【手続補正書】
【提出日】令和3年11月5日(2021.11.5)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
クロマトグラフィーカラムでのＲＮＡの保持時間を変更する方法であって、ＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数を、元のＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数に対して変更することにより、前記ＲＮＡ配列を適合させる工程を含むことを特徴とする方法。
【請求項２】
前記元のＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数を決定する工程と、前記適合されたＲＮＡ配列を得るために、前記Ａ及び／又はＵヌクレオチドの数を増加又は減少させる工程とを含む請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記元のＲＮＡ配列中のＧ及び／又はＣヌクレオチドを、Ａ及び／又はＵヌクレオチドで置き換える工程を含む、及び／又は
前記元のＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドを、Ｇ及び／又はＣヌクレオチドで置き換える工程を含む請求項１から２のいずれかに記載の方法。
【請求項４】
前記元のＲＮＡ配列の非コード領域に、更なるヌクレオチド、好ましくはＧ及び／又はＣヌクレオチド、より好ましくはＡ及び／又はＵヌクレオチドを導入する工程を含む、及び／又は
前記ＲＮＡがコード領域を含み、前記ＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数が前記コード領域中で変更され、前記適合されたＲＮＡ配列のコード領域によりコードされるアミノ酸配列が、好ましくは前記元のＲＮＡ配列のコード領域によりコードされるアミノ酸配列に対して変更されない請求項１から３のいずれかに記載の方法。
【請求項５】
前記適合されたＲＮＡの保持時間を、Ａ及び／又はＵヌクレオチドの数を前記元のＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数に対して、少なくとも２個、好ましくは少なくとも３個、より好ましくは少なくとも４個、更により好ましくは少なくとも５個、最も好ましくは少なくとも１０個、増加させることによって長くする、又は
前記適合されたＲＮＡの保持時間を、Ａ及び／又はＵヌクレオチドの数を前記元のＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数に対して、少なくとも２個、好ましくは少なくとも３個、より好ましくは少なくとも４個、更により好ましくは少なくとも５個、最も好ましくは少なくとも１０個、減少させることによって短くする請求項１から４のいずれかに記載の方法。
【請求項６】
前記クロマトグラフィーカラムが、ＨＰＬＣカラムであり、
前記クロマトグラフィーカラムが、好ましくは固定相として逆相を含む、及び／又は
前記クロマトグラフィーカラムが、ポリスチレン、非アルキル化ポリスチレン、アルキル化ポリスチレン、ポリスチレンジビニルベンゼン、非アルキル化ポリスチレンジビニルベンゼン、アルキル化ポリスチレンジビニルベンゼン、シリカゲル、非極性残基で修飾されたシリカゲル、ブチル、オクチル、及び／又はオクタデシル含有残基から選択されるアルキル含有残基で修飾されたシリカゲル、フェニル残基で修飾されたシリカゲル、又はポリメタクリレートからなる群から選択される材料、好ましくは多孔質材料を含む、及び／又は
前記クロマトグラフィーカラムが、ビーズによって形成されたカラム又はモノリシックカラムである請求項１から５のいずれかに記載の方法。
【請求項７】
少なくとも２つのＲＮＡ種の混合物から少なくとも１つのＲＮＡ種を精製するための方法であって、
ａ）元の配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数に対してＡ及び／又はＵヌクレオチドの数を変更することにより、少なくとも１つのＲＮＡ種の配列を適合させる工程；及び
ｂ）前記適合されたＲＮＡ種が、少なくとも１つの他のＲＮＡ種から分離されるクロマトグラフィー工程を含むことを特徴とする方法。
【請求項８】
工程ａ）が、請求項１から６のいずれかに定義されたクロマトグラフィーカラムでのＲＮＡの保持時間を変更することを含み、
前記適合されたＲＮＡ種中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数が、好ましくは前記少なくとも１つの他のＲＮＡ種中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数と、少なくとも２個、好ましくは少なくとも３個、より好ましくは少なくとも４個、更により好ましくは少なくとも５個、最も好ましくは少なくとも１０個、異なる、又は
前記適合されたＲＮＡ種中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数が、前記少なくとも１つの他のＲＮＡ種中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数と、少なくとも２０個、好ましくは少なくとも３０個、より好ましくは少なくとも４０個、更により好ましくは少なくとも５０個、最も好ましくは少なくとも６０個、異なる請求項７に記載の方法。
【請求項９】
少なくとも２つのＲＮＡ種を含む混合物から少なくとも２つのＲＮＡ種を共精製するための方法であって、
ａ）元のＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数に対して、ＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数を変更することにより、少なくとも１つのＲＮＡ種の配列を適合させる工程；及び
ｂ）適合された配列を有する前記少なくとも１つのＲＮＡ種と、少なくとも１つの更なるＲＮＡ種とが共精製される、好ましくは前記共精製される少なくとも２つのＲＮＡ種が、同一画分中に溶出するクロマトグラフィー工程を含むことを特徴とする方法。
【請求項１０】
工程ａ）が、共精製される少なくとも２つのＲＮＡ種中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数が適合されるＡ及び／又はＵヌクレオチドの目標数を決定することを含む、及び／又は
前記共精製される少なくとも２つのＲＮＡ種のそれぞれの配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数が、２０個以下、より好ましくは３０個以下、更により好ましくは４０個以下、最も好ましくは５０個以下、異なる、又は
前記共精製される少なくとも２つのＲＮＡ種のそれぞれの配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数が、２個以下、好ましくは３個以下、より好ましくは４個以下、更により好ましくは５個以下、最も好ましくは１０個以下、異なる請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
少なくとも２つのＲＮＡ種の配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数を調和させるための方法であって、ＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数を、元のＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数に対して変更することにより、少なくとも１つのＲＮＡ種の配列を適合させることを含むことを特徴とする方法、好ましくは請求項１から１０で定義された特徴のいずれかを更に含む方法。
【請求項１２】
少なくとも２つの調和されたＲＮＡ種を含む混合物の合成のための方法であって、
ａ）少なくとも２つのＲＮＡ種の配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数を調和させることを含む工程であって、少なくとも１つのＲＮＡ種の配列が、ＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数を元のＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数に対して変更することにより適合される工程；及び
ｂ）少なくとも２つの調和されたＲＮＡ種の合成工程を含むことを特徴とする方法。
【請求項１３】
工程ｂ）が、前記少なくとも２つの調和されたＲＮＡ種を別々に合成することを含む、又は１つのバッチにおける、前記少なくとも２つの調和されたＲＮＡ種の合成を含む請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
請求項１から１１のいずれかで定義された特徴のいずれかによって更に特徴付けられる請求項１２から１３のいずれかに記載の方法。
【請求項１５】
少なくとも１つのＲＮＡ又は少なくとも１つのＲＮＡ種がコード領域を含むｍＲＮＡであり、元のＲＮＡ配列のコード領域が最適化されたコード配列を含み、
前記最適化されたコード配列が、Ｃ最大化コード配列、Ｇ／Ｃ増加コード配列、Ｇ／Ｃ最適化コード配列、ヒトコドン使用最適化コード配列、ＣＡＩ最大化コード配列、又はそれらの任意の組合せから選択され、
