【手続補正書】
【提出日】令和3年3月19日(2021.3.19)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
腫瘍抗原を選択する方法であって、
ａ）細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを提供するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、対象のがんまたは腫瘍細胞において発現される１つまたは複数の突然変異、スプライスバリアント、または転座を含む異なる異種ポリペプチドを含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示されるポリペプチドによるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドによって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドに対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを同定するステップであって、刺激、阻害および／または抑制により、前記ポリペプチドが腫瘍抗原であることが示される、ステップと、
ｆ）前記同定された腫瘍抗原の中から、（ｉ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の腫瘍抗原、および／または（ｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと
を含む方法。
【請求項２】
腫瘍抗原を選択する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるかどうかを、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、対象応答プロファイルを得るステップと、
ｆ）前記同定された腫瘍抗原の中から、がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の抗原を選択する、および／または、がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと
を含む方法。
【請求項３】
対象応答プロファイルを得るまたは生成する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記ライブラリーの前記細菌細胞またはビーズを対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害、および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、対象応答プロファイルを得るまたは生成するステップと
を含む方法。
【請求項４】
標的応答プロファイルを得るまたは生成する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記ライブラリーの前記細菌細胞またはビーズを、がんに対する応答を示すまたは以前示した対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、標的応答プロファイルを得るまたは生成するステップと
を含む方法。
【請求項５】
対象応答プロファイルと標的応答プロファイルとの比較を、対象をがん治療の候補として同定するための指標とする方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、前記対象応答プロファイルを得るまたは生成するステップと
を含み、前記対象応答プロファイルと標的応答プロファイルとの前記比較は、前記対象ががん治療の開始、継続、改変、中止または不開始の候補対象として選択することができることの指標である、方法。
【請求項６】
腫瘍抗原を選択する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害、および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、対象応答プロファイルを得るまたは生成するステップと、
ｆ）前記対象応答プロファイルを標的応答プロファイルと比較するステップと、
ｇ）前記比較に基づいて１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと
を含む方法。
【請求項７】
腫瘍抗原を選択する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるかどうかを、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、対象応答プロファイルを得るステップと、
ｆ）前記同定された腫瘍抗原の中から、（ｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の抗原、ならびに／または（ｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと
を含む方法。
【請求項８】
腫瘍抗原を同定する方法であって、
ａ）細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、対象のがんまたは腫瘍細胞において発現される１つまたは複数の突然変異、スプライスバリアント、または転座を含む異なる異種ポリペプチドを含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示されるポリペプチドによるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドによって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドに対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを同定するステップであって、刺激、阻害および／または抑制により、前記ポリペプチドが腫瘍抗原であることが示される、ステップと
を含む方法。
【請求項９】
潜在的な腫瘍抗原を選択する方法であって、
ａ）細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、対象のがんまたは腫瘍細胞において発現される１つまたは複数の突然変異、スプライスバリアント、または転座を含む異種ポリペプチドを含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示されるポリペプチドによるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドによって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドに対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを同定し、刺激、阻害および／または抑制する１つまたは複数のポリペプチドを腫瘍抗原として同定するステップと、
ｆ）前記同定されたポリペプチドの中から、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを選択するステップ
を含む方法。
【請求項１０】
腫瘍抗原を選択する方法であって、
ａ）細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、対象のがんまたは腫瘍細胞において発現されるがんまたは腫瘍細胞において発現される１つまたは複数の突然変異、スプライスバリアント、または転座を含む異なる異種ポリペプチドを含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示されるポリペプチドによるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドによって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドに対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを同定し、刺激、阻害および／または抑制する１つまたは複数のポリペプチドを腫瘍抗原として同定するステップと、
ｆ）前記同定された腫瘍抗原の中から、（ｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の腫瘍抗原、および／または（ｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップ
を含む方法。
【請求項１１】
１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを決定するステップが、１つまたは複数の免疫メディエーターのレベルを測定することを含む、請求項１から１０までのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記１つまたは複数の免疫メディエーターが、前記リンパ球によって発現されるサイトカイン、可溶性メディエーター、および細胞表面マーカーからなる群から選択される、請求項１から１１までのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記１つまたは複数の免疫メディエーターが、（ａ）サイトカインであり、必要に応じてＴＲＡＩＬ、ＩＦＮ−ガンマ、ＩＬ−１２ｐ７０、ＩＬ−２、ＴＮＦ−アルファ、ＭＩＰ１−アルファ、ＭＩＰ１−ベータ、ＣＸＣＬ９、ＣＸＣＬ１０、ＭＣＰ１、ＲＡＮＴＥＳ、ＩＬ−１ベータ、ＩＬ−４、ＩＬ−６、ＩＬ−８、ＩＬ−９、ＩＬ−１０、ＩＬ−１３、ＩＬ−１５、ＣＸＣＬ１１、ＩＬ−３、ＩＬ−５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、ＩＬ−２３Ａ、ＩＬ−２４、ＩＬ−２７、ＩＬ−３１、ＩＬ−３２、ＴＧＦ−ベータ、ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦ、ＴＲＡＮＣＥ（ＲＡＮＫ  Ｌとしても公知）、ＭＩＰ３−アルファ、およびフラクタルカインからなる群から選択される１つまたは複数のサイトカインである、ならびに／または（ｂ）可溶性メディエーターであり、必要に応じてグランザイムＡ、グランザイムＢ、ｓＦａｓ、ｓＦａｓＬ、パーフォリン、およびグラニュライシンからなる群から選択される１つまたは複数の可溶性メディエーターである、ならびに／または（ｃ）細胞表面マーカーであり、必要に応じてＣＤ１０７ａ、ＣＤ１０７ｂ、ＣＤ２５、ＣＤ６９、ＣＤ４５ＲＡ、ＣＤ４５ＲＯ、ＣＤ１３７（４−１ＢＢ）、ＣＤ４４、ＣＤ６２Ｌ、ＣＤ２７、ＣＣＲ７、ＣＤ１５４（ＣＤ４０Ｌ）、ＫＬＲＧ−１、ＣＤ７１、ＨＬＡ−ＤＲ、ＣＤ１２２（ＩＬ−２ＲＢ）、ＣＤ２８、ＩＬ７Ｒａ（ＣＤ１２７）、ＣＤ３８、ＣＤ２６、ＣＤ１３４（ＯＸ−４０）、ＣＴＬＡ−４（ＣＤ１５２）、ＬＡＧ−３、ＴＩＭ−３（ＣＤ３６６）、ＣＤ３９、ＰＤ１（ＣＤ２７９）、ＦｏｘＰ３、ＴＩＧＩＴ、ＣＤ１６０、ＢＴＬＡ、２Ｂ４（ＣＤ２４４）、およびＫＬＲＧ１からなる群から選択される１つまたは複数の細胞表面マーカーである、請求項１から１２までのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
リンパ球活性化が、（ａ）対照レベルよりも少なくとも２０％、４０％、６０％、８０％、１００％、１２０％、１４０％、１６０％、１８０％、または２００％高いまたは低い、（ｂ）対照レベルの平均よりも少なくとも１、２、または３標準偏差高いまたは低い、または（ｃ）対照に対する応答レベル中央値よりも少なくとも１、２、３、４または５中央絶対偏差（ＭＡＤ）高いまたは低い、１つまたは複数の発現または分泌された免疫メディエーターのレベルを評価することにより決定される、請求項１から１３までのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
リンパ球非応答性が、１つまたは複数の発現または分泌された免疫メディエーターのレベルが、（ａ）対照レベルの５％以内、１０％、１５％、または２０％である、（ｂ）対照レベルの平均よりも１標準偏差未満または２標準偏差未満高いまたは低い、または（ｃ）対照に対する応答レベル中央値よりも１中央絶対偏差（ＭＡＤ）未満または２中央絶対偏差（ＭＡＤ）よりも高いまたはそれよりも低いことを評価することにより決定される、請求項１から１３までのいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
１つまたは複数の選択された抗原またはその免疫原性断片と担体とを組み合わせるステップを含む、免疫原性組成物を製造する方法であって、前記１つまたは複数の選択された抗原が、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのかを、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを評価することによって決定するステップと、
ｅ）各活性化された腫瘍抗原を、（ｉ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを刺激する抗原、または（ｉｉ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／もしくは抑制する抗原として同定するステップと、
