【手続補正書】
【提出日】令和3年10月29日(2021.10.29)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｔアームと、Ｄアームと、アンチコドンアームと、アクセプタアームとを含む修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）であって、前記Ｔアームが伸長因子１−α１（ＥＦ１α）と相互作用するヌクレオチドを有するＴステムを含む、修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
【請求項２】
配列番号１〜５３８のいずれか一つからなる修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）であって、チミジンがウラシルで置換されている、修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
【請求項３】
前記ｔＲＮＡが配列番号４からなり、チミジンがウラシルで置換されている、請求項２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
【請求項４】
前記ｔＲＮＡが配列番号１６からなり、チミジンがウラシルで置換されている、請求項２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
【請求項５】
前記ｔＲＮＡが配列番号２４からなり、チミジンがウラシルで置換されている、請求項２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
【請求項６】
前記ｔＲＮＡが配列番号３３からなり、チミジンがウラシルで置換されている、請求項２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
【請求項７】
前記ｔＲＮＡが配列番号３８からなり、チミジンがウラシルで置換されている、請求項２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
【請求項８】
前記ｔＲＮＡが配列番号４４からなり、チミジンがウラシルで置換されている、請求項２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
【請求項９】
前記ｔＲＮＡが配列番号４８からなり、チミジンがウラシルで置換されている、請求項２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
【請求項１０】
前記ｔＲＮＡが配列番号５３からなり、チミジンがウラシルで置換されている、請求項２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
【請求項１１】
配列番号５６〜６０、６２〜６６、８４〜８６、９０〜１１１、１１３、１２８〜１４３、１４７〜１４９、１５３〜１５６、１６１〜１７４、１７６、１７８、１８１、１８４〜１８６、１９２、１９６〜１９７、１９９〜２０１、２０５、２１３〜２４０、２４６、２５５〜２５６、２５８〜２８５、２９９、３０５〜３１２、３１４、３１８〜３３２、３３５〜３４４、３４６、３５０〜３５４、３５７〜３６０、３６２、３６５〜３７０、３７２〜３８３、３８８〜３９０、３９２、３９４〜４０１、４０３〜４０７、４１４〜４１６、４１８、４２２、４２５、４２８〜４３３、４３７、４４４〜４４５、４５２、４５５、４５９〜４６３、４７０、４７２〜４７４、４７６、４８７〜４９２、５２５、５３０〜５３９、５４５〜５５０、５５３〜５５５、５６１〜５６３および５６７〜５７９のいずれか１つからなる修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）であって、チミジンがウラシルで置換されている、修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
【請求項１２】
Ｔアームと、Ｄアームと、アンチコドンアームと、アクセプタアームとを含む修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）であって、
（ａ）前記アンチコドンアームがトリヌクレオチドアンチコドンを含み、前記アンチコドンが５’−ＵＣＡ−３’であり、かつＴＧＡ終止コドンを認識し、前記アクセプタアームがアルギニン、トリプトファン若しくはグリシンに作動可能に連結されており；
（ｂ）前記アンチコドンアームがトリヌクレオチドアンチコドンを含み、前記アンチコドンが５’−ＵＵＡ−３’であり、かつＴＡＡ終止コドンを認識し、前記アクセプタアームがグルタミン若しくはグルタミン酸に作動可能に連結されており；または
（ｃ）前記アンチコドンアームがトリヌクレオチドアンチコドンを含み、前記アンチコドンが５’−ＣＵＡ−３’であり、かつＴＡＧ終止コドンを認識し、前記アクセプタアームがトリプトファン、グルタミン酸若しくはグルタミンに作動可能に連結されている；
修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
【請求項１３】
前記Ｔアームが伸長因子１−α１（ＥＦ１α）との相互作用を増強しまたは調整する合理的なヌクレオチド置換を含む、請求項１２に記載の修飾されたｔＲＮＡ。
【請求項１４】
オリゴヌクレオチドが１５０ヌクレオチド未満の全長を有する、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の修飾されたｔＲＮＡをコードするオリゴヌクレオチド配列。
【請求項１５】
