【手続補正書】
【提出日】令和3年4月2日(2021.4.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
タンパク質結合部分及び架橋基を含む化合物またはその薬学的に許容され得る塩であって、
前記架橋基が、アミノ酸と化学選択的に反応することができる部分である、化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項２】
前記架橋基が、スルフヒドリル反応性架橋基、アミノ反応性架橋基、カルボキシル反応性架橋基、カルボニル反応性架橋基、またはトリアゾール形成架橋基である、請求項１に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項３】
前記架橋基が、（ａ）混合ジスルフィド、（ｂ）マレイミド、（ｃ）ビニルスルホン、（ｄ）ビニルケトン、または（ｅ）ハロゲン化アルキルを含む、請求項１または２に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項４】
前記架橋基が、式Ｉ：
【化１】
2020520988.tif 000001
の構造を含み、
式中、波線が、前記架橋基の、前記化合物の残部への付着点を図示し、
ａが、０、１、または２であり、
ＲＡが、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールである、請求項３に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項５】
前記架橋基が、式Ｉｂ、Ｉｃ、Ｉｄ、またはＩｅ：
【化２】
2020520988.tif 000002
の構造を含み、
式中、波線が、前記架橋基の、前記化合物の残部への付着点を図示し、
ＸＡが、−Ｃ（Ｏ）−または−ＳＯ２−であり、
ＸＢが、−Ｃ（Ｏ）−またはＣＲＥＲＦであり、
ＲＢ及びＲＣが、独立して、水素、ハロゲン、任意選択で置換されたヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであり、
ＲＤが、水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであり、
ＲＥ及びＲＦが、独立して、水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルである、請求項１〜３のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項６】
前記架橋基が、式Ｉｆ、Ｉｇ、Ｉｈ、またはＩｉ：
【化３】
2020520988.tif 000003
の構造を含み、
式中、波線が、前記架橋基の、前記化合物の残部への付着点を図示し、
ＸＣが、−Ｃ（Ｏ）−または−ＳＯ２−であり、
ＸＤが、存在しない、ＮＲＪＲＫ、またはＯＲＬであり、
ＲＧ、ＲＨ、及びＲＩが、独立して、水素、ニトリル、ハロゲン、任意選択で置換されたヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであり、
ＲＪ、ＲＫ、及びＲＬが、独立して、存在しない、水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルである、請求項１〜３のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項７】
前記架橋基が、式ＩｊまたはＩｋ：
【化４】
2020520988.tif 000004
の構造を含み、
式中、波線が、前記架橋基の、前記化合物の残部への付着点を図示し、
ＸＥが、存在しない、ＮＲＮＲＯ、またはＯＲＰであり、
ＲＭが、水素、ハロゲン、任意選択で置換されたヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであり、
ＲＮ、ＲＯ、及びＲＰが、独立して、水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルである、請求項１または２に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項８】
前記架橋基が、式ＩｍまたはＩｎ：
【化５】
2020520988.tif 000005
の構造を含み、
式中、波線が、前記架橋基の、前記化合物の残部への付着点を図示し、
ＸＦが、存在しない、ＮＲＳＲＴ、またはＯＲＵであり、
ＸＧが、存在しないまたは−Ｃ（Ｏ）−であり、
Ｙが、ハロゲンおよびニトリルから選択された脱離基であり、
ＲＱ及びＲＲが、独立して、水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであり、
ＲＳ、ＲＴ、及びＲＵが、独立して、存在しない、水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルである、請求項１〜３のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項９】
前記架橋基が、エポキシドを含み、
前記架橋基が、式Ｉｏ：
【化６】
2020520988.tif 000006
の構造を含み、
式中、波線が、前記架橋基の、前記化合物の残部への付着点を図示し、
ＲＶ、ＲＷ、及びＲＸが、独立して、水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルである、請求項１または２に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１０】
前記架橋基が、式Ｉｐ：
【化７】
2020520988.tif 000007
の構造を含み、
式中、波線が、前記架橋基の、前記化合物の残部への付着点を図示し、
点線が、前記構造が芳香族となるために必要に応じて含まれる任意選択の二重結合を表し、
ｂが、０、１、または２であり、
Ｙが、ニトリル、ハロゲン、メシレート、トシレート、およびトリフレートから選択された脱離基であり、
ＲＹ及びＲＺが、独立して、水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであり、
ＸＨ、ＸＩ、ＸＪ、ＸＫ、及びＸＬのそれぞれが、独立して、存在しない、ＮＲＡＡ、またはＣＲＡＢであり、ＸＨ、ＸＩ、ＸＪ、ＸＫ、及びＸＬのうちの少なくとも５つが、ＮＲＡＡ、またはＣＲＡＢであり、
ＲＡＡが、存在しない、または水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、もしくは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであり、
