(57)【要約】【課題】植物における特定の部位を青色化するための新たな技術を提供する。【解決手段】本発明者らは、青色の花底部で特異的に発現している青色化遺伝子を同定、単離し、この遺伝子を発現させることによってチューリップの花弁の青色化が達成できることを発見した。本発明によって、チューリップがもつ青色化遺伝子を紫色の細胞で発現させることを特徴とする花弁細胞の青色化方法が提供される。本発明はまた、青色化遺伝子と人為的に構築したフェリチン抑制遺伝子を紫色細胞で発現させることを特徴とする花弁細胞の青色化方法も提供する。本発明は、本発明の花弁細胞の青色化方法における使用に有用な花弁特異的プロモーターもまた、提供する。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
青色化した植物体作出のための植物細胞の作製方法であって、該植物細胞に、以下：
（ａ）配列番号１に記載の核酸配列を含む核酸の相補鎖とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１に記載の核酸配列と少なくとも８０％相同な配列を含む核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｃ）配列番号２に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；および
（ｄ）配列番号２に記載のアミノ酸配列に１または数個の欠失、付加、または置換を含むアミノ酸配列からなるポリペプチドであって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸、
からなる群より選択される核酸を導入する工程を包含し、該核酸は、花弁特異的プロモーターに作動可能に連結されている、方法。
【請求項２】
青色化した植物体の作出方法であって、以下：
（ｉ）植物細胞に、以下：
（ａ）配列番号１に記載の核酸配列を含む核酸の相補鎖とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１に記載の核酸配列と少なくとも８０％相同な配列を含む核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｃ）配列番号２に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；および
（ｄ）配列番号２に記載のアミノ酸配列に１または数個の欠失、付加、または置換を含むアミノ酸配列からなるポリペプチドであって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸、
からなる群より選択される核酸を導入する工程であって、該核酸は、花弁特異的プロモーターに作動可能に連結されている、工程、ならびに
（ｉｉ）工程（ｉ）で作製した該植物細胞から植物体を再生する工程、
を包含する、方法。
【請求項３】
青色化した植物体作出のための植物細胞の作製方法であって、該植物細胞に、以下（１）の核酸および（２）の核酸：
（１）以下、（ａ）〜（ｄ）からなる群から選択される核酸、
（ａ）配列番号１に記載の核酸配列を含む核酸の相補鎖とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１に記載の核酸配列と少なくとも８０％相同な配列を含む核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｃ）配列番号２に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；および
（ｄ）配列番号２に記載のアミノ酸配列に１または数個の欠失、付加、または置換を含むアミノ酸配列からなるポリペプチドであって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸、
（２）以下（ｅ）〜（ｈ）からなる群から選択される核酸の発現量を低下させる核酸、
（ｅ）配列番号３に記載の核酸配列を含む核酸の相補鎖とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸であって、鉄イオン貯蔵活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｆ）配列番号３に記載の核酸配列と少なくとも８０％相同な配列を含む核酸であって、鉄イオン貯蔵活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｇ）配列番号４に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；および
（ｈ）配列番号４に記載のアミノ酸配列に１または数個の欠失、付加、または置換を含むアミノ酸配列からなるポリペプチドであって、鉄イオン貯蔵活性を有するポリペプチドをコードする核酸、
を導入する工程を包含し、該核酸は、花弁特異的プロモーターに作動可能に連結されている、方法。
【請求項４】
青色化した植物体の作出方法であって、以下：
（ｉ）植物細胞に、以下（１）の核酸および（２）の核酸：
（１）以下、（ａ）〜（ｄ）からなる群から選択される核酸、
（ａ）配列番号１に記載の核酸配列を含む核酸の相補鎖とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１に記載の核酸配列と少なくとも８０％相同な配列を含む核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｃ）配列番号２に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；および
（ｄ）配列番号２に記載のアミノ酸配列に１または数個の欠失、付加、または置換を含むアミノ酸配列からなるポリペプチドであって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸、
（２）以下（ｅ）〜（ｈ）からなる群から選択される核酸の発現量を低下させる核酸、
（ｅ）配列番号３に記載の核酸配列を含む核酸の相補鎖とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸であって、鉄イオン貯蔵活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｆ）配列番号３に記載の核酸配列と少なくとも８０％相同な配列を含む核酸であって、鉄イオン貯蔵活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｇ）配列番号４に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；および
（ｈ）配列番号４に記載のアミノ酸配列に１または数個の欠失、付加、または置換を含むアミノ酸配列からなるポリペプチドであって、鉄イオン貯蔵活性を有するポリペプチドをコードする核酸、
を導入する工程であって、該核酸は、花弁特異的プロモーターに作動可能に連結されている、工程、ならびに
（ｉｉ）工程（ｉ）で作製した該植物細胞から植物体を再生する工程、
を包含する、方法。
【請求項５】
前記花弁特異的プロモーターが、配列番号１５の塩基配列を有するＭｙｂ転写因子遺伝子プロモーターである、請求項１〜４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６】
前記花弁特異的プロモーターが、配列番号１６の塩基配列を有するアントシアニジン合成酵素遺伝子プロモーターである、請求項１〜４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
前記植物体が青色の花弁を有する、請求項２または４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８】
前記植物がチューリップである、請求項１〜７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項９】
前記チューリップが、紫水晶、夢の紫、プリンスチャールズ、ネグリタ、コートダジュール、ネプチューン、ブルージム、パープルパレス、パープルワールド、パープルフラッグ、ルーブル、ブルーパーロット、アメジスト、カラベラ、パープルマーベル、パンディオン、フランスハルス、アテラ、プリンスチャールズ、紫帽子、およびレリアンスからなる群より選択される、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
青色の花弁を有する植物であって、請求項２または４〜６のいずれか１項に記載の方法によって作出された植物。
【請求項１１】
前記植物がチューリップである、請求項１０に記載の植物。
【請求項１２】
前記チューリップが、紫水晶、夢の紫、プリンスチャールズ、ネグリタ、コートダジュール、ネプチューン、ブルージム、パープルパレス、パープルワールド、パープルフラッグ、ルーブル、ブルーパーロット、アメジスト、カラベラ、パープルマーベル、パンディオン、フランスハルス、アテラ、プリンスチャールズ、紫帽子、およびレリアンスからなる群より選択される、請求項１１に記載の植物。
【請求項１３】
青色化した植物体作出のための植物細胞であって、請求項１、３、５または６のいずれか１項に記載の方法によって作製された、細胞。
【請求項１４】
配列番号１５の塩基配列を有する、核酸。
【請求項１５】
配列番号１６の塩基配列を有する、核酸。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、植物の花色改変法に関する。詳しくは、チューリップの青色化遺伝子を紫色の細胞で発現させることにより青色に改変する方法に関するものである。また、内在性のフェリチン遺伝子の発現を抑制しかつ青色化遺伝子を発現させることにより、より濃い青色に改変する方法に関するものである。
【背景技術】
【０００２】
花色は花卉園芸作物において最も重要な形質の一つであり、古くから様々な改良がなされてきた。花色の成分は、主にアントシアニン、カロテノイド、ベタレインがあり、多くの植物がもつ赤色、橙色、紫色はアントシアニンに由来している。アントシアニンは化学構造上母核となるアントシアニジンに糖が結合したものであり、植物種により糖の種類が異なり、さらにはアシル化などの修飾を受ける。アントシアニジンは主にペラルゴニジン（橙色）、シアニジン（赤色）、デルフィニジン（紫色）の３種類が存在し、Ｂ環の水酸基の数がそれぞれ１個〜３個と変化するに従い色調が変化する。
【０００３】
青色の花の多くはデルフィニジン色素を持つことが知られているが、アントシアニンが局在する植物細胞内の液胞は一般に弱酸性であり、弱酸性下ではデルフィニジンは紫色を示すことが実験的に確かめられている（非特許文献１；非特許文献２；非特許文献３）。そのため青色を呈するためには植物種に特有のメカニズムが存在している。例えば、液胞内ｐHのアルカリ性化（アサガオ）、金属イオンによる錯体形成（アジサイ、ツユクサ）
、フラボンやフラボノールによるコピグメント効果（キキョウ）などがある。
【０００４】
これまで、青色がない植物、特にデルフィニジン色素を持たない植物において新たに青色の花を作出する目的で、切り花に着色剤を吸わせて青くする方法や遺伝子組換え技術を使って、他の植物由来のデルフィニジン合成酵素遺伝子（フラボノイド３’，５’水酸化酵素遺伝子）を導入した遺伝子組換え体を作る試みがなされてきた（非特許文献４；非特許文献５）。例えば、これまで育成された遺伝子組換え技術によって花色が改変されたバラやカーネーション（いわゆる青いバラや青いカーネーション）は、他の植物由来のフラボノイド３’，５’水酸化酵素遺伝子を導入しデルフィニジン色素を新たに作らせることに成功したものである。しかし、花色は青色と紫色の中間色を呈しており、明確に青色と呼べるまでには至っていない。
【０００５】
チューリップ花弁の色素としては、ペラルゴニジン、シアニジン、デルフィニジンをそれぞれ母核とするアントシアニンが存在している（非特許文献６；非特許文献７）。さらに、本発明者らの解析により１１種類のフラボノールが存在することも判明している（非特許文献８）。チューリップの花色は主にアントシアニンによる橙色、赤色、紫色およびカロテノイドによる黄色であり、これらが組み合わされて様々な色を呈している。しかしながら、花弁全体が青色の花は存在しない。
【０００６】
ところが、チューリップでは花弁内側の底の部分（花底部）が青い品種がいくつか存在している。この花底部に特異的な青色発現は古くから知られ、チューリップの野生種でも見られる現象である。チューリップの育種は１６世紀から始まった（非特許文献９）が、その当時から花底部の青色を花弁全体に広げようとする試みがなされてきた。しかしながら、当業者の長年の努力にも関わらず、チューリップ花弁の青色化は未だ実現していない。それは、花底部と花弁上部では未知の異なった生理的メカニズムが存在していることを暗示している。そこで、我々は生理的に何が違うのかを解析したところ、花底部の細胞の液胞内では鉄イオンが花弁上部より約２５倍多く含まれており、デルフィニジンと鉄イオンとフラボノールが錯体を形成することで青色を呈することを見出し報告している（非特許文献１０）。しかしながら、ツユクサでは鉄イオンとマグネシウムイオンで青色になることが示されており（非特許文献１１）、またヤグルマギクでは青色色素の結晶のＸ線解析から鉄イオンとカルシウムイオンが必要であることが示されている（非特許文献１２）ことから、チューリップ花弁の青色化には鉄イオンのみならず、他の複数の因子が関与していると考えられていた。
【０００７】
植物において、鉄は生長に不可欠な必須元素であると同時に、鉄は生物体内でヒドロキシラジカルと呼ばれる強力は酸化性物質発生の原因となるため、鉄の過剰な吸収は植物にとって毒性を示すことが知られている（非特許文献１３）。そのため、植物体内への吸収や細胞内の濃度は厳密に調節されていることが分かっている。しかしながら、そのメカニズムについては未だ十分には解明されておらず不明な点が多い。現在、モデル植物であるシロイヌナズナやイネでの研究から、土壌中の鉄イオン吸収や植物体内での輸送に関わる遺伝子やタンパク質の解明が進められつつある。このような遺伝子の例として、シロイヌナズナにおけるＶＩＴ１遺伝子が挙げられる（非特許文献１４）。非特許文献２においては、ＶＩＴ遺伝子は、種子や芽生えの子葉維管束での発現が最も高いことが示されている。しかしながら、ＶＩＴ１遺伝子導入により酵母ＣＣＣ１遺伝子（ＶＩＴ遺伝子のオルソログ）ノックアウト変異体では液胞への鉄イオン蓄積が３倍上昇したが、シロイヌナズナＶＩＴ遺伝子ノックアウト変異体では野性型と比較して種子や子葉での鉄含量に差が見られないことから、鉄イオン濃度の調節はまだまだ未解明の部分が多い。さらに、シロイヌナズナにおいて液胞内から細胞質側へ鉄イオン、マンガンイオン、カドミウムイオンを輸送するトランスポーター（ＡｔＮＲＡＭＰ２，３）等（非特許文献１５）、鉄イオンのホメオスタシスには多数の因子が関連することが明らかであった。これらの事実から、液胞内の鉄イオンレベルの人為的調節は到底不可能であると考えられていた（非特許文献１６）。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００８】
【非特許文献１】Ｇｏｔｏ，Ｔ．，Ｐｒｏｇ．Ｃｈｅｍ．Ｏｒｇ．．Ｎａｔ．Ｐｒｏｄｕｃｔｓ  ５２：１１３−１５８，１９８７
【非特許文献２】Ｂｒｏｕｉｌｌａｒｄ，Ｒ．，Ｉｎ  Ｔｈｅ  Ｆｌａｖｏｉｄｓ：Ａｄｖａｎｃｅ  ｉｎ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ｓｉｎｃｅ  １９８０，ｐｐ．５２５−５３８，１９８８
【非特許文献３】Ｙｏｓｈｉｄａ，Ｋ．，ｅｔ  ａｌ．，Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．４４：２６２−２６８，２００３
【非特許文献４】Ｆｕｋｕｉ，Ｙ．，ｅｔ  ａｌ．，Ｐｈｙｔｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ６３：１５−２３，２００３
【非特許文献５】Ｋａｔｓｕｍｏｔｏ，Ｙ．，ｅｔ  ａｌ．，Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．，４８：１５８９−１６００，２００７
【非特許文献６】Ｔｏｒｓｋａｎｇｅｒｐｏｌｌ，Ｋ．，ｅｔ  ａｌ．，Ｐｈｙｔｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ５２：１６８７−１６９２，１９９９
