【手続補正書】
【提出日】令和3年6月21日(2021.6.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１２０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１２０】
本開示は以下の実施形態を含む。
［１］
T細胞の機能を調節するためのアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［２］
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは、
T細胞の増殖、T細胞の殺傷能力もしくは抗ウイルス性サイトカインを産生する能力
のうちの1つ又は複数を調節する、［1］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［３］
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは、T細胞により発現される免疫関連遺伝子又は免疫調節遺伝子の活性又は発現のレベルのうちの1つ又は複数を調節し、但し、前記遺伝子はCTLA4遺伝子ではない、［1］又は［2］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［４］
前記発現のレベルは、前記免疫関連遺伝子又は免疫調節遺伝子のアイソフォーム発現を改変するスプラシング調節である、［3］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［５］
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは、免疫チェックポイント分子をブロックすることによりT細胞の機能を調節する、［3］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［６］
前記免疫チェックポイント分子はPD-1である、［5］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［７］
前記発現のレベルは、前記免疫関連遺伝子又は免疫調節遺伝子の直接的な又は選択的な下方制御のうちの1つである、［3］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［８］
前記オリゴヌクレオチドは、前記免疫関連遺伝子又は免疫調節遺伝子のプレmRNA又は成熟mRNAの標的領域に特異的にハイブリダイズする、［7］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［９］
前記遺伝子は、IFN-γ、グランザイム、パーフォリン1、PD-1、PRDM1、PD-L1、CD40LG、NDFIP1、PDCD1LG2、REL、BTLA、CD80、CD160、CD244、LAG3、TIGIT. ADORA2A、及びTIM-3を含む群から選択されるいずれか1つである、［8］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［１０］
前記オリゴヌクレオチドは、IFN-γ RNAのエクソン、イントロン、又はエクソン-イントロン境界の標的領域に特異的にハイブリダイズし、前記標的領域は、エクソン1及びエクソン2を含む群から選択されるいずれか1つである、［9］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［１１］
前記オリゴヌクレオチドは、パーフォリンのエクソン、イントロン、又はエクソン-イントロン境界の標的領域に特異的にハイブリダイズし、前記標的領域はエクソン2bである、［9］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［１２］
前記オリゴヌクレオチドは、グランザイムRNAのエクソン、イントロン、又はエクソン-イントロン境界の標的領域に特異的にハイブリダイズし、前記標的領域はエクソン3である、［9］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［１３］
前記オリゴヌクレオチドは、PD-1 RNAのエクソン、イントロン、又はエクソン-イントロン境界の標的領域に特異的にハイブリダイズし、前記標的領域はエクソン2である、［9］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［１４］
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号6508、69648、2565、7274、15372、63352、67190、66260、25333、25599、25676、43942、45170、45445、61632、及び53882のいずれか1つから選択される配列を含む、［1］〜［13］のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［１５］
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは修飾ポリヌクレオチド骨格を含む、［1］〜［14］のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［１６］
前記修飾ポリヌクレオチド骨格は、ポリヌクレオチドの少なくとも1個の糖の代わりに修飾部分を含む、［15］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［１７］
前記修飾部分は、ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー(PMO)、ペプチド結合ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー(PPMO)、及び非ペプチドデンドリマーオクタグアニジン部分タグ化モルホリノオリゴマーからなる群から選択される、［16］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［１８］
前記修飾ポリヌクレオチド骨格は、少なくとも1個の修飾ヌクレオチド間連結を含む、［15］〜［17］のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［１９］
