(57)【要約】      （修正有）【課題】抗精神病薬に基づく処置により誘導される錐体外路症状（ＥＰＳ）の発症を予測する方法およびＥＰＳの発症に関連するいくつかのＳＮＰの配列に基づいて患者に合わせた医療の提供。【解決手段】対象において抗精神病薬に基づく処置により誘導される錐体外路症状（ＥＰＳ）の発症を予測する方法であって、ｉ）前記対象由来の遺伝物質を含んでなる試料において、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９の一塩基多型（ＳＮＰ）の配列を決定すること、およびｉｉ）前記ＳＮＰの配列に基づいて前記対象がＥＰＳを発症するリスクを予測することを含んでなる、方法。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
対象において抗精神病薬に基づく処置により誘導される錐体外路症状（ＥＰＳ）の発症
を予測する方法であって、
ｉ）前記対象由来の遺伝物質を含んでなる試料において、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４
５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９の一塩基多型（ＳＮＰ）の配
列を決定すること、および
ｉｉ）前記ＳＮＰの配列に基づいて前記対象がＥＰＳを発症するリスクを予測すること
を含んでなる、方法。
【請求項２】
表１による対立遺伝子の組み合わせの１つの存在が、対象がＥＰＳを発症するリスクが
高いことを示し、あるいは、表２による対立遺伝子の組み合わせの１つの存在が、対象が
ＥＰＳを発症するリスクが低いことを示す、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している対象であって、ＤＲＤ２遮断効力が低
い抗精神病薬に基づく療法を受ける対象を選択する方法であって、
ｉ）前記対象由来の遺伝物質を含んでなる試料において、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４
５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの配列を決定するこ
と、および
ｉｉ）前記ＳＮＰの配列に基づいてＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法を
受ける前記対象を選択すること
を含んでなる、方法。
【請求項４】
表１による対立遺伝子の組み合わせの１つの存在が試料において検出される場合に、Ｄ
ＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法を受ける対象として選択される、請求項３
に記載の方法。
【請求項５】
抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している対象を処置するために適切な抗精神病
薬に基づく療法を選択する方法であって、
ｉ）前記対象由来の遺伝物質を含んでなる試料において、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４
５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの配列を決定するこ
と、および
ｉｉ）前記ＳＮＰの配列に基づいて適切な抗精神病薬に基づく療法を選択すること
を含んでなり、前記抗精神病薬が、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法およ
び任意の抗精神病薬に基づく療法からなる群から選択される、方法。
【請求項６】
表１による対立遺伝子の組み合わせの１つの存在が、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病
薬に基づく療法を受けるものとして選択される対象であることを示し、あるいは、表２に
よる対立遺伝子の組み合わせの１つの存在が、任意の抗精神病薬に基づく療法を受けるも
のとして選択される対象であることを示す、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
任意の抗精神病薬に基づく療法が、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬、ＤＲＤ２遮断
効力が中程度の抗精神病薬およびＤＲＤ２遮断効力が高い抗精神病薬からなる群から選択
される、請求項５または６に記載の方法。
【請求項８】
ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法が、さらに補助的抗パーキンソン病薬
、好ましくは、抗コリン薬を含んでなる、請求項３〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３
９のＳＮＰの配列を決定するのに適切な試薬を含んでなるキットであって、前記試薬が、
ＤＮＡまたはＲＮＡプローブを含んでなる、キット。
【請求項１０】
ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３
９のＳＮＰの配列に基づいて、対象において抗精神病薬に基づく処置により誘導されるＥ
ＰＳの発症を予測するための、請求項９に記載のキットの使用。
【請求項１１】
対象において抗精神病薬により処置可能な疾患の処置に用いるためのＤＲＤ２遮断効力
が低い抗精神病薬であって、前記対象が、請求項３または４に記載の方法によって選択さ
れるか、あるいは、前記対象が、該対象から単離された遺伝物質を含有する試料がｒｓ１
１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９の一塩
基多型（ＳＮＰ）において表１による対立遺伝子の組み合わせの１つを示すことにより特
徴づけられる、抗精神病薬。
【請求項１２】
前記処置が、さらに補助的抗パーキンソン病薬、好ましくは、抗コリン薬を含んでなる
、請求項１１に記載の抗精神病薬により処置可能な疾患の処置に用いるためのＤＲＤ２遮
断効力が低い抗精神病薬。
【請求項１３】
対象において抗精神病薬に基づく処置により誘導されるＥＰＳの発症を予測するための
、抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している対象であって、ＤＲＤ２遮断効力が低
い抗精神病薬に基づく療法を受ける対象を選択するための、または抗精神病薬により処置
可能な疾患に罹患している対象を処置するための適切な抗精神病薬に基づく療法を選択す
るための、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０
５３６３９のＳＮＰの使用。
【請求項１４】
表１による対立遺伝子の組み合わせの１つの存在が、対象がＥＰＳを発症するリスクが
高いことを示し、あるいは、表２による対立遺伝子の組み合わせの１つの存在が、対象が
ＥＰＳを発症するリスクが低いことを示し、あるいは、表１による対立遺伝子の組み合わ
せの１つの存在が試料において検出された場合に、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に
基づく療法を受ける対象として選択され、あるいは、表１による対立遺伝子の組み合わせ
の１つの存在が、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法を受けるものとして選
択される対象であることを示し、あるいは、表２による対立遺伝子の組み合わせの１つの
存在が、任意の抗精神病薬に基づく療法を受けるものとして選択される対象であることを
示す、請求項１３に記載の使用。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、抗精神病薬に基づく処置により誘導される錐体外路症状（ＥＰＳ）の発症を
予測する方法および患者に合わせた医療を提供する方法に関する。本発明はまた、診断お
よび予測の医療方法を実施するためのキットに関する。
【背景技術】
【０００２】
抗精神病薬処置により発現する錐体外路症状（ＥＰＳ）は、抗精神病薬の高頻度かつ重
篤な急性有害反応であり、この徴候は投薬の開始から数日以内に現れ得る。ＥＰＳは、い
くつかの認められた症候群、すなわち、パーキンソニズム、アカシジア、急性ジストニア
およびジスキネジアを含む複合表現型である。クロザピンのない時代から状況は改善され
ているが、ＥＰＳの問題は解決していない；例えば、大規模な有効性試験であるＣＡＴＩ
Ｅ（統合失調症を有する患者における抗精神病薬投薬の比較有効性）において、１０．５
％の患者がＥＰＳ関連の理由により割り当てられた投薬を中止した。
【０００３】
ＥＰＳの根底にある正確なメカニズムは明らかではないが、線条体ドーパミンＤ２受容
体（ＤＲＤ２）の遮断が主な原因と考えられている。運動活性の本質的な制御は、主要な
構成要素が線条体である大脳基底核が担っている。背側線条体において、ドーパミンはド
ーパミンＤ１受容体（ＤＲＤ１）またはＤＲＤ２のいずれかと相互作用することにより運
動活性を調節し、２つの異なる投影経路（「直接」および「間接」経路）と、最も重要な
ことには、視床の反対の刺激をもたらす。このモデルによれば、ドーパミンは、直接経路
の活性を増加させ、同時に間接経路を阻害することにより運動活性を促進させる。
【０００４】
