【手続補正書】
【提出日】令和3年11月4日(2021.11.4)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
明細書に記載の発明。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２３３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２３３】
均等物
当業者は、本明細書に記載される本発明の特定の実施形態に対する多くの均等物を認識し、または日常的な実験のみを使用して確認することができるであろう。そのような均等物は、添付の特許請求の範囲に含まれることが意図される。
特定の実施形態では、例えば以下の項目が提供される。
（項目１）
減少したＣＤＨ１レベルを有する癌に罹患した対象を治療する方法であって、１）ＲＨＯＡドミナントネガティブポリペプチドまたはその生物学的に活性な断片をコードする核酸、および２）ＲＨＯＡドミナントネガティブポリペプチドまたはその生物学的に活性な断片、からなる群から選択される少なくとも１つの薬剤の治療的有効量を前記対象に投与することを含む、方法。
（項目２）
前記癌がＣＤＨ１発現を喪失している、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記癌が上皮間葉転換（ＥＭＴ）を起こしつつあるか、または既に起こしている、項目１または２に記載の方法。
（項目４）
前記癌が、びまん性胃癌（ＤＧＣ）、乳小葉癌、転移性乳癌、転移性肺癌、転移性非小細胞肺癌、結腸癌、膵臓癌、前立腺癌、脳腫瘍および黒色腫からなる群から選択される、項目１〜３のいずれか一項に記載の方法。
（項目５）
前記薬剤が、（ｉ）配列番号１、２、および３からなる群から選択されるポリペプチドとその全長にわたって少なくとも８０％同一であるＲＨＯＡドミナントネガティブポリペプチド、またはその生物学的に活性な断片ならびに（ｉｉ）（ｉ）のＲＨＯＡドミナントネガティブポリペプチドまたはその生物学的に活性な断片をコードする核酸配列、からなる群から選択され、前記核酸配列は、配列番号４、５、６、７、８、９、１０、および１１からなる群から選択される核酸配列、または前記生物学的に活性な断片をコードするその一部と、その全長にわたって少なくとも８０％同一である、項目１〜４のいずれか一項に記載の方法。
（項目６）
前記薬剤が、配列番号１、２、または３のＲＨＯＡドミナントネガティブポリペプチド配列を含む、項目１〜５のいずれか一項に記載の方法。
（項目７）
前記薬剤が、ＲＨＯＡドミナントネガティブポリペプチド、またはその生物学的に活性な断片であり、かつそれに融合した異種ポリペプチドをさらに含む、項目１〜６のいずれか一項に記載の方法。
（項目８）
前記融合ポリペプチドが、対応する非融合ＲＨＯＡドミナントネガティブポリペプチド、またはその生物学的に活性な断片よりも長い半減期および／または細胞透過性を有する、項目７に記載の方法。
（項目９）
前記異種ポリペプチドが、Ｆｃドメインおよび／または細胞透過性ペプチドである、項目７に記載の方法。
（項目１０）
前記薬剤が、発現ベクターまたは細胞内に含まれる核酸である、項目１〜５のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１）
前記対象に免疫療法および／または癌療法を施すことをさらに含み、任意で、前記免疫療法および／または癌療法が前記薬剤の前、後、または同時に施される、項目１〜１０のいずれか一項に記載の方法。
（項目１２）
前記免疫療法が、細胞ベースである、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
前記免疫療法が、癌ワクチンおよび／またはウイルスを含む、項目１１に記載の方法。
（項目１４）
前記免疫療法が、免疫チェックポイントを阻害する、項目１１に記載の方法。
（項目１５）
前記免疫チェックポイントが、ＣＴＬＡ−４、ＰＤ−１、ＶＩＳＴＡ、Ｂ７−Ｈ２、Ｂ７−Ｈ３、ＰＤ−Ｌ１、Ｂ７−Ｈ４、Ｂ７−Ｈ６、ＩＣＯＳ、ＨＶＥＭ、ＰＤ−Ｌ２、ＣＤ１６０、ｇｐ４９Ｂ、ＰＩＲ−Ｂ、ＫＩＲファミリー受容体、ＴＩＭ−１、ＴＩＭ−３、ＴＩＭ−４、ＬＡＧ−３、ＧＩＴＲ、４−ＩＢＢ、ＯＸ−４０、ＢＴＬＡ、ＳＩＲＰアルファ（ＣＤ４７）、ＣＤ４８、２Ｂ４（ＣＤ２４４）、Ｂ７．１、Ｂ７．２、ＩＬＴ−２、ＩＬＴ−４、ＴＩＧＩＴ、ＨＨＬＡ２、ブチロフィリン、およびＡ２ａＲからなる群から選択される、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記癌療法が、放射線、放射線増感剤、および化学療法からなる群から選択される、項目１１に記載の方法。
