# Projet FooSIN : tâche 3.1 Formations en relation avec les principes FAIR. Rapport des résultats de l'enquête

Sylvie Cocaud, Anne-Sophie Grenier, Dominique L'Hostis

► To cite this version:

Sylvie Cocaud, Anne-Sophie Grenier, Dominique L'Hostis. Projet FooSIN : tâche 3.1 Formations en relation avec les principes FAIR. Rapport des résultats de l'enquête. [0] INRAE. 2021, 16 p. hal-03260886

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Submitted on 15 Jun 2021

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# Projet FooSIN : tâche 3.1
## Formations en relation avec les principes FAIR. Rapport des résultats de l'enquête

Sylvie Cocaud, Dominique L'Hostis, Anne-Sophie Grenier. INRAE, Direction pour la Science Ouverte
(DipSO)- 2021

## Rappel de la commande

La tâche 3.1 du WP Go Train du projet FooSIN<fnref n="1" /> doit permettre d'identifier les **matériels et actions de formation existant dans les organisations partenaires** en rapport avec les principes FAIR, et de proposer des pistes d'amélioration apportées par l'examen des actions de formation menées par des acteurs internationaux.

### 1- Enquête

Un questionnaire d'enquête a été rédigé et diffusé à l'ensemble des partenaires du projet FooSIN pour identifier les formations entièrement dédiées aux principes FAIR, ou intégrées à des formations plus larges, en français ou anglais (voir questionnaire en annexe).

L'invitation à renseigner ce questionnaire a été diffusée une première fois en juin 2020 via une liste d'adresses de messagerie établie à partir des partenaires du projet, puis diffusée une seconde fois, via la liste de diffusion RDA France-FAIR à sa création en novembre 2020.

Dix-neuf enregistrements ont été saisis directement par des organisateurs de formations, dont 13 par des partenaires FooSIN.

Vingt-huit enregistrements ont été saisis par l'équipe projet. Ils décrivent des formations identifiées à partir de requêtes sur internet, ou de sites de référence sur la science ouverte.

Les formations axées sur l'analyse et la visualisation des données, ciblant un niveau expert (data scientists), n'ont pas été retenues.

Les analyses décrites dans ce rapport sont réalisées à partir de ces 47 enregistrements. Ce corpus représente un instantané non exhaustif des formations abordant les principes FAIR. Les données sont accessibles sur le portail data INRAE([10.15454/BP9PBL](https://data.inrae.fr/data/viewer/10.15454/BP9PBL)).

<footnote n="1">¹ FooSIN (ANR-19-DATA-0019-01) est la participation française au GO FAIR Food Systems Implementation Network - FooSIN. Il vise à 1) accélérer la mise en œuvre des principes FAIR dans les communautés agriculture et alimentation, et 2) positionner la France comme un leader dans cette démarche en donnant de la visibilité aux actions et productions françaises au niveau international.</footnote>
# 2- Résultats

## 2.1- Organisateurs des formations

Treize formations sont organisées par les partenaires du projet FooSIN :

- 2 par le CIRAD

- 3 par les différentes composantes de l'Université de Montpellier

- 8 par INRAE seul ou à travers des partenariats (IFB)

34 formations proviennent d'organisations externes :

<table><thead><tr><th>Typologie - Organisateur</th><th>Pays</th><th>Organisation</th></tr></thead><tbody><tr><td rowspan="5">Collectif recherche international</td><td rowspan="5">INT</td><td>CODATA</td></tr><tr><td>Open Science MOOC</td></tr><tr><td>DataONE</td></tr><tr><td>FORCE11 Scholarly Communication Institute (FSCI)</td></tr><tr><td>GODAN</td></tr><tr><td>Collectif recherche européen</td><td>EUR</td><td>CESSDA</td></tr><tr><td rowspan="2">Projet européen</td><td rowspan="2">EUR</td><td>PARTHENOS</td></tr><tr><td>FOSTER</td></tr><tr><td rowspan="2">Collectif recherche national</td><td>FRA</td><td>MSH Val de Loire</td></tr><tr><td>NLD</td><td>Research Data Netherlands</td></tr><tr><td>Infrastructure de recherche</td><td>FRA</td><td>ANAEE-France</td></tr><tr><td rowspan="2">Organisme de recherche</td><td rowspan="2">FRA</td><td>INIST-CNRS</td></tr><tr><td>INRIA</td></tr><tr><td rowspan="5">Université</td><td>DNK</td><td>Denmark Universities</td></tr><tr><td rowspan="2">FRA</td><td>Université de Lorraine</td></tr><tr><td>Université de Paris</td></tr><tr><td>INT</td><td>The University of North Carolina at Chapel Hill ; The University of Edinburgh</td></tr><tr><td>NLD</td><td>Delft University of Technology</td></tr><tr><td></td><td></td><td>Maastricht University</td></tr></tbody></table>
<table><tr><td rowspan="6">USA</td><td>Vanderbilt University</td></tr><tr><td>Institute of Museum and Library Science (IMLS)</td></tr><tr><td>Johns Hopkins University</td></tr><tr><td>Network of the National Library of Medicine (NNLM)</td></tr><tr><td>North Carolina State University</td></tr><tr><td>University of Washington</td></tr></table>

