【手続補正書】
【提出日】平成17年8月23日(2005.8.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４０】
図７はこのようにして得られる光量分布の一例であり、画像７１上で線密度は光量密度を示している。さらに破線で示した部分が検出対象設置領域７２である。この領域は本ソフトウェアを使用する際に使用者が指定すればよいが、あらかじめ画像７１内に標識が含まれていれば、自動的に認識することも可能である。本ソフトウェアでは、検出対象の画像に対して、画像７１上における領域７２の光量分布画像データに基づき、光量（輝度あるいは濃度）の補正を行う。
最も簡易な例としては、蛍光アクリル板や感光フィルムのように、光源に対する反射や吸収発光および変色する特性に優れた板材を撮影し、その画像を光量分布画像として用いることである。さらに厳密性を高めたい場合には、受光素子を走査して、個々の部位の光量を検出し、電気信号に変換する。この電気信号の例えば振幅値（又は、振幅値に相当するデジタル値）に対し、予め光源がこの部位に照射した場合の光量値であって、基準となる光量値に対応する電気信号の基準振幅値（又は、振幅値に相当するデジタル値）を記憶手段に記憶し、用時、この基準振幅値を記憶手段から呼び出して、比較し、検出した振幅値が基準振幅値に基づいた所定の閾値内にあれば、補正せず、閾値外であれば、基準値の閾値に補正する為の補正アルゴリズムを設定する。
その後、この光源により、照明された担体上の試料であって、補正アルゴリズム適用エリアの部位に対し、得られる受光光量を補正アルゴリズムによって、値の修正、例えば、光量が少ない場合の補正アルゴリズムは、その受光値が実際の光源の光量よりも少ない場合は、実際の光量パラメータを減算することにより補正する。
また、補正に用いられる画像は照射光量分布画像に限らず、撮影などのデータ記録時にノイズとして含まれてしまうものも利用される。例えば傷がついたフィルタを使用したり、蛍光管などの光源の形状が画像に写りこむことが避けられない場合などである。これらのノイズの位置や形状などの性質が判明する画像を記録しておけば、それに基づいて本ソフトウェアで補正を行い、例えば、画像の狭い領域で、急激に、受光色彩が変化するような場合、この部分を隣接する部位の受光色彩に置き換えることでノイズを消去した画像が得られる。これまでに述べた照射光量分布画像、ノイズ画像などの補正用データは、可能ならば実験者自身が作成してもよい。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４２】
部分的画像データからの全体イメージ作成とマッピング
図５に示したようなスキャニングシステムを用いれば、光量の均一性は確保されるが、この場合には検出対象のごく限られた領域にしか光照射できないため、目的領域を切り出したい場合など、全体に対する位置づけを把握する必要がある操作のときに扱いにくい。これについても、本ソフトウェアで機能を補う必要がある。具体的には、スキャニングして得られた光学的データ（部分画像データ）を、スキャニング位置に応じて配置し、図７に示すような１枚の全体イメージ７１を作成する。全体イメージ７１上には通常、複数の光学的シグナルが分布している。さらに、光源および検出器によって現在の照射（測定）位置で得られる光学的データ（画像）領域７２を、破線や色枠で画像上に示す。画像領域７２は、検出器から得られるデータを、本ソフトウェアによって全体イメージ作成の際に利用したデータとマッチングさせて認識すればよい。ただし、画像が複雑な場合等は、スキャニングシステムから直接、位置情報を得て認識する場合もありうる。このようにして全体イメージおよび現在照射されている領域が同時に表示されれば、現在照射（測定）されている領域が全体イメージの中でどの位置にあたるかが把握しやすく、切り出しなどの操作を正確に行うことが可能である。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４３】
さらに、このようなイメージング方法は、紫外、赤外、温度変化など、目に見えないシグナル領域に対して、切り出しなどの作業を行う場合にも有用である。すなわち、目に見えない赤外光などの試料シグナルを発生させる行程と、検出対象上に可視光源などで目に見える指標（部分イメージ）を発生させる行程と、試料シグナルを可視化したものおよび目に見える指標を合成して全体イメージ化する行程を組み合わせることにより、全体イメージを確認しながら作業を行えるのである。なお、全体イメージ７１に対して、現在の画像領域７２が時間変化している場合には、操作を主体とするならば現在の画像を優先して表示する。
