【手続補正書】
【提出日】令和2年12月15日(2020.12.15)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２５２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２５２】
(実施例13.他の例示的で非限定的な実施態様)
特許請求された主題のさらなる利点は、特許請求された主題の特定の実施態様を記載している以下の例から明白である。
1.タンパク質プロファイルを作成する方法であって:
a.)血液試料を採取すること;
b.)該血液試料由来の赤血球成分を採取すること;
c.)該赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルを測定すること;
d.)該赤血球成分を1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させること;
e.)該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させた赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルを測定すること;並びに
f.)該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させる前及び接触させた後の赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化を決定することを含み、
ここで、作成されたタンパク質プロファイルが、該赤血球成分を該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させる前及び接触させた後にレベルの変化を有する1種以上のタンパク質を含む、方法。
2.タンパク質プロファイルを作成する方法であって:
a.)血液試料又は血液試料由来の赤血球成分を採取すること;
b.)該血液試料又は該赤血球成分由来の第一の部分及び第二の部分を採取すること;
c.)該血液試料又は該赤血球成分由来の第二の部分を1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させること;
d.)該血液試料又は該赤血球成分の第一の部分及び第二の部分由来の1種以上のタンパク質のレベルを測定すること(ここで、該第一の部分は該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させていない);並びに
e.)該血液試料又は該赤血球成分の第一の部分及び該血液試料又は該赤血球成分の第二の部分由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化を決定すること
を含み、
ここで、作成されたタンパク質プロファイルが、該血液試料又は該赤血球成分の第一の部分及び該血液試料又は該赤血球成分の第二の部分由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化を有する1種以上のタンパク質を含む、方法。
3.血液試料と赤血球成分の両方が採取される、例2記載の方法。
4.タンパク質プロファイルを作成する方法であって:
a.)疾患又は障害を有さない対象に由来する血液試料を採取すること;
b.)該血液試料由来の赤血球成分を採取すること;
c.)該赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルを測定すること;
d.)該赤血球成分を1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させること;
e.)該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させた赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルを測定すること;並びに
f.)該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させる前及び接触させた後の赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化を決定すること
を含み、
ここで、作成されたタンパク質プロファイルが、該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させる前及び接触させた後の該赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化を含む、方法。
5.疾患タンパク質プロファイルを作成する方法であって:
a.)疾患又は障害を有する対象から、例1〜3の1つ又は複数に従って作成される第一のタンパク質プロファイルを得ること;
b.)該疾患又は障害を有さない対象から、例4に従って作成される第二のタンパク質プロファイルを得ること(ここで、該第二のタンパク質プロファイルは、該第一のタンパク質プロファイルが得られた同じ赤血球成分から得られる);及び
c.)該疾患又は障害を有する対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化と該疾患又は障害を有さない対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化の差を比較すること
を含み、
ここで、作成される疾患タンパク質プロファイルが、該疾患又は障害を有する対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化と該疾患又は障害を有さない対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化の間で差がある1種以上のタンパク質を含む、方法。
6.該赤血球成分が全血又は単離赤血球から採取される、例1〜5の1つ又は複数記載の方法。
7.該赤血球成分が赤血球又は赤血球膜である、例6記載の方法。
8. 2種以上のタンパク質、3種以上のタンパク質、4種以上のタンパク質、5種以上のタンパク質、6種以上のタンパク質、7種以上のタンパク質、8種以上のタンパク質、9種以上のタンパク質、又は10種以上のタンパク質のレベルが測定される、例1〜7の1つ又は複数記載の方法。
9. 3種以上のタンパク質のレベルが測定される、例8記載の方法。
