# Fiche action n° CBN-08 :
## Gestion, développement et diffusion de la base de données Habitats

**Titre du programme** : Gestion, développement et diffusion de la base de données Habitats

**Responsables CBNBP** : R. BAUDOIN, F. VEST, O. JUPILLE

**Territoire concerné** : totalité de l'agrément

**Structure commanditaire** : Siège, Seine-Saint-Denis, Seine-et-Marne, Sologne et Bourgogne

**Interlocuteur** : Siège

**Durée du programme** : Permanent

**Financement** : Seine-Saint-Denis, Seine-et-Marne, Sologne et Bourgogne (voir fiche programme)

### Objectif et descriptif des actions menées:

La connaissance des habitats constitue le deuxième volet des inventaires conduits par le Conservatoire. Elle vise à obtenir, comme pour la flore, un corpus de données acquit sur la base d'une méthodologie scientifique et partagée au niveau national, afin de dresser un état des lieux des habitats présents et de donner des priorités d'action aux décideurs en terme de conservation et d'aménagement du territoire.

Comme pour la flore, il est nécessaire de combiner l'établissement de référentiel et des observations de terrain. Une application couplant le SGBDR MS-Access et le SIG MapInfo a été construite en 2006 à partir des spécifications du guide méthodologique.

Elle est pour l'instant principalement orientée vers la saisie sur le terrain à l'aide de tablettes PC. Elle est régulièrement mise à jour en fonction des remarques des utilisateurs.

<figure><img src="image_41.png" /><figcaption>Structure de la base de données Habitats</figcaption></figure>

### Résultats :

au 5 février 2008

<table><tr><td>297</td><td>communes visitées sur 10 départements</td></tr><tr><td>6766</td><td>habitats observés dont</td></tr><tr><td>4895</td><td>habitats rattachés à un syntaxon.</td></tr><tr><td></td><td>Soit :</td></tr><tr><td>25</td><td>au niveau de la classe</td></tr><tr><td>33</td><td>au niveau de l'ordre</td></tr><tr><td>1665</td><td>au niveau de l'alliance</td></tr><tr><td>1273</td><td>au niveau de la sous-alliance</td></tr><tr><td>1899</td><td>au niveau de l'association</td></tr><tr><td>6510</td><td>habitats rattachés à un code Corine biotope dont</td></tr><tr><td>4869</td><td>possèdent un code Corine et un syntaxon</td></tr><tr><td>106</td><td>habitats rattachés à un code Natura 2000 *</td></tr><tr><td></td><td>(tous ont un code Corine ; 104 ont aussi un syntaxon)</td></tr><tr><td>2159</td><td>relevés phytosociologiques représentant</td></tr></table>
<table><tr><td>39672</td><td>informations élémentaires sensu Flora, regroupant</td></tr><tr><td>1090</td><td>taxons valides</td></tr></table>

<table><thead><tr><td>Répartition des habitats dans les classes</td><td>Nombre d'habitats</td></tr></thead><tbody><tr><td>Querco roboris-Fagetea sylvatica</td><td>1893</td></tr><tr><td>Arrhenatheretea elatioris</td><td>688</td></tr><tr><td>Crataego monogynae-Prunetea spinosae</td><td>604</td></tr><tr><td>Phragmiti australis-Magnocaricetea elatae</td><td>257</td></tr><tr><td>Artemisietea vulgaris</td><td>220</td></tr><tr><td>Festuco valesiacae-Brometea erecti</td><td>160</td></tr><tr><td>Potametea pectinati</td><td>150</td></tr><tr><td>Alnetea glutinosae</td><td>131</td></tr><tr><td>Filipendulo ulmariae-Convolvuletea sepium</td><td>114</td></tr><tr><td>Agrostietea stoloniferae</td><td>94</td></tr><tr><td>Epilobietea angustifolii</td><td>90</td></tr><tr><td>Calluno vulgaris-Ulicetea minoris</td><td>57</td></tr><tr><td>Molinio caeruleae-Juncetea acutiflori</td><td>53</td></tr><tr><td>Galio aparines-Urticetea dioicae</td><td>48</td></tr><tr><td>Lemnetea minoris</td><td>42</td></tr><tr><td>Melampyro pratensis-Holcetea mollis</td><td>38</td></tr><tr><td>Scheuchzerio palustris-Caricetea fuscae</td><td>31</td></tr><tr><td>Trifolio medii-Geranietea sanguinei</td><td>31</td></tr><tr><td>Helianthemetea guttati</td><td>29</td></tr><tr><td>Isoeto durieui-Juncetea bufonii</td><td>20</td></tr><tr><td>Glycerio fluitantis-Nasturtietea officinalis</td><td>18</td></tr><tr><td>Koelerio glaucae-Corynephoretea canescentis</td><td>18</td></tr><tr><td>Stellarietea mediae</td><td>18</td></tr><tr><td>Oxycocco palustris-Sphagnetea magellanici</td><td>16</td></tr><tr><td>Agropyretea pungentis</td><td>14</td></tr><tr><td>Bidentetea tripartitae</td><td>13</td></tr><tr><td>Littorelletea uniflorae</td><td>12</td></tr><tr><td>Cytisetea scopario-striati</td><td>10</td></tr><tr><td>Sedo albi-Scleranthetea biennis</td><td>10</td></tr><tr><td>Nardetea strictae</td><td>7</td></tr><tr><td>Polygono arenastri-Poetea annuae</td><td>4</td></tr><tr><td>Sisymbrietea officinalis</td><td>4</td></tr><tr><td>Asplenietea trichomanis</td><td>1</td></tr><tr><td>Charetea fragilis</td><td>1</td></tr><tr><td>Montio fontanae-Cardaminetea amarae</td><td>1</td></tr><tr><td>Parietarietea judaicae</td><td>1</td></tr><tr><td>Thlaspietea rotundifolii</td><td>1</td></tr></tbody></table>

<footnote>* La saisie du code Natura 2000 n'est possible que depuis décembre 2007</footnote>
Localisation des communes étudiées au 5 fév. 2008

<figure><img src="image_42.png" /></figure>

**Perspectives :**

- Développer des outils d'analyse et de rendu cartographique pour une édition web.