【非特許文献７】Ｔｏｒｓｋａｎｇｅｐｏｌｌ，Ｋ．，ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｓｙｓｔ．Ｅｃｏｌ．３３：４９９−５１０，２００５
【非特許文献８】荘司、他，園芸学研究  ６，別（２）：３１０，２００７
【非特許文献９】チューリップ・鬱金香    木村敬助著  農文協
【非特許文献１０】荘司  和明ら，「Ｐｅｒｉａｎｔｈ  Ｂｏｔｔｏｍ−Ｓｐｅｃｉｆｉｃ  Ｂｌｕｅ  Ｃｏｌｏｒ  Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ  ｉｎ  Ｔｕｌｉｐ  ｃｖ．  Ｍｕｒａｓａｋｉｚｕｉｓｈｏ  Ｒｅｑｕｉｒｅｓ  Ｆｅｒｒｉｃ  Ｉｒｏｎｓ」，Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．４８（２）：２４３−２５１（２００７）
【非特許文献１１】Ｋｏｎｄｏ，Ｔ．，ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ３５８：５１５−５１８，１９９２
【非特許文献１２】Ｓｈｉｏｎｏ，Ｍ．，ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ４３６：７９１，２００５
【非特許文献１３】Ｃｕｒｉｅ，Ｃ．，ａｎｄ  Ｂｒｉａｔ，Ｊ−Ｆ．，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｐｌａｎｔ  Ｂｉｏｌ．５４：１８３−２０６，２００３
【非特許文献１４】Ｓｕｎ  Ａ．Ｋｉｍら，「Ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｉｒｏｎ  ｉｎ  Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  Ｓｅｅｄ  Ｒｅｑｕｉｒｅｓ  ｔｈｅ  Ｖａｃｕｏｌａｒ  Ｍｅｍｂｒａｎｅ  Ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒ  ＶＩＴ１」，Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｖｏｌ３１４，２００６年１１月２４日
【非特許文献１５】Ｔｈｏｍｉｎｅ，  Ｓ．，  ｅｔ  ａｌ．，  Ｐｌａｎｔ  Ｊ．  ３４：  ６８５−６９５，  ２００３
【非特許文献１６】Ｂｒｉａｔ，Ｊ−Ｆ．，ｅｔ  ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｏｐｉｎｉｏｎ  ｉｎ  Ｐｌａｎｔ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ２００７，１０：２７６−２８５
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００９】
このことから、植物における特定の部位を青色化するための新たな技術の開発が課題となっている。
【課題を解決するための手段】
【００１０】
本発明者らは、鋭意研究を重ねた結果、青色の花底部で特異的に発現している青色化遺伝子を同定、単離し、この遺伝子を発現させることによってチューリップの花弁の青色化が達成できることを予想外に発見し、本発明を完成させた。本発明者らはさらに、チューリップの青色化に関連している別の遺伝子であるフェリチン遺伝子をも同定、単離し、その発現様式を解析することによって、青色化遺伝子とフェリチン遺伝子の発現をコントロールすることによってさらに濃い青色化が達成できることも発見した。上述のように、チューリップの青色発現には鉄イオンを含むいくつかの因子が関与していると考えられていたという事実、および液胞内の鉄イオンレベルの人為的調節は到底不可能であると考えられていたという事実に鑑みると、本願発明によって達成されたチューリップの花弁の青色化という効果は、当業者が容易に想到し得なかった顕著な効果である。本願発明は、当業者が１６世紀から試みていたチューリップ花弁の青色化を実現したものであり、この効果はまさに予想外であった。
【００１１】
本発明は、上記課題を解決するために、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
青色化した植物体作出のための植物細胞の作製方法であって、その植物細胞に、以下：
（ａ）配列番号１に記載の核酸配列を含む核酸の相補鎖とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１に記載の核酸配列と少なくとも８０％相同な配列を含む核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｃ）配列番号２に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；および
（ｄ）配列番号２に記載のアミノ酸配列に１または数個の欠失、付加、または置換を含むアミノ酸配列からなるポリペプチドであって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸、
からなる群より選択される核酸を導入する工程を包含し、その核酸は、花弁特異的プロモーターに作動可能に連結されている、方法。
（項目２）
青色化した植物体の作出方法であって、以下：
（ｉ）植物細胞に、以下：
（ａ）配列番号１に記載の核酸配列を含む核酸の相補鎖とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１に記載の核酸配列と少なくとも８０％相同な配列を含む核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｃ）配列番号２に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；および
（ｄ）配列番号２に記載のアミノ酸配列に１または数個の欠失、付加、または置換を含むアミノ酸配列からなるポリペプチドであって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸、
からなる群より選択される核酸を導入する工程であって、その核酸は、花弁特異的プロモーターに作動可能に連結されている、工程、ならびに
（ｉｉ）工程（ｉ）で作製したその植物細胞から植物体を再生する工程、
を包含する、方法。
（項目３）
青色化した植物体作出のための植物細胞の作製方法であって、その植物細胞に、以下（１）の核酸および（２）の核酸：
（１）以下、（ａ）〜（ｄ）からなる群から選択される核酸、
（ａ）配列番号１に記載の核酸配列を含む核酸の相補鎖とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１に記載の核酸配列と少なくとも８０％相同な配列を含む核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｃ）配列番号２に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；および
（ｄ）配列番号２に記載のアミノ酸配列に１または数個の欠失、付加、または置換を含むアミノ酸配列からなるポリペプチドであって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸、
（２）以下（ｅ）〜（ｈ）からなる群から選択される核酸の発現量を低下させる核酸、
（ｅ）配列番号３に記載の核酸配列を含む核酸の相補鎖とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸であって、鉄イオン貯蔵活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｆ）配列番号３に記載の核酸配列と少なくとも８０％相同な配列を含む核酸であって、鉄イオン貯蔵活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｇ）配列番号４に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；および
（ｈ）配列番号４に記載のアミノ酸配列に１または数個の欠失、付加、または置換を含むアミノ酸配列からなるポリペプチドであって、鉄イオン貯蔵活性を有するポリペプチドをコードする核酸、
を導入する工程を包含し、その核酸は、花弁特異的プロモーターに作動可能に連結されている、方法。
（項目４）
青色化した植物体の作出方法であって、以下：
（ｉ）植物細胞に、以下（１）の核酸および（２）の核酸：
（１）以下、（ａ）〜（ｄ）からなる群から選択される核酸、
（ａ）配列番号１に記載の核酸配列を含む核酸の相補鎖とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１に記載の核酸配列と少なくとも８０％相同な配列を含む核酸であって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｃ）配列番号２に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；および
（ｄ）配列番号２に記載のアミノ酸配列に１または数個の欠失、付加、または置換を含むアミノ酸配列からなるポリペプチドであって、鉄イオン輸送活性を有するポリペプチドをコードする核酸、
（２）以下（ｅ）〜（ｈ）からなる群から選択される核酸の発現量を低下させる核酸、
（ｅ）配列番号３に記載の核酸配列を含む核酸の相補鎖とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸であって、鉄イオン貯蔵活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｆ）配列番号３に記載の核酸配列と少なくとも８０％相同な配列を含む核酸であって、鉄イオン貯蔵活性を有するポリペプチドをコードする核酸；
（ｇ）配列番号４に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；および
（ｈ）配列番号４に記載のアミノ酸配列に１または数個の欠失、付加、または置換を含むアミノ酸配列からなるポリペプチドであって、鉄イオン貯蔵活性を有するポリペプチドをコードする核酸、
を導入する工程であって、その核酸は、花弁特異的プロモーターに作動可能に連結されている、工程、ならびに
（ｉｉ）工程（ｉ）で作製したその植物細胞から植物体を再生する工程、
を包含する、方法。
（項目５）
上記花弁特異的プロモーターが、配列番号１５の塩基配列を有するＭｙｂ転写因子遺伝子プロモーターである、項目１〜４のいずれか１項に記載の方法。
（項目６）
上記花弁特異的プロモーターが、配列番号１６の塩基配列を有するアントシアニジン合成酵素遺伝子プロモーターである、項目１〜４のいずれか１項に記載の方法。
（項目７）
上記植物体が青色の花弁を有する、項目２または４のいずれか１項に記載の方法。
（項目８）
上記植物がチューリップである、項目１〜７のいずれか１項に記載の方法。
（項目９）
上記チューリップが、紫水晶、夢の紫、プリンスチャールズ、ネグリタ、コートダジュール、ネプチューン、ブルージム、パープルパレス、パープルワールド、パープルフラッグ、ルーブル、ブルーパーロット、アメジスト、カラベラ、パープルマーベル、パンディオン、フランスハルス、アテラ、プリンスチャールズ、紫帽子、およびレリアンスからなる群より選択される、項目８に記載の方法。
（項目１０）
青色の花弁を有する植物であって、項目２または４〜６のいずれか１項に記載の方法によって作出された植物。
（項目１１）
上記植物がチューリップである、項目１０に記載の植物。
（項目１２）
上記チューリップが、紫水晶、夢の紫、プリンスチャールズ、ネグリタ、コートダジュール、ネプチューン、ブルージム、パープルパレス、パープルワールド、パープルフラッグ、ルーブル、ブルーパーロット、アメジスト、カラベラ、パープルマーベル、パンディオン、フランスハルス、アテラ、プリンスチャールズ、紫帽子、およびレリアンスからなる群より選択される、項目１１に記載の植物。
（項目１３）
青色化した植物体作出のための植物細胞であって、項目１、３、５または６のいずれか１項に記載の方法によって作製された、細胞。
（項目１４）
配列番号１５の塩基配列を有する、核酸。
（項目１５）
配列番号１６の塩基配列を有する、核酸。
【発明の効果】
【００１２】
本発明により、植物における特定の部位を青色化するための新たな技術が提供される。
【図面の簡単な説明】
【００１３】
【図１】図１は、チューリップ品種「紫水晶」の花色およびアントシアニン色素を示す。（ａ）に示されるように花弁全体は紫色であるが、（ｂ）に示されるように、花底部のみ青色を示す。図１（ｃ）は、この紫色および青色の基となるデルフィニジン３−Ｏ−ルチノシド色素の構造を示す。
【図２】図２は、チューリップの花底部から単離された青色化遺伝子の核酸配列（上段；配列番号１）、およびその核酸配列によってコードされるアミノ酸配列（下段；配列番号２）を示す。
【図３】図３は、細胞の青色化に影響を及ぼすチューリップフェリチン遺伝子の核酸配列（上段；配列番号３）およびアミノ酸配列（下段；配列番号４）を示す。遺伝子導入の際には、この遺伝子を改良した抑制遺伝子を用いる。
【図４】図４は、青色化遺伝子およびフェリチン遺伝子の花弁発達過程での発現解析の結果を示す。図４（ａ）は紫水晶の発達過程における、抱芽期から老化期まで６  ｓｔａｇｅを示す。図４（ｂ）は、各ｓｔａｇｅにおける青色化遺伝子の発現を示し、図４（ｃ）は、各ｓｔａｇｅにおけるフェリチン遺伝子の発現を示す。（ｂ）および（ｃ）における発現は、リアルタイムＲＴ−ＰＣＲ法によって定量化した。
【図５】図５は、紫水晶の各組織における（ａ）青色化遺伝子の、（ｂ）フェリチン遺伝子の、発現解析結果を示す。
【図６】図６は、紫水晶以外の他品種における発現解析結果を示す。図６（ａ）の上段は花底部が青い品種であり、下段は花底部が青くない品種である（いずれも発育ｓｔａｇｅ４のもの）。図６（ｂ）は各品種における青色化遺伝子の発現解析を示し、図６（ｃ）は各品種におけるフェリチン遺伝子の発現解析を示す。
【図７】図７は、本発明において使用される遺伝子導入ベクターを示す。ＫｍＲ：カナマイシン耐性遺伝子、ＧＦＰ：緑色蛍光タンパク質遺伝子、ＴｇＶＩＴ−Ａ１：チューリップ青色化遺伝子、ＴｇＦＥＲ１：チューリップフェリチン遺伝子、ＴｇＦＥＲ１−ＲＮＡｉ：チューリッップフェリチン抑制遺伝子、ＰＮＯＳ：ノパリン合成酵素遺伝子プロモーター、ＴＮＯＳ：ノパリン合成酵素遺伝子ターミネーター、Ｐ３５Ｓ：カリフラワーモザイクウイルス３５Ｓプロモーター。
【図８】図８は、図７に示される各遺伝子導入ベクターの導入による、紫色花弁細胞への遺伝子導入結果を示す。遺伝子導入細胞を矢印で示す（写真左）。導入細胞はＧＦＰにより蛍光を発する（写真右）。ｐＢＩ−ＢＣＦは青色化遺伝子導入用ベクターを、ｐＢＩ−ａｎｔｉ−ＢＣＦは青色化遺伝子のアンチセンス遺伝子導入用ベクター）を、ｐＢＩ−ＦＥＲはフェリチン遺伝子の導入用ベクターを、ｐＢＩ−ＦＥＲ−ＲＮＡｉはフェリチンの抑制遺伝子導入用ベクターを、そしてｐＢＩ−ＢＣＦ−ＦＥＲ−ＲＮＡｉは青色化遺伝子およびフェリチン抑制遺伝子導入用ベクターをそれぞれ示す。
【図９】図９は、フェリチン抑制遺伝子の配列を示す。この配列は、フェリチンｃＤＮＡの２９２−５４７ｂｐの部分（大文字部分）を含み、間にＡｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ  ＷＲＫＹ３３  ｇｅｎｅ由来のイントロンとベクターの配列（小文字部分）が挟まれている（配列番号１４）。
【図１０】図１０は、青色化遺伝子導入ベクターｐＢＩ−ＢＣＦを導入して２日目、２週間目、および３週間目の、カルスの細胞増殖およびＧＦＰ蛍光の様子を示す。
【図１１】図１１は、ＭＹＢ遺伝子およびＡＮＳ遺伝子の、種々の組織における発現を示す。対照として、細胞内で恒常的に発現しているＧＡＰＤＨ遺伝子を用いた。
【図１２】図１２は、花弁特異的プロモーターであるＭＹＢ遺伝子プロモーターの塩基配列（配列番号１５）を示す。
【図１３】図１３は、花弁特異的プロモーターであるＡＮＳ遺伝子プロモーターの塩基配列（配列番号１６）を示す。
【図１４】図１４は、ＭＹＢ遺伝子プロモーターまたはＡＮＳ遺伝子プロモーターと、青色化遺伝子（ＶＩＴ遺伝子）とを繋いで作製された、青色化遺伝子導入用ベクターを示す。青色化遺伝子が導入された紫色細胞において、紫色から青色への細胞の色の変化が観察された。
【図１５】図１５は、花弁特異的プロモーターのプロモーター活性の確認を示す。
