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# Evaluation de l'état de conservation des habitats naturels marins à l'échelle d'un site Natura 2000 – Guide méthodologique

Fanny Lepareur

► To cite this version:

Fanny Lepareur. Evaluation de l'état de conservation des habitats naturels marins à l'échelle d'un site Natura 2000 – Guide méthodologique. Rapport SPN 2011 / 3, Service du Patrimoine Naturel (SPN), MNHN. 2011, pp.55. mnhn-05383265

HAL Id: mnhn-05383265

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Submitted on 26 Nov 2025

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# Evaluation de l'état de conservation des habitats naturels marins à l'échelle d'un site Natura 2000

## Guide Méthodologique

### Version 1
Référence bibliographique du document :

Lepareur F., 2011. Evaluation de l'état de conservation des habitats naturels marins à l'échelle d'un site Natura 2000 – Guide méthodologique - Version 1. Février 2011. Rapport SPN 2011 / 3, MNHN, Paris, 55 pages.

Crédits photographiques de la page de couverture :

- Herbier à *Posidonia oceanica* (1120*), © Sandrine Ruitton

- Coralligène (1170-14), © Stéphane Sartoretto

- Récif d'Hermelles *Sabellaria alveolata* (1170-4), Roche supralittorale (1170-1), Champ de blocs (1170-9), Zone de résurgence d'un estran de sable fin (1140-3), © Fanny Lepareur

Crédits photographiques de la 4e de couverture :

- Coralligène (1170-14), © Noëmie Michez

- Encorbellement à *Lithophyllum lichenoides* (1170-12), © Fanny Lepareur
## Personnes consultées pour l'élaboration de ce document

Les scientifiques qui ont corrigé et commenté les tableaux de descripteurs et qui ont alimenté le travail de réflexion :

**Pour la façade Méditerranée** : Mme Denise Bellan-Santini (DIMAR - Station Marine d'Endoume), Mme Christine Pergent-Martini (Université de Corse), M. Gérard Pergent (Université de Corse), M. Marc Verlaque (DIMAR), M. Jean-Michel Amouroux (LECOB - Station Marine de Banyuls/Mer), Mme Céline Labrune (LECOB - Station marine de Banyuls/Mer), M. Stéphane Sartoretto (IFREMER-LER Provence-Azur-Corse).

**Pour la façade Atlantique/Manche/Mer du Nord** : Mme Sandrine Derrien-Courtel (MNHN - Station de Biologie Marine de Concarneau), Mme Marie-Noëlle de Casamajor (IFREMER), M. Pierre-Guy Sauriau (CNRS), M. Laurent Soulier (IMA), M. Laurent Guérin (MNHN - Station Marine de Dinard), M. Christian Hily (LEMAR (IUEM)), Melle Morgane Lejart (LEMAR (IUEM)), Melle Maud Bernard (Hémisphère Sub, encadrée par les laboratoires LEMAR (IUEM) et URU420 (Université de Rennes 1)).

*En cours de consultation* : M. Jacques Grall (LEMAR (IUEM)), M. Nicolas Desroy (IFREMER), M. Eric Thiebault (CNRS - Station Biologique de Roscoff).

Les personnes qui se sont impliquées dans le travail de réflexion au MNHN-SPN : Julien Touroult (Directeur adjoint), Guillaume Dirberg (Responsable du pôle marin), Hugues Casabonnet (pôle marin) et Nathalie Carnino.

Rédaction : Fanny Lepareur (MNHN-SPN)
# Préambule

Suite à la phase de désignation des sites Natura 2000 sur le domaine marin, un marché a été lancé en 2010 par l'Agence des Aires Marines Protégées (AAMP) à la demande du MEDDTL, intitulé « Inventaires biologiques et analyse écologique de l'existant – Natura 2000 en mer ». Ce marché vise à réaliser la base cartographique des sites Natura 2000 en mer désignés au titre de la Directive « Habitat-Faune-Flore » (DHFF) et à évaluer l'état de conservation des habitats naturels marins et des habitats d'espèces marines d'intérêt communautaire à l'échelle de chaque site. Il s'agit de deux démarches différentes qui nécessitent des informations bien spécifiques mais qui peuvent être combinées sur le terrain. Les critères utilisés pour l'identification d'un habitat reposent sur des caractères qui ne sont pas nécessairement pertinents ou suffisants pour juger de son état de conservation. Pour évaluer cet état, il est nécessaire de s'intéresser, au sein d'un même habitat, aux paramètres qui traduisent des variations selon les pressions et impacts auxquels il est soumis. Conformément à l'article R. 414-11 du Code de l'environnement, cet état doit être renseigné dans le document d'objectifs (Docobs) du site de façon à pouvoir orienter les prises de décision.

Pour le marché Natura 2000 en mer, le MNHN-SPN a été désigné pour assurer un appui scientifique notamment en proposant une démarche qualité, des référentiels et des guides méthodologiques.

Le présent rapport correspond à une **première version du Guide méthodologique pour évaluer l'état de conservation des habitats naturels**<fnref n="1" /> marins au niveau local (site Natura 2000). Cette première version est plus particulièrement à l'attention des bureaux d'études (BET) qui font le travail de cartographie des habitats et l'évaluation de l'état de ces habitats dans les sites dans le cadre du marché de l'AAMP. Elle sera également diffusée aux services de l'Etat. Cette version 1 présente la démarche entreprise pour l'évaluation de l'état de conservation des habitats naturels marins au niveau local (site Natura 2000). Il précise ainsi ce qu'on l'on entend par état de conservation à l'échelle du site et fait état des réflexions en cours à l'heure actuelle sur les descripteurs et les méthodes à utiliser pour qualifier l'état de conservation des habitats au sein des sites Natura 2000.

Les tableaux de synthèse des descripteurs permettant d'évaluer l'état de conservation sont en cours de correction par les scientifiques référents. Compte-tenu des délais imposés par le marché, les tableaux sont fournis dans une version évolutiveselon les différentes corrections des scientifiques et selon l'avancée des connaissances (programmes et études sur ce sujet). Dans le délai du marché et selon le calendrier des campagnes en mer des BET, des tableaux actualisés de descripteurs pourraient alors leur être envoyés.

Ensuite, en parallèle, ce guide évoluera avec l'avancée des programmes et des études en cours sur le sujet avec le développement d'indicateurs, d'indices et de protocoles d'évaluation plus précis pour certains habitats. Ce guide méthodologique, qui pourrait avoir plusieurs versions (diffusion aux services de l'Etat et BET dans le délai du marché), constituera un outil de référence pour permettre d'évaluer les habitats naturels marins dans les sites Natura 2000.

A noter que des travaux complémentaires seront réalisés à part pour les espèces marines d'intérêt communautaire ainsi que pour les habitats naturels « Estuaires » et « Lagunes côtières ».

<footnote n="1">¹ Les habitats d'espèces marines d'intérêt communautaire ne sont pas traités dans ce guide.</footnote>
# 1 Contexte et objectifs

## 1.1 Le cadre juridique

### 1.1.1 Evaluation nationale à l'échelle biogéographique

La Directive dite « Habitats-Faune-Flore » (DHFF) fixe un objectif à atteindre à savoir maintenir ou restaurer dans un état de conservation favorable les habitats naturels et les espèces d'intérêt communautaire inscrits aux annexes I, II, IV et V (art. 2). Pour atteindre cet objectif, la directive impose aux Etats membres de constituer un réseau d'aires gérées (Natura 2000) pour les habitats naturels de l'annexe I et les espèces de l'annexe II, de réaliser une surveillance de l'état de conservation des habitats et des espèces listés dans la DHFF (art. 11) et d'en rendre compte périodiquement (art. 17). Pour cela, un rapport doit être fourni tous les six ans à la Commission européenne (le premier rapport a été rendu en 2007). En France, l'évaluation de l'état de conservation des habitats naturels et des espèces concerne les six **domaines biogéographiques** du territoire métropolitain dont **deux domaines marins** (Atlantique marin et Méditerranée marin). Cette évaluation est réalisée selon **un cadre méthodologique commun** pour tous les Etats membres (European Commission, 2005) fourni par la **Commission européenne** et **adapté au niveau national par le MNHN** (Bensettiti et al., 2006).

### 1.1.2 Evaluation à l'échelle du site Natura 2000

L'évaluation et le suivi de l'état de conservation des habitats et des espèces à l'échelle du site **Natura 2000** sont prévus dans l'art. R. 414-11 et l'art. R. 414-8-5 du code de l'Environnement qui sont la transposition en droit français des dispositions de l'article 6 de la DHFF. Cette évaluation est intégrée dans les documents cadre de gestion élaborés pour chaque site Natura 2000 du réseau français, les Documents d'objectifs (Docobs).

L'approche méthodologique proposée par la Commission européenne s'applique à l'échelle d'un domaine biogéographique, mais n'est **pas directement adaptée à l'échelle d'un site Natura 2000**. Il est donc **nécessaire d'établir une méthode, plus orientée vers la gestion** (diagnostiquer l'état, suivre l'état de façon à évaluer l'effet des actions entreprises à l'échelle du site sur cet état de conservation etc.), qui s'adapte aux différents habitats naturels à cette échelle locale. Dans un premier temps, cette méthodologie ne traite que des habitats naturels marins. Des études complémentaires seront menées pour les espèces marines d'intérêt communautaire et pour les habitats estuariens et lagunaires.

## 1.2 Principe et objectifs de l'évaluation à l'échelle d'un site

Dans le cadre de l'élaboration des Docobs, les opérateurs des sites Natura 2000, et les BET dans le cas présent, doivent évaluer l'état de conservation des habitats naturels présents dans leur site. Afin de s'assurer qu'une **évaluation homogène et cohérente** soit réalisée sur l'ensemble du réseau de sites Natura 2000, il est essentiel qu'une **méthode soit développée, partagée et standardisée**. C'est pour cette raison qu'il est nécessaire d'engager des réflexions au niveau national afin de disposer d'une méthodologie élaborée sur des fondements scientifiques et validée pour évaluer et suivre sur le long terme l'état de conservation des habitats naturels d'intérêt communautaire à l'échelle du site.
Ces réflexions méthodologiques sur l'évaluation de l'état de conservation des habitats naturels d'intérêt communautaire à l'échelle du site Natura 2000, développées au MNHN, ont abouti pour les habitats forestiers (Carnino, 2009) en partenariat avec l'ONF et ont été engagées pour les habitats agropastoraux en ce qui concerne le milieu terrestre.

Le présent rapport concerne les **habitats naturels marins d'intérêt communautaire**. Ce cadre méthodologique commun à tous les habitats marins est nécessaire pour répondre à **deux objectifs**.

* Le premier objectif concerne la **gestion du site**. Ce cadre méthodologique devra être utilisé comme un **outil de référence** par les opérateurs, les résultats obtenus après analyses aideront à **orienter des actions de gestion pour agir en faveur d'un bon état de conservation**. En effet, il s'agit de disposer d'un cadre factuel pour diagnostiquer l'état des composantes d'un site Natura 2000, connaitre son évolution et évaluer l'effet des mesures de gestion mises en œuvre sur cet état de conservation.

* Le second objectif est de contribuer à l'évaluation nationale des habitats naturels par domaine biogéographique. La méthodologie et sa mise en œuvre permettront de disposer de données récoltées à l'échelle des sites. En ce sens, ces données ne devront pas faire que l'objet d'une simple compilation. Elles devront alimenter une réflexion globale entreprise par les experts scientifiques (intégration d'autres paramètres, réflexion sur une échelle plus vaste, dans et en dehors des sites, ...).

Le premier rapport concernant l'évaluation de l'état de conservation à l'échelle biogéographique (rapportage article 17) a été remis en 2007. Cette première évaluation à l'échelle biogéographique a été basée sur les meilleures données disponibles fournies par les partenaires (collectées lors de programmes de suivis et d'inventaires) et exprimée à dire d'experts au vu de ces connaissances (évaluation des paramètres). Les nouvelles données de terrain acquises lors de l'évaluation à l'échelle des sites Natura 2000 renforceront ces connaissances et alimenteront ainsi la prochaine évaluation nationale qui sera remise à la Commission en 2013.

# 2 Définitions

## 2.1 Habitat naturel d'intérêt communautaire

La DHFF définit un **habitat naturel** comme une zone terrestre ou aquatique qui se distingue par ses caractéristiques géographiques, abiotiques et biotiques, qu'elles soient entièrement naturelles ou semi-naturelles (art. 1). Selon les Cahiers d'habitats côtiers Natura 2000 (tome 2 : Bensettiti & al. (coord.), 2004), l'habitat est décrit par :

- ses caractéristiques stationnelles (climatiques, physico-chimiques, édaphiques), correspondant au **biotope**, et leurs variabilités spatiales et temporelles ;

- les organismes vivant au sein de cet habitat, correspondant à la **biocénose**, et qui par leur caractère intégrateur définissent l'habitat.
Un habitat naturel est dit « d'intérêt communautaire » lorsqu'il figure à l'annexe I de la directive. Cette annexe liste des habitats naturels qui sont :

- en danger de disparition dans leur aire de répartition naturelle ;

- ou avec une aire de répartition naturelle réduite par suite de leur régression ou en raison de leur aire intrinsèquement restreinte ;

- ou qui constituent un exemple remarquable de caractéristiques propres à l'une ou à plusieurs des régions biogéographiques (art. 1).

Un habitat naturel d'intérêt communautaire est dit « prioritaire » lorsqu'il est en danger de disparition sur le territoire européen où le traité s'applique et pour la conservation duquel la Communauté porte une responsabilité particulière, compte tenu de l'importance de la part de leur aire de répartition naturelle comprise dans ce territoire (art. 1). Les types d'habitats naturels prioritaires sont indiqués par un astérisque (*) à l'annexe I de la directive.

Les **8 habitats naturels marins d'intérêt communautaire** présents en France et listés dans l'annexe I de la DHFF sont retranscrit dans le tableau 1.

<table><caption>**Tableau 1 :** Habitats naturels marins d'intérêt communautaire présents en France</caption><thead><tr><td>Code UE</td><td>Intitulé de l'habitat générique</td></tr></thead><tbody><tr><td>1110</td><td>Bancs de sable à faible couverture permanente d'eau marine</td></tr><tr><td>1120*</td><td>Herbiers à Posidonies</td></tr><tr><td>1130</td><td>Estuaires</td></tr><tr><td>1140</td><td>Replats boueux ou sableux exondés à marée basse</td></tr><tr><td>1150*</td><td>Lagunes côtières</td></tr><tr><td>1160</td><td>Grandes criques et baies peu profondes</td></tr><tr><td>1170</td><td>Récifs</td></tr><tr><td>8330</td><td>Grottes marines submergées ou semi-submergées</td></tr></tbody></table>

Les habitats soumis à évaluation dans cette méthodologie concernent les **habitats naturels marins** (code UE 11xx et 8330) **dans leur version déclinée des Cahiers d'habitats côtiers** (tome 2). Les habitats « Estuaires » (code UE 1130) et « Lagunes côtières » (code UE 1150*) feront l'objet d'une étude complémentaire.

## 2.2 Etat de conservation d'un habitat naturel marin

### 2.2.1 A l'échelle biogéographique

Au sens de la DHFF, l'état de conservation d'un habitat naturel résulte de « l'effet de l'ensemble des influences agissant sur cet habitat ainsi que sur les espèces typiques qu'il abrite, et qui peuvent affecter à long terme sa répartition naturelle, sa structure et ses fonctions ainsi que la survie à long terme de ses espèces typiques sur le territoire européen » (art. 1).

En d'autres termes, pour définir l'état de conservation d'un habitat naturel, les effets de l'ensemble des influences (anthropiques ou naturelles) sur les habitats naturels sont pris en compte, ces effets pouvant affecter à long terme :

- la répartition naturelle de ces habitats ainsi que les superficies qu'ils couvrent

- les caractéristiques physiques et/ou biologiques de ces habitats (substrat, granulométrie, espèces ingénieures) c'est-à-dire les structures de ces habitats
- les fonctions de ces habitats (nourricerie, frayère, zone de transit ou de repos),

- les « espèces typiques » c'est-à-dire les espèces les plus appropriées pour diagnostiquer l'état de conservation de la structure et des fonctions de l'habitat.

L'état de conservation d'un habitat naturel est considéré comme **favorable** lorsque (art. 1):

- son aire de répartition naturelle ainsi que les superficies qu'il couvre au sein de cette aire sont stables ou en extension,

- la structure et les fonctions spécifiques nécessaires à son maintien existent et sont susceptibles de perdurer dans un avenir prévisible,

- l'état de conservation des espèces qui lui sont typiques est favorable.

### 2.2.2 A l'échelle du site Natura 2000

Les définitions précédentes sont appliquées à l'échelle d'un domaine biogéographique mais ne sont **pas directement utilisables à l'échelle locale (site Natura 2000)**. Comme pour la réflexion menée sur les habitats forestiers au MNHN (Carnino, 2009a), nous retiendrons les grandes lignes de la définition de la directive en ne conservant que ce qui s'adapte à l'échelle d'un site. L'évolution de l'aire de répartition naturelle des habitats naturels s'évaluant uniquement à grande échelle ne sera donc pas prise en compte.

Un habitat naturel marin peut alors être considéré en **bon état de conservation, à l'échelle d'un site Natura 2000**, lorsque :

- ses structures caractéristiques sont présentes et les fonctions spécifiques et nécessaires à son maintien sont assurées ;

- il ne subit aucune atteinte susceptible de nuire à sa pérennité ;

- les espèces qui lui sont typiques peuvent s'exprimer et assurer leur cycle biologique.