ＥＰＳの発症についての潜在的なリスク因子、例えば、若年、男性および精神医学的診
断、特には、気分障害等、を同定するためのいくつかの研究が試みられている。薬理遺伝
学マーカーも試験されている（Zhang and Malhotra, 2011, Expert Opin Drug Metab Tox
icol 7:9-37）。いくつかの遺伝的バリアントがＥＰＳの出現に大きな影響を与え得るに
も関わらず（Gasso et al., 2009, Pharmacogenomics J 9:404-10; Greenbaum et al., 2
009, Pharmacogenomics J 9:103-10）、いずれの単一の因子もこの現象を予測することが
できない。
【０００５】
Ａｌｍｏｇｕｅｒａら（2012, Pharmacogenomics J. doi: 10.1038/tpj.2011.57 (Epub
ahead of print Jan 3 2012)）には、いくつかの遺伝子における遺伝的バリアントと統
合失調症を有する患者においてリスペリドンにより引き起こされる有害作用との関連が記
載されている。分析された遺伝子バリアントはいずれもリスペリドンに反応するあるいは
有害作用を示す患者を予測する能力に関して既に記載されている。Ａｌｍｏｇｕｅｒａら
にはまた、ＡＤＲＢ２遺伝子バリアントである１６Ｇｌｙ、ＳＬＣ６Ａ４  Ｌ／Ｓ、ＳＬ
Ｃ６Ａ４  Ｓ／ＳおよびＤＲＤ３  ９Ｇｌｙが、リスペリドンにより処置された患者にお
ける性的有害事象、傾眠、ＥＰＳおよび体重増加の発症と相関することが開示されている
。
【０００６】
国際公開第２０１１／１４８３７９号には、パーキンソニズムおよび他の抗精神病薬誘
導ＥＰＳへの耐性に関連する遺伝子型、特には、遺伝子ＺＦＰＭ２におけるｒｓ１２６７
８７１９のＳＮＰおよび遺伝子ＲＧＳ２におけるｒｓ４６０６のＳＮＰが記載されている
。
【０００７】
国際公開第２００７／１４４８７４号には、抗精神病薬により誘導されるＥＰＳへの耐
性に関連する遺伝子型、特には、ｒｓ２１７９６５２、ｒｓ１９３３６９５、ｒｓ２７４
６０７３、ｒｓ４６０６、ｒｓ１８１９７４１およびｒｓ１１５２７４６のＳＮＰが記載
されている。さらに、この文献では、ＥＰＳの発症または悪化の素因と関連する遺伝子型
が同定された。ＥＰＳと関連する遺伝子バリアントはＲＧＳ２遺伝子に存在する。
【０００８】
Ｘｕら（2007, J.Clin.Psychiatry, 68:1358-67）には、遺伝子ＡＫＴ１におけるｒｓ
３８０３３００のＳＮＰおよび統合失調症の発症に関連する該遺伝子における５つのＳＮ
Ｐからなるハプロタイプの同定が記載されている。しかしながら、ｒｓ３８０３３００の
ＳＮＰもハプロタイプもＥＰＳの発症とは何ら関係を示さない。
【０００９】
このように、抗精神病薬に基づく処置により誘導されるＥＰＳの発症の予測を可能にす
る方法が当技術分野においてなお求められている。
【発明の概要】
【００１０】
本発明者らは、抗精神病薬による処置を受けている患者において錐体外路症状（ＥＰＳ
）の発症を予測するための信頼できる方法を提供する一塩基多型（ＳＮＰ）のセット初め
て同定した。例えば、本明細書の実施例１に示されるように、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ
４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの対立遺伝子の組
み合わせのいくつかが、対象がＥＰＳを発症するリスクが高いことを予測し、一方で、他
の対立遺伝子の組み合わせが、対象がＥＰＳを発症するリスクが低いことを予測する。
【００１１】
したがって、第一の面において、本発明は、対象において抗精神病薬に基づく処置によ
り誘導される錐体外路症状（ＥＰＳ）の発症を予測する方法であって、
ｉ）前記対象由来の遺伝物質を含んでなる試料において、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４
５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９の一塩基多型（ＳＮＰ）の配
列を決定すること、および
ｉｉ）前記ＳＮＰの配列に基づいて前記対象がＥＰＳを発症するリスクを予測すること
を含んでなる方法に関する。
【００１２】
別の面において、本発明は、抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している対象であ
って、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法を受ける対象を選択する方法であ
って、
ｉ）前記対象由来の遺伝物質を含んでなる試料において、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４
５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの配列を決定するこ
と、および
ｉｉ）前記ＳＮＰの配列に基づいてＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法を
受ける対象を選択すること
を含んでなる方法に関する。
【００１３】
別の側面において、本発明は、抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している対象を
処置するために適切な抗精神病薬に基づく療法を選択する方法であって、
ｉ）前記対象由来の遺伝物質を含んでなる試料において、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４
５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの配列を決定するこ
と、および
ｉｉ）前記ＳＮＰの配列に基づいて適切な抗精神病薬に基づく療法を選択すること
を含んでなり、前記抗精神病薬が、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法およ
び任意の抗精神病薬に基づく療法からなる群から選択される方法に関する。
【００１４】
別の面において、本発明は、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８
１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの配列を決定するのに適切な試薬を含んでなるキ
ットであって、前記試薬が、ＤＮＡまたはＲＮＡプローブを含んでなるキットに関する。
【００１５】
別の面において、本発明は、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８
１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの配列を決定するのに適切な試薬を含んでなるキ
ットの、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５
３６３９のＳＮＰの配列に基づいて、対象において抗精神病薬に基づく処置により誘導さ
れるＥＰＳの発症を予測するための使用に関する。
【００１６】
別の面において、本発明は、対象において抗精神病薬により処置可能な疾患の処置に用
いるためのＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬であって、前記対象が、抗精神病薬により
処置可能な疾患に罹患している対象であって、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づ
く療法を受ける対象を選択する方法を用いて選択された、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神
病薬に関する。
【００１７】
別の面において、本発明は、対象において抗精神病薬に基づく処置により誘導されるＥ
ＰＳの発症を予測するための、抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している対象であ
って、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法を受ける対象を選択するための、
または抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している対象を処置するための、適切な抗
精神病薬に基づく療法を選択するためのｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７
２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの使用に関する。
【発明の具体的説明】
【００１８】
本発明者らは、抗精神病薬により処置を受けている患者において錐体外路症状（ＥＰＳ
）の発症を予測するための信頼できる方法を提供する一塩基多型（ＳＮＰ）のセット初め
て同定した。
【００１９】
本発明者らは、９つのＳＮＰについて抗精神病薬に基づく療法を受けている２４１人の
精神病患者をスクリーニングする研究を行い、ＥＰＳのリスクへのそれらの寄与を検討し
た。本発明者らは、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８および
ｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの組み合わせが統計的に有意であることを見出した。この知
見は、抗精神病薬で処置可能な疾患の処置におけるＥＰＳの新たな遺伝的予測因子への道
を開き、医師が対象に合わせて療法を設計するのを助ける。これらの知見に基づいて、本
発明者らは、ここに詳細に記載される本発明の方法を開発した。
【００２０】
誤解を避けるために、本発明の方法はヒトまたは動物体に実施する診断を含むものでは
ない。本発明の方法は、好ましくは、対象からあらかじめ取り除いた試料に対して行われ
る。以下に記載される本発明のキットは、対象から試料を取り出す手段を含み得る。
【００２１】
対象において抗精神病薬に基づく処置により誘導されるＥＰＳの発症を予測する方法
第一の面において、本発明は、対象において抗精神病薬に基づく処置により誘導される
ＥＰＳの発症を予測する方法（以下「本発明の第一の方法」という）であって、
ｉ）前記対象由来の遺伝物質を含んでなる試料において、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４
５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９の一塩基多型（ＳＮＰ）の配
列を決定すること、および
ｉｉ）前記ＳＮＰの配列に基づいて前記対象がＥＰＳを発症するリスクを予測すること
を含んでなる方法に関する。
【００２２】
本明細書で用いられる「抗精神病薬に基づく処置により誘導される錐体外路症状（ＥＰ
Ｓ）の発症を予測する」との用語は、抗精神病薬に基づく処置の結果として患者がＥＰＳ
を発症する見込みをいう。本発明の予測方法は、任意の特定の患者に最も適当な処置様式
を選択することにより処置を決定するために臨床的に用いることができる。本発明の予測
方法は、患者が抗精神病薬に基づく処置等の処置計画に良好に反応してＥＰＳを発症する
可能性がある場合に診断の有益な手段である。予測は診断因子を含み得る。
【００２３】
当業者であれば理解できるであろうが、予測は、評価される対象の１００％について正
確であることが好ましいが、その必要はない。しかしながら、この用語は、統計的に有意
な部分の対象が所定の転帰を有する可能性が高いと同定できることを要する。よく知られ
た種々の統計的評価手段、例えば、信頼区間の決定、ｐ−値の決定、交差検証分類率等を
用いることによる当業者によるさらなる手間をかけずに、対象が統計的に有意であるか否
かを決定することができる。詳細はDowdy and Wearden, Statistics for Research, John
Wiley & Sons, New York 1983に見出すことができる。好ましい信頼区間は少なくとも５
０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％また
は少なくとも９５％である。ｐ−値は、好ましくは、０．０１、０．００５またはそれ以
下である。
【００２４】
本明細書で使用される「錐体外路症状」または「ＥＰＳ」または「錐体外路副作用（Ｅ
ＰＳＥ）」との用語は、抗精神病薬の摂取の結果として患う、急性ジストニア反応、偽パ
ーキンソニズム、アカシジア（静座不能）、震え、不随意で反復的な体の動き（遅発性ジ
スキネジア）を含む運動制御への種々の影響をいう。ＥＰＳは通常シンプソン−アンガス
評価尺度で評価される。この尺度は１０項目を含む：歩行、腕落下、肩の振動、肘の硬直
、手首の硬直、脚の揺れ、頭部落下、眉間反射（ｇｌａｂｅｌｌａ  ｔａｐ）、振戦およ
び唾液分泌。各項目は０〜４の間で評価される。全体スコアは項目を足し、１０で割るこ
とにより得られる。０．３以下のスコアが正常範囲内と考えらえる。 
【００２５】
「処置」または「療法」との用語は、処置中に、対象の状態を直接的または間接的に改
善すること、または対象における状態または障害の進行を遅らせること、または疾患また
は障害の少なくとも１つの症状を寛解させることを目的としてヒトを含む対象に医療的支
援が提供される任意のプロセス、作用、適用、療法等を含む。本明細書で用いられる「抗
精神病薬に基づく処置」または「抗精神病薬に基づく療法」との用語は、少なくとも１つ
の抗精神病薬を含んでなる任意の処置または療法をいう。
【００２６】
本明細書で用いられる「抗精神病薬」または「神経遮断薬」との用語は、主に精神病（
妄想または幻覚および病的な思考を含む）に対処するのに使用される精神病薬物をいい、
非精神病性障害の対処における使用も増加している。抗精神病薬は、解剖治療化学（ＡＴ
Ｃ）コードＮ０５Ａを考慮して設計される。抗精神病薬は、定型すなわち第一世代の抗精
神病薬および非定型すなわち第二世代の抗精神病薬の２つのグループに大別される。定型
抗精神病薬は化学構造に従って分類されるが、非定型抗精神病薬は薬理学的特性に従って
分類される。これらには、しばしば非定型として分類されるセロトニン−ドーパミン拮抗
薬（ドーパミン拮抗薬およびセロトニン拮抗薬を参照）、多元受容体標的化抗精神病薬（
ＭＡＲＴＡ、いくつかの系を標的とするもの）およびドーパミン部分作動薬が含まれる。
【００２７】
近年、ドーパミン作動性受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）を遮断する効力に従って抗精神病薬を
分ける、すなわち抗精神病薬をＤＲＤ２遮断効力が低い、中程度および高い抗精神病薬に
分ける新しい分類系が使用されている。ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬は対象におい
てＥＰＳを誘導する可能性がより低いことが当技術分野において知られているが、ＤＲＤ
２遮断効力が中程度および高い抗精神病薬は対象においてはＥＰＳを誘導する可能性がよ
り高いことが当技術分野において知られている。ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬の非
限定例としては、クロザピン、ジプラシドン、クエチアピンおよびオランザピンが挙げら
れる。ＤＲＤ２遮断効力が中程度の抗精神病薬の非限定例としては、アミスルプリド、リ
スペリドンおよびズクロペンチキソール（zuclopenixol）が挙げられる。ＤＲＤ２遮断効
力が高い抗精神病薬の非限定例としては、ハロペリドールおよびクロルプロマジンが挙げ
られる（Gardner et al., 2005, Can Med Assoc J 172:1703-11）。
【００２８】
本明細書で用いられる「対象」との用語は、ヒト、非ヒト霊長類（例えば、チンパンジ
ーならびに他の類人猿およびサル種）等の個体；トリ、魚、ウシ、ヒツジ、ブタ、ヤギお
よびウマ等の家畜；イヌおよびネコ等の家庭哺乳類；マウス、ラットおよびモルモット等
の齧歯類を含む実験動物をいう。この用語は特定の年齢または性別を示すものではない。
本発明の特定の態様において、対象は哺乳類である。本発明の好ましい態様において、対
象はヒトである。本発明のより好ましい態様において、対象は、抗精神病薬により処置可
能な疾患と診断されている。
【００２９】
当業者に認識されているように、抗精神病薬に基づく処置は、精神病を示す障害または
疾患を処置することに向けられるだけではなく、他の種類の障害または疾患を処置するの
に用いることができる。よって、本発明の第一の方法の別の特定の態様において、対象は
抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している。本明細書で使用される「抗精神病薬に
より処置可能な疾患」は、抗精神病薬による処置中に、状態を改善することができる、進
行を遅らせることができる、または、少なくとも１つの症状を寛解させることができる任
意の障害または疾患をいう。抗精神病薬により処理可能な疾患の非限定例としては、統合
失調症、統合失調感情障害、急性精神病性障害、妄想性障害、統合失調型パーソナリティ
障害、双極性障害、強迫性障害、パーソナリティ障害、精神病性うつ病、行為障害、認知
障害、悪心嘔吐およびアルツハイマー病が挙げられる。
【００３０】
第一の工程において、本発明の第一の方法は、前記対象由来の遺伝物質を含んでなる試
料において、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１
０５３６３９の一塩基多型（ＳＮＰ）の配列を決定することを含んでなる。
【００３１】
本明細書で用いられる「一塩基多型」または「ＳＮＰ」との用語は、単一のヌクレオチ
ド（Ａ、Ｃ、ＴまたはＧ）に起こる核酸のヌクレオチド配列の多様性であって、可能性の
ある各配列が集団の１％以上の割合で存在することをいう。ＳＮＰは典型的にはhttp://w
ww.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/でアクセス可能な国立バイオテクノロジー情報セン
ター（ＮＣＢＩ）のＳＮＰデータベース（ｄｂＳＮＰ）のアクセッション番号を用いて命
名される。一般に、ＳＮＰは遺伝的多様性の最も一般的な形態の１つを表す。これらの多
型はゲノムにおいて単一のヌクレオチドが（例えば、置換、付加または欠失を介して）変
更された際に現れる。多型部位についての配列の各型は多型部位の対立遺伝子と呼ばれる
。ＳＮＰは何世代にもわたって進化的に安定な傾向があり、それ自体を集団全体にわたる
