(57)【要約】      （修正有）【課題】患者が２型糖尿病を発症するリスクを、進行の短期リスク（ＳＴＲ）及び長期リスクの定義済み数学的モデルを使用して評価する方法、システム、及び回路を提供する。【解決手段】患者が２型糖尿病を発症するリスクを、進行の短期リスク（ＳＴＲ）及び長期リスクの定義済み数学的モデルを使用して評価する方法、システム、及び回路である。これらの評価により、グルコース測定値が同等である患者、具体的には、空腹時血漿グルコース（ＦＰＧ）値が中又は低（正常）である患者のリスクを階層化することが可能である。ＳＴＲモデル又はＩＲ（インスリン抵抗性）モデルは、炎症バイオマーカ（例えば、ＧｌｙｃＡのＮＭＲ導出測定値）と、患者の少なくとも１つの生物試料から選択された複数のリポタンパク質成分と、を含んでよい。本発明の実施形態は又、β細胞の機能障害又は損傷のマーカとしてＳＴＲスコアを生成する方法、システム、及び回路を提供する。【選択図】図１Ａ
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
患者が２型糖尿病を発症するか、且つ／又は膵β細胞の損傷及び／又は機能障害を有するリスクを評価する方法であって、
２型糖尿病を発症するリスクの定義済み数学的モデルを使用して、患者の短期糖尿病リスク因子（ＳＤＲＦ）スコアをプログラムで計算するステップであって、前記定義済み数学的モデルは、定義済み高密度リポタンパク質粒子（ＨＤＬ−Ｐ）副母集団の濃度測定値と、少なくとも１つの炎症マーカの濃度測定値と、前記計算されたＳＤＲＦスコアを生成する為にそれぞれの定義済み係数と数学的に結合された、前記モデルの各成分である少なくとも１つの相互作用パラメータの濃度測定値と、を含む、前記ステップを含む方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
著作権の保有
本特許文書の開示の一部に、著作権保護の対象となる素材が含まれる。著作権所有者であるリポサイエンス・インコーポレイテッド（ＬｉｐｏＳｃｉｅｎｃｅ，  Ｉｎｃ．）は、誰によるものであれ、本特許文書又は本特許開示の再現が、特許商標局の特許ファイル又は記録にある通りであれば、これに対して異議を有するものではないが、そうでない場合は、何であれあらゆる著作権を所有するものである。
【０００２】
関連出願の相互参照
本出願は、参照により内容があたかも本明細書に完全に記載されているかのように本明細書に組み込まれている、２０１４年１月６日に出願された米国特許仮出願第６１／９２３，８５５号の利益及び優先権を主張するものである。
【０００３】
本明細書は、全般的には、インビトロ生物試料の分析に関する。
【背景技術】
【０００４】
２型真性糖尿病（Ｔ２ＤＭ又は「糖尿病」）は、米国及び他の国々において最も費用がかかり負担の大きい慢性疾患の１つである。Ｔ２ＤＭの決定的な特徴は高血糖であり、これは、インスリン分泌反応の不良又は不足により炭水化物（グルコース）利用障害が発生したことの影響である。Ｔ２ＤＭは、何年も前から始まる代謝異常の晩期発現である。その原因は、インスリン抵抗性の漸増とβ細胞機能の低下とが結びついたことであると考えられている。インスリンの血糖低下作用に対する標的組織の漸増抵抗を補償するのに十分なインスリンを膵β細胞が分泌できていれば、患者は正常な空腹時グルコースレベルを維持できる。高血糖、そしてＴ２ＤＭへの移行は、インスリン抵抗性の増大に直面してインスリンの高分泌を維持できなくなる進行性β細胞機能障害の結果として起こる。
【０００５】
２型糖尿病は、これまで、血中グルコース（糖）レベルの増大（高血糖）を検出することによって診断されてきた。糖尿病を特徴づけているのは高血糖であるが、糖尿病は、インスリン抵抗性から本格的な糖尿病に至る一連の事象のうちの最晩期の進行状態である。従って、高血糖などの典型的な症状が発現する前に、２型糖尿病を発症するリスクが患者にあるかどうか（即ち、２型糖尿病にかかりやすい素因を患者が有しているかどうか）を識別する方法があることが望ましいであろう。疾患の指標をより早期に検出できれば（例えば、高血糖と見なされるほどグルコースレベルが上昇する前に検出できれば）、疾患の発症を実際に防ぐことはできなくても、疾患に対するより効果的な治療につながる可能性がある。
【０００６】
インスリン抵抗性を評価する最も直接的且つ正確な方法が複数あるが、これらは手間も時間もかかる為、臨床に応用するのは現実的ではない。これらの探究方法のうちの「ゴールドスタンダード」は、高インスリン正常血糖クランプ法であり、これは、クランプ中に最大グルコース処理率（ＧＤＲ、インスリン抵抗性に反比例する）を定量化する方法である。再現性が若干低い（ＣＶが１４〜３０％の）別の至難な探究方法として、最小モデル分析を行い頻繁にサンプルされる静脈内耐糖能検査（ＩＶＧＴＴ）があり、これは、インスリン抵抗性の逆であるインスリン感受性（Ｓｉ）を測定するものである。
【０００７】
現在では、２型糖尿病に進行するリスクは、主に空腹時グルコースで評価され、濃度が１００〜１２５ｍｇ／ｄＬであれば高リスクの「前糖尿病」状態にあるとされ、患者の空腹時血漿グルコースレベルが１２６ｍｇ／ｄＬ以上であれば、現在ではＴ２ＤＭであるとされる。しかしながら、前糖尿病である個々の患者（近い将来にＴ２ＤＭを発症するリスクが最大である患者）の実際のリスクは、ばらつきが大きい。
【０００８】
ＮＭＲ分光法により、低密度リポタンパク質（ＬＤＬ）、高密度リポタンパク質（ＨＤＬ）、超低密度リポタンパク質（ＶＬＤＬ）が、インビトロの血漿試料又は血清試料からのＬＤＬ、ＨＤＬ、及びＶＬＤＬの各粒子サブクラスとして同時に測定されてきた。参照により内容があたかも本明細書に完全に記載されているかのように本明細書に組み込まれている米国特許第４，９３３，８４４号、及び同第６，６１７，１６７号を参照されたい。オトヴォス等（Ｏｔｖｏｓ  ｅｔ  ａｌ．）の米国特許第６，５１８，０６９号には、患者がＴ２ＤＭを発症するリスクを評価する為の、ＮＭＲ導出のグルコース値及び／又は特定のリポタンパク値の測定法について記載されている。
【０００９】
大まかに述べると、血漿試料及び／又は血清試料中のリポタンパク質を評価する為に、ＮＭＲスペクトルの化学シフト領域内の、ＮＭＲ分光法で抽出された複数の信号の振幅が、複合メチル信号エンベロープのデコンボリューションによって抽出されて、サブクラス濃度が得られる。各サブクラスは、ＮＭＲ周波数及びリポタンパク質の直径に関連付けられた、多数の（典型的には６０超の）離散的な寄与サブクラス信号で表される。ＮＭＲ評価は、ＮＭＲ信号をインターロゲートすることにより、様々な副集団の濃度を生成することが可能であり、典型的には７３個の離散副集団（２７個がＶＬＤＬ用、２０個がＬＤＬ用、並びに２６個がＨＤＬ用）の濃度を生成することが可能である。これらの副集団は更に、ＶＬＤＬ、ＬＤＬ、又はＨＤＬのサブクラス内の特定のサイズ範囲に関連付けられるものとして特徴づけられてよい。
【００１０】
高度なリポタンパク質検査パネル、例えば、リポサイエンス社（ＬｉｐｏＳｃｉｅｎｃｅ、ローリー、ノースカロライナ州）から入手可能なＬＩＰＯＰＲＯＦＩＬＥＲリポタンパク質検査などは、典型的には、全てのＨＤＬサブクラスの濃度を合計する総高密度リポタンパク質粒子（ＨＤＬ−Ｐ）の測定（例えば、ＨＤＬ−Ｐ数）、並びに全てのＬＤＬサブクラスの濃度を合計する総低密度リポタンパク質粒子（ＬＤＬ−Ｐ）の測定（例えば、ＬＤＬ−Ｐ数）を含んでいる。ＬＤＬ−Ｐ数及びＨＤＬ−Ｐ数は、それらのそれぞれの粒子の濃度を、ｎｍｏｌ／Ｌなどの濃度単位で表す。リポサイエンス社は又、リポタンパク質ベースのインスリン抵抗性及び感受性指数（「ＬＰ−ＩＲ」指数）を開発した。これについては、参照により内容があたかも本明細書に完全に記載されているかのように本明細書に組み込まれている米国特許第８，３８６，１８７号に記載されている。
【００１１】
図１Ａは、Ｔ２ＤＭの発症前のインスリン抵抗性及びインスリン生成の変化の時間軸を示しており、この進行の間にβ細胞機能障害が起こっている。グルコースは、Ｔ２ＤＭに進行する際の急激な増加までは比較的安定した状態にとどまりうる。例えば、メーソン等（Ｍａｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．）、糖尿病（Ｄｉａｂｅｔｅｓ）、２００７年、５６号、ｐ．２０５４−６を参照されたい。図１Ｂは、様々なグルコース範囲と一連のＴ２ＤＭ進行とを示す。この進行の間に糖尿病の合併症が起こりうる。グルコースが１００〜１１０ｍｇ／ｄＬの範囲にある人々の多くがＴ２ＤＭには進行せず、グルコースが９０〜９９ｍｇ／ｄＬの「正常」範囲にある他の人々が、例えば、５年以内に糖尿病を発症する可能性がある。現在では、糖尿病が進行するリスクは、主にグルコース尺度で評価されるが、これは、グルコース代謝の悪化に対する反応であって、グルコース代謝を悪化させる原因ではない。糖尿病に進行する人々とそうでない人々とをよりよく区別できる検査に対する診断ニーズが満たされていない。ＡＡＣＥ前糖尿病コンセンサスステートメント（ＡＡＣＥ  Ｐｒｅｄｉａｂｅｔｅｓ  Ｃｏｎｓｅｎｓｕｓ  Ｓｔａｔｅｍｅｎｔ）、内分泌腺治療（Ｅｎｄｏｃｒｉｎｅ  ｐｒａｃｔｉｃｅ）、２００８年、１４巻（７号）、ｐ．９４１を参照されたい。
【００１２】
人が２型糖尿病を発症するリスクを発症前に予測又は査定できる評価方法、及び／又は、介入によって進行を遅らせたり、且つ／又は、心臓血管のリスクを治療したりできるように、進行のリスクがある人々を早期に識別する方法が依然として必要とされている。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１３】
本発明は、背景技術の課題を解決するためのものである。
【課題を解決するための手段】
【００１４】
本発明の実施形態は、血糖値のいかんを問わず糖尿病リスクを評価できる、空腹時血漿生物試料からの（ｉ）インスリン抵抗性（ＩＲ）（例えば、ｅＬＰ−ＩＲ）及び（ｉｉ）短期糖尿病リスク因子（ＳＤＲＦ）の多重マーカを提供する。
【００１５】
本発明の実施形態は、患者が将来２型糖尿病を発症するリスクの、多重パラメータ（多変量）リスク進行モデルによるリスク評価を提供し、１つのモデルはＳＤＲＦに関し、（例えば、３年未満、例えば、検査後、半年以内、１年以内、２年以内、又は３年以内の）短期リスク（「ＳＴＲ」）に関連付けられ、別のモデルはＩＲに関し、これは、ＳＴＲ及び（例えば、３年超、例えば、検査後３．５年、４年、５年、又は５〜１０年の）長期リスク（「ＬＴＲ」）の両方に関する重要なリスクパラメータでありうる。
【００１６】
ＳＤＲＦは、スコアとして与えられてよい。ＳＤＲＦスコアは、短期リスクに対して正の相関があり、従って、β細胞機能に対して逆の相関があるか、膵β細胞機能障害に対して正の相関があると考えられている。
【００１７】
ＩＲスコアは、「ｅＬＰ−ＩＲ」（拡張リポタンパク質インスリン抵抗性）スコアを使用して識別可能である。
【００１８】
ＳＴＲモデルは、ロジスティック回帰により評価される。ＩＲモデルは、少なくとも１つの調査母集団に基づいて、ＨＯＭＡ−ＩＲ又はＳｉ（頻繁にサンプルされる静脈内耐糖能検査によって評価されるインスリン抵抗性）のいずれか又は両方に関する線形回帰モデルにより評価されてよい。
【００１９】
本発明の実施形態は、糖尿病リスクモデルへの入力として多重パラメータ糖尿病リスクパラメータを使用することにより、定義済み時間軸（典型的には５年）以内に転化するリスクに関連付けられた糖尿病リスク指数（ＤＲＩ）スコアを生成することが可能である。
【００２０】
リスクモデルの各係数は、様々なマーカ入力を結合できる識別を生成する為に、（ＩＲモデルに従う）それぞれの短期及び長期の糖尿病転化のロジスティック回帰によって定義されてよい。
【００２１】
（ＳＴＲに関する）ＳＤＲＦパラメータ及びＩＲパラメータは、リスクが低いほど値が低く、リスクが高いほど値が高い、定義済み範囲内の数値スコア又は数値として与えられてよい。実施形態によっては、ＳＤＲＦスコア及びＩＲスコアを結合することにより、糖尿病リスク指数（「ＤＲＩ」）スコアが与えられてよい。
【００２２】
本発明の実施形態は、ＤＲＩスコア即ち「糖尿病リスク指数」の為の、ＳＤＲＦ及びＩＲの両モデルからの成分を有するロジスティック回帰モデルを提供することが可能であり、ＤＲＩスコアは、典型的には３〜７年、例えば、検査後約５年の時間軸に関連付けられる。
【００２３】
本発明の実施形態は、リスクを抱えながら、β細胞機能を改善又は安定化する療法の効果が見込まれるか、且つ／又は、患者のインスリン生成能力の改善が見込まれる患者を識別することに使用できるＳＴＲ評価を生成することが可能である。そのような療法の非限定的な例として、心筋梗塞後患者に使用されてきた、再構成ＨＤＬの静注の療法が可能であると考えられている。
【００２４】
本発明の実施形態は、薬物療法、創薬、及び／又は治験の為のＳＴＲスコアを提供することが可能である。ＳＴＲスコアは、β細胞機能の障害及び／又は変化を識別するマーカとして使用可能である。
【００２５】
ＳＴＲスコアは、定義済み母集団に対する相対スコア又は絶対スコアであってよい。ＳＴＲスコアは、患者に対するベースラインＳＴＲスコア及びその後のＳＴＲスコアとして使用されてよく、変化は、療法又は創薬プログラムが投与されてからの変化を反映する。
【００２６】
ＳＴＲ、ＩＲ、及び／又はＤＲＩの各スコアは、薬物療法の投与前、投与中、及び／又は投与後に生成されてよく、これによって、患者におけるそれぞれのスコアの変化を識別することが可能であり、従って、薬物療法による良い変化又は悪い変化を識別することが可能である。
【００２７】
ＳＤＲＦスコア及び／又はＳＴＲスコアは、β細胞機能及び／又はインスリン生成能力を改善又は安定化しうる療法又は薬物の評価、又は薬物の望ましくない副作用の評価に使用されてよい。
【００２８】
このリスク評価は、グルコース測定値単独ではできないリスクの階層化を行うそれぞれのＳＴＲスコア、ＩＲスコア、及びＤＲＩスコアを生成することが可能であり、グルコース測定値から切り離されてよい。
【００２９】
ＤＲＩスコアが使用される場合、ＤＲＩスコアは、ＳＤＲＦ及びＩＲの両リスク予測モデルからの幾つかの成分又は全ての成分を使用する、約５年の転化リスクのリスク予測モデルに基づいてよく、両リスク予測モデルに対して異なる定義済み重み付け因子を使用して重み付けすることにより、ＤＲＩスコアが生成されてよい。このリスク評価は、グルコース測定値を考慮してよい。グルコース測定値が使用される場合、グルコース測定値は、２型糖尿病への転化の時間軸の確立を支援することが可能であり、且つ／又は、リスクの評価に使用されてよい。糖尿病リスク指数スコアは、グルコース情報なしで使用されてよく、背景に存在する代謝問題に関連付けられた、短期及び長期の両方にわたるリスクを反映することが可能である。
【００３０】
これらの多変量モデルは、治験に関して、又は治験中に、療法中に、薬剤開発に関して、患者に対する薬物療法の選択又は指示に関して、且つ／又は、抗肥満薬又は他の薬物療法候補を識別又はモニタリングする為に、患者の評価に使用されてよい。
【００３１】
短期多変量モデルは、ＧｌｙｃＡのＮＭＲ測定値、高密度リポタンパク質（ＨＤＬ）粒子の定義済み副母集団の濃度に関連付けられたリポタンパク質成分（ＨＭＰ）、及びＧｌｙｃＡの測定値にＨＭＰ（高密度リポタンパク質（ＨＤＬ）粒子の定義済み副母集団の濃度）が乗じられた相互作用パラメータ、即ち、ＨＭＰ×ＧｌｙｃＡを含んでよい。
【００３２】
ＧｌｙｃＡは好ましい炎症マーカであってよいが、他の炎症マーカも使用されてよく、例えば、フィブリノーゲン、ハプトグロビン、α１−酸性糖タンパク質、ＣＲＰ（Ｃ反応性タンパク質）、ｈｓ−ＣＲＰ（高感受性ＣＲＰ）、又はＩＬ−６（インターロイキン−６）が使用されてよい。
【００３３】
ＨＤＬ副母集団は、中ＨＤＬ粒子サブクラス（ＨＭＰ）のみを含んでよい。中ＨＤＬ−Ｐは、小及び大のＨＤＬ粒子サブクラスを除いたＨＤＬ粒子の副母集団を意味し、厳密なサイズ範囲は、測定方法間、及び調査母集団間で異なる可能性があり、これらは、短期におけるリスクモデル（典型的には、少なくとも１つの定義済み調査母集団のロジスティック回帰モデル）、又は長期用としてＩＲに基づくリスクモデルを使用して、糖尿病のリスクを最大化する。
【００３４】
ほんの一例として、中ＨＤＬ−Ｐは、直径が約８．３ｎｍ（平均）から、上の値が９．４ｎｍ（平均）、又は１０．０ｎｍ（平均）、又は１０．２ｎｍ（平均）までのＨＤＬ粒子のみを含んでよい。
【００３５】
ＳＤＲＦ及び／又はＳＴＲリスクモデルは、インスリン分泌機能損傷及び／又は膵β細胞機能障害のマーカである成分を含んでよい。
【００３６】
ＤＲＩリスクモデルは、インスリン抵抗性のマーカである成分、並びにＳＤＲＦマーカ又はＳＤＲＦスコアである成分を含んでよい。
【００３７】
ＩＲ多変量モデルは、少なくとも１つの定義済みリポタンパク質成分と、少なくとも１つの定義済み分岐鎖アミノ酸と、を含んでよい。任意選択で、このモデルは、少なくとも１つの炎症バイオマーカを含んでよい。長期（ＩＲ）多変量モデルは、バリンと、同じＮＭＲスペクトルから導出された複数のリポタンパク質成分（例えば、サブクラス）と、を含んでよい。複数のリポタンパク質成分がＬＰ−ＩＲ及びＶＭＰ（超低密度リポタンパク質粒子、中ＶＬＤＬサブクラス粒子数、又は「中ＶＬＤＬ−Ｐ」の定義済み副母集団の濃度）を含んでよい。
【００３８】