ｆ）前記同定された腫瘍抗原から、（ｉ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の抗原、（ｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原、（ｉｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の抗原、ならびに／または（ｉｖ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと
を含む方法によって選択される、方法。
【請求項１７】
対象応答プロファイルの１つまたは複数の特徴を、対象をがん治療の候補として同定するための指標とする方法であって、前記対象応答プロファイルを得るステップを含み、前記対象応答プロファイルが、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのかを、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを評価することによって決定するステップと、
ｅ）各活性化される腫瘍抗原を、（ｉ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを刺激する抗原、または（ｉｉ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する抗原として同定して、前記対象応答プロファイルを得るまたは生成するステップと
によって生成され、
前記対象応答プロファイルの前記１つまたは複数の特徴は、前記対象ががん治療の開始、継続、改変、中止または不開始の候補対象として選択できることの指標である、方法。
【請求項１８】
１つまたは複数の抗原、またはその免疫原性断片を含む免疫原性組成物であって、
前記１つまたは複数の抗原が、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのかを、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを評価することによって決定するステップと、
ｅ）各活性化される腫瘍抗原を、（ｉ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを刺激する抗原、または（ｉｉ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する抗原として同定するステップと、
ｆ）前記同定された腫瘍抗原の中から、（ｉ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の抗原、（ｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原、（ｉｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の抗原、ならびに／または（ｉｖ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと
を含む方法によって選択される、免疫原性組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１１２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１１２】
本明細書に記載の本教示は、以下の種々の例示的な実施形態の説明を付属図と共に読めばより詳細に理解されよう。下記の図は単に例証するためのものであり、本教示の範囲を決して限定しないことが理解されるべきである。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
対象応答プロファイルを得るまたは生成する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記ライブラリーの前記細菌細胞またはビーズを対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害、および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、対象応答プロファイルを得るまたは生成するステップと
を含む方法。
（項目２）
前記対象応答プロファイルが、前記複数の腫瘍抗原に関連する前記１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルの表示を含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
標的応答プロファイルを得るまたは生成する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記ライブラリーの前記細菌細胞またはビーズを、がんに対する応答を示すまたは以前示した対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、標的応答プロファイルを得るまたは生成するステップと
を含む方法。
（項目４）
前記対象が、がんに対して少なくとも１つの有益な応答を示すまたは以前示した、項目３に記載の方法。
（項目５）
前記有益な応答が、がん治療または治療の組合せに対する正の臨床応答、例えば、１つまたは複数の正の臨床的エンドポイントを含む、項目４に記載の方法。
（項目６）
前記有益な応答が、がんに対する自然応答を含む、項目４に記載の方法。
（項目７）
前記有益な応答が、がんのクリアランス、例えば、あるレベルの、がんのクリアランスに関連する１つまたは複数の臨床的尺度を含む、項目４に記載の方法。
（項目８）
前記有益な応答が、例えば所定の期間（例えば、少なくとも１週間、２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、または少なくとも１カ月、２カ月、３カ月、４カ月、５カ月、６カ月、７カ月、８カ月、９カ月、１０カ月、１１カ月、１２カ月、または少なくとも１年、２年、３年、４年、５年、６年、７年、８年、９年、１０年、１１年、１２年）にわたって、がんの再燃、再発、および／または転移がないことを含む、項目４に記載の方法。
（項目９）
前記有益な応答が、正のがん予後を含む、項目４に記載の方法。
（項目１０）
前記有益な応答が、がん治療または治療の組合せに対する測定可能な毒性の応答または副作用がないことを含む、項目４に記載の方法。
（項目１１）
前記対象が、がんに対して少なくとも１つの有害な応答または有益でない応答を示すまたは以前示した、項目３に記載の方法。
（項目１２）
前記有害な応答が、がん治療または治療の組合せに対する負の臨床応答および／または応答不全を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
前記有害な応答が、がんのクリアランスの欠如、例えば、あるレベルの、がんのクリアランスの欠如に関連する１つまたは複数の臨床的尺度を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１４）
前記有害な応答が、がんの再燃、再発、および／または転移の少なくとも１つを含む、項目１１に記載の方法。
（項目１５）
前記有害な応答が、負のがん予後を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１６）
前記有害な応答が、がん治療または治療の組合せに対する１つまたは複数の毒性の応答または副作用（例えば、１つまたは複数の測定可能な毒性の応答または副作用）を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１７）
前記標的応答プロファイルを得るために使用される前記ライブラリーが、項目１に記載の対象応答プロファイルを得るために使用されるものと同じライブラリーである、項目３から１６までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１８）
追加的な対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）および／またはリンパ球を用いてステップａ）からｅ）を繰り返して、集団に基づくまたは複合的な標的応答プロファイルを得るステップをさらに含む、項目３から１７までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１９）
前記標的応答プロファイルが、前記複数の腫瘍抗原に関連する前記１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルの表示を含む、項目２から１８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２０）
対象をがん治療の候補として同定する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、対象応答プロファイルを得るまたは生成するステップと、
ｆ）前記対象応答プロファイルを標的応答プロファイルと比較して、前記対象をがん治療の開始、継続、改変、中止または不開始の候補対象として選択するステップと
を含む方法。
（項目２１）
前記対象応答プロファイルが、前記複数の腫瘍抗原に関連する前記１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルの表示を含む、項目２０に記載の方法。
（項目２２）
ｇ）前記細菌細胞またはビーズを標的対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｈ）前記ＡＰＣを、前記標的対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｉ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｊ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、前記標的応答プロファイルを得るまたは生成するステップと
を含む方法によって前記標的応答プロファイルを生成するステップをさらに含む、項目２０または２１に記載の方法。
（項目２３）
前記標的応答プロファイルが、前記複数の腫瘍抗原に関連する前記１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルの表示を含む、項目２２に記載の方法。
（項目２４）
前記標的応答プロファイルが、がんに対する少なくとも１つの有益な応答を示すまたは以前示した１または複数の標的対象に由来する、項目２０から２３までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２５）
前記有益な応答が、がん治療または治療の組合せに対する正の臨床応答を含む、項目２４に記載の方法。
（項目２６）
前記有益な応答が、がんに対する自然応答を含む、項目２４に記載の方法。
（項目２７）
前記有益な応答が、がんのクリアランス、例えば、あるレベルの、がんのクリアランスに関連する１つまたは複数の臨床的尺度を含む、項目２４に記載の方法。
（項目２８）
前記有益な応答が、例えば所定の期間（例えば、少なくとも１週間、２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、または少なくとも１カ月、２カ月、３カ月、４カ月、５カ月、６カ月、７カ月、８カ月、９カ月、１０カ月、１１カ月、１２カ月、または少なくとも１年、２年、３年、４年、５年、６年、７年、８年、９年、１０年、１１年、１２年）にわたって、がんの再燃、再発、および／または転移がないことを含む、項目２４に記載の方法。
（項目２９）
前記有益な応答が、正のがん予後を含む、項目２４に記載の方法。
（項目３０）
前記有益な応答が、がん治療または治療の組合せに対する１つまたは複数の毒性の応答および／または副作用（例えば、１つまたは複数の測定可能な毒性の応答または副作用）がないことを含む、項目２４に記載の方法。
（項目３１）
前記標的応答プロファイルが、がんに対する１つまたは複数の有害な応答および／または有益でない応答を示すまたは以前示した１または複数の標的対象に由来する、項目２０から２３までのいずれか一項に記載の方法。
（項目３２）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がん治療または治療の組合せに対する負の臨床応答および／または応答不全を含む、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がんのクリアランスの欠如、例えば、あるレベルの、がんのクリアランスの欠如に関連する１つまたは複数の臨床的尺度を含む、項目３１に記載の方法。
（項目３４）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がんの再燃、再発、および／または転移の少なくとも１つを含む、項目３１に記載の方法。
（項目３５）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、負のがん予後を含む、項目３１に記載の方法。
（項目３６）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がん治療または治療の組合せに対する１つまたは複数の毒性の応答および／または副作用（例えば、１つまたは複数の測定可能な毒性の応答および／または副作用）を含む、項目３１に記載の方法。
（項目３７）
がん治療またはがん治療の組合せの開始のための前記候補対象を選択するステップをさらに含む、項目２０から３６までのいずれかに記載の方法。
（項目３８）
がん治療またはがん治療の組合せの継続のための前記候補対象を選択するステップをさらに含む、項目２０から３６までのいずれかに記載の方法。
（項目３９）
