(57)【要約】      （修正有）【課題】ナイセリア属ＯＲＦ２０８６タンパク質の単離とその利用方法を提供する。【解決手段】該交差反応性免疫原性抗原が被験者における髄膜炎菌血清群Ｂ（Neisseria meningitides serogroup B）による感染に対して免疫原性を提供するタンパク質をナイセリア菌株から単離する。更に組換えにより製造することのできる免疫原性部分、その生物学的均等物、前述の物質に免疫特異的に結合する抗体、および前述の各物質をコードする核酸配列、同様に髄膜炎菌血清群Ｂによる感染に対して有効な免疫原性組成物において、該物質を使用することができる。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下を含む組成物：
（ａ）ナイセリア種（Neisseria species）のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ２
０８６）によりコードされる少なくとも１つのタンパク質であって、該オープンリーディングフレームが交差反応性の免疫原性抗原をコードし、該交差反応性免疫原性抗原が被験者における髄膜炎菌血清群Ｂ（Neisseria meningitides serogroup B）による感染に対して免疫原性を提供するタンパク質；または
（ｂ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；または
（ｃ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質または（ｂ）に記載の免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物。
【請求項２】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：２５４から２５９のアミノ酸配列のいずれかを含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
少なくとも１つのタンパク質が、ナイセリア菌株Ｌ３  ６２７５，ＣＤＣ２３６９，ＣＤＣ１０３４，Ｌ４  ８９１，Ｂ１６Ｂ６，Ｗ１３５（ＡＴＣＣ３５５５９），Ｃ１１，Ｙ（ＡＴＣＣ３５５６１），Ｍ９８  ２５０７３２，Ｍ９８  ２５０７７１，ＣＤＣ１１３５，Ｍ９７  ２５２１５３，ＣＤＣ１６１０，ＣＤＣ１４９２，Ｌ８  Ｍ９７８；Ｍ９７  ２５２９８８，Ｍ９７  ２５２６９７，６５５７，２９９６，Ｍ９７  ２５２９７６，Ｍ９７  ２５１８５４，ＣＤＣ１５２１，Ｍ９８  ２５０６２２，８７０４４６，Ｍ９７  ２５３２４８，Ｍ９８  ２５０８０９，Ｌ５  Ｍ９８１，ＮＭＢまたはＭ９８  ２５０５７２のいずれかのＯＲＦ２０８６によりコードされる、請求項１に記載の組成物。
【請求項４】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：２６０から２７８または２７９から２９９のアミノ酸配列のいずれかを含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項５】
少なくとも１つのタンパク質が、ナイセリア菌株８８００４９，Ｍ９８２，ＣＤＣ１５７３，Ｍ９７  ２５３５２４またはＭ９８  ２５０６７０のいずれかのＯＲＦ２０８６によりコードされる、請求項１に記載の組成物。
【請求項６】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：２−１７４の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項７】
配列番号：１７６−２５２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む少なくとも１つのタンパク質を付加的に含む、請求項６に記載の組成物。
【請求項８】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：２２４−２５２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項９】
前記の少なくとも１つのタンパク質、免疫原性部分または生物学的均等物が、非病原性であり実質的にいかなる感染性不純物も含まない、請求項１に記載の組成物。
【請求項１０】
少なくとも１つのタンパク質が、質量分析による測定で分子量  約２６，０００から約３０，０００ダルトンである、請求項１に記載の組成物。
【請求項１１】
少なくとも１つのタンパク質が、１０％−２０％ＳＤＳポリアクリルアミドゲルにおける測定で分子量  約２８−３５ｋＤａである、請求項１０に記載の組成物。
【請求項１２】
該組成物が医薬的に受容可能なバッファー、希釈剤、アジュバントまたは担体を付加的に含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項１３】
該組成物が付加的に担体を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項１４】
該組成物が付加的にアジュバントを含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項１５】
該アジュバントが液体を含む、請求項１４に記載の組成物。
【請求項１６】
タンパク質が組換えタンパク質である、請求項１に記載の組成物。
【請求項１７】
タンパク質が天然のナイセリア種から単離される、請求項１に記載の組成物。
【請求項１８】
タンパク質がリポタンパク質である、請求項１に記載の組成物。
【請求項１９】
タンパク質が脂質化されていない、請求項１に記載の組成物。
【請求項２０】
組成物が少なくとも１つのＰｏｒＡ、ＰｏｒＢ、トランスフェリン結合タンパク質、またはopacityタンパク質（Ｏｐｃ）を付加的に含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項２１】
組成物がナイセリア種の少なくとも１つの付加的な表面抗原を付加的に含み、前記の付加的な表面抗原がＯＲＦ２０８６タンパク質ではない、請求項１に記載の組成物。
【請求項２２】
該組成物が付加的に多糖を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項２３】
該組成物が付加的なペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質を含み、該組成物が哺乳類において２つまたはそれより多くの細菌に対して免疫応答を惹起する複合体を形成する、請求項１に記載の組成物。
【請求項２４】
配列番号：２５４−２５９のいずれかを含む、少なくとも１つの免疫原性タンパク質またはポリペプチド、を含む組成物。
【請求項２５】
少なくとも１つのタンパク質が、質量分析による測定で分子量  約２６，０００−３０，０００ダルトンである、請求項２４に記載の組成物。
【請求項２６】
少なくとも１つのタンパク質が、１０％−２０％ＳＤＳポリアクリルアミドゲルにおける測定で分子量  約２８−３５ｋＤａである、請求項２５に記載の組成物。
【請求項２７】
該組成物が医薬的に受容可能なバッファー、希釈剤、アジュバントまたは担体を付加的に含む、請求項２４に記載の組成物。
【請求項２８】
該組成物が付加的に担体を含む、請求項２４に記載の組成物。
【請求項２９】
該組成物が付加的にアジュバントを含む、請求項２４に記載の組成物。
【請求項３０】
該アジュバントが液体を含む、請求項２９に記載の組成物。
【請求項３１】
タンパク質が脂質化されていない、請求項２４に記載の組成物。
【請求項３２】
タンパク質が組換えタンパク質である、請求項２４に記載の組成物。
【請求項３３】
タンパク質またはポリペプチドが天然のナイセリア種から単離される、請求項２４に記載の組成物。
【請求項３４】
タンパク質がリポタンパク質である、請求項２４に記載の組成物。
【請求項３５】
組成物が、少なくとも１つのＰｏｒＡ、ＰｏｒＢ、トランスフェリン結合タンパク質、またはopacityタンパク質（Ｏｐｃ）を付加的に含む、請求項２４に記載の組成物。
【請求項３６】
組成物がナイセリア種の少なくとも１つの付加的な表面抗原を付加的に含み、前記の付加的な表面抗原がＯＲＦ２０８６タンパク質ではない、請求項２４に記載の組成物。
【請求項３７】
該組成物が付加的に多糖を含む、請求項２４に記載の組成物。
【請求項３８】
該組成物が付加的なペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質を含み、該組成物が哺乳類において２つまたはそれより多くの細菌に対して免疫応答を惹起する複合体を形成する、請求項２４に記載の組成物。
【請求項３９】
配列番号：２６０−２７８のいずれかを含む、少なくとも１つの免疫原性タンパク質またはポリペプチドを含む組成物。
【請求項４０】
該組成物が医薬的に受容可能なバッファー、希釈剤、アジュバントまたは担体を付加的に含む、請求項３９に記載の組成物。
【請求項４１】
配列番号：２７９−２９９のいずれかを含む、少なくとも１つの免疫原性タンパク質またはポリペプチドを含む組成物。
【請求項４２】
該組成物が医薬的に受容可能なバッファー、希釈剤、アジュバントまたは担体を付加的に含む、請求項４１に記載の組成物。
【請求項４３】
配列番号：３００のアミノ酸配列を含む、少なくとも１つの単離されたタンパク質を含む組成物：ここで、
配列中ｘはいずれかのアミノ酸であり；
配列中５番目のアミノ酸から９番目のアミノ酸までの領域は、０から５個のいずれかのアミノ酸であり；
配列中６７番目のアミノ酸から６９番目のアミノ酸までの領域は、０から３個のいずれかのアミノ酸であり；そして
配列中１５６番目のアミノ酸は、０から１個のいずれかのアミノ酸である。
【請求項４４】
５番目のアミノ酸から９番目のアミノ酸までの領域が０、４または５個のアミノ酸を含む、請求項４３に記載の組成物。
【請求項４５】
６７番目のアミノ酸から６９番目のアミノ酸までの領域が０または３個のアミノ酸を含む、請求項４３に記載の組成物。
【請求項４６】
少なくとも１つのタンパク質が、質量分析による測定で分子量  約２６，０００−３０，０００ダルトンである、請求項４３に記載の組成物。
【請求項４７】
少なくとも１つのタンパク質が、１０％−２０％ＳＤＳポリアクリルアミドゲルにおける測定で分子量  約２８−３５ｋＤａである、請求項４６に記載の組成物。
【請求項４８】
該組成物が医薬的に受容可能なバッファー、希釈剤、アジュバントまたは担体を付加的に含む、請求項４３に記載の組成物。
【請求項４９】
該組成物が付加的に担体を含む、請求項４３に記載の組成物。
【請求項５０】
該組成物が付加的にアジュバントを含む、請求項４３に記載の組成物。
【請求項５１】
該アジュバントが液体を含む、請求項５０に記載の組成物。
【請求項５２】
タンパク質が脂質化されていない、請求項４３に記載の組成物。
【請求項５３】
タンパク質が組換えタンパク質である、請求項４３に記載の組成物。
【請求項５４】
タンパク質が天然のナイセリア種から単離される、請求項４３に記載の組成物。
【請求項５５】
タンパク質がリポタンパク質である、請求項４３に記載の組成物。
【請求項５６】
組成物が、少なくとも１つのＰｏｒＡ、ＰｏｒＢ、トランスフェリン結合タンパク質、またはopacityタンパク質（Ｏｐｃ）を付加的に含む、請求項４３に記載の組成物。
【請求項５７】
組成物がナイセリア種の少なくとも１つの付加的な表面抗原を付加的
に含み、前記の付加的な表面抗原がＯＲＦ２０８６タンパク質ではない、請求項４３に記載の組成物。
【請求項５８】
該組成物が付加的に多糖を含む、請求項４３に記載の組成物。
【請求項５９】
該組成物が付加的なペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質を含み、該組成物が哺乳類において２つまたはそれより多くの細菌に対して免疫応答を惹起する複合体を形成する、請求項４３に記載の組成物。
【請求項６０】
以下を含む組成物：
（ａ）配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む少なくとも１つのタンパク質；
（ｂ）配列番号：１−２５３の奇数番号のいずれかの核酸配列を含むポリヌクレオチドと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされる、少なくとも１つのタンパク質；
（ｃ）（ａ）もしくは（ｂ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；または
（ｄ）（ａ）もしくは（ｂ）に記載の少なくとも１つのタンパク質もしくは（ｃ）に記載の免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物。
【請求項６１】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：２−１７４の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項６２】
配列番号：１７６−２５２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む少なくとも１つのタンパク質を付加的に含む、請求項６１に記載の組成物。
【請求項６３】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：２−１２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項６４】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：１４−２４の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項６５】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：２６−４２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項６６】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：５０−６０の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項６７】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：６２−１０８の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項６８】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：１１０−１３８の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項６９】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：１４０−１５６の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項７０】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：１５８−１７４の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項７１】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：２２４−２５２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項７２】
組成物が少なくとも１つのＰｏｒＡ、ＰｏｒＢ、トランスフェリン結合タンパク質、またはopacityタンパク質（Ｏｐｃ）を付加的に含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項７３】
組成物がナイセリア種の少なくとも１つの付加的な表面抗原を付加的に含み、前記の付加的な表面抗原がＯＲＦ２０８６タンパク質ではない、請求項６０に記載の組成物。
【請求項７４】
少なくとも１つのタンパク質が、質量分析による測定で分子量  約２６，０００から約３０，０００である、請求項６０に記載の組成物。
【請求項７５】
少なくとも１つのタンパク質が、１０％−２０％ＳＤＳポリアクリルアミドゲルにおける測定で分子量  約２８−３５ｋＤａである、請求項７４に記載の組成物。
【請求項７６】
該組成物が医薬的に受容可能なバッファー、希釈剤、アジュバントまたは担体を付加的に含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項７７】
該組成物が付加的に担体を含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項７８】
該組成物が付加的にアジュバントを含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項７９】
該アジュバントが液体を含む、請求項７８に記載の組成物。
【請求項８０】
タンパク質が脂質化されていない、請求項６０に記載の組成物。
【請求項８１】
タンパク質が組換えタンパク質である、請求項６０に記載の組成物。
【請求項８２】
タンパク質が天然のナイセリア種から単離される、請求項６０に記載の組成物。
【請求項８３】
タンパク質がリポタンパク質である、請求項６０に記載の組成物。
【請求項８４】
該組成物が付加的に多糖を含む、請求項６０に記載の組成物。
【請求項８５】
該組成物が付加的なペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質を含み、該組成物が哺乳類において２つまたはそれより多くの細菌に対して免疫応答を惹起する複合体を形成する、請求項６０に記載の組成物。
【請求項８６】
ナイセリア種の第１の細菌株の少なくとも１つの抗原であって、ナイセリア種の第２の細菌株による被験者の感染に対して免疫原性を提供する該抗原を含む組成物。
【請求項８７】
第１の菌株がナイセリア種の菌株であり、前記の第２の菌株が髄膜炎菌血清群Ｂの菌株である、請求項８６に記載の組成物。
【請求項８８】
第１の菌株が、菌株Ｌ３  ６２７５，ＣＤＣ２３６９，ＣＤＣ１０３４，Ｌ４  ８９１，Ｂ１６Ｂ６，Ｗ１３５（ＡＴＣＣ３５５５９），Ｃ１１，Ｙ（ＡＴＣＣ３５５６１），Ｍ９８  ２５０７３２，Ｍ９８  ２５０７７１，ＣＤＣ１１３５，Ｍ９７  ２５２１５３，ＣＤＣ１６１０，ＣＤＣ１４９２，Ｌ８  Ｍ９７８；Ｍ９７  ２５２９８８，Ｍ９７  ２５２６９７，６５５７，２９９６，Ｍ９７  ２５２９７６，Ｍ９７  ２５１８５４，ＣＤＣ１５２１，Ｍ９８  ２５０６２２，８７０４４６，Ｍ９７  ２５３２４８，Ｍ９８  ２５０８０９，Ｌ５  Ｍ９８１，ＮＭＢまたはＭ９８  ２５０５７２のいずれかである、請求項８６に記載の組成物。
【請求項８９】
第１の菌株が、菌株８８００４９，Ｍ９８２，ＣＤＣ１５７３，Ｍ９７  ２５３５２４またはＭ９８  ２５０６７０である、請求項８６に記載の組成物。
【請求項９０】
タンパク質が組換えタンパク質である、請求項８６に記載の組成物。
【請求項９１】
タンパク質が天然のナイセリア種から単離される、請求項８６に記載の組成物。
【請求項９２】
タンパク質がリポタンパク質である、請求項８６に記載の組成物。
【請求項９３】
該組成物が医薬的に受容可能なバッファー、希釈剤、アジュバントまたは担体を付加的に含む、請求項８６に記載の組成物。
【請求項９４】
該組成物が付加的に担体を含む、請求項８６に記載の組成物。
【請求項９５】
該組成物が付加的にアジュバントを含む、請求項８６に記載の組成物。
【請求項９６】
該アジュバントが液体を含む、請求項９５に記載の組成物。
【請求項９７】
タンパク質が脂質化されていない、請求項８６に記載の組成物。
【請求項９８】
該組成物が付加的に多糖を含む、請求項８６に記載の組成物。
【請求項９９】
該組成物が付加的なペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質を含み、該組成物が哺乳類において２つまたはそれより多くの病原菌に対して免疫応答を惹起する複合体を形成する、請求項８６に記載の組成物。
【請求項１００】
配列番号：３０１のアミノ酸配列を含む、少なくとも１つの単離されたタンパク質を含
む組成物：ここで、
配列中ｘはいずれかのアミノ酸であり；
配列中５番目のアミノ酸から８番目のアミノ酸までの領域は、０から４個のいずれかのアミノ酸であり；
配列中６６番目のアミノ酸から６８番目のアミノ酸までの領域は、０から３個のいずれかのアミノ酸である。
【請求項１０１】
少なくとも１つのタンパク質が、質量分析による測定で分子量  約２６，０００から約３０，０００である、請求項１００に記載の組成物。
【請求項１０２】
少なくとも１つのタンパク質が、１０％−２０％ＳＤＳポリアクリルアミドゲルにおける測定で分子量  約２８−３５ｋＤａである、請求項１０１に記載の組成物。
【請求項１０３】
該組成物が医薬的に受容可能なバッファー、希釈剤、アジュバントまたは担体を付加的に含む、請求項１００に記載の組成物。
【請求項１０４】
該組成物が付加的に担体を含む、請求項１００に記載の組成物。
【請求項１０５】
該組成物が付加的にアジュバントを含む、請求項１００に記載の組成物。
【請求項１０６】
該アジュバントが液体を含む、請求項１０５に記載の組成物。
【請求項１０７】
タンパク質が脂質化されていない、請求項１００に記載の組成物。
【請求項１０８】
タンパク質が組換えタンパク質である、請求項１００に記載の組成物。
【請求項１０９】
タンパク質が天然のナイセリア種から単離される、請求項１００に記載の組成物。
【請求項１１０】
タンパク質がリポタンパク質である、請求項１００に記載の組成物。
【請求項１１１】
該組成物が付加的に多糖を含む、請求項１００に記載の組成物。
【請求項１１２】
該組成物が付加的なペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質を含み、該組成物が哺乳類において２つまたはそれより多くの病原菌に対して免疫応答を惹起する複合体を形成する、請求項１００に記載の組成物。
【請求項１１３】
５番目のアミノ酸から８番目のアミノ酸までの領域が０または４個のアミノ酸を含む、請求項１００に記載の組成物。
【請求項１１４】
６６番目のアミノ酸から６８番目のアミノ酸までの領域が０または３個のアミノ酸を含む、請求項１００に記載の組成物。
【請求項１１５】
配列番号：３０２のアミノ酸配列を含む、少なくとも１つの単離されたタンパク質を含む組成物：ここで、
配列中ｘはいずれかのアミノ酸であり；
配列中８番目のアミノ酸から１２番目のアミノ酸までの領域は、０から５個のいずれかのアミノ酸である。
【請求項１１６】
８番目のアミノ酸から１２番目のアミノ酸までの領域が０または５個のアミノ酸を含む、請求項１１５に記載の組成物。
【請求項１１７】
少なくとも１つのタンパク質が、質量分析による測定で分子量  約２６，０００から約３０，０００である、請求項１１５に記載の組成物。
【請求項１１８】
少なくとも１つのタンパク質が、１０％−２０％ＳＤＳポリアクリルアミドゲルにおける測定で分子量  約２８−３５ｋＤａである、請求項１１７に記載の組成物。
【請求項１１９】
該組成物が医薬的に受容可能なバッファー、希釈剤、アジュバントまたは担体を付加的に含む、請求項１１５に記載の組成物。
【請求項１２０】
該組成物が付加的に担体を含む、請求項１１５に記載の組成物。
【請求項１２１】
該組成物が付加的にアジュバントを含む、請求項１１５に記載の組成物。
【請求項１２２】
該アジュバントが液体を含む、請求項１２１に記載の組成物。
【請求項１２３】
タンパク質が脂質化されていない、請求項１１５に記載の組成物。
【請求項１２４】
タンパク質が組換えタンパク質である、請求項１１５に記載の組成物。
【請求項１２５】
タンパク質が天然の材料から単離される、請求項１１５に記載の組成物。
【請求項１２６】
該組成物が付加的に多糖を含む、請求項１１５に記載の組成物。
【請求項１２７】
該組成物が付加的なペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質を含み、該組成物が哺乳類において２つまたはそれより多くの細菌に対して免疫応答を惹起する複合体を形成する、請求項１１５に記載の組成物。
【請求項１２８】
以下のいずれかと免疫特異的に結合する少なくとも１つの抗体を含む組成物：
（ａ）ナイセリア種のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ２０８６）によりコードされる少なくとも１つのタンパク質であって、該オープンリーディングフレームが交差反応性の免疫原性抗原をコードし、該交差反応性抗原が被験者における髄膜炎菌血清群Ｂによる感染に対して免疫原性を提供するタンパク質；または
（ｂ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；または
（ｃ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質または（ｂ）に記載の１つの免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物。
【請求項１２９】
抗体がモノクローナル抗体である、請求項１２８に記載の組成物。
【請求項１３０】
医薬的に受容可能な担体を付加的に含む、請求項１２８に記載の組成物。
【請求項１３１】
以下のいずれかと免疫特異的に結合する少なくとも１つの抗体を含む組成物：
（ａ）配列番号：２５４から２５９のいずれかを含む少なくとも１つのタンパク質；または
（ｂ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；または
（ｃ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質もしくは（ｂ）に記載の１つの免疫原
性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物。
【請求項１３２】
少なくとも１つのタンパク質、その免疫原性部分またはその生物学的均等物が、配列番号：２６０−２９９のいずれかを含む、請求項１３１に記載の組成物。
【請求項１３３】
少なくとも１つの抗体がモノクローナル抗体である、請求項１３１に記載の組成物。
【請求項１３４】
配列番号：３００のアミノ酸配列を含む、少なくとも１つの単離されたタンパク質と免疫特異的に結合する、少なくとも１つの抗体を含む組成物：ここで、
配列中ｘはいずれかのアミノ酸であり；
配列中５番目のアミノ酸から９番目のアミノ酸までの領域は、０から５個のいずれかのアミノ酸であり；
配列中６７番目のアミノ酸から６９番目のアミノ酸までの領域は、０から３個のいずれかのアミノ酸であり；そして
配列中１５６番目のアミノ酸は０から１個のいずれかのアミノ酸である。
【請求項１３５】
少なくとも１つの抗体がモノクローナル抗体である、請求項１３４に記載の組成物。
【請求項１３６】
以下のいずれかと免疫特異的に結合する少なくとも１つの抗体を含む組成物：
（ａ）配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む少なくとも１つのタンパク質；
（ｂ）配列番号：１−２５３の奇数番号のいずれかの核酸配列を含むポリヌクレオチドと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされる、少なくとも１つのタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；または
（ｄ）（ａ）または（ｂ）に記載の少なくとも１つのタンパク質または（ｃ）に記載の免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物。
【請求項１３７】
以下の少なくとも１つのポリヌクレオチドを含む組成物：
（ａ）ナイセリア種のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ２０８６）によりコードされる少なくとも１つのタンパク質、もしくは前記の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分もしくは生物学的均等物をコードするポリヌクレオチドであって、該オープンリーディングフレームが交差反応性の免疫原性抗原をコードし、該交差反応性の免疫原性抗原が被験者における髄膜炎菌血清群Ｂによる感染に対して免疫原性を提供する、ポリヌクレオチド；または
（ｂ）（ａ）に記載のポリヌクレオチドのいずれかとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
【請求項１３８】
Ｐ４リーダー配列（配列番号：３２２）を付加的に含む、請求項１３７に記載の組成物。
【請求項１３９】
該組成物がベクターを含む、請求項１３７に記載の組成物。
【請求項１４０】
ベクターがプラスミドである、請求項１３９に記載の組成物。
【請求項１４１】
ベクターがファージである、請求項１３９に記載の組成物。
【請求項１４２】
ストリンジェントな条件が、高いストリンジェンシーのサザンハイブリダイゼーションの条件である、請求項１３７に記載の組成物。
【請求項１４３】
さらにＰ４リーダー配列（配列番号：３２２）を含む、請求項１３７に記載の組成物。
【請求項１４４】
ポリヌクレオチドが組換えポリヌクレオチドである、請求項１３７に記載の組成物。
【請求項１４５】
ポリヌクレオチドが天然の材料から単離される、請求項１３７に記載の組成物。
【請求項１４６】
該組成物が、付加的なペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質をコードする核酸配列を付加的に含む、請求項１３７に記載の組成物。
【請求項１４７】
以下の少なくとも１つのポリヌクレオチドを含む組成物：
（ａ）配列番号：２５４−２５９、２６０−２７８もしくは２７９−２９９のいずれかを含む単離された少なくとも１つのタンパク質をコードするポリヌクレオチド、または（ｂ）（ａ）に記載のポリヌクレオチドのいずれかとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
【請求項１４８】
Ｐ４リーダー配列（配列番号：３２２）を付加的に含む、請求項１４７に記載の組成物。
【請求項１４９】
該組成物がベクターを含む、請求項１４７に記載の組成物。
【請求項１５０】
ストリンジェントな条件が、高いストリンジェンシーのサザンハイブリダイゼーションの条件である、請求項１４７に記載の組成物。
【請求項１５１】
Ｐ４リーダー配列（配列番号：３２２）をさらに含む、請求項１４７に記載の組成物。
【請求項１５２】
ポリヌクレオチドが組換えポリヌクレオチドである、請求項１４７に記載の組成物。
【請求項１５３】
ポリヌクレオチドが天然の材料から単離される、請求項１４７に記載の組成物。
【請求項１５４】
該組成物が、付加的なペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質をコードする核酸配列を付加的に含む、請求項１４７に記載の組成物。
【請求項１５５】
以下の少なくとも１つのポリヌクレオチドを含む組成物：
（ａ）配列番号：３００のアミノ酸配列を含む少なくとも１つのタンパク質をコードするポリヌクレオチドであって、ｘはいずれかのアミノ酸であり、５番目のアミノ酸から９番目のアミノ酸までの領域は、０から５個のいずれかのアミノ酸であり、６７番目のアミノ酸から６９番目のアミノ酸までの領域は、０から３個のいずれかのアミノ酸であり；そして１５６番目のアミノ酸は０から１個のいずれかのアミノ酸である、ポリヌクレオチド、または、
（ｂ）（ａ）に記載のポリヌクレオチドのいずれかとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
【請求項１５６】
Ｐ４リーダー配列（配列番号：３２２）を付加的に含む、請求項１５５に記載の組成物。
【請求項１５７】
以下を含む組成物：
（ａ）以下の少なくとも１つをコードする少なくとも１つのポリヌクレオチド：（ｉ）配列番号２−２５２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む少なくとも１つのタンパク質；（ｉｉ）配列番号１−２５３の奇数番号のいずれかの核酸配列を含むポリヌクレオチ
ドと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされる少なくとも１つのタンパク質、（ｉｉｉ）（ｉ）または（ｉｉ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；もしくは（ｉｖ）（ｉ）もしくは（ｉｉ）に記載の少なくとも１つのタンパク質または（ｉｉｉ）に記載の免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物、または
（ｂ）（ａ）に記載のポリヌクレオチドのいずれかと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする少なくとも１つのポリヌクレオチド。
【請求項１５８】
前記の少なくとも１つのポリヌクレオチドが、配列番号１−２５３の奇数番号のいずれかの核酸配列を含む、請求項１５７に記載の組成物。
【請求項１５９】
該組成物がベクターを含む、請求項１５７に記載の組成物。
【請求項１６０】
ストリンジェントな条件が、高いストリンジェンシーのサザンハイブリダイゼーションの条件である、請求項１５７に記載の組成物。
【請求項１６１】
該組成物が、付加的なペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質をコードする核酸配列を付加的に含む、請求項１５７に記載の組成物。
【請求項１６２】
以下を含む組成物：
（ａ）ナイセリア種の第１の細菌株の少なくとも１つの抗原であって、ナイセリア種の第２の細菌株による被験者の感染に対して免疫原性を提供する該抗原をコードする、少なくとも１つのポリヌクレオチド；または
（ｂ）（ａ）の少なくとも１つののポリヌクレオチドと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする少なくとも１つのポリヌクレオチド。
【請求項１６３】
前記の少なくとも１つの単離されたポリヌクレオチドが、配列番号：１−２５３の奇数番号のいずれかの核酸配列を含む、請求項１６２に記載の組成物。
【請求項１６４】
Ｐ４リーダー配列（配列番号：３２２）を付加的に含む、請求項１６２に記載の組成物。
【請求項１６５】
該組成物がベクターを含む、請求項１６２に記載の組成物。
【請求項１６６】
ストリンジェントな条件が、高いストリンジェンシーのサザンハイブリダイゼーションの条件である、請求項１６２に記載の組成物。
【請求項１６７】
該組成物が、付加的なペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質をコードする核酸配列を付加的に含む、請求項１６２に記載の組成物。
【請求項１６８】
以下のいずれかを含むベクターを含む組成物：
（ａ）配列番号：２５４−２５９、２６０−２７８もしくは２７９−２９９のいずれかのアミノ酸配列を含む、少なくとも１つのタンパク質；または
（ｂ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；または
（ｃ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質もしくは（ｂ）に記載の免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物。
【請求項１６９】
ベクターがプラスミドである、請求項１６８に記載の組成物。
【請求項１７０】
ベクターがファージである、請求項１６８に記載の組成物。
【請求項１７１】
ベクターがバクテリオファージである、請求項１６８に記載の組成物。
【請求項１７２】
ベクターが緩和ファージ(moderate phage)である、請求項１６８に記載の組成物。
【請求項１７３】
配列番号：３００のアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする少なくとも１つのポリヌクレオチドを含むベクターを含む組成物：ここで、
配列中ｘはいずれかのアミノ酸であり；
配列中５番目のアミノ酸から９番目のアミノ酸までの領域は、０から５個のいずれかのアミノ酸であり；
配列中６７番目のアミノ酸から６９番目のアミノ酸までの領域は、０から３個のいずれかのアミノ酸であり；そして
配列中１５６番目のアミノ酸は、０から１個のいずれかのアミノ酸である。
【請求項１７４】
ベクターがプラスミドである、請求項１７３に記載の組成物。
【請求項１７５】
ベクターがファージである、請求項１７３に記載の組成物。
【請求項１７６】
以下のいずれかを含むベクターを含む組成物：
（ａ）配列番号：２−２５２の偶数番号のポリペプチドの少なくとも１つをコードする少なくとも１つのポリヌクレオチド；または
（ｂ）（ａ）に記載の少なくとも１つのポリヌクレオチドの少なくとも１つと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする少なくとも１つのポリヌクレオチド。
【請求項１７７】
ベクターが配列番号：１−１５３のいずれかの核酸配列を含む、請求項１７６に記載の組成物。
【請求項１７７】
ベクターがプラスミドである、請求項１７６に記載の組成物。
【請求項１７８】
ベクターがファージである、請求項１７６に記載の組成物。
【請求項１７９】
ベクターがバクテリオファージである、請求項１７６に記載の組成物。
【請求項１８０】
ベクターが緩和ファージ(moderate phage)である、請求項１７６に記載の組成物。
【請求項１８１】
ベクターで形質転換/トランスフェクトまたは感染させた宿主細胞を含む組成物であっ
て、該ベクターが以下のいずれかを含む該組成物：
（ａ）ナイセリア種のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ２０８６）によりコードされる少なくとも１つのタンパク質であって、該オープンリーディングフレームが交差反応性の免疫原性抗原をコードし、該交差反応性免疫原性抗原が被験者における髄膜炎菌血清群Ｂによる感染に対して免疫原性を提供するタンパク質；または
（ｂ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；または
（ｃ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質または（ｂ）に記載の免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物。
【請求項１８２】
ベクターで形質転換/トランスフェクトまたは感染させた宿主細胞を含む組成物であっ
て、該ベクターが以下のいずれかを含む該組成物：
（ａ）配列番号：２５４−２５９、２６０−２７８または２７９−２９９のいずれかを含
む少なくとも１つのタンパク質；または
（ｂ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；または
（ｃ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質もしくは（ｂ）に記載の免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物。
【請求項１８３】
以下のいずれかをコードする核酸を宿主細胞で発現させることを含む過程により調製される組成物：
（ａ）ナイセリア種のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ２０８６）によりコードされる少なくとも１つのタンパク質であって、該オープンリーディングフレームが交差反応性の免疫原性抗原をコードし、該交差反応性免疫原性抗原が被験者における髄膜炎菌血清群Ｂによる感染に対して免疫原性を提供する、タンパク質；または
（ｂ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；または
（ｃ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質もしくは（ｂ）に記載の免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物。
【請求項１８４】
核酸配列が配列番号：１−２５３の奇数番号のいずれかである、請求項１８３に記載の組成物。
【請求項１８５】
核酸配列が配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれかを含むタンパク質をコードする、請求項１８３に記載の組成物。
【請求項１８６】
核酸配列が配列番号：２−１７４の偶数番号のいずれかを含むタンパク質をコードする、請求項１８３に記載の組成物。
【請求項１８７】
タンパク質が、質量分析による測定で分子量  約２６，０００から約３０，０００である、請求項１８３に記載の組成物。
【請求項１８８】
タンパク質が、１０％−２０％ＳＤＳポリアクリルアミドゲルにおける測定で分子量  約２８−３５ｋＤａである、請求項１８７に記載の組成物。
【請求項１８９】
該組成物が医薬的に受容可能なバッファー、希釈剤、アジュバントまたは担体を付加的に含む、請求項１８３に記載の組成物。
【請求項１９０】
該組成物が付加的に担体を含む、請求項１８３に記載の組成物。
【請求項１９１】
該組成物が付加的にアジュバントを含む、請求項１８３に記載の組成物。
【請求項１９２】
該アジュバントが液体である、請求項１９１に記載の組成物。
【請求項１９３】
タンパク質が脂質化されたタンパク質である、請求項１８３に記載の組成物。
【請求項１９４】
以下のいずれかをナイセリア種から単離、精製することを含む過程により調製される組成物：
（ａ）ナイセリア種のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ２０８６）によりコードされる少なくとも１つのタンパク質であって、該オープンリーディングフレームが交差反応性の免疫原性抗原をコードし、該交差反応性免疫原性抗原が被験者における髄膜炎菌血清群Ｂによる感染に対して免疫原性を提供する、タンパク質；または
（ｂ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；ま
たは
（ｃ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質もしくは（ｂ）に記載の免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物。
【請求項１９５】
少なくとも１つのポリヌクレオチドが、配列番号：１−２５３の奇数番号のいずれかの核酸配列を含む、請求項１９４に記載の組成物。
【請求項１９６】
過程が、少なくとも１つの単離されたポリヌクレオチドに天然ではないリーダー配列を導入することをさらに含む、請求項１９４に記載の組成物。
【請求項１９７】
天然ではないリーダー配列がＰ４リーダー配列（配列番号：３２２）である、請求項１９６に記載の組成物。
【請求項１９８】
以下のいずれかをナイセリア種から単離、精製することを含む過程により製造される組成物：
（ａ）配列番号：２５４−２５９、２６０−２７８または２７９−２９９のいずれかを含む、少なくとも１つのタンパク質；または
（ｂ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；または
（ｃ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質もしくは（ｂ）に記載の免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物。
【請求項１９９】
ポリペプチドが、質量分析による測定で分子量  約２６，０００から約３０，０００である、請求項１９８に記載の組成物。
【請求項２００】
ポリペプチドが、１０％−２０％ＳＤＳポリアクリルアミドゲルにおける測定で分子量
約２８−３５ｋＤａである、請求項１９９に記載の組成物。
【請求項２０１】
該組成物が医薬的に受容可能なバッファー、希釈剤、アジュバントまたは担体を付加的に含む、請求項１９８に記載の組成物。
【請求項２０２】
該組成物が付加的に担体を含む、請求項１９８に記載の組成物。
【請求項２０３】
該組成物が付加的にアジュバントを含む、請求項１９８に記載の組成物。
【請求項２０４】
該アジュバントが液体を含む、請求項２０３に記載の組成物。
【請求項２０５】
タンパク質が脂質化されたタンパク質である、請求項１９８に記載の組成物。
【請求項２０６】
配列番号：３００のアミノ酸配列を含む少なくとも１つの単離されたタンパク質をベクター中に挿入することを含む過程により製造される組成物：ここで、
配列中ｘはいずれかのアミノ酸であり；
配列中５番目のアミノ酸から９番目のアミノ酸までの領域は、０から５個のいずれかのアミノ酸であり；
配列中６７番目のアミノ酸から６９番目のアミノ酸までの領域は、０から３個のいずれかのアミノ酸であり；そして
配列中１５６番目のアミノ酸は、０から１個のいずれかのアミノ酸である。
【請求項２０７】
ベクターがプラスミドである、請求項２０６に記載の組成物。
【請求項２０８】
ベクターがファージである、請求項２０６に記載の組成物。
【請求項２０９】
ベクターがバクテリオファージである、請求項２０６に記載の組成物。
【請求項２１０】
ベクターが緩和ファージ(moderate phage)である、請求項２０６に記載の組成物。
【請求項２１１】
天然ではないリーダー配列をさらに含む、請求項２０６に記載の組成物。
【請求項２１２】
