# Plan de gestion des données de l'unité de recherche PROSE (UR1461 INRAE)

Cédric Midoux

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Cédric Midoux. Plan de gestion des données de l'unité de recherche PROSE (UR1461 INRAE). INRAE - UR PROSE. 2026, 34 p. hal-05442197

HAL Id: hal-05442197

https://hal.inrae.fr/hal-05442197v1

Submitted on 16 Jan 2026

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> PGD PROSE

Plan de gestion des données de l'unité de recherche PROSE (UR1461 INRAE)

2026-01-16 – Version 26.01

10.17180/qy54-2h45

INRAE

Institut national de recherche pour
l'agriculture, l'alimentation et l'environnement

<figure><img src="image_2.png" /></figure>

<figure><img src="image_3.png" /></figure>
<figure><img src="image_4.png" /></figure>
<table><tr><td><strong>Avant-propos</strong></td><td><strong>5</strong></td></tr><tr><td>Renseignements sur l'entité de recherche</td><td>5</td></tr><tr><td>Renseignements sur le plan</td><td>6</td></tr></table>

<table><tr><td><strong>1 Métadonnées & Données des expérimentations</strong></td><td><strong>9</strong></td></tr><tr><td>1.1 Description des données et collecte ou réutilisation de données existantes</td><td>9</td></tr><tr><td>1.2 Documentation et qualité des données</td><td>10</td></tr><tr><td>1.3 Exigences légales et éthiques, code de conduite</td><td>11</td></tr><tr><td>1.4 Traitement et analyse des données</td><td>11</td></tr><tr><td>1.5 Stockage et sauvegarde des données pendant le processus de recherche</td><td>12</td></tr><tr><td>1.6 Partage des données et conservation à long terme</td><td>12</td></tr></table>

<table><tr><td><strong>2 Codes, Scripts, Workflows & Modèles</strong></td><td><strong>15</strong></td></tr><tr><td>2.1 Description générale du logiciel</td><td>15</td></tr><tr><td>2.2 Outils et environnement d'exécution</td><td>15</td></tr><tr><td>2.3 Préservation du logiciel</td><td>16</td></tr><tr><td>2.4 Questions juridiques</td><td>16</td></tr><tr><td>2.5 Valorisation scientifique</td><td>17</td></tr></table>

<table><tr><td><strong>3 Résultats d'analyses, de simulations et statistiques</strong></td><td><strong>19</strong></td></tr><tr><td>3.1 Description des données et collecte ou réutilisation de données existantes</td><td>19</td></tr><tr><td>3.2 Documentation et qualité des données</td><td>20</td></tr><tr><td>3.3 Exigences légales et éthiques, code de conduite</td><td>20</td></tr><tr><td>3.4 Traitement et analyse des données</td><td>21</td></tr><tr><td>3.5 Stockage et sauvegarde des données pendant le processus de recherche</td><td>21</td></tr><tr><td>3.6 Partage des données et conservation à long terme</td><td>22</td></tr></table>

<table><tr><td><strong>4 Documents produits de rédaction</strong></td><td><strong>23</strong></td></tr><tr><td>4.1 Description des données et collecte ou réutilisation de données existantes</td><td>23</td></tr><tr><td>4.2 Documentation et qualité des données</td><td>24</td></tr><tr><td>4.3 Exigences légales et éthiques, code de conduite</td><td>24</td></tr><tr><td>4.4 Traitement et analyse des données</td><td>25</td></tr><tr><td>4.5 Stockage et sauvegarde des données pendant le processus de recherche</td><td>25</td></tr><tr><td>4.6 Partage des données et conservation à long terme</td><td>26</td></tr></table>

<table><tr><td><strong>5 Documents d'évaluations & données administratives</strong></td><td><strong>27</strong></td></tr><tr><td>5.1 Description des données et collecte ou réutilisation de données existantes</td><td>27</td></tr><tr><td>5.2 Documentation et qualité des données</td><td>28</td></tr><tr><td>5.3 Exigences légales et éthiques, code de conduite</td><td>28</td></tr><tr><td>5.4 Traitement et analyse des données</td><td>29</td></tr><tr><td>5.5 Stockage et sauvegarde des données pendant le processus de recherche</td><td>29</td></tr><tr><td>5.6 Partage des données et conservation à long terme</td><td>30</td></tr></table>

<table><tr><td><strong>Appendices</strong></td><td><strong>31</strong></td></tr></table>

<table><tr><td><strong>A Serveur de stockage</strong></td><td><strong>31</strong></td></tr></table>

<table><tr><td><strong>B Liens d'intérêt</strong></td><td><strong>33</strong></td></tr></table>
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# Avant-propos

<figure><img src="image_6.png" /></figure>

## La science ouverte à INRAE

### Principes pour la gouvernance des données, des codes et des algorithmes

1. Il faut partager et réutiliser les données en respectant les valeurs de la science.

2. Les données doivent être gérées en vue de les rendre FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable).

3. Les données doivent être « aussi ouvertes que possible, aussi fermées que nécessaire ».

4. L'ouverture des données contribue à l'innovation et à la création de valeur pour la société.

<figure><img src="image_7.png" /></figure>

## Cadre général

Ce document n'a pas de valeur juridique et est destiné uniquement à un usage organisationnel. Il précise les pratiques et responsabilités relatives à la gestion des données de recherche au sein de l'unité, **sous l'autorité et la responsabilité du directeur ou de la directrice d'unité,** qui reste seul responsable légal en matière de gouvernance et de gestion des données.

# Renseignements sur l'unité de recherche

## Nom de l'unité

- Procédés Biotechnologiques au Service de l'Environnement

## Acronyme

- PROSE

## Identifiant

- Unité de recherche INRAE - UR 1461

- RNSR : 200518614R

## Description

L'unité PROSE mène des recherches sur les biotechnologies environnementales, depuis l'échelle des communautés microbiennes jusqu'à celle des procédés (stations d'épuration, digesteurs anaérobies, procédés bioélectrochimiques pour la bioraffinerie, ...), en articulation avec les grands enjeux sociétaux de développement durable, d'économie circulaire et de bioéconomie.
Affiliée aux départements TRANSFORM et MICA d'INRAE, l'unité PROSE s'inscrit dans une démarche transdisciplinaire fondée sur l'écologie microbienne, la biogéochimie, le génie des procédés, les mesures physiques et la modélisation.

L'unité PROSE est composée d'un **pôle de chercheurs et chercheuses porteurs de projets**, d'un **pôle analytique** regroupant un laboratoire de microbiologie moléculaire et un laboratoire de chimie dotés d'équipements de pointe, et d'un **pôle expérimentation** ayant une capacité à déployer ses compétences à la fois à l'échelle pilote et sur le terrain.

