(57)【要約】  本発明の課題は、３’末端の水酸基を擬似固相保護基で保護され、５’末端の水酸基を保護されたｎ個重合オリゴヌクレオチドを原料として、（１）５’末端の水酸基の脱保護工程、（２）３’位水酸基がホスホロアミダイト化されたｐ個重合オリゴヌクレオチドの添加による５’末端への伸長工程、および（３）ホスファイトトリエステルの酸化工程または硫化工程、を連続的に液中で行うことにより、効率的かつ高収率で、ｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドを製造する方法を提供することである。  脱保護工程において特定のカチオン捕捉剤を添加すること、脱保護反応終了後に中和処理を施すこと、および酸化工程または硫化工程で特定の酸化剤または硫化剤を使用することにより、上記課題が解決できることを見出した。【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の工程（１）〜（３）を含有する、オリゴヌクレオチドの製造方法。
（１）非極性溶媒中において、３’位水酸基が擬似固相保護基で保護され、かつ５’位水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されたｎ個重合オリゴヌクレオチド（ｎは、１以上の任意の整数を示す。）、酸、ならびにピロール誘導体およびインドール誘導体から選択される少なくとも一種のカチオン捕捉剤を反応させて５’位水酸基の一時保護基を除去した後、有機塩基により中和する工程、
（２）工程（１）の中和後の反応液に、３’位水酸基がホスホロアミダイト化され、かつ５’位水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されたｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｐは、１以上の任意の整数を示す。）を添加して、工程（１）で得られた５’位水酸基の一時保護基が除去されたｎ個重合オリゴヌクレオチドと、その５’位水酸基を介してホスファイトトリエステル結合により縮合させる工程、ならびに
（３）工程（２）の反応液に、酸化剤または硫化剤を添加して、工程（２）で得られたｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドのホスファイトトリエステル結合を、ホスフェートトリエステル結合またはチオホスフェートトリエステル結合へと変換する工程。
【請求項２】
ｐが１である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
更に、下記工程（４）を含有する、請求項１または２に記載の方法。
（４）工程（３）で得られた反応液に極性溶媒を添加して、ｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドを沈殿させて、固液分離により取得する工程。
【請求項４】
更に、下記工程（５）を含有する、請求項３に記載の方法。
（５）工程（４）で得られたｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドの保護基を全て除去する工程。
【請求項５】
酸性条件下で除去可能な一時保護基が、ジメトキシトリチル基、またはモノメトキシトリチル基である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
非極性溶媒が、ハロゲン系溶媒、芳香族系溶媒、エステル系溶媒、脂肪族系溶媒、非極性エーテル系溶媒、およびこれらの組合せからなる群より選択される溶媒である、請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
非極性溶媒が、ジクロロメタン、クロロホルム、１，２−ジクロロエタン、ベンゼン、トルエン、キシレン、メシチレン、ヘキサン、ペンタン、ヘプタン、ノナン、シクロヘキサン、酢酸エチル、酢酸イソプロピル、ｔｅｒｔ−ブチルメチルエーテル、シクロペンチルメチルエーテル、およびこれらの組合せからなる群より選択される溶媒である、請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
極性溶媒が、アルコール系溶媒、またはニトリル系溶媒である、請求項３〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
極性溶媒が、メタノール、またはアセトニトリルである、請求項３〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
ピロール誘導体またはインドール誘導体が、ピロール、３−メチルピロール、２，４−ジメチルピロール、インドール、４−メチルインドール、５−メチルインドール、６−メチルインドール、７−メチルインドール、５，６−ジメチルインドール、および６，７−ジメチルインドールからなる群より選択される少なくとも一種である、請求項１〜９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
酸化剤が、ヨウ素、（１Ｓ）−（＋）−（１０−カンファニルスルフォニル）オキサジリジン、ｔｅｒｔ−ブチルヒドロペルオキシド、２−ブタノンペルオキシド、１，１−ジヒドロペルオキシシクロドデカン、ビス（トリメチルシリル）ペルオキシド、またはｍ−クロロ過安息香酸である、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
硫化剤が、３−（（Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノメチリデン）アミノ）−３Ｈ−１，２，４−ジチアゾール−５−チオン、３Ｈ−１，２−ベンゾジチオール−３−オン−１，１−ジオキシド、３Ｈ−１，２−ベンゾジチオール−３−オン、フェニルアセチルジスルフィド、テトラエチルチウラムジスルフィド、３−アミノ−１，２，４−ジチアゾール−５−チオン、または硫黄である、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
酸が、トリフルオロ酢酸、ジクロロ酢酸、トリフルオロメタンスルホン酸、トリクロロ酢酸、メタンスルホン酸、塩酸、酢酸またはｐ−トルエンスルホン酸である、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
有機塩基が、ピリジン、２，４，６−トリメチルピリジン、ベンズイミダゾール、１，２，４−トリアゾール、Ｎ−フェニルイミダゾール、２−アミノ−４，６−ジメチルピリミジン、１，１０−フェナントロリン、イミダゾール、Ｎ−メチルイミダゾール、２−クロロベンズイミダゾール、２−ブロモベンズイミダゾール、２−メチルイミダゾール、２−フェニルベンズイミダゾール、Ｎ−フェニルベンズイミダゾール、および５−ニトロベンズイミダゾールからなる群より選択される少なくとも一種である、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
脱保護ステップにおいて、ピロール誘導体、およびインドール誘導体から選択される少なくとも一種のカチオン捕捉剤を含有することを特徴とする、連続的改良ホスホロアミダイト法によるオリゴヌクレオチドの製造方法。
【請求項１６】
一般式（Ｉ）：
【化１】
2012157723.tif 000055
［式中、
Ｌは、式（ａ１）：
【化２】
2012157723.tif 000056
（式中、＊は、Ｙとの結合位置を示し；
＊＊は、保護される基との結合位置を示し；
Ｌ１は、置換されていてもよい２価のＣ１−２２炭化水素基を示し；かつ
Ｌ２は、単結合を示すか、または＊＊Ｃ（＝Ｏ）Ｎ（Ｒ２）−Ｒ１−Ｎ（Ｒ３）＊＊＊（式中、＊＊は、Ｌ１との結合位置を示し、＊＊＊は、Ｃ＝Ｏとの結合位置を示し、Ｒ１は、置換されていてもよいＣ１−２２アルキレン基を示し、Ｒ２およびＲ３は、それぞれ独立して、水素原子もしくは置換されていてもよいＣ１−２２アルキル基を示すか、またはＲ２およびＲ３が一緒になって、置換されていてもよいＣ１−２２アルキレン結合を形成していてもよい。）で表される基を示す。）で示される基を示し、
Ｙは、酸素原子、またはＮＲ（Ｒは、水素原子、アルキル基またはアラルキル基を示す。）を示し、ならびに
Ｚは、式（ａ２）：
【化３】
2012157723.tif 000057
［式中、＊は、Ｙとの結合位置を示し；
Ｒ４は、水素原子であるか、あるいはＲｂが、下記式（ａ３）で表される基である場合には、Ｒ６と一緒になって単結合または−Ｏ−を示して、環Ｂと共にフルオレニル基またはキサンテニル基を形成していてもよく； 
ｋ個のＲ５は、独立してそれぞれ炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を有する有機基を示し；
ｋは、１〜４の整数を示し；
環Ａは、ｋ個のＯＲ５に加えて、更にハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルキル基、およびハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基からなる群から選択される置換基を有していてもよく；
Ｒａは、水素原子を示し；ならびに
Ｒｂは、水素原子、または式（ａ３）：
【化４】
2012157723.tif 000058
（式中、＊は、結合位置を示し；
ｊは、０〜４の整数を示し；
ｊ個のＲ７は、独立してそれぞれ炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を有する有機基を示し；
Ｒ６は、水素原子を示すか、またはＲ４と一緒になって単結合または−Ｏ−を示して、環Ａと共にフルオレニル基またはキサンテニル基を形成していてもよく；かつ
環Ｂは、ｊ個のＯＲ７に加えて、更にハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルキル基、およびハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基からなる群から選択される置換基を有していてもよい。）で表される基を示す。］で表される基を示す。］
で示される、擬似固相保護基。
【請求項１７】
一般式（ＩＩ）：
【化５】
2012157723.tif 000059
［式中、
ｍは、０以上の任意の整数を示し、
ｍ＋１個のＢａｓｅは、独立してそれぞれ保護されていてもよい核酸塩基を示し、
Ｑは、水素原子、または酸性条件下で除去可能な一時保護基を示し、
Ｘは、水素原子、ハロゲン原子または保護されていてもよい水酸基を示し、
ｍ個のＸ’は、独立してそれぞれ水素原子、ハロゲン原子、または保護されていてもよい水酸基を示し、
ｍ個のＲ８は、独立してそれぞれ酸素原子もしくは硫黄原子を示し、
ｍ個のＷＧは、独立してそれぞれ電子吸引性基を示し、
Ｌは、式（ａ１）：
【化６】
2012157723.tif 000060
（式中、＊は、Ｙとの結合位置を示し；
＊＊は、ヌクレオチド３’水酸基との結合位置を示し；
Ｌ１は、置換されていてもよい２価のＣ１−２２炭化水素基を示し；かつ
Ｌ２は、単結合を示すか、または＊＊Ｃ（＝Ｏ）Ｎ（Ｒ２）−Ｒ１−Ｎ（Ｒ３）＊＊＊（式中、＊＊は、Ｌ１との結合位置を示し、＊＊＊は、Ｃ＝Ｏとの結合位置を示し、Ｒ１は、置換されていてもよいＣ１−２２アルキレン基を示し、Ｒ２およびＲ３は、それぞれ独立して、水素原子もしくは置換されていてもよいＣ１−２２アルキル基を示すか、またはＲ２およびＲ３が一緒になって、置換されていてもよいＣ１−２２アルキレン結合を形成していてもよい。）で表される基を示す。）で示される基を示し、
Ｙは、酸素原子、またはＮＲ（Ｒは、水素原子、アルキル基またはアラルキル基を示す。）を示し、ならびに
Ｚは、式（ａ２）：
【化７】
2012157723.tif 000061
［式中、＊は、Ｙとの結合位置を示し；
Ｒ４は、水素原子を示すか、あるいはＲｂが、下記式（ａ３）で表される基である場合には、Ｒ６と一緒になって単結合または−Ｏ−を示して、環Ｂと共にフルオレニル基またはキサンテニル基を形成していてもよく； 
ｋ個のＲ５は、独立してそれぞれ炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を有する有機基を示し；
ｋは、１〜４の整数を示し；
環Ａは、ｋ個のＯＲ５に加えて、更にハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルキル基、およびハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基からなる群から選択される置換基を有していてもよく；
Ｒａは、水素原子を示し；
かつＲｂは、水素原子、または式（ａ３）：
【化８】
2012157723.tif 000062
（式中、＊は、結合位置を示し；
ｊは、０〜４の整数を示し；
ｊ個のＲ７は、独立してそれぞれ炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を有する有機基を示し；
Ｒ６は、水素原子を示すか、またはＲ４と一緒になって単結合または−Ｏ−を示して、環Ａと共にフルオレニル基またはキサンテニル基を形成していてもよく；かつ
環Ｂは、ｊ個のＯＲ７に加えて、更にハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルキル基、およびハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基からなる群から選択される置換基を有していてもよい。）で表される基を示す。］で表される基を示す。］
で示されるヌクレオチド。
【請求項１８】
ｍが０である、請求項１７に記載のヌクレオチド。
【請求項１９】
一般式（ＩＩ）中のＬが、スクシニル基であり、かつ
Ｒ５および／またはＲ７が、炭素原子数１０〜４０のアルキル基である、請求項１７または１８に記載のヌクレオチド。
【請求項２０】
一般式（ＩＩ）中のＬが、スクシニル基であり、かつ
ＲａおよびＲｂが、共に水素原子であり、かつＲ５が、炭素原子数１０〜４０のアルキル基である、請求項１７または１８に記載のヌクレオチド。
【請求項２１】
一般式（ＩＩ）中のＬが、スクシニル基であり、かつ
Ｒ５および／またはＲ７が、炭素原子数１２〜３０のアルキル基である、請求項１７または１８に記載のヌクレオチド。
【請求項２２】
一般式（ＩＩ）中のＬが、スクシニル基であり、かつ
Ｙ−Ｚが、３，４，５−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ基、
３，５−ジ（ドコシルオキシ）ベンジルオキシ基、
３，５−ジ［３’，４’，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルオキシ基、
３，４，５−トリ［３’，４’，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルオキシ基、
３，４，５−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルアミノ基、
２，４−ジ（ドコシルオキシ）ベンジルアミノ基、
３，５−ジ（ドコシルオキシ）ベンジルアミノ基、
ジ（４−ドコシルオキシフェニル）メチルアミノ基、
４−メトキシ−２−［３’，４’，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルアミノ基、
４−メトキシ−２−［３’，４’，５’−トリ（オクタデシルオキシ）シクロヘキシルメチルオキシ］ベンジルアミノ基、
２，４−ジ（ドデシルオキシ）ベンジルアミノ基、
フェニル（２，３，４−トリ（オクタデシルオキシ）フェニル）メチルアミノ基、
ジ［４−（１２−ドコシルオキシドデシルオキシ）フェニル］メチルアミノ基、
３，５−ジ［３’，４’，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルアミノ基、および
３，４，５−トリ［３’，４’，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルアミノ基
からなる群より選択される基である、請求項１７または１８に記載のヌクレオチド。
【請求項２３】
Ｑが、モノメトキシトリチル基、またはジメトキシトリチル基である、請求項１７〜２２のいずれか一項に記載のヌクレオチド。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、特定のオリゴヌクレオチドの製造方法に関する。更に、特定の擬似固相保護基、および特定のヌクレオシドに関する。
【背景技術】
【０００２】
オリゴヌクレオチドの合成方法には、リン酸トリエステル法、Ｈ−ホスホネート法、ホスホロアミダイト法などがあり、現在ではホスホロアミダイト法を用いた固相合成（固相法）が最も汎用されている（非特許文献１）。固相法はプロセス最適化がなされ自動化も進んでおり、スピード面で有利であるが、設備制約上スケールアップに制限があり、試薬・原料を過剰に使用し、途中段階での反応の進行状況の確認、中間体構造解析等も困難という欠点がある。
一方、液相法によるオリゴヌクレオチドの合成方法も検討されてきたが、操作が煩雑であり収率も低いため、多重合度のオリゴヌクレオチドを大量かつ迅速に合成することは困難であった。【０００３】
近年、液相法と固相法のそれぞれの欠点を解消しようとする試みとして、モノメトキシポリエチレングリコール（ＭＰＥＧ）を保護基として用いるオリゴヌクレオチド製法が開示されている（非特許文献２〜４）。しかしながら２０量体までのＤＮＡの合成例が示されているものの、各反応での晶析単離操作が必須であることや、ＭＰＥＧ分子自身が単分子ではないために反応の進行状況等を確認することが困難であった。【０００４】
一方、疎水性基結合ヌクレオシドを用いたオリゴヌクレオチドの合成方法が開示されている（特許文献１）。当該方法により２１量体のオリゴヌクレオチドの合成が達成できたと報告されているが、５’−保護基の脱保護、カップリング、酸化の各工程で晶析単離操作が毎回実施されており、工程が著しく多く煩雑であった。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００５】
【特許文献１】特開２０１０−２７５２５４号公報
【非特許文献】
【０００６】
【非特許文献１】S. L. Beaucage, D. E. Bergstorm, G. D. Glick, R. A. Jones, Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry; John Wiley & Sons (2000)
【非特許文献２】Nucleic Acid Res., 1990, Vol.18, No.11, 3155-3159
【非特許文献３】Nucleic Acid Res., 1993, Vol.21, No.5, 1213-1217
【非特許文献４】Bioconjugate Chem., 1997, Vol.8, No.6, 793-797
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
本発明者らは、上記課題を鑑みて鋭意検討した結果、特に、特許文献１に記載の疎水性基結合ヌクレオシドを用いたオリゴヌクレオチドの合成方法では、脱保護工程において遊離保護基（すなわち、カチオン）の捕捉剤として使用されているメタノールは次工程のカップリング反応の阻害物質となるゆえに、完全除去する必要があり、その目的のために晶析単離工程、共沸除去工程などの煩雑な操作が必須であることが分かった。
また、特許文献１に例示されているメタノール以外のカチオン捕捉剤が使用された場合には、脱保護剤として使用される酸の中和工程において５’−水酸基が再保護化などの副反応が起こることが判明し、酸を中和でなく、晶析単離により除去する必要があることも判明した。
すなわち、本発明の課題は、疎水性基結合ヌクレオシドを用いたオリゴヌクレオチドの合成方法において、必須工程ともいうべき晶析単離工程を含む多工程を省略した、工業的に有利な製造方法を提供することである。
更に具体的には、３’末端の水酸基が擬似固相保護基で保護され、５’末端の水酸基が一時保護基で保護されたｎ個重合オリゴヌクレオチドを原料として、（１）一時保護基で保護された５’末端水酸基の脱保護工程、（２）３’位がホスホロアミダイト化されたｐ個重合オリゴヌクレオチド添加による５’末端への伸長工程、および（３）ホスファイトトリエステル部位の酸化工程または硫化工程、を各工程ごとに晶析単離を要せず、連続的に液中で行うことにより、効率的かつ高収率で、ｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｎ及びｐは、独立して、１以上の任意の整数を示す。）を製造する方法を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
本発明者らは鋭意検討の結果、一時保護基で保護された５’位水酸基の脱保護反応中または脱保護反応後に特定のカチオン捕捉剤を添加し、脱保護反応終了後に有機塩基により中和処理を施し、更に酸化剤または硫化剤で酸化処理または硫化処理を施すことにより、上記課題が解決できることを見出した。
本発明は以下を含む。
［１］以下の工程（１）〜（３）を含有する、オリゴヌクレオチドの製造方法。
（１）非極性溶媒中において、３’位水酸基が擬似固相保護基で保護され、かつ５’位水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されたｎ個重合オリゴヌクレオチド（ｎは、１以上の任意の整数を示す。）、酸、ならびにピロール誘導体およびインドール誘導体から選択される少なくとも一種のカチオン捕捉剤を反応させて５’位水酸基の一時保護基を除去した後、有機塩基により中和する工程、
（２）工程（１）の中和後の反応液に、３’位水酸基がホスホロアミダイト化され、かつ５’位水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されたｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｐは、１以上の任意の整数を示す。）を添加して、工程（１）で得られた５’位水酸基の一時保護基が除去されたｎ個重合オリゴヌクレオチドと、その５’位水酸基を介してホスファイトトリエステル結合により縮合させる工程、ならびに
（３）工程（２）の反応液に、酸化剤または硫化剤を添加して、工程（２）で得られたｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドのホスファイトトリエステル結合を、ホスフェートトリエステル結合またはチオホスフェートトリエステル結合へと変換する工程。
［２］ｐが１である、上記［１］に記載の方法。
［３］更に、下記工程（４）を含有する、上記［１］または［２］に記載の方法。
（４）工程（３）で得られた反応液に極性溶媒を添加して、ｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドを沈殿させて、固液分離により取得する工程。
［４］更に、下記工程（５）を含有する、上記［３］に記載の方法。
（５）工程（４）で得られたｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドの保護基を全て除去する工程。
［５］酸性条件下で除去可能な一時保護基が、ジメトキシトリチル基、またはモノメトキシトリチル基である、上記［１］〜［４］のいずれか一つに記載の方法。
［６］非極性溶媒が、ハロゲン系溶媒、芳香族系溶媒、エステル系溶媒、脂肪族系溶媒、非極性エーテル系溶媒、およびこれらの組合せからなる群より選択される溶媒である、上記［１］〜［５］のいずれか一つに記載の方法。
［７］非極性溶媒が、ジクロロメタン、クロロホルム、１，２−ジクロロエタン、ベンゼン、トルエン、キシレン、メシチレン、ヘキサン、ペンタン、ヘプタン、ノナン、シクロヘキサン、酢酸エチル、酢酸イソプロピル、ｔｅｒｔ−ブチルメチルエーテル、シクロペンチルメチルエーテル、およびこれらの組合せからなる群より選択される溶媒である、上記［１］〜［５］のいずれか一つに記載の方法。
［８］極性溶媒が、アルコール系溶媒、またはニトリル系溶媒である、上記［３］〜［７］のいずれか一つに記載の方法。
［９］極性溶媒が、メタノール、またはアセトニトリルである、上記［３］〜［７］のいずれか一つに記載の方法。
［１０］ピロール誘導体またはインドール誘導体が、ピロール、３−メチルピロール、２，４−ジメチルピロール、インドール、４−メチルインドール、５−メチルインドール、６−メチルインドール、７−メチルインドール、５，６−ジメチルインドール、および６，７−ジメチルインドールからなる群より選択される少なくとも一種である、上記［１］〜［９］のいずれか一つに記載の方法。
［１１］酸化剤が、ヨウ素、（１Ｓ）−（＋）−（１０−カンファニルスルフォニル）オキサジリジン、ｔｅｒｔ−ブチルヒドロペルオキシド、２−ブタノンペルオキシド、１，１−ジヒドロペルオキシシクロドデカン、ビス（トリメチルシリル）ペルオキシド、またはｍ−クロロ過安息香酸である、上記［１］〜［１０］のいずれか一つに記載の方法。
［１２］硫化剤が、３−（（Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノメチリデン）アミノ）−３Ｈ−１，２，４−ジチアゾール−５−チオン、３Ｈ−１，２−ベンゾジチオール−３−オン−１，１−ジオキシド、３Ｈ−１，２−ベンゾジチオール−３−オン、フェニルアセチルジスルフィド、テトラエチルチウラムジスルフィド、３−アミノ−１，２，４−ジチアゾール−５−チオン、または硫黄である、上記［１］〜［１０］のいずれか一つに記載の方法。
［１３］酸が、トリフルオロ酢酸、ジクロロ酢酸、トリフルオロメタンスルホン酸、トリクロロ酢酸、メタンスルホン酸、塩酸、酢酸またはｐ−トルエンスルホン酸である、上記［１］〜［１２］のいずれか一つに記載の方法。
［１４］有機塩基が、ピリジン、２，４，６−トリメチルピリジン、ベンズイミダゾール、１，２，４−トリアゾール、Ｎ−フェニルイミダゾール、２−アミノ−４，６−ジメチルピリミジン、１，１０−フェナントロリン、イミダゾール、Ｎ−メチルイミダゾール、２−クロロベンズイミダゾール、２−ブロモベンズイミダゾール、２−メチルイミダゾール、２−フェニルベンズイミダゾール、Ｎ−フェニルベンズイミダゾール、および５−ニトロベンズイミダゾールからなる群より選択される少なくとも一種である、上記［１］〜［１３］のいずれか一つに記載の方法。
［１５］脱保護ステップにおいて、ピロール誘導体、およびインドール誘導体から選択される少なくとも一種のカチオン捕捉剤を含有することを特徴とする、連続的改良ホスホロアミダイト法によるオリゴヌクレオチドの製造方法。
［１６］一般式（Ｉ）：【０００９】
【化１】
2012157723.tif 000002
【００１０】
［式中、
Ｌは、式（ａ１）：【００１１】
【化２】
2012157723.tif 000003
【００１２】
（式中、＊は、Ｙとの結合位置を示し；
＊＊は、保護される基との結合位置を示し；
Ｌ１は、置換されていてもよい２価のＣ１−２２炭化水素基を示し；かつ
Ｌ２は、単結合を示すか、または＊＊Ｃ（＝Ｏ）Ｎ（Ｒ２）−Ｒ１−Ｎ（Ｒ３）＊＊＊（式中、＊＊は、Ｌ１との結合位置を示し、＊＊＊は、Ｃ＝Ｏとの結合位置を示し、Ｒ１は、置換されていてもよいＣ１−２２アルキレン基を示し、Ｒ２およびＲ３は、それぞれ独立して、水素原子もしくは置換されていてもよいＣ１−２２アルキル基を示すか、またはＲ２およびＲ３が一緒になって、置換されていてもよいＣ１−２２アルキレン結合を形成していてもよい。）で表される基を示す。）で示される基を示し、
Ｙは、酸素原子、またはＮＲ（Ｒは、水素原子、アルキル基またはアラルキル基を示す。）を示し、ならびに
Ｚは、式（ａ２）：【００１３】
【化３】
2012157723.tif 000004
【００１４】
［式中、＊は、Ｙとの結合位置を示し；
Ｒ４は、水素原子であるか、あるいはＲｂが、下記式（ａ３）で表される基である場合には、Ｒ６と一緒になって単結合または−Ｏ−を示して、環Ｂと共にフルオレニル基またはキサンテニル基を形成していてもよく； 
ｋ個のＲ５は、独立してそれぞれ炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を有する有機基を示し；
ｋは、１〜４の整数を示し；
環Ａは、ｋ個のＯＲ５に加えて、更にハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルキル基、およびハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基からなる群から選択される置換基を有していてもよく；
Ｒａは、水素原子を示し；ならびに
Ｒｂは、水素原子、または式（ａ３）：【００１５】
【化４】
2012157723.tif 000005
【００１６】
（式中、＊は、結合位置を示し；
ｊは、０〜４の整数を示し；
ｊ個のＲ７は、独立してそれぞれ炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を有する有機基を示し；
Ｒ６は、水素原子を示すか、またはＲ４と一緒になって単結合または−Ｏ−を示して、環Ａと共にフルオレニル基またはキサンテニル基を形成していてもよく；かつ
環Ｂは、ｊ個のＯＲ７に加えて、更にハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルキル基、およびハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基からなる群から選択される置換基を有していてもよい。）で表される基を示す。］で表される基を示す。］
で示される、擬似固相保護基。
［１７］一般式（ＩＩ）：【００１７】
【化５】
2012157723.tif 000006
【００１８】
［式中、
ｍは、０以上の任意の整数を示し、
ｍ＋１個のＢａｓｅは、独立してそれぞれ保護されていてもよい核酸塩基を示し、
Ｑは、水素原子、または酸性条件下で除去可能な一時保護基を示し、
Ｘは、水素原子、ハロゲン原子、または保護されていてもよい水酸基を示し、
ｍ個のＸ’は、独立してそれぞれ水素原子、ハロゲン原子、または保護されていてもよい水酸基を示し、
ｍ個のＲ８は、独立してそれぞれ酸素原子もしくは硫黄原子を示し、
ｍ個のＷＧは、独立してそれぞれ電子吸引性基を示し、
Ｌは、式（ａ１）：【００１９】
【化６】
2012157723.tif 000007
【００２０】
（式中、＊は、Ｙとの結合位置を示し；
＊＊は、ヌクレオチド３’水酸基との結合位置を示し；
Ｌ１は、置換されていてもよい２価のＣ１−２２炭化水素基を示し；かつ
Ｌ２は、単結合を示すか、または＊＊Ｃ（＝Ｏ）Ｎ（Ｒ２）−Ｒ１−Ｎ（Ｒ３）＊＊＊（式中、＊＊は、Ｌ１との結合位置を示し、＊＊＊は、Ｃ＝Ｏとの結合位置を示し、Ｒ１は、置換されていてもよいＣ１−２２アルキレン基を示し、Ｒ２およびＲ３は、それぞれ独立して、水素原子もしくは置換されていてもよいＣ１−２２アルキル基を示すか、またはＲ２およびＲ３が一緒になって、置換されていてもよいＣ１−２２アルキレン結合を形成していてもよい。）で表される基を示す。）で示される基を示し、
Ｙは、酸素原子、またはＮＲ（Ｒは、水素原子、アルキル基またはアラルキル基を示す。）を示し、ならびに
Ｚは、式（ａ２）：【００２１】
【化７】
2012157723.tif 000008
【００２２】
［式中、＊は、Ｙとの結合位置を示し；
Ｒ４は、水素原子を示すか、あるいはＲｂが、下記式（ａ３）で表される基である場合には、Ｒ６と一緒になって単結合または−Ｏ−を示して、環Ｂと共にフルオレニル基またはキサンテニル基を形成していてもよく； 
ｋ個のＲ５は、独立してそれぞれ炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を有する有機基を示し；
ｋは、１〜４の整数を示し；