## 2.3 Etat de référence : « Etat de conservation favorable » (pour l'échelle biogéographique) et le « bon état de conservation » (pour l'échelle du site)

La Directive ne fournit aucune précision sur **cet état de référence** puisqu'elle laisse à chaque Etat membre le soin de le définir. Il s'agit à l'échelle **biogéographique** des « **Favorable Reference Value – FRV** » qui sont à définir pour les habitats naturels essentiellement par les critères d'aire de répartition d'un habitat et de superficie couverte par l'habitat. Les lignes directrices de la méthode communautaire ou Guideline (European Commission, 2005) montrent la multiplicité des approches possibles pour définir ces valeurs de référence qui, contrairement aux valeurs de référence pour le « très bon état écologique » de la Directive Cadre sur l'Eau (DCE), **ne renvoient pas à un état vierge de toute action anthropique** (ou très peu perturbé).

Par contre, ces valeurs de référence ne sont **pas transposables à l'échelle du site**. La Commission européenne déconseille d'utiliser le terme « état de conservation favorable » à une échelle autre que l'échelle biogéographique, cette terminologie se rapportant spécifiquement à la méthode appliquée à cette échelle biogéographique, qui n'est pas pertinente à l'échelle locale. A l'échelle du site, on utilise donc le terme d'état de référence pour le « bon état de conservation ».
Pour chacun des descripteurs, l'évaluation consiste entre autres à diagnostiquer si la valeur actuelle correspond à un bon état ou non. Il s'agit de positionner la **valeur actuelle** de chaque descripteur par rapport à une **valeur seuil théorique** correspondant au minimum requis pour atteindre ce bon état de conservation. Cependant, il n'y a aucune vision précise et partagée de cet état de référence dans le contexte de Natura 2000 (Carnino, 2009a). De plus, dans le milieu marin, compte tenu des difficultés et des coûts pour collecter des données, cet état de référence est encore plus délicat à définir qu'en milieu terrestre.

**Remarque** : Le bon état de conservation n'est pas une référence absolue ni un pur concept scientifique mais **une co-construction entre des principes écologiques et des choix sociaux**. On ne peut pas donner une réponse purement scientifique à une question qui renvoie à une vision co-construite de ce que l'Europe, les Etats membres et la société en général souhaitent définir comme état de référence. Cependant, il y a une prise en compte d'un cadre fixé de viabilité à long terme des écosystèmes, qui prend donc en compte des notions scientifiques. Dans ce contexte, il nous parait approprié d'établir des références à partir d'une **consultation et d'une co-construction d'un ensemble d'experts scientifiques** sur la base de l'ensemble des critères et descripteurs qu'il semble pertinent de relever dans les sites. Ces valeurs de référence (= valeurs seuil) peuvent correspondre à des valeurs historiques (une valeur dans le passé à un instant t), des valeurs potentielles (mais à éviter), modélisées ou co-construites à dire d'experts. **Cela fera l'objet d'une prochaine étape de cette méthodologie** (cf. remarques dans la partie 5).

# 3 Principe de la méthode et démarche adoptée pour son élaboration

La méthodologie adoptée consiste à évaluer l'état de conservation d'un habitat naturel marin en renseignant des **critères** d'évaluation à l'aide de **descripteurs** (avec des variables qualitatives ou quantitatives à « mesurer »). Les descripteurs doivent être pertinents, simples et pragmatiques. Ils doivent décrire l'état de conservation d'un habitat naturel. Les valeurs renseignées pour chacun des descripteurs les plus pertinents seront comparées à des valeurs de référence lors d'une prochaine étape de cette méthodologie (cf. remarques dans les parties 2.3 et 5) afin de mieux guider l'opérateur dans le choix des mesures de gestion à mettre en œuvre pour agir en faveur du bon état.

## 3.1 Choix des critères et descripteurs

Les critères et descripteurs choisis doivent permettre de rendre compte de l'état de conservation des habitats naturels marins à l'échelle d'un site Natura 2000.

Le principe consiste à retenir, parmi les paramètres définis par la Commission européenne pour évaluer l'état de conservation à l'échelle biogéographique, ceux étant appréhendables à l'échelle des sites Natura 2000.

A l'échelle biogéographique ces paramètres sont :

- l'aire de répartition de l'habitat,

- la superficie recouverte par l'habitat au sein de cette aire,

- la structure et les fonctionnalités de l'habitat (dont les espèces typiques) et,
- les perspectives futures (en fonction des pressions actuelles et des menaces susceptibles de compromettre leur maintien dans le futur).

Nous retiendrons donc pour évaluer l'état de conservation d'un habitat naturel marin à un **temps donné** et à l'échelle d'un **site Natura 2000**, **deux paramètres** :

1) la **structure et la fonctionnalité** de l'habitat,

2) les **menaces et pressions** portées à l'habitat,

Afin de choisir les **critères** et les **descripteurs** les plus pertinents pour les paramètres « **structure et fonctionnalité** » et « **menaces et pressions** », une **recherche bibliographique** a été réalisée. Dans un souci de cohérence et d'harmonisation avec des suivis déjà mis en place (REBENT, DCE, Réseau de Surveillance Posidonies, Réseau de Suivi Lagunaire), cette recherche bibliographique s'est appuyée sur les « paramètres » ou « indicateurs » de ces suivis, les plus pertinents à suivre pour évaluer l'état de conservation des habitats naturels marins (cf. fiches techniques DCE et REBENT). Il a également été pris en compte le cahier des charges qui avait été transmis aux BET Atlantique (Bajjouk, 2009) et les fiches de synthèse des Cahiers d'habitats côtiers Natura 2000 (Bensettiti et al. (coord.), 2004). Cette recherche de descripteurs a été complétée par des études (Desroy et al., 2009 ; Ganteaume et al., 2005 ; Lejart et al., 2010 ; Pergent et al., 2008 ; Thibaut & Mannoni, 2007 ; etc.) et des thèses se rapportant au sujet (Dubois, 2003 ; Le Loc'h, 2004). Suite à cette recherche bibliographique, une **synthèse de ces descripteurs** a été formalisée sous forme de **tableaux**, reprenant la structure de la démarche adoptée (« Paramètres » en adéquation avec ce qui est demandé au niveau biogéographique pour la Commission européenne, « critères » et « descripteurs ») (cf. tableau 2).

Ces tableaux ont été créés pour chaque habitat naturel ou groupe d'habitats (cf. annexe II). En effet, certains habitats des Cahiers d'habitats ont été regroupés dans un but opérationnel pour faciliter le travail de terrain comme dans le cas des habitats subtidaux meubles. Parfois, au contraire, ces habitats ont été divisés en plusieurs entités, c'est le cas des habitats remarquables (caractérisés, par exemple, par une espèce ingénieure et ayant un rôle fonctionnel important) comme les herbiers de zostères.

Suite à ce travail de synthèse, des **scientifiques référents** ont apporté leurs **corrections** et leurs **remarques** sur cette synthèse de descripteurs importants à prendre en compte pour évaluer cet état de conservation.

Dans les tableaux, à chaque descripteur, correspondent des « **variables** » qualitatives ou quantitatives ainsi que des **méthodes** de collecte de l'information (cf. partie 3.2).

<table><caption>**Tableau 2 :** Démarche proposée pour évaluer l'état de conservation suivant les deux paramètres retenus.</caption><thead><tr><th>Paramètres</th><th>Critères</th><th>Descripteurs</th><th>Variables</th><th>Méthodes de collecte</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="2">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Menaces et pressions</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

Le renseignement d'un 3ème paramètre « **superficie de l'habitat** » viendra nuancer l'appréciation de l'état de conservation obtenu, sachant que pour ce dernier paramètre, il est pertinent de regarder son évolution dans le temps et pas seulement à un instant t.
## 3.2 Méthodes de collecte des données pour renseigner les descripteurs

Des données doivent être récoltées sur chaque site pour renseigner les paramètres et leurs descripteurs afin d'évaluer l'état de conservation des habitats naturels. Le plan d'échantillonnage adopté dépend du travail de cartographie des habitats dans le site.

### 3.2.1 Méthodes pour les descripteurs du paramètre « structure et fonctionnalité »

Si aucune méthode standardisée ne permet de renseigner l'ensemble des descripteurs de la « structure et de la fonctionnalité » des habitats naturels, la collecte des données repose néanmoins sur :

- des **protocoles existants** comme ceux utilisés pour le REBENT Breton ou pour la Directive Cadre sur l'Eau,

- des **méthodes établies scientifiquement** pour décrire les différents habitats ou groupes d'habitats (nombre de réplicats / dimensions pour les bennes, carottes,...).

En effet, il est important que les protocoles soient **harmonisés** avec les différents protocoles de suivis (type REBENT, DCE, Réseau de Surveillance Posidonies) ou méthodes existantes afin de replacer les données obtenues pour l'évaluation de l'état de conservation dans un contexte plus global.

A noter qu'une fiche de synthèse a été développée par le GIS Posidonie, basée sur les travaux de Jean-Georges Harmelin, pour aider à la caractérisation de l'habitat coralligène dans le cadre de Natura 2000 (Antonioli, 2010). Elle constitue un outil de terrain permettant d'avoir une base commune pour relever certains descripteurs de l'état de conservation du coralligène lors des campagnes d'échantillonnages afin de renseigner le tableau de synthèse (annexe II p.53). Cette fiche devrait faire l'objet d'une publication dans la revue des travaux scientifiques du Parc National de Port-Cros en 2011.

Ensuite, des études et des programmes sont en cours pour pallier les lacunes méthodologiques qui peuvent exister pour certains habitats et pour développer des indices et indicateurs pour évaluer leur état de conservation.

Deux thèses portent sur les estrans rocheux, sur le domaine atlantique marin :

- la thèse de Mathieu Le Duigou (laboratoire LIENSs (UMR 6250 CNRS-Université de La Rochelle) en collaboration avec l'association IODDE et le laboratoire LEMAR (IUEM)) sur « L'évaluation de l'impact de la pêche à pied récréative sur les peuplements benthiques associés aux blocs rocheux du médiolittoral charentais : exemple de l'île d'Oléron ». Un des objectifs de cette thèse est d'identifier des outils de gestion pertinents pour évaluer l'état de santé de l'habitat (taxons indicateurs, indice biotique).

- la thèse de Maud Bernard (Hémisphère Sub, encadrée par les laboratoires LEMAR (IUEM) et URU420 (Université de Rennes 1)) sur la « Hiérarchisation intégrée des valeurs de conservation des estrans rocheux du littoral breton : application méthodologique à la problématique Natura 2000 ». Un des objectifs de cette thèse est d'élaborer des méthodologies d'évaluation de la qualité écologique des estrans par la recherche d'indicateurs spécifiques à chaque type de perturbation sur des habitats ciblés (recherche d'indicateurs spécifiques à chaque type de perturbation, recherche de bioindicateurs, mise au point d'indices).

De plus, un programme est conduit dans le cadre d'une convention de partenariat entre l'Agence des Aires Marines Protégées et l'IFREMER (Laboratoire Environnement Ressources Provence-Azur-Corse) (2011-2013) afin de permettre d'évaluer l'état de conservation du coralligène en
Méditerranée : « Mise au point d'un indice global d'évaluation de l'état de conservation des formations coralligènes ». Cette étude s'appuiera sur une coopération des scientifiques de la façade méditerranéenne, ainsi que la participation de plusieurs gestionnaires d'aires marines protégées.

Enfin, une étude sur l'évaluation de l'état de conservation des habitats rocheux infralittoraux et circalittoraux est en cours à la Station marine de Concarneau (MNHN) avec une analyse de données déjà existantes et une phase de test sur le terrain en mars.

### 3.2.2 Méthodes pour les descripteurs du paramètre « menaces et pressions »

Concernant les descripteurs des « menaces et pressions », les méthodes de collecte reposent pour la plupart sur de l'observation directe sur le terrain.

Les menaces et les pressions listées dans les tableaux sont les plus fréquentes et les plus dommageables pour l'état de conservation des habitats naturels. D'autres types d'atteintes peuvent néanmoins être identifiés sur le terrain et remettre en cause l'état de conservation de l'habitat naturel. Dans ce cas, il faut tout de même relever l'information pour être le plus descriptif possible.

Certains descripteurs de l'état de conservation seront à relever localement mais de nombreuses pressions ont un effet plus diffus dans le site. Elles devront être renseignées en parcourant intégralement le site, voire ses alentours, avec les observations de terrain. Il est également recommandé d'utiliser des résultats d'études spécifiques (étude d'impact, évaluation d'incidence, ...) lorsqu'elles sont disponibles, pour définir et décrire au mieux ces pressions.

### 3.2.3 Méthodes pour le paramètre « superficie de l'habitat »

Enfin, l'appréciation de l'état de conservation des habitats naturels s'obtient en complétant l'analyse à travers l'étude des superficies. Pour renseigner le paramètre « **superficie de l'habitat** », il faut donc se baser sur le travail de cartographie des habitats, qui peut être effectué à un moment différent de la collecte d'informations pour l'évaluation ou combiné avec celle-ci.

## 4 Critères et descripteurs retenus pour évaluer l'état de conservation des habitats naturels marins

Suite au travail bibliographique et aux retours de correction des scientifiques référents, plusieurs critères et descripteurs ont été retenus pour les différents habitats naturels marins ou groupes d'habitats, pour étudier les deux paramètres suivant :

- la **structure** et les **fonctions** spécifiques du type d'habitat naturel marin nécessaires à son maintien ;

- les **menaces** et les **pressions** que peut subir cet habitat naturel et qui peut nuire à sa pérennité.

Dans cette partie 4, nous décrirons les critères et descripteurs qui permettent d'obtenir un état de conservation et le paramètre « superficie » qui peut nuancer le résultat de l'évaluation.
## 4.1 Critères et descripteurs relatifs à l'état de la structure et de la fonctionnalité des habitats naturels marins

Evaluer l'état de la structure et de la fonctionnalité d'un type d'habitat marin suppose d'évaluer l'état de ses diverses composantes, soit en évaluant les composants eux-mêmes, soit en s'appuyant sur des espèces indicatrices d'un bon fonctionnement écologique (sens donné aux « espèces typiques » dans la DHFF) ou indicatrices d'un mauvais fonctionnement. D'une manière générale, on ne fait pas de distinction entre structure et fonctions, les deux étant intiment liés.
Parmi ces composantes de l'habitat, on retient :

- la composante faunistique

- la composante floristique

- la structure générale (d'un herbier/d'un banc de maërl/d'un récif d'Hermelles/du coralligène)

- l'état de vitalité/santé (d'un herbier/d'un banc de maërl/ d'un récif d'Hermelles/du coralligène)

- l'aspect du sédiment pour les habitats de substrat meuble, ...

### La composante faunistique

La composante faunistique est un élément important qu'il faut prendre en compte à la fois pour caractériser l'habitat suivant la typologie souhaitée (Natura 2000, EUNIS, REBENT, etc.) mais également pour évaluer son état.

Dans le cas des sédiments meubles, les descripteurs de l'état de conservation correspondent à l'observation des espèces :

- caractéristiques de l'habitat (dont les espèces « leaders »),

- les espèces opportunistes ou sensibles à un excès en matière organique (MO) (témoin d'une pollution en MO ou d'une absence de pollution),

- les espèces sensibles à une perturbation physique et,

- les espèces nécrophages (signe d'une mortalité importante des espèces présentes dans l'habitat).

D'autre part, un travail portant sur la sensibilité des espèces caractéristiques des habitats Natura 2000 vis-à-vis de la pression de pêche est en cours de réalisation au MNHN suivant la méthodologie développée par Tyler-Walters & al., 2004 et 2009. La présence d'espèces « sensibles » ou au contraire d'espèces « opportunistes » face aux activités de pêche participera à l'évaluation de l'état de conservation.

Pour évaluer l'état de conservation d'un substrat meuble considéré, par le biais de la composante faunistique, on prendra alors en compte la composition, la densité des différentes espèces ainsi que la structure de populations des espèces dites « leaders » ou caractéristiques.

Pour les substrats rocheux, les descripteurs concernent l'observation de la faune fixée (intégratrice de changement de conditions du milieu).

Par exemple, pour évaluer l'état de conservation d'un champ de blocs, par le biais de la composante faunistique, on prendra en compte le rapport entre le taux de recouvrement des espèces coloniales (ascidies, éponges bryozoaires) et celui des spirorbes (signe d'une perturbation) (travaux de Hily et Le Hir, 2004).

Pour les herbiers et les zones recouvertes d'algues, les populations d'herbivores, avec le renseignement des densités d'individus, peuvent être prises en compte (signe d'un possible déséquilibre du réseau trophique).
L'évaluation de la superficie d'habitats remarquables abritant une forte biodiversité comme les bancs de moules *Mytilus edulis* dans les substrats meubles intertidaux atlantiques et les bancs huîtres plates *Ostrea edulis* sur les substrats meubles (habitats OSPAR) sont également à prendre en compte.

## La composante floristique

La composition floristique est également un élément important pour caractériser l'habitat (surtout pour les substrats rocheux recouverts d'algues et les herbiers) et pour évaluer son état.

**Pour les herbiers de posidonies et de zostères**, les descripteurs de l'état de conservation comprennent l'intégrité ou la fragmentation de l'herbier ainsi que son taux de recouvrement.

**Pour les substrats rocheux recouverts d'algues**, les descripteurs se rattachent aux ceintures algales. Selon les habitats, ils prennent en compte leur composition, leur intégrité ou leur fragmentation, leur recouvrement (pour les blocs rocheux, le rapport entre taux de recouvrement des algues brunes/rouges et celui des algues vertes), l'état des lames etc.

## La structure générale

Celle-ci correspond à la physionomie et à l'agencement des éléments constituant un habitat naturel caractérisé par une ou plusieurs espèces ingénieures (maërl, phanérogames, coralligène etc.).

Les descripteurs dépendent ici du type d'habitat et concernent en général le recouvrement des herbiers, des bancs de maërl, des récifs d'Hermelles ou autres bioconstructions. Ils doivent intégrer le degré de fragmentation et les profondeurs des limites supérieures et inférieures de l'habitat considéré.

