# Estudio genético de 15.504 accesiones de tomate y establecimiento y caracterización de la colección nuclear resultante

David Alonso, Giuseppe Aprea, Paola Ferrante, Fain V. Vanessa, Cristina Casanova, María Figás, Salvador Soler, Ivanka Tringovska, Stanislava Grozeva, Daniela Ganeva, et al.

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David Alonso, Giuseppe Aprea, Paola Ferrante, Fain V. Vanessa, Cristina Casanova, et al. Estudio genético de 15.504 accesiones de tomate y establecimiento y caracterización de la colección nuclear resultante. X CONGRESO DE MEJORA GENÉTICA DE PLANTAS, Sep 2022, Pontevedra, España. *hal-03737981*

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# Estudio genético de 15.504 accesiones de tomate y establecimiento y caracterización de la colección nuclear resultante

David Alonso<fnref n="1" />*, Giuseppe Aprea<fnref n="2" />, Paola Ferrante<fnref n="2" />, Vanessa V. Fain<fnref n="3" />, Cristina Casanova<fnref n="1" />, María Figás<fnref n="1" />, Salvador Soler<fnref n="1" />, Ivanka Tringovska<fnref n="4" />, Stanislava Grozeva<fnref n="4" />, Daniela Ganeva<fnref n="4" />, Gancho Passev<fnref n="4" />, Olivia Demurtas<fnref n="2" />, Manuela Costanzo<fnref n="2" />, Saleh Alseekh<fnref n="5" />, Alisdair R. Fernie<fnref n="5" />, Jose Luis Rambla<fnref n="6" />,<fnref n="7" />, Antonio Granell<fnref n="6" />, Lorenzo Barchi<fnref n="8" />, Roland Schafleitner<fnref n="9" />, Andreas Börner<fnref n="10" />, Jeremy Salinier<fnref n="11" />, Arnaud Bovy<fnref n="12" />, Filiz Boyaci<fnref n="13" />, Véronique Lefebvre<fnref n="11" />, Nils Stein<fnref n="10" />, Jaime Prohens<fnref n="1" />, María José Díez Niclós<fnref n="1" />, Giovanni Giuliano<fnref n="2" />

La variabilidad genética de tomate conservada en los bancos de germoplasma a nivel mundial constituye uno de los recursos más importantes de genes de interés para la mejora vegetal. Sin embargo, la falta de precisión en los datos de pasaporte y la escasa información fenotípica y genotípica de las colecciones suponen una de las principales limitaciones para su explotación. En el marco del proyecto europeo G2P-SOL, 15.504 accesiones de tomate, cultivado y de especies silvestres relacionadas, se han inventariado y genotipado mediante un panel de 5.000 sondas a través de la plataforma SPET. Esto ha permitido la construcción de una colección nuclear compuesta de 383 accesiones de tomate cultivado y 49 silvestre relacionadas basada en información genotípica y fenotípica que ha sido fenotipada en dos ambientes distintos: Plovdiv (Bulgaria) y Alboraya (Valencia). También se realizaron análisis metabolómicos para compuestos semi polares, lípidos y volátiles. La caracterización genotípica de

<footnote n="1">¹Instituto de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana (COMAV) – Universitat Politècnica de València (UPV), Valencia, Spain.</footnote>

<footnote n="2">²Italian National Agency for new Technologies, Energy and Sustainable Economic Development (ENEA), Casaccia Res. Ctr., Rome, Italy</footnote>

<footnote n="3">³Department of Science, University of Rome “Roma Tre”, Rome, Italy</footnote>

<footnote n="4">⁴Maritsa Vegetable Crops Research Institute (MVCRI), Agricultural Academy, Plovdiv, Bulgaria</footnote>

<footnote n="5">⁵Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, Potsdam-Golm, Germany</footnote>

<footnote n="6">⁶Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas (IBMCP) – Universitat Politècnica de València (UPV), Valencia, Spain.</footnote>

<footnote n="7">⁷Departamento de Ciencias Agrarias y del Medio Natural, Universitat Jaume I, 12071 Castellón de la Plana, Spain.</footnote>

<footnote n="8">⁸Dipartimento di Scienze Agrarie, Forestali e Alimentari (DISAFA), University of Torino, Grugliasco, Turin, Italy</footnote>

<footnote n="9">⁹The World Vegetable Center (AVRDC), Shanhua, Tainan, Taiwan</footnote>

<footnote n="10">¹⁰Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Gatersleben, Germany</footnote>

<footnote n="11">¹¹INRAE, GAFL, Montfavet, France</footnote>

<footnote n="12">¹²Wageningen University and Research (WUR), Wageningen, The Netherlands</footnote>

<footnote n="13">¹³Bati Akdeniz Agricultural Research Institute (BATEM), Antalya, Turkey</footnote>

<footnote>*Autor para la correspondencia: daalmar8@upv.es</footnote>

<footnote>Palabras clave: germoplasma, tomate, colección nuclear, SPET, metabolómica</footnote>
colecciones tan grandes puede ayudar a mejorar el manejo de los materiales en los bancos de germoplasma mediante la identificación de duplicados y accesiones mal clasificadas. Se ha identificado aproximadamente un 12% de duplicados dentro y entre bancos de germoplasma. Respecto a la caracterización fenotípica y metabolómica de la colección nuclear, se ha encontrado una gran diversidad relacionada con la arquitectura de la planta y características del fruto como el tamaño, la forma, la firmeza, el color y los °Brix. En cuanto a los perfiles metabolómicos, se ha identificado y evaluado la expresión de 162 compuestos semi polares, 195 lípidos y 55 compuestos volátiles. Estos resultados representan la base de análisis GWAS con el objetivo de identificar QTLs que expliquen el control de los principales caracteres de interés agronómico, así como estudios de domesticación y diversificación del cultivo.