【手続補正書】
【提出日】令和3年8月12日(2021.8.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
それを必要とする対象において胆汁うっ滞性疾患又は病態を治療するための医薬の製造における、少なくとも２つの細菌ＯＴＵ又は種を含む組成物の使用であって、
前記少なくとも２つの細菌ＯＴＵ又は種が、前記対象に投与された際に、（ｉ）胆汁酸若しくは胆汁酸塩代謝活性を示す特性、（ｉｉ）ヒコール酸の濃度を増加させる特性、又は（ｉｉｉ）リトコール酸（ＬＣＡ）レベルを増加させない特性のうちの１以上を示すことができる使用。
【請求項２】
前記少なくとも２つの細菌ＯＴＵ又は種が、図１６の配列に対して少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含む、請求項１に記載の使用。
【請求項３】
前記少なくとも２つの細菌ＯＴＵ又は種が、
アリスティペス・ファインゴールディイ（Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ  ｆｉｎｅｇｏｌｄｉｉ）、バクテロイデス・ユニフォルミス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ）、バクテロイデス・ブルガータス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｖｕｌｇａｔｕｓ）、バクテロイデス・ｓｐ３＿１＿１９（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｓｐ＿３＿１＿１９）、バクテロイデス・インテスティナーリス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌｉｓ）、バクテロイデス・ｓｐ＿２０＿３（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｓｐ＿２０＿３）、バクテロイデス・カカエ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｃａｃｃａｅ）、バクテロイデス・ファエシス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｆａｅｃｉｓ）、バクテロイデス・ｓｐ＿３＿１＿２３（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｓｐ＿３＿１＿２３）、バクテロイデス・ｓｐ＿Ｄ２０（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｓｐ＿Ｄ２０）、バクテロイデス・エガーシイ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｅｇｇｅｒｔｈｉｉ）、バルネシエラ・インテスティニホミニス（Ｂａｒｎｅｓｉｅｌｌａ  ｉｎｔｅｓｔｉｎｉｈｏｍｉｎｉｓ）、ビフィドバクテリウム・シュードカテヌラツム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｐｓｅｕｄｏｃａｔｅｎｕｌａｔｕｍ）、ブラウチア・シンキイ（Ｂｌａｕｔｉａ  ｓｃｈｉｎｋｉｉ）、ブラウチア・  ワクスレレ（Ｂｌａｕｔｉａ  ｗｅｘｌｅｒａｅ）、ブラウチア・  ｓｐ＿Ｍ２５（Ｂｌａｕｔｉａ  ｓｐ＿Ｍ２５）、ブラウチア・プロダクタ（Ｂｌａｕｔｉａ  ｐｒｏｄｕｃｔａ）、クロストリジウム・ｓｐ＿ＳＭ４＿１（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ  ｓｐ＿ＳＭ４＿１）、クロストリジウム・ラバレンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌａｖａｌｅｎｓｅ）、クロストリジウム・イノキュウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｉｎｎｏｃｕｕｍ）、クロストリジウム・アスパラギホルメ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ａｓｐａｒａｇｉｆｏｒｍｅ）、クロストリジウム・スパイロフォルメ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐｉｒｏｆｏｒｍｅ）、クロストリジウム・ハイレモンアエ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｈｙｌｅｍｏｎａｅ）、  クロストリジウム・ソルデリイ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｏｒｄｅｌｌｉｉ）、  クロストリジウム・ｓｐ＿ＹＩＴ＿１２０６９（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐ＿ＹＩＴ＿１２０６９）、クロストリジウム・パラピュトリフィカム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐａｒａｐｕｔｒｉｆｉｃｕｍ）、クロストリジウム・グライコリカム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｇｌｙｃｏｌｉｃｕｍ）、クロストリジウム・ゴニイ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｇｈｏｎｉｉ）、クロストリジウム・ラクチフェルメンタンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｌａｃｔｉｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、クロストリジウム・ビリデ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｖｉｒｉｄｅ）、クロストリジウム・ｓｐ＿ＨＧＦ２（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐ＿ＨＧＦ２）、クロストリジウム・シンビオサム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｙｍｂｉｏｓｕｍ）、クロストリジウム・シンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｃｉｎｄｅｎｓ）、クロストリジウム・ディスポリカム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｓｐｏｒｉｃｕｍ）、クロストリジウム・ブチリカム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｕｔｙｒｉｃｕｍ）、クロストリジウム・オルビスシンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｏｒｂｉｓｃｉｎｄｅｎｓ）、クロストリジウム・ボルテアエ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｂｏｌｔｅａｅ）、クロストリジウム・ｓｐ＿７＿２＿４３ＦＡＡ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐ＿７＿２＿４３ＦＡＡ）、コリンゼラ・アエロファシエンス（Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ  ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ）、コプロバチルス・ｓｐ＿Ｄ７（Ｃｏｐｒｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ＿Ｄ７）、コプロコッカス・コメス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｃｏｍｅｓ）、コプロコッカス・オイタクツス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ  ｅｕｔａｃｔｕｓ）、ドレア・ロンギカテナ（Ｄｏｒｅａ  ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ）、ドレア・フォルミシゲネランス（Ｄｏｒｅａ  ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ）、エリシペロトリクス菌＿３＿１＿５３（Ｅｒｙｓｉｐｅｌｏｔｒｉｃｈａｃｅａｅ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ＿３＿１＿５３）、ユウバクテリウム・ｓｐ＿３＿１＿３１（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐ＿３＿１＿３１）、ユウバクテリウム・ｓｐ＿ＷＡＬ＿１４５７１（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐ＿ＷＡＬ＿１４５７１）、ユウバクテリウム・リモサム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｉｍｏｓｕｍ）、ユウバクテリウム・ハリイ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｈａｌｌｉｉ）、ユウバクテリウム・レクターレ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒｅｃｔａｌｅ）、ユウバクテリウム・コントルタム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｃｏｎｔｏｒｔｕｍ）、ゲンミゲル・フォルミシリス（Ｇｅｍｍｉｇｅｒ  ｆｏｒｍｉｃｉｌｉｓ）、ラクノスピラ菌＿２＿１＿５８ＦＡＡ（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ＿２＿１＿５８ＦＡＡ）、ラクノスピラ菌＿９＿１＿４３ＢＦＡＡ（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ＿９＿１＿４３ＢＦＡＡ）、ラクノスピラ菌＿３＿１＿５７ＦＡＡ＿ＣＴ１（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ＿３＿１＿５７ＦＡＡ＿ＣＴ１）、ラクノスピラ菌＿５＿１＿５７ＦＡＡ（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ＿５＿１＿５７ＦＡＡ）、ラクノスピラ菌＿ｏｒａｌ＿ｔａｘｏｎ＿Ｆ１５（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ  ｂａｃｔｅｒｉｕｍ＿ｏｒａｌ＿ｔａｘｏｎ＿Ｆ１５）、ラクトバチルス・アシドフィラス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）、ラクトバチルス・ガセリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｇａｓｓｅｒｉ）、パラバクテロイデス・ディスタゾニス（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ）、シュードフラボニフラクター・カピローサス（Ｐｓｅｕｄｏｆｌａｖｏｎｉｆｒａｃｔｏｒ  ｃａｐｉｌｌｏｓｕｓ）、ロゼブリア・ファエカリス（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ  ｆａｅｃｉｓ）、ルミノコッカス・オベウム（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｏｂｅｕｍ）、ルミノコッカス・ブローミイ（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｂｒｏｍｉｉ）、ルミノコッカス・ラクタリス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｌａｃｔａｒｉｓ）、ターネレラ・ｓｐ＿６＿１＿５８ＦＡＡ（Ｔａｎｎｅｒｅｌｌａ  ｓｐ＿６＿１＿５８ＦＡＡ）又はこれらの組み合わせから選択される、請求項１又は２に記載の使用。
【請求項４】
前記少なくとも２つの細菌ＯＴＵ又は種が、バクテロイデス・ファエシス、バクテロイデス・ｓｐ＿３＿１＿２３、バクテロイデス・ｓｐ＿Ｄ２０、バクテロイデス・ユニフォルミス、バクテロイデス・ブルガータス、ビフィドバクテリウム・シュードカテヌラツム、ブラウチア・ワクスレレ、クロストリジウム・ゴニイ、クロストリジウム・グライコリカム、クロストリジウム・シンビオサム、クロストリジウム・ハイレモンアエ、コリンゼラ・アエロファシエンス、ユウバクテリウム・リモサム、ユウバクテリウム・レクターレ、ラクノスピラ菌＿５＿１＿５７ＦＡＡ、パラバクテロイデス・ディスタゾニス、シュードフラボニフラクター・カピローサス、ロゼブリア・ファエカリス、ルミノコッカス・ラクタリス、ルミノコッカス・ブローミイ又はこれらの組み合わせから選択される、請求項１〜３のいずれか一項に記載の使用。
【請求項５】
（１）アリスティペス・ファインゴールディイが配列番号７と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２）バクテロイデス・ユニフォルミスが、配列番号４５と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３）バクテロイデス・ブルガータスが、配列番号５３、配列番号５４、配列番号５５又はこれらの組み合わせと少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４）バクテロイデス・ｓｐ３＿１＿１９が、配列番号３３と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５）バクテロイデス・インテスティナーリスが、配列番号２２と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６）バクテロイデス・ｓｐ＿２０＿３が、配列番号２０と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（７）バクテロイデス・カカエが、配列番号９、配列番号１０又は両方と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（８）バクテロイデス・ファエシスが、配列番号１３と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（９）バクテロイデス・ｓｐ＿３＿１＿２３が、配列番号３４と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１０）バクテロイデス・ｓｐ＿Ｄ２０が、配列番号３９と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１１）バクテロイデス・エガーシイが、配列番号１２と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１２）バルネシエラ・インテスティニホミニスが、配列番号５９と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１３）ビフィドバクテリウム・シュードカテヌラツムが、配列番号１１３、配列番号１１４又は両方と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１４）ブラウチア・シンキイが、配列番号１３０と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１５）ブラウチア・ワクスレレが、配列番号１３３と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１６）ブラウチア・ｓｐ＿Ｍ２５が、配列番号１３１と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１７）ブラウチア・プロダクタが、配列番号１２８、配列番号１２９又は両方と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１８）クロストリジウム・ｓｐ＿ＳＭ４＿１が、配列番号１４２と