【手続補正書】
【提出日】平成16年10月8日(2004.10.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（a）遺伝子を含むDNAを作製し、（b）作製したDNAを転写してRNAにし、（c）得られたRNAの3'末端側にスペーサーを介してアミノ酸またはアミノ酸に類似した化学構造骨格を有する物質と共有結合し得る、ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質を連結し、（d）得られた連結体をmRNAとして無細胞タンパク質合成系でタンパク質合成を行い、遺伝子を含む核酸部と前記遺伝子の翻訳産物とを連結することを特徴とする対応付け分子の構築工程と、構築工程で得られた対応付け分子を淘汰する淘汰工程とを含むことを特徴とする所望のタンパク質の選択方法。
【請求項２】
（a）遺伝子を含むDNAを作製し、（b）作製したDNAを転写してRNAにし、（c）得られたRNAの3'末端側にスペーサーを介してアミノ酸またはアミノ酸に類似した化学構造骨格を有する物質と共有結合し得る、ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質を連結し、（d）得られた連結体をmRNAとして無細胞タンパク質合成系でタンパク質合成を行い、遺伝子を含む核酸部と前記遺伝子の翻訳産物とを連結することを特徴とする対応付け分子の構築工程と、構築工程で得られた対応付け分子を淘汰する淘汰工程と、淘汰工程により選択された対応付け分子の遺伝子部分を増幅する増幅工程とを含み、増幅工程で得られたDNAを構築工程に供することにより、構築工程、淘汰工程及び増幅工程を繰り返し行うことを特徴とする所望のタンパク質の選択方法。
【請求項３】
（a）遺伝子を含むDNAを作製し、（b）作製したDNAを転写してRNAにし、（c）得られたRNAの3'末端側にスペーサーを介してアミノ酸またはアミノ酸に類似した化学構造骨格を有する物質と共有結合し得る、ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質を連結し、（d）得られた連結体をmRNAとして無細胞タンパク質合成系でタンパク質合成を行い、遺伝子を含む核酸部と前記遺伝子の翻訳産物とを連結することを特徴とする対応付け分子の構築工程と、構築工程で得られた対応付け分子を淘汰する淘汰工程と、淘汰工程により選択された対応付け分子の遺伝子部分を増幅する増幅工程とを含むことを特徴とする所望のタンパク質をコードするDNAの取得方法。
【請求項４】
増幅工程で得られたDNAを構築工程に供することにより、構築工程、淘汰工程及び増幅工程を繰り返し行うことを特徴とする請求項３記載のDNAの取得方法。
【請求項５】
（a）遺伝子を含むDNAを作製し、（b）作製したDNAを転写してRNAにし、（c）得られたRNAの3'末端側にスペーサーを介してアミノ酸またはアミノ酸に類似した化学構造骨格を有する物質と共有結合し得る、ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質を連結し、（d）得られた連結体をmRNAとして無細胞タンパク質合成系でタンパク質合成を行い、遺伝子を含む核酸部と前記遺伝子の翻訳産物とを連結することを特徴とする対応付け分子の構築工程と、構築工程で得られた対応付け分子を淘
汰する淘汰工程とを含むことを特徴とする所望のタンパク質をコードするRNAの選択方法。
【請求項６】
（a）遺伝子を含むDNAを作製し、（b）作製したDNAを転写してRNAにし、（c）得られたRNAの3'末端側にスペーサーを介してアミノ酸またはアミノ酸に類似した化学構造骨格を有する物質と共有結合し得る、ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質を連結し、（d）得られた連結体をmRNAとして無細胞タンパク質合成系でタンパク質合成を行い、遺伝子を含む核酸部と前記遺伝子の翻訳産物とを連結することを特徴とする対応付け分子の構築工程と、構築工程で得られた対応付け分子を淘汰する淘汰工程と、淘汰工程により選択された対応付け分子の遺伝子部分を増幅する増幅工程とを含み、増幅工程で得られたDNAを構築工程に供することにより、構築工程、淘汰工程及び増幅工程を繰り返し行うことを特徴とする所望のタンパク質をコードするRNAの選択方法。
【請求項７】
遺伝子を含むDNAが、さらに転写・翻訳開始配列、及び開始コドンを含む請求項１〜６のいずれかに記載の方法。
【請求項８】
スペーサーが高分子物質からなる請求項１〜７のいずれかに記載の方法。
【請求項９】
スペーサーの長さが、１００〜１０００Åの範囲である請求項１〜８のいずれかに記載の方法。