環Ａは、ｋ個のＯＲ５に加えて、更にハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルキル基、およびハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基からなる群から選択される置換基を有していてもよく；
Ｒａは、水素原子を示し；かつＲｂは、水素原子、または式（ａ３）：【００２３】
【化８】
2012157723.tif 000009
【００２４】
（式中、＊は、結合位置を示し；
ｊは、０〜４の整数を示し；
ｊ個のＲ７は、独立してそれぞれ炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を有する有機基を示し；
Ｒ６は、水素原子を示すか、またはＲ４と一緒になって単結合または−Ｏ−を示して、環Ａと共にフルオレニル基またはキサンテニル基を形成していてもよく；かつ
環Ｂは、ｊ個のＯＲ７に加えて、更にハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルキル基、およびハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基からなる群から選択される置換基を有していてもよい。）で表される基を示す。］で表される基を示す。］
で示されるヌクレオチド。
［１８］ｍが０である、上記［１７］に記載のヌクレオチド。
［１９］一般式（ＩＩ）中のＬが、スクシニル基であり、かつ
Ｒ５および／またはＲ７が、炭素原子数１０〜４０のアルキル基である、上記［１７］または［１８］に記載のヌクレオチド。
［２０］一般式（ＩＩ）中のＬが、スクシニル基であり、かつ
ＲａおよびＲｂが、共に水素原子であり、かつＲ５が、炭素原子数１０〜４０のアルキル基である、上記［１７］または［１８］に記載のヌクレオチド。
［２１］一般式（ＩＩ）中のＬが、スクシニル基であり、かつ
Ｒ５および／またはＲ７が、炭素原子数１２〜３０のアルキル基である、上記［１７］または［１８］に記載のヌクレオチド。
［２２］一般式（ＩＩ）中のＬが、スクシニル基であり、かつ
Ｙ−Ｚが、３，４，５−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ基、
３，５−ジ（ドコシルオキシ）ベンジルオキシ基、
３，５−ジ［３’，４’，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルオキシ基、
３，４，５−トリ［３’，４’，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルオキシ基、
３，４，５−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルアミノ基、
２，４−ジ（ドコシルオキシ）ベンジルアミノ基、
３，５−ジ（ドコシルオキシ）ベンジルアミノ基、
ジ（４−ドコシルオキシフェニル）メチルアミノ基、
４−メトキシ−２−［３’，４’，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルアミノ基、
４−メトキシ−２−［３’，４’，５’−トリ（オクタデシルオキシ）シクロヘキシルメチルオキシ］ベンジルアミノ基、
２，４−ジ（ドデシルオキシ）ベンジルアミノ基、
フェニル（２，３，４−トリ（オクタデシルオキシ）フェニル）メチルアミノ基、
ジ［４−（１２−ドコシルオキシドデシルオキシ）フェニル］メチルアミノ基、
３，５−ジ［３’，４’，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルアミノ基、および
３，４，５−トリ［３’，４’，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルアミノ基
からなる群より選択される基である、上記［１７］または［１８］に記載のヌクレオチド。
［２３］Ｑが、モノメトキシトリチル基、またはジメトキシトリチル基である、上記［１７］〜［２２］のいずれか一つに記載のヌクレオチド。
【発明の効果】
【００２５】
一時保護基で保護された５’末端水酸基の脱保護反応中または脱保護反応後に特定のカチオン捕捉剤を添加すること、脱保護反応終了後に中和処理を施すこと、および酸化工程または硫化工程で特定の酸化剤または硫化剤を使用することにより、３’末端水酸基が擬似固相保護基で保護され、かつ５’末端水酸基が一時保護基で保護されたｎ個重合オリゴヌクレオチドを原料として、（１）一時保護基で保護された５’末端水酸基の脱保護工程、（２）３’位がホスホロアミダイト化されたｐ個重合オリゴヌクレオチド添加による５’末端への伸長工程、および（３）ホスファイトトリエステル部位の酸化工程または硫化工程、をこの順序で連続的に液中で行うことにより、効率的かつ高収率で、ｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドを製造する方法を提供できるようになった。
【発明を実施するための形態】
【００２６】
本発明は、脱保護工程で特定のカチオン捕捉剤を添加すること、脱保護反応終了後に中和処理を施すこと、および酸化工程または硫化工程で特定の酸化剤または硫化剤を使用することにより、３’末端水酸基を擬似固相保護基で保護され、かつ５’末端水酸基を一時保護基で保護されたｎ個重合オリゴヌクレオチドを原料として、（１）一時保護基で保護された５’末端水酸基の脱保護工程、（２）３’位がホスホロアミダイト化されたｐ個重合オリゴヌクレオチド添加による５’末端への伸長工程、および（３）ホスファイトトリエステル部位の酸化工程または硫化工程、をこの順序で連続的に液中で行うことにより、効率的かつ高収率で、ｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドを製造する方法である。
【００２７】
文中で特に断らない限り、本明細書で用いるすべての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者に一般に理解されるのと同じ意味をもつ。本明細書に記載されたものと同様または同等の任意の方法および材料は、本発明の実施または試験において使用することができるが、好ましい方法および材料を以下に記載する。本明細書で言及したすべての刊行物および特許は、例えば、記載された発明に関連して使用されうる刊行物に記載されている、構築物および方法論を記載および開示する目的で、参照として本明細書に組み入れられる。
【００２８】
本明細書において、オリゴヌクレオチドの構成単位となる「ヌクレオシド」とは、核酸塩基が糖（例えば、リボース）の１’位にＮ−グリコシド化により結合された化合物を意味する。
【００２９】
本明細書において、「核酸塩基」とは、核酸の合成に使用されるものであれば特に制限されず、例えば、シトシル基、ウラシル基、チミニル基等のピリミジン塩基、アデニル基、グアニル基等のプリン塩基を挙げることができる。また、「保護されていてもよい核酸塩基」とは、例えば、アミノ基を有する核酸塩基であるアデニル基、グアニル基、またはシトシル基において、アミノ基が保護されていてもよいことを意味し、核酸塩基のアミノ基が５’位の脱保護条件に耐え得る保護基により保護されている核酸塩基が好ましい。かかる「アミノ基の保護基」としては、特に限定されず、例えば、プロテクティブ・グループス・イン・オーガニック・シンセシス（ＰＲＯＴＥＣＴＩＶＥ  ＧＲＯＵＰＳ  ＩＮ  ＯＲＧＡＮＩＣ  ＳＹＮＴＨＥＳＩＳ）、第３版、ジョン・ウィリー・アンド・サンズ（ＪＯＨＮ  ＷＩＬＬＹ＆ＳＯＮＳ）出版（１９９９年）等に記載されている保護基を挙げることができる。かかる「アミノ基の保護基」の具体例としては、例えば、ピバロイル基、ピバロイロキシメチル基、トリフルオロアセチル基、フェノキシアセチル基、４−イソプロピルフェノキシアセチル基、４−tert−ブチルフェノキシアセチル基、アセチル基、ベンゾイル基、イソブチリル基、ジメチルホルムアミジニル基、９−フルオレニルメチルオキシカルボニル基等を挙げることができる。これらの中でも、フェノキシアセチル基、４−イソプロピルフェノキシアセチル基、アセチル基、ベンゾイル基、イソブチリル基、及びジメチルホルムアミジニル基が好ましい。また、核酸塩基のカルボニル基が保護されていてもよく、例えば、フェノール、２，５−ジクロロフェノール、３−クロロフェノール、３，５−ジクロロフェノール、２−ホルミルフェノール、２−ナフトール、４−メトキシフェノール、４−クロロフェノール、２−ニトロフェノール、４−ニトロフェノール、４−アセチルアミノフェノール、ペンタフルオロフェノール、４−ピバロイロキシベンジルアルコール、４−ニトロフェネチルアルコール、２−（メチルスルフォニル）エタノール、２−（フェニルスルフォニル）エタノール、２−シアノエタノール、２−（トリメチルシリル）エタノール、ジメチルカルバミン酸クロライド、ジエチルカルバミン酸クロライド、エチルフェニルカルバミン酸クロライド、１−ピロリジンカルボン酸クロライド、４−モルホリンカルボン酸クロライド、ジフェニルカルバミン酸クロライド等を反応させて、カルボニル基を保護することが出来る。ここで、カルボニル基の保護基については、特に導入しなくてもよい場合がある。また、該「核酸塩基」には、上記した基の他に、核酸塩基が任意の置換基（例えば、ハロゲン原子、アルキル基、アラルキル基、アルコキシ基、アシル基、アルコキシアルキル基、ヒドロキシ基、アミノ基、モノアルキルアミノ、ジアルキルアミノ、カルボキシ、シアノ、ニトロ等）により任意の位置に１〜３個置換されている修飾核酸塩基（例えば、８−ブロモアデニル基、８−ブロモグアニル基、５−ブロモシトシル基、５−ヨードシトシル基、５−ブロモウラシル基、５−ヨードウラシル基、５−フルオロウラシル基、５−メチルシトシル基、８−オキソグアニル基、ヒポキサンチニル基等）も���含される。
【００３０】
本明細書中、「ハロゲン原子」とは、フッ素原子、塩素原子、臭素原子、またはヨウ素原子である。
【００３１】
本明細書中、「アルキル（基）」としては、直鎖状または分岐鎖状の炭素数１以上のアルキル基が挙げられ、特に炭素数範囲の限定がない場合には、好ましくはＣ１−１０アルキル基であり、より好ましくはＣ１−６アルキル基である。炭素数範囲の限定がない場合の好適な具体例としては、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、ｓｅｃ−ブチル、ｔｅｒｔ−ブチル、ペンチル、ヘキシル等が挙げられ、特にメチル、エチルが好ましい。
【００３２】
本明細書中、「アラルキル（基）」としては、Ｃ７−２０アラルキル基が挙げられ、好ましくはＣ７−１６アラルキル基（Ｃ６−１０アリール−Ｃ１−６アルキル基）である。好適な具体例としては、ベンジル、１−フェニルエチル、２−フェニルエチル、１−フェニルプロピル、ナフチルメチル、１−ナフチルエチル、１−ナフチルプロピル等が挙げられ、特にベンジルが好ましい。
【００３３】
本明細書中、「アルコキシ（基）」としては、炭素数１以上のアルコキシ基が挙げられ、特に炭素数範囲の限定がない場合には、好ましくはＣ１−１０アルコシ基であり、より好ましくはＣ１−６アルコキシ基である。炭素数範囲の限定がない場合の好適な具体例としては、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、イソプロポキシ、ブトキシ、イソブトキシ、ｓｅｃ−ブトキシ、ｔｅｒｔ−ブトキシ、ペンチルオキシ、ヘキシルオキシ等が挙げられ、特にメトキシ、エトキシが好ましい。
【００３４】
本明細書中、「アシル（基）」としては、例えば、直鎖状または分岐鎖状のＣ１−６アルカノイル基、Ｃ７−１３アロイル基等が挙げられる。具体的には、例えば、ホルミル、アセチル、ｎ−プロピオニル、イソプロピオニル、ｎ−ブチリル、イソブチリル、ピバロイル、バレリル、ヘキサノイル、ベンゾイル、ナフトイル、レブリニル等が挙げられ、これらはそれぞれ置換されていてもよい。
【００３５】
本明細書中、「アルケニル（基）」としては、直鎖状または分岐鎖状のＣ２−６アルケニル基等が好ましく、例えば、ビニル、１−プロペニル、アリル、イソプロペニル、ブテニル、イソブテニル等が挙げられる。中でも、Ｃ２−Ｃ４アルケニル基が好ましい。
【００３６】
本明細書中、「アルキニル（基）」としては、Ｃ２−６アルキニル基等が好ましく、例えば、エチニル、１−プロピニル、２−プロピニル、１−ブチニル、２−ブチニル、３−ブチニル、１−ペンチニル、２−ペンチニル、３−ペンチニル、４−ペンチニル、１−ヘキシニル、２−ヘキシニル、３−ヘキシニル、４−ヘキシニル、５−ヘキシニル等が挙げられる。中でも、Ｃ２−Ｃ４アルキニル基が好ましい。
【００３７】
本明細書中、「シクロアルキル（基）」は、環状アルキル基を意味し、例えば、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル等が挙げられる。中でも、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル等のＣ３−Ｃ６シクロアルキル基が好ましく、シクロヘキシルが特に好ましい。
【００３８】
本明細書中、「アリール（基）」は、芳香族性を示す単環式あるいは多環式（縮合）の炭化水素基を意味し、具体的には、例えば、フェニル、１−ナフチル、２−ナフチル、ビフェニリル、２−アンスリル等のＣ６−１４アリール基等が挙げられる。中でもＣ６−１０アリール基がより好ましく、フェニルが特に好ましい。
【００３９】
本明細書中、「炭化水素基」としては、例えば、脂肪族炭化水素基、芳香脂肪族炭化水素基、単環式飽和炭化水素基および芳香族炭化水素基等が挙げられ、具体的には、例えば、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基、シクロアルキル基、アリール基、アラルキル基等の１価基およびそれらから誘導される２価基である。
【００４０】
本明細書中、「炭化水素基を有する有機基」とは、前記「炭化水素基」を有する基を意味し、「炭化水素基を有する有機基」中の「炭化水素基」以外の部位は任意に設定することができる。例えば、リンカーとして−Ｏ−、−Ｓ−、−ＣＯＯ−、−ＯＣＯＮＨ−、および−ＣＯＮＨ−等の部位を有していてもよい。
【００４１】
〔擬似固相保護基〕
本発明に使用される、擬似固相保護基とは、該基が反応基質に結合することにより非極性溶媒に可溶化し、液相中の反応が可能であると共に、極性溶媒の添加により沈殿し、固液分離が可能となる、反応性と後処理の簡便性を兼ね備えた保護基であって、５’末端水酸基の保護基を除去し得る酸性条件で安定な基でありさえすれば、特に限定されない。擬似固相保護基としては、例えば、非特許文献２〜４、特許文献１等に開示された基が挙げられるが、中でも下記一般式（Ｉ）で表される擬似固相保護基は、目的とするオリゴヌクレオチド製造方法において高収率が達成できるという観点で好ましい擬似固相保護基である。
【００４２】
一般式（Ｉ）：
【００４３】
【化９】
2012157723.tif 000010
【００４４】
［式中、
Ｌは、式（ａ１）：
【００４５】
【化１０】
2012157723.tif 000011
【００４６】
（式中、＊は、Ｙとの結合位置を示し；
＊＊は、保護される基との結合位置を示し；
Ｌ１は、置換されていてもよい２価のＣ１−２２炭化水素基を有する基を示し；かつ
Ｌ２は、単結合を示すか、または＊＊Ｃ（＝Ｏ）Ｎ（Ｒ２）−Ｒ１−Ｎ（Ｒ３）＊＊＊（式中、＊＊は、Ｌ１との結合位置を示し、＊＊＊は、Ｃ＝Ｏとの結合位置を示し、Ｒ１は、置換されていてもよいＣ１−２２アルキレン基を示し、Ｒ２およびＲ３は、それぞれ独立して、水素原子もしくは置換されていてもよいＣ１−２２アルキル基を示すか、またはＲ２およびＲ３が一緒になって、置換されていてもよいＣ１−２２アルキレン結合を形成していてもよい。）で表される基（リンカー）を示す。）で示される基を示し、
Ｙは、単結合、酸素原子、またはＮＲ（Ｒは、水素原子、アルキル基またはアラルキル基を示す。）を示し、ならびに
Ｚは、式（ａ２）：
【００４７】
【化１１】
2012157723.tif 000012
【００４８】
［式中、＊は、Ｙとの結合位置を示し；
Ｒ４は、水素原子を示すか、あるいはＲｂが、下記式（ａ３）で表される基である場合には、Ｒ６と一緒になって単結合または−Ｏ−を示して、環Ｂと共にフルオレニル基またはキサンテニル基を形成していてもよく； 
ｋ個のＲ５は、独立してそれぞれ炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を有する有機基を示し；
ｋは、１〜４の整数を示し；
環Ａは、ｋ個のＯＲ５に加えて、更にハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルキル基、およびハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基からなる群から選択される置換基を有していてもよく；
Ｒａは、水素原子を示し；ならびに
Ｒｂは、水素原子、または式（ａ３）：
【００４９】
【化１２】
2012157723.tif 000013
【００５０】
（式中、＊は、結合位置を示し；
ｊは、０〜４の整数を示し；
ｊ個のＲ７は、独立してそれぞれ炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を有する有機基を示し；
Ｒ６は、水素原子を示すか、またはＲ４と一緒になって単結合または−Ｏ−を示して、環Ａと共にフルオレニル基またはキサンテニル基を形成していてもよく；かつ
環Ｂは、ｊ個のＯＲ７に加えて、更にハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルキル基、およびハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基からなる群から選択される置換基を有していてもよい。）で表される基、または式（ａ２’）：
【００５１】
【化１３】
2012157723.tif 000014
【００５２】
（式中、＊は、結合位置を示し；
ｋ’個のＲ５’は、独立してそれぞれ炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を有する有機基を示し；
ｋ’は、１〜４の整数を示し；
環Ｃは、ｋ’個のＯＲ５’に加えて、更にハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルキル基、およびハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基からなる群から選択される置換基を有していてもよい。）で示される基を示す。］で示される基を示す。］で表される基である。
【００５３】
上記式（Ｉ）で表される擬似固相保護基により保護される基としては、例えば、水酸基、アミノ基が挙げられ、中でもヌクレオシドまたはヌクレオチドの３’水酸基が好ましい。
上記式（ａ１）で表されるリンカーＬの好ましい態様としては、式（ａ１）中、Ｌ１が、エチレン基、またはＣＨ２−Ｏ−１，４−フェニレン−Ｏ−ＣＨ２を示し；かつ
Ｌ２が、単結合を示すか、または＊＊Ｃ（＝Ｏ）Ｎ（Ｒ２）−Ｒ１−Ｎ（Ｒ３）＊＊＊（式中、＊＊は、Ｌ１との結合位置を示し、＊＊＊は、Ｃ＝Ｏとの結合位置を示し、Ｒ１は、Ｃ１−６アルキレン基を示し、Ｒ２およびＲ３は、独立してそれぞれ水素原子、もしくは置換されていてもよいＣ１−６アルキル基を示すか、またはＲ２およびＲ３が一緒になって、置換されていてもよいＣ１−６アルキレン結合を形成していてもよい。）で表される基である、基である。
【００５４】
上記式（ａ１）で表されるリンカーＬの別の好ましい態様としては、式（ａ１）中、Ｌ１が、エチレン基を示し；かつ
Ｌ２が、単結合を示す、基である。
【００５５】
上記式（ａ１）で表されるリンカーＬの別の好ましい態様としては、式（ａ１）中、Ｌ１が、エチレン基を示し；かつ
Ｌ２中のＮ（Ｒ２）−Ｒ１−Ｎ（Ｒ３）部分が、ピペラジニレン基を示す、基である。
【００５６】
上記式（ａ１）で表されるリンカーＬの更に別の好ましい態様としては、式（ａ１）中、Ｌ１が、エチレン基を示し；かつ
Ｌ２が、＊＊Ｃ（＝Ｏ）Ｎ（Ｒ２）−Ｒ１−Ｎ（Ｒ３）＊＊＊（式中、＊＊は、Ｌ１との結合位置を示し、＊＊＊は、Ｃ＝Ｏとの結合位置を示し、Ｒ１は、ペンチレン基、またはヘキシレン基を示し、Ｒ２およびＲ３は、それぞれ独立して、水素原子もしくはメチル基を示す。）で表される基である、基である。
【００５７】
上記リンカーＬの特に好ましい例は、入手が容易で安価なスクシニル基である。
【００５８】
Ｙの好ましい態様としては、酸素原子、またはＮＲ（Ｒは、水素原子、アルキル基またはアラルキル基を示す。）である。
Ｒとして好ましくは、水素原子、Ｃ１−６アルキル基またはＣ７−１６アラルキル基であり、より好ましくは水素原子、メチル、エチルまたはベンジルであり、特に好ましくは水素原子である。
【００５９】
Ｚの好ましい態様としては、式（ａ２）で表される基である。
上記式（ａ２）で表されるＺの好ましい態様としては、式（ａ２）中、ＲａおよびＲｂは、共に水素原子を示し；
Ｒ４は、水素原子を示し、 
ｋ個のＲ５は、独立してそれぞれ炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を有する有機基（例えば、Ｃ１０−４０アルキル基）を示し；かつ
ｋは、１〜３の整数を示す、基である。
【００６０】
上記式（ａ２）で表されるＺの別の好ましい態様としては、式（ａ２）中、
ｋは、１〜３の整数を示し；
ＲａおよびＲｂは、共に水素原子を示し；
Ｒ４は、水素原子を示し； 
ｋ個のＲ５は、独立してそれぞれ炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を１〜３個有するベンジル基、または炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を１〜３個有するシクロヘキシル基を示し；かつ
環Ａが、ｋ個のＯＲ５に加えて、更にハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルキル基、およびハロゲン原子で置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基からなる群から選択される置換基を有していてもよい、基である。
【００６１】
上記式（ａ２）で表されるＺの別の好ましい態様としては、式（ａ２）中、
Ｒａは、水素原子を示し； 
Ｒｂは、上記式（ａ３）（式中、＊は結合位置を示し；ｊは、０〜３の整数を示し；ｊ個のＲ７は、独立してそれぞれＣ１０−４０アルキル基を示し；
Ｒ４およびＲ６は、共に水素原子を示す。）で表される基である、基である。
【００６２】
上記式（ａ２）で表されるＺの更に別の好ましい態様としては、式（ａ２）中、
Ｒａは、水素原子を示し；
Ｒｂは、上記式（ａ３）（式中、＊は結合位置を示し；ｊは、０〜３の整数を示し；ｊ個のＲ７は、独立してそれぞれＣ１０−４０アルキル基を示し；
Ｒ６は、環ＡのＲ４と一緒になって単結合または−Ｏ−を形成し、それにより環Ａと環Ｂは一緒になってフルオレニル基またはキサンテニル基を示す。）で表される基である、基である。
【００６３】
上記一般式（Ｉ）で表される擬似固相保護基としては、５’末端水酸基の保護基を除去し得る酸性条件下では切断されにくく、塩基性条件下で切断される基が好ましい。
【００６４】
かかる擬似固相保護基の代表的な例としては、例えば、上記一般式（Ｉ）中のＬが、上記式（ａ１）で表される基（好ましくは、スクシニル基等）であり、かつ
Ｙ−Ｚが、以下の基であるものが挙げられる。
３，４，５−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ基、
３，５−ジ（ドコシルオキシ）ベンジルオキシ基、
３，５−ジ［３’，４'，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルオキシ基、
３，４，５−トリ［３’，４'，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルオキシ基、
３，４，５−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルアミノ基、
２，４−ジ（ドコシルオキシ）ベンジルアミノ基、
３，５−ジ（ドコシルオキシ）ベンジルアミノ基、
ジ（４−ドコシルオキシフェニル）メチルアミノ基、
４−メトキシ−２−［３’，４'，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルアミノ基、
４−メトキシ−２−［３’，４'，５’−トリ（オクタデシルオキシ）シクロヘキシルメチルオキシ］ベンジルアミノ基、
２，４−ジ（ドデシルオキシ）ベンジルアミノ基、
フェニル（２，３，４−トリ（オクタデシルオキシ）フェニル）メチルアミノ基、
ジ［４−（１２−ドコシルオキシドデシルオキシ）フェニル］メチルアミノ基、
３，５−ジ［３’，４'，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルアミノ基、または
３，４，５−トリ［３’，４'，５’−トリ（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルアミノ基。
【００６５】
〔擬似固相保護基により３’位水酸基が保護され、かつ５’位水酸基が一時保護基で保護されたヌクレオチド〕
本発明に使用される、擬似固相保護基をヌクレオチドの３’位水酸基に結合させることにより、擬似固相合成に適したヌクレオチドを製造することができる。
中でも目的とするオリゴヌクレオチド製造方法において高収率が達成できるという観点で好ましいヌクレオチドとしては、下記一般式（ＩＩ）で表される化合物（以下、本発明化合物と称することもある。）が挙げられる。
【００６６】
一般式（ＩＩ）：
【００６７】
【化１４】
2012157723.tif 000015
【００６８】
［式中、
ｍは、０以上の任意の整数を示し、
ｍ＋１個のＢａｓｅは、独立してそれぞれ保護されていてもよい核酸塩基を示し、
Ｑは、水素原子または酸性条件下で除去可能な一時保護基を示し、
Ｘは、水素原子、ハロゲン原子または保護されていてもよい水酸基を示し、
ｍ個のＸ’は、独立してそれぞれ水素原子、ハロゲン原子、または保護されていてもよい水酸基を示し、
ｍ個のＲ８は、独立してそれぞれ酸素原子もしくは硫黄原子を示し、
ｍ個のＷＧは、独立してそれぞれ電子吸引性基を示し、
Ｙは、単結合、酸素原子またはＮＲ（Ｒは、水素原子、アルキル基またはアラルキル基を示す。）を示し、かつ
Ｌ、およびＺは、式（ａ１）の＊＊が、ヌクレオチド３’水酸基との結合位置を示すことを除いて、前記と同義である。］
【００６９】
本発明化合物のうち、一般式（ＩＩ）中のＹが酸素原子またはＮＲ（Ｒは、水素原子、アルキル基またはアラルキル基を示す。）であるものは、新規化合物である。
【００７０】
本発明化合物は、５’位の水酸基の酸素原子を介して、３’位水酸基がホスホロアミダイト化され、かつ５’位水酸基が一時保護基で保護されたｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｐは、１以上の任意の整数を示す。）と結合し、ｍ＋１+ｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｐは、１以上の任意の整数を示す。）を形成する。
ｍが０の時、本発明化合物は、「ヌクレオシド」と解し、オリゴヌクレオチド合成における３’位末端の出発化合物である。また、本発明化合物には、広義には５’位水酸基が未保護（Ｑが水素原子）のものも包含される。
【００７１】
ｍは、０以上の任意の整数を示し、好ましくは、０である。ｍの上限は、特に限定されるものではないが、４９以下が好ましく、２９以下がより好ましく、１９以下が更に好ましい。
本発明化合物であるヌクレオチドを構成するリボース残基の２位の基Ｘ及びｍ個のＸ’は、それぞれ独立して、水素原子、ハロゲン原子または保護されていてもよい水酸基である。
ハロゲン原子としては、フッ素原子、塩素原子が好ましく、フッ素原子がより好ましい。
「保護されていてもよい水酸基」の保護基としては、特に限定されず、例えば、プロテクティブ・グループス・イン・オーガニック・シンセシス（ＰＲＯＴＥＣＴＩＶＥ  ＧＲＯＵＰＳ  ＩＮ  ＯＲＧＡＮＩＣ  ＳＹＮＴＨＥＳＩＳ）、第３版、ジョン・ウィリー・アンド・サンズ（ＪＯＨＮ  ＷＩＬＬＹ＆ＳＯＮＳ）出版（１９９９年）等に記載されている任意の保護基を挙げることができる。具体的には、メチル基、ベンジル基、ｐ−メトキシベンジル基、ｔｅｒｔ−ブチル基、メトキシメチル基、メトキシエチル基、２−テトラヒドロピラニル基、エトキシエチル基、シアノエチル基、シアノエトキシメチル基、フェニルカルバモイル基、１，１−ジオキソチオモルホリン−４−チオカルバモイル基、アセチル基、ピバロイル基、ベンゾイル基、トリメチルシリル基、トリエチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル基、［（トリイソプロピルシリル）オキシ］メチル（Ｔｏｍ）基、１−（４−クロロフェニル）−４−エトキシピペリジン−４−イル（Ｃｐｅｐ）基等を挙げることができる。これらの中でも、トリエチルシリル基、トリイソプロピルシリル基、またはｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル基であることが好ましく、経済性及び入手の容易さの観点から、ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル基であることが特に好ましい。
【００７２】
本発明化合物の５’位水酸基の保護基として用いることができる一時保護基Ｑとしては、酸性条件下で脱保護可能であり、水酸基の保護基として用いられるものであれば、特に限定はされないが、トリチル基、９−（９−フェニル）キサンテニル基、９−フェニルチオキサンテニル基、１，１−ビス（４−メトキシフェニル）−１−フェニルメチル基（ジメトキシトリチル基）等のジ（Ｃ１−６アルコキシ）トリチル基、１−（４−メトキシフェニル）−１，１−ジフェニルメチル基（モノメトキシトリチル基）等のモノ（Ｃ１−１８アルコキシ）トリチル基等を挙げることができる。これらの中でも、脱保護のしやすさ、入手の容易さの観点から、モノメトキシトリチル基、ジメトキシトリチル基であることが好ましく、より好ましくは、ジメトキシトリチル基である。
ｍ個のＲ８は、独立してそれぞれ酸素原子もしくは硫黄原子を示し、好ましくは酸素原子である。
ｍ個のＷＧは、独立してそれぞれ電子吸引性基を示す。当該電子吸引性基としては、例えば、シアノ基、ニトロ基等が挙げられ、好ましくはシアノ基である。
【００７３】
本明細書中、Ｒ５またはＲ７として示される「炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基を有する有機基」とは、その分子構造中に炭素数が１０以上の脂肪族炭化水素基を有する１価の有機基である。
【００７４】
「脂肪族炭化水素基を有する有機基」における「脂肪族炭化水素基」とは、直鎖または分岐状の飽和または不飽和の脂肪族炭化水素基であり、炭素数１０以上の脂肪族炭化水素基が好ましく、炭素数１０〜４０の脂肪族炭化水素基がより好ましく、炭素数１２〜３０の脂肪族炭化水素基が特に好ましい。
「脂肪族炭化水素基を有する有機基」における「脂肪族炭化水素基」の部位は、特に限定されず、末端に存在しても（１価基）、それ以外の部位に存在してもよい（例えば２価基）。
【００７５】
「脂肪族炭化水素基」としては、炭素数１０以上の直鎖状または分岐鎖状のアルキル基、直鎖状または分岐鎖状のアルケニル基等の１価基およびそれらから誘導される２価基が挙げられ、中でも炭素数１０〜４０のアルキル基が好ましく、炭素数１２〜３０のアルキル基が特に好ましい。「脂肪族炭化水素基」の具体例としては、例えば、デシル基、ドデシル基、トリデシル基、ミリスチル基、セチル基、ステアリル基、オレイル基、リノリル基、アラキル基、ベヘニル基、イソステアリル基等の１価基およびそれらから誘導される２価基が挙げられる。
