Rapport final

<table><thead><tr><th>St.</th><th>Lieu-dit</th><th>Section inter-barrage</th><th>SeqRR de la section 1993-2009</th><th>SeqRR de la station 1993-2009</th><th>SeqRR de la section depuis 2010</th><th>SeqRR de la station depuis 2010</th><th>Largeur</th></tr></thead><tbody><tr><td>S20</td><td>Pontulaire</td><td>A. M. Coet-Cren</td><td>25282</td><td>5056.4</td><td>20549.3</td><td>4109.86</td><td>13.62</td></tr><tr><td>S21</td><td>Pontulaire am.</td><td>A. M. Coet-Cren</td><td>25282</td><td>5056.4</td><td>20549.3</td><td>4109.86</td><td>14.2</td></tr><tr><td>S22</td><td>Maison forestière</td><td>A. M. Coet-Cren</td><td>25282</td><td>5056.4</td><td>20549.3</td><td>4109.86</td><td>20.1</td></tr><tr><td>S23</td><td>P. Neuf am.</td><td>A. M. Coet-Cren</td><td>25282</td><td>5056.4</td><td>20549.3</td><td>4109.86</td><td>18.28</td></tr><tr><td>S24</td><td>Coat Cren</td><td>A. M. Coet-Cren</td><td>25282</td><td>5056.4</td><td>20549.3</td><td>4109.86</td><td>18.4</td></tr><tr><td>S25</td><td>Coat Cren am.</td><td>A. P. Callec</td><td>32875</td><td>10958.33</td><td>24665.6</td><td>8221.867</td><td>14.75</td></tr><tr><td>S26</td><td>P. Callec A.</td><td>A. P. Callec</td><td>32875</td><td>10958.33</td><td>24665.6</td><td>8221.867</td><td>16.2</td></tr><tr><td>S27</td><td>P. Callec pisciculture</td><td>A. P. Callec</td><td>32875</td><td>10958.33</td><td>24665.6</td><td>8221.867</td><td>19.65</td></tr><tr><td>S28</td><td>P. Callec am.</td><td>A. M. Neuf</td><td>16968</td><td>4242</td><td>13424.7</td><td>3356.175</td><td>12.89</td></tr><tr><td>S29</td><td>Coscodo</td><td>A. M. Neuf</td><td>16968</td><td>4242</td><td>13424.7</td><td>3356.175</td><td>11.65</td></tr><tr><td>S30</td><td>Locorion</td><td>A. M. Neuf</td><td>16968</td><td>4242</td><td>13424.7</td><td>3356.175</td><td>20.32</td></tr><tr><td>S31</td><td>M. neuf</td><td>A. M. Neuf</td><td>16968</td><td>4242</td><td>13424.7</td><td>3356.175</td><td>7.53</td></tr><tr><td>S32</td><td>Mané</td><td>A. M. Herveno</td><td>2392</td><td>1196</td><td>6294.673</td><td>3147.337</td><td>16.58</td></tr><tr><td>S33</td><td>M. Hervéno</td><td>A. M. Herveno</td><td>2392</td><td>1196</td><td>6294.673</td><td>3147.337</td><td>6.665</td></tr><tr><td>S34</td><td>M. Brodimont</td><td>A. M. Brondimont</td><td>3816</td><td>3816</td><td>5388.5</td><td>5388.5</td><td>12.74</td></tr><tr><td>S35</td><td>Le Stume</td><td>A. M. Penvern</td><td>8194</td><td>2731.33</td><td>9424.8</td><td>3141.6</td><td>12.69</td></tr><tr><td>S36</td><td>Saint Connet</td><td>A. M. Penvern</td><td>8194</td><td>2731.33</td><td>9424.8</td><td>3141.6</td><td>19.32</td></tr><tr><td>S37</td><td>M. Penvern</td><td>A. M. Penvern</td><td>8194</td><td>2731.33</td><td>9424.8</td><td>3141.6</td><td>9.07</td></tr><tr><td>S38</td><td>Cabreno</td><td>A. P. Kervegan</td><td>8947</td><td>4473.5</td><td>12259.4</td><td>6129.7</td><td>7.26</td></tr><tr><td>S39</td><td>Guéméné</td><td>A. P. Kervegan</td><td>8947</td><td>4473.5</td><td>12259.4</td><td>6129.7</td><td>6</td></tr><tr><td>SA82</td><td>Bras P. Callec am.</td><td>Bras de P. Callec</td><td>7115</td><td>7115</td><td>5329.2</td><td>5329.2</td><td>12.76</td></tr></tbody></table>

A ces 40 stations du cours principal, s'ajoutent des stations situées sur les affluents principaux (Tableau 18). Les SeqRR totales de chaque affluent ont été évaluées une seule fois soit en 1995 ou en 1996 (Claude 1996). Pour calculer une SeqRR par station, nous avons distingué les affluents contribuant peu dans l'abondance totale du fleuve (SeqRR < 3700 m²; le Penlan, le Kernec et le Kerlégan) de ceux contribuant plus (SeqRR > 7100 m²; le Saint Sauveur, le Pont Ar-Belec, le Kergustan et le Kerusten). Pour les affluents contribuant peu à l'abondance, nous avons considéré que lorsque plusieurs stations étaient échantillonnées sur un de ces affluents, elles pouvaient être regroupées en une seule station. Les données d'IA correspondantes ont donc été moyennées afin d'obtenir une seule valeur d'IA par affluent. Ce fut principalement le cas au début du suivi, entre 1993 et 1996 où certains petits affluents étaient "sur-échantillonnés". Pour les affluents contribuant plus à l'abondance, nous avons considéré toutes les stations qui ont été échantillonnées au cours du suivi et divisé la SeqRR de l'affluent par le nombre de stations le constituant. Nous avons également considéré que lorsque l'affluent n'était pas colonisé de façon naturelle, la station ne contribuait pas dans l'estimation de l'abondance locale et avait donc une SeqRR égale à zéro (Tableau 18).
**Tableau 18 : Caractéristiques des stations échantillonnées par IA de type CPUE sur les affluents du Scorff depuis 1993.**

Les surfaces en équivalent radier-rapide (SeqRR) sont exprimées en m².

Penlan global peut être constitué de 3 stations selon les années : Penlan aval (SA21), Penlan moyen (SA22)) et Penlan amont (SA23). Kernec global peut aussi être constitué de 3 stations : Kernec aval (SA31), Kernec moyen (SA32) et Kernec amont (SA33). De même pour Kerlégan global : Kerlégan aval (SA41), Kerlégan moyen (SA42) et Kerlégan amont (SA43).

<table><thead><tr><th>Station</th><th>Lieu-dit</th><th>Localisation</th><th>Année de colonisation</th><th>SeqRR</th></tr></thead><tbody><tr><td>S40</td><td>Moulin à tan</td><td>Aval Moulin Tronscorff</td><td>Pas encore colonisé</td><td>0</td></tr><tr><td>S41</td><td>Tronscorff</td><td>Aval Moulin Tronscorff</td><td>Pas encore colonisé</td><td>0</td></tr><tr><td>SA11</td><td>Saint Sauveur</td><td>Saint Sauveur</td><td>2003 & 2012</td><td>4298</td></tr><tr><td>SA12</td><td>Saint Sauveur Moustoir</td><td>Saint Sauveur</td><td>2003 & 2012</td><td>4298</td></tr><tr><td>SA23</td><td>Penlan (global)</td><td>Penlan</td><td>1993</td><td>3637</td></tr><tr><td>SA32</td><td>Kernec (global)</td><td>Kernec</td><td>1993</td><td>2442</td></tr><tr><td>SA41</td><td>Kerlégan (global)</td><td>Kerlégan</td><td>1993</td><td>3485</td></tr><tr><td>SA71</td><td>Pont Ar Belec amont</td><td>Pont Ar Belec</td><td>2004</td><td>4793</td></tr><tr><td>SA72</td><td>Pont Ar Belec aval</td><td>Pont Ar Belec</td><td>2004</td><td>4793</td></tr><tr><td>SA811</td><td>Ruisseau Lignol</td><td>Kergustan</td><td>2012</td><td>9371.65 jusqu'en 2014<br>5427.65 à partir de 2015</td></tr><tr><td>SA83</td><td>Kerlautre</td><td>Kergustan</td><td>2012</td><td>9371.65 jusqu'en 2014<br>5427.65 à partir de 2015</td></tr><tr><td>SA812</td><td>Ruisseau Saint Caradec</td><td>Kerusten</td><td>2015</td><td>3944</td></tr><tr><td>SA812B</td><td>Ruisseau Saint Caradec (FUTUR)</td><td>Kerusten</td><td>2015</td><td>3944</td></tr></tbody></table>

Du fait du regroupement de certaines stations sur les petits affluents et du fait que le nombre de stations échantillonnées sur un petit affluent n'est pas constant au cours du temps, la largeur moyenne de la rivière utilisée dans la relation de proportionnalité va varier selon les années (Tableau 19). Deux stations sur le ruisseau de Saint Caradec, ruisseau colonisé en 2015, ont déjà été intégrées dans la modélisation mais leur largeur n'a pas encore été mesurée. Une largeur de 3 mètres a pour le moment été considérée mais pour la mise à jour incluant l'année 2015, il sera nécessaire d'aller mesurer la largeur de la rivière au niveau de ces deux stations.

Un travail important de vérification des données d'IA a été effectué avec la collaboration de Nicolas Jeannot (INRA U3E, Rennes) notamment pour les affluents où il s'agissait de faire la distinction entre des données absentes (pas d'échantillonnage de la station) et des données d'IA égales à zéro. Ainsi, au total, 53 stations sont considérées dans la modélisation (Tableau 20).
<table><caption>**Tableau 19 : Largeur moyenne considérée (m) pour les stations échantillonnées par IA de type CPUE sur les affluents des rivières SA812 et SA812B**

Les largeurs des stations SA812 et SA812B n'ont pas encore été mesurées. La station SA812 a été échantillonnée pour inclure dans la modélisation) et la station SA812B n'a encore jamais été échantillonnée mais il est prévu à court terme (ici-dans la modélisation) qu'elle sera incluse dans la modélisation pour permettre une mise à jour rapide dans les années à venir avec une la</caption><thead><tr><th>Station</th><th>Lieu-dit</th><th>Localisation</th><th>1993</th><th>1994</th><th>1995</th><th>1996</th><th>1997</th><th>1998</th><th>1999</th><th>2000</th><th>2001</th><th>2002</th><th>2003</th><th>2004</th><th>2005</th><th>2006</th><th>2007</th></tr></thead><tbody><tr><td>SA82</td><td>Bras de Pont Callec amont</td><td>Bras de Pont Callec</td><td>14.5</td><td>13.63</td><td>13.63</td><td>13.63</td><td>12.76</td><td>12.76</td><td>12.76</td><td>12.76</td><td>12.76</td><td>12.76</td><td>12.76</td><td>12.76</td><td>12.76</td><td>12.76</td><td>12.76</td></tr><tr><td>S40</td><td>Moulin à tan</td><td>Aval Moulin Tronscorff</td><td>6.1</td><td>6.1</td><td>6.1</td><td>6.1</td><td>6.1</td><td>6.1</td><td>6.1</td><td>6.1</td><td>6.1</td><td>6.1</td><td>6.1</td><td>6.1</td><td>6.1</td><td>6.1</td><td>6.1</td></tr><tr><td>S41</td><td>Tronscorff</td><td>Aval Moulin Tronscorff</td><td>6.25</td><td>6.25</td><td>6.25</td><td>6.25</td><td>6.25</td><td>6.25</td><td>6.25</td><td>6.25</td><td>6.25</td><td>6.25</td><td>6.25</td><td>6.25</td><td>6.25</td><td>6.25</td><td>6.25</td></tr><tr><td>SA11</td><td>Saint Sauveur</td><td>Saint Sauveur</td><td>10.04</td><td>10.04</td><td>10.04</td><td>10.04</td><td>10.04</td><td>10.04</td><td>10.04</td><td>10.04</td><td>10.04</td><td>10.04</td><td>10.04</td><td>10.04</td><td>10.04</td><td>10.04</td><td>10.04</td></tr><tr><td>SA12</td><td>Saint Sauveur Moustoir</td><td>Saint Sauveur</td><td>5.82</td><td>5.82</td><td>5.82</td><td>5.82</td><td>5.82</td><td>5.82</td><td>5.82</td><td>5.82</td><td>5.82</td><td>5.82</td><td>5.82</td><td>5.82</td><td>5.82</td><td>5.82</td><td>5.82</td></tr><tr><td>SA23</td><td>Penlan (global)</td><td>Penlan</td><td>2.163</td><td>2.63</td><td>2.163</td><td>2.163</td><td>1.23</td><td>1.23</td><td>1.23</td><td>1.23</td><td>1.23</td><td>1.23</td><td>1.23</td><td>1.23</td><td>1.23</td><td>1.23</td><td>1.23</td></tr><tr><td>SA32</td><td>Kernec (global)</td><td>Kernec</td><td>3.25</td><td>3.27</td><td>3.205</td><td>3.275</td><td>3.34</td><td>3.34</td><td>3.34</td><td>3.34</td><td>3.34</td><td>3.34</td><td>3.34</td><td>3.34</td><td>3.34</td><td>3.34</td><td>3.34</td></tr><tr><td>SA41</td><td>Kerlégan (global)</td><td>Kerlégan</td><td>3.567</td><td>3.567</td><td>3.567</td><td>3.567</td><td>3.51</td><td>3.510</td><td>3.51</td><td>3.510</td><td>3.51</td><td>3.510</td><td>3.51</td><td>3.510</td><td>3.51</td><td>3.510</td><td>3.51</td></tr><tr><td>SA71</td><td>Pont Ar Belec amont</td><td>Pont Ar Belec</td><td>4.56</td><td>4.56</td><td>4.56</td><td>4.56</td><td>4.56</td><td>4.56</td><td>4.56</td><td>4.56</td><td>4.56</td><td>4.56</td><td>4.56</td><td>4.56</td><td>4.56</td><td>4.56</td><td>4.56</td></tr><tr><td>SA72</td><td>Pont Ar Belec aval</td><td>Pont Ar Belec</td><td>4.54</td><td>4.54</td><td>4.54</td><td>4.54</td><td>4.54</td><td>4.54</td><td>4.54</td><td>4.54</td><td>4.54</td><td>4.54</td><td>4.54</td><td>4.54</td><td>4.54</td><td>4.54</td><td>4.54</td></tr><tr><td>SA811</td><td>Ruisseau Lignol</td><td>Kergustan</td><td>5.84</td><td>5.84</td><td>5.84</td><td>5.84</td><td>5.84</td><td>5.84</td><td>5.84</td><td>5.84</td><td>5.84</td><td>5.84</td><td>5.84</td><td>5.84</td><td>5.84</td><td>5.84</td><td>5.84</td></tr><tr><td>SA83</td><td>Kerlautre</td><td>Kergustan</td><td>6.22</td><td>6.22</td><td>6.22</td><td>6.22</td><td>6.22</td><td>6.22</td><td>6.22</td><td>6.22</td><td>6.22</td><td>6.22</td><td>6.22</td><td>6.22</td><td>6.22</td><td>6.22</td><td>6.22</td></tr><tr><td>SA812</td><td>Ruisseau Saint Caradec</td><td>Kerusten</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td></tr><tr><td>SA812B</td><td>Ruisseau Saint Caradec (FUTUR)</td><td>Kerusten</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td><td>?</td></tr></tbody></table>

Servanty & Prévost

Février 2016
**Tableau 20 : Effectifs en tacons (0+) capturés sur les stations échantillonnées par IA de type CPUE sur le Scorff et ses [Tableau sur deux pages].**

Les stations qui ne sont pas encore colonisées par le saumon atlantique mais sur lesquelles un échantillonnage est modèle (S40 et S41) en prévision de leur future colonisation. Il en est de même pour les stations du ruisseau de Saint (SA812 et SA812B).