前記修飾ヌクレオチド間連結は修飾ホスフェートを含む、［18］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［２０］
前記修飾ホスフェートは、硫黄原子を置換する非架橋酸素原子、ホスホネート、ホスホロチオエート、ホスホジエステル、ホスホロモルホリデート、ホスホロピペラジデート、及びホスホロアミデートを含む群から選択される、［19］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［２１］
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは、リボ核酸、デオキシリボ核酸、DNAホスホロチオエート、RNAホスホロチオエート、2’-O-メチル-オリゴリボヌクレオチド及び2’-O-メチル-オリゴデオキシリボヌクレオチド、2’-O-ヒドロカルビルリボ核酸、2’-O-ヒドロカルビルDNA、2’-O-ヒドロカルビルRNAホスホロチオエート、2’-O-ヒドロカルビルDNAホスホロチオエート、2’-F-ホスホロチオエート、2’-F-ホスホジエステル、2’-メトキシエチルホスホロチオエート、2-メトキシエチルホスホジエステル、デオキシメチレン(メチルイミノ)(デオキシMMI)、2’-O-ヒドロカルビルMMI、デオキシ-メチルホスホネート、2’-O-ヒドロカルビルメチルホスホネート、モルホリノ、4’-チオDNA、4’-チオRNA、ペプチド核酸、3’-アミデート、デオキシ3’-アミデート、2’-O-ヒドロカルビル3’-アミデート、ロックド核酸、シクロヘキサン核酸、三環式DNA、2’フルオロ-アラビノ核酸、N3’-P5’ホスホロアミデート、カルバメート連結、ホスホトリエステル連結、ナイロン骨格修飾、及び上述の骨格の混合物を含む群から選択される骨格を含む、［1］〜［20］のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［２２］
前記オリゴヌクレオチドは、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの活性、細胞分布、又は細胞取り込みを増強する1個又は複数個のコンジュゲートに化学的に連結されている、［1］〜［21］のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［２３］
患者の癌又は自己免疫疾患の処置における使用のための［1］〜［22］のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［２４］
前記疾患は癌であり、前記患者は、さらなる抗がん剤又は処置が施される患者である、［23］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［２５］
前記癌は、HBV誘発性HCC、EBV誘発性非ホジキンリンパ腫を含む群から選択されるいずれか1つである、［23］又は［24］に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
［２６］
［1］〜［25］のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチドと、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
［２７］
T細胞レセプター遺伝子をコードする核酸分子をさらに含む［26］に記載の組成物。
［２８］
前記核酸分子はmRNAである、［27］に記載の組成物。
［２９］
前記組成物は、裸で又は送達剤との複合体で、患者への非経口投与に適している、［26］〜［28］のいずれか一項に記載の組成物。
［３０］
前記担体は、ナノ粒子、例えば、ポリマーナノ粒子;リポソーム、例えば、pH感受性リポソーム、抗体結合リポソーム;ウイルスベクター、カチオン性脂質、ポリマー、UsnRNA、例えば、U7 snRNA、及び細胞膜透過ペプチドを含む群から選択される、［29］に記載の組成物。
［３１］
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、経口投与、又は直腸投与、又は経粘膜投与、又は腸内投与、又は筋肉内投与、又は皮下投与、又は髄内投与、又は髄腔内投与、又は直接脳室内投与、又は静脈内投与、又は硝子体内投与、又は腹腔内投与、又は鼻腔内投与、又は眼内投与される、［26］〜［30］のいずれか一項に記載の組成物。
［３２］
患者の疾患を処置する方法であって、［1］〜［25］のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド、又は［26］〜［31］のいずれか一項に記載の組成物の薬学的有効量を投与することを含む方法。
［３３］
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドはT細胞にトランスフェクトされており、前記方法は、前記患者への前記トランスフェクトされたT細胞を投与することを含む、［32］に記載の方法。
［３４］
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ソノフォレーシス、電気パルス、エレクトロポレーション、浸透圧ショック、リン酸カルシウム沈殿、及びDEAEデキストラントランスフェクション、脂質媒介送達、及び受動送達を含む群から選択されるいずれか1つにより、T細胞にトランスフェクトされているか、又は導入されている、［33］に記載の方法。
［３５］
前記担体は、ナノ粒子、例えば、ポリマーナノ粒子;リポソーム、例えば、pH感受性リポソーム、抗体結合リポソーム;ウイルスベクター、カチオン性脂質、ポリマー、UsnRNA、例えば、U7 snRNA、及び細胞透過性ペプチドからなる群から選択される、［32］〜［34］のいずれか一項に記載の方法。
［３６］
前記アンチセンスオリゴヌクレオチド又は組成物が、経口投与、又は直腸投与、又は経粘膜投与、又は腸内投与、又は筋肉内投与、又は皮下投与、又は髄内投与、又は髄腔内投与、又は直接脳室内投与、又は静脈内投与、又は硝子体内投与、又は腹腔内投与、又は鼻腔内投与、又は眼内投与される、［32］〜［35］のいずれか一項に記載の方法。
［３７］
前記疾患は、HBV誘発性HCC、EBV誘発性非ホジキンリンパ腫を含む群から選択される癌である、［32］〜［36］のいずれか一項に記載の方法。
［３８］
