【手続補正書】
【提出日】令和3年2月8日(2021.2.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＣＦ患者の呼吸器系の少なくとも一部に投与されるアルギネートオリゴマーによる治療に、その患者が応答する可能性を判定する方法であって、該方法は、
（ｉ）前記患者の呼吸器系由来の粘液の検査試料について、１３９５ｃｍ−１〜１４０５ｃｍ−１、１５３７ｃｍ−１〜１５４７ｃｍ−１、および１５７８ｃｍ−１〜１５８８ｃｍ−１の波数範囲のそれぞれから選択された波数における正規化赤外（ＩＲ）吸光度値を１つ以上、または前記波数範囲のそれぞれにおける正規化ＩＲ透過率値を１つ以上、取得することと、
（ｉｉ）前記波数範囲のそれぞれについて、その範囲内の前記吸光度値のうちの少なくとも１つ、またはその範囲内の前記透過率値のうちの少なくとも１つ、を提供することで、前記３つの波数範囲のそれぞれにおける吸光度値および／または透過率値を含む検査パターンを取得することと、および
（ｉｉｉ）そのようにして取得した前記吸光度値および／または透過率値の検査パターンを、前記治療に応答しなかった少なくとも１人のＣＦ患者の呼吸器系由来の少なくとも１つの粘液試料から準備された負の基準パターン、および／または前記治療に応答した少なくとも１人のＣＦ患者の呼吸器系由来の少なくとも１つの粘液試料から準備された正の基準パターンと比較することと、を含む、方法であって
（ａ）前記負の基準パターンに一致する、かつ／または前記正の基準パターンに一致しない、検査パターンは、前記患者が前記治療に応答しないことを示し、
（ｂ）前記正の基準パターンに一致する、かつ／または前記負の基準パターンに一致しない、検査パターンは、前記患者が前記治療に応答することを示す、方法。
【請求項２】
前記治療に対する応答は、前記ＣＦ患者の呼吸器合併症またはＣＦの症状の改善および予防、あるいは前記ＣＦ患者の呼吸器合併症またはＣＦの症状の進展の遅延を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記検査パターンは、各波数範囲内の単一波数からの単一ＩＲ吸光度値、または各波数範囲内の同一の単一波数において取得された複数の吸光度値の平均ＩＲ吸光度値のいずれかのみから形成される、請求項１または請求項２に記載の方法。
【請求項４】
（ｉ）第１の波数範囲は、１３９６ｃｍ−１〜１４０４ｃｍ−１、１３９７ｃｍ−１〜１４０３ｃｍ−１、１３９８ｃｍ−１〜１４０２ｃｍ−１、１３９９ｃｍ−１〜１４０１ｃｍ−１、または約１４００ｃｍ−１であり、および／または
（ｉｉ）第２の波数範囲は、１５３８ｃｍ−１〜１５４６ｃｍ−１、１５３９ｃｍ−１〜１５４５ｃｍ−１、１５４０ｃｍ−１〜１５４４ｃｍ−１、１５４１ｃｍ−１〜１５４３ｃｍ−１、または約１５４２ｃｍ−１であり、および／または
（ｉｉｉ）第３の波数範囲は、１５７９ｃｍ−１〜１５８７ｃｍ−１、１５８０ｃｍ−１〜１５８６ｃｍ−１、１５８１ｃｍ−１〜１５８５ｃｍ−１、１５８２ｃｍ−１〜１５８４ｃｍ−１、または約１５８３ｃｍ−１である、請求項１〜３のいずれか一つに記載の方法。
【請求項５】
前記試料は、痰である、請求項１〜４のいずれか一つに記載の方法。
【請求項６】
前記ＩＲ吸光度値またはＩＲ透過率値は、フーリエ変換赤外（ＦＴＩＲ）分光計、好ましくは、ＡＴＲ−ＦＴＩＲ分光計または透過ＦＴＩＲ分光計によって準備されてもよい、請求項１〜５のいずれか一つに記載の方法。
【請求項７】
前記ＩＲ吸光度値またはＩＲ透過率値のうちの１つ以上は、本発明の前記波数範囲のうちの１つ以上にわたる連続的なＩＲ吸収スペクトルまたはＩＲ透過スペクトルの一部、またはその複数の部分として提供され、
好ましくは、前記ＩＲスペクトルの範囲は、４０００〜４５０ｃｍ−１、１８００〜９５０ｃｍ−１、１７００〜１０００ｃｍ−１、または１７００〜１２００ｃｍ−１である、請求項１〜６のいずれか一つに記載の方法。
【請求項８】
前記ＩＲ吸光度値またはＩＲ透過率値は、最小最大正規化またはベクトル正規化によって正規化され、
好ましくは正規化は、アミドＩの波数における吸光度または透過率に基づき、