【図１６】図１６は、花弁特異的プロモーターと青色化遺伝子（ＶＩＴ遺伝子）とを繋いだベクター（ｐＢＴ−１またはｐＢＴ−１１）導入後のカルスの再分化の様子を示す。遺伝子導入されたシュートまたはその一部（丸枠）で、ＧＦＰ蛍光を確認できる。
【発明を実施するための形態】
【００１４】
チューリップには青い花は存在しないが、花底が青い品種は存在している。品種「紫水晶」は、花弁全体が紫色で花底部のみ青色を示す。色素分析の結果、アントシアニン色素は共にデルフィニジンを母核とする同一色素（デルフィニジン３−Ｏ−ルチノシド）である（図１）。
【００１５】
本発明において、チューリップ「紫水晶」の花弁上部と花底部で発現している遺伝子の解析を網羅的に比較した結果、花底部で特異的に発現している遺伝子の存在を確認し、この遺伝子を青色化遺伝子（配列番号１）と名付けた（図２）。この遺伝子は既知の液胞型鉄イオントランスポーター遺伝子と相同性が高いが、花弁細胞で発現し花色を改変できる機能を持つ新たな遺伝子と言える。
【００１６】
さらに、本発明者らは、動物や植物において鉄イオンの貯蔵タンパク質と知られるフェリチンタンパク質に着目し、同じチューリップ花弁の上部からフェリチン遺伝子（配列番号３）を単離した（図３）。これら遺伝子の花弁上部と花底部での発現を花の発育ステージ毎に比較したところ、青色化遺伝子はｓｔａｇｅ  １〜３で花底部の表皮細胞で強く発現し花弁上部では発現せず、フェリチン遺伝子はｓｔａｇｅ  ４の花弁上部表皮細胞で強く発現し花底部では発現していないことを見出した（図４）。
【００１７】
すなわち、青色化遺伝子とフェリチン遺伝子は花弁の紫色細胞と花底の青色細胞では全く逆の発現パターンを示すことを明らかにした。この様な事実はこれまで他の植物においても報告例は無く新たな発見である。理論に束縛されることは意図しないが、これらの事実から、青色細胞では青色化遺伝子が発現しフェリチン遺伝子の発現が抑制されることにより細胞内の鉄イオンは液胞内へ運ばれ、そこでデルフィニジン色素と結合し錯体を形成するために青色を呈するが、一方、紫色細胞ではフェリチン遺伝子が発現し青色化遺伝子の発現が抑制されることにより細胞内の鉄イオンはフェリチンが存在する色素体に運ばれ液胞内へは運ばれないためデルフィニジン色素は紫色を呈することが論理的に推察できた。また、それぞれの遺伝子発現を他の組織でも調べたところ、青色化遺伝子は花底部表皮細胞で最も強く発現していること。また、フェリチン遺伝子も花弁柔組織や茎で発現するものの花弁上部表皮組織で最も強く発現した（図５）。これらの事実は、これらの遺伝子が花色発現と密接な関係を持っていることを強く示唆している。
【００１８】
さらに、上記推論をより強固にするため、紫水晶以外の品種で花底部が青い品種と青くない品種で比較したところ、花底部が青い品種すべてにおいて、紫水晶と同様の結果を得たことから花底部における青色発現には、青色化遺伝子の発現とフェリチン遺伝子の発現抑制が関与していることがここでも強く示唆された（図６）。
【００１９】
そこで、花弁上部の紫色細胞へ実際に青色化遺伝子を導入するため遺伝子導入用ベクターを構築した（図７）。ここでは、青色化遺伝子発現用ベクター（ｐＢＩ−ＢＣＦ）、青色化遺伝子のアンチセンスベクター（ｐＢＩ−ａｎｔｉＢＣＦ）、フェリチン発現用ベクター（ｐＢＩ−ＦＥＲ）、フェリチン遺伝子抑制用ベクター（ｐＢＩ−ＦＥＲ−ＲＮＡｉ）、青色化遺伝子発現およびフェリチン遺伝子抑制用ベクター（ｐＢＩ−ＢＣＦ−ＦＥＲ−ＲＮＡｉ）を作成した。これらのベクターを花弁上部の紫色細胞へ導入したところ、青色化遺伝子の導入で紫色細胞が青色に変化することを確認した（図８）。さらに、紫色細胞内で発現しているフェリチン遺伝子の発現を抑制するため、ＲＮＡ干渉技術を使って人為的に構築したフェリチン抑制遺伝子を同時に導入（ｐＢＩ−ＢＣＦ−ＦＥＲ−ＲＮＡｉ）すると、実際の花底部の青色に近い濃い青色に改変できることを実証した（図８）。
【００２０】
以下に本発明を、必要に応じて、添付の図面を参照して例示の実施例により記載する。本明細書の全体にわたり、単数形の表現は、特に言及しない限り、その複数形の概念をも含むことが理解されるべきである。また、本明細書において使用される用語は、特に言及しない限り、当該分野で通常用いられる意味で用いられることが理解されるべきである。したがって、他に定義されない限り、本明細書中で使用される全ての専門用語および科学技術用語は、本発明の属する分野の当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。矛盾する場合、本明細書（定義を含めて）が優先する。
【００２１】
以下に提供される実施形態は、本発明のよりよい理解のために提供されるものであり、本発明の範囲は以下の記載に限定されるべきではない。本明細書中の記載を参酌して、本発明の範囲内で適宜改変を行うことができることは、当業者に明らかである。
【００２２】
本明細書において用いられる「植物」とは、植物界に属する生物の総称であり、葉緑体、硬い細胞壁、豊富な永続性の胚的組織の存在、および運動する能力がない生物により特徴付けられる。植物の種類は、例えば、「原色牧野植物大図鑑」（北隆館（１９８２））などにおいて広範に分類されており、そこに記載されるすべての種類の植物が、本発明において使用され得る。代表的には、植物は、細胞壁の形成・葉緑体による同化作用をもつ顕花植物をいう。「植物」は、単子葉植物および双子葉植物のいずれも含む。単子葉植物としては、ユリ科植物が挙げられる。好ましい単子葉植物としては、チューリップ、ユリ、トウモロコシ、コムギ、イネ、エンバク、オオムギ、ソルガム、ライムギ及びアワが挙げられ、さらに好ましくはチューリップであるが、これらに限定されない。双子葉植物としては、アブラナ科植物、マメ科植物、ナス科植物、ウリ科植物、ヒルガオ科植物が挙げられるが、これらに限定されない。アブラナ科植物としては、ハクサイ、ナタネ、キャベツ、カリフラワーが挙げられるが、これらに限定されない。特に他で示さない限り、植物は、植物体、植物器官、植物組織、植物細胞、および種子のいずれをも意味する。植物器官の例としては、根、葉、茎、および花などが挙げられる。特定の実施形態では、植物は、植物体を意味し得る。本発明において特に好ましい植物はチューリップであり、中でもデルフィニジン色素を作り、かつフェリチンを多く発現している品種（例えば、紫水晶、夢の紫、プリンスチャールズ、ネグリタ、コートダジュール、ネプチューン、ブルージム、パープルパレス、パープルワールド、パープルフラッグ、ルーブル、ブルーパーロット、アメジスト、カラベラ、パープルマーベル、パンディオン、フランスハルス、アテラ、プリンスチャールズ、紫帽子、およびレリアンスなどが挙げられるが、これらに限定されない）が好ましい。
【００２３】
別の実施形態において、本発明において使用され得る植物種の例としては、ユリ科、ナス科、イネ科、アブラナ科、バラ科、マメ科、ウリ科、シソ科、アカザ科、セリ科、ヒルガオ科、キク科などの植物が挙げられる。さらに、本発明において使用され得る植物種の例としては、任意の樹木種、任意の果樹種、クワ科植物（例えば、ゴム）、およびアオイ科植物（例えば、綿花）が挙げられる。
【００２４】
ユリ科の植物の例としては、ユリ、オモト、バイモ、カタクリに属する植物が挙げられ、例えば、チューリップ、エンレイソウなどを含む。本発明において特に好ましい植物はチューリップであり、中でも紫水晶、夢の紫、プリンスチャールズ、ネグリタ、コートダジュール、ネプチューン、ブルージム、パープルパレス、パープルワールド、パープルフラッグ、ルーブル、ブルーパーロット、アメジスト、カラベラ、パープルマーベル、パンディオン、フランスハルス、アテラ、プリンスチャールズ、紫帽子、およびレリアンスなど（しかし、これらに限定されない）が好ましい。
【００２５】
本明細書において用いられる「植物細胞」とは、上記植物に由来し、再生能を有する任意の細胞をいう。植物細胞の例としては、カルスおよび懸濁培養細胞が挙げられる。
【００２６】
本明細書中において使用される「再生能」とは、個体または器官の一部（例えば、細胞）から、元の個体または器官を再生する能力をいう。本発明において「再生能を有する細胞」とは、カルスまたは不定胚などが挙げられるが、これらに限定されない。
【００２７】
本明細書において使用される用語「細胞」とは、任意の植物または動物由来であって、自己複製能と分化能とを有する、未分化で幼若な任意の細胞を指し、カルスも含まれる。
【００２８】
本発明の方法は、植物細胞（カルスおよび懸濁培養細胞を含む）または植物組織（休眠組織（完熟種子、未熟種子、冬芽、および塊茎を含む）、生殖質、生長点、および花芽を含む）に対して、例えばパーティクルガン、アグロバクテリウム、エレクトロポレーション等の遺伝子導入法によって形質転換を行うことによって実施される。本発明の方法は、好ましくは植物を対象に実施される。
【００２９】
本明細書において使用する場合、用語「鉄イオン輸送活性」とは、植物（特に、チューリップ）において液胞に鉄イオンを輸送する活性のことをいう。鉄イオン輸送活性は、例えば、鉄の放射性同位元素５９Ｆｅを含む水溶液を切り花に吸収させ、液胞内の５９Ｆｅの取り込みを指標として測定する。あるいは、鉄イオン輸送活性は、導入遺伝子による耐性獲得を指標として、測定することができる。酵母の培養において鉄を含有する培地で鉄感受性変異株を培養すると、変異株は液胞内に鉄を輸送できないので鉄の毒性により致死性を示す。しかし、鉄イオン輸送活性を有するタンパク質をコードする遺伝子を導入した組換え酵母は、液胞内への鉄輸送活性を持つので鉄は液胞内に蓄積され無毒化するため鉄耐性を示す。本発明において、鉄イオン輸送活性を有する代表的なタンパク質は青色化遺伝子であり、配列番号２に記載のアミノ酸配列を有し、配列番号１に記載の核酸によってコードされるタンパク質である。
【００３０】
本明細書において使用する場合、用語「鉄イオン貯蔵活性」とは、植物（特に、チューリップ）においてタンパク質内に鉄イオンを貯蔵する活性のことをいう。鉄イオン貯蔵活性は、例えば以下のように測定することができる。鉄貯蔵が予想されるタンパク質の遺伝子を大腸菌内で発現させ組換えタンパク質を作る。この時、培地中に鉄の合成安定同位体５７Ｆｅを既知濃度加えておく。作られた組換えタンパク質を精製後、同位体希釈−質量分析法により自然界に最も多く存在する５６Ｆｅと同位体５７Ｆｅの比を求める。添加した５７Ｆｅの量はわかっているので、それから５６Ｆｅ量が求められる。鉄イオン貯蔵活性があれば精製タンパク質において鉄イオンが検出可能される。あるいは、原始吸光法またはＩＣＰ法によっても鉄濃度は測定できる。本発明において、鉄イオン貯蔵活性を有する代表的なタンパク質はフェリチンであり、配列番号４に記載のアミノ酸配列を有し、配列番号３に記載の核酸によってコードされるタンパク質である。本明細書において使用する場合、タンパク質における鉄イオンの「貯蔵」とは、その内部の空洞に鉄イオンを取り込むことをいう。
【００３１】
「フェリチン」とは、鉄を含む複合タンパク質の一つである。フェリチンは水溶性タンパク質であり、動物、植物からバクテリアまで広く生体内に存在している。フェリチンは直径約１３ｎｍの球殻状タンパク質で、内部に７ｎｍの空洞を持つ。内部の空洞に金属イオンを取り込み、酸化物のコアを形成することができる。生体内ではこの空洞内に鉄を酸化物の形で取り込むことができ、体内の鉄の無毒化や鉄濃度のコントロールの役割を担っている。コアの大きさは内壁の大きさに制限され最大でも７ｎｍである。これは鉄原子４５００個分に相当する。鉄以外の金属としてマンガン、コバルト、ニッケル、クロム、インジウムなどがフェリチン内に取り込まれ、コア形成をすることが報告されている。
【００３２】
本明細書で使用される場合、「青色化した植物体」とは、その植物体の少なくとも一部（例えば、その植物体の花弁、茎、葉などが挙げられるが、これらに限定されない）が青色化した任意の植物体をいい、その植物体全体が青色化しているものに必ずしも限定されない。「青色化した植物体」における青色化部位は、好ましくは花弁である。「青色化した植物体」における植物体は、好ましくはチューリップである。
【００３３】
本明細書で使用される場合、「青色化した植物体作出のための植物細胞」とは、その植物細胞から植物体を再生させたときに、再生した植物体の少なくとも一部が青色化しているような植物細胞をいう。ある実施形態においては、この植物細胞全体が青色化している。ある実施形態においては、この植物細胞の一部のみが青色化している。ある実施形態においては、この植物細胞自体は青色化していない。
【００３４】
本発明において、植物体における色は、一般に色を数値として表すＣＩＥＬ＊ａ＊ｂ＊表色系による色彩値を指標として判断される。ＣＩＥＬ＊ａ＊ｂ＊表色系による色彩値は、実体顕微鏡で白色光照明下で得られる画像のＣＩＥＬ＊ａ＊ｂ＊値によって表される。ＣＩＥＬ＊ａ＊ｂ＊表色系では、Ｌ軸、ａ軸、およびｂ軸の３次元で色を表す。明度をＬ軸上で０（黒）から１００（白）で表し、ａ軸上では赤が正、緑が負、ｂ軸上では黄が正、青が負を表す。ＣＩＥＬ＊ａ＊ｂ＊は、赤、緑、黄、青を数値化し、その組み合わせによって色を表現し、さらに明るさの要素も付け加えられる。ＣＩＥＬ＊ａ＊ｂ＊による色の表現はほぼ無限に存在するといえる。また、色は連続的につながっており、例えば、赤から紫、青、緑に至る変化においても明瞭に区別できるものではなく、必ずその中間色は存在する。本発明では便宜上、以下のとおり紫色および青色、濃い青色の範囲を指定するがこの範囲に収まらない色も存在することは明白である。
紫色        ２０≦Ｌ＊≦８０，    ４０≦ａ＊≦９０，      −５０＜ｂ＊≦−１０
青色        ２０≦Ｌ＊≦８０，    −８≦ａ＊≦９０，    −１０７≦ｂ＊≦−５０
濃い青色      ５≦Ｌ＊＜２０，    −８≦ａ＊≦９０，    −１０７≦ｂ＊≦−５０。
【００３５】
本明細書において使用する場合、用語「形質転換」、「形質導入」および「トランスフェクション」は、特に言及しない限り互換可能に使用され、宿主細胞への核酸の導入を意味する。本発明においては、パーティクルガン、アグロバクテリウム、エレクトロポレーション等の遺伝子導入法による形質転換が使用される。
【００３６】
「形質転換体」とは、形質転換によって作製された細胞などの生命体の全部または一部をいう。形質転換体としては、原核細胞、酵母、植物細胞、植物体、動物細胞、昆虫細胞等が例示される。形質転換体は、その対象に依存して、形質転換細胞、形質転換組織、形質転換宿主などともいわれ、本明細書においてそれらの形態をすべて包含するが、特定の文脈において特定の形態を指し得る。本明細書においては、代表的に、形質転換体は植物細胞または植物体である。
【００３７】
本明細書において「再生する」とは、個体の一部分から個体全体が復元される現象を意味する。例えば、再生により、カルスやプロトプラストなどの細胞および葉または根などの組織片から植物体が形成される。
【００３８】
形質転換体（例えば、形質転換された植物細胞）を植物体へと再生する方法は当該分野において周知である。そのような方法としては、Ｒｏｇｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ  １１８：  ６２７−６４０（１９８６）；Ｔａｂａｔａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．，２８：７３−８２（１９８７）；Ｓｈａｗ，Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ：Ａ  ｐｒａｃｔｉｃａｌ  ａｐｐｒｏａｃｈ．ＩＲＬ  ｐｒｅｓｓ（１９８８）；Ｓｈｉｍａｍｏｔｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ３３８：  ２７４（１９８９）；Ｍａｌｉｇａ  ｅｔ
ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ：Ａ  ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  ｃｏｕｒｓｅ．  Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ（１９９５）；Ｈｉｅｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｌａｎｔ
Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ  ３５：２０５（１９９７）；Ｔｏｋｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｌａｎｔ
