【手続補正書】
【提出日】令和3年8月2日(2021.8.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
少なくとも１つの制御配列に作動可能に連結された、配列番号４〜２９のいずれかと少なくとも９５％の配列同一性を有するＣＹＰ４Ｖ２タンパク質又はそのバリアントをコードする配列を含む核酸分子を含むベクター。
【請求項２】
前記ベクターがウイルスベクター、プラスミド、非ウイルスベクター又はこれらのハイブリッドである、請求項１に記載のベクター。
【請求項３】
前記ウイルスベクターが、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクター、アデノウイルスベクター、レンチウイルスベクター、単純ヘルペスウイルス（ＨＳＶ）ベクター、バキュロウイルスベクター、センダイウイルスベクター、及びレトロウイルスベクターからなる群から選択される、請求項２に記載のベクター。
【請求項４】
前記ベクターが組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクターである、請求項１〜請求項３のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項５】
前記ｒＡＡＶベクターが、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２のいずれかの血清型、又はＡＡＶのその他の天然由来の血清型、分離株、若しくは分岐群、又はそれらのハイブリッド、バリアント、若しくは誘導体から選択されるＶＰ１、ＶＰ２、又はＶＰ３カプシドタンパク質を含む、請求項４に記載のベクター。
【請求項６】
前記ｒＡＡＶベクターが、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、又はＡＡＶのその他の天然由来の血清型、分離株、若しくは分岐群、又はそれらの変異体、キメラ、バリアント、若しくは融合体から選択される、５′ＡＡＶ末端逆位反復配列（ＩＴＲ）又は３′ＡＡＶ  ＩＴＲを含む、請求項４又は請求項５に記載のベクター。
【請求項７】
前記ｒＡＡＶベクターが、キメラＡＡＶ，シャッフルＡＡＶ、又はカプシド改変ＡＡＶである、請求項４〜請求項６のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項８】
前記ｒＡＡＶベクターが偽型ＡＡＶである、請求項４〜請求項６のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項９】
前記ｒＡＡＶベクターがハイブリッドＡＡＶである、請求項４〜請求項６のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項１０】
前記ｒＡＡＶベクターが、１又は複数の天然由来のＡＡＶカプシドタンパク質に１又は複数の改変を含む、請求項４〜請求項９のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項１１】
前記ＡＡＶカプシドタンパク質に対する改変が、１又は複数のアミノ酸残基Ｙ−Ｆ、Ｋ−Ｒ、Ｔ−Ａ、Ｓ−Ａ、又はＴ−Ｖ置換を含む、請求項１０に記載のベクター。
【請求項１２】
前記ｒＡＡＶベクターが、ＡＡＶ２／５、ＡＡＶ２／８、ＡＡＶ２／２、ＡＡＶ２（Ｙ４４４Ｆ＋Ｙ５００Ｆ＋Ｙ７３０Ｆ）、ＡＡＶ２／１、ＡＡＶ２／９、ＡＡＶ２／８（Ｙ７３３Ｆ）、ＡＡＶ２／６、ＡＡＶ２／４、ＡＡＶ２／７、ＡＡＶ５、ＡＡＶ２、ＡＡＶ８、ＡＡＶ１、ＡＡＶ９、ＡＡＶ６、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ７、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、Ａｎｃ８０、ＡＡＶ  ７ｍ８、ＡＡＶ−ＤＪ、ＳｈＨ１０、ＡＡＶ−ＰＨＰ．Ｂ、ｒｈ１０、及びそのハイブリッド、誘導体、又はバリアントからなる群より選択される、請求項４〜請求項１１のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項１３】
前記ｒＡＡＶベクターが、一本鎖ＡＡＶベクター又は自己相補性ＡＡＶ（ｓｃＡＡＶ）ベクターである、請求項４〜請求項１２のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項１４】
前記ベクターが、プラスミド、裸の（ｎａｋｅｄ）核酸、リポソーム、デンドリマー、ナノ粒子、ポリマー、ポリプレックス、又は脂質ポリマー系である、請求項１に記載のベクター。
【請求項１５】
前記ナノ粒子が、リポソームナノ粒子、固体脂質ナノ粒子、又はリポソームプロタミン／ＤＮＡリポプレックス（ＬＰＤ）である、請求項１４に記載のベクター。
【請求項１６】
前記ＣＹＰ４Ｖ２タンパク質又はそのバリアントをコードする配列が、配列番号１〜３のいずれかと少なくとも７６％の配列同一性を有する、請求項１〜請求項１５のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項１７】
前記制御配列がプロモーターを含む、請求項１〜請求項１６のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項１８】
前記プロモーターが、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞特異的プロモーター、光受容体特異的プロモーター、網膜細胞特異的プロモーター、角膜細胞特異的プロモーター、眼細胞特異的プロモーター、細胞特異的プロモーター、組織特異的プロモーター、構成的プロモーター、ユビキタスプロモーター、制御されたプロモーター、誘導性プロモーター、又はそれらの誘導体、ハイブリッド、若しくは組み合わせである、請求項１７に記載のベクター。
【請求項１９】
前記プロモーターが、ＣＡＧプロモーター（ＣＡＧＧＳプロモーター、ＣＢプロモーター又はＣＢＡプロモーターとしても知られる）、ニワトリβアクチンプロモーター、小型ＣＢＡ（ｓｍＣＢＡ）プロモーター、ＣＢＳＢプロモーター、ＣＢｈプロモーター、βアクチンプロモーター、ヒトβアクチンプロモーター、伸長因子１α短（ＥＦＳ）プロモーター、伸長因子１α（ＥＦ−１α）プロモーター、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）プロモーター、ＰＧＫプロモーター、ＵＢＣプロモーター、ＧＵＳＢプロモーター、ＵＣＯＥプロモーター、ＶＭＤ２（卵黄状黄斑ジストロフィー２；ＢＥＳＴ１としても知られる）プロモーター、ＲＰＥ６５プロモーター、ＧＲＫ１プロモーター、ヒト光受容体間レチノイド結合タンパク質近位（ＩＲＢＰ）プロモーター、ｈＩＲＢＰプロモーターの２３５ｎｔ断片、ＲＰＧＲ近位プロモーター、赤オプシンプロモーター、赤緑オプシンプロモーター、青オプシンプロモーター、マウスオプシンプロモーター、ロドプシン（Ｒｈｏ）プロモーター、βホスホジエステラーゼ（ＰＤＥ）プロモーター、網膜色素変性症（ＲＰ１）プロモーター、ＮＸＮＬ２／ＮＸＮＬ１プロモーター、網膜変性スロー／ペリフェリン２（Ｒｄｓ／ｐｅｒｐｈＺ）プロモーター、ＩＲＢＰ／ＧＮＡＴ２プロモーター（錐体トランスデューシンαプロモーターに融合したｈＩＲＢＰエンハンサー）、Ｒｄｓ（網膜変性スロー）プロモーター、ｈＰＤＥ６ｂプロモーター、又はＶＥｃａｄプロモーター（ＶＥ−カドヘリン／カドヘリン５（ＣＤＨ５）／ＣＤ１４４プロモーター）、カルシウム感受性プロモーター、ＮＦＡＴプロモーター、亜鉛誘導性ヒツジメタロチオネイン（ＭＸ）プロモーター、デキサメタゾン（Ｄｅｘ）誘導性マウス乳癌ウイルス（ＭＭＴＶ）プロモーター、Ｔ７ポリメラーゼプロモーター系、エクジソン昆虫プロモーター、テトラサイクリン抑制系、テトラサイクリン誘導系、ＲＵ４８６誘導系、及びラパマイシン誘導系、並びにそれらのハイブリッド、バリアント、及び誘導体からなる群より選択される、請求項１７に記載のベクター。
【請求項２０】
前記制御配列がコザック（Ｋｏｚａｋ）配列またはそのバリアントを含む、請求項１〜請求項１９のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項２１】
前記制御配列がエンハンサーを含む、請求項１〜請求項２０のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項２２】
前記エンハンサーが、転写後制御因子（ＰＲＥ）、内部リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）、イントロン制御配列、ミニイントロンスプライスドナー／スプライスアクセプター（ＳＤ−ＳＡ）、又は構成的輸送要素（ＣＴＥ）を含む、請求項２１に記載のベクター。
【請求項２３】
前記エンハンサーが、ウッドチャック肝炎ウイルス転写後調節エレメント（ＷＰＲＥ）エンハンサー、Ｂ型肝炎ウイルス転写後制御エレメント（ＨＰＲＥ又はＨＢＶＰＲＥ）エンハンサー、ＩＲＢＰエンハンサー、Ｍａｓｏｎ−ＰｆｉｚｅｒサルウイルスＣＴＥエンハンサー、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）最初期（ｉｍｍｅｄｉａｔｅ  ｅａｒｌｙ）エンハンサー、ＳＶ４０エンハンサー、鳥白血病ウイルスＣＴＥエンハンサー、並びにこれらの誘導体、ハイブリッド及びバリアントからなる群より選択される、請求項２１に記載のベクター。
【請求項２４】
前記制御配列がポリアデニル化（ポリＡ）シグナルを含む、請求項１〜請求項２３のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項２５】
前記ポリＡシグナルが、ウシ成長ホルモンポリアデニル化シグナル（ｂＧＨポリＡ）、スモールポリＡシグナル（ＳＰＡ）、ヒト成長ホルモンポリアデニル化シグナル（ｈＧＨポリＡ）、ＳＶ４０ポリＡシグナル、ＳＶ４０初期ポリＡシグナル、ＳＶ４０後期ポリＡシグナル、並びにこれらの誘導体、ハイブリッド、及びバリアントからなる群より選択される、請求項２４に記載のベクター。
【請求項２６】
前記制御配列が、ポリＡシグナルと作動可能に連結されている上流エンハンサー（ＵＳＥ）を含む、請求項１〜請求項２５のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項２７】
前記ＵＳＥが、ＳＶ４０後期２×ＵＳＥ、ＨＩＶ−１（ヒト免疫不全ウイルス１）ＵＳＥ、ＧＨＶ（地リス肝炎ウイルス）ＵＳＥ、アデノウイルス（Ｌ３）ＵＳＥ、ｈＴＨＧＢ（ヒトプロトロンビン）ＵＳＥ、及びｈＣ２（ヒトＣ２補体遺伝子）ＵＳＥ、並びにこれらの誘導体、バリアント、及びにハイブリッドからなる群より選択される、請求項２６に記載のベクター。
【請求項２８】
前記制御配列が、イントロン配列、ＵＴＲ配列、スプライス部位配列、上流制御ドメイン配列、応答要素配列、誘導性要素配列、複製起点配列、内部リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）配列、転写開始配列、終止配列、ＲＮＡプロセシング配列、ジャンクション配列、リンカー配列、並びにこれらの誘導体、ハイブリッド、及びバリアントからなる群より選択される少なくとも１つを含む、請求項１〜請求項２７のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項２９】
前記制御配列が、前記制御配列により発現が制御されるＣＹＰ４Ｖ２コード配列に対して異種又は同種である、請求項１〜請求項２８のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項３０】
前記制御配列が、臓器特異的、組織特異的、又は細胞特異的マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）標的配列を含む、請求項１〜請求項２８のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項３１】
前記ベクターのいずれかの部分が、
配列番号６０〜６４のＣＹＰ４Ｖ２発現カセット配列のいずれかと少なくとも４３％の配列同一性を有するか、
配列番号６０のヌクレオチド（ｎｔ）２３７〜ヌクレオチド３５７９；配列番号６１のヌクレオチド１６６〜ヌクレオチド３５１５；配列番号６２のヌクレオチド１６６〜ヌクレオチド３５１５；配列番号６３のヌクレオチド１６６〜ヌクレオチド３５１５；又は配列番号６４のヌクレオチド１３０〜ヌクレオチド２０９７のいずれかの配列と少なくとも４３％の配列同一性を有する、
請求項１〜請求項３０のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項３２】
医薬的に許容可能な担体及び特定の投与経路又はデバイスに適する追加の成分中に含まれる、請求項１〜請求項３１のいずれか１項に記載のベクター。
【請求項３３】
請求項１〜請求項３２のいずれか１項に記載のベクターを含む細胞。
【請求項３４】
哺乳動物細胞又は昆虫細胞である、請求項３３に記載の細胞。
【請求項３５】
ＨＥＫ２９３細胞、２９３Ｔ細胞、Ａ４５９細胞、Ｓｆ９細胞、又はこれらの誘導体若しくはバリアントであるか、ベクター生産に用いられる他の細胞である、請求項３３に記載の細胞。
【請求項３６】
両アレルＣＹＰ４Ｖ２変異を伴う、クリスタリン網膜症（ＢＣＤ、Ｂｉｅｔｔｉ結晶性角膜網膜ジストロフィー、Ｂｉｅｔｔｉ結晶性網膜症、Ｂｉｅｔｔｉ網膜ジストロフィーとしても知られる）、網膜色素変性症（ＲＰ）、又は遺伝性網膜変性（ＩＲＤ）に罹患するヒト対象の、または前記ヒト対象に由来する、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞、ＲＰＥ前駆細胞、光受容体細胞、光受容体前駆細胞、脈絡膜細胞、網膜細胞、網膜前駆細胞、人工多能性幹（ｉＰＳ）細胞、又は幹細胞である、請求項３３に記載の細胞。
【請求項３７】
ヒト対象の網膜に、請求項３３又は請求項３６に記載の細胞を送達することにより、必要とするヒト対象において、両アレルＣＹＰ４Ｖ２変異を伴う、クリスタリン網膜症（ＢＣＤ、Ｂｉｅｔｔｉ結晶性角膜網膜ジストロフィー、Ｂｉｅｔｔｉ結晶性網膜症、Ｂｉｅｔｔｉ網膜ジストロフィーとしても知られる）、網膜色素変性症（ＲＰ）、又は遺伝性網膜変性（ＩＲＤ）を治療、阻止、又は予防するための、請求項３３又は請求項３６に記載の細胞を含む医薬組成物。
【請求項３８】
請求項１〜請求項３２のいずれか１項に記載のベクターで眼細胞を形質導入することにより、両アレルＣＹＰ４Ｖ２変異を伴う、クリスタリン網膜症（ＢＣＤ、Ｂｉｅｔｔｉ結晶性角膜網膜ジストロフィー、Ｂｉｅｔｔｉ結晶性網膜症、Ｂｉｅｔｔｉ網膜ジストロフィーとしても知られる）、網膜色素変性症（ＲＰ）、又は遺伝性網膜変性（ＩＲＤ）に罹患するヒト対象の眼細胞の機能障害、機能喪失、ジストロフィー、障害、変性、又は萎縮を治療、進行阻止又は遅延、救助若しくは改善するため、又は前記ヒト対象の眼細胞の死滅を防止するための、請求項１〜請求項３２のいずれか１項に記載のベクターを含む医薬組成物。
【請求項３９】
前記眼細胞が、網膜細胞、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞、光受容体細胞（桿体及び錐体）、脈絡膜上皮細胞、角膜上皮細胞、脈絡膜細胞、角膜細胞、網膜双極細胞、光受容体前駆細胞、神経節細胞、又は視神経細胞である、請求項３８に記載の医薬組成物。
【請求項４０】
請求項１〜請求項３２のいずれか１項に記載のベクターをヒト対象の網膜に送達することにより、必要とするヒト対象において、両アレルＣＹＰ４Ｖ２変異を伴う、クリスタリン網膜症（ＢＣＤ、Ｂｉｅｔｔｉ結晶性角膜網膜ジストロフィー、Ｂｉｅｔｔｉ結晶性網膜症、Ｂｉｅｔｔｉ網膜ジストロフィーとしても知られる）、網膜色素変性症（ＲＰ）、又は遺伝性網膜変性（ＩＲＤ）を治療、阻止、又は予防するための医薬組成物であって、
前記ヒト対象の、１又は複数の網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞、１又は複数の脈絡膜細胞、又は１又は複数の光受容体細胞が、前記ベクターにより形質導入される、
請求項１〜請求項３２のいずれか１項に記載のベクターを含む医薬組成物。
【請求項４１】
請求項１〜請求項３２のいずれか１項に記載のベクターを眼細胞に接触させることを含む、眼細胞で外因性ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子をインビトロで発現する方法であって、
前記眼細胞は網膜細胞、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞、光受容体細胞（桿体又は錐体）、脈絡膜上皮細胞、角膜上皮細胞、脈絡膜細胞、角膜細胞、網膜双極細胞、光受容体前駆細胞、神経節細胞、又は視神経細胞である、方法。
【請求項４２】
請求項１〜請求項３２のいずれか１項に記載のベクターをヒト対象の網膜に送達することにより、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞の萎縮、ジストロフィー、機能不全、変性又は死滅と関連するヒト対象の疾患を治療、阻止、又は予防するための、請求項１〜請求項３２のいずれか１項に記載のベクターを含む医薬組成物であって、
前記ヒト対象の１又は複数のＲＰＥ細胞が前記ベクターにより形質導入される、医薬組成物。
【請求項４３】
医薬組成物をヒト対象の網膜に送達することにより、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞の萎縮、ジストロフィー、機能障害、変性、又は死滅と関連する前記ヒト対象の疾患を治療、阻止、又は予防するための医薬組成物であって、
前記医薬組成物はＲＰＥ細胞、ＲＰＥ前駆細胞又は幹細胞を含み、
前記ＲＰＥ細胞、ＲＰＥ前駆細胞又は幹細胞は請求項１〜請求項３２のいずれか１項に記載のベクターを含む、医薬組成物。
【請求項４４】
眼疾患に罹患しているヒト対象におけるヒトの眼疾患を治療又は予防するための、ウイルスベクターを含む医薬組成物であって、
前記ウイルスベクターは、治療的導入遺伝子に作動可能に連結された、配列番号３５と少なくとも８０％の配列同一性を有する伸長因子１α短（ＥＦＳ）プロモーター及び／又は配列番号３６と少なくとも８０％の配列同一性を有するスモールポリアデニル化（ポリＡ）シグナル（ＳＰＡ）を含む核酸分子を含み、
前記医薬組成物中のウイルスベクターが前記ヒト対象の眼に送達される、医薬組成物。
【請求項４５】
配列番号２の核酸配列と少なくとも８０％の配列同一性を有する、ＣＹＰ４Ｖ２タンパク質をコードする核酸配列と、前記核酸配列に作動可能に連結された１又は複数の制御配列と、を含む発現カセット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１２７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１２７】
いくつかの実施形態では、前記プロモーターは、ＣＡＧプロモーター（ハイブリッドＣＭＶ初期エンハンサー／ニワトリβアクチンプロモーター（ＣＡＧＧＳプロモーター、ＣＢプロモーター又はＣＢＡプロモーターとしても知られる））、ニワトリβアクチンプロモーター、小型ＣＢＡ（ｓｍＣＢＡ）プロモーター、ＣＢＳＢプロモーター、又はＣＢｈプロモーター、その他のβアクチンプロモーター（例えば、ヒトβアクチンプロモーター）、伸長因子１α短（ＥＦＳ）プロモーター、伸長因子１α（ＥＦ−１α）プロモーター、ＣＭＶプロモーター、ＰＧＫプロモーター、ＵＢＣプロモーター、ＧＵＳＢプロモーター、ＵＣＯＥプロモーター、ＶＭＤ２（卵黄状黄斑ジストロフィー２；ＢＥＳＴ１としても知られる）プロモーター、ＲＰＥ６５プロモーター、又はそれらのハイブリッド若しくは誘導体からなる群から選択される。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１４４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１４４】
