【手続補正書】
【提出日】令和3年10月28日(2021.10.28)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
がん関連タンパク質の免疫原性断片を含む単離されたペプチドであって、前記断片が、ヘテロクリティック突然変異を含む、単離されたペプチド。
【請求項２】
前記ヘテロクリティック突然変異が、アンカー位置における好ましいアミノ酸への突然変異である、請求項１に記載の単離されたペプチド。
【請求項３】
前記断片が、長さ約７アミノ酸〜約１１アミノ酸の間、長さ約８アミノ酸〜約１０アミノ酸の間、または長さ約９アミノ酸である、請求項１または２に記載の単離されたペプチド。
【請求項４】
前記がん関連タンパク質が、がん精巣抗原または癌胎児性抗原である、前記いずれかの請求項に記載の単離されたペプチド。
【請求項５】
前記がん関連タンパク質が、次のヒト遺伝子：ＲＮＦ４３、ＳＴＥＡＰ１、ＣＥＡＣＡＭ５、ＧＡＧＥ１、ＴＥＲＴ、ＫＬＨＬ７、ＭＡＧＥＡ３、ＭＡＧＥＡ４、ＭＡＧＥＡ６、ＮＵＦ２、ＮＹＥＳＯ１、ＰＡＧＥ４、ＰＲＡＭＥ、ＰＳＡ、ＰＳＭＡ、ＳＡＲＴ３、ＳＳＸ２およびＳＵＲＶＩＶＩＮのうち１つによってコードされる、前記いずれかの請求項に記載の単離されたペプチド。
【請求項６】
（ａ）前記がん関連タンパク質が、ＲＮＦ４３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４６を含む；
（ｂ）前記がん関連タンパク質が、ＳＴＥＡＰ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１５２および１５４のいずれか１つを含む；
（ｃ）前記がん関連タンパク質が、ＣＥＡＣＡＭ５によってコードされ、前記断片が、配列番号１００、１０２、１０４、１０６および１０８のいずれか１つを含む；
（ｄ）前記がん関連タンパク質が、ＧＡＧＥ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１１０および１１２のいずれか１つを含む；
（ｅ）前記がん関連タンパク質が、ＴＥＲＴによってコードされ、前記断片が、配列番号１１４を含む；
（ｆ）前記がん関連タンパク質が、ＫＬＨＬ７によってコードされ、前記断片が、配列番号１１６を含む；
（ｇ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１１８、１２０、１２２および１２４のいずれか１つを含む；
（ｈ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１２６を含む；
（ｉ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ６によってコードされ、前記断片が、配列番号１２８を含む；
（ｊ）前記がん関連タンパク質が、ＮＵＦ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１３０および１３２のいずれか１つを含む；
（ｋ）前記がん関連タンパク質が、ＮＹＥＳＯ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１３４および１３６のいずれか１つを含む；
（ｌ）前記がん関連タンパク質が、ＰＡＧＥ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１３８を含む；
（ｍ）前記がん関連タンパク質が、ＰＲＡＭＥによってコードされ、前記断片が、配列番号１４０を含む；
（ｎ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４２を含む；
（ｏ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＭＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４４を含む；
（ｐ）前記がん関連タンパク質が、ＳＡＲＴ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４８を含む；
（ｑ）前記がん関連タンパク質が、ＳＳＸ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１５０を含む；または
（ｒ）前記がん関連タンパク質が、ＳＵＲＶＩＶＩＮによってコードされ、前記断片が、配列番号１５６および１５８のいずれか１つを含む、
請求項５に記載の単離されたペプチド。
【請求項７】
（ａ）前記がん関連タンパク質が、ＲＮＦ４３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４６からなる；
（ｂ）前記がん関連タンパク質が、ＳＴＥＡＰ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１５２および１５４のいずれか１つからなる；
（ｃ）前記がん関連タンパク質が、ＣＥＡＣＡＭ５によってコードされ、前記断片が、配列番号１００、１０２、１０４、１０６および１０８のいずれか１つからなる；
（ｄ）前記がん関連タンパク質が、ＧＡＧＥ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１１０および１１２のいずれか１つからなる；
（ｅ）前記がん関連タンパク質が、ＴＥＲＴによってコードされ、前記断片が、配列番号１１４からなる；
（ｆ）前記がん関連タンパク質が、ＫＬＨＬ７によってコードされ、前記断片が、配列番号１１６からなる；
（ｇ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１１８、１２０、１２２および１２４のいずれか１つからなる；
（ｈ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１２６からなる；
（ｉ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ６によってコードされ、前記断片が、配列番号１２８からなる；
（ｊ）前記がん関連タンパク質が、ＮＵＦ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１３０および１３２のいずれか１つからなる；
（ｋ）前記がん関連タンパク質が、ＮＹＥＳＯ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１３４および１３６のいずれか１つからなる；
（ｌ）前記がん関連タンパク質が、ＰＡＧＥ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１３８からなる；
（ｍ）前記がん関連タンパク質が、ＰＲＡＭＥによってコードされ、前記断片が、配列番号１４０からなる；
（ｎ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４２からなる；
（ｏ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＭＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４４からなる；
（ｐ）前記がん関連タンパク質が、ＳＡＲＴ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４８からなる；
（ｑ）前記がん関連タンパク質が、ＳＳＸ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１５０からなる；または
（ｒ）前記がん関連タンパク質が、ＳＵＲＶＩＶＩＮによってコードされ、前記断片が、配列番号１５６および１５８のいずれか１つからなる、
請求項６に記載の単離されたペプチド。
【請求項８】
（ａ）前記がん関連タンパク質が、ＲＮＦ４３によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１４６からなる；
（ｂ）前記がん関連タンパク質が、ＳＴＥＡＰ１によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１５２および１５４のいずれか１つからなる；
（ｃ）前記がん関連タンパク質が、ＣＥＡＣＡＭ５によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１００、１０２、１０４、１０６および１０８のいずれか１つからなる；
（ｄ）前記がん関連タンパク質が、ＧＡＧＥ１によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１１０および１１２のいずれか１つからなる；
（ｅ）前記がん関連タンパク質が、ＴＥＲＴによってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１１４からなる；
（ｆ）前記がん関連タンパク質が、ＫＬＨＬ７によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１１６からなる；
（ｇ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ３によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１１８、１２０、１２２および１２４のいずれか１つからなる；
（ｈ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ４によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１２６からなる；
（ｉ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ６によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１２８からなる；
（ｊ）前記がん関連タンパク質が、ＮＵＦ２によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１３０および１３２のいずれか１つからなる；