【００７６】
「脂肪族炭化水素基を有する有機基」中の「脂肪族炭化水素基」以外の部位は任意に設定することができる。例えば、リンカーとして−Ｏ−、−Ｓ−、−ＣＯＯ−、−ＯＣＯＮＨ−、および−ＣＯＮＨ−、並びに、炭化水素基（１価基または２価基）等の部位を有していてもよい。かかる「炭化水素基」としては、例えば、脂肪族炭化水素基、芳香脂肪族炭化水素基、単環式飽和炭化水素基および芳香族炭化水素基等が挙げられ、具体的には、例えば、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基、シクロアルキル基、アリール基、アラルキル基等の１価基およびそれらから誘導される２価基が用いられる。「脂肪族炭化水素基」以外の部位の「アルキル基」、「アルケニル基」、「アルキニル基」、「シクロアルキル基」、「アリール基」、または「アラルキル基」としては、例えば、前記したのと同様のものを挙げることができる。当該「炭化水素基」は、ハロゲン原子（塩素原子、臭素原子、フッ素原子、ヨウ素原子）、１個以上のハロゲン原子により置換されていてもよいＣ１−６アルキル基、オキソ基等から選択される置換基で置換されていてもよい。
【００７７】
本明細書中、一般式（ＩＩ）中のＹを構成するＲは、水素原子、アルキル基またはアラルキル基であり、好ましくは、水素原子、Ｃ１−６アルキル基またはＣ７−１６アラルキル基であり、より好ましくは水素原子、メチル、エチルまたはベンジルであり、特に好ましくは水素原子である。
【００７８】
上記一般式（ＩＩ）中のＺを構成する「Ｒ５（基）」および／または「Ｒ７（基）」として示される「脂肪族炭化水素基を有する有機基」は、分岐等によって複数の「脂肪族炭化水素基」が存在してもよい。「脂肪族炭化水素基を有する有機基」中に「脂肪族炭化水素基」が複数存在する場合には、その各々は同一のものであっても異なるものであってもよい。
【００７９】
上記一般式（ＩＩ）中のＺを構成する「Ｒ５（基）」および／または「Ｒ７（基）」として示される「脂肪族炭化水素基を有する有機基」における、炭素数合計の下限は１０以上が好ましく、１２以上がより好ましく、１４以上が更に好ましく、１８以上が更に一層好ましく、３０以上が殊更好ましい。一方、「Ｒ５（基）」および／または「Ｒ７（基）」として示される「脂肪族炭化水素基を有する有機基」における、炭素数合計の上限は、２００以下が好ましく、１５０以下がより好ましく、１２０以下が更に好ましく、１００以下が更に一層好ましく、８０以下が殊更好ましく、６０以下が特に好ましい。当該炭素数が大きいほど、オリゴヌクレオチドが長鎖となった場合でも本発明化合物の極性溶媒における結晶性が良好となる。
【００８０】
一般式（ＩＩ）中のＹ−Ｚの好ましい態様は、前記一般式（Ｉ）におけるＹ−Ｚの好ましい態様と同様である。
【００８１】
一般式（ＩＩ）で表される本発明化合物の好ましい態様としては、一般式（ＩＩ）中、ｍが０であり、
Ｂａｓｅが、それぞれ保護されていてもよい、シトシル基、ウラシル基、チミニル基、アデニル基、またはグアニル基であり；
Ｑが、ジ（Ｃ１−６アルコキシ）トリチル基、またはモノ（Ｃ１−６アルコキシ）トリチル基であり；
Ｘが、水素原子、ハロゲン原子、または保護されていてもよい水酸基であり；かつ
Ｌ−Ｙ−Ｚが、前記一般式（Ｉ）において好ましい態様として示された各基の組合せと同様である、
化合物である。
【００８２】
上記一般式（ＩＩ）で表される本発明化合物の別の好ましい態様としては、一般式（ＩＩ）中、ｍが０であり、
Ｂａｓｅが、それぞれ保護されていてもよい、シトシル基、ウラシル基、チミニル基、アデニル基、またはグアニル基であり；
Ｑが、ジメトキシトリチル基、またはモノメトキシトリチル基であり；
Ｘが、水素原子、ハロゲン原子、または保護されていてもよい水酸基であり；かつ
Ｌ−Ｙ−Ｚが、前記一般式（Ｉ）において好ましい態様として示された各基の組合せと同様である、
化合物である。
【００８３】
上記一般式（ＩＩ）で表される本発明化合物の更に別の好ましい態様としては、一般式（ＩＩ）中、ｍが０であり、
Ｂａｓｅが、それぞれ保護されていてもよい、シトシル基、ウラシル基、チミニル基、アデニル基、またはグアニル基であり；
Ｑが、ジメトキシトリチル基であり；
Ｘが、水素原子、フッ素原子、メトキシ基、アセトキシ基、またはｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリロキシ基であり；かつ
Ｌ−Ｙ−Ｚが、前記一般式（Ｉ）において好ましい態様として示された各基の組合せと同様である、
化合物である。
【００８４】
〔擬似固相保護基の前駆体（Ｚ−Ｙ−Ｈ）（アルコールまたはアミン）の製造方法〕
前記擬似固相保護基の前駆体の製造方法としては、特に限定されないが、自体公知の方法（例えば、Ｂｕｌｌ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．Ｊｐｎ．２００１，７４，７３３−７３８、特開２０００−４４４９３号公報、国際公開第２００６／１０４１６６号パンフレット、国際公開第２００７／０３４８１２号パンフレット、国際公開第２００７／１２２８４７号パンフレット、国際公開第２０１０／１１３９３９号パンフレット等参照）またはこれらに準ずる方法に従って原料化合物から製造することができる。
なお、原料化合物として使用する化合物、例えば、一般式（ＩＩ）中のＺを構成するＲ５、Ｒ７に対応するハロゲン化物等は、市販品として入手可能であるか、あるいは、自体公知の方法またはこれらに準ずる方法に従って製造することができる。
【００８５】
ｍが０である一般式（ＩＩ）（以下、「一般式（ＩＩａ）」と称する）で表される本発明化合物の製造方法としては、特に限定されないが、自体公知の方法またはこれらに準ずる方法（Ｒｉｃｈａｒｄ Ｔ．Ｐｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ２００４，３２，６２３−６３１．）に従って、上記擬似固相保護基の前駆体から製造することができる。
なお、擬似固相保護基の前駆体（Ｚ−Ｙ−Ｈ）は、上記したとおり、自体公知の方法またはこれらに準ずる方法に従って製造することができる。また、原料化合物が反応に影響を及ぼす置換基（例えば、水酸基、アミノ基、カルボキシ基）を有する場合には、原料化合物を予め公知の方法に従い、適当な保護基で保護した後に反応を行うことが一般的である。かかる保護基は、反応後に、酸処理、アルカリ処理、接触還元等の公知の方法に従い除去することができる。
上記一般式（ＩＩａ）のＬがスクシニル基である化合物の一般的な製造方法を以下に示す。
【００８６】
【化１５】
2012157723.tif 000016
【００８７】
（式中の各記号は前記と同義である。）
５’位水酸基が保護基Ｑにより保護されたヌクレオシド（ａ）を、塩基存在下、コハク酸無水物と反応させることにより、３’位水酸基にコハク酸が導入された化合物（ｂ）を得る。化合物（ｂ）を縮合剤存在下、Ｚ−Ｙ−Ｈと脱水縮合させることにより、一般式（ＩＩａ）で表される化合物を得ることができる。
【００８８】
上記ヌクレオシド（ａ）から化合物（ｂ）の変換工程は、反応に不活性な溶媒中で行うのが有利である。このような溶媒としては、反応が進行する限り特に限定されないが、ジクロロメタン、１，２−ジクロロエタン、クロロホルム、四塩化炭素等のハロゲン化炭化水素溶媒、ベンゼン、トルエン、キシレン等の芳香族炭化水素系溶媒、またはペンタン、ヘキサン、ヘプタン、オクタン等の脂肪族炭化水素系溶媒、またはジエチルエーテル、テトラヒドロフラン、シクロペンチルメチルエーテル等のエーテル系溶媒、あるいはそれらの混合溶媒が好ましい。中でもジクロロメタン、またはクロロホルムが特に好ましい。
【００８９】
塩基としては、特に限定されないが、例えば、後述するような有機塩基が挙げられ、好ましくはトリエチルアミンである。
【００９０】
上記脱水縮合工程は、反応に不活性な溶媒中で行うのが有利である。このような溶媒としては、反応が進行する限り特に限定されないが、ジクロロメタン、１，２−ジクロロエタン、クロロホルム、四塩化炭素等のハロゲン化炭化水素溶媒、ベンゼン、トルエン、キシレン等の芳香族炭化水素系溶媒、またはペンタン、ヘキサン、ヘプタン、オクタン等の脂肪族炭化水素系溶媒、或いはそれらの混合溶媒が好ましい。中でもジクロロメタン、クロロホルムが特に好ましい。
【００９１】
化合物（ｂ）とＺ−Ｙ−Ｈとの縮合反応に使用する縮合剤としては、ジシクロヘキシルカルボジイミド（ＤＣＣ）、ジイソプロピルカルボジイミド（ＤＩＣ）、Ｎ−エチル−Ｎ’−３−ジメチルアミノプロピルカルボジイミドおよびその塩酸塩（ＥＤＣ・ＨＣｌ）、ヘキサフルオロリン酸（ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ）トリピロリジノホスホニウム(ＰｙＢｏｐ)、Ｏ−（ベンゾトリアゾール−１−イル）−Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’−テトラメチルウロニウム  テトラフルオロボレート（ＴＢＴＵ）、１−［ビス（ジメチルアミノ）メチレン］−５−クロロ−１Ｈ−ベンゾトリアゾリウム−３−オキシド  ヘキサフルオロホスフェート（ＨＣＴＵ）、Ｏ−ベンゾトリアゾール−Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’−テトラメチルウロニウム  ヘキサフルオロホスフェート（ＨＢＴＵ）等が挙げられる。中でもＨＢＴＵ、ＨＣＴＵ、Ｎ−エチル−Ｎ’−３−ジメチルアミノプロピルカルボジイミドおよびその塩酸塩（ＥＤＣ・ＨＣｌ）が好ましい。
【００９２】
縮合剤の使用量は、化合物（ｂ）１モルに対して、１〜１０モル使用することができ、好ましくは１〜５モルである。また、Ｚ−Ｙ−Ｈの使用量は、化合物（ｂ）１モルに対して１〜１０モル使用することができ、好ましくは１〜５モルである。反応温度は、反応が進行しさえすれば特に限定されないが、−１０℃〜５０℃が好ましく、０℃〜３０℃がより好ましい。反応時間は、３０分〜７０時間である。
【００９３】
上記一般式（ＩＩａ）中のＬがスクシニル基以外の化合物についても、上記製造方法におけるコハク酸無水物に代えて、対応する酸無水物、対応するジカルボン酸ハライド、対応するジカルボン酸の活性エステル等を用いて、同様の反応を行うことにより製造することができる。
ｍが１以上である一般式（ＩＩ）で示される化合物は、出発原料として、一般式（ＩＩａ）で示される化合物を用いて、下記の本発明の製造方法に従い、５’末端伸長プロセスを繰り返すことにより製造することができる。
【００９４】
〔本発明の製造方法〕
次に、本発明にかかるオリゴヌクレオチドの製造方法（以下、「本発明の製造方法」ともいう。）について説明する。具体的には、適宜保護されたｎ個重合オリゴヌクレオチドから、適宜保護されたｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドへの製造方法について説明していくが、例えば、ｎ＝１の場合には、ｎ個重合オリゴヌクレオチドは、「ヌクレオシド」と解し、ｐ＝１の場合には、ｐ個重合オリゴヌクレオチドは、「ヌクレオシド」と解し、ｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドは、「ジヌクレオチド」と解すべきものである。
本発明は、以下の工程（１）〜（３）を含有するオリゴヌクレオチドの製造方法、である。
（１）非極性溶媒中において、３’位水酸基が擬似固相保護基で保護され、かつ５’位水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されたｎ個重合オリゴヌクレオチド（ｎは、１以上の任意の整数を示す。）、酸、ならびにピロール誘導体およびインドール誘導体から選択される少なくとも一種のカチオン捕捉剤を反応させて５’位水酸基の一時保護基を除去した後、有機塩基により中和する工程、
（２）工程（１）の中和後の反応液に、３’位水酸基がホスホロアミダイト化され、かつ５’位水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されたｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｐは、１以上の任意の整数を示す。）を添加し、工程（１）で得られた５’位水酸基の一時保護基が除去されたｎ個重合オリゴヌクレオチドと、その５’位水酸基を介してホスファイトトリエステル結合により縮合させる工程、ならびに
（３）工程（２）の反応液に、酸化剤、または硫化剤を添加して、工程（２）で得られたｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドのホスファイトトリエステル結合を、ホスフェートトリエステル結合またはチオホスフェートトリエステル結合へと変換する工程。
ｎの上限は、特に限定されるものではないが、５０以下が好ましく、３０以下がより好ましく、２０以下が更に好ましい。
ｐの上限は、特に限定されるものではないが、５０以下が好ましく、３０以下がより好ましく、２０以下が更に好ましく、５以下が更に一層好ましく、３以下が特に好ましい。
【００９５】
更に、下記工程（４）を含有させることにより、簡便かつ効果的に過剰原料や副生物を除去して、ｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドを精製することができる。
（４）工程（３）で得られた反応液に極性溶媒を添加して、ｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドを沈殿させて、固液分離により取得する工程。
なお、本発明の工程（４）は、液相法にも、固相法にも存在し得ない、擬似固相保護基に特有の工程である。
【００９６】
原料の当量管理と反応制御することによって副生物の発生量を制御できる状況であれば、工程（１）〜工程（３）の基本単位として繰り返し、工程（４）を含有させることが好ましい。
また、副生物発生を厳格に管理・制御でき、高純度のオリゴヌクレオチドに導けるという観点で、工程（１）〜工程（４）を基本単位として繰り返すことが好ましい。
【００９７】
本発明の製造方法には、更に、工程（５）を含有させることにより、オリゴヌクレオチドを単離・製造することができる。
（５）工程（４）で得られたｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドの保護基を全て除去する工程。
【００９８】
以下に、各工程について詳細に説明する。
【００９９】
工程（１）（脱保護工程）
本工程は、非極性溶媒中において、３’位水酸基が擬似固相保護基で保護され、かつ５’位水酸基が酸性条件下で除去可能な一時保護基で保護されたｎ個重合オリゴヌクレオチド（ｉ）（式中、ｍは、０以上の任意の整数を示し、ｍ＝０の場合は、ヌクレオシドを示す。）の５’末端水酸基の一時保護基Ｑ（Ｑは前記と同義である。）を、酸の添加により除去した後に、有機塩基の添加により中和する工程（脱保護工程）である。
【０１００】
【化１６】
2012157723.tif 000017
【０１０１】
（式中、ｍ個のＲ８は、酸素原子もしくは硫黄原子を示し、ｍ個のＷＧは、電子吸引性基（例えば、シアノ基）を示し、ｍ個のＸ’は、それぞれ独立してＸと同義であり、他の記号は、前記と同義である。）
【０１０２】
本工程は、反応に影響を及ぼさない溶媒中で行われる。当該溶媒における溶解度が高い程、優れた反応性が期待できるため、本発明の化合物の溶解度の高い非極性溶媒を選択することが好ましい。具体的には、クロロホルム、ジクロロメタン、１，２−ジクロロエタン等のハロゲン系溶媒；ベンゼン、トルエン、キシレン、メシチレン等の芳香族系溶媒；酢酸エチル、酢酸イソプロピル等のエステル系溶媒；ヘキサン、ペンタン、ヘプタン、オクタン、ノナン、シクロヘキサン等の脂肪族系溶媒；ジエチルエーテル、シクロペンチルメチルエーテル、ｔｅｒｔ−ブチルメチルエーテル等の非極性エーテル系溶媒が挙げられる。これらの溶媒は２種以上を適宜の割合で混合して用いてもよい。また、上記非極性溶媒に、アセトニトリル、プロピオニトリル等のニトリル系溶媒、Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド、Ｎ，Ｎ−ジメチルアセトアミド、Ｎ−メチルピペリドン等のアミド系溶媒等の極性溶媒を、ｎ個重合オリゴヌクレオチドが溶解し得る限り、適宜の割合で混合して用いてもよい。中でも、ジクロロメタン、クロロホルム、１，２−ジクロロエタン、ベンゼン、トルエン、キシレン、メシチレン、ヘキサン、ペンタン、ヘプタン、ノナン、シクロヘキサン、酢酸エチル、酢酸イソプロピル、ｔｅｒｔ−ブチルメチルエーテル、シクロペンチルメチルエーテル、または、これらの組合せ等が好ましく、クロロホルム、ジクロロメタン、トルエンが特に好ましい。
【０１０３】
本工程におけるｎ個重合オリゴヌクレオチド（ｉ）の溶媒中の濃度は、溶解していれば特に限定されないが、好ましくは１〜３０重量％である。
【０１０４】
本脱保護工程、それに続く縮合工程、および酸化工程を液中で連続して行うためには、本工程において、ｎ個重合オリゴヌクレオチド（ｉ）の５’位水酸基の一時保護基Ｑの除去反応中、または除去反応後に、カチオン捕捉剤を使用することが必須である。
【０１０５】
カチオン捕捉剤としては、除去された保護基Ｑによる再保護（原料戻り）や脱保護された官能基への副反応が進行しなければ、特に限定されないが、ピロール、２−メチルピロール、３−メチルピロール、２，３−ジメチルピロール、２，４−ジメチルピロール等のピロール誘導体；インドール、４−メチルインドール、５−メチルインドール、６−メチルインドール、７−メチルインドール、５，６−ジメチルインドール、６，７−ジメチルインドール等のインドール誘導体を使用することができる。良好なカチオン捕捉効果が得られるという観点で、ピロール、３−メチルピロール、２，４−ジメチルピロール、インドール、４−メチルインドール、５−メチルインドール、６−メチルインドール、７−メチルインドール、５，６−ジメチルインドール、６，７−ジメチルインドールが好ましく、ピロール、３−メチルピロール、インドールがより好ましく、ピロール、インドールが更に好ましく、ピロールが特に好ましい。
【０１０６】
本工程におけるカチオン捕捉剤の使用量は、ｎ個重合オリゴヌクレオチド（ｉ）１モルに対し、１〜５０モル使用することができ、好ましくは５〜２０モルである。
【０１０７】
本工程に使用する酸としては、良好な脱保護が達成できさえすれば特に限定されないが、トリフルオロ酢酸、ジクロロ酢酸、トリフルオロメタンスルホン酸、トリクロロ酢酸、メタンスルホン酸、塩酸、酢酸、ｐ−トルエンスルホン酸等を使用することが好ましい。良好な反応を達成できるという観点で、トリフルオロ酢酸、ジクロロ酢酸、トリフルオロメタンスルホン酸、トリクロロ酢酸がより好ましく、トリフルオロ酢酸、ジクロロ酢酸、トリフルオロメタンスルホン酸が更に好ましく、トリフルオロ酢酸、トリフルオロメタンスルホン酸が更に一層好ましく、トリフルオロ酢酸が特に好ましい。これら酸は、上記非極性溶媒で希釈しても構わない。また、前記酸を使用する際には、特定の塩基を組み合わせて、酸性度を適宜調整して使用しても構わない。
【０１０８】
本工程における酸の使用量は、ｎ個重合オリゴヌクレオチド（ｉ）１モルに対し、１〜１００モル使用することができ、好ましくは１〜４０モルである。
【０１０９】
本工程の反応温度は、反応が進行しさえすれば特に限定されないが、−１０℃〜５０℃が好ましく、０℃〜４０℃がより好ましい。反応時間は、使用するｎ個重合オリゴヌクレオチドの種類、酸の種類、溶媒の種類、反応温度等により異なるが、５分〜５時間である。
【０１１０】
脱保護剤として使用される酸は次工程の縮合工程中に存在すると、５’位水酸基が一時保護基Ｑにより保護され、かつ３’位水酸基がホスホロアミダイト化されたｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｉｉ）の保護基Ｑの脱保護を誘発するため、除去または中和処理が必要である。本発明では、反応液中で連続的に縮合工程を行うため、有機塩基により中和を行う。
中和に使用する有機塩基としては、前出の酸を中和することができ、得られた塩が縮合剤として機能しうるものであれば特に限定されないが、反応が良好に進行するという観点で、ピリジン、２，４，６−トリメチルピリジン、ベンズイミダゾール、１，２，４−トリアゾール、Ｎ−フェニルイミダゾール、２−アミノ−４，６−ジメチルピリミジン、１，１０−フェナントロリン、イミダゾール、Ｎ−メチルイミダゾール、２−クロロベンズイミダゾール、２−ブロモベンズイミダゾール、２−メチルイミダゾール、２−フェニルベンズイミダゾール、Ｎ−フェニルベンズイミダゾール、５−ニトロベンズイミダゾールが好ましく、ピリジン、２，４，６−トリメチルピリジン、ベンズイミダゾール、１，２，４−トリアゾール、Ｎ−フェニルイミダゾール、Ｎ−メチルイミダゾール、２−アミノ−４，６−ジメチルピリミジン、１，１０−フェナントロリンがより好ましく、ピリジン、２，４，６−トリメチルピリジン、ベンズイミダゾール、１，２，４−トリアゾール、Ｎ−フェニルイミダゾールが更に好ましく、ピリジン、２，４，６−トリメチルピリジン、ベンズイミダゾール、１，２，４−トリアゾールが更に一層好ましく、ピリジン、２，４，６−トリメチルピリジン、ベンズイミダゾールが特に好ましい。
【０１１１】
本工程における有機塩基の使用量は、酸１モルに対し、１〜１０モル使用することができ、好ましくは１〜３モルである。
【０１１２】
本工程において、特に好ましい酸と有機塩基との組合せは、トリフルオロ酢酸とピリジン、トリフルオロ酢酸と２，４，６−トリメチルピリジンまたはトリフルオロメタンスルホン酸とベンズイミダゾールである。
【０１１３】
工程（２）（縮合工程）
本工程は、前記工程（１）で得られたｎ個重合オリゴヌクレオチドの５’位水酸基の脱保護体（ｉｉ）と、５’位水酸基が一時保護基Ｑにより保護され、かつ３’位水酸基がホスホロアミダイト化されたｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｉｉ）（式中、ｑは、０以上の任意の整数を示し、ｑ＝０の場合は、ヌクレオシドを示す。）とを縮合させる工程である。
５’位水酸基が一時保護基Ｑにより保護され、かつ３’位水酸基がホスホロアミダイト化されたｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｉｉ）としては、ｐが１である場合（すなわち、５’位水酸基が一時保護基Ｑにより保護され、かつ３’位水酸基がホスホロアミダイト化されたヌクレオシド）が好ましい。
ｑの上限は、特に限定されるものではないが、４９以下が好ましく、２９以下がより好ましく、１９以下が更に好ましく、４以下が更に一層好ましく、２以下が特に好ましい。
【０１１４】
【化１７】
2012157723.tif 000018
【０１１５】
［式中、Ｘ’は、Ｘと同義であり、Ｒ９、Ｒ１０は、それぞれ独立して、アルキル基を示すか、または隣接する窒素原子と一緒になって形成する、５または６員の飽和環状アミノ基を示す。かかる飽和環状アミノ基は、窒素原子の他に環構成原子として酸素原子または硫黄原子を１個有していてもよい。他の記号は前記と同義である。］
【０１１６】
本工程は、前記工程（１）で得られたｎ個重合オリゴヌクレオチドの５’位水酸基の脱保護体（ｉｉ）を単離することなく、工程（１）後の反応液に、３’位水酸基がホスホロアミダイト化され、かつ５’位水酸基が一時保護基Ｑにより保護されたｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｉｉ）を直接添加するだけで行うことができる。本縮合工程は、工程（１）の脱保護反応の際に添加した酸と、中和反応の際に添加した有機塩基が塩形成した塩（例えば、ピリジン・トリフルオロ酢酸塩）が縮合剤として作用することから、工程（１）および（２）を液中で連続して行うことは、単離操作の省略のみならず、反応効率を向上させるという利点も有する。本縮合反応の進行が遅い場合には、付加的に別途縮合剤（例えば、ピリジン・トリフルオロ酢酸塩、テトラゾール、５−ベンジルチオ−１Ｈ−テトラゾール、４，５−ジシアノイミダゾール等）を添加することにより反応効率を更に向上させることもできる。
【０１１７】
また、本工程においては、反応液の酸性度が高くなると、一時保護基Ｑが脱離する副反応が生じることがあるので、反応液の酸性化を抑える目的でＮ−メチルイミダゾールを添加することが好ましい。
【０１１８】
酸性度の調整のために添加するＮ−メチルイミダゾールの使用量は、中和の際に使用する有機塩基１モルに対し、０．１〜１モル使用することができ、好ましくは０．５モルである。
【０１１９】
本工程に使用される、３’位水酸基がホスホロアミダイト化され、かつ５’位水酸基が一時保護基Ｑにより保護されたｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｉｉ）としては、下記式：
【０１２０】
【化１８】
2012157723.tif 000019
【０１２１】
（式中の記号は、前記と同義である。）で表される基が結合したｐ個重合オリゴヌクレオチドを挙げることができる。かかるｐ個重合オリゴヌクレオチドの核酸塩基としては、前記と同義の基が挙げられる。
【０１２２】
本工程に使用される、３’位水酸基がホスホロアミダイト化され、かつ５’位水酸基が一時保護基Ｑにより保護されたｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｉｉ）は、５’位水酸基が一時保護基Ｑにより保護され、かつ３’位水酸基が保護されていないｐ個重合オリゴヌクレオチドに下記一般式（ｃ）、（ｄ）で表されるホスホロアミダイト化試薬を反応させる公知の方法（Ｍ．Ｈ．Ｃａｒｕｔｈｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ  １９８７，１５４，２８７−３１３；Ｓ．Ｌ．Ｂｅａｕｃａｇｅ  ａｎｄ  Ｍ．Ｈ．Ｃａｒｕｔｈｅｒｓ，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  Ｌｅｔｔｅｒｓ  １９８１，２２，１８５９−１８６２．）に従い、製造することができる。
【０１２３】
【化１９】
2012157723.tif 000020
【０１２４】
（式（ｃ）、（ｄ）中、Ｒ１1は、ハロゲン原子を示し、他の記号は、前記と同義である。）
【０１２５】
本工程は、反応に影響を及ぼさない溶媒中で行われる。具体的には、前記工程（１）と同様の非極性溶媒が挙げられる。また、上記非極性溶媒に、アセトニトリル、プロピオニトリル等のニトリル系溶媒；アセトン、２−ブタノン等のケトン系溶媒；Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド、Ｎ，Ｎ−ジメチルアセトアミド、Ｎ−メチルピロリドン等のアミド系溶媒；１，４−ジオキサン、テトラヒドロフラン等の極性エーテル系溶媒；ジメチルスルホキシド等のスルホキシド系溶媒を、５’位水酸基の一時保護基が除去されたｎ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｉ）が溶解し得る限り、適宜の割合で混合して用いてもよい。
この場合、極性溶媒としては、アミド系溶媒、ニトリル系溶媒、及びこれらの組合せが好ましく、アセトニトリル、Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド、Ｎ−メチルピペリドン、及びこれらの組合せがより好ましく、アセトニトリルが特に好ましい。
極性溶媒は、３’位水酸基がホスホロアミダイト化され、かつ５’位水酸基が一時保護基Ｑにより保護されたｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｉｉ）、縮合剤等の溶液として添加してもよい。
【０１２６】
３’位水酸基がホスホロアミダイト化され、かつ５’位水酸基が一時保護基Ｑにより保護されたｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｉｉ）の使用量は、工程（１）で得られた５’位水酸基の一時保護基が除去されたｎ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｉ）１モルに対し、１〜１０モル使用することができ、好ましくは１〜５モルである。
【０１２７】
反応温度は、反応が進行しさえすれば特に限定されないが、０℃〜１００℃が好ましく、２０℃〜５０℃がより好ましい。反応時間は、縮合させるｎ個重合オリゴヌクレオチドの種類、反応温度等によって異なるが、５分〜２４時間である。
【０１２８】
工程（３）（酸化工程、または硫化工程）
工程（２）で得られたｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｖ）に酸化剤または硫化剤を反応させることにより、該ｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｖ）のホスファイトトリエステル結合を、ホスフェートトリエステル結合またはチオホスフェートトリエステル結合へと変換する工程である。
【０１２９】
【化２０】
2012157723.tif 000021
【０１３０】
（式中の記号は、前記と同義である。）
【０１３１】
本工程は、工程（２）で得られたｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｖ）を単離することなく、工程（２）後の反応液に、酸化剤または硫化剤を、直接添加するだけで行うことができる。
【０１３２】
本工程に使用する「酸化剤」としては、他の部位を酸化することなく、ホスファイトトリエステル結合を、ホスフェートトリエステル結合に酸化する能力がありさえすれば、特に限定されないが、ヨウ素、（１Ｓ）−（＋）−（１０−カンファニルスルフォニル）オキサジリジン、ｔｅｒｔ−ブチルヒドロペルオキシド（ＴＢＨＰ）、２−ブタノンペルオキシド、１，１−ジヒドロペルオキシシクロドデカン、ビス（トリメチルシリル）ペルオキシド、ｍ−クロロ過安息香酸を使用することが好ましい。良好な酸化反応が達成できるという観点で、ヨウ素、（１Ｓ）−（＋）−（１０−カンファニルスルフォニル）オキサジリジン、ｔｅｒｔ−ブチルヒドロペルオキシド、２−ブタノンペルオキシド、１，１−ジヒドロペルオキシシクロドデカンがより好ましく、ヨウ素、（１Ｓ）−（＋）−（１０−カンファニルスルフォニル）オキサジリジン、ｔｅｒｔ−ブチルヒドロペルオキシド、２−ブタノンペルオキシドが更に好ましく、ヨウ素、ｔｅｒｔ−ブチルヒドロペルオキシドが更に一層好ましく、ヨウ素が特に好ましい。かかる酸化剤は、０．０５〜２Ｍの濃度になるように適当な溶媒で希釈して使用することができる。かかる希釈溶媒としては、反応に不活性な溶媒であれば特に限定されないが、ピリジン、ＴＨＦ、ジクロロメタン、水、またはこれら任意の混合溶媒を挙げることができる。中でも、例えば、ヨウ素／水／ピリジン―ＴＨＦあるいはヨウ素／ピリジン―酢酸、過酸化剤（ＴＢＨＰ）／ジクロロメタンまたはｔｅｒｔ−ブチルヒドロペルオキシド／ノナンを用いるのが好ましい。
【０１３３】
