【手続補正書】
【提出日】平成16年11月12日(2004.11.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号２のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が２６３ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項２】
配列番号４のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が１８５３ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項３】
配列番号６のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が１４９１ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項４】
配列番号６のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が４２７２ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項５】
配列番号８のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が２１９７ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項６】
配列番号８のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が２６７ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項７】
配列番号１４のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が１２９９ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項８】
配列番号１８のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が１３６５ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項９】
配列番号２３のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が３０６１ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項１０】
配列番号２３のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が７６２ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項１１】
配列番号２３のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が１９７３ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項１２】
配列番号２６のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が２８５２ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項１３】
配列番号３０のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が２７８８ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項１４】
配列番号３４のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が５２１ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項１５】
配列番号３６のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が１４０５ｂｐおよび／または１５２８ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項１６】
配列番号４３のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が１２６９ｂｐおよび／または２５５１ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項１７】
配列番号４６のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が２２４７ｂｐを中心として±５％の範囲を中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌の所定の株であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項１８】
配列番号６のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が８２８ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置
に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が腸炎ビブリオ菌であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項１９】
配列番号１２のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が６７０ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が腸炎ビブリオ菌であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項２０】
配列番号１８のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が１１５３ｂｐおよび／または２０１０ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が腸炎ビブリオ菌であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項２１】
配列番号３２のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が６５９ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が腸炎ビブリオ菌であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。
【請求項２２】
配列番号９のプライマーを用いて識別対象となる細菌のＤＮＡに対し、熱変性工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応方法を適用することにより、前記識別対象となる細菌のＤＮＡ断片を増幅するステップと、
前記増幅されたＤＮＡ断片に対して電気泳動法を適用し、電気泳動像を得るステップと、
前記電気泳動像においてＤＮＡ断片長が１２４５ｂｐを中心として±５％の範囲内の位置に現れるか否かに基づいて前記識別対象となる細菌が大腸菌または赤痢菌であるか否かを識別するステップとを備えたことを特徴とする細菌識別方法。