【手続補正書】
【提出日】令和3年4月2日(2021.4.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）によってコードされる主要組織適合性複合体（ＭＨＣ）を発現する対象におけるがんの処置における使用のための医薬組成物であって、前記医薬組成物は、ペプチド、または前記ペプチドをコードする組換えポリヌクレオチドを含み、
前記ペプチドは、エプスタイン・バーウイルス（ＥＢＶ）ＢＡＬＦ５遺伝子またはヒトパピローマウイルス１６型（ＨＰＶ−１６）Ｅ６遺伝子によってコードされるウイルス抗原性ペプチドの少なくとも８個の連続したアミノ酸を含み；
ここで、
（ａ）前記対象は、ＨＬＡ  Ａ０２：０１対立遺伝子によってコードされるＭＨＣを発現し、前記ウイルス抗原性ペプチドは、ＳＬＹＰＳＩＩＱＡ、ＶＬＤＤＧＱＱＩＲＶ、ＳＬＦＶＡＰＩＳＬ、ＴＬＭＫＧＶＥＬＶ、ＧＬＩＰＩＤＭＹＡＶまたはＦＡＦＲＤＬＣＩＶである；
（ｂ）前記対象は、ＨＬＡ  Ａ０１：０１対立遺伝子によってコードされるＭＨＣを発現し、前記ウイルス抗原性ペプチドは、ＩＳＥＹＲＨＹＣＹである；
（ｃ）前記対象は、ＨＬＡ  Ａ０３：０１対立遺伝子によってコードされるＭＨＣを発現し、前記ウイルス抗原性ペプチドは、ＫＩＳＥＹＲＨＹＣＹである；
（ｄ）前記対象は、ＨＬＡ  Ｂ０７：０２対立遺伝子によってコードされるＭＨＣを発現し、前記ウイルス抗原性ペプチドは、ＮＰＹＡＶＣＤＫＣＬである；または
（ｅ）前記対象は、ＨＬＡ  Ｂ０８：０１対立遺伝子によってコードされるＭＨＣを発現し、前記ウイルス抗原性ペプチドは、ＣＶＹＣＫＱＱＬＬである、医薬組成物。
【請求項２】
前記ウイルス抗原性ペプチドが、ＳＬＹＰＳＩＩＱＡ（配列番号３９８）を含み、前記対象が、Ａ０２：０１  ＨＬＡ対立遺伝子によってコードされるＭＨＣ分子を発現する、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項３】
前記ウイルス抗原性ペプチドが、ＶＬＤＤＧＱＱＩＲＶ（配列番号４２０）を含み、前記対象が、Ａ０２：０１  ＨＬＡ対立遺伝子によってコードされるＭＨＣ分子を発現する、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項４】
前記ウイルス抗原性ペプチドが、ＳＬＦＶＡＰＩＳＬ（配列番号３９４）を含み、前記対象が、Ａ０２：０１  ＨＬＡ対立遺伝子によってコードされるＭＨＣ分子を発現する、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項５】
前記ウイルス抗原性ペプチドが、ＴＬＭＫＧＶＥＬＶ（配列番号４０９）を含み、前記対象が、Ａ０２：０１  ＨＬＡ対立遺伝子によってコードされるＭＨＣ分子を発現する、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項６】
前記ウイルス抗原性ペプチドが、ＧＬＩＰＩＤＭＹＡＶ（配列番号２７３）を含み、前記対象が、Ａ０２：０１  ＨＬＡ対立遺伝子によってコードされるＭＨＣ分子を発現する、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項７】
前記ウイルス抗原性ペプチドが、ＦＡＦＲＤＬＣＩＶ（配列番号５６）を含み、前記対象が、Ａ０２：０１  ＨＬＡ対立遺伝子によってコードされるＭＨＣ分子を発現する、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項８】
前記ウイルス抗原性ペプチドが、ＩＳＥＹＲＨＹＣＹ（配列番号５８）を含み、前記対象が、Ａ０１：０１  ＨＬＡ対立遺伝子によってコードされるＭＨＣ分子を発現する、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項９】
前記ウイルス抗原性ペプチドが、ＫＩＳＥＹＲＨＹＣＹ（配列番号６２）を含み、前記対象が、Ａ０３：０１  ＨＬＡ対立遺伝子によってコードされるＭＨＣ分子を発現する、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項１０】
前記ウイルス抗原性ペプチドが、ＮＰＹＡＶＣＤＫＣＬ（配列番号６７）を含み、前記対象が、Ｂ０７：０１  ＨＬＡ対立遺伝子によってコードされるＭＨＣ分子を発現する、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項１１】
前記ウイルス抗原性ペプチドが、ＣＶＹＣＫＱＱＬＬ（配列番号５１）を含み、前記対象が、Ｂ０８：０１  ＨＬＡ対立遺伝子によってコードされるＭＨＣ分子を発現する、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項１２】
