【手続補正書】
【提出日】令和2年11月30日(2020.11.30)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
２つまたはそれよりも多くの抗原性ペプチドに融合したＰＥＳＴ含有ペプチドを含む融合ポリペプチドをコードする第１のオープンリーディングフレームを含む核酸を含む組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株であって、少なくとも１つの抗原性ペプチドが、がん関連タンパク質に由来し、かつ反復性がん突然変異を含み、少なくとも１つの抗原性ペプチドが、がん関連タンパク質に由来し、かつヘテロクリティック突然変異を含む、組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項２】
前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、細菌分泌シグナル配列を含み、前記融合ポリペプチドが、カルボキシ末端側の抗原性ペプチドに融合したユビキチンタンパク質をさらに含み、前記ＰＥＳＴ含有ペプチド、前記２つまたはそれよりも多くの抗原性ペプチド、前記ユビキチン、および前記カルボキシ末端側の抗原性ペプチドが、前記融合ポリペプチドのアミノ末端からカルボキシ末端までタンデムに配置されている、請求項１に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３】
（ａ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＫＲＡＳ、ＥＧＦＲ、Ｕ２ＡＦ１、ＢＲＡＦ、ＰＩＫ３ＣＡ、およびＴＰ５３のすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含む；あるいは
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、（ｉ）次の遺伝子：ＫＲＡＳ、ＥＧＦＲ、Ｕ２ＡＦ１、ＢＲＡＦ、ＰＩＫ３ＣＡ、およびＴＰ５３のすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異；ならびに（ｉｉ）次の反復性がん突然変異：ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｃ、ＥＧＦＲ＿Ｌ８５８Ｒ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、Ｕ２ＡＦ１＿Ｓ３４Ｆ、ＢＲＡＦ＿Ｖ６００Ｅ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｖ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＴＰ５３＿Ｒ１５８Ｌ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ａ、ＥＧＦＲ＿Ｌ８６１ＱおよびＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｌのすべてを含む；あるいは
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、（ｉ）次の遺伝子：ＫＲＡＳ、ＥＧＦＲ、Ｕ２ＡＦ１、ＢＲＡＦ、ＰＩＫ３ＣＡ、およびＴＰ５３のすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異；（ｉｉ）次の反復性がん突然変異：ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｃ、ＥＧＦＲ＿Ｌ８５８Ｒ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、Ｕ２ＡＦ１＿Ｓ３４Ｆ、ＢＲＡＦ＿Ｖ６００Ｅ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｖ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＴＰ５３＿Ｒ１５８Ｌ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ａ、ＥＧＦＲ＿Ｌ８６１ＱおよびＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｌのすべて；ならびに（ｉｉｉ）表３５に示されるペプチドのすべてを含む；あるいは
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、（ｉ）次の遺伝子：ＫＲＡＳ、ＥＧＦＲ、Ｕ２ＡＦ１、ＢＲＡＦ、ＰＩＫ３ＣＡ、およびＴＰ５３のすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異；（ｉｉ）次の反復性がん突然変異：ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｃ、ＥＧＦＲ＿Ｌ８５８Ｒ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、Ｕ２ＡＦ１＿Ｓ３４Ｆ、ＢＲＡＦ＿Ｖ６００Ｅ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｖ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＴＰ５３＿Ｒ１５８Ｌ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ａ、ＥＧＦＲ＿Ｌ８６１ＱおよびＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｌのすべて；ならびに（ｉｉｉ）表３５および３６に示されるペプチドのすべてを含む；あるいは
（ｅ）前記抗原性ペプチドが、（ｉ）次の遺伝子：ＫＲＡＳ、ＥＧＦＲ、Ｕ２ＡＦ１、ＢＲＡＦ、ＰＩＫ３ＣＡ、およびＴＰ５３のすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異；（ｉｉ）次の反復性がん突然変異：ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｃ、ＥＧＦＲ＿Ｌ８５８Ｒ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、Ｕ２ＡＦ１＿Ｓ３４Ｆ、ＢＲＡＦ＿Ｖ６００Ｅ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｖ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＴＰ５３＿Ｒ１５８Ｌ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ａ、ＥＧＦＲ＿Ｌ８６１ＱおよびＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｌのすべて；ならびに（ｉｉｉ）表３５および３６に示されるペプチドのすべてを含み、反復性がん突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つまたは複数に、配列番号３１６に示されるリンカーが先行し、ヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つまたは複数に、配列番号８２１〜８２９のうちのいずれか１つに示されるリンカーが先行し；必要に応じて、前記融合ポリペプチドが、配列番号８９５に示される配列を含む、請求項１または２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項４】
（ａ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ６、ＭＡＧＥＡ４、ＧＡＧＥ１、ＮＹＥＳＯ１、ＳＴＥＡＰ１、およびＲＮＦ４３のすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含む；あるいは
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、（ｉ）次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ６、ＭＡＧＥＡ４、ＧＡＧＥ１、ＮＹＥＳＯ１、ＳＴＥＡＰ１、およびＲＮＦ４３のすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異、ならびに（ｉｉ）表３６に示されるペプチドのすべてを含む；あるいは
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、（ｉ）次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ６、ＭＡＧＥＡ４、ＧＡＧＥ１、ＮＹＥＳＯ１、ＳＴＥＡＰ１、およびＲＮＦ４３のすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異、ならびに（ｉｉ）表３５および３６に示されるペプチドのすべてを含む；あるいは
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、（ｉ）次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ６、ＭＡＧＥＡ４、ＧＡＧＥ１、ＮＹＥＳＯ１、ＳＴＥＡＰ１、およびＲＮＦ４３のすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異、ならびに（ｉｉ）表３５および３６に示されるペプチドのすべてを含み、反復性がん突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つまたは複数に、配列番号３１６に示されるリンカーが先行し、ヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つまたは複数に、配列番号８２１〜８２９のうちのいずれか１つに示されるリンカーが先行し、必要に応じて、前記融合ポリペプチドが、配列番号８９５に示される配列を含む、請求項１または２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項５】
（ａ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＳＰＯＰ、ＣＨＥＫ２、ＲＧＰＤ８、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ、およびＡＲのすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含む；あるいは
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、（ｉ）次の遺伝子：ＳＰＯＰ、ＣＨＥＫ２、ＲＧＰＤ８、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ、およびＡＲのすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異；ならびに（ｉｉ）次の反復性がん突然変異：ＳＰＯＰ＿Ｆ１３３Ｖ、ＣＨＥＫ２＿Ｋ３７３Ｅ、ＲＧＰＤ８＿Ｐ１７６０Ａ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｉ６３４Ｔ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｄ６２９Ｙ、ＳＰＯＰ＿Ｗ１３１Ｇ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｄ６２６Ｎ、ＳＰＯＰ＿Ｆ１３３Ｌ、ＡＲ＿Ｔ８７８Ａ、ＡＲ＿Ｌ７０２Ｈ、ＡＲ＿Ｗ７４２Ｃ、ＡＲ＿Ｈ８７５ＹおよびＡＲ＿Ｆ８７７Ｌのすべてを含む；あるいは
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、（ｉ）次の遺伝子：ＳＰＯＰ、ＣＨＥＫ２、ＲＧＰＤ８、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ、およびＡＲのすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異；（ｉｉ）次の反復性がん突然変異：ＳＰＯＰ＿Ｆ１３３Ｖ、ＣＨＥＫ２＿Ｋ３７３Ｅ、ＲＧＰＤ８＿Ｐ１７６０Ａ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｉ６３４Ｔ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｄ６２９Ｙ、ＳＰＯＰ＿Ｗ１３１Ｇ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｄ６２６Ｎ、ＳＰＯＰ＿Ｆ１３３Ｌ、ＡＲ＿Ｔ８７８Ａ、ＡＲ＿Ｌ７０２Ｈ、ＡＲ＿Ｗ７４２Ｃ、ＡＲ＿Ｈ８７５ＹおよびＡＲ＿Ｆ８７７Ｌのすべて；ならびに（ｉｉｉ）表５２に示されるペプチドのすべてを含む；あるいは
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、（ｉ）次の遺伝子：ＳＰＯＰ、ＣＨＥＫ２、ＲＧＰＤ８、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ、およびＡＲのすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異；（ｉｉ）次の反復性がん突然変異：ＳＰＯＰ＿Ｆ１３３Ｖ、ＣＨＥＫ２＿Ｋ３７３Ｅ、ＲＧＰＤ８＿Ｐ１７６０Ａ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｉ６３４Ｔ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｄ６２９Ｙ、ＳＰＯＰ＿Ｗ１３１Ｇ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｄ６２６Ｎ、ＳＰＯＰ＿Ｆ１３３Ｌ、ＡＲ＿Ｔ８７８Ａ、ＡＲ＿Ｌ７０２Ｈ、ＡＲ＿Ｗ７４２Ｃ、ＡＲ＿Ｈ８７５ＹおよびＡＲ＿Ｆ８７７Ｌのすべて；ならびに（ｉｉｉ）表５２および５３に示されるペプチドのすべてを含む；あるいは
（ｅ）前記抗原性ペプチドが、（ｉ）次の遺伝子：ＳＰＯＰ、ＣＨＥＫ２、ＲＧＰＤ８、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ、およびＡＲのすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異；（ｉｉ）次の反復性がん突然変異：ＳＰＯＰ＿Ｆ１３３Ｖ、ＣＨＥＫ２＿Ｋ３７３Ｅ、ＲＧＰＤ８＿Ｐ１７６０Ａ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｉ６３４Ｔ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｄ６２９Ｙ、ＳＰＯＰ＿Ｗ１３１Ｇ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｄ６２６Ｎ、ＳＰＯＰ＿Ｆ１３３Ｌ、ＡＲ＿Ｔ８７８Ａ、ＡＲ＿Ｌ７０２Ｈ、ＡＲ＿Ｗ７４２Ｃ、ＡＲ＿Ｈ８７５ＹおよびＡＲ＿Ｆ８７７Ｌのすべて；ならびに（ｉｉｉ）表５２および５３に示されるペプチドのすべてを含み、反復性がん突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つまたは複数に、配列番号３１６に示されるリンカーが先行し、ヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つまたは複数に、配列番号８２１〜８２９のうちのいずれか１つに示されるリンカーが先行し；必要に応じて、前記融合ポリペプチドが、配列番号８９３に示される配列を含む、請求項１または２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項６】
（ａ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ４、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＳＳＸ２、ＳＡＲＴ３、ＰＡＧＥ４、ＰＳＭＡ、およびＰＳＡのすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含む；あるいは
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、（ｉ）次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ４、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＳＳＸ２、ＳＡＲＴ３、ＰＡＧＥ４、ＰＳＭＡ、およびＰＳＡのすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異、ならびに（ｉｉ）表５３に示されるペプチドのすべてを含む；あるいは
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、（ｉ）次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ４、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＳＳＸ２、ＳＡＲＴ３、ＰＡＧＥ４、ＰＳＭＡ、およびＰＳＡのすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異、ならびに（ｉｉ）表５２および５３に示されるペプチドのすべてを含む；あるいは
