【手続補正書】
【提出日】令和3年2月1日(2021.2.1)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
膵臓癌関連病態を判定するための方法であって、
（ａ）試験される個体からの試料を提供するステップと、
（ｂ）ＣＡ１９−９、および、表Ａに定義される群から選択される２つ以上のバイオマーカーの前記試験試料中の存在および／または量を測定するステップと、を含むまたはそれらからなり、
【表１−１】
2020507760.tif 000001
【表１−２】
2020507760.tif 000002
ＣＡ１９−９、および、表Ａに定義される群から選択される前記２つ以上のバイオマーカーの前記試験試料中の存在および／または量が、前記個体における前記膵臓癌関連病態を示し、
表Ａに定義される群から選択される前記２つ以上のバイオマーカーが、補体Ｃ４および補体Ｃ５を含む、
方法。
【請求項２】
ステップ（ｂ）が、１つ以上の抗体またはその抗原結合断片を用いて行われ、前記１つ以上の抗体またはその抗原結合断片が、配列番号１７１の配列を含む抗体またはその抗原結合断片を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ステップ（ａ）における前記試料が、以下のリスク群：
（ａ）膵臓癌の家族歴を有する個体、
（ｂ）初発ＩＩ型糖尿病（ｎｅｗ−ｏｎｓｅｔ  ｄｉａｂｅｔｅｓ  ｔｙｐｅ  ＩＩ）と診断された個体、または
（ｃ）膵臓癌を示唆するもしくはそれと一致する症状を有する個体、のうちの１つに属する患者からのものである、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
前記方法が、
（ｉ）早期膵臓癌の判定および／もしくは病期分類のため、
（ｉｉ）膵臓癌を有するもしくは発症するリスクのある個体を識別するため、
（ｉｉｉ）膵臓癌の判定および／もしくは病期分類のため、
（ｉｖ）膵臓癌と慢性膵炎とを差別化するため、ならびに／または、
（ｖ）膵管内乳頭粘液性腫瘍の存在、例えば、悪性ＩＰＭＮを検出するため、のものである、請求項１〜３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
前記膵臓癌が、膵腺癌であり、任意選択で、前記膵臓癌が、膵管腺癌である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
前記膵臓癌が、早期膵臓癌であり、任意選択で、前記方法が、Ｉ期および／またはＩＩ期膵臓癌の前記判定のためのものである、請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
（ｃ）１つ以上の対照試料を、
ｉ．膵臓癌に罹患していない個体、および／または、
ｉｉ．膵臓癌に罹患している個体であって、試料が前記試験試料の病期と異なる病期のものであった、個体、および／または、
ｉｉｉ．慢性膵炎に罹患している個体、から提供するステップと、
（ｄ）ステップ（ｂ）において測定される前記３つ以上のバイオマーカーの前記対照試料中の存在および／または量を測定することによって、前記１つ以上の対照試料のバイオマーカーシグネチャーを判定するステップと、をさらに含むまたはさらにそれらからなり、
ステップ（ｂ）において測定される前記３つ以上のバイオマーカーの前記試験試料中の存在および／または量が、ステップ（ｄ）において測定される前記３つ以上のバイオマーカーの前記対照試料中の存在および／または量と異なる場合には、前記膵臓癌関連病態が識別され、ならびに／あるいは、
（ｅ）１つ以上の対照試料を、
ｉ．膵臓癌に罹患している個体、および／または、
ｉｉ．膵臓癌に罹患している個体であって、試料が前記試験試料の病期と同じ病期のものであった、個体、から提供するステップと、
（ｆ）ステップ（ｂ）において測定される前記３つ以上のバイオマーカーの前記対照試料中の存在および／または量を測定することによって、前記対照試料のバイオマーカーシグネチャーを判定するステップと、をさらに含むまたはさらにそれらからなり、
ステップ（ｂ）において測定される前記３つ以上のバイオマーカーの前記試験試料中の存在および／または量が、ステップ（ｆ）において測定される前記３つ以上のバイオマーカーの前記対照試料中の存在および／または量と対応する場合には、前記膵臓癌関連病態が識別され、
任意選択で、膵臓癌に罹患していない前記個体が、健康な個体であり、
任意選択で、膵臓癌に罹患している前記１つ以上の個体が、腺癌（例えば、膵管腺癌または管状乳頭膵腺癌）、膵肉腫、悪性漿液性嚢胞腺腫、腺扁平上皮癌、印環細胞癌、肝癌、コロイド癌、未分化癌、および破骨細胞様巨細胞を伴う未分化癌からなる群から選択される膵臓癌に罹患している、