ＲＡＢが、水素、ニトリル、ハロゲン、任意選択で置換されたヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルである、請求項１または２に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１１】
前記架橋基が、内部架橋基であり、
前記架橋基が、式Ｉｑ、Ｉｒ、またはＩｓ：
【化８】
2020520988.tif 000008
の構造を含み、
式中、波線が、前記架橋基の、前記化合物の残部への付着点を図示し、
ＸＭが、−Ｃ（Ｏ）−または−ＳＯ２−であり、
ＸＮが、存在しない、ＮＲＡＥ、またはＯであり、
ＲＡＣ及びＲＡＤが、独立して、水素、ニトリル、ハロゲン、任意選択で置換されたヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであり、
ＲＡＥが、水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルである、請求項１または２に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１２】
プレゼンタータンパク質結合部分及び架橋基を含み、
前記プレゼンタータンパク質結合部分が、ＦＫＢＰ結合部分、シクロフィリン結合部分、またはＰＩＮ１結合部分である、化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１３】
前記プレゼンタータンパク質結合部分が、ＦＫＢＰ１２、ＦＫＢＰ１２．６、ＦＫＢＰ１３、ＦＫＢＰ２５、ＦＫＢＰ５１、またはＦＫＢＰ５２と結合することができる、請求項１２に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１４】
前記プレゼンタータンパク質結合部分が、ＰＰ１Ａ、ＣＹＰＢ、ＣＹＰＣ、ＣＹＰ４０、ＣＹＰＥ、ＣＹＰＤ、ＮＫＴＲ、ＳＲＣｙｐ、ＣＹＰＨ、ＣＷＣ２７、ＣＹＰＬ１、ＣＹＰ６０、ＣＹＰＪ、ＰＰＩＬ４、ＰＰＩＬ６、ＲＡＮＢＰ２、またはＰＰＷＤ１と結合することができる、請求項１２に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１５】
前記ＦＫＢＰ結合部分が、式ＩＩａまたはＩＩｂ：
【化９】
2020520988.tif 000009
の構造を含み、
式中、Ｚ１及びＺ２が、それぞれ、独立して、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキルであるか、またはＺ１及びＺ２が、それらが付着している原子と、組み合わさって、任意選択で置換された１０〜４０員の大環状分子を形成し、Ｚ１またはＺ２のうちの少なくとも１つが、前記架橋基への付着点を含み、
ｂ及びｃが、独立して、０、１、または２であり、
ｄが、０、１、２、３、４、５、６、または７であり、
Ｘ１及びＸ２が、それぞれ、独立して、存在しない、ＣＨ２、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、またはＮＲ４であり、
各Ｒ１及びＲ２が、独立して、水素、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであるか、あるいはＲ１及びＲ２が、それらが結合している炭素原子と組み合わさって、Ｃ＝Ｏを形成するまたはＲ１及びＲ２が、組み合わさって、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリルもしくは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルを形成し、
各Ｒ３が、独立して、ヒドロキシル、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、もしくは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであるか、または２つのＲ８が組み合わさって、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、もしくは任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールを形成し、
各Ｒ４が、独立して、水素、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたアリール、Ｃ３−Ｃ７カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、及び任意選択で置換されたＣ３−Ｃ７カルボシクリルＣ１−Ｃ６アルキルである、請求項１３に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１６】
前記プレゼンタータンパク質結合部分が、構造：
【化１０】
2020520988.tif 000010
を含む、請求項１５に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１７】
前記シクロフィリン結合部分が、式ＩＩＩまたはＩＶ：
【化１１】
2020520988.tif 000011
の構造を含み、
式中、Ｚ３、Ｚ４、Ｚ５、及びＺ６が、それぞれ、独立して、ヒドロキシル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキルであるか、またはＺ３及びＺ４もしくはＺ５及びＺ６が、それらが付着している原子と、組み合わさって、任意選択で置換された１０〜４０員の大環状分子を形成し、
Ｚ３、Ｚ４、Ｚ５、Ｚ６、またはＲ５のうちの少なくとも１つが、前記架橋基への付着点を含み、
ｅが、０、１、２、３、または４であり、
Ｒ５が、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであり、
Ｒ６が、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキルであり、
各Ｒ７が、独立して、ヒドロキシル、シアノ、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキルであり、
Ｒ８が、水素、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたアリール、Ｃ３−Ｃ７カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、及び任意選択で置換されたＣ３−Ｃ７カルボシクリルＣ１−Ｃ６アルキルである、請求項１２に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１８】