【請求項１０】
スペーサーが核酸を含む請求項１〜９のいずれかに記載の方法。
【請求項１１】
核酸が、RNAもしくはDNAの一本鎖、RNAもしくはDNAとDNAとの二本鎖、RNAと短鎖のPNAもしくはDNAとの二本鎖、RNAとDNAとからなる一本鎖、または、RNAとDNAとからなる一本鎖と短鎖のDNAとの二本鎖である請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
スペーサーがポリエチレングリコールを含む請求項１〜１１のいずれかに記載の方法。
【請求項１３】
ポリエチレングリコールの分子量が３０００〜３００００である請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
スペーサーが、ポリエチレングリコールとDNAとからなる請求項１２または１３記載の方法。
【請求項１５】
ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質が、ピューロマイシン、3'-N-アミノアシルピューロマイシンアミノヌクレオシドまたは3'-N-アミノアシルアデノシンアミノヌクレオシドである請求項１〜１４のいずれかに記載の方法。
【請求項１６】
遺伝子を含む核酸部と前記遺伝子の翻訳産物との連結が、共有結合によってなる請求項１〜１５のいずれかに記載の方法。
【請求項１７】
共有結合がアミド結合である請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
淘汰工程において選択される対応付け分子が、物質との相互作用を指標として選択されるものである請求項１〜１７のいずれかに記載の方法。
【請求項１９】
淘汰工程が、固相に結合した物質と構築工程で得られた対応付け分子との相互作用による複合体を分離する工程を含む請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
遺伝子が、抗体またはその部分の遺伝子である請求項１〜１９のいずれかに記載の方法。
【請求項２１】
遺伝子が、酵素またはその部分の遺伝子である請求項１〜１９のいずれかに記載の方法。
【請求項２２】
遺伝子を含むDNAが、ランダム塩基配列からなる請求項１〜１９のいずれかに記載の方法。
【請求項２３】
遺伝子を含むDNAが、異なる遺伝子を有する複数のDNAからなるライブラリーである請求項１〜２２のいずれかに記載の方法。
【請求項２４】
遺伝子を有するRNAの3'末端に、高分子物質からなるスペーサーが結合した分子。
【請求項２５】
請求項２４に記載の分子の3'末端側に、アミノ酸またはアミノ酸に類似した化学構造骨格を有する物質と共有結合し得る、ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類
似した化学構造骨格を有する物質が結合した分子。
【請求項２６】
ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質が、ピューロマイシン、3'-N-アミノアシルピューロマイシンアミノヌクレオシドまたは3'-N-アミノアシルアデノシンアミノヌクレオシドである請求項２５に記載の分子。
【請求項２７】
RNAが、さらに転写・翻訳開始配列、及び開始コドンを含む請求項２４〜２６のいずれかに記載の分子。
【請求項２８】
スペーサーの長さが、１００〜１０００Åの範囲である請求項２４〜２７のいずれかに記載の分子。
【請求項２９】
スペーサーが、核酸を含む請求項２４〜２８のいずれかに記載の分子。
【請求項３０】
核酸が、RNAもしくはDNAの一本鎖、RNAもしくはDNAとDNAとの二本鎖、RNAと短鎖のPNAもしくはDNAとの二本鎖、RNAとDNAとからなる一本鎖、または、RNAとDNAとからなる一本鎖と短鎖のDNAとの二本鎖である請求項２９に記載の分子。
【請求項３１】
スペーサーが、ポリエチレングリコールを含む請求項２４〜３０のいずれかに記載の分子。
【請求項３２】
スペーサーが、ポリエチレングリコールとDNAとからなる請求項３１に記載の分子。
【請求項３３】
ポリエチレングリコールの分子量が、３０００〜３００００である請求項３１または３２に記載の方法。
【請求項３４】
遺伝子が、抗体またはその部分の遺伝子である請求項２４〜３３のいずれかに記載の分子。
【請求項３５】
遺伝子が、酵素またはその部分の遺伝子である請求項２４〜３３のいずれかに記載の分子。
【請求項３６】
遺伝子が、ランダム塩基配列からなる請求項２４〜３３のいずれかに記載の分子。
【請求項３７】
請求項２４〜３６のいずれかに記載の分子であって、異なる遺伝子を有する複数の分子からなるライブラリー。
【請求項３８】
