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# Prévalence Et Diversité Des Souches De Vibrio Dans Les Eaux Et Les Poissons Des Fermes Aquacoles De La Lagune Ebrié

Aubin Cyrille TOULE¹*, Adjo Thérèse ANOMAN², Brice Judicaël ASSI-Clair², Paul Simplice DJEKE¹, Ama Antoinette ADINGRA¹ et Marina KOUSSEMON²

¹Centre de Recherches Océanologiques, BP V18 Abidjan, Côte d'Ivoire.

²UFR des Sciences et Technologies des Aliments (STA), Université Nangui Abrogoua, 02 BP 801 Abidjan 02, Côte d'Ivoire.

*Auteur correspondant, E-mail : Aubin Cyrille TOULE; toulenco@gmail.com; toule.aubin@cro.edu ci

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**Résumé** – La lagune Ebrié servant de source d'eau pour de nombreuses stations aquacoles, abrite de nombreux microorganismes pathogènes tels que les Vibrio, ce qui constitue une menace pour les ressources halieutiques et la santé humaine. L'objectif de cette étude était d'évaluer la prévalence et la diversité des souches de Vibrio dans les eaux et les poissons des fermes aquacoles de la lagune Ebrié. Des échantillons d'eau et de poissons ont été prélevés dans stations aquacoles de Layo et Jacqueville ainsi que dans la lagune Ebrié, pour analyses. Les charges en Vibrio ont été déterminées par la technique des membranes filtrantes pour les échantillons d'eau et par la méthode du nombre le plus probable (NPP) pour les échantillons de poissons. L'identification des espèces Vibrio a été réalisée à l'aide de tests biochimiques. Dans les stations aquacoles et la lagune, les charges de Vibrio des eaux variaient de 3,3 à 4,26 log UFC/100 mL et celles des poissons de 5,1. 10³ à 5,29. 10⁴ UFC/g. Environ 49,4 % des poissons analysés étaient contaminés par Vibrio. Les souches de Vibrio isolées des eaux et des poissons appartiennent à six espèces dont V. cholerae, V. mimicus, V. fluvialis, V. alginolyticus, V. parahaemolyticus et V. vulnificus regroupées en 23 biotypes différents. La diversité de souches de Vibrio dans les milieux aquacole et lagunaire indique un risque sanitaire pour les activités d'élevage ainsi que pour les consommateurs.

**Mots clés** – Lagune Ebrié, aquaculture, Vibrio, biotypes.

**Abstract** – Ebrié lagoon serving as a source of water for many aquaculture stations, is to home numerous pathogenic microorganisms such as Vibrio, posing a threat to fishery resources and human health. The objective of this study was to assess the prevalence and diversity of Vibrio strains in waters and fishes from aquaculture farms in Ebrié lagoon. Water and fishes samples were taken from Layo and Jacqueville aquaculture stations, as well as from Ebrié lagoon, for analysis. Vibrio counts were determined using the membrane filter technique for water samples and the Most Probable Number (MPN) method for fishes samples. Vibrio species were identified by biochemical tests. In aquaculture stations and the lagoon, Vibrio counts in waters ranged from 3.3 to 4.26 log CFU/100 mL and in fishes from 5.1. 10³ to 5.29. 10⁴ CFU/g. Some 49.4% of fishes analyzed were contaminated with Vibrio. Vibrio strains isolated from waters and fishes belong to six species including V. cholerae, V. mimicus, V. fluvialis, V. alginolyticus, V. parahaemolyticus and V. vulnificus, grouped into 23 different biotypes. The diversity of Vibrio strains in aquaculture and lagoon environments indicates a health risk for farming activities as well as for consumers.

