Au delà de l'utilité de décrire la dynamique de ces différentes facettes, ces approches doivent être affinées pour préciser à la fois la direction du réarrangement des communautés, leurs conséquences (en particulier sur le fonctionnement des écosystèmes) et les moyens d'infléchir ces dynamiques (en évaluant l'effet des mesures de conservation). En testant la **réponse de ces indicateurs** (amplitude, inertie, sens et intensité), il sera ainsi possible de mieux caractériser la flexibilité de la réponse des communautés (capacités de résilience, points de ruptures et d'adaptation).

Par ailleurs, la part de ces résultats attribuables à des **mécanismes** évolutifs (adaptations locales), écologiques (changements de niches, compétition, changements dans

les interactions entre espèces et niveaux trophiques), et aux dynamiques des populations de chaque espèce (survie, reproduction) reste encore largement à déterminer.

Ceci est valable pour les communautés étudiées indépendamment des interactions comme pour les réseaux. Aussi nous ne disposons que de peu d'idées sur ce qu'il faut faire concrètement pour **conserver un réseau**, si tel est l'objectif, dans le contexte des changements globaux (rapides et multi-formes). Des questions simples comme « Faut-il garder les espèces spécialistes ou généralistes ? Faut-il privilégier l'équivalence fonctionnelle ou phylogénétique ? » sont encore largement sans réponses.

## 3.5 Indicateurs de résilience des socio-écosystèmes

Les indicateurs de résilience des socio-écosystèmes peuvent être de trois types :

* **Les indicateurs d'état** : ils décrivent à un instant $t$ la qualité « adaptative » d'un socio-écosystème. On peut ainsi évaluer la réactivité du système.

* **Les indicateurs de changement** : ils permettent à une communauté de noter les changements environnementaux grâce à des marqueurs endogènes. Un des exemples les plus frappants est le décalage entre les conditions climatiques actuelles et les calendriers saisonniers souvent basés sur la cyclicité du monde naturel (date de floraison des plantes, date et parcours de migration des animaux, etc). En développant ces connaissances, les sociétés sont capables d'opter pour une stratégie préventive.

* **Les indicateurs de potentiel d'adaptation** : ils sont évalués en confrontant l'exposition à un changement, la sensibilité et la capacité d'adaptation du socio-écosystème. Si une société a su développer une forte capacité

d'adaptation, elle sera capable d'être en situation de pro-action face à un changement. Elle saura transformer en opportunité certaines perturbations.

La multiplication des méthodes d'évaluation des services écosystémiques, qu'ils s'agissent d'évaluations monétaires, biophysiques, socio-culturelles ou encore d'approches multicritères, offre un panel d'indicateurs d'états et de tendances qui mettent en évidence le niveau de dépendance des sociétés humaines vis-à-vis du fonctionnement des écosystèmes ou de certaines de leur composantes. En croisant ces informations avec des prédictions d'évolution de la composition et des fonctionnalités des écosystèmes il est possible de développer des outils d'aide à la décision permettant notamment d'établir des priorités dans les politiques économiques et environnementales et, ce faisant, d'accroître les capacités d'adaptation des sociétés aux changements environnementaux.

## 3.6 Indicateurs prenant en compte les interactions

Un champ de recherches relativement vierge consisterait à **définir des indicateurs du potentiel adaptatif des socio-écosystèmes qui intégreraient les interactions entre les différents mécanismes de flexibilité** : par exemple des indicateurs de flexibilité phénotypique qui prendraient en compte à la fois les capacités de changements génétiques et la plasticité phénotypique, ou bien des indicateurs de

résilience qui prendraient en compte à la fois les changements phénotypique au sein des espèces et les changements d'abondance de celles-ci (assurance écologique et évolutive). On pourrait également développer des indicateurs qui prennent en compte les pratiques et modes de gestion, couplés à la dynamique de l'écosystème.
# 4. INTÉGRER CES SOURCES DE FLEXIBILITÉ DANS LES SCÉNARIOS DE BIODIVERSITÉ

## 4.1 Utiliser les indicateurs pour orienter les choix de modélisation / scénarisation

On peut douter de l'efficacité opérationnelle d'une stratégie de modélisation qui intégrerait toutes les sources et mécanismes de flexibilité, à toutes les échelles, et pour toutes les composantes des socio-écosystèmes dont on souhaite scénariser le devenir. Modéliser c'est simplifier la réalité en incorporant les mécanismes majeurs d'évolution des systèmes et en négligeant ceux qui vont avoir peu d'impact. **Les indicateurs du potentiel d'adaptation discutés précédemment peuvent nous aider à faire des choix, à hiérarchiser les mécanismes non pas sur la base d'a priori non nécessairement bien fondés, comme la séparation des échelles de temps écologiques et évolutives, mais sur la base d'informations sur le rôle relatif, la dynamique et les échelles spatiales et temporelles des différents types de réponses. Par exemple, des indicateurs du potentiel d'évolution génétique devraient nous permettre d'identifier quand il est nécessaire d'incorporer ce type de réponse dans les**

scénarios, pour quelles populations et pour quels traits, et quand cela n'est pas nécessaire. De manière assez évidente, la prise en compte de l'évolution de résistances est incontournable dans la scénarisation de la gestion de populations de pathogènes et de vecteurs dont les tailles de population sont énormes. Inversement, prendre en compte les capacités d'évolution de résistance à la sécheresse chez des espèces spécialisées où cette diversité d'adaptation a été perdue ou très réduite n'améliorera pas les prédictions sur le devenir de ces populations. Entre ces deux extrêmes, les indicateurs qualitatifs ou quantitatifs peuvent nous aider à orienter les choix de modélisation, en définissant par exemple des groupes fonctionnels sur la base de l'importance de ces différentes sources de flexibilité, et plus généralement en informant les compromis nécessaires à réaliser entre précision, généralité et réalisme dans la construction de ces scenarios.

## 4.2 Défis de modélisation liés au couplage

Pour appréhender la flexibilité des agro-écosystèmes face aux changements globaux, il est nécessaire d'intégrer les différentes formes de flexibilité dans des modèles mathématiques. Deux voies peuvent être suivies. La première est de trouver des formalismes simples et génériques qui permettent de rendre compte d'une très grande variété de situations. Ces modèles théoriques (Chevin et al., 2010) permettent une résolution analytique qui nous donne l'ensemble des cas envisageables. Ces modèles rendent compte des points de basculement possibles, mais, par contre, ils ne permettent pas forcément de quantifier explicitement les seuils correspondant à ces points de basculement pour une situation écologique spécifique. Ils doivent donc être complétés par des modèles de simulations qui quantifient les sources de flexibilité pour des situations précises. Ces modèles permettront en plus d'affiner les scénarios dans ces cas écologiques pour lesquels la quantification de l'évolution des services écosytémiques rendus est importante (p. ex. plantes de grandes cultures, forêts, pêches). **Il faut arriver à faire dialoguer ces deux types d'approches pour préciser les scénarios de l'évolution de la biodiversité.**

Un des enjeux est donc de développer chacun de ces types de modélisation. En ce qui concerne la modélisation théorique, la prise en compte de plusieurs sources de flexibilité rend plus difficile la résolution analytique.

Les modèles de simulation ont vocation à coupler des modèles de physiologie, de dynamique des populations, de génétique voir d'impact des pathogènes. Pour ces modèles de simulation, nous sommes confrontés à une série de problèmes complexes. D'abord, il faut arriver à coupler des modèles développés séparément. Ceci nécessite parfois un interfaçage entre programmes codés dans différents langages ou le recodage de programmes dans un langage commun. Ensuite, il faut cibler les variables permettant de faire le lien entre les différents modèles (p. ex. la teneur en réserves carbonés des arbres qui pilote la probabilité de mortalité). Enfin, il faut arriver pour des situations précises (p. ex. un cortège d'espèces et un site) à paramétrer et à valider ces modèles complexes. Pour faciliter ce travail de paramétrisation et de validation, il est judicieux de partir de situations bien documentées (p. ex. sites atelier). Cela pose évidemment aussi la question de la parcimonie et du niveau de description requis pour quantifier l'évolution des
écosystèmes. L'idée n'est pas de prédire précisément leur évolution, mais plutôt de donner des gammes de variations spatiales ou temporelles de l'environnement (climat, sol) pour lesquelles les capacités de flexibilité permettent la sur-

vie des populations. Ce travail nécessite aussi la réalisation d'études de sensibilité afin de déterminer quels processus sont à retenir et quels sont ceux que l'on peut négliger.