Ｊ  ４７：９６９  （２００６）などが挙げられる。従って、当業者は、上記当該分野で周知の方法を目的とするトランスジェニック植物に応じて適宜使用することによって、形質転換体（例えば、形質転換された植物細胞）を再生させることができる。チューリップは、例えば、球根りん片を厚さ２〜３ｍｍにスライスし、これをＭｕｒａｓｈｉｇｅ−Ｓｋｏｏｇ培地（ショ糖２０ｇ／Ｌ、２，４−Ｄ  ２ｍｇ／Ｌ、ＢＡ  ０．２ｍｇ／Ｌ）にて、２０℃でカルス誘導し、これに目的の遺伝子を導入し、Ｍｕｒａｓｈｉｇｅ−Ｓｋｏｏｇ培地（ショ糖２０ｇ／Ｌ、２，４−Ｄ  ０．２ｍｇ／Ｌ）にて、２０℃、光照射下で、シュートを誘導することによって再生させることができる。
【００３９】
本発明の方法により核酸導入／形質転換された細胞および組織は、当該分野において公知の任意の方法によって、分化、成長および／または増殖され得る。植物種の場合、細胞または組織を分化、成長および／または増殖させる工程は、例えば、その植物細胞もしくは植物組織またはそれらを含む植物体を栽培することによって達成され得る。本明細書では、植物の栽培は当該分野において公知の任意の方法により行うことができる。植物の栽培方法は、例えば、監修  島本功および岡田清，「モデル植物の実験プロトコール−イネ・シロイヌナズナ編−」：細胞工学別冊植物細胞工学シリーズ４；イネの栽培法（奥野員敏）ｐｐ．２８−３２、ならびに、丹羽康夫著，シロイヌナズナの栽培法，ｐｐ．３３−４０に例示されており、当業者であれば容易に実施することができることから本明細書では詳述する必要はない。例えば、シロイヌナズナの栽培は土耕、ロックウール耕、水耕いずれでも行うことができる。白色蛍光灯（６０００ルクス程度）の下、恒明条件で栽培すれば播種後４週間程度で最初の花が咲き、開花後１６日程度で種子が完熟する。１さやで約４０〜５０粒の種子が得られ、播種後２〜３ケ月で枯死するまでの間に１００００粒程度の種子が得られる。また、例えば、コムギの栽培においては、播種後に一定期間の低温短日条件にさらされなければ、出穂および開花しないことが周知である。従って、例えば、人工環境下（例えば、温室やグロスチャンバー）においてコムギを栽培する場合には、生育初期段階で、コムギ幼植物に低温短日処理（例えば、２０℃  明期８時間（約２０００ルクス）および８℃  暗期１６時間での処理など）を行う必要がある。この処理は春化処理（ｖｅｒｎａｌｉｚａｔｉｏｎ）と呼ばれる。このような各植物種ごとに必要とされる栽培条件は、当該分野において一般に広く知られており、従って、本明細書中で詳述する必要はない。例えば、チューリップは、２０℃で、明期１２時間、暗期１２時間のサイクルで栽培される。
【００４０】
本明細書において使用される用語「タンパク質」、「ポリペプチド」、「オリゴペプチド」および「ペプチド」は、本明細書において同じ意味で使用され、任意の長さのアミノ酸のポリマーをいう。
【００４１】
本明細書において使用される用語「ポリヌクレオチド」、「オリゴヌクレオチド」および「核酸」は、本明細書において同じ意味で使用され、任意の長さのヌクレオチドのポリマーをいう。他にそうではないと示されなければ、特定の核酸配列はまた、明示的に示された配列と同様に、その保存的に改変された改変体（例えば、縮重コドン置換体）および相補配列を包含することが企図される。具体的には、縮重コドン置換体は、１またはそれ以上の選択された（または、すべての）コドンの３番目の位置が混合塩基および／またはデオキシイノシン残基で置換された配列を作成することにより達成され得る（Ｂａｔｚｅｒら、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．１９：５０８１（１９９１）；Ｏｈｔｓｕｋａら、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６０：２６０５−２６０８（１９８５）；Ｒｏｓｓｏｌｉｎｉら、Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｐｒｏｂｅｓ  ８：９１−９８（１９９４））。
【００４２】
本明細書において、「遺伝子」とは、遺伝形質を規定する因子である、細胞中に存在する核酸の一定の長さの配列をいう。本発明において遺伝子は、遺伝形質を規定するものであっても規定しないものであってもよい。本明細書において、遺伝子は、通常ゲノムに存在するものをさすが、それに限定されず、染色体外の配列、ミトコンドリアの配列なども包含することが理解される。多くの遺伝子は、通常染色体上に一定の順序に配列している。タンパク質の一次構造を規定するものを構造遺伝子といい、その発現を左右するものを調節遺伝子（たとえば、プロモーター）という。本明細書では、「遺伝子」は、「ポリヌクレオチド」、「オリゴヌクレオチド」および「核酸」ならびに／あるいは「タンパク質」「ポリペプチド」、「オリゴペプチド」および「ペプチド」をさすことがある。本明細書において遺伝子の「オープンリーディングフレーム」または「ＯＲＦ」とは、遺伝子の塩基配列を３塩基ずつに区切った時の３通りの枠組の１つであって、開始コドンを有し、そして途中に終止コドンが出現せずある程度の長さを持ち、実際にタンパク質をコードする可能性のある読み枠をいう。本明細書では、遺伝子は、特に言及しない限り、構造遺伝子および調節遺伝子を包含する。したがって、例えば、ＤＮＡポリメラーゼ遺伝子というときは、通常、ＤＮＡポリメラーゼの構造遺伝子ならびにＤＮＡポリメラーゼのプロモーターなどの転写および／または翻訳の調節配列の両方を包含する。本発明では、構造遺伝子のほか、転写および／または翻訳などの調節配列もまた、本発明が対象とする遺伝子として有用であることが理解される。本明細書では、「遺伝子」は、「ポリヌクレオチド」、「オリゴヌクレオチド」、「核酸」および「核酸分子」ならびに／または「タンパク質」、「ポリペプチド」、「オリゴペプチド」および「ペプチド」を指すことがある。本明細書においてはまた、「遺伝子産物」は、遺伝子によって発現された「ポリヌクレオチド」、「オリゴヌクレオチド」、「核酸」および「核酸分子」ならびに／または「タンパク質」「ポリペプチド」、「オリゴペプチド」および「ペプチド」を包含する。当業者であれば、遺伝子産物が何たるかはその状況に応じて理解することができる。
【００４３】
本明細書において遺伝子（例えば、核酸配列、アミノ酸配列など）の「相同性」とは、２以上の遺伝子配列の、互いに対する同一性の程度をいう。また、本明細書において配列（核酸配列、アミノ酸配列など）の同一性とは、２以上の対比可能な配列の、互いに対する同一の配列（個々の核酸、アミノ酸など）の程度をいう。従って、ある２つの遺伝子の相同性が高いほど、それらの配列の同一性または類似性は高い。２種類の遺伝子が相同性を有するか否かは、配列の直接の比較、または核酸の場合ストリンジェントな条件下でのハイブリダイゼーション法によって調べられ得る。２つの遺伝子配列を直接比較する場合、その遺伝子配列間でＤＮＡ配列が、代表的には少なくとも５０％同一である場合、好ましくは少なくとも７０％同一である場合、より好ましくは少なくとも８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％同一である場合、それらの遺伝子は相同性を有する。本明細書において、遺伝子（例えば、核酸配列、アミノ酸配列など）の「類似性」とは、上記相同性において、保存的置換をポジティブ（同一）とみなした場合の、２以上の遺伝子配列の、互いに対する同一性の程度をいう。従って、保存的置換がある場合は、その保存的置換の存在に応じて相同性と類似性とは異なる。また、保存的置換がない場合は、相同性と類似性とは同じ数値を示す。
【００４４】
本明細書では、アミノ酸配列および塩基配列の類似性、同一性および相同性の比較は、配列分析用ツールであるＦＡＳＴＡを用い、デフォルトパラメータを用いて算出される。
【００４５】
本明細書において「フラグメント」とは、全長のポリペプチドまたはポリヌクレオチド（長さがｎ）に対して、１〜ｎ−１までの配列長さを有するポリペプチドまたはポリヌクレオチドをいう。フラグメントの長さは、その目的に応じて、適宜変更することができ、例えば、その長さの下限としては、ポリペプチドの場合、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５，２０、２５、３０、４０、５０およびそれ以上のアミノ酸が挙げられ、ここの具体的に列挙していない整数で表される長さ（例えば、１１など）もまた、下限として適切であり得る。また、ポリヌクレオチドの場合、５、６、７、８、９、１０、１５，２０、２５、３０、４０、５０、７５、１００およびそれ以上のヌクレオチドが挙げられ、ここの具体的に列挙していない整数で表される長さ（例えば、１１など）もまた、下限として適切であり得る。本明細書において、ポリペプチドおよびポリヌクレオチドの長さは、上述のようにそれぞれアミノ酸または核酸の個数で表すことができるが、上述の個数は絶対的なものではなく、同じ機能を有する限り、上限または下限としての上述の個数は、その個数の上下数個（または例えば上下１０％）のものも含むことが意図される。そのような意図を表現するために、本明細書では、個数の前に「約」を付けて表現することがある。しかし、本明細書では、「約」のあるなしはその数値の解釈に影響を与えないことが理解されるべきである。本明細書において有用なフラグメントの長さは、そのフラグメントの基準となる全長タンパク質の機能のうち少なくとも１つの機能が保持されているかどうかによって決定され得る。
【００４６】
本明細書において遺伝子の「相同性」とは、２以上の遺伝子配列の、互いに対する同一性の程度をいう。従って、ある２つの遺伝子の相同性が高いほど、それらの配列の同一性または類似性は高い。２種類の遺伝子が相同性を有するか否かは、配列の直接の比較、または核酸の場合ストリンジェントな条件下でのハイブリダイゼーション法によって調べられ得る。２つの遺伝子配列を直接比較する場合、その遺伝子配列間でＤＮＡ配列が、代表的には少なくとも５０％同一である場合、好ましくは少なくとも７０％同一である場合、より好ましくは少なくとも８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％同一である場合、それらの遺伝子は相同性を有する。
【００４７】
本明細書において「ストリンジェントなハイブリダイズ条件」とは、当該分野で慣用される周知の条件をいう。本発明のポリヌクレオチド中から選択されたポリヌクレオチドをプローブとして、コロニー・ハイブリダイゼーション法、プラーク・ハイブリダイゼーション法あるいはサザンブロットハイブリダイゼーション法等を用いることにより、そのようなポリヌクレオチドを得ることができる。具体的には、ストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチドは、コロニーあるいはプラーク由来のＤＮＡを固定化したフィルターを用いて、０．７〜１．０ＭのＮａＣｌ存在下、６５℃でハイブリダイゼーションを行った後、０．１〜２倍濃度のＳＳＣ（ｓａｌｉｎｅ−ｓｏｄｉｕｍ  ｃｉｔｒａｔｅ）溶液（１倍濃度のＳＳＣ溶液の組成は、１５０ｍＭ  塩化ナトリウム、１５ｍＭ
クエン酸ナトリウムである）を用い、６５℃条件下でフィルターを洗浄することにより同定できるポリヌクレオチドを意味する。ハイブリダイゼーションは、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  ２ｎｄ  ｅｄ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔ  １−３８、ＤＮＡ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  １：Ｃｏｒｅ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｓｅｃｏｎｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ（１９９５）等の実験書に記載されている方法に準じて行うことができる。ここで、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする配列からは、好ましくは、Ａ配列のみまたはＴ配列のみを含む配列が除外される。「ハイブリダイズ可能なポリヌクレオチド」とは、上記ハイブリダイズ条件下で別のポリヌクレオチドにハイブリダイズすることができるポリヌクレオチドをいう。ハイブリダイズ可能なポリヌクレオチドとして具体的には、本発明で具体的に示されるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするＤＮＡの塩基配列と少なくとも６０％以上の相同性を有するポリヌクレオチド、好ましくは８０％以上の相同性を有するポリヌクレオチド、さらに好ましくは９５％以上の相同性を有するポリヌクレオチドを挙げることができる。
【００４８】
本明細書では塩基配列の同一性の比較および相同性の算出は、配列分析用ツールであるＢＬＡＳＴを用いてデフォルトパラメータを用いて算出される。同一性の検索は例えば、ＮＣＢＩのＢＬＡＳＴ  ２．２．９  （２００４．５．１２  発行）を用いて行うことができる。本明細書における同一性の値は通常は上記ＢＬＡＳＴを用い、デフォルトの条件でアラインした際の値をいう。ただし、パラメーターの変更により、より高い値が出る場合は、最も高い値を同一性の値とする。複数の領域で同一性が評価される場合はそのうちの最も高い値を同一性の値とする。
【００４９】
本明細書において、「検索」とは、電子的にまたは生物学的あるいは他の方法により、ある核酸塩基配列を利用して、特定の機能および／または性質を有する他の核酸塩基配列を見出すことをいう。電子的な検索としては、ＢＬＡＳＴ（Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３−４１０（１９９０））、ＦＡＳＴＡ（Ｐｅａｒｓｏｎ  ＆  Ｌｉｐｍａｎ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．，ＵＳＡ  ８５：２４４４−２４４８（１９８８））、Ｓｍｉｔｈ  ａｎｄ  Ｗａｔｅｒｍａｎ法（Ｓｍｉｔｈ  ａｎｄ  Ｗａｔｅｒｍａｎ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１４７：１９５−１９７（１９８１））、およびＮｅｅｄｌｅｍａｎ  ａｎｄ  Ｗｕｎｓｃｈ法（Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ  ａｎｄ  Ｗｕｎｓｃｈ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４３−４５３（１９７０））などが挙げられるがそれらに限定されない。生物学的な検索としては、ストリンジェントハイブリダイゼーション、ゲノムＤＮＡをナイロンメンブレン等に貼り付けたマクロアレイまたはガラス板に貼り付けたマイクロアレイ（マイクロアレイアッセイ）、ＰＣＲおよびｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションなどが挙げられるがそれらに限定されない。本明細書において、本発明において使用されるプロモーターとしては、このような電子的検索、生物学的検索によって同定された対応する配列も含まれるべきであることが意図される。
【００５０】
本明細書において遺伝子、ポリヌクレオチド、ポリペプチドなどの「発現」とは、その遺伝子などがインビボで一定の作用を受けて、別の形態になることをいう。好ましくは、遺伝子、ポリヌクレオチドなどが、転写および翻訳されて、ポリペプチドの形態になることをいうが、転写されてｍＲＮＡが作製されることもまた発現の一態様であり得る。より好ましくは、そのようなポリペプチドの形態は、翻訳後プロセシングを受けたものであり得る。
【００５１】
アミノ酸は、その一般に公知の３文字記号か、またはＩＵＰＡＣ−ＩＵＢ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ  Ｃｏｍｍｉｓｓｉｏｎにより推奨される１文字記号のいずれかにより、本明細書中で言及され得る。ヌクレオチドも同様に、一般に受け入れられた１文字コードにより言及され得る。
【００５２】
その文字コードは以下のとおりである。
アミノ酸
３文字記号  １文字記号  意味
Ａｌａ      Ａ          アラニン
Ｃｙｓ      Ｃ          システイン
Ａｓｐ      Ｄ          アスパラギン酸
Ｇｌｕ      Ｅ          グルタミン酸
Ｐｈｅ      Ｆ          フェニルアラニン
Ｇｌｙ      Ｇ          グリシン
Ｈｉｓ      Ｈ          ヒスチジン
Ｉｌｅ      Ｉ          イソロイシン