**Keywords** – Ebrié lagoon, aquaculture, Vibrio, biotypes.
# I. INTRODUCTION

En Côte d'Ivoire, le poisson représente la principale source de protéine animale consommée par les populations, en particulier par les couches les plus défavorisées. Malgré cela, la production locale moyenne reste faible avec une moyenne de 80 000 tonnes/an, alors que la consommation nationale s'élève à environ 300 000 tonnes/an [1]. Pour pallier ce déficit et atteindre l'autosuffisance, en plus des importations de poissons, plusieurs stations d'aquaculture ont été créées notamment la station d'aquaculture et expérimentale de Layo et la station aquacole d'alevinage de Jacqueville situées dans les secteurs IV et V de la lagune Ebrié. Ces stations aquacoles sont souvent confrontées à des problèmes de pollution chimiques et microbiologiques en raison des pressions anthropiques subit par la lagune Ebrié. En effet, en octobre 1999, des mortalités massives de poissons ont été observées dans ces deux secteurs de la lagune Ebrié situés dans les départements de Dabou et Jacqueville. En mai 2013, ce phénomène cyclique s'est aggravé entrainant la fermeture de la pêche et de nombreuses fermes aquacoles [2]. De plus, de fréquents cas de maladies diarrhÉiques notamment le choléra (maladie hydrique) ont été signalés dans les régions lagunaires en Côte d'Ivoire. Les maladies diarrhÉiques transmises par l'eau et les aliments contaminés continuent de sévir à travers le monde, particulièrement dans les pays en développement, en raison des conditions d'hygiène précaires. Parmi ces maladies, les infections à vibrion occupent des proportions significatives et revêtent encore de nos jours un caractère Épidémique dans les pays Évoqués. L'espèce *Vibrio cholerae*, responsable du choléra est à l'origine d'épidémies catastrophiques dans de nombreux pays en développement, constituant un problème de santé publique majeur [3]. Par ailleurs, les autres espèces de Vibrio restent souvent ignorées, en raison du manque de moyens de recherche adéquats [4]. Pourtant, celles-ci pourraient être à l'origine d'entérites infectieuses, de dermatoses ou d'autres ulcérations cutanées et profondes.

La présente étude visait à évaluer la prévalence et la diversité des souches de Vibrio dans les eaux et les poissons des fermes aquacoles de la lagune Ebrié.

# II. MATERIEL ET METHODES

## 2.1. Site d'étude

Cette étude a été menée dans les secteurs IV et V de la lagune Ebrié, englobant les stations aquacoles de Layo et de Jacqueville ainsi que dans le milieu lagunaire adjacent (Figure 1). Huit points de prélèvement ont été sélectionnés sur ces sites en tenant compte des rejets (eaux usées, excréments, ordures ménagères) et des activités anthropiques. A la station aquacole de Layo (SAL), 4 points de prélèvement ont été sélectionnés dans les étangs E5, E6, E11 et E13 qui sont utilisées pour l'élevage de différentes espèces de poissons. A environ 1 Km de la SAL, deux points de prélèvement ont été retenus dont l'un dans le canal du Niéki entouré d'une plantation industrielle de bananiers, où se pratiquent la baignade, la défécation et les activités ménagères ; et l'autre dans la lagune Ebrié à Layo où la pêche est fortement pratiquée. A la station aquacole de Jacqueville (SAJ), les prélèvements ont été effectués dans un enclos de grossissement situé en pleine lagune (cage-flottante). Cette station se trouve à proximité d'un village de pêcheurs (Ahua) dont les habitants utilisent les eaux de la lagune pour leurs activités ménagères. Au niveau de la lagune Ebrié à N'djem, un point de prélèvement a été sélectionné près des installations sanitaires sur pilotis, recevant les déchets ménagers. Ce site est un lieu pour les activités récréatives.
<figure><img src="image_4.png" /><figcaption>Fig. 1. Localisation du site d'étude</figcaption></figure>