10.該赤血球成分を、1種以上のプロテアーゼインヒビター、2種以上のプロテアーゼインヒビター、3種以上のプロテアーゼインヒビター、4種以上のプロテアーゼインヒビター、5種以上のプロテアーゼインヒビター、6種以上のプロテアーゼインヒビター、7種以上のプロテアーゼインヒビター、8種以上のプロテアーゼインヒビター、9種以上のプロテアーゼインヒビター、又は10種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させる、例1〜7の1つ又は複数記載の方法。
11.該赤血球成分を、少なくとも2つのプロテアーゼインヒビターを含むプロテアーゼインヒビターカクテルと接触させる、例1〜7の1つ又は複数記載の方法。
12.該赤血球成分をプロテアーゼインヒビターカクテルA8127sと接触させる、例1〜7の1つ又は複数記載の方法。
13.該1種以上のプロテアーゼインヒビターが、セリンプロテアーゼインヒビター、システインプロテアーゼインヒビター、メタロプロテアーゼインヒビター、アスパラギン酸プロテアーゼインヒビター、及びアミノペプチダーゼインヒビターからなる群から選択される、例1〜7の1つ又は複数記載の方法。
14.該1種以上のタンパク質のレベルの変化が、スチューデントのT検定、ANOVA検定、混合効果モデル、マン・ホイットニー検定、ウィルコクソンの順位和、及びスペルマン(Spermans)の順位相関からなる群から選択される統計解析によって決定される、例1〜7の1つ又は複数記載の方法。
15.該1種以上のタンパク質のレベルの変化が0倍〜5倍の倍数変化である、例1〜7の1つ又は複数記載の方法。
16.該疾患又は障害を有する対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化と該疾患又は障害を有さない対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化の差が、スチューデントのT検定、ANOVA検定、混合効果モデル、マン・ホイットニー検定、ウィルコクソンの順位和、及びスペルマン(Spermans)の順位相関からなる群から選択される統計解析によって決定される、例5〜7の1つ又は複数記載の方法。
17.該疾患又は障害を有する対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化と該疾患又は障害を有さない対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化の差が該レベルの変化の増加又は該レベルの変化の減少である、例5〜7の1つ又は複数記載の方法。
18.該対象がヒト又は非ヒト動物である、例1〜17の1つ又は複数記載の方法。
19.該1種以上のタンパク質のレベルが1以上の抗体を用いて測定される、例1〜17の1つ又は複数記載の方法。
20.該1種以上のタンパク質が、ケモカイン、サイトカイン、成長因子、受容体、細胞内シグナル伝達物質、ホルモン、核内転写因子、神経伝達物質、細胞外マトリックス成分、糖タンパク質、炎症性タンパク質、及び酵素からなる群から選択される、例1〜17の1つ又は複数記載の方法。
21.該1種以上のタンパク質が、表1に掲載されているタンパク質又は表2に掲載されているタンパク質からなる群から選択される、例1〜17の1つ又は複数記載の方法。
22.該疾患又は障害が子癇前症である、例1〜17の1つ又は複数記載の方法。
23.該疾患タンパク質プロファイルが、IL-1β、IL-8、TNF-α、IL-1ra、MCP-1、G-CSG、GM-CSF、IL-6、IFNα2、IL-1a、IL-18、MIF、IL-2ra、及びHGFからなる群から選択される1種以上のタンパク質を含む子癇前症タンパク質プロファイルである、例22記載の方法。
24.該疾患又は障害が結腸直腸癌である、例1〜17の1つ又は複数記載の方法。
25.該疾患タンパク質プロファイルが、IL-6、IFN-γ、IL-4、IL-13、MIF、エオタキシン、RANTES、IL-7、IP-10、PDGF、及びIL-12p40からなる群から選択される1種以上のタンパク質を含む癌タンパク質プロファイルである、例24記載の方法。
26.対象における疾患又は障害をモニタリングする方法であって:
a.)該疾患又は障害を有する対象から、第一の時点における第一の血液試料及び第二の時点における第二の血液試料を採取すること;
b.)該疾患又は障害についての例5に従って作成される疾患タンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルを該第一の血液試料及び第二の血液試料中で測定すること;並びに
c.)該第一の血液試料及び第二の血液試料中の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化の差を決定すること
を含み、
ここで、該第一の血液試料及び第二の血液試料中の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化の差が該疾患又は障害の変化を示す、方法。
27.対象における治療の効果をモニタリングする方法であって:
a.)該対象から、第一の時点で例1〜3の1つ又は複数に従って作成される第一のタンパク質プロファイルを得ること及び第二の時点で例1〜4の1つ又は複数に従って作成される第二のタンパク質プロファイルを得ること;並びに
b.)該第一のタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化を該第二のタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化と比較すること
を含み、
ここで、該第一のタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質レベルの変化と該第二のタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化の差が該治療の効果を示す、方法。
28.該第一の時点が治療前であり、該第二の時点が治療後である、例27記載の方法。
29.該第一の時点が治療前であり、該第二の時点が治療中である、例27記載の方法。
30.該第一の時点及び該第二の時点が治療中である、例27記載の方法。
31.該第一の時点が治療中であり、該第二の時点が治療後である、例27記載の方法。
32.該第一の時点及び該第二の時点が治療後である、例27記載の方法。
33.該対象が同じ治療を受けたことがある、例27記載の方法。
34.該対象が異なる治療を受けたことがある、例27記載の方法。
35.該血液試料が少量の血液試料である、例27〜34の1つ又は複数記載の方法。
36.該対象が、1日に1回以上、1日に2回以上、1日に3回以上、1日に4回以上、及び1日に5回以上からなる群から選択される回数モニタリングされる、例34記載の方法。
