(57)【要約】      （修正有）【課題】分泌タンパク質またはそれらをコードする遺伝子、および該タンパク質、遺伝子を利用した、医学的障害の検出、処置、予防方法の提供。【解決手段】207個のヒト分泌タンパク質、およびこのようなタンパク質をコードする遺伝子のコード領域を含む単離された核酸。また、ヒト分泌タンパク質を産生するためのベクター、宿主細胞、抗体、および組換え方法。さらに、これらのヒト分泌タンパク質に関連する障害を診断および処置するために有用な診断および治療方法。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
単離された核酸分子であって、以下からなる群から選択される配列に少なくとも95％同一のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子：
(a)配列番号１０６のポリヌクレオチドフラグメント、または配列番号１０６にハイブリダイズし得るATCCTM寄託番号９７９７７またはATCCTM寄託番号２０９０８２に含まれるcDNA配列のポリヌクレオチドフラグメント；
(b)配列番号３２９のポリペプチドフラグメントをコードするか、または配列番号１０６にハイブリダイズし得るATCCTM寄託番号９７９７７またはATCCTM寄託番号２０９０８２に含まれるcDNA配列によってコードされるポリペプチドフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
(c)配列番号３２９のポリペプチドドメインをコードするか、または配列番号１０６にハイブリダイズし得るATCCTM寄託番号９７９７７またはATCCTM寄託番号２０９０８２に含まれるcDNA配列によってコードされるポリペプチドドメインをコードする、ポリヌクレオチド；
(d)配列番号３２９のポリペプチドエピトープをコードするか、または配列番号１０６にハイブリダイズし得るATCCTM寄託番号９７９７７またはATCCTM寄託番号２０９０８２に含まれるcDNA配列によってコードされるポリペプチドエピトープをコードする、ポリヌクレオチド；
(e)生物学的活性を有する、配列番号３２９のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、または配列番号１０６にハイブリダイズし得るATCCTM寄託番号９７９７７またはATCCTM寄託番号２０９０８２に含まれるcDNA配列；
(f)配列番号１０６の改変体であるポリヌクレオチド；
(g)配列番号１０６の対立遺伝子改変体であるポリヌクレオチド；
(h)配列番号３２９の種相同体をコードするポリヌクレオチド；
(i)(a)〜(h)において特定されるポリヌクレオチドのいずれか１つにストリン
ジェント条件下でハイブリダイズし得るポリヌクレオチドであって、ここで、該
ポリヌクレオチドは、Ａ残基のみまたはＴ残基のみのヌクレオチド配列を有する
核酸分子に、ストリンジェント条件下でハイブリダイズしない。
【請求項２】
単離されたポリペプチドであって、以下からなる群から選択される配列に少なくとも95％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド：
(a)配列番号３２９のポリペプチドフラグメント、またはATCCTM寄託番号９７９７７またはATCCTM寄託番号２０９０８２に含まれるコードされた配列；
(b)生物学的活性を有する、配列番号３２９のポリペプチドフラグメント、またはATCCTM寄託番号９７９７７またはATCCTM寄託番号２０９０８２に含まれるコードされた配列；
(c)配列番号３２９のポリペプチドドメイン、またはATCCTM寄託番号９７９７７またはATCCTM寄託番号２０９０８２に含まれるコードされた配列；
(d)配列番号３２９のポリペプチドエピトープ、またはATCCTM寄託番号９７９７７またはATCCTM寄託番号２０９０８２に含まれるコードされた配列；
(e)配列番号３２９の分泌形態、またはATCCTM寄託番号９７９７７またはATCCTM寄託番号２０９０８２に含まれるコードされた配列；
(f)配列番号３２９の全長タンパク質、またはATCCTM寄託番号９７９７７またはATCCTM寄託番号２０９０８２に含まれるコードされた配列；
(g)配列番号３２９の改変体；
(h)配列番号３２９の対立遺伝子改変体；
(i)配列番号３２９の種相同体。
【請求項３】
医学的状態を予防、処置、または緩和するための組成物であって、請求項２に記載のポリペプチドまたは請求項７に記載の抗体の治療有効量を含む、組成物。
【請求項４】
被験体において病理学的状態、または病理学的状態に対する感受性を診断することを補助するための方法であって、生物学的サンプルにおいて請求項２に記載のポリペプチドの発現の存在または量を決定する工程を含み、ここで該ポリペプチドの発現の存在または量が、病理学的状態、または病理学的状態に対する感受性を示す、方法。
【請求項５】
前記状態が、癌または潰瘍性大腸炎である請求項３に記載の組成物。
【請求項６】
前記状態が、癌または潰瘍性大腸炎である請求項４に記載の方法。
【請求項７】
単離された抗体またはそのフラグメントであって、以下からなる群から選択される単離されたＨＲＤＦＢ８５ポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体またはそのフラグメント：
(a)アミノ酸配列が、配列番号３２９のアミノ酸残基１〜２０１よりなるポリペプチド；
(b)アミノ酸配列が、配列番号３２９のアミノ酸残基２〜２０１よりなるポリペプチド；
(c)アミノ酸配列が、配列番号３２９のアミノ酸残基２２〜２０１よりなるポリペプチド；
(d)アミノ酸配列が、ATCCTM寄託番号９７９７７に含まれるcDNAクローンによりコードされる全長ＨＲＤＦＢ８５ポリペプチドのアミノ酸配列からなるポリペプチド；
(e)アミノ酸配列が、ATCCTM寄託番号２０９０８２に含まれるcDNAクローンによりコードされる全長ＨＲＤＦＢ８５ポリペプチドのアミノ酸配列からなるポリペプチド；
(f)アミノ酸配列が、ATCCTM寄託番号９７９７７に含まれるcDNAクローンによりコードされる全長ＨＲＤＦＢ８５ポリペプチドの、Ｎ末端メチオニン残基を除くアミノ酸配列からなるポリペプチド；
(g)アミノ酸配列が、ATCCTM寄託番号２０９０８２に含まれるcDNAクローンによりコードされる全長ＨＲＤＦＢ８５ポリペプチドの、Ｎ末端メチオニン残基を除くアミノ酸配列からなるポリペプチド；
(h)アミノ酸配列が、ATCCTM寄託番号９７９７７に含まれるcDNAクローンによりコードされる成熟ＨＲＤＦＢ８５ポリペプチドのアミノ酸配列からなるポリペプチド；
(i)アミノ酸配列が、ATCCTM寄託番号２０９０８２に含まれるcDNAクローンによりコードされる成熟ＨＲＤＦＢ８５ポリペプチドのアミノ酸配列からなるポリペプチド；
(j)細胞培養物から精製されたポリペプチドであって、該ＨＲＤＦＢ８５ポリペプチドが、配列番号３２９のアミノ酸１〜２０１よりなるポリペプチドまたはそのフラグメント。
【請求項８】
前記抗体またはそのフラグメントが、ポリクローナルである、請求項７に記載の抗体またはそのフラグメント。
【請求項９】
前記抗体またはそのフラグメントが、モノクローナルである、請求項７に記載の抗体またはそのフラグメント。
【請求項１０】
以下からなる群から選択される、請求項７に記載の抗体またはそのフラグメント：
(a)キメラ抗体またはそのフラグメント；
(b)ヒト化抗体またはそのフラグメント；
(c)ヒト抗体またはそのフラグメント；
(d)単鎖抗体；および
(e)Ｆａｂフラグメント。
【請求項１１】
標識された、請求項７に記載の抗体またはそのフラグメント。
【請求項１２】
請求項７に記載の抗体またはそのフラグメントを産生する単離された細胞。
【請求項１３】
生物学的サンプル中のＨＲＤＦＢ８５ポリペプチドを検出する方法であって、以下の工程：
(a)該生物学的サンプルを請求項７に記載の抗体またはそのフラグメントと接触させる工程；および
(b)該生物学的サンプル中のＨＲＤＦＢ８５ポリペプチドを検出する工程
を包含する方法。
【請求項１４】
請求項７に記載の抗体またはそのフラグメントを生産する方法であって、以下の工程：
(a)配列番号３２９のアミノ酸残基２２〜２０１よりなるポリペプチドまたはそのフラグメントで非ヒト動物を免疫化する工程；および
(b)該抗体またはそのフラグメントを回収する工程
を包含する方法。
【請求項１５】
明細書に記載の単離された核酸分子。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、新たに同定されたポリヌクレオチドおよびこれらのポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド、このようなポリヌクレオチドおよびポリペプチドの使用、ならびにそれらの産生に関する。
【背景技術】
【０００２】
膜によって取り囲まれる単一コンパートメントとして存在する細菌とは異なり、ヒト細胞および他の真核生物は、膜によって多くの機能的に異なるコンパートメントに細分される。それぞれの膜に結合したコンパートメント、すなわちオルガネラは、そのオルガネラの機能に不可欠な種々のタンパク質を含む。細胞は、特定の細胞オルガネラにタンパク質を標的化するために、タンパク質内に位置するアミノ酸モチーフである「ソーティングシグナル」を使用する。
【０００３】
シグナル配列、シグナルペプチド、またはリーダー配列と呼ばれるソーティングシグナルの１つの型は、小胞体（ER）と呼ばれるオルガネラに１つのクラスのタンパク質を指向させる。ERは、膜結合したタンパク質をすべての他の型のタンパク質から分離する。一旦ERに局在すると、タンパク質の両方の群とも、ゴルジ体と呼ばれる別のオルガネラにさらに指向され得る。ここで、ゴルジは、タンパク質を、分泌小胞、細胞膜、リソソーム、および他のオルガネラを含む小胞に分布させる。
【０００４】
シグナル配列によってERに標的化されたタンパク質は、分泌タンパク質として細胞外空間に放出され得る。例えば、分泌タンパク質を含む小胞は、細胞膜と融合し、そして細胞外空間にその内容物を放出し得る（エキソサイトーシスと呼ばれるプロセスである）。エキソサイトーシスは、構成的に、またはトリガーシグナルの受け取りの後に生じ得る。後者の場合には、タンパク質は、エキソサイトーシスが誘起されるまで、分泌小胞（または分泌顆粒）に貯蔵される。同様に、細胞膜上に存在するタンパク質はまた、タンパク質を膜に保持する「リンカー」のタンパク質分解切断によって、細胞外空間に分泌され得る。
【０００５】
近年大きく進歩したにもかかわらず、ヒトの分泌タンパク質をコードする遺伝子の少数のみが同定されている。これらの分泌タンパク質には、商業的価値のあるヒトインスリン、インターフェロン、第VIII因子、ヒト成長ホルモン、組織プラスミノーゲン活性化因子、およびエリスロポエチンが挙げられる。したがって、ヒト生理学における分泌タンパク質の広がった役割を考慮すると、新規のヒトの分泌タンパク質およびそれらをコードする遺伝子を同定および特徴づけすることの必要がある。この知見は、分泌タンパク質またはそれらをコードする遺伝子を使用することによって、医学的障害を検出、処置、および予防することを可能にする。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００６】
本発明は、新規ポリヌクレオチドおよびコードされたポリペプチドに関する。さらに、本発明は、ポリペプチドおよびポリヌクレオチドを産生するためのベクター、宿主細胞、抗体、および組換え方法に関する。ポリペプチドに関連する障害を検出する診断方法、およびこのような障害を処置するための治療方法も提供される。本発明は、さらに、ポリペプチドの結合パートナーを同定するためのスクリーニング方法に関する。
本発明は、例えば以下を提供する。
項目１．単離された核酸分子であって、以下からなる群から選択される配列に少なくとも95％同一のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含む、単離された核酸分子：
(a)配列番号Ｘのポリヌクレオチドフラグメント、または配列番号Ｘにハイブリダイズし得るATCC寄託番号Ｚに含まれるcDNA配列のポリヌクレオチドフラグメント；
(b)配列番号Ｙのポリペプチドフラグメントをコードするか、または配列番号Ｘにハイブリダイズし得るATCC寄託番号Ｚに含まれるcDNA配列によってコードされるポリペプチドフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド；
(c)配列番号Ｙのポリペプチドドメインをコードするか、または配列番号Ｘにハイブリダイズし得るATCC寄託番号Ｚに含まれるcDNA配列によってコードされるポリペプチドドメインをコードする、ポリヌクレオチド；
(d)配列番号Ｙのポリペプチドエピトープをコードするか、または配列番号Ｘにハイブリダイズし得るATCC寄託番号Ｚに含まれるcDNA配列によってコードされるポリペプチドエピトープをコードする、ポリヌクレオチド；
(e)生物学的活性を有する、配列番号Ｙのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、または配列番号Ｘにハイブリダイズし得るATCC寄託番号Ｚに含まれるcDNA配列；
(f)配列番号Ｘの改変体であるポリヌクレオチド；
(g)配列番号Ｘの対立遺伝子改変体であるポリヌクレオチド；
(h)配列番号Ｙの種相同体をコードするポリヌクレオチド；
(i)(a)〜(h)において特定されるポリヌクレオチドのいずれか１つにストリンジェント条件下でハイブリダイズし得るポリヌクレオチドであって、ここで、該ポリヌクレオチドは、Ａ残基のみまたはＴ残基のみのヌクレオチド配列を有する核酸分子に、ストリンジェント条件下でハイブリダイズしない。
項目２．前記ポリヌクレオチドフラグメントが、分泌タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、項目１に記載の単離された核酸分子。
項目３．前記ポリヌクレオチドフラグメントが、配列番号Ｙとして同定される配列、または配列番号Ｘにハイブリダイズし得るATCC寄託番号Ｚに含まれるcDNA配列によってコードされるポリペプチド、をコードするヌクレオチド配列を含む、項目１に記載の単離された核酸分子。
項目４．前記ポリヌクレオチドフラグメントが、配列番号Ｘの全体のヌクレオチド配列、または配列番号Ｘにハイブリダイズし得るATCC寄託番号Ｚに含まれるcDNA配列を含む、項目１に記載の単離された核酸分子。
項目５．前記ヌクレオチド配列が、C末端またはN末端のいずれかからの連続するヌクレオチド欠失を含む、項目２に記載の単離された核酸分子。
項目６．前記ヌクレオチド配列が、C末端またはN末端のいずれかからの連続するヌクレオチド欠失を含む、項目３に記載の単離された核酸分子。
項目７．項目１に記載の単離された核酸分子を含む、組換えベクター。
項目８．項目１に記載の単離された核酸分子を含む、組換え宿主細胞を作製する
方法。
項目９．項目８に記載の方法によって産生される、組換え宿主細胞。
項目１０．ベクター配列を含む、項目９に記載の組換え宿主細胞。
項目１１．以下からなる群から選択される配列に少なくとも95％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド：
(a)配列番号Ｙ、またはATCC寄託番号Ｚに含まれるコードされた配列の、ポリペプチドフラグメント；
(b)生物学的活性を有する、配列番号Ｙ、またはATCC寄託番号Ｚに含まれるコードされた配列の、ポリペプチドフラグメント；
(c)配列番号Ｙ、またはATCC寄託番号Ｚに含まれるコードされた配列の、ポリペプチドドメイン；
(d)配列番号Ｙ、またはATCC寄託番号Ｚに含まれるコードされた配列の、ポリペプチドエピトープ；
(e)配列番号Ｙ、またはATCC寄託番号Ｚに含まれるコードされた配列の、分泌形態；
(f)配列番号Ｙ、またはATCC寄託番号Ｚに含まれるコードされた配列の、全長タンパク質；
(g)配列番号Ｙの改変体；
(h)配列番号Ｙの対立遺伝子改変体；または
(i)配列番号Ｙの種相同体。
項目１２．前記分泌形態または前記全長タンパク質が、C末端またはN末端のいずれかからの連続するアミノ酸欠失を含む、項目１１に記載の単離されたポリペプチド。
項目１３．項目１１に記載の単離されたポリペプチドに特異的に結合する、単離された抗体。
項目１４．項目１１の単離されたポリペプチドを発現する、組換え宿主細胞。
項目１５．単離されたポリペプチドを作製する方法であって、
(a)該ポリペプチドが発現されるような条件下で、項目１４に記載の組換え宿主細胞を培養する工程；および
(b)該ポリペプチドを回収する工程、
を包含する、方法。
項目１６．項目１５に記載の方法によって産生される、ポリペプチド。
項目１７．医学的状態を予防、処置、または緩和する方法であって、項目１１に記載のポリペプチドまたは項目１に記載のポリヌクレオチドの治療有効量を、哺乳動物被験体に投与する工程を包含する、方法。
項目１８．被験体において病理学的状態、または病理学的状態に対する感受性を診断する方法であって、
(a)項目１に記載のポリヌクレオチドにおいて変異の存在または非存在を決定する工程；および
(b)該変異の存在または非存在に基づいて病理学的状態、または病理学的状態に対する感受性を診断する工程、
を包含する、方法。
項目１９．被験体において病理学的状態、または病理学的状態に対する感受性を診断する方法であって、
(a)生物学的サンプルにおいて項目１１に記載のポリペプチドの発現の存在または量を決定する工程、および
(b)該ポリペプチドの発現の存在または量に基づいて病理学的状態、または病理学的状態に対する感受性を診断する工程、
を包含する、方法。
項目２０．項目１１に記載のポリペプチドに対する結合パートナーを同定する方法であって、
(a)項目１１に記載のポリペプチドを結合パートナーと接触させる工程；および
(b)該結合パートナーが該ポリペプチドの活性をもたらすかどうかを決定する工程、
を包含する、方法。
項目２１．配列番号ＹのcDNA配列に対応する、遺伝子。
項目２２．生物学的アッセイにおいて活性を同定する方法であって、
(a)細胞において配列番号Ｘを発現させる工程；
(b)その上清を単離する工程；
(c)生物学的アッセイにおいて活性を検出する工程；および
(d)該活性を有する該上清においてタンパク質を同定する工程、
を包含する、方法。
項目２３．項目２２に記載の方法によって産生される、産物。
【発明を実施するための形態】
【０００７】
(詳細な説明)
定義
以下の定義は、本明細書全体を通して使用される特定の用語の理解を容易にするために提供される。
【０００８】
本発明において、「単離された」とは、その元の環境（例えば、それが天然に存在する場合は天然の環境）から取り出された物質をいい、したがって、天然の状態から「人間の手によって」変化されている。例えば、単離されたポリヌクレオチドは、ベクターまたは組成物の一部であり得るか、あるいは細胞内に含まれ得、そしてなお「単離され」ている。なぜなら、ベクター、組成物、または特定の細胞が、ポリヌクレオチドの元の環境ではないからである。
【０００９】
本発明において、「分泌」タンパク質とは、ER、分泌小胞、または細胞外空間にシグナル配列の結果として指向され得るタンパク質、ならびにシグナル配列を必ずしも含まないが細胞外空間に放出されるタンパク質をいう。分泌タンパク質が、細胞外空間に放出される場合、分泌タンパク質は、「成熟」タンパク質を産生するために細胞外プロセシングを受け得る。細胞外空間への放出は、エキソサイトーシスおよびタンパク質分解切断を含む多くの機構によって生じ得る。
【００１０】
本明細書で使用される場合、「ポリヌクレオチド」とは、配列番号Ｘに含まれる核酸配列を有する分子、またはATCCに寄託されたクローン内に含まれるcDNAをいう。例えば、ポリヌクレオチドは、5'および3'非翻訳配列、シグナル配列を含むか、もしくは含まないコード領域、分泌タンパク質コード領域を含む全長cDNA配列のヌクレオチド配列、ならびにこの核酸配列のフラグメント、エピトープ、ドメイン、および改変体を含み得る。さらに、本明細書で使用される場合、「ポリペプチド」とは、広く定義される場合、ポリヌクレオチドから生じた翻訳されたアミノ酸配列を有する分子をいう。
【００１１】
本発明では、配列番号Ｘとして同定された全長配列は、しばしば、複数のクローンに含まれる重複配列によって生成された（コンティグ分析）。配列番号Ｘについての配列のすべてまたはほとんどを含む代表的クローンを、アメリカンタイプカルチャーコレクション（「ATCC」）に寄託した。表１に示すように、各クローンは、cDNAクローンID (Identifier)およびATCC寄託番号によって同定される。ATCCは、10801University Boulevard, Manassas, Virginia 20110-2209, USAに位置する。ATCC寄託は、特許手続の目的のための微生物の寄託の国際承認に係るブダペスト条約によって行われた。
【００１２】
本発明の「ポリヌクレオチド」はまた、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、配列番号Ｘに含まれる配列、その補体、またはATCCに寄託されたクローン内に含まれるcDNAにハイブリダイズし得るポリヌクレオチドを含む。「ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件」とは、50％ホルムアミド、５×SSC（750mMNaCl、75mMクエン酸ナトリウム）、50mMリン酸ナトリウム（pH7.6）、５×デンハート溶液、10％硫酸デキストラン、および20μg/ml変性剪断サケ精子DNAを含む溶液中での42℃での一晩インキュベーション、次いで0.1×SSC中で約65℃にてフィルターを洗浄することをいう。
【００１３】
より低いストリンジェンシーなハイブリダイゼーション条件で本発明のポリヌクレオチドにハイブリダイズする核酸分子もまた意図される。ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーおよびシグナル検出の変化は、主として、ホルムアミド濃度（より低い割合のホルムアミドが、低下したストリンジェンシーを生じる）；塩濃度、または温度の操作によって行われる。例えば、より低いストリンジェンシー条件は、６×SSPE（20×SSPE＝3M NaCl；0.2M NaH２PO４；0.02M EDTA、pH7.4）、0.5％SDS、30％ホルムアミド、100μg/mlサケ精子ブロッキングDNAを含む溶液中での37℃での一晩インキュベーション、次いで１×SSPE、0.1％ SDSを用いた50℃での洗浄を含む。さらに、さらにより低いストリンジェンシーを達成するために、ストリンジェントなハイブリダイゼーション後に行われる洗浄は、より高い塩濃度（例えば、５×SSC）で行われ得る。
【００１４】
上記の条件における変化が、ハイブリダイゼーション実験においてバックグラウンドを抑制するために使用される代替的なブロッキング試薬の包含および／または置換によって達成され得ることに留意すること。代表的なブロッキング試薬には、デンハート試薬、BLOTTO、ヘパリン、変性サケ精子DNA、および市販の製品処方物が挙げられる。特異的ブロッキング試薬の包含は、適合性の問題に起因して、上記のハイブリダイゼーション条件の改変を必要とし得る。
【００１５】
もちろん、ポリＡ＋配列（例えば、任意の3'末端ポリＡ＋配列表に示されるcDNAの付加物）に、またはT（もしくはU）残基の相補的ストレッチにのみハイブリダイズするポリヌクレオチドは、このようなポリヌクレオチドが、ポリ(A)ストレッチまたはその相補体（例えば、事実上任意の二本鎖cDNAクローン）を含む任意の核酸分子にハイブリダイズするので、「ポリヌクレオチド」の定義に包含されない。
【００１６】
本発明のポリヌクレオチドは、任意のポリリボヌクレオチドまたはポリデオキシリボヌクレオチドから構成され得、これは、非改変RNAもしくはDNAまたは改変RNAもしくはDNAであり得る。例えば、ポリヌクレオチドは、一本鎖および二本鎖DNA、一本鎖および二本鎖領域の混合物であるDNA、一本鎖および二本鎖RNA、ならびに一本鎖および二本鎖領域の混合物であるRNA、一本鎖、またはより代表的には二本鎖もしくは一本鎖および二本鎖領域の混合物であり得るDNAおよびRNAを含むハイブリッド分子から構成され得る。さらに、ポリヌクレオチドは、RNAまたはDNAあるいはRNAとDNAとの両方を含む三本鎖領域から構成され得る。ポリヌクレオチドはまた、安定性のために、または他の理由のために改変された１つ以上の改変された塩基またはDNAもしくはRNA骨格を含み得る。「改変された」塩基には、例えば、トリチル化された塩基およびイノシンのような普通でない塩基が挙げられる。種々の改変が、DNAおよびRNAに対して行われ得；したがって、「ポリヌクレオチド」は、化学的、酵素的、または代謝的に改変された形態を含む。
【００１７】
本発明のポリペプチドは、ペプチド結合または改変されたペプチド結合、すなわち、ペプチドアイソスター(isostere)によって互いに連結したアミノ酸から構成され得、そして遺伝子がコードする20個のアミノ酸以外のアミノ酸を含み得る。ポリペプチドは、翻訳後プロセシングのような天然のプロセスによって、または当該技術分野で周知の化学的改変技術によってのいずれかで、改変され得る。このような改変は、基本テキスト、およびより詳細な研究論文、ならびに多くの研究文献に十分記載される。改変は、ペプチド骨格、アミノ酸側鎖、およびアミノまたはカルボキシル末端を含むポリペプチドのどこでも生じ得る。同じ型の改変が、所定のポリペプチド中のいくつかの部位で同じまたは種々の程度で存在し得ることが理解される。また、所定のポリペプチドは多くの型の改変を含み得る。ポリペプチドは、例えば、ユビキチン化の結果として、分枝され得、そしてそれは、分枝を含むかまたは含まない、環状であり得る。環状、分枝、および分枝した環状ポリペプチドは、翻訳後天然プロセスから生じ得、または合成方法によって作製され得る。改変には、アセチル化、アシル化、ADP-リボシル化、アミド化、フラビンの共有結合、ヘム部分の共有結合、ヌクレオチドまたはヌクレオチド誘導体の共有結合、脂質または脂質誘導体の共有結合、ホスファチジルイノシトールの共有結合、架橋、環化、ジスルフィド結合形成、脱メチル化、共有結合架橋の形成、システインの形成、ピログルタミン酸の形成、ホルミル化、γ-カルボキシル化、グリコシル化、GPIアンカー形成、ヒドロキシル化、ヨウ素化、メチル化、ミリストイル化、酸化、ペグ化(pegylation)、タンパク質分解プロセシング、リン酸化、プレニル化、ラセミ化、セレノイル化、硫酸化、アルギニル化のようなタンパク質へのアミノ酸のトランスファーRNA媒介付加、およびユビキチン化が挙げられる。（例えば、PROTEINS-STRUCTUREAND MOLECULAR PROPERTIES, 第2版, T.E. Creighton, W.H. Freeman and Company, NewYork (1993)；POSTTRANSLATIONAL COVALENT MODIFICATION OF PROTEINS, B.C. Johnson編,Academic Press, New York, 1-12頁 (1983)；Seifterら, Meth Enzymol 182:626-646(1990)；Rattanら, Ann NY Acad Sci 663:48-62 (1992)を参照のこと）。
【００１８】
「配列番号Ｘ」とは、ポリヌクレオチド配列をいうが、「配列番号Ｙ」とは、ポリペプチド配列をいい、両方の配列とも、表１に特定された整数によって規定される。
【００１９】
「生物学的活性を有するポリペプチド」とは、特定の生物学的アッセイで測定した場合、用量依存性を伴うかまたは伴わずに本発明のポリペプチド（成熟形態を含む）の活性と類似であるが、必ずしも同一ではない活性を示すポリペプチドをいう。用量依存性が存在する場合、ポリペプチドの用量依存性と同一である必要はないが、むしろ本発明のポリペプチドと比較した場合に、所定の活性における用量依存性に実質的に類似する（すなわち、候補ポリペプチドは、本発明のポリペプチドと比較して、より大きな活性を示すか、または約1/25以上、および好ましくは、約1/10以上の活性、および最も好ましくは、約1/3以上の活性を示す必要がある
本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチド
遺伝子番号１によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、メラノサイト中において主に発現され、そして精巣、卵巣、腎臓、および他の組織においてより少ない程度で発現される。
【００２０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびにガン、色素沈着欠損症を含む神経堤由来細胞の障害、黒色腫、生殖器官の欠損、および腎臓の欠損を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、皮膚、生殖系、および腎臓系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【００２１】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、黒色腫のようなガンおよび発達しつつある生殖系の欠損を含む、神経堤由来細胞の数または運命（fate）における変化によって生じる障害を処置するために有用であることを示す。
【００２２】
遺伝子番号２によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、乳児の脳および胎児の肺において主に発現される。
【００２３】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびに脳または肺の発育上の障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、中枢神経系および肺系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【００２４】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、中枢神経系および発達しつつある肺における細胞の異常な増殖に関連する障害を処置または診断するために有用であることを示す。
【００２５】
遺伝子番号３によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、胸部リンパ節において主に発現され、そして卵巣ガンおよび軟骨肉腫においてより少ない程度で発現される。
【００２６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差の同定のため、ならびに炎症のような免疫応答または腫瘍についての免疫サーベイランスを含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。この遺伝子は、腫瘍に関連する炎症性の応答のために重要であり得る。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Lys-45〜Val-50、Lys-69〜Arg-76のような配列番号236に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【００２７】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、腫瘍によって誘導される炎症に関連するものを含む免疫応答の処置または診断に有用であることを示す。
【００２８】
遺伝子番号４によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、Ｔ細胞およびＴ細胞リンパ腫において主に発現される。
【００２９】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびにＴ細胞に関連する免疫疾患（例えば、炎症）、自己免疫状態およびガン（Ｔ細胞リンパ腫を含む）を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、Ｔ細胞および免疫系の他の細胞）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【００３０】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、炎症性疾患、自己免疫性疾患、およびＴ細胞リンパ腫を含む腫瘍のような障害に基づくＴ細胞を診断および処置するために有用であることを示す。
【００３１】
遺伝子番号５によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、活性化された単球において主に発現される。
【００３２】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびに炎症、自己免疫、感染、または単球の活性化に関連する障害を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Asp-19〜Arg-31のような配列番号238に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【００３３】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、感染、炎症応答、または自己免疫疾患を含む、単球の活性化を生じる疾患を診断または処置するために有用であることを示す。
【００３４】
遺伝子番号６によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、オリゴヌクレオチド鎖またはポリデオキシヌクレオチド鎖の伸張を触媒することにおいて重要であると考えられている末端デオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼと、配列相同性を共有する。
【００３５】
この遺伝子は、活性化されたヒト好中球において主に発現される。
【００３６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差の同定のため、ならびにガン（特に、白血病のような血液のガン）および好中球減少症のような好中球の欠乏を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、心臓血管系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【００３７】
組織分布および末端デオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、急性白血病の処置およびディファレンシャルな診断に有用であることを示す。あるいは、この遺伝子は、好中球の増殖において機能性であり、そして例えば、化学療法の結果として付随する好中球減少症のような、好中球減少症の処置として有用である。
【００３８】
遺伝子番号７によってコードされるタンパク質の特徴
コンティグは、米国特許第5,508,261号およびPCT公開第WO 92/22568に開示されるような、ヒトの慢性性腺刺激性（HCG）アナログGT-βサブユニットに対して合理的な相同性を示す。これらの同一性においては、構造的に重要なシステイン残基の高い程度の保存が存在する。
【００３９】
この遺伝子は、IL-1およびLPSによって誘導される好中球において主に発現される。
【００４０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差の同定のため、ならびに免疫系の疾患（炎症性疾患およびアレルギーを含む）を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【００４１】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、発現が主に好中球中であるので、免疫系の疾患の処置／診断に有用であり、そして化学療法後の好中球減少症の処置のための好中球の分化または増殖のための成長因子として有用であり得ることを示す。
【００４２】
遺伝子番号８によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、IL-1およびLPSによって誘導される好中球において主に発現される。
【００４３】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差の同定のため、ならびに免疫系の疾患（炎症性疾患およびアレルギーを含む）を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Ser-14〜Pro-22、Leu-43〜Val-53のような、配列番号241に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【００４４】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、発現が主に好中球中であるので、免疫系の疾患の処置および診断に有用であり、そして化学療法後の好中球減少症の処置のための好中球の分化または増殖のための成長因子として有用であり得ることを示す。
【００４５】
遺伝子番号９によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、IL-1およびLPSによって誘導される好中球において主に発現される。
【００４６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差の同定のため、ならびに免疫系の疾患（炎症性疾患およびアレルギーを含む）を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Tyr-22〜His-35のような、配列番号242に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【００４７】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、発現が主に好中球中であるので、免疫系の疾患の処置／診断に有用であり、そして化学療法後の好中球減少症の処置のための好中球の分化または増殖のための成長因子として有用であり得ることを示す。
【００４８】
遺伝子番号10によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、活性化されたＴ細胞において主に発現され、そして内皮細胞においてより少ない程度で発現される。
【００４９】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびにＴリンパ球のガンを含む免疫機能の不全および自己免疫障害および炎症を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【００５０】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫障害（特に、Ｔ細胞起源の障害）の処置および診断に有用であり、そしてCD4陽性細胞のようなＴ細胞の特定のサブセットについての成長因子として作用し得ることを示す。これによって、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、HIVおよび他の免疫易感染性（compromising）疾病の有用な治療法となる。
【００５１】
遺伝子番号11によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、胎児の組織において主に発現される。
【００５２】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、および多くの発育上の異常の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、発達しつつある胎児）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【００５３】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、発達しつつある胎児における特定の細胞型についての成長因子または分化因子として有用であり、そして遺伝子が異常に発現される症例において、治療の代替物または他の型において有用であり得ることを示す。
【００５４】
遺伝子番号12によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、Ｔ細胞において主に発現され、そして神経膠芽細胞腫、髄膜腫、およびウィルムス腫瘍を含む腫瘍組織においてより少ない程度で発現される。
【００５５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差の同定のため、ならびに自己免疫状態（例えば、慢性関節リウマチ）を含む免疫系の疾患、炎症性の障害、およびガンを含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Thr-9〜Ser-14のような、配列番号245に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【００５６】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、慢性関節リウマチおよび炎症性応答を含む免疫機能障害の診断／調節に有用であることを示す。
【００５７】
遺伝子番号13によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、胎盤において主に発現され、そして胎児の肝臓および骨髄においてより少ない程度で発現される。
【００５８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差の同定のため、および血液病学的障害の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、血液病学的系および免疫系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【００５９】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、化学療法患者または腎臓疾患の処置において、造血（hematapoietic）幹細胞または始原細胞の成長因子として有用であることを示す。
【００６０】
遺伝子番号14によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、間質細胞において主に発現される。
【００６１】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびにガン、好中球減少症、および血小板減少症を含む造血障害の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、造血および免疫）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【００６２】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、特に、化学療法の処置後において、造血幹細胞または始原細胞の成長因子として有用であることを示す。
【００６３】
遺伝子番号15によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、７個のタンパク質の複合体（これは、非クラスリン膜コートの主要な構成要素である）であるコアトマー（coatomer）の構成要素として重要であると考えられる、Bos taurus由来のε-COPと、配列相同性を共有する。この遺伝子によってコードされる好ましいポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含む：
【００６４】
【化１】
2010279364.tif 000002
この遺伝子は、活性化された単球およびＴ細胞において主に発現され、そして複数の他の組織においてより少ない程度で発現される。
【００６５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびに免疫調節（特に、これらの細胞中での輸送問題に関連する）を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【００６６】
組織分布およびε-COPに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫学的機能不全を生じ得るタンパク質の細胞性の輸送を伴う問題の処置／診断に有用であることを示す。
【００６７】
遺伝子番号16によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、ポリヌクレオチドの代謝において重要であると考えられるRNAへリカーゼと配列相同性を共有する。このコンティグの翻訳産物は、LeishmaniabraziliensisのLbeIF4A抗原に対して良好な相同性を示す。LbeIF4A抗原またはその免疫原性部分は、リーシュマニア属（特に、L.donovani、L. chagasi、L. infantum、L. major、L. braziliensis、L. panamensis、L.tropica、およびL. guyanensis）に対して防御免疫を誘導するために使用され得る。これはまた、Leishmania感染を検出するため、または細胞性および／もしくは体液性の免疫応答を刺激するため、またはインターロイキン-12の産生を刺激するために診断的に使用され得る。
【００６８】
この遺伝子は、結腸ガンにおいて主に発現され、そして下垂体においてより少ない程度で発現される。
【００６９】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差の同定のため、およびガン（特に、結腸）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、胃腸系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、以下の残基のような、配列番号249に示される配列を含むエピトープが挙げられる：Glu-93〜Ala-98、Gln-150〜Leu-156、Leu-220〜Leu231、Leu-268〜Arg-273、Val-324〜Pro-341、Arg-372〜Asn-380、Ser-405〜Gly-410、Phe-426〜Ala-433、Glu-458〜Asp-470、Arg-506〜Ser-547。
【００７０】
組織分布およびRNAヘリカーゼに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、結腸ガンの診断試験の開発に有用であることを示す。
【００７１】
遺伝子番号17によってコードされるタンパク質の特徴
このコンティグの翻訳産物は、マウスにおいてJNK相互作用タンパク質-1、すなわちJIP-1と命名された、JNKに特異的に結合する細胞質性タンパク質に対して配列相同性を有する。JIP-1はJNKの細胞質での保持、およびJNKによって調節される遺伝子発現の阻害を引き起こした。
【００７２】
この遺伝子は、脳（下垂体、小脳、前頭部皮質、胎児の脳を含む）において主に発現され、そして腎臓皮質においてより少ない程度で発現される。
【００７３】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、および中枢神経系の障害（虚血、癲癇、パーキンソン病、および精神分裂症を含む）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、中枢神経系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。さらに、このコンティグの翻訳産物は、細胞の増殖（Bcr-Abl腫瘍遺伝子による形質転換を含む）の際のJNKシグナル伝達経路の影響を抑制し得る。好ましいエピトープとして、以下の残基のような、配列番号250に示される配列を含むエピトープが挙げられる：Pro-6〜Ser-26、Ala-30〜Asp-41、Gly-55〜Ser-61、Gly-74〜Thr-80、Tyr-117〜Ala-123、Tyr-167〜Asp-172、Ala-212〜Cys-223、Pro-239〜Tyr-244。
【００７４】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、神経変性性疾患の処置としての、ニューロンの生存性および／または分化の増強に有用であることを示す。
【００７５】
遺伝子番号18によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、原生動物の寄生虫に由来する、肝臓のステージ（stage）抗原と配列相同性を共有する。
【００７６】
この遺伝子は、胎児の組織において主に発現され、そして活性化されたＴ細胞および他の免疫細胞においてより少ない程度で発現される。
【００７７】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびに発育上の異常および免疫機能の疾患を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【００７８】
組織分布および原生動物の抗原に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、寄生虫の感染の処置／免疫調節に有用であることを示す。
【００７９】
遺伝子番号19によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子によってコードされる好ましいポリペプチドは、以下のポリペプチド配列を含む：
【００８０】
【化２】
2010279364.tif 000003
このようなポリペプチドをコードするポリヌクレオチドがまた、提供される。
【００８１】
この遺伝子は、間質およびCD34枯渇骨髄細胞において主に発現され、そして胚起源の組織においてより少ない程度で発現される。
【００８２】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差の同定のため、ならびに血液病学的起源の疾患（ガンおよび免疫不全を含む）を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、造血および免疫）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Ser-28〜Gln-34のような、配列番号252に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【００８３】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、好中球減少症を罹患している化学療法患者の処置に有用であり得る、造血幹細胞または始原細胞の成長因子として有用であることを示す。
【００８４】
遺伝子番号20によってコードされるタンパク質の特徴
好ましいポリペプチドフラグメントは、別のオープンリーディングフレーム中に見出され得る。これらの好ましいポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含む：
【００８５】
【化３】
2010279364.tif 000004
【００８６】
【化４】
2010279364.tif 000005
これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。
【００８７】
この遺伝子は、胎児の肝臓およびCNSに関連する組織において発現される。
【００８８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびに肝臓およびCNS疾患を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、肝臓およびCNS）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Gln-26〜Lys-34のような、配列番号253に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【００８９】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、肝臓の疾患（例えば、肝細胞性ガン腫）およびCNSの疾患の診断および処置に有用であることを示す。
【００９０】
遺伝子番号21によってコードされるタンパク質の特徴
別のオープンリーディングフレームにおいて、この遺伝子は、最近クローン化された２つ（カリオフェリン（karyopherin）β3およびRan_GTP結合タンパク質5（登録番号gi|2102696およびgnl|PID|e328731を参照のこと））に対して配列相同性を示す。Ran_GTP結合タンパク質は、核局在化シグナル（NLS）-依存性核輸送の重要な媒介因子である、インポーチン（importin）-βに関連する。相同性に基いて、この遺伝子は、RAN_GTP結合タンパク質と同様に活性であり得るようである。好ましいポリペプチドフラグメントは、アミノ酸配列：VRVAAAESMXLLLECAXVRGPEYLTQMWHFMCDALIKAIGTEPDSDVLSEIMHSFAK（配列番号467）を含む。これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。
【００９１】
この遺伝子は、胸腺組織において発現される。
【００９２】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差の同定のため、ならびに免疫障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【００９３】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫障害の診断および処置に有用であることを示す。
【００９４】
遺伝子番号22によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、前立腺および破骨細胞腫において主に発現される。好ましいポリペプチドフラグメントはまた、アミノ酸配列：
MEINNQNCFIVIDLVRTVMENGVEGLLIFGAFLPESWLIGVRCSSEPPKALLLILAHSQKRRLDGWSFIRHLRVHYCVSLTIHFS（配列番号468）を含む。このポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列もまた、好ましい。
【００９５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびに骨および前立腺の疾患、およびガン（特に、骨および前立腺のガン）を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、骨および前立腺系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Met-1〜Ser-11のような、配列番号255に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【００９６】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、骨および前立腺の障害（特に、これらの系におけるガン）の診断および処置に有用であることを示す。
【００９７】
遺伝子番号23によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、免疫抑制剤の公知の細胞質ゾルレセプターである、FK506結合タンパク質（FKBP-13）ファミリーと配列相同性を共有する。最近、別のグループによって、FK506結合タンパク質ファミリーに対する相同性を認識する、非常に類似の遺伝子がクローン化され、それらの遺伝子はFKBP23と呼ばれている。（登録番号2827255を参照のこと。）
この遺伝子は、リンパ性の組織において主に発現される。
【００９８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため（特に、免疫抑制剤治療に対するそれらの影響の受けやすさについて）、ならびに免疫抑制の障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、以下の残基のような、配列番号256に示される配列を含むエピトープが挙げられる：Ala-19〜Val-31、Arg-38〜Gly-49、Ala-61〜Lys-66、Tyr-68〜Pro-78、Gly-116〜Ala-121、Asp-154〜Ser-162、Glu-173〜Gln-186、Phe-194〜Gly-203、Pro-207〜Val-212。
【００９９】
組織分布、ならびにFKBP-12および-13に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫抑制の障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０１００】
遺伝子番号24によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、脳および網膜において主に発現される。この遺伝子は、第８番染色体にマップされ、従って、第８番染色体のマーカーとして連鎖分析において使用され得る。
【０１０１】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびに神経学的疾患状態および眼球に関連する疾患状態を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の多くの障害（特に、中枢神経系の障害）について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Cys-34〜Asp-40のような、配列番号257に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【０１０２】
網膜における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、失明、色覚異常、損傷した視力、近視および遠視、色素性網膜炎、増殖性網膜炎、ならびに網膜芽細胞腫を含む、眼の障害を処置および／または検出するために有用であることを示す。脳における発現は、その役割が、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチングトン病、精神分裂症、躁病、痴呆、妄想症、強迫性障害、および恐慌性障害のような、神経変性性の疾患および行動障害の検出／処置に有用であることを示す。
【０１０３】
遺伝子番号25によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、スタートミン（stathmin）ファミリーと呼ばれる神経系において発現されるタンパク質の新たに同定されたクラスに対して配列相同性を示す。（登録番号2585991を参照のこと；Eur.J. Biochem. 248（3）794-804（1997）もまた参照のこと。）スタートミンファミリーは、種々の細胞内シグナル伝達経路の相互作用の中継として関与する、遍在性リンタンパク質であるようである。これらの経路は、細胞の増殖および分化に影響を与える。好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０１０４】
【化５】
2010279364.tif 000006
これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。
【０１０５】
この遺伝子は、脳において主に発現される。
【０１０６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびに神経学的障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、中枢神経系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０１０７】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチングトン病、精神分裂症、躁病、痴呆、妄想症、強迫性障害、および恐慌性障害のような、神経変性性の疾患状態および行動障害の検出／処置に有用であることを示す。
【０１０８】
遺伝子番号26によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子のポリヌクレオチド配列は、Flt3リガンドペプチドに類似のドメインを含む。好ましいポリペプチドフラグメントは、アミノ酸配列：
PTRCCTTQPCRSSARRPCWVPMVPSPEGREXQPTCPS（配列番号471）を含む。従って、この遺伝子は、脈管形成および／またはリンパ管形成（lymphangiogenesis）を促進することが公知のプロセスである、Flt3レセプターへの結合のような活性を有し得る。
【０１０９】
この遺伝子は、ヒトの扁桃腺において主に発現され、そして奇形癌、胎盤、結腸ガン、および胎児の腎臓においてより少ない程度で発現される。
【０１１０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差の同定のため、ならびに扁桃の疾患およびガン（例えば、結腸ガン、生殖系のガン、および腎臓ガン）を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、扁桃、結腸、生殖器官、および腎臓）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Pro-22〜Glu-33のような、配列番号259に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【０１１１】
扁桃およびいくつかのガンおよび胎児の組織における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、扁桃または結腸の疾患（例えば、扁桃腺炎）、炎症性の疾患（鼻腔および副鼻腔を含む）の、特に、インフルエンザ、アデノウイルス、パラインフルエンザ、ライノウイルスの感染の間の診断および処置に有用であることを示す。この遺伝子はまた、鼻咽頭または結腸起源の新生物の診断および処置においても有用である。
【０１１２】
遺伝子番号27によってコードされるタンパク質の特徴
別のリーディングフレームにおいて、好ましいポリペプチドをコードする大きなオープンリーディングフレームが存在する。好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０１１３】
【化６】
2010279364.tif 000007
【０１１４】
【化７】
2010279364.tif 000008
この遺伝子は、ヒトの精巣において主に発現される。
【０１１５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびにガンを含む男性の生殖に関する障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、男性の生殖系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０１１６】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、生殖機能または他の全身的な機能を有するホルモンとして；避妊薬の開発；精巣に原因がある男性性不妊（例えば、クラインフェルター症候群、精索静脈瘤、精巣炎）；男性の性的不能；精巣の新生物；および副睾丸炎のような炎症性の障害に有用であることを示す。
【０１１７】
遺伝子番号28によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、アポトーシス性の（apoptotic）Ｔ細胞において主に発現される。
【０１１８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差示的同定のため、ならびにＴ細胞に関連する疾患、および一般的にはガンを含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の多くの障害（特に、免疫系の障害）について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０１１９】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫系の障害に有用であることを示す。さらに、この遺伝子が、アポトーシス性の細胞から単離され、そしてアポトーシスとガンとの関係の理解に基づくので、おそらくこの遺伝子は、ガンの発生において役割を果たし得る。
【０１２０】
遺伝子番号29によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、ヒトの扁桃において主に発現される。
【０１２１】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差の同定のため、ならびに胃腸の障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、胃腸系）の多くの障害について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０１２２】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、胃腸の疾患の診断および処置に有用であることを示す。
【０１２３】
遺伝子番号30によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、機能が知られていない、CaenorhabditiselegansのC44C1.2遺伝子産物と配列相同性を共有する。好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０１２４】
【化８】
2010279364.tif 000009
これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。この遺伝子は、ヒトの第11番染色体にマップされ、従って、第11番染色体のマーカーとして連鎖解析において有用である。
【０１２５】
この遺伝子は、ヒトのＴ細胞において主に発現され、そしてヒトの結腸のガン腫においてより少ない程度で発現される。
【０１２６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに免疫障害およびガンを含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対して指向される抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系および胃腸系）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプル中で、特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、以下の残基のような、配列番号263に示される配列を含むエピトープが挙げられる：Leu-21からAla-30、Ser-38からAsp-47、Pro-87からAsp-94、Leu-197からThr-204、Pro-256からSer-262、Thr-277からArg-282、Thr-293からTrp-303。
【０１２７】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫障害および胃腸の疾患の診断および処置に有用であることを示す。
【０１２８】
遺伝子番号31によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、Caenorhabditis elegansのリボソームタンパク質L11と配列相同性を共有する。（登録番号156201を参照のこと。）好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
ERGVSINQFCKEFNERTKDIKEGIPLPTKILVKPDRTFEIKIGQPTVSYFLKAAAGIEKGARQTGKEVAGLVTLKHVYEIARIKAQDEAFALQDVPLSSVVRSIIGSARSLGIRVVKDLSSEELAAFQKERAIFLAAQKEADLAAQEEAAKK（配列番号483）。これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。
【０１２９】
この遺伝子は、ヒトの胚組織において発現され、そしてヒトの上皮様肉腫および他の組織においてより少ない程度で発現される。
【０１３０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに発育障害および上皮細胞ガンを含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、胚細胞系および上皮細胞系）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Lys-34からGly-40のような、配列番号264に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【０１３１】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、発育障害および上皮ガンの診断および処置に有用であることを示す。
【０１３２】
遺伝子番号32によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、休止Ｔ細胞において主に発現される。
【０１３３】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに炎症性の障害および一般的な免疫障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０１３４】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫系の障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０１３５】
遺伝子番号33によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、第１染色体上に存在すると考えられる。従って、この遺伝子に由来するポリヌクレオチドは、第１染色体のマーカーとして連鎖解析において有用である。
【０１３６】
この遺伝子は、前立腺において主に発現され、そしてソアレス(soares)成体の脳、ヒトの臍帯静脈の内皮細胞、および羊膜細胞においてより少ない程度で発現される。
【０１３７】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに前立腺に関連する障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、泌尿器系および神経系）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０１３８】
組織分布は、この遺伝子に対応するタンパク質産物が、泌尿器系および神経系の障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０１３９】
遺伝子番号34によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、R05G6.4遺伝子産物と配列相同性を共有する。（登録番号gi|1326338を参照のこと。）この遺伝子はまたシクロフィリン様タンパク質CyP-60と配列相同性を共有する。（登録番号1199598を参照のこと、Biochem.J. 314（1）313-319（1996）もまた参照のこと。）好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０１４０】
【化９】
2010279364.tif 000010
これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。
【０１４１】
この遺伝子は、ヒトの精巣において主に発現され、そして他の組織においてより少ない程度で発現される。
【０１４２】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに男性生殖障害および特に精巣ガンを含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０１４３】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、男性の生殖系障害、および特に、精巣ガンの診断および処置に有用であることを示す。
【０１４４】
遺伝子番号35によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、リン脂質の代謝において重要であると考えられる、SaccharomycescerevisiaeのLpe5pと配列相同性を共有する。
【０１４５】
この遺伝子は、肝臓および脳において主に発現される。
