【手続補正書】
【提出日】令和3年4月12日(2021.4.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
それらの会合に適した条件下で（たとえば水溶液中で）相互に会合して逆平行、２−ヘリックスバンドルを形成する相補的な第１ヘプタッドリピート（ＨＲ１）および第２ヘプタッドリピート（ＨＲ２）領域を含むヘテロロガスな構造安定化部分に、作動可能な状態で下流において結合したエンベロープウイルス融合エクトドメインポリペプチドを含む、キメラポリペプチド。
【請求項２】
ＨＲ１およびＨＲ２領域がエクトドメインポリペプチドに対する相補性を欠如し、したがってそれらはエクトドメインポリペプチドの構造要素とではなく優先的に相互に逆平行、２−ヘリックスバンドルを形成する、請求項１に記載のキメラポリペプチド。
【請求項３】
ＨＲ１およびＨＲ２領域はそれぞれ独立して、（ａ−ｂ−ｃ−ｄ−ｅ−ｆ−ｇ−）ｎまたは（ｄ−ｅ−ｆ−ｇ−ａ−ｂ−ｃ−）ｎとして表記されるｎ回反復７残基パターンのアミノ酸タイプを特徴とし、その際、パターン要素‘ａ’〜‘ｇ’はアミノ酸タイプが位置する一般的なヘプタッド位置を表わし、ｎは２に等しいかまたはそれより大きい数値であり、一般的なヘプタッド位置‘ａ’および‘ｄ’の少なくとも５０％（または少なくとも５１％〜少なくとも９９％、およびその間のすべての整数パーセント）が疎水性アミノ酸タイプにより占有され、一般的なヘプタッド位置‘ｂ’、‘ｃ’、‘ｅ’、‘ｆ’および‘ｇ’の少なくとも５０％（または少なくとも５１％〜少なくとも９９％、およびその間のすべての整数パーセント）が親水性アミノ酸タイプにより占有され、その結果生じる疎水性アミノ酸タイプと親水性アミノ酸タイプの分布によりヘプタッドリピート領域の同定が可能になる、請求項１または請求項２に記載のキメラポリペプチド。
【請求項４】
ＨＲ１およびＨＲ２領域の一方または両方が、内在性クラスＩエンベロープウイルス融合タンパク質ヘプタッドリピート領域アミノ酸配列を含み、それからなり、または本質的にそれからなる、請求項１〜３のいずれか１項に記載のキメラポリペプチド。
【請求項５】
ＨＲ１およびＨＲ２領域が、それぞれ１以上のクラスＩエンベロープウイルス融合タンパク質の相補的な内在性ヘプタッドリピートＡ（ＨＲＡ）およびヘプタッドリピートＢ（ＨＲＢ）領域を含み、それからなり、または本質的にそれからなる、請求項４に記載のキメラポリペプチド。
【請求項６】
ＨＲＡ領域アミノ酸配列とＨＲＢ領域アミノ酸配列が同一のクラスＩエンベロープウイルス融合タンパク質に由来する、請求項５に記載のキメラポリペプチド。
【請求項７】
ＨＲＡ領域アミノ酸配列とＨＲＢ領域アミノ酸配列が異なるクラスＩエンベロープウイルス融合タンパク質に由来する、請求項５に記載のキメラポリペプチド。
【請求項８】
ＨＲ１およびＨＲ２領域が独立して、オルソミキソウイルス、パラミキソウイルス、レトロウイルス、コロナウイルス、フィロウイルスおよびアレナウイルスにより発現される融合タンパク質のＨＲＡおよびＨＲＢ領域から選択される、請求項１〜７のいずれか１項に記載のキメラポリペプチド。
【請求項９】
構造安定化部分（たとえば、ＨＲ１およびＨＲ２領域の一方または両方を含む）が、構造安定化部分に対する免疫応答の惹起を阻害する免疫サイレンシング部分を含む、請求項１〜８のいずれか１項に記載のキメラポリペプチド。
【請求項１０】
免疫サイレンシング部分が、グリコシル化酵素（たとえば、グリコシルトランスフェラーゼ）により認識されてグリコシル化されるグリコシル化部位である、請求項９に記載のキメラポリペプチド。
【請求項１１】
構造安定化部分（たとえば、ＨＲ１およびＨＲ２領域の一方または両方を含む）が、１以上の非天然アミノ酸を含む、請求項１〜１０のいずれか１項に記載のキメラポリペプチド。
【請求項１２】
１以上の非天然アミノ酸がポリエチレングリコールのカップリングを可能にする、請求項１１に記載のキメラポリペプチド。
【請求項１３】
１以上の非天然アミノ酸が免疫刺激部分のカップリングを可能にする、請求項１１に記載のキメラポリペプチド。
【請求項１４】
１以上の非天然アミノ酸が、脂質のカップリングを可能にする（たとえば、特に宿主免疫応答を刺激するために、キメラポリペプチドのエクトドメインをディスプレイする脂質ベシクルまたはウイルス様粒子の形成を容易にする）、請求項１１に記載のキメラポリペプチド。
【請求項１５】