本工程に使用する「硫化剤」としては、ホスファイトトリエステル結合を、チオホスフェートトリエステル結合に変換しうる能力がありさえすれば、特に限定されないが、３−（（Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノメチリデン）アミノ）−３Ｈ−１，２，４−ジチアゾール−５−チオン（ＤＤＴＴ）、３Ｈ−１，２−ベンゾジチオール−３−オン−１，１−ジオキシド（Ｂｅａｕｃａｇｅ試薬）、３Ｈ−１，２−ベンゾジチオール−３−オン、フェニルアセチルジスルフィド（ＰＡＤＳ）、テトラエチルチウラムジスルフィド（ＴＥＴＤ）、３−アミノ−１，２，４−ジチアゾール−５−チオン（ＡＤＴＴ）、硫黄を使用することが好ましい。良好な反応が進行しうるという観点で、３−（（Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノメチリデン）アミノ）−３Ｈ−１，２，４−ジチアゾール−５−チオン（ＤＤＴＴ）、３Ｈ−１，２−ベンゾジチオール−３−オン−１，１−ジオキシド（Ｂｅａｕｃａｇｅ試薬）、３Ｈ−１，２−ベンゾジチオール−３−オン、フェニルアセチルジスルフィド（ＰＡＤＳ）がより好ましく、３−（（Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノメチリデン）アミノ）−３Ｈ−１，２，４−ジチアゾール−５−チオン、３Ｈ−１，２−ベンゾジチオール−３−オン−１，１−ジオキシドが更に好ましく、３−（（Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノメチリデン）アミノ）−３Ｈ−１，２，４−ジチアゾール−５−チオンが特に好ましい。かかる硫化剤は、０．０５〜２Ｍの濃度になるように適当な溶媒で希釈して使用することができる。かかる希釈溶媒としては、反応に不活性な溶媒であれば特に限定されないが、例えば、ジクロロメタン、アセトニトリル、ピリジン又はこれら任意の混合溶媒が挙げられる。
【０１３４】
酸化剤または硫化剤の使用量は、工程（２）で得られたｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｖ）１モルに対し、１〜５０モル使用することができ、好ましくは１〜５モルである。
【０１３５】
反応温度は、反応が進行しさえすれば特に限定されないが、０℃〜１００℃が好ましく、２０℃〜５０℃がより好ましい。反応時間は、ｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｉｖ）の種類、使用する酸化剤または硫化剤の種類、反応温度等によって異なるが、１分〜３時間である。
【０１３６】
工程（４）（沈殿化および固液分離工程）
本工程は、工程（３）で得られたホスフェートトリエステル結合またはチオホスフェートトリエステル結合を有するｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｖ）を含む反応液に極性溶媒を添加することにより該ｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｖ）を沈殿させて、固液分離により取得する工程である。
【０１３７】
本工程における目的物ｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｖ）を沈殿させるための極性溶媒としては、例えば、メタノール、エタノール、イソプロパノール等のアルコール系溶媒；アセトニトリル、プロピオニトリル等のニトリル系溶媒；アセトン、２−ブタノン等のケトン系溶媒；１，４−ジオキサン、テトラヒドロフラン等の極性エーテル系溶媒；ジメチルホルムアミド、ジメチルアセトアミド、Ｎ−メチルピペリドン等のアミド系溶媒、ジメチルスルホキシド等のスルホキシド系溶媒；水等、ならびにこれら２種以上の混合溶媒が挙げられる。中でも、アルコール系溶媒、ニトリル系溶媒が好ましく、メタノールまたはアセトニトリルがより好適に使用される。本発明における極性溶媒としては、特に実用的観点からメタノールが好ましい。
極性溶媒は、目的物の極性溶媒中へのロスを最小限とするために水を含んでいてもよい。特に、極性溶媒としてアセトニトリルを用いた場合には、目的物が極性溶媒へ溶解してロスが増加する傾向にあり、僅かに水を含むアセトニトリルを用いることでそのロスを最小限にすることができる。
この場合、極性溶媒中の水の含量は、１〜１０％（ｖ／ｖ）が好ましく、３〜８％（ｖ／ｖ）がより好ましい。水含量が低すぎる場合は、目的物の極性溶媒中へのロスが増える場合があり、水含量が高すぎる場合は、過剰のモノマー等不要物の極性溶媒中への除去が不十分となる傾向がある。
【０１３８】
酸化剤としてヨウ素を使用した場合の沈殿化の際には、沈殿化溶媒であるメタノールにチオ硫酸ナトリウム（ハイポ）を飽和させた溶液を使用することにより、ヨウ素による着色を除去することができ、５’位水酸基が保護されたｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｖ）を純度良く単離することが可能である。
【０１３９】
硫化剤を使用した場合の沈殿化の際には、沈殿化溶媒であるメタノールに３価のリン試薬（例えば、トリメチルホスファイト、トリエチルホスファイト、トリス（２−カルボキシエチル）ホスフィン等）、ハイポ等の還元剤を飽和させた溶液を使用することにより、５’位水酸基が保護されたｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチド（ｖ）を純度良く単離することが可能である。
【０１４０】
本発明のオリゴヌクレオチドの製造方法は、上記工程（１）〜（４）を所望の回数繰返すことで高純度かつ高収率で目的のオリゴヌクレオチドを得ることができる。
【０１４１】
工程（５）（脱保護・オリゴヌクレオチド単離工程）
本発明のオリゴヌクレオチドの製造方法においては、工程（４）の後に、保護基の種類・性質に応じて、脱保護を行い、オリゴヌクレオチドを単離することができる。脱保護の方法としては、例えば、プロテクティブ・グループス・イン・オーガニック・シンセシス（ＰＲＯＴＥＣＴＩＶＥ  ＧＲＯＵＰＳ  ＩＮ  ＯＲＧＡＮＩＣ  ＳＹＮＴＨＥＳＩＳ）、第３版、ジョン・ウィリー・アンド・サンズ（ＪＯＨＮ  ＷＩＬＬＹ＆ＳＯＮＳ）出版（１９９９年）等に記載されている脱保護方法に従い、オリゴヌクレオチドの全ての保護基を除去する工程を行うことができる。具体的には、本願発明における擬似固相保護基、ならびに核酸塩基の保護基であるフェノキシアセチル基、アセチル基等、リン酸骨格を保護しているシアノエチル基等は、アンモニア水、アンモニア水／エタノール溶液、またはアンモニア水とメチルアミン水溶液の混合液で処理することにより、全て除去することができる。また、ヌクレオチド５’水酸基の保護基は、工程（１）で使用される酸またはそれらを適宜希釈した溶液で処理することにより除去することができる。
保護基を有しない、オリゴヌクレオチドは酵素により容易に分解されやすいため、空気清浄度管理下でオリゴヌクレオチドを単離することが好ましい。
【０１４２】
上記各工程における反応の進行の確認は、いずれも一般的な液相有機合成反応と同様の方法を適用できる。すなわち、薄層シリカゲルクロマトグラフィー、高速液体クロマトグラフィー等を用いて反応を追跡することができる。
【０１４３】
工程（４）、あるいは工程（５）より得られたオリゴヌクレオチドは、更に有機合成反応を施すことにより、所望のオリゴヌクレオチド誘導体へと導くこともできる。
本発明によって製造されたオリゴヌクレオチドは、各種人体用または動物用の医薬品（ＲＮＡ、ＤＮＡ、オリゴ核酸医薬、等）、機能性食品、特定保健食品、食品、化成品、生体用や工業用の高分子材料、等の各種用途に使用することができる。
【実施例】
【０１４４】
以下、実施例に沿って本発明を更に詳細に説明するが、これら実施例は本発明の範囲を何ら限定するものではない。また、本発明において使用する試薬や装置、材料は特に言及されない限り、商業的に入手可能である。また、本明細書において、略号で表示する場合、各表示は、ＩＵＰＡＣ−ＩＵＢ Ｃｏｍｍｉｓｓｉｏｎ ｏｎ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅによる略号あるいは当該分野における慣用略号に基づくものである。【０１４５】
参考例１：３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルアミンの合成【０１４６】
【化２１】
2012157723.tif 000022
【０１４７】
（１）３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルクロリドの合成
アルゴン雰囲気下、３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルアルコール（１０．０ｇ，１１．０ｍｍｏｌ）をジクロロメタン（１００ｍＬ）に溶解させ、Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（８４．０μＬ，１．１０ｍｍｏｌ）、塩化チオニル（１．２０ｍＬ，１６．４ｍｍｏｌ）を加えて３０℃で９０分間攪拌した。反応終了後の反応液を減圧濃縮し、アセトニトリルを添加することで析出した固体を濾過した。得られた固体を減圧乾燥し、表題の化合物（１０．０ｇ，９８．２％）を白色固体として得た。
（２）３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルアジドの合成
３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルクロリド（４．０２ｇ，４．３１ｍｍｏｌ）をクロロホルム（４０ｍＬ）とＮ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（１２０ｍＬ）の混合溶媒に溶解させ、アジ化ナトリウム（４１８ｍｇ，６．４２ｍｍｏｌ）を加えて８０℃で３時間攪拌した。反応終了後、反応液を室温まで冷却し、精製水（１５０ｍＬ）で洗浄後、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥後に濾過し、減圧濃縮した濾液にメタノールを添加することで析出した固体を濾過した。得られた固体を減圧乾燥させて表題の化合物（３．９２ｇ，９７．４％）を白色固体として得た。
（３）３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルアミンの合成
アルゴン雰囲気下、３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルアジド（３．００ｇ，３．２１ｍｍｏｌ）を脱水テトラヒドロフラン（３５ｍＬ）に溶解させ、氷冷下、水素化リチウムアルミニウム（１６２ｍｇ，４．３０ｍｍｏｌ）を添加し、反応液を室温で２時間攪拌した。反応終了後の反応液に精製水（２ｍＬ）と４．０ｍｏｌ／Ｌ  水酸化ナトリウム水溶液（２ｍＬ）を滴下して未反応の水素化リチウムアルミニウムを分解させた後、反応液をセライト濾過した。濾液を減圧濃縮後、アセトニトリルを添加することで析出した固体を濾過し、減圧乾燥させて表題の化合物（３．０９ｇ）を白色固体として定量的に得た。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．８０（ジクロロメタン：ヘキサン＝１：１）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８８（ｔ，９Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ，Ｈ３Ｃ，−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），１．２７−１．４６（ｍ，９６Ｈ，−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），１．７０−１．８２（ｍ，６Ｈ，−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），３．７６（ｓ，２Ｈ，Ｈ２Ｎ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），３．９２（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，−Ｏ−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），３．９７（ｔ，４Ｈ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，−Ｏ−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），６．５０（ｓ，２Ｈ，−ｂｅｎｚｙｌ）【０１４８】
参考例２：３，５−ビス（ドコシルオキシ）ベンジルアルコールの合成【０１４９】
【化２２】
2012157723.tif 000023
【０１５０】
（１）メチル［３，５−ビス（ドコシルオキシ）］ベンゾエートの合成
炭酸カリウム（１９．９ｇ，１４４ｍｍｏｌ）を、脱水Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（２００ｍＬ）中に懸濁させ、１−ブロモドコサン（１５．６ｇ，４６．７ｍｍｏｌ）、メチル（３，５−ジヒドロキシ）ベンゾエート（３．６０ｇ，２１．４ｍｍｏｌ）を加えて９０℃で終夜攪拌した。反応終了後、反応液を精製水（８００ｍＬ）中に注ぎ込み１時間攪拌した後、析出した固体を濾過した。得られた固体をジクロロメタン（８００ｍＬ）に再度溶解させて不溶物を濾過し、濾液を減圧濃縮後、アセトンを加えて再度固体を析出させた。濾過して得られた固体をメタノール中でスラリー洗浄し、濾過後に得られた固体を減圧乾燥させて表題の化合物（１３．９ｇ，９６．５％）を白色固体として得た。
（２）３，５−ビス（ドコシルオキシ）ベンジルアルコールの合成
アルゴン雰囲気下、メチル［３，５−ビス（ドコシルオキシ）］ベンゾエート（２．０３ｇ，２．５９ｍｍｏｌ）を脱水テトラヒドロフラン（５０ｍＬ）に溶解させ、氷冷下、水素化リチウムアルミニウム（１４８ｍｇ，３．９３ｍｍｏｌ）を加えて４０℃で１時間攪拌した。酢酸エチルを滴下して未反応の水素化リチウムアルミニウムを分解させた後、ジエチルエーテルを加えて、塩酸水で洗浄した。有機層を減圧濃縮し、濃縮液にメタノールを添加することで析出した固体を濾過した。得られた固体を減圧乾燥させて表題の化合物（１．７３ｇ，８８．０％）を白色固体として得た。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．８０（酢酸エチル：ヘキサン＝１：４）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８８（ｔ，６Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ，Ｈ３Ｃ−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），１．２５−１．８０（ｍ，８４Ｈ，−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），３．９３（ｔ，４Ｈ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，−Ｏ−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），４．６２（ｄ，２Ｈ，Ｊ＝６．１Ｈｚ，ＨＯ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），６．３８（ｓ，１Ｈ，−ｂｅｎｚｙｌ），６．５０（ｓ，２Ｈ，−ｂｅｎｚｙｌ）【０１５１】
参考例３：３，５−ビス（ドコシルオキシ）ベンジルアミンの合成【０１５２】
【化２３】
2012157723.tif 000024
【０１５３】
３，５−ビス（ドコシルオキシ）ベンジルアルコールから参考例１の方法に従って表題の化合物を合成した。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．５０（ジクロロメタン：ヘキサン＝１：４）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８８（ｔ，６Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ，Ｈ３Ｃ−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），１．２５−１．７９（ｍ，８４Ｈ，−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），３．７９（ｓ，２Ｈ，Ｈ２Ｎ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），３．９３（ｔ，４Ｈ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，−Ｏ−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），６．３４（ｓ，１Ｈ，−ｂｅｎｚｙｌ），６．４４（ｓ，２Ｈ，−ｂｅｎｚｙｌ）【０１５４】
参考例４：２，４−ビス（ドコシルオキシ）ベンジルアルコールの合成【０１５５】
【化２４】
2012157723.tif 000025
【０１５６】
（１）２，４−ビス（ドコシルオキシ）ベンズアルデヒドの合成
アルゴン雰囲気下、２，４−ジヒドロキシベンズアルデヒド（３．００ｇ，２１．７ｍｍｏｌ）、炭酸カリウム（３０．０ｇ，２１７ｍｍｏｌ）、１−ブロモドコサン（１７．３ｇ，４４．５ｍｍｏｌ）を脱水Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（１５０ｍＬ）中に加え、７０℃で終夜攪拌した。反応終了後の反応液を精製水（１Ｌ）中に注ぎ込み、１時間攪拌を行った後、析出した固体を濾過した。得られた固体をメタノール中でスラリー洗浄し、濾過して得られた固体を減圧乾燥させて表題の化合物（１６．３ｇ，９９．３％）を白色固体として得た。
（２）２，４−ビス（ドコシルオキシ）ベンジルアルコールの合成
アルゴン雰囲気下、２，４−ビス（ドコシルオキシ）ベンズアルデヒド（２．９９ｇ，３．９６ｍｍｏｌ）を脱水テトラヒドロフラン（６０ｍＬ）とメタノール（６．０ｍＬ）の混合溶媒に溶解させ、水素化ホウ素ナトリウム（３７５ｍｇ，９．９１ｍｍｏｌ）を加えて４０℃で２時間攪拌した。反応終了後、精製水（２．０ｍＬ）を滴下して未反応の水素化ホウ素ナトリウムを分解させた後、セライト濾過した。濾液を減圧濃縮し、メタノールを添加することで析出した固体を濾過した。得られた固体を減圧乾燥させて表題の化合物（２．７７ｇ，９２．９％）を白色固体として得た。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．８０（酢酸エチル：ヘキサン＝１：４）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８８（ｔ，６Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ，Ｈ３Ｃ−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），１．２５−１．８０（ｍ，８４Ｈ，−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），２．２３（ｔ，１Ｈ，Ｊ＝６．５Ｈｚ，ＨＯ−ｂｅｎｚｙｌ），３．９４（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，−Ｏ−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），３．９８（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，−Ｏ−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），４．６１（ｄ，２Ｈ，Ｊ＝６．５Ｈｚ，ＨＯ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），６．４２（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．２Ｈｚ，−ｂｅｎｚｙｌ），６．４５（ｓ，１Ｈ，−ｂｅｎｚｙｌ），７．１２（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．２Ｈｚ，−ｂｅｎｚｙｌ）【０１５７】
参考例５：２，４−ビス（ドコシルオキシ）ベンジルアミンの合成【０１５８】
【化２５】
2012157723.tif 000026
【０１５９】
２，４−ビス（ドコシルオキシ）ベンジルアルコールから参考例１の方法に従って表題の化合物を合成した。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．４０（ジクロロメタン：メタノール＝９：１）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８８（ｔ，６Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ，Ｈ３Ｃ−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），１．２５−１．８１（ｍ，８４Ｈ，−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），３．７５（ｓ，２Ｈ，Ｈ２Ｎ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），３．９１−３．９７（ｍ，４Ｈ，−Ｏ−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），６．３９（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．２Ｈｚ，−ｂｅｎｚｙｌ），６．４４（ｓ，１Ｈ，−ｂｅｎｚｙｌ），７．０７（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．２Ｈｚ，−ｂｅｎｚｙｌ）【０１６０】
参考例６：２，３，４−トリス（オクタデシルオキシ）ベンズヒドリルアミンの合成【０１６１】
【化２６】
2012157723.tif 000027
【０１６２】
（１）２，３，４−トリス（オクタデシルオキシ）ベンゾフェノンの合成
アルゴン雰囲気下、２，３，４−トリヒドロキシベンゾフェノン（１．６１ｇ，７．００ｍｍｏｌ）、１−ブロモオクタデカン（７．３２ｇ，２２．０ｍｍｏｌ）、炭酸カリウム（４．３５ｇ，３１．５ｍｍｏｌ）を脱水Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（３０ｍＬ）中に加え、８０℃で終夜攪拌した。反応終了後、反応液に精製水（２００ｍＬ）を添加し、１時間攪拌した後に、析出した固体を濾過した。得られた固体をメタノール中でスラリー洗浄し、濾過後に減圧乾燥させて表題の化合物（６．３１ｇ，９１．１％）を白色固体として得た。
（２）２，３，４−トリス（オクタデシルオキシ）ベンズヒドリルアルコールの合成
２，３，４−トリス（オクタデシルオキシ）ベンゾフェノン（３．００ｇ，３．０４ｍｍｏｌ）を、クロロホルム（３０ｍＬ）とメタノール（１０ｍＬ）の混合溶媒に溶解させ、水素化ホウ素ナトリウム（３６０ｍｇ，９．５１ｍｍｏｌ）を添加し、４５℃で２時間攪拌した。反応終了後、０．１ｍｏｌ／Ｌ塩酸水を滴下することで未反応の水素化ホウ素ナトリウムを分解させた後、１．０ｍｏｌ／Ｌ塩酸水で洗浄し、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥後に濾過し、濾液を減圧濃縮した。濃縮液にメタノールを添加することで析出した固体を濾過後に減圧乾燥させて表題の化合物（２．９８ｇ，９９．０％）を白色固体として得た。
（３）Ｎ−（９−フルオレニルメトキシカルボニル）−２，３，４−トリス（オクタデシルオキシ）ベンズヒドリルアミンの合成
アルゴン雰囲気下、２，３，４−トリス（オクタデシルオキシ）ベンズヒドリルアルコール（２．４４ｇ，２．４６ｍｍｏｌ）、９−フルオレニルメチルカーバメート（１．０６ｇ，４．４１ｍｍｏｌ）を脱水トルエン（４０ｍＬ）中に５０℃で溶解させた後、メタンスルホン酸（５１．４μＬ，７４０μｍｏｌ）を加えて１００℃で終夜攪拌した。反応終了後、反応液を減圧濃縮し、メタノールを添加することで析出した固体を濾過した。得られた固体を減圧乾燥させて表題の化合物（３．３７ｇ，９８．１％）を白色固体として得た。
（４）２，３，４−トリス（オクタデシルオキシ）ベンズヒドリルアミンの合成
Ｎ−（９−フルオレニルメトキシカルボニル）−２，３，４−トリス（オクタデシルオキシ）ベンズヒドリルアミン（３．３７ｇ，２．８９ｍｍｏｌ）を、クロロホルム（３０ｍＬ）とアセトニトリル（１５ｍＬ）の混合溶媒に溶解させた後、２０％ピペリジン［１−メチル−２−ピロリドン溶液］（２８．６ｍＬ，５７．９ｍｍｏｌ）を添加し、室温で３０分間攪拌した。反応終了後の反応液を減圧濃縮し、メタノールを添加することで析出した固体を濾過した。得られた固体を減圧乾燥することで表題の化合物（２．８０ｇ，９７．９％）を白色固体として得た。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．６０（ジクロロメタン：メタノール＝９：１）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８８（ｔ，９Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ，Ｈ３Ｃ−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），１．２６−１．８１（ｍ，１０２Ｈ，−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），３．７７−３．８６（ｍ，２Ｈ，−Ｏ−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），３．９１−３．９５（ｍ，４Ｈ，−Ｏ−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），５．４０（ｓ，１Ｈ，Ｈ２Ｎ−ＣＨ−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），６．５８（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．７Ｈｚ，−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），６．８８（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．７Ｈｚ，−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），７．２０−７．３７（ｍ，５Ｈ，−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ）【０１６３】
参考例７：３，４，５−トリス［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルアルコールの合成【０１６４】
【化２７】
2012157723.tif 000028
【０１６５】
（１）メチル｛３，４，５−トリス［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］｝ベンゾエートの合成
アルゴン雰囲気下、没食子酸メチル（１８２ｍｇ，１．００ｍｍｏｌ）、３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルクロリド（２．８１ｇ，３．０１ｍｍｏｌ）、炭酸カリウム（１．３９ｇ，１０．１ｍｍｏｌ）を脱水Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（２０ｍＬ）中に加え、７０℃で終夜攪拌した。反応液を室温まで冷却させた後、精製水（５０ｍＬ）を添加することで析出した固体を濾過した。得られた固体をアセトニトリル中でスラリー洗浄後に濾過し、得られた固体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（ジクロロメタン−ヘキサン）で精製し、表題の化合物（２．３１ｇ，８０．５％）を白色固体として得た。
（２）３，４，５−トリス［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルアルコールの合成
メチル｛３，４，５−トリス［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］｝ベンゾエート（１．０１ｇ，３５０μｍｏｌ）を脱水シクロペンチルメチルエーテル（２０ｍＬ）に溶解させ、氷冷下、水素化リチウムアルミニウム（３１．８ｍｇ，８４０μｍｏｌ）を加えて室温で２時間攪拌した。反応終了後、０．１ｍｏｌ／Ｌ塩酸水を滴下することで未反応の水素化リチウムアルミニウムを分解させた後、１．０ｍｏｌ／Ｌ塩酸水で洗浄し、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥後に濾過した。得られた濾液を減圧濃縮後、メタノールを添加することで析出した固体を濾過後に減圧乾燥させて表題の化合物（９４０ｍｇ，９４．６％）を白色固体として得た。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．８０（ジクロロメタン：ヘキサン＝２：１）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８８（ｔ，２７Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ，Ｈ３Ｃ−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），１．２６−１．７５（ｍ，３０６Ｈ，−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），３．７７（ｔ，４Ｈ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，−Ｏ−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），３．８７（ｔ，１０Ｈ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，−Ｏ−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），３．９２（ｔ，４Ｈ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，−Ｏ−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），４．５７（ｄ，２Ｈ，Ｊ＝６．０Ｈｚ，ＨＯ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），４．９７（ｓ，２Ｈ，ＨＯ−ｂｅｎｚｙｌ−Ｏ−ＣＨ２−ｐｈｅｎｙｌ），５．０１（ｓ，４Ｈ，ＨＯ−ｂｅｎｚｙｌ−Ｏ−ＣＨ２−ｐｈｅｎｙｌ），６．６１（ｓ，４Ｈ，ＨＯ−ｂｅｎｚｙｌ−Ｏ−ｂｅｎｚｙｌ），６．６３（ｓ，２Ｈ，ＨＯ−ｂｅｎｚｙｌ−Ｏ−ｂｅｎｚｙｌ），６．６６（ｓ，２Ｈ，ＨＯ−ｂｅｎｚｙｌ−Ｏ−ｂｅｎｚｙｌ）．【０１６６】
参考例８：４，４’−ビス（ドコシルオキシ）ベンズヒドロールの合成【０１６７】
【化２８】
2012157723.tif 000029
【０１６８】
（１）４，４’−ジドコシルオキシ−ベンゾフェノンの合成
４，４’−ジヒドロキシ−ベンゾフェノン（８．２ｇ，３８．３ｍｍｏｌ）、１−ブロモドコサン（３１．３ｇ，８０．４ｍｍｏｌ）にＤＭＦ（３００ｍＬ）、炭酸カリウム（１５．９ｇ，１１５ｍｍｏｌ）を加え８０℃で６．５時間攪拌した。モノアルキル化体の消失を確認した後反応液を氷冷し、攪拌がしっかりとされている状態で１Ｎ塩酸（３００ｍＬ）と水（１５０ｍＬ）をゆっくりと加えた。スラリーをろ過し、得られた結晶を水およびメタノールで洗浄し表題の化合物（２８．３ｇ，３４．１ｍｍｏｌ，８９％）を得た。