（ｋ）前記がん関連タンパク質が、ＮＹＥＳＯ１によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１３４および１３６のいずれか１つからなる；
（ｌ）前記がん関連タンパク質が、ＰＡＧＥ４によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１３８からなる；
（ｍ）前記がん関連タンパク質が、ＰＲＡＭＥによってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１４０からなる；
（ｎ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＡによってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１４２からなる；
（ｏ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＭＡによってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１４４からなる；
（ｐ）前記がん関連タンパク質が、ＳＡＲＴ３によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１４８からなる；
（ｑ）前記がん関連タンパク質が、ＳＳＸ２によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１５０からなる；または
（ｒ）前記がん関連タンパク質が、ＳＵＲＶＩＶＩＮによってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１５６および１５８のいずれか１つからなる、
請求項７に記載の単離されたペプチド。
【請求項９】
前記断片が、次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２のうち１つまたは複数に結合する、前記いずれかの請求項に記載の単離されたペプチド。
【請求項１０】
前記いずれかの請求項に記載の単離されたペプチドをコードする核酸。
【請求項１１】
ヒトにおける発現のためにコドン最適化されているか、またはＬｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓにおける発現のためにコドン最適化されている、請求項１０に記載の核酸。
【請求項１２】
ＤＮＡを含む、請求項１０または１１に記載の核酸。
【請求項１３】
ＲＮＡを含む、請求項１０または１１に記載の核酸。
【請求項１４】
配列番号９７１、９７３、７５９〜７６８、９６１〜９６４、９７６、９６９、３９３〜４１０、７３９〜７４８、９５７〜９６０、８４９〜８５８、２２３〜３９２、４１１〜７３８、７４９〜７５８、７６９〜８４８、８５９〜９５６、９６５〜９６８、９７０、９７２、９７４、９７５および９７７、および同じアミノ酸配列をコードするそれらの縮重バリアントのいずれか１つから選択される配列を含む、請求項１０〜１３のいずれか一項に記載の核酸。
【請求項１５】
配列番号９７１、９７３、７５９〜７６８、９６１〜９６４、９７６、９６９、３９３〜４１０、７３９〜７４８、９５７〜９６０、８４９〜８５８、２２３〜３９２、４１１〜７３８、７４９〜７５８、７６９〜８４８、８５９〜９５６、９６５〜９６８、９７０、９７２、９７４、９７５および９７７、および同じアミノ酸配列をコードするそれらの縮重バリアントのいずれか１つから選択される配列からなる、請求項１４に記載の核酸。
【請求項１６】
（ａ）請求項１〜９のいずれか一項に記載の１つもしくは複数の単離されたペプチドまたは請求項１０〜１５のいずれか一項に記載の１つもしくは複数の核酸；および
（ｂ）アジュバント
を含む医薬組成物であって、必要に応じて、前記アジュバントが、無毒化リステリオリジンＯ（ｄｔＬＬＯ）、顆粒細胞／マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）タンパク質、ＧＭ−ＣＳＦタンパク質をコードするヌクレオチド分子、サポニンＱＳ２１、モノホスホリルリピドＡ、非メチル化ＣｐＧ含有オリゴヌクレオチドまたはＭｏｎｔａｎｉｄｅ  ＩＳＡ  ５１を含む、医薬組成物。
【請求項１７】
次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２の各々に結合するペプチドまたは前記ペプチドをコードする核酸を含む、請求項１６に記載の医薬組成物。
【請求項１８】
（ａ）表３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｂ）表５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｃ）表１１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｄ）表１９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｅ）表９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｆ）表７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｇ）表１３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｈ）表１５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｉ）表１７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；あるいは
（ｊ）表２１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表２１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸
を含む、請求項１６または１７に記載の医薬組成物。
【請求項１９】
（ａ）表３に記載のペプチドの全て、もしくは表３に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｂ）表５に記載のペプチドの全て、もしくは表５に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｃ）表１１に記載のペプチドの全て、もしくは表１１に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｄ）表１９に記載のペプチドの全て、もしくは表１９に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｅ）表９に記載のペプチドの全て、もしくは表９に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｆ）表７に記載のペプチドの全て、もしくは表７に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｇ）表１３に記載のペプチドの全て、もしくは表１３に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｈ）表１５に記載のペプチドの全て、もしくは表１５に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｉ）表１７に記載のペプチドの全て、もしくは表１７に記載のペプチドの全てをコードする核酸；または
（ｊ）表２１に記載のペプチドの全て、もしくは表２１に記載のペプチドの全てをコードする核酸
を含む、請求項１８に記載の医薬組成物。
【請求項２０】
請求項１〜９のいずれか一項に記載の単離されたペプチドのいずれか１つをコードする、または前記単離されたペプチドのうち２つまたはそれより多くをコードする核酸を含む組換え細菌株。
【請求項２１】
前記２つまたはそれより多くのペプチドが、
（ａ）表３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｂ）表５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｃ）表１１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｄ）表１９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｅ）表９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｆ）表７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｇ）表１３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｈ）表１５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｉ）表１７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；あるいは
（ｊ）表２１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表２１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸
を含む、請求項２０に記載の組換え細菌株。
【請求項２２】
前記２つまたはそれより多くのペプチドが、