Ｌｙｓ      Ｋ          リジン
Ｌｅｕ      Ｌ          ロイシン
Ｍｅｔ      Ｍ          メチオニン
Ａｓｎ      Ｎ          アスパラギン
Ｐｒｏ      Ｐ          プロリン
Ｇｌｎ      Ｑ          グルタミン
Ａｒｇ      Ｒ          アルギニン
Ｓｅｒ      Ｓ          セリン
Ｔｈｒ      Ｔ          トレオニン
Ｖａｌ      Ｖ          バリン
Ｔｒｐ      Ｗ          トリプトファン
Ｔｙｒ      Ｙ          チロシン
Ａｓｘ                  アスパラギンまたはアスパラギン酸
Ｇｌｘ                  グルタミンまたはグルタミン酸
Ｘａａ                  不明または他のアミノ酸。
【００５３】
塩基
記号  意味  
ａ    アデニン
ｇ    グアニン
ｃ    シトシン
ｔ    チミン
ｕ    ウラシル
ｒ    グアニンまたはアデニンプリン
ｙ    チミン／ウラシルまたはシトシンピリミジン
ｍ    アデニンまたはシトシンアミノ基
ｋ    グアニンまたはチミン／ウラシルケト基
ｓ    グアニンまたはシトシン
ｗ    アデニンまたはチミン／ウラシル
ｂ    グアニンまたはシトシンまたはチミン／ウラシル
ｄ    アデニンまたはグアニンまたはチミン／ウラシル
ｈ    アデニンまたはシトシンまたはチミン／ウラシル
ｖ    アデニンまたはグアニンまたはシトシン
ｎ    アデニンまたはグアニンまたはシトシンまたはチミン／ウラシル、不明、または他の塩基。
【００５４】
本明細書において、「フラグメント」とは、全長のポリペプチドまたはポリヌクレオチド（長さがｎ）に対して、１〜ｎ−１までの配列長を有するポリペプチドまたはポリヌクレオチドをいう。フラグメントの長さは、その目的に応じて、適宜変更することができ、例えば、その長さの下限としては、ポリペプチドの場合、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５，２０、２５、３０、４０、５０およびそれ以上のアミノ酸が挙げられ、ここで具体的に列挙していない整数で表される長さ（例えば、１１など）もまた、下限として適切であり得る。また、ポリヌクレオチドの場合、５、６、７、８、９、１０、１５，２０、２５、３０、４０、５０、７５、１００、２００、３００、４００、５００、６００、６００、７００、８００、９００、１０００およびそれ以上のヌクレオチドが挙げられ、ここで具体的に列挙していない整数で表される長さ（例えば、１１など）もまた、下限として適切であり得る。
【００５５】
本発明において使用されるポリペプチドは、天然型のポリペプチドと実質的に同一の作用を有する限り、アミノ酸配列中の１以上（例えば、１または数個）のアミノ酸が置換、付加および／または欠失していてもよく、糖鎖が置換、付加および／または欠失していてもよい。
【００５６】
あるアミノ酸を、同様の疎水性指数を有する他のアミノ酸により置換して、そして依然として同様の生物学的機能を有するタンパク質（例えば、酵素活性において等価なタンパク質）を生じさせ得ることが当該分野で周知である。このようなアミノ酸置換において、疎水性指数が±２以内であることが好ましく、±１以内であることがより好ましく、および±０．５以内であることがさらにより好ましい。疎水性に基づくこのようなアミノ酸の置換は効率的であることが当該分野において理解される。親水性指標もまた、改変体作製において考慮される。米国特許第４、５５４、１０１号に記載されるように、以下の親水性指数がアミノ酸残基に割り当てられている：アルギニン（＋３．０）；リジン（＋３．０）；アスパラギン酸（＋３．０±１）；グルタミン酸（＋３．０±１）；セリン（＋０．３）；アスパラギン（＋０．２）；グルタミン（＋０．２）；グリシン（０）；スレオニン（−０．４）；プロリン（−０．５±１）；アラニン（−０．５）；ヒスチジン（−０．５）；システイン（−１．０）；メチオニン（−１．３）；バリン（−１．５）；ロイシン（−１．８）；イソロイシン（−１．８）；チロシン（−２．３）；フェニルアラニン（−２．５）；およびトリプトファン（−３．４）。アミノ酸が同様の親水性指数を有しかつ依然として生物学的等価体を与え得る別のものに置換され得ることが理解される。このようなアミノ酸置換において、親水性指数が±２以内であることが好ましく、±１以内であることがより好ましく、および±０．５以内であることがさらにより好ましい。
【００５７】
本発明において、「保存的置換」とは、アミノ酸置換において、元のアミノ酸と置換されるアミノ酸との親水性指数または／および疎水性指数が上記のように類似している置換をいう。保存的置換の例は、当業者に周知であり、例えば、次の各グループ内での置換：アルギニンおよびリジン；グルタミン酸およびアスパラギン酸；セリンおよびスレオニン；グルタミンおよびアスパラギン；ならびにバリン、ロイシン、およびイソロイシン、などが挙げられるがこれらに限定されない。
【００５８】
本明細書において、「改変体」とは、もとのポリペプチドまたはポリヌクレオチドなどの物質に対して、一部が変更されているものをいう。そのような改変体としては、置換改変体、付加改変体、欠失改変体、短縮（ｔｒｕｎｃａｔｅｄ）改変体、対立遺伝子変異体などが挙げられる。対立遺伝子（ａｌｌｅｌｅ）とは、同一遺伝子座に属し、互いに区別される遺伝的改変体のことをいう。従って、「対立遺伝子変異体」とは、ある遺伝子に対して、対立遺伝子の関係にある改変体をいう。「種相同体またはホモログ（ｈｏｍｏｌｏｇ）」とは、ある種の中で、ある遺伝子とアミノ酸レベルまたはヌクレオチドレベルで、相同性（好ましくは、６０％以上の相同性、より好ましくは、８０％以上、８５％以上、９０％以上、９５％以上の相同性）を有するものをいう。そのような種相同体を取得する方法は、本明細書の記載から明らかである。「オルソログ（ｏｒｔｈｏｌｏｇ）」とは、オルソロガス遺伝子（ｏｒｔｈｏｌｏｇｏｕｓ  ｇｅｎｅ）ともいい、二つの遺伝子がある共通祖先からの種分化に由来する遺伝子をいう。例えば、多重遺伝子構造をもつヘモグロビン遺伝子ファミリーを例にとると、ヒトとマウスのαヘモグロビン遺伝子はオルソログであるが，ヒトのαヘモグロビン遺伝子とβヘモグロビン遺伝子はパラログ（遺伝子重複で生じた遺伝子）である。オルソログは、分子系統樹の推定に有用であることから、本発明のオルソログもまた、本発明において有用であり得る。
【００５９】
本明細書において「機能的改変体」とは、基準となる配列が担う生物学的活性を保持する改変体をいう。
【００６０】
本明細書において「保存的（に改変された）改変体」は、アミノ酸配列および核酸配列の両方に適用される。特定の核酸配列に関して、保存的に改変された改変体とは、同一のまたは本質的に同一のアミノ酸配列をコードする核酸をいい、核酸がアミノ酸配列をコードしない場合には、本質的に同一な配列をいう。遺伝コードの縮重のため、多数の機能的に同一な核酸が任意の所定のタンパク質をコードする。例えば、コドンＧＣＡ、ＧＣＣ、ＧＣＧ、およびＧＣＵはすべて、アミノ酸アラニンをコードする。したがって、アラニンがコドンにより特定される全ての位置で、そのコドンは、コードされたポリペプチドを変更することなく、記載された対応するコドンの任意のものに変更され得る。このような核酸の変動は、保存的に改変された変異の１つの種である「サイレント改変（変異）」である。核酸においては、保存的置換は、例えば、プロモーター活性を測定しながら確認することができる。
【００６１】
本明細書中において、機能的に等価なポリペプチドをコードする遺伝子を作製するために、アミノ酸の置換のほかに、アミノ酸の付加、欠失、または修飾もまた行うことができる。アミノ酸の置換とは、もとのペプチドを１つ以上、例えば、１〜１０個、好ましくは１〜５個、より好ましくは１〜３個のアミノ酸で置換することをいう。アミノ酸の付加とは、もとのペプチド鎖に１つ以上、例えば、１〜１０個、好ましくは１〜５個、より好ましくは１〜３個のアミノ酸を付加することをいう。アミノ酸の欠失とは、もとのペプチドから１つ以上、例えば、１〜１０個、好ましくは１〜５個、より好ましくは１〜３個のアミノ酸を欠失させることをいう。アミノ酸修飾は、アミド化、カルボキシル化、硫酸化、ハロゲン化、アルキル化、グリコシル化、リン酸化、水酸化、アシル化（例えば、アセチル化）などを含むが、これらに限定されない。置換、または付加されるアミノ酸は、天然のアミノ酸であってもよく、非天然のアミノ酸、またはアミノ酸アナログでもよい。天然のアミノ酸が好ましい。
【００６２】
本明細書において発現されるべきポリペプチドの核酸形態は、そのポリペプチドのタンパク質形態を発現し得る核酸分子をいう。この核酸分子は、発現されるポリペプチドが天然型のポリペプチドと実質的に同一の活性を有する限り、上述のようにその核酸の配列の一部が欠失または他の塩基により置換されていてもよく、あるいは他の核酸配列が一部挿入されていてもよい。あるいは、５’末端および／または３’末端に他の核酸が結合していてもよい。また、ポリペプチドをコードする遺伝子をストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、そのポリペプチドと実質的に同一の機能を有するポリペプチドをコードする核酸分子でもよい。このような遺伝子は、当該分野において公知であり、本発明において利用することができる。
【００６３】
このような核酸は、周知のＰＣＲ法により得ることができ、化学的に合成することもできる。これらの方法に、例えば、部位特異的変異誘発法、ハイブリダイゼーション法などを組み合わせてもよい。
【００６４】
本明細書において、ポリペプチドまたはポリヌクレオチドの「置換、付加または欠失」とは、もとのポリペプチドまたはポリヌクレオチドに対して、それぞれアミノ酸もしくはその代替物、またはヌクレオチドもしくはその代替物が、置き換わること、付け加わることまたは取り除かれることをいう。このような置換、付加または欠失の技術は、当該分野において周知であり、そのような技術の例としては、部位特異的変異誘発技術などが挙げられる。置換、付加または欠失は、１つ以上であれば任意の数でよく、そのような数は、その置換、付加または欠失を有する改変体において目的とする機能が保持される限り、多くすることができる。例えば、そのような数は、１または数個であり得、そして好ましくは、全体の長さの２０％以内、１０％以内、または１００個以下、５０個以下、２５個以下などであり得る。
【００６５】
本明細書において遺伝子について言及する場合、「ベクター」とは、目的のポリヌクレオチド配列を目的の細胞へと移入させることができるものをいう。そのようなベクターとしては、原核生物細胞、酵母、植物細胞、動物細胞、昆虫細胞、植物個体および動物個体等の宿主細胞において自律複製が可能であるか、または染色体中への組込みが可能で、本発明のポリヌクレオチドの転写に適した位置にプロモーターを含有しているものが例示される。本明細書では、例えば、ＢＡＣベクターを用いることができる。ＢＡＣベクターとは、大腸菌のＦプラスミドをもとにして作製されたプラスミドで、約３００ｋｂ以上の巨大なサイズのＤＮＡ断片をも大腸菌などの細菌内で安定に保持し増殖させることが可能なベクターである。ＢＡＣベクターは、少なくともＢＡＣベクターの複製に必須の領域を含む。その複製に必須の領域としては、例えば、Ｆプラスミドの複製開始点であるｏｒｉＳまたはその改変体が挙げられる。
【００６６】
本明細書において「プロモーター」（またはプロモーター配列）とは、遺伝子の転写の開始部位を決定し、またその頻度を直接的に調節するＤＮＡ上の領域をいい、通常ＲＮＡポリメラーゼが結合して転写を始める塩基配列である。したがって、本明細書においてある遺伝子のプロモーターの働きを有する部分を「プロモーター部分」という。プロモーターの領域は、ＤＮＡ解析用ソフトウエアを用いてゲノム塩基配列中のタンパク質コード領域を予測すれば、プロモーター領域を推定することができる。推定プロモーター領域は、構造遺伝子ごとに変動するが、通常構造遺伝子の上流にあるが、これらに限定されず、構造遺伝子の下流にもあり得る。
【００６７】
本発明において、プロモーターは花弁特異的プロモーターであり得る。花弁特異的プロモーターとしては、アントシアニジン合成酵素遺伝子プロモーターやＭｙｂ転写因子遺伝子プロモーターが挙げられる。Ｍｙｂ転写因子遺伝子（ＭＹＢ遺伝子）プロモーターは、配列番号１５の塩基配列を有し、アントシアニジン合成酵素遺伝子（ＡＮＳ遺伝子）プロモーターは、配列番号１６の塩基配列を有する。他の花弁特異的遺伝子プロモーターとして、花色関連遺伝子が考えられ、ＭＹＢ、ＡＮＳ以外のプロモーターとして下記遺伝子プロモーターが考えられる。これらはいずれもアントシアニンやフラボノールなどの生合成に関わるものである。
ＡＳ（オーレウシジン合成酵素）遺伝子
ＡＮＲ（アントシアニジン還元酵素）遺伝子
ＣＨＩ（カルコン異性化酵素）遺伝子
ＣＨＳ（カルコン合成酵素）遺伝子
ＤＦＲ（ジヒドロフラボノール４−還元酵素）遺伝子
Ｆ３Ｈ（フラバノン３−水酸化酵素）遺伝子
Ｆ３’Ｈ（フラボノイド３’−水酸化酵素）遺伝子
Ｆ３’５’Ｈ（フラボノイド３’，５’−水酸化酵素）遺伝子
ＦＬＳ（フラボノール合成酵素）遺伝子
ＦＮＳ（フラボン合成酵素）遺伝子
ＧＳＴ（グルタチオンＳ−転移酵素）遺伝子
ＵＦ３ＧＴ（ＵＤＰ−グルコース３−Ｏ−グリコシル転移酵素）遺伝子。
【００６８】
本明細書において「エンハンサー」は、目的遺伝子の発現効率を高めるために用いられ得る。エンハンサーは複数個用いられ得るが１個用いられてもよいし、用いなくともよい。プロモーター中のプロモーター活性を強める領域もまたエンハンサーと呼ばれることがある。
【００６９】
本明細書において使用する場合、「作動可能に連結された（る）」とは、所望の配列の発現（作動）がある転写翻訳調節配列（例えば、プロモーター、エンハンサーなど）または翻訳調節配列の制御下に配置されることをいう。プロモーターが遺伝子に作動可能に連結されるためには、通常、その遺伝子のすぐ上流にプロモーターが配置されるが、必ずしも隣接して配置される必要はない。
【００７０】
本明細書において使用する場合、「発現ベクター」は、構造遺伝子およびその発現を調節するプロモーターに加えて種々の調節エレメントが宿主の細胞中で作動し得る状態で連結されている核酸配列をいう。調節エレメントは、好ましくは、ターミネーター、薬剤耐性遺伝子（例えば、カナマイシン耐性遺伝子、ハイグロマイシン耐性遺伝子など）のような選抜マーカーおよび、エンハンサーを含み得る。生物（例えば、植物）の発現ベクターのタイプおよび使用される調節エレメントの種類が、宿主細胞に応じて変わり得ることは、当業者に周知の事項である
本明細書において使用する場合、「導入ベクター」とは、目的のポリヌクレオチド配列を目的の細胞へと移入させることができるベクターをいう。そのようなベクターとしては、原核細胞、酵母、植物細胞、動物細胞、昆虫細胞、植物個体および動物個体等の宿主細胞において自立複製が可能、または染色体中への組込みが可能で、本発明のポリヌクレオチドの転写に適した位置にプロモーターを含有しているものが例示される。
【００７１】
本明細書において「上流」という用語は、特定の基準点からポリヌクレオチドの５’末端に向かう位置を示す。
【００７２】
本明細書において「下流」という用語は、特定の基準点からポリヌクレオチドの３’末端に向かう位置を示す。
【００７３】
本明細書において「発現量」とは、目的の細胞などにおいて、ポリペプチドまたはｍＲＮＡが発現される量をいう。そのような発現量としては、本発明の抗体を用いてＥＬＩＳＡ法、ＲＩＡ法、蛍光抗体法、ウェスタンブロット法、免疫組織染色法などの免疫学的測定方法を含む任意の適切な方法により評価される本発明ポリペプチドのタンパク質レベルでの発現量、またはノーザンブロット法、ドットブロット法、ＰＣＲ法などの分子生物学的測定方法を含む任意の適切な方法により評価される本発明のポリペプチドのｍＲＮＡレベルでの発現量が挙げられる。「発現量の変化」とは、上記免疫学的測定方法または分子生物学的測定方法を含む任意の適切な方法により評価される本発明のポリペプチドのタンパク質レベルまたはｍＲＮＡレベルでの発現量が増加あるいは減少することを意味する。
【００７４】
