【手続補正書】
【提出日】令和3年5月21日(2021.5.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
試料処理システムであって、
免疫分析器又は化学分析器を備える分析器と、
質量分析計と、
一次試料を受け取るための少なくとも１つの試料調製ステーションであって、前記少なくとも１つの試料調製ステーションは、前記分析器による分析のために第１の処理済み試料を作成するように処理するために、前記一次試料からの第１の試料アリコートを第１の反応容器に分配するように作動し、前記質量分析計による分析のために第２の処理済み試料を作成するように処理するために、第２の試料アリコートを第２の反応容器に分配するように作動し、前記分析器は、前記少なくとも１つの試料調製ステーションから前記第１の処理済み試料を受け取り、前記第１の処理済み試料に関する一次分析を実施するように構成されている、少なくとも１つの試料調製ステーションと、
前記第２の処理済み試料アリコートから前記第２の処理済み試料を受け取り、質量分析のために前記第２の処理済み試料を前記質量分析計に移すための少なくとも１つの試料導入装置と、
制御システムであって、前記制御システムは、前記一次試料を処理して前記第１の処理済み試料及び前記第２の処理済み試料にするように前記少なくとも１つの試料調製ステーションを制御し、前記第１の試料アリコートからの前記第１の処理済み試料を受け取ることと前記第１の処理済み試料に関する一次分析を実施することとを前記分析器に行わせ、前記第２の試料アリコートからの前記第２の処理済み試料を受け取ることと前記第２の処理済み試料を前記質量分析計に移すこととを前記少なくとも１つの試料導入装置に行わせ、前記第２の処理済み試料に関する質量分析を実施して前記第２の処理済み試料の中の特定の分析物の存在、不在、及び／又は量を検出することを前記質量分析計に行わせるように構成されている、制御システムと
を備える、試料処理システム。
【請求項２】
前記少なくとも１つの試料調製ステーションは、前記分析器と共に使用するための第１の試料調製ステーションと、前記質量分析計と共に使用するための第２の試料調製ステーションとを備える、請求項１に記載の試料処理システム。
【請求項３】
前記第１の処理済み試料は、分析物分子に結合するように発光又は蛍光ラベルの存在下で調製され、前記分析器は、前記ラベルによって生成された光を検出することによって前記分析物分子を検出するための光学検出ステーションをさらに備える、請求項１に記載の試料処理システム。
【請求項４】
前記少なくとも１つの試料調製ステーションは、
複数の試料管を保持するように構成されている試料提示ユニットであって、前記複数の試料管は、各々、前記一次試料を収容する、試料提示ユニットと、
選択された試料管からの試料の一部を前記第１の試料アリコート及び前記第２の試料アリコートに分取するように構成されるアリコートステーションであって、前記アリコートステーションは、少なくとも１つのピペッタと、前記分析器によるイムノアッセイ又は化学アッセイを実施するための試薬を備える第１の試薬パックと前記質量分析計による質量分析を実施するための試薬を備える第２の試薬パックとを少なくとも保持する手段と、前記第１の試薬パックからの試薬を前記第１の試料アリコートに移す手段と、前記第２の試薬パックからの試薬を前記第２の試料アリコートに移す手段とを備える、アリコートステーションと
を備える、請求項１に記載の試料処理システム。
【請求項５】
前記第１の試薬パック及び前記第２の試薬パックのうちの少なくとも１つは、質量タグ、発光ラベル、化学発光ラベル、電気化学発光ラベル、蛍光ラベル、放射性ラベル、同位体ラベル、又はＤＮＡラベルから成る群から選択されるラベルを備える試薬を収容する、請求項４に記載の試料処理システム。
【請求項６】
前記少なくとも１つの試料導入装置は、前記質量分析計への溶出前に対象となる分析物を濃縮するように作動する小容量のトラップ及び溶出システムと、イオン化の後だが前記質量分析計による質量分析の前に同重体又は異性体化合物を分離するための微分型電気移動度分析計とを備える、請求項１に記載の試料処理システム。
【請求項７】
前記少なくとも１つの試料導入装置は、前記第２の試料アリコートから前記第２の処理済み試料を受け取るための開ポート試料採取インターフェースを備える、請求項１に記載の試料処理システム。
【請求項８】
前記質量分析は、二次分析を含み、前記制御システムは、前記一次分析から、前記第１の処理済み試料中の分析物の濃度が所定の閾値を下回っているか、上回っているか、又は前記所定の閾値に等しいかどうかを決定することと、前記決定に基づいて、
前記少なくとも１つの試料調製ステーションに、前記第２の処理済み試料を作成させることと、
