(57)【要約】      （修正有）【課題】重量が増大した植物の製造方法を提供する。【解決手段】フィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制された植物を、通常の栽培条件における栄養素の濃度よりも少なくとも１．５倍高い濃度にて栽培することによって、当該機能が抑制されていない植物と比して、重量が増大することを見出した。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
重量が増大した植物の製造方法であって、
フィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制された植物を、通常の栽培条件における栄養素の濃度と比して少なくとも１．５倍高い濃度にて栽培する、方法。
【請求項２】
前記栄養素は、窒素、リン酸及びカリウムである、請求項１に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、重量が増大した植物の製造方法に関し、より詳しくは、フィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制された植物を、高栄養条件下にて栽培することにより、当該機能が抑制されていない植物と比して重量が増大した植物を製造する方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
国連が発表した「世界人口予測２０１７年改訂版」によると、世界で７６億人いる人口は２０３０年までに８６億人に達し、その後もさらに増加すると予測され、増加した人口を賄う農作物等の確保が急務となっている。さらに、地球温暖化対策としてバイオ燃料が注目されており、食料としてのみならず、その原料としての農作物の需要も、急速に拡大している。
【０００３】
しかし、耕作可能な農地は限られていることから、単位面積又は植物一個体あたりの収量（重量）を増加させることが必要になる。このようなニーズに対応するために、農作物の生産性をより高めることのできる技術の開発が期待される。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００４】
【非特許文献１】Ｔａｋａｎｏ  Ｍ．ら、Ｔｈｅ  Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ、２００１年、１３巻、５２１〜５３４ページ
【非特許文献２】Ｔａｋａｎｏ  Ｍ．ら、Ｔｈｅ  Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ、２００５年、１７巻、３３１１〜３３２５ページ
【非特許文献３】Ｇｕｒｕｒａｎｉ  ＭＡ．ら、Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ  Ａｄｖ．、２０１５年１−２月、３３巻、１号、５３−６３ページ
【非特許文献４】長谷あきら等監修、植物の光センシング−光情報の受容とシグナル伝達（細胞工学別冊−植物細胞工学シリーズ）、「１−１  フィトクロム研究のたどってきた道」、秀潤社、２００１年１０月１日発行、３７ページ
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
本発明は、前記課題に鑑みてなされたものであり、単位面積又は植物一個体あたりの収量の増加を可能とする、重量が増大した植物の製造方法を提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【０００６】
本発明者らは、前記目的を達成すべく鋭意研究を重ね、ｐｈｙＡを欠損したイネ（ｐｈｙＡ欠損イネ）を、水耕液を用いて異なる栄養条件下で栽培した結果、高栄養条件では、ｐｈｙＡ欠損イネの重量がその親品種よりも有意に増加することを明らかにした。一方、低栄養条件（前記高栄養条件と比して、各栄養素（窒素、リン及びカリウム等）の濃度が０．４倍となる条件）では親品種と比して顕著な変化が認められないことも見出した。
【０００７】
フィトクロム（ｐｈｙ）は植物の主要な光受容体で、植物における多くの生理現象で重要な役割を果たすことが知られている。イネは異なる役割を担っている３個のｐｈｙ（ｐｈｙＡ、ｐｈｙＢ、ｐｈｙＣ）を有し、各ｐｈｙをコードする遺伝子の欠損変異体（非遺伝子組換え体）が単離されている。しかしながら、通常の栽培条件下で育てたｐｈｙＡ欠損イネは親品種と比較して表現形質に違いが見られないことが報告されており（非特許文献１〜４）、前述の高栄養条件下におけるｐｈｙＡ欠損イネの重量増大は、従前の知見から予期できない驚くべき効果であった。
【０００８】
本発明者らはさらに、ｐｈｙＡ欠損イネ及びその親品種を、野外の水田にて、疎植（株間３０ｃｍ）又は密植（株間１５ｃｍ、疎植と比べて２倍高い密度）にて育てることによって、１個体あたりの栄養条件（施肥量）を変化させ、疎植のイネは密植のイネに比べて栄養素が２倍となるようにした。なお、通常の水田栽培において、株間は一般的に１５〜２０ｃｍであるため、疎植のイネは通常の栽培条件と比して栄養素が１．５〜２倍となる。
【０００９】
その結果、疎植ではｐｈｙＡ欠損イネは親品種と比べて全植物体及び籾の乾燥重量が共に有意に増加することが明らかになった。一方、密植（通常の栽培条件）では、親品種と比べて全植物体及び籾の乾燥重量ともに変化が認められなかった。
【００１０】
また、栽植密度を統一した上で、施肥量を通常の２倍として水田栽培を行なった結果、前記同様に、その高栄養条件下では、ｐｈｙＡ欠損イネは親品種と比べて収量が増加することも確認できた。
【００１１】
本発明は、上記知見に基づくものであり、より詳しくは、以下を提供するものである。
