【手続補正書】
【提出日】令和3年1月27日(2021.1.27)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
式Ｉ
【化１１】
2020509001.tif 000001
の化合物、又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体（式中、
Ｒ１は、非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ２は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ３は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、及びＲ７はそれぞれに独立してＨ又はヒドロキシルであり；
Ｒ８は、Ｈ又は非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｘは、Ｃ（Ｏ）ＯＨ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｍＳＯ３Ｈ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｎＣＯ２Ｈ、又はＯＳＯ３Ｈであり；
ｍは１、２又は３であり；且つ
ｎは、１、２又は３である）
及び１種以上の腸内マイクロバイオーム種、並びに薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
【請求項２】
Ｒ１がメチル又はエチルである、請求項１に記載の医薬組成物。
【請求項３】
Ｒ１がエチルである、請求項１又は２に記載の医薬組成物。
【請求項４】
Ｒ２がＨである、請求項１〜３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項５】
Ｒ２がヒドロキシルである、請求項１〜３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項６】
Ｒ３がＨである、請求項１〜５のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項７】
Ｒ３がヒドロキシルである、請求項１〜５のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項８】
Ｒ４がヒドロキシルであり、且つＲ５がＨである、請求項１〜７のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項９】
Ｒ４がＨであり、且つＲ５がヒドロキシルである、請求項１〜７のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項１０】
Ｒ６がヒドロキシルであり、且つＲ７がＨである、請求項１〜９のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項１１】
Ｒ６がＨであり、且つＲ７がヒドロキシルである、請求項１〜９のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項１２】
Ｒ８がＨである、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項１３】
Ｒ８がメチル又はエチルである、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項１４】
Ｒ８がメチルである、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項１５】
Ｘが、Ｃ（Ｏ）ＯＨ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ＳＯ３Ｈ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ＣＯ２Ｈ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）２ＳＯ３Ｈ、又はＣ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）２ＣＯ２Ｈである、請求項１〜１４のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項１６】
ＸがＣ（Ｏ）ＯＨである、請求項１〜１５のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項１７】
ＸがＯＳＯ３Ｈである、請求項１〜１４のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項１８】
前記化合物が、式Ｉｂ−１又はＩｂ−２：
【化１２】
2020509001.tif 000002
又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体である、請求項１に記載の医薬組成物。
【請求項１９】
前記化合物が、式Ｉｃ：
【化１３】
2020509001.tif 000003
又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体である、請求項１に記載の医薬組成物。
【請求項２０】
前記化合物が：
【化１４】
2020509001.tif 000004
又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体である、請求項１に記載の医薬組成物。
【請求項２１】
前記化合物が：
【化１５】
2020509001.tif 000005
又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体である、請求項１に記載の医薬組成物。
【請求項２２】
前記化合物が：
【化１６】
2020509001.tif 000006
又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体である、請求項１に記載の医薬組成物。
【請求項２３】
前記化合物が：
【化１７】
2020509001.tif 000007
又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体である、請求項１に記載の医薬組成物。
【請求項２４】
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種が：アクチノミセス科（Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔａｃｅａｅ）、ボゴリエラ科（Ｂｏｇｏｒｉｅｌｌａｃｅａｅ）、ブレビバクテリウム科（Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、セルロモナス科（Ｃｅｌｌｕｌｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、アコレプラズマ科（Ａｃｈｏｌｅｐｌａｓｍａｔａｃｅａｅ）、アシドチオバシラス科（Ａｃｉｄｉｔｈｉｏｂａｃｉｌｌａｃｅａｅ）、アルカニヴォラックス科（Ａｌｃａｎｉｖｏｒａｃａｃｅａｅ）、アルテロモナス科（Ａｌｔｅｒｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、ブラッタバクテリウム科（Ｂｌａｔｔａｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、カルジオバクテリウム科（Ｃａｒｄｉｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、クラミジア科（Ｃｈｌａｍｙｄｉａｃｅａｅ）、クロマチウム科（Ｃｈｒｏｍａｔｉａｃｅａｅ）、クロストリジウム目（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ）ファミリーＸＩＩＩ．（所属不明）、シクロバクテリウム科（Ｃｙｃｌｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、デハロコッコイデス科（Ｄｅｈａｌｏｃｏｃｃｏｉｄａｃｅａｅ）、デスルフォバクター科（Ｄｅｓｕｌｆｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、デスルフォバルブス科（Ｄｅｓｕｌｆｏｂｕｌｂａｃｅａｅ）、エクトチオロドスピラ科（Ｅｃｔｏｔｈｉｏｒｈｏｄｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）、エルシミクロビウム科（Ｅｌｕｓｉｍｉｃｒｏｂｉａｃｅａｅ）、エントモプラズマ科（Ｅｎｔｏｍｏｐｌａｓｍａｔａｃｅａｅ）、エリスロバクター科（Ｅｒｙｔｈｒｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、ガリオネラ科（Ｇａｌｌｉｏｎｅｌｌａｃｅａｅ）、ハロアナエロビウム科（Ｈａｌａｎａｅｒｏｂｉａｃｅａｅ）、ヨネシア科（Ｊｏｎｅｓｉａｃｅａｅ）、コフレリア科（Ｋｏｆｌｅｒｉａｃｅａｅ）、レプトスピラ科（Ｌｅｐｔｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）、メタノバクテリウム科（Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、メチロコッカス科（Ｍｅｔｈｙｌｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