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、（ｉ）次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ４、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＳＳＸ２、ＳＡＲＴ３、ＰＡＧＥ４、ＰＳＭＡ、およびＰＳＡのすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異、ならびに（ｉｉ）表５２および５３に示されるペプチドのすべてを含み、反復性がん突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つまたは複数に、配列番号３１６に示されるリンカーが先行し、ヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つまたは複数に、配列番号８２１〜８２９のうちのいずれか１つに示されるリンカーが先行し、必要に応じて、前記融合ポリペプチドが、配列番号８９３に示される配列を含む、請求項１または２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項７】
（ａ）前記カルボキシ末端側の抗原性ペプチドが、がん関連タンパク質に由来し、かつヘテロクリティック突然変異を含む；ならびに／あるいは
（ｂ）前記カルボキシ末端側の抗原性ペプチドが、約７〜１１、８〜１０、または９アミノ酸長である；ならびに／あるいは
（ｃ）前記カルボキシ末端側の抗原性ペプチドが、次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２、およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２のうちの１つまたは複数に結合する；ならびに／あるいは
（ｄ）前記カルボキシ末端側の抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＳＴＥＡＰ１、ＣＥＡＣＡＭ５、ＮＹＥＳＯ１、およびＮＵＦ２のうちの１つによってコードされるタンパク質に由来する；ならびに／あるいは
（ｅ）前記カルボキシ末端側の抗原性ペプチドが、配列番号７９６、７９７、７９８、７９９、８００、および８０７に示されるペプチドから選択される、請求項２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項８】
（ａ）各抗原性ペプチドが、がん関連タンパク質の断片であり、約７〜２００アミノ酸長である；ならびに／あるいは
（ｂ）前記融合ポリペプチドが、少なくとも約５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、もしくは２５個の抗原性ペプチドを含むか、または約５〜５０、１０〜４０、もしくは２０〜３０個の抗原性ペプチドを含む；ならびに／あるいは
（ｃ）前記融合ポリペプチドが、反復性がん突然変異を含む少なくとも約２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個の抗原性ペプチド、または反復性がん突然変異を含む約５〜３０もしくは１０〜２０個の抗原性ペプチドを含み、かつ／あるいは、
（ｄ）前記融合ポリペプチドが、ヘテロクリティック突然変異を含む少なくとも約２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個の抗原性ペプチド、またはヘテロクリティック突然変異を含む約５〜３０もしくは１０〜２０個の抗原性ペプチドを含み、必要に応じて、反復性がん突然変異を含む前記抗原性ペプチドがタンデムになっており、ヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドがタンデムになっている、または反復性がん突然変異を含む前記抗原性ペプチドおよびヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドが、前記融合ポリペプチド内で混ざり合っている、請求項２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項９】
前記２つまたはそれよりも多くの抗原性ペプチドが、ペプチドリンカーを介して互いに連結しており、
必要に応じて、前記ペプチドリンカーが、可動性リンカーおよび／もしくは剛性リンカーおよび／もしくは免疫プロテアソームプロセシングリンカーを含むか、または配列番号３１３〜３１６、３１９、および８２１〜８２９に示されるリンカーのうちの１つもしくは複数が、前記２つもしくはそれよりも多くの抗原性ペプチドを連結させるために使用されており、
必要に応じて、ヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つまたは複数の上流の前記ペプチドリンカーが、免疫プロテアソームプロセシングリンカーであるか、または配列番号８２１〜８２９に示されるリンカーから選択される、請求項１から２および７から８のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項１０】
（ａ）前記融合ポリペプチドのいかなる領域も、スライディング２１アミノ酸ウィンドウを用いてＫｙｔｅおよびＤｏｏｌｉｔｔｌｅのハイドロパシー指数によりハイドロパシーをスコアリングしたとき、約１．６のカットオフを超えるスコアを有しない；ならびに／あるいは
（ｂ）前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つが、異なる反復性がん突然変異を含み、かつ同じがん関連タンパク質の断片である；ならびに／あるいは
（ｃ）前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つにおける前記反復性がん突然変異が、同じがん関連タンパク質に由来し、かつ、天然に共存しない；ならびに／あるいは
（ｄ）前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つが、同じがん関連タンパク質の重複断片であり、必要に応じて、前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つにおける前記反復性がん突然変異が、同じがん関連タンパク質に由来し、かつ前記がん関連タンパク質の同じアミノ酸残基において生じ、必要に応じて、前記抗原性ペプチドのうちの２つが、同じ反復性がん突然変異を含む、請求項１から２および７から８のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項１１】
（ａ）反復性がん突然変異を含む各抗原性ペプチドが、異なる反復性がん突然変異を含む；ならびに／あるいは
（ｂ）前記融合ポリペプチドにおける各反復性がん突然変異が、体細胞フレームシフト突然変異または体細胞ミスセンス突然変異であり、必要に応じて、前記融合ポリペプチドにおける各反復性がん突然変異が、体細胞ミスセンス突然変異である；ならびに／あるいは
（ｃ）反復性がん突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてが、前記反復性がん突然変異の各側に隣接する同数のアミノ酸を有し、必要に応じて、前記反復性がん突然変異の各側の隣接アミノ酸の数が、少なくとも１０アミノ酸である、請求項１から２および７から１０のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項１２】
（ａ）前記抗原性ペプチドが、特定のタイプのがんに由来する、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個の最もよく見られる反復性がん突然変異または反復性体細胞ミスセンスがん突然変異を含む；ならびに／あるいは
（ｂ）特定のタイプのがんを有する患者の少なくとも約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、３５％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％が、前記融合ポリペプチドにおける抗原性ペプチドの組合せに含まれる反復性がん突然変異を有する；ならびに／あるいは
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、特定のタイプのがんに由来する、少なくとも約２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、もしくは３０個の異なる反復性がん突然変異または反復性体細胞ミスセンスがん突然変異を含むか、あるいは前記抗原性ペプチドが、特定のタイプのがんに由来する、約２〜８０、１０〜６０、１０〜５０、１０〜４０、もしくは１０〜３０個の異なる反復性がん突然変異または反復性体細胞ミスセンスがん突然変異を含む、請求項１から２および７から１１のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項１３】
前記特定のタイプのがんが、非小細胞肺がん、前立腺がん、膵臓がん、膀胱がん、乳がん、子宮がん、卵巣がん、低悪性度神経膠腫、結腸直腸がん、または頭頸部がんである、請求項１２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項１４】
前記抗原性ペプチドが、２つまたはそれよりも多くのがん関連タンパク質に由来し、
必要に応じて、前記２つまたはそれよりも多くのがん関連タンパク質が、少なくとも約２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のがん関連タンパク質であるか、または前記２つまたはそれよりも多くのがん関連タンパク質が、約２〜３０、２〜２５、２〜２０、２〜１５、もしくは２〜１０個のがん関連タンパク質である、請求項１から２および７から１３のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項１５】
前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＡＣＶＲ２Ａ、ＡＤＡＭ２８、ＡＫＴ１、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ、ＡＲ、ＡＲＩＤ１Ａ、ＢＭＰＲ２、ＢＲＡＦ、ＣＨＥＫ２、Ｃ１２ｏｒｆ４、ＣＴＮＮＢ１、ＤＯＣＫ３、ＥＧＦＲ、ＥＳＲ１、ＦＢＸＷ７、ＦＧＦＲ３、ＦＨＯＤ３、ＧＮＡＳ、ＨＲＡＳ、ＩＤＨ１、ＩＤＨ２、ＫＩＡＡ２０２６、ＫＲＡＳ、ＫＲＴＡＰ１−５、ＫＲＴＡＰ４−１１、ＬＡＲＰ４Ｂ、ＭＢＯＡＴ２、ＮＦＥ２Ｌ２、ＰＧＭ５、ＰＩＫ３ＣＡ、ＰＬＥＫＨＡ６、ＰＯＬＥ、ＰＴＥＮ、ＲＧＰＤ８、ＲＮＦ４３、ＲＸＲＡ、ＳＭＡＤ４、ＳＰＯＰ、ＳＶＩＬ、ＴＧＦＢＲ２、ＴＰ５３、ＴＲＩＭ４８、ＵＢＲ５、Ｕ２ＡＦ１、ＷＮＴ１６、ＸＹＬＴ２、ＺＢＴＢ２０およびＺＮＦ８１４のうちの１つまたは複数によってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含む、請求項１から２および７から１４のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項１６】
（ａ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＫＲＡＳ、ＥＧＦＲ、Ｕ２ＡＦ１、ＢＲＡＦ、ＰＩＫ３ＣＡ、およびＴＰ５３のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＳＰＯＰ、ＣＨＥＫ２、ＲＧＰＤ８、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ、およびＡＲのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＫＲＡＳ、Ｕ２ＡＦ１、ＴＰ５３、ＳＭＡＤ４、およびＧＮＡＳのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＰＩＫ３ＣＡ、ＦＧＦＲ３、ＴＰ５３、ＲＸＲＡ、ＦＢＸＷ７、およびＮＦＥ２Ｌ２のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｅ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＰＩＫ３ＣＡ、ＡＫＴ１、およびＥＳＲ１のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｆ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＰＴＥＮ、ＫＲＡＳ、ＰＩＫ３ＣＡ、ＣＴＮＮＢ１、ＦＢＸＷ７、およびＴＰ５３のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｇ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＴＰ５３のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｈ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＴＰ５３、ＰＩＫ３ＣＡ、ＩＤＨ１、ＩＤＨ２、およびＥＧＦＲのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｉ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＫＲＡＳ、ＢＲＡＦ、ＰＩＫ３ＣＡ、およびＴＰ５３のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、あるいは
（ｊ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＰＩＫ３ＣＡ、ＣＨＥＫ２、ＲＧＰＤ８、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ、ＴＰ５３、ＺＮＦ８１４、ＫＲＴＡＰ１−５、ＫＲＴＡＰ４−１１、およびＨＲＡＳのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含む、
請求項１５に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項１７】
（ａ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｃ、ＥＧＦＲ＿Ｌ８５８Ｒ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、Ｕ２ＡＦ１＿Ｓ３４Ｆ、ＢＲＡＦ＿Ｖ６００Ｅ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｖ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＴＰ５３＿Ｒ１５８Ｌ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ａ、ＥＧＦＲ＿Ｌ８６１ＱおよびＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｌのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＳＰＯＰ＿Ｆ１３３Ｖ、ＣＨＥＫ２＿Ｋ３７３Ｅ、ＲＧＰＤ８＿Ｐ１７６０Ａ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｉ６３４Ｔ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｄ６２９Ｙ、ＳＰＯＰ＿Ｗ１３１Ｇ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｄ６２６Ｎ、ＳＰＯＰ＿Ｆ１３３Ｌ、ＡＲ＿Ｔ８７８Ａ、ＡＲ＿Ｌ７０２Ｈ、ＡＲ＿Ｗ７４２Ｃ、ＡＲ＿Ｈ８７５ＹおよびＡＲ＿Ｆ８７７Ｌのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｃ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、Ｕ２ＡＦ１＿Ｓ３４Ｆ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｖ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｑ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ１７５Ｈ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｃ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｒ、ＫＲＡＳ＿Ｑ６１Ｈ、ＴＰ５３＿Ｒ２８２Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｈ、ＴＰ５３＿Ｇ２４５Ｓ、ＳＭＡＤ４＿Ｒ３６１Ｃ、ＧＮＡＳ＿Ｒ２０１ＣおよびＧＮＡＳ＿Ｒ２０１Ｈのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＦＧＦＲ３＿Ｓ２４９Ｃ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｑ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４２Ｋ、ＲＸＲＡ＿Ｓ４２７Ｆ、ＦＢＸＷ７＿Ｒ５０５Ｇ、ＴＰ５３＿Ｒ２８０Ｔ、ＮＦＥ２Ｌ２＿Ｅ７９Ｋ、ＦＧＦＲ３＿Ｒ２４８Ｃ、ＴＰ５３＿Ｋ１３２Ｎ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ１７５ＨおよびＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｃのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｅ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４２Ｋ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｈ１０４７Ｒ、ＡＫＴ１＿Ｅ１７Ｋ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｈ１０４７Ｌ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｑ５４６Ｋ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ａ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｇ、ＥＳＲ１＿Ｋ３０３Ｒ、ＥＳＲ１＿Ｄ５３８Ｇ、ＥＳＲ１＿Ｙ５３７Ｓ、ＥＳＲ１＿Ｙ５３７Ｎ、ＥＳＲ１＿Ｙ５３７ＣおよびＥＳＲ１＿Ｅ３８０Ｑのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｆ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＰＴＥＮ＿Ｒ１３０Ｇ、ＰＴＥＮ＿Ｒ１３０Ｑ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｖ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｈ１０４７Ｒ；ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｒ８８Ｑ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４２Ｋ、ＣＴＮＮＢ１＿Ｓ３７Ｆ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１３Ｄ、ＣＴＮＮＢ１＿Ｓ３７Ｃ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｈ１０４７Ｌ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｇ１１８Ｄ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ａ、ＦＢＸＷ７＿Ｒ５０５ＣおよびＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｗのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｇ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｑ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ１７５Ｈ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｃ、ＴＰ５３＿Ｒ２８２Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｈ、ＴＰ５３＿Ｙ２２０Ｃ、ＴＰ５３＿Ｉ１９５Ｔ、ＴＰ５３＿Ｃ１７６Ｙ、ＴＰ５３＿Ｈ１７９Ｒ、ＴＰ５３＿Ｓ２４１ＦおよびＴＰ５３＿Ｈ１９３Ｒのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｈ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｌ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｃ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｈ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｇ１１８Ｄ、ＩＤＨ１＿Ｒ１３２Ｃ、ＩＤＨ１＿Ｒ１３２Ｇ、ＩＤＨ１＿Ｒ１３２Ｈ、ＩＤＨ１＿Ｒ１３２Ｓ、ＩＤＨ２＿Ｒ１７２Ｋ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ４５３ＫおよびＥＧＦＲ＿Ｇ５９８Ｖのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｉ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｃ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、ＢＲＡＦ＿Ｖ６００Ｅ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｖ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ１７５Ｈ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｃ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｈ１０４７Ｒ、ＴＰ５３＿Ｒ２８２Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３ＨおよびＫＲＡＳ＿Ｇ１３Ｄのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、あるいは
（ｊ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＣＨＥＫ２＿Ｋ３７３Ｅ、ＲＧＰＤ８＿Ｐ１７６０Ａ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｉ６３４Ｔ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｑ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４２Ｋ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ１７５Ｈ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｈ１０４７Ｒ、ＴＰ５３＿Ｒ２８２Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｈ、ＴＰ５３＿Ｇ２４５Ｓ、ＴＰ５３＿Ｙ２２０Ｃ、ＺＮＦ８１４＿Ｄ４０４Ｅ、ＫＲＴＡＰ１−５＿Ｉ８８Ｔ、ＫＲＴＡＰ４−１１＿Ｌ１６１ＶおよびＨＲＡＳ＿Ｇ１３Ｖのうちの１つもしくは複数またはすべてを含む、請求項１６に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項１８】
（ａ）前記抗原性ペプチドが、表３５に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、表５２に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、表６８に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、表７６に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｅ）前記抗原性ペプチドが、表８７に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｆ）前記抗原性ペプチドが、表９５に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｇ）前記抗原性ペプチドが、表１００に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｈ）前記抗原性ペプチドが、表１０４に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｉ）前記抗原性ペプチドが、表１０８に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、あるいは
（ｊ）前記抗原性ペプチドが、表１１２に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含む、
請求項１７に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項１９】
ヘテロクリティック突然変異を含む各抗原性ペプチドが、約７〜１１、８〜１０、または９アミノ酸長である；ならびに／あるいは
ヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドが、次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２、およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２のうちの１つまたは複数またはすべてに結合する、請求項１から２および７から１８のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項２０】
前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＧＡＧＥ１、ｈＴＥＲＴ、ＫＬＨＬ７、ＭＡＧＥＡ３、ＭＡＧＥＡ４、ＭＡＧＥＡ６、ＮＵＦ２、ＮＹＥＳＯ１、ＰＡＧＥ４、ＰＲＡＭＥ、ＰＳＡ、ＰＳＭＡ、ＲＮＦ４３、ＳＡＲＴ３、ＳＳＸ２、ＳＴＥＡＰ１およびＳＵＲＶＩＶＩＮのうちの１つまたは複数によってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含む、請求項１から２および７から１９のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項２１】
（ａ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ６、ＭＡＧＥＡ４、ＧＡＧＥ１、ＮＹＥＳＯ１、ＳＴＥＡＰ１、およびＲＮＦ４３のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ４、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＳＳＸ２、ＳＡＲＴ３、ＰＡＧＥ４、ＰＳＭＡ、およびＰＳＡのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＴＥＡＰ１、ＭＡＧＥＡ３、ＰＲＡＭＥ、ｈＴＥＲＴ、およびＳＵＲＶＩＶＩＮのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＧＡＧＥ１、ＮＹＥＳＯ１、ＲＮＦ４３、ＮＵＦ２、ＫＬＨＬ７、ＭＡＧＥＡ３、およびＰＲＡＭＥのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｅ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＭＡＧＥＡ３、ＰＲＡＭＥ、およびｈＴＥＲＴのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｆ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＰＲＡＭＥ、ｈＴＥＲＴ、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＮＵＦ２、ＫＬＨＬ７、およびＳＡＲＴ３のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｇ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＳＡＲＴ３、ＮＵＦ２、ＫＬＨＬ７、ＰＲＡＭＥ、およびｈＴＥＲＴのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｈ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ６、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＳＡＲＴ３、ＮＵＦ２、ＫＬＨＬ７、およびｈＴＥＲＴのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｉ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ６、ＭＡＧＥＡ４、ＧＡＧＥ１、ＮＹＥＳＯ１、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、およびＭＡＧＥＡ３のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、あるいは
（ｊ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ４、ＳＴＥＡＰ１、ＮＹＥＳＯ１、ＰＲＡＭＥ、およびｈＴＥＲＴのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含む、
請求項２０に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項２２】
（ａ）前記抗原性ペプチドが、表３６に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、表５３に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、表６９に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、表７７に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｅ）前記抗原性ペプチドが、表８８に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｆ）前記抗原性ペプチドが、表９６に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｇ）前記抗原性ペプチドが、表１０１に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｈ）前記抗原性ペプチドが、表１０５に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｉ）前記抗原性ペプチドが、表１０９に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、あるいは
（ｊ）前記抗原性ペプチドが、表１１３に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含む、
請求項２１に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項２３】
（ａ）前記抗原性ペプチドが、表３５および３６に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、表５２および５３に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、表６８および６９に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、表７６および７７に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｅ）前記抗原性ペプチドが、表８７および８８に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｆ）前記抗原性ペプチドが、表９５および９６に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｇ）前記抗原性ペプチドが、表１００および１０１に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｈ）前記抗原性ペプチドが、表１０４および１０５に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｉ）前記抗原性ペプチドが、表１０８および１０９に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、あるいは
（ｊ）前記抗原性ペプチドが、表１１２および１１３に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含む、
請求項１から２および７から２２のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項２４】
（ａ）前記融合ポリペプチドが、配列番号８５９、８６０、８６１、８６２、８６３、８６４、８６５、８９４、８９５、および９０５のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｂ）前記融合ポリペプチドが、配列番号８７１、８７２、８７３、８７４、８７５、８７６、８７７、８９２、８９３、および９０６のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｃ）前記融合ポリペプチドが、配列番号８６６、８６７、８６８、８６９、８７０、および９０８のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｄ）前記融合ポリペプチドが、配列番号８７８、８７９、８８０、８８１、８８２、８８８、８８９、８９０、および８９１のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｅ）前記融合ポリペプチドが、配列番号８８３、８８４、８８５、８８６、８８７、および９０７のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｆ）前記融合ポリペプチドが、配列番号８９６、８９７、および９０４のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｇ）前記融合ポリペプチドが、配列番号８９８および８９９のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｈ）前記融合ポリペプチドが、配列番号９００および９０１のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｉ）前記融合ポリペプチドが、配列番号９０２および９０３のいずれか１つに示される配列を含むか、または