第一のオリゴヌクレオチド配列と第二のオリゴヌクレオチド配列とを含むオリゴヌクレオチドであって、前記第一および第二のオリゴヌクレオチド配列が、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の修飾されたｔＲＮＡを独立にコードし、前記第一および第二のオリゴヌクレオチドが１５０ヌクレオチド未満の全長を独立に有し、前記２つの配列がタンデムである、オリゴヌクレオチド。
【請求項１６】
前記オリゴヌクレオチドがＤＮＡである、請求項１５に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１７】
プロモーターと、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の修飾されたｔＲＮＡをコードする核酸または請求項１４〜１６のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド配列とを含む発現カセット。
【請求項１８】
請求項１４〜１６のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドまたは請求項１７に記載の発現カセットを含むベクター。
【請求項１９】
前記ベクターがウイルスベクターまたはプラスミドベクターである、請求項１８に記載のベクター。
【請求項２０】
請求項１〜１３のいずれか一項に記載の修飾されたｔＲＮＡ、請求項１４〜１６のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド、または請求項１８若しくは１９に記載のベクターと、
薬学的に許容され得る担体と、
を含む、組成物。
【請求項２１】
前記担体がリポソームである、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２２】
請求項１８または１９に記載のベクターを含む細胞。
【請求項２３】
終止コドン関連遺伝子疾患を処置するための、請求項２０または２１に記載の組成物。
【請求項２４】
未成熟終止コドンと関連する前記遺伝子疾患が、嚢胞性線維症、筋ジストロフィー、β−サラセミアまたはリドル症候群である、請求項２３に記載の組成物。
【請求項２５】
細胞中のナンセンス変異を含むヌクレオチド配列に対する翻訳を回復させるための、請求項２０または２１に記載の組成物であって、前記組成物は前記細胞に導入されることを特徴とし、ここで、修飾されたｔＲＮＡが、ナンセンス変異を含む前記ヌクレオチド配列に対する翻訳を回復させる、組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２６４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２６４】
本発明を実施するための本発明者らが知る最良の態様を含む本発明の実施形態が本明細書に記載されている。前記記載を読めば、これらの実施形態の変形が当業者に自明なものとなり得る。本発明者らは、当業者が適宜このような変更を利用することを予期し、本発明者らは、本発明が本明細書に具体的に記載されているものとは異なって実施されることを意図する。したがって、本発明は、適用法によって許容されるところにより、本明細書に添付された特許請求の範囲に記載された主題の全ての改変および均等物を含む。さらに、本明細書に別段の記載がなければ、または文脈上明らかに矛盾しなければ、全ての可能なその変形中での上記要素のあらゆる組み合わせが本発明によって包含される。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
Ｔアームと、Ｄアームと、アンチコドンアームと、アクセプタアームとを含む修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）であって、前記Ｔアームが伸長因子１−α１（ＥＦ１α）と相互作用するヌクレオチドを有するＴステムを含む、修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
（項目２）
配列番号１〜５３８のいずれか一つからなる修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）であって、チミジンがウラシルで置換されている、修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
（項目３）
前記ｔＲＮＡが配列番号４からなり、チミジンがウラシルで置換されている、項目２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
（項目４）
前記ｔＲＮＡが配列番号１６からなり、チミジンがウラシルで置換されている、項目２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
（項目５）
前記ｔＲＮＡが配列番号２４からなり、チミジンがウラシルで置換されている、項目２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
（項目６）
前記ｔＲＮＡが配列番号３３からなり、チミジンがウラシルで置換されている、項目２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
（項目７）
前記ｔＲＮＡが配列番号３８からなり、チミジンがウラシルで置換されている、項目２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
（項目８）
前記ｔＲＮＡが配列番号４４からなり、チミジンがウラシルで置換されている、項目２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
