# DLScaff: Deep Learning and Hi-C data for chimeric contigs detection

Alexis Mergez, Raphaël Mourad, Matthias Zytnicki

<figure><img src="image_1.png" /></figure>

To cite this version:

Alexis Mergez, Raphaël Mourad, Matthias Zytnicki. DLScaff: Deep Learning and Hi-C data for chimeric contigs detection. JOBIM (JOURNÉES OUVERTES EN BIOLOGIE, INFORMATIQUE ET MATHÉMATIQUES) 2023, Jun 2023, Toulouse, France. hal-04147306

HAL Id: hal-04147306

https://hal.science/hal-04147306

Submitted on 30 Jun 2023

HAL is a multi-disciplinary open access
archive for the deposit and dissemination of sci-
entific research documents, whether they are pub-
lished or not. The documents may come from
teaching and research institutions in France or
abroad, or from public or private research centers.

L'archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est
destinée au dépôt et à la diffusion de documents
scientifiques de niveau recherche, publiés ou non,
émanant des établissements d'enseignement et de
recherche français ou étrangers, des laboratoires
publics ou privés.

<figure><img src="image_2.png" /></figure>

Distributed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License
# DLScaff: Deep Learning and Hi-C
## data for chimeric contigs detection

Alexis MERGEZ, Raphaël MOURAD and Matthias ZYTNICKI

MIAT, Toulouse INRAE, 31326 CEDEX, Castanet-Tolosan, France

<figure><img src="image_3.png" /></figure>

RÉPUBLIQUE
FRANÇAISE

Liberté
Égalité
Fraternité

<figure><img src="image_4.png" /></figure>

<figure><img src="image_5.png" /></figure>

<figure><img src="image_6.png" /></figure>

GSCORE : Proportion of detected break-points

<figure><img src="image_7.png" /><figcaption>Fig.6 - NNCLR, CNN and YaHS results on YaHS synthetic dataset</figcaption></figure>