【手続補正書】
【提出日】令和3年3月12日(2021.3.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
それを必要とする個体において免疫応答を調節するための、多量体ポリペプチドを含む医薬であって、
該多量体ポリペプチドは、
ａ）ｉ）がん細胞により提示されるエピトープである、ヒトパピローマウイルスＥ７エピトープまたはがん関連抗原中に存在するエピトープを含むペプチド、及び
ｉｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩポリペプチド
を含む第１のポリペプチド、ならびに
ｂ）第２のＭＨＣクラスＩポリペプチドを含む第２のポリペプチド
を含み、
該多量体ポリペプチドは、１または複数の免疫調節ポリペプチドを含み、
該第１および／または第２のポリペプチドは、任意で免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含み、
免疫チェックポイント阻害剤と組み合わせて用いられることを特徴とする、医薬。
【請求項２】
ａ）該第１のＭＨＣクラスＩポリペプチドが、β２−ミクログロブリン（β２Ｍ）ポリペプチドであり、および該第２のＭＨＣポリペプチドが、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである、または
ｂ）該第１のＭＨＣクラスＩポリペプチドが、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドであり、および該第２のＭＨＣポリペプチドが、β２Ｍポリペプチドである、請求項１に記載の医薬。
【請求項３】
該１または複数の免疫調節ポリペプチドの少なくとも１つが、対応する野生型免疫調節ポリペプチドの免疫共調節ポリペプチドに対する親和性と比較して、該免疫共調節ポリペプチドに対する低減した親和性を呈する変異免疫調節ポリペプチドである、請求項１または２に記載の医薬。
【請求項４】
該免疫調節ポリペプチドが、４−１ＢＢＬポリペプチド、ＣＤ８０ポリペプチド、ＣＤ８６ポリペプチド、ＩＬ−２ポリペプチド、Ｂ７−１ポリペプチド、Ｂ７−２ポリペプチド、ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチド、ＯＸ−４０Ｌポリペプチド、ＰＤ−Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、及びＰＤ−Ｌ２ポリペプチドからなる群から選択される、請求項１乃至３のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項５】
それを必要とする個体において免疫応答を調節するための、多量体ポリペプチドを含む医薬であって、
該多量体ポリペプチドは、
ａ）ｉ）ヒトパピローマウイルスＥ７エピトープを含むペプチドエピトープ、及び
ｉｉ）β２−ミクログロブリン（β２Ｍ）ポリペプチドである、第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチド
を含む第１のポリペプチド、ならびに
ｂ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである、第２のＭＨＣポリペプチドを含む第２のポリペプチド
を含み、
該多量体ポリペプチドは、１または複数の免疫調節ドメインを含み、
該第１および／または第２のポリペプチドは、任意で免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含み、
該１または複数の免疫調節ドメインの少なくとも１つが、配列番号１に記載されるアミノ酸配列を有するＩＬ−２の、ＩＬ２Ｒに対する結合親和性と比較して、配列番号１８、１９及び２０に記載されるアミノ酸配列をそれぞれ有するα、β及びγポリペプチドを含むＩＬ−２受容体（ＩＬ２Ｒ）に対する低減した結合親和性を呈する変異ＩＬ−２ポリペプチドであり、
免疫チェックポイント阻害剤と組み合わせて用いられることを特徴とする、医薬。
【請求項６】
該免疫チェックポイント阻害剤および該多量体ポリペプチドが、個体に、同時にまたは異なる時間に投与されるように用いられることを特徴とする、請求項１乃至５のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項７】
該第２のポリペプチドが、１つまたは２つの免疫調節ポリペプチドを含み、ならびにそれぞれの免疫調節ポリペプチドが、
配列番号１に記載されるアミノ酸配列と比較して、Ｈ１６Ａのアミノ酸置換を含む変異ＩＬ−２ポリペプチド、および
配列番号１に記載のアミノ酸配列と比較して、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａのアミノ酸置換を含む、変異ＩＬ−２ポリペプチド
からなる群から選択される、請求項５に記載の医薬。
【請求項８】
該ペプチドエピトープが、ＨＰＶ１６Ｅ７／８２−９０（ＬＬＭＧＴＬＧＩＶ；配列番号７５）、ＨＰＶ１６Ｅ７／８６−９３（ＴＬＧＩＶＣＰＩ；配列番号７６）、ＨＰＶ１６Ｅ７／ｌｌ−２０（ＹＭＬＤＬＱＰＥＴＴ；配列番号７７）、およびＨＰＶ１６Ｅ７／ｌｌ−１９（ＹＭＬＤＬＱＰＥＴ；配列番号７８）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項５乃至７のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項９】
該第１および／または第２のポリペプチドが、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含み、ならびに該ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドが、配列番号４４のアミノ酸配列と比較して、Ｌ２３４ＡおよびＬ２３５Ａのアミノ酸置換を含む、請求項１乃至８のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項１０】