## Domaines de recherche (selon classification de l'OCDE)

- Environmental biotechnology

## Date de création

- 2019-05-13

## Adresse

- 1 rue Pierre-Gilles de Gennes, 92761 Antony Cedex

## Site

- https://prose.jouy.hub.inrae.fr/

## Établissements et tutelles

- INRAE - Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement ROR - Établissement tutelle

- Département de recherche TRANSFORM (Aliments, produits biosourcés et déchets) ROR - Département pilote

- Département de recherche MICA (Microbiologie et chaîne alimentaire) ROR

- Centre Île-de-France - Jouy-en-Josas - Antony ROR

- Université Paris-Saclay ROR

## Direction

- Bouchez Theodore ID - Directeur d'unité

- Mazéas Laurent ID - Directeur adjoint

## Renseignements sur le plan

### Modèle du plan

- Science Europe : modèle structuré pour les entités de recherche

### Titre du plan

- Plan de l'entité "Procédés Biotechnologiques au Service de l'Environnement"
Objet et périmètre du plan

Ce plan s'inscrit dans le cadre des activités de recherche de l'unité PROSE et des projets de recherche auxquels elle contribue.

Version

– Version 26.01 – Première version publiée

Identifiant

– doi 10.17180/qy54-2h45

☐ hal-05442197

Langue

– Français

Licence

– [cc BY-SA](https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/) - Creative Commons Attribution Share Alike 4.0 International

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Coordinateur de la rédaction du PGD

– Midoux Cédric [ID](https://www.cldp.org/) - Référent Données opérationnel

Produits de recherche

1. Métadonnées & Données des expérimentations (Jeux de données)

2. Codes, Scripts, Workflows & Modèles (Logiciel)

3. Résultats d'analyses, de simulations et statistiques (Ressource interactive)

4. Documents produits de rédaction (Texte)

5. Documents d'évaluations & données administratives (Autre)
<figure><img src="image_8.png" /><figcaption>Diagramme des relations entre les produits de recherche</figcaption></figure>
# Chapitre 1

## Métadonnées & Données des expérimentations

- **Nom** : Métadonnées & Données des expérimentations

- **Nom abrégé** : meta&data_exp

- **Type** : Jeux de données

- **Mots clés** : expérimentation, mesures, métadonnées, omique, métabolomique, microscopie, spectrométrie

- **Contient des données personnelles** : Non

### 1.1 Description des données et collecte ou réutilisation de données existantes

#### 1.1.1 Description générale du produit de recherche

Ce produit de recherche regroupe l'ensemble des données et métadonnées issues des expérimentations de l'unité, réalisées aussi bien en laboratoire que sur le terrain. Il s'agit de données brutes, directement issues des instruments de mesure, non interprétées.

On retrouve notamment :

- Mesures expérimentales et physico-chimiques

- Métadonnées associées aux expérimentations

- Données omiques (séquençage)

- Images de microscopie

- Analyse du carbone (TOC-L)

- Analyse en flux continu (QuAAtro)

- Données de chromatographie ionique (AGV, composés soufrés, anions, cations)

- Données spectrales par spectrométrie de masse isotopique (IRMS) ou par spectrométrie de masse haute résolution (Orbitrap)

- Données métabolomiques (Orbitrap et FT-ICR)

Les formats de données utilisés varient selon le type d'observation ou de mesure :

- csv/tsv (ou export xlsx) pour les mesures expérimentales et physico-chimiques

- txt pour les données textuelles

- fastq pour les données omiques

- jpg ou format constructeur pour les images de microscopie

- csv/tsv ou format constructeur (raw, xy, tlk, cmb, dxf, ...) pour les données de chromatographie, spectrométrie, métabolomiques
Lorsque les données sont produites dans des formats propriétaires, elles sont exportées et archivées autant que possible dans des formats standards et ouverts. Elles sont décrites en anglais. Le domaine d'application couvre les bioprocédés environnementaux.

Une attention particulière est portée à la complétude et à la cohérence des métadonnées (sans systématiquement recourir à un vocabulaire contrôlé) et à leur suivi. Celles-ci sont centralisées sur le serveur de l'unité.

Aucun identifiant pérenne n'est associé aux jeux de données de ce produit de recherche. Il ne contient ni données sensibles, ni données à aspects éthiques.

### 1.1.2 Réutilisation de données existantes

Des données de recherche issues d'expérimentations antérieures ou externes peuvent être réutilisées comme données complémentaires, de comparaisons ou pour des méta-analyses. Cela concerne particulièrement les données omiques, librement disponibles dans des bases de données internationales ouvertes.

La réutilisation de données préexistantes n'est généralement pas contrainte par des questions de licences ou de coûts, mais elle peut l'être par des différences de plans expérimentaux, de formats ou d'interopérabilité des métadonnées.

### 1.1.3 Production et collecte de nouvelles données

Les données sont le résultat d'observations ou d'expérimentations.

Ces données peuvent être produites soit par l'unité, soit par des tiers (collaborations académiques, partenaires industriels et prestataires extérieurs) :

- **Mesures expérimentales et physico-chimiques** : produites par PROSE (pôles analytique et expérimentation), en laboratoire ou sur le terrain, et par des partenaires industriels

- **Données omiques (séquençage)** : produites à PROSE (pôle analytique : *Miseq* - *Illumina* et *Minion* - *Oxford Nanopore*) et via des prestataires extérieurs

- **Données métabolomiques** : produites à PROSE (pôle analytique : *LTQ-Orbitrap XL - Thermo*) et via des collaborations académiques

- **Images de microscopie** : produites à PROSE (pôle analytique : *microscopie confocale - Zeiss*) et via des collaborations académiques

- **Données spectrales** : produites via des collaborations académiques

## 1.2 Documentation et qualité des données

### 1.2.1 Métadonnées et documentation accompagnant les données

Les jeux de données de ce produit de recherche sont stockés sur le serveur de l'unité, avec une organisation par projet de recherche.

Il n'existe pas de convention unifiée de nommage, d'organisation, de classification, de vocabulaire contrôlé ou de suivi de versions à l'échelle de l'unité pour décrire les jeux de données de ce produit de recherche. Ces organisations et conventions sont définies au niveau de chaque projet.

La traçabilité des expérimentations et obtention des mesures est assurée et archivée par les cahiers de laboratoire papiers de l'unité. Des sommes de contrôle (md5sum) sont utilisées pour garantir la non-corruption des données produites et sont conservées comme métadonnées tout au long du projet, de la production à la publication.