## 2.2. Echantillonnage d'eau et de poissons

De mars à octobre 2015, six campagnes d'échantillonnage d'eau et de poissons ont été effectuées sur chaque site, soit deux durant la saison sèche (mars-avril), deux pendant la saison des pluies (juin-juillet) et deux durant saison des crues (septembre-octobre). Au total, 228 échantillons ont été prélevés, comprenant 48 échantillons d'eau et 180 échantillons de poissons. Pour l'échantillonnage d'eau, les prélèvements ont été effectués à environ 20 cm de profondeur à l'aide de bouteilles borosilicatées de 1000 ml préalablement stérilisées à raison de 8 échantillons par point de prélèvement. Concernant l'échantillonnage des poissons, les prélèvements ont été effectués sur le tilapia (Oreochromis niloticus) de poids marchand de 140 à 210 g de 6 points de prélèvement, à raison de 30 échantillons par point. Les échantillons de poissons ont été recueillis individuellement dans des sachets Stomacher auprès des aquaculteurs et des pêcheurs, après la pêche. Les différents échantillons d'eau et de poissons prélevés ont été conservés dans une glacière isotherme contenant de la carboglace, puis immédiatement transportés au laboratoire pour les différentes analyses.

## 2.3. Analyses bactériologiques

### Dénombrement de Vibrio dans les échantillons d'eau et de poissons

Le dénombrement de Vibrio dans les échantillons d'eau a été réalisée par la méthode de filtration sur membrane [5]. Des volumes de 1, 5 et 10 mL de chaque échantillon d'eau ont été filtrés à travers une membrane filtrante stérile en cellulose, de porosité 0,45 µm (Sartorius Stedim Biotech, Allemagne). Les membranes ont été ensuite placées dans des boîtes de Pétri sur la gélose TCBS (Himedia, Inde), lesquelles ont été incubées à 37 °C pendant 24 H. Le dénombrement de Vibrio dans les échantillons de poissons a été faite selon la méthode canadienne MFLP-37 par la technique du nombre le plus probable (NPP) [6]. Des ensemencements de trois tubes à essai contenant chacun 10 mL d'eau peptonée alcaline à 2 % de NaCl avec 1 mL de chacune des dilutions subséquentes réalisées à partir des échantillons de poissons. L'incubation a été faite par la suite à 37 °C pendant 24 H.
## 2.4. Isolement des souches de Vibrio

A partir des boîtes de Pétri utilisées pour le dénombrement de Vibrio par la méthode de filtration et des bouillons utilisés pour le dénombrement par la méthode du NPP, un isolement par stries sur milieu TCBS en boîtes de Pétri a été effectué afin d'obtenir des colonies bien isolées. Après 24 H d'incubation à 37 °C, les colonies jaunes et plates de 2 à 3 mm de diamètre présomptives de V. cholerae, les colonies jaunes de grande taille présomptives de V. alginolyticus, les colonies jaunes ou translucides présomptives de V. fluvialis et de V. vulnificus, les colonies vertes de 2 à 3 mm de diamètre présomptives de V. mimicus et les colonies incolores à centre vert présomptives de V. parahaemolyticus isolées sur milieu TCBS ont été retenues comme celles caractéristiques des Vibrio [7].

## 2.5. Identification des souches présomptives de Vibrio

L'identification des Vibrio a été réalisée sur des souches pures isolées sur gélose nutritive alcaline à 3 % de NaCl par la recherche des caractères morphologiques, la recherche de l'oxydase et par la galerie API 20 E. La lecture des différentes réactions a été effectuée à l'aide du tableau d'identification associé à la galerie, et le nom de la bactérie a été obtenu à l'aide du catalogue analytique et du logiciel APIWEB.

## 2.6. Analyse statistique

L'analyse statistique a été réalisée à l'aide du logiciel Statistica 7.1. Le test de Newmann-Keuls a permis d'effectuer l'analyse de variance (ANOVA à un facteur) pour étudier le degré de différence entre les charges de Vibrio.

# III. RESULTATS

## 3.1. Niveau de contamination des eaux par Vibrio selon les points de prélèvement

Les charges moyennes de Vibrio dans les eaux aux différents points de prélèvement ont varié de 3,3 à 4,26 log UFC/100 mL avec la charge la plus élevée enregistrée dans l'étang E5 et la plus faible charge à Layo (Figure 2).

