(57)【要約】【課題】蛋白質の機能を損なわずにチップ基板に蛋白質／ペプチドを固定化したり、基板上でその機能を損なわずに維持することができるように固定化する方法を提供すること。【解決手段】化学修飾したダイヤモンド／ＤＬＣ（Diamond-like Carbon）チップを活性化試薬により活性化した後、蛋白質／ペプチドを前記チップ上にスポッティングしてカップリング反応を行い、次いで未反応活性基のブロッキング操作を行う、チップ上に蛋白質／ペプチドを固定する方法において、スポティング添加剤として３０％ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）又は３０％ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）を用いたり、活性化試薬により活性化した後、MilliQ水で洗浄した後の乾燥を１時間の減圧乾燥処理により行う。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
化学修飾したダイヤモンド／ＤＬＣ（Diamond-like Carbon）チップを活性化試薬により活性化した後、蛋白質／ペプチドを前記チップ上にスポッティングしてカップリング反応を行う、チップ上に蛋白質／ペプチドを固定する方法であって、活性化試薬により活性化した後、チップを洗浄した洗浄水の乾燥処理として３０〜１２０分間の減圧乾燥処理を行うことを特徴とする蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項２】
洗浄水が、MilliQ水であることを特徴とする請求項１記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項３】
スポッティング添加剤としてジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）又はポリエチレングリコール（ＰＥＧ）を用いることを特徴とする請求項１又は２記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項４】
２０〜４０％ＤＭＳＯ又は２０〜４０％ＰＥＧを用いることを特徴とする請求項３記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項５】
３０％ＤＭＳＯ又は３０％ＰＥＧを用いることを特徴とする請求項４記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項６】
カップリング反応後、３０〜４５℃で２〜４時間乾燥させることを特徴とする請求項１〜５のいずれか記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項７】
活性化試薬が、ＷＳＣＤ・ＨＣｌ及びＮＨＳを含有する溶液であることを特徴とする請求項１〜６のいずれか記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項８】
カップリング反応を行った後、未反応活性基のブロッキング操作を行うことを特徴とする請求項１〜７のいずれか記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項９】
蛋白質／ペプチドが、抗原又は抗体であることを特徴とする請求項１〜８のいずれか記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項１０】
抗原がアレルゲンであることを特徴とする請求項９記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項１１】
アレルゲンがアレルゲンエピトープ又はアレルゲンエピトープを含むペプチドであることを特徴とする請求項１０記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項１２】
アレルゲンエピトープ又はアレルゲンエピトープを含むペプチドとして、化学修飾されたペプチドを用いることを特徴とする請求項１１記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項１３】
アレルゲンエピトープを含むペプチドとして、ＭＨＣクラスII分子に結合するペプチド部分のＮ末端側及び／又はＣ末端側に少なくとも２個以上のアミノ酸が付加されたエピトープ含有ペプチドを用いることを特徴とする請求項１１記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項１４】
アレルゲンエピトープを含むペプチドとして、アレルゲンのエピトープを含むプロテアーゼ分解ペプチドを用いることを特徴とする請求項１２〜１３のいずれか記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項１５】
プロテアーゼ分解ペプチドが、トリプシン分解ペプチドであることを特徴とする請求項１４記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項１６】
アレルゲンとして、食物アレルゲンを用いることを特徴とする請求項１１〜１５のいずれか記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項１７】