いくつかの実施形態では、前記プロモーターは、ＣＡＧプロモーター（ハイブリッドＣＭＶ初期エンハンサー／ニワトリβアクチンプロモーター（ＣＡＧＧＳプロモーター、ＣＢプロモーター又はＣＢＡプロモーターとしても知られる））、ニワトリβアクチンプロモーター、小型ＣＢＡ（ｓｍＣＢＡ）プロモーター、ＣＢＳＢプロモーター、又はＣＢｈプロモーター、その他のβアクチンプロモーター（例えば、ヒトβアクチンプロモーター）、伸長因子１α短（ＥＦＳ）プロモーター、伸長因子１α短（ＥＦ−１α）プロモーター、ＣＭＶプロモーター、ＰＧＫプロモーター、ＵＢＣプロモーター、ＧＵＳＢプロモーター、ＵＣＯＥプロモーター、ＶＭＤ２（卵黄状黄斑ジストロフィー２；ＢＥＳＴ１としても知られる）プロモーター、ＲＰＥ６５プロモーター、又はそれらのハイブリッド若しくは誘導体からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、前記プロモーターは、ＣＡＧプロモーター（ハイブリッドＣＭＶ初期エンハンサー／ニワトリβアクチンプロモーター（ＣＡＧＧＳプロモーター、ＣＢプロモーター又はＣＢＡプロモーターとしても知られる））、伸長因子１α短（ＥＦＳ）プロモーター、伸長因子１α短（ＥＦ−１α）プロモーター、ＣＭＶプロモーター、又はそれらの誘導体若しくはハイブリッドである。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１４６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１４６】
いくつかの実施形態では、インビトロ治療のために、細胞あたり約１×１０３ＧＣ〜約１×１０６ＧＣ（ＧＣ：ゲノムコピー、ゲノムを含むＡＡＶ粒子を測定する（ベクターゲノム（ｖｇ）又はゲノム粒子（ｇｐ）としても知られる））の量（ＭＯＩ：感染多重度）で前記標的細胞への感染が行われる。いくつかの実施形態では、対象の眼へのインビボ投与のために、１回の投与は、約１×１０６ＧＣ〜約２×１０１３ＧＣのオーダー（例えば、約１×１０１１ＧＣ〜約１×１０１２ＧＣの高用量範囲、約１×１０１０ＧＣ〜約１×１０１１ＧＣの中用量範囲、約１×１０９ＧＣ〜約１×１０１０ＧＣの低用量範囲、約１×１０６ＧＣ〜約１×１０９ＧＣの超低用量範囲、及び約１×１０１２ＧＣ〜約２×１０１３ＧＣの超高用量範囲）で、又はこれらの範囲内の用量であってかつ所望の効果を提供するのに充分な任意の用量で実施することができる。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２６１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２６１】
眼に投与される細胞の治療有効量は、当業者に知られており、移植される細胞の種類、移植される細胞の成熟度、移植後の分裂が予想されるかどうか、置換の標的となる領域のサイズ又は細胞の数、及び治療される対象（例えば、治療対象の年齢、性別、体重、疾患進行度、及び状態）、投与経路、並びに必要なレジメンによって変わり得る。眼細胞療法で使用される細胞の治療有効量は、１回の投与で約１×１０３細胞から約１×１０８細胞の範囲内でありうる。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２７８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２７８】
構造的な類似性に加えて、Ｐ４５０タンパク質は機能的な類似性も共有している。Ｐ４５０酵素によって触媒される最も一般的な反応は、モノオキシゲナーゼ反応であり、例えば、酸素の１つの原子を有機基質（ＲＨ）の脂肪族の部分に挿入し、残りの１つの酸素原子は水に還元される：
ＲＨ＋Ｏ２＋ＮＡＤＰＨ＋Ｈ＋→ＲＯＨ＋Ｈ２Ｏ＋ＮＡＤＰ＋。
多くのヒドロキシル化反応（ヒドロキシル基の挿入）はＰ４５０酵素を使用する。多くのＰ４５０酵素は、基質としてステロイド及び／又は脂肪酸を有する。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３３４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３３４】
ＡＡＶベクターに加えて、他のウイルスベクターをＣＹＰ４Ｖ２遺伝子治療に使用してもよい。例えば、アデノウイルスベクターも遺伝子送達に有用であることが実証されている。例えば、Mori et al., 2002. IOVS, 43:1610-1615には、導入遺伝子（緑色蛍光タンパク質）がＣＭＶプロモーターによって駆動される、Ｅ−１が欠失し、部分的にＥ−３が欠失した５型Ａｄであるアデノウイルスベクターの使用が記載されている。１０７〜１０８個のウイルス粒子の注入により発現レベルのピークが得られ、網膜下注入では硝子体内注入よりも高いレベルの発現が得られた。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３４９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３４９】
制御配列又はハイブリッド制御配列が複数のバージョンを有し、複数の名称を有することが一般的であることは、当技術分野で公知である。例えば、様々なプロモーター、エンハンサー、及びポリＡシグナルには多くのバージョンがあり、非限定的な例として、ＣＭＶプロモーター、ＥＦ１αプロモーター、ＷＰＲＥエンハンサー、及びＳＶ４０ポリＡシグナルが挙げられる。ＣＡＧプロモーターは、ＣＢＡプロモーター、ＣＢプロモーター、又はＣＡＧＧＳプロモーターを含むがこれらに限定されない複数の代替名称を有する。また、制御配列を短縮、改変、又は他の配列と組み合わせて、誘導体又はバリアントを作製することもでき、例えば、ＣＡＧ（ＣＢＡ、ＣＢ、又はＣＡＧＧＳとしても知られる）プロモーターは、ＣＭＶ最初期エンハンサー、ニワトリβアクチンプロモーター、及びウサギβグロビン遺伝子のハイブリッドであり、ｓｍＣＢＡプロモーターは、切断型ＣＡＧプロモーターであり、ＣＢＳＢプロモーターは短縮型ＣＡＧプロモーターであって、ＣＭＶ最初期エンハンサーの５’末端で約１５２ｂｐ異なるものであることも当技術分野で公知である。さらに、制御配列は別称で称されることもあり、例えば、ＨＰＲＥ又はＷＰＲＥなどの転写後制御エレメントはエンハンサーとも称される。本明細書に記載の制御配列は、そのような制御配列のすべてのバリエーション、誘導体、及び／又はハイブリッドを想定している。制御配列に関して本明細書で提供される任意の例示的な配列は本質的に例示的なものであり、そのような制御配列の定義又は範囲を例示的な配列に示されるものに限定するものではない。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３７１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３７１】
最も効果的な投与手段及び治療上有効な投与量を決定する方法は、当業者に公知であり、ベクター、そのカプシド構造、ベクターデザイン（例えば、ｓｓＡＡＶ  ｖｓ．  ｓｃＡＡＶ）、発現カセットの組成、ベクターの発現レベル、プロモーター、他の制御配列又は核酸分子、ベクター力価、標的細胞型、標的発現レベル、標的とする面積又は細胞の数、及び治療対象（例えば、治療対象の年齢、性別、体重、疾患進行度及び状態、並びに潜在的な免疫反応）、投与経路、治療の標的となる細胞の位置（例えば、網膜  ｖｓ．  角膜）、野生型の細胞及び／又は組織における関連遺伝子の性質及び発現レベル、及び必要なレジメンによっても変わり得る。治療有効用量は、疾患モデル（例えば、ＢＣＤ細胞モデル（例えば、ＢＣＤ患者のｉＰＳ−ＲＰＥ細胞系））又は動物モデルで決定及び評価し、臨床試験で確認又は改良することができる。インビトロでの細胞の治療では、投与量は通常ＭＯＩとして表され、その後、治療される細胞の数をＭＯＩに乗じる。ＭＯＩは通常、細胞あたり約１×１０３ＧＣから約１×１０６ＧＣの範囲内であるか、又は細胞あたり約１００〜約１０，０００ＧＣの感染性ＭＯＩ（ＧＣ：ゲノムコピー、ゲノムを含むＡＡＶ粒子の測定（ベクターゲノム（ｖｇ）又はゲノム粒子（ｇｐ）としても知られる）である。インビボ治療の場合、上記の要因に加えて、実際の投与量は、投与中の各患者に固有の個々の状況（例えば、以下で説明する先天性脈絡膜欠如の症例の患者６の網膜下投与中の投与量の減少など）によっても影響を受ける可能性がある。よって、インビボでの１回の投与の治療上有効な用量は、約１×１０６〜２×１０１３ＧＣのオーダー（例えば、約１×１０１１ＧＣ〜約１×１０１２ＧＣの高用量範囲、約１×１０１０ＧＣ〜約１×１０１１ＧＣの中用量範囲、約１×１０９ＧＣ〜約１×１０１０ＧＣの低用量範囲、約１×１０６ＧＣ〜約１×１０９ＧＣの超低用量範囲、及び約１×１０１２ＧＣ〜約２×１０１３ＧＣの超高用量範囲）で、又はこれらの範囲内の用量であってかつ所望の効果を提供するのに充分な任意の用量であってよい。一実施形態では、前記組成物は、約１×１０６〜約２×１０１３ＧＣの用量で投与される。別の実施形態では、インビボ投与量は、治療の標的となる細胞数に標的ＭＯＩを乗じて決定される（例えば、細胞あたり１×１０３ＧＣ〜約１×１０６ＧＣ）。眼への任意の１回の投与におけるｒＡＡＶベクターを含む薬剤の体積は、約１μＬ（０．００１ｍＬ）〜約１０００μＬ（１ｍＬ）の範囲内であり得る。
【手続補正１０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３７４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３７４】
例えば、Ｂａｉｎｂｒｉｄｇｅの研究では、血清型２の組換えアデノ随伴ウイルスベクターであるｔｇＡＡＧ７６ベクターが遺伝子送達に使用された。前記ベクターには、他の箇所で説明したように、ヒトＲＰＥ６５プロモーターによって駆動され、ウシ成長ホルモンポリアデニル化部位によって終結するヒトＲＰＥ６５コード配列が含まれる。前記ベクターは、Ｂ５０パッケージング細胞系、ｔｇＡＡＧ７６ベクターゲノムを含むアデノウイルス−アデノ随伴ウイルスハイブリッドシャトルベクター、及びアデノウイルス５ヘルパーウイルスを使用して、ＧＭＰ（適正製造基準）ガイドラインに従ってＴａｒｇｅｔｅｄ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎによって生産された。前記ベクターは、１×１０１１ベクター粒子／ｍＬの力価で緩衝生理食塩水に満たし、１ｍＬのアリコートで−７０℃で凍結された。
【手続補正１１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３７５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３７５】
Ｍａｇｕｉｒｅは、ＬＣＡ２のイヌモデルでＡＡＶ２．ＲＰＥ６５の単回網膜下注射後に視覚機能の長期的かつ持続的な（＞７．５年、観察継続中）回復をもたらすことが実証されているＲＰＥ６５  ｃＤＮＡを含む複製欠損ＡＡＶベクターである、組換えＡＡＶ２．ｈＲＰＥ６５ｖ２ウイルスベクターを使用した。ＡＡＶ２．ＲＰＥ６５の作製に使用されるシスプラスミドには、カナマイシン耐性遺伝子が含まれている。このウイルスはＣｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｃｅｌｌｕｌａｒ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  ＴｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓによってＨＥＫ２９３細胞のトリプルトランスフェクション後に製造され、微小溶液操作、ろ過、陽イオン交換クロマトグラフィー（ＰＯＲＯＳ  ５０ＨＳ、ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ、ニュージャージー州ピスカタウェイ）、密度勾配超遠心分離、及びＰＢＳ内での透析ろ過によって単離及び精製された。この組み合わせにより、空のカプシドと残留塩化セシウムが効率的に除去されるなど、ＡＡＶベクター生成物の最適な純度を得ることができる。生成物の一部にＰＦ６８  ＮＦプリルポロキサマー１８８（ＰＦ６８、ＢＡＳＦ、ルートヴィヒスハーフェン、ドイツ）を添加して、製品接触面に対するベクターのその後の損失を防止した。精製されたウイルスは、ＰＦ６８を使用したものも使用していないものも、滅菌６０ｍＬシリンジ及びシリンジフィルターを使用して０．２２μｍフィルターを通過させ、使用時まで滅菌チューブ内で凍結保存（−８０℃）した。プルロニックＦ−６８  ＮＦプリルポロキサマー１８８を添加した１５０μＬのリン酸緩衝生理食塩水中のＡＡＶ２．ｈＲＰＥ６５ｖ２の１．５×１０１０ベクターゲノムの注入が、網膜下腔投与として行われた。
【手続補正１２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３７６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３７６】
Ｈａｕｓｗｉｒｔｈが使用したウイルスベクターは、ヒトＲＰＥ６５遺伝子を担持するように改変された組換えアデノ随伴ウイルス血清型２（ｒＡＡＶ２）ベクター（ｒＡＡＶ２−ＣＢＳＢ−ｈＲＰＥ６５）であり、ＲＰＥ６５欠乏症の動物モデルで視力を回復することが以前に実証されていた。ＲＰＥ６５−ＬＣＡウイルスベクターは、網膜下注射により送達された（１５０μＬで５．９６×１０１０ベクターゲノム）。
【手続補正１３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３７７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３７７】
治療薬（例えば、タンパク質、核酸分子、発現カセット、遺伝子治療ベクター、細胞）の、非限定的な例として眼への、投与の方法及びプロトコル、並びに他の手順及びプロトコル（非限定的な例として免疫試験、眼科検査、及び免疫抑制剤）は当技術分野で公知である。例えば、以下は、ＭａｃＬａｒｅｎが先天性脈絡膜欠如の治療に使用したＡＡＶベクターの網膜下注射の例である。緩衝塩類溶液（Ａｌｃｏｎ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ、米国テキサス州フォートワース）を用いて、４１Ｇテフロンカニューレ（ＤＯＲＣ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  ＢＶ、ザイドラント、オランダ）を用いて網膜を剥離する手術が最初に行われた。網膜の標的領域が下層の網膜色素上皮から剥離されると、ＡＡＶ２．ＲＥＰ１の１×１０１０ゲノム粒子を含む固定容量（０．１ｍＬ）が、最初の５人の患者において作製された網膜下腔に新しいシリンジを介して注入された。患者６では、減量された最大６×１０９個のゲノム粒子が注入された。ベクターは同じ網膜切開を介してゆっくりと注入され、剥離をさらに拡大させた。手術は最初の５人の患者では合併症はなかったが、患者６では、網膜の末梢黄斑からの剥離が困難であったため、中心窩に近い点から剥離を誘発する必要があり、乳頭黄斑束の明らかな伸展が生じた。視力６／７・５の患者のこの重要な構造の伸展関連の損傷に関する懸念のため、２番目の工程ではより少量のベクター（最大０．０６ｍＬ）が注入された。全ての患者で、注射器に残っている余剰のベクターは、カニューレを通してポリプロピレンバイアルに排出され、その後凍結された。この余剰ベクターは、ヒト由来のＨＴ１０８０細胞系の形質導入後、ウェスタンブロットで効力について後で試験された。患者は、１０日間のプレドニゾロンの経口投与のコースで治療された。これは、１ｍｇ／ｋｇ（７０〜１００ｍｇ）で７日間、手術の２日前から開始され、その後、４０ｍｇで１日、２０ｍｇで１日、及び１０ｍｇで１日へと減量された。手術前、術後１週間、及び術後５〜６週間の時点で免疫学的検査のために血液試料が採取された。MacLaren et al., Lancet. 2014 March 29;383(9923):1129-1137を参照。
【手続補正１４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３９８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３９８】
ｉＰＳＣを生成するために、５×１０４個の線維芽細胞を播種し、細胞が接着して（約１２時間）約７０％〜８０％コンフルエントとなるまで１２ウェルプレートで培養した。培地を除去し、前記細胞に、５００μＬの線維芽細胞培地で、Ｏｃｔ３／４、Ｓｏｘ２、Ｋｌｆ４、及びｃ−Ｍｙｃ（ＣｙｔｏＴｕｎｅ（登録商標−ｉＰＳ  ２．０センダイウイルスリプログラミングキット、Ａ１６５１７、Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を発現するセンダイウイルスを、５：５：３：５のＭＯＩでトランスフェクトした。前記細胞を、３７℃、５％ＣＯ２で一晩インキュベートした後、ウイルス含有培地を除去し、ＫＯ−ＤＭＥＭ培地と交換した（ノックアウトＤＭＥＭ、１５％ノックアウト血清代替物、１Ｌ−グルタミン、１非必須アミノ酸、１ペニシリン−ストレプトマイシン、０．１ｍＭβ−メルカプトエタノール、１０ｎｇ／ｍＬ塩基性線維芽細胞成長因子（ｂＦＧＦ））。トランスフェクトされた細胞を、培地を毎日交換しながら約７日間インキュベートした。
【手続補正１５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０４２２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０４２２】
細胞生存率アッセイ：
青色光暴露：ｉＰＳ−ＲＰＥ細胞を３．５ｃｍディッシュ及び４ウェルチャンバーディッシュに播種した。２か月後、１０μｇ／ｍＬグルコースを含むＰＢＳ（＋）内で１時間、１．５ｍＷ／ｃｍ２で、細胞を４３０±２０ｎｍ（青色）の光に暴露した。全ての細胞系で同じ播種密度を用いた。青色光に暴露後、処置した細胞に新しいＲＰＥ培地を供給し、５％ＣＯ２及び３７℃のインキュベーターに一晩回収した。
【手続補正１６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０４３４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０４３４】
表３の脚注：
ＷＴ：野生型対照ｉＰＳ−ＲＰＥ。Ｐ１：患者１のｉＰＳ−ＲＰＥ。Ｐ２：患者２のｉＰＳ−ＲＰＥ。
患者の未処置試料及びＡＡＶ処置試料は培養日及びクローン系統で一致させた。
Ｐ１  ＡＡＶ２．ｏｐ及びＰ２  ＡＡＶ２．ｏｐの試料をＡＡＶ２．ＣＹＰ４Ｖ２ｏｐで処置し（１日、ＭＯＩ：５×１０４ＧＣ／細胞）、処置後１０日で回収した。
Ｐ２  ＡＡＶ２ｔｒｉｐ．ｏｐ試料をＡＡＶ２ｔｒｉ（Ｙ−Ｆ）．ＣＹＰ４Ｖ２ｏｐで処置し（１日、ＭＯＩ：５×１０４ＧＣ／細胞）、処置後１０日で回収した。
Ｐ２  ＡＡＶ８．ｆｖ試料をＡＡＶ８．ＣＹＰ４Ｖ２ｆｖで処置し（１日、ＭＯＩ：２×１０５ＧＣ／細胞）、処置後１０日で回収した。
Ｐ２  ｓｃＡＡＶ１．ｏｐ試料をｓｃＡＡＶ１．ＣＹＰ４Ｖ２ｏｐで処置し（１日、ＭＯＩ：２×１０５ＧＣ／細胞）、処置後４日で回収した。
【手続補正１７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０４７５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０４７５】