<figure><img src="image_5.png" /><figcaption>Fig. 2. Charges moyennes de Vibrio des échantillons d'eau selon les points de prélèvement</figcaption></figure>

Des variations saisonnières des charges de Vibrio (p < 0,05) sont observées dans les eaux des étangs (E6, E11, E13) excepté l'étang E5. Ces variations sont caractérisées par de fortes charges pendant la saison sèche et de faibles charges pendant les saisons des pluies et des crues. Par ailleurs, aucune variation saisonnière des charges de Vibrio n'est observée au niveau des stations lagunaires excepté dans le canal. A cette station, la charge de Vibrio présente des variations saisonnières bien marquées. On observe également une augmentation de la charge de Vibrio pendant la saison sèche (Tableau I).
<table><caption>**Tableau I :** Variations saisonnières des charges de *Vibrio* des échantillons d'eau</caption><thead><tr><th rowspan="2">Etangs</th><th colspan="3">Charges de Vibrio (log UFC/100 mL)</th></tr><tr><th>Saison sèche</th><th>Saison des pluies</th><th>Saison des crues</th></tr></thead><tbody><tr><td>E5</td><td>4,57 ± 0,01<sup>a*</sup></td><td>4,06 ± 0,01<sup>a*</sup></td><td>4,15 ± 0,02<sup>a*</sup></td></tr><tr><td>E6</td><td>4,04 ± 0,02<sup>a*</sup></td><td>3,29 ± 0,01<sup>b**</sup></td><td>3,35 ± 0,01<sup>b**</sup></td></tr><tr><td>E11</td><td>4,34 ± 0,01<sup>a*</sup></td><td>3,19 ± 0,14<sup>b**</sup></td><td>3,30 ± 0,01<sup>b**</sup></td></tr><tr><td>E13</td><td>3,86 ± 0,02<sup>a*</sup></td><td>3,12 ± 0,01<sup>b**</sup></td><td>3,50 ± 0,01<sup>b**</sup></td></tr><tr><td>Canal</td><td>4,35 ± 0,01<sup>a*</sup></td><td>3,68 ± 0,02<sup>b*</sup></td><td>3,42 ± 0,01<sup>b**</sup></td></tr><tr><td>Layo</td><td>3,56 ± 0,02<sup>a*</sup></td><td>3,18 ± 0,01<sup>a**</sup></td><td>3,17 ± 0,2<sup>a**</sup></td></tr><tr><td>SAJ</td><td>3,71 ± 0,01<sup>a*</sup></td><td>3,67 ± 0,01<sup>a*</sup></td><td>3,45 ± 0,01<sup>a**</sup></td></tr><tr><td>N'djem</td><td>4,41 ± 0,01<sup>a*</sup></td><td>4,13 ± 0,04<sup>a*</sup></td><td>3,98 ± 0,05<sup>a*</sup></td></tr></tbody></table>

Les moyennes de la même ligne avec des lettres différentes et celles de la même colonne avec des astérix différents présentent une différence significative à P < 0,05. SAJ : station aquacole de Jacqueville

## 3.2. Niveau de contamination des poissons par Vibrio

Les poissons contaminés par *Vibrio* proviennent de tous les 6 points de prélèvement, avec des prévalences de contamination comprises entre 30 et 66,7 %. La prévalence la plus élevée est enregistrée dans l'étang E5 et la plus faible dans l'étang E11 (Tableau II).