食物アレルゲンとして、カゼインナトリウム、α−カゼイン、β−カゼイン、κ−カゼイン、α−ラクトアルブミン、β−ラクトグロブリン、オボムコイド、オボアルブミン、コンアルブミンから選ばれる１種又は２種以上のアレルゲンを用いることを特徴とする請求項１６記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法。
【請求項１８】
請求項１〜１７のいずれか記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法で得られた蛋白質／ペプチド固定化チップ。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、化学修飾したダイヤモンド／ＤＬＣ（Diamond-like Carbon）チップ上に蛋白質／ペプチドをその機能を損なわずに安定的に固定化する方法や該方法により得られる蛋白質／ペプチド固定化チップに関する。
【背景技術】
【０００２】
従来、シリコン等の基板上にダイヤモンドをコーティングしたり、ダイヤモンドライクカーボン（ＤＬＣ）をコーティングする技術は一般に広く利用されている。例えば、これらを利用したＤＮＡ固定化チップ（例えば、特許文献１〜４参照）、本発明者らによるダイヤモンドコーティング高密度集積タンパクチップ（例えば、非特許文献１参照）、ダイヤモンド基板上に有機単分子膜を直接的な検出部として形成してなる有機単分子膜／半導体構造を有する半導体センシングデバイス（例えば、特許文献５参照）が提案されている。その他、様々な種類のアレルゲンから抽出した、各スポットに付着させた一つの粗蛋白を有する固体の基板をアレルギー疾患患者から得た検体と反応させることによって、様々な種類のアレルゲンを同時に検出することができ、特定アレルゲンにより起こされるアレルギー反応に関連する抗体の種類を検出することができるアレルギー診断用蛋白質チップとアレルゲンの検出方法及びアレルギー誘発抗体の検出方法（例えば、特許文献６参照）が知られている。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００３】
【特許文献１】ＷＯ９９／４０１７３号公報
【特許文献２】ＷＯ９９／４１３６２号公報
【特許文献３】ＷＯ９９／６３０７２号公報
【特許文献４】特開２００５−５５３６５号公報
【特許文献５】特開２００４−４００７号公報
【特許文献６】特表２００４−５３３６２５号公報
【非特許文献】
【０００４】
【非特許文献１】NEW DIAMOND,Vol.20,No.3(2004),30-31
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
各種チップ等の基板上に蛋白質を固定する場合、一般的に蛋白質は３次元立体構造が変わりやすいため、立体構造と密接に関係すると推定される蛋白質の機能を維持するためには、特別な配慮と工夫を必要とする。蛋白質の固定化において、アフィニティークロマトグラフィーなどでの固定化法のような従来のマクロ固定化技術では、固定化によって蛋白質の大幅な失活が起こっても対象が限定されているため、検出過程でシグナルの増幅ができるため目的物質の特定が可能である。しかし、ハイスループットな高密度蛋白質チップの作製には、より微量の蛋白質をその活性、コンフォメーションを維持したままで固定化する技術を確立しなければならない。蛋白質の活性は、複雑な立体構造に依存しており、蛋白質を基板表面に固定化することで立体構造が破壊された場合、通常失活する。本発明の課題は、蛋白質の機能を損なわずにチップ基板に蛋白質／ペプチドを固定化したり、基板上でその機能を損なわずに維持することができるように固定化する方法を提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【０００６】
本発明者らは、化学修飾したダイヤモンド／ＤＬＣ（Diamond-like Carbon）チップを活性化試薬により活性化した後、蛋白質／ペプチドを前記チップ上にスポッティングしてカップリング反応を行い、次いで未反応活性基のブロッキング操作を行う、チップ上に蛋白質／ペプチドを固定化する方法において、スポッティング添加剤として３０％ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）又は３０％ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）を用いたり、活性化試薬により活性化した後、MilliQ水で洗浄した後の乾燥を１時間の減圧乾燥処理により行うと、アレルゲン等の蛋白質／ペプチドの機能を損なわずにチップ基板に蛋白質／ペプチドを固定化したり、基板上でその機能を損なわずに維持することができることを見い出し、本発明を完成するに至った。
【０００７】
すなわち本発明は、（１）化学修飾したダイヤモンド／ＤＬＣ（Diamond-like