天然ではないリーダー配列がＰ４リーダー配列（配列番号：３２２）である、請求項２１１に記載の組成物。
【請求項２１３】
以下を宿主細胞で発現させること含む過程により製造される組成物：
（ａ）ナイセリア種のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ２０８６）によりコードされる少なくとも１つのタンパク質、または前記の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分または生物学的均等物をコードする少なくとも１つの単離されたポリヌクレオチドであって、該オープンリーディングフレームが交差反応性の免疫原性抗原をコードし、該交差反応性免疫原性抗原が被験者における髄膜炎菌血清群Ｂによる感染に対して免疫原性を提供する、ポリヌクレオチド、および（ｂ）前記の少なくとも１つの単離されたポリヌクレオチドに結合する、天然ではないリーダー配列。
【請求項２１４】
天然ではないリーダー配列がＰ４リーダー配列（配列番号：３２２）である、請求項２１３に記載の組成物。
【請求項２１５】
以下を含む過程により製造される組成物：
以下のいずれかをコードする核酸配列を宿主細胞で発現させること：
（ａ）ナイセリア種のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ２０８６）によりコードされる少なくとも１つのタンパク質であって、該オープンリーディングフレームが交差反応性の免疫原性抗原をコードし、該交差反応性免疫原性抗原が被験者における髄膜炎菌血清群Ｂによる感染に対して免疫原性を提供する、タンパク質；もしくは
（ｂ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；もしくは
（ｃ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質もしくは（ｂ）に記載の免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物；または
前述の核酸配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸配列を宿主細胞で発現させること。
【請求項２１６】
核酸配列が配列番号：１−２５３の奇数番号のいずれかである、請求項２１５に記載の組成物。
【請求項２１７】
核酸配列が配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれかをコードする、請求項２１５に記載の組成物。
【請求項２１８】
タンパク質が、質量分析による測定で分子量  約２６，０００から約３０，０００である、請求項２１５に記載の組成物。
【請求項２１９】
タンパク質が、１０％−２０％ＳＤＳポリアクリルアミドゲルにおける測定で分子量  約２８−３５ｋＤａである、請求項２１８に記載の組成物。
【請求項２２０】
該組成物が医薬的に受容可能なバッファー、希釈剤、アジュバントまたは担体を付加的に含む、請求項２１５に記載の組成物。
【請求項２２１】
該組成物が付加的に担体を含む、請求項２１５に記載の組成物。
【請求項２２２】
該組成物が付加的にアジュバントを含む、請求項２１５に記載の組成物。
【請求項２２３】
該アジュバントが液体を含む、請求項２２２に記載の組成物。
【請求項２２４】
ストリンジェントな条件が、高いストリンジェンシーのサザンハイブリダイゼーションの条件である、請求項２１５に記載の組成物。
【請求項２２５】
以下のいずれかをナイセリア種から単離、精製することを含む過程により製造される組成物：
（ａ）配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む少なくとも１つのポリペプチドをコードする少なくとも１つのポリヌクレオチド；または
（ｂ）（ａ）の少なくとも１つのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズする少なくとも１つのポリヌクレオチド。
【請求項２２６】
少なくとも１つのポリヌクレオチドが、配列番号：１−２５３の奇数番号のいずれかの核酸配列を含む、請求項２２５に記載の組成物。
【請求項２２７】
過程が、少なくとも１つのポリヌクレオチドに天然ではないリーダー配列を導入することをさらに含む、請求項２２５に記載の組成物。
【請求項２２８】
天然ではないリーダー配列がＰ４リーダー配列（配列番号：３２２）である、請求項２２７に記載の組成物。
【請求項２２９】
以下のいずれかをナイセリア種から単離、精製することを含む過程により調製される組成物：
（ａ）配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む、少なくとも１つのタンパク質； 
（ｂ）配列番号：１−２５３の奇数番号のいずれかの核酸配列を含むポリヌクレオチドと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされる、少なくとも１つのタンパク質；
（ｃ）（ａ）もしくは（ｂ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；または
（ｄ）（ａ）もしくは（ｂ）に記載の少なくとも１つのタンパク質もしくは（ｃ）に記載の免疫原性フラグメント、の少なくとも１つの生物学的均等物。
【請求項２３０】
タンパク質が、質量分析による測定で分子量  約２６，０００から約３０，０００である、請求項２２９に記載の組成物。
【請求項２３１】
タンパク質が、１０％−２０％ＳＤＳポリアクリルアミドゲルにおける測定で分子量  約２８−３５ｋＤａである、請求項２３０に記載の組成物。
【請求項２３２】
該組成物が医薬的に受容可能なバッファー、希釈剤、アジュバントまたは担体を付加的に含む、請求項２２９に記載の組成物。
【請求項２３３】
該組成物が付加的に担体を含む、請求項２２９に記載の組成物。
【請求項２３４】
該組成物が付加的にアジュバントを含む、請求項２２９に記載の組成物。
【請求項２３５】
該アジュバントが液体を含む、請求項２３４に記載の組成物。
【請求項２３６】
ストリンジェントな条件が、高いストリンジェンシーのサザンハイブリダイゼーションの条件である、請求項２２９に記載の組成物。
【請求項２３７】
以下のいずれかをベクターに挿入することを含む過程により調製される組成物：
（ａ）配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれかを含む少なくとも１つのポリペプチドをコードする少なくとも１つの単離されたポリヌクレオチド；または
（ｂ）（ａ）の少なくとも１つのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズする少なくとも１つの単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２３８】
ベクターがプラスミドである、請求項２３７に記載の組成物。
【請求項２３９】
ベクターがファージである、請求項２３７に記載の組成物。
【請求項２４０】
ベクターがバクテリオファージである、請求項２３７に記載の組成物。
【請求項２４１】
ベクターが緩和ファージ(moderate phage)である、請求項２３７に記載の組成物。
【請求項２４２】
天然ではないリーダー配列をさらに含む、請求項２３７に記載の組成物。
【請求項２４３】
天然ではないリーダー配列がＰ４リーダー配列（配列番号：３２２）である、請求項２４２に記載の組成物。
【請求項２４４】
以下のポリヌクレオチドの少なくとも１つを宿主細胞で発現させること含む過程により調製される組成物：
（ａ）ナイセリア種のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ２０８６）によりコードされる少なくとも１つのタンパク質、または前記の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分または生物学的均等物をコードするポリヌクレオチドであって、該オープンリーディングフレームが交差反応性の免疫原性抗原をコードし、該交差反応性免疫原性抗原が被験者における髄膜炎菌血清群Ｂによる感染に対して免疫原性を提供する、ポリヌクレオチド、および
（ｂ）（ａ）に記載のポリヌクレオチドのいずれかとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
【請求項２４６】
前記の少なくとも１つのポリヌクレオチドに結合する天然ではないリーダー配列を付加的に含む、請求項２４４に記載の組成物。
【請求項２４６】
天然ではないリーダー配列がＰ４リーダー配列（配列番号：３２２）である、請求項２４５に記載の組成物。
【請求項２４７】
少なくとも１つの免疫原性の菌株非特異的髄膜炎菌抗原であって、非病原性でいかなる感染性不純物も実質的に含まない該抗原を含む組成物。
【請求項２４８】
抗原が、配列番号：２−６の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２４９】
抗原が、配列番号：８−１２の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２５０】
抗原が、配列番号：１４−１８の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列が同一であるアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２５１】
抗原が、配列番号：２０−２４の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２５２】
抗原が、配列番号：２６−３０の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２５３】
抗原が、配列番号：３２−３６の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２５４】
抗原が、配列番号：３８−４２の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２５５】
抗原が、配列番号：４４−４８の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２５６】
抗原が、配列番号：５０−５４の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２５７】
抗原が、配列番号：５６−６０の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２５８】
抗原が、配列番号：６２−６６の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２５９】
抗原が、配列番号：６８−７２の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２６０】
抗原が、配列番号：７４−７８の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２６１】
抗原が、配列番号：８０−８４の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２６２】
抗原が、配列番号：８６−９０の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２６３】
抗原が、配列番号：９２−９６の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２６４】
抗原が、配列番号：９８−１０２の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２６５】
抗原が、配列番号：１０４−１０８の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２６６】
抗原が、配列番号：１１０−１１４の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミ
ノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２６７】
抗原が、配列番号：１１６−１２０の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２６８】
抗原が、配列番号：１２２−１２６の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２６９】
抗原が、配列番号：１２８−１３２の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２７０】
抗原が、配列番号：１３４−１３８の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２７１】
抗原が、配列番号：１４０−１４４の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２７２】
抗原が、配列番号：１４６−１５０の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２７３】
抗原が、配列番号：１５２−１５６の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２７４】
抗原が、配列番号：１５８−１６２の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２７５】
抗原が、配列番号：１６４−１６８の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２７６】
抗原が、配列番号：１７０−１７４の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２７７】
抗原が、配列番号：１７６−１８０の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２７８】
抗原が、配列番号：１８２−１８６の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２７９】
抗原が、配列番号：１８８−１９２の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２８０】
抗原が、配列番号：１９４−１９８の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２８１】
抗原が、配列番号：２００−２０４の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２８２】
抗原が、配列番号：２０６−２１０の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２８３】
抗原が、配列番号：２１２−２１６の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２８４】
抗原が、配列番号：２１８−２２２の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２８５】
抗原が、配列番号：２２４−２２８の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２８６】
抗原が、配列番号：２３０−２３４の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２８７】
抗原が、配列番号：２３６−２４０の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２８８】
抗原が、配列番号：２４２−２４６の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２８９】
抗原が、配列番号：２４８−２５２の偶数番号のいずれかと少なくとも約７０％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項２４７に記載の抗原。
【請求項２９０】
哺乳類の免疫応答を惹起するための薬剤の製造における、請求項１−２８９のいずれかに記載の組成物の使用。
【請求項２９１】
該組成物を非経口的に投与する、請求項２９０の記載による使用。
【請求項２９２】
該組成物を粘膜から投与する、請求項２９０の記載による使用。
【請求項２９３】
哺乳類の細菌性髄膜炎に対して有効な薬剤における、請求項１−２８９のいずれかに記載の組成物の使用。
【請求項２９４】
該組成物を非経口的に投与する、請求項２９３の記載による組成物の使用。
【請求項２９５】
該組成物を粘膜から投与する、請求項２９３の記載による組成物の使用。
【請求項２９６】
該組成物を皮下注または筋注により投与する、請求項２９３の記載による組成物の使用。
【請求項２９７】
以下のいずれかをコードする核酸配列を宿主細胞で発現させることを含む組成物の調製法：
（ａ）ナイセリア種のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ２０８６）によりコードされる少なくとも１つのタンパク質であって、該オープンリーディングフレームが交差反応性の免疫原性抗原をコードし、該交差反応性免疫原性抗原が被験者における髄膜炎菌血清群Ｂによる感染に対して免疫原性を提供するタンパク質；または
（ｂ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；または
（ｃ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質もしくは（ｂ）に記載の１つの免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物。
【請求項２９８】
核酸配列をin vivoで発現させる、請求項２９７に記載の方法。
【請求項２９９】
核酸配列をin vitroで発現させる、請求項２９７に記載の方法。
【請求項３００】
Ｐ４リーダー配列（配列番号：３２２）を結合することをさらに含む、請求項２９７に記載の方法。
【請求項３０１】
少なくとも１つのタンパク質が配列番号：２５４−２９９のいずれかを含む、請求項２９７に記載の方法。
【請求項３０２】
以下のポリヌクレオチドの少なくとも１つを髄膜炎菌から単離、精製することを含む組成物の調製法：
（ａ）ナイセリア種のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ２０８６）によりコードされる少なくとも１つのタンパク質、または前記の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分または生物学的均等物をコードするポリヌクレオチドであって、該オープンリーディングフレームが交差反応性の免疫原性抗原をコードし、該交差反応性免疫原性抗原が被験者における髄膜炎菌血清群Ｂによる感染に対して免疫原性を提供する、ポリヌクレオチド；または
（ｂ）（ａ）に記載のポリヌクレオチドのいずれかと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
【請求項３０３】
ストリンジェントな条件が、高いストリンジェンシーのサザンハイブリダイゼーションの条件である、請求項３０２に記載の組成物。
【請求項３０４】
タンパク質、免疫原性部分または生物学的均等物のいずれかをナイセリア種から単離、精製することを含む、組成物の調製法。
【請求項３０５】
本請求項に記載のタンパク質、免疫原性部分または生物学的均等物のいずれかを含む組成物を動物に導入した後、同動物から抗体を回収することを含む、抗体組成物の調製法。
【請求項３０６】
請求項１−２８９の組成物の１つまたはそれより多くの有効量を哺乳類に投与することを含む、同哺乳類における免疫応答を惹起する方法。
【請求項３０７】
該組成物を非経口的に投与する、請求項３０６の記載による使用。
【請求項３０８】
該組成物を粘膜から投与する、請求項３０６の記載による使用。
【請求項３０９】
請求項１−２９８の組成物の１つまたはそれ以上の有効量を哺乳類に投与することを含む、同哺乳類における細菌性髄膜炎を予防または治療する方法。
【請求項３１０】
該組成物を非経口的に投与する、請求項３０９の記載による使用。
【請求項３１１】
該組成物を粘膜から投与する、請求項３０９の記載による使用。
【請求項３１２】
該組成物を皮下注または筋注により投与する、請求項３０９の記載による組成物の使用。
【請求項３１３】
以下を含む哺乳類における細菌性髄膜炎を予防または治療する方法：
配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれかまたは配列番号：２５４−２９９のいずれかのアミノ酸配列を含む、タンパク質、免疫原性部分または生物学的均等物と免疫特異的に結合する抗体を含む抗体組成物の有効量を同哺乳類に投与すること。
【請求項３１３】
該組成物を非経口的に投与する、請求項３１２の記載による使用。
【請求項３１４】
該組成物を粘膜から投与する、請求項３１２の記載による使用。
【請求項３１５】
該組成物を皮下注または筋注により投与する、請求項３１２の記載による組成物の使用。
【請求項３１６】
以下のいずれかをコードする核酸配列を宿主細胞で発現させること
を含む組成物の調製法：
（ａ）配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれか、または配列番号：２５４−２９９のいずれかのアミノ酸配列を含む、少なくとも１つのタンパク質；
（ｂ）配列番号：１−２５３の奇数番号のいずれかの核酸配列を含むポリヌクレオチドと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされる、少なくとも１つのタンパク質；
（ｃ）（ａ）もしくは（ｂ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；または
（ｄ）（ａ）もしくは（ｂ）に記載の少なくとも１つのタンパク質もしくは（ｃ）に記載の免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物。
【請求項３１７】
核酸配列をin vivoで発現させる、請求項３１６に記載の方法。
【請求項３１８】
核酸配列をin vitroで発現させる、請求項３１６に記載の方法。
【請求項３１９】
ベクターがプラスミドである、請求項３１６に記載の方法。
【請求項３２０】
ベクターがファージである、請求項３１６に記載の方法。
【請求項３２１】
前記の少なくとも１つの単離されたポリヌクレオチドに、天然ではないリーダー配列を結合することをさらに含む、請求項３１６に記載の方法。
【請求項３２２】
天然ではないリーダー配列がＰ４リーダー配列（配列番号：２６７）である、請求項３１６に記載の方法。
【請求項３２３】
配列番号：３００のアミノ酸配列を含む少なくとも１つの単離されたタンパク質をナイセリア種から単離、精製することを含む組成物の調製法：ここで
配列中ｘはいずれかのアミノ酸であり；
配列中５番目のアミノ酸から９番目のアミノ酸までの領域は、０から５個のいずれかのアミノ酸であり；
配列中６７番目のアミノ酸から６９番目のアミノ酸までの領域は、０から３個のいずれかのアミノ酸であり；そして
配列中１５６番目のアミノ酸は、０から１個のいずれかのアミノ酸である。
【請求項３２４】
少なくとも１つの単離されたポリヌクレオチドに、天然ではないリーダー配列を導入することをさらに含む、請求項３２３に記載の方法。
【請求項３２５】
天然ではないリーダー配列がＰ４リーダー配列（配列番号：３２２）である、請求項３２３に記載の方法。
【請求項３２６】
以下のいずれかをナイセリア種から単離、精製することを含む組成物の調製法：
（ａ）配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列、もしくは配列番号：２５４−２５９、２６０−２７８もしくは２７９−２９９のいずれかのアミノ酸配列を含む、少なくとも１つのタンパク質；または
（ｂ）配列番号：１−２５３の奇数番号のいずれかの核酸配列を含むポリヌクレオチドと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされる、少なくとも１つのタンパク質。
【請求項３２７】
ストリンジェントな条件が、高いストリンジェンシーのサザンハイブリダイゼーションの条件である、請求項３２６に記載の組成物。
【請求項３２８】
以下を含む組成物を動物に導入した後、同動物から抗体を回収することを含む、抗体組成物の調製法：
（ａ）配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列、もしくは配列番号：２５４−２５９、２６０−２７８もしくは２７９−２９９のいずれかのアミノ酸配列を含む、少なくとも１つのタンパク質；または
（ｂ）配列番号：１−２５３の奇数番号のいずれかのポリヌクレオチドと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされる、少なくとも１つのタンパク質。
【請求項３２９】
ストリンジェントな条件が、高いストリンジェンシーのサザンハイブリダイゼーションの条件である、請求項３２８に記載の組成物。
【請求項３３０】
以下の核酸配列を発現する組換え細胞を含む、形質転換/トランスフェクトまたは感染
させた細胞株：
（ａ）配列番号：２５４−２５９、２６０−２７８もしくは２７９−２９９のいずれかのアミノ酸配列を含む、少なくとも１つの単離されたタンパク質をコードする核酸配列；または
（ｂ）（ａ）に記載のポリヌクレオチドのいずれかとストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸配列。
【請求項３３１】
以下を含む、形質転換/トランスフェクトまたは感染させた細胞株：
以下の核酸配列を発現する組換え細胞、すなわち（ａ）ナイセリア種のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ２０８６）によりコードされる少なくとも１つのタンパク質、もしくは前記の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分もしくは生物学的均等物をコードする核酸配列であって、該オープンリーディングフレームが交差反応性の免疫原性抗原をコードし、該交差反応性免疫原性抗原が被験者における髄膜炎菌血清群Ｂによる感染に対して免疫原性を提供する、核酸配列、または（ｂ）（ａ）のポリヌクレオチドのいずれかとストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸配列；または
以下をコードする核酸配列を発現する組換え細胞、すなわち（ｃ）（ａ）もしくは（ｂ）のいずれかによりコードされる少なくとも１つのポリペプチド；または（ｄ）配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む少なくとも１つのポリペプチド。
【請求項３３２】
ポリペプチドがモノクローナル抗体である、請求項３３１に記載の形質転換/トランス
フェクトまたは感染させた細胞株。
【請求項３３３】
組換え細胞がハイブリドーマである、請求項３３１に記載の形質転換/トランスフェク
トまたは感染させた細胞株。
【請求項３３４】
組換え細胞がトリオーマである、請求項３３１に記載の形質転換/トランスフェクトま
たは感染させた細胞株。
【請求項３３５】
以下を含む、形質転換/トランスフェクトまたは感染させた細胞株：
以下を含む核酸配列を発現する組換え細胞：
（ａ）配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれかを含むタンパク質をコードする少なくとも１つのポリヌクレオチド； 
（ｂ）配列番号：１−２５３の奇数番号のいずれかの核酸配列を含む少なくとも１つのポリヌクレオチド；
（ｃ）（ａ）もしくは（ｂ）のいずれかとストリンジェントな条件下でハイブリダイズする少なくとも１つのポリヌクレオチド；または
以下をコードする核酸配列を発現する組換え細胞：
（ｄ）（ａ）、（ｂ）もしくは（ｃ）によりコードされる少なくとも１つのポリペプチド；または
（ｅ）配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む少なくとも１つのポリペプチド。
【請求項３３６】
ポリペプチドがモノクローナル抗体である、請求項３３５に記載の形質転換/トランス
フェクトまたは感染させた細胞株。
【請求項３３７】
組換え細胞がハイブリドーマである、請求項３３５に記載の形質転換/トランスフェク
トまたは感染させた細胞株。
【請求項３３８】
組換え細胞がトリオーマである、請求項３３５に記載の形質転換/トランスフェクトま
たは感染させた細胞株。
【請求項３３９】
検査サンプルの殺菌活性をＯＲＦ２０８６抗血清に対して検出することを含む、免疫原性タンパク質を同定する方法。
【請求項３４０】
ＯＲＦ２０８６核酸プローブに対して検査サンプルのポリヌクレオチド検出することを含む、免疫原性タンパク質を同定する方法。
【請求項３４１】
実質的に当請求項で述べた組成物。
【請求項３４２】
実質的に当請求項で述べた使用。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
発明の属する技術分野
本発明は、菌株、例えば髄膜炎菌（Neisseria meningitidis ）（血清群Ａ、Ｂ、Ｃ、
Ｄ、Ｗ−１３５、Ｘ、Ｙ、Ｚおよび２９Ｅ）、淋菌（Neisseria gonorrhoeae）、および Neisseria lactamicaを含むナイセリア種の菌株から単離することのできる、ナイセリア
属(Neisseria)ＯＲＦ２０８６タンパク質（サブファミリーＡおよびサブファミリーＢ）
ならびに該タンパク質の免疫原性部分および/または生物学的均等物に関する。本発明は
また、該タンパク質、免疫原性部分および/または生物学的均等物に免疫特異的に結合す
る抗体にも関する。さらに本発明は、前述のタンパク質、免疫原性部分、生物学的均等物、および/またはその抗体のいずれかをコードする核酸配列を含む、単離されたポリヌク
レオチドに関する。加えて本発明は免疫原性組成物および、髄膜炎菌、そして特に髄膜炎菌血清群Ｂに起因する髄膜炎菌感染の予防、治療および/または診断におけるそれらの使
用、ならびに該組成物の製造法に関する。本発明は組換えした型および天然材料から単離された型の双方、ならびに脂質化された型（脂質化型）および脂質化されていない型（非脂質化型）の双方に関する。
【背景技術】
【０００２】
発明の背景
髄膜炎菌性髄膜炎は、抗生物質を使用してもなお数時間以内で小児および若年成人を死亡させ得る破壊的な疾患である。Pizza et al., 2000, Science 287: 1816-1820。
髄膜炎は、激しい頭痛、発熱、食欲喪失、光や音に対する不耐、筋肉硬直（特に頸部）、および重篤な場合には痙攣、死に至る嘔吐および下痢をきたす、髄膜の炎症を特徴とする。髄膜炎菌性髄膜炎の症状は突然表れ、最終的には特徴的な出血性発疹を伴う髄膜炎菌性敗血症に至る。何らかの生存のチャンスがあるとすれば、即時の診断および抗生物質の大量投与を含む迅速な治療が重要である。2000, Batam Medical Dictionary, Third Edition 302。
【０００３】
髄膜炎菌性髄膜炎は、髄膜炎菌（Neisseria meningitides、the meningococcus）すな
わちＡ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｗ−１３５、Ｘ、Ｙ、Ｚおよび２９Ｅを含むいくつかの病原性血清群に分類される、グラム陰性のきょう膜を有する細菌に起因する。骨髄炎菌うちの血清群Ｂ菌株が世界的な髄膜炎菌性疾患の主因である。例えば血清群Ｂは、米国および欧州在住の新生児および小児における細菌性髄膜炎の約５０％に関与することが、医学文献に報告されている。髄膜炎菌血清群Ｂに起因する髄膜炎菌性疾患を予防するためのワクチンは、現在はない。
【０００４】
血清群Ｂ髄膜炎菌性疾患を予防するための免疫原性組成物の開発は、Goldschneiderら
の仕事以来３０年以上にわたり研究者らにより試みられてきた。Goldschneider et al., 1969, J. Exp. Med. 129(6): 1307-26; Goldschneider et al., 1969, J. Exp. Med. 129(6): 1327-48; Gotschlich et al., 1969, J. Exp. Med. 129(6): 1385-95; およびGotschlich et al., 1969, J. Exp. Med. 129(6): 1367-84。第二次世界大戦以降、北米から事実上消失した血清群Ａによる疾患 (Achtman, M., 1995, Trends in Microbiology 3(5): 186-92) とは異なり、血清群ＢおよびＣの有機体に起因する疾患は、先進国の多くにわたり風土的に残存する。疾患の発病率は、風土病としては少ない地域の１/１００，０００
未満から、流行性疾患として高リスクな母集団にあたる２００/１００，０００までと様
々である。
【０００５】
多糖の複合体を基本とするワクチンが髄膜炎菌血清群ＡおよびＣに対して開発され、疾
患の予防に有効なようである。現在、血清群Ａ、Ｃ、Ｙ、＆Ｗ−１３５由来のきょう膜多糖から作製された免疫原性組成物を入手することができる。Ambrosch et al., Immunogenicity and side-effects of a new tetravalent（新規４価物質の免疫原性および副作用
）. Bulletin of the World Health Organization 61(2): 317-23。しかしこの免疫原性
組成物はＴ細胞非依存性の免疫応答を惹起し、年少の小児には有効ではなく、そして髄膜炎菌性疾患の５０％以上の原因となる血清群Ｂ菌株への適用はできない。
【０００６】
他の研究者もまた、きょう膜多糖を用いての免疫原性組成物の開発を試みてきた。最近、血清群Ｃのきょう膜物質をタンパク質に複合させることにより製造された、血清群Ｃ疾患用の免疫原性組成物について、欧州における使用に関するライセンスが取得された。しかし血清群Ｂのきょう膜は、そのきょう膜の多糖が、ヒトの神経組織の発達に関する糖質部分との類似性をもたらすポリシアル酸を含むため、ワクチンの候補としては不適切となり得る。この糖質部分は自己抗原として認識され、したがってヒトにおける免疫原性は低い。
【０００７】
血清群Ｂによる疾患のためのこれに代わるワクチン抗原として、外膜タンパク質（ＯＭＰ）が開発されてきた。ＰｏｒＡの２つの変異性の領域に結合するモノクローナル抗体により髄膜炎菌の血清型サブタイプに分類されるスキームが定義される。したがってＰｏｒＡタンパク質は髄膜炎菌株に関する血清型サブタイプに分類される抗原として提供され (Abdillahi et al., 1988, Microbial Pathogenesis 4(1): 27-32)、血清群Ｂの免疫原性
組成物の成分として盛んに研究されている (Poolman, 1996, Adv. Exp. Med. Biol. 397:
73-7)、というのもこれらは殺菌性抗体を産生できるからである(Saukkonen, 1987, Microbial Pathogenesis 3(4): 261-7)。殺菌性抗体は防護の指標と考えることができ、新た
な免疫原性組成物のいかなる候補物質もこれらの機能的な抗体を産生すべきであると考えられる。
【０００８】
動物と同様ヒトにおける研究も、血清型サブタイプに分類される抗原であるＰｏｒＡが殺菌性抗体を産生することを示している。しかしＰｏｒＡに対する免疫応答は一般に血清型サブタイプ特異的である。特に血清型サブタイプに分類されるデータは、ＰｏｒＡから作成される免疫原性組成物は、このような１つの免疫原性組成物の適用できる各血清型サブタイプに対して、１つのＰｏｒＡが必要であり、おそらく６個から９個程度のＰｏｒＡが必要となる可能性があることを示す。したがって血清群Ｂ菌株の７０−８０％に適用できるためには、６−９個のＰｏｒＡが必要となる。このように臨床的に単離された十分な数の髄膜炎菌血清型サブタイプに対して防護するために、このタンパク質の変異性の特性が多価ワクチン組成物を必要とすることになる。
【０００９】
血清群Ｂ髄膜炎菌に関する免疫原性組成物の開発が非常に困難であったため、最近、いくつかの研究グループにより、新たな免疫原性組成物の候補物質を同定する一助とするため、血清群ＡおよびＢの双方の代表的な複数の菌株のゲノムの配列決定が行われた。Tettlin, 2000, Science, 287(5459): 1809-15; Pizza et al., 2000, Science 287: 1816-1820。新たな免疫原性組成物の候補物質を同定することは、ナイセリア属のゲノムの知識があるとしても、適当な数学的アルゴリズムが今のところない挑戦的なプロセスである。事実最近の報告は、理論的に膜をスパンするドメインを含む何百ものオープンリーディングフレーム（“ＯＲＦｓ”）が同定されているにもかかわらず、発現、精製および表面の反応性の誘導、および機能的に活性な抗体を含む問題から、血清群Ｂ髄膜炎菌の免疫原性組成物に関して７つの候補物質を導くことしかできなかったことを示している。(Id)参照のこと。これらの１つは、既に知られているものであった。
【００１０】
したがって、（１）多数のナイセリア菌株に対して殺菌性抗体を産生する；（２）多数の菌株の表面と反応する；（３）実際の攻撃に対して受動的な防護を与える；および/ま
たは（４）コロニー化を防ぐ、免疫原性組成物の必要性は依然として残されている。
【発明の開示】
【課題を解決するための手段】
【００１１】
発明の概要
これらおよびその他の必要性を満たすために、およびその目的を考慮して、本発明は２０８６サブファミリーＡタンパク質および２０８６サブファミリーＢタンパク質を含む、ナイセリアＯＲＦ２０８６タンパク質（“２０８６タンパク質”）を提供する。各２０８６タンパク質は、髄膜炎菌（血清群Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｗ−１３５、Ｘ、Ｙ、Ｚおよび２９Ｅ）、淋菌およびNeisseria lactamicaの菌株を含む、天然のナイセリア菌株から単離す
ることのできるタンパク質である。２０８６タンパク質はまた組換え技術を用いて製造することもできる。
【００１２】
特に本発明は２０８６タンパク質、その免疫原性部分、および/またはその生物学的均
等物、前述のいずれかと免疫特異的に結合する抗体、および前述のいずれかをコードする核酸配列を含むポリヌクレオチドを提供する。本発明は組成物、免疫原性組成物、および髄膜炎菌感染、そして特に髄膜炎菌に起因する髄膜炎菌性疾患の予防、治療、および/ま
たは診断におけるそれらの使用、ならびに該組成物の製造法を含む。当明細書において２０８６タンパク質は組換えの型および天然材料から単離された型、ならびに脂質化型および非脂質化型の双方を含む。
【００１３】
本発明は予想外にそして有益なことに以下の組成物、すなわち（１）多数のナイセリア菌株、例えば髄膜炎菌、淋菌、および/またはNeisseria lactamicaに対して殺菌性抗体を産生する；（２）多数の菌株の表面と反応する；（３）実際の攻撃に対して受動的な防護を与える；（４）コロニー化を防ぐ組成物、ならびに該組成物の使用法および該組成物の製造法を提供する。本発明の様々な態様を以下に述べる。
【００１４】
配列の概要
配列番号  検討した配列について：