（ｉ）前記対象応答プロファイルが、前記がん治療または組合せに対する１つまたは複数の有益な応答を示すまたは以前示した標的対象由来の標的応答プロファイルと類似している場合、および／または（ｉｉ）前記対象応答プロファイルが、前記がん治療または組合せに対する１つまたは複数の有害な応答を示すまたは以前示した前記標的対象由来の標的応答プロファイルと類似していない場合、前記対象を候補対象として選択するステップを含む、項目３７または項目３８に記載の方法。
（項目４０）
前記候補対象を、がん治療の改変のために選択するステップをさらに含む、項目２０から３６までのいずれかに記載の方法。
（項目４１）
前記候補対象を、がん治療の中止または不開始のために選択するステップをさらに含む、項目２０から３６までのいずれかに記載の方法。
（項目４２）
（ｉ）前記対象応答プロファイルが、前記がん治療に対する１つまたは複数の有害な応答を示すまたは以前示した標的対象由来の前記標的応答プロファイルと類似している場合、および／または（ｉｉ）前記対象応答プロファイルが、前記がん治療に対する１つまたは複数の有益な応答を示すまたは以前示した標的対象由来の前記標的応答プロファイルと類似していない場合、前記対象をがん治療の改変、中止、および／または不開始の候補対象として選択するステップを含む、項目４０または４１に記載の方法。
（項目４３）
前記がん治療またはがん治療の組合せを前記候補対象に施行するステップをさらに含む、項目３７から３９までのいずれか一項に記載の方法。
（項目４４）
前記候補対象に施行する前記がん治療を改変するステップをさらに含む、項目４０から４２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目４５）
前記候補対象に対する前記がん治療を中止するまたは開始しないステップをさらに含む、項目４０から４２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目４６）
腫瘍抗原を選択する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害、および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、対象応答プロファイルを得るまたは生成するステップと、
ｆ）前記対象応答プロファイルを標的応答プロファイルと比較するステップと、
ｇ）前記比較に基づいて１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと
を含む方法。
（項目４７）
前記対象応答プロファイルが、前記複数の腫瘍抗原に関連する前記１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルの表示を含む、項目４６に記載の方法。
（項目４８）
ｈ）前記細菌細胞またはビーズを標的対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｉ）前記ＡＰＣを、前記標的対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｊ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｋ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、前記標的応答プロファイルを得るまたは生成するステップと
を含む方法によって前記標的応答プロファイルを生成するステップをさらに含む、項目４６または４７に記載の方法。
（項目４９）
前記標的応答プロファイルが、前記複数の腫瘍抗原に関連する前記１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルの表示を含む、項目４８に記載の方法。
（項目５０）
前記標的応答プロファイルが、がんに対する１つまたは複数の有益な応答を示すまたは以前示した１または複数の標的対象に由来する、項目４６から４９までのいずれか一項に記載の方法。
（項目５１）
前記有益な応答が、がん治療または治療の組合せに対する正の臨床応答を含む、項目５０に記載の方法。
（項目５２）
前記有益な応答が、がんに対する自然応答を含む、項目５０に記載の方法。
（項目５３）
前記有益な応答が、がんのクリアランス、例えば、あるレベルの、がんのクリアランスに関連する１つまたは複数の臨床的尺度を含む、項目５０に記載の方法。
（項目５４）
前記有益な応答が、例えば、所定の期間（例えば、少なくとも１週間、２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、または少なくとも１カ月、２カ月、３カ月、４カ月、５カ月、６カ月、７カ月、８カ月、９カ月、１０カ月、１１カ月、１２カ月、または少なくとも１年、２年、３年、４年、５年、６年、７年、８年、９年、１０年、１１年、１２年）にわたる、がんの再燃、再発、および／または転移を含む、項目５０に記載の方法。
（項目５５）
前記有益な応答が、正のがん予後を含む、項目５０に記載の方法。
（項目５６）
前記有益な応答が、がん治療または治療の組合せに対する１つまたは複数の毒性の応答および／または副作用（例えば、１つまたは複数の測定可能な毒性の応答および／または副作用）がないことを含む、項目５０に記載の方法。
（項目５７）
前記標的応答プロファイルが、がんに対する１つまたは複数の有害な応答または有益でない応答を示すまたは以前示した１または複数の標的対象に由来する、項目４６から４９までのいずれか一項に記載の方法。
（項目５８）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がん治療または治療の組合せに対する負の臨床応答および／または応答不全を含む、項目５７に記載の方法。
（項目５９）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がんのクリアランスの欠如、例えば、あるレベルの、がんのクリアランスの欠如に関連する１つまたは複数の臨床的尺度を含む、項目５７に記載の方法。
（項目６０）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がんの再燃、再発、および／または転移の少なくとも１つを含む、項目５７に記載の方法。
（項目６１）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、負のがん予後を含む、項目５７に記載の方法。
（項目６２）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がん治療または治療の組合せに対する１つまたは複数の毒性の応答および／または副作用（例えば、１つまたは複数の測定可能な毒性の応答および／または副作用）を含む、項目５７に記載の方法。
（項目６３）
がんに対する有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップ、および／または、がんに対する有害な応答または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップを含む、項目４６から６２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目６４）
がんに対する有害な応答または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップ、および／または、がんに対する有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップを含む、項目４６から６２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目６５）
第１の対象に、前記選択された抗原またはその免疫原性断片の１つまたは複数を含む免疫原性組成物を投与するステップをさらに含む、項目６３に記載の方法。
（項目６６）
前記第１の対象に、前記選択された抗原またはその免疫原性断片の１つまたは複数を含まない免疫原性組成物を投与するステップをさらに含む、項目６４に記載の方法。
（項目６７）
前記第１の対象に、がん治療または治療の組合せを施行するステップをさらに含む、項目６５または６６に記載の方法。
（項目６８）
対象における免疫応答を誘導する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇またはレベルの低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、対象応答プロファイルを得るまたは生成するステップと、
ｆ）前記対象応答プロファイルを標的応答プロファイルと比較するステップと、
ｇ）前記比較に基づいて１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと、
ｈ）前記対象に、前記選択された抗原またはその免疫原性断片の１つまたは複数を含む免疫原性組成物を投与するステップと
を含む方法。
（項目６９）
前記対象応答プロファイルが、前記複数の腫瘍抗原に関連する前記１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルの表示を含む、項目６８に記載の方法。
（項目７０）
ｉ）前記細菌細胞またはビーズを標的対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｊ）前記ＡＰＣを、前記標的対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｋ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｌ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、前記標的応答プロファイルを得るまたは生成するステップと
を含む方法によって前記標的応答プロファイルを生成するステップをさらに含む、項目６８または６９に記載の方法。
（項目７１）
前記標的応答プロファイルが、前記複数の腫瘍抗原に関連する前記１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルの表示を含む、項目７０に記載の方法。
（項目７２）
前記標的応答プロファイルが、がんに対する少なくとも１つの有益な応答を示すまたは以前示した１または複数の標的対象に由来する、項目６８から７１までのいずれか一項に記載の方法。
（項目７３）
前記有益な応答が、がん治療または治療の組合せに対する正の臨床応答を含む、項目７２に記載の方法。
（項目７４）
前記有益な応答が、がんに対する自然応答を含む、項目７２に記載の方法。
（項目７５）
前記有益な応答が、がんのクリアランス、例えば、あるレベルの、がんのクリアランスに関連する１つまたは複数の臨床的尺度を含む、項目７２に記載の方法。
（項目７６）
前記有益な応答が、例えば所定の期間（例えば、少なくとも１週間、２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、または少なくとも１カ月、２カ月、３カ月、４カ月、５カ月、６カ月、７カ月、８カ月、９カ月、１０カ月、１１カ月、１２カ月、または少なくとも１年、２年、３年、４年、５年、６年、７年、８年、９年、１０年、１１年、１２年）にわたって、がんの再燃、再発、および／または転移がないことを含む、項目７２に記載の方法。
（項目７７）
前記有益な応答が、正のがん予後を含む、項目７２に記載の方法。
（項目７８）
前記有益な応答が、がん治療または治療の組合せに対する１つまたは複数の毒性の応答および／または副作用（例えば、１つまたは複数の測定可能な毒性の応答または副作用）がないことを含む、項目７２に記載の方法。
（項目７９）
（ｉ）がんに対する１つまたは複数の有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の腫瘍抗原、および／または（ｉ）がんに対する１つまたは複数の有害な応答または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択し、投与するステップを含む、項目６８から７８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目８０）
対象における免疫応答を誘導する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、対象応答プロファイルを得るまたは生成するステップと、
ｆ）前記対象応答プロファイルを標的応答プロファイルと比較するステップと、
ｇ）前記比較に基づいて１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと、
ｈ）前記対象に、前記選択された抗原またはその免疫原性断片の１つまたは複数を含まない免疫原性組成物を投与するステップと
を含む方法。
（項目８１）
前記対象応答プロファイルが、前記複数の腫瘍抗原に関連する前記１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルの表示を含む、項目８０に記載の方法。
（項目８２）
ｉ）前記細菌細胞またはビーズを標的対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｊ）前記ＡＰＣを、前記標的対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｋ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｌ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、前記標的応答プロファイルを得るまたは生成するステップと
を含む方法によって前記標的応答プロファイルを生成するステップをさらに含む、項目８０または８１に記載の方法。
（項目８３）