## 4.3 Défis liés aux changements d'échelle

Les processus impliqués dans l'adaptation des agro-écosystèmes opèrent à des échelles de temps (c-à-d de la seconde au siècle) et d'espace (c-à-d de la molécule au biome) très variées. Nous avons vu que la compréhension des mécanismes impliqués dans l'adaptation nécessitait parfois d'étudier les processus à fine échelle, notamment en physiologie (en lien avec la biochimie) ou en génétique (en interface avec la biologie moléculaire). La non linéarité des processus ainsi que le dépassement des gammes de variations environnementales actuellement expérimentées (notamment en termes de CO2) rend nécessaire un programme réductionniste au cas par cas (Steel, 2004). Ces études faites sur certains objets écologiques bien connus et importants (p. ex. les moustiques) permettent de bien comprendre toute la chaîne d'expression des phénotypes impliqués dans l'adaptation au changement global. Mais ce programme réductionniste prend le risque de s'éloigner des échelles d'intérêt pour les écologues et la société que sont l'écosystème et la région. Une réflexion sur les changements d'échelles spatiale et temporelle est donc nécessaire.

Dans ce contexte quatre défis paraissent majeurs. Premièrement, il faut mener une réflexion sur les hiérarchies d'échelles. Les échelles spatiales supérieures servent de cadre de fonctionnement aux échelles inférieures (p. ex. la photosynthèse d'une feuille dépend de la lumière interceptée qui est fonction des conditions environnementales et des feuilles au dessus d'elles), et les échelles inférieures de base matérielle aux échelles supérieures (p. ex. la photosynthèse a lieu dans le stroma et dans la membrane des chloroplastes). Pour chaque source de flexibilité et chaque phénotype étudié, il faut trouver le bon équilibre dans la description des différentes échelles. Ensuite, si plusieurs échelles emboîtées doivent être prises en compte, il faut trouver les principes ponts permettant de faire le lien entre les lois développés à ces différentes échelles. Deuxièmement, il existe des processus spécifiquement spatiaux comme la dispersion des propagules ou les flux latéraux de matière. Etudier ces processus pose des problèmes et enjeux spécifiques et requiert l'usage d'un outillage statistique particulier. Par exemple, pour la dispersion le passage des échelles locales (noyau de dispersion de graines) à une échelle régionale (p. ex. avancée

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Mélange des eaux de deux torrents au pied de l'Antisana en Equateur. Ce volcan de la Cordillère des Andes constitue un des plus intéressants sujets d'étude des conséquences du réchauffement climatique en Amérique latine puisqu'on estime que le tiers de son glacier a disparu en l'espace de 30 ans. Olivier Dangles, IRD.
d'un front de colonisation) demeure un enjeu important. Troisièmement, du fait de la réponse non linéaire de nombreux processus aux variations de l'environnement, tout usage de moyennes biaise potentiellement systématiquement les résultats de simulations (Davi et al., 2006). Il est donc nécessaire lors de changements d'échelle (p. ex. de la parcelle à la région), soit de tester le caractère négligeable de ces biais, soit d'utiliser des paramètres équivalents. Qu

trièmement, le changement d'échelle requiert aussi l'usage d'outils spécifiques. En ce qui concerne l'écologie végétale, si la télédetection semble prometteuse pour estimer à de larges échelles la phénologie (Guyon et al., 2011), le niveau de recouvrement du couvert (Turner et al., 1999) ou même la composition biochimique des feuilles (le Maire et al., 2008), l'investigation des variations spatiales du sol et du sous-sol pose encore plus de problèmes.

## 4.4 Défis liés à la confrontation aux données (validation)

La complexité croissante liée à l'intégration de différents mécanismes de flexibilité dans la réponse des socio-écosystèmes aux changements globaux rend encore plus aigus les défis de recherche liés à la confrontation de ces scénarios de biodiversité aux données. Cette confrontation est nécessaire à la fois pour paramétrer les modèles et aussi pour les valider. En effet, si l'exercice de scénarisation ne consiste pas à prédire un futur mais à comparer des options pour différents futurs, le sens de ces comparaisons dépend de la qualité de nos outils de modélisation. Valider la qualité des prédictions de différents modules séparément et de leur couplage est donc crucial.

Dans cette optique, il y a un besoin crucial de renforcer l'acquisition de données, notamment des suivis à long terme, et de disposer de grosses bases de données (notamment en terme d'étendue spatiale). Les données historiques (sur des échelles de temps variées) seront également nécessaires pour valider et paramétrer les scénarios. Il est également nécessaire de poursuivre les efforts de mise en cohérence des systèmes d'observation de la biodiversité, mais aussi de développer des approches expérimentales pour mieux comprendre les processus. Le développement d'approches comparatives (notamment fondées sur des analyses phylogénétiques) est également prometteur pour à la fois informer et tester les scénarios de biodiversité.
## CONCLUSION

Dans un contexte marqué par l'accélération du changement global, la question de l'adaptation des espèces, des écosystèmes et des modes d'interaction des sociétés humaines avec la biodiversité a pris une importance croissante dans les politiques environnementales, ainsi que dans les négociations internationales dans le champ de l'environnement. La prise en compte de cet enjeu engendre d'importants besoins de mobilisation des connaissances et rend nécessaire un effort de recherche accru dans ce domaine, pour combler les lacunes de connaissance.

L'état des lieux, comme la partie prospective de ce rapport, mettent en lumière des besoins de recherche fondamentale pour comprendre les processus et les interactions multiples impliquées dans les réponses des organismes, des écosystèmes et des socio-écosystèmes au changement global. Ils soulignent aussi la nécessité de recherches plus en « aval » sur le potentiel d'adaptation (au sens positif du terme) des différents niveaux de biodiversité et sur les façons de le favoriser tant pour faciliter les processus évolutifs dans leur ensemble que pour assurer le bien-être humain en lien avec celle-ci. Le document illustre que ces mécanismes d'adaptation, ou plus généralement de flexibilité, des socio-écosystèmes sont multiples et interagissent les uns avec les autres ; ce document montre également que ces mécanismes ont leurs limites. Le rôle que joueront ces mécanismes de flexibilité dans les réponses de la biodiversité aux changements globaux dans le futur reste donc une inconnue critique pour notre capacité à anticiper ces changements.

Les réflexions conduites, et les exemples mobilisés, illustrent bien que toutes les réponses spontanées ne sont pas adaptatives (c'est-à-dire qu'elles ne vont pas nécessairement dans le sens d'une résolution du problème posé par le changement, en terme de survie des éléments de la biodiversité concernés). On pourrait ajouter que toutes les adaptations qui réussissent à résoudre un problème causé par le changement global ne sont pas nécessairement un progrès du point de vue de la préservation de la biodiversité : des robots pollinisateurs ne sauraient remplacer les abeilles, ni les poissons d'élevage leurs homologues sauvages. On pourrait multiplier les exemples.

Il s'agit donc bien de connaître et de mesurer le potentiel d'adaptation, pour mieux anticiper les états futurs de la biodiversité, mais aussi pour être en mesure de mieux favoriser ce potentiel. La connaissance des réponses spontanées du monde vivant et des sociétés humaines doit interagir étroitement avec les réflexions sur les stratégies et les modes d'action à mettre en place. L'accroissement des connaissances doit en outre contribuer à réduire (autant que possible) et à mieux gérer l'incertitude sur les risques associés au changement global.

Si les réponses à apporter aux changements subis par biodiversité représentent un défi majeur, les acteurs de la biodiversité s'intéressent de plus en plus à la façon dont les écosystèmes eux-mêmes, de par leur aptitude à répondre au changement global peuvent être mobilisés pour renforcer les capacités d'adaptation des sociétés, notamment face au changement climatique, à travers des approches telles que « ecosystem-based adaptation » (mise en avant par différentes organisations d'envergure internationale), ou plus récemment les « solutions fondées sur la nature », notion mise en avant par l'UICN et qui commence à interroger les cercles politiques et scientifiques. Ces approches pourront sans doute apporter une contribution positive à l'équilibre futur des relations homme-nature, à condition qu'elles se donnent pour objectif de rétablir le potentiel adaptatif et évolutif des systèmes naturels, en s'appuyant sur les réponses adaptatives de la biodiversité pour relever les défis posés par le changement global.

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BIBLIOGRAPHIE

Ackerman J.D., Roubik D.W. (2012) Can extinction risk help explain plant-pollinator specificity among euglossine bee pollinated plants? *Oikos*, **12**, 1821–1827.

Adger W.N. (2006) Vulnerability. *Global Environmental Change*, **16**, 268–281.

Agashe D., Falk J.J., Bolnick D.I. (2011) Effects of founding genetic variation on adaptation to a novel resource. *Evolution*, **65**, 2481–2491.

