Compte-rendu intermédiaire Programme
ANR-20-SEBM-0005 DEFERM

Jean-Claude Manuguerra

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Jean-Claude Manuguerra. Compte-rendu intermédiaire Programme ANR-20-SEBM-0005 DEFERM. Institut Pasteur. 2023. pasteur-05191493

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Public Domain
Projet

DEFERM

Programme ANR-20-SEBM-0005

<table><tr><td>A</td><td>IDENTIFICATION</td><td>2</td></tr><tr><td>B</td><td>LIVRABLES ET JALONS</td><td>2</td></tr><tr><td>C</td><td>RAPPORT D'AVANCEMENT</td><td>4</td></tr><tr><td>C.1</td><td>Objectifs initiaux du projet</td><td>4</td></tr><tr><td>C.2</td><td>Travaux effectués et résultats atteints sur la période concernée</td><td>4</td></tr><tr><td>C.3</td><td>Difficultés rencontrées et solutions</td><td>5</td></tr><tr><td>C.4</td><td>Faits et résultats marquants</td><td>6</td></tr><tr><td>C.5</td><td>Travaux spécifiques aux entreprises (le cas échéant)</td><td>6</td></tr><tr><td>C.6</td><td>Réunions du consortium (projets collaboratifs)</td><td>6</td></tr><tr><td>C.7</td><td>Commentaires libres</td><td>7</td></tr><tr><td>D</td><td>VALORISATION ET IMPACT DU PROJET DEPUIS LE DEBUT</td><td>7</td></tr><tr><td>D.1</td><td>Publications et communications</td><td>7</td></tr><tr><td>D.2</td><td>Autres éléments de valorisation</td><td>8</td></tr><tr><td>D.3</td><td>Pôles de compétitivité (projet labellisés)</td><td>9</td></tr><tr><td>D.4</td><td>Personnels recrutés en CDD (hors stagiaires)</td><td>9</td></tr><tr><td>D.5</td><td>État financier</td><td>10</td></tr><tr><td>E</td><td>ANNEXES EVENTUELLES</td><td>10</td></tr></table>

Ce document est à remplir par le coordinateur en collaboration avec les partenaires du projet. Il doit être transmis par le coordinateur aux échéances prévues dans les actes attributifs :

1. à l'ANR

2. aux pôles de compétitivité ayant accordé leur label au projet.

L'ensemble des partenaires doit avoir une copie de la version transmise à l'ANR.

Il doit être accompagné d'un résumé public du projet mis à jour, conformément au modèle associé à ce document.

Ce modèle doit être utilisé uniquement pour le(s) compte(s)-rendu(s) intermédiaire(s) défini(s) dans les actes attributifs de financement, hors rapport T0+6 pour lequel il existe un modèle spécifique. Il existe également un modèle spécifique au compte-rendu final.
## A IDENTIFICATION

<table><tr><td>Acronyme du projet</td><td>DEFERM</td></tr><tr><td>Titre du projet</td><td>Mesures de décontamination visant à restaurer les installations et l'environnement après une libération naturelle ou volontaire de microorganismes pathogènes<br><b>Decontamination measures to restore facilities and the environment after a natural or deliberate release of pathogenic microorganisms</b></td></tr><tr><td>Coordinateur du projet<br>(société/organisme)</td><td>Institut Pasteur</td></tr><tr><td>Date de début du projet</td><td>01/04/21 (Kick off meeting 11/2021)</td></tr><tr><td>Date de fin du projet</td><td>31/01/24</td></tr><tr><td>Labels et correspondants des pôles de compétitivité<br>(pôle, nom et courriel du corresp.)</td><td></td></tr><tr><td>Site web du projet, le cas échéant</td><td>https://www.thw-forschung.de/EN/Projekte/DEFERM</td></tr></table>

<table><tr><td colspan="3">Rédacteur de ce rapport</td></tr><tr><td>Civilité, prénom, nom</td><td>M. Jean-Claude Manuguerra</td><td>M. Matthieu Cocagne</td></tr><tr><td>Téléphone</td><td></td><td>+ 33 1 76 53 53 96</td></tr><tr><td>Courriel</td><td>Jean-claude.manuguerra@pasteur.fr</td><td>matthieu.cocagne@pasteur.fr</td></tr><tr><td>Date de rédaction</td><td>17/10/2023</td><td>17/10/2023</td></tr><tr><td>Période faisant l'objet du rapport d'activité</td><td></td><td></td></tr></table>

## B LIVRABLES ET JALONS

Quand le projet en comporte, reproduire ici le tableau des jalons et livrables fourni au début du projet. Mentionner l'ensemble des livrables, y compris les éventuels livrables abandonnés, et ceux non prévus dans la liste initiale.

