【手続補正書】
【提出日】令和3年6月24日(2021.6.24)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
(ａ)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)、ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)、ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)、ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)およびＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)から選択されるペプチドに特異的に結合するＴＣＲα鎖ポリペプチドのＣＤＲ３を含むポリペプチド；および／または
(ｂ)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)、ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)、ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)、ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)およびＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)から選択されるペプチドに特異的に結合するＴＣＲβ鎖ポリペプチドのＣＤＲ３を含むポリペプチド
をコードする、単離核酸配列。
【請求項２】
核酸配列が(ａ)および(ｂ)両者をコードし、ここで、(ａ)および(ｂ)が一体となってＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)、ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)、ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)、ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)およびＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)から選択されるペプチドに特異的に結合する、請求項１に記載の単離核酸配列。
【請求項３】
コードされたポリペプチドがＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)に特異的に結合する、請求項１または２に記載の単離核酸配列。
【請求項４】
(ｉ)(ａ)のＣＤＲ３がＣＡＶＴＧＡＲＬＭＦ(配列番号２)と少なくとも９０％配列同一性を有するアミノ酸配列を有するおよび／または
(ii)(ｂ)のＣＤＲ３がＣＡＳＳＰＧＧＬＳＮＥＱＦ(配列番号５)と少なくとも９０％配列同一性を有するアミノ酸配列を有する、
請求項３に記載の単離核酸配列。
【請求項５】
(ｉ)(ａ)のＣＤＲ３が配列番号１に特異的に結合するＴＣＲα鎖可変領域内であり、所望により(ａ)がＴＣＲα鎖定常領域をさらに含むおよび／または
(ii)(ｂ)のＣＤＲ３が配列番号１に特異的に結合するＴＣＲβ鎖可変領域内であり、所望により(ｂ)がＴＣＲβ鎖定常領域をさらに含む、
請求項３または４に記載の単離核酸配列。
【請求項６】
核酸配列がＴ細胞受容体をコードする、請求項１〜５の何れかに記載の単離核酸配列。
【請求項７】
請求項１〜６の何れかに記載の核酸配列を含む、ベクター。
【請求項８】
請求項１〜６の何れかに記載の核酸配列または請求項７に記載のベクターでトランスフェクトまたは形質導入された、修飾細胞。
【請求項９】
(ｉ)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)(ここで、アミノ酸システインはシステイニル化されている)；
(ii)ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)；
(iii)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)；
(iv)ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)；および
(ｖ)ＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)
から選択されるアミノ酸配列を含む、単離ペプチド。
【請求項１０】
請求項９に記載のペプチドをコードする、単離核酸配列。
【請求項１１】
請求項１０に記載の核酸配列を含む、ベクター。
【請求項１２】
請求項１〜６または１０の何れかに記載の核酸配列または請求項７または１１に記載のベクター、請求項８に記載の修飾細胞または請求項９に記載の単離ペプチドおよび薬学的に許容される添加物、アジュバント、希釈剤および／または担体を含む、医薬組成物。
【請求項１３】
ヒト対象におけるΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍の処置または予防に使用するための、請求項１２に記載の医薬組成物。
【請求項１４】
ヒト対象におけるΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍の処置または予防用医薬の製造における、請求項１２に記載の医薬組成物の使用。
【請求項１５】
Ｔ細胞受容体をエクスビボで産生する方法であって、請求項１〜６の何れかに記載の核酸配列と細胞を、配列番号１、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８または配列番号２９から選択されるペプチドに特異的に結合するＴ細胞受容体を産生するように、該核酸配列が該細胞に取り込まれ、発現される条件下で接触させることを含む、方法。
【請求項１６】
ヒト対象におけるΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍についてのバイオマーカーであって、
(ｉ)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)、
(ii)ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)；
(iii)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)；