前記組換えポリヌクレオチドがＲＮＡである、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項１３】
前記ウイルス抗原性ペプチドが、約５００ｎＭ未満の結合親和性で主要組織適合性複合体（ＭＨＣ）クラスＩに結合する、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項１４】
前記ペプチドが、１００アミノ酸長またはそれ未満である、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項１５】
前記ペプチドが、ｉｎ  ｖｉｖｏ半減期、細胞標的化、抗原取り込み、抗原プロセシング、ＭＨＣ親和性、ＭＨＣ安定性、または抗原提示を増大させる改変をさらに含む、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項１６】
前記ウイルスタンパク質エピトープ配列が、ＨＰＶ−１６のＥ６遺伝子によってコードされ、前記がんが、子宮頸がん、頭頸部がん、肛門がん、泌尿生殖器がん、婦人科がんおよび子宮がんからなる群から選択される、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項１７】
前記ウイルスタンパク質エピトープ配列が、ＥＢＶのＢＡＬＦ５遺伝子によってコードされ、前記がんが、バーキットリンパ腫、ホジキンリンパ腫、胃がんおよび鼻咽頭癌からなる群から選択される、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項１８】
組合せ治療のための追加の治療剤をさらに含み、前記追加の治療剤が、化学療法剤、免疫治療剤または免疫チェックポイント阻害剤を含む、請求項１に記載の使用のための医薬組成物。
【請求項１９】
ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）によってコードされる主要組織適合性複合体（ＭＨＣ）を発現する対象におけるがんの処置における使用のための医薬組成物であって、前記医薬組成物は、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）を有するＴ細胞を含み、
前記ＴＣＲは、ＭＨＣ：ペプチド複合体に結合し、前記ＭＨＣ：ペプチド複合体の前記ペプチドは、エプスタイン・バーウイルス（ＥＢＶ）ＢＡＬＦ５遺伝子またはヒトパピローマウイルス１６型（ＨＰＶ−１６）Ｅ６遺伝子によってコードされるウイルス抗原性ペプチドの少なくとも８個の連続したアミノ酸を含み；
ここで、
（ａ）前記ＭＨＣ：ペプチド複合体の前記ＭＨＣは、ＨＬＡ  Ａ０２：０１対立遺伝子によってコードされ、前記対象は、ＨＬＡ  Ａ０２：０１対立遺伝子によってコードされるＭＨＣを発現し、前記ウイルス抗原性ペプチドは、ＳＬＹＰＳＩＩＱＡ、ＶＬＤＤＧＱＱＩＲＶ、ＳＬＦＶＡＰＩＳＬ、ＴＬＭＫＧＶＥＬＶ、ＧＬＩＰＩＤＭＹＡＶまたはＦＡＦＲＤＬＣＩＶである；
（ｂ）前記ＭＨＣ：ペプチド複合体の前記ＭＨＣは、ＨＬＡ  Ａ０１：０１対立遺伝子によってコードされ、前記対象は、ＨＬＡ  Ａ０１：０１対立遺伝子によってコードされるＭＨＣを発現し、前記ウイルス抗原性ペプチドは、ＩＳＥＹＲＨＹＣＹである；
（ｃ）前記ＭＨＣ：ペプチド複合体の前記ＭＨＣは、ＨＬＡ  Ａ０３：０１対立遺伝子によってコードされ、前記対象は、ＨＬＡ  Ａ０３：０１対立遺伝子によってコードされるＭＨＣを発現し、前記ウイルス抗原性ペプチドは、ＫＩＳＥＹＲＨＹＣＹである；
（ｄ）前記ＭＨＣ：ペプチド複合体の前記ＭＨＣは、ＨＬＡ  Ｂ０７：０２対立遺伝子によってコードされ、前記対象は、ＨＬＡ  Ｂ０７：０２対立遺伝子によってコードされるＭＨＣを発現し、前記ウイルス抗原性ペプチドは、ＮＰＹＡＶＣＤＫＣＬである；または
（ｅ）前記ＭＨＣ：ペプチド複合体の前記ＭＨＣは、ＨＬＡ  Ｂ０８：０１対立遺伝子によってコードされ、前記対象は、ＨＬＡ  Ｂ０８：０１対立遺伝子によってコードされるＭＨＣを発現し、前記ウイルス抗原性ペプチドは、ＣＶＹＣＫＱＱＬＬである、医薬組成物。
【請求項２０】
前記Ｔ細胞が、前記対象からのものである、請求項１９に記載の使用のための医薬組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３８】
本発明の態様または実施形態がマーカッシュ群または代替のその他のグループ化に関して説明される場合、本発明は挙げられた群すべてを全体として包含するだけでなく、群の各メンバーを個々におよび主群のすべての可能なサブグループおよび群のメンバーの１つまたは複数が存在しない主群も包含する。本発明は、特許請求される発明における任意の群メンバーの１つまたは複数の明確な排除も想定する。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