<table><thead><tr><th>Station</th><th>Lieu-dit</th><th>1993</th><th>1994</th><th>1995</th><th>1996</th><th>1997</th><th>1998</th><th>1999</th><th>2000</th><th>2001</th><th>2002</th><th>2003</th><th>2004</th><th>2005</th><th>2006</th><th>2007</th></tr></thead><tbody><tr><td>S1</td><td>Maison rivière</td><td>8</td><td>22</td><td>25</td><td>26</td><td>9</td><td>13</td><td>5</td><td>9</td><td>14</td><td>16</td><td>38</td><td>24</td><td>18</td><td>4</td><td>7</td></tr><tr><td>S2</td><td>Moulin Saint Yves</td><td></td><td>14</td><td>1</td><td>14</td><td>18</td><td>8</td><td>23</td><td>33</td><td>3</td><td>28</td><td>29</td><td>14</td><td>35</td><td>11</td><td>24</td></tr><tr><td>S3</td><td>Lomener</td><td>11</td><td>8</td><td>12</td><td>40</td><td>86</td><td>26</td><td>28</td><td>28</td><td>7</td><td>64</td><td>91</td><td>47</td><td>86</td><td>25</td><td>49</td></tr><tr><td>S4</td><td>Gourdeau</td><td>18</td><td>16</td><td>25</td><td>17</td><td>59</td><td>16</td><td>21</td><td>27</td><td>4</td><td>50</td><td>70</td><td>65</td><td>76</td><td>48</td><td>56</td></tr><tr><td>S5</td><td>Trou de gaz</td><td>4</td><td>13</td><td>12</td><td>19</td><td>40</td><td>9</td><td>12</td><td>34</td><td>2</td><td>54</td><td>94</td><td>46</td><td>73</td><td>28</td><td>27</td></tr><tr><td>S6</td><td>Moulin Roch</td><td>7</td><td>11</td><td>3</td><td>8</td><td>32</td><td>5</td><td>7</td><td>39</td><td>8</td><td>40</td><td>105</td><td>12</td><td>74</td><td>37</td><td>36</td></tr><tr><td>S7</td><td>Pont Kerlo aval</td><td>2</td><td>2</td><td>0</td><td>13</td><td>9</td><td>3</td><td>3</td><td>16</td><td>3</td><td>30</td><td>54</td><td>26</td><td>62</td><td>28</td><td>25</td></tr><tr><td>S8</td><td>Pont Kerlo moyen</td><td>0</td><td>4</td><td>0</td><td>8</td><td>8</td><td>4</td><td>1</td><td>9</td><td>2</td><td>27</td><td>61</td><td>26</td><td>79</td><td>19</td><td>20</td></tr><tr><td>S9</td><td>Pont Kerlo pisciculture</td><td>6</td><td>14</td><td>0</td><td>25</td><td>7</td><td>13</td><td>6</td><td>25</td><td>13</td><td>55</td><td>64</td><td>28</td><td>36</td><td>32</td><td>26</td></tr><tr><td>S10</td><td>Fanguiguo</td><td>2</td><td>8</td><td>3</td><td>41</td><td>41</td><td>4</td><td>11</td><td>29</td><td>4</td><td>36</td><td>50</td><td>19</td><td>60</td><td>25</td><td>6</td></tr><tr><td>S11</td><td>Saint Inifer</td><td>15</td><td>34</td><td>7</td><td>70</td><td>56</td><td>11</td><td>24</td><td>52</td><td>4</td><td>68</td><td>69</td><td>42</td><td>77</td><td>71</td><td>31</td></tr><tr><td>S12</td><td>Kerlégan</td><td>8</td><td>26</td><td>7</td><td>52</td><td>62</td><td>17</td><td>31</td><td>32</td><td>13</td><td>58</td><td>78</td><td>44</td><td>67</td><td>74</td><td>22</td></tr><tr><td>S13</td><td>Moulin papier aval</td><td>12</td><td>16</td><td>17</td><td>51</td><td>57</td><td>19</td><td>20</td><td>34</td><td>9</td><td>48</td><td>74</td><td>39</td><td>68</td><td>36</td><td>13</td></tr><tr><td>S14</td><td>Moulin papier</td><td>22</td><td>30</td><td>14</td><td>63</td><td>74</td><td>27</td><td>39</td><td>64</td><td>10</td><td>111</td><td>101</td><td>91</td><td>65</td><td>75</td><td>66</td></tr><tr><td>S15</td><td>Stang aval</td><td>8</td><td>11</td><td>11</td><td>97</td><td>106</td><td>28</td><td>10</td><td>33</td><td>3</td><td>78</td><td>48</td><td>40</td><td>47</td><td>76</td><td>61</td></tr><tr><td>S16</td><td>Moulin du Stang</td><td>13</td><td>15</td><td>2</td><td>72</td><td>35</td><td>19</td><td>6</td><td>27</td><td>9</td><td>50</td><td>78</td><td>69</td><td>39</td><td>97</td><td>63</td></tr><tr><td>S17</td><td>Kervinel aval</td><td>6</td><td>23</td><td>0</td><td>47</td><td>31</td><td>29</td><td>0</td><td>30</td><td>4</td><td>35</td><td>35</td><td>50</td><td>57</td><td>53</td><td>35</td></tr><tr><td>S18</td><td>Kervinel moyen</td><td>8</td><td>12</td><td>2</td><td>70</td><td>66</td><td>20</td><td>7</td><td>68</td><td>2</td><td>36</td><td>77</td><td>36</td><td>47</td><td>47</td><td>35</td></tr><tr><td>S19</td><td>Kervinel amont</td><td>8</td><td>25</td><td>11</td><td>58</td><td>70</td><td>11</td><td>8</td><td>70</td><td>11</td><td>76</td><td>85</td><td>50</td><td>52</td><td>34</td><td>31</td></tr><tr><td>S20</td><td>Pontulaire</td><td>15</td><td>14</td><td>6</td><td>59</td><td>34</td><td>7</td><td>7</td><td>31</td><td>4</td><td>32</td><td>72</td><td>47</td><td>65</td><td>18</td><td>20</td></tr><tr><td>S21</td><td>Pontulaire amont</td><td>13</td><td>15</td><td>7</td><td>48</td><td>34</td><td>7</td><td>15</td><td>56</td><td>0</td><td>25</td><td>102</td><td>38</td><td>49</td><td>39</td><td>29</td></tr><tr><td>S22</td><td>Maison forestière</td><td>10</td><td>9</td><td>4</td><td>43</td><td>40</td><td>5</td><td>5</td><td>62</td><td>1</td><td>28</td><td>50</td><td>35</td><td>20</td><td>36</td><td>25</td></tr><tr><td>S23</td><td>Pont Neuf amont</td><td>7</td><td>6</td><td>2</td><td>20</td><td>15</td><td>0</td><td>7</td><td>7</td><td>0</td><td>12</td><td>32</td><td>20</td><td>10</td><td>20</td><td>9</td></tr><tr><td>S24</td><td>Coat Cren</td><td>3</td><td>11</td><td>3</td><td>18</td><td>11</td><td>0</td><td>1</td><td>20</td><td>1</td><td>7</td><td>22</td><td>16</td><td>20</td><td>9</td><td>8</td></tr><tr><td>S25</td><td>Coat Cren amont</td><td>11</td><td>19</td><td>2</td><td>14</td><td>9</td><td>0</td><td>1</td><td>19</td><td>0</td><td>5</td><td>36</td><td>5</td><td>11</td><td>15</td><td>17</td></tr></tbody></table>
Rapport final

<table><thead><tr><th>Station</th><th>Lieu-dit</th><th>1993</th><th>1994</th><th>1995</th><th>1996</th><th>1997</th><th>1998</th><th>1999</th><th>2000</th><th>2001</th><th>2002</th><th>2003</th><th>2004</th><th>2005</th><th>2006</th><th>2007</th></tr></thead><tbody><tr><td>S26</td><td>Pont Callec aval</td><td>12</td><td>35</td><td>10</td><td>7</td><td>3</td><td>0</td><td>7</td><td>20</td><td>0</td><td>21</td><td>60</td><td>24</td><td>38</td><td>18</td><td>18</td></tr><tr><td>S27</td><td>Pont Callec pisciculture</td><td>6</td><td>27</td><td>1</td><td>6</td><td>0</td><td>0</td><td>10</td><td>27</td><td>0</td><td>37</td><td>78</td><td>37</td><td>45</td><td>45</td><td>63</td></tr><tr><td>S28</td><td>Pont Callec amont</td><td>12</td><td>18</td><td>12</td><td>20</td><td>4</td><td>2</td><td>3</td><td>12</td><td>0</td><td>36</td><td>40</td><td>18</td><td>18</td><td>30</td><td>15</td></tr><tr><td>S29</td><td>Coscodo</td><td>11</td><td>14</td><td>15</td><td>31</td><td>10</td><td>2</td><td>2</td><td>10</td><td>2</td><td>44</td><td>72</td><td>42</td><td>59</td><td>41</td><td>23</td></tr><tr><td>S30</td><td>Locorion</td><td>16</td><td>22</td><td>42</td><td>67</td><td>38</td><td>1</td><td>1</td><td>13</td><td>4</td><td>63</td><td>66</td><td>66</td><td>71</td><td>93</td><td>22</td></tr><tr><td>S31</td><td>Moulin neuf</td><td>9</td><td>17</td><td>19</td><td>30</td><td>9</td><td>0</td><td>1</td><td>9</td><td>5</td><td>54</td><td>39</td><td>53</td><td>49</td><td>46</td><td>20</td></tr><tr><td>S32</td><td>Mané</td><td>1</td><td>8</td><td>30</td><td>26</td><td>14</td><td>1</td><td>0</td><td>11</td><td>4</td><td>44</td><td>39</td><td>26</td><td>35</td><td>47</td><td>22</td></tr><tr><td>S33</td><td>Moulin Hervéno</td><td>9</td><td>18</td><td>22</td><td>16</td><td>8</td><td>1</td><td>2</td><td>23</td><td>6</td><td>55</td><td>67</td><td>21</td><td>40</td><td>30</td><td>39</td></tr><tr><td>S34</td><td>Moulin Brodimont</td><td>6</td><td>26</td><td>36</td><td>11</td><td>10</td><td>2</td><td>0</td><td>7</td><td>8</td><td>40</td><td>47</td><td>22</td><td>29</td><td>30</td><td>17</td></tr><tr><td>S35</td><td>Le Stume</td><td>18</td><td>29</td><td>37</td><td>12</td><td>39</td><td>6</td><td>6</td><td>9</td><td>9</td><td>32</td><td>34</td><td>28</td><td>71</td><td>42</td><td>24</td></tr><tr><td>S36</td><td>Saint Connet</td><td>10</td><td>19</td><td>42</td><td>20</td><td>30</td><td>0</td><td>0</td><td>7</td><td>12</td><td>6</td><td>45</td><td>27</td><td>51</td><td>18</td><td>10</td></tr><tr><td>S37</td><td>Moulin Penvern</td><td>9</td><td>28</td><td>29</td><td>10</td><td>12</td><td>0</td><td>2</td><td>0</td><td>2</td><td>13</td><td>45</td><td>21</td><td>27</td><td>21</td><td>16</td></tr><tr><td>S38</td><td>Cabreno</td><td>2</td><td></td><td>27</td><td>4</td><td>2</td><td>0</td><td>1</td><td>0</td><td>0</td><td>12</td><td>19</td><td>2</td><td>9</td><td>11</td><td>3</td></tr><tr><td>S39</td><td>Guéméné</td><td>13</td><td>0</td><td>12</td><td>7</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>23</td><td>0</td><td>23</td><td>15</td><td>6</td></tr><tr><td>SA82</td><td>Bras de Pont Callec amont</td><td>0</td><td>6</td><td>33</td><td>20</td><td>41</td><td>0</td><td>0</td><td>3</td><td>0</td><td>5</td><td>43</td><td>5</td><td>4</td><td>17</td><td>35</td></tr><tr><td>S40</td><td>Moulin à tan</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>S41</td><td>Tronscorff</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>SA11</td><td>Saint Sauveur</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>7</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>SA12</td><td>Saint Sauveur Moustoir</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>32</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>SA23</td><td>Penlan (global)</td><td>1</td><td>3</td><td>4</td><td>4</td><td>0</td><td>21</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>2</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>7</td></tr><tr><td>SA32</td><td>Kernec (global)</td><td>9</td><td>0</td><td>4</td><td>2</td><td>0</td><td>3</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>1</td><td>3</td><td>1</td><td>23</td></tr><tr><td>SA41</td><td>Kerlégan (global)</td><td>9</td><td>3</td><td>0</td><td>4</td><td>4</td><td>0</td><td>3</td><td>9</td><td>10</td><td>1</td><td>14</td><td>7</td><td>8</td><td>12</td><td>18</td></tr><tr><td>SA71</td><td>Pont Ar Belec amont</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td></tr><tr><td>SA72</td><td>Pont Ar Belec aval</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td></tr><tr><td>SA811</td><td>Ruisseau Lignol</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>SA83</td><td>Kerlautre</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>SA812</td><td>Ruisseau Saint Caradec</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>SA812B</td><td>Ruisseau Saint Caradec: Futur</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>
L'effet du débit lors des échantillonnages par IA a été inclus comme covariable pour expliquer une partie des variations de la densité locale annuelle en échelle log. Le débit moyen annuel a été calculé à partir des débits quotidiens observés les jours de pêche sur les 40 stations du cours principal, pondéré par le nombre de stations échantillonnées un jour donné (Tableau 21). De même, nous avons considéré que la densité locale annuelle en échelle log ($\log(d)_{i,t}$) résultait d'un effet aléatoire selon la station échantillonnée ($\log(S)_i$) en plus d'un effet aléatoire annuel ($\log(Y)_t$) et d'un effet résiduel de variance ($\sigma_d^2$).

$$ \log(d)_{i,t} = \log(Y)_t + \log(S)_i + \varepsilon_d $$

$$ \text{où } \log(Y)_t \sim \text{Normal}(\mu_{d_t}, \sigma_{d_t}^2), \log(S)_i \sim \text{Normal}(0, \sigma_{d_i}^2) \text{ et } \varepsilon_d \sim \text{Normal}(0, \sigma_d^2) $$

$$ \text{où } \mu_{d_t} = \alpha_0 + \alpha_1 \times \text{std}Q_t \text{ avec } \text{std}Q_t \text{ la covariable de débit log transformée et centrée-réduite et } \alpha_0 \sim \text{Normal}(0,100), \alpha_1 \sim \text{Normal}(0,100), $$

$$ \text{et où } \sigma_{d_i} \sim \text{Uniform}(0,10), \sigma_{dt} \sim \text{Uniform}(0,10), \sigma_d \sim \text{Uniform}(0,10) $$

<caption>**Tableau 21 : Débit moyen (m³/s) calculé selon les jours d'échantillonnage par IA de type CPUE sur le cours principal du Scorff et pondéré par le nombre de stations échantillonnées un jour donné.**</caption>

Ce débit moyen est log transformé et standardisé (centré-réduit) dans le modèle pour être utilisé comme covariable temporelle pour expliquer les variations de la densité locale annuelle.

<table><thead><tr><td>Année</td><td>Débit moyen (m³/s)</td></tr></thead><tbody><tr><td>1993</td><td>2.178947</td></tr><tr><td>1994</td><td>2.362564</td></tr><tr><td>1995</td><td>1.540769</td></tr><tr><td>1996</td><td>0.722641</td></tr><tr><td>1997</td><td>0.490923</td></tr><tr><td>1998</td><td>1.622051</td></tr><tr><td>1999</td><td>2.773590</td></tr><tr><td>2000</td><td>1.51</td></tr><tr><td>2001</td><td>1.15754</td></tr><tr><td>2002</td><td>0.85315</td></tr><tr><td>2003</td><td>0.33185</td></tr><tr><td>2004</td><td>1.39359</td></tr><tr><td>2005</td><td>0.50674</td></tr><tr><td>2006</td><td>0.72051</td></tr><tr><td>2007</td><td>1.75</td></tr><tr><td>2008</td><td>1.27949</td></tr><tr><td>2009</td><td>0.77728</td></tr><tr><td>2010</td><td>0.59405</td></tr><tr><td>2011</td><td>0.62097</td></tr><tr><td>2012</td><td>1.12256</td></tr><tr><td>2013</td><td>0.61531</td></tr><tr><td>2014</td><td>0.75269</td></tr></tbody></table>
Une fois les estimations annuelles des densités locales obtenues, il est possible d'effectuer des regroupements pour les stations localisées sur le Scorff (39 stations au total) selon les profils temporels observés. Pour cela, nous utilisons des méthodes de regroupement hiérarchique utilisant une procédure ascendante et des méthodes dites d'agglomération (Annexe 18).

### Extrapolation de l'abondance et de la densité pour la totalité du Scorff

Pour extrapoler la densité et l'abondance pour la totalité du Scorff, nous avons dans un premier temps réajusté les estimations de la densité locale en corrigeant l'effet annuel ($\log(Y)_t$) selon le débit moyen observé lorsque les relevés d'habitat ont été effectués par Anthony Claude en 1995 ou 1996 (cas uniquement du Kergustan, du Kerusten et de Saint-Sauveur Moustoir ; Claude 1996) et par Camille Saget en 2010 (pour le cours principal uniquement ; Saget 2011). Ce débit moyen ($Q_{hab}$) a été calculé à partir des débits quotidiens observés les jours où des relevés ont été effectués (Tableau 22). Il est par la suite log transformé et centré-réduit selon la moyenne et l'écart-type des débits moyens annuels qui ont été observés les jours d'échantillonnage par IA de type CPUE ($\text{std}Q_{hab}_t$).

$$ \log(Y_{pred})_t = \alpha_0 + \alpha_1 \times \text{std}Q_{hab}_t + \varepsilon_t $$

où $\varepsilon_t = \log(Y)_t - \mu_{d,t}$ et correspond aux résidus de l'effet aléatoire annuel. Les autres paramètres sont issus de l'estimation de la densité locale.

La densité prédite à un site $i$, une année $t$ résulte donc de cet effet aléatoire annuel ajusté ($\log(Y_{pred})_t$) et également de l'effet aléatoire selon la station échantillonnée ($\log(S)_i$) et de l'effet résiduel ($\varepsilon_d$), qui ont été précédemment estimés lors de l'estimation de la densité locale.

$$ \log(d_{pred})_{i,t} = \log(Y_{pred})_t + \log(S)_i + \varepsilon_d $$

**Tableau 22 : Débit moyen observé (m³/s) les années où des relevés d'habitat ont été effectués par Anthony Claude (1996) et Camille Saget (2011).**

Ce débit moyen est par la suite log transformé et centré-réduit selon la moyenne et l'écart-type des débits moyens annuels qui ont été observés les jours d'échantillonnage par IA de type CPUE (Tableau 21).

<table><thead><tr><td></td><td>Débit moyen (m³/s)</td></tr></thead><tbody><tr><td>1995</td><td>1.197947368</td></tr><tr><td>1996</td><td>0.794666667</td></tr><tr><td>2010</td><td>0.670285714</td></tr></tbody></table>

## 3.2. Résultats

### Calibration des IA de type CPUE avec les estimations de densités

La probabilité de capture moyenne par enlèvements successifs lors du premier passage est estimée à 0.53 (BCI95% : [0.4 ; 0.67]). La diminution de celle-ci pour le deuxième passage est estimée à 0.92 (BCI95% : [0.65 ; 1.13]) en échelle logit. La probabilité de capture au cours du deuxième passage est donc égale en moyenne à 0.31.