(iv)ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)；および
(ｖ)ＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)
から選択されるペプチドである、バイオマーカー。
【請求項１７】
対象から単離したサンプル中のペプチドの存在を決定するための方法であって、ここで、ペプチドは(ｉ)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)；(ii)ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)；(iii)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)；(iv)ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)；および(ｖ)ＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)から選択され、
ここで、サンプル中の該ペプチドの存在が対象をΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍を有するとして同定するものであり、そして該ペプチドの非存在が対象をΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍を有しないとして同定するものである
方法。
【請求項１８】
ヒト対象におけるΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍の処置または予防に使用するための請求項１２に記載の医薬組成物であって、該対象は該対象から単離されたサンプルにおけるペプチドの存在によりΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍を有するとして同定されており、ここで、該ペプチドは
(ｉ)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)；
(ii)ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)；
(iii)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)；
(iv)ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)；および
(ｖ)ＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)
から選択されるものである、医薬組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５４】
修飾細胞は、ＣＤ８  Ｔ細胞、ＣＤ４  Ｔ細胞、ＮＫ細胞、ＮＫＴ細胞、ガンマ−デルタＴ細胞、造血幹細胞、前駆細胞、Ｔ細胞株またはＮＫ−９２細胞株からなる群から選択され得る。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６４】
さらなる態様において、本発明は、本発明の核酸配列を含むベクターを提供する。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２０３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２０３】
ある実施態様において、(ａ)のＣＤＲ１(例えばアルファ鎖可変領域内)は、配列番号１のペプチドのＮ末端に特異的に結合する能力を維持しながら、配列番号１４のアミノ酸配列と少なくとも８５％配列同一性を有するアミノ酸配列を有し得る。換言すると、配列番号１４の配列に比して１アミノ酸置換を有する機能的ＣＤＲ１も包含される。上記のとおり、アミノ酸置換は保存的アミノ酸置換であり得る。同様に、パーセント同一性は、対照配列(例えば配列番号１４)の全長に対する同一性のパーセンテージとして計算され得る。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２６１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２６１】
宿主細胞(およびその修飾細胞)は、ＴＣＲ遺伝子移入後抗腫瘍免疫を付与できるあらゆる細胞であり得る。適切な細胞の非限定的例は、自己または同種ナチュラルキラー(ＮＫ)細胞、ＮＫＴ細胞、ガンマ−デルタＴ細胞、造血幹細胞または他の前駆細胞およびＴＣＲ遺伝子移入後抗腫瘍免疫を付与できる任意の他の自己または同種細胞もしくは細胞株(例えばＮＫ−９２またはＴ細胞株)を含む。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３６６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３６６】
引用文献
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さらに、本発明は次の態様を包含する。
１. (ａ)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)、ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)、ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)、ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)およびＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)から選択されるペプチドに特異的に結合するＴＣＲα鎖ポリペプチドのＣＤＲ３を含むポリペプチド；および／または
(ｂ)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)、ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)、ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)、ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)およびＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)から選択されるペプチドに特異的に結合するＴＣＲβ鎖ポリペプチドのＣＤＲ３を含むポリペプチド
をコードする、単離核酸配列。
