【手続補正書】
【提出日】令和3年3月9日(2021.3.9)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ｉ）単離された生存可能な非病原性真菌株および（ｉｉ）単離された生存可能な非病原性細菌株を含む組成物。
【請求項２】
凍結乾燥または噴霧乾燥されている、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
被験体においてバイオフィルムを破壊することが可能である酵素をさらに含む、請求項１または２に記載の組成物。
【請求項４】
被験体の予め選択された領域内に位置する病原性細菌および病原性真菌を含むバイオフィルムを破壊するための剤形であって、（ｉ）前記バイオフィルムを破壊することが可能な酵素、（ｉｉ）前記被験体の前記領域において複製することが可能な非病原性真菌株、および（ｉｉｉ）前記被験体の前記領域において複製することが可能な非病原性細菌株を含む組成物を含む、剤形。
【請求項５】
前記組成物が少なくとも２つの異なる非病原性細菌株を含む、請求項１から２のいずれか一項に記載の組成物または請求項４に記載の剤形。
【請求項６】
前記組成物が３つの異なる非病原性細菌株を含む、請求項１から２のいずれか一項に記載の組成物または請求項４に記載の剤形。
【請求項７】
前記非病原性細菌株が、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｍおよびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｅｕｔｅｒｉから選択される、請求項１から２もしくは５から６のいずれか一項に記載の組成物または請求項４から６のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項８】
前記非病原性細菌株が、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ  ＬＢ  ２０、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ  Ｓ  ４６およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ  ＲＰ  ３２から選択される、請求項１から２もしくは５から７のいずれか一項に記載の組成物または請求項４から７のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項９】
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ  ＬＢ  ２０、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ  Ｓ  ４６およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ  ＲＰ  ３２を含む、請求項８に記載の組成物または請求項８に記載の剤形。
【請求項１０】
前記非病原性真菌株が、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂｏｕｌａｒｄｉｉ、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｔｅｓ  ｓｐ  ＨＺ１７８、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂａｙａｎｕｓ、Ｐｉｃｈｉａ  ｂｕｒｔｏｎｉｉ、Ｐｉｃｈｉａ  ｊａｄｉｎｉｉ、Ｐｉｃｈｉａ  ｋｕｄｒｉａｖｚｅｖｉｉ、Ｐｉｃｈｉａ  ｏｎｙｃｈｉｓ、Ｐｉｃｈｉａ  ｓｐ．およびＰｉｃｏａ  ｊｕｎｉｐｅｒから選択される、請求項１から２もしくは５から９のいずれか一項に記載の組成物または請求項４から９のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項１１】
前記非病原性真菌株がＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂｏｕｌａｒｄｉｉ  ＳＢ４８である、請求項１０に記載の組成物または請求項１０に記載の剤形。
【請求項１２】
被験体においてバイオフィルムを破壊することが可能な酵素をさらに含む、請求項５から１１のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１３】
前記酵素が、アミラーゼ、セルラーゼ、ヘミセルラーゼ、リゾチーム、ペクチナーゼ、ＤＮアーゼＩ、セラチアペプチダーゼまたはセラチオペプチダーゼ、ヘミセルラーゼ／ペクチナーゼ複合体、β−１，３−グルカナーゼ、酸性プロテアーゼ、アルカリプロテアーゼ、グルコアミラーゼ、エンドグルカナーゼ、キシラナーゼ、リパーゼ、リゾチーム、プロテアーゼ／ペプチダーゼ複合体、ジペプチジルペプチダーゼＩＶ（ＤＰＰ−ＩＶ）、キトサナーゼ、ブロメライン、パパイン、キーウィプロテアーゼアクチニジ、植物由来のプロテアーゼおよびフィターゼからなる群より選択される、請求項３もしくは１２のいずれか一項に記載の組成物または請求項４から１１のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項１４】