La relation de proportionnalité estimée selon la largeur de la rivière est la suivante :
**Figure 27** : Représentation graphique de la relation de proportionnalité entre la densité (poissons/m²) et les valeurs de la niveau de la station d'échantillonnage, établie pour le site du Scorff.

Les lignes de contour représentent la valeur médiane de la densité qui est estimée à partir de la relation de proportionnalité sont pas représentées.

<figure><img src="image_36.png" /></figure>
$$ \log(k_{cpue}) = \alpha_0 + \alpha_1 \times \log(W) \text{ avec } \alpha_0 = -0.153 (\text{BCI95\% } [-0.567; 0.223]) \text{ et } \alpha_1 = 0.420 (\text{BCI95\% } [0.228; 0.617]) $$

Ainsi, la densité locale pour une valeur d'IA donnée augmente avec la largeur de la rivière. La représentation graphique de cette relation permet de prédire quelle densité moyenne peut être attendue selon l'IA observé à une station d'échantillonnage et la largeur de la rivière au niveau de celle-ci (Figure 27) ou de prédire l'IA moyen à une station selon la densité estimée à cette station et sa largeur (Annexe 19).

## Estimation de l'abondance et de la densité locale par indice d'abondance

La modélisation nous permet d'obtenir les estimations annuelles de densités locales. Nous ne présentons pas ici toutes ces estimations locales (au total 53 stations) mais présentons, à titre d'exemple, la station de Lomener (station S3 ; Figure 28). Nous pouvons noter de plus fortes densités à partir de l'année 2002. Les résultats concernant le regroupement hiérarchique avec contrainte de contiguïté spatiale effectué pour les stations situées sur le Scorff sont présentés en Annexe 18.

<caption>**Figure 28 : Box plots des densités annuelles (en m² équivalent radier-rapide) de tacons (0+) sur la station de Lomener sur le Scorff.**</caption>

Les box plots représentent ici l'intervalle de crédibilité à 95% et la médiane. La ligne continue représente la moyenne sur la série temporelle.

<figure><img src="image_37.png" /></figure>

## Reconstitution de la série chronologique d'abondance

La reconstitution de la série chronologique pour le Scorff dans sa globalité montre bien l'augmentation de la population en tacons ces dernières années (Figure 29). L'année 2001 est celle caractérisée par le plus faible effectif (médiane : 3169, BCI95% [2307 ; 4452]) et l'année 2011 par le plus fort (médiane : 33670, BCI95% [25340 ; 45440] ; Annexe 20)
**Figure 29** : Box plots des estimations annuelles des effectifs de tacons (0+) sur le Scorff (cours principal et affluents) depuis 1993.

Les box plots représentent ici l'intervalle de crédibilité à 95% et la médiane. La ligne continue représente la moyenne sur la série temporelle.

<figure><img src="image_38.png" /></figure>

## 4. Site de l'Oir

### 4.1. Spécificités et données utilisées

**Estimation de l'abondance et de la densité locale par enlèvements successifs**

Toutes les données d'ES récoltées dans le cadre des pêches électriques n'ont pas pu être considérées, soit parce que certaines stations ont été échantillonnées très irrégulièrement, soit parce que la surface exacte de certaines stations échantillonnées n'est pas connue certaines années. De même, les stations dont l'habitat était uniquement constitué de profonds n'ont pas été considérées. En ce qui concerne les affluents, seuls ceux déjà colonisés ont été considérés : La Roche, Pont-Levesque et Moulin du Bois. Enfin, seules les stations pour lesquelles un suivi de 5 ans minimum a été effectué ont été conservées pour l'analyse. Ainsi, 29 stations ont été sélectionnées sur le cours principal de l'Oir (Tableau 23), 20 sur le ruisseau de La Roche, 4 sur le ruisseau de Pont Levesque et 4 sur le ruisseau du Moulin du Bois (Tableau 24). Depuis 2009, certaines stations sont échantillonnées dans le cadre des Pêches électriques Toutes Espèces (PTE) qui consistent en un échantillonnage en 3 passages. Toutefois, du fait de la mise en place récente de ces stations et du fait que les 3 passages ne sont pas systématiquement effectués, la donnée de pêche électrique du troisième passage n'a pas été considérée dans la modélisation.
<table><caption>**Tableau 23 :** Effectifs de tacons (0+) capturés par enlèvements successifs au cours du premier passage (C1) et du second passage (C2) sur le cours principal de l'Oir utilisés pour les estimations.</caption><thead><tr><th></th><th>1987</th><th>1988</th><th>1989</th><th>1990</th><th>1991</th><th>1992</th><th>1993</th><th>1994</th><th>1995</th><th>1996</th><th>1997</th><th>1998</th><th>1999</th><th>2000</th><th>2001</th><th>2002</th><th>2003</th><th>2004</th><th>2005</th><th>2006</th><th>2007</th></tr><tr><th></th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th></tr></thead><tbody><tr><td>OIR1.2</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>49</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>3</td><td>0</td><td>14</td><td>NA</td><td>37</td><td>NA</td><td>10</td><td>NA</td><td>9</td><td>NA</td><td>16</td><td>NA</td><td>1</td><td>NA</td><td>4</td><td>NA</td><td>3</td></tr><tr><td>OIR1.3</td><td>3</td><td>0</td><td>20</td><td>5</td><td>19</td><td>1</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>79</td><td>13</td><td>3</td><td>0</td><td>30</td><td>5</td><td>27</td><td>7</td><td>74</td><td>27</td><td>21</td><td>5</td><td>31</td><td>4</td><td>27</td><td>5</td><td>41</td><td>9</td><td>8</td><td>5</td><td>12</td></tr><tr><td>OIR1.4</td><td></td><td>0</td><td>NA</td><td>2</td><td>0</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>1</td><td>0</td><td>1</td><td>0</td><td>NA</td><td>1</td><td>NA</td><td>3</td><td>0</td><td>1</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>1</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>7</td><td>NA</td><td>1</td></tr><tr><td>OIR2.1</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>29</td><td>NA</td><td>62</td><td>NA</td><td></td><td>19</td><td>NA</td><td>9</td><td>NA</td><td></td><td>14</td><td>NA</td><td>22</td><td>NA</td><td>20</td><td>NA</td><td>12</td><td>NA</td><td>26</td><td>NA</td><td>12</td><td>NA</td><td>12</td></tr><tr><td>OIR2.5</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>8</td><td>NA</td><td>14</td><td>NA</td><td>0</td><td>0</td><td>5</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>8</td><td>NA</td><td>2</td><td>NA</td><td>3</td><td>NA</td><td>13</td><td>NA</td><td>3</td><td>NA</td><td>4</td><td>NA</td><td>4</td></tr><tr><td>OIR2.6</td><td>0</td><td>0</td><td>14</td><td>1</td><td>11</td><td>1</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>8</td><td>0</td><td>12</td><td>1</td><td>1</td><td>0</td><td>7</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>15</td><td>3</td><td>0</td><td>0</td><td>4</td><td>NA</td><td>12</td><td>1</td><td>6</td><td>NA</td><td>10</td><td>3</td><td>8</td></tr><tr><td>OIR2.7</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>35</td><td>NA</td><td>74</td><td>NA</td><td>2</td><td>NA</td><td></td><td>10</td><td>NA</td><td>63</td><td>NA</td><td>28</td><td>NA</td><td>50</td><td>NA</td><td>60</td><td>NA</td><td>38</td><td>NA</td><td>45</td><td>NA</td><td>30</td><td>NA</td><td>30</td></tr><tr><td>OIR2.8</td><td>5</td><td>0</td><td>56</td><td>3</td><td>53</td><td>4</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>15</td><td>2</td><td>70</td><td>17</td><td>2</td><td>0</td><td>12</td><td>1</td><td>25</td><td>4</td><td>33</td><td>12</td><td>25</td><td>14</td><td>33</td><td>11</td><td>64</td><td>12</td><td>45</td><td>12</td><td>40</td><td>7</td><td>41</td><td>NA</td><td>41</td></tr><tr><td>OIR3.2</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>27</td><td>NA</td><td>1</td><td>NA</td><td></td><td>4</td><td>0</td><td>7</td><td>0</td><td>5</td><td>4</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>2</td><td>0</td><td>2</td><td>0</td><td>4</td><td>NA</td><td>4</td><td>NA</td><td>4</td></tr><tr><td>OIR3.3'</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>13</td><td>NA</td><td>13</td><td>NA</td><td>10</td><td>NA</td><td>17</td><td>NA</td><td>11</td><td>NA</td><td>44</td><td>NA</td><td>25</td><td>NA</td><td>19</td><td>NA</td><td>28</td><td>NA</td><td>28</td></tr><tr><td>OIR3.4'</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>16</td><td>NA</td><td>51</td><td>NA</td><td>35</td><td>NA</td><td>28</td><td>NA</td><td>9</td><td>NA</td><td>67</td><td>NA</td><td>27</td><td>NA</td><td>24</td><td>NA</td><td>29</td><td>NA</td><td>29</td></tr><tr><td>OIR3.5</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>14</td><td>NA</td><td>34</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>34</td><td>NA</td><td>66</td><td>NA</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>OIR4.2</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>8</td><td>NA</td><td>6</td><td>NA</td><td>3</td><td>NA</td><td>3</td><td>0</td><td>1</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td></td><td>7</td><td>NA</td><td>7</td></tr><tr><td>OIR4.3</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>5</td><td>NA</td><td>7</td><td>NA</td><td>6</td><td>NA</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>OIR4.4</td><td>1</td><td>0</td><td>2</td><td>1</td><td>0</td><td>0</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>0</td><td>NA</td><td>1</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>OIR4.5</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>2</td><td>0</td><td>6</td><td>1</td><td>4</td><td>0</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>OIR4.6</td><td>2</td><td>1</td><td>6</td><td>1</td><td>9</td><td>2</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>2</td><td>2</td><td>21</td><td>3</td><td>21</td><td>1</td><td>3</td><td>1</td><td>11</td><td>0</td><td>2</td><td>0</td><td>16</td><td>3</td><td>30</td><td>8</td><td>42</td></tr><tr><td>OIR4.7</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>20</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>151</td><td>NA</td><td>140</td><td>NA</td><td>171</td><td>NA</td><td>55</td><td>NA</td><td>197</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>125</td><td>NA</td><td>160</td><td>NA</td><td>234</td><td>NA</td><td>234</td></tr><tr><td>OIR4.8</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>11</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>46</td><td>NA</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>OIR5.2a</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>73</td><td>NA</td><td>103</td><td>NA</td><td>77</td><td>NA</td><td>156</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>111</td><td>NA</td><td>24</td><td>NA</td><td>72</td><td>NA</td><td>72</td><td>NA</td><td>72</td></tr><tr><td>OIR5.2b</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>349</td><td>NA</td><td>485</td><td>NA</td><td>129</td><td>NA</td><td>522</td><td>NA</td><td>1</td><td>NA</td><td>246</td><td>NA</td><td>179</td><td>NA</td><td>479</td><td>NA</td><td>479</td><td>NA</td><td>479</td></tr><tr><td>OIR5.3</td><td>3</td><td>0</td><td>3</td><td>0</td><td>0</td><td>2</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>0</td><td>NA</td><td>1</td><td>0</td><td>0</td><td>NA</td><td>4</td><td>0</td><td>4</td><td>1</td><td>0</td><td>0</td><td>8</td><td>NA</td><td>19</td><td>3</td><td>11</td><td>2</td><td>0</td><td>16</td><td>2</td><td>0</td><td>6</td><td>NA</td><td>15</td><td>2</td></tr><tr><td>OIR5.4</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>4</td><td>NA</td><td>46</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>74</td><td>NA</td><td>79</td><td>NA</td><td>110</td><td>NA</td><td>25</td><td>NA</td><td>131</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>40</td><td>NA</td><td>51</td><td>NA</td><td>86</td><td>NA</td><td>86</td></tr><tr><td>OIR5.5</td><td>20</td><td>1</td><td>30</td><td>2</td><td>57</td><td>6</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>5</td><td>4</td><td>0</td><td>50</td><td>6</td><td>0</td><td>0</td><td>37</td><td>3</td><td>36</td><td>10</td><td>48</td><td>NA</td><td>2</td><td>3</td><td>62</td><td>12</td><td>0</td><td>0</td><td>22</td><td>1</td><td>11</td><td>2</td><td>47</td></tr><tr><td>OIR5.6</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>0</td><td>NA</td><td>30</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>46</td><td>NA</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>OIR5.7</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>33</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>102</td><td>NA</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>PTE03</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>PTE04</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>PTE05</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>
Rapport final

**Tableau 24 : Effectifs de tacons (0+) capturés par enlèvements successifs au cours du premier passage (C1) et du second passage (C2) sur les affluents colonisés de l'Oir utilisés pour les estimations.**

Abréviations : RR, La Roche ; mbam, Moulin du Bois amont ; mbav, Moulin du Bois aval ; plam, Pont Levesque amont

<table><thead><tr><th></th><th>1987</th><th>1988</th><th>1989</th><th>1990</th><th>1991</th><th>1992</th><th>1993</th><th>1994</th><th>1995</th><th>1996</th><th>1997</th><th>1998</th><th>1999</th><th>2000</th><th>2001</th><th>2002</th><th>2003</th><th>2004</th><th>2005</th><th>2006</th><th>2007</th></tr><tr><th></th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th><th>C1</th><th>C2</th></tr></thead><tbody><tr><td>RR01</td><td>12</td><td>2</td><td>23</td><td>7</td><td>3</td><td>NA</td><td>4</td><td>NA</td><td>7</td><td>NA</td><td>7</td><td>NA</td><td>10</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>3</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>19</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>RR02</td><td>26</td><td>8</td><td>50</td><td>11</td><td>6</td><td>NA</td><td>13</td><td>NA</td><td>36</td><td>NA</td><td>29</td><td>NA</td><td>17</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>5</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>71</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>RR03</td><td>60</td><td>NA</td><td>20</td><td>1</td><td>5</td><td>NA</td><td>3</td><td>NA</td><td>10</td><td>NA</td><td>14</td><td>NA</td><td>13</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>3</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>35</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>RR04</td><td>18</td><td>4</td><td>61</td><td>NA</td><td>7</td><td>NA</td><td>10</td><td>NA</td><td>18</td><td>NA</td><td>26</td><td>NA</td><td>18</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>5</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>74</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>RR05</td><td>57</td><td>NA</td><td>61</td><td>1</td><td>5</td><td>1</td><td>10</td><td>2</td><td>20</td><td>5</td><td>31</td><td>6</td><td>32</td><td>6</td><td>0</td><td>0</td><td>5</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>108</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>RR06</td><td>22</td><td>1</td><td>103</td><td>NA</td><td>14</td><td>NA</td><td>2</td><td>NA</td><td>28</td><td>NA</td><td>64</td><td>NA</td><td>47</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>6</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>124</td><td>25</td><td>64</td></tr><tr><td>RR07</td><td>9</td><td>NA</td><td>79</td><td>NA</td><td>14</td><td>NA</td><td>2</td><td>NA</td><td>28</td><td>NA</td><td>36</td><td>NA</td><td>64</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>1</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>112</td><td>NA</td><td>61</td></tr><tr><td>RR08</td><td>70</td><td>NA</td><td>52</td><td>NA</td><td>15</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>29</td><td>NA</td><td>32</td><td>NA</td><td>56</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>3</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>141</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>RR09</td><td>8</td><td>1</td><td>59</td><td>NA</td><td>17</td><td>NA</td><td>1</td><td>NA</td><td>43</td><td>NA</td><td>29</td><td>NA</td><td>31</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>143</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>RR10</td><td>31</td><td>NA</td><td>63</td><td>13</td><td>28</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>66</td><td>NA</td><td>37</td><td>NA</td><td>24</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>1</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>178</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>RR11</td><td>10</td><td>2</td><td>71</td><td>NA</td><td>37</td><td>5</td><td>1</td><td>0</td><td>61</td><td>9</td><td>47</td><td>6</td><td>8</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>2</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>149</td><td>31</td><td>81</td></tr><tr><td>RR12</td><td>96</td><td>NA</td><td>85</td><td>NA</td><td>27</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>55</td><td>NA</td><td>44</td><td>NA</td><td>1</td><td>NA</td><td>1</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>98</td><td>NA</td><td>22</td><td>NA</td><td>80</td></tr><tr><td>RR13</td><td>131</td><td>NA</td><td>79</td><td>NA</td><td>20</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>47</td><td>NA</td><td>27</td><td>NA</td><td>6</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>2</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>90</td><td>NA</td><td>23</td></tr><tr><td>RR14</td><td>5</td><td>NA</td><td>81</td><td>NA</td><td>12</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>45</td><td>NA</td><td>42</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>111</td><td>NA</td><td>17</td></tr><tr><td>RR15</td><td>12</td><td>NA</td><td>39</td><td>NA</td><td>2</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>69</td><td>NA</td><td>46</td><td>NA</td><td>6</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>97</td><td>NA</td><td>17</td><td>NA</td><td>82</td></tr><tr><td>RR16</td><td>2</td><td>NA</td><td>53</td><td>NA</td><td>4</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>43</td><td>NA</td><td>35</td><td>NA</td><td>2</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>53</td><td>NA</td><td>18</td></tr><tr><td>RR17</td><td></td><td>16</td><td>NA</td><td></td><td>3</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>14</td><td>NA</td><td>18</td><td>NA</td><td>2</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>6</td><td>NA</td><td>7</td></tr><tr><td>RR18</td><td></td><td>93</td><td>10</td><td></td><td>12</td><td>1</td><td>0</td><td>0</td><td>44</td><td>3</td><td>55</td><td>5</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>0</td><td>74</td><td>11</td><td>34</td><td>9</td></tr><tr><td>RR19</td><td></td><td>78</td><td>NA</td><td></td><td>7</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>30</td><td>NA</td><td>16</td><td>NA</td><td>1</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>1</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>54</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>RR20</td><td></td><td>30</td><td>NA</td><td></td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>17</td><td>NA</td><td>9</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>0</td><td>NA</td><td>21</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>mbam1</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>mbam2</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>mbav1</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>mbav2</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>plam1</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>plam2</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>plav1</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>plav2</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

Servant & Prévost

Février 2016
Les surfaces d'habitat favorable aux juvéniles sur l'Oir ont été mesurées en 1995 (Claude 1996) et sont disponibles par type d'habitat (radiers-rapides ou plats) pour chaque station échantillonnée sur le cours principal (Tableau 25). Pour les affluents, bien que la surface totale échantillonnée par station soit connue, la surface exacte en radiers-rapides et en plats n'est pas connue. Nous avons donc considéré que les proportions en habitat par station étaient égales aux proportions en radiers-rapides et en plats observés par Claude (1996) au sein de chaque affluent (Tableau 26). A savoir, le ruisseau de Pont Levesque est constitué de 51% de radiers-rapides et de 36% de plats, le ruisseau du Moulin du Bois est constitué de 72% de radiers-rapides et de 24% de plats et le ruisseau de La Roche est constitué de 80% de radiers-rapides et de 18% de plats (Claude 1996).