【０１４６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに代謝障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、代謝系および神経系）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、以下の残基のような、配列番号268中に示される配列を含むエピトープが挙げられる：Pro-14からLeu-20、Lys-28からAsn-38、Arg-109からArg-114、Lys-119からAsn-124、Glu-152からLeu-157、Pro-172からVal-180。
【０１４７】
組織分布およびSacchearomyces cerevisiaeのLpe5pに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、代謝障害および神経障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０１４８】
遺伝子番号36によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、C. elegansによってコードされる、核リボヌクレオプロテインＵ（HNRNPU）（登録番号gi|1703576を参照のこと）と配列相同性を共有する。好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０１４９】
【化１０】
2010279364.tif 000011
このポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。
【０１５０】
この遺伝子は、精巣工体において主に発現される。
【０１５１】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに男性の生殖系疾患を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、男性の生殖系）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０１５２】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、男性の生殖障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０１５３】
遺伝子番号37によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、扁桃において主に発現される。
【０１５４】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに炎症性疾患および生殖障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、扁桃）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０１５５】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、炎症性疾患および生殖障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０１５６】
遺伝子番号38によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、ヒトオプソニンタンパク質P35フラグメントと配列相同性を共有する。（登録番号R94181を参照のこと。）オプソニンタンパク質は、食細胞による病原性微生物の食作用を活性化する。好ましいポリペプチドフラグメントは、アミノ酸配列：GCDSCPPHLPREAFAQDTQAEGECSSRAERADMCPDAPPSQEVPEGPGAAP（配列番号489）を含む。これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。
【０１５７】
この遺伝子は、免疫関連の組織（例えば、胸腺、マクロファージ、Ｔ細胞）において主に発現され、そして多くの他の組織においてより少ない程度で発現される。
【０１５８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに免疫障害および感染性の疾患を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の多くの障害（特に、免疫系および感染性の疾患）について、この遺伝子の有意に高いまたは低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Lys-9からArg-14、Met-38からAsp-51のような、配列番号271に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【０１５９】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫障害の診断および処置、ならびに感染性の疾患の処置および／または診断に有用であることを示す。
【０１６０】
遺伝子番号39によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、組織修復において重要であると考えられる、α-2 Ｉ型コラーゲンと配列相同性を共有する。（例えば、211607を参照のこと。）好ましいポリペプチドフラグメントは、アミノ酸配列：
PQLPSCGRPWPGTASVFQSHTQGPREDPDPCRAQGSAGTHCPISLSPPRQ（配列番号490）を含む。これらのポリペプチド配列をコードするポリヌクレオチド配列もまた、好ましい。
【０１６１】
この遺伝子は、脳において主に発現され、そして腎臓および胸腺においてより少ない程度で発現される。
【０１６２】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに脳障害、腎臓障害、および免疫障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の多くの障害（特に、脳障害、腎臓障害、および免疫障害）について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０１６３】
組織分布およびα-2 Ｉ型コラーゲンに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、組織修復、および脳障害、腎臓障害、免疫障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０１６４】
遺伝子番号40によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、組織修復、腫瘍転移において重要であると考えられる、ミニコラーゲンと配列相同性を共有する。（登録番号gnl|PID|ｄ1006976を参照のこと。）好ましいポリペプチドフラグメントは、アミノ酸配列：
PGFRGPSGSLGCSFFPRSLGRVLPPGCQRPGAHADSSPPPTP（配列番号491）を含む。このポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドもまた、好ましい。
【０１６５】
この遺伝子は、卵巣ガンにおいて発現され、そして樹状細胞および平滑筋においてより少ない程度で発現される。
【０１６６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに腫瘍転移および組織修復を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の多くの障害（特に、腫瘍転移および組織修復）について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Asn-2からHis-11のような、配列番号273に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【０１６７】
組織分布およびミニコラーゲン遺伝子に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、腫瘍転移および組織修復の診断および処置に有用であることを示す。
【０１６８】
遺伝子番号41によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、HIV TATタンパク質と配列相同性を共有する。（登録番号328416を参照のこと。）好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０１６９】
【化１１】
2010279364.tif 000012
これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。
【０１７０】
この遺伝子は、乳児の脳において主に発現され、そして胸部および精巣においてより少ない程度で発現される。
【０１７１】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに脳、精巣、および胸部の障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の多くの障害（特に、脳、精巣、および乳房の障害）について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Pro-7からVal-15のような、配列番号274に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【０１７２】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、脳、精巣、および乳房、ならびに他の関連する障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０１７３】
遺伝子番号42によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、乳児の脳、ヒトの小脳において主に発現され、そして髄芽細胞腫においてより少ない程度で発現される。
【０１７４】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに脳に関連する障害および髄芽細胞腫および他の脳腫瘍を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の多くの障害（特に、脳に関連する障害および脳腫瘍（髄芽細胞腫を含む））について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Thr-41からGlu-47のような、配列番号275に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【０１７５】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、ヒトの脳に関連する障害、脳腫瘍、および髄芽細胞腫の診断および処置に有用であることを示す。
【０１７６】
遺伝子番号43によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、lck SH2ドメインについてのホスホチロシン非依存性リガンドに関連するシグナル伝達において重要であると考えられている、lckSH2ドメインのホスホチロシン非依存性リガンドと配列相同性を共有する。（登録番号gi|1184951を参照のこと。）好ましいポリペプチドフラグメントは、アミノ酸配列：ESSGQARTLADPGPGWPRQQGMCFGSLTGLSTTPHGFLTVSAEADPRLIESLSQMLSMGFSDEGGWLTRLLQTKNYDIGAALDTIQYSKH（配列番号498）を含む。このポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。おそらく、この遺伝子は、lckSH2ドメインについてのホスホチロシン非依存性リガンドのファミリーの新規のメンバーである。
【０１７７】
この遺伝子は、胎盤において主に発現され、そして内皮細胞および好中球においてより少ない程度で発現される。
【０１７８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに生殖の疾患、心臓血管の疾患、免疫疾患、および感染性の疾患障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、心臓血管系、生殖系、および免疫系）の多くの障害、ならびに感染性の疾患について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０１７９】
組織分布およびlck SH2ドメインについてのホスホチロシン非依存性リガンドに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、心臓血管系、生殖系、および免疫系疾患、ならびに感染性の疾患の診断および処置に有用であることを示す。
【０１８０】
遺伝子番号44によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、胎児の脳、小脳において主に発現され、そして胎盤においてより少ない程度で発現される。
【０１８１】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびにニューロン細胞に関連する障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の多くの障害（特に、ニューロン細胞に関連する障害）について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Thr-20からGly-28のような、配列番号277に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【０１８２】
組織分布およびプロリンリッチタンパク質遺伝子に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、ニューロン細胞に関連する障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０１８３】
遺伝子番号45によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、シナプスの生理において重要であると考えられる、ヒトのプレセレベリンと配列相同性を共有する。（登録番号gi|180251を参照のこと。）セレベリン様の免疫反応性が、プルキンエ細胞のシナプス後部構造と関連することが、観察されている。従って、この遺伝子もまたシナプス活性を有するようである。好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０１８４】
【化１２】
2010279364.tif 000013
これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。
【０１８５】
この遺伝子は、小脳および乳児の脳において主に発現される。ノーザン分析によって、2.4kbの単一の転写物が、脳組織中で観察された。
【０１８６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびにニューロン細胞のシグナル伝達およびシナプスの生理を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、ニューロン細胞のシグナル伝達およびシナプスの生理）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０１８７】
組織分布および遺伝子または遺伝子ファミリーに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、ニューロン細胞に関連する障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０１８８】
遺伝子番号46によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、胎児の肝臓および脾臓において発現され、そして骨髄、臍帯静脈、およびＴ細胞においてより少ない程度で発現される。
【０１８９】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに免疫系（特に、造血作用）の障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の多くの障害（特に、造血作用の障害および免疫障害）について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Asp-30からGlu-57のような、配列番号279に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【０１９０】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、造血作用の障害および免疫障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０１９１】
遺伝子番号47によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、ウイルスの複製において重要であると考えられる、ネコのカルシウイルスの12kDの核酸結合タンパク質と配列相同性を共有する。（登録番号59264を参照のこと）
この遺伝子は、ヒトの心筋症において主に発現され、そしてＴヘルパー細胞、胎児の脳、および滑膜肉腫においてより少ない程度で発現される。
【０１９２】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに心筋症およびウイルス感染を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、心臓血管系）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Trp-20からCys-26のような、配列番号280に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【０１９３】
心筋症における組織分布および、ウイルスの12kDの核酸結合タンパク質に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、虚血、高血圧、先天的、弁または心臓周囲の異常によって引き起こされるものを含む、心筋症の診断および介入に有用であることを示す。この遺伝子の発現パターンは、これらの状態の結果または原因であり得る。
【０１９４】
遺伝子番号48によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、腫瘍の壊死、細菌およびウイルス感染、免疫疾患および免疫反応において重要であると考えられる、腫瘍壊死因子に関連する遺伝子産物と配列相同性を共有する。
【０１９５】
この遺伝子は、結腸ガンにおいて主に発現され、そして卵巣ガンおよび乳ガンにおいてより少なく発現される。
【０１９６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに結腸、卵巣、または乳房起源の腫瘍を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、結腸、卵巣、および乳房）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０１９７】
組織分布および腫瘍壊死因子に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、結腸、卵巣、および乳房起源のガンの介入に有用であることを示す。なぜなら、TNFファミリーのメンバーは、腫瘍の発達に関与することが公知であるからである。
【０１９８】
遺伝子番号49によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、保護、潤滑、および細胞接着のような細胞外マトリックス機能において重要であると考えられる、ムチン（例えば、上皮性のムチン）と配列相同性を共有する（例えば、登録番号R68002を参照のこと）。好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列：
PRSRPALRPGRQRPPSHSATSGVLRPRKKPDP（配列番号500）を含む。これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。さらにこの遺伝子は、染色体22q11.2-qterにマップされ、従って、第22染色体の連鎖解析においてマーカーとして使用され得る。
【０１９９】
この遺伝子は、脳梁(corpus colosum)において主に発現される。
【０２００】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに腫瘍（特に、脳梁）および転移性の病変を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、脳梁および他の固形の組織）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷した組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０２０１】
組織分布およびムチンに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、血清腫瘍マーカーまたは免疫治療の標的に有用であることを示す。なぜなら、腫瘍細胞は、極端に上昇したレベルのムチンの発現を有し、そして上皮の組織中にこの分子を移動させる(shed)からである。
【０２０２】
遺伝子番号50によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、CD34涸渇バフィーコート臍帯血および初代樹状細胞において主に発現される。
【０２０３】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに造血障害および免疫学的障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の多くの障害（特に、造血系および免疫系）について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。
【０２０４】
CD34涸渇バフィーコート臍帯血および初代樹状細胞における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、造血障害および免疫障害の診断および処置に有用であることを示す。上記の組織分布において、分泌されたタンパク質または細胞表面のタンパク質は、しばしば、細胞の活性化（例えば、サイトカイン）に関与するか、または細胞表面の活性化に関与する分子である。
【０２０５】
遺伝子番号51によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、レトロウイルスのrev応答性エレメントへの結合において重要であると考えられる、インターフェロン誘導性1-8遺伝子によってコードされるポリペプチドと配列相同性を共有する。好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列：MTLITPSXKLTFXKGNKSWSSRACSSTLVDP（配列番号501）を含む。これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。
【０２０６】
この遺伝子は、CD34陽性細胞および好中球において主に発現される。
【０２０７】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびにレトロウイルス感染（例えば、AIDS）および他の免疫障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の多くの障害（特に、免疫系）について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Gln-51からTrp-62のような、配列番号284に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【０２０８】
組織分布およびインターフェロン誘導性遺伝子1-8に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、レトロウイルス（HIVを含む）感染の介入に有用であることを示す。この因子は、ウイルスの安定性または細胞内へのウイルスの進入に関与し得る。あるいは、ウイルス／因子複合体は、細胞性の免疫反応を誘発し得る。
【０２０９】
遺伝子番号52によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、イムノグロブリンλ鎖（登録番号2865484を参照のこと）と配列相同性を共有する。従って、この遺伝子は、イムノグロブリンλ鎖と類似の活性を有するようである。好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列：GHPSPALSIAPSDGSQLPCDEVPYGEAHVTRYCKKPLTNSHLETEAQSSSL（配列番号502）を含む。これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。
【０２１０】
この遺伝子は、ホジキンリンパ腫において主に発現される。
【０２１１】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびにホジキンリンパ腫および他の免疫障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。好ましいエピトープとして、残基：Pro-27からThr-32のような、配列番号285に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【０２１２】
ホジキンリンパ腫における組織分布および配列相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、ホジキンリンパ腫の診断に有用であることを示す。なぜなら、腫瘍塊により上昇した発現および分泌は、この型の腫瘍の指標であり得るからである。さらに、遺伝子産物は、ガンの免疫治療において標的として使用され得る。この遺伝子は、リンパ系起源の細胞において発現されるので、天然の遺伝子産物は、免疫機能に関与し得る。従って、これはまた、関節炎、喘息、免疫不全疾患（例えば、AIDS）、および白血病を含む免疫学的障害のために試薬として使用され得る。
【０２１３】
遺伝子番号53によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、ISLR遺伝子のHomo sapiens mRNAのcDNA（登録番号AB003184を参照のこと）に対して広範囲にわたって相同性を有する。このタンパク質は、Igスーパーファミリーの新規のメンバーであると考えられており、そして保存された隣接配列およびC2型イムノグロブリン（Ig）様ドメインを有するロイシンリッチ反復（LRR）を含む。これらのドメインは、タンパク質間相互作用または細胞接着に重要であり、従って、新規のタンパク質ISLRはまた、他のタンパク質または細胞と相互作用し得るという可能性が存在する。ISLR遺伝子は、インサイチュハイブリダイゼーションにおいて、蛍光によってヒト染色体15q23-q24上にマップされた（MedlineArticle No. 97468140を参照のこと）。ISLR遺伝子に対する相同性は、別の独立したグループによってもまた確認されている（登録番号Hs.102171を参照のこと）。
【０２１４】
この遺伝子は、ヒトの網膜、心臓、骨格筋、前立腺、卵巣、小腸、甲状腺、副腎皮質、精巣、胃、脊髄、胎児の胚および胎児の腎臓組織、結腸、扁桃腺および胃ガンを含む、多数の組織において発現され、そしてエストラジオールで処置された子宮内膜間質細胞、胸部組織、滑膜、リンパ腫、および多数の他の腫瘍においてより少なく発現される。
【０２１５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに結腸、卵巣、および乳房起源の腫瘍を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に、結腸、卵巣、および乳房）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。さらにこの遺伝子は、染色体15q23-q24上にマップされ、従って、第15染色体の連鎖解析においてマーカーとして使用され得る。
【０２１６】
結腸、卵巣、および乳房起源の腫瘍中での組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、これらの腫瘍、さらに、発現が示されている他の腫瘍の診断および介入に有用であることを示す。タンパク質およびこのタンパク質を指向する抗体は、上記に列挙された腫瘍および組織についての腫瘍マーカーおよび／または免疫治療の標的としての有用性を示し得る。
【０２１７】
遺伝子番号54によってコードされるタンパク質の特徴
遺伝子は、多剤耐性遺伝子１（登録番号P06795を参照のこと）に対して相同性を有する。好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０２１８】
【化１３】
2010279364.tif 000014
このポリヌクレオチドフラグメントによってコードされるポリペプチドフラグメントもまた、好ましい。
【０２１９】
この遺伝子は、肺、食道、白血病（Jurkat細胞）および乳ガンにおいて主に発現され、そしてGM-CSF胎児組織で処置されたマクロファージおよび広範な組織においてより少なく発現される。
【０２２０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに広範な起源のガンを含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の多くの障害（特に、固形の腫瘍、肺、および白血病）について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。さらに、肺組織における高い発現レベル、および多剤耐性細胞中で薬物の蓄積が少ないことの原因である流出ポンプとしての多剤耐性タンパク質１遺伝子の提唱されている機能に起因して、タンパク質およびその変異体もまた、遺伝子治療の標的として（特に、慢性患者について）有益であり得る。好ましいエピトープとして、残基：Met-1からLys-16のような、配列番号287に示される配列を含むエピトープが挙げられる。
【０２２１】
広範なガンおよび胎児の組織における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、活性に増殖中の細胞（例えば、ガン）の検出に有用であることを示す。遺伝子産物は、ガンのマーカーまたは免疫治療の標的に使用され得る。
【０２２２】
遺伝子番号55によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、Ｘ染色体にマップされる。
【０２２３】
この遺伝子は、脳において主に発現され、そして発生中の胚においてより少なく発現される。
【０２２４】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のため、ならびに神経変性疾患状態および発育障害を含むがこれに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対して指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織（単数または複数）または細胞型（単数または複数）の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。伴性障害を含む、上記の組織または細胞（特に、神経学上の、発育系、および心臓血管系）の多くの障害について、この遺伝子の有意により高いまたはより低いレベルでの発現が、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン性組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプル中で、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有していない個体に由来する健常な組織または体液中での発現レベル）と比較して日常的に検出され得る。さらに、この遺伝子は、Ｘ染色体にマップされ、従って、この染色体についての連鎖解析においてマーカーとして使用され得る。
【０２２５】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、神経変性疾患状態および行動障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、クラインフェルター症候群、精神分裂症、躁病、痴呆、妄想症、強迫神経症の障害、および恐慌性障害）の検出／処置に有用であることを示す。さらに、遺伝子または遺伝子産物はまた、発生中の胚に関連する発育障害、伴性障害、または心臓血管系の障害の処置および／または検出において役割を果たし得る。
【０２２６】
遺伝子番号56によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、増殖因子レセプターから細胞骨格へのシグナル伝達を媒介することにおいて重要であると思われるパキシリン（paxillin）と配列相同性を共有する。好ましいポリヌクレオチドフラグメントは、以下の配列を含む：
【０２２７】
【化１４】
2010279364.tif 000015
（配列番号506）。また好ましいのは、これらのポリヌクレオチドフラグメントによってコードされるポリぺプチドフラグメントでる。より好ましくは、ポリぺプチドフラグメントは、アミノ酸配列：
【０２２８】
【化１５】
2010279364.tif 000016
を含む。これらの好ましいポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントがまた、意図される。
【０２２９】
この遺伝子は、主に脳において、およびより少ない程度で、発生する胚において発現される。
【０２３０】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（神経学的な疾患状態および発生的な異常を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に免疫および神経系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。さらに、この遺伝子は、第11染色体にマップされる遺伝子（登録番号T87404を参照のこと）と相同性を共有するので、遺伝子およびその翻訳される産物は、第11染色体における連鎖分析のために使用され得る。
【０２３１】
組織分布およびパキシリンに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、脳および／または発生する胚における異常なシグナル伝達と関連する疾患状態の処置および／または検出に有用であることを示す。これは、神経変性の疾患状態および行動障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティングトン病、精神分裂病、躁病、痴呆、パラノイア、強迫性障害、および恐慌性障害）の処置または検出、ならびに胚発生の欠陥の処置および／または検出もまた含む。
【０２３２】
遺伝子番号57によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に胎児脾臓、脳において、およびより少ない程度で、６週齢の胚において発現される。
【０２３３】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（免疫障害、神経学的障害、および発生的な異常を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に免疫および発生系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Arg-28〜Gly-34として配列番号290において示される配列を含有するエピトープである。
【０２３４】
胎児脾臓におけるこの遺伝子の発現は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、免疫異常（例えば、関節炎、喘息、AIDSのような免疫不全疾患、および白血病）の処置／検出に有用であることを示す。さらに、初期胚におけるこの遺伝子の発現は、胚発生における重要な役割を示し、およびそれゆえに遺伝子または遺伝子産物は、胚発生欠陥の処置および／または検出において使用され得た。これは、神経変性の疾患状態および行動障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティングトン病、精神分裂病、躁病、痴呆、パラノイア、強迫性障害、および恐慌性障害）の処置または検出、ならびにまた胚発生欠陥の処置および／または検出を含む。
【０２３５】
遺伝子番号58によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、神経変性の疾患の歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮において破壊される遺伝子と、配列相同性を共有する。さらに、長いオープンリーディングフレームは、選択的なフレームに存在する。好ましいポリぺプチドフラグメントは、以下を含む：
【０２３６】
【化１６】
2010279364.tif 000017
この遺伝子は、主に前立腺ガンにおいて、およびより少ない程度で、松果体においておよび胎児肺において、発現される。
【０２３７】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（神経学的な状態、および肺障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に神経、肺、および内分泌系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Asn-9〜Leu-14として配列番号29において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０２３８】
松果体におけるこの遺伝子、および神経変性の疾患状態の歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮において破壊される遺伝子に対するその相同体の豊富さは、この遺伝子が、他の神経変性の疾患状態および行動障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティングトン病、精神分裂病、躁病、痴呆、パラノイア、強迫性障害、および恐慌性障害）の処置および／または検出において有用であり得ることを示す。胎児肺におけるこの遺伝子の豊富さは、成体におけるこのタンパク質産物の発現の誤った調節（misregulation）が、特に肺におけるリンパ腫または肉腫形成を導き得ること；また、特定の肺欠陥（例えば、肺浮腫および寒栓症）、気管支炎、および嚢胞性線維症に対する素因に関与し得ることを示唆し；ならびに従って、遺伝子またはこの遺伝子によってコードされるタンパク質が、これらの肺障害の検出および／または処置において使用され得た。
【０２３９】
遺伝子番号59によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、発生している胚において主に発現される。
【０２４０】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（発生的な異常を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に発生系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０２４１】
主に肺におけるこの遺伝子の発現は、この遺伝子が、胚発生において重要な役割を果たすこと、および遺伝子またはこの遺伝子によってコードされるタンパク質が、胚におけるまたは乳児における発生の欠陥の処置および／または検出において使用され得たことを示す。
【０２４２】
遺伝子番号60によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、ネスチン（中間フィラメントタンパク質）に対する相同性を示し、この発現は、中枢神経系前駆体細胞の増殖と相関し、そして脳腫瘍の同定において有用である。この遺伝子は、第１染色体にマップされ、そしてそれゆえに、第１染色体についての連鎖分析におけるマーカーとして使用され得る（登録番号AA527348を参照のこと）。
【０２４３】
この遺伝子は、主に腎臓において、およびより少ない程度で、脳において発現される。
【０２４４】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（腎障害および神経変性状態を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に排泄系および神経系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Thr-128〜Asn-135として配列番号293において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０２４５】
組織分布およびネスチンに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、神経変性の疾患状態および行動障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティングトン病、精神分裂病、躁病、痴呆、パラノイア、強迫性障害、および恐慌性障害）の検出および／または処置に有用であることを示す。さらに、腎臓におけるその豊富さは、これが、急性の腎不全および腎臓と関連する他の疾患状態の処置および検出において有用であることを示す。
【０２４６】
遺伝子番号61によってコードされるタンパク質の特徴
遺伝子は、ラトロフィリン関連性タンパク質１前駆体およびカルシウム独立性のα-ラトロキシンレセプターと相同性を共有する。好ましいポリぺプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０２４７】
【化１７】
2010279364.tif 000018
（配列番号519）。
【０２４８】
また好ましいのは、これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである（登録番号2213659を参照のこと）。この遺伝子の翻訳産物は、CD97（７個の膜貫通結合化レセプター）と配列相同性を共有する。
【０２４９】
この遺伝子は、主に乳児脳においておよび内皮細胞において発現される。
【０２５０】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（神経学的な障害および造血性の障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に神経学的な系および造血系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Lys-13〜Leu-21として配列番号294において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０２５１】
この遺伝子の組織分布は、神経変性の疾患状態および行動障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティングトン病、精神分裂病、躁病、痴呆、パラノイア、強迫性障害、および恐慌性障害）の検出および／または処置において有用であり得ることを示唆し、一方、造血細胞タイプにおけるその発現は、遺伝子が、免疫または造血障害（関節炎、喘息、および免疫不全疾患を含む）の処置または検出のために重要であり得ることを示す。
【０２５２】
遺伝子番号62によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、胎児肝臓および胎児脾臓において、主に発現される。
【０２５３】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（血液学的障害および免疫学的な障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に免疫系および造血系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Ser-91〜Lys-98として配列番号295において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０２５４】
胎児肝臓−脾臓におけるこの遺伝子の組織分布は、この遺伝子が、免疫または造血の障害（関節炎、白血病、喘息、および免疫不全疾患を含む）の処置または検出のために重要であり得たことを示す。
【０２５５】
遺伝子番号63によってコードされるタンパク質の特徴
遺伝子は、ヒト血清アミロイドタンパク質と相同性を共有する。好ましいポリぺプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０２５６】
【化１８】
2010279364.tif 000019
（配列番号520）（登録番号W13671を参照のこと）。これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた好ましい。この遺伝子は、第９染色体にマップされ、およびそれゆえに、第９染色体についての連鎖分析におけるマーカーとして使用され得る（登録番号AA004342を参照のこと）。
【０２５７】
この遺伝子は、胎児肝臓および脾臓において、主に発現される。
【０２５８】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（造血性の障害および免疫障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に造血系および免疫系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０２５９】
胎児肝臓−脾臓におけるこの遺伝子の組織分布は、この遺伝子が、免疫または造血の障害（関節炎、白血病、喘息、および免疫不全疾患を含む）の処置または検出のために重要であり得たことを示す。
【０２６０】
遺伝番号64によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、第３染色体にマップされ、およびそれゆえに、第３染色体についての連鎖分析におけるマーカーとして使用され得る（登録番号AA219669を参照のこと）。
【０２６１】
この遺伝子は、脳において特異的に発現される。
【０２６２】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（神経変性の疾患状態を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に神経学的な系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０２６３】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、神経変性の疾患状態および行動障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティングトン病、精神分裂病、躁病、痴呆、パラノイア、強迫性障害、および恐慌性障害）の検出および／または処置に有用であることを示す。
【０２６４】
遺伝子番号65によってコードされるタンパク質の特徴
遺伝子は、酵母タンパク質と相同性を共有する。好ましいポリぺプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
（配列番号521）。また好ましいのは、これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである（登録番号1332638を参照のこと）。
【０２６５】
この遺伝子は、胎児組織（胎児（fetus）および胎児（fetal）の肝臓）において、主に発現される。
【０２６６】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（肝臓の異常およびガン（例えば、肝芽腫）を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に肝臓系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Asn-59〜Glu-64として配列番号298において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０２６７】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、肝臓障害およびガン（例えば、肝芽腫、黄疸、肝炎、肝臓代謝疾患、および肝細胞前駆体細胞の分化に起因する状態を含む）の検出および処置に有用であることを示す。さらに、胎児における発現は、発生異常、胎児欠損、出生前障害、ならびに種々の創傷治癒モデルおよび／または組織外傷におけるタンパク質産物についての有用な役割を示唆する。
【０２６８】
遺伝子番号66によってコードされるタンパク質の異常
遺伝子は、Ｂ細胞表面抗原と相同性を有し、これは、遺伝子が、免疫応答（免疫系の障害および感染を含むがこれらに制限されない）において役割を果たすことを示し得る。好ましいポリヌクレオチドフラグメントは、以下の配列を含む：
【０２６９】
【化１９】
2010279364.tif 000020
（配列番号523）。また好ましいのは、これらのポリヌクレオチドフラグメントによってコードされるポリぺプチドフラグメントである（登録番号T94535を参照のこと）。さらに、この遺伝子は、インターフェロン-γレセプターと相同性を共有する。好ましいポリぺプチドフラグメントはまた、以下のアミノ酸配列を含む：
【０２７０】
【化２０】
2010279364.tif 000021
。
また好ましいのは、これらのポリぺプチドフラグメントによってコードされるポリヌクレオチドフラグメントである。
【０２７１】
この遺伝子は、Ｔ細胞および胆嚢において、主に発現される。
【０２７２】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（免疫学的な障害および状態（免疫不全、ガン、白血病、造血）を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に免疫系および消化系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Thr-41〜Gly-52として配列番号299において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０２７３】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、免疫障害（白血病、リンパ腫、自己免疫障害、免疫抑制（移植）および免疫不全（例えば、AIDS）、炎症、ならびに造血障害を含む）の処置または診断に有用であることを示す。胆嚢におけるこの遺伝子の発現は、特に膵臓の、消化の障害におけるこの遺伝子産物についての可能な役割を示唆する。
【０２７４】
遺伝子番号67によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、第11染色体にマップされ、およびそれゆえに、第11染色体についての連鎖分析におけるマーカーとして使用され得る（登録番号第AA011622を参照のこと）。
【０２７５】
この遺伝子は、多様な胎児および発生的な組織（例えば、胎児脾臓、乳児脳）において、主に発現される。
【０２７６】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（発生的な異常、免疫異常、または神経学的な異常を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に発達中の免疫系および中枢神経系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Ser-38〜Ser-43として配列番号300において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０２７７】
組織の分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、発生的な異常および胎児欠損に有用であることを示す。乳児脳における検出は、神経学的な障害（脳および神経系の発生的なおよび神経変性の両方の状態、行動障害、鬱病、精神分裂病、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティング病、躁病、痴呆）における役割を示唆する。さらに、脾臓における検出は、免疫学的に媒介される障害（例えば、免疫不全、炎症、ガン、創傷治癒、組織修復、造血）の検出および処置における役割を同様に示唆する。
【０２７８】
遺伝子番号68によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に脾臓、Ｔ細胞、および胎児心臓において発現される。
【０２７９】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（免疫学的欠損（AIDSを含む）、および心血管性の障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に免疫系および心血管系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０２８０】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫障害（白血病、リンパ腫、自己免疫障害、免疫不全（例えば、AIDS）、免疫抑制の状態（移植）、および造血障害を含む）の診断および処置のために有用であることを示す。胎児心臓における発現は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、心血管性の障害（例えば、心臓疾患、再狭窄、アテローム性動脈硬化症、発作、アンギナ、血栓症）の処置および診断に有用であることを示す。
【０２８１】
遺伝子番号69によってコードされるタンパク質の特徴
遺伝子は、ヒトコラーゲンタンパク質と相同性を共有する。好ましいポリぺプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０２８２】
【化２１】
2010279364.tif 000022
（配列番号529）（登録番号124886を参照のこと）。また好ましいのは、これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである。
【０２８３】
この遺伝子は、胎児心臓において主に発現される。
【０２８４】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（心血管性の障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に心血管系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Pro-32〜Ser-39として配列番号302において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０２８５】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、心血管性の障害（例えば、心臓疾患、再狭窄、アテローム性動脈硬化症、発作、アンギナ、血栓症）の処置および診断に有用であることを示す。
【０２８６】
遺伝子70によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、ニワトリ１本鎖DNA結合タンパク質と配列相同性を共有する。好ましいポリぺプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列：
【０２８７】
【化２２】
2010279364.tif 000023
（配列番号534）を含む。また好ましいのは、これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである（登録番号1562534を参照のこと）。
【０２８８】
この遺伝子は、主に胎盤において、ならびにより少ない程度で、胎児心臓および種々の他の組織および細胞型において発現される。
【０２８９】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（発生的な異常、胎児欠損（および特に、心血管系の）を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に生殖系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０２９０】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、発生的な異常または胎児欠損、卵巣および他の子宮内膜のガン、生殖機能不全、心血管性の障害、ならびに出生前の障害の検出および処置に有用であることを示す。
【０２９１】
遺伝子番号71によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に胎児肝臓において、ならびにより少ない程度で、乳房および精巣において発現される。
【０２９２】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（肝臓障害（肝芽腫を含む）および生殖性の障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に肝臓系および生殖系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０２９３】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、肝臓障害およびガン（例えば、肝芽腫、黄疸、肝炎、肝臓代謝疾患、および肝細胞前駆体細胞の分化に起因する状態を含む）の検出および処置に有用であることを示す。精巣および乳房における発現は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、内分泌および生殖性の障害（例えば、精子成熟、乳汁生成、精巣ガン、および乳ガン）の検出および処置に有用であることを示す。
【０２９４】
遺伝子番号72によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、第１染色体にマップされ、およびそれゆえに、第１染色体についての連鎖分析におけるマーカーとして使用され得る（登録番号W93595を参照のこと）。
【０２９５】
この遺伝子は、主に平滑筋において、およびより少ない程度で、脳において発現される。
【０２９６】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（心血管性の異常および神経学的な障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に心血管系および中枢神経系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０２９７】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、再狭窄、アテローム性動脈硬化症、発作、アンギナ、血栓症、創傷治癒、および心臓疾患の他の状態の検出および処置に有用であることを示す。さらに、脳における発現は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、脳および神経系の、発生的な、変性の、および行動の状態（例えば、精神分裂病、鬱病、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティングトン病、躁病、痴呆、パラノイア、欲求行動、および睡眠障害）の検出および処置に有用であることを示す。
【０２９８】
遺伝子番号73によってコードされるタンパク質の特徴
遺伝子は、ヒトストロマリン-2と相同性を共有する。好ましいポリヌクレオチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列：
【０２９９】
【化２３】
2010279364.tif 000024
【０３００】
【化２４】
2010279364.tif 000025
を含む。また好ましいのは、これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである（登録番号R65208を参照のこと）。この遺伝子は、第７染色体にマップされ、およびそれゆえに、第７染色体についての連鎖分析においてマーカーとして使用され得る（登録番号D52585を参照のこと）。
【０３０１】
この遺伝子は、主に脳（乳児脳、成人脳、下垂体、小脳、海馬、精神分裂病者の海馬、扁桃体）において発現される。
【０３０２】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差示的同定のための、ならびに疾患および状態（脳および神経系の発生的なおよび神経変性の疾患を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、これらのポリぺプチドに指向されるポリぺプチドおよび抗体は、組織または細胞のタイプの差示的同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に中枢神経系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Thr-25〜Lys-36、Lys55〜Ser-63として配列番号306において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０３０３】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、脳および神経系の、発生的な、変性の、および行動の状態（例えば、精神分裂病、鬱病、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティングトン病、躁病、痴呆、パラノイア、欲求行動、および睡眠障害）の検出および処置に有用であることを示す。
【０３０４】
遺伝子番号74によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、精神分裂病を被るヒトの海馬において主に発現される。
【０３０５】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（CNS、特に精神分裂病の障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特にCNS（例えば、精神分裂病）の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Gly-38〜Ala-44として配列番号307において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０３０６】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、精神分裂病およびCNSを含む他の障害の、研究、診断、および処置に有用であることを示す。
【０３０７】
遺伝子75によってコードされるタンパク質の特徴
本発明の好ましいポリぺプチドは、この遺伝子によってコードされる以下のアミノ酸配列：
【０３０８】
【化２５】
2010279364.tif 000026
（配列番号540）を含む。このようなポリぺプチドをコードするポリヌクレオチドがまた、提供される。
【０３０９】
この遺伝子は、主に子宮内膜腫瘍において、およびより少ない程度で、羊水細胞において発現される。
【０３１０】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（生殖および免疫の障害（特に、それらの系のガン）を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に生殖系および免疫系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Ser-3〜Arg-9として配列番号308において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０３１１】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、免疫および生殖の障害（特に、それらの系のガン）の研究および処置に有用であることを示す。
【０３１２】
遺伝子番号76によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に腎臓皮質において、およびより少ない程度で、初期の段階のヒト脳において発現される。
【０３１３】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（腎臓の障害（例えば、腎臓ガン）を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に腎臓の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Gly-38〜Gly45、Gly-47〜Gly-52、Pro-92〜Lys-110として配列番号309において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０３１４】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物は、腎臓疾患（例えば、腎臓のガン）の研究、処置、および診断に有用であることを示す。
【０３１５】
遺伝子77によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、腎臓髄質において主に発現される。
【０３１６】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（代謝障害および腎臓障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、これらのポリぺプチドに指向されるポリぺプチドおよび抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に代謝系および腎臓系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０３１７】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、代謝および腎臓の疾患および障害の研究、処置、および診断に有用であることを示す。
【０３１８】
遺伝子番号78によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、慢性の滑膜炎および微小血管の内皮において発現される。
【０３１９】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（関節炎およびアテローム性動脈硬化症を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に脈管系および骨格系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０３２０】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、関節炎および他の炎症性の疾患、ならびに心臓血管性の疾患の、研究、診断、および処置に有用であることを示す。
【０３２１】
遺伝子番号79によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、休止Ｔ細胞および活性化単球において発現される。
【０３２２】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（免疫障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に免疫系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０３２３】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、炎症性の状態のような免疫疾患の研究および処置に有用であることを示す。
【０３２４】
遺伝子番号80によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、多様な免疫系組織（例えば、好中球、Ｔ細胞、ならびにTNF誘導性の上皮および内皮細胞）において発現される。
【０３２５】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（感染性障害および免疫障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に免疫系および脈管系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような異常を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Met-1〜Trp-6として配列番号313において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０３２６】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、感染性の疾患、免疫障害、および脈管障害の研究および処置に有用であることを示す。
【０３２７】
遺伝子番号81によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、活性化された好中球において発現される。
【０３２８】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（炎症および他の免疫状態を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、これらのポリぺプチドに指向されるポリぺプチドおよび抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に免疫系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０３２９】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、免疫異常の研究および処置に有用であることを示す。
【０３３０】
遺伝子番号82によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、好中球において発現される。
【０３３１】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（炎症性の状態および他の免疫状態を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に免疫系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Ala-83〜Thr-91として配列番号315において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０３３２】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、免疫障害の研究および処置に有用であることを示す。
【０３３３】
遺伝子番号83によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、ヒト好中球において発現される。
【０３３４】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（炎症性および免疫障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に免疫系および炎症系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０３３５】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、炎症系および免疫系の障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０３３６】
遺伝子番号84によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、ヒト好中球において発現される。