＜１＞  重量が増大した植物の製造方法であって、フィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制された植物を、通常の栽培条件における栄養素の濃度と比して少なくとも１．５倍高い濃度にて栽培する、方法。
＜２＞  前記栄養素は、窒素、リン酸及びカリウムである、＜１＞に記載の方法。
【００１２】
なお、フィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制された植物を、高栄養条件（通常の栽培条件における栄養素の濃度と比して少なくとも１．５倍高い濃度）にて栽培することによって、当該機能が抑制されていない植物と比して、重量が増大する理由は必ずしも定かではないが、本発明者らは以下のように推察する。
【００１３】
すなわち、本発明者らが、ｐｈｙＡ欠損イネ及びその親品種にて、吸収される栄養素量を比較したところ、高栄養条件において、ｐｈｙＡ欠損イネにおける多くの栄養素の吸収能が、親品種と比較して大きく促進することが明らかになった。このことから、高栄養条件下における当該栄養素吸収能の向上に伴い、植物重量の増大が生じたものと推察する。
【発明の効果】
【００１４】
本発明によれば、重量が増大した植物を製造することが可能となり、ひいては、単位面積又は植物一個体あたりの収量の増加が可能となる。さらに、上述のとおり、本発明において用いられるフィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制された植物は、栄養素（肥料）の吸収能が高いため、残存肥料が少なく、環境負荷が低減される。
【００１５】
また、農作物においては、栽培環境適性や味覚、抵抗性等の特性の異なるさまざまな品種が存在し、生産者は目的に合った特性を有する品種を選択して栽培している。本発明によれば、このような品種において、ゲノム編集等によってフィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制することにより、各品種の有する特性を変化させることなく、重量を増大、ひいては生産性を向上させることが可能となる。
【図面の簡単な説明】
【００１６】
【図１】ｐｈｙＡ欠損イネ（系統  Ａ♯１）及びその親品種の水耕栽培において、新しい高栄養水耕液又は低栄養水耕液に交換してから、４、２４、４８時間目までに吸収された乾燥重量（ＤＷ）当たりの各種栄養素の吸収量を測定した結果を示す、グラフである。
【発明を実施するための形態】
【００１７】
後述の実施例に示すとおり、本発明者らは、ｐｈｙＡを欠損したイネを、高栄養条件で栽培することによって、その親品種よりも有意に増加することを明らかにした。一方、通常の栽培条件及び低栄養条件下での栽培では、親品種と比して顕著な変化が認められないことも見出している。
【００１８】
したがって、本発明は、フィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制された植物を、通常の栽培条件における栄養素の濃度と比して少なくとも１．５倍高い濃度にて栽培する、重量が増大した植物の製造方法を、提供する。
【００１９】
（植物）
本発明において重量増大の対象となる「植物」は、フィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制されれば、特に制限はなく、例えば、単子葉植物（例えば、イネ、トウモロコシ、ソルガム、コムギ等のイネ科植物）及び双子葉植物（例えば、トマト、ジャガイモ等のナス科植物）を含む被子植物、裸子植物、コケ植物、シダ植物、草本植物、並びに木本植物が挙げられる。さらに、これら植物の遺伝子組み換え体やゲノム編集体（例えば、除草剤耐性作物、害虫耐性作物、病害耐性作物、食味向上作物、保存性向上作物、収量向上作物）であっても良い。
【００２０】
本発明によって増大する「重量」は、植物体全体の重量であってもよく、その一部分の重量であってもよい。一部分としては、特に制限はないが、種子、果実、茎、葉、根、塊茎、花等が挙げられる。また、重量は、乾燥重量であってもよく、新鮮重量（生重量）であってもよい。本発明において、「重量が増大した」とは、フィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制されていない植物と比較して、前述の植物体全体又は少なくとも一部分の重量が有意に増大していることが意味する。
【００２１】
（フィトクロムＡ遺伝子）
本発明において「フィトクロムＡ遺伝子」とは、光受容タンパク質の１種であるフィトクロムＡ（ｐｈｙＡ）をコードする遺伝子であり、例えば、下記表に示すアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする遺伝子（下記表に示すヌクレオチド配列を含むタンパク質をコードする遺伝子が挙げられる。なお、表１において「遺伝子数」は、各植物種が有するフィトクロムＡ遺伝子の遺伝子数（パラロガス遺伝子の数）を示す。
【００２２】
【表１】
2020130174.tif 000002
【００２３】
また、自然界においてもヌクレオチド配列が変異することは起こり得ることである。そして、それに伴いコードするアミノ酸も変化し得る。したがって、本発明のフィトクロムＡ遺伝子には、その機能が抑制されることによって、植物の重量を増大する活性を有するタンパク質をコードする限り、表１に記載のうちのいずれかに記載のアミノ酸配列において１又は複数のアミノ酸が置換、欠失、付加、及び／又は挿入されたアミノ酸配列からなるタンパク質をコードする遺伝子も含まれる。ここで「複数」とは、通常５００アミノ酸以内、好ましくは４００アミノ酸以内、より好ましくは３００アミノ酸以内、さらに好ましくは２００アミノ酸以内、より好ましくは１５０アミノ酸以内、さらに好ましくは１００アミノ酸以内、より好ましくは５０アミノ酸以内（例えば、４０アミノ酸以内、３０アミノ酸以内、２０アミノ酸以内）、さらに好ましくは１０アミノ酸以内、特に好ましくは数個のアミノ酸以内（例えば、５アミノ酸以内、４アミノ酸以内、３アミノ酸以内、２アミノ酸以内）である。