、メチロフィルス科（Ｍｅｔｈｙｌｏｐｈｉｌａｃｅａｅ）、ミクソコッカス科（Ｍｙｘｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ニトロソモナス科（Ｎｉｔｒｏｓｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、ニトロスピラ科（Ｎｉｔｒｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）、オセアノスピリルム科（Ｏｃｅａｎｏｓｐｉｒｉｌｌａｃｅａｅ）、オシロスピラ科（Ｏｓｃｉｌｌｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）、ピスキリケッチア科（Ｐｉｓｃｉｒｉｃｋｅｔｔｓｉａｃｅａｅ）、プロピオニバクテリア科（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、シュードアルテロモナス科（Ｐｓｅｕｄｏａｌｔｅｒｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、プニセイコッカス科（Ｐｕｎｉｃｅｉｃｏｃｃａｃｅａｅ）、リケッチア科（Ｒｉｃｋｅｔｔｓｉａｃｅａｅ）、ルブロバクター科（Ｒｕｂｒｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、シェワネラ科（Ｓｈｅｗａｎｅｌｌａｃｅａｅ）、スピロヘータ科（Ｓｐｉｒｏｃｈａｅｔａｃｅａｅ）、スピロプラズマ科（Ｓｐｉｒｏｐｌａｓｍａｔａｃｅａｅ）、ステレラセアエ科（Ｓｕｔｔｅｒｅｌｌａｃｅａｅ）、シントロフォモナス科（Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、テルムス科（Ｔｈｅｒｍａｃｅａｅ）、コリネバクテリア科（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、デルマバクター科（Ｄｅｒｍａｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、ディエジア科（Ｄｉｅｔｚｉａｃｅａｅ）、ゲオデルマトフィラス科（Ｇｅｏｄｅｒｍａｔｏｐｈｉｌａｃｅａｅ）、ゴルドニア科（Ｇｏｒｄｏｎｉａｃｅａｅ）、イントラスポランギウム科（Ｉｎｔｒａｓｐｏｒａｎｇｉａｃｅａｅ）、ミクロバクテリウム科（Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、ミクロコッカス科（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ミクロモノスポラ科（Ｍｉｃｒｏｍｏｎｏｓｐｏｒａｃｅａｅ）、マイコバクテリア科（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、ノカルジア科（Ｎｏｃａｒｄｉａｃｅａｅ）、プロミクロモノスポラ科（Ｐｒｏｍｉｃｒｏｍｏｎｏｓｐｏｒａｃｅａｅ）、プロピオニバクテリウム亜目（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｎｅａｅ）、ストレプトマイセス科（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｔａｃｅａｅ）、マイクロコッカス亜目（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｉｎｅａｅ）、ビフィドバクテリウム科（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、コリオバクテリウム科（Ｃｏｒｉｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、デイノコッカス科（Ｄｅｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ハロバクテロイデス科（Ｈａｌｏｂａｃｔｅｒｏｉｄａｃｅａｅ）、アリシクロバシラス科（Ａｌｉｃｙｃｌｏｂａｃｉｌｌａｃｅａｅ）、バチルス科（Ｂａｃｉｌｌａｃｅａｅ）、バチルス目（Ｂａｃｉｌｌａｌｅｓ）（所属不明）ＸＩ、リステリア科（Ｌｉｓｔｅｒｉａｃｅａｅ）、パエニバシラス科（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌａｃｅａｅ）、プラノコッカス科（Ｐｌａｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、スタフィロコッカス科（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、アエロコッカス科（Ａｅｒｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、カルノバクテリウム科（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、エンテロコッカス科（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ラクトバチルス科（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌａｃｅａｅ）、ロイコノストック科（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃａｃｅａｅ）、ストレプトコッカス科（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、クリステンセネラ科（Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎｅｌｌａｃｅａｅ）、クロストリジウム科（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ）、ルミノコッカス科（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ファミリーＸＩＩＩ（所属不明）、ペプトストレプトコッカス科（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ファミリーＸＩ（所属不明）、ラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）、ユウバクテリウム科（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、エリシペロトリクス科（Ｅｒｙｓｉｐｅｌｏｔｒｉｃｈａｃｅａｅ）、エリシペロトリクス科（Ｅｒｙｓｉｐｅｌｏｔｒｉｃｈａｃｅａｅ）ＸＶＩ、エリシペロトリクス科（Ｅｒｙｓｉｐｅｌｏｔｒｉｃｈａｃｅａｅ）ＸＶＩＩ、エリシペロトリクス科（Ｅｒｙｓｉｐｅｌｏｔｒｉｃｈａｃｅａｅ）ＸＶＩＩＩ、アキダミノコッカス科（Ａｃｉｄｉａｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ペプトコッカス科（Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ベイヨネラ科（Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａｃｅａｅ）、バクテロイデス科（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄａｃｅａｅ）、ポルフィロモナス科（Ｐｏｒｐｈｙｒｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、プレボテラ科（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａｃｅａｅ）、リケネーラ科（Ｒｉｋｅｎｅｌｌａｃｅａｅ）、サイトファーガ科（Ｃｙｔｏｐｈａｇａｃｅａｅ）、フラボバクテリウム科（Ｆｌａｖｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、キチノファガ科（Ｃｈｉｔｉｎｏｐｈａｇａｃｅａｅ）、スフィンゴバクテリウム科（Ｓｐｈｉｎｇｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、フソバクテリア科（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、レプトトリキア科（Ｌｅｐｔｏｔｒｉｃｈｉａｃｅａｅ）、ヴィクチヴァリス科（Ｖｉｃｔｉｖａｌｌａｃｅａｅ）、プランクトミケス科（Ｐｌａｎｃｔｏｍｙｃｅｔａｃｅａｅ）、カウロバクター科（Ｃａｕｌｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、アウランチモナス科（Ａｕｒａｎｔｉｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、ブラジリゾビウム科（Ｂｒａｄｙｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）、ブルセラ科（Ｂｒｕｃｅｌｌａｃｅａｅ）、ヒフォミクロビウム科（Ｈｙｐｈｏｍｉｃｒｏｂｉａｃｅａｅ）、メチロバクテリウム科（Ｍｅｔｈｙｌｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