唯一のＣＤ80部分である本発明1096または1097の方法。
[本発明1099]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、前記野生型または非改変ＣＤ80ポリペプチドと比較してＰＤ−Ｌ1への結合に対する増加した親和性を示す、本発明1096〜1098のいずれかの方法。
[本発明1100]
前記結合試薬が、検出可能部分または検出することのできる部分である部分に直接または間接的に連結される、本発明1088及び1090〜1099のいずれかの方法。
[本発明1101]
前記部分がＦｃ領域である、本発明1100の方法。
[本発明1102]
前記Ｆｃ領域が非ヒト、任意でマウスまたはウサギである、本発明1101の方法。
[本発明1103]
結合した結合試薬の存在の検出が、免疫組織化学、偽免疫組織化学、免疫蛍光、フローサイトメトリー、ＥＬＩＳＡ、または免疫ブロッティングによる、本発明1088及び1090〜1102のいずれかの方法。
[本発明1104]
前記免疫調節タンパク質を前記対象に投与することをさらに含む、本発明1091〜1103のいずれかの方法。
[本発明1105]
前記免疫調節タンパク質が、第1の多量体化ドメインに連結された第1のバリアントＣＤ80ポリペプチド及び第2の多量体化ドメインに連結された第2のバリアントＣＤ80ポリペプチドを含む多量体であり、前記第1及び第2の多量体化ドメインが、相互作用して前記第1及び第2のバリアントＣＤ80ポリペプチドを含む多量体を形成する、本発明1083〜1104のいずれかの方法。
[本発明1106]
前記多量体が二量体である、本発明1105の方法。
[本発明1107]
前記第1のバリアントＣＤ80ポリペプチド及び前記第2のバリアントＣＤ80ポリペプチドが同一である、本発明1105または本発明1106の方法。
[本発明1108]
前記多量体化ドメインが、Ｆｃ領域であるか、またはそれを含む、本発明1105〜1107のいずれかの方法。
[本発明1109]
前記Ｆｃ領域が、野生型Ｆｃ領域と比較して1つまたは複数のアミノ酸置換を含むバリアントＦｃ領域であり、前記Ｆｃ領域が、前記野生型Ｆｃ領域と比較して低下した1つまたは複数のエフェクター機能を示し、任意で前記野生型Ｆｃが、ヒトＩｇＧ1である、本発明1108の方法。
[本発明1110]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、非改変ＣＤ80またはその特異的結合断片に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2に記載の位置の番号付けに基づいた7、12、13、15、16、18、21、20、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、33、34、35、36、37、38、41、42、43、44、46、47、48、51、53、54、55、57、58、61、62、63、64、65、67、68、69、70、71、72、73、74、76、77、78、79、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、及び／または97に対応する1つまたは複数のアミノ酸改変を含む、本発明1083〜1109のいずれかの方法。
[本発明1111]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、非改変ＣＤ80またはその特異的結合断片に、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2に記載の位置の番号付けに基づいた
2020511143.tif 000014
に対応する1つまたは複数のアミノ酸改変を含む、本発明1083〜1110のいずれかの方法。
[本発明1112]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、1つまたは複数の位置13、18、21、22、24、26、27、33、35、37、38、41、43、46、47、48、53、61、62、68、70、71、79、85、87、88、90、91、93、94、95または97位に対応する1つまたは複数のアミノ酸改変を含み、任意で前記1つまたは複数のアミノ酸改変が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2の番号付けに基づいた
2020511143.tif 000015
から選択される、本発明1083〜1110のいずれかの方法。
[本発明1113]
前記1つまたは複数のアミノ酸改変が、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2に記載の位置の番号付けに基づいた
2020511143.tif 000016
2020511143.tif 000017
2020511143.tif 000018
2020511143.tif 000019
2020511143.tif 000020
から選択される、本発明1083〜1112のいずれかの方法。
[本発明1114]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、
アミノ酸改変Ｈ18Ｙ、
アミノ酸改変Ａ26Ｅ、
アミノ酸改変Ｅ35Ｄ、
アミノ酸改変Ｄ46Ｅ、
アミノ酸改変Ｄ46Ｖ、
アミノ酸改変Ｍ47Ｉ、
アミノ酸改変Ｍ47Ｌ、
アミノ酸改変Ｖ68Ｍ、
アミノ酸改変Ａ71Ｇ、
アミノ酸改変Ｌ85Ｑ、または
アミノ酸改変Ｄ90Ｇ
を含む、本発明1083〜1113のいずれかの方法。
[本発明1115]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、アミノ酸改変
2020511143.tif 000021
を含む、本発明1083〜1114のいずれかの方法。
[本発明1116]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、アミノ酸改変Ｅ35Ｄ／Ｍ47Ｉ、Ｅ35Ｄ／Ｍ47Ｌ、Ｅ35Ｄ／Ｍ47Ｖ、またはＥ35Ｄ／Ｖ68Ｍを含む、本発明1083〜1115のいずれかの方法。
[本発明1117]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、アミノ酸改変Ｅ35Ｄ／Ｍ47Ｌ／Ｖ68ＭまたはＥ35Ｄ／Ｍ47Ｖ／Ｖ68Ｍを含む、本発明1083〜1116のいずれかの方法。
[本発明1118]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、アミノ酸改変Ｅ35Ｄ／Ｍ47Ｉ／Ｌ70Ｍを含む、本発明1083〜1116のいずれかの方法。