**Tableau 25 : Caractéristiques des stations échantillonnées par ES sur le cours principal de l'Oir utilisées pour les estimations.**

Les surfaces de radiers-rapides (Srr) et de plats (spl) de chaque station sont exprimées en m².

<table><thead><tr><td>Station</td><td>Srr</td><td>Spl</td><td>Secteur</td></tr></thead><tbody><tr><td>OIR1.2</td><td>22.72</td><td>370.64</td><td>1</td></tr><tr><td>OIR1.3</td><td>251.27</td><td>93.65</td><td>1</td></tr><tr><td>OIR1.4</td><td>0</td><td>134.4</td><td>1</td></tr><tr><td>OIR2.1</td><td>150.88</td><td>566.68</td><td>2</td></tr><tr><td>PTE03</td><td>102.88</td><td>72.59</td><td>2</td></tr><tr><td>OIR2.5</td><td>98.46</td><td>483.77</td><td>3</td></tr><tr><td>OIR2.6</td><td>111.73</td><td>145.2</td><td>3</td></tr><tr><td>OIR2.7</td><td>112.76</td><td>479.29</td><td>3</td></tr><tr><td>OIR2.8</td><td>251.35</td><td>133.5</td><td>3</td></tr><tr><td>PTE04</td><td>132.85</td><td>229.2</td><td>3</td></tr><tr><td>OIR3.2</td><td>0</td><td>327.6</td><td>4</td></tr><tr><td>OIR3.3'</td><td>264.32</td><td>1102.82</td><td>4</td></tr><tr><td>OIR3.4'</td><td>243.86</td><td>1029.41</td><td>5</td></tr><tr><td>OIR3.5</td><td>110</td><td>631.06</td><td>5</td></tr><tr><td>OIR4.2</td><td>58.5</td><td>98.28</td><td>6</td></tr><tr><td>OIR4.3</td><td>0</td><td>245.52</td><td>6</td></tr><tr><td>OIR4.4</td><td>0</td><td>62.665</td><td>6</td></tr><tr><td>OIR4.5</td><td>112</td><td>60.06</td><td>6</td></tr><tr><td>OIR4.6</td><td>97.9</td><td>110.4</td><td>6</td></tr><tr><td>OIR4.7</td><td>634.58</td><td>839.2</td><td>6</td></tr><tr><td>OIR4.8</td><td>149.75</td><td>249.49</td><td>6</td></tr><tr><td>OIR5.2a</td><td>779.5</td><td>1164.85</td><td>7</td></tr><tr><td>OIR5.2b</td><td>798.25</td><td>944.4</td><td>8</td></tr><tr><td>OIR5.3</td><td>65.1</td><td>213.5</td><td>8</td></tr><tr><td>OIR5.4</td><td>57</td><td>70.2</td><td>8</td></tr><tr><td>OIR5.5</td><td>80</td><td>176</td><td>8</td></tr><tr><td>OIR5.6</td><td>134.75</td><td>141.5</td><td>8</td></tr><tr><td>OIR5.7</td><td>342.2</td><td>297.5</td><td>8</td></tr><tr><td>PTE05</td><td>112.05</td><td>66.24</td><td>9</td></tr></tbody></table>
**Tableau 26 : Caractéristiques des stations échantillonnées par ES sur les affluents de l'Oir utilisées pour les estimations.**

Les surfaces totales, de radiers-rapides (Srr) et de plats (Spl) de chaque station sont exprimées en m². Abréviations : RR, La Roche ; mbam, Moulin du Bois amont ; mbav, Moulin du Bois aval ; plam, Pont Levesque amont ; plav, Pont Levesque aval.

<table><thead><tr><td>Station</td><td>Surface totale</td><td>Srr</td><td>Spl</td><td>Secteur</td></tr></thead><tbody><tr><td>mbam1</td><td>75</td><td>54</td><td>18</td><td>11</td></tr><tr><td>mbam2</td><td>102.2</td><td>73.584</td><td>24.528</td><td>11</td></tr><tr><td>mbav1</td><td>127.3</td><td>91.656</td><td>30.552</td><td>11</td></tr><tr><td>mbav2</td><td>55.8</td><td>40.176</td><td>13.392</td><td>11</td></tr><tr><td>plam1</td><td>81.5</td><td>41.565</td><td>29.34</td><td>12</td></tr><tr><td>plam2</td><td>219</td><td>111.69</td><td>78.84</td><td>12</td></tr><tr><td>plav1</td><td>247</td><td>125.97</td><td>88.92</td><td>12</td></tr><tr><td>plav2</td><td>199.5</td><td>101.745</td><td>71.82</td><td>12</td></tr><tr><td>RR01</td><td>104</td><td>83.2</td><td>18.72</td><td>13</td></tr><tr><td>RR02</td><td>193.7</td><td>154.96</td><td>34.866</td><td>13</td></tr><tr><td>RR03</td><td>83.2</td><td>66.56</td><td>14.976</td><td>13</td></tr><tr><td>RR04</td><td>198.3</td><td>158.64</td><td>35.694</td><td>13</td></tr><tr><td>RR05</td><td>179</td><td>143.2</td><td>32.22</td><td>13</td></tr><tr><td>RR06</td><td>243.2</td><td>194.56</td><td>43.776</td><td>13</td></tr><tr><td>RR07</td><td>241.4</td><td>193.12</td><td>43.452</td><td>13</td></tr><tr><td>RR08</td><td>196.2</td><td>156.96</td><td>35.316</td><td>13</td></tr><tr><td>RR09</td><td>269</td><td>215.2</td><td>48.42</td><td>13</td></tr><tr><td>RR10</td><td>245.6</td><td>196.48</td><td>44.208</td><td>13</td></tr><tr><td>RR11</td><td>175.2</td><td>140.16</td><td>31.536</td><td>13</td></tr><tr><td>RR12</td><td>237.9</td><td>190.32</td><td>42.822</td><td>13</td></tr><tr><td>RR13</td><td>160.6</td><td>128.48</td><td>28.908</td><td>13</td></tr><tr><td>RR14</td><td>218.6</td><td>174.88</td><td>39.348</td><td>13</td></tr><tr><td>RR15</td><td>166.9</td><td>133.52</td><td>30.042</td><td>13</td></tr><tr><td>RR16</td><td>172.7</td><td>138.16</td><td>31.086</td><td>13</td></tr><tr><td>RR17</td><td>070.4</td><td>56.32</td><td>12.672</td><td>13</td></tr><tr><td>RR18/PTE07</td><td>172.3</td><td>137.84</td><td>31.014</td><td>13</td></tr><tr><td>RR19</td><td>149.4</td><td>119.52</td><td>26.892</td><td>13</td></tr><tr><td>RR20</td><td>85.2</td><td>68.16</td><td>15.336</td><td>13</td></tr></tbody></table>

Il n'a pas été possible d'estimer une probabilité de capture par station, ni même de considérer que la probabilité de capture au deuxième passage était diminuée d'une quantité $\varepsilon_p$. En effet, malgré l'utilisation de priors informatifs pour la moyenne et l'écart-type de la probabilité de capture ($logit^{-1}(\mu_p) \sim Beta(2,1)$, $\sigma_p \sim Cauchy^+(0,1) \times 0.25$), des problèmes d'estimation des paramètres étaient observés. De même, l'effet du débit lors des échantillonnages par ES sur le cours principal a été inclus comme covariable pour expliquer une partie des variations de la probabilité de capture moyenne annuelle sans que cela résolve ces problèmes d'estimation. Cette covariable n'a donc pas été considérée par la suite. Ces problèmes sont liés au fait que les données de pêche par ES à l'échelle locale de la station sont souvent peu informatives. En effet, d'une part, de nombreuses stations ont été échantillonnées en un seul passage au lieu de deux (voir Tableau 23 et Tableau 24 ; 972 données correspondant à un premier passage et 308 données correspondant à un deuxième passage) et d'autre
part, le nombre de poissons capturés est souvent faible. Ainsi, sur 308 données de pêche avec deux passages, 18.5% ont une première pêche avec un effectif de zéro poisson capturé, 4.8% ont une première pêche avec un effectif de un seul poisson capturé, 5.2% ont un effectif de deux poissons capturés et 19.2% ont un effectif entre trois et dix poissons capturés.

Afin d'améliorer l'estimation de la probabilité de capture, nous avons donc effectué des regroupements de stations selon des secteurs sur l'Oir ou ses affluents qui ont été définis en tenant compte de la disposition des IA de type CPUE effectués à l'heure actuelle (voir la partie concernant le suivi par IA de type CPUE pour plus de détails). Ce regroupement a priori a été décidé en concertation avec Frédéric Marchand (INRA U3E, Rennes). Ainsi, sur le cours principal, 10 secteurs ont été considérés (Tableau 25 avec, en plus, le secteur 10 constitué uniquement de la station suivie par IA de type CPUE appelée IAS10) tandis que chaque affluent constitue un secteur supplémentaire (Tableau 26).

La densité locale annuelle en échelle log est constituée d'une densité moyenne ($\mu_{d_r}$) selon sa localisation $r$ (cours principal ou un des 3 affluents), d'un effet aléatoire annuel ($\log(Y)_t$), d'un effet d'interaction entre le secteur $g$ et l'année $t$ ($\log(G)_{gt}$) et d'une erreur résiduelle de variance ($\sigma_d^2$).

$$ \log(d)_{i,t} = \mu_{d_r} + \log(Y)_t + \log(G)_{gt} + \varepsilon_d \text{ où } \log(Y)_t < 2.3 \text{ et } \log(Y)_t \sim \text{Normal}(0, \sigma_{dt}^2), \\ \log(G)_{gt} \sim \text{Normal}(0, \sigma_{dgt}^2) \text{ et } \varepsilon_d \sim \text{Normal}(0, \sigma_d^2) $$

$$ \text{avec } \mu_{d_r} \sim \text{Uniform}(-10,10), \sigma_{dt} \sim \text{Uniform}(0,10), \sigma_{dgt} \sim \text{Uniform}(0,10) \text{ et } \\ \sigma_d \sim \text{Uniform}(0,10) $$

## Calibration des IA de type CPUE avec les estimations des densités de population par ES

Six stations échantillonnées par IA de type CPUE ont également été échantillonnées par ES pendant plusieurs années entre 1994 et 2008 (Tableau 27). Ce suivi nous permet de construire une relation de proportionnalité entre IA et les densités estimées par ES, selon la largeur de la station, spécifique au site de l'Oir. Toutefois, à la différence des données de Prévost & Nihouarn (1999), une station échantillonnée par IA n'est pas forcément constituée d'une unique station échantillonnée par ES (Tableau 28).

<table><caption>**Tableau 27 :** Effectifs de tacons (0+) capturés par pêche électrique par CPUE (IA) utilisés dans la modélisation pour construire la relation de proportionnalité en fonction de la largeur de la station sur l'Oir.</caption><thead><tr><th>Station</th><th>1994</th><th>1995</th><th>1996</th><th>1997</th><th>1999</th><th>2000</th><th>2001</th><th>2002</th><th>2003</th><th>2004</th><th>2005</th><th>2006</th><th>2007</th><th>2008</th></tr></thead><tbody><tr><td>IAS02</td><td>4</td><td></td><td>18</td><td>51</td><td>12</td><td>17</td><td>57</td><td>14</td><td>20</td><td>21</td><td>19</td><td>26</td><td>8</td><td>22</td></tr><tr><td>IAS04</td><td>3</td><td>18</td><td>17</td><td>47</td><td>16</td><td>20</td><td>24</td><td>22</td><td>47</td><td>40</td><td>22</td><td>52</td><td>43</td><td>43</td></tr><tr><td>IAS05</td><td>8</td><td>38</td><td>3</td><td>0</td><td>37</td><td>34</td><td>37</td><td>13</td><td>25</td><td>2</td><td>36</td><td>63</td><td>54</td><td>38</td></tr><tr><td>IAS08</td><td>2</td><td></td><td>4</td><td>23</td><td>60</td><td></td><td>72</td><td>30</td><td>85</td><td>0</td><td>47</td><td>59</td><td>88</td><td>74</td></tr><tr><td>IAS11</td><td>3</td><td></td><td></td><td></td><td>29</td><td></td><td>11</td><td>0</td><td>15</td><td>0</td><td>34</td><td>22</td><td>18</td><td>12</td></tr><tr><td>IAS12</td><td>42</td><td>1</td><td>0</td><td></td><td>66</td><td></td><td>38</td><td>0</td><td>47</td><td>0</td><td>25</td><td>7</td><td>36</td><td>18</td></tr></tbody></table>
**Tableau 28 :** Caractéristiques des stations échantillonnées par IA de type CPUE utilisées dans la modélisation pour construire la relation de proportionnalité en fonction de la largeur de la station sur l'Oir.

La largeur moyenne est calculée selon la largeur de chaque station ES constituant une station IA (en m). Les surfaces d'habitat de radiers-rapides (Srr) sont exprimées en m².

<table><thead><tr><th>Station</th><th>Localisation</th><th>Largeur moyenne</th><th>Stations échantillonnées par ES constituant une station IA</th><th>Srr</th><th>Secteur</th></tr></thead><tbody><tr><td>IAS02</td><td>Oir</td><td>5.45</td><td>OIR1.2 + OIR1.3</td><td>319.43</td><td>1</td></tr><tr><td>IAS04</td><td>Oir</td><td>4.6625</td><td>OIR2.8</td><td>310.39</td><td>3</td></tr><tr><td>IAS05</td><td>Oir</td><td>4.303125</td><td>OIR4.5 + OIR4.6 + (42% rr) OIR4.7</td><td>467.18</td><td>6</td></tr><tr><td>IAS08</td><td>Oir</td><td>3.416666667</td><td>OIR5.2b (3% rr) + OIR5.3 + OIR5.4 + OIR5.5 + OIR5.6</td><td>355.45</td><td>8</td></tr><tr><td>IAS11</td><td>P. Levesque</td><td>2.03181445</td><td>plav1 + plav2</td><td>140.16</td><td>12</td></tr><tr><td>IAS12</td><td>La Roche</td><td>1.384980237</td><td>RR11</td><td>227.715</td><td>13</td></tr></tbody></table>

Sur chaque station IA, la pêche s'effectue uniquement dans les habitats radier-rapide. La densité locale au niveau de chaque station IA est donc calculée en pondérant les densités locales, qui sont estimées au niveau des stations échantillonnées par ES et exprimées par unité de surface en équivalent radier-rapide, par leurs surfaces d'habitat radiers-rapides. Par exemple :

$$d_{IAS05,t} = \frac{(d_{OIR4.5,t} \times Srr_{OIR4.5}) + (d_{OIR4.6,t} \times Srr_{OIR4.6}) + (d_{OIR4.7,t} \times Srr_{OIR4.7} \times 0.42)}{(Srr_{OIR4.5} + Srr_{OIR4.6} + (0.42 \times Srr_{OIR4.7}))}$$

### Estimation de l'abondance et de la densité locale par indice d'abondance

Cinq stations supplémentaires échantillonnant uniquement par IA de type CPUE ont été mises en place sur le cours principal (Tableau 29) et assurent depuis 2009 avec les 6 stations précédentes un suivi régulier (Tableau 30). Ainsi, depuis 2009, les stations échantillonnées auparavant par ES sur le cours principal ne le sont plus mais 3 nouvelles stations (PTE03, PTE04 et PTE05) échantillonnant par ES ont été mises en place (Tableau 23). En ce qui concerne les affluents, le ruisseau du Moulin du Bois n'est désormais plus du tout suivi tandis que le ruisseau de Pont Levesque est suivi par une station IA (Tableau 28). En revanche, le Ruisseau de la Roche est suivi à la fois par ES (20 stations ; Tableau 24) et par une station IA (Tableau 28).

**Tableau 29 :** Caractéristiques des stations échantillonnées uniquement par IA de type CPUE sur l'Oir utilisées pour les estimations.