## 2.2- Formations génériques, formations spécialisées

Les formations génériques représentent 36 des 47 enregistrements (soit 77%). Seuls 23% des formations sont orientées vers un domaine spécialisé. On retrouve ces pourcentages dans les deux groupes de formations : FooSIN et externe.

<figure><img src="image_2.png" /><figcaption>Figure 1 : Type de formation organisée</figcaption></figure>

Formations appliquées à un domaine scientifique, tel qu'indiqué par les répondants :

* FooSIN : Sciences de la vie et de la santé, Bioinformatique, Sciences Animales (bovins)

* Externe : Sciences Biomédicales, Sciences environnementales, Agriculture et nutrition, Sciences de l'Ingénieur, Recherche clinique, Sciences humaines et sociales

## 2.3- Modalités de formation

* 16 formations en présentiel

* 21 formations en ligne et Mooc

* 4 classes virtuelles

* Autres : 2 guides en ligne, 2 multimodales, 2 au choix en présentiel ou en ligne
<figure><img src="image_3.png" /><figcaption>Figure 2 : Modalités des formations organisées</figcaption></figure>

## 2.4- Durée des formations

<figure><img src="image_4.png" /><figcaption>Figure 3 : Durée des formations organisées</figcaption></figure>

Les formations organisées par les partenaires FooSIN sont plutôt des formations longues (2 jours ou plus).

### Formations courtes

L'échantillon intègre 11 formations courtes (2-4h) qui sont soit des séances introductives génériques, soit des séances spécialisées sur un point ou un outil.
## Formations longues

Vingt-trois formations dépassent une durée de 2 jours : pour des publics avertis (7), débutants (11), tous niveaux (5). Huit délivrent une attestation de type badge ou certificat.

Ces formations longues sont de typologie diverse et assez difficiles à caractériser. Nous distinguons cependant les formations de type :

* MOOC avec interaction entre apprenants et enseignants :

* Recherche reproductible : principes méthodologiques pour une science transparente

* Open Science: Sharing Your Research with the World

* Gestion des données pour la recherche clinique

* Auto-formations comme le site Doranum ou Open Science MOOC

* Formations universitaires diplômantes :

* DU Scientific Data Management (SDM)

* Junior Research Lab

## 2.5- Niveau pré-requis pour les formations

<figure><img src="image_5.png" /><figcaption>Figure 4 : Niveau pré-requis par les formations</figcaption></figure>

La majorité des formations cible un public débutant et n'exige aucun pré-requis. Neuf formations (soit 19% seulement) s'adressent à un public averti :

* 3 sont dédiées à un domaine scientifique : Bioinformatique, Sciences Biomédicales, Sciences de la vie et de la santé, 6 sont génériques

* 1 est de courte durée, les 8 autres sont des formations longues de plus de 2 jours
## 2.6- Langue

Rappel : seules les formations en anglais et/ou en français ont été prises en compte.

<figure><img src="image_6.png" /><figcaption>Figure 5 : Langue des formations FooSIN</figcaption></figure>

<figure><img src="image_7.png" /><figcaption>Figure 6 : Langue des formations externes</figcaption></figure>

## 2.7- Sujets abordés dans les formations

Une liste de sujets a été créée pour identifier le contenu des formations et faciliter la saisie dans le formulaire à renseigner. Un champ libre permettait aux répondants d'indiquer d'éventuels sujets complémentaires, mais la plupart d'entre eux étaient déjà dans la liste, en particulier les outils liés à la reproductibilité des données.