前記酵素が、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｔｅａｒｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓアミラーゼ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｍｙｌｏｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓアミラーゼ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ
ｓｕｂｔｉｌｉｓアミラーゼ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉアミラーゼ、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｎｉｇｅｒアミラーゼおよびＡｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｏｒｙｚａｅアミラーゼからなる群より選択されるアミラーゼである、請求項１３に記載の組成物または請求項１３に記載の剤形。
【請求項１５】
前記組成物が、約１００から約５，０００ＳＫＢ単位のアミラーゼ、約２００から約４，０００ＳＫＢ単位のアミラーゼ、約３００から約２，０００ＳＫＢ単位のアミラーゼ、または約４００から約１，０００ＳＫＢ単位のアミラーゼを含む、請求項３もしくは１２から１４のいずれか一項に記載の組成物または請求項４から１１もしくは１３から１４のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項１６】
前記組成物が約５００ＳＫＢ単位のアミラーゼを含む、請求項１５に記載の組成物または請求項１５に記載の剤形。
【請求項１７】
前記組成物がカプセル剤の中に位置する、請求項１から３もしくは５から１６のいずれか一項に記載の組成物または請求項４から１１もしくは１３から１６のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項１８】
経口剤形である、請求項１から３もしくは５から１７のいずれか一項に記載の組成物または請求項４から１１もしくは１３から１７のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項１９】
前記組成物が顆粒剤、ペレット剤または散剤として製剤化されている、請求項１から２もしくは５から１１のいずれか一項に記載の組成物または請求項４から１１もしくは１３から１７のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項２０】
前記組成物が、コーティングされた散剤として製剤化されており、必要に応じて、コーティングされた散剤として製剤化されている前記組成物が、バイオフィルムを破壊することが可能な酵素とさらに組み合わされている、請求項１から２、５から１１もしくは１９のいずれか一項に記載の組成物または請求項４から１１もしくは１３から１９のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項２１】
前記散剤がヒドロキシプロピルメチルセルロースでコーティングされている、請求項２０に記載の組成物または請求項２０に記載の剤形。
【請求項２２】
前記カプセル剤が約５０ｍｇから約１，０００ｍｇの前記組成物を含む、請求項１７から２１のいずれか一項に記載の組成物または請求項１７から２１のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項２３】
前記カプセル剤が約７００ｍｇの前記組成物を含む、請求項２２に記載の組成物または請求項２２に記載の剤形。
【請求項２４】
前記組成物が、約１００億から約４００億、約１５０億から約４００億、約２００億から約４００億、約１００億から約３００億、約１５０億から約３００億、約２００億から約３００億のコロニー形成単位の前記非病原性細菌株（複数可）を含む、請求項１から３もしくは５から２３のいずれか一項に記載の組成物または請求項４から１１もしくは１３から２３のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項２５】
前記組成物が、約１０億から約１００億、約２０億から約８０億、約３０億から約６０億コロニー形成単位の前記非病原性真菌株（複数可）を含む、請求項１から３もしくは５から２４のいずれか一項に記載の組成物または請求項４から１１もしくは１３から２４のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項２６】