- Généraliser l'usage des tablettes PC

- Migrer l'application cartographique vers ArcGIS

**Documents de référence :**

- Guide méthodologique, inventaire et cartographie des habitats naturels et semi naturels au CBNBP. JUPILLE O. et al., 2006.

- Cartographie des habitats naturels et des espèces végétales appliquée aux sites terrestres du réseau Natura 2000. Guide méthodologique. Mathieu CLAIR et al., 2005

- Prodrome des végétations de France. BARDAT et al., 2004. Publications scientifiques du M.N.H.N.
## Fiche action n° CBN-09 :
Site Internet du Conservatoire botanique national du Bassin parisien -
Partie "applicative"

**Titre du programme** : Application de consultation web du système d'information du Conservatoire botanique national du Bassin parisien

**Responsable CBNBP** : F. VEST

**Territoire concerné** : CBNBP

**Structure commanditaire** :

**Interlocuteur** : F. VEST

**Durée du programme** : continu

**Financement** :

**Objectif et descriptif des actions menées** :

Application de consultation avec un accès contrôlé de la base de données Flora en fonction des utilisateurs.

Développement : java/jsp

Architecture : STRUTS.

Hébergement : serveur Apache Tomcat/5.0.28 couplé avec un serveur Apache sur OS Linux Red Hat.

Cette application remplace l'application Flora développée sous Access et MapInfo.
Actuellement, 137 utilisateurs sont recensés.

**Résultats** :

Différents modules ont été développés :

- flore (consultation, validation des données),

- diathèque (consultation et saisie),

- gestion des utilisateurs et des droits.

**Perspectives** :

Evolution et amélioration de l'ergonomie.

Amélioration des sorties (listings...).

Création d'un module pour la gestion des bibliographies.

Création d'un module de saisie.

**Documents de référence** :

http://www.cbnbp.fr
RECHERCHE
La recherche au Conservatoire a deux thèmes principaux : (1) la mise au point de techniques de gestion des populations menacées d'extinction et (2) l'étude de la distribution de la flore sur le territoire d'agrément.

En 2007, en ce qui concerne le premier thème, l'étude pilote menée sur *Arenaria grandiflora* L. en forêt de Fontainebleau, a bénéficié d'une avancée significative par la mise au point de marqueurs moléculaires censés permettre de déterminer la composition génétique optimale des populations réintroduites (voir fiche restauration de populations).

Pour le deuxième thème, diverses méthodologies sont testées : des méthodes ponctuelles dont le but est de relier l'état de la diversité floristique à un instant donné en fonction des structures paysagères environnantes et des actions anthropiques (voir la fiche sur la flore des villes et celle sur la flore des rivières), et des méthodes de suivi qui permettent plutôt de relier la dynamique des communautés végétales à l'histoire des habitats qu'elles occupent (voir la fiche sur les suivis de populations de plantes communes).
Synthèse des recherches

Fiche action n° Rech-01 : La restauration des populations de plantes menacées d'extinction

Fiche action n° Rech-02 : La flore en ville

Fiche action n° Rech-03 : L'état de conservation des rivières

Fiche action n° Rech-04 : Le suivi de populations de plantes communes
## Fiche action n° Rech-01 :
### La restauration des populations de plantes menacées d'extinction

**Titre du programme** : Réintroduction d' *Arenaria grandiflora* L. en forêt de Fontainebleau

**Responsable CBNBP** : Nathalie Machon

**Territoire concerné** : la forêt de Fontainebleau

**Structure commanditaire** : ONF

**Interlocuteur** : Claude LAGARDE

**Durée du programme** : 4 ans

**Financement** : ONF

### Objectif et descriptif des actions menées :

En 1998, une introduction de populations d' *Arenaria grandiflora* L. a été effectuée en forêt de Fontainebleau, à partir d'un mélange d'individus bouturés sur des individus des populations naturelles de Fontainebleau et de Chinon. Depuis lors, nous suivons les effectifs chaque année. Nous voulons maintenant connaître la part que les individus des différentes provenances ont pris dans les descendances observées sur le terrain. Des marqueurs microsatellites ont été mis au point sur *Arenaria grandiflora* L. pour déterminer à terme l'origine géographique de tous les individus nés dans les populations d'introduction.

### Résultats :

Nous avons construit une banque génomique d'ADN enrichie de di- et de trinucléotides en modifiant la méthode décrite par Giraud et al. (2002). Après enrichissement, les fragments de PCR ont été clonés selon le protocole TOPO TA (Invitrogen) et insérés dans des cellules d'E. coli. Les colonies transformées ont été transférées sur des membranes Hybond N+ et screenées par hybridation avec un mélange d'oligonucléotides radioactifs (γ32P)

Parmi les 265 clones positifs, 137 ont été séquencés. A peu près 70% des clones contenaient des motifs microsatellites de taille convenable (plus de 6 répétitions). Les séquences ont été assemblées et éditées par le logiciel BioEdit. Sur les 60 motifs trinucléotides, 30% étaient des séquences uniques et à peu près la moitié des séquences dinucléotides avaient des régions flanquantes convenables pour définir des amorces.

Donc, 33 microsatellites ont été définis grâce au logiciel Primer 3. Ils ont été testés pour amplification et polymorphisme. Sur les 17 locus polymorphes, 14 sont de qualité satisfaisante et seront utilisés pour caractériser et génotyper les individus fondateurs (n=19) et leurs descendants nés dans les populations créées.

