【手続補正書】
【提出日】令和3年2月12日(2021.2.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）対象によって発現されるＨＬＡ対立遺伝子によってコードされる配列を含み、
（ｉ）前記対象によって発現される前記ＨＬＡ対立遺伝子をコードする配列、それに連結された、
（ｉｉ）親和性アクセプターペプチドをコードする配列
を含む組換えポリ核酸によってコードされる、親和性アクセプタータグ付きＨＬＡタンパク質を細胞中で発現させ、これにより親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体を形成し、前記親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体が発現された場合、分泌されず、細胞膜に組み込まれるステップ；
（ｂ）前記親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体のＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドまたは複合体を識別するステップ；および
（ｃ）（ｉ）識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドもしくは複合体の１つもしくは複数の配列に基づいて治療薬を開発するステップ、または（ｉｉ）識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドもしくは複合体の１つもしくは複数の配列を含むＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドデータベースを生成するステップ
を含む方法。
【請求項２】
前記親和性アクセプタータグ付きＨＬＡタンパク質が、クラスＩＩ  ＨＬＡα鎖およびクラスＩＩ  ＨＬＡβ鎖を含む、親和性アクセプタータグ付きＨＬＡクラスＩＩタンパク質である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記組換えポリ核酸が、（ｉ）第１の親和性アクセプターペプチドをコードする配列に連結された前記クラスＩＩ  ＨＬＡα鎖をコードする第１の配列、および（ｉｉ）第２の親和性アクセプターペプチドをコードする配列に連結された前記クラスＩＩ  ＨＬＡβ鎖をコードする第２の配列を含み、ここで前記第１の親和性アクセプターペプチドおよび前記第２  第１の親和性アクセプターペプチドが異なる、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記親和性アクセプターペプチドをコードする前記配列が、前記ＨＬＡ対立遺伝子をコードする前記配列のＮ末端に作動可能に連結されている、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記細胞が内在性ＨＬＡを発現する、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記方法が、親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体を単離もしくは富化するステップ、または親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体を発現する細胞を単離もしくは富化するステップをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
富化している親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体が、親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体を免疫沈降するステップを含む、請求項６記載の方法。
【請求項８】
親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体を発現する細胞を富化する前記ステップが、親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体を発現する細胞に、親和性アクセプターペプチド特異的結合分子を接触させることを含む、請求項６記載の方法。
【請求項９】
前記親和性アクセプターペプチドがＢＡＰ（ビオチンアクセプタータンパク質）である、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記親和性アクセプターペプチド特異的結合分子が、ビオチンまたは前記親和性アクセプターペプチドに特異的な抗体である、請求項８に記載の方法。
【請求項１１】
前記富化するステップが、親和性アクセプターペプチド特異的結合分子に特異的な親和性分子を接触させることをさらに含む、請求項８に記載の方法。
【請求項１２】
前記親和性分子がストレプトアビジン、ＮｅｕｔｒＡｖｉｄｉｎ、またはその誘導体である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記細胞が抗原提示細胞（ＡＰＣ）である、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
前記細胞が初代細胞または細胞株である、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記ＨＬＡ対立遺伝子特異的ペプチドデータベースを用いてマシンを訓練するステップをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