【０３３７】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（炎症系および免疫系の障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に炎症系および免疫系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０３３８】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、免疫性および炎症系の障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０３３９】
遺伝子番号85によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、活性化好中球において発現される。
【０３４０】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（炎症および免疫系の疾患を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に免疫系および炎症系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような異常を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０３４１】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、炎症系および免疫系の疾患の診断および処置に有用であることを示す。
【０３４２】
遺伝子番号86によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、活性化好中球において発現される。
【０３４３】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（炎症および免疫系の障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に炎症系および免疫系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような異常を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Met-1〜Gly-6、Gly-32〜Pro-43、Leu-55〜Gln-60として配列番号319において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０３４４】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、免疫および炎症系の障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０３４５】
遺伝子番号87によってコードされるタンパク質の特徴
特定の実施態様において、本発明のポリぺプチドは、配列：
【０３４６】
【化２６】
2010279364.tif 000027
を含む。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドはまた、本発明によって包含される。この遺伝子の翻訳産物は、変異抑制において重要であると考えられるアクチン変異の抑制因子と配列相同性を共有する。
【０３４７】
この遺伝子は、主に胎児肝臓において、およびより少ない程度で、多様な他の組織において発現される。
【０３４８】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（肝臓および変異を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、これらのポリぺプチドに指向されるポリぺプチドおよび抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に肝臓またはガンの多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような異常を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Val-53〜Arg-60、Thr-88〜Thr-94、Ala-142〜Ser-150、Gly-188〜Glu-196、Gly-208〜Ser-214、Thr-227〜Gly-232、Lys-279〜Phe-285として配列番号320において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０３４９】
組織分布およびアクチン変異の抑制因子に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、肝臓障害またはガンの診断に有用であることを示唆する。
【０３５０】
遺伝子番号88によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、第９染色体にマップされ、およびそれゆえ、第９染色体についてのマーカーとして連鎖分析において使用され得る。特定の実施態様において、本発明のポリぺプチドは、配列：
【０３５１】
【化２７】
2010279364.tif 000028
【０３５２】
【化２８】
2010279364.tif 000029
（配列番号551）を含む。これらのポリぺプチドをコードするポリヌクレオチドはまた、本発明によって含まれる。これらのポリぺプチドは、シグナル伝達において重要であると考えられるホスホリパーゼA2活性化タンパク質（例えば、Wangら、Gene161(2):237-241（1995）を参照のこと）と有意な相同性を共有する。
【０３５３】
この遺伝子は、主に内皮細胞において、より少ない程度で、胎盤、子宮内膜間質細胞、骨肉腫、精巣腫瘍、筋肉、および血管が豊富であるようである乳児脳において、発現される。
【０３５４】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（脈管系の異常、異所性の新脈管形成、腫瘍新脈管形成を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供するにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に脈管系または腫瘍の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような異常を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０３５５】
内皮細胞およびいくつかの潜在的に非常に血管新生化された組織におけるこの遺伝子の組織分布、ならびにホスホリパーゼA2活性化タンパク質に対するその相同性は、この遺伝子が、新脈管形成または脈管形成において、内皮細胞についてシグナルを伝達することに関与し得ることを示唆する。
【０３５６】
遺伝子番号89によってコードされるタンパク質の特徴
特定の実施態様において、本発明のポリぺプチドは、配列：
【０３５７】
【化２９】
2010279364.tif 000030
（配列番号559）を含む。この遺伝子の翻訳産物は、ヒトrasインヒビター、およびゴルジ液胞輸送において重要であると考えられる酵母VPS9pと配列相同性を共有する。
【０３５８】
この遺伝子は、主にＴ細胞およびメラニン細胞において、ならびにより少ない程度で、種々の他の細胞において発現される。
【０３５９】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（Ｔ細胞およびメラニン細胞を含む機能不全および障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供するにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に免疫系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０３６０】
組織分布、およびrasインヒビターに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、シグナル伝達を調節するために有用であること；Ｔ細胞およびメラニン細胞を含む障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０３６１】
遺伝子番号90によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、第９染色体にマップされ、およびそれゆえ、本発明のポリペプチドは第９染色体についてのマーカーとして、連鎖分析において使用され得る。この遺伝子の翻訳産物は、嗅覚ニューロンの尖端樹状突起における化学感受性の線毛の維持、増殖、または分化を影響するにおいて重要であると考えられる、ニューロンのオルファクトメディン（olfactomedin）関連性ER局在化タンパク質と配列相同性を共有する。特定の実施態様において、本発明のポリぺプチドは配列：
【０３６２】
【化３０】
2010279364.tif 000031
（配列番号566）を含む。
【０３６３】
この遺伝子は、松果体において発現される。
【０３６４】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（神経性の障害および内分泌学的な障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供するにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に神経系または内分泌系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織またはこのような障害を有する個体から採取された細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Leu-20〜Ala-26、Arg-32〜Arg-39、Thr-104〜Gly112として配列番号323において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０３６５】
組織分布、およびオルファクトメディン関連タンパク質に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、松果体においてニューロン細胞の維持、増殖、または分化に有用であること、それゆえ、松果体における神経性の障害の診断および処置に有用であり得ることを示す。
【０３６６】
遺伝子番号91によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、前立腺およびアポトーシスＴ細胞において、主に発現される。
【０３６７】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（前立腺疾患およびＴ細胞機能不全を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供するにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に前立腺ガンの多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、一定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織またはこのような障害を有する個体から採取された細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０３６８】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、前立腺およびＴ細胞における異常な活性の検出、またはおそらくこの異常の処置に有用であることを示す。
【０３６９】
遺伝子番号92によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に前立腺において、ならびにより少ない程度で、平滑筋細胞、線維芽細胞、および胎盤において発現される。
【０３７０】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（前立腺または脈管系における障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供するにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に前立腺または脈管系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような異常を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０３７１】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、前立腺または高度に血管新生化された組織（例えば、胎盤）の機能を調節するために有用であることを示す。
【０３７２】
遺伝子番号93によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に胚および胎児組織段階のヒトにおいて、ならびにより少ない程度で、広範に多様な他の増殖性の組織において、発現される。
【０３７３】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（胚発生および細胞増殖における障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供するにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に胚の組織および増殖性の細胞の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような異常を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０３７４】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、発生するおよび増殖性の細胞および器官における異常性の診断または処置に有用であることを示す。
【０３７５】
遺伝子番号94によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、形質転換において重要であると考えられる形質転換関連タンパク質と配列相同性を共有する。
【０３７６】
この遺伝子は、主に雌性生殖組織（すなわち、乳ガン細胞、胎盤、および卵巣）において、ならびにより少ない程度で、胎児の肺において発現される。
【０３７７】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（生殖組織のガンまたは機能不全を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供するにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に生殖系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Ser-50〜Pro-61として配列番号327において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０３７８】
組織分布、および形質転換関連タンパク質に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、生殖器官（すなわち、乳房、胎盤、および卵巣）における形質転換（すなわち、腫瘍形成）によって引き起こされる状態の診断および処置に有用であることを示す。
【０３７９】
遺伝子番号95によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に精巣、横紋筋肉腫、乳児脳において、およびより少ない程度で、いくつかの腫瘍および高度に血管新生化された組織において、発現される。
【０３８０】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（腫瘍形成、異常な新脈管形成、および／または神経性の障害を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供するにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に腫瘍組織または脈管組織の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Arg-46〜Trp-54、Pro-60〜Ile-69、Asn-116〜Ala-122、Arg-147〜Lys-153、Ser-158〜Glu-170、Ile-399〜Ser-405、Pro-486〜Met-499、Pro-502〜Asp-508として配列番号328において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０３８１】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、ある範囲の疾患状態に有用である（腫瘍または脈管障害の処置、ならびに神経性の障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティングトン病、精神分裂病、躁病、痴呆、パラノイア、強迫性障害、および恐慌性障害）の処置を含む）ことを示す。
【０３８２】
遺伝子番号96によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、第７染色体にマップされ、およびそれゆえ、本発明のポリヌクレオチドは、第７染色体についてのマーカーとして、連鎖分析において使用され得る。この遺伝子の翻訳産物は、Clostridium perfringensエンテロトキシン（CPE）レセプター遺伝子産物に対して相同であり、ならびに前立腺に特異的なヒトORFおよび稀突起膠細胞に特異的な糖タンパク質（これらの両方は、組織特異的タンパク質である）（例えば、Katahiraら、J.Cell Biol. 136(6):1239-1247（1997）を参照のこと）と配列相同性を共有する。PMID:9087440；UI:97242441。
【０３８３】
この遺伝子は、主に膵臓腫瘍および潰瘍性結腸炎において、ならびにより少ない程度で、いくつかの腫瘍および正常な組織において発現される。
【０３８４】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞のタイプの差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（膵臓障害、潰瘍性結腸炎、腫瘍、および食中毒を含むが、これらに制限されない）の診断のための試薬として、有用である。同様に、ポリぺプチドおよびこれらのポリぺプチドに指向される抗体は、組織または細胞のタイプの差次的な同定のための免疫学的プローブを提供するにおいて有用である。上記の組織または細胞の、特に消化系または腫瘍形成系の多くの障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有しない個体からの健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、有意により高いまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、またはこのような異常を有する個体から採取された別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Gly-147〜Met-152、Cys-177〜Lys-188として配列番号329において示される配列を含有するエピトープを含む。
【０３８５】
組織分布、ならびに前立腺および稀突起膠細胞特異的タンパク質に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、膵臓、潰瘍性結腸炎、および腫瘍における障害の診断または処置のマーカーについて有用であることを示す。さらに、Clostoridium perfringenesエンテロトキシンについてのヒトレセプターに対する同一性は、このレセプターの可溶性部分が、perfringensエンテロトキシンの活性をブロックすることによって、Clostoridiaperfringensと関連する食中毒の処置において使用され得ることを示す。
【０３８６】
遺伝子番号97によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、代謝に重要であると考えられるATPアーゼと配列相同性を共有する。
【０３８７】
この遺伝子は、主に、精巣およびいくつかの造血細胞において発現され、そしてより少ない程度で他の組織において発現される。
【０３８８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の示差的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（白血病および造血障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、造血系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Leu-37からAla-42として配列番号330に示される配列を含むエピトープを含む。
【０３８９】
組織分布およびATPアーゼとの相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、白血病および他の造血障害の診断および処置のマーカーに有用であることを示す。
【０３９０】
遺伝子番号98によりコードされるタンパク質の特徴
特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは以下の配列を含む：MRSARPSLGCLPSWAFSQALNI（配列番号568）；LLGLKGLAPAEISAVCEKGNFN（配列番号569）；VAHGLAWSYYIGYLRLILPELQARIR（配列番号570）；TYNQHYNNLLRGAVSQRC（配列番号571）；ILLPLDCGVPDNLSMADPNIRFLDKLPQQTGDRAGIKDRVYSN（配列番号572）；SIYELLENGQRAGTCVLEYATPLQTLFAMSQYSQAGFSGEDRLEQ（配列番号573）；AKLFCRTLEDILADAPESQNNCRLIAYQEPADDSSFSLSQEVLRHLRQEEKEEVTVGSLKTSAVPSTSTMSQEPELLISGMEKPLPLRTDFS（配列番号574）；および／またはLLGLKGLAPAEISAVCEKGNFNVAHGLAWSYYIGYLRLILPEL（配列番号575）。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた本発明により含まれる。
【０３９１】
この遺伝子は、主に、前立腺BPHにおいて発現され、そしてより少ない程度で骨髄において発現される。
【０３９２】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の示差的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（良性前立腺肥大または前立腺ガンを含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、男性泌尿器系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Ile-60からAsn-69、Leu-106からAsp-112、Glu-130からGly-136、Phe-160からGlu-167、Pro-184からCys-190、Glu-197からSer-202、Arg-215からGlu-221、Thr-237からPro-242として配列番号331に示される配列を含むエピトープを含む。
【０３９３】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、良性前立腺肥大または前立腺ガンの診断または処置に有用であることを示す。
【０３９４】
遺伝子番号99によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、唾液腺において発現される。
【０３９５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（唾液腺の障害または損傷を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、腺組織の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０３９６】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、唾液腺または他の腺組織の障害または損傷の処置に有用であることを示す。
【０３９７】
遺伝子番号100によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は第15染色体に位置し、従って、本発明のポリヌクレオチドは、第15染色体のマーカーとして連鎖解析において使用され得る。この遺伝子の翻訳産物は、未知機能のC.elegans遺伝子と配列相同性を共有する。特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは以下の配列を含む：DPRVRLNSLTCKHIFISLTQ（配列番号583）；TMKLLKLRRNIVKLSLYRHFTN（配列番号576）；TLILAVAASIVFIIWTTMKFRI（配列番号577）；VTCQSDWRELWVDDAIWRLLFSMILFVI（配列番号578）；MVLWRPSANNQRFAFSPLSEEEEEDEQ（配列番号580）；KEPMLKESFEGMKMRSTKQEPNGNSKVNKAQEDDL（配列番号584）；および／またはKWVEENVPSSVTDVALPALLDSDEERMITHFERSKME（配列番号582）。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた本発明により含まれる。
【０３９８】
この遺伝子は、主に、甲状腺において発現され、そしてより少ない程度で破骨細胞腫、腎臓髄質、および肺において発現される。
【０３９９】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の示差的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（甲状腺機能不全またはガンを含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、内分泌系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Lys-107からLeu-124、Glu-150からThr-159、Pro-173からAsp-179、Ser-192からSer-201として配列番号333に示される配列を含むエピトープを含む。
【０４００】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、甲状腺機能不全またはガンの診断または処置に有用であることを示す。
【０４０１】
遺伝子番号101によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は第16染色体に位置し、従って、本発明のポリヌクレオチドは、第16染色体のマーカーとして連鎖解析において使用され得る。特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは、以下の配列：IRHELTVLRDTRPACA（配列番号585）；および／またはMDFXMALIYD（配列番号586）を含む。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた本発明により含まれる。
【０４０２】
この遺伝子は、主に、腎臓皮質において発現され、そしてより少ない程度で成人脳、脳梁(corpuscolosum)、海馬、および前頭皮質において発現される。
【０４０３】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（神経学的障害を含むが、それに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、中枢神経系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４０４】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、神経学的障害の処置または診断に有用であることを示す。
【０４０５】
遺伝子番号102によりコードされるタンパク質の特徴
特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは、以下の配列を含む：MQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNA（配列番号587）；LRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPF（配列番号588）；ASLVSNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQT（配列番号589）；SQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTAPNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPY（配列番号590）；MRSMMQSLSQNPDLAAQMMLNNPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQ（配列番号591）；MQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGLIPGFTPGLGALGSTGGSSGTNGSNATPSENTSPTAGT（配列番号592）；TEPGHQQFIQQMLQALAGVNPQLQNPEVRFQQQLEQLSAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS（配列番号593）；RNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAA（配列番号594）；GNPFASLVSNTSS（配列番号595）；ENRDPLPNPWA（配列番号595）；GKILKDQDTLSQHGIHD（配列番号597）；GLTVHLVIKTQNRP（配列番号598）；SELQSQMQRQLLSNPEMM（配列番号599）；PEISHMLNNPDIMR（配列番号600）；および／またはRQLIMANPQMQQLIQRNP（配列番号601）。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた本発明により含まれる。
【０４０６】
この遺伝子は、主に、乳房において発現される。
【０４０７】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の示差的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（乳ガンを含むが、それに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、腫瘍系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４０８】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、いくつかの型の乳ガンの処置および診断に有用であることを示す。
【０４０９】
遺伝子番号103によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、分泌セリンプロテアーゼ、および溶菌機能に重要であると考えられるリゾチームＣ前駆体と配列相同性を共有する。特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは以下の配列を含む：NLCHVDCQDLLNPNLLAGIHCAKRIVS（配列番号602）；LDGFEGYSLSDWLCLAFVESKFN（配列番号603）；NENADGSFDYGLFQINSHYWCN（配列番号604）；および／またはNLCHVDCQDLLNPNLLAGIHCAKRIVS（配列番号605）。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた本発明により含まれる。
【０４１０】
この遺伝子は、主に、精巣において発現される。
【０４１１】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の示差的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（感染を含むが、それに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、免疫系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Ile-62からPhe-70、Asn-78からAsn-84として配列番号336に示される配列を含むエピトープを含む。
【０４１２】
組織分布およびリゾチームＣ前駆体との相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、単球（moncyte）-マクロファージ系を追加免疫することに有用であり、そして免疫剤(immunoagent)活性を増強することを示す。
【０４１３】
遺伝子番号104によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、アポトーシスＴ細胞において発現される。
【０４１４】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（免疫障害を含むが、それに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、免疫系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４１５】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、いくつかの免疫障害の処置および診断に有用であることを示す。
【０４１６】
遺伝子番号105によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、中枢神経系における軸索経路発見に重要であると考えられるDrosophilaARIタンパク質（受託2058299；EMBL：遺伝子座DMARIADNE、受託X98309）と配列相同性を共有する。特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは以下の配列を含む：IREVNEVIQNPAT（配列番号606）；ITRILLSHFNWDKEKLMERYFDGNLEKLFA（配列番号607）；NTRSSAQDMPCQICYLNYPNSYF（配列番号608）；TGLECGHKFCMQCWSEYLTTKIMEEGMGQTISCPAHG（配列番号614）；CDILVDDNTVMRLITDSKVKLKYQHLITNSFVECNRLLKWCPAPDCHHVVKVQYPDAKPV（配列番号609）；CDILVDDNTVMRLITDSKVKLKYQHLITNSFVECNRLLKWCPAPDCHHVVKV（配列番号610）；GCNHMVCRNQNCKAEFCWVCLGPWEPHGSAWYNCNRYNEDDAKAARDAQERSRAALQRYL（配列番号611）；FYCNRYMNHMQSLRFEHKLYAQVKQKMEEMQQHNMSWIEVQFLKKAVDVLCQCRATLMYT（配列番号612）；YVFAFYLKKNNQSIIFENNQADLENATEVLSGYLERDISQDSLQDIKQKVQDKYRYCESR（配列番号613）。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた本発明により含まれる。
【０４１７】
この遺伝子は、主に、成人脳において発現され、そしてより少ない程度で子宮内膜腫瘍、メラノサイト、および乳児脳において発現される。
【０４１８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（軸索経路発生に関与する疾患または損傷を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、中枢神経系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４１９】
組織分布およびARIタンパク質との相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、軸索経路発生に関与する疾患状態または損傷（神経変性疾患および神経損傷を含む）の処置に有用であることを示す。
【０４２０】
遺伝子番号106によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、神経伝達物質およびペプチドホルモンの神経内分泌貯蔵小胞の内在性膜タンパク質であると考えられる、シトクロームb561(Susscrofa)と配列相同性を共有する。
【０４２１】
この遺伝子は、主に、前頭皮質において発現され、そしてより少ない程度で横紋筋肉腫において発現される。
【０４２２】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（神経学的障害を含むが、それに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、中枢神経系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Ser-18からPro-24として配列番号339に示される配列を含むエピトープを含む。
【０４２３】
組織分布およびシトクロームb561(Sus scrofa)との相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、神経学的障害の処置および診断に有用であることを示す。この遺伝子はまた、いくつかの型のガンの調節に重要であり得る。
【０４２４】
遺伝子番号107によりコードされるタンパク質の特徴
特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは以下の配列を含む：MWGYLFVDAAWNFLGCLICGW（配列番号615）；MHFISSGNVSAIRSSILLLRXSLSYLGNCLRVSAIFVYFLLFLLLS（配列番号616）；および／またはMDQALRGSPSEGFSTDPSPPQVGRQIPSFPPWRRLVLPKASGCFLEREWWLCVFKLRTRPGAEAHAYNSSILGGRGKGIT（配列番号617）。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた本発明により含まれる。
【０４２５】
この遺伝子は、主に、膵臓腫瘍において発現され、そしてより少ない程度で小脳において発現される。
【０４２６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の示差的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（膵臓腫瘍を含むが、それに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、内分泌系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基Pro-22からPhe-33として配列番号340に示される配列を含むエピトープを含む。
【０４２７】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、膵臓腫瘍の診断および処置に有用であることを示す。
【０４２８】
遺伝子番号108によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は第17染色体に位置し、従って、本発明のポリヌクレオチドは、第17染色体のマーカーとして連鎖解析において使用され得る。特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは、以下の配列を含む：MLPALASCCHFSPPEQAARLKKLQEQEKQQKVEFRKRMEKEVSDFIQDSGQIKKKFQPMNKIERSILHDVVEVAGLTSFSFGEDDDCRYVMIFKKEFAPSDEELDSYRRGEEWDPQKAEEKRNXKELAQRQ（配列番号618）；EEEAAQQGPVVVSPASDYKDKYSHLIGKGAAKDAAHMLQANKTYGCXPVANKRDTRSIEEAMNEIRAKKRLRQSGE（配列番号619）；PPRRPAQLPLTPGAGQGAGRDKAAAIRAHPGAPPLNHLLP（配列番号620）；AVPQAGGKQVFDLSPLELGYVRGMCVCV（配列番号621）および／またはMLPALASCCHFSPPEQAARLKKLQEQEKQQKVEFRKRMEKEVSDFIQDSGQIKKKFQPMNKIERSILHDVVEVAGLTSFSFGEDDDCRYVMIFKKEFAPSDEELDSYRRGEEWDPQKAEEKRNXKELAQRQEEEAAQQGPVVVSPASDYKDKYSHLIGKGAAKDAAHMLQANKTYGCXPVANKRDTRSIEEAMNEIRAKKRLRQSGE（配列番号622）。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた本発明により含まれる。この遺伝子の翻訳産物は、先体の構造タンパク質成分として役割を果たし得るFSA-1と配列相同性を共有する。
【０４２９】
この遺伝子は、主に、胎児腎臓および精子において発現される。
【０４３０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の示差的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（男性生殖障害（特に、先体機能不全を含む）を含むが、それに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、男性生殖系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Glu-8からAsn-35として配列番号341に示される配列を含むエピトープを含む。
【０４３１】
組織分布およびFSA-1との相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、精子の先体機能不全による不妊症の処置に有用であることを示す。
【０４３２】
遺伝子番号109によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、下垂体において発現され、そしてより少ない程度で精巣上体(epididymus)において発現される。
【０４３３】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の示差的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（男性生殖障害を含むが、それに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、男性生殖系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Met-1からTrp-6として配列番号342に示される配列を含むエピトープを含む。
【０４３４】
この遺伝子は下垂体および精巣上体の両方において見出されるので、これは、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、男性生殖障害の処置および診断に有用であることを示す。これは、精巣上体を標的にする下垂体生成分泌ペプチドを含み得る。
【０４３５】
遺伝子番号110によりコードされるタンパク質の特徴
特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは、以下の配列：LLCPVLNSGXSWNFPHPSQPEYSFHGFHSTRLWI（配列番号623）；および／またはPSTPWFLFLLGLTCPFSTSHPRWDSIPP（配列番号624）を含む。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明により含まれる。
【０４３６】
この遺伝子は、主に、休止Ｔ細胞において発現される。
【０４３７】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の示差的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（Ｔ細胞傷害を含むが、それに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、免疫系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４３８】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、特定の免疫障害（特に、Ｔ細胞に関与する障害）の処置および診断に有用であることを示す。
【０４３９】
遺伝子番号111によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、小脳および脳全体において発現され、そしてより少ない程度で乳児脳および胎児腎臓において発現される。
【０４４０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（神経学的障害を含むが、それに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、中枢神経系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Asp-48からGly-55として配列番号344に示される配列を含むエピトープを含む。
【０４４１】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、神経学的障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０４４２】
遺伝子番号112によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、リボソームの初期アセンブリに重要であると考えられるE.coliリボソームタンパク質s15と相同な酵母ミトコンドリアリボソームタンパク質と配列相同性を共有する（受託番号M38016を参照のこと）。この遺伝子は第１染色体に位置し、従って、第１染色体についての連鎖解析におけるマーカーとして使用され得る。
【０４４３】
この遺伝子は、主に、発達組織において発現される。
【０４４４】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（創傷治癒に加えて、ガンおよび腫瘍の発達を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、免疫および発達の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４４５】
組織分布およびE.coliリボソームタンパク質s15との相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、RNAのタンパク質への翻訳に重要な、ミトコンドリアにおけるリボソームアセンブリに関連する疾患に有用であることを示す。従って、これは、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、多発性腫瘍の診断および介入、ならびに発達組織と同様の調節下にあると考えられる創傷治癒に有用であることを示す。タンパク質ならびにこのタンパク質に対して指向される抗体は、上記に列挙された腫瘍および組織についての免疫療法標的に加えて、腫瘍マーカーとしての有用性を有する。
【０４４６】
遺伝子番号113によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、ウイルス結合および取り込みに重要であると考えられるヒトポリオウイルスレセプター前駆体と配列相同性を共有する。好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：ELSISISNVALADEGEYTCSIFTMPVRTAKSLVTVLGIPQKPIITGYKSSLREKDTATLNCQSSGSKPAARLTWRKGDQELHGEPTRIQEDPNGKTFTVSSSVTFQVTREDDGASIVCSVNHESLKGADRSTSQRIEVLYTPTAMIRPDPPHPREGQKLLLHCEGRGNPVPQQYLWEKEGSVPPLKMTQESALIFPFLNKSDSGTYGCTATSNMGSYKAYYTLNVND（配列番号625）。これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた好ましい（受託番号gnllPIDld1002627を参照のこと）。
【０４４７】
この遺伝子は、ほとんどヒト脳組織だけで発現される。
【０４４８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（ウイルス疾患に対する感受性およびCNS疾患（特に、その系のガン）を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、中枢神経系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Leu-26からAsp-37、Lys-53からSer-59として配列番号346に示される配列を含むエピトープを含む。
【０４４９】
組織分布およびポリオウイルスレセプター前駆体との相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、感染のためにウイルス粒子の結合および取り込みを伴う疾患の処置および予防に有用であることを示す。これはまた、外来DNAを感染細胞に挿入することが目的である遺伝子治療において役立ち得る。このタンパク質の助けにより、この外来DNAの結合および取り込みが促進され得る。さらに、この遺伝子の過剰発現は、CNSに関与する異常（特に、その系のガン）を示すことが予想される。
【０４５０】
遺伝子番号114によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、α-1コラーゲンIII型に加えて、Caenorhabditiselegans第III染色体におけるYO87_CAEEL推定（hypothetical）28.5KDタンパク質ZK1236.7と配列相同性を共有する（受託番号gil537432を参照のこと）。この遺伝子の１つの実施態様は、以下のアミノ酸配列を含むポリペプチドフラグメントである：VPELPDRVHQLHQAVQGCALGRPGFPGGPTHSGHHKSHPGPAGGDYNRCDRPGQVHLHNPRGTGRRGQLHPTAGPGVHRRACPSQQLPHRLGPGVPCPSPSLTPVLPSWTQSWCGLPGYTSSS（配列番号630）。さらなる実施態様は、これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである。
【０４５１】
この遺伝子は、主に、脳細胞において発現され、そしてより少ない程度で活性化ＢおよびＴ細胞において発現される。
【０４５２】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（神経変性および免疫学的障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、神経系および免疫系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Glu-34からGlu-39、Gly-51からSer-72、Ala-88からGlu-93、Gln-100からVal-105として配列番号347に示される配列を含むエピトープを含む。
【０４５３】
組織分布ならびにCaenorhabditis elegans第III染色体におけるYO87_CAEEL推定28.5KDタンパク質ZK1236.7および保存α-1コラーゲンIII型タンパク質との相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、神経変性疾患状態および行動障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、精神分裂病、そう病、痴呆、偏執症、強迫性障害、および恐慌性障害）の検出および処置に有用であることを示す。この遺伝子がリンパ起源の細胞において発現されるので、この天然遺伝子産物は免疫機能に関与し得る。従って、これはまた、免疫学的障害（関節炎、喘息、免疫不全疾患（例えば、AIDS）、および白血病を含む）の薬剤として使用され得る。
【０４５４】
遺伝子番号115によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、細胞により無機硫酸を取り込ませるその能力を介する硝子軟骨形成に重要であると考えられる、α3IX型コラーゲンと配列相同性を共有する（受託番号gil975657を参照のこと）。この遺伝子の１つの実施態様は、以下のアミノ酸配列を含むポリペプチドフラグメントである：SLRRPRSAAXQTLTTFLSSVSSASSSALPGSREPCDPRAPPPPRSGSAASCCSCCCSCPRRRAPLRSPRGSKRRIRQREVVDLYNGMCLQGPAGVPGRDGSPGANGIPGTPGIPGRDGFKGEKGECLRESFEESWTPNYKQCSWSSLNYGIDLGKIAECTFTKMRSNSALRVLFSGSLRLKCRNACCQRWYFTFNGAECSGPLPIEAIIYLDQGSPEMNSTINIHRTSSVEGLCEGIGAGLVDVAIWVGTCSDYPKGDASTGWNSVSRIIIEELPK（配列番号634）。さらなる実施態様は、このポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである。
【０４５５】
この遺伝子は、主に、平滑筋において発現され、そしてより少ない程度で滑膜組織において発現される。
【０４５６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（小人症、背柱変形、および特定の関節異常、ならびに軟骨形成不全（すなわち、脊椎骨端形成異常、家族性変形性関節症、AtelosteogenesisII型、骨幹端軟骨形成不全シュミド型、および自己免疫障害）を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、骨格系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健康組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４５７】
組織分布およびα3IX型コラーゲンとの配列相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、多くの異なる型の軟骨形成不全を導くこの遺伝子の変異と関連する疾患の処置および診断に有用であることを示す。このタンパク質またはその変異が発生初期で上皮細胞に、および後期で発生中の頭骸顔面構造の軟骨細胞に影響を及ぼし得るので、この産物の使用により、四肢および脊柱(spine）の骨の異常な成長および発生は、子宮内で日常的に検出または処置され得る。
【０４５８】
遺伝子番号116によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、ウイルス複製に重要であると考えられるレトロウイルス関連逆転写酵素と配列相同性を共有する。この遺伝子の１つの実施態様は、以下のアミノ酸配列：TKKENCRPASLMNIDTKILNKILMNQ（配列番号640）を含むポリペプチドフラグメントである。さらなる実施態様は、これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである（受託番号pir|A25313|GNHUL1を参照のこと）。
【０４５９】
この遺伝子は、主に、ヒト髄膜腫(meningima)において発現される。
【０４６０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（レトロウイルス疾患（例えば、AIDS）を含み、潜在的な細胞分裂遺伝子のトランス活性化による特定のガンを含むかもしれないが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、免疫系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４６１】
組織分布およびレトロウイルス関連逆転写酵素との相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、レトロウイルス感染と関連する疾患および疾病の検出および処置に有用であることを示す。なぜなら機能的逆転写酵素(RT)またはRT様分子は、レトロウイルス生活環の絶対必要な成分であるからである。
【０４６２】
遺伝子番号117によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、C.elegansに由来する未知遺伝子と配列相同性を共有し、ならびに胚発生に必要であることが知られている、トロンボスポンジン3およびグルコセレブロシダーゼの両方に隣接する遺伝子である哺乳動物メタキシン(metaxin)と弱い相同性を共有する。好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：MCNLPIKVVCRANAEYMSPSGKVPXXHVGNQVVSELGPIVQFVKAKGHSLSDGLEEVQKAEMKAYMELVNNMLLTAELYLQWCDEATVGXITHXRYGSPYPWPLXHILAYQKQWEVKRKXKAIGWGKKTLDQVLEDVDQCCQALSQRLGTQPYFFNKQPTELDALVFGHLYTILTTQLTNDELSEKVKNYSNLLAFCRRIEQHYFEDRGKGRLS（配列番号641）；MCNLPIKVVCRANAEYMSPSGKVPXXHVGNQVVSELGPIVQFVK（配列番号642）。これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた好ましい（受託番号gi|1326108を参照のこと）。
【０４６３】
この遺伝子は、主に、胎児組織において発現され、そしてより少ない程度で造血細胞および組織（脾臓、単球、およびＴ細胞を含む）において発現される。
【０４６４】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差示的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（ガン；リンパ増殖性障害；炎症；軟骨肉腫、およびゴーシェ病を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、造血系および胚系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４６５】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、ガンおよび他の増殖性障害の診断および処置に有用であることを示す。胚組織および増殖細胞により特徴付けられる他の細胞供給源における発現は、このタンパク質が調節または細胞分裂に役割を果たし得ることを示す。さらに、造血細胞および組織における発現は、このタンパク質が造血細胞系譜の増殖、分化、および生存に役割を果たし得ることを示す。従って、この遺伝子は、リンパ増殖性障害の処置に、ならびに初期の造血幹細胞および拘束された前駆細胞に由来する種々の造血系譜の維持および分化に有用であり得る。
【０４６６】
遺伝子番号118によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、RNA分子からcDNA鎖への合成に重要であり、そしてレトロウイルスの感染RNA鎖がそれらのDNA相補物に転写される方法である、逆転写酵素と配列相同性を共有する。この遺伝子の１つの実施態様は、以下のアミノ酸配列を含むポリペプチドフラグメントである：MXXXNSHITIFTLNVNGLNAPNERHRLANWIQSQDQVCCIQETHLTGRDTHRLKIKGWRKIYQANGKQKK（配列番号647）。さらなる実施態様は、これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチドフラグメントである（受託番号gi|2072964を参照のこと）。
【０４６７】
この遺伝子は、主に、皮膚において発現され、そしてより少ない程度で好中球において発現される。
【０４６８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（ガン、造血障害；炎症；免疫監視機構障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、表皮および／または造血系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４６９】
組織分布および逆転写酵素との相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドがガン治療に有用であることを示す。皮膚における発現はまた、この遺伝子が創傷治癒および線維症に有用であることを示す。好中球による発現はまた、この遺伝子産物が、炎症および免疫監視機構（すなわち、ウイルス病原体の認識）の制御に役割を果たすことを示す。逆転写酵素ファミリーメンバーはまた、AIDSの検出および処置に有用である。
【０４７０】
遺伝子番号119によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、RNA分子のcDNAコピー合成に重要であり、そしてレトロウイルスが、そのゲノムを遺伝可能なDNAコピーに逆転写する方法である、逆転写酵素と配列相同性を共有する。
【０４７１】
この遺伝子は、主に、脳の前頭皮質において発現る。
【０４７２】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（ガンおよび神経変性障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、CNSおよび末梢神経系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４７３】
組織分布および逆転写酵素との相同性は、これがガンおよびAIDSの処置に有用であることを示唆する。脳における発現は、これが神経変性障害および神経変性に役割を果たすことを示す。
【０４７４】
遺伝子番号120によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の１つの実施態様は、Schizosaccharomycespombeにおける推定タンパク質と相同性を有する（受託番号2281980を参照のこと）。この遺伝子の別の実施態様は、以下のアミノ酸配列：IYHLHSWIFFHFKRAFCMCFITMKVIHAHCSKLRKCXNAQISVFCTTLTASYPT（配列番号651）を含むポリペプチドフラグメントである。さらなる実施態様は、これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである。この遺伝子は第18番染色体に位置し、従って、第18番染色体についての連鎖分析におけるマーカーとして使用され得る。
【０４７５】
この遺伝子は、主に、成人視床下部において発現され、そしてより少ない程度で乳児脳において発現される。
【０４７６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差示的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（神経変性障害；内分泌機能；およびめまいを含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、脳、CNSおよび末梢神経系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４７７】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、神経変性障害の処置および診断；脳またはニューロン起源の腫瘍の診断；全身およびホメオスタシスのホルモン制御を含む処置、行動障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティングトン病、精神分裂病、そう病、痴呆、偏執症、強迫性障害、および恐慌性障害）の処置および診断に有用であることを示す。さらに、この遺伝子または遺伝子産物はまた、発生中の胚と関連する発育障害の処置および／または検出に役割を果たし得る。
【０４７８】
遺伝子番号121によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、c-mycプロモーターエレメントへの結合、従って、その転写調節に重要であると考えられるヒトIRLBタンパク質と配列相同性を共有する（受託番号gi|33969を参照のこと）。この遺伝子は第１番染色体に位置し、従って、第１番染色体についての連鎖分析におけるマーカーとして使用され得る。
【０４７９】
この遺伝子は、主に、脳および胸部において発現され、そしてより少ない程度で種々の造血組織および細胞において発現される。
【０４８０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差示的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（脳および胸部のガン；リンパ増殖性障害；神経変性疾患を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、CNS、胸部、および免疫系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４８１】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、脳、胸部、および造血系のガンの処置および診断に有用であることを示す。さらに、これは、神経変性障害、ならびに造血系障害（免疫能力における欠損および炎症を含む）の処置に有用であり得る。タンパク質ならびにこのタンパク質に対して指向される抗体は、腫瘍マーカーならびに上記で列挙された腫瘍および組織についての免疫療法標的としての有用性を示し得る。
【０４８２】
遺伝子番号122によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、膜を横断するプロトン移動に重要であると考えられるプロトンチャンネルの重要な成分であるATP合成酵素と配列相同性を共有する。
【０４８３】
この遺伝子は、主に、Ｔ細胞リンパ腫において発現される。
【０４８４】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（Ｔ細胞リンパ腫を含むが、これに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、免疫系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４８５】
組織分布およびATP合成酵素との相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、プロトン輸送、ホメオスタシス、および代謝における欠損の処置、ならびにリンパ腫の診断および処置に有用であることを示す。この遺伝子はリンパ起源の細胞において発現されるので、この天然遺伝子産物は免疫機能に関与し得る。従って、これはまた、免疫学的障害（関節炎、喘息、免疫不全疾患（例えば、AIDS）、および白血病を含む）の薬剤として使用され得る。
【０４８６】
遺伝子番号123によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は第15番染色体に位置し、従って、第15番染色体についての連鎖分析におけるマーカーとして使用され得る。
【０４８７】
この遺伝子は、主に、種々の胎児組織（胎児の肝臓、肺、および脾臓を含む）において発現され、そしてより少ない程度で種々の血液細胞（好酸球およびＴ細胞を含む）において発現される。
【０４８８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差示的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（ガン（異常細胞増殖）；Ｔ細胞リンパ腫；および造血障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、胎児および免疫系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４８９】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、細胞増殖を含む状態の処置および診断に有用であることを示す。胎児組織ならびに種々の血球細胞系譜におけるこの遺伝子の発現は、これが細胞増殖；アポトーシス；または細胞生存のいずれかに役割を果たし得ることを示す。従って、これは、種々のガンおよび悪性疾患の管理および処置に有用であり得る。さらに、血球細胞におけるその発現は、これが造血性の障害および状態にさらなる役割を果たし得、そして自己免疫、免疫調節、免疫監視機構、および炎症を含む疾患を処置することに有用であり得ることを示唆する。
【０４９０】
遺伝子番号124によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、胎盤において発現され、そしてより少ない程度で松果体および横紋筋肉腫において発現される。
【０４９１】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（発育障害、内分泌障害、および女性生殖障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、関連する疾患状態が起こりそうな系（例えば、免疫系）の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Leu-69からVal-76として配列番号357に示される配列を含むエピトープを含む。
【０４９２】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、発育障害の診断および処置に有用であることを示す。タンパク質ならびにそのタンパク質に対して指向される抗体は、腫瘍マーカーならびに上記で列挙された腫瘍および組織についての免疫療法標的としての有用性を示し得る。
【０４９３】
遺伝子番号125によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、良性前立腺肥大において発現される。
【０４９４】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差示的同定のための試薬、ならびに良性前立腺肥大の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、生殖系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４９５】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、良性前立腺肥大の処置および診断に有用であることを示す。タンパク質ならびにそのタンパク質に対して指向される抗体は、腫瘍マーカーならびに上記で列挙された腫瘍および組織についての免疫療法標的としての有用性を示し得る。
【０４９６】
遺伝子番号126によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、アポトーシスＴ細胞において発現され、そしてより少ない程度でサプレッサーＴ細胞および潰瘍性大腸炎において発現される。
【０４９７】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（未熟（premature）アポトーシスを含む疾患ならびに免疫学的障害および胃腸障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、免疫系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０４９８】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、特に免疫細胞系譜における、不適切なレベルのアポトーシスを含む障害の処置および診断に有用であることを示す。この遺伝子はリンパ起源の細胞において発現されるので、この天然遺伝子産物は免疫機能に関与し得る。従って、これはまた、免疫学的障害（関節炎、喘息、免疫不全疾患（例えば、AIDS）、および白血病を含む）ための薬剤として使用され得る。
