【手続補正書】
【提出日】令和2年5月12日(2020.5.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヒト被験体を軽度歯周炎又は進行性歯周炎に分類するシステムであって、以下の：
−被験体の口腔液試料の、肝細胞増殖因子（ＨＧＦ）、マトリックスメタロプロテイナーゼ８（ＭＭＰ８）、マトリックスメタロプロテイナーゼ９（ＭＭＰ９）、インターロイキン−１β（ＩＬ１β）、インターロイキン−６（ＩＬ６）、コラーゲンテロペプチド、及び場合によりメタロペプチダーゼ阻害剤１（ＴＩＭＰ１）、のバイオマーカーの濃度を測定する検出手段；
−前記被験体の口腔液試料中のバイオマーカーの測定濃度から分類結果を決定する、１又はそれ以上の処理ユニット；を含み、
ここで、前記システムは、第１段階で、ＨＧＦ、ＭＭＰ８、及びＭＭＰ９を含むバイオマーカーのセットの濃度を測定して、第１段階濃度の測定結果を獲得し、前記処理ユニットは、前記第１段階濃度を処理して、第２段階でＩＬ１−β、ＩＬ６、及びコラーゲンテロペプチドを含むバイオマーカーのセットの濃度を測定するか否かの結果を提示し、それにより前記処理ユニットが、場合によっては、前記第１段階濃度を処理して、前記第２段階でＴＩＭＰ１の濃度を測定するように代替的に表示し、
前記システムは、第２段階濃度の測定結果を獲得して、それにより、処理ユニットが第２段階濃度を処理して、軽度又は進行性歯周炎の分類結果を提示する、
システム。
【請求項２】
ヒト被験体が歯周炎であることが疑われる、請求項１に記載のシステム。
【請求項３】
試料中のバイオマーカーの濃度を測定する検出手段を備えた、被験体の口腔液の前記試料を受け取る、１又はそれ以上の容器を備える、請求項１又は２に記載のシステム。
【請求項４】
さらに、以下の：
システムの一部又はリモートインタフェースのいずれかである、前記表示をユーザに提示するユーザインタフェース；及び、
プロセッサからユーザインタフェースへ表示を転送する、１又はそれ以上の処理ユニットとユーザインタフェースとの間のデータ接続
を備える、請求項１〜３のいずれか一項に記載のシステム。
【請求項５】
口腔液試料を受け取り、全てのバイオマーカーの濃度を測定する検出手段を備える、単一の容器を備える、請求項１〜４のいずれか一項に記載のシステム。
【請求項６】
口腔液試料を受け取り、ＨＧＦ、ＭＭＰ８、及びＭＭＰ９の濃度を測定する検出手段を備える第１容器と、ＩＬ１−β、ＩＬ６、及びコラーゲンテロペプチドの濃度を測定する第２容器と、ＨＧＦ及びＴＩＭＰ−１の濃度を測定する第３容器とを含む、請求項１〜５のいずれか一項に記載のシステム。
【請求項７】
前記第２容器及び前記第３容器は、異なるモジュールとして提示され、いずれの容器もシステムに挿入されうる、請求項６に記載のシステム。
【請求項８】
プロセッサは、インターネットベースのアプリケーションにより機能しうる、請求項１〜７のいずれか一項に記載のシステム。
【請求項９】
ヒト被験体が軽度歯周炎又は進行性歯周炎であるかを評価する体外方法であって、以下の：
−被験体由来の口腔液試料中のタンパク質ＨＧＦ、ＭＭＰ８、及びＭＭＰ９の濃度の測定する工程；
−測定結果を、（ｉ）歯周炎であることが知られている患者群の口腔液試料中のタンパク質ＨＧＦ、ＭＭＰ８、及びＭＭＰ９の濃度を決定すること；（ｉｉ）前記患者から得られた結果からクラスタ化技術を用いて、２つの第１特定クラスタ及び第２非特定クラスタを獲得すること、より得られたクラスタセンタと比較して、前記被験体の測定結果が前記第１クラスタ又は第２クラスタのどちらに適合するかを判定する工程；
−前記被験体が第１クラスタに適合する場合は、さらに、前記被験体の口腔液試料のＩＬ１−β、ＩＬ６、及びコラーゲンテロペプチドを含むタンパク質の濃度を測定して、前記タンパク質について測定された共同濃度を反映する試験値を得る工程；
