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open science

# Plan de gestion de structure de la plateforme
## ChemoSens

Michel Visalli, Anne-Laure Loiseau, Caroline Peltier, Thibault Chabin, Kipédène Coulibaly, Carole Tournier

► To cite this version:

Michel Visalli, Anne-Laure Loiseau, Caroline Peltier, Thibault Chabin, Kipédène Coulibaly, et al. Plan de gestion de structure de la plateforme ChemoSens. INRAE. 2024. hal-04677644v2

HAL Id: hal-04677644

https://hal.science/hal-04677644v2

Submitted on 6 Sep 2024

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Open licence - etalab
# Plan de gestion de structure de la plateforme ChemoSens

DOI: 10.17180/APYD-TD39

Langue: française

## 1. Renseignements sur le plan

### 1.1. Versions

<table><thead><tr><td>Version</td><td>Date</td><td>Modifié par</td><td>Validé par</td></tr></thead><tbody><tr><td>1.0</td><td>26/08/2024</td><td>Michel Visalli</td><td>Carole Tournier</td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

### 1.2. Contributeurs

<table><thead><tr><td>Nom, prénom</td><td>Statut et affiliation</td><td>Rôle(s)</td><td>ETP affecté à la gestion, au traitement et au partage des données</td><td>Mail Téléphone ORCID</td></tr></thead><tbody><tr><td>Tournier, Carole</td><td>IR INRAE, CSGA</td><td>Responsable de la structure</td><td>0</td><td>carole.tournier@inrae.fr</td></tr><tr><td>Visalli, Michel</td><td>IR INRAE, CSGA</td><td>Responsable des Données Opérationnelles du CSGA et du pôle "ingénierie logicielle, statistiques et science des données" de ChemoSens<br/>Personne contact pour les données "analyse sensorielle" et "consommateur"</td><td>0.3</td><td>michel.visalli@inrae.fr<br/>https://orcid.org/0000-0002-7286-396X</td></tr><tr><td>Loiseau, Anne-Laure</td><td>AI INRAE, CSGA</td><td>Responsable qualité<br/>Personne contact pour les données "administratives" et "équipements et échantillons"</td><td>0</td><td>anne-laure.loiseau@inrae.fr</td></tr><tr><td>Peltier, Caroline</td><td>IR INRAE, CSGA</td><td>Personne contact pour les données "physico-chimie"</td><td>0.7</td><td>caroline.peltier@inrae.fr<br/>https://orcid.org/0000-0002-7926-955X</td></tr></tbody></table>
<table><tr><td>Chabin, Thibault</td><td>IR INRAE, CSGA</td><td>Personne contact pour les données "neuro-physiologie"</td><td>0.2</td><td><a href="mailto:thibault.chabin@inrae.fr">thibault.chabin@inrae.fr</a></td></tr><tr><td>Coulibaly, Kipédène</td><td>IE INRAE, CSGA</td><td>Personne contact pour les codes informatiques</td><td>0.2</td><td><a href="mailto:kipedene.coulibaly@inrae.fr">kipedene.coulibaly@inrae.fr</a></td></tr></table>

## 1.3. Licence

Le plan de gestion de structure est sous licence Etalab Open License 2.0.

Les créateurs de ce plan acceptent que tout ou partie de texte de ce plan soit réutilisé et personnalisé si nécessaire pour un autre plan. Il n'y a pas besoin de citer les créateurs en tant que source. L'utilisation de toute partie de texte de ce plan n'implique pas que les créateurs soutiennent ou aient une quelconque relation avec un autre plan.

## 2. Informations sur la structure

**Nom de la structure** : ChemoSens

**Nature** : plateforme

**Coordonnées** : Site INRAE - Bât. Le Magnen, 17 rue Sully 21000 Dijon ; Site Université de Bourgogne - Bât. Centre des Sciences du Goût, 9E boulevard Jeanne d'Arc 21000 Dijon

**Site internet** : https://www.chemosens.fr/

**Identifiant de la structure** : 1324

**Etablissements tutelles** : INRAE (département AlimH et TRANSFORM, CNRS, UB, Institut Agro

**Principaux partenaires** : ChemoSens est au service de la communauté scientifique et socio-économique. Elle développe des partenariats permettant d'étudier le rôle de lipides alimentaires dans la santé, les mécanismes chimiques et physiologiques de la perception sensorielle des aliments et le comportement alimentaire des consommateurs. Ses principaux partenaires sont les chercheurs du CSGA, les équipes d'autres unités de recherche publique et de CHU en France et des partenaires industriels nationaux et internationaux.

**Départements de rattachement INRAE** : AlimH et Transform

**Financement du fonctionnement** : Le fonctionnement de ChemoSens est soutenu par les deux départements tutelles et la CNOC (Commission Nationale des Outils Collectifs) d'INRAE, les projets de recherche publics (ANR, ISITE, Région, FEDER, Europe) et privés et prestation de service.
**Financement des équipements acquis** : Le financement des équipements est soutenu principalement par des demandes spécifiques auprès de la CNOC et d'IBISA, le contrat Plan Etat-Région BFC et dans une moindre mesure de l'autofinancement issu des prestations de service.

**Financement permettant l'acquisition des jeux de données** : Les jeux de données sont acquis dans le cadre des différents projets de recherche publics dans lesquels ChemoSens est pilote ou partenaire et ce sur l'ensemble de ces domaines d'expertise.

**Origine des salaires du personnel affecté** : Le personnel affecté à la plateforme sont des agents titulaires d'INRAE (AlimH et Transform) et du CNRS. La plateforme recrute également des ingénieurs en CDDs sur contrats de recherche.

