# Plan de Gestion de Données de l'Entité Unité Expérimentale Grandes Cultures Innovation Environnement (UE 0972 GCIE)

Stéphanie Arnoult, Eric Hanocq, Jean-François Hû

► To cite this version:

Stéphanie Arnoult, Eric Hanocq, Jean-François Hû. Plan de Gestion de Données de l'Entité Unité Expérimentale Grandes Cultures Innovation Environnement (UE 0972 GCIE). INRAE. 2024. hal-04989185v2

HAL Id: hal-04989185

https://hal.inrae.fr/hal-04989185v2

Submitted on 13 Mar 2025

HAL is a multi-disciplinary open access
archive for the deposit and dissemination of sci-
entific research documents, whether they are pub-
lished or not. The documents may come from
teaching and research institutions in France or
abroad, or from public or private research centers.

L'archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est
destinée au dépôt et à la diffusion de documents
scientifiques de niveau recherche, publiés ou non,
émanant des établissements d'enseignement et de
recherche français ou étrangers, des laboratoires
publics ou privés.

<figure><img src="image_1.png" /></figure>

Distributed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License
# Plan de Gestion de données de l'Entité Unité Expérimentale Grandes Cultures Innovation Environnement (UE 0972 GCIE)

Plan de gestion de données créé à l'aide de DMP OPIDOR, basé sur le modèle "Science Europe : modèle structuré pour les entités de recherche" fourni par INRAE - Institut national de recherche pour l'agriculture l'alimentation et l'environnement.

## 1- RENSEIGNEMENTS SUR LE PLAN

**Titre du plan** : Plan de Gestion de Données Entité Unité Expérimentale Grandes Cultures Innovation Environnement (PGD Entité UE GCIE)

**Langue** : fra

**Date de création** : 2020-02-03

**Date de dernière modification** : 2025-01-15

**Identifiant** : doi:10.57745/G4G9NR (identifiant Recherche Data Gouv)

**Documents (publications, sites web...)** : site internet UE GCIE : https://gcie.isc.inrae.fr/

### Résumé

Ce PDG explicite la manière dont sont obtenues, documentées, analysées, stockées et partagées les données produites par l'UE GCIE. Ce document est conçu comme un outil pour gérer les données. Il a vocation à servir de base et à être adapté pour la rédaction des PGD de projets scientifiques.

### Contributeurs

<table><thead><tr><td>Nom</td><td>Affiliation</td><td>Rôles</td></tr></thead><tbody><tr><td>Eric Hanocq</td><td>INRAE</td><td>Coordinateur du plan de gestion de données<br/>Responsable du plan de gestion de données</td></tr><tr><td>Stéphanie Arnoult</td><td>INRAE</td><td>Personne contact pour les données</td></tr><tr><td>Frédéric de Lamotte</td><td>INRAE</td><td>Référent Données Stratégique du département Biologie et Amélioration des Plantes (BAP)</td></tr></tbody></table>

Droits d'auteur : Le(s) créateur(s) de ce plan accepte(nt) que tout ou partie de texte de ce plan soit réutilisé et personnalisé si nécessaire pour un autre plan. Vous n'avez pas besoin de citer le(s) créateur(s) en tant que source. L'utilisation de toute partie de texte de ce plan n'implique pas que le(s) créateur(s) soutien(nen)t ou aient une quelconque relation avec votre projet ou votre soumission

### Historique des versions

<table><thead><tr><td>Date</td><td>n° de version</td><td>Status</td><td>Auteur</td><td>Affiliation de l'auteur</td><td>Validé par</td><td>Validé le</td></tr></thead><tbody><tr><td>2020-02-03</td><td>1.0</td><td>validé</td><td>Eric Hanocq, Jean-Fraçois Hû</td><td>INRAE, UE GCIE</td><td></td><td></td></tr><tr><td>2025-01-15</td><td>2.0</td><td></td><td>Eric Hanocq, Jean-François Hû,</td><td>INRAE, UE GCIE</td><td>Equipe INRAE</td><td>15-01-2025</td></tr></tbody></table>
# 2- RENSEIGNEMENTS SUR L'ENTITE

## Nom de l'entité

UE0972 UE GCIE-Picardie

Unité Expérimentale Grandes Cultures Innovation Environnement

Site internet : https://gcie.isc.inrae.fr/

Dataverse : https://entrepot.recherche.data.gouv.fr/dataverse.xhtml?alias=ue_gcie

## Type d'entité

Unité expérimentale

## Description de l'entité

L'Unité Expérimentale Grandes Cultures Innovation Environnement - Picardie est l'unité expérimentale la plus septentrionale d'INRAE située dans une zone de grandes cultures représentative de l'agriculture de l'Europe du nord. Elle fait partie du centre INRAE des Hauts-de-France et est placée sous la tutelle du département Biologie Amélioration des Plantes et la co-tutelle du département AgroEcoSystem.