前記組成物が、約１５０億コロニー形成単位のＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ、約１００億コロニー形成単位のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ、約３５億コロニー形成単位のＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂｏｕｌａｒｄｉｉ、および約１５億コロニー形成単位のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓを含む、請求項１から３もしくは５から２５のいずれか一項に記載の組成物または請求項４から１１もしくは１３から２５のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項２７】
前記領域が、胃腸管、尿路、生殖管、上気道、下気道、胆管、口、目、鼻、耳または皮膚である、請求項４から１１または１３から２６のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項２８】
前記被験体がヒトである、請求項４から１１または１３から２７のいずれか一項に記載の剤形。
【請求項２９】
バイオフィルムの破壊またはバイオフィルムの形成の阻止を必要とする被験体の予め選択された領域内に位置する病原性細菌および／または病原性真菌を含むバイオフィルムを破壊するかまたはその形成を阻止するための請求項１から３もしくは５から２６のいずれか一項に記載の組成物または請求項４から１１もしくは１３から２８のいずれか一項に記載の剤形であって、前記組成物または剤形が前記被験体に投与され、前記組成物または前記剤形の投与により前記被験体においてバイオフィルムが破壊されることを特徴とする、組成物または剤形。
【請求項３０】
前記病原性真菌がＣａｎｄｉｄａ  ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓまたはその組み合わせである、請求項２９に記載の組成物または剤形。
【請求項３１】
前記バイオフィルムが、（ｉ）Ｃａｎｄｉｄａ  ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓおよびＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、（ｉｉ）Ｃａｎｄｉｄａ  ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓおよびＳｅｒｒａｔｉａ  ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、または、（ｉｉｉ）Ｃａｎｄｉｄａ  ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉおよびＳｅｒｒａｔｉａ  ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓを含む、請求項２９または３０に記載の組成物または剤形。
【請求項３２】
前記バイオフィルムが、Ｅ．ｃｏｌｉおよびＢａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｓｐｐ．を含む、請求項２９に記載の組成物または剤形。
【請求項３３】
前記Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｓｐｐ．が、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｏｐｒｏｐｈｉｌｕｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｅｇｇｅｒｔｈｉｉ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｏｖａｔｕｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｐｌｅｂｅｉｕｓおよびＢａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｕｎｉｆｏｒｍｉｓを含む群より選択される、請求項３２に記載の組成物または剤形。
【請求項３４】
前記組成物または前記剤形中の酵素が、前記バイオフィルムに存在する細胞外マトリクス多糖（ＥＰＳ）を破壊する、請求項２９から３３のいずれか一項に記載の組成物または剤形。
【請求項３５】
前記組成物または前記剤形を投与すると、非病原性細菌株が、（ｉ）前記バイオフィルム中の前記病原性細菌に取って代わる、（ｉｉ）前記バイオフィルムの基層への前記病原性細菌または真菌の付着を妨害する、（ｉｉｉ）前記バイオフィルムに存在する細胞外ポリマーマトリクスから前記病原性細菌または真菌を追い出す、（ｉｖ）前記バイオフィルム中の前記病原性真菌のフィラメント化を阻止する、または（ｖ）上述のいずれかの組み合わせを行う、請求項２９から３４のいずれか一項に記載の組成物または剤形。
【請求項３６】