前記マシンを訓練するために使用される変数が、ペプチド配列、アミノ酸の物理特性、ペプチドの物理特性、細胞内のペプチドの供給源タンパク質の発現レベル、タンパク質安定性、タンパク質翻訳率、ユビキチン化部位、タンパク質分解率、リボソームプロファイリングからの翻訳効率、タンパク質切断性、タンパク質局在化、ＴＡＰ輸送を容易にする宿主タンパク質のモチーフ、自食作用を受ける宿主タンパク質、リボソーム失速を好むモチーフ、およびナンセンス変異依存性分解（ＮＭＤ）を好むタンパク質特性からなる群から選択される１つまたは複数の変数を含む、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
前記組換えポリ核酸が、第１の親和性アクセプタータグ付きＨＬＡをコードする第１の配列、および第２の親和性アクセプタータグ付きＨＬＡをコードする第２の配列を含み、
ここで、前記第１の配列は、第１の親和性アクセプターペプチドをコードする配列に連結された第１のＨＬＡをコードする第１のＨＬＡ対立遺伝子の配列を含み、
前記第２の配列は、第２の親和性アクセプターペプチドをコードする配列に連結された第２のＨＬＡをコードする第２のＨＬＡ対立遺伝子の配列を含み、
前記第１のＨＬＡ対立遺伝子および前記第２のＨＬＡ対立遺伝子は、異なるＨＬＡ対立遺伝子である、請求項１に記載の方法。
【請求項１８】
前記方法が、識別された前記ＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドもしくは複合体の１つもしくは複数の配列に基づいて前記治療薬を開発するステップを含み、前記治療薬が、
（ａ）前記１つもしくは複数の配列を含む１つもしくは複数のペプチド、
（ｂ）前記１つもしくは複数のペプチドをコードするポリヌクレオチド、
（ｃ）前記１つもしくは複数のペプチドを含む１つもしくは複数のＡＰＣ、
（ｄ）前記１つもしくは複数のペプチドとの複合体における、ＨＬＡに特異的なＴ細胞受容体（ＴＣＲ）、または
（ｅ）前記１つもしくは複数のペプチドとの複合体における、ＨＬＡに特異的なＴＣＲもしくはキメラＴ細胞受容体（ＣＡＲ）を含む細胞
を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１９】
（ａ）請求項１に記載の方法によって識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドの前記１つもしくは複数の配列を含む１つまたは複数のペプチド、
（ｂ）前記１つもしくは複数のペプチドをコードするポリヌクレオチド、
（ｃ）前記１つもしくは複数のペプチドを含む１つもしくは複数のＡＰＣ、
（ｄ）前記１つもしくは複数のペプチドとの複合体における、ＨＬＡに特異的なＴ細胞受容体（ＴＣＲ）、または
（ｅ）前記１つもしくは複数のペプチドとの複合体における、ＨＬＡに特異的なＴＣＲもしくはキメラＴ細胞受容体（ＣＡＲ）を含む細胞
を含む、組成物。
【請求項２０】
薬学的に許容される担体および
（ａ）請求項１に記載の方法によって識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドの前記１つもしくは複数の配列を含む１つまたは複数のペプチド、
（ｂ）前記１つもしくは複数のペプチドをコードするポリヌクレオチド、
（ｃ）前記１つもしくは複数のペプチドを含む１つもしくは複数のＡＰＣ、
（ｄ）前記１つもしくは複数のペプチドとの複合体における、ＨＬＡに特異的なＴ細胞受容体（ＴＣＲ）、または
（ｅ）前記１つもしくは複数のペプチドとの複合体における、ＨＬＡに特異的なＴＣＲもしくはキメラＴ細胞受容体（ＣＡＲ）を含む細胞
を含む、疾患の治療に使用するための医薬組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５８７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０５８７】
一部の実施形態では、アッセイするステップは、第１および／もしくは第２の親和性アクセプタータグ付きクラスＩもしくはクラスＩＩ  ＨＬＡ対立遺伝子を配列決定すること、第１および／もしくは第２の親和性アクセプタータグ付きクラスＩもしくはクラスＩＩ  ＨＬＡ対立遺伝子ＲＮＡをコードするＲＮＡを検出すること、第１および／もしくは第２の親和性アクセプタータグ付きクラスＩもしくはクラスＩＩ  ＨＬＡ対立遺伝子タンパク質を検出すること、またはその組合せを含む。一部の実施形態では、第１および第２の親和性アクセプタータグ付きクラスＩまたはクラスＩＩ  ＨＬＡ対立遺伝子は、ユニークなバーコード配列を含む。一部の実施形態では、第１の配列および第２の配列は、ユニークなバーコード配列を含む。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
（項目１）
（ａ）対象によって発現されるＨＬＡ対立遺伝子によってコードされる配列を含み、
（ｉ）対象によって発現される前記ＨＬＡ対立遺伝子をコードする配列、それに連結された、
（ｉｉ）親和性アクセプターペプチドをコードする配列
を含む組換えポリ核酸によってコードされる、親和性アクセプタータグ付きＨＬＡタンパク質を細胞中で発現させ、これにより親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体を形成するステップ；
（ｂ）前記親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体のＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドまたは複合体を識別するステップ；および
（ｃ）（ｉ）識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドもしくは複合体の１つもしくは複数の配列に基づいて治療薬を開発するステップ、または（ｉｉ）識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドもしくは複合体の１つもしくは複数の配列を含むＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドデータベースを生成するステップ