<table><caption>**Tableau II :** Prévalence de contamination des poissons par *Vibrio* selon les points de prélèvement</caption><thead><tr><th>Points de prélèvement</th><th>Nombre d'échantillons analysés</th><th>Prévalence de contamination</th></tr></thead><tbody><tr><td>E5</td><td>30</td><td>20 (66,7)</td></tr><tr><td>E6</td><td>30</td><td>16 (53,3)</td></tr><tr><td>E11</td><td>30</td><td>9 (30)</td></tr><tr><td>E13</td><td>30</td><td>12 (40)</td></tr><tr><td>Layo</td><td>30</td><td>18 (60)</td></tr><tr><td>SAJ</td><td>30</td><td>14 (46,7)</td></tr><tr><td><strong>Total</strong></td><td><strong>180</strong></td><td><strong>89 (49,4)</strong></td></tr></tbody></table>

Les charges moyennes de *Vibrio* varient de 5,1. 10³ ± 5,43. 10³ UFC/g à 5,29. 10⁴ ± 1,03. 10⁴ UFC/g. La charge la plus élevée est observée dans l'étang E5 et la plus faible est enregistrée à SAJ (5,1. 10³ ± 5,43. 10³ UFC/g). Une différence significative (P < 0,05) est observée entre les différentes charges des étangs (E5, E6, E11 et E13) et celles de Layo et SAJ (Tableau III).
<table><caption>**Tableau III :** Charges moyennes de *Vibrio* des poissons selon les points de prélèvement</caption><thead><tr><td>Points de prélèvement</td><td>Charges moyennes de Vibrio (UFC/g)</td></tr></thead><tbody><tr><td>E5</td><td>5,29. 10<sup>4</sup> ± 1,03. 10<sup>4</sup> b</td></tr><tr><td>E6</td><td>4,31. 10<sup>4</sup> ± 1,03. 10<sup>4</sup> b</td></tr><tr><td>E11</td><td>2,28. 10<sup>4</sup> ± 2,77. 10<sup>3</sup> b</td></tr><tr><td>E13</td><td>2,79. 10<sup>4</sup> ± 4,85. 10<sup>3</sup> b</td></tr><tr><td>Layo</td><td>6,91. 10<sup>3</sup> ± 7,66. 10<sup>3</sup> a</td></tr><tr><td>SAJ</td><td>5,1. 10<sup>3</sup> ± 5,43. 10<sup>3</sup> a</td></tr></tbody></table>

Les moyennes affectées de différentes lettres sont significativement différentes au seuil de 5%.

SAJ : station aquacole de Jacqueville

### 3.3. Diversité des souches de Vibrio isolées des eaux et des poissons

Un total de 135 souches de *Vibrio* est isolé dans l'ensemble des échantillons analysés, avec une prévalence de 34,1 % (46 souches) dans les échantillons d'eau et 65,9 % (89 souches) dans les échantillons de poissons. Ces souches de *Vibrio* appartiennent à six espèces dont *V. cholerae*, *V. mimicus*, *V. fluvialis*, *V. alginolyticus*, *V. parahaemolyticus* et *V. vulnificus*. Au niveau des échantillons d'eau, les six espèces de *Vibrio* isolées sont représentées, avec une prédominance de *V. cholerae* (47,8 %). Les échantillons de poissons quant-à-eux, sont contaminés par trois espèces de *Vibrio* (*V. cholerae*, *V. alginolyticus* et *V. parahaemolyticus*), avec une prédominance de *V. alginolyticus* (52,8 %) (Tableau IV).

<table><caption>**Tableau IV :** Fréquence d'isolement des souches de Vibrio selon la source</caption><thead><tr><th rowspan="3">Espèces de Vibrio isolées</th><th colspan="3">Nombre (Fréquence en %)</th></tr><tr><th colspan="2">Sources</th><th rowspan="2">Total N (%)</th></tr><tr><th>Eaux</th><th>Poissons</th></tr></thead><tbody><tr><td>V. cholerae</td><td>22 (47,8)</td><td>26 (29,2)</td><td>48 (35,6)</td></tr><tr><td>V. mimicus</td><td>4 (8,7)</td><td>0 (0)</td><td>4 (3,0)</td></tr><tr><td>V. fluvialis</td><td>2 (4,3)</td><td>0 (0)</td><td>2 (1,5)</td></tr><tr><td>V. alginolyticus</td><td>2 (4,3)</td><td>47 (52,8)</td><td>49 (36,3)</td></tr><tr><td>V. parahaemolyticus</td><td>6 (13,0)</td><td>16 (18,0)</td><td>22 (16,3)</td></tr><tr><td>V. vulnificus</td><td>10 (21,7)</td><td>0 (0)</td><td>10 (7,4)</td></tr></tbody><tfoot><tr><th>Total N (%)</th><td>46 (34,1)</td><td>89 (65,9)</td><td>135 (100)</td></tr></tfoot></table>