前記試料導入装置に、前記第２の処理済み試料を前記質量分析計に移すことを行わせることと、
前記質量分析計に、二次分析を実施させ、前記第２の処理済み試料中の前記分析物又は別の分析物を検出かつ／又は定量化させることと、
前記一次分析及び前記二次分析のうちの少なくとも１つに基づいて報告を生成することと
を行うようにさらに作動する、請求項１に記載の試料処理システム。
【請求項９】
前記少なくとも１つの試料導入装置によって前記質量分析計に移す前に前記第２の試料アリコートを貯蔵するための試料貯蔵部をさらに備える、請求項１に記載の試料処理システム。
【請求項１０】
前記少なくとも１つの試料導入装置は、
トラップ内への注入のために前記第２の処理済み試料をインジェクタにポンプ圧送するための第１のポンプと、
質量分析計適合緩衝液を前記トラップ内へポンプ圧送し、トラップ分析物を前記質量分析計内へ溶出するための第２のポンプと、
前記第１のポンプが前記第２の処理済み試料を前記トラップ内へポンプ圧送しているときに前記トラップを廃棄物ステーションに接続するための、及び、前記第２のポンプが前記質量分析計適合緩衝液を前記トラップ内へポンプ圧送しているときに前記トラップを前記質量分析計に接続するための切替弁と
を備える、請求項１に記載の試料処理システム。
【請求項１１】
統合試料処理システムによって実施される方法であって、
前記統合試料処理システムが、
一次試料を受け取ることと、
第１の反応容器において、前記一次試料から、第１の処理済み試料を含有する第１の試料アリコートを調製することと、
第２の反応容器において、前記一次試料から、第２の処理済み試料を含有する第２の試料アリコートを調製することと、
一次分析において前記第１の処理済み試料を分析し、分析物を検出することと、
前記第２の処理済み試料を少なくとも１つの試料導入装置に移し、質量分析のために前記第２の処理済み試料を前記少なくとも１つの試料導入装置から質量分析計に移し、前記第２の処理済み試料の中の特定の分析物の存在、不在、及び／又は量を検出することと
を含む、方法。
【請求項１２】
前記第１の処理済み試料を調製することは、発光又は蛍光ラベルを追加し、分析物分子に結合することを含み、前記第１の処理済み試料を分析することは、前記第１の処理済み試料からの光を検出し、前記分析物分子を検出することを含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記第２の試料アリコートを調製することは、前記分析物分子の内標準物質を追加することを含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１４】
前記第１の試料アリコートを調製することは、第１の試薬パックからの試薬を前記第１の試料アリコートに移すことを含み、前記第２の試料アリコートを調製することは、第２の試薬パックからの試薬を前記第２の試料アリコートに移すことを含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１５】
前記少なくとも１つの試料導入装置は、前記質量分析計への溶出前に対象となる分析物を濃縮するように作動する小容量のトラップ及び溶出システムと、イオン化の後だが前記質量分析計による質量分析の前に同重体又は異性体化合物を分離するための微分型電気移動度分析計とを備え、前記第２の処理済み試料を前記少なくとも１つの試料導入装置から前記質量分析計に移すことは、
前記トラップにおいて前記特定の分析物を濃縮することと、
前記濃縮された分析物を試料溶液としてイオン源に溶出することと、
前記イオン源において前記試料溶液からイオンを生成することと、
微分型電気移動度分析計において前記生成されたイオンを分離することと、
質量分析のために前記分離されたイオンを前記質量分析計に移すことと
をさらに含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１６】
前記少なくとも１つの試料導入装置は、前記第２の試料アリコートからの前記第２の処理済み試料を受け取るための開ポート試料採取インターフェースを備え、前記第２の処理済み試料を前記少なくとも１つの試料導入装置から前記質量分析計に移すことは、
前記第２の試料アリコートからの前記第２の処理済み試料を、前記開ポート試料採取インターフェースの試料採取端部に送達される溶媒に移すことと、
前記開ポート試料採取インターフェースの中心管を通して前記第２の処理済み試料及び溶媒を吸収することと、
前記吸収された第２の処理済み試料及び溶媒を前記開ポート試料採取インターフェースからイオン源に移すことと、
前記イオン源において、前記移された第２の処理済み試料及び溶媒からイオンを生成することと、
質量分析のために前記生成されたイオンを前記質量分析計内へ移すことと