Par exemple, **pour les herbiers de posidonies**, les descripteurs concernent la structure de l'herbier (structures érosives, limite inférieure, densité à – 15 m, recouvrement foliaire, rhizomes plagiotropes) et la structure de la matte (déchaussement et compacité).

Les descripteurs de l'état de conservation de la structure **du coralligène** concernent quant à eux les profondeurs des limites inférieures et supérieures du coralligène ainsi que sa porosité (complexité et âge de la bioconstruction).

**Pour les algues subtidales**, la structure des champs de laminaires et leurs différentes strates peuvent être comparées à une forêt avec l'identification de strates « arbustives » et « herbacées » ce qui donne une information sur la complexité de ces champs.

## L'état de vitalité/santé

Les descripteurs liés à l'état de vitalité/santé traduisent une partie de la composante fonctionnalité de l'habitat. Ils dépendent du type d'habitat (herbier/ banc de maërl/ récif d'Hermelles/ coralligène).

Selon les herbiers, ils décriront par exemple l'état des feuilles, leur longueur, leur production, la croissance des rhizomes, etc.
**Pour les récifs d'Hermelles**, Dubois (2003) a développé un indice de l'état de santé IS qui peut être calculé à partir de différents paramètres.

**Pour le coralligène**, cet état de santé sera décrit à partir de l'état des bioconstructeurs (taille, recouvrement morts et vivants...) et des bioérodeurs (abondance et formes) ainsi qu'à l'état des peuplements associés que ce soit les gorgones (densité, proportions des colonies nécrosées, taille) ou d'autres espèces dressées.

## L'aspect du sédiment

**Pour les sédiments meubles**, les descripteurs liés à ce critère permettent de signaler la présence ou l'absence de pollution. Ils correspondent à l'épaisseur de la couche oxydée pour les vases, la couleur, l'odeur du sédiment et à l'observation de galeries et de microhabitats.

## Autres

D'autres critères et leurs descripteurs propres à certains habitats naturels sont évalués pour définir l'état de conservation.

Par exemple, la laisse de mer est un critère d'évaluation important pour les **habitats supralittoraux**. Les descripteurs pourront alors être la présence ou l'absence sur la côte, le volume représenté, le pourcentage de linéaire côtier où elle est présente et les espèces qui lui sont associées.

**Pour l'habitat générique « Lagunes côtières »**, l'intégrité des berges (nature, morphologie et végétaux des prés salés) et le fonctionnement hydraulique (échange mer/lagune et comblement) sont également des critères d'évaluation. La réflexion sur la méthode d'évaluation de l'état de conservation de cet habitat débute et fera l'objet d'une étude complémentaire.

## 4.2 Critères et descripteurs relatifs aux pressions et menaces pesant sur les habitats naturels marins

Concernant les descripteurs des « **menaces et pressions** », les méthodes de collecte reposent pour la plupart sur de l'observation directe sur le terrain.

Il est possible de classer ces différentes « menaces et pressions » sur l'habitat naturel selon différentes catégories :

- les perturbations physiques

- les perturbations biologiques

- les pollutions (excès en MO, macrodéchets, hydrocarbures etc.)

### Les perturbations physiques

Ce critère comprend plusieurs descripteurs tels que le degré d'artificialisation du site (bétonnage, enrochements, épis, etc.), le remaniement du sédiment pour les substrats meubles (passage d'engins, traces/sillons, traitement mécanique du sable, réensablement), le ramassage mécanique des laisses de mer et les perturbations sur les substrats durs (arrachage de blocs, arrachage de grands invertébrés sessiles etc.).
Pour ces perturbations physiques, il faut alors noter la présence de ces atteintes et évaluer le pourcentage de superficies perturbées. L'imagerie acoustique permet de repérer certains impacts dans des zones immergées comme les traces/sillons dus à la pêche aux arts trainants ou a l'extraction de granulats.

## Les perturbations biologiques

Ces perturbations biologiques sont le fait d'espèces qui deviennent envahissantes dans certains endroits et leur prolifération menace les écosystèmes, les habitats et d'autres espèces.

La prolifération de ces espèces peut être un facteur de perturbation de la structure et du fonctionnement de l'habitat naturel, mais il a été choisi de traiter cet aspect sous l'angle des pressions.

En Méditerranée, cela concerne surtout des algues avec certaines Caulerpes (*Caulerpa taxifolia* et *Caulerpa racemosa* var. *cylindracea*), des Rhodobiontes (*Acrothamnion preissii*, *Womersleyella setacea*) et des algues brunes filamenteuses.

Pour la côte atlantique, ces perturbations sont généralement dues aux crépidules (*Crepidula fornicata*) et aux huîtres japonaises (*Crassostrea gigas*).

Pour ces perturbations biologiques, il faut alors noter la présence de ces espèces envahissantes et le pourcentage de superficies recouvertes par ces espèces.

## Pollutions

Pour ce critère, il faut prendre en compte la présence de sources potentielles de nuisance proche (émissaires, ports, cours d'eau, ...) et de macrodéchets et évaluer le pourcentage de superficies recouvertes de traces d'hydrocarbures et d'algues vertes opportunistes (*Enteromorpha*, *Cladophora*, *Uva*), témoins d'une perturbation (enrichissement en MO, etc.).

Si un point DCE est relevé à proximité ou dans le site Natura 2000, les analyses et résultats peuvent être utilisés pour décrire l'état écologique de la masse d'eau, dans les secteurs où les paramètres DCE sont bien calibrés (ceci est en cours de réflexion).

## 4.3 Elément complémentaire pour l'appréciation de l'état de conservation: la superficie de l'habitat naturel

L'appréciation de l'état de conservation des habitats s'obtient en complétant l'analyse à travers l'étude des superficies.

L'évolution dans le temps des superficies (augmentation ou régression) ou des limites spatiales de l'habitat naturel sont en effet de bons descripteurs de l'état de conservation. Néanmoins, ils peuvent être difficiles à mesurer suivant les connaissances existantes sur le site ou suivant sa configuration et les habitats naturels qui s'y trouvent. En effet, les superficies en mer peuvent être très étendues et ne pas être intégralement couvertes et échantillonnées lors du travail cartographique, en cours dans le cadre du marché de l'AAMP.
# 5 Analyse et évaluation de l'état de conservation

## 5.1 Principe de l'analyse pour évaluer l'état de conservation

La Commission européenne a établi une méthode d'analyse pour l'évaluation à l'échelle biogéographique « à feux tricolores » que l'on applique aux différents **paramètres** retenus (European Commission, 2005). Pour définir l'état de chaque paramètre, la France a précisé dans un guide méthodologique (Bensettiti et al., 2006) la démarche à adopter pour appliquer la méthode communautaire sur son propre territoire, à l'échelle des domaines biogéographiques. Cependant, l'évaluation à l'échelle d'un site Natura 2000 n'a pas été abordée dans ce guide.

Plusieurs approches ont été envisagées à l'échelle du site pour le milieu terrestre et notamment pour les forêts (Carnino, 2009a) mais un manque de connaissance et de données suffisantes dans le milieu marin ainsi que la difficulté de prospection en mer nous a conduits, pour l'instant et compte-tenu des délais imposés par le marché de l'AAMP, à privilégier une approche en deux étapes :

- **une 1ère étape descriptive** : à travers le renseignement des descripteurs définis précédemment. La remontée des données brutes via la mise en œuvre de protocoles cohérents avec les protocoles déjà existants permet de positionner les descripteurs dans un contexte plus global.

- **une 2ème étape soumis à avis d'experts** : au vu des descripteurs renseignés et du contexte global (suivis déjà réalisés de certains descripteurs), **un avis** sur l'état de conservation pourra être rendu si cela est possible par les experts scientifiques sans, pour l'instant, donner de valeurs-seuil ou gammes de valeurs pour attribuer l'état de conservation à un état "bon", "mauvais" etc. A ce jour, une réflexion en est cours pour classer l'état de conservation des habitats naturels marins et est réalisée en cohérence avec la réflexion menée pour la définition du « Bon Etat Ecologique » de la Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM).

Les BET en charge des études sur le terrain renseignent donc les descripteurs, point par point, quand cela est pertinent selon le site, en utilisant un plan d'échantillonnage et des protocoles adaptés. Si cela est possible, ils peuvent donner un avis sur l'état de conservation des habitats naturels qu'ils ont évalué selon leurs observations au niveau local.

Les descripteurs évalués doivent ensuite être transmis aux scientifiques référents pour qu'ils puissent donner leur avis également quand cela est possible. L'« avis d'experts » reste indispensable pour l'évaluation de l'état de conservation des habitats naturels marins. Cependant, l'« avis d'experts » sera mieux détaillé et décliné grâce aux descripteurs.

Des **grilles** ont été élaborées **pour lister les réponses** des BET et de leurs scientifiques référents pour que **l'analyse de l'état de conservation soit homogène** sur tous les sites Natura 2000 en mer. Les consignes pour le remplissage de ces grilles sont détaillées dans la partie 5.2.

### Perspective pour une 3ème étape :

Le retour d'expérience de cette démarche (1ère et 2ème étapes) doit permettre peu à peu de dégager les descripteurs les plus importants et mieux circonscrire les valeurs-seuils qui définissent le bon ou le mauvais état de conservation (valeurs pour chacune des catégories d'état qui vont être identifiées c'est-à-dire « bon », « altéré », ...).

Cette dernière étape de classification de l'état des habitats naturels marins avec la définition des valeurs-seuils, des états de référence ne pourra se faire qu'après la
remontée des données brutes, via le renseignement des descripteurs, et après réflexion de
la communauté scientifique. Ce travail sera fait en cohérence avec la réflexion menée
pour la définition du « Bon Etat Ecologique » des « descripteurs » de l'annexe I de la
DCSMM. De plus, certains programmes, études et thèses déjà lancés ou bientôt lancés
auront avancé dans cette réflexion sur la classification de l'état de conservation de
certains habitats (comme le programme sur l'habitat coralligène de l'IFREMER et de
l'AAMP et la thèse sur les estrans rocheux de Maud Bernard). Ces travaux seront alors
pleinement intégrés dans cette 3ème étape.

## 5.2 Consignes pour l'analyse avec grilles de réponses

Afin de suivre la **démarche qualité** préconisée par le MNHN, une grille pour chaque habitat ou
groupe d'habitats (onglets dans les deux fichiers Excel joints) a été élaborée pour **lister les
réponses** des BET et de leurs scientifiques référents pour que **l'analyse de l'état de
conservation soit homogène sur tous les sites Natura 2000 en mer**. Les deux fichiers Excel
sont *Grille de réponse – Descripteurs EC Atl V10.xls* et *Grille de réponse – Descripteurs EC Med V6.xls*

Le renseignement de ces grilles se fait en plusieurs étapes :

### 1ère étape : Le renseignement des grilles de réponses

Les BET en charge des études sur le terrain doivent renseigner les grilles de réponses
correspondant aux habitats présents dans leur site. Pour chaque habitat, ils renseignent :

* la **superficie de l'habitat**, sa **répartition dans le site**, des informations sur la **précision des données** (extrapolation, réalisation d'un échantillonnage suffisant pour permettre d'établir une matrice d'erreur associée à la carte, fourchette, ordre de grandeur de l'approximation (au km² près, à la 10aine de km², ha...)) et **éventuellement les tendances** de la superficie dans le temps ;

* les **descripteurs** pour cet habitat avec le remplissage des colonnes des grilles de réponses (voir le tableau 3 ci-dessous pour voir les réponses possibles). Les questions auxquels les BET doivent répondre sont les suivantes :

* Selon leur pertinence d'après les conditions locales, quels descripteurs ont-été relevés dans le site? Pour ceux qui ont été relevés, quels protocoles ont-été utilisés?

* Donner la valeur des descripteurs (quantitative ou qualitative)

* Existe t'il une grille d'interprétation/de lecture pour caractériser l'état du descripteur? Si oui, donner le résultat et dans tous les cas, soumettre à avis d'experts pour qualifier le descripteur.

* les scientifiques référents, au vu de la valeur attribuée au descripteur et selon si celui-ci a été caractérisé via une grille d'interprétation, donnent leur avis (si cela est possible) pour caractériser l'état du descripteur.

* Si cela est possible, les BET peuvent également donner un avis sur l'état de ces descripteurs selon leurs observations sur le terrain.
<table><caption>**Tableau 3 : Réponses possibles à faire figurer dans les grilles de réponses pour l'analyse de l'état de conservation**</caption><thead><tr><th></th><th>Paramètres</th><th>Critères</th><th>Descripteurs</th><th>Métriques</th><th>Ont-ils été relevés sur le site ?</th><th>Valeur du descripteur (quantitative ou qualitative)</th><th>Une grille de lecture / d'interprétation, permettant de caractériser l'état des descripteurs, a-t-elle été utilisée ?</th><th>Avis d'expert(s) : Nom du (des) scientifique(s) et réponses pour attribuer un état au descripteur considéré</th><th>Avis du BET : au vu de son expérience du terrain et de ses observations</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="2">Réponses possibles</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td>NON<br/>Expliquer pourquoi ce descripteur n'a pas été relevé (non pertinent au vu des conditions locales, manque de moyens ...)</td><td></td><td>NON<br/>Dans ce cas, passer directement à la colonne « avis d'experts »</td><td>NE PEUT PAS SE PRONONCER<br/>Dans ce cas, expliquer pourquoi (manque de connaissance...)</td><td rowspan="2">Texte libre</td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td></td><td>OUI<br/>Dans ce cas, quel protocole a été utilisé ?</td><td></td><td>OUI<br/>Dans ce cas, préciser quelle grille et donner le résultat d'après la grille mais soumettre également à « avis d'experts »</td><td>PEUT SE PRONONCER<br/>Dans ce cas, donner l'état du descripteur considéré dans le site et y associer un commentaire</td></tr></tbody></table>

## 2ème étape : la caractérisation de l'état de conservation de l'habitat considéré

Au vu de la caractérisation de ces descripteurs et au vu de la superficie qui peut venir nuancer l'appréciation de l'état de conservation, les scientifiques référents concluent sur l'état de conservation de l'habitat naturel marin considéré s'il est possible de se prononcer en l'état actuel des connaissances. Actuellement, avant la réflexion sur le « Bon Etat Ecologique » de la DCSMM et avant la publication d'études spécifiques sur le sujet (programmes et thèses), l'« avis d'experts » reste indispensable pour l'évaluation de l'état de conservation des habitats naturels marins. Cependant, l'« avis d'experts » sera mieux détaillé et décliné grâce aux descripteurs.
# 6 Bilan et perspectives futures pour les méthodes

Dans un premier temps, le guide méthodologique sera envoyé plus particulièrement aux bureaux d'études qui réalisent actuellement la cartographie des habitats et l'évaluation de l'état de conservation de ces habitats dans les sites Natura 2000 en mer (marché Agence des aires marines protégées, 2010). Ce rapport sera également diffusé aux services de l'Etat et aux opérateurs des sites Natura 2000.

Ensuite, ce guide méthodologique sera amené à évoluer avec l'avancée des connaissances et avec une réflexion menée avec les scientifiques. Des indicateurs, des indices et des protocoles d'évaluation précis développés par le biais de programmes, études et thèses seront alors intégrés dans ce nouveau guide. Dans ce contexte, une formation sur les méthodologies plus précises développées dans le cadre de ces études serait alors à envisager pour les gestionnaires de sites et les bureaux d'études.

Ce guide constituera un outil de référence permettant d'évaluer l'état de conservation des habitats naturels dans les sites de façon à pouvoir orienter les prises de décision et permettant également de contribuer à l'évaluation au niveau national pour laquelle s'est engagée la France vis-à-vis de l'Europe (article 17 de la DHFF sur l'évaluation des habitats et des espèces listés dans la directive, au niveau national tous les 6 ans).
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Harmelin J-G et Garrabou J., 2005. Suivi d'une population de *Paramuricea clavata* (Risso, 1826) (Cnidaria, Octocorallia, Gorgonacea) dans le parc national de Port-Cros (Méditerranée, France) : comparaison des états 1992 et 2004 sur le site de la Galère. Port-Cros natl. Park, Fr., vol. 21 : p 175-191.

Hily C. et Grall J., 2003a. Echantillonnage quantitatif des biocénoses subtidales des fonds meubles. Fiche technique n°1 REBENT (http://www.ifremer.fr/rebent/)

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Hily C. et Le Hir M., 2004. Impacts de la pêche à pied et de la plongée sur la biodiversité de la faune marine et mise au point d'outils d'évaluation. Programme LITEAU 1.

Hily C., 2006a. Suivi des herbiers de zostères. Fiche technique n°4 REBENT (http://www.ifremer.fr/rebent/)

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Hily C., 2006c. Fiche de synthèse sur les biocénoses : les herbiers de Zostères marines. Fiche biologique REBENT n°2 (http://www.ifremer.fr/rebent/)

Hiscock K., Langmead O., Warwick R. & Smith A., 2005. Identification of seabed indicator species to support implementation of the EU Habitats and Water Framework Directives. Second edition. *Report to the Joint Nature Conservation Committee and the Environment Agency from the Marine Biological Association*. Plymouth: Marine Biological Association. JNCC Contract F90-01-705. 77 pp. (The report can be accessed at: http://www.marlin.ac.uk/PDF/MBA_Indicators_2005.pdf)

Ifremer, Créocean et UMII, 2000. Mise à jour d'indicateurs du niveau d'eutrophisation des milieux lagunaires méditerranéens – Rapport final : Tome I et II, 412 pp.

Ifremer et Cepralmar, 2004. Outil d'évaluation du niveau d'eutrophisation des milieux lagunaires - Réseau de Suivi Lagunaire du Languedoc-Roussillon : Bilan des résultats 2003. Rapport RSL-04/2004, chap. 17, 14 pp.

