【手続補正書】
【提出日】令和3年4月2日(2021.4.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
１４〜４０個の環原子を含む大環状化合物であって、
（ａ）哺乳類標的タンパク質相互作用部分、及び
（ｂ）プレゼンタータンパク質結合部分を含み、
前記化合物及びプレゼンタータンパク質が、標的タンパク質に特異的に結合する複合体を形成し、前記化合物及び前記プレゼンタータンパク質のそれぞれが、前記複合体の形成の不在下では、前記標的タンパク質に実質的に結合しない、もしくは
前記化合物及びプレゼンタータンパク質が、前記複合体の形成の不在下での前記標的タンパク質に対する前記化合物及び前記プレゼンタータンパク質のそれぞれの親和性よりも少なくとも５倍大きい親和性で標的タンパク質に結合する複合体を形成する、前記化合物、
またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項２】
前記プレゼンタータンパク質結合部分が、式Ｉ：
【化１】
2020513036.tif 000001
の構造を含み、
式中、ｎが、０または１であり、
Ｘ１及びＸ３が、それぞれ独立して、Ｏ、Ｓ、ＣＲ３Ｒ４、またはＮＲ５であり、
Ｘ２が、Ｏ、Ｓ、またはＮＲ５であり、
Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３、及びＲ４が、それぞれ独立して、水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、もしくは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであるか、またはＲ１、Ｒ２、Ｒ３、もしくはＲ４のうちのいずれか２つが、それらが結合する１個もしくは複数の原子と一緒になって、任意選択で置換されたカルボシクリル、任意選択で置換されたヘテロシクリル、任意選択で置換されたアリール、もしくは任意選択で置換されたヘテロアリールを形成し、
各Ｒ５が、独立して、水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、もしくは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであるか、またはＲ５及びＲ１、Ｒ２、Ｒ３、もしくはＲ４のうちの１つが、それらが結合する１個もしくは複数の原子と一緒になって、任意選択で置換されたヘテロシクリルもしくは任意選択で置換されたヘテロアリールを形成する、請求項１に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項３】
前記プレゼンタータンパク質結合部分が、式ＩＩ〜ＩＶ：
【化２】
2020513036.tif 000002
のいずれか１つの構造を含み、
式中、ｏ、及びｐが、独立して、０、１、または２であり、
ｑが、０〜７の間の整数であり、
ｒが、０〜４の間の整数であり、
Ｘ４及びＸ５がそれぞれ、独立して、存在しない、ＣＨ２、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、またはＮＲ１１であり、
各Ｒ６及びＲ７が、独立して、水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであるか、またはＲ６及びＲ７が、それらが結合する炭素原子と組み合わさって、Ｃ＝Ｏを形成し、
各Ｒ８が、独立して、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、もしくは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであるか、または２つのＲ８が組み合わさって、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、もしくは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールを形成し、
Ｒ９及びＲ１１が、独立して、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであり、
Ｒ１０が、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキルであり、
Ｒ１２及びＲ１３がそれぞれ、独立して、水素、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたアリール、Ｃ３−Ｃ７カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、及び任意選択で置換されたＣ３−Ｃ７カルボシクリルＣ１−Ｃ６アルキルである、請求項１または２に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項４】
前記プレゼンタータンパク質結合部分が、式Ｖ：
【化３】
2020513036.tif 000003
の構造を含み、
式中、Ｒ１４が、水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルである、請求項３に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項５】
前記プレゼンタータンパク質結合部分が、式ＶＩまたはＶＩＩ：
【化４】
2020513036.tif 000004
の構造を含み、
式中、ｓ及びｔがそれぞれ、独立して、０〜７の整数であり、
Ｘ６及びＸ７がそれぞれ、独立して、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、またはＮＲ１９であり、
Ｒ１５及びＲ１７がそれぞれ、独立して、水素ヒドロキシル、または任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキルであり、
Ｒ１６及びＲ１８がそれぞれ、独立して、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであり、