**Domaines de recherche** (selon classification de l'OCDE) : 1 Natural Sciences, 2 Engineering and Technology, 3 Medical and Health Sciences

**Champs thématiques des recherches** : sciences des aliments, comportement du consommateur

**Périmètre thématique des données** : food and food processing, human nutrition and food security

**Mots-clés** : lipides, flaveur, goût, spectrométrie de masse, électro-encéphalographie, Food Oral Processing, olfactométrie, gustométrie, analyse sensorielle, chimiométrie, sensométrie, comportement alimentaire, consommateur

**Coordonnées du(des) responsable(s)** : Carole Tournier, Plateforme ChemoSens, UMR CSGA 17 rue Sully, 21000 Dijon

**Présentation de la plateforme** : La plateforme ChemoSens est située au Centre des Sciences du Goût et de l'Alimentation (UMR CSGA) à Dijon. C'est une Infrastructure Scientifique Collective du centre INRAE (Institut National de Recherche en Agriculture, Alimentation et Environnement) de Bourgogne Franche-Comté, également labelisée Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie au niveau national (GIS IBISA, https://www.ibisa.net) et plateforme de la région Bourgogne Franche-Comté. Sa démarche qualité est certifiée ISO 9001.

La plateforme réunit des compétences et un parc technologique de haut niveau dans les domaines suivants : spectrométrie de masse, olfactométrie et gustométrie, analyse sensorielle et comportement du consommateur, neuroimagerie, ingénierie logicielle, statistiques et science des données. Ses expertises et outils participent à répondre aux questions de recherche sur le rôle de lipides alimentaires dans le fonctionnement des tissus neurosensoriels, les mécanismes chimiques et physiologiques de la perception sensorielle des aliments et le comportement alimentaire des consommateurs. ChemoSens propose ses services aux chercheurs du CSGA et à de nombreux partenaires externes issus du monde académique et socio-économique.

ChemoSens est un membre structurant de l'infrastructure de recherche (IR) distribuée PROBE du département TRANSFORM (https://www.inrae.fr/infrastructures-recherche-au-sein-dinrae) et de l'IR nationale CALIS (Consommateur – ALiment -Santé, https://calis.ir.inrae.fr/).
## 3. Principales activités et services autour de la donnée

<table><thead><tr><th>Type d'activités et de services</th><th>Activité ou service ouvert (description du service)</th></tr></thead><tbody><tr><td><strong>Création/collecte de données</strong></td><td>Activité + Service ouvert (cf. 4.1)</td></tr><tr><td><strong>Traitement de données</strong></td><td></td></tr><tr><td><ul><li>Correction et nettoyage des données</li><li>Analyse de donnée</li><li>Visualisation des données</li><li>Publication des données</li></ul></td><td><table><tbody><tr><td>Activité</td></tr><tr><td>Activité + Service ouvert au CSGA</td></tr><tr><td>Activité + Service ouvert au CSGA</td></tr><tr><td>Activité</td></tr></tbody></table></td></tr><tr><td><strong>Gestion de données/codes/logiciels</strong></td><td></td></tr><tr><td><ul><li>Intégration de données (dans SI ou BD internes)</li><li>Gestion de logiciels externes</li><li>Gestion de bases de données externes</li><li>Standardisation</li><li>Gestion de codes (forge...)</li></ul></td><td><table><tbody><tr><td>Activité</td></tr><tr><td>Activité + Service ouvert (Fizz)</td></tr><tr><td>Activité + Service ouvert au CSGA</td></tr><tr><td>Activité</td></tr><tr><td>Activité</td></tr></tbody></table></td></tr><tr><td><strong>Développement</strong></td><td></td></tr><tr><td><ul><li>Modèle(s)</li><li>Algorithmique(s)</li><li>Workflow(s)</li><li>Script(s)</li><li>Logiciel(s)</li><li>Base(s) de données ou SI</li></ul></td><td><table><tbody><tr><td>Activité + Service ouvert au CSGA</td></tr><tr><td>Activité + Service ouvert au CSGA</td></tr><tr><td>Activité</td></tr><tr><td>Activité + Service ouvert au CSGA</td></tr><tr><td>Activité + Service ouvert (cf. Recensement des actifs numériques)</td></tr><tr><td>Activité + Service ouvert au CSGA</td></tr></tbody></table></td></tr><tr><td><strong>Formation</strong></td><td></td></tr><tr><td><ul><li>Logiciels de statistique (R)</li><li>Logiciels d'enquête (LimeSurvey, SurveyMonkey)</li><li>Logiciels d'analyse sensorielle (Fizz, TimeSens)</li><li>BDD de recrutement de volontaires (PanelSens)</li></ul></td><td><table><tbody><tr><td>Activité</td></tr><tr><td>Activité + Service ouvert au CSGA</td></tr><tr><td>Activité + Service ouvert au CSGA</td></tr><tr><td>Activité + Service ouvert au CSGA</td></tr></tbody></table></td></tr></tbody></table>
# 4. Présentation des données produites et utilisées par la structure

