(57)【要約】      （修正有）【課題】癌および感染症などの疾病を治療および診断するための抗体または抗体断片の提供。【解決手段】ヒトプログラム細胞死リガンド１（ＰＤ−Ｌ１）タンパク質の免疫グロブリンＶ（ＩｇＶ）ドメインに結合せず、免疫グロブリンＣ（ＩｇＣ）ドメインに特異的に結合できる抗体または抗体断片。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
単離された抗体または抗体断片であって、ヒトプログラム細胞死リガンド１（ＰＤ−Ｌ１）タンパク質への特異性を有し、配列識別番号１のＶＨ  ＣＤＲ１、配列識別番号２のＶＨ  ＣＤＲ２、配列識別番号３のＶＨ  ＣＤＲ３、配列識別番号４のＶＬ  ＣＤＲ１、配列識別番号５のＶＬ  ＣＤＲ２、および、配列識別番号６のＶＬ  ＣＤＲ３を含む抗体または抗体断片。
【請求項２】
重鎖定常領域、軽鎖定常領域、Ｆｃ領域、または、それらの組み合わせを更に含む、請求項１に記載の抗体または抗体断片。
【請求項３】
前記軽鎖定常領域はカッパまたはラムダ鎖定常領域である、請求項２に記載の抗体または抗体断片。
【請求項４】
前記抗体または抗体断片は、ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＥまたはＩｇＤのアイソタイプである、請求項１に記載の抗体または抗体断片。
【請求項５】
前記アイソタイプは、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４である、請求項４に記載の抗体または抗体断片。
【請求項６】
前記抗体または抗体断片は、キメラ抗体、ヒト化抗体、または、完全ヒト型抗体である、請求項１から５のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。
【請求項７】
前記抗体または抗体断片はヒト化抗体である、請求項６に記載の抗体または抗体断片。
【請求項８】
Ｋａｂａｔナンバリングによる、
（ａ）位置４４のＳｅｒ、
（ｂ）位置４９のＡｌａ、
（ｃ）位置５３のＡｌａ、
（ｄ）位置９１のＩｌｅ、
（ｅ）位置１のＧｌｕ、
（ｆ）位置３７のＶａｌ、
（ｇ）位置４０のＴｈｒ、
（ｈ）位置５３のＶａｌ、
（ｉ）位置５４のＧｌｕ、
（ｊ）位置７７のＡｓｎ、
（ｋ）位置９４のＡｒｇ、および、
（ｌ）位置１０８のＴｈｒ、ならびに、
それらの組み合わせ
から成る群から選択される１または複数のアミノ酸残基を含む重鎖可変領域を含む、請求項６に記載の抗体または抗体断片。
【請求項９】
Ｋａｂａｔナンバリングによる、（ａ）位置４４のＳｅｒ、（ｂ）位置４９のＡｌａ、（ｃ）位置５３のＡｌａ、および／または、（ｄ）位置９１のＩｌｅ、および、それらの組み合わせを含む重鎖可変領域を含む、請求項７に記載の抗体または抗体断片。
【請求項１０】
Ｋａｂａｔナンバリングによる、
（ａ）位置２２のＳｅｒ、
（ｂ）位置４２のＧｌｎ、
（ｃ）位置４３のＳｅｒ、
（ｄ）位置６０のＡｓｐ、および、
（ｅ）位置６３のＴｈｒ、ならびに、
それらの組み合わせ
から成る群から選択される１または複数のアミノ酸残基を含む軽鎖可変領域を含む、請求項６に記載の抗体または抗体断片。
【請求項１１】
配列識別番号７‐２６から成る群から選択されるアミノ酸配列、または、配列識別番号７‐２６から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の配列同一性を有するペプチドを含む重鎖可変領域を含む、請求項１から１０のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。
【請求項１２】
配列識別番号２７‐３３から成る群から選択されるアミノ酸配列、または、配列識別番号２７‐３３から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の配列同一性を有するペプチドを含む軽鎖可変領域を含む、請求項１から１１のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。
【請求項１３】
配列識別番号２０のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列識別番号２８のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、請求項１に記載の抗体または抗体断片。
【請求項１４】
単離された抗体または抗体断片であって、前記抗体または抗体断片は、ヒトプログラム細胞死リガンド１タンパク質（ＰＤ−Ｌ１タンパク質）の免疫グロブリンＣドメイン（ＩｇＣドメイン）に特異的に結合でき、前記ＩｇＣドメインは、アミノ酸残基１３３‐２２５から成る、抗体または抗体断片。
【請求項１５】
前記ＰＤ−Ｌ１タンパク質のアミノ酸残基Ｙ１３４、Ｋ１６２またはＮ１８３のうち少なくとも１つに結合できる、請求項１４に記載の抗体または抗体断片。
【請求項１６】
前記ＰＤ−Ｌ１タンパク質のアミノ酸残基Ｙ１３４、Ｋ１６２およびＮ１８３に結合できる、請求項１４に記載の抗体または抗体断片。
【請求項１７】
前記ＰＤ−Ｌ１タンパク質の免疫グロブリンＶドメイン（ＩｇＶドメイン）に結合しない前記抗体または抗体断片であって、前記ＩｇＶドメインはアミノ酸残基１９‐１２７から成る、請求項１４に記載の抗体または抗体断片。
【請求項１８】
前記抗体または抗体断片は、キメラ抗体、ヒト化抗体、または、完全ヒト型抗体である、請求項１４から１７のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。
【請求項１９】
前記抗体または抗体断片はヒト化抗体である、請求項１に記載の抗体または抗体断片。
【請求項２０】
請求項１から１９のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片と、薬学的に許容可能な担体とを含む組成物。
【請求項２１】
請求項１から１９のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片をコードする１または複数のポリヌクレオチドを含む単離細胞。
【請求項２２】
治療を必要とする患者の癌または感染を治療する方法であって、請求項１から１９のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片の有効量を前記患者に投与する段階を備える方法。
【請求項２３】
前記癌は固形腫瘍である、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記癌は、膀胱癌、肝臓癌、結腸癌、直腸癌、子宮内膜癌、白血病、リンパ腫、膵臓癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、乳癌、尿道癌、頭頸部癌、胃腸癌、胃癌、食道癌、卵巣癌、腎癌、悪性黒色腫、前立腺癌、および、甲状腺癌から成る群から選択される、請求項２２に記載の方法。
【請求項２５】
前記患者に第２の癌治療剤を投与する段階を更に備える、請求項２２に記載の方法。
【請求項２６】
前記感染は、ウイルス感染、細菌感染、真菌感染、または、寄生虫感染である、請求項２２に記載の方法。
【請求項２７】
治療を必要とする患者の癌または感染を治療する方法であって、
（ａ）請求項１から１９のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片を用いて、インビトロで細胞を処理する段階と、
（ｂ）処理された前記細胞を前記患者に投与する段階と
を備える方法。
【請求項２８】
段階（ａ）の前に、前記細胞を個人から単離する段階を更に備える、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
前記細胞は前記患者から単離される、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
前記細胞は、前記患者とは異なるドナー個人から単離される、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
前記細胞はＴ細胞である、請求項２７から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２】
前記Ｔ細胞は、腫瘍浸潤Ｔリンパ球、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、または、それらの組み合わせである、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
試料におけるＰＤ−Ｌ１の発現を検出する方法であって、
前記抗体または抗体断片が前記ＰＤ−Ｌ１に結合する条件下で、請求項１から１９のいずれか一項にに記載の抗体または抗体断片に前記試料を接触させる段階と、
前記試料におけるＰＤ−Ｌ１の発現を示す前記結合を検出する段階と
を備える方法。
【請求項３４】
前記試料は、腫瘍細胞、腫瘍組織、感染組織または血液試料を含む、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
単離された抗体または抗体断片であって、ヒトＰＤ−Ｌ１タンパク質への特異性を有し、
（ａ）配列識別番号１のＶＨ  ＣＤＲ１、または、配列識別番号１の位置１、２もしくは５において、単一置換、欠失もしくは挿入を有する、配列識別番号１の変異型、
（ｂ）配列識別番号２のＶＨ  ＣＤＲ２、または、配列識別番号２の位置７、８、１４もしくは１５において、単一置換、欠失もしくは挿入を有する、配列識別番号２の変異型、
（ｃ）配列識別番号３のＶＨ  ＣＤＲ３、または、配列識別番号３の位置１、２、３、４、５もしくは６において、単一置換、欠失もしくは挿入を有する、配列識別番号３の変異型、
（ｄ）配列識別番号４のＶＬ  ＣＤＲ１、または、配列識別番号４の位置３において、単一置換、欠失もしくは挿入を有する配列識別番号４の変異型、
（ｅ）配列識別番号５のＶＬ  ＣＤＲ２、または、配列識別番号５の位置１、２、３、４、５もしくは６において、単一置換、欠失もしくは挿入を有する、配列識別番号５の変異型、および、
（ｆ）配列識別番号６のＶＬ  ＣＤＲ３、または、配列識別番号６の位置１１もしくは２において、単一置換、欠失もしくは挿入を有する、配列識別番号６の変異型
を含む抗体または抗体断片。
【請求項３６】
前記配列識別番号１の変異型は、配列識別番号６１‐６７から成る群から選択される、請求項３５に記載の抗体または抗体断片。
【請求項３７】
前記配列識別番号２の変異型は、配列識別番号６８‐７７から成る群から選択される、請求項３５に記載の抗体または抗体断片。
【請求項３８】
前記配列識別番号３の変異型は、配列識別番号７８‐９０から成る群から選択される、請求項３５に記載の抗体または抗体断片。
【請求項３９】
前記配列識別番号４の変異型は、配列識別番号９１‐９２から成る群から選択される、請求項３５に記載の抗体または抗体断片。
【請求項４０】
前記配列識別番号５の変異型は、配列識別番号９３‐１０５から成る群から選択される、請求項３５に記載の抗体または抗体断片。
【請求項４１】
前記配列識別番号６の変異型は、配列識別番号１０６‐１１１から成る群から選択される、請求項３５に記載の抗体または抗体断片。
【請求項４２】
重鎖定常領域、軽鎖定常領域、Ｆｃ領域、または、それらの組み合わせを更に備える、請求項３５から４１のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。
【請求項４３】
前記抗体または抗体断片はキメラ抗体、ヒト化抗体、または、完全ヒト型抗体である、請求項３５から４１のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。
【請求項４４】
Ｋａｂａｔナンバリングによる、
（ａ）位置４４のＳｅｒ、
（ｂ）位置４９のＡｌａ、
（ｃ）位置５３のＡｌａ、
（ｄ）位置９１のＩｌｅ、
（ｅ）位置１のＧｌｕ、
（ｆ）位置３７のＶａｌ、
（ｇ）位置４０のＴｈｒ、
（ｈ）位置５３のＶａｌ、
（ｉ）位置５４のＧｌｕ、
（ｊ）位置７７のＡｓｎ、
（ｋ）位置９４のＡｒｇ、および、
（ｌ）位置１０８のＴｈｒ、ならびに、
それらの組み合わせ
から成る群から選択される１または複数のアミノ酸残基を含む重鎖可変領域を含む、請求項４３に記載の抗体または抗体断片。
【請求項４５】
Ｋａｂａｔナンバリングによる、（ａ）位置４４のＳｅｒ、（ｂ）位置４９のＡｌａ、（ｃ）位置５３のＡｌａ、および／または、（ｄ）位置９１のＩｌｅ、ならびに、それらの組み合わせを含む重鎖可変領域を含む、請求項４３に記載の抗体または抗体断片。
【請求項４６】
Ｋａｂａｔナンバリングによる、
（ａ）位置２２のＳｅｒ、
（ｂ）位置４２のＧｌｎ、
（ｃ）位置４３のＳｅｒ、
（ｄ）位置６０のＡｓｐ、および、
（ｅ）位置６３のＴｈｒ、ならびに、
それらの組み合わせ
から成る群から選択される１または複数のアミノ酸残基を含む軽鎖可変領域を含む請求項４３に記載の抗体または抗体断片。
【請求項４７】
請求項１から１９または３５から４６のいずれか一項に記載の抗体断片と、免疫細胞上の分子への特異性を有する第２の抗原結合断片とを含む、単離された二重特異性抗体。
【請求項４８】
前記分子は、ＰＤ−１、ＣＴＬＡ−４、ＬＡＧ−３、ＣＤ２８、ＣＤ１２２、４‐１ＢＢ、ＴＩＭ３、ＯＸ−４０、ＯＸ４０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ４０Ｌ、ＬＩＧＨＴ、ＩＣＯＳ、ＩＣＯＳＬ、ＧＩＴＲ、ＧＩＴＲＬ、ＴＩＧＩＴ、ＣＤ２７、ＶＩＳＴＡ、Ｂ７Ｈ３、Ｂ７Ｈ４、ＨＥＶＭ、ＢＴＬＡ、ＫＩＲおよびＣＤ４７から成る群から選択される、請求項４７に記載の二重特異性抗体。
【請求項４９】
前記抗体断片、および、前記第２の抗原結合断片は、Ｆａｂ断片、一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）または単一ドメイン抗体から各々独立に選択される、請求項４７に記載の二重特異性抗体。
【請求項５０】
Ｆｃ断片を更に含む、請求項４７に記載の二重特異性抗体。
【発明の詳細な説明】
【背景技術】
【０００１】
分化抗原群２７４（ＣＤ２７４）またはＢ７ホモログ１（Ｂ７−Ｈ１）とも知られているプログラム細胞死リガンド１（ＰＤ−Ｌ１）は、妊娠、組織同種移植、自己免疫疾患、および、肝臓炎などの他の病状など、特定の事象中に免疫系の抑制において主な役割を果たすと考えられている４０ｋＤａの１型細胞膜貫通タンパク質である。ＰＤ−Ｌ１がＰＤ−１またはＢ７．１に結合すると、リンパ節におけるＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を低減する阻害シグナルが伝達される。加えて、ＰＤ−１は、Ｂｃｌ−２遺伝子の下向き調節によって更に媒介されるアポトーシスを通して、リンパ節における外来抗原特異的Ｔ細胞の蓄積を制御することもできる。
【０００２】
ＰＤ−Ｌ１の上向き調節は、癌が宿主の免疫系を回避することを可能にし得ることが示されている。腎細胞癌の患者からの腫瘍標本の解析から、ＰＤ−Ｌ１の高い腫瘍発現は、腫瘍の進行性の増加、および、死亡リスクの増加に関連することが分かった。癌免疫療法として多くのＰＤ−Ｌ１阻害剤が開発中であり、それらは臨床試験において良い結果を示している。
【０００３】
ＰＤ−Ｌ１の阻害は、癌の治療に加えて、感染症を治療する可能性を示している。細胞内感染のモデルマウスにおいて、Ｌモノサイトゲネスは、Ｔ細胞、ＮＫ細胞、マクロファージにおけるＰＤ−Ｌ１タンパク質の発現を誘導した。ＰＤ−Ｌ１の遮断（例えば、遮断抗体の使用）の結果、感染したマウスの死亡率が増加した。遮断により、マクロファージによる一酸化窒素およびＴＮＦαの生成が減少し、ＮＫ細胞によるグランザイムＢの生成が減少し、Ｌモノサイトゲネス抗原特異的ＣＤ８  Ｔ細胞の増殖が減少した（ただし、ＣＤ４  Ｔ細胞の増殖は減少しなかった）。この証拠は、ＰＤ−Ｌ１が細胞内感染において正の共刺激分子として機能することを示す。
【発明の概要】
【０００４】
本開示は、ヒトＰＤ−Ｌ１タンパク質への高い結合親和性を有する抗ＰＤ−Ｌ１抗体を提供し、ＰＤ−Ｌ１とその受容体ＰＤ−１との間の相互作用を効果的に遮断できる。例において、これらの抗ＰＤ−Ｌ１抗体がＴ細胞免疫反応を促進し、腫瘍増殖を阻害することが実証されたことも重要である。ＰＤ−Ｌ１タンパク質の細胞外部分の免疫グロブリンＶドメインに結合する既知の抗ＰＤ−Ｌ１抗体との違いとして、これらの抗体は、免疫グロブリンＣドメイン、特に、アミノ酸残基Ｙ１３４、Ｋ１６２およびＮ１８３に結合する。これらの抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、様々な種類の癌および感染症の治療などの、治療の目的に有用であり、診断および予後の目的に使用できる。
【０００５】
本開示の一実施形態は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体または抗体断片を提供し、抗体または抗体断片は、ヒトのプログラム細胞死リガンド１（ＰＤ−Ｌ１）タンパク質の免疫グロブリンＣ（ＩｇＣ）ドメインに特異的に結合できる。いくつかの実施形態において、ＩｇＣドメインは、アミノ酸残基１３３〜２２５から成る。いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、ＰＤ−Ｌ１タンパク質のアミノ酸残基Ｙ１３４、Ｋ１６２またはＮ１８３のうち少なくとも１つに結合できる。いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、ＰＤ−Ｌ１タンパク質のアミノ酸残基Ｙ１３４、Ｋ１６２およびＮ１８３のうち少なくとも１つに結合できる。いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、ＰＤ−Ｌ１タンパク質の免疫グロブリンＶ（ＩｇＶ）ドメインに結合せず、ＩｇＶドメインは、アミノ酸残基１９‐１２７から成る。 
【０００６】
本開示の一実施形態は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体または抗体断片を提供し、抗体または抗体断片は、ヒトのプログラム細胞死リガンド１（ＰＤ−Ｌ１）タンパク質への特異性を有し、配列識別番号１のＶＨ  ＣＤＲ１、配列識別番号２のＶＨ  ＣＤＲ２、配列識別番号３のＶＨ  ＣＤＲ３、配列識別番号４のＶＬ  ＣＤＲ１、配列識別番号５のＶＬ  ＣＤＲ２、および、配列識別番号６のＶＬ  ＣＤＲ３を含む。いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、重鎖定常領域、軽鎖定常領域、Ｆｃ領域、または、それらの組み合わせを更に含む。いくつかの実施形態において、軽鎖定常領域は、カッパまたはラムダ鎖定常領域である。いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＥまたはＩｇＤのアイソタイプである。いくつかの実施形態において、アイソタイプはＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４である。抗体または抗体断片は、キメラ抗体、ヒト化抗体、または、完全ヒト型抗体であるが、これらに限定されない。一態様において、抗体または抗体断片はヒト化抗体である。
【０００７】
いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、Ｋａｂａｔナンバリングによる、（ａ）位置４４のＳｅｒ、（ｂ）位置４９のＡｌａ、（ｃ）位置５３のＡｌａ、（ｄ）位置９１のＩｌｅ、（ｅ）位置１のＧｌｕ、（ｆ）位置３７のＶａｌ、（ｇ）位置４０のＴｈｒ、（ｈ）位置５３のＶａｌ、（ｉ）位置５４のＧｌｕ、（ｊ）位置７７のＡｓｎ、（ｋ）位置９４のＡｒｇ、および、（ｌ）位置１０８のＴｈｒ、ならびに、それらの組み合わせから成る群から選択される１または複数のアミノ酸残基を含む重鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、Ｋａｂａｔナンバリングによる、（ａ）位置４４のＳｅｒ、（ｂ）位置４９のＡｌａ、（ｃ）位置５３のＡｌａ、および／または、（ｄ）位置９１のＩｌｅ、および、それらの組み合わせを含む重鎖可変領域を含む。
【０００８】
いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、Ｋａｂａｔナンバリングによる、（ａ）位置２２のＳｅｒ、（ｂ）位置４２のＧｌｎ、（ｃ）位置４３のＳｅｒ、（ｄ）位置６０のＡｓｐ、および、（ｅ）位置６３のＴｈｒ、ならびに、それらの組み合わせから成る群から選択される１または複数のアミノ酸残基を含む軽鎖可変領域を含む。
【０００９】
抗体または抗体断片の非限定的な例には、配列識別番号７‐２６から成る群から選択されるアミノ酸配列、または、配列識別番号７〜２６から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の配列同一性を有するペプチドを含む重鎖可変領域を有するものが含まれる。抗体または抗体断片の非限定的な例には、配列識別番号２７‐３３から成る群から選択されるアミノ酸配列、または、配列識別番号２７‐３３から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％の配列同一性を有するペプチドを含む軽鎖可変領域を有するものが含まれる。抗体または抗体断片の非限定的な例には、配列識別番号２０のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列識別番号２８のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを有するものが含まれる。
【００１０】
抗体および抗体断片の生物学的に同等な変異型についても説明する。いくつかの実施形態において、単離された抗体または抗体断片が提供され、当該抗体または抗体断片は、ヒトＰＤ−Ｌ１タンパク質への特異性を有し、（ａ）配列識別番号１のＶＨ  ＣＤＲ１、または、配列識別番号１の位置１、２もしくは５において、単一置換、欠失もしくは挿入を有する、配列識別番号１の変異型、（ｂ）配列識別番号２のＶＨ  ＣＤＲ２、または、配列識別番号２の位置７、８、１４もしくは１５において、単一置換、欠失もしくは挿入を有する、配列識別番号２の変異型、（ｃ）配列識別番号３のＶＨ  ＣＤＲ３、または、配列識別番号３の位置１、２、３、４、５もしくは６において、単一置換、欠失もしくは挿入を有する、配列識別番号３の変異型、（ｄ）配列識別番号４のＶＬ  ＣＤＲ１、または、配列識別番号４の位置３において、単一置換、欠失もしくは挿入を有する配列識別番号４の変異型、（ｅ）配列識別番号５のＶＬ  ＣＤＲ２、または、配列識別番号５の位置１、２、３、４、５もしくは６において、単一置換、欠失もしくは挿入を有する、配列識別番号５の変異型、および、（ｆ）配列識別番号６のＶＬ  ＣＤＲ３、または、配列識別番号６の位置１１もしくは２において、単一置換、欠失もしくは挿入を有する、配列識別番号６の変異型を含む。
【００１１】
いくつかの実施形態において、配列識別番号１の変異型は、配列識別番号６１‐６７から成る群から選択される。いくつかの実施形態において、配列識別番号２の変異型は、配列識別番号６８‐７７から成る群から選択される。いくつかの実施形態において、配列識別番号３の変異型は、配列識別番号７８‐９０から成る群から選択される。いくつかの実施形態において、配列識別番号４の変異型は、配列識別番号９１‐９２から成る群から選択される。いくつかの実施形態において、配列識別番号５の変異型は、配列識別番号９３‐１０５から成る群から選択される。いくつかの実施形態において、配列識別番号６の変異型は、配列識別番号１０６‐１１１から成る群から選択される。
【００１２】
いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、Ｋａｂａｔナンバリングによる、（ａ）位置４４のＳｅｒ、（ｂ）位置４９のＡｌａ、（ｃ）位置５３のＡｌａ、（ｄ）位置９１のＩｌｅ、（ｅ）位置１のＧｌｕ、（ｆ）位置３７のＶａｌ、（ｇ）位置４０のＴｈｒ、（ｈ）位置５３のＶａｌ、（ｉ）位置５４のＧｌｕ、（ｊ）位置７７のＡｓｎ、（ｋ）位置９４のＡｒｇ、および、（ｌ）位置１０８のＴｈｒ、ならびに、それらの組み合わせから成る群から選択される１または複数のアミノ酸残基を含む重鎖可変領域を含む。いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、Ｋａｂａｔナンバリングによる、（ａ）位置４４のＳｅｒ、（ｂ）位置４９のＡｌａ、（ｃ）位置５３のＡｌａ、および／または、（ｄ）位置９１のＩｌｅ、ならびに、それらの組み合わせを含む重鎖可変領域を含む。