該β２−ミクログロブリン（β２Ｍ）ポリペプチドが、配列番号９５、１９５、９６、９７および９８に記載されるアミノ酸配列のそれぞれの２１乃至１１９位のアミノ酸を含み、該アミノ酸配列が、任意でＲ１２Ｃのアミノ酸置換を含む、請求項２乃至９のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項１１】
該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、ＨＬＡ−Ａ重鎖である、請求項２乃至１０のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項１２】
該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、配列番号２９に記載されるアミノ酸配列の２５乃至３６５位のアミノ酸を含み、該アミノ酸配列が、任意でＹ８４Ａのアミノ酸置換、Ａ２３６Ｃのアミノ酸置換、またはＹ８４ＡおよびＡ２３６Ｃのアミノ酸置換の両方を含む、請求項２乃至１１のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項１３】
該第１のポリペプチドおよび該第２のポリペプチドが、ジスルフィド結合を介して互いに共有結合的に連結され、該ジスルフィド結合は、該β２Ｍポリペプチド中のＣｙｓ残基と、該ＭＨＣ重鎖ポリペプチド中のＣｙｓ残基を結ぶ、請求項２乃至１２のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項１４】
該β２Ｍポリペプチドのアミノ酸残基１２位のＣｙｓが、該ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのアミノ酸残基２３６位のＣｙｓにジスルフィド結合している、請求項１３に記載の医薬。
【請求項１５】
該第１のポリペプチドおよび該第２のポリペプチドが、ジスルフィド結合を介して互いに共有結合的に連結され、該第１のポリペプチドが、該ペプチドエピトープと該β２Ｍポリペプチドとの間にリンカーを含み、および該ジスルフィド結合が、該リンカー中に存在するＣｙｓを該ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのＣｙｓに連結する、請求項２乃至１２のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項１６】
該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、配列番号２９に記載されるアミノ酸配列の２５乃至３６５位のアミノ酸を含み、該アミノ酸配列が、任意でＹ８４Ａのアミノ酸置換、Ａ２３６Ｃのアミノ酸置換、またはＹ８４ＡおよびＡ２３６Ｃのアミノ酸置換の両方を含む、請求項２乃至１５のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項１７】
該多量体ポリペプチドが、
ａ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）アミノ酸配列ＹＭＬＤＬＱＰＥＴＴ（配列番号７７）を含み、１０アミノ酸の長さを有するペプチドエピトープ、および
ｉｉ）β２−ミクログロブリン（β２M）ポリペプチドである、第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチド
を含む、第１のポリペプチド、ならびに
ｂ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）配列番号１に記載のアミノ酸配列と比較して、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａのアミノ酸置換を含む、変異ＩＬ−２ポリペプチドである、第１の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）配列番号１に記載のアミノ酸配列と比較して、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａのアミノ酸置換を含む、変異ＩＬ−２ポリペプチドである、第２の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである、第２のＭＨＣポリペプチド、および
ｉｖ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチド
を含む、第２のポリペプチド
を含み、
該β２−ミクログロブリン（β２Ｍ）ポリペプチドが、配列番号９５、１９５、９６、９７および９８に記載されるアミノ酸配列のそれぞれの２１乃至１１９位のアミノ酸を含み、該アミノ酸配列が、任意でＲ１２Ｃのアミノ酸置換を含み、
該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、配列番号２９に記載されるアミノ酸配列の２５乃至３６５位のアミノ酸を含み、該アミノ酸配列が、任意でＹ８４Ａのアミノ酸置換、Ａ２３６Ｃのアミノ酸置換、またはＹ８４ＡおよびＡ２３６Ｃのアミノ酸置換の両方を含み、および
該第１のポリペプチドおよび該第２のポリペプチドが、ジスルフィド結合を介して互いに共有結合的に連結され、および該ジスルフィド結合は、該β２Ｍポリペプチドのアミノ酸残基１２位のＣｙｓと、該ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのアミノ酸残基２３６位のＣｙｓを結ぶ、
請求項５乃至１６のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項１８】
ｉ）該β２−ミクログロブリン（β２Ｍ）ポリペプチドが、配列番号４８に示されるアミノ酸配列を含み、
ｉｉ）該第１及び第２の変異ＩＬ−２ポリペプチドが、配列番号４９に示されるアミノ酸配列を含み、
ｉｉｉ）該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、配列番号５０に示されるアミノ酸配列を含み、および
ｉｖ）該Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドが、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドであり、および配列番号４４、４５、４６または４７に示されるアミノ酸配列を含む、