（ｊ）前記融合ポリペプチドが、配列番号９１８および９１９のいずれか１つに示される配列を含む、
請求項２３に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項２５】
前記融合ポリペプチドが、約１５０ｋＤａ以下または約１２５ｋＤａ以下の分子量を有する、請求項１から２および７から２４のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項２６】
融合ポリペプチドをコードする第１のオープンリーディングフレームを含む核酸を含む組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株であって、前記融合ポリペプチドが、２つまたはそれよりも多くの抗原性ペプチドに融合したＰＥＳＴ含有ペプチドを含み、各抗原性ペプチドが、反復性がん突然変異を含み、前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つが、異なる反復性がん突然変異を含み、かつ同じがん関連タンパク質の断片である、組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項２７】
前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つにおける前記反復性がん突然変異が、同じがん関連タンパク質に由来し、かつ、天然に共存しない；ならびに／あるいは
前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つが、同じがん関連タンパク質の重複断片であり、必要に応じて、前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つにおける前記反復性がん突然変異が、同じがん関連タンパク質に由来し、かつ前記がん関連タンパク質の同じアミノ酸残基において生じる、請求項２６に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項２８】
前記融合ポリペプチドにおける前記反復性がん突然変異のうちの１つまたは複数が、体細胞ミスセンス突然変異である；ならびに／あるいは
前記融合ポリペプチドにおける前記反復性がん突然変異のうちの１つまたは複数が、体細胞フレームシフト突然変異である、請求項２７に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項２９】
前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＫＲＡＳ、ＢＲＡＦ、ＰＩＫ３ＣＡ、ＴＲＩＭ４８、ＰＴＥＮ、ＰＯＬＥ、ＰＧＭ５、ＭＢＯＡＴ２、ＫＩＡＡ２０２６、ＦＢＸＷ７、Ｃ１２ｏｒｆ４、ＺＢＴＢ２０、ＸＹＬＴ２、ＷＮＴ１６、ＵＢＲ５、ＴＧＦＢＲ２、ＳＶＩＬ、ＲＮＦ４３、ＰＬＥＫＨＡ６、ＬＡＲＰ４Ｂ、ＦＨＯＤ３、ＤＯＣＫ３、ＢＭＰＲ２、ＡＲＩＤ１Ａ、ＡＤＡＭ２８およびＡＣＶＲ２Ａのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含み、
必要に応じて、前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＴＲＩＭ４８＿Ｙ１９２Ｈ、ＰＴＥＮ＿Ｒ１３０Ｎ、ＰＯＬＥ＿Ｖ４１１Ｌ、ＰＯＬＥ＿Ｐ２８６Ｒ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｈ１０４７Ｒ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｒ８８Ｎ、ＰＧＭ５＿Ｉ９８Ｖ、ＭＢＯＡＴ２＿Ｒ４３Ｎ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、ＫＩＡＡ２０２６＿Ｒ５７４Ｃ、ＦＢＸＷ７＿Ｒ４６５Ｃ、Ｃ１２ｏｒｆ４＿Ｒ３３５Ｎ、ＢＲＡＦ＿Ｖ６００Ｅ、ＺＢＴＢ２０＿ｐ．Ｐｒｏ６９２ＬｅｕｆｓＴｅｒ４３、ＸＹＬＴ２＿ｐ．Ｇｌｙ５２９ＡｌａｆｓＴｅｒ７８、ＷＮＴ１６＿ｐ．Ｇｌｙ１６７ＡｌａｆｓＴｅｒ１７、ＵＢＲ５＿ｐ．Ｇｌｕ２１２１ＬｙｓｆｓＴｅｒ２８、ＴＧＦＢＲ２＿ｐ．Ｇｌｕ１５０ＧｌｙｆｓＴｅｒ３５、ＳＶＩＬ＿ｐ．Ｍｅｔ１８６３ＴｒｐｆｓＴｅｒ４４、ＲＮＦ４３＿ｐ．Ｇｌｙ６５９ＶａｌｆｓＴｅｒ４１、ＰＬＥＫＨＡ６＿ｐ．Ｖａｌ３２８ＴｙｒｆｓＴｅｒ１７２、ＬＡＲＰ４Ｂ＿ｐ．Ｔｈｒ１６３ＨｉｓｆｓＴｅｒ４７、ＦＨＯＤ３＿ｐ．Ｓｅｒ３３６ＶａｌｆｓＴｅｒ１３８、ＤＯＣＫ３＿ｐ．Ｐｒｏ１８５２ＧｌｎｆｓＴｅｒ４５、ＢＭＰＲ２＿ｐ．Ａｓｎ５８３ＴｈｒｆｓＴｅｒ４４、ＡＲＩＤ１Ａ＿ｐ．Ａｓｐ１８５０ＴｈｒｆｓＴｅｒ３３、ＡＤＡＭ２８＿ｐ．Ａｓｎ７５ＬｙｓｆｓＴｅｒ１５およびＡＣＶＲ２Ａ＿ｐ．Ｌｙｓ４３５ＧｌｕｆｓＴｅｒ１９のうちの１つもしくは複数またはすべてを含み、
必要に応じて、前記抗原性ペプチドが、表１１６に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含み、
必要に応じて、前記融合ポリペプチドが、配列番号９１７のいずれか１つに示される配列を含む、請求項２７から２８のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３０】
前記融合ポリペプチドが、前記２つまたはそれよりも多くの抗原性ペプチドの組合せのＮ末端側および／またはＣ末端側に１つまたは複数のペプチドタグをさらに含み、前記１つまたは複数のペプチドタグが、ＦＬＡＧタグおよびＳＩＩＮＦＥＫＬタグのうちの一方または両方を含む、ならびに／あるいは
前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、前記融合ポリペプチドのＮ末端にあり、
必要に応じて、前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、ＬＬＯのＮ末端断片であり、
必要に応じて、前記ＬＬＯのＮ末端断片が、配列番号３３６に示される配列を有する、請求項１から２９のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３１】
前記核酸が、エピソームプラスミドに存在する；ならびに／あるいは
前記核酸が、前記組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株に抗生物質耐性を与えない、請求項１から３０のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３２】
弱毒化栄養要求性Ｌｉｓｔｅｒｉａ株であり、
必要に応じて、前記弱毒化栄養要求性Ｌｉｓｔｅｒｉａ株が、１つまたは複数の内在性遺伝子に、前記１つまたは複数の内在性遺伝子を不活性化させる突然変異を含み、
必要に応じて、前記１つまたは複数の内在性遺伝子が、ａｃｔＡ、ｄａｌ、およびｄａｔを含む、請求項１から３１のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３３】
前記核酸が、代謝酵素をコードする第２のオープンリーディングフレームを含み、
必要に応じて、前記代謝酵素が、アラニンラセマーゼ酵素またはＤ−アミノ酸アミノトランスフェラーゼ酵素である、請求項１から３２のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３４】
前記融合ポリペプチドがｈｌｙプロモーターから発現される、請求項１から３３のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３５】
組換えＬｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ株であり、
必要に応じて、前記組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株が、ａｃｔＡ、ｄａｌ、およびｄａｔの欠失、またはこれらにおける不活性化突然変異を含む、弱毒化Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ株であり、前記核酸が、エピソームプラスミドに存在し、かつアラニンラセマーゼ酵素またはＤ−アミノ酸アミノトランスフェラーゼ酵素をコードする第２のオープンリーディングフレームを含み、前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、ＬＬＯのＮ末端断片である、請求項１から３４のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
【請求項３６】
請求項１から３５のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株を含む免疫原性組成物。
【請求項３７】
前記免疫原性組成物が、２つまたはそれよりも多くの組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株の組合せを含み、各組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株が、異なる抗原性ペプチドセット、または異なる順序における同じ抗原性ペプチドセットを含み、
必要に応じて、各組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株が、異なる抗原性ペプチドセットを含み、
必要に応じて、前記組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株の組合せが、約５〜１０、１０〜１５、１５〜２０、２０〜２５、２５〜３０、３０〜３５、３５〜４０、４０〜４５、４５〜５０、５０〜６０、６０〜７０、７０〜８０、８０〜９０、９０〜１００、１００〜１２０、１２０〜１４０、１４０〜１６０、１６０〜１８０、１８０〜２００、２００〜２２０、２２０〜２４０、２４０〜２６０、２６０〜２８０、または２８０〜３００個の異なる抗原性ペプチドを含む、請求項３６に記載の免疫原性組成物。
【請求項３８】
アジュバントをさらに含み、
必要に応じて、前記アジュバントが、顆粒細胞／マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）タンパク質、ＧＭ−ＣＳＦタンパク質をコードするヌクレオチド分子、サポニンＱＳ２１、モノホスホリルリピドＡ、非メチル化ＣｐＧ含有オリゴヌクレオチド、または解毒リステリオリシンＯタンパク質を含む、請求項３６から３７のいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
【請求項３９】
対象において腫瘍またはがんに対する免疫応答を誘導する、あるいは対象において腫瘍またはがんを防止または処置する方法における使用のための請求項３６から３８のいずれか一項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物を投与するステップを含むことを特徴とする、免疫原性組成物。
【請求項４０】
複数の異なる免疫原性組成物が前記対象に投与されることを特徴とし、
必要に応じて、複数の異なる免疫原性組成物が前記対象に同時にまたは連続的に投与されることを特徴とする、請求項３９に記載の免疫原性組成物。
【請求項４１】
（ｉ）複数の異なる免疫原性組成物が、約２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０個の免疫原性組成物を含む；ならびに／あるいは
（ｉｉ）前記対象が、１つまたは複数のがん関連タンパク質における１つまたは複数の反復性がん突然変異に関連するがんを有し、前記対象に投与される前記免疫原性組成物が、前記がんに関連する１つまたは複数の反復性がん突然変異を含む抗原性ペプチドを含み、
必要に応じて、前記方法が、前記投与するステップの前に、前記対象を前記１つまたは複数の反復性がん突然変異のうちの少なくとも１つについてスクリーニングして、それを同定するステップを含み、前記対象に投与される前記免疫原性組成物が、前記対象において同定された前記１つまたは複数の反復性がん突然変異のうちの前記少なくとも１つを含む抗原性ペプチドを含むか、あるいは
前記方法が、前記投与するステップの前に、前記対象を反復性がん突然変異についてスクリーニングして、それを同定するステップを含まないことを特徴とする、請求項４０に記載の免疫原性組成物。
【請求項４２】
請求項１から３５のいずれか一項に記載の１つまたは複数の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株を含む細胞バンクであって、必要に応じて、冷凍細胞バンクまたは凍結乾燥細胞バンクである、細胞バンク。
【請求項４３】
免疫療法構築物を生成する方法であって、
（ａ）前記免疫療法構築物に含めるための、がん関連タンパク質における反復性がん突然変異セットおよびヘテロクリティック突然変異セットを選択するステップと、
（ｂ）前記反復性がん突然変異のそれぞれおよび前記ヘテロクリティック突然変異のそれぞれを含む抗原性ペプチドを設計するステップと、
（ｃ）抗原性ペプチドセットを選択するステップであって、前記各抗原性ペプチドのハイドロパシーを検査すること、および抗原性ペプチドが、選択されたハイドロパシー指数閾値を超えるスコアを有する場合はこれを修飾または選択解除することを含むステップと、
（ｄ）前記選択された抗原性ペプチドのそれぞれを含む融合ポリペプチドを設計するステップと、
（ｅ）前記融合ポリペプチドをコードする核酸構築物を生成するステップと
を含む方法。
【請求項４４】
前記反復性がん突然変異が、ステップ（ａ）において、次の基準：
（ｉ）複数のタイプのがんまたは特定のタイプのがんにおける発生頻度、
（ｉｉ）がん関連タンパク質の機能的ドメイン内の位置、
（ｉｉｉ）公知のがんドライバー突然変異または化学療法耐性突然変異としてのステータス、および
（ｉｖ）体細胞ミスセンス突然変異または体細胞フレームシフト突然変異としての同定のうちの１つまたは複数に基づいて選択される、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
前記ヘテロクリティック突然変異が、ステップ（ａ）において、次の基準：
（ｉ）次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２、およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２のうちの１つまたは複数に結合する能力、
（ｉｉ）ＣＤ８＋Ｔリンパ球応答を生成する能力、および
（ｉｉｉ）対応する野生型配列と同等かまたはこれよりも強い特定のＨＬＡ型に対する結合親和性
のうちの１つまたは複数に基づいて選択される、請求項４３または４４に記載の方法。
【請求項４６】
ステップ（ａ）において選択される前記反復性がん突然変異セットが、次の基準：
（ｉ）前記セットが、約３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、もしくは５０個以下の反復性がん突然変異、および／または約３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、もしくは５０個以下のヘテロクリティック突然変異を含むこと、
（ｉｉ）前記セットが、特定のタイプのがんを有するがん患者の少なくとも約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％において見出される反復性がん突然変異を含むこと、および
（ｉｉｉ）前記セットが、特定のタイプのがんに由来する、少なくとも約２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、または４０個の異なる反復性がん突然変異または反復性体細胞ミスセンス突然変異を含むこと
のうちの１つまたは複数に基づいて選択される、請求項４３から４４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４７】
反復性がん突然変異を含むようにステップ（ｂ）において設計される各抗原性ペプチドが、前記反復性がん突然変異および各側の隣接配列を含む前記がん関連タンパク質の断片を含むように設計され、
必要に応じて、反復性がん突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてが、前記反復性がん突然変異の各側に少なくとも約１０個の隣接アミノ酸を含む、請求項４３から４６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４８】
（ｉ）ヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてが、アンカー位置に好ましいアミノ酸を有するように設計される；ならびに／あるいは
（ｉｉ）抗原性ペプチドが、ステップ（ｃ）において、Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓにおける分泌可能性を予測する、ハイドロパシー閾値未満の場合に選択され、必要に応じて、前記抗原性ペプチドが、ＫｙｔｅおよびＤｏｏｌｉｔｔｌｅのハイドロパシー指数２１アミノ酸ウィンドウによってスコアリングされ、約１．６のカットオフを超えるスコアを有するペプチドはすべて除外されるか、または前記カットオフ未満のスコアを有するように修飾される、請求項４３から４７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４９】