配列番号：１  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｌ３  ６２７５菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２  天然のリーダー配列を用いて作製されるＬ３  ６２７５菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：３  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｌ３  ６２７５由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：４  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＬ３  ６２７５菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：５  Ｌ３  ６２７５菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：６  Ｌ３  ６２７５菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：７  天然のリーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ２３６９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：８  天然のリーダー配列を用いて作製されるＣＤＣ２３６９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：９  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ２３６９由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１０  Ｐ４リーダータンパク質を用いて作製されるＣＤＣ２３６９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１１  ＣＤＣ２３６９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１２  ＣＤＣ２３６９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１３  天然のリーダー配列と結合させた場合に、ＣＤＣ１０３４菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１４  天然のリーダータンパク質を用いて作製されるＣＤＣ１０３４菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１５  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ１０３４由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１６  Ｐ４リーダータンパク質を用いて作製されるＣＤＣ１０３４菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１７  ＣＤＣ１０３４菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１８  ＣＤＣ１０３４菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１９  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｌ４  ８９１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２０  天然のリーダー配列を用いて作製されるＬ４  ８９１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２１  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｌ４  ８９１由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２２  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＬ４  ８９１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２３  Ｌ４  ８９１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２４  Ｌ４  ８９１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２５  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｂ１６Ｂ６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２６  天然のリーダー配列を用いて作製されるＢ１６Ｂ６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２７  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｂ１６Ｂ６由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２８  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＢ１６Ｂ６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２９  Ｂ１６Ｂ６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：３０  Ｂ１６Ｂ６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：３１  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｗ１３５（ＡＴＣＣ３５５５９）菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：３２  天然のリーダー配列を用いて作製されるＷ１３５（ＡＴＣＣ３５５５９）菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：３３  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｗ１３５（ＡＴＣＣ３５５５９）由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：３４  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＷ１３５（ＡＴＣＣ３５５５９）菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：３５  Ｗ１３５（ＡＴＣＣ３５５５９）菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：３６  Ｗ１３５（ＡＴＣＣ３５５５９）菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：３７  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｃ１１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：３８  天然のリーダー配列を用いて作製されるＣ１１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：３９  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｃ１１由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：４０  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＣ１１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：４１  Ｃ１１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：４２  Ｃ１１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：４３  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｙ（ＡＴＣＣ３５５６１）菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：４４  天然のリーダー配列を用いて作製されるＹ（ＡＴＣＣ３５５６１）菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：４５  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｙ（ＡＴＣＣ３５５６１）由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：４６  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＹ（ＡＴＣＣ３５５６１）菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：４７  Ｙ（ＡＴＣＣ３５５６１）菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：４８  Ｙ（ＡＴＣＣ３５５６１）菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：４９  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９８  ２５０７３２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：５０  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９８  ２５０７３２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：５１  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９８  ２５０７３２由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：５２  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９８  ２５０７３２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：５３  Ｍ９８  ２５０７３２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：５４  Ｍ９８  ２５０７３２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：５５  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９８  ２５０７７１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：５６  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９８  ２５０７７１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：５７  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９８  ２５０７７１由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：５８  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９８  ２５０７７１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：５９  Ｍ９８  ２５０７７１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：６０  Ｍ９８  ２５０７７１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：６１  天然のリーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ１１３５菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：６２  天然のリーダー配列を用いて作製されるＣＤＣ１１３５菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：６３  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ１１３５由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：６４  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＣＤＣ１１３５菌株由来の成熟２
０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：６５  ＣＤＣ１１３５菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：６６  ＣＤＣ１１３５菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：６７  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５２１５３菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：６８  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５２１５３菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：６９  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５２１５３由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：７０  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５２１５３菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：７１  Ｍ９７  ２５２１５３菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：７２  Ｍ９７  ２５２１５３菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：７３  天然のリーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ１６１０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：７４  天然のリーダー配列を用いて作製されるＣＤＣ１６１０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：７５  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ１６１０由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：７６  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＣＤＣ１６１０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：７７  ＣＤＣ１６１０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：７８  ＣＤＣ１６１０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：７９  天然のリーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ１４９２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：８０  天然のリーダー配列を用いて作製されるＣＤＣ１４９２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：８１  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ１４９２由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：８２  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＣＤＣ１４９２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：８３  ＣＤＣ１４９２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：８４  ＣＤＣ１４９２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：８５  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｌ８  Ｍ９７８菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：８６  天然のリーダー配列を用いて作製されるＬ８  Ｍ９７８菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：８７  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｌ８  Ｍ９７８由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：８８  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＬ８  Ｍ９７８菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：８９  Ｌ８  Ｍ９７８菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：９０  Ｌ８  Ｍ９７８菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：９１  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５２９８８菌株由
来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：９２  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５２９８８菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：９３  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５２９８８由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：９４  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５２９８８菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：９５  Ｍ９７  ２５２９８８菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：９６  Ｍ９７  ２５２９８８菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：９７  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５２６９７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：９８  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５２６９７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：９９  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５２６９７由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１００  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５２６９７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１０１  Ｍ９７  ２５２６９７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１０２  Ｍ９７  ２５２６９７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１０３  天然のリーダー配列を結合させた場合に、６５７７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１０４  天然のリーダー配列を用いて作製される６５７７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１０５  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、６５７７由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１０６  Ｐ４リーダー配列を用いて作製される６５７７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１０７  ６５７７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１０８  ６５７７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１０９  天然のリーダー配列を結合させた場合に、２９９６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１１０  天然のリーダー配列を用いて作製される２９９６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１１１  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、２９９６由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１１２  Ｐ４リーダー配列を用いて作製される２９９６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１１３  ２９９６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１１４  ２９９６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１１５  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５２９７６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１１６  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５２９７６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１１７  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５２９７６由来の
成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１１８  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５２９７６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１１９  Ｍ９７  ２５２９７６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１２０  Ｍ９７  ２５２９７６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１２１  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５１８５４菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１２２  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５１８５４菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１２３  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５１８５４由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１２４  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５１８５４菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１２５  Ｍ９７  ２５１８５４菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１２６  Ｍ９７  ２５１８５４菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１２７  天然のリーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ１５２１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１２８  天然のリーダー配列を用いて作製されるＣＤＣ１５２１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１２９  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ１５２１由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１３０  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＣＤＣ１５２１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１３１  ＣＤＣ１５２１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１３２  ＣＤＣ１５２１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。配列番号：１３３  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９８  ２５０６２２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１３４  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９８  ２５０６２２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１３５  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９８  ２５０６２２由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１３６  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９８  ２５０６２２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１３７  Ｍ９８  ２５０６２２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１３８  Ｍ９８  ２５０６２２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１３９  天然のリーダー配列を結合させた場合に、８７０４４６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１４０  天然のリーダー配列を用いて作製される８７０４４６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１４１  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、８７０４４６由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１４２  Ｐ４リーダー配列を用いて作製される８７０４４６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１４３  ８７０４４６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１４４  ８７０４４６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１４５  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５３２４８菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１４６  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５３２４８菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１４７  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５３２４８由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１４８  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５３２４８菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１４９  Ｍ９７  ２５３２４８菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１５０  Ｍ９７  ２５３２４８菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１５１  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９８  ２５０８０９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１５２  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９８  ２５０８０９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１５３  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９８  ２５０８０９由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１５４  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９８  ２５０８０９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１５５  Ｍ９８  ２５０８０９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１５６  Ｍ９８  ２５０８０９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１５７  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｌ５  Ｍ９８１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１５８  天然のリーダー配列を用いて作製されるＬ５  Ｍ９８１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１５９  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｌ５  Ｍ９８１由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１６０  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＬ５  Ｍ９８１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１６１  Ｌ５  Ｍ９８１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１６２  Ｌ５  Ｍ９８１菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。配列番号：１６３  天然のリーダー配列を結合させた場合に、ＮＭＢ菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１６４  天然のリーダー配列を用いて作製されるＮＭＢ菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１６５  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、ＮＭＢ由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１６６  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＮＭＢ菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１６７  ＮＭＢ菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１６８  ＮＭＢ菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１６９  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９８  ２５０５７２菌株
由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１７０  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９８  ２５０５７２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１７１  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９８  ２５０５７２由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１７２  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９８  ２５０５７２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１７３  Ｍ９８  ２５０５７２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１７４  Ｍ９８  ２５０５７２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１７５  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ａ４  Ｓａｎｆｏｒｄ；Ｍ９７  ２５１８３６  ＰＡＲＴ；Ｍ９７  ２５１９５７；Ｍ９７  ２５１９８５；Ｍ９７
２５２０６０；Ｍ９７  ２５１８７０；Ｍ９７  ２５１９９４；Ｍ９８  ２５００２４；Ｍ９７  ２５１９０５；Ｍ９７  ２５１８７６；Ｍ９７  ２５１８９８；またはＭ９７
２５１８３０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１７６  天然のリーダー配列を用いて作製されるＡ４  Ｓａｎｆｏｒｄ；Ｍ９７  ２５１８３６  ＰＡＲＴ；Ｍ９７  ２５１９５７；Ｍ９７  ２５１９８５；Ｍ９７  ２５２０６０；Ｍ９７  ２５１８７０；Ｍ９７  ２５１９９４；Ｍ９８  ２５００２４；Ｍ９７  ２５１９０５；Ｍ９７  ２５１８７６；Ｍ９７  ２５１８９８；またはＭ９７  ２５１８３０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１７７  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ａ４  Ｓａｎｆｏｒｄ；Ｍ９７  ２５１８３６  ＰＡＲＴ；Ｍ９７  ２５１９５７；Ｍ９７  ２５１９８５；Ｍ９７  ２５２０６０；Ｍ９７  ２５１８７０；Ｍ９７  ２５１９９４；Ｍ９８  ２５００２４；Ｍ９７  ２５１９０５；Ｍ９７  ２５１８７６；Ｍ９７  ２５１８９８；またはＭ９７  ２５１８３０由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１７８  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＡ４  Ｓａｎｆｏｒｄ；Ｍ９７
２５１８３６  ＰＡＲＴ；Ｍ９７  ２５１９５７；Ｍ９７  ２５１９８５；Ｍ９７  ２５２０６０；Ｍ９７  ２５１８７０；Ｍ９７  ２５１９９４；Ｍ９８  ２５００２４；Ｍ９７  ２５１９０５；Ｍ９７  ２５１８７６；Ｍ９７  ２５１８９８；またはＭ９７  ２５１８３０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１７９  Ａ４  Ｓａｎｆｏｒｄ；Ｍ９７  ２５１８３６  ＰＡＲＴ；Ｍ９７  ２５１９５７；Ｍ９７  ２５１９８５；Ｍ９７  ２５２０６０；Ｍ９７  ２５１８７０；Ｍ９７  ２５１９９４；Ｍ９８  ２５００２４；Ｍ９７  ２５１９０５；Ｍ９７  ２５１８７６；Ｍ９７  ２５１８９８；またはＭ９７  ２５１８３０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１８０  Ａ４  Ｓａｎｆｏｒｄ；Ｍ９７  ２５１８３６  ＰＡＲＴ；Ｍ９７  ２５１９５７；Ｍ９７  ２５１９８５；Ｍ９７  ２５２０６０；Ｍ９７  ２５１８７０；Ｍ９７  ２５１９９４；Ｍ９８  ２５００２４；Ｍ９７  ２５１９０５；Ｍ９７  ２５１８７６；Ｍ９７  ２５１８９８；またはＭ９７  ２５１８３０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１８１  天然のリーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ９３７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１８２  天然のリーダー配列を用いて作製されるＣＤＣ９３７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１８３  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ９３７由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１８４  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＣＤＣ９３７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１８５  ＣＤＣ９３７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１８６  ＣＤＣ９３７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１８７  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５２０９７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１８８  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５２０９７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１８９  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５２０９７由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１９０  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５２０９７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１９１  Ｍ９７  ２５２０９７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１９２  Ｍ９７  ２５２０９７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１９３  天然のリーダー配列を結合させた場合に、８７０２２７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１９４  天然のリーダー配列を用いて作製される８７０２２７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１９５  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、８７０２２７由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１９６  Ｐ４リーダー配列を用いて作製される８７０２２７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１９７  ８７０２２７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：１９８  ８７０２２７菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：１９９  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｈ３５５菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２００  天然のリーダー配列を用いて作製されるＨ３５５菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２０１  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｈ３５５由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２０２  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＨ３５５菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２０３  Ｈ３５５菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２０４  Ｈ３５５菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２０５  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｈ４４ ７６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２０６  天然のリーダー配列を用いて作製されるＨ４４ ７６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２０７  Ｐ４リーダー配列を用いて作製される、Ｈ４４ ７６由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２０８  Ｈ４４ ７６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２０９  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｈ４４ ７６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２１０  Ｈ４４ ７６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２１１  天然のリーダー配列を結合させた場合に、８５２９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２１２  天然のリーダー配列を用いて作製される８５２９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２１３  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、８５２９由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２１４  Ｐ４リーダー配列を用いて作製される８５２９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２１５  ８５２９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２１６  ８５２９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２１７  天然のリーダー配列を結合させた場合に、６９４０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２１８  天然のリーダー配列を用いて作製される６９４０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２１９  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、６９４０由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２２０  Ｐ４リーダー配列を用いて作製される６９４０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２２１  ６９４０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２２２  ６９４０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２２３  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９８２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２２４  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９８２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２２５  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９８２由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２２６  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９８２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２２７  Ｍ９８２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２２８  Ｍ９８２菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２２９  天然のリーダー配列を結合させた場合に、８８００４９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２３０  天然のリーダー配列を用いて作製される８８００４９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２３１  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、８８００４９由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２３２  Ｐ４リーダー配列を用いて作製される８８００４９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２３３  ８８００４９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２３４  ８８００４９菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２３５  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５３５２４、Ｍ９７  ２５１８８５、およびＭ９７  ２５１９２６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２３６  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５３５２４、Ｍ９７  ２５１８８５、およびＭ９７  ２５１９２６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２３７  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９７  ２５３５２４、Ｍ９７  ２５１８８５、およびＭ９７  ２５１９２６由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ
酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２３８  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９７  ２５３５２４、Ｍ９７
２５１８８５、およびＭ９７  ２５１９２６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２３９  Ｍ９７  ２５３５２４、Ｍ９７  ２５１８８５、およびＭ９７  ２５１９２６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２４０  Ｍ９７  ２５３５２４、Ｍ９７  ２５１８８５、およびＭ９７  ２５１９２６菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２４１  天然のリーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９８  ２５０６７０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２４２  天然のリーダー配列を用いて作製されるＭ９８  ２５０６７０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２４３  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、Ｍ９８  ２５０６７０由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２４４  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＭ９８  ２５０６７０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２４５  Ｍ９８  ２５０６７０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２４６  Ｍ９８  ２５０６７０菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２４７  天然のリーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ１５７３菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２４８  天然のリーダー配列を用いて作製されるＣＤＣ１５７３菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２４９  Ｐ４リーダー配列を結合させた場合に、ＣＤＣ１５７３由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２５０  Ｐ４リーダー配列を用いて作製されるＣＤＣ１５７３菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。
配列番号：２５１  ＣＤＣ１５７３菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸配列。
配列番号：２５２  ＣＤＣ１５７３菌株由来の成熟２０８６タンパク質のアミノ酸配列。配列番号：２５３  Neisseria lactamicaの菌株由来の２０８６タンパク質のアミノ酸配
列をコードする部分的な核酸配列。
配列番号：２５４から２５９  タンパク質の２０８６ファミリーのタンパク質に関するアミノ酸配列。
配列番号：２６０から２７８  ２０８６サブファミリーＡのタンパク質に関するアミノ酸配列。
配列番号：２７９から２９９  ２０８６サブファミリーＢのタンパク質に関するアミノ酸配列。
配列番号：３００  は本発明の１つの態様による２０８６タンパク質ファミリー（“２０８６タンパク質”）に対応するアミノ酸コンセンサス配列である。
配列番号：３０１  は本発明の１つの態様による２０８６タンパク質サブファミリーＡに対応するアミノ酸コンセンサス配列である。
配列番号：３０２  は本発明の１つの態様による２０８６タンパク質サブファミリーＢに対応するアミノ酸コンセンサス配列である。
配列番号：３０３  ＢａｍＨＩ制限部位を含むreverseプライマーの核酸配列（化合物番
号４６２３）。
配列番号：３０４  ＮｄｅＩ制限部位を含むforwardプライマーの核酸配列（化合物番号
４６２４）。
配列番号：３０５  forwardプライマーの核酸配列（化合物番号４６２５）。
配列番号：３０６  forwardプライマーの核酸配列（化合物番号５００５）。
配列番号：３０７  reverseプライマーの核酸配列（化合物番号５００７）。
配列番号：３０８  ＢｇｌＩＩ制限部位を含むreverseプライマーの核酸配列（化合物番
号５１３５）。
配列番号：３０９  ＢａｍＨＩ制限部位を含むforwardプライマーの核酸配列（化合物番
号５６５８）。
配列番号：３１０  ＳｐｈＩ制限部位を含むreverseプライマーの核酸配列（化合物番号
５６６０）。
配列番号：３１１  ＢａｍＨＩ制限部位を含むforwardプライマーの核酸配列（化合物番
号６３８５）。
配列番号：３１２  ＢｇｌＩＩおよびＮｄｅＩ制限部位を含むforwardプライマーの核酸
配列（化合物番号６４０６）。
配列番号：３１３  forwardプライマーの核酸配列（化合物番号６４７０）。
配列番号：３１４  reverseプライマーの核酸配列（化合物番号６４７２）。
配列番号：３１５  ＢａｍＨＩ制限部位を含むforwardプライマーの核酸配列（化合物６
４７３）。
配列番号：３１６  ＢｇｌＩＩおよびＮｄｅＩ制限部位を含むforwardプライマーの核酸
配列（化合物番号６４７４）。
配列番号：３１７  forwardプライマーの核酸配列（化合物番号６４９５）。
配列番号：３１８  reverseプライマーの核酸配列（化合物番号６４９６）。
配列番号：３１９  ＳｐｈＩ制限部位を含むreverseプライマーの核酸配列（化合物番号
６４５３）。
配列番号：３２０  ＢｇｌＩＩ制限部位を含むreverseプライマーの核酸配列（化合物番
号６６０５）。
配列番号：３２１  ＢｇｌＩＩおよびＮｄｅＩ制限部位を含むforwardプライマーの核酸
配列（化合物番号６７２１）。
配列番号：３２２  Ｐ４リーダー配列の核酸配列。
配列番号：３２３  天然の２０８６リーダーバリアント１の核酸配列。
配列番号：３２４  天然の２０８６リーダーバリアント２の核酸配列。
配列番号：３２５  天然の２０８６リーダーバリアント３の核酸配列。
配列番号：３２６  天然の２０８６リーダーバリアント４の核酸配列。
配列番号：３２７  はＰ４４３１のアミノ酸配列である。
配列番号：３２８  はＰ５１６３のアミノ酸配列である。
配列番号：３２９  は本発明の１つの態様によるアミノ酸配列である。
【００１５】
発明の詳細な説明
髄膜炎菌血清群Ｂに対して交差機能性の殺菌活性を有する抗原の新たなクラスは、感染に対する免疫感作のために多価ＰｏｒＡのアプローチを必要としない。このような抗原を期せずして同定することができ、当明細書にこれを記載し主張する。１つのこのような抗原の存在は、髄膜炎菌株由来の可溶性外膜タンパク質（ｓＯＭＰ）の複合体混合物中で最初に認められた。この抗原の殺菌活性を、目的のタンパク質混合物が数種のタンパク質しか含まなくなるまで、一連の分画化およびタンパク質の精製ステップを通して追跡した。この混合物中の主要なタンパク質は、Ｎ末端アミノ酸配列決定およびペプチドマッピングにより同定した。殺菌活性を示す目的のタンパク質を、ＯＲＦ２０８６タンパク質、すなわち脂質化タンパク質（より限定的にＬＰ２０８６とも表す）として同定した。“ＯＲＦ２０８６タンパク質”は、ナイセリア種のオープンリーディングフレーム２０８６（ＯＲＦ２０８６）によりコードされるタンパク質を表す。
【００１６】
当明細書に記述したように、髄膜炎菌より単離されたナイセリア種ＯＲＦ２０８６タンパク質（“２０８６タンパク質”または“ＯＲＦ２０８６”タンパク質とも表し、当明細
書では互変性を持って使用する、または非脂質化タンパク質としてＰ２０８６および当該タンパク質の脂質化バージョンとしてＬＰ２０８６とも表した）を基本とする新規免疫原性組成物の候補物質は、細胞の分画化、異なる界面活性剤による抽出、タンパク質の精製、抗血清の製造を含み、そして多数の菌株を用いての殺菌活性のアッセイを組み合わせて同定した。上に引用した参考文献に開示されている免疫原性の可能性のある組成物および診断法に代わるものとして、本発明は組成物に関し、そしてタンパク質、その免疫原性部分およびその生物学的均等物、ならびに該ポリペプチド、その一部および均等物をコードする遺伝子、および該物質に免疫特異的に結合する抗体の使用を通しての髄膜炎菌感染の治療法および/または予防法に関する。
【００１７】
本発明の態様に従って、単離されたポリペプチド、その免疫原性部分、および/または
その生物学的均等物を含む、２０８６を基本とする免疫原性物質は、交差反応性または菌株非特異性を示す該物質の能力を基本とする免疫原性候補物質として、期せずして同定された。特に候補物質は以下の能力、すなわち（１）多数のナイセリア菌株、および/また
は淋菌株に対して殺菌性抗体を産生する；（２）多数の菌株の表面と反応する；（３）実際の攻撃に対して受動的な防護を与える；および/または（４）コロニー化を防ぐ、能力
を期せずして示すことが同定された。したがって本発明は、単離されたポリペプチド、その免疫原性部分、および/またはその物生物学的均等物を含む、該免疫原性物質を含む免
疫原性組成物、ならびに髄膜炎菌による感染に対して該物質を使用する方法を提供する。（２０８６タンパク質の同定に用いる方法に関しては、当明細書の実施例１を参照のこと。）
当明細書で使用する場合、“菌株非特異的”という用語は、髄膜炎菌の１つ以上の菌株（例えば異種の髄膜炎菌株）に対して有効な免疫応答を惹起する抗原の特徴をいう。“交差反応性”という用語は本明細書で使用する場合、“菌株非特異的”という用語と互変性をもって使用する。“免疫原性の菌株非特異的な髄膜炎菌の抗原”という用語は当明細書で使用する場合、同抗原は別の細菌（例えば他のナイセリア菌株、例えば淋菌株）から単離することも、または組換え技術を用いて製造することもできるが、髄膜炎菌から単離することのできる抗原をいう。
【００１８】
本発明の２０８６タンパク質は脂質化タンパク質および非脂質化タンパク質を含む。さらに本発明はまた、中間体化合物/組成物として各タンパク質に対応する、未成熟なタン
パク質または前タンパク質の使用もまた含む。
【００１９】
本発明はまた、本発明の実施により前述の免疫原性作用物質に免疫特異的に結合する抗体も提供する。さらに本発明は前述のいずれかをコードする核酸配列を含む単離されたポリヌクレオチドに関する。したがって本発明は組成物および/または免疫原性組成物、お
よび髄膜炎菌性髄膜炎、特に血清群Ｂ髄膜炎菌性疾患の予防、治療、および/または診断
におけるそれらの使用、ならびに該組成物の製造法を提供する。
【００２０】
本発明の組成物は高い免疫原性があり、殺菌性抗体を産生できることが示された。これらの抗体は血清群、血清型および血清型サブタイプの異なる髄膜炎菌株に対する交差反応性がある。したがって本発明の組成物は、異種のナイセリア菌株に対して殺菌性抗体を生成する能力を示すことにより、従来の髄膜炎菌のワクチンの試みの欠点を克服するものである。したがって特に有利な点として、本発明はより少ない成分で構成されて、従来から使用されている薬剤に匹敵する防護機能を惹起することができる免疫原性組成物を提供する。その際、同組成物または免疫原性物質（例えば限定するものではないが、ポリペプチド、免疫原性部分またはフラグメント、および生物学的均等物等）を、単独でまたは他の抗原または（免疫原性）物質と組み合わせて使用して、髄膜炎菌性感染および疾患からの免疫学的防護を惹起し、同様に他の病原菌に起因する感染および/または疾患から免疫学
的防護を惹起することができる。このことから、多数の菌株に対しての防護に必要な抗原
の数を減らすことにより、髄膜炎菌性感染に対して使用するための免疫原性組成物のデザインを簡素化することができる。事実、精製２０８６タンパク質は、髄膜炎菌性疾患に関与する複数の菌株に対して十分な免疫原性を適用できるために必要なタンパク質の数を、劇的にそして期せずして減らすことになる。２０８６タンパク質は、同タンパク質の野生型であるリポタンパク質として、天然の髄膜炎菌におけるよりずっと高レベルで大腸菌内で組み換え発現させることができる。
【００２１】
１つの菌株由来の２０８６タンパク質に対して作用する抗体が、無関係の（すなわち異種の）菌株を死滅させることが発見されたため、“２０８６相同部分”の存在について多数の異種の菌株の特徴付けを行い、配列の保存レベルを決定する試みを行った。ＰＣＲで調べた菌株の約７０％は、菌株８５２９由来のオリジナルの２０８６遺伝子を増幅するプライマーを用いて増幅することのできる、２０８６相同部分を有していたが、残りのおよそ３０％はこの試験ではネガティブであった。これら残りのおよそ３０％は、８５２９由来のオリジナルの２０８６遺伝子と約６０％のアミノ酸配列しか相同ではない２０８６相同体を含むことが見出された。他のプライマーにより、これらのおよそ３０％の菌株から２０８６相同部分を増幅できることが同定された。検査を行った髄膜炎菌株を、プライマーセットで２０８６相同部分を増幅できるかどうかにより、サブファミリーＡまたはサブファミリーＢに属するものと命名した。これらの実験の詳細は以下の実施例５に概説した。
【００２２】
（多数の血清型サブタイプにおける２０８６タンパク質の存在）
髄膜炎菌株間における２０８６遺伝子の配列の保存レベルを決定するため、サブファミリーＡおよびＢから幾つかの代表例について全長の遺伝子としてクローニングし、ＤＮＡ配列分析を行った。当明細書で開示したようにプライマーを用いて（例えば表５を参照のこと）、異なる血清型サブタイプの抗原を発現し、かつまた共通のタンパク質、Ｐ２０８６を発現する２４の血清群Ｂ髄膜炎菌株を同定した。これらの配列の例を当明細書に提供し、成熟ＤＮＡ配列（すなわちすべてのリポタンパク質のシグナル配列はシステイン残基で切断された）として示す。例えば限定はしないが、配列番号：２−２５２の偶数番号のアミノ酸配列を参照のこと。
【００２３】
２０８６タンパク質は野生型菌株中には多量に存在しないが、殺菌性抗体の標的である。これらの抗体はＰｏｒＡに応答して産生される抗体とは異なり、異種の血清型サブタイプを発現する菌株を死滅させることができる。
【００２４】
２０８６タンパク質に対する抗体はまた、髄膜炎菌による攻撃から新生仔ラットを受動的に防護する。（表８参照のこと）２０８６タンパク質の組換え発現は、髄膜炎菌性疾患の予防のための免疫原性組成物として２０８６タンパク質を使用することを可能にする。臨床的試みにおける最近の髄膜炎菌の免疫原性組成物の候補物質はすべて、多くの異なるタンパク質を含む複合体混合物または外膜タンパク質調製物であった。血清型サブタイプ特異性を提供するＰｏｒＡタンパク質は、血清型サブタイプに関連する疾患の約７０−８０％に適用できるために、免疫原性組成物中に６から９のバリアントを含むことが必要になる。対照的に、１つの２０８６タンパク質のみに対する抗血清が、西欧および米国で単離されるこの疾患の約６５％に関与する６つの血清型サブタイプの代表的なものを死滅できることが、当明細書において明確に示されている。したがって精製２０８６タンパク質は、髄膜炎菌性疾患に関与する複数の血清型サブタイプに適用できる十分な免疫原性組成物を提供するために必要なタンパク質の数を減らせる可能性がある。
【００２５】
（タンパク質、免疫原性部分および生物学的均等物）
本発明により提供される２０８６タンパク質は、単離されたタンパク質である。“単離された”という用語は、天然の状態から人の手により変化したことを意味する。“単離さ
れた”組成物または物質が自然界で生じる場合、それはそのオリジナルの環境から変化したまたは除外された、またはその双方の状態である。例えば生きている動物に本来存在するポリペプチドまたはポリヌクレオチドは“単離され”ていないが、その本来の状態で共存する物質から分離された同ポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、当明細書で使用する用語によれば “単離されて”いる。したがって当明細書で使用する場合、“単離され
たタンパク質”という用語は、本来の素材から単離されたタンパク質および組換え技術を用いて作製されるたタンパク質、ならびに他の抗原および/または賦形剤、例えば医薬的
に受容可能な担体、バッファー、アジュバント等と組み合わせた場合のこのようなタンパク質を包含する。
【００２６】
２０８６タンパク質、その免疫原性部分および/またはその生物学的均等物は、本発明
の態様にしたがって、以下のアミノ酸配列のいずれかを含む：
ＡＤＩＧｘＧＬＡＤＡ（配列番号：２５４）、配列中ｘはいずれかのアミノ酸である；
ＩＧｘＧＬＡＤＡＬＴ（配列番号：２５５）、配列中ｘはいずれかのアミノ酸である；
ＳＬＮＴＧＫＬＫＮＤ（配列番号：２５６）；
ＳＬＮＴＧＫＬＫＮＤＫｘＳＲＦＤＦ（配列番号：２５７、配列中ｘはいずれかのアミノ酸である）；
ＳＧＥＦＱｘＹＫＱ（配列番号：２５８）、配列中ｘはいずれかのアミノ酸である；または
ＩＥＨＬＫｘＰＥ（配列番号：２５９）、配列中ｘはいずれかのアミノ酸である。
【００２７】
２０８６サブファミリーＡタンパク質、その免疫原性部分および/またはその生物学的
均等物は、本発明の態様にしたがって、以下のアミノ酸配列のいずれかを含む：
ＧＧＧＶＡＡＤＩＧｘ（配列番号：２６０）、配列中ｘはいずれかのアミノ酸である；
ＳＧＥＦＱＩＹＫＱ（配列番号：２６１）；
ＨＳＡＶＶＡＬＱＩＥ（配列番号：２６２）；
ＥＫＩＮＮＰＤＫＩＤ（配列番号：２６３）；
ＳＬＩＮＱＲＳＦＬＶ（配列番号：２６４）；
ＳＧＬＧＧＥＨＴＡＦ（配列番号：２６５）；
ＧＥＨＴＡＦＮＱＬＰ（配列番号：２６６）；
ＳＦＬＶＳＧＬＧＧＥＨ（配列番号：２６７）；
ＥＫＩＮＮＰＤＫＩＤＳＬＩＮＱＲＳＦＬＶＳＧＬＧＧＥＨＴＡＦＮＱＬＰ（配列番号：２６８）；
ＧＫＡＥＹＨＧＫＡＦ（配列番号：２６９）；
ＹＨＧＫＡＦＳＳＤＤ（配列番号：２７０）；
ＧＫＡＥＹＨＧＫＡＦＳＳＤＤ（配列番号：２７１）；
ＩＥＨＬＫＴＰＥＱＮ（配列番号：２７２）；
ＫＴＰＥＱＮＶＥＬＡ（配列番号：２７３）；
ＩＥＨＬＫＴＰＥＱＮＶＥＬＡ（配列番号：２７４）；
ＡＥＬＫＡＤＥＫＳＨ（配列番号：２７５）；
ＡＶＩＬＧＤＴＲＹＧ（配列番号：２７６）；
ＡＥＬＫＡＤＥＫＳＨＡＶＩＬＧＤＴＲＹＧ（配列番号：２７７）；または
ＥＥＫＧＴＹＨＬＡＬ（配列番号：２７８）。
【００２８】
２０８６サブファミリーＢタンパク質、その免疫原性部分および/またはその生物学的
均等物は、本発明の態様にしたがって、以下のアミノ酸配列のいずれかを含む：
ＬＩＴＬＥＳＧＥＦＱ（配列番号：２７９）；
ＳＡＬＴＡＬＱＴＥＱ（配列番号：２８０）；
ＦＱＶＹＫＱＳＨＳＡ（配列番号：２８１）；
ＬＩＴＬＥＳＧＥＦＱＶＹＫＱＳＨＳＡＬＴＡＬＱＴＥＱ（配列番号：２８２）；
ＩＧＤＩＡＧＥＨＴＳ（配列番号：２８３）；
ＥＨＴＳＦＤＫＬＰＫ（配列番号：２８４）；
ＩＧＤＩＡＧＥＨＴＳＦＤＫＬＰＫ（配列番号：２８５）；
ＡＴＹＲＧＴＡＦＧＳ（配列番号：２８６）；
ＤＤＡＧＧＫＬＴＹＴ（配列番号：２８７）；
ＩＤＦＡＡＫＱＧＨＧ（配列番号：２８８）；
ＫＩＥＨＬＫＳＰＥＬ（配列番号：２８９）；
ＡＴＹＲＧＴＡＦＧＳＤＤＡＧＧＫＬＴＹＴＩＤＦＡＡＫＱＧＨＧＫＩＥＨＬＫＳＰＥＬＮＶ（配列番号：２９０）；
ＨＡＶＩＳＧＳＶＬＹ（配列番号：２９１）；
ＫＧＳＹＳＬＧＩＦＧ（配列番号：２９２）；
ＶＬＹＮＱＤＥＫＧＳ（配列番号：２９３）；
ＨＡＶＩＳＧＳＶＬＹＮＱＤＥＫＧＳＹＳＬＧＩＦＧ（配列番号：２９４）；
ＡＱＥＶＡＧＳＡＥＶ（配列番号：２９５）；
ＩＨＨＩＧＬＡＡＫＱ（配列番号：２９６）；
ＶＥＴＡＮＧＩＨＨＩ（配列番号：２９７）；
ＡＱＥＶＡＧＳＡＥＶＥＴＡＮＧＩＨＨＩＧＬＡＡＫＱ（配列番号：２９８）；または
ＶＡＧＳＡＥＶＥＴＡＮＧＩＨＨＩＧＬＡＡＫＱ（配列番号：２９９）。
２０８６タンパク質は本発明の態様にしたがって、以下のコンセンサス配列および/また
はその免疫原性部分を含む。
【００２９】
２０８６タンパク質のコンセンサス配列（配列番号：３００）
ＣＳＳＧ-----ＧＧＧＶｘＡＤＩＧｘＧＬＡＤＡＬＴｘＰｘＤｘＫＤＫｘＬｘＳＬＴＬ
ｘｘＳｘｘｘＮｘｘＬｘＬｘＡＱＧＡＥＫＴｘｘｘＧＤ---ＳＬＮＴＧＫＬＫＮＤＫｘＳ
ＲＦＤＦｘｘｘＩｘＶＤＧｘｘＩＴＬｘＳＧＥＦＱｘＹＫＱｘＨＳＡｘｘＡＬＱｘＥｘｘｘｘｘｘｘｘｘｘｘｘｘｘＲｘＦｘｘｘｘｘｘＧＥＨＴｘＦｘｘＬＰｘｘ-ｘＡｘＹｘＧ
ｘＡＦｘＳＤＤｘｘＧｘＬｘＹｘＩＤＦｘｘＫＱＧｘＧｘＩＥＨＬＫｘＰＥｘＮＶｘＬＡｘｘｘｘＫｘＤＥＫｘＨＡＶＩｘＧｘｘｘＹｘｘｘＥＫＧｘＹｘＬｘｘｘＧｘｘＡＱＥｘＡＧｘＡｘＶｘｘｘｘｘｘＨｘＩｘｘＡｘＫＱ
前述のコンセンサス配列において、“ｘ”はいずれかのアミノ酸を表し、５番目のアミノ酸から９番目のアミノ酸までの領域は、０から５個のいずれかのアミノ酸であり、６７番目のアミノ酸から６９番目のアミノ酸までの領域は、０から３個のいずれかのアミノ酸であり、１５６番目のアミノ酸は、０から１個のいずれかのアミノ酸である。５番目のアミノ酸から９番目のアミノ酸までの領域は、好ましくは０、４または５個のアミノ酸を含む。６７番目のアミノ酸から６９番目のアミノ酸までの領域は、好ましくは０または３個のアミノ酸を含む。このコンセンサス配列が２０８６タンパク質の高い可変性を説明することは、特に注目すべきであろう。理論的には、それに固執する意図はないが、この高い可変性が有益なそして予想外の交差反応性を提供すると考えられる。
【００３０】
本発明の実施により、２０８６タンパク質は免疫原性、非病原性および菌株非特異的であると特徴付けられる。さらに、本発明のさらなる実施によりこれらのタンパク質は予想外の免疫原性を示すが、約２％から約４０％は保存されていない。
【００３１】
当明細書で使用する場合“保存されていない”という用語は、挿入、置換および/また
は欠失が起こり得るアミノ酸の数を、タンパク質中のアミノ酸総数のパーセントで表す。例えばタンパク質の４０％が保存されておらず、例えば２６３個のアミノ酸を有する場合、アミノ酸の置換の起こり得るタンパク質中のアミノ酸の位置は１０５箇所ある。同様に例えばタンパク質の１０％が保存されておらず、例えば約２８０個のアミノ酸を有する場合、アミノ酸の置換の起こり得るアミノ酸の位置は２８箇所ある。２０８６タンパク質もまた、タンパク質の免疫原性を損なわずにアミノ酸残基の欠失させることができる。
【００３２】
さらに２０８６タンパク質は可変領域での相同性に基づいてサブファミリーに分割することができる。例えば限定する意図はないが、２つのこのようなサブファミリー、すなわちサブファミリーＡおよびサブファミリーＢのコンセンサス配列を以下に提供する。
【００３３】
２０８６サブファミリーＡ配列（ＳＥＱ  ＩＤ  ３０１）
ＣＳＳＧ----ＧＧＧＶＡＡＤＩＧｘＧＬＡＤＡＬＴｘＰｘＤｘＫＤＫｘＬｘＳＬＴＬｘｘＳｘｘｘＮｘｘＬｘＬｘＡＱＧＡＥＫＴｘｘｘＧＤ---ＳＬＮＴＧＫＬＫＮＤＫｘＳＲ
ＦＤＦｘｘｘＩｘＶＤＧＱｘＩＴＬｘＳＧＥＦＱＩＹＫＱｘＨＳＡＶＶＡＬＱＩＥＫＩＮＮＰＤＫＩＤＳＬＩＮＱＲＳＦＬＶＳＧＬＧＧＥＨＴＡＦＮＱＬＰｘＧＫＡＥＹＨＧＫＡＦＳＳＤＤｘｘＧｘＬｘＹｘＩＤＦｘｘＫＱＧｘＧｘＩＥＨＬＫＴＰＥＱＮＶＥＬＡｘＡＥＬＫＡＤＥＫＳＨＡＶＩＬＧＤＴＲＹＧｘＥＥＫＧＴＹＨＬＡＬｘＧＤＲＡＱＥＩＡＧｘＡＴＶＫＩｘＥＫＶＨＥＩｘＩＡｘＫＱ
記号“ｘ”はいずれかのアミノ酸である。
【００３４】
５番目のアミノ酸から８番目のアミノ酸までの領域は、０から４個のいずれかのアミノ酸である。
６６番目のアミノ酸から６８番目のアミノ酸までの領域は、０から３個のいずれかのアミノ酸である。
【００３５】
５番目のアミノ酸から８番目のアミノ酸までの領域は、好ましくは０または４個のアミノ酸を含む。６６番目のアミノ酸から６８番目のアミノ酸までの領域は、好ましくは０または３個のアミノ酸を含む。
【００３６】
２０８６サブファミリーＢ（配列番号  ３０２）
ＣＳＳＧＧＧＧ-----ＶｘＡＤＩＧｘＧＬＡＤＡＬＴＡＰＬＤＨＫＤＫｘＬｘＳＬＴＬ
ｘｘＳｘｘｘＮｘｘＬｘＬｘＡＱＧＡＥＫＴＹＧＮＧＤＳＬＮＴＧＫＬＫＮＤＫＶＳＲＦＤＦＩＲＱＩＥＶＤＧｘＬＩＴＬＥＳＧＥＦＱＶＹＫＱＳＨＳＡＬＴＡＬＱＴＥＱｘＱＤｘＥｘＳｘＫＭＶＡＫＲｘＦｘＩＧＤＩＡＧＥＨＴＳＦＤＫＬＰＫｘｘｘＡＴＹＲＧＴＡＦＧＳＤＤＡＧＧＫＬＴＹＴＩＤＦＡＡＫＱＧＨＧＫＩＥＨＬＫＳＰＥＬＮＶｘＬＡｘｘＹＩＫＰＤＥＫｘＨＡＶＩＳＧＳＶＬＹＮＱＤＥＫＧＳＹＳＬＧＩＦＧｘｘＡＱＥＶＡＧＳＡＥＶＥＴＡＮＧＩＨＨＩＧＬＡＡＫＱ
記号“ｘ”はいずれかのアミノ酸である。
【００３７】
８番目のアミノ酸から１２番目のアミノ酸までの領域は、０から５個のいずれかのアミノ酸である。
８番目のアミノ酸から１２番目のアミノ酸までの領域は、好ましくは０または５個のアミノ酸を含む。
【００３８】
本発明の実施により、２０８６タンパク質サブファミリーをさらにクラスターに分割することができる。例えば本発明の１つの実施により以下のクラスターを提供する：配列番号：２−１２の偶数番号；配列番号：１４−２４の偶数番号；配列番号：２６−４２の偶数番号；配列番号：５０−６０の偶数番号；配列番号：６２−１０８の偶数番号；配列番号：１１０−１３８の偶数番号；配列番号：１４０−１５６の偶数番号；配列番号：１５８−１７４の偶数番号；および配列番号：２２４−２５２の偶数番号。
【００３９】
本発明のポリペプチド配列は配列番号：２−２５２の偶数番号の基準配列(reference sequence)と同一とすることができる、すなわち１００％同一である、または同一性の％が１００％未満であるような、基準配列と比較して多数のアミノ酸の変換を含むこともできる。このような変換は、保存されるおよび保存されない置換または挿入を含む、少なくと
も１つのアミノ酸の欠失、置換を含む。変換は、基準ポリペプチド配列のアミノ末端またはカルボキシル末端の位置で、またはこれらの末端の位置の間のあらゆる位置で、すなわち基準アミノ酸配列中のアミノ酸の間に個々に点在して、もしくは基準アミノ酸配列内の１つまたはそれより多くの隣接するグループとして起こり得る。
【００４０】
したがって本発明はまた、配列表に含まれるアミノ酸配列（すなわち配列番号：２−２５２の偶数番号）と同一の配列を有するタンパク質もまた提供する。特定の配列に依存して、配列の同一性の程度は好ましくは６０％以上（例えば６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９７％、９９％、９９．９％、またはそれより多く）である。これらの相同タンパク質は突然変異および対立遺伝子のバリアントを含む。
【００４１】
本発明の好ましい態様において、２０８６タンパク質または他の２０８６ポリペプチド（例えば免疫学的部分および生物学的均等物）は、髄膜炎菌の相同菌株および少なくとも１つの異種菌株に対する殺菌性抗体を産生する。具体的には、２０８６ポリペプチドに対する抗体は新生仔ラットへの髄膜炎菌による例えば経鼻的な攻撃から受動的に防護する。さらなる好ましい態様において、２０８６ポリペプチドは新生仔ラットに関するこのような防護を、相同菌株および少なくとも１つの異種菌株に対して示す。ポリペプチドは、配列番号：２−２５２の偶数番号で述べたような、上記の“配列のまとめ”から選択することができ、またはポリペプチドは、列記したポリペプチドのあらゆる免疫学的フラグメントまたは生物学的均等物とすることができる。好ましくはポリペプチドは上記の配列のまとめにおける配列番号：２−２５２の偶数番号のいずれかから選択する。
【００４２】
本発明はまた、生物学的に均等な２０８６ポリペプチドの対立遺伝子のバリアントまたはその他のバリアントにも関する。適切な生物学的均等物は以下の能力、すなわち（１）相同菌株ならびに少なくとも１つの異種ナイセリア菌株および/または淋菌株に対して殺
菌性抗体を産生する；（２）相同菌株ならびに少なくとも１つの異種ナイセリア菌株および/または淋菌株の表面と反応する；（３）実際の攻撃に対して受動的な防護を与える；
および/または（４）コロニー化を防ぐ、能力を示すものとする。
【００４３】
適切な生物学的均等物は、当明細書で特定した２０８６タンパク質（すなわち配列番号：２−２５２の偶数番号）の１つと、少なくとも約６０％、好ましくは少なくとも約７０％、より好ましくは少なくとも約７５％、さらにより好ましくは約８０％、さらにより好ましくは約８５％、さらにより好ましくは約９０％、さらにより好ましくは約９５％またはさらにより好ましくは約９８％、またはさらにより好ましくは約９９％の類似性を有するが、ただし均等物は、本発明の２０８６タンパク質の１つと等しい免疫原生特性を実質的に惹起することができるものとする。
【００４４】
あるいは生物学的均等物は、配列番号：２−２５２の偶数番号の２０８６タンパク質の１つと等しい免疫原性特性を実質的に有する。本発明の態様により、生物学的均等物は、配列番号：２−２５２の偶数番号と等しい免疫原性特性を実質的に有する。
【００４５】
生物学的均等物は、本発明のタンパク質のバリアントおよび修飾物を作成することにより得られる。同タンパク質のこれらのバリアントおよび修飾物は、１つまたはそれより多くのアミノ酸の挿入、欠失または置換によりアミノ酸配列を変えることにより得ることができる。実質的に等しいまたは改善された性質を有するポリペプチドを作成するために、アミノ酸配列を、例えば置換により修飾する。変化を導入する好ましい方法として、部位特異的突然変異誘発によりポリペプチドの核酸配列の予め決定された変化を行うことを含む。
【００４６】
本発明のポリペプチドの構造について修飾および変化があっても、なお髄膜炎菌の免疫
原性を有する分子を得ることができる。例えば限定はしないが、免疫原性の喪失が認められない配列において、保存されない置換および保存される置換を含めての、あるアミノ酸から他のアミノ酸への置換は可能である。ポリペプチドの生物学的機能活性を規定するのは、そのポリペプチドの相互作用の能力および本質であるため、多数のアミノ酸配列の置換をポリペプチド配列（またはもちろんその元になるＤＮＡコード配列）中で行い、それでもなお類似の性質を持つポリペプチドを得ることは可能である。本発明は、本明細書のポリペプチドの構造、ならびに該ポリペプチドをコードする核酸配列のあらゆる変化を意図するが、この場合同ポリペプチドは免疫原性を保持するものとする。当業者は開示されたポリペプチドおよびしたがってポリヌクレオチドを、当明細書で提供した指示に基づいて容易に修飾することができるだろう。
【００４７】
例えば、置換または欠失の許されるある種の可変領域が同定された。先に述べたように２０８６コンセンサス配列は本発明の実施により、タンパク質の２０８６ファミリーの保存領域および保存されない領域を示している。
【００４８】
このような変化を作成するには、当業者の公知のあらゆる技術を利用することができる。例えば限定する意図はないが、アミノ酸のハイドロパシック・インデックスを考慮することができる。ポリペプチドにおける相互作用の生物学的機能を与えるハイドロパシックアミノ酸インデックスの重要性は、当該技術分野では一般に理解されている。Kyte et al. 1982. J. Mol. Bio. 157: 105-132。
特に、作成される生物学的に均等なポリペプチドまたはペプチドを、免疫学的態様において使用することを意図する場合には、類似するアミノ酸の置換はまた、親水性に基づいて行うこともできる。米国特許第４，５５４，１０１号（当明細書において参照として援用する）は、ポリペプチドの最大の局所的な親水性の平均値は、近接するアミノ酸の親水性により決定される場合、その免疫原性、すなわちポリペプチドの生物学的特性に相関すると記載している。
【００４９】
ポリペプチドの生物学的均等物はまた、部位特異的突然変異誘発を用いて製造することもできる。部位特異的突然変異誘発は、元になるＤＮＡの特異的突然変異を通してポリペプチドの配列から誘導される第２世代のポリペプチド、または生物学的機能の均等なポリペプチドまたはペプチドの製造に有用な技術である。このような変化は、アミノ酸の置換が望ましい場合には望ましい。同技術はさらに、例えば前述の１つまたはそれより多くの考察を組み入れた配列のバリアントを、１つまたはそれより多くのヌクレオチドの配列の変化をＤＮＡに導入することにより、作製し検査する能力をいつでも提供することができる。部位特異的突然変異誘発は、所望の変異のＤＮＡ配列ならびに十分な数の隣接するヌクレオチドをコードする特異的なオリゴヌクレオチドの使用を通して変異体の作製を可能にし、交差させた欠失の接合部の両側方向に安定な二本鎖を形成するための、十分なサイズのプライマー配列および配列複雑度を提供することができる。典型的には、変化させる配列の接合部の両側の約５から１０残基を含む、約１７から２５ヌクレオチドの長さのプライマーが好ましい。
【００５０】
一般に部位特異的突然変異誘発の技術は当該技術分野でよく知られている。理解されていることと思うが、同技術は典型的には１本鎖および２本鎖の双方の形で存在することのできるファージベクターを利用する。典型的には当明細書にしたがっての部位特異的突然変異誘発は、選択された髄膜炎菌のポリペプチド配列のすべてまたは一部をコードするＤＮＡ配列をベクターの配列中に含む、１本鎖ベクターを得ることから始める。所望の変異の配列をもっているオリゴヌクレオチドプライマーを（例えば合成により）作製する。次に変異をもっているＤＮＡ鎖の合成を完成させるため、このプライマーを１本鎖ベクターとアニーリングさせ、酵素、例えば大腸菌ポリメラーゼＩ  Klenowフラグメントを用いて伸長させる。このように１方の鎖がオリジナルの変異していない配列をコードし、第２の
鎖が所望の変異をもつヘテロの二本鎖が形成される。次にこのヘテロ二本鎖のベクターを用いて、適当な細胞、例えば大腸菌細胞を形質転換させ、変異をもっている組換えベクターを含むクローンを選択する。市販の入手可能なキットは、オリゴヌクレオチドプライマーを除くすべての試薬が添付されている。
【００５１】
２０８６ポリペプチドは、配列番号２−２５２の偶数番号の１つからのアミノ酸配列を有する２０８６タンパク質に対して、実質的に配列の類似するものおよび/または生物学
的均等物を含む、あらゆるタンパク質またはポリペプチドを含む。さらに、本発明の２０８６ポリペプチドは特定の材料に限定されない。したがって本発明は、様々な材料からのポリペプチドの一般的な検出および単離を提供する。また２０８６ポリペプチドは、当該分野の技術に十分に含まれるような、当明細書に提供されたガイダンスに基づいて、組換えにより、または当該技術分野で公知のその他の合成法において、作製することができる。
【００５２】
２０８６ポリペプチドは、さらなる構造分析または機能分析において、または試薬、例えば２０８６に関連するポリペプチドおよび２０８６の特異的抗体の作成において使用するためのフラグメントに、好都合なことに切断できることを、本発明において意図する。この切断は、精製または未精製の髄膜炎菌ポリペプチドをペプチダーゼ、例えばエンドプロテイナーゼｇｌｕ−Ｃ(Boehringer, Indianapolis, IN)で処理することにより達成することができる。ＣＮＢｒによる処理は、ペプチドフラグメントを天然の髄膜炎菌２０８６ポリペプチドから生成するもうひとつの方法である。組換え技術もまた、２０８６タンパク質の特定のフラグメントを作成するために使用することができる。
【００５３】
“バリアント”はこの用語を当明細書で使用する場合、基準のポリヌクレオチドまたはポリペプチドとは各々異なるが、本質的な特性は保持しているポリヌクレオチドまたはポリペプチドである。ポリヌクレオチドの典型的なバリアントは、もうひとつの、基準のポリヌクレオチドともヌクレオチド配列が異なる。バリアントのヌクレオチド配列の変化が、基準のポリヌクレオチドにコードされるポリペプチドのアミノ酸配列を変化させてもいいし、変化させなくてもいい。ヌクレオチドの変化は、以下に述べるように基準配列にコードされるポリペプチド中のアミノ酸の置換、付加、欠失、融合および切り詰め（truncation）に帰着し得る。ポリペプチドの典型的なバリアントは、もう一つの、基準のポリペプチドとはアミノ酸配列が異なる。一般に差異は限定されるため、基準のポリペプチドの配列とバリアントの配列とは全体に非常に類似しており、多くの領域で同一である（すなわち生物学的に均等である）。バリアントおよび基準のポリペプチドは、１つまたはそれより多くの置換、付加、欠失のあらゆる組み合わせによりアミノ酸配列が異なっていていよい。置換されたまたは挿入されたアミノ酸残基は、遺伝子コードにコードされているものであってもよく、されていないものでもよい。ポリヌクレオチドまたはポリペプチドのバリアントは対立遺伝子バリアントのように自然界で起こり得るし、あるいは自然界で起こっていることが知られていないバリアントもあり得る。ポリヌクレオチドおよびポリペプチドの自然界では起こらないバリアントは、突然変異誘発技術によりまたは直複合成することにより作成することができる。
【００５４】
“同一性”は当該技術分野で知られているように、２つもしくはそれより多くのポリペプチド配列、または２つもしくはそれより多くのポリヌクレオチド配列を比較することにより決定される、これらの配列間の関係である。当該技術分野において、“同一性”はまた、場合によってはポリペプチド配列鎖またはポリヌクレオチド配列鎖間でマッチさせることにより決定される、このような配列間の配列関連性の程度を意味する。“同一性”および“類似性”は公知の方法により容易に算出することができ、その方法として非限定的に以下を含む。すなわちComputational Molecular Biology（コンピューターによる分子
生物学）, Lesk, A. M. 編、 Oxford University Press, New York, 1988; Biocomputing
: Informatics and Genome Projects（バイオコンピューター計算；インフォマティクス
およびゲノムプロジェクト）, Smith, D. W. 編 Academic Press, New York, 1993; Computer Analysis of Sequence Data, Part I（配列データのコンピューター分析、パートＩ）, Griffin, A. M., and Griffin, H. G. 編、Humana Press, New Jersey, 1994; Sequence Analysis in Molecular Biology（分子生物学における配列分析）, von Heinje, G.,
Academic Press, 1987; および Sequence Analysis Primer（配列分析  プライマー）, Gribskov, M. およびDevereux, J. 編、M Stockton Press, New York, 1991;およびCarillo, H. およびLipman, D., SIAM J. Applied Math., 48: 1073 (1988)。同一性を決定す
る好ましい方法は、検査する配列間の最大のマッチングが得られるようにデザインされている。同一性および類似性を決定する方法は、公開されている入手可能なコンピュータープログラムに体系的にまとめられている。２つの配列間の同一性および類似性を決定する、好ましいコンピュータープログラムの方法として、ＧＣＧプログラムパッケージ(Devereux, J., et al 1984)、ＢＬＡＳＴＰ、ＢＬＡＳＴＮ、およびＦＡＳＴＡ(Altschul, S. F., et al., 1990)を含むがこれに限定されない。ＢＬＡＳＴＸプログラムは、ＮＣＢＩ
および他の情報源より公開されており、入手可能である(BLAST Manual, Altschul, S., et al., NCBI NLM NIH Bethesda, Md. 20894; Altschul. S., et al., 1990)。周知のSmith Waterman アルゴリズムもまた同一性の決定に利用することができる。
【００５５】
これに限定する意図はないが例として、本発明のアミノ酸配列は基準配列である配列番号：２−２５２の偶数番号と同一とすることができる；すなわち１００％同一である、または同一性の％が１００％未満であるような、基準配列と比較して多数のアミノ酸の変換を含むことができる。このような変換は、保存されるおよび保存されない置換または挿入を含む、少なくとも１つのアミノ酸の欠失、置換からなる群から選択され、この場合該変換は、基準のポリペプチド配列のアミノ末端もしくはカルボキシル末端の位置で、またはこれらの末端の位置の間のあらゆるところで、すなわち基準配列中のアミノ酸の間で個々に、もしくは基準配列内で１つもしくはそれ以上の隣接する群としてのいずれかで起こり得る。得られた同一性の％のアミノ酸の変換の数は、配列番号：２−２５２のアミノ酸総数に各同一性パーセントの数値百分率（１００で割る）を掛けて、配列番号：２−２５２のいずれかのアミノ酸の該総数からその積を引くことにより決定される、または：
ｎａ＝ｘａ−（ｘａ・ｙ）、
式中ｎａはアミノ酸の変換数であり、ｘａは配列番号：２−２５２のアミノ酸の総数、およびｙは例えば７０％に対しては０．７０、８０％に対しては０．８０、８５％に対しては０．８５等であり、ｘａおよびｙの積が整数でない場合は小数点以下を切り捨てて、ｘａから引く。
【００５６】
好ましい態様において、上記のポリペプチドは配列番号：２−２５２の偶数番号で示したタンパク質、例えば２０８６タンパク質の成熟プロセスを経た型から選択する。２０８６タンパク質または均等物等は、脂質化されていても脂質化されていなくてもよい。
【００５７】
ＱＲＦ２０８６は、天然の２０８６シグナル配列を用いて大腸菌内で発現させることができる。しかしタンパク質の発現を改善する方法を発見することは望ましい。本発明の態様により、リーダー配列でタンパク質の脂質化型を生成する。例えば以下に、発現を促進するための分類不可能なインフルエンザ菌（nontypable Haemophilus influenzae）Ｐ４
タンパク質のシグナル配列の使用について記載する。
【００５８】
細菌のリポタンパク質のプロセシングは、１つのシグナル配列を含む前駆体またはプロリポタンパク質の合成から始まるが、このことは言い換えればリポタンパク質のプロセシング/修飾部位のコンセンサスを含むことになる。このプロリポタンパク質は最初に、グ
ラム陰性菌の内膜上またはグラム陽性菌の膜上の共通のＳｅｃシステムを通って透過する。Ｓｅｃシステムにより一度膜内に入ると、プロリポタンパク質はコンセンサス部位でシ
グナルペプチダーゼＩＩにより切断され、暴露されたＮ末端システイン残基はグリセル化およびアシル化される。Hayashi et al. 1990. Lipoproteins in bacteria（細菌におけ
るリポタンパク質）、J. Bioenerg. Biomembr. Jun; 22(3): 451-71; Oudega et al. 1993.Escherichia coli SecB, SecA, and SecY proteins are required for expression and
membrane insertion of the bacteriocin release protein, a small lipoprotein（大
腸菌のＳｅｃＢ、ＳｅｃＡ、およびＳｅｃＹタンパク質は、バクテリオシンリリースタンパク質である小さなリポタンパク質の発現および膜への挿入に必要である） J. Bacteriol. Mar; 175(5): 1543-7; Sankaran et al. 1995. Modificartion of bacterial lipoproteins（細菌のリポタンパク質の修飾）Methods Enzymol. 250: 683-97。
【００５９】
グラム陰性菌において、脂質化されたタンパク質の外膜への移送は、リポタンパク質のポジション２での分別シグナルに依存する膜特異性を伴って、固有のＡＢＣトランスポーターシステムにより仲介される。Yakushi et al. 2000. A new ABC transporter mediating the detachment of lipid modified proteins from membrenes（脂質で修飾されたタ
ンパク質の膜からの剥離を仲介する新たなＡＢＣトランスポーター） Nat Cell Biol. Apr; 2(4): 212-8。
【００６０】
細菌のリポタンパク質との融合およびそれらのシグナル配列の融合体を用いて、細菌の表面上に組換えタンパク質を提示させた。米国特許第５，５８３，０３８号および６，１３０，０８５号。リポタンパク質のシグナル配列を交換すると、リポタンパク質の産生を増加できる。De et al. 2000. Purification and characterization of Streptococcus pneumoniae palmitoylated pneumococcal surface adhesin A expressed in Escherichia coli.（大腸菌で発現させた、肺炎球菌のパルミトイル酸化した肺炎球菌表面の接着因子
