【手続補正書】
【提出日】令和3年7月30日(2021.7.30)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヒトＣＤ３９（ｈＣＤ３９）に結合することができる単離された抗体分子であって、重鎖可変領域（ＶＨ）および軽鎖可変領域（ＶＬ）を含み、
前記ＶＨが、以下：
ａ）配列番号２または配列番号２６に示す配列を有するＶＨＣＤＲ１、
ｂ）配列番号４７または配列番号６４に示す配列を有するＶＨＣＤＲ２、および
ｃ）配列番号８３に示す配列を有するＶＨＣＤＲ３
を含み；
前記ＶＬが、以下：
ａ）配列番号１１１に示す配列を有するＶＬＣＤＲ１、
ｂ）配列番号１２６に示す配列を有するＶＬＣＤＲ２、および
ｃ）配列番号１４２に示す配列を有するＶＬＣＤＲ３
を含む、単離された抗体分子。
【請求項２】
ヒトＣＤ３９（ｈＣＤ３９）に結合することができる単離された抗体分子であって、重鎖および軽鎖を含み、前記重鎖が、配列番号２５５からなる配列を有する分子を含み、前記軽鎖が、配列番号２５６からなる配列を有する分子を含む、単離された抗体分子。
【請求項３】
請求項２に記載の単離された抗体分子をコードする、単離された核酸。
【請求項４】
請求項３に記載の核酸を含む発現ベクター。
【請求項５】
請求項４に記載のベクターを含む、原核生物または真核生物の宿主細胞。
【請求項６】
組換えタンパク質を製造するための方法であって、請求項３に記載の核酸を原核生物または真核生物の宿主細胞内で発現させるステップ、および前記細胞または細胞培養上清から前記タンパク質を回収するステップを含む、方法。
【請求項７】
ヒトＣＤ３９（ｈＣＤ３９）に結合することができる単離された抗体分子であって、請求項１に記載の重鎖可変領域（ＶＨ）および軽鎖可変領域（ＶＬ）を含み、前記ＶＨが、配列番号１８０に示す配列を有するＶＨを含み、前記ＶＬが、配列番号２２０に示す配列を有するＶＬを含む、単離された抗体。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１３】
一部の実施形態では、抗体は、疾患または状態を処置するために使用される。一部の態様では、疾患または状態は、がん、自己免疫疾患、および感染症から選択される。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
（項目１）
ヒトＣＤ３９（ｈＣＤ３９）に特異的に結合し、かつ以下のもの：
ａ）ＣＤ３９のＡＴＰへの結合を阻害すること；
ｂ）ＣＤ３９によるＡＴＰのＡＤＰへのおよび／またはＡＤＰのＡＭＰへの変換を阻害すること；
ｃ）ＡＴＰまたはＡＤＰに対するＣＤ３９の親和性を減少させること；
ｄ）ＣＤ３９からのＡＤＰまたはＡＭＰの放出を阻害することまたは妨げること；
ｅ）ＣＤ３９の処理能力を妨げることまたは阻害すること；
ｆ）血小板凝集を阻害すること；
ｇ）ホスフェート、ＡＤＰ、ＡＭＰ、および／もしくはアデノシンのレベルを減少させること、ならびに／またはＡＴＰのレベルを増加させること；
ｈ）Ｔエフェクター細胞機能を増加させること；
ｉ）組織中または循環中の調節性Ｔ細胞の数を減少させること；
ｊ）調節性Ｔ細胞または調節性Ｔ細胞活性を抑制すること；
ｋ）Ｂ細胞機能を増加させること；
ｌ）抗原提示細胞機能を増加させること；
ｍ）腫瘍細胞に対するＣＤ３９機能を阻害すること；
ｎ）リン酸化イソプレノイド、リン酸化ビタミンＢ代謝産物、および／またはリン酸化リボフラビンに由来するホスホ抗原のうちの少なくとも１つのプロセシングを阻害すること；
ｏ）ＭＡＩＴ細胞およびγδＴ細胞から選択されるホスホ抗原特異的Ｔ細胞の活性化を減少させることまたは防止すること；
ｐ）血管新生を阻害すること；
ｑ）刺激されたＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を増加させること；
ｒ）ＩＮＦ−γ、ＴＮＦ−α、ＩＬ−２および／またはＩＬ−１βの刺激されたＰＢＭＣによる分泌を増加させること
のうちの１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、または１８個が可能である、抗原結合タンパク質。
（項目２）
以下の特性：
ａ）モノクローナル抗体であること；
ｂ）ヒト抗体、ヒト化抗体、もしくはキメラ抗体であること；
ｃ）二重特異性抗体、多重特異性抗体、ダイアボディ、もしくは多価抗体であること；
ｄ）ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、もしくはＩｇＭタイプのものであること；