エクトドメインポリペプチドがクラスＩエンベロープウイルス融合タンパク質エクトドメインに対応する、請求項１〜１４のいずれか１項に記載のキメラポリペプチド。
【請求項１６】
エクトドメインポリペプチドが内在性ＨＲＡ領域および内在性ＨＲＢ領域のうち一方または両方を含む、請求項１５に記載のキメラポリペプチド。
【請求項１７】
クラスＩ融合タンパク質が、オルソミキソウイルス、パラミキソウイルス、レトロウイルス、コロナウイルス、フィロウイルスおよびアレナウイルスから選択されるクラスＩエンベロープ融合タンパク質ウイルスからのものである、請求項１５または請求項１６に記載のキメラポリペプチド。
【請求項１８】
エクトドメインポリペプチドがクラスＩＩＩエンベロープウイルス融合タンパク質エクトドメインに対応する、請求項１〜１４のいずれか１項に記載のキメラポリペプチド。
【請求項１９】
クラスＩＩＩ融合タンパク質が、ラブドウイルスおよびヘルペスウイルスから選択されるクラスＩＩＩエンベロープ融合タンパク質ウイルスからのものである、請求項１８に記載のキメラポリペプチド。
【請求項２０】
エクトドメインポリペプチド（たとえば、クラスＩまたはクラスＩＩＩ）が前駆体エクトドメインポリペプチド全体またはその一部を含むか、あるいはそれからなる、請求項１〜１９のいずれか１項に記載のキメラポリペプチド。
【請求項２１】
エクトドメインポリペプチドまたはその一部が、内在性シグナルペプチド、プロテアーゼ開裂部位、エクトドメインの内在性ヘッド部分、エクトドメインの内在性ステム部分、内在性ムチン様ドメイン、内在性膜近傍外部領域および内在性融合ペプチドのうちいずれか１以上を欠如する、請求項２０に記載のキメラポリペプチド。
【請求項２２】
エクトドメインポリペプチドをプロテアーゼによるタンパク質分解開裂に対してより低い感受性にするために、野生型または基準の融合タンパク質の１以上の内在性タンパク質分解開裂部位（たとえば、１以上のフーリン開裂部位）が変化または欠失している、請求項２０または請求項２１に記載のキメラポリペプチド。
【請求項２３】
エクトドメインポリペプチドは、そのエクトドメインポリペプチドが対応する融合後形態のエンベロープウイルス融合タンパク質には存在しない少なくとも１つの融合前エピトープを含む、請求項１〜２２のいずれか１項に記載のキメラポリペプチド。
【請求項２４】
構造安定化部分のＨＲ１領域とＨＲ２領域がリンカーにより結合している、請求項１〜２３のいずれか１項に記載のキメラポリペプチド。
【請求項２５】
リンカーが約１〜約１００のアミノ酸残基（およびそれらの間のすべての整数のアミノ酸残基）からなる、請求項２４に記載のキメラポリペプチド。
【請求項２６】
リンカーが約１〜約５０のアミノ酸残基（およびそれらの間のすべての整数のアミノ酸残基）からなる、請求項２４に記載のキメラポリペプチド。
【請求項２７】
リンカーが約５０〜約１００のアミノ酸残基（およびそれらの間のすべての整数のアミノ酸残基）からなる、請求項２４に記載のキメラポリペプチド。
【請求項２８】
リンカーが、キメラポリペプチドの精製を容易にする精製部分、キメラポリペプチドに対する免疫応答を調節する免疫調節部分、細胞特異的部分、および構造柔軟性を付与する部分から選択される少なくとも１つの部分を含む、請求項２４〜２７のいずれか１項に記載のキメラポリペプチド。
【請求項２９】
それらの会合に適した条件下で（たとえば水溶液中で）相互に会合して逆平行、２−ヘリックスバンドルを形成する相補的な第１ヘプタッドリピート（ＨＲ１）および第２ヘプタッドリピート（ＨＲ２）領域を含むヘテロロガスな構造安定化部分に、作動可能な状態で下流において結合したタンパク性分子を含む、キメラポリペプチド。
【請求項３０】
タンパク性分子が療法用ポリペプチドである、請求項２９に記載のキメラポリペプチド。
【請求項３１】
宿主生物において請求項１〜２８のいずれか一項記載のキメラポリペプチドの内因性産生のための核酸構築体。
【請求項３２】
請求項３１に記載の核酸構築体であって、宿主生物が哺乳動物である、前記核酸構築体。
【請求項３３】
請求項３１に記載の核酸構築体であって、宿主生物がヒトである、前記核酸構築体。
【請求項３４】
前記核酸構築体がｍＲＮＡを含む、請求項３１〜３３のいずれかに記載の核酸構築体。
【請求項３５】
請求項１〜２８のいずれか一項記載のキメラポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
【請求項３６】
前記ポリヌクレオチドがｍＲＮＡを含む、請求項３５記載のポリヌクレオチド。