（ａ）表３に記載のペプチドの全て、もしくは表３に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｂ）表５に記載のペプチドの全て、もしくは表５に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｃ）表１１に記載のペプチドの全て、もしくは表１１に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｄ）表１９に記載のペプチドの全て、もしくは表１９に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｅ）表９に記載のペプチドの全て、もしくは表９に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｆ）表７に記載のペプチドの全て、もしくは表７に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｇ）表１３に記載のペプチドの全て、もしくは表１３に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｈ）表１５に記載のペプチドの全て、もしくは表１５に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｉ）表１７に記載のペプチドの全て、もしくは表１７に記載のペプチドの全てをコードする核酸；または
（ｊ）表２１に記載のペプチドの全て、もしくは表２１に記載のペプチドの全てをコードする核酸
を含む、請求項２１に記載の組換え細菌株。
【請求項２３】
２つまたはそれより多くのペプチドの組合せが、次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２の各々に結合する、請求項２０〜２２のいずれか一項に記載の組換え細菌株。
【請求項２４】
Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ、Ｌｉｓｔｅｒｉａ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ、ＳｈｉｇｅｌｌａまたはＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ株である、請求項２０〜２３のいずれか一項に記載の組換え細菌株。
【請求項２５】
Ｌｉｓｔｅｒｉａ株であり、必要に応じて、前記Ｌｉｓｔｅｒｉａ株が、Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ株である、請求項２４に記載の組換え細菌株。
【請求項２６】
融合ポリペプチドをコードする第１のオープンリーディングフレームを含む核酸を含む組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株であって、前記融合ポリペプチドが、がん関連タンパク質の免疫原性断片に融合されたＰＥＳＴ含有ペプチドを含み、前記断片が、ヘテロクリティック突然変異を含む、組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項２７】
前記ヘテロクリティック突然変異が、アンカー位置における好ましいアミノ酸への突然変異である、請求項２６に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項２８】
前記断片が、長さ約７アミノ酸〜約１１アミノ酸の間、長さ約８アミノ酸〜約１０アミノ酸の間、または長さ約９アミノ酸である、請求項２６または２７に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項２９】
前記がん関連タンパク質が、がん精巣抗原または癌胎児性抗原である、請求項２６〜２８のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３０】
前記がん関連タンパク質が、次のヒト遺伝子：ＲＮＦ４３、ＳＴＥＡＰ１、ＣＥＡＣＡＭ５、ＧＡＧＥ１、ＴＥＲＴ、ＫＬＨＬ７、ＭＡＧＥＡ３、ＭＡＧＥＡ４、ＭＡＧＥＡ６、ＮＵＦ２、ＮＹＥＳＯ１、ＰＡＧＥ４、ＰＲＡＭＥ、ＰＳＡ、ＰＳＭＡ、ＳＡＲＴ３、ＳＳＸ２およびＳＵＲＶＩＶＩＮのうち１つによってコードされる、請求項２６〜２９のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３１】
（ａ）前記がん関連タンパク質が、ＲＮＦ４３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４６を含む；
（ｂ）前記がん関連タンパク質が、ＳＴＥＡＰ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１５２および１５４のいずれか１つを含む；
（ｃ）前記がん関連タンパク質が、ＣＥＡＣＡＭ５によってコードされ、前記断片が、配列番号１００、１０２、１０４、１０６および１０８のいずれか１つを含む；
（ｄ）前記がん関連タンパク質が、ＧＡＧＥ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１１０および１１２のいずれか１つを含む；
（ｅ）前記がん関連タンパク質が、ＴＥＲＴによってコードされ、前記断片が、配列番号１１４を含む；
（ｆ）前記がん関連タンパク質が、ＫＬＨＬ７によってコードされ、前記断片が、配列番号１１６を含む；
（ｇ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１１８、１２０、１２２および１２４のいずれか１つを含む；
（ｈ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１２６を含む；
（ｉ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ６によってコードされ、前記断片が、配列番号１２８を含む；
（ｊ）前記がん関連タンパク質が、ＮＵＦ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１３０および１３２のいずれか１つを含む；
（ｋ）前記がん関連タンパク質が、ＮＹＥＳＯ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１３４および１３６のいずれか１つを含む；
（ｌ）前記がん関連タンパク質が、ＰＡＧＥ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１３８を含む；
（ｍ）前記がん関連タンパク質が、ＰＲＡＭＥによってコードされ、前記断片が、配列番号１４０を含む；
（ｎ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４２を含む；
（ｏ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＭＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４４を含む；
（ｐ）前記がん関連タンパク質が、ＳＡＲＴ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４８を含む；
（ｑ）前記がん関連タンパク質が、ＳＳＸ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１５０を含む；または
（ｒ）前記がん関連タンパク質が、ＳＵＲＶＩＶＩＮによってコードされ、前記断片が、配列番号１５６および１５８のいずれか１つを含む、
請求項３０に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３２】
（ａ）前記がん関連タンパク質が、ＲＮＦ４３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４６からなる；
（ｂ）前記がん関連タンパク質が、ＳＴＥＡＰ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１５２および１５４のいずれか１つからなる；
（ｃ）前記がん関連タンパク質が、ＣＥＡＣＡＭ５によってコードされ、前記断片が、配列番号１００、１０２、１０４、１０６および１０８のいずれか１つからなる；
（ｄ）前記がん関連タンパク質が、ＧＡＧＥ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１１０および１１２のいずれか１つからなる；
（ｅ）前記がん関連タンパク質が、ＴＥＲＴによってコードされ、前記断片が、配列番号１１４からなる；
（ｆ）前記がん関連タンパク質が、ＫＬＨＬ７によってコードされ、前記断片が、配列番号１１６からなる；
（ｇ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１１８、１２０、１２２および１２４のいずれか１つからなる；
（ｈ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１２６からなる；
（ｉ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ６によってコードされ、前記断片が、配列番号１２８からなる；
（ｊ）前記がん関連タンパク質が、ＮＵＦ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１３０および１３２のいずれか１つからなる；
（ｋ）前記がん関連タンパク質が、ＮＹＥＳＯ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１３４および１３６のいずれか１つからなる；
（ｌ）前記がん関連タンパク質が、ＰＡＧＥ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１３８からなる；
（ｍ）前記がん関連タンパク質が、ＰＲＡＭＥによってコードされ、前記断片が、配列番号１４０からなる；
（ｎ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４２からなる；
（ｏ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＭＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４４からなる；
（ｐ）前記がん関連タンパク質が、ＳＡＲＴ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４８からなる；
（ｑ）前記がん関連タンパク質が、ＳＳＸ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１５０からなる；または
