# Modélisation des protéines

Gwenaëlle André-Leroux

► To cite this version:

Gwenaëlle André-Leroux. Modélisation des protéines. 3ème cycle. (Modélisation des protéines), 2015, pp.74. hal-02797792

HAL Id: hal-02797792

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Submitted on 5 Jun 2020

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# Cycle "Bioinformatique par la pratique" 2017

## Module 19 : Analyse in silico de structures 3D de protéines. Modélisation par homologie de protéines homologues, sauvage et mutées, arrimage de ligands.

### Objectifs

Connaître les bases de la modélisation moléculaire : modélisation par homologie, arrimage (docking) de ligands, mutations in silico. Une demi-journée dédiée à la modélisation de vos protéines d'intérêts.

### Programme

- Visualiser : Connaître les bases de la visualisation des protéines en 3D avec PYmol.

- Comprendre : Analyse des structures 3D de protéines (RX ou RMN). Recherche d'homologues avec HHpred, I-Tasser, etc... Modélisation par homologie avec Modeller, Phyre2. Principes et applications.

- Prédire : Docking de ligands avec Autodock. Prédiction des mutations in silico. Principes et applications.

* ✓ L'accent sera mis sur les points forts et les limites des différents outils et la pratique avec de nombreux "hand-on tutorials"

* ✓ Plus une session dédiée : «bring your own protein».

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### Dates & Horaires

23 et 24 mars 2017
9H30 ~ 17h30

### Durée

2 jours

### Intervenant

Gwenaelle André-Leroux
Véronique Martin

### Tarifs

225 euros HT (INRA)
250 euros HT (hors INRA)

### Modalités pédagogiques

Théorie : 20% - Pratique : 80% - 10 stagiaires par session - Chaque stagiaire disposera d'un poste informatique dédié avec les logiciels installés.

### Modalités de paiement

Uniquement par bon de commande

### Conditions d'annulation

En l'absence d'annulation par mail avant le **9 mars 2017**, le paiement sera dû.

### Contacts

veronique.martin@jouy.inra.fr Tél. : 01 34 65 29 74

formation.migale@jouy.inra.fr

http://migale.jouy.inra.fr/?q=fr/formations