前記バイオフィルムが、胃腸管、尿路、生殖管、上気道、下気道、胆管、口、目、鼻、耳または皮膚に位置する、請求項２９から３５のいずれか一項に記載の組成物または剤形。
【請求項３７】
前記組成物または前記剤形の投与が、高アンモニア血症、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ大腸炎、肝硬変と関連した肝性脳障害、炎症性腸疾患、クローン病および／または過敏性腸疾患を処置することを特徴とする、請求項２９から３５のいずれか一項に記載の組成物または剤形。
【請求項３８】
前記組成物または前記剤形の投与が、前記被験体における前記領域の天然のマイクロバイオームの回復を可能にすることを特徴とする、請求項２９から３７のいずれか一項に記載の組成物または剤形。
【請求項３９】
（ｉ）単離された非病原性真菌株および（ｉｉ）単離された非病原性細菌株を含むプロバイオティック組成物を含む、焼いた食品。
【請求項４０】
前記プロバイオティック組成物が、アミラーゼ、セルラーゼ、ヘミセルラーゼ、リゾチーム、ペクチナーゼ、ＤＮアーゼＩ、セラチアペプチダーゼまたはセラチオペプチダーゼ、ヘミセルラーゼ／ペクチナーゼ複合体、β−１，３−グルカナーゼ、酸性プロテアーゼ、アルカリプロテアーゼ、グルコアミラーゼ、エンドグルカナーゼ、キシラナーゼ、リパーゼ、リゾチーム、プロテアーゼ／ペプチダーゼ複合体、ジペプチジルペプチダーゼＩＶ（ＤＰＰ−ＩＶ）、キトサナーゼ、ブロメライン、パパイン、キーウィプロテアーゼアクチニジ、植物由来のプロテアーゼおよびフィターゼから選択される酵素をさらに含む、請求項３９に記載の焼いた食品。
【請求項４１】
被験体において栄養素吸収を改善するためのプロバイオティック組成物であって、（ｉ）単離された非病原性真菌株および（ｉｉ）単離された非病原性細菌株を含み、前記被験体による消費または前記被験体への投与を特徴とする、プロバイオティック組成物。
【請求項４２】
前記プロバイオティック組成物が、アミラーゼ、セルラーゼ、ヘミセルラーゼ、リゾチーム、ペクチナーゼ、ＤＮアーゼＩ、セラチアペプチダーゼまたはセラチオペプチダーゼ、ヘミセルラーゼ／ペクチナーゼ複合体、β−１，３−グルカナーゼ、酸性プロテアーゼ、アルカリプロテアーゼ、グルコアミラーゼ、エンドグルカナーゼ、キシラナーゼ、リパーゼ、リゾチーム、プロテアーゼ／ペプチダーゼ複合体、ジペプチジルペプチダーゼＩＶ（ＤＰＰ−ＩＶ）、キトサナーゼ、ブロメライン、パパイン、キーウィプロテアーゼアクチニジ、植物由来のプロテアーゼおよびフィターゼから選択される酵素をさらに含む、請求項４１に記載のプロバイオティック組成物。
【請求項４３】
前記プロバイオティック組成物が少なくとも２つの異なる非病原性細菌株を含む、請求項３９もしくは４０のいずれか一項に記載の焼いた食品または請求項４１もしくは４２のいずれか一項に記載のプロバイオティック組成物。
【請求項４４】
前記プロバイオティック組成物が３つの異なる非病原性細菌株を含む、請求項３９もしくは４０のいずれか一項に記載の焼いた食品または請求項４１もしくは４２のいずれか一項に記載のプロバイオティック組成物。
【請求項４５】
前記非病原性細菌株が、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｍおよびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｅｕｔｅｒｉから選択される、請求項３９から４０もしくは４３から４４のいずれか一項に記載の焼いた食品または請求項４１から４４のいずれか一項に記載のプロバイオティック組成物。
【請求項４６】
前記非病原性細菌株が、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ  ＬＢ  ２０、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ  Ｓ  ４６およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ  ＲＰ  ３２から選択される、請求項３９から４０もしくは４３から４４のいずれか一項に記載の焼いた食品または請求項４１から４５のいずれか一項に記載のプロバイオティック組成物。
【請求項４７】
前記非病原性真菌株が、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂｏｕｌａｒｄｉｉ、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｔｅｓ  ｓｐ  ＨＺ１７８、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂａｙａｎｕｓ、Ｐｉｃｈｉａ  ｂｕｒｔｏｎｉｉ、Ｐｉｃｈｉａ  ｊａｄｉｎｉｉ、Ｐｉｃｈｉａ  ｋｕｄｒｉａｖｚｅｖｉｉ、Ｐｉｃｈｉａ  ｏｎｙｃｈｉｓ、Ｐｉｃｈｉａ  ｓｐ．およびＰｉｃｏａ  ｊｕｎｉｐｅｒからなる群より選択される、請求項３９から４０もしくは４３から４４のいずれか一項に記載の焼いた食品または請求項４０から４６のいずれか一項に記載のプロバイオティック組成物。