Pour les données omiques, le standard de métadonnées de la communauté utilisé est le *Minimum Information about any (x) Sequence (MIxS).*
Pour certaines mesures génériques, le schéma de métadonnées Dublin Core est envisagé comme cadre de description minimal et permettra d'améliorer l'interopérabilité et la réutilisation de ces données.

Une documentation spécifique, produit par le fournisseur, est associée aux appareils de mesure utilisés.

## 1.2.2 Méthodes utilisées pour assurer la qualité scientifique des données

La qualité et la conformité des données collectées sont garanties par la traçabilité des activités de recherche tel que : la calibration programmée des instruments, le respect des protocoles, la standardisation des procédures, l'utilisation de témoins positifs, négatifs et de blancs, la réalisation de triplicats, la validation des saisies, l'utilisation de somme de contrôle, et l'expertise des opérateurs.

# 1.3 Exigences légales et éthiques, code de conduite

## 1.3.1 Questions juridiques, titularité, droits de propriété intellectuelle et législation applicable

Par défaut, les données produites et collectées appartiennent à INRAE. Elles sont diffusées selon le principe «aussi ouvertes que possible, aussi fermées que nécessaire», et mises à disposition sous licence libre Creative Commons **CC BY-SA** ou **Etalab 2.0**.

Dans certains projets, notamment dans le cadre de partenariats industriels, un accord de consortium peut venir restreindre l'accès, la titularité ou la propriété des données.

Dans le cas particulier des prestations de service et campagnes de mesures réalisées pour le compte d'un tiers, la propriété des données produites revient au client commanditaire. Les modalités d'accès, de diffusion et d'ouverture éventuelle des données peuvent être précisées et négociées dans le contrat de prestation ou la convention associée. À l'issue de la prestation, l'unité n'est plus responsable des données produites, ni de leur stockage, archivage ou diffusion.

## 1.3.2 Responsabilités et gouvernance

Dans tous les cas, la responsabilité et la gouvernance des données relève du porteur de projet de recherche, par délégation du directeur ou de la directrice d'unité. Il est de sa responsabilité de veiller à la bonne collecte, description, organisation, traitement, stockage, valorisation des jeux de données de ce produit de recherche. Les agents impliqués dans la production sont responsables de la qualité et de la traçabilité des données qu'ils génèrent. L'institut assure pour sa part l'administration et la maintenance technique des infrastructures de stockage.

## 1.3.3 Questions éthiques et codes déontologiques

Les jeux de données de ce produit de recherche ne soulèvent pas de questions éthiques particulières. Aucun comité d'éthique n'est requis. Par défaut, les jeux de données de ce produit de recherche suivent la charte de déontologie, d'intégrité scientifique et d'éthique d'INRAE.

# 1.4 Traitement et analyse des données
### 1.4.1 Traitement des données

Selon le niveau de reproductibilité, portabilité et passage à l'échelle nécessaire, les jeux de données de ce produit de recherche peuvent être traités avec différents outils :

- des logiciels tableurs tels que Excel

- des langages de programmation libres pour la science des données tels que R et Python, une attention particulière est apportée au suivi de version du code et à l'environnement d'exécution (voir chapitre Codes, Scripts, Workflows & Modèles)

- des logiciels propriétaires spécifiques aux instruments de mesure utilisés tels que TOC-L Sample, AACE, Chromeleon, Isodat, Xcalibur, W4M/R, SPIX

Dans tous les cas, les données brutes sont conservées jusqu'à l'issue du projet et à la valorisation. Les résultats de traitement de données relèvent du produit de recherche Résultats d'analyses, de simulations et statistiques.

Les traitements peuvent être réalisés directement sur les instruments, sur les postes de travail des agents de l'unité, ou sur des infrastructures scientifiques collectives offrant des solutions de calcul scientifique mutualisées, comme les clusters MIGALE ou GenoToul.

## 1.5 Stockage et sauvegarde des données pendant le processus de recherche

### 1.5.1 Stockage et sauvegarde tout au long du projet

Pendant les projets, les données sont stockées sur le serveur interne pnas de l'unité (voir annexe Serveur de stockage), administré par la DSI de l'institut, avec une organisation par projet dans le dossier 6_JProjets/. Les droits d'accès (lecture/écriture) sont définis par le porteur du projet au démarage du projet.

Les données brutes issues des instruments sont également stockées par lot d'analyses dans le dossier 5_Donnees/, organisé par sous-dossiers par appareil ou thématique (Bioanalyzer/, Chimie/, microGC/, Microscope/, Potentiostat/, qPCR/, Sequencage/, Spectrophotometre/, TapeStation/). L'écriture dans ces dossiers est réservée aux agents en charge de la production des données.

Dans certains cas (par exemple, systèmes d'exploitation d'appareils obsolètes ou non reliés au serveur), les données peuvent être temporairement stockées en local, sur les instruments de mesures ou sur disques durs externes. C'est en particulier le cas pour les données intermédaires en phase de collecte, d'interprétation et de conversion.

L'ensemble des données représente environ une dizaine de téraoctets. Les coûts associés sont pris en charge par l'institut.

Il n'existe pas de politique complémentaire de sauvegarde, de géo-réplication ou de sécurité des données.

## 1.6 Partage des données et conservation à long terme

### 1.6.1 Partage des données

Au cours du projet de recherche, le partage des données avec les partenaires impliqués s'effectue via le service sécurisé FileSender mis à disposition par le groupement d'intérêt public RENATER.

À la fin du projet de recherche, les données sont valorisées, partagées à la communauté et diffusées via des entrepôts institutionnels, thématiques ou généralistes, tels que le dataverse de l'institut sur
Recherche Data Gouv, ENA database pour les données omiques ou Metabolomics Workbench pour les données métabolomiques.

Lorsque cela est pertinent, les jeux de données sont valorisés en tant que tel sous forme de *data papers* dans des journaux tel que *Data in Brief*, *Scientific Data* ou *Microbiology Resource Announcements*.

Dans le cas spécifiques des données issues de partenaires industriels, un accord de consortium poura limiter ou définir le partage et la réutilisation de données pré-existantes.

