Science ouverte (Open science), qui considère la science comme un bien commun dont la diffusion est d'intérêt public et général.

**Protocole OAI-PMH** : le protocole OAI-PMH est un protocole qui définit les conditions du transfert de métadonnées d'une archive ouverte, produite par un fournisseur de données, vers le serveur d'un fournisseur de services.

**Revue par les pairs / Peer-reviewing** : La révision, ou relecture, ou évaluation, des articles par les pairs (peer review) est l'étape incontournable avant la publication. Elle permet de vérifier le contenu scientifique de l'article et son apport original par rapport à ce qui a été publié dans le domaine concerné.

**Supplementary materials / Données supplémentaires** : données additionnelles à une publication contenant des informations aidant à sa compréhension.

**TDM** : La fouille de textes et de données (text and data mining - TDM) consiste à explorer, via un algorithme de fouille, des corpus immenses - composés notamment d'articles scientifiques ou de données expérimentales - afin d'en déduire des nouvelles connaissances.

**Voie dorée** : la voie dorée s'applique à la publication d'articles dans des revues en libre accès, quel que soit leur mode de financement. Elle correspond à la deuxième stratégie recommandée dans l'Initiative de Budapest pour l'Accès Ouvert : « Revues alternatives : en second lieu, les savants ont besoin des moyens pour lancer une nouvelle génération de revues alternatives engagées dans le libre accès et pour aider les revues existantes qui choisissent d'opérer la transition vers l'accès libre. »

**Voie verte** : la voie verte qualifie l'auto-archivage par les chercheurs ou l'archivage par une tierce personne des articles dans des archives ouvertes. Elle correspond à la première stratégie préconisée dans l'Initiative de Budapest pour l'Accès Ouvert : « Auto-archivage : en premier lieu, les savants ont besoin d'outils et d'assistance pour déposer leurs articles de revues à comité de lecture dans des archives électroniques ouvertes, une pratique communément appelée auto-archivage. »
TABLE DES ILLUSTRATIONS

<table><tr><td>Figure 1 : Un nexus d'articles selon Crossref</td><td>9</td></tr><tr><td>Figure 2 : Les infrastructures comme élément d'ouverture des sciences</td><td>11</td></tr><tr><td>Figure 3 : Le cycle de vie des données de recherche</td><td>18</td></tr><tr><td>Figure 4 : La longue traîne des données de recherche</td><td>32</td></tr><tr><td>Figure 5 : Les métadonnées obligatoires à la description d'un jeu de données selon le DataCite</td><td>41</td></tr><tr><td>Figure 6 : les différentes étapes du dépôt dans HAL</td><td>48</td></tr><tr><td>Figure 7 : Les différents types de document représentés dans l'échantillon</td><td>51</td></tr><tr><td>Figure 8 : Les types de dépôts dans HAL sans annexes (bleu) et avec annexes (rouge)</td><td>52</td></tr><tr><td>Figure 9 : 14 des extensions retrouvées le plus souvent dans les annexes de HAL sur un total de 230</td><td>53</td></tr><tr><td>Figure 10 : Les champs disciplinaires des dépôts sans annexe (bleu) et des dépôts avec annexes (rouge) dans HAL</td><td>54</td></tr><tr><td>Figure 11 : Les dépôts avec annexes par sous-disciplines en SHS</td><td>55</td></tr></table>
<figure><img src="image_14.png" /></figure>
TABLE DES MATIERES