【請求項４８】
前記非病原性真菌株がＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂｏｕｌａｒｄｉｉ  ＳＢ４８である、請求項４７に記載の焼いた食品または請求項４７に記載のプロバイオティック組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２２】
本発明の他の特徴および利点は、以下の詳細な記載および請求項から明らかとなる。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
（ｉ）単離された生存可能な非病原性真菌株および（ｉｉ）単離された生存可能な非病原性細菌株を含む組成物。
（項目２）
凍結乾燥または噴霧乾燥されている、項目１に記載の組成物。
（項目３）
被験体においてバイオフィルムを破壊することが可能である酵素をさらに含む、項目１または２に記載の組成物。
（項目４）
被験体の予め選択された領域内に位置する病原性細菌および病原性真菌を含むバイオフィルムを破壊するための剤形であって、（ｉ）前記バイオフィルムを破壊することが可能な酵素、（ｉｉ）前記被験体の前記領域において複製することが可能な非病原性真菌株、および（ｉｉｉ）前記被験体の前記領域において複製することが可能な非病原性細菌株を含む組成物を含む、剤形。
（項目５）
前記組成物が少なくとも２つの異なる非病原性細菌株を含む、項目１から２のいずれか一項に記載の組成物または項目４に記載の剤形。
（項目６）
前記組成物が３つの異なる非病原性細菌株を含む、項目１から２のいずれか一項に記載の組成物または項目４に記載の剤形。
（項目７）
前記非病原性細菌株が、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｍおよびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｅｕｔｅｒｉから選択される、項目１から２もしくは５から６のいずれか一項に記載の組成物または項目４から６のいずれか一項に記載の剤形。
（項目８）
前記非病原性細菌株が、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ  ＬＢ  ２０、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ  Ｓ  ４６およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ  ＲＰ  ３２から選択される、項目１から２もしくは５から７のいずれか一項に記載の組成物または項目４から７のいずれか一項に記載の剤形。
（項目９）
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ  ＬＢ  ２０、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ  Ｓ  ４６およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ  ＲＰ  ３２を含む、項目８に記載の組成物または項目８に記載の剤形。
（項目１０）
前記非病原性真菌株が、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂｏｕｌａｒｄｉｉ、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｔｅｓ  ｓｐ  ＨＺ１７８、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂａｙａｎｕｓ、Ｐｉｃｈｉａ  ｂｕｒｔｏｎｉｉ、Ｐｉｃｈｉａ  ｊａｄｉｎｉｉ、Ｐｉｃｈｉａ  ｋｕｄｒｉａｖｚｅｖｉｉ、Ｐｉｃｈｉａ  ｏｎｙｃｈｉｓ、Ｐｉｃｈｉａ  ｓｐ．およびＰｉｃｏａ  ｊｕｎｉｐｅｒから選択される、項目１から２もしくは５から９のいずれか一項に記載の組成物または項目４から９のいずれか一項に記載の剤形。
（項目１１）
前記非病原性真菌株がＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂｏｕｌａｒｄｉｉ  ＳＢ４８である、項目１０に記載の組成物または項目１０に記載の剤形。
（項目１２）
被験体においてバイオフィルムを破壊することが可能な酵素をさらに含む、項目５から１１のいずれか一項に記載の組成物。
（項目１３）
前記酵素が、アミラーゼ、セルラーゼ、ヘミセルラーゼ、リゾチーム、ペクチナーゼ、ＤＮアーゼＩ、セラチアペプチダーゼまたはセラチオペプチダーゼ、ヘミセルラーゼ／ペクチナーゼ複合体、β−１，３−グルカナーゼ、酸性プロテアーゼ、アルカリプロテアーゼ、グルコアミラーゼ、エンドグルカナーゼ、キシラナーゼ、リパーゼ、リゾチーム、プロテアーゼ／ペプチダーゼ複合体、ジペプチジルペプチダーゼＩＶ（ＤＰＰ−ＩＶ）、キトサナーゼ、ブロメライン、パパイン、キーウィプロテアーゼアクチニジ、植物由来のプロテアーゼおよびフィターゼからなる群より選択される、項目３もしくは１２のいずれか一項に記載の組成物または項目４から１１のいずれか一項に記載の剤形。