、フィロバクテリア科（Ｐｈｙｌｌｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、リゾビウム科（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）、キサントバクター科（Ｘａｎｔｈｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、ロドバクター科（Ｒｈｏｄｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、アセトバクター科（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、ロドスピリラム科（Ｒｈｏｄｏｓｐｉｒｉｌｌａｃｅａｅ）、スフィンゴモナス科（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、アルカリゲネス科（Ａｌｃａｌｉｇｅｎａｃｅａｅ）、バークホルデリア科（Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａｃｅａｅ）、コマモナス科（Ｃｏｍａｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、オキサロバクター科（Ｏｘａｌｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、ステレラ科（Ｓｕｔｅｒｅｌｌａｃｅａｅ）、ナイセリア科（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａｃｅａｅ）、ロドシクルス科（Ｒｈｏｄｏｃｙｃｌａｃｅａｅ）、デスルホビブリオ科（Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｂｒｉｏｎａｃｅａｅ）、カンピロバクター科（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、ヘリコバクター科（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、アエロモナス科（Ａｅｒｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、サクシニビブリオ科（Ｓｕｃｃｉｎｉｖｉｂｒｉｏｎａｃｅａｅ）、腸内細菌科（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、パスツレラ科（Ｐａｓｔｅｕｒｅｌｌａｃｅａｅ）、モラクセラ科（Ｍｏｒａｘｅｌｌａｃｅａｅ）、シュードモナス科（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、ビブリオ科（Ｖｉｂｒｉｏｎａｃｅａｅ）、シノバクター科（Ｓｉｎｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、キサントモナス科（Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、ブラキスピラ科（Ｂｒａｃｈｙｓｐｉｒａｃｅａｅ）、シネルギステス科（Ｓｙｎｅｒｇｉｓｔａｃｅａｅ）、マイコプラズマ科（Ｍｙｃｏｐｌａｓｍａｔａｃｅａｅ）、及びウェルコミクロビウム科（Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａｃｅａｅ）から選択されるファミリーにおけるメンバーである、請求項１〜２３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項２５】
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種がグラム陽性である、請求項１〜２４のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項２６】
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種が、ビフィドバクテリウム・ブレーベ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ）、ビフィドバクテリウム・ロングム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ）、ラクトバチルス・パラカゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐａｒａｃａｓｅｉ）、ペディオコッカス・ペントサセウス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｅｎｔｏｓａｃｅｕｓ）、ラクトコッカス・ラクティス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｌａｃｔｉｓ）、ストレプトコッカス・パラサングイニス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐａｒａｓａｎｇｕｉｎｉｓ）、ストレプトコッカス・サリバリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）、ストレプトコッカス・サーモフィルス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）、ルミノコッカス・ブローミイ（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｂｒｏｍｉｉ）、ルミノコッカス・トルキース（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｏｒｑｕｅｓ）、未分類のアナエロツルンカス（Ａｎａｅｒｏｔｒｕｎｃｕｓ）、未分類のサブドリグラヌルム（Ｓｕｂｄｏｌｉｇｒａｎｕｌｕｍ）、クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）、ブラウティア（ルミノコッカス）・オベウム（Ｂｌａｕｔｉａ  （Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）  ｏｂｅｕｍ）、ドレア・ロンギカテナ（Ｄｏｒｅａ  ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ）、ユウバクテリウム・ラムルス（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒａｍｕｌｕｓ）、ルミノコッカス・グナバス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｇｎａｖｕｓ）、ルミノコッカス・トルキース（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｏｒｑｕｅｓ）、ラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａ）細菌５＿１＿６３ＦＡＡ、ラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）細菌３＿１＿５７ＦＡＡ＿ＣＴ１、及びラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）細菌８＿１＿５７ＦＡＡ、未分類のコプロバチルス（Ｃｏｐｒｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、クロストリジウム・スパイロフォルメ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐｉｒｏｆｏｒｍｅ）、クロストリジウム・シンビオサム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｙｍｂｉｏｓｕｍ）、ベイロネラ・パルブーラ（Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａ  ｐａｒｖｕｌａ）、及び未分類のベイロネラ（Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａ）から選択される、請求項１〜２５のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項２７】
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種がグラム陰性である、請求項１〜２４のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項２８】