Ifremer, 2005. Recommandations pour un programme de surveillance adapté aux objectifs de la DCE. Recommandations concernant le benthos. Fiche technique n°6 : Angiospermes – Herbier à *Zostera marina*.

ISO/FDIS 16665:2005(F). Qualité de l'eau — Lignes directrices pour l'échantillonnage quantitatif et le traitement d'échantillons de la macrofaune marine des fonds meubles.

Lejart M., Larzillière A. et Hily C., 2010. Etude des herbiers et des champs de blocs du Parc naturel marin d'Iroise : cartographie et caractérisation de l'état de conservation. 184pp.

Le Loc'h F., 2004. Structure, fonctionnement, évolution des communautés benthiques des fonds meubles exploités du plateau continental Nord Gascogne. Thèse de Doctorat de l'Université de Bretagne Occidentale, 326 pp. + annexes.
NF EN ISO 19493 : 2007. Qualité de l'eau — Lignes directrices pour les études biologiques marines des peuplements du substrat dur.

Parc naturel régional de la Narbonnaise en Méditerranée, en cours. Document d'objectifs du site Complexe lagunaire de Bages Sigean (FR9101440) et de la ZPS Etangs de la Narbonnais (FR9112007).

Pena V. & Barbara I., 2008. Biological importance of an Atlantic European maërl bed off Benencia Island (northwest Iberian Peninsula). Botanica Marina, vol. 51, p. 493–505.

Pérès J-M. et Picard J., 1964. Nouveau manuel de bionomie benthique de la Méditerranée. Recueil des travaux de la station marine d'Endoume, bulletin 31, fascicule 47, p. 1-37.

Perez T., Sartoretto S., Soltan D., Capo S., Fourt M., Dutrieux E., Vacelet J., Harmelin J.G., Rebouillon P., 2000. Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l'état du milieu marin. *Système d'évaluation de la Qualité des Milieux littoraux – Volet biologique*. Rapport Agences de l'Eau, 4 fascicules, 642 pp.

Pergent G., 2007. Protocole pour la mise en place d'une surveillance des herbiers de Posidonies. Programme « MedPosidonia » / CAR/ASP – Fondation d'entreprise TOTAL pour la Biodiversité et la Mer ; Mémorandum d'Accord N°21/2007/RAC/SPA/ Medposidonia Nautilus-Okianos : 21p.

Pergent G., Leonardini R., Lopez Y Royo C., Mimault B. et Pergent-Martini C., 2008. Mise en œuvre d'un Réseau de Surveillance Posidonies le long du littoral de la Corse – Rapport de synthèse. Contrat Office de l'Environnement de la Corse et GIS Posidonie Centre de Corse, GIS Posidonie Publ., Corte : 273 pp. + Cédérom.

PNUE-PAM-CAR/ASP, 2007. Manuel d'interprétation des types d'habitats marins pour la sélection des sites à inclure dans les inventaires nationaux de sites naturels d'intérêt pour la Conservation. Pergent G., Bellan-Santini D., Bellan G., Bitar G., Harmelin J.G. eds., CAR/ASP publ., Tunis : 199pp.

Ricquiers L., Desroy N., Dubois S., Guérin L., Gerla D., Legendre A., Le Mao P. & Rougerie M., 2009. Évolution du récif à *Sabellaria alveolata* (L.) de la baie du Mont-Saint-Michel. Poster.

Thibaut T & Mannoni P-M. 2007. Cartographie des paysages marins : encorbellements à *Lithophyllum* et faciès à cystoseires - Site Natura 2000 FR 9301624 - Cap Lardier – Cap Taillat – Cap Camarat. Contrat Sivom du Littoral des Maures – GIS Posisdonie. LEML Publ. 17 p. + cartes.

Tyler-Walters, H., Lear, D. & Allen J.H., 2004. *Identifying offshore biotope complexes and their sensitivities.* Report to Centre for Environmental, Fisheries, and Aquaculture Sciences from the Marine Life Information Network (*MarLIN*). Plymouth: Marine Biological Association of the UK. [Sub contract reference A1148]

Tyler-Walters H., Rogers S. I., Marshall C. E. & Hiscock K., 2009. A method to assess the sensitivity of sedimentary communities to fishing activities. Aquatic Conserv.: Mar. Freshw. Ecosyst., vol. 19, p. 285-300.
**Internet :**

The Marine Life Information Network (MarLIN): http://www.marlin.ac.uk/

Le RÉseau BENTique (REBENT) : http://www.ifremer.fr/rebent/

The OSPAR Convention : http://www.ospar.org/

RSL (Réseau de Suivi Lagunaire) : http://rsl.cepralmar.com/

**Présentations Powerpoint présentées lors des journées d'information pour les BET du 29-30 avril 2010 à Niolon :**

« Les constructions coralligènes - Présentation générale - Analyse de l'état de conservation - Protocole d'acquisition des données » par Stéphane Sartoretto, IFREMER

« Les herbiers de Posidonies – Structure et fonctionnalités » et « Quelle représentation cartographique pour les herbiers de magnoliophytes marines » par Christine Pergent-Martini et Gérard Pergent, Université de Corse.

« Importance de l'hydrodynamisme – relation directe avec la bathymétrie et la profondeur » par Jean-Michel Amouroux et Céline Labrune, Station Marine de Banyuls/Mer.

« Substrats durs dans les sites Natura 2000 » par Denise Bellan-Santini, Station Marine d'Endoume.
# Annexe I : Tableaux de synthèse des descripteurs de l'état de conservation des habitats naturels marins

Domaine Atlantique marin : version 10 (pages 28 à 41)

Domaine Méditerranée marin : version 6 (pages 42 à 55)

**Remarque** : ce qui en rouge dans les tableaux est en cours de réflexion
# 1 - Substrats meubles supralittoraux 1140-1/2

## 1) Caractéristiques des substrats meubles

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Type de sédiment (sable ou galets)</td><td>Observation directe</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Cahiers d'habitats côtiers (tome 2)

- Dauvin (Edit.), 1997

## 2) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><td>Paramètres</td><td>Critères</td><td>Descripteurs</td><td>Métriques à renseigner</td><td>Méthodes de collecte</td><td>Echelle de collecte</td></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="2">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td>Laisses de mer</td><td>1 - Laisses de mer</td><td>Présence/absence, volume, % linéaire côtier</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>Espèces associées aux laisses de mer</td><td>2 - Amphipodes, Isopodes, Insectes, autres</td><td>Présence/absence, abondance (faible/moyenne/forte)</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr></tbody></table>

<table><tbody><tr><td rowspan="9">Menaces et pressions</td><td rowspan="3">Perturbations physiques</td><td>3 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochement, bétonnage, épis ...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>4 - Remaniement du sédiment par piétinement, traitement mécanique du sable, passage engins...</td><td>Observations et évaluation pourcentage superficie sédiments perturbés</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>5 - Réensablement</td><td>Observations</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td rowspan="4">Pollutions</td><td>6 - Ramassage laisses de mer</td><td>Observations</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>7 - Algues vertes opportunistes (Enteromorpha, Cladophora, Ulva)</td><td>Observation pourcentage superficie recouverte</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>8 -Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Observation pourcentage superficie polluée</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>9 - Macrodéchets</td><td>Observation volume, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr></tbody></table>
## 2 - Substrats meubles médiolittoraux 1130-1, 1140-3/6, 1160-1/2

### 1) Caractéristiques des substrats meubles

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Type de sédiment (analyse granulométrique, taux de matière organique)</td><td>Carotte et analyse en laboratoire</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Fiche n°10 DCE (In: Guillaumont (coord.), 2005)

- Fiche technique n°3 REBENT (Grall et Hily, 2006)

- Dauvin (Edit.), 1997

### 2) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>Interprétation imagerie satellitaire, aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

### 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><th>Paramètres</th><th>Critères</th><th>Descripteurs</th><th>Métriques à renseigner</th><th>Méthodes de collecte</th><th>Echelle de collecte</th><th>protocole DCE</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="4">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="3">Composition faunistique</td><td>1 - Espèces "indicatrices", caractéristiques</td><td>Présence/absence des espèces (attention: casser toutes les coquilles pour vérifier les contenus (présence/absence de l'animal ou d'un locataire de la coquille)) + densité et structure de populations</td><td>Carottier à main (3 à 5 carottes)</td><td>carotte</td><td>X</td></tr><tr><td>2 - dont espèces "leader"</td><td>Densité et structure de populations</td><td>Carottier à main (3 à 5 carottes)</td><td>carotte</td><td>X</td></tr><tr><td>3 - Espèces sensibles aux perturbations physiques (épifaune sessile ex. polychètes tubicoles (Lanice conchilega)…)</td><td>Densité et structure de populations + superficie de recouvrement pour Lanice conchilega...</td><td>Carottier à main (3 à 5 carottes) et observation directe</td><td>carotte + habitat</td><td>X</td></tr><tr><td>Autres</td><td>4 - Laisses de mer</td><td>Présence/absence, volume, % linéaire côtier</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr></tbody></table>

<table><tbody><tr><td rowspan="13">Menaces et pressions</td><td rowspan="3">Perturbations physiques</td><td>5 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, bétonnages, épis, canalisations, installations portuaires ...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>6 - Remaniement du sédiment par pêche à pied, pêche aux arts trainants, piétinement, traitement mécanique du sable, passage engins...</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>7 - Réensablement</td><td>Observations</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="5">Pollutions</td><td>8 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, enrochement, engraissement de plages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>9 - Couche oxydée pour certains sédiments (vases), proliférations bactériennes</td><td>Epaisseur de la couche oxydée, couleur, odeur</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td>X</td></tr><tr><td>10 - Algues vertes opportunistes (Ulva, Enteromorpha, Cladophora)</td><td>Evaluation pourcentage superficie recouverte</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>11 - Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Evaluation pourcentage superficie polluée</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>12 - Macrodéchets flottants ou rejetés à la côte</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td></td><td>13 - Pollution des eaux</td><td>Voir ce qui a été déjà étudié pour la masse d'eau considérée (DCE) = acquis. Si pas de point DCE, indices AMBI, BENTIX ... Attention, à discuter !</td><td>DCE</td><td>Masse d'eau</td><td>X</td></tr></tbody></table>
# 3 - Substrats meubles infralittoraux 1110-1/4

## 1) Caractéristiques des substrats meubles

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Nature du sédiment (analyse granulométrique, taux de matière organique, ...)</td><td>Benne et analyse en laboratoire</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Morphologie (dunes hydrauliques, bancs, ...)</td><td>Interprétation imagerie acoustique + dans certains cas, vérité terrain (plongée et/ou vidéo)</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

## 2) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie acoustique + vérité terrain (benne et/ou vidéo)</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>Interprétation imagerie acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><th>Paramètres</th><th>Critères</th><th>Descripteurs</th><th>Métriques à renseigner</th><th>Méthodes de collecte</th><th>Echelle de collecte</th><th>Protocole DCE</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="7">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="3">Aspect du sédiment</td><td>1 - Couche oxydée (pour vases)</td><td>Observation épaisseur couche oxydée</td><td>Benne (3 à 5 bennes)</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td>2 - Couleur, odeur</td><td>Evaluation</td><td>Benne (3 à 5 bennes)</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td>3 - Galeries, microhabitats...</td><td>Observations</td><td>Benne (3 à 5 bennes)</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td rowspan="4">Composition faunistique</td><td>4 - Espèces "indicatrices", caractéristiques</td><td>Identification et dénombrement pour richesse spécifique, abondance, biomasse, indices de diversité... (attention: casser toutes les coquilles pour vérifier les contenus (présence/absence de l'animal ou d'un locataire de la coquille)) + densité et structure de populations</td><td>Benne (3 à 5 bennes)</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td>5 - dont espèces "leader"</td><td>Benne (3 à 5 bennes)</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td>6 - Espèces sensibles aux perturbations physiques comme épifaune sessile (cnidaires, polychètes tubicoles, grands bivalves ...)</td><td>Drague/chalut à perche</td><td>Trait de drague/chalut</td><td></td></tr><tr><td>7 - Espèces nécrophages comme crustacés décapodes (Liocarcinus depurator, Pagurus sp. ...)</td><td>Benne/drague/chalut à perche/plongée/vidéo</td><td>voir</td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Autres</td><td>8 - Bancs de crépidules, d'huîtres plates,...</td><td>Observations et évaluation abondance (faible/moyenne/forte)</td><td>Benne/drague/chalut à perche/plongée/vidéo</td><td>voir</td><td></td></tr><tr><td>9 - Bancs de crépidules, d'huîtres plates,...</td><td>Observations et évaluation abondance (faible/moyenne/forte)</td><td>Imagerie acoustique + vérité terrain</td><td>habitat</td><td></td></tr></tbody></table>

<table><tbody><tr><td rowspan="10">Menaces et pressions</td><td rowspan="2">Perturbations physiques</td><td>9 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, bétonnages, épis, canalisations, passages de câbles, installations portuaires, récifs artificiels, éoliennes ...)</td><td>Imagerie satellitaire, acoustique et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>10 - Remaniement sédiments (traces/sillons) par pêche aux arts trainants, extraction de granulats, dragage et rejets de dragage...</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, acoustique et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="5">Pollutions</td><td>11 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Evaluation pourcentage superficie sédiments remaniés</td><td>Imagerie acoustique + observations</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>12 - Couche oxydée pour certains sédiments (vases), proliférations bactériennes...</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, engraissement de plages, rejets de dragages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>13 - Macrodéchets, filets et autres engins de pêche, mouillages perdus, corps morts</td><td>Epaisseur de la couche oxydée, couleur, odeur</td><td>Benne et observation directe</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td>14 - Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>Point vérité terrain</td><td></td></tr><tr><td>15 - Pollution des eaux</td><td>Evaluation pourcentage superficie polluée</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td>Voir ce qui a été déjà étudié pour la masse d'eau considérée (DCE) = acquis. Si pas de point DCE, indices AMBI, BENTIX ... Attention, à discuter !</td><td>DCE</td><td>Masse d'eau</td><td>X</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Fiche n°10 DCE (In: Guillaumont (coord.), 2005)

- Fiche technique n°1 REBENT (Grall et Hily, 2003)

- Norme ISO/FDIS 16665:2005(F)

- Dauvin (Edit.), 1997

- Grall, J. et Coïc, N., 2005

- Le Loc'h, 2004
# 4 - Bancs de maërl 1110-3 et 1160-2

Remarque : 1110-3 (sables grossiers et graviers à *Phymatolithon calcareum*) et 1160-2 (Sédiments envasés à *Lithothamnion corallioides*)

## 1) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>interprétation imagerie acoustique + vérité terrain (benne/vidéo/plongée)</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>interprétation imagerie acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Fiche n°2 DCE (In: Guillaumont (coord.), 2005)

- Fiche technique n°2 REBENT (Hily et Grall, 2003)

- Fiche biologique n°1 REBENT (Grall, 2003)

## 2) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><td>Paramètres</td><td>Critères</td><td>Descripteurs</td><td>Métriques à renseigner</td><td>Méthodes de collecte</td><td>Echelle de collecte</td><td>Protocole DCE</td></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="5">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="2">Structure générale du banc</td><td>1 - Taux de recouvrement du banc</td><td>Surface maërl vivant sur surface prélèvement de la benne</td><td>Benne (3 à 5 bennes)</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td>2 - Pourcentage de maërl vivant</td><td>Poids maërl vivant sur poids total maërl (vivant + mort)</td><td>Benne (3 à 5 bennes)</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td>Etat de vitalité du maërl</td><td>3 - Taux de vitalité</td><td>surface maërl vivant/ (surface maërl vivant + mort)</td><td>Benne (3 à 5 bennes)</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td rowspan="2">Composition en espèces</td><td>4 - Espèces sensibles aux perturbations physiques (épifaune sessile comme éponges, ascidies... et grands suspensivores)</td><td>Densité et structures de populations</td><td>Benne + photo/vidéo</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td>5 - Espèces nécrophages (pagures, crabes, ...)</td><td>Observations et évaluation abondance (faible/moyenne/forte)</td><td>Benne/plongée/vidéo</td><td>voir</td><td>X</td></tr></tbody></table>

<table><tbody><tr><td rowspan="5">Menaces et pressions</td><td rowspan="2">Perturbations physiques</td><td>6 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (canalisations, passages de câbles, installations portuaires, éoliennes ...)</td><td>Imagerie satellitaire, acoustique et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>7 - Remaniement bancs (traces/sillons) par pêche aux arts trainants, extraction maërl, ...</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, acoustique et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Perturbations biologiques</td><td>8 - Crépidules (Crepidula fornicata)</td><td>Evaluation pourcentage de recouvrement</td><td>Imagerie acoustique + benne</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>9 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, enrochement, engraissement de plages, rejets de dragages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Pollutions</td><td>10 - Macrodéchets, filets et autres engins de pêche, mouillages perdus, corps morts</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>Point vérité terrain</td><td></td></tr><tr><td>11 - Pollution des eaux</td><td>Voir ce qui a été déjà étudié pour la masse d'eau considérée (DCE) = acquis. Si pas de point DCE, indices AMBI, BENTIX ... Attention, à discuter !</td><td>DCE</td><td>Masse d'eau</td><td>X</td></tr></tbody></table>
# 5 - Herbiers à *Zostera noltii* (Médiolittoral) 1130-1, 1140-3, 1160-3

## 1) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale, limite supérieure et limite inférieure</td><td>interprétation imagerie satellitaire, aéroportée + vérité terrain (à pied et avec lunette de Calfa ou plongée pour les limites inférieures)</td><td>Herbier</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat (échelle à définir ultérieurement)</td><td>interprétation imagerie satellitaire, aéroportée + vérité terrain</td><td>Herbier</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Bajjouk, 2009

- Fiche n°7 DCE (In: Guillaumont (coord.), 2005)

- Fiche technique n°4 REBENT (Hily, 2006)

- Fiche biologique n°2 REBENT (Hily, 2006)

