【手続補正書】
【提出日】令和3年1月15日(2021.1.15)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
病原体またはがんを有するか、または有する疑いのあるヒト患者を処置するための、医薬組成物の組み合わせ物であって、該組み合わせ物が、
（１）阻害性免疫チェックポイント阻害剤を含む医薬組成物と；
（２）ヒト細胞の集団を含む医薬組成物と
を含み、
該ヒト細胞の集団が、該病原体またはがんの抗原に特異的であり、該ヒト患者の疾患細胞によって発現される第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞系に由来する抗原特異的Ｔ細胞を含み；該第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、該ヒト患者への治療的投与に適しており、かつ、該抗原の認識に基づいた、それぞれのＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞の活性に関して、該疾患細胞によって発現されるＨＬＡ対立遺伝子およびＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちのサブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せである、
医薬組成物の組み合わせ物。
【請求項２】
病原体またはがんを有するか、または有する疑いのあるヒト患者を処置するための、医薬組成物の組み合わせ物であって、該組み合わせ物が、
（１）刺激性免疫チェックポイント活性化剤を含む医薬組成物と；
（２）ヒト細胞の集団を含む医薬組成物と
を含み、
該ヒト細胞の集団が、該病原体またはがんの抗原に特異的であり、該ヒト患者の疾患細胞によって発現される第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞系に由来する抗原特異的Ｔ細胞を含み；該第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、該ヒト患者への治療的投与に適しており、かつ、該抗原の認識に基づいた、それぞれのＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞の活性に関して、該疾患細胞によって発現されるＨＬＡ対立遺伝子およびＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちのサブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せである、
医薬組成物の組み合わせ物。
【請求項３】
病原体またはがんを有するか、または有すると疑われるヒト患者への、阻害性免疫チェックポイント阻害剤または刺激性免疫チェックポイント活性化剤の投与と組み合わせた治療的投与のためのＴ細胞系を選択する方法であって、該方法が、
該病原体またはがんの抗原の少なくとも１つのエピトープを認識し、該ヒト患者の疾患細胞によって発現される第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞系を選択すること
を含み、該第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、該ヒト患者への治療的投与に適しており、かつ、該抗原の認識に基づいた、それぞれのＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞の活性に関して、該疾患細胞によって発現されるＨＬＡ対立遺伝子およびＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちのサブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せである、
方法。
【請求項４】
病原体またはがんを有するか、または有する疑いのあるヒト患者を処置するための医薬組成物であって、該医薬組成物が、
（１）阻害性免疫チェックポイント阻害剤と；
（２）該病原体またはがんの抗原に特異的であり、該ヒト患者の疾患細胞によって発現される第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞系に由来する抗原特異的Ｔ細胞を含むヒト細胞の集団と
を含み；該第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、該ヒト患者への治療的投与に適しており、かつ、該抗原の認識に基づいた、それぞれのＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞の活性に関して、該疾患細胞によって発現されるＨＬＡ対立遺伝子およびＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちのサブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せである、
医薬組成物。
【請求項５】
病原体またはがんを有するか、または有する疑いのあるヒト患者を処置するための医薬組成物であって、該医薬組成物が、
（１）刺激性免疫チェックポイント活性化剤と；
（２）該病原体またはがんの抗原に特異的であり、該ヒト患者の疾患細胞によって発現される第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞系に由来する抗原特異的Ｔ細胞を含むヒト細胞の集団と