<table><thead><tr><th rowspan="2">N°</th><th rowspan="2">Intitulé</th><th rowspan="2">Nature*</th><th colspan="3">Date de fourniture</th><th rowspan="2">Partenaires<br>(souligner le responsable)</th></tr><tr><th>Prévue<br>initiale<br>ment</th><th>Replani<br>fiée</th><th>Livrée</th></tr></thead><tbody><tr><td colspan="7"><b>A - Conception- Scenario Development (lead: THW, co -lead : SDIS13, Firefighters Dortmund, RKI, Helmut-Schmidt University, ALU-CSS, Hahn-Schickard, Ademtech, Institut Pasteur)</b></td></tr><tr><td>A.1</td><td>Scenario development</td><td>Meetings<br>minutes,<br>report</td><td>Q1<br>30/06/<br>2021</td><td></td><td>11/11/<br>2021</td><td rowspan="4">All members<br>shown above</td></tr><tr><td>A.2</td><td>Specification of end-user requirements<br>and processes to be further analysed ()</td><td>Meetings<br>minutes,<br>report</td><td>Q2<br>30/09/<br>2021</td><td></td><td>03/02/<br>2022</td></tr><tr><td>A.3</td><td>Technical specification and interface<br>definition</td><td>Meetings<br>minutes,<br>report</td><td>Q3<br>31/12/<br>2021</td><td></td><td>03/02/<br>2022</td></tr><tr><td>A.4</td><td>Definition of realistic and scalable set of<br>scenarios</td><td>Meetings<br>minutes,<br>report</td><td>Q4<br>31/03/<br>2022</td><td></td><td>07/01/<br>2022</td></tr><tr><td colspan="7"><b>B - Detection System (lead: Hahn Schickard, Ademtech, RKI, SDIS13)</b></td></tr><tr><td>B.1</td><td>Specification, ongoing process</td><td>SOPs</td><td>Q1<br>30/06/<br>2021</td><td></td><td>June<br>2022</td><td rowspan="3">All members<br>shown above</td></tr><tr><td>B.2</td><td>Methode development: mechanical lysis<br>of model organisms in mycrofluidic<br>cartridge and qPCR assay development</td><td>SOPs</td><td>Q6<br>30/09/<br>2022</td><td></td><td>Dec<br>2022</td></tr><tr><td>B.3</td><td>Multiplex qPCR Assay development</td><td>SOPs</td><td>Q6<br>30/09/<br>2022</td><td></td><td>Sept<br>2023</td></tr></tbody></table>
<table><thead><tr><th rowspan="2">N°</th><th rowspan="2">Intitulé</th><th rowspan="2">Nature*</th><th colspan="3">Date de fourniture</th><th rowspan="2">Partenaires (souligner le responsable)</th></tr><tr><th>Prévue initiale ment</th><th>Replani fiée</th><th>Livrée</th></tr></thead><tbody><tr><td>B.4</td><td>Integration of qPCR based detection and small scale production of functional models. M1, proof of concept</td><td>Cartridge prototype</td><td>Q6 30/09/ 2022</td><td></td><td>Dec 2022</td><td></td></tr><tr><td>B.5</td><td>Adaptation to advanced processing instrument for fast qPCR based detection</td><td>Cartridge prototype</td><td>Q8 31/03/ 2023</td><td>Dec 2023</td><td></td><td></td></tr><tr><td>B.6</td><td>Investigation of processes for cartridge production scale up</td><td>Cartridges</td><td>Q9 30/06/ 2023</td><td>Dec 2023</td><td></td><td>All members shown above</td></tr><tr><td>B.7</td><td>Production of 300 cartridges for validation experiments at partners and field demonstration</td><td>Cartridges</td><td>Q11 31/12/ 2023</td><td>Janv 2024</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

C - Decontamination of bacterial and viral pathogens (lead: RKI, co-lead: Pasteur Institute, CEA, HSU)

<table><tbody><tr><td>C.1</td><td>Generation of spore forming bacteria and viruses, evaluation of test carrier and disinfectants</td><td>Stock of bacteria and viruses</td><td>Q3 (31/12/2021)</td><td>June 2023</td><td>All members shown above</td></tr><tr><td>C.2</td><td>Establishment of pathogen dissemination procedure in an area so chamber (RKI, Institute Pasteur+ CETEP)</td><td>SOPs</td><td>Q6 30/09/ 2022</td><td>June 2023</td><td></td></tr><tr><td>C.3</td><td>Establishment of decontamination procedures in an aerosol chamber (RKI, Institute Pasteur+ CETEP)</td><td>SOPs</td><td>Q8 31/03/ 2023</td><td>June 2023</td><td></td></tr><tr><td>C.4</td><td>Validation of decontamination procedures for pathogens in a small scale test room, development of a model</td><td>SOP</td><td>Q12 31/12/ 2024</td><td>March 2023</td><td></td></tr><tr><td>C.5</td><td>Small scale analysis of hot spots, where aerosols settles down</td><td>Report</td><td>Q9 30/06/ 2023</td><td>Septe mbre 2022</td><td></td></tr></tbody></table>

D - Operational Grid (lead HSU, CEA, RKI, SDIS13)