Ａの精製および特徴づけ）Vaccine. Mar 6; 18(17): 1811-21。
【００６１】
細菌のタンパク質の脂質化は、タンパク質の免疫学的反応を増加または修飾することが知られている。Erdil et al. 1993.  Role of attached lipid in immunogenisity of Borrelia burgdorferi OspA（Borrelia burgdorferi OspA の免疫原性における結合した脂
質の役割）Infect. Immun. Jan; 61(1): 81-90; Snapper et al. 1995. Bacterial lipoproteins may substitute for cytokines in the humoral immune response to T cell-independent type II antigens（細菌のリポタンパク質は、Ｔ細胞非依存性タイプＩＩ抗原への体液性免疫応答における、サイトカインと置き換わることができる）J. Immunol. Dec 15; 155(12): 5582-9。しかし細菌のリポタンパク質の発現は、プロセシングの緊縮に
より複雑化し得る。Pollitt et al. 1986. Effect of amino acid substitutions at the
signal peptide cleavage site of the Escherichia coli major outer membrane lipoprotein（大腸菌の主要な外膜リポタンパク質のシグナルペプチド切断部位でのアミノ酸の置換の影響）、J. Biol. Chem. Feb 5; 261(4): 1835-7; Lunn et al. 1987. Effects of
prolipoprotein signal peptide mutations on secretion of hybrid prolipo-beta-lactamase in Escherichia coli(大腸菌のハイブリッド  ポリリポ・ベータ・ラクタマーゼ
の分泌におけるポリリポタンパク質のシグナルペプチドの変異の影響)、J. Biol. Chem. Jun 15; 262(17): 8318-24; Klein et al. 1988. Distinctive properties of signal sequences from bacterial lipoproteins （細菌のリポタンパク質のシグナル配列の顕著な特性）、Protein Eng. Apr; 2(1): 15-20。細菌のリポタンパク質の発現はまた、他の問
題、例えば毒性および低発現レベルにより複雑になる。Gomez et al. 1994. Nucleotide
The Bacullus subtilis lipoprotein LplA causes cell lysis when expressed in Escherichia coli. （枯草菌リポタンパク質ＬｐｌＡは大腸菌で発現させた場合に溶菌の原
因になる）、Microbiology. Aug; 140(Pt8): 1839-45; Hannsson et al. 1995. Expression of truncated and full-length forms of the Lyme disease Borrelia outer surface
protein A in Escherichia coli. （Lyme病のボレリア属の外表面タンパク質Ａの、長い領域の欠落した型および全長の型の大腸菌内での発現）、Protein Expr. Purif. Feb; 6(
1): 15-24; Yakushi et al. 1997. Lethality of the covalent linkage between mislocalized major outer membrane lipoprotein and the peptidoglycan of Escheerichia coli. （大腸菌の誤って局在化した主要な外膜リポタンパク質およびペプチドグリカンとの共有結合の致死性、J. Bacteriol. May; 179(9): 2857-62。
【００６２】
分類不可能なインフルエンザ菌はＰ４と命名されたリポタンパク質（タンパク質“ｅ”としても知られている）を発現する。Ｐ４タンパク質の組換え型は天然のＰ４シグナル配列を用いて大腸菌内で高レベルで発現させることができる。米国特許第５，９５５，５８０号。天然のＰ４シグナル配列を、大腸菌内の発現ベクター中の天然のＯＲＦ２０８６シグナル配列と置き換えると、ＯＲＦ２０８６の発現レベルが増加する。
【００６３】
発現を増加させるために異種のＰ４シグナル配列を用いるこのコンセプトは、他の細菌のリポタンパク質に拡大することができる。特に細菌のゲノム分析により、目的のものである可能性のある多くのＯＲＦを同定することができる。異種のホスト細胞、例えば大腸菌内で、その天然のシグナル配列を含む各ＯＲＦを発現させるという試みは、安定性、適合性などを含む、様々なシグナル配列を使用することに付随する様々な問題を引き起こす。これらの問題を最小にするため、Ｐ４シグナル配列を利用して目的の各ＯＲＦを発現させる。上述のように、Ｐ４シグナル配列は異種の２０８６ＯＲＦの発現を向上させる。発現ベクターは、目的のＯＲＦの本来のシグナル配列を欠失させ、そのＯＲＦにＰ４シグナル配列を結合することにより作成する。次に適切なホスト細胞をその発現ベクターを用いて形質転換、トランスフェクションまたは感染させ、ＯＲＦの天然のシグナル配列を用いての発現と比較してＯＲＦの発現を増加させる。
【００６４】
非脂質化型は、オリジナルのリーダー配列を欠損するタンパク質により、またはホスト細胞において脂肪酸のアシル化の部位を特定しない配列部分に置き換えたリーダー配列により産生させる。
【００６５】
他に特に言及していなければ、本発明の２０８６タンパク質の様々な型を当明細書では
“２０８６”タンパク質という。他に言及していなければ上述のように“２０８６ポリ
ペプチド”もまた、２０８６タンパク質ならびにその免疫原性部分または生物学的均等物を意味する。
【００６６】
完全長の単離、精製された髄膜炎菌２０８６タンパク質は、１０％から２０％の勾配ＳＤＳポリアクリルアミドゲル（ＳＤＳ−ＰＡＧＥ）の測定で、約２８から３５ｋＤａの明確な分子量を有する。より限定的には、このタンパク質は質量分析による測定で、約２６，０００から３０，０００ダルトンの分子量を有する。
【００６７】
好ましくは２０８６ポリペプチドおよび該ポリペプチドをコードするヌクレオチドを、髄膜炎菌および/または他の菌種に起因する感染の予防または改善に使用する。
（抗体）
配列番号：２−２５２のアミノ酸配列、それらのフラグメント、およびそれらの類似体、またはそれらを発現する細胞を含む本発明のタンパク質はまた、免疫原として使用して本発明のポリペプチドに免疫特異的な抗体を産生させることができる。本発明は、免疫特異的なポリペプチドに対する抗体、およびこのような抗体を使用しての髄膜炎菌の存在の検出、受動的防護の提供、または細胞、細胞もしくは組織の抽出物、もしくは生物学的液体中のポリペプチドの量もしくは濃度の測定を含む。
【００６８】
本発明の抗体は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、キメラ抗体、および抗イディオタイプ抗体を含む。ポリクローナル抗体は、１つの抗原で感作した複数の動物の血清に由来する抗体分子の異質な（heterogeneous）母集団である。モノクローナル抗体は
、特異的な抗原に対する実質的に同質の抗体の集団である。モノクローナル抗体は、当業者に公知の方法、例えばKohler and Milstein, 1975, Nature 256: 495-497 および米国
特許第４，３７６，１１０号の方法により得ることができる。このような抗体はＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＥ、ＩｇＡ、ＧＩＬＤおよびそれらのあらゆるサブクラスを含むあらゆる免疫グロブリンのクラスとすることができる。
【００６９】
キメラ抗体は、分子の異なる部分が異なる動物種に由来する分子で、例えばネズミのモノクローナル抗体由来の可変領域およびヒトの免疫グロブリンの定常部領域を有する分子である。キメラ抗体およびそれらの製造法は当該技術分野で知られている（Cabilly et al., 1984, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81: 3273-3277; Morrison et al., 1984, Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 81: 6851-6855; Boulianne et al., 1984, Nature 312: 643-646; Cabilly et al., 欧州特許出願１２５０２３(１９８４年１１月１４日公開)；Taniguchi et al., 欧州特許出願 1７１４９６(１９８５年２月１９日公開)；Morrison et al., 
欧州特許出願１７３４９４（１９８６年３月５日公開）；Neuberger et al.,ＰＣＴ出願
ＷＯ８６/０１５３３（１９８６年３月１３日公開）；Kudo et al., 欧州特許出願１８４１８７（１９８６年６月１１日公開）；Morrison et al., 欧州特許出願１７３４９４（
１９８６年３月５日公開）；Sahagan et al.,1986, J. Immunol. 137: 1066-1074: Robinson et al.,ＰＣＴ/ＵＳ８６/０２２６９（１９８７年５月７日公開）；Liu et al., 1987, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84: 3439-3443; Sun et al., 1987, Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 84: 214-218; Better et al., 1988, Science 240: 1041-1043）。これらの参照文献を当明細書によりその全内容において参照として援用する。
【００７０】
抗イディオタイプ（抗Ｉｄ）抗体は、抗体の抗原結合部位に一般に結合する固有の決定基を認識する抗体である。抗Ｉｄ抗体は、モノクローナル抗体を作成した動物と等しい種および遺伝子型の動物（例えば同系のマウス）を、それに対して抗Ｉｄ抗体が産生されるモノクローナル抗体で免疫感作することにより作製する。免疫感作された動物は、これらのイソタイプ決定基に対する抗体（抗Ｉｄ抗体）を産生することにより、免疫感作する抗体のイディオタイプ決定基を認識して応答することになる。
【００７１】
したがって本発明のポリペプチドに対して産生されたモノクローナル抗体を用いて、適切な動物で抗Ｉｄ抗体を誘発することができる。このように免疫感作されたマウス由来の脾臓細胞を用いて、抗Ｉｄモノクローナル抗体を分泌する抗Ｉｄハイブリドーマを作成することができる。さらにこの抗Ｉｄ抗体をキャリアー、例えばキーホール・リンペット・ヘモシアニン（ＫＬＨ）にカップルさせて、さらにＢＡＬＢ/ｃマウスの免疫感作に使用
することができる。これらのマウス由来の血清は、Ｒ−ＰＴＰアーゼエピトープに対して特異的な最終的なｍＡｂの結合特性を有する、抗・抗Ｉｄ抗体を含むことになる。したがってこの抗Ｉｄ抗体は、それらのイディオタイプのエピトープ、または評価するエピトープと構造的に類似する“イディオトープ”、例えば化膿連鎖球菌のポリペプチドを有する。
【００７２】
“抗体”という用語はまた、完全な分子、ならびにフラグメント、例えば抗原に結合することのできるＦａｂの双方を含むことを意味する。Ｆａｂフラグメントは完全な抗体のＦｃフラグメントを欠損しており、血中からより急速に排泄され、本来の抗体より非特異的な組織への結合を低くすることができる（Wahl et al., 1983, J.Nucl. Med. 24: 316-325）。本発明に有用な抗体のＦａｂおよび他のフラグメントを、完全な抗体分子に関す
る方法により、髄膜炎菌ポリペプチドの検出および定量に使用できることは理解されるだろう。
【００７３】
本発明の抗体、例えば抗イディオタイプ（“抗Ｉｄ”）抗体を、上述のポリペプチドに特異的な免疫学的有効量の抗体の投与を含む、哺乳類のホストにおけるナイセリア属の感
染の治療法または予防法に利用することができる。抗Ｉｄ抗体はまた、さら別の動物において免疫応答を導入するための“免疫原”として使用して、いわゆる抗・抗Ｉｄ抗体を作成することもできる。この抗・抗Ｉｄは、抗Ｉｄを誘導したオリジナルのｍＡｂとエピトープ的には同一となり得る。したがってｍＡｂのイディオタイプの決定基に対する抗体を使用することにより、同一の特異性をもつ抗体を発現する他のクローンを同定することができる。
【００７４】
この抗体は様々な方法、例えばタンパク質が発現されていることの確認、またはタンパク質が発現されている場所を確認するために使用できる。標識された抗体（例えばＦＡＣＳの蛍光標識）を無傷の細菌と共にインキュベーションできるので、例えば細菌表面上の標識の存在によりタンパク質の位置を確認することができる。
【００７５】
本発明のポリペプチドに対して産生される抗体は、ポリペプチドもしくはエピトープをもっているフラグメント、類似体、または細胞を、規定のプロトコルを用いて動物に投与することにより得ることができる。モノクローナル抗体を作製するためには、継続的な細胞株の培養により産生される抗体を提供する、あらゆる技術を使用する。
【００７６】
（ポリヌクレオチド）
本発明のタンパク質と同様に、本発明のポリヌクレオチドは、配列番号：１−２５３：の奇数番号の基準配列のいずれかと同一である、すなわち１００％同一であるヌクレオチド配列を含むことができる、または基準配列と比較して多数のヌクレオチドの変換までを含むことができる。このような変換は、トランジションおよびトランスバージョン、または挿入を含む、少なくとも１つのヌクレオチドの欠失、置換からなる群から選択され、この場合該変換は、基準ヌクレオチド配列の５’末端または３’末端の位置で、またはこれらの末端の位置の間のあらゆるところで、すなわち基準配列中のヌクレオチドの間で個々に点在して、もしくは基準配列中の１つまたはそれ以上の隣接する群としてのいずれかで起こり得る。ヌクレオチドの変換された数は、配列番号：１−２５３の奇数番号のいずれかのヌクレオチドの総数に、各同一性パーセントの数値百分率（１００で割った値）を掛けて、該配列のヌクレオチドの該総数からその積を引くことにより決定する。
【００７７】
限定する意図はないが例として、髄膜炎菌の単離されたポリヌクレオチドは、配列番号：１−２５３のいずれかの核酸配列と少なくとも７０％の同一性を有するポリヌクレオチド配列；その縮重バリアントまたはそのフラグメントを含み、この場合該ポリヌクレオチド配列は配列番号：１−２５３の核酸配列の全ポリヌクレオチド領域に渡り、ｎｎ個までの核酸の変換を含むことができる。式中ｎｎは変換の最大数であり、以下の式により算出される：
ｎｎ＝ｘｎ−（ｘｎ・ｙ）
式中ｘｎは配列番号：１−２５３のいずれかのヌクレオチドの総数であり、ｙは０．７０の値であり、ｘｎおよびｙの積が整数でないいかなる値も小数点以下を切り捨てて、ｘｎから引く。もちろんｙはまた、８０％に対しては０．８０、８５％に対しては０．８５、９０％に対しては０．９０、９５％に対しては０．９５、等の値をとることができる。配列番号：２−２５２のいずれかのアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列の変化は、このコードする配列におけるナンセンス変異、ミスセンス変異またはフレームシフト変異を生成し、それによりこのような変化後、ポリヌクレオチドにコードされるポリペプチドを変化させ得る。
【００７８】
本発明のある態様は、２０８６タンパク質および２０８６タンパク質に対して作成された抗体をコードするポリヌクレオチド（当明細書では“２０８６ポリヌクレオチド”または“ＯＲＦ２０８６ポリヌクレオチド”という）に関する。好ましい態様において、本発明の単離されたポリヌクレオチドは、配列番号：１および配列番号：２５３の間の奇数番
号の１つから選択されたヌクレオチド配列、その縮重バリアント、またはそのフラグメントと、少なくとも約９５％の同一性を有するヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドである。当明細書で定義する場合“縮重バリアント”は、遺伝子コードの縮重により配列番号：１および配列番号：２５３の間の奇数番号で示されるヌクレオチド配列とは異なるが、なお配列番号：１−２５３の奇数番号で示されるヌクレオチド配列によりコードされるものと等しい２０８６タンパク質（すなわち配列番号：２−２５２の偶数番号）をコードする、ポリヌクレオチド（およびそのフラグメント）と定義する。
【００７９】
他の態様においてポリヌクレオチドは、配列番号：１−２５３の奇数番号の１つから選択されるヌクレオチド配列、その縮重バリアントまたはそのフラグメントの相補鎖である。なお他の態様において、ポリヌクレオチドはＤＮＡ、染色体ＤＮＡ、ｃＤＮＡおよびＲＮＡからなる群から選択され、さらに異種のヌクレオチドを含むことができる。もう一つの態様において単離されたポリヌクレオチドは、高いストリンジェンシーのハイブリダイズ条件下で、配列番号：１−２５３の１つから選択されるヌクレオチド配列、その相補鎖、その縮重バリアント、またはそのフラグメントとハイブリダイズする。なお他の態様において、ポリヌクレオチドは中程度のストリンジェンシーのハイブリダイズ条件下でハイブリダイズする。
【００８０】
２０８６ポリヌクレオチドは天然、合成または半合成の材料から得ることができる；さらにヌクレオチド配列は、自然界で生成される配列とすることができる、または１つまたは複数の塩基の置換、欠失、挿入および逆位を含む変異により、このような自然界で生成される配列と関連付けることができるが、ただしこのような配列を含む核酸分子は、常に上述の２０８６免疫原性ポリペプチドとして発現させることができることは理解されるだろう。核酸分子はＲＮＡ、ＤＮＡ、１本鎖もしくは２本鎖、直鎖もしくは共有結合で閉じた環状型とすることができる。ヌクレオチド配列は、それに隣接して位置する発現コントロール配列を有することができ、このようなコントロール配列は通常異種の材料に由来する。一般に本発明の核酸配列の組換え発現は、核酸配列の末端部において終止コドン配列、例えばＴＡＡを使用することになる。
【００８１】
本発明はまた、低レベルのストリンジェンシーの条件下で、より好ましくはストリンジェントな条件下で、そして最も好ましくは高度にストリンジェントな条件下で、当明細書で述べたポリヌクレオチドとハイブリダイズすることのできるポリヌクレオチドを含む。ストリンジェンシーの条件の例を以下の“ストリンジェンシーの条件の表”に示す：高度にストリンジェントな条件は少なくとも、例えばＡ−Ｆの条件と同程度にストリンジェントであり；ストリンジェントな条件は少なくとも例えばＧ−Ｌの条件と同程度にストリンジェントであり；そして低レベルのストリンジェンシーの条件は少なくともＭ−Ｒの条件と同程度にストリンジェントである。
【００８２】
【表１】
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【００８３】
ｂｐＩ：ハイブリッドの長さは、ハイブリダイズしているポリヌクレオチドのハイブリダイズした領域を構成する長さである。ポリヌクレオチドを未知の配列の標的ポリヌクレオチドとハイブリダイズさせる場合は、ハイブリッドの長さはハイブリダイズしているポリヌクレオチドの長さと仮定する。配列の分かっているポリヌクレオチドをハイブリダイズさせる場合、ハイブリッドの長さはポリヌクレオチド配列を整列(align)し、最適な配
列相補性のある１つまたは複数の領域を同定することにより、決定することができる。
【００８４】
バッファーＨ：ＳＳＰＥ（１ｘＳＳＰＥは０．１５Ｍ  ＮａＣｌ、１０ｍＭ  ＮａＨ２
ＰＯ４、および１．２５ｍＭ  ＥＤＴＡ、ｐＨ７．４である）は、ハイブリダイゼーションおよび洗浄バッファーにおいてはＳＳＣ（１ｘＳＳＣは０．１５Ｍ  ＮａＣｌおよび１５ｍＭクエン酸ナトリウム）に換えることができる；洗浄はハイブリッド形成完了後１５分間に行う。
【００８５】
ＴＢからＴＲまで：長さ５０塩基対未満であることが予想されるハイブリッドのためのハイブリダイゼーション温度は、ハイブリッドの融解温度（Ｔｍ）より５−１０ＥＣ低くすべきであり、この場合Ｔｍは以下の式より決定される。長さ１８塩基対未満のハイブリッドに関しては、Ｔｍ（ＥＣ）＝２（Ａ＋Ｔ塩基の数）＋４（Ｇ＋Ｃ塩基の数）とする。長さ１８および４９塩基対の間のハイブリッドに関しては、Ｔｍ（ＥＣ）＝８１．５＋１６．６（ｌｏｇ１０［Ｎａ＋］）＋０．４１（％Ｇ＋Ｃ）−（６００/Ｎ）とするが、式
中Ｎはハイブリッドの塩基数であり、［Ｎａ＋］はハイブリダイゼーションバッファー中のナトリウムイオン濃度である（１ｘＳＳＣの［Ｎａ＋］＝０．１６５Ｍ）。
【００８６】
ポリヌクレオチドのハイブリダイゼーションに関するストリンジェントの条件のさらなる例は、Sambrook, J., E.F. Fritsch, and T. Maniatis, 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual（分子のクローニング：実験室マニュアル）, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 9章および11章、およびCurrent Protocols in Molecular Biology（分子生物学における最新のプロトコル）, 1995, F.M. Ausubel et
al.編、John Wiley & Sons, Inc.,セクション2.10および6.3-6.4、に提供されており、
これらを当明細書において参照として援用する。
【００８７】
本発明はまた、これらのポリヌクレオチドに完全に相補的なポリヌクレオチドを提供し、またアンチセンス配列をも提供する。本発明のアンチセンス配列（アンチセンスオリゴヌクレオチドともいう）は、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの発現を遮断する、内部で産生される配列および外部から投与される配列の双方を含む。本発明のアンチセンス配列は、例えば約１５−２０塩基対を含む。アンチセンス配列は、例えば上流の翻訳されない配列に結合するプロモーターを妨害することにより転写を阻害するように、またはリボソームの結合を妨げることで本発明のポリペプチドをコードする転写物の翻訳を妨げるように、デザインすることができる。
【００８８】
本発明のポリヌクレオチドは多くの方法で（例えば化学的合成、ＤＮＡライブラリーから、生物体自体から）製造し、多様な形（例えば１本鎖、２本鎖、ベクター、プローブ、プライマー）とすることができる。“ポリヌクレオチド”という用語はＤＮＡおよびＲＮＡ、およびまたそれらの類似体、例えば主鎖の修飾を含む類似体を含む。
【００８９】
本発明のさらなる実施により、本発明のポリヌクレオチドはＤＮＡライブラリー、例えばｃＤＮＡライブラリーを含む。
（融合タンパク質）
本発明はまた融合タンパク質に関する。“融合タンパク質”は、２つのしばしば無関係の融合した遺伝子またはそのフラグメントにコードされるタンパク質をいう。例えば融合タンパク質は、免疫グロブリン分子の定常部領域の様々な部分を、もう一つの免疫原性タンパク質またはその一部と共に含む。多くの場合免疫グロブリンＦｃ領域を融合タンパク質の一部分として利用することは、例えば治療および診断に使用すると薬物動態学的特性の改善をもたらすという利点がある（例えばＥＰ  ０  ２３２  ２６２  Ａ１を参照のこと）。他方使用によっては、融合タンパク質を発現、検出および精製した後にＦｃ部分を除くことができることが望ましい。本発明の２０８６ポリヌクレオチドを本発明のポリペプチドの組換え生成に使用し、このヌクレオチドに成熟ポリペプチドそのものをコードする配列、またはリーディングフレーム中に他のコード配列、例えばリーダー配列もしくは分泌配列、前タンパク質もしくはプロタンパク質もしくはプレプロタンパク質の配列、ま
たは他の融合ペプチド部分をコードする配列と共に、成熟ポリペプチドをコードする配列を含ませることができる。例えば２０８６ポリペプチドまたは融合ポリペプチドの精製を促進するマーカー配列をコードさせることができる（Gentz et al., 1989を参照のこと、当明細書中にこの全内容を参照として援用する）。このように本発明の実施において、Ｈｉｓタグによる発現産生物の精製を可能とする融合ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの製造を意図する。ポリヌクレオチドはまた、コードしない５’および３’配列、例えば転写されるが翻訳されない配列、すなわちスプライシングおよびポリアデニル化のシグナルも含むことができる。このような融合ポリペプチドは、以下に記述するように組換えＤＮＡをクローニングする媒体でホスト細胞を形質転換/トランスフェクションまた
は感染させることにより、作成することができ、その後ホスト細胞から単離して、他のホスト細胞タンパク質を実質的に含まない融合ポリペプチドを提供することができる。
【００９０】
（免疫原性組成物）
本発明の１つの側面は、少なくとも１つの２０８６タンパク質または該タンパク質をコードする核酸を含む、免疫原性組成物を提供する。上述の組成物は以下の能力、すなわち（１）複数の菌株に対して殺菌性抗体を産生する；（２）複数の菌株の表面と反応する；（３）実際の攻撃に対して受動的な防護を与える；（４）コロニー化を防ぐ能力を有する。
【００９１】
このような免疫原性組成物の処方物は当業者には周知である。本発明の免疫原性組成物は好ましくは、医薬的に受容可能な担体を含む。適切な医薬的に受容可能な担体および/
または希釈剤は、従来の溶媒、分散媒体、充填剤、固体の担体、水溶液、コーティング剤、抗菌剤および抗カビ剤、等張液、吸収遅延剤、等のいずれかおよびすべてを含む。適切な医薬的に受容可能な担体として、例えば水、生理食塩水、リン酸緩衝化生理食塩水、デキストロース、グリセロール、エタノール等の１つまたはそれより多く、ならびにそれらを組み合わせたものを含む。医薬的に受容可能な担体はさらに少量の補助物質、例えば抗体の品質保障期間または有効性を高める、湿潤剤または乳化剤、保存剤またはバッファーを含むことができる。医薬的に受容可能な担体の製造および使用は当該技術分野で公知である。従来のいずれの媒体または薬剤も活性成分と共存できない場合を除いて、本発明の免疫原性組成物におけるその使用を意図する。
【００９２】
このような免疫原性組成物は非経口的に、例えば皮下注または筋注のいずれかの注射により、ならびに経口または経鼻により投与することができる。筋肉内への免疫感作の方法は、WolffらによりおよびSedegah らにより記載されている。他の投与形態として、例え
ば経口処方物、経肺処方物、座剤、および経皮投与を利用できるが、これらに限定されない。経口処方物は例えば、医薬的グレードのマンニトール、ラクトース、スターチ、ステアリン酸マグネシウム、サッカリン酸ナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウム等のような通常用いられる賦形剤を含むが、これらに限定されない。
【００９３】
本発明の免疫原性組成物は、１つまたはそれ以上のアジュバントを含み、これは水酸化アルミニウム；リン酸アルミニウム；ＳＴＩＭＵＬＯＮ（登録商標）  ＱＳ−２１（Aquila Biopharmaceuticals, Inc., Framingham, MA）；ＭＰＬ（登録商標）（３−Ｏ−脱ア
シル化モノホスホリル脂質Ａ；Corixa, Hamilton, MT）、５２９（アミノアルキルグルコサミンフォスフェート化合物、Corixa, Hamilton, MT）、ＩＬ−１２（Genetics Institute, Cambridge, MA）；ＧＭ−ＣＳＦ（Immunex Corp., Seattle, Washington）；Ｎ−ア
セチル−ムラミル−Ｌ−セロニル(theronl)−Ｄ−イソグルタミン（ｔｈｒ−ＭＤＰ）；
Ｎ−アセチル−ノル−ムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミン（ＣＧＰ  １１６３７、ｎｏｒ−ＭＤＰともいう）；Ｎ−アセチルムラミル−Ｌ−アラニル−Ｄ−イソグルタミニル−Ｌ−アラニン−２−（１’−２’−ジパルミトイル−ｓｎ−グリセロ−３−ヒドロキシホスホリルオキシ−エチルアミン）（ＣＧＰ  １９８３５Ａ、ＭＴＰ−ＰＥともい
う）；およびコレラ毒素を含むが、これに限定されない。使用可能な他の例として、コレラ毒素の非毒性誘導体（そのＡサブユニットを含む）、および/または髄膜炎菌ポリペプ
チドとコレラ菌毒素もしくはそのＢサブユニット（“ＣＴＢ”）との複合体もしくは遺伝子工学による融合体、プロコレラゲノイド(procholeragenoid)、カビの多糖（シゾフィランを含む）、ムラミルジペプチド、ムラミルジペプチド（“ＭＤＰ”）誘導体、ホルボールエステル、大腸菌の易熱性毒素、ブロックポリマー、またはサポニンが挙げられる。
【００９４】
ある好ましい態様において本発明のタンパク質を、粘膜用アジュバントを含む経口投与用免疫原性組成物中に使用し、ヒト宿主における髄膜炎菌感染の治療または予防に使用する。粘膜用アジュバントはコレラ毒素とすることができる；しかし好ましくは、本発明に従って使用することのできるコレラ毒素以外の粘膜アジュバントとして、コレラホロトキシンの非毒性誘導体を含み、この場合Ａサブユニットが突然変異誘発されたもの、化学的に修飾されたコレラ毒素、またはコレラ毒素アミノ酸配列の修飾により生成される関連タンパク質である。本発明の免疫原性組成物の製造に特に有用となり得る特定のコレラ毒素として、国際特許出願公開第ＷＯ  ００/１８４３４号に開示されている、変異コレラホ
ロトキシンＥ２９Ｈを参照のこと（この全内容を当明細書において参照として援用する）。これらを本発明のポリペプチドに加える、または複合させることができる。粘膜アジュバント特性または送達特性を有する他の分子、例えば大腸菌易熱性毒素（ＬＴ）に、同じ技術を適用することができる。粘膜用アジュバント活性または送達活性を有する他の化合物として、例えば胆汁；ポリカチオン、例えばＤＥＡＥ−デキストランおよびポリオルニチン；界面活性剤、例えばドデシルベンゼン硫酸ナトリウム；脂質を複合した物質；抗生物質、例えばストレプトマイシン；ビタミンＡ；および粘膜表面の構造的または機能的完全性を変えるその他の物質、を使用することができる。他の粘膜活性化合物として、微生物の構造の誘導体、例えばＭＤＰ；アクリジンおよびシメチジンを含む。ＳＴＩＭＵＬＯＮ（登録商標）ＱＳ−２１、ＭＰＬおよびＩＬ−１２もまた上述のように使用することができる。
【００９５】
本発明の免疫原性組成物は、吸収に適するサイズのマイクロスフェアを形成するように、ＩＳＣＯＭＳ（免疫を刺激する複合物質）、ＣＴＢを含有するＩＳＣＯＭＳ、リポソーム、または化合物、例えばアクリレートもしくはＤＬ−ラクチド/グリコシド共重合体中
にカプセル化した剤形で送達することができる。本発明のタンパク質はまた、油性エマルジョン中に混合することもできる。
【００９６】
（複数の抗原）
本発明のタンパク質、ポリヌクレオチドおよび均等物を含む免疫原性物質は、免疫組成物中に単一の活性免疫原として投与することができるが、あるいは同組成物は、他のナイセリア属、免疫原性ポリペプチド、または１つまたはそれより多くの微生物病原体（例えば限定はしないがウイルス、プリオン、細菌、もしくはカビ）の免疫学的に活性なタンパク質、またはきょう膜の多糖を含む他の活性な免疫原を含むことができる。組成物は１つまたはそれより多くの所望のタンパク質、フラグメントまたは医薬的化合物を、選択された適用に所望されるように含むことができる。同様に、免疫原性組成物中に１つまたはそれより多くの核酸を使用する本発明の組成物はまた、上述のようにタンパク質の同じ変異を示す群をコードする核酸を含むことができる。
【００９７】
あらゆる複数の抗原または多価免疫原組成物を、本発明により意図するものとする。例えば本発明の組成物は、２つまたはそれより多くの２０８６タンパク質の組み合わせ、２０８６タンパク質と１つまたはそれより多くのＰｏｒＡタンパク質との組み合わせ、２０８６タンパク質と髄膜炎菌血清群Ａ、Ｃ、ＹおよびＷ１３５多糖および/または多糖複合
体との組み合わせ、２０８６タンパク質と髄膜炎菌および肺炎球菌を組み合わせたものとの組み合わせ、または粘膜への送達に適する形の前述の物質のいずれかの組み合わせを含
むことができる。当業者はこのような複数の抗原または多価免疫原組成物を、容易に製剤化することができるだろう。
【００９８】
本発明はまた、病原体に対して有用なあらゆる組成物を本発明の組成物中に、または本発明の組成物と共に組み合わせることのできる、多重免疫感作処方を意図する。例えば限定はしないが、本発明の免疫原性組成物と、肺炎球菌に対して免疫感作するためのもう１つの免疫学的組成物を、多重免疫感作処方の一部として患者に投与することができる。当業者は、多重免疫感作計画を開発、実行するために、本発明の免疫原性組成物と共に合わせて使用する免疫原性組成物を、容易に選択することができるだろう。
【００９９】
本発明の特定の態様は、肺炎球菌感染の予防または改善のための組成物中に、または治療計画の一部として、本発明の１つもしくはそれより多くのポリペプチド、またはそれをコードする核酸を使用することに関する。２０８６ポリペプチドまたは２０８６ポリヌクレオチドを、肺炎球菌感染に対して使用するあらゆる免疫原性組成物と組み合わせることができる。また２０８６ポリペプチドまたは２０８６ポリヌクレオチドを、あらゆる他のタンパク質または多糖を基本とする髄膜炎菌ワクチンと組み合わせることもできる。
【０１００】
２０８６ポリペプチド、フラグメントおよび均等物は、複合免疫原性組成物の一部として使用することができる；この場合、いくつかの血清型および/またはいくつかの疾患に
対して免疫原性特性を有する組成物を作成するために、１つまたはそれより多くのタンパク質またはポリペプチドを担体と複合させる。あるいは２０８６ポリペプチドの１つを、他の免疫原性ポリペプチドの担体タンパク質として使用することができる。
【０１０１】
本発明はまた、哺乳類に本発明の免疫原性組成物を提供するステップを含む、該哺乳類における免疫応答を誘導する方法に関する。免疫原性組成物は、治療する動物またはヒトにおいて抗原性があり、このような組成物中に含まれる免疫学的有効量のポリペプチドが、髄膜炎菌感染に対して所望の免疫応答を惹起する。好ましい態様は、免疫学的有効量の組成物をヒトに投与することを含む、ヒトにおける髄膜炎菌感染の改善または予防を含む治療法に関する。
【０１０２】
“免疫学的有効量”という語句は本明細書で使用する場合、１回の投与にでまたは一連の投与の一部としてのいずれかにより、治療した個体の免疫系が細菌感染の臨床的衝撃を低減する応答を引き起こす少なくとも要因となるのに十分な、哺乳類のホスト（好ましくはヒト）へのその用量の投与をいう。この有効量は、細菌による負荷をわずかに軽減する程度から感染の予防までの範囲とすることができる。理想的には治療した個体が、細菌感染によるより重症な臨床症状を発現しなくなる。投与量は個体の特定の条件に依存して変えることができる。この量はルーチンの試みで、あるいは当業者に公知の方法により決定することができる。
【０１０３】
本発明のもう一つの特定の側面は、本発明のタンパク質または免疫原性部分そのものを発現するベクターまたはプラスミドを、免疫原性組成物として使用することに関する。したがって本発明のさらなる側面として、哺乳類における免疫応答を誘導する方法を提供し、その方法は少なくとも１つの単離された２０８６ポリペプチドを発現するベクターまたはプラスミドを哺乳類に提供することを含む。本発明のタンパク質は、外来ポリペプチドとしてポリペプチドまたは免疫原性部分を発現するために必要な遺伝的材料を含む、生きているベクターを用いて、特に生きている組換え細菌、ウイルスまたはその他の生きている物質を用いて、哺乳類に送達することができる。
【０１０４】
本発明のさらなる実施により、哺乳類における細菌性髄膜炎を診断するための方法を提供する：その方法として、哺乳類、または該哺乳類由来の組織サンプル、配列番号２−２
５２の偶数番号のいずれかのアミノ酸配列を含む少なくとも１つのポリペプチドと免疫特異的に結合する抗体を含む抗体組成物を接触させた該哺乳類または組織サンプル、における免疫複合体の存在を検出する；その場合哺乳類または組織サンプルは免疫複合体の形成に適する条件下で抗体組成物と接触させる。
【０１０５】
（ウイルスベクターおよび非ウイルスベクター）
好ましいベクターは、特にin vitro および in vivoの細胞アッセイに関してはウイル
スベクター、例えばレンチウイルス、レトロウイルス、ヘルペスウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ワクシニアウイルス、バキュロウイルス、および望ましい細胞指向性を有するその他の組換えウイルスである。このように２０８６タンパク質またはその免疫原性フラグメントをコードする核酸を、ウイルスベクターを用いてまたはＤＮＡを直接導入することにより、in vivo、ex vivo、またはin vitroで導入することができる。標的組織内での発現は、例えばウイルスベクターもしくは受容体リガンドを用いて、または組織特異的なプロモーターを使用することにより、またはそれら双方により、遺伝子組換えしたベクターを特定の細胞にターゲティングすることにより達成することができる。標的への遺伝子の送達はＰＣＴ出願公開第ＷＯ  ９５/２８４９４号に記載されており、
その全内容を当明細書において参照として援用する。
【０１０６】
in vivoまたはex vivoターゲティングにおいて、または治療法として使用する一般的なウイルスベクターは、ＤＮＡを基本とするベクターおよびレトロウイルスベクターである。ウイルスベクターの構築法および使用法は、当該技術分野で公知である（例えばMiller
and Rosman, Biotechniques, 1992, 7: 980-990）。好ましくはウイルスベクターは複製欠陥とする、すなわちウイルスベクターは標的細胞内で自動的に複製することはできない。好ましくは複製欠陥ウイルスは最小のウイルスとする、すなわちゲノムを外膜で包みウイルス粒子を形成するために必要なウイルスのゲノム配列のみを保有するものとする。
【０１０７】
ＤＮＡウイルスベクターは弱毒または欠陥ＤＮＡウイルス、例えば限定はしないが単純ヘルペスウイルス（ＨＳＶ）、パピローマーウイルス、エプスタイン・バーウイルス（ＥＢＶ）、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）等を含む。ウイルス遺伝子を完全にまたはほぼ完全に欠損する欠陥ウイルスが好ましい。欠陥ウイルスは細胞内への導入後の感染性はない。欠陥ウイルスベクターを使用することで、ベクターが他の細胞に感染する可能性を憂慮することなく、特定の、局所的領域の細胞への投与が可能となる。このように特定の組織を特異的に標的とすることができる。特定のベクターの例として以下を含むがこれに限定されない、すなわち欠陥ヘルペスウイルス１（ＨＳＶ１）ベクター(Kaplitt et al., Molec. Cell. Neurosci., 1991, 2: 320-330)、糖タンパク質Ｌ遺伝子を欠損する欠陥ヘルペスウイルスベクター、または他の欠陥ヘルペスウイルスベクター（ＰＣＴ出願公開第ＷＯ  ９４/２１８０７号およびＷＯ  ９２/０５２６３号）；弱毒アデノウイルスベクター、例えばStratford-Perricaudet et al.に記載されているベクター (J. Clin. Invest., 1992, 90: 626-630; またLa Salle et al., Science, 1993, 259: 988-990も参照のこと)；および欠陥アデノ随伴ウイルスベクター（Samulski et al., J. Virol., 1987, 61: 3096-3101; Samulski et al., J. Virol., 1989, 63: 3822-3828; Lebkowski et al., Mol. Cell. Biol., 1988, 8: 3988-3996）が挙げられ、これらの各文献を当明細書において参照として援用する。
【０１０８】
様々な会社からウイルスベクターが市販されており、以下を含むがこれに限定されない、すなわちAvigen, Inc. (Alameda, CA;ＡＡＶベクター)、Cell Genesys (Foster City, CA;レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、ＡＡＶベクター、およびレンチ
ウイルスベクター)、Clontech (レトロウイルスベクターおよびバキュロウイルスベクタ
ー)、Genovo, Inc.(Sharon Hill, PA; アデノウイルスベクターおよびＡＡＶベクター)、Genvec (アデノウイルスベクター)、IntroGene (Leiden, Netherlands: アデノウイルス
ベクター)、Molecular Medicine (レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、
ＡＡＶベクターおよびヘルペスウイルスベクター)、Norgen (アデノウイルスベクター)、Oxford BioMedica (Oxford, United Kingdom; レンチウイルスベクター)、およびTransgene (Strasbourg, France; アデノウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、レトロウイルスベクター、およびレンチウイルスベクター)があり、その全内容を当明細書に
おいて参照として援用する。
【０１０９】
（アデノウイルスベクター）
アデノウイルスは、本発明の核酸を様々なタイプの細胞に効率的に送達するように修飾することのできる、真核ＤＮＡウイルスである。アデノウイルスには様々な血清型がある。これらの血清型のうち、本発明の範疇において好ましくは２型または５型ヒトアデノウイルス（Ａｄ２もしくはＡｄ５）または動物起源のアデノウイルスを使用する（ＰＣＴ出願公開第ＷＯ  ９４/２６９１４号を参照のこと）。本発明の範疇に使用することのでき
る動物起源のこれらのアデノウイルスは、イヌ、ウシ、ネズミ（例：Mavl, Beard et al., Virology, 1990, 75-81）、ヒツジ、ブタ、トリ、およびサル（例：ＳＡＶ）を起源と
するアデノウイルスを含む。好ましくは動物起源のアデノウイルスは、イヌアデノウイルス、より好ましくはＣＡＶ２アデノウイルス（例えばManhattanまたはＡ２６/６１株、ＡＴＣＣ  ＶＲ−８００）である。様々な複製欠陥アデノウイルスおよび最小のアデノウイルスのベクターについて記載されてきた（ＰＣＴ出願公開第ＷＯ  ９４/２６９１４号、
ＷＯ  ９５/０２６９７号、ＷＯ  ９４/２８９３８号、ＷＯ  ９４/２８１５２号、ＷＯ
９４/１２６４９号、ＷＯ  ９５/０２６９７号、ＷＯ  ９６/２２３７８号）。本発明
による複製欠陥組換えアデノウイルスは、当業者に公知のいずれの技術でも製造することができる（Levrero et al., Gene, 1991, 101: 195; 欧州特許出願公開第ＥＰ  １８５  ５７３号；Graham, EMBO J., 1984, 3: 2917; Graham et al., J. Gen. Virol., 1977, 36: 59）。組換えアデノウイルスは一般の当業者に周知の標準的な分子生物学的技術を用
いて回収し精製される。
【０１１０】
（アデノ随伴ウイルス）
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）は、それらの感染する細胞のゲノム中に安定して部位特異的に組み込むことのできる、比較的小さなサイズのＤＮＡウイルスである。これらはまた、細胞の成長、形態または分化になんら影響を与えることなく広範囲の細胞に感染することができ、ヒトの病理への関与は認められていない。ＡＡＶゲノムはクローン化、配列決定および特徴付けが完了している。In vitroおよび in vivoで遺伝子を伝達するためのＡＡＶ由来のベクターの使用について、記述されている（ＰＣＴ出願公開第ＷＯ  ９１/
１８０８８号およびＷＯ  ９３/０９２３９号；米国特許第４，７９７，３６８号および
５，１３９，９４１号；欧州特許出願公開第ＥＰ  ４８８  ５２８号を参照のこと）。本発明による複製欠陥組換えＡＡＶは、目的の核酸配列の両側を２つのＡＡＶ逆位末端反復（ＩＴＲ）領域ではさんで含むプラスミド、およびＡＡＶのキャプシド形成遺伝子（ｒｅｐおよびｃａｐ遺伝子）を保有するプラスミドを、ヒトヘルパーウイルス（例えばアデノウイルス）で感染させた細胞株内に、合わせてトランスフェクト(cotransfect)すること
により、製造することができる。次に作製した組換えＡＡＶを標準的な技術により精製する。
【０１１１】
（レトロウイルスベクター）
本発明のもう一つに実施において、核酸をレトロウイルスベクターに導入することができる、例えば以下の文献、米国特許第５，３９９，３４６号；Mann et al., Cell, 1983,
33: 153; 米国特許第４，６５０，７６４号および４，９８０，２８９号；Markowitz et
al., J. Virol., 1988, 62: 1120; 米国特許第５，１２４，２６３号；欧州特許出願公
開第ＥＰ  ４５３  ２４２号およびＥＰ  １７８  ２２０号；Bernstein et al., Genet.
