# Le projet DNA-thèque RSE

Christian Mougin, Samuel Mondy, Natacha Nikolic, Sylvia Bruneau

► To cite this version:

Christian Mougin, Samuel Mondy, Natacha Nikolic, Sylvia Bruneau. Le projet DNA-thèque RSE. Journées One Water 2025, Aug 2025, Bordeaux - Talence, France. 2025. hal-05231647

HAL Id: hal-05231647

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Submitted on 31 Aug 2025

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Il est important de préserver le patrimoine génétique de la biodiversité. Dans ce contexte, l'ADN est une ressource biologique conservée dans les centres de ressources biologiques de la plupart des infrastructures. L'ADN est également utile pour :

* Capturer des instantanés de la biodiversité pour des études longitudinales et rétrospectives,

* Anticiper les coévolutions des domaines de recherche et des technologies,

* Démêler les mécanismes épigénétiques/génétiques en jeu dans l'adaptation des espèces aux changements environnementaux,

* Contribuer aux objectifs de RSE : réduire la dépendance énergétique et les émissions de GES,

* Empêcher la perte des collections d'ADN en cas de coupure de courant ou de panne des congélateurs/climatiseurs.

BRC4Env propose un projet portant sur la conservation à long terme de l'ADN à température ambiante, qui pourrait donner lieu à un partenariat avec One Water.

### Empreinte eau (défi 2) – Eau sentinelle (défi 3)

### Explorer la faisabilité d'une Aquathèque (PC5)

Notre approche s'appuie sur deux Work Packages :

**WP1. Étudier les besoins en matière de stockage patrimonial et l'empreinte carbone réelle** > Mettre en place un plan de gestion de l'ADN pour INRAE

**WP2. Développer un protocole pour garantir une stabilité quasi immuable de l'ADN à température ambiante** > Utiliser diverses matrices d'ADN agro-environnementales aquatiques et terrestres

* Comparer trois technologies de stockage à température ambiante,

* Utiliser la modélisation d'Arrhenius pour simuler le stockage à long terme,

* Effectuer un contrôle qualité de l'ADN, un séquençage short/long read, un séquençage shotgun, un séquençage T2T,

* Évaluer comment la dégradation de l'ADN affecte la qualité et la fiabilité des données en métabarcoding, métagénomique et séquencage du génome entier (WGS).

<table><thead><tr><th>ADN de matrices agro-environnementales</th><th>ADNe</th><th>Plancton</th><th>Sol</th><th>Vertébrés</th></tr></thead><tbody><tr><td>Short &/or Long-reads</td><td>S</td><td>S & L</td><td>S & L</td><td>S & L</td></tr><tr><td>DNA breaking</td><td>+</td><td>+</td><td>+</td><td>+</td></tr><tr><td>Deamination</td><td>+</td><td>-</td><td>-</td><td>-</td></tr><tr><td>Metabarcoding</td><td>+</td><td>+</td><td>+</td><td>-</td></tr><tr><td>Metagenomic</td><td>-</td><td>+</td><td>+</td><td>+</td></tr><tr><td>WGS</td><td>-</td><td>+</td><td>+</td><td>+</td></tr><tr><td>Methylome</td><td>-</td><td>+</td><td>+</td><td>+</td></tr></tbody></table>

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FRANCE
GENOMIQUE

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### Résultats attendus

* Démontrer la fiabilité de la conservation à long terme de l'ADN à température ambiante,

* Développer des archives patrimoniales d'ADN pour les études sur la biodiversité,

* Réduire les coûts énergétiques et environnementaux,

* Soutenir la recherche innovante en génomique et épigénomique.

Une avancée vers une biobanque ambiante d'ADN, d'ARN et d'organoïdes

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BRC-RARe

French network of Biological Resource Centers for Research in Biology, Agronomy and Environment

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BRC

4Env

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PILIER ENVIRONNEMENT DE L'IR RARe

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RÉPUBLIQUE
FRANÇAISE

Liberté
Égalité
Fraternité

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PROGRAMME
DE RECHERCHE

ONEWATER
EAU BIEN COMMUN

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Géosciences pour une Terre darable

brgm

INRAO

université
de BORDEAUX

https://www.brc4env.fr/

https://doi.org/10.15454/TRBJTB

https://www.agrobrc-rare.org/