表１〜表６のいずれか１つの中の配列の少なくとも８個の連続したアミノ酸を含むペプチドを含む免疫原性ワクチン組成物。
（項目２）
前記ペプチドが合成ペプチドである、項目１に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目３）
前記ペプチドが組換えペプチドである、項目１に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目４）
前記ペプチドが、内在性レトロウイルスタンパク質由来の配列を含む、項目１に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目５）
前記ペプチドが、外因性ウイルスタンパク質由来の配列を含む、項目１に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目６）
前記ペプチドが、がんを有する対象のがん細胞によって発現されるタンパク質の配列を含み、前記タンパク質が、前記対象の非がん細胞によって発現されるレベルよりも高いレベルで前記がん細胞によって発現される、項目１に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目７）
前記ペプチドが、１００アミノ酸長またはそれ未満である、項目１から６のいずれかに記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目８）
前記ペプチドが、約５から約５０アミノ酸長または約１５から約３５アミノ酸長である、項目１から７のいずれかに記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目９）
前記ペプチドが、約３０アミノ酸長もしくはそれ未満または約１５アミノ酸長もしくはそれ未満である、項目１から８のいずれかに記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目１０）
前記ペプチドが、約５００ｎＭ未満の結合親和性で主要組織適合性複合体（ＭＨＣ）クラスＩに結合する配列を含む、項目１から９のいずれかに記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目１１）
前記ペプチドが、約１０００ｎＭ未満の結合親和性で主要組織適合性複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩに結合する配列を含む、項目１から９のいずれかに記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目１２）
前記ペプチドが、前記少なくとも８個の連続したアミノ酸に隣接する非天然アミノ酸をさらに含む、項目１から１１のいずれかに記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目１３）
前記組成物が、表１〜表６のいずれか１つの中の配列の少なくとも８個の連続したアミノ酸を含む第２のペプチドをさらに含み、第２の抗原性ペプチドが、約１０００ｎＭ未満の結合親和性でＭＨＣクラスＩまたはクラスＩＩに結合する、項目１から１２のいずれかに記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目１４）
ペプチドが、ポリグリシンまたはポリセリンリンカーを使用して連結される、項目１３に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目１５）
前記第２の抗原性ペプチドが、約１０００ｎＭ未満または約５００ｎＭ未満の結合親和性でＭＨＣクラスＩまたはクラスＩＩに結合する、項目１３または１４に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目１６）
前記ペプチドが、ｉｎ  ｖｉｖｏ半減期、細胞標的化、抗原取り込み、抗原プロセシング、ＭＨＣ親和性、ＭＨＣ安定性、または抗原提示を増大させる改変をさらに含む、項目１から１５のいずれかに記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目１７）