請求項１７に記載の医薬。
【請求項１９】
該第１のポリペプチドが、該エピトープと該β２−ミクログロブリンポリペプチドとの間にリンカーを含み、および該第２のポリペプチドが、
ａ）該変異ＩＬ−２ポリペプチドの第１のコピーと該変異ＩＬ−２ポリペプチドの第２のコピーとの間、
ｂ）該変異ＩＬ−２ポリペプチドと該ＭＨＣ重鎖ポリペプチドとの間、および
ｃ）該ＭＨＣ重鎖ポリペプチドと前記ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドとの間
の１つ以上にペプチドリンカーを含む、
請求項１８に記載の医薬。
【請求項２０】
該ペプチドリンカーが、（ＧＧＧＧＳ）３、（ＧＧＧＧＳ）４、及びＡＡＡＧＧからなる群から選択される、請求項１９に記載の医薬。
【請求項２１】
該多量体ポリペプチドが、
ａ）配列番号４２に示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド、および
ｂ）配列番号３３に示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド、
または
ａ）配列番号４２に示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド、および
ｂ）配列番号３６に示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド、
または
ａ）配列番号４２に示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド、及び
ｂ）配列番号３９に示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド
を含むヘテロ二量体ポリペプチドである、請求項１７乃至２０のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項２２】
該免疫チェックポイント阻害剤が、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ４０、ＣＤ１２２、ＣＤ９６、ＣＤ７３、ＣＤ４７、ＯＸ４０、ＧＩＴＲ、ＣＳＦ１Ｒ、ＪＡＫ、ＰＩ３Ｋδ、ＰＩ３Ｋγ、ＴＡＭ、アルギナーゼ、ＣＤ１３７、ＩＣＯＳ、Ａ２ＡＲ、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ４、ＢＴＬＡ、ＣＴＬＡ−４、ＬＡＧ３、ＴＩＭ３、ＶＩＳＴＡ、ＣＤ９６、ＴＩＧＩＴ、ＣＤ１２２、ＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１及びＰＤ−Ｌ２からなる群から選択されるポリペプチドに結合する抗体である、請求項１乃至２１のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項２３】
該免疫チェックポイント阻害剤が、ＰＤ−Ｌ１またはＣＴＬＡ４に特異的な抗体である、請求項１乃至２２のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項２４】
該免疫チェックポイント阻害剤が、ＰＤ−１に特異的な抗体である、請求項１乃至２２のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項２５】
それを必要とする個体において免疫応答を調節するための、多量体ポリペプチドを含む医薬の製造における、該多量体ポリペプチドの使用であって、
該多量体ポリペプチドは、
ａ）ｉ）がん細胞により提示されるエピトープである、ヒトパピローマウイルスＥ７エピトープまたはがん関連抗原中に存在するエピトープを含むペプチド、及び
ｉｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩポリペプチド
を含む第１のポリペプチド、ならびに
ｂ）第２のＭＨＣクラスＩポリペプチドを含む第２のポリペプチド
を含み、
該多量体ポリペプチドは、１または複数の免疫調節ポリペプチドを含み、
該第１および／または第２のポリペプチドは、任意で免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含み、
免疫チェックポイント阻害剤と組み合わせて用いられることを特徴とする、使用。
【請求項２６】
ａ）該第１のＭＨＣクラスＩポリペプチドが、β２−ミクログロブリン（β２Ｍ）ポリペプチドであり、および該第２のＭＨＣポリペプチドが、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである、または
ｂ）該第１のＭＨＣクラスＩポリペプチドが、ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドであり、および該第２のＭＨＣポリペプチドが、β２Ｍポリペプチドである、請求項２５に記載の使用。
【請求項２７】
該１または複数の免疫調節ポリペプチドの少なくとも１つが、対応する野生型免疫調節ポリペプチドの免疫共調節ポリペプチドに対する親和性と比較して、該免疫共調節ポリペプチドに対する低減した親和性を呈する変異免疫調節ポリペプチドである、請求項２５または２６に記載の使用。
【請求項２８】
該免疫調節ポリペプチドが、４−１ＢＢＬポリペプチド、ＣＤ８０ポリペプチド、ＣＤ８６ポリペプチド、ＩＬ−２ポリペプチド、Ｂ７−１ポリペプチド、Ｂ７−２ポリペプチド、ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチド、ＯＸ−４０Ｌポリペプチド、ＰＤ−Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、及びＰＤ−Ｌ２ポリペプチドからなる群から選択される、請求項２５乃至２７のいずれか一項に記載の使用。
【請求項２９】
それを必要とする個体において免疫応答を調節するための、多量体ポリペプチドを含む医薬の製造における、該多量体ポリペプチドの使用であって、
該多量体ポリペプチドは、