請求項１〜６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
ステップ（ｂ）が、前記２つ以上のバイオマーカー（複数可）のタンパク質またはポリペプチドの発現を測定することを含み、
任意選択で、ステップ（ｂ）、（ｄ）、および／またはステップ（ｆ）が、表Ａに列挙されるバイオマーカータンパク質またはポリペプチドに結合することができる１つ以上の第１の結合剤を用いて行われ、
【表２−１】
2020507760.tif 000003
【表２−２】
2020507760.tif 000004
任意選択で、記第１の結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含むまたはそれからなり、
任意選択で、前記抗体またはその抗原結合断片が、組み換え抗体またはその抗原結合断片であり、ならびに／あるいは、
前記抗体またはその抗原結合断片が、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ、免疫グロブリン分子の結合ドメインからなる群から選択され、
任意選択で、前記第１の結合剤が、表面上に固定される、
請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
ステップ（ｂ）、（ｄ）、および／またはステップ（ｆ）が、前記３つ以上のバイオマーカーに結合することができる第２の結合剤を含むアッセイを用いて行われ、前記第２の結合剤が、検出可能部分を含み、
任意選択で、前記第２の結合剤が、抗体またはその抗原結合断片を含むまたはそれからなり、
任意選択で、前記抗体またはその抗原結合断片が、組み換え抗体またはその抗原結合断片であり、ならびに／あるいは、
前記抗体またはその抗原結合断片が、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ、免疫グロブリン分子の結合ドメインからなる群から選択される、
請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
ステップ（ｂ）、（ｄ）、および／またはステップ（ｆ）が、アレイを用いて行われ、
任意選択で、前記アレイが、マクロアレイ、マイクロアレイ、ナノアレイからなる群から選択される、
請求項１〜９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記方法が、
（ｉ）前記試料中に存在するバイオマーカーをビオチンで標識することと、
（ｉｉ）前記ビオチン標識タンパク質を、その表面上の離散した位置に固定化された複数のｓｃＦｖを含むアレイと接触させることであって、前記ｓｃＦｖが、表Ａにおけるタンパク質の２つ以上に対して特異性を有する、接触させることと、
【表３−１】
2020507760.tif 000005
【表３−２】
2020507760.tif 000006
（ｉｉｉ）（前記ｓｃＦｖ上に固定化された）前記ビオチン標識タンパク質を、蛍光色素を含むストレプトアビジン複合体と接触させることと、
（ｉｖ）前記アレイ表面上の離散した位置にある前記色素の存在を検出することと、を含み、
前記アレイ表面上の前記色素の発現が、前記試料における表Ａからのバイオマーカーの発現を示す、請求項８〜１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
ステップ（ｂ）、（ｄ）、および／または（ｆ）が、前記２つ以上のバイオマーカーをコードする核酸分子の発現を測定することを含み、
任意選択で、ステップ（ｂ）、（ｄ）、および／または（ｆ）において前記２つ以上のバイオマーカーの発現を測定することが、各々個別に表Ａに識別される前記バイオマーカーの１つをコードする核酸分子に選択的に結合することができる１つ以上の結合部分を用いて行われ、
【表４−１】
2020507760.tif 000007
【表４−２】
2020507760.tif 000008
任意選択で、前記１つ以上の結合部分が、各々核酸分子を含むまたはそれからなる、
請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
ステップ（ａ）、（ｃ）、および／または（ｅ）で提供される前記試料が、未分画血液、血漿、血清、組織液、膵臓組織、乳汁、胆汁、および尿からなる群から選択され、
任意選択で、ステップ（ａ）、（ｃ）、および／または（ｅ）で提供される前記試料が、未分画血液、血漿、および血清からなる群から選択され、ならびに／あるいは、
ステップ（ａ）、（ｃ）、および／または（ｅ）で提供される前記試料が、血清である、