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種が、バクテロイデス・オバツス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｏｖａｔｕｓ）、バクテロイデス・プレビウス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｐｌｅｂｅｉｕｓ）、バクテロイデス・ユニフォルミス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ）、バクテロイデス目ｐｈ８（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄａｌｅｓ  ｐｈ８）、オドリバクター・スプランクニカス（Ｏｄｏｒｉｂａｃｔｅｒ  ｓｐｌａｎｃｈｎｉｃｕｓ）、パラプレボテーラ・クララ（Ｐａｒａｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ  ｃｌａｒａ）、未分類のパラプレボテーラ（Ｐａｒａｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、アリスティペス・ピュトレディニス（Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ  ｐｕｔｒｅｄｉｎｉｓ）、アリスティペス・シャーヒイ（Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ  ｓｈａｈｉｉ）、エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）、及びアッカーマンシア・ムシニフィラ（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ）から選択される、請求項１〜２７のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項２９】
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種が、内因性胆汁酸による増殖阻害に感受性である、請求項１〜２３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項３０】
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種が、ヒト腸内マイクロバイオーム種である、請求項１〜２３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項３１】
前記化合物又はその薬学的に許容されるアミノ酸抱合体若しくは塩が、前記医薬組成物中において５〜２５ｍｇの量で存在する、請求項１〜３０のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項３２】
前記医薬組成物が、１００〜１０１２コロニー形成単位の量の前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種を含む、請求項１〜３１のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項３３】
前記化合物又はその薬学的に許容されるアミノ酸抱合体若しくは塩が、経口、非経口、又は局所投与のために製剤化される、請求項１〜３２のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項３４】
前記化合物又はその薬学的に許容されるアミノ酸抱合体若しくは塩が、経口投与のために製剤化される、請求項１〜３３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項３５】
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種が、経口投与のために製剤化される、請求項１〜３４のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項３６】
ＦＸＲ介在性の疾患若しくは病態、又は前記腸内マイクロバイオームの異常な組成が関与する疾患若しくは病態を治療又は予防するための、請求項１〜３５のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項３７】
式Ｉ：
【化１８】
2020509001.tif 000008
の化合物、又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体（式中、
Ｒ１は、非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ２は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ３は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、及びＲ７はそれぞれに独立してＨ又はヒドロキシルであり；
Ｒ８は、Ｈ又は非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｘは、Ｃ（Ｏ）ＯＨ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｍＳＯ３Ｈ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｎＣＯ２Ｈ、又はＯＳＯ３Ｈであり；
ｍは１、２又は３であり；且つ
ｎは、１、２又は３である）を含む組成物であって、
ＦＸＲ介在性の疾患若しくは病態、又は前記腸内マイクロバイオームの異常な組成が関与する疾患若しくは病態を治療又は予防する際に１種以上の腸内マイクロバイオーム種と組み合わせて使用するための、組成物。
【請求項３８】
式Ｉ：
【化１９】
2020509001.tif 000009
の化合物、又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体（式中、
Ｒ１は、非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ２は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ３は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、及びＲ７はそれぞれに独立してＨ又はヒドロキシルであり；
Ｒ８は、Ｈ又は非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｘは、Ｃ（Ｏ）ＯＨ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｍＳＯ３Ｈ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｎＣＯ２Ｈ、又はＯＳＯ３Ｈであり；
ｍは１、２又は３であり；且つ
ｎは、１、２又は３である）の使用であって、
ＦＸＲ介在性の疾患若しくは病態、又は前記腸内マイクロバイオームの異常な組成が関与する疾患若しくは病態の治療又は予防のための１種以上の腸内マイクロバイオーム種との併用療法ための医薬の製造における使用。
【請求項３９】
式Ｉ：
【化２０】
2020509001.tif 000010
の化合物、又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体（式中、
Ｒ１は、非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ２は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ３は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、及びＲ７はそれぞれに独立してＨ又はヒドロキシルであり；
Ｒ８は、Ｈ又は非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｘは、Ｃ（Ｏ）ＯＨ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｍＳＯ３Ｈ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｎＣＯ２Ｈ、又はＯＳＯ３Ｈであり；
ｍは１、２又は３であり；且つ
ｎは、１、２又は３である）、及び１種以上の腸内マイクロバイオーム種を含む組み合わせ物であって、
ＦＸＲ介在性の疾患若しくは病態、又は前記腸内マイクロバイオームの異常な組成が関与する疾患若しくは病態を治療又は予防するための、組み合わせ物。
【請求項４０】
疾患又は病態を治療又は予防する際のＦＸＲリガンドの有効性を増強するための組成物であって、１種以上の腸内マイクロバイオーム種を含む、組成物。
【請求項４１】
疾患又は病態の治療又は予防におけるＦＸＲリガンドの有効性を増強するための医薬の製造における、１種以上の腸内マイクロバイオーム種の使用。
【請求項４２】
１種以上の腸内マイクロバイオーム種を含む組成物であって、前記組成物は、ＦＸＲ介在性の疾患若しくは病態、又は前記腸内マイクロバイオームの異常な組成が関与する疾患若しくは病態を治療又は予防するための組成物であり、前記組成物は、式Ｉ：
【化２０】
2020509001.tif 000011
の化合物、又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体（式中、
Ｒ１は、非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ２は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ３は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、及びＲ７はそれぞれに独立してＨ又はヒドロキシルであり；