（ｉ）ステップ（ｃ）が、対象ＨＬＡに結合する前記抗原性ペプチドの能力に基づいて抗原性ペプチドをスコアリングし選択することをさらに含み；ならびに／あるいは
（ｉｉ）ステップ（ｄ）における前記融合ポリペプチド内の抗原性ペプチドの順序が、ランダム化を使用して選択され；ならびに／あるいは
（ｉｉｉ）前記融合ポリペプチドが、約１５０ｋＤａ以下または約１２５ｋＤａ以下の分子量を有するように設計される、請求項４３から４８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５０】
（ｉ）ステップ（ｄ）が、前記融合ポリペプチドのハイドロパシーを検査すること、および前記融合ポリペプチドのいずれかの領域が選択されたハイドロパシー指数閾値を超えるスコアを有する場合、前記抗原性ペプチドを並べ替えること、または問題がある抗原性ペプチドを除去することのいずれかをさらに含み、必要に応じて、前記融合ポリペプチドが、スライディング２１アミノ酸ウィンドウを用いてＫｙｔｅおよびＤｏｏｌｉｔｔｌｅのハイドロパシー指数によりスコアリングされ、前記閾値が約１．６であり、ならびに／あるいは
（ｉｉ）ステップ（ｅ）が、前記核酸配列を最適化することをさらに含み、必要に応じて、前記最適化がコドン最適化を含み；ならびに／あるいは
（ｉｉｉ）前記核酸をＬｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ株に導入するステップと、コードされた前記融合ポリペプチドの発現および分泌を確認するステップとをさらに含む、請求項４３から４９のいずれか一項に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１２】
別の態様では、免疫療法構築物を生成する方法であって、（ａ）免疫療法構築物に含めるための、がん関連タンパク質における反復性がん突然変異セットおよびヘテロクリティック突然変異セットを選択するステップと、（ｂ）反復性がん突然変異のそれぞれおよびヘテロクリティック突然変異のそれぞれを含む抗原性ペプチドを設計するステップと、（ｃ）抗原性ペプチドセットを選択するステップであって、各抗原性ペプチドのハイドロパシーを検査すること、および抗原性ペプチドが、選択されたハイドロパシー指数閾値を超えるスコアを有する場合はこれを修飾または選択解除することを含むステップと、（ｄ）選択された抗原性ペプチドのそれぞれを含む融合ポリペプチドを設計するステップと、（ｅ）融合ポリペプチドをコードする核酸構築物を生成するステップとを含む方法が、本明細書において提供される。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
２つまたはそれよりも多くの抗原性ペプチドに融合したＰＥＳＴ含有ペプチドを含む融合ポリペプチドをコードする第１のオープンリーディングフレームを含む核酸を含む組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株であって、少なくとも１つの抗原性ペプチドが、がん関連タンパク質に由来し、かつ反復性がん突然変異を含み、少なくとも１つの抗原性ペプチドが、がん関連タンパク質に由来し、かつヘテロクリティック突然変異を含む、組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目２）
前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、細菌分泌シグナル配列を含み、前記融合ポリペプチドが、カルボキシ末端側の抗原性ペプチドに融合したユビキチンタンパク質をさらに含み、前記ＰＥＳＴ含有ペプチド、前記２つまたはそれよりも多くの抗原性ペプチド、前記ユビキチン、および前記カルボキシ末端側の抗原性ペプチドが、前記融合ポリペプチドのアミノ末端からカルボキシ末端までタンデムに配置されている、項目１に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３）
前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＫＲＡＳ、ＥＧＦＲ、Ｕ２ＡＦ１、ＢＲＡＦ、ＰＩＫ３ＣＡ、およびＴＰ５３のすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含む、項目１または２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４）
前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｃ、ＥＧＦＲ＿Ｌ８５８Ｒ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、Ｕ２ＡＦ１＿Ｓ３４Ｆ、ＢＲＡＦ＿Ｖ６００Ｅ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｖ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＴＰ５３＿Ｒ１５８Ｌ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ａ、ＥＧＦＲ＿Ｌ８６１ＱおよびＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｌのすべてを含む、項目３に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５）
前記抗原性ペプチドが、表３５に示されるペプチドのすべてを含む、項目４に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目６）
前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ６、ＭＡＧＥＡ４、ＧＡＧＥ１、ＮＹＥＳＯ１、ＳＴＥＡＰ１、およびＲＮＦ４３のすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含む、項目１または２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目７）
前記抗原性ペプチドが、表３６に示されるペプチドのすべてを含む、項目６に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目８）
前記抗原性ペプチドが、表３５および３６に示されるペプチドのすべてを含む、項目５または７に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目９）
反復性がん突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つまたは複数に、配列番号３１６に示されるリンカーが先行し、ヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つまたは複数に、配列番号８２１〜８２９のうちのいずれか１つに示されるリンカーが先行する、項目８に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目１０）
前記融合ポリペプチドが、配列番号８９５に示される配列を含む、項目９に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目１１）
前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＳＰＯＰ、ＣＨＥＫ２、ＲＧＰＤ８、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ、およびＡＲのすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含む、項目１または２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目１２）
前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＳＰＯＰ＿Ｆ１３３Ｖ、ＣＨＥＫ２＿Ｋ３７３Ｅ、ＲＧＰＤ８＿Ｐ１７６０Ａ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｉ６３４Ｔ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｄ６２９Ｙ、ＳＰＯＰ＿Ｗ１３１Ｇ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｄ６２６Ｎ、ＳＰＯＰ＿Ｆ１３３Ｌ、ＡＲ＿Ｔ８７８Ａ、ＡＲ＿Ｌ７０２Ｈ、ＡＲ＿Ｗ７４２Ｃ、ＡＲ＿Ｈ８７５ＹおよびＡＲ＿Ｆ８７７Ｌのすべてを含む、項目１１に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目１３）
前記抗原性ペプチドが、表５２に示されるペプチドのすべてを含む、項目１２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目１４）
前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ４、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＳＳＸ２、ＳＡＲＴ３、ＰＡＧＥ４、ＰＳＭＡ、およびＰＳＡのすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含む、項目１または２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目１５）
前記抗原性ペプチドが、表５３に示されるペプチドのすべてを含む、項目１４に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目１６）
前記抗原性ペプチドが、表５２および５３に示されるペプチドのすべてを含む、項目１３または１５に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目１７）
反復性がん突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つまたは複数に、配列番号３１６に示されるリンカーが先行し、ヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つまたは複数に、配列番号８２１〜８２９のうちのいずれか１つに示されるリンカーが先行する、項目１６に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目１８）
前記融合ポリペプチドが、配列番号８９３に示される配列を含む、項目１７に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目１９）
前記カルボキシ末端側の抗原性ペプチドが、がん関連タンパク質に由来し、かつヘテロクリティック突然変異を含む、項目２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目２０）
前記カルボキシ末端側の抗原性ペプチドが、約７〜１１、８〜１０、または９アミノ酸長である、項目２または１９に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目２１）
前記カルボキシ末端側の抗原性ペプチドが、次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２、およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２のうちの１つまたは複数に結合する、項目２および１９から２０のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目２２）
前記カルボキシ末端側の抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＳＴＥＡＰ１、ＣＥＡＣＡＭ５、ＮＹＥＳＯ１、およびＮＵＦ２のうちの１つによってコードされるタンパク質に由来する、項目２および１９から２１のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目２３）
前記カルボキシ末端側の抗原性ペプチドが、配列番号７９６、７９７、７９８、７９９、８００、および８０７に示されるペプチドから選択される、項目２２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目２４）
各抗原性ペプチドが、がん関連タンパク質の断片であり、約７〜２００アミノ酸長である、項目１から２および１９から２３のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目２５）
前記融合ポリペプチドが、少なくとも約５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、もしくは２５個の抗原性ペプチドを含むか、または約５〜５０、１０〜４０、もしくは２０〜３０個の抗原性ペプチドを含む、項目１から２および１９から２４のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目２６）
前記融合ポリペプチドが、反復性がん突然変異を含む少なくとも約２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個の抗原性ペプチド、または反復性がん突然変異を含む約５〜３０もしくは１０〜２０個の抗原性ペプチドを含み、かつ／あるいは、
前記融合ポリペプチドが、ヘテロクリティック突然変異を含む少なくとも約２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個の抗原性ペプチド、またはヘテロクリティック突然変異を含む約５〜３０もしくは１０〜２０個の抗原性ペプチドを含む、
項目１から２および１９から２５のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目２７）
反復性がん突然変異を含む前記抗原性ペプチドがタンデムになっており、ヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドがタンデムになっている、項目２６に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目２８）
反復性がん突然変異を含む前記抗原性ペプチドおよびヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドが、前記融合ポリペプチド内で混ざり合っている、項目２６に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目２９）
前記２つまたはそれよりも多くの抗原性ペプチドが、ペプチドリンカーを介して互いに連結している、項目１から２および１９から２８のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３０）
前記ペプチドリンカーが、可動性リンカーおよび／もしくは剛性リンカーおよび／もしくは免疫プロテアソームプロセシングリンカーを含むか、または配列番号３１３〜３１６、３１９、および８２１〜８２９に示されるリンカーのうちの１つもしくは複数が、前記２つもしくはそれよりも多くの抗原性ペプチドを連結させるために使用されている、項目２９に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３１）
ヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つまたは複数の上流の前記ペプチドリンカーが、免疫プロテアソームプロセシングリンカーであるか、または配列番号８２１〜８２９に示されるリンカーから選択される、項目３０に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３２）
前記融合ポリペプチドのいかなる領域も、スライディング２１アミノ酸ウィンドウを用いてＫｙｔｅおよびＤｏｏｌｉｔｔｌｅのハイドロパシー指数によりハイドロパシーをスコアリングしたとき、約１．６のカットオフを超えるスコアを有しない、項目１から２および１９から３１のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３３）
前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つが、異なる反復性がん突然変異を含み、かつ同じがん関連タンパク質の断片である、項目１から２および１９から３２のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３４）
前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つにおける前記反復性がん突然変異が、同じがん関連タンパク質に由来し、かつ、天然に共存しない、項目１から２および１９から３３のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３５）
前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つが、同じがん関連タンパク質の重複断片である、項目１から２および１９から３４のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３６）
前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つにおける前記反復性がん突然変異が、同じがん関連タンパク質に由来し、かつ前記がん関連タンパク質の同じアミノ酸残基において生じる、項目３５に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３７）