を含み；該第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、該ヒト患者への治療的投与に適しており、かつ、該抗原の認識に基づいた、それぞれのＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞の活性に関して、該疾患細胞によって発現されるＨＬＡ対立遺伝子およびＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちのサブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せである、
医薬組成物。
【請求項６】
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤が、プログラム細胞死１（ＰＤ１）、プログラム細胞死リガンド１（ＰＤ−Ｌ１）、プログラム細胞死リガンド１（ＰＤ−Ｌ２）、細胞傷害性Ｔリンパ球関連タンパク質４（ＣＴＬＡ４）、リンパ球活性化３（ＬＡＧ３）、Ｔ細胞免疫グロブリンおよびムチンドメイン含有タンパク質３（ＴＩＭ３）、Ｔ細胞活性化のＶドメインＩｇサプレッサー（ＶＩＳＴＡ）、アデノシンＡ２ａ受容体（Ａ２ａＲ）、Ｂ７ホモログ３（Ｂ７−Ｈ３）、Ｂ７ホモログ４（Ｂ７−Ｈ４）、ＢおよびＴリンパ球関連（ＢＴＬＡ）、インドールアミン−２，３−ジオキシゲナーゼ（ＩＤＯ）、トリプトファン２，３−ジオキシゲナーゼ（ＴＤＯ）、またはキラー細胞免疫グロブリン様受容体（ＫＩＲ）の阻害剤である、請求項１に記載の医薬組成物の組み合わせ物、請求項３に記載の方法または請求項４に記載の医薬組成物。
【請求項７】
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤がＰＤ１の阻害剤である、請求項６に記載の医薬組成物の組み合わせ物、方法または医薬組成物。
【請求項８】
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤が、ＰＤ１に結合し、その活性を阻害するモノクローナル抗体である、請求項７に記載の医薬組成物の組み合わせ物、方法または医薬組成物。
【請求項９】
前記モノクローナル抗体が、ニボルマブ、ピディリズマブ、ＭＥＤＩ０６８０、またはペンブロリズマブである、請求項８に記載の医薬組成物の組み合わせ物、方法または医薬組成物。
【請求項１０】
前記刺激性免疫チェックポイント活性化剤が、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ４０、ＣＤ１２２、ＣＤ１３７、ＯＸ４０、グルココルチコイド誘導ＴＮＦＲ関連タンパク質リガンド（ＧＩＴＲ）、または誘導性Ｔ細胞共刺激因子（ＩＣＯＳ）の活性化剤である、請求項２に記載の医薬組成物の組み合わせ物、請求項３に記載の方法または請求項５に記載の医薬組成物。
【請求項１１】
前記第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、表示に従って、前記疾患細胞によって発現される第２のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せに関連付けられている相対活性よりも低い前記抗原の認識に基づく相対活性の指標に関連付けられていることに基づいて、サブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せとして分類され、該表示が（ｉ）複数のＨＬＡ対立遺伝子および必要に応じてＨＬＡ対立遺伝子の組合せを同定し、（ｉｉ）各々が該抗原の少なくとも１つのエピトープを認識し、該複数における該ＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちの複数の異なるものによって拘束されるＴ細胞系の相対活性の指標を開示し、該表示において、各々の同定されたＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せは、該ＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束される該Ｔ細胞系の相対活性のそれぞれの指標に関連付けられており、該相対活性は、該抗原の認識に基づく該Ｔ細胞系の既知の活性の相対量である、請求項１から１０のいずれかに記載の医薬組成物の組み合わせ物、方法または医薬組成物。
【請求項１２】
前記第２のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞系が利用可能であり、前記ヒト患者への治療的投与に適している、請求項１１に記載の医薬組成物の組み合わせ物、方法または医薬組成物。
【請求項１３】
前記Ｔ細胞系が、前記ヒト患者と同種異系のヒトドナーに由来する、請求項１から１２のいずれかに記載の医薬組成物の組み合わせ物、方法または医薬組成物。
【請求項１４】
前記ヒト患者が移植ドナーからの移植のレシピエントとなっており、前記ヒトドナーが該移植ドナーとは異なる第三者ドナーである、請求項１３に記載の医薬組成物の組み合わせ物、方法または医薬組成物。
【請求項１５】
Ｔ細胞の前記活性が、前記病原体またはがんを有するヒト患者の処置における該Ｔ細胞のｉｎ  ｖｉｖｏ臨床的有効性である、請求項１から１４のいずれか一項に記載の医薬組成物の組み合わせ物、方法または医薬組成物。
【請求項１６】
前記抗原が病原体の抗原であり、該病原体がサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）である、請求項１から１５のいずれかに記載の医薬組成物の組み合わせ物、方法または医薬組成物。
【請求項１７】
前記抗原が病原体の抗原であり、該病原体がエプスタインバーウイルス（ＥＢＶ）である、請求項１から１５のいずれかに記載の医薬組成物の組み合わせ物、方法または医薬組成物。
【請求項１８】