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３／３００ＭＨｚ）δ＝０．８８（６Ｈ，ｔ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，ＯＣ２２Ｈ４５  Ｃ２２−Ｈ），１．１−１．６（７６Ｈ，ｂｒ，ＯＣ２２Ｈ４５  Ｃ３−２１−Ｈ），１．８１（４Ｈ，ｍ，ＯＣ２２Ｈ４５Ｃ２−Ｈ），２．０４（１Ｈ，ｓ，−ＯＨ），４．０３（４Ｈ，ｔ，Ｊ＝６．５Ｈｚ，ＯＣ２２Ｈ４５Ｃ１−Ｈ），６．９４（４Ｈ，ｄ，Ｊ＝８．８Ｈｚ，Ｐｈ  Ｃ３，３’，５，５’−Ｈ），７．７７（４Ｈ，ｄ，Ｊ＝８．７Ｈｚ，Ｐｈ  Ｃ２，２’，６，６’−Ｈ）【０１６９】
（２）４，４’−ビス（ドコシルオキシ）ベンズヒドロールの合成
４，４’−ジドコシルオキシ−ベンゾフェノン（２８．３ｇ，３４．１ｍｍｏｌ）にＴＨＦ（３００ｍＬ），メタノール（１５ｍＬ）を加え６０℃に加熱した。水素化ホウ素ナトリウム（６．１０ｇ，１６１ｍｍｏｌ）をゆっくりと加え、その温度のまま４時間攪拌した後反応液を氷冷し、１Ｎ塩酸（８０ｍＬ）を滴下した。ＴＨＦを留去し、水（４５０ｍＬ）を加えた後１Ｎ塩酸をｐＨが５〜７になるまで加えスラリーをろ過し、得られた結晶を水およびメタノールで洗浄して、表題の化合物（２８．５ｇ，３４．１ｍｍｏｌ，９９％）を得た。
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３／３００ＭＨｚ）δ０．８８（６Ｈ，ｔ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，ＯＣ２２Ｈ４５  Ｃ２２−Ｈ），１．１−１．６（７６Ｈ，ｂｒ，ＯＣ２２Ｈ４５  Ｃ３−２１−Ｈ），１．７３（４Ｈ，ｍ，ＯＣ２２Ｈ４５Ｃ２−Ｈ），２．０４（１Ｈ，ｓ，−ＯＨ），３．９３（４Ｈ，ｔ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，ＯＣ２２Ｈ４５  Ｃ１−Ｈ），５．７６（１Ｈ，ｓ，ＨＯ−ＣＨＰｈ２），６．８５（４Ｈ，ｄ，Ｊ＝８．７Ｈｚ，Ｐｈ  Ｃ３，３’，５，５’−Ｈ），７．２５（４Ｈ，ｄ，Ｊ＝８．６Ｈｚ，Ｐｈ  Ｃ２，２’，６，６’−Ｈ）【０１７０】
参考例９：４，４’−ビス（ドコシルオキシ）ベンズヒドリルアミンの合成【０１７１】
【化２９】
2012157723.tif 000030
【０１７２】
（１）Ｎ−（９−フルオレニルメトキシカルボニル）−ビス（４−ドコシルオキシフェニル）メチルアミンの合成
４，４’−ビス（ドコシルオキシ）ベンズヒドロール（７１３ｍｇ，８５６μｍｏｌ）にトルエン（１５ｍｌ）、９−フルオレニルメチルカーバメート（２４６ｍｇ，１．０３ｍｍｏｌ）、メタンスルホン酸（８．３μｌ，１２８μｍｏｌ）を加え、１００℃で３時間攪拌した。４，４’−ビス（ドコシルオキシ）ベンズヒドロールの消失を確認した後、室温に戻した後、２．５％重曹水（１０ｍｌ）を加えて攪拌した。分層して有機層を水（１０ｍｌ×２）でさらに洗浄した。有機層を減圧留去し、残渣をメタノール（１０ｍｌ）で洗浄して、表題の化合物（５４０ｍｇ，５１２μｍｏｌ，収率６０％）を得た。
１Ｈ−ＮＭＲ  （ＣＤＣｌ３／３００ＭＨｚ）δ０．８８（９Ｈ，ｔ，Ｊ＝６．６，Ｃ２１Ｈ４２−ＣＨ３），１．１０−１．５０（８２Ｈ，ｂｒ，Ａｌｋｙｌ−Ｈ），１．７７（４Ｈ，ｍ，−Ｏ−ＣＨ２−ＣＨ２−Ｃ２０Ｈ４１），３．９３（４Ｈ，ｄ，Ｊ＝６．６，−Ｏ−ＣＨ２−Ｃ２１Ｈ４３），４．２１（１Ｈ，ｂｒ，ｓ，ｆｌｕｏｒｅｎｅ  Ｃ９−Ｈ），４．４３（２Ｈ，ｂｒ，ｄ，Ｊ＝６．６，ｆｌｕｏｒｅｎｅ−ＣＨ２−Ｏ），５．２３（１Ｈ，ｂｒ，ｓ，Ｆｍｏｃ−ＮＨ−  ｏｒ  Ｆｍｏｃ−ＮＨ−ＣＨ），５．８５（１Ｈ，ｂｒ，ｓ，Ｆｍｏｃ−ＮＨ−  ｏｒ  Ｆｍｏｃ−ＮＨ−ＣＨ），６．８４（４Ｈ，ｄ，Ｊ＝８．７，Ｐｈ  Ｃ３，５−Ｈ），７．１１（４Ｈ，ｄ，Ｊ＝８．７，Ｐｈ  Ｃ２，６−Ｈ），７．２５−７．３５（２Ｈ，ｂｒ，ｍ，ｆｌｕｏｒｅｎｅ  Ｃ２，７−Ｈ），７．３９（２Ｈ，ｂｒ，ｔ，Ｊ＝６．９，ｆｌｕｏｒｅｎｅ  Ｃ３，６−Ｈ），７．５９（２Ｈ，ｂｒ，ｓ，ｆｌｕｏｒｅｎｅ  Ｃ１，８−Ｈ），７．７５（２Ｈ，ｂｒ，ｄ，Ｊ＝６．６，ｆｌｕｏｒｅｎｅ  Ｃ４，５−Ｈ）
（２）４，４’−ビス（ドコシルオキシ）ベンズヒドリルアミンの合成
ジクロロメタン（１０ｍｌ）にＤＢＵ（１，８−ジアザビシクロ［５，４，０］−７−ウンデセン，２００μｌ）を加え、そこに、参考例９（１）で得られた化合物（５００ｍｇ，４７４μｍｏｌ）を加え室温で５時間攪拌した。１Ｎ塩酸（１．３ｍｌ）を滴下し、攪拌した後、溶媒を留去し残渣をアセトニトリル（１０ｍｌ）で洗浄して、表題の化合物（３４０ｍｇ，４０８μｍｏｌ，収率８６％）を得た。
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３／３００ＭＨｚ）δ０．８８（６Ｈ，ｔ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，ＯＣ２２Ｈ４５  Ｃ２２−Ｈ），１．１−１．６（７８Ｈ，ｂｒ，ＯＣ２２Ｈ４５Ｃ３−２１−Ｈ，−ＮＨ２），１．７５（４Ｈ，ｍ，ＯＣ２２Ｈ４５Ｃ２−Ｈ），３．９２（４Ｈ，ｔ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，ＯＣ２２Ｈ４５  Ｃ１−Ｈ），５．１２（１Ｈ，ｓ，Ｈ２Ｎ−ＣＨＰｈ２），６．８３（４Ｈ，ｄ，Ｊ＝８．６Ｈｚ，Ｐｈ  Ｃ３，３’，５，５’−Ｈ），７．２４（４Ｈ，ｄ，Ｊ＝８．６Ｈｚ，Ｐｈ  Ｃ２，２’，６，６’−Ｈ）【０１７３】
実施例１（ヌクレオシドの合成）：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成【０１７４】
【化３０】
2012157723.tif 000031
【０１７５】
（１）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−Ｏ−スクシネートの合成
アルゴン雰囲気下、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン（５．００ｇ，９．１８ｍｍｏｌ）、コハク酸無水物（１．３８ｇ，１３．８ｍｍｏｌ）、トリエチルアミン（３．８５ｍＬ，２７．５ｍｍｏｌ）をジクロロメタン（９５ｍＬ）に溶解して室温で８時間攪拌した。薄層クロマトグラフィーで反応の完結を確認した後、２．０Ｍ  リン酸−トリエチルアミン  バッファー（ｐＨ  ７．５０）で３回分液洗浄した後、有機層を減圧留去し、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−Ｏ−スクシネートのトリエチルアミン塩（７．０２ｇ，９８％）を無色の泡状固体として得た。
（２）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成
３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルアルコール（３．０６ｇ，３．３５ｍｍｏｌ）を、ジクロロメタン（３５ｍＬ）に溶解し、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−Ｏ−スクシネートのトリエチルアミン塩（３．００ｇ，４．０２ｍｍｏｌ）、２−（１Ｈベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３−テトラメチルウロニウムヘキサフルオホスフェート［ＨＢＴＵ］（１．９８ｇ，５．２３ｍｍｏｌ）、ジイソプロピルエチルアミン（９２５μＬ，５．２３ｍｍｏｌ）、ジメチルアミノピリジン（６３９ｍｇ，５．２３ｍｍｏｌ）を加えて攪拌し、薄層クロマトグラフィーにて反応の完結を確認した後、メタノールを加えて濃縮し、吸引濾過し５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）］ベンジルスクシネート（４．７７ｇ，収率９３％）を白色固体として得た。
Ｒｆ＝０．７８（ＣＨ２Ｃｌ２／ＭｅＯＨ，１０：１）．
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ＝０．８８（ｔ，９Ｈ，Ａｒ−ＣＨ３），１．２９（ｂｒ，ｓ，９０Ｈ，（ＣＨ２）１５），１．３６（ｓ，３Ｈ，Ｎ５−ＣＨ３），１．７７（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２ＣＨ２），２．４５（ｍ，２Ｈ，２’−Ｈ），２，６７（ｍ，４Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ−ＣＨ２ＣＨ２），３．４８（ｍ，２Ｈ，５’−Ｈ），３．７９（ｓ，６Ｈ，ＤＭＴｒ−ＯＣＨ３），３．９５（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２），４．１２（ｍ，１Ｈ，４’−Ｈ），５．０１（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−ＣＨ２−ｓｕｃｃｉｎｙｌ），５．５０（ｍ，１Ｈ，３’−Ｈ），６．４２（ｔ，１Ｈ，１’−Ｈ），６．５３（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−Ｈ），６．８４−７．２６（ｍ，１３Ｈ，ＤＭＴｒ−Ａｒ−Ｈ），７．６０（ｓ，１Ｈ，Ｎ６−Ｈ）．【０１７６】
実施例２（ジヌクレオチドの液中連続合成１）：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成【０１７７】
【化３１】
2012157723.tif 000032
【０１７８】
アルゴン雰囲気下、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（５１１ｍｇ，３３２μｍｏｌ）をジクロロメタン（５．１１ｍＬ）に溶解し、ピロール（２３０μＬ，３．３２ｍｍｏｌ）、トリフルオロ酢酸（２９６μＬ，３．９８ｍｍｏｌ）を加えて室温で１５分間攪拌し、反応の完結は薄層クロマトグラフィーにより確認した。反応混合液をピリジン（３２２μＬ，３．９８ｍｍｏｌ）で中和した後、Ｎ−メチルイミダゾール（１５８μＬ，１．９９ｍｍｏｌ）、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホロアミダイト（４９４ｍｇ，６６４μｍｏｌ）のアセトニトリル溶液を加え、室温で６０分間攪拌し、薄層クロマトグラフィーにより反応の完結を確認した。更に、０．２Ｍ  ヨウ素  ピリジン／ＴＨＦ／Ｈ２Ｏ溶液（３．３２ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した。チオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を反応容器に投入し、０℃で１０分間攪拌した後、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過後、乾燥して５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル  デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（５９７ｍｇ，９９．２％）を白色固体として得た。
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ＝０．８８（ｔ，９Ｈ，Ｊ＝７．０４Ｈｚ，Ａｒ−ＣＨ３），１．２６（ｂｒ，ｓ，９０Ｈ，（ＣＨ２）１５），１．３０（ｓ，３Ｈ，Ｎ１５−ＣＨ３），１．４０（ｓ，３Ｈ，Ｎ２５−ＣＨ３），１．７７（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２ＣＨ２），２．３０（ｍ，２Ｈ，２’１−Ｈ），２．４０（ｍ，２Ｈ，２’２−Ｈ），２．６８（ｍ，４Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ−ＣＨ２ＣＨ２），２．７５（ｍ，２Ｈ，５’１−Ｈ），３．３９（ｍ，２Ｈ，５’２−Ｈ），３．７９（ｓ，６Ｈ，ＤＭＴｒ−ＯＣＨ３），３．９４（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２），４．１１（ｍ，１Ｈ，４’１−Ｈ），４．２５（ｍ，４Ｈ，ｃｙａｎｏｅｔｈｙｌ−ＣＨ２ＣＨ２ ａｎｄ  ｍ，１Ｈ，４’２−Ｈ），５．００（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−ＣＨ２−ｓｕｃｃｉｎｙｌ），５．１８（ｍ，１Ｈ，３’２−Ｈ），５．２７（ｍ，１Ｈ，３’１−Ｈ），６．２４（ｍ，１Ｈ、１’１−Ｈ），６．４２（ｍ，１Ｈ、１’２−Ｈ），６．５３（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−Ｈ），６．８３−７．３８（ｍ，１３Ｈ，ＤＭＴｒ−Ａｒ−Ｈ），７．３８（ｍ，１Ｈ，Ｎ６−Ｈ），７．５３（ｍ，１Ｈ，Ｎ６−Ｈ）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ＝０．８８（ｔ，９Ｈ，Ｊ＝７．０４ＨＺ，Ａｒ−ＣＨ３），１．２６（ｂｒ，ｓ，９０Ｈ，（ＣＨ２）１５），１．３０（ｓ，３Ｈ，Ｎ１５−ＣＨ３），１．４０（ｓ，３Ｈ，Ｎ２５−ＣＨ３），１．７７（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２ＣＨ２），２．３０（ｍ，２Ｈ，２’１−Ｈ），２．６８（ｍ，２Ｈ，２’２−Ｈ  ａｎｄ  ｍ，４Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ−ＣＨ２ＣＨ２），２．７５（ｍ，２Ｈ，５’１−Ｈ），３．５３（ｍ，２Ｈ，５’２−Ｈ），３．７９（ｓ，６Ｈ，ＤＭＴｒ−ＯＣＨ３），３．９４（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２），４．１１（ｍ，１Ｈ，４’１−Ｈ），４．２５（ｍ，４Ｈ，ｃｙａｎｏｅｔｈｙｌ−ＣＨ２ＣＨ２  ａｎｄ  ｍ，１Ｈ，４’２−Ｈ），５．０１（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−ＣＨ２−ｓｕｃｃｉｎｙｌ），５．１８（ｍ，１Ｈ，３’２−Ｈ），５．３１（ｍ，１Ｈ，３’１−Ｈ），６．２４（ｍ，１Ｈ、１’１−Ｈ），６．４２（ｍ，１Ｈ，１’２−Ｈ），６．５３（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−Ｈ），６．８３−７．３８（ｍ，１３Ｈ，ＤＭＴｒ−Ａｒ−Ｈ），７．３８（ｍ，１Ｈ，Ｎ１６−Ｈ），７．５３（ｍ，１Ｈ，Ｎ２６−Ｈ）【０１７９】
実施例３（ホスホロチオエート２量体の液中連続合成）：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホロチオニル  デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成【０１８０】
【化３２】
2012157723.tif 000033
【０１８１】
アルゴン雰囲気下、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（２００ｍｇ，１３０μｍｏｌ）をジクロロメタン（３．００ｍＬ）に溶解し、ピロール（８９．８μＬ，１．３０ｍｍｏｌ）、トリフルオロ酢酸（１１６μＬ，１．５６ｍｍｏｌ）を加えて室温で１５分間攪拌し、反応の完結を薄層クロマトグラフィーにより確認した。反応混合液をピリジン（１２６μＬ，１．５６ｍｍｏｌ）で中和した後、Ｎ−メチルイミダゾール（６１．８μＬ，０．７７９ｍｍｏｌ）、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホロアミダイト（１９４ｍｇ，２６０μｍｏｌ）のアセトニトリル溶液を加え、室温で６０分間攪拌し、薄層クロマトグラフィーにより反応の完結を確認した。更に、０．０５Ｍ  ３−（（Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノメチリデン）アミノ）−３Ｈ−１，２，４−ジチアゾール−５−チオン  ピリジン／アセトニトリル溶液（７．７９ｍＬ）を加えて室温で３０分間攪拌した。チオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を反応容器に投入し、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過後、乾燥して５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホロチオニル  デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（２４７ｍｇ，９９．５％）を白色固体として得た。
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ＝０．８８（ｔ，９Ｈ，Ｊ＝６．８Ｈｚ，Ａｒ−ＣＨ３），１．２８（ｂｒ，ｓ，９０Ｈ，（ＣＨ２）１５），１．３０（ｓ，３Ｈ，Ｎ１５−ＣＨ３），１．４６（ｓ，３Ｈ，Ｎ２５−ＣＨ３），１．７３（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２ＣＨ２），２．２８（ｍ，２Ｈ，２’１−Ｈ），２．４１（ｍ，２Ｈ，２’２−Ｈ），２．６８（ｍ，２Ｈ，５’１−Ｈ  ａｎｄ  ｍ，４Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ−ＣＨ２ＣＨ２），３．４４（ｍ，２Ｈ，５’２−Ｈ），３．７９（ｓ，６Ｈ，ＤＭＴｒ−ＯＣＨ３），３．９５（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２），４．１０（ｍ，１Ｈ，４’１−Ｈ），４．３１（ｍ，４Ｈ，ｃｙａｎｏｅｔｈｙｌ−ＣＨ２ＣＨ２  ａｎｄ  ｍ，１Ｈ，４’２−Ｈ），５．０１（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−ＣＨ２−ｓｕｃｃｉｎｙｌ），５．２６（ｍ，１Ｈ，３’１−Ｈ），５．３２（ｍ，１Ｈ，３’２−Ｈ），６．２７（ｍ，１Ｈ、１’１−Ｈ），６．３８（ｍ，１Ｈ、１’２−Ｈ），６．５３（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−Ｈ），６．８４−７．２９（ｍ，１３Ｈ，ＤＭＴｒ−Ａｒ−Ｈ），７．２９（ｍ，１Ｈ，Ｎ１６−Ｈ），７．５６（ｍ，１Ｈ，Ｎ２６−Ｈ）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ＝０．８８（ｔ，９Ｈ，Ａｒ−ＣＨ３），１．２８（ｂｒ，ｓ，９０Ｈ，（ＣＨ２）１５），１．３０（ｓ，３Ｈ，Ｎ１５−ＣＨ３），１．４６（ｓ，３Ｈ，Ｎ２５−ＣＨ３），１．７３（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２ＣＨ２），２．４１（ｍ，２Ｈ，２’２−Ｈ），２．６８（ｍ，２Ｈ，２’１−Ｈ  ａｎｄ  ｍ，４Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ−ＣＨ２ＣＨ２），２．７７（ｍ，２Ｈ，５’１−Ｈ），３．４４（ｍ，２Ｈ，５’２−Ｈ），３．７９（ｓ，６Ｈ，ＤＭＴｒ−ＯＣＨ３），３．９５（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２），４．１７（ｍ，１Ｈ，４’１−Ｈ），４．３１（ｍ，４Ｈ，ｃｙａｎｏｅｔｈｙｌ−ＣＨ２ＣＨ２  ａｎｄ  ｍ，１Ｈ，４’２−Ｈ），５．０１（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−ＣＨ２−ｓｕｃｃｉｎｙｌ），５．３３（ｍ，１Ｈ，３’１−Ｈ  ａｎｄ  ｍ，１Ｈ，３’２−Ｈ），６．２７（ｍ，１Ｈ、１’１−Ｈ），６．３８（ｍ，１Ｈ、１’２−Ｈ），６．５３（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−Ｈ），６．８４−７．２９（ｍ，１３Ｈ，ＤＭＴｒ−Ａｒ−Ｈ），７．２９（ｍ，１Ｈ，Ｎ１６−Ｈ），７．５６（ｍ，１Ｈ，Ｎ２６−Ｈ）【０１８２】
実施例４（ジヌクレオチドの液中連続合成２）：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（tert−ブチルジメチルシリル）ウリジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル  デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成【０１８３】
【化３３】
2012157723.tif 000034
【０１８４】
アルゴン雰囲気下、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（２００ｍｇ，１３０μｍｏｌ）をジクロロメタン（３．００ｍＬ）に溶解し、ピロール（８９．８μＬ，１．３０ｍｍｏｌ）、トリフルオロ酢酸（１１６μＬ，１．５６ｍｍｏｌ）を加えて室温で１５分間攪拌し、反応の完結を薄層クロマトグラフィーにより確認した。反応混合液をピリジン（１２６μＬ，１．５６ｍｍｏｌ）で中和した後、Ｎ−メチルイミダゾール（６１．８μＬ，０．７７９ｍｍｏｌ）、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル）ウリジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホロアミダイト（２２４ｍｇ，２６０μｍｏｌ）のアセトニトリル溶液を加え、室温で６０分間攪拌し、薄層クロマトグラフィーにより反応の完結を確認した。更に、０．２Ｍ  ヨウ素  ピリジン／ＴＨＦ／Ｈ２Ｏ溶液（１．３３ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した。チオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を反応容器に投入し、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過後、乾燥して５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル）ウリジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル  デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（２５７ｍｇ，９８．３％）を白色固体として得た。
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ＝０．１３（ｔ，６Ｈ，Ｊ＝３．８Ｈｚ，−ＯＳｉ（Ｍｅ２）ｔＢｕ），０．８８（ｔ，９Ｈ，Ｊ＝６．４，−ＯＳｉ（Ｍｅ２）ｔＢｕ  ａｎｄ  ｔ，９Ｈ，Ｊ＝６．３６，Ａｒ−ＣＨ３），１．２８（ｂｒ，ｓ，９０Ｈ，（ＣＨ２）１５），１．３０（ｓ，３Ｈ，Ｎ５−ＣＨ３），１．７５（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２ＣＨ２），２．２６（ｍ，２Ｈ，２’２−Ｈ），２．３８（ｍ，１Ｈ，２’１−Ｈ），２．６６（ｍ，４Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ−ＣＨ２ＣＨ２），２．７３（ｍ，２Ｈ，５’１−Ｈ），３．４７（ｍ，２Ｈ，５’２−Ｈ），３．７９（ｓ，６Ｈ，ＤＭＴｒ−ＯＣＨ３），３．９４（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２），４．２５（ｍ，４Ｈ，ｃｙａｎｏｅｔｈｙｌ−ＣＨ２ＣＨ２  ａｎｄ  ｍ，１Ｈ，４’１−Ｈ），４．５１（ｍ，１Ｈ，４’２−Ｈ），４．９３（ｍ，１Ｈ，３’２−Ｈ），５．００（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−ＣＨ２−ｓｕｃｃｉｎｙｌ），５．２０（ｍ，１Ｈ，３’１−Ｈ），５．２５（ｍ，１Ｈ，Ｎ１５−Ｈ），５．９７（ｍ，１Ｈ、１’１−Ｈ），６．２１（ｍ，１Ｈ、１’２−Ｈ），６．５３（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−Ｈ），６．８５−７．２８（ｍ，１３Ｈ，ＤＭＴｒ−Ａｒ−Ｈ），７．２９（ｍ，１Ｈ，Ｎ１６−Ｈ），７．８３（ｍ，１Ｈ，Ｎ２６−Ｈ）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ＝０．１３（ｔ，６Ｈ，Ｊ＝３．８Ｈｚ，−ＯＳｉ（Ｍｅ２）ｔＢｕ），０．８８（ｔ，９Ｈ，Ｊ＝６．４，−ＯＳｉ（Ｍｅ２）ｔＢｕ  ａｎｄ  ｔ，９Ｈ，Ｊ＝６．３６，Ａｒ−ＣＨ３），１．２８（ｂｒ，ｓ，９０Ｈ，（ＣＨ２）１５），１．３０（ｓ，３Ｈ，Ｎ５−ＣＨ３），１．７５（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２ＣＨ２），２．３８（ｍ，１Ｈ，２’１−Ｈ），２．５８（ｍ，２Ｈ，２’２−Ｈ），２．６８（ｍ，４Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ−ＣＨ２ＣＨ２），２．７３（ｍ，２Ｈ，５’１−Ｈ），３．６２（ｍ，２Ｈ，５’２−Ｈ），３．８０（ｓ，６Ｈ，ＤＭＴｒ−ＯＣＨ３），３．９４（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２），４．２５（ｍ，４Ｈ，ｃｙａｎｏｅｔｈｙｌ−ＣＨ２ＣＨ２  ａｎｄ  ｍ，１Ｈ，４’１−Ｈ），４．５１（ｍ，１Ｈ，４’２−Ｈ），４．９３（ｍ，１Ｈ，３’２−Ｈ），５．０１（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−ＣＨ２−ｓｕｃｃｉｎｙｌ），５．２５（ｍ，１Ｈ，Ｎ１５−Ｈ），５．３０（ｍ，１Ｈ，３’１−Ｈ），５．９７（ｍ，１Ｈ、１’１−Ｈ），６．２１（ｍ，１Ｈ、１’２−Ｈ），６．５３（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−Ｈ），６．８５−７．２８（ｍ，１３Ｈ，ＤＭＴｒ−Ａｒ−Ｈ），７．２９（ｍ，１Ｈ，Ｎ１６−Ｈ），７．８３（ｍ，１Ｈ，Ｎ２６−Ｈ）【０１８５】
実施例５（２０量体オリゴヌクレオチドの液中連続合成）：デオキシチミジニル−［３’→５’］−デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシグアニジル−［３’→５’］−デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシチミジニル−［３’→５’］ −デオキシグアニジル−［３’→５’］ −デオキシチミジニル−［３’→５’］ −デオキシグアニジル−［３’→５’］−デオキシアデニリル−［３’→５’］ −デオキシシチジニル−［３’→５’］ −デオキシアデニリル−［３’→５’］ −デオキシチミジニル−［３’→５’］ −デオキシグアニジル−［３’→５’］−デオキシシチジニル−［３’→５’］ −デオキシアデニリル−［３’→５’］ −デオキシチミジニル−［３’→５’］ −デオキシチミジンの合成
（１）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−デオキシチミジン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ４−ベンゾイル−デオキシシチジン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ４−ベンゾイル−デオキシシチジン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ４−ベンゾイル−デオキシシチジン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ２−イソブチリル−デオキシグアノシン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ４−ベンゾイル−デオキシシチジン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ４−ベンゾイル−デオキシシチジン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ２−イソブチリル−デオキシグアノシン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ２−イソブチリル−デオキシグアノシン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ６−ベンゾイル−デオキシアデノシン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ４−ベンゾイル−デオキシシチジン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ６−ベンゾイル−デオキシアデノシン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ２−イソブチリル−デオキシグアノシン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ４−ベンゾイル−デオキシシチジン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ６−ベンゾイル−デオキシアデノシン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン  ３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成
実施例２と同様の操作を１９回繰り返して、上記化合物（２．５５ｇ）を得た。
（２）脱保護および精製工程
実施例５の（１）で合成された化合物（１００ｍｇ，１０．３μｍｏｌ）と３０％アンモニア水：エタノール＝３：１溶液（５．００ｍＬ）をオートクレーブに入れて８０℃で２時間加熱した後、凍結乾燥した。凍結乾燥品を０．１Ｍ酢酸アンモニウム水溶液で希釈し、Ｃ−１８カートリッジ精製を行い得られた溶出液を凍結乾燥し、目的物である  デオキシチミジニル−［３’→５’］−デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシグアニジル−［３’→５’］−デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシチミジニル−［３’→５’］ −デオキシグアニジル−［３’→５’］ −デオキシチミジニル−［３’→５’］ −デオキシグアニジル−［３’→５’］−デオキシアデニリル−［３’→５’］ −デオキシシチジニル−［３’→５’］ −デオキシアデニリル−［３’→５’］ −デオキシチミジニル−［３’→５’］ −デオキシグアニジル−［３’→５’］−デオキシシチジニル−［３’→５’］ −デオキシアデニリル−［３’→５’］ −デオキシチミジニル−［３’→５’］ −デオキシチミジンを得た。
ＨＰＬＣ（ｓｈｏｄｅｘ  ＯＤＰ（４．６φ×１５０ｍｍ）、ｆｌｏｗ  ｒａｔｅ  １．０ｍＬ／ｍｉｎ、ＭｅＣＮ、Ｈ２Ｏ  ｇｒａｄｉｅｎｔ：０−１５ｍｉｎ；２  ｔｏ  ９８％、１５  ｔｏ  ２５ｍｉｎ；９８％、λ＝２５４ｎｍ）：Ｒｔ＝５．６１ｍｉｎ（９６．３％）；
ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ：６０４３．６６［Ｍ−Ｈ］-【０１８６】
試験例１（カチオン捕捉剤の検討）
試験化合物として、５’位水酸基を４，４’−ジメトキシトリチル（以下、ＤＭＴｒと略称することもある。）で保護した、実施例１の化合物（以下、ＤＭＴｒ保護化合物と略称することもある。）を使用し、ＤＭＴｒカチオン捕捉候補物質の試験・評価を行った。
ＤＭＴｒ保護化合物（５０．０ｍｇ，３２．５μｍｏｌ）をジクロロメタン（３５０μＬ）に溶解させて原料溶液とし、表１に記載のカチオン捕捉剤候補物質（１６２μｍｏｌ）を添加し、トリフルオロ酢酸（２９．２μＬ，３９４μｍｏｌ）を加えて、下記ＴＬＣ測定条件で、反応液のＤＭＴｒ保護化合物のスポットがＵＶと呈色反応の両者で消失確認できるまで、室温で約３０分間攪拌した。