【００２４】
さらに、現在の技術水準においては、当業者であれば、特定の遺伝子のヌクレオチド配列情報を利用して、同種若しくは他の植物から、その相同遺伝子を同定することが可能である。相同遺伝子を同定するための方法としては、例えば、ハイブリダイゼーション技術（Ｓｏｕｔｈｅｒｎ，Ｅ．Ｍ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，９８：５０３，１９７５）やポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）技術（Ｓａｉｋｉ，Ｒ．Ｋ．，ｅｔ  ａｌ．Ｓｃｉｅｎｃｅ，２３０：１３５０−１３５４，１９８５、Ｓａｉｋｉ，Ｒ．Ｋ．ｅｔ  ａｌ．Ｓｃｉｅｎｃｅ，２３９：４８７−４９１，１９８８）が挙げられる。相同遺伝子を同定するためには、通常、ストリンジェントな条件下でハイブリダイゼーション反応を行なう。ストリンジェントなハイブリダイゼーションの条件としては、６Ｍ  尿素、０．４％  ＳＤＳ、０．５ｘＳＳＣの条件又はこれと同等のストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件を例示できる。よりストリンジェンシーの高い条件、例えば、６Ｍ  尿素、０．４％ＳＤＳ、０．１ｘＳＳＣの条件を用いれば、より相同性の高い遺伝子の単離を期待することができる。本発明のフィトクロムＡ遺伝子には、その機能が抑制されることによって、植物の重量を増大する活性を有するタンパク質をコードする限り、表１に記載のうちのいずれかに記載のヌクレオチド配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件でハイブリダイズするＤＮＡを含む遺伝子が含まれる。
【００２５】
同定された相同遺伝子がコードするタンパク質は、通常、前記特定の遺伝子がコードするそれと高い相同性（高い類似性）、好ましくは高い同一性を有する。ここで「高い」とは、少なくとも６０％以上、好ましくは７０％以上、より好ましくは８０％以上、さらに好ましくは８５％以上、より好ましくは９０％以上、さらに好ましくは９５％以上（例えば、９６％以上、９７％以上、９８％以上、９９％以上）のことである。フィトクロムＡ遺伝子には、その機能が抑制されることによって、植物の重量を増大する活性を有するタンパク質をコードする限り、表１に記載のうちのいずれかに記載のアミノ酸配列と６０％以上の相同性（類似性）又は同一性を有するアミノ酸配列をコードする遺伝子が含まれる。
【００２６】
配列の相同性は、ＢＬＡＳＴのプログラム（Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２１５：４０３−４１０，１９９０）を利用して決定することができる。該プログラムは、Ｋａｒｌｉｎ及びＡｌｔｓｃｈｕｌによるアルゴリズムＢＬＡＳＴ（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８７：２２６４−２２６８，１９９０，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９０：５８７３−５８７７，１９９３）に基づいている。例えば、ＢＬＡＳＴによってアミノ酸配列を解析する場合には、パラメーターは、例えばｓｃｏｒｅ＝５０、ｗｏｒｄｌｅｎｇｔｈ＝３とする。また、Ｇａｐｐｅｄ  ＢＬＡＳＴプログラムを用いて、アミノ酸配列を解析する場合は、Ａｌｔｓｃｈｕｌら（Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２５：３３８９−３４０２，１９９７）に記載されているように行うことができる。ＢＬＡＳＴとＧａｐｐｅｄ  ＢＬＡＳＴプログラムを用いる場合には、各プログラムのデフォルトパラメーターを用いる。これらの解析方法の具体的な手法は公知である。
【００２７】
上述の本発明のフィトクロムＡ遺伝子がコードするタンパク質が、その機能が抑制されることによって、植物の重量を増大する活性を有するか否かは、例えば、後述の実施例に示すように、当該遺伝子の機能を抑制することにより、高栄養条件下で栽培した植物の重量が増大しているか否かを検定することにより判定することができる。
【００２８】
（フィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制された植物）
本発明において、「フィトクロムＡ遺伝子の機能の抑制」には、該機能の完全な抑制（阻害）及び部分的な抑制の双方が含まれる。また、複数のフィトクロムＡ遺伝子（ｐｈｙＡ１〜ｐｈｙＡ５等のパラロガス遺伝子）を有する植物種も存在する（例えば、表１に示すコムギにおいて、ＡＥＡ４０４３０、ＡＥＡ４０４３９及びＡＥＡ４０４４９にて示されるアミノ酸配列をコードする遺伝子は、各々ｐｈｙＡ１遺伝子、ｐｈｙＡ２遺伝子及びｐｈｙＡ３遺伝子である）。かかる植物種の場合、少なくとも１のフィトクロムＡ遺伝子（例えば、コムギにおいてｐｈｙＡ１遺伝子のみ）の機能が抑制されていればよいが、全てのフィトクロムＡ遺伝子（例えば、コムギにおいてはｐｈｙＡ１遺伝子、ｐｈｙＡ２遺伝子及びｐｈｙＡ３遺伝子）の機能が抑制されていることが好ましい。また、フィトクロムＡ遺伝子の機能の抑制には、フィトクロムＡ遺伝子の発現抑制の他、フィトクロムＡ遺伝子がコードするタンパク質の活性の抑制が含まれる。そして、かかる抑制は、例えば、フィトクロムＡ遺伝子のコード領域、非コード領域、転写制御領域（プロモーター領域）等に変異を導入することによって行なうことができる。