Elle propose 2 dispositifs expérimentaux : un dispositif « champ » de 166 ha de surfaces dédiées à l'expérimentation et un dispositif « conditions contrôlées » constitué de plusieurs chapelles de serre (240 m2) et enceintes climatiques (35 m2). Le dispositif champ, exceptionnel par la profondeur de ses limons moyens à argileux, propose des terres fertiles, homogènes et regroupées sous un climat océanique altéré. Les chambres climatiques possèdent des caractéristiques spécifiques pour l'étude de la résistance des plantes au froid (possibilité de températures basses avec un éclairement important).

L'unité conduit des expérimentations en collaboration avec une quinzaine d'équipes de recherche INRAE ainsi que d'autres organismes publics ou privés, selon trois axes principaux :

* La caractérisation et l'évaluation d'espèces de grandes cultures (céréales, maïs, protéagineux) en réponse à différents stress biotiques et abiotiques aux niveaux agronomique et génétique. L'unité est notamment fortement impliquée dans l'Innovation Variétale et Diversification ainsi que dans les expérimentations menées pour le GEVES (Groupe d'Etude et de contrôle des Variétés Et des Semences) sur le domaine ;

* La caractérisation et l'évaluation de cultures à vocation biomasse pour une valorisation multi-usages (énergie, matériaux, produits chimiques ...) ; l'unité a acquis une expertise sur la conduite et le phénotypage de ces cultures, en particulier sur le miscanthus ;

* La mise au point et l'évaluation de systèmes de culture innovants à bas niveaux d'intrants avec notamment un engagement dans le plan national Ecophyto ayant pour objectif de réduire les usages de produits phytopharmaceutiques.

En plus de ces trois axes, L'unité héberge et co-gère, avec l'UMR Transfrontalière BioEcoAgro du département AgroEcoSystem, le dispositif SOERE ACBB, Système d'Observation et d'Expérimentation sur le long terme pour la Recherche en Environnement avec pour thématique Agro-Ecosystèmes, Cycles Bio-Géochimiques et Biodiversité.

L'unité est également équipée d'outils de phénotypage haut débit permettant d'évaluer différents caractères d'intérêt sur un grand nombre de plantes. Elle utilise un drone et 2 caméras, une de type RGB (Red Green Blue) et l'autre de type multispectrale. L'unité est aujourd'hui intégrée dans un réseau national notamment pour le
traitement et l'analyse des images produites.

L'unité est intégrée au Système de Management Environnemental collectif des entités expérimentales INRAE et a obtenu à titre collectif la certification ISO 14001 (N°121013) depuis 2015. Elle est également labellisée Infrastructure de recherche Scientifique Collective depuis 2017.

## Identifiant de l'entité

UE 0972 GCIE

DOI: 10.15454/1.5572425838988464E12 (DISC-INRAE)

## Responsabilités

<table><thead><tr><td>Nom, Prénom</td><td>Courriel</td><td>Rôle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Hanocq, Eric</td><td><a href="mailto:eric.hanocq@inrae.fr">eric.hanocq@inrae.fr</a></td><td>- Directeur d'Unité<br/>- Responsable de la conservation à long terme</td></tr><tr><td>Arnoult, Stéphanie</td><td><a href="mailto:stephanie.arnoult@inrae.fr">stephanie.arnoult@inrae.fr</a></td><td>- Directrice adjointe de l'unité<br/>- Référent Données Opérationnel (RDO) – département BAP<br/>- Contact pour les données</td></tr><tr><td>De Lamotte, Frédéric</td><td><a href="mailto:frederic.de-lamotte@inrae.fr">frederic.de-lamotte@inrae.fr</a></td><td>Référent Données Stratégique (RDS) -<br/>département BAP</td></tr></tbody></table>

## Etablissement(s) tutelle(s)

INRAE

## Département de rattachement INRAE

Biologie et Amélioration des Plantes (BAP)

Co-tutelle : département AgroEcoSystem

## Financeur(s) (permettant l'acquisition des jeux de données – hors projet)

Subvention d'Etat, INRAE

# 3- DESCRIPTION DES DONNEES ET COLLECTE OU REUTILISATION DE DONNEES EXISTANTES

## 3.1 DESCRIPTION GENERALE DES PRODUITS DE RECHERCHE

### 3.1.1 Produit de recherche : Données structurelles dispositif champ

#### Mode d'obtention des données

Données générées par l'entité

#### Origine
Observation

Expérimentation

Analyse

## Type de données

Jeu de données

Objet physique

## Nature des données

Données environnementales (localisation GPS des parcelles, données de structure, texture et composition du sol, suivi météorologique via la station météo située sur le domaine...)

et de production (données de rendement machine,...)