特異的な遺伝的異常を研究するのに使用することができる。ＳＮＰがタンパク質コード領
域に生じる場合は、遺伝的疾患の発症を導き得るタンパク質のバリアント型の発現（欠損
であることもある）を導くことができる。ＳＮＰは非コード領域で生じることもあるが、
そのような場合であっても特異なまたは欠陥のあるスプライシングやタンパク質発現レベ
ルの変更という結果となり得る。それゆえＳＮＰは遺伝的疾患の有効な指標として機能す
ることができる。ＳＮＰはまた、疾患または疾患の早い進行の素因を有する個体の同定、
該疾患に罹患している個体の遺伝子型決定、および発病プロセスにおける標的タンパク質
の役割に関して明らかにされた見識に基づく薬剤開発の促進のための診断および／または
予後手段として使用することができる。ＳＮＰについての配列の各型はＳＮＰの対立遺伝
子と呼ばれる。
【００３２】
本明細書で用いられる「対立遺伝子」との用語は、遺伝子、座位または遺伝的多型の２
またはそれ以上の形態の１つに関する。異なる対立遺伝子が異なる形質をもたらすことが
ある；しかしながら、異なる対立遺伝子が同じ遺伝子の発現をもたらすこともあろう。大
部分の多細胞生物は２セットの染色体を有する、すなわち、２倍体である。これらの染色
体は相同染色体と呼ばれる。２倍体生物は各染色体上の各遺伝子（１つの対立遺伝子）の
１コピーを有する。双方の対立遺伝子が同一である場合それらはホモ接合体である。双方
の対立遺伝子が異なる場合それらはヘテロ接合体である。
【００３３】
本明細書で用いられる「試料」または「生体試料」との用語は、対象から単離された生
体材料をいう。生体試料は所望のＳＮＰを検出するのに適切な任意の生体材料を含有し、
対象の細胞および／または非細胞の材料を含むことができる。本発明において、試料は、
研究中の対象由来の遺伝物質、例えば、ＤＮＡ、ゲノムＤＮＡ（ｇＤＮＡ）、相補的ＤＮ
Ａ（ｃＤＮＡ）、ＲＮＡ、ヘテロ核ＲＮＡ（ｈｎＲＮＡ）、ｍＲＮＡ等を含んでなる。試
料は任意の適切な組織または体液（例えば、血液、唾液、血漿、血清、尿、脳脊髄液（Ｃ
ＳＦ）、便、頬または頬咽頭の拭き取り検体（ｓｗａｂ）、外科標本および生検から得ら
れた標本等）から単離することができる。細胞または組織試料を単離する方法は当業者に
よく知られている。特定の態様において、試料は血液、尿、唾液、血清、血漿、頬または
頬咽頭の拭き取り検体、毛髪、外科標本および生検から得られた標本からなる群から選択
される。好ましい態様において、試料は血液、毛髪、尿および唾液から選択される。
【００３４】
「ＳＮＰの配列を決定する」または「ＳＮＰを検出する」との用語は、本発明において
区別せずに使用され、研究中の対象の双方の対立遺伝子における特定のＳＮＰの配列の決
定をいう。ＳＮＰの配列の決定は当業者に知られる多様なプロセスにより行うことができ
る。
【００３５】
いくつかの態様において、例えば、ＳＮＰの配列の決定が全血由来の試料において行わ
れる際には、これが前記ＳＮＰの検出に直接使用され得る。他の態様において、第一段階
として、核酸が体液（例えば、全血、唾液、滑液等）に存在する細胞から抽出され、この
ような場合において、前記試料から抽出された全核酸は、続く増幅に適切な作業物質とな
ろう。試料の核酸の単離は、当業者に知られる方法により行うことができる。前記方法と
しては、例えば、Sambrook et al., 2001. “Molecular cloning: a Laboratory Manual
”, 3rd ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, N.Y., Vol. 1-3に見出すことがで
きる。さらに、上述のように、いくつかの態様において、試料からの分析のための核酸の
作出は核酸の増幅を必要とする。多くの増幅法は、例えば、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣ
Ｒ）、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）等の酵素連鎖反応または自己保持配列複製、ローリン
グサークル増幅アッセイ等を用いる；この列挙は例示に過ぎず、限定されるものではない
。核酸を増幅する方法はSambrook et al., 2001（上述）に記載される。
【００３６】
核酸の単離および（必要であれば）増幅後、本発明の異なるＳＮＰの配列が検出される
。患者の核酸における本明細に開示される１またはいくつかのＳＮＰまたは多型に存在す
るヌクレオチドの分析が、ＳＮＰまたは多型に存在するヌクレオチドを決定することがで
きる任意の方法または技術により行うことができることは当業者に容易に認識されよう。
例えば、配列決定、ミニ配列決定、ハイブリダイゼーション、制限酵素断片分析、オリゴ
ヌクレオチドライゲーションアッセイ、対立遺伝子特異的ＰＣＲまたはこれらの組み合わ
せを実施することにより、本発明の第一の方法においてＳＮＰを検出し得る。したがって
、一般的なＳＮＰの検出のための系および方法としては、限定されるものではないが、核
酸配列決定、ハイブリダイゼーション法およびアレイ技術（例えば、Ａｃｌａｒａ  Ｂｉ
ｏＳｃｉｅｎｃｅｓ、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ、Ａｇｉｌｅｎｔ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅ
ｓ、Ｉｌｌｕｍｉｎａ  Ｉｎｃ．等から入手可能な技術）を含む；増幅された核酸断片に
おける移動度シフト、１本鎖ＤＮＡ高次構造多型（ＳＳＣＰ）、変性剤濃度勾配ゲル電気
泳動（ＤＧＧＥ）、化学的ミスマッチ切断（ＣＭＣ）、制限酵素断片長多型（ＲＦＬＰ）
およびＷＡＶＥ分析等に基づく技術も使用することができる（Methods Mol. Med. 2004; 
108: 173-88）。当然、この列挙は例示に過ぎず、限定されるものではない。当業者であ
ればこのような検出を達成する任意の適当な方法を使用することができる。当技術分野に
おいて明らかように、前記ＳＮＰの配列はいずれか一方の核酸鎖あるいは両鎖から決定す
ることができる。本発明において、前記ＳＮＰの配列は両鎖から決定される。
【００３７】
別の特定の態様において、前記ＳＮＰの配列の決定はリアルタイムＰＣＲにより行われ
る。
【００３８】
本発明で使用されるＳＮＰは以下に同定される：
−ｒｓ１１３０２１４はＡＫＴ１遺伝子に位置し、配列番号１；
【化１】
2020089370.tif 000002
に対応し、
−ｒｓ４５６９９８はＦＣＨＳＤ１遺伝子に位置し、配列番号２；
【化２】
2020089370.tif 000003
に対応し、
−ｒｓ７２１１８１８はＲＰＴＯＲ遺伝子に位置し、配列番号３；
【化３】
2020089370.tif 000004
に対応し、および
−ｒｓ１０５３６３９はＤＤＩＴ４遺伝子に位置し、配列番号４；
【化４】
2020089370.tif 000005
に対応する。
【００３９】
第二の工程において、本発明の第一の方法は、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８
、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの配列に基づいて前記対象がＥ
ＰＳを発症するリスクを予測することを含んでなる。
【００４０】
これに関連して、本発明によれば、組み合わせて対象において抗精神病薬に基づく処置
により誘導されるＥＰＳの発症を予測することと有意に関連するいくつかの特異的なＳＮ
Ｐのみならず、表１および２に記載されるようなＥＰＳを発症する高いおよび低いリスク
に対応する前記ＳＮＰの対立遺伝子の組み合わせが提供される。よって、特定の態様にお
いて、表１による対立遺伝子の組み合わせの１つの存在が、対象がＥＰＳを発症するリス
クが高いことを示す。別の特定の態様において、表２による対立遺伝子の組み合わせの１
つの存在が、対象がＥＰＳを発症するリスクが低いことを示す。
【００４１】
【表１】
2020089370.tif 000006
各ＳＮＰについて：０＝対立遺伝子１のホモ接合；１＝対立遺伝子１／対立遺伝子２のヘ
テロ接合；２＝対立遺伝子２のホモ接合
ｒｓ１１３０２１４：  −対立遺伝子１＝Ｇ；対立遺伝子２＝Ｔ；
−遺伝子型０＝ＧＧ；遺伝子型１＝ＧＴ；遺伝子型２＝ＴＴ
ｒｓ４５６９９８：    −対立遺伝子１＝Ｔ；対立遺伝子２＝Ｇ；
−遺伝子型０＝ＴＴ；遺伝子型１＝ＧＴ；遺伝子型２＝ＧＧ
ｒｓ７２１１８１８：  −対立遺伝子１＝Ａ；対立遺伝子２＝Ｇ；
−遺伝子型０＝ＡＡ；遺伝子型１＝ＡＧ；遺伝子型２＝ＧＧ
ｒｓ１０５３６３９：  −対立遺伝子１＝Ｔ；対立遺伝子２＝Ａ；
−遺伝子型０＝ＴＴ；遺伝子型１＝ＡＴ；遺伝子型２＝ＡＡ
【００４２】
【表２】
2020089370.tif 000007
各ＳＮＰについて：０＝対立遺伝子１のホモ接合；１＝対立遺伝子１／対立遺伝子２のヘ
テロ接合；２＝対立遺伝子２のホモ接合
ｒｓ１１３０２１４：  −対立遺伝子１＝Ｇ；対立遺伝子２＝Ｔ；
−遺伝子型０＝ＧＧ；遺伝子型１＝ＧＴ；遺伝子型２＝ＴＴ
ｒｓ４５６９９８：    −対立遺伝子１＝Ｔ；対立遺伝子２＝Ｇ；
−遺伝子型０＝ＴＴ；遺伝子型１＝ＧＴ；遺伝子型２＝ＧＧ
ｒｓ７２１１８１８：  −対立遺伝子１＝Ａ；対立遺伝子２＝Ｇ；
−遺伝子型０＝ＡＡ；遺伝子型１＝ＡＧ；遺伝子型２＝ＧＧ
ｒｓ１０５３６３９：  −対立遺伝子１＝Ｔ；対立遺伝子２＝Ａ；