前記標的応答プロファイルが、前記複数の腫瘍抗原に関連する前記１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルの表示を含む、項目８２に記載の方法。
（項目８４）
前記標的応答プロファイルが、がんに対する１つまたは複数の有害な応答および／または有益でない応答を示すまたは以前示した１または複数の標的対象に由来する、項目８０から８３までのいずれか一項に記載の方法。
（項目８５）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がん治療または治療の組合せに対する負の臨床応答および／または応答不全を含む、項目８４に記載の方法。
（項目８６）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がんのクリアランスの欠如、例えば、あるレベルの、がんのクリアランスの欠如に関連する１つまたは複数の臨床的尺度を含む、項目８４に記載の方法。
（項目８７）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がんの再燃、再発、および／または転移の少なくとも１つを含む、項目８４に記載の方法。
（項目８８）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、負のがん予後を含む、項目８４に記載の方法。
（項目８９）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がん治療または治療の組合せに対する１つまたは複数の毒性の応答および／または副作用（例えば、１つまたは複数の測定可能な毒性の応答および／または副作用）を含む、項目８４に記載の方法。
（項目９０）
がんに対する有害な応答または有益でない応答に関連する免疫メディエーターの発現または分泌を上昇させる１つまたは複数の腫瘍抗原、および／または、がんに対する有益な応答に関連する免疫メディエーターの発現または分泌を阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップを含む、項目８０から８９までのいずれか一項に記載の方法。
（項目９１）
前記対象に、がん治療または治療の組合せを施行するステップをさらに含む、項目５６から９０までのいずれか一項に記載の方法。
（項目９２）
腫瘍抗原を選択する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるかどうかを、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、対象応答プロファイルを得るステップと、
ｆ）前記同定された腫瘍抗原の中から、がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の抗原を選択する、および／または、がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと
を含む方法。
（項目９３）
前記対象応答プロファイルを標的応答プロファイルと比較するステップと、前記比較に基づいて１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップとをさらに含む、項目９２に記載の方法。
（項目９４）
前記標的応答プロファイルが、がんに対する少なくとも１つの有益な応答を示すまたは以前示した１または複数の標的対象に由来する、項目９３に記載の方法。
（項目９５）
前記有益な応答が、がん治療または治療の組合せに対する正の臨床応答を含む、項目９４に記載の方法。
（項目９６）
前記有益な応答が、がんに対する自然応答を含む、項目９４に記載の方法。
（項目９７）
前記有益な応答が、がんのクリアランス、例えば、あるレベルの、がんのクリアランスに関連する１つまたは複数の臨床的尺度を含む、項目９４に記載の方法。
（項目９８）
前記有益な応答が、例えば所定の期間（例えば、少なくとも１週間、２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、または少なくとも１カ月、２カ月、３カ月、４カ月、５カ月、６カ月、７カ月、８カ月、９カ月、１０カ月、１１カ月、１２カ月、または少なくとも１年、２年、３年、４年、５年、６年、７年、８年、９年、１０年、１１年、１２年）にわたって、がんの再燃、再発、および／または転移がないことを含む、項目９４に記載の方法。
（項目９９）
前記有益な応答が、正のがん予後を含む、項目９４に記載の方法。
（項目１００）
前記有益な応答が、がん治療または治療の組合せに対する１つまたは複数の毒性の応答および／または副作用（例えば、１つまたは複数の測定可能な毒性の応答または副作用）がないことを含む、項目９４に記載の方法。
（項目１０１）
前記対象に、前記選択された抗原またはその免疫原性断片の１つまたは複数を含む免疫原性組成物を投与するステップをさらに含む、項目９２から１０１までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１０２）
腫瘍抗原を選択する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるかどうかを、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、対象応答プロファイルを得るステップと、
ｆ）前記同定された腫瘍抗原の中から、（ｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の抗原、ならびに／または（ｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと
を含む方法。
（項目１０３）
前記対象応答プロファイルを標的応答プロファイルと比較するステップと、前記比較に基づいて１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップとをさらに含む、項目１０２に記載の方法。
（項目１０４）
前記標的応答プロファイルが、がんに対する１つまたは複数の有害な応答および／または有益でない応答を示すまたは以前示した１または複数の標的対象に由来する、項目１０３に記載の方法。
（項目１０５）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がん治療または治療の組合せに対する負の臨床応答および／または応答不全を含む、項目１０４に記載の方法。
（項目１０６）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がんのクリアランスの欠如、例えば、あるレベルの、がんのクリアランスの欠如に関連する１つまたは複数の臨床的尺度を含む、項目１０４に記載の方法。
（項目１０７）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がんの再燃、再発、および／または転移の少なくとも１つを含む、項目１０４に記載の方法。
（項目１０８）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、負のがん予後を含む、項目１０４に記載の方法。
（項目１０９）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がん治療または治療の組合せに対する１つまたは複数の毒性の応答および／または副作用（例えば、１つまたは複数の測定可能な毒性の応答および／または副作用）を含む、項目１０４に記載の方法。
（項目１１０）
前記対象に、前記選択された抗原またはその免疫原性断片の１つまたは複数を含まない免疫原性組成物を投与するステップをさらに含む、項目１０２から１０９までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１１１）
前記対象に、がん治療または治療の組合せを施行するステップをさらに含む、項目１０１または１１０に記載の方法。
（項目１１２）
対象における免疫応答を誘導する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、対象応答プロファイルを得るステップと、
ｆ）前記同定された腫瘍抗原の中から、（ｉ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の抗原、ならびに／または（ｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと、
ｇ）前記対象に、前記選択された抗原またはその免疫原性断片の１つまたは複数を含む免疫原性組成物を投与するステップと
を含む方法。
（項目１１３）
前記免疫原性組成物を投与するステップの前に、前記対象応答プロファイルを標的応答プロファイルと比較するステップと、前記比較に基づいて１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップとをさらに含む、項目１１２に記載の方法。
（項目１１４）
前記標的応答プロファイルが、がんに対する少なくとも１つの有益な応答を示すまたは以前示した１または複数の標的対象に由来する、項目１１３に記載の方法。
（項目１１５）
前記有益な応答が、がん治療または治療の組合せに対する正の臨床応答を含む、項目１１３に記載の方法。
（項目１１６）
前記有益な応答が、がんに対する自然応答を含む、項目１１３に記載の方法。
（項目１１７）
前記有益な応答が、がんのクリアランス、例えば、あるレベルの、がんのクリアランスに関連する１つまたは複数の臨床的尺度を含む、項目１１３に記載の方法。
（項目１１８）
前記有益な応答が、例えば所定の期間（例えば、少なくとも１週間、２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、または少なくとも１カ月、２カ月、３カ月、４カ月、５カ月、６カ月、７カ月、８カ月、９カ月、１０カ月、１１カ月、１２カ月、または少なくとも１年、２年、３年、４年、５年、６年、７年、８年、９年、１０年、１１年、１２年）にわたって、がんの再燃、再発、および／または転移がないことを含む、項目１１３に記載の方法。
（項目１１９）
前記有益な応答が、正のがん予後を含む、項目１１３に記載の方法。
（項目１２０）
前記有益な応答が、がん治療または治療の組合せに対する１つまたは複数の毒性の応答および／または副作用（例えば、１つまたは複数の測定可能な毒性の応答または副作用）がないことを含む、項目１１３に記載の方法。
（項目１２１）
対象における免疫応答を誘導する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の腫瘍抗原を同定して、対象応答プロファイルを得るステップと、
ｆ）前記対象応答プロファイルを標的応答プロファイルと比較するステップと、
ｇ）前記同定された腫瘍抗原の中から、（ｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の抗原、ならびに／または（ｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと、
ｈ）前記対象に、前記選択された抗原またはその免疫原性断片の１つまたは複数を含まない免疫原性組成物を投与するステップと
を含む方法。
（項目１２２）
前記対象応答プロファイルを標的応答プロファイルと比較するステップと、前記比較に基づいて１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップとをさらに含む、項目１２１に記載の方法。
（項目１２３）
前記標的応答プロファイルが、がんに対する１つまたは複数の有害な応答および／または有益でない応答を示すまたは以前示した１または複数の標的対象に由来する、項目１２２に記載の方法。
（項目１２４）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がん治療または治療の組合せに対する負の臨床応答および／または応答不全を含む、項目１２２に記載の方法。
（項目１２５）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がんのクリアランスの欠如、例えば、あるレベルの、がんのクリアランスの欠如に関連する１つまたは複数の臨床的尺度を含む、項目１２２に記載の方法。
（項目１２６）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がんの再燃、再発、および／または転移の少なくとも１つを含む、項目１２２に記載の方法。
（項目１２７）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、負のがん予後を含む、項目１２２に記載の方法。
（項目１２８）
前記有害な応答および／または有益でない応答が、がん治療または治療の組合せに対する１つまたは複数の毒性の応答および／または副作用（例えば、１つまたは複数の測定可能な毒性の応答および／または副作用）を含む、項目１２２に記載の方法。
（項目１２９）
前記対象に、がん治療または治療の組合せを施行するステップをさらに含む、項目１１２、１１３、１２１または１２２のいずれか一項に記載の方法。
（項目１３０）
腫瘍抗原を同定する方法であって、
ａ）細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、対象のがんまたは腫瘍細胞において発現される１つまたは複数の突然変異、スプライスバリアント、または転座を含む異なる異種ポリペプチドを含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示されるポリペプチドによるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドによって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドに対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを同定するステップであって、刺激、阻害および／または抑制により、前記ポリペプチドが腫瘍抗原であることが示される、ステップと