Eng., 1985, 7: 235; McCormick, BioTechnology, 1985, 3: 689; ＰＣＴ出願公開第Ｗ
Ｏ  ９５/０７３５８号；およびKuo de al., Blood, 1993, 82: 845に記載されており、
これらの各文献をその全内容において参照として援用する。レトロウイルスは分裂細胞に感染する組み込むタイプのウイルスである。レトロウイルスゲノムは２つのＬＴＲ、キャプシド形成配列および３つのコード領域（ｇａｇ、ｐｏｌおよびｅｎｖ）を含む。組換えレトロウイルスにおいては、一般にｇａｇ、ｐｏｌおよびｅｎｖ遺伝子をすべてまたは部分的に欠失させ、目的の異種の核酸配列で置き換える。これらのベクターは異なるタイプのレトロウイルス、例えばＨＩＶ、ＭｏＭｕＬＶ（“ネズミMoloney白血病ウイルス”）
、ＭＳＶ（“ネズミMoloney肉腫ウイルス”）、ＨａＳＶ（“Harvey肉腫ウイルス”）；
ＳＮＶ（“脾臓壊死ウイルス”）；ＲＳＶ（“Rous肉腫ウイルス”）およびFriendウイルス、から作成することができる。適切なパッケージング細胞株は先行技術に記載されており、特にＰＡ３１７細胞株（米国特許第４，８６１，７１９号）；ＰｓｉＣＲＩＰ細胞株（ＰＣＴ出願公開第ＷＯ  ９０/０２８０６号）およびＧＰ＋ｅｎｖＡｍ−１２細胞株（
ＰＣＴ出願公開第ＷＯ  ８９/０７１５０号）が挙げられる。加えて組換えレトロウイル
スベクターは、転写活性ならびにｇａｇ遺伝子の一部に含まれ得る、余分のキャプシド形成配列を抑制するため２つのＬＴＲの間に修飾を含ませることができる（Bender et al.,
J. Virol., 1987, 61: 1639）。組換えレトロウイルスベクターは一般の当業者に公知の標準的な技術により精製される。
【０１１２】
レトロウイルスベクターは感染性の粒子として機能するように、または１世代のトランスフェクションを行うように作成することができる。前者の場合ウイルスは、発癌性の形質転換特性に関与する遺伝子を除くすべてのウイルス遺伝子を保持し、かつ異種の遺伝子を発現するように修飾する。非感染性のウイルスベクターは、そのウイルスのパッケージングシグナルは破壊するが、異種の遺伝子およびパッケージングシグナルを含むように作製された、一緒に導入する(co-introduceed)ウイルスのパッケージングに必要な構造遺伝子は保持するように操作する。したがって作製されたウイルス粒子はさらなるウイルスを産生する能力はない。
【０１１３】
レトロウイルスベクターはまたＤＮＡウイルスにより導入することもでき、この場合１サイクルのレトロウイルスの複製が可能となり、トランスフェクション効率が増幅される（ＰＣＴ出願公開第ＷＯ  ９５/２２６１７号、ＷＯ  ９５/２６４１１号、ＷＯ  ９６/
３９０３６号、およびＷＯ  ９７/１９１８２号を参照のこと）。
【０１１４】
（レンチウイルスベクター）
本発明のもう一つの実施において、レンチウイルスベクターを直接送達のための媒体物質として使用して、脳、網膜、筋肉、肝臓および血液を含むいくつかの組織のタイプにおいて導入遺伝子の発現を持続することができる。このベクターをこれらの組織の分裂細胞および非分裂細胞に効率的に形質導入し、目的の遺伝子の長期間の発現を達成することができる。総説として、Naldini, Curr. Opin. Biotechnol., 1998, 9: 457-62を参照のこ
と;またZufferey, et al., J. Virol., 1998, 72: 9873-80も参照のこと。レンチウイル
スのパッケージング細胞株は入手可能であり、当該技術分野で一般に知られている。これらは遺伝子治療用の高力価のレンチウイルスベクターの産生を促進する。一例として、ウイルス粒子を１０６  ＩＵ/ｍＬ以上の力価で少なくとも３から４日間産生できる、テト
ラサイクリン誘発型ＶＳＶ−Ｇ類型レンチウイルスパッケージング細胞株がある（Kafri,
et al., J. Viol., 1999, 73: 576-584）。誘発型細胞株により産生されたベクターは、in vitroおよびin vivoで非分裂細胞に効率的に形質導入させるため必要に応じて濃縮す
ることができる。
【０１１５】
（非ウイルスベクター）
本発明のもう一つの実施において、リポフェクションにより裸のＤＮＡとしてまたは他のトランスフェクション促進物質（ペプチド、ポリマー等）と共に、ベクターをin vivo
で導入することができる。合成陽イオン脂質を使用して、マーカーをコードする遺伝子をin vivoでトランスフェクションするためのリポソームを製造することができる。（Felgner et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1987, 84: 7413-7417; Felgner and Ringold, Science, 1989, 337: 387-388; Mackey, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1988, 85: 8027-8031; Ulmer et al., Science, 1993, 259: 1745-1748）。核酸の伝達に有用な脂質化合物および脂質組成物はＰＣＴ特許出願公開第ＷＯ  ９５/１８８６３号お
よびＷＯ  ９６/１７８２３号、および米国特許第５，４５９，１２７号に記載されてい
る。脂質はターゲティングのために他の分子と化学的にカップルさせることができる（Macky, et al., 上記参照のこと）。標的のペプチド、例えばホルモンもしくは神経伝達物
質、および抗体のようなタンパク質、または非ペプチド分子をリポソームと化学的にカップルさせることができる。
【０１１６】
他の分子、例えばカチオン性オリゴペプチド（例えばＰＣＴ特許出願公開第ＷＯ  ９５/２１９３１号）、ＤＮＡ結合タンパク質由来のペプチド（例えばＰＣＴ特許出願公開第
ＷＯ  ９６/２５５０８号）またはカチオン性ポリマー（例えばＰＣＴ特許出願公開第Ｗ
Ｏ  ９５/２１９３１号）もまた、in vivoでの核酸のトランスフェクションの促進に有用である。
【０１１７】
in vivoにおいて、裸のＤＮＡプラスミドとしてのベクターを導入することもまた可能
である。ワクチンの目的、または遺伝子治療のための裸のＤＮＡベクターを、当該技術分野の公知の方法、例えばエレクトロポレーション、マイクロインジェクション、細胞融合、ＤＥＡＥデキストラン、リン酸カルシウム沈降法、遺伝子銃の使用、またはＤＮＡベクター輸送体の使用により、所望の宿主細胞内に導入することができる（例えばWu et al.,
J. Biol. Chem., 1992, 267: 963-967; Wu and Wu, J. Biol. Chem., 1988, 263: 14621-14624; カナダ特許出願公開第２，０１２，３１１号；Williams et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1991, 88: 2726-2730）。受容体を介してＤＮＡを送達する方法もまた利用できる（Curiel et al., Hum. Gene Ther., 1992, 3: 147-154; Wu and Wu, J. Biol. Chem., 1987, 262: 4429-4432）。米国特許第５，５８０，８５９号および５，５８９，
４６６号は、哺乳類におけるトランスフェクション促進物質を使用せずに外来ＤＮＡ配列を送達する方法を開示している。最近、electrotransferと命名された比較的低電圧で高
効率のin vivo ＤＮＡ伝達技術について記述があった（Mir et al., C. P. Acad. Sci., 1988, 321: 893; ＰＣＴ出願公開第ＷＯ  ９９/０１１５７号；ＷＯ  ９９/０１１５８号；ＷＯ９９/０１１７５号）。したがって本発明のさらなる態様は、本発明の２０８６ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子の一定量を、所望によりトランスフェクション促進物質と共にヒトに投与することを含む、該ヒトにおける免疫応答の誘導法に関する。この場合該ポリペプチドは、発現する場合には免疫原性を保持するものとし、免疫原性組成物中に含ませてヒトに投与する場合には、ナイセリア属の病原体、例えば髄膜炎菌によるその後のヒトへの感染時に、疾患の増強を誘発しない防護を提供する。トランスフェクション促進剤は当該技術分野で知られており、ブピビカイン（bupivicaine）、およびその他の
局所麻酔剤（例えば米国特許第５，７３９，１１８号を参照のこと）およびカチオン性ポリアミン（国際特許出願第ＷＯ  ９６/１００３８号に公開されている）を含む、これら
の文献を当明細書において参照として援用する。
【０１１８】
本発明はまた、上述のように２０８６ポリペプチドに特異的なモノクローナル抗体またはポリクローナル抗体のいずれかとすることができる抗体に関する。このような抗体は当業者に周知の方法で作成することができる。
【０１１９】
（細菌の発現系およびプラスミド）
本発明はまた、プロモーター配列およびイニシエーター配列を有する発現コントロール配列、および本発明のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、すなわちプロモータ
ー配列およびイニシエーター配列の３’側に位置するヌクレオチド配列を含む組換えＤＮＡ分子、例えば、ベクターまたはプラスミドを提供する。なおもう一つの側面において本発明は、プロモーター配列およびイニシエーター配列を有する発現コントロール配列、および２０８６ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、すなわちプロモーター配列およびイニシエーター配列の３’側に位置するヌクレオチド配列を含む、２０８６ポリペプチドを発現することのできる、組換えＤＮＡクローニング媒体を提供する。さらなる側面において、上述のように組換えＤＮＡクローニング媒体および/または組換えＤＮＡ分子
を含む宿主細胞を提供する。適切な発現コントロール配列および宿主細胞/クローニング
媒体との組み合わせは、当該技術分野で良く知られており、例としてSambrook et al. (1989)に記載されている。
【０１２０】
本発明の所望の１つのポリペプチドを発現する、組換えＤＮＡクローニング媒体および/または宿主細胞を、対応する２０８６ポリヌクレオチドを含むプラスミドで、このよう
なクローニング媒体または宿主細胞を、形質転換、トランスフェクト、または感染させることによりいったん作製した後は、クローニング媒体または宿主細胞を、ポリペプチドを発現するような条件下で培養する。次にこのポリペプチドを、当業者に周知の技術により宿主細胞の成分を実質的に含まないように単離する。
【０１２１】
以下の実施例は本発明の好ましい態様を説明するためのものである。以下に示す実施例に開示された技術は、本発明を実践する上でうまく機能するように本発明者らにより今回開発された技術を説明するものであり、したがってその実践のための好ましい方法を構築するものと考えることができることを、当業者は理解すべきであろう。しかし当業者は本開示を考慮して、開示されている具体的な態様に多くの変更が可能であり、本発明の精神および範疇から離れずに同様のまたは類似の結果がなお得られることを、理解すべきであろう。
【実施例】
【０１２２】
実施例
実施例１
（異種の菌株に対して殺菌性抗体を産生することのできるナイセリア菌膜タンパク質抽出物の同定）
以下の表IIに示したように、ＬＯＳ除去した（LOS-depleted）外膜タンパク質調製物が殺菌性抗体を産生することが示された。これらの抗体はしばしば各菌株のＰｏｒＡへと方向付けられる。血清群Ｂ髄膜炎菌株８５２９（Ｂ：１５：Ｐ１．７ｂ，３）由来のＬＯＳを除去した外膜調製物は、意外なことに幾つかの異種菌株に対して殺菌性抗体を産生することから、この点において通常とは異なっている。
【０１２３】
【表２−１】
2010162023.tif 000003
【０１２４】
異種への殺菌性抗体の産生に関与する抗原（複数）の単離および特徴付けを促進するため、どの界面活性剤で最適ni
抗原（複数）抽出ができるかの同定を検討した。
【０１２５】
（菌株および培養条件）
凍結バイアルからの髄膜炎菌株８５２９をＧＣプレート上で画線培養した。（髄膜炎菌株８５２９はThe RIYM, Bilthoven, The Netherlandsより供与を受けた）。プレートを３６℃/５％ＣＯ２で７．５時間インキュベーションした。いくつかのコロニーを使用して
、修飾したFrantz培地＋ＧＣ補足成分  ５０ｍＬを含むフラスコに接種した。フラスコを３６℃でエアシェーカー(air shaker)中でインキュベーションし、２００ＲＰＭで４．５時間撹拌した。５ｍＬを使用して、修飾したFrantz培地＋ＧＣ補足成分 ４５０ｍＬを含
むFrenbachフラスコに接種した。このフラスコを３６℃でair shaker中でインキュベーションし、１００ＲＰＭで１１時間撹拌した。４５０ｍＬすべてを使用して、１０Ｌのファーメンター内の修飾したFrantz培地＋ＧＣ補足成分  ８．５Ｌ中に接種した。
【０１２６】
【表２−２】
2010162023.tif 000004
【０１２７】
発酵中、以下のようにパラメータのコントロールを行った：温度＝３６℃；ｐＨ＝７．４；溶解酸素濃度＝２０％。泡の発生をコントロールするためＰ−２０００消泡剤を数滴加えた。増殖が定常期に達するまで培養を行った。ＯＤ６５０＝５．２５で細胞を遠心して集めた。典型的には湿った細胞ペレット総計１００−３００グラムを〜８．５Ｌの培地から得た。
【０１２８】
（異種への殺菌性抗体を産生する髄膜炎菌由来の外膜タンパク質分画の部分的精製：）
細胞の湿重量１００グラムを懸濁し、１０ｍＭ  ＨＥＰＥＳ−ＮａＯＨ、ｐＨ７．４、１ｍＭ  Ｎａ２ＥＤＴＡにて湿重量の５倍量とし、〜１８，０００ｐｓｉで容器に取り付けた１１０Ｙマイクルフルイダイザー(microfluidizer)を通して溶菌させた。溶菌液を清澄にし、３００，０００×ｇ、１時間、１０℃で遠心して細胞のエンベロープを単離した。細胞のエンベロープホモジナイザーで懸濁させて同じバッファーで２回洗浄し、上記のように遠心した。次に細胞のエンベロープを１０ｍＭ  ＨＥＰＥＳ−ＮａＯＨ、ｐＨ７．４、１ｍＭ  ＭｇＣｌ２中の１％（ｗ/ｖ）TritonX-100溶液３２０ｍＬで抽出した。以下の表IIIに示したように、続いてのTritonX-100およびZwittergent 3-14を用いての異なる界面活性剤による抽出、およびその後のマウスの免疫感作の結果、Tritonが目的の候補物質を最適に抽出することを決定することができた。このTritonX-100抽出物は表IIIに列記した５種の菌株のうち４種に対して殺菌性抗体反応を示したため、次にBioRad Rotophor 
ユニットの分取用等電点電気泳動（ＩＥＦ）による分画を行った。両性電解質濃度は１％ｐＨ４−６を混合して１％ｐＨ３−１０とした。表IIIに示したように、いくつかの分画
が異種への殺菌性反応を示すことが発見された。ＩＥＦから得られた、５．５−７．８のｐＨ範囲に濃縮されている分画は、殺菌性のアッセイにより決定したところほとんどの菌株に対して異種への反応を示した。プールしたＩＥＦ分画を濃縮し、両性電解質をエタノール沈殿により除去した。陰イオン交換カラムで、約５．５−７．８のｐＨ範囲で得られたタンパク質の一部を吸着させ、吸着タンパク質と非吸着タンパク質によるマウスの免疫感作後に得られた殺菌活性を比較することによりさらに精製を行った。再び表IIに表したように、多くのタンパク質は陰イオン交換樹脂に吸着されたが、カラムに吸着されなかったタンパク質が異種へのより高い殺菌性抗体を産生した。
【０１２９】
【表３】
2010162023.tif 000005
【０１３０】
図１Ａに示したように、ＳＤＳ−ＰＡＧＥで決定したところ、非吸着分画に２つの主なタンパク質が存在していた。これらのタンパク質を同定するため、２種類の分析を行った。１つの分析として限定タンパク質分解（図１Ａおよび図１Ｂを参照のこと）の後、ペプチドの単離およびタンパク質の直接配列決定を行った。他の分析としてＳＤＳ−ＰＡＧＥの後、ゲル切り出し、タンパク質分解酵素による消化、およびＬＣ−ＭＳ/ＭＳ（液体ク
ロマトグラフィータンデム質量分析）を行い、（図３参照）目的の調製物の成分の質量分析の情報を得た。（本セクションで後述するペプチドマッピング法および配列決定法を参照のこと）
髄膜炎菌ＡのSangerゲノム配列を、Zagursky and Russell, 2001, BioTechniques, 31:
636-659に記載されている方法およびアルゴリズムを用いて分析した。この網羅的分析により、１２，０００以上のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）の可能性が得られた。上述の直接配列決定データおよび質量分析データの双方は、非吸着分画の主要成分が、Sangerのデータベースの分析に存在するいくつかのＯＲＦ産生物であることを示した。こ
の方法論により同定された３つの顕著なタンパク質は、ＯＲＦ４４３１、５１６３および２０８６に対応していた（図１Ｂおよび３を参照のこと）。
【０１３１】
ＯＲＦ４４３１は、分画中で同定された最も顕著なタンパク質であったが、組換え脂質化４４３１に対するマウスの抗体は殺菌性ではなく、動物モデルにおける防護的応答は提供しなかった。ＯＲＦ５１６３のさらなる分析は研究中である。
当実施例で述べた調製物の第２に顕著な成分はＯＲＦ２０８６の生成物に対応している。
【０１３２】
（免疫原性の方法：）
（抗血清の調製：）
記載がない限り、タンパク質組成物/ワクチンは総タンパク質２５μｇを含むように処
方し、２０μｇ  ＱＳ−２１をアジュバントとして加えた。６−８週齢のメスのSwiss-Websterマウスに０．２ｍＬの用量を皮下注（臀部）により第０週および４週に投与した。
血液を第０週および４週に採取し、最終的な全採血は第６週に行った。
【０１３３】
（殺菌性のアッセイ：）
殺菌性のアッセイは本質的には記載されているように（Mountzouros and Howell, 2000, J. Clin. Microbiol. 38(8): 2878-2884を参照のこと）行った。ＳＢＡに関する補体を介しての抗体依存性の殺菌性力価は、アッセイに導入した標的細胞の５０％以上を死滅させる検査血清の、最も高い希釈度の逆数として表した（ＢＣ５０力価）。
【０１３４】
（２０８６タンパク質の同定に使用する方法：）
（臭化シアン分解およびフラグメントの直接配列決定：）
陰イオン交換カラム非吸着分画（Anion Exchange Unadosoebed Fraction、ＡＥＵＦ）
の臭化シアン分解。ＡＥＵＦは９０％冷却エタノールで沈殿させ、７０％ギ酸中の１０ｍｇ/ｍＬ  臭化シアン溶液にて、タンパク質濃度１ｍｇ/ｍＬとなるように可溶化した。反応はオーバーナイト、室温、暗所で行った。切断した生成物を真空遠心で乾燥させ、ペレットをＨＥ/０．１％に低下したＴＸ−１００で可溶化した。ＳＤＳ−ＰＡＧＥに続いて
Ｎ末端アミノ酸配列決定を使用し、この分画の成分を同定した。
【０１３５】
（成分を同定するためのプロテアーゼ消化/逆相/Ｎ末端配列決定：）
ＡＥＵＦはＧｌｕＣ（Ｖ８）、ＬｓｙＣまたはＡｒｇＣのいずれかで消化した。酵素に対するタンパク質の比は、１μｇ酵素に対して３０μｇタンパク質とした。消化は３７℃、オーバーナイトで行った。消化したタンパク質混合物（３０μｇ）を７ミクロンAquapore ＲＦ−３００カラムにかけ、０．１％トリフルオロ酢酸中の１０−９５％アセトニト
リル溶液の濃度勾配で溶出し、ピークを手動で集めた。タンパク質を含まないブランクも流し、これから得られたピークをサンプルのクロマトグラムから差し引いた。サンプルのみから得られるピークを質量分析計で分析し、明確な質量の得られたサンプルをＮ末端アミノ酸配列決定で分析した。
【０１３６】
（Ｎ末端アミノ酸配列決定：）
ブロットから切り出したバンドについては、そのタンパク質サンプルをＳＤＳゲルからＰＶＤＦ膜に移し、アミドブラック（脱イオン水中に１０％酢酸、０．１％アミドブラック）で染色し、１０％酢酸で脱色した。そして所望のタンパク質のバンドを１０本のレーンすべてからメタノールで洗浄した外科用メスまたはミニExactoナイフで切り出し、Applied Biosystems 477A Protein Sequencer（タンパク質シーケンサ） の反応カートリッジに設置した。溶液中のサンプルを直接配列決定するため、Prosorb カートリッジを組み立て、ＰＶＤＦを６０μＬのメタノールで湿らせた。ＰＶＤＦを脱イオン水５０μＬですすいで、サンプル（５０μＬ）をＰＶＤＦにのせた。５０μＬの脱イオン水を用いてサンプ
ルをすすいだ後、ProsorbＰＶＤＦをパンチで切り出し、乾燥させ、Applied Biosystems 477Aタンパク質シーケンサの反応カートリッジにセットした。双方の方法について、Applied Biosystems Ｎ末端シーケンサを、１２またはそれ以上のサイクル（１サイクル  ブ
ランク、１サイクル  スタンダード、および１０またはそれ以上のサイクル  所望の残基の同定）の間、至適ブロット条件下で作動させ、Applied Biosystems  120A PTH AnalyzerでＰＴＨ−アミノ酸検出を行った。サイクルのデータはアナログのチャートレコーダー
でおよび装置のソフトウェアによりデジタルに、の双方で集めた。アミノ酸の割り当ては、分析計のＰＴＨ−アミノ酸のスタンダードのセットおよびそれらの各保持時間との比較により、アナログデータおよびデジタルデータを用いて行った（システイン残基は変換中に破壊されるため検出されない）。１つの残基から複数の配列情報が得られるため、割り当ての第１、第２の決定はシグナルの強度に基づいて行う。
【０１３７】
（ＬＣ−ＭＳ/ＭＳ）
ＩＥＦで精製したタンパク質サンプルをさらにＳＤＳポリアクリルアミドゲル電気泳動で分析した。タンパク質はクーマシーブルー染色で視覚化し、目的のバンドを手で切り出し、還元、アルキル化し、in situで自動化インゲルトリプシン消化ロボットを用いてト
リプシン（Promaga, Madison, WI）による消化を行った（１）。消化後、ペプチド抽出物を最終容量１０−２０μＬまで、Savant Speed Vac Concentrartor (ThermoQuest, Holebrook, NY)を用いて濃縮した。
【０１３８】
ペプチド抽出物を自動マイクロエレクトロスプレー逆相ＨＰＬＣで分析した。手短に言えば、マイクロエレクトロスプレー装置(interface)は長さ５０ｃｍ、直径７５μｍ、オ
リフィス直径８μｍのPicofritヒューズド(fused)シリカスプレーニードル（New Objective, Cambridge MA）に、１０μｍ  Ｃ１８逆相ビーズ（YMC, Wilmington, NC）を１０ｃ
ｍの長さまで詰めたものからなる。Picofritニードルは質量分析計の検出器の前に設置した手製のベースに固定したファイバーオプティックホルダー(fiber optic holder)(Melles Griot, Irvine, CA)に取り付けた。カラムの後方はチタンユニオンに通してエレクトロスプレー装置への電気的接触を提供するようにした。このユニオンは、ＨＰＬＣ溶媒ポンプ（ABI 140C, Perkin-Elmer, Norwalk, CT）に接続させたＦＡＭＯＳオートサンプラー
（LC-Padkings, San Francisco, CA）への一定の長さのヒューズドシリカキャピラリー（ＦＳＣ）のチューブに接続した。ＨＰＬＣ溶媒ポンプは５０μＬ/分の流量を提供するが
、マイクロタイトスプリッティングティー(microtight splitting tee)（Upchurch Scientific, Oak Harbor, WA）を用いて２５０ｎＬ/分にまで減量し、ＦＳＣトランスファーラインを用いてオートサンプラーまで送達させた。ＬＣポンプおよびオートサンプラーは各々インターナルユーザープログラムを用いてコントロールした。サンプルはプラスティック製のオートサンプラーバイアルに挿入し、シールし、５μＬのサンプルループを用いて注入した。
【０１３９】
（マイクロキャピラリーＨＰＬＣ質量分析計：）
インゲル消化から抽出されたペプチドを、マイクロエレクトロスプレーＨＰＬＣシステムにて５０分の０−５０％溶媒Ｂ（Ａ：０．１Ｍ  ＨｏＡｃ，Ｂ：９０％ＭｅＣＮ/０．
１Ｍ  ＨｏＡｃ）の濃度勾配により分離した。ペプチドの分析はFinnigan LCQ イオント
ラップ質量分析計（ThermoQuest, San Jose, CA）にてスプレー電圧１．５ｋＶで作動し
、キャピラリー温度を１５０℃に加熱して行った。データは本装置に提供されているデータ取得用ソフトウェアを用いて、自動ＭＳ/ＭＳモードで得た。取得法は１回のＭＳスキ
ャン（３７５−１２００ｍ/ｚ）の後、ＭＳスキャンで最も量の多い３イオンについての
ＭＳ/ＭＳスキャンを含んだ。dynamic exclusion機能およびisotope exclusion機能を用
いて、分析するペプチドイオン数を増加した（セッティング：３ａｍｕ＝exclusion width、３分＝exclusion duration、３０秒＝pre-exclusion duration、３０ａｍｕ＝isotope
exclusion width）。ＭＳ/ＭＳデータの自動分析は、髄膜炎菌（Sangerによる）の完全
なゲノムから導かれたタンパク質のデータベースを用いて、Finningen Bioworks データ
分析パッケージ（ThermoQuest, San Jose, CA）に組み込んだＳＥＱＵＥＳＴコンピュー
ターアルゴリズムを用いて行った。研究の結果を図３に示す。
【０１４０】
（実施例２）
（組換え脂質化Ｐ２０８６（ｒＬＰ２０８６）のクローニング：）
Ａ）天然のリーダー配列：
（材料物質：）
８５２９と命名されたサブグループＢ髄膜炎菌株の臨床的に単離されたものから、ＰＣＲによりＯＲＦ２０８６遺伝子を増幅した。この菌株の血清群、血清型および血清型サブタイプを括弧内に示す；８５２９（Ｂ：１５，Ｐ１：７ｂ，３）。この髄膜炎菌株はThe RIVM, Bilthoven, The Netherlandsより供与を受けた。髄膜炎菌株８５２９由来の成熟２０８６タンパク質の遺伝子配列は当明細書において配列番号２１２として提供する。
【０１４１】
（ＰＣＲ増幅およびクローニング法：）
ＯＲＦ２０８６を目で見たところ、この遺伝子がリポタンパク質シグナル配列の可能性を有することを示していた。所有の隠れマルコフモデル リポタンパク質（Hidden Markov
Model Lipoprotei）アルゴリズムを用いてのさらなる分析により、ＯＲＦ２０８６がリ
ポタンパク質のシグナル配列を含むことを確認した。より天然様のコンホメーションでＰ２０８６を組換え発現させるため、オリゴヌクレオチドプライマーはリポタンパク質シグナル配列をそのまま含む完全長の遺伝子を増幅するようにデザインし、髄膜炎菌Ａ  ＯＲＦ２０８６のSanger配列の分析に基づいた、すなわち（５’プライマー−ＣＴ  ＡＴＴ  ＣＴＧ  ＣＡＴ  ＡＴＧ  ＡＣＴ  ＡＧＧ  ＡＧＣおよび３’プライマー−ＧＣＧＣ  ＧＧＡＴＣＣ  ＴＴＡ  ＣＴＧ  ＣＴＴ  ＧＧＣ  ＧＧＣ  ＡＡＧ  ＡＣＣ）とし、これらを各々配列番号３０４（化合物番号４６２４）および配列番号３０３（化合物番号４６２３）とする（当明細書の表IV参照のこと）。２０８６遺伝子は、髄膜炎菌株８５２９よりポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）［ABI 2400 thermal cycler, Applied Biosystems, Foster City, CA］により増幅した。正しいサイズの増幅産物を結合し、ｐＣＲ２．１−ＴＯＰＯ（Invitrogen）中にクローニングした。プラスミドＤＮＡをＮｄｅＩおよびＢａｍＨＩにより制限消化し、ゲル精製し、ｐＥＴ−２７ｂ（＋）ベクター（Novagen）中に結合
させた。
【０１４２】
当明細書で述べたオリゴヌクレオチドプライマーは、PerSeptive Biosystems oligonucleotide synthesizer（オリゴヌクレオチド合成装置）、Applied Biosystems, Foster City CAで、β−シアノエチルホスホロアミダイト化学、Applied Biosystems, Foster City
CAを用いて合成した。ＯＲＦ２０８６遺伝子ファミリーのＰＣＲ増幅に用いたプライマ
ーを表IVに列記するが、これは本発明の非限定的なプライマーの例を示すものである。
【０１４３】
【表４】
2010162023.tif 000006
【０１４４】
（天然のリーダー配列を用いてのｒＬＰ２０８６リポタンパク質の発現：）
図５に示すように、プラスミドｐＰＸ７３４０をＢＬＲ（ＤＥ３）ｐＬｙｓＳ宿主細胞（Life Sciences）中に形質転換/トランスフェクトまたは感染させた。１つの形質転換体を選択し、２％グルコース、カナマイシン（３０μｇ/ｍＬ）、クロラムフェニコール（
３０μｇ/ｍＬ）、およびテトラサイクリン（１２μｇ/ｍＬ）を含む５０ｍＬ  Terrific
Brothに接種した。オーバーナイトの培養でＯＤ６００は６．０であった。オーバーナイト培養液を１％グリセロールおよび同じ抗生物質を含むTerrific Broth  １リットル中に希釈した。スタート時のＯＤ６００は０．４であった。２時間後ＯＤ６００は１．６になり、誘導前のサンプルを採取した。ＯＤ６００＝１に均等な細胞を遠心し、上清を除去し
た。全細胞のペレットを１５０μＬ  Ｔｒｉｓ−ＥＤＴＡバッファーおよび１５０μＬ  ２ｘＳＤＳ−ＰＡＧＥサンプルバッファーに再度懸濁した。ＩＰＴＧを最終濃度１ｍＭになるように加えた。３．５時間後上述のように誘導後のサンプルを採取し、ＳＤＳ−ＰＡＧＥで分析した（図４）。
【０１４５】
（ｒＬＰ２０８６の精製：）