前記抗原性ペプチドのうちの２つが、同じ反復性がん突然変異を含む、項目３６に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３８）
反復性がん突然変異を含む各抗原性ペプチドが、異なる反復性がん突然変異を含む、項目１から２および１９から３６のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目３９）
前記融合ポリペプチドにおける各反復性がん突然変異が、体細胞フレームシフト突然変異または体細胞ミスセンス突然変異である、項目１から２および１９から３８のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４０）
前記融合ポリペプチドにおける各反復性がん突然変異が、体細胞ミスセンス突然変異である、項目３９に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４１）
反復性がん突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてが、前記反復性がん突然変異の各側に隣接する同数のアミノ酸を有する、項目１から２および１９から４０のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４２）
前記反復性がん突然変異の各側の隣接アミノ酸の数が、少なくとも１０アミノ酸である、項目４１に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４３）
前記抗原性ペプチドが、特定のタイプのがんに由来する、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個の最もよく見られる反復性がん突然変異または反復性体細胞ミスセンスがん突然変異を含む、項目１から２および１９から４２のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４４）
特定のタイプのがんを有する患者の少なくとも約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、３５％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％が、前記融合ポリペプチドにおける抗原性ペプチドの組合せに含まれる反復性がん突然変異を有する、項目１から２および１９から４３のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４５）
前記抗原性ペプチドが、特定のタイプのがんに由来する、少なくとも約２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、もしくは３０個の異なる反復性がん突然変異または反復性体細胞ミスセンスがん突然変異を含むか、あるいは前記抗原性ペプチドが、特定のタイプのがんに由来する、約２〜８０、１０〜６０、１０〜５０、１０〜４０、もしくは１０〜３０個の異なる反復性がん突然変異または反復性体細胞ミスセンスがん突然変異を含む、項目１から２および１９から４４のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４６）
前記特定のタイプのがんが、非小細胞肺がん、前立腺がん、膵臓がん、膀胱がん、乳がん、子宮がん、卵巣がん、低悪性度神経膠腫、結腸直腸がん、または頭頸部がんである、項目４３から４５のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４７）
前記抗原性ペプチドが、２つまたはそれよりも多くのがん関連タンパク質に由来する、項目１から２および１９から４６のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４８）
前記２つまたはそれよりも多くのがん関連タンパク質が、少なくとも約２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のがん関連タンパク質であるか、または前記２つまたはそれよりも多くのがん関連タンパク質が、約２〜３０、２〜２５、２〜２０、２〜１５、もしくは２〜１０個のがん関連タンパク質である、項目４７に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目４９）
前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＡＣＶＲ２Ａ、ＡＤＡＭ２８、ＡＫＴ１、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ、ＡＲ、ＡＲＩＤ１Ａ、ＢＭＰＲ２、ＢＲＡＦ、ＣＨＥＫ２、Ｃ１２ｏｒｆ４、ＣＴＮＮＢ１、ＤＯＣＫ３、ＥＧＦＲ、ＥＳＲ１、ＦＢＸＷ７、ＦＧＦＲ３、ＦＨＯＤ３、ＧＮＡＳ、ＨＲＡＳ、ＩＤＨ１、ＩＤＨ２、ＫＩＡＡ２０２６、ＫＲＡＳ、ＫＲＴＡＰ１−５、ＫＲＴＡＰ４−１１、ＬＡＲＰ４Ｂ、ＭＢＯＡＴ２、ＮＦＥ２Ｌ２、ＰＧＭ５、ＰＩＫ３ＣＡ、ＰＬＥＫＨＡ６、ＰＯＬＥ、ＰＴＥＮ、ＲＧＰＤ８、ＲＮＦ４３、ＲＸＲＡ、ＳＭＡＤ４、ＳＰＯＰ、ＳＶＩＬ、ＴＧＦＢＲ２、ＴＰ５３、ＴＲＩＭ４８、ＵＢＲ５、Ｕ２ＡＦ１、ＷＮＴ１６、ＸＹＬＴ２、ＺＢＴＢ２０およびＺＮＦ８１４のうちの１つまたは複数によってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含む、項目１から２および１９から４８のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５０）
（ａ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＫＲＡＳ、ＥＧＦＲ、Ｕ２ＡＦ１、ＢＲＡＦ、ＰＩＫ３ＣＡ、およびＴＰ５３のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＳＰＯＰ、ＣＨＥＫ２、ＲＧＰＤ８、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ、およびＡＲのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＫＲＡＳ、Ｕ２ＡＦ１、ＴＰ５３、ＳＭＡＤ４、およびＧＮＡＳのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＰＩＫ３ＣＡ、ＦＧＦＲ３、ＴＰ５３、ＲＸＲＡ、ＦＢＸＷ７、およびＮＦＥ２Ｌ２のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｅ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＰＩＫ３ＣＡ、ＡＫＴ１、およびＥＳＲ１のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｆ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＰＴＥＮ、ＫＲＡＳ、ＰＩＫ３ＣＡ、ＣＴＮＮＢ１、ＦＢＸＷ７、およびＴＰ５３のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｇ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＴＰ５３のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｈ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＴＰ５３、ＰＩＫ３ＣＡ、ＩＤＨ１、ＩＤＨ２、およびＥＧＦＲのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、
（ｉ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＫＲＡＳ、ＢＲＡＦ、ＰＩＫ３ＣＡ、およびＴＰ５３のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含むか、あるいは
（ｊ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＰＩＫ３ＣＡ、ＣＨＥＫ２、ＲＧＰＤ８、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ、ＴＰ５３、ＺＮＦ８１４、ＫＲＴＡＰ１−５、ＫＲＴＡＰ４−１１、およびＨＲＡＳのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含む、
項目４９に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５１）
（ａ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｃ、ＥＧＦＲ＿Ｌ８５８Ｒ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、Ｕ２ＡＦ１＿Ｓ３４Ｆ、ＢＲＡＦ＿Ｖ６００Ｅ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｖ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＴＰ５３＿Ｒ１５８Ｌ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ａ、ＥＧＦＲ＿Ｌ８６１ＱおよびＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｌのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＳＰＯＰ＿Ｆ１３３Ｖ、ＣＨＥＫ２＿Ｋ３７３Ｅ、ＲＧＰＤ８＿Ｐ１７６０Ａ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｉ６３４Ｔ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｄ６２９Ｙ、ＳＰＯＰ＿Ｗ１３１Ｇ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｄ６２６Ｎ、ＳＰＯＰ＿Ｆ１３３Ｌ、ＡＲ＿Ｔ８７８Ａ、ＡＲ＿Ｌ７０２Ｈ、ＡＲ＿Ｗ７４２Ｃ、ＡＲ＿Ｈ８７５ＹおよびＡＲ＿Ｆ８７７Ｌのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｃ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、Ｕ２ＡＦ１＿Ｓ３４Ｆ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｖ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｑ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ１７５Ｈ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｃ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｒ、ＫＲＡＳ＿Ｑ６１Ｈ、ＴＰ５３＿Ｒ２８２Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｈ、ＴＰ５３＿Ｇ２４５Ｓ、ＳＭＡＤ４＿Ｒ３６１Ｃ、ＧＮＡＳ＿Ｒ２０１ＣおよびＧＮＡＳ＿Ｒ２０１Ｈのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＦＧＦＲ３＿Ｓ２４９Ｃ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｑ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４２Ｋ、ＲＸＲＡ＿Ｓ４２７Ｆ、ＦＢＸＷ７＿Ｒ５０５Ｇ、ＴＰ５３＿Ｒ２８０Ｔ、ＮＦＥ２Ｌ２＿Ｅ７９Ｋ、ＦＧＦＲ３＿Ｒ２４８Ｃ、ＴＰ５３＿Ｋ１３２Ｎ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ１７５ＨおよびＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｃのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｅ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４２Ｋ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｈ１０４７Ｒ、ＡＫＴ１＿Ｅ１７Ｋ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｈ１０４７Ｌ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｑ５４６Ｋ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ａ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｇ、ＥＳＲ１＿Ｋ３０３Ｒ、ＥＳＲ１＿Ｄ５３８Ｇ、ＥＳＲ１＿Ｙ５３７Ｓ、ＥＳＲ１＿Ｙ５３７Ｎ、ＥＳＲ１＿Ｙ５３７ＣおよびＥＳＲ１＿Ｅ３８０Ｑのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｆ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＰＴＥＮ＿Ｒ１３０Ｇ、ＰＴＥＮ＿Ｒ１３０Ｑ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｖ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｈ１０４７Ｒ；ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｒ８８Ｑ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４２Ｋ、ＣＴＮＮＢ１＿Ｓ３７Ｆ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１３Ｄ、ＣＴＮＮＢ１＿Ｓ３７Ｃ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｈ１０４７Ｌ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｇ１１８Ｄ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ａ、ＦＢＸＷ７＿Ｒ５０５ＣおよびＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｗのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｇ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｑ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ１７５Ｈ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｃ、ＴＰ５３＿Ｒ２８２Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｈ、ＴＰ５３＿Ｙ２２０Ｃ、ＴＰ５３＿Ｉ１９５Ｔ、ＴＰ５３＿Ｃ１７６Ｙ、ＴＰ５３＿Ｈ１７９Ｒ、ＴＰ５３＿Ｓ２４１ＦおよびＴＰ５３＿Ｈ１９３Ｒのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｈ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｌ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｃ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｈ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｇ１１８Ｄ、ＩＤＨ１＿Ｒ１３２Ｃ、ＩＤＨ１＿Ｒ１３２Ｇ、ＩＤＨ１＿Ｒ１３２Ｈ、ＩＤＨ１＿Ｒ１３２Ｓ、ＩＤＨ２＿Ｒ１７２Ｋ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ４５３ＫおよびＥＧＦＲ＿Ｇ５９８Ｖのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｉ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｃ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、ＢＲＡＦ＿Ｖ６００Ｅ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｖ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ１７５Ｈ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｃ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｈ１０４７Ｒ、ＴＰ５３＿Ｒ２８２Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３ＨおよびＫＲＡＳ＿Ｇ１３Ｄのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、あるいは