−遺伝子型０＝ＴＴ；遺伝子型１＝ＡＴ；遺伝子型２＝ＡＡ
【００４３】
本明細書で用いられる「ＥＰＳを発症するリスク」との用語は、抗精神病薬に基づく療
法により処置されている対象がＥＰＳを発症する素因、罹患性または見込みをいう。ＥＰ
Ｓを発症するリスクとは一般的には高いまたは低いリスクがあることを意味する。この点
において、ＥＰＳを発症するリスクが高い、抗精神病薬に基づく療法により処置されてい
る対象は、表１による対立遺伝子の組み合わせの１つを示す対象である。よって、ＥＰＳ
を発症するリスクが高い対象は、少なくとも５０％、または少なくとも６０％、または少
なくとも７０％、または少なくとも８０％、または少なくとも９０％、または少なくとも
９５％、または少なくとも９７％、または少なくとも９８％、または少なくとも９９％、
または少なくとも１００％のＥＰＳを発症する可能性を有する。同様に、ＥＰＳを発症す
るリスクが低い、抗精神病薬に基づく療法により処置されている対象は、表２による対立
遺伝子の組み合わせの１つを示す対象である。よって、ＥＰＳを発症するリスクが低い対
象は、少なくとも０％、または少なくとも１％、または少なくとも２％、または少なくと
も３％、または少なくとも５％、または少なくとも１０％、または少なくとも２０％、ま
たは少なくとも３０％、または少なくとも４０％、または少なくとも４９％のＥＰＳを発
症する可能性を有する。
【００４４】
一般に、「リスクを予測する」、「リスクの予測」または類似の表現は、抗精神病薬に
基づく療法により処置されている対象のＥＰＳを発症する高いまたは低いリスクに関する
。当業者であれば理解できるであろうが、予測（またはリスク）は、評価される対象の１
００％について正確であることが好ましいが、その必要はない。しかしながら、この用語
は、統計的に有意な部分の対象がＥＰＳを発症する可能性が高いと同定できることを要す
る。よく知られた種々の統計的評価手段、例えば、信頼区間の決定、ｐ−値の決定、ステ
ューデントのｔ検定、マン・ホイットニー検定等を用いることによる当業者によるさらな
る手間をかけずに対象が統計的に有意であるか否かを決定することができる。詳細はDowd
y and Wearden, Statistics for Research, John Wiley & Sons, New York 1983に見出す
ことができる。好ましい信頼区間は少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７
０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％である。ｐ−値は、好ま
しくは、０．１、０．０５、０．０２、０．０１またはそれ以下である。
【００４５】
抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している対象であって、ＤＲＤ２遮断効力が低い
抗精神病薬に基づく療法を受ける対象を選択する方法
ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３
９のＳＮＰの予測値はさらに、抗精神病薬により誘導されるＥＰＳを発症するリスクが高
い患者であって、ＥＰＳを誘導する可能性が低い療法、すなわち、ＤＲＤ２遮断効力が低
い抗精神病薬に基づく療法を受ける患者の選択を実現できることが当業者に理解されよう
。よって、別の面において、本発明は、抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している
対象であって、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法を受ける対象を選択する
方法（以下「本発明の第二の方法」という）であって、
ｉ）前記対象由来の遺伝物質を含んでなる試料において、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４
５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの配列を決定するこ
と、および
ｉｉ）前記ＳＮＰの配列に基づいてＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法を
受ける前記対象を選択すること
を含んでなる方法に関する。
【００４６】
「対象」、「抗精神病薬」、「抗精神病薬により処置可能な疾患」、「ＤＲＤ２遮断効
力が低い抗精神病薬に基づく療法」、「ＳＮＰ」、「ｒｓ１１３０２１４」、「ｒｓ４５
６９９８」、「ｒｓ７２１１８１８」、「ｒｓ１０５３６３９」および「遺伝物質を含ん
でなる試料」との用語ならびにこれらの詳細については、本発明の第一の方法に関して詳
細に記載されており、本発明による第二の方法に関しても同義に用いられる。
【００４７】
第一の工程において、本発明の第二の方法は、前記対象由来の遺伝物質を含んでなる試
料において、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１
０５３６３９のＳＮＰの配列を決定することを含んでなる。ＳＮＰの配列を決定すること
の詳細のみならず検出すべきＳＮＰの詳細についても本発明の第一の方法に関して詳細に
記載されており、本発明による第二の方法に関しても同義で適用される。
【００４８】
第二の工程において、本発明の第二の方法は、前記ＳＮＰの配列に基づいてＤＲＤ２遮
断効力が低い抗精神病薬に基づく療法を受ける前記対象を選択することを含んでなる。
【００４９】
本発明の第二の方法の特定の態様において、表１による対立遺伝子の組み合わせの１つ
の存在が試料において検出される場合に、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療
法を受ける対象として選択される。好ましい態様において、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精
神病薬は、クロザピン、ジプラシドン、クエチアピンおよびオランザピンからなる群から
選択される。
【００５０】
別の特定の態様において、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法は補助的抗
パーキンソン病薬をさらに含んでなる。本明細書で用いられる「補助的（ａｄｊｕｖａｎ
ｔ）」または「補助療法」との用語は、通常は抗精神病薬がＥＰＳを誘導する可能性を低
減するために付加的処置として与えられる抗精神病薬により処置可能な疾患の任意の型の
処置をいう。このような補助処置の目的は、療法を受ける対象がＥＰＳを発症するリスク
を改善することである。
【００５１】
本明細書で用いられる「抗パーキンソン病薬」は、パーキンソン病（ＰＤ）またはパー
キンソニズムの症状を処置および緩和することを意図する薬剤の種類をいう。これらの薬
剤の大部分は中枢神経系においてドーパミン活性を増加させるか、アセチルコリン活性を
低減させることのいずれかにより作用する。抗パーキンソン病薬の例としては、ドーパミ
ン作動性前駆体、選択的モノアミン酸化酵素Ｂ阻害剤、カテコール−Ｏ−メチルトランス
フェラーゼ（ＣＯＭＴ）阻害剤、ドーパミン受容体作動薬および抗コリン薬が挙げられる
。好ましい態様において、抗パーキンソン病薬は抗コリン薬である。本明細書に用いられ
る「抗コリン薬」との用語は、神経細胞において神経伝達物質であるアセチルコリンがそ
の受容体へ結合することを選択的に遮断することにより副交感神経の神経インパルスを阻
害する薬剤群をいう。副交感神経系の神経線維は、胃腸管、尿路、肺等に存在する平滑筋
の不随意運動に関与している。抗コリン薬は、影響を受ける受容体に従って、ムスカリン
性アセチルコリン受容体に作動する抗ムスカリン作用薬およびニコチン性アセチルコリン
受容体に作動する抗ニコチン作用薬に分類される。抗コリン薬の例としては、限定される
ものではないが、ベンズトロピン、イプラトロピウム、オキシトロピウム、チオトロピウ
ム、グリコピロレート、オキシブチニン、トルテロジン、クロロフェナミン、ジフェンヒ
ドラミン、ジメンヒドリナート、ブプロピオン、ヘキサメトニウム、ツボクラリン、デキ
ストロメトルファン、メカミラミンおよびドキサクリウムが挙げられる。
【００５２】
抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している対象を処置するために適切な抗精神病薬
に基づく療法を選択する方法
本発明はまた、処置すべき対象に存在するｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒ
ｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの対立遺伝子の組み合わせに従って
個別療法を選択することについても検討する。
【００５３】
よって、別の面において、本発明は、抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している
対象を処置するために適切な抗精神病薬に基づく療法を選択する方法（以下「本発明の第
三の方法」という）であって、
ｉ）前記対象由来の遺伝物質を含んでなる試料において、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４