Aigner P.A. (2001) Optimality modeling and fitness trade-offs: when should plants become pollinator specialists? *Oikos*, **95**, 177–184.

Aubret F., Shine R. (2010) Thermal plasticity in young snakes: how will climate change affect the thermoregulatory tactics of ectotherms? *Journal of Experimental Biology*, **213**, 242–248.

Auger-Rozenberg M.A., Barbaro L., Battisti A., Blache S., Charbonnier Y., Denux O., Garcia J., Goussard F., Imbert C.E., Kerdelhué C., Roques A., Torres-Leguizamon M., Vetillard F. (2015) Ecological responses of parasitoids, predators and associated insect communities to the climate-driven expansion of pine processionary moth. In A. Roques (Ed.), *Processionary Moths and Climate Change: An Update*. (pp. 311–358). Springer/Quae.

Bajdeck Mc, Allison E., Halls A., Dulvy N. (2010) Impacts of climate variability and change on fishery-based livelihoods. *Marine Policy*, **34**, 375–383.

Barbet-Massin M., Thuiller W., Jiguet F. (2012) The fate of European breeding birds under climate, land-use and dispersal scenarios. *Global Change Biology*, **18**, 881–890.

Barnagaud V., Jiguet F., Barbet-Massin, M., Le Viol, I., Archaux, F., J.-Y. D. (2012) Relating habitat and climatic niches in birds. *PLoS ONE*, **7**(3).

Barnosky A.D., Matzke N., Tomiya S., Wogan G.O.U., Swartz B., Quental T.B., Marshall C., McGuire J.L., Lindsey E.L., Maguire K.C., Ben Mersey B., Ferrer E.A. (2011) Has the Earth's sixth mass extinction already arrived? *Nature*, **471**, 51–57.

Bartomeus I., Vilà M., Santamaría L. (2008a) Contrasting effects of invasive plants in plant-pollinator networks. *Oecologia*, **155**, 761–770.

Bartomeus I., Vilà M., Santamaría L. (2008b) Contrasting effects of invasive plants in plant-pollinator networks. *Oecologia*, **155**, 761–770.

Bascompte J. (2009) Disentangling the web of life. *Science*, **325**, 416–419.

Bascompte J., Jordano P., Melián C.J., Olesen J.M. (2003) The nested assembly of plant-animal mutualistic networks. *Proceedings of the National Academy of Sciences*, **100**, 9383–9387.

Bastolla U., Fortuna M. A., Pascual-García A., Ferrera A., Luque B., Bascompte J. (2009) The architecture of mutualistic networks minimizes competition and increases biodiversity. *Nature*, **458**, 1018–1020.

Battisti A., Avci M., Avtzis D.N., Ben Jamaa M.L., Al. E. (2015) Natural History of the Processionary Moths (*Thaumetopoea* spp.): New Insights in Relation to Climate Change. In A. Roques (Ed.), *Processionary Moths and Climate Change: An Update*. (pp. 15–18). Springer/Quae.

Battisti A., Stastny M., Netherer S., Robinet C., Schopf A., Roques A., Larsson S. (2005) Expansion of geographic range in the pine processionary moth caused by increased winter temperatures. *Ecological Applications*, **15**, 2084–2096.

Bell G., Gonzalez A. (2009) Evolutionary rescue can prevent extinction following environmental change. *Ecology Letters*, **12**, 942–948.

Benadi G., Blüthgen N., Hovestadt T., Poethke H.J. (2012) Population Dynamics of Plant and Pollinator Communities: Stability Reconsidered. *The American Naturalist*, **179**, 157–158.

Benot M.L., Saccone P., Pautrat E., Vicente R., Colace M. P., Grigulis K., Clement JC, Lavorel S. (2014) Stronger Short-Term Effects of Mowing Than Extreme Summer Weather on a Subalpine Grassland. *Ecosystems*, **17**, 458–472.

Bersaglieri T., Sabeti P.C., Patterson N., Vanderploeg T., Schaffner S. F., Drake J.A., Rhodes M., Reich D.E., Hirschhorn J. N. (2004) Genetic signatures of strong recent positive selection at the lactase gene. *American Journal of Human Genetics*, **74**, 1111–1120.

Biesmeijer J.C., Roberts S.P.M., Reemer M., Ohlemüller R., Edwards M., Peeters T., Schaffers A.P., Potts S.G., Kleukers R., Thomas C.D., Settele J., Kunin W.E. (2006) Parallel declines in pollinators and insect-pollinated plants in Britain and the Netherlands. *Science*, **313**, 351–354.

Bongers F., Poorter L., Hawthorne W.D., Sheil D. (2009) The intermediate disturbance hypothesis applies to tropical forests, but disturbance contributes little to tree diversity. *Ecology Letters*, **12**, 798–805.

Bonnemaison J. (1996) *Gens de pirogue et gens de la terre*. Paris: ORSTOM.

Bourgault P., Thomas D., Perret P., Blondel J. (2010) Spring vegetation phenology is a robust predictor of breeding date across broad landscapes: A multi-site approach using the Corsican blue tit (*Cyanistes caeruleus*). *Oecologia*, **162**, 885–892.

Bowlby J. (1969) Continuité et discontinuité; vulnérabilité et résilience. *Devenir*, **4**, 7–31.

Bradshaw A.D. (2006) Unravelling phenotypic plasticity - Why should we bother? *New Phytologist*, **170**, 644-648.
Brookfield H. (2001) *Exploring agrodiversity*. New York: Columbia University Press.

Brookfield H., Padoch C. (1994) Appreciating agrodiversity: A look at the dynamism and diversity of indigenous farming practices. *Environement*, 36, 271-289.

Byé P., Muchnik J. (1995) *Innovations et sociétés. Quelles agricultures ? Quelles innovations ? I- Dynamisme temporel de l'innovation (Actes du XIVème séminaire d'économie rurale, CIRAD-INRA-Orstom, 13-16 sept. 1993)*. Montpellier: CIRAD.

Cadotte M.W., Carscadden K., Mirotnick N. (2011) Beyond species: Functional diversity and the maintenance of ecological processes and services. *Journal of Applied Ecology*, 48, 1079-1087.

Cameron S.A., Lozier J.D., Strange J. P., Koch J.B., Cordes N., Solter L.F., Griswold T.L. (2011) Patterns of widespread decline in North American bumble bees. *Proceedings of the National Academy of Sciences*, 108, 662-667.

Cantoni C., Lallau B. (2010) La résilience des Turkana. Une communauté de pasteurs kenyans à l'épreuve des incertitudes climatiques et politiques. *Développement Durable et Territoire*, 1.

Chalcoff V.R., Aizen M.A., Ezcurra C. (2012) Erosion of a pollination mutualism along an environmental gradient in a south Andean treelet, Embothrium coccineum (Proteaceae). *Oikos*, 121, 471-480.

Chan Y.F., Marks, M.E., Jones F.C., Villarreal G., Shapiro M.D., Brady S.D., Southwick A.M., Absher D.M., Grimwood J., Schmutz J., Myers R.M., Petrov D., Jónsson B., Schlüter D., Bell M.A., Kingsley D.M. (2010) Adaptive evolution of pelvic reduction in sticklebacks by recurrent deletion of a Pitx1 enhancer. *Science*, 327, 302-305.

Charmantier A., Gienapp P. (2014) Climate change and timing of avian breeding and migration: Evolutionary versus plastic changes. *Evolutionary Applications*, 7, 15-28.

Charmantier A., McCleery R.H., Cole, L.R., Perrins C., Kruuk L.E.B., Sheldon B.C. (2008) Adaptive phenotypic plasticity in response to climate change in a wild bird population. *Science*, 320, 800-803.

Chase J. M., Leibold M., (2003) Ecological Niches: Linking Classical and Contemporary Approaches, University of Chicago Press, Chicago.

Chauveau J.-P., Yung J.-M. (Eds.) (1995) *Innovations et sociétés. Quelles agricultures ? Quelles innovations ? II- Les diversités de l'innovation. XIVème séminaire d'économie rurale, CIRAD-INRA-Orstom, 13-16 sept. 1993* (Vol. I). Montpellier: CIRAD-INRA-Orstom.

Chauveau J.-P., Cormier-Salem M-C., Mollard E. (Eds.). (1999) *L'innovation en agriculture. Questions de méthodes et terrains d'observation*. coll. A travers champs. Paris: IRD.

