【手続補正書】
【提出日】令和3年3月18日(2021.3.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
試料中のＨＰＩＶ−３を検出する方法であって、
前記試料を少なくとも第１および第２の増幅オリゴマーと接触させ、それにより組成物を形成することと、
ＨＰＩＶ−３核酸の存在下で、ＨＰＩＶ−３アンプリコンを生成する核酸増幅反応を前記組成物中で行うことと、
少なくとも１つの前記アンプリコンの有無を検出することと、を含み、
（ａ）前記第１の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３の１２７０位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第２の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３の１３５５位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第１および第２の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３アンプリコンを生成するように構成される、または
（ｂ）前記第１の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３の１３５５位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第２の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３の１４３７位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第１および第２の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３アンプリコンを生成するように構成される、方法。
【請求項２】
前記アンプリコンが、ＨＰＩＶ−３の１３０５位、ＨＰＩＶ−３の１３５５位、ＨＰＩＶ−３の１３８０位のうちの１つ以上を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記第１のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号２５の配列を含む、請求項１〜２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４】
前記第１のオリゴマーが、配列番号２５の配列を含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
前記第２のオリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号３６からなる配列を有するオリゴマーと競合する、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
前記第２のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３６の配列を含む、請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
前記第２のオリゴマーが、配列番号３６の配列を含む、請求項１〜６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記第１のオリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号２８からなる配列を有するオリゴマーと競合する、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記第１のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号２８の配列を含む、請求項１または８に記載の方法。
【請求項１０】
前記第１のオリゴマーが、配列番号２８の配列を含む、請求項１、８、または９に記載の方法。
【請求項１１】
前記第２のオリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号３７からなる配列を有するオリゴマーと競合する、請求項１または８〜１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記第２のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３７の配列を含む、請求項１または８〜１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記第２のオリゴマーが、配列番号３７の配列を含む、請求項１または８〜１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
前記第１のオリゴマーが、少なくとも１つの５−メチルシトシン残基を含む、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
前記第１のオリゴマー中のＣ残基のうちの少なくとも約半分が、５−メチル化されている、請求項１〜１４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
前記第１のオリゴマー中のＣ残基の実質的に全てが、５−メチル化されている、請求項１〜１５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７】
前記第２のオリゴマーが、少なくとも１つの５−メチルシトシンを含む、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
前記第２のオリゴマー中のＣ残基のうちの少なくとも約半分が、５−メチル化されている、請求項１〜１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
前記第２のオリゴマー中のＣ残基の実質的に全てが、５−メチル化されている、請求項１〜１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０】
前記アンプリコンの有無が、前記アンプリコンへの第３のオリゴマーのハイブリダイゼーションの発生または不発生によって検出される、請求項１に記載の方法。
【請求項２１】
前記ＨＰＩＶ−３核酸が、前記ＨＰＩＶ−３アンプリコンの生成をモニタリングすることによって定量化される、請求項１〜２０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２】
前記第３のオリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号３１、３２、３３、３４、または３５からなる配列を有するオリゴマーと競合する、請求項２０〜２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３】
前記第３のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３１の配列、または最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３２の配列、または最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３３の配列、または最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３４の配列、または最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３５の配列を含む、請求項２０〜２２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４】
前記第３のオリゴマーが、配列番号３１、配列番号３２、配列番号３３、配列番号３４、または配列番号３５の配列を含む、請求項２０〜２２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５】
前記第３のオリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号２６、２７、２８、２９、または３０からなる配列を有するオリゴマーと競合する、請求項２０〜２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６】
前記第３のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号２６の配列、または最大２つまでのミスマッチを有する配列番号２７の配列、または最大２つまでのミスマッチを有する配列番号２８の配列、または最大２つまでのミスマッチを有する配列番号２９の配列を含む、請求項２０〜２１または２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
前記第３のオリゴマーが、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、または配列番号２９の配列を含む、請求項２０〜２１または２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】
前記第３のオリゴマーが、少なくとも１つの５−メチルシトシンを含む、請求項２０〜２７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
前記第３のオリゴマー中のＣ残基のうちの少なくとも約半分が、５−メチル化されている、請求項２０〜２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
前記第３のオリゴマー中のＣ残基の実質的に全てが、５−メチル化されている、請求項２０〜２９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１】
前記組成物が、前記第３のオリゴマーとは異なる第４のオリゴマーをさらに含み、前記第４のオリゴマーが、前記アンプリコンにハイブリダイズするように構成され、検出可能な標識を含む、請求項２０〜３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２】
前記第４のオリゴマーが、配列番号３１、３２、３３、３４、または３５の配列を含む、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記第４のオリゴマーが、配列番号２６、２７、２８、２９、または３０の配列を含む、請求項３１に記載の方法。
【請求項３４】
前記第４のオリゴマーが、少なくとも１つの５−メチルシトシンを含む、請求項３１〜３３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５】
前記第４のオリゴマー中のＣ残基のうちの少なくとも約半分が、５−メチル化されている、請求項３１〜３４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６】
前記第４のオリゴマー中のＣ残基の実質的に全てが、５−メチル化されている、請求項３１〜３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７】
第１のヒトパラインフルエンザウイルス１（ＨＰＩＶ−１）増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーをさらに含み、
前記第１のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−１の３３０〜４９０位または９６０〜１１００位内に位置する少なくとも１つのＨＰＩＶ−１の位置を含む少なくとも約５０ヌクレオチド長のＨＰＩＶ−１アンプリコンを増幅するように構成される、請求項１〜３６のいずれか一項に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６９】
試料中のＨＰＩＶ−１核酸、ＨＰＩＶ−２核酸、ＨＰＩＶ−３核酸、および／またはＨＰＩＶ−４核酸を検出または定量化するための本明細書に開示された組成物またはキットの使用もまた本明細書に開示される。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
少なくとも第１および第２の増幅オリゴマーを含む組成物またはキットであって、
前記第１の増幅オリゴマーおよび第２の増幅オリゴマーが、１２９５〜１３０５位、１３５０〜１３６０位、および／または１３８０〜１３９０位の範囲に位置する少なくとも１つのヒトパラインフルエンザウイルス３（ＨＰＩＶ−３）位置を含む少なくとも約５０ヌクレオチド長のＨＰＩＶ−３アンプリコンを増幅するように構成される、組成物またはキット。
（項目２）
少なくとも第１および第２の増幅オリゴマーを含む組成物またはキットであって、
（ａ）前記第１の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３の１２７０位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第２の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３の１３５５位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第１および第２の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３アンプリコンを生成するように構成される、または
（ｂ）前記第１の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３の１３５５位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第２の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３の１４３７位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第１および第２の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３アンプリコンを生成するように構成される、組成物またはキット。
（項目３）
試料中のＨＰＩＶ−３を検出する方法であって、
前記試料を少なくとも第１および第２の増幅オリゴマーと接触させ、それにより組成物を形成することと、
ＨＰＩＶ−３核酸の存在下で、少なくとも約５０ヌクレオチド長のＨＰＩＶ−３アンプリコンを生成する核酸増幅反応を前記組成物中で行うことと、
少なくとも１つの前記アンプリコンの有無を検出することと、を含み、
前記第１の増幅オリゴマーおよび前記第２の増幅オリゴマーが、１２９５〜１３０５位、１３５０〜１３６０位、および／または１３８０〜１３９０位内に位置する少なくとも１つのヒトパラインフルエンザウイルス３（ＨＰＩＶ−３）位置を含むＨＰＩＶ−３アンプリコンを増幅するように構成される、方法。
（項目４）
試料中のＨＰＩＶ−３を検出する方法であって、
前記試料を少なくとも第１および第２の増幅オリゴマーと接触させ、それにより組成物を形成することと、
ＨＰＩＶ−３核酸の存在下で、ＨＰＩＶ−３アンプリコンを生成する核酸増幅反応を前記組成物中で行うことと、
少なくとも１つの前記アンプリコンの有無を検出することと、を含み、
（ａ）前記第１の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３の１２７０位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第２の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３の１３５５位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第１および第２の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３アンプリコンを生成するように構成される、または
（ｂ）前記第１の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３の１３５５位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第２の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３の１４３７位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第１および第２の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−３アンプリコンを生成するように構成される、方法。
（項目５）
前記アンプリコンが、ＨＰＩＶ−３の１３０５位を含む、項目１〜４のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６）
前記アンプリコンが、ＨＰＩＶ−３の１３５５位を含む、項目１〜５のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目７）
前記アンプリコンが、ＨＰＩＶ−３の１３８０位を含む、項目１〜６のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目８）
前記第１のオリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号２５からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目１〜７のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目９）
前記第１のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号２５の配列を含む、項目１〜８のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０）
前記第１のオリゴマーが、配列番号２５の配列を含む、項目１〜９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１）