Matériel végétal (variétés implantées)

Itinéraires techniques (interventions répertoriées via le logiciel Geofolia)

Inventaire des équipements (matériel agricole) et stocks (fluides et consommables)

Rapports des contrôles réglementaires effectués sur les équipements

## Format des données

<table><thead><tr><td>Nature des données</td><td>Format des données</td><td>Commentaire</td></tr></thead><tbody><tr><td>Données environnementales</td><td>Coordonnées GPS : .shp, .shx, .prj<br>Données de structure, texture et composition du sol : .pdf, .xlsx, .csv<br>Suivi météorologique : extractions en format .xlsx, .csv, .pdf</td><td></td></tr><tr><td>Données de production</td><td>.x.xlsx, .csv, .pdf,</td><td></td></tr><tr><td>Matériel végétal</td><td>.x.xlsx, .csv, .pdf</td><td></td></tr><tr><td>Itinéraires techniques</td><td>Exportation du logiciel Geofolia en format .x.xlsx, .pdf</td><td></td></tr><tr><td>Inventaire des équipements et stocks</td><td>.x.xlsx</td><td></td></tr><tr><td>Rapports des contrôles réglementaires effectués sur les équipements</td><td>.pdf</td><td></td></tr></tbody></table>

## Périmètre thématique des données

Ecologie et Biodiversité

Climat

Systèmes et pratiques agricoles

Diversité des pratiques agricoles

Insectes et entomologie Micro-organismes

Sélection végétale et produits végétaux

Pathologie et santé des plantes

Sols et sciences du sol

Ressources en eau
### 3.1.2 Produit de recherche : Données structurelles dispositif conditions contrôlées

#### Mode d'obtention des données

Données générées par l'entité

#### Origine

Observation

Expérimentation

Analyse

#### Type de données

Jeu de données

Objet physique

#### Nature des données

Données environnementales au niveau des serres et chambres climatisées (suivi en direct via le superviseur ARIA version 2.221 licence 1 pour les serres)

Données liées aux consommations des fluides (relevés compteurs,...)

Rapports des contrôles réglementaires effectués sur les équipements

#### Format des données

<table><thead><tr><td>Nature des données</td><td>Format des données</td><td>Commentaire</td></tr></thead><tbody><tr><td>Données environnementales au niveau des serres et chambres climatisées</td><td>Visualisation via le logiciel Aria Extraction possible en .xlsx, .pdf</td><td></td></tr><tr><td>Données de consommation des fluides</td><td>.xlsx, .csv, .pdf</td><td></td></tr><tr><td>Rapports des contrôles réglementaires effectués sur les équipements</td><td>.pdf</td><td></td></tr></tbody></table>

#### Périmètre thématique des données

Ecologie et Biodiversité

Climat

Systèmes et pratiques agricoles

Insectes et entomologie Micro-organismes

Sélection végétale et produits végétaux

Pathologie et santé des plantes

Sols et sciences du sol

Ressources en eau

### 3.1.3 Produit de recherche : Données expérimentales

#### Mode d'obtention des données

Données générées par l'entité

#### Origine

Observation

Expérimentation
## Type de données

- Jeu de données

- Objet physique

- Image

## Nature des données

- Données environnementales

- Suivi météorologique sur l'ensemble du site (station météo avec données référencées sur le site https://agroclim.inrae.fr/climatik/)

- Données issues de capteurs sols et centrales d'acquisition pour le suivi des conditions de croissance installés sur différents dispositifs au champ

- Données issues de sondes TDR (mesures indirectes de l'humidité du sol), barres Solems (mesure du rayonnement du couvert), etc pour caractériser l'environnement

- Données phénotypiques

- Mesures directes de variables quantitatives sur grandes cultures (pois, maïs, céréales, cultures biomasse) : hauteur, stades de développement, notations maladies, comptages, surface foliaire, variations de couleur,...