「中ＶＬＤＬ粒子」又は「ＶＭＰ」という用語は、直径／サイズが３５〜６０ｎｍの範囲（平均）である粒子の濃度を意味する。
【００３９】
ＤＲＩリスクモデルは、ＳＤＲＦモデル及びＩＲモデルからの成分を含んでよく、典型的にはそれぞれから３つの成分を含んでよく、ＳＴＲモデルからはＨＭＰ、ＧｌｙｃＡ、ＨＭＰ×ＧｌｙｃＡを含んでよく、ＩＲモデルからはＬＰ−ＩＲ、バリン、及び中ＶＬＤＬ−Ｐを含んでよい。
【００４０】
本発明の実施形態は、定義済みの短期及び長期の多重成分リスク進行モデルを使用して、患者のインビトロ血漿又は血清試料のＮＭＲスペクトルを評価することにより、将来糖尿病を発症するリスクの評価、及び／又は、グルコースが正常であるか若干高くなった患者のリスク階層化を行う方法、回路、ＮＭＲ分光計又はＮＭＲ分析器、及びプロセッサを含む。
【００４１】
実施形態によっては、ＳＴＲスコア及びＩＲスコアに重みを付けることによって、定義済み数値範囲内のＤＲＩスコアが生成されてよい。実施形態によっては、５年（又は他のより長期の転化期間）にわたるリスクに対するＩＲの寄与がＳＤＲＦより大きくなるように、ＩＲスコアが重み付けされてよい。
【００４２】
本発明の実施形態は、患者が２型糖尿病を発症するか、且つ／又は膵β細胞の損傷及び／又は機能障害を有するリスクを評価する方法を対象とする。本方法は、２型糖尿病を発症するリスクの定義済み数学的モデルを使用して、患者の短期糖尿病リスク因子（ＳＤＲＦ）スコアをプログラムで計算するステップを含む。定義済み数学的モデルは、定義済み高密度リポタンパク質粒子（ＨＤＬ−Ｐ）副母集団の濃度測定値と、少なくとも１つの炎症マーカの濃度測定値と、計算されたＳＤＲＦスコアを生成する為にそれぞれの定義済み係数と数学的に結合された、モデルの各成分である少なくとも１つの相互作用パラメータの濃度測定値と、を含む。患者は、ＳＤＲＦスコアが母集団標準の第３三分位数値以上であれば、３年以内に２型糖尿病に転化するリスクがあるか、且つ／又は、β細胞機能障害のリスクがある。
【００４３】
定義済みＨＤＬ−Ｐ副母集団は、中ＨＤＬ−Ｐである。
【００４４】
炎症マーカはＧｌｙｃＡであってよい。相互作用パラメータは、ＧｌｙｃＡに中ＨＤＬ−Ｐの濃度を乗じたものであってよい。患者は、中ＨＤＬ−Ｐ値及びＧｌｙｃＡ値が母集団標準の第３三分位数値内にあれば、β細胞機能障害のリスクがある。
【００４５】
本方法は、インスリン抵抗性の定義済み数学的モデルを使用して、患者のインスリン抵抗性（ＩＲ）スコアをプログラムで計算するステップを含んでよい。
【００４６】
ＩＲスコアの為の、インスリン抵抗性の定義済み数学的モデルは、複数の成分を含んでよく、これら複数の成分は、患者の少なくとも１つのインビトロ生物試料から取得される、ＳＤＲＦスコアの計算に使用されてよい、定義済みＨＤＬ−Ｐ副母集団の濃度測定値と、炎症マーカの測定値と、ＶＬＤＬ−Ｐ（超低密度リポタンパク質／カイロミクロン粒子サブクラス）の定義済み副母集団の測定値と、０〜１００の範囲を有するＩＲ指数であって、この範囲は、低から高、インスリン感受性からインスリン抵抗性までを表す、ＩＲ指数と、分岐鎖アミノ酸（ＢＣＡＡ）の測定値と、を含む。
【００４７】
ＩＲの定義済み数学的モデルの成分は、ＩＲスコアを生成する為に数学的に結合されてよい。
【００４８】
ＶＬＤＬ−Ｐの定義済み副母集団の測定値は、中ＶＬＤＬ−Ｐの濃度であってよく、ＢＣＡＡはバリンである。
【００４９】
本方法は、ＳＤＲＦスコアとＩＲスコアとを結合することにより、糖尿病リスクスコアをプログラムで計算するステップを含んでよい。
【００５０】
ＳＤＲＦスコア及びＩＲスコアの係数を、ＳＤＲＦ及びＩＲを含むロジスティック回帰モデルから導出して、少なくとも１つの定義済み母集団調査を行って実際の５年での糖尿病転化を予測することにより、患者のグルコース値にかかわらず５年以内に転化するリスクを有するＤＲＩスコアが生成されてよい。
【００５１】
本方法は、患者の測定されたグルコース値及び／又はＨｂＡ１ｃ値を評価するステップと、グルコース測定値及びＤＲＩスコアに基づく、５年で２型糖尿病に転化するリスクのリスク推定値を有するレポートを電子的に提供するステップと、を含んでよい。
【００５２】
ＳＤＲＦスコアは次式で計算されてよい。ＳＤＲＦスコア＝−（Ａ）（ＨＤＬ−Ｐ中）−（Ｂ）（ＧｌｙｃＡ）＋（Ｃ）（ＧｌｙｃＡ×ＨＤＬ−Ｐ中）。Ａ、Ｂ、及びＣは、２型糖尿病を発症するリスクの定義済み数学的モデルとしての、短期糖尿病転化のロジスティック回帰モデルからの定義済みβ係数である。ＧｌｙｃＡは炎症マーカであってよく、ＨＤＬ−Ｐ中は中サイズのＨＤＬ−Ｐ副母集団であり、ＧｌｙｃＡ×ＨＤＬ−Ｐ中は相互作用パラメータであってよい。
【００５３】
ＩＲスコアは、ｅＬＰ−ＩＲスコアであってよく、次式で計算される。ｅＬＰ−ＩＲ＝（Ａ）（ＬＰ−ＩＲ）＋（Ｂ）（バリン）−（Ｃ）（ＶＬＤＬ−Ｐ中）−（Ｄ）（ＨＤＬ−Ｐ中）＋（Ｅ）（ＧｌｙｃＡ）。Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、及びＥは、インスリン抵抗性に関する線形回帰モデルからの定義済みβ係数である。ＧｌｙｃＡは炎症マーカであってよく、ＨＤＬ−Ｐ中は、中ＨＤＬ−Ｐ副母集団の濃度であってよく、ＶＬＤＬ−Ｐ中は、中ＶＬＤＬ−Ｐ副母集団の濃度であってよく、バリンは分岐鎖アミノ酸であってよく、ＬＰ−ＩＲは、６つの定義済みリポタンパク質サブクラスを使用して計算されるリポタンパク質インスリン抵抗性指数であってよく、インスリン感受性からインスリン抵抗性までを表す０〜１００の範囲の数値を有する。
【００５４】
本方法は、ＳＤＲＦスコアを使用して、薬物療法を評価するステップ、治験を評価するステップ、又は創薬の候補を評価するステップのうちの少なくとも１つを更に含んでよい。
【００５５】
本方法は、それぞれの生物試料から、時間経過に対する複数のＳＤＲＦスコアを計算することにより、ＳＤＲＦスコアの変化を評価して、β細胞機能障害の変化を識別するステップを含んでよい。
【００５６】
ＳＤＲＦスコアに関連付けられたロースコアは−６．４と−１．６の間にあってよく、−４．１は調査母集団の約２５パーセンタイルに関連付けられてよく、−３．８より大きな値は調査母集団の約７５パーセンタイルに関連付けられてよい。−３．８より大きなスコアの値は、血糖値に関係なく、β細胞機能障害のリスク、及び／又は２型糖尿病への早期転化のリスクが高まっていることを示してよく、血糖測定値が普通である患者の、２型糖尿病への転化のリスクを、様々なＳＤＲＦスコアに対して階層化できる。
【００５７】
ＳＤＲＦスコアは、定義済み数値スコア範囲内でレポートに与えられてよく、母集団標準の第４四分位数（４Ｑ）、第５五分位数（５Ｑ）、又は第１０十分位数に関連付けられるスコアは、２年以内に２型糖尿病を発症するリスク、及び／又はβ細胞機能障害のリスク、及び／又はβ細胞の損傷のリスクが、より低いスコアに比べて高まっていることを反映する。
【００５８】
ＨＤＬ−Ｐ副母集団は、直径が、８．３ｎｍから、９．４ｎｍ、１０．０ｎｍ、又は１０．２ｎｍのうちのいずれかまでの範囲である中ＨＤＬ粒子サブクラスだけを含んでよい。
【００５９】
本方法は、次式を使用してＤＲＩスコアを生成するステップを含んでよい。ＤＲＩスコア＝Ｘ（ＩＲスコア）＋Ｙ（ＳＤＲＦ）。Ｘ及びＹは、定義済み調査母集団を使用する、グルコース値が１１０ｍｇ/ｄＬより低い人々の５年糖尿病転化のロジスティック回帰モデルによって定義される係数であってよく、ＤＲＩスコアは、可能なＤＲＩロースコアの範囲にわたって複数の均等な副部分を使用するＤＲＩスコア範囲に数学的に変更される。
【００６０】
ローＤＲＩスコアは、約−３．０から約１．８の範囲であってよい。
【００６１】
本発明の実施形態は、リスクを抱えながら、β細胞機能を改善又は安定化する療法の効果が見込まれるか、且つ／又は、患者のインスリン生成能力の改善が見込まれる患者を識別する方法が対象であってよい。本方法は、患者の生物試料の定義済みリポタンパク質成分及び代謝成分の測定値を結合することにより、短期リスクスコアを電子的に生成するステップであって、上記成分は、高密度リポタンパク質粒子（ＨＤＬ−Ｐ）副母集団と、ＨＤＬ−Ｐ副母集団及び炎症マーカを使用する相互作用パラメータと、を含む、上記ステップを含んでよい。
【００６２】
他の実施形態は、膵β細胞機能を改善し、且つ／又は２型糖尿病（Ｔ２ＤＭ）を防ぐ、再構成ＨＤＬの静注などの薬物療法の効果が見込まれる患者を識別する方法が対象である。本方法は、患者の生物試料の定義済みリポタンパク質成分及び代謝成分の測定値を使用して、定義済み短期糖尿病リスク因子（ＳＤＲＦ）スコアを生成するステップを含んでよい。これらの成分は、高密度リポタンパク質粒子（ＨＤＬ−Ｐ）副母集団と、ＨＤＬ−Ｐ副母集団及び炎症マーカを使用する相互作用パラメータと、を含む。本方法は、ＳＤＲＦスコアが定義済み母集団標準より高くなった患者を識別するステップであって、高くなったＳＤＲＦスコアは、これらの患者において、膵β細胞機能を改善し、且つ／又はＴ２ＤＭを防ぐ療法の効果が見込まれることを示す、上記ステップを含んでよい。
【００６３】
本方法は、少なくとも１つのプロセッサを使用して実施されてよい。
【００６４】
ＳＤＲＦスコア用の生物試料の測定値の全て又は一部が、全てＮＭＲ導出の測定値であってよい。
【００６５】
他の実施形態は、患者が２型糖尿病に転化するリスクを評価する方法が対象であり、これは、
（ａ）次式を使用してＳＤＲＦスコアをプログラムで計算するステップであって、
ＳＤＲＦスコア＝−（Ａ）（ＨＤＬ−Ｐ中）−（Ｂ）（ＧｌｙｃＡ）＋（Ｃ）（ＧｌｙｃＡ×ＨＤＬ−Ｐ中）、
Ａ、Ｂ、及びＣは、２型糖尿病を発症するリスクの定義済み数学的モデルとしての、短期糖尿病転化のロジスティック回帰モデルからの定義済みβ係数であり、ＧｌｙｃＡは炎症マーカであり、ＨＤＬ−Ｐ中は中サイズのＨＤＬ−Ｐ副母集団であり、ＧｌｙｃＡ×ＨＤＬ−Ｐ中は相互作用パラメータである、上記ステップと、
（ｂ）次式を使用してｅＬＰ−ＩＲスコアをプログラムで計算するステップであって、
ｅＬＰ−ＩＲ＝（Ａ）（ＬＰ−ＩＲ）＋（Ｂ）（バリン）−（Ｃ）（ＶＬＤＬ−Ｐ中）−（Ｄ）（ＨＤＬ−Ｐ中）＋（Ｅ）（ＧｌｙｃＡ）、
Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、及びＥは、インスリン抵抗性に関する線形回帰モデルからの定義済みβ係数であり、ＧｌｙｃＡは炎症マーカであり、ＨＤＬ−Ｐ中は、中ＨＤＬ−Ｐ副母集団の濃度であり、ＶＬＤＬ−Ｐ中は、中ＶＬＤＬ−Ｐ副母集団の濃度であり、バリンは分岐鎖アミノ酸であり、ＬＰ−ＩＲは、６つの定義済みリポタンパク質サブクラスを使用して計算されるリポタンパク質インスリン抵抗性指数であって、インスリン感受性からインスリン抵抗性までを表す０〜１００の範囲の数値を有する、上記ステップと、
（ｃ）次式を使用してＤＲＩロースコアをプログラムで生成するステップであって、
ＤＲＩロースコア＝Ｘ（ｅＬＰ−ＩＲ）＋Ｙ（ＳＤＲＦ）、
Ｘ及びＹは、定義済み調査母集団を使用する、グルコース値が１１０ｍｇ/ｄＬより低い人々の５年糖尿病転化のロジスティック回帰モデルによって定義される係数であり、ＤＲＩロースコアは、可能なＤＲＩロースコアの範囲にわたって複数の均等な副部分を使用する０〜１０又は１〜１０の範囲に数学的に変更される、上記ステップと、によって行われる。
【００６６】
当業者であれば、以下の好ましい実施形態の図面及び詳細説明を読むことにより、本発明の更なる特徴、利点、及び細部を理解されるであろう。但し、そのような説明は、本発明の例示に過ぎない。一実施形態に関して説明される特徴は、具体的に説明されることなく他の実施形態に組み込まれることが可能である。即ち、一実施形態に関して説明された本発明の態様は、別の実施形態に関して具体的に説明されることなく別の実施形態に組み込まれてよいことに注意されたい。即ち、全ての実施形態、及び／又は任意の実施形態の特徴が、任意の様式及び／又は組み合わせで組み合わせられてよい。出願者は、最初に提出されたどのクレームでも変更したり、それに応じて新しいクレームがあれば提出したりする権利を保有し、これには、最初はそのようにクレームされていなかった、最初に提出されたどのクレームでも、他の任意のクレームに従属したり、他の任意のクレームの任意の特徴を組み込んだりする為に、補正できる権利が含まれる。以下の明細書では、本発明の上述及び他の態様が詳細に説明される。
【００６７】
当業者であれば本開示に照らして理解されるように、本発明の実施形態は、方法、システム、装置、及び／又はコンピュータプログラム製品、或いはこれらの組み合わせを含んでよい。
【００６８】
この特許ファイル又は出願ファイルは、カラーで作成された図面を少なくとも１つ含む。この特許又は特許出願広報のコピーにカラー図面が添付されたものは、所定の料金を支払って請求することにより、特許商標局から提供される。
【００６９】
以下の明細書では、本発明の上述及び他の目的及び態様が詳細に説明される。
【図面の簡単な説明】
【００７０】
【図１Ａ】２型糖尿病の進行を病理生理学的に示すチャートである。
【図１Ｂ】一連の２型糖尿病の進行を、糖尿病の合併症が悪化する例とともに示すチャートである。
【図２Ａ】本発明の実施形態による、２つの別々の多重パラメータリスクモデルに基づく糖尿病リスク予測を示すチャートであり、一方のモデルはβ細胞機能障害に関連付けられる短期リスクに関するものであり、一方のモデルはＩＲに関するものである。
【図２Ｂ】本発明の実施形態による、炎症マーカ及びＢＣＡＡ（分岐鎖アミノ酸）に対応する例示的特定成分を有する２つの別々の多重パラメータリスクモデルに基づく糖尿病リスク予測を示すチャートであり、一方のモデルは短期リスクに関するものであり、一方のモデルはインスリン抵抗性に関するものである。
【図３Ａ】本発明の実施形態による、例示的サイズ範囲を有するリポタンパク質の副母集団を示す図である。
【図３Ｂ】本発明の実施形態による、例示的サイズ範囲を有するリポタンパク質の副母集団を示す図である。
【図４】本発明の実施形態による、糖尿病の発症との（陽性及び陰性の）関連付けに基づく糖尿病リスク評価の為の例示的ＨＤＬ副母集団グループ分けのチャートである。
【図５】本発明の実施形態による、図４のサイズ別グループ分けによる、ＨＤＬの様々な副母集団に対するリスク関連付けを示すグラフである。
【図６Ａ】本発明の実施形態による、ＭＥＳＡの５年でのＴ２ＤＭへの転化（ｎ＝３５９／４２１１）に基づく、グルコースカテゴリ（低リスク、中リスク、高リスク）に対する糖尿病転化率のグラフであり、これは、中リスクのグルコース患者に関して、Ｔ２ＤＭに進行するリスクが高まっている患者を階層化又はよりよく識別することの満たされていないニーズを示している。
【図６Ｂ】本発明の実施形態による、ＩＲＡＳの５年でのＴ２ＤＭへの転化（ｎ＝１３４／９７８）に基づく、グルコースカテゴリ（低リスク、中リスク、高リスク）に対する糖尿病転化率のグラフであり、中リスクのグルコース患者について、Ｔ２ＤＭに進行するリスクが高まっている患者を階層化又はよりよく識別することの満たされていないニーズを示している。
【図７】ＭＥＳＡ調査母集団（ｎ＝３４５０）の諸特性の表である。
【図８】本発明の実施形態による、ＧｌｙｃＡピーク領域を（当該領域の拡大図により）示すＮＭＲスペクトルである。
【図９】本発明の実施形態による、中ＨＤＬ−Ｐ（ＨＤＬ−Ｐ中）の３つの定義済みレベル（高、中、低）についてのＧｌｙｃＡレベルに対する予測短期糖尿病転化率のグラフであり、（母集団標準に対して）ＧｌｙｃＡの約８０パーセンタイルレベルにおいて、高レベルの中ＨＤＬ−Ｐが「良い」から「悪い」に転じることを示している。
【図１０】本発明の実施形態による、図２とよく似たブロック図であり、ｅＬＰ−ＩＲスコア及びＳＤＲＦスコアを生成する為に各注目成分とともに使用されてよい例示的係数を示しており、ｅＬＰ−ＩＲスコア及びＳＤＲＦスコアは単独で使用されてもよく、ＤＲＩスコアを形成する為に結合されてもよい。
【図１１Ａ】本発明の実施形態による、アテローム性動脈硬化症の多民族研究（ＭＥＳＡ）における、ＤＲＩスコア（ｎ＝１〜１０）ごとの、グルコースカテゴリ（ｍｇ／ｄＬ単位）に対する予測糖尿病転化率（％）のグラフである。
【図１１Ｂ】本発明の実施形態による、ＩＲＡＳ（インスリン抵抗性アテローム性動脈硬化症研究）における、ＤＲＩスコア（ｎ＝１〜１０）ごとの、グルコースカテゴリ（ｍｇ／ｄＬ単位）に対する予測糖尿病転化率（％）のグラフである。
【図１２】本発明の実施形態による、インスリン抵抗性のｅＬＰ−ＩＲ多重マーカパラメータに寄与するパラメータのチャートである。
【図１３】本発明の実施形態による、短期リスクのＳＤＲＦ多重マーカパラメータに寄与するパラメータのチャートである。
【図１４】本発明の実施形態による、ＩＲＡＳにおける５．２年の追跡の間の糖尿病への転化（ｎ＝１３４／９７６）を示すチャートであり、ＭＥＳＡを用いて開発されたモデルの妥当性を実証するものである。
【図１５】本発明の実施形態による、ＧｌｙｃＡ及び中ＨＤＬ−Ｐ（ＨＤＬ−Ｐ中）のそれぞれのレベル（低、中、又は高）に従って細分されたＩＲＡＳ参加者（全員の空腹時グルコースが１１０ｍｇ／ｄＬ以下）の９つの副母集団における実際の５年糖尿病転化率（％）を示すチャートである。注目された参加者８５０人のうち、８８人が糖尿病に転化した。