## 1.6.2 Conservation à long terme

Il n'existe pas de politique d'archivage à long terme ni de politique de suppression. Les données restent stockées sur le serveur de l'unité.
<figure><img src="image_9.png" /></figure>
# Chapitre 2

## Codes, Scripts, Workflows & Modèles

- **Nom** : Codes, Scripts, Workflows & Modèles

- **Nom abrégé** : codes

- **Type** : Logiciels

- **Mots clés** : code, script, workflow, modèle, analyse, simulation, logiciel

- **Contient des données personnelles** : Non

### 2.1 Description générale du logiciel

#### 2.1.1 Dénomination et description du logiciel

Ce produit de recherche regroupe l'ensemble des codes informatiques produits dans le périmètre
des projets de recherche de l'unité.

Il comprend notamment :

- Scripts de traitement et d'analyse des données

- Workflows d'analyse et environnements d'exécution associés

- Développements de packages, d'outils et de logiciels

- Modèles de simulations numériques

Ces codes peuvent être développés par l'unité de recherche ou par ses partenaires. Le domaine d'application couvre les bioprocédés environnementaux. Le public cible est avant tout scientifique : membres de l'unité, communauté académique ou partenaires industriels.

Ces développements s'inscrivent dans le cycle de vie des données de la recherche de ce plan de gestion et assurent la transition des données brutes (voir chapitre Métadonnées & Données des expéri-mentations) aux résultats analytiques (voir chapitre Résultats d'analyses, de simulations et statistiques).

Des bibliothèques, plugings, modules ou composants externes, libres ou propriétaires, développés par la communauté ou par des entreprises, peuvent être utilisés dans le cadre de ces développements. Dans la mesure du possible, les solutions logicielles libres sont privilégiées.

Ce produit de recherche ne contient ni données sensibles ni éléments à caractère éthique. Les coûts associés à son stockage sont faibles et pris en charge par l'institut.

### 2.2 Outils et environnement d'exécution

#### 2.2.1 Environnement de développement

Les codes de ce produit de recherche sont gérés avec le système de gestion de versions Git, garan-
tissant le suivi des modifications, la sauvegarde décentralisée et la collaboration entre développeurs.
Les dépôts sont hébergés sur la forge institutionnelle (https://forge.inrae.fr/), soit dans
le groupe de l'unité (https://forge.inrae.fr/prose), soit dans un espace projet dédié à un
projet de recherche, soit dans l'espace personnel d'un agent.

Pour certains développements d'envergure, un miroir peut être mis en place sur GitHub afin d'améliorer la visibilité et la diffusion.

Par défaut, l'accès aux codes est ouvert et public, sauf restriction spécifique liée à un projet ou à un partenariat.

Suivant les besoins, des frameworks d'intégration continue peuvent être mis en œuvre, notamment GitLab CI, avec des GitLab Pages pour le déploiement de sites de documentation, de rapports d'exécution ou de démonstrateurs.

2.2.2 Documentation

Une documentation technique accompagne chaque code, stockée dans le même dépôt que le code
source, sous forme d'un README.md, ou d'un site web déployé via GitLab Pages suivant les besoins.

Les tickets (issues) permettent de suivre les évolutions, les anomalies et les demandes d'amélioration.

Des fichiers de configuration (requirements.txt, environment.yml, renv.lock, ...) assurent la portabilité et reproductibilité des environnements d'exécution.

2.2.3 Environnement d'exécution

Les langages et outils utilisés varient selon l'objectif des développements de ce produits de recherches :

- R ou Python pour les scripts de traitement et d'analyse

- Quarto, Rmdown ou Jupyter Notebook pour les notebooks et rapports d'analyse

- Snakemake ou Galaxy pour les workflows d'analyse

- Python pour les modèles métaboliques

- MATLAB ou COMSOL pour les modèles de simulation numérique

- Dockerfile, conda, renv ou pyenv pour la gestion des environnements d'exécution

Les exécutions peuvent être réalisées sur les postes de travail des agents de l'unité (principalement sous Windows), ou sur des infrastructures scientifiques collectives disposant d'environnements de calcul mutualisés, basés sur GNU/Linux.

2.3 Préservation du logiciel

2.3.1 Référencement et archivage pérenne

Si il y a lieu, lorsque le niveau de maturité est atteint, les développements de ce produit de recherche sont archivés dans Software Heritage, garantissant la préservation du code source et de son historique. Les notices associées sont déposées dans le catalogue HAL de l'unité, permettant leur référencement et leur valorisation institutionnelle et leur diffusion.

Un identifiant pérenne (SWHID, HALid, DOI) peut être attribué lors de ces étapes pour faciliter la
citation et l'intégration dans les publications.

2.4 Questions juridiques
## 2.4.1 Aspects juridiques en lien avec la gestion du logiciel

Par défaut, les développements de ce produit de recherche appartiennent à INRAE. Ils sont diffusés sous licence libre, GPLv3 (licence contaminante copyleft) ou MIT (licence permissive).

Dans certains projets, notamment dans le cadre de partenariats industriels, un accord de consortium peut restreindre l'accès, la titularité ou la propriété intellectuelle des développements.

## 2.4.2 Responsabilités et gouvernance

Dans tous les cas, la responsabilité de la gouvernance et de la diffusion du code de ce produit de recherche relève du porteur de projet de recherche, par délégation du directeur ou de la directrice d'unité. Il veille à sa maintenance et à sa valorisation. Les agents impliqués dans la production sont responsables de la qualité, la documentation, la traçabilité et la portabilité des codes qu'ils génèrent. L'institut assure pour sa part l'administration et la maintenance technique des infrastructures de stockage et de diffusion.

# 2.5 Valorisation scientifique

## 2.5.1 Valorisation scientifique

Selon les projets, lorsque le niveau de maturité de développement est atteint, les codes de ce produit de recherche peuvent être valorisés en tant que tel sous forme de software papers dans des journaux tel que *Journal of Open Source Software*, ou associé à un publication scientifique décrivant les méthodes et les résultats associés.
<figure><img src="image_10.png" /></figure>
## Résultats d'analyses, de simulations et statistiques

- **Nom** : Résultats d'analyses, de simulations et statistiques

- **Nom abrégé** : analytical_results

- **Type** : Ressources interactives

- **Mots clés** : analyses, rapports, simulations, transformations, statistiques

- **Contient des données personnelles** : Non

### 3.1 Description des données et collecte ou réutilisation de données existantes

#### 3.1.1 Description générale du produit de recherche

Ce produit de recherche regroupe l'ensemble des résultats analytiques, d'agrégation, de simulation, de modélisation et de statistiques issus de l'analyse, la transformation et l'interprétation, par l'unité de recherche, des données expérimentales (voir chapitre *Métadonnées & Données des expérimentations*), produites au sein de l'unité ou non, à l'aide des scripts d'analyse (voir chapitre *Codes, Scripts, Workflows & Modèles*), produit au sein de l'unité ou non.