【００２９】
本発明において、フィトクロムＡ遺伝子に導入される変異としては、該遺伝子の機能を抑制する限り特に制限はなく、例えば、ヌクレオチドの置換、欠失、付加、及び／又は挿入が挙げられるが、ナンセンス変異、フレームシフト変異、ヌル変異が好ましい。また、フィトクロムＡ遺伝子に導入される変異の個数としても、該遺伝子の機能を抑制する限り特に制限はなく、１個でもよく、また複数個（例えば、２個、３個以下、５個以下、１０個以下、２０個以下、３０個以下、４０個以下、５０個以下）でもよい。
【００３０】
また、フィトクロムＡ遺伝子に導入される変異としては、当該遺伝子がコードするタンパク質のアミノ酸配列全部を失わせる必要はなく、その一部が失われるか変化するように当該遺伝子内に導入されてもよい。
【００３１】
なお、遺伝子の変異により発現するタンパク質の一部が欠失する場合、通常、全体の２０％以上が欠失していればよく、好ましくは３０％以上、より好ましくは４０％以上、さらに好ましくは５０％以上、より好ましくは６０％以上、より好ましくは７０％以上、さらに好ましくは８０％以上（例えば、８５％以上、９０％以上、９５％以上）欠失していればよい。
【００３２】
また、このような一部を欠失させるような変異において、フィトクロムＡ遺伝子がコードするタンパク質の活性を奏する上で重要であると想定される領域又は部位を欠失させるような変異が挙げられる。かかる領域は、例えば、上記表１に示すＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号にて特定される各配列において、それら領域等の情報が「Ｒｅｇｉｏｎ」及び「Ｓｉｔｅ」として示されているので、当業者であれば把握することができる。それら領域等の中で、フィトクロムＡ遺伝子がコードするタンパク質の活性を奏する上で重要な、光受容を行なう発色団が結合する領域であることから、ＧＡＦドメインにおいて、その全部又は一部が欠失するような変異が導入されることが好ましい。なお、例えば、イネフィトクロムＡ（ＸＰ＿０１５６３０３４０に記載のアミノ酸配列からなる）において、ＧＡＦドメインは２２０〜４１２位のアミノ酸からなる領域である。
【００３３】
フィトクロムＡ遺伝子への変異の導入は、当業者であれば公知の変異導入方法により達成することができる。かかる公知の方法としては、ゲノム編集法、物理的変異導入法、化学的変異剤を用いる方法、トランスポゾン等をゲノムＤＮＡに導入する方法が挙げられるが、これらに限定はされない。
【００３４】
ゲノム編集法は、部位特異的なヌクレアーゼ（例えば、ジンクフィンガーヌクレアーゼ（ＺＦＮ）、転写活性化様エフェクターヌクレアーゼ（ＴＡＬＥＮ）、ＣＲＩＳＰＲ−Ｃａｓ９等のＤＮＡ二本鎖切断酵素）を利用して、標的遺伝子を改変する方法である。例えば、ＺＦＮｓ（米国特許６２６５１９６号、８５２４５００号、７８８８１２１号、欧州特許１７２０９９５号）、ＴＡＬＥＮｓ（米国特許８４７０９７３号、米国特許８５８６３６３号）、ヌクレアーゼドメインが融合されたＰＰＲ（ｐｅｎｔａｔｒｉｃｏｐｅｐｔｉｄｅｒｅｐｅａｔ）（Ｎａｋａｍｕｒａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｌａｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｐｈｙｓｉｏｌ  ５３：１１７１−１１７９（２０１２））等の融合タンパク質や、ＣＲＩＳＰＲ−Ｃａｓ９（米国特許８６９７３５９号、国際公開２０１３／１７６７７２号）、ＣＲＩＳＰＲ−Ｃｐｆ１（Ｚｅｔｓｃｈｅ  Ｂ．ｅｔ  ａｌ．，Ｃｅｌｌ，１６３（３）：７５９−７１，（２０１５））やＴａｒｇｅｔ−ＡＩＤ（Ｋ．Ｎｉｓｈｉｄａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｔａｒｇｅｔｅｄ  ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  ｅｄｉｔｉｎｇ  ｕｓｉｎｇ  ｈｙｂｒｉｄ  ｐｒｏｋａｒｙｏｔｉｃ  ａｎｄ  ｖｅｒｔｅｂｒａｔｅ  ａｄａｐｔｉｖｅ  ｉｍｍｕｎｅ  ｓｙｓｔｅｍｓ，  Ｓｃｉｅｎｃｅ，ＤＯＩ：１０．１１２６／ｓｃｉｅｎｃｅ．ａａｆ８７２９，（２０１６））等のガイドＲＮＡとタンパク質の複合体を用いる方法が挙げられる。
【００３５】
物理的変異導入法としては、例えば、重イオンビーム（ＨＩＢ）照射、速中性子線照射、ガンマ線照射、紫外線照射が挙げられる（Ｈａｙａｓｈｉら、Ｃｙｃｌｏｔｒｏｎｓ  ａｎｄ  Ｔｈｅｉｒ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ、２００７年、第１８回国際会議、２３７〜２３９ページ、及び、Ｋａｚａｍａら、Ｐｌａｎｔ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、２００８年、２５巻、１１３〜１１７ページ参照のこと）。
【００３６】
化学的変異剤を用いる方法としては、例えば、化学変異剤によって種子等を処理する方法（Ｚｗａｒ及びＣｈａｎｄｌｅｒ、Ｐｌａｎｔａ、１９９５年、１９７巻、３９〜４８ページ等  参照）が挙げられる。化学変異剤としては特に制限はないが、エチルメタンスルホート（ＥＭＳ）、Ｎ−エチル−Ｎ−ニトロソウレア（ＥＮＵ）、Ｎ−メチル−Ｎ−ニトロソウレア（ＭＮＵ）、アジ化ナトリウム、亜硫酸水素ナトリウム、ヒドリキシルアミン、Ｎ−メチル−Ｎ’−ニトロ−Ｎ−ニトログアニジン（ＭＮＮＧ）、Ｎ−メチル−Ｎ’−ニトロソグアニジン（ＮＴＧ）、Ｏ−メチルヒドロキシルアミン、亜硝酸、蟻酸及びヌクレオチド類似体が挙げられる。