[本発明1119]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、アミノ酸改変Ｅ35Ｄ／Ｍ47Ｖ／Ｎ48Ｋ／Ｖ68Ｍ／Ｋ89Ｎを含む、本発明1083〜1117のいずれかの方法。
[本発明1120]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、アミノ酸改変Ｈ18Ｙ／Ａ26Ｅ／Ｅ35Ｄ／Ｍ47Ｌ／Ｖ68Ｍ／Ａ71Ｇ／Ｄ90Ｇを含む、本発明1083〜1117のいずれかの方法。
[本発明1121]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、アミノ酸改変Ｅ35Ｄ／Ｄ46Ｅ／Ｍ47Ｖ／Ｖ68Ｍ／Ｄ90Ｇ／Ｋ93Ｅを含む、本発明1083〜1117のいずれかの方法。
[本発明1122]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、アミノ酸改変Ｅ35Ｄ／Ｄ46Ｖ／Ｍ47Ｌ／Ｖ68Ｍ／Ｌ85Ｑ／Ｅ88Ｄを含む、本発明1083〜1117のいずれかの方法。
[本発明1123]
前記免疫調節タンパク質が可溶性であり、任意で、前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、ＣＤ80膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを欠く、本発明1083〜1122のいずれかの方法。
[本発明1124]
前記非改変ＣＤ80が、（ｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2に記載のアミノ酸の配列を含むか、（ｉｉ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2に対して少なくとも95％の配列同一性を有するアミノ酸の配列を含むか、または（ｉｉｉ）ＩｇＶドメインもしくはその特異的結合断片を含む（ｉ）もしくは（ｉｉ）の一部分である、本発明1083〜1123のいずれかの方法。
[本発明1125]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、ＩｇＶドメインもしくはその特異的結合断片であるか、またはそれを含む、本発明1083〜1124のいずれかの方法。
[本発明1126]
前記ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片が、前記免疫調節タンパク質の唯一のＣＤ80部分である、本発明1083〜1125のいずれかの方法。
[本発明1127]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、最大1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20個のアミノ酸改変を含む、本発明1083〜1126のいずれかの方法。
[本発明1128]
前記免疫調節タンパク質がＦｃ融合タンパク質である、本発明1083〜1127のいずれかの方法。
[本発明1129]
前記疾患または状態が、腫瘍またはがんである、本発明1081、1082、及び1086〜1128のいずれかの方法。
[本発明1130]
前記対象が、ＰＤ−1／ＰＤ−Ｌ1またはＰＤ−1／ＰＤ−Ｌ2の拮抗物質による治療後、寛解後に再発したか、不応性になったか、またはノンレスポンダーである、本発明1075〜1129のいずれかの方法。
[本発明1131]
前記拮抗物質が抗ＰＤ−1抗体、任意でニボルマブまたはペンブロリズマブである、本発明1130の方法。
[本発明1132]
前記免疫応答が減少される、本発明1075〜1081のいずれかの方法。
[本発明1133]
前記疾患または状態が、炎症性または自己免疫性疾患または状態である、本発明1075〜1081及び1132のいずれかの方法。
[本発明1134]
生体試料中のＣＤ80結合パートナーを検出する方法であって、
（ａ）生体試料を、本発明1001〜1030のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチドを含む結合試薬と接触させることと、
（ｂ）前記生体試料の細胞内または細胞上に結合した前記結合試薬の存在を検出することと
を含む、前記方法。
[本発明1135]
前記結合パートナーが、ＰＤ−Ｌ1、ＣＤ28、ＣＴＬＡ−4またはこれらの組み合わせである、本発明1134の方法。
[本発明1136]
前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、非改変ＣＤ80またはその特異的結合断片のＩｇＶドメインまたはＩｇＣドメインまたはその特異的結合断片の1つまたは複数の位置に1つまたは複数のアミノ酸改変を含み、前記バリアントＣＤ80ポリペプチドが、ＰＤ−Ｌ1のエクトドメインへの非改変ＣＤ80の結合親和性と比較してＰＤ−Ｌ1のエクトドメインに対して増加した結合親和性を示す、本発明1134または本発明1135の方法。
[本発明1137]
前記生体試料が、体液、細胞、もしくは組織試料であるか、またはそれを含む、本発明1134〜1136のいずれかの方法。
[本発明1138]
前記体液が、血清、血漿、または尿である、本発明1137の方法。
[本発明1139]
前記組織試料が、腫瘍組織試料である、本発明1137の方法。
[本発明1140]
前記腫瘍組織試料が、腫瘍浸潤免疫細胞、腫瘍細胞、間質細胞、またはそれらの任意の組み合わせを含む、本発明1139の方法。
[本発明1141]
前記ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片を含む、本発明1134〜1140のいずれかのバリアントＣＤ80ポリペプチド。
[本発明1142]
前記ＩｇＶドメインまたはその特異的結合断片が、前記結合試薬の唯一のＣＤ80部分である、本発明1141の方法。
[本発明1143]
前記結合試薬が、検出可能部分である標識にまたは検出することのできる部分に直接または間接的に連結される、本発明1134〜1142のいずれかの方法。
[本発明1144]
前記部分がＦｃ領域である、本発明1143の方法。
[本発明1145]
前記Ｆｃ領域が非ヒト、任意でマウスまたはウサギである、本発明1144の方法。
[本発明1146]
結合した結合試薬の存在の検出が、免疫組織化学、偽免疫組織化学、免疫蛍光、フローサイトメトリー、ＥＬＩＳＡ、または免疫ブロッティングによる、本発明1134〜1145のいずれかの方法。