【０４９９】
遺伝子番号127によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、ラージ細胞において発現される。
【０５００】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差示的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（炎症およびＴ細胞自己免疫障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、免疫系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Asp-23からGly-29として配列番号360に示される配列を含むエピトープを含む。
【０５０１】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、炎症およびＴ細胞自己免疫障害の処置および診断に有用であることを示す。この遺伝子はリンパ起源の細胞において発現されるので、この天然遺伝子産物は免疫機能に関与し得る。従って、これはまた、免疫学的障害（関節炎、喘息、免疫不全疾患（例えば、AIDS）、および白血病を含む）ための薬剤として使用され得る。
【０５０２】
遺伝子番号128によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、機能未知のC.elegansコード領域C47D12.2と配列相同性を共有する（受託番号gnl|PID|e348986を参照のこと）。この遺伝子の１つの実施態様は、以下のアミノ酸配列を含むポリペプチドフラグメントである：
【０５０３】
【化３１】
2010279364.tif 000032
さらなる実施態様は、これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである。この遺伝子は第18番染色体に位置し、従って、第18番染色体についての連鎖分析におけるマーカーとして使用され得る。
【０５０４】
この遺伝子は、主に、平滑筋において発現され、そしてより少ない程度で胎児肝臓において発現される。
【０５０５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（アテローム性動脈硬化症ならびに他の心臓血管障害および肝臓障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、循環系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０５０６】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、循環系障害（アテローム性動脈硬化症、高血圧、および血栓症）の診断および処置に有用であることを示す。さらに、組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、肝臓の障害およびガン（例えば、胚芽細胞腫、黄疸、肝炎、肝臓代謝病、および肝細胞前駆細胞の分化に起因する状態）の検出および処置に有用であることを示す。さらに、胎児における発現は、発生異常、胎児欠損症、出生前障害、ならびに種々の創傷治癒モデルおよび／または組織外傷におけるこのタンパク質産物の有用な役割を示唆する。
【０５０７】
遺伝子番号129によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、現在既知の機能を有さないC.elegansタンパク質F40F11.1に加えて、細胞代謝に重要であると考えられるリボソームタンパク質と配列相同性を共有する（受託番号gnl|PID|e244552を参照のこと）。好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０５０８】
【化３２】
2010279364.tif 000033
これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた好ましい。
【０５０９】
この遺伝子は、主に、ウィルムス腫瘍において発現され、そしてより少ない程度で胸腺および支質細胞において発現される。
【０５１０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（RNA翻訳に影響を及ぼす疾患を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、ウィルムス腫瘍の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Thr-11からAsp-20として配列番号362に示される配列を含むエピトープを含む。
【０５１１】
組織分布およびリボソームタンパク質との相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、RNA翻訳に影響を及ぼす疾患に有用であることを示す。
【０５１２】
遺伝子番号130によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、全体的な転写調節に重要であると考えられる酵母DNAヘリカーゼと配列相同性を共有する（受託番号gnl|PID|e243594を参照のこと）。この遺伝子の１つの実施態様は、以下のアミノ酸配列を含むポリペプチドフラグメントである：
【０５１３】
【化３３】
2010279364.tif 000034
さらなる実施態様は、これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである。
【０５１４】
この遺伝子は、主に、扁桃において発現される。
【０５１５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差示的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（脳の疾患および障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、中枢神経系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０５１６】
組織分布およびDNAヘリカーゼとの相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、RNA転写に影響を及ぼす疾患（特に、発育障害および創傷治癒）に有用であることを示す。なぜなら後者は、発生の転写調節に近づくと考えられるからである。
【０５１７】
遺伝子番号131によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、前立腺において発現され、そしてより少ない程度で扁桃および膵臓腫瘍において発現される。
【０５１８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（前立腺膨大ならびに胃腸障害（特に、膵臓および胆嚢の障害）を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、生殖系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０５１９】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、前立腺疾患（良性前立腺肥大および前立腺ガンを含む）の処置および診断に有用であることを示す。さらに、膵臓腫瘍における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、発現が示された他の組織に加えて、これらの腫瘍の診断および介入に有用であることを示す。タンパク質ならびにこのタンパク質に対して指向される抗体は、腫瘍マーカーおよび／または上記で列挙された腫瘍および組織についての免疫療法標的としての有用性を示し得る。
【０５２０】
遺伝子番号132によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、成人肺において発現され、そしてより少ない程度で視床下部において発現される。
【０５２１】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（肺疾患および神経性障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、肺系および呼吸系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０５２２】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、肺障害および呼吸障害（例えば、気腫、肺炎、ならびに肺水腫および肺塞栓）の診断および処置に有用であることを示す。さらに、組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、神経変性疾患状態および行動障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティングトン病、精神分裂病、そう病、痴呆、偏執症、強迫性障害、および恐慌性障害）の検出／処置に有用であることを示す。さらに、この遺伝子または遺伝子産物はまた、発生中の胚と関連する発育障害、伴性障害、または心臓血管系障害の検出および／または処置に役割を果たし得る。
【０５２３】
遺伝子番号133によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、ヒト肝臓において発現される。
【０５２４】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（肝硬変および他の肝臓障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、消化系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０５２５】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、肝臓障害（例えば、肝硬変、黄疸、および肝炎(hepatitus)）の診断および処置に有用であることを示す。タンパク質ならびにこのタンパク質に対して指向される抗体は、腫瘍マーカーおよび／または上記で列挙された組織についての免疫療法標的としての有用性を示し得る。
【０５２６】
遺伝子番号134によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、胎児腎臓において発現され、そしてより少ない程度で胎児の肝臓および脾臓において発現される。
【０５２７】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差示的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（肝臓および腎臓の発生および再生ならびに免疫学的障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、消化系および排出系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Pro-70からArg-77、Tyr-102からThr-107として配列番号367に示される配列を含むエピトープを含む。
【０５２８】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、腎臓および肝臓の疾患（例えば、肝硬変、腎不全、腎結石、ならびに肝不全、胚芽細胞腫、黄疸、肝炎、肝臓代謝病、および肝細胞前駆細胞の分化に起因する状態）の診断および処置に有用であることを示す。さらに、胎児における発現は、発育異常、胎児欠損症、出生前障害、ならびに種々の創傷治癒モデルおよび／または組織外傷におけるこのタンパク質産物の有用な役割を示唆する。
【０５２９】
遺伝子番号135によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、脳、骨髄において発現され、そしてより少ない程度で胎盤、Ｔ細胞、精巣、および好中球において発現される。
【０５３０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織あるいは細胞型の差異に基づく同定のための試薬、ならびに疾患および状態（神経変性疾患および免疫学的疾患ならびにガンを含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織あるいは細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の（特に、神経系および免疫系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）と比較して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは脊髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Met-1からHis-6として配列番号368に示される配列を含むエピトープを含む。
【０５３１】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、神経変性疾患状態および行動障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンティングトン病、精神分裂病、そう病、痴呆、偏執症、強迫性障害、および恐慌性障害）の検出／処置に有用であることを示す。さらに、この遺伝子または遺伝子産物はまた、発生中の胚と関連する発育障害または伴性障害の処置および／または検出に役割を果たし得る。
【０５３２】
遺伝子番号136によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、ヒトWD反復タンパク質HAN11に相同である。好ましいポリぺプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０５３３】
【化３４】
2010279364.tif 000035
【０５３４】
【化３５】
2010279364.tif 000036
これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた好ましい。
【０５３５】
この遺伝子は、主に胎盤、胚、T細胞、および胎児肺、ならびにより少ない程度に内皮細胞、扁桃腺、および骨髄において発現される。
【０５３６】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のための試薬、ならびに癌に加えて免疫学的および発達的疾患を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリぺプチドに対するポリぺプチドおよび抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの疾患について、特に免疫系の組織および細胞について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、その疾患を有さない個体由来の健常な組織または体液における発現レベル）に対して有意に高いかまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、特定の組織（例えば、癌性組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取した他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープには、残基Gly-19からGln-28、Pro-36からPhe-42として配列番号369に示される配列を含むエピトープが含まれる。
【０５３７】
結腸、卵巣、および乳房起源の腫瘍における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、発現が示されている他の腫瘍に加えて、これらの腫瘍の診断および介入に有用であることを示す。タンパク質およびこのタンパク質に対して指向される抗体は、上記に列挙した腫瘍および組織についての腫瘍マーカーおよび/または免疫治療用標的としての有用性を示し得る。遺伝子がリンパ系起源の細胞において発現されるので、天然の遺伝子産物は、免疫機能に関与し得る。それゆえ、これは、関節炎、喘息、AIDSのような免疫不全疾患、および白血病を含む免疫学的障害のための薬剤としてもまた使用され得る。
【０５３８】
遺伝子番号137によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主にTNFおよびINF誘導性の上皮細胞、T細胞、および腎臓において発現される。
【０５３９】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のための試薬、および炎症性状態（特に腎臓における炎症反応）を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリぺプチドに対するポリぺプチドおよび抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの疾患、特に腎臓系の疾患について、標準的遺伝子発現レベル（すなわち、その疾患を有さない個体由来の健常な組織または体液における発現レベル）と比較して、有意により高いレベルまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、そのような疾患を有する個体から採取した特定の組織（例えば、癌性組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。好ましいエピトープには、残基：Thr-67からGly-72、Gln-132からAla-145、Arg-150からPro-157として配列番号370に示される配列を含むエピトープが含まれる。
【０５４０】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、腎臓の炎症によって引き起こされる損傷を処置するために有用であることを示す。
【０５４１】
遺伝子番号138によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、第１番染色体にマップされ、それゆえ、第１番染色体についての連鎖分析におけるマーカーとして使用され得る（アクセッション番号D63485を参照のこと）。
【０５４２】
この遺伝子は、主に、乳癌および結腸癌において、そしてより低い程度で胸腺および胎児脾臓において発現される。
【０５４３】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のための試薬として、ならびに疾患および状態（癌、特に乳癌および結腸組織の癌を含むがこれらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリぺプチドに対するポリぺプチドおよび抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に免疫系の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、その疾患を有さない個体に由来する健常な組織または体液における発現レベルと比較して有意により高いかまたは低いレベル）でのこの遺伝子の発現は、このような疾患を有する個体から採取した特定の組織（例えば、癌性および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０５４４】
結腸および乳房起源の腫瘍における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、発現が示されている他の腫瘍に加えて、これらの腫瘍の診断および介入のために有用であることを示す。タンパク質、ならびにそのタンパク質に対して指向される抗体は、上記に列挙した腫瘍および組織のための腫瘍マーカーおよび/または免疫治療用標的としての有用性を示し得る。
【０５４５】
配列番号139によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は第17番染色体にマップされ、したがって第17番染色体についての連鎖分析におけるマーカーとして使用され得る。
【０５４６】
この遺伝子は、主としてCD34陽性細胞で、およびより低い程度では活性化されたT細胞および好中球で発現される。
【０５４７】
したがって、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、免疫学的に関連する疾患および造血性の障害を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に免疫系および造血系の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベル）に対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、癌性および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０５４８】
CD34、T細胞、および好中球における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、造血性の障害および免疫学的に関連する疾患（例えば、貧血、白血病、炎症、感染、アレルギー、免疫不全障害、関節炎、喘息、AIDSのような免疫不全疾患）の処置および診断のために有用である。
【０５４９】
遺伝子番号140によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、別のグループによって最近クローン化された。彼らは、この遺伝子をKIAA0313遺伝子と呼んだ。（アクセッション番号d1021609を参照のこと。）好ましいポリぺプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０５５０】
【化３６】
2010279364.tif 000037
これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリぺプチドフラグメントもまた好ましい。この遺伝子は、第４番染色体にマップされ、それゆえ第４番染色体についての連鎖分析においてマーカーとして使用され得る（アクセッション番号AB002311を参照のこと）。
【０５５１】
この遺伝子は、主として卵巣癌、精巣、脳、および結腸の腫瘍において発現される。
【０５５２】
したがって、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のための試薬として、および卵巣、精巣、脳、および結腸の癌を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリぺプチドに対するポリぺプチドおよび抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に男性および女性の生殖系の障害については、標準的遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、癌性および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０５５３】
結腸、卵巣、精巣、および脳起源の腫瘍における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、発現が示されている他の腫瘍に加えて、これらの腫瘍の診断および介入にとって有用であることを示す。タンパク質、およびそのタンパク質に対して指向される抗体は、上記の腫瘍および組織についての腫瘍マーカーおよび/または免疫治療用標的としての有用性を示し得る。
【０５５４】
遺伝子番号141によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主として脾臓および結腸の癌において発現される。
【０５５５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（結腸癌および免疫学的障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の（特に、胃腸管および免疫系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）に対して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された、特定の組織（例えば、癌性組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０５５６】
結腸、卵巣、乳房起源の腫瘍における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、発現が示されている他の腫瘍に加えて、これらの腫瘍の診断および介入にとって有用であることを示す。タンパク質、およびこのタンパク質に対する抗体は、上記の腫瘍および組織についての腫瘍マーカーおよび/または免疫治療用標的としての有用性を示し得る。
【０５５７】
遺伝子142によってコードされるタンパク質の特徴
翻訳産物は、T細胞転位タンパク質、推定のジンクフィンガー因子（アクセッション番号340454を参照のこと）、およびGタンパク質結合レセプターTM5のコンセンサスポリぺプチド（アクセッション番号R50734を参照のこと）に相同である。好ましいポリぺプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０５５８】
【化３７】
2010279364.tif 000038
これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた好ましい。
【０５５９】
この遺伝子は、主として胎児脳において発現される。
【０５６０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための試薬、ならびに疾患および状態（脳腫瘍を含む神経性障害を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の（特に、中枢神経系の）多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体に由来する健常組織または体液における発現レベル）に対して、有意に高いまたは低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取された、特定の組織（例えば、癌性組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０５６１】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、神経変性疾患状態および行動障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、精神分裂病、躁病、痴呆、パラノイア、強迫性障害、および恐怖性障害）の検出/処置のために有用であることを示す。さらに、遺伝子または遺伝子産物はまた、胚の発達に関連する発達障害の処置および/または検出において役割を果たし得る。
【０５６２】
遺伝子番号143によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子についての翻訳産物は、Fasリガンドに対して有意な相同性を有する。これは、システインリッチII型膜貫通タンパク質/腫瘍壊死因子レセプターホモログである。このタンパク質内の変異は、一般化したリンパ球増殖性疾患を生じ、これはリンパ節腫脹および自己免疫疾患の発症を導くことが示されている（Medline文献番号94185175を参照のこと）。好ましいポリぺプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０５６３】
【化３８】
2010279364.tif 000039
（配列番号689）。
これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドもまた好ましい（アクセッション番号473565を参照のこと）。
【０５６４】
この遺伝子は、主として骨芽細胞、肺、および脳において発現される。
【０５６５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための試薬、ならびに骨芽細胞関連疾患、肺疾患、神経性疾患、および免疫学的疾患を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に骨格および神経系の障害については、標準的遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベル）と比較して、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、癌性組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Trp-33〜Thr-40、Lys-45〜Ile-63として配列番号376に示される配列を含むエピトープを含む。
【０５６６】
Fasリガンドに対するその相同性と組み合わせた骨芽細胞、肺、および脳の腫瘍における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、発現が示されている他の腫瘍に加えて、これらの腫瘍の診断および介入にとって有用であることを示す。タンパク質、およびそのタンパク質に対する抗体は、上記に列挙した腫瘍および組織のための腫瘍マーカーおよび/または免疫治療用標的としての有用性を示し得る。Fasリガンド遺伝子が、リンパ球起源の細胞において発現されることが公知であるので、天然の遺伝子産物は、免疫機能に関与し得る。それゆえ、それはまた、喘息を含む免疫学的障害、AIDSおよび白血病のような免疫不全疾患、ならびに狼瘡および関節炎を含む種々の自己免疫障害についての薬剤としても使用され得る。
【０５６７】
遺伝子番号144によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、酵母のSEC15-SAP4遺伝子間領域における21.5KDの膜貫通タンパク質と配列相同性を共有する（アクセッション番号1723971を参照のこと）。好ましいポリぺプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０５６８】
【化３９】
2010279364.tif 000040
【０５６９】
【化４０】
2010279364.tif 000041
これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた好ましい。
【０５７０】
この遺伝子は、主として骨巨細胞腫、血管外皮細胞腫、肝臓、肺において発現される。
【０５７１】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプル中の組織または細胞型の示差的同定のための試薬として、ならびに骨巨細胞腫、血管外皮細胞腫、肝臓、肺の癌を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリぺプチドに対するポリぺプチドおよび抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の障害、特に肺および肝臓系の多くの障害について、この遺伝子の発現は、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、この障害を有さない個体由来の健常な組織または体液における発現レベル）に比較して、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、癌性組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織または細胞サンプルにおいて日常的に検出され得る。
【０５７２】
この組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、骨巨細胞腫、血管外皮細胞腫、肝臓、肺の腫瘍のために有用であることを示す。
【０５７３】
遺伝子番号145によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、グルカゴン-69遺伝子と相同性を共有する。これは、この遺伝子が、代謝を調節するにおいて役割を果たすことを示し得る。（アクセッション番号60318を参照のこと。）この遺伝子の１つの実施態様は、以下のアミノ酸配列を含むポリぺプチドフラグメントである：
【０５７４】
【化４１】
2010279364.tif 000042
（配列番号694）。さらなる実施態様は、これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである。
【０５７５】
この遺伝子は、主として脳、腎臓、結腸、および精巣において発現される。
【０５７６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のための試薬として、ならびに脳、腎臓、結腸、精巣の癌を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のために有用である。同様に、これらのポリぺプチドに対するポリぺプチドおよび抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブの提供において有用である。上記の組織または細胞の障害、特に、男性の生殖系、神経系、循環系、および胃腸系の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、その障害を有さない個体由来の健常な組織または体液における発現レベル）と比較して、有意により高いかまたはより低いレベルは、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、癌性および創傷の組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて検出され得る。
【０５７７】
脳、腎臓、結腸、および精巣起源の腫瘍における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、発現が示されている他の腫瘍に加えて、これらの腫瘍の診断および介入に有用であることを示す。タンパク質、ならびにそのタンパク質に対する抗体は、上記の腫瘍および組織についての腫瘍マーカーおよび/または免疫治療用標的としての有用性を示し得る。
【０５７８】
脳、腎臓、結腸、および精巣起源の腫瘍における組織分布は組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、発現が示されている他の腫瘍に加えて、これらの腫瘍の診断および介入のために有用であることを示す。この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、神経変性疾患状態および行動障害（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、精神分裂病、躁病、痴呆、パラノイア、強迫性障害、および恐怖性障害）の検出/処置のために有用であることを示す。さらに、遺伝子または遺伝子産物はまた、胚発生、性的に関連する障害、または心血管系の障害に関連する発達障害の処置および/または検出において役割を果たし得る。
【０５７９】
遺伝子番号146によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、発生の間を通じて遺伝子発現の調節に重要であると考えられる巨大（goliath）タンパク質と配列相同性を共有する。タンパク質は、転写因子として作用し得る。この遺伝子についての１つの実施態様は、以下のアミノ酸配列を含むポリぺプチドフラグメントである：
【０５８０】
【化４２】
2010279364.tif 000043
さらなる実施態様は、これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである（アクセッション番号157535を参照のこと）。さらに、別の実施態様は、これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである：
【０５８１】
【化４３】
2010279364.tif 000044
【０５８２】
【化４４】
2010279364.tif 000045
さらなる実施態様は、これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである。Jurkat細胞株に対して試験された場合、この遺伝子を含有する細胞から除去された上清は、GAS経路を活性化した。従って、この遺伝子は、免疫細胞をJAKS/STATシグナル伝達経路を介して活性化するようである。
【０５８３】
この遺伝子は、主としてマクロファージ、乳房、腎臓において発現され、より低い程度に、滑膜、視床下部、および横紋筋肉腫において発現される。
【０５８４】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリぺプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の示差的同定のための試薬、ならびに精神分裂病および癌を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に免疫および神経系の障害については、標準的遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベル）と比較して、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、癌性組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０５８５】
組織分布およびジンクフィンガータンパク質に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、精神分裂病、腎臓障害、および他の癌の処置に有用であることを示す。マクロファージ、乳房、および腎臓起源における組織分布は、この遺伝子に対応するポリぺプチドポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、発現が示されている他の腫瘍に加えて、これらの組織内の腫瘍の診断および介入に有用であることを示す。タンパク質、およびこのタンパク質に対する抗体は、上記に列挙した腫瘍および組織についての腫瘍マーカーおよび/または免疫治療用標的としての有用性を示し得る。この遺伝子が、リンパ球起源の細胞において発現されるので、天然の遺伝子産物は、免疫機能に関与し得る。従って、これはまた、関節炎、喘息、免疫不全疾患（例えば、AIDSおよび白血病）を含む免疫学的障害のための薬剤としても使用され得る。
【０５８６】
遺伝子番号147によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、平衡化ヌクレオシドトランスポーターであるHNP36タンパク質（遺伝子転写において重要であり、そしてヌクレオシドトランスポーター機構の構成要素として作用すると考えられている）と配列相同性を共有する（アクセッション番号1845345を参照のこと）。この遺伝子の１つの実施態様は、以下のアミノ酸配列を含むポリぺプチドフラグメントである：
【０５８７】
【化４５】
2010279364.tif 000046
さらなる実施態様は、これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである。
【０５８８】
この遺伝子は、主として好酸球および大動脈内皮細胞において発現され、そしてより低い程度に臍帯血管内皮細胞および胸腺において発現される。
【０５８９】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、造血性疾患を含むがこれらに限定されない疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に循環系の障害について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織および細胞型（例えば、脳および神経系の他の組織、血球、および免疫系の細胞および組織、ならびに癌組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０５９０】
組織分布およびHNP36タンパク質に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリぺプチドが、血液新生物および造血性疾患の処置のために有用であることが示されている。
【０５９１】
遺伝子番号148によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、乳ガン細胞株、胸腺支質細胞、および卵巣において主に発現される。
【０５９２】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに疾患および状態（内分泌および乳ガンを含む女性生殖系疾患を含むがこれらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対して指向される抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞、特に、内分泌系の多数の障害について、この遺伝子の有意により高いかまたはより低いレベルの発現は、このような障害を有する個体から採取した、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、この障害を有さない個体由来の健常な組織または体液における発現レベルとの比較で、日常的に検出され得る。
【０５９３】
組織分布によって、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、内分泌障害の診断および処置に有用であることが示唆される。さらに、胸腺、卵巣、および胸部起源の腫瘍における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、発現が示されている他の腫瘍に加えて、これらの腫瘍の診断および介入に有用であることが示唆される。タンパク質およびこのタンパク質に指向する抗体は、上記に列挙した腫瘍および組織についての腫瘍マーカーおよび／または免疫療法標的としての有用性を示し得る。
【０５９４】
遺伝子番号149によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、schizosaccharomyces pombeの２つの保存遺伝子pmt1およびpmt2との相同性を有する。この遺伝子についての１つの実施態様は、以下のアミノ酸配列を含むポリペプチドフラグメントである：
【０５９５】
【化４６】
2010279364.tif 000047
。さらなる実施態様は、これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントでる（受託番号e1216734号を参照のこと）
この遺伝子は、網膜および卵巣において主に発現され、そして、乳ガン細胞、精巣上体および骨肉種においてより少ない程度で発現される。
【０５９６】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに疾患および状態（神経成長障害、ガン、生殖系障害を含むがこれらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対して指向される抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞、特に、神経系及び生殖系の多数の障害について、この遺伝子の有意により高いかまたはより低いレベルの発現は、このような障害を有する個体から採取した、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、この障害を有さない個体由来の健常な組織または体液における発現レベルとの比較で、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、配列番号382において残基Met-1〜Gly-7として示される配列を含むエピトープを含む。
【０５９７】
組織分布によって、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、生殖系障害およびガンの診断および処置に有用であることが示唆される。
【０５９８】
遺伝子番号150によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子についての１つの実施態様は、以下のアミノ酸配列を含むポリペプチドフラグメントである：
【０５９９】
【化４７】
2010279364.tif 000048
（配列番号716）。さらなる実施態様は、これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである。
【０６００】
この遺伝子は、12週齢胚において主に発現され、そして血管周囲細胞腫および前脳皮質においてより少ない程度で発現される。
【０６０１】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに疾患および状態（成長障害および血管周囲細胞腫を含むがこれらに限定されない９）の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対して指向される抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞、特に、循環系および神経系の多数の障害について、この遺伝子の有意により高いかまたはより低いレベルの発現は、このような障害を有する個体から採取した、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、この障害を有さない個体由来の健常な組織または体液における発現レベルとの比較で、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、配列番号383において残基Leu-4〜Lys-11として示される配列を含むエピトープを含む。
【０６０２】
組織分布によって、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、成長障害、血管周囲細胞腫および他の軟組織腫瘍の処置に有用であることが示唆される。
【０６０３】
遺伝子番号151によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、ヒトDNAミスマッチ修復タンパク質PMS3に対して相同性を有することが見い出された。好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０６０４】
【化４９】
2010279364.tif 000049
これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた好ましい（受託番号R95250を参照のこと）。
【０６０５】
この遺伝子は、好中球において主に発現される。
【０６０６】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに疾患および状態（遺伝子不安定性から生じるリンパ腫、免疫不全疾患およびガンを含むがこれらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対して指向される抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞、特に、免疫系の多数の障害について、この遺伝子の有意により高いかまたはより低いレベルの発現は、このような障害を有する個体から採取した、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、この障害を有さない個体由来の健常な組織または体液における発現レベルとの比較で、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、配列番号384において残基Met-1〜Lys-6として示される配列を含むエピトープを含む。
【０６０７】
好中球における組織分布および配列相同性によって、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、ホジキンリンパ腫の診断に有用であることが示唆される。なぜなら、腫瘍塊による高い発現および分泌は、この型の腫瘍の指標であり得るからである。さらに、遺伝子産物は、ガンの免疫療法における標的として使用され得る。遺伝子がリンパ起源の細胞において発現されるので、天然の遺伝子産物は、免疫機能に関与し得る。従って、これはまた、関節炎、喘息、免疫不全疾患(例えば、AIDS）および白血病を含む免疫障害についての薬剤として使用され得る。さらに、公知のDNA修復タンパク質とのその相同性は、遺伝子が遺伝子治療の適用においてガン素因および予防を確立するのに有用であり得ることを示唆する。
【０６０８】
遺伝子番号152によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、好中球において主に発現される。
【０６０９】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに疾患および状態（感染性疾患およびリンパ腫を含むが、それに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対して指向される抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞、特に、免疫系の多数の障害について、この遺伝子の有意により高いかまたはより低いレベルの発現は、このような障害を有する個体から採取した、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、この障害を有さない個体由来の健常な組織または体液における発現レベルとの比較で、日常的に検出され得る。
【０６１０】
組織分布によって、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、炎症および感染性疾患の処置に有用であることが示唆される。
【０６１１】
遺伝子番号153によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子についての１つの実施態様は、以下のアミノ酸配列を含むポリペプチドフラグメントである：
【０６１２】
【化５０】
2010279364.tif 000050
さらなる実施態様は、これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである。
【０６１３】
この遺伝子は、好中球において主に発現される。
【０６１４】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに疾患および状態（感染性疾患および炎症を含むが、それに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対して指向される抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞、特に、免疫系の多数の障害について、この遺伝子の有意により高いかまたはより低いレベルの発現は、このような障害を有する個体から採取した、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、この障害を有さない個体由来の健常な組織または体液における発現レベルとの比較で、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、配列番号386において残基Ser-11〜Pro-17として示される配列を含むエピトープを含む。
【０６１５】
組織分布によって、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが感染性疾患および炎症の処置に有用であることが示唆される。
【０６１６】
遺伝子番号154によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、卵巣、子宮、脂肪組織、脳および肝臓を含む複数の組織において発現される。
【０６１７】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに疾患および状態（子宮ガン、卵巣ガン、脳腫瘍、および肝臓ガンを含むがこれらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対して指向される抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞、特に、女性生殖系の多数の障害について、この遺伝子の有意により高いかまたはより低いレベルの発現は、このような障害を有する個体から採取した、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、この障害を有さない個体由来の健常な組織または体液における発現レベルとの比較で日常的に検出され得る。
【０６１８】
この遺伝子の組織分布によって、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが女性生殖系、肥満、および肝臓疾患（特に、上記組織のガン）の処置における診断または治療用途に有用であることが示唆される。
【０６１９】
遺伝子番号155によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、第３染色体にマッピングされる。従って、これは、第３染色体についての連鎖分析のマーカーとして有用であり得る（受託番号D87452を参照のこと）。
【０６２０】
この遺伝子は、脳、動脈内皮細胞、平滑筋、下垂体、精巣、メラノサイト、脾臓、好中球および胎盤を含む複数の組織において発現する。
【０６２１】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに疾患および状態（免疫不全症を含む免疫障害、脳腫瘍および女性生殖系のガンならびに心臓血管障害（例えば、アテローム性動脈硬化症および発作）を含むが、それに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対して指向される抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞、特に、中枢神経系および免疫系の多数の障害について、この遺伝子の有意により高いかまたはより低いレベルの発現は、このような障害を有する個体から採取した、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、この障害を有さない個体由来の健常な組織または体液における発現レベルとの比較で、日常的に検出され得る。
【０６２２】
組織分布によって、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、精神分裂症、神経変性、新生物形成、脳腫瘍ならびに心臓血管障害および女性生殖器障害（これには上記組織内のガンを含む）を含む神経系における障害を処置するのに有用であることが示唆される。
【０６２３】
遺伝子番号156によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、シトクロームb561をコードするヒト遺伝子と配列相同性を共有する（受託番号P10897を参照のこと）。シトクロームb561は、カテコールアミンおよびアミド化ペプチドを含む分泌ベシクルのサブセットに対して特異的である膜貫通電子輸送タンパク質である。このタンパク質は、ベシクル内酵素ドパミンβヒドロキシラーゼおよびαペプチドアミダーゼとの還元等価物を供給すると考えられる。本発明の好ましいポリペプチドは以下のアミノ酸配列：
【０６２４】
【化５１】
2010279364.tif 000051
；ならびにこの遺伝子の少なくとも20アミノ酸の抗原性フラグメントおよび/または生物学的に活性なフラグメントを含む。これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた好ましい。
【０６２５】
この遺伝子は、アネルギー性T細胞において主に発現される。
【０６２６】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の示差的同定のため、ならびに疾患および状態（免疫系疾患および代謝関連疾患を含むが、それらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチドおよびこれらのポリペプチドに対して指向される抗体は、組織または細胞型の示差的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞、特に、免疫系の多数の障害について、この遺伝子の有意により高いかまたはより低いレベルの発現は、このような障害を有する個体から採取した、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）、または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、もしくは髄液）、または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、この障害を有さない個体由来の健常な組織または体液における発現レベルとの比較で、日常的に検出され得る。
【０６２７】
組織分布によって、この遺伝子に対応するタンパク質産物またはRNAは、免疫系および代謝の疾患または状態（これは、テイサックス病、フェニルケト尿症、ガラクトース血症、種々のポルフィリン症、およびフルラー症候群を含む）の処置または診断について有用であることが示唆される。
【０６２８】
遺伝子番号157によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、哺乳動物発生に重要であるコラーゲンと配列相同性を共有する。この遺伝子はまた、bcl-2との配列相同性も示す（受託番号第P90988を参照のこと）。好ましいポリペプチドフラグメントは、アミノ酸配列：
【０６２９】
【化５２】
2010279364.tif 000052
を含む。このポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチド配列もまた好ましい。
【０６３０】
この遺伝子は、HL-60組織培養細胞において主に発現され、そしてより少ない程度で肝臓、胸部、および子宮に発現される。
【０６３１】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の示差的な同定のため、ならびに疾患および状態（免疫疾患、遺伝性障害（免疫分子のMHCクラスを含む）、ならびに発生障害および生殖障害を含むがこれらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチド、およびこれらのポリペプチドを指向する抗体は、組織または細胞型の示差的な同定のための免疫学的なプローブを提供する点において有用である。上記の組織または細胞（特に、免疫系および生殖系）の多数の障害について、有意により高いかまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取される特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、骨髄液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に関して、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、配列番号390において、残基：Ser-39〜Gly-46、Leu-49〜Ala-62として示される配列を含むエピトープを含む。
【０６３２】
組織分布およびコラーゲンに対する相同性によって、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、遺伝性MHC障害および特定の自己免疫障害（これは、慢性関節リウマチ、狼瘡、強皮症、および皮膚筋炎を含む）ならびに多くの生殖器障害（これは、子宮ガンおよび乳ガンを含む）の診断および処置に有用であることが示唆される。
【０６３３】
遺伝子番号158によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、脳の扁桃領域で主に発現される。
【０６３４】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の示差的な同定のため、ならびに疾患および状態（種々の脳障害、特に、感情および個性をもたらす障害を含むがこれらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様にポリペプチド、およびこれらのポリペプチドを指向する抗体は、組織または細胞型の示差的な同定のための免疫学的なプローブを提供する点において有用である。上記の組織または細胞（特に、脳および中枢神経系）の多数の障害について、有意により高いかまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取される特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、骨髄液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に関して、日常的に検出され得る。
【０６３５】
組織分布によって、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、種々の脳障害（特に、双極性障害、単極性抑鬱、および痴呆の処置および/または診断に有用であることが示唆される。
【０６３６】
遺伝子番号159によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、脳、平滑筋、腎臓、唾液腺、およびT細胞を含む種々の組織および細胞型において発現される。
【０６３７】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の示差的な同定のため、ならびに疾患および状態（種々の器官（脳、平滑筋、腎臓、唾液腺、およびT細胞を含む）のガンならびに心臓血管障害を含むがこれらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチド、およびこれらのポリペプチドを指向する抗体は、組織または細胞型の示差的な同定のための免疫学的なプローブを提供する点において有用である。上記の組織または細胞（特に、中枢神経系、泌尿器系、唾液系、消化器系、および免疫系）の多数の障害について、有意により高いかまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取される特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、骨髄液、または髄液）または、別の組織もしくは細胞サンプルにおいて標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に関して、、日常的に検出され得る。
【０６３８】
脳、平滑筋およびT細胞における組織分布によって、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、種々の神経障害および心臓血管障害（上記の組織内のガンには限定されない）の診断に有用であることが示唆される。さらに、遺伝子産物は、ガンの免疫療法における標的として使用され得る。この遺伝子がリンパ起源の細胞において発現されるので、天然の遺伝子産物は、免疫機能に関与し得る。従って、関節炎、喘息、免疫不全疾患（例えば、AIDS）および白血病を含む免疫障害についての薬剤として使用され得る。
【０６３９】
遺伝子番号160によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、細胞相互作用、細胞外マトリクス形成において重要であると考えられるコラーゲンとの配列相同性を共有し、そして自己免疫障害における同一性決定因子であることが見いだされている。さらに、この遺伝子は、酵母タンパク質Sls1p（これは、液胞成分であり、酵母Yarrowia lipolyticaにおけるタンパク質転移過程に関与している）と配列相同性を示している（受託番号1052828号を参照のこと；J.Biol.Chem.271、11668〜11675（1996）もまた参照のこと）。マウスとは、この同じ領域が、キネシンの重鎖と配列相同性を示す。（受託番号第2062607号を参照のこと。）近年、キネシンの重鎖の抑制が、マウスβ細胞の初代培養物からのインスリン分泌を阻害することが示された。（Endocrinology138（5)、1979-1988（1997）を参照のこと。）さらに、キネシンは、薬物耐性および細胞不死化と関連することが見い出された。（468355を参照のこと）。従って、この遺伝子はまた、遺伝子抑制エレメントとして作用するようである。
【０６４０】
この遺伝子は、大網において主に発現され、そして種々の器官および細胞型（これは、胆嚢、支質骨髄細胞、リンパ節、肝臓、精巣、下垂体および胸腺を含む）においてより低い程度に発現される。
【０６４１】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の示差的な同定のため、ならびに疾患および状態（内分泌系、胃腸系および免疫系（自己免疫障害ならびに種々の器官および細胞型におけるガンを含む）の障害を含むがこれらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチド、およびこれらのポリペプチドを指向する抗体は、組織または細胞型の示差的な同定のための免疫学的なプローブを提供する点において有用である。上記の組織または細胞（特に免疫系および胃腸系）の多数の障害について、有意により高いかまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取される特定の組織（例えば、ガンおよび創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、骨髄液、または髄液）または、別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に関して、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、配列番号393において、残基：Asn-27〜Leu-47、Gln-81〜Lys-88、Asp-93〜Lys-102、Asn-107〜Leu-116、Met-129〜Glu-141、Glu-150〜Asp-157、Lys-176〜Glu-185、Glu-333〜Tyr-349、Cys-393〜Leu-403、Gln-423〜Gly-429として示される配列を含むエピトープを含む。
【０６４２】
種々の内分泌組織および免疫組織における組織分布およびコラーゲン保存モチーフに対するに対する相同性によって、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、慢性関節リウマチ、全身エリテマトーデス、強皮症、皮膚筋炎を含むがこれらに限定されない種々の自己免疫障害の診断について有用であることが示唆される。この遺伝子は、リンパ起源の細胞において発現されるので、天然の遺伝子産物は、免疫機能に関与し得る。したがって、これは、関節炎、喘息、免疫不全疾患（例えば、AIDSを含む）および白血病を含む免疫障害についての薬剤として使用され得る。
【０６４３】
遺伝子番号161によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、メタロプロテイナーゼ２の組織インヒビターと相同性を有する。このようなインヒビターは、コラゲナーゼのようなメタロプロテインの適正な調節に重要である（受託番号P16368号を参照のこと）。さらに、この遺伝子は、第１７染色体にマッピングされる。従って、これは、第１７染色体についての連鎖解析においてマーカーとして使用され得る（受託番号P16368号を参照のこと）。
【０６４４】
この遺伝子は、種々の型のガン（破骨細胞腫、軟骨肉腫、および横紋筋肉腫を含む）において主に発現され、そしていくつかの非悪性組織（滑膜、扁桃、精巣、胎盤を含む）においてより低い程度に発現される。
【０６４５】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の示差的な同定のため、ならびに疾患および状態（種々の型のガン、特に骨および軟骨のガン、ならびに種々の自己免疫障害を含むがこれらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチド、およびこれらのポリペプチドを指向する抗体は、組織または細胞型の示差的な同定のための免疫学的なプローブを提供する点において有用である。上記の組織または細胞（特に骨格筋系）の多数の障害について、有意により高いかまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取される特定の組織（例えば、ガンおよび創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、骨髄液、または髄液）または、別の組織もしくは細胞サンプルにおいて標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に関して、日常的に検出され得る。
【０６４６】
種々のガンにおける組織分布およびコラゲナーゼインヒビターとの配列相同性によって、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、慢性関節リウマチ、狼瘡、強皮症、および皮膚筋炎のような種々の自己免疫障害の検出に有用であることが示唆される。従って、これはまた、関節炎、喘息、免疫不全疾患（例えば、AIDSを含む）および白血病を含む免疫障害についての薬剤として使用され得る。
【０６４７】
遺伝子番号162によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、ミトコンドリアATP6遺伝子と相同である。従って、この遺伝子ファミリーのホモログであるようである（受託番号第X76197号を参照のこと）。
【０６４８】
この遺伝子は、脳組織において主に発現される。
【０６４９】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の示差的な同定のため、ならびに疾患および状態（種々の脳障害（ダウン症候群、抑鬱、精神分裂病、および癲癇を含む）を含むがこれらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、ポリペプチド、およびこれらのポリペプチドを指向する抗体は、組織または細胞型の示差的な同定のための免疫学的なプローブを提供する点において有用である。上記の組織または細胞（特に、中枢神経系）の多数の障害について、有意により高いかまたはより低いレベルでのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取される特定の組織（例えば、ガンおよび創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、骨髄液、または髄液）または、別の組織もしくは細胞サンプルにおいて標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液における発現レベル）に関して、日常的に検出され得る。
【０６５０】
脳組織における組織分布によって、この遺伝子が、脳腫瘍を含むがこれに限定されない種々の神経障害の診断に有用であることが示唆される。さらに、遺伝子産物は、脳における腫瘍の免疫療法における標的として、ならびに肥満およびテイサックス病、フェニルケトン尿症、およびフルラー症候群のような代謝障害の診断について使用され得る。
【０６５１】
遺伝子番号163によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、胎盤、好中球、および毛細血管内皮細胞において発現され、そしてより少ない量では脳、膵臓、脾臓、胸腺、および骨を含む複数の組織において発現される。
【０６５２】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプル中に存在する組織または細胞型の差次的な同定のための、ならびに疾患および状態（好中球減少および他の免疫系の疾患を含むが、これらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的プローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に免疫系）の多数の障害について、標準的な遺伝子レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０６５３】