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１９）クロストリジウム・ラバレンスが、配列番号１８４と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２０）クロストリジウム・イノキュウムが、配列番号１７９、配列番号１８０、配列番号１８１、配列番号１８２又はこれらの組み合わせと少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２１）クロストリジウム・アスパラギホルメが、配列番号１４３と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２２）クロストリジウム・スパイロフォルメが、配列番号１９４と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２３）クロストリジウム・ハイレモンアエが、配列番号１７６、配列番号１７７、配列番号１７８、又はこれらの組み合わせと少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２４）クロストリジウム・ソルデリイが、配列番号１９０と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２５）クロストリジウム・ｓｐ＿ＹＩＴ＿１２０６９が、配列番号１９７と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２６）クロストリジウム・パラピュトリフィカムが、配列番号１８８と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２７）クロストリジウム・グライコリカムが、配列番号１７３と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２８）クロストリジウム・ゴニイが、配列番号１７２と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２９）クロストリジウム・ビリデが、配列番号２００と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３０）クロストリジウム・ｓｐ＿ＨＧＦ２が、配列番号１９３と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３１）クロストリジウム・シンビオサムが、配列番号１９８、配列番号１９９又は両方と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３２）クロストリジウム・シンデンスが、配列番号１８９と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３３）クロストリジウム・ディスポリカムが、配列番号１７０、配列番号１７１又は両方と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３４）クロストリジウム・ブチリカムが、配列番号１５０、配列番号１５１又は両方と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３５）クロストリジウム・オルビスシンデンスが、配列番号１８６と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３６）クロストリジウム・ボルテアエが、配列番号１４９と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３７）クロストリジウム・ｓｐ＿７＿２＿４３ＦＡＡが、配列番号１９１と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３８）コリンゼラ・アエロファシエンスが、配列番号２０１と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３９）コプロバチルス・ｓｐ＿Ｄ７が、配列番号２０６と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４０）コプロコッカス・コメスが、配列番号２０７と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４１）コプロコッカス・オイタクツスが、配列番号２０８と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４２）ドレア・ロンギカテナが、配列番号２１１と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４３）ドレア・フォルミシゲネランスが、配列番号２１０と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４４）エリシペロトリクス菌＿３＿１＿５３が、配列番号２１４と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４５）ユウバクテリウム・ｓｐ＿３＿１＿３１が、配列番号２２７と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４６）ユウバクテリウム・ｓｐ＿ＷＡＬ＿１４５７１が、配列番号２２９と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４７）ユウバクテリウム・リモサムが、配列番号２２２と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４８）ユウバクテリウム・ハリイが、配列番号２２０、配列番号２２１又は両方と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４９）ユウバクテリウム・レクターレが、配列番号２２３、配列番号２２４、配列番号２２５、配列番号２２６又はこれらの組み合わせと少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５０）ユウバクテリウム・コントルタムが、配列番号２１７と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５１）ラクノスピラ菌＿２＿１＿５８ＦＡＡが、配列番号２４４と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５２）ラクノスピラ菌＿９＿１＿４３ＢＦＡＡが、配列番号２５０と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５３）ラクノスピラ菌＿３＿１＿５７ＦＡＡ＿ＣＴ１が、配列番号２４５と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５４）ラクノスピラ菌＿５＿１＿５７ＦＡＡが、配列番号２４７と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５５）ラクノスピラ菌＿ｏｒａｌ＿ｔａｘｏｎ＿Ｆ１５が、配列番号２５１と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５６）ラクトバチルス・アシドフィラスが、配列番号２５２、配列番号２５３又は両方と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５７）ラクトバチルス・ガセリが、配列番号２６０、配列番号２６１、配列番号２６２、配列番号２６３、配列番号２６４、配列番号２６５、配列番号２６６又はこれらの組み合わせと少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５８）パラバクテロイデス・ディスタゾニスが、配列番号２７２、配列番号２７３、配列番号２７４、配列番号２７４、配列番号２７５、配列番号２７６、配列番号２７７、配列番号２７８又はこれらの組み合わせと少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５９）シュードフラボニフラクター・カピローサスが、配列番号２９２と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６０）ロゼブリア・ファエカリスが、配列番号２９４と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６１）ルミノコッカス・オベウムが、配列番号３０３、配列番号３０４、配列番号３０５又はこれらの組み合わせと少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６２）ルミノコッカス・ブローミイが、配列番号２９９、配列番号３００又は両方と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６３）ルミノコッカス・ラクタリスが、配列番号３０２と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；又は