【００１３】
いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、Ｋａｂａｔナンバリングによる、（ａ）位置２２のＳｅｒ、（ｂ）位置４２のＧｌｎ、（ｃ）位置４３のＳｅｒ、（ｄ）位置６０のＡｓｐ、および、（ｅ）位置６３のＴｈｒ、ならびに、それらの組み合わせから成る群から選択される１または複数のアミノ酸残基を含む軽鎖可変領域を含む。
【００１４】
いくつかの実施形態において、本開示の抗体または抗体断片と、薬学的に許容可能な担体とを含む組成物を提供する。更に、いくつかの実施形態において、本開示の抗体または抗体断片をコードする１または複数のポリヌクレオチドを含む単離細胞を提供する。
【００１５】
治療方法および使用も提供される。一実施形態において、本開示の抗体または抗体断片の有効量を、それらを必要とする患者に投与する段階を備える、患者の癌または感染を治療する方法を提供する。いくつかの実施形態において、癌は固形腫瘍である。いくつかの実施形態において、癌は、膀胱癌、肝臓癌、結腸癌、直腸癌、子宮内膜癌、白血病、リンパ腫、膵臓癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、乳癌、尿道癌、頭頸部癌、胃腸癌、胃癌、食道癌、卵巣癌、腎癌、悪性黒色腫、前立腺癌、および、甲状腺癌から成る群から選択される。いくつかの実施形態において、癌は、膀胱癌、肝臓癌、膵臓癌、非小細胞肺癌、乳癌、尿道癌、結腸直腸癌、頭頸部癌、扁平上皮細胞癌、メルケル細胞癌、胃腸癌、胃癌、食道癌、卵巣癌、腎癌および小細胞肺癌から成る群から選択される。いくつかの実施形態において、方法は更に、第２の癌治療剤を患者に投与する段階を備える。いくつかの実施形態において、感染は、ウイルス感染、細菌感染、真菌感染、または、寄生虫感染である。
【００１６】
別の実施形態において、治療が必要な患者の癌または感染を治療する方法が提供され、当該方法は、（ａ）本開示の抗体または抗体断片を用いて、インビトロで細胞を処理する段階と、（ｂ）処理された細胞を患者に投与する段階とを備える。いくつかの実施形態において、方法は更に、段階（ａ）の前に、個人から細胞を単離する段階を備える。いくつかの実施形態において、細胞は患者から単離される。いくつかの実施形態において、細胞は、患者とは異なるドナー個人から単離される。いくつかの実施形態において、細胞はＴ細胞であり、その非限定的な例には、腫瘍浸潤Ｔリンパ球、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、または、それらの組み合わせが含まれる。
【００１７】
診断方法および使用も提供される。一実施形態において、抗体または抗体断片がＰＤ−Ｌ１に結合する条件下で、抗体または抗体断片に試料を接触させる段階と、試料におけるＰＤ−Ｌ１の発現を示す結合を検出する段階とを備える、試料におけるＰＤ−Ｌ１の発現を検出する方法を提供する。いくつかの実施形態において、試料は、腫瘍細胞、腫瘍組織、感染組織または血液試料を含む。
【００１８】
本開示の抗体および断片は、二重特異性抗体を調製するために使用できる。一実施形態において、本開示の断片と、免疫細胞上の分子への特異性を有する第２抗原結合断片とを含む、単離された二重特異性抗体を提供する。いくつかの実施形態において、分子は、ＰＤ−１、ＣＴＬＡ−４、ＬＡＧ−３、ＣＤ２８、ＣＤ１２２、４‐１ＢＢ、ＴＩＭ３、ＯＸ−４０、ＯＸ４０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ４０Ｌ、ＬＩＧＨＴ、ＩＣＯＳ、ＩＣＯＳＬ、ＧＩＴＲ、ＧＩＴＲＬ、ＴＩＧＩＴ、ＣＤ２７、ＶＩＳＴＡ、Ｂ７Ｈ３、Ｂ７Ｈ４、ＨＥＶＭまたはＢＴＬＡ、ＣＤ４７およびＣＤ７３から成る群から選択される。いくつかの実施形態において、断片、および、第２の断片は、Ｆａｂ断片、一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）または単一ドメイン抗体から各々独立に選択される。いくつかの実施形態において、二重特異性抗体は、Ｆｃ断片を更に含む。
【図面の簡単な説明】
【００１９】
【図１】ＨＬ１２１０−３が高い親和性でヒトＰＤ−Ｌ１に結合できることを示す。
【００２０】
【図２】ＨＬ１２１０−３がヒトＰＤ−Ｌ１のヒトＰＤ１への結合を効率的に阻害できることを示す。
【００２１】
【図３】ＨＬ１２１０−３抗体が、哺乳類細胞上で発現するＰＤ−Ｌ１に対するＰＤ−１の結合を非常に効率的に阻害できることを示す。
【００２２】
【図４】試験対象の抗ＰＤ−Ｌ１抗体が、ヒトＴ細胞応答を促進できることを示す。
【００２３】
【図５】組換えＰＤ−Ｌ１に対するＨＬ１２１０−３の結合速度を示す。
【００２４】
【図６】すべての試験対象のヒト化抗体が、ヒトＰＤ−Ｌ１に対して、キメラ抗体と同等の結合効力を有することを示す。
【００２５】
【図７】すべての試験対象のヒト化抗体が、哺乳類細胞上で発現するＰＤ−Ｌ１に対して、キメラ抗体と同等に非常に効率的に結合できることを示す。
【００２６】
【図８】ヒト化抗体Ｈｕ１２１０−４１が低い親和性でアカゲザルＰＤ−Ｌ１に結合でき、ラットおよびマウスＰＤ−Ｌ１に結合できないことを示す。
【００２７】
【図９】Ｈｕ１２１０−４１抗体が、Ｂ７−ＤＣ、Ｂ７−１、Ｂ７−２、Ｂ７−Ｈ２、ＰＤ−１、ＣＤ２８、ＣＴＬＡ４、ＩＣＯＳおよびＢＴＬＡではなく、Ｂ７−Ｈ１（ＰＤ−Ｌ１）のみに特異的に結合できることを示す。
【００２８】
【図１０】Ｈｕ１２１０−４１が、ヒトＰＤ１およびＢ７−１に対するヒトＰＤ−Ｌ１の結合を効率的に阻害できることを示す。
【００２９】
【図１１】Ｈｕ１２１０−４１が、ヒトＰＤ１およびＢ７−１に対するヒトＰＤ−Ｌ１の結合を効率的に阻害できることを示す。
【００３０】
【図１２】Ｈｕ１２１０−８、Ｈｕ１２１０−９、Ｈｕ１２１０−１６、Ｈｕ１２１０−１７、Ｈｕ１２１０−２１およびＨｕ１２１０−３６ヒト化抗体が、混合リンパ球反応におけるＩＦＮγおよびＩＬ‐２の生成を用量依存的に促進できることを示す。
【００３１】
【図１３】Ｈｕ１２１０−４０、Ｈｕ１２１０−４１およびＨｕ１２１０−１７ヒト化抗体が、ＣＭＶリコールアッセイにおけるＩＦＮγの生成を用量依存的に促進できることを示す。
【００３２】
【図１４】ＨＣＣ８２７−ＮＳＧ異種移植モデルにおいて、Ｈｕ１２１０−３１が５ｍｇ／ｋｇで、腫瘍増殖を３０％阻害できることを示す。
【００３３】
【図１５】Ｈｕ１２１０−４１抗体が、ＨＣＣ８２７−ＮＳＧ異種移植モデルにおいて、腫瘍増殖を用量依存的に阻害でき、一方、腫瘍重量はまた、Ｈｕ１２１０−４１抗体によって用量依存的に抑制されることを示す。
【００３４】
【図１６】発現の関数として、各ＰＤ−Ｌ１変異型について、平均結合値をプロットする（対照：抗ＰＤ−Ｌ１  ｍＡｂ反応性）。
【００３５】
【図１７】抗ＰＤ−Ｌ１Ｈｕ１２１０−４１抗体への結合に関与する残基である、Ｙ１３４、Ｋ１６２およびＮ１８３の位置を（球体で）示す。
【発明を実施するための形態】
【００３６】
［定義］
「１」または「一」という語句のエンティティは、１または複数のエンティティを指すことに留意されたい。例えば、「１つの抗体」は、１または複数の抗体を表すものと理解されるべきである。したがって、本明細書においては、「１」（または「一」）、「１または複数」、「少なくとも１つ」という語句は、交換可能に使用できる。
【００３７】
本明細書において使用される「ポリペプチド」という語句は、単一の「ポリペプチド」、および、複数の「ポリペプチド」を包含することを意図し、アミド結合（ペプチド結合としても知られている）によって直線状に連結されるモノマー（アミノ酸）から構成される分子を指す。「ポリペプチド」という語句は、２つ以上のアミノ酸の任意の鎖または複数の鎖を指し、産物の特定の長さを指すものではない。したがって、２つ以上のアミノ酸の鎖または複数の鎖を指すために使用される、ペプチド、ジペプチド、トリペプチド、オリゴペプチド、「タンパク質」、「アミノ酸鎖」、または、任意の他の語句は、「ポリペプチド」の定義に含まれ、「ポリペプチド」という語句は、これらの語句のいずれかの代わりに、または、それらと交換可能に使用され得る。「ポリペプチド」という語句はまた、これらに限定されないが、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、既知の保護／遮断基による誘導体化、タンパク質切断、または、非天然に発生するアミノ酸による改変を含む、ポリペプチドの発現後改変の産物を指すことを意図する。ポリペプチドは、天然の生物学的ソースに由来し得るか、または、組換え技術によって生成され得るが、必ずしも、指定された核酸配列から翻訳されるわけではない。ポリペプチドは、化学合成を含む任意の方式で生成され得る。
【００３８】
本明細書において、細胞、ＤＮＡまたはＲＮＡなどの核酸に関連して「単離」という語句が使用される場合、高分子の天然のソースに存在する、他のＤＮＡまたはＲＮＡからそれぞれ分離された分子を指す。「単離」という語句は、本明細書において使用される場合、組換えＤＮＡ技法によって生成されたときに細胞物質、ウイルス物質もしくは培地を、または、化学的に合成されたときは前駆的化学物質もしくは他の化学物質を実質的に含まない核酸またはペプチドを指すこともある。更に、「単離された核酸」は、断片として自然に発生しない、天然の状態で見られないであろう核酸断片を含めることを意味している。「単離」という語句は、本明細書において、他の細胞タンパク質または組織から単離された細胞またはポリペプチドを指すためにも使用される。単離されたポリペプチドとは、精製されたポリペプチド、および、組換えのポリペプチドの両方を包含することを意味している。
【００３９】
本明細書において使用される、「組換え」という語句は、ポリペプチド、または、ポリヌクレオチドに関連する場合、自然に存在しないポリペプチドまたはポリヌクレオチドの形態を意図し、それらの非限定的な例は、通常は共に発生しないであろうポリヌクレオチドまたはポリペプチドを組み合わせることによって形成できる。
【００４０】
「相同性」または「同一性」または「類似性」は、２つのペプチドの間、または、２つの核酸分子の間の配列類似性を指す。相同性は、比較の目的で揃えられ得る各配列における位置を比較することによって決定できる。比較される配列内のある位置が、同一の塩基またはアミノ酸によって占められるとき、分子はその位置において相同である。    配列間の相同性の程度は、配列によって共有される、一致する位置または相同的な位置の数の関数である。「関連のない」、または、「非相同的」配列は、本開示の配列の１つと４０％未満の同一性（好ましくは２５％未満の同一性）を共有する。
【００４１】
ポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチド領域（またはポリペプチドまたはポリペプチド領域）が別の配列と特定の割合（例えば、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％または９９％）の配列同一性を有することは、揃えられたとき、２つの配列の比較において、その割合の塩基（またはアミノ酸）が同一であることを意味する。このアライメントおよび百分率相同性または配列同一性は、例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ  ｅｔ  ａｌ．  ｅｄｓ．  （２００７）  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙにおいて説明されているものなど、本技術分野において知られているソフトウェアプログラムを使用して決定できる。好ましくは、デフォルトパラメータがアライメントのために使用される。１つのアライメントプログラムは、デフォルトパラメータを使用するＢＬＡＳＴである。特に、プログラムは、以下のデフォルトパラメータを使用するＢＬＡＳＴＮおよびＢＬＡＳＴＰである。Ｇｅｎｅｔｉｃ  ｃｏｄｅ  ＝  ｓｔａｎｄａｒｄ；  ｆｉｌｔｅｒ  ＝  ｎｏｎｅ；  ｓｔｒａｎｄ  ＝  ｂｏｔｈ；  ｃｕｔｏｆｆ  ＝  ６０；  ｅｘｐｅｃｔ  ＝  １０；  Ｍａｔｒｉｘ  ＝  ＢＬＯＳＵＭ６２；  Ｄｅｓｃｒｉｐｔｉｏｎｓ  ＝  ５０  ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ；  ｓｏｒｔ  ｂｙ  ＝  ＨＩＧＨ  ＳＣＯＲＥ；  Ｄａｔａｂａｓｅｓ  ＝  ｎｏｎ−ｒｅｄｕｎｄａｎｔ，  ＧｅｎＢａｎｋ  ＋  ＥＭＢＬ  ＋  ＤＤＢＪ  ＋  ＰＤＢ  ＋  ＧｅｎＢａｎｋ  ＣＤＳ  ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎｓ  ＋  ＳｗｉｓｓＰｒｏｔｅｉｎ  ＋  ＳＰｕｐｄａｔｅ  ＋  ＰＩＲ。生物学的に同等のポリヌクレオチドとは、上で示された指定の百分率相同性を有し、かつ、同一または同様の生物学的活性を有するポリペプチドをコードするものである。
【００４２】
「同等の核酸またはポリヌクレオチド」という語句は、核酸のヌクレオチド配列またはその相補的配列とある程度の相同性、または、配列同一性を有するヌクレオチド配列を有する核酸を指す。二本鎖核酸のホモログとは、ある程度の相同性を有するヌクレオチド配列を有する核酸、または、その相補的配列を含むことを意図している。一態様において、核酸のホモログは、核酸またはその相補的配列にハイブリダイズすることが可能である。同様に、「同等のポリペプチド」は、基準ポリペプチドのアミノ酸配列とある程度の相同性または配列同一性を有するポリペプチドを指す。いくつかの態様において、配列同一性は、少なくとも約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％または９９％である。いくつかの態様において、同等のポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、基準のポリペプチドまたはポリヌクレオチドと比較したとき、１、２、３、４または５個の追加、欠失、置換および組み合わせを有する。いくつかの態様において、同等の配列は、基準配列の活性（例えば、エピトープ結合）または構造（例えば塩橋）を保持する。 
【００４３】
ハイブリダイゼーション反応は、異なる「厳密性」の条件下で実行できる。一般に、低厳密性ハイブリダイゼーション反応は、約１０倍のＳＳＣ溶液、または、同等のイオン強度／温度の溶液において、約４０℃で実行される。中程度の厳密性のハイブリダイゼーションは、典型的には、約６倍のＳＳＣにおいて、約５０℃で実行される。高厳密性ハイブリダイゼーション反応は、一般的に、約１倍のＳＳＣにおいて、約６０℃で実行される。ハイブリダイゼーション反応は、当業者によく知られている「生理的条件」下で実行することもできる。生理的条件の非限定的な例は、細胞において通常見られる温度、イオン、強度、ｐＨ、および、Ｍｇ２＋濃度である。
【００４４】
ポリヌクレオチドは、４個のヌクレオチド塩基、すなわち、アデニン（Ａ）、シトシン（Ｃ）、グアニン（Ｇ）、チミン（Ｔ）の特定配列（ポリヌクレオチドがＲＮＡであるとき、チミンの代わりにウラシル（Ｕ））から構成される。したがって、「ポリヌクレオチド配列」という語句は、ポリヌクレオチド分子の文字表現である。この文字表現は、中央処理装置を有するコンピュータ内のデータベースに入力でき、機能ゲノミクスおよび相同性検索などのバイオインフォマティクスの用途に使用できる。「ポリモーフィズム」という語句は、１つより多くの形態の遺伝子またはその部分が共存することを指す。遺伝子のうち、少なくとも２つの異なる形態、すなわち、２つの異なるヌクレオチド配列がある部分は、「遺伝子の多型領域」と呼ばれる。多型領域は単一のヌクレオチドであってよく、異なる対立遺伝子において同一性は異なる。
【００４５】
「ポリヌクレオチド」および「オリゴヌクレオチド」という語句は、交換可能に使用され、デオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチドまたはその類似体のいずれかである、任意の長さの高分子形態のヌクレオチドを指す。ポリヌクレオチドは、任意の３次元構造を有することができ、既知または未知の任意の機能を実行し得る。以下はポリヌクレオチドの非限定的な例である。遺伝子または遺伝子断片（例えば、プローブ、プライマー、ＥＳＴまたはＳＡＧＥタグ）、エクソン、イントロン、メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）、トランスファーＲＮＡ、リボソームＲＮＡ、リボザイム、ｃＤＮＡ、ｄｓＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、組換えポリヌクレオチド、分岐型ポリヌクレオチド、プラスミド、ベクター、任意の配列の単離ＤＮＡ、任意の配列の単離されたＲＮＡ、核酸プローブおよびプライマー。ポリヌクレオチドは、メチル化ヌクレオチドおよびヌクレオチド類似体などの改変されたヌクレオチドを含み得る。ヌクレオチド構造への改変は、もしある場合、ポリヌクレオチドの構築の前または後に付与することができる。ヌクレオチドの配列は、非ヌクレオチド成分によって割り込まれ得る。ポリヌクレオチドは重合後、標識部分への連結などにより、更に改変され得る。また、この語句は、二本鎖および一本鎖の分子両方を指す。別段の記載がある場合、または、必要である場合を除き、本開示の任意の実施形態のポリヌクレオチドは、二本鎖形と、二本鎖形を形成することが知られている、または、予想される、２つの相補的な一本鎖形の各々とを含む。
【００４６】
ポリヌクレオチドに適用される「コード」という語句は、ポリヌクレオチドが天然型の状態において、または、当業者によく知られている方法によって操作されるとき、転写および／または翻訳されてポリペプチドおよび／またはその断片のためのｍＲＮＡを生成できる場合、ポリペプチドを「コード」するといわれるポリヌクレオチドを指す。アンチセンス鎖は、そのような核酸の相補鎖であり、コード配列をそれから推測できる。
【００４７】
本明細書において使用される「抗体」または「抗原結合ポリペプチド」は、抗原を特異的に認識してそれに結合するポリペプチドまたはポリペプチド複合体を指す。抗体は、全抗体および任意の抗原結合断片、または、それらの一本鎖であってよい。したがって、「抗体」という語句は、抗原に結合する生物学的活性を有する免疫グロブリン分子の少なくとも一部を含む分子を含む任意のタンパク質またはペプチドを含む。そのような例には、これらに限定されないが、重鎖もしくは軽鎖の相補性決定領域（ＣＤＲ）またはそれらのリガンド結合部分、重鎖もしくは軽鎖可変領域、重鎖もしくは軽鎖定常領域、フレームワーク（ＦＲ）領域、または、それらの任意の部分、または、結合タンパク質の少なくとも１つ一部が含まれる。
【００４８】
本明細書において使用される、「抗体断片」または「抗原結合断片」という語句は、Ｆ（ａｂ'）２、Ｆ（ａｂ）２、Ｆａｂ'、Ｆａｂ、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、および同様のものなどの抗体の一部である。構造にかかわらず、抗体断片は、完全な抗体によって認識される抗原と同一のものに結合する。「抗体断片」という語句は、アプタマー、スピゲルマー、２特異性抗体を含む。「抗体断片」という語句は、特異的抗原に結合して複合体を形成することによって抗体のように機能する、合成タンパク質、または、遺伝子組み換えタンパク質も含む。
【００４９】
「一本鎖可変断片」または「ｓｃＦｖ」は、免疫グロブリンの重鎖（ＶＨ）および軽鎖（ＶＬ）の可変領域の融合タンパク質を指す。いくつかの態様において、この領域は１０〜約２５アミノ酸の短いリンカペプチドに結合する。リンカは、柔軟性のためのグリシン、および、溶解性のためのセリンまたはスレオニンが豊富であり得、ＶＨのＮ末端、または、ＶＬのＣ末端のいずれかに接続され得る（逆も成立する）。このタンパク質は、定常領域が除去されていてリンカが導入されているが、元の免疫グロブリンの特異性を保持する。本技術分野において、ＳｃＦｖ分子が知られており、例えば、米国特許第５,８９２,０１９号において説明されている。 
【００５０】
抗体という語句は、生化学的に区別できる様々な幅広いクラスのポリペプチドを包含する。当業者であれば、重鎖はガンマ、ミュー、アルファ、デルタ、または、イプシロン（γ、μ、α、δ、ε）として、また、それらの中のいくつかのサブクラス（例えば、γｌ‐γ４）に分類されることを理解するであろう。この鎖の性質によって、抗体の「クラス」がそれぞれＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＧまたはＩｇＥとして決定される。免疫グロブリンのサブクラス（アイソタイプ）、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＧ５などは、特徴がはっきりしており、機能的な特化を付与することが知られている。これらのクラスおよびアイソタイプの各々の改変版は、当業者が本開示を参照して容易に認識でき、従って、本開示の範囲内にある。すべての免疫グロブリンのクラスが本開示の範囲内にあることは明確であり、以下の説明は一般的に、免疫グロブリン分子のＩｇＧクラスに関連する。ＩｇＧに関連して、標準の免疫グロブリン分子は、分子量約２３,０００ドルトンである２つの同一の軽鎖ポリペプチドと、分子量５３,０００−７０,０００である２つの同一の重鎖ポリペプチドとを含む。４本の鎖は、典型的には、「Ｙ」の形状でジスルフィド結合によって連結され、軽鎖は「Ｙ」の開いた部分から開始する重鎖と対を形成し、可変領域全体にわたって連続している。
【００５１】
本開示の抗体、抗原結合ポリペプチド、それらの変異型または誘導体には、これらに限定されないが、ポリクローナル、モノクローナル、多特異性、ヒト型、ヒト化、霊長類化もしくはキメラ抗体、一本鎖抗体、エピトープ結合断片、例えば、Ｆａｂ、Ｆａｂ'およびＦ（ａｂ'）２、Ｆｄ、Ｆｖｓ、一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）、一本鎖抗体、ジスルフィド連結Ｆｖ（ｓｄＦｖ）、ＶＫまたはＶＨドメインのいずれかを含む断片、Ｆａｂ発現ライブラリによって生成される断片、抗イディオタイプ（抗Ｉｄ）抗体（例えば、本明細書において開示されるＬＩＧＨＴ抗体への抗Ｉｄ抗体を含む）が含まれる。本開示の免疫グロブリンまたは抗体分子は、任意の種類（例えば、ＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡ、ＩｇＹ）、クラス（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１およびＩｇＡ２）、または、免疫グロブリン分子のサブクラスであり得る。
【００５２】
軽鎖はカッパまたはラムダ（Κ、λ）のいずれかに分類される。各重鎖クラスは、カッパまたはラムダのいずれかの軽鎖に結合し得る。一般に、軽鎖および重鎖は、互いに共有結合し、免疫グロブリンがハイブリドーマ、Ｂ細胞、または、遺伝子組み換えの宿主細胞のいずれかによって生成されるとき、２つの重鎖の「テール」部分は、共有結合性ジスルフィド連結または非共有結合性連結によって互いに結合される。重鎖において、アミノ酸配列は、Ｙ形状の分岐端におけるＮ末端から、各鎖の底部におけるＣ末端まで続いている。
【００５３】
軽鎖および重鎖は両方、構造および機能的に相同の複数の領域に分割される。「定常」および「可変」という語句は、機能について使用される。これに関連して、軽鎖（ＶＫ）および重鎖（ＶＨ）部分両方の可変ドメインは、抗原認識および特異性を決定することを理解されたい。逆に、軽鎖（ＣＫ）および重鎖（ＣＨ１、ＣＨ２またはＣＨ３）の定常ドメインは、分泌、経胎盤移動性、Ｆｃ受容体結合、相補的結合および同様のものなどの重要な生物学的特性を付与する。慣習的に、定常領域ドメインの番号は、抗体の抗原結合部位またはアミノ末端から遠ざかるにつれて増加する。可変領域におけるＮ末端部分およびＣ末端部分は定常領域であり、ＣＨ３およびＣＫドメインはそれぞれ、重鎖および軽鎖のカルボキシ末端を実際に含む。
【００５４】
上で示されるように、可変領域は、抗体が抗原上のエピトープを選択的に認識して特異的に結合することを可能にする。つまり、抗体のＶＫドメインおよびＶＨドメイン、または、相補性決定領域（ＣＤＲ）のサブセットは結合して、３次元の抗原結合部位を画定する可変領域を形成する。この４要素抗体構造は、Ｙの各腕の末端に存在する抗原結合部位を形成する。より具体的には、抗原結合部位は、ＶＨおよびＶＫ鎖の各々における３個のＣＤＲ（すなわち、ＣＤＲ−Ｈ１、ＣＤＲ−Ｈ２、ＣＤＲ−Ｈ３、ＣＤＲ−Ｌ１、ＣＤＲ−Ｌ２およびＣＤＲ−Ｌ３）によって画定される。いくつかの例、例えば、ラクダ科に由来する、または、ラクダ科免疫グロブリンをベースにして操作された特定の免疫グロブリン分子において、完全な免疫グロブリン分子は、軽鎖が無く重鎖のみから成ることがあり得る。例えば、Ｈａｍｅｒｓ−Ｃａｓｔｅｒｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｎａｔｕｒｅ  ３６３：４４６−４４８  （１９９３）を参照されたい。