（ｅ）については、（ｂ）の理論的根拠と同様に、プロモーターは標的細胞（例えば、治療の標的細胞型がＲＰＥの場合はＲＰＥ細胞、標的細胞型が角膜細胞の場合は角膜細胞）の発現を促進するためにうまく機能する必要がある。プロモーターは、遺伝子治療ベクターの発現カセットの主要な要素である。最適なプロモーター選択により、標的特異性及び遺伝子発現を高めることができる。治療の対象となる細胞型又は組織型に応じて、ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子治療で使用されるプロモーターは、構成的プロモーターであっても細胞特異的プロモーターであってもよい（例えば、ＲＰＥ細胞に特異的なプロモーター、ＲＰＥ及び光受容体の両方に特異的なプロモーター、ＲＰＥ細胞及び脈絡膜細胞に特異的なプロモーター、ＲＰＥ、光受容体細胞、及び脈絡膜細胞に特異的なプロモーター、角膜細胞に特異的なプロモーター、ＲＰＥ、光受容体細胞、脈絡膜、及び角膜細胞に特異的なプロモーター、又は眼細胞に特異的なプロモーター）。ＣＹＰ４Ｖ２はほぼ遍在的に発現しており、複数の細胞型がＢＣＤで影響を受ける（主要なものはＲＰＥであり、他の細胞型には、例えば、角膜、網膜、リンパ球が含まれる）ので、この設計では、複数の組織型及び細胞型における発現カセット及び送達ベクターの効果を広げるために、構成的プロモーターを選択した。ｓｓＡＡＶベクターで使用される発現カセットには、強力な構成的プロモーターである、長さ約１．７ｋｂであるＣＡＧプロモーターを使用した（例示的な配列を配列番号３２に示す）。ＣＡＧプロモーター（ＣＢＡ、ＣＡＧＧＳ、又はＣＢプロモーターとしても知られる）は強力な合成プロモーターである。ＣＡＧプロモーターは、次の制御要素で構成されている：
（Ｃ）サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）初期エンハンサー要素、
（Ａ）ニワトリβアクチン遺伝子のプロモーター領域と１番目のエクソン、及びニワトリのβアクチン遺伝子とウサギのβグロビン遺伝子からのキメライントロン、並びに
（Ｇ）ウサギβグロビン遺伝子のスプライスアクセプター。
ＣＡＧプロモーターは、哺乳動物細胞で発現を駆動するために最も一般的に使用される構成的プロモーターであるＣＭＶプロモーター（例示的な配列を配列番号４０に示す）よりも強力で持続的な活性を有するため使用された。ｓｃＡＡＶベクターで使用される発現カセットには、ｓｃＡＡＶのパッケージングサイズの制限により、はるかに短い構成的プロモーターである伸長因子１α短（ＥＦＳ）プロモーターを使用した（例示的な配列を配列番号３５に示す）。ＥＦＳプロモーターは、ＥＦ−１αプロモーター（約１．２Ｋｂ、例示的な配列を配列番号４１に示す）の小型化バージョンである。ＥＦ−１αプロモーターは、ヒト伸長因子−１α（ＥＦ−１α）に由来する構成的プロモーターである。ＥＦＳプロモーターは、ｓｓＡＡＶの発現カセット設計にも使用できる。ＣＡＧプロモーター、ＣＭＶプロモーター、ＥＦ１αプロモーター、及びＥＦＳプロモーターに加えて、他の構成的プロモーターを使用してもよく、非限定的な例として、ＣＭＶプロモーターなどの別のウイルスプロモーター；ｓｍＣＢＡプロモータープロモーター、ＣＢＳＢプロモーター、又はＣＢｈプロモーターなどのＣＡＧ（ＣＢＡ、ＣＡＧＧＳ、又はＣＢプロモーターとしても知られる）の誘導体又はバリアント；その他のβアクチンプロモーター（例えば、ヒトβアクチンプロモーター）；ＥＦ−１αプロモーターの誘導体又はバリアント；ＰＧＫプロモーター；ＵＢＣプロモーター；ＧＵＳＢプロモーター；ＵＣＯＥプロモーター；又は本明細書に記載の他のプロモーターが挙げられる。さらに、ＲＰＥにおける発現を駆動するために、細胞特異的プロモーターを用いることもでき、非限定的な例として、本明細書に記載の眼細胞特異的プロモーター、例えばＶＭＤ２（ＢＥＳＴ１としても知られる）プロモーター又はＲＰＥ６５プロモーターが挙げられる。
【手続補正１８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５３８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０５３８】
治療有効用量は、疾患モデル（例えば、ＢＣＤ細胞モデル（例えば、ＢＣＤ患者由来のｉＰＳ−ＲＰＥ細胞系））又は動物モデルで決定及び評価し、臨床試験で確認又は改良することができる。インビトロでの細胞の治療では、投与量は通常ＭＯＩとして表され、その後、治療される細胞の数をＭＯＩに乗じる。ＭＯＩは通常、細胞あたり約１×１０３ＧＣから約１×１０６ＧＣの範囲内であるか、又は細胞あたり約１００〜約１０，０００ＧＣの感染性ＭＯＩ（ＧＣ：ゲノムコピー、ゲノムを含むＡＡＶ粒子（ベクターゲノム（ｖｇ）又はゲノム粒子（ｇｐ）としても知られる）を測定する）の範囲内である。インビボ治療では、用量を決定するために、投与経路、標的とする領域の面積又は細胞の数、及び治療対象（例えば、治療対象の年齢、体重、疾患進行度、及び状態、並びに潜在的な免疫反応）、並びに治療の対象となる細胞の位置（例えば、網膜  ｖｓ．  角膜）などの代表的な臨床的要因を考慮する必要がある。さらに、使用するＡＡＶ．ＣＹＰ４Ｖ２ベクターの形質導入効率及びレスキューの有効性も考慮する必要がある。最後に、可能であれば、患者間の細胞レベルでの最適用量の個人差も考慮する必要があり、これは患者特異的ｉＰＳ−ＲＰＥ細胞で評価することができる。よって、インビボでの眼への１回の局所投与の治療上有効な用量は、約１×１０６ＧＣ〜約２×１０１３ＧＣのオーダー（例えば、約１×１０１１ＧＣ〜約１×１０１２ＧＣの高用量範囲、約１×１０１０ＧＣ〜約１×１０１１ＧＣの中用量範囲、約１×１０９ＧＣ〜約１×１０１０ＧＣの低用量範囲、約１×１０６ＧＣ〜約１×１０９ＧＣの超低用量範囲、及び約１×１０１２ＧＣ〜約２×１０１３ＧＣの超高用量範囲）、又はこれらの範囲内であって所望の効果を提供するのに充分な任意の用量であってよい。一実施形態では、組成物は、約１×１０６ＧＣ〜約２×１０１３ＧＣの用量で投与される。別の実施形態では、インビボ投与量は、治療の標的となる細胞数に標的ＭＯＩ（例えば、細胞あたり約１×１０３ＧＣ〜約１×１０６ＧＣ）を乗じて決定される。眼への任意の１回の局所投与におけるｒＡＡＶベクターを含む薬剤の体積は、約１μＬ（０．００１ｍＬ）〜約１０００μＬ（１ｍＬ）の範囲内であり得る。血流を介した送達による治療は、はるかに高い用量を必要とし、体重１ｋｇあたり約１×１０６〜約２×１０１４ＧＣの範囲内となりえる。
【手続補正１９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５９９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０５９９】
プロトコル番号２（ＲＮＰを用いたエレクトロポレーション）：
１．氷入りバケツを使用する。１つのｓｇＲＮＡ（品目番号４、５、又は６；ｇＲＮＡは組み合わせないこと）、１つのｓｓＯＤＮドナー鋳型（品目番号７又は８）、ＳｐＣａｓ９タンパク質（品目番号９）、及びＣａｓ９−Ｐｕｒｏ発現ベクターを氷上で解凍する。Ｃａｓ９−Ｐｕｒｏ発現ベクターは、選択マーカーとして使用される。これはｐＸ４５９−ｈＳｐＣａｓ９−２Ａ−Ｐｕｒｏプラスミドであり、ｇＲＮＡにクローニングしなかったことを除いて、図１５に示す構造を有する。
２．１．７ｍＬエッペンドルフチューブ及び６ウェルプレートに明確にラベルを付ける。サンプル毎に１本のエッペンドルフチューブ及び１個のウェルを準備する。各ウェルに３ｍＬの培地（ＳｔｅｍＣｅｌｌ  ＴｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓのＴｅＳＲ−Ｅ８（カタログ番号０５９４０））を加える。
３．２５ｍＬのＰＢＳ入りの１０ｃｍディッシュを１個準備して、Ｎｅｏｎ（登録商標）チップを洗浄する。
４．エレクトロポレーションされた細胞を入れるための６ウェルプレートを準備する。各ウェルに３ｍＬの培地を加える。
５．各エッペンドルフチューブに、４μｇ（４μＬのストック）ｓｇＲＮＡ（品目番号４、５、又は６）及び１０μｇ（１０μＬのストック）のＳｐＣａｓ９タンパク質（品目番号９）を追加し、チューブを室温で少なくとも１０分間置く。
６．５μｇ（５μＬのストック）のｓｓＯＤＮ（品目番号７又は８）及び２．５μｇ（２．５μＬのストック）のＣａｓ９−Ｐｕｒｏ発現ベクターを各チューブに追加する。
７．適切なＮｅｏｎ（登録商標）ＥＰバッファーＲで細胞を再懸濁し、最終密度１×１０７細胞／ｍＬとする。
８．１０５μＬの細胞懸濁液を分注し、ＣＲＩＳＰＲ  ＲＮＰ混合物とともに各エッペンドルフチューブに加える。
９．３ｍＬのＢｕｆｆｅｒ  Ｅ２をＮｅｏｎ（登録商標）ピペットに添加し、Ｎｅｏｎ（登録商標）ピペットをＮｅｏｎ（登録商標）ピペットステーションに置く。
１０．１００μＬのＮｅｏｎ（登録商標）チップを使用する。各エッペンドルフチューブから１００μＬのＥＰ混合液を吸引し、Ｎｅｏｎ（登録商標）ピペットに挿入する。
１１．上記表９のＥＰ条件のうちの１つを適用し、上記のプロトコル番号１の工程３〜６を行う。
【手続補正２０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０６０３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０６０３】
３．細胞を採取しカウントする：５×１０５ｉＰＳ細胞
４．３〜５回静かに上下にピペッティングして、ＲＮＰ＋ｓｓＯＤＮ（１０μＬ）と共に細胞を懸濁する。
５．２０μＬのＬｏｎｚａキットバッファーを細胞懸濁液に添加し、ヌクレオフェクション前のインキュベーション時間を最小限にする。
６．混合物（３０μＬ）をＬｏｎｚａキットウェルにロードする。インピーダンスを確認する。
７．設定パラメーター（ＤＳ１５０）を使用して細胞をエレクトロポレーションする。
８．７０μＬのｍＴｅＳＲ（ＲＯＣＫ阻害剤を含む）をキットのウェルに直接添加して、エレクトロポレーションした細胞を静かに再懸濁する。 
９．６ウェルプレートの１つのウェルで細胞を継代培地中に播種する。
１０．エレクトロポレーションの２４時間後に細胞の生存率を観察し、培地を培養培地に交換する。
【手続補正２１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０６１８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０６１８】
本明細書は、生成物の作製に組み合わせて使用可能な方法及び組成、並びに前記方法及び組成による生成物を開示する。これら及び他の材料が本明細書に開示されており、これらの方法及び組成の組み合わせ、サブセット、相互作用、グループなどが開示されていることが理解される。すなわち、これらの組成及び方法の様々な個々の及び集合的な組み合わせ並びに変更への具体的な言及は明示的に開示されていない可能性もあるが、それぞれ本明細書で具体的に意図及び説明される。例えば、特定の物の組成又は特定の方法が開示及び考察され、多くの組成物や方法が説明されている場合、特に反対の指示がない限り、その組成及び方法のありとあらゆる組み合わせ及び変更が具体的に想定されている。同様に、これらの任意のサブセット又は組み合わせも具体的に想定され、開示されている。
（付記）本開示は以下の実施形態を含む。
＜１＞
ヒト対象の眼疾患を治療又は予防するための組成物であって、
前記組成物は発現カセットを含むベクターを含み、
前記発現カセットは、１又は複数の制御配列に作動可能に連結された、機能的又は非変異ＣＹＰ４Ｖ２タンパク質をコードする核酸分子又はその非病原性バリアントを含み、
前記疾患は、眼細胞の機能障害、ジストロフィー、障害、変性、萎縮及び／又は死滅に関連している、
組成物。
＜２＞
眼細胞の機能障害、ジストロフィー、障害、変性、萎縮及び／又は死滅を予防、阻止、進行遅延、治療、又は改善するための組成物であって、
前記組成物は発現カセットを含むベクターを含み、
前記発現カセットは、１又は複数の制御配列に作動可能に連結された、機能的又は非変異ＣＹＰ４Ｖ２タンパク質をコードする核酸分子又はその非病原性バリアントを含む、
組成物  。
疾患：
＜３＞
前記眼疾患又は眼細胞変性は、ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子に両アレル変異を有する遺伝性網膜変性（ＩＲＤ）又は網膜色素変性症（ＲＰ）である、＜１＞又は＜２＞に記載の組成物。
＜４＞
前記疾患、又は前記眼細胞変性は、クリスタリン網膜症（ＢＣＤ、Ｂｉｅｔｔｉ結晶性角膜網膜ジストロフィーとしても知られる）に関連する、＜１＞、＜２＞、又は＜３＞に記載の組成物。
＜５＞
前記ベクターはウイルスベクター、プラスミド、又は非ウイルスベクターである、＜１＞〜＜４＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜６＞
前記ウイルスベクターは、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクター、アデノウイルスベクター、レンチウイルスベクター、単純ヘルペスウイルスベクター、バキュロウイルスベクター、センダイウイルスベクター、及びレトロウイルスベクターからなる群から選択される、＜５＞に記載の組成物。
＜７＞
前記ベクターは、組換えＡＡＶベクター（ｒＡＡＶ）である、＜５＞又は＜６＞に記載の組成物。
＜８＞
前記ｒＡＡＶにおけるＡＡＶゲノム又はＡＡＶカプシドタンパク質は、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、又はその他のＡＡＶの血清型、分離株、若しくは分岐群、又はそれらの誘導体、バリアント、若しくはハイブリッドのいずれか１つに由来する、＜５＞、＜６＞、又は＜７＞に記載の組成物。
＜９＞
前記ｒＡＡＶは、偽型ＡＡＶ（例えば、ＡＡＶ２／５、ＡＡＶ２／８、ＡＡＶ２／１、ＡＡＶ２／９、ＡＡＶ２／６、ＡＡＶ２／４、ＡＡＶ２／６、ＡＡＶ５／２、ＡＡＶ８／１、ＡＡＶ８／２、ＡＡＶ２／７、ＡＡＶ２／１２、及びＡＡＶ２／１０）又はハイブリッドＡＡＶ（例えば、ＡＡＶ−ＤＪ、ＡＡＶ−ＤＪ／８、又はＡＡＶ−ＤＪ／９）である、＜５＞〜＜８＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜１０＞
前記ｒＡＡＶは、１又は複数のカプシド変異（例えば、Ｙ−Ｆ、Ｋ−Ｒ、Ｔ−Ａ、Ｓ−Ａ及び／又はＴ−Ｖ変異（例えば、Ｙ４４４Ｆ、Ｙ５００Ｆ、Ｙ７３０Ｆ、Ｙ２５２Ｆ、Ｙ２７２Ｆ、Ｙ７００Ｆ、Ｙ７０４Ｆ、及びＴ４９１Ｖからの１又は複数のカプシド変異を有するＡＡＶ２、又は異なるＡＡＶ血清型における対応する変異（例えば、ＡＡＶ２（Ｙ４４４Ｆ＋Ｙ５００Ｆ＋Ｙ７３０Ｆ）、ＡＡＶ２（Ｙ−Ｆを４つ（ｑｕａｄＹ−Ｆ）＋Ｔ−Ｖ）、又はＡＡＶ２／８（Ｙ７３３Ｆ））））を含む、＜５＞〜＜９＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜１１＞
前記ｒＡＡＶの血清型は、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、Ａｎｃ８０、ｒｈ１０、及び／又はＳｈＨ１０からなる群から選択される又は由来する、＜５＞〜＜１０＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜１２＞
前記ｒＡＡＶは、ＡＡＶ２／５、ＡＡＶ２／８、ＡＡＶ２／２、ＡＡＶ２（Ｙ４４４Ｆ＋Ｙ５００Ｆ＋Ｙ７３０Ｆ）、ＡＡＶ２／１、ＡＡＶ２／９、ＡＡＶ２／８（Ｙ７３３Ｆ）、ＡＡＶ２／６、ＡＡＶ２／４、ＡＡＶ２／７、ＡＡＶ５、ＡＡＶ２、ＡＡＶ８、ＡＡＶ１、ＡＡＶ９、ＡＡＶ６、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ４、ＡＡＶ７、ＡＡＶ１２、Ａｎｃ８０、ＡＡＶ  ７ｍ８、ＡＡＶ−ＤＪ、ＳｈＨ１０、ＡＡＶ−ＰＨＰ．Ｂ、又はそれらのハイブリッド、誘導体、若しくはバリアントからなる群から選択される又は由来する、＜５＞〜＜１１＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜１３＞
前記ｒＡＡＶベクターは、一本鎖ＡＡＶベクター又は自己相補的ＡＡＶ（ｓｃＡＡＶ）ベクターである、＜５＞〜＜１２＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜１４＞
前記ベクターは、プラスミド、裸の（ｎａｋｅｄ）核酸、リポソーム（例えば、カチオン性又はアニオン性リポソーム）、デンドリマー、ナノ粒子、ポリマー（例えば、ポリプレックス）、脂質ポリマー系、固体脂質ナノ粒子、又はリポソームプロタミン／ＤＮＡリポプレックス（ＬＰＤ）である、＜５＞に記載の組成物。
＜１５＞
前記核酸配列にコードされる前記機能的又は非変異ＣＹＰ４Ｖ２タンパク質は、配列番号４〜６からなる群から選択される配列のいずれかに対して少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性（例えば、少なくとも８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％の配列同一性）を有するポリペプチドを含む、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜１６＞
前記核酸分子は、配列番号１、２、又は３に示す配列のいずれかと少なくとも７５％の配列同一性を有する、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜１７＞
前記核酸分子は、配列番号１、２、又は３に示す配列のいずれかと少なくとも８０％の配列同一性を有する、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜１８＞
前記核酸分子は、配列番号１、２、又は３に示す配列を含む、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜１９＞
前記核酸分子は、配列番号４、５、及び６から選択されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードするコドン最適化配列を含む、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２０＞
前記制御配列は、プロモーターを含む、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２１＞
前記プロモーターは、ＲＰＥ細胞特異的プロモーター、網膜細胞特異的プロモーター、角膜細胞特異的プロモーター、眼細胞特異的プロモーター、又は構成的プロモーターである、＜２０＞に記載の組成物。
＜２２＞
前記プロモーターは、βアクチンプロモーター若しくはウイルスプロモーター又はそれらのハイブリッドである、＜２０＞に記載の組成物。
＜２３＞
前記プロモーターは、ＣＡＧプロモーター（ハイブリッドＣＭＶ初期エンハンサー／ニワトリβアクチンプロモーター（ＣＡＧＧＳプロモーター、ＣＢプロモーター又はＣＢＡプロモーターとしても知られる））、ニワトリβアクチンプロモーター、小型ＣＢＡ（ｓｍＣＢＡ）プロモーター、ＣＢＳＢプロモーター、又はＣＢｈプロモーター、その他のβアクチンプロモーター（例えば、ヒトβアクチンプロモーター）、伸長因子１α短（ＥＦＳ：ｅｌｏｎｇａｔｉｏｎ  ｆａｃｔｏｒ  １  ａｌｐｈａ  ｓｈｏｒｔ）プロモーター、伸長因子１α（ＥＦ−１α）プロモーター、ＣＭＶプロモーター、ＰＧＫプロモーター、ＵＢＣプロモーター、ＧＵＳＢプロモーター、ＵＣＯＥプロモーター、ＶＭＤ２（卵黄状黄斑ジストロフィー２、ＢＥＳＴ１としても知られる）プロモーター、ＲＰＥ６５プロモーター、又はそれらのハイブリッド、バリアント、若しくは誘導体からなる群から選択される、＜２０＞に記載の組成物。
＜２４＞
前記制御配列は、ウシ成長ホルモンポリアデニル化シグナル（ｂＧＨポリＡ）、スモールポリＡシグナル（ＳＰＡ）、ヒト成長ホルモンポリアデニル化シグナル（ｈＧＨポリＡ）、ＳＶ４０ポリＡシグナル、ＳＶ４０後期ポリＡシグナル、又はそれらの誘導体、ハイブリッド、若しくはバリアントからなる群から選択されるポリＡシグナルである、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２５＞
前記制御配列は、コザック（Ｋｏｚａｋ）配列を含む、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２６＞