ｒＬＰ２０８６を異なる界面活性剤の抽出により、大腸菌から可溶化した。天然の環境下のＰ２０８６とは異なり、ｒＬＰ２０８６はTriton X-100およびZwittergen 3-12では
顕著には可溶化されなかった。ｒＬＰ２０８６の塊はサルコシルにより可溶化され、このことは髄膜炎菌の状態とは異なる大腸菌の外膜成分との相互作用があることを示している。いったん可溶化したｒＬＰ２０８６は、混入する大腸菌タンパク質の多くを陰イオン交換樹脂にｐＨ８で吸着させることにより除去する方法で、天然のタンパク質と同様に精製することができる。ｒＬＰ２０８６の理論上のｐＩより１．５以上高いｐＨであるにもかかわらず、ｒＬＰ２０８６はｐＨ８では吸着されないままであった。さらなる精製は、陽イオン交換樹脂にｐＨ４．５でｒＬＰ２０８６を吸着させることにより達成した。
【０１４６】
ＳＤＳ−ＰＡＧＥ後のｒＬＰ２０８６の均質性を図２に示す。ｒＬＰ２０８６の質量は、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ質量分析により２７，８３６と決定された。この質量は理論上の質量２７，１００とは７３６異なり、この値から細菌のリポタンパク質に共通するＮ末端を修飾する脂質の質量を概算できる。天然のものおよびｒＬＰ２０８６の双方とも外膜リポタンパク質であると考えられる。Ｎ末端配列決定の試みは阻害され、このことは末端の修飾と一致する。
【０１４７】
（精製法：）
Ｐ２０８６を発現するＢＬＲ  ＤＥ３  ｐＬｙｓＳ細胞の凍結ペレットを１０ｍＭ  ＨＥＰＥＳ−ＮａＯＨ/１ｍＭ  ＥＤＴＡ/１μｇ/ｍＬ  Pefabloc SCプロテアーゼ阻害剤(Roche)ｐＨ７．４（ＨＥＰ）中に、２０ｍＬ/ｇ細胞湿重量で再懸濁し、マイクロフルイダイザー(Microfluidics Corporation Model 110Y)で溶菌した。細胞溶菌液を１５０，０００ｘ ｇで１時間遠心した。ペレットをＨＥＰで２回洗浄して２回遠心し、得えられた膜
のペレットをオーバーナイト凍結した。ペレットを１０ｍＭ  ＨＥＰＥＳ−ＮａＯＨ/１
ｍＭ  ＭｇＣｌ２/１％ＴＸ−１００  ｐＨ７．４で３０分間可溶化した後、１５０，０
００ｘ ｇで３時間遠心した。これを３回繰り返した。膜のペレットを５０ｍＭ  Ｔｒｉ
ｓ−ＨＣｌ/５ｍＭ  ＥＤＴＡ/１％  Zwittergent３−１２  ｐＨ８で上のように２回洗
浄した後、５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ/５ｍＭ  ＥＤＴＡ/１％  Zwittergent３−１４
ｐＨ８および５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ/５ｍＭ  ＥＤＴＡ/１％  Zwittergent３−
１４/０．５Ｍ  ＮａＣｌ  ｐＨ８の各溶液で２回洗浄した。
【０１４８】
次にｒＬＰ２０８６を５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ/５ｍＭ  ＥＤＴＡ/１％サルコシル
ｐＨ８で可溶化した。このサルコシル抽出物を１％  Zwittergent３−１４（Ｚ３−１
４）となるように調整し、３０倍量以上の５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ/５ｍＭ  ＥＤＴ
Ａ/１％ Ｚ３−１４で２回透析した。透析したｒＬＰ２０８６抽出物を９０％エタノールで沈殿させ、残っているサルコシルを除去し、５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ/５ｍＭ  Ｅ
ＤＴＡ/１％ Ｚ３−１４  ｐＨ８（ＴＥＺ）で可溶化した。不溶性物質を遠心して除去し、上清を陰イオン交換クロマトグラフィーカラムにかけ、結合しなかった分画中のｒＬＰ２０８６を集めた。次に結合しなかった物質を３０倍量以上の２５ｍＭ  ＮａＡｃ/１％
Ｚ３−１４  ｐＨ４．５で２回透析し、陽イオン交換クロマトグラフィーカラムにかけた。０−０．３Ｍ  ＮａＣｌの濃度勾配でｒＬＰ２０８６を溶出させ、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ（クーマシー染色）で分析した。ｒＬＰ２０８６のプールはレーザーデンシトメトリーにより８４％の純度であることが決定された。
【０１４９】
（ｒＬＰ２０８６サブファミリーＢに対する抗血清の表面の反応性および殺菌活性）
表VIIに示したように、サブファミリーＢ菌株８５２９由来の精製ｒＬＰ２０８６に対
する抗血清は、全細胞のＥＬＩＳＡにより、検査した１０種の２０８６サブファミリーＢ菌株すべてに対して表面の反応性を示した。殺菌活性は、異種の血清型サブタイプ抗原のＰｏｒＡを発現する２０８６サブファミリーＢ菌株の１０種の内の９種に対して検出された。これらの菌株は、西欧、アメリカ大陸、オーストラリアおよびニュージーランドを通しての血清群Ｂ髄膜炎菌性疾患の起因菌の代表的なものである。殺菌性アッセイで死滅しなかった唯一の菌株である８７０２２７は、全細胞のＥＬＩＳＡにより抗ｒＬＰ２０８６（サブファミリーＢ）血清と強く反応し、この菌株がＰ２０８６に共通のエピトープを含むタンパク質を発現することを示した。
【０１５０】
表VIIに列記した２０８６サブファミリーＡ菌株についても、全細胞のＥＬＩＳＡによ
り表面の反応性の検査を行った。これら３種の菌株のうち２種は、非常に低レベルの反応性を有しているようであるが、一部の２０８６サブファミリーＡ菌株はｒＬＰ２０８６サブファミリーＢに対して作製した抗体との交差反応性ない可能性があることを示した。８５２９菌株由来の２０８６サブファミリーＢの遺伝子を同定するために、使用したＰＣＲ増幅法を菌株８７０４４６、ＮＭＢおよび６５５７についても行った。２０８６サブファミリーＢのＰＣＲ増幅産物は検出されなかった。
【０１５１】
（免疫原性の方法：）
（抗血清の製造：）
先に実施例１で述べたようにワクチンを処方した。しかし１０μｇの用量を使用した。
【０１５２】
（全細胞の酵素結合免疫吸着検定法（ＥＬＩＳＡ）：）
髄膜炎菌の全細胞の懸濁液を、滅菌した０．０１Ｍリン酸塩、０．１３７Ｍ  ＮａＣｌ，０．００２Ｍ  ＫＣｌ（ＰＢＳ）中に、６２０ｎｍでの光学密度０．１まで希釈した。この懸濁液から０．１ｍＬずつ、Nunc BacＴ９６ウェルプレート（カタログ番号２−６９６２０）の各ウェルに加えた。細胞を、プレート上で室温で３日間乾燥させた後、カバーしてひっくり返し、４℃で保存した。プレートを洗浄バッファー（０．０１Ｍ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、０．１３９Ｍ  ＮａＣｌ/ＫＣｌ、０．１％ ドデシルポリ（オキシエチレレングリコールエーテル(oxyethlereneglycolether)）n  ｎ＝２３ (Brij-35 （登録商標）ICI Americas, Inc., Wilmington, Delawareより入手可能)、ｐＨ  ７．０−７．４）で３
回洗浄した。抗血清の希釈は、ＰＢＳ、０．０５％ Tween−２０/Azide中で調製し、０．１ｍＬをコートしたプレートに移した。プレートは３７℃で２時間インキュベーションした。プレートを洗浄バッファーで３回洗浄した。抗マウス−ヤギＩｇＧ  ＡＰ（Southern
Biotech）をＰＢＳ/０．０５％Tween−２０で１：１５００に希釈し、０．１ｍＬを各ウェルに加え、プレートを３７℃で２時間インキュベーションした。プレートを（上記のように）洗浄した。基質溶液は、１Ｍ  ジエタノールアミン/０．５ｍＭ  ＭｇＣｌ２中に
ｐ−ニトロフェニルホスフェート（Sigma）を希釈して１ｍｇ/ｍＬに調製した。基質を１ウェル当たり０．１ｍＬずつプレートに加え、室温で１時間インキュベーションした。反応は３Ｎ  ＮａＯＨを５０μＬ/ウェル加えることにより停止し、６９０ｎｍを参照とし
て４０５ｎｍで測定した。
【０１５３】
Ｂ．）Ｐ４リーダー配列：
（ＰＣＲ増幅およびクローニング法：）
ｒＬＰ２０８６の発現を最適化するため、分類不可能なインフルエンザ菌のＰ４シグナル配列の後部に２０８６遺伝子をクローニングした（Green et al., 1991）。リポタンパク質のクローニングに使用したプライマーを表IVに列記し、化合物番号：５６５８、５６６０、６４７３、６５４３および６３８５により識別する。ＯＲＦ２０８６を髄膜炎菌Ｂ株８５２９より、以下の化合物番号５６５８および５６６０のプライマーを用いて増幅し
た。ＯＲＦ２０８６を髄膜炎菌サブグループＢ株ＣＤＣ１５７３より、以下の化合物番号６３８５および５６６０のプライマーを用いて増幅した。ＯＲＦ２０８６を髄膜炎菌サブグループＢ株２９９６より、以下の化合物番号６４７３および６５４３のプライマーを用いて増幅した。Ｎ末端（５’）プライマーは２０８６遺伝子の成熟領域と同一となるようにデザインした（システインのすぐ下流の３番目のアミノ酸がセリン残基で始まる）。制限部位ＢａｍＨＩ（ＧＧＡＴＴＣ）を各Ｎ末端のプライマーの５’末端に組み込み、２番目のアミノ酸に成熟タンパク質のグリシン残基が挿入されるようにした。Ｃ末端（３’）プライマーは、２０８６遺伝子のＣ末端と相同になるようにデザインし、終止コドンならびにクローニングの目的のためのＳｐｈＩ部位を含めた。各髄膜炎菌Ｂ株から増幅したフラグメントを中間体のベクターにクローニングし、配列分析でスクリーニングした。
【０１５４】
正しいクローンからのプラスミドＤＮＡをＢａｍＨＩおよびＳｐｈＩ制限酵素（New England Biolabs, (NEB)）で消化した。ｐＬＰ３３９と命名されたベクター（出願人の譲受人により提供された）を発現ベクターとして選択した。このベクターは、ｐＢＡＤ１８−Ｃｍ主鎖（Beckwith et al., 1995）を利用し、分類不可能なインフルエンザ菌のＰ４リ
ポタンパク質シグナル配列およびＰ４遺伝子を含む（Green et al., 1991）。ｐＬＰ３３９ベクターを部分的に制限酵素ＢａｍＨＩで消化し、次にＳｐｈＩで消化した。増幅した２０８６フラグメント（ＢａｍＨＩ/ＳｐｈＩ）を各々別々にｐＬＰ３３９ベクター（部
分的なＢａｍＨＩ/ＳｐｈＩ）中に結合した。このクローニング法では、Ｐ４リポタンパ
ク質シグナル配列の後ろに成熟２０８６遺伝子を設置する。ＢａｍＨＩ部位は、Ｐ４シグナル配列および２０８６遺伝子の間のクローニング接合部に残る（図７に示したプラスミドコンストラクトを参照のこと）。以下にＢａｍＨＩクローニング接合部の配列の一例を示す：
［Ｐ４シグナル配列］−ＴＧＴ  ＧＧＡ  ＴＣＣ−［残りの２０８６成熟核酸配列］
［Ｐ４シグナル配列］−Ｃｙｓ  Ｇｌｙ  Ｓｅｒ−［残りの２０８６成熟アミノ酸配列］
図７に示したように増幅した各フラグメントを、Ｐ４リーダー配列を含む修飾したｐＢＡＤ１８−Ｃｍベクター内にクローニングした。ｒＰ４ＬＰ２０８６（組換えＰ４脂質化２０８６）を発現する組換え大腸菌ＢＬＲｐＰＸ７３４３で発酵を行い、さらにグルコースを添加して細胞密度の増加を試みた。ファーメンターは、Sambrookによる１％グルコースを補った完全なＭ９Minimal培地  １０Ｌで満たした。
【０１５５】
ファーメンター中の最初のグルコース濃度は４５ｇ/Ｌとした。ファーメンターに最初
のＯＤが〜０．２５となるように接種した。〜ＯＤ  ２５でさらに２０ｇ/Ｌのグルコー
スを追加した。グルコースが枯渇したＯＤ  ６３．４の時点で１％  アラビノースで培養を誘導した。誘導後も３時間まで発酵を継続した。誘導後ｔ＝０、１、２、３でサンプルを採取し、ＢＳＡにてタンパク質を定量した。ｔ＝３で、タンパク質収量は〜３．５ｇ/
Ｌそして総細胞タンパク質の７％であった。湿った細胞ペースト総計８９５グラムを〜１０Ｌの培養液から得た。
ｒＰ４ＬＰ２０８６の精製は先の実施例２、セクションＡで述べたものと同じ方法で行った。
【０１５６】
（実施例３）
（非脂質化成熟２０８６タンパク質の発展的遺伝子情報：）
２０８６タンパク質の免疫原性をさらに評価するため、Ｐ２０８６の非脂質化型のクローニングおよび発現を行った。
【０１５７】
（ＯＲＦ２０８６のＰＣＲによる遺伝子増幅：）
非脂質化２０８６遺伝子のＰＣＲ増幅に使用したオリゴヌクレオチドを表IVのプライマー表に列記する。菌株８５２９由来の２０８６遺伝子は、表に示す化合物番号５１３５お
よび６４０６（それぞれ、配列番号３０８および３１２）で識別されるプライマーで増幅することができる。菌株ＣＤＣ１５７３由来の２０８６遺伝子は、化合物番号５１３５および６４７４（それぞれ、配列番号３０８および３１６）で識別されるプライマーで増幅することができる。菌株２９９６由来の２０８６遺伝子は、化合物番号６４０６および６６０５（それぞれ、配列番号３１２および３２０）で識別されるプライマーで増幅することができる。
【０１５８】
これらのプライマーの特徴として、各プライマー中に合成ＢｇｌＩＩ制限部位、化合物番号６４０６および６４７４中の合成ＮｄｅＩ制限部位、および化合物番号５１３５および６６０５において３つのリーディングフレームすべてに終止コドンが存在する、を含む。プライマー番号６４０６および６４７４は、１つのＡＴＧ（Ｍｅｔ）が第２のアミノ終止コドン（ＡＣＧ）に融合して成熟２０８６ポリペプチドの１つのアミノ酸の置換（ＴＧＣ  Ｃｙｓに置き換わる）を表す配列を含む、２０８６遺伝子を増幅する。
【０１５９】
ＰＣＲクローニングベクターはＴＯＰＯ−ＰＣＲ２．１、Invitrogen, Valencia, CAとした。
非脂質化２０８６タンパク質の発現に使用するベクターは、Novagen, Madison, WIのｐＥＴ９ａとした。
【０１６０】
大腸菌クローニング株はＴｏｐ１０、Invitrogen, Carlsbad, CAとした。
大腸菌発現株はＢＬＲ（ＤＥ３）ｐＬｙｓＳ、Novagen, Madison, WIとした。
クローニングを目的とする培地はSambrookらによるグリセロールを１％滅菌グルコースに置き換え、適当な抗生物質（アンピシリンまたはカナマイシン）を加えたTerrific Broth 液または寒天培地とした。  
プラスミドの精製はQiagen Spin Miniprep Kit(Valencia, CA)で行った。
【０１６１】
（非脂質化２０８６発現のための産生用菌株または細胞株の調製：）
２０８６遺伝子は髄膜炎菌株８５２９由来の染色体ＤＮＡからポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）［AmpliTaq and ABI 2400 thermal cycler, Applied Biosystems, Foster City,
CA］により増幅した。各反応において化合物番号６４７４および５１３５（それぞれ、
配列番号３１６および３０８）により識別される２つのオリゴヌクレオチドを、２０８６遺伝子のＰＣＲの増幅に用いた。増幅された２０８６ＰＣＲ産物を、直接ＴＯＰＯ−ＰＣＲ２．１クローニングベクター中にクローニングし、１００μｇ/ｍｌアンピシリンおよ
び２０μｇ/ｍｌ  Ｘ−Ｇａｌを補ったTerrific Broth寒天培地上で選択した。白色コロ
ニーを選択し、培養した。プラスミドＤＮＡはQiagen miniprep kitを用いて調製し、Ｐ
ＣＲのフラグメントが挿入されているかどうかプラスミドをスクリーニングした。ＰＣＲ産物が挿入されたプラスミドのＤＮＡ配列決定を行った（ＡＢＩ３７７シーケンサにてBig Dye化学使用、Applied Biosystems, Foster City, CA）。
【０１６２】
正しいＤＮＡ配列を示すプラスミドをＢｇｌＩＩ制限酵素で消化し、ＢｇｌＩＩフラグメントをGeneClean II 精製キット（Bio101, Carlsbad, CA）を用いてゲル精製した。精
製されたＢｇｌＩＩフラグメントを発現ベクターｐＥＴ９ａのＢａｍＨＩ部位にクローニングした。ｐＥＴ９ａ/２０８６クローンを、３０μｇ/ｍｌカナマイシンを補ったTerrific Brothプレート上で選択した。カナマイシン耐性クローンを培養し、ミニプレップ プ
ラスミドＤＮＡを調製した。ＢａｍＨＩ部位での２０８６遺伝子の配向が適当かどうかついて、プラスミドをスクリーニングした。正しく配向されたプラスミドは２０８６遺伝子のアミノ末端へのＴ７抗原の融合を呈示する（ｒＰ２０８６Ｔ７）。これらのｒＰ２０８６Ｔ７遺伝子融合物をＢＬＲ（ＤＥ３）ｐＬｙｓＳに形質転換し、Terrific Broth/Kan 
プレート上で選択し、Terrific Broth中で培養し、１ｍＭ  ＩＰＴＧ（イソプロピル β
−Ｄ−チオガラクトピラノシド）でｒＰ２０８６Ｔ７融合タンパク質の発現を誘導した。
ｒＰ２０８６Ｔ７融合タンパク質は高レベルで発現された。
【０１６３】
次にこれらの融合プラスミドをＮｄｅＩ制限酵素により消化した。この酵素はＴ７抗原を欠失させ、成熟２０８６遺伝子をベクターにより提供されるＡＴＧ開始部位に直接結合する。これらのＮｄｅＩによる欠失プラスミドをＴｏｐ１０細胞内に形質転換し、Terrific Broth/Kan プレート上で選択した。候補のクローンを培養し、ミニプレップ プラスミドＤＮＡを調製した。プラスミドＤＮＡのＤＮＡ配列決定を行い、欠失および２０８６遺伝子配列が組み込まれたことを確認した。これらのプラスミドをｐＰＸ７３２８と命名したプラスミドマップに表した（図６）。正しいＤＮＡ配列を呈示するプラスミドをＢＬＲ（ＤＥ３）ｐＬｙｓＳ中に形質転換し、Terrific Broth/Kan プレート上で選択し、、Terrific Broth中で培養し、ＩＰＴＧにて２０８６タンパク質の発現を誘導した。ｐＥＴ９
ａベクターは、Ｔ７−タグを除去した場合に、菌株ＢＬＲ（ＤＥ３）ｐＬｙｓＳ内で成熟２０８６タンパク質を発現できなかった。
【０１６４】
（非脂質化２０８６タンパク質の産生：）
精製プラスミドＤＮＡを用いて、発現株ＢＬＲ（ＤＥ３）ｐＬｙｓＳを形質転換した。プラスミドを保有するＢＬＲ（ＤＥ３）ｐＬｙｓＳ細胞はカナマイシン耐性であり、１ｍＭ  ＩＰＴＧの添加により高レベルのＰｏｒＡタンパク質の高レベルの発現を誘導することができる。ｒＰ２０８６Ｔ７融合タンパク質は大腸菌細胞株ＢＬＲ（ＤＥ３）ｐＬｙｓＳ中で、総タンパク質の〜４０％で不溶性の封入体として発現させることができる。この精製融合タンパク質を用いてマウスを免疫感作し、異種の髄膜炎菌株に対して顕著なレベルの殺菌性抗体を産生した（表V参照のこと）。
【０１６５】
（２０８６非脂質化遺伝子突然変異誘発：）
ＰＣＲプライマーの突然変異誘発を２０８６遺伝子の５’末端で行った。成熟ｒＰ２０８６Ｔ７の高発現レベルを示しながらＴ７タグを除去できるかどうかを決定するため、発現の研究を進めている。
【０１６６】
（非脂質化ｒＰ２０８６Ｔ７の精製：）
非脂質化ｒＰ２０８６Ｔ７を発現する大腸菌ＢＬＲ（ＤＥ３）ｐＬｙｓＳ細胞を、１０ｍＭ  Ｈｅｐｅｓ−ＮａＯＨ/５ｍＭ  ＥＤＴＡ/１ｍＭ  Pefabloc SC  ｐＨ７．４中で
マイクロフルイダイザーにより溶菌した。次に溶菌液を１８，０００ｘ ｇで３０分間遠
心した。封入体ペレットを５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ/５ｍＭ  ＥＤＴＡ/１％  Triton
Ｘ−１００  ｐＨ８で３回洗浄し、その度に２４，０００ｘ ｇで３０分間遠心した。次に封入体ペレットを５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ/５ｍＭ  ＥＤＴＡ/１％  Zwittergent
３−１４  ｐＨ８で２回洗浄し、その度に２４，０００ｘ ｇで１５分間遠心した。封入
体ペレットを次に５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ/５ｍＭ  ＥＤＴＡ/４Ｍ  尿素  ｐＨ８で２時間可溶化した後、遠心して不溶物質を除去した。上清（可溶化したｒＰ２０８６Ｔ７）サンプルを４等分した。ストック溶液を用いて、１つのサンプルは５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ/５ｍＭ  ＥＤＴＡ/２５０ｍＭ  ＮａＣｌ/２Ｍ  尿素  ｐＨ８（界面活性剤な
し）に調整し、１つは５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ/５ｍＭ  ＥＤＴＡ/２５０ｍＭ  ＮａＣｌ/２Ｍ  尿素/１％  水素化Triton Ｘ−１００  ｐＨ８(ＴＸ−１００)に調整し、１
つは５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ/５ｍＭ  ＥＤＴＡ/２５０ｍＭ  ＮａＣｌ/２Ｍ  尿素/１％  Zwittergent３−１２  ｐＨ８（Ｚ３−１２）に調整し、そして１つは５０ｍＭ  
Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ/５ｍＭ  ＥＤＴＡ/２５０ｍＭ  ＮａＣｌ/２Ｍ  尿素/１％  Zwittergent３−１４  ｐＨ８（Ｚ３−１４）に調整した。尿素を除去するため、サンプルを尿素
を含まない各々のバッファーに対して、完全に平衡になるまで透析した。次にサンプルを尿素を含まない、６０ｍＭ  ＮａＣｌの各バッファーに対して完全に平衡になるまで透析し、ＮａＣｌ濃度を下げた。２，０００ｘ ｇで１５分間遠心して不溶物質を除去し、得
られた上清（リフォールディングしたｒＰ２０８６Ｔ７）をさらなる実験に用いた。ｒＰ
２０８６Ｔ７の均一性は、クーマシー染色のＳＤＳ−ＰＡＧＥおよびレーザーデンシトメトリーを用いて決定したところ、９１−９５％であった。
【０１６７】
免疫原性の方法−実施例２で述べたとおり
この精製融合タンパク質を用いてマウスを免疫感作し、異種の髄膜炎菌株に対して著明なレベルの殺菌性抗体を作製した（以下の表V参照のこと）：
【０１６８】
【表５】
2010162023.tif 000007
【０１６９】
（実施例４）
（ＯＲＦ２０８６のキメラクローンの開発）
菌株ＣＤＣ−１５７３由来の２０８６遺伝子のＮ末端領域は、菌株８５２９および２９９６由来の２０８６遺伝子には存在しない繰り返し部分を含む（図８参照のこと）。この繰り返し部分が大腸菌に基づいた２つの発現系（ｐＥＴおよびｐＢＡＤ）からの組換え２０８６タンパク質の発現レベルの増加に関与していると思われる。ＣＤＣ−１５７３  ２０８６遺伝子からの組換えタンパク質発現レベルは、ｐＥＴおよびｐＢＡＤ発現系において、同じ発現系を用いた菌株８５２９および２９９６による２０８６遺伝子からの組換え発現レベルに比して、顕著に高かった。３つすべての菌株由来の２０８６遺伝子のＮ末端領域は、この繰り返し部分を除いて比較的相同である。したがって、菌株８５２９および２９９６由来の２０８６遺伝子に、菌株ＣＤＣ−１５７３のＮ末端を融合させることにより、これらの遺伝子から発現される組換え２０８６タンパク質の発現レベルが、ｐＥＴおよびｐＢＡＤ発現系を用いた場合に増加する、と仮定するのは妥当である。
【０１７０】
（材料および方法：）
菌株８５２９および２９９６由来の染色体ＤＮＡを精製し、キメラ２０８６遺伝子のＰＣＲ増幅の鋳型として使用した。化合物番号６７２１および５１３５（それぞれ、配列番号３２１および３０８）のＰＣＲプライマーを用いて、菌株８５２９由来のキメラ２０８６遺伝子を増幅し、化合物番号６７２１および６６０５（それぞれ、配列番号３２１および３２０）のＰＣＲプライマーを用いて、菌株２９９６由来のキメラ２０８６遺伝子を増幅した。ＰＣＲ産物をInvitrogenのＰＣＲ２．１  ＴＯＰＯベクター内に直接クローニングし、ＤＮＡ配列分析によりスクリーニングし、完全なキメラ２０８６遺伝子であることを同定した。この遺伝子を次にＢｇｌＩＩによりＰＣＲ２．１ベクターから切り出し、ＢｇｌＩＩフラグメントをｐＥＴ９ａプラスミドのＢａｍＨＩ部位に挿入した。プラスミド挿入物を適当な配向かどうかスクリーニングした後、ＮｄｅＩの消化を行った。直線状のＮｄｅＩフラグメントは自ら結合して、ｐＥＴ９ａベクターから寄与されたＴ７タグ配列を含む小さなＮｄｅＩフラグメントの欠失を達成する。この欠失によりキメラ２０８６遺伝子の５’末端にＴ７プロモーターが直接結合することになる。ＮｄｅＩにより欠失させたプラスミドを大腸菌株ＢＬ２１（ＤＥ３）内に形質転換し、ＩＰＴＧの誘導によりキメラ２０８６タンパク質を発現しているかどうか、カナマイシン耐性コロニーをスクリーニ
ングした。
【０１７１】
最初の研究は、ｐＥＴ９ａ系で発現させた場合、菌株２９９６由来のキメラ２０８６遺伝子は、天然の２９９６/２０８６遺伝子に比して約２倍の組換えタンパク質を発現する
ことを示している。ｐＢＡＤ系についてはまだ検査していない。
【０１７２】
わずか１回の実験を行ったに過ぎないが、キメラ２０８６遺伝子の有用性が高いことをデータは示している。ＣＤＣ−１５７３Ｎ末端を、菌株８５２９および２９９６由来の２０８６遺伝子に融合することで、組換え２０８６タンパク質の発現の増大を提供することができる。
【０１７３】
（実施例５）
（髄膜炎菌株の２０８６ＰＣＲスクリーニング：）
臨床的に単離された菌株中での２０８６遺伝子の保存性を決定するため、８８種の髄膜炎菌株についてＰＣＲ増幅を行った。
【０１７４】
ＯＲＦ２０８６の最初のＰＣＲの同定は、化合物番号：４６２３、４６２４および４６２５（それぞれ、配列番号３０３、３０４および３０５）で識別される表IVに列記したプライマーを利用した（上記の実施例２参照のこと）。これらのプライマーはSangerの髄膜炎菌血清群Ａの配列に基づいてデザインされたものである。多数の菌株のスクリーニングを促進するため、２０８６遺伝子について内側のプライマーをデザインした。総計８８種の髄膜炎菌株を、化合物番号５００５および５００７（配列番号３０６および３０７）で識別される新たにデザインした内側の２０８６プライマーを用いて、ＰＣＲによるスクリーニングを行った。これらのプライマーにより、８８種の髄膜炎菌株のうちの６３種（〜７０％）から２０８６遺伝子を同定することができた（表VI−Ａ参照のこと）。
【０１７５】
Sangerの髄膜炎菌血清群Ａの配列およびＴＩＧＲの髄膜炎菌血清群Ｂの配列について、２０８６遺伝子周囲の拡大領域を調べ、整列した。プライマーは、２０８６遺伝子の上流領域および下流領域に対応するようにデザインした。この目的は、これらのプライマーを使用して、配列比較のための様々な髄膜炎菌由来の２０８６遺伝子の完全長以上の長さを増幅することであった。化合物番号６４７０および６４７２（それぞれ、配列番号：３１３および３１４）を用いての１つの菌株（６５５７）のＰＣＲ増幅では、産物は低収量であった。菌株６５５７の増幅産物をクローニングし、プラスミドＤＮＡの配列分析を行った。結果は、これまでに認められていたものより配列可変性の大きい新しいタイプの２０８６遺伝子であることを示した。菌株６５５７由来の２０８６遺伝子は、配列決定された他の菌株とアミノ酸レベルで〜７５％同一であった。興味深いことに菌株６５５７は、以前に上述の２０８６のＰＣＲスクリーニングによりネガティブと評価された３０％の菌株の１つであった。
【０１７６】
菌株６５５７中のＣ末端可変領域に特異的な内側のプライマーをデザインした。これらのプライマーを用いて、以前に２０８６ＰＣＲスクリーニングでネガティブと評価された〜３０％の菌株の、より可変性の高い２０８６遺伝子のスクリーニングを行った。入手可能なすべての髄膜炎菌株（ｎ＝８８）について、これらの新たに同定された内側の２０８６プライマー（化合物番号６４９５および６４９６により識別される；それぞれ、配列番号１５９および１６０）を用いてＰＣＲによりスクリーニングを行った。以前に２０８６のＰＣＲでネガティブと評価された〜３０％の菌株のみが、今回のスクリーニングではＰＣＲポジティブであった。以前にＰＣＲネガティブ（〜３０％）であった菌株から増幅された遺伝子の一群は２０８６遺伝子の新しいタイプまたは２０８６遺伝子の第２ファミリーと表すべきであり、当明細書では２０８６サブファミリーＡと命名した。８５２９由来のプライマーにより菌株の〜７０％から増幅された２０８６遺伝子の群を、当明細書では
サブファミリーＢと命名した。
【０１７７】
２０８６遺伝子のサブファミリーＡを、非限定的に配列番号１−１７３の奇数番号で例示する。２０８６遺伝子のサブファミリーＢを、非限定的に配列番号１７５−２５１の奇数番号で例示する。
【０１７８】
ＰＣＲ増幅の研究に使用した髄膜炎菌株は以下の表、表VI−Ａおよび表VI−Ｂから選択した。表に列記した菌株を髄膜炎菌株の例として非限定的に提供する。表VI−Ａに列記した菌株を２０８６タンパク質サブファミリーＡと分類し、表VI−Ｂに列記した菌株を２０８６タンパク質サブファミリーＢと分類する。各表に列記された菌株を血清型により分類する。表に示したように、菌株は以下の４箇所から入手できる：MPHL-Manchester Public
Health Laboratory, Manchester, UK; RIVM, Bilthoven, the Netherlands; University
of Iowa, College of Medicine, Department of Microbiology, Iowa City, IA; およびWalter Reed Army Institute of Research, Washington, D.C.。
【０１７９】
【表６−１】
2010162023.tif 000008
【０１８０】
【表６−２】
2010162023.tif 000009
【０１８１】
【表６−３】
2010162023.tif 000010
【０１８２】
他の菌株も感染した患者から単離して容易に入手することができる。
【０１８３】
（実施例６）
（髄膜炎菌株に対するｒＬＰ２０８６抗血清の反応性）
以下の表、表VIIは、上述のｒＬＰ２０８６の交差反応性および交差防護能(cross protection capacity)を示す。表に示したように、ｒＬＰ２０８６を全細胞ＥＬＩＳＡ（ＷＣＥ）力価、殺菌性のアッセイ（ＢＣＡ）および新生仔ラット（ＩＲ）アッセイを含む様々な技術を用いて、処理および分析を行い、２０８６タンパク質に対して作製されたポリクローナル抗体の細菌細胞表面の活性を決定した。