## 4.1. Données produites

<table><thead><tr><th>Code</th><th>Description</th><th>Nature</th><th>Type</th><th>Volume actuel &amp; prévisionnel</th><th>Logiciels et équipements utilisés pour produire les données</th><th>Coûts associés aux logiciels</th><th>Format des données</th></tr></thead><tbody><tr><td colspan="8" style="background-color: #cccccc; font-weight: bold;">P0</td></tr><tr><td>P0.1</td><td>Données administratives et organisationnelles</td><td>Corpus textuel</td><td>texte</td><td>quelques Go au total</td><td>Suite Office<br>Sharepoint<br>Visio Pro<br>RCS<br>Gesdoc<br>Boite mail ChemoSens<br>Base de suivi d'activités</td><td>Fourni par INRAE<br>Fourni par INRAE<br>63€/an<br>BDD interne<br>BDD interne<br>Fourni par INRAE<br>BDD interne</td><td>.docx, ..xlsx, .pptx, .vsd</td></tr><tr><td>P0.2</td><td>Données de recrutement</td><td>Enquête</td><td>texte</td><td>quelques Mo au total</td><td>PanelSens<br>LimeSurvey<br>SurveyMonkey</td><td>BDD interne<br>Fourni par INRAE<br>900€/an/4 utilisateurs</td><td>.lss, ..xlsx</td></tr><tr><td>P0.3</td><td>Données d'indemnisation</td><td>Papier</td><td>texte</td><td>-</td><td>Fiche papier</td><td>-</td><td>-</td></tr><tr><td>P0.4</td><td>Données des sites web</td><td>Corpus textuel</td><td>texte</td><td>quelques Mo au total</td><td>Prestation de service</td><td>675€/an</td><td>.html, .css</td></tr><tr><td colspan="8" style="background-color: #cccccc; font-weight: bold;">P1</td></tr><tr><td>P1.1</td><td>Codes pour les infoservices ChemoSens (intranet)</td><td>Code</td><td>software</td><td>~1 Go au total</td><td>Visual Studio code<br>WAMP</td><td>Gratuit<br>Gratuit</td><td>.php, .sql, .html, .css, .js</td></tr><tr><td>P1.2</td><td>Codes pour les web apps et API www.chemosenstools.com</td><td>Code</td><td>software</td><td>~5 Go au total</td><td>Visual studio</td><td>Gratuit</td><td>.cs, .ts, .js, .html, .css, .json</td></tr><tr><td>P1.3</td><td>Codes R</td><td>Code</td><td>software</td><td>quelques Ko par fichier</td><td>R<br>RStudio</td><td>Gratuit<br>Gratuit</td><td>.r</td></tr><tr><td>P1.4</td><td>Codes SAS</td><td>Code</td><td>software</td><td>quelques Ko par fichier</td><td>SAS</td><td>250€/an/utilisateur (5 utilisateurs)</td><td>.sas</td></tr></tbody></table>
<table><tbody><tr><td>P1.5</td><td>Codes Matlab</td><td>Code</td><td>software</td><td>quelques Ko par fichier</td><td>Matlab</td><td>500 à 1500€/utilisateur en fonction des modules (1 utilisateur)</td><td>.m</td></tr><tr><td>P1.6</td><td>Codes Python</td><td>Code</td><td>software</td><td>quelques Ko par fichier</td><td>PyCharm Google Colab Anaconda</td><td>Gratuit Gratuit Gratuit</td><td>.py .joblib .pickle</td></tr><tr><td>P2</td><td>Analyse sensorielle</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>P2.1</td><td>Données d'analyse sensorielle</td><td>Expérimentation</td><td>texte</td><td>quelques Mo par fichier</td><td>TimeSens Fizz V3 PsychoPy EPrime</td><td>Logiciel interne 3500€/an Gratuit 1000€/utilisateur (1 utilisateur)</td><td>.ts2 (JSON crypté) .frs, .frt .psyexp</td></tr><tr><td>P2.2</td><td>Jeu de données d'analyse sensorielle</td><td>Jeu de données</td><td>texte</td><td>~65 Go au total</td><td>Excel ExcelStat</td><td>Fourni par INRAE 100€/an/utilisateur</td><td>.xlxs</td></tr><tr><td>P3</td><td>Physico-chimie</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>P3.1.1</td><td>Données LCMS</td><td>Expérimentation</td><td>spectre de masse</td><td>~3 To au total</td><td>Orbitrap Fusion Logiciel Xcalibur, Free Style</td><td>Fournis à l'achat</td><td>.raw, .mzXML (con vertis par msConve rt)</td></tr><tr><td>P3.1.2</td><td>Jeu de données LCMS</td><td>Jeu de données</td><td>texte</td><td>~150 Ko / fichier</td><td>R (package LCMS)</td><td>Outil interne</td><td>.xlxs</td></tr><tr><td>P3.2.1</td><td>Données PTRMS</td><td>Expérimentation</td><td>spectre de masse</td><td>~800 Go au total</td><td>PTRMS-TOF-8000 Ionicon Logiciel PTR-MS Manager, TPS-Controller, TOFDaQ</td><td>Fournis à l'achat</td><td>.h5</td></tr></tbody></table>
<table><tr><td>P3.2.2</td><td>Jeu de données PTRMS</td><td>Jeu de données</td><td>texte</td><td>~150Ko / fichier</td><td>R (package PTRMS), PTRViewer</td><td>Outil interne</td><td>.csv, .txt, .xlsx</td></tr><tr><td>P3.3.1</td><td>Données GCO</td><td>Expérimentation</td><td>Profil odorant</td><td>~13 Go au total</td><td>GC-MS MSD4 Agilent OpenLAB ChemStation AGILENT - factoryRecorderSoftware 2/3</td><td>7000 €</td><td>.xlsx</td></tr><tr><td>P3.3.2</td><td>Jeu de données GCO</td><td>Jeu de données</td><td>texte</td><td>~50Ko</td><td>Manuel</td><td>-</td><td>.xlsx</td></tr><tr><td>P3.4.1</td><td>Données GCMS</td><td>Expérimentation</td><td>spectre de masse</td><td>~300 Go au total</td><td>3 appareils MASS010, GC-MSD4 et MASS008 Logiciels ChemStation Logiciel MassHunter</td><td>Fournis à l'achat<br>10 000 €</td><td>.d</td></tr><tr><td>P3.4.2</td><td>Jeu de données GCMS</td><td>Jeu de données</td><td>texte</td><td>~50 Ko par fichier</td><td>Manuel</td><td></td><td>.xlsx</td></tr><tr><td>P3.5.1</td><td>Données SFC/UPLC</td><td>Expérimentation</td><td>spectre de masse</td><td>~180 Go au total</td><td>instrument Waters Logiciel MassLynx</td><td>Fourni à l'achat</td><td>.d,<br>.mzML (convertis par msConvert)</td></tr><tr><td>P3.5.2</td><td>Jeu de données SFC/UPLC</td><td>Jeu de données</td><td>texte</td><td>~4 Go</td><td>Code R</td><td>Outil interne</td><td>.xlsx</td></tr><tr><td>P3.6.1</td><td>Données MALDI</td><td>Expérimentation</td><td>spectre de masse + Images</td><td>NR</td><td>Instrument MALDI-MS (plateforme BIBS) Logiciels FlexControl, FlexImaging</td><td>Fourni à l'achat</td><td>.d</td></tr><tr><td>3.7.1</td><td>INRAMass (spectres masse)<br>INRAsniff (descripteurs GC-O)<br>INRACarom (coef. partage)<br>INRAMol (caract. mol. arôme)<br>INRAOlgus (Olfaction et Gustation)</td><td>Base de données diverses</td><td>arômes</td><td>~6 Go au total</td><td>MyISAM</td><td>Bases internes</td><td>.myd</td></tr></table>
<table><tbody><tr><td></td><td>Lipides-fusion<br>Lipides_waters</td><td></td><td>Gangliosides</td><td>Excel<br>Excel</td><td></td><td>.xls<br>.xls</td></tr><tr><td>P4</td><td colspan="6">Neuro - Physiologie</td></tr><tr><td>P4.1</td><td>Enregistrements vidéos</td><td>Observation</td><td>audiovisuel</td><td>~400 Go</td><td>webcam</td><td>0</td><td>.webm</td></tr><tr><td>P4.2</td><td>Données EEG</td><td>Expérimentation</td><td>numérique</td><td>~2 To</td><td>Instrument Biosemi, MBrainTrain, Brain procuets</td><td>Fourni avec le matériel</td><td>.bdf, .eph, .eeg, .set</td></tr><tr><td>P4.3</td><td>Données physiologiques (ECG, respiratoire, EDA)</td><td>Expérimentation</td><td>numérique</td><td>Intégrés aux données EEG</td><td>Biosemi, Burghart, BrainProducts</td><td>Fourni avec la matériel EEG ou appareils de gustométrie</td><td>.bdf .eeg .csv</td></tr><tr><td>P4.4</td><td>Données d'IRM fonctionnelle</td><td>xpérimentation</td><td>numérique</td><td>~800 Go</td><td>Siemens Skyra (CHU Dijon)</td><td>Coût calculé au temps utilisation machine</td><td>Nifti, .m,</td></tr><tr><td>P5</td><td colspan="6">Consommateur</td></tr><tr><td>P5.1</td><td>Données d'enquête</td><td>Enquête</td><td>texte</td><td>2 Mo</td><td>LimeSurvey SurveyMonkey</td><td>Fourni par INRAE 900€/an/4 utilisateurs</td><td>.lss,.xlxs .xlxs</td></tr><tr><td>P5.2</td><td>Données de consommation</td><td>Enquête</td><td>texte</td><td>quelques Mo par fichier</td><td>CodAppro</td><td>Outil interne</td><td>.json</td></tr><tr><td>P5.3</td><td>Jeu de données de consommation</td><td>Jeu de données</td><td>texte</td><td>~6 Go au total</td><td>Excel</td><td>Fourni par INRAE</td><td>.xlxs</td></tr><tr><td>P6</td><td colspan="6">Equipements et échantillons</td></tr><tr><td>P6.1</td><td>Données de températures de chambres froides et congélateurs -80°C</td><td>Données sur les équipements</td><td>texte</td><td>quelques Mo</td><td>Oceaview</td><td>1250€/an (2 sites)</td><td>.pdf, .xlxs</td></tr></tbody></table>
<table><tr><td>P6.2</td><td>Données sur les équipements (caractéristiques, métrologie)</td><td>Données sur les équipements</td><td>texte</td><td>quelques Mo</td><td>Base inventaire matériel<br>Base de suivi métrologique<br>Base agrément<br>Base habilitation<br>Base maintenance</td><td>Outils internes</td><td>.pdf, .xlsx</td></tr><tr><td>P6.3</td><td>Données physicochimiques et microbiologiques des aliments consommés</td><td>Données sur les aliments</td><td>texte</td><td>quelques Mo</td><td>Extranet prestataire</td><td>Fourni par prestataire</td><td>.pdf</td></tr></table>