### Perspectives :

Pour les analyses génétiques, des fragments de feuilles ont été prélevés sur 267 individus en mai et juin 2007 et séchés sur silica-gel. Ils seront analysés début 2008. Connaissant le nombre de plantes issues des fondateurs (1) de Fontainebleau et (2) de Chinon, il sera possible d'identifier les bénéfices éventuels du fait de faire des mélanges de provenances pour le succès de plans de restauration.
**Documents de référence:**

Bottin, L., Le Cadre S, Quilichini A., Moret J., Bardin P. Machon N. 2008 "Re-establishment trials in endangered plants: a review and the example of *Arenaria grandiflora* L., a species on the brink of extinction in the Parisian region (France)". *Ecoscience* in press

Giraud T, Fournier E, Vautrin D, Solignac M, Vercken E, Bakan B, Brygoo Y (2002) Isolation of eight polymorphic microsatellite loci, using an enrichment protocol, in the phytopathogenic fungus Fusarium culmorum. Molecular Ecology Notes, 2, 121-123.
## Fiche action n° Rech-02 :
### La flore en ville

**Titre du programme** : Impact des plantes invasives sur la biodiversité des villes

**Responsable CBNBP** : Nathalie Machon

**Territoire concerné** : petite couronne de l'agglomération parisienne

**Structure commanditaire** : Ile-de-France

**Interlocuteur** :

**Durée du programme** : 4 ans

**Financement** : Ile-de-France

### Objectif et descriptif des actions menées:

Les effets des plantes invasives sur les communautés végétales restent méconnus dans les milieux urbains très perturbés. Nous avons cherché à (1) estimer l'importance relative des espèces invasives et des facteurs environnementaux dans la production des patterns de richesse et de composition des communautés végétales des villes, (2) caractériser les impacts des espèces invasives sur les sols et leurs conséquences sur la végétation, (3) réfléchir à la nature 'driver' ou 'passenger' des espèces invasives dans le contexte urbain.

Nous avons étudié une espèce, la renouée du Japon, *Reynoutria japonica* Houtt., dans un milieu, les friches urbaines, à une échelle spatiale fine, les stations envahies. Nous avons analysé le sol et la végétation le long de transects partant du centre de la zone envahie vers la zone non envahie.

### Résultats :

Nous avons constaté une composition floristique similaire entre zones envahies et non envahies, mais une richesse et un recouvrement très inférieurs sous le couvert de la renouée. Nos résultats montrent par ailleurs un effet positif de la renouée sur l'incorporation de matière organique et l'activité biologique. En outre, la teneur en matière organique influence significativement la richesse spécifique. La renouée du Japon enrichirait donc les sols, entretiendrait un feedback positif, mais en serait la seule bénéficiaire en excluant les espèces concurrentes par une forte compétitivité vis-à-vis des ressources en lumière, en eau et en nutriments.

En résumé, la renouée du Japon profite des perturbations pour coloniser de nouveaux sites, puis, localement, enrichit les sols mais réduit drastiquement la diversité végétale.

### Perspectives :

Un suivi spatio-temporel permettrait de voir si ces effets délétères demeurent localisés ou s'ils peuvent à terme menacer réellement la flore urbaine. Les implications seraient majeures en termes de politique de gestion des espèces invasives et de politique d'urbanisme.

### Documents de référence :

* MAUREL, N. 2007. Impact des plantes invasives sur les communautés végétales en milieu urbain. L'exemple de *Reynoutria japonica* Houtt. Mémoire de stage de Master 2.

* EHRENFELD, J. G. 2003. Effects of exotic plant invasions on soil nutrient cycling processes. Ecosystems 6:503-523.
* Godefroid, S., D. Monbaliu, and N. Koedam. 2007. The role of soil and microclimatic variables in the distribution patterns of urban wasteland flora in Brussels, Belgium. *Landscape and Urban Planning* 80:45-55.

* Niemela, J. 1999. *Ecology and urban planning. Biodiversity and Conservation* 8:119-131.

* Wolfe, B. E., and J. N. Klironomos. 2005. *Breaking new ground: Soil communities and exotic plant invasion. Bioscience* 55:477-487.
## Fiche action n° Rech-03 :
### L'état de conservation des rivières

**Titre du programme** : Etat de conservation des rivières à renoncules

**Responsable CBNBP** : Nathalie Machon

**Territoire concerné** : Régions Centre et IdF

**Structure commanditaire** :

**Interlocuteur** :

**Durée du programme** : 3 ans

**Financement** :

### Objectif et descriptif des actions menées:

Dans le cadre de l'évaluation de l'état de conservation de l'habitat UE-3260 : « Rivières à Renoncules », l'année 2007 a été rythmée par l'alternance de périodes de terrain et de périodes d'analyse de données.

Concernant la partie terrain, les relevés de végétation se sont basés sur différents protocoles (relevés exhaustifs, transects, quadrats, relevés phytosociologiques). 17 sites d'étude, situés sur quatre rivières d'Ile-de-France et du Loiret, ont été sélectionnés en 2006 et font l'objet de suivi depuis deux ans. En 2007, trois saisons de terrain se sont succédées : printemps (en mai), été (en juillet) et automne (en septembre). Les données ont été saisies informatiquement mais nécessiteront quelques remises en forme avant exploitation.

Concernant la partie analyse, les données 2006 ont servi à l'élaboration d'un premier article portant sur l'impact des aménagements anthropiques (ponts, aménagement des berges, pose d'épis...) sur les variables environnementales et les communautés végétales.

### Résultats :

Les résultats ont montré qu'il est nécessaire de travailler à différentes échelles spatiales (bassin versant, rivière, site, ...), l'échelle la plus fine étant la plus significative pour détecter un impact potentiel. En général, une altération de l'habitat due à l'aménagement des rivières par chenalisation entraîne une homogénéisation des conditions environnementales et par conséquent des changements de composition d'espèces. Les cortèges floristiques sont plus similaires entre bras de rivière soumis à un aménagement anthropique qu'entre bras plus « naturels ». Certaines espèces ont été rarement trouvées dans les secteurs les plus perturbés par l'homme (par exemple *Helosciadium nodiflorum* (L.) W.D.J.Koch et *Berula erecta* (Huds.) Coville). Elles pourraient être indicatrices des rivières les mieux préservées. Au contraire, d'autres espèces croissent principalement dans ces sites (par exemple *Potamogeton crispus* L.). Leur présence témoignerait d'un mauvais état de conservation.