Carbon）チップを活性化試薬により活性化した後、チップを洗浄した洗浄水の乾燥処理として３０〜１２０分間の減圧乾燥処理を行うことを特徴とする蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（２）洗浄水が、MilliQ水であることを特徴とする上記（１）記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（３）スポッティング添加剤としてジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）又はポリエチレングリコール（ＰＥＧ）を用いることを特徴とする上記（１）又は（２）記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（４）２０〜４０％ＤＭＳＯ又は２０〜４０％ＰＥＧを用いることを特徴とする上記（３）記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（５）３０％ＤＭＳＯ又は３０％ＰＥＧを用いることを特徴とする上記（４）記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（６）カップリング反応後、３０〜４５℃で２〜４時間乾燥させることを特徴とする上記（１）〜（５）のいずれか記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（７）活性化試薬が、ＷＳＣＤ・ＨＣｌ及びＮＨＳを含有する溶液であることを特徴とする上記（１）〜（６）のいずれか記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（８）カップリング反応を行った後、未反応活性基のブロッキング操作を行うことを特徴とする上記（１）〜（７）のいずれか記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（９）蛋白質／ペプチドが、抗原又は抗体であることを特徴とする上記（１）〜（８）のいずれか記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法に関する。
【０００８】
さらに本発明は、（１０）抗原がアレルゲンであることを特徴とする上記（９）記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（１１）アレルゲンがアレルゲンエピトープ又はアレルゲンエピトープを含むペプチドであることを特徴とする上記（１０）記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（１２）アレルゲンエピトープ又はアレルゲンエピトープを含むペプチドとして、化学修飾されたペプチドを用いることを特徴とする上記（１１）記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（１３）アレルゲンエピトープを含むペプチドとして、ＭＨＣクラスII分子に結合するペプチド部分のＮ末端側及び／又はＣ末端側に少なくとも２個以上のアミノ酸が付加されたエピトープ含有ペプチドを用いることを特徴とする上記（１１）記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（１４）アレルゲンエピトープを含むペプチドとして、アレルゲンのエピトープを含むプロテアーゼ分解ペプチドを用いることを特徴とする上記（１２）〜（１３）のいずれか記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（１５）プロテアーゼ分解ペプチドが、トリプシン分解ペプチドであることを特徴とする上記（１４）記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（１６）アレルゲンとして、食物アレルゲンを用いることを特徴とする上記（１１）〜（１５）のいずれか記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（１７）食物アレルゲンとして、カゼインナトリウム、α−カゼイン、β−カゼイン、κ−カゼイン、α−ラクトアルブミン、β−ラクトグロブリン、オボムコイド、オボアルブミン、コンアルブミンから選ばれる１種又は２種以上のアレルゲンを用いることを特徴とする上記（１６）記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法や、（１８）上記（１）〜（１７）のいずれか記載の蛋白質／ペプチドの固定化方法で得られた蛋白質／ペプチド固定化チップに関する。
【発明の効果】
【０００９】
本発明によると、ごく少量の蛋白質やペプチドを効率良く正確にチップ上に搭載でき、載せたサンプルは蛋白質／ペプチドとしての機能を維持しており、一連の操作で蛋白質／ペプチドが剥がれることなく安定的に固定されたハイスループットの蛋白／ペプチドチップを作製することができる。
【図面の簡単な説明】
【００１０】
【図１】チップの活性化から蛍光検出までの基本操作手順を示す図である。
【図２】活性化処理後のスポティング前の乾燥処理条件の検討結果を示す図である。
【図３】蛋白質／ペプチドをスポティングする抗原チップにおける添加剤ＤＭＳＯとＰＥＧの効果を示す図である。
【図４】ダイヤモンドライクカーボン（ＤＬＣ）チップとダイヤモンドコーティング（GENE DIA）に蛋白質／ペプチドをスポティングするときの添加剤ＤＭＳＯの効果を示す図である。
【図５】抗原をスポティングした後の乾燥条件（３時間）の検討結果を示す図である。
【図６】抗原をスポティングした後の乾燥条件（終夜）の検討結果を示す図である。
【図７】直接抗体結合法及びプロテインG 間接抗体結合法におけるグリセロールの影響を示すを示す図である。
【図８】直接抗体結合法における抗体結合量へのＤＮＳＯの影響を示す図である。
【図９】直接抗体結合法におけるＴＮＦ−α抗原抗体結合量へのＤＮＳＯの影響を示す図である。
【図１０】小児及び健常人の食物（牛乳・卵）アレルギー検査（ＩｇＧ）の結果を示す図である。
【図１１】小児及び健常人の食物（牛乳・卵）アレルギー検査（ＩｇＧ）の結果を示す図である。