## 4.2. Données utilisées par la structure provenant de sources extérieures

<table><thead><tr><td>Code</td><td>Nom du jeu de données</td><td>Nature</td><td>Source/DOI</td><td>Volume</td><td>Format(s)</td><td>Conditions d'acquisition</td><td>Version utilisée</td><td>Fréquence d'a cquisition/MA J</td><td>Coût</td></tr></thead><tbody><tr><td>E1</td><td>CIQUAL</td><td>Données nutritionnelles sur les aliments</td><td>https://ciqual.anses.fr/</td><td>quelques Mo</td><td>.xlsx</td><td>Données publiques</td><td>2020</td><td>NA</td><td>0</td></tr><tr><td>E2</td><td>AGRIBALYSE</td><td>Données environnementales sur les aliments</td><td>https://doc.agribalyse.fr/documentation/</td><td>quelques Mo</td><td>.xlsx</td><td>Données publiques</td><td>3.1.1</td><td>NA</td><td>0</td></tr><tr><td>E3</td><td>Open Food Facts</td><td>Données sur les aliments</td><td>https://fr.openfoodfacts.org/</td><td>plusieurs Go</td><td>.json</td><td>Données publiques</td><td>NA</td><td>NA</td><td>0</td></tr><tr><td>E4</td><td>FoodEX</td><td>Données sur les aliments</td><td>https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2015.EN-804</td><td>quelques Mo</td><td>.xlsx</td><td>Données publiques</td><td>NA</td><td>NA</td><td>0</td></tr></tbody></table>
<table><tr><td>E5</td><td>Wiley Registry/NIST Mass</td><td>Données d'identification de spectres de masse</td><td>https://sciencesolutions.wiley.com/solutions/technique/gc-ms/wiley-registry-nist-mass-spectral-library/</td><td>3 millions de spectres (630 Mo)</td><td>.I</td><td>Payant</td><td>2017</td><td>1x/10 an</td><td>20000€</td></tr><tr><td>E6</td><td>Lipid Search</td><td>Données d'identification et quantification des lipides par LC-MS</td><td>https://assets.thermofisher.com/TFS-Assets/CMD/brochures/BR-63951-LipidSearch-BR63951-EN.pdf</td><td>NR</td><td>NR</td><td>Payant, ThermoScientific</td><td>NR</td><td>NR</td><td>NR</td></tr><tr><td>E7</td><td>LipidMaps</td><td>Données lipidomiques</td><td>http://www.lipidmaps.org</td><td></td><td></td><td>Open access</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>E8</td><td>LipidWeb</td><td>Données SM des lipides</td><td>http://www.lipidhome.co.uk</td><td></td><td></td><td>Page web</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>E9</td><td>LipidView</td><td>Données SM electrospray des lipides</td><td>accès via la Plate-Forme Lipidomique de l'Université de Bourgogne</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr></table>
# 5. Cadre éthique et réglementaire de collecte des données

## 5.1. Etudes impliquant la personne humaine

### 5.1.1. Contexte légal

Toutes les études impliquant des interactions avec des humains sont déclarées dans la base EIPH (Etude Impliquant la Personne Humaine) du CSGA pour information au directeur de l'unité. Le logigramme ci-dessous permet de déterminer les démarches réglementaires à mettre en œuvre.

