【手続補正書】
【提出日】令和2年12月8日(2020.12.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子内の２本鎖切断（ＤＳＢ）を誘発する、またはＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子を修飾する方法であって、細胞に、配列番号５〜１２９から選択されるガイド配列、または配列番号５〜１２９から選択される配列と少なくとも９０％同一であるガイド配列を含む、ガイドＲＮＡを含む組成物を送達することを含む、方法。
【請求項２】
（ｉ）ＲＮＡガイドされたＤＮＡ結合剤、またはＲＮＡガイドされたＤＮＡ結合剤をコードする核酸と、（ｉｉ）配列番号５〜１２９から選択されるガイド配列、または配列番号５〜１２９から選択される配列と少なくとも９０％同一であるガイド配列を含むガイドＲＮＡと、を含む、対象におけるアルファ１アンチトリプシン欠乏症（ＡＡＴＤ）の治療における使用のための組成物。
【請求項３】
（ｉ）ＲＮＡガイドされたＤＮＡ結合剤、またはＲＮＡガイドされたＤＮＡ結合剤をコードする核酸と、（ｉｉ）配列番号５〜１２９から選択されるガイド配列、または配列番号５〜１２９から選択される配列と少なくとも９０％同一であるガイド配列を含む、ガイドＲＮＡと、を含む、対象における肝臓内のアルファ１アンチトリプシン（ＡＡＴ）蓄積の低減または防止における使用のための組成物。
【請求項４】
配列番号５〜１２９から選択されるガイド配列、または配列番号５〜１２９から選択される配列と少なくとも９０％同一であるガイド配列を含む、ガイドＲＮＡまたはそのガイドＲＮＡをコードするベクターを含む、組成物。
【請求項５】
細胞または対象におけるＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子内の２本鎖切断（ＤＳＢ）の誘発、
細胞または対象におけるＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子内の修飾、
対象におけるアルファ１アンチトリプシン欠乏症（ＡＡＴＤ）の治療、
対象におけるＡＡＴの血清中濃度または肝臓中濃度の低減、および
対象における肝臓内のアルファ１アンチトリプシン（ＡＡＴ）蓄積の低減または防止
から選択される少なくとも１つにおける使用のための、請求項４に記載の組成物。
【請求項６】
前記組成物が、細胞内のＡＡＴレベルを低減する、請求項１に記載の方法、または請求項２、３もしくは５に記載の使用のための組成物。
【請求項７】
前記ＡＡＴレベルが、前記細胞に前記組成物を送達する前のＡＡＴレベルと比較して、少なくとも４０％低減される、請求項６に記載の方法または使用のための組成物。
【請求項８】
前記組成物が前記ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子の編集をもたらすものであり、任意選択で、前記編集が、編集された集団のパーセンテージ（編集パーセント）として計算され、任意選択で、前記編集パーセントが３０から９０％の間である、請求項１〜３および５〜７のいずれか１項に記載の方法または使用のための組成物。
【請求項９】
前記ガイドＲＮＡが、ヒトＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子のエクソン２、３、４または５内に存在する標的配列に対し少なくとも部分的に相補的である、請求項１〜８のいずれか１項に記載の方法または組成物。
【請求項１０】
前記ガイドＲＮＡがシングルガイド（ｓｇＲＮＡ）である、請求項１〜９のいずれか１項に記載の方法または組成物。
【請求項１１】
前記ｓｇＲＮＡが、配列番号１３０の修飾を有するガイド配列、または配列番号１３０を含む、請求項１０に記載の方法または組成物。
【請求項１２】
配列番号１３０における各Ｎが、任意の天然または非天然のヌクレオチドであり、前記Ｎが前記ガイド配列を形成し、かつ前記ガイド配列がＲＮＡガイドされたＤＮＡ結合剤をＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子へと標的化させるものであり、任意選択で、配列番号１３０における各Ｎが、配列番号５〜１２９から選択されるガイド配列で集合的に置き換えられる、請求項１１に記載の方法または組成物。
【請求項１３】
前記ｓｇＲＮＡが、配列番号５〜１２９のガイド配列のうちのいずれか１つおよび配列番号１４０のヌクレオチドを含む、請求項１０〜１２のいずれか１項に記載の方法または組成物。
【請求項１４】
前記ガイドＲＮＡが少なくとも１つの修飾を含む、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の方法または組成物。
【請求項１５】
前記少なくとも１つの修飾が、
２’−Ｏ−メチル（２’−Ｏ−Ｍｅ）修飾ヌクレオチド、