前記第２のオリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号３６からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目１〜６または８〜１０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１２）
前記第２のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３６の配列を含む、項目１〜６または８〜１１のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１３）
前記第２のオリゴマーが、配列番号３６の配列を含む、項目１〜６または８〜１２のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１４）
前記第１のオリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号２８からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目１〜４、６〜７、または１１〜１３のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１５）
前記第１のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号２８の配列を含む、項目１〜４、６〜７、または１１〜１４のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１６）
前記第１のオリゴマーが、配列番号２８の配列を含む、項目１〜４、６〜７、または１１〜１５のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１７）
前記第２のオリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号３７からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目１〜１０または１４〜１６のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１８）
前記第２のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３７の配列を含む、項目１〜１０または１４〜１７のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１９）
前記第２のオリゴマーが、配列番号３７の配列を含む、項目１〜１０または１４〜１８のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２０）
前記第１のオリゴマーが、少なくとも１つの５−メチルシトシン残基を含む、項目１〜１９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２１）
前記第１のオリゴマー中のＣ残基のうちの少なくとも約半分が、５−メチル化されている、項目１〜２０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２２）
前記第１のオリゴマー中のＣ残基の実質的に全てが、５−メチル化されている、項目１〜２１のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２３）
前記第２のオリゴマーが、少なくとも１つの５−メチルシトシンを含む、項目１〜２２のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２４）
前記第２のオリゴマー中のＣ残基のうちの少なくとも約半分が、５−メチル化されている、項目１〜２３のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２５）
前記第２のオリゴマー中のＣ残基の実質的に全てが、５−メチル化されている、項目１〜２４のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２６）
前記組成物またはキットが、前記アンプリコンにハイブリダイズするように構成された第３のオリゴマーをさらに含み、前記第３のオリゴマーが、検出可能な標識を含む、項目１〜２５のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目２７）
前記アンプリコンの有無が、前記アンプリコンへの前記第３のオリゴマーのハイブリダイゼーションの発生または不発生によって検出される、項目２６に記載の方法。
（項目２８）
前記ＨＰＩＶ−３核酸が、前記ＨＰＩＶ−３アンプリコンの生成をモニタリングすることによって定量化される、項目３〜２７のいずれか一項に記載の方法。
（項目２９）
前記第３のオリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号３１、３２、３３、３４、または３５からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目２６〜２８のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３０）
前記第３のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３１の配列を含む、項目２６〜２９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３１）
前記第３のオリゴマーが、配列番号３１の配列を含む、項目２６〜２９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３２）
前記第３のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３２の配列を含む、項目２６〜２９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３３）
前記第３のオリゴマーが、配列番号３２の配列を含む、項目２６〜２９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３４）
前記第３のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３３の配列を含む、項目２６〜２９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３５）
前記第３のオリゴマーが、配列番号３３の配列を含む、項目２６〜２９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３６）
前記第３のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３４の配列を含む、項目２６〜２９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３７）
前記第３のオリゴマーが、配列番号３４の配列を含む、項目２６〜２９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３８）
前記第３のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３５の配列を含む、項目２６〜２９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目３９）
前記第３のオリゴマーが、配列番号３５の配列を含む、項目２６〜２９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４０）
前記第３のオリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号２６、２７、２８、２９、または３０からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目２６〜２８のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４１）
前記第３のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号２６の配列を含む、項目２６〜２８または４０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４２）
前記第３のオリゴマーが、配列番号２６の配列を含む、項目２６〜２８または４０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４３）
前記第３のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号２７の配列を含む、項目２６〜２８または４０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４４）
前記第３のオリゴマーが、配列番号２７の配列を含む、項目２６〜２８または４０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４５）
前記第３のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号２８の配列を含む、項目２６〜２８または４０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４６）