前記制御配列は、エンハンサーを含む、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２７＞
前記エンハンサーは、非限定的な例としてＷＰＲＥエンハンサー、ＨＰＲＥエンハンサー、ＣＴＥエンハンサー又はそれらの誘導体、ハイブリッド、若しくはバリアントが挙げられるウイルスエンハンサーである、＜２６＞に記載の組成物。
＜２８＞
配列番号６０〜６４に示すＣＹＰ４Ｖ２発現カセット配列のいずれかと少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸分子を含む、ＢＣＤを治療若しくは予防するための組成物、又はＢＣＤを治療若しくは予防するための組成物を製造するための組成物。
＜２９＞
医薬的に許容される担体と、特定の投与経路に適した追加の成分とで製剤化されている、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜３０＞
発現カセットを含むベクターを対象に投与することを含み、
前記発現カセットは１又は複数の制御配列に作動可能に連結された機能的又は非変異ＣＹＰ４Ｖ２タンパク質をコードする核酸分子又はその非病原性バリアントを含み、
前記疾患は、眼細胞の機能障害、ジストロフィー、障害、変性、萎縮及び／又は死滅に関連している、
ヒト対象の眼疾患を治療又は予防するための方法。
＜３１＞
発現カセットを含むベクターを前記眼細胞へ送達することを含み、
前記発現カセットは１又は複数の制御配列に作動可能に連結された機能的又は非変異ＣＹＰ４Ｖ２タンパク質をコードする核酸分子又はその非病原性バリアントを含む、
眼細胞の機能障害、ジストロフィー、障害、変性、萎縮及び／又は死滅を予防、阻止、進行遅延、治療、又は改善するための方法。
＜３２＞
前記眼細胞は、網膜細胞、角膜細胞、脈絡膜細胞、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞、光受容体細胞、及び／又は脈絡膜上皮細胞である、＜３０＞又は＜３１＞に記載の方法。
＜３３＞
前記眼疾患又は眼細胞変性は、ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子に両アレル変異を有する遺伝性網膜変性（ＩＲＤ）又は網膜色素変性症（ＲＰ）である、＜３０＞又は＜３１＞に記載の方法。
＜３４＞
前記疾患又は前記眼細胞変性は、クリスタリン網膜症（ＢＣＤ、Ｂｉｅｔｔｉ結晶性角膜網膜ジストロフィーとしても知られる）に関連する、＜３０＞又は＜３１＞に記載の方法。
＜３５＞
前記ベクターはウイルスベクター、プラスミド、又は非ウイルスベクターである、＜３０＞〜＜３４＞のいずれか一項に記載の方法。
＜３６＞
前記ウイルスベクターは、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクター、アデノウイルスベクター、レンチウイルスベクター、単純ヘルペスウイルスベクター、バキュロウイルスベクター、センダイウイルスベクター、及びレトロウイルスベクターからなる群から選択される、＜３５＞に記載の方法。
＜３７＞
前記ベクターは、組換えＡＡＶベクター（ｒＡＡＶ）である、＜３６＞に記載の方法。
＜３８＞
前記ｒＡＡＶは、ＡＡＶゲノム又はその誘導体、及び／又はＡＡＶカプシドタンパク質又はその誘導体若しくはバリアントを含む、＜３７＞に記載の方法。
＜３９＞
前記ｒＡＡＶは、キメラＡＡＶ、シャッフルＡＡＶ、又はカプシド改変ＡＡＶである、＜３７＞又は＜３８＞に記載の方法。
＜４０＞
前記ｒＡＡＶにおけるＡＡＶゲノム又はＡＡＶカプシドタンパク質は、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、又はその他のＡＡＶの血清型、分離株、若しくは分岐群、又はそれらの誘導体、バリアント、若しくはハイブリッドのいずれか１つに由来する、＜３６＞、＜３７＞、＜３８＞、又は＜３９＞に記載の方法。
＜４１＞
前記ｒＡＡＶは、偽型ＡＡＶ（例えば、ＡＡＶ２／５、ＡＡＶ２／８、ＡＡＶ２／１、ＡＡＶ２／９、ＡＡＶ２／６、ＡＡＶ２／４、ＡＡＶ２／６、ＡＡＶ５／２、ＡＡＶ８／１、ＡＡＶ８／２、ＡＡＶ２／７、ＡＡＶ２／１２、及びＡＡＶ２／１０）又はハイブリッドＡＡＶ（例えば、ＡＡＶ−ＤＪ、ＡＡＶ−ＤＪ／８、又はＡＡＶ−ＤＪ／９）である、＜３７＞〜＜４０＞のいずれか一項に記載の方法。
＜４２＞
前記ｒＡＡＶは、１又は複数のカプシド変異（例えば、Ｙ−Ｆ、Ｋ−Ｒ、Ｔ−Ａ、Ｓ−Ａ及び／又はＴ−Ｖ変異（例えば、Ｙ４４４Ｆ、Ｙ５００Ｆ、Ｙ７３０Ｆ、Ｙ２５２Ｆ、Ｙ２７２Ｆ、Ｙ７００Ｆ、Ｙ７０４Ｆ、及びＴ４９１Ｖからの１又は複数のカプシド変異を有するＡＡＶ２、又は異なるＡＡＶ血清型における対応する変異（例えば、ＡＡＶ２（Ｙ４４４Ｆ＋Ｙ５００Ｆ＋Ｙ７３０Ｆ）、ＡＡＶ２（Ｙ−Ｆを４つ（ｑｕａｄＹ−Ｆ）＋Ｔ−Ｖ）、又はＡＡＶ２／８（Ｙ７３３Ｆ））））を含む、＜３７＞〜＜４１＞のいずれか一項に記載の方法。
＜４３＞
前記ｒＡＡＶの血清型は、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、Ａｎｃ８０、ｒｈ１０、及び／又はＳｈＨ１０からなる群から選択される又は由来する、＜３７＞〜＜４２＞のいずれか一項に記載の方法。
＜４４＞
前記ｒＡＡＶは、ＡＡＶ２／５、ＡＡＶ２／８、ＡＡＶ２／２、ＡＡＶ２（Ｙ４４４Ｆ＋Ｙ５００Ｆ＋Ｙ７３０Ｆ）、ＡＡＶ２／１、ＡＡＶ２／９、ＡＡＶ２／８（Ｙ７３３Ｆ）、ＡＡＶ２／６、ＡＡＶ２／４、ＡＡＶ２／７、ＡＡＶ５、ＡＡＶ２、ＡＡＶ８、ＡＡＶ１、ＡＡＶ９、ＡＡＶ６、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ４、ＡＡＶ７、ＡＡＶ１２、Ａｎｃ８０、ＡＡＶ  ７ｍ８、ＡＡＶ−ＤＪ、ＳｈＨ１０、ＡＡＶ−ＰＨＰ．Ｂ、又はそれらのハイブリッド、誘導体、若しくはバリアントからなる群から選択される又は由来する、＜３７＞〜＜４３＞のいずれか一項に記載の方法。
＜４５＞
前記ｒＡＡＶベクターは、一本鎖ＡＡＶベクター又は自己相補的ＡＡＶ（ｓｃＡＡＶ）ベクターである、＜３７＞〜＜４４＞のいずれか一項に記載の方法。
＜４６＞
前記ベクターは、プラスミド、裸の（ｎａｋｅｄ）核酸、リポソーム（例えば、カチオン性又はアニオン性リポソーム）、デンドリマー、ナノ粒子、ポリマー（例えば、ポリプレックス）、脂質ポリマー系、固体脂質ナノ粒子、又はリポソームプロタミン／ＤＮＡリポプレックス（ＬＰＤ）である、＜３０＞〜＜３４＞のいずれか一項に記載の方法。
＜４７＞
前記核酸配列にコードされる前記機能的又は非変異ＣＹＰ４Ｖ２タンパク質は、配列番号４〜６からなる群から選択される配列のいずれかに対して少なくとも８０％のアミノ酸配列同一性（例えば、少なくとも８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％の配列同一性）を有するポリペプチドを含む、＜３０＞〜＜４６＞のいずれか一項に記載の方法。
＜４８＞
前記核酸分子は、配列番号１、２、又は３に示す配列のいずれかと少なくとも７５％の配列同一性を有する、＜３０＞〜＜４７＞のいずれか一項に記載の方法。
＜４９＞
前記核酸分子は、配列番号１、２、又は３に示す配列のいずれかと少なくとも８０％の配列同一性を有する、＜３０＞〜＜４８＞のいずれか一項に記載の方法。
＜５０＞
前記核酸分子は、配列番号１、２、又は３に示す配列を含む、＜３０＞〜＜４９＞のいずれか一項に記載の方法。
＜５１＞
前記核酸分子は、配列番号４、５、及び６から選択されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードするコドン最適化配列を含む、＜３０＞〜＜５０＞のいずれか一項に記載の方法。
＜５２＞
前記制御配列は、プロモーターを含む、＜３０＞〜＜５１＞のいずれか一項に記載の方法。
＜５３＞
前記プロモーターは、ＲＰＥ細胞特異的プロモーター、網膜細胞特異的プロモーター、角膜細胞特異的プロモーター、眼細胞特異的プロモーター、又は構成的プロモーターである、＜５２＞に記載の方法。
＜５４＞
前記プロモーターは、βアクチンプロモーター若しくはウイルスプロモーター又はそれらのハイブリッドである、＜５２＞に記載の方法。
＜５５＞
前記プロモーターは、ＣＡＧプロモーター（ハイブリッドＣＭＶ初期エンハンサー／ニワトリβアクチンプロモーター（ＣＡＧＧＳプロモーター、ＣＢプロモーター又はＣＢＡプロモーターとしても知られる））、ニワトリβアクチンプロモーター、小型ＣＢＡ（ｓｍＣＢＡ）プロモーター、ＣＢＳＢプロモーター、又はＣＢｈプロモーター、その他のβアクチンプロモーター（例えば、ヒトβアクチンプロモーター）、伸長因子１α短（ＥＦＳ：ｅｌｏｎｇａｔｉｏｎ  ｆａｃｔｏｒ  １  ａｌｐｈａ  ｓｈｏｒｔ）プロモーター、伸長因子１α（ＥＦ−１α）プロモーター、ＣＭＶプロモーター、ＰＧＫプロモーター、ＵＢＣプロモーター、ＧＵＳＢプロモーター、ＵＣＯＥプロモーター、ＶＭＤ２（卵黄状黄斑ジストロフィー２、ＢＥＳＴ１としても知られる）プロモーター、ＲＰＥ６５プロモーター、又はそれらのハイブリッド、バリアント、若しくは誘導体からなる群から選択される、＜５２＞に記載の方法。
＜５６＞
前記制御配列は、ポリアデニル化（ポリＡ）シグナルを含む、＜３０＞〜＜５５＞のいずれか一項に記載の方法。
＜５７＞
前記ポリＡシグナルは、ウシ成長ホルモンポリアデニル化シグナル（ｂＧＨポリＡ）、スモールポリＡシグナル（ＳＰＡ）、ヒト成長ホルモンポリアデニル化シグナル（ｈＧＨポリＡ）、ＳＶ４０ポリＡシグナル、ＳＶ４０後期ポリＡシグナル、又はそれらの誘導体、ハイブリッド、若しくはバリアントである、＜５６＞に記載の方法。
＜５８＞
前記制御配列は、コザック（Ｋｏｚａｋ）配列を含む、＜３０＞〜＜５７＞のいずれか一項に記載の方法。
＜５９＞
前記制御配列は、エンハンサーを含む、＜３０＞〜５７＞のいずれか一項に記載の方法。
＜６０＞
前記エンハンサーは、ＷＰＲＥエンハンサー、ＨＰＲＥエンハンサー、ＣＴＥエンハンサー又はそれらの誘導体、ハイブリッド、若しくはバリアントが挙げられるがこれらに限定されないウイルスエンハンサーである、＜５９＞に記載の方法。
＜６１＞
配列番号６０〜６４に示すＣＹＰ４Ｖ２発現カセット配列のいずれかと少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸分子を含むベクターを投与することを含む、ＢＣＤを治療又は予防するための方法。
＜６２＞
前記組成物は、医薬的に許容される担体と、特定の投与経路に適した追加の成分とで製剤化されている、＜３０＞〜＜６１＞のいずれか一項に記載の方法。
＜６３＞
配列番号６０〜６４に示すＣＹＰ４Ｖ２発現カセット配列のいずれかと少なくとも８０％の配列同一性を有する核酸分子を含む組成物であって、ＢＣＤを治療又は予防するためのベクターの製造に使用する組成物。
＜６４＞
インビトロ治療のために、細胞あたり約１×１０３ＧＣ〜約１×１０６ＧＣ（ＧＣ：ゲノムコピー；ゲノムを含むＡＡＶ粒子を測定する）の量（ＭＯＩ：感染多重度）で前記標的細胞の感染が行われる、＜３０＞〜＜６３＞のいずれか一項に記載の方法。
＜６５＞
対象の眼へのインビボ投与のために、１回の投与は、約１×１０６ＧＣ〜約２×１０１３ＧＣのオーダー（例えば、約１×１０１１ＧＣ〜約１×１０１２ＧＣの高用量範囲、約１×１０１０ＧＣ〜約１×１０１１ＧＣの中用量範囲、約１×１０９ＧＣ〜約１×１０１０ＧＣの低用量範囲、約１×１０６ＧＣ〜約１×１０９ＧＣの超低用量範囲、及び約１×１０１２ＧＣ〜約２×１０１３ＧＣの超高用量範囲）で、又はこれらの範囲内の用量であってかつ所望の効果を提供するのに充分な任意の用量で実施できる、＜３０＞〜＜６４＞のいずれか一項に記載の方法。
＜６６＞
前記投与工程は、疾患症状の発現前又は疾患症状の発現後に行われる、＜３０＞〜＜６５＞のいずれか一項に記載の方法。
＜６７＞
前記投与及び／又は標的化送達は、眼及び／又は眼細胞に対するものである、＜３０＞〜＜６６＞のいずれか一項に記載の方法。
＜６８＞
前記投与は、網膜下注射、硝子体内注射によるか、又は前記ベクターを封入したデバイスを硝子体内に埋め込むことによるものである、＜３０＞〜＜６７＞のいずれか一項に記載の方法。
＜６９＞
前記投与は、前記ベクターを対象の網膜下、眼の後部、角膜、網膜、脈絡膜、ＲＰＥ細胞、光受容体若しくは角膜上皮細胞、又はＣＥ細胞に効果的に送達するその他の任意の投与方法によるものである、＜３０＞〜＜６８＞のいずれか一項に記載の方法。
＜７０＞
前記眼への投与は、血流を介した送達によって達成される、＜６７＞に記載の方法。
＜７１＞
前記眼細胞は、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞、光受容体細胞（ＰＲＣ）、角膜上皮細胞（ＣＥＣ）、脈絡膜内皮（ＣＥ）細胞、網膜細胞、角膜細胞、水晶体細胞、神経節細胞、視神経細胞、及び／又は脈絡膜細胞、並びに幹細胞（例えば、ｉＰＳＣ、ＥＳ細胞、ＭＳＣ、成体幹細胞及び／又は組織特異的幹細胞が挙げられるがこれらに限定されない）に由来するこれらの種類の細胞からなる群から選択される、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜７２＞
前記ベクターは、医薬的に許容される担体と、特定の投与経路に適した追加の成分とで製剤化されている、＜３０＞〜＜７１＞のいずれか一項に記載の方法。
＜７３＞
ＢＣＤを有する、ＢＣＤを発症するリスクがある、又は両アレルＣＹＰ４Ｖ２変異を有する対象を同定することをさらに含む、＜３０＞〜＜７２＞のいずれか一項に記載の方法。
＜７４＞
１又は複数の制御配列に作動可能に連結された、ヒトＣＹＰ４Ｖ２タンパク質をコードする配列番号２の核酸配列又は配列番号２の前記核酸配列と少なくとも９０％の配列同一性を有する核酸配列を含む核酸分子を含むベクターを前記対象の眼細胞に送達することを含む、ヒト対象のクリスタリン網膜症（ＢＣＤ）を治療又は予防する方法。
＜７５＞
前記ベクターは、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクターである、＜７４＞に記載の方法。 
＜７６＞
前記制御配列は、プロモーターである、＜７４＞及び＜７５＞に記載の方法。
＜７７＞
ヒトＣＹＰ４Ｖ２タンパク質をコードする配列番号２の核酸配列又は配列番号２の前記核酸配列と少なくとも９０％の配列同一性を有する核酸配列を含む核酸分子。
＜７８＞
＜７７＞に記載の核酸分子と、該核酸配列に作動可能に連結された１又は複数の制御配列とを含む発現カセット。
＜７９＞
＜７７＞の核酸分子又は＜７８＞の発現カセットを含むベクター。
＜８０＞
ウイルスベクターであるか、又は組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクター、組換えアデノウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクター、組換え単純ヘルペスウイルスベクター、組換えバキュロウイルスベクター、組換えセンダイウイルスベクター、及び組換えレトロウイルスベクターからなる群から選択される、＜７９＞に記載のベクター。
＜８１＞
プラスミド又は非ウイルスベクターである、＜７９＞に記載のベクター。
＜８２＞
前記非ウイルスベクターは、裸の（ｎａｋｅｄ）核酸、リポソーム（例えば、カチオン性又はアニオン性リポソーム）、デンドリマー、ナノ粒子、ポリマー（例えば、ポリプレックス）、脂質ポリマー系、固体脂質ナノ粒子、又はリポソームプロタミン／ＤＮＡリポプレックス（ＬＰＤ）からなる群から選択される、＜８１＞に記載のベクター。
＜８３＞
＜７７＞に記載の核酸分子及び／又は＜７９＞〜＜８２＞のいずれか一項に記載のベクターを含む宿主細胞。
＜８４＞
ウイルスベクター媒介遺伝子治療において、ウイルスベクターに対する免疫応答を低下させ、形質導入効率を維持し、ウイルスベクター及び／又は免疫抑制剤の用量を低下させ、及び／又は同じ遺伝疾患の様々な患者に対する治療効果を最大化する方法であって、
（ａ）抗原領域変異若しくは他の変異を有するバリアント又は前記ウイルスベクターのカプシドのバリアントを作製することによる、前記遺伝子治療のための標的細胞型において充分な形質導入効率を持つ複数の組換えウイルスベクター（例えば、ｒＡＡＶ）のプールの確立を、前記疾患に関連する標的細胞（例えば、ＢＣＤに対するＣＹＰ４Ｖ２遺伝子治療におけるｉＰＳ−ＲＰＥ又はＲＰＥ細胞系）において上記変異又はバリアントが充分な形質導入効率を有することが確認された後で行うこと、
（ｂ）遺伝子治療を必要とする対象における様々なウイルスベクター血清型及び／又はカプシド変異又はバリアントに対する既存の中和抗ウイルスベクター抗体（ＮＡｂ）を検出し、及び／又は上記対象に由来する患者特異的疾患標的細胞（例えば、ｉＰＳ−ＲＰＥ細胞）において様々なウイルスベクターを試験及び比較すること、
（ｃ）前記ウイルスベクターのプールから、
（ｉ）前記疾患標的細胞における充分な形質導入効率、
（ｉｉ）前記対象の既存のＮＡｂとの低い交差反応性、及び／又は
（ｉｉｉ）前記対象の患者特異的疾患標的細胞（例えば、ＢＣＤのＣＹＰ４Ｖ２遺伝子治療における患者特異的ｉＰＳ−ＲＰＥ又はＲＰＥ細胞系）における良好な表現型レスキュー結果、
を有するウイルスベクターを選択することであって、
上記ウイルスベクターのプールは、様々な血清型及び／又はカプシド改変ウイルスベクター（例えば、カプシド変異体ＡＡＶ及び／又はカプシドタンパク質バリアントＡＡＶが挙げられるがこれらに限定されない）を含む、
前記選択すること、
（ｄ）（ｃ）から選択された前記ウイルスベクターを前記対象への投与に使用すること、及び
（ｅ）前記対象が遺伝子治療の投与を必要とするたびに、上記（ｂ）〜（ｄ）（既存のＮＡｂに関連する部分のみ）を繰り返すこと（例えば、限定されるものではないが、同じ臓器（例えば、眼又は反対側の眼）又は別の臓器へのフォローアップ投与）、
を含む、
方法。
＜８５＞
ヒト網膜疾患の治療又は予防にＡＡＶベクター媒介遺伝子治療を使用する方法であって、前記ＡＡＶベクターは、治療用導入遺伝子に作動可能に連結されたＥＦＳプロモーター（配列番号３５）及び／又はスモールポリＡ（配列番号３６）を含む核酸分子、又は配列番号３５との間で少なくとも９０％の配列同一性を有するか、若しくは配列番号３６との間で少なくとも８５％の配列同一性を有する核酸分子、を含む、方法。
＜８６＞
前記ＡＡＶベクターは、一本鎖ＡＡＶである、＜８５＞に記載の方法。
＜８７＞
前記ＡＡＶベクターは、自己相補的ＡＡＶ（ｓｃＡＡＶ）である、＜８５＞に記載の方法。
＜８８＞
標的遺伝子に１又は複数の変異を含む、
（ａ）対象から提供された幹細胞、若しくは対象から提供された細胞からリプログラミングされた幹細胞、又は
（２）対象から提供された幹細胞に由来する細胞、若しくは対象から提供された細胞からリプログラミングされた幹細胞に由来する細胞、
を含む、細胞系の組成物を含む細胞疾患モデル。
＜８９＞
前記幹細胞は、人工多能性幹（ｉＰＳ）細胞である、＜８８＞に記載の組成物。
＜９０＞
前記幹細胞は、胚性幹（ＥＳ）細胞、体性（又は成体）幹細胞、組織特異的幹細胞、又は間葉系幹細胞（ＭＳＣ）である、＜８８＞に記載の組成物。
＜９１＞
前記対象から提供される細胞は、体細胞である、＜８８＞に記載の組成物。
＜９２＞
前記対象から提供される細胞は、皮膚細胞、線維芽細胞、又は血液細胞である、＜８８＞に記載の組成物。
＜９３＞
対象から提供される前記細胞は、皮膚線維芽細胞又は末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）である、＜８８＞又は＜９２＞に記載の組成物。
＜９４＞
対象から提供される前記細胞は、尿細胞、腎上皮細胞、毛包、又は真皮乳頭細胞である、＜８８＞に記載の組成物。
＜９５＞
幹細胞に由来する前記細胞は、眼細胞である、＜８８＞に記載の組成物。
＜９６＞
前記眼細胞は、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞、光受容体細胞（ＰＲＣ、例えば、桿体細胞、錐体細胞、及び光受容体前駆細胞）、網膜細胞、角膜細胞、角膜上皮細胞（ＣＥＣ）、視神経細胞、水晶体細胞、脈絡膜内皮（ＣＥ）細胞、視神経細胞、又は脈絡膜細胞である、＜９５＞に記載の組成物。