ｅ）抗原結合抗体断片であること；
ｆ）Ｆａｂ断片、Ｆａｂ’断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、もしくはＦｖ断片であること；および／または
ｇ）単鎖抗体、単一ドメイン抗体、もしくはナノボディであること
のうちの１、２、３、４、５、６、または７個を有する、項目１に記載の抗原結合タンパク質。
（項目３）
ｈＣＤ３９に結合し、かつ以下の特性：
ａ）（ｉ）ホスフェート（Ｐｉ）の放出の減少、（ｉｉ）ＡＴＰレベルにおける増加、ならびに（ｉｉｉ）ＡＤＰ、ＡＭＰ、および／またはアデノシンレベルの減少のうちの少なくとも１つによって決定される、ＡＴＰのＡＤＰへのおよび／またはＡＤＰのＡＭＰへの加水分解を遮断することまたは減少させること、
ｂ）Ｔエフェクター細胞活性を増加させること；
ｃ）調節性Ｔ細胞を抑制するか、または調節性Ｔ細胞活性を減少させること；
ｄ）組織中または循環中の調節性Ｔ細胞の数を減少させること；
ｅ）Ｂ細胞機能を増加させること；
ｆ）抗原提示細胞機能を増加させること；
ｇ）腫瘍細胞に対するＣＤ３９機能を阻害すること；
ｈ）リン酸化イソプレノイド、リン酸化ビタミンＢ代謝産物、およびリン酸化リボフラビンに由来するホスホ抗原のうちの少なくとも１つのプロセシングを遮断することまたは阻害すること；
ｉ）ＭＡＩＴ細胞およびγδＴ細胞から選択されるホスホ抗原特異的Ｔ細胞の活性化を減少させることまたは防止すること；
ｋ）血管新生を阻害すること；
ｌ）ＡＴＰおよび／またはＡＤＰに対する親和性を減少させること；
ｍ）ＣＤ３９からのＡＤＰまたはＡＭＰの放出を阻害すること；
ｎ）ＣＤ３９の処理能力を妨げることまたは阻害すること；
ｏ）血小板凝集を阻害すること；
ｐ）刺激されたＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を増加させること；
ｒ）ＩＮＦ−γ、ＴＮＦ−α、ＩＬ−２、および／またはＩＬ−１βの刺激されたＰＢＭＣによる分泌を増加させること
のうちの１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６個を有する有効量の抗体を含む、薬学的組成物。
（項目４）
項目１または項目２に記載の抗原結合タンパク質を含む薬学的組成物。
（項目５）
有効量の以下のもの：
ａ）抗ＰＤ−１抗体、
ｂ）抗ＰＤ−Ｌ１抗体、
ｃ）抗ＣＤ７３抗体、
ｄ）抗ＣＤ３８抗体、
ｅ）抗Ａ２Ａ受容体抗体、
ｆ）抗Ａ２Ｂ受容体抗体、
ｇ）抗Ａ２Ａ／Ａ２Ｂ二重受容体抗体、もしくはこれらの任意の組み合わせ、または
ｈ）小分子阻害剤、
のうちの少なくとも１つあるいはこれらの組み合わせをさらに含む、項目４に記載の薬学的組成物。
（項目６）
ａ）阻害性受容体もしくはリガンドに対する抗体、および／または
ｂ）共刺激受容体もしくはリガンドに対する抗体、
のうちの１つまたは両方あるいはこれらの組み合わせをさらに含む、項目４または項目５に記載の薬学的組成物。
（項目７）
（ｉ）前記阻害性受容体またはリガンドが、ＣＴＬＡ−４、ＰＤ−Ｌ２、ＬＡＧ−３、Ｔｉｍ３、ニューリチン（ｎｅｕｒｉｔｉｎ）、ＢＴＬＡ、ＣＥＣＡＭ−１、ＣＥＣＡＭ−５、ＶＩＳＴＡ、ＬＡＩＲ１、ＣＤ１６０、２Ｂ４、ＴＧＦ−Ｒ、ＨＨＬＡ２、ＩＬＴ２、ＩＬＴ３、ＩＬＴ４、ＨＬＡ−Ｇ、ＨＬＡ−Ｃ、および／もしくはキラー細胞免疫グロブリン様受容体（ＫＩＲ）のうちの少なくとも１つである、ならびに／または
（ｉｉ）前記共刺激受容体またはリガンドが、ＯＸ４０、ＣＤ２、ＣＤ２７、ＣＤＳ、ＩＣＡＭ−１、ＬＦＡ−１、ＩＣＯＳ（ＣＤ２７８）、４−１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＧＩＴＲ、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＢＡＦＦＲ、ＨＶＥＭ、ＣＤ７、ＬＩＧＨＴ、ＮＫＧ２Ｃ、ＳＬＡＭＦ７、ＮＫｐ８０、ＣＤ１６０、Ｂ７−Ｈ３、および／もしくはＣＤ８３のうちの少なくとも１つである、項目６に記載の薬学的組成物。
（項目８）
前記共刺激受容体またはリガンドＬＦＡ−１が、ＬＦＡ−１  β鎖ＣＤ１８および／またはＬＦＡ−１  α鎖ＣＤ１１ａをさらに含む、項目７に記載の薬学的組成物。
（項目９）
以下の特性：
ａ）約２０ｎＭ未満のＫＤでヒトＣＤ３９ポリペプチドもしくはそのバリアントに結合すること；
ｂ）約２００ｎＭ未満のＫＤでカニクイザルＣＤ３９ポリペプチドもしくはそのバリアントに結合すること；
ｃ）約２００ｎＭ未満のＫＤでマウスＣＤ３９ポリペプチドもしくはそのバリアントに結合すること；または