【図１２】小児及び健常人の食物（牛乳・卵）アレルギー検査（ＩｇＥ）の結果を示す図である。
【図１３】化学修飾したダイヤモンド／ＤＬＣチップの活性化とカップリング反応の概略を示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００１１】
本発明の蛋白質／ペプチドの固定化方法としては、化学修飾したダイヤモンド／ＤＬＣ（Diamond-like Carbon）チップを活性化試薬により活性化した後、蛋白質／ペプチドを前記チップ上にスポッティングしてカップリング反応を行う、チップ上に蛋白質／ペプチドを固定する方法であって、スポッティング添加剤としてＤＭＳＯ又はＰＥＧを用いる方法であれば特に制限されず、上記化学修飾したダイヤモンド／ＤＬＣチップとしては、シリコン、ガラス、ステンレス、プラスチック等の基板上にダイヤモンド又はダイヤモンドライクカーボン（ＤＬＣ）をコーティングしたダイヤモンド／ＤＬＣチップに、蛋白質／ペプチドをカップリング反応等により結合させることができるような化学修飾がなされたダイヤモンド／ＤＬＣチップであれば特に制限されず、例えば、かかる化学修飾としては、ダイヤモンド／ＤＬＣチップ表面を塩素処理、アンモニア処理、ジカルボン酸処理等による塩素化、アミノ化、カルボキシル化等がなされたダイヤモンド／ＤＬＣチップを例示することができるが、中でも、カルボキシル化ダイヤモンド／ＤＬＣチップを好適に例示することができる。上記化学修飾したダイヤモンド／ＤＬＣチップは、市販品（東洋鋼鈑）を利用することもできる。
【００１２】
上記化学修飾したダイヤモンド／ＤＬＣチップは、活性化試薬により活性化処理に付される。例えば、カルボキシル化ダイヤモンド／ＤＬＣチップに蛋白質／ペプチドを固定化させる方法として、基盤表面に導入されたカルボキシル基（−ＣＯＯＨ基）を利用し、アミノ基（−ＮＨ２基）を持つ蛋白質／ペプチドを1-Etyl-3-(3-dimethylamino Propyl)-carbodiimide, hydrochloride (WSCD・HCl)や、N-Hydroxy- succinimide (NHS)やその他の化学架橋剤を用いて共有結合により固定化させることが好ましい。チップの活性化とカップリング反応の概略を図１３に示す。
【００１３】
上記活性化処理後のチップはMilliQ水（超純水）で洗浄され、ペプチドのカップリング反応（固定化操作）が行われるが、この蛋白質／ペプチドの固定化操作の前処理として、十分な除湿、乾燥が蛋白質／ペプチドの固定化量と固定化量の均一性に重要な因子であり、そのため真空デシケーターで３０〜１２０分、好ましくは１時間程度減圧乾燥処理することがきわめて好ましい。また、ペプチドのカップリング反応は、活性化処理後のチップ、好ましくは減圧乾燥処理が施されたチップに蛋白質／ペプチド溶液をスポッティングして、３０〜４２℃で２〜４時間、好ましくは３７℃で３時間インキュベーションすることにより行うことができるが、スポッティング添加剤としてＤＭＳＯやＰＥＧを用いると、蛋白質／ペプチドの機能を損なわずにチップ基板に蛋白質／ペプチドを固定化したり、結合量が増加したり、基板上でその機能を損なわずに維持することができる。また、スポッティング反応後、３０〜４２℃で２〜４時間、特に３７℃で３時間乾燥させることが好ましい。この乾燥後、ＢＳＡ等を用いた未反応活性基のブロッキング操作を行うことが好ましい。このような本発明の蛋白質／ペプチドの固定化方法により、本発明の蛋白質／ペプチド固定化チップを作製することができる。
【００１４】
上記ＤＭＳＯやＰＥＧは、蛋白質／ペプチドをチップ基板表面に固定化する際の溶媒（０．１Ｍリン酸カリウム緩衝液、ｐＨ６．０）に添加して通常用いられるが、使用濃度としては、両者共に１０〜５０％、特に３０％前後が好ましい。また、ＰＥＧとしては、分子量２００〜４００、好ましくは３００前後のＰＥＧを好適に例示することができる。
【００１５】
本発明の蛋白質／ペプチドの固定化方法の対象となる蛋白質／ペプチドとしては、抗原又は抗体を好適に例示することができ、抗原としては、アレルゲン、各種ガン抗原、サイトカイン等を例示することができる。上記アレルゲンとしては、免疫原性を有するものであれば特に制限されず、卵類、牛乳類、肉類、魚類、甲殻類及び軟体動物類、穀類、豆類及びナッツ類、果実類、野菜類、ビール酵母、ゼラチンなどの食物アレルゲンを好適に例示することができ、中でも乳アレルゲンの主要成分としてのαｓ１−カゼイン、αｓ２−カゼイン、β−カゼイン、κ−カゼイン、α−ラクトアルブミンや、ホエーアレルゲンの主要成分であるβ−ラクトグロブリンや、卵白アレルゲンの主要成分としてのオボムコイド、オボアルブミン、コンアルブミンや、小麦アレルゲンの主要成分としてのグリアジンや、そばの主要タンパク質である分子量２４ｋＤａと７６ｋＤａのタンパク質や、落花生の主要タンパク質であるＡｒａｈ１を具体的に例示することができる。
【００１６】
また、アレルゲンペプチドとして、糖鎖修飾ペプチド、リン酸化ペプチド、アシール化ペプチド、アセチル化ペプチド、メチル化ペプチド、ユビキチン化ペプチド等の化学修飾ペプチドを用いることもでき、かかる化学修飾ペプチドは、天然の化学修飾ペプチドであっても、人為的な化学修飾ペプチドであってもよい。さらに、アレルゲンエピトープを含むペプチドとして、ＭＨＣクラスII分子に結合する７〜１５アミノ酸サイズ等のペプチド部分のＮ末端側及び／又はＣ末端側に少なくとも２個以上のアミノ酸が付加されたエピトープ含有ペプチドを用いると、患者抗体と数倍から数十倍高感度に反応する点で好ましい。かかるＭＨＣクラスII分子に結合するペプチド部分のＮ末端側及び／又はＣ末端側に少なくとも２個以上のアミノ酸が付加されたエピトープ含有ペプチド等のアレルゲンエピトープを含むペプチドは、ペプチド合成により作製することもできるが、アレルゲンのエピトープを含むプロテアーゼ分解ペプチドとして作製することもできる。かかるプロテアーゼとしては、トリプシン、キモトリプシン、カテプシン、リジルエンドペプチダーゼを挙げることができる。特に、アレルゲンが食物アレルゲンのとき、トリプシン分解ペプチドをプロテアーゼ分解ペプチドとして好適に例示することができる。