【図１６】本発明の実施形態による、インスリン抵抗性及びＳＤＲＦが高レベル又は低レベルである架空の患者についての、時間経過に対する空腹時グルコースレベル（ｍｇ／ｄＬ）の例示的グラフであり、これは、ＳＤＲＦ及びＩＲ（例えばｅＬＰ−ＩＲ）を使用することにより、グルコース値が時間経過に対して安定するか、（例えば、短期間であれ長期間であれ）将来の糖尿病につながる道筋を有するかを予測することが可能であることを示す。色分けにより、時間経過に対してグルコースレベルが安定している３人の患者（緑色）と、糖尿病に転化する可能性がある患者（赤色）とが区別されている。
【図１７】短期リスクの程度（例えば、ＳＤＲＦスコア）を与える例示的レポートであり、その変化を監視することによって、時間経過に対するβ細胞機能／機能障害の評価が行われてよい。
【図１８】本発明の実施形態による、例示的患者レポートの概略図であり、このレポートは、ＤＲＩスコア、（インスリン抵抗性に関連付けられた）ＩＲスコア、及び（β細胞機能に関連付けられた）ＳＴＲスコアのうちの１つ以上を与えることが可能である。
【図１９】本発明の実施形態による、時間経過に対するＤＲＩスコア、ＩＲスコア、又はＳＴＲスコアのうちの１つ以上における変化を評価する為に使用されてよい例示的グラフであり、これは、治療の適用量又はタイプに基づいてよく、或いは相互に関連付けられてよい。
【図２０Ａ】本発明の実施形態による、定義済み時間軸（例えば、５年）以内でのＴ２ＤＭへの転化を予測する為の、各リスクカテゴリに関連付けられたＤＲＩスコアを有する例示的患者レポートを示す。
【図２０Ｂ】本発明の実施形態による、定義済み時間軸（例えば、５年）以内でのＴ２ＤＭへの転化を予測する為の、各リスクカテゴリに関連付けられたＤＲＩスコアを有する例示的患者レポートを示す。
【図２０Ｃ】本発明の実施形態による、定義済み時間軸（例えば、５年）以内でのＴ２ＤＭへの転化を予測する為の、各リスクカテゴリに関連付けられたＤＲＩスコアを有する例示的患者レポートを示す。
【図２１】本発明の実施形態による、ＳＴＲ、ＩＲ、及び／又はＤＲＩリスク指数モジュール及び／又は回路を使用して患者のリスクを分析するシステムの概略図である。
【図２２】本発明の実施形態による、ＮＭＲ分光装置の概略図である。
【図２３】本発明の実施形態による、データ処理システムの概略図である。
【図２４】本発明の実施形態による、将来２型糖尿病を発症するか、且つ／又は前糖尿病を有するリスクを評価することに使用可能な例示的動作のフローチャートである。
【発明を実施するための形態】
【００７１】
以下では、本発明の実施形態が図示された添付図面を参照しながら、本発明をより詳細に説明する。しかしながら、本発明は、多様な形態で実施されてよく、本明細書において説明される実施形態に限定されるものとして解釈されるべきではない。むしろ、これらの実施形態は、本開示が綿密且つ完全であって本発明の範囲を当業者に完全に伝達するように提供されている。
【００７２】
全体を通して、類似の参照符号は類似の要素を参照する。図面では、特定の線、層、構成要素、要素、又は外形の厚さが明確さの為に誇張されている場合がある。「図（Ｆｉｇｕｒｅ）」という語は、本明細書及び図面において、略記である「図（ＦＩＧ．）」及び「図（Ｆｉｇ．）」と区別なく使用されている。
【００７３】
破線は、特に断らない限り、任意選択の特徴又は動作を示す。
【００７４】
本明細書で使用される術語は、特定の実施形態を説明することを目的としているに過ぎず、本発明の限定を意図するものではない。本明細書において使用される単数形「ａ」、「ａｎ」、及び「ｔｈｅ」は、文脈上明らかに矛盾する場合を除き、複数形も同様に包含するものとする。更に、当然のことながら、「備える（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」及び／又は「備える（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」という語は、本明細書で使用された際には、述べられた特徴、整数、手順、操作、要素、及び／又は構成要素の存在を明記するものであり、１つ以上の他の特徴、整数、手順、操作、要素、構成要素、及び／又はこれらの集まりの存在又は追加を排除するものではない。本明細書では、「及び／又は（ａｎｄ／ｏｒ）」という語は、関連付けられて列挙されたアイテムの１つ以上のありとあらゆる組み合わせを包含する。本明細書では、「ＸとＹの間（ｂｅｔｗｅｅｎ  Ｘ  ａｎｄ  Ｙ）」や「およそＸとＹの間（ｂｅｔｗｅｅｎ  ａｂｏｕｔ  Ｘ  ａｎｄ  Ｙ）」などの句は、Ｘ及びＹを包含するように解釈されるべきである。本明細書では、「およそＸとＹの間（ｂｅｔｗｅｅｎ  ａｂｏｕｔ  Ｘ  ａｎｄ  Ｙ）」などの句は「約Ｘと約Ｙの間（ｂｅｔｗｅｅｎ  ａｂｏｕｔ  Ｘ  ａｎｄ  ａｂｏｕｔ  Ｙ）」の意味である。本明細書では、「およそＸからＹまで（ｆｒｏｍ  ａｂｏｕｔ  Ｘ  ｔｏ  Ｙ）」などの句は「約Ｘから約Ｙまで（ｆｒｏｍ  ａｂｏｕｔ  Ｘ  ｔｏ  ａｂｏｕｔ  Ｙ）」の意味である。
【００７５】
糖尿病リスク指数又はスコアの為のリスク進行モデルの成分の例示的説明が、２０１３年３月１４日に出願された米国特許出願第１３／８３０，７８４号及び２０１３年６月７日に出願された国際公開第ＰＣＴ／ＵＳ２０１３／０４４６７９号にあり、これらは、参照により内容があたかも本明細書に完全に記載されているかのように本明細書に組み込まれている。
【００７６】
特に定義されない限り、本明細書で使用されるあらゆる用語（技術用語及び科学用語を含む）の意味は、本発明が帰属する当該技術分野の当業者によって一般的に理解される意味と同じである。更に当然のことながら、語句、例えば、一般的に利用されている辞書において定義されている語句は、本明細書及び関連技術分野の文脈におけるそれらの語句の意味と整合性がある意味を有するものとして解釈されるべきであり、本明細書において明示的にそのように定義されない限り、理想化された意味又は過度に形式的な意味として解釈されるべきではない。よく知られている機能や構造については、簡潔さ及び／又はわかりやすさの為に、詳細には説明されない場合がある。
【００７７】
「約（ａｂｏｕｔ）」という語は、指定された値又は数の±１０％（算術的平均値又は平均値全般）を意味する。
【００７８】
「前糖尿病」という用語は、患者又は被験者にとっての、疾患状態ではないリスク状態を意味する。従って、「前糖尿病」という用語は、２型糖尿病とはまだ診断されていない人の意味であり、現時点で米国糖尿病学会（Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｄｉａｂｅｔｅｓ  Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ）によって定義されているように、空腹時血漿グルコースレベルが１００ｍｇ／ｄＬと１２５ｍｇ／ｄＬの間にあるか、経口グルコース負荷試験レベルが１４０ｍｇ／ｄＬと１９９ｍｇ／ｄＬの間にあるか、Ａ１Ｃが５．７％から６．４％の間にある個人に関連付けられる。これらについては以下の表１で表されるとおりである（検査の各タイプにおいて、レベルが大きいほど、２型糖尿病のリスクが高くなる）。
糖尿病及び前糖尿病に対応する血液検査レベル
【表１】
2020144137.tif 000003
３つの検査の全てにおいて、前糖尿病範囲では、検査結果が高いほど、糖尿病のリスクが大きい。米国糖尿病学会（Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｄｉａｂｅｔｅｓ  Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ）、糖尿病の標準治療２０１２（Ｓｔａｎｄａｒｄｓ  ｏｆ  ｍｅｄｉｃａｌ  ｃａｒｅ  ｉｎ  ｄｉａｂｅｔｅｓ―２０１２）、糖尿病ケア（Ｄｉａｂｅｔｅｓ  Ｃａｒｅ）、２０１２年、３５巻（補遺１）、Ｓ１２、表２を参照されたい。
【００７９】
本発明の実施形態は、空腹時グルコースレベルが同等か似通っている複数の患者のリスクを階層化することに特に適していてよい。大まかに述べると、ＳＴＲスコア及びＩＲスコアを、単独で、又は結合してＤＲＩスコアとして用いて、将来２型糖尿病を発症するリスクを、単独で階層化するか、ＦＰＧ又は他のグルコース測定、例えば、Ａ１Ｃ（ヘモグロビンＡ１Ｃを用いた非空腹時試料）測定又は経口グルコース負荷測定を併用して階層化することが可能であると考えられている。ＳＴＲ、ＩＲ、又はＤＲＩ糖尿病リスクスコアのうちの１つ以上を用いて、グルコースレベルが同等だが根本的な代謝状態が異なる複数の患者の２型糖尿病リスクを階層化することが可能である。
【００８０】
ＳＤＲＦとβ細胞機能障害とのつながりは、現時点では仮説である。これは、ＳＤＲＦがβ細胞機能の客観的尺度と実際に関連付けられることの直接的な証拠（あまり多くは存在せず、しかもあまり良好な証拠ではない）が、本特許出願の提出日の時点で確立されていない為である。しかしながら、ＳＤＲＦは、長期リスクではなく短期リスクにのみ寄与し、ＩＲとは無関係である為、現時点では推論に過ぎないとしても、β細胞機能障害とのつながりが強くうかがわれる。
【００８１】
本発明の実施形態は、比較的短い時間枠（典型的には５年以内）での「累積」糖尿病リスクを、ＩＲ状態及びβ細胞機能に基づいて与えることが可能である。このリスクには、インスリン抵抗性（いかなる時間枠であれ、糖尿病リスクの不可欠要因）が寄与し、更には、典型的には晩期発現であるβ細胞機能障害も寄与する（これは比較的短期の（典型的には２〜３年以内の）転化にのみ影響を及ぼす）。従って、５年以内のＴ２ＤＭへの転化のリスクを評価する為に、ＩＲ（例えば、ｅＬＰ−ＩＲ）及びβ細胞機能障害（ＳＤＲＦ）の両方の評価が行われてよい。全体リスクのうちのβ細胞部分の相対的重要性は、関心対象の時間枠が長いよりは短いほど大きく、３年での転化のリスクの約５０％を占める可能性があり、５年での転化のリスクの約３０％を占める可能性があり、１０年での転化の（累積）リスクの１０％未満を占める可能性がある。従って、本発明の実施形態は、ＩＲスコアとＳＤＲＦスコアを結合することが可能な、５年糖尿病リスクの新しい多重マーカ（ＤＲＩスコア）を提供することが可能である。
【００８２】
関心対象の期間が長いほど、糖尿病のリスクに対するＩＲの重要性がＳＤＲＦに比べて高くなる。特定の実施形態によっては、これらの糖尿病スコアの一方又は両方が、関心対象のリスクの時間枠と相互に関連するように「重み付け」されてよい。例えば、ＩＲ（例えば、ｅＬＰ−ＩＲ）及びＳＤＲＦの各構成部分は、ＤＲＩスコアを生成する為に、測定されたＳＤＲＦ値より大きな値を有するように重み付けされてよい。ＤＲＩスコアを生成する式を以下に示す。
ＤＲＩスコア＝ＸＩＲ＋ＹＳＤＲＦ  式１
【００８３】
ＤＲＩスコアは、ＩＲスコアとＳＤＲＦスコアを結合したものであってよく、ＸとＹは定義済みの係数であり、ＬＴＲ  ＤＲＩ評価の場合はＸ＞Ｙである。例えば、５年の時間軸で転化するリスクの場合は、Ｘが約７０％であってよく、Ｙが約３０％であってよい。Ｘ及びＹは、他の値を有してよい。表２は、５年で転化するリスクの場合の、ＤＲＩスコアに対する相対的な重みセットの例を含み、これらは、実施形態によっては、最大値が１、１０、又は１００であってよい。評価窓／リスク期間が長くなるほど、ＳＤＲＦスコアとＤＲＩリスクとの関連性が小さくなりうるのは明らかであろう。
ＩＲとＳＤＲＦの重み
【表２】
2020144137.tif 000004
【００８４】
実施形態によっては、５年の（又は他の適切な）観察期間を有する１つ以上の調査対象母集団からの糖尿病転化データを用いた分析が可能であり、年齢、性別、人種、空腹時グルコース、ＩＲ（例えば、ｅＬＰ−ＩＲ又は他のＩＲ尺度）、ＳＤＲＦなどの予測変数を含むロジスティック回帰分析を実施することが可能である。この予測モデルからは、ＩＲ及びＳＤＲＦの為の係数を生成できる。そして、ＤＲＩは、式（１）に従って、定義済みの係数（Ｘ）を乗じたＩＲ（例えば、ｅＬＰ−ＩＲ）と、定義済みの係数（Ｙ）を乗じたＳＤＲＦとの和として計算されてよい。分析の時間枠が長いほど、ＳＤＲＦスコアよりもＩＲスコアが支配的になる。即ち、β係数は、更なる重み付けを何ら必要としない、関連付けられた統計的関係の為の数値を与える。
【００８５】
本発明の実施形態は、ＤＲＩスコアの臨床出力、並びに、結合してＤＲＩスコアを生成することが可能な２つの多重マーカの一方又は両方の臨床出力を提供する。２つの多重マーカは、ＩＲパラメータとβ細胞機能障害部分のＳＤＲＦであり、ＩＲパラメータ（例えば、ｅＬＰ−ＩＲスコア）は、ダイエット、運動及び減量、及び／又はインスリン抵抗性改善剤によって対処可能であってよく、ＳＤＲＦは、この機能障害を対象とする薬剤によって潜在的に対処可能であってよい。ＳＤＲＦの上昇を測定してレポートする別の理由は、近い将来に糖尿病になる可能性があり、従って、（最低限の減量と薬剤とによる）何らかの対策を行う緊急性が高まっていることを患者に警告する為である。
【００８６】
本発明の実施形態は、ＳＴＲスコアを用いて、薬物療法によってβ細胞機能が改善又は安定化する効果が見込まれる患者を識別することが可能である。
【００８７】
本発明の実施形態は、ＳＴＲスコアを用いて、薬物療法の評価、治験、及び／又は創薬の推進を行うことが可能である。
【００８８】
「患者」という用語は、広く用いられており、検査又は分析の為の生物試料を提供する人を意味する。
【００８９】
「ＧｌｙｃＡ」という用語は、Ｎ−アセチルグルコサミン及び／又はＮ−アセチルガラクトサミンの部分構造を含む急性相反応糖タンパク質の炭水化物部分からの、より具体的には、２−ＮＡｃＧｌｃメチル群及び２−ＮＡｃＧａｌメチル群のプロトンからの複合ＮＭＲ信号の測定から導出できるバイオマーカを意味する。ＧｌｙｃＡ信号は、約４７℃（±０．５℃）において、血漿ＮＭＲスペクトルの約２．００ｐｐｍに中心がある。ピーク位置は、分光計の視野に無関係であるが、生物試料の分析温度に応じてばらつく可能性があり、尿生物試料中には見つからない。従って、ＧｌｙｃＡピーク領域は、検査試料の温度がばらつけばばらつく可能性がある。図８は、本発明の実施形態による、ＧｌｙｃＡピーク領域の（その領域の拡大図における）ＮＭＲスペクトルを示す。
【００９０】
ＧｌｙｃＡ  ＮＭＲ信号は、臨床的に関係する信号寄与分のみを含むように、定義済みのピーク領域にあるＮＭＲ信号のサブセットを含んでよく、この領域の信号に対するタンパク質寄与分を除外してよい（これについては後で詳述する）。
【００９１】
本明細書では、化学シフト位置（ｐｐｍ）は、２．５１９  ｐｐｍにあるＣａＥＤＴＡ信号を内部基準とするＮＭＲスペクトルを意味する。従って、本明細書において説明及び／又は特許請求される注目ピーク位置は、当業者にはよく知られているように、化学シフトがどのように生成されるか、又は基準とされるかに応じて様々であってよい。従って、明確化の為に言うと、説明及び／又は特許請求されるピーク位置のうちの幾つかは、当業者にはよく知られているように、他の対応する化学シフト中に別の等価なピーク位置を有する。
【００９２】
「生物試料」という用語は、インビトロの血液、血漿、血清、ＣＳＦ、唾液、洗浄液、喀痰、又は人間や動物の組織試料を意味する。本発明の実施形態は、人間の血漿又は血清の生物試料を、特にＧｌｙｃＡ（これは、例えば、尿中には見つからない）に関して評価することに特に適していてよい。血漿試料又は血清試料は、空腹時又は非空腹時のものであってよい。グルコースがＮＭＲによって測定される場合、生物試料は、典型的には、空腹時の血漿試料又は血清試料である。しかしながら、グルコースは、任意の適切な手段で測定されてよい。
【００９３】
「母集団標準（ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ  ｎｏｒｍ）」及び「標準（ｓｔａｎｄａｒｄ）」という用語は、フラミンガム子孫研究（Ｆｒａｍｉｎｇｈａｍ  Ｏｆｆｓｐｒｉｎｇ  Ｓｔｕｄｙ）、又はアテローム性動脈硬化症の多民族研究（Ｍｕｌｔｉ−Ｅｔｈｎｉｃ  Ｓｔｕｄｙ  ｏｆ  Ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ）（ＭＥＳＡ）、又は他の、全体母集団の代表として十分大規模な試料を有する研究のような、１つ以上の大規模な研究によって定義された値を意味する。しかしながら、本発明は、ＭＥＳＡ又はフラミンガム子孫研究の母集団値に限定されない。これは、現在定義されている、正常な母集団及びリスクがある母集団の値又はレベルが時間とともに変化する可能性がある為である。従って、臨床疾患状態を有するレベル及び／又はリスクの上昇又は下降を評価する為に、リスクセグメントにある定義済みの母集団からの値に関連付けられた基準範囲（例えば、四分位数又は五分位数）が提供され、利用されてよい。
【００９４】
本明細書では、「ＮＭＲスペクトル分析」という用語は、プロトン（１Ｈ）核磁気共鳴分光技術を用いて、生物試料（例えば、血漿又は血清）中に存在するそれぞれのパラメータを測定できるデータを取得する手段を意味する。
【００９５】
「測定する」及びその派生語は、レベル又は濃度を特定すること、且つ／又は、リポタンパク質サブクラスを確実に特定することを意味し、これは、リポタンパク質サブクラスの平均粒子サイズを測定することを含んでよい。
【００９６】
「ＮＭＲ導出」という用語は、関係付けられた測定値が、ＮＭＲ分光計内のインビトロ生物試料の１回以上のスキャンで得られたＮＭＲ信号／スペクトルを使用して計算されることを意味する。