ヌクレオチド間のホスホロチオエート（ＰＳ）結合、
２’−フルオロ（２’−Ｆ）修飾ヌクレオチド、
５’末端における最初の５個のヌクレオチドのうちの１つ以上における修飾、
３’末端における最後の５個のヌクレオチドのうちの１つ以上における修飾、
最初の４つのヌクレオチド間のＰＳ結合、
最後の４つのヌクレオチド間のＰＳ結合、
５’末端における最初の３個のヌクレオチドにおける２’−Ｏ−Ｍｅ修飾ヌクレオチド、および
３’末端における最後の３個のヌクレオチドにおける２’−Ｏ−Ｍｅ修飾ヌクレオチド
から選択される、請求項１４に記載の方法または組成物。
【請求項１６】
前記ガイドＲＮＡが、配列番号１３０の前記修飾ヌクレオチドを含む、請求項１５に記載の方法または組成物。
【請求項１７】
前記ガイドＲＮＡと、任意選択でＲＮＡガイドされたＤＮＡ結合剤またはＲＮＡガイドされたＤＮＡ結合剤をコードする核酸とが、脂質ナノ粒子（ＬＮＰ）と会合している、請求項１〜１６のいずれか１項に記載の方法または組成物。
【請求項１８】
前記ＬＮＰが、
（ｉ）ＣＣＤ脂質、任選選択で脂質Ａ、
（ｉｉ）中性脂質、任選選択でＤＳＰＣ
（ｉｉｉ）ヘルパー脂質、任選選択でコレステロール、および
（ｉｖ）ステルス脂質、任選選択でＰＥＧ２ｋ−ＤＭＧ
から選択される少なくとも１種を含む、請求項１７に記載の方法または組成物。
【請求項１９】
前記組成物が、ＲＮＡガイドされたＤＮＡ結合剤、またはＲＮＡガイドされたＤＮＡ結合剤をコードするｍＲＮＡをさらに含み、任意選択で、前記ＲＮＡガイドされたＤＮＡ結合剤がＣａｓクリベース、任意選択でＣａｓ９であり、または、前記ＲＮＡガイドされたＤＮＡ結合剤がニッカーゼもしくは修飾されている、請求項１〜１８のいずれか１項に記載の方法または組成物。
【請求項２０】
前記組成物が薬学的製剤であり、かつ薬学的に許容される担体または賦形剤をさらに含む、請求項１〜１９のいずれか１項に記載の方法または組成物。
【請求項２１】
非相同末端結合（ＮＨＥＪ）が、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子内のＤＳＢの修復中に突然変異をもたらすものであり、任意選択で、ＮＨＥＪが、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子内のＤＳＢの修復中にヌクレオチドの欠失または挿入をもたらすものであり、任意選択で、前記ヌクレオチドの欠失または挿入が、ＳＥＲＰＩＮＡ１遺伝子内のフレームシフトまたはナンセンス突然変異を誘発する、請求項１〜３および５〜２０のいずれか１項に記載の方法または使用のための組成物。
【請求項２２】
前記組成物の投与が前記対象におけるＡＡＴレベルを低減する、請求項２、３および５〜２１のいずれか１項に記載の使用のための組成物。
【請求項２３】
前記ＡＡＴレベルが少なくとも４０％低減される、請求項２２に記載の使用のための組成物。
【請求項２４】
前記対象がヒトである、請求項２、３および５〜２３のいずれか１項に記載の使用のための組成物。
【請求項２５】
前記対象が、
ＡＡＴＤ野生型、任意選択でＡＡＴＤ野生型または遺伝性ＡＡＴＤ；
ＡＡＴＤの家族歴；および
ＡＡＴＤの肝臓症状のみ、または主にＡＡＴＤの肝臓症状
から選択される少なくとも１つを有する、請求項２、３および５〜２４のいずれか１項に記載の使用のための組成物。
【請求項２６】
前記対象が、ＳＥＲＰＩＮＡ１座位におけるＺアレルについてヘテロ接合性であり、任意選択で、前記対象が、前記ＳＥＲＰＩＮＡ１座位において１つのＺアレルおよび１つのＳアレルを有する、および／または、前記対象が、ＡＡＴのアミノ酸配列中にＥ３４２Ｋ変異を有しないが、野生型ＡＡＴのレベル低減を有する、請求項２、３および５〜２５のいずれか１項に記載の使用のための組成物。
【請求項２７】
前記対象が浮腫、腹水、もしくは黄疸の改善、安定化、もしくは緩徐化を有し、または肝臓移植の必要性が遅延する、請求項２、３および５〜２６のいずれか１項に記載の使用のための組成物。
【請求項２８】
前記組成物または薬学的製剤がウイルスベクターを介してまたは脂質ナノ粒子を介して送達される、請求項１〜４または７〜２７のいずれか１項に記載の方法または組成物。
【請求項２９】
配列番号１４０または１４１の配列をさらに含み、任意選択で配列番号１３０の修飾パターンをさらに含む、請求項１〜２８のいずれか１項に記載の方法または組成物。
【請求項３０】
配列番号１３１〜１３９から選択される配列をさらに含む、請求項１〜２８のいずれか１項に記載の方法または組成物。
【請求項３１】
配列番号１３１〜１３９から選択される前記配列が、表２内の前記それぞれの配列について示されている前記修飾を含む、請求項３０に記載の方法または組成物。
【請求項３２】
前記細胞が肝臓細胞であり、任意選択で前記肝臓細胞が肝細胞である、請求項１〜３１のいずれか１項に記載の方法または組成物。