【００３７】
トランスポゾン等をゲノムＤＮＡに導入する方法としては、例えば、ＴＯＳ１７等のトランスポゾン、Ｔ−ＤＮＡ等を植物のゲノムＤＮＡに挿入する方法が挙げられる（Ｋｕｍａｒら、Ｔｒｅｎｄｓ  Ｐｌａｎｔ  Ｓｃｉ．、２００１年、６巻、３号、１２７〜１３４ページ、及び、Ｔａｍａｒａら、Ｔｒｅｎｄｓ  ｉｎ  Ｐｌａｎｔ  Ｓｃｉｅｎｃｅ、１９９９年、４巻、３号、９０〜９６ページ  参照）。
【００３８】
以上の方法により変異が導入された植物については、公知の方法により、フィトクロムＡ遺伝子に変異が導入されていることを確認することができる。かかる公知の方法としては、例えば、ＤＮＡシークエンス法（次世代シークエンシング法等）、ＰＣＲ法、マイクロアレイを用いた解析法、サザンブロット法、ノーザンブロット法が挙げられる。かかる方法によれば、フィトクロムＡ遺伝子に変異が導入されているか否かを、変異導入前後の当該遺伝子の配列又は長さを比較することによって判断することができる。また、ノーザンブロット法、ＲＴ−ＰＣＲ法、ウェスタンブロット法、ＥＬＩＳＡ法、マイクロアレイによる解析法等を利用することにより、転写制御領域等に変異が導入された植物において、フィトクロムＡ遺伝子の転写産物又は翻訳産物の発現量の低下が認められれば、該植物はフィトクロムＡ遺伝子に変異が導入された植物であると確認することもできる。
【００３９】
また、フィトクロムＡ遺伝子に変異が導入されていることを確認する他の方法として、ＴＩＬＬＩＮＧ（標的誘導型ゲノム特定位傷害、Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ  Ｉｎｄｕｃｅｄ  Ｌｏｃａｌ  Ｌｅｓｉｏｎｓ  ＩＮ  Ｇｅｎｏｍｅｓ）が挙げられる（Ｓｌａｄｅら、Ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ  Ｒｅｓ．、２００５年、１４巻、１０９〜１１５ページ、及び、Ｃｏｍａｉら、Ｐｌａｎｔ  Ｊ．、２００４年、３７巻、７７８〜７８６ページ  参照）。特に、前述の重イオンビーム照射や化学的変異剤等を用いて植物ゲノム中に非選択的変異を導入した場合には、フィトクロムＡ遺伝子又はその一部をＰＣＲで増幅した後に、該増幅産物に変異を有する個体を、前記ＴＩＬＬＩＮＧ等により選抜することができる。この場合にも、フィトクロムＡ遺伝子のヌル変異体を有する植物を得ることができる。
【００４０】
また、上述の方法により変異が導入された植物と野生型の植物とを交配させ、戻し交配を行うことにより、フィトクロムＡ遺伝子以外の遺伝子に導入された変異を除去することもできる。
【００４１】
フィトクロムＡ遺伝子に変異を導入することにより当該遺伝子の機能が抑制された植物が、フィトクロムＡ遺伝子のヘテロ接合体（ｈｅｔｅｒｏｚｙｇｏｔｅ）である場合がある。そのような場合、例えば、当該ヘテロ接合体とコントロール植物とを交配して得られるＦ１植物体同士を交配してＦ２植物体を得ることにより、当該Ｆ２植物体から当該変異が導入されたフィトクロムＡ遺伝子を有するホモ接合体（ｈｏｍｏｚｙｇｏｔｅ）を選抜することができる。またフィトクロムＡ遺伝子の機能が完全に抑制されるという観点から、ホモ接合体であることが好ましい。この場合、「当該変異が導入されたフィトクロムＡ遺伝子を有するホモ接合体である植物」には、互いに同一である変異を有するフィトクロムＡ対立遺伝子（ａｌｌｅｌｅ）を２つ有する植物だけでなく、第１の変異を有し活性が抑制されたタンパク質をコードする第１のフィトクロムＡ対立遺伝子と、第２の変異を有し活性が抑制されたタンパク質をコードする第２のフィトクロムＡ対立遺伝子とを有する植物が含まれる。
【００４２】
本発明において、フィトクロムＡ遺伝子の機能を抑制する方法として、上述の変異導入の他、フィトクロムＡ遺伝子の転写産物と相補的なｄｓＲＮＡ（二重鎖ＲＮＡ、例えばｓｉＲＮＡ）をコードするＤＮＡを用いる方法、フィトクロムＡ遺伝子の転写産物と相補的なアンチセンスＲＮＡをコードするＤＮＡ（アンチセンスＤＮＡ）を用いる方法、フィトクロムＡ遺伝子の転写産物を特異的に開裂するリボザイム活性を有するＲＮＡをコードするＤＮＡ用いる方法（リボザイム法）といった、フィトクロムＡ遺伝子の転写産物を標的とする方法も挙げられる。
【００４３】
本発明において、フィトクロムＡ遺伝子機能の抑制は、上述の方法等に応じ、種々の植物体、種子又は植物細胞に対して行うことができる。植物細胞には、植物由来の培養細胞の他、植物体中の細胞も含まれる。さらに、種々の形態の植物由来の細胞、例えば、懸濁培養細胞、プロトプラスト、葉の切片、カルス、未熟胚、花粉等が含まれる。
【００４４】
また、本発明において、上述の、部位特異的ヌクレアーゼ、融合タンパク質又はガイドＲＮＡとタンパク質の複合体をコードするＤＮＡ、トランスポゾンをコードするＤＮＡ、二重鎖ＲＮＡをコードするＤＮＡ、アンチセンスＲＮＡをコードするＤＮＡ、リボザイム活性を有するＲＮＡをコードするＤＮＡ等を、ベクターに挿入した形態にて植物の細胞に導入してもよい。
【００４５】
フィトクロムＡ遺伝子の機能を抑制するための前記ＤＮＡが挿入されるベクターとしては、植物細胞内で挿入遺伝子を発現させることが可能なものであれば特に制限はないが、前記ＤＮＡを恒常的又は誘導的に発現させるためのプロモーターを含有しうる。恒常的に発現させるためのプロモーターとしては、例えば、カリフラワーモザイクウイルスの３５Ｓプロモーター、イネのアクチンプロモーター、トウモロコシのユビキチンプロモーター等が挙げられる。また、誘導的に発現させるためのプロモーターとしては、例えば、糸状菌・細菌・ウイルスの感染や侵入、低温、高温、乾燥、紫外線の照射、特定の化合物の散布等の外因によって発現することが知られているプロモーター等が挙げられる。さらに、本発明にかかるＤＮＡとしてｓｉＲＮＡ等の短いＲＮＡをコードするＤＮＡを発現させるためのプロモーターとしては、ｐｏｌIII系のプロモーターが好適に用いられる。