On retrouve en particulier :

- Résultats d'analyses

- Analyses statistiques

- Données transformées ou agrégées

- Résultats de simulations et modélisations

- Images transformées

Les formats des résultats analytiques sont variés :

- PDF ou html pour les rapports d'analyse

- docx, txt ou qmd pour les sources éditable associées

- csv/tsv pour les données transformées au format tabulé

- parquet, RDS ou RData pour les objets R et Python

- m, math et fig pour les modèles, données et figures issues de simulations avec MATLAB

- autres formats spécifiques tels que *biom* pour certaines données biologiques

Dans la mesure du possible, les résultats analytiques sont produits dans des formats standards et ouverts. Ils sont décrits en français ou en anglais. Les sources éditable sont conservées afin de permettre la réutilisation et la traçabilité. Le domaine d'application couvre les bioprocédés environnementaux. Le public cible est avant tout scientifique : membres de l'unité, communauté académique ou partenaires industriels.
Aucun identifiant pérenne n'est attribué par défaut à ces résultats analytiques de ce produit de recherche. Il ne contient ni données sensibles, ni éléments à aspects éthique.

### 3.1.2 Réutilisation de données existantes

Les résultats analytiques de ce produit de recherche sont issus de l'utilisation des données expérimentales brutes associées aux codes et workflows.

### 3.1.3 Production et collecte de nouvelles données

Les résultats analytiques produit dans ce produit de recherche sont issus de la transformation, de l'analyse et de l'interprétation des données expérimentales brutes par les codes, workflows scripts d'analyses. Les rapports d'analyse incluent également des éléments de mises en contexte, d'expertise et d'interprétation scientifique.

Aucun coût spécifique n'est associé à la production de ces résultats analytiques.

## 3.2 Documentation et qualité des données

### 3.2.1 Métadonnées et documentation accompagnant les données

Les résultats analytiques de ce produit de recherche sont stockés sur le serveur de l'unité, avec une organisation par projet de recherche. Les droits d'accès sont définis par le porteur du projet lors du démarrage du projet.

Il n'existe pas de convention unifiée de nommage, d'organisation, de classification, de vocabulaire contrôlé ou de suivi de versions à l'échelle de l'unité pour décrire les résultats analytiques de ce produit de recherche. Ces organisations et conventions sont définies au niveau de chaque projet, selon ses besoins spécifiques.

Au-delà des métadonnées générales, les versions des scripts, les paramètres et environnements d'exécution, et les versions des bases de données utilisées sont conservés comme métadonnées associées aux résultats analytiques produits. Ces éléments permettent de garantir la reproductibilité, la traçabilité et la compréhension des analyses.

L'adoption d'un schéma de métadonnées standard, tel que le Dublin Core, est envisagée pour faciliter la description et l'operability des résultats analytiques.

### 3.2.2 Méthodes utilisées pour assurer la qualité scientifique des données

La reproductibilité et la traçabilité des analyses, associées à l'expertise scientifique et technique des agents, garantissent la qualité des résultats analytiques de ce produit de recherche.

## 3.3 Exigences légales et éthiques, code de conduite

### 3.3.1 Questions juridiques, titularité, droits de propriété intellectuelle et législation applicable

Par défaut, les résultats analytiques appartiennent à INRAE. Ils sont diffusés selon le principe « aussi ouverts que possible, aussi fermés que nécessaire», et mis à disposition sous licence libre Creative Commons CC BY-SA ou Etalab 2.0.

Dans certains projets, notamment dans le cadre de partenariats industriels, un accord de consortium peut venir restreindre l'accès, la titularité ou la propriété des données.
Dans le cas particulier des prestations de service réalisées pour le compte d'un tiers, la propriété des résultats analytiques revient au client commanditaire. Les modalités d'accès, de diffusion et d'ouverture éventuelle des données peuvent être précisées et négociées dans le contrat de prestation ou la convention associée. À l'issue de la prestation, l'unité n'est plus responsable des résultats analytiques produits, ni de leur stockage, archivage ou diffusion.

## 3.3.2 Responsabilités et gouvernance

Dans tous les cas, la responsabilité et la gouvernance des résultats analytiques relèvent du porteur de projet de recherche, par délégation du directeur ou de la directrice d'unité. Il veille à la production, la description, l'organisation, le stockage et la valorisation des résultats analytiques. Les agents impliqués sont garants de la qualité, de la reproductibilité et de la traçabilité des résultats qu'ils produisent. L'institut assure l'administration et la maintenance technique des infrastructures de stockage et de sauvegarde.

## 3.3.3 Questions éthiques et codes déontologiques

Les résultats analytiques de ce produit de recherche ne soulèvent pas de questions éthiques particulières. Aucun comité d'éthique n'est requis. Par défaut, les résultats analytiques de ce produit de recherche suivent la charte de déontologie, d'intégrité scientifique et d'éthique d'INRAE.

# 3.4 Traitement et analyse des données

## 3.4.1 Traitement des données

Selon le niveau de reproductibilité, portabilité et d'automatisation recherché, les traitements des résultats analytiques sont réalisés à l'aide de tableurs tels que Excel, de logiciels libres pour la science des données, tels que R ou Python, ou de logiciels spécialisés de simulation, d'analyse d'images ou tous autres logiciels ou outils pertinents. Les rapports peuvent être rédigé avec Quarto ou Jupyter Notebook.

Les traitements sont effectués soit sur les postes de travail des agents de l'unité, soit sur des infrastructures scientifiques collectives offrant des solutions de calcul scientifique mutualisées, notamment les clusters MIGALE ou GenoToul.

# 3.5 Stockage et sauvegarde des données pendant le processus de recherche

## 3.5.1 Stockage et sauvegarde tout au long du projet

Pendant les projets, les résultats analytiques sont stockés sur le serveur interne pnas de l'unité (voir annexe *Serveur de stockage*), administré par la DSI de l'institut, avec une organisation par projet dans le dossier `6_Projets/`. Les droits d'accès (lecture/écriture) sont définis par le porteur du projet au démarage du projet.

Dans certains cas, pour permettre une analyse en itinérance, les résultats analytiques peuvent être dupliqués localement sur les postes de travail ou dans l'espace *Nextcloud* personnel de l'agent en charge de l'interprétation.

L'ensemble des résultats analytiques, en particulier les images transformées, représente environ un à deux téraoctets. Les coûts de stockage associés sont pris en charge par l'institut.
Il n'existe pas de politique complémentaire de sauvegarde, de géo-réplication ou de sécurité des données.

