La prévalence de Cryptosporidium spp. et de Giardia spp. a été étudiée dans 13 élevages bovins laitiers de la région de Sétif au nord-est de l’Algérie. Au total, 634 prélèvements de fèces ont été réalisés dont 302 chez des veaux et 332 chez des adultes. Cryptosporidium spp. a été identifié dans neuf élevages (69,2 p. 100) et dans 22 p. 100 de l’ensemble des animaux. Le parasite a été observé dans toutes les classes d’âge avec une prévalence plus élevée chez les veaux de 4 à 30 jours (p < 0,01). L’excrétion d’oocystes de Cryptosporidium spp. a été très significativement associée aux diarrhées, notamment chez les veaux âgés de moins de 30 jours (p < 0,001). D’autre part, Giardia spp. a été identifié dans 53,8 p. 100 des élevages et chez 13,8 p. 100 de l’ensemble des animaux. Contrairement à Cryptosporidium spp., l’infestation par Giardia spp. a semblé plus élevée chez les veaux plus âgés (4–12 mois) (p < 0,05). Aucune association significative n’a été signalée entre l’excrétion des kystes de Giar­dia spp. et le type des fèces. L’association des deux parasites a été trouvée chez 10,2 p. 100 de l’ensemble des veaux diarrhéiques. Ce travail montre l’importance de Cryptosporidium spp. et, pour la première fois en Algérie, de Giardia spp. chez les bovins laitiers de la région de Sétif.