５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの配列を決定するこ
と、および
ｉｉ）前記ＳＮＰの配列に基づいて適切な抗精神病薬に基づく療法を選択すること
を含んでなり、前記抗精神病薬が、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法およ
び任意の抗精神病薬に基づく療法からなる群から選択される方法に関する。
【００５４】
「対象」、「抗精神病薬」、「抗精神病薬に基づく療法」、「抗精神病薬により処置可
能な疾患」、「ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法」、「ＳＮＰ」、「ｒｓ
１１３０２１４」、「ｒｓ４５６９９８」、「ｒｓ７２１１８１８」、「ｒｓ１０５３６
３９」および「遺伝物質を含んでなる試料」との用語ならびにこれらの詳細については、
本発明の第一の方法に関して詳細に記載されており、本発明による第三の方法に関しても
同義に用いられる。
【００５５】
第一の工程において、本発明の第三の方法は、前記対象由来の遺伝物質を含んでなる試
料において、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１
０５３６３９のＳＮＰの配列を決定することを含んでなる。ＳＮＰの配列を決定すること
の詳細のみならず検出すべきＳＮＰの詳細についても本発明の第一の方法に関して詳細に
記載されており、本発明による第三の方法に関しても同義で適用される。
【００５６】
第二の工程において、本発明の第三の方法は、前記ＳＮＰの配列に基づいて適切な抗精
神病薬に基づく療法を選択することを含んでなり、前記抗精神病薬は、ＤＲＤ２遮断効力
が低い抗精神病薬に基づく療法および任意の抗精神病薬に基づく療法からなる群から選択
される。
【００５７】
特定の態様において、表１による対立遺伝子の組み合わせの１つの存在が、ＤＲＤ２遮
断効力が低い抗精神病薬に基づく療法を受けるものとして選択される対象であることを示
し、表２による対立遺伝子の組み合わせの１つの存在が、任意の抗精神病薬に基づく療法
を受けるものとして選択される対象であることを示す。
【００５８】
好ましい態様において、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬は、クロザピン、ジプラシ
ドン、クエチアピンおよびオランザピンからなる群から選択される。
【００５９】
別の好ましい態様において、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法は補助的
抗パーキンソン病薬をさらに含んでなる。より好ましい態様において、補助的抗パーキン
ソン病薬は抗コリン薬である。「補助的」および「補助的抗パーキンソン病薬」との用語
ならびにこれらの詳細については、本発明の第二の方法に関して詳細に記載されており、
本発明による第三の方法に関しても同義に用いられる。
【００６０】
本明細書で用いられる「任意の抗精神病薬に基づく療法」との用語は、ＤＲＤ２遮断効
力が低い抗精神病薬、ＤＲＤ２遮断効力が中程度の抗精神病薬およびＤＲＤ２遮断効力が
高い抗精神病薬からなる群から区別なく選択される抗精神病薬に基づく療法をいう。よっ
て、好ましい態様において、任意の抗精神病薬に基づく療法は、ＤＲＤ２遮断効力が低い
抗精神病薬、ＤＲＤ２遮断効力が中程度の抗精神病薬およびＤＲＤ２遮断効力が高い抗精
神病薬からなる群から選択される。より好ましい態様において、ＤＲＤ２遮断効力が低い
抗精神病薬はクロザピン、ジプラシドン、クエチアピンおよびオランザピンからなる群か
ら選択される。別のより好ましい態様において、ＤＲＤ２遮断効力が中程度の抗精神病薬
はアミスルプリド、リスペリドンおよびズクロペンチキソールからなる群から選択される
。別のより好ましい態様において、ＤＲＤ２遮断効力が高い抗精神病薬はハロペリドール
およびクロルプロマジンからなる群から選択される。
【００６１】
本発明のキット
本発明はまた本発明に従って用いるためのキットの製造も検討する。
【００６２】
よって、別の面において、本発明は、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７
２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの配列を決定するのに適切な試薬を含ん
でなるキットであって、該キットの試薬がＤＮＡまたはＲＮＡプローブを含んでなるキッ
ト（以下「本発明のキット」という）に関する。
【００６３】
適切なキットは、チューブ、バイアルならびに収縮包装およびブロー成形されたパッケ
ージを含む適切な容器および包装材料における、本発明に従って用いるための種々の試薬
を含む。加えて、本発明のキットは、キット中の異なる要素の同時、逐次または個別使用
のための説明書を含むことができる。前記説明書は、印刷物の形態とすることもできるし
、電子記録媒体（磁気ディスク、テープ等）、光媒体（ＣＤ−ＲＯＭ、ＤＶＤ）等の、対
象が読めるように説明書を記憶することができる電子保持体の形態であってもよい。追加
としてまたは代わりに、媒体は前記説明書を提供するインターネットアドレスを含むこと
ができる。
【００６４】
本発明に従う例示的キットに含まれるのに適切な材料は、以下：ｒｓ１１３０２１４、
ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰに隣接するＤ
ＮＡまたはｃＤＮＡ配列ドメインにアニールする遺伝子特異的ＰＣＲプライマー対（オリ
ゴヌクレオチド）；ＰＣＲの実施を必要とすることなく、ゲノムＤＮＡまたはｃＤＮＡの
いずれかにおける特異的配列ドメインを増幅することができる試薬；ＰＣＲまたは非ＰＣ
Ｒ増幅により増幅された配列ドメインにおける可能性のある種々の対立遺伝子を区別する
のに必要な試薬（例えば、制限エンドヌクレアーゼ、多型の対立遺伝子の１つに優先的に
アニールするオリゴヌクレオチド（オリゴヌクレオチドからのシグナルを増幅し、より安
定に対立遺伝子を区別する酵素または蛍光化学基を含有するように修飾されるものを含む
））；または種々の対立遺伝子に由来する生成物を物理的に分離するのに必要な試薬（例
えば、アガロースもしくはポリアクリルアミドおよび電子泳動に使用するための緩衝液、
ＨＰＬＣカラム、ＳＳＣＰゲル、ホルムアミドゲルまたはＭＡＬＤＩ−ＴＯＦのためのマ
トリックス支持体）の１または複数を含んでなる。
【００６５】
２またはそれ以上の対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド対
を含んでなるキットであって、各対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチドまたはオリゴヌク
レオチド対がそれぞれｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およ
びｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの１つに向けられるキットについて特に検討する。ここで
「に向けられる」との用語は、ＳＮＰに存在する対立遺伝子を同定することができるオリ
ゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド対を意味することは理解されよう。例として、
本発明は、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０
５３６３９のＳＮＰを調べる複数のオリゴヌクレオチドプローブを含んでなるプローブセ
ットを含んでなるキットであって、前記オリゴヌクレオチドプローブが、プローブセット
中のオリゴヌクレオチドプローブの少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３
０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少
なくとも８０％または少なくとも９０％を構成するキットを検討する。
【００６６】
特定の態様において、該キットは、少なくとも４つのオリゴヌクレオチドプローブのセ
ットを含み、各オリゴヌクレオチドプローブはｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、
ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの対立遺伝子の１つに特異的であ
り、前記オリゴヌクレオチドプローブは、プローブセット中のオリゴヌクレオチドプロー
ブの少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少な
くとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％または少なくと
も９０％を構成する。好ましい態様において、該キットは、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４
５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの対立遺伝子の１つ
にそれぞれ特異的である４つのオリゴヌクレオチドプローブのセットを含む。
【００６７】
特定の態様において、該キットは、少なくとも４つのオリゴヌクレオチド対プローブの