<table><tbody><tr><td>D.1</td><td>Aerosol chamber with surogates: Decontamination of different materials, kinds of surfaces, geometries, and decon means</td><td>SOPs</td><td>Q2 30/09/ 2021</td><td>June 2023</td><td>All members shown above</td></tr><tr><td>D.2</td><td>Comparison of different decon means, and methods (small, and medium scale)</td><td>Lab data</td><td>Q4 31/03/ 2022</td><td>Dec20 23</td><td></td></tr><tr><td>D.3</td><td>Investigation of different decon means, parameters, and methods (large scale)</td><td>SOPs and lab data</td><td>Q8 31/03/ 2023</td><td>31/12/ 2023</td><td></td></tr><tr><td>D.4</td><td>Development of a parameter grid for a short-cut determination of operation process data</td><td>Report</td><td>Q11 31/12/ 2023</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

E - Organizational Safety Culture (lead: ALU-CSS, CNRS, SDIS13, FDDO)

<table><tbody><tr><td>E.1</td><td>Comparative Study on institutional and legal structures of biological emergency response</td><td>Report</td><td>Q6 30/09/ 2022</td><td>Dec 2022</td><td>All members shown above</td></tr><tr><td>E.2</td><td>Comparative Study on safety culture of responsible first responders</td><td>Report</td><td>Q10 30/09/ 2023</td><td>Jun 2023</td><td></td></tr></tbody></table>

F - Decontamination Procedures and Evaluation (FDDO/SDIS13, HSU, THW, RKI, CEA, IP)

<table><tbody><tr><td>F.1</td><td>Definition, planning, and generation of test system set ups for X decontamination procedures</td><td>Report</td><td>Q8 31/03/ 2023</td><td>31/01/ 2024</td><td>All members shown above</td></tr><tr><td>F.2</td><td>Practical operational procedure and description of the matched procedures</td><td>SOPs</td><td>Q10 30/09/ 2023</td><td>31/01/ 2024</td><td></td></tr><tr><td>F.3</td><td>Description of the matched procedures</td><td>Report</td><td>Q12 31/01/ 2024</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

G - Operational and Tactical System Evaluation (FDDO/SDIS13, members all)
<table><thead><tr><th rowspan="2">N°</th><th rowspan="2">Intitulé</th><th rowspan="2">Nature*</th><th colspan="3">Date de fourniture</th><th rowspan="2">Partenaires<br>(souligner le responsable)</th></tr><tr><th>Prévue<br>initiale<br>ment</th><th>Replani<br>fiée</th><th>Livrée</th></tr></thead><tbody><tr><td>G.1</td><td>Detailed planning and generation of the test system set up</td><td>Report</td><td>Q6<br>30/09/<br>2022</td><td></td><td>Dec<br>2022</td><td></td></tr><tr><td>G.2</td><td>Test of procedures on decontamination by end users</td><td>Lab data</td><td>Q10<br>30/09/<br>2023</td><td>Mar<br>2023</td><td></td><td></td></tr><tr><td>G.3</td><td>Test of selected procedures on a decontamination place with aerosolization decon</td><td>Report,<br>photos</td><td>Q12<br>31/01/<br>2024</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td colspan="7"><strong>H - Dissemination and scientific exchange and evaluation (THW, all members)</strong></td></tr><tr><td>H.1</td><td>Presentation and participation in events</td><td>Powerpoint<br>presentations<br>and posters</td><td>Q12<br>31/01/<br>2024</td><td></td><td></td><td>All members<br>shown above</td></tr><tr><td>H.2</td><td>Workshops with active participation of young scientists</td><td>Powerpoint<br>presentations<br>and posters</td><td>Q12<br>31/01/<br>2024</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>H.3</td><td>Integration of the results into educational courses</td><td>Curriculum<br>and programs</td><td>Q12<br>31/01/<br>2024</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>H.4</td><td>Scientific, and public papers, and announcements</td><td>Articles</td><td>Q12<br>31/01/<br>2024</td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

Q1 : starts on 1st April 2021

# C RAPPORT D'AVANCEMENT

## C.1 OBJECTIFS INITIAUX DU PROJET

Maximum 10 à 20 lignes.

L'objectif du projet est de travailler sur différents scénarios afin d'aborder les procédures et les processus concrets des premiers intervenants dans un contexte politique réel basé sur des menaces causées par des micro-organismes pathogènes. Les scénarios incluent des disséminations accidentelles, délibérées ou naturelles. Cette approche nous permet de tirer parti de l'expertise allemande et française en matière de première intervention et d'harmoniser les procédures entre les premiers intervenants. Les projets précédents se sont déjà concentrés sur la détection (Aquanano, EMERGE, EuroBioTox), le développement d'un dispositif d'aérosol automatisé et d'un agent de décontamination non corrosif (Room-Disinfect), ainsi que sur la formation à l'aspect médical des menaces biologiques par des agents pathogènes humains (projet EFFO). Bien que les réglementations actuelles proposent des perspectives de restauration des matériels médicaux, il n'y a pour l'instant aucunes analyses approfondies et validations des procédures en place. Ce projet vise à proposer une méthode simple d'identification des pathogènes et du protocole de décontamination à utiliser suivant le ou les pathogènes préalablement détectés. Des évaluations approfondies des différents moyens de décontamination disponibles et des méthodes d'application compléteront les informations opérationnelles.

