【手続補正書】
【提出日】平成17年4月8日(2005.4.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
タンパク質のＣ末端に結合する能力を有する物質一分子に対して一分子の標識物質と一分子の親和性物質又は共有結合形成性反応基とが結合して成るタンパク質のラベル化試薬を用いてＣ末端を標識したタンパク質。
【請求項２】
タンパク質のラベル化試薬において、標識物質と親和性物質又は共有結合形成性反応基がそれぞれスペーサーを介して、タンパク質のＣ末端に結合する能力を有する物質に結合している、請求項１に記載のタンパク質。
【請求項３】
標識物質が蛍光物質である、請求項１又は２に記載のタンパク質。
【請求項４】
親和性物質が、ビオチン、マルトース、グアニンヌクレオチド、金属イオン、グルタチオン、タンパク質結合性ＤＮＡ、抗原分子、カルモジュリン結合ペプチド、ＡＴＰ、及びエストラジオールからなる群より選ばれる物質であり、共有結合形成性反応基が、ケトン基、ジオール基、アジド基又はソラレンである、請求項１から３の何れか１項に記載のタンパク質。
【請求項５】
タンパク質のＣ末端に結合する能力を有する物質が、ピューロマイシン、3’−Ｎ−アミノアシルピューロマイシンアミノヌクレオシド、又は3’−Ｎ−アミノアシルアデノシンアミノヌクレオシドのいずれかの化学構造骨格を含む化合物又はそれらの類縁体である、請求項１から４の何れか１項に記載のタンパク質。
【請求項６】
タンパク質のＣ末端に結合する能力を有する物質一分子に対して一分子の標識物質と一分子の親和性物質又は共有結合形成性反応基とが結合して成るタンパク質のラベル化試薬の存在下においてタンパク質をコードする核酸を用いて転写・翻訳系においてタンパク質合成を行うことにより得られる、請求項１から５の何れか１項に記載のタンパク質。
【請求項７】
分子中の親和性物質又は共有結合形成性反応基を介して固相に結合していることを特徴とする、請求項１から６の何れかに記載のタンパク質。
【請求項８】
分子中の親和性物質又は共有結合形成性反応基が、固相に結合された特定のポリペプチドと結合している、請求項１から７の何れか１項に記載のタンパク質。
【請求項９】
固相に結合された特定のポリペプチド／分子中の親和性物質又は共有結合形成性反応基の組み合わせが、ビオチン結合タンパク質／ビオチン、マルトース結合タンパク質／マルトース、Ｇタンパク質／グアニンヌクレオチド、ポリヒスチジンペプチド／金属イオン、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ／グルタチオン、ＤＮＡ結合タンパク質／ＤＮＡ、抗体／抗原分子、カルモジュリン／カルモジュリン結合ペプチド、ＡＴＰ結合タンパク質／ＡＴＰ、及びエストラジオール受容体タンパク質／エストラジオール、ケトン基／ヒドラジド基、ジオール基／ヒドラジド基、アジド基／アルキル基、ソラレン／核酸塩基よりなる群から選ばれるいずれかの組み合わせである、請求項１から８の何れか１項に記載のタンパク質。
【請求項１０】
請求項７から９のいずれかに記載の固相に結合したタンパク質の集合体を含むプロテインチップ。
【請求項１１】
一分子中に一分子の標識物質と一分子の親和性物質又は共有結合形成性反応基を有することを特徴とする、核酸、糖鎖又は生理活性分子から選ばれる物質。
【請求項１２】
標識物質が蛍光物質である、請求項１１に記載の物質。
【請求項１３】
親和性物質が、ビオチン、マルトース、グアニンヌクレオチド、金属イオン、グルタチオン、タンパク質結合性ＤＮＡ、抗原分子、カルモジュリン結合ペプチド、ＡＴＰ、及びエストラジオールからなる群より選ばれる物質であり、共有結合形成性反応基が、ケトン基、ジオール基、アジド基又はソラレンである、請求項１１又は１２に記載の物質。
【請求項１４】
５’末端又は３’末端の何れか片方を一分子の標識物質で標識した一本鎖核酸と、該一本鎖核酸の塩基配列に相補的な塩基配列を有し、５’末端又は３’末端の何れかを片方を一分子の親和性物質又は共有結合形成性反応基で標識した一本鎖核酸とをアニーリングさせることにより得られる、請求項１１から１３の何れか１項に記載の物質。