### Perspectives :

A la suite de ces conclusions, une deuxième analyse des données est en cours et tend à montrer à quelles saisons les aménagements anthropiques affectent de manière la plus significative les variables et les espèces. Les observations qui en découleront pourront donner des pistes quand à la gestion et l'entretien des rivières.

### Documents de référence:

Rambaud M., Pavoine S., Combroux I, Haury J., Moret J. et Machon N. Human activities and effects to the channel and riparian zone: the case of Running Stream with Water Crowfoot (*Ranunculus* spp.) en cours de publication
# Fiche action n° Rech-04 :
## Le suivi de populations de plantes communes

**Titre du programme** : Suivi de plantes communes

**Responsable CBNBP** : Emmanuelle PORCHER

**Territoire concerné** : Ile-de-France

**Structure commanditaire** : Ile-de-France

**Interlocuteur** :

**Durée du programme** : 3 ans

**Financement** : Ile-de-France

### Objectif et descriptif des actions menées :

Afin de gérer au mieux la biodiversité, il est nécessaire de bien connaître sa répartition spatiale, ainsi que l'évolution de cette répartition au cours du temps, sous l'influence des nombreux facteurs responsables des ses changements. Pour les plantes, le nombre d'espèces existant et la forte structuration spatiale qui les caractérise constituent pour ce type d'études une difficulté particulière.

Le but des suivis de plantes communes est d'identifier les nombreux facteurs agissant sur la répartition des espèces (activités humaines, environnement biotique et abiotique, caractéristiques biologiques des espèces...). Il s'agit donc de mettre au point un protocole à la fois simple (pour que de nombreux points puissent être renseignés), facilement reproductible (pour qu'un maximum d'observateurs puissent travailler de façon identique) et systématique (pour éviter les biais d'échantillonnage).

Une approche préliminaire a été testée sur deux années, sur une soixantaine de sites répartis aléatoirement en Ile-de-France.

### Résultats :

Grâce au protocole mis au point en 2006, les analyses statistiques montrent que les espèces repérées dans les quadrats sont principalement des espèces banales, très communes ou communes (fig1).

<figure><img src="image_43.png" /><figcaption>**Figure 1** : Fréquence des espèces par classe de rareté. Le statut de rareté à 8 degrés a été défini par ARNAL et KOVACS (2000).</figcaption></figure>
Par l'échantillonnage aléatoire que nous avons opéré, nous avons eu accès à une bonne représentativité des grands types de milieux présents dans la région (67% agricole, 23% forestier et 10% urbain).

589 espèces ont été observées (sur un total de 1730 espèces = 1/3 des espèces IdF).

Les analyses ont permis de montrer quels sont les facteurs qui influencent le plus la composition des communautés végétales (Fig2).

<figure><img src="image_44.png" /></figure>

**Figure 2** : Partition hiérarchique montrant la contribution indépendante de 4 variables sur la richesse spécifique des placettes. La diversité paysagère correspond à l'indice de Shannon du paysage pour une maille donnée. Il intègre le nombre, la diversité et la répartition des patchs dans une maille.

La richesse en espèces dans une placette dépend d'abord de l'habitat dans lequel elle se trouve, puis de la fragmentation et ensuite de la qualité de la roche-mère.

**Perspectives** : À partir des données obtenues, nous chercherons à voir quel est le degré de spécialisation des communautés végétales en fonction de l'évolution spatiale et temporelle de l'activité humaine autour des sites suivis.

**Documents de référence :**

Abadie, J.-C., C. Andrade, N. Machon, E. Porcher. 2008 *Rapid biodiversity assessment in plant survey: a case study in human dominated landscape*. Biodiversity and Conservation in press.
PERSPECTIVES
Les orientations du CBNBP restent les mêmes en 2008. L'ensemble des actions entreprises ces dernières années se poursuivra. Après la connaissance de la flore, les programmes de connaissance sur les habitats prendront une part de plus en plus importante au sein des actions du Conservatoire. On observera une montée en puissance de ces actions en Bourgogne (étude de typologie habitats humides de la Bresse), en région Centre (expertise de la Sologne) mais aussi en Ile-de-France puisque la cartographie des habitats, entreprise en Seine-et-Marne et en Seine-Saint-Denis, s'étendra à tout le territoire francilien suite à la signature d'une convention avec la Région Ile-de-France. Le Conservatoire participera aussi au projet national de cartographie qui doit voir le jour dans les prochains mois.

En Bourgogne, de nouvelles actions liées à la mise en place d'un Observatoire de la biodiversité débuteront en 2008. Des partenariats nouveaux prennent forme cette année (AERMC, Conseil général Côte d'Or, RN Combe Lavaux) qui vont permettre de décliner les trois axes de travail de la délégation (Conservation / Habitats / Connaissance via l'Observatoire) en parallèle aux missions financées par les partenaires principaux.

En région Centre, le soutien scientifique et technique du CBNBP auprès de la Région sera consacré à la mise en place d'outils de connaissance et de gestion du patrimoine naturel (Livre rouge, liste noire des espèces invasives et Observatoire de la Biodiversité).

En Ile-de-France, une part importante du programme 2008 sera consacrée à la réalisation d'atlas départementaux (Hauts-de-Seine, Val-de-Marne, Seine-et-Marne). Des partenariats nouveaux, notamment avec la Région Ile-de-France, favoriseront la mise en place d'une cartographie des habitats sur le reste de la région (hors Seine-et-Marne et Seine-saint-Denis déjà en cours), mais aussi l'établissement d'une liste rouge et la mise en place d'actions de suivi sur les espèces du Livre rouge tome 2.

En Sarthe, le projet d'atlas de la flore du département devrait aboutir.