遺伝子型を反映する塩基配列を有する核酸部と、前記遺伝子型を反映する塩基配列がコードするタンパク質を含むタンパク質部とが直接共有結合している分子であって、核酸部がDNAを含む分子。
【請求項３９】
核酸部が、さらに転写・翻訳開始配列、及び開始コドンを含む請求項３８に記載の分子。
【請求項４０】
核酸部に含まれるDNAが、DNAとRNAとの二本鎖である請求項３８または３９に記載の分子。
【請求項４１】
核酸部に含まれるDNAが、DNAの一本鎖である請求項３８または３９に記載の分子。
【請求項４２】
核酸部に含まれるDNAが、DNAの二本鎖である請求項３８または３９に記載の分子。
【請求項４３】
核酸部に含まれるDNAが、RNAの逆転写反応によって生成されたものである請求項３８〜４２のいずれかに記載の分子。
【請求項４４】
核酸部が、遺伝子型を反映する塩基配列の3'末端側に、スペーサーを介して、アミノ酸またはアミノ酸に類似した化学構造骨格を有する物質と共有結合し得る、ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質が結合した分子である請求項３８〜４３のいずれかに記載の分子。
【請求項４５】
ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質が、ピューロマイシン、3'-N-アミノアシルピューロマイシンアミノヌクレオシドまたは3'-N-アミノアシルアデノシンアミノヌクレオシドである請求項４４に記載の分子。
【請求項４６】
スペーサーが、高分子物質からなる請求項４４または４５に記載の分子。
【請求項４７】
スペーサーが、１００〜１０００Åの長さを有する請求項４４〜４６のいずれかに記載の分子。
【請求項４８】
スペーサーが核酸を含む請求項４４〜４７のいずれかに記載の分子。
【請求項４９】
核酸が、RNAもしくはDNAの一本鎖、RNAもしくはDNAとDNAとの二本鎖、RNAと短鎖のPNAもしくはDNAとの二本鎖、RNAとDNAとからなる一本鎖、または、RNAとDNAとからなる一本鎖と短鎖のDNAとの二本鎖である請求項４８に記載の分子。
【請求項５０】
スペーサーが、ポリエチレングリコールを含む請求項４４〜４９のいずれかに記載の分子。
【請求項５１】
スペーサーが、ポリエチレングリコールとDNAとからなる請求項５０に記載の分子。
【請求項５２】
ポリエチレングリコールが、３０００〜３００００の分子量を有する請求項５０または５１に記載の方法。
【請求項５３】
遺伝子が、抗体またはその部分の遺伝子である請求項３８〜５２のいずれかに記載の分子。
【請求項５４】
遺伝子が、酵素またはその部分の遺伝子である請求項３８〜５２のいずれかに記載の分子。
【請求項５５】
遺伝子が、ランダム塩基配列からなる請求項３８〜５２のいずれかに記載の分子。
【請求項５６】
請求項３８〜５５のいずれかに記載の分子であって、異なる遺伝子を有する複数の分子からなるライブラリー。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２４】
また、本発明の好ましい態様によれば、核酸部が、タンパク質をコードする遺伝子を含み、タンパク質部が該核酸部の遺伝子の翻訳産物である上記の対応付け分子が提供される。核酸部は、好ましくは、RNAからなる遺伝子と、前記遺伝子にスペーサーを介して連結したサプレッサーtRNAとを含む。サプレッサーtRNAは、好ましくは、前記遺伝子の終止コドンに対応するアンチコドンを含む。あるいは、核酸部は、RNAからなる遺伝子と、DNAとRNAまたはDNAとポリエチレングリコールからなるスペーサー部分とを含む。また、核酸部は、DNAからなる遺伝子とDNAとRNAからなるスペーサー部分とを含んでもよい。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３３】
さらに具体的には、以下のものが提供される。
（１）  （a）遺伝子を含むDNAを作製し、（b）作製したDNAを転写してRNAにし、（c）得られたRNAの3'末端側にスペーサーを介してアミノ酸またはアミノ酸に類似した化学構造骨格を有する物質と共有結合し得る、ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質を連結し、（d）得られた連結体をmRNAとして無細胞タンパク質合成系でタンパク質合成を行い、遺伝子を含む核酸部と前記遺伝子の翻訳産物とを連結することを特徴とする対応付け分子の構築工程と、構築工程で得られた対応付け分子を淘汰する淘汰工程とを含むことを特徴とする所望のタンパク質の選択方法。