を含む方法。
（項目１３１）
腫瘍抗原を選択する方法であって、
ａ）細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを提供するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、対象のがんまたは腫瘍細胞において発現される１つまたは複数の突然変異、スプライスバリアント、または転座を含む異なる異種ポリペプチドを含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示されるポリペプチドによるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドによって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドに対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを同定するステップであって、刺激、阻害および／または抑制により、前記ポリペプチドが腫瘍抗原であることが示される、ステップと、
ｆ）前記同定された腫瘍抗原の中から、（ｉ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の腫瘍抗原、および／または（ｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと
を含む方法。
（項目１３２）
前記同定されたポリペプチドの中から、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを選択するステップをさらに含む、項目１３１に記載の方法。
（項目１３３）
潜在的な腫瘍抗原を選択する方法であって、
ａ）細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、対象のがんまたは腫瘍細胞において発現される１つまたは複数の突然変異、スプライスバリアント、または転座を含む異種ポリペプチドを含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示されるポリペプチドによるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドによって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドに対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを同定し、刺激、阻害および／または抑制する１つまたは複数のポリペプチドを腫瘍抗原として同定するステップと、
ｆ）前記同定されたポリペプチドの中から、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを選択するステップ
を含む方法。
（項目１３４）
ＡＰＣへの曝露の１つまたは複数の前のラウンドを受けた、前記対象由来のリンパ球を用いて、ステップｂ）からｅ）まで、またはステップｃ）からｅ）を繰り返すステップをさらに含む、項目１３３に記載の方法。
（項目１３５）
前記同定された腫瘍抗原の中から、（ｉ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の腫瘍抗原、および／または（ｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップをさらに含む、項目１３３または１３４に記載の方法。
（項目１３６）
前記対象に、前記選択された腫瘍抗原または選択されたポリペプチドまたはその免疫原性断片の１つまたは複数を含む免疫原性組成物を投与するステップをさらに含む、項目１３３から１３５までのいずれかに記載の方法。
（項目１３７）
前記対象に前記選択された腫瘍抗原および選択されたポリペプチドまたはその免疫原性断片の１つまたは複数の組合せを含む免疫原性組成物を投与するステップをさらに含む、項目１３３から１３５までのいずれかに記載の方法。
（項目１３８）
前記対象に、がん治療または治療の組合せを施行するステップをさらに含む、項目１３６または１３７に記載の方法。
（項目１３９）
腫瘍抗原を選択する方法であって、
ａ）細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、対象のがんまたは腫瘍細胞において発現されるがんまたは腫瘍細胞において発現される１つまたは複数の突然変異、スプライスバリアント、または転座を含む異なる異種ポリペプチドを含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示されるポリペプチドによるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドによって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドに対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを同定し、刺激、阻害および／または抑制する１つまたは複数のポリペプチドを腫瘍抗原として同定するステップと、
ｆ）前記同定された腫瘍抗原の中から、（ｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の腫瘍抗原、および／または（ｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップ
を含む方法。
（項目１４０）
前記対象に、前記選択された腫瘍抗原またはその免疫原性断片の１つまたは複数を含まない免疫原性組成物を投与するステップをさらに含む、項目１３９に記載の方法。
（項目１４１）
前記対象に、がん治療または治療の組合せを施行するステップをさらに含む、項目１４０に記載の方法。
（項目１４２）
前記ＡＰＣが、前記対象から単離されたヒトＡＰＣである、項目１から１４１までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１４３）
前記細菌細胞が、細胞溶解素ポリペプチドをさらに含む、項目１から１４２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１４４）
前記細胞溶解素ポリペプチドが、リステリオリジンＯ（ＬＬＯ）である、項目１４３に記載の方法。
（項目１４５）
前記ＡＰＣがアレイにおいて提供され、前記アレイの各位置にある前記ＡＰＣが、各セットが異なる腫瘍抗原を含む細菌細胞のセットと接触される、項目１から１４４までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１４６）
前記ＡＰＣおよびリンパ球が、末梢血から単離されたものである、項目１から１４５までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１４７）
前記ＡＰＣが、不死化細胞を含む、項目１から１４５までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１４８）
前記リンパ球が、がんまたは腫瘍に由来するものである、項目１から１４７までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１４９）
前記腫瘍抗原が、がんまたは腫瘍に存在する突然変異、スプライスバリアント、または転座をコードする全長ポリペプチドを含む、項目１から１４８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１５０）
前記腫瘍抗原が、がんまたは腫瘍に存在する突然変異、スプライスバリアント、または転座をコードする全長ポリペプチドの断片であるポリペプチドを含む、項目１から１４８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１５１）
前記腫瘍抗原が、がんまたは腫瘍に存在するウイルスまたは他の感染因子によってコードされる全長ポリペプチドを含む、項目１から１４８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１５２）
前記腫瘍抗原が、がんまたは腫瘍に存在するウイルスまたは他の感染因子によってコードされる全長ポリペプチドの断片であるポリペプチドを含む、項目１から１４８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１５３）
前記腫瘍抗原が、がんまたは腫瘍に関連する自己抗原をコードする全長ポリペプチドを含む、項目１から１４８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１５４）
前記腫瘍抗原が、がんまたは腫瘍に関連する自己抗原をコードする全長ポリペプチドの断片であるポリペプチドを含む、項目１から１４８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１５５）
対象における免疫応答を誘導する方法であって、
ａ）細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、対象のがんまたは腫瘍細胞において発現される１つまたは複数の突然変異、スプライスバリアント、または転座を含む異なる異種ポリペプチドを含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示されるポリペプチドによるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドによって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドに対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを同定し、刺激、阻害および／または抑制するポリペプチドを腫瘍抗原として同定するステップと、
ｆ）前記同定された腫瘍抗原の中から、（ｉ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の腫瘍抗原、および／または（ｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと、
ｇ）前記対象に、前記選択された抗原またはその免疫原性断片の１つまたは複数を含む免疫原性組成物を投与するステップと
を含む方法。
（項目１５６）
対象における免疫応答を誘導する方法であって、
ａ）細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、対象のがんまたは腫瘍細胞において発現される１つまたは複数の突然変異、スプライスバリアント、または転座を含む異なる異種ポリペプチドを含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示されるポリペプチドによるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドによって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドに対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを同定するステップであって、刺激、阻害および／または抑制により、前記ポリペプチドが腫瘍抗原であることが示される、ステップと、
ｆ）前記同定されたポリペプチドの中から、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを選択するステップと、
ｇ）前記対象に、前記選択されたポリペプチドまたはその免疫原性断片の１つまたは複数を含む免疫原性組成物を投与するステップと
を含む方法。
（項目１５７）
対象における免疫応答を誘導する方法であって、
ａ）細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、対象のがんまたは腫瘍細胞において発現される１つまたは複数の突然変異、スプライスバリアント、または転座を含む異なる異種ポリペプチドを含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示されるポリペプチドによるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドによって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドに対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを同定するステップであって、刺激、阻害および／または抑制により、前記ポリペプチドが腫瘍抗原であることが示される、ステップと、
ｆ）前記同定された腫瘍抗原およびポリペプチドから、（ｉ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチド、（ｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の腫瘍抗原、および／または（ｉｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと、
ｇ）前記対象に、前記選択された腫瘍抗原およびポリペプチドまたはその免疫原性断片の１つまたは複数を含む免疫原性組成物を投与するステップと