（項目１７）
前記薬剤が、前記癌中の生存細胞または増殖細胞の数を減少させ、かつ／または前記癌細胞を含む腫瘍の体積またはサイズを減少させる、項目１〜１６のいずれか一項に記載の方法。
（項目１８）
前記癌を治療するための少なくとも１つの追加の治療薬またはレジメンを前記対象に投与することをさらに含む、項目１〜１７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１９）
減少したＣＤＨ１レベルを有する癌細胞の生存率または増殖を減少させる方法であって、前記癌細胞を１）ＲＨＯＡドミナントネガティブポリペプチドまたはその生物学的に活性な断片をコードする核酸、および２）ＲＨＯＡドミナントネガティブポリペプチドまたはその生物学的に活性な断片、からなる群から選択される少なくとも１つの薬剤と接触させることを含む、方法。
（項目２０）
前記癌細胞がＣＤＨ１発現を喪失している、項目１９に記載の方法。
（項目２１）
前記癌細胞が、上皮間葉転換（ＥＭＴ）を起こしつつあるか、または既に起こしている、項目１９または２０に記載の方法。
（項目２２）
前記癌細胞が、びまん性胃癌（ＤＧＣ）、乳小葉癌、転移性乳癌、転移性肺癌、転移性非小細胞肺癌、結腸癌、膵臓癌、前立腺癌、脳腫瘍、黒色腫からなる群から選択される癌を有する対象から得られる、項目１９〜２１のいずれか一項に記載の方法。
（項目２３）
前記薬剤が、（ｉ）配列番号１、２、および３からなる群から選択されるポリペプチドとその全長にわたって少なくとも８０％同一であるＲＨＯＡドミナントネガティブポリペプチド、またはその生物学的に活性な断片、ならびに（ｉｉ）（ｉ）のＲＨＯＡドミナントネガティブポリペプチドまたはその生物学的に活性な断片をコードする核酸配列、からなる群から選択され、前記核酸配列は、配列番号４、５、６、７、８、９、１０、および１１からなる群から選択される核酸配列、または前記生物学的に活性な断片をコードするその一部と、その全長にわたって少なくとも８０％同一である、項目１９〜２２のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４）
前記薬剤が、配列番号１、２、または３のＲＨＯＡドミナントネガティブポリペプチド配列を含む、項目１９〜２３のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５）
前記薬剤が、ＲＨＯＡドミナントネガティブポリペプチド、またはその生物学的に活性な断片であり、かつそれに融合した異種ポリペプチドをさらに含む、項目１９〜２４のいずれか一項に記載の方法。
（項目２６）
前記融合ポリペプチドが、対応する非融合ＲＨＯＡドミナントネガティブポリペプチド、またはその生物学的に活性な断片よりも長い半減期および／または細胞透過性を有する、項目２５に記載の方法。
（項目２７）
前記異種ポリペプチドが、Ｆｃドメインおよび／または細胞透過性ペプチドである、項目２６に記載の方法。
（項目２８）
前記薬剤が、発現ベクターまたは細胞内に含まれる核酸である、項目１９〜２３のいずれか一項に記載の方法。
（項目２９）
前記癌細胞を免疫療法および／または癌療法と接触させることをさらに含み、任意で、前記免疫療法および／または癌療法が前記薬剤の前、後、または同時に施される、項目１９〜２８のいずれか一項に記載の方法。
（項目３０）
前記免疫療法が細胞ベースである、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
前記免疫療法が癌ワクチンおよび／またはウイルスを含む、項目２９に記載の方法。
（項目３２）
前記免疫療法が免疫チェックポイントを阻害する、項目２９に記載の方法。
（項目３３）