（６４）ターネレラ・ｓｐ＿６＿１＿５８ＦＡＡが、配列番号３１１と少なくとも９５％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含む、請求項３又は４に記載の使用。
【請求項６】
（１）アリスティペス・ファインゴールディイが、配列番号７と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２）バクテロイデス・ユニフォルミスが、配列番号４５と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３）バクテロイデス・ブルガータスが、配列番号５３、配列番号５４、配列番号５５又はこれらの組み合わせと少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４）バクテロイデス・ｓｐ３＿１＿１９が、配列番号３３と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５）バクテロイデス・インテスティナーリスが、配列番号２２と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６）バクテロイデス・ｓｐ＿２０＿３が、配列番号２０と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（７）バクテロイデス・カカエが、配列番号９、配列番号１０又は両方と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（８）バクテロイデス・ファエシスが、配列番号１３と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（９）バクテロイデス・ｓｐ＿３＿１＿２３が、配列番号３４と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１０）バクテロイデス・ｓｐ＿Ｄ２０が、配列番号３９と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１１）バクテロイデス・エガーシイが、配列番号１２と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１２）バルネシエラ・インテスティニホミニスが、配列番号５９と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１３）ビフィドバクテリウム・シュードカテヌラツムが、配列番号１１３、配列番号１１４又は両方と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１４）ブラウチア・シンキイが、配列番号１３０と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１５）ブラウチア・ワクスレレが、配列番号１３３と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１６）ブラウチア・ｓｐ＿Ｍ２５が、配列番号１３１と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１７）ブラウチア・プロダクタが、配列番号１２８、配列番号１２９又は両方と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１８）クロストリジウム・ｓｐ＿ＳＭ４＿１が、配列番号１４２と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１９）クロストリジウム・ラバレンスが、配列番号１８４と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２０）クロストリジウム・イノキュウムが、配列番号１７９、配列番号１８０、配列番号１８１、配列番号１８２又はこれらの組み合わせと少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２１）クロストリジウム・アスパラギホルメが、配列番号１４３と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２２）クロストリジウム・スパイロフォルメが、配列番号１９４と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２３）クロストリジウム・ハイレモンアエが、配列番号１７６、配列番号１７７、配列番号１７８又はこれらの組み合わせと少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２４）クロストリジウム・ソルデリイが、配列番号１９０と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２５）クロストリジウム・ｓｐ＿ＹＩＴ＿１２０６９が、配列番号１９７と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２６）クロストリジウム・パラピュトリフィカムが、配列番号１８８と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２７）クロストリジウム・グライコリカムが、配列番号１７３と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２８）クロストリジウム・ゴニイが、配列番号１７２と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２９）クロストリジウム・ビリデが、配列番号２００と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３０）クロストリジウム・ｓｐ＿ＨＧＦ２が、配列番号１９３と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３１）クロストリジウム・シンビオサムが、配列番号１９８、配列番号１９９、又は両方と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３２）クロストリジウム・シンデンスが、配列番号１８９と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３３）クロストリジウム・ディスポリカムが、配列番号１７０、配列番号１７１又は両方と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３４）クロストリジウム・ブチリカムが、配列番号１５０、配列番号１５１又は両方と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３５）クロストリジウム・オルビスシンデンスが、配列番号１８６と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３６）クロストリジウム・ボルテアエが、配列番号１４９と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３７）クロストリジウム・ｓｐ＿７＿２＿４３ＦＡＡが、配列番号１９１と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