（２）  （a）遺伝子を含むDNAを作製し、（b）作製したDNAを転写してRNAにし、（c）得られたRNAの3'末端側にスペーサーを介してアミノ酸またはアミノ酸に類似した化学構造骨格を有する物質と共有結合し得る、ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質を連結し、（d）得られた連結体をmRNAとして無細胞タンパク質合成系でタンパク質合成を行い、遺伝子を含む核酸部と前記遺伝子の翻訳産物とを連結する
ことを特徴とする対応付け分子の構築工程と、構築工程で得られた対応付け分子を淘汰する淘汰工程と、淘汰工程により選択された対応付け分子の遺伝子部分を増幅する増幅工程とを含み、増幅工程で得られたDNAを構築工程に供することにより、構築工程、淘汰工程及び増幅工程を繰り返し行うことを特徴とする所望のタンパク質の選択方法。
（３）  （a）遺伝子を含むDNAを作製し、（b）作製したDNAを転写してRNAにし、（c）得られたRNAの3'末端側にスペーサーを介してアミノ酸またはアミノ酸に類似した化学構造骨格を有する物質と共有結合し得る、ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質を連結し、（d）得られた連結体をmRNAとして無細胞タンパク質合成系でタンパク質合成を行い、遺伝子を含む核酸部と前記遺伝子の翻訳産物とを連結することを特徴とする対応付け分子の構築工程と、構築工程で得られた対応付け分子を淘汰する淘汰工程と、淘汰工程により選択された対応付け分子の遺伝子部分を増幅する増幅工程とを含むことを特徴とする所望のタンパク質をコードするDNAの取得方法。
（４）  増幅工程で得られたDNAを構築工程に供することにより、構築工程、淘汰工程及び増幅工程を繰り返し行うことを特徴とする３記載のDNAの取得方法。
（５）  （a）遺伝子を含むDNAを作製し、（b）作製したDNAを転写してRNAにし、（c）得られたRNAの3'末端側にスペーサーを介してアミノ酸またはアミノ酸に類似した化学構造骨格を有する物質と共有結合し得る、ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質を連結し、（d）得られた連結体をmRNAとして無細胞タンパク質合成系でタンパク質合成を行い、遺伝子を含む核酸部と前記遺伝子の翻訳産物とを連結することを特徴とする対応付け分子の構築工程と、構築工程で得られた対応付け分子を淘汰する淘汰工程とを含むことを特徴とする所望のタンパク質をコードするRNAの選択方法。
（６）  （a）遺伝子を含むDNAを作製し、（b）作製したDNAを転写してRNAにし、（c）得られたRNAの3'末端側にスペーサーを介してアミノ酸またはアミノ酸に類似した化学構造骨格を有する物質と共有結合し得る、ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質を連結し、（d）得られた連結体をmRNAとして無細胞タンパク質合成系でタンパク質合成を行い、遺伝子を含む核酸部と前記遺伝子の翻訳産物とを連結することを特徴とする対応付け分子の構築工程と、構築工程で得られた対応付け分子を淘汰する淘汰工程と、淘汰工程により選択された対応付け分子の遺伝子部分を増幅する増幅工程とを含み、増幅工程で得られたDNAを構築工程に供することにより、構築工程、淘汰工程及び増幅工程を繰り返し行うことを特徴とする所望のタンパク質をコードするRNAの選択方法。
（７）  遺伝子を含むDNAが、さらに転写・翻訳開始配列、及び開始コドンを含む１〜６のいずれかに記載の方法。
（８）  スペーサーが高分子物質からなる１〜７のいずれかに記載の方法。
（９）  スペーサーの長さが、１００〜１０００Åの範囲である１〜８のいずれかに記載の方法。
（１０）  スペーサーが核酸を含む１〜９のいずれかに記載の方法。
（１１）  核酸が、RNAもしくはDNAの一本鎖、RNAもしくはDNAとDNAとの二本鎖、RNAと短鎖のPNAもしくはDNAとの二本鎖、RNAとDNAとからなる一本鎖、または、RNAとDNAとからなる一本鎖と短鎖のDNAとの二本鎖である１０に記載の方法。
（１２）  スペーサーがポリエチレングリコールを含む１〜１１のいずれかに記載の方法。
（１３）  ポリエチレングリコールの分子量が３０００〜３００００である１２に記載の方法。
（１４）  スペーサーが、ポリエチレングリコールとDNAとからなる９または１３記載の方法。
（１５）  ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質が、ピューロマイシン、3'-N-アミノアシルピューロマイシンアミノヌクレオシドまたは3'-N-アミノアシルアデノシンアミノヌクレオシドである１〜１４のいずれかに記載の方法。