- Mesures indirectes : statut hydrique, rendement, phénotypage métabolique par analyse d'échantillons (teneur en Carbone, Azote, etc)

- Appréciations intégratives dans le cadre de l'innovation variétale (note des sélectionneurs, évaluations générales)

## Format des données

<table><thead><tr><th colspan="2">Nature des données</th><th>Format des données</th><th>Commentaire</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="3">Données environnementales</td><td>Suivi météorologique</td><td>Visualisation en format .xlsx, .csv</td><td></td></tr><tr><td>Suivi des conditions de croissance, données issues de capteurs sols, centrales d'acquisition</td><td>Visualisation en format ..xlsx, .csv</td><td></td></tr><tr><td>Données issues de sondes TDR, Barres Solmes,...</td><td>Visualisation en format .ods, .csv</td><td></td></tr><tr><td rowspan="3">Données phénotypiques</td><td>Mesures directes</td><td>.ods, .csv, .raw, .jpg, .jpeg, .tif</td><td></td></tr><tr><td>Mesures indirectes</td><td>.ods, .csv</td><td></td></tr><tr><td>Appréciations intégratives dans le cadre de l'innovation variétale</td><td>.ods, .csv</td><td></td></tr></tbody></table>

## Périmètre thématique des données

- Ecologie et Biodiversité

- Climat

- Systèmes et pratiques agricoles
Insectes et entomologie

Micro-organismes

Sélection végétale et produits végétaux

Pathologie et santé des plantes

Sols et sciences du sol

Ressources en eau

### 3.1.4 Produit de recherche : Echantillons et matériel végétal

#### Mode d'obtention des données

Données générées par l'entité

#### Origine

Expérimentation

#### Type de données

Objet physique

#### Nature des données

Les échantillons et le matériel végétal produits sont issus des expérimentations et des parcelles en homogénéisation mises en place sur le domaine expérimental de l'UE GCIE.

Ils ont différentes natures :

- Echantillons de sol pour suivi des reliquats azotés et texture, structure du sol

- Echantillons d'insectes prélevés dans le cadre de projets sur le suivi de la faune

- Echantillons végétaux :

- Bruts utilisés pour différentes analyses chimiques et métabolomiques (stockage à -80°C possible)

- Secs après protocole de séchage selon les des projets pour analyses ou broyage

- Broyés selon les besoins des projets pour analyses.

- Produits de récolte toutes espèces confondues destinés à la vente

- Lignées de recherche ou d'innovation variétale

#### Format des données

Objet physique

#### Périmètre thématique des données

Ecologie et Biodiversité

Climat

Insectes et entomologie

Micro-organismes

Sélection végétale et produits végétaux

Pathologie et santé des plantes

Sols et sciences du sol

### 3.1.5 Produit de recherche : Imagerie

#### Mode d'obtention des données

Données générées par l'entité
### Origine

- Observation

- Expérimentation

- Analyse

### Type de données

- Image

- Vidéo

### Nature des données

Images / vidéos acquises sur les différentes cultures par :

- Appareil photo numérique, téléphone portable

- Appareil photographique de type RGB (trépied, perche, drone [Zenmuse P1])

- Capteur de type multispectral [MicaSence RedEdge-P dual] (via vecteur drone)

### Format des données

<table><thead><tr><td>Nature des données</td><td>Format des données</td><td>Commentaire</td></tr></thead><tbody><tr><td>Images et vidéos acquises par appareil photo numérique, téléphone portable</td><td>.jpg / .jpeg / .tiff / .mov / .mpeg4</td><td></td></tr><tr><td>Images et vidéos acquises par appareil photo de type RGB</td><td>.jpg / .jpeg / .tiff / .mov / .mpeg4 / .dng / .raw</td><td></td></tr><tr><td>Images et vidéos acquises par capteur de type multispectral (MicaSense RedEdge-P dual)</td><td>.dng / .raw</td><td></td></tr></tbody></table>

### Périmètre thématique des données

- Ecologie et Biodiversité

- Climat

- Insectes et entomologie

- Sélection végétale et produits végétaux

- Pathologie et santé des plantes

- Sols et sciences du sol

## 3.2 COLLECTE OU REUTILISATION DES DONNEES EXISTANTES

### 3.2.1 Quelles données seront réutilisées ?

Les données produites par l'entité pourront être réutilisées.

Selon le type de données et de projet / convention : une réflexion des scientifiques impliqués en concertation avec l'UE GCIE est nécessaire ; A définir dans le PGD du projet

De façon globale, les données produites par l'UE GCIE peuvent être réutilisées comme suit :

- pour des méta-analyses dans le cas des données d'essai

- dans le cadre de suivi des dispositifs (structuraux et expérimentaux) long-termes

- pour la réutilisation du matériel génétique ressource à des fins de recherche
### 3.2.2 La lecture des données nécessite-t-elle le recours à un logiciel ou un outil spécifique ? Si oui, lequel ?