【請求項１５】
分子中の親和性物質又は共有結合形成性反応基を介して固相に結合していることを特徴とする、請求項１１から１４の何れかに記載の物質。
【請求項１６】
分子中の親和性物質又は共有結合形成性反応基が、固相に結合された特定のポリペプチドと結合している、請求項１１から１５の何れかに記載の物質。
【請求項１７】
固相に結合された特定のポリペプチド／分子中の親和性物質又は共有結合形成性反応基の組み合わせが、ビオチン結合タンパク質／ビオチン、マルトース結合タンパク質／マルトース、Ｇタンパク質／グアニンヌクレオチド、ポリヒスチジンペプチド／金属イオン、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ／グルタチオン、ＤＮＡ結合タンパク質／ＤＮＡ、抗体／抗原分子、カルモジュリン／カルモジュリン結合ペプチド、ＡＴＰ結合タンパク質／ＡＴＰ、及びエストラジオール受容体タンパク質／エストラジオール、ケトン基／ヒドラジド基、ジオール基／ヒドラジド基、アジド基／アルキル基、ソラレン／核酸塩基よりなる群から選ばれるいずれかの組み合わせである、請求項１１から１６の何れかに記載の物質。
【請求項１８】
請求項１５から１７のいずれかに記載の固相に結合した物質の集合体を含むチップ。
【請求項１９】
固相を有する支持体を保持する手段、該支持体に請求項１から６の何れかに記載したＣ末端を標識したタンパク質を導入する手段、及び該支持体を洗浄する手段を有することを特徴とする、請求項１０に記載のプロテインチップを作成するための装置。
【請求項２０】
固相を有する支持体を保持する手段、該支持体に請求項１１から１４の何れかに記載した物質を導入する手段、及び該支持体を洗浄する手段を有することを特徴とする、請求項１８に記載のチップを作成するための装置。
【請求項２１】
タンパク質、核酸、糖鎖又は生理活性分子と標的分子との間の相互作用の分析方法であって、下記の工程を含む方法：
（ａ）一分子中に一分子の第１の標識物質と一分子の親和性物質又は共有結合形成性反応基とを有するタンパク質、核酸、糖鎖又は生理活性分子と、第２の標識物質で標識した標的分子とを接触させる工程；及び
（ｂ）上記タンパク質、核酸、糖鎖又は生理活性分子と相互作用した標的分子中の第２の標識のシグナルを検出する工程；
【請求項２２】
標的分子がタンパク質、核酸、糖鎖、又は低分子化合物である請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
第２の標識物質が蛍光標識試薬である、請求項２１又は２２に記載の方法。
【請求項２４】
標的分子が請求項１から９の何れかに記載のタンパク質である、請求項２１から２３の何れか１項に記載の方法。
【請求項２５】
標的分子が請求項１１から１７の何れかに記載の核酸である、請求項２１から２３の何れかに記載の方法。
【請求項２６】
上記工程（ａ）に先立って、固相に固定化されたタンパク質、核酸、糖鎖又は生理活性分子の量を、エバーネッセント光を用いて、当該第１の標識物質のシグナルを指標として定量する工程を含む、請求項２１から２５の何れかに記載の方法。
【請求項２７】
工程（ｂ）で検出された第２の標識物質のシグナル強度と、予め定量化しておいた固相に固定化されたタンパク質、核酸、糖鎖又は生理活性分子の量とを用いて、当該固定化物質の単位量当たりのシグナル強度を、エバーネッセント光を用いて測定することにより、分子間の相互作用の強度を定量化する工程を含む、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
第２の標識の検出を蛍光イメージングアナライザー法により行う、請求項２１から２７の何れかに記載の方法。
【請求項２９】
（１）請求項１０に記載のプロテインチップ又は請求項１８に記載のチップを保持する手段、（２）該チップに標識物質で標識した標的分子を接触させる手段、（３）該チップを洗浄する手段、及び（４）標的分子中の標識物質からのシグナルを測定する手段を有する、請求項２１から２８の何れかに記載の方法のために使用する、分子間の相互作用の分析のための装置。