更に、ピリジン（３１．８μＬ，３９４μｍｏｌ）で中和後の反応液に対して、下記ＴＬＣ測定条件により、下記評価基準で評価を行った。
○（効果あり）：ＤＭＴｒ保護化合物のスポットが、ＵＶと呈色反応の両者で確認されなかった場合
×（効果なし）：ＤＭＴｒ保護化合物のスポットが、ＵＶと呈色反応のいずれか、または、両者で確認された場合
結果を表１に示す。
〔薄層クロマトグラフィー（ＴＬＣ）測定条件〕
ＴＬＣ板（２ｃｍ×５ｃｍ角、メルク社製）に対して、ＴＬＣスポッティングキャピラリーチューブ５μＬ（Ｈｉｒｓｃｈｍａｎｎ  Ｌａｂｏｒｇｅｒａｅｔｅ社製）を用いて、反応液を原点付近にスポットし、展開液（ジクロロメタン／メタノール＝１０／１）により展開し、ＵＶ（２５４ｎｍ）と、呈色反応（リンモリブデン酸−エタノール溶液に浸漬後、ホットプレート（約３００℃）で１０秒以上）で目視確認した。
（ＤＭＴｒ保護化合物Ｒｆ値＝０．７０，ＤＭＴｒ脱保護化合物Ｒｆ値＝０．４０）【０１８７】
【表１】
2012157723.tif 000035
【０１８８】
カチオン捕捉剤として汎用されるジメチルスルフィド、アニソール、チオアニソール、クレゾール、１，３，５−トリメチルベンゼン、１，３−ジメトキシベンゼン、１，３，５−トリメトキシベンゼン、スクシンイミド、またはフタルイミドを使用した場合には、中和後に、再び５’末端水酸基が保護基Ｑにより保護されることから、カチオン捕捉剤として十分に機能しないことが分かった。また、慣用のカチオン捕捉剤であるトリアルキルシラン（例、トリイソプロピルシラン、トリエチルシラン等）を使用した場合には、５’末端水酸基が中和後にトリアルキルシリル化されるため、次の縮合工程に使用することができないことが分かった。更にメタノールをカチオン捕捉剤として使用した場合には、カチオンを不可逆的に捕捉するものの、次工程の縮合反応を妨げるため、適用できないことも分かった。
一方、中和反応後もＤＭＴｒカチオンの無害化状態を保持できる捕捉剤として、ピロール、３−メチルピロール、２，４−ジメチルピロール等のピロール誘導体、インドール等のインドール誘導体が有効であることが分かった。【０１８９】
試験例２（カチオン捕捉剤としてメタノールを用いた場合）
試験化合物として、５’位水酸基の保護基が４，４’−ジメトキシトリチルである実施例１の化合物を使用し、試験例１でＤＭＴｒカチオンスカベンジャーとして有効性が確認されたメタノールについて、脱保護・縮合の液中連続合成が可能であるか否かについて以下に示す方法で検討した。【０１９０】
アルゴン雰囲気下、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルス］クシネート（１００ｍｇ，６５．０μｍｏｌ）をジクロロメタン（１．５ｍＬ）に溶解し、メタノール（１３．２μＬ，３２５μｍｏｌ）、トリフルオロ酢酸（５７．９μＬ，７７９μｍｏｌ）を加えて室温で１５分間攪拌し、反応の完結をＨＰＬＣにより確認した。反応混合液をピリジン（６３．０μＬ，７７９μｍｏｌ）で中和した後、Ｎ−メチルイミダゾール（３０．９μＬ，３９０μｍｏｌ）、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホロアミダイト（９６．８ｍｇ，１３０μｍｏｌ）のアセトニトリル溶液を加え、室温で６０分間攪拌後の反応系をＨＰＬＣにより分析した。脱保護反応後の反応系と縮合反応後の反応系のＨＰＬＣピーク面積値を表２に示す。【０１９１】
【表２】
2012157723.tif 000036
【０１９２】
上記結果より、メタノールはＤＭＴｒカチオンの無害化を中和後も維持し続けたが、同一系内で縮合反応を連続して行っても、縮合反応はほとんど進行しないことが明らかとなった。【０１９３】
試験例３（カチオン捕捉剤としてトリエチルシランを用いた場合）
試験化合物として、５’位水酸基の保護基が４，４’−ジメトキシトリチルである実施例１の化合物を使用し、ＤＭＴｒカチオンスカベンジャーとしてトリエチルシランを用い、脱保護反応を以下に示す方法で検討した。【０１９４】
アルゴン雰囲気下、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（１００ｍｇ，６５．０μｍｏｌ）をジクロロメタン（１．５ｍL）に溶解し、トリエチルシラン（５１．７μＬ，３２５μｍｏｌ）、トリフルオロ酢酸（５７．９μＬ，７７９μｍｏｌ）を加えて室温で１５分間攪拌し、反応の完結を薄層クロマトグラフィーにより確認した。反応混合液をピリジン（６３．０μＬ，７７９μｍｏｌ）で中和した後、メタノール溶液を反応容器に投入し、キリヤマ漏斗を用いた吸引濾過後、乾燥した。乾燥して得られた固体の１Ｈ−ＮＭＲ（下記）を測定した結果、５’位水酸基がトリエチルシリル化された５’−Ｏ−（トリエチルシリル）デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートと５’−ＯＨ−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートが１’位のプロトン強度比で５’位トリエチルシリル体：５’位ＯＨ体＝０．２６：１．００の混合物として得られた。
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ＝０．６８（ｄｄ，６Ｈ，Ｓｉ（ＣＨ２ＣＨ３）３），０．８６（ｔ，９Ｈ，Ａｒ−ＣＨ３）， ０．９９（ｔ，９Ｈ，（ＣＨ２ＣＨ３）３），１．２６（ｂｒ，ｓ，９０Ｈ，（ＣＨ２）１５），１．３０（ｓ，３Ｈ，Ｎ５−ＣＨ３），１．７５（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２ＣＨ２），２．１２（ｍ，２Ｈ，２’−Ｈ），２．６８（ｍ，６Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ−ＣＨ２ＣＨ２），３．８８（ｍ，２Ｈ，５’−Ｈ），３．９８（ｍ，６Ｈ，Ａｒ−ＯＣＨ２），４．０７（ｍ，１Ｈ，４’−Ｈ），５．０２（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−ＣＨ２−ｓｕｃｃｉｎｙｌ），５．２８（ｍ，１Ｈ，３’−Ｈ），６．３７（ｔ，１Ｈ，１’−Ｈ），６．５４（ｓ，２Ｈ，Ａｒ−Ｈ），７．６２（ｓ，１Ｈ，Ｎ６−Ｈ）【０１９５】
上記結果より、トリエチルシランは脱保護反応中でのＤＭＴｒカチオン無害化には有効であるが、中和後には脱保護体の一部の５’位水酸基をトリエチルシリル化し、連続する縮合工程に悪影響を与えるため、ＤＭＴｒカチオンスカベンジャーとしては不適当であることが明らかとなった。【０１９６】
試験例４（液中連続反応後の沈殿化、単離を行う工程を変更した場合）
試験化合物として、５’−ＯＨ−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートを使用し、縮合、酸化、および脱保護反応の順に同一系内で連続して行う検討を以下の方法で行った。【０１９７】
アルゴン雰囲気下、５’−ＯＨ−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（７９．３ｍｇ，５２．３μｍｏｌ）をジクロロメタン（１．５ｍＬ）に溶解し、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホロアミダイト（７７．９ｍｇ，１０５μｍｏｌ）と１Ｈ−テトラゾール（３６．６ｍｇ，５２３μｍｏｌ）のアセトニトリル溶液を加えた。室温で６０分間攪拌し、薄層クロマトグラフィーにより反応の完結を確認した。更に、反応液に０．２Ｍ  ヨウ素  ピリジン／ＴＨＦ／Ｈ２Ｏ溶液（１．１ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、ＴＦＡ（４６．６μＬ，６２８μｍｏｌ）を投入し、反応の追跡をＨＰＬＣ分析により行った。縮合反応後、ＴＦＡの投入前と投入後３０分間室温で攪拌させた反応系のＨＰＬＣピーク面積値を表３に示す。【０１９８】
【表３】
2012157723.tif 000037
【０１９９】
上記結果より、ヨウ素／ピリジンを酸化剤として用いた液中連続合成法を縮合反応から開始した場合、縮合反応後の反応系を２％ＴＦＡの状態にしても５’位水酸基のＤＭＴｒ基が脱保護されないことが明らかとなった。このことから、本発明におけるオリゴヌクレオチドの液中連続合成においては、５’位水酸基の一時保護基であるＤＭＴｒ基の除去（脱保護）、縮合、および酸化の順に行い、酸化後にハイポを飽和させたメタノール等の添加による沈殿化、および固液分離する単離操作を行うのが良いことが分かった。【０２００】
実施例６：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−Ｎ−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシナメートの合成【０２０１】
【化３４】
2012157723.tif 000038
【０２０２】
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−Ｏ−スクシネートのトリエチルアミン塩（１．４５ｇ，１．９４ｍｍｏｌ）、３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルアミン（１．０２ｇ，１．１０ｍｍｏｌ）を脱水ジクロロメタン（１５ｍＬ）に溶解させ、２−（１Ｈ−ベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート［ＨＢＴＵ］（２．５３ｇ，６．６０ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン（１．１７ｍＬ，６．６０ｍｍｏｌ）を加えて室温で１時間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにて原料の消失を確認した後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で洗浄し、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥後に濾過し、濾液を減圧濃縮した。濃縮液にメタノールを添加後、濾過して得られた固体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（ジクロロメタン／メタノール，１％ｖ／ｖトリエチルアミン）で精製し表題の化合物（１．２２ｇ，７２．４％）を白色固体として得た。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．５０（ジクロロメタン：メタノール＝４：１）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８９（ｔ，９Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ，Ｈ３Ｃ（ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ）），１．２５−１．７９（ｍ，１０２Ｈ，−ＣＨ２−（ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ）），１．３５（ｓ，３Ｈ，Ｎ５−ＣＨ３−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），２．４５（ｍ，２Ｈ，２’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），２．５１（ｍ，２Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ），２．７０（ｍ，２Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ），３．４６（ｍ，２Ｈ，５’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），３．７９（ｓ，６Ｈ，Ｈ３ＣＯ−ＤＭＴｒ），３．７９−３．９５（ｍ，６Ｈ，Ｂｎ−Ｏ−ＣＨ２−），４．１５（ｍ，１Ｈ，４’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），４．３２（ｄ，２Ｈ，Ｊ＝５．５Ｈｚ，−ＮＨ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），５．４７（ｍ，１Ｈ，３’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），５．７２（ｄ，２Ｈ，Ｊ＝５．５Ｈｚ，−ＮＨ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），６．４１（ｍ，１Ｈ，１’−Ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．４５（ｓ，２Ｈ，−ｂｅｎｚｙｌ），６．８３（ｄ，４Ｈ，Ｊ＝９．０Ｈｚ，ＤＭＴｒ），７．２４−７．３８（ｍ，９Ｈ，ＤＭＴｒ），７．６１（ｓ，１Ｈ，Ｎ６−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），７．９５（ｂｒ・ｓ，Ｎ３−ＮＨ−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ）【０２０３】
実施例７：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−［３，５−ビス（ドコシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成【０２０４】
【化３５】
2012157723.tif 000039
【０２０５】
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−Ｏ−スクシネートのトリエチルアミン塩（８３７ｍｇ，１．１２ｍｍｏｌ）、３，５−ビス（ドコシルオキシ）ベンジルアルコール（５００ｍｇ，６６０μｍｏｌ）を脱水ジクロロメタン（１０ｍＬ）と脱水ジエチルエーテル（１０ｍＬ）の混合溶媒に溶解させた後、２−（１Ｈ−ベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート［ＨＢＴＵ］（３．００ｇ，７．８２ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン（１．４０ｍＬ，７．８２ｍｍｏｌ）を加えて３０℃で４時間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにて原料の消失を確認した後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で洗浄し、得られた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥後に濾過した。濾液を減圧濃縮し、メタノールを添加することで析出した固体を濾過後、シリカゲルカラムクロマトグラフィー（ジクロロメタン／メタノール、１％ｖ／ｖトリエチルアミン）で精製することで表題の化合物（７０２ｍｇ，７６．９％）を白色固体として得た。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．６０（ジクロロメタン：メタノール＝９：１）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８８（ｔ，６Ｈ，Ｊ＝７．０，  Ｈ３Ｃ−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），１．２５−１．７６（ｍ，８４Ｈ，−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），１．３５（ｓ，３Ｈ，Ｎ５−ＣＨ３−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），２．４５（ｍ，２Ｈ，２’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），２．６７（ｍ，４Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ），３．４６（ｍ，２Ｈ，５’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），３．７９（ｓ，６Ｈ，ＣＨ３Ｏ−ＤＭＴｒ），３．９０（ｔ，４Ｈ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，Ｂｎ−Ｏ−ＣＨ２−），４．１１（ｍ，１Ｈ，４’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），５．０３（ｓ，２Ｈ，ＮＨ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），５．４７（ｍ，１Ｈ，３’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．３８（ｍ，１Ｈ，３’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．８５（ｓ，２Ｈ，−ｂｅｎｚｙｌ），６．８３（ｄ，４Ｈ，Ｊ＝９．０，ＤＭＴｒ），７．２４−７．３８（ｍ，９Ｈ，ＤＭＴｒ），７．６０（ｍ，１Ｈ，Ｎ６−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），７．９７（ｂｒ・ｓ，１Ｈ，Ｎ３−ＮＨ−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ）【０２０６】
実施例８：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−Ｎ−［３，５−ビス（ドコシルオキシ）ベンジル］スクシナメートの合成【０２０７】
【化３６】
2012157723.tif 000040
【０２０８】
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−Ｏ−スクシネートのトリエチルアミン塩（２２３ｍｇ，２９９μｍｏｌ）、３，５−ビス（ドコシルオキシ）ベンジルアミン（１３３ｍｇ，１７５μｍｏｌ）を脱水ジクロロメタン（５ｍＬ）に溶解させ、２−（１Ｈ−ベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート［ＨＢＴＵ］（３７５ｍｇ，９５４μｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン（１７０μＬ，９５４μｍｏｌ）を加えて室温で２時間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにて原料の消失を確認した後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で洗浄し、得られた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥後に濾過し、減圧濃縮した濾液にメタノールを添加することで析出した固体を濾過した。得られた固体を減圧乾燥させて表題の化合物（２０５ｍｇ，８４．６％）を白色固体として得た。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．４０（ジクロロメタン：メタノール＝９：１）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８８（ｔ，６Ｈ，Ｊ＝７．０，Ｈ３Ｃ−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），１．２５−１．７５（ｍ，８４Ｈ，−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），１．３５（ｓ，３Ｈ，Ｎ５−ＣＨ３−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），２．４５（ｍ，２Ｈ，２’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），２．５２（ｍ，２Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ），２．６９（ｍ，２Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ），３．４６（ｍ，２Ｈ，５’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），３．７９（ｓ，６Ｈ，ＣＨ３Ｏ−ＤＭＴｒ），３．８９（ｔ，４Ｈ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，−Ｏ−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），４．１４（ｍ，１Ｈ，４’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），４．３４（ｄ，２Ｈ，Ｊ＝５．６Ｈｚ，−ＮＨ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），５．４７（ｍ，１Ｈ，３’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），５．７４（ｔ，１Ｈ，Ｊ＝５．６Ｈｚ，−ＮＨ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），６．３５（ｍ，１Ｈ，１’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．３８（ｓ，２Ｈ，−ｂｅｎｚｙｌ），６．８３（ｄ，４Ｈ，Ｊ＝９．０Ｈｚ，−ＤＭＴｒ），７．２４−７．３８（ｍ，９Ｈ，−ＤＭＴｒ），７．６１（ｓ，１Ｈ，Ｎ６−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），７．９３（ｂｒ・ｓ，１Ｈ，Ｎ３−ＮＨ−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ）【０２０９】
実施例９：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−［２，４−ビス（ドコシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成【０２１０】
【化３７】
2012157723.tif 000041
【０２１１】
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−Ｏ−スクシネートのトリエチルアミン塩（１．６９ｇ，２．２４ｍｍｏｌ）、２，４−ビス（ドコシルオキシ）ベンジルアルコール（９９０ｍｇ，１．３２ｍｍｏｌ）を脱水ジクロロメタン（１５ｍＬ）に溶解し、２−（１Ｈ−ベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート［ＨＢＴＵ］（２．７７ｇ，７．２０ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン（１．２８ｍＬ，７．２０ｍｍｏｌ）を加えて室温で１時間攪拌した。薄層クロマトグラフィーにて原料の消失を確認した後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で洗浄し、得られた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥後に濾過し、減圧濃縮した濾液にメタノールを添加することで析出した固体を濾過後、乾燥させて表題の化合物（１．６８ｇ，９２．０％）を白色固体として得た。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．７０（ジクロロメタン：メタノール＝９：１）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８８（ｔ，６Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ，Ｈ３Ｃ−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），１．２５−１．７５（ｍ，８４Ｈ，−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），１．３５（ｓ，３Ｈ，Ｎ５−ＣＨ３−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），２．４４（ｍ，２Ｈ，２’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），２．６４（ｍ，４Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ），３．４５（ｍ，２Ｈ，５’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），３．７９（ｓ，６Ｈ，Ｈ３Ｃ−ＤＭＴｒ），３．９２（ｍ，４Ｈ，−Ｏ−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），４．１０（ｍ，１Ｈ，４’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），５．１１（ｓ，２Ｈ，−Ｏ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），５．４７（ｍ，１Ｈ，３’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．３９（ｍ，１Ｈ，１’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．４２（ｓ，２Ｈ，−ｂｅｎｚｙｌ），６．８３（ｄ，４Ｈ，Ｊ＝８．９Ｈｚ，−ＤＭＴｒ），７．１７−７．３９（ｍ，９Ｈ，−ＤＭＴｒ），７．６０（ｓ，１Ｈ，Ｎ６−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），７．９７（ｂｒ・ｓ，１Ｈ，Ｎ３−ＮＨ−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ）【０２１２】
実施例１０：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−Ｎ−［２，４−ビス（ドコシルオキシ）ベンジル］スクシナメートの合成【０２１３】
【化３８】
2012157723.tif 000042
【０２１４】
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−Ｏ−スクシネートのトリエチルアミン塩（１．７０ｇ，２．２８ｍｍｏｌ）、２，４−ビス（ドコシルオキシ）ベンジルアミン（１．０１ｇ，１．３２ｍｍｏｌ）を脱水ジクロロメタン（１５ｍＬ）に溶解させ、２−（１Ｈ−ベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート［ＨＢＴＵ］（２．７３ｇ，７．２０ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン（１．２８ｍＬ，７．２０ｍｍｏｌ）を加えて室温で１時間攪拌した。薄層クロマトグラフィーにて原料の消失を確認した後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で洗浄し、得られた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥後に濾過した。減圧濃縮した濾液にメタノールを添加することで析出した固体を濾過し、減圧乾燥させて表題の化合物（１．７５ｇ，９６．０％）を白色固体として得た。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．６０（ジクロロメタン：メタノール＝９：１）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８８（ｔ，６Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ，Ｈ３Ｃ−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），１．２５−１．７４（ｍ，８４Ｈ，−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），１．３４（ｓ，３Ｈ，Ｎ５−ＣＨ３−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），２．４５（ｍ，２Ｈ，２’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），２．４６（ｍ，２Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ），２．６６（ｍ，２Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ），３．４５（ｍ，２Ｈ，５’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），３．７９（ｓ，６Ｈ，Ｈ３ＣＯ−ＤＭＴｒ），３．８９（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，−Ｏ−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），３．９４（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，−Ｏ−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），４．１１（ｍ，１Ｈ，４’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），４．３５（ｄ，２Ｈ，Ｊ＝５．７Ｈｚ，−ＮＨ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），５．４７（ｍ，１Ｈ，３’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），５．９３（ｔ，１Ｈ，Ｊ＝５．７Ｈｚ，−ＮＨ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），６．３８（ｍ，１Ｈ，１’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．４２（ｓ，２Ｈ，−ｂｅｎｚｙｌ），６．８３（ｄ，４Ｈ，Ｊ＝９．０Ｈｚ，−ＤＭＴｒ），７．１１−７．３８（ｍ，９Ｈ，−ＤＭＴｒ），７．６０（ｓ，１Ｈ，Ｎ６−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），７．９６（ｂｒ・ｓ，１Ｈ，Ｎ３−ＮＨ−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ）【０２１５】
実施例１１：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−Ｎ−［４，４’−ビス（ドコシルオキシ）ベンズヒドリル］スクシナメートの合成【０２１６】
【化３９】
2012157723.tif 000043
【０２１７】