## 2) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><th>Paramètres</th><th>Critères</th><th>Descripteurs</th><th>Métriques à renseigner</th><th>Méthodes de collecte</th><th>Echelle de collecte</th><th>Protocole DCE</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="10">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="2">Structure générale de l'herbier</td><td>1 - Degré de fragmentation de l'herbier (DF)</td><td>Proportion de l'enveloppe non recouverte par l'herbier<br>DF = 1 - (surface exacte de l'herbier / surface enveloppe)</td><td>Imagerie satellitaire ou aéroportée (surface enveloppe) + traitement informatique (surface exacte de l'herbier=Nombre de pixel herbier x surface pixel)</td><td>herbier</td><td>X</td></tr><tr><td>2 - Sédiment</td><td>Granulométrie<br>Taux de matière organique</td><td>Carotte<br>Carotte</td><td>carotte<br>carotte</td><td>X<br>X</td></tr><tr><td rowspan="5">Etat de vitalité de l'herbier</td><td>3 - Recouvrement de l'herbier</td><td>Taux de recouvrement (% herbier / substrat)</td><td>Quadrat à pied ou en plongée</td><td>quadrat</td><td></td></tr><tr><td>4 - Densité des pieds (1 pied = 1 faisceau de feuilles)</td><td>Nombre de pieds/m²</td><td rowspan="5">Quadrat de 0,1m² (4 réplicats)</td><td rowspan="5">quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td>5 - Surface foliaire</td><td>Nombre de pieds/m²<br>Longueur et largueur moyenne des feuilles<br>Nombre de feuilles par pied</td><td>X</td></tr><tr><td>6 - Biomasse</td><td>Biomasse des feuilles (g/m²)<br>Biomasse des rhizomes (g/m²)</td><td>X</td></tr><tr><td>7 - Epiphytes</td><td>Biomasse matière sèche</td><td>X</td></tr><tr><td>8 - Brouteurs</td><td>Nombre/m²</td><td>X</td></tr><tr><td>Espèces associées</td><td>9 - Faune associée (endogée et mégafaune vagile)</td><td>Diversité et abondance</td><td>carotte et observation directe</td><td>carotte et herbier</td><td>X</td></tr><tr><td>Autres</td><td>10 - Etat des feuilles</td><td>Entières, déchirées, broutées</td><td>Observation directe</td><td>à voir</td><td></td></tr></tbody></table>

<table><tbody><tr><td rowspan="10">Menaces et pressions</td><td rowspan="2">Perturbations physiques</td><td>11 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, bétonnages, épis, canalisations, installations portuaires ...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>12 - Remaniement du sédiment par pêche à pied, ...</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="6">Pollutions</td><td>13 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Observations et évaluation pourcentage superficie sédiments perturbés</td><td>Observation directe, imageries</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>14 - Couche oxydée pour certains sédiments (vases), proliférations bactériennes...</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ...</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>15 - Algues vertes opportunistes (Ulva, Enteromorpha, Cladophora)</td><td>Epaisseur de la couche oxydée, couleur, odeur</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>16 - Macrodéchets</td><td>Evaluation superficie de recouvrement</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>17 - Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Evaluation pourcentage superficie polluée</td><td>Observation directe</td><td>Point vérité terrain</td><td></td></tr><tr><td>18 - Pollution des eaux</td><td>Voir ce qui a été déjà étudié pour la masse d'eau considérée (DCE) = acquis. Attention, à discuter !</td><td>DCE</td><td>Masse d'eau</td><td>X</td></tr></tbody></table>
# 5 bis - Herbiers à *Zostera marina* (Infralittoral) 1110-1, 1160

## 1) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td><td>Protocole LEMAR PNM Iroise</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale, limite supérieure et limite inférieure</td><td>interprétation imagerie satellitaire, aéroportée, acoustique + vérité terrain (Vidéo)</td><td>Herbier</td><td>X</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Lejart et al., 2010

- Fiche n°6 DCE (In: Guillaumont (coord.), 2005)

- Fiche technique n°4 REBENT (Hily, 2006)

- Fiche biologique n°2 REBENT (Hily, 2006)

## 2) Caractérisation de l'herbier

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td><td>Protocole LEMAR PNM Iroise</td></tr></thead><tbody><tr><td>Fragmentation de l'herbier :<br/>- homogène (grande tâche uniforme sans interruption dans son enveloppe globale)<br/>- fragmenté (tâches avec proportion sédiment< herbier dans enveloppe globale)<br/>- très fragmenté (tâches avec sédiment>herbier dans enveloppe globale)</td><td>Vidéo ou lunette de Calfa selon la profondeur (+GPS) à l'intérieur de l'herbier, soit de manière aléatoire, soit le long d'un transect</td><td>Herbier</td><td>X</td></tr><tr><td>Densité de l'herbier (taux de recouvrement de l'herbier par rapport au substrat (en %))</td><td>Vidéo, lunette de Calfa ou plongée</td><td>Tâche de l'herbier</td><td>X</td></tr><tr><td>Longueur des brins de Zostères (&lt;25cm; &lt;50cm; &gt;50cm)</td><td>Prélèvement</td><td>Tâche de l'herbier</td><td>X</td></tr></tbody></table>

## 2) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><td>Paramètres</td><td>Critères</td><td>Descripteurs</td><td>Métriques à renseigner</td><td>Méthodes de collecte</td><td>Echelle de collecte</td><td>Protocole DCE/REBENT</td><td>Protocole LEMAR PNM Iroise</td></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="10">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="2">Structure générale de l'herbier</td><td>1 - Fragmentation de l'herbier</td><td>Proportion sédiment par rapport à l'herbier dans l'enveloppe globale:<br/>- homogène (grande tâche uniforme sans interruption dans son enveloppe globale)<br/>- fragmenté (tâches avec proportion sédiment< herbier dans enveloppe globale)<br/>- très fragmenté (tâches avec sédiment>herbier dans enveloppe globale)</td><td>Vidéo ou lunette de Calfa selon la profondeur (+GPS) à l'intérieur de l'herbier, soit de manière aléatoire, soit le long d'un transect</td><td>herbier</td><td></td><td>X</td></tr><tr><td>2 - Sédiment</td><td>Granulométrie<br/>Taux de matière organique</td><td>Carotte<br/>Carotte</td><td>carotte<br/>carotte</td><td>X<br/>X</td><td>X<br/>X</td></tr><tr><td rowspan="5">Etat de vitalité de l'herbier</td><td>3 - Densité des pieds (1 pied = 1 faisceau de feuilles)</td><td>Nombre de pieds/m²</td><td>Quadrat de 0,1m² (2-3 réplicats)</td><td>quadrat</td><td>X</td><td>X</td></tr><tr><td>4 - Surface foliaire</td><td>Nombre de pieds/m²<br/>Longueur et largueur moyenne des feuilles</td><td>Quadrat de 0,1m² (2-3 réplicats)</td><td>quadrat</td><td>X</td><td>X</td></tr><tr><td>5 - Biomasse</td><td>Nombre de feuilles par pied<br/>Biomasse des feuilles (g/m²)<br/>Biomasse des rhizomes (g/m²)</td><td>Prélèvement de 1/2 quadrat de 0,1m² (2 réplicat)</td><td>1/2 quadrat</td><td>X<br/>X<br/>X</td><td>X<br/>X<br/>X</td></tr><tr><td>6 - Indice de maladie : Wasting Disease Index</td><td>Taux de recouvrement (en %) de la maladie sur les feuilles (tâches sombres)</td><td>Prélèvement dans l'herbier de 10 pieds</td><td>herbier</td><td>X</td><td>X</td></tr></tbody></table>
<table><tr><td rowspan="3">Espèces associées</td><td>7 - Epiphytes</td><td>Biomasse matière sèche (g/m²)</td><td>Prélèvement de 10 pieds</td><td>herbier</td><td>X</td><td>X</td></tr><tr><td>8 - Brouteurs</td><td>Nombre/m²</td><td>Quadrat</td><td>quadrat</td><td>X</td><td>X</td></tr><tr><td>9 - Faune associée (endogée et mégafaune vagile)</td><td>Diversité et abondance</td><td>carotte et observation directe</td><td>carotte et herbier</td><td>X</td><td>X</td></tr><tr><td>Autres</td><td>10 - Etat des feuilles</td><td>Entières, déchirées, broutées</td><td>Observation directe</td><td>à voir</td><td></td><td>X</td></tr></table>

<table><tr><td rowspan="10">Menaces et pressions</td><td rowspan="3">Perturbations physiques</td><td>11 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, bétonnages, épis, canalisations, passages de cables, installations portuaires ...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td><td></td></tr><tr><td>12 - Remaniement du sédiment par pêche aux arts trainants (traces/sillons), mouillage, ...</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td><td></td></tr><tr><td></td><td>Observations et évaluation pourcentage superficie sédiments perturbés</td><td>Observation directe, imageries</td><td>habitat</td><td></td><td></td></tr><tr><td rowspan="5">Pollutions</td><td>13 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, engraissement de plages, rejets de dragages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td><td></td><td></td></tr><tr><td>14 - Couche oxydée pour certains sédiments (vases), proliférations bactériennes...</td><td>Epaisseur de la couche oxydée, couleur, odeur</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td><td></td></tr><tr><td>15 - Algues vertes opportunistes (Ulva, Enteromorpha, Cladophora)</td><td>Evaluation superficie de recouvrement</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td><td>X</td></tr><tr><td>16 - Macrodéchets, filets et autres engins de pêche, mouillages perdus, corps morts</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>Point vérité terrain</td><td></td><td></td></tr><tr><td>17 - Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Evaluation pourcentage superficie polluée</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td><td></td></tr><tr><td rowspan="2"></td><td>18 - Pollution des eaux</td><td>Voir ce qui a été déjà étudié pour la masse d'eau considérée (DCE) = acquis. Attention, à discuter !</td><td>DCE</td><td>Masse d'eau</td><td>X</td><td></td></tr></table>
# 6 - Substrats rocheux médiolittoraux 1170-1/3

## 1) Caractéristiques de l'habitat rocheux

<table><thead><tr><th>A renseigner</th><th>Protocole de détermination</th><th>Echelle</th></tr></thead><tbody><tr><td>Morphologie de la côte (continue/gros blocs/petits blocs)</td><td>Interprétation imagerie satellitaire, aéroportée ou observation directe</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Substrat (calcaire, granit, roche métamorphique, conglomérat ...)</td><td>Observation directe</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Pente</td><td>Observation directe</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Exposition aux vagues</td><td>Observation directe</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

si présence de blocs => voir n°10 champs de blocs

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Fiche de synthèse REBENT/Natura2000 n°2 (Dion et al., 2009)

- Fiche technique n°5 REBENT (Hily et Grall, 2006)

- Norme NF EN ISO 19493 : 2007

- Fiche technique n°11 REBENT (Ar Gall et Connan, 2004)

## 2) Superficie

<table><thead><tr><th>A renseigner</th><th>Protocole de détermination</th><th>Echelle</th></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie satellitaire</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Superficie des ceintures algales et limites inférieures et supérieures, pourcentage linéaire côtier</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée ou observation directe</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>Interprétation imagerie satellitaire, aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><th>Paramètres</th><th>Critères</th><th>Descripteurs</th><th>Métriques à renseigner</th><th>Méthodes de collecte</th><th>Echelle de collecte</th><th>Protocole REBENT</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="7">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="3">Ceintures de Fucales en mode abrité</td><td rowspan="2">1 - Ensemble des ceintures de Fucales (autres ceintures pour côte Basque)</td><td>Identification des espèces (espèces indicatrices) pour déterminer ceintures</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>Nombre de ceintures</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>2 - Pour chaque ceinture (dans zones identifiées comme représentatives du site)</td><td>Intégrité des ceintures (continues/fragmentées)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Roche en mode exposé</td><td rowspan="2">3 - Composition en espèces</td><td>Pourcentage de recouvrement de la roche nue, de la faune fixée (patelles, cirripèdes, huîtres) et de la flore</td><td>Quadrats</td><td>quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td>Identification et dénombrement flore et faune (gros organismes) pour densité, structure de populations</td><td>Quadrats</td><td>quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td rowspan="2">4 - Moulière</td><td rowspan="2">Evaluation pourcentage superficie</td><td>Pourcentage de recouvrement de la roche nue, de la faune fixée (patelles, cirripèdes, huîtres) et de la flore</td><td>Quadrats</td><td>quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td>Identification et dénombrement flore et faune (gros organismes) pour densité, structure de populations</td><td>Quadrats</td><td>quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>
<table><tr><td rowspan="12">Menaces et pressions</td><td rowspan="2">Perturbations physiques</td><td>5 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (bétonnage, épis, canalisations, installations portuaires ...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>6 - Perturbation par pêche à pied, piétinement...</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td rowspan="5">Pollutions</td><td>7 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, enrochement, engraissement de plages, rejets de dragages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>8 - Ruissellements et suintements côtiers</td><td>Localisation</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>9 - Algues vertes opportunistes (Enteromorpha, Ulva, Cladophora)</td><td>Evaluation pourcentage superficie de recouvrement</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>10 - Macrodéchets flottants ou rejetés à la côte</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>11 - Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Evaluation pourcentage superficie polluée</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>12 - Pollution des eaux</td><td>Voir ce qui a été déjà étudié pour la masse d'eau considérée (DCE) = acquis. Attention, à discuter !</td><td>DCE</td><td>Masse d'eau</td><td>X</td></tr></table>
# 7 - Récifs d'Hermelles 1170-4

## 1) Nature du substrat

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Nature du substrat</td><td>Observation directe</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Dubois, 2003

- Desroy et al., 2009

- Bajjouk, 2009

## 2) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>interprétation imagerie satellitaire, aéroportée ou acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><td>Paramètres</td><td>Critères</td><td>Descripteurs</td><td>Métriques à renseigner</td><td>Méthodes de collecte</td><td>Echelle de collecte</td></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="4">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="3">Structure générale du récif</td><td>1 - Recouvrement du récif</td><td>Taux de recouvrement</td><td>Imagerie satellitaire ou acoustique + observation directe</td><td>récif</td></tr><tr><td>2 - Etat structural</td><td>Pourcentage de chaque état structural (boules indépendantes/boules coalescentes/platier/boules dégradées/platier dégradé)</td><td>Imagerie satellitaire ou aéroportée + observation directe</td><td>récif</td></tr><tr><td>3 - Degré de fragmentation du récif</td><td>en un seul bloc/fragmenté en gros blocs/moyens blocs/petits blocs/très petits blocs</td><td>Imagerie satellitaire ou acoustique + observation directe</td><td>récif</td></tr><tr><td>Indicateurs synthétiques/indices</td><td>4 - Indice de l'état de santé IS (S. Dubois)</td><td>IS = DF + (BI + SC - D - BID - SCD - RM - RH - RU) x R</td><td>Imagerie satellitaire (mailles) + quadrats</td><td>récif, maille et quadrats</td></tr></tbody></table>

<table><tbody><tr><td rowspan="15">Menaces et pressions</td><td rowspan="3">Perturbations physiques</td><td>5 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, bétonnage, canalisations, tables conchylioles ...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>6 - Perturbation récifs par pêche à pied, piétinement, arrachage de blocs...</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>7 - Crépidules (Crepidula fornicata)</td><td>Observations et évaluation pourcentage superficie substrat perturbé</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td rowspan="2">Perturbations biologiques</td><td>8 - Moules</td><td>Evaluation pourcentage de recouvrement</td><td>Observation directe</td><td>récif</td></tr><tr><td>9 - Huîtres japonaises</td><td>Evaluation pourcentage de recouvrement</td><td>Observation directe</td><td>récif</td></tr><tr><td rowspan="5">Pollutions</td><td>10 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, enrochement, engraissement de plages, rejets de dragages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>11 - Ruissellements et suintements côtiers</td><td>Localisation</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>12 - Algues vertes opportunistes (Enteromorpha, Ulva, Cladophora)</td><td>Evaluation pourcentage superficie de recouvrement</td><td>Observation directe</td><td>récif</td></tr><tr><td>13 - Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Evaluation pourcentage superficie polluée</td><td>Observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>14 - Macrodéchets flottants ou rejetés à la côte</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td></td><td>15 - Pollution des eaux</td><td>Voir ce qui a été déjà étudié pour la masse d'eau considérée (DCE) = acquis. Attention, à discuter !</td><td>DCE</td><td>Masse d'eau</td></tr></tbody></table>
## 4) Indice de l'état de santé IS (Dubois, 2004)

$$IS = DF + (BI + SC - D - BID - SCD - RM - RH - RU) \times R$$

$$IS = DF + (BI + SC + P - PD - BID - RH - RM) \times R$$

P = Platier

PD = Platier dégradé

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Méthodes de collecte</td><td>Echelle de collecte</td></tr></thead><tbody><tr><td>DF = degré de fragmentation</td><td>1 : le récif est composé d'un seul gros bloc 2 : le récif est composé de plusieurs gros blocs 3 : le récif est composé de blocs appartenant à un large spectre de taille 4 : le récif est composé de nombreux blocs petits et moyens 5 : le récif se compose uniquement de très petits blocs</td><td>Maille</td></tr><tr><td>BI = pourcentage de recouvrement des boules isolées</td><td>Estimé in situ sur une maille de 75x75m</td><td>Maille</td></tr><tr><td>SC = pourcentage de recouvrement des structures coalescentes</td><td>Estimé in situ sur une maille de 75x75m</td><td>Maille</td></tr><tr><td>D = pourcentage de recouvrement de l'état dégradé</td><td>Estimé in situ sur une maille de 75x75m</td><td>Maille</td></tr><tr><td>BID = pourcentage de recouvrement des boules isolées dégradées</td><td>Estimé in situ sur une maille de 75x75m</td><td>Maille</td></tr><tr><td>SCD = pourcentage de recouvrement des structures coalescentes dégradées</td><td>Estimé in situ sur une maille de 75x75m</td><td>Maille</td></tr><tr><td>RH = pourcentage de recouvrement des huîtres</td><td>Estimation sur un quadrat de 1 m² (3 quadrats dans chaque maille 75x75m)</td><td>Quadrat</td></tr><tr><td>RM = pourcentage de recouvrement des moules</td><td>Estimation sur un quadrat de 1 m² (3 quadrats dans chaque maille 75x75m)</td><td>Quadrat</td></tr><tr><td>RU = pourcentage de recouvrement des ulves</td><td>Estimation sur un quadrat de 1 m² (3 quadrats dans chaque maille 75x75m)</td><td>Quadrat</td></tr><tr><td>R = pourcentage de récif au sein de la maille de 50 m²</td><td>Estimé in situ sur une maille de 75x75m</td><td>Maille</td></tr></tbody></table>