を含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１７】
前記少なくとも１つの試料導入装置は、微分型電気移動度分析計をさらに備え、前記生成されたイオンを前記質量分析計内へ移すことは、
微分型電気移動度分析計において前記生成されたイオンを分離することと、
質量分析のために前記分離されたイオンを前記質量分析計内へ移すことと
をさらに含む、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
前記質量分析は、二次分析を含み、前記方法は、
前記一次分析から、前記第１の処理済み試料中の分析物の濃度が所定の閾値を下回っているか、上回っているか、又は前記所定の閾値に等しいかどうかを決定することと、
前記決定に基づいて、
前記第２の処理済み試料を調製することと、
前記第２の処理済み試料を前記質量分析計に移すことと、
前記質量分析計を使用して二次分析を実施し、前記第２の処理済み試料中の前記分析物又は別の分析物を検出かつ／又は定量化することと、
前記一次分析及び前記二次分析のうちの少なくとも１つに基づいて報告を生成することと
をさらに含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１９】
前記第２の処理済み試料を移す前に、前記方法は、
前記第２の処理済み試料を試料貯蔵部に移すことと、
前記第１の処理済み試料が分析されるまで、前記第２の処理済み試料を貯蔵することと、
前記一次分析に基づいて、二次分析のために前記貯蔵された第２の処理済み試料を前記質量分析計に移すことと
をさらに含む、請求項１１に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１６】
本発明の別の実施形態は、質量分析計と、試料導入装置と、制御システムと、を備える試料処理システムに関し、制御システムは、質量分析計及び試料導入装置の動作を制御し、かつ制御システムは、プロセッサ及びコンピュータ可読媒体を含む。コンピュータ可読媒体は、方法であって、質量分析計によって、試料の第１の試料アリコートの第１の処理済み試料アリコートから分析物の一次分析を実施することと、一次分析を実施した後に、試料処理システム内の質量分析計又は分析器によって、試料の第２のアリコートから導出された第２の処理済み試料アリコート中の分析物又は別の分析物の二次分析を実施することと、を含む、方法を実施するために、プロセッサによって実行可能なコードを含む。
本発明は、例えば、以下を提供する。
（項目１）
分析器であって、（ｉ）試料を収容する複数の試料管を保持するように構成されている試料提示ユニットと、（ｉｉ）少なくとも１つのピペッタを含み、前記複数の試料管内の試料管にある分析物を含む試料の第１の試料アリコートを反応容器に提供し、かつ第２のアリコートを提供するように構成されているアリコートステーションと、（ｉｉｉ）前記反応容器内の前記試料の第１の処理済み試料アリコート中の前記分析物を検出するように構成されている光学検出ステーションと、を含む、分析器と、
前記分析器に連結された質量分析計であって、前記質量分析計は、前記第２の試料アリコートから導出された第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から受け取り、前記第２の処理済み試料アリコート中の前記分析物を検出するように構成されている、質量分析計と、
前記分析器及び前記質量分析計を制御するように構成されている制御システムと、を備える、試料処理システム。
（項目２）
前記試料の前記アリコートが第１の試料アリコートであり、前記試料処理システムは、
前記分析器内の複数の試料アリコート処理装置であって、前記複数の試料アリコート処理装置は、前記第１の試料アリコートを処理して前記第１の処理済み試料アリコートを形成することができ、かつ前記試料の第２の試料アリコートを処理して前記第２の処理済み試料アリコートを形成することができる、複数の試料アリコート処理装置と、
前記制御システム、前記分析器、及び前記質量分析計に連結された試料導入装置であって、前記試料導入装置は、前記第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に移すように構成されている、試料導入装置と、を更に備える、項目１に記載の試料処理システム。
（項目３）
前記試料アリコートが第１の試料アリコートであり、前記制御システムは、
データプロセッサと、
コンピュータ可読媒体であって、前記コンピュータ可読媒体は、方法であって、
前記光学検出ステーションからのデータを使用して、前記光学検出ステーションにおける前記第１の処理済み試料アリコート中の前記分析物の検出が、所定の閾値を下回っているか、上回っているか、又はそれに等しいかを決定することと、