# 3.6 Partage des données et conservation à long terme

## 3.6.1 Partage des données

Au cours du projet de recherche, le partage des résultats analytiques avec les partenaires impliqués s'effectue via le service sécurisé *FileSender* mis à disposition par le groupement d'intérêt public RENA-TER.

À la fin du projet de recherche, les résultats analytiques associés à une publication scientifique sont déposés sous forme de *dataset* dans le dataverse de l'institut sur Recherche Data Gouv, sous licence libre Creative Commons CC BY-SA ou Etalab 2.0.

Dans le cas spécifiques des résultats analytiques issues de partenaires industriels, un accord de consortium poura limiter ou définir le partage et la réutilisation de données pré-existantes.

## 3.6.2 Conservation à long terme

Il n'existe pas de politique d'archivage à long terme ni de politique de suppression. Les résultats analytiques restent stockés sur le serveur de l'unité.
# Chapitre 4

## Documents produits de rédaction

- **Nom** : Documents produits de rédaction

- **Nom abrégé** : texts

- **Type** : Texte

- **Mots clés** : articles, rapports, publications, thèses, posters, présentations

- **Contient des données personnelles** : Non

### 4.1 Description des données et collecte ou réutilisation de données existantes

#### 4.1.1 Description générale du produit de recherche

Ce produit de recherche regroupe l'ensemble des documents de rédaction produits par l'unité. Ces productions interviennent généralement à l'issue de l'analyse et de l'interprétation des résultats scientifiques (voir chapitre Résultats d'analyses, de simulations et statistiques), lors des phases de valorisation et de diffusion.

On retrouve en particulier :

- Publications scientifiques des agents de l'unité

- Abstract de conférences et posters

- Présentations scientifiques et techniques

- Protocoles expérimentaux

- Thèses

- Rapports de stage

- Fichiers multimédias associés (images, audio, vidéos)

Les formats des documents de rédaction sont variés :

- PDF pour les versions finales publiées

- docx, TeX ou qmd pour les sources éditable associées

- pptx ousvg pour les posters et productions graphiques

- Potentiellement png, jpeg ou mp4 pour les fichiers multimédias associés

Dans la mesure du possible, les documents de rédactions sont produits dans des formats standards et ouverts. Ils sont rédigés en français ou en anglais. Les sources éditable sont conservées afin d'assurer la traçabilité et la réutilisation des productions scientifiques. Le domaine d'application couvre les bioprocédés environnementaux. Le public cible est avant tout scientifique : membres de l'unité, communauté académique ou partenaires industriels.

Aucun identifiant pérenne n'est attribué par défaut aux documents de rédaction de ce produit de recherche. Il ne contient ni données sensibles, ni éléments à aspects éthique.
### 4.1.2 Réutilisation de données existantes

Les documents de rédaction de ce produit de recherche sont issus de l'utilisation de **résultats analytiques** associés aux productions de la communauté sous forme de bibliographie. Une fois publiés, ils peuvent servir de référence pour initier de nouveaux projets de recherche portés par l'unité ou non.

### 4.1.3 Production et collecte de nouvelles données

Les documents de rédaction rédigés dans ce produit de recherche sont issus de l'interprétation et de la valorisation des **données expérimentales brutes** et des **résultats analytiques**, mobilisant l'expertise et d'interprétation scientifique des agents.

Aucun coût spécifique n'est associé à la production de ces documents de rédactions.

## 4.2 Documentation et qualité des données

### 4.2.1 Métadonnées et documentation accompagnant les données

Selon les projets de recherche et les contributeurs, les documents de rédaction de ce produit de recherche sont soit stockés sur le serveur interne de l'unité, avec une organisation par projet de recherche, soit versionnés dans un espace projet du groupe de l'unité sur la forge institutionnelle (https://forge.inrae.fr/prose). Dans les deux cas, les droits d'accès sont définis par le porteur du projet au démarrage du projet.

Il n'existe pas de convention unifiée de nommage, d'organisation ou de classification à l'échelle de l'unité pour décrire les documents de rédactions. Ces conventions et organisations sont définies au niveau de chaque projet selon ses besoins spécifiques.

Une attention particulière est portée à la contribution de chacun et à la paternité scientifique des documents produits.

Les métadonnées minimales sont décrites par type de document dans le référentiel de HAL.

### 4.2.2 Méthodes utilisées pour assurer la qualité scientifique des données

La rigueur des étapes de rédaction, les relectures et validations croisées, le suivi des contributions, la constitution d'une bibliographie exhaustive, associées à l'expertise scientifique et technique des agents, garantissent la qualité des documents de rédaction de ce produit de recherche.

## 4.3 Exigences légales et éthiques, code de conduite

### 4.3.1 Questions juridiques, titularité, droits de propriété intellectuelle et législation applicable

Par défaut, les documents de rédaction appartiennent à INRAE. Ils sont diffusés selon le principe « aussi ouverts que possible, aussi fermés que nécessaire », et mis à disposition sous licence libre Creative Commons CC BY-SA ou Etalab 2.0.

Dans certains projets, notamment dans le cadre de partenariats industriels, un accord de consortium peut venir restreindre l'accès, la titularité ou la propriété des données.
## 4.3.2 Responsabilités et gouvernance

Dans tous les cas, la responsabilité et la gouvernance des documents de rédaction relèvent du porteur de projet de recherche, par délégation du directeur ou de la directrice d'unité. Il veille à la production, la reconnaissance et représentativité des contributions en matière de paternité scientifique, la conformité juridique et éthique des documents produits, le stockage et la conservation des sources et des métadonnées associées, la valorisation et la publication des productions finales dans les archives ouvertes institutionnelles. Les agents impliqués dans la réaction sont garants de la rigueur, de la qualité et de l'intégrité scientifique des documents qu'ils produisent. L'institut assure pour sa part l'administration et la maintenance technique des infrastructures de stockage et de sauvegarde.

## 4.3.3 Questions éthiques et codes déontologiques

Les documents de rédaction de ce produit de recherche ne soulèvent pas de questions éthiques supplémentaires aux questions d'intégrité scientifique. Aucun comité d'éthique n'est requis. Par défaut, les documents de rédaction de ce produit de recherche suivent la charte de déontologie, d'intégrité scientifique et d'éthique d'INRAE.

# 4.4 Traitement et analyse des données

## 4.4.1 Traitement des données

Les traitements sont réalisés à l'aide d'éditeurs de texte (Word, LibreOffice) ou d'environnements de développement pour les rédactions en LaTeX ou Quarto. Les présentations et posters peuvent être réalisés avec PowerPoint, Beamer, Quarto, Inkscape ou tout autre outil pertinent.