## C.2 TRAVAUX EFFECTUES ET RESULTATS ATTEINTS SUR LA PERIODE CONCERNEE

Maximum 1 page. Travaux et résultats obtenus pendant la période concernée, conformité de l'avancement des travaux avec le plan initialement prévu. Prévision de travaux pour la (les) prochaine(s) période(s).

Ademtech a développé une formule de mix PCR et RT-PCR lyophilisé pour son intégration dans un disque d'analyse développé par Hahn Schickard, l'IP ayant fourni le matériel biologique (WP B). Ademtech a ainsi pu optimiser les différents tests multiplexes de détection de pathogènes choisis (annexe 1).

C'est dans le WP C que l'IP est le plus impliqué. Ce WP porte sur des tests à petite échelle des procédures d'échantillonnage et de décontamination avec des agents pathogènes viraux. RKI et IP ont tenté d'adopter des procédures d'échantillonnage et de décontamination semblables. Les virus qui représentent un intérêt spécial sont listés en annexe 2 et ont été choisis sur la base de leurs propriétés morphostructurales et du niveau de confinement.

<footnote>* jalon, rapport, logiciel, prototype, données, ...</footnote>
Le comportement de ces virus, pathogènes pour l'homme, vis-à-vis des procédures de décontamination testées ont été comparé à celui de deux bactériophages. Ces bactériophages seront produits et employés lors d'un exercice en plein air à grande échelle selon les scénarios issus du WP A. Nous avons testé 2 procédures par fumigation avec 2 produits, 2 procédures par aérosolisation avec 2 produits, et une procédure utilisant des UV-C. Les tests ont été menés avec les surfaces listées en annexe 3. Quelles que soit les conditions de décontamination et quelle que soit la nature des surfaces, les virus eucaryotes sont soit totalement soit partiellement inactivés. En revanche pour les virus procaryotes substituts, les décontaminations appliquées ont été moins efficaces. Une hypothèse que nous allons vérifier est que les bactériophages seraient protégés par leur milieu de culture riche en protéines.

L'équipe de Mines Paris Tech est impliquée dans le WP E visant à enrichir le projet en explorant les dimensions sociales et pratiques des pompiers et des premiers intervenants dans la réponse opérationnelle aux menaces. Ont été réalisées : 1/ une étude de cas qualitative axée sur la "culture de la sécurité" des pompiers français face aux menaces biologiques, 2/ avec l'équipe allemande, une étude comparative visant à sensibiliser aux différences et aux similitudes de la culture opérationnelle et organisationnelle face aux risques biologiques. L'objectif est de faciliter l'apprentissage mutuel et d'améliorer l'interopérabilité de la préparation et de la gestion de la situation. Tout d'abord, les chercheurs ont procédé à un examen approfondi de divers documents qui comprenaient des rapports, des documents politiques, des plans stratégiques et des articles scientifiques. Cette analyse a fourni des informations sur les structures, les politiques et les approches formalisées de chaque organisation en matière de biosécurité. Deuxièmement, les chercheurs ont mené des entretiens qualitatifs approfondis avec un groupe diversifié d'experts spécialisés dans la biosécurité, y compris des pompiers, des scientifiques et d'autres premiers intervenants. Ces entretiens ont permis d'approfondir les perceptions, les expériences et les défis rencontrés par les personnes directement impliquées dans la réponse aux risques biologiques. Enfin, les chercheurs ont observé des séances de formation basées sur des scénarios auxquelles participaient des pompiers allemands et français. Ces observations ont fourni un contexte réel pour l'évaluation des pratiques de formation et de leur efficacité. Les résultats de cette analyse suggèrent qu'en dehors des différences formelles (par exemple, la structure organisationnelle), il existe un degré élevé de similitude entre les cultures de sécurité des services d'incendie français et allemands. Par ailleurs, il semblerait que les pratiques et techniques apprises et formées couvrant un large éventail de risques (par exemple, les incendies, les radiations, les risques chimiques) ne peuvent pas être facilement extrapolées aux menaces biologiques en raison de la nature distincte de ces menaces en termes de temporalité, de spatialité et de détectabilité. Le CEA a mis à la disposition du RKI et de l'IP un générateur de mousse statique permettant une production de mousse de décontamination à petite échelle (quelque litres par minute) afin de réaliser les expérimentations en laboratoire. Par ailleurs le CEA a finalisé le développement d'un générateur de mousse portable de type sac à dos élaboré pour une utilisation et pratique déployable sur le terrain. Ce sac à dos a été testé et évalué lors du premier test de terrain à Dortmund en mars 2023.

