# Un test génétique utile à la production des poneys de sport

Sophie Dhorne-Pollet, Bernard Dumont Saint Priest, Sophie S. Danvy, Margot

Colin, Elise Oden, Anne Ricard, Eric Barrey

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Sophie Dhorne-Pollet, Bernard Dumont Saint Priest, Sophie S. Danvy, Margot Colin, Elise Oden, et al.. Un test génétique utile à la production des poneys de sport. Journées Sciences et Innovations Equines, Institut Français du Cheval et de l'Equitation, May 2025, IFCE Saumur, France., 10.1371/journal.pone.0244064). . hal-05248826

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Submitted on 10 Sep 2025

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# Un test génétique utile à la production des poneys de sport

Sophie Dhorne-Pollet ¹, Bernard Dumont Saint Priest ², Sophie Danvy ², Margot Colin ³, Elise Oden ³, Anne Ricard ²,¹ et Eric Barrey ¹

¹ Université Paris-Saclay, AgroParisTech, INRAE, GABI UMR1313, Jouy-en-Josas. ² IFCE, Pole développement, innovation et recherche, 61310 Exmes. ³ LABÉO, 1 route de Rosel, Saint-Contest.

## Contexte

Pour améliorer l'aptitude à l'obstacle, l'élevage des poneys de sport fait le plus souvent appel à un croisement entre une jument poney et un étalon cheval de sport.

Ces croisements se font traditionnellement de manière très intuitive. Cette pratique de croisement améliore l'aptitude à l'obstacle mais rend très aléatoire le respect de la hauteur maximale au garrot dont les limites sont fixées à 1,48 m non ferré et 1,49 m ferré.

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Le risque: à aptitude sportive équivalente, un poney « hors taille » a une valeur marchande plus faible que celle d'un poney qui reste dans la taille réglementaire.

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Plusieurs études ont mis en évidence des marqueurs génétiques significativement associés à la taille au garrot chez les chevaux de sport.

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Mais qu'en est il de la population des poneys de sport?

## Matériel et méthodes

### Identification des variants génétiques associés à la taille

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Manhattan plot
GWAS pour la hauteur au garrot
(Ricard et coll. 2020; DOI:10.1371/journal.pone.0244064)

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702 chevaux génotypés sur puce
Affimetrix 670K SNP

Trois SNP localisés sur le chromosome 3 qui à eux seuls expliquent une amplitude de la taille de +/- 3 cm chez les chevaux Selle français.

### Echantillonnage

* 31 échantillons de sang prélevés sur des chevaux de taille et de génotypes connus.

* 48 échantillons de sang prélevés sur des poneys de taille connus.

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### Test de génotypage par PCR quantitative en point final

Test de génotypage par discrimination allélique utilisant la PCR quantitative en point final couplée à l'utilisation de sondes d'hydrolyse (de type TaqMan MGB probes)

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## Résultats

<table><caption>**Tableau 1:** Fréquences alléliques chez les poneys et les chevaux pour les trois SNP significativement associés à la taille.</caption><thead><tr><th rowspan="2"></th><th colspan="2">SNP1</th><th colspan="2">SNP2</th><th colspan="2">SNP3</th></tr><tr><th>Allèle</th><th>Pourcentage<br>(%)</th><th>Allèle</th><th>Pourcentage<br>(%)</th><th>Allèle</th><th>Pourcentage<br>(%)</th></tr></thead><tbody><tr><th rowspan="2">Poney<br>(&lt; 1,49 m)</th><td>T</td><td>97,1</td><td>G</td><td>97,1</td><td>C</td><td>91,4</td></tr><tr><td>C</td><td>2,9</td><td>A</td><td>2,9</td><td>T</td><td>8,6</td></tr><tr><th rowspan="2">Chevaux</th><td>T</td><td>56,8</td><td>G</td><td>56,8</td><td>C</td><td>53,4</td></tr><tr><td>C</td><td>43,2</td><td>A</td><td>43,2</td><td>T</td><td>46,6</td></tr></tbody></table>

<figure><img src="image_12.png" /><figcaption>**Tableau 2:** Fréquences des génotypes dans la population des chevaux (A) et des poneys (B).</figcaption></figure>

<figure><img src="image_13.png" /><figcaption>**Tableau 3:** Tableau des croisements possibles. En ligne et en colonne sont présentés les quatre combinaisons de génotypes des parents pour les trois SNP significativement associés à la taille.</figcaption></figure>

<table><thead><tr><th rowspan="2">SNP1 SNP2 SNP3</th><th colspan="4">Génotypes des parents</th><th rowspan="2">C/C</th></tr><tr><th>T/T</th><th>G/G</th><th>C/T</th><th>T/C</th></tr></thead><tbody><tr><td>T/T</td><td>G/G</td><td>C/C</td><td>Très favorable</td><td>Très aléatoire Très aléatoire</td><td>Défavorable</td></tr><tr><td>T/T</td><td>G/G</td><td>C/T</td><td>Très aléatoire</td><td>Très aléatoire Très aléatoire</td><td>Défavorable</td></tr><tr><td>T/C</td><td>G/A</td><td>C/T</td><td>Très aléatoire</td><td>Très aléatoire Très aléatoire</td><td>Défavorable</td></tr><tr><td>C/C</td><td>A/A</td><td>T/T</td><td>Défavorable</td><td>Défavorable Défavorable</td><td>Très défavorable</td></tr></tbody></table>

## Applications pratiques - Conseils aux éleveurs

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Génotypage rapide et à grande échelle de la population des chevaux et des poneys. Un test de génotypage est disponible.

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Identification des reproducteurs porteurs des variants génétiques favorables.

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Faire des croisements raisonnés après génotypage des reproducteurs.

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LABÉO
Pôle d'analyses et de rédaction
de Normandie

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Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement

Centre Inrae Île-de-France_Jouy-en-Josas_Antony

UMR 1313 GABI; Equipe Biologie Intégrative et Génétique Equine

Domaine de Vilvert • 78352 Jouy-en-Josas Cedex • FRANCE

www.jouy.inra.fr/gabi

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