Un total de 23 biotypes différents est observé au niveau des six espèces *Vibrio* isolées. *V. cholerae* est l'espèce qui regroupe le plus de biotype (9 biotypes) et *V. fluvialis* le moins de biotype (un biotype) (Tableau V).
<table><caption>Tableau V : Nombre de biotypes selon l'espèce de *Vibrio* isolée</caption><thead><tr><th>Espèces de Vibrio isolées</th><th>Nombre de biotypes</th></tr></thead><tbody><tr><td>V. cholerae</td><td>9</td></tr><tr><td>V. mimicus</td><td>2</td></tr><tr><td>V. fluvialis</td><td>1</td></tr><tr><td>V. alginolyticus</td><td>5</td></tr><tr><td>V. parahaemolyticus</td><td>3</td></tr><tr><td>V. vulnificus</td><td>3</td></tr><tr><td>Total</td><td>23</td></tr></tbody></table>

Dans les étangs (E5, E6, E11 et E13), *V. cholerae* est isolée aussi bien dans les eaux que dans les poissons, tandis que *V. alginolyticus* est isolée uniquement dans les poissons. Dans les eaux du canal, *V. cholerae* est la seule espèce isolée. A Layo, *V. cholerae*, *V. alginolyticus* et *V. parahaemolyticus* sont isolées aussi bien dans les eaux que dans les poissons, tandis que *V. mimicus* est isolée seulement dans les eaux. A la station aquacole de Jacqueville, *V. cholerae* et *V. alginolyticus* sont isolées dans les eaux et les poissons alors que *V. mimicus*, *V. fluvialis* et *V. vulnificus* ne sont isolées que dans les eaux. A N'djem, *V. parahaemolyticus* et *V. vulnificus* sont isolées uniquement dans les eaux (Tableau VI).

<table><caption>Tableau VI : Distribution des espèces *Vibrio* en fonction des points de prélèvement</caption><thead><tr><th rowspan="3">PP</th><th colspan="12">Souches de Vibrio isolées</th></tr><tr><th colspan="2">V. cholerae</th><th colspan="2">V. mimicus</th><th colspan="2">V. fluvialis</th><th colspan="2">V. alg</th><th colspan="2">V. para</th><th colspan="2">V. vulnificus</th></tr><tr><th>Eau</th><th>P</th><th>Eau</th><th>P</th><th>Eau</th><th>P</th><th>Eau</th><th>P</th><th>Eau</th><th>P</th><th>Eau</th><th>P</th></tr></thead><tbody><tr><td>E5</td><td>+</td><td>+</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>+</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td></tr><tr><td>E6</td><td>+</td><td>+</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>+</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td></tr><tr><td>E11</td><td>+</td><td>+</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>+</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td></tr><tr><td>E13</td><td>+</td><td>+</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>+</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td></tr><tr><td>Canal</td><td>+</td><td>ND</td><td>-</td><td>ND</td><td>-</td><td>ND</td><td>-</td><td>ND</td><td>-</td><td>ND</td><td>-</td><td>ND</td></tr><tr><td>Layo</td><td>+</td><td>+</td><td>+</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td><td>+</td><td>+</td><td>+</td><td>+</td><td>-</td><td>-</td></tr><tr><td>SAJ</td><td>+</td><td>+</td><td>+</td><td>-</td><td>+</td><td>-</td><td>+</td><td>+</td><td>-</td><td>-</td><td>+</td><td>-</td></tr><tr><td>N'djem</td><td>-</td><td>ND</td><td>-</td><td>ND</td><td>-</td><td>ND</td><td>-</td><td>ND</td><td>+</td><td>ND</td><td>+</td><td>ND</td></tr></tbody></table>

PP : points de prélèvement, P : poissons, V. alg : *V. alginolyticus*, V. para : *V. parahaemolyticus*. + : présence, - : absence, ND : non déterminé.