前記第３のオリゴマーが、配列番号２８の配列を含む、項目２６〜２８または４０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４７）
前記第３のオリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号２９の配列を含む、項目２６〜２８または４０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４８）
前記第３のオリゴマーが、配列番号２９の配列を含む、項目２６〜２８または４０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目４９）
前記第３のオリゴマーが、少なくとも１つの５−メチルシトシンを含む、項目２６〜４８のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５０）
前記第３のオリゴマー中のＣ残基のうちの少なくとも約半分が、５−メチル化されている、項目２６〜４９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５１）
前記第３のオリゴマー中のＣ残基の実質的に全てが、５−メチル化されている、項目２６〜５０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５２）
前記組成物またはキットが、前記第３のオリゴマーとは異なる第４のオリゴマーをさらに含み、前記第４のオリゴマーが、前記アンプリコンにハイブリダイズするように構成され、検出可能な標識を含む、項目２６〜５１のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５３）
前記第４のオリゴマーが、配列番号３１、３２、３３、３４、または３５の配列を含む、項目５２に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５４）
前記第４のオリゴマーが、配列番号２６、２７、２８、２９、または３０の配列を含む、項目５２に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５５）
前記第４のオリゴマーが、少なくとも１つの５−メチルシトシンを含む、項目５２〜５４のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５６）
前記第４のオリゴマー中のＣ残基のうちの少なくとも約半分が、５−メチル化されている、項目５２〜５５のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５７）
前記第４のオリゴマー中のＣ残基の実質的に全てが、５−メチル化されている、項目５２〜５６のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５８）
第１のヒトパラインフルエンザウイルス１（ＨＰＩＶ−１）増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーをさらに含み、
前記第１のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−１の３３０〜４９０位または９６０〜１１００位内に位置する少なくとも１つのＨＰＩＶ−１の位置を含む少なくとも約５０ヌクレオチド長のＨＰＩＶ−１アンプリコンを増幅するように構成される、項目１〜５７のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目５９）
少なくとも第１のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーを含む組成物またはキットであって、
前記第１のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−１の３３０〜４９０位または９６０〜１１００位内に位置する少なくとも１つのＨＰＩＶ−１の位置を含む少なくとも約５０ヌクレオチド長のＨＰＩＶ−１アンプリコンを増幅するように構成される、組成物またはキット。
（項目６０）
試料中のＨＰＩＶ−１を検出する方法であって、
前記試料を少なくとも第１および第２の増幅オリゴマーと接触させ、それにより組成物を形成することと、
ＨＰＩＶ−１核酸の存在下で、ＨＰＩＶ−１アンプリコンを生成する核酸増幅反応を前記組成物中で行うことと、
少なくとも１つの前記アンプリコンの有無を検出することと、を含み、
前記第１のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−１の３３０〜４９０位または９６０〜１１００位内に位置する少なくとも１つのＨＰＩＶ−１の位置を含む少なくとも約５０ヌクレオチド長のＨＰＩＶ−１アンプリコンを増幅するように構成される、方法。
（項目６１）
前記第１のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−１の９７０位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第２のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−１の１０９８位を含む部位にハイブリダイズするように構成される、項目５８〜６０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６２）
前記第１のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−１核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号６からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目５８〜６１のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６３）
前記第１のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、最大２までつのミスマッチを有する配列番号６の配列を含む、項目５８〜６２のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６４）
前記第１のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、配列番号６の配列を含む、項目５８〜６２のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６５）
前記第２のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−１核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号２４からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目５８〜６４のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６６）
前記第２のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号２４の配列を含む、項目５８〜６５のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６７）
前記第２のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、配列番号２４の配列を含む、項目５８〜６５のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６８）
前記第１のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−１の３３１位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第２のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−１の４８６位を含む部位にハイブリダイズするように構成される、項目５８〜５９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目６９）
前記第１のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−１核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号１７からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目５８〜５９または６８のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目７０）
前記第１のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号１７の配列を含む、項目５８〜５９または６８〜６９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目７１）