決定に応答して、前記分析器に、前記第２の試料アリコートを処理して前記第２の処理済み試料アリコートを形成させ、かつ前記試料導入装置に、前記第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に移させることと、
前記質量分析計に、前記第２の処理済み試料アリコート中の前記分析物又は別の分析物の存在を検出させることと、を含む、方法を実施するために、前記データプロセッサによって実行可能なコードを含む、コンピュータ可読媒体と、を含む、項目２に記載の試料処理システム。
（項目４）
前記試料導入装置が、ピックアンドプレース装置、移動シャトル、トラップ及び溶出装置、開ポート装置、又はダイレクトインジェクション装置を備える、項目２に記載の試料処理システム。
（項目５）
前記分析器が、前記試料の別のアリコートを収容する別の反応容器を貯蔵するように構成されている試料貯蔵ユニットを更に含む、項目１に記載の試料処理システム。
（項目６）
前記質量分析計、前記分析器、及び前記制御システムが、単一の器具内で一体的に接続されている、項目１に記載の試料処理システム。
（項目７）
前記分析器が試薬貯蔵部を更に含み、前記試薬貯蔵部は、イムノアッセイを実施するための試薬を含む第１の複数の試薬パックと、前記質量分析計において質量分析を実施するための試薬を含む第２の複数の試薬パックと、を含む、複数の試薬パックを含む、項目１に記載の試料処理システム。
（項目８）
前記分析器が免疫化学分析器であり、前記分析器は、
前記試料アリコートを収容する前記反応容器内に１つ以上の試薬を分配するように構成されている試薬分配ステーションを更に含む、項目１に記載の試料処理システム。
（項目９）
前記分析器が、磁石を含む分離ステーションを更に含み、前記磁石は、前記反応容器内の前記試料中の他の成分から前記分析物を分離するためのものである、項目１に記載の試料処理システム。
（項目１０）
前記試料アリコートが第１の試料アリコートであり、前記反応容器が第１の反応容器であり、前記試料処理システムは、
前記分析器内の複数の試料アリコート処理装置であって、前記複数の試料アリコート処理装置は、前記第１の試料アリコートを処理して前記第１の処理済み試料アリコートを形成することができ、かつ前記試料の第２の試料アリコートを処理して前記第２の処理済み試料アリコートを形成することができる、複数の試料アリコート処理装置を更に備え、
前記制御システムは、
データプロセッサと、
コンピュータ可読媒体であって、前記コンピュータ可読媒体は、方法であって、
前記光学検出ステーションに、前記第１の処理済み試料アリコート中の前記分析物を検出させることと、
前記質量分析計に、前記分析器から移された前記第２の処理済み試料アリコート中の前記分析物を検出させることと、を含む、方法を実施するために、前記データプロセッサによって実行可能なコードを含む、コンピュータ可読媒体と、を含む、項目１に記載の試料処理システム。
（項目１１）
少なくとも１つのピペッタを含むアリコートステーションを含む分析器と、質量分析計と、試料導入装置と、制御システムであって、前記制御システムは、前記分析器、及び前記質量分析計、前記試料導入装置、及び前記制御システムに動作可能に連結されている、制御システムと、を備える試料処理システムによって実施される方法であって、前記方法は、
前記アリコートステーションの前記少なくとも１つのピペッタにより、試料の第１の試料アリコート、及び前記試料の第２の試料アリコートを提供することと、
前記分析器内の複数の処理装置のうちの１つ以上によって、試料の前記第１の試料アリコートを処理して第１の処理済み試料アリコートを形成することと、
前記分析器内の前記複数の処理装置のうちの１つ以上によって、前記試料の前記第２の試料アリコートを処理して第２の処理済み試料アリコートを形成することと、
前記分析器によって、前記分析器を使用して、前記第１の処理済み試料アリコート中の分析物を検出するためのプロセスを実施することと、
前記試料導入装置によって、前記第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に移すことと、
前記質量分析計を使用して、前記第２の処理済み試料アリコート中の前記分析物又は別の分析物を検出することと、を含む、方法。
（項目１２）
前記複数の処理装置が、ピペッティングステーション、試薬分配ステーション、インキュベータ、並びに洗浄及び分離ステーションのうちの２つ以上を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
検出するための前記プロセスが、前記分析器を使用して、前記分析物の量又は存在を検出することを含み、前記質量分析計によって前記分析物を検出する前記プロセスも、前記分析物の量又は存在を検出することを含む、項目１１に記載の方法。