Les traitements sont principalement effectués sur les postes de travail des agents de l'unité. Pour permettre une édition collaborative, les documents peuvent être déposés et édités avec Nextcloud. D'autre part, les documents peuvent être gérés sous contrôle de version (Git) afin d'assurer la traçabilité des modifications et la coordination entre contributeurs.

# 4.5 Stockage et sauvegarde des données pendant le processus de recherche

## 4.5.1 Stockage et sauvegarde tout au long du projet

Pendant les projets, les documents de rédaction sont stockés sur le serveur interne pnas de l'unité (voir annexe *Serveur de stockage*), administré par la DSI de l'institut, avec une organisation par projet dans le dossier `6_Jrojets/`. Les droits d'accès (lecture/écriture) sont définis par le porteur du projet au démarage du projet.

Pour faciliter l'édition collaborative, les documents peuvent être dupliqués dans l'espace personnel Nextcloud d'un des agents en charge de la rédaction.

Pour certains projets, les documents de rédaction sont également versionnés sur la forge institutionnelle (https://forge.inrae.fr/prose), garantissant le suivi des modifications, la sauvegarde décentralisée et la collaboration entre rédacteurs.

L'ensemble des documents représente un volume inférieur à un téraoctet. Les coûts de stockage sont pris en charge par l'institut.

Il n'existe pas de politique complémentaire de sauvegarde, de géo-réplication ou de sécurité des données.
# 4.6 Partage des données et conservation à long terme

## 4.6.1 Partage des données

Au cours du projet de recherche, le partage des documents de rédaction avec les partenaires s'effectue via le service Nextcloud, qui permet une édition collaborative, ou via le service sécurisé de transfert de fichiers FileSender.

Les protocoles expérimentaux et analytiques peuvent être publiés sous forme de *protocol papers* dans des journaux tel que Nature Protocols, STAR Protocols ou MethodsX. Ils peuvent aussi être déposés sur la plateforme protocols.io.

Lors de leur publication, les publications scientifiques, abstract de communications orales, posters de conférence, thèses et rapports de stage sont déposés dans le catalogue HAL de l'unité, ce qui permet leur référencement, leur valorisation institutionnelle et leur diffusion. Les autres documents de rédaction de ce produit de recherche peuvent également y être déposés.

Les articles publiés en accès ouvert immédiat peuvent être déposés dans leur version finale éditeur sur l'archive ouverte. Conformément à la Loi pour une République Numérique, le manuscrit auteur des articles publiés sous abonnement peuvent être déposé dans une archive ouverte et diffusé après un embargo de six mois (domaine des sciences, de la technique et de la médecine) à douze mois (domaine des sciences humaines et sociales).

## 4.6.2 Conservation à long terme

Il n'existe pas de politique d'archivage à long terme ni de politique de suppression. Les documents de rédaction restent stockés sur le serveur de l'unité.
# Chapitre 5

## Documents d'évaluations & données administratives

- **Nom** : Documents d'évaluations & données administratives

- **Nom abrégé** : admin

- **Type** : Autre

- **Mots clés** : gestion, évaluation, indicateurs, données administratives, finances, budgets, projets, partenariats, stratégie, pilotage

- **Contient des données personnelles** : Oui

### 5.1 Description des données et collecte ou réutilisation de données existantes

#### 5.1.1 Description générale du produit de recherche

Ce produit de recherche regroupe l'ensemble des critères d'évaluation et des données administratives nécessaires au suivi des activités scientifiques, techniques et financières de l'unité de recherche. Ces informations sont mobilisées pour la structuration interne, la planification stratégique, la production de bilans d'activité, ainsi que pour les évaluations institutionnelles conduites par les tutelles administratives ou des autorités extérieures, en particulier le *Haut Conseil de l'évaluation de la recherche et de l'enseignement supérieur (HCERES)*.

On retrouve en particulier :

- Critères d'évaluation et indicateurs de performance scientifique, technique et organisationnelle

- Données relatives aux appels à projets, aux projets déposés et financés

- Données financières (budgets, dépenses, subventions)

- Données administratives et de ressources humaines

- Données de partenariats et conventions de collaboration

- Éléments stratégiques de pilotage (rapports d'activité, bilans, prospectives)

Les formats des données administratives sont principalement :

- textuel (docx, pdf)

- tableur (xlsx, csv)

- présentation (pptx, pdf)

- exports et extraction issus de systèmes d'information internes (Sifac, HR Access, etc.)

Dans la mesure du possible, les documents administratifs sont produits dans des formats standards et ouverts afin d'en garantir la pérennité et la réutilisation. Ils sont rédigés en français ou en anglais. Les sources éditables sont conservées afin d'assurer la traçabilité, la réutilisation interne et la cohérence des processus administratifs.
Ce produit de recherche comprend de nombreuses données sensibles, à caractère personnel et confidentiel, nécessitant un traitement avec grande minutie, confidentialité et sécurité, conforme aux exigences légales.

### 5.1.2 Réutilisation de données existantes

Les données administratives ne réutilisent des des données collectées qu'à des fins compatibles avec les objectifs pour lesquels elles ont été initialement collectées, et uniquement avec l'accord des parties prenantes intéressées.

### 5.1.3 Production et collecte de nouvelles données

Les données administratives sont produites en continu dans le périmètre de l'unité. Elles proviennent notamment des dossiers d'évaluation scientifique et technique, des candidatures aux appels à projets rédigés par les membres de l'unité, du suivi des budgets et des dépenses, de la gestion des ressources humaines, des conventions, contrats et partenariats signés, des rapports de pilotage.

## 5.2 Documentation et qualité des données

### 5.2.1 Métadonnées et documentation accompagnant les données

Les conventions d'organisation, de structuration et de documentation sont définies par les services d'appui à la recherche d'INRAE. Les gestionnaires administratifs de l'unité veillent à leur application rigoureuse, conformément aux procédures nationales.

### 5.2.2 Méthodes utilisées pour assurer la qualité des données

La qualité des données administratives repose sur des procédures de saisie, de vérification, de validation, de contrôle, et de sécurisation. Ces procédures garantissent l'exactitude, la cohérence, la fiabilité et la confidentialité des données collectées et produites.

## 5.3 Exigences légales et éthiques, code de conduite

### 5.3.1 Mesures appliquées pour assurer la protection des données à caractère personnel

Les données administratives de ce produit de recherche contiennent des données à caractère personnel (DCP). Leur collecte, traitement, stockage et partage respectent le Règlement Général sur la Protection des Données (RGPD) et la législation nationale en vigueur.