前記改変が、担体タンパク質へのコンジュゲーション、リガンドへのコンジュゲーション、抗体へのコンジュゲーション、ＰＥＧ化、ポリシアリル化、ＨＥＳ化、組換えＰＥＧミメティック、Ｆｃ融合、アルブミン融合、ナノ粒子付着、ナノ粒子封入、コレステロール融合、鉄融合、アシル化、アミド化、グリコシル化、側鎖酸化、リン酸化、ビオチン化、表面活性物質の付加、アミノ酸模倣物の付加、または非天然アミノ酸の付加である、項目１６に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目１８）
前記ペプチドが、抗原提示細胞による標的化を増大させる改変を含む、項目１６に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目１９）
前記抗原提示細胞が、樹状細胞である、項目１８に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目２０）
前記樹状細胞による標的化を増大させる前記改変が、ＤＥＣ２０５、ＸＣＲ１、ＣＤ１９７、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ１２３、ＣＤ２０９、ＣＤ２７３、ＣＤ２８３、ＣＤ２８９、ＣＤ１８４、ＣＤ８５ｈ、ＣＤ８５ｊ、ＣＤ８５ｋ、ＣＤ８５ｄ、ＣＤ８５ｇ、ＣＤ８５ａ、ＣＤ１４１、ＣＤ１１ｃ、ＣＤ８３、ＴＳＬＰ受容体、またはＣＤ１ａマーカーである、項目１９に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目２１）
表１〜表６のいずれか１つの中の配列の少なくとも８個の連続したアミノ酸をそれぞれ含む、少なくとも２個、少なくとも３個、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、少なくとも９個、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、少なくとも１８個、少なくとも１９個、少なくとも２０個、少なくとも２１個、少なくとも２２個、少なくとも２３個、少なくとも２４個、少なくとも２５個、少なくとも２６個、少なくとも２７個、少なくとも２８個、少なくとも２９個、または少なくとも３０個のペプチドを含む、項目１から２０のいずれかに記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目２２）
表１〜表６のいずれか１つの中の配列の少なくとも８個の連続したアミノ酸をそれぞれ含む、２から２０個のペプチドを含む、項目１から２０のいずれかに記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目２３）
少なくとも１個、少なくとも２個、少なくとも３個、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、少なくとも９個、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、少なくとも１８個、少なくとも１９個、少なくとも２０個、少なくとも２１個、少なくとも２２個、少なくとも２３個、少なくとも２４個または少なくとも２５個、少なくとも２６個、少なくとも２７個、少なくとも２８個、少なくとも２９個、または少なくとも３０個の追加の抗原性ペプチドをさらに含む、項目１から２２のいずれかに記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目２４）
前記追加の抗原性ペプチドが、個々の患者の腫瘍に対して特異的である、項目２３に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目２５）
前記追加の抗原性ペプチドが、前記患者の腫瘍試料のゲノム、エクソームおよび／またはトランスクリプトームと、非腫瘍試料のゲノム、エクソームおよび／またはトランスクリプトームとの間の配列差異を同定することによって選択される、項目２４に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目２６）
配列差異を同定することが、次世代配列決定を実施することを含む、項目２５に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目２７）
表１〜表６のいずれか１つの中の配列の少なくとも８個の連続したアミノ酸を含むペプチドを含む抗原提示細胞を含む組成物。
（項目２８）
前記抗原提示細胞が、樹状細胞である、項目２７に記載の組成物。
（項目２９）
項目１から２８のいずれかに記載の組成物を含むｉｎ  ｖｉｖｏ送達系。
（項目３０）
細胞透過性ペプチド、ナノ粒子封入、ウイルス様粒子、またはリポソームを含む、項目２９に記載の送達系。
（項目３１）
前記細胞透過性ペプチドが、ＴＡＴペプチド、単純ヘルペスウイルスＶＰ２２、トランスポータン、またはＡｎｔｐである、項目２９に記載の送達系。