（項目１４）
前記第１の試料アリコートを処理することが、
試薬を、前記第１の試料アリコートを収容する反応容器内に分配することと、
前記試薬及び前記試料アリコートを収容する前記反応容器をインキュベートすることと、
洗浄及び磁気分離プロセスを使用して、前記第１の試料アリコート中の他の成分から前記分析物を分離することと、を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１５）
前記試料が生体液である、項目１１に記載の方法。
（項目１６）
前記試料を前記分析器から前記質量分析計に移すことが、前記試料導入装置によって、前記試料を前記質量分析計に注入することを含む、項目１１に記載の方法。
（項目１７）
前記第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に移すことが、前記試料導入装置によって、トラップ及び溶出システムを使用して前記第２の処理済み試料アリコートを移すことを含む、項目１１に記載の方法。
（項目１８）
前記分析器によって、前記第２の処理済み試料アリコートを処理することが、前記第２の処理済み試料アリコート中の前記分析物を誘導体化することを含む、項目１１に記載の方法。
（項目１９）
試料貯蔵ユニット内の反応容器内に前記第２の試料アリコートを貯蔵することを更に含む、項目１１に記載の方法。
（項目２０）
前記方法が、高圧液体クロマトグラフィカラム又は遠心分離器を利用しない、項目１１に記載の方法。
（項目２１）
少なくとも１つのピペッタを含むアリコートステーションを含む分析器と、質量分析計と、試料導入装置と、制御システムであって、前記制御システムは、前記分析器、前記質量分析計、前記試料導入装置、及び前記制御システムに動作可能に連結されている、制御システムと、を備える試料処理システムによって実施される方法であって、前記方法は、
前記アリコートステーションの前記少なくとも１つのピペッタにより、試料の第１の試料アリコート、及び前記試料の第２の試料アリコートを提供することと、
前記分析器によって、反応容器内の試料の前記第１の試料アリコートから導出された第１の処理済み試料アリコート中の分析物の一次分析を実施することと、
前記試料導入装置によって、前記試料の前記第２の試料アリコートから導出された第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に移すことと、
質量分析計によって、二次分析において、前記第２の処理済み試料アリコート中の前記分析物又は別の分析物の二次分析を実施することと、を含む、方法。
（項目２２）
前記一次分析が実施され得るように、前記分析器によって、前記第１の試料アリコートを第１の反応容器内で処理することを更に含む、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
前記分析器によって、前記第２の試料アリコートを第２の反応容器内で処理して、前記第２の試料アリコートを前記質量分析計用に調製することを更に含む、項目２１に記載の方法。
（項目２４）
前記試料導入装置によって、前記第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に移す前に、前記方法は、
前記制御システムによって、前記第２の処理済み試料アリコートを作製する前に、前記第１の処理済み試料アリコート中の分析物の濃度が、所定の閾値を下回っているか、上回っているか、又はそれに等しいかを決定することを更に含む、項目２１に記載の方法。
（項目２５）
前記第１の処理済み試料アリコート中の前記分析物の濃度が、所定の閾値以下である、項目２４に記載の方法。
（項目２６）
前記第２の試料アリコートに対して免疫精製プロセスを実施することを更に含む、項目２２に記載の方法。
（項目２７）
前記試料から追加の試料アリコートを取得し、前記追加の試料アリコートを試料貯蔵ユニット内に貯蔵することを更に含む、項目２２に記載の方法。
（項目２８）
前記分析器が磁気洗浄ステーションを含む、項目２３に記載の方法。
（項目２９）
前記第２の試料アリコートを処理することが、前記第２の試料アリコート中の他の成分から前記分析物を分離するために、前記磁気洗浄ステーションにおいて磁気分離プロセスを使用することを含む、項目２８に記載の方法。
（項目３０）
前記試料導入装置がトラップ及び溶出システムを含む、項目２１に記載の方法。
（項目３１）
前記第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に移すことが、前記第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に注入することを含む、項目２１に記載の方法。
（項目３２）