を含む方法。
（項目２）
識別された前記ＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドまたは複合体の１つまたは複数の配列に基づいて治療薬を開発するステップを含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記治療薬が対象に特異的である、項目２に記載の方法。
（項目４）
前記治療薬が疾患に特異的である、項目２に記載の方法。
（項目５）
前記治療薬が、
（ａ）前記１つまたは複数の配列を含む１つまたは複数のペプチド、
（ｂ）前記１つまたは複数のペプチドをコードするポリヌクレオチド、
（ｃ）前記１つまたは複数のペプチドを含む１つまたは複数のＡＰＣ、
（ｄ）前記１つまたは複数のペプチドとの複合体におけるＨＬＡに特異的なＴ細胞受容体（ＴＣＲ）、
（ｅ）前記１つまたは複数のペプチドとの複合体におけるＨＬＡに特異的なＴＣＲまたはキメラＴ細胞受容体（ＣＡＲ）を含む細胞
を含む、項目２に記載の方法。
（項目６）
前記治療薬を、疾患を有する対象に投与するステップをさらに含む、項目２に記載の方法。
（項目７）
前記治療薬の前記１つまたは複数のペプチドの少なくとも１つが、識別された対応するＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドと同じ長さであるか、またはそれより長い、項目５に記載の方法。
（項目８）
アジュバントを前記対象に投与するステップをさらに含む、項目６に記載の方法。
（項目９）
前記疾患が、がん、自己免疫疾患または感染性疾患である、項目６に記載の方法。
（項目１０）
識別された前記ＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドまたは複合体の１つまたは複数の配列に基づいて、前記ＨＬＡ対立遺伝子を発現する対象に特異的な治療薬を製剤化するステップをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目１１）
前記親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体のペプチドが、前記細胞によって内在的にプロセシングされ、提示される、項目１に記載の方法。
（項目１２）
前記親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体のペプチドが、内在性ペプチドである、項目１に記載の方法。
（項目１３）
前記組換えポリ核酸が、第１の親和性アクセプタータグ付きＨＬＡをコードする第１の配列および第２の親和性アクセプタータグ付きＨＬＡをコードする第２の配列を含み、前記第１の配列が、
（ａ）第１のＨＬＡをコードする第１のＨＬＡ対立遺伝子の配列、それに連結された、
（ｂ）第１の親和性アクセプターペプチドをコードする配列
を含み；前記第２の配列が、
（ｃ）第２のＨＬＡをコードする第２のＨＬＡ対立遺伝子の配列、それに連結された、
（ｄ）第２の親和性アクセプターペプチドをコードする配列
を含み；前記第１のＨＬＡ対立遺伝子および前記第２のＨＬＡ対立遺伝子が異なるＨＬＡである、項目１に記載の方法。
（項目１４）
識別するステップが、ＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドの配列を識別することを含む、項目１に記載の方法。
（項目１５）
識別するステップが、対象によって発現される前記ＨＬＡ対立遺伝子に結合するＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドを識別することを含む、項目１に記載の方法。
（項目１６）
識別するステップが、前記親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体のＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドまたは複合体の供給源タンパク質の発現レベルを決定することを含む、項目１に記載の方法。
（項目１７）
前記発現レベルが、前記供給源タンパク質の量または前記供給源タンパク質をコードするＲＮＡの量を測定することによって決定される、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
識別するステップが、前記親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体のＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドまたは複合体を特徴付けることを含む、項目１に記載の方法。
（項目１９）
識別するステップが、生化学分析、質量分析、ＭＳ分析、ＭＳ／ＭＳ分析、ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ分析、またはその組合せを実施することを含む、項目１に記載の方法。
（項目２０）
識別するステップが、親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体に結合したペプチドの配列の結合親和性または安定性を評価することを含む、項目１に記載の方法。
（項目２１）
識別するステップが、前記親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体に結合したペプチドの配列が変異を含有するかどうかを決定することを含む、項目１に記載の方法。
（項目２２）
識別するステップが、前記親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体中のペプチドとＨＬＡ分子との会合を評価することを含む、項目１に記載の方法。
（項目２３）
識別するステップが、質量分析を実施することを含む、項目１に記載の方法。
（項目２４）