Ｒ１９が、水素、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、Ｃ３−Ｃ７カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、及び任意選択で置換されたＣ３−Ｃ７カルボシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであり、
Ａｒが、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールまたは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールである、請求項４に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項６】
前記標的相互作用部分が、式ＩＸ：
【化５】
2020513036.tif 000005
の構造を含み、
式中、ｕが、１〜２０の整数であり、
各Ｙが、独立して、任意のアミノ酸、Ｏ、ＮＲ、Ｓ、Ｓ（Ｏ）ＳＯ２であるか、または式Ｘ〜ＸＩＩＩ：
【化６】
2020513036.tif 000006
のいずれか１つの構造を有し、
式中、各Ｒ２０が、独立して、水素、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたアリール、Ｃ３−Ｃ７カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、及び任意選択で置換されたＣ３−Ｃ７カルボシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであるか、またはＲ１９が、任意のＲ２０、Ｒ２１、Ｒ２２、Ｒ２３、Ｒ２４、Ｒ２５、Ｒ２６、Ｒ２７、Ｒ２８、Ｒ２９、もしくはＲ３０と組み合わさって、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、もしくは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールを形成し、
各Ｒ２１及びＲ２２が、独立して、水素、ハロゲン、任意選択で置換されたヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノであるか、またはＲ２０及びＲ２１が組み合わさって、＝Ｏ、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、もしくは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルを形成するか、またはＲ２１もしくはＲ２２が、任意のＲ２０、Ｒ２１、Ｒ２２、Ｒ２３、Ｒ２４、Ｒ２５、Ｒ２６、Ｒ２７、Ｒ２８、Ｒ２９、もしくはＲ３０と組み合わさって、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、もしくは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールを形成し、
各Ｒ２３、Ｒ２４、Ｒ２５、及びＲ２６が、独立して、水素、ヒドロキシルであるか、またはＲ２２及びＲ２３が組み合わさって、＝Ｏを形成するか、またはＲ２３、Ｒ２４、Ｒ２５、もしくはＲ２６が、任意のＲ２０、Ｒ２１、Ｒ２２、Ｒ２３、Ｒ２４、Ｒ２５、Ｒ２６、Ｒ２７、Ｒ２８、Ｒ２９、もしくはＲ３０と組み合わさって、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、もしくは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールを形成し、
各Ｒ２７、Ｒ２８、Ｒ２９、及びＲ３０が、独立して、水素、ハロゲン、任意選択で置換されたヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、もしくは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであるか、またはＲ２７、Ｒ２８、Ｒ２９、もしくはＲ３０が、任意のＲ２０、Ｒ２１、Ｒ２２、Ｒ２３、Ｒ２４、Ｒ２５、Ｒ２６、Ｒ２７、Ｒ２８、Ｒ２９、もしくはＲ３０と組み合わさって、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、もしくは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールを形成する、請求項１〜５のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項７】
前記化合物が、式ＸＩＶ〜ＸＶＩＩＩ：
【化７】
2020513036.tif 000007
のいずれか１つの構造を有する、請求項６に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項８】
前記標的タンパク質への結合に関与する各環原子を含む分子の部位が、構造：
【化８−１】
2020513036.tif 000008
【化８−２】
2020513036.tif 000009
を有さない、請求項１〜７のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項９】
前記化合物が、構造：
【化９】
2020513036.tif 000010
を含まない、請求項１〜８のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１０】
前記複合体が、前記標的タンパク質に、前記複合体がｍＴＯＲ及び／またはカルシニューリンのそれぞれに結合するよりも、少なくとも５倍大きい親和性で結合する、請求項１〜９のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１１】
前記複合体が、前記標的タンパク質に、前記化合物が前記プレゼンタータンパク質との複合体において結合していないときの前記標的に対する前記化合物の親和性よりも、少なくとも５倍大きい親和性で結合する、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１２】
前記複合体が、前記標的タンパク質に、前記プレゼンタータンパク質が前記化合物との複合体において結合していないときの前記標的に対する前記プレゼンタータンパク質の親和性よりも、少なくとも５倍大きい親和性で結合する、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１３】