胎盤における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、種々の女性の生殖障害の診断に有用であることを示唆する。さらに、遺伝子産物は、種々のガンの免疫治療における標的として使用され得る。遺伝子はリンパ系および内分泌起源のいくつかの細胞において発現されるので、天然の遺伝子産物は、それぞれ、免疫機能および代謝調節に関与し得る。それゆえ、それはまた、関節炎、喘息、免疫不全障害（例えば、AIDS）および白血病を含む免疫学的な障害についての薬剤として使用され得る。
【０６５４】
遺伝子番号164によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、好中球、単球、骨髄、および胎児肝臓において発現される。
【０６５５】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的な同定のため、ならびに疾患および状態（免疫系障害（狼瘡などの自己免疫障害を含むが、これらに限定されない）および免疫不全障害を含むが、これらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的なプローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に免疫系）の多数の障害について、標準的な遺伝子レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０６５６】
種々の免疫系組織における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、ホジキンリンパ腫、関節炎、喘息、免疫不全疾患（例えば、AIDS）、および白血病のような種々の免疫学的障害の診断に有用であることを示唆する。
【０６５７】
遺伝子番号165によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子転写産物は、ジストロフィン（これは、 DucheneおよびBecker筋ジストロフィーの両方において欠損性であると考えられる）と配列相同性を共有する。好ましいポリペプチドフラグメントは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０６５８】
【化５３】
2010279364.tif 000053
。これらのポリペプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた好ましい。さらに、この遺伝子マップは第６染色体に対してであり、それゆえ従って、第６染色体についてのリンケージ分析におけるマーカーとして使用され得る（登録番号N62896を参照のこと）。
【０６５９】
この遺伝子は、心臓、腎臓、および脳を含む多くの組織において発現される。
【０６６０】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的な同定のため、ならびに疾患および状態（筋ジストロフィーおよび心血管疾患のような筋骨格の障害を含むが、これらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的なプローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に筋組織）の多数の障害について、標準的な遺伝子レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０６６１】
組織分布およびジストロフィンに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、筋ジストロフィーおよび他の障害の診断および処置に有用であることを示唆する。
【０６６２】
遺伝子番号166によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、ヒト小脳において発現される。
【０６６３】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的な同定のため、ならびに疾患および状態（中枢神経系の障害（アルツハイマー病、パーキンソン病、ALS、および精神病）を含むが、これらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的なプローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に中枢神経系）の多数の障害について、標準的な遺伝子レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープには、配列番号399の残基Pro-20〜Gly-26、Leu-37〜Pro-42、His-57〜Gly-63に示される配列を含むものが含まれる。
【０６６４】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、中枢神経系の障害の処置/診断に有用であり、そして神経変性疾患の進行を遅めることによって神経細胞の生存を保護または増強し得ることを示唆する。
【０６６５】
遺伝子番号167によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子によってコードされる好ましいポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含む：MKLLICGNYLAPSHSESSRRCCLLCFYPLCLEINFGMKVFLSMPFLVLFQSLIQED（配列番号731）。このようなポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた提供される。この遺伝子は、第15染色体に存在すると考えられている。従って、この遺伝子由来のポリヌクレオチドは、第15染色体マーカーとしてリンケージ分析において有用である。
【０６６６】
この遺伝子は、主に、ヒト精巣ガンにおいて発現され、より少ない量で正常なヒト精巣において発現される。
【０６６７】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的な同定のため、ならびに疾患および状態（精巣の疾患（特にガン）および他の生殖障害を含むが、これらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的なプローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に男性の生殖組織）の多数の障害について、標準的な遺伝子レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０６６８】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、ガンを含む精巣の病気の処置/診断に有用であることを示唆する。
【０６６９】
遺伝子番号168によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、胎児肝臓において発現される。
【０６７０】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的な同定のため、ならびに疾患および状態（造血発達に影響を及ぼす状態および代謝性疾患を含むが、これらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的なプローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に肝臓系および胎児造血系）の多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、配列番号401の残基His-7〜Trp-17、Leu-19〜Lys-27、Pro-33〜Gly-44、Lys-68〜Gly-74、Lys-85〜Cys-95に示される配列を含む。
【０６７１】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、肝臓の発達および造血系の疾患の処置/診断に有用であり、造血肝細胞に対する成長文化因子として働くことを示唆する。
【０６７２】
遺伝子番号169によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子によってコードされるポリペプチドは、膜結合レセプターであると考えられている。この細胞外ドメインは、以下のアミノ酸配列から成ると予期される：
【０６７３】
【化５４】
2010279364.tif 000054
。従って、この遺伝子によってコードされる好ましいポリペプチドは、上に示されるような細胞外ドメインを含む。しかし、Ｎ末端からの最初のシステインおよびＣ末端の最初のシステインまでの、細胞外ドメインのいずれかの末端の欠失が、全長細胞外ドメインの生物学的機能を保持することが予期される。なぜなら、システインは、二次構造を分子に提供することを担うと考えられるからである。従って、細胞外ドメインのいずれかの末端（または両方の末端）からの1つ以上のアミノ酸の欠失が意図される。当然、システインを含むさらなる欠失もまた、このようなポリペプチドが免疫学的特性（例えば、惹起する能力および免疫応答）を有することが予期される場合に有用であることが意図される。上記のポリペプチドの全てをコードするポリヌクレオチドが提供される。
【０６７４】
この遺伝子は、主に、ヒト骨巨細胞腫において発現され、より少ない量で海馬および軟骨肉腫において発現される。
【０６７５】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的な同定のため、ならびに疾患および状態（ガン（特に骨および結合組織のガン）を含むが、これらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的なプローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に骨格系）の多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、配列番号402の残基Met-1〜Cys-6、Ala-41〜Tyr-49、Lys-76〜Lys-84に示される配列を含むものを含む。
【０６７６】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、骨および結合組織のガンの診断に有用であり、そして骨または結合組織成長に関与する細胞の成長因子として作用し得ることを示唆する。
【０６７７】
遺伝子番号170によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子によってコードされる好ましいポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含む：
NSVPNLQTLAVLTEAIGPEPAIPRXPREPPVATSTPATPSAGPQPLPTGTVLVPGGPAPPCLGEAWALLLPPCRPSLTSCFWSPRPSPWKETGV（配列番号733）。このようなポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが、本明細書中に提供される。
【０６７８】
この遺伝子は、主に、造血前駆細胞において発現される。
【０６７９】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的な同定のため、ならびに疾患および状態（ガンおよび自己免疫障害を含む血液の疾患を含むが、これらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的なプローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に血液/循環系）の多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、配列番号403の残基Gln-4〜His-10、Pro-25〜His-32に示される配列を含むものを含む。
【０６８０】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、造血細胞の増殖分化に関与する疾患の診断に有用であることを示唆する。
【０６８１】
遺伝子番号171によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子によってコードされる好ましいポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含む：ALQLAFYPDAVEEWLEENVHPSLQRLQXLLQDLSEVSAPP（配列番号734）；および/またはCHPPALAGTLLRTPEGRAHARGLLLEAGGA（配列番号735）。このようなポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた提供される。この遺伝子のタンパク質産物は、メタロチオネインと相同性を共有する。従って、この遺伝子によってコードされるポリペプチドはメタロチオネイン活性を有することが予期される。このような活性は当該分野は公知であり、そして本明細書中の他の場所に記載される。
【０６８２】
この遺伝子は、主に、腎皮質において発現される。
【０６８３】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的な同定のため、ならびに疾患および状態（ガンおよび腎不全を含む腎臓病を含むが、これらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的なプローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に腎臓系）の多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、配列番号404の残基Ser-47〜Gln-52に示される配列を含むものを含む。
【０６８４】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、腎不全を含む腎臓の疾患の処置/診断に有用であることを示唆する。
【０６８５】
遺伝子番号172によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、12週齡の初期ヒトにおいて発現される。
【０６８６】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的な同定のため、ならびに疾患および状態（発達異常を含むが、これらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的なプローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に発達している胚）の多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、配列番号405の残基Gln-31〜Thr-43、Gly-51〜Ser-58、Pro-65〜Pro-72に示される配列を含むものを含む。
【０６８７】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、胎児組織での発達問題の処置/診断に有用であることを示唆する。この遺伝子は、初期（特に造血、心血管、および神経発達）における生命器官発達に関与し得る。
【０６８８】
遺伝子番号173によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の転写産物は、トランスゴルジネットワーク（TGN）の細胞に主に局在することが知られている内在性膜タンパク質であるTGN38と配列相同性を共有する。
【０６８９】
この遺伝子は、主に発達している胚において発現され、より少ない量でリンパ腫、子宮内膜、前立腺（protate）、および結腸を含むガン組織において発現される。
【０６９０】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的な同定のため、ならびに疾患および状態（発達異常およびガンを含むが、これらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的なプローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に発達している胎児）の多数の障害について、標準的な遺伝子レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、配列番号406の残基His-65〜Ser-72、Pro-82〜Gly-91、Pro-98〜Glu-118、Ser-126〜Gly-166、Pro-180〜Asp-188、Tyr-209〜Lys-214、Gln-220〜Leu-228に示される配列を含むものを含む。
【０６９１】
組織分布および内在性膜タンパク質に対する相同性は、ポリヌクレオチドおよびこの遺伝子に対応するポリペプチドが、異常（aberrant）発現が異常性に関連する場合、ガンおよび発達異常の診断に有用であることを示唆する。
【０６９２】
遺伝子番号174によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、sec63の対立遺伝子であるE.coliからのdnaJ心臓ショックタンパク質と配列相同性を共有し、この遺伝子は酵母において小胞体を介して発生期分泌タンパク質の通過に影響を及ぼす。
【０６９３】
この遺伝子は、主に、ホジキンリンパ腫において発現され、より少ない量で精巣において発現される。
【０６９４】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的な同定のため、ならびに疾患および状態（ガンを含むが、これらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的なプローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に免疫系）の多数の障害について、標準的な遺伝子レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、配列番号407の残基Thr-13〜Trp-21、Arg-74〜Asp-81に示される配列を含むものを含む。
【０６９５】
組織分布およびdnaJへの相同性は、ポリヌクレオチドおよびこの遺伝子に対応するポリペプチドがホジキンリンパ腫を含むガンの診断に有用であることを示唆する。
【０６９６】
遺伝子番号175によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、内皮細胞において発現され、より少ない量で骨髄幹細胞において発現される。
【０６９７】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的な同定のため、ならびに疾患および状態（血管形成異常（糖尿病網膜症、筋変性、および動脈硬化およびガンを含む他の疾患を含む）を含む疾患を含むが、これらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的なプローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に血管系）の多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０６９８】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質産物が、血管形成における増加および減少が創傷治癒プロセスの指標および因子である疾患の処置に有用であることを示唆する。
【０６９９】
遺伝子番号176によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、細胞外シグナルに対する、cAMPおよびタンパク質キナーゼCによって媒介される応答を調節することによって細胞（特に乳房）における塩化物伝導性を制御するのに重要であると考えられるMAT8（マウス）と相同性を共有する。
【０７００】
この遺伝子は、主に、羊膜細胞および造血細胞（マクロファージ、好中球、Ｔ細胞、TNF誘導性細胞大動脈内皮を含む）において発現され、より少ない量で精巣、TNF誘導性上皮細胞および平滑筋において発現される。
【０７０１】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的な同定のため、ならびに疾患および状態（Ｔ細胞、マクロファージ、および/または好中球（特にTNFを含む）、またガンによって媒介される免疫応答を含むが、これらに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的なプローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に免疫系）の多数の障害について、標準的な遺伝子レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、配列番号409の残基Thr-19〜Ala-33、Leu-54〜Asp-82、Pro-89〜Ala97、Pro-100〜Lys125、Ser-127〜Phe-135、Gly-164〜Leu-169、Cys-173〜Arg-178に示される配列を含むものを含む。
【０７０２】
組織分布およびmat-8への相同性は、ポリヌクレオチドおよびこの遺伝子に対応するポリペプチドが、TNFのようなサイトカインに対する炎症応答の調節、ならびにこのような炎症の持続および/または重篤度の調節に有用であることを示唆する。ポリヌクレオチドおよびこの遺伝子由来のポリペプチドは、癌の診断および処置に有用であると考えられる。
【０７０３】
遺伝子番号177によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に、内皮細胞において発現される。
【０７０４】
それゆえ、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的な同定のため、ならびに疾患および状態（血管再狭窄を含むが、これに限定されない）の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに指向されるポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的な同定のための免疫学的なプローブを提供することにおいて有用である。上記の組織または細胞（特に血管系）の多数の障害について、標準的な遺伝子発現レベル（すなわち、障害を有さない個体からの健康な組織または体液における発現レベル）と比較した場合、有意により高いか、またはより低いレベルでのこの遺伝子の発現が、特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）もしくは体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）、またはこのような障害を有する個体から採取された別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０７０５】
組織分布は、ポリヌクレオチドおよびこの遺伝子に対応するポリペプチドが、血管形成の後の血管再狭窄などの損傷に対する血管応答に関連する疾患の処置に有用であることを示唆する。
【０７０６】
遺伝子番号178によってコードされるタンパク質の特徴
本発明の1つの実施態様は、以下を包含する：
【０７０７】
【化５５】
2010279364.tif 000055
【０７０８】
【化５６】
2010279364.tif 000056
。
【０７０９】
この遺伝子は、主に精巣上体炎（epidydimus）および子宮内膜腫瘍において、ならびにより低い程度でＴ細胞リンパ腫および大腸ガン由来の細胞系統において発現される。
【０７１０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、精巣および子宮内膜細胞を含む生殖器官の腫瘍を含むがこれらに限定されない、疾患および状態を診断するための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に生殖系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープとしては、残基：Ser-67〜Lys-72、Val-87〜Leu-93、Tyr-128〜Pro-141、Asp-204〜Gly-210として、配列番号411に示される配列を含むものが挙げられる。
【０７１１】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質生成物が、生殖系の子宮内膜または上皮腫瘍の腫瘍を処置するのに有用であることを示す。
【０７１２】
遺伝子番号179によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子によりコードされる好ましいポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０７１３】
【化５７】
2010279364.tif 000057
。
この遺伝子の翻訳産物は、ニューロプシン（neuropsin）（これは脳における細胞外シグナル伝達経路を調節するのに重要であると考えられている新規のセリンプロテアーゼである）と配列相同性を共有する。他のセリンプロテアーゼとの構造的類似性のために、この遺伝子のタンパク質生成物は、当該分野で公知かつ本明細書中の他の場所に記載される方法によりアッセイされ得るセリンプロテアーゼ活性を有することが予想される。
【０７１４】
この遺伝子は主に子宮内膜腫瘍において、ならびにより低い程度で大腸ガン、良性の肥大性前立腺および胸腺において、発現される。
【０７１５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、子宮内膜または大腸のガンおよび良性の前立腺の肥大を含むがこれらに限定されない、疾患および状態を診断するための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に尿生殖体系または生殖系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープとしては、残基：Gly-12〜Ser-22、Pro-34〜Ser-53として、配列番号412に示される配列を含むものが挙げられる。
【０７１６】
組織分布およびセリンプロテアーゼとの相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが子宮内膜または大腸のガンおよび前立腺の肥大のような過剰増殖性障害を診断または処置するのに有用であることを示す。
【０７１７】
遺伝子番号180によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子によってコードされる好ましいポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０７１８】
【化５８】
2010279364.tif 000058
このようなポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた提供される。
【０７１９】
この遺伝子は主に胎児の脳において発現される。
【０７２０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、CNSにおける幹細胞を同定および増殖させることを包含するが、これらに限定されない、疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に神経系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０７２１】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質生成物が中枢神経系における（または中枢神経系の）幹細胞集団を検出および増殖させるために有用であることを示す。
【０７２２】
遺伝子番号181によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は主に初期段階のヒトの脳および間質細胞株において発現される。
【０７２３】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、CNSの発達上の異常を含むがこれらに限定されない、疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に中枢神経系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープとしては、残基：Gln-42〜Gln-47、Gln-54〜Pro-60として、配列番号414に示される配列を含むものが挙げられる。
【０７２４】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質生成物が中枢神経系の発達に役割を果たすことを示す。それゆえ、この遺伝子およびこの産物は、中枢神経系の発達上の異常の診断または処置のために有用である。
【０７２５】
遺伝子番号182によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子によりコードされる好ましいポリペプチドは、以下のアミノ酸配列を含む：
【０７２６】
【化５９】
2010279364.tif 000059
【０７２７】
【化６０】
2010279364.tif 000060
これらのポリペプチドは、種々のTGF-βファミリーメンバーに構造的に類似する。従って、このポリペプチドは細胞の成長および増殖の調節において種々の活性を有することが予想される。
【０７２８】
この遺伝子は、主に骨巨細胞腫、微小血管内皮および骨髄由来細胞株において発現される。
【０７２９】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、特に、幹細胞の異常増殖を包含する血液性疾患を含むがこれらに限定されない、疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に免疫系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープとしては、残基：Ser-33〜Ala-39として、配列番号415に示される配列を含むものが挙げられる。
【０７３０】
組織分布は、この遺伝子のタンパク質生成物が免疫系の前駆体の疾患の処置に有用であることを示す。適用には、前駆細胞のインビボの増殖、前駆細胞のエキソビボ増殖、またはリンパ腫のような循環系の腫瘍の処置が含まれる。
【０７３１】
遺伝子番号183によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は第17染色体にマップされ、それゆえ本発明のポリヌクレオチドは連鎖分析において第17染色体についてのマーカーとして使用され得る。特定の実施態様においては、本発明のポリペプチドは以下の配列を含む：
【０７３２】
【化６１】
2010279364.tif 000061
さらなる特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは以下の配列を含む：
【０７３３】
【化６２】
2010279364.tif 000062
これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明により包含される。
【０７３４】
この遺伝子は、主に胆嚢、精巣および胎児の脳において、そしてより低い程度でいくつかの腫瘍および胎児組織において発現される。
【０７３５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、ガンのような増殖関連疾患を含むがこれらに限定されない、疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に精巣、胆嚢および胎児の脳について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０７３６】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドがガンのような増殖関連疾患の診断および処置に有用であることを示す。
【０７３７】
遺伝子番号184によりコードされるタンパク質の特徴
特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは、以下の配列を含む：SLCCPEGAEGC（配列番号:762）および/またはQLKKTHYDRPCP（配列番号:763）。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明に包含される。
【０７３８】
この遺伝子は、主に間質細胞、扁桃および神経膠芽腫細胞において、およびより低い程度で他のいくつかの組織において発現される。
【０７３９】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、免疫障害および炎症性障害ならびに神経膠芽腫を含むがこれらに限定されない、疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に間質細胞、扁桃および神経膠芽腫について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。さらに、この遺伝子の生成物は膵臓細胞のβ細胞への分化を調節すると考えられる。従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、インシュリン依存性糖尿病および、関連状態（例えば、膵臓低機能症）の処置ならびに予防そして未分化型の膵臓ガンの処置に有用である。好ましいエピトープとしては、残基：Pro-27〜Ala-32として配列番号417に示される配列を含むものが挙げられる。
【０７４０】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫障害および炎症性障害ならびに神経膠芽腫の診断および処置に有用であることを示す。
【０７４１】
遺伝子番号185によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に肝細胞ガンにおいて、ならびにより低い程度で他の組織において発現される。
【０７４２】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、肝臓疾患を含むがこれらに限定されない、疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に肝臓について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープとしては、残基：Gly-32〜Lys-39として配列番号418に示される配列を含むものが挙げられる。
【０７４３】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、肝臓疾患の診断および処置に有用であることを示す。
【０７４４】
遺伝子番号186によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に海馬において、ならびにより低い程度で他の組織において発現される。
【０７４５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、神経障害を含むがこれらに限定されない、疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に海馬について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０７４６】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、神経障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０７４７】
遺伝子番号187によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主に骨ガンおよび海馬において、ならびにより低い程度で骨巨細胞腫および他の組織において発現される。
【０７４８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、骨関連障害および神経疾患を含むがこれらに限定されない、疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に骨、破骨細胞および海馬について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０７４９】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、骨関連障害および神経疾患の診断および処置に有用であることを示す。
【０７５０】
遺伝子番号188によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は第４染色体にマッピングされ、それゆえ、本発明のポリヌクレオチドは第４染色体のためのマーカーとして連鎖分析に使用され得る。
【０７５１】
この遺伝子は、主に海馬、脊髄および視床下部のような神経組織において、ならびにより低い程度で卵巣のような２、３の他の組織において発現される。
【０７５２】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、神経疾患を含むがこれらに限定されない、疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に神経組織について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０７５３】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、神経障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０７５４】
遺伝子番号189によりコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は第10染色体にマッピングされ、それゆえ、本発明のポリヌクレオチドは第10染色体のためのマーカーとして連鎖分析に使用され得る。
【０７５５】
この遺伝子は、主に神経組織および免疫組織において、ならびにより低い程度で皮膚腫瘍、肺などのような、２、３の他の組織において発現される。
【０７５６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、神経および免疫関連障害を含むがこれらに限定されない、疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に神経および免疫関連組織について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープとしては、残基：Pro-19〜Asp-25として配列番号422に示される配列を含むものが挙げられる。
【０７５７】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、神経および免疫関連障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０７５８】
遺伝子番号190によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、前立腺ガンの存在に重要であると考えられるヒト転移性前立腺ガンの同型接合体欠損領域に位置する遺伝子、ヒトN33と配列相同性を共有する。特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは以下の配列を含む：
【０７５９】
【化６３】
2010279364.tif 000063
これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明により包含される。
【０７６０】
この遺伝子は、主に、乳児副腎前立腺細胞株において、ならびにより低い程度で肝臓、平滑筋などのような２、３の他の組織において発現される。
【０７６１】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、前立腺ガンおよび内分泌障害を含むがこれらに限定されない、疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に前立腺および副腎について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープとしては、残基：Pro-34〜Gly-43、Arg-113〜Pro-120として配列番号423に示される配列を含むものが挙げられる。
【０７６２】
組織分布およびN33に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、前立腺ガンおよび内分泌障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０７６３】
遺伝子番号191によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主にＴ細胞において、ならびにより低い程度で胎児肺において発現される。
【０７６４】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、免疫障害を含むがこれらに限定されない、疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に免疫について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープとしては、残基：Trp-3〜Phe-9として配列番号424に示される配列を含むものが挙げられる。
【０７６５】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０７６６】
遺伝子番号192によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は第６染色体にマッピングされ、それゆえ、本発明のポリヌクレオチドは第６染色体のためのマーカーとして連鎖分析に使用され得る。神経活性およびニューロトロフィンは、遺伝子発現を変更することによって、一部でシナプス再構築を誘導する。この遺伝子は、海馬遺伝子によりコードされるグリコシルホスファチジルイノシトール−アンカータンパク質であり、神経活性を所有すると考えられる。この分子は、成体における可塑性に関連する発達中の神経系およびニューロン構造の分裂後期分化ニューロンにおいて発現されると考えられる。この遺伝子のメッセージは神経活性により、ならびに活性調節ニューロトロフィンであるBDNFおよびNT-3により誘導されると考えられている。この遺伝子の産物は、一次胚海馬および皮質培養物において軸索の神経突起（outgrowth）および分枝を刺激し、そして活性誘導神経突起伸長の下流エフェクターとして作用すると考えられている。特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは以下の配列を含む：
【０７６７】
【化６４】
2010279364.tif 000064
このポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明により包含される。
【０７６８】
この遺伝子は、主にヒト胎盤、子宮内膜腫瘍および中枢神経系（CNS）の組織において発現される。
【０７６９】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、生殖障害、ガンおよび神経疾患に関するものを包含するがこれらに限定されない、疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供するのに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に生殖および神経障害について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルと比較して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または別の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープとしては、残基：Asp-47〜Asp-63、His-75〜Tyr-80、Pro-83〜Tyr-89として配列番号425に示される配列が含むものが挙げられる。
【０７７０】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、子宮内膜腫瘍のような生殖障害の診断および処置に有用であることを示す。CNSの組織におけるこの遺伝子の発現およびそのNeuritinに対する強い相同性は、この遺伝子からのタンパク質産物もまた、神経障害の処置および診断に、ならびに（例えば、損傷後の）神経組織の再生に使用され得ることを示唆する。
【０７７１】
遺伝子番号193によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、発生に重要と考えられるテネイシンの配列と相同性を共有する。この遺伝子の翻訳産物は、線維芽細胞増殖因子ファミリーのリガンドであると考えられている。ＦＧＦリガンド活性は、当該分野で公知であり、本明細書中の他のところで開示される公知の方法によってアッセイされ得る。
【０７７２】
この遺伝子は、主として子宮内膜腫瘍および他の型の腫瘍で発現される。
【０７７３】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、ガンを含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特にガン組織について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Gly-29〜Glu-34、Arg-71〜Arg-76、Thr-176〜Cys-182、Gly-184〜Glu-199として配列番号426に示される配列を含むエピトープを含む。
【０７７４】
組織分布およびテネイシンに対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、ガンの診断および処置に有用であることを示す。
【０７７５】
遺伝子番号194によってコードされるタンパク質の特徴
特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは、以下の配列を含む：ＭＮＳＡＡＧＦＳＨＬＤＲＲＥＲＶＬＫＬＧＥＳＦＥＫＱＰＲＣＡＳＴＬＣ（配列番号779）。これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドはまた、本発明に含まれる。
【０７７６】
この遺伝子は、主としてヒト胎児肺および好中球で発現される。
【０７７７】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、肺発生および呼吸障害を含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に呼吸系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０７７８】
胎児肺および好中球における組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、肺および免疫関連疾患（例えば、肺ガン、ウイルス性、真菌性、または細菌性感染（例えば、結核により生じる病変）、炎症（例えば、肺炎）、代謝性病変など）の診断および処置に有用であることを示す。
【０７７９】
遺伝子番号195によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主として胸部リンパ節で発現される。
【０７８０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、免疫障害を含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に免疫系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０７８１】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０７８２】
遺伝子番号196によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、第５番染色体にマップされ、従って本発明のポリヌクレオチドは、第５番染色体についてのマーカーとして連鎖分析に使用され得る。この遺伝子の翻訳産物は、リン酸化およびシグナル伝達プロセスに重要であると考えられるヒトＭ期リンタンパク質４と配列相同性を共有する。特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは、以下の配列を含む：
【０７８３】
【化６５】
2010279364.tif 000065
これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドもまた、本発明に含まれる。
【０７８４】
この遺伝子は、主としてヒト海馬で、およびより少ない程度で、前立腺、ヒト前頭皮質で、発現される。
【０７８５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、生殖系および神経系に関連した障害を含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に生殖系および神経系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０７８６】
組織分布およびヒトＭ期リンタンパク質４との相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、生殖系および神経系の傷害の診断および処置に有用であることを示す。
【０７８７】
遺伝子番号197によってコードされるタンパク質の特徴
特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは、以下の配列を含む：
【０７８８】
【化６６】
2010279364.tif 000066
これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドはまた、本発明に含まれる。
【０７８９】
この遺伝子は、主としてヒト原発性乳ガンで、およびより少ない程度では、ヒト成人脾臓、ホジキンリンパ腫Ｉ型、唾液腺で発現される。
【０７９０】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、ガンおよび免疫障害を含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特にガンおよび免疫系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Ser-126〜Gly-138として配列番号430に示される配列を含むエピトープを含む。
【０７９１】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、ガンおよび免疫障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０７９２】
遺伝子番号198によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主として単球で発現される。
【０７９３】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、血球細胞障害を含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に免疫系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０７９４】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、血球細胞障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０７９５】
遺伝子番号199によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主としてヒト卵巣および滑液で、およびより低い程度で、ヒト８週全胚で発現される。
【０７９６】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、生殖障害および発育障害を含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に生殖系およびに発育系ついて、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０７９７】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、生殖障害および発育障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０７９８】
遺伝子番号200によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は第８番染色体にマップされる。従って、本発明のポリヌクレオチドは、第８番染色体のマーカーとして連鎖分析において使用され得る。この遺伝子の翻訳産物は、コラーゲンプロリンリッチドメインと限られた配列相同性を共有する。
【０７９９】
この遺伝子は、主としてＣＮＳで発現される。
【０８００】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、神経疾患を含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に神経系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Pro-35〜Asp-41として配列番号433に示される配列を含むエピトープを含む。
【０８０１】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、神経性疾患の診断および処置に有用であることを示す。
【０８０２】
遺伝子番号201によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、哺乳動物ヒトヒストンＨ１ａタンパク質と相同性を共有する。この遺伝子の１つの実施態様は、以下のアミノ酸配列を含むポリペプチドフラグメントである：
【０８０３】
【化６７】
2010279364.tif 000067
さらなる実施態様は、これらのポリペプチド（受託番号pir|S24178を参照のこと）フラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントである。
【０８０４】
この遺伝子は、主として好中球で発現される。
【０８０５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、免疫障害を含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に免疫系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０８０６】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫障害の診断および処置に有用であることを示す。この遺伝子はリンパ系起源の細胞で発現するので、天然の遺伝子産物は、きわめて重大な免疫機能に関与し得る。従って、この遺伝子はまた、関節炎、喘息、AIDSのような免疫不全疾患、および白血病を含む免疫障害のための薬剤として使用され得る。
【０８０７】
遺伝子番号202によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主として好中球で発現される。
【０８０８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、免疫障害を含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に免疫系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０８０９】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫障害の診断および処置に有用であることを示す。この遺伝子はリンパ系起源の細胞で発現するので、天然の遺伝子産物は、免疫機能に関与し得る。従って、この遺伝子はまた、関節炎、喘息、AIDSのような免疫不全疾患、および白血病を含む免疫障害のための薬剤として使用され得る。
【０８１０】
遺伝子番号203によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主として好中球で発現される。
【０８１１】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、感染障害、免疫障害およびガンを含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に免疫系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Thr-31〜Lys-36として配列番号436に示される配列を含むエピトープを含む。
【０８１２】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、感染障害、免疫障害およびガンの診断および処置に有用であることを示す。この遺伝子はリンパ系起源の細胞で発現するので、天然の遺伝子産物は、免疫機能に関与し得る。従って、この遺伝子はまた、関節炎、喘息、AIDSのような免疫不全疾患、および白血病を含む免疫障害のための薬剤として使用され得る。タンパク質、ならびにこのタンパク質を指向する抗体は、上記に列挙した腫瘍および組織についての腫瘍マーカーおよび／また免疫治療標的としての有用性を示し得る。
【０８１３】
遺伝子番号204によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、第16番染色体にマップされ、従って本発明のポリヌクレオチドは、第16番染色体についてのマーカーとして連鎖分析に使用され得る。この遺伝子の翻訳産物は、乳酸の代謝に重要であると考えられるラクテートデヒドロゲナーゼと配列相同性を共有する。
【０８１４】
この遺伝子は、主としてヒト扁桃腺で、およびより低い程度で脾臓および好中球で発現される。
【０８１５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、免疫障害、感染障害、およびガンを含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に免疫障害、感染障害、およびガンについて、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Gly-7〜Ser-12として配列番号437に示される配列を含むエピトープを含む。
【０８１６】
組織分布および乳酸デヒドロゲナーゼ遺伝子に対する相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、免疫障害、感染障害、およびガンの診断および処置に有用であることを示す。
【０８１７】
遺伝子番号205によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子の翻訳産物は、脳において発生的に調節される、Gcap1タンパク質との配列相同性を共有する。
【０８１８】
この遺伝子は、主として胎盤および子宮内膜腫瘍で、およびより低い程度でいくつかの他の腫瘍で、発現される。
【０８１９】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、血管形成／脈管形成および腫瘍形成を含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に血管系および腫瘍について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０８２０】
組織分布およびGcap1タンパク質との相同性は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、腫瘍形成の血管系の障害または機能障害の、診断および処置に有用であることを示す。
【０８２１】
遺伝子番号206によってコードされるタンパク質の特徴
特定の実施態様において、本発明のポリペプチドは、以下の配列を含む：
【０８２２】
【化６８】
2010279364.tif 000068
【０８２３】
【化６９】
2010279364.tif 000069
これらのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドはまた、本発明に含まれる。
【０８２４】
この遺伝子は、主として精巣で発現される。
【０８２５】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、雄性の生殖障害および内分泌障害を含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に生殖系および内分泌系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。
【０８２６】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、雄性生殖障害および内分泌障害の診断および処置に有用であることを示す。
【０８２７】
遺伝子番号207によってコードされるタンパク質の特徴
この遺伝子は、主として胎児肺で発現される。
【０８２８】
従って、本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、生物学的サンプルに存在する組織または細胞型の差示的同定のための、ならびに、嚢胞性線維症のような肺疾患を含む（しかしこれらに限定されない）疾患および状態の診断のための試薬として有用である。同様に、これらのポリペプチドに対するポリペプチドおよび抗体は、組織または細胞型の差示的同定のための免疫学的プローブを提供することに有用である。上記の組織または細胞の多くの障害、特に呼吸系について、標準的な遺伝子発現レベル、すなわち、障害を有さない個体からの健常組織または体液中の発現レベルに対して、有意により高いまたはより低いレベルのこの遺伝子の発現は、このような障害を有する個体から採取した特定の組織（例えば、ガン組織および創傷組織）または体液（例えば、血清、血漿、尿、滑液、または髄液）または他の組織もしくは細胞サンプルにおいて、日常的に検出され得る。好ましいエピトープは、残基：Tyr-49〜Cys-54として配列番号440に示される配列を含むエピトープを含む。
【０８２９】
組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、発育中の肺（特に肺が発生する最後の組織である成熟前の幼児）に関連する障害の診断および処置に有用であることを示す。組織分布は、この遺伝子に対応するポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、肺ガンの診断および処置に有用であることを示す。なぜなら、この遺伝子は細胞分裂の調節に関与し得るからであり、特に胎児組織において発現するからである。タンパク質、ならびにこのタンパク質を指向する抗体は、上記に列挙した腫瘍および組織についての腫瘍マーカーおよび免疫治療標的としての有用性を示し得る。
【０８３０】
【化７０】
2010279364.tif 000070
【０８３１】
【化７１】
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【０８３２】
【化７２】
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【０８３３】
【化７３】
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【０８３４】
【化７４】
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【０８３５】
【化７５】
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【０８３６】
【化７６】
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【０８３７】
【化７７】
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【０８３８】
【化７８】
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【０８３９】
【化７９】
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【０８４０】
【化８０】
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【０８４１】
【化８１】
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【０８４２】
【化８２】
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【０８４３】
【化８３】
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【０８４４】
【化８４】
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【０８４５】
【化８５】
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【０８４６】
【化８６】
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【０８４７】
【化８７】
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【０８４８】
【化８８】
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【０８４９】
【化８９】
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【０８５０】
【化９０】
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【０８５１】
【化９１】
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【０８５２】
【化９２】
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【０８５３】
【化９３】
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【０８５４】
【化９４】
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【０８５５】
【化９５】
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【０８５６】
【化９６】
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【０８５７】
【化９７】
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表１は、上記の各「遺伝子番号」に対応する情報を要約する。「ヌクレオチド配列番号X」として同定されるヌクレオチド配列は、表１において同定される「cDNAクローンID」から、およびいくつかの場合において、さらなる関連のDNAクローンから得られる部分的に相同な（「重複する」）配列から構築された。重複する配列は、高い縮重性の単一の連続した配列（通常、各ヌクレオチドの位置で３〜５個の重複する配列）に構築され、配列番号Ｘとして同定される最終的な配列を得た。
【０８５８】
cDNAクローンIDは、その日付に寄託され、そして「ATCC受託番号Ｚおよび日付」において列挙される対応する受託番号が与えられた。寄託物のいくつかは、同じ遺伝子に対応する複数の異なるクローンを含む。「ベクター」は、cDNAクローンIDにおいて含まれるベクターの型をいう。
【０８５９】
「総ヌクレオチド配列」は、「遺伝子番号」によって同定されるコンティグにおけるヌクレオチドの総数をいう。寄託されたクローンは、これらの配列の全てまたはほとんどを含み得、この配列は配列番号Ｘの「クローン配列の５’ヌクレオチド」および「クローン配列の３’ヌクレオチド」として示されるヌクレオチドの位置によって反映される。推定開始コドン（メチオニン）の配列番号Ｘのヌクレオチドの位置は、「開始コドンの５’ヌクレオチド」として同定される。同様に、推定シグナル配列の配列番号Ｘのヌクレオチドの位置は、「シグナルペプチドの第一のアミノ酸の５’ヌクレオチド」として同定される。
【０８６０】
翻訳されたアミノ酸配列は、メチオニンで始まり、「アミノ酸配列番号Ｙ」として同定されるが、他のリーディングフレームもまた、公知の分子生物学技術を使用して容易に翻訳され得る。これらのオルタナティブオープンリーディングフレームによって生成されるポリペプチドは、本発明によって具体的に意図される。
【０８６１】
推定シグナルペプチドの配列番号Ｙの第一および最後のアミノ酸の位置は、「シグナルペプチドの第一のアミノ酸」および「シグナルペプチドの最後のアミノ酸」として同定される。分泌部分の配列番号Ｙの推定される第一アミノ酸の位置は、「分泌タンパク質の推定第一のアミノ酸」として同定される。最後には、オープンリーディングフレームにおける最後のアミノ酸の配列番号Ｙのアミノ酸の位置は、「ORFの最後のアミノ酸」として同定される。
【０８６２】
配列番号Ｘおよび翻訳される配列番号Ｙは、十分に正確であり、そしてそうでなければ、当該分野において周知であるおよび以下でさらに記載される種々の使用に適切である。例えば、配列番号Ｘは、配列番号Ｘにおいて含まれる核酸配列または寄託されたクローンに含まれるcDNAを検出する核酸ハイブリダイゼーションプローブを設計するために有用である。これらのプローブはまた、生物学的サンプル中の核酸分子にハイブリダイズし、それによって本発明の種々の法医学（forensic）の、および診断の方法を可能にする。同様に、配列番号Ｙから同定されるポリぺプチドは、表１において同定されるcDNAクローンによってコードされる分泌タンパク質に特異的に結合する抗体を作製するために使用され得る。
【０８６３】
それにもかかわらず、配列決定反応によって生成されるDNA配列は、配列決定のエラーを含み得る。エラーは、誤って同定されたヌクレオチドとして、または生成されたDNA配列におけるヌクレオチドの挿入または欠失として存在する。誤って挿入されたか、または欠失されたヌクレオチドは、推定アミノ酸配列のリーディングフレームにおいてフレームシフトを引き起こす。これらの場合において、作製されるDNA配列は、実際のDNA配列と99.9%を超えて同一（例えば、1000塩基を超えるオープンリーディングフレームにおける１塩基の挿入または欠失）であり得るにもかかわらず、推定アミノ酸配列は、実際のアミノ酸配列とは異なる。
【０８６４】
従って、ヌクレオチド配列またはアミノ酸配列における正確さを必要とするこれらの適用のために、本発明は、配列番号Ｘとして同定され、作製されたヌクレオチド配列、および配列番号Ｙとして同定され、推定の翻訳されたアミノ酸配列のみではなく、表１において記載されるような、ATCCに寄託された本発明のヒトcDNAを含むプラスミドDNAのサンプルもまた提供する。寄託された各クローンのヌクレオチド配列は、公知の方法に従って寄託されたクローンの配列決定によって容易に決定され得る。次いで、推定アミノ酸配列は、このような寄託物から証明され得る。さらに、特定のクローンによってコードされるタンパク質のアミノ酸配列はまた、ペプチド配列決定によって、または寄託されたヒトcDNAを含む適切な宿主細胞中でタンパク質を発現し、このタンパク質を収集し、そしてその配列を決定することによって、直接的に決定され得る。
【０８６５】
本発明はまた、配列番号Ｘ、配列番号Ｙ、または寄託されたクローンに対応する遺伝子に関する。対応する遺伝子は、本明細書中に開示される配列情報を使用して、公知の方法に従って単離され得る。このような方法は、開示された配列からプローブまたはプライマーを調製する工程、およびゲノム物質の適切な供給源から対応する遺伝子を同定または増幅する工程を包含する。
【０８６６】
本発明においてまた提供されるものは、種相同体である。種相同体は、本明細書中に提供される配列から適切なプローブまたはプライマーを作製し、そして所望の相同体について適切な核酸供給源をスクリーニングすることによって単離および同定され得る。