本明細書において使用する場合、「選抜マーカー」とは、目的の核酸構築物、ベクターを含む宿主細胞を選択する指標として機能する遺伝子をいう。選抜マーカーとしては、蛍光マーカー、発光マーカー、および薬剤耐性選抜マーカーが挙げられるが、これらに限定されない。「蛍光マーカー」としては、緑色蛍光プロテイン（ＧＦＰ）、青色蛍光プロテイン（ＣＦＰ）、黄色蛍光プロテイン（ＹＦＰ）および赤色蛍光プロテイン（ｄｓＲｅｄ）のような蛍光タンパク質をコードする遺伝子が挙げられるが、これらに限定されない。「発光マーカー」としては、ルシフェラーゼのような発光タンパク質をコードする遺伝子が挙げられるが、これらに限定されない。「薬剤耐性選抜マーカー」としては、ハイグロマイシン耐性遺伝子、カナマイシン耐性遺伝子、ネオマイシン耐性遺伝子、ヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ（ｈｐｒｔ）、ジヒドロ葉酸還元酵素遺伝子、グルタミンシンセターゼ遺伝子、アスパラギン酸トランスアミナーゼ、メタロチオネイン（ＭＴ）、アデノシンデアミナーゼ（ＡＤＡ）、アデノシンデアミナーゼ（ＡＭＰＤ１，２）、キサンチン−グアニン−ホスホリボシルトランスフェラーゼ、ＵＭＰシンターゼ、Ｐ−グリコプロテイン、アスパラギンシンテターゼ、およびオルニチンデカルボキシラーゼなどが挙げられる。除草剤耐性遺伝子としては、ＡＬＳ（ＡＨＡＳ）遺伝子やＰＰＯ遺伝子などが挙げられる。「ネガティブ選抜マーカー」としては、ジフテリア毒素タンパク質Ａ鎖遺伝子（ＤＴ−Ａ）、ＥｘｏｔｏｘｉｎＡ遺伝子、Ｒｉｃｉｎ  ｔｏｘｉｎ  Ａ遺伝子、ｃｏｄＡ遺伝子、シトクロムＰ−４５０遺伝子、ＲＮａｓｅ  Ｔ１遺伝子およびｂａｒｎａｓｅ遺伝子などが挙げられるが、これらに限定されない。
【００７５】
（一般生化学・分子生物学）
（一般技術）
本明細書において用いられる分子生物学的手法、生化学的手法、微生物学的手法は、当該分野において周知であり慣用されるものであり、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  Ｊ．ｅｔ  ａｌ．（１９８９）．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒおよびその３ｒｄ  Ｅｄ．（２００１）；Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．（１９８７）．Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｇｒｅｅｎｅ  Ｐｕｂ．Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ  ａｎｄ  Ｗｉｌｅｙ−Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ；Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．（１９８９）．Ｓｈｏｒｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ：Ａ  Ｃｏｍｐｅｎｄｉｕｍ  ｏｆ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｒｏｍ  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｇｒｅｅｎｅ  Ｐｕｂ．Ａｓｓｏｃｉａｔ  ＥＳ  ａｎｄ  Ｗｉｌｅｙ−Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ；Ｉｎｎｉｓ，Ｍ．Ａ．（１９９０）．ＰＣＲ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ：Ａ  Ｇｕｉｄｅ  ｔｏ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ａｎｄ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ；Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．（１９９２）．Ｓｈｏｒｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ：Ａ  Ｃｏｍｐｅｎｄｉｕｍ  ｏｆ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｒｏｍ  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｇｒｅｅｎｅ  Ｐｕｂ．Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ；Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．（１９９５）．Ｓｈｏｒｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ：Ａ  Ｃｏｍｐｅｎｄｉｕｍ  ｏｆ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｒｏｍ  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｇｒｅｅｎｅ  Ｐｕｂ．Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ；Ｉｎｎｉｓ，Ｍ．Ａ．ｅｔ  ａｌ．（１９９５）．ＰＣＲ  Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ；Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．Ｍ．（１９９９）．Ｓｈｏｒｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ：Ａ  Ｃｏｍｐｅｎｄｉｕｍ  ｏｆ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｒｏｍ  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｗｉｌｅｙ，ａｎｄ  ａｎｎｕａｌ  ｕｐｄａｔｅｓ；Ｓｎｉｎｓｋｙ，Ｊ．Ｊ．ｅｔ  ａｌ．（１９９９）．ＰＣＲ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ：Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｆｏｒ  Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ  Ｇｅｎｏｍｉｃｓ，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ、別冊実験医学「遺伝子導入＆発現解析実験法」羊土社、１９９７などに記載されており、これらは本明細書において関連する部分（全部であり得る）が参考として援用される。
【００７６】
人工的に合成した遺伝子を作製するためのＤＮＡ合成技術および核酸化学については、例えば、Ｇａｉｔ，Ｍ．Ｊ．（１９８５）．Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ：Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ，ＩＲＬＰｒｅｓｓ；Ｇａｉｔ，Ｍ．Ｊ．（１９９０）．Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ：Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ，ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ；Ｅｃｋｓｔｅｉｎ，Ｆ．（１９９１）．Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ  ａｎｄ  Ａｎａｌｏｇｕｅｓ：Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ，ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ；Ａｄａｍｓ，Ｒ．Ｌ．ｅｔａｌ．（１９９２）．Ｔｈｅ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ，Ｃｈａｐｍａｎ＆Ｈａｌｌ；Ｓｈａｂａｒｏｖａ，Ｚ．ｅｔ  ａｌ．（１９９４）．Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ｏｆ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ，Ｗｅｉｎｈｅｉｍ；Ｂｌａｃｋｂｕｒｎ，Ｇ．Ｍ．ｅｔ  ａｌ．（１９９６）．Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  ｉｎ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ；Ｈｅｒｍａｎｓｏｎ，Ｇ．Ｔ．（Ｉ９９６）．Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓなどに記載されており、これらは本明細書において関連する部分が参考として援用される。
【００７７】
本明細書において引用された、科学文献、特許、特許出願などの参考文献は、その全体が、各々具体的に記載されたのと同じ程度に本明細書において参考として援用される。
【００７８】
以上、本発明を、理解の容易のために好ましい実施形態を示して説明してきた。以下に、実施例に基づいて本発明を説明するが、上述の説明および以下の実施例は、例示の目的のみに提供され、本発明を限定する目的で提供したのではない。従って、本発明の範囲は、本明細書に具体的に記載された実施形態にも実施例にも限定されず、請求の範囲によってのみ限定される。
【実施例】
【００７９】
（一般的実施例）
１．植物における、液胞への鉄イオンの輸送活性の測定
鉄イオン輸送活性は、鉄の放射性同位元素５９Ｆｅを含む水溶液を切り花に吸収させ、液胞内の５９Ｆｅの取り込みを指標として測定する。あるいは、鉄イオン輸送活性は、導入遺伝子による耐性獲得を指標として、測定することができる。酵母の培養において鉄を含有する培地で鉄感受性変異株を培養すると、変異株は液胞内に鉄を輸送できないので鉄の毒性により致死性を示す。しかし、鉄イオン輸送活性を有するタンパク質をコードする遺伝子を導入した組換え酵母は、液胞内への鉄輸送活性を持つので鉄は液胞内に蓄積され無毒化するため鉄耐性を示す。
【００８０】
２．植物における、鉄イオン貯蔵活性の測定
鉄貯蔵が予想されるタンパク質の遺伝子を大腸菌内で発現させ組換えタンパク質を作る。この時、培地中に鉄の合成安定同位体５７Ｆｅを既知濃度加えておく。作られた組換えタンパク質を精製後、同位体希釈−質量分析法により自然界に最も多く存在する５６Ｆｅと同位体５７Ｆｅの比を求める。添加した５７Ｆｅの量はわかっているので、それから５６Ｆｅ量が求められる。鉄イオン貯蔵活性があれば精製タンパク質において鉄イオンが検出可能される。あるいは、原始吸光法またはＩＣＰ法によっても鉄濃度は測定できる。
【００８１】
（実施例１：チューリップ品種「紫水晶」の花弁で発現している遺伝子の解析）
紫水晶の花弁が着色を開始した時期の蕾を花弁上部と花底部に切り分け、それぞれの花弁内側の表皮１００ｍｇをピンセットで剥ぎ取り１．５ｍｌマイクロチューブに入れ液体窒素で凍結した。凍結した組織はホモジナイザーペッスルを用いて粉砕し、０．５ｍｌのＰｌａｎｔ  ＲＮＡ  Ｒｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  Ｒｅａｇｅｎｔ（インビトロジェン）を加え１０分間室温にてＲＮＡ抽出を行った。抽出後、遠心操作（１５，０００ｒｐｍ、５分）により細胞残渣を沈殿し上清液をＲＮｅａｓｙ  Ｐｌａｎｔ  Ｍｉｎｉ  Ｋｉｔ（キアゲン）を用いてマニュアルに従い精製した。次に精製したＲＮＡからＦｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ  Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ  Ｄｉｓｐｌａｙ  ｋｉｔ  ローダミンバージョン（タカラバイオ）により９種類の蛍光下流プライマーを用いて１ｓｔ  ｃＤＮＡを合成した。さらに、同キットに含まれる２４種類の１０ｍｅｒプライマーおよび１２種類の１０ｍｅｒ  Ｐｒｉｍｅｒ  Ｓｅｔ（オペロン社製）をもちいてマニュアルに従いＰＣＲ反応（９４℃，  ２分；  ４０℃，  １分；  ７２℃，  １分；  ３５サイクル）を行った。この反応では９種類の蛍光アンカープライマーおよび３６種類の上流プライマーを用いて３２４通りのＰＣＲ反応を花弁上部と花底部それぞれの表皮組織で行った。
【００８２】
得られたＰＣＲ産物は８％変性ポリアクリルゲルで電気泳動（１５００Ｖ，  ２ｈｒ）後、フルオロ・イメージアナライザーＦＬＡ−５１００（フジフィルム）で読み取り、花弁上部と花底部の増幅バンドを比較した。その結果、花底部だけで発現している６種類の遺伝子の存在が確認された。そこで、それぞれのＤＮＡバンドをゲルから切り出し、１．５ｍｌマイクロチューブに入れ、５０μｌの滅菌水を加え１００℃、１０分間抽出を行った。さらに、抽出液１μｌと増幅に用いたプライマー組み合わせで再度ＰＣＲ反応を行い、増幅産物を大腸菌クローニングベクターｐＴ７―Ｂｌｕｅ  Ｔベクター（タカラバイオ）にサブクローニングした。
【００８３】
得られたＤＮＡは常法に従いＤＮＡ塩基配列を決定した。さらに、得られた塩基配列情報を基に５’−ＲＡＣＥ用プライマーを設計し５’−ＲＡＣＥシステム（インビトロジェン）により５’側のクローニングを行った。また、同様に大腸菌ベクターへサブクローニング後にＤＮＡの塩基配列を決定した。
【００８４】
得られたＤＮＡ塩基配列情報を基にＤＮＡデータベースで既存の遺伝子との比較を行った結果、タンパク質リン酸化酵素（キナーゼ）遺伝子、ＤＮＡ結合活性を持つタンパク質遺伝子、液胞型鉄イオントランスポーター遺伝子等との相同性を持つことが判明した。また、機能未知の遺伝子も存在した。特に、液胞型鉄イオントランスポーター遺伝子は３種類の配列があることが判明した。これらの結果から、花底部の青色化に直接関係していると思われるのは液胞型鉄イオントランスポーターと相同性を持つ遺伝子であると考え、これらを青色化遺伝子と位置づけ、それぞれＴｇＶＩＴ−Ａ１、ＴｇＶＩＴ−Ａ２およびＴｇＶＩＴ−Ｂ１と命名した。
【００８５】
（実施例２：鉄イオン貯蔵タンパク質フェリチンの遺伝子単離）
フェリチンは細胞内で鉄イオンを貯蔵する機能を持つタンパク質として知られている。植物細胞内では葉緑体（色素体）の中に局在し細胞内の鉄イオン濃度の調節に関与していると考えられている。チューリップの花底部における青色化に鉄イオンが必須であることから、花弁細胞内でフェリチン遺伝子が発現しているのか否かを調べる目的で、チューリップのフェリチン遺伝子の単離を試みた。
【００８６】
まず、チューリップ花弁から単離、精製したＲＮＡを基に５’−ＲＡＣＥシステム（インビトロジェン）を用いて１ｓｔ  ｃＤＮＡを合成し、続いて３’端にＴｄＴとｄＣＴＰを用いてオリゴｄＣを付加した。次に、オリゴｄＣにハイブリダイズするＡｂｒｉｄｅｄ
Ａｎｃｈｏｒ  ｐｒｉｍｅｒと遺伝子配列が既に判明しているダイズ、セイヨウナタネ、シロイヌナズナ、コムギのＤＮＡ塩基配列から相同性の高い領域に対するプライマー（５’−ＣＣＶＡＳＹＣＫＴＣＫＳＡＲＹＴＧＲＧＣＮＡＣＡＴＡＹＴＣ−３’：配列番号５）を合成しＰＣＲ反応（９４℃，１分；６０℃，１分；７２℃，１分；３５サイクル）により増幅した。ここで、プライマー配列における「Ｒ」とはグアニンまたはアデニンを意味し、「Ｙ」とはチミン／ウラシルまたはシトシンを意味し、「Ｍ」とはアデニンまたはシトシンを意味し、「Ｋ」とはグアニンまたはチミン／ウラシルを意味し、「Ｓ」とはグアニンまたはシトシンを意味し、「Ｗ」とはアデニンまたはチミン／ウラシルを意味し、「Ｂ」とはグアニンまたはシトシンまたはチミン／ウラシルを意味し、「Ｄ」とはアデニンまたはグアニンまたはチミン／ウラシルを意味し、「Ｈ」とはアデニンまたはシトシンまたはチミン／ウラシルを意味し、「Ｖ」とはアデニンまたはグアニンまたはシトシンを意味する。その結果、予想されるサイズ（８００ｂｐ）での増幅が得られた。さらに、この増幅産物がフェリチン遺伝子の一部であることを確認するため、得られたＤＮＡ断片の内部に存在するダイズ、セイヨウナタネ、シロイヌナズナ、コムギのＤＮＡ塩基配列において相同性の高い領域に対するプライマー（５’−ＲＴＢＡＲＹＧＡＲＣＡＲＡＴＣＡＡＴＧＴＧＧＡＲＴＷＣＡＡ−３’：配列番号６）を合成し、再度ＰＣＲを行った。その結果、予想されたサイズ（４３０ｂｐ）に増幅断片を得ることができたことから、最初に増幅した８００ｂｐのＤＮＡはフェリチン遺伝子の一部であることが示された。さらに、塩基配列の結果フェリチンであることが確認された。また、得られたＤＮＡ断片の塩基配列を基にプライマーを合成（５’−ＴＣＣＣＡＴＣＣＣＴＴＣＴＣＴＣＴＣＣＡＣＡＣＣＣＣＧ―３’：配列番号７）し、ｏｌｉｇｏｄＴプライマーとの間でてＰＣＲ（９４℃，３０秒；６０℃，３０秒；７２℃，１分；３５サイクル）を行いフェリチン遺伝子下流領域のクローン化並びに塩基配列決定を行った。その結果、チューリップフェリチン遺伝子は１，０６０ｂｐからなり２４８アミノ酸からなる分子量２７，２８８のタンパク質をコードすることが明らかになった（図３）。また、他植物のフェリチン同様、チューリップのフェリチンはＮ末端側に葉緑体（色素体）移行シグナル配列を持ち、成熟型タンパク質はシロイヌナズナと７７％、イネと７４％の相同性を示したことから単離した遺伝子をＴｇＦＥＲ１と命名した。