（ｒ）前記がん関連タンパク質が、ＳＵＲＶＩＶＩＮによってコードされ、前記断片が、配列番号１５６および１５８のいずれか１つからなる、
請求項３１に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３３】
前記断片が、次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２のうち１つまたは複数に結合する、請求項２６〜３２のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３４】
前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、細菌分泌シグナル配列を含み、前記融合ポリペプチドが、前記断片に融合されたユビキチンタンパク質をさらに含み、前記ＰＥＳＴ含有ペプチド、前記ユビキチンおよびカルボキシ末端抗原性ペプチドが、前記融合ポリペプチドのアミノ末端からカルボキシ末端へ直列に配列されている、請求項２６〜３３のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３５】
前記融合ポリペプチドが、がん関連タンパク質の２つまたはそれより多くの免疫原性断片に融合された前記ＰＥＳＴ含有ペプチドを含み、前記２つまたはそれより多くの断片の各々が、ヘテロクリティック突然変異を含む、請求項２６〜３４のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３６】
前記２つまたはそれより多くの免疫原性断片が、介在配列なしで互いに直接融合されているか、またはペプチドリンカーを介して互いに連結されており、必要に応じて、配列番号２０９〜２１７に記載のリンカーのうち１つまたは複数が、前記２つまたはそれより多くの免疫原性断片を連結させるために使用されている、請求項３５に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３７】
前記融合ポリペプチド中の２つまたはそれより多くの免疫原性断片の組合せが、次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２の各々に結合する、請求項３５または３６に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３８】
前記２つまたはそれより多くの免疫原性断片が、
（ａ）表３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｂ）表５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｃ）表１１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｄ）表１９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｅ）表９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｆ）表７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｇ）表１３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｈ）表１５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｉ）表１７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；または
（ｊ）表２１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く
を含む、請求項３５〜３７のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３９】
前記２つまたはそれより多くの免疫原性断片が、
（ａ）表３に記載のペプチドの全て；
（ｂ）表５に記載のペプチドの全て；
（ｃ）表１１に記載のペプチドの全て；
（ｄ）表１９に記載のペプチドの全て；
（ｅ）表９に記載のペプチドの全て；
（ｆ）表７に記載のペプチドの全て；
（ｇ）表１３に記載のペプチドの全て；
（ｈ）表１５に記載のペプチドの全て；
（ｉ）表１７に記載のペプチドの全て；または
（ｊ）表２１に記載のペプチドの全て
を含む、請求項３８に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項４０】
前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、前記融合ポリペプチドのＮ末端にある、請求項２６〜３９のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項４１】
前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、ＬＬＯのＮ末端断片である、必要に応じて、ＬＬＯの前記Ｎ末端断片が、配列番号５９に記載の配列を有する、請求項４０に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項４２】
前記核酸が、エピソームプラスミドにある、請求項２６〜４１のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項４３】
前記核酸が、前記組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株に抗生物質耐性を付与しない、請求項２６〜４２のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項４４】
弱毒化栄養要求性Ｌｉｓｔｅｒｉａ株であり、前記弱毒化栄養要求性Ｌｉｓｔｅｒｉａ株が、１つまたは複数の内在性遺伝子を不活性化する、前記１つまたは複数の内在性遺伝子中の突然変異を含み、前記１つまたは複数の内在性遺伝子が、ａｃｔＡ、ｄａｌおよびｄａｔを含む、請求項２６〜４３のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項４５】
前記核酸が、代謝酵素をコードする第２のオープンリーディングフレームを含み、前記代謝酵素が、アラニンラセマーゼ酵素またはＤ−アミノ酸アミノトランスフェラーゼ酵素である、請求項２６〜４４のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項４６】
前記融合ポリペプチドが、ｈｌｙプロモーターから発現される、請求項２６〜４５のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項４７】
組換えＬｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ株である、請求項２６〜４６のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項４８】
前記組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株が、ａｃｔＡ、ｄａｌおよびｄａｔの欠失またはａｃｔＡ、ｄａｌおよびｄａｔ中の不活性化突然変異を含む弱毒化Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ株であり、前記核酸が、エピソームプラスミドにあり、アラニンラセマーゼ酵素またはＤ−アミノ酸アミノトランスフェラーゼ酵素をコードする第２のオープンリーディングフレームを含み、前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、ＬＬＯのＮ末端断片である、請求項２６〜４７のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項４９】
（ａ）請求項２０〜２５のいずれか一項に記載の組換え細菌株または請求項２６〜４８のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株；および
（ｂ）アジュバント
を含む免疫原性組成物であって、必要に応じて、前記アジュバントが、無毒化リステリオリジンＯ（ｄｔＬＬＯ）、顆粒細胞／マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）タンパク質、ＧＭ−ＣＳＦタンパク質をコードするヌクレオチド分子、サポニンＱＳ２１、モノホスホリルリピドＡまたは非メチル化ＣｐＧ含有オリゴヌクレオチドを含む、免疫原性組成物。
【請求項５０】
対象における腫瘍またはがんに対する免疫応答を誘導または増強するあるいは前記対象における前記腫瘍またはがんを予防または処置する方法における使用のための、請求項１〜９のいずれか一項に記載の単離されたペプチド、請求項１０〜１５のいずれか一項に記載の核酸、請求項１６〜１９のいずれか一項に記載の医薬組成物、請求項２０〜２５のいずれか一項に記載の組換え細菌株、請求項２６〜４８のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株または請求項４９に記載の免疫原性組成物であって、前記方法は、前記対象に前記単離されたペプチド、前記核酸、前記医薬組成物、前記組換え細菌株、前記組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株または前記免疫原性組成物を投与するステップを含み、
必要に応じて、前記がんは、非小細胞肺がん、前立腺がん、膵臓がん、膀胱がん、乳がん、子宮がん、卵巣がん、低悪性度神経膠腫、結腸直腸がんまたは頭頸部がんである、
単離されたペプチド、核酸、医薬組成物、組換え細菌株、組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株または免疫原性組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００８】