前記第１のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、配列番号１７の配列を含む、項目５８〜５９または６８〜６９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目７２）
前記第２のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−１核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号２２からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目５８〜５９または６８〜７１のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目７３）
前記第２のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号２２の配列を含む、項目５８〜５９または６８〜７２のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目７４）
前記第２のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、配列番号２２の配列を含む、項目５８〜５９または６８〜７２のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目７５）
前記組成物またはキットが、前記ＨＰＩＶ−１アンプリコンにハイブリダイズするように構成された第３のＨＰＩＶ−１オリゴマーをさらに含み、前記第３のオリゴマーが、検出可能な標識を含む、項目５８〜７４のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目７６）
前記第３のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号５、７、８、９、１２、１３、１４、１５、１６、１８、１９、２０、２１、２３、または１２５からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目７５に記載の組成物、キット、または方法。
（項目７７）
前記第３のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号５、７、８、９、１２、１３、１４、１５、１６、１８、１９、２０、２１、２３、または１２５の配列を含む、項目７５または７６に記載の組成物、キット、または方法。
（項目７８）
前記第３のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、配列番号５、７、２１、２３、または１２５の配列を含む、項目７７に記載の組成物、キット、または方法。
（項目７９）
前記第３のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、配列番号８、９、２０、または１２５の配列を含む、項目７７に記載の組成物、キット、または方法。
（項目８０）
前記第３のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、配列番号１２、１３、１４、または１５の配列を含む、項目７７に記載の組成物、キット、または方法。
（項目８１）
前記第３のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、配列番号１６、１８、または１９の配列を含む、項目７７に記載の組成物、キット、または方法。
（項目８２）
前記第３のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号１０または１１からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目７５に記載の組成物、キット、または方法。
（項目８３）
前記第３のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号１０または１１の配列を含む、項目７５または８２に記載の組成物、キット、または方法。
（項目８４）
前記第３のＨＰＩＶ−１オリゴマーが、配列番号１０または１１の配列を含む、項目７５または８２に記載の組成物、キット、または方法。
（項目８５）
前記第１、第２、および第３のＨＰＩＶ−１オリゴマーのうちの少なくとも１つ、少なくとも２つ、またはそれぞれが、少なくとも１つの５−メチルシトシンを含む、項目５８〜８４のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目８６）
前記第１、第２、および／または第３のＨＰＩＶ−１オリゴマー中のＣ残基のうちの少なくとも約半分が、５−メチル化されている、項目５８〜８４のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目８７）
前記第１、第２、および／または第３のＨＰＩＶ−１オリゴマー中のＣ残基の実質的に全てが、５−メチル化されている、項目５８〜８４のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目８８）
第１のヒトパラインフルエンザウイルス１（ＨＰＩＶ−２）増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−２増幅オリゴマーをさらに含み、
前記第１のＨＰＩＶ−２増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−２増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−２の１６００〜１７００位内に位置する少なくとも１つのＨＰＩＶ−２の位置を含む少なくとも約５０ヌクレオチド長のＨＰＩＶ−２アンプリコンを増幅するように構成される、項目１〜８７のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目８９）
少なくとも第１のＨＰＩＶ−２増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−２増幅オリゴマーを含む組成物またはキットであって、
前記第１のＨＰＩＶ−２増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−２増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−２の１６００〜１７００位内に位置する少なくとも１つのＨＰＩＶ−２の位置を含む少なくとも約５０ヌクレオチド長のＨＰＩＶ−２アンプリコンを増幅するように構成される、組成物またはキット。
（項目９０）
試料中のＨＰＩＶ−２を検出する方法であって、
前記試料を少なくとも第１および第２の増幅オリゴマーと接触させ、それにより組成物を形成することと、
ＨＰＩＶ−２核酸の存在下で、ＨＰＩＶ−２アンプリコンを生成する核酸増幅反応を前記組成物中で行うことと、
少なくとも１つの前記アンプリコンの有無を検出することと、を含み、
前記第１のＨＰＩＶ−２増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−２増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−２の１６００〜１７００位内に位置する少なくとも１つのＨＰＩＶ−２の位置を含む少なくとも約５０ヌクレオチド長のＨＰＩＶ−２アンプリコンを増幅するように構成される、方法。
（項目９１）
前記第１のＨＰＩＶ−２増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−２の１６０３位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第２のＨＰＩＶ−２増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−２の１６９８位を含む部位にハイブリダイズするように構成される、項目８８〜９０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目９２）
前記第１のＨＰＩＶ−２増幅オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−２核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号４４からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目８８〜９１のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目９３）
前記第１のＨＰＩＶ−２オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号４４の配列を含む、項目８８〜９２のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目９４）
前記第１のＨＰＩＶ−２オリゴマーが、配列番号４４の配列を含む、項目８８〜９２のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目９５）