２. 核酸配列が(ａ)および(ｂ)両者をコードし、ここで、(ａ)および(ｂ)が一体となってＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)、ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)、ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)、ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)およびＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)から選択されるペプチドに特異的に結合する、項１に記載の単離核酸配列。
３. コードされたポリペプチドがＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)に特異的に結合する、項１または２に記載の単離核酸配列。
４. (ａ)のＣＤＲ３がＣＡＶＴＧＡＲＬＭＦ(配列番号２)と少なくとも９０％配列同一性を有するアミノ酸配列を有する、項３に記載の単離核酸配列。
５. (ａ)のＣＤＲ３が配列番号３または配列番号４の核酸配列によりコードされる、項４に記載の単離核酸配列。
６. (ｂ)のＣＤＲ３がＣＡＳＳＰＧＧＬＳＮＥＱＦ(配列番号５)と少なくとも９０％配列同一性を有するアミノ酸配列を有する、項３〜５の何れかに記載の単離核酸配列。
７. (ｂ)のＣＤＲ３が配列番号６または配列番号７の核酸配列によりコードされる、項６に記載の単離核酸配列。
８. (ａ)のＣＤＲ３が配列番号１に特異的に結合するＴＣＲα鎖可変領域内であり、所望により(ａ)がＴＣＲα鎖定常領域をさらに含む、項３〜７の何れかに記載の単離核酸配列。
９. ＴＣＲα鎖可変領域が配列番号８と少なくとも９０％配列同一性を有するアミノ酸配列を有する、項８に記載の単離核酸配列。
１０. (ａ)のＴＣＲα鎖可変領域が配列番号９または配列番号１０の核酸配列によりコードされる、項９に記載の単離核酸配列。
１１. (ｂ)のＣＤＲ３が配列番号１に特異的に結合するＴＣＲβ鎖可変領域内であり、所望により(ｂ)がＴＣＲβ鎖定常領域をさらに含む、項３〜１０の何れかに記載の単離核酸配列。
１２. ＴＣＲβ鎖可変領域が配列番号１１と少なくとも９０％配列同一性を有するアミノ酸配列を有する、項１１に記載の単離核酸配列。
１３. (ｂ)のＴＣＲβ鎖可変領域が配列番号１２または配列番号１３の核酸配列によりコードされる、項１２に記載の単離核酸配列。
１４. (ａ)のＣＤＲ３が配列番号８と少なくとも９０％配列同一性を有するＴＣＲα鎖可変領域内であり、ここで、ＣＤＲ３が配列番号２ののアミノ酸配列を有し、所望により(ａ)がＴＣＲα鎖定常領域を含む、項３〜１３の何れかに記載の単離核酸配列。
１５. ＴＣＲα鎖可変領域ＣＤＲ１が配列番号１４のアミノ酸配列を有し、ＴＣＲα鎖可変領域ＣＤＲ２が配列番号１５のアミノ酸配列を有する、項１４に記載の単離核酸配列。
１６. (ｂ)のＣＤＲ３が配列番号１１と少なくとも９０％配列同一性を有するＴＣＲβ鎖可変領域内であり、ここで、ＣＤＲ３が配列番号５ののアミノ酸配列を有し、所望により(ｂ)がＴＣＲβ鎖定常領域を含む、項３〜１５の何れかに記載の単離核酸配列。
１７. ＴＣＲβ鎖可変領域ＣＤＲ１が配列番号１６のアミノ酸配列を有し、ＴＣＲβ鎖可変領域ＣＤＲ２が配列番号１７のアミノ酸配列を有する、項１６に記載の単離核酸配列。
１８. ペプチドＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)がシステイニル化されている、項１〜１７の何れかに記載の単離核酸配列。
１９. 核酸配列がＴ細胞受容体をコードする、項１〜１８の何れかに記載の単離核酸配列。
２０. 項１〜１９の何れかに記載の核酸配列を含む、ベクター。
２１. ベクターがプラスミドまたはウイルスベクターであり、所望によりベクターがレトロウイルス、レンチウイルス、アデノ随伴ウイルス、アデノウイルス、ワクシニアウイルス、カナリアポックスウイルス、ヘルペスウイルス、ミニサークルベクターおよび合成ＤＮＡまたはＲＮＡからなる群から選択される、項２０に記載のベクター。
２２. 項１〜１９の何れかに記載の核酸配列または項２０または２１に記載のベクターでトランスフェクトまたは形質導入された、修飾細胞。
２３. 修飾細胞がＣＤ８  Ｔ細胞、ＣＤ４  Ｔ細胞、ＮＫ細胞、ＮＫＴ細胞、ガンマ−デルタＴ細胞、造血幹細胞、前駆細胞、Ｔ細胞株またはＮＫ−９２細胞株からなる群から選択される、項２２に記載の修飾細胞。
２４. 修飾細胞がヒト細胞である、項２２または２３に記載の修飾細胞。
２５. (ｉ)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)(ここで、アミノ酸システインはシステイニル化されている)；
(ii)ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)；
(iii)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)；
(iv)ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)；および
(ｖ)ＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)
から選択されるアミノ酸配列を含む、単離ペプチド。
２６. ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)のアミノ酸システインがシステイニル化されている、項２５に記載のペプチド。
２７. ペプチドが２０以下のアミノ酸を有する、項２５または２６に記載のペプチド。
２８. ペプチドが
(ｉ)配列番号１(ここで、アミノ酸システインはシステイニル化されている)；
(ii)配列番号２６；
(iii)配列番号２７；
(iv)ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)；および
(ｖ)ＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)
から選択される配列からなる、項２７に記載のペプチド。
２９. 項２５〜２８の何れかに記載のペプチドをコードする、単離核酸配列。
３０. 項２９に記載の核酸配列を含む、ベクター。
３１. 項１〜１９の何れかに記載の核酸配列または項２９、項２０、２１または３０に記載のベクター、項２２〜２４の何れかに記載の修飾細胞または項２５〜２８の何れかに記載の単離ペプチドおよび薬学的に許容される添加物、アジュバント、希釈剤および／または担体を含む、医薬組成物。