コードされたアミノ酸配列は、好ましくは、対応する野生型ｍＲＮＡによってコードされるアミノ酸配列と比較して変更されない請求項１から１４のいずれかに記載の方法。
【請求項１６】
前記少なくとも１つのＲＮＡ又は少なくとも１つのＲＮＡ種が、少なくとも１つのコード領域を含み、前記コード領域が、好ましくは、配列番号２６〜１４０７９、１４０８０〜１６２６４、１６２６５〜２８６４０、２８６４１〜３０５６８のいずれかに係る核酸配列、又はこれらの核酸配列のいずれかの断片若しくは変異体を含む請求項１から１５のいずれかに記載の方法。
【請求項１７】
請求項１から１６のいずれかに記載の方法によって得ることができることを特徴とするＲＮＡ、好ましくは適合されたＲＮＡ。
【請求項１８】
請求項１７に記載のＲＮＡに対応する又は請求項１７に記載のＲＮＡをコードする核酸配列を含むことを特徴とするベクター。
【請求項１９】
少なくとも２つのＲＮＡ種を含む組成物であって、少なくとも１つのＲＮＡ種の配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数が、元のＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数に対して変更することにより、少なくとも１つのＲＮＡ種の配列が適合されていることを特徴とする組成物。
【請求項２０】
少なくとも１つのＲＮＡ種の配列が、請求項１から１６のいずれかに定義された特徴のいずれかを含む方法によって適合されており、
少なくとも２つのＲＮＡ種の配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数が、好ましくは調和され、より好ましくは請求項１１に記載の方法を使用することによって調和される請求項１９に記載の組成物。
【請求項２１】
前記組成物が、インフルエンザウイルスに由来するペプチド又はタンパク質、又は前記ペプチド又はタンパク質の断片若しくは変異体をコードする少なくとも１つのコード領域を含む少なくとも１つのＲＮＡ種を含む、及び／又は
前記少なくとも１つのＲＮＡ種が、インフルエンザウイルスヘマグルチニン（ＨＡ）及び／又はインフルエンザウイルスノイラミニダーゼ（ＮＡ）、又はそれらの断片若しくは変異体をコードする請求項１９から２０のいずれかに記載の組成物。
【請求項２２】
少なくとも１つのＲＮＡ種のＲＮＡが、好ましくはカチオン性又はポリカチオン性ポリマー、カチオン性又はポリカチオン性多糖、カチオン性又はポリカチオン性脂質、カチオン性又はポリカチオン性タンパク質、カチオン性又はポリカチオン性ペプチド、又はそれらの任意の組合せから選択される１つ以上のカチオン性又はポリカチオン性化合物と複合体化又は少なくとも部分的に複合体化又は会合している、及び／又は
少なくとも１つのＲＮＡ種のＲＮＡが、脂質、好ましくはカチオン性又は中性脂質と複合体化又は会合し、それにより好ましくはリポソーム、リポプレックス、脂質ナノ粒子、又はナノリポソームを形成する請求項１９から２１のいずれかに記載の組成物。
【請求項２３】
請求項１７に記載のＲＮＡ又は請求項１９から２２のいずかに記載の組成物を含むワクチンであって、
任意で、前記ワクチンはインフルエンザウイルスワクチンであることを特徴とするワクチン、好ましくは多価ワクチン。
【請求項２４】
請求項１７に記載のＲＮＡ、請求項１９から２２のいずれかに記載の組成物、又は請求項２３に記載のワクチン、任意に、可溶化のための液体ビヒクル、及び任意に、前記成分の用法及び用量に関する情報を提供する技術的指示を含むことを特徴とするキット又はキットオブパーツ。
【請求項２５】
医薬として使用するための、請求項１９から２２のいずれかに記載の組成物、請求項２３に記載のワクチン、又は請求項２４に記載のキット又はキットオブパーツ。
【請求項２６】
適合されたＲＮＡを提供するための方法であって、以下の工程：
ａ）任意に、元のＲＮＡ配列中のヌクレオチドの総数を決定する工程；
ｂ）前記元のＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数を決定する工程；
ｃ）コードされたアミノ酸配列を変更せずに、少なくとも１つの代替コドンで置き換えることができる前記元のＲＮＡ配列中のコドンを決定する工程；
ｄ）少なくとも１つの元のコドンを代替コドンで置き換えることにより、ＲＮＡ配列中のＡ及び／又はＵヌクレオチドの数を予め設定した数のＡ及び／又はＵヌクレオチドに調整することであって、前記代替コドンが、前記元のコドンと同一のアミノ酸をコードし、更にＡ及び／又はＵヌクレオチドの含量が高いという特徴を有する工程；及び
ｅ）任意に、好ましくはインビトロ転写を介して、前記ＲＮＡを生成する工程を含むことを特徴とする方法。