【請求項３７】
エンベロープウイルス融合タンパクに対する免疫応答を惹起するための医薬組成物であって、前記組成物は請求項３１〜３４のいずれか一項記載の核酸構築体、または請求項３５または３６記載のポリヌクレオチドを含む、前記医薬組成物。
【請求項３８】
請求項３１〜３４のいずれか一項記載の一つ又はそれ以上の核酸構築体、または請求項３５もしくは３６記載のポリヌクレオチドを含む、組成物。
【請求項３９】
前記組成物が免疫調節組成物である、請求項３８記載の組成物。
【請求項４０】
宿主細胞において作動可能である調節要素に作動可能な状態で連結した、請求項１〜３０のいずれか１項に記載のキメラポリペプチドに対するコーディング配列を含む、核酸構築体。
【請求項４１】
請求項３１〜３４、および４０のいずれか一項記載の核酸構築体を含む宿主細胞。
【請求項４２】
宿主細胞が原核宿主細胞である、請求項４１に記載の宿主細胞。
【請求項４３】
宿主細胞が真核宿主細胞である、請求項４２に記載の宿主細胞。
【請求項４４】
キメラポリペプチド複合体を製造する方法であって、請求項１〜３０のいずれか１項に記載のキメラポリペプチドを、キメラポリペプチド複合体の形成に適した条件下で（たとえば水溶液中で）結合させ、それにより、３つのキメラポリペプチドサブユニットを含む、キメラポリペプチドのそれぞれの構造形成部分の２−ヘリックスバンドルのオリゴマー化により形成された６ヘリックスバンドルを特徴とするキメラポリペプチド複合体を製造する方法。
【請求項４５】
請求項１〜３０のいずれか１項に記載のキメラポリペプチドサブユニットを３つ含み、キメラポリペプチドのそれぞれの構造形成部分の２−ヘリックスバンドルのオリゴマー化により形成された６ヘリックスバンドルを特徴とする、キメラポリペプチド複合体。
【請求項４６】
キメラポリペプチドサブユニットがそれぞれエンベロープウイルス融合エクトドメインポリペプチドを含み、複合体が融合後形態のエンベロープウイルス融合タンパク質またはその複合体には存在しない目的とするエンベロープウイルス融合タンパク質（たとえば、野生型エンベロープウイルス融合タンパク質）またはその複合体の少なくとも１つの融合前エピトープを含む、請求項４５に記載の複合体。
【請求項４７】
請求項１〜３０のいずれか１項に記載のキメラポリペプチド、または請求項４５もしくは請求項４６に記載のキメラポリペプチド複合体、および医薬的に許容できるキャリヤー、希釈剤またはアジュバントを含む、組成物。
【請求項４８】
エンベロープウイルスの融合タンパク質またはその融合タンパク質の複合体と結合する薬剤（たとえば、小分子または高分子）を同定する方法であって、前記および本明細書の他のいずれかの箇所に概説的に記載したエクトドメインポリペプチドを含むキメラポリペプチドまたはキメラポリペプチド複合体と候補薬剤を接触させ、その際、エクトドメインポリペプチドはエンベロープウイルスの融合タンパク質に対応する；そしてキメラポリペプチドまたはキメラポリペプチド複合体への候補薬剤の結合を検出することを含む方法。
【請求項４９】
さらに、候補薬剤を融合タンパク質またはその融合タンパク質の複合体と接触させ、そして融合タンパク質またはその複合体への候補薬剤の結合を検出することを含む、請求項４８に記載の方法。
【請求項５０】
候補薬剤が化合物ライブラリー（たとえば、小分子または高分子のライブラリー）の一部である、請求項４８または請求項４９に記載の方法。
【請求項５１】
さらに、候補薬剤をライブラリーから単離することを含む、請求項４８〜５０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５２】
候補薬剤がキメラポリペプチドまたはキメラポリペプチド複合体に特異的に結合する、請求項４８〜５１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５３】
候補薬剤が融合タンパク質またはその融合タンパク質の複合体に特異的に結合する、請求項４８〜５２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５４】