（ｊ）前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４５Ｋ、ＣＨＥＫ２＿Ｋ３７３Ｅ、ＲＧＰＤ８＿Ｐ１７６０Ａ、ＡＮＫＲＤ３６Ｃ＿Ｉ６３４Ｔ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｑ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｅ５４２Ｋ、ＴＰ５３＿Ｒ２４８Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ１７５Ｈ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｈ１０４７Ｒ、ＴＰ５３＿Ｒ２８２Ｗ、ＴＰ５３＿Ｒ２７３Ｈ、ＴＰ５３＿Ｇ２４５Ｓ、ＴＰ５３＿Ｙ２２０Ｃ、ＺＮＦ８１４＿Ｄ４０４Ｅ、ＫＲＴＡＰ１−５＿Ｉ８８Ｔ、ＫＲＴＡＰ４−１１＿Ｌ１６１ＶおよびＨＲＡＳ＿Ｇ１３Ｖのうちの１つもしくは複数またはすべてを含む、項目５０に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５２）
（ａ）前記抗原性ペプチドが、表３５に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、表５２に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、表６８に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、表７６に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｅ）前記抗原性ペプチドが、表８７に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｆ）前記抗原性ペプチドが、表９５に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｇ）前記抗原性ペプチドが、表１００に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｈ）前記抗原性ペプチドが、表１０４に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｉ）前記抗原性ペプチドが、表１０８に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、あるいは
（ｊ）前記抗原性ペプチドが、表１１２に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含む、
項目５１に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５３）
ヘテロクリティック突然変異を含む各抗原性ペプチドが、約７〜１１、８〜１０、または９アミノ酸長である、項目１から２および１９から５２のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５４）
ヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドが、次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２、およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２のうちの１つまたは複数またはすべてに結合する、項目１から２および１９から５３のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５５）
前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＧＡＧＥ１、ｈＴＥＲＴ、ＫＬＨＬ７、ＭＡＧＥＡ３、ＭＡＧＥＡ４、ＭＡＧＥＡ６、ＮＵＦ２、ＮＹＥＳＯ１、ＰＡＧＥ４、ＰＲＡＭＥ、ＰＳＡ、ＰＳＭＡ、ＲＮＦ４３、ＳＡＲＴ３、ＳＳＸ２、ＳＴＥＡＰ１およびＳＵＲＶＩＶＩＮのうちの１つまたは複数によってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含む、項目１から２および１９から５４のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５６）
（ａ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ６、ＭＡＧＥＡ４、ＧＡＧＥ１、ＮＹＥＳＯ１、ＳＴＥＡＰ１、およびＲＮＦ４３のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ４、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＳＳＸ２、ＳＡＲＴ３、ＰＡＧＥ４、ＰＳＭＡ、およびＰＳＡのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＴＥＡＰ１、ＭＡＧＥＡ３、ＰＲＡＭＥ、ｈＴＥＲＴ、およびＳＵＲＶＩＶＩＮのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＧＡＧＥ１、ＮＹＥＳＯ１、ＲＮＦ４３、ＮＵＦ２、ＫＬＨＬ７、ＭＡＧＥＡ３、およびＰＲＡＭＥのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｅ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＭＡＧＥＡ３、ＰＲＡＭＥ、およびｈＴＥＲＴのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｆ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＰＲＡＭＥ、ｈＴＥＲＴ、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＮＵＦ２、ＫＬＨＬ７、およびＳＡＲＴ３のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｇ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＳＡＲＴ３、ＮＵＦ２、ＫＬＨＬ７、ＰＲＡＭＥ、およびｈＴＥＲＴのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｈ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ６、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、ＳＡＲＴ３、ＮＵＦ２、ＫＬＨＬ７、およびｈＴＥＲＴのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、
（ｉ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ６、ＭＡＧＥＡ４、ＧＡＧＥ１、ＮＹＥＳＯ１、ＳＴＥＡＰ１、ＲＮＦ４３、およびＭＡＧＥＡ３のうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含むか、あるいは
（ｊ）前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＣＥＡＣＡＭ５、ＭＡＧＥＡ４、ＳＴＥＡＰ１、ＮＹＥＳＯ１、ＰＲＡＭＥ、およびｈＴＥＲＴのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質におけるヘテロクリティック突然変異を含む、
項目５５に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５７）
（ａ）前記抗原性ペプチドが、表３６に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、表５３に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、表６９に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、表７７に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｅ）前記抗原性ペプチドが、表８８に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｆ）前記抗原性ペプチドが、表９６に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｇ）前記抗原性ペプチドが、表１０１に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｈ）前記抗原性ペプチドが、表１０５に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｉ）前記抗原性ペプチドが、表１０９に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、あるいは
（ｊ）前記抗原性ペプチドが、表１１３に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含む、
項目５６に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５８）
（ａ）前記抗原性ペプチドが、表３５および３６に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｂ）前記抗原性ペプチドが、表５２および５３に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｃ）前記抗原性ペプチドが、表６８および６９に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｄ）前記抗原性ペプチドが、表７６および７７に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｅ）前記抗原性ペプチドが、表８７および８８に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｆ）前記抗原性ペプチドが、表９５および９６に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｇ）前記抗原性ペプチドが、表１００および１０１に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｈ）前記抗原性ペプチドが、表１０４および１０５に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、
（ｉ）前記抗原性ペプチドが、表１０８および１０９に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含むか、あるいは
（ｊ）前記抗原性ペプチドが、表１１２および１１３に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含む、
項目１から２および１９から５７のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目５９）
（ａ）前記融合ポリペプチドが、配列番号８５９、８６０、８６１、８６２、８６３、８６４、８６５、８９４、８９５、および９０５のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｂ）前記融合ポリペプチドが、配列番号８７１、８７２、８７３、８７４、８７５、８７６、８７７、８９２、８９３、および９０６のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｃ）前記融合ポリペプチドが、配列番号８６６、８６７、８６８、８６９、８７０、および９０８のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｄ）前記融合ポリペプチドが、配列番号８７８、８７９、８８０、８８１、８８２、８８８、８８９、８９０、および８９１のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｅ）前記融合ポリペプチドが、配列番号８８３、８８４、８８５、８８６、８８７、および９０７のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｆ）前記融合ポリペプチドが、配列番号８９６、８９７、および９０４のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｇ）前記融合ポリペプチドが、配列番号８９８および８９９のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｈ）前記融合ポリペプチドが、配列番号９００および９０１のいずれか１つに示される配列を含むか、
（ｉ）前記融合ポリペプチドが、配列番号９０２および９０３のいずれか１つに示される配列を含むか、または
（ｊ）前記融合ポリペプチドが、配列番号９１８および９１９のいずれか１つに示される配列を含む、
項目５８に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目６０）
前記融合ポリペプチドが、約１５０ｋＤａ以下または約１２５ｋＤａ以下の分子量を有する、項目１から２および１９から５９のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目６１）
融合ポリペプチドをコードする第１のオープンリーディングフレームを含む核酸を含む組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株であって、前記融合ポリペプチドが、２つまたはそれよりも多くの抗原性ペプチドに融合したＰＥＳＴ含有ペプチドを含み、各抗原性ペプチドが、反復性がん突然変異を含み、前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つが、異なる反復性がん突然変異を含み、かつ同じがん関連タンパク質の断片である、組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目６２）
前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つにおける前記反復性がん突然変異が、同じがん関連タンパク質に由来し、かつ、天然に共存しない、項目６１に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目６３）
前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つが、同じがん関連タンパク質の重複断片である、項目６１または６２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目６４）
前記抗原性ペプチドのうちの少なくとも２つにおける前記反復性がん突然変異が、同じがん関連タンパク質に由来し、かつ前記がん関連タンパク質の同じアミノ酸残基において生じる、項目６３に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目６５）
前記融合ポリペプチドにおける前記反復性がん突然変異のうちの１つまたは複数が、体細胞ミスセンス突然変異である、項目６１から６４のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目６６）
前記融合ポリペプチドにおける前記反復性がん突然変異のうちの１つまたは複数が、体細胞フレームシフト突然変異である、項目６１から６５のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目６７）
前記抗原性ペプチドが、次の遺伝子：ＫＲＡＳ、ＢＲＡＦ、ＰＩＫ３ＣＡ、ＴＲＩＭ４８、ＰＴＥＮ、ＰＯＬＥ、ＰＧＭ５、ＭＢＯＡＴ２、ＫＩＡＡ２０２６、ＦＢＸＷ７、Ｃ１２ｏｒｆ４、ＺＢＴＢ２０、ＸＹＬＴ２、ＷＮＴ１６、ＵＢＲ５、ＴＧＦＢＲ２、ＳＶＩＬ、ＲＮＦ４３、ＰＬＥＫＨＡ６、ＬＡＲＰ４Ｂ、ＦＨＯＤ３、ＤＯＣＫ３、ＢＭＰＲ２、ＡＲＩＤ１Ａ、ＡＤＡＭ２８およびＡＣＶＲ２Ａのうちの１つもしくは複数またはすべてによってコードされるタンパク質に由来する反復性がん突然変異を含む、項目６１から６６のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目６８）
前記抗原性ペプチドが、次の反復性がん突然変異：ＴＲＩＭ４８＿Ｙ１９２Ｈ、ＰＴＥＮ＿Ｒ１３０Ｎ、ＰＯＬＥ＿Ｖ４１１Ｌ、ＰＯＬＥ＿Ｐ２８６Ｒ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｈ１０４７Ｒ、ＰＩＫ３ＣＡ＿Ｒ８８Ｎ、ＰＧＭ５＿Ｉ９８Ｖ、ＭＢＯＡＴ２＿Ｒ４３Ｎ、ＫＲＡＳ＿Ｇ１２Ｄ、ＫＩＡＡ２０２６＿Ｒ５７４Ｃ、ＦＢＸＷ７＿Ｒ４６５Ｃ、Ｃ１２ｏｒｆ４＿Ｒ３３５Ｎ、ＢＲＡＦ＿Ｖ６００Ｅ、ＺＢＴＢ２０＿ｐ．Ｐｒｏ６９２ＬｅｕｆｓＴｅｒ４３、ＸＹＬＴ２＿ｐ．Ｇｌｙ５２９ＡｌａｆｓＴｅｒ７８、ＷＮＴ１６＿ｐ．Ｇｌｙ１６７ＡｌａｆｓＴｅｒ１７、ＵＢＲ５＿ｐ．Ｇｌｕ２１２１ＬｙｓｆｓＴｅｒ２８、ＴＧＦＢＲ２＿ｐ．Ｇｌｕ１５０ＧｌｙｆｓＴｅｒ３５、ＳＶＩＬ＿ｐ．Ｍｅｔ１８６３ＴｒｐｆｓＴｅｒ４４、ＲＮＦ４３＿ｐ．Ｇｌｙ６５９ＶａｌｆｓＴｅｒ４１、ＰＬＥＫＨＡ６＿ｐ．Ｖａｌ３２８ＴｙｒｆｓＴｅｒ１７２、ＬＡＲＰ４Ｂ＿ｐ．Ｔｈｒ１６３ＨｉｓｆｓＴｅｒ４７、ＦＨＯＤ３＿ｐ．Ｓｅｒ３３６ＶａｌｆｓＴｅｒ１３８、ＤＯＣＫ３＿ｐ．Ｐｒｏ１８５２ＧｌｎｆｓＴｅｒ４５、ＢＭＰＲ２＿ｐ．Ａｓｎ５８３ＴｈｒｆｓＴｅｒ４４、ＡＲＩＤ１Ａ＿ｐ．Ａｓｐ１８５０ＴｈｒｆｓＴｅｒ３３、ＡＤＡＭ２８＿ｐ．Ａｓｎ７５ＬｙｓｆｓＴｅｒ１５およびＡＣＶＲ２Ａ＿ｐ．Ｌｙｓ４３５ＧｌｕｆｓＴｅｒ１９のうちの１つもしくは複数またはすべてを含む、項目６７に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目６９）