ａ）ｉ）ヒトパピローマウイルスＥ７エピトープを含むペプチドエピトープ、及び
ｉｉ）β２−ミクログロブリン（β２Ｍ）ポリペプチドである、第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチド
を含む第１のポリペプチド、ならびに
ｂ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである、第２のＭＨＣポリペプチドを含む第２のポリペプチド
を含み、
該多量体ポリペプチドは、１または複数の免疫調節ドメインを含み、
該第１および／または第２のポリペプチドは、任意で免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含み、
該１または複数の免疫調節ドメインの少なくとも１つが、配列番号１に記載されるアミノ酸配列を有するＩＬ−２の、ＩＬ２Ｒに対する結合親和性と比較して、配列番号１８、１９及び２０に記載されるアミノ酸配列をそれぞれ有するα、β及びγポリペプチドを含むＩＬ−２受容体（ＩＬ２Ｒ）に対する低減した結合親和性を呈する変異ＩＬ−２ポリペプチドであり、
免疫チェックポイント阻害剤と組み合わせて用いられることを特徴とする、使用。
【請求項３０】
該免疫チェックポイント阻害剤および該多量体ポリペプチドが、個体に、同時にまたは異なる時間に投与されるように用いられることを特徴とする、請求項２５乃至２９のいずれか一項に記載の使用。
【請求項３１】
該第２のポリペプチドが、１つまたは２つの免疫調節ポリペプチドを含み、ならびにそれぞれの免疫調節ポリペプチドが、
配列番号１に記載されるアミノ酸配列と比較して、Ｈ１６Ａのアミノ酸置換を含む変異ＩＬ−２ポリペプチド、および
配列番号１に記載のアミノ酸配列と比較して、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａのアミノ酸置換を含む、変異ＩＬ−２ポリペプチド
からなる群から選択される、請求項２９に記載の使用。
【請求項３２】
該ペプチドエピトープが、ＨＰＶ１６Ｅ７／８２−９０（ＬＬＭＧＴＬＧＩＶ；配列番号７５）、ＨＰＶ１６Ｅ７／８６−９３（ＴＬＧＩＶＣＰＩ；配列番号７６）、ＨＰＶ１６Ｅ７／ｌｌ−２０（ＹＭＬＤＬＱＰＥＴＴ；配列番号７７）、およびＨＰＶ１６Ｅ７／ｌｌ−１９（ＹＭＬＤＬＱＰＥＴ；配列番号７８）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２９乃至３１のいずれか一項に記載の使用。
【請求項３３】
該第１および／または第２のポリペプチドが、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含み、ならびに該ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドが、配列番号４４のアミノ酸配列と比較して、Ｌ２３４ＡおよびＬ２３５Ａのアミノ酸置換を含む、請求項２５乃至３２のいずれか一項に記載の使用。
【請求項３４】
該β２−ミクログロブリン（β２Ｍ）ポリペプチドが、配列番号９５、１９５、９６、９７および９８に記載されるアミノ酸配列のそれぞれの２１乃至１１９位のアミノ酸を含み、該アミノ酸配列が、任意でＲ１２Ｃのアミノ酸置換を含む、請求項２６乃３３のいずれか一項に記載の使用。
【請求項３５】
該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、ＨＬＡ−Ａ重鎖である、請求項２６乃至３４のいずれか一項に記載の使用。
【請求項３６】
該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、配列番号２９に記載されるアミノ酸配列の２５乃至３６５位のアミノ酸を含み、該アミノ酸配列が、任意でＹ８４Ａのアミノ酸置換、Ａ２３６Ｃのアミノ酸置換、またはＹ８４ＡおよびＡ２３６Ｃのアミノ酸置換の両方を含む、請求項２６乃至３５のいずれか一項に記載の使用。
【請求項３７】
該第１のポリペプチドおよび該第２のポリペプチドが、ジスルフィド結合を介して互いに共有結合的に連結され、該ジスルフィド結合は、該β２Ｍポリペプチド中のＣｙｓ残基と、該ＭＨＣ重鎖ポリペプチド中のＣｙｓ残基を結ぶ、請求項２６乃至３６のいずれか一項に記載の使用。
【請求項３８】
該β２Ｍポリペプチドのアミノ酸残基１２位のＣｙｓが、該ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのアミノ酸残基２３６位のＣｙｓにジスルフィド結合している、請求項３７に記載の使用。
【請求項３９】
該第１のポリペプチドおよび該第２のポリペプチドが、ジスルフィド結合を介して互いに共有結合的に連結され、該第１のポリペプチドが、該ペプチドエピトープと該β２Ｍポリペプチドとの間にリンカーを含み、および該ジスルフィド結合が、該リンカー中に存在するＣｙｓを該ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのＣｙｓに連結する、請求項２６乃至３６のいずれか一項に記載の使用。
【請求項４０】
該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、配列番号２９に記載されるアミノ酸配列の２５乃至３６５位のアミノ酸を含み、該アミノ酸配列が、任意でＹ８４Ａのアミノ酸置換、Ａ２３６Ｃのアミノ酸置換、またはＹ８４ＡおよびＡ２３６Ｃのアミノ酸置換の両方を含む、請求項２６乃至３９のいずれか一項に記載の使用。
【請求項４１】
該多量体ポリペプチドが、
ａ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）アミノ酸配列ＹＭＬＤＬＱＰＥＴＴ（配列番号７７）を含み、１０アミノ酸の長さを有するペプチドエピトープ、および
ｉｉ）β２−ミクログロブリン（β２M）ポリペプチドである、第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチド
を含む、第１のポリペプチド、ならびに
