# L'herbier ALF du CIRAD: Une collection de plantes Africaines en ligne

Samantha Bazan, Simon Taugourdeau, Ousmane Ndiaye

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Samantha Bazan, Simon Taugourdeau, Ousmane Ndiaye. L'herbier ALF du CIRAD: Une collection de plantes Africaines en ligne. Colloque international science ouverte au Sud: Enjeux et perspectives pour une nouvelle dynamique, Oct 2019, Dakar, Sénégal. UCAD, 1 poster, 2019. hal-05174440

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Submitted on 21 Jul 2025

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# Une collection de plantes Africaines en ligne

Bazan Samantha¹, Taugourdeau Simon¹,², Ndiaye Ousmane³

1 - SELMET, Univ Montpellier, CIRAD, INRA, SupAgro, Montpellier, France, 2 - CIRAD, UMR SELMET-DP PPZS Dakar, Sénégal, 3 - ISRA Centre de recherche zootechnique de Dahra, PPZS Dahra, Sénégal

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L'herbier ALF est riche en spécimens provenant d'Afrique et en particulier de la zone Soudano-sahélienne. Les importants travaux des agropastoralistes et des malherbologistes ont permis d'enrichir considérablement la collection sur ces thématiques.

## Données d'herbier et informatisation

Un spécimen d'herbier se compose d'un échantillon de la plante accompagné d'une étiquette renseignée.

Les données essentielles sont :

- la date et le lieu de collecte
- le nom du collecteur
- le nom scientifique de l'espèce

D'autres données peuvent être ajoutées :

- Phénologie
- Nom vernaculaire
- Usages

Pour valoriser au mieux ces données, elles sont depuis des années saisies dans des bases de données spécifiques. L'herbier du Cirad utilise Sonnerat, une base de données commune avec le MNHN.

<figure><img src="image_3.png" /><figcaption>Vu de l'herbier du Cirad
photo Pierre Poilecot)</figcaption></figure>

<figure><img src="image_4.png" /><figcaption>Planches d'herbiers sous la loupe binoculaire pour identification</figcaption></figure>

## Quels usages pour l'herbier ?

Les herbiers sont classiquement utilisés en botanique pour

- Décrire et classer les plantes
- Servir de référence
- Comprendre la distribution des espèces
- Apprendre la botanique

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- Etudier l'impact des changements climatiques
- Réaliser des analyses génétiques
- Etudier des usages pour l'homme
- Analyser les liens homme/plante par la linguistique
- Optimiser des mesures de conservation

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Il existe une très grande variété de thématiques de recherche s'appuyant sur les herbiers, parfois très éloignées de la botanique fondamentale.

Nous développons des protocoles d'analyses chimiques non-destructives en utilisant la SPIR (Spectrométrie Proche InfraRouge)

## L'herbier ALF du Cirad

- 60 000 spécimens
- 60 types
- 5 500 espèces
- 50 pays représentés
- 300 collecteurs

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## Herbier

Collection de plantes ou de parties de plantes desséchées sous presse, étiquetées et nommées qui servent pour les études de botanique.

Institut où sont conservées ces plantes séchées.

<figure><img src="image_8.png" /><figcaption>Plateforme de numérisation e-ReColNat
(Crédit photo Picturae)</figcaption></figure>

<figure><img src="image_9.png" /><figcaption>Banc de numérisation de l'herbier</figcaption></figure>

## Numérisation

32 000 planches de l'herbier du Cirad ont été numérisées dans le cadre du programme national e-ReColNat (2015). Ces images haute-qualité sont accessibles sur la plateforme Recolnat, et nous poursuivons la numérisation de l'herbier.

<figure><img src="image_10.png" /><figcaption>Moteur de recherche eReColNat, spécimens herbier ALF</figcaption></figure>

Le programme E-ReColNat a pour objectif d'extraire et de mettre à disposition les données naturalistes des collections françaises. Le programme est coordonné par le Museum national d'histoire naturelle et concerne plus de 60 partenaires. Cela représente potentiellement 100 millions de spécimens naturalistes en France enseignant 350 ans de récolte. La méthode consiste à associer une numérisation massive avec une saisie des données via le web 2.0 / web participatif.

## Mise en ligne

L'herbier du Cirad est accessible physiquement à tous sur demande et sa base de données est en ligne.

Le site web de l'herbier permet :

- Rechercher des spécimens
- Visualiser toutes les données informatisées et bientôt d'accéder au scan de la planche

<figure><img src="image_11.png" /><figcaption>Moteur de recherche dans la base herbier ALF</figcaption></figure>

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alf.plantnet-project.org

herbieralf@cirad.fr

Samantha Bazan
Conservatrice de l'herbier ALF
samantha.bazan@cirad.fr

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cirad
LA RECHERCHE AGRONOMIQUE POUR LE DÉVELOPPEMENT

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RECOLNAT

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