（項目３２）
表１〜表６のいずれか１つの中の配列の少なくとも８個の連続したアミノ酸を含むペプチドをコードする組換えポリヌクレオチドを含む免疫原性ワクチン組成物。
（項目３３）
前記組換えポリヌクレオチドが、ＲＮＡ、必要に応じて、自己増幅ＲＮＡである、項目３２に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目３４）
前記ＲＮＡが、安定性を増大させ、細胞標的化を増大させ、翻訳効率、アジュバント活性、サイトゾル到達性を増大させ、かつ／または細胞傷害性を減少させるように改変されている、項目３３に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目３５）
前記改変が、担体タンパク質へのコンジュゲーション、リガンドへのコンジュゲーション、抗体へのコンジュゲーション、コドン最適化、ＧＣ含有量の増大、改変ヌクレオシドの組み込み、５’−ｃａｐもしくはｃａｐ類似体の組み込み、および／またはアンマスクしたポリＡ配列の組み込みである、項目３４に記載の免疫原性ワクチン組成物。
（項目３６）
表１〜表６のいずれか１つの中の配列の少なくとも８個の連続したアミノ酸を含むペプチドをコードする組換えポリヌクレオチドを含む細胞を含む組成物。
（項目３７）
表１〜表６のいずれか１つの中の配列の少なくとも８個の連続したアミノ酸を含むペプチドをコードする配列を含むポリヌクレオチドを含むベクターを含む組成物。
（項目３８）
前記ポリヌクレオチドが、プロモーターに作動可能に連結されている、項目３７に記載の組成物。
（項目３９）
前記ポリヌクレオチドが、自己増幅ＲＮＡレプリコン、プラスミド、ファージ、トランスポゾン、コスミド、ウイルス、またはビリオンである、項目３７または３８に記載の組成物。
（項目４０）
前記ウイルスが、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス、レンチウイルス、またはそのシュードタイプである、項目３９に記載の組成物。
（項目４１）
項目３２から４０のいずれかに記載の組成物を含むｉｎ  ｖｉｖｏ送達系。
（項目４２）
球状核酸、ウイルス、ウイルス様粒子、プラスミド、細菌性プラスミド、またはナノ粒子を含む、項目４１に記載の送達系。
（項目４３）
ペプチド：ＭＨＣ複合体に特異的に結合するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）であって、前記ペプチド：ＭＨＣ複合体のペプチドのペプチドが、表１〜表６のいずれか１つの中の配列の少なくとも８個の連続したアミノ酸を含むペプチドである、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）。
（項目４４）
ペプチド：ＭＨＣ複合体に特異的に結合するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）を含むＴ細胞であって、前記ペプチド：ＭＨＣ複合体のペプチドのペプチドが、表１〜表６のいずれか１つの中の配列の少なくとも８個の連続したアミノ酸を含むペプチドである、Ｔ細胞。
（項目４５）
ヘルパーＴ細胞または細胞傷害性Ｔ細胞である、項目４４に記載のＴ細胞。
（項目４６）
自家患者Ｔ細胞である、項目４４または４５に記載のＴ細胞。
（項目４７）
がんの処置を必要とする対象においてがんを処置する方法であって、項目１から２８および３２から４０のいずれかに記載の組成物；項目２９から３１、４１および４２のいずれかに記載の送達系；項目４３に記載のＴＣＲ；または項目４４から４６のいずれかに記載のＴ細胞を前記対象に投与することを含み、前記対象が、表１〜表６のいずれか１つの中の配列の少なくとも８個の連続したアミノ酸を含むタンパク質を発現するがん細胞を含む、方法。
（項目４８）
前記対象がヒトである、項目４７に記載の方法。
（項目４９）
前記がんが、泌尿生殖器がん、婦人科がん、肺がん、胃腸がん、頭頸部がん、悪性神経膠芽腫、悪性中皮腫、非転移性または転移性乳がん、トリプルネガティブ乳がん（ＴＮＢＣ）、悪性メラノーマ、メルケル細胞癌または骨軟部組織肉腫、血液新生物、多発性骨髄腫、くすぶり型骨髄腫（ＳＭＭ）、急性骨髄性白血病、慢性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群および急性リンパ芽球性白血病、非小細胞肺がん（ＮＳＣＬＣ）、乳がん、転移性結腸直腸がん、ホルモン感受性またはホルモン不応性前立腺がん、結腸直腸がん、卵巣がん、肝細胞がん、腎細胞がん、膵臓がん、胃がん、食道がん、肝細胞がん、胆管細胞がん、頭頸部扁平上皮がん、軟部組織肉腫、ならびに小細胞肺がんからなる群から選択される、項目４７または４８に記載の方法。