を含む方法。
（項目１５８）
対象における免疫応答を誘導する方法であって、
ａ）細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、対象のがんまたは腫瘍細胞において発現される１つまたは複数の突然変異、スプライスバリアント、または転座を含む異なる異種ポリペプチドを含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを前記対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示されるポリペプチドによるリンパ球の活性化に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドによって活性化されるのか、または１つまたは複数のＡＰＣによって提示される１つまたは複数のポリペプチドに対して応答性ではないのかを、例えば、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベル（例えば、対照と比べたレベルの上昇または低下）を評価する（例えば、検出または測定する）ことによって決定するステップと、
ｅ）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数のポリペプチドを同定し、刺激、阻害および／または抑制するポリペプチドを腫瘍抗原として同定するステップと、
ｆ）前記同定された腫瘍抗原の中から、（ｉ）がんに対する少なくとも１つの有害な応答および／または有益でない応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の腫瘍抗原、および／または（ｉｉ）がんに対する少なくとも１つの有益な応答に関連する１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の腫瘍抗原を選択するステップと、
ｇ）前記対象に、前記選択された抗原またはその免疫原性断片の１つまたは複数を含まない免疫原性組成物を投与するステップと
を含む方法。
（項目１５９）
前記対象に、がん治療または治療の組合せを施行するステップをさらに含む、項目１５６から１５８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１６０）
前記複数の腫瘍抗原が、少なくとも１種、３種、５種、１０種、１５種、２０種、２５種、３０種、５０種、１００種、１５０種、２５０種、５００種、７５０種、１０００種またはそれよりも多くの異なる腫瘍抗原、またはその一部分を含む、項目１から１５９までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１６１）
１つまたは複数のリンパ球が、１つまたは複数の腫瘍抗原によって活性化されるのか、または１つまたは複数の腫瘍抗原に対して応答性ではないのかを決定するステップが、１つまたは複数の免疫メディエーターのレベルを測定することを含む、項目１から１６０までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１６２）
前記１つまたは複数の免疫メディエーターが、前記リンパ球によって発現されるサイトカイン、可溶性メディエーター、および細胞表面マーカーからなる群から選択される、項目１から１６１までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１６３）
前記１つまたは複数の免疫メディエーターが、サイトカインである、項目１から１６２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１６４）
前記１つまたは複数のサイトカインが、ＴＲＡＩＬ、ＩＦＮ−ガンマ、ＩＬ−１２ｐ７０、ＩＬ−２、ＴＮＦ−アルファ、ＭＩＰ１−アルファ、ＭＩＰ１−ベータ、ＣＸＣＬ９、ＣＸＣＬ１０、ＭＣＰ１、ＲＡＮＴＥＳ、ＩＬ−１ベータ、ＩＬ−４、ＩＬ−６、ＩＬ−８、ＩＬ−９、ＩＬ−１０、ＩＬ−１３、ＩＬ−１５、ＣＸＣＬ１１、ＩＬ−３、ＩＬ−５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、ＩＬ−２３Ａ、ＩＬ−２４、ＩＬ−２７、ＩＬ−３１、ＩＬ−３２、ＴＧＦ−ベータ、ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦ、ＴＲＡＮＣＥ（ＲＡＮＫ  Ｌとしても公知）、ＭＩＰ３−アルファ、およびフラクタルカインからなる群から選択される、項目１６３に記載の方法。
（項目１６５）
前記１つまたは複数の免疫メディエーターが、可溶性メディエーターである、項目１から１６４までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１６６）
前記１つまたは複数の可溶性メディエーターが、グランザイムＡ、グランザイムＢ、ｓＦａｓ、ｓＦａｓＬ、パーフォリン、およびグラニュライシンからなる群から選択される、項目１６５に記載の方法。
（項目１６７）
前記１つまたは複数の免疫メディエーターが、細胞表面マーカーである、項目１から１６４までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１６８）
前記１つまたは複数の細胞表面マーカーが、ＣＤ１０７ａ、ＣＤ１０７ｂ、ＣＤ２５、ＣＤ６９、ＣＤ４５ＲＡ、ＣＤ４５ＲＯ、ＣＤ１３７（４−１ＢＢ）、ＣＤ４４、ＣＤ６２Ｌ、ＣＤ２７、ＣＣＲ７、ＣＤ１５４（ＣＤ４０Ｌ）、ＫＬＲＧ−１、ＣＤ７１、ＨＬＡ−ＤＲ、ＣＤ１２２（ＩＬ−２ＲＢ）、ＣＤ２８、ＩＬ７Ｒａ（ＣＤ１２７）、ＣＤ３８、ＣＤ２６、ＣＤ１３４（ＯＸ−４０）、ＣＴＬＡ−４（ＣＤ１５２）、ＬＡＧ−３、ＴＩＭ−３（ＣＤ３６６）、ＣＤ３９、ＰＤ１（ＣＤ２７９）、ＦｏｘＰ３、ＴＩＧＩＴ、ＣＤ１６０、ＢＴＬＡ、２Ｂ４（ＣＤ２４４）、およびＫＬＲＧ１からなる群から選択される、項目１６７に記載の方法。
（項目１６９）
前記リンパ球が、ＣＤ４＋Ｔ細胞を含む、項目１から１６８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１７０）
前記リンパ球が、ＣＤ８＋Ｔ細胞を含む、項目１から１６８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１７１）
前記リンパ球が、ＮＫＴ細胞、ガンマ−デルタＴ細胞、またはＮＫ細胞を含む、項目１から１６８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１７２）
前記リンパ球が、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＮＫＴ細胞、ガンマ−デルタＴ細胞、およびＮＫ細胞の任意の組合せを含む、項目１から１６８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１７３）
リンパ球活性化が、対照レベルよりも少なくとも２０％、４０％、６０％、８０％、１００％、１２０％、１４０％、１６０％、１８０％、または２００％高いまたは低い、１つまたは複数の発現または分泌された免疫メディエーターのレベルを評価することにより決定される、項目１から１７２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１７４）
リンパ球活性化が、対照レベルの平均よりも少なくとも１、２、または３標準偏差高いまたは低い、１つまたは複数の発現または分泌された免疫メディエーターのレベルを評価することにより決定される、項目１から１７２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１７５）
リンパ球活性化が、対照に対する応答レベル中央値よりも少なくとも１、２、３、４または５中央絶対偏差（ＭＡＤ）高いまたは低い、１つまたは複数の発現または分泌された免疫メディエーターのレベルを評価することにより決定される、項目１から１７２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１７６）
リンパ球非応答性が、１つまたは複数の発現または分泌された免疫メディエーターのレベルが対照レベルの５％以内、１０％、１５％、または２０％であることを評価することにより決定される、項目１から１７２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１７７）
リンパ球非応答性が、対照レベルの平均よりも１標準偏差未満または２標準偏差未満高いまたは低い、１つまたは複数の発現または分泌された免疫メディエーターのレベルを評価することにより決定される、項目１から１７２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１７８）
リンパ球非応答性が、対照に対する応答レベル中央値よりも１中央絶対偏差（ＭＡＤ）未満または２中央絶対偏差（ＭＡＤ）よりも高いまたはそれよりも低い、１つまたは複数の発現または分泌された免疫メディエーターのレベルを評価することにより決定される、項目１から１７２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１７９）
前記対象応答プロファイルが、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の異なる腫瘍抗原を含む、項目１から１７８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１８０）
前記対象応答プロファイルが、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の異なる腫瘍抗原を含む、項目１から１７８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１８１）
前記対象応答プロファイルが、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の異なる腫瘍抗原を含む、項目１から１７８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１８２）
前記対象応答プロファイルが、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の異なる腫瘍抗原の組合せを含む、項目１から１７８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１８３）
前記標的応答プロファイルが、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる１つまたは複数の異なる腫瘍抗原を含む、項目１から１８２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１８４）
前記標的応答プロファイルが、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する１つまたは複数の異なる腫瘍抗原を含む、項目１から１８２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１８５）
前記標的応答プロファイルが、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の異なる腫瘍抗原を含む、項目１から１８２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１８６）
前記標的応答プロファイルが、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である１つまたは複数の異なる腫瘍抗原の組合せを含む、項目１から１８２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１８７）
前記標的応答プロファイルが、前記がん治療に臨床的に応答する対象の集団由来の、または前記がん治療に臨床的に応答することができない対象由来の、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを上昇させる異なる腫瘍抗原の平均数を含む、項目１から１８２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１８８）
前記標的応答プロファイルが、前記がん治療に臨床的に応答する対象の集団由来の、または前記がん治療に臨床的に応答することができない対象由来の１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルを阻害および／または抑制する異なる腫瘍抗原の平均数を含む、項目１から１８２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１８９）
前記標的応答プロファイルが、前記がん治療に臨床的に応答する対象の集団由来の、または前記がん治療に臨床的に応答することができない対象由来の、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である異なる腫瘍抗原の平均数を含む、項目１から１８２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１９０）
前記標的応答プロファイルが、前記がん治療に臨床的に応答する対象の集団由来の、または前記がん治療に臨床的に応答することができない対象の集団由来の、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小である異なる腫瘍抗原の組合せを含む、項目１から１８２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１９１）