前記抗原ががんの抗原であり、該抗原がウィルムス腫瘍１（ＷＴ１）である、請求項１から１５のいずれかに記載の医薬組成物の組み合わせ物、方法または医薬組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４３】
本明細書に記載される医薬組成物の具体的な実施形態では、Ｔ細胞系は、病原体またはがんの抗原に由来する１つもしくは複数のペプチドまたはタンパク質を負荷されてもおらず、それらを発現するように遺伝子操作されてもいない抗原提示細胞に対するｉｎ  ｖｉｔｒｏの実質的な細胞傷害性を欠いている。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
病原体またはがんを有するか、もしくは有する疑いのあるヒト患者を処置する方法であって、該方法が、
（１）阻害性免疫チェックポイント阻害剤を該ヒト患者に投与することと；
（２）該病原体またはがんの抗原に特異的であり、該ヒト患者の疾患細胞によって発現される第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞系に由来する抗原特異的Ｔ細胞を含むヒト細胞の集団を該ヒト患者に投与することと
を含み；該第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、該抗原の認識に基づいた、それぞれのＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞の活性に関して、該疾患細胞によって発現されるＨＬＡ対立遺伝子およびＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちのサブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せである、
方法。
（項目２）
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤が、プログラム細胞死１（ＰＤ１）、プログラム細胞死リガンド１（ＰＤ−Ｌ１）、プログラム細胞死リガンド１（ＰＤ−Ｌ２）、細胞傷害性Ｔリンパ球関連タンパク質４（ＣＴＬＡ４）、リンパ球活性化３（ＬＡＧ３）、Ｔ細胞免疫グロブリンおよびムチンドメイン含有タンパク質３（ＴＩＭ３）、Ｔ細胞活性化のＶドメインＩｇサプレッサー（ＶＩＳＴＡ）、アデノシンＡ２ａ受容体（Ａ２ａＲ）、Ｂ７ホモログ３（Ｂ７−Ｈ３）、Ｂ７ホモログ４（Ｂ７−Ｈ４）、ＢおよびＴリンパ球関連（ＢＴＬＡ）、インドールアミン−２，３−ジオキシゲナーゼ（ＩＤＯ）、トリプトファン２，３−ジオキシゲナーゼ（ＴＤＯ）、またはキラー細胞免疫グロブリン様受容体（ＫＩＲ）の阻害剤である、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤が、阻害性免疫チェックポイントに結合し、その活性を阻害する抗体である、項目１または２に記載の方法。
（項目４）
前記抗体がモノクローナル抗体である、項目３に記載の方法。
（項目５）
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤がＰＤ１の阻害剤である、項目２に記載の方法。
（項目６）
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤が、ＰＤ１に結合し、その活性を阻害するモノクローナル抗体である、項目５に記載の方法。
（項目７）
前記モノクローナル抗体が、ニボルマブ、ピディリズマブ、ＭＥＤＩ０６８０、またはペンブロリズマブである、項目６に記載の方法。
（項目８）
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤がＰＤ−Ｌ１の阻害剤である、項目２に記載の方法。
（項目９）
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤が、ＰＤ−Ｌ１に結合し、その活性を阻害するモノクローナル抗体である、項目８に記載の方法。
（項目１０）
前記モノクローナル抗体が、ｍｐｄｌ３２８０Ａ、デュルバルマブ、アベルマブ、ｂｍｓ−９３６５５９、またはアテゾリズマブである、項目９に記載の方法。
（項目１１）
病原体またはがんを有するか、もしくは有する疑いのあるヒト患者を処置する方法であって、該方法が、
（１）刺激性免疫チェックポイント活性化剤を該ヒト患者に投与することと；
（２）該病原体またはがんの抗原に特異的であり、該ヒト患者の疾患細胞によって発現される第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞系に由来する抗原特異的Ｔ細胞を含むヒト細胞の集団を該ヒト患者に投与することと
を含み；該第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、該抗原の認識に基づいた、それぞれのＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞の活性に関して、該疾患細胞によって発現されるＨＬＡ対立遺伝子およびＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちのサブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せである、
方法。
（項目１２）
前記刺激性免疫チェックポイント活性化剤が、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ４０、ＣＤ１２２、ＣＤ１３７、ＯＸ４０、グルココルチコイド誘導ＴＮＦＲ関連タンパク質リガンド（ＧＩＴＲ）、または誘導性Ｔ細胞共刺激因子（ＩＣＯＳ）の活性化剤である、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