−前記被験体が第２クラスタに適合する場合は、前記被験体の口腔液試料の、場合によっては、さらに、ＴＩＭＰ１の濃度を測定して、前記ＴＩＭＰ１及び以前に測定されたＨＧＦの共同濃度を反映する試験値を得る工程；及び
−前記試験値を、進行性歯周炎に関連する共同濃度を同様の方法で反映する閾値と比較して、その結果が前記被験体の軽度歯周炎又は進行性歯周炎を表示するかを評価する工程；
を、含む、方法。
【請求項１０】
ヒト被験体が歯周炎であることが疑われる、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
閾値が、進行性歯周炎の存在に関連する参照試料のタンパク質について決定された濃度に基づく、請求項９又は１０に記載の方法。
【請求項１２】
唾液中の歯周炎用バイオマーカーの濃度を決定するキットであって、各々異なるバイオマーカーを指向し、かつ、各々、ＨＧＦ、ＭＭＰ８、ＭＭＰ９、ＩＬ１−β、ＩＬ６、コラーゲンテロペプチド、及びＴＩＭＰ１に結合することができる、７つの検出試薬を含み、前記キットは、ＨＧＦ、ＭＭＰ８、及びＭＭＰ９を含む第１セット、ＩＬ１−β、ＩＬ６、及びコラーゲンテロペプチドを含む第２セット、並びにＴＩＭＰ１及びＨＧＦを含む第３セットである、３つの異なる前記バイオマーカーのセットの前記濃度を別個に処理し、前記検出試薬が、チップ、マイクロタイタープレート、ビーズ又は樹脂などの固体支持体上に収容される、キット。
【請求項１３】
ヒト患者由来の口腔液試料中のタンパク質の濃度に基づいて、歯周炎が疑われる前記ヒト患者の軽度歯周炎又は進行性歯周炎の診断する方法であって、以下の：
−前記ヒト患者の口腔液試料中のタンパク質ＨＧＦ、ＭＭＰ８、及びＭＭＰ９の濃度を測定する工程；
−測定結果を、（ｉ）歯周炎であることが知られている患者群の口腔液試料中のタンパク質ＨＧＦ、ＭＭＰ８、及びＭＭＰ９の濃度を決定し；（ｉｉ）前記患者から得られた結果からクラスタ化技術を用いて、２つの第１特定クラスタ及び第２非特定クラスタを獲得することにより、得られたクラスタセンタと比較して、前記被験体の測定結果が前記第１クラスタ又は第２クラスタのどちらに適合するかを判定する工程；
−前記被験体が第１クラスタに適合する場合は、さらに、前記被験体の口腔液試料のＩＬ１−β、ＩＬ６、及びコラーゲンテロペプチドを含むタンパク質の濃度を測定して、前記タンパク質について測定された共同濃度を反映する試験値を得る工程；
−前記被験体が第２クラスタに適合する場合は、前記被験体の口腔液試料の、場合によっては、さらに、ＴＩＭＰ１の濃度を測定して、前記ＴＩＭＰ１及びそれ以前に測定されたＨＧＦの共同濃度を反映する試験値を得る工程；及び
−得られた試験値と、進行性歯周炎に関連する共同濃度を同様の方法で反映する閾値と比較して、その結果が前記被験体の軽度歯周炎又は進行性歯周炎を表示するかを評価する工程；
を含む、方法。
【請求項１４】
タンパク質ＨＧＦ、ＭＭＰ８、及びＭＭＰ９を検出し、（ｉ）タンパク質ＩＬ１−β、ＩＬ６、及びコラーゲンテロペプチド、又は（ｉｉ）タンパク質ＴＩＭＰ１を、別個に検出する方法であって、以下の：
（ａ）ヒト患者から口腔液試料を得る工程；及び
（ｂ）前記タンパク質を結合する検出試薬と試料を接触させて、各タンパク質と検出試薬との結合を検出して、前記タンパク質が試料中に存在するか否かを検出する工程；
を含む、方法。
【請求項１５】
患者の軽度歯周炎又は進行性歯周炎の評価のバイオマーカーとしての、口腔液試料、又はヒト患者の試料における、ＨＧＦ、ＭＭＰ８、及びＭＭＰ９タンパク質、並びに（ｉ）ＩＬ１−β、ＩＬ６、及びコラーゲンテロペプチドタンパク質、又は（ｉｉ）タンパク質ＴＩＭＰ１の、使用。