（項目１４）
前記酵素が、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｔｅａｒｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓアミラーゼ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｍｙｌｏｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓアミラーゼ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ
ｓｕｂｔｉｌｉｓアミラーゼ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉアミラーゼ、Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｎｉｇｅｒアミラーゼおよびＡｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ  ｏｒｙｚａｅアミラーゼからなる群より選択されるアミラーゼである、項目１３に記載の組成物または項目１３に記載の剤形。
（項目１５）
前記組成物が、約１００から約５，０００ＳＫＢ単位のアミラーゼ、約２００から約４，０００ＳＫＢ単位のアミラーゼ、約３００から約２，０００ＳＫＢ単位のアミラーゼ、または約４００から約１，０００ＳＫＢ単位のアミラーゼを含む、項目３もしくは１２から１４のいずれか一項に記載の組成物または項目４から１１もしくは１３から１４のいずれか一項に記載の剤形。
（項目１６）
前記組成物が約５００ＳＫＢ単位のアミラーゼを含む、項目１５に記載の組成物または項目１５に記載の剤形。
（項目１７）
前記組成物がカプセル剤の中に位置する、項目１から３もしくは５から１６のいずれか一項に記載の組成物または項目４から１１もしくは１３から１６のいずれか一項に記載の剤形。
（項目１８）
経口剤形である、項目１から３もしくは５から１７のいずれか一項に記載の組成物または項目４から１１もしくは１３から１７のいずれか一項に記載の剤形。
（項目１９）
前記組成物が顆粒剤、ペレット剤または散剤として製剤化されている、項目１から２もしくは５から１１のいずれか一項に記載の組成物または項目４から１１もしくは１３から１７のいずれか一項に記載の剤形。
（項目２０）
前記組成物が、コーティングされた散剤として製剤化されており、必要に応じて、コーティングされた散剤として製剤化されている前記組成物が、バイオフィルムを破壊することが可能な酵素とさらに組み合わされている、項目１から２、５から１１もしくは１９のいずれか一項に記載の組成物または項目４から１１もしくは１３から１９のいずれか一項に記載の剤形。
（項目２１）
前記散剤がヒドロキシプロピルメチルセルロースでコーティングされている、項目２０に記載の組成物または項目２０に記載の剤形。
（項目２２）
前記カプセル剤が約５０ｍｇから約１，０００ｍｇの前記組成物を含む、項目１７から２１のいずれか一項に記載の組成物または項目１７から２１のいずれか一項に記載の剤形。
（項目２３）
前記カプセル剤が約７００ｍｇの前記組成物を含む、項目２２に記載の組成物または項目２２に記載の剤形。
（項目２４）
前記組成物が、約１００億から約４００億、約１５０億から約４００億、約２００億から約４００億、約１００億から約３００億、約１５０億から約３００億、約２００億から約３００億のコロニー形成単位の前記非病原性細菌株（複数可）を含む、項目１から３もしくは５から２３のいずれか一項に記載の組成物または項目４から１１もしくは１３から２３のいずれか一項に記載の剤形。
（項目２５）
前記組成物が、約１０億から約１００億、約２０億から約８０億、約３０億から約６０億コロニー形成単位の前記非病原性真菌株（複数可）を含む、項目１から３もしくは５から２４のいずれか一項に記載の組成物または項目４から１１もしくは１３から２４のいずれか一項に記載の剤形。
（項目２６）
前記組成物が、約１５０億コロニー形成単位のＢｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ、約１００億コロニー形成単位のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ、約３５億コロニー形成単位のＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂｏｕｌａｒｄｉｉ、および約１５億コロニー形成単位のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓを含む、項目１から３もしくは５から２５のいずれか一項に記載の組成物または項目４から１１もしくは１３から２５のいずれか一項に記載の剤形。
（項目２７）