37.該対象が、1週間に1回以上、1週間に2回以上、1週間に3回以上、1週間に4回以上、1週間に5回以上、1週間に6回以上、及び1週間に7回以上からなる群から選択される回数モニタリングされる、例35記載の方法。
38.該対象が毎日モニタリングされる、例35記載の方法。
39.該対象が、1週間に1回、2週間に1回、3週間に1回、及び4週間に1回からなる群から選択される回数モニタリングされる、例35記載の方法。
40.疾患又は障害を診断する方法であって:
a.)請求項3に従って作成される少なくとも1つの疾患タンパク質プロファイルを得ること;
b.)対象に由来する血液試料を採取すること;
c.)該血液試料由来の赤血球成分を採取すること;
d.)該赤血球成分の少なくとも第一の部分を1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させること;
e.)該赤血球成分の第一の部分における疾患タンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベル及び該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させていない該赤血球成分の第二の部分における少なくとも1種のタンパク質のレベルを測定すること;
f.)該赤血球成分の第一の部分における少なくとも1種のタンパク質と該赤血球成分の第二の部分における少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化を決定すること;並びに
g.)該赤血球成分の第一の部分及び該赤血球成分の第二の部分における少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化を該疾患タンパク質プロファイル中の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化と比較すること
を含み、
ここで、該疾患タンパク質プロファイル中の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化と比較した該赤血球成分の第一の部分及び該赤血球成分の第二の部分における少なくとも1種のタンパク質のレベルの同じ又は同様の変化が、該対象が該疾患又は障害を有することを示す、方法。
41.対象における疾患又は障害を診断する方法であって:
a.)例1〜3の1つ又は複数に従って作成される該対象についての少なくとも1つのタンパク質プロファイルを得ること;及び
b.)該少なくとも1つのタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化を例5に従って作成される疾患タンパク質プロファイル由来の該少なくとも1種のタンパク質のレベル変化と比較すること
を含み、
ここで、該疾患タンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化に対する該対象についての少なくとも1つのタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの同じ又は同様の変化が、該対象が該疾患又は障害を有することを示す、方法。
42.対象における疾患又は障害を診断する方法であって:
a.)該対象についての例1〜3の1つ又は複数に従って作成される少なくとも1つのタンパク質プロファイルを得ること;
b.)例4に従って作成される少なくとも1つのタンパク質プロファイルを得ること;及び
c.)該対象についての少なくとも1つのタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化を例4に従って作成される少なくとも1つのタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化と比較すること
を含み、
ここで、該対象についての少なくとも1つのタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化と例4に従って作成される少なくとも1つのタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化の差が、該対象が該疾患又は障害を有することを示す、方法。
43.血液試料のタンパク質プロファイルを作成するためのキットであって:
a.)赤血球成分を採取するための少なくとも1つの試薬;
b.)1種以上のプロテアーゼインヒビター;及び
c.)該赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルを測定するための少なくとも1つの試薬
を含む、キット。
44.該キットが対象由来の血液試料を採取するための少なくとも1つの試薬をさらに含む、例43記載の方法。
45. 1種以上のタンパク質のレベルを測定するための試薬が1以上の抗体である、例43記載の方法。
46. 1種以上のタンパク質を検出するか又はそのレベルを測定するための試薬が酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)装置である、例45記載の方法。
47.該1種以上のプロテアーゼインヒビターがプロテアーゼインヒビターカクテルを含む、例43記載の方法。
48.該プロテアーゼインヒビターカクテルがA8127sである、例47記載の方法。
49.タンパク質プロファイルを作成する方法であって:
a.)疾患又は障害を有する対象由来の血液試料を採取すること;
b.)該血液試料の少なくとも一部を白血球除去して、赤血球濃縮試料を産生すること;
c.)該赤血球濃縮試料の第一の部分を1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させること;及び
d.)該赤血球濃縮試料中の1種以上のタンパク質の存在を検出すること
を含み、
ここで、作成される該タンパク質プロファイルが該赤血球濃縮試料中で検出される1種以上のタンパク質を含む、方法。
50.タンパク質プロファイルを作成する方法であって:
a.)疾患又は障害を有する対象由来の血液試料を採取すること;
b.)該血液試料の少なくとも一部を白血球除去して、赤血球濃縮試料を産生すること;
c.)該赤血球濃縮試料中の赤血球及び血漿を単離すること;
d.)該赤血球を1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させること;
e.)該赤血球中の1種以上のタンパク質のレベル及び該血漿中の1種以上のタンパク質のレベルを測定すること;並びに
e.)該赤血球中の1種以上のタンパク質のレベル対該血漿中の1種以上のタンパク質のレベルを含むタンパク質比を計算すること,
を含み、
ここで、作成される該タンパク質プロファイルが少なくとも2:1のタンパク質比を有する1種以上のタンパク質を含む、方法。