ｄ）ａ）、ｂ）、およびｃ）のうちの少なくとも２個の組み合わせ
のうちの１つまたは複数を有する、項目１に記載の抗原結合タンパク質。
（項目１０）
ヒトＣＤ３９への結合に関して参照抗原結合タンパク質と競合するか、または競合することができる抗原結合タンパク質であって、前記参照抗原結合タンパク質が、項目１に記載の抗原結合タンパク質である、抗原結合タンパク質。
（項目１１）
ヒトＣＤ３９に結合するか、またはヒトＣＤ３９への結合に関して参照抗原結合タンパク質と競合することができる抗原結合タンパク質であって、前記参照抗原結合タンパク質が、これらに限定されないが、Ｄ１５０、Ｅ１５３、Ｒ１５４あるいはＮ９９単独、またはＤ１５０、Ｅ１５３、Ｒ１５４もしくはこれらの任意の組み合わせとの組み合わせを含む、ヒトＣＤ３９ポリペプチド上の配列番号２４９の位置１４３〜１５８または２７４〜２７７におけるエピトープに結合する、抗原結合タンパク質。
（項目１２）
ヒトＣＤ３９への結合に関して前記抗原結合タンパク質および参照抗体が交差競合するか、または交差競合することができる、項目１０または項目１１に記載の抗原結合タンパク質。
（項目１３）
ヒト重鎖定常領域もしくは断片またはこれらのバリアントを含み、定常領域のバリアントが、配列番号１７９〜２１８に示す任意の配列から最大２０の保存的に改変されたアミノ酸置換を含む、項目１に記載の抗原結合タンパク質。
（項目１４）
ヒトＣＤ３９（ｈＣＤ３９）に結合することができる単離された抗体分子であって、重鎖可変領域（ＶＨ）および軽鎖可変領域（ＶＬ）を含み、ＶＨおよび／またはＶＬが、以下：
ａ）配列番号１〜４５に示す配列を有するＶＨＣＤＲ１、
ｂ）配列番号４６〜８１に示す配列を有するＶＨＣＤＲ２、
ｃ）配列番号８２〜１０９に示す配列を有するＶＨＣＤＲ３、
ｄ）配列番号１１０〜１２４に示す配列を有するＶＬＣＤＲ１、
ｅ）配列番号１２５〜１４０に示す配列を有するＶＬＣＤＲ２、および
ｆ）配列番号１４１〜１６６に示す配列を有するＶＬＣＤＲ３
のうちの１、２、３、４、５、または６個を含む、単離された抗体分子。
（項目１５）
ヒトＣＤ３９（ｈＣＤ３９）に結合することができる単離された抗体分子であって、重鎖可変領域（ＶＨ）および軽鎖可変領域（ＶＬ）を含み、
前記ＶＨが、以下：
ａ）配列番号１〜４５に示す配列を有するＶＨＣＤＲ１、
ｂ）配列番号４６〜８１に示す配列を有するＶＨＣＤＲ２、および
ｃ）配列番号８２〜１０９に示す配列を有するＶＨＣＤＲ３
を含み；
前記ＶＬが、以下：
ａ）配列番号１１０〜１２４に示す配列を有するＶＬＣＤＲ１、
ｂ）配列番号１２５〜１４０に示す配列を有するＶＬＣＤＲ２、および
ｃ）配列番号１４１〜１６６に示す配列を有するＶＬＣＤＲ３
を含む、単離された抗体分子。
（項目１６）
項目１、項目１４、または項目１５に記載の抗原結合タンパク質をコードする、単離された核酸。
（項目１７）
項目１６に記載の核酸を含む発現ベクター。
（項目１８）
項目１７に記載のベクターを含む、原核生物または真核生物の宿主細胞。
（項目１９）
項目１６または項目１７のいずれかに記載の核酸をコードする腫瘍溶解性ウイルス。
（項目２０）
組換えタンパク質を製造するための方法であって、項目１６に記載の核酸を原核生物または真核生物の宿主細胞内で発現させるステップ、および前記細胞または細胞培養上清から前記タンパク質を回収するステップを含む、方法。
（項目２１）
がん、慢性感染症、または炎症性疾患に罹患した被験体を処置するための方法であって、有効量の項目１に記載の抗原結合タンパク質を含む薬学的組成物または項目３に記載の薬学的組成物を前記被験体に投与するステップを含む、方法。
（項目２２）
前記がんが固形がんである、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
前記がんが血液がんである、項目２１に記載の方法。
（項目２４）
免疫系機能のモジュレーションを必要とする被験体において免疫系機能をモジュレートするための方法であって、前記被験体の免疫細胞集団を、免疫系がモジュレートされるような条件下で、有効量の項目１に記載の抗原結合タンパク質を含む薬学的組成物と接触させるステップを含む、方法。
（項目２５）
免疫応答の誘発または強化を必要とする被験体において免疫応答を誘発するか、または強化するための方法であって、抗原結合タンパク質を含む薬学的組成物を前記被験体に投与するステップを含み、前記免疫応答が腫瘍抗原に対して生じる、方法。
（項目２６）
前記被験体がヒト被験体である、項目２４または項目２５に記載の方法。