Ｒ８は、Ｈ又は非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｘは、Ｃ（Ｏ）ＯＨ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｍＳＯ３Ｈ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｎＣＯ２Ｈ、又はＯＳＯ３Ｈであり；
ｍは１、２又は３であり；且つ
ｎは、１、２又は３である）と組み合わせて投与されることを特徴とする、組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１３】
本願を通して引用された全ての参考文献（参考文献、発行された特許、出願公開公報、及び同時係属特許出願）の内容は、それらの全体が参照により本明細書に明示的に組み込まれる。本明細書中で引用する参考文献は、本願に対する先行技術であることを認めるものではない。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
式Ｉ
【化１１】
2020509001.tif 000012
の化合物、又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体（式中、
Ｒ１は、非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ２は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ３は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、及びＲ７はそれぞれに独立してＨ又はヒドロキシルであり；
Ｒ８は、Ｈ又は非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｘは、Ｃ（Ｏ）ＯＨ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｍＳＯ３Ｈ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｎＣＯ２Ｈ、又はＯＳＯ３Ｈであり；
ｍは１、２又は３であり；且つ
ｎは、１、２又は３である）
及び１種以上の腸内マイクロバイオーム種、並びに薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
（項目２）
Ｒ１がメチル又はエチルである、項目１に記載の医薬組成物。
（項目３）
Ｒ１がエチルである、項目１又は２に記載の医薬組成物。
（項目４）
Ｒ２がＨである、項目１〜３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目５）
Ｒ２がヒドロキシルである、項目１〜３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目６）
Ｒ３がＨである、項目１〜５のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目７）
Ｒ３がヒドロキシルである、項目１〜５のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目８）
Ｒ４がヒドロキシルであり、且つＲ５がＨである、項目１〜７のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目９）
Ｒ４がＨであり、且つＲ５がヒドロキシルである、項目１〜７のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目１０）
Ｒ６がヒドロキシルであり、且つＲ７がＨである、項目１〜９のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目１１）
Ｒ６がＨであり、且つＲ７がヒドロキシルである、項目１〜９のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目１２）
Ｒ８がＨである、項目１〜１１のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目１３）
Ｒ８がメチル又はエチルである、項目１〜１１のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目１４）
Ｒ８がメチルである、項目１〜１３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目１５）
Ｘが、Ｃ（Ｏ）ＯＨ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ＳＯ３Ｈ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ＣＯ２Ｈ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）２ＳＯ３Ｈ、又はＣ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）２ＣＯ２Ｈである、項目１〜１４のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目１６）
ＸがＣ（Ｏ）ＯＨである、項目１〜１５のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目１７）
ＸがＯＳＯ３Ｈである、項目１〜１４のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目１８）
前記化合物が、式Ｉｂ−１又はＩｂ−２：
【化１２】
2020509001.tif 000013
又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体である、項目１に記載の医薬組成物。
（項目１９）
前記化合物が、式Ｉｃ：
【化１３】
2020509001.tif 000014
又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体である、項目１に記載の医薬組成物。
（項目２０）
前記化合物が：
【化１４】
2020509001.tif 000015
又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体である、項目１に記載の医薬組成物。
（項目２１）
前記化合物が：
【化１５】
2020509001.tif 000016
又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体である、項目１に記載の医薬組成物。
（項目２２）
前記化合物が：
【化１６】
2020509001.tif 000017
又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体である、項目１に記載の医薬組成物。
（項目２３）
前記化合物が：
【化１７】
2020509001.tif 000018
又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体である、項目１に記載の医薬組成物。
（項目２４）
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種が：アクチノミセス科（Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔａｃｅａｅ）、ボゴリエラ科（Ｂｏｇｏｒｉｅｌｌａｃｅａｅ）、ブレビバクテリウム科（Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、セルロモナス科（Ｃｅｌｌｕｌｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、アコレプラズマ科（Ａｃｈｏｌｅｐｌａｓｍａｔａｃｅａｅ）、アシドチオバシラス科（Ａｃｉｄｉｔｈｉｏｂａｃｉｌｌａｃｅａｅ）、アルカニヴォラックス科（Ａｌｃａｎｉｖｏｒａｃａｃｅａｅ）、アルテロモナス科（Ａｌｔｅｒｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、ブラッタバクテリウム科（Ｂｌａｔｔａｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、カルジオバクテリウム科（Ｃａｒｄｉｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、クラミジア科（Ｃｈｌａｍｙｄｉａｃｅａｅ）、クロマチウム科（Ｃｈｒｏｍａｔｉａｃｅａｅ）、クロストリジウム目（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ）ファミリーＸＩＩＩ．