＜９７＞
前記幹細胞に由来する細胞は、ニューロン細胞である、＜８８＞に記載の組成物。
＜９８＞
前記変異は、前記対象にとって内因性である、＜８８＞に記載の組成物。
＜９９＞
前記変異は、遺伝子編集又は遺伝子操作を介して人工的に導入される、＜８８＞又は＜９８＞に記載の組成物。
＜１００＞
前記細胞系は、前記対象にとって内因性及び／又は外因性である複数の変異を含む、＜８８＞に記載の組成物。
＜１０１＞
前記対象は、哺乳動物である、＜８８＞に記載の組成物。
＜１０２＞
前記対象は、ヒトである、＜８８＞に記載の組成物。
＜１０３＞
前記標的遺伝子は、表４に示す遺伝子を含む、＜８８＞に記載の組成物。
＜１０４＞
前記標的遺伝子は、
変異若しくは欠陥を有する、ＣＹＰ４Ｖ２、ＣＹＰ１Ｂ１、ＭＹＯ７Ａ、ＤＦＮＢ３１、ＵＳＨ１Ｃ、ＵＳＨ１Ｇ、ＣＤＨ２３、ＰＣＤＨ１５、ＣＬＲＮ１、ＡＣＯ２、ＡＦＧ３Ｌ２、ＡＴＸＮ２、ＡＵＨ、Ｃ１２ｏｒｆ６５、ＣＩＳＤ２、ＦＯＸＣ１、ＦＯＸＦ２、ＬＴＢＰ２、ＭＴＰＡＰ、ＭＹＯＣ、ＮＤＵＦＳ１、ＮＲ２Ｆ１、ＯＰＡ１、ＯＰＡ３、ＯＰＴＮ、ＰＡＸ６、ＰＤＧＦ、ＰＩＴＸ２、ＰＯＬＧ、ＳＰＧ７、ＴＥＫ、ＴＸＮＲＤ２、ＷＦＳ１、ＡＢＣＡ４、ＲＥＰ−１、ＲＰＥ６５、ＣＥＰ２９０、ＰＤＥ６Ｂ、ＲＰＧＲ、ＭＥＲＴＫ、ＭＴ−ＮＤ４、ＦＡＭ４７Ｅ、ＧＢＡ、ＧＣＨ１、ＨＴＲＡ２、ＬＲＲＫ２、ＰＡＲＫ２、ＰＩＮＫ１、ＳＮＣＡ、ＳＹＮＪ１、ＮＰＣ１、ＮＰＣ２、ＣＹＰ４Ａ１１、ＣＹＰ４Ａ２２、ＣＹＰ４Ｂ１、ＣＹＰ４Ｆ２、ＣＹＰ４Ｆ３、ＣＹＰ４Ｆ８、ＣＹＰ４Ｆ１１、ＣＹＰ４Ｆ１２、ＣＹＰ４Ｆ２２、ＣＹＰ４Ｘ１、ＣＹＰ４Ｚ１、若しくはＣＹＰ４６Ａの遺伝子、又は
不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする、ＣＹＰ４Ｖ２、ＣＹＰ１Ｂ１、ＭＹＯ７Ａ、ＤＦＮＢ３１、ＵＳＨ１Ｃ、ＵＳＨ１Ｇ、ＣＤＨ２３、ＰＣＤＨ１５、ＣＬＲＮ１、ＡＣＯ２、ＡＦＧ３Ｌ２、ＡＴＸＮ２、ＡＵＨ、Ｃ１２ｏｒｆ６５、ＣＩＳＤ２、ＦＯＸＣ１、ＦＯＸＦ２、ＬＴＢＰ２、ＭＴＰＡＰ、ＭＹＯＣ、ＮＤＵＦＳ１、ＮＲ２Ｆ１、ＯＰＡ１、ＯＰＡ３、ＯＰＴＮ、ＰＡＸ６、ＰＤＧＦ、ＰＩＴＸ２、ＰＯＬＧ、ＳＰＧ７、ＴＥＫ、ＴＸＮＲＤ２、ＷＦＳ１、ＡＢＣＡ４、ＲＥＰ−１、ＲＰＥ６５、ＣＥＰ２９０、ＰＤＥ６Ｂ、ＲＰＧＲ、ＭＥＲＴＫ、ＭＴ−ＮＤ４、ＦＡＭ４７Ｅ、ＧＢＡ、ＧＣＨ１、ＨＴＲＡ２、ＬＲＲＫ２、ＰＡＲＫ２、ＰＩＮＫ１、ＳＮＣＡ、ＳＹＮＪ１、ＮＰＣ１、ＮＰＣ２、ＣＹＰ４Ａ１１、ＣＹＰ４Ａ２２、ＣＹＰ４Ｂ１、ＣＹＰ４Ｆ２、ＣＹＰ４Ｆ３、ＣＹＰ４Ｆ８、ＣＹＰ４Ｆ１１、ＣＹＰ４Ｆ１２、ＣＹＰ４Ｆ２２、ＣＹＰ４Ｘ１、ＣＹＰ４Ｚ１、若しくはＣＹＰ４６Ａの遺伝子
を含む、＜８８＞に記載の組成物。
＜１０５＞
前記標的遺伝子は、ＣＹＰ４Ｖ２である、＜８８＞に記載の組成物。
＜１０６＞
前記細胞系は、ｉＰＳ細胞を含む、＜１０５＞に記載の組成物。
＜１０７＞
前記細胞系は、ｉＰＳ−ＲＰＥ細胞を含む、＜１０５＞に記載の組成物。
＜１０８＞
前記細胞系は、ｉＰＳ−光受容体（ｉＰＳ−ＰＲＣ）細胞、ｉＰＳ−角膜上皮細胞（ｉＰＳ−ＣＥＣ）、ｉＰＳ−脈絡膜内皮（ＣＥ）細胞、ｉＰＳ−角膜細胞、ｉＰＳ−脈絡膜細胞、ｉＰＳ−視神経細胞、ｉＰＳ−眼細胞、又はｉＰＳ−ニューロン細胞を含む、＜１０５＞に記載の組成物。
＜１０９＞
前記細胞系におけるＣＹＰ４Ｖ２変異は対象にとって内因性である、＜８８＞又は＜１０５＞〜＜１０８＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜１１０＞
前記対象は、ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子又はＣＹＰ４Ｖ２遺伝子のオーソログに病的変異を有する、＜８８＞又は＜１０９＞に記載の組成物。
＜１１１＞
前記対象は、表１に示す少なくとも１つのホモ接合性変異又は複合した２つのヘテロ接合性変異を有する、＜８８＞又は＜１０９＞に記載の組成物。
＜１１２＞
前記対象は、遺伝性網膜変性（ＩＲＤ）又は網膜色素変性症（ＲＰ）を有する、＜８８＞に記載の組成物。
＜１１３＞
前記対象は、クリスタリン網膜症（ＢＣＤ；Ｂｉｅｔｔｉ結晶性角膜網膜ジストロフィー、Ｂｉｅｔｔｉ結晶性網膜症、Ｂｉｅｔｔｉ網膜ジストロフィーとしても知られる）を有するか、又はＢＣＤを発症するリスクがある、＜８８＞に記載の組成物。
＜１１４＞
前記細胞系は、前記対象にとって外因性であり、遺伝子編集又は遺伝子操作を介して人工的に導入される少なくとも１つのＣＹＰ４Ｖ２変異を含む、＜８８＞又は＜１０５＞に記載の組成物。
＜１１５＞
前記細胞系は、
ｉＰＳ細胞、ＥＳ細胞、ＭＳＣ、組織特異的幹細胞、若しくは成体幹細胞、又は
ｉＰＳ細胞、ＥＳ細胞、ＭＳＣ、組織特異的幹細胞、若しくは成体幹細胞に由来する、ＲＰＥ細胞、光受容体細胞、角膜上皮細胞、脈絡膜内皮（ＣＥ）細胞若しくは脈絡膜細胞、
を含む、＜８８＞又は＜１１４＞に記載の組成物。
＜１１６＞
ＢＣＤ患者の細胞若しくは細胞系に由来する、又は人工的に作製された両アレルＣＹＰ４Ｖ２変異を有する細胞若しくは細胞系に由来する、ｉＰＳ細胞若しくはｉＰＳ細胞系又はｉＰＳ−ＲＰＥ細胞若しくはｉＰＳ−ＲＰＥ細胞系を含む、ＢＣＤヒト細胞モデル組成物又はＣＹＰ４Ｖ２機能不全細胞モデル組成物。
＜１１７＞
前記細胞系は、健康な対照の対応する細胞系と比較して、以下の化合物群の１又は複数の化合物について異常な生化学的プロファイルを有するか、異常なＲＰＥ機能、又はより高い細胞萎縮、細胞変性、若しくは細胞死レベルを有する、＜８８＞又は＜１０５＞〜＜１１６＞のいずれか一項に記載の組成物。
（ｉ）脂肪酸、
（ｉｉ）セラミド、
（ｉｉｉ）スフィンゴミエリン、
（ｉｖ）スフィンゴシン、
（ｖ）スフィンガニン、
（ｖｉ）ヒドロキシ脂肪酸、
（ｖｉｉ）コルチコステロイド、又は
（ｖｉｉｉ）タンパク質（ＣＹＰ４Ｖ２以外）
＜１１８＞
前記細胞系は、健康な対照の対応する細胞系と比較して、表２に示す１又は複数の化合物について異常な生化学的プロファイルを有する、＜８８＞又は＜１０５＞〜＜１１７＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜１１９＞
患者の細胞系（又はその疾患を引き起こす遺伝子の外因性変異を含む、遺伝子編集又は遺伝子操作された細胞系）と健康な対照とにおける細胞生存率レベルを評価及び比較することを含む、疾患細胞モデルにおける異常又は表現型を発見する方法。
＜１２０＞
患者の細胞系（又はその疾患を引き起こす遺伝子の外因性変異を含む、遺伝子編集又は遺伝子操作された細胞系）と健康な対照とにおけるＲＰＥ機能レベル（例えば、食作用活性、経上皮耐性）を評価及び比較することを含み、
前記細胞系はＲＰＥ細胞系である（幹細胞由来のＲＰＥ細胞系でもよい）、
疾患細胞モデルにおける異常又は表現型を発見する方法。
＜１２１＞
細胞系間の比較が、光への暴露なしで行われる、＜１１９＞又は＜１２０＞に記載の方法。
＜１２２＞
細胞系間の比較が、光への暴露後に行われる、＜１１９＞又は＜１２０＞に記載の方法。
＜１２３＞
細胞系間の比較が、青色光への暴露後に行われる、＜１１９＞、＜１２０＞、又は＜１２２＞に記載の方法。
＜１２４＞
細胞生存率が、死細胞／生細胞比、病気の細胞／健康な細胞の比若しくはこれらに類似の比；又は死細胞／全体の細胞若しくは生細胞／全体の細胞の百分率によって測定される、＜１１９＞、＜１２１＞、＜１２２＞、又は＜１２３＞に記載の方法。
＜１２５＞
患者の細胞系（又はその疾患を引き起こす遺伝子の外因性変異を含む、遺伝子編集又は遺伝子操作された細胞系）と健康な対照との間で、１又は複数の化合物のレベルを評価及び比較することを含み、
前記１又は複数の化合物は以下の群から選択される、
疾患細胞モデルにおける異常又は表現型を発見する方法。
（ｉ）脂肪酸、
（ｉｉ）セラミド、
（ｉｉｉ）スフィンゴミエリン、
（ｉｖ）スフィンゴシン、
（ｖ）スフィンガニン、
（ｖｉ）ヒドロキシ脂肪酸、
（ｖｉｉ）コルチコステロイド、及び／又は
（ｖｉｉｉ）タンパク質
＜１２６＞
評価される化合物のうち１又は複数は、表２に示されている、＜１２５＞に記載の方法。
＜１２７＞
化合物レベルの識別及び／又は評価が、ＬＣ−ＭＳ、ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ、ＧＣ−ＭＳ、ＧＣ−ＭＳ／ＭＳ、及び／又はＦＩＡ−ＭＳ／ＭＳを使用して実施される、＜１２５＞又は＜１２６＞に記載の方法。
＜１２８＞
前記疾患細胞モデルは、表４に示される変異又は欠陥を有する遺伝子を少なくとも１つ含む、＜１１９＞、＜１２０＞、又は＜１２５＞の方法。
＜１２９＞
前記疾患細胞モデルは、ＣＹＰ４Ｖ２、ＣＹＰ１Ｂ１、ＭＹＯ７Ａ、ＤＦＮＢ３１、ＵＳＨ１Ｃ、ＵＳＨ１Ｇ、ＣＤＨ２３、ＰＣＤＨ１５、ＣＬＲＮ１、ＡＣＯ２、ＡＦＧ３Ｌ２、ＡＴＸＮ２、ＡＵＨ、Ｃ１２ｏｒｆ６５、ＣＩＳＤ２、ＦＯＸＣ１、ＦＯＸＦ２、ＬＴＢＰ２、ＭＴＰＡＰ、ＭＹＯＣ、ＮＤＵＦＳ１、ＮＲ２Ｆ１、ＯＰＡ１、ＯＰＡ３、ＯＰＴＮ、ＰＡＸ６、ＰＤＧＦ、ＰＩＴＸ２、ＰＯＬＧ、ＳＰＧ７、ＴＥＫ、ＴＸＮＲＤ２、ＷＦＳ１、ＡＢＣＡ４、ＲＥＰ−１、ＲＰＥ６５、ＣＥＰ２９０、ＰＤＥ６Ｂ、ＲＰＧＲ、ＭＥＲＴＫ、ＭＴ−ＮＤ４、ＦＡＭ４７Ｅ、ＧＢＡ、ＧＣＨ１、ＨＴＲＡ２、ＬＲＲＫ２、ＰＡＲＫ２、ＰＩＮＫ１、ＳＮＣＡ、ＳＹＮＪ１、ＮＰＣ１、ＮＰＣ２、ＣＹＰ４Ａ１１、ＣＹＰ４Ａ２２、ＣＹＰ４Ｂ１、ＣＹＰ４Ｆ２、ＣＹＰ４Ｆ３、ＣＹＰ４Ｆ８、ＣＹＰ４Ｆ１１、ＣＹＰ４Ｆ１２、ＣＹＰ４Ｆ２２、ＣＹＰ４Ｘ１、ＣＹＰ４Ｚ１、又はＣＹＰ４６Ａの遺伝子の中からの、変異又は欠陥を有する遺伝子を含む、＜１１９＞、＜１２０＞、又は＜１２５＞の方法。
＜１３０＞
ＢＣＤ患者由来のｉＰＳ−ＲＰＥ細胞系に由来する細胞、又は人工の遺伝子編集若しくは遺伝子操作の結果として変異若しくは欠陥を有するＣＹＰ４Ｖ２遺伝子を含んでいるｉＰＳ−ＲＰＥ細胞系に由来する細胞を、試験薬に接触させることと、
上記試験薬による接触前と比較した、表２に示す１又は複数の化合物のレベルの正常化；前記細胞内の非欠陥ＣＹＰ４Ｖ２核酸配列の増加；前記細胞内のＣＹＰ４Ｖ２ポリペプチドの量の増加；及び／又は細胞構造、細胞形態若しくは細胞機能の改善、又は細胞生存率の改善、について前記細胞を評価することと、
を含み、
上記試験薬による処理前と比較した、表２に示す１又は複数の化合物のレベルの正常化；前記細胞内の非欠陥ＣＹＰ４Ｖ２核酸配列の増加；前記細胞内のＣＹＰ４Ｖ２ポリペプチドの量の増加；及び／又は細胞構造、細胞形態、細胞機能、又は細胞生存率の改善、は、試験薬がＢＣＤに対して治療効果を有することの指標となり、
細胞系間の比較は、光への暴露後及び／又は光への暴露なしで行うことができる、
ＢＣＤに対する治療効果について試験薬をスクリーニングする方法。
＜１３１＞
前記試験薬は、核酸又はそのアナログ、核酸配列を含む又はポリペプチドをコードするベクター、ポリペプチド又はそのアナログ、抗体、化学物質、小分子、及び／又はそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される、＜１３０＞に記載の方法。
＜１３２＞
前記細胞は、ＰＣＲ技術、イムノアッセイ、シークエンシング、生化学アッセイ、機能アッセイ、細胞生存率アッセイ、顕微鏡検査、又はそれらの組み合わせを用いて評価される、＜１３０＞に記載の方法。
＜１３３＞
ＢＣＤ患者由来のｉＰＳ−ＲＰＥ細胞系からの複数の細胞試料、又は人工の遺伝子編集若しくは遺伝子操作の結果として変異若しくは欠陥を有するＣＹＰ４Ｖ２遺伝子を含んでいるｉＰＳ−ＲＰＥ細胞系からの複数の細胞試料を、様々な製剤、ベクター、又はコンストラクトに製剤化又はパッケージングされた試験薬に接触させることと、
上記試験薬による処理前と比較した、及び／又は同じ試験薬ではあるものの異なる製剤、ベクター、又はコンストラクトに製剤化又はパッケージングされた試験薬で処理された細胞試料と比較した、表２に記載の１又は複数の化合物のレベルの正常化；前記細胞内の非欠陥ＣＹＰ４Ｖ２核酸配列の増加；前記細胞内のＣＹＰ４Ｖ２ポリペプチドの量の増加；細胞構造、細胞形態、細胞機能、又は細胞生存率の改善；及び／又は細胞耐性若しくは細胞死、について前記細胞試料を評価することによって、上記製剤、ベクター、又はコンストラクトの効率又は有効性を決定及び比較することと、
を含み、
前記細胞は、ＰＣＲ技術、イムノアッセイ、シークエンシング、生化学アッセイ、細胞生存率アッセイ、顕微鏡検査、又はそれらの組み合わせを用いて評価され、
細胞系間の比較は、光への暴露後及び／又は光への暴露なしで行うことができる、
ＢＣＤの試験薬を含む製剤、ベクター、又はコンストラクトの有効性又は効率をスクリーニングする方法。
＜１３４＞
ＢＣＤ患者由来のｉＰＳ−ＲＰＥ細胞系からの複数の細胞試料、又は人工の遺伝子編集若しくは遺伝子操作の結果として変異若しくは欠陥を有するＣＹＰ４Ｖ２遺伝子を含んでいるｉＰＳ−ＲＰＥ細胞系からの複数の細胞試料を、細胞試料ごとに異なる用量で、試験薬に接触させることと、
上記試験薬による処理前と比較した、及び／又は同じ試験薬ではあるものの異なる用量の試験薬で処理された細胞試料と比較した、表２に記載の１又は複数の化合物のレベルの正常化；前記細胞内の非欠陥ＣＹＰ４Ｖ２核酸配列の増加；前記細胞内のＣＹＰ４Ｖ２ポリペプチドの量の増加；細胞構造、細胞形態、細胞生存率若しくは細胞機能の改善；及び／又は細胞耐性若しくは細胞死、について前記細胞試料を評価することによって、異なる用量の有効性及び安全性を決定及び比較し、それにより適切な用量範囲を決定することと、
を含み、
前記細胞は、ＰＣＲ技術、イムノアッセイ、シークエンシング、生化学アッセイ、機能アッセイ、細胞生存率アッセイ、顕微鏡検査、又はそれらの組み合わせを用いて評価され、
細胞系間の比較は、光への暴露後及び／又は光への暴露なしで行うことができる、
ＢＣＤのための試験薬の効果的かつ安全な投与量範囲をスクリーニングする方法。
＜１３５＞
網膜又は網膜細胞に治療薬を送達するための送達デバイス又は送達方法の有効性又は効率をスクリーニング又は評価する方法であって、
（ｉ）ＢＣＤ患者由来のｉＰＳ−ＲＰＥ細胞系からの細胞試料、又は人工の遺伝子編集若しくは遺伝子操作の結果として変異若しくは欠陥を有するＣＹＰ４Ｖ２遺伝子を含んでいるｉＰＳ−ＲＰＥ細胞系からの細胞試料を、前記送達デバイス又は送達方法を使用せずに、試験薬に接触させることと、
（ｉｉ）ＢＣＤ患者由来のｉＰＳ−ＲＰＥ細胞系からの別個の細胞試料、又は人工の遺伝子編集若しくは遺伝子操作の結果として変異若しくは欠陥を有するＣＹＰ４Ｖ２遺伝子を含んでいるｉＰＳ−ＲＰＥ細胞系からの別個の細胞試料を、前記送達デバイス又は送達方法を使用して、（ｉ）と同じ用量の前記試験薬に接触させることと、
（ｉｉｉ）上記試験薬による処理前と比較した、及び／又は同じ用量の同じ試験薬による処理であって前記送達デバイス又は送達方法を使用していない処理と比較した、表２に示す１又は複数の化合物のレベルの正常化；前記細胞内の非欠陥ＣＹＰ４Ｖ２核酸配列の増加；前記細胞内のＣＹＰ４Ｖ２ポリペプチドの量の増加；細胞構造、細胞形態若しくは細胞機能の改善；細胞耐性若しくは細胞死；及び／又は前記細胞内の前記試験薬のレベル、について（ｉ）及び（ｉｉ）からの前記細胞試料を評価及び比較することによって、上記送達デバイス又は送達方法の有効性又は効率を決定及び比較することと、
を含み、
前記細胞は、ＰＣＲ技術、イムノアッセイ、シークエンシング、生化学アッセイ、機能アッセイ、細胞生存率、顕微鏡検査、又はそれらの組み合わせを用いて評価され、
細胞系間の比較は、光への暴露後及び／又は光への暴露なしで行うことができる、
方法。
＜１３６＞
前記網膜細胞は、ＲＰＥ細胞である、＜１３５＞に記載の方法。
＜１３７＞
本願の遺伝子編集療法に係る項又はＲＮＰに係る項のいずれか１つによって患者の細胞系の変異を遺伝的に修正することを含む、同質遺伝子対照を生成する方法。
＜１３８＞
インビトロで患者特異的ｉＰＳ−眼細胞モデルで決定された最適用量レベル（例えば、インビトロでの遺伝子治療のＭＯＩとして示される）に、インビボ治療の標的となる眼細胞（例えば、ＲＰＥ細胞、光受容体細胞、又はＲＰＥ細胞と光受容体細胞）の推定数を乗じることにより、インビボで使用するための遺伝子治療ベクターの用量レベル（例えば、ＧＣ又はｇｐ）を得ること、
を含み、
上記ベクターの用量レベルが、乗数（例えば、１〜１０（例えば、網膜下注射の場合は１〜５、硝子体内注射の場合は５〜１０）；適用される前記乗数に影響を与える他の要因としては、標的領域のサイズ及び治療される対象（例えば、治療対象の年齢、体重、並びに疾患進行度、及び状態、並びに潜在的な免疫反応（すなわち、既存のＮＡｂ）、治療の標的となる眼細胞の位置と密度）が挙げられる）によって調整されることによって、インビボ治療の治療有効用量範囲を提案し、該治療有効用量範囲は臨床試験で確認又はさらに改良可能である、
患者特異的ｉＰＳ−眼細胞を使用して、インビボでの治療の治療有効量を評価及び提案する方法。
＜１３９＞
前記方法は、個々の患者のインビボでの治療に使用される個別化した最適用量を評価又は提案するために使用される、＜１３８＞に記載の方法。
＜１４０＞
前記疾患は、遺伝性網膜障害（ＩＲＤ）又は網膜色素変性症（ＲＰ）である、＜１３８＞又は＜１３９＞に記載の方法。
＜１４１＞
前記疾患はＢＣＤであり、
前記ｉＰＳ−眼細胞はｉＰＳ−ＲＰＥ細胞であり、
インビボでの治療の標的となる前記眼細胞はＲＰＥ細胞である、
＜１３８＞又は＜１３９＞に記載の方法。
＜１４２＞
（ａ）ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子の核酸配列、又はＣＹＰ４Ｖ２遺伝子の隣接１００ｂｐ以内の核酸配列を（「標的配列」を）標的とするＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡ、及び
（ｂ）機能的ＣＲＩＳＰＲ関連タンパク質（Ｃａｓ）
を含む組成物。
＜１４３＞
（ｃ）ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子又はその一部の修正、破壊、又は置換のための、ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子の野生型配列又は機能的配列の全部又は一部を含むドナー核酸配列、をさらに含む、＜１４２＞に記載の組成物。
＜１４４＞
前記組成物の１又は複数の成分は、該成分をコードするＤＮＡ分子、該成分をコードするｍＲＮＡ分子、ＲＮＡ分子、ポリペプチド、及び／又はリボ核タンパク質（ＲＮＰ）、又はタンパク質−ＲＮＡ複合体の形態で提供される、＜１４２＞又は＜１４３＞に記載の組成物。
＜１４５＞
前記組成物の２以上の成分は、別々の分子にある又は１つの分子若しくは１つの複合体に組み合わされているか、別々のベクターにある又は１つのベクターに組み合わされているか、１又は複数の核酸複合体にあるか、１又は複数のＲＮＰ複合体にある、＜１４２＞又は＜１４３＞に記載の組成物。
＜１４６＞
前記ドナー核酸配列は、一本鎖ドナーオリゴヌクレオチド（ｓｓＯＤＮ）又はベクター中に提供される、＜１４３＞に記載の組成物。
＜１４７＞
前記ベクターがプラスミド、組換えＡＡＶベクター、組換えレンチウイルスベクター、及び／又はそれらの組み合わせである、＜１４２＞〜＜１４６＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜１４８＞
＜１４２＞〜＜１４７＞のいずれか一項に記載の組成物を含む病的ＣＹＰ４Ｖ２変異を有する細胞を含む組成物。
＜１４９＞
（ａ）前記ＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡは、
（ｉ）標的遺伝子（「標的遺伝子」）中又は標的遺伝子の隣接１００ｂｐ以内にある標的配列に相補的であるプロトスペーサーエレメント配列、及びｔｒａｎｓ−ａｃｔｉｖａｔｉｎｇ  ｃｒＲＮＡ（ｔｒａｃｒＲＮＡ）の相補的な領域に対応する配列、を含むＣＲＩＳＰＲ  ＲＮＡ（ｃｒＲＮＡ）と、