医薬品における［1］〜［25］のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチドの使用。
［３９］
T細胞により発現される免疫関連遺伝子又は免疫調節遺伝子のプレmRNAのエクソンスキッピングを誘発する方法であって、［1］〜［25］のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は［26］〜［31］のいずれか一項に記載の組成物を細胞に送達することを含む方法。
［４０］
前記細胞はヒト細胞である、［39］に記載の方法。
［４１］
T細胞の機能を調節する方法であって、［1］〜［25］のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチドを前記T細胞に投与することを含む方法。
［４２］
前記方法は、T細胞レセプター遺伝子をコードする核酸分子を前記T細胞に投与することにより前記T細胞の特異性を調節することをさらに含む、［41］に記載の方法。
［４３］
T細胞レセプター遺伝子をコードする前記核酸分子を、ソノフォレーシス、電気パルス、エレクトロポレーション、浸透圧ショック、リン酸カルシウム沈殿、及びDEAEデキストラントランスフェクション、脂質媒介送達、及び受動送達を含む群から選択されるいずれか1つにより、前記T細胞にトランスフェクトさせるか、又は導入する、［42］に記載の方法。
［４４］
［1］〜［25］のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチドで形質転換されたか又はトランスフェクトされたT細胞。
［４５］
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは、エレクトロポレーションにより前記T細胞にトランスフェクトされているか、又は導入されている、［44］に記載のT細胞。
［４６］
T細胞レセプター遺伝子をコードする核酸分子をさらに含む［44］又は［45］に記載のT細胞。
［４７］
前記核酸分子はmRNAである、［46］に記載のT細胞。
［４８］
任意選択で容器中の、［1］〜［25］のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチドと、パッケージ挿入物、パッケージラベル、説明書、又は他のラベリングとを含むキット。
上記の説明では本発明の好ましい実施形態が説明されているが、本発明から逸脱することなく、設計又は構成の詳細における多くの変形又は改変を行ない得ることを当業者は理解するだろう。
【手続補正２】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
T細胞の殺傷能力、又は細胞傷害効果、抗腫瘍効果、若しくは抗ウイルス効果を発揮する能力、T細胞が抗ウイルス性サイトカインを産生する能力、T細胞の増殖、のうちの1つ又は複数を調節する、アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは、免疫関連遺伝子又は免疫調節遺伝子のアイソフォーム発現を改変することによって、T細胞により発現される免疫関連遺伝子又は免疫調節遺伝子の発現を調節し、
前記遺伝子は、PD-1、IFN-γ、グランザイム、パーフォリン1、TIM-3、LAG3、及びADORA2Aを含む群から選択されるいずれか1つであり、
任意で、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは、リボ核酸（RNA）又は化学修飾されたRNAを含む骨格を有してもよい、
アンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項２】
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは、前記免疫関連遺伝子又は免疫調節遺伝子のプレmRNAにアニールすることによりエクソンスキッピングを誘発することができる、請求項１に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項３】
a) 前記オリゴヌクレオチドは、PD-1 RNAのエクソン2若しくは3における標的領域に特異的にハイブリダイズし、それによってPD-1の可溶性アイソフォームを発現させ膜結合型PD-1の発現を減少させるか；又は
b) 前記オリゴヌクレオチドは、IFN-γ RNAのエクソン若しくはエクソン-イントロン境界の標的領域に特異的にハイブリダイズし、前記標的領域は、エクソン2及びエクソン3を含む群から選択されるいずれか1つであるか；又は
c) 前記オリゴヌクレオチドは、パーフォリンのエクソン若しくはエクソン-イントロン境界の標的領域に特異的にハイブリダイズし、前記標的領域はエクソン2bであるか； 又は
d) 前記オリゴヌクレオチドは、グランザイムRNAのエクソン若しくはエクソン-イントロン境界の標的領域に特異的にハイブリダイズし、前記標的領域はエクソン3であるか； 
e) 前記オリゴヌクレオチドは、LAG3のエクソン若しくはエクソン-イントロン境界の標的領域に特異的にハイブリダイズし、前記標的領域はエクソン2であるか；又は
f) 前記オリゴヌクレオチドは、TIM-3のエクソン若しくはエクソン-イントロン境界の標的領域に特異的にハイブリダイズし、前記標的領域はエクソン4であるか；
g) 前記オリゴヌクレオチドは、ADORA2Aのエクソン若しくはエクソン-イントロン境界の標的領域に特異的にハイブリダイズし、前記標的領域はエクソン2である、
請求項１又は２に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項４】
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号6508、69648、2565、7274、15372、63352、67190、66260、25333、25599、25676、43942、45170、45445、61632、53882、3186、及び3209のいずれか1つから選択される配列を含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項５】
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは修飾ポリヌクレオチド骨格を含み、