【００１７】
本発明の蛋白質／ペプチドの固定化方法により作製される蛋白質／ペプチド固定化チップを用いると、イムノアッセイにより有利にアレルゲンエピトープの判定を行うことができる。かかるイムノアッセイとしては、蛋白質／ペプチド固定化チップに捕捉された検体中のアレルゲン認識抗体を検出することができる公知のイムノアッセイであれば特に制限されないが、標識２次抗体を用いるＥＬＩＳＡが好ましく、標識２次抗体としては、Ｃｙ３，Ｃｙ５，ＦＩＴＣ，ローダミン等の蛍光標識２次抗体、ペルオキシダーゼ，アルカリフォスファターゼ等の酵素標識２次抗体、磁気ビーズ標識２次抗体、赤外標識２次抗体を例示することができ、２次抗体としては抗ＩｇＧ抗体又は抗ＩｇＥ抗体を例示することができるが、Ｃｙ３標識抗ＩｇＧ抗体やＣｙ３標識抗ＩｇＥ抗体を好適に挙げることができる。そして、上記２次抗体としては、抗体のＦａｂ断片やＦ（ａｂ’）２断片等も使用することがき、例えば、Ｆａｂ断片は抗体をパパイン等で処理することにより、またＦ（ａｂ’）２断片はペプシン等で処理することにより調製することができる。
【００１８】
以下、実施例により本発明をより具体的に説明するが、本発明の技術的範囲はこれらの例示に限定されるものではない。
【実施例１】
【００１９】
１．実験材料
ジーンシリコンＣ４（３ｍｍ×３ｍｍ）、ジーンスライドＤＬＣ（東洋鋼鈑）、９６穴マイクロプレートＵ底(Greiner)、３８４穴マイクロプレート平底(NUNC)を購入して用いた。オボムコイド(ＯＶＭ)(SIGMA)、フロイントの完全アジュバント(DIFCO)、ネンブタール(大日本製薬)、Hybond-C Gridded membranes(Amersham)、スキムミルク、Peroxidase-F(ab’)２goat anti rabbit ＩｇＧ(H+L)(ZYMED)、ECL(Amersham)、CNBr-cativated Sepharose 4B(Pharmacia)、ImmunoPure ＩｇＧ Purification Kit(PIERCE)、７ＭGuanigine-HCl(ｐＨ８．６)、Dithiothreitol(ＤＴＴ)、トリプシン(SigmaまたはPromega)、α-Cyano-4-hydroxycinnamic acid(Sigma)、Non-immunized rabbit ＩｇＧ、Goat anti-rabbit ＩｇＧ(H+L)Ｃｙ３，Ｃｙ５conjugate(ZYMED)、抗ヒトＩｇＧ抗体(Fc specific)Ｃｙ３，Ｃｙ５conjugate(ZYMED)、抗ヒトＩｇＥ抗体(Fc specific)Ｃｙ３，Ｃｙ５conjugate(ZYMED)、ＷＳＣＤ・ＨＣｌ (ペプチド研究所)、ＮＨＳ(ペプチド研究所)、ＤＭＳＯ(和光純薬)、防腐剤(０．５％チメロサール)を購入して用いた。
【００２０】
２．基本操作
ダイヤモンド／ＤＬＣ（Diamond-like Carbon）チップによる抗原（アレルゲン）の検出と特異抗体の定量における諸条件を検討するため、以下に示す（１）〜（６）の一連の操作を行った。チップの活性化から蛍光検出までの基本操作手順を図１に示す。
【００２１】
（１）ＤＬＣチップの活性化
ＤＬＣチップを９６穴マイクロプレートに入れ、MilliQ水で１回洗浄後、５０μＬの活性化試薬（１００ｍＭＷＳＣ，２０ｍＭ ＮＨＳ，０．１Ｍ リン酸カリウム緩衝液；ｐＨ６．０）をプレートに分注し、室温で３０分間遮光した状態で振とうしながら反応させた。反応液を吸引除去後、MilliQ水でチップを十分に洗浄し、８連チューブにチップを移し卓上遠心機を用いチップの水分を直ちに完全に除去した。
【００２２】
（２）抗原（アレルゲン）のカップリング反応
０．１Ｍリン酸カリウム緩衝液（ｐＨ６．０）にＤＭＳＯを３０％の濃度で添加し、この溶液にスポッティングを行うアレルゲンを溶解した。アレルゲンはＳＴＡＭＰＵＭＡＮマイクロアレイヤー（日本レーザー電子）を用いてスポッティングした。チップをマイクロアレイヤーのサンプリング用ホルダーにセットしてスポット操作を行った。スポット後、チップを３７℃の条件下にクールインキュベーター：ＣＮ−２５Ａ（三菱電機エンジニアリング）でインキュベートした。
【００２３】
（３）未反応活性基のブロッキング操作
チップを９６穴マイクロプレートに移し、５０ｍＭのＴＴＢＳ［０．０５％ Ｔｗｅｅｎ２０，２０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．５），１５０ｍＭ ＮａＣｌ］を加え、プレートシェーカーを用いて洗浄作業を行った。固定化反応後に残存する活性基を処理するため、１５０ｍＭのＮａＣｌ含有１ＭＴｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．０）を加え、遮光した状態下に１時間室温で反応させ未反応基を完全に不活性化した。さらに、チップへの抗体の非特異的反応をブロックするため、遮光条件下に０．１％ＢＳＡを含むＰＢＳ溶液と４℃で一晩反応させた。