【００９７】
「リポタンパク質成分」という用語は、１つ以上のサブクラス（サブタイプ）のリポタンパク質のサイズ及び／又は濃度を含むリポタンパク質粒子に関連付けられた数学的リスクモデルの中のリポタンパク質成分を意味する。リポタンパク質成分は、複数のリポタンパク質パラメータのリポタンパク質粒子サブクラス、濃度、サイズ、比、及び／又は数学的積（乗算値）、及び／又は、定義済みリポタンパク質パラメータのリポタンパク質サブクラス測定値、又は他のパラメータ（例えば、ＧｌｙｃＡ）と結合されたリポタンパク質サブクラス測定値のいずれを含んでもよい。
【００９８】
「相互作用パラメータ」という用語は、数学的積及び／又は比として結合された（掛け合わされた）少なくとも２つの別々の定義済み患者パラメータを意味し、典型的には、一方のパラメータがＨＤＬ−Ｐの副母集団であり、他方が炎症マーカである。相互作用パラメータの例として、ＨＤＬの副母集団が含まれてよく、例えば、中ＨＤＬ−Ｐ（「ＨＭＰ」）／総ＨＤＬ−Ｐ、（ＨＭＰ）（ＧｌｙｃＡ）、（ＨＭＰ）（ＨＺ）、及び／又は定義済みリポタンパク質副母集団に対する炎症マーカの比（例えば、ＨＭＰに対するＧｌｙｃＡの比）が含まれてよく、これらに限定されない。「ＨＺ」という用語は、平均ＨＤＬサイズを意味する。ＧｌｙｃＡは、炎症バイオマーカである。他の炎症マーカも相互作用パラメータにおいて使用されてよく、例えば、ＣＲＰ（Ｃ反応性タンパク質）、ｈｓ−ＣＲＰ（高感受性ＣＲＰ）、ＩＬ−６（インターロイキン−６）、フィブリノーゲン、ハプトグロビン、及びα１−酸性糖タンパク質が使用されてよい。
【００９９】
「数学的モデル」という用語と「モデル」という用語は区別なく使用され、これらは、ＳＴＲ及び／又はＤＲＩ（「糖尿病リスク指数」）とともに使用された場合は、患者が将来の一定期間内に２型糖尿病を発症するリスクを評価する為に使用される統計的リスクモデルを意味し、或いは、ＩＲとともに使用された場合は、１つ以上の調査母集団に基づくインスリン抵抗性モデルから得られるリスク（糖尿病リスクの良い予測子）を意味する。ＳＴＲは、長期リスク（ＬＴＲ）の場合より短い期間が対象である。リスクモデルは、任意の適切なモデルであってよく、或いは、これを含んでよく、そのようなモデルとして、ロジスティックモデル、混合モデル、又は階層型線形モデルのうちの１つ以上があり、これらに限定されない。ＳＴＲリスクモデル及びＤＲＩリスクモデルは、定義済み時間枠以内に２型糖尿病に転化する確率に基づくリスク尺度を与えることが可能であり、定義済み時間枠は、典型的には、ＳＴＲの場合は０〜３年以内、ＬＴＲの場合は３年超である。ＳＴＲ／ＳＤＲＦリスクモデルは、３年未満の時間枠が対象であってよく、例えば、検査後の６か月以内、１年以内、１．５年以内、２年以内、２．５年以内、又は３年以内が対象であってよい。ＩＲリスクは、ＳＴＲ及びＬＴＲ長期リスクの両方にとって重要なリスクパラメータとなる可能性があり、対象期間は、例えば、検査後の３年超であり、例えば、３．５年、４年、５年、又は５〜１０年である。
【０１００】
ＤＲＩ期間は約５〜７年であってよく、より典型的には、約５年である。ＳＴＲ、ＩＲ、及び／又はＤＲＩの各リスクモデルは、標準χ２値及び／又はｐ値を尺度として、Ｔ２ＤＭを発症するリスクを階層化することが可能である（ｐ値は十分に代表的な調査母集団を有する）。
ＭＥＳＡ追跡期間
【表３】
2020144137.tif 000005
【０１０１】
表３は、異なるＭＥＳＡ診察（追跡検査）の為の追跡期間を示す。ＳＴＲパラメータは、診察２で糖尿病と診断されることを予測する為に回帰モデルから導出されてよい。平均追跡期間は１．６年であった（最短０．９年、最長３．４年）。図１３は、ＭＥＳＡの診察２又は３において診断されたＤＭを示す。ＩＲパラメータは、ＳＴＲからＬＴＲにかけて任意の時間枠を有してよく、一方、ＳＤＲＦが関連するのはＳＴＲにおいてのみである。実施形態によっては、ＩＲモデルは、（図１２に示された）ＨＯＭＡ−ＩＲを予測する線形回帰モデルから導出可能である。
【０１０２】
当業者であれば理解されるように、ほぼ全ての母集団調査が、ある固定期間（例えば、５年）を置いた追跡を実施しており、その期間のどの時点で糖尿病と診断されたかはモニタリングしていない。そこで、回帰モデルは、より早くに糖尿病に転化した人々もいれば、より遅くに転化した人々もいる累積尺度である。
【０１０３】
「ＬＰ−ＩＲ」スコアという用語は、インスリンに対して感受性がある状態からインスリンに対して抵抗性がある状態までの患者のインスリン感受性の等級付けを、様々な定義済みリポタンパク質成分に関連付けられたリスクスコアの合計により行う、リポタンパク質ベースのインスリン抵抗性スコアを意味する。ＬＰ−ＩＲスコアの詳細については、例えば、参照により内容があたかも本明細書に完全に記載されているかのように本明細書に組み込まれている、米国特許出願第８，３８６，１８７号、並びに、シャラウロヴァ  Ｉ等（Ｓｈａｌａｕｒｏｖａ  Ｉ  ｅｔ  ａｌ．）、リポタンパク質インスリン抵抗性指数：リポタンパク質粒子から導出されたインスリン抵抗性尺度（Ｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ  Ｉｎｓｕｌｉｎ  Ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ  Ｉｎｄｅｘ：  Ａ  Ｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ  Ｐａｒｔｉｃｌｅ−Ｄｅｒｉｖｅｄ  Ｍｅａｓｕｒｅ  ｏｆ  Ｉｎｓｕｌｉｎ  Ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ）、メタボリック・シンドローム・アンド・リレーテッド・ディスオーダーズ（Ｍｅｔａｂｏｌｉｃ  Ｓｙｎｄｒｏｍｅ  ａｎｄ  Ｒｅｌａｔｅｄ  Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ）、１２巻、８号、２０１４年１０月、ｐ．４２２−４２９を参照されたい。大まかに述べると、大ＶＬＤＬ、ＶＬＤＬサイズ、及び小ＬＤＬは、陽性のリスク関連付けを有し、大ＨＤＬ、ＬＤＬサイズ、及びＨＤＬサイズは、陰性の関連付けを示す。これら６つの成分は、ＬＰ−ＩＲスコアの生成に使用されてよく（例えば、図２ＢのＬＰ−ＩＲに関連付けられて示された最下行の各成分を参照されたい）、これらは、典型的には、１〜１００のスコアであり、個々の成分のリスクスコアは、米国特許出願第８，３８６，１８７号の表３に記載されているように変動する。ＬＰ−ＩＲスコアは、リポタンパク質のＮＭＲ導出測定値、又は他の測定方法を用いて計算されてよい。
【０１０４】
本発明の実施形態は、糖尿病の病理生理学に関連するバイオマーカを含むリスクモデルを用いてよく、これには、インスリン抵抗性、β細胞機能又はインスリン分泌の機能障害、炎症、及び非インスリン（ＮＩ）依存型グルコース取り込みの不全のうちの２つ以上が含まれる。
【０１０５】
ＨＤＬの役割は複雑であり、ＨＤＬ−Ｃは比較的粗いバイオマーカであると見なされている。近年、研究者らは、糖尿病の病理生理学においてＨＤＬが傍観者ではなくアクティブなプレイヤーであると提言している。ドリュー等（Ｄｒｅｗ  ｅｔ  ａｌ．）、明らかになりつつある、グルコース代謝におけるＨＤＬの役割（Ｔｈｅ  Ｅｍｅｒｇｉｎｇ  Ｒｏｌｅｓ  ｏｆ  ＨＤＬ  ｉｎ  Ｇｌｕｃｏｓｅ  Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ）、ネイチャー・レビューズ・エンドクリノロジ（Ｎａｔ．  Ｒｅｖ．，  Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌ．）、８号、ｐ．２３７−２４５、２０１２年、２０１２年１月２４日オンライン公開を参照されたい。
【０１０６】
正常から糖尿病に至る血糖の軌跡は、典型的には、グルコースレベルが長期間にわたって完全に安定していることで特徴づけられてよく、この期間の間に、インスリン抵抗性の上昇がβ細胞インスリン分泌の増加によって補償され、その後、概ね約３年未満でインスリン抵抗性が急激に上昇し、β細胞の塊及び機能が失われることによって、糖尿病の診断が下る。例えば、参照により内容があたかも本明細書に完全に記載されているかのように本明細書に組み込まれている、タバック  ＡＧ等（Ｔａｂａｋ  ＡＧ  ｅｔ  ａｌ．）、ランセット（Ｌａｎｃｅｔ）、２００９年、３７３号、ｐ．２２１５−２１を参照されたい。短期間で糖尿病に転化する人は、インスリン抵抗性及びβ細胞の機能障害又は損傷を有する可能性が高い。ＩＲに関連付けられたマーカは、転化の時間枠に関係なく、糖尿病の発症を予測する。一方、ＩＲ及びグルコースと無関係に短期転化の予測を強化するマーカは、ＩＲマーカによって提供される長期転化の予測を単独では強化しない。
【０１０７】
図２Ａを参照すると、本発明の実施形態は、リポタンパク質パラメータ及び代謝パラメータの少なくとも２つの独立した多重マーカを用いた糖尿病リスク評価を提供する。この２つの多重マーカパラメータは、定義済みのリポタンパク質パラメータ及び代謝パラメータを含む。この２つの多重マーカパラメータは、（ｉ）複数の定義済みリポタンパク質パラメータ及び代謝パラメータを含むインスリン抵抗性用ＩＲリスク因子スコア、並びに、（ｉｉ）複数の定義済みリポタンパク質パラメータ及び代謝パラメータを含むβ細胞機能障害用のＳＴＲ又はＳＤＲＦリスク因子スコア（ＳＤＲＦリスク因子スコアに使用されるパラメータの一部は、ＳＴＲリスク因子スコアに使用されるパラメータと部分的に重なる可能性がある）として示されている。ＳＴＲリスク因子スコアは、中ＨＤＬ−Ｐ、炎症マーカ、及び相互作用パラメータという成分のうちの複数又は全てに関連付けられた複数の独立した値の結合（例えば、合計）を含んでよい。相互作用パラメータは、炎症マーカとＨＤＬ−Ｐの定義済み副母集団（典型的には中ＨＤＬ−Ｐ）であってよい。
【０１０８】
ＩＲリスク因子は、ＩＲ指数だけを含んでよく、或いは、ＩＲ指数と、他の定義済みのリポタンパク質パラメータ及び代謝パラメータとを含んでよい。例えば、ＩＲリスク因子スコアは、（ａ）炎症マーカ、（ｂ）中ＨＤＬ−Ｐ、（ｃ）中ＶＬＤＬ−Ｐ、（ｄ）１つ以上の分岐鎖アミノ酸（ＢＣＡＡ）、及び（ｅ）定義済みの数値範囲を有するインスリン抵抗性指数という成分のうちの複数又は全ての独立した値又はスコアを結合することにより生成されてよい。ＢＣＡＡは、バリン、ロイシン、及びイソロイシンのうちの１つ以上を含んでよく、これらは、ＮＭＲ又は他の方法で測定されてよい。ＢＣＡＡのＮＭＲ測定については、例えば、参照により内容があたかも本明細書に完全に記載されているかのように本明細書に組み込まれている国際公開第ＰＣＴ／ＵＳ２０１３／０６４１４２号を参照されたい。
【０１０９】
ＩＲリスク因子は、（後で詳述される）ＬＰ−ＩＲ又はｅＬＰ−ＩＲ、或いは他の適切なインスリン抵抗性指数であってよい。例えば、代謝物質を用いたインスリン抵抗性指数については、参照により内容があたかも本明細書に完全に記載されているかのように本明細書に組み込まれている、フ等（Ｈｕ  ｅｔ  ａｌ．）の米国特許出願公開第２００９／０１５５８２６号（「フ（Ｈｕ）」）において明らかにされている。フ（Ｈｕ）は、表４、５、６、７、８、９Ａ、９Ｂ、２７、２８、及び２９（段落９８）のうちの１つ以上において、バイオマーカを使用してインスリン抵抗性を評価する為のバイオマーカの使用を提案している。１つ以上のバイオマーカのレベルを確定した後、このレベルを疾患又は症状の基準レベルと比較することにより、それら１つ以上のバイオマーカのそれぞれの等級を決定してよい。等級の集計は、患者のスコア（例えば、インスリン抵抗性（ＩＲ）スコア）を生成する任意のアルゴリズムを使用して行われてよい（段落１０６）。続いて段落１０７で与えられる例によれば、ＩＲスコアの１００は２型糖尿病を示すが、スコアが２５未満であれば正常なグルコース耐性を示すことになる。
【０１１０】
図２Ｂを参照すると、リポタンパク質パラメータ及び代謝パラメータの２つの独立した多重マーカは、（ｉ）ＩＲリスク因子スコア用拡張ＬＰ−ＩＲインスリン抵抗性（「ｅＬＰ−ＩＲ」）スコア、並びに（ｉｉ）ＳＴＲ因子スコア用短期糖尿病リスク因子（「ＳＤＲＦ」）スコアとして示されている。ＳＤＲＦスコアは、ＧｌｙｃＡ×中ＨＤＬ−Ｐとして示されている、少なくとも１つの相互作用パラメータを含んでよい。多重マーカパラメータのこの２つの独立したリスク因子スコアは、インビトロ生物試料中のいかなる血糖値においても、糖尿病リスクを評価することが可能である。生物試料は、空腹時血漿生物試料であってよい。
【０１１１】
ｅＬＰ−ＩＲ指数は、例えば、ＬＰ−ＩＲを使用するように示されているが、定義済みの範囲を有する他のインスリン抵抗性指数又はスコアが使用されてもよい。
【０１１２】
ｅＬＰ−ＩＲスコアは、ＬＰ−ＩＲスコアの拡張版であり、これは、ｅＬＰ−ＩＲスコアが、（チャートの最下部の、ＬＰ−ＩＲボックスから展開されている行にある各成分によって示されている６つの注目リポタンパク質成分を有する）ＬＰ−ＩＲスコアと、図示されるようにＧｌｙｃＡ、中ＨＤＬ−Ｐ、中ＶＬＤＬ−Ｐ、及びバリンを含む、追加の定義済みの各成分とを含むことによる。バリンの代わりに、例えば、ロイシンやイソロイシンなど、他のＢＣＡＡが含まれたり、使用されたりしてもよい。ＧｌｙｃＡは、炎症バイオマーカの１つであり、他の炎症バイオマーカ（例えば、フィブリノーゲン、ｈｓ−ＣＲＰ、ＧＲＰ、ＩＬ−６、又はハプトグロビンなど）が含まれたり、ＧｌｙｃＡの代わりに使用されたりしてもよい。
【０１１３】
ＳＤＲＦスコアは、中ＨＤＬ−Ｐと、ＧｌｙｃＡとして示されている少なくとも１つの炎症マーカ、更には少なくとも１つの相互作用パラメータを含んでよい。相互作用パラメータは、ｅＬＰ−ＩＲスコア又はＬＰ−ＩＲスコアでは使用されていないが、これは、相互作用パラメータが長期リスクに関連付けられていない為である（相互作用パラメータは、インスリン抵抗性には統計的に関連付けられていないが、糖尿病リスクには関連付けられている）。ここでも、別の炎症マーカ又は相互作用パラメータが使用されてもよい。特に、相互作用パラメータ、例えば、中間ＨＤＬ−ＰとＧｌｙｃＡの相互作用は、これらの変数とβ細胞機能障害との関係を反映すると考えられている。この結果は、糖尿病の病理生理学におけるＨＤＬの複数の役割に関する最近の証拠、並びに炎症によるＨＤＬ機能性の変調を疫学的に支持する。図９は、ＨＤＬ機能性の変調をグラフィカルに示しており、例えば、ＧｌｙｃＡで評価される炎症のレベルが増大するにつれてリスク因子が陰性から陽性に変化する様子を示している。ＭＥＳＡの場合はＧｌｙｃＡの約８０パーセンタイルにあるように示される６５パーセンタイル値がＩＲＡＳによって識別されており、これらは両方とも約３５０〜３６０μｍｏｌ／Ｌのレベルにある。
【０１１４】
数学的モデルは、他の臨床パラメータも使用してよく、例えば、性別、年齢、ＢＭＩ、高血圧薬剤の使用の有無、グルコース等を使用してよい。
【０１１５】
ＳＴＲ、ＩＲ、及びＤＲＩの各パラメータは、定義済みの数値範囲内で、糖尿病に転化するリスクが低ければ低いスコアが関連付けられ、リスクが高ければ高いスコアが関連付けられる数値スコアとして与えられてよいと考えられているが、リスクのスコア又は指数は、患者レポート上では別の様式で示されてよい。ＳＴＲ、ＩＲ、及びＤＲＩの各スコアは、数値又は英数字で表された結果として与えられてよく、典型的には、定義済みの尺度上、又は定義済みの値範囲内の数値スコアを含んで与えられてよい。例えば、特定の実施形態では、ＳＴＲ、ＩＲ、及び／又はＤＲＩの各スコアは、定義済みの範囲内のスコア、例えば、ローエンドは０と１の間、ハイエンドは１０又は１００となるスコアとして与えられてよく、或いは、そのようなスコアを含んでよい。範囲は、例えば、０〜０．１、０〜１、０〜５、０〜１０、１〜１０、０〜２４、１〜２４、０〜１００、１〜１００、１０〜１００、０〜１０００、１〜１０００、１０〜１０００などであってよい。将来にＴ２ＤＭを発症するリスクに関し、典型的には、最小リスクに最小数が関連付けられ、リスクが大きいほど大きな数が関連付けられる。範囲内の小さな値は、１、２、３、４、５などのように「０」より大きくてよく、或いは負の数（例えば、−１、−２、−３、−４、−５など）であってもよい。他の指数の例として、例えば、英数字の指数、更にはリスクの度合いを示すアイコンなどがあってよく、例えば、「ＬＲ１」（低リスク）、ＩＲ５（中リスク）、「ＨＲ９」（高リスク）や、「ＤＲＩ陽性」、「ＤＲＩ高い」、「ＤＲＩニュートラル」、「ＤＲＩ低い」、「ＤＲＩ良い」、「ＤＲＩ悪い」、「ＤＲＩ警戒」などの言葉であってよく、これらに限定されない。
【０１１６】
ＩＲ、ＳＴＲ、又はＤＲＩの各スコアは、全てが０〜１０又は１〜１０の範囲であってよい。
【０１１７】
ＩＲスコア及びＳＤＲＦスコアは範囲が０〜１００又は１〜１００であってよく、ＤＲＩスコアは範囲が０〜１０又は１〜１０であってよい。これは、リスクモデルが定義済みの小さな係数をそれぞれのリスクモデルの別々の成分に適用できる為であり、例えば、０．００１未満の値（典型的には約０．００９）をＩＲスコアに適用できる為である（図１０）。
【０１１８】