前記領域が、胃腸管、尿路、生殖管、上気道、下気道、胆管、口、目、鼻、耳または皮膚である、項目４から１１または１３から２６のいずれか一項に記載の剤形。
（項目２８）
前記被験体がヒトである、項目４から１１または１３から２７のいずれか一項に記載の剤形。
（項目２９）
バイオフィルムの破壊またはバイオフィルムの形成の阻止を必要とする被験体の予め選択された領域内に位置する病原性細菌および／または病原性真菌を含むバイオフィルムを破壊するかまたはその形成を阻止する方法であって、前記被験体に項目１から３もしくは５から２６のいずれか一項に記載の組成物または項目４から１１もしくは１３から２８のいずれか一項に記載の剤形を投与することを含み、前記組成物または前記剤形の投与により前記被験体においてバイオフィルムが破壊される、方法。
（項目３０）
前記病原性真菌がＣａｎｄｉｄａ  ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｃａｎｄｉｄａ  ａｌｂｉｃａｎｓまたはその組み合わせである、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
前記バイオフィルムが、（ｉ）Ｃａｎｄｉｄａ  ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓおよびＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ、（ｉｉ）Ｃａｎｄｉｄａ  ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓおよびＳｅｒｒａｔｉａ  ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、または、（ｉｉｉ）Ｃａｎｄｉｄａ  ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉおよびＳｅｒｒａｔｉａ  ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓを含む、項目２９または３０に記載の方法。
（項目３２）
前記バイオフィルムが、Ｅ．ｃｏｌｉおよびＢａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｓｐｐ．を含む、項目２９に記載の方法。
（項目３３）
前記Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｓｐｐ．が、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃｏｐｒｏｐｈｉｌｕｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｅｇｇｅｒｔｈｉｉ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｏｖａｔｕｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆｒａｇｉｌｉｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｐｌｅｂｅｉｕｓおよびＢａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｕｎｉｆｏｒｍｉｓを含む群より選択される、項目３２に記載の方法。
（項目３４）
前記組成物または前記剤形中の酵素が、前記バイオフィルムに存在する細胞外マトリクス多糖（ＥＰＳ）を破壊する、項目２９から３３のいずれか一項に記載の方法。
（項目３５）
前記組成物または前記剤形を投与すると、非病原性細菌株が、（ｉ）前記バイオフィルム中の前記病原性細菌に取って代わる、（ｉｉ）前記バイオフィルムの基層への前記病原性細菌または真菌の付着を妨害する、（ｉｉｉ）前記バイオフィルムに存在する細胞外ポリマーマトリクスから前記病原性細菌または真菌を追い出す、（ｉｖ）前記バイオフィルム中の前記病原性真菌のフィラメント化を阻止する、または（ｖ）上述のいずれかの組み合わせを行う、項目２９から３４のいずれか一項に記載の方法。
（項目３６）
前記バイオフィルムが、胃腸管、尿路、生殖管、上気道、下気道、胆管、口、目、鼻、耳または皮膚に位置する、項目２９から３５のいずれか一項に記載の方法。
（項目３７）
前記組成物または前記剤形の投与が、高アンモニア血症、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ大腸炎、肝硬変と関連した肝性脳障害、炎症性腸疾患、クローン病および／または過敏性腸疾患を処置する、項目２９から３５のいずれか一項に記載の方法。
（項目３８）
前記組成物または前記剤形の投与が、前記被験体における前記領域の天然のマイクロバイオームの回復を可能にする、項目２９から３７のいずれか一項に記載の方法。
（項目３９）
前記組成物または前記剤形による処置に適する検査被験体が、