セットを含み、各オリゴヌクレオチド対プローブはｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９
８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの対立遺伝子の１つに特異的
であり、前記オリゴヌクレオチド対プローブは、プローブセット中のオリゴヌクレオチド
プローブの少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％
、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％または少
なくとも９０％を構成する。好ましい態様において、該キットは、ｒｓ１１３０２１４、
ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの対立遺伝子
の１つにそれぞれ特異的である４つのオリゴヌクレオチド対プローブのセットを含む。
【００６８】
別の面において、本発明は、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８
１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの配列に基づいて、対象において抗精神病薬に基
づく処置により誘導されるＥＰＳの発症を予測するための、本発明によるキットの使用に
関する。本発明によるキットの詳細は本発明のキットに関して詳細に記載されており、前
記キットの使用に関しても同義で適用される。
【００６９】
本発明の個別療法
上に定義された第二の方法は、また、抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している
患者への個別療法の提供を可能にする。特には、ＥＰＳを発症する高いリスクを有すると
考えらえる患者は、ＥＰＳを誘導する可能性がより低いことが知られている抗精神病薬に
基づく療法からおそらく最も利益を受けるであろう。反対に、ＥＰＳを発症するリスクが
低いことを示す患者は任意の抗精神病薬に基づく療法で処置され得る。
【００７０】
このように、別の面において、本発明は、対象において抗精神病薬で処置可能な疾患の
処置に用いるための、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬（以下「本発明の個別療法」と
いう）であって、前記対象が本発明の第二の方法に従って選択される抗精神病薬に関する
。
【００７１】
本発明の第二の方法の詳細は、本発明の第二の方法に関して詳細に記載されており、本
発明による個別療法に関しても同義で適用される。
【００７２】
「対象」、「抗精神病薬」、「処置」、「抗精神病薬により処置可能な疾患」および「
ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬」との用語ならびにこれらの詳細については、本発明
の第一の方法に関して詳細に記載されており、本発明による個別療法に関しても同義に用
いられる。
【００７３】
特定の態様において、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬は、クロザピン、ジプラシド
ン、クエチアピンおよびオランザピンからなる群から選択される。
【００７４】
別の特定の態様において、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法は補助的抗
パーキンソン病薬をさらに含んでなる。より好ましい態様において、補助的抗パーキンソ
ン病薬は抗コリン薬である。「補助的」および「補助的抗パーキンソン病薬」との用語な
らびにこれらの詳細については、本発明の第二の方法に関して詳細に記載されており、本
発明の個別療法に関しても同義に用いられる。
【００７５】
本発明の使用
別の面において、本発明は、対象において抗精神病薬に基づく処置により誘導されるＥ
ＰＳの発症を予測するためのｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１
８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの使用（以下「本発明の第一の使用」という）に関
する。
【００７６】
本発明の第一の使用の特定の態様において、表１による対立遺伝子の組み合わせの１つ
の存在は、対象がＥＰＳを発症するリスクが高いことを示す。
【００７７】
本発明の第一の使用の別の特定の態様において、表２による対立遺伝子の組み合わせの
１つの存在は、対象がＥＰＳを発症するリスクが低いことを示す。
【００７８】
別の面において、本発明は、抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している対象であ
って、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法を受ける対象を選択するためのｒ
ｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９の
ＳＮＰの使用（以下「本発明の第二の使用」という）に関する。
【００７９】
本発明の第二の使用の特定の態様において、表１による対立遺伝子の組み合わせの１つ
の存在が試料において検出された場合に、ＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療
法を受ける対象として選択される。
【００８０】
別の面において、本発明は、抗精神病薬により処置可能な疾患に罹患している対象を処
置するための適切な抗精神病薬に基づく療法を選択するためのｒｓ１１３０２１４、ｒｓ
４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９のＳＮＰの使用（以下「本
発明の第三の使用」という）に関する。
【００８１】
本発明の第三の使用の特定の態様において、表１による対立遺伝子の組み合わせの１つ
の存在は、対象がＤＲＤ２遮断効力が低い抗精神病薬に基づく療法を受けるものとして選
択されることを示す。
【００８２】
本発明の第一の使用の別の特定の態様において、表２による対立遺伝子の組み合わせの
１つの存在は、対象が任意の抗精神病薬に基づく療法を受けるものとして選択されること
を示す。
【００８３】
本発明の第一、第二および第三の方法の用語および詳細については本発明の方法に関し
て詳細に記載されており、本発明による使用に関しても同義に用いられる。
【００８４】
本発明について、単に例示とする以下の実施例を用いて本発明の範囲を限定することな
く以下に詳説する。
【実施例】
【００８５】
材料および方法
対象
有意性の５％レベル、８０％パワーおよび２倍のＥＰＳリスク（オッズ比）を前提とす
るサンプルサイズ計算は、検討する対立遺伝子の担持と関連した（対立遺伝子頻度＞０．
１）。計算はＱｕａｎｔｏ１．２  ｓｏｆｔｗａｒｅ（http://hydra.usc.edu/gxe）を用
いて行った。
【００８６】
抗精神病薬療法を受ける３２１名の精神科入院患者のコホートは、ホスピタルクリニッ
ク（バルセロナ、スペイン）の精神科において３年の期間（２００２−２００４）にわた
り継続的に採用された。このコホートの２４１名の対象がここに示されるＥＰＳの遺伝薬
理学的研究に参加した。対象はＤＳＭ−ＩＶ基準に従って診断された：１８４名の対象が
統合失調症（ｎ＝１２５）および関連する障害（ｎ＝２２  統合失調感情障害；ｎ＝２７
急性精神病性障害；ｎ＝９  妄想性パラノイド障害；ｎ＝１  統合失調型障害）と診断
された；４０名は双極性障害を有すると診断された；および１７名は他の診断結果（パー
ソナリティ障害、精神病性うつ病、行動障害、軽度認知障害および強迫性障害を含む）を
有した。抗精神病薬投薬により誘導される急性ＥＰＳはシンプソン−アンガス尺度４８を
用いて評価した。入院期間および／または運動障害の病歴の間にＥＰＳを示した（シンプ
ソン−アンガス＞３）６９名の患者は症例と考えられた。検討の際または以前にＥＰＳを
示さなかった（シンプソン−アンガス≦３）１７２名の患者は対照とした。これらの集団
の全記述は以前の研究に見出すことができる(Gasso et al., 2009, cited supra; Mas et
al., 2012, Pharmacogenomics J 12:255-9)。同意書および全血試料は各対象から得た。
本研究はホスピタルクリニックの倫理委員会により承認されたものである。
【００８７】
予測構築および予測因子評価のための独立したデータセットを得るために、データセッ
トは訓練集団と検証集団に分けた。この目的のために、分割は抗精神病薬処置に従って行
った：リスペリドンで処置した患者のコホート（ｎ＝１１４、３９症例および７５対照）
（コホート１）はデータを訓練し、最良の予測因子を試験するのに使用した；リスペリド
ンとは異なる他の抗精神病薬（ハロペリドール  ｎ＝２７；クロザピン  ｎ＝２４；アミ
スルプリド  ｎ＝３；オランザピン  ｎ＝３４；ズクロペンチキソール  ｎ＝６；ジプラ
シドン  ｎ＝１０；クエチアピン  ｎ＝２２）で処置した残りの患者による第二のコホー
ト（ｎ＝１２７、３０症例および９７対照）（コホート２）は予測因子を検証するのに使
用した。最終工程として、本発明者らは、コホート３と呼ばれる全コホート（ｎ＝２４１