（項目２７）
前記抗原結合タンパク質が、二重特異性抗体または複合体形成性抗原結合タンパク質を含む、項目２５に記載の方法。
（項目２８）
前記抗原結合タンパク質、前記二重特異性抗体、または前記複合体形成性抗原結合タンパク質が、前記被験体において以下のもの：
ａ）標的細胞集団においてＣＤ３９  ＡＴＰアーゼ活性を減少させること；
ｂ）エフェクターＴ細胞の活性に対する調節性Ｔ細胞の抑制を減少させること；
ｃ）調節性Ｔ細胞のレベルを減少させること；
ｄ）エフェクターＴ細胞を活性化すること；
ｅ）エフェクターＴ細胞の増殖を誘発することもしくは強化すること；
ｆ）腫瘍成長を阻害すること；および／または
ｇ）腫瘍退行を誘発すること
のうちの１、２、３、４、５、６、または７個を達成するのに十分な量で投与される、項目２７に記載の方法。
（項目２９）
前記標的細胞集団が、Ｔ細胞、Ｂ細胞、単球、マクロファージ、樹状細胞、骨髄由来サプレッサー細胞、および／または腫瘍細胞を含む、項目２８に記載の方法。
（項目３０）
以下：
ａ）化学療法を施行するステップ；
ｂ）放射線療法を施行するステップ；および／または
ｃ）１つもしくは複数の追加の治療剤を投与するステップ
のうちの１つまたは複数をさらに含む、項目２５に記載の方法。
（項目３１）
前記１つまたは複数の追加の治療剤が、１つまたは複数の免疫刺激剤を含む、項目３０に記載の方法。
（項目３２）
前記１つまたは複数の免疫刺激剤が、免疫細胞の阻害性受容体に対するアンタゴニストを含む、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
前記阻害性受容体が、ＣＴＬＡ−４、ＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、ＬＡＧ−３、Ｔｉｍ３、ニューリチン、ＢＴＬＡ、ＣＥＣＡＭ−１、ＣＥＣＡＭ−５、ＶＩＳＴＡ、ＬＡＩＲ１、ＣＤ１６０、２Ｂ４、ＴＧＦ−Ｒ、および／またはキラー細胞免疫グロブリン様受容体（ＫＩＲ）のうちの少なくとも１つである、項目３２に記載の方法。
（項目３４）
前記１つまたは複数の免疫刺激剤が、免疫細胞の共刺激受容体のアゴニストを含む、項目３１に記載の方法。
（項目３５）
前記共刺激受容体が、ＯＸ４０、ＣＤ２、ＣＤ２７、ＣＤＳ、ＩＣＡＭ−１、ＬＦＡ−１、ＩＣＯＳ（ＣＤ２７８）、４−１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＧＩＴＲ、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＢＡＦＦＲ、ＨＶＥＭ、ＣＤ７、ＬＩＧＨＴ、ＮＫＧ２Ｃ、ＳＬＡＭＦ７、ＮＫｐ８０、ＣＤ１６０、Ｂ７−Ｈ３、またはＣＤ８３リガンドである、項目３４に記載の方法。
（項目３６）
前記共刺激受容体またはリガンドＬＦＡ−１が、ＬＦＡ−１  β鎖ＣＤ１８および／またはＬＦＡ−１  α鎖ＣＤ１１ａをさらに含む、項目３５に記載の方法。
（項目３７）
前記１つまたは複数の免疫刺激剤がサイトカインを含む、項目３１に記載の方法。
（項目３８）
前記サイトカインが、ＩＬ−２、ＩＬ−５、ＩＬ−７、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、および／またはＩＬ−２１のうちの少なくとも１つである、項目３７に記載の方法。
（項目３９）
前記１つまたは複数の免疫刺激剤が腫瘍溶解性ウイルスを含む、項目３１に記載の方法。
（項目４０）
前記腫瘍溶解性ウイルスが、単純ヘルペスウイルス、水疱性口内炎ウイルス、アデノウイルス、ニューカッスル病ウイルス、ワクシニアウイルス、またはマラバウイルスである、項目３９に記載の方法。
（項目４１）
前記１つまたは複数の免疫刺激剤が、キメラ抗原操作Ｔ細胞を含む、項目３１に記載の方法。
（項目４２）
前記１つまたは複数の免疫刺激剤が、二重または多重特異性Ｔ細胞指向性抗体を含む、項目３１に記載の方法。
（項目４３）
１つまたは複数の追加の治療剤が、免疫抑制剤のための少なくとも１つのトラップ（ｔｒａｐ）を含む、項目２５に記載の方法。
（項目４４）
免疫抑制剤のための前記少なくとも１つのトラップが、抗ＴＧＦ−ベータ抗体、ＴＧＦｂ受容体トラップ、抗ＩＬ−１０抗体および／もしくは抗ＩＬ−１０受容体トラップ、ならびに／または抗ＩＬ−３５抗体トラップおよび／もしくは抗ＩＬ−３５受容体トラップのうちの少なくとも１つを含む、項目４３に記載の方法。
（項目４５）