上述のように、ＳＴＲ、ＩＲ、及びＤＲＩの各糖尿病リスク指数又はスコアは、グルコース測定値と切り離されてよい。従って、例えば、ＳＴＲ、ＩＲ、又はＤＲＩの各スコアのうちの１つ以上が、スクリーニング検査として、又はグルコースと無関係のリスクを階層化する為に、患者に関して計算されてよい。即ち、ＳＴＲ／ＩＲ又はＤＲＩは、グルコースレベルが１１０ｍｇ／ｄＬを下回る（例えば、８０〜１１０ｍｇ／ｄＬの範囲である）患者のリスクを階層化する為に使用されてよく、且つ／又は、空腹時グルコース又は他の血糖尺度と無関係に糖尿病への転化を予測することが可能である。
【０１１９】
ＳＤＲＦ及びＩＲという異なる２つの測定値によって与えられる情報の理解を支援する為に、両方のデータ点が供給された時点で検査結果を生成する指導指針及び／又は電子プログラムが、臨床医に対して提供されてよい。結合データ評価は、検査室からのダウンロードとして、又は、例えばリポサイエンス社（ローリー、ノースカロライナ州）などの提供会社からのダウンロードとして、提供されてよい。指導指針は、臨床医がＳＴＲスコア及び／又はＤＲＩスコアによって提供されるリスク階層化を理解できるように、且つ、時間がかかり、高価であり、或いは、患者にとって面倒であると考えられるグルコースチャレンジテストを指示すべきかどうかを臨床医に知らせることができるように、臨床医に提供されてよい。ＳＴＲ、ＩＲ、及び／又はＤＲＩの各スコアに基づいてリスク情報を生成できる電子リスク分析回路（例えば、インターネットを介してアクセス可能なポータル）が提供されてもよい。
【０１２０】
ＳＴＲ／ＳＤＲＦ、ＩＲ、及び／又はＤＲＩの各スコアは、同時発生のグルコース測定値と無関係に、且つ／又は、同時発生のグルコース測定値を必要とせずに生成されてよく、各患者がどのリスクカテゴリに属しうるかを臨床医が考察することを可能にする為に使用されてよい。
【０１２１】
リポタンパク質は、血漿、血清、全血、及びリンパ中に見られる様々な粒子を含み、それらは、様々なタイプ及び量のトリグリセリド、コレステロール、リン脂質、スフィンゴ脂質、及びタンパク質を含む。これらの様々な粒子は、これがなければ疎水性である血中の脂質分子の可溶化を可能にし、脂肪分解、脂質生成、並びに、消化管、肝臓、筋肉組織、及び脂肪組織の間の脂質輸送に関連する様々な機能を果たす。血中及び／又は血漿中のリポタンパク質は、様々な方法で分類されてきており、大まかには、密度、又は電気泳動移動度、又はＨＤＬの主要タンパク質であるアポリポタンパク質Ａ−１（Ａｐｏ  Ａ−１）の尺度などの物理特性に基づいて分類されている。
【０１２２】
核磁気共鳴によって決定される粒子サイズに基づく分類により、サイズ又はサイズ範囲が異なるリポタンパク質粒子が区別される。例えば、ＮＭＲ測定によって少なくとも１５個の異なるリポタンパク質粒子サブタイプを識別することが可能であり、これには、少なくとも５サブタイプの高密度リポタンパク質（ＨＤＬ）、少なくとも４サブタイプの低密度リポタンパク質（ＬＤＬ）、及び少なくとも６サブタイプの超低密度リポタンパク質（ＶＬＤＬ）が含まれ、ＶＬＤＬは、ＴＲＬ（高トリグリセリドリポタンパク質）Ｖ１からＶ６と呼ばれることがある。
【０１２３】
ＮＭＲ導出の推定リポタンパク質サイズ、例えば、ＨＤＬ−Ｐ粒子サイズのＨ１〜Ｈ２６は、厳密なものではなく、各サブクラスをサイズ範囲で推定する為の大まかなものである。他の方法により、ＮＭＲで推定されるサブクラスサイズと相互に関連する別のサイズ範囲が提供されてもよい。
【０１２４】
更に又、リポタンパク質粒子のＮＭＲ測定は本明細書に記載の分析には特に適しているが、現時点又は将来には他の技術を用いてこれらのパラメータを測定することも可能であり、本発明の実施形態は、この測定方法に限定されないことも考えられている。又、本明細書に記載のデコンボリューションプロトコルの代わりに（例えば、別のデコンボリューションプロトコルを含む）別の、ＮＭＲを使用するプロトコルが使用されてよいことも考えられている。例えば、カエス等（Ｋａｅｓｓ  ｅｔ  ａｌ．）、リポタンパク質亜分画プロファイル：定量的形質遺伝子座の遺伝率及び識別（Ｔｈｅ  ｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ  ｓｕｂｆｒａｃｔｉｏｎ  ｐｒｏｆｉｌｅ：  ｈｅｒｉｔａｂｉｌｉｔｙ  ａｎｄ  ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅ  ｔｒａｉｔ  ｌｏｃｉ）、脂質研究ジャーナル（Ｊ  Ｌｉｐｉｄ  Ｒｅｓ）、４９巻、ｐ．７１５−７２３、２００８年、並びに、スナ等（Ｓｕｎａ  ｅｔ  ａｌ．）、血漿リポタンパク質サブクラスの１Ｈ  ＮＭＲメタボロミクス：自己組織化マップによる代謝クラスタリングの解明（１Ｈ  ＮＭＲ  ｍｅｔａｂｏｌｏｍｉｃｓ  ｏｆ  ｐｌａｓｍａ  ｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ  ｓｕｂｃｌａｓｓｅｓ：  ｅｌｕｃｉｄａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｍｅｔａｂｏｌｉｃ  ｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇ  ｂｙ  ｓｅｌｆ−ｏｒｇａｎｉｚｉｎｇ  ｍａｐｓ）、ＮＭＲイン・バイオメディシン（ＮＭＲ  Ｂｉｏｍｅｄ）、２００７年、２０号、ｐ．６５８−６７２を参照されたい。リポタンパク質サブクラス粒子濃度を測定する代替技術として、密度ベースの分離技術を用いてリポタンパク質粒子を評価しイオン移動度を分析する浮遊選別及び超遠心分離がある。垂直自動プロファイル法（ｖｅｒｔｉｃａｌ  ａｕｔｏ  ｐｒｏｆｉｌｅ  ｍｅｔｈｏｄｏｌｏｇｙ）又は他の細分画方法も潜在的に利用されてよい。参照により内容があたかも本明細書に完全に記載されているかのように本明細書に組み込まれている、マーチン等（Ｍａｒｔｉｎ  ｅｔ  ａｌ．）、高密度リポタンパク質亜分画：最新の見解と臨床実践応用（Ｈｉｇｈ−ｄｅｎｓｉｔｙ  ｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ  ｓｕｂｆｒａｃｔｉｏｎｓ：  Ｃｕｒｒｅｎｔ  ｖｉｅｗｓ  ａｎｄ  ｃｌｉｎｉｃａｌ  ｐｒａｃｔｉｃｅ  ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ）、トレンド・イン・エンドクリノジ・アンド・メタボリズム（Ｔｒｅｎｄｓ  Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌ  Ｍｅｔａｂ）、２０１４年、２５号、ｐ．３２９−３３６を参照されたい。
【０１２５】
リポタンパク質サブクラスのグループ分けは、本発明の一部の特定の実施形態に従って合計することによってＶＬＤＬ−Ｐ、ＨＤＬ−Ｐ、及びＬＤＬ−Ｐの数値を決定することが可能な濃度を有するサブクラスを含んでよい。なお、注目される「小、大、及び中」の各サイズ範囲は、その上端値又は下端値を広げたり狭めたりする為に、或いは更に、注目範囲内の特定の範囲を排除したりする為に、変えられたり、再定義されたりしてよい。注目される粒子サイズは、典型的には平均測定値を意味するが、他の区分が使用されてもよい。図３Ａ及び図３Ｂは、リポタンパク質の様々な副母集団の例示的サイズ範囲を示す。本発明の実施形態は、脂質変数や代謝変数との相関によって評価される機能的／代謝的関連性に基づいてサイズ範囲でグループ分けされたサブクラスにリポタンパク質粒子を分類する。従って、上述のように、この評価によって、２０を超える離散的な副母集団（サイズ）のリポタンパク質粒子の測定を行うことが可能であり、典型的には、約３０〜８０個の（或いは更に多くの）異なるサイズの副母集団のリポタンパク質粒子の測定を行うことが可能である。
【０１２６】
ＧｌｙｃＡの測定計算が行われる場合、ＨＤＬ及びＬＤＬのグループ分けの離散数は、リポタンパク質サブクラスの定量的測定に用いられるものより少なくてよい（リポタンパク質測定にＮＭＲが用いられる場合）。様々なサイズのサブクラスは、それぞれの分光学的に別個である脂質メチル群ＮＭＲ信号の振幅から定量化されることが可能である。参照により内容があたかも本明細書に完全に記載されているかのように本明細書に組み込まれている、ジェヤラジャー等（Ｊｅｙａｒａｊａｈ  ｅｔ  ａｌ．）、核磁気共鳴分光法によるリポタンパク質粒子分析（Ｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ  ｐａｒｔｉｃｌｅ  ａｎａｌｙｓｉｓ  ｂｙ  ｎｕｃｌｅａｒ  ｍａｇｎｅｔｉｃ  ｒｅｓｏｎａｎｃｅ  ｓｐｅｃｔｒｏｓｃｏｐｙ）、クリニックス・イン・ラボラトリ・メディシン（Ｃｌｉｎ  Ｌａｂ  Ｍｅｄ）、２００６年、２６号、ｐ．８４７−８７０を参照されたい。
【０１２７】
「ＬＤＬ−Ｐ」という用語は、複数の定義済みＬＤＬサブクラスの濃度の合計である、低密度リポタンパク質粒子数（ＬＤＬ−Ｐ）の測定値（例えば、ＬＤＬ−Ｐ数）を意味する。総ＬＤＬ−Ｐは、１８〜２３ｎｍの範囲のサイズを含む全てのＬＤＬサブクラス（大、小）の濃度（μｍｏｌ／Ｌ）の合計である総低密度リポタンパク質粒子（ＬＤＬ−Ｐ）の測定により生成されてよい。実施形態によっては、ＬＤＬ−Ｐ測定では、（全てのＬＤＬサブクラス副母集団の合計ではなく）選択されたＬＤＬサブクラスの組み合わせを用いてよい。本明細書では、「小ＬＤＬ粒子」という用語は、典型的には、サイズ範囲が約１８ｎｍから２０．５ｎｍ未満、典型的には、１９〜２０ｎｍである粒子を包含する。「大ＬＤＬ粒子」という用語は、直径が約２０．５〜２３ｎｍの範囲である粒子を包含する。ただし、ＬＤＬサブクラスの粒子は、他のサイズ範囲で分けられてもよい。例えば、「小」サイズは約１９〜２０．５ｎｍの範囲であってよく、中は約２０．５〜２１．２ｎｍの範囲であってよく、大は約２１．２〜２３ｎｍの範囲であってよい。更に、中密度リポタンパク質粒子（「ＩＤＬ」又は「ＩＤＬ−Ｐ」）は、直径が約２３〜２９ｎｍの範囲であり、「大」ＬＤＬと定義された粒子の中に含まれてよい（或いは、小ＶＬＤＬと定義された粒子の中に含まれてもよい）。従って、例えば、ＬＤＬサブクラスは、１９〜２８ｎｍの範囲であってよい。
【０１２８】
「ＨＤＬ−Ｐ」という用語は、定義済みの副母集団のリポタンパク質サブクラスの濃度である、高密度リポタンパク質粒子数（ＨＤＬ−Ｐ）の測定値（例えば、ＨＤＬ−Ｐ数）を意味する。総ＨＤＬ−Ｐは、約７ｎｍから約１５ｎｍ、典型的には７．３又は７．４ｎｍから１３．５又は１４ｎｍのサイズ範囲にある全てのＨＤＬサブクラス（これは、サイズに基づいて、大、中、小などの別々のサイズカテゴリにグループ分けされてよい）の濃度（μｍｏｌ／Ｌ）の合計である総高密度リポタンパク質粒子（ＨＤＬ−Ｐ）の測定により生成されてよい。
【０１２９】
ＨＤＬサブクラス粒子の範囲は、典型的には約７ｎｍから約１５ｎｍであり、より典型的には約７．３ｎｍから約１４ｎｍ（例えば、７．４ｎｍから１３．５ｎｍ）である。ＨＤＬ−Ｐ濃度は、少なくとも、ＮＭＲデコンボリューションを含む特定の方法で測定される場合には、そのＨＤＬサブクラスのそれぞれの副母集団の粒子濃度の合計である。ＨＤＬ副母集団は、中ＨＤＬ粒子サブクラス（ＨＭＰ）を含んでよい。中ＨＤＬ−Ｐは、本明細書では「ＨＭＰ」又は「ＨＤＬ−Ｐ中」又は「中ＨＤＬ−Ｐ」の略称で区別なく参照され、小ＨＤＬ及び大ＨＤＬの粒子サブクラスを除くＨＤＬ粒子の定義済み副母集団を意味する。ＨＭＰ／中ＨＤＬ−Ｐ／ＨＤＬ−Ｐ中の厳密なサイズ範囲は、測定方法間並びに調査母集団間でばらつく可能性がある。
【０１３０】
しかしながら、当業者にはよく知られているように、ＨＭＰ／中ＨＤＬ−Ｐ／ＨＤＬ−Ｐ中、並びに他の、様々なＩＲ／ＳＴＲリスクモデルにおいて使用されるリポタンパク質副母集団は、短期又は長期の多重パラメータＳＴＲ及びＩＲリスクモデルの一方又は両方のリスクモデル（典型的には、少なくとも１つの定義済み調査母集団のロジスティック回帰モデル）を使用して、糖尿病への転化のリスクの相関を最大化するように選択されてよい。
【０１３１】
図５は、サイズでグループ分けされたＨＤＬ副母集団と、ＭＥＳＡによる糖尿病発症リスクの関連付けと、をグラフィカルに示す。ここで注目されるように、ＨＤＬ−Ｐ中サブクラスのＨＤＬサイズは、ばらつくことがあり、調査母集団内のリスク関連付けに依存することがあり、このグラフは、あくまで例であるが、異なるサイズのグループ分けとの陰性及び陽性の関連付けを示す。このグラフは、本発明の実施形態による、２６個のＨＤＬ副母集団の、９個の異なるサイズのグループ分け又は副母集団の場合の糖尿病リスク関連付けを示しており、選択されたＨＤＬサブクラスの更なるグループ分けが３つのボックスで示されている。ロジスティック回帰モデルのχ２値は、４９６８人のＭＥＳＡ参加者の間での６年間の追跡の間にＭＥＳＡ調査母集団内で確定されたリスク関連付けの強度及び符号を示しており、４１１件の糖尿病発症が診断されている（９個の副母集団の全てが同じロジスティック回帰モデルに含まれて、年齢、性別、人種、及びグルコースに関して調整が行われた）。
【０１３２】
実施形態によっては、ＨＤＬ−Ｐの様々な副母集団が、１から２６の番号で識別されてよく、図４に示されるように、「１」は、ＨＤＬクラスの最小サイズ副母集団を表し、「２６」は、ＨＤＬクラスの最大サイズ副母集団を表す。
【０１３３】
ＨＭＰは、例えば、それぞれの副母集団のＨ９〜Ｈ１４、又はＨ９〜Ｈ１５、及び任意選択でＨ９〜Ｈ１７に対応するサイズのＨＤＬ粒子を含んでよい。図４は、中ＨＤＬ−Ｐ副母集団を定義することに使用可能な、任意選択の様々な例示的サブクラスグループ分けを示す。これらのサイズカテゴリは、母集団標準においてリスクが中程度である人々のリスク階層化を最適化するように、９０ｍｇ／ｄＬ（又は更に低い値）から１１０ｍｇ／ｄＬの（空腹時）グルコース測定値に基づいて選択されてよい。即ち、様々な副母集団がどのようにグループ分けされるべきかを、ＬＰ−ＩＲ又はインスリン抵抗性ではなく、Ｔ２ＤＭとのリスク関連付けに基づいて決定する為に、特定のパラメータに対するリポタンパク質サブクラス副母集団又はグループは、ＭＥＳＡ、ＩＲＡＳ及び／又はフラミンガムなどの調査母集団の統計分析に基づいて選択されてよい。  
【０１３４】
実施形態によっては、中ＨＤＬ−Ｐ  （ＨＭＰ／ＨＤＬ−Ｐ中）は、８．３〜９．２ｎｍ、８．３〜９．４ｎｍ、８．３〜９．７ｎｍ、８．３〜１０ｎｍ、又は８．３〜１０．２  ｎｍ（ＮＭＲ測定に基づく推定サイズ）のいずれかの範囲にあるＨＤＬ−Ｐと関連付けられてよい。
【０１３５】
糖尿病予測性能は、ＩＲＡＳ調査データセットにおいては、サイズ範囲を多少狭めれば向上した。又、（中ＨＤＬ−Ｐの範囲が８．３ｎｍから１０．０ｎｍであった）ＭＥＳＡ研究データセットにおいては、それほど悪くなかった。一方、中ＨＤＬ−Ｐの上方範囲は、例えば、９．４ｎｍ、１０．０ｎｍ、又は１０．  ２ｎｍであってよく、或いは、それより若干高いか低くてもよい。
【０１３６】
「大ＶＬＤＬ粒子」という用語は、６０ｎｍ以上、例えば、６０〜２６０ｎｍの粒子を意味する。「中ＶＬＤＬ粒子」（「中ＶＬＤＬ−Ｐ」又は「ＶＬＤＬ−Ｐ中）という用語は、サイズが３５〜６０ｎｍの範囲の粒子を意味する。「小ＶＬＤＬ粒子」という用語は、２９〜３５ｎｍの範囲の粒子を意味する。「ＶＬＤＬ−Ｐ」という用語は、複数の定義済みＶＬＤＬサブクラスの濃度の合計である、超低密度リポタンパク質粒子数（ＶＬＤＬ−Ｐ）の測定値（例えば、ＶＬＤＬ−Ｐ数）を意味する。総ＶＬＤＬ−Ｐは、全てのＶＬＤＬサブクラス（大、中、小）の濃度（ｎｍｏｌ／Ｌ）を合計することによって生成されてよい。中ＶＬＤＬ及び大ＶＬＤＬの厳密なサイズ範囲は、測定方法間並びに調査母集団間でばらつく可能性があるが、それぞれは、異なるサブクラスグループ分けのリスク関連付けに基づいて定義されることが可能な、リポタンパク質の定義済み副母集団に関連付けられる。
【０１３７】
上述のように、本発明の実施形態は、リスクを抱えているが、薬剤、診療、ダイエット、運動、又は他の介入の効果が見込まれる患者又は被験者をＴ２ＤＭの発症前に識別する為に、患者又は被験者のインビトロ生物試料の様々な定義済みのリポタンパク質バイオマーカ又はパラメータ、或いは代謝バイオマーカ又はパラメータの定義済み数学的リスクモデルを用いてＳＴＲ、ＩＲ、及びＤＲＩの各スコアを提供する。
【０１３８】
治験中に、且つ／又は、創薬の為に、代謝機能又は細胞機能の陽性又は陰性の変化を監視する為に、ＳＴＲ、ＩＲ、及び／又はＤＲＩの各スコアのうちの１つ以上も使用されてよく、或いは、代替として使用されてよい。
【０１３９】
ＳＴＲ、ＩＲ、及び／又はＤＲＩの各評価は、グルコース測定値と切り離されてよく、スクリーニングツールとして比較的簡単に生成でき、リスクを抱えた人を従来の検査より早期に識別できる可能性がある。
【０１４０】
本明細書では、「未処理生物試料」という用語は、塊の分光分析の為の試料標本と異なり、採取後に物理的又は化学的に変質する処理が行われない（ただし、緩衝剤及び希釈剤は使用されてよい）生物試料を意味する。従って、生物試料が採取された後、その生物試料の各成分は、変質されたり除去されたりしない。例えば、血清生物試料が採取された後、その血清に対して、血清から何らかの成分を除去する処理は行われない。実施形態によっては、未処理生物試料に対して濾過処理及び／又は限外濾過が行われない。
【０１４１】