【００８７】
（実施例３：青色化遺伝子および鉄イオン貯蔵タンパク質フェリチン遺伝子の花弁発達過程での発現解析）
青色化遺伝子とフェリチン遺伝子が花の発達過程でどのような発現パターンを示すかは、花色発現に関わることであり重要であると考えられる。そこで、紫水晶の抱芽期から老化期まで６段階に分けた花弁（図４ａ）を材料に、各発育ステージ毎に実施例１同様花弁上部と花底部を切り分け、それぞれの表皮および柔組織から全ＲＮＡを単離、精製した。次に得られたＲＮＡ２μｇを基にＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔ  ＩＩ（インビトロジェン）により１ｓｔ  ｃＤＮＡ合成をした。ＴｇＶＩＴに特異的プライマー（Ｆ１：５’−ＧＡＧＣＣＴＣＡＣＧＴＧＴＡＴＡＡＴＣＣ−３’，Ｒ１（配列番号８）：５’−ＴＧＣＡＣＴＣＴＣＴＡＧＴＧＣＴＣＴＣＣ−３’（配列番号９））およびＴｇＦＥＲ特異的プライマー（Ｆ１：５’−ＴＧＣＡＴＡＣＴＴＴＧＡＴＣＧＧＧＡＣＡ―３’，Ｒ１（配列番号１０）：５’−ＴＣＧＧＡＧＧＣＡＴＣＡＧＧＡＴＡＧＡＣ―３’（配列番号１１））を用いて定量ＰＣＲを行った。内部標準遺伝子として細胞内で恒常的に発現しているＧＡＰＤＨ（ｇｌｙｃｅｒａｌｄｅｈｙｄｅｓ−３−ｐｈｏｓｐｈａｔｅ  ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ）遺伝子（Ｆ１：５’−ＣＡＡＧＴＣＴＧＡＣＡＴＣＣＡＣＡＴＴＧ−３’，Ｒ１（配列番号１２）：５’−ＴＧＣＡＣＡＧＴＡＧＴＣＡＴＣＡＡＡＣＣ−３’（配列番号１３））を用い開花期（ｓｔａｇｅ  ４）の花弁上部表皮組織で発現しているＴｇＶＩＴまたはＴｇＦＥＲの発現量を１とした相対値で遺伝子発現の相対定量値を求めた。
【００８８】
その結果、ＴｇＶＩＴ遺伝子の発現は花底部の表皮組織に特異的であり、開花以前の蕾（ｓｔａｇｅ  １〜３）で高く、着色が始まるｓｔａｇｅ  ４以降は抑制されることが明らかになった（図４ａ）。この現象は、花底部での鉄イオンが開花以前から液胞内に蓄積していることを示唆し、青色発現が紫色を経ずに始まる現象を裏付けている。また、ＴｇＦＥＲ遺伝子の発現は花弁上部の表皮組織および柔組織で高く、花底部では低い。特に、表皮組織での着色が始まるｓｔａｇｅ  ４で一時的に高くなり、柔組織では抱芽期（ｓｔａｇｅ  １）から着色期（ｓｔａｇｅ  ４）にかけて発現が誘導される（図４ｂ）。以上の結果から、理論に束縛されることは意図しないが、花底部ではＴｇＶＩＴ遺伝子が発現し、ＴｇＦＥＲ遺伝子の発現が抑制されることで、鉄イオンは液胞に蓄積し青色を発現する。花弁上部ではＴｇＶＩＴ遺伝子の発現が抑制され、ＴｇＦＥＲ遺伝子が発現することで、鉄イオンは色素体に移行し液胞に蓄積されないため紫色を呈するという推測が考えられた。このような現象はこれまで全く知られておらず、今回の実験で初めて明らかにされたものである。
【００８９】
（実施例４：青色化遺伝子およびフェリチン遺伝子の組織別発現解析）
青色化遺伝子とフェリチン遺伝子が花弁以外の組織でどう発現しているかを明らかにすることは、これら遺伝子の特性を調べる上で重要であり、組織中の鉄イオンの動態を推察する上でも重要である。そのため、葉、茎、球根（りん片）、根での遺伝子発現量を比較した。その結果、開花期での青色化遺伝子の発現は、葉や茎など他の組織でも若干発現が見られるものの花底部表皮組織で最も高く、花底部に特異性が高いことが判明した（図５ａ）。すなわち、チューリップの特性を調べたことによってこのような遺伝子の関与が初めて明らかにされたと言える。さらに、同時期のフェリチン遺伝子は花弁上部の表皮組織や柔組織また茎で強く発現している（図５ｂ）。これもチューリップの特性であり、これまで他の植物も含めて花弁上部と花底部での遺伝子発現の違いを調べた例はなく、本発明によって初めて明らかにされた現象である。以上の結果から、開花期において青色化遺伝子およびフェリチン遺伝子の発現は花弁組織での発現が最も高く、花色発現に大きく関係していることが示唆された。
【００９０】
（実施例５：青色化遺伝子およびフェリチン遺伝子の他品種での発現）
紫水晶で明らかになった青色化遺伝子とフェリチン遺伝子の花弁での発現パターンが紫水晶に特徴的なものか、あるいは他の品種にも共通する現象かを調べることは青色化メカニズムの不変性を論ずる上で重要なことである。そこで、花底部が青い紫水晶、白雪姫、ミレラ、紫雲、クィーンオブナイトおよび花底部が青くない白雲、メセアポゼラン、黄小町、ゴールデンメロディー、ゴールデンエンパイヤステート、パープルパレス、ネプチューンの蕾（ｓｔａｇｅ４）の花弁上部および花底部表皮組織における遺伝子発現量を定量ＰＣＲ法にて比較した。
【００９１】
その結果、青色化遺伝子の発現は、花底部が青い品種すべてにおいて花弁上部では発現せず花底部のみで発現し、特にミレラやクィーンオブナイトでは紫水晶より強く発現していた（図６ｂ）。また、花底部が青くない品種では黄小町とゴールデンエンパイヤステートの花底部で発現が見られるものの、他の品種では花底部での発現は見られなかった。黄小町とゴールデンエンパイヤステートでは青色化遺伝子の発現により液胞への鉄イオンの蓄積があるが、デルフィニジン色素が作られていないため青くはならないと考えられる。
【００９２】
フェリチン遺伝子の発現は、花底部の青い品種すべてにおいて花弁上部の表皮組織で強く発現し花底部での発現は低い。また、花底部が青くない品種ではゴールデンメロディとゴールデンエンパイヤステートが花弁上部で強く発現するものの、他の品種では花弁上部と同程度に花底部でも発現している（図６ｃ）。さらに、パープルパレスやネプチューンは花弁が紫色であるにも関わらず花底部は青くない。これは、花底部で青色化遺伝子が発現せず、フェリチン遺伝子が発現していることによって、鉄イオンが液胞に運ばれないためであると考えられる。
【００９３】
以上の結果から、花底部が青い品種においてはいずれも花底部での青色化遺伝子の発現とフェリチン遺伝子の発現抑制が見られることから、これら遺伝子の発現制御がチューリップでは不変的に青色化に深く関わっていることが示された。また、これらの結果から青色化遺伝子は単に液胞への鉄イオン輸送という機能のみならず明確に青色を発現するために機能していると言える。
【００９４】
（実施例６：遺伝子導入用ベクターの構築）
青色化遺伝子とフェリチン遺伝子が花弁の青色化に関わることを証明するため、花弁上部の紫色細胞への遺伝子導入を試みた。
【００９５】
まず、Ｇａｔｅ  ｗａｙ  システムによりベクターを作成するため、エントリーベクターｐＥＮＴＲ／ＳＤ／Ｄ（インビトロジェン）にマニュアルに従いＴｇＶＩＴ−Ａ１遺伝子またはＴｇＦＥＲ１遺伝子またはＴｇＶＩＴ−Ａ１のアンチセンス（逆向き）またはＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）用にＴｇＦＥＲ１遺伝子の一部を繋いだエントリーベクターを作製した。ＲＮＡｉのコンストラクトに使った部分はフェリチンｃＤＮＡの２９２−５４７ｂｐの部分（図９における大文字部分）であり、間にＡｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ  ＷＲＫＹ３３  ｇｅｎｅ由来のイントロンとベクターの配列（図９における小文字部分）が挟まれている（配列番号１４）（図９を参照のこと）。
【００９６】
次にＬＲクロナーゼ酵素（インビトロジェン）によりディスティネーションベクターｐＢＩ−ＯＸ−ＧＷ（ＧＦＰ）（インプランタイノベーションズ）に目的遺伝子を移行し遺伝子導入用ベクターｐＢＩ−ＢＣＦ、ｐＢＩ−ａｎｔｉＢＣＦ、ｐＢＩ−ＦＥＲを作成し、ｐＢＩ−ｓｅｎｓｅ，ａｎｔｉｓｅｎｓｅ−ＧＷ（インプランタイノベーションズ）を用いてｐＢＩ−ＦＥＲ−ＲＮＡｉを作成し、さらにｐＢＩ−ＦＥＲ−ＲＮＡｉの制限酵素ＰｍｅＩ部位にｐＢＩ−ＢＣＦのＡｖｒＩＩ−ＥｃｏＲＩ部位を末端平滑化後に連結しｐＢＩ−ＢＣＦ−ＦＥＲ−ＲＮＡｉを作製した（図７）。それぞれのベクターには遺伝子導入の際に標識となるＧＦＰ（緑色蛍光タンパク質）遺伝子が組み込まれている。
【００９７】
（実施例７：紫色花弁細胞への遺伝子導入）
実施例６において作成した遺伝子導入用ベクターをパーティクルガン法によってチューリップ紫水晶の花弁上部紫色細胞へ遺伝子導入し色の変化を観察した。
【００９８】
１．５ｍｌ用マイクロチューブにパーティクルガン用金粒子（０．６μｍ）０．３ｍｇ（６０ｍｇ／ｍｌ濃度）を入れ、ベクターＤＮＡ５μｇ（１μｇ／μｌ濃度）を加えよく混合した。それに更に２．５Ｍ塩化カルシウム溶液５０μｌと０．１Ｍスペルミジン溶液２０μｌを順次加えボルテックスミキサーで３分間混合した。それを３０分間室温で静置した後、５００ｒｐｍ、３分遠心し金粒子を沈殿した。その上清を捨てた後、７０％エタノールを１ｍｌ加え金粒子を洗い、遠心後エタノールを除き、さらに１００％エタノール１ｍｌで洗浄した。さらに遠心後エタノールを除き、最後に１００％エタノール１００μｌを加え金粒子をよくほぐしながらエタノール中に分散させた。さらに、超音波処理により金粒子を細かく分散させた。これを１０μｌずつマイクロキャリアディスクの中央に乗せ風乾した。次に、パーティクルガン装置（バイオラッドＰＤＳ−１０００／Ｈｅシステム）を使い２８インチＨｇの真空下で１３５０ｐｓｉの圧力で遺伝子導入を行った。
【００９９】
遺伝子導入した花弁は２０℃に置き２日後に蛍光実体顕微鏡の青色光励起下でＧＦＰタンパク質により緑色蛍光を発する細胞が遺伝子導入された細胞であることからその細胞の色を観察した。
【０１００】
その結果、青色化遺伝子を発現するｐＢＩ−ＢＣＦ導入細胞では紫色から青色への改変が見られ、青色化遺伝子を逆向きに挿入したｐＢＩ−ａｎｔｉ−ＢＣＦでは青色化しないことが確かめられた。このことから青色化遺伝子の発現が花底部における青色化に必須であることが示された（図８）。また、フェリチン遺伝子を発現するｐＢＩ−ＦＥＲおよびＲＮＡ干渉によってフェリチン遺伝子の発現を抑制するｐＢＩ−ＦＥＲ−ＲＮＡｉ導入細胞の花色は紫色のままであることから、フェリチン遺伝子は直接青色化には影響しないと考えられた。ところが、青色化遺伝子を発現しかつフェリチン遺伝子の発現を抑制するｐＢＩ−ＢＣＦ−ＦＥＲ−ＲＮＡｉ導入細胞はｐＢＩ−ＢＣＦ導入細胞より濃い青色を示すことから、フェリチン遺伝子の発現抑制が青色化へ間接的に影響していることが示された（図８）。
【０１０１】
これは、花底部での青色発現を再現しているものであり、これまでの推論が正しいことを示す結果であるといえる。すなわち、「紫水晶」花底部では青色化遺伝子の発現とフェリチン遺伝子の発現抑制により青色発現が行われており、これら遺伝子の発現を花弁上部の紫色細胞で再現することにより、青色細胞と同程度の青さを紫色細胞でも再現できることを示した最初の例である。
【０１０２】
ここで改変した青色を客観的に表現するために一般に色を数値として表すＣＩＥＬ＊ａ＊ｂ＊表色系による色彩値を求めた。方法は、顕微分光測光法により顕微分光測光計（日本分光MSV-300型）により細胞の色彩をＣＩＥＬ＊ａ＊ｂ＊値で表した。その結果、表１
に示す通り青色の数値が得られた。
【０１０３】
【表１】
2010022365.tif 000002
上述のように、本発明では、以下のように紫色、青色、および濃い青色を指定する。
紫色        ２０≦Ｌ＊≦８０，    ４０≦ａ＊≦９０，      −５０＜ｂ＊≦−１０
青色        ２０≦Ｌ＊≦８０，    −８≦ａ＊≦９０，    −１０７≦ｂ＊≦−５０
濃い青色      ５≦Ｌ＊＜２０，    −８≦ａ＊≦９０，    −１０７≦ｂ＊≦−５０
表１において、紫色の細胞（Ｌ＝３７．９，ａ＝６８．８，ｂ＝−４４．８）は上記の紫色の範囲に含まれ、青色化遺伝子の導入により青色の細胞（Ｌ＝２２．８，ａ＝６０．８，ｂ＝−８２．８）へと変化した。さらに、青色化遺伝子とフェリチン抑制遺伝子を導入した場合の青色細胞（Ｌ＝７．１，ａ＝２６．５，ｂ＝−５９．５）となり、単に青色化遺伝子を導入した細胞に比べて明るさや赤色が顕著に下がっており濃い青色に変化したことが読み取られる。
【０１０４】
（実施例８  遺伝子導入ベクターｐＢＩ−ＢＣＦのカルスへの導入）
カルスに、実施例６において作製した青色化遺伝子導入ベクターｐＢＩ−ＢＣＦを導入した。
【０１０５】
（カルスの誘導）
チューリップ球根の外側の外皮を剥き、２〜４分割程度の大きさに切り分けた。それを滅菌した密閉容器に入れ、１０％次亜塩素酸ナトリウム溶液を球根が十分浸かる程度に加え５〜１０分間超音波をかけた。その後、５〜１０分間静置し球根の滅菌を行った。滅菌処理後、クリーンベンチ内において滅菌水で２〜３回球根をすすぎ、濾紙上で球根のりん片を厚さ２ｍｍ程度にスライスし、カルス誘導培地に置床した。
【０１０６】
カルス誘導は、基本培地をＭＳ（Ｍｕｒａｓｈｉｇｅ  ＆  Ｓｋｏｏｇ）培地とした。ただし、無機塩類は１／２倍濃度で、ＮＨ４ＮＯ３のみ１／４倍濃度を使用した。以下に、組成および濃度を示す。
（無機塩類）１Ｌ当たり、
ＮＨ４ＮＯ３              ０．４１ｇ
ＫＮＯ３                ０．９５ｇ
ＫＨ２ＰＯ４              ８５ｍｇ
ＭｎＳＯ４・４Ｈ２Ｏ      １１．１５ｍｇ
ＺｎＳＯ４・４Ｈ２Ｏ      ４．３ｍｇ
ＣｕＳＯ４・５Ｈ２Ｏ      ０．０１２５ｍｇ
ＮａＭｏＯ４・２Ｈ２Ｏ    ０．１２５ｍｇ
ＣｏＣｌ２・６Ｈ２Ｏ      ０．０１２５ｍｇ
ＫＩ                    ０．４１５ｍｇ
Ｈ３ＢＯ３                ３．１ｍｇ
ＣａＣｌ２・２Ｈ２Ｏ      ２２０ｍｇ
ＭｇＳＯ４・７Ｈ２Ｏ      １８５ｍｇ
ＦｅＳＯ４・７Ｈ２Ｏ      １３．９ｍｇ
Ｎａ２−ＥＤＴＡ          １８．６５ｍｇ
（ビタミン類）
ニコチン酸            ０．５ｍｇ
チアミン塩酸          ０．１ｍｇ
ピリドキシ塩酸        ０．５ｍｇ
ミオ−イノシトール    １００ｍｇ
グリシン              ２ｍｇ
（糖）
サッカロース  ４０ｇ
（植物ホルモン）
２，４−Ｄ（２，４−Ｄｉｃｈｌｏｒｏｐｈｅｎｏｘｙａｃｅｔｉｃ  Ａｃｉｄ）    １ｍｇ
ＢＡ（６−Ｂｅｎｚｙｌａｄｅｎｉｎｅ）    １ｍｇ
（固化剤）
ゲランガム    ２ｇ
（ｐＨ調整）
ｐＨ５．８  ＫＯＨ
【０１０７】
これらの成分を混合した後、１２１℃、２０分間オートクレーブにより滅菌し、６０℃程度に冷めたら９ｃｍの滅菌シャーレに分注した。培地上にりん片の切片を置床したらパラフィルムで密閉し、２０℃、暗条件で培養した。
【０１０８】
（遺伝子導入）
上記りん片置床から１〜２ヶ月経過しカルス形成が認められた後、パーティクルガン法によりカルス細胞への遺伝子導入を図った。以下に遺伝子導入条件を示す。
【０１０９】
金粒子の調製：金粒子（６０ｍｇ／ｍｌ）を１．５ｍｌマイクロチューブに取り、９９．５％エタノール１ｍｌを加え激しく懸濁した。その後、７，０００ｒｐｍで遠心し金粒子を沈殿させ、エタノールを捨てた。そこに滅菌水１ｍｌを加えて洗浄し、遠心後、滅菌水を捨てた。次いで５０％グリセロールを加え、よく懸濁した。
【０１１０】
金粒子へのＤＮＡコーティング：金粒子５０μｌ（０．３ｍｇ）を１．５ｍｌマイクロチューブにとり、遺伝子導入ベクター（ｐＢＩ−ＢＣＦ）ＤＮＡ（１μｇ／μｌ）５μｌを加え、ボルテックスミキサーで激しく混合した。そこに、ＣａＣｌ２（２．５Ｍ）５０μｌとスペルミジン（０．１Ｍ）２０μｌを順次加え、ボルテックスミキサーで混合した。混合後、室温で３０分間静置し、その後、７，０００ｒｐｍで遠心後上清を取り除き、新たに７０％エタノール１ｍｌを加え軽く攪拌した。遠心後エタノールを取り除き、新たに９９．５％エタノール１ｍｌを加え軽く攪拌した。遠心後エタノールを除き、新たに９９．５％エタノール５０μｌを加え金粒子をよく懸濁した。その懸濁液１０μｌずつをマイクロキャリアの中心にのせ、風乾した。以下の条件でカルス細胞への遺伝子導入を行った。