【００４６】
植物細胞へ前記ＤＮＡ又は該ＤＮＡが挿入されたベクター等を導入する方法としては、例えば、パーティクルガン法、アグロバクテリウムを介する方法（アグロバクテリウム法）、ポリエチレングリコール法、電気穿孔法（エレクトロポーレーション）等、当業者に公知の種々の方法を用いることができる。
【００４７】
なお、ＤＮＡの形態をとらずとも、上述の、部位特異的ヌクレアーゼ、融合タンパク質、トランスポゾンは、タンパク質として、上述の、ガイドＲＮＡ、二重鎖ＲＮＡ、アンチセンスＲＮＡ、リボザイム活性を有するＲＮＡは、ＲＮＡとして、植物細胞に導入しても、変異を導入することはできる。
【００４８】
また、上述の方法等により遺伝子の機能が人為的に抑制された植物細胞から植物体を再生することにより、重量が増大した植物を得ることができる。
【００４９】
例えば、イネにおいて、形質転換植物体を作出する手法については、ポリエチレングリコールによりプロトプラストへ遺伝子導入し、植物体を再生させる方法（Ｄａｔｔａ，Ｓ．Ｋ．Ｉｎ  Ｇｅｎｅ  Ｔｒａｎｓｆｅｒ  Ｔｏ  Ｐｌａｎｔｓ（Ｐｏｔｒｙｋｕｓ  Ｉ  ａｎｄ  Ｓｐａｎｇｅｎｂｅｒｇ  Ｅｄｓ．）ｐｐ６６−７４，１９９５）、電気パルスによりプロトプラストへ遺伝子導入し、植物体を再生させる方法（Ｔｏｋｉ  ｅｔ  ａｌ．Ｐｌａｎｔ  Ｐｈｙｓｉｏｌ．１００，１５０３−１５０７，１９９２）、パーティクルガン法により細胞へ遺伝子を直接導入し、植物体を再生させる方法（Ｃｈｒｉｓｔｏｕ  ｅｔ  ａｌ．Ｂｉｏ／ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，９：９５７−９６２，１９９１）及びアグロバクテリウムを介して遺伝子を導入し、植物体を再生させる方法（Ｈｉｅｉ  ｅｔ  ａｌ．Ｐｌａｎｔ  Ｊ．６：２７１−２８２，１９９４）など、いくつかの技術が既に確立し、本願発明の技術分野において広く用いられている。
【００５０】
また、その他の植物であっても、Ｔａｂｅｉら（田部井豊  編、「形質転換プロトコール［植物編］」、株式会社化学同人、２０１２年９月２０日出版）に記載に方法を用い、形質転換及び植物体への再生を行なうことができる。
【００５１】
また、上述の方法等により、一旦、フィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制されている植物体が得られれば、該植物体から有性生殖又は無性生殖により子孫を得ることが可能である。さらに、該植物体やその子孫あるいはクローンから繁殖材料（例えば、種子、切穂、株、カルス、プロトプラスト等）を得て、それらを基に該植物体を量産することも可能である。したがって本発明には、前記重量が増大した植物の子孫及びクローン、並びに、それらの繁殖材料が含まれる。
【００５２】
以上、本発明に係る「フィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制された植物」の好適な態様について説明したが、当該植物は、上述の人為的な変異導入等によるものに限定されるものではなく、自然変異によってフィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制された植物も含まれる。
【００５３】
また、農作物は、栽培環境適性や味覚、抵抗性等の特性の異なるさまざまな品種が存在し、生産者は目的に合った特性を有する品種を選択して栽培している。そのため、このような既存の品種において、上述の方法等により、フィトクロムＡ遺伝子の機能を抑制すれば、各品種の有する特性を変化させることなく重量を増大（生産性を向上）させることができる。
【００５４】
（植物の栽培方法）
後述の実施例に示すとおり、本発明の製造方法において、上述のフィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制された植物を、通常の栽培条件における栄養素の濃度と比して少なくとも１．５倍高い濃度にて栽培することによって、重量が増大した植物を得ることができる。
【００５５】
本発明に係る「栄養素」は、植物の生長に関与する栄養素であればよく、必須栄養素であってもよく、有用栄養素であってもよい。必須栄養素としては、例えば、多量一次要素（窒素、リン、カリウム、炭素、水素、酸素）、多量二次要素（マグネシウム、カルシウム、硫黄）、微量要素（ホウ素、塩素、マンガン、鉄、亜鉛、銅、モリブデン、ニッケル）が挙げられる。これらの中で、本発明に係る栄養素として、窒素、リン及びカリウムが好ましく、窒素、リン、カリウム及びマグネシウムがより好ましい。
【００５６】
また、前述の栄養素の通常の栽培条件における濃度は、当業者であれば、各植物品種に対し、土壌特性に基づき設定された標準施肥量（例えば、日本農林水産省が示す施肥基準）として理解することができる。より具体的には、表２に示す施肥量が、各植物種における通常の栽培条件における栄養素の濃度として挙げられる。
【００５７】
【表２】
2020130174.tif 000003
【００５８】
なお、表２において、イネは粘質土にて栽培した場合の施肥基準を示す（但し、コシヒカリ等を、粘質の泥炭・黒泥土にて栽培する場合の、五酸化二リンの施肥基準は、表２に記載の８ｋｇ／１０ａの代わりに１０ｋｇ／１０ａとなる）。
【００５９】