好ましくは前記アミドＩの波数は、１６３５ｃｍ−１〜１６４５ｃｍ−１、１６３７ｃｍ−１〜１６４３ｃｍ−１、１６３９ｃｍ−１〜１６４１ｃｍ−１、または約１６４０ｃｍ−１である、請求項１〜７のいずれか一つに記載の方法。
【請求項９】
ステップ（ｉｉ）およびステップ（ｉｉｉ）は、
（ｉｉ）前記波数範囲のそれぞれについて、その範囲内の前記吸光度値のうちの少なくとも１つ、またはその範囲内の前記透過率値のうちの少なくとも１つ、を、前記波数範囲にわたる連続的なＩＲスペクトルまたはその部分である、検査ＩＲスペクトルの形態で、提供すること、および
（ｉｉｉ）前記検査ＩＲスペクトルを、前記治療に応答しなかった少なくとも１人のＣＦ患者の呼吸器系由来の少なくとも１つの粘液試料から準備された少なくとも１つの負のＩＲ基準スペクトル、および／または前記治療に応答した少なくとも１人のＣＦ患者の呼吸器系由来の少なくとも１つの粘液試料から準備された少なくとも１つの正の基準ＩＲスペクトルと比較すること、であり、
（ａ）前記負の基準ＩＲスペクトルに一致する、かつ／または前記正の基準ＩＲスペクトルに一致しない、検査ＩＲスペクトルは、前記患者が前記治療に応答しないことを示し、
（ｂ）前記正の基準ＩＲスペクトルに一致する、かつ／または前記負の基準ＩＲスペクトルに一致しない、検査ＩＲスペクトルは、前記患者が前記治療に応答することを示す、請求項１〜８のいずれか一つに記載の方法。
【請求項１０】
ステップ（ｉｉ）およびステップ（ｉｉｉ）は、
（ｉｉ）前記波数範囲のそれぞれについて、その範囲内の前記吸光度値のうちの１つ、またはその範囲内の前記透過率値のうちの１つ、を提供し、そのようにして提供された３つの値を、当該そのようにして提供された３つの値を座標として有する、ユークリッド空間内の単一検査データポイントとして表すこと、および
（ｉｉｉ）前記検査データポイントを、前記治療に応答しなかった少なくとも１人のＣＦ患者の呼吸器系由来の少なくとも１つの粘液試料から準備された負の基準データポイント、および／または前記治療に応答した少なくとも１人のＣＦ患者の呼吸器系由来の少なくとも１つの粘液試料から準備された正の基準データポイントと比較すること、であり、
（ａ）前記検査データポイントが、前記負の基準データポイントと近接性があること、および／または前記正の基準データポイントと近接性がないことは、前記患者が（the patient the patient）前記治療に応答しないことを示し、
（ｂ）前記検査データポイントが、前記正の基準データポイントと近接性があること、および／または前記負の基準データポイントと近接性がないことは、前記患者が前記治療に応答することを示す、請求項１〜８のいずれか一つに記載の方法。
【請求項１１】
検査ＩＲ吸光度値および／または検査ＩＲ透過率値のパターンは、前記波数範囲のうちの２つ、好ましくは３つについて、前記検査ＩＲ吸光度値または検査ＩＲ透過率値の、同一の波数範囲の同一の波数における基準パターンのＩＲ吸光度値またはＩＲ透過率値からの正または負の偏差が２５％以下である場合に、基準パターンに一致する、請求項１〜８のいずれか一つに記載の方法。
【請求項１２】
検査パターンと基準パターンとの間の一致は、数式Ｉ
【数４】
2020507573.tif 000001
を適用することによって分析され、
Ａは、波数範囲１３９５ｃｍ−１〜１４０５ｃｍ−１内の正規化ＩＲ吸光度値であり、Ｂは、波数範囲１５３７ｃｍ−１〜１５４７ｃｍ−１内の正規化ＩＲ吸光度値であり、Ｃは、波数範囲１５７８ｃｍ−１〜１５８８ｃｍ−１内の正規化吸光度値であり、吸光度は、最小最大正規化によって、アミドＩピークを基準ピークとして０〜２．０のスケールで正規化され、予測結果が０．５以上であることは、前記患者がアルギネートオリゴマーによる治療に応答することを示し、予測結果が０．５未満であることは、前記患者が応答しないことを示す、請求項１〜８のいずれか一つに記載の方法。
【請求項１３】
検査パターンと基準パターンとの間の一致は、数式ＩＩ
【数５】
2020507573.tif 000002
を適用することによって分析され、