Les surfaces de radiers-rapides (Srr) sont exprimées en m².

<table><thead><tr><th>Station</th><th>Localisation</th><th>Largeur moyenne (m)</th><th>Srr (m²)</th><th>Secteur</th></tr></thead><tbody><tr><td>IAS03</td><td>Oir</td><td>4.684375</td><td>694.39</td><td>2</td></tr><tr><td>IAS06</td><td>Oir</td><td>3.55</td><td>356.3</td><td>6</td></tr><tr><td>IAS07</td><td>Oir</td><td>3.585714286</td><td>405.6</td><td>7</td></tr><tr><td>IAS09</td><td>Oir</td><td>2.623076923</td><td>335.64</td><td>9</td></tr><tr><td>IAS10</td><td>Oir</td><td>1.98</td><td>400</td><td>10</td></tr></tbody></table>
**Tableau 30 : Effectifs de tacons (0+) capturés sur les stations échantillonnées uniquement par pêche électrique par CPUE (IA) sur l'Oir et ses affluents utilisés pour les estimations.**

Les stations en gras sont les stations avec lesquelles la relation de proportionnalité a été établie (Tableau 28). Les données pour les années servant à construire cette relation ont été présentées dans le Tableau 27 (T.27).

<table><thead><tr><th>Station</th><th>1994</th><th>1999</th><th>2007</th><th>2008</th><th>2009</th><th>2010</th><th>2011</th><th>2012</th><th>2013</th><th>2014</th></tr></thead><tbody><tr><td>IAS03</td><td>6</td><td>23</td><td></td><td></td><td>42</td><td>32</td><td>32</td><td>27</td><td>16</td><td>31</td></tr><tr><td>IAS06</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>43</td><td>59</td><td>89</td><td>69</td><td>81</td><td>73</td></tr><tr><td>IAS07</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>36</td><td>48</td><td>49</td><td>46</td><td>57</td><td>100</td></tr><tr><td>IAS09</td><td></td><td></td><td>42</td><td>56</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>IAS10</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>22</td><td>22</td><td>30</td><td>45</td><td>34</td><td>23</td></tr><tr><td>IAS02</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>50</td><td>26</td><td>26</td><td>13</td><td>23</td><td>24</td></tr><tr><td>IAS04</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>50</td><td>52</td><td>47</td><td>25</td><td>45</td><td>37</td></tr><tr><td>IAS05</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>53</td><td>67</td><td>82</td><td>34</td><td>87</td><td>61</td></tr><tr><td>IAS08</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>54</td><td>75</td><td>63</td><td>75</td><td>84</td><td>66</td></tr><tr><td>IAS11</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>2</td><td>27</td><td>39</td><td>25</td><td>21</td><td>38</td></tr><tr><td>IAS12</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>T.27</td><td>3</td><td>24</td><td>20</td><td>32</td><td>20</td><td>35</td></tr></tbody></table>

### Extrapolation de l'abondance et de la densité pour la totalité de l'Oir

L'abondance annuelle par secteur $g$ ($N_{g,t}$) est obtenue à partir de la densité moyenne ($\mu_{d_r}$) selon la localisation $r$ (cours principal ou un des 3 affluents), de l'effet aléatoire annuel ($Y_t$) et de l'effet d'interaction entre le secteur et l'année $t$ ($G_{g \times t}$), qui ont été présentés auparavant (voir p. 98), multipliée par la surface de radiers-rapides (Srr) et de plats (spl) de chaque secteur (Tableau 31).

$$N_{g,t} \sim \text{Poisson}(\lambda_{g,t}) \text{ avec } \lambda_{g,t} = e^{(\mu_{d_r}+Y_t+G_{g \times t})} \times (S_{rr,g} + \alpha_{Pl} \times S_{pl,g})$$

L'abondance annuelle totale est donc obtenue en sommant l'abondance annuelle de tous les secteurs. Il est également possible d'obtenir l'abondance annuelle uniquement pour le cours principal (somme de l'abondance des dix premiers secteurs) ou pour un affluent en particulier.

## 4.2. Résultats

### Processus d'observation lors des ES et facteur de conversion en radier-rapide

La probabilité de capture moyenne par enlèvements successifs, quels que soient le secteur ou l'année, est estimée à 0.81 (BCI95% [0.79 ; 0.83]). Le modèle permet également d'estimer les probabilités de capture annuelles par secteur mais nous ne présenterons pas ces résultats ici.

Le facteur de conversion d'une surface de plats en équivalent radier-rapide est estimé à 0.13 (BCI95% : [0.09 ; 0.18]) et est plus faible que celui estimé par Prévost & Porcher (1996). Les habitats de type « plats courants ou plats lents » sont donc un peu moins favorables aux juvéniles de saumon.
<table><caption>**Tableau 31 : Caractéristiques des secteurs utilisés dans la modélisation sur l'Oir et ses affluents.**
Les surfaces de radiers-rapides (Srr) et de plats (spl) de chaque secteur sont exprimées en m².</caption><thead><tr><th>Secteur</th><th>Localisation</th><th>Spl</th><th>Srr</th></tr></thead><tbody><tr><td>1</td><td>Oir</td><td>3267.065</td><td>465.871</td></tr><tr><td>2</td><td>Oir</td><td>3560.085</td><td>1429.688</td></tr><tr><td>3</td><td>Oir</td><td>3549.7</td><td>1133.17</td></tr><tr><td>4</td><td>Oir</td><td>2848.51</td><td>393.23</td></tr><tr><td>5</td><td>Oir</td><td>2986.85</td><td>456.99</td></tr><tr><td>6</td><td>Oir</td><td>1841.615</td><td>1052.73</td></tr><tr><td>7</td><td>Oir</td><td>1967.25</td><td>1355.6</td></tr><tr><td>8</td><td>Oir</td><td>3583.77</td><td>2629.735</td></tr><tr><td>9</td><td>Oir</td><td>1516.99</td><td>2300.59</td></tr><tr><td>10</td><td>Oir</td><td>1359.3</td><td>2585.05</td></tr><tr><td>11</td><td>Moulin du Bois</td><td>710.75</td><td>2066.25</td></tr><tr><td>12</td><td>Pont Levesque</td><td>1752.75</td><td>2452.75</td></tr><tr><td>13</td><td>La Roche</td><td>551</td><td>2495</td></tr></tbody></table>

### Calibration des IA de type CPUE avec les estimations des densités de population par ES

La relation de proportionnalité estimée selon la largeur de la rivière est la suivante :

$$ \log(k_{cpue}) = \alpha0 + \alpha1 \times \log(W) $$

$$ \text{avec } \alpha0 = -0.797 (\text{BCI95\%} [-1.024; -0.579]) \text{ et } \alpha1 = 0.817 (\text{BCI95\%} [0.65; 0.986]) $$

Ainsi, la densité locale augmente avec la largeur de la rivière. La représentation graphique de cette relation permet de prédire quelle densité peut être attendue selon l'IA observé à une station d'échantillonnage et la largeur de la rivière au niveau de celle-ci (Figure 30) ou de prédire l'IA à une station selon la densité estimée à cette station et sa largeur (Annexe 21).

### Estimation des abondances et des densités locales

La modélisation nous permet d'obtenir les estimations annuelles de densités locales. Nous ne présentons pas ici toutes ces estimations locales mais présentons, à titre d'exemple, une station qui a échantillonnée depuis le début du suivi de la population en 1987. Celle-ci a d'abord été échantillonnée par ES (OIR2.8) puis par IA de type CPUE à partir de 2009 (IAS04 ; Figure 31).

D'une manière générale, les estimations liées à un échantillonnage par IA sont moins précises que celles obtenues par un échantillonnage par ES.
Rapport final

**Figure 30** : Représentation graphique de la relation de proportionnalité entre la densité (poissons/m²) et les valeurs de l'échantillonnage, établie pour le site de l'Oir.

Les lignes de contour représentent la valeur médiane de la densité qui est estimée à partir de la relation de proportionnalité entre la densité et l'échantillonnage. Les lignes sont pas représentées.

<figure><img src="image_39.png" /></figure>
**Figure 31 :** Box plots des densités annuelles (en m² équivalent radier-rapide) de tacons (0+) sur une station échantillonnée par ES puis par IA sur l'Oir.

Les box plots représentent ici l'intervalle de crédibilité à 95% et la médiane. La ligne continue représente la moyenne sur la série temporelle.

La station (OIR2.8) est suivie par ES jusqu'en 2008 puis devient une station IA à partir de 2009 (IAS04).

<figure><img src="image_40.png" /></figure>

## Reconstitution de la série chronologique d'abondance

Du fait que tous les secteurs n'ont pas été suivis régulièrement tous les ans et que des secteurs ne sont plus du tout suivis (secteur de Moulin du Bois, secteur 4 et 5), l'extrapolation de l'abondance de ces secteurs pour ces années-là est donc plus imprécises puisqu'elles reposent uniquement sur de la prédiction (Figure 32 pour un exemple).
**Figure 32 :** Box plots des estimations annuelles des effectifs de tacons (0+) sur le secteur 7 sur l'Oir depuis 1987.

Les box plots représentent ici l'intervalle de crédibilité à 95% et la médiane. La ligne continue représente la moyenne sur la série temporelle. Les années marquées d'une étoile sont les années pour lesquelles aucun échantillonnage n'a été effectué.

Le secteur 7 est constitué d'une station ayant échantillonnée par ES jusqu'en 2008 (OIR5.2a) et d'une station échantillonnant par IA depuis 2009 (IAS07).

<figure><img src="image_41.png" /></figure>

Toutefois, ces imprécisions locales n'empêchent pas d'avoir une vision globale de la production en tacons. Ainsi, la reconstitution de la série chronologique pour l'Oir dans sa totalité montre une augmentation de la population en tacons ces dernières années (Figure 33). L'année 2014 est celle caractérisée par le plus fort effectif (médiane : 11240, BCI95% [7586 ; 17731] ; Annexe 22). L'année 1998 est, en revanche, une année exceptionnellement basse (médiane : 53, BCI95% [19 ; 149]). Ceci est encore plus évident lors de la comparaison des estimations des effets annuels (Figure 34). L'effet annuel en échelle log est estimé aux alentours de -4, ce qui signifie que les effectifs ont été environ 100 fois inférieurs à la normale.

Une amélioration possible du modèle serait d'exclure cette année exceptionnellement basse de la hiérarchie afin de réduire les incertitudes dans les prédictions notamment pour les valeurs supérieures. En effet, du fait qu'un effectif, 100 fois inférieur à la normale ($e^{-4}$), a été observé lors de la série chronologique, la structure lognormale du modèle fait qu'il est possible d'envisager qu'il pourrait se produire des années exceptionnellement bonnes où les effectifs pourraient être plus de 50 fois supérieurs à la normale ($e^4$). Considérant que ceci est toutefois très peu probable dans le cas de populations de Salmonidés, le modèle a, pour le moment, été contraint pour que l'effet annuel ne puisse pas être 10 fois supérieur à la moyenne ($e^{2.3}$, voir aussi p. 98).
**Figure 33 :** Box plots des estimations annuelles des effectifs de tacons (0+) sur l'Oir (cours principal et affluents) depuis 1987.

Les box plots représentent ici l'intervalle de crédibilité à 95% et la médiane. La ligne continue représente la moyenne sur la série temporelle. Aucun échantillonnage n'a été effectué en 1990.

<figure><img src="image_42.png" /></figure>

**Figure 34 :** Box plots des estimations des effets annuels lors de l'estimation de la densité locale sur l'Oir (cours principal et affluents) depuis 1987.

Aucun échantillonnage n'a été effectué en 1990 (année marquée d'une étoile).

<figure><img src="image_43.png" /></figure>
<figure><img src="image_44.png" /></figure>
Conclusions, Perspectives

Les modèles exposés ici présentent des séries chronologiques homogènes et ce, pour chaque stade de vie et pour chaque cours d'eau. Ces modèles sont construits sur des principes communs d'analyse et sont cohérents entre eux. De même, les estimations sont obtenues par une approche d'inférence bayésienne commune et au moyen d'un seul et même outil de calcul numérique (OpenBUGS). Il faut également souligner que le maximum de données disponibles a été mobilisé dans ce travail et certaines n'avaient encore jamais été traitées à ce jour comme par exemple, les données d'indice d'abondance des affluents du Scorff ou encore les données d'enlèvements successifs sur de nombreuses stations de l'Oir ainsi que les données d'indice d'abondance. Ces modèles permettront également d'obtenir facilement une mise à jour annuelle, un apport essentiel dans le cadre de la communication des données à l'international auprès du groupe de travail sur le saumon Atlantique Nord du Conseil International pour l'Exploration de la Mer. Cette mise à jour annuelle pourrait encore être facilitée et automatisée en créant par exemple une interface sous le logiciel R connectant la base de données de l'ORE DiaPFC avec les différents modèles.

L'utilisation de modèles Bayésiens Hiérarchiques a permis une nette amélioration des estimations aussi bien des processus d'observation (probabilités de capture) en incluant notamment des covariables temporelles, que des variables d'intérêt comme les abondances annuelles selon les stades de vie. Pour continuer à améliorer l'estimation des effectifs et pour essayer de mieux comprendre et appréhender les variations annuelles, il serait possible d'intégrer des covariables temporelles dans le processus dynamique. Ainsi, par exemple les variations des températures d'eau de surface pourraient expliquer celles de la survie en mer des adultes ou les variations de débit dans la rivière celles de la survie embryo-larvaire (Crozier & Hutchings 2014). Il serait également possible d'ajuster les fenêtres temporelles considérées pour calculer les débits moyens annuels utilisés pour estimer les probabilités de capture au lieu de considérer la même fenêtre temporelle quelle que soit l'année (cas des adultes et des smolts dévalants). En effet, bien que les fenêtres temporelles actuelles aient été choisies pour être suffisamment larges pour pouvoir intégrer des variations annuelles, celles-ci peuvent probablement encore être mieux ajustées. Ces estimations constituent la première étape pour construire un modèle de dynamique de population liant les différents modèles d'estimations des effectifs des stades de vie comme l'analyse stock-recrutement ; ces modèles étant eux-mêmes des outils pour refonder le système de régulation de l'exploitation du saumon en France.
<figure><img src="image_45.png" /></figure>
Bibliographie

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Beaugrand C & Reid PC. 2012. Relationships between North Atlantic salmon, plankton, and hydroclimatic change in the Northeast Atlantic. ICES Journal of Marine Science 69: 1549-1562.

Bohlin T, Hamrin S, Heggberget TG, Rasmussen G & Saltveit SV. 1989. Electrofishing - Theory and practice with special emphasis on salmonids. Hydrobiologia 173: 9-43.

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# Annexes

## Annexe 1 : Calcul des débits manquants pour le site de l'Oir.

1/ Calcul des débits manquants pour la période du 15 octobre au 31 décembre, période considérée pour la modélisation des effectifs d'adultes anadromes.

Pour l'année 2010, nous avons considéré les données issues de stations hydrométriques proches de celle de Ducey afin de déterminer la corrélation entre les débits mesurés sur la période considérée et pour les années communes (de 2004 à 2012, sans l'année 2010). Quatre stations étaient disponibles : la station mesurant la Sée à Chérencé-le-Roussel, la station mesurant la Sée à Tirepied, la station mesurant le Beuvron à Saint-Senier et la station mesurant le Beuvron à Saint-James. La meilleure corrélation est détectée entre le débit mesuré à Chérencé-le-Roussel (r = 0.9265). Le débit de 2010 (en l/s) est donc obtenu en appliquant la relation linéaire suivante :

$$ \ln(\text{Débit}_{\text{Ducey}}) = 0.8788 \times \ln(\text{Débit}_{\text{Chérencé}}) + 0.4537 $$

Pour les années 1984 et 1985, aucun débit n'était relevé sur les stations précédemment citées car elles n'ont été mises en place que plusieurs années après. Nous avons donc utilisé les données de pluviométrie relevées à Ducey et regardé la corrélation entre celles-ci et les débits relevés à Ducey sur la période considérée. Bien que cette corrélation ne soit pas excellente (r = 0.6688), nous avons néanmoins déterminé une relation linéaire entre le débit et la pluviométrie en estimant que cette corrélation était suffisante pour notre utilisation. En effet, seules deux années sont concernées par un débit manquant sur la série temporelle longue de 30 ans et une relation simple de type linéaire semble donc être un bon compromis par rapport à l'utilisation de modèles plus sophistiqués de type hydrologique (rainfall-flow model) pour reconstituer les débits manquants. Les débits en 1984 et 1985 (en l/s) sont donc obtenus en utilisant la relation linéaire suivante :

$$ \ln(\text{Débit}_{\text{Ducey}}) = 1.5707 \times \ln(\text{Pluvio}) - 1.9126 $$

2/ Calcul du débit manquant pour la période du 1er avril au 30 avril, période considérée pour la modélisation des effectifs de smolts dévalant.

Il n'existe pas de données de débit pour le mois d'avril 1986. Aucune station proche n'est encore installée et la corrélation avec la pluviométrie pour la période considérée est très faible (r < 0.3). Nous avons donc sélectionné 3 années pour lesquelles le débit observé sur la période du 16 au 31 mai (période où les mesures de débit ont repris en 1986) était similaire à celui observé en 1986 (moyenne de 852.125 l/s et débit observé le 16 mai de 963 l/s) : l'année 1998 qui a un débit moyen de 827.625 l/s et un débit de 889 l/s le 16 mai, l'année 2002 qui a un débit moyen de 858.8125 l/s et un débit de 803 l/s le 16 mai et l'année 2014 qui a un débit moyen de 887.5 l/s et un débit de 977 l/s le 16 mai.
Toutefois, l'année 2002 est caractérisée par un épisode de crue pendant cette période et elle n'est donc pas considérée ultérieurement dans l'analyse.