Cheaib A., Badeau V., Boe J., Chuine I., Delire C., Dufrêne E., François C., Gritti E.S., Legay M., Pagé C., Thuiller W., Viovy N., Leadley P. (2012) Climate change impacts on tree ranges: Model intercomparison facilitates

understanding and quantification of uncertainty. *Ecology Letters*, 15, 533-544.

Cheung W.W.L., Lam V.W.Y., Sarmiento J. L., Kearney K., Watson R., Zeller D., Pauly D. (2010) Large-scale redistribution of maximum fisheries catch potential in the global ocean under climate change. *Global Change Biology*, 16, 24-35.

Chevin L.M., Lande R. (2010) When do adaptive plasticity and genetic evolution prevent extinction of a density-regulated population? *Evolution*, 64, 1143-1150.

Chevin L.M., Lande R., Mace G.M. (2010) Adaptation, plasticity, and extinction in a changing environment: Towards a predictive theory. *PLoS Biology*, 8(4).

Chuine I., Beaubien E. G. (2001) Phenology is a major determinant of tree species range. *Ecology Letters*, 4, 500-510.

Clavel J., Julliard R., Devictor V. (2010) Worldwide decline of specialist species: Toward a global functional homogenization? *Frontiers in Ecology and the Environment*, 9, 222-228.

Coleman J.S., McConnaughay K.D.M., Ackerly D.D. (1994) Interpreting phenotypic variation in plants. *Trends in Ecology and Evolution*, 9, 187-191.

Cormier-Salem M.C. (1992) *Gestion et évolution des espaces aquatiques: la Casamance*. Paris, Orstom, coll. Études et Thèses.

Cormier-Salem M.C. (1994) Environmental changes, agricultural crisis and small scale fishing development in the Casamance region, Senegal. *Ocean & Coastal Management*, 24, 109-124.

Cormier-Salem M.C. (1999) Innovation and relations sociétés-environnement. In J.P. Chauveau, M.C. Cormier-Salem, E. Mollard (Eds.), *L'innovation en agriculture. Questions de méthode et terrains d'observation* (pp. 127-168). Paris: IRD, coll. A travers Champs.

Cormier-Salem M.C. (Ed.) (1999) *Rivières du Sud. Sociétés et mangroves ouest-africaines*. Paris, IRD, vol. I.

Cormier-Salem, M.C. (1991) Logiques de développement en Afrique: les experts à l'école paysanne. *Ecodecision (Revue Environnement et Politiques/Environment and Policy Magazine)*, 2, 78-91.

Cornwell W.K., Ackerly D.D. (2009) Community assembly and shifts in plant trait distributions across an environmental gradient in coastal California. *Ecological Monographs*, 79, 109-126.

Crispo E., Dibattista J.D., Correa C.C., Thibert-Plante X., McKellar A.E., Schwartz A.K., Berner D., De León L. F. (2010) The evolution of phenotypic plasticity in response to anthropogenic disturbance. *Evolutionary Ecology Research*, 12, 47-66.

Cury P., Roy C. (1991) *Pêcheries ouest-africaines. Variabilité, instabilité et changement*. Paris: ORSTOM.
Cutter S.L., Boruff B.J., Shirley W.L. (2003) Social vulnerability to environmental hazards. *Social Science Quarterly*, 84, 242-261.

Dauphiné A. (2001) *Risques et catastrophes observer, spatialiser, comprendre, gérer. Collection U. Géographie*.

Davey C.M., Chamberlain D.E., Newson S.E., Noble D.G., Johnston A. (2012) Rise of the generalists: Evidence for climate driven homogenization in avian communities. *Global Ecology and Biogeography*, 21, 568-578.

Davi H., Bouriaud O., Dufrêne E., Soudani K., Pontailler J.Y., le Maire G., François C., Brédac N., Granierc A., le Dantec V. (2006) Effect of aggregating spatial parameters on modelling forest carbon and water fluxes. *Agricultural and Forest Meteorology*, 139, 269-287.

De Mazancourt C., Johnson E., Barraclough T.G. (2008) Biodiversity inhibits species' evolutionary responses to changing environments. *Ecology Letters*, 11, 380-388.

De Perthuis C., Hallegatte S., Lecocq F. (2010) *L'économie de l'adaptation au changement climatique - Rapport pour le Conseil Economique pour le Développement Durable (CEDD)*.

Devaux C., Lande R. (2009) Displacement of flowering phenologies among plant species by competition for generalist pollinators. *Journal of Evolutionary Biology*, 22, 1460-1470.

Devictor V., van Swaay C., Brereton T., Brotons L., Chamberlain D., Heliölä J., Herrando S., Julliard R., Kuussaari M., Lindström Å., Reif J., Roy D.B., Schweiger O., Settele J., Stefanescu C., Van Strien A., Van Turnhout C., Vermouzek Z., Wa V. (2012) Differences in the climatic debts of birds and butterflies at a continental scale. *Nature Climate Change*, 2, 121-124.

Devictor V., Julliard R., Couvet D., Lee A., Jiguet F. (2007) Functional homogenization effect of urbanization on bird communities. *Conservation Biology*, 21, 741-751.

Devictor V., Julliard R., Jiguet F. (2008) Distribution of specialist and generalist species along spatial gradients of habitat disturbance and fragmentation. *Oikos*, 117, 507-514.

Devictor V., Mouillot D., Meynard C., Jiguet F., Thuiller W., Mouquet N. (2010) Spatial mismatch and congruence between taxonomic, phylogenetic and functional diversity: The need for integrative conservation strategies in a changing world. *Ecology Letters*, 13, 1030-1040.

DeWitt T. J., Sih A., Wilson D.S. (1998) Costs and limits of phenotypic plasticity. *Trends in Ecology and Evolution*, 13, 77-81.

DeWitt T., Scheiner S. (Eds.) (2004) *Phenotypic Plasticity, Functional and Conceptual Approaches. Phenotypic plasticity: Functional and conceptual Approaches*. Oxford University Press.

Djogbénou L., Chandre F., Berthomieu A., Dabiré R., Koffi A., Àlout H., Weill M. (2008) Evidence of introgression of the ace-1R mutation and of the ace-1 duplication in West African *Anopheles gambiae* s. s. *PLoS ONE*, 3(5).

Dobremez, L., Nettier, B., Legeard, J.-P., Caraguel, B., Garde, L., Vieux, S., Lavorel S., Della-Vedova M. (2014). Les alpages sentinelles: un dispositif original pour une nouvelle forme de gouvernance partagée face aux enjeux climatiques. *Revue de Géographie Alpine / Journal of Alpine Research*, 2, 10 pp.

Dormann C.F., Schymanski S.J., Cabral J., Chuine I., Graham C., Hartig F., Kearney M., Morin X., Römermann C., Schröder B., Singer A. (2012) Correlation and process in species distribution models: Bridging a dichotomy. *Journal of Biogeography*, 39, 2119-2131.

Doxa A., Paracchini M.L., Pointereau P., Devictor V., Jiguet F. (2012) Preventing biotic homogenization of farmland bird communities: The role of High Nature Value farmland. *Agriculture, Ecosystems and Environment*, 148, 83-88.

Duputié A., Rutschmann A., Ronce O., Chuine I. (2015) Phenological plasticity will not help all species adapt to climate change. *Global Change Biology*, 21, 3062-3073.

Enjalbert J., Dawson J.C., Paillard S., Rhoné B., Rousselle Y., Thomas M., Goldringer I. (2011) Dynamic management of crop diversity: From an experimental approach to on-farm conservation. *Comptes Rendus - Biologies*, 334, 458-468.

Etterson J. R., Shaw R.G. (2001) Constraint to adaptive evolution in response to global warming. *Science*, 294, 151-154.

Fenster C.B., Armbruster W.S., Wilson P., Dudash M.R., Thomson J.D. (2004) Pollination syndromes and floral specialization. *Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics*, 35, 375-403.

Fontaine C., Collin C.L., Dajoz I. (2008) Generalist foraging of pollinators: Diet expansion at high density. *Journal of Ecology*, 96, 1002-1010.

Fontaine C., Guimarães P.R., Kéfi S., Loeuille N., Memmott J., Van Der Putten W.H., van Veen F.J.F., Thébault E. (2011). The ecological and evolutionary implications of merging different types of networks. *Ecology Letters*, 14, 1170-1181.

Franks S.J., Sim S., Weis A.E. (2007). Rapid evolution of flowering time by an annual plant in response to a climate fluctuation. *Proceedings of the National Academy of Sciences*, 104, 1278-1282.

Futuyma D.J., Moreno G. (1988) The Evolution of Ecological Specialization. *Annual Review of Ecology and Systematics*, 19, 207-233.

Gallopín G.C. (2006) Linkages between vulnerability, resilience, and adaptive capacity. *Global Environmental Change*, 16, 293-303.