（項目５０）
少なくとも１つの免疫チェックポイント阻害剤を前記対象に投与することをさらに含む、項目４７から４９のいずれかに記載の方法。
（項目５１）
前記チェックポイント阻害剤が、ＣＴＬＡ−４、ＰＤＬ１、ＰＤＬ２、ＰＤ１、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ４、ＢＴＬＡ、ＨＶＥＭ、ＴＩＭ３、ＧＡＬ９、ＬＡＧ３、ＶＩＳＴＡ、ＫＩＲ、２Ｂ４、ＣＤ１６０、ＣＧＥＮ−１５０４９、ＣＨＫ１、ＣＨＫ２、Ａ２ａＲ、およびＢ−７ファミリーリガンドまたはこれらの組合せからなる群から選択されるチェックポイントタンパク質を阻害する、項目５０に記載の方法。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１７８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１７８】
ある特定の実施形態では、Ｔヘルパーペプチドは、集団の大部分に存在するヘルパーＴ細胞により認識されるペプチドである。これは、ＨＬＡクラスＩＩ分子の多く、ほとんどまたは全てに結合するアミノ酸配列を選択することにより達成することができる。これらは、「緩やかなＨＬＡ拘束性（ｌｏｏｓｅｌｙ  ＨＬＡ−ｒｅｓｔｒｉｃｔｅｄ）」または「無差別な（ｐｒｏｍｉｓｃｕｏｕｓ）」Ｔヘルパー配列として公知である。無差別なアミノ酸配列の例として、破傷風トキソイドの８３０〜８４３位（ＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩＴＥ（配列番号１））、Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ  ｆａｌｃｉｐａｒｕｍ  ＣＳタンパク質の３７８〜３９８位（ＤＩＥＫＫＩＡＫＭＥＫＡＳＳＶＦＮＶＶＮＳ（配列番号２））およびＳｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  １８ｋＤタンパク質の１１６位（ＧＡＶＤＳＩＬＧＧＶＡＴＹＧＡＡ（配列番号３））などの抗原からの配列が挙げられる。他の例として、ＤＲ１−４−７スーパーモチーフ、またはＤＲ３モチーフのいずれかを有するペプチドが挙げられる。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１７９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１７９】
あるいは、天然に見られないアミノ酸配列を使用して、緩やかなＨＬＡ拘束様式でヘルパーＴリンパ球を刺激することができる合成ペプチドを調製することが可能である（例えばＰＣＴ公開ＷＯ  ９５／０７７０７を参照のこと）。Ｐａｎ−ＤＲ結合エピトープと呼ばれるこれらの合成化合物（例えばＰＡＤＲＥ、Ｅｐｉｍｍｕｎｅ，Ｉｎｃ．、Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ）は、ほとんどのＨＬＡ−ＤＲ（ヒトＨＬＡクラスＩＩ）分子に結合するように設計されている。例えば、式：ａＫＸＶＷＡＮＴＬＫＡＡａ（配列番号４）を有し、「Ｘ」がシクロヘキシルアラニン、フェニルアラニンまたはチロシンのいずれかであり、ａがＤ−アラニンまたはＬ−アラニンのいずれかであるｐａｎ−ＤＲ結合エピトープペプチドは、ほとんどのＨＬＡ−ＤＲ対立遺伝子に結合すること、およびＨＬＡ型にかかわらず、ほとんどの個体からのヘルパーＴリンパ球の応答を刺激することが分かっている。ｐａｎ−ＤＲ結合エピトープの代替物は、全て「Ｌ」の天然アミノ酸を含み、エピトープをコードする核酸の形態で提供することができる。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２６４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２６４】
（実施例１）
免疫原性の可能性を有する変異配列の同定
出願人らは、以下のエピトープが、がん患者において再発することを発見した。
【表１】
2020515640.tif 000001
それぞれのエピトープについて、非変異タンパク質エピトープの全長アミノ酸配列を得た。生殖細胞系タンパク質配列で見られない任意の構成要素９マーまたは１０マーに印をつけ、使用可能なアルゴリズムを使用して６個の共通のＨＬＡ対立遺伝子（ＨＬＡ−Ａ０１：０１、ＨＬＡ−Ａ０２：０１、ＨＬＡ−Ａ０３：０１、ＨＬＡ−Ａ２４：０２、ＨＬＡ−Ｂ０７：０２およびＨＬＡ−Ｂ０８：０１）に対する結合潜在力についてスコア付けした。１０００ｎＭより優れたスコアの任意のペプチドを指定した。
【表２】