A partir des données de débits relevés entre le 16 et le 31 mai, nous avons caractérisé la pente correspondant à la diminution du débit en fonction d'un pas de temps journalier pour les 3 années considérées :

$$1986 : -10.988 \times (\textit{Date}) + 1110.3 \text{ avec } r^2 = 0.7949$$

$$1998 : -6.7618 \times (\textit{Date}) + 986.53 \text{ avec } r^2 = 0.6478$$

$$2014 : -9.1794 \times (\textit{Date}) + 1103.2 \text{ avec } r^2 = 0.5616$$

Nous avons ensuite calculé la pente moyenne de ces 3 équations (-8.9764) et utiliser celle-ci pour rétrocalculer les débits du mois d'avril 1986 en prenant comme date de départ le 16 mai, date à laquelle le débit est à nouveau mesuré sur la station hydrométrique de Ducey (963 l/s).

La moyenne du débit du mois d'avril complet est ensuite calculée une fois les débits journaliers du mois d'avril rétrocalculés : 1236,78 l/s
**Annexe 2 : Box plots des résidus temporels standardisés des probabilités de capture à Eu pour les castillons (1HM) et les saumons de plusieurs hivers de mer (PHM).**

Les données aberrantes peuvent être mises en évidence lorsque les résidus standardisés ne sont pas compris entre -2 et 2. Dans le cas des 1HM, il y a potentiellement deux années qui ne sont pas vraiment expliquées par les débits observés : 1995 et 2011.

1HM

<figure><img src="image_46.png" /></figure>

PHM

<figure><img src="image_47.png" /></figure>
<figure><img src="image_48.png" /></figure>
**Annexe 3 :** Effectifs annuels estimés pour les adultes anadromes entrant dans la Bresle selon la classe d'âge de mer (1HM : castillons, PHM : plusieurs hivers de mer) depuis 1984.

<table><thead><tr><th rowspan="2"></th><th colspan="4">1HM</th><th colspan="4">PHM</th></tr><tr><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th></tr></thead><tbody><tr><td>1984</td><td>48</td><td>62</td><td>64.34</td><td>96</td><td>32</td><td>46</td><td>47.36</td><td>74</td></tr><tr><td>1985</td><td>88</td><td>102</td><td>103.7</td><td>130</td><td>22</td><td>38</td><td>40.12</td><td>67</td></tr><tr><td>1986</td><td>141</td><td>172</td><td>175.6</td><td>231</td><td>25</td><td>40</td><td>41.14</td><td>67</td></tr><tr><td>1987</td><td>110</td><td>134</td><td>137.9</td><td>189</td><td>30</td><td>43</td><td>45.46</td><td>74</td></tr><tr><td>1988</td><td>65</td><td>101</td><td>106.9</td><td>184</td><td>18</td><td>37</td><td>39.78</td><td>76</td></tr><tr><td>1989</td><td>131</td><td>180</td><td>188.2</td><td>294</td><td>27</td><td>50</td><td>52.27</td><td>93</td></tr><tr><td>1990</td><td>54</td><td>68</td><td>71.52</td><td>110</td><td>37</td><td>55</td><td>57.01</td><td>89</td></tr><tr><td>1991</td><td>132</td><td>159</td><td>162.5</td><td>215</td><td>21</td><td>31</td><td>31.96</td><td>51</td></tr><tr><td>1992</td><td>124</td><td>135</td><td>137.7</td><td>167</td><td>36</td><td>45</td><td>46.95</td><td>67</td></tr><tr><td>1993</td><td>34</td><td>46</td><td>51.28</td><td>100</td><td>18</td><td>27</td><td>29.32</td><td>52</td></tr><tr><td>1994</td><td>31</td><td>47</td><td>51.21</td><td>94</td><td>9</td><td>20</td><td>21.23</td><td>44</td></tr><tr><td>1995</td><td>65</td><td>107</td><td>112.5</td><td>190</td><td>2</td><td>8</td><td>9.453</td><td>25</td></tr><tr><td>1996</td><td>23</td><td>32</td><td>34.77</td><td>63</td><td>19</td><td>26</td><td>27.56</td><td>44</td></tr><tr><td>1997</td><td>24</td><td>30</td><td>32</td><td>53</td><td>10</td><td>14</td><td>15.03</td><td>25</td></tr><tr><td>1998</td><td>192</td><td>220</td><td>225.1</td><td>284</td><td>11</td><td>14</td><td>14.89</td><td>23</td></tr><tr><td>1999</td><td>15</td><td>28</td><td>31.57</td><td>71</td><td>30</td><td>53</td><td>56.71</td><td>107</td></tr><tr><td>2000</td><td>13</td><td>55</td><td>65.47</td><td>179</td><td>5</td><td>14</td><td>16.54</td><td>44</td></tr><tr><td>2001</td><td>30</td><td>85</td><td>93.49</td><td>210</td><td>3</td><td>18</td><td>22.86</td><td>72</td></tr><tr><td>2002</td><td>85</td><td>108</td><td>111.1</td><td>152</td><td>21</td><td>34</td><td>36.51</td><td>64</td></tr><tr><td>2003</td><td>15</td><td>27</td><td>30.47</td><td>66</td><td>13</td><td>25</td><td>26.24</td><td>48</td></tr><tr><td>2004</td><td>62</td><td>81</td><td>83.37</td><td>119</td><td>10</td><td>15</td><td>15.94</td><td>27</td></tr><tr><td>2005</td><td>224</td><td>257</td><td>259.3</td><td>308</td><td>38</td><td>50</td><td>51.73</td><td>75</td></tr><tr><td>2006</td><td>88</td><td>106</td><td>108.3</td><td>141</td><td>91</td><td>119</td><td>122.7</td><td>174</td></tr><tr><td>2007</td><td>47</td><td>70</td><td>75.1</td><td>130</td><td>14</td><td>22</td><td>23.55</td><td>40</td></tr><tr><td>2008</td><td>99</td><td>132</td><td>137</td><td>202</td><td>5</td><td>12</td><td>13.99</td><td>33</td></tr><tr><td>2009</td><td>74</td><td>87</td><td>88.53</td><td>114</td><td>38</td><td>56</td><td>57.79</td><td>87</td></tr><tr><td>2010</td><td>116</td><td>137</td><td>139.3</td><td>179</td><td>34</td><td>48</td><td>49.51</td><td>76</td></tr><tr><td>2011</td><td>125</td><td>137</td><td>138.8</td><td>166</td><td>26</td><td>37</td><td>38.43</td><td>60</td></tr><tr><td>2012</td><td>107</td><td>131</td><td>134.9</td><td>185</td><td>27</td><td>40</td><td>41.29</td><td>66</td></tr><tr><td>2013</td><td>106</td><td>132</td><td>136.4</td><td>193</td><td>56</td><td>80</td><td>83.37</td><td>130</td></tr></tbody></table>
<figure><img src="image_49.png" /></figure>
<table><caption>**Annexe 4 :** Effectifs annuels estimés pour les adultes anadromes entrant dans la Nivelle selon la classe d'âge de mer (1HM : castillons, PHM : plusieurs hivers de mer) depuis 1984.</caption><thead><tr><th rowspan="2"></th><th colspan="4">1HM</th><th colspan="4">PHM</th></tr><tr><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th></tr></thead><tbody><tr><td>1984</td><td>154</td><td>176</td><td>177.2</td><td>210</td><td>20</td><td>26</td><td>26.08</td><td>35</td></tr><tr><td>1985</td><td>73</td><td>87</td><td>87.89</td><td>110</td><td>43</td><td>52</td><td>52.35</td><td>66</td></tr><tr><td>1986</td><td>287</td><td>328</td><td>330.9</td><td>390</td><td>37</td><td>46</td><td>46.13</td><td>59</td></tr><tr><td>1987</td><td>170</td><td>191</td><td>192.5</td><td>224</td><td>43</td><td>51</td><td>51.17</td><td>63</td></tr><tr><td>1988</td><td>101</td><td>119</td><td>120.9</td><td>150</td><td>28</td><td>35</td><td>35.61</td><td>46</td></tr><tr><td>1989</td><td>212</td><td>247</td><td>250.5</td><td>309</td><td>53</td><td>67</td><td>67.63</td><td>88</td></tr><tr><td>1990</td><td>238</td><td>274</td><td>276.2</td><td>327</td><td>35</td><td>43</td><td>44.01</td><td>56</td></tr><tr><td>1991</td><td>143</td><td>165</td><td>166.9</td><td>200</td><td>48</td><td>60</td><td>61.26</td><td>81</td></tr><tr><td>1992</td><td>192</td><td>209</td><td>210.1</td><td>238</td><td>48</td><td>56</td><td>56.61</td><td>69</td></tr><tr><td>1993</td><td>439</td><td>468</td><td>469.4</td><td>507</td><td>38</td><td>46</td><td>46.61</td><td>60</td></tr><tr><td>1994</td><td>305</td><td>335</td><td>336.5</td><td>379</td><td>40</td><td>48</td><td>48.85</td><td>62</td></tr><tr><td>1995</td><td>171</td><td>183</td><td>183.5</td><td>200</td><td>46</td><td>55</td><td>56.23</td><td>73</td></tr><tr><td>1996</td><td>163</td><td>171</td><td>171.2</td><td>183</td><td>42</td><td>47</td><td>47.44</td><td>55</td></tr><tr><td>1997</td><td>106</td><td>113</td><td>113.8</td><td>124</td><td>10</td><td>12</td><td>12.71</td><td>18</td></tr><tr><td>1998</td><td>151</td><td>161</td><td>161.4</td><td>174</td><td>10</td><td>13</td><td>13.52</td><td>19</td></tr><tr><td>1999</td><td>136</td><td>146</td><td>146.2</td><td>160</td><td>30</td><td>35</td><td>35.74</td><td>45</td></tr><tr><td>2000</td><td>123</td><td>143</td><td>146.2</td><td>188</td><td>28</td><td>33</td><td>34.13</td><td>45</td></tr><tr><td>2001</td><td>176</td><td>188</td><td>188.6</td><td>206</td><td>24</td><td>29</td><td>29.02</td><td>37</td></tr><tr><td>2002</td><td>364</td><td>390</td><td>391.5</td><td>424</td><td>33</td><td>38</td><td>38.42</td><td>47</td></tr><tr><td>2003</td><td>27</td><td>31</td><td>31.22</td><td>38</td><td>56</td><td>64</td><td>64.31</td><td>75</td></tr><tr><td>2004</td><td>80</td><td>89</td><td>89.4</td><td>103</td><td>15</td><td>19</td><td>18.98</td><td>24</td></tr><tr><td>2005</td><td>78</td><td>87</td><td>87.81</td><td>104</td><td>11</td><td>14</td><td>14.37</td><td>20</td></tr><tr><td>2006</td><td>40</td><td>47</td><td>47.48</td><td>59</td><td>26</td><td>31</td><td>31.15</td><td>39</td></tr><tr><td>2007</td><td>58</td><td>65</td><td>65.3</td><td>76</td><td>14</td><td>17</td><td>17.29</td><td>23</td></tr><tr><td>2008</td><td>54</td><td>62</td><td>62.42</td><td>75</td><td>24</td><td>28</td><td>28.25</td><td>35</td></tr><tr><td>2009</td><td>45</td><td>51</td><td>51.09</td><td>60</td><td>18</td><td>21</td><td>21.3</td><td>27</td></tr><tr><td>2010</td><td>137</td><td>148</td><td>148.5</td><td>163</td><td>22</td><td>25</td><td>25.76</td><td>32</td></tr><tr><td>2011</td><td>39</td><td>44</td><td>44.3</td><td>52</td><td>39</td><td>44</td><td>44.56</td><td>52</td></tr><tr><td>2012</td><td>48</td><td>60</td><td>61.7</td><td>83</td><td>12</td><td>16</td><td>16.59</td><td>23</td></tr><tr><td>2013</td><td>71</td><td>81</td><td>82.08</td><td>97</td><td>36</td><td>42</td><td>42.2</td><td>51</td></tr><tr><td>2014</td><td>45</td><td>57</td><td>58.78</td><td>81</td><td>40</td><td>47</td><td>47.72</td><td>58</td></tr></tbody></table>
<figure><img src="image_50.png" /></figure>
**Annexe 5 : Box plots des résidus temporels standardisés des probabilités de capture au Moulin des Princes pour les castillons (1HM) et les saumons de plusieurs hivers de mer (PHM).**

Les données aberrantes peuvent être mises en évidence lorsque les résidus standardisés ne sont pas compris entre -2 et 2. Dans le cas des 1HM, il y a potentiellement 3 années qui s'éloignent des prédictions en lien avec le débit moyen observé: 1998, 2000 et 2003.

<figure><img src="image_51.png" /></figure>
<figure><img src="image_52.png" /></figure>
**Annexe 6 : Différences de mortalité annuelle entre les individus marqués et non-marqués par classe d'âge de mer (1HM, PHM).**

La ligne continue représente une absence de différence entre les individus marqués et non-marqués.
Les étoiles signalent les années pour lesquelles la mortalité des individus marqués est significativement plus élevée que celle des individus non-marqués.

Il faut remarquer que l'échelle de l'axe des ordonnées n'est pas la même selon la classe d'âge de mer.

<figure><img src="image_53.png" /></figure>
<figure><img src="image_54.png" /></figure>
**Annexe 7 : Box plots des résidus temporels standardisés des probabilités de capture pendant ou après la reproduction pour les castillons (1HM) et les saumons de plusieurs hivers de mer (PHM) sur la rivière Scorff.**

Les données aberrantes peuvent être mises en évidence lorsque les résidus standardisés ne sont pas compris entre -2 et 2. Dans le cas des 1HM, l'année 2005 s'éloigne des prédictions en lien avec le débit moyen observé et le nombre de nuits de capture effectué.

<figure><img src="image_55.png" /></figure>
<figure><img src="image_56.png" /></figure>
**Annexe 8 :** Effectifs annuels estimés pour les adultes anadromes entrant dans le Scorff selon la classe d'âge de mer (1HM : castillons, PHM : plusieurs hivers de mer) depuis 1994.

<table><thead><tr><th rowspan="2"></th><th colspan="4">1HM</th><th colspan="4">PHM</th></tr><tr><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th></tr></thead><tbody><tr><td>1994</td><td>374</td><td>509</td><td>521.1</td><td>738</td><td>46</td><td>80</td><td>84.75</td><td>151</td></tr><tr><td>1995</td><td>705</td><td>784</td><td>788.5</td><td>899</td><td>77</td><td>96</td><td>97.98</td><td>129</td></tr><tr><td>1996</td><td>636</td><td>694</td><td>696.5</td><td>774</td><td>64</td><td>84</td><td>85.95</td><td>120</td></tr><tr><td>1997</td><td>415</td><td>467</td><td>470.4</td><td>546</td><td>55</td><td>70</td><td>71.45</td><td>98</td></tr><tr><td>1998</td><td>515</td><td>555</td><td>557.9</td><td>615</td><td>18</td><td>27</td><td>27.88</td><td>45</td></tr><tr><td>1999</td><td>220</td><td>252</td><td>254.4</td><td>303</td><td>72</td><td>94</td><td>95.91</td><td>130</td></tr><tr><td>2000</td><td>245</td><td>305</td><td>312</td><td>416</td><td>33</td><td>46</td><td>47.55</td><td>70</td></tr><tr><td>2001</td><td>281</td><td>310</td><td>311.2</td><td>352</td><td>29</td><td>41</td><td>42.73</td><td>64</td></tr><tr><td>2002</td><td>524</td><td>582</td><td>585.1</td><td>666</td><td>14</td><td>22</td><td>22.85</td><td>37</td></tr><tr><td>2003</td><td>196</td><td>229</td><td>231.9</td><td>283</td><td>46</td><td>59</td><td>60.78</td><td>84</td></tr><tr><td>2004</td><td>1048</td><td>1119</td><td>1121</td><td>1207</td><td>52</td><td>66</td><td>67</td><td>89</td></tr><tr><td>2005</td><td>417</td><td>452</td><td>453.4</td><td>500</td><td>107</td><td>129</td><td>131.1</td><td>166</td></tr><tr><td>2006</td><td>824</td><td>890</td><td>893.4</td><td>982</td><td>82</td><td>104</td><td>106.6</td><td>143</td></tr><tr><td>2007</td><td>431</td><td>483</td><td>485.8</td><td>559</td><td>75</td><td>94</td><td>96.18</td><td>128</td></tr><tr><td>2008</td><td>249</td><td>284</td><td>286.6</td><td>338</td><td>68</td><td>88</td><td>90.06</td><td>123</td></tr><tr><td>2009</td><td>227</td><td>260</td><td>263</td><td>313</td><td>92</td><td>116</td><td>118.5</td><td>158</td></tr><tr><td>2010</td><td>707</td><td>764</td><td>766.8</td><td>841</td><td>50</td><td>65</td><td>66.73</td><td>92</td></tr><tr><td>2011</td><td>352</td><td>386</td><td>387.8</td><td>438</td><td>185</td><td>217</td><td>219</td><td>267</td></tr><tr><td>2012</td><td>322</td><td>378</td><td>382.1</td><td>467</td><td>113</td><td>145</td><td>147.4</td><td>197</td></tr><tr><td>2013</td><td>541</td><td>599</td><td>601.4</td><td>679</td><td>79</td><td>103</td><td>105.2</td><td>143</td></tr><tr><td>2014</td><td>653</td><td>729</td><td>733.2</td><td>837</td><td>115</td><td>139</td><td>140.9</td><td>178</td></tr></tbody></table>
<figure><img src="image_57.png" /></figure>
**Annexe 9 : Echappements annuels estimés (nombre d'adultes participant à la reproduction) sur le Scorff selon la classe d'âge de mer (1HM : castillons, PHM : plusieurs hivers de mer) depuis 1994.**