前記第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、前記ヒト患者への治療的投与に適しており、かつ、前記抗原の認識に基づいた、それぞれのＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞の活性に関して、前記疾患細胞によって発現されるＨＬＡ対立遺伝子およびＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちのサブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せである、項目１から１２のいずれかに記載の方法。
（項目１４）
前記第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、表示に従って、前記疾患細胞によって発現される第２のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せに関連付けられている相対活性よりも低い前記抗原の認識に基づく相対活性の指標に関連付けられていることに基づいて、サブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せとして分類され、該表示が（ｉ）複数のＨＬＡ対立遺伝子および必要に応じてＨＬＡ対立遺伝子の組合せを同定し、（ｉｉ）各々が該抗原の少なくとも１つのエピトープを認識し、該複数における該ＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちの複数の異なるものによって拘束されるＴ細胞系の相対活性の指標を開示し、該表示において、各々の同定されたＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せは、該ＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束される該Ｔ細胞系の相対活性のそれぞれの指標に関連付けられており、該相対活性は、該抗原の認識に基づく該Ｔ細胞系の既知の活性の相対量である、項目１から１３のいずれかに記載の方法。
（項目１５）
前記第２のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞系が利用可能であり、前記ヒト患者への治療的投与に適している、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
病原体またはがんを有するか、もしくは有すると疑われるヒト患者への、阻害性免疫チェックポイント阻害剤または刺激性免疫チェックポイント活性化剤の投与と組み合わせた治療的投与のためのＴ細胞系を選択する方法であって、該方法が、
該病原体またはがんの抗原の少なくとも１つのエピトープを認識し、該ヒト患者の疾患細胞によって発現される第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞系を選択すること
を含み、該第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、該抗原の認識に基づいた、それぞれのＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞の活性に関して、該疾患細胞によって発現されるＨＬＡ対立遺伝子およびＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちのサブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せである、
方法。
（項目１７）
前記第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、前記ヒト患者への治療的投与に適しており、かつ、それぞれのＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞の活性に関して、前記疾患細胞によって発現されるＨＬＡ対立遺伝子およびＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちのサブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せである、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
前記第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、表示に従って、前記疾患細胞によって発現される第２のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せに関連付けられている相対活性よりも低い前記抗原の認識に基づく相対活性の指標に関連付けられていることに基づいて、サブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せとして分類され、該表示が（ｉ）複数のＨＬＡ対立遺伝子および必要に応じてＨＬＡ対立遺伝子の組合せを同定し、（ｉｉ）各々が該抗原の少なくとも１つのエピトープを認識し、該複数における該ＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちの複数の異なるものによって拘束されるＴ細胞系の相対活性の指標を開示し、該表示において、各々の同定されたＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せは、該ＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束される該Ｔ細胞系の相対活性のそれぞれの指標に関連付けられており、該相対活性は、該抗原の認識に基づく該Ｔ細胞系の既知の活性の相対量である、項目１６または１７に記載の方法。