51.該1種以上のタンパク質が、少なくとも3:1、少なくとも4:1、少なくとも5:1、少なくとも10:1、少なくとも15:1、及び少なくとも20:1からなる群から選択されるタンパク質比を有する、例49記載の方法。
52.タンパク質プロファイルを作成する方法であって:
a.)疾患又は障害を有する対象由来の血液試料を採取すること;
b.)該血液試料の少なくとも一部を白血球除去して、赤血球濃縮試料を産生すること;
c.)該赤血球濃縮試料中の赤血球を1種以上のプロテアーゼインヒビターを含有する培地中でインキュベートすること;及び
d.)1種以上のタンパク質を該培地中で検出すること,
を含み、
ここで、作成されるタンパク質プロファイルが該培地中で検出される1種以上のタンパク質を含む、方法。
53.該赤血球濃縮試料中で検出される該1種以上のタンパク質のレベルを測定することをさらに含む、例48又は例51記載の方法。
54. 2種以上のタンパク質、3種以上のタンパク質、4種以上のタンパク質、5種以上のタンパク質、6種以上のタンパク質、7種以上のタンパク質、8種以上のタンパク質、9種以上のタンパク質、もしくは10種以上のタンパク質の存在が検出されるか、又は2種以上のタンパク質、3種以上のタンパク質、4種以上のタンパク質、5種以上のタンパク質、6種以上のタンパク質、7種以上のタンパク質、8種以上のタンパク質、9種以上のタンパク質、又は10種以上のタンパク質のレベル、11種以上のタンパク質、12種以上のタンパク質、13種以上のタンパク質、14種以上のタンパク質、もしくは15種以上のタンパク質のレベルが測定される、例48〜52の1つ又は複数記載の方法。
55. 3種以上のタンパク質の存在が検出されるか、又は3種以上のタンパク質のレベルが測定される、例53記載の方法。
56.該赤血球濃縮試料を、2種以上のプロテアーゼインヒビター、3種以上のプロテアーゼインヒビター、4種以上のプロテアーゼインヒビター、5種以上のプロテアーゼインヒビター、6種以上のプロテアーゼインヒビター、7種以上のプロテアーゼインヒビター、8種以上のプロテアーゼインヒビター、9種以上のプロテアーゼインヒビター、又は10種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させる、例48〜54の1つ又は複数記載の方法。
57.該赤血球濃縮試料を3種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させる、例55記載の方法。
58.該赤血球濃縮試料を3種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させ、かつ2種以上のタンパク質の存在を検出するか、又は2種以上のタンパク質のレベルを測定する、例55記載の方法。
59.該赤血球を2種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させ、かつ3種以上のタンパク質の存在を検出するか、又は3種以上のタンパク質のレベルを測定する、例55記載の方法。
60.該1種以上のプロテアーゼインヒビターが、セリンプロテアーゼインヒビター、システインプロテアーゼインヒビター、メタロプロテアーゼインヒビター、及びアスパラギン酸プロテアーゼインヒビターからなる群から選択される、例48〜58の1つ又は複数記載の方法。
61.該対象がヒト又は非ヒト動物である、例48〜59の1つ又は複数記載の方法。
62.該1種以上のタンパク質の存在が検出されるか、又は1種以上のタンパク質のレベルが1以上の抗体を用いて測定される、例48〜60の1つ又は複数記載の方法。
63.該1種以上のタンパク質が、ケモカイン、サイトカイン、成長因子、受容体、細胞内シグナル伝達物質、ホルモン、核内転写因子、神経伝達物質、及び細胞外マトリックス成分、並びに酵素からなる群から選択される、例48〜60の1つ又は複数記載の方法。
64.該1種以上のタンパク質が、表1に掲載されているタンパク質又は表2に掲載されているタンパク質からなる群から選択される、例48〜60の1つ又は複数記載の方法。
65.該血液試料が、フローサイトメトリー、磁気ビーズ分離、遠心分離、セルロースカラム、及びデキストラン沈降からなる群から選択される1以上の方法によって白血球除去される、例48〜60の1つ又は複数記載の方法。
66.該血液試料がデキストラン沈降によって白血球除去される、例64記載の方法。
67.対象における疾患又は障害をモニタリングする方法であって:
a.)例48〜60の1つ又は複数に従って作成される少なくとも1つのタンパク質プロファイルを第一の時点及び第二の時点における該対象から得ること;並びに
b.)該第一の時点における該対象の少なくとも1つのタンパク質プロファイルを該第二の時点における該対象の少なくとも1つのタンパク質プロファイルと比較すること
を含み、
ここで、該第二の時点における該対象の少なくとも1つのタンパク質プロファイルと比較した該第一の時点における該対象の少なくとも1つのタンパク質プロファイルにおける1種以上のタンパク質の存在又はレベルの差が該疾患又は障害の変化を示す。
68.対象における治療をモニタリングする方法であって:
a.)例48〜60の1つ又は複数に従って作成される少なくとも1つのタンパク質プロファイルを治療前及び治療後の対象から得ること;並びに
b.)該治療前の対象の少なくとも1つのタンパク質プロファイルを該治療後の対象の少なくとも1つのタンパク質プロファイルと比較すること,
を含み、
ここで、該治療後の対象の少なくとも1つのタンパク質プロファイルと比較した該治療前の対象の少なくとも1つのタンパク質プロファイルにおける1種以上のタンパク質の存在又はレベルの差が該対象に対する該治療の効果を示す、方法。
69.治療を全く受けたことがない対象の少なくとも1つのタンパク質プロファイルが治療を受けた該対象の少なくとも1つのタンパク質プロファイルと比較される、例67記載の方法。
70.ある時点での治療後の対象の少なくとも1つのタンパク質プロファイルが異なる時点での該治療後の対象の少なくとも1つのタンパク質プロファイルと比較される、例67記載の方法。
71.該対象が同じ治療を受けたことがある、例69記載の方法。
72.該対象が異なる治療を受けたことがある、例69記載の方法。
73.該血液試料が少量の血液試料である、例66〜71の1つ又は複数記載の方法。
74.該対象が、1日に1回以上、1日に2回以上、1日に3回以上、1日に4回以上、及び1日に5回以上からなる群から選択される回数モニタリングされる、例66〜72の1つ又は複数記載の方法。