【０８６７】
本発明のポリぺプチドは、任意の適切な様式で調製され得る。このようなポリぺプチドとしては、単離された天然に存在するポリぺプチド、組換え的に生成されたポリぺプチド、合成的に生成されたポリぺプチド、またはこれらの方法の組合せによって生成されたポリぺプチドが挙げられる。このようなポリぺプチドを調製するための手段は、当該分野において十分に理解される。
【０８６８】
ポリぺプチドは、分泌タンパク質の形態（成熟形態を含む）であり得るか、またはより大きいタンパク質（例えば、融合タンパク質）の部分であり得る（以下を参照のこと）。分泌配列またはリーダー配列、プロ配列、精製を補助する配列（例えば、複数のヒスチジン残基）、または組換え生成の間の安定性のためのさらなる配列を含むさらなるアミノ酸配列を含むことは、しばしば有利である。
【０８６９】
本発明のポリぺプチドは、好ましくは、単離された形態において提供され、および好ましくは実質的に精製される。ポリぺプチド（分泌されるポリぺプチドを含む）の組換え的に生成されたバージョン（version）は、SmithおよびJohnson、Gene 67:31-40（1988）に記載される１工程の方法によって実質的に精製され得る。本発明のポリぺプチドはまた、当該分野において周知である方法における分泌タンパク質に対して惹起される本発明の抗体を使用して、天然のまたは組換えの供給源から精製され得る。
【０８７０】
シグナル配列
タンパク質が、シグナル配列、ならびにその配列についての切断点を有するか否かを予測するための方法が、利用可能である。例えば、McGeoch，Virus Res. 3:271-286（1985）の方法は、短い荷電Ｎ末端荷電領域およびそれに続く完全な（切断されていない）タンパク質の非荷電領域からの情報を使用する。vonHeinje，Nucleic Acids Res．14:4683-4690（1986）の方法は、切断部位の周辺の残基（代表的に-13〜+２残基）からの情報を使用し、ここで、+１は、分泌タンパク質のアミノ末端を示す。これらの方法のぞれぞれについての、公知の哺乳動物分泌タンパク質の切断点を予測する正確さは、75〜80%の範囲にある（vonHeinje、前出）。しかし、２つの方法は、所定のタンパク質について、同じ推定切断点を必ずしも生成するとは限らない。
【０８７１】
本発明の場合において、分泌されるポリぺプチドの推定アミノ酸配列は、SignalPと呼ばれるコンピュータープログラム（HenrikNielsenら、Protein Engineering 10:1-6（1997））によって分析された。このプログラムは、アミノ酸配列に基づいてタンパク質の細胞での位置を予測する。この局在化のコンピューター予測の一部として、McGeochおよびvonHeinjeの方法が援用される。このプログラムによる、本明細書中に記載される分泌タンパク質のアミノ酸配列の分析は、表１において示される結果を提供した。
【０８７２】
しかし、当業者に理解されるように、切断部位は、時折、生物に応じて変化し、そして絶対的な確実性を伴っては予測され得ない。従って、本発明は、配列番号Ｙにおいて示される配列を有する分泌されるポリぺプチドを提供し、これは推定切断点の５残基（すなわち、＋または−５残基）内で始まるＮ末端を有する。同様に、ある場合において、分泌タンパク質からのシグナル配列の切断は、必ずしも均一ではなく、１つ以上の分泌される種を生じることもまた認識される。これらのポリぺプチド、およびこのようなポリぺプチドをコードするポリヌクレオチドは、本発明によって意図される。
【０８７３】
さらに、上述の分析によって同定されるシグナル配列は、天然に存在するシグナル配列を必ずしも予測しないかもしれない。例えば、天然に存在するシグナル配列は、推定シグナル配列からさらに上流にあり得る。しかし、推定シグナル配列は、分泌タンパク質をERに指向し得るようである。これらのポリぺプチド、およびこのようなポリぺプチドをコードするポリヌクレオチドは、本発明によって意図される。
【０８７４】
ポリヌクレオチドおよびポリぺプチド改変体
「改変体」とは、本発明のポリヌクレオチドまたはポリぺプチドとは異なるが、その本質的な特性を保持するポリヌクレオチドまたはポリぺプチドをいう。一般に、改変体は、全体的に密接に類似し、そして、多くの領域において、本発明のポリヌクレオチドまたはポリぺプチドに同一である。
【０８７５】
本発明の参照ヌクレオチド配列に、例えば、少なくとも95%「同一」であるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドによって、ポリヌクレオチドのヌクレオチド配列が、ポリヌクレオチド配列がポリぺプチドをコードする参照ヌクレオチド配列の各100ヌクレオチドあたり５つまでの点変異を含み得ることを除いて、参照配列に対して同一であることが意図される。換言すれば、参照ヌクレオチド配列に対して少なくとも95％同一のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを得るために、参照配列のヌクレオチドの５％までが、別のヌクレオチドで欠失または置換され得るか、または参照配列中の総ヌクレオチドの５％までの多数のヌクレオチドで参照配列中に挿入され得る。問い合わせ配列は、表１に示される配列全体、ORF（オープンリーディングフレーム）、または本明細書中で記載されるように特定される任意のフラグメントであり得る。
【０８７６】
実際問題として、任意の特定の核酸分子またはポリぺプチドが、本発明のヌクレオチド配列に少なくとも90％、95％、96％、97％、98％、または99％同一であるか否かは、公知のコンピュータープログラムを使用して従来的に決定され得る。問い合わせ配列（本発明の配列）と本配列との間の最も良好な全体的な適合性（全体的な配列整列としてもまた参照される）を決定するための好ましい方法は、Brutlagら（Comp．App.Biosci．（1990）6:237-245）のアルゴリズムに基づくFASTDBコンピュータープログラムを使用して決定され得る。配列整列において、問い合わせ配列および本配列は、両方ともにDNA配列である。RNA配列は、UからTに変換することによって比較され得る。この全体的な配列整列の結果は、同一性パーセントで示される。同一性パーセントを算定するためにDNA配列のFASTDB整列において使用される好ましいパラメーターは：Matrix＝Unitary、k-tuple＝４、MismatchPenalty＝１、Joining Penalty＝30、Randomization Group Length＝０、Cutoff Score＝１、GapPenalty＝５、Gap Size Penalty 0.05、Window Size＝500または本ヌクレオチド配列の長さ（どちらかより短い方）である。
【０８７７】
本配列が、5'または3'欠失のために（内部欠失のためではなく）問い合わせ配列より短い場合、手動の補正が結果に対してなされなけらばならない。これは、同一性パーセントを計算する場合に、FASTDBプログラムが本配列の5'および3'切断を考慮しないからである。5'末端または3'末端で切断される本配列について、問い合わせ配列に対して、同一性パーセントは、問い合わせ配列の総塩基のパーセントとして一致/整列されない本配列の5'および3'である問い合わせ配列の塩基の数を計算することによって補正される。ヌクレオチドが一致/整列されるか否かは、FASTDB配列整列の結果によって決定される。次いで、このパーセントは、同一性パーセントから差し引かれ、特定のパラメーターを用いて上記のFASTDBプログラムによって算定され、最終的な同一性パーセントのスコアに到達する。この補正されたスコアが、本発明の目的に使用されるものである。FASTDB整列によって示されるように、問い合わせ配列と一致/整列されいていない、本配列の5'および3'塩基の外側の塩基のみが、同一性パーセントのスコアを手動で調整する目的で算定される。
【０８７８】
例えば、90塩基の本配列は、同一性パーセントを決定するために100塩基問い合わせ配列に整列される。本配列、および従って、FASTDB整列の5'末端で生じる欠失は、5'末端で最初の10塩基の一致/整列を示さない。10個の不対合塩基は、配列の10％（一致していない5'および3'末端での塩基の数/問い合わせ配列の塩基の総数）を表し、そのため10％は、FASTDBプログラムによって算定される同一性パーセントのスコアから差し引かれる。残りの90塩基が完全に一致する場合は、最終的な同一性パーセントは90％である。別の例では、90塩基の本配列は、100塩基の問い合わせ配列と比較される。この場合、欠失は、内部欠失であり、その結果、問い合わせ配列と一致/整列しない本配列の5'または3'に塩基がない。この場合、FASTDBによって算定される同一性パーセントは手動で補正されない。再び、問い合わせ配列と一致/整列しない本配列の5'または3'の塩基のみが手動で補正される。他の手動の補正は、本発明の目的ではなされない。
【０８７９】
本発明の問い合わせアミノ酸配列に、例えば、少なくとも95％「同一」であるアミノ酸配列を有するポリぺプチドにより、本ポリペプチドのアミノ酸配列は、本ポリぺプチド配列が、問い合わせアミノ酸配列の各100個のアミノ酸あたり５つまでのアミノ酸の変更を含み得ることを除いて、問い合わせ配列に同一であることが意図される。換言すれば、問い合わせアミノ酸配列に少なくとも95％同一であるアミノ酸配列を有するポリぺプチドを得るために、本配列におけるアミノ酸残基の５％までが、挿入、欠失、（消えない（indels））または別のアミノ酸で置換され得る。参照配列のこれらの変化は、参照アミノ酸配列のアミノ末端もしくはカルボキシ末端部位で生じ得るか、またはそれらの末端部位の間のどこにでも生じ得、参照配列中の残基間で個々に、または参照配列内の１つ以上の連続する塩基においてのいずれかで、散在される。
【０８８０】
実際問題として、任意の特定のポリぺプチドが、例えば、表１に示されるアミノ酸配列に対して、または寄託されたDNAクローンによってコードされるアミノ酸配列に対して、少なくとも90％、95％、96％、97％、98％、または99％同一であるか否かは、従来的に、公知のコンピュータープログラムを使用して決定され得る。問い合わせ配列（本発明の配列）と本配列との間での最良の全体的な一致（全体的配列整列としても参照される）を決定するための好ましい方法は、Brutlagら（Comp.App. Biosci. (1990) 6:237-245）のアルゴリズムに基づくFASTDBコンピュータープログラムを使用して決定され得る。配列整列において、問い合わせおよび本配列は、両方ともヌクレオチド配列であるかまたは両方ともアミノ酸配列であるかのいずれかである。上記全体的配列整列の結果は、同一性パーセントで示される。FASTDBアミノ酸整列に用いられる好ましいパラメーターは：Matrix＝PAM0、k-tuple＝２、Mismatch Penalty＝１、Joining Penalty＝20、Randomization Group Length＝０、CutoffScore＝１、Window Size = 配列の長さ、Gap Penalty＝５、Gap Size Penalty = 0.05、Window Size＝500または本アミノ酸配列の長さ（どちらかより短い方）である。
【０８８１】
本配列が、Ｎ末端またはＣ末端欠失により（内部の欠失のためではなく）問い合わせ配列よりも短い場合、手動の補正が結果に対してなされなけらばならない。これは、FASTDBプログラムが、全体的な同一性パーセントを算定する場合に、本配列のＮ末端およびＣ末端切断を考慮しないからである。Ｎ末端およびＣ末端で切断される本配列について、問い合わせ配列に対して、同一性パーセントは、問い合わせ配列の総塩基のパーセントとして、対応する本残基と一致/整列しない本配列のＮ末端およびＣ末端側である問い合わせ配列の残基の数を計算することによって補正される。残基が一致/整列されているか否かは、FASTDB配列整列の結果によって決定される。次いで、このパーセントは、同一性パーセントから差し引かれ、上記のFASTDBプログラムによって特定のパラメーターを使用して計算され、最終的な同一性パーセントのスコアに到達する。この最終的な同一性パーセントのスコアは、本発明の目的で使用されるものである。問い合わせ配列と一致/整列していない本配列のＮ末端およびＣ末端側の残基のみが、同一性パーセントのスコアを手動で調整する目的で考慮される。すなわち、本配列の最も遠いＮ末端およびＣ末端残基の外側の問い合わせ残基位置のみである。
【０８８２】
例えば、90アミノ酸残基の本配列は、同一性パーセントを決定するために100残基の問い合わせ配列と整列される。欠失が本配列のＮ末端で生じ、そしてそれゆえFASTDB整列は、N末端での最初の10残基の一致/整列を示さない。10個の不対合残基は、配列の10％（一致していないＮ末端およびＣ末端での残基の数/問い合わせ配列中の残基の総数）を表し、その結果FASTDBプログラムによって計算される同一性パーセントのスコアから10％が差し引かれる。残りの90残基が完全に一致した場合、最終的な同一性パーセントは90％である。別の例において、90残基の本配列が、100残基の問い合わせ配列と比較される。この場合、欠失は、内部欠失であり、そのため問い合わせ配列と一致/整列しない本配列のＮ末端またはＣ末端の残基は存在しない。この場合、FASTDBによって算定される同一性パーセントは、手動で補正されない。再び、FASTDB整列において示される、問い合わせ配列と一致/整列しない本配列のＮ末端およびＣ末端の外の残基位置のみが手動で補正される。他の手動の補正は、本発明の目的のためにはなされない。
【０８８３】
改変体は、コード領域、非コード領域、またはその両方における変化を含み得る。特に好ましいものは、サイレントな置換、付加、または欠失を生成するが、コードされるポリぺプチドの特性または活性を変化しない変化を含むポリヌクレオチド改変体である。遺伝コードの縮重に起因するサイレントな置換によって生成されるヌクレオチド改変体は、好ましい。さらに、任意の組合せにおいて５〜10、１〜５、もしくは１〜２アミノ酸が置換、欠失、または付加される改変体もまた、好ましい。ポリヌクレオチド改変体は、多様な理由（例えば、特定の宿主についてのコドン発現を至適化する（ヒトmRNAにおけるコドンを、E.coliのような細菌宿主によって好ましいコドンに変化する））ために、生成され得る。
【０８８４】
天然に存在する改変体は、「対立遺伝子改変体」と呼ばれ、そして生物の染色体上の所定の遺伝子座を占有する遺伝子のいくつかの代替の形態のうちの１つをいう。（Genes II、Lewin，B.,編 John Wiley & Sons，New York（1985））。これらの対立遺伝子改変体は、ポリヌクレオチドレベルおよび／またはポリぺプチドレベルのいずれかで変化し得る。あるいは、天然に存在しない改変体は、変異誘発技術によってまたは直接的な合成によって生成され得る。
【０８８５】
タンパク質工学および組換えDNA技術の公知の方法を使用して、改変体は、本発明のポリぺプチドの特性を改善または変化するために作製され得る。例えば、１つ以上のアミノ酸は、生物学的機能の実質的な欠損を伴わずに、分泌タンパク質のＮ末端またはＣ末端から欠失され得る。Ronら、J．Biol．Chem．268:2984-2988（1993）の著者らは、３、８、または27個のアミノ末端のアミノ酸残基を欠失した後であってもヘパリン結合活性を有する改変体KGFタンパク質を報告している。同様に、インターフェロンγは、このタンパク質のカルボキシ末端から８〜10個のアミノ酸残基を欠失した後、10倍までのより高い活性を示している（Dobeliら、J．Biotechnology7:199-216（1988））。
【０８８６】
さらに、豊富な証拠は、改変体が、しばしば、天然に存在するタンパク質の生物学的活性に類似する活性を保持することを実証する。例えば、Gayleおよび共同研究者ら（J．Biol．Chem 268:22105-22111（1993））は、ヒトサイトカインIL-1aの広範囲にわたる変異分析を行った。彼らは、ランダムな変異誘発を使用して、分子の全長にわたって改変体当たり平均2.5アミノ酸の変化になる、3,500個を超える個々のIL-1a変異体を作製した。複数の変異が、全ての可能なアミノ酸の位置で試験された。この研究者らは、「分子の大部分は、結合活性または生物学的活性のいずれかに対してほとんど影響を伴わないで変化され得る」ことを見出した。（要約を参照のこと）。実際、試験された3,500個を超えるヌクレオチド配列のうち、わずか23個の独特なアミノ酸配列が、野生型と活性が有意に異なるタンパク質を生成した。
【０８８７】
さらに、ポリぺプチドのＮ末端またはＣ末端からの１つ以上のアミノ酸の欠失が、１つ以上の生物学的機能の改変または欠失を生じたとしても、他の生物学的活性はなお保持され得る。例えば、分泌される形態を認識する抗体を誘導および／または結合する、欠失改変体の能力は、分泌される形態の残基の過半数未満が、Ｎ末端またはＣ末端から除去される場合に保持されるようである。タンパク質のＮ末端またはＣ末端残基を欠損する特定のポリぺプチドが、このような免疫原性活性を保持するか否かは、本明細書中に記載されおよびそうでなければ当該分野において公知の日常的な方法によって容易に決定され得る。
【０８８８】
従って、本発明はさらに、実質的な生物学的活性を示すポリぺプチド改変体を含む。このような改変体としては、活性に対する影響をほとんど有さないように、当該分野において公知の一般的な法則に従って選択される、欠失、挿入、逆位、反復、および置換が挙げられる。例えば、表現型的にサイレントなアミノ酸置換を作製する方法に関する指針は、Bowie，J.U.ら、Science 247:1306-1310(1990)において提供され、ここで、著者らは変化に対するアミノ酸配列の寛容を研究するための２つの主要なストラテジーがあることを指摘する。
【０８８９】
第１のストラテジーは、進化の過程の間の天然の選別によるアミノ酸置換の寛容を利用する。異なる種におけるアミノ酸配列を比較して、保存されるアミノ酸が同定され得る。これらの保存されるアミノ酸は、タンパク質の機能について重要であるようである。対照的に、置換が天然の選別によって寛容されたアミノ酸の位置は、これらの位置がタンパク質の機能に重要ではないことを示す。従って、アミノ酸置換を寛容する位置は改変され得るが、なおタンパク質の生物学的活性を維持する。
【０８９０】
第２のストラテジーは、タンパク質機能に重要な領域を同定するために、クローン化された遺伝子の特定の位置でアミノ酸変化を導入するための遺伝子工学を使用する。例えば、部位特異的変異誘発またはアラニンスキャニング変異誘発（分子中の各残基で一のアラニン変異の導入）が、使用され得る。（CunninghamおよびWells，Science 244:1081-1085（1989））。次いで、得られた変異分子は生物学的活性について試験され得る。
【０８９１】
著者らが言及するように、これらの２つのストラテジーは、タンパク質がアミノ酸置換に驚くほど寛容であることを明らかにした。著者らはさらに、どのアミノ酸変化が、タンパク質中の特定のアミノ酸位置で許容されるようであるかを示す。例えば、最も埋もれている（タンパク質の三次構造内の）アミノ酸残基は、非極性側鎖を必要とするが、表面側鎖の特徴は、一般にほとんど保存されない。さらに、寛容される保存的なアミノ酸置換は、脂肪族または疎水性アミノ酸のAla、Val、Leu、およびIleの置換；水酸基残基のSerおよびThrの置換；酸性残基のAspおよびGluの置換；アミド残基のAsnおよびGlnの置換、塩基性残基のLys、Arg、およびHisの置換；芳香族残基のPhe、Tyr、およびTrpの置換、ならびに小さなサイズのアミノ酸のAla、Ser、Thr、Met、およびGlyの置換を含む。
【０８９２】
保存的なアミノ酸置換以外に、本発明の改変体は、（ｉ）１つ以上の非保存的なアミノ酸残基の置換、ここでは置換されるアミノ酸残基は、遺伝コードによってコードされるアミノ酸残基であってもよくもしくはそうでなくてもよい、または（ii）置換基を有する１つ以上のアミノ酸残基での置換、または（iii）別の化合物（例えば、ポリぺプチドの安定性および／もしくは可溶性を増加するための化合物（例えば、ポリエチレングリコール））との成熟ポリぺプチドの融合、または（iv）さらなるアミノ酸（例えば、IgGFc融合領域ペプチド、またはリーダーもしくは分泌配列、または精製を容易にする配列）とのポリぺプチドの融合を含む。このような改変体ポリぺプチドは、本明細書中の教示から、当業者の範囲内であることが考えられる。
【０８９３】
例えば、他の荷電されたアミノ酸または中性のアミノ酸を用いる荷電されたアミノ酸のアミノ酸置換を含むポリぺプチド改変体は、改善された特性（例えば、より少ない凝集）を伴うタンパク質を生成し得る。薬学的処方物の凝集は、凝集体の免疫原活性に起因して、活性を減少し、かつクリアランスを増加する。（Pinckardら、Clin．Exp．Immunol．2:331-340（1967）；Robbinsら、Diabetes 36：838-845（1987）；Clelandら、Crit．Rev．TherapeuticDrug Carrier Systems 10：307-377（1993））。
【０８９４】
ポリヌクレオチドおよびポリぺプチドフラグメント
本発明において、「ポリヌクレオチドフラグメント」とは、寄託されたクローンに含まれるか、または配列番号Ｘにおいて示される核酸配列を有する短いポリヌクレオチドをいう。短いヌクレオチドフラグメントは、好ましくは、少なくとも約15ヌクレオチド、およびより好ましくは少なくとも約20ヌクレオチド、なおより好ましくは少なくとも約30ヌクレオチド、およびさらにより好ましくは少なくとも約40ヌクレオチドの長さである。「少なくとも20ヌクレオチドの長さ」のフラグメントは、例えば、寄託されたクローンに含まれるcDNA配列または配列番号Ｘにおいて示されるヌクレオチド配列からの20個以上の連続した塩基を含むことが意図される。これらのヌクレオチドフラグメントは、本明細書中で考察されるように、診断プローブおよびプライマーとして有用である。もちろん、より大きなフラグメント（例えば、50、150、500、600、2000ヌクレオチド）が好ましい。
【０８９５】
さらに、本発明のポリヌクレオチドフラグメントの代表的な例は、例えば、配列番号Ｘまたは寄託されたクローンにおいて含まれるcDNAのヌクレオチド番号のおよそ１〜50、51〜100、101〜150、151〜200、201〜250、251〜300、301〜350、351〜400、401〜450、451〜500、501〜550、551〜600、651〜700、701〜750、751〜800、800〜850、851〜900、901〜950、951〜1000、1001〜1050、1051〜1100、1101〜1150、1151〜1200、1201〜1250、1251〜1300、1301〜1350、1351〜1400、1401〜1450、1451〜1500、1501〜1550、1551〜1600、1601〜1650、1651〜1700、1701〜1750、1751〜1800、1801〜1850、1851〜1900、1901〜1950、1951〜2000、または2001〜最後からの配列を有するフラグメントを含む。この情況において、「およそ」は、具体的に列挙される範囲、いずれかの末端もしくは両方の末端で、いくつかの（５、４、３、２、もしくは１個）ヌクレオチドだけより大きなまたはより小さな範囲を含む。好ましくは、これらのフラグメントは、生物学的活性を有するポリぺプチドをコードする。より好ましくは、これらのポリヌクレオチドは、本明細書で議論されるようなプローブまたはプライマーとして使用され得る。
【０８９６】
本発明において、「ポリぺプチドフラグメント」とは、配列番号Ｙにおいて含まれ、または寄託されたクローンに含まれるcDNAによってコードされる、短いアミノ酸配列をいう。タンパク質フラグメントは、「自立構造」であり得るか、またはフラグメントが部分または領域を形成するより大きなポリぺプチド内に、最も好ましくは単一の連続した領域として、含まれ得る。本発明のポリぺプチドフラグメントの代表的な例は、例えばコード領域のアミノ酸番号の約１〜20、21〜40、41〜60、61〜80、81〜100、102〜120、121〜140、141〜160、または161〜最後からのフラグメントを含む。さらに、ポリぺプチドフラグメントは、約20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、または150アミノ酸の長さであり得る。この情況において、「約」は、具体的に列挙される範囲、いずれかの末端または両方の末端で、いくつかの（５、４、３、２、または１個）アミノ酸長だけより大きなまたはより小さな範囲を含む。
【０８９７】
好ましいポリぺプチドフラグメントは、分泌タンパク質および成熟形態を含む。さらに好ましいポリぺプチドフラグメントは、アミノ末端もしくはカルボキシ末端、またはその両方から、連続した一連の欠失された残基を有する、分泌タンパク質または成熟形態を含む。例えば、１〜60個の範囲の任意の数のアミノ酸は、分泌ポリペプチドまたは成熟形態のいずれかのアミノ末端から欠失され得る。同様に、１〜30個の範囲の任意数のアミノ酸は、分泌タンパク質または成熟形態のカルボキシ末端から欠失され得る。さらに、上述のアミノ末端およびカルボキシ末端の欠失の任意の組み合わせが好ましい。同様に、これらのポリぺプチドフラグメントをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、好ましい。
【０８９８】
特に、本発明のポリぺプチドのN末端欠失は、一般式m-pによって記載され得、ここでpは、ポリぺプチドのアミノ酸の総数であり、そしてmは、２から(p-1)までの整数であり、そしてここでこれらの整数の両方（mおよびp）は、配列番号Yにおいて同定されるアミノ酸残基の位置に対応する。
【０８９９】
さらに、本発明のポリぺプチドのC末端欠失はまた、一般式1-nによって記載され得、ここで、nは、２から(p-1)までの整数であり、そして再びここでこれらの整数（nおよびp）は、配列番号Yにおいて同定されるアミノ酸残基の位置に対応する。
【０９００】
本発明はまた、アミノ末端およびカルボキシル末端の両方から1つ以上のアミノ酸が欠失したポリぺプチドを提供し、これは一般的に配列番号Yの残基m-nを有するとして記載され得、ここでmおよびnは、上記の整数である。
【０９０１】
構造ドメインまたは機能ドメイン（例えば、αヘリックスおよびαヘリックス形成領域、βシートおよびβシート形成領域、ターンおよびターン形成領域、らせんおよびらせん形成領域、親水性領域、疎水性領域、α両親媒性領域、β両親媒性領域、可変領域、表面形成領域、基質結合領域、および抗原性指標の高い領域を含むフラグメント）によって特徴付けられるポリぺプチドおよびポリヌクレオチドのフラグメントもまた、好ましい。保存されるドメイン内にある配列番号Ｙのポリぺプチドフラグメントは、本発明によって具体的に意図される。さらに、これらのドメインをコードするポリヌクレオチドフラグメントもまた、意図される。
【０９０２】
他の好ましいフラグメントは、生物学的に活性なフラグメントである。生物学的に活性なフラグメントは、本発明のポリぺプチドの活性に類似の活性を示すが、必ずしも同一である必要はないフラグメントである。フラグメントの生物学活性は、改善された所望の活性、または減少された所望されない活性を含み得る。
【０９０３】
エピトープおよび抗体
本発明において、「エピトープ」とは、動物において、特にヒトにおいて、抗原性または免疫原性活性を有するポリぺプチドフラグメントをいう。本発明の好ましい実施態様は、エピトープを含むポリぺプチドフラグメント、およびこのフラグメントをコードするポリヌクレオチドに関する。抗体が結合し得るタンパク質分子の領域は、「抗原性エピトープ」と定義される。対照的に、「免疫原性エピトープ」は、抗体応答を誘発するタンパク質の一部と定義される。（例えば、Geysenら、Proc．Natl．Acad．Sci．USA 81：3998-4002（1983）を参照のこと）。
【０９０４】
エピトープとして機能するフラグメントは任意の従来の手段によって産生され得る(例えば、Houghten.R.A.,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:5131-5135 (1985)、米国特許第4,631,211号でさらに記載される、を参照のこと)。
【０９０５】
本発明において、抗原性エピトープは、好ましくは少なくとも７つ、より好ましくは少なくとも９つ、そして最も好ましくは約15〜約30アミノ酸の間の配列を含む。抗原性エピトープは、エピトープに特異的に結合する抗体（モノクローナル抗体を含む）を惹起するために有用である（例えば、Wilsonら、Cell37:767-778 (1984); Sutcliffe, J.G.ら、Science 219: 660-666 (1983)を参照のこと）。
【０９０６】
同様に、免疫原性エピトープは、当該分野で周知の方法に従って抗体を誘導するために使用され得る(例えば、Sutcliffeら、前出; Wilsonら、前出； Chow, M.ら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA82: 910-914;およびBittle, F. J.ら、J. GenVirol. 66:2347-2354 (1985)を参照のこと)。好ましい免疫原性エピトープは分泌タンパク質を含む。免疫原性エピトープは、動物系（例えば、ウサギまたはマウス）にアルブミンのようなキャリアタンパク質とともに提示され得るか、または免疫原性エピトープが十分に長い場合（少なくとも、約25アミノ酸）には、キャリアなしで提示され得る。しかし、わずか８〜10アミノ酸を含む免疫原性エピトープは、変性ポリペプチドにおいて（例えば、ウエスタンブロッティングにおいて）、少なくとも線状エピトープに結合し得る抗体を惹起するのに十分であることが示されている。
【０９０７】
本明細書中で使用される用語「抗体」(Ab)または「モノクローナル抗体」(Mab)は、タンパク質に特異的に結合し得るインタクトな分子および抗体フラグメント（例えば、FabおよびF(ab')2フラグメント）を含むことを意味する。FabおよびF(ab')2フラグメントは、インタクトな抗体のFcフラグメントを欠損し、循環からより迅速に排除され、そしてインタクトな抗体よりも少ない非特異的組織結合を有し得る。（Wahlら、J. Nucl. Med. 24: 316-325 (1983)）。従って、これらのフラグメントは、FABの産物または他の免疫グロブリン発現ライブラリーと同様に好ましい。さらに、本発明の抗体はキメラ抗体、単鎖抗体、およびヒト化抗体を含む。
【０９０８】
融合タンパク質
本発明の任意のポリペプチドは、融合タンパク質を産生するために使用され得る。例えば、本発明のポリペプチドは、第２のタンパク質と融合される場合、抗原性タグとして使用され得る。本発明のポリペプチドに対して惹起される抗体は、ポリペプチドに結合することによって、第２のタンパク質を間接的に検出するために使用され得る。さらに、分泌されるタンパク質は、細胞位置をトラフィッキングシグナルに基づいて標的化するので、本発明のポリペプチドは、他のタンパク質に一旦融合されれば標的化分子として使用され得る。
【０９０９】
本発明のポリペプチドと融合され得るドメインの例は、異種シグナル配列のみならず、また他の異種機能性領域をも含む。融合は、必ずしも直接的である必要はないが、リンカー配列を介して起こり得る。
【０９１０】
さらに、融合タンパク質はまた、本発明のポリペプチドの特徴を改良するために操作され得る。例えば、さらなるアミノ酸、特に荷電アミノ酸の領域が、宿主細胞からの精製または続く取り扱いおよび貯蔵の間の安定性および持続性を改良するためにポリペプチドのＮ末端へ付加され得る。また、ペプチド部分は精製を容易にするためにポリペプチドへ付加され得る。このような領域はポリペプチドの最終調製の前に除去され得る。ポリペプチドの取り扱いを容易にするためのペプチド部分の付加は当該分野でよく知られる日常的な技術である。
【０９１１】
さらに、本発明のポリペプチド（フラグメント、そして特にエピトープを含む）は、免疫グロブリン(IgG)の定常ドメインの一部と組み合わせられ得、キメラポリぺプチドを生じる。これらの融合タンパク質は精製を容易にし、そしてインビボにおける増大した半減期を示す。１つの報告された例は、ヒトCD4ポリペプチドの最初の２つのドメイン、および哺乳動物の免疫グロブリンの重鎖または軽鎖の定常領域の種々のドメインからなるキメラタンパク質を記載している(EPA 394,827; Trauneckerら、Nature 331: 84-86(1988))。ジスルフィド連結二量体構造（IgGに起因する）を有する融合タンパク質もまた、単量体分泌タンパク質またはタンパク質フラグメント単独よりも、他の分子に結合しそして中和するのにさらに効率的であり得る(Fountoulakisら、J.Biochem. 270: 3958-3964 (1995))。
【０９１２】
同様に、EP-A-O 464 533(カナダ国対応特許第2045869号)は、別のヒトタンパク質またはその部分とともに免疫グロブリン分子の定常領域の種々の部分を含む融合タンパク質を開示する。多くの場合、融合タンパク質のFc部分は、治療および診断において有益であり、従って、例えば、改良された薬物動態学的な特性を生じ得る(EP-A0232 262)。あるいは、融合タンパク質が発現され、検出され、そして精製された後に、Fc部分を欠失させることが望ましい。例えば、融合タンパク質が免疫化のための抗原として使用される場合、Fc部分は、治療および診断を妨害し得る。例えば、薬物の発見において、hIL-5のようなヒトタンパク質は、hIL-5のアンタゴニストを同定するための高処理能力スクリーニングアッセイの目的のためにFc部分と融合されてきた(D.Bennettら、J. Molecular Recognition 8:52-58 (1995); K. Johansonら、J. Biol. Chem.270: 9459-9471 (1995)を参照のこと)。
【０９１３】
さらに、本発明のポリペプチドはマーカー配列（例えば、融合されたポリペプチドの精製を容易にするペプチド）に融合され得る。好ましい実施態様において、マーカーアミノ酸配列は、とりわけヘキサ−ヒスチジンペプチド（例えば、pQEベクター（QIAGEN,Inc., 9259 Eton Avenue, Chatsworth, CA, 91311）において提供されるタグ）であり、これらの多くのマーカーアミノ酸配列が市販されている。例えば、Gentzら、Proc.Natl. Acad. Sci. USA 86: 821-824(1989)に記載されるように、ヘキサ−ヒスチジンは、融合タンパク質の都合の良い精製を提供する。精製のために有用な別のペプチドタグ、「HAタグ」は、インフルエンザ赤血球凝集素タンパク質由来のエピトープに対応する(Wilsonら、Cell 37: 767 (1984))。
【０９１４】
従って、任意のこれら上記の融合物は、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドを使用して操作され得る。
【０９１５】
ベクター、宿主細胞、およびタンパク質産生
本発明はまた、本発明のポリヌクレオチドを含むベクター、宿主細胞、および組換え技術によるポリペプチドの産生に関連する。例えば、ベクターは、ファージベクター、プラスミドベクター、ウイルスベクター、またはレトロウイルスベクターであり得る。レトロウイルスベクターは、複製コンピテント、または複製欠損であり得る。後者の場合、一般的にウイルス増殖は、補完性(complementing)宿主細胞にのみ生じる。
【０９１６】
ポリヌクレオチドは、宿主における増殖のために選択マーカーを含むベクターに連結され得る。一般に、プラスミドベクターは、リン酸カルシウム沈澱のような沈澱物、または荷電脂質との複合体において導入される。ベクターがウイルスである場合、ウィルスベクターは、適切なパッケージング細胞株を使用してインビトロでパッケージングされ、次いで宿主細胞に形質導入され得る。
【０９１７】
ポリヌクレオチド挿入物は、適切なプロモーター（いくつか挙げれば、例えば、ファージλPLプロモーター、E.coli lacプロモーター、trpプロモーター、phoAプロモーターおよびtacプロモーター、SV40初期プロモーターおよびSV40後期プロモーター、ならびにレトロウイルスLTRのプロモーター）に作動可能に連結されるべきである。他の適切なプロモーターは当業者に公知である。発現構築物はさらに、転写開始、転写終結のための部位、および転写領域において、翻訳のためのリボソーム結合部位を含む。構築物によって発現される転写物のコード部分は、好ましくは、始めに翻訳開始コドン、および翻訳されるためのポリペプチドの末端に適切に位置される終結コドン(UAA、UGAまたはUAG)を含む。
【０９１８】
示されるように、発現ベクターは、好ましくは少なくとも１つの選択マーカーを含む。このようなマーカーは、真核細胞培養のためのジヒドロ葉酸レダクターゼ、G418、またはネオマイシン耐性遺伝子、ならびにE.coliおよび他の細菌において培養するためのテトラサイクリン、カナマイシンまたはアンピシリン耐性遺伝子を含む。適切な宿主の代表的な例は、細菌細胞（例えば、E.coli、StreptomycesおよびSalmonellatyphimurium細胞)；酵母細胞のような真菌細胞；Drosophilia S2およびSpodoptera Sf9細胞のような昆虫細胞；CHO細胞、COS細胞、293細胞、およびBowesメラノーマ細胞のような動物細胞；ならびに植物細胞を含むが、これらに限定されない。上記の宿主細胞のための適切な培養培地および条件は、当該分野で公知である。
【０９１９】
細菌における使用のために好ましいベクターの中に、pQE70、pQE60およびpQE-9（QIAGEN,Inc.から入手可能）；pBluescriptベクター、Phagescriptベクター、pNH8A、pNH16a、pNH18A、pNH46A（StratageneCloning Systems, Inc.から入手可能）；およびptrc99a、pKK223-3、pKK233-3、pDR540、pRIT5（PharmaciaBiotech, Inc.から入手可能）を含む。好ましい真核生物ベクターの中には、pWLNEO、pSV2CAT、pOG44、pXT1およびpSG（Stratageneから入手可能）；およびpSVK3、pBPV、pMSGおよびpSVL（Pharmaciaから入手可能）が含まれる。他の適切なベクターは当業者に容易に明らかである。
【０９２０】
宿主細胞への構築物の導入は、リン酸カルシウムトランスフェクション、DEAE-デキストラン媒介トランスフェクション、カチオン性脂質媒介トランスフェクション、エレクトロポレーション、形質導入、感染、または他の方法によってもたらされ得る。このような方法は、Davisら、BasicMethods In Molecular Biology (1986)のような多くの標準的研究室マニュアルに記載される。本発明のポリペプチドは、実際、組換えベクターを欠損する宿主細胞によって発現され得ることが特に意図される。
【０９２１】
本発明のポリペプチドは、硫酸アンモニウム沈澱またはエタノール沈澱、酸抽出、陰イオンまたは陽イオン交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィーおよびレクチンクロマトグラフィーを含む周知の方法によって組換え細胞培養物から回収され得、そして精製され得る。最も好ましくは、高速液体クロマトグラフィー（「HPLC」）が精製のために使用される。
【０９２２】
本発明のポリペプチド、および好ましくは分泌形態はまた、以下から回収され得る：直接単離されるかまたは培養されるかにかかわらず、体液、組織および細胞を含む天然の供給源から精製された産物；化学的合成手順の産物；ならびに、例えば、細菌細胞、酵母細胞、高等植物細胞、昆虫細胞、および哺乳動物細胞を含む、原核生物宿主または真核生物宿主から組換え技術によって産生された産物。組換え産生手順に使用される宿主に依存して、本発明のポリペプチドはグリコシル化され得るかまたは非グリコシル化され得る。さらに、本発明のポリペプチドはまた、宿主媒介プロセスの結果として、いくつかの場合において、最初の改変されたメチオニン残基を含み得る。従って、一般に、翻訳開始コドンによってコードされるＮ末端メチオニンが、すべての真核生物細胞における翻訳後の任意のタンパク質から高い効率で除去されることは当該分野において周知である。ほとんどのタンパク質においてＮ末端メチオニンもまた、ほとんどの原核生物において効果的に除去されるが、いくつかのタンパク質について、この原核生物除去プロセスは、Ｎ末端メチオニンが共有結合するアミノ酸の性質に依存して、非効率的である。
【０９２３】
ポリヌクレオチドの使用
本明細書中で同定された各々のポリヌクレオチドは、試薬として多数の方法において使用され得る。以下の説明は例示的であるとみなされるべきであり、そして公知の技術を利用する。
【０９２４】
本発明のポリヌクレオチドは、染色体同定のために有用である。実際の配列データ（反復多型性）に基づく染色体マーキング試薬で、現在利用可能であるのはわずかであるため、新しい染色体マーカーを同定する必要性が存在するままである。本発明の各々のポリヌクレオチドは、染色体マーカーとして使用され得る。
【０９２５】
簡単に言うと、配列は、配列番号Xで示される配列からPCRプライマー（好ましくは15〜25bp）を調製することによって染色体にマッピングされ得る。プライマーが、ゲノムDNA中の１つより多くの予測されたエキソンにまたがらないように、プライマーは、コンピューター分析を使用して選択され得る。次いで、これらのプライマーは、個々のヒト染色体を含む体細胞ハイブリッドのPCRスクリーニングのために使用される。配列番号Xに対応するヒト遺伝子を含むそれらのハイブリッドのみが、増幅したフラグメントを産生する。
【０９２６】
同様に、体細胞ハイブリッドは、特定の染色体に対してポリヌクレオチドをPCRマッピングする迅速な方法を提供する。単一のサーマルサイクラーを使用して1日あたり３つ以上のクローンが割り当てられ得る。さらに、ポリヌクレオチドの準局在化（sublocalization）は、特定の染色体フラグメントのパネルで達成され得る。使用され得る他の遺伝子マッピング戦略は、インサイチュハイブリダイゼーション、標識フローソート(labeledflow sorted)染色体でのプレスクリーニング、および染色体特異的cDNAライブラリーを構築するためのハイブリダイゼーションによる前選択を含む。
【０９２７】
ポリヌクレオチドの正確な染色体配置はまた、中期染色体スプレッド（spread）の蛍光インサイチュハイブリダイゼーション(FISH)を使用して達成され得る。この技術は500または600塩基ほどの短さのポリヌクレオチドを使用する；しかし2,000〜4,000bpのポリヌクレオチドが好ましい。この技術の総説に関しては、Vermaら、「HumanChromosomes: a Manual of Basic Techniques」, Pergamon Press, New York (1988)を参照のこと。
【０９２８】
染色体マッピングについては、ポリヌクレオチドは、個々に（単一染色体またはその染色体上の単一部位をマークするために）またはパネルで（複数部位および/または複数染色体をマークするために）使用され得る。好ましいポリヌクレオチドは、cDNAの非コード領域に対応する。なぜなら、コード配列は、遺伝子ファミリー内により保存される傾向があり、従って、染色体マッピングの間の交叉ハイブリダイゼーションの機会が増加するからである。
【０９２９】
一旦、ポリヌクレオチドが正確な染色体位置にマップされると、ポリヌクレオチドの物理的位置は、連鎖分析において使用され得る。連鎖分析は、染色体位置と特定の疾患の提示との間の同時遺伝(coinheritance)を確立する。(疾患マッピングデータは、例えば、V. McKusick, MendelianInheritance in Man（Johns Hopkins University Welch Medical Libraryを通してオンラインで利用可能である）において見い出される)。１メガベースマッピング解像度および20kbあたり１遺伝子と仮定すると、疾患と関連する染色体領域に正確に配置されるcDNAは、50〜500の潜在的な原因遺伝子の１つであり得る。
【０９３０】
従って、一旦、同時遺伝が確立されると、罹患個体と非罹患個体との間でのポリヌクレオチドおよび対応する遺伝子における差異が試験され得る。まず、染色体中の可視構造改変（例えば、欠損または転位）は染色体スプレッドにおいて、またはPCRによって試験される。構造的改変が存在しない場合、点変異の存在が確認される。何人かのまたは全ての罹患された個体で観察されたが、正常な個体では観察されなかった変異は、変異が疾患を引き起こし得ることを示す。しかし、いくつかの正常な個体由来のポリペプチドおよび対応する遺伝子の完全な配列決定は、多型性を変異と区別するために要求される。新しい多型性が同定される場合、この多型ポリペプチドはさらなる連鎖分析のために使用され得る。
【０９３１】
さらに、非羅患個体と比較した羅患個体の遺伝子の増加または減少した発現が、本発明のポリヌクレオチドを使用して評価され得る。任意のこれらの改変（改変された発現、染色体再配置、または変異）は、診断マーカーまたは予後マーカーとして使用され得る。
【０９３２】
前記に加えて、ポリヌクレオチドは、トリプルヘリックス形成またはアンチセンスDNAもしくはRNAによって遺伝子発現を制御するために使用され得る。両方の方法は、DNAまたはRNAへのポリヌクレオチドの結合に依存する。これらの技術に関して、好ましいポリヌクレオチドは通常、20〜40塩基長であり、そして転写に関与する遺伝子領域(トリプルヘリックスLeeら、Nucl.Acids Res.6:3073 (1979); Cooneyら、Science 241: 456 (1988);およびDervanら、Science251: 1360 (1991)を参照のこと)またはmRNA自体(アンチセンス-Okano, J. Neurochem. 56:560 (1991);Oligodeoxy-nucleotides as Antisense Inhibitors of Gene Expression, CRC Press,Boca Raton, FL (1988))のいずれかに相補的である。トリプルヘリックス形成は、最適にはDNAからのRNA転写を遮断するが、アンチセンスRNAハイブリダイゼーションは、ポリペプチドへのmRNA分子の翻訳を阻止する。両方の技術は、モデル系において効果的であり、そして本明細書に開示される情報は、疾患を処置するための試みにおいて、アンチセンスまたはトリプルヘリックスポリヌクレオチドを設計するために使用され得る。
【０９３３】
本発明のポリヌクレオチドはまた、遺伝子治療において有用である。遺伝子治療の１つの目標は、遺伝子欠損を修正する試みにおいて、欠損遺伝子を有する生物へ正常遺伝子を挿入することである。本発明に開示されるポリヌクレオチドは、高度に正確な様式でこのような遺伝子欠損を標的とする手段を提供する。別の目標は、宿主ゲノム中には存在しなかった新しい遺伝子を挿入することであり、それによって宿主細胞中に新しい形質を生成する。
【０９３４】
ポリヌクレオチドはまた、微小な生物学的サンプルから個体を同定するために有用である。例えば、米国軍は、その職員を同定するために制限フラグメント長の多型性（RFLP）の使用を考慮している。この技術において、個体のゲノムDNAは１つ以上の制限酵素で消化され、そして職員を同定するため固有なバンドを生じるためのサザンブロットについてプローブされる。この方法は、「ドッグタグ」（これは、欠損され、スイッチされ、または盗まれ、ポジティブな同定を困難にし得る）の現在の限界に苦しまない。本発明のポリヌクレオチドは、RFLPのためのさらなるDNAマーカーとして使用され得る。
【０９３５】
本発明のポリヌクレオチドはまた、個体のゲノムの選択された部分の実際の塩基ごとのDNA配列を決定することによって、RFLPのための代替として使用され得る。これらの配列は、このような選択されたDNA（これは、次いで配列決定され得る）を増幅しそして単離するためにPCRプライマーを調製するために使用され得る。各個体が固有のセットのDNA配列を有するので、この技術を使用して、個体が同定され得る。一旦、固有のIDデータベースが個体について確立されると、個体が生存していようとまたは死亡していようとにかかわらず、個体のポジティブ同定が、極めて小さな組織サンプルから作製され得る。
【０９３６】
法医学生物学もまた、本明細書に開示されるようなDNAに基づく同定技術を使用して利益を得る。組織（例えば、髪または皮膚）、または体液（例えば、血液、唾液、精液など）のような非常に小さな生物学的サンプルから得られたDNA配列は、PCRを使用して増幅され得る。ある先行技術において、DQaクラスIIHLA遺伝子のような多型性遺伝子座から増幅された遺伝子配列は、個体を同定するための法医学生物学において使用される。(Erlich, H., PCRTechnology, Freeman and Co. (1992))。一旦、これらの特異的多型性遺伝子座が増幅されると、これらは１つ以上の制限酵素で消化される。これは、DQaクラスIIHLA遺伝子に対応するDNAでプローブされたサザンブロットについてのバンドの同定するセットを生じる。同様に、本発明のポリヌクレオチドは、法医学的目的のための多型性マーカーとして使用され得る。
【０９３７】
また、特定の組織の供給源を同定し得る試薬についての必要性が存在する。例えば、未知の起源の組織を提供される場合、法医学においてこのような必要性が生じる。適切な試薬は、例えば、本発明の配列から調製される特定の組織に特異的なDNAプローブまたはプライマーを含み得る。このような試薬のパネルは、種および/または器官型によって組織を同定し得る。同様の様式で、これらの試薬は、夾雑物について組織培養物をスクリーニングするために使用され得る。
【０９３８】
少なくとも、本発明のポリヌクレオチドは、サザンゲルでの分子量マーカーとして、特定の細胞型における特定のmRNAの存在に関する診断プローブとして、新規なポリヌクレオチドを発見するプロセスでの公知の配列を「差し引き」するためのプローブとして、「遺伝子チップ」または他の支持体に付着させるためのオリゴマーを選択および作製するため、DNA免疫技術を用いて抗DNA抗体を惹起させるため、および免疫応答を誘発する抗原として、使用され得る。
【０９３９】
ポリペプチドの使用
本明細書中に同定される各ポリペプチドは、多くの方法に使用され得る。以下の説明は、例示としてみなされるべきであり、そして公知の技術を使用する。
【０９４０】
本発明のポリペプチドは、抗体に基づいた技術を使用して生物学的サンプル中のタンパク質レベルをアッセイするために使用され得る。例えば、組織におけるタンパク質発現は、古典的な免疫組織化学的方法を用いて研究され得る(Jalkanen, M.ら、 J. Cell. Biol. 101:976-985(1985); Jalkanen, M.ら、J.Cell. Biol. 105:3087-3096(1987))。タンパク質遺伝子発現を検出するのに有用である、抗体に基づいた他の方法には、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)およびラジオイムノアッセイ(RIA)のようなイムノアッセイが含まれる。適切な抗体アッセイの標識は、当該技術分野で公知であり、そして例えば、グルコースオキシダーゼのような酵素標識、ならびにヨウ素(125I、121I)、炭素(14C)、硫黄(35S)、トリチウム(3H)、インジウム(112In)、およびテクネチウム(99mTc)のような放射性同位体、ならびにフルオレセインおよびローダミンのような蛍光標識、ならびにビオチンが挙げられる。
【０９４１】
生物学的サンプル中の分泌タンパク質レベルをアッセイすることに加えて、タンパク質はまた、画像化によりインビボで検出され得る。タンパク質をインビボで画像化するための抗体の標識またはマーカーとしては、Ｘ線ラジオグラフィー、NMRまたはESRにより検出可能なものが挙げられる。Ｘ線ラジオグラフィーについては、適切な標識は、検出可能な放射線を発するが、被験体に対して明白には有害ではないバリウムまたはセシウムのような放射性同位体を含む。NMRおよびESRに適切なマーカーには、例えば重水素のような検出可能な特徴的なスピンを有するものが含まれ、これは、関連したハイブリドーマのための栄養素を標識することにより抗体に取り込まれ得る。
【０９４２】
放射性同位体(例えば、131I、112In、99mTc)、放射線不透過性物資、または核磁気共鳴により検出可能な物質のような適切な検出可能な画像化部分で標識された、タンパク質特異的抗体または抗体フラグメントは、哺乳動物に(例えば、非経口的、皮下、または腹腔内に)導入される。被験体のサイズおよび用いられる画像化システムは、診断画像を生成するために必要な画像化部分の量を決定することが当該分野で理解される。放射性同位体部分の場合には、ヒト被験体について、注射される放射能の量は、通常、99mTcの約５〜20ミリキュリーの範囲である。次いで、標識された抗体または抗体フラグメントは、特定のタンパク質を含む細胞の位置に優先的に蓄積される。インビボ腫瘍画像化は、S.W.Burchielら、「Immunopharmacokinetics of Radiolabeled Antibodies and TheirFragments」(Tumor Imaging：The Radiochemical Detection of Cancerの第13章、S.W.BurchielおよびB.A. Rhodes編、Masson Publishing Inc.(1982)）に記載される。
【０９４３】
従って、本発明は、障害の診断方法を提供し、この方法は、（ａ）個体の細胞または体液中の本発明のポリペプチドの発現をアッセイする工程；（ｂ）この遺伝子発現レベルを標準の遺伝子発現レベルと比較する工程を包含し、これによって、標準的な発現レベルと比較して、アッセイされたポリペプチドの遺伝子発現レベルの増加または減少が、障害の指標になる。
【０９４４】
さらに、本発明のポリペプチドを用いて疾患を処置し得る。例えば、患者は、ポリペプチド(例えば、インスリン)の非存在またはレベルの減少を元に戻すこと、異なるポリペプチド(例えば、ヘモグロビンＢに対するヘモグロビンＳ)の非存在またはレベルの減少を補充すること、ポリペプチド(例えば、ガン遺伝子)の活性を阻害すること、ポリペプチドの活性を(例えば、レセプターに結合することによって)活性化すること、遊離リガンド(例えば、炎症を低減させる際に用いられる可溶性TNFレセプター)を膜結合レセプターと競合させることによって膜結合レセプターの活性を減少させること、または所望の応答(例えば、血管の増殖)をもたらすことに取り組む際に、本発明のポリペプチドが投与され得る。
【０９４５】
同様に、本発明のポリペプチドに指向される抗体を用いてもまた、疾患を処置し得る。例えば、本発明のポリペプチドに指向される抗体の投与によって、ポリペプチドに結合して、そしてポリペプチドの過剰産生を低減し得る。同様に、抗体の投与によって、例えば、膜に結合したポリペプチド(レセプター)へ結合することにより、ポリペプチドを活性化し得る。
【０９４６】
少なくとも本発明のポリペプチドは、当業者に周知の方法を用いるSDS-PAGEゲルまたは分子ふるいゲル濾過カラムの分子量マーカーとして使用され得る。ポリペプチドを用いてもまた、抗体を惹起し得、次いで、この抗体を使用して、宿主細胞の形質転換を評価する方法として、組換え細胞からのタンパク質発現を測定する。さらに、本発明のポリペプチドを使用して、以下の生物学的活性を試験し得る。
【０９４７】
生物学的活性
本発明のポリヌクレオチドおよびポリペプチドをアッセイに用いて、１つ以上の生物学的活性について試験し得る。これらのポリヌクレオチドおよびポリペプチドが、特定のアッセイにおいて確かに活性を示すならば、これらの分子は、生物学的活性に関連した疾患に関与し得る可能性が高い。従って、このポリヌクレオチドおよびポリペプチドを用いて、関連する疾患を処置し得る。
【０９４８】
免疫活性
本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、免疫細胞の増殖、分化、または移動（走化性）の活性化もしくは阻害によって、免疫系の不全または障害を処置するに有用であり得る。免疫細胞は、造血と称されるプロセス、すなわち、多能性幹細胞から骨髄性細胞(血小板、赤血球、好中球、およびマクロファージ)およびリンパ系(ＢおよびＴリンパ球) 細胞を産生するプロセスを介して発生する。これらの免疫不全または障害の病因は、遺伝性、体細胞性（例えば、ガンまたはいくつかの自己免疫障害）、後天性(例えば、化学治療または毒素による)、または感染性であり得る。さらに、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、特定の免疫系疾患または障害のマーカーまたは検出因子として使用され得る。
【０９４９】
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、造血細胞の不全または障害を処置または検出するに有用であり得る。本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドを使用して、特定の(または多くの)型の造血細胞の減少に関連する障害を処置するための取り組みにおいて、多能性幹細胞を含む造血細胞の分化および増殖を増加させ得る。免疫学的な不全症候群の例には、以下が挙げられるがそれらに限定されない：血液タンパク質障害(例えば、無ガンマグロブリン血症、低ガンマグロブリン血症)、毛細血管拡張性運動失調、分類不能型免疫不全、ディ・ジョージ症候群、HIV感染、HTLV-BLV感染、白血球接着不全症候群、リンパ球減少、食細胞殺菌機能不全、重症複合型免疫不全(SCID)、ヴィスコット−オールドリッチ障害、貧血、血小板減少症、または血色素尿。
【０９５０】
さらに、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドはまた、止血活性(出血を停止する)または血栓崩壊活性(血餅の形成)を調節するために使用され得る。例えば、止血または血栓崩壊活性を増加させることによって、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、血液凝固障害(例えば、無フィブリノーゲン血症、因子欠乏)、血液血小板障害(例えば、血小板減少症)、または外傷、手術もしくは他の原因から生じる創傷を処置するために使用され得る。あるいは、止血活性または血栓崩壊活性を減少させ得る、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドを用いて、凝固を阻害または溶解し得る。これらの分子は、心臓発作(梗塞)、発作、または瘢痕の処置に重要であり得る。
【０９５１】
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドはまた、自己免疫障害を処置または検出するのに有用であり得る。多くの自己免疫障害は、免疫細胞によって、自己を外来物質として不適切に認識することからもたらされる。この不適切な認識は、宿主組織の破壊を導く免疫応答を生じる。それゆえ、免疫応答、特にＴ細胞の増殖、分化、または走化性を阻害する本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドの投与は、自己免疫障害を予防するのに有効な治療であり得る。
【０９５２】
本発明によって処置または検出され得る自己免疫障害の例としては、以下が挙げられるが、それらに限定されない：アディソン病、溶血性貧血、抗リン脂質症候群、慢性関節リウマチ、皮膚炎、アレルギー性脳脊髄炎、糸球体腎炎、グッドパスチャー症候群、グレーヴズ病、多発性硬化症、重症筋無力症、神経炎、結膜炎、水疱性類天疱瘡、天疱瘡、多発性内分泌腺症、紫斑、ライター病、スティッフマン症候群、自己免疫性甲状腺炎、全身性エリテマトーデス、自己免疫性肺炎症、ギヤンバレー症候群、インスリン依存性糖尿病、および自己免疫炎症性眼病。
【０９５３】
同様に、例えば、喘息(特に、アレルギー性喘息)または他の呼吸問題のようなアレルギー性反応および状態はまた、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドにより処置され得る。さらに、これらの分子を用いてアナフィラキシー、抗原性分子に対する過敏症、または血液型不適合性を処置し得る。
【０９５４】
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドはまた、器官拒絶または対宿主性移植片病(GVHD)を処置および/または予防するために用いられ得る。器官拒絶は、宿主免疫細胞が免疫応答を介して移植された組織を破壊することにより生じる。同様に、免疫応答はまた、GVHDに関与しているが、この場合、外来の移植された免疫細胞は宿主組織を破壊する。免疫応答、特にＴ細胞の増殖、分化、または走化性を阻害する本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドの投与は、器官拒絶またはGVHDを予防するのに有効な治療であり得る。
【０９５５】
同様に、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドはまた、炎症を調節するために用いられ得る。例えば、このポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、炎症性応答に関与する細胞の増殖および分化を阻害し得る。これらの分子は、以下を含む炎症状態(急性および慢性の両方の状態)を処置するために使用され得る：感染に関連した炎症(例えば、敗血症性ショック、敗血症、または全身性炎症応答症候群(SIRS))、虚血性再灌流傷害、内毒素死亡、関節炎、補体媒介性超急性拒絶、腎炎、サイトカインまたはケモカイン誘導性肺傷害、炎症性腸疾患、クローン病、またはサイトカイン(例えば、TNFまたはIL-1)の過剰産生からもたらされる状態。
【０９５６】
過剰増殖性障害
ポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、新生物を含む過剰増殖性障害を処置または検出するために使用され得る。本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、直接的相互作用または間接的相互作用を介して障害の増殖を阻害し得る。あるいは、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、過剰増殖性障害を阻害し得る他の細胞を増殖させ得る。
【０９５７】
例えば、免疫応答を増加させることによって、特に過剰増殖性障害の抗原性の質を上げることによって、またはＴ細胞の増殖、分化、もしくは移動によって、過剰増殖性障害は処置され得る。この免疫応答は、存在する免疫応答を増強させるかまたは新たな免疫応答を開始させるかのいずれかによって上昇され得る。あるいは、免疫応答の減少はまた、化学療法剤のような過剰増殖性障害を処置する方法であり得る。
【０９５８】
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドにより処置されるかまたは検出され得る過剰増殖性障害の例には、以下に位置する新生物が含まれるがこれらに限定されない：腹部、骨、乳房、消化器系、肝臓、膵臓、腹膜、内分泌腺(副腎、副甲状腺、下垂体、精巣、卵巣、胸腺、甲状腺)、眼、頭部および頸部、神経(中枢および末梢)、リンパ系、骨盤、皮膚、軟組織、脾臓、胸部、ならびに泌尿生殖器。
【０９５９】
同様に、他の過剰増殖性障害もまた、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドにより処置または検出され得る。このような過剰増殖性障害の例には、以下が挙げられるがこれらに限定されない：高ガンマグロブリン血症、リンパ球増殖性(lymphoproliferative)障害、パラプロテイン血症、紫斑病、サルコイドーシス、セザリー症候群、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、ゴシェ病、組織球増殖症、および任意のその他の過剰増殖性疾患、加えて上記に列挙した器官系に位置する新生物。
【０９６０】
感染性疾患
本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、感染因子を処置または検出するために用いられ得る。例えば、免疫応答を上昇させることによって、特にＢおよび/またはＴ細胞の増殖および分化を増加させることによって、感染性疾患が処置され得る。免疫応答は、存在する免疫応答を増強させるか、または新たな免疫応答を開始させるかのいずれかにより上昇され得る。あるいは、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドはまた、必ずしも免疫応答を誘発することなく、感染因子を直接阻害し得る。
【０９６１】
ウイルスは、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドにより処置または検出され得る疾患または症状を引き起こし得る感染因子の一例である。ウイルスの例としては、以下のDNAおよびRNAウイルス科が挙げられるがこれらに限定されない：アルボウイルス、アデノウイルス科、アレナウイルス科、アルテリウイルス、ビルナウイルス科、ブニヤウイルス科、カリチウイルス科、サルコウイルス科(Circoviridae)、コロナウイルス科、フラビウイルス科、ヘパドナウイルス科(肝炎)、ヘルペスウイルス科(例えば、サイトメガロウイルス、単純ヘルペス、帯状疱疹)、モノネガウイルス(Mononegavirus)(例えば、パラミクソウイルス科、モルビリウイルス、ラブドウイルス科)、オルソミクソウイルス科(例えば、インフルエンザ)、パポバウイルス科、パルボウイルス科、ピコルナウイルス科、ポックスウイルス科(例えば、痘瘡またはワクシニア)、レオウイルス科(例えば、ロタウイルス)、レトロウイルス科(HTLV-I、HTLV-II、レンチウイルス)、およびトガウイルス科(例えば、ルビウイルス属)。これらの科内に入るウイルスは、以下を含むがこれらに限定されない種々の疾患または症状を引き起こし得る：関節炎、細気管支炎（bronchiollitis）、脳炎、眼性感染症(例えば、結膜炎、角膜炎)、慢性疲労症候群、肝炎(Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｅ型、慢性活動性、デルタ)、髄膜炎、日和見感染症(例えば、AIDS)、肺炎、バーキットリンパ腫、水痘、出血熱、麻疹、流行性耳下腺炎、パラインフルエンザ、狂犬病、感冒、ポリオ、白血病、風疹、性感染病、皮膚病(例えば、カポージ、イボ)、およびウイルス血症。本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドを用いて、任意のこれらの症状または疾患が処置または検出され得る。
【０９６２】
同様に、疾患または症状を引き起こし得、かつ本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドによって処置または検出され得る細菌性因子または真菌性因子は、以下のグラム陰性およびグラム陽性細菌科および真菌類を含むがこれらに限定されない：Actinomycetales(例えば、Corynebacterium、Mycobacterium、Norcardia)、Aspergillosis、Bacillaceae(例えば、Anthrax、Clostridium)、Bacteroidaceae、Blastomycosis、Bordetella、Borrelia、Brucellosis、Candidiasis、Campylobacter、Coccidioidomycosis、Cryptococcosis、Dermatocycoses、Enterobacteriaceae(Klebsiella、Salmonella、Serratia、Yersinia)、Erysipelothrix、Helicobacter、Legionellosis、Leptospirosis、Listeria、Mycoplasmatales、Neisseriaceae(例えば、Acinetobacter、Gonorrhea、Menigococcal)、Pasteurellaceaの感染症(例えば、Actinobacillus、Heamophilus、Pasteurella)、Pseudomonas、Rickettsiaceae、Chlamydiaceae、Syphilis、およびStaphylococcal。これらの細菌または真菌の科は、以下を含むがこれらに限定されない疾患または症状を引き起こし得る：菌血症、心内膜炎、眼感染症(結膜炎、結核、ブドウ膜炎)、歯肉炎、日和見感染症(例えば、AIDSに関連した感染症)、爪周囲炎、プロテーゼ関連感染症、ライター病、気道感染症(例えば、百日咳または蓄膿症)、敗血症、ライム病、ネコ引っ掻き病、赤痢、パラチフス熱、食中毒、腸チフス、肺炎、淋病、髄膜炎、クラミジア、梅毒、ジフテリア、らい病、パラ結核、結核、狼瘡、ボツリヌス中毒、壊疽、破傷風、膿痂疹、リウマチ熱、猩紅熱、性感染病、皮膚病(例えば、蜂巣炎、皮膚真菌症(dermatocycoses))、毒血症、尿路感染症、創傷感染症。本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドを用いて、任意のこれらの症状または疾患を処置または検出し得る。
【０９６３】
さらに、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドにより処置または検出され得る疾患または症状を引き起こす寄生虫性因子としては以下のファミリーが挙げられるがこれらに限定されない：アメーバ症、バベシア症、コクシジウム症、クリプトスポリジウム症、二核アメーバ症、交疫、外部寄生生物症(Giardiasis)、ジアルジア鞭毛虫症、蠕虫症、リーシュマニア症、タイレリア症、トキソプラスマ症、トリパノソーマ症、およびトリコモナス症。これらの寄生生物は、以下を含むがこれらに限定されない種々の疾患または症状を引き起こし得る：疥癬、ツツガムシ病、眼性感染症、腸疾患(例えば、赤痢、ジアルジア鞭毛虫症)、肝臓疾患、肺疾患、日和見感染症(例えば、AIDS関連)、マラリア、妊娠合併症、およびトキソプラスマ症。本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドを用いて、任意のこれらの症状または疾患を処置または検出し得る。
【０９６４】
好ましくは、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドを用いる処置は、患者に有効量のポリペプチドを投与するか、または患者から細胞を取り除いて、本発明のポリヌクレオチドをこの細胞に供給し、そして患者に操作した細胞を戻す(エキソビボ治療)か、のいずれかによるものであり得る。さらに、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドはワクチン中の抗原として用いられて、感染性疾患に対する免疫応答を惹起し得る。
【０９６５】
再生
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドを用いて、細胞を分化させ、増殖させ、そして誘引して、組織の再生を導き得る(Science 276:59-87(1997)を参照のこと)。組織の再生を用いて、先天性欠損、外傷(創傷、熱傷、切開、または潰瘍)、加齢、疾患(例えば、骨粗鬆症、変形性関節炎(osteocarthritis)、歯周病、肝不全)、美容形成手術を含む手術、線維症、再灌流傷害、または全身性サイトカイン損傷により損傷を受けた組織を修復、置換、または保護し得る。
【０９６６】
本発明を用いて再生し得る組織としては、以下が挙げられる：器官(例えば、膵臓、肝臓、腸、腎臓、皮膚、内皮)、筋肉(平滑筋、骨格筋、または心筋)、脈管(脈管内皮を含む)、神経、造血、および骨格(骨、軟骨、腱、および靭帯)の組織。好ましくは、再生は、瘢痕なく、または瘢痕が低減されて生じる。再生はまた、新脈管形成を含み得る。
【０９６７】
さらに、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、治癒するのが困難な組織の再生を増加し得る。例えば、腱/靭帯再生を増大させることによって、損傷後の回復時間が早まる。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドはまた、損傷を回避する試みにおいて予防的に使用され得る。処置され得る特定の疾患は、腱炎、手根管症候群、および他の腱欠損または靭帯欠損を含む。非治癒創傷の組織再生のさらなる例は、圧迫性潰瘍(pressureulcer)、脈管不全、外科的創傷、および外傷性創傷に関連する潰瘍を含む。
【０９６８】
同様に、神経および脳組織はまた、神経細胞を増殖および分化させるために本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドを使用することによって再生され得る。本方法を用いて処置され得る疾患は、中枢神経系疾患および末梢神経系疾患、神経障害、または機械的および外傷性障害（例えば、脊髄障害、頭部外傷、脳血管疾患、および発作(stoke)）を含む。詳細には、末梢神経傷害と関連する疾患、末梢神経障害（例えば、化学療法または他の医学的療法から生じる）、局在神経障害、および中枢神経系疾患（例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、筋萎縮性側索硬化症、およびシャイ−ドレーガー症候群）はすべて、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドを用いて処置され得る。