<table><tr><td>SIGLES ET ABREVIATIONS</td><td>7</td></tr><tr><td>INTRODUCTION</td><td>9</td></tr><tr><td>ENVIRONNEMENT DE STAGE</td><td>13</td></tr><tr><td>1. Le Centre pour la Communication Scientifique Directe et ses services</td><td>13</td></tr><tr><td>2. Support utilisateur et alimentation de la base de connaissances</td><td>15</td></tr><tr><td>PARTIE 1 : ÉTAT DE L'ART : LES DONNEES DE LA RECHERCHE ET LEURS ENJEUX</td><td>17</td></tr><tr><td>1. Définitions</td><td>17</td></tr><tr><td>1.1. Les données de la recherche</td><td>17</td></tr><tr><td>1.2. Les entrepôts de données</td><td>19</td></tr><tr><td>2. Enjeux politiques, organisationnels et sociétaux des données de la recherche</td><td>21</td></tr><tr><td>2.1. Les acteurs des données de la recherche</td><td>21</td></tr><tr><td>2.1.1. Une incitation à déposer de plus en plus vive de la part des financeurs et tutelles</td><td>22</td></tr><tr><td>2.1.2. De nouveaux modèles éditoriaux</td><td>25</td></tr><tr><td>2.2. Les modalités de la collaboration entre chercheurs et professionnels de l'IST</td><td>27</td></tr><tr><td>2.3. Impacts socio-culturels de la libération des données</td><td>29</td></tr><tr><td>3. Enjeux scientifiques</td><td>30</td></tr><tr><td>3.1. La recherche par les données, quelles limites et quels changements épistémologiques ?</td><td>31</td></tr><tr><td>3.2. Un encouragement à la vérification, réutilisation et à la création</td><td>32</td></tr><tr><td>4. Les questions juridiques</td><td>34</td></tr><tr><td>4.1. Le droit français</td><td>34</td></tr><tr><td>4.1. La loi pour une République Numérique</td><td>35</td></tr><tr><td>PARTIE 2 : LES ENTREPOTS DE DONNEES : DES DEFIS TECHNIQUES, DOCUMENTAIRES ET SCIENTIFIQUES</td><td>37</td></tr><tr><td>1. Les entrepôts français</td><td>37</td></tr><tr><td>2. La préparation et publication des données</td><td>38</td></tr><tr><td>2.1. Les formats utilisés</td><td>38</td></tr><tr><td>2.2. Métadonnées et description</td><td>39</td></tr><tr><td>2.3. Les licences et les entrepôts de données</td><td>42</td></tr><tr><td>2.4. Validation des dépôts et coûts de publication</td><td>43</td></tr><tr><td>3. La consultation, le partage et la réutilisation</td><td>44</td></tr><tr><td>3.1. Accessibilité (disponibilité, sécurisation et accès)</td><td>44</td></tr></table>
<table><tr><td>3.2. Citation de données et jeux de données</td><td>46</td></tr></table>

PARTIE 3 : LES DONNEES DE RECHERCHE DANS HAL : ETUDE

<table><tr><td>EXPLORATOIRE</td><td>48</td></tr></table>

<table><tr><td>1. Méthodologie</td><td>49</td></tr></table>

<table><tr><td>2. Résultats de l'étude</td><td>50</td></tr></table>

<table><tr><td>2.1. Le type de document « Données de recherche »</td><td>50</td></tr></table>

<table><tr><td>2.2. Les annexes dans HAL : des données de recherche ?</td><td>50</td></tr></table>

<table><tr><td>2.2.1. A l'intérieur des fichiers</td><td>51</td></tr></table>

<table><tr><td>2.2.2. Les types de publications</td><td>51</td></tr></table>

<table><tr><td>2.2.3. Une myriade de formats de fichiers</td><td>53</td></tr></table>

<table><tr><td>2.2.4. L'approche disciplinaire</td><td>54</td></tr></table>

<table><tr><td>3. Des données supplémentaires multiples et non structurées</td><td>55</td></tr></table>

<table><tr><td>4. Quelles évolutions envisager pour HAL ?</td><td>56</td></tr></table>

<table><tr><td>4.1. Renforcer les collaborations existantes et faire fructifier les échanges internationaux</td><td>56</td></tr></table>

<table><tr><td>4.2. Favoriser le lien entre publication et données</td><td>56</td></tr></table>

<table><tr><td>4.3. HAL comme archive ouverte de données</td><td>57</td></tr></table>

<table><tr><td>CONCLUSION</td><td>60</td></tr></table>

<table><tr><td>SOURCES</td><td>63</td></tr></table>

<table><tr><td>BIBLIOGRAPHIE</td><td>66</td></tr></table>

<table><tr><td>ANNEXES</td><td>71</td></tr></table>

<table><tr><td>GLOSSAIRE</td><td>77</td></tr></table>

<table><tr><td>TABLE DES ILLUSTRATIONS</td><td>79</td></tr></table>

<table><tr><td>TABLE DES MATIERES</td><td>81</td></tr></table>