【００２４】
（４）抗原（アレルゲン）認識抗体の捕捉反応
ブロッキングバッファーを吸引除去し、抗体希釈バッファー［６０ｍｇ／ｍＬＢＳＡ，ＰＢＳ（ｐＨ７．４）、０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０］で種々の濃度に１次抗体を希釈した後、チップの入ったプレートに分注し遮光条件下に室温で５時間振とうしながら反応させた。
【００２５】
（５）２次抗体の反応
１次抗体反応液を吸引除去し、洗浄バッファーを加え、プレートシェーカーを用いて洗浄作業を行った。次に蛍光標識した２次抗体を、０．１％ＢＳＡを含むＰＢＳ溶液で１．５μｇ／ｍＬに希釈し、チップの入ったプレートに分注して遮光条件下に室温で１時間振とうして反応させた。
【００２６】
（６）抗原チップに捕捉された抗体の検出
２次抗体との反応後、反応液を吸引除去し、洗浄バッファーとMilliQ水でチップを洗浄し、水分を除去するためにスピンダウンを行った。次にＦＬＡ−８０００蛍光スキャナー：ＦＬＡ−８０００(FUJIFILM)を用いて蛍光強度を測定し、各チップから得られたスポットの蛍光強度の数値化を行った。
【実施例２】
【００２７】
蛋白質／ペプチドを化学修飾したダイヤモンド／ＤＬＣ（Diamond-like Carbon）チップチップ上にスポッティングしてカップリング反応を行い、次いで未反応活性基のブロッキング操作を行う、チップ上に蛋白質／ペプチドを固定する方法において、蛋白質／ペプチドの機能を損なわずにチップ基板に蛋白質／ペプチドを固定化したり、結合量を増加させたり、基板上でその機能を損なわずに維持するための至適条件について検討した。
【００２８】
１．蛋白質／ペプチドをスポッティングする前処理条件の検討
上記基本操作（１）におけるチップの活性化反応後、チップをMilliQ水で洗浄し、次いで基本操作（２）のカップリング反応による蛋白質／ペプチドの固定化操作が行われるが、この蛋白質／ペプチドの固定化操作の前処理として、十分な除湿、乾燥が蛋白質／ペプチドの固定化量と固定化量の均一性に及ぼす影響について調べた。
【００２９】
上記基本操作（１）における遠心脱水後のチップの乾燥処理条件について検討した。抗原としては、各種濃度（５０，７５，１００，２００ｆｍｏｌ／スポット）のオボムコイドを用い、また、１次抗体としては１０倍希釈の患者血清を、２次抗体としては１．５μｇ／ｍｌのＣｙ３標識ヤギ抗ヒトＩｇＥ抗体を用いた。乾燥処理としては、１）真空デシケーターで１時間減圧乾燥処理、２）３７〜４２℃で１時間の加温乾燥処理、３）室温（ＲＴ）で１時間の乾燥処理、をそれぞれ比較した。結果を図２に示す。これらの結果から、１時間減圧乾燥処理で、蛋白質／ペプチドの固定化量の増加と均一性において至適条件が得られた。
【００３０】
２．蛋白質／ペプチドを固定化する際の溶媒の検討
蛋白質／ペプチドの活性は、複雑な立体構造に依存しており、蛋白質／ペプチドを基板表面に固定化する際の溶媒（０．１Ｍリン酸カリウム緩衝液、ｐＨ６．０）に添加する添加剤が重要である。そこで、添加剤として、１）一般に蛋白質の安定化剤として使用される１０〜３０％のグリセロール、２）２０〜４０％のＤＭＳＯ、３）２０〜４０％のＰＥＧ（分子量３００）を、それぞれ用いた場合の蛋白質／ペプチドの固定化量と固定化量の均一性に及ぼす影響について、基板の種類［ダイヤモンドコーティング（GENE DIA）、ダイヤモンドライクカーボン（ＤＬＣ）チップ］、基板の素材（シリコン、ガラス、ステンレス）も加味して調べてみた。
【００３１】
抗原（アレルゲン）としては、１００ｆｍｏｌ／スポットのα−カゼイン、β−カゼイン、κ-カゼイン、α−ラクトアルブミン、β―ラクトグロブリン、オボムコイド、オボアルブミン、コンアルブミンを用いた。また、１次抗体としては１０倍希釈の患者血清を、２次抗体としては１．５μｇ／ｍｌのＣｙ３標識ヤギ抗ヒトＩｇＥ抗体を用いた。
【００３２】
まず、上記基本操作（２）における３０％ＤＭＳＯに代えて１０〜３０％のグリセロールを用いた結果、１０〜３０％のグリセロールは、蛋白質／ペプチドのスポティング添加剤としては、基板の種類（ダイヤモンドコーティング、ダイヤモンドライクカーボンチップ）、基板の素材（シリコン、ガラス、ステンレス）を問わず、全てにおいて効果がないことがわかった。
【００３３】
そこで、１）３０％ＤＭＳＯ、２）３０％ＰＥＧ、３）ブランク（−）について同様に調べた。結果を図３に示す。その結果、３０％ＤＭＳＯと３０％ＰＥＧをそれぞれ蛋白質／ペプチドのスポッティング添加剤として添加することで、蛋白質／ペプチドの結合量と抗体との反応性が保たれ、高い反応性が実現できた。３０％ＤＭＳＯと３０％ＰＥＧの間では、わずかに３０％ＰＥＧの方がスポティング効率の高いことが判明した。この場合、基板の種類（ダイヤモンドコーティング、ダイヤモンドライクカーボンチップ）、基板の素材（シリコン、ガラス、ステンレス）で共通していることがわかった。
【００３４】