Ghalambor C.K., McKay J.K., Carroll S.P., Reznick D.N. (2007) Adaptive versus non-adaptive phenotypic plasticity and the potential for contemporary adaptation in new environments. *Functional Ecology*, 21, 394-407.
Gienapp P., Lof M., Reed T.E., McNamara J., Verhulst S., Visser M.E. (2013) Predicting demographically sustainable rates of adaptation: can great tit breeding time keep pace with climate change? *Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences*, 368, 20120289.

Gienapp P., Teplitsky C., Alho J.S., Mills J.A., Merilä J. (2008) Climate change and evolution: Disentangling environmental and genetic responses. *Molecular Ecology*, 17, 167-178.

Gillon Y., Chaboud C., Boutrais J., Mullon, C. (2000)
*Du bon usage des ressources renouvelables*. Paris: IRD, coll.
Latitudes 23.

Godelier M. (1978) La part idéelle du réel. Essai sur l'idéologie. *L'Homme*, 18, 155-188.

Goldringer I., Prouin C., Rousset M., Galic N., Bonnin I. (2006) Rapid differentiation of experimental populations of wheat for heading time in response to local climatic conditions. *Annals of Botany*, 98, 805-817.

Gomulkiewicz R., Houle D. (2009) Demographic and genetic constraints on evolution. *The American Naturalist*, 174, E218-E229.

Gonin P., Lassailly-Jacob V. (2002) Les réfugiés de l'environnement. Une nouvelle catégorie de migrants forcés? *Revue Européenne Des Migrations Internationales*, 18, 139-160.

Graham C.H., Fine P.V.A. (2008) Phylogenetic beta diversity: Linking ecological and evolutionary processes across space in time. *Ecology Letters*, 11, 1265-1277.

Gritti E.S., Duputié A., Massol F., Chuine I. (2013)
Estimating consensus and associated uncertainty between
inherently different species distribution models. *Methods
in Ecology and Evolution*, 4, 442-452.

Guyon D., Guillot M., Vitasse Y., Cardot H., Hagolle O., Delzon S., Wigneron J.P. (2011) Monitoring elevation variations in leaf phenology of deciduous broadleaf forests from SPOT/VEGETATION time-series. *Remote Sensing of Environment*, 115, 615-627.

Hegland S.J., Nielsen A., Lázaro A., Bjerknes A.L., Totland, Ø. (2009) How does climate warming affect plant-pollinator interactions? *Ecology Letters*, 12, 184-195.

Helmuth B., Kingsolver J.G., Carrington E. (2005)
Biophysics, physiological ecology, and climate change: does mechanism matter? *Annual Review of Physiology*, 67, 177-201.

Henry J. P., Pontis C., David J., Gouyon P.H. (1991) An expe-
riment on dynamic conservation of genetic resources with
metapopulations. In A. Seitz & V. Loeschcke (Eds.), *Species
conservation: a population-biological approach* (pp. 185-198).

Herrera C.M. (1988). Variation in mutualisms - the spatio-temporal mosaic of a pollinator assemblage. *Biological Journal of the Linnean Society*, 35, 95-125.

Hobbs R.J., Higgs E., Harris J.A. (2009) Novel ecosystems: implications for conservation and restoration. *Trends in Ecology and Evolution*, 24, 599-605.

Holling C.S. (1973) Resilience and Stability of Ecological Systems. *Annual Review of Ecology and Systematics*, 4, 1-23.

Hopkins R. (2008) *The Transition Handbook: From Oil Dependency to Local Resilience*. Green Publishing.

Houle D. (1992) Comparing evolvability and variability of quantitative traits. *Genetics*, 130, 195-204.

Huey R., Hertz P. (1984) Is a Jack-of-all-temperatures a master of none? *Evolution*, 38, 441-444.

Hugonie G., Sainero M., Geiger S. (2006) *Clés pour l'enseignement de la géographie*. Paris: Scéren-CRDP Versailles, coll. «Aide à la mise en œuvre des programmes».

Hüppop O., Hüppop K. (2003) North Atlantic Oscillation and timing of spring migration in birds. *Proceedings of the Royal Society of London Series B, Biological Sciences*, 270, 233-240.

Husby A., Nussey D.H., Visser M.E., Wilson A.J., Sheldon B.C., Kruuk L.E.B. (2010) Contrasting patterns of phenotypic plasticity in reproductive traits in two great tit (Parus major) populations. *Evolution*, 64, 2221-2237.

Iambert C.E., Goussard F., Roques A. (2012) Is the expansion of the pine processionary moth, due to global warming, impacting the endangered Spanish moon moth through an induced change in food quality? *Integrative Zoology*, 7, 147-157.

Ings T. C., Montoya J. M., Bascompte J., Blüthgen N., Brown L., Dormann C.F., Edwards F., Figueroa D., Jacob U., Iwan Jones J., Lauridsen R.B., Ledger M.E., Lewis H.M., Olesen J.M., Frank Van Veen E.J., Warren P.H., Woodward, G. (2009) Ecological networks-beyond food webs. *The Journal of Animal Ecology*, 78, 253-269.

Jiguet F., Devictor V., Julliard R., Couvet D. (2012) French citizens monitoring ordinary birds provide tools for conservation and ecological sciences. *Acta Oecologica*, 44, 58-66.

Jones K.E., Bielby J., Cardillo M., Fritz S.A., O'Dell J., Orme C.D.L., Safi K., Sechrest W., Boakes E.H., Carbone C., Connolly C., Cutts M.J., Foster J.K., Grenyer R., Habib M. Plaster C.A., Price S.A., Rigby E.A., Rist J., Teacher A., Bininda-Emonds O.R.P, Gittleman J.L., Mace G.M., Purvis A. (2009) PanTHERIA: a species-level database of life history, ecology, and geography of extant and recently extinct mammals. *Ecology*, 90, 2648.

Jump A.S., Peñuelas J. (2005) Running to stand still: Adaptation and the response of plants to rapid climate change. *Ecology Letters*, 8, 1010-1020.

Jung V., Albert C.H., Violle C., Kunstler G., Loucougaray G., Spiegelberger T. (2014) Intraspecific trait variability mediates the response of subalpine grassland communities to extreme drought events. *Journal of Ecology*, 102, 45-53.
Kampichler C., van Turnhout C.A.M., Devictor V., van der Jeugd H.P. (2012) Large-scale changes in community composition: Determining land use and climate change signals. *PLoS ONE*, 7(4).

Kattge J., Díaz S., Lavorel S., et al. (2011) TRY - a global database of plant traits. *Global Change Biology*, 17, 2905–2935.

Kearney M., Porter W. (2009) Mechanistic niche modelling: Combining physiological and spatial data to predict species' ranges. *Ecology Letters*, 12, 334–350.

Kellermann V., van Heerwaarden B., Sgrò C.M., Hoffmann A.A. (2009) Fundamental evolutionary limits in ecological traits drive *Drosophila* species distributions. *Science*, 325, 1244–1246.

Kerdelhué C., Battisti A., Burban C., Branco M., Al. E. (2015) Genetic diversity and structure at different spatial scales in the processionary moths. In A. Roques (Ed.), *Processionary Moths and Climate Change: An Update*. (pp. 163–226). Springer/Quae.

Kiester A.R., Lande R., Schemske D.W. (1984) Models of coevolution and speciation in plants and their pollinators. *American Naturalist*, 124, 220–243.

Kirkpatrick M. (2009) Patterns of quantitative genetic variation in multiple dimensions. *Genetica*, 136, 271–284.

Kokko H., López-Sepulcre A. (2007) The ecogenetic link between demography and evolution: Can we bridge the gap between theory and data? *Ecology Letters*, 10, 773-782.

Kremer A., Ronce O., Robledo-Arnuncio J.J., Guillaume F., Bohrer G., Nathan, R., Bridle J.R., Richard Gomulkiewicz R., Klein E.K., Ritland K., Kuparinen A., Schueler S. (2012) Long-distance gene flow and adaptation of forest trees to rapid climate change. *Ecology Letters*, 15, 378-392.

Kuparinen A., Katul G., Nathan R., Schurr F.M. (2009) Increases in air temperature can promote wind-driven dispersal and spread of plants. *Proceedings Royal Society of London, Series B: Biological Sciences*, 276, 3081–3087.

Labbé P., Berthomieu A., Berticat C., Alout H., Raymond M., Lenormand T., Weill M. (2007) Independent duplications of the acetylcholinesterase gene conferring insecticide resistance in the mosquito *Culex pipiens*. *Molecular Biology and Evolution*, 24, 1056–1067.