前記対象応答プロファイルの腫瘍抗原の数が、前記標的応答プロファイルの抗原の数と１以下、２以下、３以下、４以下、５以下、または１０以下異なる場合、前記対象応答プロファイルが前記標的応答プロファイルと類似している、項目１から１９０までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１９２）
前記対象応答プロファイルが、活性化リンパ球および／または非応答性リンパ球によって発現および／または分泌される複数のサイトカインのそれぞれに対する異なる腫瘍抗原の数を含む、項目１から１９１までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１９３）
前記標的応答プロファイルが、対応する複数のサイトカインのそれぞれに対する抗原の数を含む、項目１９２に記載の方法。
（項目１９４）
前記標的応答プロファイルが、前記がん治療に臨床的に応答する対象の集団由来の活性化リンパ球および／または非応答性リンパ球によって発現および／または分泌される、対応する複数のサイトカインのそれぞれに対する抗原の平均数を含む、項目１９２に記載の方法。
（項目１９５）
前記標的応答プロファイルが、前記がん治療に臨床的に応答することができない対象の集団由来の活性化リンパ球および／または非応答性リンパ球によって発現および／または分泌される、対応する複数のサイトカインのそれぞれに対する抗原の平均数を含む、項目１９２に記載の方法。
（項目１９６）
前記標的応答プロファイルが、前記がん治療に臨床的に応答する対象の集団由来の、または前記がん治療に臨床的に応答することができない対象の集団由来の活性化リンパ球および／または非応答性リンパ球によって発現および／または分泌される、対応する複数のサイトカインのそれぞれに対する抗原の組合せを含む、項目１９２に記載の方法。
（項目１９７）
前記対象応答プロファイルの複数のサイトカインのうちの少なくとも２つに対する腫瘍抗原の数が、前記標的応答プロファイルの対応する複数のサイトカインに対する抗原の数と１以下、２以下、３以下、４以下、５以下、または１０以下異なるである場合、前記対象応答プロファイルが前記標的応答プロファイルと類似している、項目１から１９０までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１９８）
対象が、前記がん治療に対する臨床的応答性の尺度または指標の少なくとも１つを示す、項目１から１９７までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１９９）
対象が、前記がん治療に対する臨床的応答不全の尺度または指標の少なくとも１つを示す、項目１から１９７までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２００）
前記がん治療が、免疫チェックポイント遮断治療を含む、項目１から１９９までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２０１）
前記免疫チェックポイント遮断治療が、ペムブロリズマブ、ニボルマブ、イピリムマブ、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、トレメリムマブ、またはセミプリマブの投与を含む、項目２００に記載の方法。
（項目２０２）
前記免疫チェックポイント遮断治療が、２つまたはそれよりも多くの免疫チェックポイント阻害剤の投与を含む、項目２００または２０１に記載の方法。
（項目２０３）
前記がん治療が、免疫抑制遮断治療を含む、項目１から２０２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２０４）
前記免疫抑制遮断治療が、Ｖｉｓｔａ（Ｂ７−Ｈ５、Ｔ細胞活性化のｖ−ドメインＩｇサプレッサー）阻害剤、Ｌａｇ−３（リンパ球活性化遺伝子３、ＣＤ２２３）阻害剤、ＩＤＯ（インドールアミン−ピロール−２，３−ジオキシゲナーゼ−１，２）阻害剤、またはＫＩＲ受容体ファミリー（キラー細胞免疫グロブリン様受容体）阻害剤、ＣＤ４７阻害剤、またはＴｉｇｉｔ（ＩｇおよびＩＴＩＭドメインを有するＴ細胞免疫受容体）阻害剤の投与を含む、項目２０３に記載の方法。
（項目２０５）
前記免疫抑制遮断治療が、２つまたはそれよりも多くの免疫抑制阻害剤の投与を含む、項目２０３または２０４に記載の方法。
（項目２０６）
前記がん治療が、免疫活性化治療を含む、項目１から２０５までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２０７）
前記免疫活性化治療が、ＣＤ４０アゴニスト、ＧＩＴＲ（グルココルチコイド誘導性ＴＮＦ−Ｒ関連タンパク質、ＣＤ３５７）アゴニスト、ＯＸ４０（ＣＤ１３４）アゴニスト、４−１ＢＢ（ＣＤ１３７）アゴニスト、ＩＣＯＳ（誘導性Ｔ細胞刺激物質、ＣＤ２７８）アゴニスト、ＩＬ−２（インターロイキン２）アゴニスト、またはインターフェロンアゴニストの投与を含む、項目２０６に記載の方法。
（項目２０８）
免疫活性化が、２つまたはそれよりも多くの免疫活性化因子の投与を含む、項目２０６または２０７に記載の方法。
（項目２０９）
前記がん治療が、アジュバント治療を含む、項目１から２０８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２１０）
前記アジュバント治療が、ＴＬＲアゴニスト（例えば、ＣｐＧまたはポリＩ：Ｃ）、ＳＴＩＮＧアゴニスト、自然免疫の非特異的刺激、樹状細胞、ＧＭ−ＣＳＦ、ＩＬ−１２、ＩＬ−７、Ｆｌｔ−３、または他のサイトカインの投与を含む、項目２０９に記載の方法。
（項目２１１）
前記がん治療が、腫瘍溶解性ウイルス治療を含む、項目１から２１０までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２１２）
前記腫瘍溶解性ウイルス治療が、タリモジーン・ラハーパレプベックの投与を含む、項目２１１に記載の方法。
（項目２１３）
前記がん治療が、１つまたは複数の化学療法剤の投与を含む、項目１から２１２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２１４）
前記がん治療が、放射線照射を含む、項目１から２１３までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２１５）
前記がん治療が、外科的切除を含む、項目１から２１４までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２１６）
前記がん治療が、細胞に基づく治療を含む、項目１から２１５までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２１７）
前記細胞に基づく治療が、樹状細胞、キメラ抗原受容体Ｔ（ＣＡＲ−Ｔ）細胞、Ｔ細胞受容体形質導入細胞、腫瘍浸潤性リンパ球（ＴＩＬ）、またはナチュラルキラー（ＮＫ）細胞の投与を含む、項目２１６に記載の方法。
（項目２１８）
前記がん治療が、局所温熱療法または低温療法を含む、項目１から２１７までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２１９）
前記がん治療が、１つまたは複数の抗腫瘍抗体の投与を含む、項目１から２１８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２２０）
前記抗腫瘍抗体が、二重特異性抗体を含む、項目２１９に記載の方法。
（項目２２１）
前記がん治療が、１つまたは複数の抗血管新生剤の投与を含む、項目１から２２０までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２２２）
前記がん治療が、免疫チェックポイント遮断による治療、免疫抑制遮断による治療、免疫活性化による治療、アジュバント治療、腫瘍溶解性ウイルスによる治療、化学療法薬による治療、放射線照射による治療、外科的治療、細胞に基づく治療、温熱療法による治療、低温療法による治療、抗腫瘍抗体による治療、および抗血管新生治療の任意の組合せを含む、項目１から２２１までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２２３）
１つまたは複数の選択された抗原を用いて対象における免疫応答を誘導する方法であって、
ａ）複数の腫瘍抗原を含む細菌細胞またはビーズを含むライブラリーを得る、提供する、または生成するステップであって、前記ライブラリーの各細菌細胞またはビーズが、異なる腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｂ）前記細菌細胞またはビーズを第１の対象由来の抗原提示細胞（ＡＰＣ）と接触させるステップであって、前記ＡＰＣが、前記細菌細胞またはビーズを内部に取り込む、ステップと、
ｃ）前記ＡＰＣを、前記第１の対象由来のリンパ球と、１つまたは複数のＡＰＣによって提示される腫瘍抗原によるリンパ球の刺激または阻害および／もしくは抑制に適した条件下で接触させるステップと、
ｄ）リンパ球を刺激する１つまたは複数の刺激性腫瘍抗原を同定し、リンパ球を刺激しない１つまたは複数の非刺激性腫瘍抗原を同定して、対象応答プロファイルを生成するステップと、
ｅ）前記対象応答プロファイルを標的応答プロファイルと比較するステップであって、前記標的応答プロファイルが、がん治療に臨床的に応答する第２の対象由来のものであり、前記標的応答プロファイルが、リンパ球を刺激する１つまたは複数の同定された刺激性腫瘍抗原を含み、かつ、リンパ球を刺激しない１つまたは複数の同定された非刺激性腫瘍抗原を含む、ステップと、
ｆ）１つまたは複数の抗原を選択するステップであって、前記１つまたは複数の抗原が前記対象応答プロファイルにおいて非刺激性であると同定され、同じ１つまたは複数の抗原が前記標的応答プロファイルにおいて刺激性であると同定される、ステップと、
ｇ）前記第１の対象に、前記選択された抗原の１つまたは複数を含む免疫原性組成物を投与するステップと
を含む方法。
（項目２２４）
がん治療を前記対象に施行するステップをさらに含む、項目２２３に記載の方法。
（項目２２５）
前記対象応答プロファイルが、前記複数の腫瘍抗原に関連する前記１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルの表示を含む、項目２２３または２２４に記載の方法。
（項目２２６）
項目１から２２５までのいずれか一項に従って得られたまたは作成された標的応答プロファイルの１つまたは複数の抗原を含む本発明の免疫原性組成物。
（項目２２７）
項目１から２２５までのいずれか一項に従って選択された１つまたは複数の抗原を含む本発明の免疫原性組成物。
（項目２２８）
（ｉ）１つまたは複数のヘパラナーゼポリペプチドまたはその免疫原性断片および（ｉｉ）ＳＭＡＤ４ポリペプチドまたはその免疫原性断片を含む免疫原性組成物。
（項目２２９）
前記１つまたは複数のヘパラナーゼポリペプチドまたは断片および前記ＳＭＡＤ４ポリペプチドまたは断片が、それぞれ８〜２９アミノ酸の長さである、項目２２８に記載の免疫原性組成物。
（項目２３０）
前記ヘパラナーゼポリペプチドが、配列番号６または配列番号７のアミノ酸配列を含む、項目２２９または２２９に記載の免疫原性組成物。
（項目２３１）
前記ＳＭＡＤ４ポリペプチドが、配列番号８のアミノ酸配列を含む、項目２２８から２３０までのいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
（項目２３２）
配列番号６、配列番号７、または配列番号８のアミノ酸の総数の約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％からなる１つまたは複数の免疫原性断片を含む、項目２２８から２３１までのいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
（項目２３３）
約１アミノ酸、約２アミノ酸、約３アミノ酸、約４アミノ酸、約５アミノ酸、約１０アミノ酸、約１５アミノ酸、約２０アミノ酸、約２５アミノ酸、約３０アミノ酸、約３５アミノ酸、約４０アミノ酸、約４５アミノ酸、約５０アミノ酸、またはそれよりも多くのアミノ酸を欠く配列番号６、配列番号７、または配列番号８からなる１つまたは複数の免疫原性断片を含む、項目２２８から２３２までのいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
（項目２３４）
前記１つまたは複数のヘパラナーゼポリペプチドが、配列番号６または配列番号７と少なくとも８５％、９０％、９５％、９７％、または９９％同一であるアミノ酸配列を含む、項目２２８から２３３までのいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
（項目２３５）
前記ＳＭＡＤ４ポリペプチドが、配列番号８と少なくとも８５％、９０％、９５％、９７％、または９９％同一であるアミノ酸配列を含む、項目２２８から２３４までのいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
（項目２３６）
ヘパラナーゼアイソフォーム１ポリペプチドまたは免疫原性断片、ヘパラナーゼアイソフォーム２ポリペプチドまたは免疫原性断片、およびＳＭＡＤ４ポリペプチドまたは免疫原性断片を含む免疫原性組成物。
（項目２３７）
前記ヘパラナーゼアイソフォーム１ポリペプチドまたは免疫原性断片、前記ヘパラナーゼアイソフォーム２ポリペプチドまたは免疫原性断片および前記ＳＭＡＤ４ポリペプチドまたは免疫原性断片が、それぞれ８〜２９アミノ酸の長さである、項目２３６に記載の免疫原性組成物。
（項目２３８）