本発明において、上述のフィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制された植物を、前述の通常の栽培条件における栄養素の濃度と比して少なくとも１．５倍高い濃度にて栽培すればよいが、１．７倍高い濃度での栽培が好ましく、２倍高い濃度での栽培がより好ましく、２．５倍高い濃度での栽培がさらに好ましく、３倍高い濃度での栽培がより好ましく、３．５倍高い濃度での栽培がさらに好ましく、４倍高い濃度での栽培がより好ましい。また、栄養素量は、土壌又は水等への添加量を調整することのみならず、例えば、後述の実施例２に示すとおり、栽培間隔を調整することによっても、通常の栽培条件よりも少なくとも１．５倍高い濃度とすることができる。
【００６０】
本発明の製造方法における栽培期間としても特に制限はなく、種子からの栽培であってもよく、苗（実生苗、幼苗等）からの栽培であってもよい。栽培の期間としても特に制限はなく、例えば、幼苗期、生育期、繁茂期、成熟期、開花期及び結実期から選択される少なくとも１の期間を含むものであってもよい。また、栽培の終期としても特に制限はなく、例えば、幼苗期、生育期、繁茂期、成熟期、開花期、結実期迄が挙げられる。
【実施例】
【００６１】
以下、実施例に基づいて本発明をより具体的に説明するが、本発明は以下の実施例に限定されるものではない。また、本実施例は、以下に示す材料及び方法を用いて行なった。
【００６２】
（イネ）
ｐｈｙＡを欠損したイネ（ｐｈｙＡ欠損イネ）及びその親品種である日本晴を、以下の実験に供した。ｐｈｙＡ欠損イネは、旧農業生物資源研究所で作製されたレトロトランスポゾンＴｏｓ１７による突然変異体集団（ミュータントパネル）より選抜されたイネである（非特許文献１及び２  参照）。後述の実施例１及び４においては、ｐｈｙＡ欠損イネ  系統Ａ♯１を用い、実施例２においては、系統Ａ♯１とは独立した系統であるｐｈｙＡ欠損イネ  系統Ａ＃２を用いた。実施例３においては前記Ａ♯１とＡ♯２の２系統を用いた。
【００６３】
（水耕栽培）
３３０ｍＬの下記高栄養又は低栄養の水耕液あたり、６本のイネを用い、水耕栽培を実施した。水耕液は２日ごとに新しい液に交換し、イネは５葉期になるまで（おおよそ３週間）育てた。水耕液は、以下のとおりに、各種ストック液を混合して調製した。
【００６４】
ストック液（Ｉ〜Ｖ液）
Ｉ液（５００ｍＬストック）
ＫＮＯ３（硝酸カリウム、ＭＷ＝１０１．１）  １０１．１ｇ（２Ｍ）
ＮＨ４Ｈ２ＰＯ４（りん酸二水素アンモニウム、ＭＷ＝１１５．０３）  ５７．５ｇ（１Ｍ）
II液（２００ｍＬストック）
ＭｇＳＯ４−７Ｈ２Ｏ（硫酸マグネシウム七水和物、ＭＷ＝２４６．４８）  ４９．３ｇ（１Ｍ）
III液（１００ｍＬストック）
ＣａＣｌ２−２Ｈ２Ｏ（塩化カルシウム二水和物、ＭＷ＝１４７．０１）  ７３．５ｇ（５Ｍ）
IV液（２００ｍＬストック）
Ｈ３ＢＯ３（ホウ酸、ＭＷ＝６１．８３）  ０．５７２ｇ（４６．２６ｍＭ）
ＭｎＳＯ４−５Ｈ２Ｏ（硫酸マンガン（II）五水和物、ＭＷ＝２４１．０８）  ０．３０７ｇ（６．３７ｍＭ）
ＣｕＳＯ４−５Ｈ２Ｏ（硫酸銅（II）五水和物、ＭＷ＝２４９．７）  ０．０１２ｇ（０．２４ｍＭ）
ＺｎＳＯ４−７Ｈ２Ｏ（硫酸亜鉛（II）七水和物、ＭＷ＝２８７．５６）  ０．１５６ｇ（２．７１ｍＭ）
Ｋ２ＭｏＯ４（モリブデン酸カリウム、ＭＷ＝２３８．１３）  ０．０２３ｇ（０．４８ｍＭ）
Ｖ液（１００ｍＬストック）
ＥＤＴＡ−Ｎａ−Ｆｅ（II）−Ｈ２Ｏ（Ｆｅ−ＥＤＴＡ、ＭＷ＝３８５．０６）  ０．１９３ｇ（５０ｍＭ）。
【００６５】
高栄養の水耕液は、I液  ５００μＬ、II液  ５００μＬ、III液  １００μＬ、IV液  ５００μＬ及びV液  ２５０μＬを、超純水（Ｍｉｌｉ−Ｑ）にて１Ｌになるよう希釈し、調製した。一方、低栄養の水耕液は、高栄養の水耕液を超純水（Ｍｉｌｉ−Ｑ）で２．５倍希釈して調製した。
【００６６】
水耕栽培において、イネはグロースキャビネット（サンヨー社製。製品番号：ＭＬＲ−３５０）内で１６時間明期／８時間暗期の光条件下で育てた。光源は、植物栽培用蛍光灯のビオルックス−Ａ（ＮＥＣ社製）を使用し、温度は２８度設定、湿度設定なしで栽培した。
【００６７】
（水田栽培）
後述の実施例２においては、２００５年５月中旬にイネ幼植物（４から５葉期のイネ）を水田に移植した。肥料（基肥、穂肥）は通常の施肥量で実施した。具体的には、表２に示す日本晴の普通作物栽培基準に基づく施肥量にて栽培を行なった。イネ幼植物は３０センチ（疎植）又は１５センチ（密植）の間隔で水田に移植した。
【００６８】
また、後述の実施例３においては、２０１９年５月中旬にイネ幼植物（４から５葉期のイネ）を、１５ｃｍの間隔で２区画の水田に移植した。そして、水田圃場２区画あるうちの１区画は通常の栄養条件（表２に示す日本晴の普通作物栽培基準に基づく施肥量）にて、もう１区画は高栄養条件（前記通常の栄養条件と比べて２倍の施肥量）にて栽培を行なった。
【００６９】
（栄養素量の測定）
新しい水耕液交換後４、２４、４８時間後にサンプリングした水耕液を１３ＡＩ  ０．２μｍ  クロマトディスク（ジーエルサイエンス社製）でろ過処理し、各栄養素含量をイオンクロマトグラフ（ダイオネックス社製）を用いて測定した。
【００７０】
（実施例１）
上述のとおり、水耕液を用い、低栄養条件又は高栄養条件（低栄養条件と比べて栄養素が２．５倍濃い）にて、ｐｈｙＡ欠損イネ及び親品種を栽培した。そして、得られた各幼苗を、地上部と根に分けて乾燥重量を測定した。得られた結果を表３に示す。
【００７１】
【表３】
2020130174.tif 000004
【００７２】
表３において、「Ａ＃１」及び「ＷＴ」は各々ｐｈｙＡ欠損イネ（系統  Ａ＃１）及び親品種のデータを示す。データは平均値±標準誤差（ＳＥ）にて示す（ｎ＝５）。また、スチューデントｔ−検定によって親品種での値と比べて顕著に異なった、ｐｈｙＡ欠損イネにおける値にはアスタリスクを付している（＊Ｐ＜０．０５）。