３２. 組成物が項２５〜２８の何れかに記載の単離ペプチド、項２９に記載の核酸または項３０に記載のベクターを含み、ワクチンとして製剤されている、項３１に記載の医薬組成物。
３３. ヒト対象におけるΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍を処置または予防する方法であって、対象に治療有効量の項３１または３２に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
３４. 造血器腫瘍が骨髄腫瘍である、項３３に記載の方法。
３５. 骨髄腫瘍が急性骨髄性白血病である、項３４に記載の方法。
３６. 方法が対象における細胞介在免疫応答を誘発または増強する、項３３〜３５の何れかに記載の方法。
３７. ヒト対象におけるΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍の処置または予防に使用するための、項３１または３２に記載の医薬組成物。
３８. 造血器腫瘍が骨髄腫瘍である、項３７に記載の使用のための医薬組成物。
３９. 骨髄腫瘍が急性骨髄性白血病である、項３７または３８に記載の使用のための医薬組成物。
４０. 医薬組成物が対象における細胞介在免疫応答の誘発または増強において使用するためである、項３７〜３９の何れかに記載の使用のための医薬組成物。
４１. ヒト対象におけるΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍の処置または予防用医薬の製造における、項３１または３２に記載の医薬組成物の使用。
４２. 造血器腫瘍が骨髄腫瘍である、項４１に記載の使用。
４３. 骨髄腫瘍が急性骨髄性白血病である、項４２に記載の使用。
４４. Ｔ細胞受容体を産生する方法であって、項１〜１９の何れかに記載の核酸配列と細胞を、配列番号１、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８または配列番号２９から選択されるペプチドに特異的に結合するＴ細胞受容体を産生するように、該核酸配列が該細胞に取り込まれ、発現される条件下で接触させることを含む、方法。
４５. 方法がエクスビボである、項４４に記載の方法。
４６. ヒト対象におけるΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍についてのバイオマーカーとしてのペプチドの使用であって、ペプチドが、
(ｉ)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)、
(ii)ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)；
(iii)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)；
(iv)ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)；および
(ｖ)ＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)
から選択されるものである、使用。
４７. ヒト対象におけるΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍を診断する方法であって、
対象から単離したサンプル中のペプチドの存在を決定することを含み、ここで、ペプチドは(ｉ)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)；(ii)ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)；(iii)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)；(iv)ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)；および(ｖ)ＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)から選択され、
ここで、サンプル中の該ペプチドの存在が対象をΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍を有するとして同定するものであり、そして該ペプチドの非存在が対象をΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍を有しないとして同定するものである
方法。
４８. ヒト対象におけるΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍を処置または予防する方法であって、
(ｉ)該対象から単離したサンプル中のペプチドの存在を決定し、ここで、ペプチドはＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)、ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)、ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)、ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)およびＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)から選択されるものであり；そして
(ii)該対象に治療有効量の項３１または３２に記載の医薬組成物を投与する
ことを含む、方法。
４９. ヒト対象におけるΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍の処置または予防に使用するための項３１または３２に記載の医薬組成物であって、該対象は該対象から単離されたサンプルにおけるペプチドの存在によりΔＮＰＭ１陽性造血器腫瘍を有するとして同定されており、ここで、該ペプチドは
(ｉ)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬ(配列番号１)；
(ii)ＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２６)；
(iii)ＣＬＡＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２７)；
(iv)ＶＥＥＶＳＬＲＫ(配列番号２８)；および
(ｖ)ＡＶＥＥＶＳＬＲ(配列番号２９)
から選択されるものである、医薬組成物。