<figure><img src="image_3.png" /></figure>

L'unité dispose sur son intranet d'une page dédiée aux études sur la personne humaine comportant des guidelines, instructions, informations sur la protection des données personnelles. Au sein du CSGA, une ingénieure est en charge des questions et règles relatives aux études impliquant des volontaires.
### 5.1.2. Données personnelles

#### Ressources

L'unité CSGA dispose sur son intranet d'une page dédiée aux études impliquant la personne humaine et comportant des guidelines, instructions et accès à des ressources externes concernant le traitement des données personnelles.

#### Licéité des traitements des données

Les traitements de données sont fondés sur des missions de service public du responsable de traitement, conformément aux missions des établissements tutelles, mission de recherche publique. La licéité des traitements relève donc de l'article 6.1e du RGPD.

#### Minimisation des données

De manière générale, seules les données strictement nécessaires à l'objectif de la recherche sont collectées.

#### Consentement

Pour les projets incluant le traitement de données portant sur des catégories particulières de données relevant de l'article 9 du RGPD (données de santé, de vie personnelle et professionnelle), les personnes concernées doivent donner leur consentement explicite au traitement de ces données à caractère personnel pour une ou plusieurs finalités spécifiques, sauf lorsque le droit de l'Union ou le droit de l'État membre prévoit que l'interdiction visée au paragraphe 1 ne peut pas être levée par la personne concernée.

#### Mesures protectrices

Sauf exception, le recrutement des volontaires se fait via la base de données PanelSens de ChemoSens (cf. 7.1.3). Le contact se fait via l'envoi d'un mail d'information. Les volontaires sont informés des objectifs, des moyens et des impératifs de l'étude à l'aide d'une fiche d'information envoyée par mail en amont de la première séance. Ils disposent ainsi du temps nécessaire pour lire cette fiche. S'ils ont des questions, les volontaires peuvent contacter le responsable de l'étude après avoir reçu la fiche d'information. Cette fiche est redistribuée et lue lors de la première séance. À l'issue de la présentation de l'étude et des réponses aux questions, et s'ils le souhaitent, les volontaires signent le formulaire de consentement.

Conformément au Règlement Européen relatif à la protection des données personnelles (Règlement Européen 2016/679), les participants bénéficient d'un droit d'accès, de rectification, d'opposition, d'effacement des informations les concernant (la demande écrite doit être adressée à : Directeur CSGA, 9E Bd Jeanne d'Arc, 21000 Dijon - délai de réponse : 30 jours). Les participants peuvent aussi contacter la déléguée à la protection des données personnelles par courrier à CNRS DPD, Service de protection des Données, 2 rue Jean Zay- 54519 - Vandoeuvre lès Nancy Cedex ou par courriel à dpd.demandes@cnrs.fr

### 5.2. Etudes impliquant des données issues de ressources génétiques

La plateforme ne collecte ni ne gère de données issues de ressources génétiques.
# 6. Sécurité des données

## 6.1. Confidentialité

Toutes les données générées par la plateforme sont par défaut considérées comme confidentielles. Un accès aux données à un tiers sera possible si le coordinateur du projet autorise le partage de ses données pour analyse.

## 6.2. Mesures mises en œuvre pour assurer la confidentialité des données

### 6.2.1. Mesures générales

La plateforme est assujettie à la politique de sécurité générale du CSGA.

Le système d'information ne dispose pas d'un plan d'assurance sécurité, mais les mesures suivantes sont mises en œuvre.

#### Sécurité physique

L'accès au centre nécessite un badge nominatif. Les documents papiers sensibles sont stockés dans une armoire sécurisée fermée à clef dans un bureau sécurisé uniquement accessible par badge. La clef de l'armoire n'est accessible qu'à des personnes de l'unité désignées responsables.

#### Sécurité des données sur les postes de travail

Les postes de travail (ordinateurs fixes ou portables) ne sont accessibles qu'au personnel du CSGA, à l'aide d'un identifiant et d'un mot de passe (journalisation des accès).

Les postes de travail sont chiffrés, sécurisés (verrouillage automatique de session, antivirus, pare feu logiciel, etc.) et régulièrement mis à jour via un serveur de déploiement géré par le service informatique du centre INRAE.

Les postes de travail sont gérés par un informaticien de l'unité. La sécurité des accès réseau est assurée par un Firewall de marque PALO ALTO ainsi qu'un routeur filtrant de marque HP. La maintenance est réalisée par l'informaticien du laboratoire. Les interventions sont enregistrées dans une main-courante.

Les accès aux postes de travail et au VPN sont journalisés.

#### Sécurité des données sur les serveurs

Les serveurs ne sont accessibles qu'au personnel du CSGA, à l'aide d'un identifiant et d'un mot de passe, via un VPN (journalisation des accès). L'accès aux données d'un projet est limité au personnel de la plateforme impliqué dans le projet. Le responsable du projet délivre et suit les habilitations à l'accès et manipulations des données. Les permissions d'accès obsolètes sont supprimées.

#### Sensibilisation des personnels

Les personnes manipulant les données sont informées sur les bonnes pratiques d'hygiène numériques : rappel sur les mots de passe, pas de stockage local, pas d'utilisation de cloud public ou étranger, etc. Des formations en e-learning sont proposées aux agents par INRAE : Cybersécurité, RGPD.
Une formation est dispensée par ChemoSens pour l'utilisation de la base de données PanelSens (cf. 7.1.3). Chaque utilisateur s'engage à respecter les règles d'utilisation en signant la charte PanelSens.

### Tiers accédant aux données

Les personnels non CSGA (partenaires et sous-traitants) signent un engagement de confidentialité.

## 6.2.2. Mesures supplémentaires pour les données relevant du RGPD

### Organisation de la politique de protection de la vie privée

ChemoSens bénéficie de l'appui du délégué à la protection des données du CNRS et d'un accompagnement par le référent de la sécurité des systèmes d'information du CSGA (RSSI).