前記薬学的組成物を投与すると、Ｔ−エフェクター細胞の増殖の誘発もしくは強化、またはＴ細胞におけるΙ−カッパΒおよび／もしくはＮＦ−κΒのモジュレーション、またはＴ細胞におけるＣＤ３９活性のモジュレーション、またはＴ−エフェクター細胞におけるＴ細胞受容体誘発性シグナル伝達、またはこれらの組み合わせが生じる、項目３から項目４４のいずれか一項に記載の方法。
（項目４６）
ＣＤ３９の活性を阻害することができる項目１に記載の抗原結合タンパク質を含む被験化合物をスクリーニングする方法であって、
ＣＤ３９を含有する被験試料を、被験化合物と接触させるステップ；
対照試料に対して前記被験試料の活性を比較するステップ
を含み；
前記対照試料と比較した、前記被験試料におけるＣＤ３９の活性の減少により、前記化合物がＣＤ３９の活性を阻害するものとして同定される、方法。
（項目４７）
前記対照試料が、被験化合物と接触していない試料を含む、項目４６に記載の方法。
（項目４８）
ヒトＣＤ３９（ｈＣＤ３９）に結合することができる単離された抗体分子であって、重鎖可変領域（ＶＨ）および軽鎖可変領域（ＶＬ）を含み、
ＶＨが、以下：
ａ）配列番号１〜４５に示す配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有するＶＨＣＤＲ１、
ｂ）配列番号４６〜８１に示す配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有するＶＨＣＤＲ２、および
ｃ）配列番号８２〜１０９に示す配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有するＶＨＣＤＲ３
のうちの少なくとも１つを含み；
ＶＬが、以下：
ａ）配列番号１１０〜１２４に示す配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有するＶＬＣＤＲ１、
ｂ）配列番号１２５〜１４０に示す配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有するＶＬＣＤＲ２、および
ｃ）配列番号１４１〜１６６に示す配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有するＶＬＣＤＲ３
のうちの少なくとも１つを含む、単離された抗体分子。
（項目４９）
ヒトＣＤ３９（ｈＣＤ３９）に結合することができる単離された抗体分子であって、重鎖可変領域（ＶＨ）および軽鎖可変領域（ＶＬ）を含み、
ＶＨが、以下：
ａ）配列番号１〜４５に示す配列と相同であるアミノ酸配列を有するＶＨＣＤＲ１、
ｂ）配列番号４６〜８１に示す配列と相同であるアミノ酸配列を有するＶＨＣＤＲ２、および
ｃ）配列番号８２〜１０９に示す配列と相同であるアミノ酸配列を有するＶＨＣＤＲ３
のうちの少なくとも１つを含み；
ＶＬが、以下：
ａ）配列番号１１０〜１２４に示す配列と相同であるアミノ酸配列を有するＶＬＣＤＲ１、
ｂ）配列番号１２５〜１４０に示す配列と相同であるアミノ酸配列を有するＶＬＣＤＲ２、および
ｃ）配列番号１４１〜１６６に示す配列と相同であるアミノ酸配列を有するＶＬＣＤＲ３のうちの少なくとも１つを含む、単離された抗体分子。
（項目５０）
ヒトＣＤ３９（ｈＣＤ３９）に結合することができる単離された抗体分子であって、重鎖および軽鎖を含み、前記重鎖が、配列番号２５５、配列番号２５７、配列番号２５９、配列番号２６１、配列番号２６３、配列番号２６５、配列番号２６７、配列番号２６９、配列番号２７１、配列番号２７３、配列番号２７５、配列番号２７７、配列番号２７９、配列番号２８１、配列番号２８３、配列番号２８５、配列番号２８７、配列番号２８９、配列番号２９１、配列番号２９３、または配列番号２９５のうちの１つからなる配列を有する１つまたは複数の分子を含み、前記軽鎖が、配列番号２５６、配列番号２５８、配列番号２６０、配列番号２６２、配列番号２６４、配列番号２６６、配列番号２６８、配列番号２７０、配列番号２７２、配列番号２７４、配列番号２７６、配列番号２７８、配列番号２８０、配列番号２８２、配列番号２８４、配列番号２８６、配列番号２８８、配列番号２９０、配列番号２９２、配列番号２９４、または配列番号２９６のうちの１つからなる配列を有する１つまたは複数の分子を含む、単離された抗体分子。
（項目５１）
ヒトＣＤ３９（ｈＣＤ３９）に結合することができる単離された抗体分子であって、重鎖および軽鎖を含み、
ａ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２５５からなる配列を有し、前記軽鎖が１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２５６からなる配列を有するか；