実施形態によっては、患者のグルコース測定値が、リポタンパク質粒子の測定値、ＧｌｙｃＡ及びバリンの測定値とともに、生物試料のＮＭＲスペクトルのＮＭＲ分析により取得されてよい。しかしながら、グルコース測定値が使用される場合、グルコース測定値は、従来の化学的な方法で取得されてもよい。
【０１４２】
特定の実施形態によっては、単一の（血液／血漿）インビトロ生物試料のＧｌｙｃＡ、バリン、及びリポタンパク質のＮＭＲ測定値を分析することにより、重要な臨床情報を与え、且つ／又は、更に、患者又は被験者が２型糖尿病を発症するか、且つ／又は、将来に前糖尿病を有するリスクの予測又は評価を改良することが可能になると考えられる。
【０１４３】
図６Ａは、本発明の実施形態による、ＭＥＳＡの５年でのＴ２ＤＭへの転化（ｎ＝３５９／４２１１）に基づく、グルコースカテゴリ（低リスク、中リスク、高リスク）に対する糖尿病転化率のグラフであり、これは、中リスクのグルコース患者に関して、Ｔ２ＤＭに進行するリスクが高まっている患者を階層化又はよりよく識別することの満たされていないニーズを示している。図６Ｂは、本発明の実施形態による、ＩＲＡＳの５年でのＴ２ＤＭへの転化（ｎ＝１３４／９７８）に基づく、グルコースカテゴリ（低リスク、中リスク、高リスク）に対する糖尿病転化率のグラフであり、これも、特に低リスク又は中リスクのグルコース領域に入ると考えられる患者について、Ｔ２ＤＭに進行するリスクが高まっている患者を階層化又はよりよく識別することの満たされていないニーズを示している。図６Ａ／６Ｂは、グルコースレベル（「低」＜１００、「高」≧１００、グルコースレベルが１００〜１２５という高い範囲にある場合に「前糖尿病」と呼ばれることがある）に基づいて割り当てられたリスクと、「高くない」（＜１５％の５年転化）、「高い」（１５〜２５％）、「非常に高い」（＞２５％）として（暗黙的に）カテゴライズされたｙ軸に示される実際のリスクと、を対比させている。ＭＥＳＡでは、例えば、グルコース＜１００である「低リスク」の３９＋８７人が糖尿病を発症しており、従って、彼らのリスクは実際には低くはなかった。本発明の実施形態によって与えられるＤＲＩスコアは、「低リスク」と推定されている人々を、本当に低リスクである人々と、高リスク、更には超高リスクである人々とに細分することが可能である（これらは、各グルコースカテゴリ内で予測糖尿病率の範囲を広く取ることにより、よりよく示される）。
【０１４４】
図７は、ＭＥＳＡ調査母集団（ｎ＝３４５０）の諸特性のチャートである。
【０１４５】
図８は、ＧｌｙｃＡ、バリン、及びリポタンパク質の各サブクラスのピーク領域を示すＮＭＲスペクトルのグラフである。
【０１４６】
図９は、ＨＤＬ−Ｐ中の３つの定義済みレベル（高、中、低）についてのＧｌｙｃＡレベル（μｍｏｌ／Ｌ）に対する予測短期糖尿病転化率のグラフであり、ＧｌｙｃＡの約８０パーセンタイルレベルにおいて高ＨＤＬ−Ｐ中が「良い」から「悪い」に転じることを示している。高ＨＤＬ−Ｐ中線は、左側では低い線で表されており、この線は、右側ではリスクがより高い最上線まで上昇する。低ＨＤＬ−Ｐ中線は、（炎症が増えて）ＧＬｙｃＡレベルが大きくなるにつれてリスク関連付けが減ることを示す線上の星々で示される。
【０１４７】
ＨＤＬ−Ｐ中の各値は、２５パーセンタイル、５０パーセンタイル、及び７５パーセンタイルを表す９、１２．９、及び１７．１７であってよい。ＭＥＳＡ（ｎ＝１８１／３４５０）における短期糖尿病転化の場合の糖尿病転化の予測確率は、空腹時血漿グルコース（ＦＰＧ）＝１０５ｍｇ／ｄＬ及び５０パーセンタイルｅＬＰ−ＩＲスコア（０．９０）を有する予言的６０歳白人女性のロジスティック回帰に基づいてよい。
【０１４８】
ＧｌｙｃＡの濃度範囲は、典型的には、約２２０〜５００μｍｏｌ／Ｌの範囲であり、これには両端の数値が含まれる。
【０１４９】
図１０は、図２Ｂとよく似たブロック図であり、ｅＬＰ−ＩＲスコア及びＳＤＲＦスコアを生成する為に各注目成分とともに使用されてよい例示的係数を有する例示的数学式を示している。ｅＬＰ−ＩＲスコアとＳＤＲＦスコアとを結合することにより、ＤＲＩ  スコアを生成することが可能である。実施形態によっては、ユーザに対して、評価用として、各スコアが提供されてよく、或いは、様々なスコアのうちの１つが提供されてよい。
【０１５０】
ｅＬＰ−ＩＲスコアは、典型的には、約０．１から１．８の範囲であり、ＭＥＳＡなどの母集団標準を基準母集団として使用するパーセンタイル値の形で患者及び／又は臨床医にレポートされてよい。
【０１５１】
ＳＤＲＦスコアは、典型的には、約−６．４から−１．６の範囲であり、やはりパーセンタイル単位でレポートされてよい。
【０１５２】
ＤＲＩスコアは、典型的には、レポート目的の為に、１から１０の範囲になるように変換される。即ち、ここで与えられている例示的範囲は、ｅＬＰ−ＩＲ及びＳＤＲＦの「ロー」出力値、即ち、図１０のピラミッドの下にある２式によって生成される値の範囲である。レポート目的の為に、ＳＤＲＦ値及びｅＬＰ−ＩＲ値は、（例えば、１〜１００個のスコアを与える）パーセンタイル値に数学的に変更／変換されてよい。
【０１５３】
図１１Ａは、ＭＥＳＡ調査において、それぞれ＜９５ｍｇ／ｄＬ、９５〜９９ｍｇ／ｄＬ、及び１００〜１１０ｍｇ／ｄＬのグルコースカテゴリにある参加者についてのＤＲＩ予測糖尿病転化率（％）の範囲を有する縦棒を示すグラフであり、これは、同じ狭いグルコース範囲内にある人々のリスクをＤＲＩスコアがいかに階層化できるかを示す。
【０１５４】
図１１Ｂは、本発明の実施形態による、ＩＲＡＳ調査において、それぞれ＜９５ｍｇ／ｄＬ、９５〜９９ｍｇ／ｄＬ、及び１００〜１１０ｍｇ／ｄＬのグルコースカテゴリにある参加者についてのＤＲＩ予測糖尿病転化率（％）の範囲を示す同様のグラフであり、これは、同じグルコース範囲内にある人のリスクをＭＥＳＡ導出ＤＲＩリスクモデルが階層化できることを実証するものである。
【０１５５】
図１２は、ＭＥＳＡ（ｎ＝３４４６）における（ＨＯＭＡ−ＩＲで評価される）インスリン抵抗性を予測する３つの線形回帰モデルに含まれるパラメータを示すチャートである。各パラメータの、インスリン抵抗性との関連付けの強さが、１標準偏差増分当たりのｌｎ（ＨＯＭＡ−ＩＲ）の差分として与えられている。ｅＬＰ−ＩＲは、本発明の実施形態による、式２Ａにおいて注目される例示的β係数がインスリン抵抗性のｅＬＰ−ＩＲ多重マーカパラメータに寄与するモデル２パラメータで表されてよい。式２Ｂは、式２Ａをより一般化したものであり、（Ａ〜Ｅで示された）係数値が、（例えば、別の調査母集団、及び／又は、別の炎症マーカ、別のＩＲ、又は別のＢＣＡＡパラメータに基づいて）式２Ａで示されたものと異なってよいことを認めるものである。
ｅＬＰ−ＩＲ＝（０．００９３５）（ＬＰ−ＩＲ）＋（０．００１６８７）（バリン）−（０．００２５９４）（ＶＬＤＬ−Ｐ中）−（０．０１０９６）（ＨＤＬ−Ｐ中）＋（０．０００８４８）（ＧｌｙｃＡ）  式２Ａ
ｅＬＰ−ＩＲ＝（Ａ）（ＬＰ−ＩＲ）＋（Ｂ）（バリン）−（Ｃ）（ＶＬＤＬ−Ｐ中）−（Ｄ）（ＨＤＬ−Ｐ中）＋（Ｅ）（ＧｌｙｃＡ）  式２Ｂ
【０１５６】
図１３は、本発明の実施形態による、短期リスクのＳＤＲＦ多重マーカパラメータに寄与するパラメータのチャートであり、これらは、短期（ｎ＝１８１／３４５０）又は長期（ｎ＝２８６／３２６９）の糖尿病転化を従属変数とするＭＥＳＡのロジスティック回帰から得られたものである。様々なモデルにおける各パラメータの関連付けの強さが、１標準偏差増分当たりのオッズ比（ＯＲ）によって与えられている。ＳＤＲＦは、短期糖尿病転化に関して、β係数を使用する式３Ａを用いて、モデル４から導出された。式３Ｂは、式３Ａをより一般化したものであり、（Ａ〜Ｃで示された）係数値が、（例えば、別の調査母集団、及び／又は、別の炎症マーカ、又は別の相互作用パラメータに基づいて）式３Ａで示されたものと異なってよいことを認めるものである。
ＳＤＲＦ＝−（０．３５２）（ＨＤＬ−Ｐ中）−（０．０１０８）（ＧｌｙｃＡ）＋（０．０００９６９）（ＧｌｙｃＡ×ＨＤＬ−Ｐ中）  式３Ａ
ＳＤＲＦ＝−（Ａ）（ＨＤＬ−Ｐ中）−（Ｂ）（ＧｌｙｃＡ）＋（Ｃ）（ＧｌｙｃＡ×ＨＤＬ−Ｐ中）  式３Ｂ
【０１５７】
式２Ａ及び３Ａからの「ロー」のｅＬＰ−ＩＲリスクスコア及びＳＤＲＦリスクスコアは、それぞれが、レポート目的の為に、ＭＥＳＡなどの基準母集団内のパーセンタイル値に基づく、１から１００の範囲のそれぞれのスコアに変換されてよい。そのようなｅＬＰ−ＩＲのケースでは、０．７より小さい（２５パーセンタイル未満の）値、及び１．１より大きい（７５パーセンタイル以上の）値が、それぞれ、２型糖尿病を発症するリスクが低いこと、及び高いことを示しうる。そのようなＳＤＲＦのケースでは、−４．１より小さい（２５パーセンタイル未満の）値、及び−３．８より大きい（７５パーセンタイル以上の）値が、それぞれ、比較的短期間のうちに糖尿病に転化するリスクが低いこと、及び高いことを示しうる。ＳＤＲＦ及びｅＬＰ−ＩＲのロースコアの範囲の例を、以下の表４に示す。
ｅＬＰ−ＩＲスコア及びＳＤＲＦスコアの、ＭＥＳＡにおけるパーセンタイル値
【表４】
2020144137.tif 000006
【０１５８】
ＩＲ（例えば、ｅＬＰ−ＩＲ）に対する定義済みＨＤＬ−Ｐ副母集団は、ＳＤＲＦに使用されるＨＤＬ−Ｐ副母集団と異なってよいが、典型的には、ＳＤＲＦスコアの計算に使用される同じ定義済みＨＤＬ−Ｐ副母集団の同じ濃度測定値である。
【０１５９】
ＳＤＲＦ及びｅＬＰ−ＩＲの各スコア又はパラメータを結合して、複合又は累積ＤＲＩスコアとしてよい。実施形態によっては、グルコースが１１０ｍｇ／ｄＬ未満である人々における５年糖尿病転化のロジスティック回帰モデルを使用して、ＳＤＲＦスコア及びＩＲスコア（例えば、ｅＬＰ−ＩＲ）の係数（重み）が選択／定義されてよい。選択された重み因子は、ＩＲＡＳにおける５年リスクを評価する際の別の調査で妥当性を検査されてよい。
【０１６０】
ＭＥＳＡ（５−ｙ）及びＩＲＡＳ（５−ｙ）の両方、並びにＭＥＳＡ長期（〜１０−ｙ）におけるロジスティックモデルが生成されることにより、それら３つの状況でのＳＤＲＦ及びｅＬＰ−ＩＲに対する係数及びχ２値の例が与えられた。これらは例に過ぎず、ｅＬＰ−ＩＲ及び／又はＳＤＲＦの各成分、例えば、バリンやＧｌｙｃＡのアッセイが調節されてよく、或いは、例えば、他のＩＲモデル／スコア、他の炎症マーカ、又は他のＢＣＡＡが使用されてもよい。当業者にはよく知られているように、ロジスティックモデルを様々な成分で実行することによって、係数が選択／定義されてよい。表５は、ＤＲＩスコア用のＸ因子及びＹ因子（式１）を与える為に使用されてよい例示的係数を示すチャートである。ここで、ＳＤＲＦは、１０年転化においてはほどんど値がない。
【０１６１】
ＤＲＩスコア用の例示的なＸ係数及びＹ係数
【表５】
2020144137.tif 000007
【０１６２】
実施形態によっては、「ロー」ＤＲＩ値は、約−３．０から約＋１．８の範囲であってよいが、他のロースコア範囲も可能である。ＤＲＩロースコアは、任意選択で、例えば、１〜１０又は０〜１０の定義済み標準化スコア範囲に変換されてよい。
【０１６３】
従って、例えば、実施形態によっては、第１の係数セット（ＭＥＳＡ５年）を使用して、ＤＲＩ式がＤＲＩ＝２．１０１７（ｅＬＰ−ＩＲ）＋０．５１６３（ＳＤＲＦ）であってよい。
【０１６４】
実施形態によっては、パーセンタイルを使用せずに、ＤＲＩ範囲を、幾つかの均等部分のセット、例えば、１０〜５０個、典型的には、２０個の均等部分にセグメント化して、ロー値を０．５刻みで１から１０の範囲のＤＲＩスコア値（即ち、０．５、１．０、１．５、…、１０）に変換することによってリスク評価を与えることが可能であり、それぞれにおいては、より大きな値が、より小さな値よりリスクが高いことを表している。
【０１６５】
図１４は、本発明の実施形態による、ＩＲＡＳにおける５．２年の追跡の間の糖尿病への転化（ｎ＝１３４／９７６）を示すチャートであり、ＭＥＳＡを用いて開発されたモデルの妥当性を実証するものである。このデータは、５年糖尿病転化（実際には５．２年転化）を従属変数とする、ＩＲＡＳにおけるロジスティック回帰に基づいている。５つの回帰モデルの相対的な予測値が、尤度比（ＬＲ）χ２統計と、ＲＯＣ曲線（ＡＵＣ）の下の面積とによって与えられる。示された各変数の関連付けの強さが、１標準偏差増分当たりのオッズ比（ＯＲ）によって与えられる。Ｓｉは、頻繁にサンプルされる静脈内耐糖能検査によって測定されるインスリン感受性である。図１４は又、ｅＬＰ−ＩＲによって与えられる糖尿病リスク関連付けが、先行のＬＰ−ＩＲより（ＬＲχ２が１１９．９に対して１２４．２と）改善されることを示している。
【０１６６】
図１５は、本発明の実施形態による、ＧｌｙｃＡ及びＨＤＬ−Ｐ中の各自のレベル（三分位数による低、中、又は高）でカテゴライズされたＩＲＡＳ参加者（全員の空腹時グルコースが１１０ｍｇ／ｄＬ以下）の９つの副母集団において（予測ではなく）観察された５年糖尿病転化率に基づく相互作用パラメータの意味を示すチャートである。例えば、ＧｌｙｃＡレベルが低い場合（三分位数の下位）、ＨＤＬ−Ｐ中レベルは、糖尿病リスクとの間に強い逆相関がある（ＨＤＬ−Ｐ中が高いときの転化率が２．３％、低いときの転化率が１０．１％）。これに対し、ＧｌｙｃＡレベルが高い場合（三分位数の上位）、ＨＤＬ−Ｐ中が高レベルであることはよいことではなく、実際、転化率は、ＨＤＬ−Ｐ中が低レベルの場合（転化率が１２．９％）より悪くなっている（１７．８％）。
【０１６７】
図１６は、本発明の実施形態による、インスリン抵抗性（ＩＲ）及びＳＤＲＦスコアが高レベル又は低レベルである架空の患者についての、時間経過（年）に対する空腹時グルコース（ｍｇ／ｄＬ）の例示的グラフであり、これは、ＳＤＲＦスコア及びＩＲ（例えばｅＬＰ−ＩＲ）スコアを中程度か低いグルコース値とともに使用することにより、グルコース値が時間経過に対して安定するか、（例えば、短期間であれ長期間であれ）将来の糖尿病につながる道筋を有するかを予測することが可能であることを示す。例えば、ＳＤＲＦスコア及びＩＲスコアの両方が上昇した（例えば、７５パーセンタイルを超えた）と示された場合、グルコースの道筋は、比較的短い時間枠で、例えば、検査時点から約２〜３年以内に、上昇する可能性がより高くなる。
【０１６８】
図１７は、短期リスクの程度（例えば、ＳＤＲＦスコア）を与える例示的レポートであり、その変化を監視することによって、時間経過に対するβ細胞機能／機能障害の評価が行われてよく、又、レポートにおける基準セグメント又は履歴セグメントとして与えられてよい。ローＳＴＲスコアが第３三分位数以上であれば、例えば、−３．８（７５パーセンタイル）より大きければ、比較的短期間、例えば、検査後２年未満で糖尿病に転化するリスクが高いことを示していることになる。
【０１６９】
図２０Ａ〜２０Ｃも、別のグルコースレベルでの同じＤＲＩスコアを与える例示的レポートである。これらのレポートは、炎症マーカ（例えば、ＧｌｙｃＡ）及びＢＣＡＡ（例えば、バリン）に関する別個のスコアを与えることも可能である。
【０１７０】
ＤＲＩスコアは、関連付けられた５年リスクカテゴリとともに与えられてもよい。５年リスク時間軸は、患者がより長い時間軸の場合よりも積極的な対応（例えば、ダイエット、運動、又は薬物療法）を行うように潜在的に仕向けるか促すことで、患者にとって臨床的意義があると考えられている。しかしながら、より長い時間軸が用いられてもよい。ＤＲＩスコア（例えば、糖尿病リスク指数）は、単独で、或いは、患者のＦＰＧスコアに対する相対的なリスクのグラフによる解釈セグメントとともに提供されてよい。履歴レポートは、ＳＴＲスコア又はＤＲＩスコアをＦＰＧスコアと相互に関連付けてよい。ＦＰＧスコアが比較的一定のままであっても、ＳＴＲスコア、ＩＲスコア、又はＤＲＩスコアが増大したとすれば、これらのスコアは、糖尿病への進行を示している可能性がある。
【０１７１】
図２０Ａ〜２０Ｃは、患者らのＤＲＩスコアが同じ７．５であっても、各自のＦＰＧレベルに基づいて、５年リスクカテゴリが、それぞれ「非常に高い」、「高い」、及び「低い」のように示される、異なるリスクを有しうることを示している。
【０１７２】
図１８は、本発明の実施形態による、例示的患者レポートの概略図であり、このレポートは、ＤＲＩスコア、（インスリン抵抗性に関連付けられた）ＩＲスコア、及び（β細胞機能に関連付けられた）ＳＴＲスコアのうちの１つ以上を、他のリポタンパク質パラメータ及び／又は代謝パラメータ（例えば、炎症マーカ）とともに与えることが可能である。
【０１７３】
図１９は、本発明の実施形態による、時間経過に対するＤＲＩスコア、ＩＲスコア、又はＳＴＲスコアのうちの１つ以上における変化を評価する為に使用されてよい例示的グラフであり、これは、治療の適用量又はタイプに基づいてよく、或いは相互に関連付けられてよい。
【０１７４】
ＧｌｙｃＡレベルは、１７．８を乗ずることによってメチル基濃度単位（μｍｏｌ／Ｌ）に変換できる「任意の単位」のＮＭＲで測定されてよい。
【０１７５】
次に図２１を参照すると、幾つかの特定の実施形態では、ＳＴＲスコア、ＩＲスコア、及び／又はＤＲＩスコアの測定の、全てでなくともほとんどは、システム１０上で、又はシステム１０を使用して実施できると考えられており、システム１０は、ＮＭＲ臨床分析器２２と通信しているか、少なくとも一部がＮＭＲ臨床分析器２２の基板上にあり、ＮＭＲ臨床分析器２２については、例えば、図２２に関して後述されており、且つ／又は、参照により内容があたかも本明細書に完全に記載されているかのように本明細書に組み込まれている米国特許出願第８，０１３，６０２号に記載されている。