別の態様では、そのような組換え細菌または組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株のうち１つまたは複数を含むセルバンクが、本明細書で提供される。
本発明の実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
（項目１）
がん関連タンパク質の免疫原性断片を含む単離されたペプチドであって、前記断片が、ヘテロクリティック突然変異を含む、単離されたペプチド。
（項目２）
前記ヘテロクリティック突然変異が、アンカー位置における好ましいアミノ酸への突然変異である、項目１に記載の単離されたペプチド。
（項目３）
前記断片が、長さ約７アミノ酸〜約１１アミノ酸の間、長さ約８アミノ酸〜約１０アミノ酸の間、または長さ約９アミノ酸である、項目１または２に記載の単離されたペプチド。
（項目４）
前記がん関連タンパク質が、がん精巣抗原または癌胎児性抗原である、前記いずれかの項目に記載の単離されたペプチド。
（項目５）
前記がん関連タンパク質が、次のヒト遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＧＡＧＥ１、ＴＥＲＴ、ＫＬＨＬ７、ＭＡＧＥＡ３、ＭＡＧＥＡ４、ＭＡＧＥＡ６、ＮＵＦ２、ＮＹＥＳＯ１、ＰＡＧＥ４、ＰＲＡＭＥ、ＰＳＡ、ＰＳＭＡ、ＲＮＦ４３、ＳＡＲＴ３、ＳＳＸ２、ＳＴＥＡＰ１およびＳＵＲＶＩＶＩＮのうち１つによってコードされる、前記いずれかの項目に記載の単離されたペプチド。
（項目６）
（ａ）前記がん関連タンパク質が、ＣＥＡＣＡＭ５によってコードされ、前記断片が、配列番号１００、１０２、１０４、１０６および１０８のいずれか１つを含む；
（ｂ）前記がん関連タンパク質が、ＧＡＧＥ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１１０および１１２のいずれか１つを含む；
（ｃ）前記がん関連タンパク質が、ＴＥＲＴによってコードされ、前記断片が、配列番号１１４を含む；
（ｄ）前記がん関連タンパク質が、ＫＬＨＬ７によってコードされ、前記断片が、配列番号１１６を含む；
（ｅ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１１８、１２０、１２２および１２４のいずれか１つを含む；
（ｆ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１２６を含む；
（ｇ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ６によってコードされ、前記断片が、配列番号１２８を含む；
（ｈ）前記がん関連タンパク質が、ＮＵＦ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１３０および１３２のいずれか１つを含む；
（ｉ）前記がん関連タンパク質が、ＮＹＥＳＯ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１３４および１３６のいずれか１つを含む；
（ｊ）前記がん関連タンパク質が、ＰＡＧＥ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１３８を含む；
（ｋ）前記がん関連タンパク質が、ＰＲＡＭＥによってコードされ、前記断片が、配列番号１４０を含む；
（ｌ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４２を含む；
（ｍ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＭＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４４を含む；
（ｎ）前記がん関連タンパク質が、ＲＮＦ４３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４６を含む；
（ｏ）前記がん関連タンパク質が、ＳＡＲＴ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４８を含む；
（ｐ）前記がん関連タンパク質が、ＳＳＸ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１５０を含む；
（ｑ）前記がん関連タンパク質が、ＳＴＥＡＰ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１５２および１５４のいずれか１つを含む；または
（ｒ）前記がん関連タンパク質が、ＳＵＲＶＩＶＩＮによってコードされ、前記断片が、配列番号１５６および１５８のいずれか１つを含む、
項目５に記載の単離されたペプチド。
（項目７）
（ａ）前記がん関連タンパク質が、ＣＥＡＣＡＭ５によってコードされ、前記断片が、配列番号１００、１０２、１０４、１０６および１０８のいずれか１つからなる；
（ｂ）前記がん関連タンパク質が、ＧＡＧＥ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１１０および１１２のいずれか１つからなる；
（ｃ）前記がん関連タンパク質が、ＴＥＲＴによってコードされ、前記断片が、配列番号１１４からなる；
（ｄ）前記がん関連タンパク質が、ＫＬＨＬ７によってコードされ、前記断片が、配列番号１１６からなる；
（ｅ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１１８、１２０、１２２および１２４のいずれか１つからなる；
（ｆ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１２６からなる；
（ｇ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ６によってコードされ、前記断片が、配列番号１２８からなる；
（ｈ）前記がん関連タンパク質が、ＮＵＦ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１３０および１３２のいずれか１つからなる；
（ｉ）前記がん関連タンパク質が、ＮＹＥＳＯ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１３４および１３６のいずれか１つからなる；
（ｊ）前記がん関連タンパク質が、ＰＡＧＥ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１３８からなる；
（ｋ）前記がん関連タンパク質が、ＰＲＡＭＥによってコードされ、前記断片が、配列番号１４０からなる；
（ｌ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４２からなる；
（ｍ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＭＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４４からなる；
（ｎ）前記がん関連タンパク質が、ＲＮＦ４３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４６からなる；
（ｏ）前記がん関連タンパク質が、ＳＡＲＴ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４８からなる；
（ｐ）前記がん関連タンパク質が、ＳＳＸ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１５０からなる；
（ｑ）前記がん関連タンパク質が、ＳＴＥＡＰ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１５２および１５４のいずれか１つからなる；または
（ｒ）前記がん関連タンパク質が、ＳＵＲＶＩＶＩＮによってコードされ、前記断片が、配列番号１５６および１５８のいずれか１つからなる、
項目６に記載の単離されたペプチド。
（項目８）
（ａ）前記がん関連タンパク質が、ＣＥＡＣＡＭ５によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１００、１０２、１０４、１０６および１０８のいずれか１つからなる；
（ｂ）前記がん関連タンパク質が、ＧＡＧＥ１によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１１０および１１２のいずれか１つからなる；
（ｃ）前記がん関連タンパク質が、ＴＥＲＴによってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１１４からなる；
（ｄ）前記がん関連タンパク質が、ＫＬＨＬ７によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１１６からなる；
（ｅ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ３によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１１８、１２０、１２２および１２４のいずれか１つからなる；
（ｆ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ４によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１２６からなる；
（ｇ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ６によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１２８からなる；
（ｈ）前記がん関連タンパク質が、ＮＵＦ２によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１３０および１３２のいずれか１つからなる；
（ｉ）前記がん関連タンパク質が、ＮＹＥＳＯ１によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１３４および１３６のいずれか１つからなる；