ａ．前記検査被験体の前記領域から収集した組織または体液試料に存在する（ｉ）少なくとも１つの非病原性細菌株および／または（ｉｉ）少なくとも１つの非病原性真菌株の生物体の数または密度を定量するステップと、
ｂ．前記試料中で定量された生物体の数または密度を、健康な被験体の対応する領域の対応する試料サイズに存在する対応する生物体の数または密度と比較するステップであって、前記検査被験体からの前記試料中の生物体の数または密度が前記健康な被験体の前記対応する領域に存在する生物体の数または密度よりも小さい場合、前記検査被験体は前記組成物または前記剤形による処置に適する、ステップと
を含む方法によって同定される、項目２９から３８のいずれか一項に記載の方法。
（項目４０）
（ｉ）単離された非病原性真菌株および（ｉｉ）単離された非病原性細菌株を含むプロバイオティック組成物を含む、焼いた食品。
（項目４１）
前記プロバイオティック組成物が、アミラーゼ、セルラーゼ、ヘミセルラーゼ、リゾチーム、ペクチナーゼ、ＤＮアーゼＩ、セラチアペプチダーゼまたはセラチオペプチダーゼ、ヘミセルラーゼ／ペクチナーゼ複合体、β−１，３−グルカナーゼ、酸性プロテアーゼ、アルカリプロテアーゼ、グルコアミラーゼ、エンドグルカナーゼ、キシラナーゼ、リパーゼ、リゾチーム、プロテアーゼ／ペプチダーゼ複合体、ジペプチジルペプチダーゼＩＶ（ＤＰＰ−ＩＶ）、キトサナーゼ、ブロメライン、パパイン、キーウィプロテアーゼアクチニジ、植物由来のプロテアーゼおよびフィターゼから選択される酵素をさらに含む、項目４０に記載の焼いた食品。
（項目４２）
被験体において栄養素吸収を改善する方法であって、（ｉ）単離された非病原性真菌株および（ｉｉ）単離された非病原性細菌株を含むプロバイオティック組成物の、前記被験体による消費または前記被験体への投与を含む、方法。
（項目４３）
前記プロバイオティック組成物が、アミラーゼ、セルラーゼ、ヘミセルラーゼ、リゾチーム、ペクチナーゼ、ＤＮアーゼＩ、セラチアペプチダーゼまたはセラチオペプチダーゼ、ヘミセルラーゼ／ペクチナーゼ複合体、β−１，３−グルカナーゼ、酸性プロテアーゼ、アルカリプロテアーゼ、グルコアミラーゼ、エンドグルカナーゼ、キシラナーゼ、リパーゼ、リゾチーム、プロテアーゼ／ペプチダーゼ複合体、ジペプチジルペプチダーゼＩＶ（ＤＰＰ−ＩＶ）、キトサナーゼ、ブロメライン、パパイン、キーウィプロテアーゼアクチニジ、植物由来のプロテアーゼおよびフィターゼから選択される酵素をさらに含む、項目４２に記載の方法。
（項目４４）
前記プロバイオティック組成物が少なくとも２つの異なる非病原性細菌株を含む、項目４０もしくは４１のいずれか一項に記載の焼いた食品または項目４２もしくは４３のいずれか一項に記載の方法。
（項目４５）
前記プロバイオティック組成物が３つの異なる非病原性細菌株を含む、項目４０もしくは４１のいずれか一項に記載の焼いた食品または項目４２もしくは４３のいずれか一項に記載の方法。
（項目４６）
前記非病原性細菌株が、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｉｆｉｄｕｍおよびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｅｕｔｅｒｉから選択される、項目４０から４１もしくは４４から４５のいずれか一項に記載の焼いた食品または項目４２から４５のいずれか一項に記載の方法。
（項目４７）
前記非病原性細菌株が、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｈａｍｎｏｓｕｓ  ＬＢ  ２０、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ  Ｓ  ４６およびＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ  ＲＰ  ３２から選択される、項目４０から４１もしくは４４から４５のいずれか一項に記載の焼いた食品または項目４２から４６のいずれか一項に記載の方法。
（項目４８）
前記非病原性真菌株が、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂｏｕｌａｒｄｉｉ、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｔｅｓ  ｓｐ  ＨＺ１７８、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂａｙａｎｕｓ、Ｐｉｃｈｉａ  ｂｕｒｔｏｎｉｉ、Ｐｉｃｈｉａ  ｊａｄｉｎｉｉ、Ｐｉｃｈｉａ  ｋｕｄｒｉａｖｚｅｖｉｉ、Ｐｉｃｈｉａ  ｏｎｙｃｈｉｓ、Ｐｉｃｈｉａ  ｓｐ．およびＰｉｃｏａ  ｊｕｎｉｐｅｒからなる群より選択される、項目４０から４１もしくは４４から４５のいずれか一項に記載の焼いた食品または項目４１から４７のいずれか一項に記載の方法。
（項目４９）
前記非病原性真菌株がＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｂｏｕｌａｒｄｉｉ  ＳＢ４８である、項目４８に記載の焼いた食品または項目４８に記載の方法。