３８）コリンゼラ・アエロファシエンスが、配列番号２０１と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３９）コプロバチルス・ｓｐ＿Ｄ７が、配列番号２０６と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４０）コプロコッカス・コメスが、配列番号２０７と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４１）コプロコッカス・オイタクツスが、配列番号２０８と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４２）ドレア・ロンギカテナが、配列番号２１１と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４３）ドレア・フォルミシゲネランスが、配列番号２１０と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４４）エリシペロトリクス菌＿３＿１＿５３が、配列番号２１４と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４５）ユウバクテリウム・ｓｐ＿３＿１＿３１が、配列番号２２７と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４６）ユウバクテリウム・ｓｐ＿ＷＡＬ＿１４５７１が、配列番号２２９と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４７）ユウバクテリウム・リモサムが、配列番号２２２と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４８）ユウバクテリウム・ハリイが、配列番号２２０、配列番号２２１又は両方と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４９）ユウバクテリウム・レクターレが、配列番号２２３、配列番号２２４、配列番号２２５、配列番号２２６又は両方と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５０）ユウバクテリウム・コントルタムが、配列番号２１７と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５１）ラクノスピラ菌＿２＿１＿５８ＦＡＡが、配列番号２４４と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５２）ラクノスピラ菌＿９＿１＿４３ＢＦＡＡが、配列番号２５０と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５３）ラクノスピラ菌３＿１＿５７ＦＡＡ＿ＣＴ１が、配列番号２４５と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５４）ラクノスピラ菌＿５＿１＿５７ＦＡＡが、配列番号２４７と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５５）ラクノスピラ菌＿ｏｒａｌ＿ｔａｘｏｎ＿Ｆ１５が、配列番号２５１と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５６）ラクトバチルス・アシドフィラスが、配列番号２５２、配列番号２５３又は両方と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５７）ラクトバチルス・ガセリが、配列番号２６０、配列番号２６１、配列番号２６２、配列番号２６３、配列番号２６４、配列番号２６５、配列番号２６６又はこれらの組み合わせと少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５８）パラバクテロイデス・ディスタゾニスが、配列番号２７２、配列番号２７３、配列番号２７４、配列番号２７４、配列番号２７５、配列番号２７６、配列番号２７７、配列番号２７８又はこれらの組み合わせと少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５９）シュードフラボニフラクター・カピローサスが、配列番号２９２と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６０）ロゼブリア・ファエカリスが、配列番号２９４と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６１）ルミノコッカス・オベウムが、配列番号３０３、配列番号３０４、配列番号３０５又はこれらの組み合わせと少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６２）ルミノコッカス・ブローミイが、配列番号２９９、配列番号３００又は両方と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６３）ルミノコッカス・ラクタリスが、配列番号３０２と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；又は
（６４）ターネレラ・ｓｐ＿６＿１＿５８ＦＡＡが、配列番号３１１と少なくとも９７％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含む、請求項３〜５のいずれか一項に記載の使用。
【請求項７】
（１）アリスティペス・ファインゴールディイが、配列番号７と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２）バクテロイデス・ユニフォルミスが、配列番号４５と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３）バクテロイデス・ブルガータスが、配列番号５３、配列番号５４、配列番号５５、又はこれらの組み合わせと少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４）バクテロイデス・ｓｐ３＿１＿１９が、配列番号３３と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５）バクテロイデス・インテスティナーリスが、配列番号２２と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６）バクテロイデス・ｓｐ＿２０＿３が、配列番号２０と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（７）バクテロイデス・カカエが、配列番号９、配列番号１０、又は両方と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（８）バクテロイデス・ファエシスが、配列番号１３と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（９）バクテロイデス・ｓｐ＿３＿１＿２３が、配列番号３４と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１０）バクテロイデス・ｓｐ＿Ｄ２０が、配列番号３９と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１１）バクテロイデス・エガーシイが、配列番号１２と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１２）バルネシエラ・インテスティニホミニスが、配列番号５９と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１３）ビフィドバクテリウム・シュードカテヌラツムが、配列番号１１３、配列番号１１４、又は両方と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１４）ブラウチア・シンキイが、配列番号１３０と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１５）ブラウチア・ワクスレレが、配列番号１３３と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１６）ブラウチア・ｓｐ＿Ｍ２５が、配列番号１３１と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１７）ブラウチア・プロダクタが、配列番号１２８、配列番号１２９、又は両方と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１８）クロストリジウム・ｓｐ＿ＳＭ４＿１が、配列番号１４２と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１９）クロストリジウム・ラバレンスが、配列番号１８４と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２０）クロストリジウム・イノキュウムが、配列番号１７９、配列番号１８０、配列番号１８１、配列番号１８２又はこれらの組み合わせと少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２１）クロストリジウム・アスパラギホルメが、配列番号１４３と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２２）クロストリジウム・スパイロフォルメが、配列番号１９４と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２３）クロストリジウム・ハイレモンアエが、配列番号１７６、配列番号１７７、配列番号１７８又はこれらの組み合わせと少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか、；
（２４）クロストリジウム・ソルデリイが、配列番号１９０と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２５）クロストリジウム・ｓｐ＿ＹＩＴ＿１２０６９が、配列番号１９７と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２６）クロストリジウム・パラピュトリフィカムが、配列番号１８８と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２７）クロストリジウム・グライコリカムが、配列番号１７３と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２８）クロストリジウム・ゴニイが、配列番号１７２と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２９）クロストリジウム・ビリデが、配列番号２００と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３０）クロストリジウム・ｓｐ＿ＨＧＦ２が、配列番号１９３と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３１）クロストリジウム・シンビオサムが、配列番号１９８、配列番号１９９、又は両方と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３２）クロストリジウム・シンデンスが、配列番号１８９と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３３）クロストリジウム・ディスポリカムが、配列番号１７０、配列番号１７１又は両方と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３４）クロストリジウム・ブチリカムが、配列番号１５０、配列番号１５１又は両方と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３５）クロストリジウム・オルビスシンデンスが、配列番号１８６と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３６）クロストリジウム・ボルテアエが、配列番号１４９と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３７）クロストリジウム・ｓｐ＿７＿２＿４３ＦＡＡが、配列番号１９１と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３８）コリンゼラ・アエロファシエンスが、配列番号２０１と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３９）コプロバチルス・ｓｐ＿Ｄ７が、配列番号２０６と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４０）コプロコッカス・コメスが、配列番号２０７と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４１）コプロコッカス・オイタクツスが、配列番号２０８と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４２）ドレア・ロンギカテナが、配列番号２１１と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４３）ドレア・フォルミシゲネランスが、配列番号２１０と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４４）エリシペロトリクス菌＿３＿１＿５３が、配列番号２１４と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４５）ユウバクテリウム・ｓｐ＿３＿１＿３１が、配列番号２２７と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４６）ユウバクテリウム・ｓｐ＿ＷＡＬ＿１４５７１が、配列番号２２９と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４７）ユウバクテリウム・リモサムが、配列番号２２２と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４８）ユウバクテリウム・ハリイが、配列番号２２０、配列番号２２１、又は両方と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４９）ユウバクテリウム・レクターレが、配列番号２２３、配列番号２２４、配列番号２２５、配列番号２２６、又はこれらの組み合わせと少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５０）ユウバクテリウム・コントルタムが、配列番号２１７と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５１）ラクノスピラ菌＿２＿１＿５８ＦＡＡが、配列番号２４４と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５２）ラクノスピラ菌＿９＿１＿４３ＢＦＡＡが、配列番号２５０と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５３）ラクノスピラ菌３＿１＿５７ＦＡＡ＿ＣＴ１が、配列番号２４５と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５４）ラクノスピラ菌＿５＿１＿５７ＦＡＡが、配列番号２４７と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５５）ラクノスピラ菌＿ｏｒａｌ＿ｔａｘｏｎ＿Ｆ１５が、配列番号２５１と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５６）ラクトバチルス・アシドフィラスが、配列番号２５２、配列番号２５３、又は両方と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５７）ラクトバチルス・ガセリが、配列番号２６０、配列番号２６１、配列番号２６２、配列番号２６３、配列番号２６４、配列番号２６５、配