### Pseudonymisation

Un code temporaire aléatoire généré par PanelSens est attribué à chaque personne incluse dans une étude. Un fichier contenant la table de correspondance est constitué et conservé sur le réseau de l'unité uniquement accessible par les personnes autorisées à traiter et analyser les données.

### Cloisonnement

La base PanelSens contenant les informations identifiantes (nom, prénom) et les coordonnées postales et courriel et le numéro de téléphone des participants est totalement indépendante des fichiers résultats. Les données identifiantes et les données collectées sont séparées. A aucun moment les données directement identifiantes ne sont conservées dans les données de la recherche.

## 6.2.3. Mesures spécifiques aux transferts de données

Dans la mesure du possible, les transferts physiques (par clés USB, disques durs externes) sont évités.

Les fichiers sont envoyés par [FileSender](https://www.renater.com/en/products/file-sender), le service de transfert de fichiers sécurisé de Renater.
## 6.3. Analyse des risques et impacts

Les systèmes d'information de la plateforme n'ont pas fait l'objet d'une analyse de risques ou d'une homologation spécifique.

<table><thead><tr><td>Risque</td><td>Principaux impacts</td><td>Principales menaces</td><td>Mesures correctives</td><td>Gravité du risque</td><td>Vraisemblance du risque</td></tr></thead><tbody><tr><td>Accès illégitime à des données</td><td>Divulgation d'information</td><td>Intrusion sur les serveurs, compromission des identifiants d'accès aux services</td><td>Cf. 6.2.1 et 6.2.2</td><td>Limitée</td><td>Limitée</td></tr><tr><td>Modification ou suppression non désirée des données</td><td>Compromission des données de l'étude</td><td>Intrusion sur les serveurs, compromission des identifiants d'accès aux services, faille applicative, erreur, malveillance</td><td>Cf. 6.2.1 et 6.2.2</td><td>Limitée</td><td>Limitée</td></tr></tbody></table>

## 6.4. Plan de reprise après incident

Il n'existe pas de plan de reprise après incident propre à la plateforme, le plan de reprise est géré et piloté par les équipes informatiques du CSGA et du centre INRAE BFC. En cas de violation de données et d'incidents, le Directeur d'unité et le RSSI sont avertis puis remontent à la chaine fonctionnelle des tutelles.
# 7. Cycle de vie des données

<figure><img src="image_4.png" /></figure>

## 7.1. Données administratives

### 7.1.1. Données de gestion de ChemoSens

La plateforme dispose d'une base interne pour l'enregistrement des activités (recherche et développement, formation, management, mission transversales) des agents de la plateforme. Chaque agent saisit le nombre d'heures associées à chaque activité ou activité x projet (les projets étant déclarés dans la base RCS, cf. 7.1.2). La BDD est développée et maintenue par ChemoSens (cf. 7.4.1).
### 7.1.2. Données administratives des projets

RCS est une base de données interne dédiée à la saisie des demandes faites à la plateforme. Elle permet aux utilisateurs du CSGA de solliciter les ressources proposées par la plateforme, réserver les équipements et signaler les problèmes liés à l'utilisation des ressources et à la plateforme. Les demandes émanant de collaborateurs externes et les projets propres à la plateforme y sont également saisis, permettant ainsi de créer une base de suivi de projets. Les informations concernant le projet (porteur, financeurs, partenaires, aspects éthiques, etc.) y sont renseignées, ainsi que les besoins (expertise, support techniques, locaux et matériels). La BDD est développée et maintenue par ChemoSens (cf. 7.4.1).

Les projets sont classés en trois catégories :

* **Recherche** : La plateforme (au moins un des agents) est pilote d'un projet de recherche ou est impliquée dès le montage du projet dans la conceptualisation de la recherche (processus de définition du cadre conceptuel des objectifs, des questions de recherche). Elle s'engage à valoriser et partager les connaissances produites. Livrables types : réponse AAP, article scientifique.

* **Collaboration et prestation** : La plateforme est sollicitée par un responsable de projet pour prendre en charge la conception (processus de définition des méthodes, étapes, procédures, taille d'échantillon, participants, etc.) et/ou la réalisation (collecte de données) et/ou l'analyse des données. Livrables types : PGD, protocole expérimental, plan d'analyses, data paper, logiciel, jeu de données, rapport d'analyse, etc.

En règle générale, les données administratives des projets sont conservées sur le lecteur réseau P (hébergement dans un data center INRAE sécurisé) dans un répertoire accessible uniquement aux membres de ChemoSens (groupes de sécurités Active directory). Les demandes de droits sont effectuées grâce à un ticket sur le portail de service INRAE, puis mises en place par l'informaticien d'unité. Les données administratives des projets impliquant des équipes externes au CSGA et coordonnés par des agents INRAE sont en règle générale hébergées sur des espaces SharePoint institutionnels INRAE ouverts aux membres du projet ayant un LDAP INRAE et gérés par les coordinateurs de projets.

Un espace SharePoint institutionnel INRAE permet également à toutes les personnes travaillant à INRAE et à certains partenaires non INRAE (ayant un identifiant LDAP INRAE) de partager et versionner des documents pour la gestion de groupes de travail ou de projets internes. Cet espace est administré par INRAE et sauvegardé (sur 35 jours).

### 7.1.3. Données de recrutement et de consentement de participants

PanelSens est une base de données interne destinée à gérer les groupes de volontaires pour les études menées au CSGA. L'accès à la base est retreint au personnel du CSGA, après formation. Elle permet de : (i) centraliser l'enregistrement des données personnelles et d'en sécuriser l'accès, (ii) d'effectuer la plupart des démarches liées à la gestion des panels sans avoir à exporter les données personnelles dans d'autres fichiers ou applications. La gestion de PanelSens a été placée sous la responsabilité de Chemosens (administration, formation) et a fait l'objet d'une déclaration auprès de la Commission Nationale Informatique & Libertés (CNIL, n° d'enregistrement 1148039). Elle a fait l'objet d'une une étude d'impact sur la vie privée (DPD INRAE). La BDD est développée et maintenue par ChemoSens (cf. 7.4.1).