Liste complète : voir le questionnaire en annexe.
<figure><img src="image_8.png" /><figcaption>Figure 7 : Sujets abordés dans les formations</figcaption></figure>
<figure><img src="image_9.png" /><figcaption>Figure 8 : Les sujets des formations externes par nombre d'occurrences décroissant</figcaption></figure>

<figure><img src="image_10.png" /><figcaption>Figure 9 : Les sujets des formations FooSIN par nombre d'occurrences décroissant</figcaption></figure>
<figure><img src="image_11.png" /><figcaption>Figure 10 : Classement des sujets selon leur nombre d'occurrences sur l'ensemble des formations</figcaption></figure>

Plus de la moitié des formations (FooSIN comme externes), abordent les sujets suivants, à considérer comme des contenus incontournables.

* Plan de gestion de données,

* Métadonnées,

* Communicabilité des données, licences... (droit et open data),

* Définition des principes FAIR,

* Préservation des données,

* Identifiants.

A l'inverse, les sujets les moins souvent abordés et toujours intégrés à des formations plus larges sont :

* Nettoyage des données,

* Web sémantique, linked data,

* Ontologies, vocabulaires,

* Implémentation des principes dans un domaine particulier,

* Open source (forges logicielles),

* Services web, API.
## 2.8- Type de contenu

Les formations FooSIN semblent donner une plus grande part aux "ateliers pratiques" et "retours d'expériences" que les formations externes.

<figure><img src="image_12.png" /><figcaption>Figure 11 : Type de contenu des formations FooSIN</figcaption></figure>

<figure><img src="image_13.png" /><figcaption>Figure 12 : Type de contenu des formations externes</figcaption></figure>

La catégorie "Autre" a été utilisée pour 9 formations. Elle représente des exercices, des quiz, du tutorat, et des échanges.
Conclusion

L'enquête réalisée entre le 3/06/2020 et le 25/02/2021 porte sur un échantillon très modeste (47
réponses) et peut comporter des biais :

* Les enregistrements saisis par l'équipe projet provenant de sites web n'ont pas toujours permis de renseigner de façon précise les informations attendues dans le questionnaire.

* Différencier de façon claire les formations réelles de sites internet, de conférences ou guides d'information s'est révélé souvent difficile. Nous avons par exemple choisi de ne pas intégrer les Journées Nationales Science Ouverte (JNSO - COSO) et les "Swiss Research Data Day" dans l'enquête.

* Choix d'écarter a priori les formations orientées analyse et visualisation des données, ciblant un niveau expert (data scientists)

Les résultats ne révèlent pas de différences notables entre les formations FooSIN et les formations externes sur les différents critères examinés. L'enquête met en évidence les sujets moins abordés et qui mériteraient d'être intégrés à de futures formations, en particulier l'évaluation du niveau FAIR et la FAIRification des données (les principes FAIR étant présentés le plus souvent de façon théorique), la reproductibilité, la qualité et la réutilisation des données.
# Annexe : questionnaire d'enquête

## Formations FAIR

Les objectifs du projet ANR FooSIN sont de :

* Développer la culture FAIR et d'encourager sa mise en oeuvre,

* Prendre en compte les besoins et pratiques des acteurs français de l'agriculture et de l'agro-alimentaire,

* Encourager les approches sémantiques et linked open data.

Le projet prévoit la réalisation d'un état des lieux des formations en relation avec les principes FAIR, entièrement dédiées à ces principes ou intégrées dans des formations plus larges.

Ce questionnaire a pour objectifs de permettre à tout organisateur de signaler une formation répondant à ces critères.

<figure><img src="image_14.png" /></figure>

Merci de renseigner le questionnaire pour chaque formation signalée.

Il y a 23 questions dans ce questionnaire

## INFORMATIONS GENERALES

**[]Titre de la formation : ***

Veuillez écrire votre réponse ici :

**[]Description (mots-clés ou texte court) : ***

Veuillez écrire votre réponse ici :

**[]Durée de la formation (en heures) : ***

Veuillez écrire votre réponse ici :

**[]Date de création de la formation ***
Veuillez entrer une date :

## []Organisme formateur *

Veuillez écrire votre réponse ici :

## []Lien vers le programme ou une présentation de la formation :

Veuillez écrire votre réponse ici :

# CONTENU DE LA FORMATION

## []

## Sujets abordés au cours de la formation ?

*

Veuillez choisir toutes les réponses qui conviennent :