【０１７６】
システム１０は、ＳＴＲ、ＩＲ、及び／又はＤＲＩの各糖尿病リスク指数（例えば、スコア）のモジュール３７０を含んでよく、モジュール３７０は、複数のリスクスコア（例えば、ＨＤＬ副母集団、ＧｌｙｃＡ、バリン）のうちの１つ又は全ての成分を特定することに適したデータを収集する。システム１０は分析回路２０を含んでよく、分析回路２０は少なくとも１つのプロセッサ２０ｐを含み、プロセッサ２０ｐは分析器２２の基板上にあってよく、或いは少なくとも一部分が分析器２２から離れていてよい。後者の場合、モジュール３７０及び／又は回路２０は、全体又は一部分がサーバ１５０上にあってよい。サーバ１５０は、計算リソースをコンピュータネットワーク経由でオンデマンド提供することを含むクラウドコンピューティングにより提供されてよい。それらのリソースは、様々なインフラストラクチャサービス（例えば、コンピュータ、ストレージ等）、並びにアプリケーション、データベース、ファイルサービス、電子メール等として実施されてよい。従来型のコンピューティングモデルでは、典型的には、データとソフトウェアの両方がユーザのコンピュータに全て収容されているが、クラウドコンピューティングでは、ユーザのコンピュータは、ソフトウェア又はデータをほとんど収容しなくてよく（おそらくはオペレーティングシステム及び／又はウェブブラウザだけを収容していればよく）、外部コンピュータのネットワークにおいて発生するプロセスの為のディスプレイ端末と大差ない役割であってよい。クラウドコンピューティングサービス（又は複数のクラウドリソースの集合体）を、まとめて「クラウド」と称してよい。クラウドストレージは、データが、１つ以上の専用サーバでホストされるのではなく、複数の仮想サーバに格納される、ネットワーク化されたコンピュータデータのモデルを含んでよい。データ転送は、暗号化されてよく、業界標準又は規制基準（例えば、ＨＩＰＡＡ）に適合する任意の適切なファイアウォールを使用して、インターネットを介して実施されてよい。「ＨＩＰＡＡ」という用語は、医療保険の相互運用性と説明責任に関する法律（Ｈｅａｌｔｈ  Ｉｎｓｕｒａｎｃｅ  Ｐｏｒｔａｂｉｌｉｔｙ  ａｎｄ  Ａｃｃｏｕｎｔａｂｉｌｉｔｙ  Ａｃｔ）によって規定された米国法を意味する。患者データは、アクセッション番号又は識別子、性別、年齢、及び検査データを含んでよい。
【０１７７】
分析の結果は、インターネットなどのコンピュータネットワークを介して、電子メールなどによって、患者、電子ディスプレイ５０Ｄを含んでよい臨床医の現場５０、健康保険代理店５２、又は薬局５１及び／又は患者５３に送信されてよい。結果は、分析現場から直接送信されてよく、或いは間接的に送信されてもよい。結果は、印刷されてよく、且つ、従来式のメールで送信されてよい。この情報は、薬局及び／又は医療保険会社、更には患者に送信されてもよく、これは、不利な事象のリスクが高まる結果をもたらしうる処方又は薬剤使用を監視する為であり、或いは、矛盾する薬剤の処方を防ぐ医療警告を発する為である。結果は、「家庭用」コンピュータ、又は、スマートフォンやノートＰＣなどの広く浸透しているコンピュータ装置に宛てた電子メールにより、患者に送信されてよい。結果は、例えば、レポート全体の電子メール添付として、或いはテキストメッセージ警告として、送信されてよい。
【０１７８】
図２１を更に参照すると、様々なユーザ（例えば、臨床医の現場５０、患者５２Ｄ、及び／又は検査室又は実験室６０）に関連付けられた１つ以上の電子装置５０Ｄ、５１Ｄ、５３Ｄ、６０Ｄが、それぞれの電子装置のディスプレイと通信する電子分析回路１５５にアクセスするように構成されてよい。分析回路１５５は、サーバ１５０においてホストされてよく、様々な装置に対して、インターネットポータル又はダウンロード可能ＡＰＰ又は他のコンピュータプログラムを提供してよい。回路１５５は、ユーザ（例えば、臨床医）が（ｉ）患者のグルコース値、（ｉｉ）患者のグルコース値と糖尿病リスク指数スコア、又は（ｉｉｉ）糖尿病リスク指数スコアのうちの１つ以上を入力することを可能にするように構成されてよい。この回路は、患者のサインイン時の識別子又は他のパスワードに基づいて様々なデータフィールドを自動的に埋めてよく、或いは、ユーザがそれぞれの患者についてのＳＴＲスコア、ＩＲスコア、又はＤＲＩスコア、並びにグルコース測定値のうちの１つ以上を入力することを可能にしてよい。分析回路は、時間経過に対するＳＴＲスコア、ＩＲスコア、及び／又はＤＲＩスコアの変化を追跡して、臨床医、患者、又は他のユーザに送信されることが可能な電子レポートを生成するように構成されてよい。分析回路は又、例えば、ＳＴＲ、ＩＲ、又はＤＲＩの各リスクスコアが上昇したり、低リスク値を超えたりした場合に、再検査、追跡検査などを推奨する通知を送信してもよく、例えば、中リスクカテゴリにおいて、分析回路は、グルコース検査を行うことが適切であることを臨床医に通知したり、グルコース検査を行うことが適切であるかどうか、或いは、ＤＲＩ検査以後の監視間隔を広げることが望ましいかどうかを医師と相談して確認するよう患者に通知したりしてよい。
【０１７９】
分析回路１５５及び／又は２０は、グルコース値が中リスク範囲にある場合、即ち、空腹時血漿グルコースレベルが９０〜１１０ｍｇ／ｄＬの範囲にある場合、Ａ１Ｃ％レベルが５．７〜６．４の範囲にある場合、又は経口耐糖能レベルが１４０〜１９９ｍｇ／ｄＬの範囲にある場合に、グルコース値が同じである複数の患者について、将来２型糖尿病を発症するリスクを階層化するグラフィック情報を提供する為のリスク進行経路又は分析を生成することが可能である。この電子分析回路は、クラウドにおいてサーバ１５０の基板上にあるか、又はインターネット２２７を介してアクセス可能であってよく、或いは、当業者であれば理解されるように、別のクライアントアーキテクチャに関連付けられてよい。従って、臨床医、患者、又は他のユーザが、リスク進行についてのカスタマイズされたレポートを生成したり、他の方法でリスク階層化情報を取得したりすることが可能である。
【０１８０】
次に図２２を参照すると、各生物試料に関するＮＭＲスペクトルを少なくとも１つ取得するシステム２０７が示されている。システム２０７は、試料のＮＭＲ測定のＮＭＲデータを取得するＮＭＲ分光計２２ｓ及び／又は分析器２２を含む。一実施形態では、分光計２２ｓは、プロトン信号に対して約４００ＭＨｚでＮＭＲ信号取得を実施するように構成され、他の実施形態では、測定が、約２００ＭＨｚから約９００ＭＨｚ、又は他の適切な周波数で実施されてよい。所望の動作磁界強度に対応する他の周波数が使用されてもよい。典型的には、プロトンフロープローブが設置され、これは、試料温度を４７±０．５℃に保つ温度制御装置である。分光計２２ｓは、デジタルコンピュータ２１４又は他の信号処理装置によって制御されてよい。コンピュータ２１１は、高速フーリエ変換が実施可能でなければならない。コンピュータ２１１は又、別のプロセッサ又はコンピュータ２１３へのデータリンク２１２、並びに、ハードメモリストレージ装置２１５及び／又はリモートサーバ１５０（図１５）に接続可能なダイレクトメモリアクセスチャネル２１４を含んでもよい。
【０１８１】
デジタルコンピュータ２１１は、アナログデジタル変換器と、デジタルアナログ変換器と、パルス制御及びインタフェース回路２１６を介して分光計の作用素子と接続する低速デバイスＩ／Ｏポートと、のセットを含んでもよい。これらの素子は、デジタルコンピュータ２１１によって指示される継続時間、周波数、及び大きさを有するＲＦ励起パルスを生成するＲＦ送信器２１７と、そのパルスを増幅して、試料セル２２０及び／又はフロープローブ２２０ｐを取り囲むＲＦ送信コイル２１９と結合させるＲＦ電力増幅器２１８と、を含む。超伝導磁石２２１によって生成される９．４テスラの分極磁界の存在下で励起された試料から生成されるＮＭＲ信号が、コイル２２２によって受信され、ＲＦ受信器２２３に印加される。増幅及び濾波されたＮＭＲ信号が２２４で復調され、結果として得られた直交信号がインタフェース回路２１６に印加され、そこで、直交信号はデジタイズされてデジタルコンピュータ２１１に入力される。糖尿病リスク評価モジュール３７０又は分析回路２０、１５５（図２１）は、デジタルコンピュータ２１１に関連付けられた１つ以上のプロセッサの中にあってよく、、且つ／又は、現場にあるか離れていて、インターネット２２７などのワールドワイドネットワークを介してアクセス可能なセカンダリコンピュータ２１３又は他のコンピュータの中にあってよい。
【０１８２】
測定セル２２０内の試料からＮＭＲデータが取得された後、コンピュータ２１１による処理によって、別のファイルが生成され、これは、必要に応じて、ストレージ２１５に格納されてよい。この第２のファイルは、化学シフトスペクトルのデジタル表現であり、これは、その後、コンピュータ２１３に読み取られて、そのストレージ２２５に格納されるか、１つ以上のサーバに関連付けられたデータベースに格納される。コンピュータ２１３は、パーソナルコンピュータ、ラップトップコンピュータ、デスクトップコンピュータ、ワークステーション、ノートＰＣ、タブレット、又は他のコンピュータであってよく、コンピュータ２１３は、そのメモリに格納されているプログラムの指示の下で、本発明の教示に従って化学シフトスペクトルを処理してレポートを生成し、このレポートは、プリンタ２２６に出力されてよく、或いは、電子的に保存され、所望の電子メールアドレス又はＵＲＬまで中継されてよい。当業者であれば理解されるように、他の出力装置、例えば、コンピュータディスプレイ画面、ノートＰＣ、スマートフォンなども、結果の表示に使用されてよい。
【０１８３】
当業者にとっては当然のことながら、コンピュータ２１３及びその外部ストレージ２２５によって実施される機能は、分光計のデジタルコンピュータ２１１によって実施される機能に組み込まれてもよい。そのような場合、プリンタ２２６は、デジタルコンピュータ２１１に直接接続されてよい。当業者にはよく知られている、他のインタフェース及び出力装置も使用されてよい。
【０１８４】
本発明の実施形態は、全体がソフトウェアである実施形態、又はソフトウェア態様とハードウェア態様とが結合された実施形態の形をとってよく、本明細書では全てをまとめて「回路」又は「モジュール」と称する。
【０１８５】
当業者であれば理解されるように、本発明は、装置、方法、データ又は信号の処理システム、又はコンピュータプログラム製品として実施されてよい。従って、本発明は、全体がソフトウェアである実施形態、又はソフトウェア態様とハードウェア態様とが結合された実施形態の形をとってよい。更に、本発明の実施形態によっては、コンピュータで使用可能なストレージ媒体において実施される、コンピュータで使用可能なプログラムコード手段を有する、その媒体に格納されたコンピュータプログラム製品の形をとってよい。ハードディスク、ＣＤ−ＲＯＭ、光ストレージ装置、磁気ストレージ装置など、任意の適切なコンピュータ可読媒体が利用されてよい。
【０１８６】
コンピュータで使用可能な、又はコンピュータ可読な媒体は、電子式、磁気式、光学式、電磁式、赤外線式、又は半導体式のシステム、装置、デバイス、又は伝搬媒体であってよく、これらに限定されない。コンピュータ可読媒体のより具体的な例（非網羅的な列挙）として、１つ以上のワイヤを有する電気接続、可搬型コンピュータディスケット、ランダムアクセスメモリ（ＲＡＭ）、読み出し専用メモリ（ＲＯＭ）、消去可能プログラム可能読み出し専用メモリ（ＥＰＲＯＭ又はフラッシュメモリ）、光ファイバ、可搬型コンパクトディスク読み出し専用メモリ（ＣＤ−ＲＯＭ）などがあってよい。なお、コンピュータで使用可能な、又はコンピュータ可読な媒体は、紙、又は別の適切な媒体であってもよく、プログラムは、印刷されたら、（例えば、その紙又は他の媒体の光学式スキャンにより）電子的に取り込まれ、コンパイルされ、解釈されるか、必要に応じて他の適切な方法で処理されて、コンピュータメモリに格納されてよい。
【０１８７】
本発明の動作を実施する為のコンピュータプログラムコードは、オブジェクト指向プログラミング言語で書かれてよく、例えば、Ｊａｖａ（登録商標）７、Ｓｍａｌｌｔａｌｋ、Ｐｙｔｈｏｎ、Ｌａｂｖｉｅｗ、Ｃ＋＋、ＶｉｓｕａｌＢａｓｉｃなどで書かれてよい。しかしながら、本発明の動作を実施する為のコンピュータプログラムコードは、従来の手続き型プログラミング言語で書かれてもよく、例えば、「Ｃ」プログラミング言語や、更にはアセンブリ言語で書かれてもよい。プログラムコードは、全てがユーザのコンピュータで実行されてもよく、一部分がユーザのコンピュータでスタンドアロンソフトウェアパッケージとして実行されてもよく、一部分がユーザのコンピュータで実行されて一部分がリモートコンピュータで実行されてもよく、全てがリモートコンピュータで実行されてもよい。上記の後の方のシナリオでは、リモートコンピュータは、ローカルエリアネットワーク（ＬＡＮ）、又はワイドエリアネットワーク（ＷＡＮ）、又はセキュアドエリアネットワーク（ＳＡＮ）を介してユーザのコンピュータと接続されてよく、或いは、（例えば、インターネットサービスプロバイダを使用し、インターネットを介して）外部コンピュータと接続されてよい。
【０１８８】
本明細書の図面の幾つかのフローチャート及びブロック図は、本発明による分析モデル及び評価システム及び／又はプログラムの可能な実施態様のアーキテクチャ、機能性、及び動作を示している。これに関連して、フローチャート又はブロック図の各ブロックは、モジュール、セグメント、動作、又はコード部分を表しており、これらは、指定された論理機能を実施する為の１つ以上の実行可能命令を含む。又、代替実施態様によっては、それらのブロックに記された機能の実行が、図面に記された順序どおりでなくてもよいことにも注意されたい。例えば、連続するように示された２つのブロックが、実際にはほぼ同時に実行される可能性があり、或いは、それらのブロックが、関連する機能性に応じて、逆の順序で実行されることもありうる。
【０１８９】
図２３は、本発明の実施形態によるシステム、方法、及びコンピュータプログラム製品を示す、データ処理システム３０５の例示的実施形態のブロック図である。プロセッサ３１０は、アドレス／データバス３４８を介してメモリ３１４と通信する。プロセッサ３１０は、任意の市販のマイクロプロセッサ、又はカスタムマイクロプロセッサであってよい。メモリ３１４は、データ処理システム３０５の機能性を実施する為に使用されるソフトウェア及びデータを格納するメモリデバイスの階層全体を表す。メモリ３１４のデバイスのタイプとしては、キャッシュ、ＲＯＭ、ＰＲＯＭ、ＥＰＲＯＭ、ＥＥＰＲＯＭ、フラッシュメモリ、ＳＲＡＭ、ＤＲＡＭなどがあってよく、これらに限定されない。
【０１９０】
図２３に示されるように、メモリ３１４は、データ処理システム３０５で使用される幾つかのカテゴリのソフトウェア及びデータを含んでよく、それらは、オペレーティングシステム３５２、アプリケーションプログラム３５４、入出力（Ｉ／Ｏ）デバイスドライバ３５８、ＳＴＲ、ＩＲ、及び／又はＤＲＩリスクスコアモジュール３７０、データ３５６などであってよい。モジュール３７０は、ＧｌｙｃＡ、リポタンパク質成分、及びバリン、並びに任意選択でグルコースの各測定値を含んでよい定義済み多重マーカＳＴＲ及びＩＲパラメータの定義済み代謝パラメータ及びリポタンパク質パラメータのレベルについて、定義済み時間軸（例えば、次の５年）の間に２型糖尿病を発症するリスク、又は前糖尿病になる可能性の多重パラメータ数学的モデルにおいて考察することが可能である。
【０１９１】
データ３５６は、データ又は信号取得システム３２０から取得できるリポタンパク質パラメータ及び代謝パラメータ３６２の信号（成分及び／又は複合スペクトル線形）又は測定データを含んでよい。当業者であれば理解されるように、オペレーティングシステム３５２は、データ処理システムでの使用に適する任意のオペレーティングシステムであってよく、例えば、ＩＢＭ社（Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｂｕｓｉｎｅｓｓ  Ｍａｃｈｉｎｅｓ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ、アーモンク、ニューヨーク州）のＯＳ／２、ＡＩＸ、又はＯＳ／３９０、マイクロソフト社（Ｍｉｃｒｏｓｏｆｔ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ、レドモンド、ワシントン州）のＷｉｎｄｏｗｓＣＥ、ＷｉｎｄｏｗｓＮＴ、Ｗｉｎｄｏｗｓ９５、Ｗｉｎｄｏｗｓ９８、Ｗｉｎｄｏｗｓ２０００、又はＷｉｎｄｏｗｓＸＰ、パーム社（Ｐａｌｍ，  Ｉｎｃ．）のＰａｌｍＯＳ、アップルコンピュータ社（Ａｐｐｌｅ  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ）のＭａｃＯＳ、ＵＮＩＸ（登録商標）、ＦｒｅｅＢＳＤ、又はＬｉｎｕｘ（登録商標）、（例えば、埋め込みデータ処理システム用の）独自オペレーティングシステム又は専用オペレーティングシステムであってよい。
【０１９２】
