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open science

eLabFTW@INRAE

François Ehrenmann, Tovo Rabemanantsoa

► To cite this version:

François Ehrenmann, Tovo Rabemanantsoa. eLabFTW@INRAE. Journées de la Mesure et de la Métrologie, INRAE, Oct 2023, Sète, France. hal-04239684

HAL Id: hal-04239684

https://hal.inrae.fr/hal-04239684

Submitted on 17 Oct 2023

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Distributed under a Creative Commons Attribution - ShareAlike 4.0 International License
eLabFTW@INRAE

François Ehrenmann ¹ Tovo Rabemanantsoa ²

¹UMR Biodiversité Gènes et Communautés (BIOGECO), Cestas 33

²Direction pour la Science Ouverte (DipSO), pôle Numérique pour la Science (Num4Sci)

octobre 2023

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# Sommaire

## Contexte

- Démarche qualité dans la recherche

- Les cahiers de laboratoire électroniques (ELN)

- Un ELN : eLabFTW

## Démarche

- Groupe de travail

- Scénarios envisagés

- Focus sur le scénario 2

## Scénario 2 : Un peu de technique

- Création d'une instance

- Accès à une instance

## Perspectives

- Prochaines étapes

- Points à éclaircir

## Quelques liens

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# Contexte

## Démarche qualité dans la recherche

★ S'inscrire dans le cadre du **Plan Données pour la science** de l'institut

★ Expliciter les critères d'une démarche scientifique rigoureuse et intègre, applicable notamment dans le cadre de tous les partenariats nationaux et internationaux

★ Améliorer de la traçabilité des recherches, la gestion des données et faciliter la recherche d'informations

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# Contexte

## Les cahiers de laboratoire électroniques (ELN)

☐ Version papier paraît de moins en moins adaptée (évolution de la nature et du volume des données produites, difficulté pour rechercher / partager / diffuser l'information)

☐ ELN = véritable outil scientifique, répond aux obligations légales et contractuelles en apportant la preuve de l'invention, de ses inventeurs

☐ Saisis des métadonnées nécessaires à la description des études, expérimentations, protocoles, dispositifs d'acquisition...

☐ Outil collaboratif et de partage par excellence

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# Contexte

Un ELN : eLabFTW (e-Lab For The World)

* ✓ Logiciel libre issu de l'ESR

* ✓ Répond aux principales caractéristiques attendues d'un ELN (rapport du GT du CoSO)

* ✓ Facile à prendre en main

* ✓ Potentiel évolutif (adaptation aux différentes disciplines scientifiques)

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Les recommandations des contours d'une offre de service INRAE se déroulent en deux étapes :

- ☐ Définition et analyse des différents scénarios de mise à disposition d'une offre de service et proposition du ou des scénarios répondant aux exigences de l'institut

- ☐ Proposition d'organisation à mettre en place en termes de formation et d'accompagnement

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Les entités (unité de recherche, département, centre, projet...) installent et maintiennent leur propre instance de eLabFTW

Elles doivent veiller à :

- Respecter les recommandations de sécurité de la RSSI

- S'assurer d'avoir les ressources pérennes nécessaires au maintien du service (installation, configuration, exploitation et maintien en condition opérationnelle de leur instance)

- Garantir la présence d'au minimum un pilote (référent) qui a la formation nécessaire pour promouvoir, déployer et accompagner les utilisateurs sur l'utilisation de eLabFTW

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### Mise à disposition d'instances eLabFTW gérées par l'institut

- Service opéré par la DSI et la DipSO

- Chaque instance est configurée identiquement

- Le déploiement est entièrement automatisé

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Les instances sont hébergées chez un prestataire externe

→ Externalisation du maintien en condition opérationnelle
(MCO)

→ Possibilité d'avoir un hébergement certifié SecNumCloud

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* Le choix d'eLabFTW n'est pas une obligation

* Les 3 scénarios peuvent parfaitement cohabiter

* Peu importe le scénario choisi, la présence d'un "pilote" par instance semble vitale

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# Démarche

## Avantages/inconvénients

<table><thead><tr><td>Scénario</td><td>Avantages</td><td>Inconvénients</td></tr></thead><tbody><tr><td>OnPremise 1</td><td><ul><li>Coûts</li><li>Souveraineté</li></ul></td><td><ul><li>Disparités de versions</li><li>Ressources humaines</li></ul></td></tr><tr><td>OnPremise 2</td><td><ul><li>Coûts</li><li>Homogénéité</li><li>Maîtrise</li></ul></td><td><ul><li>Ressources dédiées</li><li>Responsabilité institutionnelle</li></ul></td></tr><tr><td>SaaS</td><td><ul><li>Confort</li><li>Possibilité de SecNumCloud</li></ul></td><td><ul><li>Coûts</li><li>Dépendance aux fournisseurs</li></ul></td></tr></tbody></table>

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- Hébergement sur les infrastructures de la DS1

- Développement par la DipSO

- Automatisation poussée au maximum

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# Un peu de technique

## Comment ça marche ?

<figure><img src="image_26.png" /><figcaption>Figure: Processus de création d'une instance</figcaption></figure>

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# Un peu de technique

## Comment ça marche ?

<figure><img src="image_34.png" /><figcaption>Figure: Processus d'accès à son instance</figcaption></figure>

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# Perspectives

## Prochaines étapes

- Choix des scénarios à adopter

- Arbitrage des conditions

- Mise en conformité (scénario 1)

- Mise en production (scénario 2)

- Choix d'un prestataire (scénario 3)

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* Granularité des instances

* Signature électronique

* 2FA

* Horodatage

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Gilles Mathieu, Dominique Pigeon, Tovo Rabemanantsoa, Christophe Chipeaux, Simon Duvillard, et al.

Rapport du groupe de travail sur les cahiers de laboratoires électroniques.

[Rapport de recherche] Comité pour la science ouverte. 2021, 68 p. (hal-03563244)

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Yaël Hersant, Nathalie Léon, Alain Rivet et Henri Valeins

Bones pratiques de mise en place d'un cahier de laboratoire électronique

CNRS, Mission pour les Initiatives Transverses et Interdisciplinaires, Cas d'eLabFTW

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https://doc.elabftw.net/index.html

Documentation eLabFTW

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Des questions ?

INRAE

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DipSO

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