# Vers un suivi de l'état écologique des mangroves françaises inspiré du RNQS : identification de bioindicateurs microbiens benthiques

Maud Fiard, Philippe Cuny, Léa Sylvi, Emma Jamon, Anna Buschendorf, Cécile Militon

<figure><img src="image_1.png" /></figure>

## To cite this version:

Maud Fiard, Philippe Cuny, Léa Sylvi, Emma Jamon, Anna Buschendorf, et al. Vers un suivi de l'état écologique des mangroves françaises inspiré du RNQS : identification de bioindicateurs microbiens benthiques. Les indicateurs biologiques opérationnels de la santé des sols : bilan scientifique et perspectives techniques, économiques et politiques, Jun 2025, Paris, France. 2025. hal-05467176

HAL Id: hal-05467176

https://ofb.hal.science/hal-05467176v1

Submitted on 20 Jan 2026

HAL is a multi-disciplinary open access archive for the deposit and dissemination of scientific research documents, whether they are published or not. The documents may come from teaching and research institutions in France or abroad, or from public or private research centers.

L'archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est destinée au dépôt et à la diffusion de documents scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, émanant des établissements d'enseignement et de recherche français ou étrangers, des laboratoires publics ou privés.

<figure><img src="image_2.png" /></figure>
# Vers un suivi de l'état écologique des mangroves françaises inspiré du RNQS : identification de bioindicateurs microbiens benthiques

Maud Fiard¹, Philippe Cuny¹, Léa Sylvi¹, Emma Jamon¹, Anna Buschendorf¹, Cécile Milton¹

¹Aix Marseille Univ., Université de Toulon, CNRS, IRD, MIO, 13288 Marseille, France

## Contexte

► **Projet DCE Mangroves :** développer un **indicateur de qualité de l'état écologique** des eaux littorales dans les bassins ultra-marins français dans le cadre de la directive cadre sur l'eau (DCE)

<figure><img src="image_3.png" /></figure>

► Étude des communautés microbiennes du sédiment par méthodes moléculaires à différents niveaux :

<figure><img src="image_4.png" /></figure>

Biomasse moléculaire
microbienne (BMM) :
Spectrophotométrie

Abondances bactériennes
et archéennes :
QPCR

Diversité et composition du
microbiote :
Séquençage Miseq Illumina
(V4-V5 ARNr 16S)

+ analyses des paramètres environnementaux :

pH, Eh, salinité, granulométrie, CHN, 22 métaux et métalloïdes traces, 66 contaminants organiques (dont pesticides, HAPs)

## Identification de bioindicateurs (2017 – 2021)

► Le compartiment microbien est-il pertinent pour déterminer la qualité des masses d'eau littorales dans le cadre de la DCE ?

### 4 stations (n=3)

<figure><img src="image_5.png" /></figure>

mangrove préservée :
réserve naturelle, ZNIEFF

Pression urbaine :
enrichissement en MO,
effluents STEP

Pression agricole :
Contaminants : dieldrine, DDT totaux, As, Cu, Ni

### Réponses du compartiment microbien

► BMM :

<figure><img src="image_6.png" /></figure>

► Diversité et composition du microbiote :
65 bioindicateurs potentiels de pression agricole (e.g., *Kineosporiaceae*, *Chromatiaceae*)

## Validation à grande échelle (2024 – 2027)

► Réponses des bioindicateurs aux pressions anthropiques ou aux conditions environnementales ?

### 31 stations (n=3)

<figure><img src="image_7.png" /></figure>

<figure><img src="image_8.png" /></figure>

Maud FIARD - Ingénieure de recherche (Dr.)
Institut Méditerranéen d'Océanologie
maud.fiard@mio.osupytheas.fr
+33-(0)4-86-09-06-05

<figure><img src="image_9.png" /></figure>

© Anti-corrélation : BMM, BAC, ARC et métaux traces

Premiers résultats, cas des métaux traces, dépassement des seuils de référence toxicologique pour le : Cu, Pb & Zn

<figure><img src="image_10.png" /></figure>

© Corrélations de Spearman : validation de bioindicateurs de « pression métallique »

<figure><img src="image_11.png" /></figure>

amU