## IV. DISCUSSION

Les eaux des structures aquacoles et celles de la lagune Ebrié sont colonisées par *Vibrio*. La présence de *Vibrio* dans tous ces écosystèmes est en accord avec sa large distribution au sein des milieux aquatiques notamment dans les eaux des estuaires et les eaux côtières ainsi que dans les eaux des infrastructures aquacoles où il constitue une grande part de la microflore autochtone
comme indiqué par Boukef-Ben et al. [8]. Ces résultats corroborent également ceux de Bakhrouf et al. [9] lors de leur étude sur une station piscicole du littoral méditerranéen en Tunisie. Dans les eaux des étangs de la station aquacole de Layo, les charges de Vibrio relevées sont élevées, tout comme celles de la station aquacole de Jacqueville. Ces fortes charges en structures d'élevage seraient dues aux activités aquacoles (alimentation, médicament, pêche, etc.) et à la forte concentration des déchets métaboliques des poissons en captivité. En effet, selon Bruni et al. [10], l'accroissement du nombre des Vibrio dans les eaux des bassins d'élevage pourrait être en relation avec l'aliment des poissons. La présence de ces germes en structure aquacole pourrait constituer un risque important, d'abord pour les poissons en élevage et ensuite pour les consommateurs. Selon Cohen et al. [11], certaines espèces bactériennes du genre Vibrio considérées aujourd'hui comme des pathogènes émergents sont impliquées dans les infections d'origine alimentaire chez l'homme après ingestion de produits de la pêche contaminés, posant ainsi un problème de santé publique. De plus, ces milieux contaminés par Vibrio pourraient constituer un danger pour les aquaculteurs lors d'un contact direct avec les eaux, causant ainsi des dermatoses ou des septicémies. Dans le canal et le milieu lagunaire à Layo et N'djem, de fortes densités de Vibrio sont également enregistrées. Ces fortes densités de Vibrio seraient dues aux rejets d'ordures ménagères et eaux usées, à la défécation anarchique et autres apports anthropiques dans le milieu lagunaire. En effet, la richesse en matière organique des milieux ainsi qu'un attachement aux surfaces planctoniques contenant de la chitine favorisent la survie et la multiplication des espèces de Vibrio [12]. Par ailleurs, les échantillons de poissons analysés sont également contaminés par Vibrio. Sur un total de 180 échantillons de poissons analysés, 89 sont contaminés par Vibrio, soit une prévalence de contamination de 49,4 %. Notons que la contamination des poissons par Vibrio est le fait que de nombreuses espèces bactériennes y compris Vibrio vivent dans les milieux aquatiques où elles restent en contact permanent avec les poissons. De plus, l'alimentation des poissons constituée en général de détritus, de vase, de planctons sont des réservoirs de Vibrio. De tels résultats confirment ceux d'Adingra et al. [13] lors de leurs études sur la qualité des poissons en Côte d'Ivoire. Les échantillons de poissons des étangs de la station aquacole de Layo possèdent des charges en Vibrio plus élevées que celles des échantillons de poissons de la station aquacole de Jacqueville. Cette différence s'expliquerait par le fait que les eaux des étangs de la station aquacole de Layo sont plus chargées en Vibrio que celles de la station aquacole de Jacqueville. En effet, selon Farama et al. [14], la concentration initiale en vibrions dans les aliments lors de la récolte serait reliée à la quantité de vibrions dans l'eau.