Vérifier si vos données générées sont dans un format propriétaire et le cas échéant le spécifier et noter le logiciel ou l'outil nécessaire.

INRAE encourage l'utilisation de format ouvert dès que possible.

Pour plus d'informations :

https://science-ouverte.inrae.fr/fr/les-donnees-et-le-numerique-scientifiques/gerer-des-donnees-et-des-codes/choix-des-formats-de

https://doranum.fr/wp-content/uploads/FS2_liste_indicativeFormats_V1.pdf

Certaines données produites par l'UE GCIE nécessitent le recours aux logiciels suivants :

<table><thead><tr><td>Nature des données produites</td><td>Logiciel utilisé</td></tr></thead><tbody><tr><td>Données environnementales, phénotypiques, ...</td><td>Microsoft Packoffice (Excel, Word, PowerPoint)</td></tr><tr><td>Cartographie des rendements</td><td>Farmwork (Trimble)</td></tr><tr><td>Gestion de parcelles : itinéraires techniques, temps de travail, coût,...</td><td>GEOFOLIA (Isagri)</td></tr><tr><td>Cartographie parcelles, géolocalisation cibles pour drone, traitement images issues capteurs RGB, multispectral</td><td>QGIS, Agisoft Metashape</td></tr></tbody></table>

## 4- DOCUMENTATION ET QUALITE DES DONNEES

### 4.1 QUELLES METADONNEES ET QUELLE DOCUMENTATION (PAR EXEMPLE MODE D'ORGANISATION DES DONNEES) ACCOMPAGNERONT LES DONNEES ?

<table><thead><tr><td>Métadonnées</td><td>Origine, mode de production des métadonnées ex : saisie manuelle, annotation atomatique...</td><td>Standard, Vocabulaires associés</td><td>Conditions ou fréquence de la mise à jour (si applicable)</td></tr></thead><tbody><tr><td>Auteur / Contact</td><td>Manuel</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Date</td><td>Manuel / automatique</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Projet</td><td>Manuel</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Lieu / géolocalisation spatiale</td><td>Manuel</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Description</td><td>Manuel</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Type de donnée / Origine des données</td><td>Manuel</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Méthodes d'acquisition</td><td>Manuel</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Mot-clé</td><td>Manuel</td><td>Thésaurus INRAE https://consultation.vocabulairesouverts.inrae.fr/thesaurus-inrae/fr/</td><td></td></tr><tr><td>A compléter selon projet / type de données</td><td>Manuel</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>
Stockez vos métadonnées et une description de vos données (informations de base : auteurs, date, sources, format, logiciel et traitements utilisés, identifiant, description du contenu, url...) dans un fichier texte associé ou dans un onglet spécifique de votre tableur (Fichier ReadMe).

Le lien ci-après donne un exemple de fichier ReadMe tel qu'il peut être réalisé :
https://recherche.data.gouv.fr/fr/categorie/33/guide/modele-de-readme

## 4.2 QUELLES SERONT LES METHODES UTILISEES POUR ASSURER LA QUALITE SCIENTIFIQUE DES DONNEES ?

Au sein de l'entité, les fichiers de données sont gérés et organisés par dispositif expérimental, thématique de recherche ou espèces.

A chaque projet correspond un dossier avec d'éventuelles subdivisions par Work package, années de culture,...

Concernant le nommage et l'organisation des fichiers, vous pouvez consulter :
https://science-ouverte.inrae.fr/fr/les-donnees-et-le-numerique-scientifiques/gerer-des-donnees-et-des-codes/nommage-et-organisation

Concernant le versionning, la modification de fichier s'accompagne de l'ajout, dans le titre du fichier, de la date à laquelle il a été modifié en format AAA-MM-JJ. Par exemple : « AAAA-MM-JJ_NOM FICHIER ».

Le processus de contrôle qualité des données dépend des types de données et des projets.

L'unité met en place des contrôles qualité des appareils et outils.

Concernant la phase de vérification des données saisies, de premières analyses descriptives et statistiques des données permettent également de déterminer s'il existe des données aberrantes ou des outliers.

# 5- EXIGENCES LEGALES ET ETHIQUES, CODE DE CONDUITE

## 5.1 CHARTE INRAE

Les aspects éthiques seront pris en compte en suivant la charte INRAE :

« La vocation d'INRAE est de produire et diffuser des connaissances pour répondre aux enjeux de société dans les domaines de l'alimentation, de l'agriculture et de l'environnement et de mobiliser ces connaissances au service de l'innovation, de l'expertise et de l'appui aux politiques publiques. Ces questions complexes, pour lesquelles la société est en attente de réponses, exigent, à chaque instant, de déployer une démarche scientifique rigoureuse au service de l'intérêt général et de s'interroger sur les enjeux éthiques des projets menés. INRAE, signataire de la Charte de déontologie des métiers de la recherche a réaffirmé son engagement au service de ces valeurs dans sa charte de déontologie, d'intégrité scientifique et d'éthique, ainsi que dans son document de politique d'Intégrité scientifique et a créé une Délégation placée auprès du Président Directeur Général de l'Institut pour promouvoir et garantir le respect de ces valeurs ».