Labbé P., Sidos N., Raymond M., Lenormand T. (2009) Resistance gene replacement in the mosquito *Culex pipiens*: Fitness estimation from long-term cline series. *Genetics*, 182, 303–312.

Lamarque P., Meyfroidt P., Nettier B., Lavorel S. (2014) How ecosystem services knowledge and values influence farmers’ decision-making. *PLoS ONE*, 9(9)

Lande R., Arnold S.J.J. (1983) The measurement of selection on correlated characters. *Evolution*, 37, 1210–1226.

Lasky J.R., Des Marais D.L., Lowry D.B., Povolotskaya I., McKay J.K., Richards J.H., Keitt T.H., Juenger T.E.

(2014) Natural Variation in Abiotic Stress Responsive Gene Expression and Local Adaptation to Climate in Arabidopsis thaliana. *Molecular Biology and Evolution*, 31, 2283–2296.

Lavorel S. (2013) Plant functional effects on ecosystem services. *Journal of Ecology*, 101, 4–8.

Le Maire G., François C., Soudani K., Berveiller D., Pontailler J. Y., Bréda N., Genet H., Davi H., Dufrêne E. (2008) Calibration and validation of hyperspectral indices for the estimation of broadleaved forest leaf chlorophyll content, leaf mass per area, leaf area index and leaf canopy biomass. *Remote Sensing of Environment*, 112, 3846–3864.

Le Rouzic A., Carlborg O. (2008) Evolutionary potential of hidden genetic variation. *Trends in Ecology and Evolution*, 23, 33–37.

Le Viol I., Jiguet F., Brotons L., Herrando S., Lindstrom A., Pearce-Higgins J. W., Reif J., van Turnhout C., Devictor V. (2012) More and more generalists: two decades of changes in the European avifauna. *Biology Letters*, 8, 780–782.

Leibold M. A., Holyoak M., Mouquet N., Amarasekare P., Chase J. M., Hoopes M.F., Holt R.D., Shurin J.B., Law R., Tilman D., Loreau M., Gonzalez, A. (2004) The metacommunity concept: A framework for multi-scale community ecology. *Ecology Letters*, 7, 601–613.

Lenormand T., Bourguet D., Guillemaud T., Raymond M. (1999) Tracking the evolution of insecticide resistance in the mosquito *Culex pipiens*. *Nature*, 400, 861–864.

Lloyd P., Plagányi É.E., Weeks, S. J., Magno-Canto, M., Plagányi G. (2012) Ocean warming alters species abundance patterns and increases species diversity in an African sub-tropical reef-fish community. *Fisheries Oceanography*, 21, 78–94.

McGill B.J., Enquist B.J., Weiher E. Westoby M. (2006) Rebuilding community ecology from functional traits. *Trends in Ecology & Evolution*, 21, 178-185.

MacNeil M.A., Graham N.A.J., Cinner J.E., Dulvy N.K., Loring P. A., Jennings, S., Polunin N.V.C., Fisk A.T., McClanahan T. R. (2010) Transitional states in marine fisheries: adapting to predicted global change. *Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences*, 365, 3753–3763.

Mazer S.J., Schick C.T. (1991) Constancy of population parameters for life history and floral traits in Raphanus sativus L. I. Norms of reaction and the nature of genotype by environment interactions. *Heredity*, 67, 143-156.

Merilä J., Hendry A.P. (2014) Climate change, adaptation, and phenotypic plasticity: The problem and the evidence. *Evolutionary Applications*, 7, 1-14.

Meyre D., Delplanque J., Chèvre J.C., et al. (2009) Genome-wide association study for early-onset and morbid adult obesity identifies three new risk loci in European populations. *Nature Genetics*, 41, 157–159.

Midgley G.F., Hughes G.O., Thuiller W., Rebelo A.G. (2006) Migration rate limitations on climate change-
induced range shifts in Cape Proteaceae. *Diversity and Distributions*, 12, 555–562.

Milleville P. (2007) *Une agronomie à l'oeuvre. Pratiques paysanes dans les campagnes du Sud*. Paris: Arguments-Quae.

Mimura M., Aitken S.N. (2007) Adaptive gradients and isolation-by-distance with postglacial migration in *Picea sitchensis*. *Heredity*, 99, 224–232.

Moneo I., Battisti A., Dufour B., Garcia-Ortiz J. C., González-Muñoz M., Moutou F., Paolucci P., Petrucco Toffolo E., Rivière J., Rodriguez-Mahillo A.I., Roques A., Roques L., Maria Vega J., Vega J. (2015) Medical and veterinary impact of the urticating processionary larvae. In A. Roques (Ed.), *Processionary Moths and Climate Change: An Update*. (pp. 359–410). Springer/Quae.

Montoya J.M., Pimm S.L., Solé R.V. (2006) Ecological networks and their fragility. *Nature*, 442, 259–264.

Morin X., Thuiller W. (2009) Comparing niche- and process-based models to reduce prediction uncertainty in species range shifts under climate change. *Ecology*, 90, 1301–1313.

Morin X., Viner D., Chuine I. (2008) Tree species range shifts at a continental scale: New predictive insights from a process-based model. *Journal of Ecology*, 96, 784–794.

Mouquet N., Devictor V., Meynard C.N., Munoz F., Bersier L.F., Chave J., Couteron P., Dalecky A., Fontaine C., Gravel D., Hardy O.J., Jabot F., Lavergne S., Leibold M., Mouillot D., Münkemüller T., Pavoine S., Prinzing A., Rodrigues A.S.L., RuRohr R.P., Thébault E., Thuiller W. (2012) Ecophylogenetics: Advances and perspectives. *Biological Reviews*, 87, 769–785.

Munday P.L., Jones G.P., Pratchett M.S., Williams A. J. (2008) Climate change and the future for coral reef fishes. *Fish and Fisheries*, 9, 261–285.

Naeem S., Duffy J.E., Zavaleta E. (2012) The Functions of Biological Diversity in an Age of Extinction. *Science*, 336, 1401–1406.

Nathan R., Horvitz N., He Y., Kuparinen A., Schurr F.M., Katul G.G. (2011) Spread of North American wind-dispersed trees in future environments. *Ecology Letters*, 14, 211–219.

Nettier B., Dobremez L., Lamarque P., Eveilleau C., Quétier F., Véron F., Lavorel S. (2012) How would Farmers in the French Alps Adapt their Systems to Different Drought and Socio-economic Context Scenarios? In *10th European IFSA Symposium*. Aarhus, Denmark. http://www.ifsa2012.dk/downloads/WS2013_2011/Baptiste_Nettier.pdf

Nicotra A.B., Atkin O.K., Bonser S.P., Davidson A.M., Finnegan E.J., Mathesius U., Poot P., Purugganan M.D., Richards C.L., Valladares F., van Kleunen, M. (2010) Plant phenotypic plasticity in a changing climate. *Trends in Plant Science*, 15, 684–692.

Nussey D.H., Postma E., Gienapp P., Visser M.E. (2005) Selection on heritable phenotypic plasticity in a wild bird

population. *Science*, 310, 304–306.

Oreskes N., Conway E.M. (2011) *Merchants of Doubt: How a Handful of Scientists Obscured the Truth on Issues from Tobacco Smoke to Global Warming* Reprint edition. New York: Bloomsbury Press.

Ostrom E. (2010) Beyond markets and states: Polycentric governance of complex economic systems. *American Economic Review*, 100, 641–672.

Osty P. L. (1978) L'exploitation agricole vue comme un système. Diffusion de l'innovation et contribution au développement. *Bulletin Technique d'Information*, 326, 43–49.

Paillard S., Goldringer I., Enjalbert J., Doussinault G., De Vallavieille-Pope C., Brabant P. (2000) Evolution of resistance against powdery mildew in winter wheat populations conducted under dynamic management. I - Is specific seedling resistance selected? *Theoretical and Applied Genetics*, 101, 449–456.

Paillard S., Goldringer I., Enjalbert J., Trottet M., David J., De Vallavieille-Pope C., Brabant P. (2000) Evolution of resistance against powdery mildew in winter wheat populations conducted under dynamic management. II - Adult plant resistance. *Theoretical and Applied Genetics*, 101, 457–462.

Pakeman R.J. (2011) Functional diversity indices reveal the impacts of land use intensification on plant community assembly. *Journal of Ecology*, 99, 1143–1151.

Parmesan C. (2006) Ecological and Evolutionary Responses to Recent Climate Change. *Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics*, 37, 637–669.

Pélissier P. (1967) Une civilisation ouest-africaine: Les Diola de la Basse-Casamance. *Acta Geographica*, 67, 3–6.