75.該対象が、1週間に1回以上、1週間に2回以上、1週間に3回以上、1週間に4回以上、1週間に5回以上、1週間に6回以上、及び1週間に7回以上からなる群から選択される回数モニタリングされる、例66〜72の1つ又は複数記載の方法。
76.該対象が毎日モニタリングされる、例66〜72の1つ又は複数記載の方法。
77.該対象が、1週間に1回、2週間に1回、3週間に1回、及び4週間に1回からなる群から選択される回数モニタリングされる、例66〜72の1つ又は複数記載の方法。
78.疾患又は障害タンパク質プロファイルを作成する方法であって:
a.)疾患又は障害を有する1以上の対象由来の血液試料を採取すること;
b.)該血液試料の少なくとも一部を白血球除去して、赤血球濃縮試料を産生すること;
c.)該赤血球濃縮試料の第一の部分を1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させること;
d.)該赤血球濃縮試料の該第一の部分における1種以上のタンパク質のレベル及び該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させていない該赤血球濃縮試料の第二の部分の該1種以上のタンパク質のレベルを測定すること;及び
e.)該赤血球濃縮試料の該第一の部分における該1種以上のタンパク質のレベルを該赤血球濃縮試料の該第二の部分における該1種以上のタンパク質のレベルと比較すること
を含み、
ここで、作成される疾患タンパク質プロファイルが、該赤血球濃縮試料の該第二の部分における該1種以上のタンパク質のレベルと比較して、該赤血球濃縮試料の該第一の部分における異なるレベルを有する1種以上のタンパク質を含む、方法。
79.該赤血球濃縮試料の該第二の部分における該1種以上のタンパク質のレベルと比較した該赤血球濃縮試料の該第一の部分における該1種以上のタンパク質のレベルの差のレベルが、スチューデントのT検定、ANOVA検定、混合効果モデル、マン・ホイットニー検定、ウィルコクソンの順位和、及びスペルマン(Spermans)の順位相関からなる群から選択される統計解析によって決定される、例77記載の方法。
80. 2種以上のタンパク質、3種以上のタンパク質、4種以上のタンパク質、5種以上のタンパク質、6種以上のタンパク質、7種以上のタンパク質、8種以上のタンパク質、9種以上のタンパク質、又は10種以上のタンパク質のレベルが測定される、例77又は例78記載の方法。
81. 3種以上のタンパク質のレベルが測定される、例79記載の方法。
82.該疾患又は障害が子癇前症である、例80記載の方法。
83.該疾患タンパク質プロファイルが、IL-1β、IL-8、TNF-α、IL-1ra、MCP-1、G-CSG、GM-CSF、IL-6、IFNα2、IL-1a、IL-18、MIF、IL-2ra、及びHGFからなる群から選択される1種以上のタンパク質を含む子癇前症タンパク質プロファイルである、例81記載の方法。
84.該疾患又は障害が癌である、例80記載の方法。
85.該疾患タンパク質プロファイルが、IL-6、IFN-γ、IL-4、IL-13、MIF、エオタキシン、RANTES、IL-7、IP-10、PDGF、及びIL-12p40からなる群から選択される1種以上のタンパク質を含む癌タンパク質プロファイルである、例83記載の方法。
86.疾患又は障害を診断する方法であって:
a.)対象由来の血液試料を採取すること;
b.)該血液試料の少なくとも一部を白血球除去して、赤血球濃縮試料を産生すること;
c.)少なくとも該赤血球濃縮試料の第一の部分を1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させること;
d.)該赤血球濃縮試料の該第一の部分における1種以上のタンパク質のレベル及び該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させていない該赤血球濃縮試料の第二の部分の該1種以上のタンパク質のレベルを測定すること;及び
e.)該赤血球濃縮試料の該第一の部分における該1種以上のタンパク質のレベルを該赤血球濃縮試料の該第二の部分における該1種以上のタンパク質のレベルと比較すること,
を含み、
ここで、該赤血球濃縮試料の該第二の部分における該1種以上のタンパク質のレベルと比較した該赤血球濃縮試料の該第一の部分における1種以上のタンパク質のレベルの差が、該対象が該疾患又は障害を有することを示す、方法。
87.該1種以上のタンパク質のレベルに差がないこと、該対象が該疾患又は障害を有さないことを示すを示す、例85記載の方法。
88.対象が疾患又は障害を有するかどうかを決定する方法であって:
a.)該対象由来の血液試料を採取すること;
b.)該血液試料の少なくとも一部を白血球除去して、赤血球濃縮試料を産生すること;
c.)少なくとも該赤血球濃縮試料の第一の部分を1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させること;
c.)該赤血球濃縮試料の該第一の部分における1種以上のタンパク質のレベル及び該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させていない該赤血球濃縮試料の第二の部分の該1種以上のタンパク質のレベルを測定すること;並びに
d.)該赤血球濃縮試料の該第一の部分における該1種以上のタンパク質のレベルを該赤血球濃縮試料の該第二の部分における該1種以上のタンパク質のレベルと比較すること
を含み、
ここで、該赤血球濃縮試料の該第二の部分における該1種以上のタンパク質のレベルと比較して該赤血球濃縮試料の該第一の部分における該1種以上のタンパク質のレベルに差がないことが、該対象が該疾患又は障害を有さないことを示す、方法。
89.対象における疾患又は障害を診断する方法であって:
a.)例48〜60の1つ又は複数に従って作成される該対象由来の少なくとも1つのタンパク質プロファイルを得ること;及び
b.)該少なくとも1つのタンパク質プロファイルを少なくとも1つの疾患タンパク質プロファイルと比較すること
を含み、
ここで、該少なくとも1つの疾患タンパク質プロファイル中の該1種以上のタンパク質の存在又はレベルと同様である該少なくとも1つのタンパク質プロファイル中の1種以上のタンパク質の存在又はレベルが、該対象が該疾患又は障害を有することを示す、方法。
90.得られる該少なくとも1つの疾患タンパク質プロファイルが例30〜33の1つ又は複数に従って作成される、例88記載の方法。
91.対象における疾患又は障害を診断する方法であって:
a.)例48〜60の1つ又は複数に従って作成される該対象由来の少なくとも1つのタンパク質プロファイルを得ること;
b.)該疾患又は障害を有さない1以上の対象由来の少なくとも1つのタンパク質プロファイルを採取すること;及び
c.)該対象から得られる該少なくとも1つのタンパク質プロファイルを該疾患又は障害を有さない1以上の対象から得られる該少なくとも1つのタンパク質プロファイルと比較すること
を含み、
ここで、該疾患又は障害を有さない1以上の対象から得られる該少なくとも1つのタンパク質プロファイル中の該1種以上のタンパク質の存在又はレベルと比較した該対象から得られる該少なくとも1つのタンパク質プロファイル中の該1種以上のタンパク質の存在又はレベルの差が、該対象が該疾患又は障害を有することを示す、方法。
92.血液試料のタンパク質プロファイルを作成するためのキットであって:
a.)血液試料を白血球除去して、赤血球濃縮試料を産生するための少なくとも1つの試薬;
b.)1種以上のプロテアーゼインヒビター;及び
c.)該赤血球濃縮試料中の1種以上のタンパク質の存在を検出するか又はそのレベルを測定するための少なくとも1つの試薬
を含む、キット。
93.該キットが対象由来の血液試料を採取するための少なくとも1つの試薬をさらに含む、例91記載の方法。
94. 1種以上のタンパク質の存在を検出するか又はそのレベルを測定するための試薬が1以上の抗体である、例91記載の方法。
95. 1種以上のタンパク質の存在を検出するか又はそのレベルを測定するための試薬が酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)装置である、例93記載の方法。
本件出願は、以下の態様の発明を提供する。
（態様１）
タンパク質プロファイルを作成する方法であって:
a.)血液試料を採取すること;
b.)該血液試料由来の赤血球成分を採取すること;
c.)該赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルを測定すること;
d.)該赤血球成分を1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させること;
e.)該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させた該赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルを測定すること;並びに
f.)該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させる前及び接触させた後の該赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化を決定すること
を含み、
ここで、作成されたタンパク質プロファイルが、該赤血球成分を該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させる前及び接触させた後にレベルの変化を有する1種以上のタンパク質を含む、前記方法。
（態様２）
タンパク質プロファイルを作成する方法であって:
a.)血液試料又は血液試料由来の赤血球成分を採取すること;
b.)該血液試料又は該赤血球成分由来の第一の部分及び第二の部分を採取すること;
c.)該血液試料又は該赤血球成分由来の第二の部分を1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させること;
d.)該血液試料又は該赤血球成分の第一の部分及び第二の部分由来の1種以上のタンパク質のレベルを測定すること(ここで、該第一の部分は該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させていない);並びに
e.)該血液試料又は該赤血球成分の第一の部分及び該血液試料又は該赤血球成分の第二の部分由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化を決定すること
を含み、
ここで、作成されたタンパク質プロファイルが、該血液試料又は該赤血球成分の第一の部分及び該血液試料又は該赤血球成分の第二の部分由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化を有する1種以上のタンパク質を含む、前記方法。
（態様３）
血液試料と赤血球成分の両方が採取される、態様2記載の方法。
（態様４）
タンパク質プロファイルを作成する方法であって:
a.)疾患又は障害を有さない対象に由来する血液試料を採取すること;
b.)該血液試料由来の赤血球成分を採取すること;
c.)該赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルを測定すること;
d.)該赤血球成分を1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させること;
e.)該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させた該赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルを測定すること;並びに
f.)該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させる前及び接触させた後の該赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化を決定すること
を含み、
ここで、作成されたタンパク質プロファイルが、該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させる前及び接触させた後の該赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化を含む、前記方法。
（態様５）
疾患タンパク質プロファイルを作成する方法であって:
a.)疾患又は障害を有する対象から、態様1〜3の1つ又は複数に従って作成される第一のタンパク質プロファイルを得ること;
b.)該疾患又は障害を有さない対象から、態様4に従って作成される第二のタンパク質プロファイルを得ること(ここで、該第二のタンパク質プロファイルは、該第一のタンパク質プロファイルが得られた同じ赤血球成分から得られる);及び
c.)該疾患又は障害を有する対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化と該疾患又は障害を有さない対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化の差を比較すること
を含み、