（項目１９）
前記第２のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞系が利用可能であり、前記ヒト患者への治療的投与に適している、項目１８に記載の方法。
（項目２０）
病原体またはがんを有するか、もしくは有すると疑われるヒト患者への、阻害性免疫チェックポイント阻害剤または刺激性免疫チェックポイント活性化剤の投与と組み合わせた治療的投与のためのＴ細胞系が由来するＴ細胞ドナーを選択する方法であって、該方法が、
（ｉ）第１の複数のＨＬＡ対立遺伝子および必要に応じてＨＬＡ対立遺伝子の組合せを同定し、（ｉｉ）各々が該病原体または該がんの抗原の少なくとも１つのエピトープを認識し、該第１の複数における該ＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちの複数の異なるものによって拘束されるＴ細胞系の生成の相対頻度の指標を開示する第１の表示を使用して、Ｔ細胞ドナーを選択すること
を含み、該第１の表示において、各々の同定されたＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せがそれぞれのＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せにより拘束される該Ｔ細胞系の生成の相対頻度のそれぞれの指標と関連付けられており、
（Ａ）選択された該Ｔ細胞ドナーが、該第１の表示において生成の最高の頻度の指標と関連付けられている、該ヒト患者の疾患細胞と共通の第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せを有し；
（Ｂ）該選択されたＴ細胞ドナーの該第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、該抗原の認識に基づいた、それぞれのＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞の活性に関して、該疾患細胞によって発現されるＨＬＡ対立遺伝子およびＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちのサブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せである、
方法。
（項目２１）
前記第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、第２の表示に従って、前記疾患細胞の第２のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せに関連付けられている相対活性よりも低い相対活性の指標に関連付けられていることに基づいて、サブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せとして分類され、該第２の表示が（Ｉ）第２の複数のＨＬＡ対立遺伝子および必要に応じてＨＬＡ対立遺伝子の組合せを同定し、（ＩＩ）各々が抗原の少なくとも１つのエピトープを認識し、該第２の複数におけるＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちの複数の異なるものによって拘束されるＴ細胞系の相対活性の指標を開示し、該第２の表示において、各々の同定されたＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せは、該ＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束される該Ｔ細胞系の相対活性のそれぞれの指標に関連付けられており、該相対活性は、該抗原の認識に基づく該Ｔ細胞系の既知の活性の相対量である、項目２０に記載の方法。
（項目２２）
該Ｔ細胞ドナーが、該ヒト患者に対して同種異系である、項目２０または２１に記載の方法。
（項目２３）
前記ヒト患者が移植ドナーからの移植のレシピエントとなっており、前記Ｔ細胞ドナーが該移植ドナーとは異なる第三者ドナーである、項目２２に記載の方法。
（項目２４）
病原体またはがんを有するか、もしくは有すると疑われるヒト患者への、阻害性免疫チェックポイント阻害剤または刺激性免疫チェックポイント活性化剤の投与と組み合わせた治療的投与のためのＴ細胞系を取得する方法であって、該方法が、
（ａ）項目２０から２３のいずれかに記載の方法に従ってＴ細胞ドナーを選択することと；
（ｂ）該選択されたＴ細胞ドナーからＴ細胞系を生成することと
を含み、該Ｔ細胞系が、第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束され、抗原の少なくとも１つのエピトープを認識する、
方法。
（項目２５）
病原体またはがんを有するか、もしくは有する疑いのあるヒト患者を処置する方法であって、
（ａ）項目１６から１９のいずれかに記載の方法に従って該ヒト患者への治療的投与のためのＴ細胞系を選択することと；
（ｂ）抗原に特異的であり、該選択されたＴ細胞系に由来する抗原特異的Ｔ細胞を含む、ヒト細胞の集団を該ヒト患者に投与することと；
（ｃ）阻害性免疫チェックポイント阻害剤を該ヒト患者に投与することと
を含む、方法。
（項目２６）