前記試料導入装置が開ポート試料採取インターフェースを含む、項目２１に記載の方法。
（項目３３）
アリコートステーションを含む分析器と、
前記分析器に連結された質量分析計と、
前記分析器及び前記質量分析計に連結された試料導入装置と、
前記分析器、前記質量分析計、及び前記試料導入装置に連結された制御システムであって、前記制御システムは、プロセッサと、コンピュータ可読媒体であって、前記コンピュータ可読媒体は、方法であって、
少なくとも１つのピペッタを含む前記アリコートステーションに、試料の第１の試料アリコート及び前記試料の第２の試料アリコートを提供するように指示することと、
前記分析器に、試料の前記第１の試料アリコートを収容する反応容器を処理して第１の処理済み試料アリコートを形成するように指示することと、
前記分析器に、前記第１の処理済み試料アリコート中の分析物の一次分析を実施するように指示することと、
前記分析器に、前記試料の前記第２のアリコートを処理して第２の処理済み試料アリコートを形成するように指示することと、
前記試料導入装置に、前記試料の前記第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に移すように指示することと、
前記質量分析計に、前記第２の処理済み試料アリコート中の前記分析物又は別の分析物の二次分析を実施するように指示することと、を含む、方法を実施するために、前記プロセッサによって実行可能なコードを含む、コンピュータ可読媒体と、を含む、制御システムと、を備える、試料処理システム。
（項目３４）
前記方法が、
前記制御システムによって、前記一次分析が所定の閾値に従って前記分析物の存在を検出するか、又は不在を検出するかを決定することを更に含む、項目３３に記載の試料処理システム。
（項目３５）
前記所定の閾値が、前記処理された第１の試料アリコート中の前記分析物の所定の量又は所定の濃度に対応している、項目３４に記載の試料処理システム。
（項目３６）
前記分析器に、前記第２の試料アリコートを処理するように指示することが、前記分析器に、反応容器内の前記第２の試料アリコートに対して免疫精製プロセスを実施するように指示することを含む、項目３３に記載の試料処理システム。
（項目３７）
前記免疫精製プロセスが、磁気分離プロセスを使用して、前記分析物を前記第２の試料アリコート中の他の成分から分離する、項目３６に記載の試料処理システム。
（項目３８）
前記分析器に、前記第２の試料アリコートを処理するように指示することが、前記分析器に、前記第２の試料アリコートに対してタンパク質沈殿プロセスを実施するように指示することを含む、項目３３に記載の試料処理システム。
（項目３９）
前記タンパク質沈殿プロセスが、磁気分離プロセスを使用して、前記分析物を前記第２の試料アリコート中の他の成分から分離する、項目３８に記載の試料処理システム。
（項目４０）
前記試料導入装置がトラップ及び溶出システムを含む、項目３３に記載の試料処理システム。
（項目４１）
前記試料導入装置に、前記試料の前記第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に移すように指示することが、前記試料導入装置に、前記試料の前記第２の処理済み試料アリコートを、前記第２の処理済み試料アリコートを注入することによって前記分析器から前記質量分析計に移すように指示することを含む、項目３３に記載の試料処理システム。
（項目４２）
前記試料導入装置が開ポート試料採取インターフェースを含む、項目３３に記載の試料処理システム。
（項目４３）
分析を実施する方法であって、前記方法は、分析器と、質量分析計と、試料導入装置と、制御システムであって、前記制御システムは、前記分析器、前記質量分析計、前記試料導入装置、及び前記制御システムに動作可能に連結されている、制御システムと、を備える試料処理システムによって実施され、前記方法は、
前記分析器によって、反応容器内の試料の第１の試料アリコートから導出される第１の処理済み試料アリコート中の疾患の第１のバイオマーカーに対する一次分析を実施することと、
前記試料導入装置によって、前記試料の第２の試料アリコートから導出された第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に移すことと、
質量分析計によって、二次分析において、前記第２の処理済み試料アリコート中の前記疾患の第２のバイオマーカーに対する二次分析を実施することと、を含む、方法。
（項目４４）
前記分析器が免疫分析器を含み、前記一次分析が、光学検出プロセスを使用して免疫分析を実施することを含む、項目４３に記載の方法。
（項目４５）