## 5.2 CONFIDENTIALITE

### 5.2.1 Identification des jeux de données contenant des données confidentielles

Certains jeux de données peuvent contenir des données confidentielles.

Les jeux de données comprenant les données suivantes nécessitent une déclaration et une anonymisation :

- les données nominatives qui permettent d'identifier une personne de manière directe ou indirecte
* données de localisation d'exploitation agricole, parcelles : données GPS, coordonnées des exploitants et/ou des exploitations

* données de contacts pour l'organisation de colloques

Il peut s'agir de données récoltées via une enquête, une interview, des vidéos, des images, données GPS de localisation d'exploitation

- les données générées par l'UE GCIE dans le cadre de conventions ou projets impliquant des partenaires privés ou institutionnels hors INRAE

**5.2.2 Quelles sont les mesures prises et les normes auxquelles il est nécessaire de se conformer pour garantir cette confidentialité ?**

- Les données nominatives : prise en compte du RGPD - suivre les recommandations INRAE :
https://donnees-personnelles.intranet.inrae.fr/les-demarches-de-mise-en-conformite/trouver-la-formalite-de-declaration

- Les données générées par l'UE GCIE dans le cadre de collaborations avec partenaires privés ou institutionnels hors INRAE : selon contrat, convention, ou accord de secret / A définir dans le PGD de projet

**5.2.3 Le cas échéant, comment la confidentialité de données fournies par des personnes sera garantie lorsque les données seront partagées ou rendues disponibles pour une analyse de second niveau ?**

- Pour le matériel végétal : MTA, encodage de lignées, certificat d'obtention

- Les données nominatives : Anonymisation en accord avec le RGPD

- Les données générées dans le cadre de collaborations avec partenaires privés ou institutionnels hors INRAE : selon convention ou contrat de recherche, il peut être explicitement demandé par les partenaires que les données ne soient pas partagées par l'UE GCIE.

**5.2.4 Comment les autres questions juridiques, comme la titularité ou les droits de propriété intellectuelle sur les données, seront-elles abordées ? Quelle est la législation applicable en la matière ?**

Les droits de propriété intellectuelle des données produites par l'UE GCIE reviennent à INRAE - Excepté si accord de consortium pour les projets et données générées lors de prestation de service ou partenaire privé détiendra les droits sur les données et les autres informations créées.

Toutes les données ne sont pas partageables : assurez-vous que vos données sont bien diffusables au regard du droit.

# 6- TRAITEMENT ET ANALYSE DES DONNEES

Il est indispensable de spécifier, pour chaque type de données, l'ensemble des outils et méthodes utilisées pour leur traitement et analyse, depuis leur acquisition jusqu'à leur mise à disposition, leur archivage ou leur destruction.

Par exemple :

- Dans le cas de mesures directes (Observation, notations et mesures) : les méthodes et outils utilisés sont basés sur les protocoles associés

- Dans le cas de mesures instrumentées : les méthodes sont spécifiques aux instruments utilisés (appareils de mesure, automates, ...)
Pour l'acquisition des données, l'UE GCIE utilise des ordinateurs, tablettes, Pad, APN, GPS, instruments spécifiques de mesure (miniPAM, Greenseeker,...)

Les données sont ensuite traitées par l'entité via des logiciels d'analyse et de traitement des données (Excel, R, QGIS, Agisoft Metashape (traitement des images)...).

Selon les projets, la chaîne de traitement et d'analyse peut être partagée entre l'entité UE GCIE et les partenaires impliqués dans le projet. Il conviendra donc de définir clairement dans le PGD de projet quels niveaux d'analyse et quelles analyses sont à réaliser par l'entité, et/ou par le demandeur d'expérimentation/partenaire/porteur de projet. Il conviendra également de bien définir les rôles de chacun dans ce pipeline de traitement et d'analyse de données.

# 7- STOCKAGE ET SAUVEGARDE DES DONNEES PENDANT LE PROCESSUS DE RECHERCHE

## 7.1 QUELS SONT LES TYPES DE FLUX EMPRUNTES PAR LES DONNEES ET LES SUPPORTS UTILISES POUR LES STOCKER ?

En local, au premier niveau, les données sont stockées sur des supports numériques divers (ordinateurs, clés USB, disques durs externes, ...), avec au moins 2 sauvegardes sur des supports différents.