【００５５】
自然に発生する抗体において、各抗原結合ドメインに存在する６個の「相補性決定領域」またはＣＤＲは、アミノ酸の短い不連続配列であり、これらは、抗体が水性環境において３次元構成をとるときに、抗原結合ドメインを形成するように特異的に配置される。抗原結合ドメインにおける残りのアミノ酸は、「フレームワーク」領域と呼ばれ、より小さい分子間の可変性を示す。フレームワーク領域は主に、βシートの形態を取り、ＣＤＲは、βシート構造を接続する、および、いくつかの場合には、βシート構造の一部を形成するループを形成する。したがって、フレームワーク領域は、鎖間の非共有結合性相互作用によってＣＤＲを正しい向きに位置決めするため足場を形成するように機能する。位置決めされたＣＤＲによって形成される抗原結合ドメインは、免疫反応性抗原上のエピトープに相補的な表面を画定する。この相補的表面は、同族エピトープに対する抗体の非共有結合を促進する。ＣＤＲおよびフレームワーク領域をそれぞれ構成するアミノ酸は、正確に定義されているので（"Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，"  Ｋａｂａｔ，  Ｅ．，  ｅｔ  ａｌ．，  Ｕ．Ｓ．  Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ  ａｎｄ  Ｈｕｍａｎ  Ｓｅｒｖｉｃｅｓ，  （１９８３）、および、Ｃｈｏｔｈｉａ  ａｎｄ  Ｌｅｓｋ，  Ｊ．  ＭｏＩ．  Ｂｉｏｌ．，  １９６：９０１−９１７  （１９８７）を参照）、当業者によって、任意の重鎖または軽鎖可変領域について、容易に同定されることができる。
【００５６】
当分野において使用および／または受け入れられている語句に２つ以上の定義がある場合、本明細書において使用される語句の定義は、別段の明示的な記載が無い限り、そのような意味をすべて含むことが意図されている。具体的な例は、重鎖および軽鎖ポリペプチドの両方の可変領域において見られる不連続抗原結合部位を説明するために、「相補性決定領域」（「ＣＤＲ」）という語句を使用することである。この特定の領域は、参照によって全体が本明細書に組み込まれる、Ｋａｂａｔ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｕ．Ｓ．  Ｄｅｐｔ．  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ  ａｎｄ  Ｈｕｍａｎ  Ｓｅｒｖｉｃｅｓ，  "Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ"  （１９８３）およびＣｈｏｔｈｉａ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  ＭｏＩ．  Ｂｉｏｌ．  １９６：９０１−９１７  （１９８７）において説明されている。ＫａｂａｔおよびＣｈｏｔｈｉａによるＣＤＲの定義は、互いに比較したときに、重複するアミノ酸残基のサブセットを含む。上記にかかわらず、抗体またはその変異型のＣＤＲを指すために、いずれかの定義を適用することは、本明細書において定義および使用される語句の範囲内にあることが意図される。上で挙げられた参考文献の各々によって定義されるＣＤＲを含む適切なアミノ酸残基を下の表において比較として説明する。特定のＣＤＲを包含する厳密な残基番号は、ＣＤＲの配列およびサイズに応じて変動する。当業者であれば、抗体の可変領域アミノ酸配列を考慮することで、どの残基が特定のＣＤＲを構成するかを定型的に決定できる。
【表１】
2020180135.tif 000002
【００５７】
また、Ｋａｂａｔ  ｅｔ  ａｌは、任意の抗体に適用される可変ドメイン配列について、ナンバリングシステムを定義した。当業者であれば、配列自体以外のいかなる実験データにも頼ることなく、この「Ｋａｂａｔナンバリング」のシステムを任意の可変ドメイン配列に明確に割り当てることができる。本明細書において使用される「Ｋａｂａｔナンバリング」は、Ｋａｂａｔ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｕ．Ｓ．  Ｄｅｐｔ．  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ  ａｎｄ  Ｈｕｍａｎ  Ｓｅｒｖｉｃｅｓ，  "Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ"  （１９８３）によって説明されるナンバリングシステムを指す。
【００５８】
上の表に加えて、Ｋａｂａｔナンバリングシステムは、ＣＤＲ領域を以下のように説明する。ＣＤＲ−Ｈ１は、約３１番目のアミノ酸（すなわち、最初のシステイン残基の後の約９残基）から開始し、約５〜７のアミノ酸を含み、次のトリプトファン残基で終了する。ＣＤＲ−Ｈ２は、ＣＤＲ−Ｈ１の末端の後の第１５の残基から開始し、約１６〜１９アミノ酸を含み、次のアルギニンまたはリシン残基で終了する。ＣＤＲ−Ｈ３は、ＣＤＲ−Ｈ２の末端の後の約３３番目のアミノ酸残基から開始し、３〜２５アミノ酸を含み、配列Ｗ‐Ｇ‐Ｘ‐Ｇにおいて終了し、Ｘは任意のアミノ酸であり、ＣＤＲ−Ｌ１は、約２４番目の残基（すなわち、システイン残基の後）から開始し、約１０〜１７残基を含み、次のトリプトファン残基で終了する。ＣＤＲ−Ｌ２は、ＣＤＲ−Ｌ１の末端の後の約１６番目の残基から開始し、約７残基を含む。ＣＤＲ−Ｌ３は、ＣＤＲ−Ｌ２の末端の後の約３３番目の残基（すなわち、システイン残基の後）から開始し、約７〜１１残基を含み、ＦまたはＷ‐Ｇ‐Ｘ‐Ｇの配列で終了し、Ｘは任意のアミノ酸である。
【００５９】
本明細書において開示される抗体は、鳥類および哺乳類を含む任意の動物起源であり得る。好ましくは、抗体は、ヒト、マウス、ロバ、ウサギ、ヤギ、モルモット、ラクダ、ラマ、ウマ、または、ニワトリの抗体である。別の実施形態において、可変領域は、（例えばサメからの）コンドリクトイド（ｃｏｎｄｒｉｃｔｈｏｉｄ）が起源であり得る。
【００６０】
本明細書において使用される「重鎖定常領域」という語句は、免疫グロブリン重鎖由来のアミノ酸配列を含む。重鎖定常領域を含むポリペプチドは、ＣＨ１ドメイン、ヒンジ（例えば、上、中央、および／または、下のヒンジ領域）ドメイン、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、もしくは、変異型、または、それらの断片のうち少なくとも１つを含む。例えば、本開示において使用するための抗原結合ポリペプチドは、（ａ）ＣＨ１ドメインを含むポリペプチド鎖、（ｂ）ＣＨ１ドメインを含むポリペプチド鎖、（ｃ）ヒンジドメインの少なくとも一部およびＣＨ２ドメイン、（ｄ）ＣＨ１ドメインおよびＣＨ３ドメインを含むポリペプチド鎖、（ｅ）ＣＨ１ドメイン、ヒンジドメインの少なくとも一部、および、ＣＨ３ドメインを含むポリペプチド鎖、または、（ｆ）ＣＨ１ドメイン、ヒンジドメインの少なくとも一部、ＣＨ２ドメイン、および、ＣＨ３ドメインを含むポリペプチド鎖を備え得る。別の実施形態において、本開示のポリペプチドは、ＣＨ３ドメインを含むポリペプチド鎖を含む。更に、本開示に使用される抗体には、ＣＨ２ドメインの少なくとも一部（例えば、ＣＨ２ドメインのすべてまたは一部）が無いことがあり得る。上で説明したように、当業者であれば、自然に発生する免疫グロブリン分子とはアミノ酸配列が異なるように重鎖定常領域が改変され得ることを理解するであろう。
【００６１】
本明細書において開示される抗体の重鎖定常領域は、異なる免疫グロブリン分子に由来し得る。例えば、ポリペプチドの重鎖定常領域は、ＩｇＧ１分子由来のＣＨ１ドメイン、および、ＩｇＧ３分子由来のヒンジ領域を含み得る。別の例において、重鎖定常領域は、部分的にＩｇＧ１分子に由来し、部分的にＩｇＧ３分子に由来するヒンジ領域を含み得る。別の例において、重鎖部分は、部分的にＩｇＧ１分子に由来し、部分的にＩｇＧ４分子に由来するキメラヒンジを含み得る。
【００６２】
本明細書において使用される、「軽鎖定常領域」という語句は、抗体軽鎖に由来するアミノ酸配列を含む。好ましくは、軽鎖定常領域は、定常カッパドメインまたは定常ラムダドメインのうち少なくとも１つを含む。
【００６３】
「軽鎖‐重鎖ペア」は、軽鎖のＣｌドメインと重鎖のＣＨ１ドメインとの間のジスルフィド結合を通して二量体を形成できる軽鎖および重鎖の組を指す。
【００６４】
上述のように、様々な免疫グロブリンのクラスの定常領域のサブユニット構造および３次元構成はよく知られている。本明細書において使用される「ＶＨドメイン」という語句は、免疫グロブリン重鎖のアミノ末端可変ドメインを含み、「ＣＨ１ドメイン」という語句は、免疫グロブリン重鎖の第１（最アミノ末端）定常領域ドメインを含む。ＣＨ１ドメインは、ＶＨドメインに隣接し、免疫グロブリン重鎖分子のヒンジ領域へのアミノ末端である。
【００６５】
本明細書において使用される「ＣＨ２ドメイン」という語句は、例えば、従来のナンバリング方式を使用すると、抗体の約２４４番目の残基から３６０番目の残基まで延在する重鎖分子の部分を含む（Ｋａｂａｔナンバリングシステムでは残基２４４〜３６０、ＥＵナンバリングシステムでは残基２３１〜３４０、Ｋａｂａｔ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｕ．Ｓ．  Ｄｅｐｔ．  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ  ａｎｄ  Ｈｕｍａｎ  Ｓｅｒｖｉｃｅｓ，  "Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ"  （１９８３）を参照）。ＣＨ２ドメインは、別のドメインと密に対になっていないという点で独自である。むしろ、２つのＮ結合型分岐炭水化物鎖は、完全な天然型のＩｇＧ分子の２つのＣＨ２ドメインの間に挿入される。また、ＣＨ３ドメインがＣＨ２ドメインからＩｇＧ分子のＣ末端へ延在し、約１０８残基を含むことが十分に立証されている。
【００６６】
本明細書において使用される「ヒンジ領域」という語句は、ＣＨ１ドメインをＣＨ２ドメインに連結させる重鎖分子の部分を含む。このヒンジ領域は、約２５の残基を含み柔軟であり、したがって、２つのＮ末端抗原結合領域が独立に移動することを可能にする。ヒンジ領域は、３つの区別されるドメイン、すなわち、上、中央、下ヒンジドメインに細分化され得る（Ｒｏｕｘ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １６１：４０８３  （１９９８））。
【００６７】
本明細書において使用される「ジスルフィド結合」という語句は、２つの硫黄原子の間に形成される共有結合を含む。アミノ酸システインは、第２のチオール基との間にジスルフィド結合またはブリッジを形成できるチオール基を含む。自然に発生する大部分のＩｇＧ分子において、ＣＨ１およびＣＫ領域はジスルフィド結合によって連結され、２つの重鎖は、Ｋａｂａｔナンバリングシステムを使用したときの２３９および２４２（ＥＵナンバリングシステムの場合、位置２２６または２２９）に対応する位置における２つのジスルフィド結合によって連結される。
【００６８】
本明細書において使用される「キメラ抗体」という語句は、免疫反応性領域または部位が第１の種から取得され、または、それに由来し、かつ、定常領域（本開示によれば、完全なもの、部分的なもの、または、改変されたものであり得る）が第２の種から取得される、任意の抗体を意味するものとする。特定の実施形態おいて、標的結合領域または部位は、非ヒトのソースに由来し（例えば。マウスまたは霊長類）、定常領域はヒト型である。
【００６９】
本明細書において使用される「ヒト化率」は、ヒト化ドメインと生殖細胞系ドメインとの間のフレームワークアミノ酸の数の差（すなわち、非ＣＤＲの差）を決定し、その数を総アミノ酸数から減算し、それを総アミノ酸数で除算し、１００で乗算することによって算出される。
【００７０】
「特異的に結合」または「特異性を有する」は、一般的に、抗体が抗原結合ドメインを介してエピトープに結合すること、および、結合が抗原結合ドメインとエピトープとの間のいくらかの相補性を伴うことを意味する。この定義によれば、ランダムな関連のないエピトープに結合する場合より容易に、抗体が抗原結合ドメインを介してエピトープに結合するとき、そのエピトープに「特異的に結合」すると言われる。「特異性」という語句は、本明細書において、特定の抗体が特定のエピトープに結合する相対的な親和性を認めるために使用される。例えば、抗体「Ａ」は、任意のエピトープについて、抗体「Ｂ」より高い特異性を有すると見なされ得る、または、抗体「Ａ」は、関連するエピトープ「Ｄ」について有する特異性より高い特異性でエピトープに結合すると言われ得る。
【００７１】
本明細書において使用される「治療」または「治療する」という語句は、治療処置および予防または防止手段の両方を指し、目的は、癌の進行などの、望ましくない生理的変化または疾患を防止または鈍化する（緩和する）。有利な、または、望ましい臨床結果には、これらに限定されないが、検出可能かどうかを問わず、症状の軽減、疾病の程度の減弱、病状の安定化（すなわち、悪化しない）、疾病の進行の遅延または鈍化、病状の改善または緩和、寛解（完全または部分を問わず）が含まれる。「治療」は、治療を受けない場合に予想される生存期間と比較して、生存期間を延ばすことも意味し得る。治療を必要とする者には、既に病態または障害を有する者、および、病態または障害を有する傾向がある者、または、病態または障害を予防されるべき者が含まれる。
【００７２】
「対象」または「個人」または「動物」または「患者」または「哺乳類」は、任意の対象、特に、診断、予後または治療が望まれる哺乳類対象を意味する。哺乳類対象には、ヒト、家畜動物、農業用の動物、または、イヌ、ネコ、モルモット、ウサギ、ラット、マウス、ウマ、畜牛、乳牛など、動物園、スポーツ、もしくは、ペット用の動物などが含まれる。
【００７３】
本明細書において使用される、「治療を必要とする患者に」または「治療を必要とする対象」などの語句は、例えば、検出、診断手順、および／または、治療に使用される、本開示の抗体または組成物の投与から恩恵を受けるであろう、哺乳類対象などの対象を含む。
【００７４】
［抗ＰＤ−Ｌ１抗体］
本開示は、ヒトＰＤ−Ｌ１タンパク質への高親和性を有する抗ＰＤ−Ｌ１抗体を提供する。試験対象の抗体は、強力な結合および阻害活性を示したので、治療および診断の用途に有用である。
【００７５】
ＰＤ−Ｌ１タンパク質は、４０ｋＤａの１型細胞膜貫通タンパク質である。細胞外部分は、Ｎ末端免疫グロブリンＶ（ＩｇＶ）ドメイン（アミノ酸１９−１２７）およびＣ末端免疫グロブリンＣ（ＩｇＣ）ドメイン（アミノ酸１３３−２２５）を含む。ＰＤ−１およびＰＤ−Ｌ１は、抗体のＩｇＶドメインおよびＴ細胞受容体のように、そのＩｇＶドメインの保存された前方および側方を通して相互作用する。当然ながら、現在の抗ＰＤ−Ｌ１抗体はすべて、ＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１との間の結合を妨害できるＩｇＶドメインに結合する。したがって、ＰＤ−Ｌ１タンパク質のＩｇＣドメインに結合する、本明細書に開示される多くのものなどの抗体が依然として効果的に、おそらくはそれ以上にＰＤ−Ｌ１を阻害でき、更に一層改善された治療効果をもたらすという本開示の発見は、驚くべき予想外のことである。
【００７６】
したがって、本開示の一実施形態は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体または抗体断片を提供し、抗体または抗体断片は、ヒトのプログラム細胞死リガンド１（ＰＤ−Ｌ１）タンパク質の免疫グロブリンＣ（ＩｇＣ）ドメインに特異的に結合できる。いくつかの実施形態において、ＩｇＣドメインは、アミノ酸残基１３３−２２５から成る。 
【００７７】
いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、ＰＤ−Ｌ１タンパク質のアミノ酸残基Ｙ１３４、Ｋ１６２またはＮ１８３のうち少なくとも１つに結合できる。いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、ＰＤ−Ｌ１タンパク質のアミノ酸残基Ｙ１３４、Ｋ１６２またはＮ１８３のうち少なくとも２つに結合できる。いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、ＰＤ−Ｌ１タンパク質のアミノ酸残基Ｙ１３４、Ｋ１６２およびＮ１８３のうち少なくとも１つに結合できる。いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、ＰＤ−Ｌ１タンパク質の免疫グロブリンＶ（ＩｇＶ）ドメインに結合せず、ＩｇＶドメインは、アミノ酸残基１９から１２７から成る。
【００７８】
本開示の一実施形態によれば、配列識別番号１−６において定義されるＣＤＲ領域を有する重鎖および軽鎖可変ドメインを含む抗体が提供される。
［表１  ＣＤＲ領域の配列］
【表２】
2020180135.tif 000003
【００７９】
実験例において示されるように、これらのＣＤＲ領域を含む抗体は、マウス、ヒト化、または、キメラのいずれも、強力なＰＤ−Ｌ１結合および阻害活性を有する。更なるコンピュータモデル化は、抗体の特性を保持または改善するように、ＣＤＲにおける特定の残基を改変できることを示した。そのような残基は、「ホットスポット」と呼ばれ、表１において下線で示される。いくつかの実施形態において、本開示の抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、表１に列挙されるように、１、２、または、３個の更なる改変を有するＶＨおよびＶＬ  ＣＤＲを含む。そのような改変は、アミノ酸の追加、欠失、または、置換であり得る。 
【００８０】
いくつかの実施形態において、改変は、ＣＤＲの各々の１つだけのホットスポット位置での置換である。いくつかの実施形態において、改変は、１、２、または、３つのそのようなホットスポット位置での置換である。一実施形態において、改変は、ホットスポット位置のうち１つでの置換である。そのような置換は、いくつかの実施形態において、保存的置換である。
【００８１】
「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が、同様の側鎖を有するアミノ酸残基に置き換えられる置換のことである。本技術分野において定義された同様の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーには、塩基性側鎖（例えば、リシン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖（例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸）、非荷電極性側鎖（例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン）、非極性側鎖（例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン）、ベータ分岐型側鎖（例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン）、および、芳香族側鎖（例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）が含まれる。したがって、免疫グロブリンポリペプチドにおける非本質的なアミノ酸残基は、好ましくは、同一の側鎖ファミリーの別のアミノ酸残基に置き換えられる。別の実施形態において、アミノ酸の鎖は、側鎖ファミリーメンバーの順序および／または組成が異なる、構造的に同様の鎖に置き換えることができる。
【００８２】
保存的アミノ酸置換の非限定的な例を以下の表に提供する。ここでは、０またはそれより高い類似性スコアは、２つのアミノ酸の間の保存的置換を示す。
［表２  アミノ酸類似性マトリクス］
【表３】
2020180135.tif 000004
［表３  保存的アミノ酸置換］
【表４】
2020180135.tif 000005
【００８３】
好適な置換を有するＣＤＲの具体的な例が、例１１の配列識別番号６１−１１１に提供される。したがって、いくつかの実施形態において、本開示の抗体は、配列識別番号１または６１‐６７のいずれか１つのＶＨ  ＣＤＲ１を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗体は、配列識別番号２または６８‐７７のいずれか１つのＶＨ  ＣＤＲ２を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗体は、配列識別番号１または７８‐９０のいずれか１つのＶＨ  ＣＤＲ３を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗体は、配列識別番号４または９１‐９２のいずれか１つのＶＬ  ＣＤＲ１を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗体は、配列識別番号５または９３‐１０５のいずれか１つのＶＬ  ＣＤＲ２を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗体は、配列識別番号６または１０６‐１１０のいずれか１つのＶＬ  ＣＤＲ３を含む。
【００８４】
いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、上記の置換のうち１つだけ、２つだけ、または、３つだけを含む。いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、配列識別番号１または配列識別番号６１−６７のいずれか１つのＶＨ  ＣＤＲ１と、配列識別番号２のＶＨ  ＣＤＲ２と、配列識別番号３のＶＨ  ＣＤＲ３と、配列識別番号４のＶＬ  ＣＤＲ１と、配列識別番号５のＶＬ  ＣＤＲ２と、配列識別番号６のＶＬ  ＣＤＲ３とを含む。
【００８５】
いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、配列識別番号１のＶＨ  ＣＤＲ１と、配列識別番号２または配列識別番号６８−７７のいずれか１つのＶＨ  ＣＤＲ２と、配列識別番号３のＶＨ  ＣＤＲ３と、配列識別番号４のＶＬ  ＣＤＲ１と、配列識別番号５のＶＬ  ＣＤＲ２と、配列識別番号６のＶＬ  ＣＤＲ３とを含む。
【００８６】
いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、配列識別番号１のＶＨ  ＣＤＲ１と、配列識別番号２のＶＨ  ＣＤＲ２と、配列識別番号３または配列識別番号７８−９０のいずれか１つのＶＨ  ＣＤＲ３と、配列識別番号４のＶＬ  ＣＤＲ１と、配列識別番号５のＶＬ  ＣＤＲ２と、配列識別番号６のＶＬ  ＣＤＲ３とを含む。
【００８７】
いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、配列識別番号１のＶＨ  ＣＤＲ１と、配列識別番号２のＶＨ  ＣＤＲ２と、配列識別番号３のＶＨ  ＣＤＲ３と、配列識別番号４または配列識別番号９１−９２のいずれか１つのＶＬ  ＣＤＲ１と、配列識別番号５のＶＬ  ＣＤＲ２と、配列識別番号６のＶＬ  ＣＤＲ３とを含む。
【００８８】
いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、配列識別番号１のＶＨ  ＣＤＲ１と、配列識別番号２のＶＨ  ＣＤＲ２と、配列識別番号３のＶＨ  ＣＤＲ３と、配列識別番号４のＶＬ  ＣＤＲ１と、配列識別番号５または配列識別番号９３−１０５のいずれか１つのＶＬ  ＣＤＲ２と、配列識別番号６のＶＬ  ＣＤＲ３とを含む。
【００８９】
いくつかの実施形態において、抗体または抗体断片は、配列識別番号１のＶＨ  ＣＤＲ１と、配列識別番号２のＶＨ  ＣＤＲ２と、配列識別番号３のＶＨ  ＣＤＲ３と、配列識別番号４のＶＬ  ＣＤＲ１と、配列識別番号５のＶＬ  ＣＤＲ２と、配列識別番号６または配列識別番号１０６−１１１のいずれか１つのＶＬ  ＣＤＲ３とを含む。
【００９０】