【０９６９】
走化性
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、走化性活性を有し得る。走化性分子は、細胞（例えば、単球、線維芽細胞、好中球、Ｔ細胞、肥満細胞、好酸球、上皮細胞、および／または内皮細胞）を、身体中の特定の部位（例えば、炎症、感染、または過剰増殖の部位）に誘引または移動させる。次いで、移動した細胞は、特定の外傷または異常性を撃退および／または治癒し得る。
【０９７０】
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、特定の細胞の走化性活性を増大し得る。次いで、これらの走化性分子を使用して、身体中の特定の位置に標的化した細胞の数を増加させることによって、炎症、感染、過剰増殖性障害、または任意の免疫系障害を処置し得る。例えば、走化性分子を使用して、免疫細胞を傷害を受けた位置に誘引することによって、組織に対する創傷および他の外傷を処置し得る。本発明の走化性分子はまた、線維芽細胞を誘引し得、これは創傷を処置するために使用され得る。
【０９７１】
本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドが走化性活性を阻害し得ることもまた意図される。これらの分子はまた、障害を処置するために使用され得る。従って、本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、走化性のインヒビターとして使用され得る。
【０９７２】
結合活性
本発明のポリペプチドは、ポリペプチドに結合する分子、またはポリペプチドが結合する分子をスクリーニングするために使用され得る。ポリペプチドと分子との結合は、結合したポリペプチドまたは分子の活性を活性化（アゴニスト）、増大、阻害（アンタゴニスト）、または減少させ得る。そのような分子の例は、抗体、オリゴヌクレオチド、タンパク質（例えば、レセプター）、または低分子を含む。
【０９７３】
好ましくは、分子は、ポリペプチドの天然のリガンド（例えば、リガンドのフラグメント）、または天然の基質、リガンド、構造的模倣物、もしくは機能的模倣物に密接に関連する（Coliganら、Current Protocols in Immunology 1(2): 第５章(1991)を参照のこと)。同様に、分子は、ポリペプチドが結合する天然のレセプター、または少なくともポリペプチドによって結合され得るレセプターのフラグメント（例えば、活性部位）に密接に関連し得る。いずれの場合においても、分子は、公知の技術を用いて合理的に設計され得る。
【０９７４】
好ましくは、これらの分子についてのスクリーニングは、ポリペプチドを、分泌タンパク質として、または細胞膜上でのいずれかで発現する適切な細胞を産生する工程を包含する。好ましい細胞は、哺乳動物、酵母、Drosophila、またはE. coli由来の細胞を含む。次いで、ポリペプチドを発現する細胞（または、発現されたポリペプチドを含む細胞膜）は、好ましくは、ポリペプチドまたは分子のいずれかの結合、刺激、または活性の阻害を観察するための分子を潜在的に含む試験化合物と接触される。
【０９７５】
アッセイは、ポリペプチドへの候補化合物の結合を簡単に試験し得、ここで結合は、標識によって、または標識された競合物との競合を包含するアッセイにおいて検出される。さらに、アッセイは、候補化合物がポリペプチドへの結合によって生成されるシグナルを生じるか否かを試験し得る。
【０９７６】
あるいは、アッセイは、細胞を含まない調製物、固体支持体に添付されたポリペプチド／分子、化学ライブラリー、または天然産物の混合物を用いて実施され得る。アッセイはまた、ポリペプチドを含む溶液を候補化合物と混合する工程、ポリペプチド／分子の活性または結合を測定する工程、およびポリペプチド／分子の活性または結合を、標準と比較する工程を簡単に包含し得る。
【０９７７】
好ましくは、ELISAアッセイは、モノクローナル抗体またはポリクローナル抗体を用いて、サンプル（例えば、生物学的サンプル）におけるポリペプチドのレベルまたは活性を測定し得る。抗体は、ポリペプチドへの直接的もしくは間接的な結合のいずれか、またはポリペプチドとの基質についての競合によって、ポリペプチドのレベルまたは活性を測定し得る。
【０９７８】
これらの上記のアッセイのすべては、診断マーカーまたは予後マーカーとして使用され得る。これらのアッセイを用いて発見される分子は、ポリペプチド／分子を活性化または阻害することによって、疾患を処置するか、または患者における特定の結果（例えば、血管増殖）をもたらすために使用され得る。さらに、アッセイは、適切に操作された細胞または組織からのポリペプチドの産生を阻害または増強し得る因子を発見し得る。
【０９７９】
従って、本発明は、以下の工程を含む本発明のポリペプチドに結合する化合物を同定する方法を包含する：(a)候補結合化合物を本発明のポリペプチドとともにインキュベートする工程；および(b)結合が生じたか否かを決定する工程。さらに、本発明は、以下の工程を含むアゴニスト／アンタゴニストを同定する方法を包含する：(a)候補化合物を本発明のポリペプチドとともにインキュベートする工程、(b)生物学的活性をアッセイする工程、および(b)ポリペプチドの生物学的活性が改変されているか否かを決定する工程。
【０９８０】
他の活性
本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドはまた、先に議論されるように造血系統に加えて、胚性幹細胞の分化または増殖を増加または減少し得る。
【０９８１】
本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドはまた、哺乳動物の特徴（例えば、身長、体重、毛の色、眼の色、皮膚、脂肪組織の割合、色素沈着、大きさ、および形）を調整する（例えば、美容外科)ために使用され得る。同様に、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、異化作用、同化作用、プロセシング、利用、およびエネルギーの貯蔵に影響を及ぼす哺乳動物の代謝を調整するために使用され得る。
【０９８２】
本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、バイオリズム、カリカディック（caricadic）リズム、うつ病（抑うつ性障害を含む）、暴力の傾向、痛みへの耐性、生殖能力（好ましくは、アクチビンまたはインヒビン様活性による）、ホルモンレベルもしくは内分泌レベル、食欲、性欲、記憶、ストレス、または他の認知の質に影響を及ぼすことによって、哺乳動物の精神状態または身体状態を変更するために使用され得る。
【０９８３】
本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドはまた、例えば、貯蔵能力、脂肪含有量、脂質、タンパク質、炭水化物、ビタミン、ミネラル、補因子、または他の栄養成分を増加または減少させるような食品添加物または保存剤として使用され得る。
【０９８４】
他の好ましい実施態様
本発明の他の好ましい実施態様は、配列番号Ｘのヌクレオチド配列中の少なくとも約50の連続したヌクレオチドの配列に、少なくとも95％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子を含み、ここでＸは表１に規定されるような任意の整数である。
【０９８５】
上記連続したヌクレオチドの配列が、表１中の配列番号Ｘについて規定されるような、ほぼクローン配列の5'ヌクレオチドの位置のヌクレオチドで始まり、そしてほぼクローン配列の3'ヌクレオチドの位置のヌクレオチドで終わる位置の範囲で、配列番号Ｘのヌクレオチド配列に含まれる、核酸分子もまた好ましい。
【０９８６】
上記連続したヌクレオチドの配列が、表１中の配列番号Ｘについて規定されるような、ほぼ開始コドンの5'ヌクレオチドの位置のヌクレオチドで始まり、そしてほぼクローン配列の3'ヌクレオチドの位置のヌクレオチドで終わる位置の範囲で、配列番号Ｘのヌクレオチド配列に含まれる、核酸分子もまた好ましい。
【０９８７】
上記連続したヌクレオチドの配列が、表１中の配列番号Ｘについて規定されるような、ほぼシグナルペプチドの第１のアミノ酸の5'ヌクレオチドの位置のヌクレオチドで始まり、そしてほぼクローン配列の3'ヌクレオチドの位置のヌクレオチドで終わる位置の範囲で、配列番号Ｘのヌクレオチド配列に含まれる、核酸分子も同様に好ましい。
【０９８８】
配列番号Ｘのヌクレオチド配列中の少なくとも約150の連続したヌクレオチドの配列に、少なくとも95％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子もまた好ましい。
【０９８９】
配列番号Ｘのヌクレオチド配列中の少なくとも約500の連続したヌクレオチドの配列に、少なくとも95％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子はさらに好ましい。
【０９９０】
さらに好ましい実施態様は、表１中の配列番号Ｘについて規定されるような、ほぼシグナルペプチドの第１のアミノ酸の5'ヌクレオチドの位置のヌクレオチドで始まり、そしてほぼクローン配列の3'ヌクレオチドの位置のヌクレオチドで終わる配列番号Ｘのヌクレオチド配列に少なくとも95％同一であるヌクレオチド配列を含む核酸分子である。
【０９９１】
さらに好ましい実施態様は、配列番号Ｘの完全なヌクレオチド配列に、少なくとも95％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子である。
【０９９２】
ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で核酸分子にハイブリダイズする単離された核酸分子もまた好ましく、ここで上記のハイブリダイズする核酸分子は、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、Ａ残基のみまたはＴ残基のみからなるヌクレオチド配列を有する核酸分子にハイブリダイズしない。
【０９９３】
表１におけるcDNAクローンIDによって同定されるヒトcDNAクローンを含むDNA分子を含む物質の組成物もまた好ましく、このDNA分子は、アメリカンタイプカルチャーコレクションに寄託された物質中に含まれ、そして上記のcDNAクローンIDについて表１中に示されるATCC寄託番号を与えられている。
【０９９４】
表１中のcDNAクローンIDによって同定されるヒトcDNAクローンのヌクレオチド配列中の少なくとも50の連続したヌクレオチドの配列に少なくとも95％同一であるヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子もまた好ましく、このDNA分子は表１において示されるATCC寄託番号を付与された寄託物中に含まれる。
【０９９５】
上記少なくとも50の連続したヌクレオチドの配列が、上記ヒトcDNAクローンによってコードされる完全なオープンリーディングフレームの配列のヌクレオチド配列中に含まれる、単離された核酸分子もまた好ましい。
【０９９６】
上記ヒトcDNAクローンによってコードされるヌクレオチド配列中の少なくとも150の連続したヌクレオチドの配列に少なくとも95％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子もまた好ましい。
【０９９７】
さらに好ましい実施態様は、上記ヒトcDNAクローンによってコードされるヌクレオチド配列中の少なくとも500の連続したヌクレオチドの配列に少なくとも95％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子である。
【０９９８】
さらに好ましい実施態様は、上記ヒトcDNAクローンによってコードされる完全なヌクレオチド配列に少なくとも95％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子である。
【０９９９】
さらに好ましい実施態様は、以下からなる群から選択される配列中の少なくとも50の連続したヌクレオチドの配列に少なくとも95％同一であるヌクレオチド配列を含む核酸分子を、生物学的サンプルにおいて検出するための方法である：配列番号Ｘのヌクレオチド配列であって、ここでＸは表１において規定されるような任意の整数である；および表１中のcDNAクローンIDによって同定され、そして表１において上記cDNAクローンについて示されるATCC寄託番号を有する寄託物中に含まれるヒトcDNAクローンによってコードされるヌクレオチド配列；上記の方法は、上記の群から選択される配列と、上記のサンプル中の少なくとも１つの核酸分子のヌクレオチド配列とを比較する工程、および上記サンプル中の上記核酸分子の配列が、上記の選択された配列に対して少なくとも95％同一であるか否かを決定する工程を包含する。
【１０００】
上記の配列を比較する工程が、上記サンプル中の核酸分子と、上記群から選択された配列を含む核酸分子との間の核酸ハイブリダイゼーションの程度を決定する工程を包含する、上記方法もまた好ましい。同様に、上記の配列を比較する工程が、上記サンプル中の核酸分子から決定されるヌクレオチド配列と、上記群から選択された配列とを比較する工程によって実施される、上記方法もまた好ましい。核酸分子は、DNA分子またはRNA分子を含み得る。
【１００１】
さらに好ましい実施態様は、生物学的サンプルの種、組織、または細胞型を同定するための方法であって、この方法は、以下からなる群から選択される配列中の少なくとも50の連続したヌクレオチドの配列に少なくとも95％同一であるヌクレオチド配列を含む上記サンプル中の核酸分子（もしあれば）を検出する工程を包含する：配列番号Ｘのヌクレオチド配列であって、ここでＸは表１において規定されるような任意の整数である；および表１中のcDNAクローンIDによって同定され、そして表１において上記cDNAクローンについて示されるATCC寄託番号を有する寄託物中に含まれるヒトcDNAクローンによってコードされるヌクレオチド配列。
【１００２】
生物学的サンプルの種、組織、または細胞型を同定するための方法は、少なくとも２つのヌクレオチド配列のパネル中のヌクレオチド配列を含む核酸分子を検出する工程を包含し得、ここで上記パネル中の少なくとも１つの配列は、上記群から選択される配列中の少なくとも50の連続したヌクレオチドの配列に少なくとも95％同一である。
【１００３】
表１において同定される分泌タンパク質をコードする遺伝子の異常な構造または発現と関連する病理学的状態を、被験体において診断するための方法もまた好ましく、この方法は、以下からなる群から選択される配列中の少なくとも50の連続したヌクレオチドの配列に少なくとも95％同一であるヌクレオチド配列を含む、核酸分子を、（もしあれば）上記被験体から得られる生物学的サンプルにおいて検出する工程を包含する：配列番号Ｘのヌクレオチド配列、ここでＸは表１において規定されるような任意の整数である；および表１中のcDNAクローンIDによって同定され、かつ表１中の上記のcDNAクローンについて示されるATCC寄託番号を有する寄託物に含まれるヒトcDNAクローンによってコードされるヌクレオチド配列。
【１００４】
病理学的状態を診断するための方法は、少なくとも２つのヌクレオチド配列のパネル中のヌクレオチド配列を含む核酸分子を検出する工程を包含し得、ここで上記パネル中の少なくとも１つの配列は、上記群から選択される配列中の少なくとも50の連続したヌクレオチドの配列に少なくとも95％同一である。
【１００５】
上記の核酸分子のヌクレオチド配列が、少なくとも２つのヌクレオチド配列のパネルを含む、単離された核酸分子を含む物質の組成物もまた好ましく、ここで上記のパネル中の少なくとも１つの配列は、以下からなる群から選択される配列中の少なくとも50の連続したヌクレオチドの配列に少なくとも95％同一である：配列番号Ｘのヌクレオチド配列、ここでＸは表１において規定されるような任意の整数である；および表１中のcDNAクローンIDによって同定され、かつ表１中の上記のcDNAクローンについて示されるATCC寄託番号を有する寄託物に含まれるヒトcDNAクローンによってコードされるヌクレオチド配列。核酸分子は、DNA分子またはRNA分子を含み得る。
【１００６】
配列番号Ｙのアミノ酸配列中の少なくとも約10の連続したアミノ酸の配列に、少なくとも90％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドもまた好ましく、ここでＹは、表１において規定されるような任意の整数である。
【１００７】
上記連続したアミノ酸の配列が、表１中の配列番号Ｙについて示されるような、ほぼ分泌部分の第１のアミノ酸の位置の残基で始まり、そしてほぼオープンリーディングフレームの最後のアミノ酸の残基で終わる位置の範囲で、配列番号Ｙのアミノ酸配列中に含まれる、ポリペプチドもまた好ましい。
【１００８】
配列番号Ｙのアミノ酸配列中の少なくとも約30の連続したアミノ酸の配列に少なくとも95％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドもまた好ましい。
【１００９】
配列番号Ｙのアミノ酸配列中の少なくとも約100の連続したアミノ酸の配列に少なくとも95％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドはさらに好ましい。
【１０１０】
配列番号Ｙの完全なアミノ酸配列に少なくとも95％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドはさらに好ましい。
【１０１１】
表１中のcDNAクローンIDによって同定され、かつ表１中の上記のcDNAクローンについて示されるATCC寄託番号を有する寄託物に含まれるヒトcDNAクローンによってコードされる分泌タンパク質の完全なアミノ酸配列において、少なくとも約10の連続したアミノ酸の配列に少なくとも90％同一のアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドはさらに好ましい。
【１０１２】
上記の連続したアミノ酸の配列が、表１中のcDNAクローンIDによって同定され、かつ表１中の上記のcDNAクローンについて示されるATCC寄託番号を有する寄託物に含まれるヒトcDNAクローンによってコードされる分泌タンパク質の分泌部分のアミノ酸配列に含まれる、ポリペプチドもまた好ましい。
【１０１３】
表１におけるcDNAクローンIDによって同定され、かつ表１のこのcDNAクローンについて示されるATCC寄託番号を有する寄託物に含まれる、ヒトcDNAクローンによってコードされるタンパク質の分泌部分のアミノ酸配列中の少なくとも約30の連続的なアミノ酸の配列に少なくとも95％同一であるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドもまた、好ましい。
【１０１４】
表１におけるcDNAクローンIDによって同定され、かつ表１のこのcDNAクローンについて示されるATCC寄託番号を有する寄託物に含まれる、ヒトcDNAクローンによってコードされるタンパク質の分泌部分のアミノ酸配列中の少なくとも約100の連続的なアミノ酸の配列に少なくとも95％同一であるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドもまた、好ましい。
【１０１５】
表１におけるcDNAクローンIDによって同定され、かつ表１のこのcDNAクローンについて示されるATCC受託番号を有する寄託物に含まれるヒトcDNAクローンによってコードされるタンパク質の分泌部分のアミノ酸配列に少なくとも95％同一であるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドもまた、好ましい。
【１０１６】
以下からなる群から選択される配列中の、少なくとも10の連続的なアミノ酸の配列に少なくとも90％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドに対して特異的に結合する単離された抗体は、さらに好ましい：配列番号Ｙのアミノ酸配列（ここで、Ｙは表１で規定される任意の整数である）；および表１におけるcDNAクローンIDによって同定され、かつ表１のこのcDNAクローンについて示されるATCC受託番号を有する寄託物に含まれる、ヒトcDNAクローンによってコードされるタンパク質の完全アミノ酸配列。
【１０１７】
以下からなる群から選択された配列中の、少なくとも10の連続的なアミノ酸の配列に少なくとも90％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドを、生物学的サンプルにおいて検出する方法はさらに好ましい：配列番号Ｙのアミノ酸配列（ここで、Ｙは表１で規定される任意の整数である）；および表１におけるcDNAクローンIDによって同定され、かつ表１のこのcDNAクローンについて示されるATCC受託番号を有する寄託物に含まれる、ヒトcDNAクローンによってコードされるタンパク質の完全アミノ酸配列；この方法は、このサンプル中における少なくとも１つのポリペプチド分子のアミノ酸配列をこの群から選択された配列と比較する工程、およびこのサンプル中におけるこのポリペプチド分子の配列が、少なくとも10の連続的なアミノ酸のこの配列と少なくとも90％同一であるかどうかを決定する工程を含む。
【１０１８】
このサンプル中における少なくとも１つのポリペプチド分子のアミノ酸配列を、この群から選択された配列と比較するこの工程が、このサンプル中のポリペプチドの、以下からなる群から選択された配列中の少なくとも10の連続的なアミノ酸の配列に対して、少なくとも90％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドと特異的に結合する抗体に対する特異的な結合の程度を決定する工程を含む、上記の方法もまた、好ましい：配列番号Ｙのアミノ酸配列（ここで、Ｙは表１に規定される任意の整数である）；および表１におけるcDNAクローンIDによって同定されかつ表１のこのcDNAクローンについて示されるATCC受託番号を有する寄託物に含まれるヒトcDNAクローンによってコードされるタンパク質の完全アミノ酸配列。
【１０１９】
配列を比較する工程が、このサンプル中のポリペプチド分子から決定されたアミノ酸配列を、この群から選択された配列と比較することによって行われる、上記の方法もまた好ましい。
【１０２０】
生物学的サンプルの種、組織または細胞型を同定する方法もまた好ましく、ここでこの方法は、このサンプル中のポリペプチド分子（このポリペプチドは、以下からなる群から選択される配列における少なくとも10の連続的なアミノ酸の配列と少なくとも90％同一であるアミノ酸配列を含む）をもし存在するならば検出する工程を含む：配列番号Ｙのアミノ酸配列（ここで、Ｙは表１に規定される任意の整数である）；および表１におけるcDNAクローンIDによって同定されかつ表１のこのcDNAクローンについて示されるATCC受託番号を有する寄託物に含まれる、ヒトcDNAクローンによってコードされる、分泌タンパク質の完全アミノ酸配列。
【１０２１】
生物学的サンプルの種、組織または細胞型を同定する上記の方法もまた好ましく、ここでこの方法は、少なくとも２つのアミノ酸配列のパネルにおけるアミノ酸配列を含むポリペプチド分子を検出する工程を含み、ここでこのパネル中の少なくとも１つの配列は、上記の群から選択された配列における少なくとも10の連続的なアミノ酸の配列と少なくとも90％同一である。
【１０２２】
被験体において、表１において同定された分泌タンパク質をコードする遺伝子の異常な構造または発現に関連する病理学的状態を診断する方法もまた、好ましい。ここで、この方法は、この被験体から得られた生物学的サンプルにおいて、少なくとも２つのアミノ酸配列のパネルにおけるアミノ酸配列を含むポリペプチド分子を検出する工程を含み、ここでこのパネル中の少なくとも１つの配列は、以下からなる群から選択される配列における少なくとも10の連続的なアミノ酸の配列と少なくとも90％同一である：配列番号Ｙのアミノ酸配列（ここで、Ｙは表１に規定される任意の整数である）；および表１におけるcDNAクローンIDによって同定されかつ表１のこのcDNAクローンについて示されるATCC受託番号を有する寄託物に含まれる、ヒトcDNAクローンによってコードされる分泌タンパク質の完全アミノ酸配列。
【１０２３】
これらの方法のいずれかにおいて、このポリペプチド分子を検出する工程は、抗体を使用することを包含する。
【１０２４】
以下からなる群から選択された配列中の、少なくとも10の連続的なアミノ酸の配列に少なくとも90％同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と、少なくとも95％同一であるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子もまた、好ましい：配列番号Ｙのアミノ酸配列（ここで、Ｙは表１に規定される任意の整数である）；および表１におけるcDNAクローンIDによって同定されかつ表１のこのcDNAクローンについて示されるATCC受託番号を有する寄託物に含まれる、ヒトcDNAクローンによってコードされる分泌タンパク質の完全アミノ酸配列。
【１０２５】
ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列が、原核生物宿主でのこのポリペプチドの発現について最適化されている、単離された核酸分子もまた好ましい。
【１０２６】
また、ポリペプチドが以下の群から選択されるアミノ酸配列を含む、単離された核酸分子もまた、好ましい：配列番号Ｙのアミノ酸配列（ここで、Ｙは表１に規定される任意の整数である）；および表１におけるcDNAクローンIDによって同定されかつ表１のこのcDNAクローンについて示されるATCC受託番号を有する寄託物に含まれる、ヒトcDNAクローンによってコードされる分泌タンパク質の完全アミノ酸配列。
【１０２７】
上記の単離された核酸分子のいずれかをベクター中に挿入する工程を含む、組換えベクターの作製方法はさらに好ましい。この方法によって生成された組換えベクターもまた、好ましい。宿主細胞中にベクターを導入する工程を含む、組換え宿主細胞を作製する方法、ならびにこの方法によって生成された組換え宿主細胞もまた、好ましい。
【１０２８】
単離されたポリペプチドを作製する方法であって、このポリペプチドが発現されるような条件下でこの組換え宿主細胞を培養する工程、およびこのポリペプチドを回収する工程を包含する、方法もまた、好ましい。単離されたポリペプチドを作製するこの方法もまた好ましく、ここでこの組換え宿主細胞は真核生物細胞であり、そしてこのポリペプチドは、以下からなる群から選択されたアミノ酸配列を含む、ヒト分泌タンパク質の分泌部分である：配列番号Ｙの分泌部分の第１のアミノ酸の位置の残基で始まる、配列番号Ｙのアミノ酸配列（ここで、Ｙは表１に記載される整数であり、そして配列番号Ｙの分泌部分の第１のアミノ酸配列の位置は表１に規定される）；および表１におけるcDNAクローンIDによって同定されかつ表１のこのcDNAクローンについて示されるATCC受託番号を有する寄託物に含まれる、ヒトcDNAクローンによってコードされるタンパク質の分泌部分のアミノ酸配列。この方法によって生成された単離されたポリペプチドもまた、好ましい。
【１０２９】
増加したレベルの分泌タンパク質活性を必要とする個体を処置する方法もまた、好ましい。ここで、この方法は、このような個体に、この個体においてこのタンパク質の活性のレベルを増加させるのに有効な本発明の単離されたポリペプチド、ポリヌクレオチド、または抗体の量を含む薬学的組成物を投与する工程を包含する。
【１０３０】
概して、本発明を記載してきたが、本発明は、例示の目的のために提供され、そして限定を意図しない、以下の実施例を参照することによってより容易に理解される。
【実施例】
【１０３１】
実施例１：寄託されたサンプルからの選択されたcDNAクローンの単離
引用されるATCC寄託物中の各cDNAクローンは、プラスミドベクター中に含まれる。表１は、各クローンが単離されたcDNAライブラリーを構築するために用いられたベクターを同定する。多くの場合、ライブラリーを構築するために使用されたベクターは、プラスミドが切り出されたファージベクターである。直下の表は、cDNAライブラリーを構築する際に使用される各ファージベクターについて関連プラスミドに相関づける。例えば、特定のクローンがベクター「LambdaZap」中に単離されているとして表１に同定される場合、対応する寄託クローンは「pBluescript」である。
【１０３２】
【化９８】
2010279364.tif 000098
ベクターLambda Zap（米国特許第5,128,256号および同第5,286,636号）、Uni-ZapXR（米国特許第5,128,256号および同第5,286,636号）、Zap Express（米国特許第5,128,256号および同第5,286,636号）、pBluescript（pBS）（Short,J.M.ら、NucleicAcids Res. 16:7583-7600(1988)；Alting-Mees,M.A.およびShort,J.M.、Nucleic Acids Res.17:9494(1989））ならびにpBK（Alting-Mees,M.A.ら、Strategies 5:58-61（1992））は、StratageneCloning Systems,Inc.、11011 N.Torrey Pines Road、La Jolla,CA,92037から市販されている。pBSは、アンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてpBKはネオマイシン耐性遺伝子を含む。両方とも、E.coli株XL-1Blue（これもまた、Stratageneから入手可能である）に形質転換され得る。pBSは、４つの形態、SK+、SK-、KS+およびKSに入る。ＳおよびＫとは、ポリリンカー領域（「Ｓ」とはSacIであり、そして「Ｋ」とは、KpnIのことであり、これらは、それぞれのリンカーの各末端での最初の部位である）に隣接するT7およびT3プライマー配列に対するポリリンカーの方向をいう。「＋」または「−」とは、f1複製起点「ori」の方向をいい、ある方向において、f1oriから開始される一本鎖レスキューはセンス鎖DNAを生成し、そして他方向ではアンチセンスを生成する。
【１０３３】
ベクターpSport１、pCMVSport 2.0およびpCMVSport3.0をLifeTechnologies、Inc.、P.O.Box 6009、Gaithersburg,MD 20897から入手した。全てのSportベクターはアンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてE.coli株DH10B（これもまた、LifeTechnologiesから入手可能である）に形質転換され得る。（例えば、Gruber,C.E.ら、Focus 15:59(1993)を参照のこと）。ベクターlafmidBA（Bento Soares、Columbia University、NY）はアンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてE.coli株XL-1 Blueに形質転換され得る。ベクターpCR（登録商標）2.1（これはInvitrogen、1600Faraday Avenue、Carlsbad、CA 92008から入手可能である）は、アンピシリン耐性遺伝子を含み、そしてE.coli株DH10B（LifeTechnologiesから入手可能である）に形質転換され得る（例えば、Clark,J.M.、Nuc.Acids Res.16:9677-9686(1988)およびMead,D.ら、Bio/Technology9:(1991)を参照のこと）。好ましくは、本発明のポリヌクレオチドは、表１中の特定のクローンについて同定されたファージベクター配列、ならびに上に示された対応するプラスミドベクター配列を含まない。
【１０３４】
表１に引用される、任意の所定のcDNAクローンについてATCC受託番号を与えられたサンプルにおける寄託物はまた、１つ以上のさらなるプラスミド（これは各々、その所定のクローンとは異なるcDNAクローンを含む）を含み得る。従って、同じATCC受託番号を共有する寄託物は、表１に同定される各cDNAクローンについてのプラスミドを少なくとも含む。代表的には、表１に引用される各ATCC寄託サンプルは、ほぼ等量（重量で）の約50のプラスミドDNA（これは各々、異なるcDNAクローンを含む）の混合物を含む；しかし、このような寄託サンプルは、50個よりも多いまたは少ないcDNAクローン（約500までのcDNAクローン）についてのプラスミドを含み得る。
【１０３５】
２つのアプローチが使用されて、表１における特定のクローンについて引用されるプラスミドDNAの寄託サンプルからそのクローンを単離し得る。第一に、プラスミドを、配列番号Xに対応するポリヌクレオチドプローブを使用して、クローンをスクリーニングすることによって直接単離する。
【１０３６】
特に、30〜40ヌクレオチドを有する特定のポリヌクレオチドを、報告されている配列に従って、AppliedBiosystems DNA合成機を使用して合成する。オリゴヌクレオチドを、例えば、32P-γ-ATPで、T4ポリヌクレオチドキナーゼを用いて標識し、そして日常的な方法に従って精製する。（例えば、Maniatisら、MolecularCloning：A Laboratory Manual、Cold Spring Harbor Press、Cold Spring、NY(1982））。プラスミド混合物を、上記のように、当業者に公知の技術（例えば、ベクター供給者によって提供される技術または上記で引用された関連の刊行物もしくは特許において提供される技術）を用いて、適切な宿主（例えば、XL-1Blue（Stratagene))に形質転換する。形質転換体を1.5％寒天プレート（適切な選択薬剤、例えば、アンピシリンを含む）に、1プレートあたり約150の形質転換体（コロニー）の密度でプレートする。これらのプレートを、細菌コロニースクリーニングについての日常的な方法（例えば、Sambrookら、MolecularCloning：A Laboratory Manual、第２版、(1989）、Cold Spring Harbor Laboratory Press、1.93頁から1.104頁）または当業者に公知の他の技術に従って、ナイロンメンブレンを使用してスクリーニングする。
【１０３７】
あるいは、配列番号Ｘの両端（すなわち、表１に規定されるクローンの５’ＮＴおよび３’ＮＴによって囲まれる配列番号Ｘの領域内）に由来する、17〜20ヌクレオチドの２つのプライマーを合成し、そしてこれらを使用して、テンプレートとして寄託されたcDNAプラスミドを使用して、所望のcDNAを増幅する。ポリメラーゼ連鎖反応を、日常的な条件下で、例えば、0.5μgの上記cDNAテンプレートを有する反応混合物の25μl中で実施する。便利な反応混合物は、1.5〜５mMMgCl2、0.01％(w/v）ゼラチン、それぞれ20μMのdATP、dCTP、dGTP、dTTP、25pmolの各プライマーおよび0.25ユニットのTaqポリメラーゼである。３５サイクルのPCR（94℃での変性を1分間；55℃でのアニールを1分間；72℃での伸長を1分間）を、Perkin-ElmerCetus自動化サーマルサイクラーを用いて実施する。増幅産物をアガロースゲル電気泳動により分析し、そして予想される分子量のDNAバンドを切り出し、そして精製する。PCR産物を、DNA産物をサブクローニングおよび配列決定することによって選択された配列であることを確認する。
【１０３８】
寄託されたクローンに存在していないかもしれない遺伝子の5’非コード部分または3’非コード部分の同定のために、いくつかの方法が利用可能である。これらの方法は、以下を含むがこれらに限定されない：フィルタープロービング、特異的プローブを使用するクローン富化、および当該分野で周知である5’および3’「RACE」プロトコルと類似するかまたは同一のプロトコル。例えば、5’RACEに類似する方法は、所望の全長転写物の失われた5’末端を作製するために利用可能である（Fromont-Racineら、NucleicAcids Res. 21(7)：1683-1684(1993））。
【１０３９】
簡潔には、特定のRNAオリゴヌクレオチドを、全長遺伝子RNA転写物をおそらく含むRNAの集団の5’末端に連結する。連結されたRNAオリゴヌクレオチドに特異的なプライマーおよび目的の遺伝子の公知の配列に特異的なプライマーを含むプライマーセットを使用して、所望の全長遺伝子の5’部分をPCR増幅する。次いで、この増幅した産物を配列決定し得、そしてこれを使用して全長遺伝子を生成し得る。
【１０４０】
この上記の方法は、所望の供給源から単離された総RNAを用いて開始するが、ポリAおよびRNAを使用し得る。次いで、RNA調製物を、必要ならばホスファターゼで処理して、後のRNAリガーゼ工程を妨害し得る分解または損傷RNAの5’リン酸基を排除し得る。次いで、ホスファターゼを不活化するべきであり、そしてRNAをメッセンジャーRNAの5’末端に存在するキャップ構造を除去するために、タバコ酸性ピロホスファターゼを用いて処理するべきである。この反応は、キャップ切断RNAの5’末端に5’リン酸基を残し、これは次いでT4RNAリガーゼを用いてRNAオリゴヌクレオチドに連結され得る。
【１０４１】
この改変RNA調製物を、遺伝子特異的なオリゴヌクレオチドを用いる第一鎖cDNA合成のためのテンプレートとして使用する。第一鎖合成反応物を、連結されたRNAオリゴヌクレオチドに特異的なプライマーおよび目的の遺伝子の公知の配列に特異的なプライマーを用いる、所望の5’末端のPCR増幅のためのテンプレートとして使用する。次いで、得られた産物を配列決定し、そして分析して5’末端配列が所望の遺伝子に属するかを確認する。
【１０４２】
実施例２：ポリヌクレオチドに対応するゲノムクローンの単離
ヒトゲノムP1ライブラリー（Genomic Systems、Inc.)を、実施例１に記載される方法に従って、配列番号Xに対応するcDNA配列について選択されたプライマーを用いるPCRによってスクリーニングする（Sambrookもまた参照のこと）。
【１０４３】
実施例３：ポリペプチドの組織分布
本発明のポリヌクレオチドのmRNA発現の組織分布を、とりわけ、Sambrookらによって記載される、ノーザンブロット分析についてのプロトコルを用いて決定する。例えば、実施例１に記載される方法によって生成されるcDNAプローブを、P32で、rediprimeTMDNA標識系（Amersham Life Science）を用いて、製造者の指示に従って標識する。標識後、プローブを、CHROMA SPIN-100TMカラム（ClontechLaboratories、Inc.)を使用して、製造者のプロトコル番号PT1200-1に従って精製する。次いで、精製した標識プローブを使用して、種々のヒト組織をmRNA発現について試験する。  
【１０４４】
種々のヒト組織（H)またはヒト免疫系組織（IM)（Clontech）を含む多重組織ノーザン（MTN）ブロットを、ExpressHybTMハイブリダイゼーション溶液（Clontech）を用いて、製造者のプロトコル番号PT1190-1に従って、標識プローブで試験する。ハイブリダイゼーションおよび洗浄後、ブロットをマウントして、そして-70℃で一晩フィルムに曝露し、そしてフィルムを標準的な手順に従って現像する。
【１０４５】
実施例４：ポリヌクレオチドの染色体マッピング
オリゴヌクレオチドプライマーセットを、配列番号Ｘの5'末端の配列に従って設計する。このプライマーは、好ましくは約100ヌクレオチドにわたる。次いで、このプライマーセットを、以下のセットの条件下でポリメラーゼ連鎖反応に使用する：95℃で30秒；56℃で1分；70℃で1分。このサイクルを32回くり反し、次に1回70℃で5分間のサイクルを行う。個々の染色体または染色体フラグメントを含む体細胞ハイブリッドパネル（Bios,Inc）に加えて、ヒト、マウス、およびハムスターDNAを鋳型として使用する。反応物を、8%ポリアクリルアミドゲルまたは3.5%アガロースゲルのいずれかで分析する。染色体マッピングを、特定の体細胞ハイブリッドにおける約100bpのPCRフラグメントの存在によって決定する。
【１０４６】
実施例５：ポリペプチドの細菌発現
本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを、実施例１に概説するように、挿入フラグメントを合成するために、DNA配列の5'および3'末端に対応するPCRオリゴヌクレオチドプライマーを使用して増幅する。cDNA挿入物を増幅するために使用されるプライマーは、発現ベクターに増幅産物をクローニングするために、好ましくはプライマーの5'末端にBamHIおよびXbaIのような制限部位を含むべきである。例えば、BamHIおよびXbaIは、細菌発現ベクターpQE-9（Qiagen,Inc., Chatsworth, CA）の制限酵素部位に対応する。このプラスミドベクターは、抗生物質耐性（Ampr）、細菌の複製起点（ori）、IPTG調節可能なプロモーター／オペレーター（P/O）、リボソーム結合部位（RBS）、6-ヒスチジンタグ（6-His）、および制限酵素クローニング部位をコードする。
【１０４７】
pQE-9ベクターをBamHIおよびXbaIで消化し、そして、増幅されたフラグメントをpQE-9ベクターに連結し、細菌RBSにおいて開始されるリーディングフレームを維持する。次いで連結混合物を、lacIリプレッサーを発現し、またカナマイシン耐性（Kanr）を与えるプラスミドpREP4の多重コピーを含む、E.coli株M15/rep4（Qiagen, Inc.）を形質転換するために使用する。形質転換体を、それらのLBプレート上で増殖する能力によって同定し、そしてアンピシリン／カナマイシン耐性コロニーを選択する。プラスミドDNAを単離し、そして制限分析によって確認する。
【１０４８】
所望の構築物を含むクローンを、Amp（100μg/ml）およびKan（25μg/ml）の両方を補充したLB培地における液体培養で一晩（O/N）増殖させる。O/N培養物を、1：100〜1：250の比で大量培養物を接種するために使用する。細胞を、0.4〜0.6の光学密度600（O.D.600）まで増殖させる。次いで、IPTG（イソプロピル-B-D-チオガラクトピラノシド）を最終濃度1mMになるように加える。IPTGは、lacIリプレッサーを不活化することによりP/Oの障害物除去誘導して遺伝子発現の増加を導く。
【１０４９】
細胞を、さらに3〜4時間増殖させる。次いで、細胞を遠心分離（6000×ｇで20分間）によって収集する。細胞ペレットを、カオトロピック剤6MグアニジンHCl中に、4℃で3〜4時間攪拌することによって可溶化させる。細胞細片を遠心分離によって取り除き、そしてポリペプチドを含む上清を、ニッケル-ニトリロ-三酢酸（「Ni-NTA」）アフィニティー樹脂カラムにロードする（QIAGEN,Inc. 前出より入手可能）。6×Hisタグを有するタンパク質は、Ni-NTA樹脂に高い親和性で結合し、そして単純な１工程の手順で精製され得る（詳細には、TheQIAexpressionist (1995) QIAGEN, Inc., 前出を参照のこと）。
【１０５０】
手短に言えば、上清を、6Mグアニジン-HCl、pH 8のカラムにロードし、カラムを最初に10容量の6Mグアニジン-HCl、pH8で洗浄し、次いで10容量の6Mグアニジン-HCl、pH 6で洗浄し、最後にポリペプチドを、6Mグアニジン-HCl、pH 5で溶出する。
【１０５１】
次いで精製したタンパク質を、リン酸緩衝化生理食塩水（PBS）または50mM 酢酸ナトリウム、pH6の緩衝液および200mM NaClに対して透析することにより再生させる。あるいは、タンパク質はNi-NTAカラムに固定化している間に、首尾よく再折り畳みされ得る。推奨条件は以下の通りである：プロテアーゼインヒビターを含む、500mM NaCl、20% グリセロール、20 mM Tris/HCl pH 7.4中の6M〜1M尿素の直線勾配を使用する再生。再生は1.5時間以上の時間をかけて行うべきである。再生後、タンパク質を250mM イミダゾールの添加によって溶出させる。イミダゾールを、PBSまたは50 mM 酢酸ナトリウム pH 6の緩衝液および200mM NaClに対する最終の透析工程によって除去する。精製したタンパク質を、4℃で保存するか、または-80℃で冷凍する。
【１０５２】
上記の発現ベクターに加えて、本発明はさらに、本発明のポリヌクレオチドに作動可能に連結されたファージオペレーターおよびプロモーターエレメントを含み、pHE4aと呼ばれる発現ベクターを含む（ATCC受託番号209645、1998年2月25日に寄託）。このベクターは以下を含む：１）選択マーカーとしてのネオマイシンホスホトランスフェラーゼ遺伝子、２）E.coli複製起点、３）T5ファージプロモーター配列、４）２つのlacオペレーター配列、５）シャイン−ダルガーノ配列、および６）ラクトースオペロンリプレッサー遺伝子（lacIq）。複製起点（oriC）は、pUC19（LTI,Gaithersburg, MD）に由来する。プロモーター配列およびオペレーター配列を合成的に作製する。
【１０５３】
NdeIおよびXbaI、BamHI、XhoI、またはAsp718によってベクターを制限処理し、制限処理された産物をゲルで泳動し、そしてより大きなフラグメント（スタッファー（stuffer）フラグメントは約310塩基対であるべきである）を単離することによって、DNAをpHEaに挿入し得る。DNA挿入物を、NdeI（5'プライマー）およびXbaI、BamHI、XhoI、またはAsp718（3'プライマー）に対する制限部位を有するPCRプライマーを使用して、実施例１に記載のPCRプロトコールに従って生成する。PCR挿入物を、ゲル精製し、そして適合する酵素で制限処理する。挿入物およびベクターを標準的なプロトコールに従って連結する。
【１０５４】
操作されたベクターは、上記のプロトコールにおいて、細菌系でタンパク質を発現させるために容易に置換され得る。
【１０５５】
実施例６：封入体からのポリペプチドの精製
以下の別の方法は、ポリペプチドが封入体の形態で存在する場合に、E. coli中で発現されたポリペプチドを精製するために使用され得る。他に指定されない場合には、以下のすべての工程は4〜10℃で行われる。
【１０５６】
E. coli発酵の生産期の完了後、細胞培養物を4〜10℃に冷却し、そして15,000rpmの連続遠心分離（Heraeus Sepatech）によって細胞を採集する。細胞ペーストの単位重量あたりのタンパク質の予想される収量および必要とされる精製タンパク質の量に基づいて、細胞ペーストの適切な量（重量による）を、100mM Tris、50 mM EDTA、pH 7.4を含む緩衝溶液に懸濁させる。細胞を、高剪断ミキサーを使用して均質な懸濁液に分散させる。
【１０５７】
次いで、マイクロフルイダイザー（microfluidizer）（Microfuidics,Corp. またはAPV Gaulin, Inc.）に２回、4000〜6000 psiで溶液を通すことによって細胞を溶解させる。次いでホモジネートを、最終濃度0.5M NaClになるようにNaCl溶液と混合し、続いて7000×ｇで15分間遠心分離を行う。得られたペレットを、0.5 M NaCl、100mM Tris、50mM EDTA、pH 7.4を使用して再度洗浄する。
【１０５８】
得られた洗浄した封入体を、1.5 M 塩酸グアニジン（GuHCl）で2〜4時間可溶化する。7000×ｇで15分間の遠心分離の後、ペレットを廃棄し、そしてポリペプチドを含む上清を4℃で一晩インキュベートしてさらなるGuHCl抽出を可能にする。
【１０５９】
不溶性粒子を除去するための高速遠心分離（30,000×ｇ）に続き、GuHCl可溶化タンパク質を、GuHCl抽出物と、50mM ナトリウム、pH 4.5、150 mM NaCl、2 mM EDTAを含む20容量の緩衝液とを、激しい攪拌で迅速に混合することによって、再折り畳みさせる。再折り畳みした希釈タンパク質溶液を、さらなる精製工程の前の12時間、混合しないで4℃で保つ。
【１０６０】
再折り畳みされたポリペプチド溶液を清澄にするために、あらかじめ準備した、40 mM酢酸ナトリウム、pH6.0で平衡化した、適切な表面積を有する0.16μmメンブレンフィルターを備える接触濾過ユニット（例えば、Filtron）を利用する。濾過したサンプルを、カチオン交換樹脂（例えば、PorosHS-50, Perseptive Biosystems）上にロードする。カラムを40 mM 酢酸ナトリウム、pH 6.0で洗浄し、そして同じ緩衝液中の250mM 、500 mM、1000 mM、および1500 mM NaClで、段階的な様式で溶出する。溶出液の280 nmにおける吸光度を継続的にモニターする。画分を収集し、そしてSDS-PAGEによってさらに分析する。
【１０６１】
次いでポリペプチドを含む画分をプールし、そして４容量の水と混合する。次いで希釈されたサンプルを、あらかじめ準備した強アニオン（Poros HQ-50, Perseptive Biosystems）および弱アニオン（Poros CM-20, PerseptiveBiosystems）交換樹脂の直列カラムのセットにロードする。カラムを40 mM 酢酸ナトリウム、pH 6.0で平衡化する。両方のカラムを、40 mM 酢酸ナトリウム、pH6.0、200 mM NaClで洗浄する。次いでCM-20カラムを10カラム容量の直線的勾配（0.2 M NaCl、50 mM 酢酸ナトリウム、pH 6.0から1.0M NaCl、50 mM 酢酸ナトリウム、pH 6.5の範囲）を用いて溶出させる。画分を、溶出液の定常Ａ280モニタリング下で収集する。次いで、（例えば、16%SDS-PAGEによって測定した）ポリペプチドを含む画分をプールする。
【１０６２】
得られたポリペプチドは、上記の再折り畳みおよび精製工程の後で95%より高い純度を示すべきである。5μgの精製タンパク質がロードされる場合、いかなる主要な混在バンドも、クマシーブルー染色した16%SDS-PAGEゲルから観察されないはずである。精製タンパク質はまた、エンドトキシン／LPS混在について試験され得、そして代表的には、LPS含量はLALアッセイに従って、0.1ng/ml未満である。
【１０６３】
実施例７：バキュロウイルス発現系におけるポリペプチドのクローニングおよび発現
この実施例では、ポリペプチドを発現するために、プラスミドシャトルベクターpA2を使用してポリヌクレオチドをバキュロウイルスに挿入する。この発現ベクターは、Autographacalifornica核多核体ウイルス（AcMNPV）の強力なポリヘドリンプロモーター、続いてBamHI、XbaI、およびAsp718のような便利な制限部位を含む。シミアンウイルス40（「SV40」）のポリアデニル化部位を、効率的なポリアデニル化のために使用する。組換えウイルスの容易な選択のために、プラスミドは、同方向にある弱いDrosophilaプロモーターの制御下でE.coli由来のβ-ガラクトシダーゼ遺伝子、続いてポリヘドリン遺伝子のポリアデニル化シグナルを含む。挿入された遺伝子は両方の側で、クローン化したポリヌクレオチドを発現する生存可能なウイルスを生成する、野生型ウイルスDNAとの細胞媒介性の相同組換えのためのウイルス配列と隣接する。
【１０６４】
他の多くのバキュロウイルスベクター（例えば、pAc373、pVL941、およびpAcIM1）は、当業者が容易に理解するように、構築物が転写、翻訳、分泌など（必要とされる場合、シグナルペプチドおよびインフレームなAUGを含む）のために適切に配置されたシグナルを提供する限りにおいて、上記のベクターの代わりに使用され得る。このようなベクターは例えば、Luckowら、Virology170:31-39 (1989) に記載される。
【１０６５】
具体的には、寄託されたクローンに含まれるcDNA配列（これは、AUG開始コドンおよび表１に同定される天然に付随するリーダー配列を含む）を、実施例１に記載のPCRプロトコールを使用して増幅させる。天然に存在するシグナル配列を使用して分泌タンパク質を産生する場合、pA2ベクターは第２のシグナルペプチドを必要としない。あるいは、ベクターを、Summersら（「AManual of Methods for Baculovirus Vectors and Insect Cell Culture Procedures」、TexasAgricultural Experimental Station Bulletin No. 1555 (1987)）に記載される標準的な方法を用いて改変して、バキュロウイルスリーダー配列を含ませ得る（pA2GP）。
【１０６６】
増幅されたフラグメントを、市販のキット（「Geneclean」BIO 101Inc., La Jolla, CA）を使用して、1%アガロースゲルから単離する。次いでフラグメントを適切な制限酵素で消化し、そして再び1%アガロースゲルで精製する。
【１０６７】
プラスミドを対応する制限酵素で消化し、そして必要に応じて、当該分野で公知の日常的な手順を用いて、仔ウシ腸ホスファターゼを用いて脱リン酸化し得る。次いでDNAを、市販のキット（「Geneclean」BIO 101 Inc., La Jolla, Ca）を使用して、1%アガロースゲルから単離する。
【１０６８】
フラグメントおよび脱リン酸化したプラスミドを、T4 DNAリガーゼを用いて互いに連結する。E.coli HB101またはXL-1 Blue（Stratagene Cloning Systems, La Jolla, Ca）のような他の適切なE.coli宿主細胞を、連結混合液で形質転換し、そして培養プレート上に広げる。プラスミドを含む細菌を、個々のコロニー由来のDNAを消化し、そして消化産物をゲル電気泳動によって分析することにより同定する。クローニングしたフラグメントの配列をDNA配列決定によって確認する。
【１０６９】
このポリヌクレオチドを含む5μgのプラスミドを、 Felgnerら、Proc.Natl. Acad. Sci. USA 84:7413-7417 (1987) によって記載されたリポフェクション法を使用して、1.0μgの市販の線状化バキュロウイルスDNA（「BaculoGoldTMバキュロウィルス DNA」, Pharmingen, San Diego, CA）とともに同時トランスフェクトする。1μgのBaculoGoldTMウイルスDNAおよび5μgのプラスミドを、50μlの無血清グレース培地（LifeTechnologies Inc., Gaithersburg, MD）を含む、マイクロタイタープレートの滅菌したウェル中で混合する。その後、10 μlリポフェクチンおよび90μlグレース培地を加え、混合し、室温で15分間インキュベートする。次いで、トランスフェクション混合液を、無血清グレース培地1mlを加えた35 mm組織培養プレートに播種したSf9昆虫細胞（ATCC CRL 1711）に滴下して加える。次いでプレートを27℃で5時間インキュベートする。次いで、トランスフェクション溶液をプレートから除去し、そして10%ウシ胎仔血清を補充した1mlのグレース昆虫培地を添加する。次いで培養を27℃で４日間継続する。
【１０７０】
４日後上清を収集し、SummersおよびSmith、前出によって記載されたようにプラークアッセイを行う。「BlueGal」（Life Technologies Inc., Gaithersburg）を含むアガロースゲルを、gal発現しているクローン（青色に着色したプラークを生ずる）の容易な同定および単離を可能にするために使用する。（この型の「プラークアッセイ」の詳細な説明はまた、LifeTechnologies Inc., Gaithersburgによって配布される、昆虫細胞培養およびバキュロウイルス学のための使用者ガイドの9-10頁に見出され得る。）適切なインキュベーションの後、青色に着色したプラークをマイクロピペッター（例えば、Eppendorf）のチップで拾う。次いで、組換えウイルスを含む寒天を、200μlのグレース培地を含む微小遠心分離チューブ中で再懸濁させ、そして組換えバキュロウイルスを含む懸濁液を、35mmディッシュに播種したSf9細胞に感染させるために使用する。４日後、これらの培養ディッシュの上清を採集し、次いで4℃に貯蔵する。
【１０７１】
ポリペプチドの発現を確認するために、10%熱非働化FBSを補充したグレース培地中でSf9細胞を増殖させる。細胞を、約２の感染多重度（「MOI」）でポリヌクレオチドを含む組換えバキュロウイルスで感染させる。放射性標識したタンパク質を所望する場合には、６時間後培地を除去し、そしてメチオニンおよびシステインを含まないSF900II培地（Life Technologies Inc., Rockville, MDから入手可能）に置き換える。42時間後、5μCiの35S-メチオニンおよび5μCiの35S-システイン（Amershamから入手可能）を添加する。細胞をさらに16時間インキュベートし、次いで遠心分離によって採集する。上清中のタンパク質および細胞内タンパク質を、SDS-PAGE、次いで（放射性標識した場合）オートラジオグラフィーによって分析する。
【１０７２】
精製タンパク質のアミノ末端のアミノ酸配列の微量配列決定法を使用して、産生されたタンパク質のアミノ末端配列を決定し得る。
【１０７３】
実施例８：哺乳動物細胞におけるポリペプチドの発現
本発明のポリペプチドを、哺乳動物細胞中で発現させ得る。代表的な哺乳動物発現ベクターは、mRNAの転写の開始を仲介するプロモーターエレメント、タンパク質コード配列、および転写の終結および転写物のポリアデニル化に必要なシグナルを含む。さらなるエレメントは、エンハンサー、コザック配列、および、RNAスプライシングのドナーおよびアクセプター部位に隣接する介在配列を含む。非常に効率的な転写は、SV40由来の初期および後期プロモーター、レトロウイルス（例えば、RSV、HTLVI、HIVI）由来の長末端反復（LTR）、およびサイトメガロウイルス（CMV）の初期プロモーターを用いて達成される。しかし、細胞エレメント（例えば、ヒトアクチンプロモーター）もまた、使用され得る。
【１０７４】
本発明を実施する際の使用に適切な発現ベクターは、例えば、pSVLおよびpMSG（Pharmacia,Uppsala, Sweden）、pRSVcat(ATCC 37152)、pSV2dhfr(ATCC 37146)、pBC12MI(ATCC 67109)、pCMVSport2.0、ならびにpCMVSport3.0のようなベクターを含む。使用され得る哺乳動物宿主細胞は、ヒトHela、293、H9およびJurkat細胞、マウスNIH3T3およびC127細胞、Cos1、Cos 7およびCV1、ウズラQC1-3細胞、マウスL細胞、ならびにチャイニーズハムスター卵巣（CHO）細胞を含む。
【１０７５】
あるいは、ポリペプチドは、染色体に組み込まれたポリヌクレオチドを含む、安定な細胞株中で発現され得る。dhfr、gpt、ネオマイシン、ハイグロマイシンのような選択マーカーを用いる同時トランスフェクションは、トランスフェクトされた細胞の同定および単離を可能にする。
【１０７６】
トランスフェクトされた遺伝子はまた、大量のコードされたタンパク質を発現するために増幅され得る。DHFR（ジヒドロ葉酸還元酵素）マーカーは、目的の遺伝子の数百または数千さえものコピーを有する細胞株の開発に有用である。（例えば、Alt,F.W.ら、J. Biol. Chem. 253:1357-1370 (1978)；Hamlin, J.L.およびMa, C.、Biochem.ら、Biophys.Acta、1097:107-143 (1990)：Page, M.J.およびSydenham, M.A.、Biotechnology 9:64-68(1991)を参照のこと。）別の有用な選択マーカーは、酵素グルタミンシンターゼ（GS）である（Murphyら、Biochem J. 227:277-279(1991)；Bebbingtonら、Bio/Technology 10:169-175 (1992)）。これらのマーカーを使用して、哺乳動物細胞を選択培地中で増殖させ、そしてもっとも高い耐性を有する細胞を選択する。これらの細胞株は、染色体に組み込まれた、増幅された遺伝子を含む。チャイニーズハムスター卵巣（CHO）およびNSO細胞は、タンパク質の産生のためにしばしば使用される。
【１０７７】
プラスミドpSV2-dhfr（ATCC受託番号37146）の誘導体である、発現ベクターpC4（ATCC受託番号209646）およびpC6（ATCC受託番号209647）は、ラウス肉腫ウイルスの強力なプロモーター（LTR）（Cullenら、Molecularand Cellular Biology, 438-447 (1985年3月)）およびCMVエンハンサー（Boshartら、Cell 41:521-530(1985)）のフラグメントを含む。例えば、BamHI、XbaI、およびAsp718の制限酵素切断部位を有するマルチクローニング部位は、目的の遺伝子のクローニングを容易にする。ベクターはまた、3'イントロン、ラットプレプロインシュリン遺伝子のポリアデニル化および終結シグナル、ならびに、SV40初期プロモーターの制御下にあるマウスDHFR遺伝子を含む。
【１０７８】
具体的には、例えば、プラスミドpC6は、適切な制限酵素によって消化され、次いで当該分野で公知の手順によって、仔ウシ腸ホスファターゼ(phosphate）を使用して脱リン酸化される。次いで、ベクターを１％アガロースゲルから単離する。
【１０７９】
本発明のポリヌクレオチドは、実施例１に概説するプロトコルに従って増幅される。天然に存在するシグナル配列が分泌タンパク質を産生するために使用される場合、ベクターは、第二のシグナルペプチドを必要としない。あるいは、天然に存在するシグナル配列が使用されない場合には、ベクターは異種シグナル配列を含むように改変され得る（例えば、WO96/34891を参照のこと)。
【１０８０】
増幅されるフラグメントが、市販のキット（「Geneclean」、BIO 101Inc., La Jolla, Ca.）を使用して１％アガロースゲルから単離される。次いで、フラグメントは、適切な制限酵素で消化され、そして再び１％アガロースゲル上で精製される。
【１０８１】
次いで、増幅されるフラグメントを同じ制限酵素で消化し、そして１％アガロースゲルで精製する。次いで、単離されたフラグメントおよび脱リン酸化したベクターを、T4 DNAリガーゼで連結する。次いで、E. coli HB101またはXL-1 Blue細胞を形質転換し、そしてプラスミドpC6に挿入されたフラグメントを含む細菌を、例えば、制限酵素分析を用いて同定する。
【１０８２】
活性なDHFR遺伝子を欠くチャイニーズハムスター卵巣細胞を、トランスフェクションに使用する。５μgの発現プラスミドpC6を、リポフェクチン（Felgnerら、前出）を用いて、0.5μgのプラスミドpSVneoとともに同時トランスフェクトする。プラスミドpSV2-neoは、優性選択マーカーである、G418を含む抗生物質の群に対する耐性を付与する酵素をコードする、Tn5からのneo遺伝子を含む。細胞を、１mg/mlのG418を補充したαマイナスMEMに播種する。２日後、細胞をトリプシン処理し、そして10、25、または50ng/mlのメトトレキサートおよび１mg/mlのG418を補充したαマイナスMEM中のハイブリドーマクローニングプレート（Greiner,Germany）中に播種する。約10〜14日後、単一のクローンをトリプシン処理し、次いで異なる濃度（50nM、100nM、200nM、400nM、800nM）のメトトレキサートを使用して、６ウェルのペトリ皿または10mlのフラスコに播種する。次いで、最高濃度のメトトレキサートで増殖するクローンを、さらに高い濃度（１μM、２μM、５μM、10μM、20μM）のメトトレキサートを含む新たな６ウェルプレートに移す。同じ手順を、100〜200μMの濃度で増殖するクローンが得られるまで繰り返す。所望の遺伝子産物の発現を、例えば、SDS-PAGEおよびウエスタンブロットによって、または逆相HPLC分析によって分析する。
【１０８３】
実施例９：タンパク質融合物
本発明のポリぺプチドは、好ましくは、他のタンパク質に融合される。これらの融合タンパク質は、種々の適用について使用され得る。例えば、本発明のポリぺプチドの、Hisタグ、HAタグ、プロテインＡ、IgGドメイン、およびマルトース結合タンパク質への融合は、精製を容易にする。（実施例５を参照のこと；EPA 394,827もまた参照のこと；Trauneckerら、Nature 331:84-86 (1988)。)  同様に、IgG-1、IgG-3、およびアルブミンへの融合は、インビボでの半減期を増大させる。本発明のポリぺプチドに融合した核局在化シグナルは、タンパク質を特定の細胞下局在に標的化し得る。一方、共有結合ヘテロダイマーまたはホモダイマーは、融合タンパク質の活性を増大または減少させ得る。融合タンパク質はまた、１つより多い機能を有するキメラ分子を作製し得る。最後に、融合タンパク質は、非融合タンパク質と比較して、融合タンパク質の溶解度および/または安定性を増大させ得る。上記の融合タンパク質の全ての型は、ポリぺプチドのIgG分子への融合を概説する以下のプロトコル、または実施例５に記載されるプロトコルを改変することによって作製され得る。
【１０８４】
簡単には、IgG分子のヒトFc部分は、以下に記載の配列の5'および3'末端にわたるプライマーを使用してPCR増幅され得る。これらのプライマーはまた、発現ベクター（好ましくは、哺乳動物発現ベクター）へのクローニングを容易にする都合の良い制限酵素部位を有するべきである。
【１０８５】
例えば、pC4（受託番号第209646号）が使用される場合、ヒトFc部分は、BamHIクローニング部位に連結され得る。3'BamHI部位が破壊されるべきであることに注意のこと。次に、ヒトFc部分を含有するベクターが、このBamHIによって再び制限処理され、ベクターを直線化し、そして実施例１に記載するPCRプロトコルによって単離された本発明のポリヌクレオチドが、このBamHI部位に連結される。ポリヌクレオチドは、終止コドンなしにクローン化され、そうでなければ、融合タンパク質は産生されないことに注意すること。
【１０８６】
天然に存在するシグナル配列が分泌タンパク質を産生するために使用される場合、pC4は、第二のシグナルペプチドを必要としない。あるいは、天然に存在するシグナル配列が使用されない場合、ベクターは異種シグナル配列を含むように改変され得る。（例えば、WO96/34891を参照のこと。）
ヒトIgG Fc領域：
【１０８７】
【化１００】
2010279364.tif 000099
実施例10：ポリぺプチドからの抗体の産生
本発明の抗体は、種々の方法によって調製され得る。（CurrentProtocols, 第２章を参照のこと。）例えば、本発明のポリぺプチドを発現する細胞は、ポリクローナル抗体を含む血清の産生を誘導するために動物に投与される。好ましい方法において、分泌タンパク質の調製物が調製され、そして精製されて、実質的に天然の夾雑物を含まないようにする。次いで、このような調製物は、より大きな比活性のポリクローナル抗血清を生成するために動物に導入される。
【１０８８】
最も好ましい方法において、本発明の抗体は、モノクローナル抗体（または、そのタンパク質結合フラグメント）である。このようなモノクローナル抗体は、ハイブリドーマ技術を使用して調製され得る。（Kohlerら、Nature 256:495 (1975); Kohlerら、Eur. J. Immunol. 6:511(1976); Kohlerら、Eur.J. Immunol. 6:292(1976); Hammerlingら：Monoclonal Antibodiesand T-Cell Hybridomas, Elsevier, N.Y.、563-681頁（1981)。)  一般に、このような手順は、動物（好ましくは、マウス）をポリぺプチドで免疫化すること、またはより好ましくは、分泌ポリぺプチド発現細胞で免疫化することを含む。このような細胞は、任意の適切な組織培養培地において培養され得る；しかし、10％ウシ胎仔血清（約56℃で不活化した）を補充し、そして約10g/lの非必須アミノ酸、約1,000U/mlのペニシリン、および約100μg/mlのストレプトマイシンを補充したEarle改変Eagle培地において細胞を培養することが好ましい。
【１０８９】
このようなマウスの脾細胞は抽出され、そして適切なミエローマ細胞株と融合される。任意の適切なミエローマ細胞株は、本発明に従って使用され得る；しかし、ATCCから入手可能な親ミエローマ細胞株（SP2O）を使用することが好ましい。融合後、得られるハイブリドーマ細胞を、HAT培地において選択的に維持し、次いでWandsら（Gastroenterology80:225-232 (1981)）に記載されるように限界希釈によってクローニングする。次いで、このような選択によって得られるハイブリドーマ細胞は、ポリぺプチドに結合し得る抗体を分泌するクローンを同定するためにアッセイされる。
【１０９０】
あるいは、ポリぺプチドに結合し得るさらなる抗体を、抗イディオタイプ抗体を使用して２工程の手順において生成し得る。このような方法は、抗体それ自体が抗原であり、それゆえ第二の抗体に結合する抗体を得ることが可能であるという事実を利用する。この方法に従って、タンパク質特異的抗体が使用されて、動物（好ましくは、マウス）を免疫する。次いで、このような動物の脾細胞を使用して、ハイブリドーマ細胞を産生する。そして、ハイブリドーマ細胞は、タンパク質特異的抗体に結合する能力がポリぺプチドによってブロックされ得る抗体を産生するクローンを同定するためにスクリーニングされる。このような抗体は、タンパク質特異的抗体に対する抗イディオタイプ抗体を含み、そしてさらなるタンパク質特異的抗体の形成を誘導する動物を免疫するために使用され得る。
【１０９１】
FabおよびF(ab')2ならびに本発明の抗体の他のフラグメントは、本明細書中で開示される方法に従って使用され得ることが理解される。このようなフラグメントは、代表的には、パパイン（Fabフラグメントを産生するために）またはペプシン（F(ab')2フラグメントを産生するために）のような酵素を使用して、タンパク質分解性切断によって産生される。あるいは、分泌タンパク質結合フラグメントは、組換えDNA技術の適用により、または合成化学により、産生され得る。
【１０９２】
ヒトにおける抗体のインビボ使用のために、「ヒト化」キメラモノクローナル抗体を使用することが好ましくあり得る。このような抗体は、上記のモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ細胞に由来する遺伝構築物を使用することによって産生され得る。キメラ抗体を産生するための方法は当該分野で公知である。（総説については、Morrison, Science 229: 1202 (1985); Oiら、BioTechniques 4:214 (1986);Cabillyら、米国特許第4,816,567号；Taniguchiら、EP 171496；Morrisonら、EP 173494；Neubergerら、WO8601533；Robinsonら、WO 8702671；Boulianneら、Nature 312:643 (1984)；Neubergerら、Nature314:268(1985)を参照のこと。）
実施例11：高処理能力スクリーニングアッセイのための分泌タンパク質の産生
以下のプロトコルは、試験されるべきポリぺプチドを含有する上清を産生する。次いで、この上清は、実施例13〜20に記載されるスクリーニングアッセイにおいて使用され得る。
【１０９３】
第一に、ポリ-D-リジン（644 587 Boehringer-Mannheim）ストック溶液（PBS中に1mg/ml）を、PBS（w/oカルシウムまたはマグネシウム17-516FBiowhittaker）中で1:20に希釈して、作業溶液50μg/mlにする。200μlのこの溶液を、各ウェル（24ウェルプレート）に添加し、室温で20分間インキュベートする。溶液を各ウェルに分配させることを確実にする（注：１２チャンネルピペッターは、１つおきのチャンネルにチップをつけて使用され得る）。ポリ-D-リジン溶液を吸引除去し、そして１mlPBS（リン酸緩衝化生理食塩水）でリンスする。PBSは、細胞をプレートする直前までウェル中に残るべきであり、そしてプレートは２週間前まで前もってポリリジンでコーティングされ得る。
【１０９４】
293T細胞（これは、P+20を過ぎて細胞を保有しない）を、２×105細胞/ウェルで、0.5mlのDMEM（Dulbecco改変Eagle培地）（4.5g/LのグルコースおよびL-グルタミン（12-604FBiowhittaker)/10％熱非働化FBS（14-503F Biowhittaker)/１×Penstrep(17-602E Biowhittaker)を含む）中にプレートする。細胞を一晩増殖させる。
【１０９５】
翌日、滅菌溶液容器（basin）：300μlリポフェクトアミン（18324-012Gibco/BRL）および5ml Optimem I(31985070 Gibco/BRL)/96ウェルプレート中で一緒に混合する。小容量のマルチチャンネルピペッターを用いて、実施例８または９に記載する方法によって産生されたポリヌクレオチドインサートを含有する約２μgの発現ベクターを、適切にラベルが付けられた96ウェルの丸底プレート中にアリコートする。マルチチャンネルピペッターを用いて、50μlのリポフェクトアミン/OptimemI混合物を各ウェルに添加する。上下にピペッティングして混合する。室温で15〜45分間インキュベートする。約20分後、マルチチャンネルピペッターを使用して150μlのOptimemIを各ウェルに添加する。コントロールとして、インサートを欠失するベクターDNAの１つのプレートは、トランスフェクションの各セットでトランスフェクトされるべきである。
【１０９６】