（１６）  遺伝子を含む核酸部と前記遺伝子の翻訳産物との連結が、共有結合によって
なる１〜１５のいずれかに記載の方法。
（１７）  共有結合がアミド結合である１６に記載の方法。
（１８）  淘汰工程において選択される対応付け分子が、物質との相互作用を指標として選択されるものである１〜１７のいずれかに記載の方法。
（１９）  淘汰工程が、固相に結合した物質と構築工程で得られた対応付け分子との相互作用による複合体を分離する工程を含む１８に記載の方法。
（２０）  遺伝子が、抗体またはその部分の遺伝子である１〜１９のいずれかに記載の方法。
（２１）  遺伝子が、酵素またはその部分の遺伝子である１〜１９のいずれかに記載の方法。
（２２）  遺伝子を含むDNAが、ランダム塩基配列からなる１〜１９のいずれかに記載の方法。
（２３）  遺伝子を含むDNAが、異なる遺伝子を有する複数のDNAからなるライブラリーである１〜２２のいずれかに記載の方法。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３４】
（２４）  遺伝子を有するRNAの3'末端に、高分子物質からなるスペーサーが結合した分子。
（２５）  ２４に記載の分子の3'末端側に、アミノ酸またはアミノ酸に類似した化学構造骨格を有する物質と共有結合し得る、ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質が結合した分子。
（２６）  ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質が、ピューロマイシン、3'-N-アミノアシルピューロマイシンアミノヌクレオシドまたは3'-N-アミノアシルアデノシンアミノヌクレオシドである２５に記載の分子。
（２７）  RNAが、さらに転写・翻訳開始配列、及び開始コドンを含む２４〜２６のいずれかに記載の分子。
（２８）  スペーサーの長さが、１００〜１０００Åの範囲である２４〜２７のいずれかに記載の分子。
（２９）  スペーサーが、核酸を含む２４〜２８のいずれかに記載の分子。
（３０）  核酸が、RNAもしくはDNAの一本鎖、RNAもしくはDNAとDNAとの二本鎖、RNAと短鎖のPNAもしくはDNAとの二本鎖、RNAとDNAとからなる一本鎖、または、RNAとDNAとからなる一本鎖と短鎖のDNAとの二本鎖である２９に記載の分子。
（３１）  スペーサーが、ポリエチレングリコールを含む２４〜３０のいずれかに記載の分子。
（３２）  スペーサーが、ポリエチレングリコールとDNAとからなる３１に記載の分子。
（３３）  ポリエチレングリコールの分子量が、３０００〜３００００である３１または３２に記載の方法。
（３４）  遺伝子が、抗体またはその部分の遺伝子である２４〜３３のいずれかに記載の分子。
（３５）  遺伝子が、酵素またはその部分の遺伝子である２４〜３３のいずれかに記載の分子。
（３６）  遺伝子が、ランダム塩基配列からなる２４〜３３のいずれかに記載の分子。
（３７）  ２４〜３６のいずれかに記載の分子であって、異なる遺伝子を有する複数の分子からなるライブラリー。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３５】
（３８）  遺伝子型を反映する塩基配列を有する核酸部と、前記遺伝子型を反映する塩基配列がコードするタンパク質を含むタンパク質部とが直接共有結合している分子であって、核酸部がDNAを含む分子。
（３９）  核酸部が、さらに転写・翻訳開始配列、及び開始コドンを含む３８に記載の分子。
（４０）  核酸部に含まれるDNAが、DNAとRNAとの二本鎖である３８または３９に記載の分子。
（４１）  核酸部に含まれるDNAが、DNAの一本鎖である３８または３９に記載の分子。
（４２）  核酸部に含まれるDNAが、DNAの二本鎖である３８または３９に記載の分子。
（４３）  核酸部に含まれるDNAが、RNAの逆転写反応によって生成されたものである３８〜４２のいずれかに記載の分子。
（４４）  核酸部が、遺伝子型を反映する塩基配列の3'末端側に、スペーサーを介して、アミノ酸またはアミノ酸に類似した化学構造骨格を有する物質と共有結合し得る、ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質が結合した分子である３８〜４３のいずれかに記載の分子。
（４５）  ヌクレオシドまたはヌクレオシドに類似した化学構造骨格を有する物質が、ピューロマイシン、3'-N-アミノアシルピューロマイシンアミノヌクレオシドまたは3'-N-アミノアシルアデノシンアミノヌクレオシドである４４に記載の分子。
（４６）  スペーサーが、高分子物質からなる４４または４５に記載の分子。