ここで、作成された疾患タンパク質プロファイルが、該疾患又は障害を有する対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化と該疾患又は障害を有さない対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化の間で差がある1種以上のタンパク質を含む、前記方法。
（態様６）
前記赤血球成分が全血又は単離赤血球から採取される、態様1〜5の1つ又は複数記載の方法。
（態様７）
前記赤血球成分が赤血球又は赤血球膜である、態様6記載の方法。
（態様８）
2種以上のタンパク質、3種以上のタンパク質、4種以上のタンパク質、5種以上のタンパク質、6種以上のタンパク質、7種以上のタンパク質、8種以上のタンパク質、9種以上のタンパク質、又は10種以上のタンパク質のレベルが測定される、態様1〜7の1つ又は複数記載の方法。
（態様９）
3種以上のタンパク質のレベルが測定される、態様8記載の方法。
（態様１０）
前記赤血球成分を、1種以上のプロテアーゼインヒビター、2種以上のプロテアーゼインヒビター、3種以上のプロテアーゼインヒビター、4種以上のプロテアーゼインヒビター、5種以上のプロテアーゼインヒビター、6種以上のプロテアーゼインヒビター、7種以上のプロテアーゼインヒビター、8種以上のプロテアーゼインヒビター、9種以上のプロテアーゼインヒビター、又は10種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させる、態様1〜7の1つ又は複数記載の方法。
（態様１１）
前記赤血球成分を、少なくとも2つのプロテアーゼインヒビターを含むプロテアーゼインヒビターカクテルと接触させる、態様1〜7の1つ又は複数記載の方法。
（態様１２）
前記赤血球成分をプロテアーゼインヒビターカクテルA8127sと接触させる、態様1〜7の1つ又は複数記載の方法。
（態様１３）
前記1種以上のプロテアーゼインヒビターが、セリンプロテアーゼインヒビター、システインプロテアーゼインヒビター、メタロプロテアーゼインヒビター、アスパラギン酸プロテアーゼインヒビター、及びアミノペプチダーゼインヒビターからなる群から選択される、態様1〜7の1つ又は複数記載の方法。
（態様１４）
前記1種以上のタンパク質のレベルの変化が、スチューデントのT検定、ANOVA検定、混合効果モデル、マン・ホイットニー検定、ウィルコクソンの順位和、及びスペルマン(Spermans)の順位相関からなる群から選択される統計解析によって決定される、態様1〜7の1つ又は複数記載の方法。
（態様１５）
前記1種以上のタンパク質のレベルの変化が0倍〜5倍の倍数変化である、態様1〜7の1つ又は複数記載の方法。
（態様１６）
前記疾患又は障害を有する対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化と前記疾患又は障害を有さない対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化の差が、スチューデントのT検定、ANOVA検定、混合効果モデル、マン・ホイットニー検定、ウィルコクソンの順位和、及びスペルマン(Spermans)の順位相関からなる群から選択される統計解析によって決定される、態様5〜7の1つ又は複数記載の方法。
（態様１７）
前記疾患又は障害を有する対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化と前記疾患又は障害を有さない対象由来の1種以上のタンパク質のレベルの変化の差が該レベルの変化の増加又は該レベルの変化の減少である、態様5〜7の1つ又は複数記載の方法。
（態様１８）
前記対象がヒト又は非ヒト動物である、態様1〜17の1つ又は複数記載の方法。
（態様１９）
前記1種以上のタンパク質のレベルが1以上の抗体を用いて測定される、態様1〜17の1つ又は複数記載の方法。
（態様２０）
前記1種以上のタンパク質が、ケモカイン、サイトカイン、成長因子、受容体、細胞内シグナル伝達物質、ホルモン、核内転写因子、神経伝達物質、細胞外マトリックス成分、糖タンパク質、炎症性タンパク質、及び酵素からなる群から選択される、態様1〜17の1つ又は複数記載の方法。
（態様２１）
前記1種以上のタンパク質が、表1に掲載されているタンパク質又は表2に掲載されているタンパク質からなる群から選択される、態様1〜17の1つ又は複数記載の方法。
（態様２２）
前記疾患又は障害が子癇前症である、態様1〜17の1つ又は複数記載の方法。
（態様２３）
前記疾患タンパク質プロファイルが、IL-1β、IL-8、TNF-α、IL-1ra、MCP-1、G-CSG、GM-CSF、IL-6、IFNα2、IL-1a、IL-18、MIF、IL-2ra、及びHGFからなる群から選択される1種以上のタンパク質を含む子癇前症タンパク質プロファイルである、態様22記載の方法。
（態様２４）
前記疾患又は障害が結腸直腸癌である、態様1〜17の1つ又は複数記載の方法。
（態様２５）
前記疾患タンパク質プロファイルが、IL-6、IFN-γ、IL-4、IL-13、MIF、エオタキシン、RANTES、IL-7、IP-10、PDGF、及びIL-12p40からなる群から選択される1種以上のタンパク質を含む癌タンパク質プロファイルである、態様24記載の方法。
（態様２６）
対象における疾患又は障害をモニタリングする方法であって:
a.)該疾患又は障害を有する対象から、第一の時点における第一の血液試料及び第二の時点における第二の血液試料を採取すること;
b.)該疾患又は障害についての態様5に従って作成される疾患タンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルを該第一の血液試料及び第二の血液試料中で測定すること;並びに
c.)該第一の血液試料及び第二の血液試料中の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化の差を決定すること
を含み、
ここで、該第一の血液試料及び第二の血液試料中の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化の差が該疾患又は障害の変化を示す、前記方法。
（態様２７）
対象における治療の効果をモニタリングする方法であって:
a.)該対象から、第一の時点で態様1〜3の1つ又は複数に従って作成される第一のタンパク質プロファイルを得ること及び第二の時点で態様1〜4の1つ又は複数に従って作成される第二のタンパク質プロファイルを得ること;並びに
b.)該第一のタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化を該第二のタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化と比較すること