好ましくは、トランスフェクションは、以下の作業をタッグチームを組んで（tag-teaming）行うべきである。タッグチームを組むことによって、時間に関する労力は半分にされ、そして細胞をPBS上であまり多くの時間過ごさせない。まず、Ａさんは、培地を細胞の４つの24ウェルプレートから吸引除去し、次いでＢさんが0.5〜１mlのPBSで各ウェルをリンスする。次いで、Ａさんは、PBSリンスを吸引除去し、そしてＢさんは、チャンネル１つおきにチップのついた12チャンネルピペッターを使用して、200μlのDNA/リポフェクトアミン/OptimemI複合体を、まず奇数のウェルに、次いで偶数のウェルにと、24ウェルプレート上の各列に添加する。37℃で６時間インキュベートする。
【１０９７】
細胞をインキュベートする間に、１×ペンストレップ（penstrep）を有するDMEM中の１％BSAか、または２mＭグルタミンおよび１×ペンストレップを含むCHO-5培地（116.6mg/LのCaCl2（無水物）；0.00130mg/LCuSO4-5H2O；0.050mg/LのFe(NO3)3-9H2O；0.417mg/LのFeSO4-7H2O；311.80mg/LのKCl；28.64mg/LのMgCl2；48.84mg/LのMgSO4；6995.50mg/LのNaCl；2400.0mg/LのNaHCO3；62.50mg/LのNaH2PO4-H2O；71.02mg/LのNa2HPO4；0.4320mg/LのZnSO4-7H2O；0.002mg/Lのアラキドン酸；1.022mg/Lのコレステロール；0.070mg/LのDL-α-トコフェロール-アセテート；0.0520mg/Lのリノール酸；0.010mg/Lのリノレン酸；0.010mg/Lのミリスチン酸；0.010mg/Lのオレイン酸；0.010mg/Lのパルミトオレイン酸（palmitricacid）；0.010mg/Lのパルミチン酸；100mg/LのPluronic F-68；0.010mg/Lのステアリン酸；2.20mg/LのTween80；4551mg/LのD-グルコース；130.85mg/mlのL-アラニン；147.50mg/mlのL-アルギニン-HCl；7.50mg/mlのL-アスパラギン-H2O；6.65mg/mlのL-アスパラギン酸；29.56mg/mlのL-シスチン、2HCl-H2O；31.29mg/mlのL-シスチン-2HCl；7.35mg/mlのL-グルタミン酸；365.0mg/mlのL-グルタミン；18.75mg/mlのグリシン；52.48mg/mlのL-ヒスチジン-HCl-H2O；106.97mg/mlのL-イソロイシン；111.45mg/mlのL-ロイシン；163.75mg/mlのL-リジンHCl；32.34mg/mlのL-メチオニン；68.48mg/mlのL-フェニルアラニン；40.0mg/mlのL-プロリン；26.25mg/mlのL-セリン；101.05mg/mlのL-スレオニン；19.22mg/mlのL-トリプトファン；91.79mg/mlのL-チロシン-2Na-2H2O；99.65mg/LのL-バリン；0.0035mg/Lのビオチン；3.24mg/LのD-パントテン酸Ca；11.78mg/Lの塩化コリン；4.65mg/Lの葉酸；15.60mg/Lのi-イノシトール；3.02mg/Lのナイアシンアミド；3.00mg/LのピリドキサールHCl；0.031mg/LのピリドキシンHCl；0.319mg/Lのリボフラビン；3.17mg/LのチアミンHCl；0.365mg/Lのチミジン；および0.680mg/LのビタミンB12；25mMのHEPES緩衝剤；2.39mg/LのヒポキサンチンNa；0.105mg/Lのリポ酸；0.081mg/Lのプトレシンナトリウム-2HCl；55.0mg/Lのピルビン酸ナトリウム；0.0067mg/Lの亜セレン酸ナトリウム；20μMのエタノールアミン；0.122mg/Lのクエン酸第二鉄；リノール酸と複合体化した41.70mg/Lのメチル-B-シクロデキストリン；オレイン酸と複合体化した33.33mg/Lのメチル-B-シクロデキストリン；ならびにレチナールと複合体化した10mg/Lのメチル-B-シクロデキストリン）のいずれかの適切な培地を調製する。（10％BSAストック溶液については、1LDMEM中に溶解したBSA(81-068-3 Bayer) 100gを溶解）。培地を濾過し、そして50μlを内毒素アッセイのために15mlポリスチレンコニカル中に収集する。
【１０９８】
トランスフェクション反応を、好ましくはタッグチームを組んでインキュベーション時間の終わりに終結させる。Ａさんは、トランスフェクション培地を吸引除去し、その間Ｂさんは、1.5mlの適切な培地を各ウェルに添加する。使用する培地に依存して45または72時間、37℃でインキュベートする：１％BSAは45時間、またはCHO-5は72時間。
【１０９９】
４日目に、300μlのマルチチャンネルピペッターを使用して、600μlを１mlの深底ウェルプレートにアリコートし、そして残りの上清を２mlの深底ウェルにアリコートする。次いで、各ウェルからの上清を実施例13〜20に記載するアッセイにおいて使用し得る。
【１１００】
活性が、上清を使用して以下に記載する任意のアッセイにおいて得られる場合、活性は、ポリぺプチドから直接に（例えば、分泌タンパク質として）か、または他のタンパク質の発現を誘導するポリぺプチドによって（これは、次いで上清中に分泌される）のいずれかに由来することが特に理解される。従って、本発明はさらに、特定のアッセイにおける活性によって特徴づけられる上清中のタンパク質を同定する方法を提供する。
【１１０１】
実施例12：GASレポーター構築物の構築
細胞の分化および増殖に関与する１つのシグナル伝達経路は、Jak-STAT経路と呼ばれる。Jak-STAT経路において活性化されたタンパク質は、多くの遺伝子のプロモーターに位置する、γ活性化部位「GAS」エレメントまたはインターフェロン感受性応答エレメント（「ISRE」）に結合する。これらのエレメントに対するタンパク質の結合は、関連する遺伝子の発現を変化させる。
【１１０２】
GASおよびISREエレメントは、シグナルトランスデューサーおよび転写のアクチベーター、すなわち「STAT」と呼ばれる転写因子のクラスによって認識される。STATファミリーの６つのメンバーが存在する。Stat1およびStat3は、Stat2と同様に（IFNαに対する応答が広範であるように）、多くの細胞型において存在する。Stat4は、より制限されており、そして多くの細胞型において存在しないが、IL-12での処理後のＴヘルパークラスＩ細胞に見出されている。Stat5は、元々は乳房成長因子と呼ばれたが、骨髄細胞を含む他の細胞においてより高い濃度で見出されている。それは、多くのサイトカインによって組織培養細胞において活性化され得る。
【１１０３】
STATは活性化されて、Janus Kinase（「Jak」）ファミリーとして知られるキナーゼのセットによってチロシンリン酸化に際して細胞質から核へ移動する。Jakは、可溶性のチロシンキナーゼの独特のファミリーを代表し、そしてTyk2、Jak1、Jak2、およびJak3を含む。これらのキナーゼは、有意な配列類似性を示し、そして一般に休止細胞において触媒的に不活性である。
【１１０４】
Jakは、以下の表によって要約されるように広範なレセプターによって活性化される。（SchidlerおよびDarnell,Ann. Rev. Biochem. 64:621-51(1995)による総説から改変。）Jakを活性化し得るサイトカインレセプターファミリーは、２つの群に分けられる：（ａ）クラスＩは、IL-2、IL-3、IL-4、IL-6、IL-7、IL-9、IL-11、IL-12、IL-15、Epo、PRL、GH、G-CSF、GM-CSF、LIF、CNTF、およびトロンボポエチンについてのレセプターを含む；そして（ｂ）クラス２は、IFN-a、IFN-g、およびIL-10を含む。クラス１レセプターは、保存されたシステインモチーフ（４つの保存されたシステインおよび１つのトリプトファンのセット）、およびWSXWSモチーフ（Trp-Ser-Xxx-Trp-Ser（配列番号２）をコードする膜近接領域）を共有する。
【１１０５】
従って、リガンドのレセプターへの結合の際、Jakは活性化され、これは次いでSTATを活性化し、これは、次いでトランスロケーションし、そしてGASエレメントに結合する。この全プロセスは、Jak-STATシグナル伝達経路に包含される。
【１１０６】
それゆえ、GASまたはISREエレメントの結合によって反映されるJak-STAT経路の活性化は、細胞の増殖および分化に関与するタンパク質を示すために使用され得る。例えば、成長因子およびサイトカインは、Jak-STAT経路を活性化することが知られる。（以下の表を参照のこと。）従って、レポーター分子に連結したGASエレメントを使用することにより、Jak-STAT経路のアクチベーターが同定され得る。
【１１０７】
【化１０２】
2010279364.tif 000100
実施例13〜14に記載される生物学的アッセイにおいて使用されるプロモーターエレメントを含む合成GASを構築するために、PCRに基づいたストラテジーをGAS-SV40プロモーター配列を生成するために採用する。5'プライマーは、IRF1プロモーターにおいて見出され、そして一定の範囲のサイトカインでの誘導の際にSTATに結合することが以前に証明されたGAS結合部位の４つのタンデムなコピーを含むが（Rothmanら、Immunity1: 457-468 (1994)）、他のGASまたはISREエレメントを代わりに使用し得る。5'プライマーはまた、SV40初期プロモーター配列に対して相補的な18bpの配列も含み、そしてXhoI部位に隣接する。5'プライマーの配列は以下である：
【１１０８】
【化１０３】
2010279364.tif 000101
。
【１１０９】
下流プライマーはSV40プロモーターに対して相補的であり、Hind III部位に隣接する：5':GCGGCAAGCTTTTTGCAAAGCCTAGGC:3'（配列番号４）。
【１１１０】
PCR増幅を、Clontechから入手したB-gal:プロモータープラスミド中に存在するSV40プロモーターのテンプレートを用いて実施する。得られたPCRフラグメントをXhoI/HindIIIを用いて消化し、そしてBLSK2-（Stratagene）にサブクローニングする。正方向および逆方向のプライマーを用いる配列決定により、挿入物が以下の配列を含むことを確認する：
【１１１１】
【化１０４】
2010279364.tif 000102
。
【１１１２】
次に、SV40プロモーターに結合したこのGASプロモーターエレメントを用いて、GAS:SEAP2レポーター構築物を操作する。ここで、レポーター分子は、分泌型アルカリホスファターゼ、すなわち「SEAP」である。しかしながら、明らかに、この実施例または他の実施例のいずれにおいても、任意のレポーターの分子が、SEAPの代わりとなり得る。SEAPの代わりに使用され得る周知のレポーター分子としては、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ（CAT）、ルシフェラーゼ、アルカリホスファターゼ、Ｂ-ガラクトシダーゼ、グリーン蛍光タンパク質（GFP)、または抗体により検出可能な任意のタンパク質が挙げられる。
【１１１３】
合成GAS-SV40プロモーターエレメントと確認された上記の配列を、GAS-SEAPベクターを作製するために、HindIIIおよびXhoIを用いて、SV40プロモーターを、増幅したGAS:SV40プロモーターエレメントで効率的に置換し、Clontechから入手したpSEAP-プロモーターベクターにサブクローニングする。しかしながらこのベクターはネオマイシン耐性遺伝子を含まず、それゆえ、哺乳動物の発現系には好ましくない。
【１１１４】
従って、GAS-SEAPレポーターを発現する哺乳動物の安定な細胞株を作製するために、GAS-SEAPカセットをSalIおよびNotIを用いて、GAS-SEAPベクターから取り出し、そしてGAS-SEAP/Neoベクターを作製するために、マルチクローニング部位におけるこれらの制限部位を用いて、ネオマイシン耐性遺伝子を含むバックボーンベクター（例えば、pGFP-1(Clontech)）に挿入する。一旦、このベクターを哺乳動物細胞にトランスフェクトすれば、このベクターは実施例13〜14に記載されるようにGAS結合のためのレポーター分子として使用され得る。
【１１１５】
他の構築物を、上記の記載を使用し、そしてGASを異なるプロモーター配列で置換して作製し得る。例えば、NFK-BおよびEGRプロモーター配列を含むレポーター分子の構築を、実施例15および16に記載する。しかし、多くの他のプロモーターは、これらの実施例に記載のプロトコルを使用して置換し得る。例えば、SRE、IL-2、NFAT、またはオステオカルシンのプロモーターを単独または組み合わせ（例えば、GAS/NF-KB/EGR、GAS/NF-KB、Il-2/NFAT、またはNF-KB/GAS）で置換し得る。同様に、他の細胞株（例えば、HELA（上皮細胞）、HUVEC（内皮細胞）、Reh（Ｂ細胞）、Saos-2（骨芽細胞）、HUVAC（大動脈細胞）、または心筋細胞）を、レポーター構築物の活性を試験するために使用し得る。
【１１１６】
実施例13：Ｔ細胞の活性についての高処理能力スクリーニングアッセイ
以下のプロトコルを、例えば、Ｔ細胞を増殖または分化させ得る増殖因子およびサイトカインのような因子を同定することによりＴ細胞の活性を評価するために使用する。Ｔ細胞の活性を実施例12で作製したGAS/SEAP/Neo構築物を用いて評価する。従って、SEAP活性を増加させる因子は、Jaks-STATSシグナル伝達経路を活性化する能力を示す。このアッセイに使用したＴ細胞はJurkatＴ細胞（ATCC受託番号TIB-152）であるが、Molt-3細胞（ATCC受託番号CRL-1552）およびMolt-4細胞（ATCC受託番号CRL-1582）細胞もまた使用し得る。
【１１１７】
Jurkat Ｔ細胞は、リンパ芽球性CD4+ Th1ヘルパー細胞である。安定な細胞株を作製するために、およそ200万のJurkat細胞をDMRIE-C（LifeTechnologies）を用いて、GAS-SEAP/neoベクターでトランスフェクト（以下に記載のトランスフェクション手順）する。トランスフェクトした細胞をおよそ20,000細胞／ウェルの密度で播種し、そして1mg/mlのジェネティチシン（genticin）に対して耐性であるトランスフェクタントを選択する。耐性コロニーを増殖させ、次いで、漸増する濃度のインターフェロンγに対するそれらの応答について試験する。選択したクローンの用量応答を示す。
【１１１８】
詳細には、以下のプロトコルにより、200μlの細胞を含む75のウェルについて十分な細胞を得る。従って、複数の96ウェルプレートについて十分な細胞を産生するために、スケールアップするか、または複数で実施するかのいずれかである。Jurkat細胞を1%のPen-Strepを有するRPMI+10%血清中で維持する。T25フラスコ中で2.5mlのOPTI-MEM（Life Technologies）と10μgのプラスミドDNAを組み合わせる。50μlのDMRIE-Cを含む2.5mlのOPTI-MEMを添加し、そして、室温で15〜45分間インキュベートする。
【１１１９】
インキュベート期間の間、細胞濃度をカウントし、必要な数の細胞（トランスフェクションあたり107個）をスピンダウンし、そして最終濃度が107細胞/mlとなるようOPTI-MEM中で再懸濁する。次いで、１mlのOPTI-MEM中の１×107個の細胞をT25フラスコに加え、そして37℃で６時間インキュベートする。インキュベーションの後、10mlのRPMI+15%血清を添加する。
【１１２０】
Jurkat:GAS-SEAP安定レポーター株をRPMI+10% 血清、1mg/mlジェネティシン、および1% Pen-Strep中で維持する。これらの細胞を実施例11に記載されるプロトコルにより産生されるようなポリペプチドを含む上清で処理する。
【１１２１】
上清で処理する日に、細胞を洗浄すべきであり、そして1mlあたり500,000個の細胞の密度となるまで新鮮なRPMI+10%血清中に再懸濁するべきである。必要な細胞の正確な数は、スクリーニングされる上清の数に依存する。１枚の96ウェルプレートについて、およそ1000万個の細胞（10枚のプレートについては１億個の細胞）が必要である。
【１１２２】
細胞を96ウェルのディッシュに分配するために、12チャンネルのピペットを用いて三角のリザーバーボートに細胞を移す。200μlの細胞を、12チャンネルのピペットを用いて、それぞれのウェルに移す（従って、１ウェル当たり100,000個の細胞を添加する）。
【１１２３】
全てのプレートに播種した後、50μlの上清を、12チャンネルピペットを用いて、上清を含む96ウェルプレートから各ウェルに直接的に移す。さらに、外来性のインターフェロンγの用量（0.1、1.0、10ng）を、ウェルH9、ウェルH10、およびウェルH11に添加し、アッセイについてのさらなる陽性コントロールとして供する。
【１１２４】
上清で処理したJurkat細胞を含む96ウェルディッシュをインキュベーターに48時間置く（注：この時間は48〜72時間の間で変化可能である）。次いで、各ウェルから35μlのサンプルを12チャンネルのピペットを用いて、不透明な96ウェルプレートに移す。不透明なプレートを（セロファン（sellophene）のカバーを用いて）覆うべきであり、そして実施例17に従ってSEAPアッセイを行うまで、−20℃で保存するべきである。残存する処理した細胞を含むプレートを４℃に置き、そして、所望するならば、特定のウェル上でのアッセイを繰り返すための物質の供給源として供する。
【１１２５】
陽性コントロールとして、100ユニット/mlのインターフェロンγを使用し得る。インターフェロンγは、JurkatＴ細胞を活性化することが公知である。代表的には、30倍を超える誘導が、陽性コントロールのウェルにおいて観察される。
【１１２６】
実施例14：骨髄性の活性を同定する高処理能力スクリーニングアッセイ
以下のプロトコルを、骨髄性細胞を増殖または分化させ得る増殖因子およびサイトカインのような因子を同定することにより骨髄性の活性を評価するために使用する。骨髄性細胞活性を実施例12において産生されたGAS/SEAP/Neo構築物を用いて評価する。従って、SEAP活性を増加させる因子は、Jaks-STATSシグナル伝達経路を活性化する能力を示す。このアッセイに使用した骨髄性細胞は、U937、前単球（pre-monocyte）細胞株であるが、TF-1、HL60、またはKG1も使用し得る。
【１１２７】
U937細胞を、実施例12において産生されたGAS/SEAP/Neo構築物で、一過性にトランスフェクトするために、DEAE-Dextran法（Kharbandaら、1994,CellGrowth & Differentiation, 5: 259-265）を用いる。最初に、２×107個のU937細胞を回集し、そしてPBSで洗浄する。U937細胞を、通常、100単位/mlのペニシリンおよび100mg/mlのストレプトマイシンを補充した10%熱非働化ウシ胎仔血清（FBS）を含むRPMI 1640培地中で増殖させる。
【１１２８】
次に、0.5mg/ml DEAE-Dextran、8μgのGAS-SEAP2プラスミドDNA、140mMNaCl、5mM KCl、375μM Na2HPO4.7H2O、1mM MgCl2、および675μMCaCl2を含む１mlの20mM Tris-HCl（pH 7.4）緩衝液に細胞を懸濁する。37℃で45分間インキュベートする。
【１１２９】
10% FBSを含むRPMI 1640培地で細胞を洗浄し、次いで、10mlの完全培地に再懸濁し、そして37℃で36時間インキュベートする。
【１１３０】
GAS-SEAP/U937安定細胞を、400μg/mlのG418中で細胞を増殖させることにより得る。G418を含まない培地を日常的な増殖のために使用するが、１〜２ヶ月毎に、細胞を二継代の間、400μg/mlG418中で再増殖させるべきである。
【１１３１】
これらの細胞を１×108個の細胞を回集すること（これは10枚の96ウェルプレートアッセイのために十分である）により試験し、そしてPBSで洗浄する。上記の増殖培地200ml中で、５×105細胞/mlの最終密度で細胞を懸濁する。96ウェルプレートにおいて１ウェルあたり200μlの細胞をプレートする（すなわち、１×105細胞/ウェル）。
【１１３２】
実施例11に記載されるプロトコルにより調製された上清を50μl添加する。37℃で48〜72時間インキュベートする。陽性コントロールとして、100単位/mlのインターフェロンγを使用し得る。インターフェロンγはU937細胞を活性化させることが公知である。代表的には、30倍を超える誘導が、陽性コントロールウェルにおいて観察される。SEAPは、実施例17に記載のプロトコルに従って上清をアッセイする。
【１１３３】
実施例15：ニューロン活性を同定する高処理能力スクリーニングアッセイ
細胞が分化および増殖をうける場合、遺伝子群は多くの異なるシグナル伝達経路を介して活性化される。これらの遺伝子の１つであるEGR1（初期増殖応答遺伝子１）を活性化時に種々の組織および細胞型において誘導する。EGR1のプロモーターはこのような誘導を担う。レポーター分子に結合したEGR1プロモーターを使用して、細胞の活性化を評価し得る。
【１１３４】
詳細には、以下のプロトコルをPC12細胞株におけるニューロン活性を評価するために使用する。PC12細胞（ラット褐色細胞腫（phenochromocytoma）細胞）は、多くのマイトジェン（例えば、TPA（テトラデカノイルホルボールアセテート）、NGF（神経成長因子）、およびEGF（上皮増殖因子））での活性化により増殖および／または分化することが公知である。この処理の間にEGR1遺伝子発現を活性化する。従って、PC12細胞を、SEAPレポーターに結合したEGRプロモーターを含む構築物で、安定にトランスフェクトすることにより、PC12細胞の活性化を評価し得る。
【１１３５】
EGR/SEAPレポーター構築物を以下のプロトコルにより組み立て得る。EGR-1プロモーター配列（-633〜+1）（SakamotoKら、Oncogene 6: 867-871(1991)）を以下のプライマーを用いて、ヒトゲノムDNAからPCR増幅し得る：
【１１３６】
【化１０５】
2010279364.tif 000103
次いで、実施例12において生成したGAS:SEAP/Neoベクターを使用して、EGR1増幅産物をこのベクターに挿入し得る。制限酵素XhoI/HindIIIを使用してGAS:SEAP/Neoベクターを線状化し、GAS/SV40スタッファー（stuffer）を取り除く。これらの同じ酵素を用いて、EGR1増幅産物を制限処理する。ベクターとEGR1プロモーターとを連結する。
【１１３７】
細胞培養のための96ウェルプレートを調製するために、コーティング溶液（コラーゲンＩ型（UpstateBiotech Inc. カタログ番号08-115）を含む30%エタノール（滅菌濾過されたもの）での1:30希釈）を１枚の10cmプレートあたり2ml、または96ウェルプレートのウェルあたり50μl添加し、そして２時間風乾させる。
【１１３８】
PC12細胞を、予めコートした10cm組織培養ディッシュ上で、100単位/mlペニシリンおよび100μg/mlストレプトマイシンを補充した、10%ウマ血清（JRH BIOSCIENCES カタログ番号12449-78P）、5% 熱非働化ウシ胎仔血清（FBS）を含むRPMI-1640培地（BioWhittaker）中で日常的に増殖させる。１つから４つへの分割を３〜４日毎に行う。細胞を掻き取ることによりプレートから取り出し、そして15回より多くの間、上下にピペッティングし再懸濁する。
【１１３９】
EGR/SEAP/Neo構築物を、実施例11に記載のLipofectamineプロトコルを使用して、PC12にトランスフェクトする。EGR-SEAP/PC12安定細胞を300μg/mlのG418中で細胞を増殖させることにより得る。G418を含まない培地を日常的な増殖のために使用するが、１〜２ヶ月毎に、細胞を２継代の間、300μg/mlのG418中で再増殖させるべきである。
【１１４０】
ニューロン活性をアッセイするために、およそ70〜80%コンフルエントである細胞を有する10cmプレートを、古い培地を除去することによりスクリーニングする。細胞をPBS（リン酸緩衝化生理食塩水）を用いて１回洗浄する。次いで、細胞を低血清培地（抗生物質とともに1%ウマ血清および0.5% FBSを含むRPMI-1640）中で一晩、飢餓させる。
【１１４１】
翌朝、培地を除去し、そしてPBSで細胞を洗浄する。プレートから細胞を掻き取り、細胞を2mlの低血清培地中でよく懸濁する。細胞数をカウントし、そしてより低血清の培地を添加し、５×105細胞/mlの最終細胞密度に到達させる。
【１１４２】
200μlの細胞懸濁液を96ウェルプレートの各ウェルに添加する（１×105細胞/ウェルに等しい）。実施例11により産生された50μlの上清を、37℃で48〜72時間加える。陽性コントロールとして、EGRを介してPC12細胞を活性化することが公知の成長因子（例えば、50ｎg/μlのニューロン成長因子（NGF））を使用し得る。代表的には、陽性コントロールウェルにおいて50倍を超えるSEAP誘導が見られる。SEAPは実施例17に従って、上清をアッセイする。
【１１４３】
実施例16：Ｔ細胞の活性についての高処理能力スクリーニングアッセイ
NF-κB（核因子κB）は、広範な種々の薬剤（炎症性サイトカインであるIL-1およびTNF、CD30およびCD40、リンホトキシン-αおよびリンホトキシン-βを含む）により、LPSまたはトロンビンへの曝露により、ならびに特定のウイルス遺伝子産物の発現により活性化される転写因子である。転写因子として、NF-κBは免疫細胞の活性化に関与する遺伝子の発現、アポトーシスの制御（NF-κBは、アポトーシスから細胞を保護するために出現する）、Ｂ細胞およびＴ細胞の発生、抗ウイルス応答および抗菌応答、ならびに複数のストレス応答を調節する。
【１１４４】
刺激されない条件において、NF-κBはI-κB（インヒビターκB）を有する細胞質に保持される。しかしながら、刺激の際に、I-κBはリン酸化され、そして分解（degraded）され、NF-κBの核への往復（shuttle）を引き起こす。これにより標的遺伝子の転写を活性化する。NF-κBにより活性化される標的遺伝子としては、IL-2、IL-6、GM-CSF、ICAM-1およびMHCクラスＩが挙げられる。
【１１４５】
その中心的な役割および一定の範囲の刺激に応答する能力に起因して、NF-κBプロモーターエレメントを利用するレポーター構築物を、実施例11において産生された上清をスクリーニングするために使用する。NF-κBのアクチベーターまたはインヒビターは、疾患の処置に有用である。例えば、NF-κBのインヒビターを、NF-κBの急性または慢性の活性化に関連する疾患（例えば、慢性関節リウマチ）を処置するために使用し得る。
【１１４６】
NF-κBプロモーターエレメントを含むベクターを構築するために、PCRに基づいたストラテジーを採用する。上流のプライマーは、NF-κB結合部位（GGGGACTTTCCC）（配列番号８）の４つのタンデムなコピー、SV40初期プロモーター配列の5'末端に対して相補的な18bpの配列を含み、そしてXhoI部位に隣接する：
【１１４７】
【化１０６】
2010279364.tif 000104
。
【１１４８】
下流プライマーは、SV40プロモーターの3'末端に対して相補的であり、そしてHindIII部位に隣接する：
5':GCGGCAAGCTTTTTGCAAAGCCTAGGC:3'（配列番号４）。
【１１４９】
PCR増幅を、Clontechから入手したpB-gal:プロモータープラスミドに存在するSV40プロモーターのテンプレートを使用して行う。得られたPCRフラグメントをXhoIおよびHindIIIで消化し、そしてBLSK2-（Stratagene）にサブクローニングする。T7およびT3プライマーを用いる配列決定により、挿入物が以下の配列を含むことを確認する：
【１１５０】
【化１０８】
2010279364.tif 000105
。
【１１５１】
次に、XhoIおよびHindIIIを使用して、pSEAP2-プロモータープラスミド（Clontech）に存在するSV40最小プロモーターエレメントをこのNF-κB/SV40フラグメントと置換する。しかしながら、このベクターはネオマイシン耐性遺伝子を含まず、それゆえ哺乳動物の発現系には好ましくない。
【１１５２】
安定な哺乳動物細胞株を作製するために、NF-κB/SV40/SEAPカセットを制限酵素SalIおよびNotIを使用して上記のNF-κB/SEAPベクターから取り出し、そしてネオマイシン耐性を含むベクターに挿入する。詳細には、SalIおよびNotIでpGFP-Iを制限処理した後に、NF-κB/SV40/SEAPカセットをpGFP-I（Clontech）に挿入し、GFP遺伝子を置換した。
【１１５３】
一旦、NF-κB/SV40/SEAP/Neoベクターを作製した後は、実施例13に記載のプロトコルに従って、安定なJurkatＴ細胞を作製し、そして維持する。同様に、これらの安定なJurkat Ｔ細胞を含む上清をアッセイするための方法がまた、実施例13に記載される。陽性コントロールとして、外因性のTNFα（0.1、1、10ng）をウェルH9、H10、およびH11に添加すると、代表的には、５〜10倍の活性化が観察される。
【１１５４】
実施例17：SEAP活性についてのアッセイ
実施例13〜16に記載されるアッセイのためのレポーター分子として、SEAP活性を、以下の一般的な手順に従ってTropixPhospho-light Kit（カタログ番号BP-400）を用いて、アッセイする。Tropix Phospho-light Kitは、以下で使用される希釈緩衝液、アッセイ緩衝液、および反応緩衝液を供給する。
【１１５５】
2.5×希釈緩衝液でディスペンサーを満たし、そして15μlの2.5×希釈緩衝液を35μlの上清を含むオプティプレート（Optiplate）に分与する。プラスチックシーラーでプレートをシールし、そして65℃で30分間インキュベートする。一様でない加温を避けるためにオプティプレートを引き離す。
【１１５６】
サンプルを室温まで15分間冷却する。ディスペンサーを空にし、そしてアッセイ緩衝液を満たす。50μlのアッセイ緩衝液を添加し、そして室温で５分間インキュベートする。ディスペンサーを空にし、そして反応緩衝液を満たす（以下の表を参照のこと）。50μlの反応緩衝液を添加し、そして室温で20分間インキュベートする。化学発光シグナルの強度は時間依存的であり、そしてルミノメーター上で５つのプレートを読むために約10分間を費やすので、５つのプレートをその度毎び処理すべきであり、10分後に２つ目のセットを開始するべきである。
【１１５７】
ルミノメーターにおける相対的な光の単位（light unit）を読みとる。ブランクとしてH12をセットし、そして結果を印字する。化学発光の増加は、レポーター活性を示す。
【１１５８】
【化１０９】
2010279364.tif 000106
実施例18:低分子の濃度および膜透過性における変化を同定する高処理能力スクリーニングアッセイ
レセプターへのリガンドの結合は、カルシウム、カリウム、ナトリウムのような低分子およびpHの細胞内レベルを変化させ、さらに膜電位を変化させることが公知である。これらの変化を特定細胞のレセプターに結合する上清の同定を行うアッセイで測定し得る。以下のプロトコルは、カルシウムについてのアッセイを記載するが、このプロトコルは、カリウム、ナトリウム、pH、膜電位、または蛍光プローブにより検出可能な任意の他の低分子における変化を検出するように容易に改変し得る。
【１１５９】
以下のアッセイは、蛍光測定画像化プレートリーダー(「FLIPR」)を使用して低分子と結合する蛍光分子（分子プローブ）における変化を測定する。明らかに、低分子を検出する任意の蛍光分子を本明細書で用いるカルシウム蛍光分子、fluo-3の代わりに使用し得る。
【１１６０】
接着細胞については、細胞を10,000〜20,000細胞／ウェルで、底が透明なCo-star黒色96-ウェルプレートに播種する。プレートをCO2インキュベーター内で20時間インキュベートする。接着細胞をBiotek洗浄器内で200μlのHBSS(Hank'sBalanced Salt Solution)で二回洗浄し、最後の洗浄後、緩衝液100μlを残す。
【１１６１】
1mg/ml fluo-3の貯蔵溶液を10％プルロニック（pluronic）酸性DMSOで作製する。細胞にfluo-3を負荷するため、12μg/mlのfluo-3を各ウェルに50μl添加する。このプレートをCO2インキュベーター中、37℃で60分間インキュベートする。プレートをBiotek洗浄器で、HBSSにより４回洗浄し、緩衝液100μlを残す。
【１１６２】
非接着細胞については、細胞を培養培地からスピンダウンする。細胞を２〜５×106細胞／mlに50mlのコニカルチューブ内でHBSSを用いて再懸濁する。1mg/mlのfluo-3の10％プルロニック酸性DMSO溶液４μlを細胞懸濁液１mlごとに加える。次に、チューブを37℃の水浴中に30〜60分間置く。細胞をHBSSで二回洗浄し、１×106細胞/mlに再懸濁し、そしてマイクロプレートに100μl/ウェルずつ分配する。プレートを1000rpmで５分間遠心分離する。次に、プレートをDenleyCellWash中で200μlで一回洗浄した後、吸引工程により最終容量を100μlにする。
【１１６３】
非細胞ベースのアッセイについては、各ウェルは、fluo-3のような蛍光分子を含有する。上清をウェルに添加し、そして蛍光変化を検出する。
【１１６４】
細胞内カルシウムの蛍光を測定するため、FLIPRを以下のパラメーターについて設定する：（１）システムゲインは、300〜800mW;（２）曝露時間は、0.4秒間；（３）カメラF/ストップは、F/2;（４）励起は488nm;（５）発光は530nm;および（６）サンプル添加量は50μl。530nmにおける発光の増加は、細胞内Ca++濃度の増加を生じる、細胞外シグナリング事象を示す。
【１１６５】
実施例19:チロシンキナーゼ活性を同定する高処理能力スクリーニングアッセイ
プロテインチロシンキナーゼ(PTK)は、多様な群の膜貫通キナーゼおよび細胞質キナーゼを表す。レセプタープロテインチロシンキナーゼ(RPTK)群には、PDGF、FGF、EGF、NGF、HGFおよびインスリンレセプターサブファミリーを含む一定の範囲の有糸分裂促進性および代謝性成長因子のレセプターがある。さらに、対応するリガンドが未知である大きなRPTKファミリーがある。RPTKのリガンドは、主として分泌型低分子タンパク質を含むが、膜結合型および細胞外マトリックスタンパク質も含有する。
【１１６６】
リガンドによるRPTKの活性化は、リガンド媒介レセプター二量体化を伴い、レセプターサブユニットのトランスリン酸化および細胞質チロシンキナーゼの活性化をもたらす。細胞質チロシンキナーゼとしては、srcファミリーのレセプター関連チロシンキナーゼ（例えば、src、yes、lck、lyn、fyn)、ならびにJakファミリーのような非レセプター結合型および細胞質ゾルプロテインチロシンキナーゼが挙げられる。Jakファミリーのメンバーは、サイトカインスーパーファミリーのレセプター（例えば、インターロイキン、インターフェロン、GM-CSFおよびレプチン（Leptin））によって誘発されるシグナル伝達を媒介する。
【１１６７】
チロシンキナーゼ活性を刺激し得る広範な公知の因子のため、チロシンキナーゼシグナル伝達経路を活性化し得る新規なヒト分泌タンパク質の同定は興味深い。従って、以下のプロトコルを設計して、チロシンキナーゼシグナル伝達経路を活性化し得るその新規なヒト分泌タンパク質を同定する。
【１１６８】
標的細胞（例えば、初代ケラチノサイト）を約25,000細胞／ウェルの密度で、NalgeNunc(Naperville,IL)から購入した96ウェルLoprodyne Silent Screen Platesに播種する。プレートを100％エタノールで30分間、二回リンスして滅菌し、水でリンスした後、一晩乾燥させる。幾つかのプレートを、100mlの細胞培養グレードI型コラーゲン(50mg/ml)、ゼラチン(2％)またはポリリジン(50mg/ml)（これらは全て、SigmaChemicals(St.Louis,MO)から購入し得る）で、またはBecton Dickinson(Bedford,MA)から購入した10％Matrigelで、または仔ウシ血清で２時間コートし、PBSでリンスした後、４℃で貯蔵する。増殖培地に5,000細胞／ウェルを播種し、製造業者のAlamarBiosciences,Inc.(Sacramento,CA)により記載されるように、48時間後にalamarBlueを使用して細胞数を間接定量することにより、これらのプレートでの細胞増殖をアッセイする。BectonDickinson(Bedford,MA)からのFalconプレートカバー#3071を使用し、Loprodyne Silent Screen Plateを覆う。FalconMicrotest III細胞培養プレートもまた、いくつかの増殖実験において使用し得る。
【１１６９】
抽出物を調製するため、A431細胞をLoprodyneプレートのナイロン膜上に播種し(20,000/200ml/ウェル)、そして完全培地内で一晩培養する。細胞を無血清基本培地中で24時間インキュベートして静止させる。EGF(60ng/ml)または実施例11で生成した上清50μlで５〜20分間処理した後、培地を除去し、100mlの抽出緩衝液（20mMHEPES pH7.5、0.15M NaCl、１％Triton X-100、0.1％SDS、2mM Na3VO4、2mMNa4P2O7およびBoeheringerMannheim(Indianapolis,IN)から入手したプロテアーゼインヒビターのカクテル(#1836170))を各ウェルに添加し、そしてプレートを旋回振盪器上、４℃で５分間振盪する。次に、プレートを減圧トランスファーマニホールド(vacuumtransfer manifold)に置き、そしてハウスバキュームを使用して抽出物を各ウェルの底の0.45mm膜で濾過する。抽出物をバキュームマニホールドの底の96-ウェル捕獲／アッセイプレートに集め、そして直ちに氷上に置く。遠心分離により明澄化した抽出物を得るため、界面活性剤で５分間可溶化した後、各ウェルの内容物を取り出し、４℃、16,000×gで15分間遠心分離する。
【１１７０】
濾過抽出物をチロシンキナーゼ活性のレベルについて試験する。チロシンキナーゼ活性を検出する多数の方法が公知であるが、本明細書においては方法の一つを記載する。
【１１７１】
一般的に、特異的な基質（ビオチン化ペプチド）上のチロシン残基をリン酸化する能力を測定することにより、上清のチロシンキナーゼ活性を評価する。この目的に使用し得るビオチン化ペプチドには、PSK1(細胞分裂キナーゼcdc2-p34のアミノ酸６〜20に対応）およびPSK2(ガストリンのアミノ酸１〜17に対応）が含まれる。両ペプチドは、ある範囲のチロシンキナーゼの基質であり、Boehringer Mannheimから入手可能である。
【１１７２】
以下の成分を順に添加することにより、チロシンキナーゼ反応をセットアップする。まず、５μMビオチン化ペプチド10μlを添加した後、次に、ATP/Mg2+(5mM ATP/50mM MgCl2)10μl、次に5×アッセイ緩衝液（40mM塩酸イミダゾール、pH7.3、40mMβ-グリセロホスフェート、1mM EGTA、100mM MgCl2、5mMMnCl2、0.5mg/ml BSA) 10μl、次にバナジン酸ナトリウム(1mM) ５μl、そして最後に水５μlを加える。成分を穏やかに混合し、反応混合物を30℃で２分間プレインキュベートする。コントロール酵素または濾過上清を10μl加えることにより反応を開始させる。
【１１７３】
次に、10μlの120mM EDTAを添加し、反応物を氷上に置くことにより、チロシンキナーゼアッセイ反応を終結させる。
【１１７４】
反応混合物の50μlのアリコートをマイクロタイタープレート(MTP)モジュールに移し、37℃で20分間インキュベートすることにより、チロシンキナーゼ活性を測定する。これにより、ストレプトアビジン(streptavadin)でコーティングした96ウェルプレートをビオチン化ペプチドと結合させる。MTPモジュールを300μl/ウェルのPBSで４回洗浄する。次に、西洋ワサビペルオキシダーゼ（抗P-Tyr-POD(0.5μ/ml))に結合体化した抗ホスホチロシン抗体75μlを、各ウェルに添加した後、37℃で１時間インキュベートする。ウェルを上記のように洗浄する。
【１１７５】
次に、ペルオキシダーゼ基質溶液(BoehringerMannheim)100μlを加え、室温で少なくとも５分間（30分間まで）インキュベートする。ELISAリーダーを使用して、405nmにおけるサンプルの吸光度を測定する。結合したペルオキシダーゼ活性のレベルをELISAリーダーを使用して定量し、これは、チロシンキナーゼ活性のレベルを反映する。
【１１７６】
実施例20:リン酸化活性を同定する高処理量スクリーニングアッセイ
実施例19に記載のタンパク質チロシンキナーゼ活性のアッセイの可能性のある代替および/または補完（compliment）として、主要な細胞内シグナル伝達中間体の活性化（リン酸化）を検出するアッセイもまた使用し得る。例えば、下記のように、一つの特定のアッセイは、Erk-1およびErk-2キナーゼのチロシンリン酸化を検出し得る。しかし、Raf、JNK、p38MAP、Mapキナーゼキナーゼ(MEK)、MEKキナーゼ、Src、筋肉特異的キナーゼ(MuSK)、IRAK、TecおよびJanusなどの他の分子、ならびに他の任意のホスホセリン、ホスホチロシンまたはホスホスレオニン分子のリン酸化を、以下のアッセイでこれらの分子をErk-1またはErk-2と置き換えることにより検出し得る。
【１１７７】
特に、96ウェルELISAプレートのウェルをプロテインG(1μg/ml)0.1mlにより室温(RT)で２時間コーティングしてアッセイプレートを作製する。次に、プレートをPBSでリンスし、３％BSA/PBSによりRTで１時間ブロックする。次に、プロテインGプレートをErk-1およびErk-2に対する二つの市販のモノクローナル抗体(100ng/ウェル）(SantaCruz Biotechnology)で処理（RTで１時間）する。（他の分子を検出するために、この工程を、上記の任意の分子を検出するモノクローナル抗体と交換することにより、容易に改変し得る）。PBSで３〜５回リンスした後、使用時まで、プレートを４℃で貯蔵する。
【１１７８】
A431細胞を20,000/ウェルで96ウェルLoprodyneフィルタープレートに播種し、増殖培地中で一晩培養する。次に、細胞を基本培地(DMEM)中で48時間飢餓させた後、EGF(6ng/ウェル）または実施例11で得た上清50μlで５〜20分間処理する。次に、細胞を可溶化し、抽出物を濾過して直接アッセイプレート内へ入れる。
【１１７９】
抽出物とともにRTで１時間インキュベートした後、ウェルを再度リンスする。陽性コントロールとして、市販のMAPキナーゼ調製物(10ng/ウェル）をA431抽出物の代わりに使用する。次に、プレートを、Erk-1およびErk-2キナーゼのリン酸化されたエピトープを特異的に認識する市販のポリクローナル（ウサギ）抗体(1μg/ml)で処理する(RTで１時間)。この抗体を標準的な手順によりビオチン化する。次に、結合したポリクローナル抗体をユーロピウムストレプトアビジン（Europium-streptavidin）およびユーロピウム（Europium）蛍光増強試薬とともにWallacDELFIA装置内で連続的にインキュベートすることによって定量する（時間分解型蛍光）。バックグラウンドを超える蛍光シグナルの増加は、リン酸化を示す。
【１１８０】
実施例21:ポリヌクレオチドに対応する遺伝子における変化の決定方法
目的の表現型（例えば、疾患）を提示する家族全員または個々の患者から単離されたRNAを単離する。次に、cDNAをこれらのRNAサンプルから当該分野で公知のプロトコルを使用して生成する（Sambrookを参照）。次に、cDNAを、配列番号Xにおける目的の領域を取り囲むプライマーを使用するPCRのテンプレートとして使用する。示唆されるPCR条件は、Sidransky,Dら、Science252:706(1991)に記載の緩衝溶液を使用し、95℃で30秒間;52〜58℃で60〜120秒間;および70℃で60〜120秒間の35サイクルからなる。
【１１８１】
次に、PCR産物を、SequiThermPolymerase(Epicentre Technologies)を用いて5'末端にT4ポリヌクレオチドキナーゼを標識したプライマーを使用して配列決定する。選択したエクソンのイントロン−エクソン境界もまた決定し、ゲノムPCR産物を分析してその結果を確認する。次に、疑わしい変異を有するPCR産物のクローン化および配列決定を行い、直接配列決定の結果を確認する。
【１１８２】
PCR産物を、Holton,T.A.およびGraham,M.W.,NucleicAcids Research,19:1156(1991)に記載のようにＴテールベクターにクローン化し、T7ポリメラーゼ(United StatesBiochemical)を用いて配列決定する。罹患個体を、非罹患個体には存在しない変異により同定する。
【１１８３】
ゲノム再配置もまた、ポリヌクレオチドに対応する遺伝子における改変を決定する方法として観察する。実施例２に従って単離したゲノムクローンを、ジゴキシゲニンデオキシ-ウリジン5'-三リン酸(Boehringer Manheim)でニックトランスレーションし、そしてJohnson, Cg.ら、MethodsCell Biol. 35: 73-99(1991)に記載のようにFISHを行う。対応するゲノムの遺伝子座への特異的ハイブリダイゼーションのために、大過剰のヒトcot-1DNAを用いて標識プローブとのハイブリダイゼーションを行う。
【１１８４】
染色体を、4,6-ジアミノ-2-フェニルインドール（4,6-diamino-2-phenylidole）およびヨウ化プロピジウムで対比染色し、ＣバンドおよびＲバンドの組み合わせを生成する。正確なマッピングのための整列イメージを、三重バンドフィルターセット(ChromaTechnology,Brattleboro,VT)と冷却電荷結合素子カメラ(Photometrics,Tucson,AZ)および可変励起波長フィルター(Johnson,Cv.ら、Genet.Anal.Tech.Appl.,8:75(1991))とを組み合わせて用いて得る。ISeeGraphical Program System (Inovision Corporation, Durham, NC)を使用して、イメージ収集、分析および染色体部分長測定を行う。プローブがハイブリダイズしたゲノム領域の染色体の変化を、挿入、欠失および転座として同定する。これらの変化を関連疾患の診断マーカーとして使用する。
【１１８５】
実施例22:生物学的サンプル中のポリペプチドの異常レベルを検出する方法
本発明のポリペプチドは生物学的サンプル中で検出され得、そしてポリペプチドレベルの上昇および低下が検出されるなら、このポリペプチドは、特定表現型のマーカーである。検出方法は数多くあり、そしてそれ故、当業者は以下のアッセイをそれらの特定の必要性に適合するように改変し得ることが理解される。
【１１８６】
例えば、抗体サンドイッチELISAを使用し、サンプル中、好ましくは、生物学的サンプル中のポリペプチドを検出する。マイクロタイタープレートのウェルを、特異的抗体を用いて最終濃度0.2〜10μg/mlでコーティングする。この抗体は、モノクローナルまたはポリクローナルのいずれかであって、実施例10に記載の方法により産生される。ウェルに対するポリペプチドの非特異的結合が減少するように、このウェルをブロックする。
【１１８７】
次に、コーティング被覆ウェルを、ポリペプチド含有サンプルを用いて室温で２時間を超えてインキュベートする。好ましくは、サンプルの系列希釈を使用して結果を確認すべきである。次に、プレートを脱イオン水または蒸留水で三回洗浄し、非結合ポリペプチドを除去する。
【１１８８】
次に、特異的抗体-アルカリホスファターゼ結合体50μlを25〜400ng濃度で加え、室温で２時間インキュベートする。プレートを再び脱イオン水または蒸留水で三回洗浄し、未結合の結合体を除去する。
【１１８９】
4-メチルウンベリフェリルリン酸(MUP)またはp-ニトロフェニルリン酸(NPP)基質溶液75μlを各ウェルに添加し、そして室温で１時間インキュベートする。反応物をマイクロタイタープレートリーダーにより測定する。対照サンプルの系列希釈を使用して標準曲線を作成し、そしてX軸（対数スケール)にポリペプチド濃度を、そしてY軸（直線スケール）に蛍光または吸光度をプロットする。標準曲線を用いてサンプル中のポリペプチド濃度を挿入する。
【１１９０】
実施例23:  ポリペプチドの処方
分泌ポリペプチド組成物を、個々の患者の臨床状態(特に、分泌ポリペプチド単独処置の副作用)、送達部位、投与方法、投与計画および開業医に知られた他の因子を考慮に入れ、GMP(goodmedical practice)を遵守する方式で処方および投薬する。従って、本明細書において目的とする「有効量」は、このような考慮を行って決定される。
【１１９１】
一般的提案として、１用量当り、非経口的に投与される分泌ポリペプチドの合計薬学的有効量は、患者体重の、約１μg/kg/日〜10mg/kg/日の範囲にあるが、上記のようにこれは治療的判断に委ねられる。さらに好ましくは、ホルモンについて、この用量は、少なくとも0.01mg/kg/日、最も好ましくはヒトに対して約0.01〜1mg/kg/日である。連続的に与える場合、代表的には、分泌ポリペプチドを約1μg/kg/時間〜約50μg/kg/時間の投薬速度で１日に１〜４回の注射かまたは連続皮下注入(例えばミニポンプを用いる)のいずれかにより投与する。静脈内用バッグ溶液もまた使用し得る。変化を観察するために必要な処置期間および応答が生じる処置後の間隔は、所望の効果に応じて変化するようである。
【１１９２】
本発明の分泌タンパク質を含む薬学的組成物を、経口的に、直腸的に、非経口的に、槽内(intracistermally)、膣内、腹腔内、局所的(粉末、軟膏、ゲル、点滴剤、もしくは経皮パッチによるなど)、口内に、または経口もしくは鼻腔スプレーとして投与する。「薬学的に受容可能なキャリア」とは、非毒性の固体、半固体または液体の充填剤、希釈剤、被包物質または任意の型の処方補助剤をいう。本明細書で用いる用語「非経口的」とは、静脈内、筋肉内、腹腔内、胸骨内（intrasternal）、皮下および関節内の注射および注入を含む投与の態様をいう。
【１１９３】
分泌ポリペプチドはまた、徐放性システムにより適切に投与される。徐放性組成物の適切な例は、成形品（例えば、フィルムまたはマイクロカプセル）の形態の半透過性ポリマーマトリックスを包含する。徐放性マトリックスには、ポリラクチド類(米国特許第3,773,919号、EP第58,481号)、L-グルタミン酸およびγ-エチル-L-グルタメートのコポリマー(Sidman,U.ら、Biopolymers 22：547-556(1983)）、ポリ(2-ヒドロキシエチルメタクリレート)(R.Langerら、J.Biomed.Mater.Res.15:167-277(1981)、およびR.Langer,Chem.Tech.12:98-105(1982))、エチレンビニルアセテート(R.Langerら）またはポリ-D-(-)-3-ヒドロキシ酪酸(EP133,988)が含まれる。徐放性組成物はまた、リポソームに封入されたポリペプチドを包含する。分泌ポリペプチドを含有するリポソームは、それ自体が公知である方法により調製される：DE3,218,121;Epsteinら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA82:3688-3692(1985);Hwangら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA77:4030-4034(1980);EP52,322;EP36,676;EP88,046;EP143,949;EP142,641;日本国特許出願第83-118008号;米国特許第4,485,045号および第4,544,545号；ならびにEP第102,324号。通常、リポソームは、小さな(約200〜800Å)ユニラメラ型であり、そこでは、脂質含有量は、約30モル％コレステロールよりも多く、選択された割合が、最適な分泌ポリペプチド治療のために調整される。
【１１９４】
非経口投与のために、１つの実施態様において、一般に、分泌ポリペプチドは、それを所望の程度の純度で、薬学的に受容可能なキャリア、すなわち用いる投薬量および濃度でレシピエントに対して毒性がなく、かつ処方物の他の成分と適合するものと、単位投薬量の注射可能な形態(溶液、懸濁液または乳濁液)で混合することにより処方される。例えば、この処方物は、酸化剤、およびポリペプチドに対して有害であることが知られている他の化合物を含まないことが好ましい。
【１１９５】
一般に、ポリペプチドを液体キャリアもしくは微細分割固体キャリアまたはその両方と均一および緊密に接触させて処方物を調製する。次に、必要であれば、生成物を所望の処方物に成形する。好ましくは、キャリアは、非経口的キャリア、より好ましくはレシピエントの血液と等張である溶液である。このようなキャリアビヒクルの例としては、水、生理食塩水、リンゲル溶液およびデキストロース溶液が挙げられる。不揮発性油およびオレイン酸エチルなどの非水性ビヒクルもまた、リポソームと同様に本明細書において有用である。
【１１９６】
キャリアは、等張性および化学安定性を高める物質のような微量の添加剤を適切に含有する。このような物質は、用いる投薬量および濃度でレシピエントに対して毒性がなく、このような物質には、リン酸塩、クエン酸塩、コハク酸塩、酢酸および他の有機酸またはそれらの塩類のような緩衝剤；アスコルビン酸などの抗酸化剤；低分子量(約10残基より少ない)ポリペプチド、例えば、ポリアルギニンまたはトリペプチド；血清アルブミン、ゼラチンまたは免疫グロブリンのようなタンパク質；ポリビニルピロリドンのような親水性ポリマー；グリシン、グルタミン酸、アスパラギン酸またはアルギニンのようなアミノ酸；セルロースまたはその誘導体、ブドウ糖、マンノースまたはデキストリンを含む、単糖類、二糖類、および他の炭水化物；EDTAのようなキレート剤；マンニトールまたはソルビトールのような糖アルコール；ナトリウムなどの対イオン；および／またはポリソルベート、ポリオキサマー（poloxamer）またはPEGなどの非イオン性界面活性剤がある。
【１１９７】
代表的には、分泌ポリペプチドは、約0.1mg/ml〜100mg/ml、好ましくは、１〜10mg/mlの濃度で、約３〜８のpHで、このようなビヒクル中に処方される。前記の特定の賦形剤、キャリアまたは安定化剤を使用することにより、ポリペプチド塩が形成されることが理解される。
【１１９８】
治療的投与に用いられるべき任意のポリペプチドは滅菌され得る。滅菌濾過メンブレン(例えば0.2ミクロンメンブレン)で濾過することにより滅菌は容易に達成される。一般に、治療用ポリペプチド組成物は、滅菌アクセスポートを有する容器、例えば、静脈内用溶液バッグまたは皮下用注射針で穿刺可能なストッパー付のバイアルに配置される。
【１１９９】
ポリペプチドは、通常、単位投薬量または複数投薬量容器、例えば、密封アンプルまたはバイアルに、水溶液または再構成するための凍結乾燥処方物として貯蔵される。凍結乾燥処方物の例として、10mlのバイアルに、滅菌濾過した1％(w/v)ポリペプチド水溶液5mlを充填し、そして得られる混合物を凍結乾燥する。凍結乾燥したポリペプチドを注射用静菌水を用いて再構成して注入溶液を調製する。
【１２００】
本発明はまた、本発明の薬学的組成物の１つ以上の成分を満たした一つ以上の容器を含む薬学的パックまたはキットを提供する。医薬品または生物学的処方物の製造、使用または販売を規制する政府機関が定めた形式の通知が、このような容器(類)に付属し得、この通知は、ヒトへの投与に対する製造、使用または販売に関する政府機関による承認を表す。さらに、本発明のポリペプチドを他の治療用化合物と組み合わせて使用し得る。
【１２０１】
実施例24:  ポリペプチドのレベル低下を処置する方法
個体における分泌タンパク質の標準または正常発現レベルの低下により引き起こされる状態は、本発明のポリペプチドを、好ましくは分泌形態で投与することにより処置し得ることが理解される。従って、本発明はまた、ポリペプチドのレベルの増加が必要な個体の処置方法を提供する。この方法は、このような個体に、このような個体でポリペプチドの活性レベルを増加させる量のポリペプチドを含む薬学的組成物を投与する工程を包含する。
【１２０２】
例えば、ポリペプチドのレベルが低下した患者は、ポリペプチドを、１日用量0.1〜100μg/kgで６日続けて服用する。好ましくは、ポリペプチドは分泌形態である。投与および処方物に基づく投薬計画の正確な詳細は、実施例23に提供されている。
【１２０３】
実施例25:  ポリペプチドのレベル上昇を処置する方法
アンチセンス技術を使用して本発明のポリペプチドの産生を阻害する。この技術は、ガンのような様々な病因に起因するポリペプチド、好ましくは分泌形態のポリペプチドのレべルを低下させる方法の１つの例である。
【１２０４】
例えば、ポリペプチドのレベルが異常に上昇したと診断された患者に、アンチセンスポリヌクレオチドを、0.5、1.0、1.5、2.0および3.0mg/kg/日で静脈内に21日間投与する。この処置に対して十分な耐性があれば、７日間の休薬期間後に、この処置を繰り返す。アンチセンスポリヌクレオチド処方は、実施例23に提供されている。
【１２０５】
実施例26:  遺伝子治療を使用する処置方法
遺伝子治療の１つの方法は、ポリペプチドを発現し得る線維芽細胞を患者に移植する。一般に、線維芽細胞は、皮膚生検により被験体から得られる。得られた組織を組織培養培地中に置き、小片に分割する。小塊の組織を組織培養フラスコの湿潤表面に置き、ほぼ10片を各フラスコに置く。このフラスコを倒置し、しっかりと閉めた後、室温で一晩置く。室温で24時間後、フラスコを反転させ、組織塊をフラスコの底に固定させたままにし、そして新鮮培地（例えば、10％FBS、ペニシリンおよびストレプトマイシンを含有するHam'sF12培地）を添加する。次に、フラスコを37℃で約１週間インキュベートする。
【１２０６】
この時点で、新鮮培地を添加し、次いで数日ごとに取り換える。さらに二週間培養した後に単層の線維芽細胞が出現する。単層をトリプシン処理し、さらに大きなフラスコにスケールアップする。
【１２０７】
Moloneyマウス肉腫ウイルスの長末端反復に隣接するpMV-7(Kirschmeier,P.T.ら、DNA,7:219-25(1988))をEcoRIおよびHindIIIで消化し、続いて仔ウシ腸ホスファターゼで処理する。線状ベクターをアガロースゲルで分画し、そしてガラスビーズを使用して精製する。
【１２０８】
本発明のポリペプチドをコードするcDNAを、それぞれ実施例１に示すような5'および3'末端配列に対応するPCRプライマーを使用して増幅し得る。好ましくは、5'プライマーはEcoRI部位を含み、そして3'プライマーはHindIII部位を含む。等量の、Moloneyマウス肉腫ウイルス線状バックボーンおよび増幅したEcoRIおよびHindIIIフラグメントをT4DNAリガーゼの存在下で一緒に加える。得られる混合物を二つのフラグメントを連結するのに適した条件下で維持する。次に、連結混合物を使用し、細菌HB101を形質転換する。次に、それを、ベクターが適切に挿入された目的の遺伝子を有することを確認する目的で、カナマイシンを含む寒天上にプレートする。
【１２０９】
両栄養性pA317またはGP+am12パッケージング細胞を、10％仔ウシ血清(CS)、ペニシリンおよびストレプトマイシンを含むDulbecco改変Eagles培地(DMEM)中の組織培養で集密密度まで増殖させる。次に、遺伝子を含むMSVベクターを培地に加え、パッケージング細胞をベクターを用いて形質導入する。このとき、パッケージング細胞は遺伝子を含む感染性ウイルス粒子を産生する（ここで、パッケージング細胞をプロデューサー細胞と呼ぶ）。
【１２１０】
形質導入されたプロデューサー細胞に新鮮培地を添加し、続いて培地を10cmプレートの集密なプロデューサー細胞から採取する。感染性ウイルス粒子を含む使用済培地をミリポアーフィルターで濾過し、はがれたプロデューサー細胞を除去した後、この培地を使用して、線維芽細胞を感染させる。線維芽細胞の準集密プレートから培地を除去し、かつプロデューサー細胞からの培地で速やかに置き換える。この培地を除去し、そして新鮮培地と置き換える。ウイルスの力価が高ければ、実質的にすべての線維芽細胞が感染され、選択は必要ではない。力価が非常に低ければ、neoまたはhisのような選択マーカーを有するレトロウイルスベクターを使用することが必要である。一旦、線維芽細胞が効率的に感染したなら、線維芽細胞を分析し、タンパク質が産生されているか否かを決定する。
【１２１１】
次に、操作された線維芽細胞を、単独で、またはサイトデックス３マイクロキャリアビーズ上で集密に増殖させた後のいずれかで宿主に移植する。
【１２１２】
実施例27：遺伝子治療を用いる処置方法−インビボ
本発明の別の局面は、インビボでの遺伝子治療方法を障害、疾患、および状態の処置のために用いることである。遺伝子治療方法は、本発明のポリペプチドの発現を増加または減少させるために動物へ裸の核酸（DNA、RNA、およびアンチセンスのDNAまたはRNA）配列を導入することに関する。本発明のポリヌクレオチドは、標的組織からのコードされるポリペプチドの発現に必要な、プロモーターまたは他の任意の遺伝エレメントに作動可能に連結され得る。このような遺伝子治療および送達の技術および方法は当該分野で公知であり、例えば、WO90/11092、WO98/11779；米国特許第5693622号、同第5705151号、同第5580859号；TabataH.ら (1997) Cardiovasc. Res. 35(3):470-479, Chao Jら (1997) Pharmacol. Res.35(6):517-522, Wolff J.A. (1997) Neuromuscul.Disord. 7(5):314-318, Schwartz B.ら(1996) Gene Ther. 3(5):405-411, Tsurumi Y.ら(1996) Circulation 94(12):3281-3290（本明細書中に参考として援用される）を参照のこと。
【１２１３】
本発明のポリヌクレオチド構築物は、注射可能な物質を動物の細胞に送達する任意の方法（例えば、組織（心臓、筋肉、皮膚、肺、肝臓、小腸など）の間隙への注射）により送達され得る。これらのポリヌクレオチド構築物は、薬学的に受容可能な液体または水性キャリア中で送達され得る。
【１２１４】
用語「裸の」ポリヌクレオチド、DNA、またはRNAは、ウイルス配列、ウイルス粒子、リポソーム処方物、リポフェクチンまたは沈澱剤などを含む、細胞への侵入を支持、促進、または容易にするように作用する任意の送達ビヒクルを含まない配列をいう。しかし、ポリヌクレオチドはまた、当業者に周知の方法により調製され得るリポソーム処方物（例えば、FelgnerP.L.ら (1995) Ann. NY Acad. Sci. 772:126-139およびAbdallah B.ら (1995) Biol. Cell85(1):1-7により教示されるもの）中で送達され得る。
【１２１５】
遺伝子治療方法において用いられる本発明のポリヌクレオチドベクター構築物は、好ましくは、宿主ゲノム中に組込まれず、複製を可能にする配列も含まない構築物である。当業者に公知の任意の強力なプロモーターは、DNAの発現を駆動するために用いられ得る。他の遺伝子治療技術とは異なり、標的細胞に裸の核酸配列を導入する１つの主な利点は、細胞中のポリヌクレオチド合成が一過性であるという性質である。複製していないDNA配列は、細胞に導入されて６ヶ月までの期間の所望のポリペプチドの産生を提供し得ることを研究は示した。
【１２１６】
本発明のポリヌクレオチド構築物は、動物内の組織（筋肉、皮膚、脳、肺、肝臓、脾臓、骨髄、胸腺、心臓、リンパ、血液、骨、軟骨、膵臓、腎臓、胆嚢、胃、腸、精巣、卵巣、子宮、直腸、神経系、眼、腺、および結合組織を含む）の間隙に送達され得る。組織間隙は、細胞間液、器官組織の細網線維間のムコ多糖マトリックス、血管壁もしくは室壁における弾性線維、線維組織のコラーゲン線維、または筋細胞を鞘で覆う結合組織内もしくは骨小窩内のこの同じマトリックスを含む。循環の血漿およびリンパチャネルのリンパ液により占められる空間は類似する。筋組織の間隙への送達は、以下に考察する理由のために好ましい。これらは、これらの細胞を含む組織への注射により便利に送達され得る。これらは、好ましくは、分化した分裂していない細胞において持続して送達および発現されるが、送達および発現は、分化していないかまたは完全には分化していない細胞（例えば、血液の幹細胞または皮膚の線維芽細胞など）において達成され得る。インビボの筋肉細胞は、特に、ポリヌクレオチドを取込み、そして発現する能力が適格である。
【１２１７】
裸のポリヌクレオチドの注射について、有効投薬量のDNAまたはRNAは、約0.05g/kg体重〜約50mg/kg体重の範囲であり得る。好ましくは、投薬量は、約0.005mg/kg〜約20mg/kgであり、より好ましくは約0.05mg/kg〜約5mg/kgである。もちろん、当業者が認識するように、この投薬量は、注射の組織部位に従って変化する。核酸配列の適切かつ有効な投薬量は、当業者により容易に決定され得、そして処置される状態および投与経路に依存し得る。好ましい投与経路は、組織間隙への非経口注射経路による。しかし、特に肺または気管支の組織、咽喉、鼻粘膜への送達のためのエアロゾル処方物の吸入のような他の非経口経路もまた用いられ得る。さらに、裸のポリヌクレオチド構築物はまた、この手順において用いられるカテーテルにより血管形成の間に動脈に送達され得る。
【１２１８】
筋肉中にインビボで注射されたポリヌクレオチドの用量応答効果は、以下の通りに決定される。本発明のポリペプチドをコードするmRNAの生成に適切なテンプレートDNAは、標準的な組換えDNA方法論に従って調製される。環状または直鎖状のいずれかであり得るテンプレートDNAは、裸のDNAとして用いられるか、リポソームと複合体化されるかのいずれかである。次いで、マウスの四頭筋に種々の量のテンプレートDNAを注射する。
【１２１９】
５〜６週齢の雌性および雄性のBalb/Cマウスに、0.3mlの2.5％Avertinを腹腔内注射することにより麻酔する。1.5cmの切開を前大腿において行ない、そして四頭筋を直接可視化する。テンプレートDNAを、0.1mlのキャリア中で１ccシリンジにおいて27ゲージ針を通して１分間にわたって、筋肉の遠位挿入部位から膝への約0.5cmに約0.2cmの深さで注射する。縫合糸を、将来の局所化の注射部位にわたって置き、そして皮膚をステンレススチールクリップで閉じる。
【１２２０】
適切なインキュベーション時間（例えば、７日間）の後に、筋肉抽出物を、四頭全体を切り出すことにより調製する。５枚目毎の15μm横断切片の個々の四頭筋を、タンパク質発現について組織化学的に染色する。タンパク質発現についての時間経過は、異なるマウスからの四頭が異なる時点で収集された以外は類似の様式で行なわれ得る。注射後の筋肉におけるDNAの持続は、注射したマウスおよびコントロールマウスから全細胞DNAおよびHIRT上清を調製した後のサザンブロット分析により決定され得る。マウスにおける上記の実験の結果を用いて、本発明の裸のDNAを用いてヒトおよび他の動物における適切な投薬量および他の処置パラメーターを推定し得る。
【１２２１】
本発明は、前記の説明および実施例で詳細に記載した通り以外にも、実施し得ることは明らかである。本発明の数多くの改変および変更は、上記の教示を考慮すれば可能であり、それ故、添付の請求の範囲の範囲内にある。
【１２２２】
発明の背景、詳細な説明および実施例において引用した各文献（特許、特許出願、雑誌記事、抄録、実験手引き書、書籍または他の開示を含む）の全開示は、本明細書中に参考として援用される。
【１２２３】
（配列表）
【１２２４】
【表１−００１】
2010279364.tif 000107
【１２２５】
【表１−００２】
2010279364.tif 000108
【１２２６】
【表１−００３】
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【１２２７】
【表１−００４】
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【１２２８】
【表１−００５】
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【１２２９】
【表１−００６】
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【１２３０】
【表１−００７】
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【１２３１】
【表１−００８】
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【１２３２】
【表１−００９】
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【１２３３】
【表１−０１０】
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【１２３４】
【表１−０１１】
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【１２３５】
【表１−０１２】
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【１２３６】
【表１−０１３】
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【１２３７】
【表１−０１４】
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【１２３８】
【表１−０１５】
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【１２３９】
【表１−０１６】
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【１２４０】
【表１−０１７】
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【１２４１】
【表１−０１８】
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【１２４２】
【表１−０１９】
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【１２４３】
【表１−０２０】
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【１２４４】
【表１−０２１】
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【１２４５】
【表１−０２２】
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【１２４６】
【表１−０２３】
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【１２４７】
【表１−０２４】
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【１２４８】
【表１−０２５】
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【１２４９】
【表１−０２６】
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【１２５０】
【表１−０２７】
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【１２５１】
【表１−０２８】
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【１２５２】
【表１−０２９】
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【１２５３】
【表１−０３０】
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【１２５４】
【表１−０３１】
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【１２５５】
【表１−０３２】
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【１２５６】
【表１−０３３】
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【１２５７】
【表１−０３４】
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【１２５８】
【表１−０３５】
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【１２５９】
【表１−０３６】
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【１２６０】
【表１−０３７】
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【１２６１】
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