ＶＨの非限定的な例は配列識別番号７−２６および１１３に提供され、そのうち、配列識別番号１１３がマウスＶＨであり、配列識別番号７−２６がヒト化ＶＨである。更に、ヒト化ＶＨのうち、配列識別番号９−１５、１７−２１および２３−２６は、１または複数の、マウスバージョンへの復帰突然変異を含む。同様に、ＶＬ（ＶＫ）の非限定的な例は、配列識別番号２７−３３において提供される。配列識別番号２８および３０は、例に示されるように、当初得られた、ＣＤＲ移植されたヒト化配列である。配列識別番号２９および３１−３３は、復帰突然変異を有するヒト化ＶＬである。 
【００９１】
復帰突然変異は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体の特定の特徴を保持するために有用であることが示される。従って、いくつかの実施形態において、本開示の抗ＰＤ−Ｌ１抗体、特に、ヒト型またはヒト化抗体は、復帰突然変異のうち１つまたは複数を含む。いくつかの実施形態において、ＶＨ復帰突然変異（すなわち、指定された位置にアミノ酸を含む）は、Ｋａｂａｔナンバリングによる、（ａ）位置４４のＳｅｒ、（ｂ）位置４９のＡｌａ、（ｃ）位置５３のＡｌａ、（ｄ）位置９１のＩｌｅ、（ｅ）位置１のＧｌｕ、（ｆ）位置３７のＶａｌ、（ｇ）位置４０のＴｈｒ、（ｈ）位置５３のＶａｌ、（ｉ）位置５４のＧｌｕ、（ｊ）位置７７のＡｓｎ、（ｋ）位置９４のＡｒｇ、および、（ｌ）位置１０８のＴｈｒ、および、それらの組み合わせから選択される１つまたは複数を含む。いくつかの実施形態において、復帰突然変異は、Ｋａｂａｔナンバリングによる、（ａ）位置４４のＳｅｒ、（ｂ）位置４９のＡｌａ、（ｃ）位置５３のＡｌａ、および／または、（ｄ）位置９１のＩｌｅ、ならびに、それらの組み合わせから選択される。 
【００９２】
いくつかの実施形態において、ＶＬ復帰突然変異は、Ｋａｂａｔナンバリングによる、（ａ）位置２２のＳｅｒ、（ｂ）位置４２のＧｌｎ、（ｃ）位置４３のＳｅｒ、（ｄ）位置６０のＡｓｐ、および、（ｅ）位置６３のＴｈｒ、ならびに、それらの組み合わせから選択される１つまたは複数である。
【００９３】
いくつかの実施形態において、本開示の抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、配列識別番号７−２６のＶＨ、配列識別番号２７−３３のＶＬ、または、それぞれの生物学的同等物を含む。ＶＨまたはＶＬの生物学的同等物は、全体的に８０％、８５％、９０％、９５％、９８％または９９％の配列同一性を有する、指定されたアミノ酸を含む配列である。配列識別番号２０の生物学的同等物は、例えば、配列識別番号２０と全体的に８０％、８５％、９０％、９５％、９８％または９９％の配列同一性を有するが、ＣＤＲ（配列識別番号１−６またはそれらの変異型）を保持し、任意で、復帰突然変異のうち１つまたは複数、または、すべてを保持するＶＨであり得る。一実施形態において、ＶＨは配列識別番号２０のアミノ酸配列を有し、ＶＬは配列識別番号２８のアミノ酸配列を有する。 
【００９４】
また、当業者であれば、本明細書に開示される抗体は、それらの由来となる、自然に発生する結合ポリペプチドと比較して、アミノ酸配列が変動するように改変され得ることを理解するであろう。例えば、指定されたタンパク質に由来するポリペプチドまたはアミノ酸配列は同様であり得て、例えば、開始配列に対して、特定のパーセントの同一性を有し、例えば、開始配列に対して、６０％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％または９９％同一であり得る。
【００９５】
特定の実施形態において、抗体は、通常は抗体に関連しない、アミノ酸配列、または、１または複数の部分を含む。例示的な改変は、以下でより詳細に説明される。例えば、本開示の抗体は、柔軟なリンカ配列を含み得る、または、官能基（例えば、ＰＥＧ、薬剤、毒物、または、標識）を追加するように改変され得る。
【００９６】
本開示の抗体、変異型、または、それらの誘導体は、改変された誘導体、すなわち、エピトープへの抗体の結合が共有結合によって防止されないように任意の種類の分子を抗体に共有結合させることによって改変された誘導体を含む。例えば、これらに限定されないが、抗体は例えば、グリコシル化、アセチル化、ＰＥＧ化、リン酸化、アミド化、既知の保護／遮断基による誘導体化、タンパク質切断、細胞リガンドまたは他のタンパク質への連結などによって改変できる。多数の化学改変のいずれも、これらに限定されないが、特異的な化学的切断、アセチル化、ホルミル化、ツニカマイシンの代謝合成などを含む、既知の技法によって実行され得る。加えて、抗体は、１または複数の非従来型アミノ酸を含み得る。 
【００９７】
いくつかの実施形態において、抗体は、治療剤、プロドラッグ、ペプチド、タンパク質、酵素、ウイルス、脂質、生物応答調節剤、医薬品、またはＰＥＧと結合され得る。
【００９８】
抗体は、放射性標識などの検出可能な標識を含み得る治療剤、免疫調節剤、ホルモン、酵素、オリゴヌクレオチド、光活性治療剤、光活性診断剤、薬物または毒物であり得る細胞傷害性剤、超音波造影剤、非放射性標識、それらの組み合わせ、および、本技術分野において既知である他のそのような物質に結合または融合され得る。
【００９９】
抗体は、化学発光化合物と結合させることによって、検出可能に標識できる。その後、化学発光標識された抗原結合ポリペプチドの存在は、化学反応の過程において生じる発光の存在を検出することによって判定される。特に有用な化学発光標識化合物の例には、ルミノール、イソルミノール、セロマティックアクリジニウムエステル、イミダゾール、アクリジニウム塩、およびシュウ酸エステルがある。
【０１００】
また、抗体は、１５２ＥＵまたはランタニド系列の他のものなどの蛍光放射金属を使用して検出可能に標識できる。これらの金属は、ジエチレントリアミン五酢酸（ＤＴＰＡ）またはエチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）などの金属キレート基を使用して、抗体に取り付けることができる。様々な部分を抗体に結合させる技法は既知である。例えば、Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ａｎｄ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ，  Ｒｅｉｓｆｅｌｄ  ｅｔ  ａｌ．  （ｅｄｓ．），  ｐｐ．  ２４３−５６  （Ａｌａｎ  Ｒ．  Ｌｉｓｓ，  Ｉｎｃ．  （１９８５）のＡｒｎｏｎ  ｅｔ  ａｌ，  "Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ｆｏｒ  Ｉｍｍｕｎｏｔａｒｇｅｔｉｎｇ  Ｏｆ  Ｄｒｕｇｓ  Ｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ"、Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ  （２ｎｄ  Ｅｄ．），  Ｒｏｂｉｎｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，  （ｅｄｓ．），  Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，  Ｉｎｃ．，  ｐｐ．  ６２３−  ５３  （１９８７）のＨｅｌｌｓｔｒｏｍ  ｅｔ  ａｌ．，  "Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ｆｏｒ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ"、  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  '８４：  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ａｎｄ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，  Ｐｉｎｃｈｅｒａ  ｅｔ  ａｌ．  （ｅｄｓ．），  ｐｐ．  ４７５−５０６  （１９８５）のＴｈｏｒｐｅ，  "Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｃａｒｒｉｅｒｓ  Ｏｆ  Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ  Ａｇｅｎｔｓ  Ｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ：  Ａ  Ｒｅｖｉｅｗ"、  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ｆｏｒ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ａｎｄ  Ｔｈｅｒａｐｙ，  Ｂａｌｄｗｉｎ  ｅｔ  ａｌ．  （ｅｄｓ．），  Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ  ｐｐ．  ３０３−１６  （１９８５）の"Ａｎａｌｙｓｉｓ，  Ｒｅｓｕｌｔｓ，  Ａｎｄ  Ｆｕｔｕｒｅ  Ｐｒｏｓｐｅｃｔｉｖｅ  Ｏｆ  Ｔｈｅ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｕｓｅ  Ｏｆ  Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ"、および、Ｉｍｍｕｎｏｌ．  Ｒｅｖ．  （５２：１１９−５８  （１９８２））のＴｈｏｒｐｅ  ｅｔ  ａｌ．，  "Ｔｈｅ  Ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ  Ａｎｄ  Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ  Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ  Ｏｆ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ−Ｔｏｘｉｎ  Ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ"を参照されたい。
【０１０１】
［二官能分子］
ＰＤ−Ｌ１は免疫チェックポイント分子であり、腫瘍抗原でもある。腫瘍抗原標的分子として、ＰＤ−Ｌ１に特異的な抗体または抗原結合断片を、免疫細胞に特異的な第２の抗原結合断片と組み合わせることで、二重特異性抗体を生成することができる。 
【０１０２】
いくつかの実施形態において、免疫細胞は、Ｔ細胞、Ｂ細胞、単球、マクロファージ、好中球、樹状細胞、食細胞、ナチュラルキラー細胞、好酸球、好塩基球およびマスト細胞から成る群から選択される。標的にできる免疫細胞上の分子には、例えば、ＣＤ３、ＣＤ１６、ＣＤ１９、ＣＤ２８およびＣＤ６４が含まれる。他の例には、ＰＤ−１、ＣＴＬＡ−４、ＬＡＧ−３（ＣＤ２２３としても知られている）、ＣＤ２８、ＣＤ１２２、４−１ＢＢ（ＣＤ１３７としても知られている）、ＴＩＭ３、ＯＸ−４０もしくはＯＸ４０Ｌ、ＣＤ４０もしくはＣＤ４０Ｌ、ＬＩＧＨＴ、ＩＣＯＳ／ＩＣＯＳＬ、ＧＩＴＲ／ＧＩＴＲＬ、ＴＩＧＩＴ、ＣＤ２７、ＶＩＳＴＡ、Ｂ７Ｈ３、Ｂ７Ｈ４、ＨＥＶＭまたはＢＴＬＡ（ＣＤ２７２としても知られている）、キラー細胞免疫グロブリン様受容体（ＫＩＲ）、および、ＣＤ４７が含まれる。二重特異性の具体的な例には、これらに限定されないが、ＰＤ−Ｌ１／ＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１／ＬＡＧ３、ＰＤ−Ｌ１／ＴＩＧＩＴ、および、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ４７が含まれる。
【０１０３】
免疫チェックポイント阻害剤として、ＰＤ−Ｌ１に特異的な抗体または抗原結合断片を、腫瘍抗原に特異的な第２の抗原結合断片と組み合わせることで、二重特異性抗体を生成できる。「腫瘍抗原」は、腫瘍細胞において生成される抗原性物質であり、すなわち、宿主における免疫反応を引き起こす。腫瘍抗原は、腫瘍細胞の同定において有用であり、癌治療に用いられる潜在的候補である。体内の通常のタンパク質は、抗原性ではない。しかしながら、特定のタンパク質は、腫瘍形成中に生成または過剰発現され、したがって、体には「外来」のものに見える。これには、免疫系からよく隔離された通常のタンパク質、通常は非常に小さい量だけ生成されるタンパク質、通常は成長の特定の段階のみにおいて生成されるタンパク質、または、突然変異に起因して構造が改変されたタンパク質を含み得る。
【０１０４】
本技術分野において、大量の腫瘍抗原が知られており、スクリーニングによって新しい腫瘍抗原を容易に同定できる。腫瘍抗原の非限定的な例には、ＥＧＦＲ、Ｈｅｒ２、ＥｐＣＡＭ、ＣＤ２０、ＣＤ３０、ＣＤ３３、ＣＤ４７、ＣＤ５２、ＣＤ１３３、ＣＤ７３、ＣＥＡ、ｇｐＡ３３、ムチン、ＴＡＧ−７２、ＣＩＸ、ＰＳＭＡ、葉酸結合タンパク質、ＧＤ２、ＧＤ３、ＧＭ２、ＶＥＧＦ、ＶＥＧＦＲ、インテグリン、αＶβ３、α５β１、ＥＲＢＢ２、ＥＲＢＢ３、ＭＥＴ、ＩＧＦ１Ｒ、ＥＰＨＡ３、ＴＲＡＩＬＲ１、ＴＲＡＩＬＲ２、ＲＡＮＫＬ、ＦＡＰおよびテネイシンが含まれる。
【０１０５】
いくつかの態様において、一価の単官能は、対応する非腫瘍細胞と比較して腫瘍細胞上で過剰発現するタンパク質に対する特異性を有する。ここで使用される「対応する非腫瘍細胞」は、腫瘍細胞の起源と同一の細胞の種類のものである非腫瘍細胞を指す。そのようなタンパク質は、必ずしも腫瘍抗原と異ならないことに留意されたい。非限定的な例には、（ａ）大部分の結腸、直腸、胸部、肺、膵臓、消化管の癌腫において過剰発現する癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、（ｂ）胸部、卵巣、結腸、肺、前立腺および子宮頸部の癌において頻繁に過剰発現するヘレグリン受容体（ＨＥＲ−２、ｎｅｕまたはｃ−ｅｒｂＢ−２）、（ｃ）胸部、頭頸部、非小細胞肺、および、前立腺など、様々な固形腫瘍において多く発現する上皮増殖因子受容体（ＥＧＦＲ）、（ｄ）アシアロ糖タンパク質受容体、（ｅ）トランスフェリン受容体、（ｆ）肝細胞で発現するセルピン酵素複合体受容体、（ｇ）膵管腺癌細胞で過剰発現する線維芽細胞増殖因子受容体（ＦＧＦＲ）、（ｈ）抗血管新生遺伝子療法のための血管内皮増殖因子受容体（ＶＥＧＦＲ）、（ｉ）粘液非産生性卵巣癌腫の９０％において選択的に過剰発現する葉酸受容体、（ｊ）細胞表面グリコカリックス、（ｋ）炭水化物受容体、（ｌ）呼吸器上皮細胞への遺伝子輸送に有用で、嚢胞性線維症などの肺疾患の治療に対して魅力的な高分子免疫グロブリン受容体が含まれる。これに関して、二重特異性の非限定的な例には、ＰＤ−Ｌ１／ＥＧＦＲ、ＰＤ−Ｌ１／Ｈｅｒ２、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ３３、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ１３３、ＰＤ−Ｌ１／ＣＥＡ、および、ＰＤ−Ｌ１／ＶＥＧＦが含まれる。
【０１０６】
異なる形態の二重特異性抗体も提供される。いくつかの実施形態において、抗ＰＤ−Ｌ１断片および第２断片の各々は、Ｆａｂ断片、一本鎖可変断片（ＳｃＦｖ）または単一ドメイン抗体から独立に選択される。いくつかの実施形態において、二重特異性抗体は更に、Ｆｃ断片を含む。 
【０１０７】
抗体または抗原結合断片だけを含むわけではない二機能性分子も提供される。腫瘍抗原標的分子として、ここで説明されるものなどの、ＰＤ−Ｌ１に特異的な抗体または抗原結合断片を、任意でペプチドリンカを通して、免疫サイトカインまたはリガンドと組み合わせることができる。連結される免疫サイトカインまたはリガンドには、これらに限定されないが、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１３、ＩＬ−１５、ＧＭ−ＣＳＦ、ＴＮＦ−(、ＣＤ４０Ｌ、ＯＸ４０Ｌ、ＣＤ２７Ｌ、ＣＤ３０Ｌ、４−１ＢＢＬ、ＬＩＧＨＴおよびＧＩＴＲＬが含まれる。そのような二官能分子は、免疫チェックポイント遮断効果を、腫瘍部位局所的免疫調節と組み合わせることができる。
【０１０８】
［抗体をコードするポリヌクレオチドおよび抗体の調製方法］
また、本開示は、本開示の抗体、変異型、または、誘導体をコードする、単離ポリヌクレオチドまたは核酸分子（例えば、配列識別番号３４−６０、１１２および１１４）を提供する。本開示のポリヌクレオチドは、同一のポリヌクレオチド分子上で、または、別個のポリヌクレオチド分子上で、抗原結合ポリペプチド、その変異型または誘導体の重鎖および軽鎖可変領域の全体をコードし得る。加えて、本開示のポリヌクレオチドは、同一のポリヌクレオチド分子上で、または、別個のポリヌクレオチド分子上で、抗原結合ポリペプチド、その変異型または誘導体の重鎖および軽鎖可変領域の一部をコードし得る。
【０１０９】
抗体を作成する方法は、本技術分野において既知であり、本明細書において説明されている。特定の実施形態において、本開示の抗原結合ポリペプチドの可変領域および定常領域の両方は、完全にヒト型である。完全ヒト型抗体は、本技術分野において説明される技法を使用して、本明細書において説明されるように作成できる。例えば、特異的抗原に対する完全ヒト型抗体は、抗原投与に応答してそのような抗体を生成するが内因性の遺伝子座を欠損するように改変されたトランスジェニック動物に抗原を投与することによって調製できる。そのような抗体を作成するために使用できる例示的技法は、参照によって全体が組み込まれる米国特許第６，１５０，５８４号、第６，４５８，５９２号、第６，４２０，１４０号に説明されている。 
【０１１０】
特定の実施形態において、調製された抗体は、例えばヒトなど、治療されるべき動物において、有害な免疫反応を誘発しない。一実施形態において、本開示の抗原結合ポリペプチド、その変異型または誘導体は、本分野において認識されている技法を使用することによって、免疫原性を低減するように改変される。例えば、抗体はヒト化、霊長類化、脱免疫化でき、または、キメラ抗体を作成できる。これらの種類の抗体は、親抗体の抗原結合特性を保持する、または、実質的に保持するが、ヒトにおいては免疫原性がより小さい、典型的にはマウスまたは霊長類抗体などの非ヒト抗体に由来する。これは、（ａ）非ヒト可変ドメインの全体をヒト定常領域に移植してキメラ抗体を生成すること、（ｂ）非ヒト相補性決定領域（ＣＤＲ）の１または複数の少なくとも一部を、重大なフレームワーク残基を保持する、または保持しない、ヒトフレームワークおよび定常領域に移植すること、または、（ｃ）非ヒト可変ドメインの全体を移植するが、表面残基の置き換えによって、ヒト様領域でそれらを「クローキング（ｃｌｏａｋｉｎｇ）」することを含む、様々な方法によって達成され得る。そのような方法は、Ｍｏｒｒｉｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ  ５７：６８５１−６８５５  （１９８４）、Ｍｏｒｒｉｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ａｄｖ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  ４４：６５−９２  （１９８８）、Ｖｅｒｈｏｅｙｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２３９：１５３４−１５３６  （１９８８）、Ｐａｄｌａｎ，  Ｍｏｌｅｃ．  Ｉｍｍｕｎ．  ２５：４８９−４９８  （１９９１）、Ｐａｄｌａｎ，  Ｍｏｌｅｃ．  Ｉｍｍｕｎ．  ３１：１６９−２１７  （１９９４）、ならびに、米国特許第５，５８５，０８９号、第５，６９３，７６１号、第５，６９３，７６２号および第６，１９０，３７０号において開示されており、これらはすべて、参照によって全体が本明細書に組み込まれる。 
【０１１１】
脱免疫は、抗体の免疫原性を低減するために使用することもできる。本明細書において使用される「脱免疫」という語句は、Ｔ細胞エピトープを改変するように抗体を変更することを含む（例えば、国際特許出願公報ＷＯ／９８５２９７６  Ａ１およびＷＯ／００３４３１７  Ａ２を参照）。例えば、開始抗体の可変重鎖および可変軽鎖の配列が解析され、相補性決定領域（ＣＤＲ）に関連するエピトープおよび配列内の他の重要な残基の位置を示す、各Ｖ領域のヒトＴ細胞エピトープ「マップ」が作成される。最終的な抗体の活性を変更するリスクが低い、代替的なアミノ酸置換を同定するべく、Ｔ細胞エピトープマップの個々のＴ細胞エピトープが解析される。アミノ酸置換の組み合わせを含む様々な代替的な可変重鎖および可変軽鎖の配列が設計され、これらの配列は後に、様々な結合ポリペプチドに組み込まれる。典型的には、１２から２４の間の変異型抗体が生成され、結合および／または機能について試験される。完全な重鎖および軽鎖遺伝子は、改変された可変領域を含み、ヒト定常領域は、発現ベクターにクローニングされ、その後、全抗体を生成するための細胞株にプラスミドが導入される。次に、抗体は、適切な生化学および生物学的アッセイにおいて比較され、最適な変異型が同定される。
【０１１２】
本開示の抗原結合ポリペプチドの結合特異性は、免疫沈降、放射免疫測定（ＲＩＡ）または酵素結合免疫吸着検定法（ＥＬＩＳＡ）などのインビトロアッセイによって決定できる。 
【０１１３】
代替的に、一本鎖ユニットの生成について説明される技法（米国特許第４，６９４，７７８号、Ｂｉｒｄ，  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４２：４２３−４４２  （１９８８）、Ｈｕｓｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ  ５５：５８７９−  ５８８３  （１９８８）およびＷａｒｄ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｎａｔｕｒｅ  ３３４：５４４−５５４  （１９８９））は、本開示の一本鎖ユニットを生成するように適合できる。一本鎖ユニットは、アミノ酸ブリッジを介してＦｖ領域の重鎖および軽鎖断片を連結することによって形成され、一本鎖融合ペプチドが結果として得られる。大腸菌における機能的Ｆｖ断片の組立の技法も使用され得る（Ｓｋｅｒｒａ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４２：  １０３８−１０４１  （１９８８））。
【０１１４】
一本鎖Ｆｖ（ＳｃＦｖ）および抗体を生成するために使用できる技法の例には、米国特許第４，９４６，７７８  ａｎｄ  ５，２５８，４９８；  Ｈｕｓｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ  ２０３：４６−８８  （１９９１）；  Ｓｈｕ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ  ９０：１９９５−１９９９  （１９９３）；およびＳｋｅｒｒａ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４０：１０３８−１０４０  （１９８８）において説明されるものが含まれる。ヒトにおける抗体のインビボ使用、および、インビトロ検出アッセイを含む、いくつかの使用について、キメラ抗体、ヒト化抗体、または、ヒト抗体を使用することが好ましいことがあり得る。キメラ抗体とは、マウスモノクローナル抗体に由来する可変領域とヒト免疫グロブリン定常領域とを有する抗体など、抗体の異なる部分が異なる動物種に由来する分子である。キメラ抗体を生成する方法は本技術分野において知られている。例えば、全体が参照によって本明細書に組み込まれる、Ｍｏｒｒｉｓｏｎ，  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２２９：１２０２  （１９８５）、Ｏｉ  ｅｔ  ａｌ．，  ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ４：２１４  （１９８６）、Ｇｉｌｌｉｅｓ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  Ｍｅｔｈｏｄｓ  １２５：１９１−２０２  （１９８９）、米国特許第５，８０７，７１５号、第４，８１６，５６７号および第４，８１６３９７号を参照されたい。
【０１１５】