Le SDIS 13 a participé à l'élaboration des scénarios (WP A) qui feront l'objet du test final (WP G) lors duquel l'apport des procédures de décontamination mise au point lors du projet vont pouvoir être tester à grande échelle directement par les sapeurs-pompiers. Nous avons pu guider les différents partenaires sur les besoins des primo-intervenants en termes de détection et en besoin de décontamination

La première phase de test à Dortmund nous a permis d'évaluer les différents types d'outils développés par le projet. Nous avons également pu manipuler l'outil de détection et constater qu'il répond parfaitement aux critères demandés que soit en termes de manipulation, de simplicité et de rapidité de réponse.

La dernière étape va consister, à travers un exercice grandeur nature de montrer l'apport du projet sur un scénario définit dans le WP A.

## C.3 DIFFICULTES RENCONTREES ET SOLUTIONS

### Maximum 10 à 20 lignes. Difficultés éventuelles rencontrées et solutions de remplacement envisagées ex : impasse technique, abandon d'un prestataire, maîtrise des délais, maîtrise des budgets. Faut-il revoir le contenu du projet ? Faut-il revoir le calendrier du projet ?

**L'Institut Pasteur a rencontré plusieurs difficultés :**

**Ressource humaines :** Enorme délai pour obtenir l'autorisation ZRR de la première personne employée sur les fonds du projet. Drainage des ressources matérielles (équipements/laboratoires) et humaines par l'épidémie de monkeypox.

**Matériels :** Délai de livraison d'un agent d'inactivation du réactif pour l'utilisation de la mousse de décontamination. Indisponibilité de notre boite à gants suite à un exercice et à un retour chez le fabricant pour modifications. Matériel de décontamination défectueux (générateur d'aérosols) et remplacé par un nouveau modèle.

**Expérimentations :** Faible rendement de certaines cultures de virus pour les expériences de mise au point et pour les exercices à grande échelle. Chute drastique de titre viral après séchage empêchant d'atteindre le titre initialement
prévu lors du design de l'expérience. Nous allons essayer d'augmenter les titres par concentration des suspensions virales par ultracentrifugation.

## C.4 FAITS ET RESULTATS MARQUANTS

En quelques lignes pour chaque fait ou résultat marquant. Cet élément pourrait donner lieu à communication, après accord du coordinateur du projet.

Concernant les résultats des décontaminations, nous avons pu remarquer que le virus du Monkeypox moins résistant que prévu (virus à ADN double brins) aux protocoles appliqués. Les bactériophages présentent une résistance bien plus importante que les virus ce qui pourrait être dû au milieu de culture utilisé.

Nous avons pu soumettre une vingtaine de premiers intervenants aux procédés de décontamination lors d'un exercice à Dortmund.

## C.5 TRAVAUX SPECIFIQUES AUX ENTREPRISES (LE CAS ECHEANT)

### Entreprise xxx

Maximum 10 à 20 lignes par entreprise. Pour chaque entreprise du consortium, décrire les activités dans le projet, en se concentrant sur les apports, collaborations et perspectives liés au projet. Préciser notamment les perspectives d'application industrielle ou technologique, de potentiel économique et commercial, d'intégration dans l'activité industrielle, etc.

<table><tr><td>Entreprise</td><td>Ademtech</td></tr><tr><td>Rédacteur (nom + adresse mél)</td><td>GABOYARD - gaboyard@ademtech.com</td></tr></table>

Les travaux d'Ademtech se sont essentiellement concentrés sur le développement de nouvelles particules magnétiques permettant la capture et l'enrichissement de suspensions virales et bactériennes à partir d'écouvillons, et la mise au point de mix (RT-)PCR lyophilisables compatibles avec une utilisation dans la technologie d'amplification sur disque dévéloppée par le partenaire allemand Hahn-Schickard.

La mise au point de ces nouvelles particules magnétiques a pu être validée en partie grâce à la collaboration avec l'IP qui a fourni des modèles de suspensions de virus et bactériophages.

Grâce aux travaux de développement de ces mix, Ademtech a pu accroître ses connaissances et son savoir-faire en matière de lyophilisation de réactifs (RT-)PCR. Les contraintes liées à l'intégration dans le disque de détection ont nécessité une étroite collaboration avec Hahn-Schickard pour toute la mise au point technique et physique des produits, mais également avec IP pour toute la validation biologique des réactifs. Sans les discussions avec IP et la fourniture de produits d'amplification et plasmide, il n'aurait pas été possible d'avancer sur la mise au point des différents tests de détection multiplexe. Le caractère hautement sensible des cibles choisies dans ce projet ne permettait même pas de travailler sur des ARN et ADN synthétiques généralement commercialisés par des sociétés comme IDT-DNA ou Thermofisher.