識別するステップが、タンデム質量分析を実施することを含む、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
識別するステップが、ＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドのＭＳ／ＭＳスペクトルを、親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体から単離されたペプチドの複数のＭＳ／ＭＳスペクトルを含むペプチドデータベースと比較することを含む、項目１に記載の方法。
（項目２６）
識別するステップが、対象に由来するＴ細胞を活性化することができるＨＬＡ−対立遺伝子特異的複合体を識別することを含む、項目１に記載の方法。
（項目２７）
前記細胞が、前記細胞によって通常発現されるＨＬＡ対立遺伝子によってコードされる内在性ＨＬＡタンパク質を発現する、項目１に記載の方法。
（項目２８）
前記細胞が、初代細胞である、項目１に記載の方法。
（項目２９）
前記細胞が、疾患を有する対象に由来する、項目２８に記載の方法。
（項目３０）
前記細胞が、細胞株である、項目１に記載の方法。
（項目３１）
前記細胞が、１つもしくは複数の内在性ＨＬＡクラスＩ対立遺伝子または１つもしくは複数の内在性ＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子を欠く操作された細胞である、項目３０に記載の方法。
（項目３２）
前記細胞が、抗原提示細胞（ＡＰＣ）である、項目１に記載の方法。
（項目３３）
前記親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体が排出されない、項目１に記載の方法。
（項目３４）
前記親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体が、発現された場合に細胞膜に組み込まれる、項目１に記載の方法。
（項目３５）
前記親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体が、可溶性の親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体である、項目１に記載の方法。
（項目３６）
前記親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体からペプチドを単離するステップを含む、項目１に記載の方法。
（項目３７）
親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体または親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体を発現する細胞を単離するステップを含む、項目１に記載の方法。
（項目３８）
親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体を富化するステップを含む、項目１に記載の方法。
（項目３９）
富化するステップが、親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体を免疫沈降することを含む、項目３８に記載の方法。
（項目４０）
富化するステップが、親和性アクセプターペプチド特異的結合分子を前記細胞に接触させることを含む、項目１に記載の方法。
（項目４１）
前記親和性アクセプターペプチドが（ビオチンアクセプタータンパク質）ＢＡＰである、項目４０に記載の方法。
（項目４２）
前記親和性アクセプターペプチド特異的結合分子が、ビオチンまたは前記親和性アクセプターペプチドに特異的な抗体である、項目４１に記載の方法。
（項目４３）
富化するステップが、前記親和性アクセプターペプチド特異的結合分子に特異的な親和性分子を接触させることを含む、項目４１に記載の方法。
（項目４４）
前記親和性分子が、ストレプトアビジン、ＮｅｕｔｒＡｖｉｄｉｎ、またはその誘導体である、項目４３に記載の方法。
（項目４５）
富化するステップが、前記細胞から、親和性アクセプタータグ付きＨＬＡ−ペプチド複合体を発現するインタクトな細胞を富化することを含む、項目３８に記載の方法。
（項目４６）
富化するステップの前に前記細胞を溶解するステップを含む、項目３８に記載の方法。
（項目４７）
前記細胞中でペプチドライブラリーを発現させるステップを含む、項目１に記載の方法。
（項目４８）
前記ペプチドライブラリーが、疾患と関連するペプチドのライブラリーを含む、項目４７に記載の方法。
（項目４９）
疾患細胞に由来するＨＬＡ−ペプチド複合体を、非疾患細胞に由来するＨＬＡ−ペプチド複合体と比較するステップを含む、項目１に記載の方法。
（項目５０）
識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドまたは複合体の１つまたは複数の配列を含むＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドデータベースを生成するステップを含む、項目１に記載の方法。
（項目５１）
前記ＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドデータベースを用いてマシンを訓練するステップをさらに含む、項目５０に記載の方法。
（項目５２）
ＨＬＡ−対立遺伝子特異的結合ペプチドを識別するための予測アルゴリズムを生成するステップをさらに含む、項目５０に記載の方法。
（項目５３）
前記マシンが、１つまたは複数の線形モデル、サポートベクターマシン、決定木およびニューラルネットワークを組み合わせる、項目５１に記載の方法。
（項目５４）