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−Ｏ−スクシネートのトリエチルアミン塩（２．０２ｇ，２．７１ｍｍｏｌ）および４，４’−ビス（ドコシルオキシ）ベンズヒドリルアミン（１．２５ｇ，１．５０ｍｍｏｌ）を脱水ジクロロメタン（１５ｍＬ）に溶解し、２−（１Ｈ−ベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート［ＨＢＴＵ］（３．４０ｇ，８．９３ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン（１．５６ｍＬ，９．００ｍｍｏｌ）を加えて４０℃で終夜攪拌した。薄層クロマトグラフィーにて原料の消失を確認した後、反応液を減圧濃縮し、濃縮液にメタノールを添加することで析出した固体を濾過した。得られた固体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（ジクロロメタン／メタノール，１％ｖ／ｖトリエチルアミン）で精製し、表題の化合物（１．６５ｇ，７５．３％）を白色固体として得た。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．７０（ジクロロメタン：メタノール＝１０：１）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８８（ｔ，６Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ，Ｈ３Ｃ−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），１．２５−１．７６（ｍ，８４Ｈ，−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），１．３６（ｓ，３Ｈ，Ｎ５−ＣＨ３−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），２．４２（ｍ，２Ｈ，２’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），２．５５（ｍ，２Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ），２．７０（ｍ，２Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ），３．４５（ｍ，２Ｈ，５’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），３．７８（ｓ，６Ｈ，Ｈ３ＣＯ−ＤＭＴｒ），３．８９（ｄｔ，４Ｈ，Ｊ＝６．７，１３．６Ｈｚ，−Ｏ−ＣＨ２−ｄｏｃｏｓｙｌｏｘｙ），４．１１（ｍ，１Ｈ，４’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），５．４８（ｍ，１Ｈ，３’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．０３（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝７．８Ｈｚ，−ＮＨ−ＣＨ−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），６．１０（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝７．８Ｈｚ，−ＮＨ−ＣＨ−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），６．３９（ｍ，１Ｈ，１’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．８１（ｍ，４Ｈ，−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），６．８３（ｄ，４Ｈ，Ｊ＝９．０Ｈｚ，−ＤＭＴｒ），７．０８−７．３９（ｍ，９Ｈ＋４Ｈ，−ＤＭＴｒ＋−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），７．５９（ｓ，１Ｈ，Ｎ６−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），７．８９（ｂｒ・ｓ，１Ｈ，Ｎ３−ＮＨ−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ）【０２１８】
実施例１２：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−Ｎ−［２，３，４−トリス（オクタデシルオキシ）ベンズヒドリル］スクシナメートの合成【０２１９】
【化４０】
2012157723.tif 000044
【０２２０】
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−Ｏ−スクシネートのトリエチルアミン塩（１．２９ｇ，１．７０ｍｍｏｌ）、２，３，４−トリス（オクタデシルオキシ）ベンズヒドリルアミン（１．０１ｇ，１．０２ｍｍｏｌ）を脱水ジクロロメタン（１５ｍＬ）に溶解し、２−（１Ｈ−ベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート［ＨＢＴＵ］（２．３１ｇ，６．０９ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン（１．０７ｍＬ，６．０６ｍｍｏｌ）を加えて室温で１時間攪拌した。薄層クロマトグラフィーにて原料の消失を確認した後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で洗浄し、得られた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥後に濾過した。減圧濃縮した濾液にメタノールを添加することで析出した固体を濾過し、減圧乾燥させて表題の化合物（１．１４ｇ，６８．８％）を白色固体として得た。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．５０（ジクロロメタン：メタノール＝９：１）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）  ｓｐｅｃｔｒａ  ｏｆ  ｄｉａｓｔｅｒｅｏｍｅｒ  １：δ０．８８（ｔ，６Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ，Ｈ３Ｃ−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），１．１６−１．８０（ｍ，３Ｈ＋１０２Ｈ，Ｎ５−ＣＨ３−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ＋−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），２．４２−２．８０（ｍ，１H＋４Ｈ，２’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ＋ｓｕｃｃｉｎｙｌ）， ３．２６（ｍ，２Ｈ，２’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），３．４５（ｍ，２Ｈ，５’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），３．７８（ｓ，６Ｈ，Ｈ３ＣＯ−ＤＭＴｒ），３．９４（ｍ，６Ｈ，−Ｏ−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），４．１２（ｍ，１Ｈ，４’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），５．５０（ｍ，１Ｈ，３’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．２５（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．６Ｈｚ，−ＮＨ−ＣＨ−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），６．４１（ｍ，１Ｈ，１’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．５９（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．６Ｈｚ，−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），６．７４（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．６Ｈｚ，−ＮＨ−ＣH−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），６．８３（ｄ，４Ｈ，Ｊ＝９．０Ｈｚ，−ＤＭＴｒ），６．９０（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．６Ｈｚ，−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），７．１１−７．３９（ｍ，９Ｈ＋５Ｈ，−ＤＭＴｒ＋−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），７．６０（ｓ，１Ｈ，Ｎ６−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），８．００（ｂｒ・ｓ，１Ｈ，Ｎ３−ＮＨ−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）  ｓｐｅｃｔｒａ  ｏｆ  ｄｉａｓｔｅｒｅｏｍｅｒ  ２：δ０．８８（ｔ，６Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ，Ｈ３Ｃ−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），１．１６−１．８０（ｍ，３Ｈ＋１０２Ｈ，Ｎ５−ＣＨ３−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ＋−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），２．４２−２．８０（ｍ，１H＋４Ｈ，２’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ＋ｓｕｃｃｉｎｙｌ）， ３．２６（ｍ，２Ｈ，２’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），３．４５（ｍ，２Ｈ，５’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），３．７８（ｓ，６Ｈ，Ｈ３ＣＯ−ＤＭＴｒ），３．９４（ｍ，６Ｈ，−Ｏ−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），４．１２（ｍ，１Ｈ，４’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），５．５０（ｍ，１Ｈ，３’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．２６（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．６Ｈｚ，−ＮＨ−ＣＨ−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），６．４１（ｍ，１Ｈ，１’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．６１（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．６Ｈｚ，−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），６．７６（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．６Ｈｚ，−ＮＨ−ＣH−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），６．８３（ｄ，４Ｈ，Ｊ＝９．０Ｈｚ，−ＤＭＴｒ），６．９２（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．６Ｈｚ，−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），７．１１−７．３９（ｍ，９Ｈ＋５Ｈ，−ＤＭＴｒ＋−ｂｅｎｚｈｙｄｒｙｌ），７．６０（ｓ，１Ｈ，Ｎ６−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），８．００（ｂｒ・ｓ，１Ｈ，Ｎ３−ＮＨ−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ）【０２２１】
実施例１３：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−イル−｛３，４，５−トリス［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジル｝スクシネートの合成【０２２２】
【化４１】
2012157723.tif 000045
【０２２３】
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−Ｏ−スクシネートのトリエチルアミン塩（４０８ｍｇ，５４８μｍｏｌ）、３，４，５−トリス［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルアルコール（９０４ｍｇ，３１８μｍｏｌ）を脱水ジクロロメタン（１０ｍＬ）に溶解し、２−（１Ｈ−ベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート［ＨＢＴＵ］（１．０９ｇ，２．８７ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン（５０７μＬ，２．８５ｍｍｏｌ）を加えて室温で１時間攪拌した。薄層クロマトグラフィーにて原料の消失を確認した後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で洗浄し、得られた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥後に濾過した。減圧濃縮した濾液にメタノールを添加することで析出した固体を濾過し、シリカゲルカラムクロマトグラフィー（ジクロロメタン／メタノール＝９９／２，１％ｖ／ｖトリエチルアミン）で精製して表題の化合物（２０７ｍｇ，６５．２％）を白色固体として得た。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．５０（ジクロロメタン：メタノール＝１９：１）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８８（ｔ，２７Ｈ，Ｊ＝６．９，  Ｈ３Ｃ−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），１．２５−１．７５（ｍ，３０６Ｈ，−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），１．３５（ｓ，３Ｈ，Ｎ５−ＣＨ３−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），２．４７（ｍ，２Ｈ，２’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），２．６６（ｍ，４Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ），３．４７（ｍ，２Ｈ，５’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），３．７４（ｔ，４Ｈ，Ｊ＝６．３Ｈｚ，−ｂｅｎｚｙｌ−Ｏ−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），３．７８（ｓ，６Ｈ，ＣＨ３Ｏ−ＤＭＴｒ），３．８６（ｔ，１０Ｈ，Ｊ＝６．３Ｈｚ，−ｂｅｎｚｙｌ−Ｏ−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），３．９２（ｔ，４Ｈ，Ｊ＝６．３Ｈｚ，−ｂｅｎｚｙｌ−Ｏ−ＣＨ２−ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ），４．１５（ｍ，１Ｈ，４’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），４．９９（ｍ，２Ｈ＋６Ｈ，−Ｏ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ−Ｏ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ＋−Ｏ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ−Ｏ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），５．４８（ｍ，１Ｈ，３’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．４２（ｍ，１Ｈ，３’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），６．６１（ｓ，６Ｈ，−Ｏ−ｂｅｎｚｙｌ−Ｏ−ｂｅｎｚｙｌ），６．６６（ｓ，２Ｈ，−Ｏ−ｂｅｎｚｙｌ−Ｏ−ｂｅｎｚｙｌ），６．８２（ｄ，４Ｈ，Ｊ＝８．９Ｈｚ，ＤＭＴｒ），７．２３−７．３８（ｍ，９Ｈ，ＤＭＴｒ），７．６０（ｍ，１Ｈ，Ｎ６−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），７．９３（ｂｒ・ｓ，１Ｈ，Ｎ３−ＮＨ−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ）【０２２４】
実施例１４：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−メトキシウリジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成【０２２５】
【化４２】
2012157723.tif 000046
【０２２６】
（１）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−メトキシウリジン−３’−Ｏ−スクシネートの合成
アルゴン雰囲気下、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−メトキシウリジン（１．９８ｇ，３．５７ｍｍｏｌ）、コハク酸無水物（６３１ｍｇ，６．３０ｍｍｏｌ）、トリエチルアミン（１．４９ｍＬ，１０．７ｍｍｏｌ）をジクロロメタン（３０ｍＬ）に溶解して室温で３時間攪拌した。薄層クロマトグラフィーで反応の完結を確認した後、２．０Ｍリン酸−トリエチルアミンバッファー（ｐＨ７．５０）で３回分液洗浄した後、有機層を減圧留去し、表題の化合物のトリエチルアミン塩（２．８０ｇ）を無色の泡状固体として定量的に得た。
（２）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−メトキシウリジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成
実施例１４−（１）で合成した化合物（１．４０ｇ，１．８４ｍｍｏｌ）、３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジルアルコール（９８９ｍｇ，１．０８ｍｍｏｌ）を脱水ジクロロメタン（４０ｍＬ）に溶解させ、２−（１Ｈ−ベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート［ＨＢＴＵ］（２．４６ｇ，６．４８ｍｍｏｌ）、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン（１．１３ｍＬ，６．４８ｍｍｏｌ）を加えて室温で１時間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにて原料の消失を確認した後、反応液にメタノールを添加後、濾過して得られた固体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（ヘキサン／酢酸エチル，１％ｖ／ｖトリエチルアミン）で精製し表題の化合物（１．４１ｇ，８４．０％）を白色固体として得た。
ＴＬＣ：Ｒｆ＝０．７２（ジクロロメタン：メタノール＝９：1）
１Ｈ−ＮＭＲ（４００ＭＨｚ）：δ０．８８（ｔ，９Ｈ，Ｊ＝６．６Ｈｚ，Ｈ３Ｃ（ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ）），１．１８−１．８０（ｍ，１０２Ｈ，−ＣＨ２−（ｏｃｔａｄｅｃｙｌｏｘｙ）），２．７０（ｍ，４Ｈ，ｓｕｃｃｉｎｙｌ），３．４２−３．５０（ｍ，１Ｈ，５’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），３．４６（ｓ，３Ｈ，２'−ＯＭｅ），３．５６−３．６２（ｍ，１Ｈ，５’−ｔｈｙｍｉｄｉｎｅ），３．７９（ｓ，６Ｈ，Ｈ３ＣＯ−ＤＭＴｒ），３．９０−４．００（ｍ，６Ｈ，Ｂｎ−Ｏ−ＣＨ２−），４．０８（ｍ，１Ｈ，２’−Ｈ），４．２４（ｍ，１Ｈ，４’−Ｈ），５．０１（ｓ，２Ｈ，−Ｏ−ＣＨ２−ｂｅｎｚｙｌ），５．２８−５．３３（ｍ，２Ｈ，３’−H  ａｎｄ  Ｎ５−Ｈ），６．０２（ｍ，１Ｈ，１’−H），６．５３（ｓ，２Ｈ，−ｂｅｎｚｙｌ），６．８４（ｍ，４Ｈ，ＤＭＴｒ），７．２４−７．３８（ｍ，９Ｈ，ＤＭＴｒ），７．８６（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．２０Ｈｚ，Ｎ６−Ｈ），８．１０（ｂｒ・ｓ，Ｎ３−ＮＨ）【０２２７】
実施例１５：デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシアデニリル−［３’→５’］−デオキシチミジニル−［３’→５’］−デオキシチミジン（５’−ｄ［ＣＡＴＴ］−３’）の合成【０２２８】
【化４３】
2012157723.tif 000047
【０２２９】
を用いた５’−ｄ［ＣＡＴＴ］−３’の合成
（１）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−Ｎ−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシナメートの合成
実施例６で合成した化合物（３０２ｍｇ，１９５μｍｏｌ）をジクロロメタン（４．５ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（７２．２μＬ，９７５μｍｏｌ）、ピロール（６６．９μＬ，９７５μｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（７８．９μＬ，９７５μｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（３８．７μＬ，４８８μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．５ｍＬ）で溶解させたｄＴ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホロアミダイト）（４３５ｍｇ，５８５μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（５．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムの飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（３８５ｍｇ）を白色固体として定量的に得た。
（２）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−Ｎ６−ベンゾイル−２’−デオキシアデノシン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−Ｎ−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシナメートの合成
実施例１５−（１）で合成した化合物（３８３ｍｇ，２００μｍｏｌ）をジクロロメタン（４．５ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（７２．２μＬ，９７５μｍｏｌ）、ピロール（６６．９μＬ，９７５μｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（７８．９μＬ，９７５μｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（３８．７μＬ，４８８μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．５ｍＬ）で溶解させたｄＡ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−Ｎ６−ベンゾイル−２’−デオキシアデノシン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホロアミダイト）（５１４ｍｇ，６００μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（５．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（４７９ｍｇ，９９．８％）を白色固体として得た。
（３）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−Ｎ４−ベンゾイル−２’−デオキシシチジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ６−ベンゾイル−２’−デオキシアデノシン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−Ｎ−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシナメートの合成
実施例１５−（２）で合成した化合物（４７６ｍｇ，１９８μｍｏｌ）をジクロロメタン（４．５ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（７２．２μＬ，９７５μｍｏｌ）、ピロール（６６．９μＬ，９７５μｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（７８．９μＬ，９７５μｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（３８．７μＬ，４８８μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．５ｍＬ）で溶解させたｄＣ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−Ｎ４−ベンゾイル−２’−デオキシシチジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホロアミダイト）（５００ｍｇ，６００μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（５．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（５２２ｍｇ，９１．９％）を白色固体として得た。
（４）デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシアデニリル−［３’→５’］−デオキシチミジニル−［３’→５’］−デオキシチミジン（５’−ｄ［ＣＡＴＴ］−３’）の合成
実施例１５−（３）で合成した化合物と、２８％アンモニア水溶液：エタノール＝３：１の溶液（４．０ｍＬ）をオートクレーブにいれて６５℃で１６時間加熱した後、反応液を遠心エバポレーターで減圧濃縮した。Ｃ−１８逆相カートリッジカラムに吸着させた後、０．１ｍｏｌ／Ｌ酢酸アンモニウム水溶液で洗浄し、２％トリフルオロ酢酸水溶液により、５’末端の水酸基に結合したジメトキトリチル基を脱保護し、２０％アセトニトリル水溶液で溶出して表題の化合物を得た。
ｍ／ｚ（ＭＡＬＤＩ  ＴＯＦ）：Ａｎａｌ．Ｃａｌｃ．ｆｏｒ  Ｃ３９Ｈ５１Ｎ１２Ｏ２３Ｐ３：１１４８．２．Ｆｏｕｎｄ  １１４７．０（Ｍ−Ｈ）−【０２３０】
実施例１６：デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシアデニリル−［３’→５’］−デオキシチミジニル−［３’→５’］−デオキシチミジン（５’−ｄ［ＣＡＴＴ］−３’）の合成【０２３１】
【化４４】
2012157723.tif 000048
【０２３２】
を用いた５’−ｄ［ＣＡＴＴ］−３’の合成
（１）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−［３，５−ビス（ドコシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成
実施例７で合成した化合物（２０２ｍｇ，１４６μｍｏｌ）をジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（５３．５μＬ，７２３μｍｏｌ）、ピロール（５０．０μＬ，７２３μｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（５８．４μＬ，７２３μｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（２８．６μＬ，３６１μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．０ｍＬ）で溶解させたｄＴ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（２０８ｍｇ，２８９μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（２．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（２２６ｍｇ，８９．０％）を白色固体として得た。
（２）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−Ｎ６−ベンゾイル−２’−デオキシアデノシン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−［３，５−ビス（ドコシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成
実施例１６−（１）で合成した化合物（２２５ｍｇ，１２９μｍｏｌ）をジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（４７．８μＬ，６４５μｍｏｌ）、ピロール（４４．６μＬ，６４５μｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（５２．１μＬ，６４５μｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（２５．６μＬ，３２３μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．０ｍＬ）で溶解させたｄＡ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（３３４ｍｇ，３８７μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（３．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（２８８ｍｇ）を定量的に白色固体として得た。