En ce qui concerne la potentielle exploitation de ces résultats, le marché concerné par ce projet est extrêmement limité. En revanche, on peut imaginer proposer à des clients académiques ou industriels ces particules magnétiques pour la capture et l'enrichissement de virus et bactéries. Cela pourrait constituer une extension d'une gamme existante. Le savoir-faire lié à la lyophilisation est quant à lui déjà valorisé en interne : plusieurs kits qPCR lyophilisés sont déjà proposés à la vente mais pour des applications en mycologie et parasitologie médicale.

## C.6 REUNIONS DU CONSORTIUM (PROJETS COLLABORATIFS)

<table><thead><tr><td>Date</td><td>Lieu</td><td>Partenaires présents</td><td>Thème de la réunion</td></tr></thead><tbody><tr><td>04/11/21</td><td>Freibourg</td><td>THW, IP, RKI, CEA, HS, ADM, ALU-CSS, HSU, SDIS13, FDDO</td><td>Consortium Meeting</td></tr><tr><td>07/06/22</td><td>Paris</td><td>THW, IP, RKI, CEA, HS, ADM, ALU-CSS, Mines-Tech, HSU, SDIS13, FDDO, SDIS06</td><td>Consortium Meeting</td></tr><tr><td>07/12/22</td><td>Berlin</td><td>THW, IP, RKI, CEA, HS, ADM, ALU-CSS, Mines-Tech, HSU,</td><td>Consortium Meeting</td></tr></tbody></table>
<table><thead><tr><td>Date</td><td>Lieu</td><td>Partenaires présents</td><td>Thème de la réunion</td></tr></thead><tbody><tr><td></td><td></td><td>SDIS13, FDDO, SDIS06, DRK, ANR, VDI</td><td></td></tr><tr><td>27/03/23</td><td>Dortmund</td><td>THW, IP, RKI, CEA, HSU ALU-CSS, Mines-Tech</td><td>Field Test</td></tr><tr><td>14/06/23</td><td>Paris</td><td>THW, IP, RKI, CEA, HS, ADM, ALU-CSS, Mines-Tech, SDIS13, FDDO</td><td>Consortium Meeting</td></tr></tbody></table>

## C.7 COMMENTAIRES LIBRES

### Commentaires du coordinateur

Commentaire général à l'appréciation du coordinateur, sur l'état d'avancement du projet, les interactions entre les différents partenaires...

Le démarrage administratif du projet ainsi que le début des travaux ont été retardés et ralentis à cause de la pandémie de Covid-19, surtout au cours de l'année 2021. Le réel « Kick off meeting » n'a eu lieu qu'en novembre 2021. Depuis les travaux ont avancé à un rythme soutenu et le programme se déroule comme prévu même si des difficultés d'ordre matériel en ont ralenti l'exécution.

Ce projet qui mêle scientifiques et premiers intervenants est différent des projets classiques mais cela en fait aussi son intérêt particulier.

La collaboration entre les partenaires à la fois du côté allemand et du côté français est fluide et efficace.

### Commentaires des autres partenaires

Éventuellement, commentaires libres des autres partenaires

...

### Question(s) posée(s) à l'ANR

Éventuellement, question(s) posée(s) à l'ANR...

# D VALORISATION ET IMPACT DU PROJET DEPUIS LE DEBUT

Cette partie rassemble des éléments cumulés depuis le début du projet qui seront suivis tout au long de son avancée, et repris dans son bilan final.

## D.1 PUBLICATIONS ET COMMUNICATIONS

Citer les publications résultant du projet en utilisant les normes habituelles du domaine. Si la publication est accessible en ligne, préciser l'adresse. L'ANR encourage, dans le respect des droits des co-auteurs et des éditeurs, à publier les articles résultant des projets qu'elle finance dans l'archive ouverte pluridisciplinaire HAL : http://hal.archives-ouvertes.fr/

Attention : éviter une inflation artificielle des publications, mentionner uniquement celles qui résultent directement du projet (postérieures à son démarrage, et qui citent le soutien de l'ANR et la référence du projet).

### Liste des publications multipartenaires (résultant d'un travail mené en commun)

<table><tr><td rowspan="3">International</td><td>Revues à comité de lecture</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Ouvrages ou chapitres d'ouvrage</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Communications (conférence)</td><td>1. Biohazard Symposium, Berlin 2022<br>2. CBRNe, Lille 2022</td></tr></table>
<table><tr><td></td><td></td><td>3. Medical Biodefense Conference, Munich 2023 (2 posters CIBU)</td></tr><tr><td rowspan="3">France</td><td>Revues à comité de lecture</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Ouvrages ou chapitres d'ouvrage</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Communications (conférence)</td><td>1. WISG 2022 (poster)<br>2. WISG 2023 (conférence)<br>3.</td></tr><tr><td rowspan="3">Actions de diffusion</td><td>Articles de vulgarisation</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Conférences de vulgarisation</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Autres</td><td>1. Site web https://www.thw-forschung.de/EN/Projekte/DEFERM/Ueber-Uns/ueber-uns_node.html<br>2.</td></tr></table>