Elles sont aussi stockées :

- en local sur le réseau géré par le centre INRAE de Versailles, avec gestion des droits d'accès.

- sur un serveur distant (pnas1), avec gestion des droits d'accès et sauvegarde sur les datacenter INRAE.

Les données peuvent être transmises par messagerie aux demandeurs. Selon la volumétrie des données, les fichiers sont transmis en pièce jointe ou via un lien donnant l'accès aux fichiers volumineux (outil FileSender par exemple).

A terme, et lorsque les données produites par l'UE ont été validées, elles seront stockées par l'UE GCIE sur le système d'information Sixtine, outil de stockage et sauvegarde des données avec gestion des droits d'accès selon projets et sauvegardes quotidiennes sur les datacenters d'INRAE.

Dans le cadre d'un projet, l'UE s'autorise à intégrer les données produites par l'UE et validées sur Sixtine 1 an après la fin du projet (ce temps pourra être néanmoins adapté en fonction du projet).

Concernant les données de type « échantillons, matériel végétal », la procédure de stockage doit être définie en concertation entre les scientifiques impliquées et l'UE GCIE lors du montage du projet. La volumétrie d'échantillons prévues, les lieux et conditions et durée de stockage devront être indiqués dans le PDG du projet.

## 7.2 QUELLE EST LA VOLUMETRIE ACTUELLE ET PREVISIONNELLE ?

Approximativement 5 à 10 To / an (prise en compte des données d'imagerie acquises par drone, sans compter les données gérées directement par BioEcoAgro pour l'ORE)

La volumétrie est amenée à augmenter avec le développement de l'activité de phénotypage haut débit par imagerie depuis 2022. Chaque année, la quantité d'images produite peut atteindre 4 To. Une réflexion nationale est en cours sur la gestion de ce type de données (stockage et archivage).
Lors de la rédaction du PGD de projet, une volumétrie estimative devra être indiquée dans la première version du PGD. Cette volumétrie devra être actualisée au réel dans les versions suivantes du PGD.

### 7.3 L'ENTITE HEBERGEANT PHYSIQUEMENT LES DONNEES A-T-ELLE UNE POLITIQUE DE SECURITE POUR SON SYSTEME D'INFORMATION ? (POLITIQUE LOCALE, CHARTE DES INFRASTRUCTURES DE RECHERCHE...)

Charte des infrastructures de recherche à INRAE (Charte des infrastructures de recherche (inrae.fr)) pour les infrastructures INRAE (Data-inrae, Nextcloud, Sharepoint).

Dans le cas d'un stockage local ou distant, se référer à la DSI pour la politique appliquée.

### 7.4 SECURITE - CONFIDENTIALITE : LES DONNEES FONT-ELLES L'OBJET D'ECHANGE OU DE PARTAGE AVEC DE TIERS ACTEURS ET SELON QUELLES MODALITES ? COMMENT SONT DETERMINES LES DROITS D'ACCES AUX DONNEES AVANT LEUR PUBLICATION ?

Certaines données font l'objet d'échange et de partage sous couvert des règles de confidentialité et d'accès des projets, ou encore sous accord de transfert de matériel biologique (MTA) pour le matériel végétal.

Les partages peuvent s'effectuer par mail, Sharepoint, Nexcloud, FileSender, (ou autres outils de partage de fichiers volumineux).

Les services Google sont à proscrire.

L'utilisation en routine du système d'information Sixtine, à terme, devrait permettre d'éviter des échanges de fichiers par mail, clé USB ou autre, puisque les personnes autorisées pourront récupérer les données sur ce système.

### 7.5 SECURITE - INTEGRITE - TRACABILITE : QUELLES SONT LES MESURES DE PROTECTION MISES EN OEUVRE POUR SUIVRE LA PRODUCTION ET L'ANALYSE DES DONNEES ?

Accès contrôlé par mots de passe

Sauvegarde régulière sur différents supports et via les datacenter INRAE.

MTA

## 8- PARTAGE DES DONNEES ET CONSERVATION A LONG TERME

### 8.1 PARTAGE DES DONNEES

#### 8.1.1 Y a-t-il une obligation de partage des données (ou à l'inverse une interdiction ou restriction) ?

Il y a une obligation de partage pour toutes les données obtenues avec un financement public.

Il y a une restriction en fonction des consortiums de projets, des accords de partenariats privés et des données nominatives.