（ｊ）前記がん関連タンパク質が、ＰＡＧＥ４によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１３８からなる；
（ｋ）前記がん関連タンパク質が、ＰＲＡＭＥによってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１４０からなる；
（ｌ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＡによってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１４２からなる；
（ｍ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＭＡによってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１４４からなる；
（ｎ）前記がん関連タンパク質が、ＲＮＦ４３によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１４６からなる；
（ｏ）前記がん関連タンパク質が、ＳＡＲＴ３によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１４８からなる；
（ｐ）前記がん関連タンパク質が、ＳＳＸ２によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１５０からなる；
（ｑ）前記がん関連タンパク質が、ＳＴＥＡＰ１によってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１５２および１５４のいずれか１つからなる；または
（ｒ）前記がん関連タンパク質が、ＳＵＲＶＩＶＩＮによってコードされ、前記単離されたペプチドが、配列番号１５６および１５８のいずれか１つからなる、
項目７に記載の単離されたペプチド。
（項目９）
前記断片が、次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２のうち１つまたは複数に結合する、前記いずれかの項目に記載の単離されたペプチド。
（項目１０）
前記いずれかの項目に記載の単離されたペプチドをコードする核酸。
（項目１１）
ヒトにおける発現のためにコドン最適化されている、項目１０に記載の核酸。
（項目１２）
Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓにおける発現のためにコドン最適化されている、項目１０に記載の核酸。
（項目１３）
ＤＮＡを含む、項目１０〜１２のいずれか一項に記載の核酸。
（項目１４）
ＲＮＡを含む、項目１０〜１２のいずれか一項に記載の核酸。
（項目１５）
配列番号２２３〜９７７、および同じアミノ酸配列をコードするそれらの縮重バリアントのいずれか１つから選択される配列を含む、項目１０〜１４のいずれか一項に記載の核酸。
（項目１６）
配列番号２２３〜９７７、および同じアミノ酸配列をコードするそれらの縮重バリアントのいずれか１つから選択される配列からなる、項目１５に記載の核酸。
（項目１７）
（ａ）項目１〜９のいずれか一項に記載の１つもしくは複数の単離されたペプチドまたは項目１０〜１６のいずれか一項に記載の１つもしくは複数の核酸；および
（ｂ）アジュバント
を含む医薬組成物。
（項目１８）
前記アジュバントが、無毒化リステリオリジンＯ（ｄｔＬＬＯ）、顆粒細胞／マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）タンパク質、ＧＭ−ＣＳＦタンパク質をコードするヌクレオチド分子、サポニンＱＳ２１、モノホスホリルリピドＡ、非メチル化ＣｐＧ含有オリゴヌクレオチドまたはＭｏｎｔａｎｉｄｅ  ＩＳＡ  ５１を含む、項目１７に記載の医薬組成物。
（項目１９）
次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２の各々に結合するペプチドまたは前記ペプチドをコードする核酸を含む、項目１７または１８に記載の医薬組成物。
（項目２０）
（ａ）表３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｂ）表５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｃ）表７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｄ）表９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｅ）表１１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｆ）表１３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｇ）表１５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｈ）表１７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｉ）表１９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；あるいは
（ｊ）表２１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表２１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸
を含む、項目１７〜１９のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目２１）
（ａ）表３に記載のペプチドの全て、もしくは表３に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｂ）表５に記載のペプチドの全て、もしくは表５に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｃ）表７に記載のペプチドの全て、もしくは表７に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｄ）表９に記載のペプチドの全て、もしくは表９に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｅ）表１１に記載のペプチドの全て、もしくは表１１に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｆ）表１３に記載のペプチドの全て、もしくは表１３に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｇ）表１５に記載のペプチドの全て、もしくは表１５に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｈ）表１７に記載のペプチドの全て、もしくは表１７に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｉ）表１９に記載のペプチドの全て、もしくは表１９に記載のペプチドの全てをコードする核酸；または
（ｊ）表２１に記載のペプチドの全て、もしくは表２１に記載のペプチドの全てをコードする核酸
を含む、項目２０に記載の医薬組成物。
（項目２２）
項目１〜９に記載の単離されたペプチドのいずれか１つをコードする核酸を含む組換え細菌株。
（項目２３）
項目１〜９に記載の単離されたペプチドのうち２つまたはそれより多くをコードする１つまたは複数の核酸を含む組換え細菌株。
（項目２４）
前記２つまたはそれより多くのペプチドが、
（ａ）表３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｂ）表５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｃ）表７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｄ）表９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｅ）表１１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｆ）表１３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｇ）表１５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｈ）表１７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；
（ｉ）表１９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表１９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸；あるいは
（ｊ）表２１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く、または表２１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多くをコードする核酸
を含む、項目２３に記載の組換え細菌株。
（項目２５）
前記２つまたはそれより多くのペプチドが、
（ａ）表３に記載のペプチドの全て、もしくは表３に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｂ）表５に記載のペプチドの全て、もしくは表５に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｃ）表７に記載のペプチドの全て、もしくは表７に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｄ）表９に記載のペプチドの全て、もしくは表９に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｅ）表１１に記載のペプチドの全て、もしくは表１１に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｆ）表１３に記載のペプチドの全て、もしくは表１３に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｇ）表１５に記載のペプチドの全て、もしくは表１５に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｈ）表１７に記載のペプチドの全て、もしくは表１７に記載のペプチドの全てをコードする核酸；
（ｉ）表１９に記載のペプチドの全て、もしくは表１９に記載のペプチドの全てをコードする核酸；または
（ｊ）表２１に記載のペプチドの全て、もしくは表２１に記載のペプチドの全てをコードする核酸
を含む、項目２４に記載の組換え細菌株。
（項目２６）
２つまたはそれより多くのペプチドの組合せが、次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２の各々に結合する、項目２３〜２５のいずれか一項に記載の組換え細菌株。
（項目２７）
Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ、Ｌｉｓｔｅｒｉａ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ、ＳｈｉｇｅｌｌａまたはＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ株である、項目２２〜２６のいずれか一項に記載の組換え細菌株。
（項目２８）
Ｌｉｓｔｅｒｉａ株であり、必要に応じて、前記Ｌｉｓｔｅｒｉａ株が、Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ株である、項目２７に記載の組換え細菌株。
（項目２９）
融合ポリペプチドをコードする第１のオープンリーディングフレームを含む核酸を含む組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株であって、前記融合ポリペプチドが、がん関連タンパク質の免疫原性断片に融合されたＰＥＳＴ含有ペプチドを含み、前記断片が、ヘテロクリティック突然変異を含む、組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３０）
前記ヘテロクリティック突然変異が、アンカー位置における好ましいアミノ酸への突然変異である、項目２９に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３１）
前記断片が、長さ約７アミノ酸〜約１１アミノ酸の間、長さ約８アミノ酸〜約１０アミノ酸の間、または長さ約９アミノ酸である、項目２９または３０に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３２）
前記がん関連タンパク質が、がん精巣抗原または癌胎児性抗原である、項目２９〜３１のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３３）
前記がん関連タンパク質が、次のヒト遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＧＡＧＥ１、ＴＥＲＴ、ＫＬＨＬ７、ＭＡＧＥＡ３、ＭＡＧＥＡ４、ＭＡＧＥＡ６、ＮＵＦ２、ＮＹＥＳＯ１、ＰＡＧＥ４、ＰＲＡＭＥ、ＰＳＡ、ＰＳＭＡ、ＲＮＦ４３、ＳＡＲＴ３、ＳＳＸ２、ＳＴＥＡＰ１およびＳＵＲＶＩＶＩＮのうち１つによってコードされる、項目２９〜３２のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３４）
（ａ）前記がん関連タンパク質が、ＣＥＡＣＡＭ５によってコードされ、前記断片が、配列番号１００、１０２、１０４、１０６および１０８のいずれか１つを含む；
（ｂ）前記がん関連タンパク質が、ＧＡＧＥ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１１０および１１２のいずれか１つを含む；
（ｃ）前記がん関連タンパク質が、ＴＥＲＴによってコードされ、前記断片が、配列番号１１４を含む；
（ｄ）前記がん関連タンパク質が、ＫＬＨＬ７によってコードされ、前記断片が、配列番号１１６を含む；
（ｅ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１１８、１２０、１２２および１２４のいずれか１つを含む；
（ｆ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１２６を含む；
（ｇ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ６によってコードされ、前記断片が、配列番号１２８を含む；
（ｈ）前記がん関連タンパク質が、ＮＵＦ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１３０および１３２のいずれか１つを含む；
（ｉ）前記がん関連タンパク質が、ＮＹＥＳＯ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１３４および１３６のいずれか１つを含む；
（ｊ）前記がん関連タンパク質が、ＰＡＧＥ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１３８を含む；
（ｋ）前記がん関連タンパク質が、ＰＲＡＭＥによってコードされ、前記断片が、配列番号１４０を含む；
（ｌ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４２を含む；
（ｍ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＭＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４４を含む；
（ｎ）前記がん関連タンパク質が、ＲＮＦ４３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４６を含む；
（ｏ）前記がん関連タンパク質が、ＳＡＲＴ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４８を含む；
（ｐ）前記がん関連タンパク質が、ＳＳＸ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１５０を含む；
（ｑ）前記がん関連タンパク質が、ＳＴＥＡＰ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１５２および１５４のいずれか１つを含む；または
（ｒ）前記がん関連タンパク質が、ＳＵＲＶＩＶＩＮによってコードされ、前記断片が、配列番号１５６および１５８のいずれか１つを含む、
項目３３に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３５）
（ａ）前記がん関連タンパク質が、ＣＥＡＣＡＭ５によってコードされ、前記断片が、配列番号１００、１０２、１０４、１０６および１０８のいずれか１つからなる；
（ｂ）前記がん関連タンパク質が、ＧＡＧＥ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１１０および１１２のいずれか１つからなる；
（ｃ）前記がん関連タンパク質が、ＴＥＲＴによってコードされ、前記断片が、配列番号１１４からなる；
（ｄ）前記がん関連タンパク質が、ＫＬＨＬ７によってコードされ、前記断片が、配列番号１１６からなる；
（ｅ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１１８、１２０、１２２および１２４のいずれか１つからなる；
（ｆ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１２６からなる；
（ｇ）前記がん関連タンパク質が、ＭＡＧＥＡ６によってコードされ、前記断片が、配列番号１２８からなる；
（ｈ）前記がん関連タンパク質が、ＮＵＦ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１３０および１３２のいずれか１つからなる；
（ｉ）前記がん関連タンパク質が、ＮＹＥＳＯ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１３４および１３６のいずれか１つからなる；
（ｊ）前記がん関連タンパク質が、ＰＡＧＥ４によってコードされ、前記断片が、配列番号１３８からなる；
（ｋ）前記がん関連タンパク質が、ＰＲＡＭＥによってコードされ、前記断片が、配列番号１４０からなる；
（ｌ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４２からなる；
（ｍ）前記がん関連タンパク質が、ＰＳＭＡによってコードされ、前記断片が、配列番号１４４からなる；
（ｎ）前記がん関連タンパク質が、ＲＮＦ４３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４６からなる；
（ｏ）前記がん関連タンパク質が、ＳＡＲＴ３によってコードされ、前記断片が、配列番号１４８からなる；
（ｐ）前記がん関連タンパク質が、ＳＳＸ２によってコードされ、前記断片が、配列番号１５０からなる；
（ｑ）前記がん関連タンパク質が、ＳＴＥＡＰ１によってコードされ、前記断片が、配列番号１５２および１５４のいずれか１つからなる；または
（ｒ）前記がん関連タンパク質が、ＳＵＲＶＩＶＩＮによってコードされ、前記断片が、配列番号１５６および１５８のいずれか１つからなる、
項目３４に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３６）
前記断片が、次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２のうち１つまたは複数に結合する、項目２９〜３５のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３７）