（ｉｉ）前記ｃｒＲＮＡの対応する領域に相補的な領域、及びＣＲＩＳＰＲ関連タンパク質９（Ｃａｓ９）と相互作用する配列、を含むｔｒａｃｒＲＮＡと、
を含み、
（ｂ）前記機能的ＣＲＩＳＰＲ関連タンパク質はＣａｓ９を含む、
＜１４２＞〜＜１４８＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜１５０＞
前記プロトスペーサーエレメントは、約２０塩基、約１９塩基、約２１塩基、約１９〜２１塩基、約１８〜２２塩基、又は約１６〜２４塩基である、＜１４９＞に記載の組成物。
＜１５１＞
前記ｃｒＲＮＡ及び前記ｔｒａｃｒＲＮＡは、別々の分子内にある、＜１４９＞又は＜１５０＞に記載の組成物。
＜１５２＞
前記ｃｒＲＮＡ及び前記ｔｒａｃｒＲＮＡは、シングルガイドＲＮＡ（ｓｇＲＮＡ）において組み合わされている、＜１４９＞又は＜１５０＞に記載の組成物。
＜１５３＞
前記ｓｇＲＮＡは、約８８〜１５０ｂｐである、＜１５２＞に記載の組成物。
＜１５４＞
前記Ｃａｓ９が、ストレプトコッカス・ピオゲネス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｙｏｇｅｎｅｓ）（ＳｐＣａｓ９）、ＳｐＣａｓ９ニッカーゼ（Ｃａｓ９ｎ  Ｄ１０Ａ）、ＳｐＣａｓ９（Ｄ１１３５Ｅ）、ｅＳｐＣａｓ９、ＳｐＣａｓ９−ＨＦ１、ＳｐＣａｓ９  ＶＲＥＲ、ＳｐＣａｓ９  ＶＱＲ、ＳｐＣａｓ９ＥＱＲ、スタフィロコッカス・アウレウス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ）（ＳａＣａｓ９）、ナイセリア・メニンギチジス（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  Ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ）、ストレプトコッカス・サーモフィラス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）、ストレプトコッカス・ニューモニエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｎｅｕｍｎｏｎｉａｅ）、カンピロバクター・コリ（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｃｏｌｉ）、カンピロバクター・ジェジュニ（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ）、ストレプトコッカス・ミュータンス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｍｕｔａｎｓ）、パスツレラ・ムルトシダ（Ｐａｓｔｅｕｒｅｌｌａ  ｍｕｌｔｏｃｉｄａ）、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）、バチルス・スミシー（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｍｉｔｈｉｉ）、トレポネーマ・デンティコーラ（Ｔｒｅｐｏｎｅｍａ  ｄｅｎｔｉｃｏｌａ）、マイコプラズマ・カニス（Ｍｙｃｏｐｌａｓｍａ  ｃａｎｉｓ）、及びエンテロコッカス・ファエカリス（ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ）から選択されるＣａｓ９オーソログ又は変異体Ｃａｓ９を含む、＜１４９＞〜＜１５３＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜１５５＞
（ａ）前記ＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡは、標的遺伝子中又は標的遺伝子の隣接１００ｂｐ以内にある標的配列に相補的であるプロトスペーサーエレメント配列を含むｃｒＲＮＡを含み、
（ｂ）前記機能的ＣＲＩＳＰＲ関連タンパク質はＣｐｆ１を含む、
＜１４２＞〜＜１４８＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜１５６＞
前記ＣＲＩＳＰＲ関連タンパク質であるＣａｓ９又はＣｐｆ１は、１、２、３又はそれ以上の核局在化配列（ＮＬＳ）をＮ末端及び／又はＣ末端にさらに含む、及び／又は、非限定的な例としてＧＦＰ又はＥＧＦＰが挙げられる選択マーカーをさらに含む、＜１４２＞〜＜１５５＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜１５７＞
前記プロトスペーサーエレメント配列は、配列番号４８〜５２からなる群から選択されるか、配列番号４８〜５２のいずれか一つとの間で少なくとも８５％の配列同一性を有し、ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子のｃ．８０２−８＿８１０ｄｅｌ１７ｉｎｓＧＣ変異を標的とするために、ＮＧＧをプロトスペーサー隣接モチーフ（ＰＡＭ）とするＣａｓタンパク質と共に使用される、＜１４２＞に記載の組成物。
＜１５８＞
前記ドナー核酸配列は、配列番号５６及び５７からなる群から選択されるか、配列番号５６及び５７のいずれか又はその相補的な配列との間で少なくとも９０％の配列同一性を有し、ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子のｃ．８０２−８＿８１０ｄｅｌ１７ｉｎｓＧＣ変異を修正、破壊、又は置換するために使用される、＜１４２＞、＜１４３＞、又は＜１５７＞に記載の組成物。
＜１５９＞
変異したＣＹＰ４Ｖ２遺伝子を持つ対象又は細胞におけるＢＣＤを治療又は予防する方法であって、
（ｉ）シークエンシングによって前記対象又は細胞における病的変異を特定すること、
（ｉｉ）前記変異に関与する最初のヌクレオチドの上流約１００ｂｐから、前記変異に関与する最後のヌクレオチドの下流約１００ｂｐまでに及ぶ領域内のＣａｓ関連ＰＡＭ部位を見つけること、
（ｉｉｉ）（ｉｉ）で特定された各ＰＡＭ部位に関連するＣＹＰ４Ｖ２配列を標的とする様々なプロトスペーサーエレメント配列を特定すること、
（ｉｖ）（ｉｉｉ）で特定されたプロトスペーサーエレメント配列を含む各ＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡの活性レベルと、オフターゲット編集のプロファイルとを、前記プロトスペーサーエレメント配列及びＰＡＭについて評価すること、
（ｖ）（ｉｖ）に基づいて１又は複数のＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡ設計を選択すること、
（ｖｉ）標的ＣＹＰ４Ｖ２変異を修正、破壊、又は置換するための相同組換修復（ＨＤＲ）に基づく１又は複数のドナー核酸配列を設計すること、
（ｖｉｉ）組成物に関する＜１＞〜＜１８＞で提供される、ＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡ、Ｃａｓ、及びドナー核酸配列を構築すること、
（ｖｉｉｉ）所望により、活性レベル及び／又はオフターゲット編集プロファイルを評価するために、前記対象から単離された細胞；前記対象由来のｉＰＳ細胞、若しくは前記対象由来の幹細胞から分化した細胞；又は前記対象から単離されたゲノムＤＮＡ、における（ｖｉｉ）の成分を検証し、さらに選択すること、及び
（ｉｘ）リボ核タンパク質又はタンパク質−ＲＮＡ複合体、ベクター、タンパク質、核酸分子、ナノ粒子、リポソーム、ミセル、ウイロソーム、核酸複合体、及び／又はそれらの組み合わせからなる群から選択される送達システムによって、前記対象又は前記細胞に（ｖｉｉｉ）の成分を投与することであって、前記送達は、エレクトロポレーションにより、若しくは、脂質媒介トランスフェクション、ヌクレオフェクション、ウイルス形質導入若しくはインジェクション、又はそれらの組み合わせによって行われる、前記投与すること、
を含む、変異したＣＹＰ４Ｖ２遺伝子を持つ対象又は細胞におけるＢＣＤを治療又は予防する方法。
＜１６０＞
（ｉ）配列番号４８〜５２の１つから選択されるか、配列番号４８〜５２の配列の１つとの間で少なくとも８０％の配列同一性を有するプロトスペーサーエレメント配列を含む、ＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡ、
（ｉｉ）配列番号５６及び５７の１つから選択されるか、配列番号５６及び５７の１つ又はその相補的な配列と少なくとも９０％の配列同一性を有するドナー核酸配列、及び
（ｉｉｉ）Ｃａｓ９タンパク質（例示的な配列を配列番号５８に示す）（所望により、１、２、３又はそれ以上のＮＬＳ、非限定的な例としてＧＦＰ又はＥＧＦＰが挙げられる選択マーカーを含む）、
を含む、インビボで対象における又はインビトロで細胞におけるＣＹＰ４Ｖ２遺伝子のｃ．８０２−８＿８１０ｄｅｌ１７ｉｎｓＧＣ変異を修正又は置換するための遺伝子編集組成物。
＜１６１＞
前記プロトスペーサーエレメント配列の前に所望によるヌクレオチドＧ（配列番号５９）が付加される、＜１６０＞に記載の組成物。
＜１６２＞
前記ＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡは、ｃｒＲＮＡ（例示的な配列（ただし、５’プロトスペーサーエレメント配列は含めていない）を配列番号５３に示す）、及びｔｒａｃｒＲＮＡ（例示的な配列を配列番号５４に示す）を含み、
前記プロトスペーサーエレメント配列は前記ｃｒＲＮＡに含まれる、
＜１６０又は＜１６１＞に記載の組成物。
＜１６３＞
前記ＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡは、前記プロトスペーサーエレメント配列を含むシングルガイドＲＮＡ（ｓｇＲＮＡ）（例示的なｓｇＲＮＡ配列（ただし、５’プロトスペーサーエレメント配列は含めていない）を配列番号５５に示す）を含む、＜１６０＞〜＜１６２＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜１６４＞
（ｉ）、（ｉｉ）、及び（ｉｉｉ）の１又は複数の成分は、当該成分をコードするＤＮＡ分子、当該成分をコードするｍＲＮＡ分子、核酸分子、ベクター、ＲＮＡ分子、ポリペプチド、リボ核タンパク質（ＲＮＰ）、又はタンパク質−ＲＮＡ複合体、及び／又はそれらの組み合わせの形態で提供される、＜１６０＞〜＜１６３＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜１６５＞
対象における眼の疾患を治療又は予防する方法であって、
前記疾患はＣＹＰ４Ｖ２遺伝子の病的な遺伝的又はエピジェネティックな変化と関連しており、
前記方法は、前記対象に細胞組成物を投与することを含み、
前記細胞組成物は、幹細胞由来の、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞、光受容体又は光受容体前駆細胞（ＰＲＣ）、角膜上皮細胞（ＣＥＣ）、脈絡膜内皮（ＣＥ）細胞、及び／又はその他の眼細胞若しくはその他の細胞を含む、
対象における眼の疾患を治療又は予防する方法。
＜１６６＞
前記幹細胞は、胚性幹（ＥＳ）細胞、ｉＰＣ細胞、ＭＳＣ、成体幹細胞、又は組織特異的幹細胞である、＜１６５＞に記載の方法。
＜１６７＞
前記幹細胞は、ＢＣＤを有しない又は病的ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子を有しない１又は複数の対象からのものであるか、又はＢＣＤを有しない又は病的ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子を有しない１又は複数の対象に由来するものである、＜１６５＞に記載の方法。
＜１６８＞
前記幹細胞は、ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子に病的変異を有する１又は複数の対象からのものであるか、又はＣＹＰ４Ｖ２遺伝子に病的変異を有する１又は複数の対象に由来するものである、＜１６５＞に記載の方法。
＜１６９＞
前記対象は、ヒト対象である、＜１６５＞〜＜１６８＞のいずれか一項に記載の方法。
＜１７０＞
（ａ）ＢＣＤに罹患したかＣＹＰ４Ｖ２遺伝子に病的変異を有する対象から単離された細胞からリプログラミングされた幹細胞、若しくはＢＣＤに罹患したかＣＹＰ４Ｖ２遺伝子に病的変異を有する対象から単離された幹細胞、又は
（２）ＢＣＤに罹患したかＣＹＰ４Ｖ２遺伝子に病的変異を有する対象から単離された幹細胞から分化した細胞、若しくはＢＣＤに罹患したかＣＹＰ４Ｖ２遺伝子に病的変異を有する対象から単離された細胞からリプログラミングされた幹細胞から分化した細胞、
を含む細胞組成物。
＜１７１＞
前記対象から単離された細胞からリプログラミングされた幹細胞は、ｉＰＣ細胞である、＜１７０＞に記載の組成物。
＜１７２＞
前記ｉＰＳ細胞は、前記対象の体細胞からリプログラミングされる、＜１７０＞に記載の組成物。
＜１７３＞
前記ｉＰＳ細胞は、皮膚細胞、血液細胞、尿細胞、有毛細胞、線維芽細胞、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）、腎上皮細胞、毛包、又は真皮乳頭細胞からリプログラミングされる、＜１７０＞に記載の組成物。
＜１７４＞
前記対象から単離された幹細胞は、ＭＳＣ、成体幹細胞、又は組織特異的幹細胞である、＜１７０記載の組成物。
＜１７５＞
前記幹細胞から分化した細胞は、眼細胞である、＜１７０＞に記載の組成物。
＜１７６＞
前記幹細胞から分化した細胞は、ＲＰＥ細胞、ＰＲＣ、網膜細胞、角膜細胞、脈絡膜細胞、ＣＥＣ、又はＣＥ細胞である、＜１７０＞又は＜１７５＞に記載の組成物。
＜１７７＞
前記幹細胞から分化した細胞は、ｉＰＳ−ＲＰＥ、ｉＰＳ−ＰＲＣ、ｉＰＳ−ＣＥＣ、又はｉＰＳ−ＣＥ細胞である、＜１７０＞に記載の組成物。
＜１７８＞
（ｉ）ｉＰＳＣへリプログラミングするために使用される、前記ＢＣＤに罹患したかＣＹＰ４Ｖ２遺伝子に病的変異を有する対象から単離された細胞、
（ｉｉ）前記ＢＣＤに罹患したかＣＹＰ４Ｖ２遺伝子に病的変異を有する対象から単離された幹細胞、若しくは前記ＢＣＤに罹患したかＣＹＰ４Ｖ２遺伝子に病的変異を有する対象から単離された細胞からリプログラミングされたｉＰＳ細胞、又は
（ｉｉｉ）前記ＢＣＤに罹患したかＣＹＰ４Ｖ２遺伝子に病的変異を有する対象から単離された幹細胞から分化した細胞、若しくは前記ＢＣＤに罹患したかＣＹＰ４Ｖ２遺伝子に病的変異を有する対象から単離された細胞からリプログラミングされたｉＰＳ細胞から分化した細胞、
は、変異ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子の影響を緩和するために遺伝的に修復される、＜１７０＞に記載の組成物。
＜１７９＞
遺伝子修復は、遺伝子導入療法によって行われる、＜１７８＞に記載の組成物。
＜１８０＞
遺伝子修復は、遺伝子治療に関する項のいずれか一項に記載の任意の組成物又は方法を使用することにより、遺伝子導入療法によって行われる、＜１７８＞に記載の組成物。
＜１８１＞
遺伝子修復は、遺伝子編集療法によって行われる、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜１８２＞
遺伝子修復は、ＣＲＩＳＰＲ遺伝子治療に関する項のいずれか一項に記載の任意の組成物又は方法を使用することにより、遺伝子編集療法によって行われる、＜１８１＞に記載の組成物。
＜１８３＞
ＣＹＰ４Ｖ２自家細胞組成物に関連する項のいずれか一項に記載の組成物を対象に投与することを含み、
前記細胞組成物は、前記対象の幹細胞由来の、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞、光受容体又は光受容体前駆細胞（ＰＲＣ）、角膜上皮細胞（ＣＥＣ）、脈絡膜内皮（ＣＥ）細胞、及び／又はその他の眼細胞若しくはその他の細胞を含む遺伝的に修復された細胞を含む、
ＢＣＤに罹患したかＣＹＰ４Ｖ２遺伝子に病的な遺伝的又はエピジェネティックな変化を有する対象における眼の疾患を治療又は予防する方法。
＜１８４＞
前記幹細胞は、ｉＰＣ細胞、ＭＳＣ、成体幹細胞、又は組織特異的幹細胞である、＜１８３＞に記載の方法。
＜１８５＞
前記ｉＰＳ細胞は、転写因子ＯＣＴ４、ＳＯＸ２、ＫＬＦ４、及びｃ−ＭＹＣのうち１又は複数を使用してリプログラミングされる、＜１８４＞に記載の方法。
＜１８６＞
前記遺伝的に修復された細胞は、遺伝子修復を行う前と比較した場合の、表２に示す１又は複数の化合物のレベルの正常化；前記細胞内の非欠陥ＣＹＰ４Ｖ２核酸配列の増加；前記細胞内の機能的ＣＹＰ４Ｖ２ポリペプチドの量の増加；及び／又は細胞構造、細胞形態、細胞生存率、又は細胞機能の改善、の１又は複数を示す、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜１８７＞
投与される細胞の量は、１回の投与で約１，０００〜約１０００万個の細胞である、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜１８８＞
投与は注射、網膜下注射、又は硝子体内注射による、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜１８９＞
投与は、前記対象の眼の網膜下の場所、後部、又は角膜に細胞を効果的に送達するその他の任意の投与方法による、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜１９０＞
細胞懸濁液の注射によって前記細胞が投与される、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜１９１＞
前記細胞は、シート、マトリックス、足場、組織、又は三次元（３Ｄ）網膜構造の一部として投与される、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜１９２＞
前記ＲＰＥ細胞は、天然及び／又は合成の足場を使用して投与され、機能的なＲＰＥ単層を生成する、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜１９３＞
前記対象はヒト対象である、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜１９４＞
（ａ）変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子、によって引き起こされる疾患に罹患した対象から単離された細胞からリプログラミングされた幹細胞、又は、
変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全又は部分的な機能又は活性を有するタンパク質をコードする遺伝子、によって引き起こされる疾患に罹患した対象から単離された幹細胞、又は
（２）変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子、によって引き起こされる疾患に罹患した対象から単離された幹細胞から分化した細胞、又は
変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子、によって引き起こされる疾患に罹患した対象から単離された細胞からリプログラミングされた幹細胞から分化した細胞、
を含む細胞組成物。
＜１９５＞
前記対象から単離された細胞からリプログラミングされた幹細胞は、ｉＰＳ細胞である、＜１９４＞に記載の組成物。
＜１９６＞
前記ｉＰＳ細胞は、前記対象の体細胞からリプログラミングされる、＜１９５＞に記載の組成物。
＜１９７＞
前記ｉＰＳ細胞は、皮膚細胞、血液細胞、尿細胞、有毛細胞、線維芽細胞、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）、腎上皮細胞、毛包、又は真皮乳頭細胞からリプログラミングされる、＜１９５＞又は＜１９６＞に記載の組成物。
＜１９８＞
前記対象から単離された幹細胞は、ＭＳＣ、成体幹細胞、又は組織特異的幹細胞である、＜１９４＞記載の組成物。