ｂ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２５７からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２５８からなる配列を有するか；
ｃ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２５９からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２６０からなる配列を有するか；
ｄ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２６１からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２６２からなる配列を有するか；
ｅ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２６３からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２６４からなる配列を有するか；
ｆ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２６５からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２６６からなる配列を有するか；
ｇ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２６７からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２６８からなる配列を有するか；
ｈ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２６９からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２７０からなる配列を有するか；
ｉ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２７１からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２７２からなる配列を有するか；
ｊ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２７３からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２７４からなる配列を有するか；
ｋ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２７５からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２７６からなる配列を有するか；
ｌ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２７７からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２７８からなる配列を有するか
ｍ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２７９からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２８０からなる配列を有するか；
ｎ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２８１からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２８２からなる配列を有するか；
ｏ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２８３からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２８４からなる配列を有するか；
ｐ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２８５からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２８６からなる配列を有するか；
ｑ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２８７からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２８８からなる配列を有するか；
ｒ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２８９からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２９０からなる配列を有するか；
ｓ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２９１からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２９２からなる配列を有するか；
ｔ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２９３からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２９４からなる配列を有するか；または
ｕ）前記重鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２９５からなる配列を有し、前記軽鎖が、１つもしくは複数の分子を含み、各分子が、配列番号２９６からなる配列を有する、単離された抗体分子。
（項目５２）
項目４８から項目５１のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質をコードする、単離された核酸。
（項目５３）
ヒトＣＤ３９（ｈＣＤ３９）に結合することができる単離された抗体分子であって、重鎖可変領域（ＶＨ）および軽鎖可変領域（ＶＬ）を含み、ＶＨおよび／またはＶＬが、以下：
ａ）（ｉ）コンセンサス配列Ｓ−Ｙ−Δ３−Ｍ−Δ５（配列番号２５〜２９および４４〜４５）（ここで、Δ３は、Ｅ、Ｆ、Ｑ、またはＹであり、Δ５は、ＨまたはＹである）によって定義されるＫａｂａｔ  ＣＤＲＨ１配列；
（ｉｉ）コンセンサス配列θ１−θ２−θ３−Ｉ−Ｓ（配列番号３０〜３７）（ここで、θ１は、Ａ、Ｈ、Ｋ、Ｌ、Ｓ、またはＷであり；θ２は、Ｌ、Ｍ、Ｎ、またはＴであり；θ３は、ＡまたはＰである）によって定義されるＫａｂａｔ  ＣＤＲ−Ｈ１配列；
（ｉｉｉ）コンセンサス配列η１−Ｙ−η３−Ｉ−Ｓ（配列番号３８〜４１）（ここで、η１は、Ｓ、Ｋ、Ｎ、またはＲであり、η３は、ＡまたはＧである）によって定義されるＫａｂａｔ  ＣＤＲ−Ｈ１配列；
（ｉｖ）コンセンサス配列Ｇ−Ｙ−Ｔ−Ｆ−Ω５−Ｓ−Ｙ（配列番号１〜２および４〜６）（ここで、Ω５は、Ｔ、Ｋ、Ｑ、Ｆ、またはＶである）によって定義されるＣｈｏｔｈｉａ  ＣＤＲ−Ｈ１配列；
（ｖ）コンセンサス配列Ｇ−Ｇ−Ｔ−Ｆ−ν５−ν６−Ｙ（配列番号１７〜２２および２４）（ここで、ν５は、Ｓ、Ｇ、またはＥであり、ν６は、Ｓ、Ｋ、Ｒ、またはＳである）によって定義されるＣｈｏｔｈｉａ  ＣＤＲ−Ｈ１配列；または
（ｖｉ）コンセンサス配列Ｇ−Ｇ−Ｔ−Ｆ−κ５−κ６−κ７（配列番号７〜１６）（ここで、κ５は、Ｓ、Ｑ、Ｐ、またはＡであり；κ６は、Ｓ、Ｋ、Ｈ、Ｌ、Ａ、またはＷであり；κ７は、Ｙ、Ｌ、Ｔ、Ｎ、またはＭである）によって定義されるＣｈｏｔｈｉａ  ＣＤＲ−Ｈ１コンセンサス配列
を含むＶＨＣＤＲ１配列、
ｂ）（ｉ）コンセンサス配列ε１−Ｉ−Ｎ−Ｐ−ε５−ε６−Ｇ−Ｓ−Ｔ−ε１０−Ｙ−Ａ−Ｑ−Ｋ−Ｆ−Ｑ−Ｇ（配列番号６３〜６６および６８）（ここで、ε１は、Ｋ、Ｓ、Ｒ、またはＶであり；ε５は、Ｌ、Ｒ、またはＳであり；ε６は、ＧまたはＶであり；ε１０は、ＳまたはＷである）によって定義されるＫａｂａｔ  ＣＤＲ−Ｈ２配列；
（ｉｉ）コンセンサス配列Ｇ−Ｉ−α３−α４−α５−α６−Ｇ−Ｔ−Ａ−Ｎ−Ｙ−Ａ−Ｑ−Ｋ−Ｆ−Ｑ−Ｇ（配列番号６９〜７２）（ここで、α３は、ＩもしくはＬであるか、または存在せず；α４は、Ｐであるか、または存在せず；α５は、Ｉ、Ｇ、またはＲであり；α６は、Ａ、Ｆ、またはＧである）によって定義されるＫａｂａｔ  ＣＤＲ−Ｈ２配列；
（ｉｉｉ）コンセンサス配列β１−Ｉ−Ｉ−Ｐ−β５−β６−Ｇ−β８−Ａ−Ｎ−Ｙ−Ａ−Ｑ−Ｋ−Ｆ−Ｇ−Ｑ（配列番号７４および７６〜７９）（ここで、β１は、ＳまたはＧであり；β５は、Ｉ、Ｅ、Ｓ、またはＴであり；β６は、Ｆ、Ｉ、またはＳであり；β８は、ＩまたはＴである）によって定義されるＫａｂａｔ  ＣＤＲ−Ｈ２配列；
（ｉｖ）コンセンサス配列Ｎ−Ｐ−ε５−ε６−Ｇ−Ｓ−Ｔ（配列番号４６〜４８）（ここで、ε５は、Ｌ、Ｒ、またはＳであり、ε６は、ＧまたはＶである）によって定義されるＣｈｏｔｈｉａ  ＣＤＲ−Ｈ２配列；