Des fiches de consentement (format papier ou numérique) sont à valider par les participants avant chaque étude. Une fois une étude terminée, les fiches de consentement (format papier) sont conservées jusqu'à 15 ans dans une armoire fermée à clef dans un bureau sécurisé uniquement accessibles par badge (cf. 6.2.1, sécurité physique). La
table de correspondance entre les codes des sujets et le code PanelSens est conservée sous format CSV dans un fichier accessible uniquement par mot de passe. Le fichier est stocké sur deux clefs USB cryptées et accessibles par mot de passe. Le mot de passe n'est connu que du responsable de l'étude. Les clefs sont conservées avec les fiches de consentement. Pour archivage définitif, les données pseudonymisées sont transférées sur deux disques durs cryptés qui seront conservés dans une armoire fermée à clef dans un bureau à accès sécurisé.

### 7.1.4. Données d'indemnisation

Un fichier Excel destiné au service comptable INRAE (SBFC) et comportant les nom, prénom, adresse mail de chaque participant est stocké sur un espace partagé sécurisé (accessible uniquement par les personnes du SBFC et par les expérimentateurs). Ces données, nécessaires en cas d'audit comptable, sont supprimées un an après la fin de l'étude.

## 7.2. Données des sites web

Le site web https://www.chemosens.fr/ est administré par Theorom Media (hébergement/sauvegarde, sécurité, versionnement) et mis à jour par Géraldine Lucchi.

Le site renvoie vers :

* Formulaire pour inscription des volontaires dans PanelSens

* Formulaire de contact chemosens

* Liste des publications de la PF

Des informations sur la plateforme sont également disponibles sur différents sites :

* https://sciencesexpertise-bfc.fr/

* https://www2.dijon.inrae.fr/csga/site_fr/chemosens.php

* https://www.ibisa.net/plateformes/chemosens-342.html

* https://calis.ir.inrae.fr/nos-installations/equipements/pole-aliment

* https://calis.ir.inrae.fr/nos-installations/equipements/pole-consommateur

La plateforme dispose également de comptes twitter et LinkedIn :

* https://x.com/probe_inrae

* https://x.com/inrae_chemosens

* https://x.com/CSGA_DIJON

* https://fr.linkedin.com/

La plateforme a une page dédiée sur ResearchGate : https://www.researchgate.net/lab/ChemoSens-Platform-Pascal-Schlich
### 7.3. Données équipements et échantillons

Le suivi des températures des enceintes réfrigérées et surgelées (chambres froides, congélateurs -80°C) est géré via une plateforme de surveillance Cloud Oceanview. L'application web assure la traçabilité des données (historique des relevés, alarmes). Les données sont consultables via un identifiant et un mot de passe, sont téléchargées mensuellement par ChemoSens et enregistrées sous le lecteur réseau P.

Les données relatives aux équipements et documentation associée (inventaire matériel, métrologie, habilitation, maintenance) sont stockées dans des bases développées en interne (cf. 7.4.1 pour détails).

Les rapports des analyses physicochimiques et microbiologiques des produits alimentaires sont mis à disposition via l'extranet du prestataire (laboratoire d'analyse). Ils sont consultables via un identifiant et un mot de passe, sont téléchargées par les agents Chemosens après édition et enregistrés sous le lecteur réseau P.

### 7.4. Développements logiciels

#### 7.4.1. Infoservices ChemoSens

PanelSens, RCS et la base de suivi des activités (cf. 7.1) sont hébergés sur un serveur linux administré par l'équipe informatique de la direction des systèmes d'informations. Les codes sont versionnés en local par l'informaticien en charge du développement et ne sont pas partagés.

Pour accéder aux deux applications web, un identifiant et un mot de passe sont nécessaires pour chacune d'elles, et ceux-ci ne sont jamais inclus dans les URL. Les mots de passe concernant PanelSens sont programmés pour être changé chaque 6 mois. Toutes les communications avec le serveur se font via le protocole HTTPS, avec un certificat et des noms de domaines fournis par INRAE.

Des machines virtuelles (VM) peuvent être utilisées par l'informaticien en charge du développement pour réaliser des tests avant mise en production. A ce stade, une VM nue (sans système d'exploitation) est disponible pour cet objectif. Elle est hébergée dans un data center du centre INRAE et administré par l'informaticien en charge du développement des outils.

#### 7.4.2. Web apps ChemoSensTools (P1.2)

Les développements sont réalisés sur l'ordinateur local de l'informaticien. Les codes sont versionnés et partagés sur une forge GitHub (cf. 7.4.4). Les applications web sont hébergées dans un data center INRAE, à Toulouse. La machine virtuelle est administrée par l'équipe informatique de ce data center. Le système d'exploitation (Windows server) et le serveur web sont administrées par l'équipe informatique du data center et l'informaticien en charge du développement. L'accès au serveur requière une connexion VPN.

L'accès aux applications web requière un identifiant et un mot de passe. Aucun identifiant ou mot de passe ne passe par les URL. Toutes les communications avec le serveur sont basées sur des web services (WCF) utilisant le protocole TLS (certificat et nom de domaines fournis par INRAE). Les données sont sauvegardées sous forme de fichiers cryptés à l'aide d'un algorithme type RSA. Seul le développeur de l'application a accès à la clé privée.
### 7.4.3. Packages R

Les packages R sont versionnés sur GitHub (cf. 7.4.4) et accessible à tous. Pour garantir la stabilité des fonctions clés, des tests unitaires sont implémentés et vérifiés à chaque mise à jour du package.

### 7.4.4. Partage et publication

Les codes informatiques ayant vocation à être réutilisés sont déposés et versionnés dans la forge GitHub de ChemoSens https://github.com/ChemoSens.

Les web apps et packages sont recensés sur le portail https://www.chemosenstools.com.

