# Plan de gestion de données du projet "Baromètre Science Ouverte Données et codes"

Aricia Bassinet, Laetitia Bracco, Eric Jeangirard, Anne L'Hôte, Patrice Lopez, Jean-François Lutz, Laurent Romary, Emmanuel Weisenburger

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## To cite this version:

Aricia Bassinet, Laetitia Bracco, Eric Jeangirard, Anne L'Hôte, Patrice Lopez, et al. Plan de gestion de données du projet "Baromètre Science Ouverte Données et codes". Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche; Université de Lorraine; Inria. 2022. hal-05391570

HAL Id: hal-05391570

https://hal.univ-lorraine.fr/hal-05391570v1

Submitted on 1 Dec 2025

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# DMP du projet "Baromètre Science Ouverte Données et codes"

Plan de gestion de données créé à l'aide de DMP OPIDOR, basé sur le modèle "ANR - Modèle de PGD (français)" fourni par
Agence nationale de la recherche (ANR).

## Renseignements sur le plan

**Titre du plan** DMP du projet "Baromètre Science Ouverte Données et codes"

**Domaines de recherche (selon classification de l'OCDE)**

**Langue** fra

**Date de création** 2022-05-02

**Date de dernière modification** 2022-09-14

**Documents (publications, rapports, brevets, plan expérimental....), sites web associés**

* Baromètre français de la Science Ouverte : https://barometredelascienceouverte.esr.gouv.fr/

## Renseignements sur le projet

**Titre du projet** Baromètre Science Ouverte Données et codes

**Acronyme** BSO3 ou BSO Données et codes

**Résumé** Création de nouveaux indicateurs, portant sur les données de la recherche et les codes logiciels, afin de mesurer la mise en œuvre d'une politique publique de la donnée.

**Sources de financement**
* France Relance :

**Date de début** 2021-09-22

**Partenaires**
* University of Lorraine [04vfs2w97](https://www.lorraine.lre.fr/en/research-and-education/la-recherche/la-recherche-ouverte-de-l-enseignement-supérieur-de-la-recherche-et-de-l-innovation)
* Ministère de l'Enseignement Supérieur, de la Recherche et de l'Innovation
* Inria [02kvxyf05](https://www.inria.fr/en/research-and-education/la-recherche/la-recherche-ouverte-de-l-enseignement-supérieur-de-la-recherche-et-de-l-innovation)

## Produits de recherche :

1. Default research output (Jeu de données)
## Contributeurs

<table><thead><tr><td>Nom</td><td>Affiliation</td><td>Rôles</td></tr></thead><tbody><tr><td>Bassinet Aricia</td><td>Université de Lorraine</td><td></td></tr><tr><td>Bracco Laetitia</td><td></td><td><ul><li>Coordinateur du projet</li><li>Personne contact pour les données</li><li>Responsable du plan de gestion de données</li></ul></td></tr><tr><td>Jeangirard Eric</td><td>Ministère de l'Enseignement Supérieur, de la Recherche et de l'Innovation</td><td></td></tr><tr><td>L'Hôte Anne</td><td>Ministère de l'Enseignement Supérieur, de la Recherche et de l'Innovation</td><td></td></tr><tr><td>Lopez Patrice</td><td>science-miner</td><td></td></tr><tr><td>Lutz Jean-François</td><td>Université de Lorraine</td><td></td></tr><tr><td>Romary Laurent</td><td>Inria</td><td></td></tr><tr><td>Weisenburger Emmanuel</td><td>Ministère de l'Enseignement Supérieur, de la Recherche et de l'Innovation</td><td></td></tr></tbody></table>

Droits d'auteur :

Le(s) créateur(s) de ce plan accepte(nt) que tout ou partie de texte de ce plan soit réutilisé et personnalisé si nécessaire pour un autre plan. Vous n'avez pas besoin de citer le(s) créateur(s) en tant que source. L'utilisation de toute partie de texte de ce plan n'implique pas que le(s) créateur(s) soutien(nen)t ou aient une quelconque relation avec votre projet ou votre soumission.
# DMP du projet "Baromètre Science Ouverte Données et codes"

## 1. Description des données et collecte ou réutilisation de données existantes

Le Baromètre Science Ouverte Données et codes réutilise les données du Baromètre français de la Science Ouverte seconde génération, notamment le corpus de métadonnées de publications. Ces données sont mises à disposition sur data ESR sous licence ouverte Etalab.

De nouvelles données seront générées par deux biais :

- L'analyse de publications en texte intégral pour y détecter des mentions de jeux de données et de logiciels,

- Le moissonnage des métadonnées d'entrepôts de jeux de données pour déterminer le corpus des données de recherche françaises.

L'analyse des publications s'appuie sur des modèles d'apprentissage automatique eux même entraînés sur des données annotées manuellement provenant de corpus existant et d'annotations propres au projet.

Les données sont de deux types : résultats de l'analyse de corpus à grande échelle des publications françaises visant à produire les indicateurs sur l'accès libre et corpus annotés manuellement visant à entraîner les modèles d'apprentissage automatique impliqués dans l'analyse.