前記免疫チェックポイントが、ＣＴＬＡ−４、ＰＤ−１、ＶＩＳＴＡ、Ｂ７−Ｈ２、Ｂ７−Ｈ３、ＰＤ−Ｌ１、Ｂ７−Ｈ４、Ｂ７−Ｈ６、ＩＣＯＳ、ＨＶＥＭ、ＰＤ−Ｌ２、ＣＤ１６０、ｇｐ４９Ｂ、ＰＩＲ−Ｂ、ＫＩＲファミリー受容体、ＴＩＭ−１、ＴＩＭ−３、ＴＩＭ−４、ＬＡＧ−３、ＧＩＴＲ、４−ＩＢＢ、ＯＸ−４０、ＢＴＬＡ、ＳＩＲＰアルファ（ＣＤ４７）、ＣＤ４８、２Ｂ４（ＣＤ２４４）、Ｂ７．１、Ｂ７．２、ＩＬＴ−２、ＩＬＴ−４、ＴＩＧＩＴ、ＨＨＬＡ２、ブチロフィリン、およびＡ２ａＲからなる群から選択される、項目２９に記載の方法。
（項目３４）
前記癌療法が、放射線、放射線増感剤、および化学療法からなる群から選択される、項目２９に記載の方法。
（項目３５）
対象において減少したＣＤＨ１レベルを有する癌を治療するための項目１に記載の薬剤の有効性を評価する方法であって、
ａ）最初の時点で、対象の試料における生存および／または増殖癌細胞の数を検出することと、
ｂ）前記薬剤の投与後の少なくとも１つの後続時点の間、工程ａ）を繰り返すことと、
ｃ）工程ａ）およびｂ）で検出された生存および／または増殖癌細胞の数を比較することと、を含み、前記最初の時点での前記試料中の量と比較した、後続試料中の生存および／または増殖癌細胞の不在、またはその数の顕著な減少は、前記薬剤が前記対象の癌を治療することを示す、方法。
（項目３６）
前記最初の時点と前記後続時点との間で、前記対象が前記癌の治療を受けたか、治療を完了したか、かつ／または寛解にある、項目３５に記載の方法。
（項目３７）
前記最初および／または少なくとも１つの後続試料が、エクスビボおよびインビボ試料からなる群から選択される、項目３５または３６に記載の方法。
（項目３８）
前記最初および／または少なくとも１つの後続試料が、前記癌の動物モデルから得られる、項目３５〜３７のいずれか一項に記載の方法。
（項目３９）
前記最初および／または少なくとも１つの後続試料が、前記対象から得られた単一試料またはプールされた試料の一部である、項目３５〜３８のいずれか一項に記載の方法。
（項目４０）
前記試料が、前記対象から得られた細胞、血清、腫瘍周囲組織、および／または腫瘍内組織を含む、項目３５〜３９のいずれか一項に記載の方法。
（項目４１）
臨床的有益率、死亡までの生存時間、病理学的完全奏効、病理学的奏効の半定量的測定、臨床的完全寛解、臨床的部分寛解、臨床的安定疾患、無再発生存期間、無転移生存期間、無病生存期間、循環腫瘍細胞減少、循環マーカー反応、およびＲＥＣＩＳＴ基準からなる群から選択される少なくとも１つの基準を測定することにより、前記薬剤に対する奏効性を決定することをさらに含む、項目３５〜４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目４２）
前記薬剤が薬学的に許容される製剤で投与される、項目１〜４１のいずれか一項に記載の方法。
（項目４３）
前記投与または接触の工程が、インビボ、エクスビボ、またはインビトロで生じる、項目１〜４２のいずれか一項に記載の方法。
（項目４４）
前記対象が前記癌の動物モデルであり、任意に、前記動物モデルがマウスモデルである、項目１〜４３のいずれか一項に記載の方法。
（項目４５）
前記対象が哺乳動物である、項目１〜４４のいずれか一項に記載の方法。
（項目４６）
前記哺乳動物がマウスまたはヒトである、項目４５に記載の方法。
（項目４７）
前記哺乳動物がヒトである、項目４６に記載の方法。
（項目４８）
減少したＣＤＨ１レベルを有する癌細胞の生存率または増殖を減少させる薬剤をスクリーニングするための細胞ベースのアッセイであって、
ａ）前記癌細胞を、１）ＲＨＯＡ変異体、またはその生物学的に活性な断片をコードする核酸、および２）ＲＨＯＡ変異体ポリペプチド、またはその生物学的に活性な断片、からなる群から選択される試験薬剤と接触させることと、
ｂ）対照と比較して癌細胞の減少した生存率または増殖を決定し、それにより癌細胞の生存率または増殖を減少させる前記試験薬剤を特定することと、を含む細胞ベースのアッセイ。
（項目４９）
前記対照が前記試験薬剤と接触していない癌細胞である、項目４８に記載の細胞ベースのアッセイ。
（項目５０）
前記対照が抗癌剤と接触した癌細胞である、項目４８に記載の細胞ベースのアッセイ。
（項目５１）
前記癌細胞が、癌の動物モデル、または癌に罹患したヒト患者から単離される、項目４８〜５０のいずれか一項に記載の細胞ベースのアッセイ。
（項目５２）
前記接触させる工程がインビボ、エクスビボ、またはインビトロで生じる、項目４８〜５１のいずれか一項に記載の細胞ベースのアッセイ。