前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、細菌分泌シグナル配列を含み、前記融合ポリペプチドが、前記断片に融合されたユビキチンタンパク質をさらに含み、前記ＰＥＳＴ含有ペプチド、前記ユビキチンおよびカルボキシ末端抗原性ペプチドが、前記融合ポリペプチドのアミノ末端からカルボキシ末端へ直列に配列されている、項目２９〜３６のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３８）
前記融合ポリペプチドが、がん関連タンパク質の２つまたはそれより多くの免疫原性断片に融合された前記ＰＥＳＴ含有ペプチドを含み、前記２つまたはそれより多くの断片の各々が、ヘテロクリティック突然変異を含む、項目２９〜３７のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３９）
前記２つまたはそれより多くの免疫原性断片が、介在配列なしで互いに直接融合されている、項目３８に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４０）
前記２つまたはそれより多くの免疫原性断片が、ペプチドリンカーを介して互いに連結されている、項目３８に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４１）
配列番号２０９〜２１７に記載のリンカーのうち１つまたは複数が、前記２つまたはそれより多くの免疫原性断片を連結させるために使用されている、項目４０に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４２）
前記融合ポリペプチド中の２つまたはそれより多くの免疫原性断片の組合せが、次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２の各々に結合する、項目３８〜４１のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４３）
前記２つまたはそれより多くの免疫原性断片が、
（ａ）表３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｂ）表５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｃ）表７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｄ）表９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｅ）表１１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｆ）表１３に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｇ）表１５に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｈ）表１７に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；
（ｉ）表１９に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く；または
（ｊ）表２１に記載のペプチドのうち２つもしくはそれより多く
を含む、項目３８〜４２のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４４）
前記２つまたはそれより多くの免疫原性断片が、
（ａ）表３に記載のペプチドの全て；
（ｂ）表５に記載のペプチドの全て；
（ｃ）表７に記載のペプチドの全て；
（ｄ）表９に記載のペプチドの全て；
（ｅ）表１１に記載のペプチドの全て；
（ｆ）表１３に記載のペプチドの全て；
（ｇ）表１５に記載のペプチドの全て；
（ｈ）表１７に記載のペプチドの全て；
（ｉ）表１９に記載のペプチドの全て；または
（ｊ）表２１に記載のペプチドの全て
を含む、項目４３に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４５）
前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、前記融合ポリペプチドのＮ末端にある、項目２９〜４４のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４６）
前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、ＬＬＯのＮ末端断片である、項目４５に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４７）
ＬＬＯの前記Ｎ末端断片が、配列番号５９に記載の配列を有する、項目４６に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４８）
前記核酸が、エピソームプラスミドにある、項目２９〜４７のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４９）
前記核酸が、前記組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株に抗生物質耐性を付与しない、項目２９〜４８のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５０）
弱毒化栄養要求性Ｌｉｓｔｅｒｉａ株である、項目２９〜４９のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５１）
前記弱毒化栄養要求性Ｌｉｓｔｅｒｉａ株が、１つまたは複数の内在性遺伝子を不活性化する、前記１つまたは複数の内在性遺伝子中の突然変異を含む、項目５０に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５２）
前記１つまたは複数の内在性遺伝子が、ａｃｔＡ、ｄａｌおよびｄａｔを含む、項目５１に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５３）
前記核酸が、代謝酵素をコードする第２のオープンリーディングフレームを含む、項目２９〜５２のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５４）
前記代謝酵素が、アラニンラセマーゼ酵素またはＤ−アミノ酸アミノトランスフェラーゼ酵素である、項目５３に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５５）
前記融合ポリペプチドが、ｈｌｙプロモーターから発現される、項目２９〜５４のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５６）
組換えＬｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ株である、項目２９〜５５のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５７）
前記組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株が、ａｃｔＡ、ｄａｌおよびｄａｔの欠失またはａｃｔＡ、ｄａｌおよびｄａｔ中の不活性化突然変異を含む弱毒化Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ株であり、前記核酸が、エピソームプラスミドにあり、アラニンラセマーゼ酵素またはＤ−アミノ酸アミノトランスフェラーゼ酵素をコードする第２のオープンリーディングフレームを含み、前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、ＬＬＯのＮ末端断片である、項目２９〜５６のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５８）
（ａ）項目２２〜２８のいずれか一項に記載の組換え細菌株または項目２９〜５７のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株；および
（ｂ）アジュバント
を含む免疫原性組成物。
（項目５９）
前記アジュバントが、無毒化リステリオリジンＯ（ｄｔＬＬＯ）、顆粒細胞／マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）タンパク質、ＧＭ−ＣＳＦタンパク質をコードするヌクレオチド分子、サポニンＱＳ２１、モノホスホリルリピドＡまたは非メチル化ＣｐＧ含有オリゴヌクレオチドを含む、項目５８に記載の免疫原性組成物。
（項目６０）
対象における腫瘍またはがんに対する免疫応答を誘導または増強する方法であって、項目１〜９のいずれか一項に記載の単離されたペプチド、項目１０〜１６のいずれか一項に記載の核酸、項目１７〜２１のいずれか一項に記載の医薬組成物、項目２２〜２８のいずれか一項に記載の組換え細菌株、項目２９〜５７のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株または項目５８〜５９のいずれか一項に記載の免疫原性組成物を前記対象に投与するステップを含む、方法。
（項目６１）
対象における腫瘍またはがんを予防または処置する方法であって、項目１〜９のいずれか一項に記載の単離されたペプチド、項目１０〜１６のいずれか一項に記載の核酸、項目１７〜２１のいずれか一項に記載の医薬組成物、項目２２〜２８のいずれか一項に記載の組換え細菌株、項目２９〜５７のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株または項目５８〜５９のいずれか一項に記載の免疫原性組成物を前記対象に投与するステップを含む、方法。
（項目６２）
前記がんが、非小細胞肺がん、前立腺がん、膵臓がん、膀胱がん、乳がん、子宮がん、卵巣がん、低悪性度神経膠腫、結腸直腸がんまたは頭頸部がんである、項目６０または６１に記載の方法。