<table><thead><tr><th rowspan="2"></th><th colspan="4">1HM</th><th colspan="4">PHM</th></tr><tr><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th></tr></thead><tbody><tr><td>1994</td><td>330</td><td>465</td><td>477</td><td>694</td><td>15</td><td>53</td><td>57.43</td><td>125</td></tr><tr><td>1995</td><td>579</td><td>670</td><td>673.4</td><td>789</td><td>21</td><td>40</td><td>42.09</td><td>73</td></tr><tr><td>1996</td><td>522</td><td>582</td><td>584.7</td><td>663</td><td>35</td><td>58</td><td>60.13</td><td>95</td></tr><tr><td>1997</td><td>369</td><td>421</td><td>425</td><td>500</td><td>8</td><td>28</td><td>29.45</td><td>60</td></tr><tr><td>1998</td><td>442</td><td>483</td><td>485.6</td><td>543</td><td>11</td><td>21</td><td>21.88</td><td>39</td></tr><tr><td>1999</td><td>192</td><td>225</td><td>227</td><td>276</td><td>36</td><td>62</td><td>63.1</td><td>99</td></tr><tr><td>2000</td><td>202</td><td>263</td><td>269.5</td><td>374</td><td>0</td><td>3</td><td>5.293</td><td>22</td></tr><tr><td>2001</td><td>246</td><td>275</td><td>276.6</td><td>317</td><td>10</td><td>33</td><td>33.26</td><td>56</td></tr><tr><td>2002</td><td>498</td><td>555</td><td>558.6</td><td>640</td><td>12</td><td>20</td><td>21.03</td><td>35</td></tr><tr><td>2003</td><td>194</td><td>228</td><td>230.6</td><td>282</td><td>24</td><td>39</td><td>40.57</td><td>64</td></tr><tr><td>2004</td><td>952</td><td>1023</td><td>1025</td><td>1111</td><td>39</td><td>54</td><td>55.44</td><td>78</td></tr><tr><td>2005</td><td>381</td><td>417</td><td>418.6</td><td>466</td><td>73</td><td>98</td><td>99.28</td><td>136</td></tr><tr><td>2006</td><td>750</td><td>816</td><td>819.2</td><td>907</td><td>50</td><td>73</td><td>74.97</td><td>112</td></tr><tr><td>2007</td><td>379</td><td>431</td><td>433.6</td><td>507</td><td>60</td><td>81</td><td>82.39</td><td>115</td></tr><tr><td>2008</td><td>235</td><td>271</td><td>273</td><td>324</td><td>52</td><td>73</td><td>74.78</td><td>108</td></tr><tr><td>2009</td><td>220</td><td>254</td><td>256.5</td><td>307</td><td>77</td><td>102</td><td>104</td><td>144</td></tr><tr><td>2010</td><td>639</td><td>698</td><td>700.5</td><td>775</td><td>44</td><td>61</td><td>62.25</td><td>88</td></tr><tr><td>2011</td><td>318</td><td>353</td><td>355.3</td><td>405</td><td>157</td><td>193</td><td>195.4</td><td>245</td></tr><tr><td>2012</td><td>286</td><td>342</td><td>346.3</td><td>431</td><td>77</td><td>113</td><td>115.1</td><td>166</td></tr><tr><td>2013</td><td>508</td><td>566</td><td>568.9</td><td>647</td><td>70</td><td>95</td><td>96.78</td><td>135</td></tr><tr><td>2014</td><td>594</td><td>670</td><td>674.3</td><td>778</td><td>99</td><td>124</td><td>126.2</td><td>163</td></tr></tbody></table>
<figure><img src="image_58.png" /></figure>
**Annexe 10 :** Box plots des résidus temporels standardisés des probabilités de capture au Moulin de Cerisel pour les castillons (1HM) et les saumons de plusieurs hivers de mer (PHM) sur la rivière Oir.
Les données aberrantes peuvent être mises en évidence lorsque les résidus standardisés ne sont pas compris entre -2 et 2. Depuis 2008, les probabilités de capture sont plus faibles que celles attendues pour le débit moyen observé.

<figure><img src="image_59.png" /></figure>
<figure><img src="image_60.png" /></figure>
Annexe 11 : Effectifs annuels estimés pour les adultes anadromes entrant dans l'Oir selon la classe d'âge de mer (1HM : castillons, PHM : plusieurs hivers de mer) depuis 1984.

<table><thead><tr><th rowspan="2"></th><th colspan="4">1HM</th><th colspan="4">PHM</th></tr><tr><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th></tr></thead><tbody><tr><td>1984</td><td>182</td><td>228</td><td>233</td><td>314</td><td>27</td><td>31</td><td>32.32</td><td>48</td></tr><tr><td>1985</td><td>206</td><td>225</td><td>228.5</td><td>271</td><td>64</td><td>68</td><td>69.78</td><td>84</td></tr><tr><td>1986</td><td>73</td><td>85</td><td>88.8</td><td>125</td><td>64</td><td>90</td><td>94.56</td><td>152</td></tr><tr><td>1987</td><td>91</td><td>164</td><td>171.8</td><td>301</td><td>4</td><td>11</td><td>12.35</td><td>31</td></tr><tr><td>1988</td><td>151</td><td>156</td><td>158.2</td><td>178</td><td>76</td><td>86</td><td>89.44</td><td>120</td></tr><tr><td>1989</td><td>196</td><td>198</td><td>199.3</td><td>209</td><td>39</td><td>41</td><td>41.5</td><td>49</td></tr><tr><td>1990</td><td>43</td><td>82</td><td>87.34</td><td>166</td><td>9</td><td>19</td><td>21.2</td><td>48</td></tr><tr><td>1991</td><td>44</td><td>46</td><td>47.06</td><td>55</td><td>2</td><td>4</td><td>5.51</td><td>17</td></tr><tr><td>1992</td><td>32</td><td>44</td><td>47.42</td><td>82</td><td>5</td><td>11</td><td>12.49</td><td>26</td></tr><tr><td>1993</td><td>99</td><td>118</td><td>122.2</td><td>171</td><td>8</td><td>14</td><td>15.25</td><td>30</td></tr><tr><td>1994</td><td>36</td><td>52</td><td>55.87</td><td>98</td><td>5</td><td>13</td><td>15.5</td><td>38</td></tr><tr><td>1995</td><td>128</td><td>141</td><td>142.2</td><td>163</td><td>3</td><td>4</td><td>4.837</td><td>12</td></tr><tr><td>1996</td><td>198</td><td>250</td><td>254</td><td>333</td><td>3</td><td>5</td><td>7.188</td><td>23</td></tr><tr><td>1997</td><td>57</td><td>62</td><td>62.92</td><td>76</td><td>1</td><td>3</td><td>5.604</td><td>28</td></tr><tr><td>1998</td><td>107</td><td>160</td><td>165.4</td><td>258</td><td>7</td><td>15</td><td>16.33</td><td>34</td></tr><tr><td>1999</td><td>173</td><td>203</td><td>206.1</td><td>256</td><td>21</td><td>34</td><td>36.55</td><td>67</td></tr><tr><td>2000</td><td>159</td><td>233</td><td>241</td><td>370</td><td>12</td><td>30</td><td>32.82</td><td>72</td></tr><tr><td>2001</td><td>161</td><td>176</td><td>177.9</td><td>205</td><td>9</td><td>14</td><td>16.38</td><td>36</td></tr><tr><td>2002</td><td>218</td><td>286</td><td>291.5</td><td>398</td><td>24</td><td>39</td><td>41.07</td><td>73</td></tr><tr><td>2003</td><td>175</td><td>182</td><td>183.1</td><td>195</td><td>27</td><td>32</td><td>32.76</td><td>45</td></tr><tr><td>2004</td><td>293</td><td>325</td><td>326.6</td><td>370</td><td>56</td><td>74</td><td>76.1</td><td>108</td></tr><tr><td>2005</td><td>120</td><td>139</td><td>140.8</td><td>170</td><td>12</td><td>21</td><td>23.6</td><td>51</td></tr><tr><td>2006</td><td>151</td><td>175</td><td>176.7</td><td>213</td><td>28</td><td>38</td><td>39.32</td><td>59</td></tr><tr><td>2007</td><td>176</td><td>182</td><td>183</td><td>194</td><td>17</td><td>27</td><td>29.06</td><td>53</td></tr><tr><td>2008</td><td>65</td><td>94</td><td>97.63</td><td>150</td><td>10</td><td>19</td><td>21.03</td><td>43</td></tr><tr><td>2009</td><td>82</td><td>135</td><td>141.8</td><td>242</td><td>15</td><td>24</td><td>26.09</td><td>48</td></tr><tr><td>2010</td><td>387</td><td>484</td><td>491.1</td><td>637</td><td>9</td><td>19</td><td>21.95</td><td>50</td></tr><tr><td>2011</td><td>164</td><td>204</td><td>206.8</td><td>268</td><td>47</td><td>68</td><td>71.41</td><td>113</td></tr><tr><td>2012</td><td>134</td><td>200</td><td>206.3</td><td>319</td><td>30</td><td>52</td><td>54.89</td><td>99</td></tr><tr><td>2013</td><td>199</td><td>258</td><td>263.7</td><td>359</td><td>39</td><td>62</td><td>65.63</td><td>113</td></tr></tbody></table>
<figure><img src="image_61.png" /></figure>
**Annexe 12** : Box plots des résidus temporels standardisés des probabilités de capture des smolts à Beauchamps et de recapture à Eu.

Les données aberrantes peuvent être mises en évidence lorsque les résidus standardisés ne sont pas compris entre -2 et 2. Il y a deux années qui s'éloignent des prédictions : 1996 au piège de Beauchamps et 2010 au piège d'Eu.

<figure><img src="image_62.png" /></figure>
<figure><img src="image_63.png" /></figure>
**Annexe 13 : Effectifs annuels estimés pour les smolts dévalant dans la Bresle depuis 1982.**

<table><thead><tr><th></th><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th></tr></thead><tbody><tr><td>1982</td><td>1 775</td><td>3 399</td><td>3 755</td><td>7 481</td></tr><tr><td>1983</td><td>1 979</td><td>3 565</td><td>3 915</td><td>7 388</td></tr><tr><td>1984</td><td>1 215</td><td>2 546</td><td>2 899</td><td>6 215</td></tr><tr><td>1985</td><td>1 993</td><td>3 698</td><td>3 833</td><td>6 545</td></tr><tr><td>1986</td><td>1 678</td><td>1 984</td><td>2 000</td><td>2 408</td></tr><tr><td>1987</td><td>807</td><td>2 127</td><td>2 413</td><td>5 530</td></tr><tr><td>1988</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>1989</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>1990</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>1991</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>1992</td><td>726</td><td>1 915</td><td>2 291</td><td>5 704</td></tr><tr><td>1993</td><td>1 478</td><td>1 763</td><td>1 777</td><td>2 158</td></tr><tr><td>1994</td><td>2 105</td><td>2 449</td><td>2 464</td><td>2 903</td></tr><tr><td>1995</td><td>298</td><td>1 775</td><td>2 165</td><td>6 494</td></tr><tr><td>1996</td><td>1 071</td><td>1 740</td><td>1 802</td><td>2 905</td></tr><tr><td>1997</td><td>5 730</td><td>6 259</td><td>6 275</td><td>6 900</td></tr><tr><td>1998</td><td>1 467</td><td>1 690</td><td>1 699</td><td>1 982</td></tr><tr><td>1999</td><td>398</td><td>667</td><td>695</td><td>1 159</td></tr><tr><td>2000</td><td>1 294</td><td>1 762</td><td>1 790</td><td>2 462</td></tr><tr><td>2001</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>2002</td><td>338</td><td>2 014</td><td>2 489</td><td>7 444</td></tr><tr><td>2003</td><td>2 501</td><td>2 987</td><td>3 008</td><td>3 647</td></tr><tr><td>2004</td><td>7 095</td><td>7 593</td><td>7 605</td><td>8 190</td></tr><tr><td>2005</td><td>4 729</td><td>5 257</td><td>5 270</td><td>5 888</td></tr><tr><td>2006</td><td>2 353</td><td>2 733</td><td>2 750</td><td>3 226</td></tr><tr><td>2007</td><td>4 852</td><td>5 447</td><td>5 471</td><td>6 214</td></tr><tr><td>2008</td><td>6 025</td><td>6 674</td><td>6 696</td><td>7 479</td></tr><tr><td>2009</td><td>917</td><td>1 168</td><td>1 183</td><td>1 540</td></tr><tr><td>2010</td><td>2 346</td><td>2 841</td><td>2 873</td><td>3 566</td></tr><tr><td>2011</td><td>5 790</td><td>6 466</td><td>6 480</td><td>7 241</td></tr><tr><td>2012</td><td>5 766</td><td>6 414</td><td>6 436</td><td>7 222</td></tr><tr><td>2013</td><td>1 457</td><td>1 857</td><td>1 886</td><td>2 493</td></tr><tr><td>2014</td><td>1 996</td><td>2 674</td><td>2 730</td><td>3 765</td></tr></tbody></table>
<figure><img src="image_64.png" /></figure>
**Annexe 14 : Box plots des résidus temporels standardisés des probabilités de capture des smolts au Moulin du Leslé et de recapture au Moulin des Princes.**

Les données aberrantes peuvent être mises en évidence lorsque les résidus standardisés ne sont pas compris entre -2 et 2. Depuis 2008, les probabilités de capture au Moulin des Princes sont systématiquement plus faibles que celles attendues pour le débit observé.

Moulin du Leslé

<figure><img src="image_65.png" /></figure>

Moulin des Princes

<figure><img src="image_66.png" /></figure>
<figure><img src="image_67.png" /></figure>
Annexe 15 : Effectifs annuels estimés pour les smolts dévalant dans le Scorff depuis 1995.

<table><thead><tr><th></th><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th></tr></thead><tbody><tr><td>1995</td><td>4 733</td><td>6 192</td><td>6 273</td><td>8 262</td></tr><tr><td>1996</td><td>1 541</td><td>1 983</td><td>2 011</td><td>2 637</td></tr><tr><td>1997</td><td>9 503</td><td>10 000</td><td>10 010</td><td>10 560</td></tr><tr><td>1998</td><td>4 239</td><td>4 867</td><td>4 885</td><td>5 645</td></tr><tr><td>1999</td><td>2 252</td><td>2 622</td><td>2 637</td><td>3 114</td></tr><tr><td>2000</td><td>2 619</td><td>3 048</td><td>3 065</td><td>3 607</td></tr><tr><td>2001</td><td>10 590</td><td>11 890</td><td>11 920</td><td>13 420</td></tr><tr><td>2002</td><td>1 111</td><td>1 249</td><td>1 254</td><td>1 426</td></tr><tr><td>2003</td><td>9 759</td><td>10 150</td><td>10 160</td><td>10 580</td></tr><tr><td>2004</td><td>7 570</td><td>7 880</td><td>7 884</td><td>8 224</td></tr><tr><td>2005</td><td>10 320</td><td>10 790</td><td>10 790</td><td>11 310</td></tr><tr><td>2006</td><td>6 423</td><td>7 167</td><td>7 188</td><td>8 072</td></tr><tr><td>2007</td><td>7 047</td><td>7 562</td><td>7 571</td><td>8 146</td></tr><tr><td>2008</td><td>9 415</td><td>10 570</td><td>10 590</td><td>11 920</td></tr><tr><td>2009</td><td>12 580</td><td>13 720</td><td>13 750</td><td>15 040</td></tr><tr><td>2010</td><td>9 738</td><td>10 570</td><td>10 590</td><td>11 530</td></tr><tr><td>2011</td><td>7 668</td><td>8 848</td><td>8 892</td><td>10 360</td></tr><tr><td>2012</td><td>6 894</td><td>8 231</td><td>8 293</td><td>10 040</td></tr><tr><td>2013</td><td>6 404</td><td>8 457</td><td>8 591</td><td>11 560</td></tr><tr><td>2014</td><td>9 270</td><td>10 290</td><td>10 310</td><td>11 480</td></tr></tbody></table>
<figure><img src="image_68.png" /></figure>
**Annexe 16: Effectifs annuels estimés pour les smolts dévalant dans l'Oir depuis 1986.**