**Remarque** : Chacun de ces facteurs a été normalisé à une valeur comprise entre 1 et 10. Les pourcentages de recouvrement des différentes structures récifales sont pondérés par le taux de recouvrement du récif au sein de chaque maille afin de standardiser les valeurs.
# 8 - Substrats rocheux infralittoraux 1170-5/7

hors côte Basque

## 1) Caractéristiques de l'habitat rocheux

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Morphologie de la côte (continue/gros blocs/petits blocs)</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou acoustique ou observation directe</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Substrat (calcaire, granit, roche métamorphique, conglomérat ...)</td><td>Observation directe</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>Pente</td><td>Observation directe</td><td>Point vérité terrain</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Fiche de synthèse REBENT/Natura2000 n°3 (Derrien-Courtel et al., 2009)

- Derrien-Courtel et Le Gal, 2010

## 2) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Superficie des ceintures algales</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou acoustique ou observation directe</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>Interprétation imagerie acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><th>Paramètres</th><th>Critères</th><th>Descripteurs</th><th>Métriques à renseigner</th><th>Méthodes de collecte</th><th>Echelle de collecte</th><th>Protocole REBENT</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="10">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="4">Laminaires</td><td>1 - Ceintures de laminaires</td><td>Identification des espèces</td><td>Plongée</td><td>Point vérité terrain</td><td>X</td></tr><tr><td>2 - Densité des laminaires</td><td>Limites inférieures des ceintures</td><td>Plongée avec transects</td><td>Point vérité terrain</td><td>X</td></tr><tr><td>3 - Recouvrement des laminaires</td><td>Evaluation pourcentage de recouvrement (par rapport à roche nue et par rapport algues rouges et vertes)</td><td>Plongée avec transects et quadrats</td><td>Point vérité terrain, quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td>4 - Etat des feuilles</td><td>Evaluation pourcentage laminaires perennes (ex Laminaria hyperborea) par rapport aux laminaires opportunistes (ex Sacchorhiza polyschides)</td><td>Plongée avec transects et quadrats</td><td>Point vérité terrain, quadrat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Autres algues comme Halidrys silicosa, sargasses, Desmarestia ligulata, Solieria chordalis...</td><td>5 - Recouvrement autres algues</td><td>Entières, déchiquetées, nécroses...</td><td>Plongée</td><td>Point vérité terrain</td><td></td></tr><tr><td>6 - Populations d'herbivores</td><td>Evaluation pourcentage autres algues par rapport aux laminaires pérennes</td><td>Plongée avec transects et quadrats</td><td>Point vérité terrain, quadrat</td><td></td></tr><tr><td>Composition faunistique</td><td></td><td>Densité des principaux macroherbivores (oursins Paracentrotus lividus, Echinus esculentus)</td><td>Plongée avec transects et quadrats</td><td>Point vérité terrain, quadrat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="4">Menaces et pressions</td><td rowspan="2">Perturbations physiques</td><td>7 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, épis, canalisations, installations portuaires, ...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>8 - Perturbations dues à l'action des engins de pêche (scoubidous) et des ancrés</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Pollutions</td><td>9 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Observations et évaluation pourcentage superficie détruite</td><td>Observation directe + imagerie</td><td>habitat, point vérité terrain</td><td></td></tr><tr><td>10 - Macrodéchets, filets de pêche et autres engins de pêche, mouillages perdus, ...</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, enrochement, engraissement de plages, rejets de dragages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td></td><td>11 - Pollution des eaux</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe, plongée</td><td>Point vérité terrain</td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td>Voir ce qui a été déjà étudié pour la masse d'eau considérée (DCE) = acquis. Attention, à discuter !</td><td>DCE</td><td>Masse d'eau</td><td>X</td></tr></tbody></table>

<table><tbody><tr><td rowspan="5">Menaces et pressions</td><td rowspan="2">Perturbations physiques</td><td>7 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, épis, canalisations, installations portuaires, ...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>8 - Perturbations dues à l'action des engins de pêche (scoubidous) et des ancrés</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="3">Pollutions</td><td>9 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Observations et évaluation pourcentage superficie détruite</td><td>Observation directe + imagerie</td><td>habitat, point vérité terrain</td><td></td></tr><tr><td>10 - Macrodéchets, filets de pêche et autres engins de pêche, mouillages perdus, ...</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, enrochement, engraissement de plages, rejets de dragages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>11 - Pollution des eaux</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe, plongée</td><td>Point vérité terrain</td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td>Voir ce qui a été déjà étudié pour la masse d'eau considérée (DCE) = acquis. Attention, à discuter !</td><td>DCE</td><td>Masse d'eau</td><td>X</td></tr></tbody></table>
### 1) Caractéristiques de l'habitat rocheux

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Morphologie de la côte (continue/gros blocs/petits blocs)</td><td>Interprétation imagerie satellitaire, acoustique ou observation directe</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Substrat (calcaire, granit, roche métamorphique, conglomérat ...)</td><td>Observation directe</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>Pente</td><td>Observation directe</td><td>Point vérité terrain</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Casamajor (De) et Lissardy, 2009.

- Casamajor (De), 2009

### 2) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Superficie de la couverture algale</td><td>Interprétation imagerie satellitaire, aéroportée ou acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>Interprétation imagerie satellitaire, aéroportée ou acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

Remarque : difficulté à mettre en œuvre par imagerie en raison de la localisation dans la zone de déferlement. Fenêtre météo de courte durée

### 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><th>Paramètres</th><th>Critères</th><th>Descripteurs</th><th>Métriques à renseigner</th><th>Méthodes de collecte</th><th>Echelle de collecte</th><th>Protocole DCE</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="6">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="5">Composition floristique</td><td>1 - Algues structurantes (Cystoseira spp. et Padina pavonica)</td><td>Identification des espèces et composition spécifique</td><td>Plongée et quadrats</td><td>Point vérité terrain, quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td>2 - Algues caractéristiques</td><td>Densité des pieds (nombre/m²)</td><td>Plongée et quadrats</td><td>Point vérité terrain, quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td>3 - Algues opportunistes comme sargasses et Desmarestia ligulata</td><td>Identification des espèces, composition spécifique et pourcentage de recouvrement</td><td>Plongée avec quadrats</td><td>Point vérité terrain, quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td>4 - Espèce indiquant le bon état écologique (Gelidium corneum et Padina pavonica)</td><td>Entières, déchiquetées...</td><td>Plongée</td><td>Point vérité terrain</td><td>X</td></tr><tr><td>5 - Etat des algues</td><td>Densité des principaux macroherbivores (oursins Paracentrotus lividus, Psammechinus miliaris, Sphaerechinus granularis)</td><td>Plongée avec quadrats</td><td>Point vérité terrain, quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td>Composition faunistique</td><td>6 - Populations d'herbivores</td><td>Entières, déchiquetées...</td><td>Plongée avec quadrats</td><td>Point vérité terrain, quadrat</td><td>X</td></tr></tbody></table>

<table><tbody><tr><td rowspan="5">Menaces et pressions</td><td rowspan="2">Perturbations physiques</td><td>7 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, épis, canalisations, installations portuaires, ...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>8 - Perturbations dues à l'action des engins de pêche et des ancrés</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="3">Pollutions</td><td>9 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Observations et évaluation pourcentage superficie détruite</td><td>Observation directe + imagerie</td><td>habitat, point vérité terrain</td><td></td></tr><tr><td>10 - Macrodéchets, filets de pêche et autres engins de pêche, mouillages perdus, ...</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, enrochement, engraissement de plages, rejets de dragages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>11 - Pollution des eaux</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe, plongée</td><td>Point vérité terrain</td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td>Voir ce qui a été déjà étudié pour la masse d'eau considérée (DCE) = acquis. Attention, à discuter !</td><td>DCE (plongée avec quadrats)</td><td>Masse d'eau</td><td>X</td></tr></tbody></table>
# 10 - Champs de blocs 1170-9

Remarque : méthodologie pour les champs de blocs du médiolittoral inférieur et frange supérieure de l'infralittoral

## 1) Caractéristiques du champ de blocs

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Catégories champs de blocs (Blocs sur blocs/Blocs sur sable/Blocs sur roche)</td><td>Observation directe</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Lejart et al., 2010

- Bajjouk, 2009

- Hily et Le Hir, 2004.

## 2) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie satellitaire + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><td>Paramètres</td><td>Critères</td><td>Descripteurs</td><td>Métriques à renseigner</td><td>Méthodes de collecte</td><td>Echelle de collecte</td><td>Protocole REBENT</td></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="5">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="2">Composition en espèces au dessus des blocs</td><td>1 - Algues brunes (Fucales) et rouges dressées en mode abrité</td><td>Evaluation pourcentage de recouvrement algues</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>2 - Algues vertes</td><td>Evaluation pourcentage de recouvrement</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="3">Composition en espèces au dessous des blocs</td><td>3 - Spirorbes</td><td>Abondance, évaluation pourcentage de recouvrement</td><td>Quadrat</td><td>quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td>4 - Faune fixée coloniale (éponges, bryozoaires, ascidies)</td><td>Présence/absence et évaluation pourcentage de recouvrement</td><td>Quadrat</td><td>quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td>5 - Faune fixée dressée</td><td>Présence/absence</td><td>Quadrat</td><td>quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td>Indicateurs synthétiques/indices</td><td>6 - Indice IVR (Indice visuel de retournement des blocs)</td><td>Dénombrement blocs "bruns" et blocs "verts ou blancs" + espèces dessous blocs</td><td>Observation directe</td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

<table><tbody><tr><td rowspan="10">Menaces et pressions</td><td rowspan="2">Perturbations physiques</td><td>7 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (bétonnage, épis, canalisations, installations portuaires ...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>8 - Perturbation par pêche à pied (coup de burin, griffes), piétinement...</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Perturbations biologiques</td><td>9 - Huîtres japonaises</td><td>Evaluation pourcentage de recouvrement</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>10 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, enrochement, engraissement de plages, rejets de dragages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="3">Pollutions</td><td>11 - Ruissellements et suintements côtiers</td><td>Localisation</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>12 - Macrodéchets flottants ou rejetés à la côte</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>13 - Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Evaluation pourcentage superficie polluée</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>14 - Pollution des eaux</td><td></td><td>Voir ce qui a été déjà étudié pour la masse d'eau considérée (DCE) = acquis. Attention, à discuter !</td><td>DCE</td><td>Masse d'eau</td><td>X</td></tr></tbody></table>
# 1 - Herbiers à Posidonies 1120*

## 1) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale comprise entre la limite supérieure et la limite inférieure</td><td>interprétation (imagerie satellitaire, aéroportée et/ou acoustique) + vérité terrain</td><td>Herbier (population)</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>interprétation imagerie satellitaire, aéroportée + vérité terrain</td><td>Herbier (population)</td></tr></tbody></table>

## 2) Types d'herbier

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Morphologies : Herbier de plaine / Herbier ondoyant / Herbier en pain de sucre / Herbier en escaliers / Herbier tigré / Récif frangeant et/ou récif barrière / Atolls (micro ou macro)</td><td>Interprétation (imagerie satellitaire, aéroportée et/ou acoustique) + vérité terrain</td><td>Herbier (population)</td></tr><tr><td>Evaluation pourcentage des différentes morphologies s'il y en a plusieurs</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Présentations de Christine Pergent-Martini et Gérard Pergent (Niolon, 29-30 avril 2010)

- Anonyme, 2007

- Boudouresque et al., 2006

- Denis et al., 2003

- Ganteaume et al. 2005

- Pergent, 2007

- Pergent et al., 2008

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><th>Paramètres</th><th>Critères</th><th>Descripteurs</th><th>Métriques à renseigner</th><th>Méthodes de collecte</th><th>Echelle de collecte</th><th>Protocole DCE</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="14">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="7">Structure générale de l'herbier (population)</td><td>1 - Substrat</td><td>Herbier sur roche, sur matte ou sur sable</td><td>Plongée</td><td>herbier (population)</td><td>X</td></tr><tr><td>2 - Structures érosives et mattes mortes</td><td>Présence d'intermattes, "marmites", tombants de matte, ... + évaluation superficie de ces structures (%)</td><td>Imagerie acoustique et satellitaire + plongée</td><td>herbier (population)</td><td>X</td></tr><tr><td>3 - Limite inférieure de l'herbier</td><td>Profondeur</td><td>Plongée avec profondimètre électronique</td><td>herbier (population)</td><td>X</td></tr><tr><td>4 - Densité de l'herbier à - 15 m</td><td>Type de limite (progressive/franche à fort recouvrement/franche à faible recouvrement/clairsemée/régressive)</td><td>Plongée et méthode pour déterminer le recouvrement</td><td>herbier (population)</td><td>X</td></tr><tr><td>5 - Recouvrement foliaire en limite inférieure</td><td>Nombre de faisceaux/m²</td><td>Plongée avec quadrats (40x40 cm) à - 15m de profondeur</td><td>quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td>6 - Rhizomes plagiotropes en limite inférieure</td><td>Taux de recouvrement [% faisceaux / zone non couverte (sédiment, roche ou matte morte)]</td><td>Plongée avec quadrats (quadrat de 1 m² avec des photographies verticales pour l'interprétation fine)</td><td>quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td>7 - Déchaussement</td><td>% de rhizomes plagiotropes</td><td>Plongée au niveau de la limite inférieure dans quadrats utilisés pour recouvrement</td><td>bande ou quadrat</td><td>X</td></tr><tr><td rowspan="2">Caractérisation de la matte</td><td>8 - Compacité de la matte</td><td>Déchaussement (distance entre sédiment et partie inférieure des rhizomes)</td><td>Plongée avec quadrats utilisés pour détermination densité (40x40 cm) ou carottier (12X15cm)</td><td>quadrat ou carotte</td><td>X</td></tr><tr><td>9 - Structures de la matte</td><td>Distance de pénétration</td><td>Plongée avec pénétromètre</td><td>mesure par zones</td><td>X</td></tr><tr><td rowspan="5">Etat de vitalité de la plante</td><td>10 - Densité foliaire</td><td>Volume de sédiment, granulométrie du sédiment, taux de MO</td><td>Carottier (12X15cm)</td><td>carotte</td><td></td></tr><tr><td>11 - Longueur moyenne des faisceaux</td><td>Nombre de feuilles/faisceaux (Analyse phénologique)</td><td>Comptage feuilles adultes et intermédiaires en plongée + prélèvement d'au moins 15 faisceaux lorsque problème identifié</td><td>faisceaux</td><td></td></tr><tr><td>12 - Surface foliaire par faisceau SF</td><td>Paramètres biométriques (Analyse phénologique)</td><td>Plongée, mesure in situ / 30 faisceaux</td><td>faisceaux</td><td></td></tr><tr><td>13 - Production de feuilles</td><td>Nombres de feuilles produites annuellement (lépidochronologie)</td><td>Uniquement pour le premier Docob et lorsque déséquilibre identifié: plongée + prélèvement d'au moins 15 faisceaux</td><td>faisceaux</td><td>X</td></tr><tr><td>14 - Croissance des rhizomes (lépidochronologie)</td><td>Vitesse de croissance des rhizomes</td><td>Uniquement pour le premier Docob et lorsque déséquilibre identifié: plongée + prélèvement</td><td>faisceaux</td><td>X</td></tr></tbody></table>
<table><tr><td></td><td></td><td></td><td>d'au moins 15 faisceaux</td><td></td><td></td></tr><tr><td rowspan="3">Flore et faune associées</td><td>15 - Epiphytes</td><td>Biomasse</td><td>Plongée, estimation visuelle + prélèvement d'au moins 15 faisceaux si prolifération apparente</td><td>faisceaux</td><td>X</td></tr><tr><td>16 - Populations d'herbivores</td><td>Densité des principaux macroherbivores (le poisson Sarpa salpa et l'oursin Paracentrotus lividus) (Nombre/m²)</td><td>Plongée avec quadrats pour les oursin (1 m²), transect pour les poissons</td><td>quadrat / transect</td><td></td></tr><tr><td>17 - Espèces "patrimoniales", protégées ou menacées sédentaires ou territoriales comme Pinna nobilis (voir listes)</td><td>Coefficient A (% de feuilles ayant perdu leur apex)</td><td>Plongée, estimation visuelle + prélèvement d'au moins 15 faisceaux si surpâturage</td><td>faisceaux</td><td>X</td></tr></table>