次ぎに、蛋白質／ペプチドのスポッティング添加剤として３０％ＤＭＳＯを添加した場合における、シリコンをコーティングしたダイヤジーン（GENE DIA）とダイヤモンドライクカーボン（ＤＬＣ）の各チップにおける蛋白質／ペプチドの結合量と抗体との反応性を調べた。上記基本操作（１）におけるチップの活性化後、ウサギＩｇＧ又は抗マウスＴＮＦ−α抗体を、３０％ＤＭＳＯ／０．１Ｍ ＭＥＳ（ｐＨ４．５）で１．５μｇ／ｍｌに希釈し、室温又は３７℃で１時間遮光してカップリング反応を行った。未反応の蛋白質は０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０を含有するＴＢＳで１０回洗浄して除去した。洗浄液を加えた後３０秒間静置し吸引除去した。ブロッキングは、１５０ｍＭＮａＣｌ含有１Ｍ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．０）を加え、室温で１時間遮光した状態下に反応させた後、０．１％ＢＳＡを含むＰＢＳ溶液中で４℃で一晩反応させた。２次抗体にはアルカリフォスファターゼ（ＡＰ）標識抗ウサギＩｇＧ（Ｈ＋Ｌ）に対するヤギのＦ（ａｂ’）２フラグメントを用いた。ＡＰの基質としてはｐＮＰＰを０．１Ｍの２−アミノ−２−メチル−１，３−プロパンジオール緩衝液（ｐＨ１０．３）で２ｍｇ／ｍｌに調整し、室温で５分間反応させた後、０．７５ＮのＮａＯＨで反応を停止させ、４０５ｎｍの吸光度を測定した。結果を図４に示す。
【００３５】
図４は、３０％ＤＭＳＯ添加の有りと無しの条件でスポッティングした後、室温（ＲＴ）か３７℃の条件でカップリング反応をした後、酵素標識した抗ＩｇＧ抗体と１時間反応して測定した結果を示している。その結果、３０％ＤＭＳＯを添加してスポッティングすることで抗体の結合量が増加することがわかった。なお、１０％ＤＭＳＯでは反応温度の影響がほとんど見られなかった。また、基板の素材（シリコン、ガラス、ステンレス）にかかわらず共通の結果が得られた。 
【００３６】
３．蛋白質／ペプチドをスポティングする際の反応温度の検討
蛋白質／ペプチドを固定化する際に、ＤＬＣとジーンダイヤでは４℃よりも室温か３７℃において結合量は多かった。室温と３７℃の間では３７℃の方が幾分固定化量が多かった（図４）。
【００３７】
４．蛋白質／ペプチドをスポッティングする際の時間の検討
蛋白質／ペプチドを固定化する際に、ＤＬＣとジーンダイヤでは固定化反応の反応時間（１ｈｒ，３ｈｒ，一晩）について至適条件を検討した。その結果、３７℃（４２℃まで）の反応温度条件で３時間反応させることで、チップ上での蛋白質／ペプチドの結合量が最も多く、バラツキなく安定して結合させることができた。
【００３８】
５．スポティング後の乾燥処理条件の検討
抗原として各種濃度（５０，７５，１００，２００ｆｍｏｌ／スポット）のオボムコイドをスポティングした後、４℃，室温（ＲＴ），３７℃の各温度条件にてチップを３時間乾燥した。１Ｍ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８）／１５０ｍＭ ＮａＣｌ，及びＢＳＡでブロッキング処理後、患者プール血清を６０％ＢＳＡを含むＰＢＳ／０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０溶液で１０倍希釈して室温で５時間反応させた。二次抗体として約１．５μｇ／ｍＬのＣｙ３標識ヤギ抗ヒトＩｇＥ抗体を用いて１時間反応させ蛍光検出した。結果を図５に示す。また、３時間の乾燥処理を終夜乾燥処理に代える以外は同様にして蛍光検出した。結果を図６に示す。
【００３９】
図５及び６に示される結果から、スポッティング後の処理条件は３７℃，３時間で蛋白質／ペプチドの固定化量の増加と均一性において至適条件が得られた。 
【実施例３】
【００４０】
スポッティング添加剤として、グリセロールまたはジメチルスルフォキシド（ＤＭＳＯ）を添加することで、微量なタンパク質を、生物学的機能を維持した状態で固定化することができるかについて詳細に検討を行った。
【００４１】
１．方法
（１）タンパク質のカップリング、洗浄およびブロッキング
１．５ｍｌ平底アシストチューブ内においてチップを１００ｍＭ ＷＳＣ、２０ｍＭ ＮＨＳにより活性化した後、直接抗体結合法あるいはプロテインＧ間接抗体結合法においてそれぞれタンパク質のカップリングを行った。直接抗体結合法として、ウサギＩｇＧあるいは抗マウスＴＮＦ−α抗体を０．１Ｍ ＭＥＳ（ｐＨ４．５）にて１．５μｇ／ｍＬに希釈後、カップリング反応をおこなった。また、プロテインＧ間接抗体結合法として、プロテインＧを０．１Ｍ ＭＥＳ（ｐＨ４．５）にて２０μｇ／ｍＬに希釈調製し、プロテインＧ分子をカップリングした。未反応のタンパク質は０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０を含有するＴＢＳで１０回洗浄することにより除去した。洗浄は、洗浄液を加えた後３０秒間静置し、吸引除去した。ブロッキングは１５０ｍＭ ＮａＣｌ含有１Ｍ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．０）を加え、室温で１時間反応させた後、０．１％ＢＳＡを含むＰＢＳ溶液中で４℃で一晩反応させた。さらにプロテインＧ間接抗体結合法の場合、ウサギＩｇＧあるいは抗マウスＴＮＦ−α抗体を０．１％ＢＳＡを含むＰＢＳで０．５μｇ／ｍＬ希釈調製し、室温で１時間振とうさせることによりチップ上に抗体分子を固定化させた。
【００４２】
（２）チップ上に固定化された抗体分子の検出
チップ上に固定化した抗体分子の結合量は、酵素標識２次抗体を用いて標識された酵素の活性測定により検量線から定量算定した。２次抗体にはＡＰ標識抗ウサギＩｇＧ（Ｈ＋Ｌ）に対するヤギのＦ(ａｂ’)２フラグメントを用いた。ＡＰの基質としては、ｐＮＰＰを０．１Ｍ 2-amino-2-methyl-1,3-propandiol緩衝液（ｐＨ１０．３）で２ｍｇ／ｍＬに調製し、室温で５分反応させた後、０．７５Ｎ ＮａＯＨで反応を停止させ、４０５ｎｍの吸光度を測定した。