<table><caption>Liste des publications monopartenaires (impliquant un seul partenaire)</caption><tbody><tr><td rowspan="3">International</td><td>Revues à comité de lecture</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Ouvrages ou chapitres d'ouvrage</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Communications (conférence)</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td rowspan="3">France</td><td>Revues à comité de lecture</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Ouvrages ou chapitres d'ouvrage</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Communications (conférence)</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td rowspan="3">Actions de diffusion</td><td>Articles de vulgarisation</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Conférences de vulgarisation</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Autres</td><td>1.<br>2.</td></tr></tbody></table>

## D.2 AUTRES ELEMENTS DE VALORISATION

Les éléments de valorisation sont les retombées autres que les publications. On détaillera notamment :

- brevets nationaux et internationaux, licences, et autres éléments de propriété intellectuelle consécutifs au projet.

- logiciels et tout autre prototype

- actions de normalisation

- lancement de produit ou service, nouveau projet, contrat,...

- le développement d'un nouveau partenariat,

- la création d'une plate-forme à la disposition d'une communauté

- création d'entreprise, essaimage, levées de fonds

- autres (ouverture internationale,...).

Ce tableau détaille les brevets nationaux et internationaux, licences, et autres éléments de valorisation consécutifs au projet, du savoir-faire, des retombées diverses en précisant les partenariats éventuels. Voir en particulier celles annoncées dans l'annexe technique.

<table><caption>Liste des éléments. Préciser les titres, années et commentaires</caption><tbody><tr><td>Brevets internationaux obtenus</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Brevet internationaux en cours d'obtention</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Brevets nationaux obtenus</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Brevet nationaux en cours d'obtention</td><td>1.<br>2.</td></tr></tbody></table>
<table><tr><td>Licences d'exploitation (obtention / cession)</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Créations d'entreprises ou essaimage</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Nouveaux projets collaboratifs</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Colloques scientifiques</td><td>1.<br>2.</td></tr><tr><td>Autres (préciser)</td><td>1.<br>2.</td></tr></table>

## D.3 POLES DE COMPETITIVITE (PROJET LABELISES)

Pour les projets labellisés par un ou plusieurs pôles de compétitivité,

### Collaboration du projet avec le(s) pôle(s) ayant labellisé

Quelles collaborations y a-t-il eu entre votre projet et le(s) pôle(s) de compétitivité l'ayant labellisé ?

...

### Activités financées par le complément de pôle (laboratoires publics uniquement)

Détailler les activités réalisées par les laboratoires publics avec le complément de financement accordé au titre de la labellisation.
Préciser notamment les partenaires impliqués et la collaboration menée avec le ou les pôles.

<table><tr><td>Montant du complément accordé par l'ANR (pour chaque labo public)</td><td>- Partenaire XXX : xxx €<br>- Partenaire YYY : yyy €</td></tr></table>

<table><thead><tr><th>Type d'action menée</th><th>Détails (exemples non limitatifs)</th><th>Dépenses complément de pôle*</th></tr></thead><tbody><tr><td>Actions contribuant à la réflexion stratégique et à la programmation scientifique du pôle</td><td>Ex : Participation aux journées thématiques organisées par le pôle</td><td>Xxx : xxy €<br>Yyy : yyy €</td></tr><tr><td>Actions de communication scientifique et publique bénéficiant à la notoriété du pôle</td><td>Ex : colloque de projets</td><td>Xxx : xxy €<br>Yyy : yyy €</td></tr><tr><td>Développement de la recherche partenariale (recherche de partenaires, frais de gestion du partenariat, ingénierie de projets,...)</td><td>Ex : accord de consortium, frais de formation à la propriété intellectuelle, à la gestion de projets, dépenses relatives au montage du projet</td><td>Xxx : xxy €<br>Yyy : yyy €</td></tr><tr><td>Valorisation de la recherche et transfert vers le monde industriel</td><td>Ex : étude de brevetabilité</td><td>Xxx : xxy €<br>Yyy : yyy €</td></tr></tbody></table>

## D.4 PERSONNELS RECRUTES EN CDD (HORS STAGIAIRES)

Ce tableau dresse le bilan du projet en termes de recrutement de personnels non permanents sur CDD ou assimilé. Renseigner une ligne par personne embauchée sur le projet quand l'embauche a été financée partiellement ou en totalité par l'aide de l'ANR et quand la contribution au projet a été d'une durée au moins égale à 3 mois, tous contrats confondus, l'aide de l'ANR pouvant ne représenter qu'une partie de la rémunération de la personne sur la durée de sa participation au projet.
Les stagiaires bénéficiant d'une convention de stage avec un établissement d'enseignement ne doivent pas être mentionnés.

Des données complémentaires sur le devenir professionnel des personnes concernées seront demandées à la fin du projet. Elles pourront faire l'objet d'un suivi jusqu'à 5 ans après la fin du projet.

