【誤訳訂正書】
【提出日】令和3年7月23日(2021.7.23)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】特許請求の範囲
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
候補分析種を順位づけるための方法であって、
分析種分子から検出されたイオン及びフラグメントイオンをマススペクトルとして提示することによって質量分析計での実験分析種を分析する工程であって、前記マススペクトルが各検出瞬時に対応するイオン質量と信号強度の組合せのリストを含む、分析する工程と、
所定の値の不合格範囲、所定の値の合格範囲及び所定の値の中立範囲をあらかじめ定める行程と、
前記所定の値の不合格範囲、前記所定の値の合格範囲及び前記所定の値の中立範囲の各々の累積信頼度スコアの部分をあらかじめ定める行程と、  前記実験分析種をライブラリヒットリスト内の複数の候補分析種に比較し、各候補分析種へ前記累積信頼度スコアの部分のひとつを割り当てる工程であって、
各候補分析種のライブラリマススペクトルに対する類似度に基づいて前記実験分析種を前記候補分析種に比較する工程、
前記ライブラリヒットリスト内の各候補分析種の前記ライブラリマススペクトル内の分子イオンの最も存在度の高い同位体の存在及びそれの質量に基づいて前記実験分析種を前記候補分析種に比較する工程、及び、
フラグメントイオンの存在度、イオンピーク中の最小イオン数、及びフラグメントイオンの質量に基づいて前記実験分析種を前記候補分析種に比較する工程、
に基づいて、前記累積信頼度スコアの部分のひとつを割り当てる工程と、
前記ライブラリヒットリスト内の誤った結果の確率を下げるために各候補分析種に割り当てられた前記累積信頼度スコアの部分に基づいて、前記候補分析種を順位づける工程と、
を備えている方法。
【請求項２】
前記ライブラリ類似度スコアのためのあらかじめ定められた前記所定の値の不合格範囲はＸ以下であり、前記ライブラリ類似度スコアのためのあらかじめ定められた前記所定の値の合格範囲はＹ以上であり、前記ライブラリ類似度スコアのためのあらかじめ定められた前記所定の値の中立範囲はＸとＹの間である、請求項１に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
【請求項３】
前記不合格範囲に入る候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は−１．５の値を割り当てられ、前記中立範囲に入る候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は０の値を割り当てられ、前記合格範囲に入る候補の前記累積信頼度スコアの部分は１の値を割り当てられる、請求項２に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
【請求項４】
前記分子イオンの前記最も存在度の高い同位体の所定の判定基準は、最低限の許容可能な存在度及び質量確度ウインドーに基づく不合格判定基準、合格判定基準、及び中立判定基準を含んでおり、前記不合格判定基準は、前記分子イオンの前記最も存在度の高い同位体の前記存在度が前記最低限の許容可能な存在度を超過し且つ前記分子イオンの前記最も存在度の高い同位体の質量が前記質量確度ウインドーの外であることを要件とし、前記合格判定基準は、前記分子イオンの前記最も存在度の高い同位体の前記存在度が前記最低限の許容可能な存在度を超過し且つ前記分子イオンの前記最も存在度の高い同位体の前記質量が前記質量確度ウインドーの内であることを要件とし、前記中立判定基準は、前記不合格判定基準及び前記合格判定基準が満たされない場合に満たされる、請求項１に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
【請求項５】
前記不合格判定基準を満たしている候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は−１．５の値を割り当てられ、前記合格判定基準を満たしている候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は１の値を割り当てられ、前記中立判定基準を満たしている候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は０の値を割り当てられる、請求項４に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
【請求項６】
前記フラグメントイオンの所定の判定基準は、最低限の許容可能な存在度及び質量確度ウインドーに基づく合格判定基準、中立判定基準、及び不合格判定基準を含んでおり、前記合格判定基準は、前記フラグメントイオンの前記存在度が前記最低限の許容可能な存在度を超過し且つ前記フラグメントイオンの前記質量が前記質量確度ウインドーの内であることを要件とし、前記中立判定基準は、前記フラグメントイオンが前記最低限の許容可能な存在度判定基準を超過しない場合又は前記フラグメントイオンのピークのどれもが少なくとも最小イオン数を包含していない場合に満たされる、請求項１に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
【請求項７】
前記合格判定基準を満たしている候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は１の値を割り当てられ、前記不合格判定基準を満たしている候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は−１．５の値を割り当てられ、前記中立判定基準を満たしている候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は０の値を割り当てられる、請求項６に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
【請求項８】
前記実験分析種をライブラリヒットリスト内の複数の候補分析種に比較し、各候補分析種へ累積信頼度スコアを割り当てる前記工程は、
保持指標値に基づいて前記実験分析種を前記候補分析種に比較し、前記保持指標値のあらかじめ定められた判定基準に基づいて各候補分析種へ前記累積信頼度スコアの第４の部分を割り当てる工程、を更に備えている、請求項１に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
【請求項９】
前記保持指標値は、１つ又はそれ以上の次元による保持指標値から選択されている、請求項８に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
【請求項１０】
前記保持指標値は、許容保持指標ウインドーに基づく合格範囲、中立判定基準、及び不合格範囲を有しており、前記合格範囲は前記許容保持指標ウインドーの内であり、前記中立判定基準は前記候補分析種の前記保持指標値が使えないことを要件とし、前記不合格範囲は前記許容保持指標ウインドーの外である、請求項８に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
【請求項１１】
前記合格範囲に入る候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は１の値を割り当てられ、前記中立判定基準を満たしている候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は０の値を割り当てられ、前記不合格範囲に入る候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は０の値を割り当てられる、請求項１０に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