Après la connaissance de la flore et des habitats, les actions du Conservatoire s'orientent vers la mise en place d'observatoires de la Biodiversité (Ile-de-France, Bourgogne, Centre), de suivis et de plans de conservation. La publication de synthèses sur les enjeux de la flore, de listes rouges ou de listes noires des espèces invasives régionales, fait partie, avec l'étude des continuités écologiques et du morcellement des habitats, des futurs grands programmes du Conservatoire.
Synthèse des perspectives

Fiche action n° Bourg-08 : Typologie des habitats humides de la Bresse bourguignonne

Fiche action n° Bourg-09 : Suivi des espèces végétales menacées et des habitats de falaise de la Réserve naturelle de la Combe Lavaux - Jean Roland

Fiche action n° Bourg-10 : Bilan sur la biodiversité des bords de routes de Côte d'or

Fiche action n° Bourg-11 : Suivi de la flore dans le programme « Réseaux Mares de Bourgogne »

Fiche action n° Centre-12 : Partenariat avec le Conseil régional du Centre

Fiche action n° IdF-15 : Inventaire de la flore des Yvelines

Fiche action n° IdF-16 : Atlas des plantes remarquables d'Île-de-France

Fiche action n° IdF-17 : Corridors écologiques et linéaires électriques

Fiche action n° IdF-18 : Cartographie régionale des habitats

Fiche action n° CBN-10 : Cartographie nationale des habitats

Fiche action n° Cons-11 : Conservation des espèces en Île-de-France

Fiche action n° Sarthe-07 : Rédaction de l'Atlas de la flore vasculaire sauvage de la Sarthe
# Fiche action n° Bourg-08 :
## Typologie des habitats humides de la Bresse bourguignonne

**Titre du programme** : Typologie des habitats humides de la Bresse bourguignonne

**Responsable CBNBP** : O. BARDET

**Territoire concerné** : Bourgogne

**Structure commanditaire** : DIREN Bourgogne / Agence de l'eau Rhône - Méditerranée & Corse

**Interlocuteur** : P. PAGNIEZ (DIREN Bourgogne), B. BOULEY (AERMC Besançon)

**Durée du programme** : 2 ans (2008-2009)

**Financement** : 27 500 € sur deux ans

### Objectif et descriptif des actions menées:

Il est proposé l'étude des habitats humides de Bresse et l'identification des sites remarquables sur le plan de la flore, des habitats et du rôle qu'ils jouent dans la conservation de la biodiversité au sein du réseau des sites de la Bresse.

Les prospections de terrain, avec l'application de la phytosociologie en tant qu'outil de description (qui inclut aussi une description pédologique), permettront la progression de la connaissance sur ce territoire et la production d'un référentiel typologique. Ce référentiel permettra aussi de mieux comprendre l'organisation spatiale des habitats et le fonctionnement des zones humides et, conformément aux chantiers du bassin Rhône-Méditerranée pour le SDAGE, d'apporter un retour de connaissances nécessaires à l'établissement d'une classification des milieux en "bon" et en "mauvais" état. Les sites remarquables seront localisés, leur flore et leurs habitats décrits.

Il est proposé d'étaler le projet sur 2 ans (2008 et 2009) pour compenser les variations de grande ampleur qui touchent fréquemment les zones humides selon les conditions climatiques annuelles.
# Fiche action n° Bourg-09 :
## Suivi des espèces végétales menacées et des habitats de falaise de la Réserve naturelle de la Combe Lavaux - JeanRoland

**Titre du programme** : Suivi des espèces végétales menacées et des habitats de falaise de la Réserve naturelle de la Combe Lavaux - JeanRoland

**Responsable CBNBP** : O. BARDET

**Territoire concerné** : Bourgogne

**Structure commanditaire** : Réserve naturelle de la Combe Lavaux - JeanRoland

**Interlocuteur** : L. SERVIERE (Communauté de Commune de Gevrey-Chambertin / Réserve naturelle de la Combe Lavaux - JeanRoland)

**Durée du programme** : 5 ans (2008-2012)

**Financement** : en cours de définition

### Objectif et descriptif des actions menées :

Suite au bilan réalisé en 2007 sur *Biscutella divionensis* Jord., espèce endémique à la RN, il a été demandé de poursuivre le travail sur la durée du prochain plan de gestion avec notamment :

- Etude de la biologie de la conservation de *Biscutella divionensis* (répartition précise, habitat dynamique de la population, stabilité)

- Etude des habitats de la falaise d'ubac (accueillant notamment la Biscutelle mais aussi d'autres espèces) dans la Combe Lavaux et de Brochon.

- Mise en place du suivi des espèces, prévu dans le plan de gestion quinquennal (*Scorzonera austriaca* Willd., *Valeriana tuberosa* L., *Veronica spicata* L., *Juncus sphaerocarpus* Nees) en collaboration avec le Conservatoire des Sites Naturels Bourguignons.
# Fiche action n° Bourg-10 :
## Bilan sur la biodiversité des bords de routes de Côte d'Or

**Titre du programme** : Bilan sur la biodiversité des bords de routes de Côte d'Or

**Responsable CBNBP** : O. BARDET

**Territoire concerné** : Côte d'Or

**Structure commanditaire** : Conseil Général de Côte d'Or

**Interlocuteur** :

**Durée du programme** : 1 an

**Financement** : en cours de définition (environ 10-12 000 €)

### Objectif et descriptif des actions menées:

Le CG21, par ses services de l'équipement et du tourisme, cherche à connaître l'intérêt des bords de route de son département (Faune et Flore) pour le valoriser et sensibiliser ses équipes d'entretien. Une réponse commune de la délégation Bourgogne du CBN et de la Société des Sciences naturelles de Bourgogne (son Président B. FROCHOT) a été faite.