を含み、
ここで、該第一のタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質レベルの変化と該第二のタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化の差が該治療の効果を示す、前記方法。
（態様２８）
前記第一の時点が治療前であり、前記第二の時点が治療後である、態様27記載の方法。
（態様２９）
前記第一の時点が治療前であり、前記第二の時点が治療中である、態様27記載の方法。
（態様３０）
前記第一の時点及び前記第二の時点が治療中である、態様27記載の方法。
（態様３１）
前記第一の時点が治療中であり、前記第二の時点が治療後である、態様27記載の方法。
（態様３２）
前記第一の時点及び前記第二の時点が治療後である、態様27記載の方法。
（態様３３）
前記対象が同じ治療を受けたことがある、態様27記載の方法。
（態様３４）
前記対象が異なる治療を受けたことがある、態様27記載の方法。
（態様３５）
前記血液試料が少量の血液試料である、態様27〜34の1つ又は複数記載の方法。
（態様３６）
前記対象が、1日に1回以上、1日に2回以上、1日に3回以上、1日に4回以上、及び1日に5回以上からなる群から選択される回数モニタリングされる、態様35記載の方法。
（態様３７）
前記対象が、1週間に1回以上、1週間に2回以上、1週間に3回以上、1週間に4回以上、1週間に5回以上、1週間に6回以上、及び1週間に7回以上からなる群から選択される回数モニタリングされる、態様35記載の方法。
（態様３８）
前記対象が毎日モニタリングされる、態様35記載の方法。
（態様３９）
前記対象が、1週間に1回、2週間に1回、3週間に1回、及び4週間に1回からなる群から選択される回数モニタリングされる、態様35記載の方法。
（態様４０）
疾患又は障害を診断する方法であって:
a.)態様3に従って作成される少なくとも1つの疾患タンパク質プロファイルを得ること;
b.)対象に由来する血液試料を採取すること;
c.)該血液試料由来の赤血球成分を採取すること;
d.)該赤血球成分の少なくとも第一の部分を1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させること;
e.)該赤血球成分の第一の部分における疾患タンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベル及び該1種以上のプロテアーゼインヒビターと接触させていない該赤血球成分の第二の部分における少なくとも1種のタンパク質のレベルを測定すること;
f.)該赤血球成分の第一の部分における少なくとも1種のタンパク質と該赤血球成分の第二の部分における少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化を決定すること;並びに
g.)該赤血球成分の第一の部分及び該赤血球成分の第二の部分における少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化を該疾患タンパク質プロファイル中の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化と比較すること
を含み、
ここで、該疾患タンパク質プロファイル中の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化と比較した該赤血球成分の第一の部分及び該赤血球成分の第二の部分における少なくとも1種のタンパク質のレベルの同じ又は同様の変化が、該対象が該疾患又は障害を有することを示す、前記方法。
（態様４１）
対象における疾患又は障害を診断する方法であって:
a.)態様1〜3の1つ又は複数に従って作成される該対象についての少なくとも1つのタンパク質プロファイルを得ること;及び
b.)該少なくとも1つのタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化を態様5に従って作成される疾患タンパク質プロファイル由来の該少なくとも1種のタンパク質のレベル変化と比較すること
を含み、
ここで、該疾患タンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化と同じ又は同様の該対象についての少なくとも1つのタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化が、該対象が該疾患又は障害を有することを示す、前記方法。
（態様４２）
対象における疾患又は障害を診断する方法であって:
a.)該対象についての態様1〜3の1つ又は複数に従って作成される少なくとも1つのタンパク質プロファイルを得ること;
b.)態様4に従って作成される少なくとも1つのタンパク質プロファイルを得ること;及び
c.)該対象についての少なくとも1つのタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化を態様4に従って作成される少なくとも1つのタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化と比較すること
を含み、
ここで、該対象についての少なくとも1つのタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化と態様4に従って作成される少なくとも1つのタンパク質プロファイル由来の少なくとも1種のタンパク質のレベルの変化の差が、該対象が該疾患又は障害を有することを示す、前記方法。
（態様４３）
血液試料のタンパク質プロファイルを作成するためのキットであって:
a.)赤血球成分を採取するための少なくとも1つの試薬;
b.)1種以上のプロテアーゼインヒビター;及び
c.)該赤血球成分由来の1種以上のタンパク質のレベルを測定するための少なくとも1つの試薬
を含む、前記キット。
（態様４４）
前記キットが対象由来の血液試料を採取するための少なくとも1つの試薬をさらに含む、態様43記載の方法。
（態様４５）
前記1種以上のタンパク質のレベルを測定するための試薬が1以上の抗体である、態様43記載の方法。
（態様４６）
前記1種以上のタンパク質を検出するか又はそのレベルを測定するための試薬が酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)装置である、態様45記載の方法。
（態様４７）
前記1種以上のプロテアーゼインヒビターがプロテアーゼインヒビターカクテルを含む、態様43記載の方法。
（態様４８）
前記プロテアーゼインヒビターカクテルがA8127sである、態様47記載の方法。