（４７）  スペーサーが、１００〜１０００Åの長さを有する４４〜４６のいずれかに記載の分子。
（４８）  スペーサーが核酸を含む４４〜４７のいずれかに記載の分子。
（４９）  核酸が、RNAもしくはDNAの一本鎖、RNAもしくはDNAとDNAとの二本鎖、RNAと短鎖のPNAもしくはDNAとの二本鎖、RNAとDNAとからなる一本鎖、または、RNAとDNAとからなる一本鎖と短鎖のDNAとの二本鎖である４８に記載の分子。
（５０）  スペーサーが、ポリエチレングリコールを含む４４〜４９のいずれかに記載の分子。
（５１）  スペーサーが、ポリエチレングリコールとDNAとからなる５０に記載の分子。
（５２）  ポリエチレングリコールが、３０００〜３００００の分子量を有する５０または５１に記載の方法。
（５３）  遺伝子が、抗体またはその部分の遺伝子である３８〜５２のいずれかに記載の分子。
（５４）  遺伝子が、酵素またはその部分の遺伝子である３８〜５２のいずれかに記載の分子。
（５５）  遺伝子が、ランダム塩基配列からなる３８〜５２のいずれかに記載の分子。
（５６）  ３８〜５５のいずれかに記載の分子であって、異なる遺伝子を有する複数の分子からなるライブラリー。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４９】
そこで、mRNA-sup tRNA（mRNAの3'側にスペーサーを介してsup tRNAを連結したもの）
の3'末端にタンパク質を結合させる実験の前に、mRNAと切り離したsup tRNAでもリボソームのＡサイトに入り、タンパク質と結合するかどうかを調べてみた。実際に、sup tRNAの3'末端にピューロマイシンを結合させたsup tRNAを調製し、これを無細胞タンパク質合成系に投入し、sup tRNA部分がリボゾームのＡサイトの終止コドンに対応して入り、タンパク質と結合するかどうか調べた。mRNAはタウ・タンパク質の４リピート領域（127残基）を用いた（Goedert, M. (1989) EMBO J. 8, 392-399）。その結果、無細胞タンパク合成系で翻訳させところ、3'末端にピューロマイシンをもつsup tRNAはリボゾームのＡサイトの終止コドンに対応して入り、タンパク質と結合することが確認できた（第２図）。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７０】
この核酸部の連結体の構築においては、先ず、T7プロモーター領域から４リピート翻訳領域の終りまでの連結体の構築は、前記（1）部位指定的な方法の核酸部の連結体の構築のところで述べた方法に準ずるが、違うところは前記で構築した連結体を鋳型にしてPCRで増幅する際に、backwardのプライマーに４リピートのＣ末端の二つの終止コドン、オーカー（CTG）とアンバー（TAA）をそれぞれCAG（グルタミン）とAAA（リジン）に変え、終止コドンをなくするように設計したプライマーを用いることである。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１０２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１０２】
2) このゲノムからT7プロモーター領域及びシャインダルガノ配列を含んだ4リピート部分をPCRによって増幅した。この際、プライマーとして、5'側は、Left+（配列番号１）と3'側はRight-（配列番号2）を使った。また、Right-の配列はオーカー終止コドンの前のロイシンをアンバー終止コドンに変異させるようになっている。PCR条件は、変性92℃/30秒、アニーリング65℃/30秒、伸長反応73℃/1分で30回繰り返した。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１１１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１１１】
（２）部位非指定的に結合させるためのゲノムの作成
Ａ. 変異4リピート部分のDNA及びRNAの作成
変異4リピート部分のDNAは、基本的に上記（１）のAと同一の方法で作成した。ただし、2つの終止コドンすなわちアンバーをグルタミン、オーカーをリジンに替えて終止コドンをなくし、また、3'末端をプリンリッチ(rich)にするために、新しいプライマーNew/Right-（配列番号10）を合成し、Left+とともに変性92℃/30秒、アニーリング65℃/30秒、伸長反応73℃/1分で30回の条件でPCRによって増幅した。このDNAを鋳型として、T7ポリメラーゼを使い37℃、2時間反応させることによりRNAゲノムを得た。