ｂ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）配列番号１に記載のアミノ酸配列と比較して、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａのアミノ酸置換を含む、変異ＩＬ−２ポリペプチドである、第１の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉ）配列番号１に記載のアミノ酸配列と比較して、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａのアミノ酸置換を含む、変異ＩＬ−２ポリペプチドである、第２の免疫調節ポリペプチド、
ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである、第２のＭＨＣポリペプチド、および
ｉｖ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチド
を含む、第２のポリペプチド
を含み、
該β２−ミクログロブリン（β２Ｍ）ポリペプチドが、配列番号９５、１９５、９６、９７および９８に記載されるアミノ酸配列のそれぞれの２１乃至１１９位のアミノ酸を含み、該アミノ酸配列が、任意でＲ１２Ｃのアミノ酸置換を含み、
該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、配列番号２９に記載されるアミノ酸配列の２５乃至３６５位のアミノ酸を含み、該アミノ酸配列が、任意でＹ８４Ａのアミノ酸置換、Ａ２３６Ｃのアミノ酸置換、またはＹ８４ＡおよびＡ２３６Ｃのアミノ酸置換の両方を含み、および
該第１のポリペプチドおよび該第２のポリペプチドが、ジスルフィド結合を介して互いに共有結合的に連結され、および該ジスルフィド結合は、該β２Ｍポリペプチドのアミノ酸残基１２位のＣｙｓと、該ＭＨＣ重鎖ポリペプチドのアミノ酸残基２３６位のＣｙｓを結ぶ、
請求項２９乃至４０のいずれか一項に記載の使用。
【請求項４２】
ｉ）該β２−ミクログロブリン（β２Ｍ）ポリペプチドが、配列番号４８に示されるアミノ酸配列を含み、
ｉｉ）該第１及び第２の変異ＩＬ−２ポリペプチドが、配列番号４９に示されるアミノ酸配列を含み、
ｉｉｉ）該ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、配列番号５０に示されるアミノ酸配列を含み、および
ｉｖ）該Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドが、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドであり、および配列番号４４、４５、４６または４７に示されるアミノ酸配列を含む、
請求項４１に記載の使用。
【請求項４３】
該第１のポリペプチドが、該エピトープと該β２−ミクログロブリンポリペプチドとの間にリンカーを含み、および該第２のポリペプチドが、
ａ）該変異ＩＬ−２ポリペプチドの第１のコピーと該変異ＩＬ−２ポリペプチドの第２のコピーとの間、
ｂ）該変異ＩＬ−２ポリペプチドと該ＭＨＣ重鎖ポリペプチドとの間、および
ｃ）該ＭＨＣ重鎖ポリペプチドと前記ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドとの間
の１つ以上にペプチドリンカーを含む、
請求項４２に記載の使用。
【請求項４４】
該ペプチドリンカーが、（ＧＧＧＧＳ）３、（ＧＧＧＧＳ）４、及びＡＡＡＧＧからなる群から選択される、請求項４３に記載の使用。
【請求項４５】
該多量体ポリペプチドが、
ａ）配列番号４２に示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド、および
ｂ）配列番号３３に示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド、
または
ａ）配列番号４２に示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド、および
ｂ）配列番号３６に示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド、
または
ａ）配列番号４２に示されるアミノ酸配列を含む第１のポリペプチド、及び
ｂ）配列番号３９に示されるアミノ酸配列を含む第２のポリペプチド
を含むヘテロ二量体ポリペプチドである、請求項４１乃至４４のいずれか一項に記載の使用。
【請求項４６】
該免疫チェックポイント阻害剤が、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ４０、ＣＤ１２２、ＣＤ９６、ＣＤ７３、ＣＤ４７、ＯＸ４０、ＧＩＴＲ、ＣＳＦ１Ｒ、ＪＡＫ、ＰＩ３Ｋδ、ＰＩ３Ｋγ、ＴＡＭ、アルギナーゼ、ＣＤ１３７、ＩＣＯＳ、Ａ２ＡＲ、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ４、ＢＴＬＡ、ＣＴＬＡ−４、ＬＡＧ３、ＴＩＭ３、ＶＩＳＴＡ、ＣＤ９６、ＴＩＧＩＴ、ＣＤ１２２、ＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１及びＰＤ−Ｌ２からなる群から選択されるポリペプチドに結合する抗体である、請求項２５乃至４５のいずれか一項に記載の使用。
【請求項４７】
該免疫チェックポイント阻害剤が、ＰＤ−Ｌ１またはＣＴＬＡ４に特異的な抗体である、請求項２５乃至４６のいずれか一項に記載の使用。
【請求項４８】
該免疫チェックポイント阻害剤が、ＰＤ−１に特異的な抗体である、請求項２５乃至４６のいずれか一項に記載の使用。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００３】
概要
本開示は、個体の免疫応答を調節する方法を提供する。本開示は、治療の方法を提供する。本開示は、個体に、多量体ポリペプチド（ｓｙｎＴａｃ）及び免疫チェックポイント阻害剤を投与することを含む、方法を提供する。本開示は、免疫チェックポイント阻害剤による治療を受けている個体に、多量体ポリペプチド（ｓｙｎＴａｃ）を投与することを含む、方法を提供する。
[本発明1001]