前記ヘパラナーゼアイソフォーム１ポリペプチドが、配列番号１のアミノ酸配列を含み、前記ヘパラナーゼアイソフォーム２ポリペプチドが、配列番号２のアミノ酸配列を含む、項目２３６または２３７に記載の免疫原性組成物。
（項目２３９）
前記ＳＭＡＤ４ポリペプチドが、配列番号３のアミノ酸配列を含む、項目２３６から２３８までのいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
（項目２４０）
配列番号６、配列番号７、または配列番号８のアミノ酸の総数の約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％からなる１つまたは複数の免疫原性断片を含む、項目２３６から２３９までのいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
（項目２４１）
約１アミノ酸、約２アミノ酸、約３アミノ酸、約４アミノ酸、約５アミノ酸、約１０アミノ酸、約１５アミノ酸、約２０アミノ酸、約２５アミノ酸、約３０アミノ酸、約３５アミノ酸、約４０アミノ酸、約４５アミノ酸、約５０アミノ酸、またはそれよりも多くのアミノ酸を欠く配列番号６、配列番号７、または配列番号８からなる１つまたは複数の免疫原性断片を含む、項目２３６から２４０までのいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
（項目２４２）
前記ヘパラナーゼアイソフォーム１ポリペプチドが、配列番号６と少なくとも８５％、９０％、９５％、９７％、または９９％同一であるアミノ酸配列を含み、前記ヘパラナーゼアイソフォーム１ポリペプチドが、配列番号７と少なくとも８５％、９０％、９５％、９７％、または９９％同一であるアミノ酸配列を含む、項目２３６から２４１までのいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
（項目２４３）
前記ＳＭＡＤ４ポリペプチドが、配列番号８と少なくとも８５％、９０％、９５％、９７％、または９９％同一であるアミノ酸配列を含む、項目２３６から２４２までのいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
（項目２４４）
アジュバントをさらに含む、項目２８８から２４２までのいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
（項目２４５）
がんを処置する方法であって、対象に項目２２８から２４４までのいずれか一項に記載の免疫原性組成物を投与するステップを含む方法。
（項目２４６）
前記対象が、がんを有するかもしくはがんのリスクがあり、および／または１つまたは複数のがんの徴候または症状を示し、および／または１つまたは複数のがんの危険因子を示す、項目２４５に記載の方法。
（項目２４７）
前記がんが、結腸直腸がん、黒色腫、または肺がんである、項目２４５または２４６に記載の方法。
（項目２４８）
対象における免疫応答を誘導する方法であって、対象に項目２２８から２４４までのいずれか一項に記載の免疫原性組成物を投与するステップを含む方法。
（項目２４９）
前記免疫応答が、１つまたは複数のリンパ球の活性化を含む、項目２４８に記載の方法。
（項目２５０）
前記１つまたは複数のリンパ球が、ＣＤ４＋Ｔ細胞を含む、項目２４９に記載の方法。
（項目２５１）
前記１つまたは複数のリンパ球が、ＣＤ８＋Ｔ細胞を含む、項目２４９または２５０に記載の方法。
（項目２５２）
前記１つまたは複数のリンパ球が、ＮＫＴ細胞、ガンマ−デルタＴ細胞、またはＮＫ細胞を含む、項目２４９から２５１までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２５３）
前記１つまたは複数のリンパ球が、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＮＫＴ細胞、ガンマ−デルタＴ細胞、およびＮＫ細胞の任意の組合せを含む、項目２４９から２５２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２５４）
前記免疫応答が、対照と比べた１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌の増大を含む、項目２４８に記載の方法。
（項目２５５）
リンパ球シグナル伝達分子が免疫メディエーターの中から選択される、項目２５４に記載の方法。
（項目２５６）
前記１つまたは複数の免疫メディエーターが、サイトカインである、項目２５４または２５５に記載の方法。
（項目２５７）
前記１つまたは複数のサイトカインが、ＴＲＡＩＬ、ＩＦＮ−ガンマ、ＩＬ−１２ｐ７０、ＩＬ−２、ＴＮＦ−アルファ、ＭＩＰ１−アルファ、ＭＩＰ１−ベータ、ＣＸＣＬ９、ＣＸＣＬ１０、ＭＣＰ１、ＲＡＮＴＥＳ、ＩＬ−１ベータ、ＩＬ−４、ＩＬ−６、ＩＬ−８、ＩＬ−９、ＩＬ−１０、ＩＬ−１３、ＩＬ−１５、ＣＸＣＬ１１、ＩＬ−３、ＩＬ−５、ＩＬ−１７、ＩＬ−１８、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、ＩＬ−２３Ａ、ＩＬ−２４、ＩＬ−２７、ＩＬ−３１、ＩＬ−３２、ＴＧＦ−ベータ、ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦ、ＴＲＡＮＣＥ（ＲＡＮＫ  Ｌとしても公知）、ＭＩＰ３−アルファ、ＭＣＰ１、およびフラクタルカインから選択される、項目２５５または２５６に記載の方法。
（項目２５８）
前記１つまたは複数の免疫メディエーターが、可溶性メディエーターである、項目２５４または２５５に記載の方法。
（項目２５９）
前記１つまたは複数の可溶性メディエーターが、グランザイムＡ、グランザイムＢ、ｓＦａｓ、ｓＦａｓＬ、パーフォリン、およびグラニュライシンから選択される、項目２５５または２５８に記載の方法。
（項目２６０）
前記１つまたは複数の免疫メディエーターが、細胞表面マーカーである、項目２５４または２５５に記載の方法。
（項目２６１）
前記１つまたは複数の細胞表面マーカーが、ＣＤ１０７ａ、ＣＤ１０７ｂ、ＣＤ２５、ＣＤ６９、ＣＤ４５ＲＡ、ＣＤ４５ＲＯ、ＣＤ１３７（４−１ＢＢ）、ＣＤ４４、ＣＤ６２Ｌ、ＣＤ２７、ＣＣＲ７、ＣＤ１５４（ＣＤ４０Ｌ）、ＫＬＲＧ−１、ＣＤ７１、ＨＬＡ−ＤＲ、ＣＤ１２２（ＩＬ−２ＲＢ）、ＣＤ２８、ＩＬ７Ｒａ（ＣＤ１２７）、ＣＤ３８、ＣＤ２６、ＣＤ１３４（ＯＸ−４０）、ＣＴＬＡ−４（ＣＤ１５２）、ＬＡＧ−３、ＴＩＭ−３（ＣＤ３６６）、ＣＤ３９、ＰＤ１（ＣＤ２７９）、ＦｏｘＰ３、ＴＩＧＩＴ、ＣＤ１６０、ＢＴＬＡ、２Ｂ４（ＣＤ２４４）、およびＫＬＲＧ１から選択される、項目２５５または２６０に記載の方法。
（項目２６２）
１つまたは複数の発現または分泌された免疫メディエーターのレベルが、対照レベルよりも少なくとも２０％、４０％、６０％、８０％、１００％、１２０％、１４０％、１６０％、１８０％、または２００％高い、項目２４８から２６１までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２６３）
対照レベルの平均よりも少なくとも１、２、または３標準偏差高い、１つまたは複数の発現または分泌された免疫メディエーターのレベルが、リンパ球活性化を示す、項目２４８から２６１までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２６４）
対照に対する応答レベル中央値よりも少なくとも１、２、３、４または５中央絶対偏差（ＭＡＤ）高いまたは低い、１つまたは複数の発現または分泌された免疫メディエーターのレベルが、リンパ球活性化を示す、項目２４８から２６１までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２６５）
前記免疫応答が、体液性応答および／または細胞応答を含む、項目２４８に記載の方法。
（項目２６６）
前記体液性応答が、応答の大きさの増大または抗原特異的免疫グロブリンＧ（ＩｇＧ）レベルおよび／または抗原特異的中和抗体レベルのベースラインからの倍の上昇を含む、項目２５４に記載の方法。
（項目２６７）
前記体液性応答が、ＩｇＧ力価のベースラインから４倍またはそれよりも大きな上昇を含む、項目２６５または２６６に記載の方法。
（項目２６８）
前記体液性応答が、５０％中和抗体力価のベースラインから２倍またはそれよりも大きな上昇を含む、項目２６５から２６７までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２６９）
前記細胞応答が、グランザイムＢ（ＧｒＢ）の分泌を含む、項目２６５から２６８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２７０）
前記細胞応答が、応答の大きさの増大またはグランザイムＢ（ＧｒＢ）レベルのベースラインからの倍の上昇を含む、項目２６５から２６９までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２７１）
前記細胞応答が、Ｔ細胞のＩＦＮ−ガンマ分泌の増大を含む、項目２６５から２７０までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２７２）
前記対象が、がんを有するかもしくはがんのリスクがあり、および／または１つまたは複数のがんの徴候または症状を示し、および／または１つまたは複数のがんの危険因子を示す、項目２４８から２７１までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２７３）
前記がんが、結腸直腸がん、黒色腫、または肺がんである、項目２７２に記載の方法。
（項目２７４）
免疫原性組成物を製造するための方法であって、項目１から２５５までに記載の方法によって同定された１つまたは複数の抗原と担体を組み合わせるステップを含む方法。
（項目２７５）
前記抗原が、適切な宿主細胞において組換えＤＮＡ技術を使用して産生される、項目２７４に記載の方法。
（項目２７６）
前記免疫原性組成物を医薬組成物として製剤化するステップを含む、項目２７４または２７５に記載の方法。
（項目２７７）
それを必要とする対象に投与するための免疫原性組成物を製造するための方法であって、
ａ．複数の抗原を含む複数の抗原性組成物を提供する、調製する、または得るステップであって、各組成物が、異なる抗原を含む、ステップと、
ｂ．標的応答プロファイルを提供する、調製する、または得るステップであって、前記標的応答プロファイルが、前記複数の抗原に関連する（例えば、それと共に決定、測定、観察される）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルの表示を含む、ステップと、
ｃ．対象応答プロファイルを提供する、調製する、または得るステップであって、前記対象応答プロファイルが、前記複数の抗原に関連する（例えば、それと共に決定、測定、観察される）１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルの表示を含む、ステップと、
ｄ．前記標的応答プロファイルと前記対象応答プロファイルを比較するステップと、
ｅ．前記比較に基づいて１つまたは複数の抗原を選択するステップと、
ｆ．前記１つまたは複数の選択された抗原を含む１つまたは複数の抗原性組成物の少なくとも一部分を医薬組成物として製剤化するステップと
を含む方法。
（項目２７８）
前記選択するステップが、がんに対する有益な応答に関連する免疫メディエーターの発現または分泌を増大させる１つまたは複数の抗原、ならびに／または、がんに対する有害な応答または有益でない応答に関連する免疫メディエーターの発現または分泌を阻害および／または抑制する１つまたは複数の抗原を選択することを含む、項目２７７に記載の方法。
（項目２７９）
前記複数の抗原性組成物が、溶液であるか、凍結乾燥されたものであるか、または合成マトリックス上にある、項目２７７または２７８に記載の方法。
（項目２８０）
それを必要とする対象に投与するための免疫原性組成物を製造する方法であって、
項目１から２２５までのいずれか一項に記載の方法によって同定された１つまたは複数の抗原またはその断片を調製するステップと、
１つまたは複数の抗原またはその断片を組み合わせるステップであって、前記１つまたは複数の抗原またはその断片が、前記対象の応答プロファイルに従って選択される、ステップと、
前記免疫原性組成物を医薬組成物として製剤化するステップと
を含む方法。
（項目２８１）
それを必要とする対象に投与するための免疫原性組成物を製造する方法であって、
項目１から２２５までのいずれか一項に記載の方法によって同定された１つまたは複数の抗原またはその断片を調製するステップと、
１つまたは複数の抗原またはその断片を組み合わせるステップであって、前記１つまたは複数の抗原またはその断片は、前記１つまたは複数の抗原が前記対象のリンパ球により、１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌を、刺激、阻害および／もしくは抑制する、ならびに／または１つまたは複数の免疫メディエーターの発現および／または分泌のレベルに対する影響が最小であることが示されているか否かに従って選択される、ステップと、
前記免疫原性組成物を医薬組成物として製剤化するステップと
を含む方法。
（項目２８２）
それを必要とする対象に投与するための免疫原性組成物を製造する方法であって、
項目１から２２５までのいずれか一項に記載の方法によって同定された１つまたは複数の抗原またはその断片を調製するステップと、
１つまたは複数の抗原またはその断片を組み合わせるステップであって、前記１つまたは複数の抗原またはその断片が、前記対象の応答プロファイルに従って選択される、ステップと、
前記免疫原性組成物を医薬組成物として製剤化するステップと
を含む方法。