ヒト化抗体とは、非ヒト種およびフレームワーク領域ならびにヒト免疫グロブリン分子の１または複数の相補性決定領域（ＣＤＲ）を有し、所望される抗原に結合する、非ヒト種抗体に由来する抗体分子である。ヒトフレームワーク領域におけるフレームワーク残基はしばしば、抗原結合を変更する、好ましくは改善するために、対応するＣＤＲドナー抗体の残基に置換される。これらのフレームワーク置換は、本技術分野において既知の方法により同定され、例えば、ＣＤＲとフレームワーク残基との相互作用をモデル化することにより、抗原結合に重要なフレームワーク残基を同定する方法、および、配列比較により、特定の位置における異常なフレームワーク残基を同定する方法が使用される。（例えば、全体が参照によって本明細書に組み込まれる、Ｑｕｅｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，米国特許第５，５８５，０８９号；Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｎａｔｕｒｅ  ３３２：３２３  （１９８８）を参照されたい。）抗体は、例えば、ＣＤＲ移植（ＥＰ  ２３９，４００；  ＰＣＴ  ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ＷＯ  ９１／０９９６７、米国特許第５，２２５，５３９、５，５３０，１０１；および第５，５８５，０８９号）、ベニアリングまたはリサーフェイシング（ＥＰ  ５９２，１０６；  ＥＰ  ５１９，５９６、Ｐａｄｌａｎ，  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  ２８（４／５）：４８９−４９８  （１９９１）、Ｓｔｕｄｎｉｃｋａ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ  ７（６）：８０５−８１４  （１９９４）、Ｒｏｇｕｓｋａ．  ｅｔ  ａｌ．，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ  ９１：９６９−９７３  （１９９４））、チェインシャフリング（全体が参照によって本明細書に組み込まれる、米国特許第５，５６５，３３２号）を含む、本技術分野において知られている様々な技法を使用してヒト化できる。
【０１１６】
完全ヒト抗体は、ヒトの患者の治療処置に特に望ましい。ヒト抗体は、ヒト免疫グロブリン配列に由来する抗体ライブラリを使用するファージディスプレイ法を含む、本技術分野において知られている様々な方法によって作成できる。米国特許第４，４４４，８８７号および第４，７１６，１１１号、ならびに、ＰＣＴ公報ＷＯ  ９８／４６６４５、ＷＯ  ９８／５０４３３、ＷＯ  ９８／２４８９３、ＷＯ  ９８／１６６５４、ＷＯ  ９６／３４０９６、ＷＯ  ９６／３３７３５およびＷＯ  ９１／１０７４１も参照されたい。これらは各々、全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
【０１１７】
また、機能的内因性免疫グロブリンを発現できないがヒト免疫グロブリン遺伝子を発現できるトランスジェニックマウスを使用してヒト抗体を生成できる。例えば、ヒト重鎖および軽鎖免疫グロブリン遺伝子複合体は、マウス胚性幹細胞内に、無作為に、または、相同組換えによって導入され得る。代替的に、ヒト重鎖および軽鎖遺伝子に加えて、ヒト可変領域、定常領域、多様性領域がマウス胚性幹細胞内に導入され得る。マウス重鎖および軽鎖免疫グロブリン遺伝子は、相同組換えによるヒト免疫グロブリン座位の導入と別個に、または同時に、非機能性を付与され得る。特に、ＪＨ領域のホモ接合型欠失は、内因性抗体の生成を防止する。改変された胚性幹細胞を増殖させ、胚盤胞に微量注入することにより、キメラマウスを作る。次に、キメラマウスを繁殖させることにより、ヒト抗体を発現するホモ接合型の子孫を作る。例えば、所望の標的ポリペプチドの全部または一部など、選択された抗原を用いて、通常の方式でトランスジェニックマウスを免疫化する。抗原に対するモノクローナル抗体は、従来のハイブリドーマ技術を使用して、免疫化されたトランスジェニックマウスから取得できる。トランスジェニックマウスが有するヒト免疫グロブリン導入遺伝子は、Ｂ細胞の分化中に再編成し、その後、クラススイッチおよび体細胞突然変異が起きる。したがって、そのような技法を使用して、治療的に有用なＩｇＧ、ＩｇＡ、ＩｇＭおよびＩｇＥ抗体を生成することが可能である。ヒト抗体を生成するためのこの技術の概要については、Ｌｏｎｂｅｒｇ  ａｎｄ  Ｈｕｓｚａｒ  Ｉｎｔ．  Ｒｅｖ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  ７３：６５−９３  （１９９５）を参照されたい。ヒト抗体およびヒトモノクローナル抗体を生成するためのこの技術、ならびに、そのような抗体を生成するためのプロトコルの詳細な説明については、例えば、参照によって全体が本明細書に組み込まれる、ＰＣＴ公報ＷＯ  ９８／２４８９３、ＷＯ  ９６／３４０９６、ＷＯ  ９６／３３７３５、米国特許第５，４１３，９２３号、第５，６２５，１２６号、第５，６３３，４２５号、第５，５６９，８２５号、第５，６６１，０１６号、第５，５４５，８０６号、第５，８１４，３１８号および第５，９３９，５９８号を参照されたい。加えて、Ａｂｇｅｎｉｘ，  Ｉｎｃ．（カリフォルニア州フリーモント）およびＧｅｎＰｈａｒｍ（カリフォルニア州サンノゼ）などの企業は、上で説明されたものと同様の技術を使用して、選択された抗原に対するヒト抗体の提供に従事できる。 
【０１１８】
選択されたエピトープを認識する完全ヒト抗体は、「誘導選択（ｇｕｉｄｅｄ  ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ）」と呼ばれる技法を使用して生成することもできる。この手法において、選択された非ヒトモノクローナル抗体、例えば、マウス抗体は、同一のエピトープを認識する完全ヒト抗体の選択を誘導するために使用される。（Ｊｅｓｐｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ７２：８９９−９０３  （１９８８。また、参照によって全体が組み込まれる、米国特許第５，５６５，３３２号も参照されたい。）
【０１１９】
別の実施形態において、所望されるモノクローナル抗体をコードするＤＮＡは、従来の手順を使用して（例えば、マウス抗体の重鎖および軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合可能なオリゴヌクレオチドプローブを使用することによって）容易に単離およびシーケンシングされ得る。単離およびサブクローニングされたハイブリドーマ細胞は、そのようなＤＮＡの好ましい供給源として機能する。ＤＮＡは一旦単離されると、発現ベクター内に配置され得て、これが次に、本来は免疫グロブリンを生成しない、大腸菌細胞、類人猿ＣＯＳ細胞、チャイニーズハムスター卵巣細胞（ＣＨＯ）細胞、または、骨髄腫細胞など、原核性または真核性の宿主細胞内にトランスフェクトされる。より具体的には、単離されたＤＮＡ（本明細書に説明されるように合成され得る）は、本明細書において参照によって組み込まれる、１９９５年１月２５日に出願された米国特許第５，６５８，５７０号（Ｎｅｗｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．）に説明されるような製造抗体について、定常領域および可変領域の配列をクローニングするために使用され得る。基本的に、これは、選択された細胞からのＲＮＡの抽出、ｃＤＮＡへの変換、Ｉｇに特異的なプライマーを使用するＰＣＲによる増幅を伴う。この目的のための好適なプライマーも米国特許第５,６５８,５７０号において説明される。以下でより詳細に説明されるように、所望される抗体を発現する形質転換細胞は、免疫グロブリンの臨床用および商用のサプライを提供するべく、比較的大量に増殖させられ得る。
【０１２０】
加えて、定型的な組換えＤＮＡ技法を使用することにより、本開示の抗原結合ポリペプチドのＣＤＲのうちの１または複数は、非ヒト抗体をヒト化するべく、フレームワーク領域内、例えば、ヒトフレームワーク領域内に挿入され得る。フレームワーク領域は、自然に発生する、または、コンセンサスフレームワーク領域であり得て、好ましくは、ヒトフレームワーク領域（ヒトフレームワーク領域の一覧は、例えば、Ｃｈｏｔｈｉａ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｊ．  Ｍｏｌ．  Ｂｉｏｌ．  ２７８：４５７−４７９  （１９９８）を参照されたい）であり得る。好ましくは、フレームワーク領域およびＣＤＲの組み合わせによって生成されるポリヌクレオチドは、例えばＬＩＧＨＴなど、所望されるポリペプチドの少なくとも１つのエピトープに特異的に結合する抗体をコードする。好ましくは、フレームワーク領域内において、１または複数のアミノ酸置換が成され得て、好ましくは、アミノ酸置換は抗原に対する抗体の結合を改善する。加えて、そのような方法は、１または複数の鎖内ジスルフィド結合を欠く抗体分子を生成するべく、鎖内ジスルフィド結合に関与する１または複数の可変領域システイン残基のアミノ酸置換または欠失を行うために使用され得る。ポリヌクレオチドへの他の変更は本開示に包含され、本技術分野の範囲内にある。
【０１２１】
加えて、適切な生物学的活性のヒト抗体分子の遺伝子と共に、適切な抗原特異性を有する、マウス抗体分子の遺伝子をスプライシングすることによる、「キメラ抗体」を生成するために開発された技法を使用できる（Ｍｏｒｒｉｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ：８５１−８５５  （１９８４）、Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｎａｔｕｒｅ  ３７２：６０４−６０８  （１９８４）、Ｔａｋｅｄａ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｎａｔｕｒｅ  ３１４：４５２−４５４  （１９８５））。本明細書において使用されるキメラ抗体とは、マウスモノクローナル抗体に由来する可変領域とヒト免疫グロブリン定常領域とを有するものなど、異なる部分が異なる動物種に由来する分子である。
【０１２２】
組換え抗体を生成するための更に別の非常に効率的な手段がＮｅｗｍａｎ，  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  １０：  １４５５−１４６０  （１９９２）において開示される。具体的には、この技法の結果、猿の可変ドメインおよびヒト定常配列を含む霊長類化抗体が生じる。この参考文献は、その全体が参照によって本明細書に組み込まれる。更に、この技法はまた、参照によって各々が本明細書に組み込まれる、本発明の譲受人に譲渡された米国特許第５，６５８，５７０、５，６９３，７８０、および、５，７５６，０９６号にも説明されている。
【０１２３】
代替的に、当業者によく知られている技法を使用して、抗体生成細胞株が選択および培養され得る。そのような技法は、様々な実験室マニュアルおよび一次出版において説明されている。これに関して、後述する開示における使用に好適な技法が、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，  Ｃｏｌｉｇａｎ  ｅｔ  ａｌ．，  Ｅｄｓ．，  Ｇｒｅｅｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ  ａｎｄ  Ｗｉｌｅｙ−Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ，  Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ  （１９９１）において説明され、これは、参照によって付録を含む全体が本明細書に組み込まれる。
【０１２４】
加えて、本開示の抗体をコードするヌクレオチド配列に、これらに限定されないが、アミノ酸置換を引き起こす特定部位突然変異誘発およびＰＣＲ媒介突然変異誘発を含む突然変異を導入するために、当業者に知られている標準的な技法を使用できる。好ましくは、変異型（誘導体を含む）は、基準となる可変重鎖領域、ＣＤＲ−Ｈ１、ＣＤＲ−Ｈ２、ＣＤＲ−Ｈ３、可変軽鎖領域、ＣＤＲ−Ｌ１、ＣＤＲ−Ｌ２、または、ＣＤＲ−Ｌ３に対して、５０未満のアミノ酸置換、４０未満のアミノ酸置換、３０未満のアミノ酸置換、２５未満のアミノ酸置換、２０未満のアミノ酸置換、１５未満のアミノ酸置換、１０未満のアミノ酸置換、５未満のアミノ酸置換、４未満のアミノ酸置換、３未満のアミノ酸置換、または、２未満のアミノ酸置換をコードする。代替的に、突然変異は、飽和突然変異誘発（ｓａｔｕｒａｔｉｏｎ  ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ）など、コード配列の全部または一部に沿って、無作為に導入でき、結果として生じる変異型は生物学的活性についてスクリーニングされ、活性を保持する変異型を同定できる。
【０１２５】
［癌治療］
本明細書において説明されるように、本開示の抗体、変異型または誘導体は、特定の治療および診断方法において使用され得る。
【０１２６】
本開示は更に、本明細書において説明される疾患または病態の１または複数を処理するために、動物、哺乳類およびヒトなどの患者に本開示の抗体を投与することを伴う抗体ベースの治療法に関連する。本開示の治療用化合物には、これらに限定されないが、本開示の抗体（本明細書において説明される変異型、および、変異型の誘導体を含む）、および、本開示の抗体（本明細書において説明される変異型、および、変異型の誘導体を含む）をコードする核酸またはポリヌクレオチドが含まれる。 
【０１２７】
本開示の抗体は、癌を治療または阻害するために使用することもできる。ＰＤ−Ｌ１は腫瘍細胞において過剰発現させることができる。腫瘍由来のＰＤ−Ｌ１は、免疫細胞上のＰＤ−１に結合でき、それによって、抗腫瘍Ｔ細胞免疫を制限する。小型分子阻害剤、または、マウス腫瘍モデルにおけるＰＤ−Ｌ１を標的にしたモノクローナル抗体を用いた結果は、ＰＤ−Ｌ１を標的にした治療法は、腫瘍増殖の効果的制御に対する重要な代替的かつ現実的手法であることを示す。実験例において示されるように、抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、癌患者の生存率の改善をもたらすことができる適応型免疫反応の機構を活性化する。
【０１２８】
従って、いくつかの実施形態において、治療を必要とする患者の癌を治療するための方法を提供する。一実施形態において、当該方法は、本開示の抗体の有効量を患者に投与することを伴う。いくつかの実施形態において、患者における癌細胞（例えば、間質細胞）のうち少なくとも１つは、ＰＤ−Ｌ１を発現する、過剰発現する、または、それを発現するように誘導される。ＰＤ−Ｌ１発現の誘導は、例えば、腫瘍ワクチンの投与または放射線治療によって行うことができる。 
【０１２９】
ＰＤ−Ｌ１タンパク質を発現する腫瘍には、膀胱癌、非小細胞肺癌、腎癌、乳癌、尿道癌、結腸直腸癌、頭頸部癌、扁平上皮細胞癌、メルケル細胞癌、胃腸癌、胃癌、食道癌、卵巣癌、腎癌、小細胞肺癌が含まれる。従って、本開示の抗体は、任意の１または複数のそのような癌を処理するために使用できる。 
【０１３０】
キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）Ｔ細胞療法などの細胞療法も本開示において提供される。好適な細胞を使用でき、それは、本開示の抗ＰＤ−Ｌ１抗体に接触させられる（または、代替的に、本開示の抗ＰＤ−Ｌ１抗体を発現するように操作される）。そのような接触または操作の後に、治療を必要とする癌患者に細胞を導入することができる。癌患者は、本明細書に開示されるような任意の種類の癌を有し得る。細胞（例えばＴ細胞）は、例えば、これらに限定されないが、腫瘍浸潤Ｔリンパ球、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、または、それらの組み合わせであり得る。 
【０１３１】
いくつかの実施形態において、細胞は癌患者自身から単離されたものである。いくつかの実施形態において、細胞は、ドナーによって、または、細胞バンクから提供される。細胞を癌患者から単離するとき、望ましくない免疫反応を最小限に抑えることができる。 
【０１３２】
本開示の抗体もしくは変異型、または、それらの誘導体を用いて治療、予防、診断、および／または、予後され得る、細胞生存の増加に関連する追加の疾病または病態には、これらに限定されないが、白血病（急性白血病、（例えば、急性リンパ球性白血病、急性骨髄性白血病（骨髄芽球性、前骨髄球性、骨髄単球性、単球性、赤白血病を含む）、慢性白血病（例えば、慢性骨髄性（顆粒球性）白血病および慢性リンパ球性白血病））を含む）、真性多血症、リンパ腫（例えば、ホジキン病および非ホジキン病）、多発性骨髄腫、原発性マクログロブリン血症、重鎖病、および、固形腫瘍（これらに限定されないが、繊維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨肉腫、脊索腫、血管肉腫、内皮肉腫、リンパ管肉腫、リンパ管内皮種、滑液腫瘍、中皮腫、ユーイング腫瘍、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、結腸癌、膵臓癌、乳癌、甲状腺癌、子宮内膜癌、悪性黒色腫、前立腺癌、卵巣癌、前立腺癌、扁平上皮細胞癌、基底細胞癌、腺癌、汗腺癌、脂腺癌、乳頭癌、乳頭腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌、気管支原性癌、腎細胞癌、肝細胞癌、胆管癌、絨毛癌、精上皮腫、胎生期癌、ウィルムス腫瘍、子宮頸癌、精巣腫瘍、肺癌、肺小細胞癌、膀胱癌、上皮癌、神経膠腫、星細胞腫、髄芽腫、頭蓋咽頭腫、上衣腫、松果体腫、血管芽腫、聴神経腫、乏突起膠腫、髄膜腫、悪性黒色腫、神経芽細胞腫、網膜芽細胞腫などの肉腫および癌腫などを含む）などの悪性腫瘍および関連する疾患の進行および／または転移が含まれる。
【０１３３】
［併用療法］
更なる実施形態において、本開示の組成物は、抗腫瘍剤、抗ウイルス剤、抗菌剤もしくは抗生物質製剤、または、抗真菌剤と組み合わせて投与される。本技術分野において知られている、これらの製剤のいずれかは、本開示の組成物において投与され得る。
【０１３４】
別の実施形態において、本開示の組成物は、化学療法剤と組み合わせて投与される。本開示の組成物と共に投与され得る化学療法剤には、これらに限定されないが、抗生物質誘導体（例えば、ドキソルビシン、ブレオマイシン、ダウノルビシン、ダクチノマイシン）、抗エストロゲン剤（例えば、タモキシフェン）、代謝拮抗物質（例えば、フルオロウラシル、５‐ＦＵ、メトトレキサート、フロクスウリジン、インターフェロンアルファ‐２ｂ、グルタミン酸、プリカマイシン、メルカプトプリン、６‐チオグアニン）、細胞傷害性剤（例えば、カルムスチン、ＢＣＮＵ、ロムスチン、ＣＣＮＵ、シトシンアラビノシド、シクロホスファミドエストラムスチン、ヒドロキシウレア、プロカルバジン、マイトマイシン、ブスルファン、シスプラチン、ビンクリスチン硫酸塩）、ホルモン（例えば、メドロキシプロゲステロン、リン酸エストラムスチンナトリウム、エチニルエストラジオール、エストラジオール、酢酸メゲストロール、メチルテストステロン、二リン酸ジエチルスチルベストロール、クロロトリアニセン、テストラクトン）、ナイトロジェンマスタード誘導体（例えば、メルファラン、クロラムブシル、メクロレタミン（ナイトロジェンマスタード）、チオテパ）、ステロイドおよび組み合わせ（例えば、リン酸ベタメタゾンナトリウム）、その他（例えば、ダカルバジン、アスパラギナーゼ、ミトタン、ビンクリスチン硫酸塩、ビンブラスチン硫酸塩、エトポシド）などが含まれる。
【０１３５】
さらなる実施形態において、本開示の組成物は、サイトカインと組み合わせて投与される。本開示の組成物と共に投与され得るサイトカインには、これらに限定されないが、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ―６、ＩＬ−７、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＩＬ−１３、ＩＬ−１５、抗ＣＤ４０、ＣＤ４０Ｌ、および、ＴＮＦ−αが含まれる。 
【０１３６】
さらなる実施形態において、本開示の組成物は、例えば、放射線療法など、他の治療または予防方式と組み合わせて投与される。 
【０１３７】
本開示の抗ＰＤ−Ｌ１抗体のうち１または複数を第２抗癌（化学療法）剤と共に使用することを含む併用療法も提供される。化学療法剤は、作用機序によって、例えば、ピリミジン類似体フロクスウリジン、カペシタビン、シタラビンなどの代謝拮抗剤／抗癌剤；プリン類似体、葉酸アンタゴニスト、および、関連する阻害剤；ビンカアルカロイド（ビンブラスチン、ビンクリスチン）などの天然産物、および、タキサン（パクリタキセル、ドセタキセル）、ビンブラスチン、ノコダゾール、エポチロン、ビノレルビン（ＮＡＶＥＬＢＩＮＥ（登録商標））、エピポドフィロトキシン（エトポシド、テニポシド）などの微小管を含む抗増殖／抗有糸分裂剤；アクチノマイシン、アムサクリン、ブスルファン、カルボプラチン、クロラムブシル、シスプラチン、シクロホスファミド（ＣＹＴＯＸＡＮ（登録商標））、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、エピルビシン、イフォスファミド、メルファラン、メクロレタミン、マイトマイシン、ミトキサントロン、ニトロソウレア、プロカルバジン、タキソール、タキソテール、テニポシド、エトポシド、トリエチレンチオホスホラミドなどのＤＮＡ損傷剤；ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、イダルビシン、アントラサイクリン、ミトキサントロン、ブレオマイシン、プリカマイシン（ミトラマイシン）、マイトマイシンなどの抗生物質；全身的にＬ−アスパラギンを代謝し、自身のアスパラギンを合成する能力が無い細胞を取り除く、Ｌ−アスパラギナーゼなどの酵素；抗血小板剤；ナイトロジェンマスタードシクロホスファミドおよび類似体（メルファラン、クロラムブシル、ヘキサメチルメラミン、チオテパ）、アルキルニトロソウレア（カルムスチン）および類似体、ストレプトゾシン、トリアゼン（ダカルバジン）などの抗増殖／抗有糸分裂アルキル化剤；葉酸類似体（メトトレキサート）などの抗増殖／抗有糸分裂代謝拮抗物質；白金配位錯体（シスプラチン、オキサリプラチン、カルボプラチン）、プロカルバジン、ヒドロキシウレア、ミトタン、アミノグルテチミド；ホルモン、ホルモン類似体（エストロゲン、タモキシフェン、ゴセレリン、ビカルタミド、ニルタミド）、および、アロマターゼ阻害剤（レトロゾールおよびアナストロゾール）；ヘパリン、合成ヘパリン塩、および、トロンビンの他の阻害剤などの抗凝固薬；組織プラスミノーゲン活性化因子、ストレプトキナーゼ、ウロキナーゼ、アスピリン、ジピリダモール、チクロピジン、クロピドグレルなどの線維素溶解剤；抗遊走剤；抗分泌剤（ブレフェルジン）；免疫抑制剤タクロリムス、シロリムス、アザチオプリン、ミコフェノール酸；化合物（ＴＮＰ−４７０、ゲニステイン）および成長因子阻害剤（血管内皮増殖因子阻害剤および線維芽細胞増殖因子阻害剤）；アンギオテンシン受容体ブロッカー、一酸化窒素ドナー；アンチセンスオリゴヌクレオチド；トラスツズマブおよびリツキシマブなどの抗体；トレチノインなどの細胞周期阻害剤および分化誘導因子；阻害剤、トポイソメラーゼ阻害剤（ドキソルビシン、ダウノルビシン、ダクチノマイシン、エニポシド、エピルビシン、エトポシド、イダルビシン、イリノテカン、ミトキサントロン、トポテカン、イリノテカン）、コルチコステロイド（コルチゾン、デキサメタゾン、ヒドロコルチゾン、メチルプレドニゾロン、プレドニゾン、プレドニゾロン）；成長因子シグナル伝達キナーゼ阻害剤；機能障害誘導因子；コレラ毒素、リシン、シュードモナス外毒素、ボルデテラ・ペルツシスのアデニル酸シクラーゼ毒素、ジフテリア毒素、カスパーゼ活性化因子；クロマチンの群に分類され得る。
【０１３８】