Ｉ／Ｏデバイスドライバ３５８は、典型的には、アプリケーションプログラム３５４が、Ｉ／Ｏデータポート、データストレージ３５６、及び特定のメモリ３１４コンポーネント及び／又は分析器２２などのデバイスと通信する為に、オペレーティングシステム３５２を介してアクセスするソフトウェアルーチンを含んでよい。アプリケーションプログラム３５４は、データ処理システム３０５の様々な機能を実施するプログラムを示しており、本発明の実施形態による動作をサポートする少なくとも１つのアプリケーションを含んでよい。最後に、データ３５６は、アプリケーションプログラム３５４、オペレーティングシステム３５２、Ｉ／Ｏデバイスドライバ３５８、及び他の、メモリ３１４に常駐可能なソフトウェアプログラムで使用される静的データ及び動的データを表す。
【０１９３】
例として図２３のアプリケーションプログラムであるモジュール３７０に関して本発明を説明したが、当業者であれば理解されるように、本発明の教示が役立つ他の構成も利用されてよい。例えば、モジュール３７０は、オペレーティングシステム３５２、Ｉ／Ｏデバイスドライバ３５８、又は他のそのような、データ処理システム３０５の論理部分に組み込まれてもよい。従って、本発明は、図２３の構成に限定されると解釈されるべきではなく、本明細書に記載の動作を実施できるあらゆる構成を包含することを意図されている。
【０１９４】
図２４は、本発明の実施形態を実施できる例示的動作のフローチャートである。実施形態によっては、炎症マーカはＮＭＲ導出のＧｌｙｃＡであり、これは、ブロック５００、５０２、５１５、５２０に関連付けられたアクション、並びに任意選択で、５０３、４１２、及び５２２に関連付けられたアクションを用いてよい。しかしながら、他の炎症マーカが使用される場合、本方法は、幾つかの実施形態によれば、ブロック４２３、５２４、５２５、及び５２６を含んでよい。
【０１９５】
ＧｌｙｃＡが炎症マーカである場合、本方法は、生物試料（例えば、血漿又は血清）のフィッティング領域からＮＭＲスペクトルのうちの（測定された）複合エンベロープＮＭＲスペクトルを取得するステップ（ブロック５００）を含んでよい。ＮＭＲ複合信号エンベロープは、ＨＤＬ、ＬＤＬ、及びＶＬＤＬ／カイロスの各成分を有する定義済みモデルと、ＧｌｙｃＡに関連付けられた定義済み化学シフト位置（例えば、２．００ｐｐｍ）に中心がある少なくともＧｌｙｃＡピーク領域に関連付けられる複数の曲線適合（例えば、ローレンツ型曲線）関数と、を使用して、電子的にデコンボリューションされる（ブロック５０２）。ＧｌｙｃＡに関連付けられたピーク領域に適用される、定義済みの数の曲線適合関数が合計されてよい（ブロック５１５）。合計された関数に転化因子を適用することによって、ＧｌｙｃＡの計算された測定値が生成されてよい（ブロック５２０）。
【０１９６】
本方法は、潜在的なβ細胞の機能障害及び／又は損傷、或いはβ細胞状態の変化を識別する為にＳＴＲリスク因子スコアを与えるステップ（ブロック５２３）を含んでよい。この状態変化は、（例えば、薬剤治療などの）療法に関連付けられた改善又は更なる損傷であってよい。
【０１９７】
本方法は、インスリン抵抗性、並びに、典型的には５〜７年以内に２型糖尿病に転化又は進行するリスクに関連付けられたＩＲリスクスコアを与えるステップ（ブロック５２４）を含んでよい。
【０１９８】
本方法は、ＩＲスコアとＳＴＲスコアとを結合するステップ（ブロック５２５）と、２型糖尿病を発症するか、且つ／又は前糖尿病を有するリスクが患者にあるかどうかを、ＩＲスコアとＳＴＲスコアとが結合されたＤＲＩスコアに基づいて識別するステップ（ブロック５２６）と、を含んでよい。ＩＲスコアは、ＤＲＩスコアに対する入力をＳＴＲスコアより大きくする為に、その重み付けされないスコアより値が大きくなるように重み付けされてよく、或いは、長期評価においてより支配的となるスコアを最初から有してよい。
【０１９９】
ＳＴＲスコア及びＩＲスコアの生成に、定義済みのリポタンパク質パラメータ及び代謝パラメータの為の関連付けられた定義済み係数を有する定義済みリスクモデルを使用することにより、１〜１０の範囲のＤＲＩスコアを生成するＳＴＲスコア及びＩＲスコアが生成されてよい。
【０２００】
任意選択で、患者及び／又は治験レポートにおいてＤＲＩスコア及び／又はＧｌｙｃＡスコアが与えられてよい（ブロック５２２）。
【０２０１】
定義済みＧｌｙｃＡデコンボリューションモデルは、信号複合エンベロープからデコンボリューション／分離可能な、約１．２１ｇ／Ｌを超える密度のタンパク質信号成分を含んでよい（ブロック５０３）。
【０２０２】
上記は、本発明を例示するものであり、本発明を限定するものと解釈されるべきではない。本発明の幾つかの例示的実施形態を説明してきたが、当業者であれば容易に理解されるように、これらの例示的実施形態においては、本発明の新規な教示及び利点から著しく逸脱しない範囲で、様々な修正が可能である。従って、そのような修正は全て、特許請求の範囲において定義される本発明の範囲に含まれるものとする。特許請求の範囲においてミーンズプラスファンクション節が使用されている場合、これは、本明細書に記載の構造を、記載された機能を実施するものとして包含し、且つ、構造的均等物のみならず均等な構造も包含するものとする。従って、当然のことながら、上記は、本発明を例示するものであって、開示された特定の実施形態に限定されるように解釈されるべきではなく、本開示の実施形態に対する修正、並びに他の実施形態は、添付の特許請求の範囲に含まれるものとする。本発明は、以下の特許請求の範囲によって定義され、特許請求の範囲に対する均等物は特許請求の範囲に含まれるものとする。
【０２０３】
〔付記１〕
患者が２型糖尿病を発症するか、且つ／又は膵β細胞の損傷及び／又は機能障害を有するリスクを評価する方法であって、
２型糖尿病を発症するリスクの定義済み数学的モデルを使用して、患者の短期糖尿病リスク因子（ＳＤＲＦ）スコアをプログラムで計算するステップであって、前記定義済み数学的モデルは、定義済み高密度リポタンパク質粒子（ＨＤＬ−Ｐ）副母集団の濃度測定値と、少なくとも１つの炎症マーカの濃度測定値と、前記計算されたＳＤＲＦスコアを生成する為にそれぞれの定義済み係数と数学的に結合された、前記モデルの各成分である少なくとも１つの相互作用パラメータの濃度測定値と、を含み、前記患者は、前記ＳＤＲＦスコアが母集団標準の第３三分位数値以上であれば、３年以内に２型糖尿病に転化するリスクがあるか、且つ／又は、β細胞機能障害のリスクがある、前記ステップを含む方法。
〔付記２〕
前記定義済みＨＤＬ−Ｐ副母集団は中ＨＤＬ−Ｐである、付記１に記載の方法。
〔付記３〕
前記炎症マーカはＧｌｙｃＡであり、前記相互作用パラメータは、ＧｌｙｃＡに中ＨＤＬ−Ｐの濃度を乗じたものであり、前記患者は、中ＨＤＬ−Ｐ値及びＧｌｙｃＡ値が前記母集団標準の第３三分位数値内にあれば、β細胞機能障害のリスクがある、付記２に記載の方法。
〔付記４〕
インスリン抵抗性の定義済み数学的モデルを使用して、前記患者のインスリン抵抗性（ＩＲ）スコアをプログラムで計算するステップを更に含む、付記１から３のいずれか一項に記載の方法。
〔付記５〕
前記ＩＲスコアの為の、インスリン抵抗性の前記定義済み数学的モデルは、複数の成分を含み、前記複数の成分は、前記患者の少なくとも１つのインビトロ生物試料から取得される、前記ＳＤＲＦスコアの計算に使用されてよい、定義済みＨＤＬ−Ｐ副母集団の濃度測定値と、前記炎症マーカの測定値と、ＶＬＤＬ−Ｐ（超低密度リポタンパク質／カイロミクロン粒子サブクラス）の定義済み副母集団の測定値と、０〜１００の範囲を有するＩＲ指数であって、前記範囲は、低から高、インスリン感受性からインスリン抵抗性までを表す、前記ＩＲ指数と、分岐鎖アミノ酸（ＢＣＡＡ）の測定値と、を含む、付記４に記載の方法。
〔付記６〕
ＩＲの前記定義済み数学的モデルの前記成分は、前記ＩＲスコアを生成する為に数学的に結合される、付記５に記載の方法。
〔付記７〕
ＶＬＤＬ−Ｐの前記定義済み副母集団の前記測定値は、中ＶＬＤＬ−Ｐの濃度であり、前記ＢＣＡＡはバリンである、付記４に記載の方法。
〔付記８〕
前記ＳＤＲＦスコアと前記ＩＲスコアとを結合することにより、糖尿病リスクスコアをプログラムで計算するステップを更に含む、付記４に記載の方法。
〔付記９〕
前記ＳＤＲＦスコア及び前記ＩＲスコアの係数を、ＳＤＲＦ及びＩＲを含むロジスティック回帰モデルから導出して、少なくとも１つの定義済み母集団調査を行って実際の５年での糖尿病転化を予測することにより、前記患者のグルコース値にかかわらず５年以内に転化するリスクを有するＤＲＩスコアが生成される、付記８に記載の方法。
〔付記１０〕
前記患者の測定されたグルコース値及び／又はＨｂＡ１ｃ値を評価するステップと、前記グルコース測定値及び前記ＤＲＩスコアに基づく、５年で２型糖尿病に転化するリスクのリスク推定値を有するレポートを電子的に提供するステップと、を更に含む、付記１から９のいずれか一項に記載の方法。
〔付記１１〕
前記ＳＤＲＦスコアは次式で計算され、
ＳＤＲＦスコア＝−（Ａ）（ＨＤＬ−Ｐ中）−（Ｂ）（ＧｌｙｃＡ）＋（Ｃ）（ＧｌｙｃＡ×ＨＤＬ−Ｐ中）、
Ａ、Ｂ、及びＣは、２型糖尿病を発症するリスクの前記定義済み数学的モデルとしての、短期糖尿病転化のロジスティック回帰モデルからの定義済みβ係数であり、ＧｌｙｃＡは前記炎症マーカであり、ＨＤＬ−Ｐ中は中サイズのＨＤＬ−Ｐ副母集団であり、ＧｌｙｃＡ×ＨＤＬ−Ｐ中は前記相互作用パラメータである、
付記１から１０のいずれか一項に記載の方法。
〔付記１２〕
前記ＩＲスコアは、次式で計算されるｅＬＰ−ＩＲスコアであり、
ｅＬＰ−ＩＲ＝（Ａ）（ＬＰ−ＩＲ）＋（Ｂ）（バリン）−（Ｃ）（ＶＬＤＬ−Ｐ中）−（Ｄ）（ＨＤＬ−Ｐ中）＋（Ｅ）（ＧｌｙｃＡ）、
Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、及びＥは、インスリン抵抗性に関する線形回帰モデルからの定義済みβ係数であり、ＧｌｙｃＡは前記炎症マーカであり、ＨＤＬ−Ｐ中は、中ＨＤＬ−Ｐ副母集団の濃度であり、ＶＬＤＬ−Ｐ中は、中ＶＬＤＬ−Ｐ副母集団の濃度であり、バリンは分岐鎖アミノ酸であり、ＬＰ−ＩＲは、６つの定義済みリポタンパク質サブクラスを使用して計算されるリポタンパク質インスリン抵抗性指数であって、インスリン感受性からインスリン抵抗性までを表す０〜１００の範囲の数値を有する、
付記４から１１のいずれか一項に記載の方法。
〔付記１３〕
ＳＤＲＦスコアを使用して、薬物療法を評価するステップ、治験を評価するステップ、又は創薬の候補を評価するステップのうちの少なくとも１つを更に含む、付記１に記載の方法。
〔付記１４〕
それぞれの生物試料から、時間経過に対する複数の前記ＳＤＲＦスコアを計算することにより、ＳＤＲＦスコアの変化を評価して、β細胞機能障害の変化を識別するステップを更に含む、付記１に記載の方法。
〔付記１５〕
前記ＳＤＲＦスコアに関連付けられたロースコアは−６．４と−１．６の間にあり、−４．１は前記調査母集団の約２５パーセンタイルに関連付けられており、−３．８より大きな値は前記調査母集団の約７５パーセンタイルに関連付けられており、−３．８より大きな値は、血糖値に関係なく、β細胞機能障害のリスク、及び／又は２型糖尿病への早期転化のリスクが高まっていることを示しており、血糖測定値が普通である患者の、２型糖尿病への転化のリスクを、様々なＳＤＲＦスコアに対して階層化できる、付記１に記載の方法。
〔付記１６〕
前記ＳＤＲＦスコアは、定義済み数値スコア範囲内でレポートに与えられ、母集団標準の第４四分位数（４Ｑ）、第５五分位数（５Ｑ）、又は第１０十分位数に関連付けられるスコアは、２年以内に２型糖尿病を発症するリスク、及び／又はβ細胞機能障害のリスク、及び／又はβ細胞の損傷のリスクが、より低いスコアに比べて高まっていることを反映する、付記１に記載の方法。
〔付記１７〕
前記ＨＤＬ−Ｐ副母集団は、直径が、８．３ｎｍから、９．４ｎｍ、１０．０ｎｍ、又は１０．２ｎｍのうちのいずれかまでの範囲である中ＨＤＬ粒子サブクラスだけを含む、付記１に記載の方法。
〔付記１８〕
次式を使用してＤＲＩスコアを生成するステップを更に含み、
ＤＲＩスコア＝Ｘ（ＩＲスコア）＋Ｙ（ＳＤＲＦ）、
Ｘ及びＹは、定義済み調査母集団を使用する、グルコース値が110ｍｇ／ｄＬより低い人々の５年糖尿病転化のロジスティック回帰モデルによって定義される係数であり、前記ＤＲＩスコアは、可能なＤＲＩロースコアの範囲にわたって複数の均等な副部分を使用するＤＲＩスコア範囲に数学的に変更される、
付記４から１７のいずれか一項に記載の方法。
〔付記１９〕
リスクを抱えながら、β細胞機能を改善又は安定化する療法の効果が見込まれるか、且つ／又は、患者のインスリン生成能力の改善が見込まれる患者を識別する方法であって、
患者の生物試料の定義済みリポタンパク質成分及び代謝成分の測定値を結合することにより、短期リスクスコアを電子的に生成するステップであって、前記成分は、高密度リポタンパク質粒子（ＨＤＬ−Ｐ）副母集団と、前記ＨＤＬ−Ｐ副母集団及び炎症マーカを使用する相互作用パラメータと、を含む、前記ステップを含む方法。
〔付記２０〕
膵β細胞機能を改善し、且つ／又は２型糖尿病（Ｔ２ＤＭ）を防ぐ、再構成ＨＤＬの静注などの薬物療法の効果が見込まれる患者を識別する方法であって、
患者の生物試料の定義済みリポタンパク質成分及び代謝成分の測定値を使用して、定義済み短期糖尿病リスク因子（ＳＤＲＦ）スコアを生成するステップであって、前記成分は、高密度リポタンパク質粒子（ＨＤＬ−Ｐ）副母集団と、前記ＨＤＬ−Ｐ副母集団及び炎症マーカを使用する相互作用パラメータと、を含む、前記ステップと、
ＳＤＲＦスコアが定義済み母集団標準より高くなった患者を識別するステップであって、前記高くなったＳＤＲＦスコアは、前記患者において、膵β細胞機能を改善し、且つ／又はＴ２ＤＭを防ぐ療法の効果が見込まれることを示す、前記ステップと、
を含む方法。
〔付記２１〕
少なくとも１つのプロセッサを使用して実施される、付記１から２０のいずれか一項に記載の方法。
〔付記２２〕
前記ＳＤＲＦスコアに関する前記生物試料の前記測定値は、ＮＭＲ導出の測定値である、付記１から２１のいずれか一項に記載の方法。
〔付記２３〕
患者が２型糖尿病に転化するリスクを評価する方法であって、
（ａ）次式を使用してＳＤＲＦスコアをプログラムで計算するステップであって、
ＳＤＲＦスコア＝−（Ａ）（ＨＤＬ−Ｐ中）−（Ｂ）（ＧｌｙｃＡ）＋（Ｃ）（ＧｌｙｃＡ×ＨＤＬ−Ｐ中）、
Ａ、Ｂ、及びＣは、２型糖尿病を発症するリスクの前記定義済み数学的モデルとしての、短期糖尿病転化のロジスティック回帰モデルからの定義済みβ係数であり、ＧｌｙｃＡは前記炎症マーカであり、ＨＤＬ−Ｐ中は中サイズのＨＤＬ−Ｐ副母集団であり、ＧｌｙｃＡ×ＨＤＬ−Ｐ中は前記相互作用パラメータである、前記ステップと、
（ｂ）次式を使用してｅＬＰ−ＩＲスコアをプログラムで計算するステップであって、
ｅＬＰ−ＩＲ＝（Ａ）（ＬＰ−ＩＲ）＋（Ｂ）（バリン）−（Ｃ）（ＶＬＤＬ−Ｐ中）−（Ｄ）（ＨＤＬ−Ｐ中）＋（Ｅ）（ＧｌｙｃＡ）、
Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、及びＥは、インスリン抵抗性に関する線形回帰モデルからの定義済みβ係数であり、ＧｌｙｃＡは前記炎症マーカであり、ＨＤＬ−Ｐ中は、中ＨＤＬ−Ｐ副母集団の濃度であり、ＶＬＤＬ−Ｐ中は、中ＶＬＤＬ−Ｐ副母集団の濃度であり、バリンは分岐鎖アミノ酸であり、ＬＰ−ＩＲは、６つの定義済みリポタンパク質サブクラスを使用して計算されるリポタンパク質インスリン抵抗性指数であって、インスリン感受性からインスリン抵抗性までを表す０〜１００の範囲の数値を有する、前記ステップと、
（ｃ）次式を使用してＤＲＩロースコアをプログラムで生成するステップであって、
ＤＲＩロースコア＝Ｘ（ｅＬＰ−ＩＲ）＋Ｙ（ＳＤＲＦ）、
Ｘ及びＹは、定義済み調査母集団を使用する、グルコース値が１１０ｍｇ／ｄＬより低い人々の５年糖尿病転化のロジスティック回帰モデルによって定義される係数であり、前記ＤＲＩロースコアは、可能なＤＲＩロースコアの範囲にわたって複数の均等な副部分を使用する０〜１０又は１〜１０の範囲に数学的に変更される、前記ステップと、
を含む方法。
【図１Ａ】
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【図１Ｂ】
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【図２Ａ】
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【図２Ｂ】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０Ａ】
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【図２０Ｂ】
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【図２０Ｃ】
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【図２１】
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【図２２】
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【図２３】
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【図２４】
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