免疫応答を調節することを、それを必要とする個体において行う方法であって、前記個体に、多量体ポリペプチド及び免疫チェックポイント阻害剤を投与することを含み、
前記多量体ポリペプチドは、
ａ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）第1の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチド
を含む、第1のポリペプチドと、
ｂ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）第2のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉ）任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格
を含む、第2のポリペプチドと
を含み、
前記多量体ポリペプチドは、1つ以上の免疫調節ポリペプチドを含み、前記1つ以上の免疫調節ポリペプチドは、
Ａ）前記第1のポリペプチドのＣ末端、
Ｂ）前記第2のポリペプチドのＮ末端、
Ｃ）前記第2のポリペプチドのＣ末端、または
Ｄ）前記第1のポリペプチドのＣ末端及び前記第2のポリペプチドのＮ末端に位置し、
前記投与することは、前記個体において、免疫応答を調節する、前記方法。
[本発明1002]
前記多量体ポリペプチドが、
ａ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）第1のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉｉ）免疫調節ドメイン
を含む、第1のポリペプチドと、
ｂ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）第2のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチド
を含む、第2のポリペプチドと
を含む、本発明1001の方法。
[本発明1003]
前記多量体ポリペプチドが、
ａ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）エピトープ、及び
ｉｉ）第1のＭＨＣポリペプチド
を含む、第1のポリペプチドと、
ｂ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）免疫調節ドメイン、
ｉｉｉ）第2のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチド
を含む、第2のポリペプチドと
を含む、本発明1001の方法。
[本発明1004]
前記多量体ポリペプチドが、
ａ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）エピトープ、及び
ｉｉ）第1のＭＨＣポリペプチド
を含む、第1のポリペプチドと、
ｂ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）第2のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチド、及び
ｉｉｉ）免疫調節ドメイン
を含む、第2のポリペプチドと
を含む、本発明1001の方法。
[本発明1005]
前記多量体ポリペプチドが、
ａ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）エピトープ、及び
ｉｉ）第1のＭＨＣポリペプチド
を含む、第1のポリペプチドと、
ｂ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）第2のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉ）免疫調節ドメイン
を含む、第2のポリペプチドと
を含む、本発明1001の方法。
[本発明1006]
前記多量体ポリペプチドが、
ａ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）エピトープ、及び
ｉｉ）第1のＭＨＣポリペプチド
を含む、第1のポリペプチドと、
ｂ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）免疫調節ドメイン、及び
ｉｉ）第2のＭＨＣポリペプチド
を含む、第2のポリペプチドと
を含む、本発明1001の方法。
[本発明1007]
前記多量体ポリペプチドが、
ａ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）エピトープ、
ｉｉ）第1のＭＨＣポリペプチド、及び
ｉｉｉ）免疫調節ドメイン
を含む、第1のポリペプチドと、
ｂ）Ｎ末端からＣ末端への順序で、
ｉ）第2のＭＨＣポリペプチド
を含む、第2のポリペプチドと
を含む、本発明1001の方法。
[本発明1008]
前記多量体ポリペプチドの前記非Ｉｇ骨格が、ＸＴＥＮポリペプチド、トランスフェリンポリペプチド、Ｆｃ受容体ポリペプチド、エラスチン様ポリペプチド、シルク様ポリペプチド、またはシルクエラスチン様ポリペプチドである、本発明1001の方法。
[本発明1009]
前記多量体ポリペプチドの前記第1のＭＨＣポリペプチドがβ2−ミクログロブリンポリペプチドであり、前記第2のＭＨＣポリペプチドがＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドである、本発明1001〜1008のいずれかの方法。
[本発明1010]
前記多量体ポリペプチドの前記β2−ミクログロブリンポリペプチドが、図6に記載されるアミノ酸配列のうちの1つに対して、少なくとも85％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、本発明1009の方法。
[本発明1011]
前記多量体ポリペプチドの前記ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−ＢまたはＨＬＡ−Ｃの重鎖である、本発明1009の方法。
[本発明1012]