いずれにしても、このようなイメージング方法を用いれば、光源が半導体レーザーのように、極めて狭い領域を照射するものであっても、全体に対する位置を正確に把握できる。したがって、蛍光管では不可能な波長や強力な照射を行うような特殊光源などを利用することも可能になる。大腸菌コロニー群や二次元電気泳動のスポット群のように、細かいスポットが無数に分布しているような検出対象の観察あるいは処理においては、むしろ全体を照射していると目的位置を把握しにくく、限定された領域の照射が有効となる場合もある。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００９６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００９６】
【図１】本発明の生体試料検出装置の一実施例のフレームを示す図
【図２】本発明の照射器の一実施例を示す図
【図３】本発明の照射器の一実施例を示す図
【図４】本発明の生体試料検出装置の一実施例を示す図
【図５】本発明の生体試料検出装置の一実施例を示す図
【図６】本発明の生体試料解析方法の一実施例を説明する為の図
【図７】本発明の生体試料検出装置の一実施例を説明する為の図
【図８】本発明の生体試料解析方法による選択領域の一例を示す図
【図９】本発明の生体試料解析方法の一実施例を示す図
【図１０】本発明の生体試料解析方法の一実施例を示す図
【図１１】本発明の生体試料解析方法の一実施例を示す図
【図１２】本発明の生体試料解析方法の一実施例を示す図
【図１３】本発明の生体試料検出装置に用いる補助器具を示す図
【図１４】本発明の生体試料検出装置に用いる補助器具を示す図
【図１５】本発明の生体試料検出装置に用いる補助器具を示す図
【図１６】本発明の生体試料検出装置に用いる補助器具の使用手順を示す図
【図１７】本発明の生体試料検出装置に用いる補助器具を示す図
【図１８】本発明の生体試料検出装置に用いる補助器具を示す図
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００９７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００９７】
１  天板
２  レンズ
３  レンズ筐体
４  上部固定部材
５  光源
６  上部フレーム
７  下部フレーム
８  調整ねじ
９  下部固定部材
１０  電源コード
１a  天板
２a  レンズ
３a  レンズ筐体
４a  フィルタ
５a  フィルタ筐体
２１  トランスイルミネーター
２２  紫外蛍光管
２３  フィルタ
３１  光源
３２  導光板
３３  反射材
４１  カバー部材
４２  固定部材
４３  遮光部材
４４  手を入れるスペース
４５  フード
５１  光透過板
５２  光源
５３  検出器
５４  検出対象
７１  全体イメージ
７２  画像領域
８１  解析対象画像
８２  長方形指定
８３  楕円（正円）指定
８４  任意の形状
８５  解析方向指定線
８６  領域幅
８７  ラベル
９１  泳動担体
９２  試料の分離パターン
９３  泳動マーカーの分離パターン
１３１  板状部品
１３２  接続部品
１３３  溝
１３１１  流路
１３１２  ホール
１３１３  リアクター
１３１４  接続用凹凸構造
１３２１  容器
１３２２  蓋
１３２３  パック
１３２４  ゲル
１４１  支持体
１４２  加工具
１４３  イメージセンサー
１４４  ケーブル
１５１  切り出しチップ
１５２  中空部分
１７１  筐体
１７２  センサー
１７３  光源
１７４  支持体
１７５  ねじ
１７６  固定部材
１７７  入力スイッチ
１７８  外部ケーブル
１８００  筐体
１８０１  検出コード
１８０２  センサー
１８０３  光源
１８０４  支持体
１８０５  ねじ
１８０６  固定部材
１８０７  入力スイッチ
１８０８  ディスプレイ
１８０９  通気孔配列
１８１０  電力出力端子
１８１１  外部ケーブル
【手続補正６】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図６】
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