【０１８４】
【表７】
2010162023.tif 000011
【０１８５】
（実施例７）
ＯＲＦ２０８６タンパク質を発現する様々なコンストラクトを調製した。以下の表、表VIIIは本発明の実施例を示し、実施を説明する目的で非限定的に提供するｒ２０８６コンストラクトの表である。
【０１８６】
【表８】
2010162023.tif 000012
【０１８７】
（実施例８）
ＬＯＳを除去した外膜タンパク質を用いてのさらなる研究により、異種の血清型サブタイプを発現する菌株に対する殺菌性抗体を産生することのできる、ＰｏｒＡ以外の外膜タンパク質（複数）を生成するさらなる菌株を同定した。以下に、髄膜炎菌の免疫原性組成物に必要なタンパク質の数を減らすことのできる、本発明の１つの態様による付加的なタンパク質、そして具体的には外膜のリポタンパク質を同定するためのさらなる研究について述べる。これらのさらなる研究は、先の実施例に記述した研究を補足するものである。
【０１８８】
細胞成分分画、異なる界面活性剤による抽出、等電点電気泳動およびイオン交換クロマトグラフィーを、複数の菌株に対する免疫感作および殺菌性のアッセイと共に使用して、目的のタンパク質の小さな群を同定した。主要成分の直接配列決定は、Ｎ末端がブロックされていることを示した。化学的分解およびタンパク質分解酵素による消化から得られたポリペプチドの直接配列決定により、内側のタンパク質の配列が得られた。Ａ群髄膜炎菌株のゲノム配列は、Sangerセンターよりダウンロードし、探索可能なデータベースを作成するため当方のバイオインフォマティクスグループが現在あるおよび私有のアルゴリズムを用いて分析した。ペプチド配列データは、ＯＲＦ２０８６が目的のものであることを示した。このＯＲＦに基づいたプライマーを使用して、菌株８５２９からのＰ２０８６遺伝子のＰＣＲを行った。遺伝子配列の分析、Ｎ末端がブロックされているという事実、およびその細胞下の位置から、Ｐ２０８６が脂質化された外膜タンパク質（ＬＰ２０８６）であることが示された。ｒＬＰ２０８６−８５２９および他の髄膜炎菌株からのバリアントを、インフルエンザ菌Ｐ４シグナル配列を用いて大腸菌内でリポタンパク質として組換え発現させた。これらの組換えタンパク質を、異なる界面活性剤の抽出により大腸菌膜から単離し、イオン交換クロマトグラフィーを用いて精製し、マウスの免疫感作に使用した。抗ＬＰ２０８６−マウス血清は、髄膜炎菌のいくつかの異なる血清型サブタイプの菌株に対して殺菌活性を促進することができた。多くの髄膜炎菌株からＰ２０８６遺伝子のさらなる分析は、これらの配列がサブファミリーＡおよびサブファミリーＢと命名した２つの群に分類されることを示した。（図１２参照のこと）サブファミリーＢタンパク質に対して作製された抗血清は、サブファミリーＢタンパク質を発現する９つの菌株に対して、およびサブファミリーＡタンパク質を発現する１つの菌株に対して殺菌性を示した。サブフ
ァミリーＡの抗血清は複数のサブファミリーＡ菌株に対して殺菌性を示した。１つのｒＰｏｒＡおよび１つのｒＬＰ２０８６の混合物は、いずれかのタンパク質だけで誘導される範囲を超えてワクチンの適用範囲を拡大する、補足的な抗体を産生した。
【０１８９】
これらの観察より以下の結論が導かれる。ｒＬＰ２０８６抗原は、異種のＰｏｒＡおよび異種のＰ２０８６タンパク質を発現する髄膜炎菌株に対して殺菌性抗体を産生することができる。抗原のＰ２０８６ファミリーは、単独でまたは他のナイセリア属の抗原と組み合わせて、有用なワクチンとなるまたは免疫原性を有することができる。
【０１９０】
以下に前述の研究を詳細に述べる。可溶性外膜タンパク質（ｓＯＭＰ）の複合混合物が、異種のＰｏｒＡタンパク質を発現する菌株に対して、ＰｏｒＡ非依存性の殺菌性抗体を産生することが発見された。異なる界面活性剤による抽出処理、等電点電気泳動およびイオン交換クロマトグラフィー、その後のマウスの免疫感作を用いて、免疫学的活性成分を追跡した。
【０１９１】
各ステップで、髄膜炎菌性疾患の世界的な疫学の典型である血清型サブタイプの抗原を含むいくつかの菌株に対する、細胞表面の反応性および殺菌活性について、血清のアッセイを行った。
【０１９２】
分離および免疫感作のこの過程を用いて、Ｂ群髄膜炎菌に関する新たな交差反応性免疫原性候補物質を同定した。
ＰｏｒＡ欠損株の作製−ｐｏｒＡ染色体遺伝子座を菌株２９９６からプラスミドｐＰＸ７０１６中にクローニングした。プラスミド内でｐｏｒＡプロモーター、Ｓ/Ｄボックス
および最初の３８Ｎ末端コドンを欠失させ、それ自体が含有するＫａｎＲ発現カセットで置き換えた。このプラスミドを制限酵素で直鎖化し、血清型サブタイプ菌株ＰＩ：５，２；ＰＩ：９；ＰＩ：７，１６；ＰＩ：１５；ＰＩ：４；ＰＩ：３およびＰＩ：１０中に自然に形質転換させた。カナマイシン耐性形質転換体を選択し、ＥＬＩＳＡにおいて血清型サブタイプ特異的モノクローナルによりＰｏｒＡ欠損についてスクリーニングした。
【０１９３】
殺菌活性のアッセイ：Mountzourous, K.T. and Howell, A.P. Detection of Complement-Mediated Antibody-Dependent Bactericidal Activity in a Flourescence-Based Serum Bactericidal Assay for Group B Neisseria meningitides（グループＢ髄膜炎菌に関
する蛍光標識を基本とする血清の殺菌性のアッセイにおける、補体を介した酵素依存的殺菌活性の検出）. J Clin Microbiol. 2000; 38: 2878-2884を参照のこと。
【０１９４】
全細胞の酵素結合免疫吸着検定法（ＥＬＩＳＡ）：髄膜炎菌の全細胞の懸濁液を、滅菌０．０１Ｍリン酸塩、０．１３７Ｍ  ＮａＣｌ，０．００２Ｍ  ＫＣｌ（ＰＢＳ）中に、６２０ｎｍにおける０．１の光学密度まで希釈した。この懸濁液から０．１ｍＬずつ、Nunc Bac Ｔ９６ウェルプレート（カタログ番号２−６９６２０）の各ウェルに加えた。細
胞を、プレート上で３７℃でオーバーナイト乾燥させた後、カバーしてひっくり返し、４℃で保存した。プレートを洗浄バッファー（０．０１Ｍ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、０．１３９Ｍ  ＮａＣｌ/ＫＣｌ、０．１％  Briji−３５、ｐＨ７．０−７．４）で３回洗浄した。抗血清の希釈は、ＰＢＳ、０．０５％ Tween−２０/Azideで調整し、０．１ｍＬをコートしたプレートに移し、３７℃で２時間インキュベーションした。プレートを洗浄バッファーで３回洗浄した。抗マウス−ヤギＩｇＧ  ＡＰ（Southern Biotech）をＰＢＳ/０．０
５％  Tween−２０で１：１５００に希釈し、０．１ｍＬを各ウェルに加え、プレートを
３７℃で２時間インキュベーションした。プレートを（上記のように）洗浄した。基質溶液は、ジエタノールアミン中のｐ−ニトロフェニルホスフェート（Sigma）で希釈して１
ｍｇ/ｍＬに調製した。基質を１ウェル当たり０．１ｍＬずつプレートに加え、室温で１
時間インキュベーションした。反応は３Ｎ  ＮａＯＨを５０μＬ/ウェル加えることによ
り停止し、６９０ｎｍを参照して４０５ｎｍで測定した。
【０１９５】
組換えＰｏｒＡの誘導：ＢＬＲ（ＤＥ３）/ｐＥＴ９ａ菌株をKan−３０および２％グルコースを補ったHySoy Broth (Sheffield Products)中で３７℃でオーバーナイト培養した。翌朝Ｏ/Ｎ培地をHySoy Broth Kan−３０および１％グリセロール中で１/２０に希釈し
、３７℃で１時間培養した。これらの培地にＩＰＴＧを最終濃度１ｍＭとなるように加えて誘導した。培地をさらに２−３時間培養した後、収穫した。
【０１９６】
組換えＰｏｒＡの精製：ｒＰｏｒＡは大腸菌封入体より８Ｍ  尿素にて可溶化し、尿素を含まないバッファーに透析することによりリフォールディングさせた。次にリフォールディングしたｒＰｏｒＡを次にダイアフィルトレーション(diafltration)により濃縮し、Ｇ２５カラムにてＮａＰＯ４  ｐＨ６にバッファーを交換した。次に透析したｒＰｏｒＡを陽イオン交換カラム(S Fractogel)にかけ１Ｍ  ＮａＣｌで溶出した。
【０１９７】
菌株８５２９（Ｐ１．７−２，３）由来のｓＯＭＰは、異種の血清型サブタイプを発現する菌株に対して、マウスにおいてＰｏｒＡ非依存性の殺菌活性を惹起する。以下の表、表IXは検討した菌株における殺菌活性を示す。
【０１９８】
【表９】
2010162023.tif 000013
【０１９９】
ＯＭＰの調製：髄膜炎菌の膜をＴＸ−１００、Zwittergent３−１４、およびZwittergent３−１４＋０．５Ｍ  ＮａＣｌで抽出した。上述のＯＭＰはZwittergent３−１４/０．５Ｍ  ＮａＣｌ抽出で可溶化した。抽出は当業者周知の技術を用いて行い、例えば米国特許第６，３５５，２５３号を参照のこと（同文献を当明細書において参照として援用する）。
【０２００】
免疫原性：メスSwiss-Websterマウスに、２０μｇ  ＱＳ−２１をアジュバントした総
タンパク質量２５μｇにて、第０週および第４週に免疫感作を行った。全採血およびデータ分析は第６週に行った。
【０２０１】
１．殺菌性（ＢＣ５０）力価は、生細胞のカウントを５０％低減する抗血清の希釈度の逆数として表した。第０週の正常なマウスの血清のＢＣ５０力価は＜２５であった。
２．ＮＳＴ＝血清型サブタイプ分類外
以下の表、表XはサブファミリーＡおよびサブファミリーＢの双方に関する組換え脂質
化Ｐ２０８６（ｒＬＰ２０８６）の精製および特徴付けのまとめを示す。
【０２０２】
【表１０】
2010162023.tif 000014
【０２０３】
【表１１】
2010162023.tif 000015
【０２０４】
精製法：すべてのバリアントは大腸菌膜よりＴＸ−１００にて可溶化した（サルコシルまたは尿素で可溶化したｒＬＰ２０８６−８５２９は除く）。さらなる精製は、Ｔｒｉｓ−ＨＣｌバッファーまたはＮａＰＯ４バッファー中で、陰イオン交換クロマトグラフフィー（ＴＭＡＥ）、サイズ排除クロマトグラフフィーおよび/または陽イオン交換クロマト
グラフフィー（S Fractogel）を組み合わせて達成した。
【０２０５】
・  菌株８５２９由来のＰ２０８６と比較してのアミノ酸の相同性
・  ＳＤＳ−ＰＡＧＥおよび、コロイド状のクーマシー染色バンド（Simply Blue 染色）のレーザーデンシトメトリーによる純度の決定
同種および異種の菌株に対するサブファミリーのメンバーのｒＬＰ２０８６−８５２９の免疫原性を検査した。
【０２０６】
以下の表XIIは、同種および異種の菌株に対して検査したサブファミリーＢのメンバー
のｒＬＰ２０８６−８５２９の免疫原性を示す。
【０２０７】
【表１２】
2010162023.tif 000016
【０２０８】
ワクチン接種手順：６−８週齢メスSwiss-Websterマウスを、１０μｇ  ｒＬＰ２０８
６−８５２９＋２０μｇ  ＱＳ−２１で、第０週および第４週に免疫感作した。データ分析は第６週の全採血時に行った。
【０２０９】
ａ．ｒＬＰ２０８６−８５２９との比較におけるＰ２０８６のアミノ酸の相同性
ｂ．吸収＝０．１での希釈度の逆数として表した終点力価
ｃ．ＢＣ５０力価は、生細胞のカウントを５０％まで低減する抗血清の希釈度の逆数として表した。第０週の正常なマウスの血清のＢＣ５０力価は＜１０であった。
【０２１０】
表XIIIは、同種および異種の菌株に対して検査したサブファミリーＢのメンバーのｒＬＰ２０８６−２９９６の免疫原性を示す。
【０２１１】
【表１３】
2010162023.tif 000017
【０２１２】
ワクチン接種手順：６−８週齢メスSwiss-Websterマウスを、１０μｇ  ｒＬＰ２０８
６−２９９６＋２０μｇ  ＱＳ−２１で、第０週および第４週に免疫感作した。データ分析は第６週の全採血時に行った。
【０２１３】
ａ．ｒＬＰ２０８６−２９９６との比較におけるＰ２０８６のアミノ酸の相同性
ｂ．吸収＝０．１での希釈度の逆数として表した終点力価
ｃ．殺菌性（ＢＣ５０）力価は、生細胞のカウントを５０％まで低減する抗血清の希釈
度の逆数として表した。第０週の正常なマウスの血清のＢＣ５０力価は＜１０であった。
【０２１４】
以下の表XIVは、ｒＬＰ２０８６およびｒＰｏｒＡに対する抗血清が、両者を混合して
殺菌活性をアッセイした場合に補足的であることを示す。
【０２１５】
【表１４】
2010162023.tif 000018
【０２１６】
ワクチン接種手順：６−８週齢メスSwiss-Websterマウスを、１０μｇ  ｒＬＰ２０８
６−８５２９＋２０μｇ  ＱＳ−２１、または１５μｇ  ｒＰｏｒＡ/１００μｇ  ＭＰ
Ｌのいずれかで、第０週および第４週に免疫感作した。データ分析は第６週の全採血時に行った。
【０２１７】
ａ． 殺菌性（ＢＣ５０）力価は、生細胞のカウントを５０％まで低減する抗血清の希
釈度の逆数として表した。第０週の正常なマウスの血清のＢＣ５０力価は＜１０であった。
【０２１８】
以下の表、表XVはｒＬＰ２０８６サブファミリーおよび２つのｒＰｏｒＡの混合物がマウスにおいて殺菌活性抗体を産生することを示す。
【０２１９】
【表１５】
2010162023.tif 000019
【０２２０】
ワクチン接種手順：６−８週齢メスSwiss-Websterマウスを、１０μｇ  各タンパク質
＋２０μｇ  ＱＳ−２１で、第０週および第４週に免疫感作した。データ分析は第６週の全採血時に行った。
【０２２１】
ａ． 殺菌性（ＢＣ５０）力価は、生細胞のカウントを５０％まで低減する抗血清の希
釈度の逆数として表した。第０週の正常なマウスの血清のＢＣ５０力価は＜１０であった。
【０２２２】
ｂ．ＳｆＡ−サブファミリーＡ、ＳｆＢ−サブファミリーＢ
ｃ．関連の一価コントロール：ｒＬＰ２０８６−８５２９、ｒＬＰ２０８６−２９９６、ｒＰ１．５−１，２−２またはｒＰ１．２２−１，１４−１抗血清
以下に上述の研究の結果をまとめる。抗ｒＬＰ２０８６抗血清は、検査した菌株１６種中１３種に対して殺菌性がある。異なる血清型サブタイプを発現する１１の菌株が、抗Ｐ２０８６血清により死滅させられる。抗ｒＬＰ２０８６血清の殺菌活性は抗ｒＰｏｒＡ血清に対して補足的である。Ｐ２０８６およびＰｏｒＡの混合物はマウスにおいて補足的な殺菌性抗体を産生する。異なる界面活性剤による抽出、精製、および多くの菌株に対する機能的な抗体のアッセイを組み合わせた免疫感作を用いて、新規ワクチン候補物質を同定することができる。Ｐ２０８６は、Ｐ２０８６およびｒＰｏｒＡの双方において異種の菌株に対して殺菌性抗体を産生するワクチン候補物質として同定された。したがって、タンパク質の２０８６ファミリーは、単独でまたは他のナイセリア属抗原と組み合わせてのいずれかにおいて、有用なワクチンとなり得る。
【０２２３】
（実施例９）
先の実施例に従って、様々な血清群のさらなる髄膜炎菌株について、ＯＲＦ２０８６遺伝子の存在に関するＰＣＲによるスクリーニングを行った。最終的に１００の髄膜炎菌株をスクリーニングした。以下に研究およびその全般的結果を述べる。これらの結果は先の実施例のデータを補足するものである。
【０２２４】
Ｃ末端の可変領域に特異的な２組の内側のＰＣＲプライマーを利用してサブファミリーＡおよびＢの遺伝子配列の違いを明らかにした。約３５０ｂｐのＰＣＲ増幅産物の存在は、２０８６遺伝子配列が染色体上に存在することを示した。すべての菌株から予想されるサイズの１つのＰＣＲ産物を得た。５５種の完全長ＯＲＦ２０８６遺伝子のヌクレオチド配列を決定、整列し（DNAStar MegAlign）、これらを用いて系統樹を作成した（図１２参照のこと）。
【０２２５】
これら２０８６遺伝子の９種を、ｐＢＡＤアラビノース誘導型プロモーター系においてｒＬＰ２０８６リポタンパク質として組換え発現させ、これら遺伝子の３種をＩＰＴＧ誘導型ｐＥＴ系においてｒＰ２０８６非脂質化タンパク質として組換え発現させた。これらの組換えタンパク質は大腸菌Ｂ中で発現させた。精製した組換えタンパク質を用いてマウスを免疫感作し、マウスの抗血清を、その血清ＩｇＧ力価および様々な異種の髄膜炎菌株に対するその殺菌活性についてアッセイした。
【０２２６】
ＯＲＦ２０８６を、以下の髄膜炎菌全細胞、精製染色体ＤＮＡ、またはプラスミドＤＮＡの鋳型の１つからＰＣＲにより増幅した。
９種のＯＲＦ２０８６遺伝子を、インフルエンザ菌Ｐ４リーダー配列をＯＲＦ２０８６遺伝子の５’末端に融合するベクターｐＬＰ３３９中にクローニングした。ｐＢＡＤ/Ｏ
ＲＦ２０８６クローンからｒＰ２０８６の脂質化型を組換え発現させるための宿主菌株として、大腸菌株ＢＬＲを使用した（図１０Ａを参照のこと）。ｐＢＡＤアラビノース誘導型プロモーターは、Ｐ４シグナル/ＯＲＦ２０８６融合タンパク質の発現に作用し、ｒＰ
２０８６の脂質化型を発現させる。シグナル配列を欠損する３種のＰ２０８６遺伝子は、
ｐＥＴ９ａベクター中の高活性Ｔ７ファージプロモーターの後ろにクローニングした。ｐＥＴ９ａ/ＯＲＦ２０８６クローンからＯＲＦ２０８６の非脂質化型を組換え発現させる
ための宿主細胞株として、大腸菌株ＢＬ２１（ＤＥ３）を使用した。（図１０Ｂ参照のこと）大腸菌株ＢＬ２１中のＤＥ３ lysogen を、ＩＰＴＧ添加によりｌａｃＵＶ５プロモ
ーターのコントロール下で誘導して、Ｔ７  ＲＮＡポリメラーゼを発現させることができる。WCE; FEMS Micro. Lett., 48 (1987) 367-371およびBCA; J. Clin. Microbiol., 38 (2000) 2878-2884を参照のこと。
【０２２７】
遺伝子ＯＲＦ２０８６を、５５種の異なる髄膜炎菌株からクローニングし、配列決定した。ヌクレオチド配列を整列し（DNAStar MegAlign）、系統樹を作成に用いた。（図１２参照のこと）。この系統樹は、ＯＲＦ２０８６遺伝子ヌクレオチド配列が２つのサブファミリーに区別されることを明らかにしている。遺伝子の２つのサブファミリーは、５’末端では類似しているが、３’末端付近はかなりの可変性を含む。重要な可変性であるとは思われるが、遺伝子のある種の鍵となる領域は異なる菌株間で非常に相同である。これらの保存領域がタンパク質としての機能的連続性を提供し、ワクチン標的として利用できる交差防護的エピトープを示している可能性がある。
【０２２８】
２０８６遺伝子をいくつかの血清群Ｂ髄膜炎菌株からクローニングし、脂質化シグナル配列を用いた場合および用いない場合で発現させた。図１１Ａおよび１１Ｂに示したように、ゲルクロマトグラフは、大腸菌Ｂの全細胞溶菌液がｒ２０８６タンパク質を発現することを示す。Ｔ７タグを融合した非脂質化型は最も高レベルで発現された。Ｔ７タグ配列はｍＲＮＡを安定化し、翻訳されるポリペプチドのレベルを有意に高めることができる。この融合タンパク質は封入体中に沈着して表れるが、公知の方法により容易に精製、リフォールディングすることができる。Ｐ２０８６の脂質化型および非脂質化型は、Ｔ７タグを融合しない場合には総細胞タンパク質の約５から８％で発現され、Ｔ７タグを融合した場合には総タンパク質の約５０％でｒＰ２０８６を発現する。タンパク質の非脂質化型は可溶性で、細胞質中に局在するようである。タンパク質の脂質化型は膜分画に関与すると思われ、界面活性剤により可溶化される。
【０２２９】
髄膜炎菌Ｂ株８５２９由来の組換え脂質化２０８６は、非脂質化型に比して一貫してより高い血清ＩｇＧ力価を示し（以下の表XVIを参照のこと）、このことは同種および異種
の髄膜炎菌株双方に対する高レベルの殺菌活性にもよく相関する（以下の表XVII参照のこと）。天然の脂質化型のタンパク質は、抗原提示するための優れた３次元構造を有しており、および/または結合した脂質がより高い免疫原性応答を刺激するアジュバントとして
作用する可能性がある。
【０２３０】
【表１６】
2010162023.tif 000020
【０２３１】
【表１７】
2010162023.tif 000021
【０２３２】
以下に本研究の結果をまとめる。検査を行ったすべての髄膜炎菌Ｂ株は、１つの２０８６様遺伝子を有しているようである。２０８６遺伝子には少なくとも２つのファミリーがある：サブファミリーＡ−菌株の約３０％およびサブファミリーＢ−菌株の約７０％。５５種の髄膜炎菌株から２０８６遺伝子をクローニングし、配列決定した。サブファミリーＡ中の配列は、ＤＮＡレベルで〜８６−１００％同一である。サブファミリーＢ中の配列は、ＤＮＡレベルで〜８９．５−１００％同一である。サブファミリーＡ中の配列はサブファミリーＢに対してＤＮＡレベルで〜６０．９％−７４％同一である。２０８６相同体を以下の菌株についてＰＣＲスクリーニングにより同定した：
髄膜炎菌Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｗ１３５、Ｙ
N. lactamica
淋菌（N. gonorrhoeae）ＦＡ１０９０
いくつかのＯＲＦ２０８６遺伝子をクローニングし組換え発現させた。
Ｐ２０８６の脂質化バージョンを９種の髄膜炎菌株から発現させた。
これらの組換えタンパク質を精製し、マウスのワクチン接種に使用した。
得られた抗血清は殺菌性である。
【０２３３】
Ｐ２０８６の非脂質化バージョンを上の９種の菌株のうちの３種から発現させた。
ｒＬＰ２０８６では、ｒＰ２０８６に比して一貫してより高い免疫応答を惹起する。
ｒＬＰ２０８６はまた、同種および異種の髄膜炎菌株の双方に対して高い殺菌活性を示した。
【０２３４】
（実施例１０）
以下の表、表XVIIIおよび表XIXは、２つのサブファミリーのメンバーのバリアントの特徴を示す。
【０２３５】
【表１８】
2010162023.tif 000022
【０２３６】
【表１９】
2010162023.tif 000023
【０２３７】
以下の表XXは、２０８６サブファミリーＡに関する蛍光標識血清の殺菌性アッセイの結果を提供する。
【０２３８】
【表２０】
2010162023.tif 000024
【０２３９】
（実施例１１）
以下にさらに、Ｐ２０８６がナイセリア属菌株内で発現することを示し、いくつかの菌株におけるＰ２０８６の発現の更なる具体的な実施例を提供する。  
【０２４０】
プレート培養した細胞をＳＤＳサンプルバッファーに再懸濁し、９８℃で４分間加熱して、細胞溶菌液を調製した。サンプルを、１０−２０％のpre-castゲル（ＩＣＮ）の各ウェルに総タンパク質〜３０−５０μｇで加え、１７５Ｖで流した。ゲルをニトロセルロー
ス膜に移した後、Ｔｒｉｓ緩衝化生理食塩水（Blotto）中の５％粉末ミルクにて３０分間ブロックした。使用する第１抗体は、マウスで各ｒＬＰ２０８６バリアントに対して作成したポリクローナル抗血清のプールとした。
【０２４１】
図１７および１８に示したように、ウェスタンブロットはＰ２０８６サブファミリーＡおよびＢの全細胞溶菌液に対する、ｒＬＰ２０８６マウス抗血清の反応性を示している。サブファミリーＡ細胞溶菌液のブロットについては、使用する抗血清はｒＬＰ２０８６−２９９６、−８７０４４６および−２５０７７１に対して作製し、ｒＬＰ２０８６−２５０７７１はBlotto中で１/５００に希釈し、他のものはBlotto中で１/１０００に希釈した。サブファミリーＢ細胞溶菌液のブロットについては、使用する抗血清は、ｒＬＰ２０８６−８５２９（Blotto中で１/１０００に希釈）、−ＣＤＣ１５７３、−Ｍ９８２および
−８８００４９（これら３種はBlotto中で１/５００に希釈）に対して作製した。第１抗
血清およびブロットは４℃でオーバーナイト、インキュベーションした。ブロットを洗浄し、抗マウス−ヤギＡＰ第２抗血清をBlotto中で１/５００として加え、ブロットを室温
で３０分間インキュベーションした。洗浄後、BCIP/NBT Membrane Phosphatase Substrate System（膜ホスファターゼ基質システム）（ＫＰＬ）を用いてブロットを現像した。
【０２４２】
（参考文献）
当明細書において先に述べた参考文献を以下に記し、その全内容を当明細書において参照として援用する。
【０２４３】
【表２１−１】
2010162023.tif 000025
【０２４４】
【表２１−２】
2010162023.tif 000026
【０２４５】
【表２１−３】
2010162023.tif 000027
【０２４６】
【表２１−４】
2010162023.tif 000028
【０２４７】
【表２１−５】
2010162023.tif 000029
【０２４８】
【表２１−６】
2010162023.tif 000030
【０２４９】
【表２１−７】
2010162023.tif 000031
【０２５０】
【表２１−８】
2010162023.tif 000032
【０２５１】
【表２１−９】
2010162023.tif 000033
【０２５２】
【表２１−１０】
2010162023.tif 000034
【０２５３】
【表２１−１１】
2010162023.tif 000035
【０２５４】
本発明はここに十分に説明したので、当明細書に述べた本発明の精神または範疇から逸脱せずに、本発明に対する変更および修飾が可能であることは一般の当業者には明らかであろう。これまでの記述は、多数の可能な変更に則して本発明の好ましい態様を述べたものである。しかしこれらの態様は単なる例に過ぎず、本発明をそれに限定するものではない。
【図面の簡単な説明】
【０２５５】
【図１−Ａ】図１Ａは、異種の菌株に対して殺菌性抗体を産生することのできるナイセリア属膜タンパク質抽出物を同定するための実験から得られた、タンパク質分画のうちの２つの主要なタンパク質を表しているＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルを表す。
【図１−Ｂ】図１Ｂは、プロテアーゼの消化および逆相Ｎ末端配列決定による、ＴＭＡＥ流出成分の分析による２つの主要なタンパク質を同定する実験の結果を表す。
【図２】図２は、ｒＬＰ２０８６のＳＤＳ−ＰＡＧＥで決定する場合の精製スキームおよび均質性を表す。
【図３】図３は、ＬＣ−ＭＳ/ＭＳおよび対応するＳＤＳ−ＰＡＧＥによる、ＴＭＡＥ流出成分の分析による２つの主要なタンパク質および１つの少量のタンパク質を同定する実験の結果を表す。
【図４】図４は、２０８６タンパク質の組換え発現のＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルである。
【図５】図５は、当明細書で述べたプラスミドｐＰＸ７３４０の模式図である。
【図６】図６は、当明細書で述べたプラスミドｐＰＸ７３２８の模式図である。
【図７】図７は、当明細書で述べたプラスミドｐＰＸ７３４３の模式図である。
【図８】図８は、様々な菌株由来の２０８６遺伝子のＮ末端領域を表す。
【図９−Ａ】図９Ａは、ナイセリア菌株中の免疫原性成分の同定における予備段階を示すフローチャートである。
【図９−Ｂ】図９Ｂは、ナイセリア菌株中の免疫原性成分の同定における最終段階を示すフローチャートである。
【図１０】図１０Ａは、本明細書の実施例に述べたように、Ｐ４シグナル/ＯＲＦ２０８６融合タンパク質の発現を誘導し、ｒＰ２０８６の脂質化型を発現させるｐＢＡＤアラビノーズ誘導型プロモーターの模式図である。図１０Ｂは、ＯＲＦ２０８６の非脂質型の組換え発現のためのｐＰＥＴ９ａ−Ｔ７ベクターの模式図である。
【図１１】図１１Ａは、ｒＬＰ２０８６タンパク質を発現する大腸菌Ｂの全細胞溶菌液を表す写真である。図１１Ｂは、ｒＰ２０８６タンパク質を発現する大腸菌Ｂの全細胞溶菌液を表す写真である。
【図１２】図１２は、ＯＲＦ２０８６タンパク質のサブファミリーおよび群の構成を示す系統樹である。
【図１３】図１３は、ｒＬＰ２０８６サブファミリーＡ抗血清に関する全細胞ＦＬＩＳＡデータのグラフである。
【図１４】図１４は、ｒＬＰ２０８６サブファミリーＢ抗血清に関する全細胞ＦＬＩＳＡデータのグラフである。
【図１５】図１５は、ｒＬＰ２０８６の混合に関する研究−ＷＣＥ力価の結果のグラフである。
【図１６】図１６は、ｒＬＰ２０８６/ｒＰｏｒＡの混合に関する研究−ＷＣＥ力価の結果のグラフである。
【図１７】図１７は、Ｐ２０８６サブファミリーＢ髄膜炎菌全細胞溶菌液に対するｒＬＰ２０８６マウス抗血清の反応性を示すウェスタンブロットである。
【図１８】図１８は、Ｐ２０８６サブファミリーＡ髄膜炎菌およびN. lactamicaの全細胞溶菌液に対するｒＬＰ２０８６マウス抗血清の反応性を示すウェスタンブロットである。
【図１−Ａ】
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【図１−Ｂ】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９−Ａ】
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【図９−Ｂ】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【配列表】
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【手続補正書】
【提出日】平成22年2月17日(2010.2.17)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下を含む組成物：
（ａ）ナイセリア種（Neisseria species）のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ２０８６）によりコードされる少なくとも１つのタンパク質であって、該オープンリーディングフレームが交差反応性の免疫原性抗原をコードし、該交差反応性免疫原性抗原が被験者における髄膜炎菌血清群Ｂ（Neisseria meningitides serogroup B）による感染に対して免疫原性を提供するタンパク質；または
（ｂ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質の少なくとも１つの免疫原性部分；または
（ｃ）（ａ）に記載の少なくとも１つのタンパク質または（ｂ）に記載の免疫原性フラグメントの、少なくとも１つの生物学的均等物。