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤が、ＰＤ１、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、ＣＴＬＡ−４、ＬＡＧ３、ＴＩＭ−３、ＶＩＳＴＡ、Ａ２ＡＲ、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ４、ＢＴＬＡ、ＩＤＯ、ＴＤＯ、またはＫＩＲの阻害剤である、項目２５に記載の方法。
（項目２７）
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤が、阻害性免疫チェックポイントに結合し、その活性を阻害する抗体である、項目２５または２６に記載の方法。
（項目２８）
前記抗体がモノクローナル抗体である、項目２７に記載の方法。
（項目２９）
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤がＰＤ１の阻害剤である、項目２５に記載の方法。
（項目３０）
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤が、ＰＤ１に結合し、その活性を阻害するモノクローナル抗体である、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
前記モノクローナル抗体が、ニボルマブ、ピディリズマブ、ＭＥＤＩ０６８０、またはペンブロリズマブである、項目３０に記載の方法。
（項目３２）
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤がＰＤ−Ｌ１の阻害剤である、項目２５に記載の方法。
（項目３３）
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤が、ＰＤ−Ｌ１に結合し、その活性を阻害するモノクローナル抗体である、項目３２に記載の方法。
（項目３４）
前記モノクローナル抗体が、ｍｐｄｌ３２８０Ａ、デュルバルマブ、アベルマブ、ｂｍｓ−９３６５５９、またはアテゾリズマブである、項目３３に記載の方法。
（項目３５）
病原体またはがんを有するか、もしくは有する疑いのあるヒト患者を処置する方法であって、
（ａ）項目１６から１９のいずれかに記載の方法に従って該ヒト患者への治療的投与のためのＴ細胞系を選択することと；
（ｂ）抗原に特異的であり、該選択されたＴ細胞系に由来する抗原特異的Ｔ細胞を含む、ヒト細胞の集団を該ヒト患者に投与することと；
（ｃ）刺激性免疫チェックポイント活性化剤を該ヒト患者に投与することと
を含む、方法。
（項目３６）
前記刺激性免疫チェックポイント活性化剤が、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ４０、ＣＤ１２２、ＣＤ１３７、ＯＸ４０、ＧＩＴＲ、またはＩＣＯＳの活性化剤である、項目３５に記載の方法。
（項目３７）
前記Ｔ細胞系が、前記ヒト患者と同種異系のヒトドナーに由来する、項目１から１９および２５から３６のいずれかに記載の方法。
（項目３８）
前記ヒト患者が移植ドナーからの移植のレシピエントとなっており、前記ヒトドナーが該移植ドナーとは異なる第三者ドナーである、項目３７に記載の方法。
（項目３９）
前記ヒト患者の前記疾患細胞のＨＬＡ割り当てを確認するステップをさらに含む、項目１から３８のいずれかに記載の方法。
（項目４０）
前記確認するステップが、少なくとも４つのＨＬＡ遺伝子座をタイピングすることを含む、項目３９に記載の方法。
（項目４１）
Ｔ細胞の前記活性が、前記抗原を発現する細胞に対する前記Ｔ細胞のｉｎ  ｖｉｔｒｏ細胞傷害活性である、項目１から１９および２５から４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目４２）
Ｔ細胞の前記活性が、前記病原体またはがんを有するヒト患者の処置における該Ｔ細胞のｉｎ  ｖｉｖｏ臨床的有効性である、項目１から１９および２５から４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目４３）
前記第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束される前記Ｔ細胞系を生成するステップをさらに含む、項目１から１９および２５から４２のいずれか一項に記載の方法。
（項目４４）
前記第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束される前記Ｔ細胞系を生成する前記ステップが、前記抗原に対するＴ細胞のｅｘ  ｖｉｖｏ感作を含む、項目４３に記載の方法。
（項目４５）
前記Ｔ細胞系が、前記抗原に由来する１つもしくは複数のペプチドまたはタンパク質を負荷されてもおらず、それらを発現するように遺伝子操作されてもいない抗原提示細胞に対するｉｎ  ｖｉｔｒｏの実質的な細胞傷害性を欠いている、項目１から１９および２５から４４のいずれか一項に記載の方法。
（項目４６）
前記抗原が病原体の抗原である、項目１から４５のいずれかに記載の方法。
（項目４７）
前記病原体がウイルス、細菌、真菌、蠕虫、または原生生物である、項目４６に記載の方法。
（項目４８）
前記病原体がウイルスである、項目４７に記載の方法。
（項目４９）
前記ウイルスがサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）である、項目４８に記載の方法。
（項目５０）
前記ウイルスがエプスタインバーウイルス（ＥＢＶ）である、項目４８に記載の方法。
（項目５１）