Celle-ci comprend :

- la réalisation de synthèses floristiques et entomologiques (listes d'espèces, espèces patrimoniales, sites),

- conseils de gestion de ces végétations,

- une formation technique aux 7 centres techniques de la Côte d'Or.
## Fiche action n° Bourg-11 :
### Suivi de la flore dans le programme "Réseaux Mares de Bourgogne"

**Titre du programme** : Suivi de la flore dans le programme "Réseaux Mares de Bourgogne"

**Responsable CBNBP** : O. BARDET

**Territoire concerné** : Bourgogne

**Structure commanditaire** : DIREN, Conseil régional de Bourgogne

**Interlocuteur** : Ph. Pagniez (DIREN Bourgogne) - M. THOMAS (CRB)

**Durée du programme** : 5 ans (2008-2012)

**Financement** : en cours de définition

**Objectif et descriptif des actions menées** :

En déclinaison des objectifs du Pôle-Relais "Mares et mouillères de France" et dans le cadre de la mise en place d'un "Observatoire de la biodiversité en Bourgogne" (voir aussi fiche Bourg-02) souhaité par la Région Bourgogne et la DIREN, le Conservatoire des Sites naturels bourguignons, le CBNBP et la Société d'Histoire naturelle d'Autun souhaitent mettre en place un dispositif spécifique de suivi des mares en Bourgogne. Le but est de suivre l'évolution de mares repérées dans des carrés échantillons de la région. Une première phase de travail porterait sur les territoires du Pays Puisaye / Forterre du Pays Auxois / Morvan. Le CBN interviendrait au niveau du diagnostique flore / habitats. Les aspects de repérage des mares, recherches foncières, pédagogie grand public, diagnostique faune se répartissent entre les deux autres partenaires.
Fiche action n° Centre-12 :
Partenariat avec le Conseil régional du Centre

Titre du programme : Réalisation de travaux liés à la connaissance et à la valorisation de la flore régionale

Responsable CBNBP : Jordane CORDIER, Patricia RIFFLART

Territoire concerné : Région Centre

Structure commanditaire : Conseil régional du Centre

Interlocuteur : Catherine BERTRAND

Durée du programme : 1 an

Financement : 30 000 €

Objectif et descriptif des actions menées:

Les objectifs généraux consistent à faire bénéficier le Conseil régional du soutien scientifique et technique du Conservatoire botanique national du Bassin parisien dans la mise en œuvre de ses outils de connaissance et de gestion du patrimoine naturel : les Réserves naturelles régionales, l'Ecopôle et l'Observatoire régional du patrimoine naturel.

Perspectives :

Il s'agit, tout en augmentant la connaissance de la flore de la région Centre, d'améliorer l'accessibilité de la connaissance ainsi que sa valorisation en actions de conservation. La contribution du CBNBP se décline selon 5 actions :

1- Inventaires communaux en région Centre

- réalisation d'inventaires dans les secteurs les moins prospectés situés au sud de la
Loire ;

- réflexion sur les modalités d'intégration et d'informatisation d'autres données
« flore » produites lors d'autres études financées par le Conseil régional ;

- accès réservé à la base de données Flora via le site Internet du CBNBP.

2- Contribution à l'Observatoire du patrimoine naturel régional

- production de cartes synthétiques concernant la répartition des espèces protégées, déterminantes ZNIEFF, de la liste rouge, exotiques envahissantes (nombre de ces espèces/commune), concernant le patrimoine floristique des régions naturelles (exemple de cartes de répartition d'espèces caractéristiques de ces régions) ;

- réalisation de liens vers le site du CBNBP depuis le site Internet de l'Observatoire du patrimoine naturel régional pour le public recherchant une information plus détaillée.

3- Listes rouges régionales de la flore et des habitats

- finalisation et actualisation de la liste rouge régionale de la flore et des habitats réalisés en partenariat avec Nature Centre et la DIREN Centre

4- Appui scientifique et technique au Conseil régional sur la mise en place des Réserves naturelles régionales

- soutien scientifique et technique au diagnostic de la flore et des habitats des sites pressentis pour le réseau des RNR. Ces prestations peuvent prendre la forme d'expertises et de portés à connaissance ;

- pour l'année 2008, le diagnostic pourrait porter sur 3 propriétés : la Côte du Prayeur à Boncourt, le site de Villemeux, la Réserve du Bois des Roches et la Réserve des Grandes Bruyères.
## 5- Groupe de travail régional « Plantes invasives »

- informatisation des données issues du réseau de collecte de données, animé par le Groupe de travail ;

- restitution de l'état des connaissances sur ces espèces.

## Documents de référence :

Note de présentation Partenariat 2008 entre le Conseil régional du Centre et le Conservatoire botanique national du Bassin parisien (CBNBP).
## Fiche action n° IdF-15 :
Inventaire de la flore du département des Yvelines

**Titre du programme** : Projet de confortement des connaissances floristiques dans le département des Yvelines

**Responsable CBNBP** : S. FILOCHE

**Territoire concerné** : Yvelines

**Structure commanditaire** : Conseil Général des Yvelines

**Interlocuteur** : Mme Eliane BELISSONT, Direction du développement territorial, économique et de l'environnement, Pôle environnement, Service des espaces naturels, 2, place André Mignot 78 012 Versailles cedex

**Durée du programme** : 3 ans (2008-2010)

**Financement** : 30 000 € par an

### Objectif et descriptif des actions menées:

Le département des Yvelines fait partie des départements les plus riches d'Ile-de-France, pourtant la connaissance en matière de diversité floristique reste encore insuffisante. Devant, la demande du Conseil général de mieux connaître son patrimoine afin d'étudier les zones à enjeux et les continuités écologiques qui pourraient se dessiner, le Conservatoire propose donc de réaliser l'inventaire de 133 communes qui, après analyse, se sont avérées très insuffisamment renseignées, selon la méthode en place. Ces inventaires seront réalisés sur une période de trois ans, et seront regroupés en trois grands secteurs. Les résultats de cette étude permettront d'évaluer, la diversité floristique de chaque commune, mais aussi de secteurs biogéographiques cohérents, et de dégager des enjeux en matière de biodiversité.
## Fiche action n° IdF-16 :
Atlas des plantes remarquables d'Ile-de-France