前記複合体が、前記標的タンパク質及び前記標的タンパク質に特異的に結合するリガンド間の天然に生じる相互作用を阻害する、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１４】
前記プレゼンタータンパク質が、プロリルイソメラーゼである、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１５】
前記プレゼンタータンパク質が、ＦＫＢＰファミリーのメンバー、シクロフィリンファミリーのメンバー、またはＰＩＮ１である、請求項１〜１４のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１６】
前記哺乳類標的タンパク質が、ＧＴＰアーゼ、ＧＴＰアーゼ活性化タンパク質、グアニンヌクレオチド交換因子、熱ショックタンパク質、イオンチャネル、コイルドコイルタンパク質、キナーゼ、ホスファターゼ、ユビキチンリガーゼ、転写因子、クロマチン修飾因子／再構成因子、または古典的なタンパク質−タンパク質相互作用ドメイン及びモチーフを伴うタンパク質である、請求項１〜１５のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１７】
請求項１〜１６のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩及びプレゼンタータンパク質を含むプレゼンタータンパク質／化合物複合体。
【請求項１８】
請求項１〜１６のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩及び薬学的に許容され得る賦形剤を含む、医薬組成物。
【請求項１９】
標的タンパク質を調節する方法に使用するための、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩、請求項１７に記載のプレゼンタータンパク質／化合物複合体、または請求項１８に記載の組成物であって、前記方法が、前記標的タンパク質を、調節量の前記化合物またはその薬学的に許容され得る塩、前記プレゼンタータンパク質／化合物複合体、または前記組成物と接触させることを含む、化合物またはその薬学的に許容され得る塩、プレゼンタータンパク質／化合物複合体、または組成物。
【請求項２０】
標的タンパク質を調節する方法に使用するための、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩、または請求項１８に記載の組成物であって、前記方法が、請求項１７に記載のプレゼンタータンパク質／化合物複合体を細胞内で、前記細胞を有効量の前記化合物またはその薬学的に許容され得る塩または前記組成物と接触させることにより、形成することを含む、化合物またはその薬学的に許容され得る塩、または組成物。
【請求項２１】
標的タンパク質を調節する方法に使用するための、請求項１７に記載のプレゼンタータンパク質／化合物複合体であって、前記方法が、前記標的タンパク質を、前記プレゼンタータンパク質／化合物複合体と接触させることを含む、プレゼンタータンパク質／化合物複合体。
【請求項２２】
プロリルイソメラーゼ活性を阻害する方法に使用するための、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩、または請求項１８に記載の組成物であって、前記方法が、前記プロリルイソメラーゼを発現する細胞を、前記化合物または前記組成物と、前記化合物及び前記プロリルイソメラーゼ間の複合体の形成を可能とする条件下で、接触させることを含み、それによりプロリルイソメラーゼ活性を阻害する、化合物またはその薬学的に許容され得る塩または組成物。
【請求項２３】
請求項１７に記載のプレゼンタータンパク質／化合物複合体を細胞内で形成する方法に使用するための、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩、または請求項１８に記載の組成物であって、前記方法が、前記プレゼンタータンパク質を発現する細胞を、前記化合物またはその薬学的に許容され得る塩または前記組成物と、前記化合物及び前記プレゼンタータンパク質間の複合体の形成を可能とする条件下で、接触させることを含む、化合物またはその薬学的に許容され得る塩または組成物。
【請求項２４】
請求項１〜１６のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩の調製のための方法であって、前記化合物またはその薬学的に許容され得る塩を生成するように改変されているＳｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ属の細菌株を培養すること、及び前記化合物またはその薬学的に許容され得る塩を発酵ブロスから単離することを含む、方法。
【請求項２５】
請求項１〜１６のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩の調製のための方法であって、Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ属の細菌株を、前記株が前記化合物またはその薬学的に許容され得る塩を生成する条件下で培養すること、及び前記化合物またはその薬学的に許容され得る塩を発酵ブロスから単離することを含む、方法。
【請求項２６】
（ｉ）哺乳類標的タンパク質及び（ｉｉ）プレゼンタータンパク質／化合物複合体を含み、前記プレゼンタータンパク質／化合物複合体が、プレゼンタータンパク質及び請求項１〜１６のいずれか一項に記載の大環状化合物またはその薬学的に許容され得る塩を含む、三分子複合体。
【請求項２７】
１４〜４０個の環原子、哺乳類標的タンパク質相互作用部分、及びプレゼンタータンパク質結合部分からなる大環状化合物またはその薬学的に許容され得る塩を含む化合物集合体であって、前記大環状化合物が、プレゼンタータンパク質と一緒になって、標的タンパク質に特異的に結合する複合体を形成し、前記大環状化合物及び前記プレゼンタータンパク質が、前記複合体の形成の不在下では、前記標的タンパク質に実質的に結合しない、化合物集合体。