更に、化学療法剤の例には、チオテパおよびシクロホスファミド（ＣＹＴＯＸＡＮ（登録商標））などのアルキル化剤；ブスルファン、インプロスルファン、ピポスルファンなどのスルホン酸アルキル；ベンゾドパ、カルボコン、メツレドパ、ウレドパなどのアジリジン；アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホラミド、トリエチレンチオホスホラミド、トリメチロールメラミンを含むエミレルミンならびにメミラメラミン；アセトゲニン（特にブラタシンおよびブラタシノン）；カンプトテシン（合成類似体トポテカンを含む）；ブリオスタチン；カリスタチン；ＣＣ−１０６５（そのアドゼレシン、カルゼレシン、ビゼレシン合成類似体を含む）；クリプトフィシン（特にクリプトフィシン１およびクリプトフィシン８）；ドラスタチン；ズオカルマイシン（合成類似体であるＫＷ−２１８９およびＣＢＩ−ＴＭＩを含む）；エロイテロビン；パンクラチスタチン；サルコジクチイン；スポンギスタチン；クロラムブシル、クロルナファジン、シクロホスファミド、エストラムスチン、イフォスファミド、メクロレタミン、メクロレタミンオキシド塩酸塩、メルファラン、ノブエンビキン、フェネステリン、プレドニムスチン、トロホスファミド、ウラシルマスタードなどのナイトロジェンマスタード；カルムスチン、クロロゾトシン、フォテムスチン、ロムスチン、ニムスチンおよびラニムスチンなどのニトロソウレア；エンジイン抗生物質（例えば、カリケアマイシン、特にカリケアマイシンγ２およびカリケアマイシンΦ１）、ジネマイシンＡを含むジネマイシン、クロドロナートなどのビスホスホナート、エスペラマイシン、ネオカルジノスタチンクロモホアおよび関連する色素タンパク質エンジイン抗生物質クロモホア、アクラシノマイシン、アクチノマイシン、オースラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン、カルミノマイシン、カルジノフィリン、クロモマイシン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、６‐ジアゾ‐５‐オキソ‐Ｌ‐ノルロイシン、ドキソルビシン（モルホリノ‐ドキソルビシン、シアノモルホリノ‐ドキソルビシン、２‐ピロリノ‐ドキソルビシンおよびデオキシドキソルビシンを含む）、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシンＣなどのマイトマイシン、マイコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポルフィロマイシン、ピューロマイシン、クエラマイシン、ロドルビシン、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシンなどの抗生物質；メトトレキサートおよび５‐フルオロウラシル（５‐ＦＵ）などの代謝拮抗剤；デモプテリン、メトトレキサート、プテロプテリン、トリメトレキサートなどの葉酸類似体；フルダラビン、６‐メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニンなどのプリン類似体；アンシタビン、アザシチジン、６−アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジンなどのピリミジン類似体；カルステロン、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトンな��のアンドロゲン；アミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタンなどの抗副腎剤；フロリン酸（ｆｒｏｌｉｎｉｃ  ａｃｉｄ）などの葉酸補充剤；トリコテセン（特にＴ−２トキシン、ベラクリンＡ、ロリジンＡ、アングイジン）；パクリタキセル（ＴＡＸＯＬ（登録商標））およびドセタキセル（ＴＡＸＯＴＥＲＥ（登録商標））などのタキソイド；シスプラチンおよびカルボプラチンなどの白金類似体；アセグラトン；アルドホスファミドグリコシド；アミノレブリン酸；エニルウラシル；アムサクリン；ヘストラブシル；ビスアントレン；エダトラキサート；デホファミン（ｄｅｆｏｆａｍｉｎｅ）；デメコルシン；ジアジコン；エルフォルムチン；エリプチニウム酢酸塩；エポチロン、エトグルシド；硝酸ガリウム；ヒドロキシウレア；レンチナン；ロイコボリン；ロニダミン；メイタンシンおよびアンサミトシンなどのメイタンシノイド；ミトグアゾン；ミトキサントロン；モピダンモール；ニトラクリン；ペントスタチン；フェナメット；ピラルビシン；ロソキサントロン；フルオロピリミジン；フォリン酸；ポドフィリン酸；２‐エチルヒドラジド；プロカルバジン；ポリサッカリド‐Ｋ（ＰＳＫ）；ラゾキサン；リゾキシン；シゾフィラン；スピロゲルマニウム；テヌアゾン酸；トリアジコン；２，２'，２''‐トリクオロトリエミルアミン；ウレタン；ビンデシン；ダカルバジン；マンノムスチン；ミトブロニトール；ミトラクトール；ピポブロマン；ガシトシン；アラビノシド（「Ａｒａ ‐ Ｃ」）；シクロホスファミド；チオペタ；クロラムブシル；ゲムシタビン（ＧＥＭＺＡＲ（登録商標））；６−チオグアニン；メルカプトプリン；メトトレキサート；ビンブラスチン；白金；エトポシド（ＶＰ−１６）；イフォスファミド；ミトキサントロン；ビンクリスチン；ビノレルビン（ＮＡＶＥＬＢＩＮＥ（登録商標））；ノバントロン；テニポシド；エダトレキサート；ダウノマイシン；アミノプテリン；ゼローダ；イバンドロネート；ＣＰＴ−１１；トポイソメラーゼ阻害剤ＲＦＳ２０００；ジフルオロメチルオルニチン（ＤＦＭＯ）；レチノイン酸などのレチノイド；カペシタビン；ＦＯＬＦＩＲＩ（フルオロウラシル、ロイコボリン、イリノテカン）；および、上記の任意の薬学的に許容可能な塩、酸または誘導体などが含まれる。
【０１３９】
また、「化学療法剤」の定義には、抗エストロゲン剤、および、選択的エストロゲン受容体モジュレーター（ＳＥＲＭ）、酵素アロマターゼの阻害剤、抗アンドロゲン剤、ならびに、腫瘍に対するホルモン作用を調節もしくは阻害するように機能する、上記の任意の薬学的に許容可能な塩、酸または誘導体などの抗ホルモン剤が含まれる。
【０１４０】
抗エストロゲン剤およびＳＥＲＭの例には、例えば、タモキシフェン（ＮＯＬＶＡＤＥＸ（登録商標）を含む）、ラロキシフェン、ドロロキシフェン、４‐ヒドロキシタモキシフェン、トリオキシフェン、ケオキシフェン、ＬＹ１１７０１８、オナプリストンおよびトレミフェン（ＦＡＲＥＳＴＯＮ（登録商標））が含まれる。
【０１４１】
酵素アロマターゼの阻害剤は、副腎におけるエストロゲン生成を調節する。例には、４（５）‐イミダゾール、アミノグルテチミド、酢酸メゲストロール（ＭＥＧＡＣＥ（登録商標））、エキセメスタン、ホルメスタン、ファドロゾール、ボロゾール（ＲＩＶＩＳＯＲ（登録商標））、レトロゾール（ＦＥＭＡＲＡ（登録商標））、アナストロゾール（ＡＲＩＭＩＤＥＸ（登録商標））が含まれる。
【０１４２】
抗アンドロゲン剤の例には、フルタミド、ニルタミド、ビカルタミド、ロイプロリド、ゴセレリンが含まれる。
【０１４３】
また、化学療法剤の例には、これらに限定されないが、レチノイド酸およびその誘導体、２‐メトキシエストラジオール、アンギオスタチン（登録商標）、エンドスタチン（登録商標）、スラミン、スクアラミン、メタロプロテイナーゼ‐１の組織阻害剤、メタロプロテイナーゼ‐２の組織阻害剤、プラスミノーゲン活性化因子阻害剤‐１、プラスミノーゲン活性化因子阻害剤‐２、軟骨由来阻害剤、パクリタキセル（ｎａｂ−パクリタキセル）、血小板第４因子、硫酸プロタミン（クルペイン）、硫酸化キチン誘導体（ズワイガニの殻から調製）、硫酸化多糖ペプチドグリカン複合体（ｓｐ−ｐｇ）、スタウロスポリン、プロリン類似体（Ｌ−アゼチジン−２−カルボン酸（ＬＡＣＡ））を含む基質代謝のモジュレーター、シスヒドロキシプロリン、ｄ，Ｌ‐３，４‐デヒドロプロリン、チアプロリン、α，α'‐ジピリジル、β‐アミノプロピオニトリルフマル酸塩、４‐プロピル‐５‐（４‐ピリジニル）‐２（３ｈ）‐オキサゾロン、メトトレキサート、ミトキサントロン、ヘパリン、インターフェロン、２マクログロブリン血清、ニワトリのメタロプロテイナーゼ‐３阻害剤（ＣｈＩＭＰ−３）、キモスタチン、β‐シクロデキストリンテトラデカ硫酸塩、エポネマイシン、フマギリン、金チオリンゴ酸ナトリウム、ｄ−ペニシラミン、β‐１‐アンチコラゲナーゼ血清、α‐２‐抗プラスミン、ビスアントレン、ロベンザリット二ナトリウム、ｎ‐２‐カルボキシフェニル‐４‐クロロアントラニル酸二ナトリウムまたは（「ＣＣＡ」）、サリドマイド、抗血管新生ステロイド、カルボキシアミノイミダゾール、ＢＢ−９４などのメタロプロテイナーゼ阻害剤を含む抗血管新生剤が含まれる。他の抗血管新生剤には、抗体、好ましくは、これらの血管新生成長因子に対するモノクローナル抗体（β−ＦＧＦ、α−ＦＧＦ、ＦＧＦ−５、ＶＥＧＦアイソフォーム、ＶＥＧＦ−Ｃ、ＨＧＦ／ＳＦ、Ａｎｇ−１／Ａｎｇ−２）が含まれる。
【０１４４】
また、化学療法剤の例には、これらに限定されないが、β‐アミノプロピオニトリル（ＢＡＰＮ）などの化合物、ならびに、参照によって本明細書に組み込まれる、コラーゲンの異常堆積に関連する疾病および病態の治療におけるリシルオキシダーゼの阻害剤およびその使用に関連する、米国特許第４，９６５，２８８号（Ｐａｌｆｒｅｙｍａｎ，ｅｔ  ａｌ．）、および、様々な病理的線維性状態の治療のためにＬＯＸを阻害する化合物に関連する、米国特許第４，９９７，８５４号（Ｋａｇａｎ  ｅｔ  ａｌ．）に開示される化合物を含む抗線維化剤が含まれる。更に、例示的な阻害剤が、参照によって本明細書に組み込まれる、２‐イソブチル‐３‐フルオロ‐、クロロ‐、または、ブロモ‐アリルアミンなどの化合物に関連する米国特許第４，９４３，５９３号（Ｐａｌｆｒｅｙｍａｎ  ｅｔ  ａｌ）、２‐（１‐ナフチルオキシメチル）‐３‐フルオロアリルアミンに関連する米国特許第５，０２１，４５６号（Ｐａｌｆｒｅｙｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．）、第５，０５９，７１４号（Ｐａｌｆｒｅｙｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．），第５，１２０，７６４号（Ｍｃｃａｒｔｈｙ  ｅｔ  ａｌ．）、第５，１８２，２９７号（Ｐａｌｆｒｅｙｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．）、第５，２５２，６０８号（Ｐａｌｆｒｅｙｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．）、米国特許出願公開第２００４／０２４８８７１（Ｆａｒｊａｎｅｌ  ｅｔ  ａｌ．）号に記載されている。
【０１４５】
また、例示的な抗線維化剤には、リシルオキシダーゼの活性部位のカルボニル基と反応する第一級アミン、より具体的には、カルボニルとの結合後に、共鳴によって安定化される産物を生成するもの、すなわち、エミレンマミン、ヒドラジン、フェニルヒドラジン、および、それらの誘導体；セミカルバジドおよび尿素誘導体；ＢＡＰＮまたは２‐ニトロエチルアミンなどのアミノニトリル；２‐ブロモ‐エチルアミン、２‐クロロエチルアミン、２‐トリフルオロエチルアミン、３‐ブロモプロピルアミン、ｐ‐ハロベンジルアミンなどの不飽和または飽和ハロアミン；セレノホモシステインラクトンなどの第一級アミンなどが含まれる。
【０１４６】
他の抗線維化剤は、細胞を貫通する、または、貫通しない銅キレート剤である。例示的な化合物には、リシルオキシダーゼによるリシル残基およびヒドロキシリシル残基の酸化的脱アミノ化で生じるアルデヒド誘導体を遮断する間接的阻害剤を含む。例には、チオールアミン、特に、ｄ−ペニシラミン、および、２‐アミノ‐５‐メルカプト‐５‐メチルヘキサン酸、Ｄ‐２‐アミノ‐３‐メチル‐３‐（（２‐アセトアミドエチル）ジチオ）酪酸、ｐ‐２‐アミノ‐３‐メチル‐３‐（（２‐アミノエチル）ジチオ）酪酸、ナトリウム‐４‐（（ｐ‐１‐ジメチル‐２‐アミノ‐２‐カルボキシエチル）ジチオ）硫化ブタン、２‐アセトアミドエチル‐２‐アセトアミドエタンチオールスルファネート、ナトリウム‐４‐メルカプトブタンスルフィナート三水和物など、その類似体が含まれる。
【０１４７】
また、化学療法剤の例には、これらに限定されないが、患者の治療に好適な治療用抗体を含む、免疫療法剤も含まれる。治療用抗体の一部の例には、シムツズマブ、アバゴボマブ、アデカツムマブ、アフツズマブ、アレムツズマブ、アルツモマブ、アマツキシマブ、アナツモマブ、アルシツモマブ、バビツキシマブ、ベクトモマブ、ベバシズマブ、ビバツズマブ、ブリナツモマブ、ブレントキシマブ、カンツズマブ、カツマキソマブ、セツキシマブ、シタツズマブ、シクツムマブ、クリバツズマブ、コナツムマブ、ダラツマブ、ドロジツマブ、ドリゴツマブ、デュシギツマブ、デツモマブ、ダセツズマブ、ダロツズマブ、エクロメキシマブ、エロツズマブ、エンシツキシマブ、エルツマキソマブ、エタラシズマブ、ファレツズマブ、フィクラツズマブ、フィギツムマブ、フランボツマブ、フツキシマブ、ガニツマブ、ゲムツズマブ、ギレンツキシマブ、グレンバツムマブ、イブリツモマブ、イゴボマブ、イマツズマブ、インダツキシマブ、イノツズマブ、インテツムマブ、イピリムマブ、イラツマブ、ラベツズマブ、レキサツムマブ、リンツズマブ、ロルボツズマブ、ルカツムマブ、マパツムマブ、マツズマブ、ミラツズマブ、ミンレツママブ、ミツモマブ、モキセツモマブ、ナルナツマブ、ナプツモマブ、ネチツムマブ、ニモツズマブ、ノフェツモマブ、オカラツズマブ、オフアツムマブ、オララツマブ、オナツズマブ、オポルツズマブ、オレゴボマブ、パニツムマブ、パサツズマブ、パトリツマブ、ペムツモマブ、ペルツズマブ、ピンツモマブ、プリツムマブ、ラコツモマブ、ラドレツマブ、リロツムマブ、リツキシマブ、ロバツムマブ、サツモマブ、シブロツズマブ、シルツキシマブ、ソリトマブ、タカツズマブ、タプリツモマブ、テナツモマブ、テプロツムマブ、チガツズマブ、トシツモマブ、トラスツズマブ、ツコツズマブ、ウブリツキシマブ、ベルツズマブ、ボルセツズマブ、ボツムマブ、ザルツムマブ、ＣＣ４９、３Ｆ８が含まれる。辺縁帯リンパ腫、ＷＭ、ＣＬＬ、および、小リンパ球性リンパ腫を含む緩慢性Ｂ細胞癌を治療するためにリツキシマブを使用できる。リツキシマブおよび化学療法剤の組み合わせは、特に効果的である。
【０１４８】
例示的な治療用抗体は更に、インジウム‐１１１、イットリウム‐９０、または、ヨウ素‐１３１などの放射性同位体粒子で標識され得る、または、それと組み合わされ得る。
【０１４９】
一実施形態において、追加の治療薬は、ナイトロジェンマスタードアルキル化剤である。ナイトロジェンマスタードアルキル化剤の非限定的な例には、クロラムブシルが含まれる。
【０１５０】
一実施形態において、本明細書において説明される化合物および組成物は、１または複数の追加の治療薬と共に使用され得る、または、それらと組み合わされ得る。１または複数の治療剤には、これらに限定されないが、Ａｂｌの阻害剤、活性化ＣＤＣキナーゼ（ＡＣＫ）、アデノシンＡ２Ｂ受容体（Ａ２Ｂ）、アポトーシスシグナル調節キナーゼ（ＡＳＫ）、オーロアキナーゼ、ブルトンのチロシンキナーゼ（ＢＴＫ）、ＢＲＤ４などのＢＥＴ−ブロモドメイン（ＢＲＤ）、ｃ−Ｋｉｔ、ｃ−Ｍｅｔ、ＣＤＫ活性化キナーゼ（ＣＡＫ）、カルモジュリン依存性タンパク質キナーゼ（ＣａＭＫ）、サイクリン依存性キナーゼ（ＣＤＫ）、カゼインキナーゼ（ＣＫ）、ジスコイジンドメイン受容体（ＤＤＲ）、上皮増殖因子受容体（ＥＧＦＲ）、フォーカルアドヒージョンキナーゼ（ＦＡＫ）、Ｆｌｔ−３、ＦＹＮ、グリコーゲンシンターゼキナーゼ（ＧＳＫ）、ＨＣＫ、ヒストンデアセチラーゼ（ＨＤＡＣ）、ＩＫＫβεなどのＩＫＫ、ＩＤＨ１などのイソクエン酸デヒドロゲナーゼ（ＩＤＨ）、ヤーヌスキナーゼ（ＪＡＫ）、ＫＤＲ、リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ（ＬＣＫ）、リシルオキシダーゼタンパク質、リシルオキシダーゼ様タンパク質（ＬＯＸＬ）、ＬＹＮ、マトリクスメタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）、ＭＥＫ、マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ（ＭＡＰＫ）、ＮＥＫ９、ＮＰＭ−ＡＬＫ、ｐ３８キナーゼ、血小板由来増殖因子（ＰＤＧＦ）、ホスホリラーゼキナーゼ（ＰＫ）、ポロ様キナーゼ（ＰＬＫ）、ホスファチジルイノシトール３−キナーゼ（ＰＩ３Ｋ）、タンパク質キナーゼＡ、Ｂおよび／またはＣなどのタンパク質キナーゼ（ＰＫ）、ＰＹＫ、脾臓チロシンキナーゼ（ＳＹＫ）、セリン／スレオニンキナーゼＴＰＬ２、セリン／スレオニンキナーゼＳＴＫ、シグナル伝達兼転写活性化因子（ＳＴＡＴ）、ＳＲＣ、ＴＢＫ１などのセリン／スレオニンタンパク質キナーゼ（ＴＢＫ）、ＴＩＥ、チロシンキナーゼ（ＴＫ）、血管内皮増殖因子受容体（ＶＥＧＦＲ）、ＹＥＳ、またはそれらの任意の組み合わせが含まれる。
【０１５１】
ＡＳＫ阻害剤にはＡＳＫ１阻害剤が含まれる。ＡＳＫ１阻害剤の例には、これらに限定されないが、ＷＯ  ２０１１／００８７０９  （Ｇｉｌｅａｄ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）およびＷＯ  ２０１３／１１２７４１  （Ｇｉｌｅａｄ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）において説明されるものが含まれる。
【０１５２】
ＢＴＫ阻害剤の例には、これに限定されないが、イブルチニブ、ＨＭ７１２２４、ＯＮＯ−４０５９およびＣＣ−２９２が含まれる。
【０１５３】
ＤＤＲ阻害剤には、ＤＤＲ１および／またはＤＤＲ２の阻害剤が含まれる。ＤＤＲ阻害剤の例には、これらに限定されないが、ＷＯ  ２０１４／０４７６２４  （Ｇｉｌｅａｄ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）、ＵＳ  ２００９／０１４２３４５  （Ｔａｋｅｄａ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ）、ＵＳ  ２０１１／０２８７０１１  （Ｏｎｃｏｍｅｄ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ）、ＷＯ  ２０１３／０２７８０２  （Ｃｈｕｇａｉ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ）およびＷＯ  ２０１３／０３４９３３  （Ｉｍｐｅｒｉａｌ  Ｉｎｎｏｖａｔｉｏｎｓ）において開示されるものが含まれる。
【０１５４】
ＨＤＡＣ阻害剤の例には、これに限定されないが、プラシノスタットおよびパノビノスタットが含まれる。
【０１５５】
ＪＡＫ阻害剤は、ＪＡＫ１、ＪＡＫ２、および／または、ＪＡＫ３を阻害する。ＪＡＫ阻害剤の例には、これらに限定されないが、フィルゴチニブ、ルキソリチニブ、フェドラチニブ、トファシチニブ、バリシチニブ、レスタウルチニブ、パクリチニブ、ＸＬ０１９、ＡＺＤ１４８０、ＩＮＣＢ０３９１１０、ＬＹ２７８４５４４、ＢＭＳ９１１５４３およびＮＳ０１８が含まれる。
【０１５６】
ＬＯＸＬ阻害剤には、ＬＯＸＬ１、ＬＯＸＬ２、ＬＯＸＬ３、ＬＯＸＬ４、および／または、ＬＯＸＬ５の阻害剤が含まれる。ＬＯＸＬ阻害剤の例には、これに限定されないが、ＷＯ  ２００９／０１７８３３  （Ａｒｒｅｓｔｏ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）において説明される抗体が含まれる。 
【０１５７】
ＬＯＸＬ２阻害剤の例には、これらに限定されないが、ＷＯ  ２００９／０１７８３３  （Ａｒｒｅｓｔｏ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ），  ＷＯ  ２００９／０３５７９１  （Ａｒｒｅｓｔｏ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）およびＷＯ  ２０１１／０９７５１３  （Ｇｉｌｅａｄ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃｓ）において説明される抗体が含まれる。
【０１５８】
ＭＭＰ阻害剤には、ＭＭＰ１〜１０の阻害剤が含まれる。ＭＭＰ９阻害剤の例には、これらに限定されないが、マリマスタット（ＢＢ−２５１６）、シペマスタット（Ｒｏ  ３２−３５５５）、および、ＷＯ  ２０１２／０２７７２１  （Ｇｉｌｅａｄ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃｓ）において説明されるものが含まれる。
【０１５９】
ＰＩ３Ｋ阻害剤には、ＰＩ３Ｋγ、ＰＩ３Ｋδ、ＰＩ３Ｋβ、ＰＩ３Ｋα、および／または、ｐａｎ−ＰＩ３Ｋの阻害剤が含まれる。ＰＩ３Ｋ阻害剤の例には、これらに限定されないが、ウォルトマンニン、ＢＫＭ１２０、ＣＨ５１３２７９９、ＸＬ７５６およびＧＤＣ−０９８０が含まれる。 
【０１６０】
ＰＩ３Ｋγ阻害剤の例には、これらに限定されないが、ＺＳＴＫ４７４、ＡＳ２５２４２４、ＬＹ２９４００２およびＴＧ１００１１５が含まれる。
【０１６１】
ＰＩ３Ｋδ阻害剤の例には、これらに限定されないが、ＰＩ３Ｋ  ＩＩ、ＴＧＲ−１２０２、ＡＭＧ−３１９、ＧＳＫ２２６９５５７、Ｘ−３３９、Ｘ−４１４、ＲＰ５０９０、ＫＡＲ４１４１、ＸＬ４９９、ＯＸＹ１１１Ａ、ＩＰＩ−１４５、ＩＰＩ−４４３、および、ＷＯ  ２００５／１１３５５６  （ＩＣＯＳ）、ＷＯ  ２０１３／０５２６９９  （Ｇｉｌｅａｄ  Ｃａｌｉｓｔｏｇａ）、ＷＯ  ２０１３／１１６５６２  （Ｇｉｌｅａｄ  Ｃａｌｉｓｔｏｇａ）、ＷＯ  ２０１４／１００７６５  （Ｇｉｌｅａｄ  Ｃａｌｉｓｔｏｇａ）、ＷＯ  ２０１４／１００７６７  （Ｇｉｌｅａｄ  Ｃａｌｉｓｔｏｇａ）、ＷＯ  ２０１４／２０１４０９  （Ｇｉｌｅａｄ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）に記載される化合物が含まれる。
【０１６２】
ＰＩ３Ｋβ阻害剤の例には、これらに限定されないが、ＧＳＫ２６３６７７１、ＢＡＹ  １０８２４３９１およびＴＧＸ２２１が含まれる。
【０１６３】
ＰＩ３Ｋα阻害剤の例には、これらに限定されないが、ブパルリシブ、ＢＡＹ  ８０−６９４６、ＢＹＬ７１９、ＰＸ−８６６、ＲＧ７６０４、ＭＬＮ１１１７、ＷＸ−０３７、ＡＥＺＡ−１２９およびＰＡ７９９が含まれる。
【０１６４】
ｐａｎ−ＰＩ３Ｋ阻害剤の例には、これらに限定されなが、ＬＹ２９４００２、ＢＥＺ２３５、ＸＬ１４７（ＳＡＲ２４５４０８）およびＧＤＣ−０９４１が含まれる。
【０１６５】
ＳＹＫ阻害剤の例には、これらに限定されないが、タマチニブ（Ｒ４０６）、フォスタマチニブ（Ｒ７８８）、ＰＲＴ０６２６０７、ＢＡＹ−６１−３６０６、ＮＶＰ−ＱＡＢ  ２０５  ＡＡ、Ｒ１１２、Ｒ３４３、および、米国特許第８，４５０，３２１号（Ｇｉｌｅａｄ  Ｃｏｎｎｅｃｔｉｃｕｔ）に記載のものが含まれる。
【０１６６】
ＴＫＩは、上皮増殖因子受容体（ＥＧＦＲ）と、線維芽細胞増殖因子（ＦＧＦ）、血小板由来増殖因子（ＰＤＧＦ）および血管内皮増殖因子（ＶＥＧＦ）の受容体とを標的とし得る。ＥＧＦＲを標的とするＴＫＩの例には、これらに限定されないが、ゲフィチニブおよびエルロチニブが含まれる。スニチニブは、ＦＧＦ、ＰＤＧＦおよびＶＥＧＦの受容体を標的とするＴＫＩの非限定的な例である。
【０１６７】
本開示の抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、いくつかの実施形態において、免疫チェックポイント阻害剤と共に使用できる。免疫チェックポイントは、シグナルを大きくする（共刺激分子）、または、シグナルを小さくする（共抑制分子）、免疫系における分子である。多くの癌は、共抑制分子に対してはアゴニスト、または、共刺激分子に対してはアンタゴニストを通して、Ｔ細胞シグナルを阻害することによって、免疫系から自身を保護している。免疫チェックポイントのアゴニストまたはアンタゴニストは、細胞によるそのような保護機序を停止させることに役立つことができる。免疫チェックポイントのアゴニストまたはアンタゴニストは、ＰＤ−１、ＣＴＬＡ−４、ＬＡＧ−３  （ＣＤ２２３としても知られている）、ＣＤ２８、ＣＤ１２２、４−１ＢＢ  （ＣＤ１３７としても知られている）、ＴＩＭ３、ＯＸ−４０／ＯＸ４０Ｌ、ＣＤ４０／ＣＤ４０Ｌ、ＬＩＧＨＴ、ＩＣＯＳ／ＩＣＯＳＬ、ＧＩＴＲ／ＧＩＴＲＬ、ＴＩＧＩＴ、ＣＤ２７、ＶＩＳＴＡ、Ｂ７Ｈ３、Ｂ７Ｈ４、ＨＥＶＭまたはＢＴＬＡ  （ＣＤ２７２としても知られている）などのチェックポイント分子のうちのいずれかの１または複数を標的とし得る。
【０１６８】
プログラムＴ細胞死１（ＰＤ−１）は、Ｔ細胞の表面に見られる膜貫通タンパク質であり、プログラムＴ細胞死リガンド１（ＰＤ−Ｌ１）または腫瘍細胞に結合したとき、Ｔ細胞活性の抑制、または、Ｔ細胞媒介細胞毒性の減少をもたらす。したがって、ＰＤ−１およびＰＤ−Ｌ１は、免疫ダウンレギュレータ、すなわち、免疫チェックポイントの「オフスイッチ」である。ＰＤ−１阻害剤の例には、これらに限定されないが、ニボルマブ、（Ｏｐｄｉｖｏ）（ＢＭＳ−９３６５５８）、ペムブロリズマブ（Ｋｅｙｔｒｕｄａ）、ピジリズマブ、ＡＭＰ−２２４、ＭＥＤＩ０６８０  （ＡＭＰ−５１４）、ＰＤＲ００１、ＭＰＤＬ３２８０Ａ、ＭＥＤＩ４７３６、ＢＭＳ−９３６５５９およびＭＳＢ００１０７１８Ｃが含まれる。