Sur la base d'une identification biochimique, 135 souches de Vibrio ont été isolées des échantillons d'eau et de poissons. Ces souches appartiennent à six espèces à savoir V. cholerae, V. mimicus, V. fluvialis, V. alginolyticus, V. parahaemolyticus et V. vulnificus, avec une prédominance de V. cholerae dans les échantillons d'eau et de V. alginolyticus dans les échantillons de poissons. Ces résultats sont similaires à ceux de Kweyang et al. [4] lors de leurs travaux sur les facteurs déterminant la distribution des Vibrio dans l'environnement aquatique au Cameroun. Les six espèces de Vibrio identifiées regroupent 23 biotypes, ce qui témoigne de la grande diversité des souches de Vibrio dans les milieux aquacole et lagunaire. En effet, Kouadio et al. [15] ont rapporté que la diversité au niveau des biotypes pourrait s'expliquer par le fait que les souches bactériennes d'origine diverse (animale, humaine, environnementale) se retrouvent dans le milieu lagunaire sans aucun traitement. La forte présence de V. cholerae et V. alginolyticus dans les deux structures d'élevage étudiées confirme les relations étroites entre ces germes et les activités aquacoles. Une telle situation a déjà été rapportée par Bruni et al. [10], pour qui ces types de germes représentent une fraction importante de la population bactérienne dans les eaux utilisées pour des élevages aquacoles. La contamination bactérienne dans les étangs de la station aquacole de Layo par les espèces V. cholerae et V. alginolyticus pourrait provenir des eaux du milieu lagunaire à Layo, d'autant plus que ces mêmes germes y sont également isolés. En effet, hormis les eaux de pluies, les eaux d'alimentation dans les étangs sont fournies par la lagune via la nappe phréatique ou accidentellement lors de la montée des eaux lagunaires pendant les saisons des pluies et des crues. Il faut aussi noter que les eaux d'alimentation dans les étangs, souillées par les activités aquacoles et les matières fécales des poissons, contenant de fortes concentrations de bactéries dont Vibrio, sont rejetées sans aucun traitement dans le milieu lagunaire, d'où une ré-contamination de ce milieu. A la station aquacole de Jaqueville, en plus des espèces V. cholerae et V. alginolyticus la présence des espèces V. mimicus, V. fluvialis et V. vulnificus s'expliquerait par le fait que les enclos d'élevage de cette station sont implantés en pleine lagune où prolifèrent une diversité d'espèces de Vibrio. Dans le canal, V. cholerae est la seule espèce de Vibrio isolée dans les eaux. Cette présence de V. cholera dans le canal s'expliquerait par le fait que cette dernière est la seule espèce continentale du genre Vibrio [16]. En plus, les échantillons d'eau ont été prélevés au niveau d'un village de pêcheurs
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situé sur la rive du canal. Ces pêcheurs défèquent dans ce milieu qui de ce fait, se trouve fortement contaminé. Dans le milieu lagunaire à N'djem, *V. parahaemolyticus* et *V. vulnificus* ont été les seules espèces isolées dans les eaux.

## V. CONCLUSION

L'évaluation du niveau de contamination bactérienne au sein des stations aquacoles et du milieu lagunaire réalisée lors de cette étude révèle que ces écosystèmes présentent des charges élevées de *Vibrio* dans leurs eaux. Les variations saisonnières des charges de *Vibrio* dans les eaux sont plus ou moins marquées. Il ressort également de cette étude que 49,4 % des poissons analysés sont contaminés par *Vibrio*. Les poissons provenant des étangs de la station aquacole de Layo présentent des charges en *Vibrio* plus élevées que ceux provenant de la station aquacole de Jacqueville et du milieu lagunaire. Au total, 23 biotypes de *Vibrio* sont isolés des eaux et des poissons. Ces biotypes appartiennent à six espèces à savoir *V. cholerae*, *V. mimicus*, *V. fluvialis*, *V. alginolyticus*, *V. parahaemolyticus* et *V. vulnificus*, avec une prédominance de *V. cholerae* dans les eaux et de *V. alginolyticus* dans les poissons. L'isolement fréquent des espèces du genre *Vibrio* en milieux aquacole et lagunaire indique un risque potentiel pour les ressources halieutiques et la santé du consommateur.

## REFERENCES

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