**Titre du programme** : Atlas des plantes remarquables d'Ile-de-France

**Responsable CBNBP** : S. FILOCHE

**Territoire concerné** : Ile-de-France

**Structure commanditaire** : Conseil régional d'Ile-de-France

**Interlocuteur** : Catherine RIBES, direction de l'environnement
33 rue Barbet de Jouy, 75007 Paris. Tél. : 01 53 85 56 23

**Durée du programme** : 3 ans (2008-2010)

**Financement** : 89 500 € par an

### Objectif et descriptif des actions menées:

Dans le cadre de la politique régionale de protection de la biodiversité et des milieux naturels, le Conservatoire réalisera un atlas régional des plantes remarquables d'Ile-de-France. Cet atlas qui se veut un véritable livre rouge de la flore menacée d'Ile-de-France, intègrera aussi une liste noire des espèces invasives. Cette action débutera les deux premières années par des inventaires afin de mettre à jour les connaissances que nous avons sur un certain nombre d'espèces devenues extrêmement rares en Ile-de-France
# Fiche perspective n° IdF-17 :
## Corridors écologiques et linéaires électriques

**Titre du programme** : Programme d'inventaires floristiques sur les emprises RTE des lignes à haute-tension

**Responsable CBNBP** : Ph. BARDIN

**Territoire concerné** : Seine-et-Marne, Val-de-Marne, Val-d'Oise

**Structure commanditaire** : Réseau Transport Electricité (RTE) et le Conseil Régional d'Ile-de-France

**Interlocuteur** : Robert ARCHAMBAULT, TENP/MCEJ RTE, Tour Le Vermont, 119 rue des Trois Fontanots, 92024 NANTERRE CEDEX (robert.archambault@rte-france.com) et Catherine RIBES, Conseil Régional Ile-de-France, Tour Montparnasse, 75014 PARIS (catherine.ribes@iledefrance.fr)

**Durée du programme** : 3 ans (2008-2010)

**Financement** : 82 714,80€ TTC par an (20% d'autofinancement par le CBNBP)

**Objectif et descriptif des actions menées** :

Programme de prospections sur les emprises de RTE situées directement à l'aplomb des lignes à haute-tension. Le programme 2008 prévoit la prospection de 280 km de linéaire sur le territoire du GET Est (Groupement Exploitation Transport). Le rendu se fera sous la forme d'une couche SIG avec la géolocalisation de toutes les espèces protégées et les habitats patrimoniaux. Un rapport annexe sera également rendu avec les préconisations de gestion, le cas échéant.

**Perspectives** :

Reconduction du programme sur 2 années suivant les résultats de l'année test 2008.

Possibilité de pérennisation plus longue sur l'ensemble du TA du CBNBP.
# Fiche action n° IdF-18 :
Cartographie régionale des habitats

**Titre du programme** : Cartographie des habitats naturels et semi-naturels d'Ile-de-France

**Responsables CBNBP** : O. JUPILLE

**Territoire concerné** : région IDF

**Structure commanditaire** : région IDF

**Interlocuteur** : C. RIBES (unité aménagement durable, direction de l'environnement)

**Durée du programme** : 2008/2012

**Financement** : 140 000€/an

## Objectif et descriptif des actions menées:

Le programme s'inscrit dans la stratégie régionale de préservation et de valorisation de la biodiversité. Il s'agit de fournir un outil d'aide à la décision pour un aménagement durable du territoire et de préciser les interventions de la région dans le cadre de sa politique en faveur des RNR par exemple.

Le travail consiste en un état des lieux des habitats franciliens. Les aspects relatifs à l'expertise, la cartographie des habitats et les continuités biologiques, sont confiés au CBNBP.

## Résultats :

- Nombre de relevés

- Surface cartographiée

- Habitats identifiés

## Perspectives :

D'un point de vue fondamental, le travail effectué permet d'acquérir des informations de base sur les habitats (typologie phytosociologique, conservation, répartition). En ce sens, il contribue à la mission de connaissance fixée au Conservatoire. D'un point de vue pratique, ces inventaires permettront de réaliser la cartographie au 1/10 000ème de la région.

Ces aspects complémentaires permettront d'une part, de caractériser les territoires à enjeux et d'évaluer les actions de gestion engagées et, d'autre part, d'orienter les recherches sur des groupements spécifiques au territoire francilien.
Fiche action n° CBN-10 :
Cartographie nationale des habitats

Titre du programme : Mise au point d'un cadre méthodologique pour l'inventaire et la cartographie des habitats naturels et semi-naturels sur le territoire national

Responsables CBNBP : O. JUPILLE

Territoire concerné : France métropolitaine

Structure commanditaire : MEDAD

Interlocuteur : H. SOUAN via la fédération des CBN

Durée du programme : 2008/2009

Financement : montant à préciser

Objectif et descriptif des actions menées:

L'objectif est de proposer une méthodologie de cartographie des habitats (communautaires ou non) sur l'ensemble du territoire national. La construction de la méthodologie est découpée en 4 actions :

- mise en correspondance des typologies de référence ;

- bilan des inventaires et des cartographies existantes ;

- test de l'apport de la télédétection pour préparer la cartographie ;

- analyses et élaboration d'un cahier des charges.

Résultats :

Production d'un cahier des charges.

Perspectives :

Renforcement de la position des CBN concernant la cartographie des habitats. Evolution vers une véritable connaissance des habitats à une échelle nationale permettant de répondre à de nombreuses attentes tant locales qu'européennes.
# Fiche perspective n° Cons-11 :
## Conservation des espèces en Ile-de-France

**Titre du programme** : Programme de conservation d'espèces menacées en Ile-de-France

**Responsable CBNBP** : Ph. BARDIN

**Territoire concerné** : Ile-de-France

**Structure commanditaire** : Conseil Régional d'Ile-de-France

**Interlocuteur** : Catherine RIBES, Conseil Régional Ile-de-France, Tour Montparnasse, 75014 PARIS (catherine.ribes@iledefrance.fr)

**Durée du programme** : 3 ans (2008-2010)

**Financement** : 100 000€ TTC par an (20% d'autofinancement par le CBNBP)

### Objectif et descriptif des actions menées :

Premier volet : état de conservation des espèces du Tome 2 du Livre Rouge, présentes en Ile-de-France.