請求項１〜１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
個体からの、ＣＡ１９−９、および、表Ａに定義される２つ以上のバイオマーカーのタンパク質および／または核酸試料中の存在を検出するための１つ以上の薬剤を含む、個体における膵臓癌の存在またはそれを有するリスクを判定するためのアレイであって、
表Ａに定義される前記２つ以上のバイオマーカーが、補体Ｃ４および補体Ｃ５を含み、
任意選択で、表Ａに定義される前記２つ以上のバイオマーカーの試料中の存在を検出するための前記１つ以上の薬剤が、請求項８または１２に定義される１つ以上の結合剤であり、
任意選択で、前記アレイが、前記タンパク質レベルで前記バイオマーカーの全てに結合することができる抗体またはその抗原結合断片を含み、
任意選択で、前記アレイが、表７に識別される前記抗体の１つ以上を含み、あるいは、
前記アレイが、表８における前記抗体の全てを含むまたは全てからなり、あるいは、
前記アレイが、ｍＲＮＡおよび／またはＤＮＡレベルで前記バイオマーカーの全てに結合することができる薬剤を含み、
任意選択で、陽性対照試料（ウシ血清アルブミンなど）をさらに含み、
任意選択で、陰性対照試料（リン酸緩衝食塩水など）をさらに含む、
アレイ。
【表５−１】
2020507760.tif 000009
【表５−２】
2020507760.tif 000010
【表６−１】
2020507760.tif 000011
【表６−２】
2020507760.tif 000012
【表６−３】
2020507760.tif 000013
【表６−４】
2020507760.tif 000014
【表６−５】
2020507760.tif 000015
【表６−６】
2020507760.tif 000016
【表６−７】
2020507760.tif 000017
【表６−８】
2020507760.tif 000018
【表６−９】
2020507760.tif 000019
【表６−１０】
2020507760.tif 000020
【表６−１１】
2020507760.tif 000021
【表６−１２】
2020507760.tif 000022
【表６−１３】
2020507760.tif 000023
【表６−１４】
2020507760.tif 000024
【表６−１５】
2020507760.tif 000025
【表６−１６】
2020507760.tif 000026
【表６−１７】
2020507760.tif 000027
【表６−１８】
2020507760.tif 000028
【表６−１９】
2020507760.tif 000029
【表６−２０】
2020507760.tif 000030
【表６−２１】
2020507760.tif 000031
【表６−２２】
2020507760.tif 000032
【表６−２３】
2020507760.tif 000033
【表６−２４】
2020507760.tif 000034
【表６−２５】
2020507760.tif 000035
【表６−２６】
2020507760.tif 000036
【表６−２７】
2020507760.tif 000037
【表６−２８】
2020507760.tif 000038
【表６−２９】
2020507760.tif 000039
【表６−３０】
2020507760.tif 000040
【表６−３１】
2020507760.tif 000041
【表６−３２】
2020507760.tif 000042
【表６−３３】
2020507760.tif 000043
【表６−３４】
2020507760.tif 000044
【表６−３５】
2020507760.tif 000045
【表６−３６】
2020507760.tif 000046
【表６−３７】
2020507760.tif 000047
【表７−１】
2020507760.tif 000048
【表７−２】
2020507760.tif 000049
【請求項１５】
個体における膵臓癌の存在またはそれを有するリスクを判定するためのバイオマーカーとしての、ＣＡ１９−９、および、表Ａに定義される群から選択される２つ以上のバイオマーカーの使用であって、
表Ａに定義される群から選択される前記２つ以上のバイオマーカーが、補体Ｃ４および補体Ｃ５を含む、使用。
【表８−１】
2020507760.tif 000050
【表８−２】
2020507760.tif 000051
【請求項１６】
（ａ）請求項１４に記載のアレイ、またはそれを作製するための構成要素と、
（ｂ）請求項１〜１３のいずれか一項に定義される前記方法を行うための指示と、を含む、膵臓癌の存在またはそれを有するリスクを判定するためのキット。