（３）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−Ｎ４−ベンゾイル−２’−デオキシシチジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ６−ベンゾイル−２’−デオキシアデノシン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］−ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−［３，５−ビス（ドコシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成
実施例１６−（２）で合成した化合物（２８７ｍｇ，１２９μｍｏｌ）をジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（４７．８μｌ，６４５μｍｏｌ）、ピロール（４４．６μｌ，６４５μｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（５２．１μＬ，６４５μｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（２５．６μＬ，３２３μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．０ｍＬ）で溶解させたｄＣ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（３２５ｍｇ，３８７μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（３．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（３１６ｍｇ，９１．２％）を白色固体として得た。
（４）デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシアデニリル−［３’→５’］−デオキシチミジニル−［３’→５’］−デオキシチミジン（５’−ｄ［ＣＡＴＴ］−３’）の合成
実施例１６−（３）で合成した化合物と、２８％アンモニア水溶液：エタノール＝３：１の溶液（４．０ｍＬ）をオートクレーブにいれて６５℃で１６時間加熱した後、反応液を遠心エバポレーターで減圧濃縮した。濃縮液をＣ−１８逆相カートリッジカラムに吸着させた後、０．１ｍｏｌ／Ｌ酢酸アンモニウム水溶液で洗浄し、２％トリフルオロ酢酸水溶液により、５’末端の水酸基に結合したジメトキトリチル基を脱保護し、２０％アセトニトリル水溶液で溶出して表題の化合物を得た。
ｍ／ｚ（ＭＡＬＤＩ  ＴＯＦ）：Ａｎａｌ．Ｃａｌｃ．ｆｏｒ  Ｃ３９Ｈ５１Ｎ１２Ｏ２３Ｐ３：１１４８．２．Ｆｏｕｎｄ  １１４７．０（Ｍ−Ｈ）−【０２３３】
実施例１７：デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシアデニリル−［３’→５’］−デオキシチミジニル−［３’→５’］−デオキシチミジン（５’−ｄ［ＣＡＴＴ］−３’）の合成【０２３４】
【化４５】
2012157723.tif 000049
【０２３５】
を用いた５’−ｄ［ＣＡＴＴ］−３’の合成
（１）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−Ｎ−［２，４−ビス（ドコシルオキシ）ベンジル］スクシナメートの合成
実施例１０で合成した化合物（１９７ｍｇ，１４３μｍｏｌ）をアルゴン雰囲気下ジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（５３．５μＬ，７２０μｍｏｌ）、ピロール（５０．０μＬ，７２０μｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（５８．４μＬ，７２０μｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（２８．６μＬ，３６０μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．０ｍＬ）で溶解させたｄＴ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（２０１ｍｇ，２８９μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（２．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（２４８ｍｇ，９９．９％）を白色固体として得た。
（２）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−Ｎ６−ベンゾイル−２’−デオキシアデノシン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−Ｎ−［２，４−ビス（ドコシルオキシ）ベンジル］スクシナメートの合成
実施例１７−（１）で合成した化合物（２３５ｍｇ，１３５μｍｏｌ）をアルゴン雰囲気下ジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（５３．５μＬ，７２０μｍｏｌ）、ピロール（５０．０μＬ，７２０μｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（５８．４μＬ，７２０μｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（２８．６μＬ，３６０μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．０ｍＬ）で溶解させたｄＡ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（３４７ｍｇ，４０５μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（３．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（２７６ｍｇ，９１．９％）を白色固体として得た。
（３）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−Ｎ４−ベンゾイル−２’−デオキシシチジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ６−ベンゾイル−２’−デオキシアデノシン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−Ｎ−［２，４−ビス（ドコシルオキシ）ベンジル］スクシナメートの合成
実施例１７−（２）で合成した化合物（２５３ｍｇ，９４．２μｍｏｌ）をアルゴン雰囲気下ジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（３４．９μＬ，４７１μｍｏｌ）、ピロール（３２．６μＬ，４７１μｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（３８．１μＬ，４７１μｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（１８．７μＬ，２３５μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．０ｍＬ）で溶解させたｄＣ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（２３６ｍｇ，２８２μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（３．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（２５２ｍｇ，９９．５％）を白色固体として得た。
（４）デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシアデニリル−［３’→５’］−デオキシチミジニル−［３’→５’］−デオキシチミジン（５’−ｄ［ＣＡＴＴ］−３’）の合成
実施例１７−（３）で合成した化合物と、２８％アンモニア水溶液：エタノール＝３：１の溶液（４．０ｍＬ）をオートクレーブにいれて６５℃で１６時間加熱した後、反応液を遠心エバポレーターで減圧濃縮した。濃縮液をＣ−１８逆相カートリッジカラムに吸着させた後、０．１ｍｏｌ／Ｌ酢酸アンモニウム水溶液で洗浄し、２％トリフルオロ酢酸水溶液により、５’末端の水酸基に結合したジメトキトリチル基を脱保護し、２０％アセトニトリル水溶液で溶出して表題の化合物を得た。
ｍ／ｚ（ＭＡＬＤＩ  ＴＯＦ）：Ａｎａｌ．Ｃａｌｃ．ｆｏｒ  Ｃ３９Ｈ５１Ｎ１２Ｏ２３Ｐ３：１１４８．２４．Ｆｏｕｎｄ  １１４９．６３（Ｍ＋Ｈ）＋【０２３６】
実施例１８：デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシアデニリル−［３’→５’］−デオキシチミジニル−［３’→５’］−デオキシチミジン（５’−ｄ［ＣＡＴＴ］−３’）の合成【０２３７】
【化４６】
2012157723.tif 000050
【０２３８】
を用いた５’−ｄ［ＣＡＴＴ］−３’の合成
（１）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−Ｎ−［２，３，４−トリス（オクタデシルオキシ）ベンズヒドリル］スクシナメートの合成
実施例１２で合成した化合物（４０１ｍｇ，２４６μｍｏｌ）をアルゴン雰囲気下ジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（９１．０μＬ，１．２３ｍｍｏｌ）、ピロール（８５．０μＬ，１．２３ｍｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（９９．５μＬ，１．２３ｍｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（４８．８μｌ，６１５μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．０ｍＬ）で溶解させたｄＴ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（３７３ｍｇ，４９２μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（４．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（４９１ｍｇ，９５．７％）を白色固体として得た。
（２）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−Ｎ６−ベンゾイル−２’−デオキシアデノシン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−Ｎ−［２，３，４−トリス（オクタデシルオキシ）ベンズヒドリル］スクシナメートの合成
実施例１８−（１）で合成した化合物（２２８ｍｇ，１１５μｍｏｌ）をアルゴン雰囲気下ジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（４２．６μＬ，５７５μｍｏｌ）、ピロール（３９．８μＬ，５７５μｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（４６．５μＬ，５７５μｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（２２．９μＬ，２８８μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．０ｍＬ）で溶解させたｄＡ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（２９６ｍｇ，３４５μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（２．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（２６９ｍｇ，９４．１％）を白色固体として得た。
（３）５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−Ｎ４−ベンゾイル−２’−デオキシシチジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−Ｎ６−ベンゾイル−２’−デオキシアデノシン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−Ｎ−［２，３，４−トリス（オクタデシルオキシ）ベンズヒドリル］スクシナメートの合成
実施例１８−（２）で合成した化合物（２５４ｍｇ，１０２μｍｏｌ）をアルゴン雰囲気下ジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（３７．８μＬ，５１０μｍｏｌ）、ピロール（３５．３μＬ，５１０μｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（４１．２μＬ，５１０μｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（２０．２μＬ，２５５μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．０ｍＬ）で溶解させたｄＣ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（２５４ｍｇ，３０６μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（２．１ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（２９３ｍｇ，９７．３％）を白色固体として得た。
（４）デオキシシチジニル−［３’→５’］−デオキシアデニリル−［３’→５’］−デオキシチミジニル−［３’→５’］−デオキシチミジン（５’−ｄ［ＣＡＴＴ］−３’）の合成
実施例１８−（３）で合成した化合物と、２８％アンモニア水溶液：エタノール＝３：１の溶液（４．０ｍＬ）をオートクレーブにいれて６５℃で１６時間加熱した後、反応液を遠心エバポレーターで減圧濃縮した。濃縮液をＣ−１８逆相カートリッジカラムに吸着させた後、０．１ｍｏｌ／Ｌ酢酸アンモニウム水溶液で洗浄し、２％トリフルオロ酢酸水溶液により、５’末端の水酸基に結合したジメトキトリチル基を脱保護し、２０％アセトニトリル水溶液で溶出して表題の化合物を得た。
ｍ／ｚ（ＭＡＬＤＩ  ＴＯＦ）：Ａｎａｌ．Ｃａｌｃ．ｆｏｒ  Ｃ３９Ｈ５１Ｎ１２Ｏ２３Ｐ３：１１４８．２４．Ｆｏｕｎｄ  １１４６．８（Ｍ−Ｈ）−【０２３９】
実施例１９：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−フルオロウリジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成【０２４０】
【化４７】
2012157723.tif 000051
【０２４１】
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（２１４ｍｇ，１３８μｍｏｌ）をアルゴン雰囲気下ジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（９６．３μＬ，１．３８ｍｍｏｌ）、ピロール（９０．０μＬ，１．３８ｍｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（１０５μＬ，１．３８ｍｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（５１．６μＬ，６９０μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．５ｍＬ）で溶解させた２’−Ｆ−Ｕ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−フルオロウリジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホロアミダイト）（３９０ｍｇ，５２０μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（３．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（２４３ｍｇ，９３．２％）を白色固体として得た。
ｍ／ｚ（ＥＳＩ−ＭＳ）：Ａｎａｌ．Ｃａｌｃ．ｆｏｒ  Ｃ１０８Ｈ１６３ＦＮ５Ｏ２０Ｐ：１９００．１６．Ｆｏｕｎｄ  １９１９．１９（Ｍ＋ＮＨ４）＋【０２４２】
実施例２０：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−メトキシウリジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−２’−メトキシウリジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成【０２４３】
【化４８】
2012157723.tif 000052
【０２４４】
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−メトキシウリジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（２０２ｍｇ，１２９μｍｏｌ）をアルゴン雰囲気下ジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（９６．３μＬ，１．３８ｍｍｏｌ）、ピロール（９０．０μＬ，１．３８ｍｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（１０５μＬ，１．３８ｍｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（５１．６μＬ，６９０μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．５ｍＬ）で溶解させた２’−ＯＭｅ−Ｕ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−メトキシウリジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホロアミダイト）（４０２ｍｇ，５２８μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（３．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（２３７ｍｇ，９５．７％）を白色固体として得た。
ｍ／ｚ（ＥＳＩ−ＭＳ）：Ａｎａｌ．Ｃａｌｃ．ｆｏｒ  Ｃ１０９Ｈ１６６Ｎ５Ｏ２２Ｐ：１９２９．４８．Ｆｏｕｎｄ  １９４７．２１（Ｍ＋ＮＨ４）＋【０２４５】
実施例２１：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−フルオロウリジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−２’−メトキシウリジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成【０２４６】
【化４９】
2012157723.tif 000053
【０２４７】
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−メトキシウリジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（１９７ｍｇ，１２７μｍｏｌ）をアルゴン雰囲気下ジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（９６．３μＬ，１．３８ｍｍｏｌ）、ピロール（９０．０μＬ，１．３８ｍｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（１０５μＬ，１．３８ｍｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（５１．６μＬ，６９０μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．５ｍＬ）で溶解させた２’−Ｆ−Ｕ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（４０４ｍｇ，５３９μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（３．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（２２８ｍｇ，９４．７％）を白色固体として得た。
ｍ／ｚ（ＥＳＩ−ＭＳ）：Ａｎａｌ．Ｃａｌｃ．ｆｏｒ  Ｃ１０８Ｈ１６３ＦＮ５Ｏ２１Ｐ：１９１７．４４．Ｆｏｕｎｄ  １９３５．１８（Ｍ＋ＮＨ４）＋【０２４８】
実施例２２：５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−メトキシウリジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成【０２４９】
【化５０】
2012157723.tif 000054
【０２５０】
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（２１４ｍｇ，１３８μｍｏｌ）をアルゴン雰囲気下ジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（９６．３μＬ，１．３８ｍｍｏｌ）、ピロール（９０．０μＬ，１．３８ｍｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（１０５μＬ，１．３８ｍｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（５１．６μＬ，６９０μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．５ｍＬ）で溶解させた２’−ＯＭｅ−Ｕ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（３９６ｍｇ，５２０μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（３．９ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（２４６ｍｇ，９４．０％）を白色固体として得た。
ｍ／ｚ（ＥＳＩ−ＭＳ）：Ａｎａｌ．Ｃａｌｃ．ｆｏｒ  Ｃ１０９Ｈ１６６Ｎ５Ｏ２１Ｐ：１９１２．１８．Ｆｏｕｎｄ  １９３１．２１（Ｍ＋ＮＨ４）＋【０２５１】
実施例２３：中和塩基として２，４，６−トリメチルピリジンを用いたワンポット反応
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成
アルゴン雰囲気下、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（２００ｍｇ，１３０μｍｏｌ）をジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（９６．３μＬ，１．３０ｍｍｏｌ）、ピロール（９０．０μＬ，１．３０ｍｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、２，４，６−トリメチルピリジン（１７１μＬ，１．３０ｍｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（４８．６μＬ，６５０μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．０ｍＬ）で溶解させたｄＴ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（１９３ｍｇ，２６０μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（２．６ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（２４１ｍｇ，９６．９％）を白色固体として得た。
ｍ／ｚ（ＥＳＩ−ＭＳ）：Ａｎａｌ．Ｃａｌｃ．ｆｏｒ  Ｃ１０９Ｈ１６６Ｎ５Ｏ２０Ｐ：１８９６．１９．Ｆｏｕｎｄ  １９１５．２３（Ｍ＋ＮＨ４）＋【０２５２】
実施例２４：脱保護試薬としてトリフルオロメタンスルホン酸を用い、中和試薬としてベンズイミダゾールを用いたワンポット反応
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成
アルゴン雰囲気下、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（２００ｍｇ，１３０μｍｏｌ）をジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロメタンスルホン酸（５．７５μＬ，６５．０μｍｏｌ）、ピロール（９０．０μＬ，１．３０ｍｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ベンズイミダゾール（７．６８ｍｇ，６５．０μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．０ｍＬ）で溶解させたｄＴ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（１９３ｍｇ，２６０μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（２．６ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和したメタノール溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（２４８ｍｇ，９８．６％）を白色固体として得た。
ｍ／ｚ（ＥＳＩ−ＭＳ）：Ａｎａｌ．Ｃａｌｃ．ｆｏｒ  Ｃ１０９Ｈ１６６Ｎ５Ｏ２０Ｐ：１８９６．１９．Ｆｏｕｎｄ  １９１５．２３（Ｍ＋ＮＨ４）＋【０２５３】
実施例２５  析出溶媒として９０％アセトニトリル水溶液を用いたワンポット反応
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−デオキシチミジン−３’−［Ｏ−（２−シアノエチル）］ホスホリル−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネートの合成
アルゴン雰囲気下、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−デオキシチミジン−３’−イル−［３，４，５−トリス（オクタデシルオキシ）ベンジル］スクシネート（２００ｍｇ，１３０μｍｏｌ）をジクロロメタン（３．０ｍＬ）に溶解させ、トリフルオロ酢酸（９６．３μＬ，１．３０ｍｍｏｌ）、ピロール（９０．０μＬ，１．３０ｍｍｏｌ）を加えて５分間撹拌した。薄層クロマトグラフィーにより脱保護反応の終了を確認し、ピリジン（１０５μＬ，１．３０ｍｍｏｌ）、Ｎ−メチルイミダゾール（５１．６μＬ，６５０μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。中和後の反応液に０．２５ｍｏｌ／Ｌ  ５−（ベンジルチオ）−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（１．５ｍＬ）で溶解させたｄＴ−ＣＥ  ホスホロアミダイト試薬（１９３ｍｇ，２６０μｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した後、０．２ｍｏｌ／Ｌ  ヨウ素  ピリジン／テトラヒドロフラン／水＝４９／４９／２溶液（２．６ｍＬ）を加えて１０分間撹拌した。反応終了後の反応液にチオ硫酸ナトリウムを飽和した９０％アセトニトリル水溶液を添加し、生じた固体を濾過後乾燥し、表題の化合物（２４８ｍｇ，９９．６％）を白色固体として得た。
ｍ／ｚ（ＥＳＩ−ＭＳ）：Ａｎａｌ．Ｃａｌｃ．ｆｏｒ  Ｃ１０９Ｈ１６６Ｎ５Ｏ２０Ｐ：１８９６．１９．Ｆｏｕｎｄ  １９１５．２２（Ｍ＋ＮＨ４）＋
【産業上の利用可能性】
【０２５４】
一時保護基で保護された５’末端水酸基の脱保護工程において特定のカチオン捕捉剤を添加すること、脱保護反応終了後に中和処理を施すこと、および酸化工程または硫化工程で特定の酸化剤または硫化剤を使用することにより、３’末端の水酸基を擬似固相保護基で保護され、かつ５’末端の水酸基を一時保護基により保護されたｎ個重合オリゴヌクレオチドを原料して、（１）５’末端の水酸基の一時保護基の脱保護工程、（２）３’末端の水酸基がホスホロアミダイト化されたｐ個重合オリゴヌクレオチド添加による５’末端伸長工程、および（３）ホスファイトトリエステル部位の酸化（または硫化）工程、を含有させることによって、効率的かつ高収率なｎ＋ｐ個重合オリゴヌクレオチドの製造方法、更にはＲＮＡ、ＤＮＡ、核酸医薬等を提供できるようになった。また、本発明のオリゴヌクレオチドの製造方法を利用した、オリゴヌクレオチド自動合成プログラム、オリゴヌクレオチド自動合成装置も展開できるようになった。【０２５５】
「“ゲノムケミストリー” 関根光雄・齋藤烈編、講談社サイエンティフィック、１−３（２００３）」によれば、通常のホスホロアミダイト法は、以下を基本単位とすることが知られている。
ＳＴＥＰ１：脱保護ステップ（鎖伸長生成物の５’水酸基の保護基の除去）、
ＳＴＥＰ２：縮合ステップ（種々の官能基を保護したヌクレオシド−３’−ホスホロアミダイトと保護ヌクレオチドとを縮合するステップ）、
ＳＴＥＰ３：キャッピングステップ（未反応の５’−水酸基をキャッピングするステップ）、および
ＳＴＥＰ４：酸化ステップ（酸化してヌクレオシドホスフェートトリエステル体を得るステップ）。【０２５６】
「連続的改良ホスホロアミダイト法」を「(ＳＴＥＰ１)脱保護ステップ、（ＳＴＥＰ２）縮合ステップ、(ＳＴＥＰ４）酸化ステップを基本単位とし、ＳＴＥＰ１、２の後で単離精製工程を経ることなく、ＳＴＥＰ１、２、４を液中で連続的に実施する方法」と定義するならば、本発明のオリゴヌクレオチドの製造方法を、以下のように表すこともできる。
〔１〕脱保護ステップにおいて、ピロール誘導体およびインドール誘導体から選択される少なくとも一種のカチオン捕捉剤を含有することを特徴とする、連続的改良ホスホロアミダイト法によるオリゴヌクレオチドの製造方法。
〔２〕更に、脱保護ステップの後、縮合ステップに先立ち、有機塩基を含有することを特徴とする、〔１〕記載のオリゴヌクレオチドの製造方法。
〔３〕更に、酸化ステップにおいて、酸化剤または硫化剤を使用することを特徴とする、〔１〕または〔２〕のいずれか記載のオリゴヌクレオチドの製造方法。
〔４〕更に、酸化ステップの後、酸化体または硫化体を極性溶媒下で晶析単離することを特徴とする、〔１〕〜〔３〕のいずれか一つに記載のオリゴヌクレオチドの製造方法。
〔５〕更に、全保護基を脱保護することを特徴とする、〔４〕記載のオリゴヌクレオチドの製造方法。【０２５７】
このように、ピロール誘導体およびインドール誘導体から選択される少なくとも一種のカチオン捕捉剤を共存させることにより、ＳＴＥＰ１、２の後で単離精製工程を経ることなく、キャッピングステップも不要な、連続的改良ホスホロアミダイト法を提供できるようになったことは大変意義深い。【０２５８】
本出願は、日本で出願された特願２０１１−１１０８７２を基礎としており、その内容は本明細書にすべて包含されるものである。
【国際調査報告】
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