En conformité avec la Politique de protection des données à caractère personnel d'INRAE, les measures suivantes sont mises en place :

- Finalité du traitement

- Minimisation et proportionnalité

- Respect des droits des personnes

- Conservation limitée des données

- Sécurité et confidentialité
## 5.3.2 Autres questions juridiques, titularité, droits de propriété intellec-tuelle et législation applicable

Les documents administratifs sont la propriété d'INRAE. Ils ne sont pas destinés à la diffusion pu-blique et ne peuvent être utilisés qu'à des fins institutionnelles et administratives. Toute réutilisation ou diffusion externe nécessite l'autorisation explicite de la direction d'unité et des parties prenantes intéressées.

## 5.3.3 Responsabilités et gouvernance

Dans tous les cas, la responsabilité et la gouvernance de ces documents administratifs relèvent du directeur ou de la directrice de l'unité de recherche. La gestion opérationnelle est assurée par les ges-tionnaires administratifs de l'unité, en coordination avec les services déconcentrés d'appui à la recherche (SDAR) et directions d'appuis à la recherche de l'institut. Les porteurs de projet demeurent responsables des aspects administratifs et financiers de leurs projets. L'institut assure la maintenance technique, la sécurité et la confidentialité des infrastructures de stockage.

## 5.3.4 Questions éthiques et codes déontologiques

Les documents administratifs de ce produit de recherche sont soumis à la charte de déontologie, d'intégrité scientifique et d'éthique d'INRAE, notamment en matière de confidentialité, d'intégrité et de transparence des données administratives.

# 5.4 Traitement et analyse des données

## 5.4.1 Traitement des données

Les traitements des documents administratifs sont réalisés à l'aide de suites bureautiques (Microsoft Office ou LibreOffice) et d'applications spécifiques utilisés par les services d'appuis à la recherche d'INRAE tel que HR Access pour la gestion des ressources humaines ou Sifac pour la gestion budgétaire et comptable.

Dans un souci de confidentialité et de sécurité, ces traitements sont effectués exclusivement sur les serveurs et environnements informatiques d'INRAE. Les données ne doivent pas être dupliquées sur les postes de travail des agents ou transférées sur des supports personnels non sécurisés.

# 5.5 Stockage et sauvegarde des données pendant le proces-sus de recherche

## 5.5.1 Stockage et sauvegarde tout au long du projet

Les documents administratifs propre à l'unité sont stockés sur le serveur interne pnas de l'unité (voir annexe *Serveur de stockage*), administré par la DSI de l'institut. Les documents confidentiels (éva-luations, ressources humaines, finances) sont conservés dans le dossier à accès limité 3_Direction/. Les documents partagés à l'échelle de l'unité (réunions, informations collectives) sont placés dans le dossier 2_Collectif/. Les droits d'accès sont définis par la direction d'unité.

Le volume total de stockage reste inférieur à un téraoctet. Les coûts de stockage sont pris en charge par l'institut.

Il n'existe pas de politique complémentaire de sauvegarde, de géo-réplication ou de sécurité des données.
# 5.6 Partage des données et conservation à long terme

## 5.6.1 Partage des données

Les seules données administratives diffusées publiquement sont les rapports d'évaluation rendus publics, notamment ceux de l'HCERES, après leur publication officielle.

Tout autres documents administratifs sont strictement confidentiels et ne sont pas communiqués en dehors de l'unité. Le partage interne au sein de l'unité fait également l'objet de contrôle et reste limité aux agents autorisés.

## 5.6.2 Conservation à long terme

Les documents administratifs à caractère personnel sont détruits au plus tard deux ans après le départ de l'agent concerné de l'unité.

Il n'existe pas d'autres politiques d'archivage à long terme ni de politique de suppression des documents administratifs de ce produit de recherche.
# Annexe A

## Serveur de stockage

Arboressence de l'espace de stockage sur le serveur interne NetApp de l'unité pnas, accessible à l'adresse \\pnas1.stockage.inrae.fr\antony-prose\1461_PROSE. Ce serveur est administré par la Direction des Systèmes d'Information (DSI) de l'institut et intégré à l'infrastructure nationale de stockage sécurisée d'INRAE. Il est géo-répliqué entre les data centers "Île-de-France - CEA" et "Toulou-se".

\\pnas1.stockage.inrae.fr\antony-prose\1461_PROSE\1_Users-public

[un dossier public pour chaque agent]

2_Collectif
3BCAR
Animation-scientifique
Centre_Antony-Jouy
Commandes
Communication
DATA
Developpement_durable
Divers
Enseignements-donnes
Finances_Collectif
Formations-suvis
Formulaires_Collectif
HCERES
Integrite-scientifique
MICA
Preventions
Qualite
RH-Accueil
Reunions_Collectif
TRANSFORM
UP_Saclay
Web
3_Direction
4_Poles_Analytique
Fiches_Projets
Formulaires_labo

Interne_Poles_Analytique

Labo_Chimie

Labo_Commun

Labo_Microbio

Materiels_Poles_Analytique

Reunions_Poles_Analytique

4_Poles_Experimentations

Essais

Finances_Poles_Experimentations

Laboratoires

Materiels_Poles_Experimentations

Metrologie

Reunions_Poles_Experimentations

4_Poles_Porteur_de_Projets

Fichesprojets_Poles_Porteur_de_Projets

Reunions_Poles_Porteur_de_Projets

5_Donnees

Bioanalyzer

Chimie

Microscope

Potentiostat

Sequencage

Spectrophotometre

TapeStation

microGC

qPCR

6_Projets

...

[un dossier interne pour chaque projet de recherche]

...

7_Ressources_Scientifiques

Congres-Proceeding

Presentations

Publi

Stages

8_Archives

9_Festivites

D'autre part, chaque agent possède un espace personnel MyDrive de 100Go par default sur l'es-
pace de stockage et d'édition collaborative Nextcloud https://nextcloud.inrae.fr/
Annexe B

Liens d'intérêt

- Espace de stockage PNAS: \\pnas1.stockage.inrae.fr\antony-prose\1461_PROSE\

- Collection HAL de l'unité de recherche PROSE : https://hal.inrae.fr/PROSE

- Groupe de l'unité sur la forge institutionnelle : https://forge.inrae.fr/prose
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PROSE - Procédés Biotechnologiques au Service de l'Environnement
1 rue Pierre-Gilles de Gennes
92 761 Antony Cedex
FRANCE

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