前記ウイルスが、ＢＫウイルス（ＢＫＶ）、ジョン・カニンガムウイルス（ＪＣＶ）、ヒトヘルペスウイルス、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、単純ヘルペスウイルス（ＨＳＶ）、水痘帯状疱疹ウイルス（ＶＺＶ）、メルケル細胞ポリオーマウイルス（ＭＣＶ）、アデノウイルス（ＡＤＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）、インフルエンザウイルス、エボラウイルス、ポックスウイルス、ラブドウイルス、またはパラミクソウイルスである、項目４８に記載の方法。
（項目５２）
前記抗原ががんの抗原である、項目１から４５のいずれかに記載の方法。
（項目５３）
前記抗原がウィルムス腫瘍１（ＷＴ１）である、項目５２に記載の方法。
（項目５４）
（１）阻害性免疫チェックポイント阻害剤と；
（２）病原体またはがんの抗原に特異的であり、第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞系に由来する抗原特異的Ｔ細胞を含むヒト細胞の集団と
を含む医薬組成物であって、
該第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、該抗原の認識に基づいた、それぞれのＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞の活性に関してサブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せである、
医薬組成物。
（項目５５）
前記阻害性免疫チェックポイント阻害剤が、ＰＤ１、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、ＣＴＬＡ−４、ＬＡＧ３、ＴＩＭ−３、ＶＩＳＴＡ、Ａ２ＡＲ、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ４、ＢＴＬＡ、ＩＤＯ、ＴＤＯ、またはＫＩＲの阻害剤である、項目５４に記載の医薬組成物。
（項目５６）
（１）刺激性免疫チェックポイント活性化剤と；
（２）病原体またはがんの抗原に特異的であり、第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞系に由来する抗原特異的Ｔ細胞を含むヒト細胞の集団と
を含む医薬組成物であって、
前記第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、該抗原の認識に基づいた、それぞれのＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束されるＴ細胞の活性に関してサブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せである、
医薬組成物。
（項目５７）
前記刺激性免疫チェックポイント活性化剤が、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ４０、ＣＤ１２２、ＣＤ１３７、ＯＸ４０、ＧＩＴＲ、またはＩＣＯＳの活性化剤である、項目５６に記載の医薬組成物。
（項目５８）
前記第１のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せが、表示に従って、第２のＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せに関連付けられている相対活性よりも低い前記抗原の認識に基づくより低い活性の指標に関連付けられていることに基づいて、サブドミナントＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せとして分類され、該表示が（ｉ）複数のＨＬＡ対立遺伝子および必要に応じてＨＬＡ対立遺伝子の組合せを同定し、（ｉｉ）各々が抗原の少なくとも１つのエピトープを認識し、該複数におけるＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せのうちの複数の異なるものによって拘束されるＴ細胞系の相対活性の指標を開示し、該表示において、各々の同定されたＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せは、該ＨＬＡ対立遺伝子またはＨＬＡ対立遺伝子の組合せによって拘束される該Ｔ細胞系の相対活性のそれぞれの指標に関連付けられており、該相対活性は、該抗原の認識に基づく該Ｔ細胞系の既知の活性の相対量である、項目５４から５７のいずれかに記載の医薬組成物。
（項目５９）
前記抗原が病原体の抗原である、項目５４から５８のいずれかに記載の医薬組成物。
（項目６０）
前記病原体がウイルス、細菌、真菌、蠕虫、または原生生物である、項目５９に記載の医薬組成物。
（項目６１）
前記病原体がウイルスである、項目６０に記載の医薬組成物。
（項目６２）
前記ウイルスがＣＭＶである、項目６１に記載の医薬組成物。
（項目６３）
前記ウイルスがＥＢＶである、項目６１に記載の医薬組成物。
（項目６４）
前記ウイルスが、ＢＫＶ、ＪＣＶ、ヒトヘルペスウイルス、ＨＰＶ、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＨＳＶ、ＶＺＶ、ＭＣＶ、ＡＤＶ、ＨＩＶ、インフルエンザウイルス、エボラウイルス、ポックスウイルス、ラブドウイルス、またはパラミクソウイルスである、項目６１に記載の医薬組成物。
（項目６５）
前記抗原ががんの抗原である、項目５４から５８のいずれかに記載の医薬組成物。
（項目６６）
前記抗原がＷＴ１である、項目６５に記載の医薬組成物。
（項目６７）
前記Ｔ細胞系が、前記抗原に由来する１つもしくは複数のペプチドまたはタンパク質を負荷されてもおらず、それらを発現するように遺伝子操作されてもいない抗原提示細胞に対するｉｎ  ｖｉｔｒｏの実質的な細胞傷害性を欠いている、項目５４から６６のいずれか一項に記載の医薬組成物。
４．  図面の簡単な説明