【０１６９】
ＣＴＬＡ−４は、免疫系をダウンレギュレートするタンパク質受容体である。ＣＴＬＡ−４阻害剤の非限定的な例には、イピリムマブ（Ｙｅｒｖｏｙ（登録商標））（ＢＭＳ−７３４０１６、ＭＤＸ−０１０、ＭＤＸ−１０１としても知られる）、および、トレメリムマブ（以前はチシリムマブ、ＣＰ−６７５，２０６）が含まれる。 
【０１７０】
リンパ球活性遺伝子３（ＬＡＧ−３）は、制御性Ｔ細胞への作用によって、および、ＣＤ８＋Ｔ細胞に対する直接作用によって、免疫反応を抑制するように機能する、細胞表面上の免疫チェックポイント受容体である。ＬＡＧ−３阻害剤には、これらに限定されないが、ＬＡＧ５２５およびＢＭＳ−９８６０１６が含まれる。
【０１７１】
ＣＤ２８は、ほぼすべてのヒトＣＤ４＋Ｔ細胞、および、すべてのＣＤ８  Ｔ細胞のうち約半分で恒常的に発現される。ＣＤ２８はＴ細胞の増殖を促す。ＣＤ２８阻害剤の非限定的な例には、ＴＧＮ１４１２が含まれる。 
【０１７２】
ＣＤ１２２は、ＣＤ８＋エフェクターＴ細胞の増殖を増加させる。非限定的な例には、ＮＫＴＲ−２１４が含まれる。 
【０１７３】
４−１ＢＢ（ＣＤ１３７としても知られている）は、Ｔ細胞の増殖に関与する。また、ＣＤ１３７媒介シグナリングは、Ｔ細胞、特に、ＣＤ８＋Ｔ細胞を、活性化誘導細胞死から保護することが知られている。ＰＦ−０５０８２５６６、ウレルマブ（ＢＭＳ−６６３５１３）およびリポカリンは、ＣＤ１３７阻害剤の例である。
【０１７４】
上記の併用療法のいずれかについて、抗ＰＤ−Ｌ１抗体を、その他の抗癌剤と同時に、または、別個に投与することができる。別個に投与するとき、抗ＰＤ−Ｌ１抗体を、その他の抗癌剤の前または後に投与することができる。 
【０１７５】
［感染の治療］
実験例において示されるように、本開示の抗体は、感染の治療に有用となり得る免疫反応を活性化できる。
【０１７６】
感染とは、病原体による、生物の体組織への侵入、それらの増殖、ならびに、これらの病原体およびそれらが生成する毒素に対する、宿主組織の反応である。感染は、ウイルス、ウイロイド、プリオン、細菌、寄生性回虫や蟯虫などの線虫、マダニ、ダニ、ノミ、シラミなどの節足動物、白癬などの真菌、サナダムシや他の蠕虫などの他の大寄生虫、などの感染病原体によって引き起こされ得る。一態様において、感染病原体は、グラム陰性菌などの細菌である。一態様において、感染病原体は、ＤＮＡウイルス、ＲＮＡウイルス、および、逆転写ウイルスなどのウイルスである。ウイルスの非限定的な例には、アデノウイルス、コクサッキーウイルス、エプスタイン・バール・ウイルス、Ａ型肝炎ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、単純ヘルペスウイルス１型、単純ヘルペスウイルス２型、サイトメガロウイルス、ヒトヘルペスウイルス８型、ＨＩＶ、インフルエンザウイルス、麻疹ウイルス、ムンプスウイルス、ヒトパピローマウイルス、パラインフルエンザウイルス、ポリオウイルス、狂犬病ウイルス、ＲＳウイルス、風疹ウイルス、水痘・帯状疱疹ウイルスが含まれる。
【０１７７】
本開示の抗体はまた、微生物および免疫細胞を標的にして微生物の除去をもたらすことにより、微生物によって引き起こされる感染症を治療すること、または、微生物を殺菌することに使用できる。一態様において、微生物には、ＲＮＡウイルスおよびＤＮＡウイルスを含むウイルス、グラム陽性細菌、グラム陰性菌、原生動物または真菌が含まれる。感染症および関連する微生物の非限定的な例は、以下の表４に提供されている。
［表４  感染症および関連する微生物感染源］
【表５】
2020180135.tif 000006
【表６】
2020180135.tif 000007
【表７】
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【表８】
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【表９】
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【表１０】
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【表１１】
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【表１２】
2020180135.tif 000013
【０１７８】
特定の患者に対する具体的な投与量および治療計画は、特定の抗体、使用される変異型または誘導体、患者の年齢、体重、一般的健康状態、性別、食生活、投与時刻、排泄率、併用薬剤、治療対象である特定の疾病の重症度を含む様々な要素に依存するであろう。医療従事者による、そのような要素の判断は、当分野における一般的な能力の範囲内である。また、その量は、治療される個々の患者、投与経路、製剤の種類、使用される化合物の特徴、疾病の重症度、および、所期の効果に依存するであろう。使用される量は、本技術分野において既知の薬学的および薬物動態学な原理によって決定できる。
【０１７９】
抗体の投与方法には、これらに限定されないが、皮内、筋肉内、腹腔内、静脈内、皮下、鼻腔内、硬膜外、および、経口の経路が含まれる。抗原結合ポリペプチドまたは組成物は、都合の良い経路によって、例えば、注入またはボーラス注射によって、上皮または粘膜内壁（例えば、口腔粘膜、直腸および腸の粘膜など）を通した吸収によって、  投与され得て、他の生物学的活性剤と共に投与され得る。したがって、開示の抗原結合ポリペプチドを含む医薬組成物は、経口、経直腸、非経口、嚢内、膣内、腹腔内、局所的（粉末、軟膏、注入薬または経皮パッチとして）、口腔内に、または、口腔もしくは鼻腔スプレーとして投与され得る。
【０１８０】
本明細書において使用される「非経口」という語句は、静脈内、筋肉内、腹腔内、胸骨内、皮下、関節内の注射および注入を含む投与方式を指す。
【０１８１】
投与は全身投与であっても、または、局所的投与であってもよい。加えて、脳室内および髄腔内注射を含む好適な経路によって中枢神経系に本開示の抗体を導入することが望ましいことがあり得る。脳室内注射は、例えば、オマヤリザーバーなどのリザーバーに取り付けられた脳室内カテーテルによって容易になり得る。また、例えば吸入器または噴霧器、および、エアロゾル剤の製剤の使用によって、肺投与を利用できる。
【０１８２】
本開示の抗体ポリペプチドまたは組成物を、治療を必要とする領域に局所的に投与することが望ましいことがあり得る。これは、例えば、これらに限定されないが、手術中の局所注入、局所適用（例えば、手術後の創傷包帯と組み合わせる）、注射によって、カテーテルによって、座薬によって、または、インプラントによって達成され得て、上記インプラントは、シアラスティック（ｓｉａｌａｓｔｉｃ）膜などの膜または繊維を含む、多孔性、非多孔性、または、ゲル状物質である。好ましくは、抗体を含む、本開示のタンパク質を投与するとき、タンパク質が吸収されない材料を使用するように注意する必要がある。
【０１８３】
別の実施形態において、抗体または組成物は、小胞、特に、リポソームにおいて輸送できる（Ｌａｎｇｅｒ，  １９９０，  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４９：１５２７−１５３３；  Ｔｒｅａｔ  ｅｔ  ａｌ．，  ｉｎ  Ｌｉｐｏｓｏｍｅｓ  ｉｎ  ｔｈｅ  Ｔｈｅｒａｐｙ  ｏｆ  Ｉｎｆｅｃｔｉｏｕｓ  Ｄｉｓｅａｓｅ  ａｎｄ  Ｃａｎｃｅｒ，  Ｌｏｐｅｚ−Ｂｅｒｅｓｔｅｉｎ  ａｎｄ  Ｆｉｄｌｅｒ  （ｅｄｓ．），  Ｌｉｓｓ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，  ｐｐ．  ３５３−３６５  （１９８９）；  Ｌｏｐｅｚ−Ｂｅｒｅｓｔｅｉｎ，  ｉｂｉｄ．，  ｐｐ．  ３１７−３２７；  ｓｅｅ  ｇｅｎｅｒａｌｌｙ  ｉｂｉｄ．を参照されたい）。
【０１８４】
更に別の実施形態において、抗原結合ポリペプチドまたは組成物は、制御された放出システムにおいて輸送できる。一実施形態において、ポンプが使用され得る（Ｓｅｆｔｏｎ，  １９８７，  ＣＲＣ  Ｃｒｉｔ．  Ｒｅｆ．  Ｂｉｏｍｅｄ．  Ｅｎｇ．  １４：２０１；  Ｂｕｃｈｗａｌｄ  ｅｔ  ａｌ．，  １９８０，  Ｓｕｒｇｅｒｙ  ８８：５０７；  Ｓａｕｄｅｋ  ｅｔ  ａｌ．，  １９８９，  Ｎ．  Ｅｎｇｌ．  Ｊ．  Ｍｅｄ．  ３２１：５７４を参照されたい）。別の実施形態において、高分子材料を使用できる（Ｍｅｄｉｃａｌ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ  ｏｆ  Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  Ｒｅｌｅａｓｅ，  Ｌａｎｇｅｒ  ａｎｄ  Ｗｉｓｅ  （ｅｄｓ．），  ＣＲＣ  Ｐｒｅｓ．，  Ｂｏｃａ  Ｒａｔｏｎ，  Ｆｌａ．  （１９７４）；  Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  Ｄｒｕｇ  Ｂｉｏａｖａｉｌａｂｉｌｉｔｙ，  Ｄｒｕｇ  Ｐｒｏｄｕｃｔ  Ｄｅｓｉｇｎ  ａｎｄ  Ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ，  Ｓｍｏｌｅｎ  ａｎｄ  Ｂａｌｌ  （ｅｄｓ．），  Ｗｉｌｅｙ，  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ  （１９８４）；  Ｒａｎｇｅｒ  ａｎｄ  Ｐｅｐｐａｓ，  Ｊ．，  １９８３，  Ｍａｃｒｏｍｏｌ．  Ｓｃｉ．  Ｒｅｖ．  Ｍａｃｒｏｍｏｌ．  Ｃｈｅｍ．  ２３：６１；  ｓｅｅ  ａｌｓｏ  Ｌｅｖｙ  ｅｔ  ａｌ．，  １９８５，  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２２８：１９０；  Ｄｕｒｉｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，  １９８９，  Ａｎｎ．  Ｎｅｕｒｏｌ．  ２５：３５１；  Ｈｏｗａｒｄ  ｅｔ  ａｌ．，  １９８９，  Ｊ．  Ｎｅｕｒｏｓｕｒｇ．  ７１：１０５を参照されたい）。更に別の実施形態において、制御された放出システムは、治療対象、すなわち、脳の付近に配置でき、したがって、全身投与の場合の数分の１のみが必要になる（例えば、Ｇｏｏｄｓｏｎ，  ｉｎ  Ｍｅｄｉｃａｌ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ  ｏｆ  Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  Ｒｅｌｅａｓｅ，  ｓｕｐｒａ，  ｖｏｌ．  ２，  ｐｐ．  １１５−１３８  （１９８４）を参照されたい）。他の制御された放出システムは、Ｌａｎｇｅｒ  （１９９０，  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４９：１５２７−１５３３）のレビューにおいて説明されている。
【０１８５】
本開示の組成物が、核酸、または、タンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む、具体的な実施形態において、核酸は、それを適切な核酸発現ベクターの一部として構築して、それが細胞内になるように投与することによって（例えば、レトロウイルスベクターの使用によって（米国特許第4,980,286号を参照））、または、直接注射によって、または、微粒子ボンバードメントの使用によって（例えば、遺伝子銃、Ｂｉｏｌｉｓｔｉｃ、Ｄｕｐｏｎｔ）、または、脂質もしくは細胞表面受容体もしくはトランスフェクト剤でコーティングすることによって、または、核に入ることが知られているホメオボックス様ペプチドに結合させて投与することなどによって（例えば、Ｊｏｌｉｏｔ  ｅｔ  ａｌ．，  １９９１，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ  ８８：１８６４−１８６８を参照されたい）、コードされたタンパク質の発現を促進するように核酸をインビボで投与できる。代替的に、核酸は、細胞内に導入され得て、相同組換えによって、発現するように宿主細胞ＤＮＡ内に組み込まれ得る。
【０１８６】
炎症性、免疫性もしくは悪性の疾病、障害または病態の、治療、抑制および予防に効果的となるであろう、本開示の抗体の量は、標準的な臨床的技法によって決定できる。加えて、最適な投与量範囲を同定することに役立てるべく、インビトロアッセイが任意で利用され得る。製剤において利用される厳密な用量は、投与経路、ならびに、疾病、障害または病態の重症度に依存し、医療従事者の判断および各患者の状況に従って決定されるべきである。有効用量は、インビトロまたは動物モデル試験システムから得られる用量反応曲線から推定され得る。 
【０１８７】
一般的な提案として、患者に投与される、本開示の抗原結合ポリペプチドの投与量は、典型的には、患者の体重に対して０．１ｍｇ／ｋｇから１００ｍｇ／ｋｇの間、患者の体重に対して０．１ｍｇ／ｋｇから２０ｍｇ／ｋｇの間、または、患者の体重に対して１ｍｇ／ｋｇから１０ｍｇ／ｋｇの間である。一般的に、ヒト抗体は、他の種に由来する抗体と比べて、ヒトの身体内における半減期が長い。これは、外来ポリペプチドに対する免疫反応に起因する。したがって、ヒト抗体の投与量を少なくすること、および、投与の頻度を少なくすることが、しばしば可能である。更に、例えば脂質化などの改変によって、抗体の（例えば脳への）摂取および組織透過性を向上させることによって、本開示の抗体の投与の投与量および頻度が減少し得る。
【０１８８】
本開示の抗体、変異型または誘導体の投与を含む、感染性または悪性の疾病、病態または障害を治療するための方法は、典型的には、インビトロで試験され、次に、ヒトに使用される前に、所望される治療または予防活性について、許容される動物モデルにおいてインビボで試験される。トランスジェニック動物を含む好適な動物モデルは当業者にとって既知である。例えば、本明細書において説明される、抗原結合ポリペプチドの治療有用性を示すインビトロアッセイは、細胞株または患者の組織試料に対する、抗原結合ポリペプチドの作用を含む。細胞株および／または組織試料に対する抗原結合ポリペプチドの作用は、本明細書の別の箇所に開示されているアッセイなど、当業者に知られている技法を利用して決定できる。本開示によれば、特定の抗原結合ポリペプチドの投与が適応されるかどうかを決定するために使用できるインビトロアッセイは、インビトロ細胞培養アッセイを含み、このアッセイでは、患者の組織試料を培地において増殖させ、化合物に曝し、または、そうでない場合、化合物を投与し、組織試料に対する当該化合物の作用を観察する。
【０１８９】
例えば、リポソーム内におけるカプセル化、微粒子、マイクロカプセル、化合物を発現可能な組換え細胞、受容体媒介エンドサイトーシス（例えば、Ｗｕ  ａｎｄ  Ｗｕ，  １９８７，  Ｊ．  Ｂｉｏｌ．  Ｃｈｅｍ．  ２６２：４４２９−４４３２を参照）、レトロウイルスもしくは他のベクターの一部としての核酸の構築など、様々な輸送システムが知られており、これらは、本開示の抗体、または、本開示の抗体をコードするポリヌクレオチドを投与するために使用できる。
【０１９０】
［診断方法］
ＰＤ−Ｌ１の過剰発現は、特定の腫瘍試料において観察され、ＰＤ−Ｌ１過剰発現細胞を有する患者は、本開示の抗ＰＤ−Ｌ１抗体を用いる治療に反応する可能性がある。従って、本開示の抗体は、診断および予後の目的のために使用することもできる。 
【０１９１】
好ましくは細胞を含む試料は、癌患者であり得る、または、診断を所望する患者であり得る患者から取得できる。細胞は、腫瘍組織もしくは腫瘍塊の細胞、血液試料、尿試料、または、患者からの任意の試料であり得る。試料の任意の前処理の後に、試料に潜在的に存在するＰＤ−Ｌ１タンパク質と抗体が相互作用することを可能にする条件下で、本開示の抗体と共に試料を培養できる。抗ＰＤ−Ｌ１抗体を利用する、ＥＬＩＳＡなどの方法を使用して、試料中のＰＤ−Ｌ１タンパク質の存在を検出できる。
【０１９２】
試料中のＰＤ−Ｌ１タンパク質の存在（任意で、量または濃度）は、当該抗体を用いる治療に患者が適しているという指標として、または、患者が癌治療に反応した（または、反応しなかった）という指標として、癌の診断に使用できる。予後の方法については、治療の進捗を示すために、癌治療の開始後に、特定の段階において検出を１回、２回、または、それ以上実行できる。
【０１９３】
［組成物］
また、本開示は、医薬組成物を提供する。そのような組成物は、有効量の抗体、および、許容可能な担体を含む。いくつかの実施形態において、組成物は更に、第２の抗癌剤（例えば、免疫チェックポイント阻害剤）を含む。
【０１９４】
具体的な実施形態において、「薬学的に許容される」という語句は、動物、より具体的には、ヒトへの使用について、連邦政府または州政府の規制機関によって承認されている、または、米国薬局方協会もしくは他の一般的に認識されている薬局方に記載されていることを意味する。更に、「薬学的に許容可能な担体」とは、一般的に、非毒性の固体、半固体、または、液体の増量剤、希釈剤、封入材、または、任意の種類の製剤補助物である。
【０１９５】
「担体」という語句は、治療薬の投与に用いる、希釈剤、補助剤、賦形剤、または、媒体を指す。当該医薬担体は、ピーナッツオイル、大豆油、鉱油、ごま油、および、同様のものなど、石油、動物、植物、または、合成に由来するものを含む、水および油などの無菌液体であってよい。医薬組成物が静脈内投与されるとき、水は好ましい担体である。また、生理食塩水、ならびに、デキストロースおよびグリセロールの水溶液を、液体担体として、特に注射液に利用できる。適切な医薬品の賦形剤には、澱粉、グルコース、ラクトース、スクロース、ゼラチン、麦芽、米、小麦、チョーク、シリカゲル、ステアリン酸ナトリウム、モノステアリン酸グリセロール、滑石、塩化ナトリウム、乾燥脱脂粉乳、グリセロール、プロピレン、グリコール、水、エタノールなどが含まれる。また、組成物は、所望される場合、わずかな量の湿潤剤もしくは乳化剤、または、酢酸塩などのｐＨ緩衝剤、クエン酸、または、リン酸塩を含み得る。ベンジルアルコールまたはメチルパラベンなどの抗菌剤、アスコルビン酸または重亜硫酸ナトリウムなどの抗酸化物質、エチレンジアミン四酢酸などのキレート剤、および、塩化ナトリウムまたはデキストロースなどの浸透圧調整剤も想定される。これらの組成物は、溶液、懸濁剤、エマルション、タブレット、錠剤、カプセル、粉末、徐放性製剤などの形態を取り得る。組成物は、トリグリセライドなど、従来の結合剤および担体と共に、座薬として製剤化され得る。経口製剤は、医薬品グレードのマンニトール、ラクトース、澱粉、マグネシウム、ステアリン酸塩、サッカリンナトリウム、セルロース、マグネシウム炭酸塩などの標準的な担体を含み得る。適切な医薬品担体の例は、参照によって本明細書に組み込まれる、Ｅ．  Ｗ．  ＭａｒｔｉｎによるＲｅｍｉｎｇｔｏｎ'ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓに記載されている。そのような組成物には、患者に対する適切な投与のための形態を提供するように、好適な量の担体と組み合わされた、好ましくは精製された形態の、治療有効量の抗原結合ポリペプチドが含まれるであろう。製剤は、投与の方式に好適なものであるべきである。非経口製剤は、ガラスまたはプラスチックからできている、アンプル、使い捨てシリンジ、または、多回投与バイアルの中に封入され得る。 
【０１９６】
一実施形態において、組成物は、ヒトへの静脈投与に適合された医薬組成物として、定型的な手順に従って製剤化される。典型的には、静脈投与のための組成物は、無菌水性等張緩衝液の溶液である。必要である場合、組成物はまた、可溶化剤と、注射の部位における疼痛を緩和するためのリグノカインなどの局所麻酔剤とを含み得る。一般的に、成分は、例えば、活性薬剤の量を示すアンプルまたは小袋などの密封容器における、凍結乾燥粉末または無水濃縮物などの単位投与量形態で、別個に供給されるか、または、共に混合されるかのいずれかである。組成物が注入によって投与される場合、組成物は、医薬品グレードの無菌水または生理食塩水を含む注入ボトルを用いて分注できる。組成物が注射によって投与される場合、投与前に成分が混合され得るように、注射用の無菌水または生理食塩水のアンプルが提供され得る。
【０１９７】
本開示の化合物は、中性または塩の形態として製剤化できる。薬学的に許容される塩には、塩酸塩、リン酸塩、酢酸塩、シュウ酸塩、酒石酸塩などに由来するものなどの陰イオンと共に形成されるものと、ナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウム、水酸化第二鉄、イソプロピルアミン、トリエチルアミン、２‐エチルアミノエタノール、ヒスチジン、プロカインなどに由来するものなど、陽イオンと共に形成されるものとが含まれる。
【０１９８】
［例］
［例１：ヒトＰＤ−Ｌ１に対するヒトモノクローナル抗体の生成］
抗ヒトＰＤ−Ｌ１マウスモノクローナル抗体は、ハイブリドーマ技術を使用して生成される。 
【０１９９】
抗原：ヒトＰＤＬ１−Ｆｃタンパク質およびヒトＰＤ−Ｌ１高発現ＣＨＯＫ１細胞株（ＰＤＬ１−ＣＨＯＫ１細胞株）。
【０２００】
免疫化：ヒトＰＤ−Ｌ１に対するマウスモノクローナル抗体を生成するために、まず、１．５×１０７  ＰＤＬ１−ＣＨＯＫ１細胞を用いて、６〜８週齢雌ＢＡＬＢ／ｃマウスを免疫化した。最初の免疫化の１４日後および３３日後にそれぞれ、１．５×１０７  ＰＤＬ１−ＣＨＯＫ１細胞を用いて、免疫化マウスを再免疫化した。ＰＤ−Ｌ１タンパク質に結合する抗体を生成するマウスを選択するために、免疫化マウスからの血清をＥＬＩＳＡによって試験した。簡単に説明すると、１μｇ／ｍｌのヒトＰＤ−Ｌ１タンパク質のＰＢＳ溶液をウェルあたり１００μｌ加えてマイクロタイタープレートをコーティングし、室温（ＲＴ）で一晩放置した後に、ウェルあたり１００μｌの５％ＢＳＡでブロックした。免疫化マウスからの血漿の希釈物を各ウェルに加え、室温で１〜２時間培養した。ＰＢＳ／Ｔｗｅｅｎを用いてプレートを洗浄し、次に、ホースラディッシュペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）と結合させた抗マウスＩｇＧ抗体と室温で１時間培養した。洗浄後、ＡＢＴＳ基質を用いてプレートを現像し、分光光度計によってＯＤ  ４０５ｎｍで解析した。免疫化の５４日後に、５０μｇヒトＰＤＬ１−Ｆｃタンパク質を用いて、抗ＰＤＬ１  ＩｇＧの十分な抗体価を有するマウスを追加免疫した。その結果として得られるマウスを融合物のために使用した。ＥＬＩＳＡによって、抗ＰＤ−Ｌ１ＩｇＧについて、ハイブリドーマの上清を試験した。
【０２０１】
更なる解析のために、ハイブリドーマクローンＨＬ１２１０−３、ＨＬ１２０７−３、ＨＬ１２０７−９およびＨＬ１１２０−３を選択した。ＨＬ１２１０−３可変領域のアミノ酸およびポリヌクレオチド配列は、下の表５に提供されている。
［表５  ＨＬ１２１０−３可変領域配列］
【表１３】
2020180135.tif 000014
【０２０２】
［例２：ヒトＰＤ−Ｌ１に対するＨＬ１２１０−３マウスモノクローナル抗体の結合活性］
ハイブリドーマクローンＨＬ１２１０−３の結合活性を評価するために、このクローンから精製されたｍＡｂに対してＥＬＩＳＡ試験を行った。簡単に説明すると、０．１μｇ／ｍｌのヒトＰＤ−Ｌ１−Ｆｃタンパク質のＰＢＳ溶液をウェルあたり１００μｌ加えてマイクロタイタープレートをコーティングし、４℃で一晩放置した後に、ウェルあたり１００μｌの５％ＢＳＡを用いてブロックした。０．２μｇ／ｍｌから開始するＨＬ１２１０−３抗体の３倍希釈を各ウェルに加え、室温で１〜２時間培養した。ＰＢＳ／Ｔｗｅｅｎを用いてプレートを洗浄し、次に、ホースラディッシュペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）と結合させたヤギ抗マウスＩｇＧ抗体と室温で１時間培養した。洗浄後、ＴＭＢ基質を用いてプレートを現像し、分光光度計によってＯＤ  ４５０〜６３０ｎｍで解析した。図１に示されるように、ＨＬ１２１０−３は、高い活性（ＥＣ５０＝５．５３９ｎｇ／ｍｌ）で、ヒトＰＤ−Ｌ１と結合できる。
【０２０３】
［例３：ＨＬ１２１０−３マウスｍＡｂによる、受容体ＰＤ−１に対するヒトＰＤ−Ｌ１結合の遮断］
［組換えヒトＰＤ−Ｌ１の使用による受容体遮断アッセイ］