Les données seront produites selon plusieurs formats :

- des fichiers en jsonl et en csv pour les résultats d'extraction des jeux de données et de codes logiciel ;

- des fichier TEI XML et JSON pour les corpus annotés manuellement dédiés à l'apprentissage automatique.

## 2. Documentation et qualité des données

Relativement aux résultats d'extraction à grande échelle sur les publications :

- aucun standard de métadonnée particulier ne sera utilisé. En revanche, les bonnes pratiques en matière de code seront respectées pour les données également : présence d'un fichier README, versionnage des fichiers, publication d'une méthodologie.

- à terme, une documentation d'accompagnement sera produite pour accompagner les établissements dans leur appropriation du Baromètre et favoriser les déclinaisons locales.

Relativement aux corpus annotés destinés l'apprentissage automatique :

- les données réutiliseront les formats et métadonnées existants basés sur la TEI XML,

- les données sont ouvertes et partagées sur Zenodo, ce qui implique la conformité des métadonnées du jeu de données et de la gestion de version de cette plateforme.

Pour la détection de mentions de jeux de données et de logiciels, la mesure de F1-score cible est fixé à 80%. Cette mesure de qualité suit les standards actuels d'évaluation en terme d'extraction d'entités. En particulier, chaque modèle est évalué :

- d'une part par "10-folds cross-validation" (moyenne de 10 partitions entraînement/évaluation du corpus annoté),

- d'autre part par "holdout set" stable, approche habituellement favorisée par les spécialistes en apprentissage automatique pour sa fiabilité par rapport au biais d'apprentissage.

Relativement à l'annotation manuelle, nous visons une qualité d'annotations de type "gold", reposant sur une annotation en double aveugle de chaque document, suivi d'une étape de réconciliation sur les cas de désaccord entre annotateurs. Il s'agit du standard de qualité le plus élevé en terme d'annotation manuelle de corpus.

## 3. Stockage et sauvegarde pendant le processus de recherche

Le code est stocké sur Github. Les données produites font l'objet d'un stockage sur le cloud privé OVH Object Storage, avec une mise à jour régulière.
Les corpus annotés étant des extensions de corpus existants, ils feront l'objet de nouvelles versions de corpus déposés sur Zenodo et référencés via DataCite.

Les données sensibles, à savoir les publications en texte intégral, ne seront pas disponibles publiquement. Elles ne seront accessibles qu'aux membres institutionnels du projet, via le cloud privé OVH Object Storage.

Les données des corpus annotés manuellement sont entièrement dérivées de documents disponibles en licence CC-BY, et ne sont donc pas sensibles en terme de copyrights.

## 4. Exigences légales et éthiques, codes de conduite

Aucune donnée à caractère personnel n'est traitée.

Les titulaires du copyright sur les données réalisées dans le projet sont les institutions impliquées dans le projet et produisant ces données.

Les corpus de métadonnées sont destinés à être ouverts en licence Etalab.

Il n'y a pas de question éthique dans ce projet.

## 5. Partage des données et conservation à long terme

Le code est partagé via le dépôt https://github.com/Barometre-de-la-Science-Ouverte/

Les corpus seront déposés au fur et à mesure de l'avancement du projet. Il n'y a pas de restriction au partage du code et des corpus de métadonnées au delà des licences indiquées précédemment. En revanche, les publications en texte intégral (PDF) ne seront pas redistribuées et n'auront qu'un usage interne au projet.

A la fin du projet, les données ainsi produites seront hébergées par le Ministère et indexées sur son propre portail d'Open Data sous licence ouverte v2.0 (Etalab), sur le même modèle que les données du Baromètre sur les publications.

Un dépôt au minimum annuel des données du projet sera également effectué dans Recherche Data Gouv. Ce dépôt comprendra les données du Baromètre publications (BSO2) et du Baromètre données et codes (BSO3).

A la fin du projet, le code et les corpus de métadonnées dans leur ensemble feront l'objet d'un dépôt dans HAL et dans Software Heritage.

Les corpus annotés manuellement seront déposés sur Zenodo, sous la forme de nouvelles versions de corpus existants ayant été étendus.

Le code et les corpus de métadonnées sont produits dans des formats libres. Aucun logiciel propriétaire n'est nécessaire pour y accéder et pour les utiliser.

Un identifiant Software Heritage sera attribué au code à l'occasion du dépôt conjoint HAL / Software Heritage.

Les jeux de données déposés dans Recherche Data Gouv se verront attribuer un DOI.

Des DOI relatifs aux versions des corpus annotés manuellement seront attribués lors des dépôts sur Zenodo.

## 6. Responsabilités et ressources en matière de gestion des données
Le gestionnaire du code et des corpus de métadonnées est l'équipe du Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche (MESR).

Il n'y a pas de ressource spécifique dédiée hormis le temps de travail des membres de l'équipe. Par le biais de l'utilisation de formats et d'outils libres, les données seront FAIR by design.