）（コホート１＋コホート３）において予測因子を試験した。
【００８８】
ＳＮＰ選択および遺伝子型決定
以下の方法に従って、ｍＴＯＲ経路遺伝子の制御に関与している異なる９つの遺伝子の
ＳＮＰを選択した；第一に、精神障害に関連する遺伝子におけるＳＮＰを見つけるために
、数種のデータベース（ＰｕｂＭｅｄ、Ｅｎｓｅｍｂｌ、Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ａｓｓｏｃｉ
ａｔｉｏｎ  Ｄａｔａｂａｓｅ、ＳＺＧｅｎｅ、ＰＤＧｅｎｅ、ＡｌｚＧｅｎｅ、ＭＳＧ
ｅｎｅ）を用いて文献調査を行った；第二に、ＳＮＰが見つからなかった場合は、他の疾
患に関連するＳＮＰを探した。というのもこの関連がタンパク質における機能変化を意味
することもあるからである；第三に、いくつかの遺伝子について、前工程でＳＮＰを選択
できなかった場合は、ＰｕｐａＳｕｉｔデータベースを用いて検索を行い、予測された機
能性を有するＳＮＰを検出した；最後に、該ＳＮＰのタイプ（同義をコードする、非同義
をコードする、イントロン、ｍＲＮＡ  ｕｔｒ）および頻度をＮＣＢＩのＳＮＰデータベ
ース（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp）で確認した。１０％より低い頻度は排除する
。選択されたＳＮＰを表３に特定する。
【００８９】
アプライドバイオシステムズより入手したＴａｑＭａｎ対立遺伝子識別プレデザインア
ッセイ（ＴａｑＭａｎ−ＳＮＰ遺伝子型決定アッセイ；ｒｓ７８７４２３４を検出するた
めのプローブＣ＿３２１２７２１１＿２０、ｒｓ１３３３５６３８を検出するためのプロ
ーブＣ＿３２８２５３３＿１０、ｒｓ２０２４６２７を検出するためのプローブＣ＿１１
６４７３７１＿１０、ｒｓ１１３０２１４を検出するためのプローブＣ＿２６３５２８２
５＿１０、ｒｓ４５６９９８を検出するためのプローブＣ＿３１１６７１０５＿１０、ｒ
ｓ１８０１５８２を検出するためのプローブＣ＿８７０１２９９＿１０、ｒｓ３７３７５
９７を検出するためのプローブＣ＿２７４７６１７＿３０、ｒｓ７２１１８１８を検出す
るためのプローブＣ＿１９７１４６５＿１０、ｒｓ１０５３６３９を検出するためのプロ
ーブＣ＿９５９６６９２＿１０）によるリアルタイムＰＣＲにより、製造業者のガイドラ
インに従って（アプライドバイオシステムズ、フォスターシティ、カリフォルニア）、多
型（表３）を検出した。
【００９０】
【表３】
2020089370.tif 000008
【００９１】
統計
ＥＰＳのリスクに対する各ＳＮＰの独立した寄与を評価するために、ＳＮＰａｓｓｏｃ
Ｒパッケージを用いてロジスティック回帰分析に基づく多変数方法により遺伝子型頻度
を評価した。また、症例および対照の両集団においてハーディ・ワインベルグ平衡からの
任意の逸脱に関してＳＮＰデータを確認した。次に、オープンソースのＭＤＲプロジェク
ト (www.epistasis.org/software.html）で入手可能なＭＤＲ２．０ソフトウェアを用い
て、他の部分に記載されるような多因子次元削減（ＭＤＲ）により遺伝子−遺伝子相互作
用を分析した。第一に、コホート１を用いて、徹底的な調査における１０倍交差検証を使
用して可能なすべての２〜４座位の相互作用を試験することにより可能なすべてのＳＮＰ
の組み合わせを構築した（試料はデータを訓練する９つの部分と試験する１つの部分を用
いて１０の部分に分けた。プロセスを１０回繰り返し、各回で試験するための異なる部分
を用いた。）。転帰パラメーターとして、本発明者らは、交差検証の一致性（cross-vali
dation consistency）（１０倍交差検証の間に計算に適用された最も良好なモデルに基づ
いて選択された多様性の同定の一致性を測定する）、試験均衡正確度（testing balanced
accuracy）（相互作用が正確に症例−対照状態を予測する程度を測定するものであって
、１０倍交差検証において行われた試験の平均である（ラベル１は該モデルによる良好な
予測を示す；ラベル０．５は該モデルが対照から症例を選択する可能性に過ぎないことを
示す））および統計的有意性（最も良好なモデルのｐ−値はＭＤＲ並べ替え試験モジュー
ル１．０を用いる１０，０００の並べ替えによる多重試験について補正した）を検討した
。第二に、得られた最も良好なモデルにより新たな多座位特性を作り出した。これが上記
の最も良好な転帰パラメーターを有するモデルである。新たな特性を構築および再分析し
て、コホート１全データセットにおいて統計値を計算し、オッズ比およびその信頼区間、
ｐ−値、感度（ＴＰ／ＴＰ＋ＦＮ、ＥＰＳ症例を正確に予測する能力を測定する）、特異
度（ＴＮ／ＴＮ＋ＦＰ、非ＥＰＳ対象を正確に却下する能力を測定する）、正確度（ＴＰ
＋ＴＮ／ＴＰ＋ＴＮ＋ＦＰ＋ＦＮ、ＥＰＳおよび非ＥＰＳ患者を正確に予測する能力を測
定する）ならびに精度（ＴＰ／ＴＰ＋ＦＰ、ＥＰＳ症例を正しく予測する能力を測定する
）を得た。第三に、構築された特性をコホート２およびコホート３で検証し、コホート１
全データセットについてと同様の統計値；オッズ比およびその信頼区間、ｐ−値、感度、
特異度、正確度ならびに精度を得た。
【００９２】
結果
コホート１において試験した際には、検討した９つのＳＮＰはいずれも単独ではＥＰＳ
のリスクに有意に寄与しなかった。表３に症例および対照における対立遺伝子の頻度、性
別および年齢により調整したロジスティック回帰分析ならびにハーディ・ワインベルグ平
衡に関するｐ−値を要約する。
【００９３】
徹底的なＭＤＲ分析の結果を表４に示す。ｒｓ１１３０２１４（ＡＫＴ１）、ｒｓ４５
６９９８（ＦＣＨＳＤ１）、ｒｓ７２１１８１８（Ｒａｐｔｏｒ）およびｒｓ１０５３６
３９（ＤＤＩＴ４）バリアントを含む４元モデルが最も良好な総合的性能（試験正確度０
．６６０）および１０／１０の交差検証の一致性（並び替え検定  ｐ＜０．０００１）を
有した。
【００９４】
【表４】
2020089370.tif 000009
【００９５】
同定された４つのＳＮＰに起因する多座位を構築し、コホート１の全データセットにお
いて試験した。２種の特性、すなわち、素因（表１）および非素因（表２）を同定した。
素因特性の保因者（症例の７８．９％と対照の１１．８％）は該特性を有しない者と比較
して２７倍ＥＰＳに罹患しやすかった（ＯＲ  ２７．９１；９５％  ＣＩ  ９．８１−７
９．３９；ｐ−値＜０．０００１）。構築された素因の遺伝的特性は、ＥＰＳを有する症
例３９名中３０名（７６．９％感度）およびＥＰＳを有しない対照７５名中６７名（８９
．３％特異度）を含む１１４名の患者中９７名（８５．１％正確度）を正確に予測した。
この特性は３８の症例、３０の真陽性および８の偽陽性（７８．９％精度）を予測した（
表５）。
【００９６】
【表５】
2020089370.tif 000010
【００９７】
データを訓練するのに使用した同じ集団において予測因子を試験することは楽観的過ぎ
るため、本発明者らはコホート２を使用して独立に構築された特性を検証した。コホート
２の全データにおいて特性を試験すると正確度は７３．２３％に低下した。コホート２は
異なるタイプの抗精神病薬により処置された患者により形成されたものであるから（リス
ペリドンにより処置された患者のみを含むコホート１とは対照的に）、このばらつきの原
因となる新たな変数がモデルに含まれた。抗精神病薬はＤＲＤ２を遮断するそれらの能力
に従って分類された。この新しい変数（抗精神病薬効力）がコホート１で同定された素因
の遺伝的特性に加えられると、コホート２の正確度が８０．３６％に上昇した（１２７名
中１０９名の患者が正確に予測された）（表５）；新たな素因特性の保因者（症例の７０
．０％と対照の９．２７％）は該特性を有しない者と比較して２２倍ＥＰＳに罹患しやす
かった（ＯＲ  ２２．８１；９５％  ＣＩ  ８．０６−６４．５０；ｐ−値＜０．０００
１）。
【００９８】
４つのＳＮＰ（コホート１で同定された）と抗精神病薬効力（コホート２での分析に含
まれる）を含む新たな予測因子はコホート３（コホート１およびコホート３）で検証した
。素因特性の保因者（症例の８５．５％と対照の１６．３％）は該特性を有しない者と比
較して３０倍ＥＰＳに罹患しやすかった（ＯＲ  ３０．２４；９５％  ＣＩ  １３．８６
−６６．３９；ｐ−値＜０．０００１）。表３において認められるように、正確度 (２４
１名中２０３名の症例が正確に予測された）、感度（ＥＰＳを有する症例６９名中５９名
が正確に予測された）および特異度（１７２名中ＥＰＳを有しない対照１４９名が正確に
予測された）について同様の値がコホート３で得られた。精度はコホート１に対しコホー
ト３で低下した（７８．９５％から６７．８２％）。
【配列表】
2020089370000001.app
【手続補正書】
【提出日】令和2年2月5日(2020.2.5)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
対象において抗精神病薬に基づく処置により誘導される錐体外路症状（ＥＰＳ）の発症を予測する方法であって、
ｉ）前記対象由来の遺伝物質を含んでなる試料において、ｒｓ１１３０２１４、ｒｓ４５６９９８、ｒｓ７２１１８１８およびｒｓ１０５３６３９の一塩基多型（ＳＮＰ）の配列を決定すること、および
ｉｉ）前記ＳＮＰの配列に基づいて前記対象がＥＰＳを発症するリスクを予測することを含んでなる、方法。
【外国語明細書】
2020089370000001.pdf