Petanidou T., Kallimanis A.S., Tzanopoulos J., Sgardelis S.P., Pantis J.D. (2008) Long-term observation of a pollination network: Fluctuation in species and interactions, relative invariance of network structure and implications for estimates of specialization. *Ecology Letters*, 11, 564–575.

Petrucco Toffolo E., Zovi D., Perin C., Paolucci P., Roques A., Battisti A., Horvath H. (2014) Size and dispersion of urticating setae in three species of processionary moths. *Integrative Zoology*, 9, 320–327.

Pigliucci M., Murren C.J., Schlichting C.D. (2006) Phenotypic plasticity and evolution by genetic assimilation. *The Journal of Experimental Biology*, 209, 2362–2367.

Pimm S. L. (1984) The complexity and stability of ecosystems. *Nature*, 307, 321–326.

Potts S.G., Biesmeijer J.C., Kremen C., Neumann P., Schweiger O., Kunin W.E. (2010) Global pollinator declines: Trends, impacts and drivers. *Trends in Ecology and Evolution*, 25, 345–353.
Potvin C., Tousignant D. (1996) Evolutionary consequences of simulated global change: genetic adaptation or adaptive phenotypic plasticity. *Oecologia*, 108, 683-693.

Primack D., Imbres C., Primack R.B., Miller-Rushing A.J., Del Tredici P. (2004) Herbarium specimens demonstrate earlier flowering times in response to warming in Boston. *American Journal of Botany*, 91, 1260-1264.

Purvis A., Hector A. (2000) Getting the measure of biodiversity. *Nature*, 405, 212-219.

Rafferty N.E., Ives A.R. (2011) Effects of experimental shifts in flowering phenology on plant-pollinator interactions. *Ecology Letters*, 14, 69-74.

Rathcke B. (1983) Competition and facilitation among plants for pollination. In *Pollination biology*, pp. 305-329.

Raymond M., Berticat C., Weill M., Pasteur N., Chevillon C. (2001) Insecticide resistance in the mosquito *Culex pipiens*: What have we learned about adaptation? *Genetica*, 112-113, 287-296.

Rhoné B., Remoué C., Galic N., Goldringer I., Bonnin I. (2008) Insight into the genetic bases of climatic adaptation in experimentally evolving wheat populations. *Molecular Ecology*, 17, 930-943.

Rhoné B., Vitalis R., Goldringer I., Bonnin I. (2010) Evolution of flowering time in experimental wheat populations: A comprehensive approach to detect genetic signatures of natural selection. *Evolution*, 64, 2110-2125.

Riba M., Mayol M., Giles B.E., Ronce O., Imbert E., Van Der Velde M., Chauvet S., Ericson L., Bijlsma R., Vosman B., Smulders M.J.M., Olivieri I. (2009) Darwin's wind hypothesis: Does it work for plant dispersal in fragmented habitats? *New Phytologist*, 183, 667-677.

Richards P. (1989) Doing What Comes Naturally: Ecological Inventiveness in African Rice Farming. In R. E. Johannes (Ed.), *Traditional Ecological Knowledge: a Collection of Essays* (p. 77). Gland, Switzerland: UICN.

Richmond A. (2003) *La résilience économique*. Paris: Eyrolles.

Ricklefs R.E. (1987) Community diversity: relative roles of local and regional processes. *Science*, 235, 167-171.

Robinet C., Baier P., Pennerstorfer J., Schopf A., Roques A. (2007) Modelling the effects of climate change on the potential feeding activity of *Thaumetopoea pityocampa* (Den. & Schiff.) (Lep., Notodontidae) in France. *Global Ecology and Biogeography*, 16, 460-471.

Robinet C., Imbert C. E., Rousselet J., Sauvard D., Garcia J., Goussard F., Roques A. (2012) Human-mediated long-distance jumps of the pine processionary moth in Europe. *Biological Invasions*, 14, 1557-1569.

Robinet C., Rousselet J., Imbert C.E., Sauvard D., Garcia J., Goussard F., Roques A. (2010) Le réchauffement climatique et le transport accidentel par l'homme responsables de l'expansion de la chenille processionnaire

du pin. Forêt Wallonne, 108, 19-27.

Ronce O. (2007) How Does It Feel to Be Like a Rolling Stone? Ten Questions About Dispersal Evolution. *Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics*, 38, 231-253.

Roques A. (Ed.) (2015) *Processionary Moths and Climate Change: An Update*. Springer/Quae.

Roques A., Rousselet J., Avci M., Avtzis D.N., Al E. (2015) Climate warming and past and present distribution of the processionary moths (Thaumetopoea spp.) in Europe, Asia Minor and North Africa. In A. Roques (Ed.), *Processionary Moths and Climate Change: An Update*. (pp. 81-162). Springer Quae.

Roullier C., Benoit L., McKey D.B., Lebot V. (2013) Historical collections reveal patterns of diffusion of sweet potato in Oceania obscured by modern plant movements and recombination. *Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America*, 110, 2205-2210.

Sargent R. D., Otto S.P. (2006) The role of local species abundance in the evolution of pollinator attraction in flowering plants. *American Naturalist*, 167, 67-80.

Savolainen O., Pyhäljärvi T., Knürr T. (2007) Gene flow and local adaptation in forest trees. *Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics*, 37, 595-619.

Schluter D. (2000) Ecological Character Displacement in Adaptive Radiation. *The American Naturalist*, 156, S4-S16.

Şekercioğlu çağan H., Primack R. B., & Wormworth J. (2012) The effects of climate change on tropical birds. *Biological Conservation*, 148, 1-18.

Silvain J.F., Le Roux X., Babin D., Barbault R., Bertin P., Bodo B., Boude J.P., Boudry P., Bourgoin T., Boyen C., Cormier-Salem M.C., Courchamp F., Couvet D., David B., Delay B., Doussan I., Jaskulke E., Lavorel S., Leadley P., Lefèvre F., Leriche H., Letourneux F., Los W., Mesleard F., Morand S., Schmidt-Lainé C., Siclet F. & Verrier E. (2009) *Prospective pour la recherche française en biodiversité*. Fondation pour la recherche sur la biodiversité, 96 pp.

Simpson S.D., Jennings S., Johnson M.P., Blanchard J.L., Schön PJ., Sims D.W., Genner M.J. (2011) Continental shelf-wide response of a fish assemblage to rapid warming of the sea. *Current Biology*, 21, 1565-1570.

Skrøppa T., Tollefrud M.M., Sperisen C., Johnsen Ø. (2009) Rapid change in adaptive performance from one generation to the next in Picea abies-Central European trees in a Nordic environment. *Tree Genetics and Genomes*, 6, 93-99.

Smart S.M., Thompson K., Marrs R.H., Le Duc M.G., Maskell L.C., Firbank L.G. (2006) Biotic homogenization and changes in species diversity across human-modified ecosystems. *Proceedings Royal Society of London, Series B, Biological Sciences*, 273, 2659-2665.

Smit B., Wandel J. (2006) Adaptation, adaptive capacity and vulnerability. *Global Environmental Change*, 16, 282-292.
Smith J., Klein R., Huq S. (2003) *Climate Change Adaptive Capacity and Development*. London: Imperial College Press.

Soule M.E. (1985) What is Conservation Biology? A new synthetic discipline addresses the dynamics and problems of perturbed and ecosystems. *BioScience*, 35, 727-734.

Stearns S.C. (1989) The evolutionary significance of phenotypic plasticity. *BioScience*, 39, 436-445.

Stebbins G.L. (1970) Adaptive Radiation of Reproductive Characteristics in Angiosperms, I: Pollination Mechanisms. *Annual Review of Ecology and Systematics*, 1, 307-326.

Steel D. (2004) Can a reductionist be a pluralist? *Biology and Philosophy*, 19, 55-73.

Steffan-Dewenter I., Tscharntke T. (1999) Effects of habitat isolation on pollinator communities and seed set. *Oecologia*, 121, 432-440.

Stevens V. M., Turlure C., Baguette M. (2010) A meta-analysis of dispersal in butterflies. *Biological Reviews*, 85, 625-642.

Suding K.N., Lavorel S., Chapin F.S., Cornelissen J.H.C., Díaz S., Garnier E., Goldberg D., Hoopper D.U., Jackson S.T., Navas, M. L. (2008) Scaling environmental change through the community-level: A trait-based response-and-effect framework for plants. *Global Change Biology*, 14, 1125-1140.

Sumaila U.R., Cheung W.W.L., Lam V.W.Y., Pauly D., Herrick S. (2011) Climate change impacts on the biophysics and economics of world fisheries. *Nature Climate Change*, 1, 449-456.