列番号２６６又はこれらの組み合わせと少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５８）パラバクテロイデス・ディスタゾニスが、配列番号２７２、配列番号２７３、配列番号２７４、配列番号２７４、配列番号２７５、配列番号２７６、配列番号２７７、配列番号２７８又はこれらの組み合わせと少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５９）シュードフラボニフラクター・カピローサスが、配列番号２９２と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６０）ロゼブリア・ファエカリスが、配列番号２９４と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６１）ルミノコッカス・オベウムが、配列番号３０３、配列番号３０４、配列番号３０５、又はこれらの組み合わせと少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６２）ルミノコッカス・ブローミイが、配列番号２９９、配列番号３００又は両方と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６３）ルミノコッカス・ラクタリスが、配列番号３０２と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；又は
（６４）ターネレラ・ｓｐ＿６＿１＿５８ＦＡＡが、配列番号３１１と少なくとも９９％同一である１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含む、請求項３〜６のいずれか一項に記載の使用。
【請求項８】
（１）アリスティペス・ファインゴールディイが、配列番号７に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２）バクテロイデス・ユニフォルミスが、配列番号４５に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３）バクテロイデス・ブルガータスが、配列番号５３、配列番号５４、又は配列番号５５に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４）バクテロイデス・ｓｐ３＿１＿１９が、配列番号３３に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５）バクテロイデス・インテスティナーリスが、配列番号２２に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６）バクテロイデス・ｓｐ＿２０＿３が、配列番号２０に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（７）バクテロイデス・カカエが、配列番号９又は配列番号１０に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（８）バクテロイデス・ファエシスが、配列番号１３に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（９）バクテロイデス・ｓｐ＿３＿１＿２３が、配列番号３４に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１０）バクテロイデス・ｓｐ＿Ｄ２０が、配列番号３９に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１１）バクテロイデス・エガーシイが、配列番号１２に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１２）バルネシエラ・インテスティニホミニスが、配列番号５９に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１３）ビフィドバクテリウム・シュードカテヌラツムが、配列番号１１３又は配列番号１１４に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１４）ブラウチア・シンキイが、配列番号１３０に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１５）ブラウチア・ワクスレレが、配列番号１３３に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１６）ブラウチア・ｓｐ＿Ｍ２５が、配列番号１３１に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１７）ブラウチア・プロダクタが、配列番号１２８又は配列番号１２９に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１８）クロストリジウム・ｓｐ＿ＳＭ４＿１が、配列番号１４２に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（１９）クロストリジウム・ラバレンスが、配列番号１８４に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２０）クロストリジウム・イノキュウムが、配列番号１７９、配列番号１８０、配列番号１８１、又は配列番号１８２に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２１）クロストリジウム・アスパラギホルメが、配列番号１４３に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２２）クロストリジウム・スパイロフォルメが、配列番号１９４に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２３）クロストリジウム・ハイレモンアエが、配列番号１７６、配列番号１７７、又は配列番号１７８に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２４）クロストリジウム・ソルデリイが、配列番号１９０に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２５）クロストリジウム・ｓｐ＿ＹＩＴ＿１２０６９が、配列番号１９７に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２６）クロストリジウム・パラピュトリフィカムが、配列番号１８８に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２７）クロストリジウム・グライコリカムが、配列番号１７３に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２８）クロストリジウム・ゴニイが、配列番号１７２に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（２９）クロストリジウム・ビリデが、配列番号２００に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３０）クロストリジウム・ｓｐ＿ＨＧＦ２が、配列番号１９３に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３１）クロストリジウム・シンビオサムが、配列番号１９８又は配列番号１９９に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３２）クロストリジウム・シンデンスが、配列番号１８９に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３３）クロストリジウム・ディスポリカムが、配列番号１７０又は配列番号１７１に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３４）クロストリジウム・ブチリカムが、配列番号１５０又は配列番号１５１に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３５）