Deuxième volet : mise en place d'un programme concret de conservation de quelques espèces à fort enjeu en Ile-de-France.

### Perspectives :

Premier volet : visite de toutes les stations des espèces franciliennes du Tome 2 du Livre Rouge.

Deuxième volet : mise en place de partenariats de terrain pour la conservation de quelques espèces à forts enjeux (gestion écologique, renforcement, réintroduction ou transplantation de populations).
# Fiche action n° Sarthe-07 :
## Rédaction de l'Atlas flore vasculaire sauvage de la Sarthe

**Titre du programme** : Atlas de la flore vasculaire sauvage du département de la Sarthe

**Responsable CBNBP** : G. HUNAULT

**Territoire concerné** : Sarthe

**Structure commanditaire** : CBNBP

**Interlocuteur** :

**Durée du programme** :

**Financement** : En cours de recherche

### Objectif et descriptif des actions menées :

La masse de données accumulées pendant l'inventaire permet désormais de publier un Atlas tout à fait pertinent de la flore vasculaire de la Sarthe, comparable à ceux déjà publiés par le CBNBP.

### Résultats :

La rédaction est déjà largement avancée, mais la saisie courant 2007 des nombreux bordereaux en retard a modifié les données, ce qui nécessite une actualisation, à la fois des notices des espèces et des diagrammes de synthèse. La rédaction de la totalité du manuscrit sera terminée fin 2008.

### Perspectives :

La publication est envisagée pour le 1er semestre 2009, sous réserve de l'obtention des financements adéquats.

### Documents de référence :
ANNEXES
Conservatoire botanique national du Bassin parisien -Organigramme au 01/01/2008

<figure><img src="image_45.png" /></figure>

**souligné** : les responsables de services
**en italiques** : les personnels contractuels
Evolution du budget depuis 1998

* l'exercice 2007 n'étant pas achevé, sont comptabilisés les financements inscrits au budget primitif.

<table><thead><tr><th>Sources de crédits</th><th>1998</th><th>1999</th><th>2000</th><th>2001</th><th>2002</th><th>2003</th><th>2004</th><th>2005</th><th>2006</th><th>2007*</th></tr><tr><th></th><th>K€ TTC</th><th>K€ TTC</th><th>K€ TTC</th><th>K€ TTC</th><th>K€ TTC</th><th>K€ TTC</th><th>K€ TTC</th><th>K€ TTC</th><th>K€ TTC</th><th>K€ TTC</th></tr></thead><tbody><tr><td>Ministère de la recherche (contrat quadriennal)</td><td>F 0</td><td>14</td><td>20</td><td>17</td><td>17</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>6</td></tr><tr><td></td><td>I 0</td><td>4</td><td>5</td><td>4</td><td>4</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>15</td><td>9</td></tr><tr><td>Ministère de l'Environnement</td><td>F 27</td><td>114</td><td>114</td><td>114</td><td>114</td><td>172</td><td>195</td><td>209</td><td>212</td><td>162</td></tr><tr><td></td><td>I 24</td><td>44</td><td>28</td><td>24</td><td>24</td><td>24</td><td>17</td><td>3</td><td>0</td><td></td></tr><tr><td>DIREN Ile de France</td><td>F 0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>10</td><td>23</td><td>107</td></tr><tr><td>ZNIEFF</td><td>I 0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>13</td><td>0</td><td>6</td></tr><tr><td>DIREN Bourgogne</td><td>F 0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>42</td><td>36</td><td>31</td><td>46</td><td>20</td><td>37</td></tr><tr><td></td><td>I 0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>9</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td></td></tr><tr><td>DIREN Centre</td><td>F 0</td><td>38</td><td>38</td><td>38</td><td>51</td><td>92</td><td>98</td><td>115</td><td>159</td><td>29</td></tr><tr><td></td><td>I 0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>7</td><td></td></tr><tr><td>Subvention du Muséum</td><td>F 0</td><td>0</td><td>90</td><td>18</td><td>131</td><td>31</td><td>37</td><td>34</td><td>0</td><td>0</td></tr><tr><td></td><td>I 0</td><td>0</td><td>8</td><td>82</td><td>85</td><td>4</td><td>7</td><td>0</td><td>0</td><td></td></tr><tr><td>Conventions avec des collectivités territoriales</td><td>F 0</td><td>0</td><td>35</td><td>37</td><td>116</td><td>138</td><td>283</td><td>287</td><td>284</td><td>514</td></tr><tr><td></td><td>I 0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>12</td><td>37</td><td>66</td><td>16</td><td>14</td><td>23</td></tr><tr><td>Ressources liées à des contrats (autres sources)</td><td>F 22</td><td>11</td><td>0</td><td>67</td><td>126</td><td>30</td><td>14</td><td>50</td><td>36</td><td>55</td></tr><tr><td></td><td>I 0</td><td>0</td><td>6</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>18</td><td>0</td><td>2</td></tr><tr><td>Ressources propres (Cherré)</td><td>F 2</td><td>25</td><td>23</td><td>30</td><td>14</td><td>17</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td></td></tr><tr><td></td><td>I 0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>9</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td></td></tr></tbody><tfoot><tr><td>TOTAL K€ TTC</td><td>75</td><td>250</td><td>367</td><td>432</td><td>745</td><td>589</td><td>749</td><td>802</td><td>770</td><td>950</td></tr></tfoot></table>

Budget du Conservatoire botanique depuis son premier agrément.

<figure><img src="image_46.png" /></figure>

L'ensemble des salaires représente une masse salariale d'environ 1376 K€.

<figure><img src="image_47.png" /><figcaption>Figure 1 : Répartition des coûts salariaux au sein du Conservatoire</figcaption></figure>