前記質量分析計が、前記第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から受け取り、前記第２の処理済み試料アリコート中の前記分析物を検出するように構成されており、前記質量分析計は、前記第１の処理済み試料アリコート中の前記分析物を検出するように構成されていない、項目１に記載の試料処理システム。
（項目４６）
分析器であって、（ｉ）試料を収容する複数の試料管を保持するように構成されている試料提示ユニットと、（ｉｉ）前記複数の試料管内の試料管にある分析物を含む試料の第１の試料アリコートを反応容器に提供し、かつ第２のアリコートを提供するように構成されているアリコートステーションと、（ｉｉｉ）前記反応容器内の前記試料の第１の処理済み試料アリコート中の前記分析物を検出するように構成されている光学検出ステーションと、を含む、分析器と、
前記分析器に連結された質量分析計であって、前記質量分析計は、前記第２のアリコートから導出された第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から受け取り、前記受け取った第２の処理済み試料アリコート中の前記分析物を検出するように構成されている、質量分析計と、
前記分析器及び前記質量分析計を制御するように構成されている制御システムと、を備える、試料処理システム。
（項目４７）
分析器と、質量分析計と、試料導入装置と、制御システムであって、前記制御システムは、前記分析器、前記質量分析計、前記試料導入装置、及び前記制御システムに動作可能に連結されている、制御システムと、を備える試料処理システムによって実施される方法であって、前記方法は、
前記分析器によって、反応容器内の試料の第１の試料アリコートから導出された第１の処理済み試料アリコート中の分析物の一次分析を実施することと、
前記第１の処理済み試料アリコート中の分析物の濃度が所定の閾値を下回っているか、上回っているか、又はそれに等しいかを決定することと、
前記試料導入装置によって、前記試料の第２の試料アリコートから導出された第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に移すことと、
質量分析計によって、二次分析において、前記第２の処理済み試料アリコート中の前記分析物又は別の分析物の二次分析を実施することと、を含む、方法。
（項目４８）
前記分析器が、ピペッティングステーション、試薬分配ステーション、インキュベータ、並びに洗浄及び分離ステーションのうちの２つ以上を含む、項目４７に記載の方法。
（項目４９）
前記分析器が免疫分析器である、項目４７に記載の方法。
（項目５０）
前記第１の試料アリコートを処理することが、
試薬を、前記第１の試料アリコートを収容する反応容器内に分配することと、
前記試薬及び前記試料アリコートを収容する前記反応容器をインキュベートすることと、
洗浄及び磁気分離プロセスを使用して、前記第１の試料アリコート中の他の成分から前記分析物を分離することと、を含む、項目４７に記載の方法。
（項目５１）
分析器であって、（ｉ）試料を収容する複数の試料管を保持するように構成されている試料提示ユニットと、（ｉｉ）前記複数の試料管内の試料管にある分析物を含む試料のアリコートを反応容器に提供するように構成されているアリコートステーションと、（ｉｉｉ）前記反応容器内の前記試料の第１の処理済み試料アリコート中の前記分析物を検出するように構成されている光学検出ステーションと、を含む、分析器と、
前記分析器に連結された質量分析計であって、前記質量分析計は、前記分析器から第１の処理済み試料アリコート及び／又は第２の処理済み試料アリコートを受け取り、前記第１の処理済み試料アリコート及び／又は前記第２の処理済み試料アリコート中の前記分析物を検出するように構成されている、質量分析計と、
試料導入装置と、
前記分析器、前記試料導入装置、及び前記質量分析計を制御するように構成されている制御システムであって、前記制御システムは、
データプロセッサと、
コンピュータ可読媒体であって、前記コンピュータ可読媒体は、方法であって、
前記光学検出ステーションからのデータを使用して、前記光学検出ステーションにおける第１の処理済み試料アリコート中の前記分析物の検出が、所定の閾値を下回っているか、上回っているか、又はそれに等しいかを決定することと、
決定に応答して、前記分析器に、前記第２の試料アリコートを処理して第２の処理済み試料アリコートを形成させ、かつ前記試料導入装置に、前記第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に移させることと、
前記質量分析計に、前記第２の処理済み試料アリコート中の前記分析物又は別の分析物の存在を検出させることと、を含む、方法を実施するために、前記データプロセッサによって実行可能なコードを含む、コンピュータ可読媒体と、を含む、制御システムと、を備える、試料処理システム。
（項目５２）