任意で、前記修飾ポリヌクレオチド骨格は、ポリヌクレオチドの少なくとも1個の糖を置き替える修飾部分を含み、
さらに任意で、前記修飾部分は、ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー(PMO)、ペプチド結合ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー(PPMO)、及び非ペプチドデンドリマーオクタグアニジン部分タグ化モルホリノオリゴマーからなる群から選択される、
請求項１〜４のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項６】
前記修飾ポリヌクレオチド骨格は、少なくとも1個の修飾ヌクレオチド間連結を含み、
任意で、前記修飾ヌクレオチド間連結は修飾ホスフェートを含み、
さらに任意で、前記修飾ホスフェートは、硫黄原子を置換する非架橋酸素原子、ホスホネート、ホスホロチオエート、ホスホジエステル、ホスホロモルホリデート、ホスホロピペラジデート、及びホスホロアミデートを含む群から選択される、
請求項４に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項７】
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは、リボ核酸、デオキシリボ核酸、DNAホスホロチオエート、RNAホスホロチオエート、2’-O-メチル-オリゴリボヌクレオチド及び2’-O-メチル-オリゴデオキシリボヌクレオチド、2’-O-ヒドロカルビルリボ核酸、2’-O-ヒドロカルビルDNA、2’-O-ヒドロカルビルRNAホスホロチオエート、2’-O-ヒドロカルビルDNAホスホロチオエート、2’-F-ホスホロチオエート、2’-F-ホスホジエステル、2’-メトキシエチルホスホロチオエート、2-メトキシエチルホスホジエステル、デオキシメチレン(メチルイミノ)(デオキシMMI)、2’-O-ヒドロカルビルMMI、デオキシ-メチルホスホネート、2’-O-ヒドロカルビルメチルホスホネート、モルホリノ、4’-チオDNA、4’-チオRNA、ペプチド核酸、3’-アミデート、デオキシ3’-アミデート、2’-O-ヒドロカルビル3’-アミデート、ロックド核酸、シクロヘキサン核酸、三環式DNA、2’フルオロ-アラビノ核酸、N3’-P5’ホスホロアミデート、カルバメート連結、ホスホトリエステル連結、ナイロン骨格修飾、及び上述の骨格の混合物を含む群から選択される骨格を含み、
及び／又は、
前記オリゴヌクレオチドは、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの活性、細胞分布、又は細胞取り込みを増強する1個又は複数個のコンジュゲートに化学的に連結されている、
請求項１〜６のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項８】
請求項１〜７のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチドで形質転換又はトランスフェクトされたT細胞であって、
任意で、前記オリゴヌクレオチドは、エレクトロポレーションによって前記T細胞にトランスフェクト又は導入されており、
さらに任意で、前記T細胞は、T細胞レセプター遺伝子をコードする核酸分子をさらに含み、任意で前記核酸分子はmRNAである、
T細胞。
【請求項９】
患者の癌、及び／又はウイルス感染、又は自己免疫疾患の処置における使用のための、請求項１〜７のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は請求項８に記載のT細胞。
【請求項１０】
患者の癌、及び／又はウイルス感染、又は自己免疫疾患のための医薬の製造における、請求項１〜７のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は請求項８に記載のT細胞の使用。
【請求項１１】
疾患は癌であり、前記患者は、さらなる抗がん剤又は抗がん処置が施される患者であり、
さらに任意で、前記癌は、HBV誘発性HCC、EBV誘発性非ホジキンリンパ腫を含む群から選択されるいずれか1つである、
請求項１０に記載の使用又は請求項９に記載の使用のためのアンチセンスオリゴヌクレオチド若しくはT細胞。
【請求項１２】
請求項１〜７のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は請求項８に記載のT細胞と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
【請求項１３】
患者の疾患を処置する方法における使用のための、請求項１〜７のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド、請求項８に記載のT細胞、又は請求項１２に記載の医薬組成物。
【請求項１４】
T細胞により発現される免疫関連遺伝子又は免疫調節遺伝子のプレmRNAのエクソンスキッピングを誘発する方法であって、請求項１〜７のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は請求項１２に記載の医薬組成物を細胞に送達することを含み、任意で、前記細胞はヒト細胞である、方法。
【請求項１５】
T細胞の機能を調節する方法であって、請求項１〜７のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチドを前記T細胞に投与することを含み、
任意で、前記方法は、T細胞レセプター遺伝子をコードする核酸分子を前記T細胞に投与することにより前記T細胞の特異性を調節することをさらに含み、
さらに任意で、T細胞レセプター遺伝子をコードする前記核酸分子は、ソノフォレーシス、電気パルス、エレクトロポレーション、浸透圧ショック、リン酸カルシウム沈殿、及びDEAEデキストラントランスフェクション、脂質媒介送達、及び受動送達を含む群から選択されるいずれか1つにより、前記T細胞にトランスフェクト又は導入される、
方法。
【請求項１６】
請求項１〜７のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチドと、パッケージ挿入物、パッケージラベル、説明書、又は他のラベリングとを含むキットであって、任意で前記アンチセンスオリゴヌクレオチドは容器中に含まれる、キット。