前記第２のＨＰＩＶ−２増幅オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−２核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号４０からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目８８〜９４のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目９６）
前記第２のＨＰＩＶ−２オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号４０の配列を含む、項目８８〜９５のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目９７）
前記第２のＨＰＩＶ−２オリゴマーが、配列番号４０の配列を含む、項目８８〜９５のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目９８）
前記組成物またはキットが、前記ＨＰＩＶ−２アンプリコンにハイブリダイズするように構成された第３のＨＰＩＶ−２オリゴマーをさらに含み、前記第３のオリゴマーが、検出可能な標識を含む、項目８８〜９７のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目９９）
前記第３のＨＰＩＶ−２オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号３８、３９、４１、４２、４３、または４５からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目９８に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１００）
前記第３のＨＰＩＶ−２オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号３８、３９、４１、４２、４３、または４５の配列を含む、項目９８または９９に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０１）
前記第３のＨＰＩＶ−２オリゴマーが、配列番号４５の配列を含む、項目９８または９９に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０２）
前記第３のＨＰＩＶ−２オリゴマーが、配列番号４３の配列を含む、項目９８または９９に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０３）
前記第３のＨＰＩＶ−２オリゴマーが、配列番号４２の配列を含む、項目９８または９９に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０４）
前記第３のＨＰＩＶ−２オリゴマーが、配列番号４１の配列を含む、項目９８または９９に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０５）
前記第３のＨＰＩＶ−２オリゴマーが、配列番号３９の配列を含む、項目９８または９９に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０６）
前記第３のＨＰＩＶ−２オリゴマーが、配列番号３８の配列を含む、項目９８または９９に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０７）
前記第１、第２、および第３のＨＰＩＶ−２オリゴマーのうちの少なくとも１つ、少なくとも２つ、またはそれぞれが、少なくとも１つの５−メチルシトシンを含む、項目８８〜１０６のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０８）
前記第１、第２、および／または第３のＨＰＩＶ−２オリゴマー中のＣ残基のうちの少なくとも約半分が、５−メチル化されている、項目８８〜１０７のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１０９）
前記第１、第２、および／または第３のＨＰＩＶ−２オリゴマー中のＣ残基の実質的に全てが、５−メチル化されている、項目８８〜１０７のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１０）
第１のヒトパラインフルエンザウイルス１（ＨＰＩＶ−４）増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーをさらに含み、
前記第１のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−４の６２０〜７４０位、２１３０〜２４１０位、２５２０〜３０４０位、または１００９０〜１１９８０位内に位置する少なくとも１つのＨＰＩＶ−４の位置を含む少なくとも約５０ヌクレオチド長のＨＰＩＶ−４アンプリコンを増幅するように構成される、
項目１〜１０９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１１）
少なくとも第１のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーを含む組成物またはキットであって、
前記第１のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−４の６２０〜７４０位、２１３０〜２４１０位、２５２０〜３０４０位、または１００９０〜１１９８０位内に位置する少なくとも１つのＨＰＩＶ−４の位置を含む少なくとも約５０ヌクレオチド長のＨＰＩＶ−４アンプリコンを増幅するように構成される、組成物またはキット。
（項目１１２）
試料中のＨＰＩＶ−４を検出する方法であって、
前記試料を少なくとも第１および第２の増幅オリゴマーと接触させ、それにより組成物を形成することと、
ＨＰＩＶ−４核酸の存在下で、ＨＰＩＶ−４アンプリコンを生成する核酸増幅反応を前記組成物中で行うことと、
少なくとも１つの前記アンプリコンの有無を検出することと、を含み、
前記第１のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーおよび第２のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−４の６２０〜７４０位、２１３０〜２４１０位、２５２０〜３０４０位、または１００９０〜１１９８０位内に位置する少なくとも１つのＨＰＩＶ−４の位置を含む少なくとも約５０ヌクレオチド長のＨＰＩＶ−４アンプリコンを増幅するように構成される、方法。
（項目１１３）
前記第１のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−４の１００９４位、１０２０５位、または１０２４８位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第２のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−４の１１６８５位、１１７３９位、または１１９８１位を含む部位にハイブリダイズするように構成される、項目１１０〜１１２のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１４）
前記第１のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−４核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号７９、８０、８１、８２、９７、９８、９９、または１００からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目１１０〜１１３のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１５）
前記第１のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号７９、８０、８１、８２、９７、９８、９９、または１００の配列を含む、項目１１０〜１１４のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１６）
前記第１のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、配列番号７９、８０、８１、８２、９７、９８、９９、または１００の配列を含む、項目１１０〜１１４のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１７）
前記第２のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−４核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号５４、６３、６４、１１３、１１４、または１１５からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目１１０〜１１６のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１８）