【０１１１】
遺伝子導入装置：ＰＤＳ−１０００／Ｈｅパーティクルデリバリーシステム（バイオラッド製）
遺伝子導入圧力：１，５５０〜１，８００ｐｓｉ
真空度：２８ｉｎＨｇ
金粒子径：０．６〜１．０μｍ。
【０１１２】
遺伝子導入から２日目、２週間目および３週間目の細胞増殖と遺伝子導入細胞におけるＧＦＰ発現の様子を示す。図１０に示す通り、青色化導入遺伝子ベクターｐＢＩ−ＢＣＦを導入した細胞は、３週間目以降、カルス細胞がクロロシス（鉄欠乏）になって白化し（図１０における矢印を参照のこと）、それ以上増殖しないことが明らかになった。理論に束縛されることを意図しないが、この現象は、青色化遺伝子が発現することにより、鉄が液胞内に輸送され、細胞質内の鉄濃度が極端に減少したためであると考えられる。この事象は、植物体に害を及ぼさずに液胞内の鉄イオンレベルを人為的に調節することが非常に困難であるということを示す一例である。
【０１１３】
（実施例９  花弁特異的プロモーターの単離）
花弁特異的に遺伝子発現を誘導するプロモーターを新規に単離した。具体的には、ます、花色の発現に関連する遺伝子であるＭｙｂ転写因子遺伝子（ＭＹＢ遺伝子）およびアントシアニジン合成酵素遺伝子（ＡＮＳ遺伝子）を単離した。ＭＹＢ遺伝子およびＡＮＳ遺伝子の発現解析を行ったところ、花弁での発現が最も強く、花弁上部と花底部の両方で発現し、他の組織においてはほとんど発現していないことが明らかになった（図１１を参照のこと）。
【０１１４】
次いで、ＭＹＢ遺伝子およびＡＮＳ遺伝子のプロモーターを、以下の方法（ＲｉｇｈｔＷａｌｋ法）によって単離し、そのＤＮＡ塩基配列を決定した。
ゲノムＤＮＡの既知配列（ＡＮＳ遺伝子とＭＹＢ遺伝子）から未知のプロモーター領域をクローニングするため、株式会社ベックスのＲｉｇｈｔＷａｌｋキットを使用した。
【０１１５】
１．既知配列内に切断箇所を持たない制限酵素を用いてゲノムＤＮＡを処理する。
２．Ｋｌｅｎｏｗ酵素（３’→５’ｅｘｏ−）を用いて１塩基伸長を行う。
３．アダプターの結合を行う。
４．アダプターに特異的なプライマー（ＷＰ１）および既知配列特異的プライマー（ＳＰ１）を用いて１回目のＰＣＲを行う。
５．１回目のＰＣＲ産物を１００倍希釈し、２回目のＰＣＲ用の鋳型にする。
６．１回目のＰＣＲに用いたプライマーの内側に位置するアダプターに特異的なプライマー（ＷＰ２）および既知配列特異的プライマー（ＳＰ２）を用いて２回目のＰＣＲを行う。
７．増幅産物の塩基配列を解析し、一部既知配列を含む未知の配列であることを確かめる。
【０１１６】
より詳細には、Ｔｏｋｕｊｉ  Ｔｓｕｃｈｉｙａ，Ｎａｎａｋｏ  Ｋａｍｅｙａ  ａｎｄ  Ｉｋｕｏ  Ｎａｋａｍｕｒａ（２００９）Ｓｔｒａｉｇｈｔ  Ｗａｌｋ：Ａ  ｍｏｄｉｆｉｅｄ  ｍｅｔｈｏｄ  ｏｆ  ｌｉｇａｔｉｏｎ−ｍｅｄｉａｔｅｄ  ｇｅｎｏｍｅ  ｗａｌｋｉｎｇ  ｆｏｒ  ｐｌａｎｔ  ｓｐｅｃｉｅｓ  ｗｉｔｈ  ｌａｒｇｅ  ｇｅｎｏｍｅ．Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ３８８：１５８−１６０を参照のこと。
【０１１７】
（ＭＹＢ遺伝子プロモーターの単離）
１．制限酵素Ｎｈｅ  Ｉを用いて５００ｎｇのゲノムＤＮＡを３７℃、１時間処理
＜反応液組成＞
ＤＮＡ（５００ｎｇ）      ７．０  ｕＬ
１０×制限酵素バッファ    ２．０  ｕＬ
ＮｈｅＩ（１０Ｕ）        １．０  ｕＬ
滅菌水                    １０．０  ｕＬ
Ｔｏｔａｌ                ２０．０  ｕＬ
【０１１８】
２．ｄＣＴＰを基質にＫｌｅｎｏｗ酵素を用いて２５℃、１５分間の１塩基伸長反応を行った。その後、７２℃、２０分間の処理によりＫｌｅｎｏｗ酵素を失活させた。
＜反応液組成＞
ステップ１反応液                        １０．０  ｕＬ
ｄＣＴＰ  （１ｍＭ）                    １．０  ｕＬ
Ｋｌｅｎｏｗ  （３’→５’ｅｘｏ−）    １．０  ｕＬ
Ｔｏｔａｌ                              １２．０  ｕＬ
【０１１９】
３．ＲＷＡ−２アダプターをＴ４  ＤＮＡ  ｌｉｇａｓｅにより１６℃、１６時間の結合を行った。
＜反応液組成＞
ステップ２反応液              １２．０  ｕＬ
ＲＷＡ−２                    ２．０  ｕＬ
Ｔ４  ＤＮＡ  ｌｉｇａｓｅ    ２．０  ｕＬ
１０×ｌｉｇａｓｅ  バッファ  ２．４  ｕＬ
滅菌水                        ５．６  ｕＬ
Ｔｏｔａｌ                    ２４．０  ｕＬ
【０１２０】
４．ステップ３の反応液２４μｌに水２６μｌを加え、その１μｌを鋳型に１回目のＰＣＲを行った。
プライマー配列
ＷＰ１：ＣＧＣＡＧＧＣＴＧＧＣＡＧＴＣＴＣＴＴＴＡＧ（配列番号１７）
ＳＰ１：ＴＴＣＧＡＧＡＣＴＧＡＡＧＡＴＧＡＡＧＡＴＡＴＡＣＣＴＧ（配列番号１８）
＜反応液組成＞
鋳型ＤＮＡ                            １．０  ｕＬ
ＫＯＤポリメラーゼ（５Ｕ／ｕＬ）      １．０  ｕＬ
１０×ＰＣＲバッファ                  ５．０  ｕＬ
ｄＮＴＰｓ（２ｍＭ）                  ５．０  ｕＬ
ＭｇＳＯ４（２５ｍＭ）                  ２．０  ｕＬ
ＷＰ１（１０ｐｍｏｌ）                １．０  ｕＬ
ＳＰ１（１０ｐｍｏｌ）                １．０  ｕＬ
滅菌水                                ３４．０  ｕＬ
Ｔｏｔａｌ                            ５０．０  ｕＬ
＜反応条件＞
９４℃  ２分  （１サイクル）
９４℃  ３０秒
６５℃  ３０秒
６８℃  ７分    （３５サイクル）
【０１２１】
５．１回目のＰＣＲ産物を１μｌを鋳型に２回目のＰＣＲを行った。反応液組成はプライマー以外、ステップ４と同じ。反応条件も同じ。
プライマー配列
ＷＰ２：ＡＴＧＣＧＧＣＣＧＣＴＣＴＣＴＴＴＡＧＧＧＴＴＡＣＡＣＧＡＴＴＧＣＴＴ（配列番号１９）
ＳＰ２：ＴＣＣＡＴＡＧＴＣＣＡＴＧＧＴＣＣＴＴＴＣＣＴＡＡＣ（配列番号２０）
【０１２２】
６．１ｋｂｐ以上のＰＣＲ産物の増幅を確認した。
【０１２３】
７．得られたＰＣＲ産物をＴＯＰＯベクターにＴＡクローニングし、塩基配列を解析した。
その結果、ＭＹＢ遺伝子上流のプロモーターを含むと予想される未知配列１，２０８ｂｐを得た。
【０１２４】
（ＡＮＳ遺伝子プロモーターの単離）
１．制限酵素ＢａｍＨ  Ｉ  を用いて５００ｎｇのゲノムＤＮＡを３７℃、１時間処理
＜反応液組成＞
ＤＮＡ（５００ｎｇ）      ７．０  ｕＬ
１０×制限酵素バッファ    ２．０  ｕＬ
ＢａｍＨＩ（１０Ｕ）      １．０  ｕＬ
滅菌水                    １０．０  ｕＬ
Ｔｏｔａｌ                ２０．０  ｕＬ
【０１２５】
２．ｄＧＴＰを基質にＫｌｅｎｏｗ酵素を用いて１塩基伸長反応を行った。
＜反応液組成＞
ステップ１反応液                        １０．０  ｕＬ
ｄＧＴＰ  （１ｍＭ）                    １．０  ｕＬ
Ｋｌｅｎｏｗ  （３’→５’ｅｘｏ−）    １．０  ｕＬ
Ｔｏｔａｌ                              １２．０  ｕＬ
【０１２６】
３．ＲＷＡ−１アダプターのＴ４  ＤＮＡ  ｌｉｇａｓｅによる結合を行った。
＜反応液組成＞
ステップ２反応液              １２．０  ｕＬ
ＲＷＡ−１                    ２．０  ｕＬ
Ｔ４  ＤＮＡ  ｌｉｇａｓｅ    ２．０  ｕＬ
１０×ｌｉｇａｓｅ  バッファ  ２．４  ｕＬ
滅菌水                        ５．６  ｕＬ
Ｔｏｔａｌ                    ２４．０  ｕＬ
【０１２７】
４．アダプターを結合した反応液２４μｌに水２６μｌを加え、その１μｌを鋳型に１回目のＰＣＲを行った。
プライマー配列
ＷＰ１：ＣＧＣＡＧＧＣＴＧＧＣＡＧＴＣＴＣＴＴＴＡＧ（配列番号２１）
ＳＰ１：ＣＴＣＡＣＣＴＴＣＴＣＡＡＴＣＡＣＣＴＣＴＴＴＴＧＣ（配列番号２２）
＜反応液組成＞
鋳型ＤＮＡ                        １．０  ｕＬ
ＫＯＤポリメラーゼ（５Ｕ／ｕＬ）  １．０  ｕＬ
１０×ＰＣＲバッファ              ５．０  ｕＬ
ｄＮＴＰｓ（２ｍＭ）              ５．０  ｕＬ
ＭｇＳＯ４（２５ｍＭ）              ２．０  ｕＬ
ＷＰ１（１０ｐｍｏｌ）            １．０  ｕＬ
ＳＰ１（１０ｐｍｏｌ）            １．０  ｕＬ
滅菌水                            ３４．０  ｕＬ    
Ｔｏｔａｌ                        ５０．０  ｕＬ
＜反応条件＞
９４℃  ２分  （１サイクル）
９４℃  ３０秒
６５℃  ３０秒
６８℃  ７分    （３５サイクル）
【０１２８】
５．１回目のＰＣＲ産物を１μｌを鋳型に２回目のＰＣＲを行った。反応液組成はプライマー以外、ステップ４と同じ。反応条件も同じ。
プライマー配列
ＷＰ２：ＡＴＧＣＧＧＣＣＧＣＴＣＴＣＴＴＴＡＧＧＧＴＴＡＣＡＣＧＡＴＴＧＣＴＴ（配列番号２３）
ＳＰ２：ＴＣＡＡＣＡＣＡＣＴＴＣＧＣＣＣＴＣＴＣＣＴＴＣ（配列番号２４）
【０１２９】
６．１ｋｂｐ以上のＰＣＲ産物の増幅を確認した。
【０１３０】
７．得られたＰＣＲ産物をＴＯＰＯベクターにＴＡクローニングし、塩基配列を解析した。
【０１３１】
その結果、ＡＮＳ遺伝子上流のプロモーターを含むと予想される未知配列８７９ｂｐを得た。
【０１３２】
上述の方法によって単離したＭＹＢ遺伝子プロモーターの塩基配列（配列番号１５）を図１２に、ＡＮＳ遺伝子プロモーターの塩基配列（配列番号１６）を、図１３にそれぞれ示す。
【０１３３】
単離したＭＹＢ遺伝子プロモーターおよびＡＮＳ遺伝子プロモーターが、実際にプロモーター活性を有しているか否かを試験するために、それぞれのプロモーター領域に青色化遺伝子（ＶＩＴ遺伝子）を繋いだベクター（ｐＢＴ−１およびｐＢＴ−１１）を構築し（図１４を参照のこと）、パーティクルガン法により花弁の紫色細胞に遺伝子導入を行った。その結果、青色化遺伝子が導入された紫色細胞において、紫色から青色への細胞の色の変化が観察された（図１５を参照のこと）ことから、それぞれのプロモーターが、実際に青色化遺伝子の発現を誘導するプロモーター活性を有していることが明らかになった。
【０１３４】
（実施例１０  花弁特異的プロモーターを用いるカルスへの青色化遺伝子の導入）
実施例９で作製した青色化遺伝子導入用ベクターｐＢＴ−１およびｐＢＴ−１１を、カルスに、実施例８と同様の方法によって導入した。遺伝子導入後、カルス誘導培地で培養を続け、２〜４週間後、カルス誘導培地にビアラホス（５０ｍｇ／ｌ）加えた培地に移植した。２〜３ヶ月の培養後、以下の再分化培地に移植し再分化を誘導した。再分化条件は、植物ホルモン２，４−Ｄ  ０．０１ｍｇ、ＢＡ  ０．２ｍｇであり、その他はカルス誘導条件と同じであった。ただし、光照射（約２，０００ｌｕｘ）で培養した。驚くべきことに、実施例８および図１０において観察されたようなカルスの増殖阻害は観察されず、細胞選抜後に再分化することが明らかになった（図１６を参照のこと）。遺伝子導入されたシュートまたはその一部（丸枠）で、ＧＦＰ蛍光を確認できる。
【０１３５】
（実施例１１：青い花弁を有する植物体の作出）
カルスに、花弁特異的プロモーター、青色化遺伝子、および選抜マーカーを含む遺伝子導入ベクターを導入し、次いで例えば選抜薬剤を含む培地中で培養を行って目的の遺伝子が導入された細胞のみを増殖させ、これを再生させることによって、青い花弁を有する植物体を得ることができる。
【０１３６】
チューリップは、例えば、球根りん片を厚さ２〜３ｍｍにスライスし、これをＭｕｒａｓｈｉｇｅ−Ｓｋｏｏｇ培地（ショ糖２０ｇ／Ｌ、２，４−Ｄ  ２ｍｇ／Ｌ、ＢＡ  ０．２ｍｇ／Ｌ）にて、２０℃でカルス誘導し、これに目的の遺伝子を導入し、Ｍｕｒａｓｈｉｇｅ−Ｓｋｏｏｇ培地（ショ糖２０ｇ／Ｌ、２，４−Ｄ  ０．２ｍｇ／Ｌ）にて、２０℃、光照射下で、シュートを誘導することによって再生させることができる。
【０１３７】
植物体へと再生はまた、Ｒｏｇｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ  １１８：  ６２７−６４０（１９８６）；Ｔａｂａｔａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．，２８：７３−８２（１９８７）；Ｓｈａｗ，Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ：Ａ  ｐｒａｃｔｉｃａｌ  ａｐｐｒｏａｃｈ．ＩＲＬ  ｐｒｅｓｓ（１９８８）；Ｓｈｉｍａｍｏｔｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ３３８：  ２７４（１９８９）；Ｍａｌｉｇａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ：Ａ  ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  ｃｏｕｒｓｅ．  Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ（１９９５）；Ｈｉｅｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｌａｎｔ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ  ３５：２０５（１９９７）；Ｔｏｋｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｌａｎｔ  Ｊ  ４７：９６９  （２００６）等に記載される方法に従って行うこともできる。さらに、近年組織培養に必要としない組換え体作出法も開発されており、必ずしも本例に限定されるものではない。
【０１３８】
以上のように、本発明の好ましい実施形態を用いて本発明を例示してきたが、本発明は、この実施形態に限定して解釈されるべきものではない。本発明は、特許請求の範囲によってのみその範囲が解釈されるべきであることが理解される。当業者は、本発明の具体的な好ましい実施形態の記載から、本発明の記載および技術常識に基づいて等価な範囲を実施することができることが理解される。
【配列表フリーテキスト】
【０１３９】
配列番号１＝青色化遺伝子の核酸配列
配列番号２＝青色化遺伝子のアミノ酸配列
配列番号３＝フェリチン遺伝子の核酸配列
配列番号４＝フェリチン遺伝子のアミノ酸配列
配列番号５＝フェリチン相同領域用プライマー
配列番号６＝フェリチン相同領域用プライマー
配列番号７＝フェリチン用プライマー
配列番号８＝ＴｇＶＩＴ特異的プライマー
配列番号９＝ＴｇＶＩＴ特異的プライマー
配列番号１０＝ＴｇＦＥＲ特異的プライマー
配列番号１１＝ＴｇＦＥＲ特異的プライマー
配列番号１２＝ＧＡＰＤＨ遺伝子用プライマー
配列番号１３＝ＧＡＰＤＨ遺伝子用プライマー
配列番号１４＝フェリチン遺伝子ＲＮＡｉ
配列番号１５＝ＭＹＢ遺伝子プロモーターの塩基配列
配列番号１６＝ＡＮＳ遺伝子プロモーターの塩基配列
【図２】
2010022365.tif 000003
【図３】
2010022365.tif 000004
【図５】
2010022365.tif 000005
【図７】
2010022365.tif 000006
【図９】
2010022365.tif 000007
【図１２】
2010022365.tif 000008
【図１３】
2010022365.tif 000009
【図１４】
2010022365.tif 000010
【図１】
2010022365.tif 000011
【図４】
2010022365.tif 000012
【図６】
2010022365.tif 000013
【図８】
2010022365.tif 000014
【図１０】
2010022365.tif 000015
【図１１】
2010022365.tif 000016
【図１５】
2010022365.tif 000017
【図１６】
2010022365.tif 000018
【配列表】
2010022365000001.app