【００４３】
（３）抗体チップに捕捉されたＴＮＦ−α抗原の検出
チップ上に固定化した抗体分子が捕捉する抗原分子の結合量は、Biosource社のマウスＴＮＦ−αイムノアッセイキットを用いて測定した。抗原溶液はマウスＴＮＦ−αを０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０含有ブロッキング溶液で６２５０ｐｇ／ｍＬに調製し、抗体チップと室温で９０分間反応させた後、ビオチン化抗マウスＴＮＦ−α抗体と反応させるＡＢＣ法により検出した。
【００４４】
２．結果
（１）グリセロールの影響について
まず、直接抗体結合法において抗体のカップリング時におけるグリセロール添加の影響を検討した。ＤＬＣの場合、３０％グリセロール存在下では抗体結合量が減少したのに対して、ジーンダイヤを用いた場合、抗体結合量が増加した（図７参照）。この差は、ＤＬＣとジーンダイヤの各基板表面の物理化学的特性によるものと推測されるが、さらに検討が必要である。さらに、プロテインＧ間接抗体結合法においても、ＤＬＣの場合３０％グリセロール存在下では抗体結合量は減少した（図７参照）。これより、グリセロールの添加は、タンパク質の安定化には適切ではないと考えられた。
【００４５】
（２）ＤＭＳＯの影響について
次に、直接抗体結合法において抗体のカップリング時にグリセロールではなくＤＭＳＯを添加した場合の影響について検討した。ＤＬＣ、ジーンダイヤともに３０％ＤＭＳＯ添加時において抗体結合量は飛躍的に増加した（図８参照）。データは示していないが、１０％ＤＭＳＯでは影響はほとんど見られなかった。しかし、ＤＬＣとジーンダイヤでは反応温度による違いが見られ、ＤＬＣでは室温よりも３７℃において抗体結合量は多かったのに対し、ジーンダイヤでは反対の結果が得られた。さらに、抗体結合量だけでなく抗体の活性が維持されているかを検討するために、直接抗体結合法により固定化した抗ＴＮＦ−α抗体が抗原であるＴＮＦ−αを捕捉できるかを解析した。その結果、３０％ＤＭＳＯ存在下において抗体だけでなく、抗原結合量も増加することが確認できた（図９参照）。これより、３０％ＤＭＳＯ存在下において微量の抗体でも固定化量が増加することにより抗原捕捉能力が増加することが明らかになった。
【実施例４】
【００４６】
本発明のチップ上に蛋白質／ペプチドを固定する方法（上記基本方法）で作製したチップを用い、実際に小児を対象とした食物アレルギーの検体の解析を行った。徳島大学の倫理委員会の承認と香川国立小児病院の倫理委員会の承認の上で、十分なインフォームドコンセントのもとに承諾の得られた臨床検体を香川小児病院（伊藤道徳先生）から供与いただき、食物アレルギーの無い健常人コントロールとの比較を行った。最初に卵と牛乳のアレルゲン成分を検定する目的で、シリコンを基板としたＤＬＣチップに、アレルゲンのタンパク質をそれぞれ１スポット当たり１０ｆｍｏｌをスポッティングし、血清を１００倍に希釈し反応を行い、２次抗体にＣｙ３標識したヤギ抗ヒトＩｇＧ抗体を用い検出した。可能な限り強く免疫したウサギ血清の希釈率は、ヒト血清では参考にならない為、図には示していないが患者と健常人からそれぞれ１検体を選択して５０、１００、２００、４００、８００、１６００倍に希釈してチップとの反応性を検定した。その結果、チップとの反応性において非特異的反応が少なく測定可能な希釈は４００−１６００倍希釈の範囲と判断された。
【００４７】
患者血清を１０００倍に希釈した測定結果を図１０に示した。患者のほとんどはミルクアレルギーで、α−，β−，κ−カゼインとそれぞれの反応強度をもって反応を示した。中にはα−ラクトアルブミン（lactoalbumin）とも反応している患者も認められたが、その比率はカゼインに比較して少数であった。しかしミルクアレルギーを主訴とするアレルギー患者であっても、卵の成分であるＯＶＭ、オボアルブミン（Ovalubumin），コンアルブミン（Conalubumin）に対しても反応性を示す患者が見いだされた（図１１参照）。ダイヤモンド／ＤＬＣチップを用いた上記の測定系では、１マイクロリッターの血清で少なくとも１８−２５項目が定性、定量測定可能であり、従来の検査法が定性的検査のみで１検査当たり２５０〜５００マイクロリッターを必要としていた検査法と比較すると、患者負担と利便性の点で優れていると推定された。
【００４８】
上記ＩｇＧの場合と同様に、卵と牛乳のアレルゲン成分を検定する目的で、シリコンを基板としたＤＬＣチップに、アレルゲンのタンパク質をそれぞれ１スポット当たり１００ｆｍｏｌをスポッティングし、血清を１０倍に希釈し反応を行い、２次抗体にＣｙ３標識したヤギ抗ヒトＩｇＥ抗体を用い検出した。測定結果を図１２に示した。
【図１】
2010204130.tif 000002
【図２】
2010204130.tif 000003
【図３】
2010204130.tif 000004
【図４】
2010204130.tif 000005
【図５】
2010204130.tif 000006
【図６】
2010204130.tif 000007
【図７】
2010204130.tif 000008
【図８】
2010204130.tif 000009
【図９】
2010204130.tif 000010
【図１０】
2010204130.tif 000011
【図１１】
2010204130.tif 000012
【図１２】
2010204130.tif 000013
【図１３】
2010204130.tif 000014