【００７３】
表３に示した結果から明らかなように、低栄養条件ではｐｈｙＡ欠損イネと親品種とで顕著な変化は認められなかった。その一方で、高栄養条件では、ｐｈｙＡ欠損イネの重量は、親品種のそれよりも有意に増加することが明らかになった。
【００７４】
（実施例２）
上述のとおり、水田において、疎植（株間：３０ｃｍ、高栄養条件）又は密植（株間：１５ｃｍ、通常の栄養条件）にてｐｈｙＡ欠損イネ及び親品種を籾が成熟するまで栽培した。そして、得られた全植物体及び籾の乾燥重量を測定した。得られた結果を表４に示す。
【００７５】
なお、通常の水田栽培において、株間は一般的には１５〜２０ｃｍである（株式会社クボタのＷｅｂサイト内、ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｔａｎｂｏ−ｋｕｂｏｔａ．ｃｏ．ｊｐ／ｆｏｏｄｓ／ｗａｔｃｈｉｎｇ／１５＿２．ｈｔｍｌ  参照）。そのため、前記疎植のイネは通常の栽培条件と比して栄養素が１．５〜２倍となる。
【００７６】
【表４】
2020130174.tif 000005
【００７７】
表４において、「Ａ＃２」及び「ＷＴ」は各々ｐｈｙＡ欠損イネ（系統  Ａ＃２）及び親品種のデータを示す。データは平均値±標準誤差（ＳＥ）にて示す（全植物体重量はｎ＝２０、籾重量はｎ＝１６）。また、スチューデントｔ−検定によって親品種での値と比べて有意に異なった、ｐｈｙＡ欠損イネにおける値にはアスタリスクを付している（＊Ｐ＜０．０５；＊＊Ｐ＜０．０１）。
【００７８】
表４に示した結果から明らかなように、疎植ではｐｈｙＡ欠損イネは親品種と比べて全植物体及び籾の乾燥重量がともに１．１倍増加することが明らかになった。一方、密植（通常の栄養条件下）では、親品種と比べて全植物体及び籾の乾燥重量ともに変化が認められなかった。
【００７９】
（実施例３）
上述のとおり、水田において、通常の栄養条件下又は高栄養条件（施肥量２倍）にてｐｈｙＡ欠損イネ（２系統）及び親品種を籾が成熟するまで栽培した。そして、得られたイネの穂及び地上部（穂以外の部分）の乾燥重量を測定した。得られた結果を表５に示す。
【００８０】
【表５】
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【００８１】
表５において、「Ａ♯１」及び「Ａ♯２」はｐｈｙＡ欠損イネの独立した２系統の各データを示し、「ＷＴ」は親品種のデータを示す。データは平均値±標準誤差（ＳＥ）にて示す（高栄養条件下での栽培：ｎ＝１５、通常の栄養条件下での栽培：ｎ＝１６）。また、スチューデントｔ−検定によって親品種での値と比べて有意に異なった、ｐｈｙＡ欠損イネにおける値にはアスタリスクを付している（＊＊＊Ｐ＜０．００１）。
【００８２】
表５に示した結果から明らかなように、ｐｈｙＡ欠損イネの２系統においては共に、高栄養条件下での栽培にて、親品種と比して収量における顕著な増加が認められた。
【００８３】
（実施例４）
実施例１〜３に示すとおり、高栄養条件にてｐｈｙＡ欠損イネを栽培した結果、その重量は親品種と比して増大した。このことから、ｐｈｙＡ欠損イネの栄養素の吸収能力が、高栄養条件下において促進することが予想される。
【００８４】
そこで、栄養素吸収能力について調べるために、上述のとおり、水耕栽培を行い、新しい高栄養水耕液又は低栄養水耕液に交換してから、４、２４、４８時間目にサンプリングした水耕液の各栄養素含量を測定し、残存量から吸収された乾燥重量（ＤＷ）当たりの各種栄養素の吸収量を算出した。そして、各種栄養素の吸収量について親品種及びｐｈｙＡ欠損イネの間で比較した。得られた結果を図１に示す。
【００８５】
図１において、「Ａ／ＷＴ＿Ｌｏｗ」は、低栄養水耕液交換後における、親品種の各種栄養素の吸収量に対する、ｐｈｙＡ欠損イネのそれの比率を示し、「Ａ／ＷＴ＿Ｈｉｇｈ」は、高栄養水耕液交換後における、親品種の各種栄養素の吸収量に対する、ｐｈｙＡ欠損イネのそれの比率を示す。アンモニウムイオン（ＮＨ４＋）及び硝酸イオン（ＮＯ３−）における「ＮＤ」は、２４時間目以降に親品種及び／又はｐｈｙＡ欠損イネが吸収し尽くしてしまったために栄養素吸収量比が算出できなかったことを示す。一方、硫酸イオン（ＳＯ４２−）及びカルシウムイオン（Ｃａ２＋）の４時間目における「ＮＤ」は、吸収量よりも植物体内から外への排出量の方が多いために栄養素吸収量比が算出できなかったことを示す。なお、イネにおける栄養素吸収が促進される時間は各栄養素ごとに異なり、窒素成分のアンモニウムイオン（ＮＨ４＋）及び硝酸イオン（ＮＯ３−）は４時間目で吸収が盛んになるのに対し、他の栄養素は２４時間目以降に吸収が促進する。
【００８６】
図１に示した結果から明らかなように、低栄養条件下では、ｐｈｙＡ欠損イネ及び親品種において、各種栄養素の吸収量の顕著な差が認められなかった。一方、高栄養条件下では、ｐｈｙＡ欠損イネにおける各種栄養素の吸収量は概して、親品種のそれと比して増大していることが明らかになった。この結果から、実施例１〜３において見出された高栄養条件下におけるｐｈｙＡ欠損イネの重量増大は、各種栄養素の吸収能の増大に依ることが示唆される。
【産業上の利用可能性】
【００８７】
以上説明したように、本発明によれば、重量が増大した植物を製造することが可能となり、ひいては、単位面積又は植物一個体あたりの収量の増加が可能となる。また、本発明において用いられるフィトクロムＡ遺伝子の機能が抑制された植物は、栄養素（肥料）の吸収能が高いため、残存肥料が少なく、環境負荷が低減される。したがって、本発明は、農業分野において有用である。
【図１】
2020130174.tif 000007