# BRC4Env: le pilier "Ressources Environnementales" de l'infrastructure AgroBRC-RARe

Christian Mougin

► To cite this version:

Christian Mougin. BRC4Env: le pilier "Ressources Environnementales" de l'infrastructure AgroBRC-RARe. Assemblée générale du Consortium Biocontrôle, Dec 2017, Paris, France. hal-01678086

HAL Id: hal-01678086

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Submitted on 5 Jun 2020

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# BRC4Env : le pilier « Ressources Environnementales » de l'infrastructure AgroBRC-RARe

Christian Mougin

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INRA
SCIENCE & IMPACT
# Qu'est ce que RARe?

## Un méta-réseau pluri-organismes porté par AllEnvi

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INRA
SCIENCE & IMPACT

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Institut de Recherche
pour la Développement
FRANCE

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cirad

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* Une Infrastructure de Recherche inscrite sur la feuille de route MESRI

## Qui fédère des CRBs et collections structurées et reconnues

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INRA
SCIENCE & IMPACT

## Des équipements de conservation, d'extraction et d'analyse

* ADN, ARN, séquençage, génotypage, transcriptomique

## Des outils de caractérisation des ressources, de suivi sanitaire...

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Les piliers de RARe

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* Plantes cultivées et apparentées sauvages

* Animaux domestiques et apparentés sauvages, espèces prélevées

* Bactéries, levures, champignons (pathogènes, agro-alimentaire)

* Consortiums de microorganismes (milieux naturels), invertébrés et vertébrés

* Ressources forestières
# Les objectifs d'AgroBRC-RARRe

## Des objectifs scientifiques partagés

* Mieux connaitre la diversité génétique des espèces utiles à- et utilisées par l'agriculture

* Organiser la collecte, la caractérisation, lasécurisation et la diffusion de ressources génétiques, génomiques et biologiques pour la recherche sur la biodiversité et sa dynamique (biologie évolutive, écologie, physiologie, génétique et génomique...)

* Préserver et fournir des échantillons de référence pour l'identification de gènes contrôlant des phénotypes d'intérêt, et pour la détection d'évolutions temporelles de la biodiversité

* Faciliter l'utilisation des ressources pour répondre aux enjeux d'adaptation de l'agriculture

## Des objectifs opérationnels

* Augmenter la visibilité nationale et internationale des CRBs

* Harmoniser les pratiques, susciter les synergies entre CRBs

* Développer une animation scientifique transversale

* Renforcer la valorisation (scientifique, partenariale...)
Les missions de BRC4Env

* Collecter, conserver, sécuriser et caractériser des échantillons de matrices environnementales (sols, sédiments, eaux), des ressources génomiques ou génétiques extraites de ces matrices, et des microorganismes (communautés), invertébrés, vertébrés, végétaux (ou des « organites »), associés à ces milieux

* Mettre à disposition ces ressources pour les utilisateurs du monde de la recherche, de la formation et du développement mais également, dans la mesure des moyens disponibles, à tout autre type d'utilisateur

* Etablir des banques d'échantillons et un référentiel d'échantillons de matrices environnementales et des échantillons biologiques associés

* Définir et mettre en place des règles partagées de fonctionnement et d'évolution, ainsi que des outils (plus-value réseau)
# Le périmètre de BRC4Env

## ❖ CRB/collections

- Animation du réseau : BRC4Env (Versailles)

- Ressources génomiques de sols : CRB GenoSol/CEES (Dijon/Orléans)

- Trichogrammes: CRB Ep-Coll (Sophia)

- Arthropodes : CRB CBGP (Montpellier)

- Echantillons ichthyologiques : CRB Colisa (Rennes/Thonon/St-Pée)

≈ une dizaine de collections sur le territoire national

## ❖ Plateformes analytiques

- Génomique environnementale : GenoSol (Dijon)

- Biochimie environnementale : Biochem-Env (Versailles)

- Chimie environnementale : Platinaae (Arras/Bordeaux)

- Imagerie cellulaire et tissulaire : DImaCell (Dijon)

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## ❖ (Infra)structures nationales d'accès aux écosystèmes

- AnaEE-France

- RECOTOX

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# Labellisation et certification

<table><thead><tr><td>Structure</td><td>CNOC INRA</td><td>IBiSA</td><td>ISO9001</td><td>NFS 96-900</td></tr></thead><tbody><tr><td>BRC4Env</td><td></td><td>En cours</td><td>En projet</td><td></td></tr><tr><td>GenoSol/CEES</td><td>2013</td><td>2015</td><td>2016</td><td></td></tr><tr><td>Ep-Coll</td><td></td><td>2015</td><td>En projet</td><td></td></tr><tr><td>Arthropodes</td><td></td><td>En cours</td><td></td><td>En projet</td></tr><tr><td>Colisa*</td><td></td><td>En cours</td><td>En projet</td><td></td></tr></tbody></table>

*U3E certifiée ISO 14001 depuis 2015

* Labellisation INRA ISC du pilier : en cours

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# Les outils

* Annuaire BRC4Env

* Espace collaboratif Sharepoint : https://sites.inra.fr/site/BRC4Env/

* Listes : contact-brc4env@inra.fr, brc4env@inra.fr, rare@inra.fr

* Site web : https://www.brc4env.fr/, http://www6.inra.fr/agrobrc-rare/

* AQ Tools (VM datacenter IdF) : BRC4Env, Ep-Coll, Colisa

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# Le partenariat

* Des projets de recherche : ANR, Nationaux, Europe...

* Des programmes nationaux d'observation : RMQS...

* Des programmes de suivi règlementaire : CNICS, DCF...

* Des partenariats avec le privé : Biocontrôle, medicinal mining...

GisSol

l'Europe
s'engage
en France
avec le PEAMP

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# Les collections d'intérêt pour le biocontrôle

## ❖ BRC4Env

* Bactéries/nématodes entomopathogènes

* Trichogrammes Ep-Coll

* Microorganismes MIAE

## ❖ CIRM

* Collection Française de Bactéries associées aux Plantes

* Champignons filamenteux
Merci pour votre attention!

Gis Sol

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INRA
SCIENCE & IMPACT

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Liberté • Égalité • Fronter de
RÉPUBLIQUE FRANÇAISE

MINISTERE
DE L'AGRICULTURE
DE L'AGROALIMENTAIRE
ET DE LA FORÉT

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Liberté • Égalité • Fronter de
RÉPUBLIQUE FRANÇAISE

Ministère de l'agriculture, du développement durable et de l'environnement

ADEME

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Agence de l'Environnement
et de la Maîtrise de l'Énergie

IRD

Institut de recherche
pour le développement

IGN

INSTITUT NATIONAL
DE L'INFORMATION
GÉOGRAPHIQUE
ET FORESTIÈRE

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INRA
SCIENCE & IMPACT

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cirad

IRD

Institut de recherche
pour le développement

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Montpellier
SupAgro

ume2
UNIVERSITE MONTPELIER 2
NICE ET RICHEIRES

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Université
Nice
Sophia Antipolis

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INRA
SCIENCE & IMPACT