前記第２のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号５４、６３、６４、１１３、１１４、または１１５の配列を含む、項目１１０〜１１７のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１１９）
前記第２のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、配列番号５４、６３、６４、１１３、１１４、または１１５の配列を含む、項目１１０〜１１７のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１２０）
前記組成物またはキットが、前記ＨＰＩＶ−４アンプリコンにハイブリダイズするように構成された第３のＨＰＩＶ−４オリゴマーをさらに含み、前記第３のオリゴマーが、検出可能な標識を含む、項目１１０〜１１９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１２１）
前記第３のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号５３、５５、５８、６０、６２、６５、６７、６８、７６、８３、８４、８５、８６、９２、９４、１０１、１０２、１０３、１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１１０、１１１、または１１２からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目１２０に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１２２）
前記第３のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号５３、５５、５８、６０、６２、６５、６７、６８、７６、８３、８４、８５、８６、９２、９４、１０１、１０２、１０３、１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１１０、１１１、または１１２の配列を含む、項目１２０〜１２１のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１２３）
前記第３のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、配列番号５３、５５、５８、６０、６２、６５、６７、６８、７６、８３、８４、８５、８６、９２、９４、１０１、１０２、１０３、１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１１０、１１１、または１１２の配列を含む、項目１２０〜１２１のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１２４）
前記第１のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−４の６２５位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第２のＨＰＩＶ−４の増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−４の７３８位を含む部位にハイブリダイズするように構成される、項目１１０〜１１２のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１２５）
前記第１のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−４核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号７８からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目１１０〜１１２または１２４のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１２６）
前記第１のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号７８の配列を含む、項目１１０〜１１２または１２４〜１２５のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１２７）
前記第１のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、配列番号７８の配列を含む、項目１１０〜１１２または１２４〜１２５のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１２８）
前記第２のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−４核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号５６からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目１１０〜１１２または１２４〜１２７のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１２９）
前記第２のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号５６の配列を含む、項目１１０〜１１２または１２４〜１２８のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１３０）
前記第２のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、配列番号５６の配列を含む、項目１１０〜１１２または１２４〜１２８のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１３１）
前記組成物またはキットが、前記ＨＰＩＶ−４アンプリコンにハイブリダイズするように構成された第３のＨＰＩＶ−４オリゴマーをさらに含み、前記第３のオリゴマーが、検出可能な標識を含む、項目１１０〜１１２または１２４〜１３０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１３２）
前記第３のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号７１からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目１３１に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１３３）
前記第３のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号７１の配列を含む、項目１３１または１３２に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１３４）
前記第３のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、配列番号７１の配列を含む、項目１３１または１３２に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１３５）
前記第１のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−４の２１２８位、２３５２位、２３８６位、２３８８位、２４０４位、または２５２４位を含む部位にハイブリダイズするように構成され、前記第２のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、ＨＰＩＶ−４の２９０７位、３００６位、または３０３９位を含む部位にハイブリダイズするように構成される、項目１１０〜１１２のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１３６）
前記第１のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−４核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号７２または１２４からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目１１０〜１１２または１３５のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１３７）
前記第１のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号７２または１２４の配列を含む、項目１１０〜１１２または１３５〜１３６のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１３８）
前記第１のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、配列番号７２または１２４の配列を含む、項目１１０〜１１２または１３５〜１３６のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１３９）