前記ＭＨＣクラスＩ重鎖ポリペプチドが、図5Ａ〜5Ｃのうちの1つに記載されるアミノ酸配列に対して、少なくとも85％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、本発明1011の方法。
[本発明1013]
前記多量体ポリペプチドの前記第1のＭＨＣポリペプチドがＭＨＣクラスＩＩのα鎖ポリペプチドであり、前記第2のＭＨＣポリペプチドがＭＨＣクラスＩＩのβ鎖ポリペプチドである、本発明1001〜1008のいずれかの方法。
[本発明1014]
前記エピトープがＴ細胞エピトープである、本発明1001〜1013のいずれかの方法。
[本発明1015]
前記多量体ポリペプチドの多量体ポリペプチドが、Ｆｃポリペプチドを含み、前記Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドが、ＩｇＧ1  Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ2  Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ3  Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ4  Ｆｃポリペプチド、ＩｇＡ  Ｆｃポリペプチド、またはＩｇＭ  Ｆｃポリペプチドである、本発明1001〜1007のいずれかの方法。
[本発明1016]
前記Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドが、図4Ａ〜4Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも85％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、本発明1015の方法。
[本発明1017]
前記多量体ポリペプチドの前記第1のポリペプチド及び前記第2のポリペプチドが、非共有結合的に会合している、本発明1001〜1016のいずれかの方法。
[本発明1018]
前記多量体ポリペプチドの前記第1のポリペプチド及び前記第2のポリペプチドが、共有結合的に連結されている、本発明1001〜1016のいずれかの方法。
[本発明1019]
前記共有結合が、ジスルフィド結合によるものである、本発明1013の方法。
[本発明1020]
前記多量体ポリペプチドの前記第1のＭＨＣポリペプチド、または前記エピトープと前記第1のＭＨＣポリペプチドとの間のリンカーが、第1のＣｙｓ残基をもたらすアミノ酸置換を含み、前記多量体ポリペプチドの前記第2のＭＨＣポリペプチドが、第2のＣｙｓ残基をもたらすアミノ酸置換を含み、前記ジスルフィド連結が、前記第1のＣｙｓ残基と前記第2のＣｙｓ残基との間にある、本発明1019の方法。
[本発明1021]
前記多量体ポリペプチドが、前記エピトープと前記第1のＭＨＣポリペプチドとの間、前記免疫調節ポリペプチドと前記ＭＨＣポリペプチドとの間、または前記ＭＨＣポリペプチドと前記Ｉｇ  Ｆｃとの間にリンカーを含む、本発明1001〜1008のいずれかの方法。
[本発明1022]
前記多量体ポリペプチドの前記免疫調節ポリペプチドが、4−1ＢＢＬポリペプチド、Ｂ7−1ポリペプチド、Ｂ7−2ポリペプチド、ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチド、ＯＸ−40Ｌポリペプチド、ＣＤ80ポリペプチド、ＣＤ86ポリペプチド、ＰＤ−Ｌ1ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、及びＰＤ−Ｌ2ポリペプチドから選択される、本発明1001〜1008のいずれかの方法。
[本発明1023]
前記多量体ポリペプチドが2つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む、本発明1001〜1022のいずれかの方法。
[本発明1024]
前記2つ以上の免疫調節ポリペプチドがタンデムに並んでいる、本発明1023の方法。
[本発明1025]
前記免疫調節ポリペプチドが、4−1ＢＢＬポリペプチド、ＣＤ80ポリペプチド、ＣＤ86ポリペプチド、ＩＬ−2ポリペプチド、Ｂ7−1ポリペプチド、Ｂ7−2ポリペプチド、ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチド、ＯＸ−40Ｌポリペプチド、ＣＤ86ポリペプチド、ＰＤ−Ｌ1ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、及びＰＤ−Ｌ2ポリペプチドから選択される、本発明1001〜1024のいずれかの方法。
[本発明1026]
前記免疫調節ポリペプチドが、変異免疫調節ポリペプチドであり、前記免疫調節ポリペプチドの天然型と比較して1つ以上のアミノ酸置換を有し、前記変異免疫調節ポリペプチドは、前記免疫調節ポリペプチドの前記天然型が結合する共調節ポリペプチドに対して、結合親和性の低下を呈する、本発明1001〜1025のいずれかの方法。
[本発明1027]
前記免疫調節ポリペプチドが、配列番号1に記載のものに対して、少なくとも85％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、変異ＩＬ−2ポリペプチドであり、
前記変異ＩＬ−2ポリペプチドは、配列番号1に記載のものと比較して、1つ以上のアミノ酸置換を有し、
前記変異ＩＬ−2ポリペプチドは、図3Ａ〜3Ｃに示されるアミノ酸配列を有するα、β及びγポリペプチドを含むＩＬ−2受容体（ＩＬ2Ｒ）に対して、配列番号1のうち1つのものに記載されるＩＬ−2アミノ酸配列の前記ＩＬ2Ｒに対する結合親和性と比較して、結合親和性の低下を呈する、
本発明1001〜1025のいずれかの方法。
[本発明1028]
前記変異ＩＬ−2ポリペプチドが、Ｅ15、Ｈ16、Ｄ20、Ｆ42、Ｙ45及びＱ126のうちの1つ以上の置換を含む、本発明1027の方法。
[本発明1029]
前記変異ＩＬ−2ポリペプチドが、
ａ）Ｆ42及びＤ20の置換、
ｂ）Ｆ42及びＨ16の置換、
ｃ）Ｆ42、Ｄ20及びＹ45の置換、または
ｄ）Ｆ42、Ｈ16及びＱ126の置換
を含む、本発明1028の方法。
[本発明1030]
前記免疫調節ポリペプチドが、変異4−1ＢＢＬ免疫調節ポリペプチドであり、