（ｖ）コンセンサス配列α３−α４−α５−α６−Ｇ−Ｔ−Ａ（配列番号５１〜５４）（ここで、α３は、ＩもしくはＬであるか、または存在せず；α４は、Ｐであるか、または存在せず；α５は、Ｉ、Ｇ、またはＲであり；α６は、Ａ、Ｆ、またはＧである）によって定義されるＣｈｏｔｈｉａ  ＣＤＲ−Ｈ２配列；または
（ｖｉ）コンセンサス配列Ｉ−Ｐ−β５−β６−Ｇ−β８−Ａ（配列番号５６〜６０）（ここで、β５は、Ｉ、Ｅ、Ｓ、またはＴであり；β６は、Ｆ、Ｉ、またはＳであり；β８は、ＩまたはＴである）によって定義されるＣｈｏｔｈｉａ  ＣＤＲ−Ｈ２配列
を含むＶＨＣＤＲ２配列、
ｃ）（ｉ）コンセンサス配列Ｇ−Ｋ−Ｒ−Ｅ−Ｇ−Ｇ−Ｔ−Ｅ−Ｙ−Ｌ−Ｒ−У１２（配列番号８２〜８６）（ここで、У１２は、Ｈ、Ｋ、Ｓ、Ｎ、またはＶである）によって定義されるＣＤＲ−Ｈ３配列；
（ｉｉ）コンセンサス配列Ｅ−Ｓ−Ｇ−Ф４−Ｙ−Ｒ−Ｄ−Ｈ−Ｒ−Ｌ−Ф１１−Ｖ（配列番号９４〜９６）（ここで、Ф４は、ＧまたはＴであり、Ф１１は、ＤまたはＧである）によって定義されるＣＤＲ−Ｈ３配列；または
（ｉｉｉ）コンセンサス配列Ｇ−Ｇ−Ａ−Ｋ−Ｙ−Ａ−Э７−Э８−Э９−Ｇ−Ｍ−Ｄ−Ｖ（配列番号８７〜９３）（ここで、Э７は、Ｓ、Ｖ、Ｇ、またはＲであり；Э８は、Ｔ、Ｑ、Ｋ、Ｇ、またはＲであり；Э９は、Ｙ、Ｈ、Ｌ、またはＷである）によって定義されるＣＤＲ−Ｈ３配列を含むＶＨＣＤＲ３配列、
ｄ）（ｉ）コンセンサス配列φ１−Ａ−Ｓ−φ４−φ５−Ｖ−φ７−φ８−φ９−Ｙ−Ｌ−Ａ（配列番号１１０１〜１１４）（ここで、φ１は、Ｅ、Ｋ、またはＲであり；φ４は、ＱまたはＥであり；φ５は、ＳまたはＹであり；φ７は、ＳまたはＡであり；φ８は、ＳまたはＹであり；φ９は、ＤまたはＳである）によって定義されるＣＤＲ−Ｌ１配列；（ｉｉ）コンセンサス配列б１−Ａ−Ｓ−Ｑ−б５−б６−б７−б８−б９−Ｌ−б１１（配列番号１１８および１２０〜１２３）（ここで、б１は、ＱまたはＲｌであり；б５は、ＤまたはＳであり；б６は、ＩまたはＶであり；б７は、ＧまたはＳであり；б８は、Ｎ、Ｒ、またはＳであり；б９は、Ｎ、Ｙ、またはＷであり；б１１は、ＡまたはＮである）によって定義されるＣＤＲ−Ｌ１配列；または
（ｉｉｉ）コンセンサス配列Ｋ−Ｓ−Ｓ−Г４−Ｓ−Ｖ−Ｌ−Г８−Ｓ−Г１０−Ｎ−Ｎ−Ｋ−Ｎ−Ｙ−Ｌ−Ａ（配列番号１１５〜１１７）（ここで、Г４は、Ｑ、ＲまたはＫであり；Г８は、ＦまたはＹであり；Г１０は、ＳまたはＮである）によって定義されるＣＤＲ−Ｌ１配列
を含むＶＬＣＤＲ１配列、
ｅ）（ｉ）コンセンサス配列ψ１−Ａ−Ｓ−ψ４−Ｒ−ψ６−ψ７（配列番号１２５〜１３６）（ここで、ψ１は、ＧまたはＹであり、ψ４は、ＳまたはＮであり；ψ６は、ＡまたはＨであり；ψ７は、Ｔ、Ｙ、またはＮである）によって定義されるＣＤＲ−Ｌ２配列；
（ｉｉ）コンセンサス配列Ｄ−Ａ−Ｓ−χ４−Ｒ−Ａ−Ｔ（配列番号１３８および１３９）（ここで、£４は、ＮまたはＫである）によって定義されるＣＤＲ−Ｌ２配列；または（ｉｉｉ）コンセンサス配列Ｗ−Ａ−Ｓ−Ｔ−Ｒ−σ６−Ｓ（配列番号１３１および１３３〜１３４）（ここで、σ６は、Ａ、Ｅ、またはＱである）によって定義されるＣＤＲ−Ｌ２配列
を含むＶＬＣＤＲ２配列、および
ｆ）（ｉ）コンセンサス配列Ｑ−Ｑ−Ｙ−π４−π５−π６−π７−Ｔ（配列番号１４１〜１４７）（ここで、π４は、Ｇ、Ｈ、またはＹであり；π５は、Ｓ、Ｎ、Ｆ、Ｇ、またはＲであり；π６は、Ｓ、Ｙ、Ａ、Ｇ、またはＲであり；π７は、Ｐ、Ｉ、またはＬである）によって定義されるＣＤＲ−Ｌ３配列；
（ｉｉ）コンセンサス配列Ｑ−Ｑ−λ３−λ４−λ５−λ６−Ｐ−Ｔ（配列番号１４８〜１５０）（ここで、λ３は、Ｒ、Ｆ、Ｈ、Ｓ、Ｌ、Ｄ、Ｙ、またはＶであり；λ４は、Ｓ、Ｖ、Ｔ、Ｇ、Ｌ、Ｙ、またはＮであり；λ５は、Ｎ、Ｌ、Ｆ、Ｋ、またはＶであり；λ６は、Ｗ、Ｆ、Ｙ、またはＬである）によって定義されるＣＤＲ−Ｌ３配列；
（ｉｉｉ）コンセンサス配列Ｑ−Ｑ−Ｙ−ρ３−ρ４−Ｗ−Ｐ−Ｌ−Ｔ（配列番号１５１および１５２）（ここで、ρ３は、ＮまたはＬであり、ρ４は、ＮまたはＬである）によって定義されるＣＤＲ−Ｌ３配列；または
（ｉｖ）コンセンサス配列Ｑ−Ｑ−ω３−ω４−ω５−ω６−Ｐ−ω８−Ｔ（配列番号１５３〜１５６）（ここで、ω３は、ＹまたはＦであり；ω４は、ＹまたはＷであり；ω５は、Ｓ、Ｌ、Ｔ、またはＦであり；ω６は、Ｔ、Ｙ、またはＦであり；ω８は、ＬまたはＰである）によって定義されるＣＤＲ−Ｌ３配列
を含むＶＬＣＤＲ３配列
のうちの１、２、３、４、５、または６個を含む、単離された抗体分子。