Le genre Enterobacter comprend 20 espèces (tableau I).Enterobacter cloacae (espèce type du genre Enterobacter) et E.aerogenes sont les espèces les plus fréquemment isolées en cliniqueen France. Les études phylogénétiques ont permis de déclassertrois espèces, Enterobacter intermedius reclassé dans le genreKluyvera, Enterobacter dissolvens reclassé en tant que sous-espèced’Enterobacter cloacae et E. sakazakii dans le genre Cronobacteren 2007 (Iversen et al., 2007). Huit nouvelles espèces ont étédécrites sur la base de l’analyse du 16SrRNA ou du gène rpoB etsont issues d’extraits végétaux, de la rhizosphère des plantes oudu sol : Enterobacter ludwigii, E. radicintans, E. arachnidis, E.helveticus, E. mori, E. pulveris, E. soli et E. turicensis. Six des20 espèces d’Enterobacter, font partie du complexe Enterobactercloacae du fait de leur proximité phénotypique et génotypique.Précédemment, l’étude du complexe « Erwinia herbicola –Enterobacter agglomerans » a montré que le groupe était constituéen fait de nombreuses espèces dont certaines innominées (Beji etal., 1998). Mais une partie des espèces appartenant auparavant àce groupe ont été reclassées dans le genre Pantoea (Gavini et al.,1989). On exclut aussi du genre Enterobacter les espèces « vraies »d’Erwinia qui sont incapables de se développer à 35-37°C