* ☐ Définition des principes FAIR

* ☐ Plan de gestion de données

* ☐ Qualité des données

* ☐ Nettoyage des données

* ☐ Organisation, nommage et format des fichiers

* ☐ Formats ouverts, standards et dictionnaires de données

* ☐ Identifiants

* ☐ Métadonnées

* ☐ Ontologies, vocabulaires

* ☐ Web sémantique, linked data

* ☐ Choix de l'entrepôt de données

* ☐ Préservation des données

* ☐ Communicabilité des données, licences... (droit et open data)

* ☐ Reproductibilité des données

* ☐ Réutilisabilité des données

* ☐ Services web, API

* ☐ Open source (forges logicielles)

* ☐ Evaluation et FAIRification des données

* ☐ Implémentation des principes dans un domaine particulier

* ☐ Autre:
Plusieurs réponses possibles

## PUBLIC DE LA FORMATION

### []Formation générique ou appliquée à un domaine scientifique *

Veuillez sélectionner une seule des propositions suivantes :

* ☐ Générique - pour tous domaines confondus

* ☐ Dédiée à un domaine scientifique

### []Merci de préciser lequel :

Répondre à cette question seulement si les conditions suivantes sont réunies :

La réponse était 'Dédiée à un domaine scientifique' à la question '8 [Q9]' (Formation générique ou appliquée à un domaine scientifique)

Veuillez écrire votre réponse ici :

### []Profil professionnel ciblé *

Veuillez choisir toutes les réponses qui conviennent :

* ☐ Technicien et ingénieur de recherche

* ☐ Chercheur, enseignant-chercheur, post-doctorant

* ☐ Etudiant, doctorant

* ☐ Documentaliste, data Librarian (spécialisé / données)

* ☐ Informaticien

* ☐ Bioinformaticien

* ☐ Grand Public

Plusieurs réponses possibles. SVP, à renseigner selon son métier, et non son statut

### []Niveau pré-requis *

Veuillez sélectionner une seule des propositions suivantes :

* ☐ Débutant

* ☐ Averti

* ☐ Expert

* ☐ Tous niveaux

## FORMATEURS

### []Animation
Intervenant interne

Intervenant externe

Informaticien ☐

<figure><img src="image_15.png" /></figure>

<figure><img src="image_16.png" /></figure>

Scientifique ☐

<figure><img src="image_17.png" /></figure>

<figure><img src="image_18.png" /></figure>

Documentaliste ☐

<figure><img src="image_19.png" /></figure>

<figure><img src="image_20.png" /></figure>

Juriste ☐

<figure><img src="image_21.png" /></figure>

<figure><img src="image_22.png" /></figure>

Autre ☐

<figure><img src="image_23.png" /></figure>

<figure><img src="image_24.png" /></figure>

Plusieurs réponses possibles

[]Vous avez sélectionné la réponse "Autre" à la question précédente (intervenant interne). Merci de préciser ci-dessous :

Répondre à cette question seulement si les conditions suivantes sont réunies :

La réponse était '1' à la question '12 [Q12]' (Animation)

Veuillez écrire votre réponse ici :

[]Vous avez répondu "Autre" à la question précédente (intervenant externe).

Merci de préciser :

Répondre à cette question seulement si les conditions suivantes sont réunies :

La réponse était '1' à la question '12 [Q12]' (Animation)

Veuillez écrire votre réponse ici :

## AUTRES CARACTERISTIQUES

[]Nombre de participants *

Veuillez écrire votre réponse ici :

Merci d'indiquer seulement un nombre ou une tranche A-B

[]Rythme de la formation *

Veuillez écrire votre réponse ici :

Précisez par exemple : le nombre de séances par mois, année ... ou "sur demande" ...

[]Type de formation *

Veuillez sélectionner une seule des propositions suivantes :
* ○Présentiel

* ○En ligne - MOOC

* ○En ligne - SPOC

* ○Classe virtuelle

* ○Serious Game

* ○Autre

Faites le commentaire de votre choix ici :

## []Type de contenus *

Veuillez choisir toutes les réponses qui conviennent :

* ☐Apports théoriques

* ☐Atelier pratique

* ☐Retour d'expérience

* ☐Autre:

## []Langue *

Veuillez sélectionner une seule des propositions suivantes :

* ○Français

* ○Anglais

* ○Français et Anglais

Sylvie COCAUD (sylvie.cocaud@inrae.fr)

Anne-Sophie GRENIER (anne-sophie.grenier@inrae.fr)

Dominique L'HOSTIS (dominique.lhostis@inrae.fr)

15/02/2021 – 10:18