前記シクロフィリン結合部分が、式ＩＶａ：
【化１２】
2020520988.tif 000012
の構造を含み、
式中、各Ｒ７’が、独立して、ヒドロキシル、シアノ、任意選択で置換されたアミノ、ハロゲン、チオール、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６ヘテロアルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６ヘテロアルキニル、任意選択で置換されたＣ３−Ｃ１０カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリール、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリル（例えば、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリール）、または任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロシクリルＣ１−Ｃ６アルキル（例えば、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ９ヘテロアリールＣ１−Ｃ６アルキル）である、請求項１７に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項１９】
前記プレゼンタータンパク質結合部分が、構造：
【化１３】
2020520988.tif 000013
を含む、請求項１７または１８に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項２０】
前記タンパク質結合部分及び前記架橋基が、リンカーを通して接合する、請求項１〜１９のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項２１】
前記リンカーが、式Ｖ：
Ａ１−（Ｂ１）ｆ−（Ｃ１）ｇ−（Ｂ２）ｈ−（Ｄ）−（Ｂ３）ｉ−（Ｃ２）ｊ−（Ｂ４）ｋ−Ａ２
式Ｖ
の構造を有し、
式中、Ａ１が、前記リンカー及びタンパク質結合部分間の結合であり、Ａ２が、前記架橋基及び前記リンカー間の結合であり、Ｂ１、Ｂ２、Ｂ３、及びＢ４が、それぞれ、独立して、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ２アルキル、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ３ヘテロアルキル、Ｏ、Ｓ、及びＮＲＮから選択され、ＲＮが、水素、任意選択で置換されたＣ１−４アルキル、任意選択で置換されたＣ２−４アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−４アルキニル、任意選択で置換されたＣ２−６ヘテロシクリル、任意選択で置換されたＣ６−１２アリール、または任意選択で置換されたＣ１−７ヘテロアルキルであり、Ｃ１及びＣ２が、それぞれ、独立して、カルボニル、チオカルボニル、スルホニル、またはホスホリルから選択され、ｆ、ｇ、ｈ、Ｉ、ｊ、及びｋが、それぞれ、独立して、０または１であり、Ｄが、任意選択で置換されたＣ１−１０アルキル、任意選択で置換されたＣ２−１０アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−１０アルキニル、任意選択で置換されたＣ２−６ヘテロシクリル、任意選択で置換されたＣ６−１２アリール、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ１０ポリエチレングリコール、もしくは任意選択で置換されたＣ１−１０ヘテロアルキルであるか、またはＡ１−（Ｂ１）ｆ−（Ｃ１）ｇ−（Ｂ２）ｈ−を−（Ｂ３）ｉ−（Ｃ２）ｊ−（Ｂ４）ｋ−Ａ２に連結する化学結合である、請求項２０に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項２２】
前記リンカーが、式ＶＩ：
【化１４】
2020520988.tif 000014
の構造を含み、
式中、Ａ１が、前記リンカー及びタンパク質結合部分間の結合であり、
Ａ２が、前記架橋基及び前記リンカー間の結合であり、
ｌが、０、１、２、または３であり、
ｍが、０または１であり、
ｎが、０、１、または２であり、
Ｘ３、Ｘ４、及びＸ５が、それぞれ、独立して、存在しない、Ｏ、Ｓ、−Ｃ≡Ｃ−、ＣＲ９Ｒ１０またはＮＲ１１であり、
各Ｒ９、Ｒ１０、及びＲ１１が、独立して、水素、任意選択で置換されたＣ１−Ｃ６アルキル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルケニル、任意選択で置換されたＣ２−Ｃ６アルキニル、任意選択で置換されたアリール、Ｃ３−Ｃ７カルボシクリル、任意選択で置換されたＣ６−Ｃ１０アリールＣ１−Ｃ６アルキル、及び任意選択で置換されたＣ３−Ｃ７カルボシクリルＣ１−Ｃ６アルキルである、請求項２１に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項２３】
構造：
【化１５−１】
2020520988.tif 000015
【化１５−２】
2020520988.tif 000016
を有する化合物またはその薬学的に許容され得る塩。
【請求項２４】
請求項１〜２３のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩、及び薬学的に許容され得る担体を含む、医薬組成物。
【請求項２５】
標的タンパク質を調節する方法に使用するための、請求項１〜２３のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩、または請求項２４に記載の組成物であって、前記方法が、前記標的タンパク質を、調節量の前記化合物またはその薬学的に許容され得る塩、または前記組成物と接触させることを含む、化合物またはその薬学的に許容され得る塩または組成物。
【請求項２６】
プロリルイソメラーゼ活性を阻害する方法に使用するための、請求項１〜２３のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容され得る塩、または請求項２４に記載の組成物であって、前記方法が、前記プロリルイソメラーゼを発現する細胞を、前記化合物またはその薬学的に許容され得る塩または前記組成物と、前記化合物及び前記プロリルイソメラーゼ間で複合体の形成を可能とする条件下で、接触させることを含み、それにより、プロリルイソメラーゼ活性を阻害する、化合物またはその薬学的に許容され得る塩または組成物。