Recommandation : consulter sur le site de datapartage: gouvernance des données/ fiche juridique partage

https://science-ouverte.inrae.fr/fr/les-donnees-et-le-numerique-scientifiques/la-gouvernance-des-donnees/logigramme-aussi-ouvert-que
### 8.1.2 Comment les données seront-elles partagées ?

Les données produites par l'UE et validées seront à terme importées et sauvegardées dans le système d'information Sixtine, ayant pour vocation le stockage et la sauvegarde sur datacenters sécurisés de l'ensemble des données produites par les UEs d'INRAE. Les accès aux données sont bien sûr gérés par des droits d'accès, ce qui permet de prendre en compte la confidentialité ou l'accès restreint de certaines données.

Les données traitées et finalisées doivent être publiées sur un entrepôt de données sauf exception. Il conviendra de définir dans le PGD du projet, à partir de quand les données peuvent être publiées dans un entrepôt.

Par exemple, dans le cas d'un projet et de valorisation sous forme de publication (article scientifique), le jeu de données associé pourra être publié dans l'entrepôt dès que l'article scientifique est accepté.

Pour le choix de l'entrepôt, il est possible de choisir un entrepôt thématique de confiance s'il existe (https://www.ouvrirlascience.fr/selectionner-un-entrepot-thematique-de-confiance-pour-le-depot-de-donnees-methodologie-et-analyse-de-loffre-existante/) ou de déposer les données sur le portail Data Inrae (Data INRAE) dans un dataverse thématique ou sur le dataverse de l'UE GCIE (https://entrepot.recherche.data.gouv.fr/dataverse.xhtml?alias=ue_gcie).

Si vos données sont déposées dans un entrepôt thématique, il est fortement recommandé de faire un lien dans le dataverse de l'UE GCIE vers les données publiées dans l'entrepôt thématique (https://entrepot.recherche.data.gouv.fr/dataverse.xhtml?alias=ue_gcie).

### 8.1.3 Avec qui ?

- Agents IINRAE authentifiés

- Partenaires de projet identifiés

De façon générale, l'Open Data est à privilégier dans le cadre de la politique « Science ouverte » de l'institut.

### 8.1.4 Sous quelle licence ?

Licence ouverte : https://www.etalab.gouv.fr/licence-ouverte-open-licence (compatible CC-BY)

Par défaut : licence ouverte sauf exception selon les projets et les consortiums

Lorsque vous déposez vos données, vérifiez la licence par défaut avant de publier.

## 8.2 CONSERVATION A LONG TERME

### 8.2.1 Quelles sont les données à conserver sur le moyen ou le long terme et quelles sont les données à détruire ?

Les UE doivent être capables de fournir les données anciennes sans limite de temps hors matériel végétal et échantillons stockés dont la conservation doit être précisée dans le PGD du projet, (cf ci-après). Il est nécessaire de préserver toutes les données non-reproductibles (données brutes), les données finales (post-analyses), ainsi que les métadonnées associées. Les données intermédiaires peuvent être conservées jusqu'à la publication.

Dans le cadre de projets et partenariat, le choix des données à conserver sur le moyen / long terme, sera à définir avec les scientifiques impliqués dans le PGD du projet. Dans la mesure du possible, indiquer une 'date d'expiration' des données générées stockées localement (ex: 5-10 ans après publication).
Concernant les données physiques, de type « échantillons et matériel végétal », la durée de conservation des échantillons devra être définie avec les scientifiques impliqués dès le début du projet / de la prestation / du partenariat dans le cadre du PGD de projet.

L'UE GCIE s'autorisera à demander aux scientifiques impliqués d'effectuer un tri des échantillons conservés compte tenu de la place disponible dans les salles / chambres froides prévues pour le stockage et la conservation d'échantillons.

## 8.2.2 Sur quelle plateforme d'archivage pérenne seront archivées les données à conserver sur le long terme ?
Sinon, quelles procédures seront mises en place pour la conservation à long terme ?

Recommandations :

1. Dépôt sur le système d'information Sixtine

2. Dépôt dans un entrepôt thématique ou sur data.inrae avec :

- Création d'un sous-dataverse de projet dans le dataverse de l'UEGCIE (https://entrepot.recherche.data.gouv.fr/dataverse.xhtml?alias=ue_gcie)

## 8.2.3 Quelle est la durée de conservation des données ?

A définir au début du projet pour chaque type de données (vigilance pour les échantillons et le matériel végétal produit)

## 8.2.4 Quelles garanties de financements couvriront les coûts associés à la conservation à long terme ?

Financements structuraux (liés à l'existence des dispositifs)

Financements partiels via les coûts expérimentaux ou de façon directe par les projets