前記変異4−1ＢＢＬ免疫調節ポリペプチドが、図37に示されるアミノ酸配列を有する4−1ＢＢポリペプチドに対して、図36Ａに示される4−1ＢＢＬアミノ酸配列の結合親和性と比較して、結合親和性の低下を呈し、及び／または
前記変異4−1ＢＢＬ免疫調節ポリペプチドが、図36Ａに示される4−1ＢＢＬアミノ酸配列の産生レベルと比較して、哺乳動物細胞による産生レベルの増加を呈する、本発明1001〜1021のいずれかの方法。
[本発明1031]
前記変異4−1ＢＢＬ免疫調節ポリペプチドが、図36Ａに記載されるアミノ酸ナンバリングに基づいて、アミノ酸91、92、94〜115、117〜126、128〜132、144〜153、155〜158、184〜187、189〜191、193〜195、197、210〜219、221〜224、226、228〜231、233及び234のうちの1つの置換を含む、本発明1030の方法。
[本発明1032]
前記変異免疫調節ポリペプチドが、前記4−1ＢＢポリペプチドに対して、図36Ａに示されるまたは配列番号213〜215のうちの1つに記載される4−1ＢＢＬアミノ酸配列によって呈される結合親和性の50％未満の結合親和性を呈する、本発明1030または1031の方法。
[本発明1033]
前記多量体ポリペプチドが、Ｎ297Ａ、Ｌ234Ａ、Ｌ235Ａ、Ｌ234Ｆ、Ｌ235Ｅ及びＰ331Ｓから選択される1つ以上のアミノ酸置換を含むＩｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、本発明1001〜1032のいずれかの方法。
[本発明1034]
前記Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドが、
ａ）Ｎ297Ａ置換、
ｂ）Ｌ234Ａ置換及びＬ235Ａ置換、
ｃ）Ｌ234Ｆ置換及びＬ235Ｅ置換、または
ｄ）Ｌ234Ｆ置換、Ｌ235Ｅ置換及びＰ331Ｓ置換
を含む、本発明1033の方法。
[本発明1035]
前記多量体ポリペプチドの前記エピトープが、アミノ酸配列ＹＭＬＤＬＱＰＥＴＴ（配列番号77）を含む、本発明1001〜1034のいずれかの方法。
[本発明1036]
前記多量体ポリペプチドの前記β2−ミクログロブリンポリペプチドが、図34Ａに示されるアミノ酸配列を含む、本発明1001〜1035のいずれかの方法。
[本発明1037]
前記多量体ポリペプチドの前記主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）の重鎖ポリペプチドが、図34Ｃに示されるアミノ酸配列を含む、本発明1001〜1036のいずれかの方法。
[本発明1038]
前記免疫チェックポイント阻害剤が、前記免疫チェックポイント阻害剤に特異的な抗体である、本発明1001〜1037のいずれかの方法。
[本発明1039]
前記抗体がモノクローナル抗体である、本発明1038の方法。
[本発明1040]
前記抗体が、少なくとも1つのヒト化軽鎖及び／または重鎖フレームワーク領域を含む、本発明1038または1039の方法。
[本発明1041]
前記抗体が、Ｆｃポリペプチドを含み、前記Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドが、ＩｇＧ1  Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ2  Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ3  Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ4  Ｆｃポリペプチド、ＩｇＡ  Ｆｃポリペプチド、またはＩｇＭ  Ｆｃポリペプチドである、本発明1038の方法。
[本発明1042]
前記抗体が、Ｆｖ断片、ナノボディまたはＦａｂ断片である、本発明1038の方法。
[本発明1043]
前記免疫チェックポイント阻害剤が、ＣＤ27、ＣＤ28、ＣＤ40、ＣＤ122、ＣＤ96、ＣＤ73、ＣＤ47、ＯＸ40、ＧＩＴＲ、ＣＳＦ1Ｒ、ＪＡＫ、ＰＩ3Ｋδ、ＰＩ3Ｋγ、ＴＡＭ、アルギナーゼ、ＣＤ137（4−1ＢＢとしても知られる）、ＩＣＯＳ、Ａ2ＡＲ、Ｂ7−Ｈ3、Ｂ7−Ｈ4、ＢＴＬＡ、ＣＴＬＡ−4、ＬＡＧ3、ＴＩＭ3、ＶＩＳＴＡ、ＣＤ96、ＴＩＧＩＴ、ＣＤ122、ＰＤ−1、ＰＤ−Ｌ1及びＰＤ−Ｌ2から選択される免疫チェックポイント阻害剤に特異的な抗体である、本発明1038〜1042のいずれかの方法。
[本発明1044]
前記免疫チェックポイント阻害剤が、ＰＤ1に特異的な抗体である、本発明1038〜1042のいずれかの方法。
[本発明1045]
前記抗体が、ペンブロリズマブ、ニボルマブ、ピジリズマブまたはＢＭＳ−39886である、本発明1044の方法。
[本発明1046]
前記免疫チェックポイント阻害剤が、ＰＤ−Ｌ1に特異的な抗体である、本発明1038〜1042のいずれかの方法。
[本発明1047]
前記抗体が、デュルバルマブ、アテゾリズマブ、ＫＮ035またはアベルマブである、本発明1046の方法。
[本発明1048]
前記免疫チェックポイント阻害剤が、ＣＴＬＡ4に特異的な抗体である、本発明1038〜1042のいずれかの方法。
[本発明1049]
前記抗体が、イピリムマブまたはトレメリムマブである、本発明1048の方法。
[本発明1050]
前記多量体ポリペプチド及び前記免疫チェックポイント阻害剤が、同じ投与経路によって投与される、本発明1001〜1049のいずれかの方法。
[本発明1051]
前記多量体ポリペプチド及び前記免疫チェックポイント阻害剤が、異なる投与経路によって投与される、本発明1001〜1049のいずれかの方法。
[本発明1052]
前記多量体ポリペプチドが、皮下、静脈内、腫瘍近傍及び筋肉内から選択される投与経路によって投与される、本発明1001〜1051のいずれかの方法。
[本発明1053]
前記免疫チェックポイント阻害剤が、皮下、静脈内、腫瘍近傍、及び筋肉内から選択される投与経路によって投与される、本発明1001〜1051のいずれかの方法。
[本発明1054]
前記個体がヒトである、本発明1001〜1053のいずれかの方法。