<table><tr><td rowspan="10">Menaces et pressions</td><td rowspan="3">Perturbations physiques</td><td>18 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, bétonnages, épis, canalisations, passages de câbles, installations portuaires, récifs artificiels, éoliennes ...)</td><td>Imagerie satellitaire, acoustique et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>19 - Remaniement sédiments par pêche aux arts trainants, extraction de sables, dragage et rejets de dragage,...</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, acoustique et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>20 - Blocs de matériau arrachés, traces/sillons dûs à l'action des chaluts et des ancrés, trous</td><td>Evaluation pourcentage superficie sédiments remaniés</td><td>Imagerie acoustique + observations</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Perturbations biologiques</td><td>21 - Caulerpes (Caulerpa taxifolia et C. racemosa var. cylindracea)</td><td>Nombre sur le site, pourcentage de surface détruite</td><td>Imagerie acoustique ou satellitaire + plongée</td><td>herbier (population)</td><td>X</td></tr><tr><td>22 - Rhodobiontes (Acrothamnion preissii, Womersleyella setacea ...)</td><td>Superficie couverte par ces espèces, colonie isolée ou en tâche, profondeur</td><td>Observation en plongée (présence et estimation % de recouvrement)</td><td>herbier (population)</td><td></td></tr><tr><td rowspan="3">Pollutions</td><td>23 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Superficie couverte par ces espèces, profondeur</td><td>Observation en plongée (présence et estimation % de recouvrement)</td><td>herbier (population)</td><td></td></tr><tr><td>24 - Couche oxydée pour certains sédiments (vases), proliférations d'épiphytes, films bactériennes</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, enrochement, engraissement de plages, rejets de dragages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>25 - Macrodéchets, filets et autres engins de pêche, mouillages perdus, corps morts</td><td>Epaisseur de la couche oxydée, couleur, odeur</td><td>Benne</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td></td><td>26 - Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Evaluation volume, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>Point vérité terrain</td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td>Evaluation pourcentage superficie polluée</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr></table>

## 4) Facultatif

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Statut reproducteur (en floraison)</td><td>Plongée</td><td>Herbier (population)</td></tr></tbody></table>
# 2 - Substrats meubles supralittoraux 1140-7/8

## 1) Caractéristiques des substrats meubles

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Type de sédiment (sable ou galets)</td><td>Observation directe</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Bellan-Santini et al., 1994

- Présentation de Jean-Michel Amouroux et Céline Labrune (Niolon, 29-30 avril 2010)

- Cahiers d'habitats côtiers (tome 2)

- PNUE-PAM-CAR/ASP, 2007

## 2) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><td>Paramètres</td><td>Critères</td><td>Descripteurs</td><td>Métriques à renseigner</td><td>Méthodes de collecte</td><td>Echelle de collecte</td></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="2">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td>Laisses de mer</td><td>1 - Laisses de mer et banquettes à Posidonies</td><td>Présence/absence, volume, % linéaire côtier</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>Espèces associées aux laisses de mer</td><td>2 - Insectes, Isopodes, Amphipodes, autres</td><td>Présence/absence, abondance (faible/moyenne/forte)</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr></tbody></table>

<table><tbody><tr><td rowspan="9">Menaces et pressions</td><td rowspan="3">Perturbations physiques</td><td>3 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochement, bétonnage, épis ...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td></td><td>Évaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>4 - Remaniement du sédiment par piétinement, traitement mécanique du sable, passage engins...</td><td>Observations et évaluation pourcentage superficie sédiments perturbés</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td rowspan="5">Pollutions</td><td>5 - Réensablement</td><td>Observations</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>6 - Ramassage laisses de mer</td><td>Observations</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>7 - Algues vertes opportunistes (Enteromorpha, Cladophora, Ulva)</td><td>Évaluation pourcentage superficie recouverte</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>8 - Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Évaluation pourcentage superficie polluée</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>9 - Macrodéchets</td><td>Évaluation volume, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr></tbody></table>
# 3 - Substrats meubles médiolittoraux 1140-9/10 (sables/graviers/galets) et 1130-2 (vases)

## 1) Caractéristiques des substrats meubles

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Type de sédiment (vases, sables, graviers ou galets)</td><td>Observation directe</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

<table><tr><td>Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :</td></tr><tr><td>- Bellan-Santini et al., 1994</td></tr><tr><td>- Présentation de Jean-Michel Amouroux et Céline Labrune (Niolon, 29-30 avril 2010)</td></tr><tr><td>- Cahiers d'habitats côtiers (tome 2)</td></tr><tr><td>- PNUE-PAM-CAR/ASP, 2007</td></tr></table>

## 2) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><th>Paramètres</th><th>Critères</th><th>Descripteurs</th><th>Métriques à renseigner</th><th>Méthodes de collecte</th><th>Echelle de collecte</th></tr></thead><tbody><tr><td>Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td>Composition faunistique</td><td>1 - Espèces caractéristiques</td><td>Présence/absence des espèces (attention: casser toutes les coquilles pour vérifier les contenus (présence/absence de l'animal ou d'un locataire de la coquille)) + structure de populations</td><td>Observation directe ou carottes (3 à 5 carottes)</td><td>habitat ou carotte</td></tr><tr><td rowspan="8">Menaces et pressions</td><td rowspan="3">Perturbations physiques</td><td>2 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, bétonnages, épis, canalisations, passages de câbles, installations portuaires ...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>3 - Remaniement du sédiment par piétinement, traitement mécanique du sable, passage engins...</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>4 - Réensablement</td><td>Observations</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td rowspan="4">Pollutions</td><td>5 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, enrochement, engraissement de plages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>6 - Algues vertes opportunistes (Enteromorpha, Cladophora)</td><td>Evaluation pourcentage superficie recouverte</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>7 - Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Evaluation pourcentage superficie polluée</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>8 - Macrodéchets flottants ou rejetés à la côte</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr></tbody></table>
# 4 - Sables vaseux de mode calme 1160-3

## 1) Caractéristiques des substrats meubles

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Nature du sédiment (analyse granulométrique et taux de matière organique)</td><td>Carotte et analyse en laboratoire</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Présence faciès d'algues (Caulerpa prolifera), d'herbiers (Cymodocea nodosa, Zostera noltii)</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Bellan-Santini et al., 1994.

- Guillaumont (coord.), 2005

- PNUE-PAM-CAR/ASP, 2007

## 2) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Enveloppe surfacique des faciès d'algues et/ou d'herbiers si présents</td><td>interprétation imagerie satellitaire, aéroportée et/ou acoustique + vérité terrain</td><td>Faciès d'algues et/ou herbier</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><th>Paramètres</th><th>Critères</th><th>Descripteurs</th><th>Métriques à renseigner</th><th>Méthodes de collecte</th><th>Echelle de collecte</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="10">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="3">Composition floristique</td><td rowspan="3">1 - Faciès d'algues (si présents)</td><td>Identification des espèces (ex. <i>Caulerpa prolifera</i>, faciès d'algues libres)</td><td>Observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>Evaluation pourcentage de recouvrement (% algues / substrat)</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation recouvrement algues (infos homogène, morcellé, ...)</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée + observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td rowspan="4">Composition faunistique</td><td rowspan="3">2 - Herbiers (si présents)</td><td>Identification des espèces (<i>Zostera noltii</i>, <i>Cymodocea nodosa</i>)</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>Evaluation pourcentage de recouvrement (% herbier / substrat)</td><td>Observation directe, cartographie herbiers monospécifiques ou mixtes</td><td>habitat</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation recouvrement herbiers (infos homogène, morcellé, ...)</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée + observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>3 - Populations d'herbivores</td><td>Densité des principaux macroherbivores (Oursin <i>Paracentrotus lividus</i>) (Nombre/m²)</td><td>Observation directe, quadrats, transects</td><td>quadrat, transect</td></tr><tr><td rowspan="4"></td><td rowspan="4"></td><td>4 - Espèces caractéristiques ("indicatrices")</td><td rowspan="4">Identification et dénombrement pour richesse spécifique, abondance, biomasse, indices de diversité... (attention: casser toutes les coquilles pour vérifier les contenus (présence/absence de l'animal ou d'un locataire de la coquille))</td><td rowspan="4">Carottier</td><td rowspan="4">carotte</td></tr><tr><td>5 - Espèces sensibles à l'enrichissement en MO (listes Pearson et Rosenberg, 1978)</td></tr><tr><td>6 - Espèces opportunistes quand enrichissement en MO (listes Pearson et Rosenberg, 1978)</td></tr><tr><td>7 - Espèces sensibles aux perturbations physiques ou prélevées par pêche à pied</td></tr><tr><td></td><td>Indicateurs synthétiques/indices</td><td>8 - M-AMBI, AMBI, BENTIX, IT ...</td><td>Calcul par rapport aux groupes écologiques</td><td>-</td><td>-</td></tr></tbody></table>
<table><tr><td rowspan="10">Menaces et pressions</td><td rowspan="3">Perturbations physiques</td><td>9 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, bétonnages, épis, canalisations, passages de câbles, installations portuaires, récifs artificiels, éoliennes ...)</td><td>Imagerie satellitaire ou aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>10 - Remaniement du sédiment par pêche à pied, piétinement, traitement mécanique du sable, passage engins...</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire ou aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>11 - Réensablement</td><td>Observations et évaluation pourcentage superficie sédiments perturbés</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td rowspan="5">Pollutions</td><td>12 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, engraissement de plages, rejets de dragages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>13 - Couche oxydée pour certains sédiments (vases), proliférations d'épiphytes sur herbiers, proliférations bactériennes, épisodes anoxiques</td><td>Epaisseur de la couche oxydée, couleur, odeur</td><td>Observation directe, benne, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>14 - Algues vertes opportunistes (Enteromorpha, Cladophora, Ulva)</td><td>Evaluation pourcentage superficie recouverte</td><td>Observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>15 - Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Evaluation pourcentage superficie polluée</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>16 - Macrodéchets, engins de pêche, mouillages perdus</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr></table>
# 5 - Substrats meubles infralittoraux 1110-5/9 (vases/sables/graviers/galets)

## 1) Caractéristiques des substrats meubles

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Nature du sédiment (granulométrie et taux de matière organique)</td><td>Benne et analyse en laboratoire</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Morphologie (dunes hydrauliques, bancs, ...)</td><td>Interprétation imagerie acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Présence faciès d'algues (Caulerpa prolifera), d'herbiers (Cymodocea nodosa..), de maërl</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Bellan-Santini et al., 1994

- Présentation de Jean-Michel Amouroux et Céline Labrune (Niolon, 29-30 avril 2010)

- Cahiers d'habitats côtiers (tome 2)

- PNUE-PAM-CAR/ASP, 2007

## 2) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Enveloppe surfacique des faciès d'algues, d'herbiers ou maërl si présents</td><td>Interprétation imagerie satellitaire, aéroportée et/ou acoustique + vérité terrain</td><td>Faciès d'algues et/ou herbier</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>Interprétation imagerie acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><th>Paramètres</th><th>Critères</th><th>Descripteurs</th><th>Métriques à renseigner</th><th>Méthodes de collecte</th><th>Echelle de collecte</th><th>Protocole DCE</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="7">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="3">Aspect du sédiment</td><td>1 - Couche oxydée (pour vases)</td><td>Observation épaisseur couche oxydée</td><td>Benne (3 à 5 bennes)</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td>2 - Couleur, odeur</td><td>Evaluation</td><td>Benne (3 à 5 bennes)</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td>3 - Galeries, microhabitats...</td><td>Observations</td><td>Benne (3 à 5 bennes)</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td rowspan="6">Composition floristique</td><td rowspan="3">4 - Herbiers de phanèrogames (si présents)</td><td>Identification des espèces (Cymodocea nodosa)</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>Evaluation pourcentage superficie de recouvrement (% herbiers / substrat)</td><td>Observation directe, imagerie acoustique, cartographie</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>Degré de fragmentation recouvrement herbiers (infos: homogène, morcellé, ...)</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée + observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">5 - Zones à Caulerpa prolifera (si présents)</td><td>Evaluation pourcentage superficie de recouvrement (% algues / substrat)</td><td>Observation directe, imagerie acoustique, cartographie</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>Degré de fragmentation recouvrement algues (infos: homogène, morcellé, ...)</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée + observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="3">6 - Faciès à maërl (si présents)</td><td>Taux de recouvrement du banc (Surface maërl vivant sur surface prélèvement de la benne)</td><td>Observation directe, imagerie acoustique, cartographie, benne (3 à 5 bennes)</td><td>habitat, benne</td><td>X</td></tr><tr><td>Pourcentage de maërl vivant (Poids maërl vivant sur poids total maërl (vivant + mort))</td><td>Benne (3 à 5 bennes)</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td>Taux de vitalité (surface maërl vivant / (surface maërl vivant + mort))</td><td>Benne (3 à 5 bennes)</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td>7 - Faciès d'algues libres / zones de décantation / gyres (si présents)</td><td></td><td>Evaluation surface</td><td>Observation directe, imagerie acoustique, cartographie</td><td>habitat</td><td></td></tr></tbody></table>
<table><tr><td rowspan="5">Composition faunistique</td><td>8 - Espèces caractéristiques exclusives</td><td>Identification et dénombrement pour richesse spécifique, abondance, biomasse, indices de diversité...</td><td rowspan="5">Benne (3 à 5 bennes)</td><td rowspan="5">benne</td><td>X</td></tr><tr><td>9 - Espèces sensibles à l'excès de matière organique (listes voir biblio)</td><td>(attention: casser toutes les coquilles pour vérifier les contenus)</td><td>X</td></tr><tr><td>10 - Espèces opportunistes à excès MO (ex <i>Cirratulus cirratus</i>) (listes voir biblio)</td><td>(présence/absence de l'animal ou d'un locataire de la coquille)) + structure de populations pour espèces caractéristiques</td><td>X</td></tr><tr><td>11 - Espèces sensibles aux perturbations physiques ex. épifaune sessile (cnidaires, grands bivalves ...)</td><td>Observations et évaluation abondance (faible/moyenne/forte)</td><td>X</td></tr><tr><td>12 - Espèces nécrophages ex. crustacés décapodes</td><td>Calcul par rapport aux groupes écologiques</td><td>X</td></tr><tr><td>Indicateurs synthétiques/indices</td><td>13 - M-AMBI, AMBI, BQI ...</td><td>Calcul par rapport aux groupes écologiques</td><td>-</td><td>-</td><td></td></tr></table>

<table><tr><td rowspan="10">Menaces et pressions</td><td rowspan="2">Perturbations physiques</td><td>14 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, bétonnages, épis, canalisations, passages de câbles, installations portuaires, récifs artificiels, éoliennes ...)</td><td>Imagerie satellitaire, acoustique et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>15 - Remaniement sédiments par pêche aux arts trainants, extraction de sables, dragage et rejets de dragage...</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, acoustique et/ou observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Perturbations biologiques</td><td>16 - Espèces opportunistes et/ou envahissantes (Caulerpes (<i>Caulerpa taxifolia</i>, <i>C. racemosa var. cylindracea</i>), Rhodobiontes (<i>Acrothamnion preissii</i>, <i>Womersleyella setacea</i>)...)</td><td>Evaluation pourcentage superficie couverte par ces espèces, colonie isolée ou en tâche, profondeur</td><td>Imagerie acoustique + observations</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td>17 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, engraissement de plages, rejets de dragages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td><td></td></tr><tr><td rowspan="3">Pollutions</td><td>18 - Couche oxydée pour certains sédiments (vases), proliférations d'épiphytes sur herbiers, proliférations bactériennes</td><td>Epaisseur de la couche oxydée, couleur, odeur</td><td>Benne (3 à 5 bennes)</td><td>benne</td><td>X</td></tr><tr><td>19 - Macrodéchets, filets et autres engins de pêche, mouillages perdus, corps morts</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>Point vérité terrain</td><td></td></tr><tr><td>20 - Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Evaluation pourcentage superficie polluée</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td><td></td></tr></table>
# 6 bis - Substrats rocheux médiolittoraux supérieurs 1170-11

## 1) Caractéristiques de l'habitat rocheux

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Morphologie de la côte (continue/gros blocs/petits blocs)</td><td>Interprétation imagerie satellitaire, aéroportée ou observation directe</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Substrat (calcaire, granit, roche métamorphique, conglomérat ...)</td><td>Observation directe</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Pente</td><td>Observation directe</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Exposition aux vagues</td><td>Observation directe</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Bellan-Santini et al., 1994

- Présentation de Denise Bellan-Santini (Niolon, 29-30 avril 2010)

- Cahiers d'habitats côtiers (tome 2)

- PNUE-PAM-CAR/ASP, 2007.