＜１９９＞
前記遺伝子は眼の発達又は機能に関与する、及び／又は前記遺伝子の変異が眼疾患を引き起こすか眼疾患を引き起こす危険因子である、＜１９４＞に記載の組成物。
＜２００＞
前記遺伝子は神経の発達又は機能に関与する、及び／又は前記遺伝子の変異が神経変性疾患を引き起こすか神経変性疾患を引き起こす危険因子である、＜１９４＞に記載の組成物。
＜２０１＞
前記遺伝子は、シトクロムＰ４５０遺伝子である、＜１９４＞に記載の組成物。
＜２０２＞
前記遺伝子は表４に示す１つの遺伝子である、＜１９４＞に記載の組成物。
＜２０３＞
前記遺伝子は、
変異若しくは欠陥を有する、ＣＹＰ４Ｖ２、ＣＹＰ１Ｂ１、ＭＹＯ７Ａ、ＤＦＮＢ３１、ＵＳＨ１Ｃ、ＵＳＨ１Ｇ、ＣＤＨ２３、ＰＣＤＨ１５、ＣＬＲＮ１、ＡＣＯ２、ＡＦＧ３Ｌ２、ＡＴＸＮ２、ＡＵＨ、Ｃ１２ｏｒｆ６５、ＣＩＳＤ２、ＦＯＸＣ１、ＦＯＸＦ２、ＬＴＢＰ２、ＭＴＰＡＰ、ＭＹＯＣ、ＮＤＵＦＳ１、ＮＲ２Ｆ１、ＯＰＡ１、ＯＰＡ３、ＯＰＴＮ、ＰＡＸ６、ＰＤＧＦ、ＰＩＴＸ２、ＰＯＬＧ、ＳＰＧ７、ＴＥＫ、ＴＸＮＲＤ２、ＷＦＳ１、ＡＢＣＡ４、ＲＥＰ−１、ＲＰＥ６５、ＣＥＰ２９０、ＰＤＥ６Ｂ、ＲＰＧＲ、ＭＥＲＴＫ、ＭＴ−ＮＤ４、ＦＡＭ４７Ｅ、ＧＢＡ、ＧＣＨ１、ＨＴＲＡ２、ＬＲＲＫ２、ＰＡＲＫ２、ＰＩＮＫ１、ＳＮＣＡ、ＳＹＮＪ１、ＮＰＣ１、ＮＰＣ２、ＣＹＰ４Ａ１１、ＣＹＰ４Ａ２２、ＣＹＰ４Ｂ１、ＣＹＰ４Ｆ２、ＣＹＰ４Ｆ３、ＣＹＰ４Ｆ８、ＣＹＰ４Ｆ１１、ＣＹＰ４Ｆ１２、ＣＹＰ４Ｆ２２、ＣＹＰ４Ｘ１、ＣＹＰ４Ｚ１、若しくはＣＹＰ４６Ａの遺伝子、又は
不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする、ＣＹＰ４Ｖ２、ＣＹＰ１Ｂ１、ＭＹＯ７Ａ、ＤＦＮＢ３１、ＵＳＨ１Ｃ、ＵＳＨ１Ｇ、ＣＤＨ２３、ＰＣＤＨ１５、ＣＬＲＮ１、ＡＣＯ２、ＡＦＧ３Ｌ２、ＡＴＸＮ２、ＡＵＨ、Ｃ１２ｏｒｆ６５、ＣＩＳＤ２、ＦＯＸＣ１、ＦＯＸＦ２、ＬＴＢＰ２、ＭＴＰＡＰ、ＭＹＯＣ、ＮＤＵＦＳ１、ＮＲ２Ｆ１、ＯＰＡ１、ＯＰＡ３、ＯＰＴＮ、ＰＡＸ６、ＰＤＧＦ、ＰＩＴＸ２、ＰＯＬＧ、ＳＰＧ７、ＴＥＫ、ＴＸＮＲＤ２、ＷＦＳ１、ＡＢＣＡ４、ＲＥＰ−１、ＲＰＥ６５、ＣＥＰ２９０、ＰＤＥ６Ｂ、ＲＰＧＲ、ＭＥＲＴＫ、ＭＴ−ＮＤ４、ＦＡＭ４７Ｅ、ＧＢＡ、ＧＣＨ１、ＨＴＲＡ２、ＬＲＲＫ２、ＰＡＲＫ２、ＰＩＮＫ１、ＳＮＣＡ、ＳＹＮＪ１、ＮＰＣ１、ＮＰＣ２、ＣＹＰ４Ａ１１、ＣＹＰ４Ａ２２、ＣＹＰ４Ｂ１、ＣＹＰ４Ｆ２、ＣＹＰ４Ｆ３、ＣＹＰ４Ｆ８、ＣＹＰ４Ｆ１１、ＣＹＰ４Ｆ１２、ＣＹＰ４Ｆ２２、ＣＹＰ４Ｘ１、ＣＹＰ４Ｚ１、若しくはＣＹＰ４６Ａの遺伝子、
を含む、＜１９４＞に記載の組成物。
＜２０４＞
前記幹細胞から分化した細胞は、任意の種類の細胞である、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２０５＞
前記幹細胞から分化した細胞は、眼細胞である、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２０６＞
前記幹細胞から分化した細胞は、ＲＰＥ細胞、ＰＲＣ、網膜細胞、角膜細胞、脈絡膜細胞、ＣＥＣ、ＣＥ細胞、又は視神経細胞である、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２０７＞
前記幹細胞から分化した細胞は、ｉＰＳ−ＲＰＥ、ｉＰＳ−ＰＲＣ、ｉＰＳ−ＣＥＣ、又はｉＰＳ−ＣＥ細胞である、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２０８＞
前記幹細胞から分化した細胞は、ニューロンである、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２０９＞
（ｉ）ｉＰＳＣへリプログラミングするために使用される、変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子、によって引き起こされる疾患に罹患した対象から単離された前記細胞、
（ｉｉ）変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子、によって引き起こされる疾患に罹患した対象から単離された前記幹細胞、又は
変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子、によって引き起こされる疾患に罹患した対象から単離された細胞からリプログラミングされたｉＰＳ細胞、又は
（ｉｉｉ）変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子、によって引き起こされる疾患に罹患した対象から単離された幹細胞から分化した前記細胞、又は
変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子、によって引き起こされる疾患に罹患した対象から単離された細胞からリプログラミングされたｉＰＳ細胞、
は、前記変異若しくは欠陥を有する遺伝子の影響を緩和するために遺伝的に修復される、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２１０＞
遺伝子修復は、遺伝子導入療法によって行われる、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２１１＞
遺伝子修復は、遺伝子治療に関する項のいずれか一項に記載の任意の組成物又は方法を使用することにより、遺伝子導入療法によって行われる、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２１２＞
遺伝子修復は、遺伝子編集療法を介して行われる、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２１３＞
遺伝子修復は、ＣＲＩＳＰＲ遺伝子編集療法に関する項のいずれか一項に記載の任意の組成物又は方法を使用することにより、遺伝子編集療法によって行われる、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２１４＞
自家細胞組成物に関連する項のいずれか一項に記載の細胞組成物を対象に投与することを含み、
前記細胞組成物は、前記対象の幹細胞由来の、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞、光受容体又は光受容体前駆細胞（ＰＲＣ）、角膜上皮細胞（ＣＥＣ）、ニューロン、脈絡膜内皮（ＣＥ）細胞、及び／又は他の眼細胞若しくは他の細胞を含む、遺伝的に修復された細胞を含み、
前記細胞組成物の変異又は欠陥を有する遺伝子が遺伝的に修復済みである、
表４に記載の、変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子、によって引き起こされる疾患に罹患した対象における疾患を治療又は予防する方法。
＜２１５＞
（ｉ）眼疾患に罹患した対象からの細胞を準備すること、
（ｉｉ）前記対象からの前記細胞に多能性を誘導してｉＰＳＣを生成すること、
（ｉｉｉ）遺伝子編集療法により、前記対象に由来する前記ｉＰＳＣにおける、表４に示され変異又は欠陥を有する遺伝子の１又は複数の変異を遺伝的に修復すること、
（ｉｖ）必要に応じて、置換移植のために前記ｉＰＳＣを眼細胞又は他の細胞に分化させること、
（ｖ）工程（ｉｉｉ）の代わりに、遺伝子導入療法によって前記ｉＰＳ由来細胞を遺伝的に修復すること、
（ｖｉ）前記ｉＰＳ由来細胞を前記対象に導入し、それにより、変異又は欠陥を有する遺伝子（「標的遺伝子」）に関連する疾患を有する前記対象を自家治療すること、
を含む、対象を自家治療する方法。
＜２１６＞
前記幹細胞は、ｉＰＣ細胞、ＭＳＣ、成体幹細胞、又は組織特異的幹細胞である、＜２１４＞又は＜２１５＞に記載の方法。
＜２１７＞
前記ｉＰＳ細胞は、転写因子ＯＣＴ４、ＳＯＸ２、ＫＬＦ４、及びｃ−ＭＹＣのうち１又は複数を使用してリプログラミングされる、＜２１６＞に記載の方法。
＜２１８＞
前記遺伝的に修復された細胞は、遺伝子修復を行う前と比較して、前記細胞内の非欠陥標的遺伝子核酸配列の増加；前記細胞内の前記標的遺伝子にコードされる機能的ポリペプチドの量の増加；前記細胞における細胞構造、細胞形態、細胞生存率、若しくは細胞機能の改善、及び／又は生化学的機能の改善若しくは正常化、のうち１又は複数を示す、＜２１４＞又は＜２１５＞に記載の方法。
＜２１９＞
投与される細胞の量は、１回の投与で約１，０００〜約１０００万個の細胞である、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２２０＞
前記投与は注射、網膜下注射、又は硝子体内注射による、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２２１＞
前記投与は、前記対象の眼の網膜下の場所、後部、若しくは角膜、又は前記置換細胞を必要とする組織若しくは臓器に細胞を効果的に送達するその他の任意の投与方法による、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２２２＞
細胞懸濁液の注射によって前記細胞が投与される、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２２３＞
前記細胞は、シート、マトリックス、足場、組織、又は三次元（３Ｄ）網膜構造の一部として投与される、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２２４＞
前記ＲＰＥ細胞は、天然及び／又は合成の足場を使用して投与され、機能的なＲＰＥ単層を生成する、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２２５＞
前記対象はヒト対象である、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２２６＞
前記疾患は、表４に示す１つ以上の遺伝子における前記対象の遺伝的又はエピジェネティックな変化又は危険因子に関連している、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２２７＞
前記疾患は、光受容体変性、網膜色素上皮細胞変性、網膜変性、角膜変性、及び／又は脈絡膜障害である、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２２８＞
前記疾患は、遺伝性網膜変性（ＩＲＤ）である、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２２９＞
前記疾患は、網膜色素変性症（ＲＰ）である、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２３０＞
前記疾患は、クリスタリン網膜症（ＢＣＤ；Ｂｉｅｔｔｉ結晶性角膜網膜ジストロフィーとしても知られる）である、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２３１＞
前記疾患は、神経変性に関連している、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２３２＞
前記疾患は、角膜ジストロフィーである、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２３３＞
前記対象は、ＢＣＤに罹患しているかＢＣＤを発症するリスクがある、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２３４＞
前記細胞は、線維芽細胞、血液細胞、又は眼細胞である、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２３５＞
前記細胞は、尿、毛、又は毛包から得られる、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２３６＞
前記眼細胞は、網膜色素上皮（ＲＰＥ）細胞、角膜上皮細胞（ＣＥＣ）、脈絡膜内皮（ＣＥ）細胞、又は光受容体細胞（ＰＲＣ）である、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２３７＞
前記遺伝的又はエピジェネティックな変化は、変異、挿入、一塩基多型、不適当なメチル化、不適当な脱メチル化、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２３８＞
前記遺伝的又はエピジェネティックな変化は、変異である、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２３９＞
前記対象からの前記ｉＰＳ−眼細胞における前記遺伝的又はエピジェネティックな変化は、遺伝子編集療法を使用して遺伝的に修復済みである、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２４０＞
前記遺伝子編集療法は、ジンクフィンガーヌクレアーゼ、ＴＡＬＥＮテクノロジー、又はＣＲＩＳＰＲテクノロジーを利用している、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２４１＞
前記対象からの前記ｉＰＳＣ−眼細胞における前記遺伝的又はエピジェネティックな変化は、遺伝子導入療法を使用して遺伝的に修復済みである、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２４２＞
前記遺伝子導入療法は、組換えＡＡＶベクター又は別のウイルスベクター又は非ウイルスベクターを利用して、移植される前記細胞に前記標的遺伝子の健全なコピー（例えば、ｃＤＮＡ）を送達する、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜２４３＞
前記投与工程は、疾患症状の発現前又は疾患症状の発現後に行われる、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２４４＞
投与は、眼、又はニューロンを含む別の臓器若しくは組織に対するものである、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２４５＞
投与は、注射、網膜下注射若しくは硝子体内注射、又は網膜への直接注射によるものである、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２４６＞
投与は、前記対象の眼の網膜下の場所、後部、若しくは角膜、又は置換細胞を必要とする組織若しくは臓器に細胞を効果的に送達するその他の任意の投与方法による、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２４７＞
投与又は移植の前に、前記細胞の遺伝子型分析を行って、表４に示す１又は複数の遺伝子の遺伝的又はエピジェネティックな変化の有無を確認すること、をさらに含む、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２４８＞
前記遺伝的又はエピジェネティックな変化は、変異である、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２４９＞
前記変異は、前記ＣＹＰ４Ｖ２核酸分子に存在する、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２５０＞
投与前に、前記対象の眼を評価して、損傷した又は維持されている光受容体、網膜細胞、又は角膜細胞の領域及び程度を特定すること、をさらに含む、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２５１＞
投与後に、前記対象をモニタリングすることをさらに含む、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２５２＞
前記モニタリングには、非侵襲的網膜イメージング、角膜検査、暗順応、コントラスト感度、視野測定、ＥＲＧ、ＯＣＴ、視力検査、及び／又は機能検査を実施することが含まれる、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２５３＞
前記モニタリングは、免疫応答について前記対象を評価することを含む、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２５４＞
投与後に、前記対象の眼を評価して、損傷した又は維持されている光受容体、網膜細胞、又は角膜細胞の領域及び程度を特定すること、をさらに含む、先行項のいずれか一項に記載の方法。
＜２５５＞
（ａ）標的遺伝子（「標的遺伝子」）中又は標的遺伝子の隣接１００ｂｐ以内にある標的配列を（「標的配列」を）標的とするＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡ、及び
（ｂ）機能的ＣＲＩＳＰＲ関連タンパク質
を、リボ核タンパク質（ＲＮＰ）又はタンパク質ＲＮＡ複合体内に含む組成物。
＜２５６＞
（ｃ）前記標的遺伝子又はその一部の修正又は置換のための、前記標的遺伝子の野生型配列又は機能的配列の全部又は一部を含むドナー核酸配列をさらに含む、＜２５５＞に記載の組成物。
＜２５７＞
前記標的遺伝子は眼の発達又は機能に関与する、及び／又は前記標的遺伝子の変異が眼疾患を引き起こすか眼疾患を引き起こす危険因子である、＜２５５＞又は＜２５６＞に記載の組成物。
＜２５８＞
前記標的遺伝子は神経の発達又は機能に関与する、及び／又は前記標的遺伝子の変異が神経変性疾患を引き起こすか神経変性疾患を引き起こす危険因子である、＜２５５＞又は＜２５６＞に記載の組成物。
＜２５９＞
前記標的遺伝子は、シトクロムＰ４５０遺伝子である、＜２５５＞又は＜２５６＞に記載の組成物。
＜２６０＞
前記標的遺伝子は、変異若しくは欠陥を有する、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする、表４に記載の少なくとも１つの遺伝子を含む、＜２５５＞又は＜２５６＞に記載の組成物。
＜２６１＞
前記ドナー核酸配列は、一本鎖ドナーオリゴヌクレオチド（ｓｓＯＤＮ）又はベクターに含まれて提供される、＜２５６＞に記載の組成物。
＜２６２＞
（ａ）前記ＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡは、（ｉ）標的遺伝子中又は標的遺伝子の隣接１００ｂｐ以内にある標的配列に相補的であるプロトスペーサーエレメント配列と、ｔｒａｎｓ−ａｃｔｉｖａｔｉｎｇ  ｃｒＲＮＡ（ｔｒａｃｒＲＮＡ）の相補的な領域に対応する配列と、を含むＣＲＩＳＰＲ  ＲＮＡ（ｃｒＲＮＡ）、及び（ｉｉ）前記ｃｒＲＮＡの対応する領域に相補的な領域と、ＣＲＩＳＰＲ関連タンパク質９（Ｃａｓ９）と相互作用する配列と、を含むｔｒａｃｒＲＮＡ、を含み、
（ｂ）前記機能的ＣＲＩＳＰＲ関連タンパク質はＣａｓ９を含む、＜２５５＞〜＜２６１＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜２６３＞
前記ｃｒＲＮＡ及び前記ｔｒａｃｒＲＮＡは、異なる核酸分子内にある、＜２６１＞又は＜２６２＞に記載の組成物。
＜２６４＞
前記ｃｒＲＮＡ及び前記ｔｒａｃｒＲＮＡは、シングルガイドＲＮＡ（ｓｇＲＮＡ）に組み合わされる、＜２６１＞又は＜２６２＞に記載の組成物。
＜２６５＞