組換えヒトＰＤ−Ｌ１の受容体ＰＤ−１への結合に対する、ＨＬ１２１０−３マウスｍＡｂの遮断効果を評価するために、ＥＬＩＳＡベースの受容体遮断アッセイを利用した。簡単に説明すると、１μｇ／ｍｌのヒトＰＤ−Ｌ１−Ｆｃタンパク質のＰＢＳ溶液をウェルあたり１００μｌ加えてマイクロタイタープレートをコーティングし、４℃で一晩放置した後に、ウェルあたり１００μｌの５％ＢＳＡを用いてブロックした。５０μｌのビオチン標識ヒトＰＤ−１−Ｆｃタンパク質、および、５０μｌで２μｇ／ｍｌから開始するＨＬ１２１０−３抗体の３倍希釈物を各ウェルに加え、３７℃で１時間培養した。ＰＢＳ／Ｔｗｅｅｎを用いてプレートを洗浄し、次に、ストレプトアビジン−ＨＲＰを用いて３７℃で１時間培養した。洗浄後、ＴＭＢ基質を用いてプレートを現像し、分光光度計によってＯＤ  ４５０〜６３０ｎｍで解析した。図２に示されるように、ＨＬ１２１０−３は、ヒトＰＤ１に対するヒトＰＤ−Ｌ１の結合をＩＣ５０＝０．７８３５ｎＭで効率的に阻害できる。
【０２０４】
［哺乳類細胞発現ヒトＰＤ−Ｌ１を使用することによる受容体遮断アッセイ］
哺乳類細胞上で発現するヒトＰＤ−Ｌ１の受容体ＰＤ−１への結合に対する、ＨＬ１２１０−３マウスｍＡｂの遮断効果を評価するために、ＦＡＣＳベース受容体遮断アッセイを使用した。簡潔に説明すると、まず、２０μｇ／ｍｌから開始する３倍段階希釈ＨＬ１２１０−３マウスｍＡｂを用いて、ＰＤＬ１−ＣＨＯＫ１細胞を室温で１時間培養した。ＦＡＣＳバッファ（ＰＢＳ＋２％  ＦＢＳ）による洗浄後、ビオチン標識ｈｕＰＤ−１を各ウェルに加え、室温で１時間培養した。次に、ストレプトアビジン−ＰＥを各ウェルに加え、ＦＡＣＳバッファを用いて、０．５時間の後洗浄を２回行った。ＰＥの平均蛍光強度（ＭＦＩ）をＦＡＣＳＡｒｉａＩＩＩによって評価した。図３に示されるように、ＨＬ１２１０−３抗体は、哺乳類細胞上で発現するＰＤ−Ｌ１に対するＰＤ−１の結合を非常に効率的に阻害できる（ＩＣ５０は２．５６ｎＭ、９２．６％の最高阻害率）。
阻害率（％）＝（１−試験抗体のＭＦＩ／対照担体のＭＦＩ）×１００％
【０２０５】
［例４：ＨＬ１２１０−３マウスｍＡｂによって促進されるヒトＴ細胞免疫反応］
ＨＬ１２１０−３マウスｍＡｂの作用を評価するために、混合リンパ球反応の環境において、ヒトＴ細胞の応答を調べた。ヒトＤＣを、ＧＭ−ＣＳＦおよびＩＬ−４の存在下で、ＣＤ１４＋単球から７日間にわたって分化させた。次に、別のドナーから単離されたＣＤ４＋Ｔ細胞を、ＤＣおよび抗ＰＤ−Ｌ１遮断抗体の希釈系列を用いて共培養した。接種後５日目に、ＩＦＮγ生成について、培養上清のアッセイを行った。その結果、ＨＬ１２１０−３抗体は、用量依存的に、ＩＦＮγの生成を促進できることが示された。このことは、抗ＰＤ−Ｌ１抗体がヒトＴ細胞応答を促進できることを示唆している（図４）。
【０２０６】
［例５：ＨＬ１２１０−３マウスｍＡｂの結合親和性］
捕捉方法を使用して、ＢＩＡＣＯＲＥＴＭ（登録商標）を用いて、組換えＰＤ−Ｌ１タンパク質（ヒトＰＤ−Ｌ１−ｈｉｓ  ｔａｑ）に対するＨＬ１２１０−３抗体結合を試験した。ＣＭ５チップ上にコーティングされた抗マウスＦｃ抗体を使用して、ＨＬ１２１０−３マウスｍＡｂを捕集された。捕集された抗体に対して、ヒトＰＤ−Ｌ１−ｈｉｓ  ｔａｑタンパク質の希釈系列を２５μｇ／ｍｌの流速で３分間注入した。抗原を９００秒間にわたって解離させた。すべての実験は、Ｂｉａｃｏｒｅ  Ｔ２００（登録商標）上で実行した。データ分析は、Ｂｉａｃｏｒｅ  Ｔ２００（登録商標）評価ソフトウェアを使用して実行した。結果を図５および下の表６に示す。
［表６  組換えヒトＰＤ−Ｌ１に対するＨＬ１２１０−３の結合速度］
【表１４】
2020180135.tif 000015
【０２０７】
［例６：ＨＬ１２１０−３マウスｍＡｂのヒト化］
ｍＡｂ  ＨＬ１２１０−３可変領域遺伝子を利用してヒト化ｍＡｂを作成した。このプロセスの第１段階において、ｍＡｂ  ＨＬ１２１０−３のＶＨおよびＶＫのアミノ酸配列をヒトＩｇ遺伝子配列の利用可能なデータベースと比較して、全体の一致率が最高のヒト生殖細胞系Ｉｇ遺伝子配列を発見した。軽鎖については、最も近いヒトのマッチは、Ｏ１８／Ｊｋ２およびＫＶ１−３９＊０１／ＫＪ２＊０４遺伝子である。重鎖については、最も近いヒトのマッチは、ＶＨ３−２１遺伝子である。一致率が高いことから、ＶＨ３−１１、ＶＨ３−２３、ＶＨ３−７＊０１およびＶＨ３−４８遺伝子も選択された。
【０２０８】
次に、ＨＬ１２１０−３軽鎖のＣＤＲ１（配列識別番号４）、２（配列識別番号５）および３（配列識別番号６）が、Ｏ１８／Ｊｋ２およびＫＶ１−３９＊０１／ＫＪ２＊０４遺伝子のフレームワーク配列に移植され、かつ、ＨＬ１２１０−３  ＶＨのＣＤＲ１（配列識別番号１）、２（配列識別番号２）および３（配列識別番号３）配列がＶＨ３−２１、ＶＨ３−１１、ＶＨ３−２３、ＶＨ３−４８またはＶＨ３−７＊０１遺伝子のフレームワーク配列に移植されるように、ヒト化可変ドメイン配列を設計した。次に、マウスのアミノ酸をヒトのアミノ酸に置き換えることによって結合および／またはＣＤＲの形態に影響を生じさせ得る何らかのフレームワーク位置があるかどうかを決定するために、３次元モデルを生成した。軽鎖の場合、フレームワーク中の２２Ｓ、４３Ｓ、６０Ｄ、６３Ｔおよび４２Ｑ（Ｋａｂａｔナンバリング、表７を参照）を同定した。重鎖の場合、フレームワークにおける１Ｅ、３７Ｖ、４０Ｔ、４４Ｓ、４９Ａ、７７Ｎ、９１Ｉ、９４Ｒおよび１０８Ｔが復帰突然変異に関与した。
【０２０９】
［表７  ヒト化設計］
【表１５】
2020180135.tif 000016
一部のヒト化抗体のアミノ酸およびヌクレオチド配列を下の表８に列挙する。
［表８  ヒト化抗体配列（太字はＣＤＲを示す）］
【表１６】
2020180135.tif 000017
【表１７】
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【表１８】
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【表１９】
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【表２０】
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【表２１】
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【表２２】
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【表２３】
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【表２４】
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【０２１０】
ヒト化ＶＨおよびＶＫ遺伝子を合成的に生成し、次に、ヒトγ１およびヒトκ定常ドメインを含むベクターにそれぞれをクローニングした。ヒトＶＨおよびヒトＶＫの組み合わせにより、４０のヒト化抗体を形成した（表９を参照）。
［表９  ＶＨおよびＶＬ領域を有するヒト化抗体］
【表２５】
2020180135.tif 000026
【表２６】
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【表２７】
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【表２８】
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【０２１１】
［例７：ヒト化ＰＤ−Ｌ１抗体の抗原結合特性］
［組換えヒトＰＤ−Ｌ１の結合特性］
抗原結合活性を評価するために、ヒト化抗体に対してＥＬＩＳＡ試験を行った。簡単に説明すると、０．１μｇ／ｍｌのヒトＰＤ−Ｌ１−Ｆｃタンパク質のＰＢＳ溶液をウェルあたり１００μｌ加えてマイクロタイタープレートをコーティングし、４℃で一晩放置した後に、１００μｌ／ウェルの５％ＢＳＡを用いてブロックした。１０μｇ／ｍｌから開始するヒト化抗体の５倍希釈物を各ウェルに加え、室温で１〜２時間培養した。ＰＢＳ／Ｔｗｅｅｎを用いてプレートを洗浄し、次に、ホースラディッシュペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）と結合させたヤギ抗マウスＩｇＧ抗体と室温で１時間培養した。洗浄後、ＴＭＢ基質を用いてプレートを現像し、分光光度計によってＯＤ  ４５０〜６３０ｎｍで解析した。図６に示されるように、すべてのヒト化抗体は、キメラ抗体に接触するヒトＰＤ−Ｌ１に対する同等の結合効力を示す。
【０２１２】
［哺乳動物細胞で発現させたヒトＰＤ−Ｌ１の結合特性］
抗原結合特性を評価するために、哺乳動物細胞で発現させたＰＤ−Ｌ１との結合について、ＦＡＣＳによってヒト化抗体を解析した。簡単に説明すると、まず、２μｇ／から開始するヒト化抗体の５倍段階希釈物を用いて、ＰＤＬ１−ＣＨＯＫ１細胞を室温で１時間培養した。ＦＡＣＳバッファ（ＰＢＳ＋２％ＦＢＳ）による洗浄後、Ａｌｅｘａ４８８−抗ヒトＩｇＧ抗体を各ウェルに加え、室温で１時間培養した。ＦＡＣＳＡｒｉａＩＩＩによって、Ａｌｅｘａ４８８のＭＦＩを評価した。図７に示されるように、すべてのヒト化抗体は、哺乳類細胞で発現されるＰＤ−Ｌ１に対して、キメラ抗体と同等に非常に効率的に結合できる。
【０２１３】
ヒト化抗体の結合速度を調査するために、この例では、Ｏｃｔｅｔ  Ｒｅｄ  ９６を使用することによって親和性順位付けを実行した。表１０に示されるように、Ｈｕ１２１０−３、Ｈｕ１２１０−８、Ｈｕ１２１０−９、Ｈｕ１２１０−１４、Ｈｕ１２１０−１７、Ｈｕ１２１０−１およびＨｕ１２１０−２２は、キメラ抗体と同等のより高い親和性を示す。
［表１０  ヒト化抗体の親和性順位］
【表２９】
2020180135.tif 000030
【０２１４】
［Ｂｉａｃｏｒｅ（登録商標）によるヒト化抗体の全体的な反応速度的親和性］
捕捉方法を使用して、ＢＩＡＣＯＲＥＴＭ（登録商標）を用いて、組換えＰＤ−Ｌ１タンパク質（ヒトＰＤ−Ｌ１−ｈｉｓ  ｔａｑ）に対するヒト化抗体結合を試験した。ＣＭ５チップ上にコーティングされた抗マウスＦｃ抗体を使用して、ＨＬ１２１０−３マウスｍＡｂを捕集された。捕集された抗体に対して、ヒトＰＤ−Ｌ１−ｈｉｓ  ｔａｑタンパク質の希釈系列を２５μｇ／ｍｌの流速で３分間注入した。抗原を９００秒間にわたって解離させた。すべての実験は、Ｂｉａｃｏｒｅ  Ｔ２００（登録商標）上で実行した。データ分析は、Ｂｉａｃｏｒｅ  Ｔ２００（登録商標）評価ソフトウェアを使用して実行し、下の表１１に示されている。
［表１１  Ｂｉａｃｏｒｅによる親和性］
【表３０】
2020180135.tif 000031
【０２１５】
［種間活性］
ｈｕＰＤ−Ｌ１、マウスＰＤ−Ｌ１、ラットＰＤ−Ｌ１、アカゲザルＰＤ−Ｌ１に対するヒト化抗体の結合を評価するために、抗体に対してＥＬＩＳＡ試験を実行した。簡単に説明すると、１μｇ／ｍｌのヒト、マウス、ラットおよびアカゲザルＰＤ−Ｌ１−Ｆｃタンパク質のＰＢＳ溶液をウェルあたり１００μｌ加えてマイクロタイタープレートをコーティングし、４℃で一晩放置した後に、１００μｌ／ウェルの５％  ＢＳＡを用いてブロックした。１μｇ／ｍｌから開始するヒト化抗体の３倍希釈を各ウェルに加え、室温で１〜２時間培養した。ＰＢＳ／Ｔｗｅｅｎを用いてプレートを洗浄し、次に、ホースラディッシュペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）と結合させたヤギ抗マウスＩｇＧ抗体と室温で１時間培養した。洗浄後、ＴＭＢ基質を用いてプレートを現像し、分光光度計によってＯＤ  ４５０〜６３０ｎｍで解析した。Ｈｕ１２１０−４１抗体は、低い親和性でアカゲザルＰＤ−Ｌ１に結合でき、ラットおよびマウスＰＤ−Ｌ１には結合できない（図８）。
【表３１】
2020180135.tif 000032
【０２１６】
［ファミリーメンバー特異性］
ヒトＢ７ファミリーおよび他の免疫チェックポイントに対する、ヒト化抗ＰＤ−Ｌ１抗体の結合を評価するために、ＥＬＩＳＡによって、Ｂ７−Ｈ１（ＰＤ−Ｌ１）、Ｂ７−ＤＣ、Ｂ７−１、Ｂ７−２、Ｂ７−Ｈ２、ＰＤ−１、ＣＤ２８、ＣＴＬＡ４、ＩＣＯＳおよびＢＴＬＡへの結合について抗体を評価した。図９に示されるように、Ｈｕ１２１０−４１抗体は、Ｂ７−Ｈ１（ＰＤ−Ｌ１）のみに特異的に結合できる。
【０２１７】
［例８：ヒト化抗体によって遮断される、ＰＤ−１に対するヒトＰＤ−Ｌ１の活性］
［細胞ベースの受容体遮断アッセイ］
哺乳類細胞上で発現するヒトＰＤ−Ｌ１の受容体ＰＤ−１への結合に対する、ヒト化抗体の遮断効果を評価するために、ＦＡＣＳベース受容体遮断アッセイを利用した。簡潔に説明すると、まず、２０μｇ／ｍｌから開始する３倍段階希釈ＨＬ１２１０−３マウスｍＡｂを用いて、ＰＤＬ１−ＣＨＯＫ１細胞を室温で１時間培養した。ＦＡＣＳバッファ（ＰＢＳ＋２％  ＦＢＳ）による洗浄後、ビオチン標識ｈｕＰＤ−１を各ウェルに加え、室温で１時間培養した。次に、ストレプトアビジン−ＰＥを各ウェルに加え、ＦＡＣＳバッファを用いて、０．５時間の２回後洗浄を行った。ＰＥの平均蛍光強度（ＭＦＩ）をＦＡＣＳＡｒｉａＩＩＩによって評価した。
阻害率（％）＝（１−試験抗体のＭＦＩ／対照担体のＭＦＩ）×１００％
【０２１８】
下の表１２に示されるように、Ｈｕ１２１０−３、Ｈｕ１２１０−９、Ｈｕ１２１０−８、Ｈｕ１２１０−１４、Ｈｕ１２１０−１７、Ｈｕ１２１０−１９およびＨｕ１２１０−２２抗体は、ＰＤ−１に対するＰＤ−Ｌ１の結合の遮断について、キメラ抗体と同等の有効性を示す。
［表１２  ＰＤ−１受容体遮断アッセイ］
【表３２】
2020180135.tif 000033
【０２１９】
［組換えヒトＰＤ−Ｌ１の使用による受容体遮断アッセイ］
ヒトＰＤ−Ｌ１について、２つの受容体、すなわち、ＰＤ−１およびＢ７−１がある。これら２つのタンパク質に対するヒト化ＰＤ−Ｌ１抗体の遮断特性を調査するために、ここでは、タンパク質ベースの受容体遮断アッセイを利用した。簡単に説明すると、１μｇ／ｍｌのヒトＰＤ−Ｌ１−Ｆｃタンパク質のＰＢＳ溶液をウェルあたり１００μｌ加えてマイクロタイタープレートをコーティングし、４℃で一晩放置した後に、ウェルあたり２００μｌの５％ＢＳＡを用いてブロックし、３７℃で２時間放置した。５０μｌのビオチン標識ヒトＰＤ−１−ＦｃまたはＢ７‐１ｖタンパク質、および、１００ｎＭ、５０μｌから開始するＰＤ−Ｌ１抗体の５倍希釈物を各ウェルに加え、３７℃で１時間培養した。ＰＢＳ／Ｔｗｅｅｎを用いてプレートを洗浄し、次に、ストレプトアビジン−ＨＲＰを用いて３７℃で１時間培養した。洗浄後、ＴＭＢ基質を用いてプレートを現像し、分光光度計によってＯＤ  ４５０ｎｍで解析した。図１０および１１に示されるように、Ｈｕ１２１０−４１は、ヒトＰＤ１およびＢ７−１に対するヒトＰＤ−Ｌ１ｎ結合を効率的に阻害できる。
【０２２０】
［例９：ヒト化抗体によって促進されるヒトＴ細胞免疫反応］
［混合リンパ球反応アッセイ］
ヒト化抗体のインビトロ機能を評価するために混合リンパ球反応の環境において、ヒトＴ細胞の応答を調べた。ヒトＤＣを、ＧＭ−ＣＳＦおよびＩＬ−４の存在下で、ＣＤ１４＋単球から７日間にわたって分化させた。次に、別のドナーから単離されたＣＤ４＋Ｔ細胞を、ＤＣおよび抗ＰＤ−Ｌ１遮断抗体の希釈系列を用いて共培養した。接種後５日目に、ＩＬ−２およびＩＦＮγ生成について、培養上清のアッセイを行った。この結果は、Ｈｕ１２１０−８、Ｈｕ１２１０−９、Ｈｕ１２１０−１６およびＨｕ１２１０−１７抗体が用量依存的に、ＩＬ−２およびＩＦＮγの生成を促進できることを示し、抗ＰＤ−Ｌ１抗体がヒトＴ細胞応答を促進できることを示唆する。
【０２２１】
［ＣＭＶリコールアッセイ］
ヒト化抗体のインビトロ機能を評価するために、ヒトＴ細胞の応答をＣＭＶリコールアッセイにおいて調べた。段階希釈されたヒト化抗体の存在下で、１μｇ／ｍｌのＣＭＶ抗原を用いて、ヒトＰＢＭＣを刺激した。図１２および１３に示されるように、Ｈｕ１２１０−４０、Ｈｕ１２１０−４１およびＨｕ１２１０−１７は、用量依存的に、ＩＦＮγの生成を促進できる。
【０２２２】
［例１０：抗ＰＤ−Ｌ１  ｍＡｂによる腫瘍増殖阻害］
ヒト肺腺癌細胞株ＨＣＣ８２７に由来する細胞は、ＮＯＤ  ｓｃｉｄ  ｇａｍｍａ（ＮＳＧ）マウスに移植される。ＮＳＧマウスは、ＮＯＤ  ｓｃｉｄ  ｇａｍｍａが欠損した、かつ、もっとも免疫不全のマウスであるため、ヒト腫瘍細胞およびＰＢＭＣ移植のレシピエントとして理想的である。移植後１０日目に、腫瘍を有するマウスの中にヒトＰＢＭＣを移植する。移植後約２０日目に、腫瘍体積が１００〜１５０ｍｍ３に到達すると、１日おきに５ｍｇ／ｋｇのＰＤ−Ｌ１抗体がマウスに投与される。腫瘍体積は、抗体投与と併せて、１日おきにモニタリングされる。図１４に示されるように、Ｈｕ１２１０−３１は、５ｍｇ／ｋｇで、腫瘍増殖を３０％阻害できる。Ｈｕ１２１０−４１抗体は、用量依存的に腫瘍増殖を阻害でき、一方、腫瘍重量も、Ｈｕ１２１０−４１抗体によって用量依存的に抑制される（図１５）。
【０２２３】
［例１１  ヒト化抗体の更なる変形および最適化のコンピュータシミュレーション］
ＣＤＲ領域またはフレームワーク領域における特定のアミノ酸残基を変更することにより、抗体の活性および／または安定性が更に改善される得る、または、保持され得ることが考えられた。計算ツール（ＶｅｃｔｏｒＮＴＩ、ｗｗｗ．ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋ／ｔｏｏｌｓ／ｍｓａ／ｃｌｕｓｔａｌｏ／で入手可能）を用いて、構造、配座、機能の特性に関連して、変異型を試験した。可能性を示したもの（ＣＤＲ領域内）を下の表に列挙する。
［表１３  ヒト化抗体への組み入れに好適なＶＨおよびＶＬ  ＣＤＲおよび変異型］
【表３３】
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【表３４】
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【表３５】
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【表３６】
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【表３７】
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【表３８】
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下線：ホットスポット突然変異残基、および、それらの置換
【０２２４】
［例１２：ＰＤ−Ｌ１エピトープの同定］
本試験は、本開示の抗体に対するＰＤ−Ｌ１の結合に関与するアミノ酸残基を同定するために実行された。
【０２２５】
ＰＤ−Ｌ１のアラニン走査ライブラリが構築された。簡単に説明すると、ＰＤ−Ｌ１の２１７の変異型クローンが、Ｉｎｔｅｇｒａｌ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒのタンパク質工学プラットフォーム上で生成された。ＰＤ−Ｌ１突然変異ライブラリにおける各変異型に対するＨｕ１２１０−４１  Ｆａｂの結合を、高スループットフローサイトメトリーによって、２連で決定した。各生データ点において、バックグラウンド蛍光を減算し、ＰＤ−Ｌ１野生型（ＷＴ）の反応性に正規化した。各ＰＤ−Ｌ１変異型について、発現の関数として、平均結合値をプロットした（対照：抗ＰＤ−Ｌ１  ｍＡｂ反応性）。予備的に重要なクローン  （十字付きの円）を同定するために、対照のｍＡｂに結合するＷＴが７０％以上、かつ、Ｈｕ１２１０−４１  Ｆａｂへの反応性を有するＷＴが３０％未満であるという閾値（破線）を適用した（図１６）。ＰＤＬ１のＹ１３４、Ｋ１６２およびＮ１８３が、Ｈｕ１２１０−４１結合に必要な残基として同定された。Ｈｕ１２１０−４１  Ｆａｂに対するＮ１８３Ａクローンの低い反応性は、それがＨｕ１２１０−４１結合について、エネルギー的に大きく寄与し、Ｙ１３４およびＫ１６２の寄与は小さいことを示唆している。
【０２２６】
図１７に示されるように、重要な残基（球体）が３次元のＰＤ−Ｌ１構造上で同定された（ＰＤＢ  ＩＤ＃  ５ＪＤＲ，  Ｚｈａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，  ２０１７）。したがって、これらの残基、Ｙ１３４、Ｋ１６２およびＮ１８３は、本開示の様々な実施形態の抗体への結合を担うＰＤ−Ｌ１のエピトープを構成している。
【０２２７】
興味深いことに、Ｙ１３４、Ｋ１６２およびＮ１８３がすべて、ＰＤ−Ｌ１タンパク質のＩｇＣドメイン中に配置されていることに留意されたい。ＰＤ−１およびＰＤ−Ｌ１両方の細胞外部分は、ＩｇＶドメインおよびＩｇＣドメインを有する。ＰＤ−Ｌ１は、ＩｇＶドメイン間の結合を通してＰＤ−１に結合することが一般に知られている。しかしながら、そのような従来の抗体と異なり、Ｈｕ１２１０−４１は、ＩｇＣドメインに結合する。これは、ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１結合の阻害において有効ではないと予想されていた。驚くべきことに、Ｈｕ１２１０−４１のこの異なるエピトープは、Ｈｕ１２１０−４１の優れた活性に寄与している可能性が高い。
【０２２８】
本開示は、本開示の個々の態様の１つの例示であることが意図される、記載された具体的な実施形態によって範囲が限定されることを意図するものではなく、機能的に同等の任意の組成物または方法は、本開示の範囲内にある。本開示の思想または範囲から逸脱することなく、様々な改変および変形を本開示の方法および組成物に成すことができることは、当業者にとって明らかであろう。したがって、本開示は、添付の特許請求の範囲およびその同等物の範囲に該当する限り、本開示の改変および変形を包含することを意図している。
【０２２９】
本明細書において言及されるすべての公報および特許出願は、個々の公報または特許出願が各々、参照によって、具体的かつ別個に組み込まれることが示される場合と同一の程度で、参照によって本明細書に組み込まれる。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【配列表】
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【手続補正書】
【提出日】令和2年8月11日(2020.8.11)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
単離された抗体または抗体断片であって、前記抗体または抗体断片は、ヒトプログラム細胞死リガンド１タンパク質（ＰＤ−Ｌ１タンパク質）の免疫グロブリンＣドメイン（ＩｇＣドメイン）に特異的に結合でき、前記ＩｇＣドメインは、アミノ酸残基１３３‐２２５から成る、抗体または抗体断片。
【請求項２】
前記ＰＤ−Ｌ１タンパク質のアミノ酸残基Ｙ１３４、Ｋ１６２またはＮ１８３のうち少なくとも１つに結合できる、請求項１に記載の抗体または抗体断片。
【請求項３】
前記ＰＤ−Ｌ１タンパク質のアミノ酸残基Ｙ１３４、Ｋ１６２およびＮ１８３に結合できる、請求項１に記載の抗体または抗体断片。
【請求項４】
前記ＰＤ−Ｌ１タンパク質の免疫グロブリンＶドメイン（ＩｇＶドメイン）に結合しない前記抗体または抗体断片であって、前記ＩｇＶドメインはアミノ酸残基１９‐１２７から成る、請求項１に記載の抗体または抗体断片。
【請求項５】
前記抗体または抗体断片は、キメラ抗体、ヒト化抗体、または、完全ヒト型抗体である、請求項１から４のいずれか一項に記載の抗体または抗体断片。
【請求項６】
前記抗体または抗体断片はヒト化抗体である、請求項５に記載の抗体または抗体断片。
【請求項７】
癌または感染を治療するための抗体または抗体断片の使用であって、前記抗体または抗体断片は、ヒトプログラム細胞死リガンド１タンパク質（ＰＤ−Ｌ１タンパク質）の免疫グロブリンＣドメイン（ＩｇＣドメイン）に特異的に結合でき、前記ＩｇＣドメインは、アミノ酸残基１３３‐２２５から成る、使用。
【請求項８】
前記癌は固形腫瘍である、請求項７に記載の使用。
【請求項９】
前記癌は、膀胱癌、肝臓癌、結腸癌、直腸癌、子宮内膜癌、白血病、リンパ腫、膵臓癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、乳癌、尿道癌、頭頸部癌、胃腸癌、胃癌、食道癌、卵巣癌、腎癌、悪性黒色腫、前立腺癌、および、甲状腺癌から成る群から選択される、請求項７に記載の使用。
【請求項１０】
前記感染は、ウイルス感染、細菌感染、真菌感染、または、寄生虫感染である、請求項７に記載の使用。
【外国語明細書】
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