（項目９）
前記ｔＲＮＡが配列番号４８からなり、チミジンがウラシルで置換されている、項目２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
（項目１０）
前記ｔＲＮＡが配列番号５３からなり、チミジンがウラシルで置換されている、項目２に記載の修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
（項目１１）
配列番号５６〜６０、６２〜６６、８４〜８６、９０〜１１１、１１３、１２８〜１４３、１４７〜１４９、１５３〜１５６、１６１〜１７４、１７６、１７８、１８１、１８４〜１８６、１９２、１９６〜１９７、１９９〜２０１、２０５、２１３〜２４０、２４６、２５５〜２５６、２５８〜２８５、２９９、３０５〜３１２、３１４、３１８〜３３２、３３５〜３４４、３４６、３５０〜３５４、３５７〜３６０、３６２、３６５〜３７０、３７２〜３８３、３８８〜３９０、３９２、３９４〜４０１、４０３〜４０７、４１４〜４１６、４１８、４２２、４２５、４２８〜４３３、４３７、４４４〜４４５、４５２、４５５、４５９〜４６３、４７０、４７２〜４７４、４７６、４８７〜４９２、５２５、５３０〜５３９、５４５〜５５０、５５３〜５５５、５６１〜５６３および５６７〜５７９のいずれか１つからなる修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）であって、チミジンがウラシルで置換されている、修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
（項目１２）
Ｔアームと、Ｄアームと、アンチコドンアームと、アクセプタアームとを含む修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）であって、
（ａ）前記アンチコドンアームがトリヌクレオチドアンチコドンを含み、前記アンチコドンが５’−ＵＣＡ−３’であり、かつＴＧＡ終止コドンを認識し、前記アクセプタアームがアルギニン、トリプトファン若しくはグリシンに作動可能に連結されており；
（ｂ）前記アンチコドンアームがトリヌクレオチドアンチコドンを含み、前記アンチコドンが５’−ＵＵＡ−３’であり、かつＴＡＡ終止コドンを認識し、前記アクセプタアームがグルタミン若しくはグルタミン酸に作動可能に連結されており；または
（ｃ）前記アンチコドンアームがトリヌクレオチドアンチコドンを含み、前記アンチコドンが５’−ＣＵＡ−３’であり、かつＴＡＧ終止コドンを認識し、前記アクセプタアームがトリプトファン、グルタミン酸若しくはグルタミンに作動可能に連結されている；
修飾された転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）。
（項目１３）
前記Ｔアームが伸長因子１−α１（ＥＦ１α）との相互作用を増強しまたは調整する合理的なヌクレオチド置換を含む、項目１２に記載の修飾されたｔＲＮＡ。
（項目１４）
オリゴヌクレオチドが１５０ヌクレオチド未満の全長を有する、項目１〜１３のいずれか一項に記載の修飾されたｔＲＮＡをコードするオリゴヌクレオチド配列。
（項目１５）
第一のオリゴヌクレオチド配列と第二のオリゴヌクレオチド配列とを含むオリゴヌクレオチドであって、前記第一および第二のオリゴヌクレオチド配列が、項目１〜１３のいずれか一項に記載の修飾されたｔＲＮＡを独立にコードし、前記第一および第二のオリゴヌクレオチドが１５０ヌクレオチド未満の全長を独立に有し、前記２つの配列がタンデムである、オリゴヌクレオチド。
（項目１６）
前記オリゴヌクレオチドがＤＮＡである、項目１５に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目１７）
プロモーターと、項目１〜１３のいずれか一項に記載の修飾されたｔＲＮＡをコードする核酸または項目１４〜１６のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド配列とを含む発現カセット。
（項目１８）
項目１４〜１６のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドまたは項目１７に記載の発現カセットを含むベクター。
（項目１９）
前記ベクターがウイルスベクターまたはプラスミドベクターである、項目１８に記載のベクター。
（項目２０）
項目１〜１３のいずれか一項に記載の修飾されたｔＲＮＡと、項目１４〜１６のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドと、または項目１８若しくは１９に記載のベクターと、
薬学的に許容され得る担体と、
を含む、組成物。
（項目２１）
前記担体がリポソームである、項目２０に記載の組成物。
（項目２２）
項目１８または１９に記載のベクターを含む細胞。
（項目２３）
終止コドン関連遺伝子疾患を処置する方法であって、終止コドン関連遺伝子疾患を処置することを必要とする患者に、項目２０または２１に記載の組成物を投与することを含む、方法。
（項目２４）
未成熟終止コドンと関連する前記遺伝子疾患が、嚢胞性線維症、筋ジストロフィー、β−サラセミアまたはリドル症候群である、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
細胞中のナンセンス変異を含むヌクレオチド配列への翻訳を回復させる方法であって、項目２０または２１に記載の組成物を前記細胞に導入することを含み、修飾されたｔＲＮＡが、ナンセンス変異を含む前記ヌクレオチド配列への翻訳を回復させる、方法。