前記マシンを訓練するために使用される変数が、ペプチド配列、アミノ酸の物理特性、ペプチドの物理特性、細胞内のペプチドの前記供給源タンパク質の発現レベル、タンパク質安定性、タンパク質翻訳率、ユビキチン化部位、タンパク質分解率、リボソームプロファイリングからの翻訳効率、タンパク質切断性、タンパク質局在化、ＴＡＰ輸送を容易にする宿主タンパク質のモチーフ、自食作用を受ける宿主タンパク質、リボソーム失速を好むモチーフ、およびナンセンス変異依存性分解（ＮＭＤ）を好むタンパク質特性からなる群から選択される１つまたは複数の変数を含む、項目５２に記載の方法。
（項目５５）
リボソーム失速を好む前記モチーフが、ポリプロリンまたはポリリシン伸長物を含む、項目５４に記載の方法。
（項目５６）
ＮＭＤを好む前記タンパク質特性が、長い３’ＵＴＲ、最後のエクソン：エクソン接合部の核酸５０個を超えて上流にある停止コドン、およびペプチド切断性からなる群から選択される、項目５４に記載の方法。
（項目５７）
ＨＬＡ−対立遺伝子特異的結合ペプチドを識別するための方法であって、項目５０に記載の方法に従って生成されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドデータベースを用いて訓練されたマシンを用いて、ペプチドの配列を分析するステップを含む方法。
（項目５８）
薬学的に許容される担体、および項目１に記載の方法に従って識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドの１つまたは複数の配列を含む１つまたは複数のペプチドを含む医薬組成物。
（項目５９）
薬学的に許容される担体、および項目１に記載の方法に従って識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドの１つまたは複数の配列を含む１つまたは複数のペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む医薬組成物。
（項目６０）
薬学的に許容される担体、および項目１に記載の方法に従って識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドの１つまたは複数の配列を含む１つまたは複数のペプチドを含む１つまたは複数の抗原提示細胞（ＡＰＣ）を含む医薬組成物。
（項目６１）
薬学的に許容される担体、および（ｉ）項目１に記載の方法に従って識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドの１つもしくは複数の配列を含む１つもしくは複数のペプチドを含むＨＬＡ−ペプチド複合体または（ｉｉ）項目１に記載の方法に従って識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的複合体に特異的なＴ細胞受容体（ＴＣＲ）を含む医薬組成物。
（項目６２）
薬学的に許容される担体、および（ｉ）項目１に記載の方法に従って識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドの１つもしくは複数の配列を含む１つもしくは複数のペプチドを含むＨＬＡ−ペプチド複合体または（ｉｉ）項目１に記載の方法に従って識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的複合体に特異的なＴＣＲを含む細胞を含む医薬組成物。
（項目６３）
項目１に記載の方法に従って識別されたＨＬＡ−対立遺伝子特異的ペプチドまたは複合体のペプチド配列情報を含むＨＬＡ−対立遺伝子特異的結合ペプチド配列データベース。
（項目６４）
第１の親和性アクセプタータグ付きＨＬＡをコードする第１の配列、および第２の親和性アクセプタータグ付きＨＬＡをコードする第２の配列を含む組換えポリ核酸を含む組成物であって、前記第１の配列が、
（ａ）第１のＨＬＡをコードする第１のＨＬＡ対立遺伝子の配列、それに連結された、
（ｂ）第１の親和性アクセプターペプチドをコードする配列
を含み；前記第２の配列が、
（ｃ）第２のＨＬＡをコードする第２のＨＬＡ対立遺伝子の配列、それに連結された、
（ｄ）第２の親和性アクセプターペプチドをコードする配列
を含み；前記第１のＨＬＡ対立遺伝子および前記第２のＨＬＡ対立遺伝子が異なるＨＬＡ対立遺伝子である、組成物。
（項目６５）
前記親和性アクセプターペプチドが（ビオチンアクセプターペプチド）ＢＡＰである、項目６４に記載の組成物。
（項目６６）
前記第１の親和性アクセプターペプチドが、前記第２の親和性アクセプターペプチドと同じである、項目６４に記載の組成物。
（項目６７）
前記第１の親和性アクセプターペプチドが前記第１のＨＬＡにとってユニークであり、前記第２の親和性アクセプターペプチドが前記第２のＨＬＡにとってユニークである、項目６４に記載の組成物。
（項目６８）
前記第１の配列および前記第２の配列が、異なる組換えポリ核酸分子上に含まれる、項目６４に記載の組成物。
（項目６９）
前記第１の配列および前記第２の配列が、同じポリ核酸分子上に含まれる、項目６４に記載の組成物。
（項目７０）
前記第１の親和性アクセプターペプチドをコードする配列が、前記第１の配列の細胞外部分をコードする配列に作動可能に連結される、項目６４に記載の組成物。
（項目７１）
前記第１の親和性アクセプターペプチドをコードする配列が、前記第１の配列の細胞内部分をコードする配列に作動可能に連結される、項目６４に記載の組成物。
（項目７２）
前記第１の親和性アクセプターペプチドをコードする配列が、前記第１の配列のＮ末端に作動可能に連結される、項目６４に記載の組成物。
（項目７３）
前記第１の親和性アクセプターペプチドをコードする配列が、前記第１の配列のＣ末端に作動可能に連結される、項目６４に記載の組成物。
（項目７４）
前記第１の配列が第１のユニークなバーコード配列をコードし、前記第２の配列が第２のユニークなバーコード配列をコードする、項目６４に記載の組成物。
（項目７５）
前記第１の配列が第１のユニークなバーコード配列を含み、前記第２の配列が第２のユニークなバーコード配列を含む、項目６４に記載の組成物。
（項目７６）
項目６４に記載の組成物を含む細胞。