Taché A. (2003) *L'Adaptation : un concept sociologique systémique*. Paris: L'Harmattan.

Tapia C. (2001) Éditorial. *Connexions*, 76, 7-13.

Thébault E., Fontaine C. (2010) Stability of ecological communities and the architecture of mutualistic and trophic networks. *Science*, 329, 853-856.

Theys J. (2002) L'approche territoriale du "développement durable", condition d'une prise en compte de sa dimension sociale. *Développement Durable et Territoires*, 1, 1-12.

Thomas C.D., Cameron A., Green R.E., Bakkenes M., Beaumont L.J., Collingham Y.C., Erasmus B.F.N., Ferreira de Siqueira M., Grainger A., Hannah L., Hughes L., Huntley B., van Jaarsveld A.S., Midgley G.F., Miles L., Ortega-Huerta M.A., Peterson A.T., Phillips O.L., Williams S. E. (2004) Extinction risk from climate change. *Nature*, 427, 145-148.

Thomas G.H. (2008) Phylogenetic distributions of British birds of conservation concern. *Proceedings Royal Society of London, Series B: Biological Sciences*, 275, 2077-2083.

Thompson J.N. (1982) *Interaction and Coevolution*. New York: John Wiley & Sons.

Thuiller W., Araújo M.B., Pearson R.G., Whittaker R. J., Brotons L., Lavorel S. (2004) Biodiversity conservation: uncertainty in predictions of extinction risk. *Nature*, 430, Brief Comm.

Thuiller W., Lavergne S., Roquet C., Boulangeat I., Lafourcade B., Araujo M. B. (2011) Consequences of climate change on the tree of life in Europe. *Nature*, 470, 531-534.

Thuiller W., Maiorano L., Mazel F., Guilhaumon F., Ficetola G.F., Lavergne S., Renaud J., Roquet C., Mouillot D. (2015) Conserving the functional and phylogenetic trees of life of European tetrapods. *Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences*, 370, 20140005.

Turner D.P., Cohen W. B., Kennedy R.E., Fassnacht K.S., Briggs J.M. (1999) Relationships between leaf area index and Landsat TM spectral vegetation indices across three temperate zone sites. *Remote Sensing of Environment*, 70, 52-68.

Tylianakis J.M., Tscharntke T., Lewis O.T. (2007) Habitat modification alters the structure of tropical host-parasitoid food webs. *Nature*, 445, 202-205.

Valiente-Banuet A., Aizen M.A., Alcantara J.M., Arroyo J., Cocucci A., Galetti M., García M.B., García D., Gómez J.M., Jordano P., Medel R., Navarro L., Obeso J.R., Oviedo R., Ramírez N., Rey P.J., Traveset A., Verdú M., Zamora R. (2015) Beyond species loss: the extinction of ecological interactions in a changing world. *Functional Ecology*, 29, 299-307.

Valladares F., Gianoli E., Gómez J.M. (2007) Ecological limits to plant phenotypic plasticity. *New Phytologist*, 176, 749-763.

Valladares F., Sanchez-Gomez D., Zavala M.A. (2006) Quantitative estimation of phenotypic plasticity: Bridging the gap between the evolutionary concept and its ecological applications. *Journal of Ecology*. 94, 1103-1116.

Vamosi S.M., Heard S.B., Vamosi J.C., Webb C.O. (2009) Emerging patterns in the comparative analysis of phylogenetic community structure. *Molecular Ecology*, 18, 572-592.

Van Buskirk J., Mulvihill R.S., Leberman R.C. (2012) Phenotypic plasticity alone cannot explain climate-induced change in avian migration timing. *Ecology and Evolution*, 2, 2430-2437.

Van Kleunen M., Fischer M. (2005) Constraints on the evolution of adaptive phenotypic plasticity in plants. *The New Phytologist*, 166, 49-60.

Vellend M. (2010) Conceptual synthesis in community ecology. *The Quarterly Review of Biology*, 85, 183-206.

Visser M.E. (2008) Keeping up with a warming world: assessing the rate of adaptation to climate change. *Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences*, 275, 649-659.
Visser M.E., Adriaensen F., Van Balen J.H., Blondel J., Dhondt A.A., Van Dongen S., Chris du E., Ivankina E.V., Kerimov A.B., de Laet J., Matthysen E., McCleery R., Orell M., Thomson, D.L. (2003) Variable responses to large-scale climate change in European Parus populations. *Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences*, 270, 367–372.

Visser M. E., Noordwijk A.J. van, Tinbergen J. M., & Lessells, C. M. (1998) Warmer springs lead to mistimed reproduction in great tits (*Parus major*). *Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences*, 265, 1867–1870.

Waddington C.H. (1960) Experiments on canalizing selection. *Genetical Research*, 1, 140-150.

Walker B., Holling C.S., Carpenter S.R., Kinzig A. (2004) Resilience, adaptability and transformability in social-ecological systems. *Ecology and Society*, 9, 5.

Waller D.M. (2015) Genetic rescue: a safe or risky bet? *Molecular Ecology*, 24, 2595-2597.

Walsh B., Blows M.W. (2009) Abundant Genetic Variation + Strong Selection = Multivariate Genetic Constraints: A Geometric View of Adaptation. *Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics*, 40, 41-59.

Webb C.O., Ackerly D.D., McPeek M. A., Donoghue M.J. (2002) Phylogenies and community ecology. *Annual Review of Ecology and Systematics*, 33, 475-505.

Weill M., Berticat C., Lutfalla G., Pasteur, N., Philips A., Fort P., Raymond M. (2004) Insecticide resistance: a silent base prediction. *Current Biology*, 14, R552-3.

Weill M., Lutfalla G., Mogensen K., Chandre F., Berthomieu A., Berticat C., Pasteur N., Philips A., Fort P., Raymond M. (2003) Comparative genomics: Insecticide resistance in mosquito vectors. *Nature*, 423,136–137.

Wilkinson D.M. (1999) The disturbing history of intermediate disturbance. *Oikos*, 84, 145–147.

Willi Y., Hoffmann A.A. (2009) Demographic factors and genetic variation influence population persistence under environmental change. *Journal of Evolutionary Biology*, 22, 124–133.

Winfree R., Bartomeus I., Cariveau D.P. (2011) Native Pollinators in Anthropogenic Habitats. *Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics*, 42, 1-22.

Wolters V., Silver W.L., Bignell D.E., Coleman D.C., Lavelle P., Van Der Putten W.H., De Ruiter P., Rusek J., Wall D.H., Wardle D.A., Brussard L., Dangerfield J.M., Brown V.K., Giller K.E., Hooper D.U., Sala O., Tiedje J., Wardle D.A. (2000) Effects of global changes on above- and belowground biodiversity in terrestrial ecosystems: implications for ecosystem functioning. *BioScience*, 50, 1089–1098.

Yakovlev I.A., Asante D.K.A., Fossdal C.G., Junttila O., Johnsen Ø. (2011) Differential gene expression related to an epigenetic memory affecting climatic adaptation in Norway spruce. *Plant Science*, 180, 132–139.

Yakovlev I.A., Fossdal C.G., Johnsen Ø. (2010) MicroRNAs, the epigenetic memory and climatic adaptation in Norway spruce. *New Phytologist*, 187, 1154–1169.

Yung J.M., Bosc P.M., Losch B. (1995) Stratégies des producteurs et phénomènes d'innovation au Sahel. In J. P. Yung & J. M. Chauveau (Eds.), *Innovations et sociétés. Quelles agricultures ? Quelles innovations ? II- Les diversités de l'innovation (Actes du XIVème séminaire d'économie rurale, CIRAD-INRA-Orstom, 13-16 sept. 1993)* (p. 379). Montpellier: CIRAD.

Zubin J., Spring B. (1977) Vulnerability: A new view of schizophrenia. *Journal of Abnormal Psychology*, 86, 103-126.
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> CITATION

Fondation pour la recherche sur la biodiversité (2015), Réponses et adaptations aux changements globaux : quels enjeux pour la recherche sur la biodiversité ? Prospective de recherche. Série FRB, Réflexions stratégiques et prospectives. Ed. Ophélie Ronce et Flora Pelegrin, 74 pp.

© FRB 2015

ISBN : 979-10-91015-16-5 (imprimé)

ISBN : 979-10-91015-17-2 (PDF)

Directeur de publication :

Pierre-Edouard Guillain

Conception graphique et figures :

Laurine Moreau

Dépôt légal novembre 2015

Image figure 4.2 :

Agne Alesiute / Evan MacDonald, the Noun Project
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