Ａ＊は、波数範囲１３９５ｃｍ−１〜１４０５ｃｍ−１内の正規化％ＩＲ透過率値であり、Ｂ＊は、波数範囲１５３７ｃｍ−１〜１５４７ｃｍ−１内の正規化％ＩＲ透過率値であり、Ｃ＊は、波数範囲１５７８ｃｍ−１〜１５８８ｃｍ−１内の正規化％透過率値であり、透過率は、最小最大正規化によって、アミドＩピークを基準ピークとして正規化され、予測結果が０．５以上であることは、前記患者がアルギネートオリゴマーによる治療に応答することを示し、予測結果が０．５未満であることは、前記患者が応答しないことを示す、請求項１〜８のいずれか一つに記載の方法。
【請求項１４】
前記方法は、呼吸器系にアルギネートオリゴマー療法を行った際に、改善しそうな呼吸器合併症またはＣＦの症状がある、あるいは、その際に、ＣＦの呼吸器合併症の進展が予防または遅延されそうである、とＣＦ患者を診断する、さらなるステップを含む、請求項１〜１３のいずれか一つに記載の方法。
【請求項１５】
ＣＦ患者を治療する方法において用いるためのアルギネートオリゴマーを含む薬剤であって、
該方法は、請求項１〜１４のいずれか一つで定義された方法によって、前記患者が、前記アルギネートオリゴマーによる治療に応答する可能性があると判定すること、および
前記患者の呼吸器系に有効量の前記アルギネートオリゴマーを投与することを含む薬剤。
【請求項１６】
前記ＣＦ患者は、
（ｉ）呼吸器系の少なくとも一部に投与されるアルギネートオリゴマーによる治療を受けたことがないＣＦ患者、または
（ｉｉ）呼吸器系の少なくとも一部に投与されるアルギネートオリゴマーによる治療を受けているところである、または受けたことがある、ＣＦ患者、である、請求項１〜１５のいずれか一つに記載の方法または薬剤。
【請求項１７】
（ｉ）前記アルギネートオリゴマーの平均分子量は、３５，０００ダルトン未満、好ましくは、３０，０００ダルトン未満、２５，０００ダルトン未満、または２０，０００ダルトン未満であり； 
（ｉｉ）前記アルギネートオリゴマーの重合度（ＤＰ）または数平均重合度（ＤＰｎ）は、４〜１００、４〜７５、４〜５０、４〜３５、４〜３０、４〜２５、４〜２２、４〜２０、４〜１８、４〜１６、または４〜１４であり； 
（ｉｉｉ）前記アルギネートオリゴマーの重合度（ＤＰ）または数平均重合度（ＤＰｎ）は、５〜５０、５〜３５、５〜３０、５〜２５、５〜２２、５〜２０、５〜１８、５〜１６、または５〜１４であり、
（ｉｖ）前記アルギネートオリゴマーの重合度（ＤＰ）または数平均重合度（ＤＰｎ）は、６〜５０、６〜３５、６〜３０、６〜２５、６〜２２、６〜２０、６〜１８、６〜１６、または６〜１４であり、あるいは
（ｖ）前記アルギネートオリゴマーの重合度（ＤＰ）または数平均重合度（ＤＰｎ）は、８〜５０、８〜３５、８〜３０、８〜２５、１０〜２５、１０〜２２、１０〜２０、１０〜１８、または１０〜１５である、請求項１〜１６のいずれか一つに記載の方法または薬剤。
【請求項１８】
（ｉ）前記アルギネートオリゴマーは、少なくとも７０％がＧ残基であるか、または少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、もしくは少なくとも９５％がＧ残基であり、
好ましくは前記アルギネートオリゴマーのＧ残基の少なくとも８０％は、Ｇブロック内に配置されて；
（ｉｉ）前記アルギネートオリゴマーの数平均重合度は、５〜２０の範囲であり、グルロネート画分（ＦＧ）は、少なくとも０．８５であり、マンヌロネート画分（ＦＭ）は、０．１５以下であり；または
（ｉｉｉ）前記アルギネートオリゴマーは、少なくとも７０％がＭ残基であるか、または少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、もしくは少なくとも９５％がＭ残基であるか、または１００％がＭ残基であり、
好ましくは前記アルギネートオリゴマーのＭ残基の少なくとも８０％は、Ｍブロック内に配置されている、請求項１〜１７のいずれか一つに記載の方法または薬剤。
【請求項１９】
請求項１〜１８のいずれか一つに記載の方法を行うように構成された、好ましくは携帯型または手持ちサイズである、赤外分光計。