前記Ｃａｓ９が、ストレプトコッカス・ピオゲネス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｙｏｇｅｎｅｓ）（ＳｐＣａｓ９）、ＳｐＣａｓ９ニッカーゼ（Ｃａｓ９ｎ  Ｄ１０Ａ）、ＳｐＣａｓ９（Ｄ１１３５Ｅ）、ｅＳｐＣａｓ９、ＳｐＣａｓ９−ＨＦ１、ＳｐＣａｓ９  ＶＲＥＲ、ＳｐＣａｓ９  ＶＱＲ、ＳｐＣａｓ９ＥＱＲ、スタフィロコッカス・アウレウス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ  ａｕｒｅｕｓ）（ＳａＣａｓ９）、ナイセリア・メニンギチジス（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  Ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ）、ストレプトコッカス・サーモフィラス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）、ストレプトコッカス・ニューモニエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｎｅｕｍｎｏｎｉａｅ）、カンピロバクター・コリ（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｃｏｌｉ）、カンピロバクター・ジェジュニ（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ）、ストレプトコッカス・ミュータンス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｍｕｔａｎｓ）、パスツレラ・ムルトシダ（Ｐａｓｔｅｕｒｅｌｌａ  ｍｕｌｔｏｃｉｄａ）、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）、バチルス・スミシー（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｍｉｔｈｉｉ）、トレポネーマ・デンティコーラ（Ｔｒｅｐｏｎｅｍａ  ｄｅｎｔｉｃｏｌａ）、マイコプラズマ・カニス（Ｍｙｃｏｐｌａｓｍａ  ｃａｎｉｓ）、及びエンテロコッカス・ファエカリス（ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｆａｅｃａｌｉｓ）から選択されるＣａｓ９オーソログ又は変異体Ｃａｓ９を含む、＜２６１＞〜＜２６４＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜２６６＞
（ａ）前記ＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡは、標的遺伝子中又は標的遺伝子の隣接１００ｂｐ以内にある標的配列に相補的であるプロトスペーサーエレメント配列を含むｃｒＲＮＡを含み、
（ｂ）前記機能的ＣＲＩＳＰＲ関連タンパク質はＣｐｆ１を含む、
＜２５５＞〜＜２６５＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜２６７＞
前記ＣＲＩＳＰＲ関連タンパク質であるＣａｓ９又はＣｐｆ１は、１、２、３又はそれ以上の核局在化配列（ＮＬＳ）をＮ末端及び／又はＣ末端にさらに含む、及び／又は非限定的な例としてＧＦＰ又はＥＧＦＰが挙げられる選択マーカーをさらに含む、＜２５５＞〜＜２６６＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜２６８＞
前記プロトスペーサーエレメントは、前記標的配列に１００％相補的であるか、標的配列に対応させると１、２、３、４、又は５個のヌクレオチドミスマッチを含む、＜２５５＞〜＜２６７＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜２６９＞
前記ｃｒＲＮＡ配列は、前記プロトスペーサーエレメントの直前に、前記ｃｒＲＮＡ配列に所望により追加されたＧヌクレオチドをさらに含む、＜２５５＞又は＜２５６＞に記載の組成物。
＜２７０＞
前記ＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡ、ｃｒＲＮＡ、及び／又はｔｒａｃｒＲＮＡ、又はｓｇＲＮＡは、化学修飾されている、＜２５５＞〜＜２６９＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜２７１＞
前記標的遺伝子の野生型バージョンは、酵素をコードする、＜２５５＞〜＜２７０＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜２７２＞
前記標的遺伝子は、
変異若しくは欠陥を有するＣＹＰ４Ｖ２、ＣＹＰ１Ｂ１、ＭＹＯ７Ａ、ＤＦＮＢ３１、ＵＳＨ１Ｃ、ＵＳＨ１Ｇ、ＣＤＨ２３、ＰＣＤＨ１５、ＣＬＲＮ１、ＡＣＯ２、ＡＦＧ３Ｌ２、ＡＴＸＮ２、ＡＵＨ、Ｃ１２ｏｒｆ６５、ＣＩＳＤ２、ＦＯＸＣ１、ＦＯＸＦ２、ＬＴＢＰ２、ＭＴＰＡＰ、ＭＹＯＣ、ＮＤＵＦＳ１、ＮＲ２Ｆ１、ＯＰＡ１、ＯＰＡ３、ＯＰＴＮ、ＰＡＸ６、ＰＤＧＦ、ＰＩＴＸ２、ＰＯＬＧ、ＳＰＧ７、ＴＥＫ、ＴＸＮＲＤ２、ＷＦＳ１、ＡＢＣＡ４、ＲＥＰ−１、ＲＰＥ６５、ＣＥＰ２９０、ＰＤＥ６Ｂ、ＲＰＧＲ、ＭＥＲＴＫ、ＭＴ−ＮＤ４、ＦＡＭ４７Ｅ、ＧＢＡ、ＧＣＨ１、ＨＴＲＡ２、ＬＲＲＫ２、ＰＡＲＫ２、ＰＩＮＫ１、ＳＮＣＡ、ＳＹＮＪ１、ＮＰＣ１、ＮＰＣ２、ＣＹＰ４Ａ１１、ＣＹＰ４Ａ２２、ＣＹＰ４Ｂ１、ＣＹＰ４Ｆ２、ＣＹＰ４Ｆ３、ＣＹＰ４Ｆ８、ＣＹＰ４Ｆ１１、ＣＹＰ４Ｆ１２、ＣＹＰ４Ｆ２２、ＣＹＰ４Ｘ１、ＣＹＰ４Ｚ１、若しくはＣＹＰ４６Ａの遺伝子、又は
不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする、ＣＹＰ４Ｖ２、ＣＹＰ１Ｂ１、ＭＹＯ７Ａ、ＤＦＮＢ３１、ＵＳＨ１Ｃ、ＵＳＨ１Ｇ、ＣＤＨ２３、ＰＣＤＨ１５、ＣＬＲＮ１、ＡＣＯ２、ＡＦＧ３Ｌ２、ＡＴＸＮ２、ＡＵＨ、Ｃ１２ｏｒｆ６５、ＣＩＳＤ２、ＦＯＸＣ１、ＦＯＸＦ２、ＬＴＢＰ２、ＭＴＰＡＰ、ＭＹＯＣ、ＮＤＵＦＳ１、ＮＲ２Ｆ１、ＯＰＡ１、ＯＰＡ３、ＯＰＴＮ、ＰＡＸ６、ＰＤＧＦ、ＰＩＴＸ２、ＰＯＬＧ、ＳＰＧ７、ＴＥＫ、ＴＸＮＲＤ２、ＷＦＳ１、ＡＢＣＡ４、ＲＥＰ−１、ＲＰＥ６５、ＣＥＰ２９０、ＰＤＥ６Ｂ、ＲＰＧＲ、ＭＥＲＴＫ、ＭＴ−ＮＤ４、ＦＡＭ４７Ｅ、ＧＢＡ、ＧＣＨ１、ＨＴＲＡ２、ＬＲＲＫ２、ＰＡＲＫ２、ＰＩＮＫ１、ＳＮＣＡ、ＳＹＮＪ１、ＮＰＣ１、ＮＰＣ２、ＣＹＰ４Ａ１１、ＣＹＰ４Ａ２２、ＣＹＰ４Ｂ１、ＣＹＰ４Ｆ２、ＣＹＰ４Ｆ３、ＣＹＰ４Ｆ８、ＣＹＰ４Ｆ１１、ＣＹＰ４Ｆ１２、ＣＹＰ４Ｆ２２、ＣＹＰ４Ｘ１、ＣＹＰ４Ｚ１、若しくはＣＹＰ４６Ａの遺伝子を含む、＜２５５＞又は＜２５６＞に記載の組成物。
＜２７３＞
前記ＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡ、ＣＲＩＳＰＲ関連タンパク質、及び／又は前記ドナー核酸配列を含む１又は複数の成分は、当該成分に転写及び／又は翻訳できるベクター、ＤＮＡ、及び／又はｍＲＮＡに別々に及び／又は追加的に提供されている、＜２５５＞〜＜２７２＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜２７４＞
＜２５５又は＜２７３＞に記載の組成物を含む医薬的に許容可能な製剤。
＜２７５＞
＜２５５＞〜＜２７４＞のいずれか一項に記載の組成物を対象に投与することを含む、変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子によって引き起こされる対象の疾患を治療する方法。
＜２７６＞
＜２５５＞〜＜１５７＞のいずれか一項に記載の組成物を対象に投与することを含む、変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子によって引き起こされる対象の眼疾患を治療する又は関連する危険因子を緩和する方法。
＜２７７＞
＜２５５＞、＜２５６＞、又は＜２５８＞〜＜２７６＞のいずれか一項に記載の組成物を対象に投与することを含む、変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子によって引き起こされる対象の神経変性疾患を治療する又は関連する危険因子を緩和する方法。
＜２７８＞
＜２５５＞〜＜２７７＞のいずれか一項に記載の組成物を対象に投与することを含む、変異若しくは欠陥を有するシトクロムＰ４５０遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードするシトクロムＰ４５０遺伝子によって引き起こされる対象の疾患を治療する又は関連する危険因子を緩和する方法。
＜２７９＞
破壊、修正、若しくは置換される、前記変異若しくは欠陥を有する遺伝子又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子は、表４に示す少なくとも１つの遺伝子の変異若しくは欠陥があるバージョン、又は表４に示す少なくとも１つの遺伝子の不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードするバージョンである、＜２７８＞に記載の方法。
＜２８０＞
前記変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子は、線維芽細胞、血液、ＲＰＥ、光受容体、網膜、角膜、脈絡膜、眼、視神経、ニューロン、若しくは幹細胞、又は幹細胞に由来する任意の種類の細胞に存在する、＜２７８＞に記載の方法。
＜２８１＞
前記組成物は、線維芽細胞、血液、ＲＰＥ、光受容体、網膜、角膜、脈絡膜、眼、視神経、ニューロン、若しくは幹細胞、又は幹細胞に由来する任意の種類の細胞に送達される、＜２７８又は＜２７９＞に記載の方法。
＜２８２＞
送達は、エレクトロポレーションにより、若しくは脂質媒介トランスフェクション、ヌクレオフェクション、ウイルス形質導入、若しくはインジェクション、又はそれらの組み合わせにより行われる、＜２８１＞に記載の方法。
＜２８３＞
前記ＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡ、ＣＲＩＳＰＲ関連タンパク質、及び／又は前記ドナー核酸配列を含む１又は複数の成分は、リボ核タンパク質又はタンパク質−ＲＮＡ複合体、ナノ粒子、リポソーム、ミセル、ウイロソーム、核酸複合体、及び／又はそれらの組み合わせからなる群から選択される送達システムを介して前記対象又は前記細胞に投与される、＜２７８＞〜＜２８２＞のいずれか一項に記載の方法。
＜２８４＞
前記治療はインビボで対象に対して行われる、＜２７８＞〜＜２８３＞のいずれか一項に記載の方法。
＜２８５＞
前記治療は、インビトロで、線維芽細胞、血液、ＲＰＥ、光受容体、網膜、角膜、脈絡膜、眼、視神経、ニューロン、若しくは幹細胞、又は幹細胞に由来する任意の種類の細胞に対して行われる、＜２７８＞〜＜２８３＞のいずれか一項に記載の方法。
＜２８６＞
前記治療した細胞は、インビボで対象に移植される、又は前記治療した細胞が幹細胞である場合、該幹細胞は移植のための所望の種類の細胞に分化させられ、その後分化した細胞はインビボで対象に移植される、＜２８５＞に記載の方法。
＜２８７＞
前記変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子は、置換される、＜２７８＞〜＜２８０＞のいずれか一項に記載の方法。
＜２８８＞
前記変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子において、１又は複数の変異が修正又は置換される、＜２７８＞〜＜２８０＞のいずれか一項に記載の方法。
＜２８９＞
前記変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子は、破壊される、＜２７８＞〜＜２８０＞のいずれか一項に記載の方法。
＜２９０＞
前記変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子において、１〜２０、２１〜４０、４１〜６０、６１〜８０、８１〜１００、１０１〜１０００、又は１００１〜１００００塩基対のヌクレオチド又は変異が破壊、修正、又は置換される、＜２７８＞〜＜２８０＞のいずれか一項に記載の方法。
＜２９１＞
前記変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子の領域が、破壊、修正、又は置換される、＜２７８＞〜＜２８０＞のいずれか一項に記載の方法。
＜２９２＞
前記変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子の約１０、８、６、４、２、又は１ｋｂ未満である領域が、破壊、修正、又は置換される、＜２７８＞〜＜２８０＞のいずれか一項に記載の方法。
＜２９３＞
前記変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子は、ヌクレオチドの挿入及び／又は欠失によって破壊、修正、又は置換される、＜２７８＞〜＜２８０＞のいずれか一項に記載の方法。
＜２９４＞
前記変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子は、片方又は両方のアレルにおいて破壊、修正、又は置換される、＜２７８＞〜＜２８０＞のいずれか一項に記載の方法。
＜２９５＞
２以上の異なるＣＲＩＳＰＲガイドＲＮＡ、２以上の異なるＣＲＩＳＰＲ関連タンパク質及び／又は２以上の異なるドナー核酸配列を使用して、前記変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子において、１又は複数の変異若しくは欠陥を破壊、修正、又は置換する、＜２７８＞〜＜２８０＞のいずれか一項に記載の方法。
＜２９６＞
前記対象は、哺乳動物である、＜２７８＞に記載の方法。
＜２９７＞
前記対象は、ヒトである、＜２７８＞に記載の方法。
＜２９８＞
前記方法は、眼の発達又は機能を改善するか、眼、網膜、又は角膜の変性を予防する、＜２７８＞に記載の方法。
＜２９９＞
前記方法は、神経学的発達又は機能を改善するか、神経変性を予防する、＜２７８＞に記載の方法。
＜３００＞
Ｐ４５０酵素の発現又は機能を改善する、＜２７８＞に記載の方法。
＜３０１＞
さらに（ｃ）変異又は変化された標的遺伝子又はその一部の生成のための、変異又は変化を有する表４に示す少なくとも１つの標的遺伝子の全部又は一部を含むドナー核酸配列を含む、＜２５５＞、＜２５７＞、＜２５８＞、又は＜２５９＞のいずれか一項に記載の組成物。
＜３０２＞
変異又は欠陥を有する表４に示す遺伝子を有する細胞を含む組成物。
＜３０３＞
本願の項のいずれか一項に記載の組成物を含む、変異又は欠陥を有するＣＹＰ４Ｖ２、ＣＹＰ１Ｂ１、ＭＹＯ７Ａ、ＤＦＮＢ３１、ＵＳＨ１Ｃ、ＵＳＨ１Ｇ、ＣＤＨ２３、ＰＣＤＨ１５、ＣＬＲＮ１、ＡＣＯ２、ＡＦＧ３Ｌ２、ＡＴＸＮ２、ＡＵＨ、Ｃ１２ｏｒｆ６５、ＣＩＳＤ２、ＦＯＸＣ１、ＦＯＸＦ２、ＬＴＢＰ２、ＭＴＰＡＰ、ＭＹＯＣ、ＮＤＵＦＳ１、ＮＲ２Ｆ１、ＯＰＡ１、ＯＰＡ３、ＯＰＴＮ、ＰＡＸ６、ＰＤＧＦ、ＰＩＴＸ２、ＰＯＬＧ、ＳＰＧ７、ＴＥＫ、ＴＸＮＲＤ２、ＷＦＳ１、ＡＢＣＡ４、ＲＥＰ−１、ＲＰＥ６５、ＣＥＰ２９０、ＰＤＥ６Ｂ、ＲＰＧＲ、ＭＥＲＴＫ、ＭＴ−ＮＤ４、ＦＡＭ４７Ｅ、ＧＢＡ、ＧＣＨ１、ＨＴＲＡ２、ＬＲＲＫ２、ＰＡＲＫ２、ＰＩＮＫ１、ＳＮＣＡ、ＳＹＮＪ１、ＮＰＣ１、ＮＰＣ２、ＣＹＰ４Ａ１１、ＣＹＰ４Ａ２２、ＣＹＰ４Ｂ１、ＣＹＰ４Ｆ２、ＣＹＰ４Ｆ３、ＣＹＰ４Ｆ８、ＣＹＰ４Ｆ１１、ＣＹＰ４Ｆ１２、ＣＹＰ４Ｆ２２、ＣＹＰ４Ｘ１、ＣＹＰ４Ｚ１、又はＣＹＰ４６Ａの遺伝子を有する細胞を含む組成物。
＜３０４＞
前記ベクターは、ＡＡＶベクターである、＜３０３＞に記載の組成物。
＜３０５＞
前記プロトスペーサーエレメント配列は、配列番号４８〜５２からなる群から選択されるか、配列番号４８〜５２の一つと少なくとも８０％の配列同一性を有し、ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子のｃ．８０２−８＿８１０ｄｅｌ１７ｉｎｓＧＣ変異を標的とするために、ＮＧＧをプロトスペーサー隣接モチーフ（ＰＡＭ）とするＣａｓタンパク質と共に使用される、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜３０６＞
前記ドナー核酸配列は、配列番号５６及び５７からなる群から選択されるか、配列番号５６及び５７のいずれか又はその相補的な配列との間で少なくとも９０％の配列同一性を有し、ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子のｃ．８０２−８＿８１０ｄｅｌ１７ｉｎｓＧＣ変異を修正、破壊、又は置換するために使用される、先行項のいずれか一項に記載の組成物。
＜３０７＞
対象に（ｉ）遺伝子編集療法組成物又は遺伝子導入療法組成物を含む、前記対象における既存の疾患細胞を標的とする組成物と、（ｉｉ）置換細胞を含む細胞組成物と、の組み合わせを投与すること、を含む、変異若しくは欠陥を有する遺伝子、又は不完全若しくは部分的な機能若しくは活性を有するタンパク質をコードする遺伝子によって引き起こされる対象の疾患を治療する方法。
＜３０８＞
前記対象は、ヒトである、＜３０７＞に記載の方法。
＜３０９＞
前記疾患は、前記対象の細胞に変性を引き起す、＜３０７＞に記載の方法。
＜３１０＞
前記変性は、ＲＰＥ細胞、ＲＰＣ、ＣＥＣ、ＣＥ細胞、網膜細胞、角膜細胞、脈絡膜細胞、視神経細胞、眼細胞、ニューロン、神経細胞、脳細胞、肝細胞、肺細胞、及び心臓細胞で起こる、＜３０７＞及び＜３０８＞に記載の方法。
＜３１１＞
前記疾患は、表４に示す少なくとも１つの遺伝子によって引き起こされる、＜３０７＞に記載の方法。
＜３１２＞
前記遺伝子編集療法組成物は、遺伝子編集療法に関するいずれか一項の項に記載の組成物である、＜３０７＞に記載の方法。
＜３１３＞
前記遺伝子導入療法組成物は、遺伝子導入療法に関するいずれか一項の項に記載の組成物である、＜３０７＞に記載の方法。
＜３１４＞
前記細胞組成物は、細胞療法に関する項又は自家細胞療法に関する項のいずれか一項に記載の組成物を含む、＜３０７＞に記載の方法。
＜３１５＞
前記細胞組成物は、治療される対象に対して同種（アロジェニック）である、＜３０７＞に記載の方法。
＜３１６＞
前記細胞組成物は、治療される前記対象にとって自家性である、＜３０７＞に記載の方法。
＜３１７＞
前記細胞組成物は、前記対象への投与前に遺伝的に修復される、＜３０７＞又は＜３１４＞に記載の方法。
＜３１８＞
前記遺伝子修復は、遺伝子編集療法によるものである、＜３０７＞又は＜３１７＞に記載の方法。
＜３１９＞
前記遺伝子編集療法は、遺伝子編集療法に関する項のいずれか一項に記載されるものによるものである、＜３０７＞又は＜３１８＞に記載の方法。
＜３２０＞
前記遺伝子編集療法は、ＣＲＩＳＰＲ  ＲＮＰに関する項のいずれか一項に記載されるものによるものである、＜３０７＞、＜３１８＞、又は＜３１９＞に記載の方法。
＜３２１＞
前記遺伝子修復は、遺伝子導入療法によるものである、＜３０７＞又は＜３１７＞に記載の方法。
＜３２２＞
前記遺伝子導入療法は、遺伝子導入療法又は遺伝子治療に関する項のいずれか一項に記載されるものによるものである、＜３０７＞又は＜３２１＞に記載の方法。
＜３２３＞
前記（ｉ）及び（ｉｉ）の組成物は、１回の投与で両方が投与される、＜３０７＞に記載の方法。
＜３２４＞
前記（ｉ）及び（ｉｉ）の組成物は、別々に投与又は別々の投与回で投与される、＜３０７＞に記載の方法。
＜３２５＞
前記置換細胞は、幹細胞に由来する、＜３０７＞に記載の方法。
＜３２６＞
前記置換細胞は、ｉＰＳ細胞に由来する、＜３０７＞及び＜３２５＞に記載の方法。
＜３２７＞
前記ｉＰＳ細胞は、治療される対象と同じ対象に由来する、＜３０７＞又は＜３２６＞に記載の方法。
＜３２８＞
前記置換細胞は、ｉＰＳ−ＲＰＥ、ｉＰＳ−ＰＲＣ、ｉＰＳ−ＣＥＣ、又はｉＰＳ−ＣＥ細胞である、＜３０７＞又は＜３２６＞に記載の方法。
＜３２９＞
前記置換細胞は、ｉＰＳ−眼細胞である、＜３０７＞又は＜３２６＞に記載の方法。
＜３３０＞
前記置換細胞は、ｉＰＳ−ニューロン細胞である、＜３０７＞又は＜３２６＞に記載の方法。
＜３３１＞
前記対象における眼の発達又は機能を改善するか、眼、網膜、又は角膜の変性を予防する、＜３０７＞に記載の方法。
＜３３２＞
前記対象における神経学的発達又は機能を改善するか、神経変性を予防する、＜３０７＞に記載の方法。
＜３３３＞
前記対象におけるＰ４５０酵素の発現又は機能を改善する、＜３０７＞に記載の方法。
＜３３４＞
前記対象は、眼、網膜、角膜、脈絡膜、又は神経の変性を患っている、＜３０７＞〜＜３３２＞のいずれか一項に記載の方法。