前記試料処理システムが、
前記分析器内の複数の試料アリコート処理装置であって、前記複数の試料アリコート処理装置は、前記第１の試料アリコートを処理して前記第１の処理済み試料アリコートを形成することができ、かつ前記試料の第２の試料アリコートを処理して前記第２の処理済み試料アリコートを形成することができる、複数の試料アリコート処理装置と、
前記分析器及び前記質量分析計であって、前記試料導入装置は、前記第２の処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に移すように構成されている、分析器及び質量分析計と、を更に備える、項目５１に記載の試料処理システム。
（項目５３）
前記試料導入装置が、ピックアンドプレース装置、移動シャトル、トラップ及び溶出装置、開ポート装置、又はダイレクトインジェクション装置を含む、項目５２に記載の試料処理システム。
（項目５４）
前記質量分析計、前記分析器、及び前記制御システムが、単一の器具内で一体的に接続されている、項目５２に記載の試料処理システム。
（項目５５）
前記分析器が試薬貯蔵部を更に含み、前記試薬貯蔵部は、イムノアッセイを実施するための試薬を含む第１の複数の試薬パックと、前記質量分析計において質量分析を実施するための試薬を含む第２の複数の試薬パックと、を含む、複数の試薬パックを含む、項目５２に記載の試料処理システム。
（項目５６）
少なくとも質量分析計と、試料導入装置と、制御システムであって、前記制御システムは、前記質量分析計及び前記試料導入装置に動作可能に連結されている、制御システムと、を備える試料処理システムによって実施される方法であって、前記方法は、
前記質量分析計によって、前記試料の第１の試料アリコートの第１の処理済み試料アリコートからの分析物の一次分析を実施することと、
前記一次分析を実施した後、前記試料処理システム内の前記質量分析計又は分析器によって、前記試料の第２のアリコートから導出された第２の処理済み試料アリコート中の前記分析物又は別の分析物の二次分析を実施することと、を含む、方法。
（項目５７）
前記試料処理システムが、免疫分析器を含む分析器を更に備える、項目５６に記載の方法。
（項目５８）
前記分析物又は前記別の分析物が、ステロイド又は依存性薬物を含む、項目５６に記載の方法。
（項目５９）
前記試料処理システムが分析器を更に含み、前記分析器はアリコートステーションを含む、項目５６に記載の方法。
（項目６０）
前記分析物が、前記第１の分析において前記第１の処理済み試料アリコート中で同定されることが可能な、分析物のパネル内の多くの分析物のうちの１つである、項目５６に記載の方法。
（項目６１）
前記試料処理システムが前記分析器を更に含み、前記二次分析は前記分析器によって実施される、項目５６に記載の方法。
（項目６２）
前記二次分析が前記質量分析計によって実施される、項目５６に記載の方法。
（項目６３）
質量分析計と、
試料導入装置と、
制御システムであって、前記制御システムは、前記質量分析計及び前記試料導入装置の動作を制御し、前記制御システムは、プロセッサと、コンピュータ可読媒体であって、前記コンピュータ可読媒体は、方法であって、
前記質量分析計によって、前記試料の第１の試料アリコートの第１の処理済み試料アリコートからの分析物の一次分析を実施することと、
前記一次分析を実施した後、前記試料処理システム内の前記質量分析計又は分析器によって、前記試料の第２のアリコートから導出された第２の処理済み試料アリコート中の前記分析物又は別の分析物の二次分析を実施することと、を含む、方法を実施するために、前記プロセッサによって実行可能なコードを含む、コンピュータ可読媒体と、を含む、制御システムと、を備える、試料処理システム。
（項目６４）
前記試料処理システムが、前記分析器を更に備え、前記分析器は、免疫分析器又は化学分析器である、項目６３に記載の試料処理システム。
（項目６５）
前記分析器がアリコートステーションを含む、項目６４に記載の試料処理システム。
（項目６６）
前記分析器が、質量分析を実施するための試薬と、イムノアッセイ分析を実施するための試薬と、を含む、項目６４に記載の試料処理システム。
（項目６７）
前記試料導入装置が、処理済み試料アリコートを前記分析器から前記質量分析計に提供するように構成されている、項目６４に記載の試料処理システム。
（項目６８）
前記分析物が、前記第１の分析において前記第１の処理済み試料アリコート中で同定されることが可能な、分析物のパネル内の多くの分析物のうちの１つである、項目６３に記載の試料処理システム。
（項目６９）
前記分析器を更に備え、前記二次分析が前記分析器によって実施される、項目６３に記載の試料処理システム。
（項目７０）
前記二次分析が前記質量分析計によって実施される、項目６３に記載の試料処理システム。