前記抗原性ペプチドが、表１１６に示されるペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてを含む、項目６８に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目７０）
前記融合ポリペプチドが、配列番号９１７のいずれか１つに示される配列を含む、項目６９に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目７１）
前記融合ポリペプチドが、前記２つまたはそれよりも多くの抗原性ペプチドの組合せのＮ末端側および／またはＣ末端側に１つまたは複数のペプチドタグをさらに含み、前記１つまたは複数のペプチドタグが、ＦＬＡＧタグおよびＳＩＩＮＦＥＫＬタグのうちの一方または両方を含む、先行する項目のいずれかに記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目７２）
前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、前記融合ポリペプチドのＮ末端にある、先行する項目のいずれかに記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目７３）
前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、ＬＬＯのＮ末端断片である、項目７２に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目７４）
前記ＬＬＯのＮ末端断片が、配列番号３３６に示される配列を有する、項目７３に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目７５）
前記核酸が、エピソームプラスミドに存在する、先行する項目のいずれかに記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目７６）
前記核酸が、前記組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株に抗生物質耐性を与えない、先行する項目のいずれかに記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目７７）
弱毒化栄養要求性Ｌｉｓｔｅｒｉａ株である、先行する項目のいずれかに記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目７８）
前記弱毒化栄養要求性Ｌｉｓｔｅｒｉａ株が、１つまたは複数の内在性遺伝子に、前記１つまたは複数の内在性遺伝子を不活性化させる突然変異を含む、項目７７に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目７９）
前記１つまたは複数の内在性遺伝子が、ａｃｔＡ、ｄａｌ、およびｄａｔを含む、項目７８に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目８０）
前記核酸が、代謝酵素をコードする第２のオープンリーディングフレームを含む、先行する項目のいずれかに記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目８１）
前記代謝酵素が、アラニンラセマーゼ酵素またはＤ−アミノ酸アミノトランスフェラーゼ酵素である、項目８０に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目８２）
前記融合ポリペプチドがｈｌｙプロモーターから発現される、先行する項目のいずれかに記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目８３）
組換えＬｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ株である、先行する項目のいずれかに記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目８４）
前記組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株が、ａｃｔＡ、ｄａｌ、およびｄａｔの欠失、またはこれらにおける不活性化突然変異を含む、弱毒化Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ株であり、前記核酸が、エピソームプラスミドに存在し、かつアラニンラセマーゼ酵素またはＤ−アミノ酸アミノトランスフェラーゼ酵素をコードする第２のオープンリーディングフレームを含み、前記ＰＥＳＴ含有ペプチドが、ＬＬＯのＮ末端断片である、先行する項目のいずれかに記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株。
（項目８５）
先行する項目のいずれかに記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株を含む免疫原性組成物。
（項目８６）
前記免疫原性組成物が、２つまたはそれよりも多くの組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株の組合せを含み、各組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株が、異なる抗原性ペプチドセット、または異なる順序における同じ抗原性ペプチドセットを含む、項目８５に記載の免疫原性組成物。
（項目８７）
各組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株が、異なる抗原性ペプチドセットを含む、項目８６に記載の免疫原性組成物。
（項目８８）
前記組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株の組合せが、約５〜１０、１０〜１５、１５〜２０、２０〜２５、２５〜３０、３０〜３５、３５〜４０、４０〜４５、４５〜５０、５０〜６０、６０〜７０、７０〜８０、８０〜９０、９０〜１００、１００〜１２０、１２０〜１４０、１４０〜１６０、１６０〜１８０、１８０〜２００、２００〜２２０、２２０〜２４０、２４０〜２６０、２６０〜２８０、または２８０〜３００個の異なる抗原性ペプチドを含む、項目８７に記載の免疫原性組成物。
（項目８９）
アジュバントをさらに含む、項目８５から８８のいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
（項目９０）
前記アジュバントが、顆粒細胞／マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）タンパク質、ＧＭ−ＣＳＦタンパク質をコードするヌクレオチド分子、サポニンＱＳ２１、モノホスホリルリピドＡ、非メチル化ＣｐＧ含有オリゴヌクレオチド、または解毒リステリオリシンＯタンパク質を含む、項目８９に記載の免疫原性組成物。
（項目９１）
対象において腫瘍またはがんに対する免疫応答を誘導する方法であって、前記対象に、項目１から８４のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株または項目８５から９０のいずれか一項に記載の免疫原性組成物を投与するステップを含む方法。
（項目９２）
対象において腫瘍またはがんを防止または処置する方法であって、前記対象に、項目１から８４のいずれか一項に記載の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株または項目８５から９０のいずれか一項に記載の免疫原性組成物を投与するステップを含む方法。
（項目９３）
複数の異なる組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株または複数の異なる免疫原性組成物が前記対象に投与される、項目９１または９２に記載の方法。
（項目９４）
前記複数の異なる組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株または複数の異なる免疫原性組成物が前記対象に同時に投与される、項目９３に記載の方法。
（項目９５）
前記複数の異なる組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株または複数の異なる免疫原性組成物が前記対象に連続的に投与される、項目９３に記載の方法。
（項目９６）
前記複数の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株または複数の異なる免疫原性組成物が、約２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０個の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株または免疫原性組成物を含む、項目９３から９５のいずれか一項に記載の方法。
（項目９７）
前記対象が、１つまたは複数のがん関連タンパク質における１つまたは複数の反復性がん突然変異に関連するがんを有し、前記対象に投与される前記組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株または前記免疫原性組成物が、前記がんに関連する１つまたは複数の反復性がん突然変異を含む抗原性ペプチドを含む、項目９３から９６のいずれか一項に記載の方法。
（項目９８）
前記方法が、前記投与するステップの前に、前記対象を前記１つまたは複数の反復性がん突然変異のうちの少なくとも１つについてスクリーニングして、それを同定するステップを含み、前記対象に投与される前記組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株または前記免疫原性組成物が、前記対象において同定された前記１つまたは複数の反復性がん突然変異のうちの前記少なくとも１つを含む抗原性ペプチドを含む、項目９７に記載の方法。
（項目９９）
前記投与するステップの前に、前記対象を反復性がん突然変異についてスクリーニングして、それを同定するステップを含まない、項目９７に記載の方法。
（項目１００）
項目１から８４のいずれか一項に記載の１つまたは複数の組換えＬｉｓｔｅｒｉａ株を含む細胞バンク。
（項目１０１）
冷凍細胞バンクまたは凍結乾燥細胞バンクである、項目１００に記載の細胞バンク。
（項目１０２）
免疫療法構築物を生成する方法であって、
（ａ）前記免疫療法構築物に含めるための、がん関連タンパク質における反復性がん突然変異セットおよびヘテロクリティック突然変異セットを選択するステップと、
（ｂ）前記反復性がん突然変異のそれぞれおよび前記ヘテロクリティック突然変異のそれぞれを含む抗原性ペプチドを設計するステップと、
（ｃ）抗原性ペプチドセットを選択するステップであって、前記各抗原性ペプチドのハイドロパシーを検査すること、および抗原性ペプチドが、選択されたハイドロパシー指数閾値を超えるスコアを有する場合はこれを修飾または選択解除することを含むステップと、
（ｄ）前記選択された抗原性ペプチドのそれぞれを含む融合ポリペプチドを設計するステップと、
（ｅ）前記融合ポリペプチドをコードする核酸構築物を生成するステップと
を含む方法。
（項目１０３）
前記反復性がん突然変異が、ステップ（ａ）において、次の基準：
（ｉ）複数のタイプのがんまたは特定のタイプのがんにおける発生頻度、
（ｉｉ）がん関連タンパク質の機能的ドメイン内の位置、
（ｉｉｉ）公知のがんドライバー突然変異または化学療法耐性突然変異としてのステータス、および
（ｉｖ）体細胞ミスセンス突然変異または体細胞フレームシフト突然変異としての同定のうちの１つまたは複数に基づいて選択される、項目１０２に記載の方法。
（項目１０４）
前記ヘテロクリティック突然変異が、ステップ（ａ）において、次の基準：
（ｉ）次のＨＬＡ型：ＨＬＡ−Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ−Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ−Ａ＊２４：０２、およびＨＬＡ−Ｂ＊０７：０２のうちの１つまたは複数に結合する能力、
（ｉｉ）ＣＤ８＋Ｔリンパ球応答を生成する能力、および
（ｉｉｉ）対応する野生型配列と同等かまたはこれよりも強い特定のＨＬＡ型に対する結合親和性
のうちの１つまたは複数に基づいて選択される、項目１０２または１０３に記載の方法。
（項目１０５）
ステップ（ａ）において選択される前記反復性がん突然変異セットが、次の基準：
（ｉ）前記セットが、約３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、もしくは５０個以下の反復性がん突然変異、および／または約３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、もしくは５０個以下のヘテロクリティック突然変異を含むこと、
（ｉｉ）前記セットが、特定のタイプのがんを有するがん患者の少なくとも約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％において見出される反復性がん突然変異を含むこと、および
（ｉｉｉ）前記セットが、特定のタイプのがんに由来する、少なくとも約２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、または４０個の異なる反復性がん突然変異または反復性体細胞ミスセンス突然変異を含むこと
のうちの１つまたは複数に基づいて選択される、項目１０２から１０４のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０６）
反復性がん突然変異を含むようにステップ（ｂ）において設計される各抗原性ペプチドが、前記反復性がん突然変異および各側の隣接配列を含む前記がん関連タンパク質の断片を含むように設計される、項目１０２から１０５のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０７）
反復性がん突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてが、前記反復性がん突然変異の各側に少なくとも約１０個の隣接アミノ酸を含む、項目１０６に記載の方法。
（項目１０８）
ヘテロクリティック突然変異を含む前記抗原性ペプチドのうちの１つもしくは複数またはすべてが、アンカー位置に好ましいアミノ酸を有するように設計される、項目１０２から１０７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０９）
抗原性ペプチドが、ステップ（ｃ）において、Ｌｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓにおける分泌可能性を予測する、ハイドロパシー閾値未満の場合に選択される、項目１０２から１０８のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１０）
前記抗原性ペプチドが、ＫｙｔｅおよびＤｏｏｌｉｔｔｌｅのハイドロパシー指数２１アミノ酸ウィンドウによってスコアリングされ、約１．６のカットオフを超えるスコアを有するペプチドはすべて除外されるか、または前記カットオフ未満のスコアを有するように修飾される、項目１０９に記載の方法。
（項目１１１）
ステップ（ｃ）が、対象ＨＬＡに結合する前記抗原性ペプチドの能力に基づいて抗原性ペプチドをスコアリングし選択することをさらに含む、項目１０２から１１０のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１２）
ステップ（ｄ）における前記融合ポリペプチド内の抗原性ペプチドの順序が、ランダム化を使用して選択される、項目１０２から１１１のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１３）
前記融合ポリペプチドが、約１５０ｋＤａ以下または約１２５ｋＤａ以下の分子量を有するように設計される、項目１０２から１１２のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１４）
ステップ（ｄ）が、前記融合ポリペプチドのハイドロパシーを検査すること、および前記融合ポリペプチドのいずれかの領域が選択されたハイドロパシー指数閾値を超えるスコアを有する場合、前記抗原性ペプチドを並べ替えること、または問題がある抗原性ペプチドを除去することのいずれかをさらに含む、項目１０２から１１３のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１５）
前記融合ポリペプチドが、スライディング２１アミノ酸ウィンドウを用いてＫｙｔｅおよびＤｏｏｌｉｔｔｌｅのハイドロパシー指数によりスコアリングされ、前記閾値が約１．６である、項目１１４に記載の方法。
（項目１１６）
ステップ（ｅ）が、前記核酸配列を最適化することをさらに含む、項目１０２から１１５のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１７）
前記最適化がコドン最適化を含む、項目１１６に記載の方法。
（項目１１８）
前記核酸をＬｉｓｔｅｒｉａ  ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ株に導入するステップと、コードされた前記融合ポリペプチドの発現および分泌を確認するステップとをさらに含む、項目１０２から１１７のいずれか一項に記載の方法。