2020515640.tif 000002
【表３−１】
2020515640.tif 000003
【表３−２】
2020515640.tif 000004
【表３−３】
2020515640.tif 000005
【表３−４】
2020515640.tif 000006
【表３−５】
2020515640.tif 000007
それぞれのエピトープについて、非変異タンパク質エピトープの全長アミノ酸配列を得た。生殖細胞系タンパク質配列で見られない任意の構成要素９マーまたは１０マーに印をつけ、使用可能なアルゴリズムを使用して６個の共通のＨＬＡ対立遺伝子（ＨＬＡ−Ａ０１：０１、ＨＬＡ−Ａ０２：０１、ＨＬＡ−Ａ０３：０１、ＨＬＡ−Ａ２４：０２、ＨＬＡ−Ｂ０７：０２およびＨＬＡ−Ｂ０８：０１）に対する結合潜在力についてスコア付けした。１０００ｎＭより優れたスコアの任意のペプチドを指定した。
【表４−１】
2020515640.tif 000008
【表４−２】
2020515640.tif 000009
【表４−３】
2020515640.tif 000010
【表４−４】
2020515640.tif 000011
【表４−５】
2020515640.tif 000012
【表５−１】
2020515640.tif 000013
【表５−２】
2020515640.tif 000014
【表５−３】
2020515640.tif 000015
それぞれのエピトープについて、非変異タンパク質エピトープの全長アミノ酸配列を得た。生殖細胞系タンパク質配列で見られない任意の構成要素９マーまたは１０マーに印をつけ、使用可能なアルゴリズムを使用して６個の共通のＨＬＡ対立遺伝子（ＨＬＡ−Ａ０１：０１、ＨＬＡ−Ａ０２：０１、ＨＬＡ−Ａ０３：０１、ＨＬＡ−Ａ２４：０２、ＨＬＡ−Ｂ０７：０２およびＨＬＡ−Ｂ０８：０１）に対する結合潜在力についてスコア付けした。１０００ｎＭより優れたスコアの任意のペプチドを指定した。
【表６−１】
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【表６−２】
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【表６−３】
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【表６−４】
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【表６−５】
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【表６−６】
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【表６−７】
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【表６−８】
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【表６−９】
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【表６−１０】
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【表６−１１】
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【表６−１２】
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【表６−１３】
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【表６−１４】
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【表６−１５】
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【表６−１６】
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【表６−１７】
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【表６−１８】
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【表６−１９】
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【表６−２０】
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