クロストリジウム・オルビスシンデンスが、配列番号１８６に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３６）クロストリジウム・ボルテアエが、配列番号１４９に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３７）クロストリジウム・ｓｐ＿７＿２＿４３ＦＡＡが、配列番号１９１に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３８）コリンゼラ・アエロファシエンスが、配列番号２０１に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（３９）コプロバチルス・ｓｐ＿Ｄ７が、配列番号２０６に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４０）コプロコッカス・コメスが、配列番号２０７に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４１）コプロコッカス・オイタクツスが、配列番号２０８に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４２）ドレア・ロンギカテナが、配列番号２１１に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４３）ドレア・フォルミシゲネランスが、配列番号２１０に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４４）エリシペロトリクス菌＿３＿１＿５３が、配列番号２１４に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４５）ユウバクテリウム・ｓｐ＿３＿１＿３１が、配列番号２２７に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４６）ユウバクテリウム・ｓｐ＿ＷＡＬ＿１４５７１が、配列番号２２９に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４７）ユウバクテリウム・リモサムが、配列番号２２２に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４８）ユウバクテリウム・ハリイが、配列番号２２０又は配列番号２２１に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（４９）ユウバクテリウム・レクターレが、配列番号２２３、配列番号２２４、配列番号２２５、又は配列番号２２６に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５０）ユウバクテリウム・コントルタムが、配列番号２１７に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５１）ラクノスピラ菌＿２＿１＿５８ＦＡＡが、配列番号２４４に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５２）ラクノスピラ菌＿９＿１＿４３ＢＦＡＡが、配列番号２５０に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５３）ラクノスピラ菌３＿１＿５７ＦＡＡ＿ＣＴ１が、配列番号２４５に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５４）ラクノスピラ菌＿５＿１＿５７ＦＡＡが、配列番号２４７に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５５）ラクノスピラ菌＿ｏｒａｌ＿ｔａｘｏｎ＿Ｆ１５が、配列番号２５１に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５６）ラクトバチルス・アシドフィラスが、配列番号２５２又は配列番号２５３に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５７）ラクトバチルス・ガセリが、配列番号２６０、配列番号２６１、配列番号２６２、配列番号２６３、配列番号２６４、配列番号２６５、又は配列番号２６６に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５８）パラバクテロイデス・ディスタゾニスが、配列番号２７２、配列番号２７３、配列番号２７４、配列番号２７４、配列番号２７５、配列番号２７６、配列番号２７７、又は配列番号２７８に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（５９）シュードフラボニフラクター・カピローサスが、配列番号２９２に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６０）ロゼブリア・ファエカリスが、配列番号２９４に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６１）ルミノコッカス・オベウムが、配列番号３０３、配列番号３０４、又は配列番号３０５に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６２）ルミノコッカス・ブローミイが、配列番号２９９又は配列番号３００に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；
（６３）ルミノコッカス・ラクタリスが、配列番号３０２に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含むか；又は
（６４）ターネレラ・ｓｐ＿６＿１＿５８ＦＡＡが、配列番号３１１に示される１６Ｓ  ｒＤＮＡ配列を含む、請求項３〜７のいずれか一項に記載の使用。
【請求項９】
胆汁酸若しくは胆汁酸塩代謝活性が、胆汁酸若しくは胆汁酸塩ヒドロラーゼ活性、脱抱合化、酸化、脱ヒドロキシル化及びこれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項１〜８のいずれか一項に記載の使用。
【請求項１０】
前記組成物が、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、４０、４５又は５０のＯＴＵ又は細菌種を含む、請求項１〜９のいずれか一項に記載の使用。
【請求項１１】
胆汁うっ滞性疾患又は病態が、全身性胆汁うっ滞（ＧＣ）、原発性硬化性肝硬変（ＰＳＣ）、原発性胆汁性肝硬変（ＰＢＳ）、進行性家族性肝内胆汁うっ滞（ＰＦＩＣ）、非アルコール性脂肪肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、非アルコール性脂肪性肝炎（ＮＡＳＨ）、妊娠期胆汁うっ滞、胆管炎、肝炎、アルコール性肝疾患、肝細胞癌、肝硬変、嚢胞性線維症、移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）、肝外胆管の閉塞又はこれらの組み合わせを含む、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の使用。
【請求項１２】
前記肝外胆管の閉塞が、胆石、炎症性狭窄、がん、膵炎又はこれらの組み合わせによるものである、請求項１１に記載の使用。
【請求項１３】
前記組成物が、胆汁うっ滞性疾患又は病態の治療と組み合わせて前記対象に投与するのに適している、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の使用。
【請求項１４】
前記胆汁うっ滞性疾患又は病態の治療が、オベチコール酸（ＯＣＡ）、ウルソデオキシコール酸（ＵＤＣＡ）又はこれらの誘導体を含む、請求項１３に記載の使用。
【請求項１５】
前記組成物が、
（ｉ）前記胆汁うっ滞性疾患又は病態の治療に関連する１以上の望ましくない副作用の低減、
（ｉｉ）前記胆汁うっ滞性疾患又は病態の治療の効果の向上、又は
（ｉｉｉ）（ｉ）と（ｉｉ）の両方
をすることができる、請求項１３又は１４に記載の使用。
【請求項１６】
前記１以上の望ましくない副作用が掻痒を含む、請求項１５に記載の使用。