Introduction : L’eau est un produit vital pour l’Homme, mais également une source de nombreuses maladies hydriques. La qualité des eaux conditionnées en bouteille et en sachet, généralement produites dans des conditions ne respectant pas les normes techniques et de salubrité, est évaluée dans 4 départements à forte activité économique dans le sud du Bénin. Méthodologie : Au total 70 unités de production dont 64 d’ensachage et 6 de mise en bouteilles d’eau ont été inspectées et leurs échantillons prélevés. Les analyses physico-chimiques ont porté sur le pH, la conductivité électrique, les solides totaux dissous (TDS) grâce à un multimètre portatif (HACH, HQ 4300) et la turbidité (turbidimètre HACH 2100 QiS). Les nitrates et fluorures ont été déterminés par un spectrophotomètre UV-Visible (HACH 3900, Germany). L’analyse bactériologique a porté sur la recherche des germes banals, des coliformes totaux et fécaux ; les bactéries spécifiques telles que E. coli, Pseudomonas, Entérocoques et Staphylococcus aureus. Résultats et Discussion : 70% des eaux conditionnées proviennent de forage sans autorisation d’exploitation préalable. Les risques de contamination identifiés sont l’absence de filtres à charbon obligatoires (64,06%), de lampe UV (42,19%) et d’hygiène (34,37%). Le pH des échantillons d’eaux varie entre 3,94 et 7,74 avec 48,57% de non conformités (norme 6,5-8,5). La teneur moyenne en nitrate des échantillons d’eaux de forage est de 28,6±90 mg/L avec 17,14% de non conformités (norme < 45mg/L). Il est noté une relation entre les valeurs élevées de TDS et de nitrate (> 45mg/L) avec un pH acide de l’eau (p= < 0,05). 100% des unités de production d’eau en bouteille (n=6) ont un forage autonome avec un pH moyen de 5,5±1,2. 83,33% et 33,33% de non-conformités ont été observées pour le pH et les nitrates. Quant à la qualité microbiologique 67,14% des échantillons (n=47) contiennent des germes banals au-delà des normes admises (50UFC/mL) dont 50% (n=3) des eaux embouteillées. Une contamination aux coliformes totaux dans 7,14% (n=5) a été observée avec un échantillon positif à E. coli (1,43%). Conclusion : Cette étude confirme la réalité de la mauvaise qualité des eaux conditionnées, surtout celle en sachet. Il urge que les pouvoirs publics amènent tous les producteurs à respecter les normes afin de protéger la santé des populations.