Les logiciels suivants ont été recensés en tant qu'actifs numériques INRAE :

<table><thead><tr><td>Logiciel</td><td>Périmètre des données</td><td>Actif numérique INRAE</td><td>Numéro APP</td></tr></thead><tbody><tr><td>CodAppro</td><td>Approvisionnements alimentaires</td><td>https://actif-numerique.inrae.fr/ansci/app/systeme-information/897</td><td>-</td></tr><tr><td>ConsoDrive</td><td>Choix alimentaires</td><td>https://actif-numerique.inrae.fr/ansci/app/systeme-information/896</td><td>-</td></tr><tr><td>ConsoTextplorer</td><td>Perception des aliments</td><td>https://actif-numerique.inrae.fr/ansci/app/systeme-information/898</td><td>IDDN.FR.001.490009.000.S.P.2022.000.30000</td></tr><tr><td>CrocNoteurs</td><td>Analyse sensorielle</td><td>https://actif-numerique.inrae.fr/ansci/app/systeme-information/895</td><td>-</td></tr><tr><td>TimeSens</td><td>Analyse sensorielle</td><td>https://actif-numerique.inrae.fr/ansci/app/systeme-information/894</td><td>IDDN.FR.001.080013.000.R.C.2011.000.30605</td></tr></tbody></table>

## 7.5. Données expérimentales

### 7.5.1. Planification

La planification des différentes étapes du projet est définie dans un diagramme de Gantt défini en amont du projet.

Suite à l'acquisition d'un financement, le protocole expérimental est affiné et proposé au partenaire. Les études faisant appel à la personne humaine sont déclarées (protocole résumé) sur la base EIPH du laboratoire pour information au DU et évaluation par la cellule. Cette évaluation guide les chercheurs dans les démarches réglementaires (classification RIPH et orientation vers le comité d'évaluation éthique ad hoc), montage du dossier éthique et constitution du dossier RGPD pour soumission à la cellule DPD du CNRS. Pour les dossiers classés RIPH (loi Jardé), le promoteur (INRAE et par délégation le centre BFC), le médecin investigateur sont définis et une assurance est contractée. Le démarrage des travaux est soumis à validation des dossiers éthiques et données personnelles. Le PGD est rédigé selon les recommandations du financeur. Les démarches réglementaires, la rédaction du PGD du projet est sous la responsabilité du porteur de projet. La plateforme prendra en charge l'entièreté des démarches pour les projets qu'elle pilote ou apportera les informations nécessaires sur les périmètres des données qu'elle collecte lorsqu'elle est partenaire. Le plan d'analyse est établi en fonction de
la disponibilité des personnels et du matériels, de la priorisation des projets et de la disponibilité des échantillons. Un planning prévisionnel est renseigné dans un tableau Excel pour chaque instrument ou manip d'analyse sensorielle. Celui-ci se doit d'être mouvant pour s'adapter aux aléas.

L'ensemble des éléments constitutifs d'un projet de recherche pris en charge par la plateforme (la demande, le protocole, PGD, données, facturation...) sont classés dans un dossier unique sur le réseau sécurisé du laboratoire (lecteur P) avec un code projet généré par la base RCS.

### 7.5.2. Création/collecte, traitement, organisation et analyse

Les logigrammes spécifiques à chaque technique sont spécifiés dans des fiches internes à la plateforme.

Les standards, vocabulaires, et taxonomies recommandés pour décrire et représenter les données et métadonnées d'analyse sensorielle sont décrits dans https://doi.org/10.57745/B35XCS (production et mise à jour des métadonnées manuelle, compatibles avec l'ontologie TransformON). Les données et métadonnées d'études consommateur sont en cours de définition dans le cadre du projet PEPR SAMS FoodXPTools.

### 7.5.3. Conservation

La plateforme n'a pas vocation à faire de l'archivage de données. La règle générale pour les collaborations et prestations est que deux mois après la clôture du projet (dernières données envoyées), les données ne sont pas conservées. Il est possible de déroger à cette règle en cas d'accord préalable avec l'utilisateur. Pour les projets de recherche, les données sont conservées jusqu'à leur publication (cf. 7.5.4).

### 7.5.4. Partage et publication

#### Droits de propriété intellectuelle

* **Projets de recherche** : ChemoSens est propriétaire des méthodes et des résultats.

* **Projets en collaboration** : ChemoSens est propriétaire des méthodes. Le coordinateur du projet et ChemoSens définissent la propriété intellectuelle des résultats d'un commun accord dans la convention associée au projet. En cas d'une implication significative de la plateforme, le co-autorat dans les publications sera de mise.

* **Projets de prestation** : ChemoSens est propriétaire des méthodes et l'utilisateur est propriétaire des résultats. ChemoSens peut donc librement communiquer sur les méthodes, mais ne pourra communiquer sur les résultats qu'après accord écrit de l'utilisateur. L'utilisateur doit systématiquement mentionner ChemoSens dans les remerciements de toute publication scientifique associée à la prestation.

#### Obligation de partage

* **Projets de recherche** : Toute mesure restrictive (absence totale de publication, restrictions d'accès aux données à la fin du projet, etc.) sera justifiée dans le PGD du projet. En l'absence de conditions juridiques, réglementaires ou éthiques justifiant l'application de ces mesures (nature des données, conditions définies dans un contrat signé avec un partenaire privé, projet de valorisation économique à venir, etc.), les données finalisées produites dans un cadre de recherche publique relèvent d'un principe d'ouverture par défaut (Loi pour une république numérique) selon le principe "ouvert autant que possible, fermé autant que nécessaire".

* **Projets en collaboration ou prestation** : Le choix de partager les données générées appartient au coordinateur du projet.
## Modalités de partage

Sauf mention contraire dans le PGD du projet, après un embargo éventuel (max 18 mois), les données issues des projets de recherche sont partagées dans un format ouvert et sous licence compatible CC-BY ou etalab avec l'ensemble de la communauté scientifique et civile.

Les PGD et protocoles ayant permis la collecte de données sont de manière générale déposés et versionnés sur l'archive ouverte INRAE https://hal.inrae.fr/.

La plateforme ne propose pas de catalogue décrivant les jeux de données qu'elle rend accessibles. Les données expérimentales sont partagées sous forme de jeux de données. Ces derniers se voient attribuer un DOI quand ils sont déposés sur l'entrepôt de ChemoSens sur Recherche Data Gouv https://entrepot.recherche.data.gouv.fr/dataverse/chemosens.

Dans la mesure du possible, les jeux de données sont décrits dans des data papers publiés dans la revue Data in brief.

## 7.5.5 Réutilisation

De manière générale, les données partagées peuvent être réutilisées à des fins de vérification, d'agrégation en bases de données ou de méta-analyse.