【請求項１２】
前記累積信頼度スコアは−６から４までの範囲である、請求項１に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
【請求項１３】
前記候補分析種は各候補分析種の前記累積信頼度スコアの降順に順位づけられる、請求項１に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
【請求項１４】
実験分析種を分析することに関する前記工程は、ガスクロマトグラフィ−質量分析計を使用して起こる、請求項１に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
【請求項１５】
前記候補分析種を順位づける前記工程は、前記候補分析種を、各候補分析種に割当てられた前記累積信頼度スコアの部分に基づいて降順に順位づける行程を備えている、請求項１に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０００８
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０００８】
開示の１つの態様は、分析種を順位づけるための方法を提供しており、方法は、例えばガスクロマトグラフィ−質量分析と関連して、質量分析計での実験分析種を分析する工程を含んでいる。方法は、実験分析種をライブラリヒットリスト内の複数の候補分析種に比較し、各候補分析種へ累積信頼度スコアを割り当てる工程であって、ライブラリ類似度スコアに基づいて実験分析種を候補分析種に比較する工程、分子イオンの最も存在度の高い同位体の存在及び質量確度に基づいて実験分析種を候補分析種に比較する工程、フラグメントイオンの存在及び質量確度に基づいて実験分析種を候補分析種に比較する工程、及び一部の実施形では保持指標値に基づいて実験分析種を候補分析種に比較する工程、に基づいて累積信頼度スコアを割り当てる工程、を含んでいる。方法は、候補分析種を各候補分析種の累積信頼度スコアに基づいて順位づける工程を含んでいる。
【誤訳訂正３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１３
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１３】
不合格判定基準を満たしている候補分析種の累積信頼度スコアの部分は−１．５の値を割り当てられ、合格判定準を満たしている候補分析種の累積信頼度スコアの部分は１の値を割り当てられ、中立判定基準を満たしている候補分析種の累積信頼度スコアの部分は０の値を割り当てられるようになっていてもよい。
【誤訳訂正４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００２３
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００２３】
【図１】分析種を順位づけるための方法のフローチャートである。
【図２】分析種を順位づけるための方法の部分のフローチャートである。
【図３】分析種を順位づけるための方法の部分のフローチャートである。
【図４】分析種を順位づけるための方法の部分のフローチャートである。
【図５】分析種を順位づけるための方法の部分のフローチャートである。
【誤訳訂正５】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００２５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００２５】
図１を参照すると、分析種を順位づけるための方法１０が概括的に示されている。分析種を順位づけるための方法１０は、ガスクロマトグラフィ−質量分析を使用して実験分析種を分析する工程１２を含んでいる。方法は工程１２に示されるクロマトグラフィ−質量分析型の配置に関連して開示されているが、他の質量分析計構成に関連した順位づけ方法にとっては他の構成が適切である。引き続き図１を参照して、方法１０は、実験分析種をライブラリヒットリスト内の複数の候補分析種と比較する工程１６−２２及び各候補分析種へ累積信頼度スコアを割り当てる工程２４−３０を含んでおり、割り当てる工程２４−３０は、ライブラリ類似度スコアに基づいて実験分析種を候補分析種に比較する工程１６、分子イオンの最も存在度の高い同位体に基づいて実験分析種を候補分析種に比較する工程１８、フラグメントイオンの存在度及び質量確度に基づいて実験分析種を候補分析種に比較する工程２０、及び一部の実施形では保持指標値に基づいて実験分析種を候補分析種に比較する工程２２、に基づいて累積信頼度スコアを割り当てる。方法は候補分析種を各候補分析種の累積信頼度スコアに基づいて順位づける工程３４を含んでいる。
【誤訳訂正６】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００３４
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００３４】
図１を参照して、累積信頼度スコアの諸部分が合計されて、候補分析種毎の累積信頼度スコアが求められることになる３２。累積信頼度スコアは−６から４までの範囲ということになろう。候補分析種は、各候補分析種の累積信頼度スコアの降順に順位づけされることができる３４。例えば、候補分析種は、デフォルトにより各候補分析種の累積信頼度スコアの降順に順位づけられ、２つ又はそれ以上の候補分析種の累積信頼度スコアの値が等しい場合にスペクトル類似度スコアによる二次的な仕分けがなされてもよい。それでもなお同点の場合、最初に見つけられた候補分析種が後で見つけられた候補分析種よりも高位に順位づけられるようになっていてもよい。
【誤訳訂正７】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００３５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００３５】
分析種を順位づけるための方法１０は、誤ったヒットを除外し、おそらくはガスクロマトグラフィ例えば因子４からの及び質量分析例えば因子１−３からの候補分析種をヒットリストの最上位に動かすことによって、候補分析種提案の信頼性を改善することができるだろう。
【誤訳訂正８】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００３９
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００３９】
１０  分析種を順位づけるための方法
８８  ライブラリ類似度スコアを比較するための方法
９０  分子イオンの最も存在度の高い同位体を比較するための方法
９２  フラグメントイオンを比較するための方法
９４  保持指標値を比較するための方法
【誤訳訂正９】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】発明の名称
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【発明の名称】候補分析種を順位づけるための方法
【誤訳訂正１０】
【訂正対象書類名】図面
【訂正対象項目名】図１
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【図１】
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