前記第２のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−４核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号５０、５１、５２、９３、９５、または９６からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目１１０〜１１２または１３５〜１３８のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１４０）
前記第２のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する、配列番号５０、５１、５２、９３、９５、または９６の配列を含む、項目１１０〜１１２または１３５〜１３９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１４１）
前記第２のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、配列番号５０、５１、５２、９３、９５、または９６の配列を含む、項目１１０〜１１２または１３５〜１３９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１４２）
前記組成物またはキットが、前記ＨＰＩＶ−４アンプリコンにハイブリダイズするように構成された第３のＨＰＩＶ−４オリゴマーをさらに含み、前記第３のオリゴマーが、検出可能な標識を含む、項目１１０〜１１２または１３５〜１４１のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１４３）
前記第３のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、ストリンジェントな条件下で、ＨＰＩＶ−３核酸へのハイブリダイゼーションを、配列番号４６、４７、４８、４９、５９、６１、６９、７０、７２、７３、７４、７５、７７、８８、９０、９１、１１６、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、または１２３からなる配列を有するオリゴマーと競合する、項目１４２に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１４４）
前記第３のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、最大２つまでのミスマッチを有する配列番号４６、４７、４８、４９、５９、６１、６９、７０、７２、７３、７４、７５、７７、８８、９０、９１、１１６、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、または１２３の配列を含む、項目１４２または１４３に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１４５）
前記第３のＨＰＩＶ−４オリゴマーが、配列番号４６、４７、４８、４９、５９、６１、６９、７０、７２、７３、７４、７５、７７、８８、９０、９１、１１６、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、または１２３の配列を含む、項目１４２または１４３に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１４６）
前記第１、第２、および第３のＨＰＩＶ−４オリゴマーのうちの少なくとも１つ、少なくとも２つ、またはそれぞれが、少なくとも１つの５−メチルシトシンを含む、項目１１０〜１４５のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１４７）
前記第１、第２、および／または第３のＨＰＩＶ−４オリゴマー中のＣ残基のうちの少なくとも約半分が、５−メチル化されている、項目１１０〜１４６のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１４８）
前記第１、第２、および／または第３のＨＰＩＶ−４オリゴマー中のＣ残基の実質的に全てが、５−メチル化されている、項目１１０〜１４７のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１４９）
前記核酸増幅反応が、サーマルサイクリングを含む、項目３〜５８、６０〜８８、または９０〜１４８のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５０）
前記核酸増幅反応が、逆転写を含む、項目３〜５８、６０〜８８、または９０〜１４９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５１）
前記核酸増幅反応が、ＲＴ−ＰＣＲを含む、項目３〜５８、６０〜８８、または９０〜１５０のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５２）
少なくとも１つの検出可能な標識が、蛍光性である、項目２６〜５８、６１〜８８、または９１〜１５１のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１５３）
蛍光標識を含む少なくとも１つのオリゴマーが、クエンチャーをさらに含む、項目１５２に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１５４）
蛍光標識を含む少なくとも１つのオリゴマーが、伸長不能なオリゴマーである、項目１５２または１５３に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１５５）
前記核酸増幅反応が、５’から３’のエキソヌクレアーゼ活性を有するポリメラーゼを用いたＰＣＲ、ならびにフルオロフォアおよびクエンチャーを含むプローブオリゴマーを使用してアンプリコンを検出することを含み、前記ポリメラーゼによる前記プローブのエキソヌクレアーゼ分解が、前記クエンチャーによる蛍光のクエンチングを低減する、項目３〜５８、６０〜８８、または９０〜１５４のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５６）
少なくとも１つ、少なくとも２つ、または少なくとも３つのオリゴマーが、少なくとも１つの非ワトソンクリック（ＮＷＣ）位置を含む、項目１〜１５５のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１５７）
ＨＰＩＶ−１、ＨＰＩＶ−２、ＨＰＩＶ−３、またはＨＰＩＶ−４にハイブリダイズするように構成されたオリゴマーのうちの少なくとも１つ、２つ、３つ、または４つがそれぞれ、少なくとも１つのＮＷＣ位置を含む、項目１５６に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１５８）
少なくとも１つ、少なくとも２つ、または少なくとも３つのオリゴマーが、縮重位置を含む、項目１〜１５７のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１５９）
ＨＰＩＶ−１、ＨＰＩＶ−２、ＨＰＩＶ−３、またはＨＰＩＶ−４にハイブリダイズするように構成されたオリゴマーのうちの少なくとも１つ、２つ、３つ、または４つがそれぞれ、少なくとも１つの縮重位置を含む、項目１５８に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１６０）
前記第１および第２の増幅オリゴマー、前記第１および第２のＨＰＩＶ−１増幅オリゴマー、前記第１および第２のＨＰＩＶ−２増幅オリゴマー、および／または前記第１ならびに第２のＨＰＩＶ−４増幅オリゴマーが、約１０〜６０塩基長、約１４〜５０塩基長、約１４〜４０塩基長、約１４〜３５塩基長、または約１５〜３０塩基長の標的ハイブリダイズ領域を含む、項目１〜１５９のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１６１）
前記ＨＰＩＶ−３アンプリコン、前記ＨＰＩＶ−１アンプリコン、前記ＨＰＩＶ−２アンプリコン、および／または前記ＨＰＩＶ−４アンプリコンが、約５０〜１０００ヌクレオチド長、約５０〜１００ヌクレオチド長、約１００〜２００ヌクレオチド長、約２００〜３００ヌクレオチド長、約３００〜４００ヌクレオチド長、約４００〜５００ヌクレオチド長、約５００〜６００ヌクレオチド長、約６００〜７００ヌクレオチド長、約７００〜８００ヌクレオチド長、約８００〜９００ヌクレオチド長、約９００〜１０００ヌクレオチド長、または約１０００〜２０００ヌクレオチド長である、項目１〜１６０のいずれか一項に記載の組成物、キット、または方法。
（項目１６２）
項目１〜２、５〜５９、６１〜８９、９１〜１１１、１１３〜１４８、または１５３〜１６１のいずれか一項に記載のキット。
（項目１６３）
項目１〜２、５〜５９、６１〜８９、９１〜１１１、１１３〜１４８、または１５３〜１６１のいずれか一項に記載の組成物。
（項目１６４）
水性、凍結、または凍結乾燥である、項目１６３に記載の組成物。
（項目１６５）
試料中のＨＰＩＶ−１核酸、ＨＰＩＶ−２核酸、ＨＰＩＶ−３核酸、および／またはＨＰＩＶ−４核酸を検出または定量化するための、項目１６２〜１６４のいずれか一項に記載の組成物またはキットの使用。