<footnote>* Estimation des dépenses imputées sur le complément de financement accordé au titre de la labellisation par un pôle de compétitivité, partenaires publics seulement.</footnote>
<table><thead><tr><th colspan="3">Identification</th><th colspan="3">Avant le recrutement sur le projet</th><th colspan="3">Recrutement sur le projet</th></tr><tr><th>Nom et prénom</th><th>Sexe H/F</th><th>Adresse email (1)</th><th>Date des dernières nouvelles</th><th>Dernier diplôme obtenu au moment du recrutement</th><th>Lieu d'études (France, UE, hors UE)</th><th>Expérience prof. antérieure (ans)</th><th>Partenaire ayant embauché la personne</th><th>Poste dans le projet (2)</th><th>Date de recrutement</th><th>Durée missions (mois) (3)</th></tr></thead><tbody><tr><td>Waldman Prunelle</td><td>F</td><td></td><td></td><td>PhD</td><td>France</td><td>5</td><td>IP</td><td>Ingénieur</td><td>12/07/2021</td><td>12</td></tr><tr><td>Cocagne Matthieu</td><td>H</td><td>matthieu.cocagne@gmail.com</td><td></td><td>Master</td><td>France</td><td>0</td><td>IP</td><td>Ingénieur</td><td>01/07/2021</td><td>18</td></tr></tbody></table>

## Aide pour le remplissage

(1) Adresse email : indiquer une adresse email la plus pérenne possible

(2) Poste dans le projet : post-doc, doctorant, ingénieur ou niveau ingénieur, technicien, vacataire, autre (préciser)

(3) Durée missions : indiquer en mois la durée totale des missions (y compris celles non financées par l'ANR) effectuées ou prévues sur le projet

Les informations personnelles recueillies feront l'objet d'un traitement de données informatisées pour les seuls besoins de l'étude anonymisée sur le devenir professionnel des personnes recrutées sur les projets ANR. Elles ne feront l'objet d'aucune cession et seront conservées par l'ANR pendant une durée maximale de 5 ans après la fin du projet concerné. Conformément à la loi n° 78-17 du 6 janvier 1978 modifiée, relative à l'Informatique, aux Fichiers et aux Libertés, les personnes concernées disposent d'un droit d'accès, de rectification et de suppression des données personnelles les concernant. Les personnes concernées seront informées directement de ce droit lorsque leurs coordonnées sont renseignées. Elles peuvent exercer ce droit en s'adressant l'ANR (http://www.agence-nationale-recherche.fr/Contact).

## D.5 ÉTAT FINANCIER

Donner un état indicatif de la consommation des crédits par les partenaires. Indiquer la conformité par rapport aux prévisions et expliquer les écarts significatifs éventuels.

<table><thead><tr><td>Nom du partenaire</td><td>Crédits consommés (en %)</td><td>Commentaire éventuel</td></tr></thead><tbody><tr><td>Institut Pasteur</td><td>28</td><td></td></tr><tr><td>Ademtech</td><td>32,4</td><td>Au 31/12/2022</td></tr><tr><td>Mines Paris Tech</td><td></td><td>Non communiqué</td></tr><tr><td>CEA</td><td>8</td><td>Non communiqué</td></tr><tr><td>SDIS13</td><td></td><td>(En attente de réponse)</td></tr></tbody></table>

## E ANNEXES EVENTUELLES

1. Listes des pathogènes choisis pour la détection

Bacillus anthracis, Francisella tularensis, SARS-CoV1/MERS-CoV, Variola virus, Monkey Pox, Yersinia pestis et Lassa virus. L'élaboration d'un design de détection des différents variants de Ebola est encore à l'étude

2. Listes des pathogènes choisis pour la décontamination
<table><thead><tr><th>Identified study viruses</th></tr></thead><tbody><tr><td>Monkeypox virus<br>(Poxviridae)</td></tr><tr><td>Rift valley fever virus<br>(Phenuiviridae)</td></tr><tr><td>Influenza A (H5N8) virus<br>(Orthomyxoviridae)</td></tr><tr><td>SARS-CoV-2<br>(Coronaviridae)</td></tr><tr><td>Echovirus 21<br>(Picornaviridae)</td></tr></tbody></table>

<table><thead><tr><th>Non-pathogenic viral surrogates</th></tr></thead><tbody><tr><td><strong>Bacteriophage Phi6</strong><br>90 nm, enveloped, segmented dsRNA<br>→ Considered as a suitable surrogate for environmental persistence and disinfection research related to enveloped viruses, especially Ebola virus (Whitworth et al. 2020, Gallandat & Lantagne, 2017...)<br><br><strong>Bacteriophage MS2</strong><br>30 nm, non-enveloped, non-segmented ssRNA<br>→ Surrogate for non-enveloped pathogenic viruses</td></tr></tbody></table>

Will be used on real-scale scenario

## 3. Liste des surfaces étudiées

Surfaces « pures » : aluminium / verre / polyéthylène.

Surfaces d'objets : linoleum / tapis / tente extérieure / tente intérieure / ceinture de sécurité.