エンベロープウイルスの融合タンパク質またはその融合タンパク質の複合体と免疫相互作用性である抗原結合分子（たとえば、中和抗体などの抗体）を製造する方法であって、（１）動物を、請求項１〜２８のいずれか１項に記載のエクトドメインポリペプチドを含むキメラポリペプチド、または請求項４５もしくは請求項４６に記載のエクトドメインポリペプチドを含むキメラポリペプチド複合体、または請求項４７に記載のそれの組成物で免疫化し、その際、エクトドメインポリペプチドはエンベロープウイルスの融合タンパク質に対応する；（２）融合タンパク質またはその複合体と免疫相互作用性であるＢ細胞をその動物から同定および／または単離する；そして（３）そのＢ細胞が発現した抗原結合分子を製造することを含む方法。
【請求項５５】
請求項５４に記載の方法により製造された抗原結合分子、またはその抗原結合分子と同じエピトープ結合特異性を備えた誘導体型の抗原結合分子。
【請求項５６】
抗体フラグメント（たとえば、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ）、一本鎖抗体（ｓｃＦｖ）およびドメイン抗体（たとえば、サメおよびラクダ科動物の抗体を含む）、ならびに抗体を含む融合タンパク質、ならびに免疫グロブリン分子の抗原結合／認識部位を含む他のいずれかの修飾構造体から選択される、請求項５５に記載の誘導体型の抗原結合分子。
【請求項５７】
請求項５５または請求項５６に記載の抗原結合分子、および医薬的に許容できるキャリヤー、希釈剤またはアジュバントを含む、組成物。
【請求項５８】
対象においてエンベロープウイルスの融合タンパク質またはその融合タンパク質の複合体に対する免疫応答を惹起するための医薬組成物であって、前記組成物は請求項４５または４６記載のエンベロープウイルス融合エクトドメイン含有キメラポリペプチド複合体を含み、キメラポリペプチド複合体のエクトドメインポリペプチドサブユニットがエンベロープウイルスの融合タンパク質に対応する、前記医薬組成物。
【請求項５９】
対象においてエンベロープウイルスの融合タンパク質またはその融合タンパク質の複合体に対する免疫応答を惹起するための医薬組成物であって、前記組成物は請求項１〜２８のいずれか一項記載のエクトドメインポリペプチド含有キメラポリペプチド、または請求項４５もしくは４６記載のエクトドメインポリペプチド含有キメラポリペプチド複合体を発現できるＤＮＡワクチンまたはウイルスベクター／レプリコンを含み、キメラポリペプチド複合体のエクトドメインポリペプチドサブユニットがエンベロープウイルスの融合タンパク質に対応する、前記組成物。
【請求項６０】
対象においてエンベロープウイルス感染症を治療または予防するための医薬組成物であって、前記組成物は請求項４５または４６記載のエンベロープウイルス融合エクトドメイン含有キメラポリペプチド複合体を含み、キメラポリペプチド複合体のエクトドメインポリペプチドサブユニットがエンベロープウイルスの融合タンパク質に対応する、前記組成物。
【請求項６１】
対象においてエンベロープウイルス感染症を治療または予防するための医薬組成物であって、前記組成物は請求項１〜２８のいずれか一項記載のエクトドメインポリペプチド含有キメラポリペプチド、または請求項４５もしくは４６記載のエクトドメインポリペプチド含有キメラポリペプチド複合体を発現できるＤＮＡワクチンまたはウイルスベクター／レプリコンを含み、キメラポリペプチド複合体のエクトドメインポリペプチドサブユニットがエンベロープウイルスの融合タンパク質に対応する、前記組成物。
【請求項６２】
対象においてエンベロープウイルス感染症を治療または予防するための医薬組成物であって、前記組成物は請求項５５または５６記載の抗原結合分子を含む、前記組成物。
【請求項６３】
それらの会合に適した条件下で（たとえば水溶液中で）相互に会合して逆平行、２−ヘリックスバンドルを形成する相補的な第１ヘプタッドリピート（ＨＲ１）および第２ヘプタッドリピート（ＨＲ２）領域を含むヘテロロガスな構造安定化部分に、作動可能な状態で下流において結合したタンパク性分子を含む、キメラポリペプチド。
【請求項６４】
キメラポリペプチド複合体を製造する方法であって、請求項６３に記載のキメラポリペプチドを、キメラポリペプチド複合体の形成に適した条件下で（たとえば水溶液中で）結合させ、それにより、３つのキメラポリペプチドサブユニットを含み、キメラポリペプチドのそれぞれの構造形成部分の２−ヘリックスバンドルのオリゴマー化により形成された６ヘリックスバンドルを特徴とするキメラポリペプチド複合体を製造する方法。
【請求項６５】
請求項６３に記載のキメラポリペプチドサブユニットを３つ含み、キメラポリペプチドのそれぞれの構造形成部分の２−ヘリックスバンドルのオリゴマー化により形成された６ヘリックスバンドルを特徴とする、キメラポリペプチド複合体。