（所属不明）、シクロバクテリウム科（Ｃｙｃｌｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、デハロコッコイデス科（Ｄｅｈａｌｏｃｏｃｃｏｉｄａｃｅａｅ）、デスルフォバクター科（Ｄｅｓｕｌｆｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、デスルフォバルブス科（Ｄｅｓｕｌｆｏｂｕｌｂａｃｅａｅ）、エクトチオロドスピラ科（Ｅｃｔｏｔｈｉｏｒｈｏｄｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）、エルシミクロビウム科（Ｅｌｕｓｉｍｉｃｒｏｂｉａｃｅａｅ）、エントモプラズマ科（Ｅｎｔｏｍｏｐｌａｓｍａｔａｃｅａｅ）、エリスロバクター科（Ｅｒｙｔｈｒｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、ガリオネラ科（Ｇａｌｌｉｏｎｅｌｌａｃｅａｅ）、ハロアナエロビウム科（Ｈａｌａｎａｅｒｏｂｉａｃｅａｅ）、ヨネシア科（Ｊｏｎｅｓｉａｃｅａｅ）、コフレリア科（Ｋｏｆｌｅｒｉａｃｅａｅ）、レプトスピラ科（Ｌｅｐｔｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）、メタノバクテリウム科（Ｍｅｔｈａｎｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、メチロコッカス科（Ｍｅｔｈｙｌｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、メチロフィルス科（Ｍｅｔｈｙｌｏｐｈｉｌａｃｅａｅ）、ミクソコッカス科（Ｍｙｘｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ニトロソモナス科（Ｎｉｔｒｏｓｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、ニトロスピラ科（Ｎｉｔｒｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）、オセアノスピリルム科（Ｏｃｅａｎｏｓｐｉｒｉｌｌａｃｅａｅ）、オシロスピラ科（Ｏｓｃｉｌｌｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）、ピスキリケッチア科（Ｐｉｓｃｉｒｉｃｋｅｔｔｓｉａｃｅａｅ）、プロピオニバクテリア科（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、シュードアルテロモナス科（Ｐｓｅｕｄｏａｌｔｅｒｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、プニセイコッカス科（Ｐｕｎｉｃｅｉｃｏｃｃａｃｅａｅ）、リケッチア科（Ｒｉｃｋｅｔｔｓｉａｃｅａｅ）、ルブロバクター科（Ｒｕｂｒｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、シェワネラ科（Ｓｈｅｗａｎｅｌｌａｃｅａｅ）、スピロヘータ科（Ｓｐｉｒｏｃｈａｅｔａｃｅａｅ）、スピロプラズマ科（Ｓｐｉｒｏｐｌａｓｍａｔａｃｅａｅ）、ステレラセアエ科（Ｓｕｔｔｅｒｅｌｌａｃｅａｅ）、シントロフォモナス科（Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、テルムス科（Ｔｈｅｒｍａｃｅａｅ）、コリネバクテリア科（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、デルマバクター科（Ｄｅｒｍａｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、ディエジア科（Ｄｉｅｔｚｉａｃｅａｅ）、ゲオデルマトフィラス科（Ｇｅｏｄｅｒｍａｔｏｐｈｉｌａｃｅａｅ）、ゴルドニア科（Ｇｏｒｄｏｎｉａｃｅａｅ）、イントラスポランギウム科（Ｉｎｔｒａｓｐｏｒａｎｇｉａｃｅａｅ）、ミクロバクテリウム科（Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、ミクロコッカス科（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ミクロモノスポラ科（Ｍｉｃｒｏｍｏｎｏｓｐｏｒａｃｅａｅ）、マイコバクテリア科（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、ノカルジア科（Ｎｏｃａｒｄｉａｃｅａｅ）、プロミクロモノスポラ科（Ｐｒｏｍｉｃｒｏｍｏｎｏｓｐｏｒａｃｅａｅ）、プロピオニバクテリウム亜目（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｎｅａｅ）、ストレプトマイセス科（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｔａｃｅａｅ）、マイクロコッカス亜目（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｉｎｅａｅ）、ビフィドバクテリウム科（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、コリオバクテリウム科（Ｃｏｒｉｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、デイノコッカス科（Ｄｅｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ハロバクテロイデス科（Ｈａｌｏｂａｃｔｅｒｏｉｄａｃｅａｅ）、アリシクロバシラス科（Ａｌｉｃｙｃｌｏｂａｃｉｌｌａｃｅａｅ）、バチルス科（Ｂａｃｉｌｌａｃｅａｅ）、バチルス目（Ｂａｃｉｌｌａｌｅｓ）（所属不明）ＸＩ、リステリア科（Ｌｉｓｔｅｒｉａｃｅａｅ）、パエニバシラス科（Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌａｃｅａｅ）、プラノコッカス科（Ｐｌａｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、スタフィロコッカス科（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、アエロコッカス科（Ａｅｒｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、カルノバクテリウム科（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、エンテロコッカス科（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ラクトバチルス科（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌａｃｅａｅ）、ロイコノストック科（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃａｃｅａｅ）、ストレプトコッカス科（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、クリステンセネラ科（Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎｅｌｌａｃｅａｅ）、クロストリジウム科（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ）、ルミノコッカス科（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ファミリーＸＩＩＩ（所属不明）、ペプトストレプトコッカス科（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ファミリーＸＩ（所属不明）、ラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）、ユウバクテリウム科（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、エリシペロトリクス科（Ｅｒｙｓｉｐｅｌｏｔｒｉｃｈａｃｅａｅ）、エリシペロトリクス科（Ｅｒｙｓｉｐｅｌｏｔｒｉｃｈａｃｅａｅ）ＸＶＩ、エリシペロトリクス科（Ｅｒｙｓｉｐｅｌｏｔｒｉｃｈａｃｅａｅ）ＸＶＩＩ、エリシペロトリクス科（Ｅｒｙｓｉｐｅｌｏｔｒｉｃｈａｃｅａｅ）ＸＶＩＩＩ、アキダミノコッカス科（Ａｃｉｄｉａｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ペプトコッカス科（Ｐｅｐｔｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ベイヨネラ科（Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａｃｅａｅ）、バクテロイデス科（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄａｃｅａｅ）、ポルフィロモナス科（Ｐｏｒｐｈｙｒｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、プレボテラ科（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａｃｅａｅ）、リケネーラ科（Ｒｉｋｅｎｅｌｌａｃｅａｅ）、サイトファーガ科（Ｃｙｔｏｐｈａｇａｃｅａｅ）、フラボバクテリウム科（Ｆｌａｖｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、キチノファガ科（Ｃｈｉｔｉｎｏｐｈａｇａｃｅａｅ）、スフィンゴバクテリウム科（Ｓｐｈｉｎｇｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、フソバクテリア科（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、レプトトリキア科（Ｌｅｐｔｏｔｒｉｃｈｉａｃｅａｅ）、ヴィクチヴァリス科（Ｖｉｃｔｉｖａｌｌａｃｅａｅ）、プランクトミケス科（Ｐｌａｎｃｔｏｍｙｃｅｔａｃｅａｅ）、カウロバクター科（Ｃａｕｌｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、アウランチモナス科（Ａｕｒａｎｔｉｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、ブラジリゾビウム科（Ｂｒａｄｙｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）、ブルセラ科（Ｂｒｕｃｅｌｌａｃｅａｅ）、ヒフォミクロビウム科（Ｈｙｐｈｏｍｉｃｒｏｂｉａｃｅａｅ）、メチロバクテリウム科（Ｍｅｔｈｙｌｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、フィロバクテリア科（Ｐｈｙｌｌｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、リゾビウム科（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）、キサントバクター科（Ｘａｎｔｈｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、ロドバクター科（Ｒｈｏｄｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、アセトバクター科（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、ロドスピリラム科（Ｒｈｏｄｏｓｐｉｒｉｌｌａｃｅａｅ）、スフィンゴモナス科（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、アルカリゲネス科（Ａｌｃａｌｉｇｅｎａｃｅａｅ）、バークホルデリア科（Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａｃｅａｅ）、コマモナス科（Ｃｏｍａｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、オキサロバクター科（Ｏｘａｌｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、ステレラ科（Ｓｕｔｅｒｅｌｌａｃｅａｅ）、ナイセリア科（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａｃｅａｅ）、ロドシクルス科（Ｒｈｏｄｏｃｙｃｌａｃｅａｅ）、デスルホビブリオ科（Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｂｒｉｏｎａｃｅａｅ）、カンピロバクター科（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、ヘリコバクター科（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、アエロモナス科（Ａｅｒｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、サクシニビブリオ科（Ｓｕｃｃｉｎｉｖｉｂｒｉｏｎａｃｅａｅ）、腸内細菌科（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、パスツレラ科（Ｐａｓｔｅｕｒｅｌｌａｃｅａｅ）、モラクセラ科（Ｍｏｒａｘｅｌｌａｃｅａｅ）、シュードモナス科（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、ビブリオ科（Ｖｉｂｒｉｏｎａｃｅａｅ）、シノバクター科（Ｓｉｎｏｂａｃｔｅｒａｃｅａｅ）、キサントモナス科（Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｄａｃｅａｅ）、ブラキスピラ科（Ｂｒａｃｈｙｓｐｉｒａｃｅａｅ）、シネルギステス科（Ｓｙｎｅｒｇｉｓｔａｃｅａｅ）、マイコプラズマ科（Ｍｙｃｏｐｌａｓｍａｔａｃｅａｅ）、及びウェルコミクロビウム科（Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａｃｅａｅ）から選択されるファミリーにおけるメンバーである、項目１〜２３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目２５）
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種がグラム陽性である、項目１〜２４のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目２６）
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種が、ビフィドバクテリウム・ブレーベ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｂｒｅｖｅ）、ビフィドバクテリウム・ロングム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌｏｎｇｕｍ）、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｃａｓｅｉ）、ラクトバチルス・パラカゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｐａｒａｃａｓｅｉ）、ペディオコッカス・ペントサセウス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ  ｐｅｎｔｏｓａｃｅｕｓ）、ラクトコッカス・ラクティス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｌａｃｔｉｓ）、ストレプトコッカス・パラサングイニス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｐａｒａｓａｎｇｕｉｎｉｓ）、ストレプトコッカス・サリバリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）、ストレプトコッカス・サーモフィルス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）、ルミノコッカス・ブローミイ（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｂｒｏｍｉｉ）、ルミノコッカス・トルキース（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｏｒｑｕｅｓ）、未分類のアナエロツルンカス（Ａｎａｅｒｏｔｒｕｎｃｕｓ）、未分類のサブドリグラヌルム（Ｓｕｂｄｏｌｉｇｒａｎｕｌｕｍ）、クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）、ブラウティア（ルミノコッカス）・オベウム（Ｂｌａｕｔｉａ  （Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）  ｏｂｅｕｍ）、ドレア・ロンギカテナ（Ｄｏｒｅａ  ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ）、ユウバクテリウム・ラムルス（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｒａｍｕｌｕｓ）、ルミノコッカス・グナバス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｇｎａｖｕｓ）、ルミノコッカス・トルキース（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｔｏｒｑｕｅｓ）、ラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａ）細菌５＿１＿６３ＦＡＡ、ラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）細菌３＿１＿５７ＦＡＡ＿ＣＴ１、及びラクノスピラ科（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ）細菌８＿１＿５７ＦＡＡ、未分類のコプロバチルス（Ｃｏｐｒｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、クロストリジウム・スパイロフォルメ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｐｉｒｏｆｏｒｍｅ）、クロストリジウム・シンビオサム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｓｙｍｂｉｏｓｕｍ）、ベイロネラ・パルブーラ（Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａ  ｐａｒｖｕｌａ）、及び未分類のベイロネラ（Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａ）から選択される、項目１〜２５のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目２７）
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種がグラム陰性である、項目１〜２４のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目２８）