## 2) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td><td>Remarques</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td><td></td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>interprétation imagerie satellitaire, aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td><td>>> délicat sur un habitat avec une faible amplitude (de qqs cm à 1 m) donc faire la différence entre les superficies artificialisées/impactées et superficies où l'habitat est préservé</td></tr></tbody></table>

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><td>Paramètres</td><td>Critères</td><td>Descripteurs</td><td>Métriques à renseigner</td><td>Méthodes de collecte</td><td>Echelle de collecte</td></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="2">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="2">Composition faunistique</td><td>1 - Espèces indicatrices d'un bon état</td><td>Présence de :<br/>Chthamalus stellatus (Poli, 1795)<br/>Chthamalus montagui Southward, 1976<br/>Patella rustica Linnaeus, 1758</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>2 - Espèces communautaires, "patrimoniales", protégées ou menacées sédentaires ou territoriales (voir annexes conventions, ZNIEFF ...)<br/>Pour cet habitat : Patella ferruginea ...</td><td>Identification, densité, taille, biotope</td><td>Observation directe, quadrats (20x20 cm), transects parallèles à la côte</td><td>habitat, quadrat, transect</td></tr></tbody></table>

<table><tbody><tr><td rowspan="7">Menaces et pressions</td><td rowspan="3">Perturbations physiques</td><td>3 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, bétonnages, épis, canalisations, passages de câbles, installations portuaires...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td></td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>4 - Piétinements, accostages</td><td>Observation des cicatrices, densité, surface, surface</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td rowspan="5">Pollutions</td><td>5 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, ..</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>6 - Ruissellements et suintements côtiers</td><td>Localisation</td><td>Observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>7 - Prolifération d'algues vertes (Enteromorpha, Ulva)</td><td>Evaluation pourcentage superficie couverte</td><td>Observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>8 - Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Evaluation pourcentage superficie polluée</td><td>Observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>9 - Macrodéchets flottants ou rejetés à la côte</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr></tbody></table>
# 6 - Substrats rocheux médiolittoraux inférieurs 1170-12

## 1) Caractéristiques de l'habitat rocheux

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Morphologie de la côte (continue/gros blocs/petits blocs)</td><td>Interprétation imagerie satellitaire, aéroportée ou observation directe</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Substrat (calcaire, granit, roche métamorphique, conglomérat ...)</td><td>Observation directe</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Pente</td><td>Observation directe</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Exposition aux vagues</td><td>Observation directe</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Ballesteros et al., 2007

- Bellan-Santini et al., 1994

- Bellan-Santini et al., 2008

- Présentation de Denise Bellan-Santini (Niolon, 29-30 avril 2010)

- Thibaut et Mannoni, 2007

- PNUE-PAM-CAR/ASP, 2007

## 2) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td><td>Remarques</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td><td></td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>interprétation imagerie satellitaire, aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td><td>>> délicat sur un habitat avec une faible amplitude (de qqs cm à 1 m) donc faire la différence entre les superficies artificialisées/impactées et superficies où l'habitat est préservé</td></tr></tbody></table>

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><th>Paramètres</th><th>Critères</th><th>Descripteurs</th><th>Métriques à renseigner</th><th>Méthodes de collecte</th><th>Echelle de collecte</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="5">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="3">Composition floristique</td><td rowspan="2">1 - Faciès/ceintures d'algues</td><td>Identification des espèces pour déterminer faciès</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>Evaluation pourcentage superficie de recouvrement (ou % linéaire côtier)</td><td>Observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td></td><td>Pour trottoir de Lithophyllum lichenoides en mode battu: morphologie (thalles isolés / coalescents localement / encorbellement), % de surface vivante</td><td>Observation directe, cartographie, linéaire de côté</td><td>habitat</td></tr><tr><td rowspan="2">Composition faunistique</td><td>2 - Faune associée</td><td>Identification pour richesse spécifique</td><td>Observation directe + quadrats 20x20 cm</td><td>quadrat</td></tr><tr><td>3 - Populations d'herbivores</td><td>Evaluation abondance des principaux herbivores (Patella spp.) (densité faible/moyenne/forte)</td><td>Observation directe ou quadrats (20x20 cm) ou transects parallèles à la côte</td><td>habitat, quadrat, transect</td></tr><tr><td></td><td>4 - Espèces communautaires, "patrimoniales", protégées ou menacées sédentaires ou territoriales (voir annexes conventions, ZNIEFF ...) ex. Patelle ferrugineuse (Patella ferruginea) ...</td><td>Identification, densité, taille, biotope</td><td>Observation directe, quadrats (20x20 cm), transects parallèles à la côte</td><td>habitat, quadrat, transect</td></tr></tbody></table>

<table><tbody><tr><td rowspan="7">Menaces et pressions</td><td rowspan="2">Perturbations physiques</td><td>5 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, bétonnages, épis, canalisations, passages de câbles, installations portuaires...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>6 - Piétinements, accostages sur trottoirs</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td rowspan="4">Pollutions</td><td>7 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Observation des cicatrices, densité, surface, ...</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>8 - Ruissellements et suintements côtiers</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports,...</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>9 - Prolifération d'algues vertes (Enteromorpha, Ulva)</td><td>Localisation</td><td>Observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>10 - Traces d'hydrocarbures, ...</td><td>Evaluation pourcentage superficie couverte</td><td>Observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td>11 - Macrodéchets flottants ou rejetés à la côte</td><td>Evaluation pourcentage superficie polluée</td><td>Observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td></td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe</td><td>habitat</td></tr></tbody></table>
# 7 - Substrats rocheux infralittoraux 1170-13

## 1) Caractéristiques de l'habitat rocheux

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Morphologie (continue/gros blocs/petits blocs)</td><td>Interprétation imagerie satellitaire, aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Substrat (calcaire, granit, roche métamorphique, conglomérat ...), substrats artificiels</td><td>Observation directe</td><td>Point vérité plongée</td></tr><tr><td>Pente</td><td>Observation directe</td><td>Point vérité plongée</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Ballesteros et al., 2007

- Bellan-Santini et al., 1994

- Bellan-Santini et al., 2008

- Présentation de Denise Bellan-Santini (Niolon, 29-30 avril 2010)

- Thibaut et Mannoni, 2007

- PNUE-PAM-CAR/ASP, 2007

## 2) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Enveloppe surfacique des faciès algaux</td><td>Interprétation imagerie satellitaire ou aéroportée ou observation directe</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat</td><td>Interprétation imagerie satellitaire, aéroportée + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><th>Paramètres</th><th>Critères</th><th>Descripteurs</th><th>Métriques à renseigner</th><th>Méthodes de collecte</th><th>Echelle de collecte</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="7">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="4">Composition floristique</td><td>1 - Ceintures/ faciès d'algues selon horizons (supérieur/moyen/profond)</td><td>Identification des espèces dominantes pour déterminer faciès</td><td>Observation directe</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>2 - Pour chaque faciès/ceintures</td><td>Evaluation du pourcentage de superficie de recouvrement</td><td>Interprétation imagerie + vérité terrain</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>3 - Ceinture de <i>Cystoseira amentacea</i> var. <i>stricta</i> (mode battu)</td><td>Individus isolés / taches / ceinture continue</td><td>Observation directe, cartographie, linéaire de côte</td><td>habitat</td></tr><tr><td>4 - Espèces "patrimoniales", protégées ou menacées (voir annexes IV, ZNIEFF, conventions ...) ex. <i>Cystoseira...</i></td><td>Identification, densité, taille, biotope, profondeur</td><td>Observation directe, quadrat et transect</td><td>Point vérité terrain, quadrat, transect</td></tr><tr><td rowspan="2">Composition faunistique</td><td>5 - Faune associée</td><td>Identification pour richesse spécifique</td><td>Observation directe avec quadrats 20x20 cm et transects</td><td>Point vérité terrain, quadrat, transect</td></tr><tr><td>6 - Populations d'herbivores</td><td>Densité des principaux macroherbivores (le poisson <i>Sarpa salpa</i> et les oursins <i>Paracentrotus lividus</i>, <i>Arbacia lixula</i>)</td><td>Observation directe en plongée (possibilité quadrats 20x20 cm et transects)</td><td>Point vérité, quadrat, transect</td></tr><tr><td></td><td>7 - Espèces communautaires, "patrimoniales", protégées ou menacées sédentaires ou territoriales (voir annexes IV, conventions, ZNIEFF ...) ex. Oursin diadème (<i>Centrostephanus longispinus</i>), Grande cigale de mer (<i>Scyllarides latus</i>), Mérou brun (<i>Epinephelus marginatus</i>), Datte de mer (Lithophaga lithophaga)...</td><td>Identification, densité, taille, biotope, profondeur</td><td>Observation directe, quadrats (20x20 cm), transects parallèles à la côte</td><td>Point vérité, quadrat, transect</td></tr></tbody></table>
<table><tbody><tr><td rowspan="15">Menaces et pressions</td><td rowspan="3">Perturbations physiques</td><td>8 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, bétonnages, épis, canalisations, passages de câbles, installations portuaires, ...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>9 - Traces/sillons dûs à l'action des engins de pêche et des ancrés</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>10 - Faciès de surpâturage à oursins (Paracentrotus / Arbacia)</td><td>Observations et évaluation pourcentage superficie détruite</td><td>Observation directe + imagerie</td><td>habitat</td></tr><tr><td rowspan="3">Perturbations biologiques</td><td>11 - Espèces opportunistes et/ou envahissantes (Caulerpes (Caulerpa taxifolia, C; racemosa var. cylindracea), Rhodobiontes (Acrothamnion preissii, Womersleyella setacea), Ostreopsis ovata</td><td>Evaluation pourcentage de superficie couverte par ces espèces + colonie isolée ou en tâche, profondeur</td><td>Observation directe, plongée / ROV</td><td>habitat</td></tr><tr><td>12 - Algues filamenteuses brunes muqueuses</td><td>Evaluation abondance (pourcentage de recouvrement), durée du phénomène (printemps/printemps-été)</td><td>Imagerie + plongée / ROV</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>13 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Urbanisme, cours d'eau, émissaires, ports, enrochement, engraissement de plages, rejets de dragages</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe, cartographie</td><td>habitat</td></tr><tr><td rowspan="2">Pollutions</td><td>14 - Prolifération de moules (Mytilus galloprovincialis) / d'algues vertes (Enteromorpha, Ulva)</td><td>Evaluation pourcentage superficie couverte par les moules / les Enteromorpha et Ulva</td><td>Observation directe, plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>15 - Macrodéchets, filets de pêche et autres engins de pêche, mouillages perdus, proliférations bactériennes</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe, plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr></tbody></table>
# 8 - Le coralligène 1170-14

## 1) Superficie

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Enveloppe surfacique totale</td><td>Interprétation imagerie acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>Degré de fragmentation de l'habitat (échelle à définir ultérieurement)</td><td>Interprétation imagerie acoustique + vérité terrain</td><td>Habitat</td></tr></tbody></table>

## 2) Types de coralligènes

<table><thead><tr><td>A renseigner</td><td>Protocole de détermination</td><td>Echelle</td></tr></thead><tbody><tr><td>Types physionomiques: Encorbellements (structure en 3D) ou bancs (% des types)</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>Présence de structures particulières (Pilier)</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>Types de faciès : à Cystoseira zosteroides / à Eunicella cavolinii / à Paramuricea clavata / à Eunicella singularis / à Lophogorgia sarmentosa / autres</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr></tbody></table>

Références bibliographiques principales pour l'élaboration de cette synthèse :

- Antonioli, 2010

- Présentation de Stéphane Sartoretto (Niolon, 29-30 avril 2010)

- Harmelin et Garrabou, 2005

## 3) Descripteurs de l'état de conservation de l'habitat

<table><thead><tr><td>Paramètres</td><td>Critères</td><td>Descripteurs</td><td>Métriques à renseigner</td><td>Méthodes de collecte</td><td>Echelle de collecte</td></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="10">Structure et fonctionnalité de l'habitat</td><td rowspan="4">Structure générale du coralligène</td><td>1 - Profondeur limite inférieure</td><td>Profondeur</td><td>Interprétation imagerie acoustique, ROV / Observation directe en plongée</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>2 - Profondeur limite supérieure</td><td>Profondeur</td><td>Observation directe en plongée / ROV, imagerie acoustique</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>3 - Porosité: complexité et âge de la bioconstruction</td><td>Cavités (hors substrat rocheux): abondance (forte, moyenne, faible), taille (centimétrique / décimétrique / métrique) et profondeur (centimétrique / décimétrique / métrique)</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Habitat</td></tr><tr><td>3 bis - Impression de diversité (coloration)</td><td>Très peu coloré/ peu coloré / coloré / très coloré</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Habitat</td></tr><tr><td rowspan="2">Etat des bioconstructions</td><td>4 - Etat des bioconstructeurs Corallinacées/Peyssonneliacées</td><td>Diversité, taille des plus gros individus (centimétrique / décimétrique), couverture totale, évaluation % de recouvrement vivant et mort (décoloré)</td><td>Observation directe en plongée, quadrat (0,5 ou 1m² en fonction de la densité des peuplements+ comptage aléatoire (sur une 20taine de quadrats))</td><td>Point vérité terrain et quadrat</td></tr><tr><td>5 - Etat des bioérodeurs (Cliona viridis, Cliona celata, oursins)</td><td>Abondance (faible/moyenne/forte) et forme cliones (peu étendue/étendue/massive)</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td rowspan="4">Diversité des peuplements associés</td><td>6 - Diversité de la macrofaune dressée (gorgones, spongiaires, bryozoaires)</td><td>Diversité et couverture (évaluation % de recouvrement)</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>6 bis - Diversité des algues dressées (Cystoseira, Halimeda, Udotea)</td><td>Diversité</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>6 ter - Diversité faune cryptique</td><td>très peu pauvre / pauvre / assez riche / très riche</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>7 - Diversité des espèces "patrimoniales", protégées ou menacées (voir annexes conventions ...) ex. Mérou brun (Epinephelus marginatus) + ichtyofaune</td><td>Identification, taille, profondeur</td><td>Observation directe en plongée, transect</td><td>Point vérité terrain, transect</td></tr><tr><td></td><td>8 - Stratification (comme forêts)</td><td>Présence strates haute/moyenne/basse et hauteur des strates</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr></tbody></table>
<table><tbody><tr><td rowspan="5">Etat de conservation des peuplements associés =&gt; gorgones</td><td>9 bis - Profondeur max et min des gorgonaires</td><td>Profondeur</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>9 - Densité des colonies</td><td>Nombre de colonies/m² (sauf moignons)</td><td>Plongée avec quadrats (0,5 ou 1m² en fonction de la densité des peuplements+ comptage aléatoire (sur une 20taine de quadrats))</td><td>quadrat</td></tr><tr><td>10 - Proportions des colonies vivantes/nécrosées/mortes</td><td>% colonies vivantes (0% nécroses) / colonies vivantes nécrosées (0-50% nécroses) / très nécrosées &gt;50%/ colonies mortes (100% nécroses)</td><td>Plongée avec quadrats (0,5 ou 1m² en fonction de la densité des peuplements+ comptage aléatoire (sur une 20taine de quadrats))</td><td>quadrat</td></tr><tr><td>11 - Taille des colonies</td><td>Hauteur max/moy colonies (centimétrique / décimétrique / métrique) sans nécroses / avec nécroses / mortes</td><td>Observation directe en plongée, quadrat (0,5 ou 1m² en fonction de la densité des peuplements+ comptage aléatoire (sur une 20taine de quadrats)), transect</td><td>Point vérité terrain, quadrat, transect</td></tr><tr><td>11 bis - Epibiontes</td><td>Recrutement: présence de juvéniles</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td rowspan="2">Etat de conservation des peuplements associés =&gt; autres espèces dressées</td><td>12 - Grands bryozoaires, spongiaires, Cystoseires</td><td>Densité, taille (centimétrique / décimétrique)</td><td>Observation directe en plongée, quadrat (0,5 ou 1m² en fonction de la densité des peuplements+ comptage aléatoire (sur une 20taine de quadrats)), transect</td><td>Point vérité terrain, quadrat, transect</td></tr></tbody></table>

<table><tbody><tr><td rowspan="10">Menaces et pressions</td><td rowspan="3">Perturbations physiques</td><td>13 - Degré d'artificialisation</td><td>Présence/absence de structures artificialisées (endiguements, enrochements, bétonnages, épis, canalisations, passages de cables, installations portuaires, récifs artificiels, éoliennes ...)</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>14 - Destruction blocs de concrétionnement</td><td>Evaluation pourcentage de superficies artificialisées</td><td>Imagerie satellitaire, aéroportée et/ou observation directe</td><td>habitat</td></tr><tr><td>15 - Destruction des grands invertébrés sessiles</td><td>Evaluation pourcentage de superficie détruite</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td rowspan="3">Perturbations biologiques</td><td>16 - Degré d'envasement</td><td>Evaluation taille des blocs cassés (centimétrique / décimétrique / métrique)</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>17 - Caulerpes invasives (C.taxifolia et C.racemosa var.cylindracea)</td><td>Position des blocs cassés (au pied des tombants ou au sein des concrétions; blocs retournés)</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>18 - Algues rouges filamenteuses invasives (Womersleyella setacea, Acrothamnion preissii)</td><td>Evaluation pourcentage de superficie détruite / observation d'organismes arrachés ou brisés accumulés au pied du tombant</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td rowspan="3">Pollutions</td><td>19 - Algues filamenteuses brunes</td><td>faible/moyen/fort</td><td>Observation directe</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>20 - Sources potentielles de nuisance proches</td><td>Evaluation pourcentage de superficie colonisée</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td>21 - Macrodéchets, filets et autres engins de pêche, mouillages perdus</td><td>Evaluation pourcentage de superficie recouverte</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td></td><td></td><td>20 - Algues rouges filamenteuses brunes</td><td>Evaluation abondance (pourcentage de recouvrement), durée du phénomène (printemps/printemps-été)</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr><tr><td></td><td></td><td>21 - Macrodéchets, filets et autres engins de pêche, mouillages perdus</td><td>Présence, évaluation quantité, dangerosité</td><td>Observation directe en plongée</td><td>Point vérité terrain</td></tr></tbody></table>
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<figure><img src="image_5.png" /></figure>

<figure><img src="image_6.png" /></figure>

## Evaluation de l'état de conservation des habitats naturels marins à l'échelle d'un site Natura 2000

Cette première version du guide méthodologique est plus particulièrement à l'attention des bureaux d'études qui font le travail sur la cartographie des habitats et l'évaluation de l'état de ces habitats dans les sites dans le cadre du marché de l'AAMP. Cette version 1 présente la démarche entreprise pour évaluer l'état de conservation des habitats naturels au sein des sites Natura 2000 en mer.

Il précise les définitions relatives à l'état de conservation au sens de la directive Habitat Faune Flore et, fait état des réflexions en cours sur les éléments d'informations et les méthodes à utiliser pour qualifier cet état de conservation à l'échelle du site.

La démarche s'appuie sur les paramètres définis par la Commission européenne pour évaluer l'état de conservation à l'échelle biogéographique en conservant ceux qui sont appréhendables à l'échelle du site Natura 2000.

Elle précise, pour renseigner et analyser les paramètres définis par la commission européenne, quels seront :

- les descripteurs retenus,

- les variables pour les mesurer et,

- les méthodes qui pourront être mises en œuvre.

Pour les différents habitats naturels marins, des tableaux ont été élaborés et récapitulent les éléments d'informations permettant d'évaluer l'état de conservation à l'échelle du site. Ces tableaux sont en cours de correction et de validation par les scientifiques référents, il est donc possible qu'ils évoluent.