<table><thead><tr><th></th><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th></tr></thead><tbody><tr><td>1986</td><td>651</td><td>744</td><td>750</td><td>878</td></tr><tr><td>1987</td><td>308</td><td>361</td><td>368</td><td>469</td></tr><tr><td>1988</td><td>357</td><td>412</td><td>416</td><td>500</td></tr><tr><td>1989</td><td>704</td><td>821</td><td>829</td><td>1 001</td></tr><tr><td>1990</td><td>762</td><td>818</td><td>827</td><td>940</td></tr><tr><td>1991</td><td>170</td><td>200</td><td>203</td><td>256</td></tr><tr><td>1992</td><td>616</td><td>675</td><td>682</td><td>784</td></tr><tr><td>1993</td><td>211</td><td>228</td><td>232</td><td>275</td></tr><tr><td>1994</td><td>418</td><td>570</td><td>595</td><td>922</td></tr><tr><td>1995</td><td>678</td><td>744</td><td>750</td><td>853</td></tr><tr><td>1996</td><td>903</td><td>1 008</td><td>1 015</td><td>1 169</td></tr><tr><td>1997</td><td>364</td><td>465</td><td>474</td><td>630</td></tr><tr><td>1998</td><td>878</td><td>1 063</td><td>1 075</td><td>1 333</td></tr><tr><td>1999</td><td>229</td><td>263</td><td>265</td><td>317</td></tr><tr><td>2000</td><td>2 068</td><td>2 167</td><td>2 171</td><td>2 293</td></tr><tr><td>2001</td><td>1 178</td><td>1 336</td><td>1 342</td><td>1 542</td></tr><tr><td>2002</td><td>2 258</td><td>2 368</td><td>2 371</td><td>2 501</td></tr><tr><td>2003</td><td>1 147</td><td>1 238</td><td>1 241</td><td>1 350</td></tr><tr><td>2004</td><td>1 139</td><td>1 233</td><td>1 237</td><td>1 351</td></tr><tr><td>2005</td><td>792</td><td>848</td><td>850</td><td>918</td></tr><tr><td>2006</td><td>1 250</td><td>1 352</td><td>1 355</td><td>1 476</td></tr><tr><td>2007</td><td>884</td><td>955</td><td>957</td><td>1 048</td></tr><tr><td>2008</td><td>1 957</td><td>2 144</td><td>2 149</td><td>2 368</td></tr><tr><td>2009</td><td>3 068</td><td>3 368</td><td>3 377</td><td>3 730</td></tr><tr><td>2010</td><td>1 209</td><td>1 399</td><td>1 407</td><td>1 657</td></tr><tr><td>2011</td><td>1 642</td><td>1 801</td><td>1 805</td><td>1 994</td></tr><tr><td>2012</td><td>1 248</td><td>1 360</td><td>1 365</td><td>1 508</td></tr><tr><td>2013</td><td>1 111</td><td>1 272</td><td>1 277</td><td>1 475</td></tr><tr><td>2014</td><td>1 368</td><td>1 551</td><td>1 558</td><td>1 784</td></tr></tbody></table>
<figure><img src="image_69.png" /></figure>
**Annexe 17 : Effectifs annuels estimés pour les tacons (0+) dans la Nivelle depuis 1985.**

<table><thead><tr><th></th><th>5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>95% BCI</th></tr></thead><tbody><tr><td>1985</td><td>971</td><td>1 321</td><td>1 345.06</td><td>1 800</td></tr><tr><td>1986</td><td>7 118</td><td>8 037</td><td>8 065.00</td><td>9 099</td></tr><tr><td>1987</td><td>10 590</td><td>11 785</td><td>11 813.77</td><td>13 130</td></tr><tr><td>1988</td><td>9 378</td><td>11 043</td><td>11 103.05</td><td>13 056</td></tr><tr><td>1989</td><td>9 288</td><td>10 667</td><td>10 699.44</td><td>12 190</td></tr><tr><td>1990</td><td>4 998</td><td>5 828</td><td>5 856.50</td><td>6 819</td></tr><tr><td>1991</td><td>5 745</td><td>6 958</td><td>7 016.82</td><td>8 499</td></tr><tr><td>1992</td><td>3 636</td><td>4 920</td><td>4 995.38</td><td>6 602</td></tr><tr><td>1993</td><td>3 727</td><td>4 705</td><td>4 767.32</td><td>6 006</td></tr><tr><td>1994</td><td>11 220</td><td>13 749</td><td>13 858.05</td><td>16 904</td></tr><tr><td>1995</td><td>4 798</td><td>5 906</td><td>5 945.77</td><td>7 245</td></tr><tr><td>1996</td><td>5 533</td><td>7 151</td><td>7 254.51</td><td>9 320</td></tr><tr><td>1997</td><td>5 962</td><td>7 543</td><td>7 637.15</td><td>9 636</td></tr><tr><td>1998</td><td>5 361</td><td>6 860</td><td>6 942.20</td><td>8 801</td></tr><tr><td>1999</td><td>8 061</td><td>9 887</td><td>9 949.27</td><td>12 042</td></tr><tr><td>2000</td><td>9 123</td><td>10 933</td><td>10 984.28</td><td>13 047</td></tr><tr><td>2001</td><td>9 910</td><td>12 242</td><td>12 325.69</td><td>15 052</td></tr><tr><td>2002</td><td>12 483</td><td>15 255</td><td>15 349.49</td><td>18 477</td></tr><tr><td>2003</td><td>5 841</td><td>7 114</td><td>7 148.88</td><td>8 585</td></tr><tr><td>2004</td><td>3 579</td><td>4 453</td><td>4 484.47</td><td>5 503</td></tr><tr><td>2005</td><td>7 757</td><td>9 402</td><td>9 471.14</td><td>11 418</td></tr><tr><td>2006</td><td>1 702</td><td>2 524</td><td>2 574.86</td><td>3 622</td></tr><tr><td>2007</td><td>2 212</td><td>3 164</td><td>3 221.72</td><td>4 420</td></tr><tr><td>2008</td><td>3 681</td><td>5 153</td><td>5 227.13</td><td>7 048</td></tr><tr><td>2009</td><td>1 938</td><td>2 833</td><td>2 889.05</td><td>4 015</td></tr><tr><td>2010</td><td>5 363</td><td>7 330</td><td>7 425.95</td><td>9 826</td></tr><tr><td>2011</td><td>3 406</td><td>4 786</td><td>4 857.55</td><td>6 542</td></tr><tr><td>2012</td><td>11 816</td><td>15 491</td><td>15 655.93</td><td>20 049</td></tr><tr><td>2013</td><td>3 348</td><td>4 764</td><td>4 841.70</td><td>6 615</td></tr><tr><td>2014</td><td>5 092</td><td>6 923</td><td>7 000.42</td><td>9 186</td></tr></tbody></table>
<figure><img src="image_70.png" /></figure>
**Annexe 18 : Regroupement hiérarchique des stations localisées sur le cours principal du Scorff selon les profils temporels observés.**

Une fois les estimations annuelles des densités locales obtenues, il est possible d'effectuer des regroupements pour les stations localisées sur le Scorff (39 stations au total) selon les profils temporels observés. Pour cela, nous utilisons des méthodes de regroupement hiérarchique utilisant une procédure ascendante et des méthodes dites d'agglomération. Afin d'imposer une contrainte de contiguïté spatiale (une station donnée n'est pas disposée au hasard et est contigüe à des stations bien spécifiques), la méthode de Ward (1963) est préférée. Celle-ci est basée sur un critère comparant les carrés des écarts. Les groupes sélectionnés lors de ce procédé minimisent la dispersion entre groupes à chaque nœud ce qui permet d'identifier des zones homogènes et proches spatialement (Murtagh & Legendre 2014). Pour cela, nous avons construit une matrice de contiguïté définit de la manière suivante entre une station i et une station j :

$$M(i, j) = \begin{cases} 1, & \text{si } i \text{ et } j \text{ sont contigus} \\ 0, & \text{le cas contraire} \end{cases}$$

Pour identifier le nombre de groupes, nous avons utilisé le critère de Caliñski-Harabasz (1974) qui a été recommandé par Gordon (1996). Il s'agit d'un ratio de variance sélectionnant le nombre de groupes qui maximise le ratio de la somme des carrés des écarts entre groupes et au sein du groupe. Le nombre de groupe maximal testé est égal à 19 pour un total de 39 stations, ce qui permet de faire un compromis entre obtenir un trop grand nombre de groupes tout en laissant la possibilité d'obtenir des petits groupes (donc constitués de peu de stations).

Afin d'atténuer les différences entre stations liées uniquement au fait qu'une station soit plus productive qu'une autre, nous avons considéré les densités médianes annuelles en échelle log centrées par station. La méthode de regroupement a été effectuée avec la bibliothèque "const.clust" (Legendre 2012) du programme R (R Core Team 2014). Cette bibliothèque permet également d'obtenir le critère de sélection du nombre de groupe par une méthode de validation croisée (Legendre 2012).

Ce regroupement hiérarchique avec contrainte de contiguïté spatiale a été effectué pour les stations situées sur le Scorff (39 stations). Le regroupement permet de distinguer 11 groupes sur le cours principal. La longueur des branches du dendrogramme permet de visualiser les groupes proches et ceux plus distants et donc de mieux comprendre les potentiels critères de classification des groupes (Figure 35). La première classification sépare les stations situées à l'aval de celles situées à l'amont du barrage de Pont Callec. Les groupes suivants sont classés selon des critères de pente de la rivière mais aussi selon des facteurs anthropiques avec notamment la séparation des groupes par les piscicultures. Deux groupes sont constitués d'une seule station : la station "Maison Rivière", située à l'extrémité avale de la rivière, qui est la seule station du cours principal encore sous l'influence des marées et la station de Guémené, située à l'extrémité amont (Figure 35).
**Figure 35** : Dendrogramme de la classification hiérarchique ascendante avec contrainte de contiguïté spatiale pour les stations échantillonnées par IA et situées sur le Scorff.

Les blocs représentés par les lignes rouges permettent de distinguer les groupes avec les stations les constituants. La longueur des branches permet de visualiser la distance séparant les groupes et les stations au sein d'un groupe.

Abréviations : *Mon*, Maison ; *Min*, Moulin ; *Pt*, Pont ; *St*, Saint

<figure><img src="image_71.png" /></figure>

A partir de ce regroupement, il est possible de visualiser les profils temporels de la densité moyenne de chaque groupe et de les comparer au profil moyen du Scorff (Figure 36). De manière globale, les densités ont augmenté depuis 2003 par rapport au début du suivi. Les stations les plus en amont ont tendance à avoir une densité plus élevée ces dernières années que le profil moyen et les stations en aval ont, au contraire, une densité plus faible que le profil moyen.

Références :

Caliński T & Harabasz J. 1974. A dendrite method for cluster analysis. Communications in Statistics. 3: 1-27.

Gordon AD. 1996. A survey of constrained classification. Computational Statistics and Data Analysis 21: 17-29.

Legendre P. 2012. `const.clust`: Space- and time-constrained clustering package. R package version 1.3.
[URL http://adn.biol.umontreal.ca/~numericalecology/Rcode/]

Murtagh F & Legendre P. 2014. Ward's hierarchical agglomerative clustering method: which algorithms implement Ward's criterion? Journal of Classification 31: 274-295.

R Core Team. 2014. R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. [URL http://www.R-project.org/]

Ward JH. 1963. Hierarchical grouping to optimize an objective function. Journal of the American Statistical Association 58: 236-244.
**Figure 36 : Profils temporels des densités moyennes estimées selon les groupes identifiés par la classification hiérarchique contiguïté spatiale et profil temporel moyen.**

La densité moyenne par groupe est calculée à partir des densités estimées au niveau de chaque station exprimées en représentée par la ligne continue. Le profil moyen (densité globale) est calculé en moyennant les densités de toutes les pointillées.

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Rapport final

**Annexe 19 : Représentation graphique de la relation de proportionnalité entre les valeurs d'IA (nb poissons/5min de la rivière au niveau de la station d'échantillonnage, établie pour le site du Scorff.**

Les lignes de contour représentent la valeur médiane des indices d'abondance qui est estimée à partir de la relation associées ne sont pas représentées.

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**Annexe 20 : Effectifs annuels estimés pour les tacons (0+) dans le Scorff (cours principal et affluents) depuis 1993.**

<table><thead><tr><th></th><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th></tr></thead><tbody><tr><td>1993</td><td>7 290</td><td>10 640</td><td>10 870</td><td>15 800</td></tr><tr><td>1994</td><td>13 300</td><td>19 950</td><td>20 420</td><td>30 320</td></tr><tr><td>1995</td><td>7 024</td><td>9 926</td><td>10 060</td><td>13 900</td></tr><tr><td>1996</td><td>9 497</td><td>13 410</td><td>13 670</td><td>19 380</td></tr><tr><td>1997</td><td>5 598</td><td>8 866</td><td>9 145</td><td>14 230</td></tr><tr><td>1998</td><td>4 517</td><td>6 445</td><td>6 557</td><td>9 250</td></tr><tr><td>1999</td><td>6 874</td><td>10 850</td><td>11 180</td><td>17 360</td></tr><tr><td>2000</td><td>14 700</td><td>20 210</td><td>20 520</td><td>28 160</td></tr><tr><td>2001</td><td>2 307</td><td>3 169</td><td>3 222</td><td>4 452</td></tr><tr><td>2002</td><td>13 020</td><td>17 710</td><td>18 020</td><td>24 650</td></tr><tr><td>2003</td><td>7 352</td><td>13 120</td><td>13 720</td><td>23 610</td></tr><tr><td>2004</td><td>18 290</td><td>24 470</td><td>24 820</td><td>33 310</td></tr><tr><td>2005</td><td>8 991</td><td>13 890</td><td>14 270</td><td>21 820</td></tr><tr><td>2006</td><td>10 860</td><td>15 280</td><td>15 570</td><td>21 930</td></tr><tr><td>2007</td><td>18 590</td><td>25 830</td><td>26 240</td><td>36 450</td></tr><tr><td>2008</td><td>16 300</td><td>21 570</td><td>21 890</td><td>29 300</td></tr><tr><td>2009</td><td>12 460</td><td>17 230</td><td>17 510</td><td>24 210</td></tr><tr><td>2010</td><td>16 220</td><td>21 600</td><td>21 910</td><td>29 300</td></tr><tr><td>2011</td><td>25 340</td><td>33 670</td><td>34 110</td><td>45 440</td></tr><tr><td>2012</td><td>22 950</td><td>32 270</td><td>32 840</td><td>46 250</td></tr><tr><td>2013</td><td>19 050</td><td>25 210</td><td>25 600</td><td>34 280</td></tr><tr><td>2014</td><td>19 500</td><td>25 970</td><td>26 340</td><td>35 270</td></tr></tbody></table>
<figure><img src="image_76.png" /></figure>
Rapport final

**Annexe 21 : Représentation graphique de la relation de proportionnalité entre les valeurs d'IA (nb poissons/5min de la rivière au niveau de la station d'échantillonnage, établie pour le site de l'Oir.**

Les lignes de contour représentent la valeur médiane des indices d'abondance qui est estimée à partir de la relation associées ne sont pas représentées.

<figure><img src="image_77.png" /></figure>
<figure><img src="image_78.png" /></figure>
**Annexe 22 :** Effectifs annuels estimés pour les tacons (0+) dans l'Oir (cours principal et affluents) depuis 1987.

<table><thead><tr><th></th><th>2.5% BCI</th><th>médiane</th><th>moyenne</th><th>97.5% BCI</th></tr></thead><tbody><tr><td>1987</td><td>376</td><td>974</td><td>1 155</td><td>2 999</td></tr><tr><td>1988</td><td>1 668</td><td>3 279</td><td>3 740</td><td>8 573</td></tr><tr><td>1989</td><td>2 520</td><td>4 555</td><td>5 091</td><td>10 791</td></tr><tr><td>1990</td><td>198</td><td>2 901</td><td>5 614</td><td>27 291</td></tr><tr><td>1991</td><td>940</td><td>1 973</td><td>2 286</td><td>5 490</td></tr><tr><td>1992</td><td>235</td><td>542</td><td>621</td><td>1 489</td></tr><tr><td>1993</td><td>1 127</td><td>2 000</td><td>2 240</td><td>4 758</td></tr><tr><td>1994</td><td>897</td><td>1 419</td><td>1 528</td><td>2 839</td></tr><tr><td>1995</td><td>1 241</td><td>2 548</td><td>2 902</td><td>6 667</td></tr><tr><td>1996</td><td>421</td><td>736</td><td>796</td><td>1 512</td></tr><tr><td>1997</td><td>2 369</td><td>3 786</td><td>4 072</td><td>7 575</td></tr><tr><td>1998</td><td>19</td><td>53</td><td>61</td><td>149</td></tr><tr><td>1999</td><td>3 867</td><td>5 407</td><td>5 715</td><td>9 272</td></tr><tr><td>2000</td><td>3 524</td><td>5 033</td><td>5 322</td><td>8 855</td></tr><tr><td>2001</td><td>5 844</td><td>8 536</td><td>9 161</td><td>16 180</td></tr><tr><td>2002</td><td>751</td><td>1 177</td><td>1 247</td><td>2 149</td></tr><tr><td>2003</td><td>4 230</td><td>5 922</td><td>6 161</td><td>9 498</td></tr><tr><td>2004</td><td>440</td><td>729</td><td>767</td><td>1 314</td></tr><tr><td>2005</td><td>3 479</td><td>4 792</td><td>5 060</td><td>8 184</td></tr><tr><td>2006</td><td>2 446</td><td>3 574</td><td>3 831</td><td>6 841</td></tr><tr><td>2007</td><td>4 873</td><td>6 639</td><td>6 897</td><td>10 480</td></tr><tr><td>2008</td><td>5 019</td><td>7 249</td><td>7 651</td><td>12 621</td></tr><tr><td>2009</td><td>3 744</td><td>5 931</td><td>6 151</td><td>9 825</td></tr><tr><td>2010</td><td>5 971</td><td>9 159</td><td>9 502</td><td>15 025</td></tr><tr><td>2011</td><td>5 279</td><td>8 281</td><td>8 626</td><td>13 885</td></tr><tr><td>2012</td><td>6 746</td><td>9 927</td><td>10 289</td><td>15 741</td></tr><tr><td>2013</td><td>7 163</td><td>10 720</td><td>11 087</td><td>17 310</td></tr><tr><td>2014</td><td>7 586</td><td>11 240</td><td>11 612</td><td>17 731</td></tr></tbody></table>