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種が、バクテロイデス・オバツス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｏｖａｔｕｓ）、バクテロイデス・プレビウス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｐｌｅｂｅｉｕｓ）、バクテロイデス・ユニフォルミス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ  ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ）、バクテロイデス目ｐｈ８（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄａｌｅｓ  ｐｈ８）、オドリバクター・スプランクニカス（Ｏｄｏｒｉｂａｃｔｅｒ  ｓｐｌａｎｃｈｎｉｃｕｓ）、パラプレボテーラ・クララ（Ｐａｒａｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ  ｃｌａｒａ）、未分類のパラプレボテーラ（Ｐａｒａｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、アリスティペス・ピュトレディニス（Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ  ｐｕｔｒｅｄｉｎｉｓ）、アリスティペス・シャーヒイ（Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ  ｓｈａｈｉｉ）、エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）、及びアッカーマンシア・ムシニフィラ（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ）から選択される、項目１〜２７のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目２９）
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種が、内因性胆汁酸による増殖阻害に感受性である、項目１〜２３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目３０）
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種が、ヒト腸内マイクロバイオーム種である、項目１〜２３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目３１）
前記化合物又はその薬学的に許容されるアミノ酸抱合体若しくは塩が、前記医薬組成物中において５〜２５ｍｇの量で存在する、項目１〜３０のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目３２）
前記医薬組成物が、１００〜１０１２コロニー形成単位の量の前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種を含む、項目１〜３１のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目３３）
前記化合物又はその薬学的に許容されるアミノ酸抱合体若しくは塩が、経口、非経口、又は局所投与のために製剤化される、項目１〜３２のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目３４）
前記化合物又はその薬学的に許容されるアミノ酸抱合体若しくは塩が、経口投与のために製剤化される、項目１〜３３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目３５）
前記１種以上の腸内マイクロバイオーム種が、経口投与のために製剤化される、項目１〜３４のいずれか一項に記載の医薬組成物。
（項目３６）
ＦＸＲ介在性の疾患若しくは病態、又は前記腸内マイクロバイオームの異常な組成が関与する疾患若しくは病態を治療又は予防する方法であって、それを必要とする対象に、項目１〜３５のいずれか一項に記載の医薬組成物を投与することを含む方法。
（項目３７）
式Ｉ：
【化１８】
2020509001.tif 000019
の化合物、又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体（式中、
Ｒ１は、非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ２は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ３は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、及びＲ７はそれぞれに独立してＨ又はヒドロキシルであり；
Ｒ８は、Ｈ又は非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｘは、Ｃ（Ｏ）ＯＨ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｍＳＯ３Ｈ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｎＣＯ２Ｈ、又はＯＳＯ３Ｈであり；
ｍは１、２又は３であり；且つ
ｎは、１、２又は３である）であって、
ＦＸＲ介在性の疾患若しくは病態、又は前記腸内マイクロバイオームの異常な組成が関与する疾患若しくは病態を治療又は予防する際に１種以上の腸内マイクロバイオーム種と組み合わせて使用するための、化合物、又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体。
（項目３８）
式Ｉ：
【化１９】
2020509001.tif 000020
の化合物、又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体（式中、
Ｒ１は、非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ２は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ３は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、及びＲ７はそれぞれに独立してＨ又はヒドロキシルであり；
Ｒ８は、Ｈ又は非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｘは、Ｃ（Ｏ）ＯＨ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｍＳＯ３Ｈ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｎＣＯ２Ｈ、又はＯＳＯ３Ｈであり；
ｍは１、２又は３であり；且つ
ｎは、１、２又は３である）の使用であって、
ＦＸＲ介在性の疾患若しくは病態、又は前記腸内マイクロバイオームの異常な組成が関与する疾患若しくは病態の治療又は予防のための１種以上の腸内マイクロバイオーム種との併用療法ための医薬の製造における使用。
（項目３９）
式Ｉ：
【化２０】
2020509001.tif 000021
の化合物、又はその薬学的に許容される塩若しくはアミノ酸抱合体（式中、
Ｒ１は、非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｒ２は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ３は、Ｈ又はヒドロキシルであり；
Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、及びＲ７はそれぞれに独立してＨ又はヒドロキシルであり；
Ｒ８は、Ｈ又は非置換Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり；
Ｘは、Ｃ（Ｏ）ＯＨ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｍＳＯ３Ｈ、Ｃ（Ｏ）ＮＨ（ＣＨ２）ｎＣＯ２Ｈ、又はＯＳＯ３Ｈであり；
ｍは１、２又は３であり；且つ
ｎは、１、２又は３である）の使用であって、
ＦＸＲ介在性の疾患若しくは病態、又は前記腸内マイクロバイオームの異常な組成が関与する疾患若しくは病態を治療又は予防する際の１種以上の腸内マイクロバイオーム種との組み合わせにおける使用。
（項目４０）
疾患又は病態を治療又は予防する際のＦＸＲリガンドの有効性を増強する方法であって、それを必要とする対象に１種以上の腸内マイクロバイオーム種を投与することを含む方法。
（項目４１）
疾患又は病態を治療又は予防する際にＦＸＲリガンドの有効性を増強することに使用するための、１種以上の腸内マイクロバイオーム種。
（項目４２）
疾患又は病態の治療又は予防におけるＦＸＲリガンドの有効性を増強するための医薬の製造における、１種以上の腸内マイクロバイオーム種の使用。
（項目４３）
疾患又は病態を治療又は予防する際にＦＸＲリガンドの有効性を増強する際の、１種以上の腸内マイクロバイオーム種の使用。